MicrobesOnline Operon Predictions for Prochlorococcus marinus str. AS9601

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1211038 1211037 A9601_00001 A9601_00011 dnaN   FALSE 0.406 2.000 0.022 NA   NA
 1211037 1211036 A9601_00011 A9601_00021     FALSE 0.457 4.000 0.039 NA   NA
 1211036 1211035 A9601_00021 A9601_00031   purF TRUE 0.686 48.000 0.019 1.000 Y NA
 1211034 1211033 A9601_00041 A9601_00051     FALSE 0.311 77.000 0.057 1.000 N NA
 1211033 1211032 A9601_00051 A9601_00061     FALSE 0.341 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1211031 1211030 A9601_00071 A9601_00081   nusB FALSE 0.354 4.000 0.016 NA   NA
 1211030 1211029 A9601_00081 A9601_00091 nusB ftsY FALSE 0.258 59.000 0.005 1.000   NA
 1211029 1211028 A9601_00091 A9601_00101 ftsY rsbU FALSE 0.214 68.000 0.018 1.000 N NA
 1211028 1211027 A9601_00101 A9601_00111 rsbU argH FALSE 0.212 62.000 0.021 1.000 N NA
 1211027 1211026 A9601_00111 A9601_00121 argH   FALSE 0.141 116.000 0.019 1.000   NA
 1211024 1211023 A9601_00141 A9601_00151   grpE TRUE 0.793 75.000 0.021 1.000 Y NA
 1211023 1211022 A9601_00151 A9601_00161 grpE dnaJ TRUE 0.884 30.000 0.168 0.017 Y NA
 1211022 1212485 A9601_00161 A9601_00171 dnaJ   TRUE 0.574 0.000 0.067 1.000   NA
 1212485 1211021 A9601_00171 A9601_00181     TRUE 0.528 -10.000 0.058 1.000   NA
 1211020 1211019 A9601_00191 A9601_00201   murB FALSE 0.207 18.000 0.030 NA   NA
 1211019 1211018 A9601_00201 A9601_00211 murB murC TRUE 0.926 17.000 0.136 0.008 Y NA
 1211016 1211015 A9601_00231 A9601_00241 thiL   FALSE 0.397 -7.000 0.031 1.000 N NA
 1211014 1211013 A9601_00251 A9601_00261 efp accB TRUE 0.499 0.000 0.120 1.000 N NA
 1211012 1211011 A9601_00271 A9601_00281 pdxA   FALSE 0.136 21.000 0.020 1.000 N NA
 1211010 1211009 A9601_00301 A9601_00311     FALSE 0.072 162.000 0.250 NA   NA
 1211009 1211008 A9601_00311 A9601_00321     FALSE 0.251 57.000 0.091 NA   NA
 1211005 1211004 A9601_00351 A9601_00361 cbiD   FALSE 0.190 54.000 0.023 1.000 N NA
 1211002 1211001 A9601_00381 A9601_00391     TRUE 0.551 81.000 0.300 NA   NA
 1211001 1212484 A9601_00391 A9601_00401     FALSE 0.181 111.000 0.150 NA   NA
 1212484 1211000 A9601_00401 A9601_00411     FALSE 0.024 156.000 0.012 NA   NA
 1210999 1210998 A9601_00421 A9601_00431     TRUE 0.547 18.000 0.458 NA   NA
 1210998 1210997 A9601_00431 A9601_00441     TRUE 0.958 17.000 0.457 0.004 Y NA
 1210989 1210988 A9601_00521 A9601_00531     FALSE 0.421 1.000 0.000 1.000   NA
 1210985 1210984 A9601_00561 A9601_00571     FALSE 0.234 0.000 0.000 NA   NA
 1210984 1210983 A9601_00571 A9601_00581     FALSE 0.230 3.000 0.000 NA   NA
 1210983 1212483 A9601_00581 A9601_00591     FALSE 0.223 -3.000 0.000 NA   NA
 1210982 1210981 A9601_00601 A9601_00611     FALSE 0.002 431.000 0.000 NA   NA
 1210978 1210977 A9601_00651 A9601_00661     TRUE 0.822 2.000 0.522 NA   NA
 1210976 1210975 A9601_00671 A9601_00681     TRUE 0.576 84.000 0.350 NA   NA
 1210975 1210974 A9601_00681 A9601_00691   smc FALSE 0.400 77.000 0.150 NA   NA
 1210974 1210973 A9601_00691 A9601_00701 smc   FALSE 0.288 46.000 0.177 NA   NA
 1210972 1309067 A9601_00711 A9601_tRNALeuVIMSS1309067   tRNA-Leu FALSE 0.182 -97.000 0.000 NA   NA
 1212480 1210969 A9601_00741 A9601_00751     TRUE 0.725 79.000 0.556 NA   NA
 1210968 1210967 A9601_00761 A9601_00771     TRUE 0.812 9.000 0.576 1.000   NA
 1210967 1212479 A9601_00771 A9601_00781     FALSE 0.282 42.000 0.182 NA   NA
 1212479 1210966 A9601_00781 A9601_00791   hit FALSE 0.131 47.000 0.010 NA   NA
 1210966 1210965 A9601_00791 A9601_00801 hit def FALSE 0.317 5.000 0.013 1.000 N NA
 1210963 1210962 A9601_00821 A9601_00831     FALSE 0.453 0.000 0.081 1.000 N NA
 1210962 1210961 A9601_00831 A9601_00841   sufC TRUE 0.936 5.000 0.482 1.000 Y NA
 1210961 1210960 A9601_00841 A9601_00851 sufC   TRUE 0.800 22.000 0.466 1.000 Y NA
 1212478 1210959 A9601_00861 A9601_00871     FALSE 0.003 274.000 0.000 NA   NA
 1210959 1212477 A9601_00871 A9601_00881     TRUE 0.810 13.000 0.947 NA   NA
 1212477 1210958 A9601_00881 A9601_00891   pgm FALSE 0.116 34.000 0.017 NA   NA
 1210958 1210957 A9601_00891 A9601_00901 pgm mgs1 FALSE 0.095 34.000 0.009 1.000 N NA
 1210954 1210953 A9601_00931 A9601_00941   cysH FALSE 0.216 16.000 0.026 1.000 N NA
 1210952 1210951 A9601_00951 A9601_00961   citT FALSE 0.410 50.000 0.296 1.000 N NA
 1210951 1210950 A9601_00961 A9601_00971 citT trkG TRUE 0.984 5.000 0.500 0.004 Y NA
 1210950 1210949 A9601_00971 A9601_00981 trkG   TRUE 0.947 19.000 0.438 0.004 Y NA
 1210947 1210946 A9601_01001 A9601_01011     TRUE 0.518 35.000 0.533 NA   NA
 1212476 1212475 A9601_01021 A9601_01031     TRUE 0.481 -3.000 0.111 NA   NA
 1210945 1294243 A9601_01041 A9601_01051     FALSE 0.162 111.000 0.128 NA   NA
 1294258 1210943 A9601_01071 A9601_01081     TRUE 0.690 25.000 1.000 NA   NA
 1210943 1210942 A9601_01081 A9601_01091     TRUE 0.615 71.000 0.421 NA   NA
 1212474 1210941 A9601_01101 A9601_01111   rbn FALSE 0.424 12.000 0.172 NA   NA
 1210941 1210940 A9601_01111 A9601_01121 rbn   FALSE 0.408 92.000 0.154 1.000   NA
 1210940 1210939 A9601_01121 A9601_01131     FALSE 0.460 3.000 0.096 1.000 N NA
 1210939 1210938 A9601_01131 A9601_01141     FALSE 0.197 26.000 0.128 1.000 N NA
 1210937 1210936 A9601_01151 A9601_01161   nadB FALSE 0.418 0.000 0.024 NA   NA
 1212473 1210933 A9601_01191 A9601_01201     FALSE 0.343 47.000 0.238 NA   NA
 1210933 1210932 A9601_01201 A9601_01211     FALSE 0.420 61.000 0.238 NA   NA
 1210932 1210931 A9601_01211 A9601_01221     FALSE 0.259 18.000 0.125 NA   NA
 1210931 1210930 A9601_01221 A9601_01231     TRUE 0.925 -3.000 0.370 1.000 Y NA
 1210926 1212472 A9601_01271 A9601_01281     FALSE 0.201 27.000 0.129 NA   NA
 1210925 1210924 A9601_01291 A9601_01301   rbfA FALSE 0.441 0.000 0.030 NA   NA
 1210924 1210923 A9601_01301 A9601_01311 rbfA hemD FALSE 0.250 -13.000 0.006 1.000 N NA
 1210922 1210921 A9601_01321 A9601_01331   crtQ TRUE 0.875 4.000 0.800 NA   NA
 1210920 1210919 A9601_01341 A9601_01351     TRUE 0.692 7.000 0.375 NA   NA
 1210919 1210918 A9601_01351 A9601_01361     TRUE 0.743 2.000 0.389 NA   NA
 1210918 1294265 A9601_01361 A9601_01371     TRUE 0.860 -7.000 0.778 NA   NA
 1210915 1210914 A9601_01401 A9601_01411     FALSE 0.363 -13.000 0.000 1.000   NA
 1212470 1210913 A9601_01421 A9601_01431     FALSE 0.422 9.000 0.117 NA   NA
 1210913 1309105 A9601_01431 A9601_tRNAAsnVIMSS1309105   tRNA-Asn FALSE 0.090 50.000 0.000 NA   NA
 1210910 1210909 A9601_01461 A9601_01471 holB tmk TRUE 0.637 -3.000 0.254 1.000 N NA
 1210909 1210908 A9601_01471 A9601_01481 tmk zntA FALSE 0.382 1.000 0.020 1.000 N NA
 1210905 1210904 A9601_01511 A9601_01521   plsX FALSE 0.418 1.000 0.026 1.000 N NA
 1210904 1210903 A9601_01521 A9601_01531 plsX fabH TRUE 0.947 54.000 0.380 0.007 Y NA
 1210903 1210902 A9601_01531 A9601_01541 fabH fabD TRUE 0.935 14.000 0.043 0.007 Y NA
 1210902 1210901 A9601_01541 A9601_01551 fabD   TRUE 0.896 6.000 0.218 1.000 Y NA
 1210900 1210899 A9601_01561 A9601_01571   ycf34 FALSE 0.320 10.000 0.023 NA   NA
 1210898 1210897 A9601_01581 A9601_01591     FALSE 0.346 59.000 0.074 1.000   NA
 1210896 1212469 A9601_01601 A9601_01611 crtB,pys pds TRUE 0.665 40.000 0.691 1.000   NA
 1212468 1212467 A9601_01621 A9601_01631     TRUE 0.591 -3.000 0.205 NA   NA
 1212465 1212464 A9601_01651 A9601_01661   ndhF FALSE 0.168 34.000 0.041 NA   NA
 1212464 1212463 A9601_01661 A9601_01671 ndhF   TRUE 0.777 131.000 0.050 0.003 Y NA
 1212463 1212462 A9601_01671 A9601_01681     FALSE 0.099 124.000 0.009 1.000   NA
 1212462 1212461 A9601_01681 A9601_01691     FALSE 0.287 48.000 0.034 1.000   NA
 1294226 1212458 A9601_01721 A9601_01731     FALSE 0.262 91.000 0.090 NA   NA
 1212458 1212457 A9601_01731 A9601_01741     TRUE 0.485 1.000 0.101 NA   NA
 1212457 1212456 A9601_01741 A9601_01751   ndhE FALSE 0.355 10.000 0.071 1.000 N NA
 1212456 1212455 A9601_01751 A9601_01761 ndhE ndhG TRUE 0.965 16.000 0.506 0.004 Y NA
 1212455 1212454 A9601_01761 A9601_01771 ndhG ndhI TRUE 0.941 14.000 0.192 0.012 Y NA
 1212454 1212453 A9601_01771 A9601_01781 ndhI ndhA TRUE 0.951 69.000 0.242 0.012 Y NA
 1212453 1212452 A9601_01781 A9601_01791 ndhA gltA TRUE 0.820 76.000 0.137 1.000 Y NA
 1212452 1212451 A9601_01791 A9601_01801 gltA   FALSE 0.091 126.000 0.094 NA   NA
 1212786 1212448 A9601_01831 A9601_01841 sui1 cysC FALSE 0.104 43.000 0.006 1.000 N NA
 1212442 1212441 A9601_01901 A9601_01911 ndhH   TRUE 0.490 10.000 0.182 NA   NA
 1212440 1212439 A9601_01921 A9601_01931 menE menC TRUE 0.924 -3.000 0.104 0.002 N NA
 1212439 1212438 A9601_01931 A9601_01941 menC menA FALSE 0.437 -3.000 0.066 1.000 N NA
 1212436 1212435 A9601_01961 A9601_01971 gshB grxC FALSE 0.387 6.000 0.028 1.000 N NA
 1212434 1212785 A9601_01981 A9601_01991 prfB   FALSE 0.412 4.000 0.025 NA   NA
 1212785 1212433 A9601_01991 A9601_02001     FALSE 0.414 7.000 0.039 NA   NA
 1212433 1212784 A9601_02001 A9601_02011   dgkA FALSE 0.458 7.000 0.123 NA   NA
 1212784 1212432 A9601_02011 A9601_02021 dgkA pabA FALSE 0.444 13.000 0.231 1.000 N NA
 1212432 1212431 A9601_02021 A9601_02031 pabA   FALSE 0.319 20.000 0.231 NA   NA
 1212430 1212429 A9601_02041 A9601_02051   argS FALSE 0.345 0.000 0.015 1.000 N NA
 1212429 1212428 A9601_02051 A9601_02061 argS nadC FALSE 0.105 28.000 0.014 1.000 N NA
 1212428 1212427 A9601_02061 A9601_02071 nadC thdF FALSE 0.352 83.000 0.014 1.000   NA
 1212423 1212422 A9601_02111 A9601_02121 rluD   FALSE 0.468 -9.000 0.018 1.000   NA
 1212418 1212417 A9601_02161 A9601_02171   pyrD FALSE 0.262 10.000 0.016 1.000 N NA
 1212417 1212416 A9601_02171 A9601_02181 pyrD rnhA FALSE 0.381 7.000 0.031 1.000 N NA
 1212416 1212415 A9601_02181 A9601_02191 rnhA rplL FALSE 0.121 48.000 0.008 1.000 N NA
 1212415 1212414 A9601_02191 A9601_02201 rplL rplJ TRUE 0.865 29.000 0.884 1.000 Y NA
 1212414 1212413 A9601_02201 A9601_02211 rplJ rplA FALSE 0.222 191.000 0.302 1.000 Y NA
 1212413 1212412 A9601_02211 A9601_02221 rplA rplK TRUE 0.974 67.000 0.838 0.044 Y NA
 1212412 1212411 A9601_02221 A9601_02231 rplK nusG TRUE 0.751 68.000 0.681 1.000 N NA
 1212411 1212410 A9601_02231 A9601_02241 nusG secE TRUE 0.732 52.000 0.843 1.000 N NA
 1212410 1212409 A9601_02241 A9601_02251 secE clpB2 FALSE 0.220 62.000 0.023 1.000 N NA
 1212407 1212406 A9601_02271 A9601_02281     TRUE 0.826 -3.000 0.576 NA   NA
 1212404 1212403 A9601_02301 A9601_02311     TRUE 0.554 3.000 0.152 NA   NA
 1212402 1212782 A9601_02331 A9601_02341     FALSE 0.063 29.000 0.000 NA   NA
 1212401 1212400 A9601_02351 A9601_02361 hemB   FALSE 0.366 63.000 0.033 1.000   NA
 1212400 1212399 A9601_02361 A9601_02371     FALSE 0.361 15.000 0.044 1.000   NA
 1212399 1212398 A9601_02371 A9601_02381   obg FALSE 0.198 41.000 0.008 1.000   NA
 1212398 1212397 A9601_02381 A9601_02391 obg   FALSE 0.176 86.000 0.005 NA   NA
 1212396 1212395 A9601_02401 A9601_02411   ecm4 FALSE 0.096 132.000 0.152 NA   NA
 1212393 1212392 A9601_02441 A9601_02451 psbA aroC FALSE 0.120 110.000 0.000 1.000   NA
 1212391 1212390 A9601_02461 A9601_02471 eda   FALSE 0.442 22.000 0.415 1.000 N NA
 1212390 1212389 A9601_02471 A9601_02481   met3 FALSE 0.198 47.000 0.061 1.000 N NA
 1212389 1212388 A9601_02481 A9601_02491 met3 psbO FALSE 0.406 73.000 0.064 1.000   NA
 1212388 1212387 A9601_02491 A9601_02501 psbO dfp FALSE 0.030 173.000 0.004 1.000   NA
 1212387 1212386 A9601_02501 A9601_02511 dfp   FALSE 0.393 -10.000 0.030 NA   NA
 1212385 1212384 A9601_02521 A9601_02531     TRUE 0.527 12.000 0.278 NA   NA
 1212383 1212382 A9601_02541 A9601_02551 pyrB   FALSE 0.127 22.000 0.019 1.000 N NA
 1309087 1212780 A9601_tRNALeuVIMSS1309087 A9601_02581 tRNA-Leu   FALSE 0.133 72.000 0.000 NA   NA
 1212780 1212379 A9601_02581 A9601_02591   ileS FALSE 0.084 121.000 0.025 NA   NA
 1294287 1212792 A9601_02601 A9601_02611     TRUE 0.783 -40.000 0.561 NA   NA
 1212375 1212374 A9601_02651 A9601_02661 thy1 dcd TRUE 0.889 2.000 0.042 1.000 Y NA
 1212374 1212373 A9601_02661 A9601_02671 dcd   FALSE 0.436 5.000 0.091 1.000 N NA
 1212372 1212371 A9601_02681 A9601_02691 ntcA   TRUE 0.593 40.000 0.612 NA   NA
 1212371 1212779 A9601_02691 A9601_02701     TRUE 0.476 1.000 0.047 NA   NA
 1212370 1212369 A9601_02711 A9601_02721   pth FALSE 0.395 4.000 0.022 NA   NA
 1212369 1212368 A9601_02721 A9601_02731 pth psbH FALSE 0.052 140.000 0.006 1.000   NA
 1212367 1212366 A9601_02741 A9601_02751 psbN psbI TRUE 0.739 109.000 0.216 0.007   NA
 1212366 1212365 A9601_02751 A9601_02761 psbI   FALSE 0.225 122.000 0.324 NA   NA
 1212364 1212363 A9601_02771 A9601_02781 leuD leuC TRUE 0.981 0.000 0.268 0.002 Y NA
 1212363 1212362 A9601_02781 A9601_02791 leuC cinA FALSE 0.357 14.000 0.032 1.000   NA
 1212362 1212361 A9601_02791 A9601_02801 cinA glyA TRUE 0.496 -3.000 0.018 1.000   NA
