MicrobesOnline Operon Predictions for Agrobacterium tumefaciens C58

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 126017 126018 Atu0001 Atu0002   maf TRUE 0.710 32.000 0.135 NA   NA
 126018 126019 Atu0002 Atu0003 maf aroE TRUE 0.995 -7.000 0.169 NA N NA
 126019 126020 Atu0003 Atu0004 aroE coaE TRUE 0.972 0.000 0.078 1.000 N NA
 126020 126021 Atu0004 Atu0005 coaE dnaQ TRUE 0.771 21.000 0.092 1.000 N NA
 126022 126023 Atu0006 Atu0007 secB fxsA FALSE 0.465 104.000 0.122 NA   NA
 126024 126025 Atu0008 Atu0009   mltA TRUE 0.996 -3.000 0.324 1.000   NA
 126025 126026 Atu0009 Atu0010 mltA   TRUE 0.995 -3.000 0.332 NA   NA
 126026 126027 Atu0010 Atu0011     TRUE 0.991 -3.000 0.183 NA   NA
 126027 126028 Atu0011 Atu0012   gyrB FALSE 0.156 159.000 0.008 1.000 N NA
 126030 126031 Atu0014 Atu0015 hpcE depA FALSE 0.053 162.000 0.000 1.000 N NA
 126031 126032 Atu0015 Atu0016 depA   FALSE 0.405 70.000 0.014 1.000   NA
 126032 126033 Atu0016 Atu0017   trpF FALSE 0.316 103.000 0.017 1.000   NA
 126033 126034 Atu0017 Atu0018 trpF trpB TRUE 0.997 2.000 0.375 0.001 Y NA
 126034 126035 Atu0018 Atu0019 trpB trpA TRUE 0.995 5.000 0.344 0.001 Y NA
 126035 126036 Atu0019 Atu0020 trpA accD TRUE 0.834 28.000 0.232 1.000 N NA
 126036 126037 Atu0020 Atu0021 accD folC TRUE 0.677 123.000 0.383 1.000 N NA
 126038 126039 Atu0022 Atu0023 trxA uvrD TRUE 0.622 78.000 0.173 1.000   NA
 126039 126040 Atu0023 Atu0024 uvrD   TRUE 1.000 -10.000 0.863 0.052 Y NA
 126040 126041 Atu0024 Atu0025     TRUE 0.993 -3.000 0.196 1.000 N NA
 126041 126042 Atu0025 Atu0026     TRUE 0.962 15.000 0.642 NA   NA
 126042 126043 Atu0026 Atu0027     TRUE 0.987 -3.000 0.085 NA   NA
 126043 3819864 Atu0027 Atu0028     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 3819864 126044 Atu0028 Atu0029   ahcY FALSE 0.121 45.000 0.000 NA   NA
 126044 126045 Atu0029 Atu0030 ahcY ptsH FALSE 0.236 129.000 0.012 1.000 N NA
 126045 126046 Atu0030 Atu0031 ptsH   TRUE 0.990 12.000 0.420 0.001 Y NA
 126046 126047 Atu0031 Atu0032     FALSE 0.418 126.000 0.145 1.000   NA
 126047 126048 Atu0032 Atu0033   chvG TRUE 0.998 -10.000 0.304 0.014   NA
 126048 126049 Atu0033 Atu0034 chvG chvI TRUE 0.980 56.000 0.829 1.000 Y NA
 126050 126051 Atu0035 Atu0036 pckA   FALSE 0.248 128.000 0.025 1.000   NA
 126052 126053 Atu0037 Atu0038 panK hisE TRUE 0.720 30.000 0.086 1.000 N NA
 126053 126054 Atu0038 Atu0039 hisE hisF TRUE 0.960 16.000 0.105 0.003 Y NA
 126054 126055 Atu0039 Atu0040 hisF hisA TRUE 0.999 -3.000 0.433 0.003 Y NA
 126055 126056 Atu0040 Atu0041 hisA hisH TRUE 0.992 2.000 0.070 0.003 Y NA
 126056 126057 Atu0041 Atu8115 hisH   TRUE 0.987 2.000 0.417 NA   NA
 126057 126058 Atu8115 Atu0043   hisB TRUE 0.633 23.000 0.041 NA   NA
 126059 126060 Atu0044 Atu0045 hslV hslU TRUE 0.965 88.000 0.752 1.000 Y NA
 126060 126061 Atu0045 Atu0046 hslU   FALSE 0.092 195.000 0.021 NA   NA
 126061 126062 Atu0046 Atu0047   glcB FALSE 0.109 55.000 0.000 NA   NA
 126065 126066 Atu0050 Atu0051 actR actS TRUE 0.951 74.000 0.560 1.000 Y NA
 126066 126067 Atu0051 Atu0052 actS hrpB TRUE 0.650 30.000 0.042 1.000 N NA
 3819865 3819866 Atu0053 Atu0054     FALSE 0.003 328.000 0.000 NA   NA
 3819866 3819867 Atu0054 Atu0055     FALSE 0.103 59.000 0.000 NA   NA
 3819869 3819870 Atu0057 Atu0058     FALSE 0.006 260.000 0.000 NA   NA
 3819870 3819871 Atu0058 Atu0059     FALSE 0.049 115.000 0.000 NA   NA
 3819871 3819872 Atu0059 Atu0060     FALSE 0.008 239.000 0.000 NA   NA
 3819872 126072 Atu0060 Atu0061   recQ FALSE 0.027 156.000 0.000 NA   NA
 126074 126075 Atu0063 Atu0064 frcB frcC TRUE 0.731 225.000 0.676 NA Y NA
 126075 126076 Atu0064 Atu0065 frcC frcA TRUE 0.997 0.000 0.797 NA   NA
 126076 126077 Atu0065 Atu0066 frcA   TRUE 0.978 -3.000 0.016 1.000   NA
 126077 126078 Atu0066 Atu0068   nrdH FALSE 0.003 665.000 0.000 1.000 N NA
 126078 126079 Atu0068 Atu0069 nrdH nrdI TRUE 0.944 14.000 0.440 NA N NA
 126079 126080 Atu0069 Atu0070 nrdI nrdE TRUE 0.776 93.000 0.081 NA Y NA
 126080 126081 Atu0070 Atu0071 nrdE nrdF TRUE 0.956 17.000 0.071 0.001 Y NA
 126083 126084 Atu0073 Atu0074   moeB TRUE 0.633 23.000 0.019 1.000 N NA
 126084 126085 Atu0074 Atu0075 moeB   TRUE 0.960 4.000 0.196 1.000   NA
 126086 126087 Atu0076 Atu0077     FALSE 0.117 49.000 0.000 NA   NA
 126093 126094 Atu0081 Atu0082 rsmC pnpA TRUE 0.565 136.000 0.021 1.000 Y NA
 126094 126095 Atu0082 Atu0084 pnpA rpsO FALSE 0.399 266.000 0.335 1.000 Y NA
 126095 126096 Atu0084 Atu0085 rpsO truB TRUE 0.641 166.000 0.211 1.000 Y NA
 126096 126097 Atu0085 Atu0086 truB rbfA TRUE 0.992 4.000 0.318 1.000 Y NA
 126097 126098 Atu0086 Atu0087 rbfA infB TRUE 0.947 76.000 0.530 1.000 Y NA
 126098 126099 Atu0087 Atu0088 infB   TRUE 0.604 103.000 0.223 NA N NA
 126099 126100 Atu0088 Atu0089   nusA TRUE 0.996 -3.000 0.075 NA Y NA
 126100 126101 Atu0089 Atu0090 nusA   TRUE 0.924 64.000 0.759 NA   NA
 126103 126104 Atu0092 Atu0093 mltB recR TRUE 0.552 35.000 0.014 1.000 N NA
 126106 126107 Atu0095 Atu0096     TRUE 0.904 25.000 0.411 1.000   NA
 126108 126109 Atu0097 Atu0098     TRUE 0.975 0.000 0.108 1.000 N NA
 126110 126111 Atu0099 Atu0100 pheA kdsB TRUE 0.862 12.000 0.083 1.000 N NA
 126113 126114 Atu0102 Atu0103   pbpC FALSE 0.068 289.000 0.000 NA Y NA
 126114 126115 Atu0103 Atu0104 pbpC   FALSE 0.048 117.000 0.000 NA   NA
 126115 3819873 Atu0104 Atu0105     FALSE 0.370 10.000 0.000 NA   NA
 126116 126117 Atu0106 Atu0107 cspA   FALSE 0.152 30.000 0.000 NA   NA
 126119 126120 Atu0108 Atu0109     FALSE 0.315 165.000 0.160 1.000 N NA
 126120 126121 Atu0109 Atu8081     FALSE 0.005 278.000 0.000 NA   NA
 126122 126123 Atu0110 Atu0111 polA   FALSE 0.128 77.000 0.000 1.000   NA
 126123 126124 Atu0111 Atu0112   rpmF FALSE 0.026 194.000 0.000 1.000   NA
 126124 126125 Atu0112 Atu0113 rpmF   FALSE 0.094 121.000 0.000 1.000 N NA
 126125 126126 Atu0113 Atu0114   dctD TRUE 0.999 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 126126 3819874 Atu0114 Atu0115 dctD   TRUE 0.713 0.000 0.000 NA   NA
 3819874 126127 Atu0115 Atu0116     FALSE 0.001 570.000 0.000 NA   NA
 126127 126128 Atu0116 Atu0117     TRUE 0.547 100.000 0.182 NA   NA
 126128 126129 Atu0117 Atu0118     TRUE 0.977 10.000 0.600 NA   NA
 126129 126130 Atu0118 Atu0119     FALSE 0.031 147.000 0.000 NA   NA
 126130 126131 Atu0119 Atu0120     FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 126132 126133 Atu0121 Atu0122 dnaJ dnaK TRUE 0.911 91.000 0.236 0.003 Y NA
 126133 3819875 Atu0122 Atu0123 dnaK   FALSE 0.004 307.000 0.000 NA   NA
 126135 126136 Atu0124 Atu0125   msrA FALSE 0.393 73.000 0.026 NA   NA
 126136 126138 Atu0125 Atu0126 msrA   FALSE 0.019 214.000 0.000 1.000   NA
 126138 126139 Atu0126 Atu0127     TRUE 0.865 83.000 0.586 1.000   NA
 126139 126140 Atu0127 Atu0128     TRUE 0.927 8.000 0.184 NA   NA
 126140 126141 Atu0128 Atu0129     TRUE 0.988 7.000 0.720 NA   NA
 126141 126142 Atu0129 Atu0130   cdd TRUE 0.905 5.000 0.060 NA   NA
 126142 126143 Atu0130 Atu0131 cdd deoD TRUE 0.995 0.000 0.242 1.000 Y NA
 126143 126144 Atu0131 Atu0132 deoD deoC TRUE 0.986 3.000 0.083 1.000 Y NA
 126144 126145 Atu0132 Atu0133 deoC deoA TRUE 0.998 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 126146 126147 Atu0134 Atu0135   upp FALSE 0.246 120.000 0.014 1.000   NA
 126147 126148 Atu0135 Atu0136 upp add TRUE 0.731 96.000 0.030 1.000 Y NA
 126148 126149 Atu0136 Atu0137 add drm TRUE 0.989 -3.000 0.086 1.000 N NA
 126149 126150 Atu0137 Atu0138 drm surf FALSE 0.048 116.000 0.000 NA   NA
 126150 126151 Atu0138 Atu0139 surf cyoD TRUE 0.890 110.000 0.849 NA   NA
 126151 126152 Atu0139 Atu0140 cyoD cyoC TRUE 0.999 0.000 0.906 0.056 Y NA
 126152 126153 Atu0140 Atu0141 cyoC cyoB TRUE 0.998 7.000 0.847 0.056 Y NA
 126153 126154 Atu0141 Atu0142 cyoB cyoA TRUE 0.985 77.000 0.915 0.011 Y NA
 126155 3819876 Atu0143 Atu0144     FALSE 0.095 66.000 0.000 NA   NA
 3819876 126156 Atu0144 Atu0145   gltB FALSE 0.005 275.000 0.000 NA   NA
 126156 126157 Atu0145 Atu0146 gltB cysJ TRUE 0.984 -3.000 0.037 1.000 N NA
 126158 126159 Atu0147 Atu0148     TRUE 0.971 84.000 0.857 NA Y NA
 126159 126160 Atu0148 Atu0149   fabI FALSE 0.027 185.000 0.000 NA N NA
 126160 126161 Atu0149 Atu0150 fabI fabB TRUE 0.986 7.000 0.265 1.000 Y NA
 126161 126163 Atu0150 Atu0151 fabB fabA TRUE 0.934 76.000 0.451 1.000 Y NA
 126164 126165 Atu0152 Atu0153   irr TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 126169 126170 Atu0157 Atu0158     TRUE 0.864 139.000 0.514 NA Y NA
 126170 126171 Atu0158 Atu0159     TRUE 0.998 0.000 0.657 NA Y NA
 126171 126172 Atu0159 Atu0160   hutC FALSE 0.264 35.000 0.000 1.000 N NA
 126172 126173 Atu0160 Atu0161 hutC exbB FALSE 0.012 266.000 0.000 1.000 N NA
 126173 126174 Atu0161 Atu0162 exbB exbD TRUE 0.996 7.000 0.810 NA Y NA
 126174 126175 Atu0162 Atu0163 exbD tonB TRUE 0.982 -3.000 0.036 NA N NA
 126175 126176 Atu0163 Atu0164 tonB   FALSE 0.069 143.000 0.000 1.000 N NA
 3819877 3819878 Atu0165 Atu0166     FALSE 0.035 138.000 0.000 NA   NA
 3819878 126177 Atu0166 Atu0167     FALSE 0.088 72.000 0.000 NA   NA
 126177 126178 Atu0167 Atu0168   gmk FALSE 0.152 88.000 0.000 1.000 N NA
 126178 126179 Atu0168 Atu0169 gmk phnM TRUE 0.899 45.000 0.173 1.000 Y NA
 126179 126180 Atu0169 Atu0170 phnM   TRUE 0.993 -3.000 0.205 1.000   NA
 126180 126182 Atu0170 Atu0171   phnE FALSE 0.055 284.000 0.075 1.000   NA
 126182 126183 Atu0171 Atu0172 phnE phnE TRUE 0.999 0.000 0.491 0.001 Y NA
 126183 126184 Atu0172 Atu0173 phnE phnD TRUE 0.971 71.000 0.568 0.001 Y NA
 126184 126185 Atu0173 Atu0174 phnD phnC TRUE 0.966 86.000 0.589 0.002 Y NA
 126185 126186 Atu0174 Atu0175 phnC   FALSE 0.183 217.000 0.189 1.000   NA
 126186 126187 Atu0175 Atu0176   phnL TRUE 0.989 -3.000 0.104 1.000   NA
 126187 126188 Atu0176 Atu0177 phnL phnK TRUE 0.984 68.000 0.859 0.039 Y NA
 126188 126189 Atu0177 Atu0178 phnK phnJ TRUE 1.000 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 126189 126190 Atu0178 Atu0179 phnJ phnI TRUE 0.947 134.000 0.880 1.000 Y NA
 126190 126191 Atu0179 Atu0180 phnI phnH TRUE 0.999 2.000 0.960 0.002 Y NA
 126191 126192 Atu0180 Atu0181 phnH phnG TRUE 1.000 -3.000 0.967 0.002 Y NA
 126194 126195 Atu0183 Atu0184 dapB glk FALSE 0.184 142.000 0.002 1.000 N NA
 126195 126196 Atu0184 Atu0185 glk mgsA TRUE 0.875 28.000 0.035 1.000 Y NA
 126196 126197 Atu0185 Atu0186 mgsA mepA FALSE 0.401 100.000 0.035 1.000 N NA
 126198 126199 Atu0187 Atu0188     FALSE 0.390 142.000 0.197 NA   NA
 126199 126200 Atu0188 Atu0189     TRUE 0.997 0.000 0.882 NA   NA
 126200 126201 Atu0189 Atu0190     TRUE 0.989 6.000 0.744 NA   NA
 126201 3819879 Atu0190 Atu0192   dadA FALSE 0.065 100.000 0.000 NA   NA
 3819879 126203 Atu0192 Atu0193 dadA glnA FALSE 0.018 185.000 0.000 NA   NA
 126203 126204 Atu0193 Atu0194 glnA ordL TRUE 0.996 -25.000 0.000 1.000 Y NA
 126205 126206 Atu0195 Atu0196 gntK   FALSE 0.086 106.000 0.000 NA N NA
 126206 126207 Atu0196 Atu0197     TRUE 0.999 -3.000 0.542 NA Y NA
 126207 126208 Atu0197 Atu0198     TRUE 0.999 -3.000 0.489 NA Y NA
 126208 126209 Atu0198 Atu0199     TRUE 0.802 105.000 0.521 NA N NA
 126209 126210 Atu0199 Atu0200     FALSE 0.029 151.000 0.000 NA   NA
 126210 126211 Atu0200 Atu0201   aau3 FALSE 0.022 169.000 0.000 NA   NA
 126213 126214 Atu0203 Atu0204     TRUE 0.733 143.000 0.637 NA   NA
 126214 126215 Atu0204 Atu0205   mmsA FALSE 0.059 224.000 0.018 NA   NA
 3819880 126216 Atu0206 Atu0207     TRUE 0.991 -3.000 0.167 1.000   NA
 126216 126217 Atu0207 Atu0208     FALSE 0.013 207.000 0.000 NA   NA
 126217 126218 Atu0208 Atu0209     FALSE 0.004 291.000 0.000 NA   NA
 126218 126219 Atu0209 Atu0210     FALSE 0.004 365.000 0.000 1.000   NA
 126219 126220 Atu0210 Atu0211     TRUE 0.804 19.000 0.150 NA N NA
 126220 126221 Atu0211 Atu0212     FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 126221 126222 Atu0212 Atu0213   pncB FALSE 0.017 192.000 0.000 NA   NA
 126225 126226 Atu0216 Atu0217 ctpI ctpH TRUE 0.998 10.000 0.941 0.009 Y NA
 126226 126227 Atu0217 Atu0218 ctpH ctpG TRUE 0.993 15.000 0.882 1.000 Y NA
 126227 126228 Atu0218 Atu0219 ctpG ctpF TRUE 0.983 34.000 0.765 1.000 Y NA
 126228 126229 Atu0219 Atu0220 ctpF ctpE TRUE 0.900 35.000 0.467 NA N NA
 126229 126230 Atu0220 Atu0221 ctpE ctpD FALSE 0.263 168.000 0.133 NA N NA
 126230 126231 Atu0221 Atu0222 ctpD ctpC TRUE 0.998 -3.000 0.222 NA Y NA
 126231 126232 Atu0222 Atu0223 ctpC ctpB TRUE 0.895 134.000 0.611 NA Y NA
 126232 126233 Atu0223 Atu0224 ctpB ctpA TRUE 0.524 102.000 0.000 NA Y NA
 126233 3819881 Atu0224 Atu0225 ctpA   FALSE 0.089 71.000 0.000 NA   NA
 3819882 126236 Atu0227 Atu0228     FALSE 0.046 120.000 0.000 NA   NA
 126238 126239 Atu0231 Atu0232 guaA   FALSE 0.075 88.000 0.000 NA   NA
 126239 126240 Atu0232 Atu0233     FALSE 0.018 183.000 0.000 NA   NA
 126242 126243 Atu0235 Atu0236     FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 126248 126249 Atu0241 Atu0242 lepA   FALSE 0.135 73.000 0.000 1.000   NA
 126249 126250 Atu0242 Atu0243     TRUE 0.997 -3.000 0.437 1.000   NA
 126251 126252 Atu8117 Atu0245     FALSE 0.068 97.000 0.000 NA   NA
 126252 126253 Atu0245 Atu0246     TRUE 0.850 18.000 0.205 1.000   NA
 126256 126257 Atu0249 Atu0250     FALSE 0.065 128.000 0.000 1.000   NA
 126259 126260 Atu0252 Atu0253     FALSE 0.059 219.000 0.014 NA   NA
 126261 126262 Atu0254 Atu0255 infC rpmI TRUE 0.819 190.000 0.652 1.000 Y NA
 126262 126263 Atu0255 Atu0256 rpmI rplT TRUE 0.991 41.000 0.928 0.012 Y NA
 126263 126264 Atu0256 Atu0257 rplT   FALSE 0.108 165.000 0.004 NA   NA
 126264 126265 Atu0257 Atu0258   pheS TRUE 0.491 26.000 0.004 NA   NA
 126265 126266 Atu0258 Atu0259 pheS pheT TRUE 0.986 25.000 0.574 0.001 Y NA
 126269 126270 Atu0262 Atu0263     TRUE 0.953 2.000 0.065 1.000   NA
 126270 126271 Atu0263 Atu0264     FALSE 0.325 109.000 0.019 1.000 N NA
 126271 126272 Atu0264 Atu0265     TRUE 0.995 0.000 0.596 1.000 N NA
 126274 126275 Atu0267 Atu0268     FALSE 0.307 12.000 0.000 NA   NA
 126277 126278 Atu0270 Atu0271     TRUE 0.774 51.000 0.231 1.000 N NA
 126278 126279 Atu0271 Atu0272   pecS TRUE 0.615 111.000 0.000 0.067 Y NA
 126281 126282 Atu0274 Atu0275 ampS   FALSE 0.295 89.000 0.006 NA   NA
 126282 126283 Atu0275 Atu0276     TRUE 0.701 13.000 0.018 NA   NA
 126285 126286 Atu0279 Atu0280     FALSE 0.370 142.000 0.176 NA   NA
 126287 126288 Atu0281 Atu0282 guaA pfs TRUE 0.728 84.000 0.012 1.000 Y NA
 126288 126289 Atu0282 Atu0283 pfs   TRUE 0.984 -3.000 0.048 NA N NA
 126289 126290 Atu0283 Atu0284   tspO TRUE 0.527 79.000 0.083 NA N NA
 126290 126291 Atu0284 Atu0285 tspO   FALSE 0.451 51.000 0.020 NA   NA
 126291 126292 Atu0285 Atu0286     TRUE 0.989 4.000 0.620 NA   NA
 126292 126293 Atu0286 Atu0287     TRUE 0.996 0.000 0.713 NA   NA
 126293 126294 Atu0287 Atu0288     TRUE 0.877 42.000 0.436 NA N NA
 126294 126295 Atu0288 Atu0289   sun FALSE 0.180 156.000 0.029 NA N NA
 126295 126296 Atu0289 Atu0290 sun   FALSE 0.414 62.000 0.020 NA   NA
 126296 126297 Atu0290 Atu0291     FALSE 0.002 427.000 0.000 NA   NA
 126297 126298 Atu0291 Atu0292     TRUE 0.932 4.000 0.055 1.000 N NA
 126298 126299 Atu0292 Atu0293     FALSE 0.086 301.000 0.213 1.000 N NA
 126300 3819885 Atu0294 Atu0295 bacA   FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 126302 126303 Atu0296 Atu0297     FALSE 0.250 122.000 0.028 NA   NA
 126303 126304 Atu0297 Atu0298   pyrF TRUE 0.658 21.000 0.044 NA   NA
 126304 126305 Atu0298 Atu0299 pyrF   TRUE 0.873 5.000 0.018 NA N NA
 126305 126306 Atu0299 Atu0300     TRUE 0.661 97.000 0.256 NA N NA
 126306 126307 Atu0300 Atu0301   dnaN FALSE 0.096 194.000 0.002 1.000 N NA
 126308 126309 Atu0302 Atu0303     TRUE 0.995 -10.000 0.165 1.000   NA
 126309 126310 Atu0303 Atu0304   nodL FALSE 0.309 17.000 0.000 1.000   NA
 126310 126311 Atu0304 Atu0305 nodL ugpA FALSE 0.056 109.000 0.000 NA   NA
 126311 126313 Atu0305 Atu0306 ugpA ugpA TRUE 0.876 171.000 0.760 NA Y NA
 126313 126314 Atu0306 Atu0307 ugpA ugpE TRUE 0.994 12.000 0.840 NA Y NA
 126314 126315 Atu0307 Atu0308 ugpE ugpC TRUE 0.967 11.000 0.160 NA Y NA
 126315 126316 Atu0308 Atu0309 ugpC   FALSE 0.259 110.000 0.016 NA   NA
 126316 126317 Atu0309 Atu0310   gshB FALSE 0.043 243.000 0.015 NA   NA
 126317 126318 Atu0310 Atu0311 gshB   FALSE 0.160 184.000 0.041 1.000 N NA
 126319 126320 Atu0312 Atu0313 cysK   TRUE 0.663 141.000 0.132 1.000 Y NA
 126320 126321 Atu0313 Atu0314   dut FALSE 0.163 78.000 0.000 1.000 N NA
 126322 126323 Atu0315 Atu0316 prfC dfp FALSE 0.396 70.000 0.002 1.000 N NA
 126323 126324 Atu0316 Atu0317 dfp   TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 126325 126326 Atu0318 Atu0319   aarF FALSE 0.002 472.000 0.000 NA   NA
 126326 126327 Atu0319 Atu0320 aarF ubiE TRUE 0.699 37.000 0.115 1.000   NA
 126328 126329 Atu0321 Atu0322 mutM fadB TRUE 0.530 35.000 0.006 1.000 N NA
 126329 126330 Atu0322 Atu0323 fadB rpsT FALSE 0.094 196.000 0.004 1.000 N NA
 126330 126332 Atu0323 Atu0324 rpsT dnaA FALSE 0.003 770.000 0.000 1.000 N NA
 126333 126334 Atu0325 Atu0326 hemN ham1 TRUE 0.955 6.000 0.218 1.000 N NA
 126334 126335 Atu0326 Atu0327 ham1 rph TRUE 0.886 18.000 0.262 1.000 N NA
 126336 126337 Atu0328 Atu0329 hrcA grpE FALSE 0.435 115.000 0.120 NA N NA
 126338 126339 Atu0330 Atu0331 ptsN   TRUE 0.766 83.000 0.353 NA N NA
 126339 126340 Atu0331 Atu0332   rpoN FALSE 0.013 234.000 0.000 NA N NA
 126340 126341 Atu0332 Atu0333 rpoN   FALSE 0.045 153.000 0.000 1.000   NA
 126341 126342 Atu0333 Atu0334     TRUE 0.974 10.000 0.543 NA   NA
 126342 126343 Atu0334 Atu0335     TRUE 0.832 14.000 0.144 NA   NA
 126344 126345 Atu0337 Atu0338 sppA ihfB TRUE 0.770 27.000 0.142 1.000 N NA
 126345 126346 Atu0338 Atu0339 ihfB   TRUE 0.597 52.000 0.085 NA   NA
 126346 126347 Atu0339 Atu0340     FALSE 0.027 298.000 0.027 NA   NA
 126347 126348 Atu0340 Atu0341   trmH TRUE 0.992 -3.000 0.213 NA   NA
 126348 126349 Atu0341 Atu0342 trmH lspA TRUE 0.975 0.000 0.104 1.000 N NA
 126349 126351 Atu0342 Atu0343 lspA barA TRUE 0.597 56.000 0.062 1.000 N NA
 126351 126352 Atu0343 Atu0344 barA   TRUE 0.513 95.000 0.130 NA   NA
 126352 126353 Atu0344 Atu0345   mutS FALSE 0.078 191.000 0.003 NA   NA
 126353 126354 Atu0345 Atu0346 mutS glnD FALSE 0.378 97.000 0.021 1.000 N NA
 126354 126355 Atu0346 Atu0347 glnD mviN TRUE 0.901 8.000 0.081 1.000   NA
 126355 126356 Atu0347 Atu0348 mviN   TRUE 0.930 0.000 0.008 NA   NA
 126356 126357 Atu0348 Atu0349   trpS FALSE 0.278 104.000 0.016 NA   NA
 126357 126358 Atu0349 Atu8118 trpS   FALSE 0.327 115.000 0.042 1.000   NA
 126358 126359 Atu8118 Atu0351     FALSE 0.362 143.000 0.151 1.000   NA
 126359 126360 Atu0351 Atu0352     TRUE 0.923 17.000 0.061 1.000 Y NA
 126360 126361 Atu0352 Atu0353     TRUE 0.756 44.000 0.209 1.000   NA
 126361 126362 Atu0353 Atu0354   fur TRUE 0.528 70.000 0.061 1.000   NA
 126362 126363 Atu0354 Atu0355 fur plsC TRUE 0.720 31.000 0.091 1.000 N NA
 126363 126364 Atu0355 Atu0356 plsC miaB FALSE 0.142 187.000 0.030 1.000 N NA
 126364 126365 Atu0356 Atu0357 miaB phoH TRUE 0.786 41.000 0.220 1.000 N NA
 126365 126366 Atu0357 Atu0358 phoH   TRUE 0.963 11.000 0.457 NA   NA
 126366 126367 Atu0358 Atu0359     TRUE 0.860 16.000 0.222 NA   NA
 126367 126368 Atu0359 Atu0360   lnt FALSE 0.219 207.000 0.213 NA   NA
 126368 126369 Atu0360 Atu0361 lnt   TRUE 0.509 134.000 0.231 1.000 N NA
 126369 126370 Atu0361 Atu0362   metK FALSE 0.224 187.000 0.113 1.000 N NA
 126370 126371 Atu0362 Atu0363 metK   FALSE 0.242 172.000 0.112 1.000   NA
 126372 126373 Atu0364 Atu0365 rbsK   FALSE 0.447 55.000 0.024 NA   NA
 126374 126375 Atu0366 Atu0367 def fmt TRUE 0.896 45.000 0.050 0.019 Y NA
 126375 126376 Atu0367 Atu0368 fmt truA TRUE 0.991 0.000 0.069 1.000 Y NA
 126377 126378 Atu0369 Atu0370   dapE TRUE 0.991 -16.000 0.050 NA   NA
 126378 126379 Atu0370 Atu0371 dapE dapD TRUE 0.965 15.000 0.109 0.001 Y NA
 126380 126381 Atu0372 Atu0373     FALSE 0.023 167.000 0.000 NA   NA
 126383 126384 Atu0375 Atu0376 hspC   TRUE 0.953 57.000 0.955 NA   NA
 126385 126386 Atu0377 Atu0378     FALSE 0.098 102.000 0.000 1.000   NA
 126388 3819886 Atu0380 Atu0381 argB   FALSE 0.118 48.000 0.000 NA   NA
 126390 126391 Atu0383 Atu0384 cgpA yidC TRUE 0.992 -3.000 0.082 0.065   NA
 126391 126392 Atu0384 Atu0385 yidC rnpA TRUE 0.975 0.000 0.105 1.000 N NA
 126392 3819887 Atu0385 Atu8066 rnpA rpmH TRUE 0.952 37.000 0.787 1.000   NA
 3819887 3819888 Atu8066 Atu0386 rpmH   FALSE 0.127 42.000 0.000 NA   NA
 126393 126394 Atu0387 Atu0388 mcpA   TRUE 0.501 195.000 0.047 0.008 Y NA
 126394 126395 Atu0388 Atu8009     FALSE 0.081 79.000 0.000 NA   NA
 126395 3819889 Atu8009 Atu0389     FALSE 0.133 38.000 0.000 NA   NA
 3819889 126396 Atu0389 Atu0390   ubiE FALSE 0.019 181.000 0.000 NA   NA
 126396 126397 Atu0390 Atu0391 ubiE   FALSE 0.007 332.000 0.000 1.000 N NA
 126397 126398 Atu0391 Atu0392     TRUE 0.998 -3.000 0.190 NA Y NA
 126398 126399 Atu0392 Atu0393     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA Y NA
 126399 126400 Atu0393 Atu0394     TRUE 0.987 43.000 1.000 NA Y NA
 126400 126401 Atu0394 Atu0395     TRUE 0.620 65.000 0.154 NA   NA
 126401 126402 Atu0395 Atu0396     FALSE 0.006 298.000 0.000 1.000   NA
 126402 126403 Atu0396 Atu0397     FALSE 0.149 170.000 0.038 NA   NA
 126403 126404 Atu0397 Atu0398     FALSE 0.404 129.000 0.167 NA   NA
 126404 126405 Atu0398 Atu0399   pyrC FALSE 0.077 113.000 0.000 NA N NA
 126405 126406 Atu0399 Atu0400 pyrC pyrE TRUE 0.579 152.000 0.072 1.000 Y NA
 126406 126407 Atu0400 Atu0401 pyrE scrK FALSE 0.410 100.000 0.039 1.000 N NA
 126407 126408 Atu0401 Atu0402 scrK   FALSE 0.064 125.000 0.000 NA N NA
 126408 126409 Atu0402 Atu0403     TRUE 0.997 -3.000 0.421 NA   NA
 126410 126411 Atu0404 Atu0405 pgi fadD FALSE 0.081 131.000 0.000 1.000 N NA
 126412 126413 Atu0406 Atu0407 fbpA1 fbpA FALSE 0.268 154.000 0.087 NA N NA
 126413 126414 Atu0407 Atu0408 fbpA fbpA3 TRUE 0.822 73.000 0.104 NA Y NA
 126414 126415 Atu0408 Atu0409 fbpA3   FALSE 0.246 180.000 0.000 NA Y NA
 126415 126416 Atu0409 Atu0410     FALSE 0.085 128.000 0.000 1.000 N NA
 126416 126417 Atu0410 Atu8119     FALSE 0.049 115.000 0.000 NA   NA
 126418 126420 Atu8120 Atu0413     FALSE 0.003 318.000 0.000 NA   NA
 126420 3819890 Atu0413 Atu0414     FALSE 0.026 157.000 0.000 NA   NA
 3819890 126421 Atu0414 Atu0415     FALSE 0.037 135.000 0.000 NA   NA
 126424 126425 Atu0419 Atu0420     FALSE 0.123 196.000 0.041 NA N NA
 126425 126426 Atu0420 Atu0421   pstC FALSE 0.177 289.000 0.107 NA Y NA
 126426 126427 Atu0421 Atu0422 pstC pstA TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.002 Y NA
 126427 126428 Atu0422 Atu0423 pstA pstB TRUE 0.985 15.000 0.402 0.002 Y NA
 126428 126429 Atu0423 Atu0424 pstB phoU TRUE 0.830 97.000 0.203 NA Y NA
 126429 126430 Atu0424 Atu0425 phoU phoB TRUE 0.719 33.000 0.128 NA N NA
 126430 3819891 Atu0425 Atu0426 phoB   FALSE 0.003 337.000 0.000 NA   NA
 3819891 126431 Atu0426 Atu0427     FALSE 0.102 60.000 0.000 NA   NA
 126431 126432 Atu0427 Atu0428   argD FALSE 0.149 31.000 0.000 NA   NA
 126432 126433 Atu0428 Atu0429 argD argF TRUE 0.836 57.000 0.058 1.000 Y NA
 126433 126434 Atu0429 Atu0430 argF hslO FALSE 0.088 237.000 0.052 1.000 N NA
 126435 126436 Atu0431 Atu0432 apaG   FALSE 0.091 235.000 0.066 NA N NA
 126437 3819892 Atu0434 Atu0435 dcd   FALSE 0.106 57.000 0.000 NA   NA
 3819892 126438 Atu0435 Atu0436     FALSE 0.008 243.000 0.000 NA   NA
 126438 126439 Atu0436 Atu0437     TRUE 0.995 0.000 0.643 NA   NA
 126440 126441 Atu0438 Atu8122 intD   FALSE 0.005 283.000 0.000 NA   NA
 126441 126445 Atu8122 Atu8123     FALSE 0.001 1050.000 0.000 NA   NA
 126445 126446 Atu8123 Atu8124     FALSE 0.024 165.000 0.000 NA   NA
 126446 126448 Atu8124 Atu0443     FALSE 0.002 499.000 0.000 NA N NA
 126449 126451 Atu0444 Atu0445     FALSE 0.013 210.000 0.000 NA   NA
 126451 126452 Atu0445 Atu0446     FALSE 0.002 488.000 0.000 NA   NA
 126452 126453 Atu0446 Atu8082     FALSE 0.025 159.000 0.000 NA   NA
 126453 126454 Atu8082 Atu0447     FALSE 0.106 57.000 0.000 NA   NA
 126454 126455 Atu0447 Atu0448     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 126455 126456 Atu0448 Atu0449     TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 126456 126457 Atu0449 Atu0450   nusG TRUE 0.735 110.000 0.444 NA   NA
 126457 126458 Atu0450 Atu8125 nusG   FALSE 0.007 245.000 0.000 NA   NA
 126458 126459 Atu8125 Atu8083     TRUE 0.739 83.000 0.333 NA   NA
 126462 126463 Atu0453 Atu0454     TRUE 0.713 0.000 0.000 NA   NA
 126463 126464 Atu0454 Atu8126     FALSE 0.013 209.000 0.000 NA   NA
 126464 126465 Atu8126 Atu8127     FALSE 0.276 13.000 0.000 NA   NA
 126465 126466 Atu8127 Atu0457     FALSE 0.051 114.000 0.000 NA   NA
 126468 3819894 Atu8128 Atu0460     TRUE 0.494 5.000 0.000 NA   NA
 3819894 126469 Atu0460 Atu0461     TRUE 0.589 3.000 0.000 NA   NA
 126469 126470 Atu0461 Atu0462     FALSE 0.123 44.000 0.000 NA   NA
 3819896 3819897 Atu0465 Atu0466     TRUE 0.589 3.000 0.000 NA   NA
 3819897 3819898 Atu0466 Atu0467     FALSE 0.040 129.000 0.000 NA   NA
 126472 3819899 Atu0468 Atu0469     FALSE 0.079 82.000 0.000 NA   NA
 3819899 3819900 Atu0469 Atu0470     FALSE 0.029 150.000 0.000 NA   NA
 126477 126478 Atu0474 Atu0475     TRUE 0.997 -3.000 0.511 NA   NA
 126478 126479 Atu0475 Atu0476   aqpZ FALSE 0.005 269.000 0.000 NA   NA
 126479 126480 Atu0476 Atu0477 aqpZ   FALSE 0.257 23.000 0.000 1.000   NA
 126485 126486 Atu0481 Atu0482 exoQ   TRUE 0.861 27.000 0.286 1.000 N NA
 126487 126488 Atu0483 Atu0484 c1   TRUE 0.734 113.000 0.092 1.000 Y NA
 126489 126490 Atu0485 Atu0486   pyrD TRUE 0.970 0.000 0.108 NA   NA
 126491 126492 Atu8129 Atu0488     TRUE 0.979 2.000 0.275 NA   NA
 126493 126494 Atu0489 Atu0490     FALSE 0.375 136.000 0.162 NA   NA
 126494 126495 Atu0490 Atu0491     FALSE 0.078 83.000 0.000 NA   NA
 126496 126497 Atu0492 Atu0493     TRUE 0.605 108.000 0.262 NA   NA
 126498 126499 Atu0494 Atu0495 lhr   TRUE 0.898 35.000 0.460 1.000   NA
 126500 126501 Atu0496 Atu8130     FALSE 0.026 158.000 0.000 NA   NA
 126501 126502 Atu8130 Atu0498     TRUE 0.816 33.000 0.274 NA   NA
 126502 126503 Atu0498 Atu0499     FALSE 0.009 265.000 0.000 1.000   NA
 126504 126505 Atu0500 Atu0501   acd FALSE 0.023 166.000 0.000 NA   NA
 126505 126506 Atu0501 Atu0502 acd   TRUE 0.927 39.000 0.247 1.000 Y NA
 126506 126507 Atu0502 Atu0503   fadB TRUE 0.792 185.000 0.562 1.000 Y NA
 126507 126508 Atu0503 Atu0504 fadB   FALSE 0.026 157.000 0.000 NA   NA
 126508 126509 Atu0504 Atu8010     FALSE 0.127 42.000 0.000 NA   NA
 126509 3819901 Atu8010 Atu0505     FALSE 0.137 36.000 0.000 NA   NA
 3819901 126511 Atu0505 Atu0506     FALSE 0.026 157.000 0.000 NA   NA
 126512 126513 Atu0507 Atu0508 phaG phaF TRUE 1.000 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 126513 126514 Atu0508 Atu0509 phaF phaE TRUE 1.000 -3.000 0.937 0.064 Y NA
 126514 126515 Atu0509 Atu0510 phaE phaD TRUE 0.999 0.000 0.944 1.000 Y NA
 126515 126516 Atu0510 Atu0511 phaD phaC TRUE 0.999 0.000 0.976 0.006 Y NA
 126516 126517 Atu0511 Atu8131 phaC phaA TRUE 0.995 0.000 0.095 0.006 Y NA
 126517 126518 Atu8131 Atu0513 phaA   FALSE 0.058 106.000 0.000 NA   NA
 126519 126520 Atu0514 Atu0515     TRUE 0.981 0.000 0.217 NA   NA
 126520 126521 Atu0515 Atu0516   cheY TRUE 0.997 -3.000 0.525 NA   NA
 126521 126522 Atu0516 Atu0517 cheY cheA TRUE 0.965 77.000 0.711 1.000 Y NA
 126522 126523 Atu0517 Atu0518 cheA cheR TRUE 0.925 14.000 0.031 1.000 Y NA
 126523 126524 Atu0518 Atu0519 cheR cheB TRUE 0.999 -3.000 0.439 1.000 Y NA
 126524 126525 Atu0519 Atu0520 cheB cheY TRUE 0.993 0.000 0.030 0.018 Y NA
 126525 126526 Atu0520 Atu0521 cheY cheD TRUE 0.996 -3.000 0.040 1.000 Y NA
 126526 126527 Atu0521 Atu0522 cheD   TRUE 0.853 15.000 0.200 NA   NA
 126527 126528 Atu0522 Atu0523   fliF TRUE 0.480 109.000 0.158 NA   NA
 126528 126530 Atu0523 Atu0524 fliF luxR FALSE 0.004 422.000 0.000 1.000 N NA
 126530 126531 Atu0524 Atu0525 luxR agrR TRUE 0.999 0.000 0.667 0.028 Y NA
 126531 126532 Atu0525 Atu0526 agrR mclA FALSE 0.063 149.000 0.000 1.000 N NA
 126534 126535 Atu0528 Atu0529 mscL aspB FALSE 0.172 155.000 0.012 1.000 N NA
 126535 126536 Atu0529 Atu0530 aspB galE FALSE 0.042 331.000 0.080 1.000 N NA
 126537 3819902 Atu0531 Atu0532     TRUE 0.926 -16.000 0.000 NA   NA
 3819902 126538 Atu0532 Atu0533   maf-2 FALSE 0.087 73.000 0.000 NA   NA
 126538 126539 Atu0533 Atu0534 maf-2 infA TRUE 0.781 34.000 0.207 NA N NA
 126539 126540 Atu0534 Atu0535 infA   TRUE 0.783 64.000 0.293 1.000 N NA
 126540 126541 Atu0535 Atu0536     TRUE 0.994 3.000 0.768 NA   NA
 126541 126542 Atu0536 Atu0537   hisD TRUE 0.948 4.000 0.157 NA   NA
 126542 126543 Atu0537 Atu0538 hisD   FALSE 0.323 134.000 0.096 NA   NA
 126543 126544 Atu0538 Atu0539   murA FALSE 0.435 114.000 0.138 NA   NA
 126544 126545 Atu0539 Atu0540 murA   FALSE 0.316 103.000 0.028 NA   NA
 126546 126547 Atu0542 Atu0543 fla flaB FALSE 0.207 242.000 0.000 0.001 Y NA
 126547 3819904 Atu0543 Atu0544 flaB   FALSE 0.163 26.000 0.000 NA   NA
 3819904 126548 Atu0544 Atu0545   flaA FALSE 0.043 124.000 0.000 NA   NA
 126548 126549 Atu0545 Atu0546 flaA fliP FALSE 0.041 372.000 0.000 1.000 Y NA
 126549 126550 Atu0546 Atu0547 fliP fliL TRUE 0.996 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 126550 126551 Atu0547 Atu0548 fliL flgH TRUE 0.923 27.000 0.043 0.006 Y NA
 126551 126552 Atu0548 Atu0549 flgH   TRUE 0.998 -3.000 0.592 NA   NA
 126552 126553 Atu0549 Atu0550   flgI TRUE 0.998 -3.000 0.531 NA   NA
 126553 126554 Atu0550 Atu0551 flgI flgA TRUE 0.998 -3.000 0.261 NA Y NA
 126554 126555 Atu0551 Atu0552 flgA flgG TRUE 0.949 21.000 0.252 NA Y NA
 126555 126556 Atu0552 Atu0553 flgG fliE TRUE 0.993 19.000 0.771 0.004 Y NA
 126556 126557 Atu0553 Atu0554 fliE flgC TRUE 0.998 -3.000 0.115 0.002 Y NA
 126557 126558 Atu0554 Atu0555 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.804 0.002 Y NA
 126558 126559 Atu0555 Atu0556 flgB   FALSE 0.149 171.000 0.040 NA   NA
 126559 126560 Atu0556 Atu0557   fliI FALSE 0.394 164.000 0.275 NA   NA
 126560 126561 Atu0557 Atu0558 fliI flgF TRUE 0.993 12.000 0.529 0.002 Y NA
 126561 126562 Atu0558 Atu0559 flgF   TRUE 0.979 2.000 0.279 NA   NA
 126563 126564 Atu0560 Atu0561 motA fliM TRUE 0.998 3.000 0.879 NA Y NA
 126564 126565 Atu0561 Atu0562 fliM fliN TRUE 0.946 64.000 0.485 NA Y NA
 126565 126566 Atu0562 Atu0563 fliN fliG TRUE 0.992 28.000 0.875 0.004 Y NA
 126566 126567 Atu0563 Atu0564 fliG flhB TRUE 0.904 126.000 0.571 1.000 Y NA
 126567 126568 Atu0564 Atu0565 flhB   TRUE 0.984 6.000 0.595 NA   NA
 126568 3819905 Atu0565 Atu0566     FALSE 0.079 81.000 0.000 NA   NA
 3819905 126569 Atu0566 Atu0567   flaD FALSE 0.233 15.000 0.000 NA   NA
 126569 126570 Atu0567 Atu0568 flaD   FALSE 0.005 280.000 0.000 NA   NA
 126570 126571 Atu0568 Atu0569   motB TRUE 0.994 -3.000 0.263 NA   NA
 126571 126572 Atu0569 Atu0570 motB   TRUE 0.999 -3.000 0.737 NA   NA
 126572 126573 Atu0570 Atu0571   motD TRUE 0.996 -3.000 0.379 NA   NA
 126573 126574 Atu0571 Atu0572 motD   TRUE 0.685 71.000 0.229 NA   NA
 126574 126575 Atu0572 Atu0573     FALSE 0.005 283.000 0.000 NA   NA
 126575 126576 Atu0573 Atu0574   flgE TRUE 0.503 106.000 0.118 1.000 N NA
 126576 126577 Atu0574 Atu0575 flgE flgK TRUE 0.989 23.000 0.667 0.006 Y NA
 126577 126578 Atu0575 Atu0576 flgK flgL TRUE 0.998 4.000 0.667 0.006 Y NA
 126578 126579 Atu0576 Atu0577 flgL flaF TRUE 0.866 35.000 0.057 NA Y NA
 126579 126580 Atu0577 Atu0578 flaF flbT TRUE 1.000 -3.000 0.829 NA Y NA
 126580 126581 Atu0578 Atu0579 flbT flgD TRUE 1.000 -9.000 0.528 NA Y NA
 126581 126582 Atu0579 Atu0580 flgD fliQ TRUE 0.960 46.000 0.509 NA Y NA
