MicrobesOnline Operon Predictions for Dechloromonas aromatica RCB

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
581152	581151	Daro_0001	Daro_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.537	210.000	0.328	1.000	Y	NA
581151	581150	Daro_0002	Daro_0003	dnaN	gyrB	TRUE	0.780	74.000	0.114	1.000	Y	NA
581150	581149	Daro_0003	Daro_0004	gyrB		FALSE	0.159	72.000	0.000	1.000	N	NA
581149	581148	Daro_0004	Daro_0005		dtd	TRUE	0.813	13.000	0.000	1.000	N	NA
581147	581146	Daro_0006	Daro_0007			TRUE	0.546	91.000	0.000	0.098	Y	NA
581146	581145	Daro_0007	Daro_0008			TRUE	0.933	27.000	0.000	0.049	Y	NA
581145	581144	Daro_0008	Daro_0009			FALSE	0.069	127.000	0.000	1.000	N	NA
581144	581143	Daro_0009	Daro_0010		gshB	TRUE	0.981	-15.000	0.038	1.000	Y	NA
581143	581142	Daro_0010	Daro_0011	gshB		TRUE	0.971	7.000	0.120	1.000		NA
581142	581141	Daro_0011	Daro_0012			FALSE	0.192	68.000	0.000	1.000		NA
581139	3337429	Daro_0014	Daro_0015			FALSE	0.145	79.000	0.000	NA		NA
581138	581137	Daro_0016	Daro_0017	rsuA	possible oxyR	TRUE	0.955	-3.000	0.008	1.000	N	NA
3337430	581135	Daro_0018	Daro_0019		dprA	TRUE	0.510	77.000	0.004	1.000	Y	NA
581135	581134	Daro_0019	Daro_0020	dprA		TRUE	0.976	-3.000	0.033	1.000		NA
581133	581132	Daro_0021	Daro_0022	def	fmt	TRUE	0.998	-3.000	0.105	0.024	Y	NA
581132	581131	Daro_0022	Daro_0023	fmt	htpX	FALSE	0.370	59.000	0.021	1.000	N	NA
581130	581129	Daro_0024	Daro_0025			TRUE	0.760	51.000	0.188	NA		NA
581129	581128	Daro_0025	Daro_0026			FALSE	0.119	103.000	0.000	1.000		NA
581128	3337431	Daro_0026	Daro_0027			TRUE	0.856	10.000	0.000	1.000		NA
581126	581125	Daro_0028	Daro_0029	sun		TRUE	0.956	-37.000	0.094	NA		NA
581125	581124	Daro_0029	Daro_0030		ntrY	TRUE	0.997	-3.000	0.810	NA		NA
581124	581123	Daro_0030	Daro_0031	ntrY	ntrX, putative	TRUE	0.996	-22.000	0.605	1.000	Y	NA
581123	581122	Daro_0031	Daro_0032	ntrX, putative	hemE	FALSE	0.084	114.000	0.000	1.000	N	NA
581122	581121	Daro_0032	Daro_0033	hemE	priA	FALSE	0.018	283.000	0.000	1.000	N	NA
581121	581120	Daro_0033	Daro_0034	priA		FALSE	0.242	52.000	0.000	NA		NA
3337432	584285	Daro_0035	Daro_0036			TRUE	0.939	-3.000	0.000	1.000		NA
584285	581118	Daro_0036	Daro_0037			TRUE	0.734	19.000	0.000	NA		NA
581118	581117	Daro_0037	Daro_0038			TRUE	0.900	0.000	0.000	NA		NA
581115	581114	Daro_0040	Daro_0041			TRUE	0.615	25.000	0.000	NA		NA
581114	581113	Daro_0041	Daro_0042			FALSE	0.373	37.000	0.000	NA		NA
581109	581108	Daro_0046	Daro_0047	metH		FALSE	0.036	201.000	0.000	1.000		NA
3337433	581105	Daro_0049	Daro_0050			TRUE	0.977	-7.000	0.036	0.097	N	NA
581105	581104	Daro_0050	Daro_0051			TRUE	0.815	7.000	0.000	NA		NA
581103	581102	Daro_0052	Daro_0053		glnK	TRUE	0.636	86.000	0.222	1.000		NA
581102	581101	Daro_0053	Daro_0054	glnK	amt	TRUE	0.950	11.000	0.061	1.000	N	NA
581100	581099	Daro_0055	Daro_0056		purU	TRUE	0.900	0.000	0.000	1.000	N	NA
581099	581098	Daro_0056	Daro_0057	purU		TRUE	0.950	6.000	0.074	1.000	N	NA
581098	581097	Daro_0057	Daro_0058			FALSE	0.286	44.000	0.000	1.000	N	NA
581097	581096	Daro_0058	Daro_0059			TRUE	0.881	0.000	0.000	NA	N	NA
581094	581093	Daro_0062	Daro_0063			TRUE	0.808	14.000	0.000	NA		NA
581091	584252	Daro_0065	Daro_R0001		tRNA-Gly	FALSE	0.297	43.000	0.000	NA		NA
584252	813560	Daro_R0001	Daro_R0002	tRNA-Gly	rrs	FALSE	0.011	535.000	0.000	NA		NA
813560	584253	Daro_R0002	Daro_R0003	rrs	tRNA-Ile	FALSE	0.195	61.000	0.000	NA		NA
584253	584254	Daro_R0003	Daro_R0004	tRNA-Ile	tRNA-Ala	TRUE	0.819	12.000	0.000	NA		NA
584254	5645260	Daro_R0004	Daro_R0005	tRNA-Ala		FALSE	0.028	212.000	0.000	NA		NA
5645260	584205	Daro_R0005	Daro_R0006		rrf	FALSE	0.109	98.000	0.000	NA		NA
581090	581089	Daro_0066	Daro_0067		ubiX	TRUE	0.948	2.000	0.020	1.000		NA
581089	581088	Daro_0067	Daro_0068	ubiX		TRUE	0.962	0.000	0.033	NA		NA
581088	3337436	Daro_0068	Daro_0069			TRUE	0.969	-19.000	0.118	NA		NA
3337436	581087	Daro_0069	Daro_0070			TRUE	0.947	0.000	0.013	NA		NA
581086	581085	Daro_0071	Daro_0072			FALSE	0.009	673.000	0.000	NA		NA
581085	3337437	Daro_0072	Daro_0073			TRUE	0.991	5.000	0.931	NA		NA
3337437	581084	Daro_0073	Daro_0074			TRUE	0.820	77.000	0.835	NA		NA
581084	581083	Daro_0074	Daro_0075			TRUE	0.996	10.000	0.437	0.001	N	NA
581082	581081	Daro_0076	Daro_0077		gln T type III homolog	TRUE	0.768	28.000	0.031	1.000	N	NA
581081	581080	Daro_0077	Daro_0078	gln T type III homolog		TRUE	0.924	40.000	0.688	1.000		NA
581080	581079	Daro_0078	Daro_0079			TRUE	0.980	5.000	0.216	1.000		NA
581079	581078	Daro_0079	Daro_0080			TRUE	0.996	11.000	0.486	1.000	Y	NA
581078	581077	Daro_0080	Daro_0081		tauA	TRUE	0.983	31.000	0.224	0.047	Y	NA
581077	581076	Daro_0081	Daro_0082	tauA		FALSE	0.014	361.000	0.000	NA		NA
581076	581075	Daro_0082	Daro_0083			FALSE	0.054	143.000	0.000	NA		NA
581075	584283	Daro_0083	Daro_0084			FALSE	0.201	169.000	0.105	NA		NA
584283	581074	Daro_0084	Daro_0085			TRUE	0.900	0.000	0.000	NA		NA
581074	581073	Daro_0085	Daro_0086			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
581073	581072	Daro_0086	Daro_0087		fabG	FALSE	0.295	86.000	0.000	0.069	N	NA
581072	581071	Daro_0087	Daro_0088	fabG		FALSE	0.031	197.000	0.000	NA		NA
581071	581070	Daro_0088	Daro_0089			FALSE	0.354	38.000	0.000	NA		NA
581070	581069	Daro_0089	Daro_0090			TRUE	0.996	4.000	0.205	0.069	Y	NA
581069	581068	Daro_0090	Daro_0091			TRUE	0.813	13.000	0.000	1.000	N	NA
581068	581067	Daro_0091	Daro_0092			TRUE	0.830	4.000	0.000	1.000	N	NA
581067	581066	Daro_0092	Daro_0093			FALSE	0.216	57.000	0.000	NA		NA
581066	581065	Daro_0093	Daro_0094			TRUE	0.652	23.000	0.000	NA		NA
581065	581064	Daro_0094	Daro_0095			TRUE	0.444	33.000	0.000	NA		NA
581064	581063	Daro_0095	Daro_0096			FALSE	0.152	76.000	0.000	NA		NA
581063	581062	Daro_0096	Daro_0097			TRUE	0.983	-3.000	0.071	NA		NA
581062	581061	Daro_0097	Daro_0098		atoB	TRUE	0.885	1.000	0.000	NA		NA
581061	3337438	Daro_0098	Daro_0099	atoB		TRUE	0.527	29.000	0.000	1.000	N	NA
3337438	581059	Daro_0099	Daro_0100			TRUE	0.601	39.000	0.035	1.000	N	NA
581059	581058	Daro_0100	Daro_0101			TRUE	0.532	35.000	0.007	1.000	N	NA
581058	581057	Daro_0101	Daro_0102			FALSE	0.354	69.000	0.033	1.000	N	NA
581056	581055	Daro_0103	Daro_0104			TRUE	0.744	32.000	0.037	1.000		NA
581055	584282	Daro_0104	Daro_0105			TRUE	0.814	13.000	0.000	NA		NA
584282	581054	Daro_0105	Daro_0106			FALSE	0.055	142.000	0.000	NA		NA
581053	581052	Daro_0107	Daro_0108			TRUE	0.975	17.000	0.235	1.000	N	NA
581052	581051	Daro_0108	Daro_0109			TRUE	0.999	14.000	0.948	0.005	Y	NA
3337439	581049	Daro_0111	Daro_0112		mrdB	TRUE	0.963	-3.000	0.022	NA	N	NA
581049	581048	Daro_0112	Daro_0113	mrdB	mrdA	TRUE	0.983	-3.000	0.073	1.000	N	NA
581048	581047	Daro_0113	Daro_0114	mrdA		TRUE	0.981	19.000	0.108	1.000	Y	NA
581047	581046	Daro_0114	Daro_0115		mreC	TRUE	0.999	0.000	0.550	0.002	Y	NA
581046	581045	Daro_0115	Daro_0116	mreC	mreB	TRUE	0.956	31.000	0.689	1.000	N	NA
581044	581043	Daro_0117	Daro_0118	gatC	gatA	TRUE	1.000	-3.000	0.643	0.001	Y	NA
581043	581042	Daro_0118	Daro_0119	gatA		TRUE	0.912	2.000	0.003	NA		NA
581042	581041	Daro_0119	Daro_0120		gatB	TRUE	0.859	14.000	0.003	NA		NA
581040	581039	Daro_0121	Daro_0122		pyrE	TRUE	0.963	-7.000	0.052	NA		NA
581038	581037	Daro_0123	Daro_0124	xth	elaB	FALSE	0.147	78.000	0.000	NA		NA
581037	581036	Daro_0124	Daro_0125	elaB		TRUE	0.810	5.000	0.000	NA		NA
581036	3337440	Daro_0125	Daro_0126			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
3337440	3337441	Daro_0126	Daro_0127			TRUE	0.858	3.000	0.000	NA		NA
581035	581034	Daro_0128	Daro_0129	ampG		TRUE	0.980	0.000	0.087	NA		NA