 1212361 1309086 A9601_02801 A9601_tRNAArgVIMSS1309086 glyA tRNA-Arg FALSE 0.142 78.000 0.000 NA   NA
 1212360 1212359 A9601_02811 A9601_02821     TRUE 0.740 13.000 0.667 NA   NA
 1212357 1212356 A9601_02841 A9601_02851 sfsA amtB FALSE 0.025 181.000 0.040 NA   NA
 1212356 1212355 A9601_02851 A9601_02861 amtB lytB TRUE 0.473 89.000 0.286 1.000 N NA
 1212355 1212354 A9601_02861 A9601_02871 lytB   FALSE 0.217 104.000 0.143 NA   NA
 1212348 1212347 A9601_02931 A9601_02941 tgt psbK FALSE 0.229 34.000 0.034 1.000   NA
 1212345 1309085 A9601_02971 A9601_tRNAMetVIMSS1309085   tRNA-Met FALSE 0.083 19.000 0.000 NA   NA
 1212344 1212343 A9601_02981 A9601_02991 pyrE   FALSE 0.441 11.000 0.034 1.000   NA
 1212341 1212340 A9601_03011 A9601_03021     FALSE 0.313 -36.000 0.020 1.000 N NA
 1212339 1212338 A9601_03031 A9601_03041     FALSE 0.238 74.000 0.020 1.000 N NA
 1212338 1212337 A9601_03041 A9601_03051   fabI FALSE 0.143 21.000 0.021 1.000 N NA
 1212336 1212335 A9601_03061 A9601_03071   degT FALSE 0.328 54.000 0.057 1.000   NA
 1212334 1212333 A9601_03081 A9601_03091 phrB   TRUE 0.882 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1212333 1212332 A9601_03091 A9601_03101   folK FALSE 0.195 48.000 0.033 1.000 N NA
 1212330 1212329 A9601_03121 A9601_03131     TRUE 0.945 6.000 0.690 NA Y NA
 1212327 1212326 A9601_03151 A9601_03161 ndhJ ndhK TRUE 0.983 0.000 0.406 0.004 Y NA
 1212326 1212325 A9601_03161 A9601_03171 ndhK ndhC TRUE 0.982 5.000 0.428 0.004 Y NA
 1212324 1212323 A9601_03181 A9601_03191 rub   TRUE 0.756 10.000 0.521 NA   NA
 1212323 1212322 A9601_03191 A9601_03201   psbE FALSE 0.338 131.000 0.625 NA   NA
 1212322 1212321 A9601_03201 A9601_03211 psbE psbF TRUE 0.976 3.000 0.837 0.004   NA
 1212321 1212320 A9601_03211 A9601_03221 psbF psbL TRUE 0.955 12.000 0.872 0.007   NA
 1212320 1212319 A9601_03221 A9601_03231 psbL psbJ TRUE 0.964 10.000 0.878 0.007   NA
 1212316 1212315 A9601_03261 A9601_03271   uvrD FALSE 0.373 6.000 0.025 1.000 N NA
 1212315 1212776 A9601_03271 A9601_03281 uvrD   FALSE 0.120 23.000 0.012 NA   NA
 1212313 1212775 A9601_03301 A9601_03311 cpeS   TRUE 0.595 -25.000 0.259 NA   NA
 1212775 1212312 A9601_03311 A9601_03321     FALSE 0.291 117.000 0.375 NA   NA
 1309084 1212310 A9601_tRNAPheVIMSS1309084 A9601_03341 tRNA-Phe xylB FALSE 0.100 93.000 0.000 NA   NA
 1212310 1212309 A9601_03341 A9601_03351 xylB metK FALSE 0.239 14.000 0.028 1.000 N NA
 1212309 1212308 A9601_03351 A9601_03361 metK rps1a, rpsA1 FALSE 0.059 138.000 0.008 1.000   NA
 1212308 1212307 A9601_03361 A9601_03371 rps1a, rpsA1   FALSE 0.122 110.000 0.025 NA   NA
 1212307 1212306 A9601_03371 A9601_03381   psbT FALSE 0.219 93.000 0.028 NA   NA
 1212306 1212305 A9601_03381 A9601_03391 psbT psbB TRUE 0.847 24.000 0.651 0.072   NA
 1212304 1212303 A9601_03401 A9601_03411 fdx psbM TRUE 0.505 106.000 0.472 1.000   NA
 1212303 1212302 A9601_03411 A9601_03421 psbM hemK FALSE 0.445 12.000 0.111 1.000   NA
 1212302 1212301 A9601_03421 A9601_03431 hemK sua5 TRUE 0.763 24.000 0.444 NA Y NA
 1309083 1212300 A9601_tRNAThrVIMSS1309083 A9601_03441 tRNA-Thr minE FALSE 0.122 65.000 0.000 NA   NA
 1212300 1212299 A9601_03441 A9601_03451 minE minD TRUE 0.915 2.000 0.347 NA Y NA
 1212299 1212298 A9601_03451 A9601_03461 minD   TRUE 0.471 100.000 0.368 1.000   NA
 1212298 1212297 A9601_03461 A9601_03471     FALSE 0.448 11.000 0.038 1.000   NA
 1212297 1212296 A9601_03471 A9601_03481     FALSE 0.233 28.000 0.071 1.000   NA
 1212295 1212294 A9601_03491 A9601_03501 petB petD TRUE 0.790 34.000 0.471 0.072   NA
 1212293 1212774 A9601_03511 A9601_03521     FALSE 0.004 262.000 0.000 NA   NA
 1294235 1309386 A9601_03531 A9601_rrsVIMSS1309386   rrs FALSE 0.007 193.000 0.000 NA   NA
 1309386 1309088 A9601_rrsVIMSS1309386 A9601_tRNAIleVIMSS1309088 rrs tRNA-Ile FALSE 0.034 125.000 0.000 NA   NA
 1309088 1309089 A9601_tRNAIleVIMSS1309088 A9601_tRNAAlaVIMSS1309089 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.127 13.000 0.000 NA   NA
 1309089 1365720 A9601_tRNAAlaVIMSS1309089 A9601_rrlVIMSS1365720 tRNA-Ala rrl FALSE 0.004 258.000 0.000 NA   NA
 1365720 1309387 A9601_rrlVIMSS1365720 A9601_rrfVIMSS1309387 rrl rrf FALSE 0.126 67.000 0.000 NA   NA
 1212292 1212291 A9601_03541 A9601_03551 mutM psaE TRUE 0.556 5.000 0.040 1.000   NA
 1212291 1212290 A9601_03551 A9601_03561 psaE   TRUE 0.497 81.000 0.152 1.000   NA
 1212290 1212289 A9601_03561 A9601_03571     TRUE 0.535 73.000 0.227 1.000   NA
 1294285 1212772 A9601_03611 A9601_03621     FALSE 0.050 112.000 0.000 NA   NA
 1212772 1212771 A9601_03621 A9601_03631     TRUE 0.501 117.000 0.750 NA   NA
 1362514 1212285 A9601_pseudoVIMSS1362514 A9601_03671 pseudo   FALSE 0.154 11.000 0.000 NA   NA
 1212768 1212284 A9601_03681 A9601_03691     FALSE 0.426 91.000 0.250 NA   NA
 1212283 1212282 A9601_03701 A9601_03711     FALSE 0.154 118.000 0.167 NA   NA
 1212282 1212281 A9601_03711 A9601_03721     FALSE 0.198 40.000 0.100 NA   NA
 1212277 1212276 A9601_03761 A9601_03771     TRUE 0.794 5.000 0.500 NA   NA
 1212276 1294238 A9601_03771 A9601_03781     TRUE 0.722 91.000 0.714 NA   NA
 1212275 1212274 A9601_03811 A9601_03821     FALSE 0.294 67.000 0.086 NA   NA
 1212273 1212765 A9601_03831 A9601_03841     FALSE 0.005 228.000 0.000 NA   NA
 1212764 1212763 A9601_03851 A9601_03861     FALSE 0.144 55.000 0.007 NA   NA
 1294232 1212272 A9601_03871 A9601_03881     FALSE 0.268 47.000 0.150 NA   NA
 1212272 1212762 A9601_03881 A9601_03891     FALSE 0.285 96.000 0.150 NA   NA
 1212271 1212270 A9601_03901 A9601_03911     FALSE 0.001 1283.000 0.000 NA   NA
 1212269 1212268 A9601_03921 A9601_03931     FALSE 0.031 128.000 0.000 NA   NA
 1212267 1212266 A9601_03941 A9601_03951   thiD FALSE 0.381 50.000 0.263 1.000 N NA
 1212761 1212264 A9601_03971 A9601_03981     FALSE 0.329 80.000 0.088 NA   NA
 1212264 1212263 A9601_03981 A9601_03991     FALSE 0.336 71.000 0.118 NA   NA
 1212261 1212260 A9601_04011 A9601_04021     FALSE 0.002 479.000 0.000 NA   NA
 1212760 1212759 A9601_04031 A9601_04041     FALSE 0.063 29.000 0.000 NA   NA
 1212759 1212259 A9601_04041 A9601_04051     FALSE 0.005 226.000 0.000 NA   NA
 1212259 1309082 A9601_04051 A9601_tRNAThrVIMSS1309082   tRNA-Thr FALSE 0.122 88.000 0.000 NA   NA
 1212258 1212758 A9601_04061 A9601_04071     FALSE 0.122 65.000 0.000 NA   NA
 1212257 1212757 A9601_04081 A9601_04091     FALSE 0.196 7.000 0.000 NA   NA
 1212756 1212755 A9601_04101 A9601_04111     TRUE 0.831 -10.000 0.667 NA   NA
 1212755 1294264 A9601_04111 A9601_04121     FALSE 0.078 243.000 0.667 NA   NA
 1294225 1212753 A9601_04141 A9601_04151     FALSE 0.022 137.000 0.000 NA   NA
 1212255 1212752 A9601_04171 A9601_04181     FALSE 0.112 90.000 0.000 NA   NA
 1212254 1212253 A9601_04191 A9601_04201     FALSE 0.235 1.000 0.000 NA   NA
 1212253 1212252 A9601_04201 A9601_04211     FALSE 0.234 0.000 0.000 NA   NA
 1212250 1212750 A9601_04231 A9601_04241     TRUE 0.841 0.000 0.600 NA   NA
 1212247 1212246 A9601_04271 A9601_04281 vsr   FALSE 0.273 66.000 0.032 NA   NA
 1212246 1212245 A9601_04281 A9601_04291     TRUE 0.753 4.000 0.423 NA   NA
 1212245 1212244 A9601_04291 A9601_04301     FALSE 0.463 0.000 0.071 NA   NA
 1212244 1212243 A9601_04301 A9601_04311     TRUE 0.674 3.000 0.286 NA   NA
 1212243 1212242 A9601_04311 A9601_04321     TRUE 0.873 1.000 0.750 NA   NA
 1212241 1212240 A9601_04331 A9601_04341 dcm   TRUE 0.712 -3.000 0.357 NA   NA
 1212240 1212239 A9601_04341 A9601_04351     TRUE 0.897 -3.000 1.000 NA   NA
 1212239 1212238 A9601_04351 A9601_04361     TRUE 0.838 3.000 0.600 NA   NA
 1212238 1212237 A9601_04361 A9601_04371     FALSE 0.113 169.000 0.429 NA   NA
 1212237 1309081 A9601_04371 A9601_tRNAThrVIMSS1309081   tRNA-Thr FALSE 0.018 141.000 0.000 NA   NA
 1309081 1309080 A9601_tRNAThrVIMSS1309081 A9601_tRNATyrVIMSS1309080 tRNA-Thr tRNA-Tyr FALSE 0.154 11.000 0.000 NA   NA
 1212236 1212235 A9601_04381 A9601_04391 aroQ miaE FALSE 0.459 1.000 0.039 1.000 N NA
 1212235 1212234 A9601_04391 A9601_04401 miaE cobI/cbiL FALSE 0.189 17.000 0.022 1.000 N NA
 1212234 1212233 A9601_04401 A9601_04411 cobI/cbiL   FALSE 0.358 0.000 0.015 NA   NA
 1212233 1212232 A9601_04411 A9601_04421     FALSE 0.215 75.000 0.011 NA   NA
 1212232 1212231 A9601_04421 A9601_04431   cbiQ TRUE 0.558 0.000 0.029 1.000   NA
 1212231 1212230 A9601_04431 A9601_04441 cbiQ   TRUE 0.490 20.000 0.447 NA   NA
 1212230 1212229 A9601_04441 A9601_04451     FALSE 0.033 168.000 0.065 NA   NA
 1212229 1212228 A9601_04451 A9601_04461     FALSE 0.070 151.000 0.194 NA   NA
 1212228 1212227 A9601_04461 A9601_04471   proC TRUE 0.556 8.000 0.224 NA   NA
 1212226 1212225 A9601_04481 A9601_04491   recO FALSE 0.183 86.000 0.009 1.000 N NA
 1212225 1212224 A9601_04491 A9601_04501 recO deoC FALSE 0.301 1.000 0.007 1.000 N NA
 1212224 1212223 A9601_04501 A9601_04511 deoC lrtA FALSE 0.099 8.000 0.017 NA N NA
 1212222 1212221 A9601_04521 A9601_04531 lipB fadD FALSE 0.145 28.000 0.029 1.000 N NA
 1212221 1212220 A9601_04531 A9601_04541 fadD   FALSE 0.427 39.000 0.388 NA   NA
 1212220 1212219 A9601_04541 A9601_04551   pdhC FALSE 0.024 219.000 0.176 NA   NA
 1212219 1212218 A9601_04551 A9601_04561 pdhC queA FALSE 0.294 7.000 0.014 1.000 N NA
 1212217 1212216 A9601_04571 A9601_04581     TRUE 0.937 85.000 0.095 0.022 Y NA
 1212216 1212215 A9601_04581 A9601_04591   metB TRUE 0.981 4.000 0.250 0.001 Y NA
 1212215 1212214 A9601_04591 A9601_04601 metB rpsD FALSE 0.188 77.000 0.008 1.000 N NA
 1212213 1212749 A9601_04611 A9601_04621     FALSE 0.400 5.000 0.025 NA   NA
 1212749 1212212 A9601_04621 A9601_04631   murE TRUE 0.481 10.000 0.049 1.000   NA
 1212212 1212211 A9601_04631 A9601_04641 murE   FALSE 0.356 82.000 0.014 1.000   NA
 1212210 1212209 A9601_04651 A9601_04661     TRUE 0.641 37.000 0.082 0.051 N NA
 1212209 1212208 A9601_04661 A9601_04671     FALSE 0.322 78.000 0.086 NA   NA
 1212206 1212205 A9601_04701 A9601_04711 mqo lepA FALSE 0.249 56.000 0.007 1.000   NA
 1212205 1212204 A9601_04711 A9601_04721 lepA dppC FALSE 0.015 170.000 0.006 1.000 N NA
 1212202 1212201 A9601_04741 A9601_04751     FALSE 0.025 176.000 0.028 NA   NA
 1212201 1212200 A9601_04751 A9601_04761     FALSE 0.462 3.000 0.084 NA   NA
 1212200 1212747 A9601_04761 A9601_04771     FALSE 0.175 50.000 0.020 NA   NA
 1212747 1212199 A9601_04771 A9601_04781     FALSE 0.268 -40.000 0.009 NA   NA
 1212199 1212746 A9601_04781 A9601_04791     FALSE 0.108 106.000 0.013 NA   NA
 1212746 1212745 A9601_04791 A9601_04801     TRUE 0.538 20.000 0.500 NA   NA
 1212745 1212198 A9601_04801 A9601_04811   sun FALSE 0.130 52.000 0.004 NA   NA
 1212197 1212196 A9601_04821 A9601_04831 mrcB chlG TRUE 0.777 2.000 0.452 1.000 N NA
 1212196 1212195 A9601_04831 A9601_04841 chlG   FALSE 0.426 9.000 0.119 NA   NA
 1212194 1212193 A9601_04851 A9601_04861 hisF ubiE FALSE 0.124 44.000 0.012 1.000 N NA
 1212191 1212190 A9601_04891 A9601_04901 salX ndhB FALSE 0.279 17.000 0.134 1.000 N NA
 1212189 1212188 A9601_04911 A9601_04921 topA   FALSE 0.324 8.000 0.020 NA   NA
 1212188 1212187 A9601_04921 A9601_04931     FALSE 0.199 21.000 0.105 NA   NA
 1212187 1212186 A9601_04931 A9601_04941   cobT FALSE 0.380 13.000 0.155 NA   NA
 1212186 1212185 A9601_04941 A9601_04951 cobT   TRUE 0.524 1.000 0.130 NA   NA
 1212182 1212181 A9601_04981 A9601_04991   ctaE TRUE 0.741 97.000 1.000 NA   NA
 1212181 1212180 A9601_04991 A9601_05001 ctaE cyoB TRUE 0.987 1.000 0.500 0.002 Y NA
 1212180 1212179 A9601_05001 A9601_05011 cyoB ctaC TRUE 0.986 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 1212178 1212177 A9601_05021 A9601_05031 ctaA cyoE TRUE 0.882 -3.000 0.090 1.000 Y NA
 1212177 1212176 A9601_05031 A9601_05041 cyoE ccmA FALSE 0.174 40.000 0.033 1.000 N NA
 1212176 1212175 A9601_05041 A9601_05051 ccmA   FALSE 0.410 48.000 0.321 1.000 N NA
 1212175 1212174 A9601_05051 A9601_05061     TRUE 0.730 8.000 0.455 NA   NA
 1212169 1212168 A9601_05111 A9601_05121   ubiA FALSE 0.367 10.000 0.043 1.000 N NA
 1212166 1212165 A9601_05141 A9601_05151   cobM FALSE 0.273 56.000 0.016 1.000   NA
 1212165 1212164 A9601_05151 A9601_05161 cobM lgt FALSE 0.417 -7.000 0.061 1.000 N NA
 1212164 1212163 A9601_05161 A9601_05171 lgt petA TRUE 0.737 11.000 0.476 1.000   NA
 1212163 1212162 A9601_05171 A9601_05181 petA petC TRUE 0.964 6.000 0.881 0.055   NA
 1212160 1212159 A9601_05201 A9601_05211 tatC   FALSE 0.296 81.000 0.027 NA   NA
 1212159 1212158 A9601_05211 A9601_05221     FALSE 0.123 30.000 0.020 NA   NA
 1212155 1212743 A9601_05251 A9601_05261 qri7   FALSE 0.325 6.000 0.015 NA   NA
 1212743 1212154 A9601_05261 A9601_05271   nhaP FALSE 0.035 161.000 0.034 NA   NA
 1212153 1309079 A9601_05281 A9601_tRNAAspVIMSS1309079 gltX tRNA-Asp FALSE 0.091 18.000 0.000 NA   NA
 1309079 1212152 A9601_tRNAAspVIMSS1309079 A9601_05291 tRNA-Asp   FALSE 0.016 150.000 0.000 NA   NA