 126582 126583 Atu0580 Atu0581 fliQ flhA TRUE 0.827 158.000 0.349 0.008 Y NA
 126583 126584 Atu0581 Atu0582 flhA fliR TRUE 0.952 30.000 0.186 0.001 Y NA
 126584 126585 Atu0582 Atu0583 fliR   TRUE 0.911 16.000 0.350 NA   NA
 126585 126586 Atu0583 Atu0584     TRUE 0.554 143.000 0.360 NA   NA
 126586 126587 Atu0584 Atu0585     TRUE 0.893 30.000 0.440 NA   NA
 126587 126588 Atu0585 Atu8132     TRUE 0.991 0.000 0.438 NA   NA
 126588 126589 Atu8132 Atu0587   tagA FALSE 0.150 184.000 0.043 1.000   NA
 126589 126590 Atu0587 Atu0588 tagA   FALSE 0.412 128.000 0.000 NA Y NA
 126590 126591 Atu0588 Atu0589   folD FALSE 0.119 78.000 0.000 NA N NA
 126593 126594 Atu0591 Atu0592 aglE aglF TRUE 0.655 249.000 0.670 NA Y NA
 126594 126595 Atu0592 Atu0593 aglF aglG TRUE 0.998 2.000 0.693 NA Y NA
 126595 126596 Atu0593 Atu0594 aglG aglA TRUE 0.950 38.000 0.387 NA Y NA
 126596 126597 Atu0594 Atu0595 aglA aglK TRUE 0.985 22.000 0.697 1.000 Y NA
 126597 126598 Atu0595 Atu8133 aglK   FALSE 0.397 171.000 0.303 NA   NA
 126599 126600 Atu0597 Atu0598   edd FALSE 0.023 219.000 0.000 1.000 N NA
 126600 126601 Atu0598 Atu0599 edd pgl TRUE 0.763 125.000 0.202 1.000 Y NA
 126601 126602 Atu0599 Atu0600 pgl zwf TRUE 0.949 11.000 0.028 1.000 Y NA
 126602 126603 Atu0600 Atu0601 zwf ordL FALSE 0.351 137.000 0.088 1.000 N NA
 126603 126604 Atu0601 Atu0602 ordL glnA TRUE 0.991 13.000 0.706 1.000 Y NA
 126608 126609 Atu0606 Atu0607   aceA FALSE 0.437 85.000 0.056 NA   NA
 126610 126611 Atu0608 Atu0609   potF FALSE 0.341 152.000 0.164 1.000   NA
 126611 126612 Atu0609 Atu0610 potF potG TRUE 0.946 82.000 0.541 1.000 Y NA
 126612 126613 Atu0610 Atu0611 potG potB TRUE 0.988 12.000 0.545 NA Y NA
 126613 126614 Atu0611 Atu0612 potB   TRUE 0.997 5.000 0.758 NA Y NA
 126615 126616 Atu0613 Atu0614     FALSE 0.033 360.000 0.095 NA N NA
 3819906 126618 Atu0616 Atu0619     FALSE 0.013 209.000 0.000 NA   NA
 126618 126619 Atu0619 Atu0620   ftsJ TRUE 0.995 -3.000 0.316 NA N NA
 126621 3819907 Atu0622 Atu0623     FALSE 0.089 71.000 0.000 NA   NA
 3819907 126622 Atu0623 Atu0624   guaB FALSE 0.078 83.000 0.000 NA   NA
 126622 126623 Atu0624 Atu8134 guaB   FALSE 0.275 96.000 0.005 NA   NA
 126623 126624 Atu8134 Atu0626   adhP FALSE 0.145 150.000 0.012 NA   NA
 126624 126625 Atu0626 Atu0627 adhP dlhH FALSE 0.259 119.000 0.018 1.000   NA
 126626 126627 Atu0628 Atu0629     TRUE 0.999 -13.000 0.316 1.000 Y NA
 126629 126630 Atu0631 Atu0632 moaB ipk TRUE 0.981 -3.000 0.018 1.000 N NA
 126630 126631 Atu0632 Atu0633 ipk   TRUE 0.918 7.000 0.107 1.000   NA
 126631 126632 Atu0633 Atu0634   ispB FALSE 0.121 192.000 0.028 1.000   NA
 126633 126634 Atu0635 Atu0636     TRUE 0.828 97.000 0.525 1.000   NA
 126634 126635 Atu0636 Atu0637   sohB FALSE 0.116 176.000 0.009 1.000   NA
 126635 126636 Atu0637 Atu0638 sohB   TRUE 0.591 21.000 0.019 NA   NA
 126636 126637 Atu0638 Atu0639   glyQ FALSE 0.174 131.000 0.006 NA   NA
 126637 126638 Atu0639 Atu0640 glyQ   FALSE 0.067 98.000 0.000 NA   NA
 126638 126639 Atu0640 Atu0641     FALSE 0.016 194.000 0.000 NA   NA
 126639 126640 Atu0641 Atu0642   aroA FALSE 0.324 75.000 0.007 NA   NA
 126641 126642 Atu0643 Atu0644   glyS FALSE 0.254 101.000 0.005 NA   NA
 126642 126643 Atu0644 Atu0645 glyS   FALSE 0.045 233.000 0.006 NA   NA
 126644 126645 Atu0646 Atu8084 mcpA   FALSE 0.003 325.000 0.000 NA   NA
 126645 126646 Atu8084 Atu0647   purD FALSE 0.131 156.000 0.010 NA   NA
 126647 126648 Atu0648 Atu0649   cfa FALSE 0.047 169.000 0.000 1.000 N NA
 126648 126649 Atu0649 Atu0650 cfa   FALSE 0.323 153.000 0.000 NA Y NA
 126649 126650 Atu0650 Atu0651   ubiA FALSE 0.068 120.000 0.000 NA N NA
 126655 126656 Atu0656 Atu0657 gsh1   FALSE 0.365 119.000 0.087 NA   NA
 126656 126657 Atu0657 Atu0658   pit TRUE 0.609 19.000 0.019 NA   NA
 126657 126658 Atu0658 Atu0659 pit   FALSE 0.229 163.000 0.069 1.000   NA
 126658 126659 Atu0659 Atu0660     FALSE 0.010 258.000 0.000 1.000   NA
 126659 126660 Atu0660 Atu0661     TRUE 0.991 -3.000 0.158 1.000   NA
 126660 126661 Atu0661 Atu0662     FALSE 0.107 113.000 0.000 1.000 N NA
 126664 126665 Atu0665 Atu0666 glcD glcE TRUE 0.538 236.000 0.266 0.013 Y NA
 126665 126666 Atu0666 Atu0667 glcE glcF TRUE 0.970 16.000 0.227 0.060 Y NA
 126667 126668 Atu0668 Atu0669     FALSE 0.006 260.000 0.000 NA   NA
 126669 126670 Atu0670 Atu8085 tag   TRUE 0.973 -3.000 0.013 NA   NA
 126673 126674 Atu0673 Atu0674     FALSE 0.438 7.000 0.000 NA   NA
 126674 126675 Atu0674 Atu0675     TRUE 0.999 -16.000 0.490 NA   NA
 126676 126677 Atu0676 Atu0677 hisS-1   TRUE 0.494 5.000 0.000 NA   NA
 126677 126678 Atu0677 Atu0678   hisS-2 FALSE 0.215 17.000 0.000 NA   NA
 126678 126679 Atu0678 Atu0679 hisS-2 hisG TRUE 0.998 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 126680 126681 Atu0680 Atu0681     FALSE 0.054 111.000 0.000 NA   NA
 126681 3819909 Atu0681 Atu8056     FALSE 0.013 209.000 0.000 NA   NA
 3819909 126682 Atu8056 Atu0682   groEL FALSE 0.099 63.000 0.000 NA   NA
 126682 126683 Atu0682 Atu0683 groEL groES TRUE 0.967 76.000 0.565 0.005 Y NA
 126684 126685 Atu0684 Atu0685   ribF TRUE 0.561 58.000 0.049 1.000 N NA
 126685 126686 Atu0685 Atu0686 ribF ileS FALSE 0.045 273.000 0.029 1.000 N NA
 126686 126687 Atu0686 Atu0687 ileS   FALSE 0.155 152.000 0.019 NA   NA
 126689 126690 Atu0689 Atu0690 rluB   TRUE 0.994 -19.000 0.079 1.000 N NA
 126690 126691 Atu0690 Atu0691     FALSE 0.353 87.000 0.013 1.000   NA
 126691 3819911 Atu0691 Atu8111     TRUE 0.929 -44.000 0.000 NA   NA
 126693 126694 Atu0693 Atu0694     TRUE 0.573 94.000 0.182 NA   NA
 126694 126695 Atu0694 Atu8086     TRUE 0.870 62.000 0.515 NA   NA
 126695 126696 Atu8086 Atu0695   kdtA FALSE 0.127 215.000 0.099 NA   NA
 126696 126697 Atu0695 Atu0696 kdtA   TRUE 0.992 -6.000 0.062 1.000   NA
 126697 126698 Atu0696 Atu0697   lpxK FALSE 0.088 205.000 0.015 1.000   NA
 126699 126700 Atu0698 Atu0699   mutL FALSE 0.152 153.000 0.019 NA   NA
 126701 126702 Atu0700 Atu0701     TRUE 0.943 87.000 0.538 1.000 Y NA
 126703 126704 Atu0702 Atu0703   kdgA TRUE 0.988 5.000 0.253 NA Y NA
 126704 126705 Atu0703 Atu0704 kdgA dgoK TRUE 0.954 16.000 0.205 1.000 Y NA
 126705 126706 Atu0704 Atu0705 dgoK fabG TRUE 0.991 0.000 0.367 1.000 N NA
 126707 126708 Atu0706 Atu0707 kdgR   FALSE 0.049 346.000 0.000 1.000 Y NA
 126708 126709 Atu0707 Atu0708   nrt FALSE 0.451 79.000 0.031 1.000 N NA
 126709 126710 Atu0708 Atu0709 nrt   FALSE 0.099 117.000 0.000 1.000 N NA
 126710 126711 Atu0709 Atu0710   corA FALSE 0.010 288.000 0.000 1.000 N NA
 126711 126712 Atu0710 Atu0711 corA   TRUE 0.942 16.000 0.133 1.000 Y NA
 126712 126713 Atu0711 Atu0712     FALSE 0.006 343.000 0.000 1.000 N NA
 126713 126714 Atu0712 Atu0713   atpI FALSE 0.005 271.000 0.000 NA   NA
 126714 126715 Atu0713 Atu0714 atpI atpA TRUE 0.673 61.000 0.195 NA   NA
 126715 126716 Atu0714 Atu0715 atpA atpC TRUE 0.926 74.000 0.628 0.003   NA
 126716 126717 Atu0715 Atu0716 atpC atpB TRUE 0.809 80.000 0.278 0.003   NA
 126717 126718 Atu0716 Atu0717 atpB atpF TRUE 0.999 2.000 0.863 0.003 Y NA
 126718 126719 Atu0717 Atu0718 atpF   FALSE 0.008 282.000 0.000 1.000   NA
 126719 126720 Atu0718 Atu0719     FALSE 0.041 160.000 0.000 1.000   NA
 126721 126722 Atu0720 Atu0721 rnhB   FALSE 0.096 332.000 0.022 1.000 Y NA
 126724 126725 Atu0723 Atu0724     TRUE 0.687 51.000 0.158 NA N NA
 126725 126726 Atu0724 Atu0725     TRUE 0.496 64.000 0.053 NA   NA
 126727 126728 Atu0726 Atu0727     TRUE 0.682 158.000 0.455 0.053 N NA
 126728 126729 Atu0727 Atu0728     FALSE 0.021 175.000 0.000 NA   NA
 126729 126730 Atu0728 Atu0730     FALSE 0.010 223.000 0.000 NA   NA
 126732 126733 Atu0732 Atu0733 mmgC   TRUE 0.982 11.000 0.303 1.000 Y NA
 126733 126734 Atu0733 Atu0734     FALSE 0.117 49.000 0.000 NA   NA
 126735 126736 Atu0735 Atu0736     TRUE 0.996 -3.000 0.062 NA Y NA
 126739 126740 Atu0740 Atu0741     FALSE 0.131 39.000 0.000 NA   NA
 126740 126741 Atu0741 Atu0742     FALSE 0.125 43.000 0.000 NA   NA
 126742 126743 Atu8012 Atu0743     FALSE 0.424 93.000 0.043 1.000   NA
 126745 126746 Atu0745 Atu0746 dxs   FALSE 0.326 90.000 0.017 NA   NA
 126746 126747 Atu0746 Atu0747   xseB FALSE 0.029 261.000 0.003 NA   NA
 126747 126748 Atu0747 Atu0748 xseB   TRUE 0.910 3.000 0.019 NA N NA
 126748 126749 Atu0748 Atu0749   bioY FALSE 0.163 26.000 0.000 NA   NA
 126749 126750 Atu0749 Atu0750 bioY   TRUE 0.945 6.000 0.211 NA   NA
 126750 126751 Atu0750 Atu0751     TRUE 1.000 -3.000 0.729 1.000 Y NA
 126753 126754 Atu0753 Atu0754 ribA aroC TRUE 0.764 13.000 0.023 1.000 N NA
 126756 126757 Atu0756 Atu0757 gpmB fabI TRUE 0.921 31.000 0.397 0.084 N NA
 126757 126758 Atu0757 Atu0758 fabI dnaJ TRUE 0.649 132.000 0.404 1.000   NA
 126758 126759 Atu0758 Atu0759 dnaJ   FALSE 0.131 210.000 0.087 NA   NA
 126763 126764 Atu0763 Atu0764     TRUE 0.879 7.000 0.056 NA   NA
 126764 126765 Atu0764 Atu0765   tldD FALSE 0.080 193.000 0.007 NA   NA
 126765 126766 Atu0765 Atu0766 tldD ialB FALSE 0.398 82.000 0.037 NA   NA
 126767 126768 Atu0767 Atu0768 coxB coxA TRUE 0.993 18.000 0.741 0.002 Y NA
 126768 126769 Atu0768 Atu0769 coxA ctaB FALSE 0.057 390.000 0.153 0.062 N NA
 126769 3819913 Atu0769 Atu8013 ctaB   TRUE 0.951 0.000 0.038 NA   NA
 3819913 126770 Atu8013 Atu0770   coxG TRUE 0.617 29.000 0.050 NA   NA
 126770 126771 Atu0770 Atu0771 coxG coxC TRUE 0.890 62.000 0.536 1.000 N NA
 126771 126772 Atu0771 Atu0772 coxC   FALSE 0.075 262.000 0.122 NA   NA
 126772 126773 Atu0772 Atu0773   surf1 TRUE 0.947 11.000 0.340 NA   NA
 126773 126774 Atu0773 Atu0774 surf1 lytB TRUE 0.596 59.000 0.105 NA   NA
 126774 126775 Atu0774 Atu0775 lytB thrB TRUE 0.675 93.000 0.251 1.000   NA
 126775 126776 Atu0775 Atu0776 thrB   TRUE 0.989 -3.000 0.104 1.000   NA
 126776 126777 Atu0776 Atu0777     FALSE 0.092 177.000 0.003 NA   NA
 126778 126779 Atu0778 Atu0779     FALSE 0.003 343.000 0.000 NA   NA
 126779 126780 Atu0779 Atu0780     TRUE 0.885 101.000 0.357 NA Y NA
 126781 126782 Atu0781 Atu0782     FALSE 0.263 107.000 0.014 NA   NA
 126782 126783 Atu0782 Atu0783     TRUE 0.816 49.000 0.333 NA   NA
 126784 126785 Atu0784 Atu0785   rimJ TRUE 0.995 -3.000 0.293 1.000 N NA
 126785 126786 Atu0785 Atu0786 rimJ   TRUE 0.885 94.000 0.674 1.000   NA
 126786 126787 Atu0786 Atu0787   thrC TRUE 0.774 22.000 0.129 1.000   NA
 3819914 126789 Atu0789 Atu0790     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 126790 126791 Atu0791 Atu0792     TRUE 0.541 46.000 0.048 NA   NA
 126794 126795 Atu0795 Atu0796     FALSE 0.113 52.000 0.000 NA   NA
 126795 126797 Atu0796 Atu0797     FALSE 0.178 49.000 0.000 1.000   NA
 126797 126798 Atu0797 Atu0798   mutY TRUE 0.978 -3.000 0.016 1.000   NA
 126799 126800 Atu8137 Atu0800     TRUE 0.581 129.000 0.333 NA   NA
 126800 126801 Atu0800 Atu0801   smc FALSE 0.455 85.000 0.039 1.000 N NA
 3819915 126807 Atu0805 Atu0806     FALSE 0.007 255.000 0.000 NA   NA
 126809 126810 Atu0809 Atu0810     TRUE 0.995 -10.000 0.188 NA   NA
 126810 126811 Atu0810 Atu0811   mqo FALSE 0.026 193.000 0.000 1.000   NA
 3819918 126813 Atu0814 Atu0815     FALSE 0.002 427.000 0.000 NA   NA
 126814 126815 Atu0816 Atu0817 cysN   TRUE 0.986 0.000 0.100 0.001 N NA
 126815 126816 Atu0817 Atu0818   cysH TRUE 0.859 29.000 0.017 1.000 Y NA
 126817 126818 Atu0819 Atu0820     FALSE 0.011 246.000 0.000 NA N NA
 126818 126819 Atu0820 Atu0821   cysT FALSE 0.208 197.000 0.020 0.002 N NA
 126819 126820 Atu0821 Atu0822 cysT   TRUE 1.000 -7.000 0.935 0.001 N NA
 126820 126821 Atu0822 Atu0823     TRUE 0.990 12.000 0.587 1.000 Y NA
 3819919 126822 Atu0824 Atu0825   qor FALSE 0.056 109.000 0.000 NA   NA
 126822 126823 Atu0825 Atu0826 qor   TRUE 0.544 119.000 0.214 1.000 N NA
 126823 126824 Atu0826 Atu0827     FALSE 0.252 173.000 0.107 1.000 N NA
 126825 126826 Atu0828 Atu0829 betI betB TRUE 0.962 12.000 0.459 1.000 N NA
 126826 126827 Atu0829 Atu0830 betB betA FALSE 0.461 231.000 0.634 1.000 N NA
 126832 126833 Atu0834 Atu0835   gst FALSE 0.224 138.000 0.028 NA N NA
 126834 126835 Atu0836 Atu0837 gst   FALSE 0.155 85.000 0.000 1.000 N NA
 126836 126837 Atu0838 Atu0839     FALSE 0.004 311.000 0.000 NA   NA
 126837 126838 Atu0839 Atu0840     TRUE 0.995 2.000 0.751 NA N NA
 126838 126839 Atu0840 Atu0841     FALSE 0.199 155.000 0.037 1.000   NA
 126840 126841 Atu0842 Atu0843     FALSE 0.036 164.000 0.000 NA N NA
 126842 126843 Atu0844 Atu0845     TRUE 0.482 111.000 0.167 NA   NA
 126845 126846 Atu0847 Atu0848 ohr   FALSE 0.330 110.000 0.044 NA   NA
 126846 126847 Atu0848 Atu0849     TRUE 0.927 62.000 0.763 NA   NA
 126848 126849 Atu0850 Atu0851     FALSE 0.001 582.000 0.000 NA   NA
 126849 126850 Atu0851 Atu0852     FALSE 0.076 86.000 0.000 NA   NA
 126851 126852 Atu0853 Atu0854     FALSE 0.167 25.000 0.000 NA   NA
 126852 126853 Atu0854 Atu0855     TRUE 0.494 98.000 0.123 NA   NA
 126855 126856 Atu0857 Atu0858   pcaC TRUE 0.993 -46.000 0.080 NA   NA
 126856 126857 Atu0858 Atu0859 pcaC   TRUE 0.994 -3.000 0.286 NA   NA
 126858 3819920 Atu0860 Atu0861     FALSE 0.128 41.000 0.000 NA   NA
 126862 126863 Atu0864 Atu0865     FALSE 0.173 73.000 0.000 1.000 N NA
 126863 126864 Atu0865 Atu0866     FALSE 0.006 345.000 0.000 1.000 N NA
 126866 126867 Atu0868 Atu0869     FALSE 0.117 49.000 0.000 NA   NA
 126869 126870 Atu0871 Atu0872 ilvE mcpC FALSE 0.047 170.000 0.000 1.000 N NA
 126874 126875 Atu0876 Atu0877 sodBI   FALSE 0.262 113.000 0.011 1.000   NA
 126877 126878 Atu0879 Atu0881     FALSE 0.148 228.000 0.154 1.000 N NA
 126878 126879 Atu0881 Atu0882     TRUE 0.947 88.000 0.424 0.010 Y NA
 126879 126880 Atu0882 Atu0883     FALSE 0.002 456.000 0.000 NA   NA
 126880 126881 Atu0883 Atu0884     TRUE 0.977 12.000 0.684 NA   NA
 126881 126882 Atu0884 Atu0885     TRUE 0.915 5.000 0.075 NA   NA
 126883 126884 Atu0886 Atu0887     FALSE 0.180 22.000 0.000 NA   NA
 126884 126885 Atu0887 Atu0888     FALSE 0.022 205.000 0.000 1.000   NA
 126886 126887 Atu0889 Atu0890     FALSE 0.072 93.000 0.000 NA   NA
 126887 126888 Atu0890 Atu0891     TRUE 0.583 79.000 0.163 NA   NA
 126889 126890 Atu0892 Atu0893     FALSE 0.002 393.000 0.000 NA   NA
 126890 126891 Atu0893 Atu0894     TRUE 0.999 -7.000 0.300 NA Y NA
 126891 126892 Atu0894 Atu0895     FALSE 0.449 242.000 0.333 NA Y NA
 126892 3819921 Atu0895 Atu0896     FALSE 0.149 31.000 0.000 NA   NA
 3819921 126893 Atu0896 Atu0897   ptrB FALSE 0.007 245.000 0.000 NA   NA
 126894 126895 Atu0898 Atu0899   dapA FALSE 0.059 105.000 0.000 NA   NA
 126895 126896 Atu0899 Atu0900 dapA   FALSE 0.242 42.000 0.000 1.000 N NA
 126896 126897 Atu0900 Atu0901   ada FALSE 0.062 150.000 0.000 1.000 N NA
 126898 126899 Atu0902 Atu0903     FALSE 0.424 85.000 0.037 1.000   NA
 126900 3819922 Atu0904 Atu0905   dskA TRUE 0.646 123.000 0.043 1.000 Y NA
 3819922 126901 Atu0905 Atu0906 dskA   FALSE 0.016 226.000 0.000 1.000   NA
 126901 126902 Atu0906 Atu0907     FALSE 0.394 103.000 0.049 1.000   NA
 126904 126905 Atu0909 Atu0910 mnhA mnhB TRUE 0.997 -3.000 0.493 NA   NA
 126905 126906 Atu0910 Atu0911 mnhB mnhC TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 126906 126907 Atu0911 Atu0912 mnhC mnhD TRUE 0.994 20.000 0.896 0.006 Y NA
 126907 126908 Atu0912 Atu0913 mnhD mnhE TRUE 1.000 -3.000 0.810 1.000 Y NA
 126908 126909 Atu0913 Atu0914 mnhE mnhF TRUE 1.000 -3.000 0.644 0.062 Y NA
 126909 126910 Atu0914 Atu0915 mnhF mnhG TRUE 0.999 -3.000 0.614 1.000 Y NA
 126910 126911 Atu0915 Atu0916 mnhG ros FALSE 0.004 434.000 0.000 1.000 N NA
 126911 126912 Atu0916 Atu0917 ros   FALSE 0.006 303.000 0.000 1.000   NA
 126912 126913 Atu0917 Atu0918     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 126914 126915 Atu0919 Atu0920     FALSE 0.113 213.000 0.069 NA   NA
 126916 126917 Atu0921 Atu8087     TRUE 0.997 -37.000 0.259 1.000 N NA
 126917 126918 Atu8087 Atu0922     FALSE 0.059 263.000 0.071 NA   NA
 3819923 126922 Atu0925 Atu0926     TRUE 0.999 -7.000 0.941 NA   NA
 126922 126923 Atu0926 Atu0927   lysE FALSE 0.043 124.000 0.000 NA   NA
 126925 126926 Atu0929 Atu0930     TRUE 0.815 14.000 0.111 NA   NA
 126926 126927 Atu0930 Atu0931     FALSE 0.003 346.000 0.000 NA   NA
 126928 126929 Atu0932 Atu0933     FALSE 0.053 112.000 0.000 NA   NA
 126930 126931 Atu0934 Atu0935     TRUE 0.989 -3.000 0.139 NA   NA
 126932 126933 Atu0936 Atu0937     FALSE 0.041 236.000 0.000 0.083   NA
 126933 126934 Atu0937 Atu0938   cueR FALSE 0.242 42.000 0.000 1.000 N NA
 126934 126936 Atu0938 Atu0939 cueR pemI FALSE 0.005 323.000 0.000 NA N NA
 126936 126937 Atu0939 Atu0940 pemI pemK TRUE 0.993 0.000 0.167 NA Y NA
 126937 3819924 Atu0940 Atu0941 pemK   FALSE 0.067 98.000 0.000 NA   NA
 3819924 126938 Atu0941 Atu0942     FALSE 0.057 107.000 0.000 NA   NA
 126939 126940 Atu0943 Atu0944   cscA FALSE 0.092 69.000 0.000 NA   NA
 126947 126948 Atu8088 Atu0951     TRUE 0.836 55.000 0.400 NA   NA
 126948 126949 Atu0951 Atu8140     FALSE 0.002 449.000 0.000 NA   NA
 126949 126950 Atu8140 Atu0953     TRUE 0.479 59.000 0.040 NA   NA
 126950 126951 Atu0953 Atu0954   gp34 FALSE 0.007 257.000 0.000 NA   NA
 126951 126952 Atu0954 Atu0955 gp34   FALSE 0.115 196.000 0.044 NA   NA
 126952 126953 Atu0955 Atu0956   gp35 TRUE 0.681 50.000 0.167 NA   NA
 126953 126954 Atu0956 Atu0957 gp35 gp36 TRUE 0.855 33.000 0.345 NA   NA
 126958 3819926 Atu0960 Atu0961     FALSE 0.006 259.000 0.000 NA   NA
 3819926 126962 Atu0961 Atu0962     FALSE 0.005 284.000 0.000 NA   NA
 126963 126964 Atu8141 Atu0964     TRUE 0.914 61.000 0.678 NA   NA
 126964 126965 Atu0964 Atu0965     TRUE 0.996 -3.000 0.390 NA   NA
 126965 126966 Atu0965 Atu0966     TRUE 0.988 -3.000 0.107 NA   NA
 126966 126967 Atu0966 Atu0967     TRUE 0.788 18.000 0.136 NA   NA
 126967 126968 Atu0967 Atu0968     TRUE 0.954 2.000 0.091 NA   NA
 126968 126969 Atu0968 Atu8142     FALSE 0.302 140.000 0.095 NA   NA
 126969 126970 Atu8142 Atu0970     TRUE 0.623 94.000 0.223 NA   NA
 126970 126971 Atu0970 Atu0971     TRUE 1.000 -10.000 0.713 1.000 Y NA
 126971 126972 Atu0971 Atu0972   lipA FALSE 0.136 208.000 0.069 NA N NA
 126972 126973 Atu0972 Atu0973 lipA cycH FALSE 0.340 151.000 0.163 NA N NA
 126973 126974 Atu0973 Atu0974 cycH cycJ TRUE 0.997 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 126974 126975 Atu0974 Atu0975 cycJ cycK TRUE 0.998 -3.000 0.125 0.002 Y NA
 126975 126976 Atu0975 Atu0976 cycK cycL TRUE 0.999 -3.000 0.644 NA Y NA
 126976 126977 Atu0976 Atu0977 cycL dop TRUE 0.650 154.000 0.200 NA Y NA
 126977 126978 Atu0977 Atu0978 dop ragA FALSE 0.116 273.000 0.222 1.000 N NA
 126978 126979 Atu0978 Atu0979 ragA ragB TRUE 0.995 10.000 0.733 1.000 Y NA
 126982 126983 Atu0982 Atu0983     FALSE 0.009 227.000 0.000 NA   NA
 126983 126984 Atu0983 Atu0984   pepN FALSE 0.036 137.000 0.000 NA   NA
 126986 3819927 Atu0985 Atu0986     FALSE 0.004 295.000 0.000 NA   NA
 126987 126988 Atu0987 Atu0988     TRUE 0.576 44.000 0.034 1.000 N NA
 126993 126994 Atu0993 Atu0994     FALSE 0.006 351.000 0.000 1.000 N NA
 126994 126995 Atu0994 Atu0995     FALSE 0.002 447.000 0.000 NA   NA
 126997 126998 Atu0997 Atu0998   bacA FALSE 0.066 123.000 0.000 NA N NA
 126999 127000 Atu0999 Atu1000 mgtE   FALSE 0.010 287.000 0.000 1.000 N NA
 127001 127002 Atu1001 Atu1002     FALSE 0.150 90.000 0.000 1.000 N NA
 127002 127003 Atu1002 Atu1003     FALSE 0.188 66.000 0.000 1.000 N NA
 127004 127005 Atu1004 Atu1005     TRUE 0.987 -3.000 0.088 NA   NA
 127005 127006 Atu1005 Atu1006   amn FALSE 0.136 67.000 0.000 NA N NA
 127009 127010 Atu1008 Atu1009     FALSE 0.038 133.000 0.000 NA   NA
 127012 127013 Atu1011 Atu8145 hisC   FALSE 0.023 168.000 0.000 NA   NA
 127014 127015 Atu1013 Atu1014     TRUE 0.539 8.000 0.000 1.000   NA
 3819928 127017 Atu1017 Atu1018     FALSE 0.004 288.000 0.000 NA   NA
 127019 127021 Atu1020 Atu1021     FALSE 0.011 508.000 0.000 0.001   NA
 3819930 127023 Atu1023 Atu1024   dapA FALSE 0.096 65.000 0.000 NA   NA
 127023 127024 Atu1024 Atu1025 dapA smpB FALSE 0.227 164.000 0.058 1.000 N NA
 127024 3819931 Atu1025 Atu1026 smpB   FALSE 0.096 65.000 0.000 NA   NA
 127025 127026 Atu1027 Atu1028 mcpV   FALSE 0.012 214.000 0.000 NA   NA
 127028 127029 Atu1029 Atu1030 rnpO   TRUE 0.630 133.000 0.058 1.000 Y NA
 127029 127030 Atu1030 Atu1031     FALSE 0.026 158.000 0.000 NA   NA
 127030 127031 Atu1031 Atu1032     FALSE 0.005 268.000 0.000 NA   NA
 127031 127032 Atu1032 Atu1033   acpS TRUE 0.979 -3.000 0.032 NA   NA
 127032 127033 Atu1033 Atu1034 acpS sipf FALSE 0.092 207.000 0.012 1.000 N NA
 127033 127034 Atu1034 Atu1035 sipf rnc TRUE 0.979 -3.000 0.010 1.000 N NA
 127034 127035 Atu1035 Atu1036 rnc   TRUE 0.649 84.000 0.098 0.062   NA
 127035 127036 Atu1036 Atu1037   fixK FALSE 0.328 149.000 0.042 0.062   NA
 127036 127037 Atu1037 Atu1038 fixK   FALSE 0.410 136.000 0.000 1.000 Y NA
 127037 127038 Atu1038 Atu1039   recO FALSE 0.207 57.000 0.000 1.000 N NA
 127041 127042 Atu1042 Atu1043     TRUE 0.917 12.000 0.123 0.035   NA
 127042 127043 Atu1043 Atu1044     TRUE 0.983 -3.000 0.049 NA   NA
 127043 127044 Atu1044 Atu1045     FALSE 0.007 256.000 0.000 NA   NA
 127045 127046 Atu1046 Atu1047     FALSE 0.292 284.000 0.281 NA Y NA
 127046 127047 Atu1047 Atu1048     TRUE 1.000 -3.000 0.875 NA Y NA
 127048 127049 Atu1049 Atu1050     FALSE 0.020 178.000 0.000 NA   NA
 127049 127050 Atu1050 Atu1051     FALSE 0.447 78.000 0.053 NA   NA
 127050 127051 Atu1051 Atu1052     TRUE 0.994 -3.000 0.258 NA   NA
 127051 127052 Atu1052 Atu1053   gcvT TRUE 0.546 39.000 0.039 NA   NA
 127052 127053 Atu1053 Atu1054 gcvT   FALSE 0.227 123.000 0.021 NA   NA
 127053 127054 Atu1054 Atu1055     TRUE 0.942 15.000 0.484 NA   NA
 127054 127055 Atu1055 Atu1056     TRUE 0.757 106.000 0.462 NA   NA
 127055 127056 Atu1056 Atu1057   nudF TRUE 0.637 99.000 0.259 NA   NA
 127057 127058 Atu1058 Atu1059     TRUE 0.868 11.000 0.103 NA   NA
 127059 127060 Atu1060 Atu1061     FALSE 0.031 147.000 0.000 NA   NA
 127060 127062 Atu1061 Atu1062   pssA FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 127062 127063 Atu1062 Atu1063 pssA psd TRUE 0.971 24.000 0.466 1.000 Y NA
 127063 127064 Atu1063 Atu1064 psd   FALSE 0.219 176.000 0.075 1.000 N NA
 127064 127065 Atu1064 Atu8147     TRUE 0.632 112.000 0.290 1.000   NA
 127066 127067 Atu1066 Atu1067   pbpB FALSE 0.006 263.000 0.000 NA   NA
 127068 127069 Atu1068 Atu1069   pip FALSE 0.009 227.000 0.000 NA   NA
 127069 127070 Atu1069 Atu1070 pip   TRUE 0.947 4.000 0.121 1.000   NA
 127070 127071 Atu1070 Atu1071     TRUE 0.992 0.000 0.263 0.001   NA
 127071 127072 Atu1071 Atu1072     TRUE 0.991 -3.000 0.158 1.000   NA
 127072 127073 Atu1072 Atu1073   cysS FALSE 0.010 259.000 0.000 1.000   NA
 127073 127074 Atu1073 Atu1074 cysS   FALSE 0.026 213.000 0.000 1.000 N NA
 127074 127075 Atu1074 Atu1075   purF FALSE 0.327 146.000 0.100 1.000 N NA
 127075 127076 Atu1075 Atu1076 purF cvpA FALSE 0.336 139.000 0.101 1.000   NA
 127076 127077 Atu1076 Atu1077 cvpA radA TRUE 0.521 90.000 0.094 1.000   NA
 127077 127078 Atu1077 Atu1078 radA   FALSE 0.438 7.000 0.000 NA   NA
 127078 127079 Atu1078 Atu1079     FALSE 0.033 143.000 0.000 NA   NA
 127079 127080 Atu1079 Atu1080   alr FALSE 0.138 66.000 0.000 NA N NA
 127081 127082 Atu1081 Atu1082     TRUE 0.854 99.000 0.625 NA N NA
 127082 127083 Atu1082 Atu1083     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 127085 127086 Atu1085 Atu1086 slyA   TRUE 0.615 126.000 0.357 NA   NA
 127086 127087 Atu1086 Atu1087     TRUE 0.881 20.000 0.311 NA   NA
 127088 127089 Atu1088 Atu1089 rplI   TRUE 0.717 15.000 0.043 NA   NA
 127089 3819932 Atu1089 Atu1090   rpsR FALSE 0.191 147.000 0.033 NA   NA
 3819932 3819933 Atu1090 Atu1091 rpsR rpsF TRUE 0.982 14.000 0.319 0.012 Y NA
 127091 127092 Atu1094 Atu1095 fabD fabG TRUE 0.953 79.000 0.432 0.003 Y NA
 127092 3819935 Atu1095 Atu1096 fabG acpP FALSE 0.314 352.000 0.321 0.003 Y NA
 3819935 127094 Atu1096 Atu1097 acpP fabF FALSE 0.266 252.000 0.106 1.000 Y NA
 127094 127095 Atu1097 Atu1098 fabF   FALSE 0.155 29.000 0.000 NA   NA
 127095 127096 Atu1098 Atu1099     FALSE 0.160 27.000 0.000 NA   NA
 127096 127097 Atu1099 Atu1100     TRUE 0.502 67.000 0.060 NA   NA
 127097 127098 Atu1100 Atu1101   gmk TRUE 0.958 6.000 0.276 NA   NA
 127099 127100 Atu1102 Atu1103   ksgA FALSE 0.088 72.000 0.000 NA   NA
 127100 127101 Atu1103 Atu1104 ksgA pdxA TRUE 0.982 0.000 0.197 1.000 N NA
 127101 127102 Atu1104 Atu1105 pdxA   TRUE 0.666 27.000 0.056 1.000   NA
 127102 127103 Atu1105 Atu1106   ostA FALSE 0.057 296.000 0.116 1.000   NA
 127103 127104 Atu1106 Atu1107 ostA   TRUE 0.977 0.000 0.153 1.000   NA
 127104 127105 Atu1107 Atu1108     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.060   NA
 127106 127107 Atu1110 Atu1111 pepA holC TRUE 0.836 26.000 0.230 1.000 N NA
 127107 127108 Atu1111 Atu1112 holC   FALSE 0.058 155.000 0.000 1.000 N NA
 127110 127111 Atu1114 Atu1115     FALSE 0.120 85.000 0.000 1.000   NA
 127111 127112 Atu1115 Atu1116   nwsB TRUE 0.913 -3.000 0.000 1.000   NA
 127112 127113 Atu1116 Atu1117 nwsB   TRUE 0.518 90.000 0.118 NA   NA
 127114 127115 Atu1118 Atu1119     TRUE 0.540 70.000 0.067 1.000   NA
 127116 127117 Atu1121 Atu1122 ligE ndk FALSE 0.302 100.000 0.010 NA N NA
 127118 3819936 Atu1123 Atu1124     TRUE 0.998 -3.000 0.714 NA   NA
 127120 127121 Atu1126 Atu1127 moaE moaD TRUE 0.997 5.000 0.501 0.002 Y NA
 127121 127122 Atu1127 Atu1128 moaD pgsA TRUE 0.972 0.000 0.082 1.000 N NA
 127122 127123 Atu1128 Atu1129 pgsA uvrC TRUE 0.627 103.000 0.227 1.000 N NA
 127123 127124 Atu1129 Atu1130 uvrC   FALSE 0.290 114.000 0.014 1.000 N NA
 127126 127127 Atu1132 Atu1133   rns TRUE 0.596 32.000 0.036 NA N NA
 127130 127131 Atu1136 Atu1137     TRUE 0.637 59.000 0.123 1.000   NA
 127132 127133 Atu1138 Atu1139     FALSE 0.307 109.000 0.000 0.000   NA
 127133 127134 Atu1139 Atu1140   purN FALSE 0.059 135.000 0.000 1.000   NA
 127134 127135 Atu1140 Atu1141 purN garS TRUE 0.931 66.000 0.230 0.002 Y NA
 127136 127137 Atu1142 Atu1143     TRUE 0.981 3.000 0.362 NA   NA
 127137 127138 Atu1143 Atu1144   ppk TRUE 0.533 102.000 0.134 1.000 N NA
 127138 127139 Atu1144 Atu1145 ppk ppx TRUE 0.997 -3.000 0.149 1.000 Y NA
 127140 127141 Atu1146 Atu8089     FALSE 0.029 150.000 0.000 NA   NA
 127141 127142 Atu8089 Atu1147     FALSE 0.022 170.000 0.000 NA   NA
 127142 127143 Atu1147 Atu1148     FALSE 0.008 238.000 0.000 NA   NA
 127143 127144 Atu1148 Atu1149   cya FALSE 0.397 145.000 0.195 1.000   NA
 127144 127145 Atu1149 Atu1150 cya   FALSE 0.007 255.000 0.000 NA   NA
 127145 127146 Atu1150 Atu1151   rnd FALSE 0.079 82.000 0.000 NA   NA
 127146 127147 Atu1151 Atu1152 rnd   FALSE 0.372 83.000 0.006 1.000 N NA
 127148 127149 Atu1153 Atu1154     TRUE 0.874 3.000 0.002 NA   NA
 127149 127150 Atu1154 Atu1155     FALSE 0.003 313.000 0.000 NA   NA
 127150 127151 Atu1155 Atu1156     FALSE 0.020 209.000 0.000 NA N NA
 127154 127155 Atu1159 Atu1160     FALSE 0.220 178.000 0.128 NA   NA
 127155 127156 Atu1160 Atu1161   hemB FALSE 0.397 98.000 0.055 NA   NA
 127157 127158 Atu1162 Atu1163   mucS FALSE 0.142 232.000 0.192 NA   NA
 127158 127159 Atu1163 Atu1164 mucS   FALSE 0.004 374.000 0.000 1.000   NA
 127159 127160 Atu1164 Atu1165   glyA FALSE 0.039 355.000 0.123 1.000   NA
 127160 127161 Atu1165 Atu1166 glyA   TRUE 0.793 13.000 0.052 NA N NA
 127161 127162 Atu1166 Atu8148   ribD* TRUE 0.976 3.000 0.277 NA N NA
 127162 127163 Atu8148 Atu1169 ribD* ribc TRUE 0.997 0.000 0.456 1.000 Y NA
 127163 127164 Atu1169 Atu1170 ribc   FALSE 0.009 294.000 0.000 1.000 N NA
 127164 127165 Atu1170 Atu1171   ribH FALSE 0.043 177.000 0.000 1.000 N NA
 127165 127166 Atu1171 Atu1172 ribH nusB TRUE 0.976 5.000 0.347 1.000 N NA
 127166 127167 Atu1172 Atu1173 nusB   TRUE 0.618 22.000 0.011 1.000 N NA
 127167 127168 Atu1173 Atu1174   rrpP FALSE 0.023 220.000 0.000 1.000 N NA
 127171 127172 Atu1176 Atu1177     TRUE 0.826 12.000 0.071 NA   NA
 127172 127173 Atu1177 Atu1178   plsX FALSE 0.363 101.000 0.044 NA   NA
 127173 127174 Atu1178 Atu1179 plsX fabH TRUE 0.995 5.000 0.380 0.003 Y NA
 127174 127175 Atu1179 Atu1180 fabH ihfA FALSE 0.155 242.000 0.207 1.000 N NA
 127175 127176 Atu1180 Atu1181 ihfA   FALSE 0.269 275.000 0.535 1.000 N NA
 127176 127177 Atu1181 Atu1182     FALSE 0.119 86.000 0.000 1.000   NA
 127177 127178 Atu1182 Atu1183     FALSE 0.002 549.000 0.000 1.000   NA
 127178 127179 Atu1183 Atu1184     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 127180 127181 Atu1186 Atu1187     FALSE 0.085 74.000 0.000 NA   NA
 127181 3819938 Atu1187 Atu1188     FALSE 0.054 111.000 0.000 NA   NA
 3819938 127183 Atu1188 Atu1189     FALSE 0.393 9.000 0.000 NA   NA
 127183 127184 Atu1189 Atu1190     FALSE 0.001 605.000 0.000 NA   NA
 127184 127185 Atu1190 Atu1191     FALSE 0.054 111.000 0.000 NA   NA
 127185 127187 Atu1191 Atu1192     FALSE 0.001 546.000 0.000 NA   NA
 3819940 127188 Atu1194 Atu1195 int   FALSE 0.004 428.000 0.000 1.000 N NA
 127188 127189 Atu1195 Atu1196     TRUE 0.805 16.000 0.087 1.000 N NA
 127189 127190 Atu1196 Atu1197   cueR TRUE 0.494 12.000 0.000 1.000 N NA
 127190 127191 Atu1197 Atu1198 cueR nikB FALSE 0.122 75.000 0.000 NA N NA
 127191 127192 Atu1198 Atu1199 nikB dppC TRUE 1.000 -10.000 0.556 NA Y NA
 127192 127193 Atu1199 Atu1200 dppC dppD TRUE 0.726 138.000 0.222 NA Y NA
 127193 127194 Atu1200 Atu1201 dppD   TRUE 0.995 9.000 0.571 0.002 Y NA
 127194 127195 Atu1201 Atu1202     FALSE 0.244 233.000 0.039 NA Y NA
 127196 127197 Atu1203 Atu1204   trkH TRUE 0.528 107.000 0.000 1.000 Y NA
 127198 127199 Atu1205 Atu1206 ilvA   FALSE 0.459 75.000 0.056 NA   NA
 127199 127200 Atu1206 Atu1207     FALSE 0.011 218.000 0.000 NA   NA
 127203 127204 Atu1210 Atu8149 cpdB   FALSE 0.221 184.000 0.154 NA   NA
 127204 127205 Atu8149 Atu1212     FALSE 0.065 100.000 0.000 NA   NA
 127206 127207 Atu1213 Atu1214     FALSE 0.113 52.000 0.000 NA   NA
 127208 127209 Atu1215 Atu1216   alaS TRUE 0.866 17.000 0.222 1.000   NA
 127209 127210 Atu1216 Atu1217 alaS cysK TRUE 0.830 13.000 0.082 1.000   NA
 127210 127211 Atu1217 Atu1218 cysK   FALSE 0.245 123.000 0.008 1.000 N NA
 127212 127213 Atu1219 Atu1220     FALSE 0.029 150.000 0.000 NA   NA
 127213 127214 Atu1220 Atu1221     FALSE 0.051 114.000 0.000 NA   NA
 127214 127215 Atu1221 Atu1222     FALSE 0.035 138.000 0.000 NA   NA
 127215 3819941 Atu1222 Atu1223     FALSE 0.094 67.000 0.000 NA   NA
 127218 127219 Atu1227 Atu8150     FALSE 0.058 106.000 0.000 NA   NA
 127219 3819944 Atu8150 Atu1229     FALSE 0.034 141.000 0.000 NA   NA
 3819944 3819945 Atu1229 Atu1230     FALSE 0.012 212.000 0.000 NA   NA
 127221 127222 Atu1233 Atu8151     FALSE 0.036 136.000 0.000 NA   NA
 127222 127223 Atu8151 Atu1235     FALSE 0.144 33.000 0.000 NA   NA
 127223 127224 Atu1235 Atu1236     TRUE 0.996 -3.000 0.357 NA   NA
 127224 127225 Atu1236 Atu1237     TRUE 0.632 224.000 0.500 NA Y NA
 127225 127226 Atu1237 Atu1238   gumB TRUE 1.000 -22.000 0.571 1.000 Y NA
 127228 127229 Atu1240 Atu1241     TRUE 0.510 98.000 0.141 NA   NA
 127231 127232 Atu1243 Atu1244 strB argC TRUE 0.984 -3.000 0.037 1.000 N NA
 127232 127233 Atu1244 Atu1245 argC speB TRUE 0.845 71.000 0.124 1.000 Y NA
 127233 127234 Atu1245 Atu1246 speB rpsI FALSE 0.256 132.000 0.024 1.000 N NA
 127234 127235 Atu1246 Atu1247 rpsI rplM TRUE 0.994 3.000 0.231 0.011 Y NA
 127235 127236 Atu1247 Atu1248 rplM   FALSE 0.007 253.000 0.000 NA   NA
 127236 3819947 Atu1248 Atu1249     FALSE 0.001 507.000 0.000 NA   NA
 127237 127238 Atu1250 Atu1251   cysD FALSE 0.427 74.000 0.040 NA   NA
 127238 127239 Atu1251 Atu1252 cysD   FALSE 0.010 224.000 0.000 NA   NA
 127239 127240 Atu1252 Atu1253     FALSE 0.021 175.000 0.000 NA   NA