581034	581033	Daro_0129	Daro_0130		metX	TRUE	0.996	-3.000	0.509	1.000		NA
581032	581031	Daro_0131	Daro_0132		cirA	TRUE	0.822	-19.000	0.000	NA		NA
581030	581029	Daro_0133	Daro_0134			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
581029	581028	Daro_0134	Daro_0135			FALSE	0.236	53.000	0.000	NA		NA
581028	581027	Daro_0135	Daro_0136			TRUE	0.996	-3.000	0.500	NA		NA
581027	3337442	Daro_0136	Daro_0137			FALSE	0.210	58.000	0.000	NA		NA
3337442	3337443	Daro_0137	Daro_0138			TRUE	0.985	5.000	0.000	0.001	Y	NA
3337443	581024	Daro_0138	Daro_0139			TRUE	0.979	-15.000	0.180	1.000	N	NA
581024	581023	Daro_0139	Daro_0140		cobD	TRUE	0.997	-7.000	0.463	0.010	N	NA
581023	3337444	Daro_0140	Daro_0141	cobD		TRUE	0.980	-3.000	0.053	1.000	N	NA
3337444	581021	Daro_0141	Daro_0142			FALSE	0.130	85.000	0.000	NA		NA
581021	581020	Daro_0142	Daro_0143			TRUE	0.986	15.000	0.471	NA		NA
581018	581017	Daro_0145	Daro_0146			TRUE	0.996	0.000	0.174	1.000	Y	NA
581017	3337445	Daro_0146	Daro_0147			FALSE	0.092	109.000	0.000	1.000	N	NA
581015	581014	Daro_0148	Daro_0149	cobT	cobS	TRUE	0.995	-3.000	0.005	0.010	Y	NA
581012	581011	Daro_0151	Daro_0152	phpB	rfaQ	TRUE	0.954	2.000	0.000	0.069	N	NA
581011	581010	Daro_0152	Daro_0153	rfaQ	rfaG	TRUE	0.998	-3.000	0.235	1.000	Y	NA
581010	581009	Daro_0153	Daro_0154	rfaG	msbA	TRUE	0.524	49.000	0.039	1.000	N	NA
581009	581008	Daro_0154	Daro_0155	msbA		TRUE	0.900	0.000	0.000	1.000	N	NA
581008	581007	Daro_0155	Daro_0156			TRUE	0.993	-3.000	0.222	1.000	N	NA
581007	581006	Daro_0156	Daro_0157		rfaQ	TRUE	0.900	0.000	0.000	1.000	N	NA
581006	581005	Daro_0157	Daro_0158	rfaQ		TRUE	0.997	-3.000	0.167	1.000	Y	NA
581005	581004	Daro_0158	Daro_0159		rfaF	TRUE	0.997	-3.000	0.182	1.000	Y	NA
581004	581003	Daro_0159	Daro_0160	rfaF		TRUE	0.984	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
581003	581002	Daro_0160	Daro_0161			TRUE	0.982	-3.000	0.000	NA	Y	NA
581002	581001	Daro_0161	Daro_0162		rfaQ	TRUE	0.982	-3.000	0.000	NA	Y	NA
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580994	580993	Daro_0169	Daro_0170	nadD		TRUE	0.990	0.000	0.221	NA		NA
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580988	580987	Daro_0175	Daro_0176		PaaF homolog	TRUE	0.556	28.000	0.000	NA		NA
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580951	580950	Daro_0214	Daro_0215		aroK	TRUE	0.691	82.000	0.319	1.000	N	NA
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580786	580785	Daro_0381	Daro_0382	PaaE	PaaF homolog	FALSE	0.155	74.000	0.000	1.000	N	NA
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580753	580752	Daro_0422	Daro_0423		dacB	TRUE	0.894	-7.000	0.000	1.000		NA
580751	580750	Daro_0424	Daro_0425		GroES (mopB)	FALSE	0.023	237.000	0.000	1.000	N	NA
580750	580749	Daro_0425	Daro_0426	GroES (mopB)	GroEL (mopA)	TRUE	0.962	41.000	0.154	0.010	Y	NA
580749	580748	Daro_0426	Daro_0427	GroEL (mopA)		FALSE	0.027	216.000	0.000	NA		NA
580748	580747	Daro_0427	Daro_0428			TRUE	0.994	2.000	0.684	NA		NA
580747	580746	Daro_0428	Daro_0429		qseB	FALSE	0.019	325.000	0.000	1.000		NA
580746	580745	Daro_0429	Daro_0430	qseB	qseC homolog	TRUE	0.997	-22.000	0.812	1.000	Y	NA
580745	584259	Daro_0430	Daro_R0014	qseC homolog	tRNA-Phe	FALSE	0.127	86.000	0.000	NA		NA
584259	3337456	Daro_R0014	Daro_0431	tRNA-Phe		FALSE	0.164	69.000	0.000	NA		NA
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580743	580742	Daro_0433	Daro_0434			FALSE	0.247	57.000	0.000	1.000		NA
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580740	580739	Daro_0436	Daro_0437			TRUE	0.952	16.000	0.087	NA		NA
580738	580737	Daro_0438	Daro_0439			TRUE	0.835	9.000	0.000	NA		NA
580736	580735	Daro_0440	Daro_0441	lpdA	aceF	TRUE	0.995	13.000	0.463	1.000	Y	NA
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580731	580730	Daro_0446	Daro_0447			TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.001	Y	NA
580730	580729	Daro_0447	Daro_0448		folD	TRUE	0.434	74.000	0.064	1.000	N	NA
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580728	580727	Daro_0449	Daro_0450	purE	emrE	TRUE	0.813	13.000	0.000	1.000	N	NA
580727	580726	Daro_0450	Daro_0451	emrE	purK	TRUE	0.900	0.000	0.000	1.000	N	NA
580726	580725	Daro_0451	Daro_0452	purK		TRUE	0.951	-3.000	0.009	NA	N	NA
584260	580723	Daro_R0015	Daro_0454	tRNA-Ala		FALSE	0.083	115.000	0.000	NA		NA
580723	580722	Daro_0454	Daro_0455		atoC	TRUE	0.816	16.000	0.000	1.000		NA
580722	580721	Daro_0455	Daro_0456	atoC		FALSE	0.043	162.000	0.000	1.000	N	NA
580721	580720	Daro_0456	Daro_0457			TRUE	0.830	28.000	0.058	1.000	N	NA
580720	580719	Daro_0457	Daro_0458			FALSE	0.087	111.000	0.000	1.000	N	NA
580719	580718	Daro_0458	Daro_0459			TRUE	0.997	-3.000	0.792	NA	N	NA
580718	580717	Daro_0459	Daro_0460			FALSE	0.068	116.000	0.000	NA	N	NA
3337458	580715	Daro_0461	Daro_0462			TRUE	0.993	2.000	0.575	NA		NA
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580551	580550	Daro_0639	Daro_0640			FALSE	0.214	81.000	0.012	NA	N	NA
580550	580549	Daro_0640	Daro_0641			TRUE	0.987	10.000	0.349	NA		NA
580547	3337478	Daro_0643	Daro_0644			TRUE	0.949	-12.000	0.053	NA	N	NA
584278	584277	Daro_0645	Daro_0646			TRUE	0.966	3.000	0.075	NA		NA
584277	580545	Daro_0646	Daro_0647			TRUE	0.932	3.000	0.021	NA		NA
580543	580542	Daro_0649	Daro_0650	rplM	rpsI	TRUE	0.998	10.000	0.601	0.014	Y	NA
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580540	580539	Daro_0652	Daro_0653			TRUE	0.514	64.000	0.079	NA		NA
580539	584276	Daro_0653	Daro_0654			FALSE	0.020	265.000	0.000	NA		NA
584276	584199	Daro_0654	Daro_R0018		rrs	FALSE	0.013	393.000	0.000	NA		NA
584199	584262	Daro_R0018	Daro_R0019	rrs	tRNA-Ile	FALSE	0.195	61.000	0.000	NA		NA
584262	584263	Daro_R0019	Daro_R0020	tRNA-Ile	tRNA-Ala	TRUE	0.819	12.000	0.000	NA		NA
584263	10270998	Daro_R0020	Daro_R0021	tRNA-Ala		FALSE	0.028	212.000	0.000	NA		NA
10270998	584204	Daro_R0021	Daro_R0022		rrf	FALSE	0.109	98.000	0.000	NA		NA
584204	580537	Daro_R0022	Daro_0655	rrf		FALSE	0.013	395.000	0.000	NA		NA
580536	580535	Daro_0656	Daro_0657			TRUE	0.932	0.000	0.005	NA		NA
580534	584264	Daro_0658	Daro_R0023	ispB	tRNA-Pro	TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
584264	580533	Daro_R0023	Daro_0659	tRNA-Pro		FALSE	0.022	247.000	0.000	NA		NA
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580532	580531	Daro_0661	Daro_0662		atoC	TRUE	0.995	-42.000	0.556	1.000	Y	NA
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580507	3337481	Daro_0686	Daro_0687	narL		FALSE	0.386	68.000	0.000	0.046	N	NA
3337481	580506	Daro_0687	Daro_0688		nhaA	FALSE	0.161	71.000	0.000	1.000	N	NA
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580501	580500	Daro_0697	Daro_0698			FALSE	0.085	113.000	0.000	1.000	N	NA
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580499	580498	Daro_0699	Daro_0700			TRUE	0.928	-3.000	0.000	1.000	N	NA
580498	580497	Daro_0700	Daro_0701			TRUE	0.485	31.000	0.000	NA		NA
580497	580496	Daro_0701	Daro_0702			TRUE	0.940	14.000	0.053	NA		NA
580494	580493	Daro_0704	Daro_0705	cpxR		TRUE	0.991	2.000	0.081	1.000	Y	NA
580493	580492	Daro_0705	Daro_0706			FALSE	0.023	243.000	0.000	1.000	N	NA
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584274	580486	Daro_0712	Daro_0713	ccoS	ccoN	FALSE	0.067	293.000	0.070	NA	N	NA
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580484	580483	Daro_0716	Daro_0717	ccoP	fixG/napH homolog	TRUE	0.726	131.000	0.103	0.035	Y	NA
580483	580482	Daro_0717	Daro_0718	fixG/napH homolog		TRUE	0.947	4.000	0.051	NA		NA
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580481	580480	Daro_0719	Daro_0720			FALSE	0.263	110.000	0.050	NA		NA