 1212152 1309078 A9601_05291 A9601_tRNATrpVIMSS1309078   tRNA-Trp FALSE 0.067 36.000 0.000 NA   NA
 1309078 1212151 A9601_tRNATrpVIMSS1309078 A9601_05301 tRNA-Trp rplS FALSE 0.098 54.000 0.000 NA   NA
 1212151 1212150 A9601_05301 A9601_05311 rplS   FALSE 0.119 24.000 0.013 NA   NA
 1212147 1212146 A9601_05341 A9601_05351 pta   FALSE 0.247 26.000 0.177 NA   NA
 1212146 1212145 A9601_05351 A9601_05361     FALSE 0.243 67.000 0.021 NA   NA
 1212145 1212144 A9601_05361 A9601_05371     FALSE 0.136 27.000 0.021 NA   NA
 1212144 1212143 A9601_05371 A9601_05381   hflC FALSE 0.394 109.000 0.429 NA   NA
 1212142 1212141 A9601_05391 A9601_05401 hemL xthA FALSE 0.004 227.000 0.000 1.000 N NA
 1212140 1212139 A9601_05411 A9601_05421     FALSE 0.261 32.000 0.217 NA   NA
 1212139 1212138 A9601_05421 A9601_05431     FALSE 0.236 52.000 0.042 NA   NA
 1212138 1212137 A9601_05431 A9601_05441     FALSE 0.460 -3.000 0.042 NA   NA
 1212136 1212135 A9601_05451 A9601_05461 thiP   FALSE 0.170 27.000 0.053 NA   NA
 1212135 1212134 A9601_05461 A9601_05471     FALSE 0.121 30.000 0.020 NA   NA
 1212134 1212133 A9601_05471 A9601_05481     FALSE 0.136 37.000 0.020 NA   NA
 1212132 1212131         TRUE 0.741 30.000 0.000 0.001   NA
 1212131 1212130   A9601_05511     FALSE 0.438 64.000 0.246 1.000 N NA
 1212129 1212128 A9601_05521 A9601_05531 hemC   FALSE 0.120 98.000 0.009 1.000 N NA
 1212126 1212125 A9601_05551 A9601_05561   argB FALSE 0.402 4.000 0.023 NA   NA
 1212125 1212124 A9601_05561 A9601_05571 argB   FALSE 0.255 64.000 0.027 NA   NA
 1212121 1212742 A9601_05601 A9601_05611 cobK cutA FALSE 0.249 14.000 0.031 1.000 N NA
 1212120 1212119 A9601_05621 A9601_05631   purA FALSE 0.196 16.000 0.021 1.000 N NA
 1212119 1212118 A9601_05631 A9601_05641 purA psb27 FALSE 0.276 82.000 0.022 NA   NA
 1212118 1212117 A9601_05641 A9601_05651 psb27 proS FALSE 0.140 27.000 0.023 NA   NA
 1212116 1212740 A9601_05661 A9601_05671     FALSE 0.385 97.000 0.273 NA   NA
 1212740 1212115 A9601_05671 A9601_05681     FALSE 0.425 -10.000 0.041 NA   NA
 1212115 1212114 A9601_05681 A9601_05691   arsC FALSE 0.450 -3.000 0.045 1.000 N NA
 1212114 1212113 A9601_05691 A9601_05701 arsC   FALSE 0.141 30.000 0.030 1.000 N NA
 1212111 1212739 A9601_05721 A9601_05731     TRUE 0.488 85.000 0.250 NA   NA
 1212739 1212110 A9601_05731 A9601_05741     TRUE 0.471 0.000 0.039 NA   NA
 1212110 1212109 A9601_05741 A9601_05751   tal FALSE 0.297 91.000 0.131 1.000 N NA
 1212108 1212107 A9601_05761 A9601_05771 fixC frr FALSE 0.380 -3.000 0.022 1.000 N NA
 1212107 1212106 A9601_05771 A9601_05781 frr pyrH TRUE 0.584 23.000 0.626 1.000 N NA
 1212106 1212105 A9601_05781 A9601_05791 pyrH cobO FALSE 0.046 129.000 0.010 1.000 N NA
 1212105 1212104 A9601_05791 A9601_05801 cobO   TRUE 0.663 35.000 0.024 0.040   NA
 1212103 1212102 A9601_05811 A9601_05821 hemH ilvB FALSE 0.361 137.000 0.031 1.000 Y NA
 1212102 1212101 A9601_05821 A9601_05831 ilvB   FALSE 0.039 176.000 0.149 NA   NA
 1212100 1362515 A9601_05841 A9601_pseudoVIMSS1362515   pseudo FALSE 0.070 24.000 0.000 NA   NA
 1362515 1212099 A9601_pseudoVIMSS1362515 A9601_05851 pseudo   FALSE 0.091 18.000 0.000 NA   NA
 1212099 1212098 A9601_05851 A9601_05861   rps1b, rpsA2, nbp1 TRUE 0.811 -3.000 0.513 NA   NA
 1212097 1212096 A9601_05871 A9601_05881     TRUE 0.701 85.000 0.465 1.000   NA
 1212096 1212095 A9601_05881 A9601_05891     TRUE 0.815 110.000 0.659 0.041   NA
 1212095 1212094 A9601_05891 A9601_05901   accA TRUE 0.555 4.000 0.033 1.000   NA
 1212094 1212093 A9601_05901 A9601_05911 accA   TRUE 0.856 -25.000 0.033 1.000 Y NA
 1212093 1212092 A9601_05911 A9601_05921   folE FALSE 0.107 154.000 0.348 1.000 N NA
 1294234 1212738 A9601_05961 A9601_05971     TRUE 0.615 83.000 0.395 NA   NA
 1212738 1212088 A9601_05971 A9601_05981     FALSE 0.421 54.000 0.274 NA   NA
 1212087 1212086 A9601_05991 A9601_06001 chlL chlB FALSE 0.286 190.000 0.226 0.002 N NA
 1212086 1212085 A9601_06001 A9601_06011 chlB chlN TRUE 0.986 7.000 0.591 0.002 Y NA
 1212085 1212084 A9601_06011 A9601_06021 chlN   FALSE 0.037 158.000 0.068 NA   NA
 1212081 1212080 A9601_06051 A9601_06061 ccmK rbcL TRUE 0.509 69.000 0.373 NA N NA
 1212080 1212079 A9601_06061 A9601_06071 rbcL rbcS TRUE 0.898 91.000 0.392 0.001 N NA
 1212079 1212078 A9601_06071 A9601_06081 rbcS csoS2 TRUE 0.670 84.000 0.474 NA   NA
 1212078 1212077 A9601_06081 A9601_06091 csoS2 csoS3 TRUE 0.869 8.000 0.925 NA   NA
 1212077 1212076 A9601_06091 A9601_06101 csoS3   TRUE 0.897 3.000 0.925 NA   NA
 1212076 1212075 A9601_06101 A9601_06111     TRUE 0.881 19.000 0.868 NA Y NA
 1212075 1212737 A9601_06111 A9601_06121     FALSE 0.386 75.000 0.147 NA   NA
 1212074 1212073 A9601_06131 A9601_06141   tdcF FALSE 0.303 86.000 0.051 NA   NA
 1212073 1212072 A9601_06141 A9601_06151 tdcF   FALSE 0.135 25.000 0.020 NA   NA
 1212071 1212070 A9601_06161 A9601_06171 hisG   FALSE 0.229 13.000 0.021 1.000 N NA
 1212070 1212069 A9601_06171 A9601_06181     TRUE 0.691 0.000 0.222 1.000   NA
 1212068 1212067 A9601_06191 A9601_06201     TRUE 0.490 6.000 0.135 NA   NA
 1212062 1309090 A9601_06251 A9601_tRNALeuVIMSS1309090   tRNA-Leu FALSE 0.073 100.000 0.000 NA   NA
 1309090 1212736 A9601_tRNALeuVIMSS1309090 A9601_06261 tRNA-Leu   FALSE 0.144 79.000 0.000 NA   NA
 1212736 1212735 A9601_06261 A9601_06271     TRUE 0.889 5.000 0.925 NA   NA
 1212735 1212061 A9601_06271 A9601_06281   trpA FALSE 0.079 44.000 0.000 NA   NA
 1212733 1212059 A9601_06311 A9601_06321     TRUE 0.542 1.000 0.143 NA   NA
 1212059 1212058 A9601_06321 A9601_06331     TRUE 0.687 38.000 0.905 NA   NA
 1212058 1212057 A9601_06331 A9601_06341   hisI FALSE 0.014 176.000 0.006 1.000 N NA
 1212055 1212054 A9601_06361 A9601_06371 clpB petE FALSE 0.303 67.000 0.106 1.000 N NA
 1212054 1212053 A9601_06371 A9601_06381 petE   TRUE 0.549 60.000 0.404 1.000 N NA
 1212053 1212052 A9601_06381 A9601_06391   hemE FALSE 0.359 9.000 0.032 1.000 N NA
 1212052 1212051 A9601_06391 A9601_06401 hemE glgB FALSE 0.092 117.000 0.024 1.000 N NA
 1212051 1212050 A9601_06401 A9601_06411 glgB   FALSE 0.436 53.000 0.220 1.000   NA
 1212050 1362516 A9601_06411 A9601_pseudoVIMSS1362516   pseudo FALSE 0.196 7.000 0.000 NA   NA
 1362516 1212732 A9601_pseudoVIMSS1362516 A9601_06421 pseudo   FALSE 0.100 55.000 0.000 NA   NA
 1212732 1212049 A9601_06421 A9601_06431     TRUE 0.554 12.000 0.317 NA   NA
 1212049 1294233 A9601_06431 A9601_06441     FALSE 0.210 19.000 0.049 NA   NA
 1212048 1212047 A9601_06451 A9601_06461   proA FALSE 0.176 67.000 0.006 NA   NA
 1212047 1212046 A9601_06461 A9601_06471 proA folB FALSE 0.264 12.000 0.023 1.000 N NA
 1212046 1212045 A9601_06471 A9601_06481 folB   TRUE 0.494 -13.000 0.027 1.000   NA
 1212044 1212043 A9601_06491 A9601_06501 prlC   TRUE 0.594 14.000 0.444 1.000 N NA
 1212043 1212042 A9601_06501 A9601_06511   thrB FALSE 0.299 80.000 0.031 1.000 N NA
 1212042 1212041 A9601_06511 A9601_06521 thrB glk FALSE 0.162 49.000 0.020 1.000 N NA
 1212041 1212040 A9601_06521 A9601_06531 glk thrS FALSE 0.263 11.000 0.020 1.000 N NA
 1212040 1212039 A9601_06531 A9601_06541 thrS trpS TRUE 0.957 4.000 0.016 0.058 Y NA
 1212039 1212038 A9601_06541 A9601_06551 trpS   FALSE 0.410 -10.000 0.034 NA   NA
 1212037 1212036 A9601_06561 A9601_06571     FALSE 0.185 21.000 0.065 NA   NA
 1212036 1212035 A9601_06571 A9601_06581     TRUE 0.965 4.000 0.894 1.000 Y NA
 1212035 1212034 A9601_06581 A9601_06591     TRUE 0.930 13.000 0.857 1.000 Y NA
 1212034 1212033 A9601_06591 A9601_06601     FALSE 0.452 -3.000 0.085 NA   NA
 1212032 1212031 A9601_06611 A9601_06621     FALSE 0.452 46.000 0.381 NA   NA
 1212030 1212029 A9601_06631 A9601_06641 menD menB TRUE 0.917 36.000 0.147 0.001 Y NA
 1212029 1212028 A9601_06641 A9601_06651 menB glgA FALSE 0.136 37.000 0.022 1.000 N NA
 1212028 1212027 A9601_06651 A9601_06661 glgA murF FALSE 0.398 13.000 0.182 1.000 N NA
 1212026 1212025 A9601_06671 A9601_06681 glmU   FALSE 0.171 49.000 0.021 NA   NA
 1212025 1212024 A9601_06681 A9601_06691   aroA FALSE 0.219 13.000 0.017 NA   NA
 1212023 1212022 A9601_06701 A9601_06711     FALSE 0.230 31.000 0.051 1.000   NA
 1212022 1212021 A9601_06711 A9601_06721   amiC TRUE 0.580 0.000 0.051 1.000   NA
 1212021 1212020 A9601_06721 A9601_06731 amiC murI TRUE 0.875 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 1212020 1212019 A9601_06731 A9601_06741 murI sds FALSE 0.132 28.000 0.024 1.000 N NA
 1212019 1212018 A9601_06741 A9601_06751 sds acs FALSE 0.221 94.000 0.080 1.000 N NA
 1212014 1212731 A9601_06791 A9601_06801 hisS   FALSE 0.304 -3.000 0.007 NA   NA
 1212731 1212730 A9601_06801 A9601_06811     TRUE 0.864 3.000 0.714 NA   NA
 1212730 1212729 A9601_06811 A9601_06821     FALSE 0.378 137.000 0.857 NA   NA
 1212013 1212012 A9601_06831 A9601_06841     FALSE 0.356 94.000 0.132 1.000   NA
 1212012 1212011 A9601_06841 A9601_06851     FALSE 0.293 40.000 0.211 NA   NA
 1212008 1212007 A9601_06881 A9601_06891     TRUE 0.636 8.000 0.235 1.000   NA
 1212005 1212004 A9601_06911 A9601_06921 mscS pncA FALSE 0.290 79.000 0.029 1.000 N NA
 1212002 1212001 A9601_06941 A9601_06951   stpA FALSE 0.270 41.000 0.059 1.000   NA
 1212000 1211999 A9601_06961 A9601_06971     FALSE 0.416 92.000 0.250 NA   NA
 1211999 1211998 A9601_06971 A9601_06981   MET17 FALSE 0.380 72.000 0.149 NA   NA
 1211998 1211997 A9601_06981 A9601_06991 MET17 metA TRUE 0.774 14.000 0.048 1.000 Y NA
 1211996 1211995 A9601_07001 A9601_07011     TRUE 0.612 31.000 0.800 1.000 N NA
 1211994 1211993 A9601_07021 A9601_07031     FALSE 0.002 383.000 0.000 NA   NA
 1212727 1211990 A9601_07061 A9601_07071     TRUE 0.821 3.000 0.538 NA   NA
 1211990 1211989 A9601_07071 A9601_07081   gloA FALSE 0.008 266.000 0.000 1.000   NA
 1211988 1212725 A9601_07101 A9601_07111     TRUE 0.761 8.000 0.500 NA   NA
 1212725 1212724 A9601_07111 A9601_07121     TRUE 0.629 52.000 0.571 NA   NA
 1212724 1309077 A9601_07121 A9601_tRNASerVIMSS1309077   tRNA-Ser FALSE 0.135 74.000 0.000 NA   NA
 1309077 1211987 A9601_tRNASerVIMSS1309077 A9601_07131 tRNA-Ser   FALSE 0.007 195.000 0.000 NA   NA
 1212722 1211986 A9601_07151 A9601_07161   nrdJ FALSE 0.325 89.000 0.132 NA   NA
 1211985 1211984 A9601_07171 A9601_07181   prfC FALSE 0.122 32.000 0.021 1.000 N NA
 1211984 1211983 A9601_07181 A9601_07191 prfC   FALSE 0.252 52.000 0.012 1.000   NA
 1211982 1211981 A9601_07201 A9601_07211     FALSE 0.272 -10.000 0.009 1.000 N NA
 1211980 1211979 A9601_07221 A9601_07231     TRUE 0.658 10.000 0.388 NA   NA
 1211979 1211978 A9601_07231 A9601_07241     FALSE 0.215 88.000 0.018 NA   NA
 1211977 1211976 A9601_07251 A9601_07261 tesA   FALSE 0.383 50.000 0.264 1.000 N NA
 1211976 1362518 A9601_07261 A9601_pseudoVIMSS1362518   pseudo FALSE 0.031 128.000 0.000 NA   NA
 1362518 1211975 A9601_pseudoVIMSS1362518 A9601_07271 pseudo   FALSE 0.208 6.000 0.000 NA   NA
 1211975 1211974 A9601_07271 A9601_07281   phnD TRUE 0.955 -3.000 0.690 1.000 Y NA
 1211974 1211973 A9601_07281 A9601_07291 phnD aspC FALSE 0.450 13.000 0.238 1.000 N NA
 1211972 1211971 A9601_07301 A9601_07311   gcpE FALSE 0.134 36.000 0.022 1.000 N NA
 1211971 1211970 A9601_07311 A9601_07321 gcpE   FALSE 0.225 61.000 0.026 1.000 N NA
 1211964 1211963 A9601_07381 A9601_07391 purK   FALSE 0.002 364.000 0.000 NA   NA
 1211963 1212720 A9601_07391 A9601_07401     TRUE 0.833 -3.000 0.600 NA   NA
 1212720 1294280 A9601_07401 A9601_07411     TRUE 0.777 -10.000 0.500 NA   NA
 1294273 1211962 A9601_07421 A9601_07431     FALSE 0.301 0.000 0.003 NA   NA
 1211962 1212719 A9601_07431 A9601_07441     FALSE 0.303 1.000 0.003 NA   NA
 1212719 1211961 A9601_07441 A9601_07451     TRUE 0.481 32.000 0.500 NA   NA
 1211961 1211960 A9601_07451 A9601_07461     FALSE 0.408 70.000 0.176 NA   NA
 1211959 1362519 A9601_07471 A9601_pseudoVIMSS1362519   pseudo FALSE 0.233 2.000 0.000 NA   NA
 1212718 1212717 A9601_07481 A9601_07491     TRUE 0.707 7.000 0.400 NA   NA
 1212717 1211958 A9601_07491 A9601_07501     TRUE 0.619 92.000 0.500 NA   NA
 1211958 1212716 A9601_07501 A9601_07511     FALSE 0.003 350.000 0.000 NA   NA
 1212716 1294274 A9601_07511 A9601_07521     TRUE 0.730 52.000 0.833 NA   NA
 1294274 1212715 A9601_07521 A9601_07531     FALSE 0.219 100.000 0.128 NA   NA
 1212715 1212714 A9601_07531 A9601_07541     FALSE 0.023 182.000 0.077 NA   NA
 1212714 1211957 A9601_07541 A9601_07551     TRUE 0.700 -16.000 0.400 NA   NA
 1211957 1212713 A9601_07551 A9601_07561     TRUE 0.562 62.000 0.400 NA   NA
 1212712 1211955 A9601_07581 A9601_07591     FALSE 0.003 291.000 0.000 NA   NA
 1211955 1212711 A9601_07591 A9601_07601     TRUE 0.893 0.000 0.857 NA   NA
 1212711 1212710 A9601_07601 A9601_07611     TRUE 0.702 93.000 0.714 NA   NA
 1212710 1211954 A9601_07611 A9601_07621     TRUE 0.828 6.000 0.625 NA   NA