 127242 127243 Atu1256 Atu1257     FALSE 0.150 90.000 0.000 1.000 N NA
 127245 127246 Atu1258 Atu1259 clpP clpX FALSE 0.338 292.000 0.352 1.000 Y NA
 127247 127248 Atu1261 Atu1262 lon hupA FALSE 0.044 290.000 0.043 1.000 N NA
 127248 127250 Atu1262 Atu1263 hupA   FALSE 0.005 344.000 0.000 1.000   NA
 127250 3819950 Atu1263 Atu1264     FALSE 0.089 71.000 0.000 NA   NA
 3819952 3819953 Atu1266 Atu1267     FALSE 0.127 42.000 0.000 NA   NA
 3819953 127254 Atu1267 Atu1268   nuoA FALSE 0.002 436.000 0.000 NA   NA
 127254 127255 Atu1268 Atu1269 nuoA nuoB TRUE 1.000 -30.000 0.396 0.002 Y NA
 127255 127256 Atu1269 Atu1270 nuoB nuoC TRUE 0.969 22.000 0.262 0.002 Y NA
 127256 127257 Atu1270 Atu1271 nuoC   TRUE 0.980 -3.000 0.023 1.000   NA
 127257 127258 Atu1271 Atu1272   nouD TRUE 0.931 2.000 0.025 1.000   NA
 127258 127259 Atu1272 Atu1273 nouD   TRUE 0.950 0.000 0.035 NA   NA
 127259 127260 Atu1273 Atu1274   nuoE TRUE 0.639 17.000 0.022 NA   NA
 127260 127261 Atu1274 Atu1275 nuoE nuoF TRUE 0.989 11.000 0.343 0.006 Y NA
 127261 127262 Atu1275 Atu1276 nuoF nuoG TRUE 0.861 150.000 0.395 0.006 Y NA
 127262 127263 Atu1276 Atu1277 nuoG nuoH TRUE 0.990 14.000 0.515 0.006 Y NA
 127263 127264 Atu1277 Atu1278 nuoH nuoI TRUE 0.977 37.000 0.500 0.006 Y NA
 127264 127265 Atu1278 Atu1279 nuoI nuoJ TRUE 0.895 138.000 0.442 0.006 Y NA
 127265 127266 Atu1279 Atu1280 nuoJ nuoK TRUE 0.980 30.000 0.484 0.002 Y NA
 127266 127267 Atu1280 Atu1281 nuoK nuoL TRUE 0.994 8.000 0.451 0.006 Y NA
 127267 127268 Atu1281 Atu1282 nuoL nuoM TRUE 0.997 0.000 0.251 0.002 Y NA
 127268 127269 Atu1282 Atu1283 nuoM nuoN TRUE 0.984 19.000 0.453 0.002 Y NA
 127269 127270 Atu1283 Atu1284 nuoN birA TRUE 0.996 -3.000 0.372 1.000 N NA
 127270 127271 Atu1284 Atu1285 birA   FALSE 0.320 204.000 0.307 1.000   NA
 127271 127272 Atu1285 Atu1286     FALSE 0.206 177.000 0.102 NA   NA
 127272 3819954 Atu1286 Atu1287     FALSE 0.083 76.000 0.000 NA   NA
 3819954 127273 Atu1287 Atu1288   proS FALSE 0.002 396.000 0.000 NA   NA
 127273 127274 Atu1288 Atu1289 proS   FALSE 0.364 128.000 0.076 1.000 N NA
 127274 127275 Atu1289 Atu1290   lolD TRUE 0.875 91.000 0.620 1.000 N NA
 127277 127278 Atu1293 Atu1294   dinP FALSE 0.191 157.000 0.025 1.000 N NA
 127278 127279 Atu1294 Atu8152 dinP   FALSE 0.454 136.000 0.228 NA   NA
 127280 127281 Atu1296 Atu1297 divK pleD TRUE 0.983 19.000 0.461 0.016 Y NA
 127281 3819956 Atu1297 Atu1298 pleD   TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 3819957 127282 Atu1299 Atu1300 rpmG   FALSE 0.420 90.000 0.028 1.000 N NA
 127282 127283 Atu1300 Atu1301     TRUE 0.919 9.000 0.159 1.000   NA
 127283 127284 Atu1301 Atu1302     TRUE 0.984 3.000 0.406 NA   NA
 127284 127285 Atu1302 Atu1303   rnr TRUE 0.561 43.000 0.050 NA   NA
 127285 127286 Atu1303 Atu1304 rnr topA TRUE 0.986 -3.000 0.045 1.000 N NA
 127286 127287 Atu1304 Atu1305 topA   FALSE 0.127 446.000 0.238 1.000 Y NA
 127287 127288 Atu1305 Atu1306     TRUE 0.725 22.000 0.070 1.000   NA
 127288 127289 Atu1306 Atu1307   pyrC TRUE 0.627 58.000 0.108 1.000   NA
 127289 127290 Atu1307 Atu1308 pyrC pyrB TRUE 0.999 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 127290 127291 Atu1308 Atu8153 pyrB   FALSE 0.009 231.000 0.000 NA   NA
 127292 127293 Atu1310 Atu1311 acd   FALSE 0.054 141.000 0.000 1.000   NA
 127293 127294 Atu1311 Atu1312     FALSE 0.150 64.000 0.000 1.000   NA
 127294 127295 Atu1312 Atu8154     TRUE 0.993 -3.000 0.235 NA   NA
 127295 127296 Atu8154 Atu1314     FALSE 0.027 154.000 0.000 NA   NA
 127296 127297 Atu1314 Atu8155     FALSE 0.002 405.000 0.000 NA   NA
 127299 127300 Atu1317 Atu1318   gatC FALSE 0.249 127.000 0.024 1.000   NA
 127300 127301 Atu1318 Atu1319 gatC gatA TRUE 0.980 57.000 0.643 0.001 Y NA
 127301 127302 Atu1319 Atu1320 gatA   FALSE 0.335 21.000 0.000 1.000 N NA
 127306 127307 Atu1324 Atu1325 gatB   FALSE 0.091 209.000 0.014 1.000 N NA
 127307 127308 Atu1325 Atu1326     TRUE 0.993 -3.000 0.085 0.011   NA
 127308 127309 Atu1326 Atu1327     FALSE 0.368 110.000 0.050 1.000   NA
 127309 127310 Atu1327 Atu1328     TRUE 0.500 132.000 0.260 NA   NA
 127311 127312 Atu1329 Atu1330 aat accC TRUE 0.926 7.000 0.114 1.000 N NA
 127312 127313 Atu1330 Atu1331 accC accB TRUE 0.974 13.000 0.153 0.001 Y NA
 127313 127314 Atu1331 Atu1332 accB aroQ TRUE 0.596 26.000 0.014 1.000 N NA
 127314 127315 Atu1332 Atu1333 aroQ   FALSE 0.410 126.000 0.110 1.000 N NA
 127318 127319 Atu1336 Atu1337     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA   NA
 127319 127320 Atu1337 Atu1338   fabG FALSE 0.182 128.000 0.000 0.057   NA
 127321 127322 Atu1339 Atu8016 rne   FALSE 0.006 260.000 0.000 NA   NA
 127323 127324 Atu1340 Atu1341 amiA mrcA FALSE 0.317 317.000 0.396 1.000 Y NA
 127324 127325 Atu1341 Atu1342 mrcA prfB FALSE 0.131 202.000 0.041 1.000 N NA
 127325 127326 Atu1342 Atu1343 prfB   FALSE 0.168 75.000 0.000 1.000 N NA
 127327 127328 Atu1344 Atu1345     TRUE 0.730 20.000 0.080 NA   NA
 127329 127330 Atu1346 Atu1347     FALSE 0.017 222.000 0.000 1.000   NA
 127332 127333 Atu1349 Atu1350   fdx TRUE 0.663 130.000 0.451 NA   NA
 127335 127336 Atu1352 Atu1353 folP folB TRUE 0.816 80.000 0.094 1.000 Y NA
 127336 127337 Atu1353 Atu1354 folB folK TRUE 0.933 20.000 0.142 1.000 Y NA
 127338 127339 Atu1355 Atu1356     FALSE 0.282 130.000 0.059 NA   NA
 127339 127340 Atu1356 Atu1357     TRUE 0.999 -3.000 0.791 NA   NA
 127340 127341 Atu1357 Atu1358     FALSE 0.309 129.000 0.072 NA   NA
 127343 127344 Atu1360 Atu1361     FALSE 0.096 65.000 0.000 NA   NA
 127345 127346 Atu1362 Atu1363   clpS FALSE 0.005 273.000 0.000 NA   NA
 127346 127347 Atu1363 Atu1364 clpS clpA TRUE 0.974 11.000 0.596 NA   NA
 127347 127348 Atu1364 Atu8156 clpA   FALSE 0.366 79.000 0.014 NA N NA
 127348 127349 Atu8156 Atu1366     TRUE 0.985 0.000 0.275 NA   NA
 127352 127353 Atu1369 Atu1370     TRUE 0.848 22.000 0.131 0.034   NA
 127353 127354 Atu1370 Atu1371     TRUE 0.995 -3.000 0.280 1.000   NA
 127354 127355 Atu1371 Atu1372     TRUE 0.964 18.000 0.696 NA N NA
 127356 127357 Atu1373 Atu1374   rpsB FALSE 0.080 194.000 0.009 NA   NA
 127357 127358 Atu1374 Atu1375 rpsB tsf FALSE 0.462 360.000 0.748 1.000 Y NA
 127358 127359 Atu1375 Atu1376 tsf pyrH TRUE 0.784 98.000 0.416 1.000 N NA
 127359 127360 Atu1376 Atu1377 pyrH rrf TRUE 0.904 67.000 0.626 1.000 N NA
 127360 127361 Atu1377 Atu1378 rrf uppS TRUE 0.843 65.000 0.409 1.000 N NA
 127361 127362 Atu1378 Atu1379 uppS cdsA TRUE 0.997 0.000 0.400 1.000 Y NA
 127362 127363 Atu1379 Atu1380 cdsA   TRUE 0.680 38.000 0.080 1.000 N NA
 127363 127364 Atu1380 Atu1381   omp1 TRUE 0.520 200.000 0.204 1.000 Y NA
 127364 127365 Atu1381 Atu1382 omp1 lpxD TRUE 0.855 50.000 0.063 1.000 Y NA
 127365 127366 Atu1382 Atu1383 lpxD fabZ TRUE 0.996 -7.000 0.212 1.000 N NA
 127366 127367 Atu1383 Atu1384 fabZ lpxA TRUE 0.987 0.000 0.264 1.000 N NA
 127367 127368 Atu1384 Atu1385 lpxA   TRUE 0.849 82.000 0.552 NA   NA
 127368 127369 Atu1385 Atu1386   lpxB TRUE 0.991 -3.000 0.173 NA   NA
 127369 127370 Atu1386 Atu1387 lpxB   FALSE 0.035 193.000 0.000 1.000 N NA
 127370 127371 Atu1387 Atu1388     TRUE 0.988 7.000 0.667 1.000 N NA
 127371 127372 Atu1388 Atu1389     TRUE 0.863 81.000 0.205 1.000 Y NA
 127372 127373 Atu1389 Atu1390     TRUE 0.999 -3.000 0.308 0.014 Y NA
 127373 127374 Atu1390 Atu1391     TRUE 1.000 -22.000 0.532 1.000 Y NA
 127377 127378 Atu1394 Atu1395   lexA FALSE 0.009 261.000 0.000 NA N NA
 127378 127379 Atu1395 Atu1396 lexA   FALSE 0.005 383.000 0.000 1.000 N NA
 127379 127380 Atu1396 Atu1397     TRUE 1.000 -19.000 1.000 1.000 Y NA
 127380 127381 Atu1397 Atu1398     TRUE 1.000 0.000 1.000 0.014 Y NA
 127381 127382 Atu1398 Atu1399     TRUE 0.966 69.000 0.667 1.000 Y NA
 127382 127383 Atu1399 Atu1400   serA TRUE 0.658 66.000 0.000 1.000 Y NA
 127383 127384 Atu1400 Atu1401 serA   FALSE 0.470 77.000 0.038 1.000 N NA
 127384 127385 Atu1401 Atu1402     TRUE 0.979 13.000 0.385 NA Y NA
 127385 127386 Atu1402 Atu1403     TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA Y NA
 127386 127387 Atu1403 Atu1404     TRUE 0.982 65.000 1.000 NA Y NA
 127387 127388 Atu1404 Atu1405     FALSE 0.064 124.000 0.000 NA N NA
 127389 127390 Atu1406 Atu1407     TRUE 0.916 11.000 0.076 0.080 N NA
 127390 127391 Atu1407 Atu1408   gutB TRUE 0.700 50.000 0.045 0.057 N NA
 127391 127392 Atu1408 Atu1409 gutB allA TRUE 0.846 0.000 0.000 1.000 N NA
 127393 127394 Atu1410 Atu1411     TRUE 0.994 -3.000 0.100 0.035 N NA
 127394 127395 Atu1411 Atu1412     TRUE 0.954 2.000 0.075 NA N NA
 127395 127396 Atu1412 Atu1413     FALSE 0.373 139.000 0.000 NA Y NA
 127396 127397 Atu1413 Atu1414   acd FALSE 0.134 69.000 0.000 NA N NA
 127397 127398 Atu1414 Atu1415 acd   TRUE 0.749 35.000 0.000 1.000 Y NA
 127398 127399 Atu1415 Atu1416     TRUE 0.999 -3.000 0.286 0.080 Y NA
 127403 127404 Atu1419 Atu1420   gcvT FALSE 0.333 156.000 0.150 1.000 N NA
 127405 127406 Atu1421 Atu1422     TRUE 0.992 -10.000 0.051 1.000   NA
 127407 127408 Atu1423 Atu1424   kdsA TRUE 0.950 0.000 0.023 1.000   NA
 127408 127409 Atu1424 Atu1426 kdsA eno FALSE 0.278 137.000 0.041 1.000 N NA
 127409 3819959 Atu1426 Atu1427 eno   FALSE 0.276 13.000 0.000 NA   NA
 3819959 127410 Atu1427 Atu1428     FALSE 0.045 122.000 0.000 NA   NA
 127410 127411 Atu1428 Atu1429   pdhA FALSE 0.072 277.000 0.104 1.000 N NA
 127411 127412 Atu1429 Atu1430 pdhA pdhB TRUE 0.985 18.000 0.456 0.000 Y NA
 127412 127413 Atu1430 Atu1431 pdhB   FALSE 0.438 7.000 0.000 NA   NA
 127413 127414 Atu1431 Atu1432   aceF FALSE 0.032 144.000 0.000 NA   NA
 127414 127415 Atu1432 Atu1433 aceF   TRUE 0.789 13.000 0.036 1.000 N NA
 127415 127416 Atu1433 Atu1434   lpdA FALSE 0.474 61.000 0.017 1.000 N NA
 127416 127417 Atu1434 Atu1435 lpdA   FALSE 0.307 98.000 0.007 1.000   NA
 127417 127418 Atu1435 Atu1436   lipA FALSE 0.289 104.000 0.009 1.000   NA
 127419 127420 Atu1437 Atu1438     FALSE 0.002 363.000 0.000 NA   NA
 127420 127421 Atu1438 Atu1439     FALSE 0.040 129.000 0.000 NA   NA
 127422 127423 Atu1440 Atu1441     FALSE 0.473 10.000 0.000 NA N NA
 127424 127425 Atu1442 Atu1443 cinA ispF TRUE 0.984 -3.000 0.061 NA   NA
 127426 127427 Atu1444 Atu1445 nifR ntrB TRUE 0.990 -3.000 0.094 1.000 N NA
 127427 127428 Atu1445 Atu1446 ntrB ntrC TRUE 0.998 -3.000 0.297 1.000 Y NA
 127428 127429 Atu1446 Atu1447 ntrC ntrY TRUE 0.691 149.000 0.205 1.000 Y NA
 127429 127430 Atu1447 Atu1448 ntrY ntrX TRUE 1.000 -10.000 0.533 1.000 Y NA
 127430 127431 Atu1448 Atu1449 ntrX trkA TRUE 0.653 49.000 0.085 1.000 N NA
 127431 3819960 Atu1449 Atu1450 trkA hfq FALSE 0.029 185.000 0.000 1.000   NA
 3819960 127434 Atu1450 Atu1451 hfq hflx FALSE 0.169 207.000 0.115 1.000   NA
 127435 127436 Atu1452 Atu1453 mazG   FALSE 0.386 76.000 0.015 1.000   NA
 127437 127438 Atu1454 Atu1455 cysG   TRUE 0.995 -7.000 0.188 NA   NA
 127438 127439 Atu1455 Atu1456   cysI TRUE 0.991 9.000 0.919 NA   NA
 127439 127440 Atu1456 Atu1457 cysI   TRUE 0.941 11.000 0.309 NA   NA
 127440 127441 Atu1457 Atu1458   mvrA FALSE 0.169 147.000 0.022 NA   NA
 127444 127445 Atu1461 Atu1462   gcvP FALSE 0.045 149.000 0.000 NA N NA
 127445 127446 Atu1462 Atu1463 gcvP gcvH TRUE 0.993 0.000 0.130 1.000 Y NA
 127446 127447 Atu1463 Atu1464 gcvH gcvT TRUE 0.955 29.000 0.202 0.002 Y NA
 3819961 127448 Atu1466 Atu1467     FALSE 0.084 75.000 0.000 NA   NA
 127448 127449 Atu1467 Atu1468     TRUE 0.858 87.000 0.600 NA   NA
 127451 127452 Atu1470 Atu1471 crcB rluC TRUE 0.567 67.000 0.083 NA N NA
 127452 127453 Atu1471 Atu1472 rluC   TRUE 0.971 7.000 0.389 1.000   NA
 127453 127454 Atu1472 Atu1473     TRUE 0.833 31.000 0.269 1.000   NA
 127454 127455 Atu1473 Atu1474     FALSE 0.464 61.000 0.036 NA   NA
 127455 127456 Atu1474 Atu1475     FALSE 0.009 234.000 0.000 NA   NA
 127457 127458 Atu1476 Atu1477     TRUE 0.610 29.000 0.046 NA   NA
 127458 127459 Atu1477 Atu1478     TRUE 0.524 26.000 0.012 NA   NA
 127461 127462 Atu1480 Atu1481     FALSE 0.034 141.000 0.000 NA   NA
 127462 127464 Atu1481 Atu1482     FALSE 0.028 152.000 0.000 NA   NA
 127464 127465 Atu1482 Atu1483     FALSE 0.002 374.000 0.000 NA   NA
 127465 127466 Atu1483 Atu1484   prtR TRUE 0.934 4.000 0.071 NA N NA
 127466 127467 Atu1484 Atu1485 prtR prtI TRUE 0.999 -3.000 0.500 NA Y NA
 127467 127468 Atu1485 Atu1486 prtI   TRUE 0.973 6.000 0.400 NA   NA
 127468 127469 Atu1486 Atu1487     FALSE 0.321 111.000 0.043 NA   NA
 127469 127470 Atu1487 Atu1488   tnp FALSE 0.020 176.000 0.000 NA   NA
 127470 127471 Atu1488 Atu1489 tnp arsH FALSE 0.020 178.000 0.000 NA   NA
 127471 127472 Atu1489 Atu1490 arsH arsC TRUE 0.812 14.000 0.105 NA   NA
 127472 127473 Atu1490 Atu1491 arsC   TRUE 0.987 3.000 0.105 1.000 Y NA
 127473 127474 Atu1491 Atu1492     FALSE 0.081 131.000 0.000 1.000 N NA
 127474 127475 Atu1492 Atu1493   clc FALSE 0.078 135.000 0.000 1.000 N NA
 127475 127476 Atu1493 Atu1494 clc   FALSE 0.289 101.000 0.005 1.000   NA
 127476 127477 Atu1494 Atu1495     TRUE 0.954 3.000 0.139 NA   NA
 127477 127478 Atu1495 Atu1496   metS TRUE 0.922 11.000 0.221 NA N NA
 127478 127479 Atu1496 Atu1497 metS holB FALSE 0.429 112.000 0.075 1.000 N NA
 127479 127480 Atu1497 Atu1498 holB tmk TRUE 0.997 -7.000 0.254 1.000 N NA
 127480 127481 Atu1498 Atu1499 tmk dac FALSE 0.108 240.000 0.099 1.000 N NA
 127481 127482 Atu1499 Atu1500 dac rlpA TRUE 0.858 74.000 0.198 NA Y NA
 3819962 127484 Atu1502 Atu8017     FALSE 0.063 101.000 0.000 NA   NA
 127484 127485 Atu8017 Atu1503     FALSE 0.003 330.000 0.000 NA   NA
 127486 127487 Atu8090 Atu1505   dac FALSE 0.348 139.000 0.146 NA   NA
 127487 127488 Atu1505 Atu1506 dac   TRUE 0.686 84.000 0.271 NA   NA
 127490 127491 Atu1508 Atu1509     FALSE 0.056 133.000 0.000 NA N NA
 127492 127493 Atu1510 Atu1511     TRUE 0.999 -7.000 0.607 NA   NA
 127493 127494 Atu1511 Atu1512   ssb FALSE 0.148 91.000 0.000 1.000 N NA
 127495 127496 Atu1513 Atu1514 uvrA   FALSE 0.387 54.000 0.005 NA   NA
 127498 127499 Atu1516 Atu1517     TRUE 0.600 32.000 0.035 1.000   NA
 127500 127501 Atu1518 Atu1519 zur znuB TRUE 0.997 -3.000 0.086 1.000 Y NA
 127501 127502 Atu1519 Atu1520 znuB znuC TRUE 1.000 -7.000 0.755 1.000 Y NA
 127505 127506 Atu1523 Atu1524 manA   FALSE 0.123 104.000 0.000 1.000 N NA
 127506 127507 Atu1524 Atu1525     FALSE 0.017 192.000 0.000 NA   NA
 127508 3819963 Atu1526 Atu1527 gntZ fixS FALSE 0.154 152.000 0.009 NA N NA
 3819963 127509 Atu1527 Atu1528 fixS fixI TRUE 0.999 -3.000 0.713 NA Y NA
 127509 127510 Atu1528 Atu1529 fixI fixH TRUE 0.998 -3.000 0.206 NA Y NA
 127510 127511 Atu1529 Atu1530 fixH fixG TRUE 0.998 -3.000 0.506 NA N NA
 127512 127513 Atu1531 Atu1532     TRUE 0.891 12.000 0.195 NA   NA
 127513 127514 Atu1532 Atu1533     FALSE 0.215 17.000 0.000 NA   NA
 127515 3819964 Atu1534 Atu1535 fixP fixQ TRUE 0.982 4.000 0.232 0.002 N NA
 3819964 127516 Atu1535 Atu1536 fixQ fixO TRUE 0.934 13.000 0.188 0.002 N NA
 127516 127517 Atu1536 Atu1537 fixO fixN TRUE 0.971 11.000 0.333 0.002 N NA
 127518 127519 Atu1539 Atu1540 hvsT   TRUE 0.995 -3.000 0.317 1.000   NA
 127519 127520 Atu1540 Atu1541     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 127522 127523 Atu1544 Atu1545     TRUE 0.506 94.000 0.118 NA   NA
 127524 127525 Atu1546 Atu1547   mgtE TRUE 0.613 72.000 0.118 1.000 N NA
 127526 127527 Atu1548 Atu1549 fdhF   TRUE 0.999 -10.000 0.769 NA   NA
 127527 127528 Atu1549 Atu1550   def FALSE 0.215 17.000 0.000 NA   NA
 127532 127533 Atu1556 Atu1557 lipB   FALSE 0.145 67.000 0.000 1.000   NA
 127533 127534 Atu1557 Atu1558     FALSE 0.054 111.000 0.000 NA   NA
 127535 127536 Atu1559 Atu1560   crtB FALSE 0.304 124.000 0.059 NA   NA
 127536 127537 Atu1560 Atu1561 crtB   TRUE 0.767 24.000 0.165 NA   NA
 127537 127538 Atu1561 Atu1562   secD TRUE 0.961 0.000 0.060 NA   NA
 127538 127539 Atu1562 Atu1563 secD yajC TRUE 0.802 83.000 0.099 NA Y NA
 127541 3819967 Atu1565 Atu1566 cysE   FALSE 0.116 50.000 0.000 NA   NA
 127545 127546 Atu1570 Atu1571   cysE TRUE 0.969 7.000 0.386 NA   NA
 127546 127547 Atu1571 Atu1572 cysE   FALSE 0.237 201.000 0.200 1.000   NA
 127548 127549 Atu1573 Atu1574   nah TRUE 0.951 30.000 0.745 NA   NA
 127551 127552 Atu1577 Atu1578     TRUE 0.923 110.000 0.548 1.000 Y NA
 127552 127553 Atu1578 Atu1579     TRUE 0.999 3.000 0.815 0.013 Y NA
 127553 127554 Atu1579 Atu1580     TRUE 0.992 13.000 0.734 1.000 Y NA
 127554 3819968 Atu1580 Atu1581     FALSE 0.011 219.000 0.000 NA   NA
 3819968 3819969 Atu1581 Atu1583     FALSE 0.009 231.000 0.000 NA   NA
 3819969 3819970 Atu1583 Atu1584     FALSE 0.031 145.000 0.000 NA   NA
 3819970 3819971 Atu1584 Atu1585     FALSE 0.074 90.000 0.000 NA   NA
 127559 127560 Atu1588 Atu1589 hom   TRUE 0.889 62.000 0.202 1.000 Y NA
 127560 127561 Atu1589 Atu1590   iunH FALSE 0.006 304.000 0.000 NA N NA
 127563 127564 Atu1592 Atu1594   msbB FALSE 0.025 279.000 0.000 0.058   NA
 127564 127565 Atu1594 Atu1595 msbB   TRUE 0.994 -3.000 0.248 1.000 N NA
 127565 127566 Atu1595 Atu1596   fabF TRUE 0.655 143.000 0.453 1.000 N NA
 127566 127567 Atu1596 Atu1597 fabF fabF TRUE 0.995 13.000 0.784 0.016 Y NA
 127567 127568 Atu1597 Atu1599 fabF fabZ TRUE 0.682 209.000 0.490 NA Y NA
 127568 127569 Atu1599 Atu1600 fabZ acpP TRUE 0.909 90.000 0.394 NA Y NA
 127569 127570 Atu1600 Atu1601 acpP hemN FALSE 0.358 115.000 0.045 1.000 N NA
 127574 127575 Atu1604 Atu1605 phbC sfsA TRUE 0.493 32.000 0.013 NA   NA
 127575 127576 Atu1605 Atu1606 sfsA map TRUE 0.675 29.000 0.080 NA   NA
 127576 127577 Atu1606 Atu1607 map radC TRUE 0.870 14.000 0.169 1.000 N NA
 127577 127578 Atu1607 Atu1608 radC   FALSE 0.053 138.000 0.000 NA N NA
 127578 127579 Atu1608 Atu1609     TRUE 0.984 2.000 0.353 NA   NA
 127580 127581 Atu1610 Atu1611 dhs gor FALSE 0.086 252.000 0.079 1.000 N NA
 127581 127582 Atu1611 Atu8160 gor   FALSE 0.386 144.000 0.200 NA   NA
 127582 127583 Atu8160 Atu1613   rpiA TRUE 0.737 17.000 0.065 NA   NA
 127586 127587 Atu1616 Atu1617 fumC   FALSE 0.032 199.000 0.000 1.000 N NA
 127588 127589 Atu1618 Atu1619 pyrG secG TRUE 0.644 52.000 0.083 1.000 N NA
 127589 127590 Atu1619 Atu1620 secG tpiA TRUE 0.517 116.000 0.184 1.000 N NA
 127590 127591 Atu1620 Atu1621 tpiA   FALSE 0.068 213.000 0.016 NA   NA
 127594 127595 Atu1624 Atu1625     TRUE 0.778 30.000 0.167 1.000 N NA
 127595 127596 Atu1625 Atu1626     FALSE 0.003 600.000 0.000 1.000 N NA
 127597 127598 Atu1627 Atu1628 clpP   TRUE 0.499 44.000 0.028 NA   NA
 127598 3819972 Atu1628 Atu1629     TRUE 0.999 -3.000 0.727 NA   NA
 127600 127601 Atu1631 Atu1632 rrpX   FALSE 0.012 243.000 0.000 1.000   NA
 127601 127602 Atu1632 Atu1633   kefA FALSE 0.036 165.000 0.000 NA N NA
 127603 3819973 Atu1634 Atu1635     FALSE 0.027 155.000 0.000 NA   NA
 127605 127606 Atu1637 Atu8018     FALSE 0.023 168.000 0.000 NA   NA
 3819974 127608 Atu1638 Atu1639     TRUE 0.925 -13.000 0.000 NA   NA
 127608 127609 Atu1639 Atu1640     FALSE 0.072 93.000 0.000 NA   NA
 127611 127612 Atu1644 Atu1645     TRUE 0.788 16.000 0.109 NA   NA
 127612 127613 Atu1645 Atu1646     TRUE 0.996 9.000 0.850 NA Y NA
 127613 127614 Atu1646 Atu1647     TRUE 0.997 11.000 0.889 0.034 Y NA
 127616 127617 Atu1649 Atu1650     FALSE 0.012 245.000 0.000 1.000   NA
 127618 127619 Atu1652 Atu1653 maeB   FALSE 0.023 166.000 0.000 NA   NA
 127620 127621 Atu1654 Atu1656   tolB FALSE 0.003 380.000 0.000 NA N NA
 127621 127622 Atu1656 Atu1657 tolB nadE FALSE 0.460 70.000 0.034 NA N NA
 127623 127624 Atu1658 Atu1659 cgmA   TRUE 0.943 0.000 0.023 NA   NA
 127624 3819977 Atu1659 Atu1660     FALSE 0.055 110.000 0.000 NA   NA
 3819977 127625 Atu1660 Atu1661   sthA FALSE 0.057 108.000 0.000 NA   NA
 127628 3819978 Atu1664 Atu1665 tig   FALSE 0.008 241.000 0.000 NA   NA
 3819979 3819980 Atu1666 Atu1667     TRUE 0.929 -63.000 0.000 NA   NA
 3819980 127630 Atu1667 Atu8161     FALSE 0.002 452.000 0.000 NA   NA
 127630 127631 Atu8161 Atu1669   gidA FALSE 0.015 378.000 0.023 NA   NA
 127631 127632 Atu1669 Atu1670 gidA adhC FALSE 0.061 151.000 0.000 1.000 N NA
 127632 127633 Atu1670 Atu8112 adhC   FALSE 0.023 166.000 0.000 NA   NA
 127633 127634 Atu8112 Atu8162     FALSE 0.057 107.000 0.000 NA   NA
 127634 127635 Atu8162 Atu1672   fadD TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 127635 127636 Atu1672 Atu1673 fadD lysA TRUE 0.631 80.000 0.056 0.033 N NA
 127639 127640 Atu1676 Atu1677 pabB tgt FALSE 0.053 161.000 0.000 1.000 N NA
 127640 127641 Atu1677 Atu1678 tgt queA TRUE 0.998 0.000 0.360 0.000 Y NA
 127641 127642 Atu1678 Atu1679 queA ppiB FALSE 0.061 250.000 0.031 1.000 N NA
 127642 127643 Atu1679 Atu1680 ppiB ppiB TRUE 0.973 37.000 0.420 0.001 Y NA
 127643 127644 Atu1680 Atu1681 ppiB coaD TRUE 0.606 30.000 0.024 1.000 N NA
 127645 3819981 Atu1682 Atu1683     FALSE 0.018 183.000 0.000 NA   NA
 3819981 127647 Atu1683 Atu1685     FALSE 0.005 279.000 0.000 NA   NA
 127647 127648 Atu1685 Atu1686   ppiD FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 127648 127649 Atu1686 Atu1687 ppiD trpD TRUE 0.699 15.000 0.014 1.000 N NA
 127649 127650 Atu1687 Atu1688 trpD trpC TRUE 0.981 11.000 0.293 1.000 Y NA
 127650 127651 Atu1688 Atu1689 trpC moaC TRUE 0.920 8.000 0.113 1.000 N NA
 127651 127652 Atu1689 Atu1690 moaC moeA TRUE 0.994 1.000 0.093 0.002 Y NA
 127652 127654 Atu1690 Atu1691 moeA   FALSE 0.003 482.000 0.000 1.000 N NA
 127655 127656 Atu1692 Atu1693   kefB FALSE 0.172 52.000 0.000 1.000   NA
 127656 127657 Atu1693 Atu1694 kefB   FALSE 0.004 293.000 0.000 NA   NA
 127658 127659 Atu1695 Atu1696 moaA   FALSE 0.259 168.000 0.125 NA N NA
 127659 127660 Atu1696 Atu1697     TRUE 0.987 2.000 0.067 NA Y NA
 127660 127661 Atu1697 Atu1698   mobA TRUE 0.977 -3.000 0.005 1.000 N NA
 127661 127662 Atu1698 Atu1699 mobA mobB TRUE 0.998 -3.000 0.056 0.002 Y NA
 127664 127665 Atu1700 Atu1701   pcm FALSE 0.053 301.000 0.089 1.000 N NA
 127665 127666 Atu1701 Atu1702 pcm surE TRUE 0.915 9.000 0.147 1.000   NA
 127666 127667 Atu1702 Atu1703 surE serS FALSE 0.116 213.000 0.058 1.000   NA
 127667 127668 Atu1703 Atu1704 serS tatC FALSE 0.440 100.000 0.065 NA N NA
 127668 127669 Atu1704 Atu1705 tatC tatB TRUE 0.999 -3.000 0.535 NA Y NA
 127669 127670 Atu1705 Atu1706 tatB tatA TRUE 0.958 54.000 0.353 0.005 Y NA
 127670 127671 Atu1706 Atu1707 tatA   FALSE 0.312 128.000 0.060 NA N NA
 127671 127672 Atu1707 Atu1708     TRUE 0.858 77.000 0.570 NA   NA
 127672 127673 Atu1708 Atu1709     TRUE 0.594 59.000 0.103 NA   NA
 127673 127674 Atu1709 Atu1710     FALSE 0.063 248.000 0.056 NA   NA
 127674 127675 Atu1710 Atu1711   argS FALSE 0.417 67.000 0.027 NA   NA
 127675 127676 Atu1711 Atu1712 argS dgt TRUE 0.531 75.000 0.062 1.000 N NA
 127677 127678 Atu1713 Atu1714     FALSE 0.029 302.000 0.038 NA   NA
 127679 127680 Atu1715 Atu1716 exoR   TRUE 0.925 -13.000 0.000 NA   NA
 127680 127681 Atu1716 Atu1717   fadL FALSE 0.006 260.000 0.000 NA   NA
 127681 127682 Atu1717 Atu1719 fadL valS FALSE 0.004 454.000 0.000 1.000 N NA
 127682 127683 Atu1719 Atu1720 valS   FALSE 0.076 219.000 0.033 NA   NA
 127683 127684 Atu1720 Atu1721   pcm FALSE 0.002 391.000 0.000 NA   NA
 127684 127685 Atu1721 Atu1722 pcm   FALSE 0.018 185.000 0.000 NA   NA
 127685 3819982 Atu1722 Atu1723     FALSE 0.074 90.000 0.000 NA   NA
 3819983 127687 Atu1724 Atu1725     FALSE 0.010 223.000 0.000 NA   NA
 3819984 127689 Atu1726 Atu1727     FALSE 0.075 89.000 0.000 NA   NA
 127689 127690 Atu1727 Atu1728   wrbA FALSE 0.307 12.000 0.000 NA   NA
 127691 127692 Atu1729 Atu1730     FALSE 0.118 88.000 0.000 1.000   NA
 127692 127693 Atu1730 Atu1731   gpt FALSE 0.086 127.000 0.000 1.000 N NA
 127693 127694 Atu1731 Atu1733 gpt nrdE FALSE 0.022 666.000 0.000 1.000 Y NA
 127694 3819985 Atu1733 Atu1734 nrdE   FALSE 0.027 154.000 0.000 NA   NA
 3819985 127695 Atu1734 Atu1735     FALSE 0.104 58.000 0.000 NA   NA
 127702 127703 Atu1742 Atu1743     TRUE 0.516 106.000 0.179 NA   NA
 127703 127704 Atu1743 Atu1744     TRUE 0.974 0.000 0.033 0.049   NA
 127706 127707 Atu1746 Atu8091 thrS   FALSE 0.220 127.000 0.023 NA   NA
 127707 127708 Atu8091 Atu1747     TRUE 0.971 -3.000 0.006 NA   NA
 127708 127709 Atu1747 Atu1748   nifU TRUE 0.906 4.000 0.041 NA   NA
 127710 127711 Atu1749 Atu1750 folE hisI FALSE 0.300 127.000 0.038 1.000 N NA
 127711 127712 Atu1750 Atu1751 hisI   FALSE 0.345 96.000 0.017 1.000   NA
 127713 127714 Atu1752 Atu1753     FALSE 0.384 155.000 0.211 1.000   NA
 127715 127716 Atu1754 Atu8163     FALSE 0.019 182.000 0.000 NA   NA
 127718 127719 Atu1758 Atu1759   sdaA TRUE 0.604 66.000 0.140 NA   NA
 3819987 127720 Atu1760 Atu8164     FALSE 0.005 270.000 0.000 NA   NA
 127721 3819988 Atu1762 Atu8019     FALSE 0.057 108.000 0.000 NA   NA
 127722 127723 Atu1763 Atu1764   metF FALSE 0.114 91.000 0.000 1.000   NA
 127725 127727 Atu1766 Atu1767     FALSE 0.005 272.000 0.000 NA   NA
 127729 127730 Atu1769 Atu1770 glnB glnA TRUE 0.848 73.000 0.145 1.000 Y NA
 127730 127731 Atu1770 Atu1771 glnA   FALSE 0.066 99.000 0.000 NA   NA
 127731 127732 Atu1771 Atu8165     FALSE 0.075 88.000 0.000 NA   NA
 127734 127735 Atu1774 Atu1775     TRUE 0.711 39.000 0.147 NA N NA
 127735 127736 Atu1775 Atu1776     FALSE 0.029 181.000 0.000 NA N NA
 127737 127738 Atu1777 Atu8020     FALSE 0.063 101.000 0.000 NA   NA
 127738 127739 Atu8020 Atu1778   mfd FALSE 0.206 18.000 0.000 NA   NA
 127739 127740 Atu1778 Atu1779 mfd   TRUE 0.930 4.000 0.078 NA   NA
 127741 127742 Atu1780 Atu1781 recG   FALSE 0.276 13.000 0.000 NA   NA
 127743 127744 Atu1782 Atu1783     TRUE 0.992 -3.000 0.211 NA   NA
 127744 127745 Atu1783 Atu1784     FALSE 0.046 120.000 0.000 NA   NA
 127745 127746 Atu1784 Atu1785     TRUE 0.654 14.000 0.012 NA   NA
 127746 127747 Atu1785 Atu1786   glmS TRUE 0.981 -3.000 0.027 1.000   NA
 127747 127748 Atu1786 Atu1787 glmS glmU FALSE 0.408 205.000 0.083 1.000 Y NA
 127748 127749 Atu1787 Atu1788 glmU   FALSE 0.087 207.000 0.006 1.000 N NA
 127749 127750 Atu1788 Atu1789     FALSE 0.019 214.000 0.000 1.000   NA
 127750 127751 Atu1789 Atu1790     TRUE 0.827 39.000 0.318 NA   NA
 127751 127752 Atu1790 Atu1791     TRUE 0.999 -3.000 0.923 NA   NA
 127752 127753 Atu1791 Atu1792     TRUE 0.998 -10.000 0.418 NA   NA
 127753 127754 Atu1792 Atu1793   pcs FALSE 0.015 227.000 0.000 1.000   NA
 127756 127757 Atu1795 Atu1796   ccdA TRUE 0.695 28.000 0.075 1.000   NA
 127758 127759 Atu1798 Atu8021     FALSE 0.027 156.000 0.000 NA   NA
 127759 127760 Atu8021 Atu1799     FALSE 0.025 160.000 0.000 NA   NA
 127760 127761 Atu1799 Atu1800     FALSE 0.037 134.000 0.000 NA   NA
 127761 127762 Atu1800 Atu1801     FALSE 0.093 68.000 0.000 NA   NA
 127762 127763 Atu1801 Atu1802   gloA FALSE 0.438 7.000 0.000 NA   NA
 127764 127765 Atu1803 Atu1804 cspA   FALSE 0.137 36.000 0.000 NA   NA
 127767 127768 Atu8166 Atu1808   ugcG FALSE 0.012 211.000 0.000 NA   NA
 127769 3819991 Atu1810 Atu1811     FALSE 0.125 43.000 0.000 NA   NA
 3819991 127770 Atu1811 Atu1812     FALSE 0.019 182.000 0.000 NA   NA
 127775 127776 Atu1815 Atu1816     TRUE 0.983 15.000 0.929 1.000 N NA
 127776 127777 Atu1816 Atu1817     TRUE 0.999 -10.000 0.459 NA Y NA
 127777 3819992 Atu1817 Atu1818     FALSE 0.095 66.000 0.000 NA   NA
 127779 127780 Atu1819 Atu1820     FALSE 0.391 112.000 0.083 NA   NA
 127780 127781 Atu1820 Atu1821   nifS TRUE 0.826 38.000 0.309 NA   NA
 127781 127782 Atu1821 Atu1822 nifS sufD TRUE 0.857 17.000 0.193 1.000 N NA
 127782 127783 Atu1822 Atu1823 sufD sufC TRUE 0.973 23.000 0.482 1.000 Y NA
 127783 127784 Atu1823 Atu1824 sufC sufB TRUE 0.940 73.000 0.466 1.000 Y NA
 127784 127785 Atu1824 Atu1825 sufB nifS FALSE 0.032 199.000 0.000 1.000 N NA
 127790 127791 Atu1830 Atu1831 bcp   TRUE 0.817 18.000 0.052 0.055   NA
 127791 127792 Atu1831 Atu1832     FALSE 0.454 90.000 0.054 1.000   NA
 127792 127793 Atu1832 Atu1833     FALSE 0.112 220.000 0.058 1.000 N NA
 127793 127794 Atu1833 Atu1834     TRUE 0.903 9.000 0.087 1.000 N NA
 127794 127795 Atu1834 Atu1835     FALSE 0.001 618.000 0.000 NA   NA
 127795 3819993 Atu1835 Atu1836     FALSE 0.052 113.000 0.000 NA   NA
 3819993 127796 Atu1836 Atu1837     FALSE 0.030 183.000 0.000 1.000   NA
 127796 127797 Atu1837 Atu1838     FALSE 0.036 137.000 0.000 NA   NA
 127797 127798 Atu1838 Atu1839   rpe FALSE 0.199 132.000 0.010 NA N NA
 127798 127799 Atu1839 Atu1840 rpe   FALSE 0.089 71.000 0.000 NA   NA
 127799 127800 Atu1840 Atu1841   purB FALSE 0.079 82.000 0.000 NA   NA
 127800 127801 Atu1841 Atu1842 purB   FALSE 0.373 71.000 0.006 1.000   NA
 127801 127802 Atu1842 Atu1843   purC FALSE 0.093 195.000 0.011 1.000   NA
 127802 3819994 Atu1843 Atu1844 purC purS TRUE 0.952 55.000 0.460 1.000 Y NA
 3819994 127803 Atu1844 Atu1845 purS purQ TRUE 0.977 68.000 0.656 0.001 Y NA
 127803 127804 Atu1845 Atu1846 purQ   FALSE 0.355 80.000 0.020 NA   NA
 127806 127807 Atu1848 Atu1849     FALSE 0.379 113.000 0.078 NA   NA
 127807 127808 Atu1849 Atu1850   purL FALSE 0.220 115.000 0.009 NA   NA
 127808 127809 Atu1850 Atu1851 purL   TRUE 0.784 17.000 0.093 NA N NA
 127811 127812 Atu1853 Atu1854   grlA FALSE 0.186 145.000 0.028 NA   NA
 127812 127813 Atu1854 Atu1855 grlA   FALSE 0.397 138.000 0.147 1.000 N NA
 127814 127815 Atu1856 Atu1857     TRUE 0.947 31.000 0.167 0.002 Y NA
 127815 127816 Atu1857 Atu1858     TRUE 0.582 20.000 0.005 NA N NA
 127816 127817 Atu1858 Atu1859   glsA FALSE 0.447 65.000 0.025 NA N NA
 127817 127818 Atu1859 Atu1860 glsA rpsD FALSE 0.425 70.000 0.011 1.000 N NA
 127820 127821 Atu1862 Atu1863     FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 127821 127822 Atu1863 Atu1864     FALSE 0.133 38.000 0.000 NA   NA
 127822 127823 Atu1864 Atu1865     FALSE 0.024 165.000 0.000 NA   NA
 127823 3819995 Atu1865 Atu1866     FALSE 0.026 158.000 0.000 NA   NA
 3819995 127824 Atu1866 Atu1867   murI FALSE 0.128 41.000 0.000 NA   NA
 127824 127825 Atu1867 Atu1868 murI lasT TRUE 0.991 -16.000 0.025 1.000 N NA
 127825 127826 Atu1868 Atu1869 lasT   FALSE 0.208 115.000 0.005 NA   NA
 127827 127828 Atu1870 Atu1871 icdA gst FALSE 0.021 336.000 0.008 1.000 N NA
 127829 127830 Atu1872 Atu1873   alaS FALSE 0.077 113.000 0.000 NA N NA
 127830 127831 Atu1873 Atu1874 alaS recA FALSE 0.095 231.000 0.054 1.000 N NA
 127832 127833 Atu1875 Atu1876     TRUE 0.738 29.000 0.131 NA N NA
 127834 3819996 Atu1877 Atu1878     FALSE 0.080 80.000 0.000 NA   NA
 127835 127836 Atu1879 Atu1880     TRUE 0.786 113.000 0.185 1.000 Y NA
 127836 127837 Atu1880 Atu1881     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.013 Y NA
 127837 127838 Atu1881 Atu1882   usg TRUE 0.659 169.000 0.273 NA Y NA
 127838 127839 Atu1882 Atu1883 usg   FALSE 0.450 85.000 0.061 NA   NA
 127840 127841 Atu1884 Atu1885 ssuA   FALSE 0.010 289.000 0.000 1.000 N NA
 127841 127842 Atu1885 Atu1886     TRUE 0.551 71.000 0.081 NA N NA
 127842 127843 Atu1886 Atu1887   exoI TRUE 0.901 20.000 0.050 NA Y NA
 127845 127846 Atu1889 Atu1890 dgk cobT TRUE 0.871 9.000 0.042 1.000 N NA
 127847 3819997 Atu1891 Atu1892 cobS   TRUE 0.628 20.000 0.028 NA   NA
 3819997 127848 Atu1892 Atu1893     TRUE 0.995 -3.000 0.305 NA   NA
 127848 127849 Atu1893 Atu1895   ribB FALSE 0.003 433.000 0.000 1.000   NA
 3819998 127850 Atu1896 Atu1897     FALSE 0.393 9.000 0.000 NA   NA
 127850 127851 Atu1897 Atu1898   rbsA TRUE 0.952 15.000 0.500 1.000 N NA
 127851 127852 Atu1898 Atu1899 rbsA rbsB TRUE 0.912 120.000 0.600 NA Y NA
 127852 127853 Atu1899 Atu1900 rbsB rbsC TRUE 0.765 133.000 0.261 NA Y NA
 127854 127855 Atu1901 Atu1902 tktB tkt TRUE 0.993 27.000 0.860 0.001 Y NA
 127855 127856 Atu1902 Atu1903 tkt glpK TRUE 0.795 122.000 0.596 1.000 N NA
 127856 127857 Atu1903 Atu1904 glpK   TRUE 0.757 45.000 0.200 1.000 N NA
 127857 127858 Atu1904 Atu1905     TRUE 0.766 25.000 0.118 1.000 N NA