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580476	580475	Daro_0724	Daro_0725		cheY	TRUE	0.977	19.000	0.082	1.000	Y	NA
580475	580474	Daro_0725	Daro_0726	cheY	cheA	TRUE	0.869	89.000	0.444	1.000	Y	NA
580474	580473	Daro_0726	Daro_0727	cheA	cheW	TRUE	0.987	23.000	0.105	0.014	Y	NA
580473	580472	Daro_0727	Daro_0728	cheW		TRUE	0.911	32.000	0.000	0.014	Y	NA
580472	580471	Daro_0728	Daro_0729			TRUE	0.853	40.000	0.000	0.014	Y	NA
580471	580470	Daro_0729	Daro_0730		cheR	TRUE	0.992	3.000	0.025	0.015	Y	NA
580470	580469	Daro_0730	Daro_0731	cheR		TRUE	0.995	13.000	0.444	1.000	Y	NA
580469	580468	Daro_0731	Daro_0732		cheB	TRUE	0.743	49.000	0.022	1.000	Y	NA
580468	580467	Daro_0732	Daro_0733	cheB		TRUE	0.444	78.000	0.000	1.000	Y	NA
580467	580466	Daro_0733	Daro_0734			FALSE	0.222	138.000	0.000	1.000	Y	NA
580466	580465	Daro_0734	Daro_0735			TRUE	0.998	18.000	0.778	0.015	Y	NA
580465	580464	Daro_0735	Daro_0736		cheY	TRUE	0.993	25.000	0.444	0.046	Y	NA
580464	580463	Daro_0736	Daro_0737	cheY		TRUE	0.732	163.000	0.667	1.000	Y	NA
580463	580462	Daro_0737	Daro_0738		cheA-like protein	TRUE	0.975	12.000	0.028	1.000	Y	NA
580462	580461	Daro_0738	Daro_0739	cheA-like protein	flhB	FALSE	0.205	174.000	0.009	1.000	Y	NA
580461	580460	Daro_0739	Daro_0740	flhB	flhA	TRUE	0.998	1.000	0.287	0.012	Y	NA
580460	580459	Daro_0740	Daro_0741	flhA	flhF	TRUE	0.994	-3.000	0.065	1.000	Y	NA
580459	580458	Daro_0741	Daro_0742	flhF		TRUE	0.973	-7.000	0.083	1.000	N	NA
580458	580457	Daro_0742	Daro_0743		fliA	TRUE	0.989	0.000	0.193	1.000	N	NA
580457	580456	Daro_0743	Daro_0744	fliA	motC	TRUE	0.991	0.000	0.089	0.046	N	NA
580456	580455	Daro_0744	Daro_0745	motC	motB	TRUE	0.997	0.000	0.248	1.000	Y	NA
580454	580453	Daro_0746	Daro_0747			TRUE	0.997	0.000	0.211	0.003		NA
580453	580452	Daro_0747	Daro_0748		flgA	TRUE	0.774	64.000	0.330	1.000		NA
580451	580450	Daro_0749	Daro_0750	flgB	flgC	TRUE	0.984	12.000	0.000	0.005	Y	NA
580450	580449	Daro_0750	Daro_0751	flgC	flgD	TRUE	0.992	14.000	0.256	NA	Y	NA
580449	580448	Daro_0751	Daro_0752	flgD	flgE	TRUE	0.974	16.000	0.047	NA	Y	NA
580448	580447	Daro_0752	Daro_0753	flgE	flgF	TRUE	0.993	20.000	0.160	0.005	Y	NA
580447	580446	Daro_0753	Daro_0754	flgF	flgG	TRUE	0.998	14.000	0.381	0.001	Y	NA
580446	580445	Daro_0754	Daro_0755	flgG	flgH	TRUE	0.998	10.000	0.463	0.006	Y	NA
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580444	580443	Daro_0756	Daro_0757	flgI	flgJ	TRUE	0.990	7.000	0.030	0.008	Y	NA
580443	580442	Daro_0757	Daro_0758	flgJ	flgK	TRUE	0.981	52.000	0.705	0.004	Y	NA
580442	580441	Daro_0758	Daro_0759	flgK	flgL	TRUE	0.994	16.000	0.080	0.001	Y	NA
580441	580440	Daro_0759	Daro_0760	flgL		TRUE	0.994	-3.000	0.250	NA		NA
580439	580438	Daro_0761	Daro_0762	fliR	fliQ	TRUE	0.996	2.000	0.056	0.003	Y	NA
580438	3337487	Daro_0762	Daro_0763	fliQ	fliP	TRUE	0.998	15.000	0.827	0.012	Y	NA
3337487	584272	Daro_0763	Daro_0764	fliP		TRUE	0.995	-7.000	0.203	1.000	Y	NA
584272	580436	Daro_0764	Daro_0765		fliN	TRUE	0.935	54.000	0.443	1.000	Y	NA
580436	580435	Daro_0765	Daro_0766	fliN	fliM	TRUE	0.999	-7.000	0.741	0.001	Y	NA
580435	580434	Daro_0766	Daro_0767	fliM	fliL	TRUE	0.990	7.000	0.012	0.001	Y	NA
580434	580433	Daro_0767	Daro_0768	fliL	fliK	TRUE	0.697	30.000	0.013	1.000		NA
580433	580432	Daro_0768	Daro_0769	fliK	fliJ	TRUE	0.897	63.000	0.317	0.006		NA
580432	580431	Daro_0769	Daro_0770	fliJ	fliI	TRUE	0.994	7.000	0.073	0.006	Y	NA
580431	580430	Daro_0770	Daro_0771	fliI	fliH	TRUE	0.995	-15.000	0.085	0.006	Y	NA
580430	580429	Daro_0771	Daro_0772	fliH	fliG	TRUE	0.997	15.000	0.320	0.006	Y	NA
580429	580428	Daro_0772	Daro_0773	fliG	fliF	TRUE	0.998	-10.000	0.220	0.006	Y	NA
580427	580426	Daro_0774	Daro_0775		atoC	TRUE	0.998	-7.000	0.679	1.000	Y	NA
580426	580425	Daro_0775	Daro_0776	atoC	fliE	TRUE	0.685	50.000	0.108	1.000	N	NA
580424	580423	Daro_0777	Daro_0778			FALSE	0.389	81.000	0.057	NA		NA
580423	580422	Daro_0778	Daro_0779			TRUE	0.985	-19.000	0.279	1.000		NA
580422	3337488	Daro_0779	Daro_0780			TRUE	0.983	13.000	0.256	1.000		NA
3337488	580421	Daro_0780	Daro_0781		fliS	TRUE	0.988	4.000	0.338	1.000		NA
580421	580420	Daro_0781	Daro_0782	fliS	fliD	TRUE	0.983	13.000	0.000	0.004	Y	NA
580420	580419	Daro_0782	Daro_0783	fliD		TRUE	0.550	55.000	0.000	NA	Y	NA
580419	580418	Daro_0783	Daro_0784			FALSE	0.340	97.000	0.000	NA	Y	NA
580417	580416	Daro_0785	Daro_0786			TRUE	0.981	-3.000	0.000	0.018		NA
584266	580414	Daro_R0025	Daro_0788	tRNA-Thr		FALSE	0.136	83.000	0.000	NA		NA
580412	580411	Daro_0789	Daro_0790			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
580411	580410	Daro_0790	Daro_0791			FALSE	0.120	90.000	0.000	NA		NA
580410	580409	Daro_0791	Daro_0792			FALSE	0.010	644.000	0.000	NA		NA
580409	3337489	Daro_0792	Daro_0793			FALSE	0.221	56.000	0.000	NA		NA
580407	3337492	Daro_0797	Daro_0798			TRUE	0.652	23.000	0.000	NA		NA
3337492	3337493	Daro_0798	Daro_0799			FALSE	0.024	233.000	0.000	NA		NA
580406	580405	Daro_0801	Daro_0802			FALSE	0.069	128.000	0.000	NA		NA
580402	813498	Daro_0805	Daro_R0026		tRNA-Met	FALSE	0.167	68.000	0.000	NA		NA
813498	813562	Daro_R0026	Daro_R0027	tRNA-Met	rrs	FALSE	0.016	317.000	0.000	NA		NA
813562	584267	Daro_R0027	Daro_R0028	rrs	tRNA-Ile	FALSE	0.195	61.000	0.000	NA		NA
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580399	580398	Daro_0808	Daro_0809	recR	petA	FALSE	0.175	84.000	0.002	1.000	N	NA
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580389	580388	Daro_0819	Daro_0820	nirC, putative		TRUE	0.723	66.000	0.275	1.000	N	NA
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584159	584158	Daro_0895	Daro_0896			FALSE	0.103	111.000	0.000	1.000		NA
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584154	584153	Daro_0900	Daro_0901		mhpB homolog	FALSE	0.013	370.000	0.000	NA		NA
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584152	584151	Daro_0902	Daro_0903			TRUE	0.995	11.000	0.750	0.092		NA
584151	584150	Daro_0903	Daro_0904			FALSE	0.315	41.000	0.000	NA		NA
584150	584149	Daro_0904	Daro_0905		mhpD homolog	TRUE	0.881	0.000	0.000	NA	N	NA
584149	584148	Daro_0905	Daro_0906	mhpD homolog	mhpF homolog	TRUE	0.839	29.000	0.000	1.000	Y	NA
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584147	584146	Daro_0907	Daro_0908	mhpE homolog		FALSE	0.320	109.000	0.000	1.000	Y	NA
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584144	584143	Daro_0910	Daro_0911		mhpC	FALSE	0.306	42.000	0.000	NA		NA
584142	584141	Daro_0912	Daro_0913		recQ	TRUE	0.877	2.000	0.000	NA		NA
584141	584140	Daro_0913	Daro_0914	recQ	lpxH	TRUE	0.833	-25.000	0.000	1.000		NA
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584135	584134	Daro_0920	Daro_0921			FALSE	0.132	185.000	0.000	NA	Y	NA
584134	584133	Daro_0921	Daro_0922		dnaJ	FALSE	0.015	294.000	0.000	NA	N	NA
584133	584132	Daro_0922	Daro_0923	dnaJ	dnaK	TRUE	0.927	84.000	0.236	0.004	Y	NA
584132	584131	Daro_0923	Daro_0924	dnaK	grpE	TRUE	0.817	68.000	0.030	0.010	Y	NA
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584128	584127	Daro_0927	Daro_0928		trx	FALSE	0.216	57.000	0.000	NA		NA
584127	3337501	Daro_0928	Daro_0929	trx	hemH	FALSE	0.240	52.000	0.000	1.000	N	NA
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584124	584123	Daro_0931	Daro_0932		recN	TRUE	0.988	0.000	0.170	1.000	N	NA
584122	3337502	Daro_0933	Daro_0934			TRUE	0.756	18.000	0.000	NA		NA
3337503	584120	Daro_0935	Daro_0936		dapB	TRUE	0.955	3.000	0.049	1.000	N	NA
584120	584119	Daro_0936	Daro_0937	dapB		TRUE	0.853	6.000	0.002	1.000	N	NA
584119	584118	Daro_0937	Daro_0938		carA	FALSE	0.081	116.000	0.000	1.000	N	NA