 1211954 1212709 A9601_07621 A9601_07631     FALSE 0.003 294.000 0.000 NA   NA
 1211953 1211952 A9601_07641 A9601_07651     FALSE 0.321 22.000 0.250 NA   NA
 1212707 1211951 A9601_07661 A9601_07671     TRUE 0.716 94.000 0.800 NA   NA
 1211950 1212706 A9601_07681 A9601_07691     TRUE 0.646 8.000 0.333 NA   NA
 1212706 1212705 A9601_07691 A9601_07701     TRUE 0.739 -3.000 0.400 NA   NA
 1212705 1211949 A9601_07701 A9601_07711     TRUE 0.775 84.000 0.714 NA   NA
 1211949 1211948 A9601_07711 A9601_07721     TRUE 0.779 78.000 0.714 NA   NA
 1211948 1211947 A9601_07721 A9601_07731     FALSE 0.022 184.000 0.065 NA   NA
 1211947 1211946 A9601_07731 A9601_07741     TRUE 0.665 101.000 0.039 1.000 Y NA
 1211946 1211945 A9601_07741 A9601_07751   pstC TRUE 0.877 106.000 0.000 0.003 Y NA
 1211945 1211944 A9601_07751 A9601_07761 pstC pstA TRUE 0.984 7.000 0.541 0.003 Y NA
 1211944 1211943 A9601_07761 A9601_07771 pstA pstB TRUE 0.992 1.000 0.952 0.003 Y NA
 1211943 1212704 A9601_07771 A9601_07781 pstB   FALSE 0.005 228.000 0.000 NA   NA
 1212704 1212703 A9601_07781 A9601_07791     TRUE 0.663 11.000 0.429 NA   NA
 1211942 1211941 A9601_07801 A9601_07811     FALSE 0.006 207.000 0.000 NA   NA
 1211941 1211940 A9601_07811 A9601_07821     TRUE 0.820 1.000 0.460 1.000   NA
 1211940 1211939 A9601_07821 A9601_07831     TRUE 0.914 -3.000 0.214 0.037   NA
 1211939 1211938 A9601_07831 A9601_07841     TRUE 0.871 3.000 0.751 1.000 N NA
 1211938 1212702 A9601_07841 A9601_07851     FALSE 0.168 36.000 0.035 NA   NA
 1212702 1212701 A9601_07851 A9601_07861     TRUE 0.629 85.000 0.429 NA   NA
 1212701 1211937 A9601_07861 A9601_07871     FALSE 0.201 99.000 0.098 NA   NA
 1211937 1211936 A9601_07871 A9601_07881     FALSE 0.069 132.000 0.082 NA   NA
 1212697 1212696 A9601_07941 A9601_07951     TRUE 0.780 10.000 0.600 NA   NA
 1212696 1212695 A9601_07951 A9601_07961     TRUE 0.559 40.000 0.556 NA   NA
 1212695 1211934 A9601_07961 A9601_07971     TRUE 0.725 82.000 0.556 NA   NA
 1294242 1211933 A9601_07991 A9601_08001     FALSE 0.294 65.000 0.098 NA   NA
 1211927 1211926 A9601_08061 A9601_08071     TRUE 0.943 -6.000 0.352 0.005   NA
 1211925 1211924 A9601_08081 A9601_08091 pcyA   TRUE 0.783 0.000 0.455 NA   NA
 1211924 1211923 A9601_08091 A9601_08101     TRUE 0.956 0.000 0.769 NA Y NA
 1211923 1211922 A9601_08101 A9601_08111     TRUE 0.914 14.000 0.769 1.000 Y NA
 1211922 1211921 A9601_08111 A9601_08121     TRUE 0.685 19.000 0.800 NA   NA
 1211921 1211920 A9601_08121 A9601_08131     FALSE 0.424 62.000 0.234 NA   NA
 1211920 1211919 A9601_08131 A9601_08141   rpsB FALSE 0.053 130.000 0.017 NA   NA
 1211919 1211918 A9601_08141 A9601_08151 rpsB tsf TRUE 0.872 45.000 0.748 1.000 Y NA
 1211918 1211917 A9601_08151 A9601_08161 tsf   FALSE 0.259 -64.000 0.008 NA   NA
 1211917 1211916 A9601_08161 A9601_08171   recG FALSE 0.125 23.000 0.016 NA   NA
 1211916 1294282 A9601_08171   recG   FALSE 0.247 58.000 0.036 NA   NA
 1294282 1211915         FALSE 0.397 -102.000 0.043 NA   NA
 1211911 1211910 A9601_08231 A9601_08241 vanY typA FALSE 0.045 130.000 0.011 1.000 N NA
 1211910 1211909 A9601_08241 A9601_08251 typA   FALSE 0.249 12.000 0.019 NA   NA
 1211909 1211908 A9601_08251 A9601_08261     FALSE 0.116 101.000 0.011 NA   NA
 1211908 1211907 A9601_08261 A9601_08271   ccmC FALSE 0.124 115.000 0.008 1.000   NA
 1211905 1211904 A9601_08291 A9601_08301 glpX hemA FALSE 0.197 19.000 0.038 1.000 N NA
 1211904 1211903 A9601_08301 A9601_08311 hemA glgC FALSE 0.062 131.000 0.027 1.000 N NA
 1211903 1211902 A9601_08311 A9601_08321 glgC gnd TRUE 0.711 97.000 0.042 1.000 Y NA
 1211902 1211901 A9601_08321 A9601_08331 gnd   TRUE 0.968 -12.000 0.046 0.003 Y NA
 1211901 1211900 A9601_08331 A9601_08341     FALSE 0.336 31.000 0.321 NA   NA
 1211900 1211899 A9601_08341 A9601_08351     TRUE 0.685 -10.000 0.358 NA   NA
 1211898 1211897 A9601_08361 A9601_08371 ilvD   FALSE 0.246 24.000 0.165 NA   NA
 1211897 1211896 A9601_08371 A9601_08381   upp FALSE 0.132 30.000 0.023 NA   NA
 1211895 1211894 A9601_08391 A9601_08401   cobW FALSE 0.374 10.000 0.039 NA   NA
 1211894 1212692 A9601_08401 A9601_08411 cobW   FALSE 0.182 47.000 0.026 NA   NA
 1212692 1211893 A9601_08411 A9601_08421   purS FALSE 0.191 100.000 0.008 1.000   NA
 1211893 1211892 A9601_08421 A9601_08431 purS   TRUE 0.989 2.000 0.656 0.002 Y NA
 1211891 1211890 A9601_08441 A9601_08451 cbbA   TRUE 0.697 148.000 0.026 0.001 Y NA
 1211890 1211889 A9601_08451 A9601_08461     FALSE 0.247 104.000 0.042 1.000   NA
 1211889 1211888 A9601_08461 A9601_08471     FALSE 0.468 3.000 0.092 NA   NA
 1211888 1211887 A9601_08471 A9601_08481   accD FALSE 0.330 2.000 0.009 NA   NA
 1211887 1211886 A9601_08481 A9601_08491 accD prkB FALSE 0.029 140.000 0.010 1.000 N NA
 1211886 1211885 A9601_08491 A9601_08501 prkB leuB TRUE 0.766 90.000 0.074 1.000 Y NA
 1211885 1211884 A9601_08501 A9601_08511 leuB lpxD FALSE 0.158 29.000 0.052 1.000 N NA
 1211884 1211883 A9601_08511 A9601_08521 lpxD proB FALSE 0.170 20.000 0.029 1.000 N NA
 1211883 1211882 A9601_08521 A9601_08531 proB   FALSE 0.408 -3.000 0.025 NA   NA
 1211882 1211881 A9601_08531 A9601_08541     TRUE 0.629 6.000 0.264 NA   NA
 1211881 1211880 A9601_08541 A9601_08551     FALSE 0.167 27.000 0.038 NA   NA
 1211880 1211879 A9601_08551 A9601_08561     FALSE 0.460 -3.000 0.042 NA   NA
 1211879 1211878 A9601_08561 A9601_08571     TRUE 0.791 1.000 0.467 NA   NA
 1211878 1211877 A9601_08571 A9601_08581     FALSE 0.370 11.000 0.111 NA   NA
 1211877 1211876 A9601_08581 A9601_08591     FALSE 0.308 15.000 0.131 NA   NA
 1211876 1211875 A9601_08591 A9601_08601   hisA FALSE 0.228 80.000 0.011 NA   NA
 1212691 1211871 A9601_08641 A9601_08651     FALSE 0.307 27.000 0.256 NA   NA
 1211871 1211870 A9601_08651 A9601_08661   nth FALSE 0.101 36.000 0.010 1.000 N NA
 1211869 1211868 A9601_08671 A9601_08681 potA   FALSE 0.004 245.000 0.000 1.000 N NA
 1294237 1211867 A9601_08691 A9601_08701     FALSE 0.263 113.000 0.294 NA   NA
 1211867 1211866 A9601_08701 A9601_08711     FALSE 0.002 336.000 0.000 1.000 N NA
 1211866 1211865 A9601_08711 A9601_08721     FALSE 0.281 105.000 0.143 1.000   NA
 1211864 1212685 A9601_08781 A9601_08791     TRUE 0.488 98.000 0.429 NA   NA
 1211863 1212684 A9601_08801 A9601_08811     TRUE 0.491 128.000 1.000 NA   NA
 1212684 1212683 A9601_08811 A9601_08821     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 1212683 1212682 A9601_08821 A9601_08831     TRUE 0.827 7.000 0.667 NA   NA
 1212682 1362520 A9601_08831 A9601_pseudoVIMSS1362520   pseudo FALSE 0.022 137.000 0.000 NA   NA
 1211862 1211861 A9601_08841 A9601_08851 livF urtD TRUE 0.918 3.000 0.126 0.020   NA
 1211861 1211860 A9601_08851 A9601_08861 urtD urtC TRUE 0.586 -7.000 0.137 1.000   NA
 1211860 1211859 A9601_08861 A9601_08871 urtC livH TRUE 0.990 0.000 0.888 0.014 Y NA
 1211859 1211858 A9601_08871 A9601_08881 livH   TRUE 0.873 83.000 0.429 NA Y NA
 1211858 1211857 A9601_08881 A9601_08891   ureG FALSE 0.038 129.000 0.079 NA N NA
 1211857 1211856 A9601_08891 A9601_08901 ureG ureF TRUE 0.985 4.000 0.550 0.005 Y NA
 1211856 1211855 A9601_08901 A9601_08911 ureF ureE TRUE 0.984 -7.000 0.560 0.005 Y NA
 1211854 1211853 A9601_08921 A9601_08931 ureD ureA TRUE 0.901 51.000 0.664 0.005 N NA
 1211853 1211852 A9601_08931 A9601_08941 ureA ureB TRUE 0.988 3.000 0.595 0.002 Y NA
 1211852 1211851 A9601_08941 A9601_08951 ureB ureC TRUE 0.985 5.000 0.486 0.002 Y NA
 1211849 1211848 A9601_08971 A9601_08981     TRUE 0.609 3.000 0.126 1.000   NA
 1211848 1211847 A9601_08981 A9601_08991     FALSE 0.448 5.000 0.050 NA   NA
 1211847 1211846 A9601_08991 A9601_09001     FALSE 0.333 92.000 0.162 NA   NA
 1211846 1212681 A9601_09001 A9601_09011     FALSE 0.320 90.000 0.136 NA   NA
 1212681 1212680 A9601_09011 A9601_09021     TRUE 0.668 67.000 0.500 NA   NA
 1309076 1211843 A9601_tRNAProVIMSS1309076 A9601_09051 tRNA-Pro   FALSE 0.065 28.000 0.000 NA   NA
 1211843 1211842 A9601_09051 A9601_09061     FALSE 0.127 38.000 0.019 1.000 N NA
 1211841 1211840 A9601_09071 A9601_09081     FALSE 0.110 34.000 0.014 NA   NA
 1211840 1211839 A9601_09081 A9601_09091   carA TRUE 0.749 15.000 0.021 1.000 Y NA
 1211839 1211838 A9601_09091 A9601_09101 carA   FALSE 0.003 338.000 0.000 NA   NA
 1211838 1211837 A9601_09101 A9601_09111     FALSE 0.341 -3.000 0.013 NA   NA
 1211837 1211836 A9601_09111 A9601_09121     TRUE 0.922 5.000 0.150 0.007   NA
 1211836 1211835 A9601_09121 A9601_09131     FALSE 0.081 126.000 0.031 NA   NA
 1211835 1211834 A9601_09131 A9601_09141   gatA FALSE 0.130 31.000 0.022 NA   NA
 1211834 1211833 A9601_09141 A9601_09151 gatA dnaE FALSE 0.228 85.000 0.019 1.000 N NA
 1211832 1211831 A9601_09161 A9601_09171   rpsO FALSE 0.366 10.000 0.037 NA   NA
 1211831 1211830 A9601_09171 A9601_09181 rpsO ruvA FALSE 0.122 32.000 0.021 1.000 N NA
 1211830 1211829 A9601_09181 A9601_09191 ruvA   TRUE 0.490 1.000 0.010 1.000   NA
 1211829 1211828 A9601_09191 A9601_09201     FALSE 0.287 19.000 0.087 1.000   NA
 1212679 1211826 A9601_09221 A9601_09231   umuC TRUE 0.542 11.000 0.267 NA   NA
 1211826 1211825 A9601_09231 A9601_09241 umuC umuD TRUE 0.838 -3.000 0.625 1.000 N NA
 1211825 1211824 A9601_09241 A9601_09251 umuD   FALSE 0.125 99.000 0.011 NA   NA
 1211824 1212678 A9601_09251 A9601_09261     FALSE 0.116 20.000 0.008 NA   NA
 1211823 1211822 A9601_09271 A9601_09281 ksgA ispE FALSE 0.206 13.000 0.016 1.000 N NA
 1211822 1294253 A9601_09281 A9601_09291 ispE   TRUE 0.489 25.000 0.488 NA   NA
 1294253 1211821 A9601_09291 A9601_09301   pdhB FALSE 0.021 180.000 0.024 NA   NA
 1211821 1211820 A9601_09301 A9601_09311 pdhB secD FALSE 0.447 4.000 0.091 1.000 N NA
 1211820 1211819 A9601_09311 A9601_09321 secD secF TRUE 0.957 21.000 0.516 0.001 Y NA
 1211819 1362521 A9601_09321 A9601_pseudoVIMSS1362521 secF pseudo FALSE 0.091 18.000 0.000 NA   NA
 1211818 1211817 A9601_09331 A9601_09341   psb28 TRUE 0.631 14.000 0.488 NA   NA
 1211817 1211816 A9601_09341 A9601_09351 psb28   FALSE 0.262 61.000 0.077 NA   NA
 1211815 1211814 A9601_09361 A9601_09371   rsbW FALSE 0.316 49.000 0.194 NA   NA
 1211813 1211812 A9601_09381 A9601_09391     FALSE 0.353 13.000 0.137 NA   NA
 1211812 1211811 A9601_09391 A9601_09401   glnA FALSE 0.138 102.000 0.022 1.000 N NA
 1211808 1294255 A9601_09431 A9601_09441 gadB   FALSE 0.348 10.000 0.030 NA   NA
 1211807 1212677 A9601_09451 A9601_09461   lspA FALSE 0.462 2.000 0.003 1.000   NA
 1212677 1212676 A9601_09461 A9601_09471 lspA   TRUE 0.826 0.000 0.554 NA   NA
 1212676 1211806 A9601_09471 A9601_09481   salY FALSE 0.309 16.000 0.140 NA   NA
 1211806 1211805 A9601_09481 A9601_09491 salY pykF TRUE 0.765 -7.000 0.476 1.000 N NA
 1211803 1211802 A9601_09511 A9601_09521     FALSE 0.169 39.000 0.029 NA   NA
 1211802 1362522 A9601_09521 A9601_pseudoVIMSS1362522   pseudo FALSE 0.065 28.000 0.000 NA   NA
 1362522 1211801 A9601_pseudoVIMSS1362522 A9601_09531 pseudo ilvA FALSE 0.039 119.000 0.000 NA   NA
 1211799 1294276 A9601_09551 A9601_09561 psaK   TRUE 0.554 67.000 0.357 NA   NA
 1294276 1211798 A9601_09561 A9601_09571     TRUE 0.827 -7.000 0.625 NA   NA
 1211798 1211797 A9601_09571 A9601_09581     TRUE 0.573 4.000 0.180 NA   NA
 1211797 1211796 A9601_09581 A9601_09591   rpmB FALSE 0.327 6.000 0.018 1.000 N NA
 1211796 1211795 A9601_09591 A9601_09601 rpmB htpG FALSE 0.134 40.000 0.019 1.000 N NA
 1211795 1211794 A9601_09601 A9601_09611 htpG hisZ FALSE 0.057 119.000 0.008 1.000 N NA
 1211794 1211793 A9601_09611 A9601_09621 hisZ suhB FALSE 0.187 19.000 0.032 1.000 N NA
 1211793 1211792 A9601_09621 A9601_09631 suhB   FALSE 0.427 6.000 0.042 1.000 N NA
 1309091 1211791 A9601_tRNASerVIMSS1309091 A9601_09641 tRNA-Ser   FALSE 0.006 214.000 0.000 NA   NA
 1211791 1211790 A9601_09641 A9601_09651     TRUE 0.978 -49.000 0.488 0.008 Y NA
 1211790 1211789 A9601_09651 A9601_09661     TRUE 0.472 34.000 0.488 NA   NA
 1211789 1211788 A9601_09661 A9601_09671     FALSE 0.185 38.000 0.045 NA   NA
 1211782 1211781 A9601_09731 A9601_09741 dapF   TRUE 0.881 0.000 0.021 1.000 Y NA
 1211781 1211780 A9601_09741 A9601_09751     TRUE 0.703 0.000 0.324 NA   NA
 1211780 1211779 A9601_09751 A9601_09761   dacB, pbp TRUE 0.528 8.000 0.195 NA   NA
 1211777 1211776 A9601_09781 A9601_09791   uvrC FALSE 0.403 10.000 0.015 1.000   NA
 1211776 1211775 A9601_09791 A9601_09801 uvrC   FALSE 0.171 89.000 0.008 NA   NA
 1211775 1211774 A9601_09801 A9601_09811     FALSE 0.437 -7.000 0.044 NA   NA
 1211772 1211771 A9601_09831 A9601_09841 ilvE metH TRUE 0.699 19.000 0.036 1.000 Y NA
 1211769 1211768 A9601_09861 A9601_09871   apa2 FALSE 0.210 49.000 0.035 NA   NA
 1211766 1211765 A9601_09901 A9601_09911   pheT FALSE 0.132 94.000 0.005 NA   NA
 1211764 1211763 A9601_09921 A9601_09931 rpmG rpsR TRUE 0.760 18.000 0.037 0.026   NA