 127859 127860 Atu1906 Atu1907     TRUE 0.998 -3.000 0.303 1.000 Y NA
 127860 127861 Atu1907 Atu1908     FALSE 0.093 105.000 0.000 1.000   NA
 127861 3819999 Atu1908 Atu1909     FALSE 0.076 86.000 0.000 NA   NA
 3819999 127862 Atu1909 Atu1910     FALSE 0.046 119.000 0.000 NA   NA
 127862 3820000 Atu1910 Atu1911     FALSE 0.002 447.000 0.000 NA   NA
 3820000 127863 Atu1911 Atu1912   mclA FALSE 0.051 114.000 0.000 NA   NA
 127865 127866 Atu1914 Atu1915     TRUE 0.986 -3.000 0.051 1.000 N NA
 127868 127869 Atu1917 Atu1918   ilvD FALSE 0.147 92.000 0.000 1.000 N NA
 127870 127871 Atu1919 Atu1920     TRUE 0.996 3.000 0.790 0.048   NA
 127871 127873 Atu1920 Atu1921     FALSE 0.002 440.000 0.000 NA   NA
 127874 127875 Atu1922 Atu1923 rplQ rpoA TRUE 0.893 119.000 0.873 1.000 N NA
 127875 127876 Atu1923 Atu1924 rpoA rpsK FALSE 0.357 196.000 0.308 1.000 N NA
 127876 127877 Atu1924 Atu1925 rpsK rpsM TRUE 0.953 139.000 0.810 0.011 Y NA
 127877 127878 Atu1925 Atu1926 rpsM adk FALSE 0.025 304.000 0.006 1.000 N NA
 127878 127879 Atu1926 Atu1927 adk prlA TRUE 0.979 -3.000 0.011 1.000 N NA
 127879 127881 Atu1927 Atu1928 prlA rplO FALSE 0.269 334.000 0.730 1.000 N NA
 127881 127882 Atu1928 Atu8065 rplO rpmD TRUE 0.991 17.000 0.653 0.002 Y NA
 127882 127883 Atu8065 Atu1929 rpmD rpsE TRUE 0.996 12.000 0.789 0.014 Y NA
 127883 127884 Atu1929 Atu1930 rpsE rplR TRUE 0.964 120.000 0.814 0.011 Y NA
 127884 127885 Atu1930 Atu1931 rplR rplF TRUE 0.995 13.000 0.815 0.011 Y NA
 127885 127886 Atu1931 Atu1932 rplF rpsH TRUE 0.987 44.000 0.808 0.011 Y NA
 127886 127887 Atu1932 Atu1933 rpsH rpsN TRUE 0.983 13.000 0.295 0.011 Y NA
 127887 127888 Atu1933 Atu1934 rpsN rplE TRUE 0.963 34.000 0.309 0.011 Y NA
 127888 127889 Atu1934 Atu1935 rplE rplX TRUE 1.000 -7.000 0.758 0.011 Y NA
 127889 127890 Atu1935 Atu1936 rplX rplN TRUE 0.995 13.000 0.810 0.014 Y NA
 127890 3820001 Atu1936 Atu1937 rplN rpsQ TRUE 0.822 235.000 0.791 0.014 Y NA
 3820001 127891 Atu1937 Atu1938 rpsQ rpmC TRUE 0.996 12.000 0.828 0.011 Y NA
 127891 127892 Atu1938 Atu1939 rpmC rplP TRUE 0.995 13.000 0.802 0.011 Y NA
 127892 127893 Atu1939 Atu1940 rplP rpsC TRUE 0.989 39.000 0.828 0.014 Y NA
 127893 127894 Atu1940 Atu1941 rpsC rplV TRUE 0.995 0.000 0.109 0.014 Y NA
 127894 127895 Atu1941 Atu1942 rplV rpsS TRUE 0.992 3.000 0.119 0.014 Y NA
 127895 127896 Atu1942 Atu1943 rpsS rplB TRUE 0.994 16.000 0.820 0.014 Y NA
 127896 127897 Atu1943 Atu1944 rplB rplW TRUE 0.989 44.000 0.849 0.010 Y NA
 127897 127898 Atu1944 Atu1945 rplW rplD TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.011 Y NA
 127898 127899 Atu1945 Atu1946 rplD rplC TRUE 0.990 13.000 0.486 0.011 Y NA
 127899 3820002 Atu1946 Atu1947 rplC rpsJ TRUE 0.777 169.000 0.307 0.014 Y NA
 3820002 127900 Atu1947 Atu1948 rpsJ tuf FALSE 0.281 311.000 0.318 1.000 Y NA
 127900 127901 Atu1948 Atu1949 tuf fusA TRUE 0.901 67.000 0.102 0.001 Y NA
 127901 127902 Atu1949 Atu1950 fusA rpsG TRUE 0.898 35.000 0.114 1.000 Y NA
 127902 127903 Atu1950 Atu1951 rpsG rpsL TRUE 0.971 78.000 0.620 0.002 Y NA
 3820003 127904 Atu1952 Atu1953     FALSE 0.307 12.000 0.000 NA   NA
 127904 127905 Atu1953 Atu1954     FALSE 0.066 99.000 0.000 NA   NA
 127906 127907 Atu1955 Atu1956 rpoC rpoB TRUE 0.823 182.000 0.851 0.001   NA
 127907 127908 Atu1956 Atu1957 rpoB rplL FALSE 0.120 264.000 0.223 1.000   NA
 127908 127909 Atu1957 Atu1958 rplL rplJ TRUE 0.987 60.000 0.884 0.011 Y NA
 127909 127910 Atu1958 Atu1959 rplJ rplA FALSE 0.284 357.000 0.302 0.014 Y NA
 127910 127911 Atu1959 Atu1960 rplA rplK TRUE 0.999 3.000 0.838 0.014 Y NA
 127911 127912 Atu1960 Atu1961 rplK nusG TRUE 0.778 146.000 0.681 1.000 N NA
 127912 127913 Atu1961 Atu1962 nusG secE TRUE 0.956 45.000 0.843 1.000 N NA
 127913 3820004 Atu1962 Atu1964 secE   FALSE 0.018 183.000 0.000 NA   NA
 3820004 127914 Atu1964 Atu1965   galE FALSE 0.040 128.000 0.000 NA   NA
 127914 127915 Atu1965 Atu1966 galE tuf FALSE 0.069 143.000 0.000 1.000 N NA
 127916 3820005 Atu1967 Atu1968     FALSE 0.233 15.000 0.000 NA   NA
 3820005 127917 Atu1968 Atu8023     FALSE 0.089 71.000 0.000 NA   NA
 127922 127923 Atu1972 Atu1973     FALSE 0.056 109.000 0.000 NA   NA
 127924 127925 Atu1974 Atu1975 cfa   TRUE 0.997 -3.000 0.324 0.057   NA
 127926 127927 Atu1977 Atu1978     TRUE 0.998 -3.000 0.722 NA   NA
 127927 127928 Atu1978 Atu1979     TRUE 0.996 -13.000 0.213 NA   NA
 127928 127929 Atu1979 Atu1980     FALSE 0.157 28.000 0.000 NA   NA
 127929 127930 Atu1980 Atu1981     TRUE 0.613 41.000 0.071 NA   NA
 127930 127931 Atu1981 Atu1982   sigK FALSE 0.042 126.000 0.000 NA   NA
 127931 127932 Atu1982 Atu1983 sigK   TRUE 0.996 -3.000 0.349 NA   NA
 127933 127934 Atu1984 Atu1985 fsrR   TRUE 0.967 5.000 0.000 0.016 Y NA
 127934 127935 Atu1985 Atu1986     TRUE 0.998 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 127937 127938 Atu1988 Atu1989     TRUE 0.909 14.000 0.000 0.016 Y NA
 127938 127939 Atu1989 Atu1990     TRUE 0.999 -7.000 0.395 1.000 Y NA
 3820007 3820008 Atu1991 Atu1992     FALSE 0.163 26.000 0.000 NA   NA
 127941 127942 Atu1993 Atu1994     FALSE 0.120 77.000 0.000 NA N NA
 127942 127943 Atu1994 Atu1995     FALSE 0.459 6.000 0.000 NA   NA
 127945 127946 Atu1998 Atu1999     TRUE 0.752 12.000 0.026 NA   NA
 127947 127948 Atu2000 Atu2001   uvrB FALSE 0.088 126.000 0.000 1.000 N NA
 127948 127949 Atu2001 Atu2002 uvrB   FALSE 0.081 79.000 0.000 NA   NA
 127950 127951 Atu2004 Atu2005     FALSE 0.017 189.000 0.000 NA   NA
 127956 127957 Atu2011 Atu2012     FALSE 0.021 210.000 0.000 1.000   NA
 127957 127958 Atu2012 Atu2013     TRUE 0.999 -12.000 0.590 NA N NA
 127958 127959 Atu2013 Atu2014     TRUE 0.992 10.000 0.607 NA Y NA
 127959 127960 Atu2014 Atu2015     FALSE 0.006 309.000 0.000 NA N NA
 127962 127963 Atu2017 Atu2018     TRUE 0.982 -3.000 0.043 NA   NA
 127963 127964 Atu2018 Atu2019   ilvC FALSE 0.052 139.000 0.000 NA N NA
 127964 127965 Atu2019 Atu2020 ilvC   TRUE 0.650 48.000 0.080 1.000 N NA
 127965 127966 Atu2020 Atu2021     FALSE 0.053 400.000 0.000 0.082 Y NA
 127968 127969 Atu2023 Atu2024 ndh pdxJ FALSE 0.173 73.000 0.000 1.000 N NA
 127971 127972 Atu2026 Atu8169     FALSE 0.080 80.000 0.000 NA   NA
 127972 127973 Atu8169 Atu2028     TRUE 0.994 -3.000 0.273 NA   NA
 127974 127975 Atu2029 Atu2030     TRUE 0.494 5.000 0.000 NA   NA
 127975 127976 Atu2030 Atu2031     TRUE 1.000 -3.000 0.909 NA Y NA
 127976 127977 Atu2031 Atu2032     FALSE 0.019 180.000 0.000 NA   NA
 127978 127979 Atu2033 Atu2034     TRUE 0.999 -7.000 0.600 NA   NA
 127979 127980 Atu2034 Atu2035   ilvH FALSE 0.088 126.000 0.000 1.000 N NA
 127980 127981 Atu2035 Atu2036 ilvH ilvI TRUE 0.959 20.000 0.146 0.001 Y NA
 127984 127985 Atu2040 Atu2041 serB   TRUE 0.980 -3.000 0.014 1.000 N NA
 127986 127987 Atu2042 Atu2043     FALSE 0.150 90.000 0.000 1.000 N NA
 127987 127988 Atu2043 Atu2044   hflC TRUE 0.562 193.000 0.084 0.006 Y NA
 127988 127989 Atu2044 Atu2045 hflC hflK TRUE 0.999 2.000 0.947 0.006 Y NA
 127989 127990 Atu2045 Atu2046 hflK folA FALSE 0.260 144.000 0.044 1.000 N NA
 127990 127991 Atu2046 Atu2047 folA thyA TRUE 0.995 -3.000 0.295 1.000 N NA
 127991 127992 Atu2047 Atu8170 thyA   FALSE 0.289 93.000 0.007 NA   NA
 3820012 127993 Atu2049 Atu8171     FALSE 0.009 229.000 0.000 NA   NA
 127993 127994 Atu8171 Atu2051     FALSE 0.002 377.000 0.000 NA   NA
 127995 127996 Atu2052 Atu2053     TRUE 0.568 92.000 0.156 NA N NA
 127996 127997 Atu2053 Atu2054     FALSE 0.059 130.000 0.000 NA N NA
 127997 127998 Atu2054 Atu2055     TRUE 0.997 -3.000 0.442 NA N NA
 127999 128000 Atu2056 Atu2057   pcrA FALSE 0.262 103.000 0.010 NA   NA
 128000 128001 Atu2057 Atu2058 pcrA   FALSE 0.009 297.000 0.000 1.000 N NA
 128003 128004 Atu2060 Atu2061     TRUE 0.913 -3.000 0.000 1.000   NA
 128004 128005 Atu2061 Atu2062     FALSE 0.046 120.000 0.000 NA   NA
 128005 128006 Atu2062 Atu2063     TRUE 0.997 -3.000 0.477 NA   NA
 128010 128011 Atu2068 Atu2069     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 128012 3820013 Atu2070 Atu2071     FALSE 0.007 245.000 0.000 NA   NA
 3820013 128013 Atu2071 Atu2072   prmA FALSE 0.033 142.000 0.000 NA   NA
 128013 128014 Atu2072 Atu2073 prmA sco1 FALSE 0.404 80.000 0.025 1.000   NA
 128014 128015 Atu2073 Atu2074 sco1   FALSE 0.322 142.000 0.125 NA   NA
 128017 128018 Atu2076 Atu2077     TRUE 0.500 48.000 0.033 NA   NA
 128018 128019 Atu2077 Atu2078     FALSE 0.236 44.000 0.000 1.000 N NA
 128020 128021 Atu2079 Atu2080     FALSE 0.018 185.000 0.000 NA   NA
 128022 128023 Atu2081 Atu2082 kka   FALSE 0.096 65.000 0.000 NA   NA
 128023 128024 Atu2082 Atu2083   recN TRUE 0.727 125.000 0.039 0.011 Y NA
 128024 128025 Atu2083 Atu2084 recN   TRUE 0.811 16.000 0.117 1.000   NA
 128025 128026 Atu2084 Atu2085   lpxC FALSE 0.091 235.000 0.064 1.000   NA
 128026 128027 Atu2085 Atu2086 lpxC ftsZ2 FALSE 0.083 271.000 0.134 1.000 N NA
 128027 128028 Atu2086 Atu2087 ftsZ2 ftsA TRUE 0.808 93.000 0.114 1.000 Y NA
 128028 128029 Atu2087 Atu2088 ftsA ftsQ TRUE 0.990 -3.000 0.137 NA N NA
 128029 128030 Atu2088 Atu2089 ftsQ ddlB TRUE 0.999 -33.000 0.372 NA Y NA
 128032 128033 Atu2091 Atu2092   murB FALSE 0.031 202.000 0.000 1.000 N NA
 128033 128034 Atu2092 Atu2093 murB murC TRUE 0.998 -3.000 0.108 0.003 Y NA
 128034 128035 Atu2093 Atu2094 murC murG TRUE 0.998 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 128035 128036 Atu2094 Atu2095 murG ftsW TRUE 0.987 7.000 0.647 1.000 N NA
 128036 128037 Atu2095 Atu2096 ftsW murD TRUE 0.982 5.000 0.297 0.002 N NA
 128037 128038 Atu2096 Atu2097 murD mraY TRUE 0.998 4.000 0.647 0.003 Y NA
 128038 128039 Atu2097 Atu2098 mraY murF TRUE 0.971 24.000 0.309 0.003 Y NA
 128039 128040 Atu2098 Atu2099 murF murE TRUE 1.000 -3.000 0.569 0.001 Y NA
 128040 128041 Atu2099 Atu2100 murE pbpB1 TRUE 0.791 58.000 0.014 1.000 Y NA
 128041 128042 Atu2100 Atu2101 pbpB1   TRUE 0.965 0.000 0.076 NA   NA
 128042 128043 Atu2101 Atu2102   mraW TRUE 0.954 2.000 0.089 NA   NA
 128043 3820014 Atu2102 Atu2103 mraW   TRUE 0.961 15.000 0.635 NA   NA
 128044 128045 Atu2104 Atu2105     TRUE 0.968 10.000 0.470 NA   NA
 128045 3820015 Atu2105 Atu2106   gsp TRUE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 3820017 128049 Atu2109 Atu2110 rnpB solA FALSE 0.059 105.000 0.000 NA   NA
 128049 128050 Atu2110 Atu2111 solA solA TRUE 0.973 60.000 0.556 0.003 Y NA
 128050 128051 Atu2111 Atu2112 solA slt TRUE 0.564 93.000 0.171 NA   NA
 128051 128052 Atu2112 Atu2113 slt   FALSE 0.047 248.000 0.026 NA   NA
 128052 128053 Atu2113 Atu2114   djlA TRUE 0.990 -3.000 0.098 1.000 N NA
 128054 128055 Atu2115 Atu2116 pfp   TRUE 0.702 53.000 0.158 1.000 N NA
 128055 128056 Atu2116 Atu2117     FALSE 0.358 137.000 0.123 NA N NA
 128056 128057 Atu2117 Atu2119     FALSE 0.004 342.000 0.000 NA N NA
 128057 128058 Atu2119 Atu2120     TRUE 0.821 51.000 0.347 NA   NA
 128058 128059 Atu2120 Atu2121   lyc FALSE 0.210 164.000 0.058 1.000   NA
 128059 128060 Atu2121 Atu2122 lyc mltB TRUE 0.789 124.000 0.235 1.000 Y NA
 128061 128062 Atu2123 Atu2124 metF   TRUE 0.949 5.000 0.160 1.000 N NA
 128062 128063 Atu2124 Atu2125   chvD FALSE 0.138 162.000 0.009 1.000   NA
 128064 128065 Atu2126 Atu2127   caiB TRUE 0.612 77.000 0.039 0.032 N NA
 128065 128066 Atu2127 Atu2128 caiB iivG TRUE 0.930 9.000 0.176 1.000 N NA
 128066 128067 Atu2128 Atu2129 iivG   FALSE 0.038 188.000 0.000 1.000 N NA
 128068 128069 Atu2130 Atu2131     TRUE 0.710 48.000 0.194 NA   NA
 128069 128070 Atu2131 Atu2132     TRUE 0.616 98.000 0.231 NA   NA
 128072 128073 Atu2134 Atu2135     TRUE 0.908 44.000 0.522 1.000 N NA
 128073 128074 Atu2135 Atu2136   parA FALSE 0.147 92.000 0.000 1.000 N NA
 128074 128075 Atu2136 Atu2137 parA   FALSE 0.024 165.000 0.000 NA   NA
 128075 128076 Atu2137 Atu2138     FALSE 0.276 13.000 0.000 NA   NA
 128076 128077 Atu2138 Atu2139     TRUE 1.000 -3.000 0.706 0.054 Y NA
 128077 128078 Atu2139 Atu2140     FALSE 0.206 18.000 0.000 NA   NA
 128078 128079 Atu2140 Atu2141     FALSE 0.033 143.000 0.000 NA   NA
 128079 128080 Atu2141 Atu2142   glnA FALSE 0.142 69.000 0.000 1.000   NA
 128080 128081 Atu2142 Atu2143 glnA   TRUE 0.831 66.000 0.070 1.000 Y NA
 128081 128082 Atu2143 Atu2144     FALSE 0.157 224.000 0.000 1.000 Y NA
 128085 128086 Atu2147 Atu2148     FALSE 0.297 204.000 0.301 NA   NA
 128086 128087 Atu2148 Atu2149     TRUE 0.999 -3.000 0.774 NA   NA
 128087 128088 Atu2149 Atu2150     TRUE 0.981 14.000 0.461 NA Y NA
 128088 128089 Atu2150 Atu2151   adh FALSE 0.110 95.000 0.000 1.000   NA
 128091 128092 Atu2153 Atu2154   tphA FALSE 0.126 79.000 0.000 1.000   NA
 128095 3820018 Atu2157 Atu2158     FALSE 0.014 202.000 0.000 NA   NA
 128096 128097 Atu2159 Atu2160 omp   FALSE 0.097 64.000 0.000 NA   NA
 128099 128100 Atu2163 Atu2164     FALSE 0.028 152.000 0.000 NA   NA
 128102 128103 Atu2166 Atu2167   rpoD FALSE 0.029 151.000 0.000 NA   NA
 128103 128104 Atu2167 Atu2168 rpoD dnaG FALSE 0.067 393.000 0.299 1.000 N NA
 128104 128105 Atu2168 Atu2169 dnaG   FALSE 0.034 387.000 0.137 1.000   NA
 128106 128107 Atu2170 Atu2171 carA   FALSE 0.002 533.000 0.000 1.000   NA
 128109 128110 Atu2173 Atu2174 mcpA   FALSE 0.004 296.000 0.000 NA   NA
 128111 128112 Atu2175 Atu2176     FALSE 0.452 99.000 0.087 NA   NA
 128113 128114 Atu2177 Atu2178   carB FALSE 0.135 156.000 0.003 NA N NA
 128114 128115 Atu2178 Atu8025 carB   FALSE 0.021 210.000 0.000 1.000   NA
 128116 128117 Atu2179 Atu2180     FALSE 0.059 153.000 0.000 1.000 N NA
 128117 128118 Atu2180 Atu2181     TRUE 0.997 0.000 0.748 1.000   NA
 128119 128120 Atu2182 Atu2183 greA lpcC FALSE 0.457 81.000 0.036 1.000 N NA
 128122 128123 Atu2185 Atu2186 trxB   TRUE 0.760 19.000 0.065 1.000 N NA
 128123 3820020 Atu2186 Atu8103   suhB FALSE 0.002 427.000 0.000 NA   NA
 3820020 128124 Atu8103 Atu2187 suhB   FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 128124 128125 Atu2187 Atu2188     TRUE 0.542 123.000 0.224 1.000 N NA
 128126 128127 Atu2189 Atu2190     TRUE 0.713 0.000 0.000 NA   NA
 3820021 128129 Atu2192 Atu2193     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 3820022 128130 Atu2194 Atu2195   chaA TRUE 0.927 -18.000 0.000 NA   NA
 128132 128133 Atu2197 Atu2198     FALSE 0.030 148.000 0.000 NA   NA
 128133 128134 Atu2198 Atu2199     FALSE 0.027 156.000 0.000 NA   NA
 128134 128135 Atu2199 Atu8026     FALSE 0.103 59.000 0.000 NA   NA
 128135 128136 Atu8026 Atu2200   cspA FALSE 0.005 268.000 0.000 NA   NA
 128138 3820023 Atu2203 Atu2204     FALSE 0.186 21.000 0.000 NA   NA
 3820023 128139 Atu2204 Atu2205   petP FALSE 0.146 32.000 0.000 NA   NA
 128139 128140 Atu2205 Atu2206 petP petR TRUE 0.995 3.000 0.392 1.000 Y NA
 128140 128141 Atu2206 Atu2207 petR envZ TRUE 0.975 32.000 0.592 1.000 Y NA
 128142 128143 Atu2208 Atu2209 csaA proC TRUE 0.886 12.000 0.163 1.000   NA
 128143 128144 Atu2209 Atu8172 proC   TRUE 0.978 3.000 0.308 NA   NA
 128144 128145 Atu8172 Atu8173     FALSE 0.021 427.000 0.080 NA   NA
 128146 128147 Atu2213 Atu2214 lgt   TRUE 0.827 16.000 0.170 NA   NA
 128147 128148 Atu2214 Atu2215     FALSE 0.277 151.000 0.107 NA   NA
 128148 128149 Atu2215 Atu2216     TRUE 0.920 2.000 0.023 NA   NA
 128149 128150 Atu2216 Atu2217     TRUE 0.809 91.000 0.485 NA   NA
 128150 128151 Atu2217 Atu2218   prsA FALSE 0.173 222.000 0.209 NA   NA
 128152 128153 Atu8174 Atu2220     TRUE 0.995 -10.000 0.129 1.000   NA
 128153 128154 Atu2220 Atu2221     TRUE 0.989 -7.000 0.027 1.000   NA
 128154 128155 Atu2221 Atu2222     TRUE 0.729 21.000 0.067 1.000   NA
 128157 128158 Atu2224 Atu2225 aldA acoR FALSE 0.034 174.000 0.000 1.000   NA
 128158 128159 Atu2225 Atu2226 acoR   FALSE 0.093 105.000 0.000 1.000   NA
 128160 128161 Atu2227 Atu2228 rplY   FALSE 0.026 303.000 0.006 1.000 N NA
 128161 128162 Atu2228 Atu2229     TRUE 0.984 18.000 0.600 1.000 Y NA
 128162 128163 Atu2229 Atu2230   pth FALSE 0.321 101.000 0.007 1.000 N NA
 128163 128164 Atu2230 Atu2231 pth   TRUE 0.539 8.000 0.000 1.000   NA
 128166 128167 Atu2233 Atu2234     FALSE 0.045 298.000 0.005 0.075 N NA
 128167 128168 Atu2234 Atu2235     TRUE 0.999 -3.000 0.433 0.053 Y NA
 128169 128170 Atu2236 Atu2237 apt fbcC FALSE 0.081 217.000 0.015 1.000 N NA
 128170 128171 Atu2237 Atu2238 fbcC fbcB TRUE 0.988 23.000 0.630 0.001 Y NA
 128171 128172 Atu2238 Atu2239 fbcB fbcF TRUE 0.950 15.000 0.029 0.001 Y NA
 128174 128175 Atu2241 Atu2242     TRUE 0.899 125.000 0.385 0.006 Y NA
 128175 128176 Atu2242 Atu2243     FALSE 0.004 380.000 0.000 1.000   NA
 128177 128178 Atu2244 Atu2245     FALSE 0.045 174.000 0.000 1.000 N NA
 128180 128181 Atu2247 Atu2248 hemF   FALSE 0.212 123.000 0.014 NA   NA
 128181 128182 Atu2248 Atu2249     TRUE 0.572 114.000 0.259 NA   NA
 128183 128184 Atu2250 Atu2251 papS   TRUE 0.992 -3.000 0.163 1.000 N NA
 128184 128185 Atu2251 Atu2252     TRUE 0.996 -3.000 0.346 NA   NA
 128186 128187 Atu2253 Atu2254 moxR   TRUE 0.939 37.000 0.697 NA   NA
 128187 128188 Atu2254 Atu8175     TRUE 0.999 -3.000 0.816 NA   NA
 128188 128189 Atu8175 Atu2257     TRUE 0.996 2.000 0.876 NA   NA
 128189 128190 Atu2257 Atu2258     FALSE 0.074 90.000 0.000 NA   NA
 128191 128192 Atu2259 Atu2260     FALSE 0.116 90.000 0.000 1.000   NA
 128196 128197 Atu2264 Atu2265 leuA   FALSE 0.005 367.000 0.000 1.000 N NA
 128199 128200 Atu2267 Atu2268   sigD TRUE 0.999 -3.000 0.812 NA   NA
 128203 128204 Atu2271 Atu2272 ureJ   FALSE 0.305 101.000 0.022 NA   NA
 128205 128206 Atu2273 Atu2274     TRUE 0.513 48.000 0.025 1.000   NA
 128206 128207 Atu2274 Atu2275     FALSE 0.027 156.000 0.000 NA   NA
 128207 128208 Atu2275 Atu2276   braC FALSE 0.093 68.000 0.000 NA   NA
 128210 128211 Atu2278 Atu2279 nolR   FALSE 0.003 543.000 0.000 1.000 N NA
 128211 128212 Atu2279 Atu2280     TRUE 1.000 -3.000 0.844 NA Y NA
 128212 128213 Atu2280 Atu2281     TRUE 0.899 111.000 0.469 NA Y NA
 128215 128216 Atu2282 Atu2283 tdk   FALSE 0.105 114.000 0.000 1.000 N NA
 128216 128217 Atu2283 Atu2284     FALSE 0.008 239.000 0.000 NA   NA
 128218 128219 Atu2285 Atu2286 atxR   FALSE 0.071 94.000 0.000 NA   NA
 128222 128223 Atu2289 Atu2290 trpE(G)   TRUE 0.961 0.000 0.036 1.000 N NA
 128226 128227 Atu2293 Atu2294     FALSE 0.011 217.000 0.000 NA   NA
 128227 128228 Atu2294 Atu2295   aglA TRUE 0.913 -3.000 0.000 1.000   NA
 128229 128230 Atu2296 Atu2297 kdgK   FALSE 0.007 332.000 0.000 1.000 N NA
 128231 128232 Atu2298 Atu2299     FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 128232 128233 Atu2299 Atu2300   engA FALSE 0.013 209.000 0.000 NA   NA
 128233 128234 Atu2300 Atu2301 engA   FALSE 0.235 134.000 0.026 1.000   NA
 128234 128235 Atu2301 Atu2302     FALSE 0.272 156.000 0.123 NA   NA
 128237 128238 Atu2304 Atu2305 sbmA   FALSE 0.079 288.000 0.068 0.055   NA
 128238 128239 Atu2305 Atu2306   map FALSE 0.020 211.000 0.000 1.000   NA
 128239 128240 Atu2306 Atu2307 map   TRUE 0.638 55.000 0.112 NA N NA
 128241 128243 Atu2308 Atu2309 bdhA xdhA FALSE 0.399 138.000 0.149 1.000 N NA
 128243 128244 Atu2309 Atu2310 xdhA xdhB FALSE 0.338 282.000 0.164 0.000 Y NA
 128244 128245 Atu2310 Atu2311 xdhB xdhC TRUE 0.988 -3.000 0.090 NA N NA
 128245 128246 Atu2311 Atu2312 xdhC   FALSE 0.013 238.000 0.000 NA N NA
 128248 128249 Atu2314 Atu2315   gda TRUE 0.981 -3.000 0.029 1.000   NA
 128249 128250 Atu2315 Atu2316 gda   FALSE 0.019 215.000 0.000 1.000   NA
 128253 128254 Atu2319 Atu2320     TRUE 0.988 -3.000 0.066 1.000 N NA
 128256 128257 Atu2322 Atu2323     TRUE 0.930 6.000 0.133 1.000   NA
 128257 128258 Atu2323 Atu2324   allA TRUE 0.998 -3.000 0.571 1.000   NA
 128258 128259 Atu2324 Atu2325 allA   TRUE 0.971 4.000 0.292 NA   NA
 128259 128260 Atu2325 Atu2326     TRUE 0.996 -3.000 0.417 NA   NA
 128260 128261 Atu2326 Atu2327     FALSE 0.110 54.000 0.000 NA   NA
 128261 128262 Atu2327 Atu2328     TRUE 0.960 0.000 0.058 NA   NA
 128262 128263 Atu2328 Atu2329     FALSE 0.117 202.000 0.052 NA   NA
 128263 128264 Atu2329 Atu2330     FALSE 0.448 97.000 0.078 NA   NA
 128268 128269 Atu2334 Atu2335     FALSE 0.024 163.000 0.000 NA   NA
 128269 128270 Atu2335 Atu2336     FALSE 0.009 236.000 0.000 NA   NA
 128270 128271 Atu2336 Atu2337     FALSE 0.081 79.000 0.000 NA   NA
 128272 128273 Atu2338 Atu2339     TRUE 0.993 4.000 0.805 NA   NA
 128273 128274 Atu2339 Atu2340     TRUE 0.891 22.000 0.365 NA   NA
 128274 128275 Atu2340 Atu2341     TRUE 0.542 4.000 0.000 NA   NA
 128275 128276 Atu2341 Atu2342     FALSE 0.343 67.000 0.000 0.074   NA
 128279 128280 Atu2345 Atu2346 gguC gguB TRUE 0.737 69.000 0.286 NA   NA
 128280 128281 Atu2346 Atu2347 gguB gguA TRUE 0.999 -3.000 0.680 NA Y NA
 128281 128282 Atu2347 Atu2348 gguA chvE TRUE 0.930 91.000 0.500 NA Y NA
 3820024 128283 Atu2349 Atu2350   gbpR FALSE 0.040 128.000 0.000 NA   NA
 128283 128284 Atu2350 Atu2351 gbpR   TRUE 0.757 74.000 0.333 NA   NA
 128285 128287 Atu2352 Atu2354     FALSE 0.006 258.000 0.000 NA   NA
 3820026 128289 Atu2357 Atu2358     FALSE 0.040 128.000 0.000 NA   NA
 128290 128291 Atu2359 Atu2360   mcpA FALSE 0.025 161.000 0.000 NA   NA
 128291 128292 Atu2360 Atu2361 mcpA   FALSE 0.004 434.000 0.000 1.000 N NA
 128292 128293 Atu2361 Atu2362     FALSE 0.074 138.000 0.000 1.000 N NA
 128293 128294 Atu2362 Atu2363     TRUE 0.920 22.000 0.100 1.000 Y NA
 128294 128295 Atu2363 Atu2364     TRUE 0.996 12.000 0.833 0.013 Y NA
 128295 128296 Atu2364 Atu2365     TRUE 0.985 23.000 0.714 1.000 Y NA
 128296 128297 Atu2365 Atu2366   nocP1 TRUE 0.930 45.000 0.286 1.000 Y NA
 3820027 3820028 Atu2367 Atu2368     FALSE 0.142 34.000 0.000 NA   NA
 3820028 128299 Atu2368 Atu2369     TRUE 0.929 -60.000 0.000 NA   NA
 128300 128301 Atu2370 Atu2371   xynA TRUE 0.983 -3.000 0.056 NA   NA
 128302 128303 Atu2372 Atu2373 exoU exoM TRUE 0.900 9.000 0.125 NA   NA
 128304 128305 Atu2374 Atu2375     FALSE 0.077 85.000 0.000 NA   NA
 128305 3820029 Atu2375 Atu2376     FALSE 0.047 118.000 0.000 NA   NA
 3820029 128306 Atu2376 Atu2377     FALSE 0.085 74.000 0.000 NA   NA
 3820030 128307 Atu2378 Atu2379   noeK FALSE 0.026 157.000 0.000 NA   NA
 128307 128308 Atu2379 Atu2380 noeK   FALSE 0.044 154.000 0.000 1.000   NA
 128308 128309 Atu2380 Atu2381     TRUE 0.978 -3.000 0.026 NA   NA
 128310 128311 Atu2382 Atu2383     TRUE 0.999 -19.000 0.571 NA   NA
 128311 128312 Atu2383 Atu2384     FALSE 0.025 162.000 0.000 NA   NA
 128313 128314 Atu2385 Atu2386 amaB dht TRUE 0.991 -3.000 0.137 1.000 N NA
 128314 128315 Atu2386 Atu2387 dht   TRUE 0.759 3.000 0.000 1.000 N NA
 128315 128316 Atu2387 Atu2388     TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000 N NA
 128316 128317 Atu2388 Atu2389     TRUE 0.684 235.000 0.661 NA Y NA
 128317 128318 Atu2389 Atu2390     TRUE 1.000 -3.000 0.855 NA Y NA
 128318 128319 Atu2390 Atu2391     TRUE 0.976 22.000 0.539 NA Y NA
 128319 128320 Atu2391 Atu2392     FALSE 0.002 603.000 0.000 NA N NA
 128320 128321 Atu2392 Atu2393     TRUE 0.837 14.000 0.130 NA N NA
 128321 128322 Atu2393 Atu2394   sinR FALSE 0.004 346.000 0.000 NA N NA
 128323 128324 Atu2395 Atu2396   ureG TRUE 0.885 4.000 0.010 1.000   NA
 128324 128325 Atu2396 Atu2397 ureG ureF TRUE 0.494 258.000 0.283 0.002 Y NA
 128325 128326 Atu2397 Atu2398 ureF ureE TRUE 0.962 43.000 0.330 0.002 Y NA
 128326 128327 Atu2398 Atu2399 ureE   FALSE 0.150 227.000 0.000 1.000 Y NA
 128327 3820031 Atu2399 Atu2400     FALSE 0.137 156.000 0.014 NA   NA
 3820031 128329 Atu2400 Atu2401   ureC TRUE 0.743 12.000 0.023 NA   NA
 128329 128330 Atu2401 Atu2402 ureC   TRUE 0.875 5.000 0.029 NA   NA
 128330 128331 Atu2402 Atu2403     TRUE 0.760 21.000 0.125 NA   NA
 128331 128332 Atu2403 Atu2404     FALSE 0.370 10.000 0.000 NA   NA
 128332 3820032 Atu2404 Atu2405   ureB TRUE 0.740 2.000 0.000 1.000   NA
 3820032 128333 Atu2405 Atu2406 ureB   TRUE 0.637 23.000 0.043 NA   NA
 128333 128334 Atu2406 Atu2407   ureA TRUE 0.837 10.000 0.049 NA   NA
 128334 128335 Atu2407 Atu2408 ureA ureD TRUE 0.905 107.000 0.664 0.002 N NA
 128335 128336 Atu2408 Atu2409 ureD   FALSE 0.225 27.000 0.000 NA N NA
 128336 128338 Atu2409 Atu2410     FALSE 0.010 255.000 0.000 NA N NA
 128338 128339 Atu2410 Atu2411     TRUE 0.726 194.000 0.731 0.032   NA
 128339 128340 Atu2411 Atu2412     TRUE 0.992 5.000 0.823 NA   NA
 128340 128341 Atu2412 Atu2413     TRUE 1.000 -3.000 0.758 NA Y NA
 128341 128342 Atu2413 Atu2414     TRUE 0.529 286.000 0.654 NA Y NA
 128342 3820033 Atu2414 Atu2415     FALSE 0.003 342.000 0.000 NA   NA
 128343 128344 Atu2416 Atu2417 glnA   FALSE 0.052 163.000 0.000 1.000 N NA
 128344 128345 Atu2417 Atu2418     FALSE 0.236 44.000 0.000 1.000 N NA
 128345 128346 Atu2418 Atu2419     TRUE 0.995 -3.000 0.143 0.015 N NA
 128346 128347 Atu2419 Atu2420     FALSE 0.005 283.000 0.000 NA   NA
 128348 128349 Atu2421 Atu2422     FALSE 0.069 143.000 0.000 1.000 N NA
 128349 128350 Atu2422 Atu8177     TRUE 0.492 119.000 0.207 NA   NA
 128350 128351 Atu8177 Atu2424     TRUE 0.535 171.000 0.475 NA   NA
 128351 128352 Atu2424 Atu2425     TRUE 0.999 0.000 0.881 0.032 Y NA
 128352 128353 Atu2425 Atu2426     TRUE 0.997 0.000 0.386 NA Y NA
 128353 128354 Atu2426 Atu2427   livH TRUE 0.992 5.000 0.406 NA Y NA
 128355 128356 Atu2428 Atu8178 pssB   FALSE 0.003 342.000 0.000 NA   NA
 128356 128357 Atu8178 Atu2430     FALSE 0.017 192.000 0.000 NA   NA
 128357 128358 Atu2430 Atu2431     FALSE 0.072 222.000 0.021 1.000   NA
 128360 128361 Atu2433 Atu2434   ctrA FALSE 0.003 325.000 0.000 NA   NA
 128361 128362 Atu2434 Atu2435 ctrA   FALSE 0.081 132.000 0.000 1.000 N NA
 128363 128365 Atu2436 Atu2437     FALSE 0.008 242.000 0.000 NA   NA
 128365 128366 Atu2437 Atu2438     FALSE 0.077 84.000 0.000 NA   NA
 128367 128368 Atu2439 Atu2440     FALSE 0.005 281.000 0.000 NA   NA
 128369 128370 Atu2441 Atu2442     FALSE 0.245 146.000 0.064 NA   NA
 128371 128372 Atu2443 Atu2444 rluD   FALSE 0.005 285.000 0.000 NA   NA
 128372 128373 Atu2444 Atu2445   rpoH FALSE 0.023 168.000 0.000 NA   NA
 128374 128375 Atu2446 Atu2447   purA FALSE 0.096 65.000 0.000 NA   NA
 128377 128378 Atu2449 Atu2450     TRUE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 128380 128381 Atu2452 Atu2453     FALSE 0.405 243.000 0.667 NA   NA
 128381 128382 Atu2453 Atu2454     FALSE 0.024 164.000 0.000 NA   NA
 128382 128383 Atu2454 Atu2455     FALSE 0.130 71.000 0.000 NA N NA
 128383 128384 Atu2455 Atu2456   lguL FALSE 0.290 19.000 0.000 1.000   NA
 128386 128387 Atu2458 Atu2459 hmuV hmuU TRUE 0.997 -3.000 0.158 1.000 Y NA
 128387 128388 Atu2459 Atu2460 hmuU hmuT TRUE 1.000 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 128389 128390 Atu2461 Atu2462     TRUE 0.783 11.000 0.027 NA   NA
 128390 128391 Atu2462 Atu2463     FALSE 0.009 227.000 0.000 NA   NA
 128391 128392 Atu2463 Atu2464   purU FALSE 0.012 213.000 0.000 NA   NA
 128393 128394 Atu2465 Atu2466     TRUE 0.999 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 128395 128396 Atu2467 Atu2469     FALSE 0.002 403.000 0.000 NA   NA
 128396 128397 Atu2469 Atu2470     TRUE 0.999 -3.000 0.938 NA   NA
 128397 128398 Atu2470 Atu2471     TRUE 0.885 107.000 0.812 NA   NA
 128399 128400 Atu2473 Atu2474     TRUE 0.802 139.000 0.356 NA Y NA
 128400 128401 Atu2474 Atu2475     TRUE 1.000 -7.000 0.870 NA Y NA
 128401 128402 Atu2475 Atu2476     TRUE 1.000 -3.000 0.870 NA Y NA
 128402 128403 Atu2476 Atu2477   dps FALSE 0.458 123.000 0.000 1.000 Y NA
 128403 128404 Atu2477 Atu2478 dps   FALSE 0.091 70.000 0.000 NA   NA
 128404 3820035 Atu2478 Atu2479     FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 128406 128407 Atu2481 Atu2482   mexE TRUE 0.801 57.000 0.298 1.000 N NA
 128407 128408 Atu2482 Atu2483 mexE mexF TRUE 0.631 132.000 0.361 1.000 N NA
 128408 3820036 Atu2483 Atu2484 mexF   FALSE 0.004 292.000 0.000 NA   NA
 128409 128410 Atu2485 Atu2486   cls TRUE 0.640 50.000 0.121 NA   NA
 128411 128412 Atu2487 Atu2488 pdxK cah FALSE 0.227 178.000 0.089 1.000 N NA
 128413 128414 Atu2489 Atu2490   asd FALSE 0.070 215.000 0.012 NA N NA
 128414 3820037 Atu2490 Atu2491 asd   TRUE 0.589 3.000 0.000 NA   NA
 128415 128416 Atu2492 Atu2493 mtbA pntA FALSE 0.037 190.000 0.000 1.000 N NA
 128416 128417 Atu2493 Atu2494 pntA pntB TRUE 0.992 21.000 0.745 0.000 Y NA
 128418 128419 Atu2495 Atu2496     TRUE 0.946 42.000 0.625 0.046   NA
 128419 128420 Atu2496 Atu2497     TRUE 0.861 21.000 0.256 1.000   NA
 128420 128421 Atu2497 Atu2498     TRUE 0.911 17.000 0.365 NA   NA
 128421 128422 Atu2498 Atu2499     TRUE 0.905 27.000 0.442 NA N NA
 128422 128423 Atu2499 Atu2500   rutA TRUE 0.998 -3.000 0.621 NA N NA
 128423 128424 Atu2500 Atu2502 rutA hemO FALSE 0.003 403.000 0.000 NA N NA
 128425 128426 Atu2503 Atu2504 dapA   TRUE 0.953 21.000 0.615 1.000 N NA
 128426 128427 Atu2504 Atu2505     TRUE 0.816 103.000 0.538 NA N NA
 128427 128428 Atu2505 Atu2506     TRUE 0.997 0.000 0.385 NA Y NA
 128428 128429 Atu2506 Atu2507     TRUE 0.997 0.000 0.455 NA Y NA
 128429 128430 Atu2507 Atu2508     TRUE 0.845 104.000 0.273 NA Y NA
 128430 128431 Atu2508 Atu2509     TRUE 0.938 21.000 0.200 NA Y NA
 128431 128432 Atu2509 Atu2510     FALSE 0.048 144.000 0.000 NA N NA
 128432 128433 Atu2510 Atu2511   dat TRUE 0.907 20.000 0.061 NA Y NA
 128434 128435 Atu2512 Atu2513     FALSE 0.198 61.000 0.000 1.000 N NA
 128435 128436 Atu2513 Atu2514   dppF TRUE 0.659 118.000 0.333 1.000 N NA
 128436 128437 Atu2514 Atu2515 dppF dppD TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.032 Y NA
 128437 128438 Atu2515 Atu2516 dppD dppC TRUE 0.998 4.000 0.800 NA Y NA
 128438 128439 Atu2516 Atu2517 dppC dppB TRUE 1.000 -3.000 0.800 NA Y NA
 128439 128440 Atu2517 Atu2518 dppB dppA TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA Y NA
 128443 128444 Atu2521 Atu2522 lpiA acvB TRUE 0.992 -3.000 0.176 1.000   NA
 128444 128445 Atu2522 Atu2523 acvB telA FALSE 0.023 202.000 0.000 1.000   NA
 128445 128446 Atu2523 Atu2524 telA   FALSE 0.002 406.000 0.000 NA   NA
 128447 128448 Atu2525 Atu2526     FALSE 0.026 158.000 0.000 NA   NA
 128448 128449 Atu2526 Atu2527     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 128449 128450 Atu2527 Atu2528   macA FALSE 0.456 13.000 0.000 1.000 N NA
 128450 128451 Atu2528 Atu2529 macA   TRUE 0.974 4.000 0.200 0.073   NA
 128451 128452 Atu2529 Atu2530     TRUE 0.775 47.000 0.238 1.000   NA
 128452 128453 Atu2530 Atu2531   actI TRUE 0.875 38.000 0.286 0.046   NA
 128454 128455 Atu2532 Atu2533     FALSE 0.084 75.000 0.000 NA   NA
 128456 128457 Atu2534 Atu2535     FALSE 0.017 240.000 0.000 1.000 N NA
 128457 128458 Atu2535 Atu2536     TRUE 1.000 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 128458 128459 Atu2536 Atu2537     FALSE 0.328 183.000 0.000 0.099 Y NA
 3820038 3820039 Atu2539 Atu2540     FALSE 0.008 239.000 0.000 NA   NA
 3820039 3820040 Atu2540 Atu2541     FALSE 0.049 115.000 0.000 NA   NA
 3820040 3820041 Atu2541 Atu2542     FALSE 0.006 260.000 0.000 NA   NA
 3820042 3820043 Atu2543 Atu2544     FALSE 0.096 65.000 0.000 NA   NA
 3820044 3820045 Atu2545 Atu2546     FALSE 0.103 59.000 0.000 NA   NA
 3820045 3820046 Atu2546 Atu2547     FALSE 0.003 328.000 0.000 NA   NA
 128464 128465 Atu2548 Atu2549 purC ameR TRUE 0.896 4.000 0.010 1.000 N NA
 128465 128466 Atu2549 Atu2550 ameR   TRUE 0.605 200.000 0.667 1.000 N NA
 128466 128467 Atu2550 Atu2551     TRUE 0.953 54.000 0.857 1.000 N NA
 128467 128468 Atu2551 Atu2552   nodT FALSE 0.062 150.000 0.000 1.000 N NA
 128470 128471 Atu2554 Atu2555 poxA kamA TRUE 0.996 -30.000 0.174 1.000 N NA
 128471 128472 Atu2555 Atu2557 kamA   FALSE 0.002 380.000 0.000 NA   NA
 128473 128474 Atu2558 Atu2559     TRUE 0.477 103.000 0.030 0.078   NA
 128475 128476 Atu2560 Atu2561 ordL modA FALSE 0.019 234.000 0.000 1.000 N NA