584118	584117	Daro_0938	Daro_0939	carA	carB	TRUE	0.998	16.000	0.345	0.001	Y	NA
584117	584116	Daro_0939	Daro_0940	carB	greA	TRUE	0.941	27.000	0.241	1.000	N	NA
584116	584115	Daro_0940	Daro_0941	greA		TRUE	0.959	5.000	0.089	NA		NA
584113	584112	Daro_0943	Daro_0944	ftsJ	hflB	FALSE	0.189	56.000	0.000	NA	N	NA
584112	584111	Daro_0944	Daro_0945	hflB	folP	TRUE	0.797	57.000	0.325	1.000	N	NA
584111	584110	Daro_0945	Daro_0946	folP	glmM	TRUE	0.989	-7.000	0.260	1.000	N	NA
584110	584109	Daro_0946	Daro_0947	glmM	tpiA	TRUE	0.682	88.000	0.082	1.000	Y	NA
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3337534	583828	Daro_1252	Daro_1253			FALSE	0.112	95.000	0.000	NA		NA
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583827	583826	Daro_1254	Daro_1255		galE	TRUE	0.981	-10.000	0.030	1.000	Y	NA
583826	583825	Daro_1255	Daro_1256	galE		TRUE	0.692	40.000	0.000	1.000	Y	NA
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583821	583820	Daro_1260	Daro_1261			TRUE	0.982	-3.000	0.000	NA	Y	NA
583820	583819	Daro_1261	Daro_1262		wcaI	TRUE	0.993	-3.000	0.000	0.017	Y	NA
583819	583818	Daro_1262	Daro_1263	wcaI	rfbD	TRUE	0.997	-3.000	0.157	1.000	Y	NA
583818	583817	Daro_1263	Daro_1264	rfbD		TRUE	0.994	11.000	0.271	0.003		NA
583817	583816	Daro_1264	Daro_1265		wecB	TRUE	0.984	-7.000	0.148	1.000		NA
583816	3337535	Daro_1265	Daro_1266	wecB		TRUE	0.900	0.000	0.000	NA		NA
3337536	583812	Daro_1267	Daro_1268			FALSE	0.085	114.000	0.000	NA		NA
583811	583810	Daro_1269	Daro_1270		rfe	TRUE	0.470	72.000	0.000	1.000	Y	NA
583810	583809	Daro_1270	Daro_1271	rfe		TRUE	0.935	4.000	0.000	0.062	N	NA
583809	3337537	Daro_1271	Daro_1272			TRUE	0.858	3.000	0.000	NA		NA
3337537	583808	Daro_1272	Daro_1273			TRUE	0.810	5.000	0.000	NA		NA
583808	583807	Daro_1273	Daro_1274			TRUE	0.988	-3.000	0.111	NA		NA
583807	583806	Daro_1274	Daro_1275			TRUE	0.966	-12.000	0.085	1.000	N	NA
583806	583805	Daro_1275	Daro_1276			TRUE	0.861	-9.000	0.000	1.000	N	NA
583805	583804	Daro_1276	Daro_1277			TRUE	0.984	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
583804	583803	Daro_1277	Daro_1278			TRUE	0.975	7.000	0.031	1.000	Y	NA
583803	583802	Daro_1278	Daro_1279		aroA	FALSE	0.158	73.000	0.000	1.000	N	NA
583802	583801	Daro_1279	Daro_1280	aroA	rpsA	FALSE	0.210	93.000	0.015	1.000	N	NA
583801	583800	Daro_1280	Daro_1281	rpsA	ihfB	TRUE	0.983	13.000	0.292	1.000	N	NA
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813350	583799	Daro_1282	Daro_1283			TRUE	0.993	-3.000	0.229	NA		NA
583799	583798	Daro_1283	Daro_1284		ugd	TRUE	0.832	10.000	0.000	1.000	N	NA
583798	583797	Daro_1284	Daro_1285	ugd	rbsK	TRUE	0.958	4.000	0.000	1.000	Y	NA
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583793	583792	Daro_1289	Daro_1290	ppa	nadE	TRUE	0.882	7.000	0.009	1.000	N	NA
583792	583791	Daro_1290	Daro_1291	nadE	glnB	TRUE	0.955	25.000	0.288	1.000	N	NA
583790	583789	Daro_1292	Daro_1293		trxB	TRUE	0.948	7.000	0.053	1.000		NA
583788	583787	Daro_1294	Daro_1295	crp		TRUE	0.980	3.000	0.158	1.000	N	NA
583787	583786	Daro_1295	Daro_1296		lolA	TRUE	0.592	68.000	0.130	1.000	N	NA
583784	583783	Daro_1298	Daro_1299			TRUE	0.807	6.000	0.000	NA		NA
583783	583782	Daro_1299	Daro_1300		serS	FALSE	0.258	50.000	0.000	NA		NA
584236	583780	Daro_R0044	Daro_1302	tRNA-Ser		FALSE	0.085	114.000	0.000	NA		NA
583780	583779	Daro_1302	Daro_1303		hsdM	TRUE	0.681	35.000	0.000	0.087		NA
583779	3337538	Daro_1303	Daro_1304	hsdM		TRUE	0.815	7.000	0.000	NA		NA
583778	583777	Daro_1305	Daro_1306	t150		TRUE	0.993	-3.000	0.080	0.086		NA
583776	583775	Daro_1307	Daro_1308			TRUE	0.947	74.000	0.240	0.001	Y	NA
583774	3337539	Daro_1309	Daro_1310			FALSE	0.013	379.000	0.000	NA		NA
3337539	813351	Daro_1310	Daro_1311			TRUE	0.876	-7.000	0.000	NA		NA
813351	583773	Daro_1311	Daro_1312		pin	FALSE	0.119	90.000	0.000	1.000	N	NA
3337540	810699	Daro_1313	Daro_1314			FALSE	0.012	413.000	0.000	NA		NA
810699	3337541	Daro_1314	Daro_1315			TRUE	0.835	9.000	0.000	NA		NA
3337541	3337542	Daro_1315	Daro_1316			FALSE	0.026	223.000	0.000	NA		NA
3337542	583772	Daro_1316	Daro_1317		dppB	FALSE	0.012	433.000	0.000	NA		NA
583772	583771	Daro_1317	Daro_1318	dppB		TRUE	0.999	-3.000	0.738	0.042	Y	NA
583771	583770	Daro_1318	Daro_1319			TRUE	0.901	1.000	0.000	1.000		NA
583769	584231	Daro_1320	Daro_R0045		tRNA-Asp	FALSE	0.080	117.000	0.000	NA		NA
584231	584230	Daro_R0045	Daro_R0046	tRNA-Asp	tRNA-Glu	TRUE	0.556	28.000	0.000	NA		NA
584230	584229	Daro_R0046	Daro_R0047	tRNA-Glu	tRNA-Ala	FALSE	0.342	39.000	0.000	NA		NA
584229	584228	Daro_R0047	Daro_R0048	tRNA-Ala	tRNA-Asp	FALSE	0.127	86.000	0.000	NA		NA
584228	584227	Daro_R0048	Daro_R0049	tRNA-Asp	tRNA-Glu	TRUE	0.556	28.000	0.000	NA		NA
584227	584226	Daro_R0049	Daro_R0050	tRNA-Glu	tRNA-Ala	TRUE	0.635	24.000	0.000	NA		NA
584226	583768	Daro_R0050	Daro_1321	tRNA-Ala	gltX	FALSE	0.175	65.000	0.000	NA		NA
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583766	583765	Daro_1324	Daro_1325			TRUE	0.878	3.000	0.000	1.000		NA
583765	583764	Daro_1325	Daro_1326			TRUE	0.814	13.000	0.000	NA		NA
583763	583762	Daro_1327	Daro_1328	ihfA		FALSE	0.033	536.000	0.000	0.086		NA
3337543	813352	Daro_1329	Daro_1330			FALSE	0.014	362.000	0.000	NA		NA
583760	583759	Daro_1334	Daro_1335			TRUE	0.947	33.000	0.667	NA		NA
583759	583758	Daro_1335	Daro_1336			FALSE	0.183	73.000	0.000	1.000		NA
583758	583757	Daro_1336	Daro_1337			FALSE	0.033	188.000	0.000	1.000	N	NA
583757	583756	Daro_1337	Daro_1338			FALSE	0.016	315.000	0.000	1.000	N	NA
583756	583755	Daro_1338	Daro_1339		nfnB	FALSE	0.035	185.000	0.000	1.000	N	NA
583755	583754	Daro_1339	Daro_1340	nfnB	glcG	FALSE	0.079	118.000	0.000	NA		NA
583752	583751	Daro_1344	Daro_1345			TRUE	0.992	-3.000	0.200	NA		NA
583751	583750	Daro_1345	Daro_1346			TRUE	0.414	37.000	0.000	1.000		NA
583749	583748	Daro_1347	Daro_1348			TRUE	0.691	84.000	0.333	NA		NA
583747	583746	Daro_1349	Daro_1350			TRUE	0.996	-3.000	0.500	NA		NA
583746	583745	Daro_1350	Daro_1351			TRUE	0.833	66.000	0.750	NA		NA
583745	583744	Daro_1351	Daro_1352			TRUE	0.978	19.000	0.375	NA		NA
583744	583743	Daro_1352	Daro_1353		mhpB	FALSE	0.057	140.000	0.000	NA		NA
583743	583742	Daro_1353	Daro_1354	mhpB	mhpD	TRUE	0.856	87.000	0.400	0.014		NA
583742	583741	Daro_1354	Daro_1355	mhpD	mhpF homolog	TRUE	0.839	29.000	0.000	1.000	Y	NA
583741	583740	Daro_1355	Daro_1356	mhpF homolog	mhpE	TRUE	0.691	21.000	0.000	1.000	N	NA
583740	583739	Daro_1356	Daro_1357	mhpE		TRUE	0.808	5.000	0.000	1.000	N	NA
583739	583738	Daro_1357	Daro_1358			FALSE	0.143	146.000	0.000	0.052	N	NA
583738	583737	Daro_1358	Daro_1359			TRUE	0.751	55.000	0.078	0.052	N	NA
583737	583736	Daro_1359	Daro_1360			TRUE	0.413	141.000	0.250	1.000	N	NA
583736	583735	Daro_1360	Daro_1361		mhpC	FALSE	0.300	49.000	0.000	1.000		NA
583735	583734	Daro_1361	Daro_1362	mhpC		FALSE	0.247	57.000	0.000	1.000		NA
583734	583733	Daro_1362	Daro_1363		aer	TRUE	0.981	-10.000	0.000	0.100	Y	NA
583732	583731	Daro_1364	Daro_1365			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
583731	3337547	Daro_1365	Daro_1366			TRUE	0.789	16.000	0.000	NA		NA
3337547	813354	Daro_1366	Daro_1367			FALSE	0.011	466.000	0.000	NA		NA
583730	583729	Daro_1368	Daro_1369			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
583729	583728	Daro_1369	Daro_1370			TRUE	0.756	18.000	0.000	NA		NA
3337549	583726	Daro_1373	Daro_1374			TRUE	0.823	11.000	0.000	NA		NA
583726	3337550	Daro_1374	Daro_1375			FALSE	0.015	336.000	0.000	NA		NA
3337550	583725	Daro_1375	Daro_1376			TRUE	0.814	13.000	0.000	NA		NA
583725	3337551	Daro_1376	Daro_1377			FALSE	0.011	1021.000	0.000	1.000		NA