 1211763 1211762 A9601_09931 A9601_09941 rpsR   FALSE 0.262 46.000 0.027 1.000   NA
 1211762 1211761 A9601_09941 A9601_09951   metG FALSE 0.329 69.000 0.013 1.000   NA
 1211761 1211760 A9601_09951 A9601_09961 metG   FALSE 0.113 26.000 0.013 NA   NA
 1211758 1211757 A9601_09981 A9601_09991   cobU FALSE 0.266 11.000 0.019 NA   NA
 1211757 1211756 A9601_09991 A9601_10001 cobU cspR FALSE 0.454 3.000 0.039 1.000 N NA
 1211756 1309092 A9601_10001 A9601_tRNAMetVIMSS1309092 cspR tRNA-Met FALSE 0.062 30.000 0.000 NA   NA
 1309092 1211755 A9601_tRNAMetVIMSS1309092 A9601_10011 tRNA-Met   FALSE 0.130 68.000 0.000 NA   NA
 1211755 1211754 A9601_10011 A9601_10021     FALSE 0.142 12.000 0.000 NA   NA
 1211754 1212675 A9601_10021 A9601_10031     FALSE 0.002 354.000 0.000 NA   NA
 1211753 1212674 A9601_10041 A9601_10051     TRUE 0.850 -3.000 0.667 NA   NA
 1212674 1211752 A9601_10051 A9601_10061     FALSE 0.004 269.000 0.000 NA   NA
 1212672 1212671 A9601_10081 A9601_10091     FALSE 0.002 444.000 0.000 NA   NA
 1211751 1212670 A9601_10101 A9601_10111     TRUE 0.748 70.000 0.667 NA   NA
 1212668 1211749 A9601_10141 A9601_10151     FALSE 0.230 33.000 0.172 NA   NA
 1212667 1211747 A9601_10171 A9601_10181     FALSE 0.402 -13.000 0.035 NA   NA
 1212666 1211746 A9601_10191 A9601_10201     FALSE 0.223 -3.000 0.000 NA   NA
 1211746 1211745 A9601_10201 A9601_10211     TRUE 0.875 1.000 0.000 0.057   NA
 1211745 1211744 A9601_10211 A9601_10221   vacB TRUE 0.680 73.000 0.439 1.000   NA
 1211744 1212665 A9601_10221 A9601_10231 vacB   FALSE 0.296 68.000 0.073 NA   NA
 1212665 1211743 A9601_10231 A9601_10241     FALSE 0.263 60.000 0.051 NA   NA
 1211743 1211742 A9601_10241 A9601_10251   PNIL34,AT103 FALSE 0.440 80.000 0.181 NA   NA
 1211742 1211741 A9601_10251 A9601_10261 PNIL34,AT103 tldD FALSE 0.155 32.000 0.034 NA   NA
 1211741 1211740 A9601_10261 A9601_10271 tldD pmbA TRUE 0.531 4.000 0.146 NA   NA
 1211740 1211739 A9601_10271 A9601_10281 pmbA fmt FALSE 0.361 -3.000 0.018 NA   NA
 1211737 1211736 A9601_10301 A9601_10311 mfd   FALSE 0.188 73.000 0.006 NA   NA
 1212664 1211735 A9601_10321 A9601_10331     TRUE 0.649 89.000 0.500 NA   NA
 1211735 1212663 A9601_10331 A9601_10341     TRUE 0.714 2.000 0.343 NA   NA
 1212663 1212662 A9601_10341 A9601_10351     FALSE 0.034 184.000 0.171 NA   NA
 1212662 1211734 A9601_10351 A9601_10361   ubiH TRUE 0.773 6.000 0.485 NA   NA
 1211734 1211733 A9601_10361 A9601_10371 ubiH   FALSE 0.293 20.000 0.200 NA   NA
 1211733 1211732 A9601_10371 A9601_10381   dapB FALSE 0.429 2.000 0.027 NA   NA
 1211730 1211729 A9601_10401 A9601_10411 folP tpi FALSE 0.193 44.000 0.039 1.000 N NA
 1211729 1212661 A9601_10411 A9601_10421 tpi   FALSE 0.328 53.000 0.042 1.000   NA
 1211728 1212660 A9601_10431 A9601_10441     FALSE 0.163 34.000 0.037 NA   NA
 1211726 1211725 A9601_10461 A9601_10471     FALSE 0.351 -10.000 0.021 NA   NA
 1211725 1294248 A9601_10471 A9601_10481     FALSE 0.379 -49.000 0.033 NA   NA
 1294248 1211724 A9601_10481 A9601_10491   ansA TRUE 0.885 1.000 0.810 NA   NA
 1211724 1294257 A9601_10491 A9601_10501 ansA   FALSE 0.002 501.000 0.000 NA   NA
 1294257 1211723 A9601_10501 A9601_10511     TRUE 0.795 76.000 0.800 NA   NA
 1211723 1211722 A9601_10511 A9601_10521     FALSE 0.324 78.000 0.055 NA   NA
 1211722 1211721 A9601_10521 A9601_10531     TRUE 0.824 -10.000 0.648 NA   NA
 1211721 1211720 A9601_10531 A9601_10541     TRUE 0.626 -3.000 0.239 NA   NA
 1212659 1211719 A9601_10551 A9601_10561     TRUE 0.848 0.000 0.625 NA   NA
 1211719 1211718 A9601_10561 A9601_10571     FALSE 0.002 471.000 0.000 NA   NA
 1294260 1211716 A9601_10591 A9601_10601     TRUE 0.801 10.000 0.667 NA   NA
 1211715 1294244 A9601_10611 A9601_10621     FALSE 0.023 136.000 0.000 NA   NA
 1211714 1212656 A9601_10641 A9601_10651     TRUE 0.851 -9.000 0.750 NA   NA
 1212656 1211713 A9601_10651 A9601_10661     TRUE 0.723 2.000 0.357 NA   NA
 1211713 1211712 A9601_10661 A9601_10671     TRUE 0.819 -3.000 0.556 NA   NA
 1211712 1211711 A9601_10671 A9601_10681   rpsU TRUE 0.474 86.000 0.250 NA   NA
 1211708 1212655 A9601_10711 A9601_10721     FALSE 0.192 21.000 0.043 NA   NA
 1212655 1212654 A9601_10721 A9601_10731     TRUE 0.522 33.000 0.571 NA   NA
 1211705 1212653 A9601_10761 A9601_10771     TRUE 0.585 7.000 0.238 NA   NA
 1212653 1212652 A9601_10771 A9601_10781     TRUE 0.673 100.000 0.833 NA   NA
 1212652 1211704 A9601_10781 A9601_10791     TRUE 0.742 93.000 0.833 NA   NA
 1211704 1212651 A9601_10791 A9601_10801     TRUE 0.512 24.000 0.500 NA   NA
 1212651 1211703 A9601_10801 A9601_10811     TRUE 0.678 69.000 0.500 NA   NA
 1211701 1212650 A9601_10851 A9601_10861     FALSE 0.237 108.000 0.207 NA   NA
 1212650 1212649 A9601_10861 A9601_10871     FALSE 0.406 44.000 0.333 NA   NA
 1212649 1211700 A9601_10871 A9601_10881     FALSE 0.339 67.000 0.128 NA   NA
 1211700 1211699 A9601_10881 A9601_10891     FALSE 0.038 156.000 0.077 NA   NA
 1211699 1211698 A9601_10891 A9601_10901   pepN FALSE 0.159 51.000 0.015 NA   NA
 1211698 1212648 A9601_10901 A9601_10911 pepN   FALSE 0.002 405.000 0.000 NA   NA
 1212647 1211697 A9601_10921 A9601_10931   purT FALSE 0.231 94.000 0.038 NA   NA
 1211697 1212646 A9601_10931 A9601_10941 purT   FALSE 0.354 10.000 0.032 NA   NA
 1211695 1211694 A9601_10961 A9601_10971     FALSE 0.391 48.000 0.286 NA   NA
 1211693 1212645 A9601_10981 A9601_10991     FALSE 0.119 19.000 0.006 NA   NA
 1212644 1212643 A9601_11001 A9601_11011     TRUE 0.643 43.000 0.714 NA   NA
 1212643 1294246 A9601_11011 A9601_11021     TRUE 0.614 96.000 0.571 NA   NA
 1211692 1212641 A9601_11031 A9601_11041     FALSE 0.210 35.000 0.140 NA   NA
 1212641 1211691 A9601_11041 A9601_11051     TRUE 0.619 41.000 0.667 NA   NA
 1211691 1211690 A9601_11051 A9601_11061     FALSE 0.166 21.000 0.027 NA   NA
 1294275 1212640 A9601_11081 A9601_11091     FALSE 0.385 132.000 0.800 NA   NA
 1211687 1212639 A9601_11111 A9601_11121     FALSE 0.192 138.000 0.444 NA   NA
 1212638 1212637 A9601_11131 A9601_11141     TRUE 0.649 89.000 0.500 NA   NA
 1212637 1212636 A9601_11141 A9601_11151     TRUE 0.663 87.000 0.500 NA   NA
 1212636 1212635 A9601_11151 A9601_11161     TRUE 0.811 1.000 0.500 NA   NA
 1212635 1212634 A9601_11161 A9601_11171     FALSE 0.442 50.000 0.333 NA   NA
 1212633 1211686 A9601_11181 A9601_11191     TRUE 0.674 86.000 0.500 NA   NA
 1211686 1211685 A9601_11191 A9601_11201     FALSE 0.158 132.000 0.300 NA   NA
 1212632 1212631 A9601_11211 A9601_11221     TRUE 0.634 98.000 0.667 NA   NA
 1212630 1212629 A9601_11231 A9601_11241     FALSE 0.003 282.000 0.000 NA   NA
 1212629 1211684 A9601_11241 A9601_11251     FALSE 0.082 127.000 0.033 NA   NA
 1362523 1211683 A9601_pseudoVIMSS1362523 A9601_11261 pseudo   FALSE 0.007 199.000 0.000 NA   NA
 1212628 1212627 A9601_11271 A9601_11281     TRUE 0.832 77.000 1.000 NA   NA
 1212627 1211682 A9601_11281 A9601_11291     TRUE 0.780 10.000 0.600 NA   NA
 1211682 1212626 A9601_11291 A9601_11301     TRUE 0.803 63.000 1.000 NA   NA
 1211678 1211677 A9601_11341 A9601_11351     FALSE 0.450 85.000 0.214 NA   NA
 1211677 1211676 A9601_11351 A9601_11361     TRUE 0.677 -12.000 0.357 NA   NA
 1362524 1212625 A9601_pseudoVIMSS1362524 A9601_11371 pseudo   FALSE 0.003 275.000 0.000 NA   NA
 1212623 1211675 A9601_11391 A9601_11401     FALSE 0.391 45.000 0.308 NA   NA
 1212622 1211674 A9601_11411 A9601_11421     FALSE 0.064 120.000 0.011 NA   NA
 1211674 1211673 A9601_11421 A9601_11431     TRUE 0.883 2.000 0.805 NA   NA
 1211673 1211672 A9601_11431 A9601_11441     FALSE 0.318 12.000 0.075 NA   NA
 1211672 1211671 A9601_11441 A9601_11451     FALSE 0.062 175.000 0.256 NA   NA
 1211671 1211670 A9601_11451 A9601_11461     FALSE 0.468 84.000 0.222 NA   NA
 1212621 1212620 A9601_11471 A9601_11481     TRUE 0.867 0.000 0.714 NA   NA
 1212620 1211669 A9601_11481 A9601_11491     FALSE 0.258 17.000 0.109 NA   NA
 1211665 1211664 A9601_11531 A9601_11541 dppB ddpA TRUE 0.972 -7.000 0.267 0.013 Y NA
 1211664 1212619 A9601_11541 A9601_11551 ddpA   FALSE 0.259 18.000 0.125 NA   NA
 1212619 1211663 A9601_11551 A9601_11561   thrA FALSE 0.250 50.000 0.119 NA   NA
 1211663 1211662 A9601_11561 A9601_11571 thrA   FALSE 0.291 46.000 0.180 NA   NA
 1211662 1211661 A9601_11571 A9601_11581     FALSE 0.112 40.000 0.008 NA   NA
 1211661 1211660 A9601_11581 A9601_11591   ruvC FALSE 0.292 -19.000 0.016 1.000 N NA
 1211660 1211659 A9601_11591 A9601_11601 ruvC chlI FALSE 0.378 6.000 0.026 1.000 N NA
 1211659 1211658 A9601_11601 A9601_11611 chlI lasT FALSE 0.056 118.000 0.007 1.000 N NA
 1211658 1211657 A9601_11611 A9601_11621 lasT   TRUE 0.567 -3.000 0.041 1.000   NA
 1211655 1211654 A9601_11641 A9601_11651     FALSE 0.211 14.000 0.021 1.000 N NA
 1211654 1211653 A9601_11651 A9601_11661     FALSE 0.421 12.000 0.069 1.000   NA
 1211653 1211652 A9601_11661 A9601_11671   guaB FALSE 0.021 231.000 0.038 1.000   NA
 1211651 1211650 A9601_11681 A9601_11691     FALSE 0.119 24.000 0.017 1.000 N NA
 1211648 1211647 A9601_11711 A9601_11721 leuA   FALSE 0.207 83.000 0.008 NA   NA
 1211645 1211644 A9601_11741 A9601_11751 folD ispA TRUE 0.727 38.000 0.250 1.000 Y NA
 1211644 1211643 A9601_11751 A9601_11761 ispA   FALSE 0.405 14.000 0.214 NA   NA
 1211641 1211640 A9601_11791 A9601_11801   zwf TRUE 0.943 3.000 0.583 NA Y NA
 1211640 1211639 A9601_11801 A9601_11811 zwf petH FALSE 0.212 111.000 0.117 1.000   NA
 1309075 1211637 A9601_tRNAGluVIMSS1309075 A9601_11831 tRNA-Glu   FALSE 0.077 42.000 0.000 NA   NA
 1211636 1211635 A9601_11841 A9601_11851     TRUE 0.805 73.000 0.850 NA   NA
 1212617 1211632 A9601_11881 A9601_11891     FALSE 0.020 234.000 0.073 1.000   NA
 1211631 1211630 A9601_11901 A9601_11911 cad cdsA FALSE 0.278 10.000 0.019 1.000 N NA
 1211629 1211628 A9601_11921 A9601_11931 todF gldA TRUE 0.652 -25.000 0.250 1.000   NA
 1211628 1211627 A9601_11931 A9601_11941 gldA clpC FALSE 0.397 16.000 0.237 1.000 N NA
 1211627 1212616 A9601_11941 A9601_11951 clpC   FALSE 0.037 180.000 0.032 1.000   NA
 1211626 1211625 A9601_11961 A9601_11971 lysA   FALSE 0.166 29.000 0.040 NA   NA
 1211625 1211624 A9601_11971 A9601_11981   uppS FALSE 0.462 4.000 0.043 NA   NA
 1211624 1211623 A9601_11981 A9601_11991 uppS bioB FALSE 0.353 6.000 0.021 1.000 N NA
 1211623 1211622 A9601_11991 A9601_12001 bioB   FALSE 0.401 -3.000 0.024 NA   NA
 1211622 1211621 A9601_12001 A9601_12011     FALSE 0.313 12.000 0.034 NA   NA
 1211620 1211619 A9601_12021 A9601_12031   recR FALSE 0.373 4.000 0.021 1.000 N NA
 1211617 1294263 A9601_12051 A9601_12061     FALSE 0.320 12.000 0.083 NA   NA
 1294263 1211616 A9601_12061 A9601_12071   srmB FALSE 0.026 151.000 0.011 NA   NA
 1211616 1211615 A9601_12071 A9601_12081 srmB recD FALSE 0.322 139.000 0.017 0.096   NA
 1211615 1211614 A9601_12081 A9601_12091 recD recB TRUE 0.939 2.000 0.120 0.002   NA
 1211614 1212615 A9601_12091 A9601_12101 recB   FALSE 0.401 13.000 0.096 1.000   NA
 1212615 1211613 A9601_12101 A9601_12111   recC TRUE 0.557 4.000 0.034 1.000   NA
 1211613 1211612 A9601_12111 A9601_12121 recC   FALSE 0.168 18.000 0.019 NA   NA
 1211612 1211611 A9601_12121 A9601_12131   pdxJ FALSE 0.395 9.000 0.046 NA   NA
 1211610 1211609 A9601_12141 A9601_12151     TRUE 0.559 44.000 0.459 1.000   NA
 1211609 1211608 A9601_12151 A9601_12161     FALSE 0.299 13.000 0.092 NA   NA
 1211608 1211607 A9601_12161 A9601_12171     TRUE 0.507 4.000 0.220 NA N NA
 1211604 1211603 A9601_12201 A9601_12211   crtH FALSE 0.247 17.000 0.096 NA   NA
 1211603 1211602 A9601_12211 A9601_12221 crtH gid FALSE 0.155 25.000 0.031 1.000 N NA
 1211602 1212614 A9601_12221 A9601_12231 gid   FALSE 0.456 7.000 0.018 1.000   NA
 1309093 1211601 A9601_tRNALysVIMSS1309093 A9601_12241 tRNA-Lys   FALSE 0.002 438.000 0.000 NA   NA
 1211600 1211599 A9601_12251 A9601_12261     TRUE 0.640 106.000 0.750 1.000   NA
 1211599 1211598 A9601_12261 A9601_12271     FALSE 0.423 131.000 0.750 1.000   NA
 1211598 1212613 A9601_12271 A9601_12281     FALSE 0.009 180.000 0.000 NA   NA
 1211596 1309094 A9601_12311 A9601_tRNAProVIMSS1309094   tRNA-Pro FALSE 0.019 140.000 0.000 NA   NA
 1309094 1211595 A9601_tRNAProVIMSS1309094 A9601_12321 tRNA-Pro   FALSE 0.006 213.000 0.000 NA   NA
 1212612 1212611 A9601_12331 A9601_12341   rpoE FALSE 0.207 -7.000 0.000 NA   NA
 1212611 1212610 A9601_12341 A9601_12351 rpoE   FALSE 0.407 4.000 0.000 1.000   NA
 1212610 1211594 A9601_12351 A9601_12361     FALSE 0.004 259.000 0.000 NA   NA
 1211594 1212609 A9601_12361 A9601_12371     FALSE 0.234 0.000 0.000 NA   NA
 1212609 1212608 A9601_12371 A9601_12381     FALSE 0.090 50.000 0.000 NA   NA
 1212608 1211593 A9601_12381 A9601_12391     FALSE 0.063 29.000 0.000 NA   NA
 1211593 1211592 A9601_12391 A9601_12401     FALSE 0.062 31.000 0.000 NA   NA