 128476 128477 Atu2561 Atu2562 modA modB TRUE 0.980 54.000 0.627 0.001 Y NA
 128477 128478 Atu2562 Atu2563 modB modC TRUE 1.000 -3.000 0.537 0.001 Y NA
 128479 128480 Atu2564 Atu2565 modE   TRUE 0.542 4.000 0.000 NA   NA
 128480 128481 Atu2565 Atu2566   thiG FALSE 0.110 89.000 0.000 NA N NA
 128481 128482 Atu2566 Atu2567 thiG thiG TRUE 0.980 5.000 0.095 1.000 Y NA
 128482 128483 Atu2567 Atu2568 thiG thiO TRUE 0.993 -3.000 0.192 1.000 N NA
 128483 128484 Atu2568 Atu2569 thiO thiC TRUE 0.936 2.000 0.022 1.000 N NA
 128485 128486 Atu2571 Atu2572 acpP acd TRUE 0.992 0.000 0.440 1.000   NA
 128486 128487 Atu2572 Atu2573 acd   FALSE 0.062 218.000 0.016 NA   NA
 128487 128488 Atu2573 Atu2574     FALSE 0.015 343.000 0.008 NA   NA
 128488 128489 Atu2574 Atu2575     TRUE 0.995 -3.000 0.300 NA   NA
 128491 128492 Atu2577 Atu2578     FALSE 0.236 44.000 0.000 1.000 N NA
 128492 128493 Atu2578 Atu2579     FALSE 0.223 192.000 0.154 1.000   NA
 128493 128494 Atu2579 Atu2580   cyaA FALSE 0.009 268.000 0.000 1.000   NA
 128495 128496 Atu8180 Atu2582     TRUE 0.494 5.000 0.000 NA   NA
 128497 128498 Atu2583 Atu2584     TRUE 0.989 -3.000 0.111 1.000   NA
 128500 128501 Atu2586 Atu2587     TRUE 0.999 -3.000 0.741 NA   NA
 128501 128502 Atu2587 Atu2588     TRUE 0.998 2.000 0.821 NA Y NA
 128502 128503 Atu2588 Atu2589     TRUE 0.999 -3.000 0.929 NA   NA
 128503 128504 Atu2589 Atu2590     TRUE 0.597 73.000 0.158 NA   NA
 128504 128505 Atu2590 Atu2591   redB TRUE 0.670 164.000 0.614 1.000   NA
 128505 128506 Atu2591 Atu2592 redB redA TRUE 0.995 -3.000 0.318 1.000   NA
 128507 128508 Atu2593 Atu2594 cutC   FALSE 0.237 27.000 0.000 1.000   NA
 128508 128509 Atu2594 Atu2595     TRUE 0.527 64.000 0.065 NA   NA
 128509 128510 Atu2595 Atu2596     TRUE 0.832 13.000 0.109 NA   NA
 128510 128511 Atu2596 Atu2597     TRUE 0.797 45.000 0.250 1.000 N NA
 128511 128512 Atu2597 Atu2598     TRUE 0.819 78.000 0.417 1.000 N NA
 128514 128515 Atu2600 Atu2601 malK malE TRUE 0.692 189.000 0.400 NA Y NA
 128515 128516 Atu2601 Atu2602 malE malG TRUE 0.945 39.000 0.357 NA Y NA
 128516 128517 Atu2602 Atu2603 malG malF TRUE 0.999 -3.000 0.433 NA Y NA
 128517 128518 Atu2603 Atu2604 malF   TRUE 0.908 14.000 0.300 NA   NA
 3820047 128519 Atu2605 Atu2606     FALSE 0.066 99.000 0.000 NA   NA
 128519 128520 Atu2606 Atu2607   glmS TRUE 0.941 25.000 0.577 1.000 N NA
 128520 128521 Atu2607 Atu2608 glmS nagA TRUE 0.996 -3.000 0.369 1.000 N NA
 128521 128522 Atu2608 Atu2609 nagA   TRUE 0.979 4.000 0.056 NA Y NA
 128523 128524 Atu2610 Atu2611     FALSE 0.281 20.000 0.000 1.000   NA
 128527 128528 Atu2614 Atu2615     FALSE 0.222 176.000 0.010 0.004   NA
 128528 128529 Atu2615 Atu2616     TRUE 0.753 46.000 0.212 1.000   NA
 128529 128530 Atu2616 Atu2617   cheW FALSE 0.038 166.000 0.000 1.000   NA
 128530 128531 Atu2617 Atu2618 cheW cheD FALSE 0.084 337.000 0.000 0.007 Y NA
 128532 3820048 Atu2619 Atu2620 fdhD   FALSE 0.085 74.000 0.000 NA   NA
 3820048 128533 Atu2620 Atu2621   atpC FALSE 0.170 24.000 0.000 NA   NA
 128533 128534 Atu2621 Atu2622 atpC atpD TRUE 0.962 132.000 0.837 0.002 Y NA
 128534 128535 Atu2622 Atu2623 atpD atpG TRUE 0.990 24.000 0.724 0.002 Y NA
 128535 128536 Atu2623 Atu2624 atpG atpA TRUE 0.991 32.000 0.846 0.002 Y NA
 128536 128537 Atu2624 Atu2625 atpA atpH TRUE 0.999 0.000 0.864 0.002 Y NA
 128537 128538 Atu2625 Atu2626 atpH   FALSE 0.005 268.000 0.000 NA   NA
 128538 128539 Atu2626 Atu2627   priA FALSE 0.331 81.000 0.014 NA   NA
 128540 128541 Atu2628 Atu2629 xerC   FALSE 0.384 81.000 0.030 NA   NA
 128542 128543 Atu2630 Atu2631     FALSE 0.118 48.000 0.000 NA   NA
 128543 128544 Atu2631 Atu2632   lpdA TRUE 0.669 127.000 0.010 0.046 Y NA
 128544 128545 Atu2632 Atu2633 lpdA   FALSE 0.466 64.000 0.018 1.000 N NA
 128545 128546 Atu2633 Atu2634     TRUE 0.649 45.000 0.091 1.000   NA
 128546 128547 Atu2634 Atu2635   sucB FALSE 0.405 70.000 0.014 1.000   NA
 128547 128548 Atu2635 Atu2636 sucB kgd TRUE 0.972 54.000 0.667 1.000 Y NA
 128548 128549 Atu2636 Atu2637 kgd sucD TRUE 0.513 176.000 0.092 1.000 Y NA
 128549 128550 Atu2637 Atu2638 sucD sucC TRUE 0.974 18.000 0.256 0.000 Y NA
 128550 128551 Atu2638 Atu2639 sucC   TRUE 0.900 34.000 0.113 1.000 Y NA
 128551 128553 Atu2639 Atu2640     FALSE 0.128 179.000 0.032 NA   NA
 128553 128554 Atu2640 Atu2641     TRUE 0.815 93.000 0.500 NA   NA
 128554 128555 Atu2641 Atu2642   sdhB FALSE 0.022 206.000 0.000 1.000   NA
 128555 128556 Atu2642 Atu2643 sdhB sdhA TRUE 0.991 16.000 0.604 0.001 Y NA
 128556 128557 Atu2643 Atu2644 sdhA sdhD TRUE 0.997 8.000 0.705 0.001 Y NA
 128557 128558 Atu2644 Atu2645 sdhD sdhC TRUE 0.984 13.000 0.291 0.000 Y NA
 128560 128561 Atu2647 Atu2648     TRUE 0.838 8.000 0.031 NA   NA
 128561 128562 Atu2648 Atu2649     TRUE 0.914 7.000 0.122 NA   NA
 128562 128563 Atu2649 Atu2650   gpsA TRUE 0.801 88.000 0.456 NA   NA
 128563 128564 Atu2650 Atu2651 gpsA gcp TRUE 0.970 0.000 0.070 1.000 N NA
 128565 128566 Atu2652 Atu2653 hemC hem4 TRUE 0.986 5.000 0.056 0.001 Y NA
 128566 128567 Atu2653 Atu2655 hem4   TRUE 0.704 74.000 0.263 NA   NA
 128567 128568 Atu2655 Atu2656     TRUE 0.977 5.000 0.408 NA   NA
 128568 128569 Atu2656 Atu2657     TRUE 0.798 15.000 0.108 NA   NA
 128569 128570 Atu2657 Atu2658   guaA TRUE 0.998 -10.000 0.452 NA   NA
 128574 128575 Atu2661 Atu2662 ppa   FALSE 0.180 170.000 0.048 1.000   NA
 128575 128576 Atu2662 Atu2663   typA FALSE 0.062 216.000 0.002 1.000   NA
 128576 128577 Atu2663 Atu2664 typA dcp FALSE 0.174 151.000 0.008 1.000 N NA
 128578 128579 Atu2665 Atu2666     TRUE 0.701 24.000 0.054 1.000 N NA
 128581 128582 Atu2668 Atu2669     FALSE 0.462 133.000 0.207 1.000   NA
 128583 128584 Atu2670 Atu2671     TRUE 0.999 -3.000 0.771 NA   NA
 128584 128585 Atu2671 Atu2672     TRUE 0.803 107.000 0.562 NA   NA
 128585 128586 Atu2672 Atu2673     FALSE 0.239 109.000 0.008 NA   NA
 128586 128587 Atu2673 Atu8182     FALSE 0.028 267.000 0.006 NA   NA
 128587 128588 Atu8182 Atu2675     FALSE 0.004 298.000 0.000 NA   NA
 128588 3820050 Atu2675 Atu2676     TRUE 0.608 52.000 0.094 NA   NA
 128590 128591 Atu2678 Atu2679 ligT   TRUE 0.581 69.000 0.077 1.000 N NA
 128592 128593 Atu2680 Atu2681     TRUE 0.999 -3.000 0.626 NA Y NA
 128593 128594 Atu2681 Atu2682     FALSE 0.121 219.000 0.101 NA   NA
 128595 128596 Atu2683 Atu2684     FALSE 0.002 372.000 0.000 NA   NA
 128596 128597 Atu2684 Atu2685   acnA FALSE 0.042 266.000 0.038 NA   NA
 128598 128599 Atu2686 Atu2687 ccmA ccmB TRUE 0.809 203.000 0.503 0.002 Y NA
 128599 128600 Atu2687 Atu2688 ccmB ccmC TRUE 0.965 75.000 0.501 0.001 Y NA
 128600 3820051 Atu2688 Atu2689 ccmC   TRUE 0.984 5.000 0.501 1.000   NA
 3820051 128601 Atu2689 Atu2690   ccmG TRUE 0.527 108.000 0.172 1.000   NA
 128602 3820052 Atu2691 Atu8092     FALSE 0.026 157.000 0.000 NA   NA
 3820052 128603 Atu8092 Atu2692   ispZ TRUE 0.980 -3.000 0.037 NA   NA
 128603 128604 Atu2692 Atu2693 ispZ fstY TRUE 0.941 3.000 0.050 1.000 N NA
 128604 128605 Atu2693 Atu2694 fstY   TRUE 0.636 33.000 0.042 1.000 N NA
 128605 128606 Atu2694 Atu2695   dapF TRUE 0.990 -3.000 0.109 1.000 N NA
 128606 128607 Atu2695 Atu2696 dapF   FALSE 0.218 123.000 0.006 1.000   NA
 128608 128609 Atu2697 Atu2698 ffh tyrA TRUE 0.791 12.000 0.023 1.000 N NA
 128609 128610 Atu2698 Atu2699 tyrA rpsP TRUE 0.649 34.000 0.050 1.000 N NA
 128610 128611 Atu2699 Atu2700 rpsP rimM TRUE 0.844 149.000 0.342 0.010 Y NA
 128611 128612 Atu2700 Atu2701 rimM trmD TRUE 0.996 5.000 0.672 1.000 Y NA
 128614 3820053 Atu2703 Atu2704 rplS   FALSE 0.113 52.000 0.000 NA   NA
 3820053 128615 Atu2704 Atu2705   prsD1 FALSE 0.125 43.000 0.000 NA   NA
 128615 128616 Atu2705 Atu2706 prsD1 prsE2 TRUE 0.999 -7.000 0.700 0.054   NA
 128616 128617 Atu2706 Atu2707 prsE2 rzcA FALSE 0.031 180.000 0.000 1.000   NA
 3820054 128619 Atu8028 Atu2709   leuC TRUE 0.551 66.000 0.086 NA   NA
 128620 3820055 Atu2710 Atu2711     FALSE 0.215 17.000 0.000 NA   NA
 3820055 128621 Atu2711 Atu2712   thiQ FALSE 0.116 50.000 0.000 NA   NA
 128621 128622 Atu2712 Atu2713 thiQ thiP TRUE 0.999 -3.000 0.522 0.012 N NA
 128622 128623 Atu2713 Atu2714 thiP thiB TRUE 0.964 20.000 0.697 1.000 N NA
 128623 128624 Atu2714 Atu2715 thiB   FALSE 0.016 194.000 0.000 NA   NA
 128624 128625 Atu2715 Atu2716     FALSE 0.067 98.000 0.000 NA   NA
 128625 128626 Atu2716 Atu2717     TRUE 0.891 5.000 0.030 1.000   NA
 128627 128628 Atu2718 Atu2719 metA   FALSE 0.416 76.000 0.016 1.000 N NA
 128631 128632 Atu2722 Atu2723 ompA gcpE FALSE 0.406 67.000 0.002 1.000 N NA
 128632 128633 Atu2723 Atu2724 gcpE   FALSE 0.257 121.000 0.011 1.000 N NA
 128633 128634 Atu2724 Atu2725     TRUE 0.983 13.000 0.438 1.000 Y NA
 128634 128635 Atu2725 Atu2726   pycA FALSE 0.085 128.000 0.000 1.000 N NA
 128635 128636 Atu2726 Atu2727 pycA   TRUE 0.486 106.000 0.100 1.000 N NA
 3820056 128638 Atu2729 Atu2730   chvB FALSE 0.003 334.000 0.000 NA   NA
 128641 128642 Atu2735 Atu2736 ilvA ilvD FALSE 0.449 125.000 0.000 1.000 Y NA
 128642 128643 Atu2736 Atu2737 ilvD   TRUE 0.905 10.000 0.116 1.000 N NA
 128643 128644 Atu2737 Atu2738     TRUE 0.995 -3.000 0.182 0.010 N NA
 128645 128646 Atu2739 Atu2740     TRUE 0.734 117.000 0.444 1.000 N NA
 128646 128647 Atu2740 Atu2741     FALSE 0.023 204.000 0.000 1.000   NA
 128647 128648 Atu2741 Atu2742     FALSE 0.233 117.000 0.017 NA   NA
 128648 128649 Atu2742 Atu2743     TRUE 0.993 5.000 0.429 NA Y NA
 128649 128650 Atu2743 Atu2744     TRUE 0.938 31.000 0.250 1.000 Y NA
 128654 128655 Atu2748 Atu2749 leuS   TRUE 0.617 47.000 0.090 NA   NA
 128655 128656 Atu2749 Atu2750     TRUE 0.846 12.000 0.097 NA   NA
 128657 128658 Atu2751 Atu2752 fdxA   FALSE 0.227 158.000 0.050 1.000 N NA
 128658 128659 Atu2752 Atu2753   mgpS TRUE 0.867 5.000 0.013 1.000   NA
 128659 128661 Atu2753 Atu2755 mgpS   FALSE 0.003 449.000 0.000 1.000   NA
 128662 128663 Atu2756 Atu2757 tesB glnK FALSE 0.026 214.000 0.000 1.000 N NA
 128663 128664 Atu2757 Atu2758 glnK amtB FALSE 0.321 174.000 0.197 1.000 N NA
 128664 128665 Atu2758 Atu2759 amtB ftsK1 FALSE 0.028 209.000 0.000 1.000 N NA
 128665 128666 Atu2759 Atu2760 ftsK1   FALSE 0.402 100.000 0.035 1.000 N NA
 128666 128667 Atu2760 Atu2761     FALSE 0.249 161.000 0.068 1.000 N NA
 128668 128669 Atu2762 Atu2763   mtrA TRUE 0.745 140.000 0.261 NA Y NA
 128672 128673 Atu2766 Atu2767 gdh   FALSE 0.255 102.000 0.006 NA   NA
 128675 128676 Atu2769 Atu2770 phbA phbB TRUE 0.704 171.000 0.319 1.000 Y NA
 128676 128677 Atu2770 Atu2771 phbB bfr FALSE 0.003 521.000 0.000 1.000 N NA
 128678 128679 Atu2772 Atu2773 ialA   TRUE 0.663 47.000 0.109 1.000   NA
 128679 128680 Atu2773 Atu2774     TRUE 0.708 63.000 0.210 1.000   NA
 128680 128681 Atu2774 Atu2775     TRUE 0.998 -10.000 0.408 NA N NA
 128681 128682 Atu2775 Atu2776     FALSE 0.213 160.000 0.067 NA   NA
 128682 128683 Atu2776 Atu2777     FALSE 0.443 159.000 0.307 NA   NA
 128683 128684 Atu2777 Atu2778   nadD TRUE 0.733 51.000 0.221 NA   NA
 128684 128685 Atu2778 Atu2779 nadD proA TRUE 0.741 43.000 0.170 1.000 N NA
 128685 128686 Atu2779 Atu2780 proA proB TRUE 0.922 38.000 0.065 0.001 Y NA
 128686 128687 Atu2780 Atu2781 proB cgtA TRUE 0.988 -3.000 0.087 1.000   NA
 128687 128688 Atu2781 Atu2782 cgtA   FALSE 0.068 215.000 0.008 1.000   NA
 128688 128689 Atu2782 Atu2783     TRUE 0.999 -3.000 0.222 0.010 Y NA
 128689 128690 Atu2783 Atu2784   rpmA TRUE 0.600 132.000 0.035 1.000 Y NA
 128690 128691 Atu2784 Atu2785 rpmA rplU TRUE 0.984 41.000 0.667 0.010 Y NA
 3820059 128692 Atu2787 Atu2788   citE TRUE 0.991 -3.000 0.179 NA   NA
 128693 128694 Atu2789 Atu2790   leuD FALSE 0.160 165.000 0.038 NA   NA
 128694 128695 Atu2790 Atu2791 leuD leuB FALSE 0.260 222.000 0.000 0.001 Y NA
 128696 128697 Atu2792 Atu2793   cobB FALSE 0.006 337.000 0.000 1.000 N NA
 128697 128698 Atu2793 Atu2794 cobB cobA TRUE 0.997 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 128700 128701 Atu2796 Atu2797 cobM chiG TRUE 0.990 -3.000 0.025 0.007   NA
 128701 128702 Atu2797 Atu2798 chiG cobL TRUE 0.995 -24.000 0.032 0.007   NA
 128704 128705 Atu2800 Atu2801 cobJ cobI TRUE 0.998 -3.000 0.138 0.007 Y NA
 128705 128706 Atu2801 Atu2802 cobI cbiC TRUE 0.999 -3.000 0.191 0.007 Y NA
 128706 128707 Atu2802 Atu2803 cbiC cobG TRUE 0.995 -3.000 0.255 1.000 N NA
 128707 128708 Atu2803 Atu2804 cobG cobN TRUE 0.989 0.000 0.333 1.000   NA
 128708 128709 Atu2804 Atu2805 cobN cobW TRUE 0.696 65.000 0.204 1.000   NA
 128709 128710 Atu2805 Atu2806 cobW   TRUE 0.992 -3.000 0.211 NA   NA
 128711 128712 Atu2807 Atu2808 cobO cbiP TRUE 0.992 2.000 0.078 0.007 Y NA
 128715 128716 Atu2811 Atu2812     FALSE 0.053 112.000 0.000 NA   NA
 128716 128717 Atu2812 Atu2813   uxaB FALSE 0.307 12.000 0.000 NA   NA
 128717 128718 Atu2813 Atu2814 uxaB   TRUE 0.994 -3.000 0.147 0.051 N NA
 128718 128719 Atu2814 Atu2815     TRUE 0.937 4.000 0.080 1.000   NA
 128719 128720 Atu2815 Atu2816     TRUE 0.984 5.000 0.500 1.000   NA
 128720 128721 Atu2816 Atu2817   rbsB TRUE 0.836 94.000 0.533 NA N NA
 128721 128722 Atu2817 Atu2818 rbsB rbsC TRUE 0.945 77.000 0.550 NA Y NA
 128722 128723 Atu2818 Atu2819 rbsC rbsA TRUE 0.993 9.000 0.600 NA Y NA
 128724 128725 Atu2821 Atu2822   garD TRUE 0.764 43.000 0.200 1.000 N NA
 128726 128727 Atu2823 Atu2824 purH   FALSE 0.231 153.000 0.068 NA   NA
 128727 128728 Atu2824 Atu2825   sun FALSE 0.235 153.000 0.071 NA   NA
 128728 128729 Atu2825 Atu2826 sun htpx TRUE 0.993 -3.000 0.075 0.024 N NA
 128730 128731 Atu2828 Atu2829 parB1 parA TRUE 0.964 30.000 0.827 1.000 N NA
 128731 128732 Atu2829 Atu2830 parA gidB TRUE 0.906 20.000 0.339 1.000 N NA
 128732 128733 Atu2830 Atu2831 gidB gidA TRUE 0.963 12.000 0.466 1.000 N NA
 128733 128734 Atu2831 Atu2832 gidA thdF TRUE 0.756 63.000 0.266 1.000   NA
 128734 128735 Atu2832 Atu2833 thdF rho FALSE 0.445 90.000 0.050 1.000   NA
 128735 128736 Atu2833 Atu2834 rho   FALSE 0.107 186.000 0.024 NA   NA
 128736 128737 Atu2834 Atu2835   hemE TRUE 0.537 45.000 0.044 NA   NA
 130570 3820062 Atu3001 Atu3002   tnp FALSE 0.072 92.000 0.000 NA   NA
 130567 130566 Atu3006 Atu3007     FALSE 0.193 20.000 0.000 NA   NA
 3820063 130565 Atu3008 Atu3009   exoZ FALSE 0.035 138.000 0.000 NA   NA
 130564 130563 Atu3010 Atu3011     TRUE 0.983 -3.000 0.053 NA   NA
 130563 130562 Atu3011 Atu3012     FALSE 0.012 213.000 0.000 NA   NA
 130562 130561 Atu3012 Atu3013     FALSE 0.026 158.000 0.000 NA   NA
 130561 130560 Atu3013 Atu3014     TRUE 0.992 -3.000 0.210 NA   NA
 130559 130558 Atu3015 Atu3016   gpmB FALSE 0.196 40.000 0.000 1.000   NA
 130558 130557 Atu3016 Atu3017 gpmB   TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130557 130556 Atu3017 Atu3018     FALSE 0.089 71.000 0.000 NA   NA
 130554 130553 Atu3020 Atu3021     FALSE 0.278 31.000 0.000 1.000 N NA
 130553 130552 Atu3021 Atu3022     TRUE 0.997 -3.000 0.154 NA Y NA
 130552 130551 Atu3022 Atu3023     TRUE 0.995 12.000 0.889 NA Y NA
 130551 130550 Atu3023 Atu3024     TRUE 0.974 61.000 0.778 NA Y NA
 130550 130549 Atu3024 Atu3025     TRUE 0.764 72.000 0.333 NA   NA
 130549 130548 Atu3025 Atu3026     FALSE 0.223 16.000 0.000 NA   NA
 130548 130547 Atu3026 Atu8093     FALSE 0.376 17.000 0.000 1.000 N NA
 130547 130546 Atu8093 Atu3027     TRUE 0.745 36.000 0.000 1.000 Y NA
 130546 130545 Atu3027 Atu3028     TRUE 0.907 -3.000 0.000 NA N NA
 130545 130544 Atu3028 Atu3029   gudD TRUE 0.792 0.000 0.000 NA N NA
 130542 130541 Atu3031 Atu3032     FALSE 0.121 45.000 0.000 NA   NA
 130541 130540 Atu3032 Atu3033     FALSE 0.096 65.000 0.000 NA   NA
 130540 130539 Atu3033 Atu3034     FALSE 0.199 19.000 0.000 NA   NA
 130537 130536 Atu3036 Atu3037     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA Y NA
 130536 130535 Atu3037 Atu3038     TRUE 0.966 5.000 0.300 NA   NA
 130535 130534 Atu3038 Atu3039     TRUE 0.919 17.000 0.375 1.000   NA
 130534 130533 Atu3039 Atu3040     TRUE 0.999 -7.000 0.800 NA   NA
 130533 130532 Atu3040 Atu3041     TRUE 0.889 44.000 0.500 NA   NA
 130532 130531 Atu3041 Atu3042     TRUE 0.630 116.000 0.333 NA   NA
 130531 130530 Atu3042 Atu3043     TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA   NA
 130530 130529 Atu3043 Atu3044   asg FALSE 0.184 45.000 0.000 1.000   NA
 130528 130527 Atu3045 Atu3046     FALSE 0.094 67.000 0.000 NA   NA
 130527 130526 Atu3046 Atu3047     TRUE 0.958 12.000 0.125 NA Y NA
 130526 130525 Atu3047 Atu3048     TRUE 0.980 42.000 0.800 NA Y NA
 130525 130524 Atu3048 Atu3049     TRUE 0.928 130.000 0.750 NA Y NA
 130524 130523 Atu3049 Atu3050     TRUE 0.749 137.000 0.250 NA Y NA
 130523 130522 Atu3050 Atu3051     TRUE 0.974 2.000 0.088 0.051   NA
 130522 130521 Atu3051 Atu3052     TRUE 0.988 -3.000 0.088 1.000   NA
 130521 130520 Atu3052 Atu3053     FALSE 0.007 289.000 0.000 1.000   NA
 130518 130517 Atu3055 Atu3056   crdS TRUE 0.742 45.000 0.217 NA   NA
 130517 130516 Atu3056 Atu3057 crdS   FALSE 0.038 132.000 0.000 NA   NA
 130513 130512 Atu3061 Atu3062     FALSE 0.018 239.000 0.000 1.000 N NA
 130512 130511 Atu3062 Atu3063     TRUE 0.769 33.000 0.194 NA N NA
 130511 130510 Atu3063 Atu3064     TRUE 0.995 -3.000 0.323 NA   NA
 130510 130509 Atu3064 Atu3065     TRUE 0.998 -3.000 0.632 NA   NA
 130509 130508 Atu3065 Atu3066     TRUE 0.984 5.000 0.526 NA   NA
 130508 130507 Atu3066 Atu3067     TRUE 0.955 25.000 0.733 NA   NA
 130505 130504 Atu3069 Atu3070   amaB TRUE 0.749 15.000 0.047 1.000   NA
 130504 130503 Atu3070 Atu3071 amaB   FALSE 0.095 104.000 0.000 1.000   NA
 130502 130501 Atu3072 Atu3073     FALSE 0.051 165.000 0.000 1.000 N NA
 130501 130500 Atu3073 Atu3074     FALSE 0.030 206.000 0.000 1.000 N NA
 130498 130497 Atu3076 Atu3077 uraA ampC FALSE 0.010 256.000 0.000 NA N NA
 130495 130494 Atu3079 Atu3080 chrA   FALSE 0.096 103.000 0.000 1.000   NA
 130494 130493 Atu3080 Atu3081     TRUE 0.929 3.000 0.054 NA   NA
 130493 130492 Atu3081 Atu8183     TRUE 0.557 77.000 0.130 NA   NA
 130492 130491 Atu8183 Atu3083     TRUE 0.991 -3.000 0.174 NA   NA
 130491 130490 Atu3083 Atu3084   sigW TRUE 0.985 -3.000 0.062 NA   NA
 130490 130489 Atu3084 Atu3085 sigW   FALSE 0.060 152.000 0.000 1.000 N NA
 130489 130488 Atu3085 Atu3086     TRUE 0.990 12.000 0.613 NA Y NA
 130488 130487 Atu3086 Atu3087     TRUE 0.996 4.000 0.571 NA Y NA
 130487 130486 Atu3087 Atu3088     FALSE 0.283 238.000 0.094 NA Y NA
 130486 130485 Atu3088 Atu3089     TRUE 0.982 31.000 0.737 NA Y NA
 130485 130484 Atu3089 Atu3090     FALSE 0.021 226.000 0.000 1.000 N NA
 130482 130481 Atu3092 Atu3093     FALSE 0.068 97.000 0.000 NA   NA
 130481 130480 Atu3093 Atu3094   mcpA FALSE 0.003 419.000 0.000 NA N NA
 130479 130478 Atu3095 Atu3096   ugpB FALSE 0.006 261.000 0.000 NA   NA
 130478 130477 Atu3096 Atu3097 ugpB ugpA TRUE 0.974 83.000 0.900 NA Y NA
 130477 130476 Atu3097 Atu3098 ugpA ugpE TRUE 0.997 8.000 0.900 NA Y NA
 130476 130475 Atu3098 Atu3099 ugpE ugpC TRUE 0.980 32.000 0.700 NA Y NA
 130474 130473 Atu3100 Atu3101     TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA Y NA
 130473 130472 Atu3101 Atu3102     TRUE 0.979 76.000 1.000 NA Y NA
 130472 130471 Atu3102 Atu3103     TRUE 0.950 73.000 0.571 NA Y NA
 130471 130470 Atu3103 Atu3104   arfA TRUE 0.997 8.000 1.000 1.000 Y NA
 130470 130469 Atu3104 Atu3105 arfA celI FALSE 0.430 121.000 0.111 1.000 N NA
 130469 130468 Atu3105 Atu3106 celI   FALSE 0.024 194.000 0.000 NA N NA
 130467 130466 Atu3107 Atu3108     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 130466 130465 Atu3108 Atu3109     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130465 130464 Atu3109 Atu3110     TRUE 0.981 -3.000 0.039 NA   NA
 130463 130462 Atu3111 Atu3112     TRUE 0.565 92.000 0.000 NA Y NA
 130462 130461 Atu3112 Atu3113     TRUE 1.000 -7.000 0.714 NA Y NA
 130461 130460 Atu3113 Atu3114     TRUE 0.958 73.000 0.643 NA Y NA
 130459 130458 Atu3115 Atu3116     FALSE 0.009 267.000 0.000 1.000   NA
 130458 130457 Atu3116 Atu3117     TRUE 0.877 11.000 0.125 NA   NA
 130457 130456 Atu3117 Atu3118     TRUE 0.913 25.000 0.476 NA   NA
 130456 130455 Atu3118 Atu3119     TRUE 0.766 19.000 0.111 NA   NA
 130454 130453 Atu3121 Atu3122 cspA   FALSE 0.053 112.000 0.000 NA   NA
 130453 3820065 Atu3122 Atu3123   rpsU FALSE 0.155 29.000 0.000 NA   NA
 3820065 130452 Atu3123 Atu3124 rpsU   FALSE 0.135 37.000 0.000 NA   NA
 130452 130451 Atu3124 Atu3126     FALSE 0.001 739.000 0.000 NA   NA
 130450 130449 Atu3127 Atu3128 rspF yteR FALSE 0.044 154.000 0.000 1.000   NA
 130449 130448 Atu3128 Atu3129 yteR picA TRUE 0.515 9.000 0.000 1.000   NA
 130448 130447 Atu3129 Atu3130 picA   FALSE 0.077 113.000 0.000 NA N NA
 130447 130446 Atu3130 Atu3131     TRUE 0.700 44.000 0.000 NA Y NA
 130446 130445 Atu3131 Atu3132     TRUE 0.987 3.000 0.131 NA Y NA
 130445 130444 Atu3132 Atu3133     TRUE 0.998 5.000 0.917 NA Y NA
 130442 130441 Atu3135 Atu3136     TRUE 0.997 1.000 0.390 0.053 Y NA
 130441 130440 Atu3136 Atu3137     TRUE 0.971 71.000 0.756 1.000 Y NA
 130440 130439 Atu3137 Atu3138     FALSE 0.275 144.000 0.065 1.000   NA
 130439 130438 Atu3138 Atu3139     TRUE 0.995 -3.000 0.176 0.030   NA
 130438 130437 Atu3139 Atu3140     TRUE 0.921 26.000 0.052 0.071 Y NA
 130437 130436 Atu3140 Atu3141   kduD FALSE 0.238 114.000 0.000 0.071 N NA
 130436 130435 Atu3141 Atu3142 kduD kduI TRUE 0.998 -3.000 0.529 1.000 N NA
 130434 130433 Atu3143 Atu3144     TRUE 0.610 90.000 0.167 1.000 N NA
 130433 130432 Atu3144 Atu3145   kdgF FALSE 0.114 51.000 0.000 NA   NA
 130431 130430 Atu3146 Atu3147     FALSE 0.014 235.000 0.000 1.000   NA
 130430 130429 Atu3147 Atu3148     TRUE 0.832 36.000 0.292 1.000   NA
 130429 130428 Atu3148 Atu3149     TRUE 0.970 10.000 0.148 NA Y NA
 130428 130427 Atu3149 Atu3150     TRUE 1.000 -3.000 0.926 NA Y NA
 130427 130426 Atu3150 Atu3151     FALSE 0.431 258.000 0.370 NA Y NA
 130423 130422 Atu3154 Atu3155 fsr   FALSE 0.156 84.000 0.000 1.000 N NA
 130421 130420 Atu3156 Atu3157     TRUE 0.990 4.000 0.231 1.000 Y NA
 130420 130419 Atu3157 Atu3158     TRUE 0.629 141.000 0.081 1.000 Y NA
 130419 130418 Atu3158 Atu3159   mmsB FALSE 0.127 102.000 0.000 1.000 N NA
 130418 130417 Atu3159 Atu3160 mmsB   TRUE 0.734 54.000 0.211 1.000   NA
 130417 130416 Atu3160 Atu3161     TRUE 0.875 18.000 0.158 0.051   NA
 130416 130415 Atu3161 Atu3162     FALSE 0.060 152.000 0.000 1.000 N NA
 130415 130414 Atu3162 Atu3163     FALSE 0.401 115.000 0.067 1.000 N NA
 130414 130413 Atu3163 Atu3164     TRUE 0.844 17.000 0.059 0.051 N NA
 130413 130412 Atu3164 Atu3165     FALSE 0.062 260.000 0.059 NA N NA
 130411 130410 Atu3166 Atu3167 scrK agaZ TRUE 1.000 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 130410 130409 Atu3167 Atu3168 agaZ   FALSE 0.428 124.000 0.000 NA Y NA
 130409 130408 Atu3168 Atu3169     TRUE 0.994 13.000 0.918 NA Y NA
 130408 130407 Atu3169 Atu3170     TRUE 0.978 13.000 0.373 NA Y NA
 130406 130405 Atu3171 Atu3172     TRUE 0.980 5.000 0.118 NA Y NA
 130405 130404 Atu3172 Atu3173     TRUE 0.997 4.000 0.647 NA Y NA
 130404 130403 Atu3173 Atu3174     TRUE 0.697 211.000 0.529 NA Y NA
 130403 130402 Atu3174 Atu3175   mdeA TRUE 0.807 39.000 0.265 NA N NA
 130402 130401 Atu3175 Atu3176 mdeA   TRUE 0.997 -3.000 0.478 1.000 N NA
 130401 130400 Atu3176 Atu3177   rnhA FALSE 0.024 217.000 0.000 1.000 N NA
 130400 130399 Atu3177 Atu3178 rnhA   FALSE 0.046 171.000 0.000 1.000 N NA
 130399 130398 Atu3178 Atu3179     TRUE 0.962 29.000 0.400 1.000 Y NA
 130398 130397 Atu3179 Atu3180     TRUE 1.000 -7.000 0.465 0.099 Y NA
 130395 130394 Atu3182 Atu3183     FALSE 0.067 98.000 0.000 NA   NA
 130394 130393 Atu3183 Atu3184     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130392 130391 Atu3185 Atu3186 ugpB ugpA TRUE 0.971 71.000 0.793 NA Y NA
 130391 130390 Atu3186 Atu3187 ugpA ugpE TRUE 0.991 10.000 0.559 NA Y NA
 130390 130389 Atu3187 Atu3188 ugpE ugpC TRUE 0.997 0.000 0.464 NA Y NA
 130388 130387 Atu3189 Atu3190     FALSE 0.003 322.000 0.000 NA   NA
 130387 130386 Atu3190 Atu3191     FALSE 0.013 210.000 0.000 NA   NA
 130386 130385 Atu3191 Atu3192     FALSE 0.030 274.000 0.000 0.053 N NA
 130385 130384 Atu3192 Atu3193     TRUE 0.563 70.000 0.067 1.000 N NA
 130384 130383 Atu3193 Atu3194     FALSE 0.049 147.000 0.000 1.000   NA
 130383 130382 Atu3194 Atu3196   speF FALSE 0.158 251.000 0.257 1.000   NA
 130380 130379 Atu3198 Atu3199     TRUE 0.871 73.000 0.217 NA Y NA
 130379 130378 Atu3199 Atu3200     TRUE 0.922 53.000 0.300 NA Y NA
 130378 130377 Atu3200 Atu3201   acrR FALSE 0.034 194.000 0.000 1.000 N NA
 130377 130376 Atu3201 Atu3202 acrR   FALSE 0.082 130.000 0.000 1.000 N NA
 130376 130375 Atu3202 Atu3203     TRUE 0.986 13.000 0.909 1.000 N NA
 130375 130374 Atu3203 Atu3204     FALSE 0.006 342.000 0.000 1.000 N NA
 130374 130373 Atu3204 Atu3205     FALSE 0.067 98.000 0.000 NA   NA
 130373 130372 Atu3205 Atu3206     FALSE 0.045 122.000 0.000 NA   NA
 130370 130369 Atu3208 Atu3210     FALSE 0.008 312.000 0.000 1.000 N NA
 130368 130367 Atu3212 Atu3213     TRUE 0.991 10.000 0.545 NA Y NA
 130367 130366 Atu3213 Atu3214     TRUE 0.999 -3.000 0.727 NA Y NA
 130366 130365 Atu3214 Atu3215     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 130365 130364 Atu3215 Atu3216     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 130364 130363 Atu3216 Atu3217   aspC TRUE 0.983 4.000 0.075 1.000 Y NA
 130359 130358 Atu3221 Atu3222     FALSE 0.072 93.000 0.000 NA   NA
 130358 130357 Atu3222 Atu3223     TRUE 0.972 70.000 0.804 NA Y NA
 130357 130356 Atu3223 Atu3224     TRUE 0.999 -3.000 0.506 NA Y NA
 130356 130355 Atu3224 Atu3225     TRUE 1.000 -3.000 0.865 NA Y NA
 130355 130354 Atu3225 Atu3226     TRUE 0.688 18.000 0.034 NA N NA
 130354 130353 Atu3226 Atu3227     FALSE 0.239 218.000 0.000 0.054 Y NA
 130352 130351 Atu3228 Atu3229 dnaE   TRUE 0.998 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 130351 130350 Atu3229 Atu3230     FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 130349 130348 Atu8184 Atu3232     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130348 130347 Atu3232 Atu8185     FALSE 0.059 105.000 0.000 NA   NA
 130346 130345 Atu3234 Atu3235     TRUE 0.921 22.000 0.481 NA   NA
 130345 130344 Atu3235 Atu3236     FALSE 0.350 145.000 0.000 NA Y NA
 130344 130343 Atu3236 Atu3237     TRUE 0.943 18.000 0.190 NA Y NA
 130343 130342 Atu3237 Atu3238     TRUE 1.000 -7.000 0.833 NA Y NA
 130342 130341 Atu3238 Atu3239     TRUE 0.855 72.000 0.179 NA Y NA
 130340 130339 Atu3240 Atu3241     TRUE 0.752 53.000 0.229 1.000   NA
 130339 130338 Atu3241 Atu3242     TRUE 0.962 18.000 0.692 NA   NA
 130336 130335 Atu3244 Atu3245     TRUE 0.762 31.000 0.000 1.000 Y NA
 130335 130334 Atu3245 Atu3246     TRUE 0.742 72.000 0.000 0.016 Y NA
 130333 130332 Atu3247 Atu3248 minE minD TRUE 0.999 -3.000 0.618 NA Y NA
 130332 130331 Atu3248 Atu3249 minD minC TRUE 0.963 36.000 0.466 1.000 Y NA
 130331 3820067 Atu3249 Atu3250 minC   FALSE 0.099 63.000 0.000 NA   NA
 130330 130329 Atu3251 Atu3252   exuR FALSE 0.038 166.000 0.000 1.000   NA
 130329 130328 Atu3252 Atu3253 exuR   TRUE 0.790 63.000 0.300 1.000 N NA
 130328 130327 Atu3253 Atu3254     TRUE 0.872 61.000 0.176 NA Y NA
 130327 130326 Atu3254 Atu3255     TRUE 0.974 68.000 0.824 NA Y NA
 130326 130325 Atu3255 Atu3256     TRUE 0.856 76.000 0.500 1.000 N NA
 130325 130324 Atu3256 Atu3257   uxuA TRUE 0.868 17.000 0.211 1.000 N NA
 130321 130320 Atu3260 Atu3261     TRUE 0.982 17.000 1.000 1.000   NA
 130320 130319 Atu3261 Atu3262     FALSE 0.100 101.000 0.000 1.000   NA
 130319 130318 Atu3262 Atu3263   selA TRUE 0.960 56.000 1.000 1.000   NA
 130316 130315 Atu3265 Atu3266     TRUE 0.565 96.000 0.182 NA   NA
 130315 130314 Atu3266 Atu3267     TRUE 0.982 2.000 0.312 NA   NA
 130314 130313 Atu3267 Atu3268     TRUE 0.998 0.000 0.625 NA Y NA
 130313 130312 Atu3268 Atu3269     FALSE 0.323 363.000 0.542 NA Y NA
 130312 130311 Atu3269 Atu3270     FALSE 0.102 60.000 0.000 NA   NA
 130310 130309 Atu3271 Atu3272   pssN FALSE 0.028 477.000 0.000 1.000 Y NA
 130309 130308 Atu3272 Atu3273 pssN   FALSE 0.093 267.000 0.000 1.000 Y NA
 130308 130307 Atu3273 Atu3274     TRUE 0.989 -3.000 0.100 NA N NA
 130306 130305 Atu3275 Atu3276 ialB   TRUE 0.713 0.000 0.000 NA   NA
 130305 130304 Atu3276 Atu3277     FALSE 0.034 174.000 0.000 1.000   NA
 130304 130303 Atu3277 Atu3278     TRUE 0.976 0.000 0.045 0.051   NA
 130303 130302 Atu3278 Atu3279     TRUE 0.961 0.000 0.061 NA   NA
 130301 130300 Atu3280 Atu3281     FALSE 0.007 335.000 0.000 1.000 N NA
 130300 130299 Atu3281 Atu3282     TRUE 0.678 52.000 0.000 NA Y NA
 130299 130298 Atu3282 Atu3283   malF TRUE 0.709 160.000 0.300 NA Y NA
 130298 130297 Atu3283 Atu3284 malF malG TRUE 0.994 5.000 0.500 NA Y NA
 130297 130296 Atu3284 Atu3285 malG   TRUE 0.880 12.000 0.000 NA Y NA
 130296 130295 Atu3285 Atu3286     FALSE 0.003 450.000 0.000 NA N NA
 130295 130294 Atu3286 Atu3287     TRUE 0.893 51.000 0.196 NA Y NA
 130294 130293 Atu3287 Atu3288     TRUE 0.978 -3.000 0.005 1.000 N NA
 130293 130292 Atu3288 Atu3289     TRUE 0.997 -13.000 0.000 0.004 Y NA
 130292 130291 Atu3289 Atu3290   thiD TRUE 0.998 -3.000 0.122 0.004 Y NA
 130289 130288 Atu3292 Atu3293 alr dadA TRUE 0.611 8.000 0.000 1.000 N NA
 130285 130284 Atu3296 Atu3297 dctD dctB TRUE 0.998 2.000 0.615 0.099 Y NA
 130283 130282 Atu3298 Atu3299 dctA   FALSE 0.032 178.000 0.000 1.000   NA
 130281 130280 Atu3300 Atu3301   fixR FALSE 0.253 38.000 0.000 1.000 N NA
 130279 130278 Atu3302 Atu3303 celD celE FALSE 0.155 61.000 0.000 1.000   NA
 130277 130276 Atu8186 Atu3307 celG celC FALSE 0.112 93.000 0.000 1.000   NA
 130276 130275 Atu3307 Atu3308 celC celB TRUE 0.913 -3.000 0.000 1.000   NA
 130275 130274 Atu3308 Atu3309 celB celA TRUE 0.997 -3.000 0.286 0.001   NA
 130274 130273 Atu3309 Atu8187 celA   TRUE 0.837 95.000 0.571 NA   NA
 130271 130270 Atu3312 Atu3313     TRUE 0.886 14.000 0.238 NA   NA
 130270 130269 Atu3313 Atu3314     TRUE 0.876 15.000 0.238 NA   NA
 130269 130268 Atu3314 Atu3315   galE TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 130268 130267 Atu3315 Atu3316 galE   TRUE 0.996 2.000 0.238 0.004 Y NA
 130264 130263 Atu3319 Atu3320     FALSE 0.002 386.000 0.000 NA   NA
 130263 130262 Atu3320 Atu3321     TRUE 0.659 149.000 0.533 NA   NA
 130262 130261 Atu3321 Atu3322     FALSE 0.175 621.000 0.933 NA   NA
 130261 130260 Atu3322 Atu3323     TRUE 0.995 9.000 1.000 0.004   NA
 130260 130259 Atu3323 Atu3324     TRUE 0.615 84.000 0.200 NA   NA
 130258 130257 Atu3325 Atu3326 exoQ exoF TRUE 0.989 8.000 0.400 NA Y NA
 130257 130256 Atu3326 Atu3327 exoF exoY TRUE 0.781 194.000 0.611 NA Y NA
 130256 130255 Atu3327 Atu8030 exoY   FALSE 0.002 422.000 0.000 NA   NA
 130255 130254 Atu8030 Atu3328     FALSE 0.223 16.000 0.000 NA   NA
 130253 130252 Atu3329 Atu3330 bioA mclA FALSE 0.067 145.000 0.000 1.000 N NA
 130251 130250 Atu3331 Atu3332     FALSE 0.193 20.000 0.000 NA   NA
 130250 130249 Atu3332 Atu3333     FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 130249 130248 Atu3333 Atu3334     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130246 130245 Atu8031 Atu3336     FALSE 0.010 224.000 0.000 NA   NA
 130245 130244 Atu3336 Atu3337   thuR FALSE 0.021 175.000 0.000 NA   NA
 130243 130242 Atu3338 Atu3339 thuE thuF TRUE 0.846 64.000 0.121 NA Y NA
 130242 130241 Atu3339 Atu3340 thuF thuG TRUE 0.999 -3.000 0.723 NA Y NA
 130241 130240 Atu3340 Atu3341 thuG thuK TRUE 0.959 11.000 0.085 NA Y NA
 130240 130239 Atu3341 Atu3342 thuK thuA TRUE 0.659 58.000 0.000 NA Y NA
 130239 130238 Atu3342 Atu3343 thuA ThuB TRUE 0.932 7.000 0.182 NA   NA
 130237 130236 Atu3344 Atu3345 exsD exsC TRUE 0.993 -3.000 0.195 1.000 N NA