3337551	583724	Daro_1377	Daro_1378		asr	FALSE	0.079	118.000	0.000	NA		NA
583722	583721	Daro_1381	Daro_1382			TRUE	0.834	9.000	0.000	1.000	N	NA
583721	3337553	Daro_1382	Daro_1383			FALSE	0.271	48.000	0.000	NA		NA
3337553	583720	Daro_1383	Daro_1384			FALSE	0.012	396.000	0.000	NA		NA
583719	583718	Daro_1385	Daro_1386			FALSE	0.050	151.000	0.000	NA		NA
583718	583717	Daro_1386	Daro_1387			FALSE	0.195	61.000	0.000	NA		NA
583717	583716	Daro_1387	Daro_1388		cspE	FALSE	0.025	231.000	0.000	NA		NA
583716	583715	Daro_1388	Daro_1389	cspE		FALSE	0.010	563.000	0.000	NA		NA
583715	583714	Daro_1389	Daro_1390			FALSE	0.127	86.000	0.000	NA		NA
583714	583713	Daro_1390	Daro_1391		acpD	TRUE	0.795	26.000	0.030	NA		NA
3337554	3337555	Daro_1393	Daro_1394	NIfM homolog	nifZ	TRUE	0.990	5.000	0.643	1.000		NA
3337555	3337556	Daro_1394	Daro_1395	nifZ	NifW homolog	TRUE	0.994	0.000	0.111	0.004		NA
3337556	583709	Daro_1395	Daro_1396	NifW homolog		TRUE	0.957	11.000	0.078	NA		NA
583709	583708	Daro_1396	Daro_1397		cysE	TRUE	0.967	21.000	0.286	NA		NA
583708	583707	Daro_1397	Daro_1398	cysE		TRUE	0.995	-7.000	0.198	1.000	Y	NA
583706	583705	Daro_1399	Daro_1400		uvrY	TRUE	0.983	3.000	0.000	0.058	Y	NA
583705	583704	Daro_1400	Daro_1401	uvrY		FALSE	0.072	125.000	0.000	1.000	N	NA
583704	583703	Daro_1401	Daro_1402			TRUE	0.832	47.000	0.286	NA		NA
583703	583702	Daro_1402	Daro_1403			TRUE	0.982	22.000	0.857	NA		NA
583702	583701	Daro_1403	Daro_1404			FALSE	0.069	128.000	0.000	NA		NA
583701	583700	Daro_1404	Daro_1405			FALSE	0.165	68.000	0.000	1.000	N	NA
583700	583699	Daro_1405	Daro_1406			FALSE	0.017	302.000	0.000	1.000	N	NA
583698	3337557	Daro_1407	Daro_1408			TRUE	0.981	17.000	0.364	NA		NA
3337557	813355	Daro_1408	Daro_1409			TRUE	0.982	-10.000	0.182	NA		NA
813355	583696	Daro_1409	Daro_1410		nafY-2	TRUE	0.990	-3.000	0.136	NA		NA
583696	3337558	Daro_1410	Daro_1411	nafY-2		FALSE	0.147	78.000	0.000	NA		NA
3337558	3337559	Daro_1411	Daro_1412		NifT homolog	FALSE	0.173	77.000	0.000	1.000		NA
3337559	583694	Daro_1412	Daro_1413	NifT homolog	nifK	TRUE	0.920	35.000	0.100	0.004	N	NA
583694	583693	Daro_1413	Daro_1414	nifK	nifD	TRUE	0.976	69.000	0.902	0.001	Y	NA
583693	583692	Daro_1414	Daro_1415	nifD	nifH	TRUE	0.560	91.000	0.026	0.001	N	NA
583689	583688	Daro_1418	Daro_1419			TRUE	0.745	37.000	0.080	NA		NA
583688	583687	Daro_1419	Daro_1420			TRUE	0.900	0.000	0.000	NA		NA
583687	583686	Daro_1420	Daro_1421		nitrite reductase subunit (putative)	TRUE	0.952	5.000	0.000	1.000	Y	NA
583686	583685	Daro_1421	Daro_1422	nitrite reductase subunit (putative)	nitroreductase	TRUE	0.978	-3.000	0.000	0.051		NA
583685	583684	Daro_1422	Daro_1423	nitroreductase		TRUE	0.858	3.000	0.000	NA		NA
583683	583682	Daro_1424	Daro_1425	ureG	UreF (putative)	TRUE	0.998	5.000	0.550	0.004	Y	NA
583682	583681	Daro_1425	Daro_1426	UreF (putative)	UreE	TRUE	0.999	-3.000	0.560	0.004	Y	NA
583681	583680	Daro_1426	Daro_1427	UreE	ureC	TRUE	0.997	2.000	0.315	0.001	N	NA
583680	583679	Daro_1427	Daro_1428	ureC	Urea amidohydrolase beta	TRUE	0.999	-3.000	0.486	0.001	Y	NA
583679	583678	Daro_1428	Daro_1429	Urea amidohydrolase beta	Urea amidohydrolase gamma	TRUE	0.999	10.000	0.595	0.001	Y	NA
583678	583677	Daro_1429	Daro_1430	Urea amidohydrolase gamma	UreH (putative)	TRUE	0.997	10.000	0.664	0.003	N	NA
3337560	583676	Daro_1431	Daro_1432			FALSE	0.251	109.000	0.000	0.061		NA
583676	583675	Daro_1432	Daro_1433		tra8_1	FALSE	0.035	185.000	0.000	1.000	N	NA
583674	583673	Daro_1434	Daro_1435	UrtE (putative)	UrtD (putative)	TRUE	0.996	7.000	0.731	0.018		NA
583673	583672	Daro_1435	Daro_1436	UrtD (putative)	UrtC (putative)	TRUE	0.996	-6.000	0.823	1.000		NA
583672	583671	Daro_1436	Daro_1437	UrtC (putative)	UrtB (putative)	TRUE	0.999	10.000	0.758	0.042	Y	NA
583670	3337561	Daro_1438	Daro_1439			TRUE	0.712	50.000	0.125	NA		NA
3337561	583669	Daro_1439	Daro_1440			FALSE	0.011	487.000	0.000	NA		NA
583669	583668	Daro_1440	Daro_1441		arcB	TRUE	0.817	12.000	0.000	1.000	N	NA
3337562	583666	Daro_1442	Daro_1443	CynS (putative)	UrtA (putative)	FALSE	0.126	77.000	0.000	NA	N	NA
583664	583663	Daro_1445	Daro_1446			TRUE	0.992	-13.000	0.214	0.043	N	NA
583663	583662	Daro_1446	Daro_1447		draG homolog	FALSE	0.065	131.000	0.000	1.000	N	NA
583662	583661	Daro_1447	Daro_1448	draG homolog	nifQ (putative)	TRUE	0.965	-21.000	0.094	1.000		NA
583661	583660	Daro_1448	Daro_1449	nifQ (putative)		TRUE	0.847	11.000	0.000	1.000		NA
583660	583659	Daro_1449	Daro_1450			TRUE	0.803	87.000	0.065	0.023	Y	NA
583659	583658	Daro_1450	Daro_1451			TRUE	0.995	17.000	0.226	0.087	Y	NA
583658	583657	Daro_1451	Daro_1452			TRUE	0.973	-22.000	0.052	0.051	N	NA
583657	583656	Daro_1452	Daro_1453			TRUE	0.987	0.000	0.052	0.087		NA
583656	583655	Daro_1453	Daro_1454		nifB	TRUE	0.959	1.000	0.032	1.000		NA
583652	583651	Daro_1457	Daro_1458	fldA	glpE	TRUE	0.813	13.000	0.000	1.000	N	NA
583651	583650	Daro_1458	Daro_1459	glpE		TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
3337563	583648	Daro_1460	Daro_1461			FALSE	0.016	312.000	0.000	NA		NA
583648	583647	Daro_1461	Daro_1462			FALSE	0.070	127.000	0.000	NA		NA
583647	583646	Daro_1462	Daro_1463		cyoE	TRUE	0.994	7.000	0.321	1.000	Y	NA
583646	3337564	Daro_1463	Daro_1464	cyoE		TRUE	0.763	25.000	0.014	NA		NA
3337564	3337565	Daro_1464	Daro_1465			TRUE	0.997	-3.000	0.722	NA		NA
583643	583642	Daro_1467	Daro_1468			TRUE	0.996	-3.000	0.536	1.000	N	NA
583642	3337567	Daro_1468	Daro_1469			TRUE	0.810	5.000	0.000	NA		NA
3337567	583641	Daro_1469	Daro_1470		cyoB	TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
583641	583640	Daro_1470	Daro_1471	cyoB		TRUE	0.990	11.000	0.015	0.003	Y	NA
583639	583638	Daro_1472	Daro_1473			FALSE	0.155	84.000	0.000	1.000		NA
583637	583636	Daro_1474	Daro_1475		modD	TRUE	0.903	7.000	0.017	NA		NA
583636	583635	Daro_1475	Daro_1476	modD	modA	TRUE	0.857	20.000	0.026	1.000	N	NA
583635	583634	Daro_1476	Daro_1477	modA	modE	TRUE	0.942	26.000	0.031	0.001		NA
583632	583631	Daro_1479	Daro_1480			FALSE	0.328	40.000	0.000	NA		NA
583631	583630	Daro_1480	Daro_1481			TRUE	0.802	-28.000	0.000	NA		NA
583630	583629	Daro_1481	Daro_1482			FALSE	0.044	161.000	0.000	NA		NA
583629	583628	Daro_1482	Daro_1483		fldA	TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
583628	583627	Daro_1483	Daro_1484	fldA		TRUE	0.856	10.000	0.000	1.000		NA
583627	583626	Daro_1484	Daro_1485			TRUE	0.924	5.000	0.033	NA		NA
583624	583623	Daro_1487	Daro_1488	nifA	nifL	TRUE	0.997	-13.000	0.214	0.057	Y	NA
583622	583621	Daro_1489	Daro_1490	rnfG	rnfE	TRUE	0.999	2.000	1.000	0.087	Y	NA
583621	583620	Daro_1490	Daro_1491	rnfE	rseC	TRUE	0.914	-3.000	0.000	NA	N	NA
583620	583619	Daro_1491	Daro_1492	rseC	rnfA	TRUE	0.921	9.000	0.029	NA	N	NA
583619	583618	Daro_1492	Daro_1493	rnfA	rnfB	TRUE	0.745	114.000	0.098	0.087	Y	NA
583618	583617	Daro_1493	Daro_1494	rnfB	rnfC	TRUE	0.994	11.000	0.092	0.032	Y	NA
583617	583616	Daro_1494	Daro_1495	rnfC	rnfD	TRUE	0.999	-3.000	0.905	0.087	Y	NA
583616	583615	Daro_1495	Daro_1496	rnfD		TRUE	0.789	16.000	0.000	NA		NA
583615	583614	Daro_1496	Daro_1497			TRUE	0.807	6.000	0.000	NA		NA
583614	5645261	Daro_1497	Daro_1498			TRUE	0.999	0.000	0.829	0.002		NA
5645261	583612	Daro_1498	Daro_1499		pntB	TRUE	0.997	0.000	0.321	0.002		NA
583612	583611	Daro_1499	Daro_1500	pntB		FALSE	0.020	231.000	0.000	NA	N	NA
583611	583610	Daro_1500	Daro_1501		nifE	FALSE	0.053	132.000	0.000	NA	N	NA
583610	583609	Daro_1501	Daro_1502	nifE		FALSE	0.017	307.000	0.000	NA		NA
583609	3337568	Daro_1502	Daro_1503			FALSE	0.115	93.000	0.000	NA		NA