 1211592 1212607 A9601_12401 A9601_12411     TRUE 0.811 1.000 0.500 NA   NA
 1212607 1212606 A9601_12411 A9601_12421     FALSE 0.091 163.000 0.333 NA   NA
 1212606 1211591 A9601_12421 A9601_12431     FALSE 0.339 11.000 0.071 NA   NA
 1212604 1212603 A9601_12441 A9601_12451     TRUE 0.617 26.000 0.750 NA   NA
 1212603 1212602 A9601_12451 A9601_12461     FALSE 0.002 441.000 0.000 NA   NA
 1212601 1211590 A9601_12471 A9601_12481     FALSE 0.033 126.000 0.000 NA   NA
 1211589 1309096 A9601_12491 A9601_tRNAProVIMSS1309096   tRNA-Pro FALSE 0.043 117.000 0.000 NA   NA
 1211588 1211587 A9601_12501 A9601_12511     FALSE 0.235 1.000 0.000 NA   NA
 1211585 1212599 A9601_12531 A9601_12541     FALSE 0.001 600.000 0.000 NA   NA
 1212599 1211584 A9601_12541 A9601_12551     TRUE 0.831 10.000 0.800 NA   NA
 1212598 1212597 A9601_12561 A9601_12571     FALSE 0.001 639.000 0.000 NA   NA
 1211583 1211582 A9601_12581 A9601_12591   sdhA FALSE 0.003 335.000 0.000 NA   NA
 1211581 1362525 A9601_12601 A9601_pseudoVIMSS1362525   pseudo FALSE 0.234 0.000 0.000 NA   NA
 1211580 1211579 A9601_12611 A9601_12621 rsuA   FALSE 0.031 151.000 0.020 NA   NA
 1211579 1211578 A9601_12621 A9601_12631     FALSE 0.138 33.000 0.024 NA   NA
 1212595 1362526 A9601_12641 A9601_pseudoVIMSS1362526   pseudo FALSE 0.004 248.000 0.000 NA   NA
 1362526 1212594 A9601_pseudoVIMSS1362526 A9601_12651 pseudo   FALSE 0.233 2.000 0.000 NA   NA
 1212593 1211577 A9601_12661 A9601_12671     FALSE 0.090 50.000 0.000 NA   NA
 1211576 1212592 A9601_12681 A9601_12691     FALSE 0.069 37.000 0.000 NA   NA
 1212592 1212591 A9601_12691 A9601_12701     FALSE 0.396 30.000 0.400 NA   NA
 1212589 1212588 A9601_12721 A9601_12731     TRUE 0.810 0.000 0.500 NA   NA
 1212588 1212587 A9601_12731 A9601_12741     TRUE 0.800 -3.000 0.500 NA   NA
 1212587 1211575 A9601_12741 A9601_12751     TRUE 0.685 3.000 0.300 NA   NA
 1211575 1211574 A9601_12751 A9601_12761     TRUE 0.562 62.000 0.400 NA   NA
 1211574 1294254 A9601_12761 A9601_12771     TRUE 0.538 106.000 0.600 NA   NA
 1294254 1212585 A9601_12771 A9601_12781     TRUE 0.811 1.000 0.500 NA   NA
 1212584 1212583 A9601_12791 A9601_12801     TRUE 0.524 107.000 0.600 NA   NA
 1212583 1212582 A9601_12801 A9601_12811     TRUE 0.791 80.000 0.750 NA   NA
 1212582 1212581 A9601_12811 A9601_12821     FALSE 0.007 193.000 0.000 NA   NA
 1212581 1211573 A9601_12821 A9601_12831     FALSE 0.008 190.000 0.000 NA   NA
 1212580 1212579 A9601_12851 A9601_12861     FALSE 0.119 178.000 0.500 NA   NA
 1212579 1212578 A9601_12861 A9601_12871     TRUE 0.765 -24.000 0.500 NA   NA
 1211572 1212577 A9601_12891 A9601_12901 mntH   FALSE 0.188 17.000 0.020 NA   NA
 1212577 1212576 A9601_12901 A9601_12911     TRUE 0.575 28.000 0.667 NA   NA
 1212576 1212575 A9601_12911 A9601_12921     TRUE 0.719 86.000 0.600 NA   NA
 1212575 1212574 A9601_12921 A9601_12931     TRUE 0.699 63.000 0.600 NA   NA
 1212574 1211571 A9601_12931 A9601_12941     TRUE 0.672 16.000 0.600 NA   NA
 1211570 1211569 A9601_12951 A9601_12961     FALSE 0.002 404.000 0.000 NA   NA
 1211568 1212573 A9601_12971 A9601_12981     TRUE 0.681 54.000 0.667 NA   NA
 1212573 1212572 A9601_12981 A9601_12991     TRUE 0.802 74.000 0.833 NA   NA
 1212571 1211567 A9601_13001 A9601_13011     FALSE 0.037 121.000 0.000 NA   NA
 1211567 1211566 A9601_13011 A9601_13021     FALSE 0.391 -3.000 0.022 NA   NA
 1211564 1211563 A9601_13041 A9601_13051     TRUE 0.857 0.000 0.667 NA   NA
 1211563 1211562 A9601_13051 A9601_13061     TRUE 0.889 35.000 0.667 0.003   NA
 1211562 1211561 A9601_13061 A9601_13071     TRUE 0.750 2.000 0.400 NA   NA
 1212570 1212569 A9601_13081 A9601_13091     TRUE 0.785 59.000 1.000 NA   NA
 1212569 1212568 A9601_13091 A9601_13101     TRUE 0.653 54.000 0.600 NA   NA
 1212567 1212787 A9601_13111 A9601_13121     TRUE 0.903 0.000 1.000 NA   NA
 1211559 1211558 A9601_13141 A9601_13151 acrA polA FALSE 0.340 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1211558 1211557 A9601_13151 A9601_13161 polA cysS FALSE 0.111 25.000 0.014 1.000 N NA
 1211557 1211556 A9601_13161 A9601_13171 cysS dxr FALSE 0.110 98.000 0.007 1.000 N NA
 1211556 1211555 A9601_13171 A9601_13181 dxr   FALSE 0.116 3.000 0.016 NA N NA
 1211554 1211553 A9601_13191 A9601_13201   pntB TRUE 0.671 -13.000 0.354 NA   NA
 1211553 1211552 A9601_13201 A9601_13211 pntB pntA-2 TRUE 0.914 9.000 0.072 0.002   NA
 1211552 1211551 A9601_13211 A9601_13221 pntA-2 pntA TRUE 0.956 13.000 0.829 0.002   NA
 1211550 1211549 A9601_13231 A9601_13241     FALSE 0.058 155.000 0.158 NA   NA
 1211549 1211548 A9601_13241 A9601_13251     FALSE 0.195 80.000 0.004 NA   NA
 1211547 1212566 A9601_13261 A9601_13271 infA   FALSE 0.159 93.000 0.011 NA   NA
 1212566 1211546 A9601_13271 A9601_13281     TRUE 0.515 55.000 0.392 NA   NA
 1211546 1212565 A9601_13281 A9601_13291     TRUE 0.583 58.000 0.392 1.000   NA
 1211545 1211544 A9601_13301 A9601_13311   ilvN FALSE 0.450 4.000 0.065 NA   NA
 1211543 1211542 A9601_13321 A9601_13331     FALSE 0.321 48.000 0.122 1.000   NA
 1211541 1211540 A9601_13341 A9601_13351 psbD psbC TRUE 0.972 -16.000 0.878 0.003   NA
 1211538 1211537 A9601_13371 A9601_13381 cobQ   TRUE 0.534 -3.000 0.026 1.000   NA
 1211535 1211534 A9601_13401 A9601_13411     TRUE 0.882 0.000 0.000 0.032   NA
 1211534 1211533 A9601_13411 A9601_13421     FALSE 0.405 -3.000 0.000 1.000   NA
 1211533 1211532 A9601_13421 A9601_13431     FALSE 0.179 7.000 0.000 1.000 N NA
 1211532 1212563 A9601_13431 A9601_13441     FALSE 0.211 -6.000 0.000 NA   NA
 1212563 1211531 A9601_13441 A9601_13451     FALSE 0.223 -3.000 0.000 NA   NA
 1211531 1212562 A9601_13451 A9601_13461     FALSE 0.196 7.000 0.000 NA   NA
 1212561 1294259 A9601_13471 A9601_13481     TRUE 0.478 89.000 0.286 NA   NA
 1309074 1211528 A9601_tRNASerVIMSS1309074 A9601_13521 tRNA-Ser afuA FALSE 0.115 62.000 0.000 NA   NA
 1211527 1211526 A9601_13531 A9601_13541 piuC   TRUE 0.544 72.000 0.326 NA   NA
 1211525 1211524 A9601_13551 A9601_13561   glyQ FALSE 0.054 146.000 0.013 1.000   NA
 1211524 1211523 A9601_13561 A9601_13571 glyQ   FALSE 0.008 219.000 0.005 NA   NA
 1211523 1211522 A9601_13571 A9601_13581     FALSE 0.202 21.000 0.109 NA   NA
 1211522 1212558 A9601_13581 A9601_13591     FALSE 0.464 3.000 0.087 NA   NA
 1211521 1211520 A9601_13601 A9601_13611     FALSE 0.128 112.000 0.072 NA   NA
 1211519 1211518 A9601_13621 A9601_13631     TRUE 0.749 77.000 0.625 NA   NA
 1211518 1211517 A9601_13631 A9601_13641   isiB FALSE 0.206 144.000 0.455 1.000   NA
 1211516 1294262 A9601_13651 A9601_13661     FALSE 0.329 15.000 0.147 NA   NA
 1294262 1211515 A9601_13661 A9601_13671     TRUE 0.542 86.000 0.333 NA   NA
 1211515 1211514 A9601_13671 A9601_13681     FALSE 0.019 206.000 0.105 NA   NA
 1211514 1211513 A9601_13681 A9601_13691     FALSE 0.360 98.000 0.263 NA   NA
 1211512 1211511 A9601_13701 A9601_13711     TRUE 0.922 7.000 0.432 1.000 Y NA
 1211511 1211510 A9601_13711 A9601_13721     FALSE 0.136 29.000 0.026 1.000 N NA
 1211509 1211508 A9601_13731 A9601_13741 sppA aroH TRUE 0.546 7.000 0.207 1.000 N NA
 1211508 1211507 A9601_13741 A9601_13751 aroH   FALSE 0.331 71.000 0.114 NA   NA
 1211507 1211506 A9601_13751 A9601_13761   rpl34, rpmH FALSE 0.141 31.000 0.027 NA   NA
 1211506 1211505 A9601_13761 A9601_13771 rpl34, rpmH rnpA TRUE 0.801 13.000 0.787 1.000   NA
 1211505 1211504 A9601_13771 A9601_13781 rnpA   FALSE 0.459 -3.000 0.041 NA   NA
 1211504 1211503 A9601_13781 A9601_13791   yidC FALSE 0.314 73.000 0.043 NA   NA
 1211503 1211502 A9601_13791 A9601_13801 yidC   FALSE 0.153 17.000 0.012 1.000 N NA
 1211502 1211501 A9601_13801 A9601_13811   serS FALSE 0.416 123.000 0.011 0.090 N NA
 1211501 1211500 A9601_13811 A9601_13821 serS   FALSE 0.312 10.000 0.024 1.000 N NA
 1211500 1211499 A9601_13821 A9601_13831   rpsN FALSE 0.214 65.000 0.020 1.000 N NA
 1211499 1211498 A9601_13831 A9601_13841 rpsN   FALSE 0.212 171.000 0.019 1.000 Y NA
 1211496 1294261 A9601_13861 A9601_13871     FALSE 0.095 25.000 0.004 NA   NA
 1309097 1211494 A9601_tRNAArgVIMSS1309097 A9601_13891 tRNA-Arg   FALSE 0.068 103.000 0.000 NA   NA
 1211493 1211492 A9601_13901 A9601_13911 ugd   TRUE 0.584 106.000 0.000 1.000 Y NA
 1211492 1211491 A9601_13911 A9601_13921     FALSE 0.134 444.000 0.000 0.018 Y NA
 1211491 1211490 A9601_13921 A9601_13931     FALSE 0.261 28.000 0.211 NA   NA
 1211490 1211489 A9601_13931 A9601_13941     TRUE 0.795 11.000 0.714 NA   NA
 1211488 1211487 A9601_13951 A9601_13961   rfe FALSE 0.124 87.000 0.000 NA   NA
 1211485 1211484 A9601_13981 A9601_13991 manC gmd FALSE 0.047 364.000 0.000 1.000 Y NA
 1211484 1211483 A9601_13991 A9601_14001 gmd   TRUE 0.941 13.000 0.125 0.010 Y NA
 1211483 1211482 A9601_14001 A9601_14011   gumC FALSE 0.467 118.000 0.000 1.000 Y NA
 1211481 1212557 A9601_14021 A9601_14031     FALSE 0.217 5.000 0.000 NA   NA
 1212557 1211480 A9601_14031 A9601_14041     FALSE 0.144 79.000 0.000 NA   NA
 1211480 1211479 A9601_14041 A9601_14051     FALSE 0.002 493.000 0.000 NA   NA
 1211479 1211478 A9601_14051 A9601_14061   rfbC TRUE 0.808 -3.000 0.457 1.000   NA
 1211478 1211477 A9601_14061 A9601_14071 rfbC   FALSE 0.461 123.000 0.017 1.000 Y NA
 1211477 1211476 A9601_14071 A9601_14081     FALSE 0.022 137.000 0.000 NA   NA
 1211476 1211475 A9601_14081 A9601_14091     FALSE 0.060 107.000 0.000 NA   NA
 1211475 1211474 A9601_14091 A9601_14101     FALSE 0.396 5.000 0.000 1.000   NA
 1211474 1211473 A9601_14101 A9601_14111     FALSE 0.164 41.000 0.000 1.000   NA
 1211473 1211472 A9601_14111 A9601_14121     FALSE 0.260 21.000 0.071 1.000   NA
 1211472 1211471 A9601_14121 A9601_14131     FALSE 0.407 4.000 0.000 1.000   NA
 1211471 1212556 A9601_14131 A9601_14141   rfe FALSE 0.037 505.000 0.034 1.000 Y NA
 1212556 1211470 A9601_14141 A9601_14151 rfe   FALSE 0.013 38.000 0.000 NA N NA
 1211470 1211469 A9601_14151 A9601_14161     FALSE 0.049 0.000 0.000 NA N NA
 1211469 1211468 A9601_14161 A9601_14171     TRUE 0.957 -16.000 0.000 0.006 Y NA
 1211467 1211466 A9601_14181 A9601_14191     FALSE 0.351 8.000 0.000 1.000   NA
 1211466 1211465 A9601_14191 A9601_14201     FALSE 0.003 341.000 0.000 NA   NA
 1211465 1211464 A9601_14201 A9601_14211     FALSE 0.140 84.000 0.000 NA   NA
 1211463 1211462 A9601_14221 A9601_14231     FALSE 0.030 159.000 0.000 1.000   NA
 1211462 1211461 A9601_14231 A9601_14241   spsE FALSE 0.261 68.000 0.000 1.000   NA
 1211461 1211460 A9601_14241 A9601_14251 spsE   TRUE 0.856 2.000 0.015 NA Y NA
 1211460 1211459 A9601_14251 A9601_14261   spsF TRUE 0.736 75.000 0.000 NA Y NA
 1212555 1309073   A9601_tRNAAlaVIMSS1309073   tRNA-Ala FALSE 0.181 -124.000 0.000 NA   NA
 1212554 1211457 A9601_14291 A9601_14301     FALSE 0.207 -7.000 0.000 NA   NA
 1211457 1211456 A9601_14301 A9601_14311     TRUE 0.699 -3.000 0.250 1.000   NA
 1211456 1211455 A9601_14311 A9601_14321     TRUE 0.865 1.000 0.000 1.000 Y NA
 1211455 1211454 A9601_14321 A9601_14331     FALSE 0.002 406.000 0.000 NA   NA
 1211453 1211452 A9601_14341 A9601_14351     FALSE 0.025 132.000 0.000 NA   NA
 1212552 1211449 A9601_14381 A9601_14391     FALSE 0.193 95.000 0.000 1.000   NA
 1211449 1211448 A9601_14391 A9601_14401     FALSE 0.330 99.000 0.250 1.000 N NA
 1211448 1211447 A9601_14401 A9601_14411   gmhA TRUE 0.507 -9.000 0.154 1.000 N NA
 1211447 1211446 A9601_14411 A9601_14421 gmhA rfaE FALSE 0.142 32.000 0.154 NA N NA
 1211446 1211445 A9601_14421 A9601_14431 rfaE   TRUE 0.811 71.000 0.222 NA Y NA
 1211445 1211444 A9601_14431 A9601_14441     TRUE 0.835 4.000 0.000 NA Y NA
 1211444 1211443 A9601_14441 A9601_14451     FALSE 0.073 39.000 0.000 NA   NA
 1211443 1211442 A9601_14451 A9601_14461     FALSE 0.064 34.000 0.000 NA   NA
 1211442 1211441 A9601_14461 A9601_14471     FALSE 0.077 42.000 0.000 NA   NA
 1211441 1212551 A9601_14471 A9601_14481     FALSE 0.207 -7.000 0.000 NA   NA
 1211440 1211439 A9601_14491 A9601_14501     FALSE 0.157 39.000 0.000 1.000   NA
 1211439 1211438 A9601_14501 A9601_14511     FALSE 0.017 146.000 0.000 NA   NA
 1211437 1211436 A9601_14521 A9601_14531 adhC rfbB FALSE 0.056 32.000 0.000 1.000 N NA
 1211436 1211435 A9601_14531 A9601_14541 rfbB   FALSE 0.212 29.000 0.152 1.000 N NA
 1211435 1211434 A9601_14541 A9601_14551     TRUE 0.986 -3.000 0.480 0.002 Y NA
 1211434 1211433 A9601_14551 A9601_14561     FALSE 0.230 3.000 0.000 NA   NA
 1211433 1211432 A9601_14561 A9601_14571     FALSE 0.230 3.000 0.000 NA   NA
 1211432 1212550 A9601_14571 A9601_14581     FALSE 0.091 18.000 0.000 NA   NA
 1212550 1211431 A9601_14581 A9601_14591   glf TRUE 0.845 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 1211430 1211429 A9601_14601 A9601_14611   lexA FALSE 0.010 175.000 0.000 NA   NA
 1211429 1211428 A9601_14611 A9601_14621 lexA argF FALSE 0.185 58.000 0.020 1.000 N NA