 130236 130235 Atu3345 Atu3346 exsC exsB TRUE 0.958 0.000 0.055 NA   NA
 130235 130234 Atu3346 Atu3347 exsB   FALSE 0.032 144.000 0.000 NA   NA
 130234 130233 Atu3347 Atu3348     TRUE 0.955 24.000 0.722 NA   NA
 130233 130232 Atu3348 Atu3349     TRUE 0.926 57.000 0.333 NA Y NA
 130232 130231 Atu3349 Atu3350     TRUE 0.997 6.000 0.889 NA Y NA
 130231 130230 Atu3350 Atu3351     TRUE 0.998 -7.000 0.111 NA Y NA
 130230 130229 Atu3351 Atu3352     FALSE 0.354 144.000 0.000 NA Y NA
 130229 130228 Atu3352 Atu3353   manC FALSE 0.006 305.000 0.000 NA N NA
 130228 130227 Atu3353 Atu3354 manC   FALSE 0.011 281.000 0.000 1.000 N NA
 130226 130225 Atu3355 Atu3356     FALSE 0.053 161.000 0.000 1.000 N NA
 130225 130224 Atu3356 Atu3357     FALSE 0.015 255.000 0.000 1.000 N NA
 130224 130223 Atu3357 Atu3358     FALSE 0.246 296.000 0.250 NA Y NA
 130223 130222 Atu3358 Atu3359     TRUE 1.000 -3.000 0.800 NA Y NA
 130222 130221 Atu3359 Atu3360     TRUE 0.993 13.000 0.789 1.000 Y NA
 130221 130220 Atu3360 Atu3361     TRUE 0.965 5.000 0.273 1.000   NA
 130220 130219 Atu3361 Atu3362     TRUE 0.858 27.000 0.318 NA   NA
 130216 130215 Atu3365 Atu8094     FALSE 0.125 43.000 0.000 NA   NA
 130214 130213 Atu3366 Atu3367     TRUE 0.937 33.000 0.283 NA Y NA
 130210 130209 Atu3370 Atu3371     TRUE 0.872 33.000 0.061 NA Y NA
 130209 130208 Atu3371 Atu3372     FALSE 0.129 234.000 0.000 NA Y NA
 130208 130206 Atu3372 Atu3374     FALSE 0.001 518.000 0.000 NA   NA
 130206 130205 Atu3374 Atu3375     FALSE 0.445 128.000 0.200 NA   NA
 130205 130204 Atu3375 Atu3376     TRUE 0.995 -3.000 0.300 NA N NA
 130204 130203 Atu3376 Atu3377     TRUE 0.960 8.000 0.308 1.000   NA
 130203 130202 Atu3377 Atu3378     TRUE 0.997 -3.000 0.474 NA   NA
 130202 130201 Atu3378 Atu3379   dppB TRUE 0.999 -3.000 0.474 NA Y NA
 130201 130200 Atu3379 Atu3381 dppB   FALSE 0.352 181.000 0.267 NA N NA
 130200 130199 Atu3381 Atu3382   prsE2 FALSE 0.028 209.000 0.000 1.000 N NA
 130199 130198 Atu3382 Atu3383 prsE2 prsD TRUE 0.997 -13.000 0.167 0.004   NA
 130198 130197 Atu3383 Atu3384 prsD   FALSE 0.233 15.000 0.000 NA   NA
 130197 130196 Atu3384 Atu3385   hasR FALSE 0.060 104.000 0.000 NA   NA
 130196 130195 Atu3385 Atu3386 hasR   TRUE 0.613 150.000 0.133 NA Y NA
 130195 130194 Atu3386 Atu3387   pfrI TRUE 0.917 112.000 1.000 NA N NA
 130194 130193 Atu3387 Atu3388 pfrI fecE FALSE 0.026 212.000 0.000 1.000 N NA
 130193 130192 Atu3388 Atu3389 fecE   TRUE 1.000 -6.000 0.833 NA Y NA
 130192 130191 Atu3389 Atu3390     TRUE 0.996 -3.000 0.053 NA Y NA
 130191 130190 Atu3390 Atu3391     TRUE 0.969 97.000 0.667 0.002 Y NA
 130188 130187 Atu3393 Atu3394   fecE TRUE 0.997 -3.000 0.375 1.000 N NA
 130187 130186 Atu3394 Atu3395 fecE   TRUE 0.999 -3.000 0.348 NA Y NA
 130186 130185 Atu3395 Atu3396     TRUE 0.979 72.000 0.958 NA Y NA
 130185 130184 Atu3396 Atu3397     FALSE 0.003 444.000 0.000 1.000   NA
 130183 130182 Atu3398 Atu3399 argE   TRUE 0.971 23.000 0.455 1.000 Y NA
 130182 130181 Atu3399 Atu3400     TRUE 0.906 29.000 0.476 NA   NA
 130181 130180 Atu3400 Atu3401     FALSE 0.284 190.000 0.235 NA   NA
 130180 130179 Atu3401 Atu3402     TRUE 0.985 14.000 0.412 0.071 Y NA
 130179 130178 Atu3402 Atu3403   attK2 TRUE 0.985 16.000 0.481 0.071 Y NA
 130177 130176 Atu3404 Atu3405 ordL hadL FALSE 0.319 16.000 0.000 1.000   NA
 130175 130174 Atu3406 Atu3407     FALSE 0.333 15.000 0.000 1.000   NA
 130174 130173 Atu3407 Atu3408   hadL TRUE 0.588 125.000 0.300 1.000   NA
 130173 130172 Atu3408 Atu3409 hadL   TRUE 0.745 94.000 0.375 NA   NA
 130172 130171 Atu3409 Atu3410     TRUE 0.918 93.000 0.450 NA Y NA
 130171 130170 Atu3410 Atu3411     TRUE 0.999 0.000 0.900 NA Y NA
 130170 130169 Atu3411 Atu3412     TRUE 0.997 0.000 0.900 NA   NA
 130166 130165 Atu3415 Atu3416     TRUE 0.762 140.000 0.158 0.016 Y NA
 130165 130164 Atu3416 Atu3417     TRUE 0.781 26.000 0.000 1.000 Y NA
 130164 130163 Atu3417 Atu3418     FALSE 0.355 14.000 0.000 1.000   NA
 130163 130162 Atu3418 Atu3419     FALSE 0.251 24.000 0.000 1.000   NA
 130162 130161 Atu3419 Atu3420     TRUE 0.789 84.000 0.421 NA   NA
 130161 130160 Atu3420 Atu3421     TRUE 0.974 24.000 0.526 NA Y NA
 130158 130157 Atu3424 Atu3425     FALSE 0.410 52.000 0.000 0.044   NA
 130157 130156 Atu3425 Atu3426     FALSE 0.044 155.000 0.000 1.000   NA
 130154 130153 Atu3429 Atu3430     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130152 130151 Atu3431 Atu3432 acd   TRUE 0.997 -3.000 0.429 NA N NA
 130151 130150 Atu3432 Atu3433     TRUE 0.673 70.000 0.200 NA N NA
 130149 130148 Atu3434 Atu3435     TRUE 0.999 -3.000 0.400 NA Y NA
 130148 130147 Atu3435 Atu3436     TRUE 0.999 -3.000 0.444 NA Y NA
 130147 130146 Atu3436 Atu3437     TRUE 1.000 -22.000 1.000 0.002 Y NA
 130146 130145 Atu3437 Atu3438     TRUE 0.787 19.000 0.094 1.000 N NA
 130145 130144 Atu3438 Atu3439   acd TRUE 0.560 68.000 0.062 1.000 N NA
 130144 130143 Atu3439 Atu3440 acd   FALSE 0.344 20.000 0.000 1.000 N NA
 130142 130141 Atu3441 Atu3442     FALSE 0.155 56.000 0.000 NA N NA
 130140 130139 Atu3444 Atu3445     TRUE 0.991 -7.000 0.065 NA   NA
 130139 130138 Atu3445 Atu3446     FALSE 0.436 94.000 0.065 NA   NA
 130138 130137 Atu3446 Atu3447     TRUE 0.947 -9.000 0.000 NA N NA
 130137 130136 Atu3447 Atu3448     TRUE 0.962 8.000 0.333 NA N NA
 130133 130132 Atu3453 Atu3454     TRUE 0.632 7.000 0.000 1.000 N NA
 130132 130131 Atu3454 Atu3455     TRUE 0.610 82.000 0.000 1.000 Y NA
 130130 130129 Atu3456 Atu3457     TRUE 0.999 0.000 0.733 0.031 Y NA
 130129 130128 Atu3457 Atu3458     TRUE 0.996 5.000 0.692 NA Y NA
 130128 130127 Atu3458 Atu3459     TRUE 0.998 0.000 0.640 NA Y NA
 130125 130124 Atu3461 Atu3462     TRUE 0.682 95.000 0.000 0.053 Y NA
 130123 130122 Atu3463 Atu3464 cpoF   FALSE 0.237 27.000 0.000 1.000   NA
 130122 130121 Atu3464 Atu8032     FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 130121 130120 Atu8032 Atu3465     FALSE 0.006 263.000 0.000 NA   NA
 130120 130119 Atu3465 Atu3466     TRUE 0.946 -6.000 0.000 1.000   NA
 130119 130118 Atu3466 Atu3467     TRUE 0.567 30.000 0.031 NA   NA
 130118 130117 Atu3467 Atu3468     TRUE 0.987 -3.000 0.083 NA   NA
 130116 130115 Atu3469 Atu3470 pgm   TRUE 0.928 -27.000 0.000 NA   NA
 130115 130114 Atu3470 Atu3471   bkdB FALSE 0.015 195.000 0.000 NA   NA
 130114 130113 Atu3471 Atu3472 bkdB bkdA2 TRUE 0.992 3.000 0.152 0.070 Y NA
 130113 130112 Atu3472 Atu3473 bkdA2 bkdA1 TRUE 0.998 4.000 0.558 0.000 Y NA
 130112 130111 Atu3473 Atu3474 bkdA1 mmgC TRUE 0.558 45.000 0.029 1.000 N NA
 130111 130110 Atu3474 Atu3475 mmgC   TRUE 0.989 12.000 0.529 1.000 Y NA
 130109 130108 Atu3476 Atu3477   acd FALSE 0.160 80.000 0.000 1.000 N NA
 130108 130107 Atu3477 Atu3478 acd mccB TRUE 0.986 9.000 0.316 1.000 Y NA
 130107 130106 Atu3478 Atu3479 mccB mccA TRUE 0.986 8.000 0.158 0.002 Y NA
 130106 130105 Atu3479 Atu3480 mccA hmgL TRUE 0.985 2.000 0.229 0.070 N NA
 130105 130104 Atu3480 Atu3481 hmgL   TRUE 0.986 -10.000 0.000 0.070 N NA
 130104 130103 Atu3481 Atu3482   panC FALSE 0.071 141.000 0.000 1.000 N NA
 130103 130102 Atu3482 Atu3483 panC panB TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.000 Y NA
 130101 130100 Atu3484 Atu3485     TRUE 0.659 51.000 0.147 NA   NA
 130099 130098 Atu3486 Atu3487     TRUE 0.938 48.000 0.357 NA Y NA
 130098 130097 Atu3487 Atu3488     TRUE 0.582 227.000 0.446 NA Y NA
 130097 130096 Atu3488 Atu3489     TRUE 0.990 15.000 0.794 NA Y NA
 130096 130095 Atu3489 Atu3490     TRUE 0.999 -3.000 0.515 NA Y NA
 130095 130094 Atu3490 Atu3491     TRUE 0.952 4.000 0.168 NA   NA
 130094 130093 Atu3491 Atu3492     TRUE 0.990 -3.000 0.147 NA   NA
 130092 130091 Atu3493 Atu3494     FALSE 0.003 318.000 0.000 NA   NA
 130091 130090 Atu3494 Atu3495     FALSE 0.292 162.000 0.167 NA   NA
 130090 130089 Atu3495 Atu3496     TRUE 0.950 10.000 0.300 1.000   NA
 130089 3820070 Atu3496 Atu3497     FALSE 0.019 181.000 0.000 NA   NA
 130088 3820071 Atu3498 Atu3499     FALSE 0.135 37.000 0.000 NA   NA
 3820071 130086 Atu3499 Atu3500     TRUE 0.930 -812.000 0.000 NA   NA
 130085 130084 Atu3501 Atu3502     TRUE 0.982 6.000 0.180 1.000 Y NA
 130084 130083 Atu3502 Atu3503     TRUE 0.994 4.000 0.583 0.001 N NA
 130083 130082 Atu3503 Atu3504     TRUE 0.918 62.000 0.479 0.001 N NA
 130082 130081 Atu3504 Atu3505     FALSE 0.047 170.000 0.000 1.000 N NA
 130077 130076 Atu3509 Atu3510     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130076 130075 Atu3510 Atu3511   grx TRUE 0.637 25.000 0.035 1.000   NA
 130075 130074 Atu3511 Atu3512 grx comF TRUE 0.752 13.000 0.027 1.000   NA
 3820072 130072 Atu3514 Atu3515 pilA   FALSE 0.088 72.000 0.000 NA   NA
 130072 130071 Atu3515 Atu3516     FALSE 0.119 173.000 0.019 NA   NA
 130071 130070 Atu3516 Atu3517     TRUE 0.988 -3.000 0.082 1.000   NA
 130070 130069 Atu3517 Atu3518   argJ TRUE 0.648 19.000 0.020 1.000   NA
 130069 130068 Atu3518 Atu3519 argJ ppiD TRUE 0.504 93.000 0.070 1.000 N NA
 130067 130066 Atu3520 Atu3521 secA   FALSE 0.030 148.000 0.000 NA   NA
 130066 130065 Atu3521 Atu3522     FALSE 0.079 82.000 0.000 NA   NA
 130065 130064 Atu3522 Atu3523     FALSE 0.162 57.000 0.000 1.000   NA
 130064 130063 Atu3523 Atu8188     TRUE 0.962 9.000 0.378 NA   NA
 130061 130060 Atu3527 Atu3528     FALSE 0.242 26.000 0.000 1.000   NA
 130060 130059 Atu3528 Atu3529   uxuA TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000 N NA
 130059 130058 Atu3529 Atu3530 uxuA uxuB TRUE 0.989 4.000 0.222 1.000 Y NA
 130058 130057 Atu3530 Atu3531 uxuB fabG TRUE 0.925 18.000 0.286 0.070 N NA
 130057 130056 Atu3531 Atu3532 fabG   FALSE 0.317 23.000 0.000 1.000 N NA
 130055 130054 Atu3533 Atu3534     TRUE 0.760 140.000 0.286 NA Y NA
 130054 130053 Atu3534 Atu3535     TRUE 0.996 11.000 1.000 NA Y NA
 130053 130052 Atu3535 Atu3536     TRUE 0.980 5.000 0.111 NA Y NA
 130050 130049 Atu3539 Atu3540     FALSE 0.114 51.000 0.000 NA   NA
 130048 130047 Atu3541 Atu3542   prp1 FALSE 0.046 120.000 0.000 NA   NA
 130042 130041 Atu3547 Atu3548     FALSE 0.031 145.000 0.000 NA   NA
 130041 130040 Atu3548 Atu3549     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130040 130039 Atu3549 Atu3550     TRUE 0.987 -7.000 0.027 NA   NA
 130039 130038 Atu3550 Atu3551     FALSE 0.253 162.000 0.091 1.000   NA
 130037 130036 Atu3553 Atu3554     FALSE 0.032 144.000 0.000 NA   NA
 130036 130035 Atu3554 Atu3555     FALSE 0.019 182.000 0.000 NA   NA
 130035 130034 Atu3555 Atu3556     FALSE 0.038 132.000 0.000 NA   NA
 130034 130033 Atu3556 Atu8033     FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 130033 130032 Atu8033 Atu3557     FALSE 0.038 133.000 0.000 NA   NA
 130032 130031 Atu3557 Atu3558     FALSE 0.309 17.000 0.000 1.000   NA
 130030 130029 Atu3559 Atu3560     TRUE 0.790 53.000 0.000 0.014 Y NA
 130028 130027 Atu3561 Atu3562     TRUE 0.928 -24.000 0.000 NA   NA
 130024 130023 Atu3565 Atu3566     FALSE 0.002 394.000 0.000 NA   NA
 130023 130022 Atu3566 Atu3567     FALSE 0.091 70.000 0.000 NA   NA
 130021 130020 Atu3568 Atu3569     FALSE 0.393 9.000 0.000 NA   NA
 130020 130019 Atu3569 Atu3570     TRUE 0.745 38.000 0.200 NA   NA
 130019 130018 Atu3570 Atu3571     TRUE 0.979 0.000 0.200 NA   NA
 130018 130017 Atu3571 Atu8113     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 130017 130016 Atu8113 Atu3572     FALSE 0.041 127.000 0.000 NA   NA
 130016 130015 Atu3572 Atu3573     FALSE 0.155 29.000 0.000 NA   NA
 130014 130013 Atu3574 Atu3575 xylG xylH TRUE 0.893 19.000 0.333 NA   NA
 130013 130012 Atu3575 Atu3576 xylH xylF TRUE 0.855 81.000 0.208 NA Y NA
 130010 130009 Atu3578 Atu3579 glpD gloA FALSE 0.036 168.000 0.000 1.000   NA
 130009 130008 Atu3579 Atu3580 gloA mutA TRUE 0.757 14.000 0.041 1.000   NA
 130008 130007 Atu3580 Atu3581 mutA pccA TRUE 0.695 127.000 0.031 0.070 Y NA
 130007 130006 Atu3581 Atu3582 pccA   TRUE 0.850 5.000 0.014 NA   NA
 130006 130005 Atu3582 Atu3583     FALSE 0.206 18.000 0.000 NA   NA
 130005 130004 Atu3583 Atu8189     FALSE 0.140 35.000 0.000 NA   NA
 130004 130003 Atu8189 Atu3585     FALSE 0.199 126.000 0.013 NA   NA
 130003 130002 Atu3585 Atu3586     FALSE 0.123 104.000 0.000 1.000 N NA
 129997 129996 Atu3591 Atu8190     TRUE 0.854 18.000 0.231 NA   NA
 129996 129995 Atu8190 Atu3593     TRUE 0.964 2.000 0.156 NA   NA
 129995 129994 Atu3593 Atu3594     TRUE 0.591 33.000 0.033 1.000   NA
 129994 129993 Atu3594 Atu3595   etfB FALSE 0.030 183.000 0.000 1.000   NA
 129993 129992 Atu3595 Atu3596 etfB etfA TRUE 0.920 26.000 0.032 0.008 Y NA
 129992 129991 Atu3596 Atu3597 etfA hbdA FALSE 0.433 115.000 0.092 1.000 N NA
 129989 129988 Atu3599 Atu3600 argH   TRUE 0.985 -13.000 0.008 NA   NA
 129988 129987 Atu3600 Atu3601   lysA TRUE 0.656 14.000 0.013 NA   NA
 129987 129986 Atu3601 Atu3602 lysA   FALSE 0.190 167.000 0.062 NA   NA
 3820075 129985 Atu8114 Atu3603     FALSE 0.047 118.000 0.000 NA   NA
 129985 129984 Atu3603 Atu3604   hpt FALSE 0.241 143.000 0.031 1.000 N NA
 129984 129983 Atu3604 Atu3605 hpt   FALSE 0.388 71.000 0.021 NA   NA
 129982 129981 Atu3606 Atu3607 ftsE ftsX TRUE 0.998 -7.000 0.139 NA Y NA
 129981 129980 Atu3607 Atu3608 ftsX   TRUE 0.702 114.000 0.417 NA   NA
 129980 129979 Atu3608 Atu3609   plsC TRUE 0.556 115.000 0.250 NA   NA
 129976 129975 Atu3611 Atu3612 tyrC hisC TRUE 0.994 0.000 0.198 1.000 Y NA
 129975 129974 Atu3612 Atu3613 hisC   FALSE 0.342 85.000 0.008 1.000   NA
 129973 129972 Atu3614 Atu3615 gloB   TRUE 0.826 12.000 0.071 NA   NA
 129970 129969 Atu3617 Atu3618 rpmB   FALSE 0.139 166.000 0.025 NA   NA
 129969 129968 Atu3618 Atu3619     FALSE 0.053 112.000 0.000 NA   NA
 129967 129966 Atu3620 Atu3621   cobT TRUE 0.997 -10.000 0.260 NA   NA
 129966 129965 Atu3621 Atu3622 cobT cobS TRUE 0.822 112.000 0.433 0.001   NA
 129965 129964 Atu3622 Atu3623 cobS dnaJ TRUE 0.539 69.000 0.065 1.000   NA
 129962 129961 Atu3625 Atu3626 aroB aroK TRUE 0.981 6.000 0.147 1.000 Y NA
 129961 3820076 Atu3626 Atu3627 aroK   TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 129960 129959 Atu3628 Atu3629   xerD TRUE 0.982 -3.000 0.043 NA   NA
 129959 129958 Atu3629 Atu3630 xerD accA TRUE 0.563 64.000 0.058 1.000 N NA
 129958 129957 Atu3630 Atu3631 accA   FALSE 0.010 453.000 0.015 NA   NA
 129957 129956 Atu3631 Atu3632     TRUE 0.984 -3.000 0.060 NA   NA
 129955 129954 Atu3633 Atu3634   dacF FALSE 0.468 188.000 0.458 NA   NA
 129953 3820077 Atu3635 Atu8111.1     FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 3820077 3820078 Atu8111.1 Atu8111.2     FALSE 0.008 238.000 0.000 NA   NA
 129952 129951 Atu3636 Atu3637   rpsU FALSE 0.026 158.000 0.000 NA   NA
 129951 129950 Atu3637 Atu3638 rpsU   FALSE 0.006 259.000 0.000 NA   NA
 129950 129949 Atu3638 Atu3639     TRUE 0.542 4.000 0.000 NA   NA
 129949 129948 Atu3639 Atu3640     TRUE 0.589 3.000 0.000 NA   NA
 129948 129947 Atu3640 Atu3641     TRUE 0.993 -3.000 0.222 NA   NA
 129947 129946 Atu3641 Atu3642   vgrG TRUE 0.950 14.000 0.500 NA   NA
 129945 129944 Atu3643 Atu3644     FALSE 0.009 228.000 0.000 NA   NA
 129944 3820079 Atu3644 Atu3645     FALSE 0.046 119.000 0.000 NA   NA
 3820080 129942 Atu3647 Atu3648     FALSE 0.002 416.000 0.000 NA   NA
 129942 129940 Atu3648 Atu3650     FALSE 0.002 483.000 0.000 NA   NA
 129940 129939 Atu3650 Atu3651     FALSE 0.178 71.000 0.000 1.000 N NA
 129939 129938 Atu3651 Atu3652     FALSE 0.035 138.000 0.000 NA   NA
 3820081 129937 Atu3653 Atu3654     FALSE 0.001 554.000 0.000 NA   NA
 129936 129935 Atu3655 Atu3656     FALSE 0.031 181.000 0.000 1.000   NA
 129935 129934 Atu3656 Atu3657     FALSE 0.009 269.000 0.000 1.000   NA
 129934 129933 Atu3657 Atu3658     FALSE 0.031 263.000 0.000 0.094 N NA
 129927 129926 Atu8034 Atu3666     FALSE 0.276 13.000 0.000 NA   NA
 129926 129925 Atu3666 Atu3667   panD FALSE 0.157 55.000 0.000 NA N NA
 129924 129923 Atu3668 Atu3669     FALSE 0.264 115.000 0.017 NA N NA
 129923 129922 Atu3669 Atu3670     TRUE 0.577 32.000 0.017 1.000 N NA
 129922 129921 Atu3670 Atu3671     TRUE 0.908 11.000 0.182 NA N NA
 129921 129920 Atu3671 Atu3672     TRUE 0.739 40.000 0.182 NA N NA
 129920 129919 Atu3672 Atu3673     TRUE 0.969 42.000 0.400 0.002 Y NA
 129919 3820082 Atu3673 Atu3674     FALSE 0.087 73.000 0.000 NA   NA
 129918 129917 Atu3675 Atu3676     TRUE 0.992 -3.000 0.083 0.069   NA
 129917 129916 Atu3676 Atu3677     TRUE 0.994 -3.000 0.250 1.000   NA
 129916 129915 Atu3677 Atu3678     FALSE 0.233 15.000 0.000 NA   NA
 129915 129914 Atu3678 Atu3679     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 129914 129913 Atu3679 Atu3680     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA   NA
 129913 129912 Atu3680 Atu3681     TRUE 0.715 38.000 0.167 NA   NA
 129912 129911 Atu3681 Atu3682     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 129911 129910 Atu3682 Atu3683     TRUE 0.935 12.000 0.000 0.002 Y NA
 129910 129909 Atu3683 Atu3684     TRUE 0.870 5.000 0.000 0.002   NA
 129909 129908 Atu3684 Atu3685     FALSE 0.333 15.000 0.000 1.000   NA
 129908 129907 Atu3685 Atu3686     FALSE 0.157 28.000 0.000 NA   NA
 129907 129906 Atu3686 Atu3687     FALSE 0.037 134.000 0.000 NA   NA
 129906 129905 Atu3687 Atu3688   fecB TRUE 0.958 54.000 0.500 1.000 Y NA
 129905 129904 Atu3688 Atu3689 fecB fecC TRUE 1.000 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 129904 129903 Atu3689 Atu3690 fecC fecD TRUE 0.996 -3.000 0.039 NA Y NA
 129903 129902 Atu3690 Atu3691 fecD fecE TRUE 0.997 -7.000 0.039 NA Y NA
 129902 129901 Atu3691 Atu3692 fecE   FALSE 0.006 352.000 0.000 1.000 N NA
 129901 129900 Atu3692 Atu3693   fecR TRUE 0.857 48.000 0.400 NA N NA
 129899 129898 Atu3694 Atu3695 pbpC   TRUE 0.910 30.000 0.473 1.000   NA
 129898 3820083 Atu3695 Atu3696     FALSE 0.046 119.000 0.000 NA   NA
 3820083 129897 Atu3696 Atu3697   lonD TRUE 0.886 11.000 0.148 NA   NA
 129897 129896 Atu3697 Atu3698 lonD   TRUE 0.645 93.000 0.222 1.000   NA
 129896 129895 Atu3698 Atu3699     TRUE 0.746 54.000 0.245 NA   NA
 3820084 129894 Atu3700 Atu3701     FALSE 0.010 224.000 0.000 NA   NA
 3820085 129893 Atu3702 Atu3703   trmU FALSE 0.036 137.000 0.000 NA   NA
 129893 129892 Atu3703 Atu3704 trmU   FALSE 0.007 253.000 0.000 NA   NA
 129892 129891 Atu3704 Atu3705     FALSE 0.002 439.000 0.000 NA   NA
 129891 129890 Atu3705 Atu3706   serA FALSE 0.002 658.000 0.000 1.000   NA
 129890 129889 Atu3706 Atu3707 serA serC TRUE 0.830 84.000 0.140 1.000 Y NA
 129889 129888 Atu3707 Atu3708 serC   FALSE 0.098 214.000 0.028 1.000 N NA
 129888 129887 Atu3708 Atu3709   mrsA FALSE 0.105 189.000 0.004 1.000 N NA
 129887 129886 Atu3709 Atu3710 mrsA ftsH FALSE 0.115 189.000 0.012 1.000 N NA
 129886 129885 Atu3710 Atu3711 ftsH mesJ FALSE 0.422 155.000 0.145 0.096 N NA
 129885 129884 Atu3711 Atu3712 mesJ   TRUE 0.723 25.000 0.085 1.000   NA
 129884 129883 Atu3712 Atu3713   palA FALSE 0.305 174.000 0.199 1.000   NA
 129883 129882 Atu3713 Atu3714 palA tolB TRUE 0.507 211.000 0.592 1.000 N NA
 129882 129881 Atu3714 Atu3715 tolB tolA TRUE 0.613 21.000 0.027 NA   NA
 129881 129880 Atu3715 Atu3716 tolA tolR TRUE 0.853 10.000 0.061 NA   NA
 129880 129879 Atu3716 Atu3717 tolR tolQ TRUE 0.892 59.000 0.220 NA Y NA
 129879 129878 Atu3717 Atu3718 tolQ   FALSE 0.315 262.000 0.593 1.000   NA
 129878 129877 Atu3718 Atu3719   mutT FALSE 0.205 125.000 0.000 0.016   NA
 129877 129876 Atu3719 Atu3720 mutT   TRUE 0.984 0.000 0.261 NA   NA
 129876 129875 Atu3720 Atu3721     FALSE 0.137 36.000 0.000 NA   NA
 129875 129874 Atu3721 Atu3722   ruvB FALSE 0.111 53.000 0.000 NA   NA
 129874 129873 Atu3722 Atu3723 ruvB ruvA TRUE 0.965 87.000 0.549 0.001 Y NA
 129873 129872 Atu3723 Atu3724 ruvA ruvC TRUE 0.978 28.000 0.451 0.007 Y NA
 129871 129870 Atu3725 Atu3726     FALSE 0.188 147.000 0.022 NA N NA
 129867 129866 Atu3729 Atu3730     FALSE 0.021 305.000 0.013 NA   NA
 129866 129865 Atu3730 Atu3731     FALSE 0.461 100.000 0.077 1.000   NA
 129865 129864 Atu3731 Atu3732     TRUE 0.713 0.000 0.000 NA   NA
 129864 3820086 Atu3732 Atu3733     TRUE 0.589 3.000 0.000 NA   NA
 3820086 3820087 Atu3733 Atu8108   6S TRUE 0.663 1.000 0.000 NA   NA
 3820087 129863 Atu8108 Atu8191 6S   FALSE 0.093 68.000 0.000 NA   NA
 129863 129862 Atu8191 Atu8192     TRUE 0.823 12.000 0.068 NA   NA
 129861 129860 Atu3736 Atu3737 tktA gapA TRUE 0.943 63.000 0.439 1.000 Y NA
 129860 129859 Atu3737 Atu3738 gapA   FALSE 0.036 317.000 0.047 1.000 N NA
 129859 129858 Atu3738 Atu3739   pgk FALSE 0.420 68.000 0.008 1.000 N NA
 129858 129857 Atu3739 Atu3740 pgk   TRUE 0.511 192.000 0.032 0.002 Y NA
 129857 129856 Atu3740 Atu3741     FALSE 0.004 350.000 0.000 1.000   NA
 129856 129855 Atu3741 Atu3742     FALSE 0.001 591.000 0.000 NA   NA
 129852 129851 Atu3745 Atu3746   motB FALSE 0.362 89.000 0.016 1.000   NA
 129851 129850 Atu3746 Atu3747 motB   FALSE 0.242 249.000 0.432 NA   NA
 129850 129849 Atu3747 Atu3748   suhB FALSE 0.079 202.000 0.014 NA   NA
 129849 129848 Atu3748 Atu3749 suhB enhC FALSE 0.163 164.000 0.026 1.000   NA
 129848 129847 Atu3749 Atu3750 enhC thiE TRUE 0.992 -3.000 0.181 1.000   NA
 129845 129844 Atu3753 Atu3754   purE TRUE 0.721 15.000 0.044 NA   NA
 129844 129843 Atu3754 Atu3755 purE purK TRUE 0.982 12.000 0.201 0.000 Y NA
 129843 3820089 Atu3755 Atu8067 purK rpmJ FALSE 0.233 147.000 0.045 1.000   NA
 3820089 129841 Atu8067 Atu3757 rpmJ   FALSE 0.098 102.000 0.000 1.000   NA
 129840 129839 Atu3758 Atu3759     FALSE 0.030 149.000 0.000 NA   NA
 129839 129838 Atu3759 Atu3760     TRUE 0.876 16.000 0.254 NA   NA
 129837 129836 Atu3761 Atu3762   pykA TRUE 0.993 0.000 0.487 NA   NA
 129835 129834 Atu3763 Atu3764     FALSE 0.003 318.000 0.000 NA   NA
 129833 129832 Atu3765 Atu3766 pepF   TRUE 0.683 100.000 0.009 1.000 Y NA
 129830 129829 Atu3768 Atu3769     TRUE 0.544 150.000 0.385 NA   NA
 129829 129828 Atu3769 Atu3770     FALSE 0.060 216.000 0.011 NA   NA
 129828 129827 Atu3770 Atu3771   hemH FALSE 0.033 351.000 0.061 1.000 N NA
 129827 129826 Atu3771 Atu3772 hemH   TRUE 0.608 58.000 0.092 NA N NA
 129826 129825 Atu3772 Atu3773     TRUE 0.993 3.000 0.313 NA Y NA
 129824 129823 Atu3774 Atu3775 kpsF   FALSE 0.102 60.000 0.000 NA   NA
 3820090 129822 Atu3776 Atu3777     FALSE 0.438 7.000 0.000 NA   NA
 129820 129819 Atu3779 Atu3780 mltB   TRUE 0.805 64.000 0.346 1.000   NA
 129819 129818 Atu3780 Atu3781     FALSE 0.011 252.000 0.000 1.000   NA
 129818 129817 Atu3781 Atu3782     TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 129816 129815 Atu3783 Atu3784 gltD gltB TRUE 0.719 183.000 0.236 0.001 Y NA
 129813 129812 Atu3786 Atu3787 kdpE kdpD TRUE 0.971 61.000 0.695 1.000 Y NA
 129812 129811 Atu3787 Atu3788 kdpD kdpC TRUE 0.656 55.000 0.106 1.000 N NA
 129811 129810 Atu3788 Atu3789 kdpC kdpB TRUE 0.996 13.000 0.877 0.001 Y NA
 129810 129809 Atu3789 Atu3790 kdpB kdpA TRUE 0.568 218.000 0.201 0.001 Y NA
 129809 129807 Atu3790 Atu3791 kdpA ansA FALSE 0.003 553.000 0.000 1.000 N NA
 129807 129806 Atu3791 Atu3792 ansA ansP TRUE 0.995 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 129804 129803 Atu3794 Atu3795     FALSE 0.019 210.000 0.000 NA N NA
 129803 129802 Atu3795 Atu3796     TRUE 0.999 -3.000 0.739 NA N NA
 129802 129801 Atu3796 Atu3797     TRUE 0.999 0.000 0.826 0.006 Y NA
 129798 129797 Atu3800 Atu3801 proX proW TRUE 0.796 96.000 0.133 NA Y NA
 129797 129796 Atu3801 Atu3802 proW proV TRUE 0.999 -7.000 0.485 NA Y NA
 129796 129795 Atu3802 Atu3803 proV hutH TRUE 0.999 -7.000 0.212 1.000 Y NA
 129795 129794 Atu3803 Atu3804 hutH   FALSE 0.012 267.000 0.000 1.000 N NA
 129794 129793 Atu3804 Atu3805   myg1 FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 129785 129784 Atu3813 Atu3814 fabG   FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 129783 129782 Atu3815 Atu3816   fdh FALSE 0.010 283.000 0.000 1.000 N NA
 129781 129780 Atu3817 Atu3818   rbsA FALSE 0.428 130.000 0.000 1.000 Y NA
 129780 129779 Atu3818 Atu3819 rbsA rbsC TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 129779 129778 Atu3819 Atu3820 rbsC rbsC TRUE 0.998 -3.000 0.286 NA Y NA
 129778 129777 Atu3820 Atu3821 rbsC rbsB TRUE 0.926 34.000 0.231 NA Y NA
 129777 3820091 Atu3821 Atu3822 rbsB   FALSE 0.040 129.000 0.000 NA   NA
 129776 129775 Atu3823 Atu3824 metE   TRUE 0.958 26.000 0.775 NA   NA
 129774 129773 Atu3826 Atu3827     TRUE 0.686 3.000 0.000 NA N NA
 129773 129772 Atu3827 Atu3828     FALSE 0.175 51.000 0.000 1.000   NA
 129770 129769 Atu3830 Atu3831   int FALSE 0.007 320.000 0.000 1.000 N NA
 129769 129768 Atu3831 Atu3832 int   FALSE 0.013 208.000 0.000 NA   NA
 129767 129766 Atu3833 Atu3834     FALSE 0.276 13.000 0.000 NA   NA
 129766 129765 Atu3834 Atu3835     TRUE 0.925 -13.000 0.000 NA   NA
 129765 129764 Atu3835 Atu3836     FALSE 0.004 291.000 0.000 NA   NA
 129764 129763 Atu3836 Atu3837     FALSE 0.121 45.000 0.000 NA   NA
 129763 3820092 Atu3837 Atu3838     FALSE 0.085 74.000 0.000 NA   NA
 129759 129758 Atu3843 Atu3844     FALSE 0.113 52.000 0.000 NA   NA
 129757 3820096 Atu3845 Atu3846     FALSE 0.186 21.000 0.000 NA   NA
 3820096 129756 Atu3846 Atu3847     FALSE 0.092 69.000 0.000 NA   NA
 129755 129754 Atu3848 Atu3849     FALSE 0.027 154.000 0.000 NA   NA
 129754 129753 Atu3849 Atu3850     TRUE 0.991 -3.000 0.049 0.040   NA
 129752 129751 Atu3851 Atu3852     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 3820101 129749 Atu3859 Atu3860     FALSE 0.003 334.000 0.000 NA   NA
 129749 129748 Atu3860 Atu3861     FALSE 0.036 169.000 0.000 1.000   NA
 129746 3820102 Atu3863 Atu3864 exsE   FALSE 0.039 131.000 0.000 NA   NA
 129745 129744 Atu3865 Atu3866     TRUE 0.994 2.000 0.667 NA   NA
 129744 129743 Atu3866 Atu3867     TRUE 0.990 5.000 0.734 NA   NA
 129743 129742 Atu3867 Atu3868     FALSE 0.192 169.000 0.058 NA N NA
 129742 129741 Atu3868 Atu3869     FALSE 0.030 148.000 0.000 NA   NA
 129741 129740 Atu3869 Atu3870   ldhA FALSE 0.155 61.000 0.000 1.000   NA
 129740 129739 Atu3870 Atu3871 ldhA lldA TRUE 0.524 108.000 0.000 1.000 Y NA
 129736 129735 Atu3874 Atu3875 lyxK   TRUE 0.965 14.000 0.231 1.000 Y NA
 129735 129734 Atu3875 Atu3876   glpD TRUE 0.991 3.000 0.588 1.000 N NA
 129734 129733 Atu3876 Atu3877 glpD   TRUE 0.858 123.000 0.385 1.000 Y NA
 129733 129732 Atu3877 Atu3878     TRUE 0.996 -3.000 0.364 1.000 N NA
 129732 129731 Atu3878 Atu3879     TRUE 0.736 81.000 0.303 NA N NA
 129731 129730 Atu3879 Atu3880     TRUE 0.991 13.000 0.727 NA Y NA
 129730 129729 Atu3880 Atu3881     TRUE 0.881 73.000 0.239 NA Y NA
 129729 3820103 Atu3881 Atu3882     FALSE 0.004 308.000 0.000 NA   NA
 3820103 129728 Atu3882 Atu3883     FALSE 0.079 82.000 0.000 NA   NA
 129720 129719 Atu3890 Atu3891 glpK   FALSE 0.447 73.000 0.034 NA N NA
 129719 129718 Atu3891 Atu3892     TRUE 0.592 188.000 0.640 NA   NA
 129718 129717 Atu3892 Atu3893     TRUE 0.995 3.000 0.854 NA   NA
 129717 129716 Atu3893 Atu3894     TRUE 0.998 4.000 0.922 NA Y NA
 129716 129715 Atu3894 Atu3895     TRUE 0.998 3.000 0.847 NA Y NA
 129715 129714 Atu3895 Atu3896     TRUE 0.995 15.000 0.865 0.009 Y NA
 129714 129713 Atu3896 Atu3897   glpD TRUE 0.558 38.000 0.019 1.000 N NA
 129713 129712 Atu3897 Atu3898 glpD glpR FALSE 0.371 108.000 0.036 1.000 N NA
 129712 129711 Atu3898 Atu3899 glpR cysG FALSE 0.070 142.000 0.000 1.000 N NA
 129711 129710 Atu3899 Atu3900 cysG nasA TRUE 0.820 11.000 0.026 1.000 N NA
 129710 129709 Atu3900 Atu3901 nasA nirD FALSE 0.370 215.000 0.294 0.043 N NA
 129709 129708 Atu3901 Atu3902 nirD nirB TRUE 0.991 6.000 0.539 0.000 N NA
 129708 129707 Atu3902 Atu3903 nirB nrtC TRUE 0.919 6.000 0.074 1.000 N NA
 129707 129706 Atu3903 Atu3904 nrtC nrtB TRUE 0.984 14.000 0.323 0.000 Y NA
 129706 129705 Atu3904 Atu3905 nrtB ntrA TRUE 0.961 114.000 0.915 NA Y NA
 129705 129704 Atu3905 Atu3906 ntrA nrtC FALSE 0.035 381.000 0.000 NA Y NA
 129704 129703 Atu3906 Atu3907 nrtC nasT TRUE 0.897 36.000 0.466 NA N NA
 129703 129702 Atu3907 Atu3908 nasT   FALSE 0.270 102.000 0.000 0.093 N NA
 129701 129700 Atu3909 Atu3910     FALSE 0.449 124.000 0.189 NA   NA
 129700 129699 Atu3910 Atu3911     TRUE 0.851 12.000 0.108 NA   NA
 129699 129698 Atu3911 Atu3912     TRUE 0.891 8.000 0.082 NA   NA
 129698 129697 Atu3912 Atu3913     TRUE 0.993 -3.000 0.203 1.000 N NA
 129697 129696 Atu3913 Atu3914   amyA FALSE 0.109 112.000 0.000 1.000 N NA
 129695 129694 Atu3915 Atu3916 soxR bfrA FALSE 0.037 190.000 0.000 1.000 N NA
 129692 129691 Atu3918 Atu3919     FALSE 0.107 56.000 0.000 NA   NA
 129690 3820105 Atu3920 Atu3921     FALSE 0.119 46.000 0.000 NA   NA
 129688 129687 Atu3923 Atu3924 repB repA TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 N NA
 129686 129685 Atu3925 Atu3926     FALSE 0.002 367.000 0.000 NA   NA
 129685 129684 Atu3926 Atu3927     FALSE 0.204 33.000 0.000 NA N NA
 129684 129683 Atu3927 Atu3928     TRUE 0.651 73.000 0.205 NA   NA
 129682 129681 Atu3929 Atu3930     FALSE 0.131 39.000 0.000 NA   NA
 129681 129680 Atu3930 Atu3931   hutU FALSE 0.025 196.000 0.000 1.000   NA
 129680 129679 Atu3931 Atu3932 hutU   TRUE 0.937 15.000 0.081 1.000 Y NA
 129679 129678 Atu3932 Atu3933   hutH TRUE 0.807 74.000 0.064 1.000 Y NA
 129678 129677 Atu3933 Atu3934 hutH hutI TRUE 0.995 -3.000 0.192 0.028 N NA
 129676 129675 Atu3935 Atu3936     TRUE 0.695 23.000 0.047 1.000 N NA
 129675 3820107 Atu3936 Atu3937     FALSE 0.001 564.000 0.000 NA   NA
 3820107 3820108 Atu3937 Atu3938     FALSE 0.003 329.000 0.000 NA   NA
 3820108 3820109 Atu3938 Atu3939     FALSE 0.103 59.000 0.000 NA   NA
 3820110 129672 Atu3941 Atu3942     FALSE 0.006 260.000 0.000 NA   NA
 129672 3820111 Atu3942 Atu3943     FALSE 0.049 115.000 0.000 NA   NA
 3820111 3820112 Atu3943 Atu3944     FALSE 0.008 239.000 0.000 NA   NA
 3820112 3820113 Atu3944 Atu3945     FALSE 0.116 50.000 0.000 NA   NA
 3820113 3820114 Atu3945 Atu3946     TRUE 0.542 4.000 0.000 NA   NA
 129669 129668 Atu3948 Atu3949   arcB TRUE 0.974 11.000 0.220 NA Y NA
 129668 129667 Atu3949 Atu3950 arcB   FALSE 0.284 18.000 0.000 NA N NA
 129664 129663 Atu3953 Atu3954     TRUE 0.900 28.000 0.100 NA Y NA
 129663 129662 Atu3954 Atu3955     TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.100 Y NA
 129662 129661 Atu3955 Atu3956     TRUE 0.960 14.000 0.200 1.000 Y NA
 129661 129660 Atu3956 Atu3957     TRUE 0.963 87.000 0.727 1.000 Y NA
 129660 129659 Atu3957 Atu3958     TRUE 0.970 52.000 0.636 1.000 Y NA
 129659 129658 Atu3958 Atu3959   dhaL TRUE 0.997 -3.000 0.345 0.048 N NA
 129658 129657 Atu3959 Atu3960 dhaL dapA TRUE 0.999 -7.000 0.690 0.068 N NA
 129657 129656 Atu3960 Atu3961 dapA   TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000 N NA
 129656 129655 Atu3961 Atu3962     FALSE 0.002 492.000 0.000 NA N NA
 129655 129654 Atu3962 Atu3963     FALSE 0.050 141.000 0.000 NA N NA
 129653 129652 Atu3964 Atu3965     TRUE 0.998 -7.000 0.238 0.043   NA
 129652 129651 Atu3965 Atu3966     TRUE 0.995 -3.000 0.190 0.043   NA
 129651 129650 Atu3966 Atu3967     FALSE 0.257 23.000 0.000 1.000   NA
 129650 129649 Atu3967 Atu3968     TRUE 0.979 58.000 0.700 0.100 Y NA
 129649 129648 Atu3968 Atu3969     TRUE 0.677 263.000 0.667 0.100 Y NA
 129648 129647 Atu3969 Atu3970     TRUE 0.992 23.000 0.889 0.100 Y NA
 129647 129646 Atu3970 Atu3971   ilvD TRUE 0.738 38.000 0.000 1.000 Y NA
 129646 129645 Atu3971 Atu3972 ilvD   TRUE 0.490 10.000 0.000 1.000   NA
 129645 129644 Atu3972 Atu3973     FALSE 0.142 34.000 0.000 NA   NA
 129643 129642 Atu3974 Atu3975 ina glf FALSE 0.011 216.000 0.000 NA   NA
 129642 129641 Atu3975 Atu3976 glf   FALSE 0.321 102.000 0.008 1.000 N NA
 129641 129640 Atu3976 Atu3977   ina FALSE 0.002 492.000 0.000 NA   NA
 129640 129639 Atu3977 Atu3978 ina   FALSE 0.001 756.000 0.000 NA   NA