583607	583606	Daro_1505	Daro_1506	nifN	nifX (putative)	TRUE	0.952	-37.000	0.084	NA		NA
583606	583605	Daro_1506	Daro_1507	nifX (putative)		TRUE	0.971	-3.000	0.029	NA		NA
583605	583604	Daro_1507	Daro_1508			TRUE	0.955	-7.000	0.037	NA		NA
583604	583603	Daro_1508	Daro_1509			TRUE	0.982	16.000	0.321	NA		NA
583603	583602	Daro_1509	Daro_1510			TRUE	0.987	-3.000	0.100	NA		NA
583602	583601	Daro_1510	Daro_1511			TRUE	0.858	3.000	0.000	NA		NA
583601	583600	Daro_1511	Daro_1512			TRUE	0.831	4.000	0.000	NA		NA
583600	583599	Daro_1512	Daro_1513			FALSE	0.075	122.000	0.000	NA		NA
583599	583598	Daro_1513	Daro_1514		nifU	TRUE	0.979	13.000	0.210	NA		NA
583598	583597	Daro_1514	Daro_1515	nifU	nifS-1 homolog	TRUE	0.904	44.000	0.716	1.000	N	NA
583597	3337569	Daro_1515	Daro_1516	nifS-1 homolog		FALSE	0.117	92.000	0.000	NA		NA
583596	583595	Daro_1517	Daro_1518			TRUE	0.618	72.000	0.163	NA		NA
583595	583594	Daro_1518	Daro_1519			TRUE	0.995	10.000	0.500	0.086		NA
583593	583592	Daro_1520	Daro_1521			TRUE	0.977	21.000	0.500	NA		NA
583591	583590	Daro_1522	Daro_1523			TRUE	0.828	8.000	0.000	NA		NA
583590	583589	Daro_1523	Daro_1524			TRUE	0.849	29.000	0.082	NA		NA
583587	583586	Daro_1526	Daro_1527			TRUE	0.852	51.000	0.444	1.000	N	NA
583586	583585	Daro_1527	Daro_1528			FALSE	0.141	331.000	0.000	0.043	Y	NA
583583	3337570	Daro_1530	Daro_1531			FALSE	0.018	294.000	0.000	NA		NA
3337570	3337571	Daro_1531	Daro_1532		phasin	FALSE	0.108	99.000	0.000	NA		NA
3337571	583581	Daro_1532	Daro_1533	phasin		FALSE	0.067	129.000	0.000	NA		NA
583581	3337572	Daro_1533	Daro_1534			FALSE	0.021	259.000	0.000	NA		NA
583578	583577	Daro_1537	Daro_1538			FALSE	0.036	183.000	0.000	NA		NA
583577	3337573	Daro_1538	Daro_1539			FALSE	0.328	40.000	0.000	NA		NA
3337573	583576	Daro_1539	Daro_1540			FALSE	0.048	156.000	0.000	NA		NA
583576	583575	Daro_1540	Daro_1541			TRUE	0.954	-21.000	0.000	1.000	Y	NA
583575	583574	Daro_1541	Daro_1542			FALSE	0.269	48.000	0.000	1.000	N	NA
583574	583573	Daro_1542	Daro_1543			FALSE	0.322	76.000	0.000	0.098	N	NA
583573	583572	Daro_1543	Daro_1544		fadE	TRUE	0.794	37.000	0.112	1.000	N	NA
583572	583571	Daro_1544	Daro_1545	fadE		TRUE	0.994	-18.000	0.242	1.000	Y	NA
583571	583570	Daro_1545	Daro_1546			TRUE	0.877	2.000	0.000	NA		NA
583570	583569	Daro_1546	Daro_1547			TRUE	0.823	11.000	0.000	NA		NA
583569	583568	Daro_1547	Daro_1548		fadL	FALSE	0.357	136.000	0.028	1.000	Y	NA
583568	583567	Daro_1548	Daro_1549	fadL		FALSE	0.293	158.000	0.027	1.000	Y	NA
583567	583566	Daro_1549	Daro_1550			TRUE	0.991	22.000	0.588	1.000	Y	NA
583566	583565	Daro_1550	Daro_1551			TRUE	0.909	4.000	0.015	NA		NA
583565	583564	Daro_1551	Daro_1552			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
583564	583563	Daro_1552	Daro_1553		fadD	TRUE	0.595	26.000	0.000	NA		NA
583563	583562	Daro_1553	Daro_1554	fadD		TRUE	0.915	0.000	0.000	1.000		NA
583562	583561	Daro_1554	Daro_1555			TRUE	0.832	25.000	0.000	0.086		NA
3337574	583560	Daro_1556	Daro_1557			FALSE	0.022	252.000	0.000	NA		NA
583559	583558	Daro_1558	Daro_1559			FALSE	0.400	134.000	0.200	NA		NA
583558	3337575	Daro_1559	Daro_1560			TRUE	0.807	6.000	0.000	NA		NA
583557	583556	Daro_1561	Daro_1562			TRUE	0.967	-3.000	0.022	NA		NA
583556	583555	Daro_1562	Daro_1563			TRUE	0.994	1.000	0.667	NA		NA
583555	583554	Daro_1563	Daro_1564		glnQ	TRUE	0.972	3.000	0.095	NA		NA
583554	583553	Daro_1564	Daro_1565	glnQ	ferredoxin	TRUE	0.588	110.000	0.333	1.000	N	NA
583553	583552	Daro_1565	Daro_1566	ferredoxin		TRUE	0.996	-3.000	0.167	0.023		NA
583552	583551	Daro_1566	Daro_1567		nosD homolog	TRUE	0.939	-3.000	0.000	1.000		NA
583551	583550	Daro_1567	Daro_1568	nosD homolog		TRUE	0.923	6.000	0.034	NA		NA
583550	583549	Daro_1568	Daro_1569			FALSE	0.355	72.000	0.034	NA		NA
583549	583548	Daro_1569	Daro_1570			TRUE	0.925	113.000	0.667	0.019	Y	NA
583548	583547	Daro_1570	Daro_1571		nosZ-2 (putative)	TRUE	0.658	87.000	0.012	0.086	Y	NA
583547	583546	Daro_1571	Daro_1572	nosZ-2 (putative)	uvrY	FALSE	0.038	172.000	0.000	1.000	N	NA
583546	583545	Daro_1572	Daro_1573	uvrY		TRUE	0.993	-3.000	0.000	0.042	Y	NA
583545	583544	Daro_1573	Daro_1574			TRUE	0.985	3.000	0.000	0.029	Y	NA
583544	583543	Daro_1574	Daro_1575		nosZ-1 (putative)	FALSE	0.055	141.000	0.000	1.000	N	NA
583542	583541	Daro_1576	Daro_1577			TRUE	0.992	0.000	0.333	NA		NA
583541	583540	Daro_1577	Daro_1578			TRUE	0.980	-3.000	0.056	NA		NA
3337576	3337577	Daro_1579	Daro_1580		qseC homolog	FALSE	0.110	433.000	0.000	0.040	Y	NA
3337577	583537	Daro_1580	Daro_1581	qseC homolog	qseB	TRUE	0.997	-16.000	1.000	1.000	Y	NA
583537	583536	Daro_1581	Daro_1582	qseB	napC	FALSE	0.325	40.000	0.000	1.000	N	NA
583535	583534	Daro_1583	Daro_1584			TRUE	0.986	17.000	0.571	NA		NA
583533	583532	Daro_1585	Daro_1586			TRUE	0.999	-3.000	0.682	1.000	Y	NA
583531	583530	Daro_1587	Daro_1588			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
583529	583528	Daro_1589	Daro_1590			TRUE	0.895	2.000	0.000	1.000		NA
583528	3337578	Daro_1590	Daro_1591			TRUE	0.939	-3.000	0.000	1.000		NA
3337578	583526	Daro_1591	Daro_1592		dnaQ	TRUE	0.851	8.000	0.000	1.000		NA
583526	583525	Daro_1592	Daro_1593	dnaQ	rnhA	TRUE	0.994	10.000	0.248	1.000	Y	NA
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3337713	584324	Daro_2623	Daro_2624			TRUE	0.980	-28.000	0.250	NA		NA
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582542	582541	Daro_2720	Daro_2721	hflX	gdhA	FALSE	0.319	45.000	0.000	1.000		NA
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582498	582497	Daro_2767	Daro_2768		livF	TRUE	0.959	30.000	0.667	NA		NA
582497	582496	Daro_2768	Daro_2769	livF	livG	TRUE	0.999	-7.000	0.667	0.016	Y	NA
582496	582495	Daro_2769	Daro_2770	livG		TRUE	0.990	-7.000	0.077	1.000	Y	NA
582495	582494	Daro_2770	Daro_2771		livH	TRUE	0.994	5.000	0.115	0.036	Y	NA
582494	582493	Daro_2771	Daro_2772	livH	livJ	TRUE	0.675	164.000	0.500	NA	Y	NA
582493	582492	Daro_2772	Daro_2773	livJ		TRUE	0.600	117.000	0.500	NA	N	NA
582492	582491	Daro_2773	Daro_2774		mhpD	TRUE	0.998	18.000	1.000	0.003	Y	NA
582491	582490	Daro_2774	Daro_2775	mhpD	aldH	TRUE	0.966	36.000	0.667	0.053	N	NA
582490	582489	Daro_2775	Daro_2776	aldH		TRUE	0.864	59.000	0.667	1.000		NA
582489	582488	Daro_2776	Daro_2777			FALSE	0.325	44.000	0.000	1.000		NA
582487	582486	Daro_2778	Daro_2779	benA	benB	TRUE	0.997	15.000	0.953	0.001	N	NA
582486	582485	Daro_2779	Daro_2780	benB	benC	TRUE	0.880	78.000	0.672	0.075	N	NA
582485	582484	Daro_2780	Daro_2781	benC	benD	TRUE	0.990	21.000	0.574	0.044	N	NA
582484	582483	Daro_2781	Daro_2782	benD	benR like regulatory protein	FALSE	0.019	273.000	0.000	1.000	N	NA
582483	584247	Daro_2782	Daro_R0071	benR like regulatory protein	tRNA-Thr	FALSE	0.024	234.000	0.000	NA		NA
584247	582482	Daro_R0071	Daro_2783	tRNA-Thr	modB	FALSE	0.010	593.000	0.000	NA		NA
582482	582481	Daro_2783	Daro_2784	modB	modC	TRUE	0.999	-3.000	0.308	0.001	Y	NA
582481	582480	Daro_2784	Daro_2785	modC		FALSE	0.067	336.000	0.000	1.000	Y	NA
582480	582479	Daro_2785	Daro_2786			TRUE	0.828	8.000	0.000	NA		NA
582479	582478	Daro_2786	Daro_2787		BarA/GacS homolog	TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
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582166	582165	Daro_3124	Daro_3125	pntB		FALSE	0.181	74.000	0.000	1.000		NA
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582163	582162	Daro_3127	Daro_3128		soxB (putative)	TRUE	0.988	-3.000	0.111	NA		NA
582162	582161	Daro_3128	Daro_3129	soxB (putative)	soxX (putative)	TRUE	0.736	81.000	0.370	1.000		NA
582161	582160	Daro_3129	Daro_3130	soxX (putative)	soxA (putative)	TRUE	0.996	15.000	0.926	0.016		NA