 1211428 1211427 A9601_14621 A9601_14631 argF   FALSE 0.127 29.000 0.022 1.000 N NA
 1211427 1211426 A9601_14631 A9601_14641     TRUE 0.569 115.000 0.010 0.012 N NA
 1211426 1211425 A9601_14641 A9601_14651     FALSE 0.205 16.000 0.021 NA   NA
 1211425 1212549 A9601_14651 A9601_14661     TRUE 0.670 -25.000 0.360 NA   NA
 1211423 1211422 A9601_14681 A9601_14691   pheS FALSE 0.198 71.000 0.011 1.000 N NA
 1211419 1211418 A9601_14721 A9601_14731 ribF thiE TRUE 0.840 8.000 0.012 1.000 Y NA
 1211418 1212548 A9601_14731 A9601_14741 thiE thiS TRUE 0.925 -10.000 0.452 1.000 Y NA
 1212548 1211417 A9601_14741 A9601_14751 thiS   FALSE 0.145 113.000 0.119 NA   NA
 1211417 1212547 A9601_14751 A9601_14761     FALSE 0.438 68.000 0.214 NA   NA
 1211416 1211415 A9601_14771 A9601_14781     TRUE 0.559 -3.000 0.070 1.000   NA
 1211415 1211414 A9601_14781 A9601_14791   trmD FALSE 0.442 -10.000 0.011 1.000   NA
 1211414 1211413 A9601_14791 A9601_14801 trmD era TRUE 0.897 1.000 0.010 0.022   NA
 1211411 1211410 A9601_14821 A9601_14831   phoH FALSE 0.270 74.000 0.024 NA   NA
 1211410 1211409 A9601_14831 A9601_14841 phoH rpsP FALSE 0.125 37.000 0.019 1.000 N NA
 1211409 1211408 A9601_14841 A9601_14851 rpsP ffh TRUE 0.488 55.000 0.361 1.000 N NA
 1211408 1211407 A9601_14851 A9601_14861 ffh   FALSE 0.236 48.000 0.016 1.000   NA
 1211405 1211404 A9601_14881 A9601_14891     FALSE 0.013 140.000 0.021 NA N NA
 1211401 1211400 A9601_14921 A9601_14931     FALSE 0.435 79.000 0.096 1.000   NA
 1211400 1212546 A9601_14931 A9601_14941     FALSE 0.404 84.000 0.154 NA   NA
 1211399 1211398 A9601_14951 A9601_14961   trpC FALSE 0.302 56.000 0.023 1.000   NA
 1211398 1211397 A9601_14961 A9601_14971 trpC lpd FALSE 0.287 13.000 0.057 1.000 N NA
 1211397 1211396 A9601_14971 A9601_14981 lpd   FALSE 0.342 12.000 0.115 1.000 N NA
 1211395 1309098 A9601_14991 A9601_tRNALeuVIMSS1309098 murA tRNA-Leu FALSE 0.001 536.000 0.000 NA   NA
 1309098 1211394 A9601_tRNALeuVIMSS1309098 A9601_15001 tRNA-Leu argD FALSE 0.208 6.000 0.000 NA   NA
 1211394 1211393 A9601_15001 A9601_15011 argD folC FALSE 0.428 12.000 0.181 1.000 N NA
 1211392 1211391 A9601_15021 A9601_15031   codA FALSE 0.305 38.000 0.246 1.000 N NA
 1309099 1211390 A9601_tRNAHisVIMSS1309099 A9601_15041 tRNA-His   FALSE 0.133 72.000 0.000 NA   NA
 1211390 1211389 A9601_15041 A9601_15051   ddlA FALSE 0.225 13.000 0.020 1.000 N NA
 1211389 1211388 A9601_15051 A9601_15061 ddlA   FALSE 0.350 11.000 0.046 NA   NA
 1211388 1211387 A9601_15061 A9601_15071   ftsQ FALSE 0.371 -10.000 0.024 NA   NA
 1211387 1211386 A9601_15071 A9601_15081 ftsQ ftsZ FALSE 0.012 180.000 0.067 NA N NA
 1211383 1211382 A9601_15111 A9601_15121     FALSE 0.191 41.000 0.084 NA   NA
 1211382 1211381 A9601_15121 A9601_15131     TRUE 0.957 25.000 0.745 0.004 Y NA
 1211381 1211380 A9601_15131 A9601_15141   ilvC FALSE 0.092 111.000 0.019 1.000 N NA
 1211380 1211379 A9601_15141 A9601_15151 ilvC cbiB TRUE 0.851 -12.000 0.017 1.000 Y NA
 1211379 1211378 A9601_15151 A9601_15161 cbiB   FALSE 0.263 49.000 0.021 1.000   NA
 1211378 1294227 A9601_15161 A9601_15171     TRUE 0.705 3.000 0.333 NA   NA
 1362527 1212544 A9601_pseudoVIMSS1362527 A9601_15181 pseudo   FALSE 0.081 98.000 0.000 NA   NA
 1212544 1212543 A9601_15181 A9601_15191     TRUE 0.771 55.000 1.000 NA   NA
 1212543 1211377 A9601_15191 A9601_15201   himA FALSE 0.091 139.000 0.200 NA   NA
 1294279 1211376 A9601_15211 A9601_15221   glgX FALSE 0.002 358.000 0.000 NA   NA
 1211375 1211374 A9601_15231 A9601_15241 melB   TRUE 0.816 10.000 0.833 NA N NA
 1211374 1212542 A9601_15241 A9601_15251     TRUE 0.752 -7.000 0.452 NA   NA
 1212542 1211373 A9601_15251 A9601_15261     TRUE 0.625 36.000 0.762 NA   NA
 1211373 1211372 A9601_15261 A9601_15271     TRUE 0.703 6.000 0.369 NA   NA
 1211371 1211370 A9601_15281 A9601_15291 pyrF tyrS FALSE 0.367 7.000 0.027 1.000 N NA
 1211370 1211369 A9601_15291 A9601_15301 tyrS   FALSE 0.282 19.000 0.034 1.000   NA
 1211368 1211367 A9601_15311 A9601_15321   pepB FALSE 0.316 25.000 0.176 1.000   NA
 1211366 1211365 A9601_15331 A9601_15341   lpxB FALSE 0.224 17.000 0.034 1.000 N NA
 1211365 1211364 A9601_15341 A9601_15351 lpxB lpxA TRUE 0.882 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 1211364 1211363 A9601_15351 A9601_15361 lpxA fabZ FALSE 0.427 5.000 0.071 1.000 N NA
 1211363 1211362 A9601_15361 A9601_15371 fabZ lpxC FALSE 0.214 18.000 0.083 1.000 N NA
 1211362 1211361 A9601_15371 A9601_15381 lpxC   TRUE 0.889 1.000 0.052 1.000 Y NA
 1211361 1211360 A9601_15381 A9601_15391     FALSE 0.249 37.000 0.058 1.000   NA
 1211360 1212541 A9601_15391 A9601_15401     FALSE 0.151 256.000 0.004 0.001   NA
 1211359 1211358 A9601_15411 A9601_15421 purD nblS TRUE 0.855 5.000 0.025 0.088 N NA
 1211357 1211356 A9601_15431 A9601_15441 kaiC kaiB TRUE 0.810 61.000 0.927 1.000   NA
 1211355 1211354 A9601_15451 A9601_15461 rplU rpmA TRUE 0.979 10.000 0.667 0.022 Y NA
 1211350 1211349 A9601_15501 A9601_15511 elaC   FALSE 0.215 75.000 0.011 NA   NA
 1211348 1211347 A9601_15521 A9601_15531     TRUE 0.701 79.000 0.500 NA   NA
 1211347 1211346 A9601_15531 A9601_15541   prmA FALSE 0.054 135.000 0.027 1.000 N NA
 1211346 1211345 A9601_15541 A9601_15551 prmA serA FALSE 0.200 19.000 0.053 1.000 N NA
 1211344 1211343 A9601_15561 A9601_15571     TRUE 0.776 1.000 0.442 NA   NA
 1211343 1309100 A9601_15571 A9601_tRNAValVIMSS1309100   tRNA-Val FALSE 0.090 50.000 0.000 NA   NA
 1309100 1211342 A9601_tRNAValVIMSS1309100 A9601_15581 tRNA-Val   FALSE 0.130 68.000 0.000 NA   NA
 1211342 1211341 A9601_15581 A9601_15591     TRUE 0.516 -7.000 0.028 1.000   NA
 1211341 1294240 A9601_15591 A9601_15601     FALSE 0.287 75.000 0.028 NA   NA
 1211340 1211339 A9601_15611 A9601_15621     FALSE 0.066 136.000 0.043 NA   NA
 1211338 1211337 A9601_15631 A9601_15641     FALSE 0.145 109.000 0.003 1.000   NA
 1211336 1211335 A9601_15661 A9601_15671 murD   FALSE 0.191 86.000 0.008 NA   NA
 1211334 1212539 A9601_15681 A9601_15691     TRUE 0.706 88.000 0.600 NA   NA
 1212539 1212538 A9601_15691 A9601_15701     FALSE 0.294 83.000 0.027 NA   NA
 1212538 1211333 A9601_15701 A9601_15711     FALSE 0.460 -3.000 0.045 NA   NA
 1211333 1211332 A9601_15711 A9601_15721     FALSE 0.272 89.000 0.068 NA   NA
 1211332 1211331 A9601_15721 A9601_15731     FALSE 0.114 102.000 0.011 NA   NA
 1212537 1211330 A9601_15741 A9601_15751     FALSE 0.056 138.000 0.079 NA   NA
 1211330 1294266 A9601_15751 A9601_15761     FALSE 0.341 78.000 0.105 NA   NA
 1294266 1212536 A9601_15761 A9601_15771     FALSE 0.111 61.000 0.000 NA   NA
 1212536 1211329 A9601_15771 A9601_15781     FALSE 0.067 26.000 0.000 NA   NA
 1211329 1212535 A9601_15781 A9601_15791     TRUE 0.546 93.000 0.429 NA   NA
 1211328 1212533 A9601_15811 A9601_15821     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 1212533 1212532 A9601_15821 A9601_15831     FALSE 0.453 68.000 0.227 NA   NA
 1212530 1212529 A9601_15851 A9601_15861     TRUE 0.719 86.000 0.600 NA   NA
 1212529 1211327 A9601_15861 A9601_15871     FALSE 0.468 82.000 0.214 NA   NA
 1294249 1212527 A9601_15891 A9601_15901     TRUE 0.793 -16.000 0.571 NA   NA
 1211326 1212525 A9601_15921 A9601_15931     FALSE 0.053 250.000 0.500 NA   NA
 1211325 1362528 A9601_15941 A9601_pseudoVIMSS1362528   pseudo FALSE 0.109 60.000 0.000 NA   NA
 1211324 1211323 A9601_15951 A9601_15961     FALSE 0.234 0.000 0.000 NA   NA
 1211323 1294231 A9601_15961 A9601_15971     FALSE 0.002 419.000 0.000 NA   NA
 1211322 1212523 A9601_15981 A9601_15991     FALSE 0.001 638.000 0.000 NA   NA
 1211320 1212522 A9601_16011 A9601_16021     FALSE 0.311 85.000 0.038 NA   NA
 1211319 1212521 A9601_16031 A9601_16041     FALSE 0.009 179.000 0.000 NA   NA
 1212520 1212519 A9601_16061 A9601_16071     FALSE 0.078 43.000 0.000 NA   NA
 1212518 1212517 A9601_16101 A9601_16111     FALSE 0.005 221.000 0.000 NA   NA
 1212517 1212516 A9601_16111 A9601_16121     FALSE 0.037 121.000 0.000 NA   NA
 1212516 1212515 A9601_16121 A9601_16131     FALSE 0.140 77.000 0.000 NA   NA
 1212515 1212514 A9601_16131 A9601_16141     FALSE 0.177 151.000 0.500 NA   NA
 1212514 1212513 A9601_16141 A9601_16151     TRUE 0.823 -3.000 0.571 NA   NA
 1212513 1212512 A9601_16151 A9601_16161     FALSE 0.284 110.000 0.286 NA   NA
 1294239 1294278 A9601_16181 A9601_16191     FALSE 0.006 203.000 0.000 NA   NA
 1294278 1211317 A9601_16191 A9601_16201     TRUE 0.745 80.000 0.600 NA   NA
 1211317 1211316 A9601_16201 A9601_16211     FALSE 0.233 2.000 0.000 NA   NA
 1212510 1212509 A9601_16221 A9601_16231     FALSE 0.001 632.000 0.000 NA   NA
 1212509 1212508 A9601_16231 A9601_16241     TRUE 0.800 -3.000 0.500 NA   NA
 1211315 1211314 A9601_16261 A9601_16271     FALSE 0.003 289.000 0.000 NA   NA
 1211314 1211313 A9601_16271 A9601_16281     FALSE 0.007 201.000 0.000 NA   NA
 1211312 1362530 A9601_16291 A9601_pseudoVIMSS1362530   pseudo FALSE 0.016 150.000 0.000 NA   NA
 1362530 1211311 A9601_pseudoVIMSS1362530 A9601_16301 pseudo   FALSE 0.001 614.000 0.000 NA   NA
 1211310 1211309 A9601_16311 A9601_16321     FALSE 0.003 309.000 0.000 NA   NA
 1211309 1211308 A9601_16321 A9601_16331   rpoZ TRUE 0.895 3.000 0.024 0.029   NA
 1211305 1211304 A9601_16361 A9601_16371 gpmI secG FALSE 0.255 24.000 0.041 1.000   NA
 1211303 1211302 A9601_16381 A9601_16391 groEL groES TRUE 0.972 52.000 0.905 0.010 Y NA
 1211301 1211300 A9601_16401 A9601_16411 atpD atpC TRUE 0.965 43.000 0.837 0.005 Y NA
 1211299 1211298 A9601_16421 A9601_16431     FALSE 0.198 107.000 0.146 NA   NA
 1211298 1211297 A9601_16431 A9601_16441   pepP FALSE 0.234 54.000 0.037 NA   NA
 1211296 1211295 A9601_16451 A9601_16461     FALSE 0.460 -3.000 0.046 NA   NA
 1211295 1211294 A9601_16461 A9601_16471   nadD FALSE 0.390 9.000 0.006 1.000   NA
 1211294 1211293 A9601_16471 A9601_16481 nadD nadE TRUE 0.970 -3.000 0.023 0.004 Y NA
 1211292 1212506 A9601_16491 A9601_16501     FALSE 0.194 28.000 0.125 NA   NA
 1212506 1211291 A9601_16501 A9601_16511     TRUE 0.550 -3.000 0.158 NA   NA
 1211291 1211290 A9601_16511 A9601_16521     TRUE 0.707 17.000 0.003 1.000 Y NA
 1211290 1211289 A9601_16521 A9601_16531   atpA TRUE 0.965 20.000 0.846 0.005 Y NA
 1211289 1211288 A9601_16531 A9601_16541 atpA atpH TRUE 0.958 32.000 0.864 0.005 Y NA
 1211288 1211287 A9601_16541 A9601_16551 atpH   TRUE 0.974 0.000 0.132 0.005 Y NA
 1211287 1211286 A9601_16551 A9601_16561     TRUE 0.985 -3.000 0.569 0.005 Y NA
 1211286 1211285 A9601_16561 A9601_16571   atpE TRUE 0.962 69.000 0.368 0.005 Y NA
 1211285 1211284 A9601_16571 A9601_16581 atpE atpB TRUE 0.771 166.000 0.679 0.005 Y NA
 1211284 1212505 A9601_16581 A9601_16591 atpB atp1 FALSE 0.236 24.000 0.151 NA   NA
 1211283 1211282 A9601_16601 A9601_16611   ccdA FALSE 0.447 83.000 0.202 1.000 N NA
 1211282 1211281 A9601_16611 A9601_16621 ccdA resB TRUE 0.920 1.000 0.371 NA Y NA
 1211279 1211278 A9601_16641 A9601_16651   glnB TRUE 0.601 25.000 0.682 NA   NA
 1211276 1211275 A9601_16671 A9601_16681 purB fumC FALSE 0.134 49.000 0.011 1.000 N NA
 1211273 1212504 A9601_16701 A9601_16711 bioF   FALSE 0.456 -3.000 0.053 NA   NA
 1212504 1211272 A9601_16711 A9601_16721     TRUE 0.567 2.000 0.163 NA   NA
 1211272 1211271 A9601_16721 A9601_16731   bioD TRUE 0.879 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 1211271 1211270 A9601_16731 A9601_16741 bioD bioA TRUE 0.977 1.000 0.124 0.002 Y NA
 1211269 1211268 A9601_16751 A9601_16761     TRUE 0.706 17.000 0.744 NA   NA
 1211266 1211265 A9601_16781 A9601_16791   fer TRUE 0.473 11.000 0.116 1.000   NA
 1211265 1211264 A9601_16791 A9601_16801 fer   TRUE 0.479 10.000 0.175 NA   NA
 1211264 1211263 A9601_16801 A9601_16811     TRUE 0.880 -13.000 1.000 NA   NA
 1211263 1211262 A9601_16811 A9601_16821     FALSE 0.049 148.000 0.100 NA   NA
 1211262 1211261 A9601_16821 A9601_16831     FALSE 0.231 19.000 0.118 NA   NA
 1211260 1211259 A9601_16851 A9601_16861   hli3 FALSE 0.133 29.000 0.022 NA   NA
 1211259 1211258 A9601_16861 A9601_16871 hli3 rpoC2 TRUE 0.588 56.000 0.476 NA   NA
 1211258 1211257 A9601_16871 A9601_16881 rpoC2 rpoC1 TRUE 0.899 34.000 0.031 0.002 Y NA
 1211257 1211256 A9601_16881 A9601_16891 rpoC1 rpoB TRUE 0.968 39.000 0.851 0.002 Y NA
 1211256 1211255 A9601_16891 A9601_16901 rpoB tatD FALSE 0.002 237.000 0.012 NA N NA
 1211255 1211254 A9601_16901 A9601_16911 tatD rpsT FALSE 0.109 18.000 0.034 NA N NA
 1211252 1211251 A9601_16931 A9601_16941 rpiA   FALSE 0.259 66.000 0.030 1.000 N NA
 1211250 1211249 A9601_16951 A9601_16961   nusA TRUE 0.618 35.000 0.759 NA   NA
 1211249 1212501 A9601_16961 A9601_16971 nusA   TRUE 0.907 -3.000 0.323 NA Y NA
 1212501 1211248 A9601_16971 A9601_16981   infB FALSE 0.240 58.000 0.171 NA N NA
 1309101 1212499 A9601_tRNAThrVIMSS1309101 A9601_17001 tRNA-Thr   FALSE 0.083 19.000 0.000 NA   NA