 129638 129637 Atu3979 Atu3980     FALSE 0.330 139.000 0.100 NA N NA
 129637 129636 Atu3980 Atu8193     TRUE 0.732 74.000 0.300 NA   NA
 129636 129635 Atu8193 Atu3982     TRUE 0.976 0.000 0.164 NA   NA
 129635 129634 Atu3982 Atu8194     FALSE 0.310 210.000 0.344 NA   NA
 129634 129633 Atu8194 Atu3984     TRUE 0.997 -3.000 0.483 NA   NA
 129627 129626 Atu3990 Atu3991 copC copA TRUE 0.513 44.000 0.000 0.003 N NA
 129626 129625 Atu3991 Atu3992 copA copB TRUE 0.952 15.000 0.500 1.000 N NA
 129625 129623 Atu3992 Atu8195 copB   FALSE 0.003 315.000 0.000 NA   NA
 129623 129622 Atu8195 Atu3994     FALSE 0.068 97.000 0.000 NA   NA
 129622 129621 Atu3994 Atu3995     FALSE 0.078 83.000 0.000 NA   NA
 129621 129620 Atu3995 Atu3996     FALSE 0.020 211.000 0.000 1.000   NA
 129619 129618 Atu3997 Atu3998 bioB bioF TRUE 0.995 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 129618 129617 Atu3998 Atu3999 bioF bioD TRUE 0.998 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 129617 129616 Atu3999 Atu4000 bioD bioA TRUE 0.998 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 129616 129615 Atu4000 Atu4001 bioA fabH TRUE 0.502 38.000 0.014 NA N NA
 129614 129613 Atu4002 Atu4003     FALSE 0.123 44.000 0.000 NA   NA
 3820115 129611 Atu4005 Atu4006     FALSE 0.044 123.000 0.000 NA   NA
 129610 3820116 Atu4007 Atu4008 arcA arcB* FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 129608 129606 Atu4009 Atu4011 tnp   FALSE 0.002 561.000 0.000 NA N NA
 129606 129605 Atu4011 Atu4012   idhA FALSE 0.003 359.000 0.000 NA   NA
 129605 129604 Atu4012 Atu4013 idhA cyaA FALSE 0.015 227.000 0.000 1.000   NA
 129604 129603 Atu4013 Atu4014 cyaA exsI FALSE 0.015 227.000 0.000 1.000   NA
 129603 129602 Atu4014 Atu4015 exsI   FALSE 0.007 246.000 0.000 NA   NA
 129600 129599 Atu4018 Atu4019     TRUE 0.928 22.000 0.143 1.000 Y NA
 129599 129598 Atu4019 Atu4020     FALSE 0.145 67.000 0.000 1.000   NA
 129598 129597 Atu4020 Atu4021     FALSE 0.002 710.000 0.000 1.000   NA
 129596 129595 Atu4022 Atu4023 fhuA fhuD TRUE 0.927 50.000 0.286 1.000 Y NA
 129595 129594 Atu4023 Atu4024 fhuD fhuB TRUE 0.999 -3.000 0.643 1.000 Y NA
 129594 129593 Atu4024 Atu4025 fhuB fhuC TRUE 0.897 35.000 0.109 1.000 Y NA
 129593 129592 Atu4025 Atu4026 fhuC   FALSE 0.007 248.000 0.000 NA   NA
 129592 129591 Atu4026 Atu4027     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 129590 129589 Atu4028 Atu4029     FALSE 0.046 152.000 0.000 1.000   NA
 129589 129588 Atu4029 Atu4030     TRUE 0.905 35.000 0.143 1.000 Y NA
 129588 129587 Atu4030 Atu4031     TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.099 Y NA
 129587 129586 Atu4031 Atu4032     TRUE 1.000 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 129586 129585 Atu4032 Atu4033     TRUE 0.936 103.000 0.619 NA Y NA
 129585 129584 Atu4033 Atu8035     FALSE 0.123 44.000 0.000 NA   NA
 129583 129582 Atu4034 Atu4035     TRUE 0.998 2.000 0.529 0.017 Y NA
 129581 129580 Atu4036 Atu4037   gcd FALSE 0.152 88.000 0.000 1.000 N NA
 129580 3820117 Atu4037 Atu4038 gcd   TRUE 0.929 -142.000 0.000 NA   NA
 129579 129578 Atu4040 Atu4041   rluA TRUE 0.777 9.000 0.009 NA   NA
 129578 129577 Atu4041 Atu4042 rluA   FALSE 0.175 51.000 0.000 1.000   NA
 129575 129574 Atu4044 Atu4045     TRUE 0.995 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 129574 129573 Atu4045 Atu4046     FALSE 0.220 219.000 0.000 0.099 Y NA
 129571 129570 Atu4048 Atu4049   exoP FALSE 0.089 125.000 0.000 1.000 N NA
 129570 129569 Atu4049 Atu4050 exoP exoN TRUE 0.930 63.000 0.357 1.000 Y NA
 129569 129568 Atu4050 Atu4051 exoN exoO TRUE 0.752 85.000 0.357 NA   NA
 129568 129567 Atu4051 Atu4052 exoO exoM TRUE 0.985 0.000 0.280 NA   NA
 129567 129566 Atu4052 Atu4053 exoM exoA TRUE 0.989 -3.000 0.143 NA   NA
 129566 129565 Atu4053 Atu4054 exoA exoL TRUE 0.793 18.000 0.143 NA   NA
 129565 129564 Atu4054 Atu4055 exoL exoK TRUE 0.731 26.000 0.129 NA   NA
 129564 129563 Atu4055 Atu4056 exoK exoH TRUE 0.963 5.000 0.250 1.000   NA
 129563 129562 Atu4056 Atu4057 exoH exoT FALSE 0.004 372.000 0.000 1.000   NA
 129561 129560 Atu4058 Atu4059 exoW exoV TRUE 0.615 52.000 0.100 NA   NA
 129559 129558 Atu4060 Atu4061 exoU exoX FALSE 0.054 111.000 0.000 NA   NA
 129556 129555 Atu4063 Atu4064   rpsU FALSE 0.375 136.000 0.136 1.000   NA
 129555 3820119 Atu4064 Atu4065 rpsU   TRUE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 129554 129553 Atu4066 Atu4067 soxB   TRUE 0.911 15.000 0.333 NA   NA
 129553 129552 Atu4067 Atu4068   soxD TRUE 0.863 12.000 0.133 NA   NA
 129552 129551 Atu4068 Atu4069 soxD soxA TRUE 0.999 -3.000 0.867 0.002   NA
 129551 129550 Atu4069 Atu4070 soxA soxG TRUE 0.999 -7.000 0.407 0.003   NA
 129549 129548 Atu4071 Atu4072   nodN FALSE 0.174 23.000 0.000 NA   NA
 129548 129547 Atu4072 Atu4073 nodN glgX TRUE 0.502 55.000 0.020 1.000 N NA
 129547 129546 Atu4073 Atu4074 glgX exoC TRUE 0.702 105.000 0.034 1.000 Y NA
 129546 129545 Atu4074 Atu4075 exoC glgA TRUE 0.973 5.000 0.032 1.000 Y NA
 129545 129544 Atu4075 Atu4076 glgA glgC TRUE 0.980 6.000 0.134 1.000 Y NA
 129544 129543 Atu4076 Atu4077 glgC glgB TRUE 0.964 22.000 0.205 0.000 Y NA
 129543 129542 Atu4077 Atu4078 glgB glgP TRUE 0.994 0.000 0.189 1.000 Y NA
 129541 129540 Atu4080 Atu4081     TRUE 0.763 1.000 0.000 1.000   NA
 129538 129537 Atu4083 Atu4085   garR FALSE 0.073 139.000 0.000 1.000 N NA
 129537 129536 Atu4085 Atu4086 garR idnO TRUE 0.837 88.000 0.167 1.000 Y NA
 129535 129534 Atu4087 Atu4088     FALSE 0.007 328.000 0.000 1.000 N NA
 129534 129533 Atu4088 Atu4089   cydD FALSE 0.050 262.000 0.025 1.000 N NA
 129533 129532 Atu4089 Atu4090 cydD cydC TRUE 1.000 -3.000 0.631 0.006 Y NA
 129532 129531 Atu4090 Atu4091 cydC cydA TRUE 0.817 68.000 0.059 1.000 Y NA
 129531 129530 Atu4091 Atu4092 cydA cydB TRUE 0.998 7.000 0.953 0.042 Y NA
 129530 129529 Atu4092 Atu8036 cydB   TRUE 0.767 40.000 0.230 NA   NA
 3820121 129528 Atu4093 Atu4094     FALSE 0.174 23.000 0.000 NA   NA
 129528 129527 Atu4094 Atu4095     FALSE 0.276 13.000 0.000 NA   NA
 129527 129526 Atu4095 Atu4096   nadC FALSE 0.050 146.000 0.000 1.000   NA
 129526 129525 Atu4096 Atu4097 nadC nadB TRUE 0.996 2.000 0.223 0.001 Y NA
 129525 129524 Atu4097 Atu4098 nadB nadA TRUE 0.999 -3.000 0.210 0.001 Y NA
 129524 129523 Atu4098 Atu4099 nadA   TRUE 0.913 4.000 0.037 1.000   NA
 129522 129521 Atu4100 Atu4101     FALSE 0.087 73.000 0.000 NA   NA
 3820122 129520 Atu4102 Atu8037     FALSE 0.028 153.000 0.000 NA   NA
 129519 129518 Atu4103 Atu4104 cmk rpsA FALSE 0.414 170.000 0.281 1.000 N NA
 129517 129516 Atu4105 Atu4106     FALSE 0.006 260.000 0.000 NA   NA
 129516 129515 Atu4106 Atu8196     FALSE 0.118 48.000 0.000 NA   NA
 129515 129514 Atu8196 Atu4108   rnd FALSE 0.077 85.000 0.000 NA   NA
 129513 129512 Atu4109 Atu4110   sdh FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 129512 129511 Atu4110 Atu4111 sdh   FALSE 0.109 55.000 0.000 NA   NA
 129511 129510 Atu4111 Atu4112     FALSE 0.010 225.000 0.000 NA   NA
 129510 129509 Atu4112 Atu4113   dppA FALSE 0.476 118.000 0.000 1.000 Y NA
 129509 129508 Atu4113 Atu4114 dppA dppB TRUE 0.883 63.000 0.097 0.099 Y NA
 129508 129507 Atu4114 Atu4115 dppB dppC TRUE 1.000 -3.000 0.779 0.099 Y NA
 129507 129506 Atu4115 Atu4116 dppC dppD TRUE 0.996 4.000 0.560 1.000 Y NA
 129506 129505 Atu4116 Atu4117 dppD dppF TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.007   NA
 129502 129501 Atu4121 Atu4122     FALSE 0.054 137.000 0.000 NA N NA
 129500 129499 Atu4123 Atu4124     TRUE 0.972 29.000 0.548 NA Y NA
 129499 129498 Atu4124 Atu4125     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.029 Y NA
 129498 129497 Atu4125 Atu4126     TRUE 0.996 3.000 0.447 1.000 Y NA
 129497 129496 Atu4126 Atu4127     TRUE 0.999 2.000 0.902 0.099 Y NA
 129496 129495 Atu4127 Atu4128     TRUE 0.924 75.000 0.390 1.000 Y NA
 129495 129494 Atu4128 Atu4129   mmsB FALSE 0.425 14.000 0.000 1.000 N NA
 129494 129493 Atu4129 Atu4130 mmsB acsA TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 129493 129492 Atu4130 Atu4131 acsA   TRUE 0.965 5.000 0.000 0.067 Y NA
 129492 129491 Atu4131 Atu4132     FALSE 0.097 119.000 0.000 1.000 N NA
 129491 129490 Atu4132 Atu4133     FALSE 0.146 32.000 0.000 NA   NA
 129490 129489 Atu4133 Atu4134     FALSE 0.042 126.000 0.000 NA   NA
 129489 129488 Atu4134 Atu4135   gcd FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 129485 129484 Atu4138 Atu4139     FALSE 0.193 20.000 0.000 NA   NA
 129484 129483 Atu4139 Atu4140     TRUE 0.990 8.000 0.842 NA   NA
 129483 129482 Atu4140 Atu4141     FALSE 0.107 56.000 0.000 NA   NA
 129482 129481 Atu4141 Atu4142   pfpI FALSE 0.103 59.000 0.000 NA   NA
 129481 129480 Atu4142 Atu4143 pfpI   FALSE 0.199 19.000 0.000 NA   NA
 3820123 129479 Atu4144 Atu4145     FALSE 0.111 53.000 0.000 NA   NA
 129479 129478 Atu4145 Atu4146     TRUE 0.969 0.000 0.104 NA   NA
 129478 129477 Atu4146 Atu4147   gshB TRUE 0.832 11.000 0.059 NA   NA
 129476 129475 Atu4148 Atu4149 lspL ugdH TRUE 0.865 87.000 0.222 1.000 Y NA
 129472 129471 Atu4153 Atu4154     FALSE 0.020 230.000 0.000 1.000 N NA
 129471 129470 Atu4154 Atu4155     TRUE 0.918 21.000 0.028 0.099 Y NA
 129470 129469 Atu4155 Atu4156     TRUE 0.991 9.000 0.472 1.000 Y NA
 129466 129465 Atu4160 Atu4161     TRUE 0.983 0.000 0.237 NA   NA
 129464 129463 Atu4162 Atu4163     TRUE 0.495 96.000 0.091 NA N NA
 129460 129459 Atu4166 Atu4167 galE/exoB   FALSE 0.022 170.000 0.000 NA   NA
 129459 129458 Atu4167 Atu4168     TRUE 0.494 5.000 0.000 NA   NA
 129457 129456 Atu4169 Atu4170 nspC   TRUE 0.942 61.000 0.444 NA Y NA
 129455 129454 Atu4171 Atu8038 deaD   TRUE 0.663 1.000 0.000 NA   NA
 129453 129452 Atu4172 Atu4173 lysC ptsI FALSE 0.214 176.000 0.069 1.000 N NA
 129452 129451 Atu4173 Atu4174 ptsI prfA TRUE 0.754 30.000 0.034 0.028 N NA
 129451 129450 Atu4174 Atu4175 prfA hemK TRUE 0.998 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 129450 129449 Atu4175 Atu4176 hemK   FALSE 0.015 396.000 0.021 1.000   NA
 129449 129447 Atu4176 Atu4177   clpB FALSE 0.015 365.000 0.006 1.000   NA
 129446 3820124 Atu4178 Atu4179     FALSE 0.022 169.000 0.000 NA   NA
 3820125 3820126 Atu4180 Atu4181     FALSE 0.003 315.000 0.000 NA   NA
 3820126 3820127 Atu4181 Atu4182     FALSE 0.103 59.000 0.000 NA   NA
 3820128 129443 Atu4184 Atu4185     FALSE 0.006 260.000 0.000 NA   NA
 129443 3820129 Atu4185 Atu4186     FALSE 0.087 73.000 0.000 NA   NA
 3820129 3820130 Atu4186 Atu4187     FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 129441 129440 Atu4189 Atu4190 dapA   TRUE 0.718 32.000 0.122 NA N NA
 129440 129439 Atu4190 Atu4191     FALSE 0.177 44.000 0.000 NA N NA
 129438 129437 Atu4192 Atu4193     TRUE 0.932 111.000 0.500 0.098 Y NA
 129437 129436 Atu4193 Atu4194     TRUE 0.967 10.000 0.333 0.098   NA
 129436 129435 Atu4194 Atu4195     TRUE 0.946 29.000 0.667 1.000   NA
 129435 129434 Atu4195 Atu4196     TRUE 0.701 45.000 0.154 1.000   NA
 129434 129433 Atu4196 Atu4197     TRUE 0.966 -22.000 0.000 1.000 N NA
 129432 129431 Atu4198 Atu4199     FALSE 0.089 71.000 0.000 NA   NA
 129431 129430 Atu4199 Atu4200     FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 129428 129427 Atu4202 Atu4203     FALSE 0.206 18.000 0.000 NA   NA
 129427 129426 Atu4203 Atu4204     FALSE 0.073 91.000 0.000 NA   NA
 129426 129425 Atu4204 Atu4205   tetR FALSE 0.006 880.000 0.000 0.072   NA
 129422 129421 Atu4208 Atu4209     TRUE 0.970 68.000 0.625 0.098 Y NA
 129421 129420 Atu4209 Atu4210     TRUE 0.999 0.000 0.775 0.098 Y NA
 129420 129419 Atu4210 Atu4211     TRUE 0.998 6.000 0.789 0.098 Y NA
 129419 129418 Atu4211 Atu4212   ugpQ TRUE 0.840 13.000 0.079 1.000 N NA
 129417 129416 Atu4213 Atu4214   cspA FALSE 0.037 134.000 0.000 NA   NA
 129416 129415 Atu4214 Atu4215 cspA ftsZ FALSE 0.006 301.000 0.000 1.000   NA
 129415 129414 Atu4215 Atu4216 ftsZ fabF FALSE 0.410 56.000 0.002 1.000   NA
 129414 129413 Atu4216 Atu4217 fabF   FALSE 0.293 147.000 0.070 1.000 N NA
 129412 129411 Atu4218 Atu4219     TRUE 0.997 0.000 0.857 NA N NA
 129411 129410 Atu4219 Atu4220     FALSE 0.152 30.000 0.000 NA   NA
 129409 129408 Atu4221 Atu4222   soxA TRUE 0.999 -7.000 0.370 0.003   NA
 129408 129407 Atu4222 Atu4223 soxA soxD TRUE 0.999 -3.000 0.923 0.002   NA
 129407 129406 Atu4223 Atu4224 soxD soxB TRUE 0.992 25.000 0.846 0.002 Y NA
 129405 129404 Atu4225 Atu4226 glxA   TRUE 0.875 88.000 0.140 0.021 Y NA
 129404 129403 Atu4226 Atu4227   purF TRUE 0.632 97.000 0.206 1.000 N NA
 129403 129402 Atu4227 Atu4228 purF fwdC TRUE 0.982 38.000 0.786 1.000 Y NA
 129402 129401 Atu4228 Atu4229 fwdC gltB TRUE 0.993 17.000 0.901 1.000 Y NA
 129401 129400 Atu4229 Atu4230 gltB glnA TRUE 0.936 86.000 0.493 1.000 Y NA
 129400 129399 Atu4230 Atu4231 glnA purU TRUE 0.501 89.000 0.062 1.000 N NA
 129399 129398 Atu4231 Atu4232 purU   FALSE 0.058 155.000 0.000 1.000 N NA
 129398 129397 Atu4232 Atu4233     FALSE 0.039 184.000 0.000 1.000 N NA
 129397 129396 Atu4233 Atu4234     TRUE 0.835 174.000 0.500 0.098 Y NA
 129396 129395 Atu4234 Atu4235     TRUE 0.766 30.000 0.000 1.000 Y NA
 129395 129394 Atu4235 Atu4236     FALSE 0.159 81.000 0.000 1.000 N NA
 129394 129393 Atu4236 Atu4237     FALSE 0.047 118.000 0.000 NA   NA
 129393 129392 Atu4237 Atu4238     TRUE 0.968 12.000 0.582 NA   NA
 129392 129391 Atu4238 Atu4239     TRUE 0.995 -3.000 0.273 1.000   NA
 129391 129390 Atu4239 Atu4240     TRUE 0.997 -3.000 0.452 NA   NA
 129390 129389 Atu4240 Atu4241   dhaS TRUE 0.995 5.000 0.548 NA Y NA
 129389 129388 Atu4241 Atu4242 dhaS   TRUE 0.970 5.000 0.333 NA   NA
 129388 129387 Atu4242 Atu4243     TRUE 0.812 57.000 0.357 NA   NA
 129387 129386 Atu4243 Atu4244     TRUE 0.940 60.000 0.304 0.098 Y NA
 129386 129385 Atu4244 Atu4245     TRUE 0.999 2.000 0.852 0.098 Y NA
 129385 129384 Atu4245 Atu4246     TRUE 1.000 -3.000 0.815 0.098 Y NA
 129384 129383 Atu4246 Atu4247   attK TRUE 0.882 13.000 0.167 1.000 N NA
 129382 129381 Atu4248 Atu4249     FALSE 0.007 250.000 0.000 NA   NA
 129381 129380 Atu4249 Atu4250     TRUE 0.889 15.000 0.000 0.098 Y NA
 129380 129379 Atu4250 Atu4251     TRUE 1.000 -10.000 0.474 0.098 Y NA
 129379 129378 Atu4251 Atu4252     TRUE 0.966 56.000 0.500 0.098 Y NA
 129378 129377 Atu4252 Atu4253     FALSE 0.227 30.000 0.000 1.000   NA
 129377 129376 Atu4253 Atu4254     TRUE 0.740 2.000 0.000 1.000   NA
 129374 129373 Atu4256 Atu4257     TRUE 0.580 74.000 0.115 1.000   NA
 129373 129372 Atu4257 Atu4258     TRUE 0.973 107.000 0.870 0.098 Y NA
 129372 129371 Atu4258 Atu4259     TRUE 0.918 55.000 0.192 0.098 Y NA
 129371 129370 Atu4259 Atu4260     FALSE 0.023 286.000 0.000 0.098 N NA
 129370 129369 Atu4260 Atu4261     TRUE 1.000 -13.000 0.833 1.000 Y NA
 129369 129368 Atu4261 Atu4262     TRUE 0.996 10.000 0.833 1.000 Y NA
 129368 129367 Atu4262 Atu4263     TRUE 0.834 118.000 0.714 NA   NA
 129365 129364 Atu4265 Atu4266     FALSE 0.140 35.000 0.000 NA   NA
 129363 129362 Atu4267 Atu4268     TRUE 0.909 32.000 0.143 1.000 Y NA
 129362 129361 Atu4268 Atu4269   phzC TRUE 0.566 57.000 0.060 1.000   NA
 129361 129360 Atu4269 Atu4270 phzC   TRUE 0.636 27.000 0.040 1.000   NA
 129358 129357 Atu8039 Atu4272   accB FALSE 0.007 286.000 0.000 1.000   NA
 129357 129356 Atu4272 Atu4273 accB accC TRUE 0.998 -3.000 0.066 0.001 Y NA
 129356 129355 Atu4273 Atu4274 accC   TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 129355 129354 Atu4274 Atu4275     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 129354 129353 Atu4275 Atu4276     TRUE 1.000 -3.000 0.750 NA Y NA
 129353 129352 Atu4276 Atu4277     TRUE 0.899 31.000 0.464 NA   NA
 129352 129351 Atu4277 Atu4278   aatA TRUE 0.840 46.000 0.348 1.000   NA
 129349 129348 Atu4280 Atu4281     TRUE 0.998 -3.000 0.640 1.000   NA
 129348 129347 Atu4281 Atu4282     TRUE 1.000 -3.000 0.810 0.011 Y NA
 129347 129346 Atu4282 Atu4283     TRUE 1.000 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 129346 129345 Atu4283 Atu4284     TRUE 0.978 31.000 0.632 1.000 Y NA
 129345 129344 Atu4284 Atu4285   menG FALSE 0.104 94.000 0.000 NA N NA
 129343 129342 Atu4286 Atu4287     TRUE 0.508 84.000 0.095 NA   NA
 129338 129337 Atu4292 Atu4293     FALSE 0.140 65.000 0.000 NA N NA
 129337 129336 Atu4293 Atu4294   yafB FALSE 0.233 15.000 0.000 NA   NA
 129335 129334 Atu4295 Atu4296 aroE   TRUE 0.995 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 129331 129330 Atu4299 Atu4300   nwsB FALSE 0.022 202.000 0.000 NA N NA
 129330 129329 Atu4300 Atu4301 nwsB   FALSE 0.008 312.000 0.000 1.000 N NA
 129329 129328 Atu4301 Atu4302     FALSE 0.081 78.000 0.000 NA   NA
 129328 129327 Atu4302 Atu4303     FALSE 0.036 137.000 0.000 NA   NA
 129327 129326 Atu4303 Atu4304     FALSE 0.167 25.000 0.000 NA   NA
 129326 129325 Atu4304 Atu4305     FALSE 0.011 243.000 0.000 NA N NA
 129325 129324 Atu4305 Atu4306     TRUE 0.867 22.000 0.000 0.017 Y NA
 129324 129323 Atu4306 Atu4307     FALSE 0.005 345.000 0.000 1.000   NA
 129323 129322 Atu4307 Atu4308     FALSE 0.004 288.000 0.000 NA   NA
 129320 129319 Atu4310 Atu4311 soxB soxD TRUE 0.970 67.000 0.533 0.002 Y NA
 129319 129318 Atu4311 Atu4312 soxD soxA TRUE 0.999 -3.000 0.867 0.002   NA
 129318 129317 Atu4312 Atu4313 soxA soxG TRUE 0.985 7.000 0.444 0.003   NA
 129317 129316 Atu4313 Atu4314 soxG glyA TRUE 0.976 19.000 0.462 1.000 Y NA
 129316 129315 Atu4314 Atu4315 glyA purU FALSE 0.086 127.000 0.000 1.000 N NA
 129313 129312 Atu4317 Atu4318     FALSE 0.015 248.000 0.000 1.000 N NA
 129312 129311 Atu4318 Atu4319     FALSE 0.005 372.000 0.000 1.000 N NA
 129311 129310 Atu4319 Atu4320   rbsB TRUE 0.841 98.000 0.542 1.000 N NA
 129310 129309 Atu4320 Atu4321 rbsB rbsA TRUE 0.844 72.000 0.125 1.000 Y NA
 129309 129308 Atu4321 Atu4322 rbsA rbsC TRUE 0.998 -10.000 0.111 1.000 Y NA
 129308 129307 Atu4322 Atu4323 rbsC rdh TRUE 0.686 40.000 0.111 1.000   NA
 129307 129306 Atu4323 Atu4324 rdh   FALSE 0.471 90.000 0.061 1.000   NA
 129306 129305 Atu4324 Atu4325   cbr TRUE 0.616 50.000 0.061 1.000 N NA
 129301 129300 Atu4330 Atu4331 impN impM TRUE 0.842 80.000 0.500 1.000   NA
 129300 129299 Atu4331 Atu4332 impM impL TRUE 0.739 83.000 0.333 NA   NA
 129299 129298 Atu4332 Atu4333 impL impK TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA   NA
 129298 129297 Atu4333 Atu4334 impK impJ TRUE 0.996 -3.000 0.385 NA   NA
 129297 129296 Atu4334 Atu4335 impJ impI TRUE 0.996 -10.000 0.231 NA   NA
 129296 129295 Atu4335 Atu4336 impI impH TRUE 0.899 11.000 0.176 NA   NA
 129295 129294 Atu4336 Atu4337 impH impG TRUE 0.945 10.000 0.300 NA   NA
 129294 129293 Atu4337 Atu4338 impG impF TRUE 0.997 -7.000 0.300 NA   NA
 129293 129292 Atu4338 Atu4339 impF impE TRUE 0.996 -7.000 0.250 NA   NA
 129292 129291 Atu4339 Atu4340 impE impD TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA   NA
 129291 129290 Atu4340 Atu4341 impD impC TRUE 0.765 55.000 0.278 NA   NA
 129290 129289 Atu4341 Atu4342 impC impB TRUE 0.636 94.000 0.235 NA   NA
 129289 129288 Atu4342 Atu4343 impB impA TRUE 0.690 66.000 0.221 NA   NA
 129287 129286 Atu4344 Atu4345 clpB   TRUE 0.645 58.000 0.158 NA   NA
 129286 129285 Atu4345 Atu4346     FALSE 0.057 107.000 0.000 NA   NA
 129285 129284 Atu4346 Atu4347     FALSE 0.307 12.000 0.000 NA   NA
 129284 129283 Atu4347 Atu4348   vgrG TRUE 0.927 15.000 0.400 NA   NA
 129283 129282 Atu4348 Atu4349 vgrG   TRUE 0.589 3.000 0.000 NA   NA
 129282 129281 Atu4349 Atu4350     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 129281 129280 Atu4350 Atu4351     FALSE 0.157 28.000 0.000 NA   NA
 129280 129279 Atu4351 Atu4352     FALSE 0.276 13.000 0.000 NA   NA
 129276 129275 Atu4355 Atu4356     FALSE 0.002 377.000 0.000 NA   NA
 129273 129272 Atu4358 Atu4359     TRUE 1.000 -3.000 0.818 0.098 Y NA
 129272 129271 Atu4359 Atu4360   thuF TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.098 Y NA
 129271 129270 Atu4360 Atu4361 thuF   TRUE 0.955 114.000 0.700 0.098 Y NA
 129270 129269 Atu4361 Atu4362     TRUE 0.948 64.000 0.500 NA Y NA
 129269 129268 Atu4362 Atu4363     TRUE 0.958 13.000 0.520 NA   NA
 129266 129265 Atu4365 Atu4366   sdhX FALSE 0.020 176.000 0.000 NA   NA
 129262 129261 Atu4369 Atu4370 rbsB   TRUE 0.929 104.000 0.583 NA Y NA
 129261 129260 Atu4370 Atu4371     TRUE 1.000 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 129260 129259 Atu4371 Atu4372   rbsC TRUE 0.998 2.000 0.667 0.097 Y NA
 129259 129258 Atu4372 Atu4373 rbsC cytR TRUE 0.979 4.000 0.333 1.000 N NA
 129258 129257 Atu4373 Atu4374 cytR   FALSE 0.202 34.000 0.000 NA N NA
 129257 129256 Atu4374 Atu4375     TRUE 0.843 12.000 0.093 NA   NA
 129256 129255 Atu4375 Atu4376     FALSE 0.028 153.000 0.000 NA   NA
 129255 129254 Atu4376 Atu4377     FALSE 0.043 152.000 0.000 NA N NA
 129254 129253 Atu4377 Atu4378     TRUE 0.995 0.000 0.600 NA   NA
 129253 129252 Atu4378 Atu4379   cy2 FALSE 0.091 70.000 0.000 NA   NA
 129251 129250 Atu4380 Atu4381 nnrR nirV FALSE 0.448 150.000 0.280 NA   NA
 129250 129249 Atu4381 Atu4382 nirV nirK FALSE 0.426 109.000 0.100 NA   NA
 129247 129246 Atu4384 Atu4385     FALSE 0.081 79.000 0.000 NA   NA
 129246 129245 Atu4385 Atu4386   norD TRUE 0.713 0.000 0.000 NA   NA
 129245 129244 Atu4386 Atu4387 norD norQ TRUE 0.924 72.000 0.590 0.001   NA
 129244 129243 Atu4387 Atu4388 norQ norB TRUE 0.922 65.000 0.529 0.001   NA
 129243 129242 Atu4388 Atu4389 norB norC TRUE 0.977 25.000 0.794 0.001   NA
 129242 129241 Atu4389 Atu8197 norC norF FALSE 0.146 167.000 0.000 0.001   NA
 129241 129240 Atu8197 Atu4391 norF norE TRUE 0.913 -3.000 0.000 1.000   NA
 129239 129238 Atu8040 Atu4392   nnrU TRUE 0.713 13.000 0.022 NA   NA
 129237 129236 Atu4393 Atu4394     TRUE 0.996 -3.000 0.051 NA Y NA
 129236 129235 Atu4394 Atu4395     FALSE 0.160 27.000 0.000 NA   NA
 129234 129233 Atu4396 Atu4397     TRUE 0.998 -9.000 0.381 1.000 N NA
 129233 129232 Atu4397 Atu4398     TRUE 0.999 6.000 0.948 0.002 Y NA
 129232 129231 Atu4398 Atu4399     TRUE 0.982 -3.000 0.046 NA   NA
 129231 129230 Atu4399 Atu4400     FALSE 0.067 98.000 0.000 NA   NA
 129230 129229 Atu4400 Atu4401     TRUE 0.943 19.000 0.080 0.097 Y NA
 129229 129228 Atu4401 Atu4402     TRUE 0.997 6.000 0.643 0.097 Y NA
 129228 129227 Atu4402 Atu4403     TRUE 0.999 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 129227 129226 Atu4403 Atu4404     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 129226 129225 Atu4404 Atu4405   napE FALSE 0.019 211.000 0.000 NA N NA
 129225 129224 Atu4405 Atu4406 napE napF TRUE 0.893 8.000 0.087 NA   NA
 129224 129223 Atu4406 Atu4407 napF napD TRUE 0.994 -7.000 0.133 NA   NA
 129223 129222 Atu4407 Atu4408 napD napA TRUE 0.996 -25.000 0.182 NA N NA
 129222 129221 Atu4408 Atu4409 napA napB TRUE 1.000 -30.000 0.643 NA Y NA
 129221 129220 Atu4409 Atu4410 napB napC TRUE 0.999 -3.000 0.490 NA Y NA
 129218 129217 Atu4412 Atu4413 rzcA rspD FALSE 0.218 111.000 0.000 0.092   NA
 129217 129216 Atu4413 Atu4414 rspD rspE TRUE 0.903 3.000 0.000 0.004   NA
 129215 129214 Atu4415 Atu4416     FALSE 0.039 130.000 0.000 NA   NA
 129214 129213 Atu4416 Atu4418   gcdH FALSE 0.026 212.000 0.000 1.000 N NA
 129212 129211 Atu4419 Atu4420     TRUE 0.515 135.000 0.000 0.071 Y NA
 129211 129210 Atu4420 Atu4421     TRUE 0.996 -3.000 0.318 1.000 N NA
 129210 129209 Atu4421 Atu4422     TRUE 0.816 167.000 0.409 0.097 Y NA
 129209 129208 Atu4422 Atu4423     TRUE 0.999 -3.000 0.350 0.097 Y NA
 129208 129207 Atu4423 Atu4424     TRUE 0.999 -7.000 0.316 1.000 Y NA
 129207 129206 Atu4424 Atu4425   iunH TRUE 0.686 3.000 0.000 NA N NA
 129206 129205 Atu4425 Atu4426 iunH adeC TRUE 0.997 -3.000 0.118 NA Y NA
 129204 129203 Atu4427 Atu4428     FALSE 0.018 217.000 0.000 1.000   NA
 129202 129201 Atu4429 Atu4430     FALSE 0.030 206.000 0.000 1.000 N NA
 129201 129200 Atu4430 Atu4431     TRUE 0.981 51.000 0.833 1.000 Y NA
 129200 129199 Atu4431 Atu4432     TRUE 0.988 22.000 0.667 0.097 Y NA
 129199 129198 Atu4432 Atu4433     TRUE 1.000 -3.000 0.667 0.097 Y NA
 129198 129197 Atu4433 Atu4434     TRUE 1.000 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 129197 129196 Atu4434 Atu4435     TRUE 1.000 -3.000 0.875 0.029 Y NA
 129196 129195 Atu4435 Atu4436   tnp FALSE 0.132 100.000 0.000 1.000 N NA
 129195 129194 Atu4436 Atu4437 tnp   FALSE 0.006 351.000 0.000 1.000 N NA
 129194 129193 Atu4437 Atu4438     FALSE 0.246 210.000 0.222 1.000 N NA
 129193 129192 Atu4438 Atu4439     FALSE 0.453 195.000 0.038 0.097 Y NA
 129192 129191 Atu4439 Atu4440     TRUE 0.999 0.000 0.829 0.097 Y NA
 129191 129190 Atu4440 Atu4441   gatA TRUE 0.603 54.000 0.061 1.000 N NA
 129190 129189 Atu4441 Atu4442 gatA   FALSE 0.078 115.000 0.000 1.000   NA
 129189 129188 Atu4442 Atu4443     TRUE 0.635 72.000 0.188 NA   NA
 129188 129187 Atu4443 Atu4444     FALSE 0.012 214.000 0.000 NA   NA
 129187 129186 Atu4444 Atu4445     TRUE 0.800 49.000 0.286 1.000   NA
 129186 129185 Atu4445 Atu4446     FALSE 0.007 294.000 0.000 1.000   NA
 129185 129184 Atu4446 Atu4447     FALSE 0.068 144.000 0.000 1.000 N NA
 129184 129183 Atu4447 Atu4448     TRUE 0.829 29.000 0.000 0.097 Y NA
 129183 129182 Atu4448 Atu4449     TRUE 0.996 13.000 0.918 0.097 Y NA
 129182 129181 Atu4449 Atu4450     TRUE 0.985 13.000 0.373 0.097 Y NA
 129181 129180 Atu4450 Atu4451   mtlK TRUE 0.828 126.000 0.326 1.000 Y NA
 129180 129179 Atu4451 Atu4452 mtlK   TRUE 0.974 7.000 0.308 0.066   NA
 129179 129178 Atu4452 Atu4453     TRUE 0.898 55.000 0.562 1.000   NA
 129174 129173 Atu4458 Atu4459   ada FALSE 0.075 267.000 0.142 NA   NA
 129173 129172 Atu4459 Atu4460 ada   FALSE 0.470 53.000 0.000 0.008 N NA
 129172 129171 Atu4460 Atu4461     TRUE 0.926 6.000 0.143 NA   NA
 129166 129165 Atu4467 Atu4468   sitD FALSE 0.013 207.000 0.000 NA   NA
 129165 129164 Atu4468 Atu4469 sitD sitC TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.006 Y NA
 129164 129163 Atu4469 Atu4470 sitC sitB TRUE 1.000 -19.000 0.857 0.092 Y NA
 129163 129162 Atu4470 Atu4471 sitB sitA TRUE 0.999 3.000 0.894 1.000 Y NA
 129160 129159 Atu4473 Atu4474 lysS gltX FALSE 0.241 250.000 0.014 0.092 Y NA
 129159 129158 Atu4474 Atu4475 gltX   FALSE 0.026 212.000 0.000 1.000 N NA
 129158 129157 Atu4475 Atu4476     FALSE 0.190 239.000 0.000 0.049 Y NA
 129157 129156 Atu4476 Atu4477     FALSE 0.153 183.000 0.033 1.000 N NA
 129155 129154 Atu4478 Atu4479 emrA emrB TRUE 0.943 22.000 0.586 1.000   NA
 129154 129153 Atu4479 Atu4480 emrB   FALSE 0.013 240.000 0.000 1.000   NA
 129153 129152 Atu4480 Atu4481     FALSE 0.112 93.000 0.000 1.000   NA
 129152 129151 Atu4481 Atu4482   xylB TRUE 0.931 48.000 0.300 1.000 Y NA
 129151 129150 Atu4482 Atu4483 xylB xylA FALSE 0.277 244.000 0.094 1.000 Y NA
 129148 129147 Atu4485 Atu4486 bgl   FALSE 0.009 293.000 0.000 1.000 N NA
 129147 129146 Atu4486 Atu4487     FALSE 0.005 369.000 0.000 1.000 N NA
 129146 129145 Atu4487 Atu4488     TRUE 1.000 -10.000 0.914 1.000 Y NA
 129145 129144 Atu4488 Atu4489     TRUE 0.880 52.000 0.164 NA Y NA
 129144 129143 Atu4489 Atu4490     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA N NA
 129142 129141 Atu4491 Atu4492     FALSE 0.024 285.000 0.008 NA   NA
 129141 129140 Atu4492 Atu4493     TRUE 0.989 -16.000 0.026 NA   NA
 129139 129138 Atu4494 Atu4495 kdgA   FALSE 0.276 123.000 0.042 NA   NA
 129138 129137 Atu4495 Atu4496     FALSE 0.057 258.000 0.055 NA   NA
 129137 129136 Atu4496 Atu4497     TRUE 0.992 -13.000 0.058 NA   NA
 129135 129134 Atu4498 Atu4499     TRUE 0.996 -6.000 0.226 NA   NA
 129132 129131 Atu4501 Atu4502   cobW FALSE 0.034 485.000 0.231 NA   NA
 129131 129130 Atu4502 Atu4503 cobW   TRUE 0.774 116.000 0.565 NA   NA
 129129 129128 Atu4504 Atu4505   pckR TRUE 0.874 133.000 0.368 0.050 Y NA
 129128 129127 Atu4505 Atu4506 pckR   FALSE 0.016 193.000 0.000 NA   NA
 129127 129126 Atu4506 Atu4507     FALSE 0.144 33.000 0.000 NA   NA
 129125 129124 Atu4508 Atu4509   iolB FALSE 0.016 224.000 0.000 1.000   NA
 129124 129123 Atu4509 Atu4510 iolB iolE TRUE 0.726 100.000 0.038 1.000 Y NA
 129123 129122 Atu4510 Atu4511 iolE iolD TRUE 0.989 2.000 0.438 1.000 N NA
 129122 129121 Atu4511 Atu4512 iolD iolC TRUE 0.989 -3.000 0.093 1.000   NA
 129121 129120 Atu4512 Atu4514 iolC   FALSE 0.033 287.000 0.021 1.000   NA
 129120 129119 Atu4514 Atu4515   livF FALSE 0.127 102.000 0.000 1.000 N NA
 129119 129118 Atu4515 Atu4516 livF livG TRUE 1.000 -19.000 0.824 0.029 Y NA
 129118 129117 Atu4516 Atu4517 livG livM TRUE 1.000 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 129117 129116 Atu4517 Atu4518 livM livH TRUE 0.999 2.000 1.000 0.097 Y NA
 129116 129115 Atu4518 Atu4519 livH livJ TRUE 0.972 91.000 0.867 1.000 Y NA
 129113 129112 Atu4521 Atu4522     FALSE 0.072 121.000 0.000 1.000   NA
 129112 129111 Atu4522 Atu4523     TRUE 0.952 6.000 0.222 1.000   NA
 129111 129110 Atu4523 Atu4524     TRUE 0.984 7.000 0.134 0.097 Y NA
 129110 129109 Atu4524 Atu4525     FALSE 0.433 220.000 0.104 0.097 Y NA
 129109 129108 Atu4525 Atu4526     TRUE 0.841 42.000 0.333 1.000   NA
 3820134 129107 Atu4527 Atu8041     FALSE 0.167 25.000 0.000 NA   NA
 129107 129106 Atu8041 Atu4528     FALSE 0.023 168.000 0.000 NA   NA
 129103 129102 Atu4531 Atu4532 aroQ aroE TRUE 0.996 -3.000 0.034 1.000 Y NA
 129102 129101 Atu4532 Atu4533 aroE   TRUE 0.970 72.000 0.750 1.000 Y NA
 129101 129100 Atu4533 Atu4534     TRUE 0.762 31.000 0.000 1.000 Y NA
 129100 129099 Atu4534 Atu4535     TRUE 0.824 37.000 0.000 0.015 Y NA
 129099 129098 Atu4535 Atu4536     TRUE 0.955 44.000 0.333 0.097 Y NA
 129098 129097 Atu4536 Atu4537     TRUE 0.996 11.000 0.714 0.011 Y NA
 129097 129096 Atu4537 Atu4538   pcaB FALSE 0.005 369.000 0.000 1.000 N NA
 129096 129095 Atu4538 Atu4539 pcaB pcaG TRUE 0.933 13.000 0.314 1.000 N NA
 129095 129094 Atu4539 Atu4540 pcaG pcaH TRUE 0.999 3.000 0.782 0.000 Y NA
 129094 129093 Atu4540 Atu4541 pcaH pcaC TRUE 0.978 -3.000 0.015 1.000   NA
 129093 129092 Atu4541 Atu4542 pcaC pcaD TRUE 0.977 4.000 0.333 1.000   NA
 129087 129086 Atu4547 Atu4548 pcaI pcaJ TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.000 Y NA
 129086 129085 Atu4548 Atu4549 pcaJ pcaF TRUE 0.990 11.000 0.517 1.000 Y NA
 129085 129084 Atu4549 Atu4550 pcaF   FALSE 0.004 447.000 0.000 1.000 N NA
 129084 129083 Atu4550 Atu4551     FALSE 0.072 285.000 0.000 NA Y NA
 129083 129082 Atu4551 Atu4552     FALSE 0.382 137.000 0.000 NA Y NA
 129082 129081 Atu4552 Atu4553   iolH TRUE 0.884 50.000 0.167 NA Y NA
 129081 129080 Atu4553 Atu4554 iolH iolG TRUE 0.860 11.000 0.089 NA   NA
 129080 129079 Atu4554 Atu4555 iolG   TRUE 0.893 9.000 0.107 NA   NA
 129079 129078 Atu4555 Atu4556   purR FALSE 0.025 192.000 0.000 NA N NA
 129077 129076 Atu4557 Atu4558     TRUE 0.697 273.000 0.750 0.097 Y NA
 129076 129075 Atu4558 Atu4559     TRUE 0.998 2.000 0.667 0.097 Y NA
 129075 129074 Atu4559 Atu4560     TRUE 0.981 0.000 0.184 1.000 N NA
 129074 129073 Atu4560 Atu4561     TRUE 0.993 -3.000 0.211 1.000   NA
 129073 129072 Atu4561 Atu4562     TRUE 0.831 14.000 0.143 NA   NA
 129071 129070 Atu4564 Atu4566     FALSE 0.020 233.000 0.000 1.000 N NA
 129068 129067 Atu4568 Atu4569     TRUE 0.661 87.000 0.143 0.097   NA
 129067 129066 Atu4569 Atu4570     TRUE 0.985 0.000 0.000 0.097 Y NA
 129066 129065 Atu4570 Atu4571     TRUE 0.998 0.000 0.440 0.097 Y NA
 129065 129064 Atu4571 Atu4572     TRUE 0.652 47.000 0.080 1.000 N NA
 129064 129063 Atu4572 Atu4573     TRUE 0.995 -3.000 0.250 1.000 N NA
 129059 129058 Atu4577 Atu4578     TRUE 0.863 112.000 0.600 0.097 N NA
 129058 129057 Atu4578 Atu4579     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.097 N NA
 129057 129056 Atu4579 Atu4580     TRUE 0.910 82.000 0.750 1.000   NA