582160	582159	Daro_3130	Daro_3131	soxA (putative)	soxZ (putative)	TRUE	0.726	79.000	0.370	NA		NA
582159	582158	Daro_3131	Daro_3132	soxZ (putative)	probable soxY family member	TRUE	0.423	150.000	0.312	NA		NA
582158	582157	Daro_3132	Daro_3133	probable soxY family member	soxD (putative)	TRUE	0.903	26.000	0.109	NA		NA
582157	582156	Daro_3133	Daro_3134	soxD (putative)	soxC (putative)	TRUE	0.990	-16.000	0.179	0.073		NA
582156	582155	Daro_3134	Daro_3135	soxC (putative)		TRUE	0.782	41.000	0.125	1.000		NA
582154	582153	Daro_3136	Daro_3137		soxF family	TRUE	0.994	12.000	0.286	1.000	Y	NA
582152	582151	Daro_3138	Daro_3139			TRUE	0.748	65.000	0.000	0.003	Y	NA
582151	582150	Daro_3139	Daro_3140		dut	TRUE	0.928	-3.000	0.000	1.000	N	NA
582150	582149	Daro_3140	Daro_3141	dut	coaBC	TRUE	0.989	0.000	0.201	1.000	N	NA
582148	582147	Daro_3142	Daro_3143	radC	rpmB	FALSE	0.185	82.000	0.003	1.000	N	NA
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581680	581679	Daro_3638	Daro_3639	cbbR		TRUE	0.414	37.000	0.000	1.000		NA
581679	581678	Daro_3639	Daro_3640		hemH	FALSE	0.249	75.000	0.006	1.000		NA
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3337819	813405	Daro_3643	Daro_3644			FALSE	0.067	129.000	0.000	NA		NA
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581642	581641	Daro_3683	Daro_3684		hemK	TRUE	0.967	14.000	0.124	1.000	N	NA
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581636	581635	Daro_3689	Daro_3690	hemA	cysA	FALSE	0.158	73.000	0.000	1.000	N	NA
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581624	3337824	Daro_3703	Daro_3704	amtB	MltD-like	FALSE	0.075	159.000	0.009	1.000	N	NA
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581610	581609	Daro_3717	Daro_3718	ftsE	ftsY (SRP receptor)	TRUE	0.994	-3.000	0.117	0.097	N	NA
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581602	3337827	Daro_3725	Daro_3726			FALSE	0.284	68.000	0.009	1.000		NA
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581581	581580	Daro_3748	Daro_3749	gabD		TRUE	0.956	5.000	0.083	NA		NA
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3337830	581571	Daro_3757	Daro_3758		ntrC	TRUE	0.903	11.000	0.014	1.000	N	NA
581571	581570	Daro_3758	Daro_3759	ntrC	glnL	TRUE	0.989	32.000	0.587	0.079	Y	NA
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3337831	581567	Daro_3762	Daro_3763		glnA	FALSE	0.267	108.000	0.048	NA		NA
581567	581566	Daro_3763	Daro_3764	glnA		FALSE	0.043	202.000	0.003	1.000	N	NA
581565	581564	Daro_3765	Daro_3766		nadA	FALSE	0.195	77.000	0.006	NA	N	NA
581564	581563	Daro_3766	Daro_3767	nadA		TRUE	0.900	8.000	0.011	NA		NA
581563	581562	Daro_3767	Daro_3768			TRUE	0.984	-10.000	0.216	NA		NA
581561	581560	Daro_3769	Daro_3770			FALSE	0.050	150.000	0.000	1.000	N	NA
581559	581558	Daro_3772	Daro_3773			FALSE	0.275	52.000	0.000	1.000		NA
581558	3337833	Daro_3773	Daro_3774			FALSE	0.078	131.000	0.000	1.000		NA
3337833	581556	Daro_3774	Daro_3775		leuB	FALSE	0.073	307.000	0.000	1.000	Y	NA
581556	581555	Daro_3775	Daro_3776	leuB		FALSE	0.076	121.000	0.000	NA		NA
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581554	581553	Daro_3777	Daro_3778			TRUE	0.826	67.000	0.714	NA		NA
581553	581552	Daro_3778	Daro_3779			TRUE	0.984	21.000	1.000	NA		NA
581552	581551	Daro_3779	Daro_3780			FALSE	0.022	250.000	0.000	NA		NA
581551	581550	Daro_3780	Daro_3781			TRUE	0.937	17.000	0.000	0.011		NA
581550	581549	Daro_3781	Daro_3782		mhpE homolog	TRUE	0.975	-3.000	0.000	0.055	N	NA
581549	581548	Daro_3782	Daro_3783	mhpE homolog	mhpF	TRUE	0.691	21.000	0.000	1.000	N	NA
581548	581547	Daro_3783	Daro_3784	mhpF	ucpA	TRUE	0.872	26.000	0.000	1.000	Y	NA
581547	3337834	Daro_3784	Daro_3785	ucpA	mhpD homolog	TRUE	0.976	15.000	0.000	0.049	Y	NA
3337834	581545	Daro_3785	Daro_3786	mhpD homolog	mhpC	TRUE	0.890	23.000	0.000	0.011		NA
581545	581544	Daro_3786	Daro_3787	mhpC	betB	TRUE	0.839	13.000	0.000	1.000		NA
581544	581543	Daro_3787	Daro_3788	betB	glcG	TRUE	0.936	23.000	0.147	NA		NA
581543	581542	Daro_3788	Daro_3789	glcG	extradiol dioxygenase (putative)	TRUE	0.900	0.000	0.000	NA		NA
581540	581539	Daro_3791	Daro_3792	Ferredoxin	phcP/dmpP/phhP/pheA6/tcb1F/aphQ homolog	TRUE	0.972	18.000	0.000	0.019	Y	NA
581539	581538	Daro_3792	Daro_3793	phcP/dmpP/phhP/pheA6/tcb1F/aphQ homolog	phcO/dmpO/phhO/pheA5/tcb1E/aphO homolog	TRUE	0.977	13.000	0.176	1.000		NA
581538	581537	Daro_3793	Daro_3794	phcO/dmpO/phhO/pheA5/tcb1E/aphO homolog	phcN/dmpN/phhN/pheA4/tcb1D homolog	FALSE	0.236	59.000	0.000	1.000		NA
581537	581536	Daro_3794	Daro_3795	phcN/dmpN/phhN/pheA4/tcb1D homolog	phcM/dmpM/phhM/pheA3/tcb1C/aphM homolog	TRUE	0.991	15.000	0.200	0.011		NA
581536	581535	Daro_3795	Daro_3796	phcM/dmpM/phhM/pheA3/tcb1C/aphM homolog	phcL/dmpL/phhL/pheA2/tcb1B/aphL homolog	TRUE	0.956	9.000	0.000	0.011		NA
581535	812947	Daro_3796	Daro_3797	phcL/dmpL/phhL/pheA2/tcb1B/aphL homolog	phcK/dmpK/phhK/pheA1/tcb1A/aphK homolog	FALSE	0.306	42.000	0.000	NA		NA
581534	581533	Daro_3798	Daro_3799			TRUE	0.934	14.000	0.000	0.034	N	NA
581532	584293	Daro_3801	Daro_3802			TRUE	0.831	4.000	0.000	NA		NA
584293	581531	Daro_3802	Daro_3803			TRUE	0.876	-7.000	0.000	NA		NA
581531	581530	Daro_3803	Daro_3804			FALSE	0.042	184.000	0.000	1.000		NA
581530	581529	Daro_3804	Daro_3805		extradiol dioxygenase (putative)	FALSE	0.195	67.000	0.000	1.000		NA
581529	581528	Daro_3805	Daro_3806	extradiol dioxygenase (putative)	betB	FALSE	0.108	109.000	0.000	1.000		NA
581528	581527	Daro_3806	Daro_3807	betB	MhpF	TRUE	0.787	16.000	0.000	1.000	N	NA
581527	581526	Daro_3807	Daro_3808	MhpF	mhpE	TRUE	0.997	-3.000	0.750	1.000	N	NA
581526	581525	Daro_3808	Daro_3809	mhpE		TRUE	0.968	-3.000	0.024	1.000	N	NA
581525	581524	Daro_3809	Daro_3810			TRUE	0.941	16.000	0.056	1.000		NA
581524	581523	Daro_3810	Daro_3811			FALSE	0.031	226.000	0.000	1.000		NA
581522	581521	Daro_3812	Daro_3813	narL		TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.034	Y	NA
581521	581520	Daro_3813	Daro_3814		todX/xylN homolog	FALSE	0.034	186.000	0.000	1.000	N	NA
581520	581519	Daro_3814	Daro_3815	todX/xylN homolog	touF/phlP/tbc2F homolog	FALSE	0.165	68.000	0.000	1.000	N	NA
581519	581518	Daro_3815	Daro_3816	touF/phlP/tbc2F homolog	touE/phlO/tbc2E homolog	TRUE	0.812	73.000	0.600	1.000		NA
581518	581517	Daro_3816	Daro_3817	touE/phlO/tbc2E homolog	touD/phlN/tbc2D	TRUE	0.880	57.000	0.200	0.011		NA
581517	581516	Daro_3817	Daro_3818	touD/phlN/tbc2D	touC/phlM/tbc2C homolog	TRUE	0.830	38.000	0.154	1.000		NA
581516	581515	Daro_3818	Daro_3819	touC/phlM/tbc2C homolog	touB/phlL/tbc2B homolog	TRUE	0.880	48.000	0.538	NA		NA
581515	581514	Daro_3819	Daro_3820	touB/phlL/tbc2B homolog	touA/phlK/tbc2A homolog	TRUE	0.791	64.000	0.444	NA		NA
581514	581513	Daro_3820	Daro_3821	touA/phlK/tbc2A homolog		FALSE	0.023	271.000	0.000	1.000		NA
581513	581512	Daro_3821	Daro_3822			FALSE	0.010	578.000	0.000	1.000	N	NA
581512	3337836	Daro_3822	Daro_3823			FALSE	0.010	651.000	0.000	NA		NA
3337836	581511	Daro_3823	Daro_3824			FALSE	0.013	388.000	0.000	NA		NA
581509	581508	Daro_3826	Daro_3827			FALSE	0.260	109.000	0.000	0.049		NA
581508	581507	Daro_3827	Daro_3828		acrD	TRUE	0.976	19.000	0.111	0.033	N	NA
581507	581506	Daro_3828	Daro_3829	acrD		TRUE	0.966	13.000	0.111	1.000	N	NA
581506	581505	Daro_3829	Daro_3830			FALSE	0.236	112.000	0.043	1.000	N	NA
584292	581503	Daro_3832	Daro_3833			TRUE	0.801	15.000	0.000	NA		NA
584291	581502	Daro_3834	Daro_3835			TRUE	0.843	12.000	0.000	1.000		NA
581499	581498	Daro_3838	Daro_3839	ferredoxin	napG	TRUE	0.996	-3.000	0.167	0.019		NA