 1212499 1211247 A9601_17001 A9601_17011     FALSE 0.047 114.000 0.000 NA   NA
 1211246 1211245 A9601_17021 A9601_17031     FALSE 0.175 32.000 0.110 NA   NA
 1211244 1211243 A9601_17041 A9601_17051 rne rnhB TRUE 0.865 -43.000 0.033 0.021 N NA
 1211240 1211239 A9601_17081 A9601_17091     TRUE 0.584 1.000 0.047 1.000   NA
 1211239 1211238 A9601_17091 A9601_17101   rpsJ FALSE 0.311 57.000 0.025 1.000   NA
 1211238 1211237 A9601_17101 A9601_17111 rpsJ tufA TRUE 0.763 99.000 0.318 1.000 Y NA
 1211237 1211236 A9601_17111 A9601_17121 tufA fusA TRUE 0.949 46.000 0.400 0.002 Y NA
 1211236 1211235 A9601_17121 A9601_17131 fusA rpsG TRUE 0.848 98.000 0.579 1.000 Y NA
 1211235 1211234 A9601_17131 A9601_17141 rpsG rpsL TRUE 0.950 26.000 0.620 0.004 Y NA
 1211234 1212498 A9601_17141 A9601_17151 rpsL   FALSE 0.105 58.000 0.000 NA   NA
 1211233 1211232 A9601_17161 A9601_17171 gltB   FALSE 0.470 1.000 0.086 NA   NA
 1211230 1212497 A9601_17191 A9601_17201     TRUE 0.848 2.000 0.625 NA   NA
 1211227 1294247 A9601_17231 A9601_17241 psaL psaI TRUE 0.852 28.000 0.583 0.015   NA
 1211226 1211225 A9601_17261 A9601_17271   psaB FALSE 0.244 104.000 0.039 1.000   NA
 1211225 1211224 A9601_17271 A9601_17281 psaB psaA TRUE 0.868 28.000 0.513 0.003   NA
 1211223 1211222 A9601_17291 A9601_17301 cobJ   FALSE 0.294 97.000 0.062 1.000   NA
 1211221 1212495 A9601_17311 A9601_17321     FALSE 0.235 1.000 0.000 NA   NA
 1212495 1212494 A9601_17321 A9601_17331     FALSE 0.223 -3.000 0.000 NA   NA
 1212494 1211220 A9601_17331 A9601_17341     FALSE 0.207 -7.000 0.000 NA   NA
 1211220 1309071 A9601_17341 A9601_tRNASerVIMSS1309071   tRNA-Ser FALSE 0.003 309.000 0.000 NA   NA
 1309071 1211219 A9601_tRNASerVIMSS1309071 A9601_17351 tRNA-Ser alr FALSE 0.115 62.000 0.000 NA   NA
 1211217 1211216 A9601_17371 A9601_17381 prfA rpmE TRUE 0.644 29.000 0.110 1.000 Y NA
 1211216 1211215 A9601_17381 A9601_17391 rpmE rpsI TRUE 0.923 15.000 0.062 0.021 Y NA
 1211215 1211214 A9601_17391 A9601_17401 rpsI rplM TRUE 0.978 10.000 0.601 0.021 Y NA
 1211214 1211213 A9601_17401 A9601_17411 rplM truA TRUE 0.537 117.000 0.058 1.000 Y NA
 1211213 1211212 A9601_17411 A9601_17421 truA rplQ TRUE 0.670 38.000 0.102 1.000 Y NA
 1211212 1211211 A9601_17421 A9601_17431 rplQ rpoA TRUE 0.773 15.000 0.873 1.000 N NA
 1211211 1211210 A9601_17431 A9601_17441 rpoA rpsK TRUE 0.624 -34.000 0.308 1.000 N NA
 1211210 1211209 A9601_17441 A9601_17451 rpsK rpsM TRUE 0.960 45.000 0.810 0.021 Y NA
 1211209 1211208 A9601_17451 A9601_17461 rpsM adk FALSE 0.006 204.000 0.000 1.000 N NA
 1211208 1211207 A9601_17461 A9601_17471 adk secY FALSE 0.370 0.000 0.019 1.000 N NA
 1211207 1211206 A9601_17471 A9601_17481 secY rplO TRUE 0.589 30.000 0.730 1.000 N NA
 1211206 1211205 A9601_17481 A9601_17491 rplO rpsE TRUE 0.963 6.000 0.148 0.028 Y NA
 1211205 1211204 A9601_17491 A9601_17501 rpsE rplR TRUE 0.971 14.000 0.814 0.028 Y NA
 1211204 1211203 A9601_17501 A9601_17511 rplR rplF TRUE 0.972 15.000 0.815 0.021 Y NA
 1211203 1211202 A9601_17511 A9601_17521 rplF rpsH TRUE 0.976 13.000 0.808 0.021 Y NA
 1211202 1211201 A9601_17521 A9601_17531 rpsH rplE TRUE 0.952 10.000 0.059 0.021 Y NA
 1211201 1211200 A9601_17531 A9601_17541 rplE rplX TRUE 0.976 75.000 0.758 0.021 Y NA
 1211200 1211199 A9601_17541 A9601_17551 rplX rplN TRUE 0.988 1.000 0.810 0.028 Y NA
 1211199 1211198 A9601_17551 A9601_17561 rplN rpsQ TRUE 0.986 -3.000 0.791 0.028 Y NA
 1211198 1212492 A9601_17561 A9601_17571 rpsQ rpmC TRUE 0.983 10.000 0.828 0.021 Y NA
 1212492 1211197 A9601_17571 A9601_17581 rpmC rplP TRUE 0.987 -3.000 0.802 0.021 Y NA
 1211197 1211196 A9601_17581 A9601_17591 rplP rpsC TRUE 0.977 12.000 0.828 0.028 Y NA
 1211196 1211195 A9601_17591 A9601_17601 rpsC rplV TRUE 0.986 0.000 0.719 0.028 Y NA
 1211195 1211194 A9601_17601 A9601_17611 rplV rpsS TRUE 0.986 -3.000 0.769 0.028 Y NA
 1211194 1211193 A9601_17611 A9601_17621 rpsS rplB TRUE 0.952 38.000 0.820 0.028 Y NA
 1211193 1211192 A9601_17621 A9601_17631 rplB rplW TRUE 0.977 13.000 0.849 0.021 Y NA
 1211192 1211191 A9601_17631 A9601_17641 rplW rplD TRUE 0.982 -3.000 0.513 0.021 Y NA
 1211191 1211190 A9601_17641 A9601_17651 rplD rplC TRUE 0.977 -3.000 0.361 0.021 Y NA
 1211189 1211188 A9601_17661 A9601_17671   hycB TRUE 0.840 6.000 0.595 1.000   NA
 1211188 1309102 A9601_17671 A9601_tRNAGlnVIMSS1309102 hycB tRNA-Gln FALSE 0.092 95.000 0.000 NA   NA
 1309102 1211187 A9601_tRNAGlnVIMSS1309102 A9601_17681 tRNA-Gln   FALSE 0.099 17.000 0.000 NA   NA
 1211187 1211186 A9601_17681 A9601_17691   recA FALSE 0.092 113.000 0.019 NA   NA
 1211185 1211184 A9601_17701 A9601_17711   dinG FALSE 0.158 30.000 0.072 NA   NA
 1211176 1211175 A9601_17791 A9601_17801   recF FALSE 0.189 52.000 0.024 1.000 N NA
 1211174 1211173 A9601_17811 A9601_17821   ppc TRUE 0.801 4.000 0.500 NA   NA
 1211173 1211172 A9601_17821 A9601_17831 ppc   TRUE 0.655 62.000 0.457 1.000   NA
 1211172 1211171 A9601_17831 A9601_17841     TRUE 0.578 1.000 0.059 1.000   NA
 1211171 1211170 A9601_17841 A9601_17851   psaD FALSE 0.356 60.000 0.091 1.000   NA
 1211170 1211169 A9601_17851 A9601_17861 psaD   FALSE 0.379 112.000 0.381 1.000   NA
 1211169 1211168 A9601_17861 A9601_17871     TRUE 0.543 0.000 0.024 1.000   NA
 1211168 1211167 A9601_17871 A9601_17881   mrp TRUE 0.883 4.000 0.041 1.000 Y NA
 1212491 1211164 A9601_17911 A9601_17921   rnd FALSE 0.024 157.000 0.012 NA   NA
 1211163 1211162 A9601_17931 A9601_17941     TRUE 0.586 36.000 0.667 NA   NA
 1211161 1294251 A9601_17951 A9601_17961 wza   FALSE 0.002 450.000 0.000 NA   NA
 1294251 1211160 A9601_17961 A9601_17971     TRUE 0.692 2.000 0.308 NA   NA
 1211160 1211159 A9601_17971 A9601_17981   purM FALSE 0.046 134.000 0.018 NA   NA
 1211157 1211156 A9601_18001 A9601_18011 wzb pebB FALSE 0.182 33.000 0.015 1.000   NA
 1211156 1211155 A9601_18011 A9601_18021 pebB pebA TRUE 0.978 1.000 0.808 0.002   NA
 1211155 1211154 A9601_18021 A9601_18031 pebA ho1 TRUE 0.743 6.000 0.360 1.000   NA
 1211154 1211153 A9601_18031 A9601_18041 ho1   TRUE 0.769 58.000 0.900 NA   NA
 1211151 1211150 A9601_18061 A9601_18071   galM FALSE 0.281 14.000 0.096 NA   NA
 1211150 1211149 A9601_18071 A9601_18081 galM   TRUE 0.680 10.000 0.339 1.000   NA
 1211149 1211148 A9601_18081 A9601_18091   kefB FALSE 0.353 44.000 0.179 1.000   NA
 1211146 1211145 A9601_18111 A9601_18121     TRUE 0.662 32.000 0.950 NA   NA
 1211145 1309070 A9601_18121 A9601_tRNAArgVIMSS1309070   tRNA-Arg FALSE 0.144 79.000 0.000 NA   NA
 1309388 1211144 A9601_rnpBVIMSS1309388 A9601_18131 rnpB rnc FALSE 0.071 38.000 0.000 NA   NA
 1211141 1211140 A9601_18161 A9601_18171 glmS psaC FALSE 0.415 81.000 0.031 1.000   NA
 1211139 1211138 A9601_18181 A9601_18191 acpP fabF TRUE 0.909 7.000 0.346 1.000 Y NA
 1211138 1211137 A9601_18191 A9601_18201 fabF tktA FALSE 0.189 44.000 0.062 1.000 N NA
 1211136 1294267 A9601_18211 A9601_18221 thiC   FALSE 0.010 198.000 0.006 NA   NA
 1294267 1211135 A9601_18221 A9601_18231     TRUE 0.719 -3.000 0.365 NA   NA
 1211135 1211134 A9601_18231 A9601_18241     TRUE 0.764 4.000 0.365 1.000   NA
 1211134 1211133 A9601_18241 A9601_18251   ruvB FALSE 0.459 -13.000 0.019 1.000   NA
 1211131 1211130 A9601_18271 A9601_18281   lysS FALSE 0.219 57.000 0.026 NA   NA
 1211130 1211129 A9601_18281 A9601_18291 lysS   FALSE 0.190 96.000 0.027 1.000 N NA
 1211129 1212489 A9601_18291 A9601_18301     FALSE 0.052 183.000 0.273 NA   NA
 1212489 1211128 A9601_18301 A9601_18311   mreC FALSE 0.351 -30.000 0.024 NA   NA
 1211128 1211127 A9601_18311 A9601_18321 mreC mreB FALSE 0.441 5.000 0.043 1.000 N NA
 1211125 1211124 A9601_18341 A9601_18351 dedA sam1 TRUE 0.540 3.000 0.024 1.000   NA
 1211120 1211119 A9601_18391 A9601_18401   mgtE FALSE 0.345 68.000 0.135 1.000 N NA
 1211119 1294272 A9601_18401 A9601_18411 mgtE   FALSE 0.314 44.000 0.135 1.000   NA
 1294272 1294241 A9601_18411 A9601_18421     TRUE 0.920 -3.000 0.278 0.046   NA
 1294241 1212488 A9601_18421 A9601_18431     TRUE 0.892 4.000 0.900 NA   NA
 1212488 1211118 A9601_18431 A9601_18441   gyrB FALSE 0.375 -3.000 0.020 NA   NA
 1211117 1211116 A9601_18451 A9601_18461 miaA infC TRUE 0.717 53.000 0.020 1.000 Y NA
 1211116 1211115 A9601_18461 A9601_18471 infC   FALSE 0.192 78.000 0.008 1.000 N NA
 1211115 1211114 A9601_18471 A9601_18481   cysE TRUE 0.736 7.000 0.452 1.000 N NA
 1211111 1309069 A9601_18511 A9601_tRNAGlyVIMSS1309069   tRNA-Gly FALSE 0.081 46.000 0.000 NA   NA
 1309069 1211110 A9601_tRNAGlyVIMSS1309069 A9601_18521 tRNA-Gly ribH FALSE 0.118 63.000 0.000 NA   NA
 1211110 1211109 A9601_18521 A9601_18531 ribH   FALSE 0.303 50.000 0.037 1.000   NA
 1211106 1211105 A9601_18561 A9601_18571 holA lysC FALSE 0.123 40.000 0.015 1.000 N NA
 1211104 1211103 A9601_18581 A9601_18591 uvrB   FALSE 0.169 30.000 0.009 1.000   NA
 1211101 1211100 A9601_18611 A9601_18621   dapA TRUE 0.782 81.000 0.605 1.000   NA
 1211100 1211099 A9601_18621 A9601_18631 dapA asd TRUE 0.882 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 1211098 1211097 A9601_18641 A9601_18651 tig   TRUE 0.776 66.000 0.025 1.000 Y NA
 1211097 1211096 A9601_18651 A9601_18661   clpX TRUE 0.621 107.000 0.037 1.000 Y NA
 1211096 1211095 A9601_18661 A9601_18671 clpX dnaX TRUE 0.696 58.000 0.008 0.082 N NA
 1211094 1211093 A9601_18681 A9601_18691     FALSE 0.378 13.000 0.164 1.000 N NA
 1211092 1211091 A9601_18701 A9601_18711 rpmI rplT TRUE 0.954 29.000 0.928 0.021 Y NA
 1211091 1211090 A9601_18711 A9601_18721 rplT   FALSE 0.169 36.000 0.003 1.000   NA
 1211090 1211089 A9601_18721 A9601_18731   thiG FALSE 0.461 3.000 0.005 1.000   NA
 1211089 1211088 A9601_18731 A9601_18741 thiG sqdB FALSE 0.210 172.000 0.009 0.022 N NA
 1211088 1211087 A9601_18741 A9601_18751 sqdB   TRUE 0.689 27.000 0.194 1.000 Y NA
 1211086 1211085 A9601_18761 A9601_18771   gcvP FALSE 0.064 130.000 0.024 NA   NA
 1211085 1211084 A9601_18771 A9601_18781 gcvP gcvH TRUE 0.939 46.000 0.249 0.001 Y NA
 1211084 1211083 A9601_18781 A9601_18791 gcvH   FALSE 0.450 3.000 0.060 1.000 N NA
 1211083 1211082 A9601_18791 A9601_18801     FALSE 0.202 19.000 0.037 NA   NA
 1211081 1211080 A9601_18811 A9601_18821 ole1 rplI FALSE 0.097 21.000 0.005 1.000 N NA
 1211080 1211079 A9601_18821 A9601_18831 rplI dnaB FALSE 0.253 59.000 0.048 1.000 N NA
 1211079 1211078 A9601_18831 A9601_18841 dnaB gidA FALSE 0.193 13.000 0.012 1.000 N NA
 1211078 1211077 A9601_18841 A9601_18851 gidA ubiC FALSE 0.052 124.000 0.008 NA   NA
 1211076 1211075 A9601_18861 A9601_18871     TRUE 0.581 86.000 0.387 NA   NA
 1211074 1211073 A9601_18881 A9601_18891     FALSE 0.179 25.000 0.043 NA   NA
 1211073 1212487 A9601_18891 A9601_18901     FALSE 0.117 117.000 0.043 NA   NA
 1212486 1211072 A9601_18911 A9601_18921   valS FALSE 0.313 -3.000 0.008 NA   NA
 1211072 1211071 A9601_18921 A9601_18931 valS   FALSE 0.119 97.000 0.004 NA   NA
 1211071 1309068 A9601_18931 A9601_tRNAValVIMSS1309068   tRNA-Val FALSE 0.187 -29.000 0.000 NA   NA
 1211070 1211069 A9601_18941 A9601_18951   speE TRUE 0.478 -3.000 0.011 1.000   NA
 1211069 1211068 A9601_18951 A9601_18961 speE speB TRUE 0.887 2.000 0.064 1.000 Y NA
 1211068 1211067 A9601_18961 A9601_18971 speB gcvT TRUE 0.699 51.000 0.010 1.000 Y NA
 1211067 1211066 A9601_18971 A9601_18981 gcvT aspS TRUE 0.716 56.000 0.018 0.041 N NA
 1211066 1211065 A9601_18981 A9601_18991 aspS pyrG FALSE 0.190 76.000 0.008 1.000 N NA
 1211065 1211064 A9601_18991 A9601_19001 pyrG nrdG FALSE 0.137 19.000 0.016 1.000 N NA
 1211064 1211063 A9601_19001 A9601_19011 nrdG   TRUE 0.678 7.000 0.270 1.000   NA
 1211063 1211062 A9601_19011 A9601_19021     TRUE 0.559 -3.000 0.037 1.000   NA
 1211062 1211061 A9601_19021 A9601_19031     TRUE 0.898 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 1211059 1211058 A9601_19051 A9601_19061   ppk TRUE 0.560 -3.000 0.037 1.000   NA
 1211058 1211057 A9601_19061 A9601_19071 ppk   FALSE 0.011 209.000 0.019 1.000 N NA
 1211057 1211056 A9601_19071 A9601_19081   SEC59 TRUE 0.644 6.000 0.292 1.000 N NA
 1211054 1211053 A9601_19101 A9601_19111 acnB eriC FALSE 0.358 10.000 0.062 1.000 N NA
 1211049 1211048 A9601_19151 A9601_19161 aroE rpsF FALSE 0.103 42.000 0.006 1.000 N NA
 1211046 1211045 A9601_19181 A9601_19191   mraY FALSE 0.011 239.000 0.027 NA   NA
 1211045 1362531 A9601_19191 A9601_pseudoVIMSS1362531 mraY pseudo FALSE 0.072 22.000 0.000 NA   NA
 1211044 1211043 A9601_19201 A9601_19211   uvrA FALSE 0.008 202.000 0.003 1.000 N NA
 1211043 1211042 A9601_19211 A9601_19221 uvrA recN TRUE 0.894 55.000 0.021 0.082 Y NA
 1211041 1211040 A9601_19231 A9601_19241     TRUE 0.781 1.000 0.452 NA   NA
 1211040 1211039 A9601_19241 A9601_19251   thrC FALSE 0.417 7.000 0.050 NA   NA
 1211039 1211038 A9601_19251 A9601_00001 thrC dnaN FALSE 0.002 336.000 0.000 1.000 N NA