581498	3337837	Daro_3839	Daro_3840	napG		FALSE	0.124	88.000	0.000	NA		NA
3337837	581497	Daro_3840	Daro_3841			FALSE	0.076	121.000	0.000	NA		NA
581497	581496	Daro_3841	Daro_3842		dadA	TRUE	0.868	-6.000	0.000	NA	N	NA
581496	581495	Daro_3842	Daro_3843	dadA	spoT	TRUE	0.928	-3.000	0.000	1.000	N	NA
581495	581494	Daro_3843	Daro_3844	spoT	rpoZ	TRUE	0.962	22.000	0.058	1.000	Y	NA
581494	581493	Daro_3844	Daro_3845	rpoZ	gmk	TRUE	0.908	17.000	0.035	1.000	N	NA
581493	581492	Daro_3845	Daro_3846	gmk		FALSE	0.295	43.000	0.000	1.000	N	NA
581489	581488	Daro_3849	Daro_3850			TRUE	0.998	0.000	0.829	1.000	Y	NA
581488	581487	Daro_3850	Daro_3851		rph	TRUE	0.936	11.000	0.040	1.000	N	NA
581487	581486	Daro_3851	Daro_3852	rph	rdgB	TRUE	0.994	-3.000	0.262	1.000	N	NA
581486	581485	Daro_3852	Daro_3853	rdgB		TRUE	0.621	84.000	0.218	1.000	N	NA
581484	581483	Daro_3854	Daro_3855			FALSE	0.111	96.000	0.000	NA		NA
581483	581482	Daro_3855	Daro_3856			FALSE	0.127	86.000	0.000	NA		NA
581482	581481	Daro_3856	Daro_3857			FALSE	0.306	42.000	0.000	NA		NA
581481	581480	Daro_3857	Daro_3858		rdgC	TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
581480	581479	Daro_3858	Daro_3859	rdgC		FALSE	0.029	208.000	0.000	1.000	N	NA
581479	581478	Daro_3859	Daro_3860			FALSE	0.258	55.000	0.000	1.000		NA
581478	581477	Daro_3860	Daro_3861		thiG	TRUE	0.983	-3.000	0.060	1.000		NA
581477	581476	Daro_3861	Daro_3862	thiG	thiS	TRUE	0.989	13.000	0.130	1.000	Y	NA
581476	581475	Daro_3862	Daro_3863	thiS		TRUE	0.835	5.000	0.000	1.000		NA
581475	581474	Daro_3863	Daro_3864		dsbA	TRUE	0.993	1.000	0.434	1.000		NA
581474	581473	Daro_3864	Daro_3865	dsbA		TRUE	0.991	10.000	0.573	1.000		NA
581473	3337839	Daro_3865	Daro_3866		argS	TRUE	0.958	10.000	0.062	1.000		NA
3337839	584290	Daro_3866	Daro_3867	argS		TRUE	0.413	32.000	0.000	NA	N	NA
584290	581471	Daro_3867	Daro_3868			TRUE	0.804	10.000	0.000	NA	N	NA
581470	581469	Daro_3869	Daro_3870	ubiB		TRUE	0.835	5.000	0.000	1.000		NA
581469	581468	Daro_3870	Daro_3871			FALSE	0.201	65.000	0.000	1.000		NA
581467	581466	Daro_3872	Daro_3873			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
581466	581465	Daro_3873	Daro_3874			FALSE	0.133	84.000	0.000	NA		NA
581464	581463	Daro_3875	Daro_3876	mobA		FALSE	0.092	109.000	0.000	NA		NA
581463	581462	Daro_3876	Daro_3877			FALSE	0.016	314.000	0.000	NA		NA
581461	581460	Daro_3878	Daro_3879		rep	FALSE	0.056	141.000	0.000	NA		NA
581460	581459	Daro_3879	Daro_3880	rep		FALSE	0.079	118.000	0.000	NA		NA
581459	581458	Daro_3880	Daro_3881			FALSE	0.250	51.000	0.000	NA		NA
581458	581457	Daro_3881	Daro_3882			TRUE	0.712	20.000	0.000	NA		NA
581457	581456	Daro_3882	Daro_3883			TRUE	0.940	34.000	0.030	0.016	Y	NA
581455	581454	Daro_3884	Daro_3885		proC	TRUE	0.995	-3.000	0.357	NA		NA
581454	581453	Daro_3885	Daro_3886	proC		TRUE	0.965	0.000	0.039	NA		NA
581453	3337840	Daro_3886	Daro_3887			TRUE	0.993	-3.000	0.220	NA		NA
581452	581451	Daro_3888	Daro_3889			FALSE	0.158	83.000	0.000	1.000		NA
581451	581450	Daro_3889	Daro_3890		pyrB	TRUE	0.997	3.000	0.452	1.000	Y	NA
581450	581449	Daro_3890	Daro_3891	pyrB		TRUE	0.996	-7.000	0.247	1.000	Y	NA
581449	581448	Daro_3891	Daro_3892			TRUE	0.962	-28.000	0.109	1.000	N	NA
581448	3337841	Daro_3892	Daro_3893			TRUE	0.988	2.000	0.263	NA	N	NA
581445	581444	Daro_3895	Daro_3896			TRUE	0.996	23.000	0.554	0.011	Y	NA
581444	581443	Daro_3896	Daro_3897			TRUE	0.988	39.000	0.795	0.011	Y	NA
581443	581442	Daro_3897	Daro_3898			TRUE	0.995	5.000	0.392	1.000	Y	NA
581442	581441	Daro_3898	Daro_3899			TRUE	0.995	15.000	0.152	0.034	Y	NA
581440	581439	Daro_3900	Daro_3901	thiD	thiE	TRUE	0.998	-13.000	0.209	0.002	Y	NA
581439	581438	Daro_3901	Daro_3902	thiE	hemL	TRUE	0.997	-3.000	0.173	1.000	Y	NA
581438	581437	Daro_3902	Daro_3903	hemL	emrE	TRUE	0.928	-3.000	0.000	1.000	N	NA
581437	581436	Daro_3903	Daro_3904	emrE	Permease, unknown substrate	TRUE	0.700	62.000	0.000	0.049	Y	NA
581435	581434	Daro_3905	Daro_3906		mtgA	FALSE	0.246	93.000	0.019	1.000		NA
581434	581433	Daro_3906	Daro_3907	mtgA	aroE	TRUE	0.989	-3.000	0.107	1.000		NA
581433	581432	Daro_3907	Daro_3908	aroE		TRUE	0.980	-3.000	0.054	1.000	N	NA
581432	3337842	Daro_3908	Daro_3909			TRUE	0.993	-3.000	0.225	1.000	N	NA
3337842	581430	Daro_3909	Daro_3910			TRUE	0.851	8.000	0.000	1.000		NA
581430	581429	Daro_3910	Daro_3911		uppP	TRUE	0.858	-15.000	0.000	1.000		NA
581429	3337843	Daro_3911	Daro_3912	uppP		TRUE	0.649	34.000	0.027	NA		NA
3337843	3337844	Daro_3912	Daro_3913			TRUE	0.823	11.000	0.000	NA		NA
3337844	581428	Daro_3913	Daro_3914			FALSE	0.077	120.000	0.000	NA		NA
581426	581425	Daro_3916	Daro_3917			TRUE	0.998	-3.000	0.459	NA	Y	NA
581425	581424	Daro_3917	Daro_3918			TRUE	0.627	137.000	0.929	1.000	N	NA
581424	581423	Daro_3918	Daro_3919			TRUE	0.998	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
581423	3337845	Daro_3919	Daro_3920			FALSE	0.198	141.000	0.000	NA	Y	NA
3337845	581421	Daro_3920	Daro_3921		thiC	FALSE	0.013	333.000	0.000	NA	N	NA
581420	581419	Daro_3922	Daro_3923			FALSE	0.230	54.000	0.000	1.000	N	NA
581419	581418	Daro_3923	Daro_3924		pcm	TRUE	0.455	61.000	0.047	1.000	N	NA
581418	581417	Daro_3924	Daro_3925	pcm		TRUE	0.989	0.000	0.200	1.000	N	NA
581417	581416	Daro_3925	Daro_3926		tolC	TRUE	0.976	8.000	0.165	1.000	N	NA
581415	581414	Daro_3927	Daro_3928	kdtA	rfaC	TRUE	0.987	0.000	0.028	1.000	Y	NA
581413	581412	Daro_3929	Daro_3930		rfbB	TRUE	0.463	32.000	0.000	NA		NA
581412	581411	Daro_3930	Daro_3931	rfbB	glmS	TRUE	0.959	10.000	0.000	1.000	Y	NA
581411	581410	Daro_3931	Daro_3932	glmS	apaH	TRUE	0.835	5.000	0.000	1.000		NA
581409	581408	Daro_3933	Daro_3934			FALSE	0.404	153.000	0.286	NA		NA
581408	581407	Daro_3934	Daro_3935			FALSE	0.111	96.000	0.000	NA		NA
581407	3337846	Daro_3935	Daro_3936			TRUE	0.919	7.000	0.029	NA		NA
3337846	581405	Daro_3936	Daro_3937		prmA	TRUE	0.943	-24.000	0.058	NA		NA
581405	581404	Daro_3937	Daro_3938	prmA	accC	TRUE	0.975	4.000	0.152	1.000	N	NA
581404	3337847	Daro_3938	Daro_3939	accC		TRUE	0.998	11.000	0.275	0.001	Y	NA
3337847	3337848	Daro_3939	Daro_3940			TRUE	0.968	20.000	0.254	1.000	N	NA
3337848	581402	Daro_3940	Daro_3941			FALSE	0.113	94.000	0.000	NA		NA
581400	581399	Daro_3943	Daro_3944			FALSE	0.127	165.000	0.000	0.033	N	NA
581399	581398	Daro_3944	Daro_3945		HoxN/HupN/NixA homolog	FALSE	0.353	41.000	0.000	1.000		NA
581398	581397	Daro_3945	Daro_3946	HoxN/HupN/NixA homolog	HupT homolog	FALSE	0.097	115.000	0.000	1.000		NA
581397	581396	Daro_3946	Daro_3947	HupT homolog		TRUE	0.947	-25.000	0.010	0.079	N	NA
581395	581394	Daro_3948	Daro_3949			TRUE	0.980	1.000	0.112	NA		NA
581394	581393	Daro_3949	Daro_3950			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA		NA
581393	581392	Daro_3950	Daro_3951			FALSE	0.028	213.000	0.000	NA		NA
581391	581390	Daro_3952	Daro_3953			TRUE	0.900	0.000	0.000	NA		NA
581389	581388	Daro_3954	Daro_3955			FALSE	0.014	447.000	0.000	1.000		NA
581388	584289	Daro_3955	Daro_3956			FALSE	0.021	254.000	0.000	NA		NA
3337849	3337850	Daro_3957	Daro_3958			FALSE	0.011	454.000	0.000	NA		NA
581386	581385	Daro_3960	Daro_3961	hupV homolog	hupU homolog	TRUE	0.997	-3.000	0.222	1.000	Y	NA
581385	581384	Daro_3961	Daro_3962	hupU homolog	hoxA homolog	TRUE	0.990	-3.000	0.140	1.000	N	NA
581384	581383	Daro_3962	Daro_3963	hoxA homolog	hoxX homolog	TRUE	0.990	-3.000	0.132	1.000	N	NA
3337851	581381	Daro_3965	Daro_3966	HypE	hypD	TRUE	0.829	53.000	0.085	1.000	Y	NA
581381	581380	Daro_3966	Daro_3967	hypD	hypC	TRUE	0.998	0.000	0.917	NA	Y	NA
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