 129055 129054 Atu4581 Atu4582     FALSE 0.432 45.000 0.000 0.041   NA
 129054 129053 Atu4582 Atu4583   sodBII FALSE 0.121 105.000 0.000 1.000 N NA
 129053 129052 Atu4583 Atu4584 sodBII   FALSE 0.038 165.000 0.000 1.000   NA
 129049 129048 Atu4587 Atu4588     FALSE 0.126 79.000 0.000 1.000   NA
 129048 129047 Atu4588 Atu4589     TRUE 0.698 46.000 0.025 0.001   NA
 129044 129043 Atu4592 Atu4593   hpaG TRUE 0.900 15.000 0.000 0.028 Y NA
 129043 129042 Atu4593 Atu4594 hpaG   FALSE 0.393 9.000 0.000 NA   NA
 129042 129041 Atu4594 Atu4595     FALSE 0.393 9.000 0.000 NA   NA
 129041 129040 Atu4595 Atu4596     FALSE 0.198 61.000 0.000 1.000 N NA
 129040 129039 Atu4596 Atu4597     TRUE 0.816 33.000 0.000 0.097 Y NA
 129038 129037 Atu4598 Atu4599     FALSE 0.103 115.000 0.000 1.000 N NA
 129036 129035 Atu4600 Atu4601     FALSE 0.003 476.000 0.000 1.000 N NA
 129035 129034 Atu4601 Atu4602     TRUE 1.000 -3.000 0.667 0.038 Y NA
 129032 129031 Atu4604 Atu4605     TRUE 0.998 -6.000 0.346 0.038   NA
 129031 129030 Atu4605 Atu4606     FALSE 0.006 300.000 0.000 1.000   NA
 129030 129029 Atu4606 Atu4607   nodX FALSE 0.006 311.000 0.000 1.000   NA
 129029 129028 Atu4607 Atu4608 nodX   TRUE 0.713 0.000 0.000 NA   NA
 129028 129027 Atu4608 Atu4609     TRUE 0.987 0.000 0.318 NA   NA
 129027 129026 Atu4609 Atu4610     TRUE 0.814 55.000 0.350 NA   NA
 129026 3820135 Atu4610 Atu4611   tnp FALSE 0.004 305.000 0.000 NA   NA
 3820135 129025 Atu4611 Atu4613 tnp   FALSE 0.008 237.000 0.000 NA   NA
 129025 129024 Atu4613 Atu4614   wbbL FALSE 0.027 155.000 0.000 NA   NA
 129024 129023 Atu4614 Atu4615 wbbL rfbA FALSE 0.076 87.000 0.000 NA   NA
 129023 129022 Atu4615 Atu4616 rfbA rfbD TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.004 Y NA
 129022 129021 Atu4616 Atu4617 rfbD rffB TRUE 0.985 5.000 0.051 0.004 Y NA
 129021 129020 Atu4617 Atu4618 rffB rfbC TRUE 0.963 3.000 0.000 1.000 Y NA
 129020 129019 Atu4618 Atu4619 rfbC uvrD FALSE 0.067 145.000 0.000 1.000 N NA
 129019 129018 Atu4619 Atu4620 uvrD dppF FALSE 0.031 267.000 0.000 0.091 N NA
 129018 129017 Atu4620 Atu4621 dppF dppD TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.029 Y NA
 129017 129016 Atu4621 Atu4622 dppD dppC TRUE 1.000 -13.000 0.500 1.000 Y NA
 129016 129015 Atu4622 Atu4623 dppC dppB TRUE 1.000 -3.000 0.875 0.097 Y NA
 129014 129013 Atu4624 Atu4625   uxuA TRUE 0.844 67.000 0.429 1.000 N NA
 129013 129012 Atu4625 Atu4626 uxuA   FALSE 0.163 78.000 0.000 1.000 N NA
 129012 129011 Atu4626 Atu4627     FALSE 0.001 590.000 0.000 NA   NA
 129011 129009 Atu4627 Atu4628     FALSE 0.017 188.000 0.000 NA   NA
 129009 129008 Atu4628 Atu4629     FALSE 0.031 203.000 0.000 1.000 N NA
 129008 3820136 Atu4629 Atu4630     FALSE 0.125 43.000 0.000 NA   NA
 3820136 129007 Atu4630 Atu4631     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 129007 129006 Atu4631 Atu4632     TRUE 0.977 4.000 0.333 1.000   NA
 129005 129004 Atu4633 Atu4634 pit*   TRUE 0.990 0.000 0.396 NA   NA
 129002 129001 Atu4636 Atu4637   nolF TRUE 0.996 2.000 0.824 NA N NA
 129000 128999 Atu4638 Atu4639     TRUE 1.000 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 128999 128998 Atu4639 Atu4640     FALSE 0.137 36.000 0.000 NA   NA
 128995 128994 Atu4643 Atu4644     FALSE 0.044 123.000 0.000 NA   NA
 128991 128990 Atu4647 Atu4648   betC TRUE 0.883 15.000 0.218 1.000 N NA
 128989 128988 Atu4649 Atu4650     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 128988 128987 Atu4650 Atu4651   argH TRUE 0.961 0.000 0.037 1.000 N NA
 128987 128986 Atu4651 Atu4652 argH   FALSE 0.211 149.000 0.025 1.000 N NA
 128986 128985 Atu4652 Atu4653     TRUE 0.999 -3.000 0.583 0.096 Y NA
 128985 128984 Atu4653 Atu4654     TRUE 0.992 18.000 0.778 0.096 Y NA
 128983 128982 Atu4655 Atu4656 xylR   TRUE 0.796 20.000 0.167 NA   NA
 128982 128981 Atu4656 Atu4657     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 128980 128979 Atu4658 Atu4659   agpT TRUE 0.494 5.000 0.000 NA   NA
 128978 128977 Atu4660 Atu4661 melA agpA TRUE 0.722 105.000 0.348 1.000 N NA
 128977 128976 Atu4661 Atu4662 agpA   TRUE 0.951 144.000 0.867 0.096 Y NA
 128976 128975 Atu4662 Atu4663     TRUE 0.998 2.000 1.000 0.096   NA
 128975 128974 Atu4663 Atu4664     TRUE 0.981 14.000 0.857 1.000   NA
 128974 128973 Atu4664 Atu4665   melA TRUE 0.921 23.000 0.464 1.000   NA
 128973 128972 Atu4665 Atu4666 melA   FALSE 0.009 292.000 0.000 1.000 N NA
 128972 128971 Atu4666 Atu4667     TRUE 0.847 12.000 0.077 1.000   NA
 128971 128970 Atu4667 Atu4668     TRUE 0.991 -3.000 0.032 0.006   NA
 128970 128969 Atu4668 Atu4669     FALSE 0.005 270.000 0.000 NA   NA
 3820137 128968 Atu4670 Atu4671     FALSE 0.003 348.000 0.000 NA   NA
 128967 128966 Atu4673 Atu4674 ftsZ1   FALSE 0.009 290.000 0.000 1.000 N NA
 128966 128965 Atu4674 Atu4675   dapA TRUE 0.601 110.000 0.227 1.000 N NA
 3820138 128963 Atu4677 Atu4678     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 128963 128962 Atu4678 Atu4679     TRUE 0.974 73.000 0.692 0.096 Y NA
 128962 128961 Atu4679 Atu4680     TRUE 0.996 13.000 0.846 0.011 Y NA
 128961 128960 Atu4680 Atu4681     TRUE 1.000 -7.000 0.650 1.000 Y NA
 128960 128959 Atu4681 Atu4682   dadA TRUE 0.997 0.000 0.238 0.091 Y NA
 128959 128958 Atu4682 Atu4683 dadA   FALSE 0.087 110.000 0.000 1.000   NA
 128958 128957 Atu4683 Atu4684     TRUE 0.894 11.000 0.167 NA   NA
 128956 128955 Atu4685 Atu4686     TRUE 0.668 193.000 0.800 NA   NA
 128954 128953 Atu4687 Atu4688     TRUE 0.947 67.000 0.375 0.096 Y NA
 128953 128952 Atu4688 Atu4689     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.011 Y NA
 128952 128951 Atu4689 Atu4690     TRUE 0.983 44.000 0.833 1.000 Y NA
 128951 128950 Atu4690 Atu4691     TRUE 0.931 24.000 0.500 1.000 N NA
 128950 128949 Atu4691 Atu4692     FALSE 0.021 226.000 0.000 1.000 N NA
 128949 128948 Atu4692 Atu4693     FALSE 0.003 468.000 0.000 1.000   NA
 128946 128945 Atu4695 Atu4696     FALSE 0.229 218.000 0.000 0.096 Y NA
 128945 128944 Atu4696 Atu4697     TRUE 0.946 19.000 0.097 0.096 Y NA
 128944 128943 Atu4697 Atu4698     TRUE 0.932 6.000 0.115 1.000 N NA
 128943 128942 Atu4698 Atu4699   trzA TRUE 0.997 0.000 0.231 0.004 Y NA
 128942 128941 Atu4699 Atu4700 trzA   TRUE 0.964 2.000 0.100 1.000 N NA
 128941 128940 Atu4700 Atu4701     TRUE 0.999 -3.000 0.388 0.002 Y NA
 128938 128937 Atu4703 Atu4704   huy TRUE 0.915 22.000 0.429 1.000   NA
 128937 128936 Atu4704 Atu4705 huy   FALSE 0.127 102.000 0.000 1.000 N NA
 128936 128935 Atu4705 Atu4706   nuoE TRUE 0.582 117.000 0.243 1.000 N NA
 128935 128934 Atu4706 Atu4707 nuoE nuoF TRUE 1.000 -3.000 0.870 0.007 Y NA
 128934 128933 Atu4707 Atu4708 nuoF fdhF TRUE 0.989 5.000 0.466 0.001   NA
 128933 128932 Atu4708 Atu4709 fdhF fdsD TRUE 0.759 75.000 0.175 0.001   NA
 128932 128931 Atu4709 Atu4710 fdsD   FALSE 0.350 116.000 0.057 1.000   NA
 128930 128929 Atu4711 Atu4712     TRUE 0.998 -3.000 0.217 1.000 Y NA
 128927 128926 Atu4714 Atu8199     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 128926 128925 Atu8199 Atu8096     TRUE 0.985 8.000 0.667 NA   NA
 128925 128924 Atu8096 Atu4716     FALSE 0.153 140.000 0.000 0.070   NA
 128923 128922 Atu4718 Atu4719   dppA TRUE 0.620 81.000 0.160 1.000 N NA
 128922 128921 Atu4719 Atu4720 dppA dppB TRUE 0.901 68.000 0.176 0.096 Y NA
 128921 128920 Atu4720 Atu4721 dppB dppC TRUE 0.976 77.000 0.762 0.096 Y NA
 128920 128919 Atu4721 Atu4722 dppC ggt TRUE 0.919 22.000 0.095 1.000 Y NA
 128919 128918 Atu4722 Atu4723 ggt   TRUE 0.967 5.000 0.286 1.000   NA
 128916 128915 Atu8200 Atu4726   sodBIII FALSE 0.016 194.000 0.000 NA   NA
 128915 128914 Atu4726 Atu4727 sodBIII   FALSE 0.078 115.000 0.000 1.000   NA
 128914 128913 Atu4727 Atu4728   exsA FALSE 0.003 460.000 0.000 1.000   NA
 128913 128911 Atu4728 Atu4729 exsA   FALSE 0.087 181.000 0.000 0.091   NA
 128910 128909 Atu4730 Atu4731     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA   NA
 128909 128908 Atu4731 Atu4732     TRUE 1.000 -28.000 0.600 NA Y NA
 128908 128907 Atu4732 Atu4733     TRUE 0.782 22.000 0.167 NA   NA
 128906 128905 Atu4734 Atu4736 acnB   FALSE 0.004 409.000 0.000 1.000 N NA
 128905 128904 Atu4736 Atu4737     FALSE 0.015 199.000 0.000 NA   NA
 128904 128903 Atu4737 Atu4738   cat FALSE 0.014 205.000 0.000 NA   NA
 128902 128901 Atu4739 Atu4740     TRUE 0.547 113.000 0.077 0.047 N NA
 128901 128900 Atu4740 Atu4741   acoR FALSE 0.345 157.000 0.167 1.000 N NA
 128900 128899 Atu4741 Atu4742 acoR   FALSE 0.069 124.000 0.000 1.000   NA
 128899 128898 Atu4742 Atu4743     FALSE 0.107 97.000 0.000 1.000   NA
 128897 128896 Atu4744 Atu4745     TRUE 0.959 118.000 0.941 NA Y NA
 128896 128895 Atu4745 Atu4746     TRUE 1.000 -7.000 0.941 1.000 Y NA
 128895 128894 Atu4746 Atu4747     TRUE 1.000 -3.000 0.938 0.096 Y NA
 128894 128893 Atu4747 Atu4748     TRUE 0.995 2.000 0.375 NA Y NA
 128893 128892 Atu4748 Atu4749     TRUE 0.694 38.000 0.118 NA N NA
 128892 128891 Atu4749 Atu4750   dpe FALSE 0.136 67.000 0.000 NA N NA
 128891 128890 Atu4750 Atu4751 dpe   FALSE 0.029 150.000 0.000 NA   NA
 128889 128888 Atu4752 Atu4753     TRUE 0.999 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 128888 128887 Atu4753 Atu4754     TRUE 0.975 13.000 0.184 0.011 Y NA
 128887 128886 Atu4754 Atu4755     TRUE 0.903 61.000 0.156 0.096 Y NA
 128886 128885 Atu4755 Atu4756     TRUE 0.527 61.000 0.049 1.000   NA
 128885 128884 Atu4756 Atu4757     TRUE 0.984 4.000 0.444 1.000   NA
 128884 128883 Atu4757 Atu4758   arcB TRUE 0.999 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 128883 128882 Atu4758 Atu4759 arcB tdcB TRUE 1.000 -3.000 0.780 1.000 Y NA
 128882 128881 Atu4759 Atu4760 tdcB   TRUE 0.915 92.000 0.268 0.011 Y NA
 128881 128880 Atu4760 Atu4761   bioA FALSE 0.150 161.000 0.000 0.011 N NA
 128880 128879 Atu4761 Atu4762 bioA gabD TRUE 0.774 14.000 0.040 1.000 N NA
 128878 128877 Atu4763 Atu4764     FALSE 0.200 60.000 0.000 1.000 N NA
 128877 128876 Atu4764 Atu4765     FALSE 0.184 45.000 0.000 1.000   NA
 128875 128874 Atu4766 Atu4767     TRUE 0.512 156.000 0.375 NA   NA
 128874 128873 Atu4767 Atu4768     TRUE 0.812 61.000 0.375 NA   NA
 128873 128872 Atu4768 Atu4769     FALSE 0.035 139.000 0.000 NA   NA
 128872 128871 Atu4769 Atu4770     FALSE 0.018 183.000 0.000 NA   NA
 128871 128870 Atu4770 Atu4771     FALSE 0.109 112.000 0.000 1.000 N NA
 128870 128869 Atu4771 Atu4772     TRUE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 128869 128868 Atu4772 Atu4773     FALSE 0.003 325.000 0.000 NA   NA
 128868 128867 Atu4773 Atu4774   nodW TRUE 0.762 65.000 0.000 0.013 Y NA
 128867 128866 Atu4774 Atu4775 nodW   TRUE 0.995 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 128866 128865 Atu4775 Atu4776   fdhF FALSE 0.013 261.000 0.000 1.000 N NA
 128864 128863 Atu4777 Atu4778   cpo FALSE 0.281 20.000 0.000 1.000   NA
 128859 128858 Atu4781 Atu4782   drrA TRUE 0.997 -3.000 0.129 1.000 Y NA
 128857 128856 Atu4783 Atu4784 afuA afuA TRUE 0.905 99.000 0.300 0.096 Y NA
 128856 128855 Atu4784 Atu4785 afuA afuB TRUE 0.977 79.000 0.800 0.096 Y NA
 128855 128854 Atu4785 Atu4786 afuB afuC TRUE 0.999 -3.000 0.632 0.096 N NA
 128854 128853 Atu4786 Atu4787 afuC   TRUE 0.900 28.000 0.400 1.000 N NA
 128851 128850 Atu4789 Atu4790 gmd fcl TRUE 0.977 11.000 0.100 0.004 Y NA
 128850 128849 Atu4790 Atu8097 fcl   TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 128849 128848 Atu8097 Atu4791     FALSE 0.135 37.000 0.000 NA   NA
 128847 128846 Atu4792 Atu4793   bme11 FALSE 0.010 224.000 0.000 NA   NA
 128846 128845 Atu4793 Atu4794 bme11 bme12 TRUE 0.986 4.000 0.150 1.000 Y NA
 128845 128844 Atu4794 Atu4795 bme12 bme13 TRUE 0.690 55.000 0.150 1.000 N NA
 128844 128843 Atu4795 Atu4796 bme13   FALSE 0.076 87.000 0.000 NA   NA
 128843 128842 Atu4796 Atu4797   rfbF TRUE 0.974 6.000 0.412 NA   NA
 128842 128841 Atu4797 Atu4798 rfbF   TRUE 0.990 -3.000 0.162 NA   NA
 128839 128838 Atu4800 Atu4801     TRUE 0.915 14.000 0.320 NA   NA
 128838 128837 Atu4801 Atu4802   hemL FALSE 0.098 118.000 0.000 1.000 N NA
 128837 128836 Atu4802 Atu4803 hemL   FALSE 0.025 216.000 0.000 1.000 N NA
 128834 128833 Atu4806 Atu4807 pssF pssL TRUE 0.985 -3.000 0.068 NA   NA
 128833 128832 Atu4807 Atu4808 pssL amsJ FALSE 0.010 226.000 0.000 NA   NA
 128831 128830 Atu4809 Atu4810     TRUE 0.615 5.000 0.000 1.000   NA
 128830 128829 Atu4810 Atu4811   rfe FALSE 0.011 255.000 0.000 1.000   NA
 128829 128828 Atu4811 Atu4812 rfe bme2 FALSE 0.416 8.000 0.000 NA   NA
 128828 128827 Atu4812 Atu4813 bme2 bme3 FALSE 0.427 57.000 0.019 NA   NA
 128827 128826 Atu4813 Atu4814 bme3 bme4 TRUE 0.899 4.000 0.033 NA   NA
 128825 128824 Atu4815 Atu4816 bme6 bme7 TRUE 0.998 -3.000 0.158 0.013 Y NA
 128824 128823 Atu4816 Atu4817 bme7 bme8 TRUE 0.998 -3.000 0.100 0.013 Y NA
 128823 128821 Atu4817 Atu4818 bme8 lrp FALSE 0.005 388.000 0.000 1.000 N NA
 128820 128819 Atu8042 Atu4819     TRUE 0.618 20.000 0.025 NA   NA
 128818 128817 Atu4820 Atu4821   fabG TRUE 0.994 -3.000 0.250 NA   NA
 128817 128816 Atu4821 Atu4822 fabG   TRUE 0.982 32.000 0.600 0.065 Y NA
 128816 128815 Atu4822 Atu4823   acaB TRUE 0.997 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 128815 128814 Atu4823 Atu4824 acaB   TRUE 0.995 -3.000 0.278 1.000 N NA
 128814 128813 Atu4824 Atu4825     TRUE 0.967 2.000 0.130 1.000 N NA
 128813 128812 Atu4825 Atu4826     TRUE 0.776 65.000 0.286 1.000 N NA
 128812 128811 Atu4826 Atu4827     TRUE 0.910 66.000 0.286 1.000 Y NA
 128811 3820139 Atu4827 Atu4828     FALSE 0.007 247.000 0.000 NA   NA
 128809 128808 Atu4830 Atu4831     TRUE 0.996 -3.000 0.372 NA   NA
 3820141 128807 Atu4832 Atu4833   cga FALSE 0.002 374.000 0.000 NA   NA
 128807 128806 Atu4833 Atu4834 cga   TRUE 0.850 38.000 0.031 1.000 Y NA
 128806 128805 Atu4834 Atu4835     TRUE 0.996 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 128805 128804 Atu4835 Atu4836     TRUE 0.898 33.000 0.100 1.000 Y NA
 128804 128803 Atu4836 Atu4837     FALSE 0.048 117.000 0.000 NA   NA
 128803 128802 Atu4837 Atu4838     TRUE 0.783 27.000 0.200 NA   NA
 128802 128801 Atu4838 Atu4839   csgA FALSE 0.281 20.000 0.000 1.000   NA
 128800 128799 Atu4840 Atu4841   deoR FALSE 0.149 31.000 0.000 NA   NA
 128798 128797 Atu4842 Atu4843     TRUE 0.976 72.000 0.875 NA Y NA
 128797 128796 Atu4843 Atu4844   rbsC TRUE 0.995 14.000 0.857 0.004 Y NA
 128796 128795 Atu4844 Atu4845 rbsC ydeZ TRUE 0.994 15.000 1.000 1.000 Y NA
 128795 128794 Atu4845 Atu4846 ydeZ   TRUE 0.993 5.000 0.857 1.000   NA
 128794 128793 Atu4846 Atu4847   rbsk TRUE 0.727 25.000 0.090 1.000   NA
 128793 128792 Atu4847 Atu4848 rbsk deoC TRUE 0.671 20.000 0.023 1.000 N NA
 128792 128791 Atu4848 Atu4849 deoC   TRUE 0.819 42.000 0.277 1.000 N NA
 128791 128789 Atu4849 Atu4850     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 128789 128788 Atu4850 Atu4851     FALSE 0.005 272.000 0.000 NA   NA
 128787 128786 Atu4852 Atu4853     FALSE 0.023 168.000 0.000 NA   NA
 128782 128781 Atu4856 Atu4857   mobC FALSE 0.025 160.000 0.000 NA   NA
 128781 128780 Atu4857 Atu4858 mobC traG TRUE 0.995 -3.000 0.300 NA   NA
 128777 128776 Atu4861 Atu4862 istB istA TRUE 0.997 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 128776 3820142 Atu4862 Atu4863 istA   FALSE 0.080 80.000 0.000 NA   NA
 128773 128772 Atu4865 Atu4866     TRUE 0.666 170.000 0.667 NA   NA
 128772 128771 Atu4866 Atu4867     FALSE 0.272 142.000 0.075 NA   NA
 128771 128770 Atu4867 Atu4868     TRUE 0.923 5.000 0.075 1.000   NA
 128764 128763 Atu4874 Atu4875     FALSE 0.002 406.000 0.000 NA   NA
 128763 128762 Atu4875 Atu4876     FALSE 0.027 156.000 0.000 NA   NA
 128762 128761 Atu4876 Atu4877     FALSE 0.060 152.000 0.000 1.000 N NA
 128761 128760 Atu4877 Atu4878     FALSE 0.127 42.000 0.000 NA   NA
 128758 128757 Atu8043 Atu4880     FALSE 0.174 23.000 0.000 NA   NA
 128754 128752 Atu4882 Atu4884     FALSE 0.002 392.000 0.000 NA   NA
 128752 128750 Atu4884 Atu8201     FALSE 0.005 283.000 0.000 NA   NA
 128750 128749 Atu8201 Atu8202     TRUE 0.992 -3.000 0.208 NA   NA
 128749 128748 Atu8202 Atu4887     FALSE 0.131 39.000 0.000 NA   NA
 128748 128747 Atu4887 Atu4888     FALSE 0.036 137.000 0.000 NA   NA
 128747 128746 Atu4888 Atu4889     FALSE 0.089 71.000 0.000 NA   NA
 128745 3820143 Atu4890 Atu4891     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 128743 128742 Atu4892 Atu4893     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 128742 128741 Atu4893 Atu4894   tnp FALSE 0.005 287.000 0.000 NA   NA
 128741 128740 Atu4894 Atu4895 tnp   FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 128739 128738 Atu4896 Atu4897     FALSE 0.007 248.000 0.000 NA   NA
 1724899 1724900 pTiC58_p4 pTiC58_p5 c' d FALSE 0.001 711.000 0.000 NA   NA
 130571 130572 Atu5000 Atu5001 repA repB TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 N NA
 130572 130573 Atu5001 Atu5002 repB repC FALSE 0.015 201.000 0.000 NA   NA
 130574 130575 Atu5003 Atu5004 socD socC TRUE 0.775 45.000 0.133 0.046   NA
 130575 130576 Atu5004 Atu5005 socC socB FALSE 0.281 20.000 0.000 1.000   NA
 130576 130577 Atu5005 Atu5006 socB socA TRUE 0.968 61.000 0.538 0.095 Y NA
 130578 3820145 Atu5007 Atu8044 socR   FALSE 0.006 262.000 0.000 NA   NA
 130580 130581 Atu5010 Atu5011     FALSE 0.004 365.000 0.000 1.000   NA
 130583 130584 Atu5013 Atu5014   stbB TRUE 0.998 -3.000 0.625 NA   NA
 3820147 130587 Atu5017 Atu5018     FALSE 0.140 35.000 0.000 NA   NA
 130587 130588 Atu5018 Atu5019     FALSE 0.163 26.000 0.000 NA   NA
 130588 130589 Atu5019 Atu5020     TRUE 0.995 -3.000 0.330 NA   NA
 130589 130590 Atu5020 Atu5021     TRUE 0.997 -3.000 0.491 NA   NA
 130590 130591 Atu5021 Atu5022     TRUE 0.990 0.000 0.400 NA   NA
 130592 130593 Atu5023 Atu5024     TRUE 0.911 30.000 0.161 NA Y NA
 130594 130595 Atu5027 Atu5028     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 3820150 130596 Atu5029 Atu5030     FALSE 0.025 161.000 0.000 NA   NA
 130597 130598 Atu5031 Atu5032     FALSE 0.015 196.000 0.000 NA   NA
 130598 130599 Atu5032 Atu5033     FALSE 0.146 32.000 0.000 NA   NA
 3820151 130600 Atu5034 Atu5035     FALSE 0.084 75.000 0.000 NA   NA
 130600 130601 Atu5035 Atu5036     FALSE 0.114 51.000 0.000 NA   NA
 130601 3820152 Atu5036 Atu5037     FALSE 0.111 53.000 0.000 NA   NA
 3820152 3820153 Atu5037 Atu5038   tnp FALSE 0.003 325.000 0.000 NA   NA
 3820153 130604 Atu5038 Atu5039 tnp   FALSE 0.001 518.000 0.000 NA   NA
 130605 130606 Atu5040 Atu5041   parB TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.037   NA
 130606 130607 Atu5041 Atu5042 parB   TRUE 0.999 -3.000 0.743 0.037 N NA
 130609 130610 Atu5044 Atu5045     TRUE 0.997 -19.000 0.262 NA   NA
 130612 130613 Atu5047 Atu5048     FALSE 0.077 85.000 0.000 NA   NA
 130613 130614 Atu5048 Atu8099     TRUE 0.791 12.000 0.045 NA   NA
 130615 130616 Atu5049 Atu5050     TRUE 0.985 13.000 0.714 0.001   NA
 130616 130617 Atu5050 Atu5051     TRUE 0.998 -3.000 0.571 1.000   NA
 130617 130618 Atu5051 Atu5052   hspAT1 FALSE 0.035 166.000 0.000 NA N NA
 130618 130619 Atu5052 Atu5053 hspAT1   TRUE 0.785 73.000 0.375 NA   NA
 130619 130620 Atu5053 Atu5054     TRUE 0.934 10.000 0.250 NA   NA
 130622 130623 Atu5056 Atu5057     FALSE 0.137 36.000 0.000 NA   NA
 130623 130624 Atu5057 Atu5058   ugpB FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 130624 130625 Atu5058 Atu5059 ugpB ugpA TRUE 0.966 59.000 0.500 0.094 Y NA
 130625 130626 Atu5059 Atu5060 ugpA ugpE TRUE 1.000 -10.000 0.667 0.094 Y NA
 130626 130627 Atu5060 Atu5061 ugpE glpQ TRUE 0.966 17.000 0.667 1.000 N NA
 130627 130628 Atu5061 Atu5062 glpQ ugpC TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 N NA
 130628 130629 Atu5062 Atu5063 ugpC   FALSE 0.344 20.000 0.000 1.000 N NA
 130631 130632 Atu5065 Atu5066 prxC   TRUE 0.600 73.000 0.160 NA   NA
 130633 130634 Atu5067 Atu5068 dapA   TRUE 0.764 23.000 0.125 1.000   NA
 130634 130635 Atu5068 Atu5069     TRUE 1.000 -7.000 1.000 1.000   NA
 130635 130636 Atu5069 Atu5070     TRUE 0.993 15.000 0.800 0.094 Y NA
 130636 130637 Atu5070 Atu5071   dppA TRUE 0.827 196.000 0.600 0.094 Y NA
 130638 130639 Atu8046 Atu5072     FALSE 0.045 122.000 0.000 NA   NA
 130639 130640 Atu5072 Atu5073   pdxA TRUE 0.906 4.000 0.031 NA N NA
 130640 130641 Atu5073 Atu5074 pdxA attL TRUE 0.992 -3.000 0.167 1.000 N NA
 130642 130643 Atu5075 Atu5076 pdhR   TRUE 0.965 4.000 0.235 NA   NA
 130645 3820156 Atu5078 Atu5079     FALSE 0.119 46.000 0.000 NA   NA
 3820156 130648 Atu5079 Atu5080     FALSE 0.095 66.000 0.000 NA   NA
 130648 130649 Atu5080 Atu5081     TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.094 Y NA
 130649 130650 Atu5081 Atu5082     TRUE 0.812 29.000 0.222 1.000   NA
 130650 130652 Atu5082 Atu5083     FALSE 0.017 221.000 0.000 1.000   NA
 130655 130656 Atu5086 Atu5087     TRUE 0.999 -3.000 0.400 NA Y NA
 130656 3820158 Atu5087 Atu5088     FALSE 0.001 827.000 0.000 NA   NA
 3820158 130657 Atu5088 Atu5089     FALSE 0.149 31.000 0.000 NA   NA
 130658 130659 Atu5090 Atu5091 rcdA rcdB TRUE 0.964 4.000 0.217 NA N NA
 130659 3820159 Atu5091 Atu5092 rcdB tnp FALSE 0.004 297.000 0.000 NA   NA
 3820159 3820160 Atu5092 Atu5093 tnp   FALSE 0.110 54.000 0.000 NA   NA
 130662 3820161 Atu5094 Atu5095 tnpA   FALSE 0.073 91.000 0.000 NA   NA
 130663 130664 Atu5096 Atu5097     FALSE 0.107 56.000 0.000 NA   NA
 130665 130666 Atu5098 Atu5099     FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 130666 130667 Atu5099 Atu5100   dnaE TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 130667 130668 Atu5100 Atu5101 dnaE   FALSE 0.073 91.000 0.000 NA   NA
 130668 130669 Atu5101 Atu5102     FALSE 0.001 617.000 0.000 NA   NA
 130669 130670 Atu5102 Atu5103   ardC FALSE 0.002 433.000 0.000 NA   NA
 130670 130671 Atu5103 Atu5104 ardC   FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 130672 130673 Atu5105 Atu5106   hupX FALSE 0.409 193.000 0.400 NA   NA
 130673 130674 Atu5106 Atu5107 hupX   FALSE 0.079 82.000 0.000 NA   NA
 130674 130675 Atu5107 Atu5108   traG FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 130675 130676 Atu5108 Atu5109 traG traD TRUE 0.996 -3.000 0.333 1.000   NA
 130676 130677 Atu5109 Atu5110 traD traC TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 130678 130679 Atu5111 Atu5112 traA   FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 130679 3820162 Atu5112 Atu5113     FALSE 0.206 18.000 0.000 NA   NA
 130680 3820163 Atu5114 Atu5115     TRUE 0.542 4.000 0.000 NA   NA
 3820163 130681 Atu5115 Atu5116   rctB FALSE 0.127 42.000 0.000 NA   NA
 130681 130682 Atu5116 Atu5117 rctB   FALSE 0.004 312.000 0.000 NA   NA
 130682 130683 Atu5117 Atu5118     FALSE 0.039 163.000 0.000 1.000   NA
 130683 130684 Atu5118 Atu5119     FALSE 0.088 126.000 0.000 1.000 N NA
 130686 130687 Atu5121 Atu5122   fabG TRUE 0.927 39.000 0.600 1.000 N NA
 130687 130688 Atu5122 Atu5123 fabG atrC TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 N NA
 130688 130689 Atu5123 Atu5124 atrC atrB TRUE 0.995 0.000 0.214 1.000 Y NA
 130689 130690 Atu5124 Atu5125 atrB atrA TRUE 0.560 115.000 0.214 1.000 N NA
 130691 130692 Atu5126 Atu5127 attA1 attA2 TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.094 Y NA
 130692 130693 Atu5127 Atu5128 attA2 attB TRUE 1.000 -10.000 0.875 0.094 Y NA
 130693 130694 Atu5128 Atu5129 attB attC TRUE 0.974 28.000 0.429 0.094 Y NA
 130694 130695 Atu5129 Atu5130 attC attD TRUE 0.929 -64.000 0.000 NA   NA
 130695 130696 Atu5130 Atu5131 attD attE FALSE 0.043 125.000 0.000 NA   NA
 130696 130697 Atu5131 Atu5132 attE attF TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA   NA
 130697 130698 Atu5132 Atu5133 attF att TRUE 0.981 -3.000 0.040 NA   NA
 130698 130699 Atu5133 Atu5134 att attH TRUE 0.999 -10.000 0.627 NA   NA
 130701 130702 Atu5137 Atu5138 blcA blcB TRUE 0.951 21.000 0.151 0.064 Y NA
 130702 130703 Atu5138 Atu5139 blcB blcC TRUE 0.561 67.000 0.075 1.000   NA
 130705 130706 Atu5141 Atu5142 attO attP FALSE 0.167 25.000 0.000 NA   NA
 130706 130707 Atu5142 Atu5143 attP attR FALSE 0.005 279.000 0.000 NA   NA
 130707 130708 Atu5143 Atu5144 attR attS FALSE 0.062 131.000 0.000 1.000   NA
 130710 130711 Atu5145 Atu5146 attT attU FALSE 0.129 40.000 0.000 NA   NA
 130713 130714 Atu5148 Atu5149 attW attX FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 130714 130715 Atu5149 Atu5150 attX attY FALSE 0.082 77.000 0.000 NA   NA
 3820164 130719 Atu5154 Atu5155 atsA atsB FALSE 0.044 123.000 0.000 NA   NA
 130719 130720 Atu5155 Atu5156 atsB atsC FALSE 0.212 55.000 0.000 1.000 N NA
 130721 3820165 Atu5157 Atu5158 atsD   FALSE 0.020 179.000 0.000 NA   NA
 3820165 130722 Atu5158 Atu5159   atsE FALSE 0.003 335.000 0.000 NA   NA
 130722 130723 Atu5159 Atu5160 atsE rctA FALSE 0.003 361.000 0.000 NA   NA
 3820166 130724 Atu5161 Atu5162   avhB1 TRUE 0.992 3.000 0.667 NA   NA
 130724 130725 Atu5162 Atu5163 avhB1 avhB2 TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 130725 130726 Atu5163 Atu5164 avhB2 avhB3 TRUE 0.999 3.000 1.000 NA Y NA
 130726 130727 Atu5164 Atu5165 avhB3 avhB4 TRUE 0.972 101.000 1.000 NA Y NA
 130727 130728 Atu5165 Atu5166 avhB4 avhB5 TRUE 0.991 0.000 0.429 NA   NA
 130728 130729 Atu5166 Atu5167 avhB5 avhB6 FALSE 0.009 235.000 0.000 NA   NA
 130729 130730 Atu5167 Atu5168 avhB6 avhB7 TRUE 0.935 36.000 0.667 NA   NA
 130730 130731 Atu5168 Atu5169 avhB7 avhB8 TRUE 0.985 4.000 0.500 NA   NA
 130731 130732 Atu5169 Atu5170 avhB8 avhB9 TRUE 0.999 0.000 1.000 NA Y NA
 130732 130733 Atu5170 Atu5171 avhB9 avhB10 TRUE 0.991 15.000 0.800 NA Y NA
 130733 130734 Atu5171 Atu5172 avhB10 avhB11 TRUE 0.993 9.000 0.600 1.000 Y NA
 130734 130735 Atu5172 Atu5173 avhB11   FALSE 0.172 52.000 0.000 1.000   NA
 130735 130736 Atu5173 Atu8203     FALSE 0.002 510.000 0.000 1.000   NA
 130736 130737 Atu8203 Atu5175   basR FALSE 0.022 208.000 0.000 1.000   NA
 130737 130738 Atu5175 Atu5176 basR basS TRUE 0.970 2.000 0.000 1.000 Y NA
 130738 130739 Atu5176 Atu5177 basS   FALSE 0.016 247.000 0.000 1.000 N NA
 130739 130740 Atu5177 Atu5178     TRUE 0.969 10.000 0.439 1.000 N NA
 130740 3820167 Atu5178 Atu5179     FALSE 0.004 298.000 0.000 NA   NA
 3820168 130742 Atu5180 Atu5181     FALSE 0.018 185.000 0.000 NA   NA
 130742 130743 Atu5181 Atu5182   qor FALSE 0.141 96.000 0.000 1.000 N NA
 130743 130744 Atu5182 Atu5183 qor   FALSE 0.119 86.000 0.000 1.000   NA
 130745 130746 Atu5184 Atu5185     FALSE 0.380 168.000 0.231 1.000 N NA
 130746 130747 Atu5185 Atu5186     TRUE 0.927 -19.000 0.000 NA   NA
 130749 130750 Atu5188 Atu5189     TRUE 0.991 -3.000 0.042 0.045   NA
 130750 130751 Atu5189 Atu5190     FALSE 0.049 115.000 0.000 NA   NA
 130751 130752 Atu5190 Atu5191     FALSE 0.025 161.000 0.000 NA   NA
 130754 130755 Atu5193 Atu5194     FALSE 0.456 13.000 0.000 1.000 N NA
 130755 130756 Atu5194 Atu5195     FALSE 0.396 167.000 0.000 0.068 Y NA
 130756 130757 Atu5195 Atu5196     FALSE 0.043 125.000 0.000 NA   NA
 130758 130759 Atu5197 Atu5198     FALSE 0.278 31.000 0.000 1.000 N NA
 130759 130760 Atu5198 Atu5199     FALSE 0.182 130.000 0.000 0.045   NA
 130760 130761 Atu5199 Atu5200     FALSE 0.004 367.000 0.000 1.000   NA
 130762 130764 Atu5201 Atu5202 pirA   FALSE 0.006 262.000 0.000 NA   NA
 130764 130765 Atu5202 Atu5203     TRUE 0.605 49.000 0.065 1.000   NA
 130765 130766 Atu5203 Atu5204   gbsA FALSE 0.074 119.000 0.000 1.000   NA
 130766 130767 Atu5204 Atu5205 gbsA   FALSE 0.008 239.000 0.000 NA   NA
 130771 130772 Atu5209 Atu5210     TRUE 0.997 -3.000 0.440 NA   NA
 130776 130777 Atu5213 Atu5214     FALSE 0.436 54.000 0.000 0.045 N NA
 130777 130778 Atu5214 Atu5215     FALSE 0.232 168.000 0.069 1.000 N NA
 3820169 3820170 Atu5216 Atu5217     FALSE 0.307 12.000 0.000 NA   NA
 3820170 130779 Atu5217 Atu5218   proV FALSE 0.003 331.000 0.000 NA   NA
 130779 130780 Atu5218 Atu5219 proV proW TRUE 0.998 -7.000 0.102 1.000 Y NA
 130780 130781 Atu5219 Atu5220 proW proX TRUE 0.643 148.000 0.051 0.093 Y NA
 130781 130782 Atu5220 Atu5221 proX   FALSE 0.046 120.000 0.000 NA   NA
 130784 130785 Atu5222 Atu5223     FALSE 0.084 75.000 0.000 NA   NA
 130785 130786 Atu5223 Atu5224     FALSE 0.100 62.000 0.000 NA   NA
 130786 130787 Atu5224 Atu5225     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA   NA
 130787 130788 Atu5225 Atu5226   pca TRUE 0.998 -7.000 0.333 1.000   NA
 130788 130789 Atu5226 Atu5227 pca   TRUE 0.990 3.000 0.562 NA   NA
 130789 130790 Atu5227 Atu5228   dhaS TRUE 0.972 31.000 0.562 NA Y NA
 130790 130791 Atu5228 Atu5229 dhaS ntaB TRUE 0.977 22.000 0.818 0.045   NA
 130791 3820171 Atu5229 Atu8059 ntaB   FALSE 0.009 230.000 0.000 NA   NA
 130792 130793 Atu5230 Atu5231     FALSE 0.025 162.000 0.000 NA   NA
 130795 130796 Atu5233 Atu5234 dsd   TRUE 0.986 9.000 0.333 NA Y NA
 130796 130797 Atu5234 Atu5235     TRUE 0.994 10.000 0.500 0.011 Y NA
 130797 130798 Atu5235 Atu5236     TRUE 1.000 -13.000 0.500 1.000 Y NA
 130798 130799 Atu5236 Atu5237     TRUE 0.988 40.000 1.000 1.000 Y NA
 130799 130800 Atu5237 Atu5238     FALSE 0.110 95.000 0.000 1.000   NA
 130800 130801 Atu5238 Atu5239     TRUE 0.703 27.000 0.077 1.000   NA
 130801 130803 Atu5239 Atu8048     FALSE 0.002 417.000 0.000 NA   NA
 130807 130808 Atu5242 Atu5243     FALSE 0.218 29.000 0.000 NA N NA
 130808 130809 Atu5243 Atu5244     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130809 130810 Atu5244 Atu5245     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130810 130811 Atu5245 Atu5246   potC TRUE 0.841 11.000 0.040 1.000 N NA
 130811 130812 Atu5246 Atu5247 potC potB TRUE 0.997 4.000 0.600 0.093 Y NA
 130812 130813 Atu5247 Atu5248 potB potA TRUE 0.995 2.000 0.250 0.093 Y NA
 130813 130814 Atu5248 Atu5249 potA potD TRUE 0.917 30.000 0.182 NA Y NA
 130816 130817 Atu5251 Atu5252     TRUE 0.846 11.000 0.057 1.000   NA
 130818 130819 Atu5253 Atu5254     FALSE 0.350 179.000 0.000 0.093 Y NA
 130819 130820 Atu5254 Atu5255     TRUE 0.994 14.000 0.818 0.093 Y NA
 130820 130821 Atu5255 Atu5256     TRUE 0.999 -3.000 0.636 1.000 Y NA
 130821 130822 Atu5256 Atu5257     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 130822 130823 Atu5257 Atu5258     FALSE 0.260 36.000 0.000 1.000 N NA
 130824 130825 Atu5259 Atu5260     FALSE 0.037 190.000 0.000 1.000 N NA
 130825 130826 Atu5260 Atu5261     TRUE 0.859 48.000 0.400 1.000   NA
 130828 130829 Atu5263 Atu5264     TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.093 Y NA
 130829 130830 Atu5264 Atu5265     TRUE 0.996 13.000 0.900 0.093 Y NA
 130832 130833 Atu5266 Atu5267     TRUE 0.999 -3.000 0.312 0.016 Y NA
 130834 130835 Atu5268 Atu5269 dctP   TRUE 0.843 63.000 0.083 1.000 Y NA
 130835 130836 Atu5269 Atu5270     TRUE 0.919 51.000 0.283 NA Y NA
 130841 130842 Atu5273 Atu5274     TRUE 0.689 93.000 0.000 0.048 Y NA
 130845 130846 Atu5277 Atu5278     FALSE 0.002 367.000 0.000 NA   NA
 130846 130847 Atu5278 Atu5279     FALSE 0.032 144.000 0.000 NA   NA
 130847 130848 Atu5279 Atu5280     FALSE 0.101 61.000 0.000 NA   NA
 3820172 130850 Atu5282 Atu5283     FALSE 0.004 292.000 0.000 NA   NA
 130851 130852 Atu5284 Atu5285   glgA TRUE 0.777 27.000 0.000 1.000 Y NA
 130852 130853 Atu5285 Atu5286 glgA   FALSE 0.001 510.000 0.000 NA   NA
 130853 130854 Atu5286 Atu5287     FALSE 0.084 75.000 0.000 NA   NA
 130854 130855 Atu5287 Atu5288     TRUE 0.963 16.000 0.667 NA   NA
 130855 130856 Atu5288 Atu5289     FALSE 0.009 227.000 0.000 NA   NA
 130857 130858 Atu5290 Atu5291     FALSE 0.034 172.000 0.000 1.000   NA
 130858 130859 Atu5291 Atu5292     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 130859 3820173 Atu5292 Atu5293     TRUE 0.988 -3.000 0.099 NA   NA
 3820173 3820174 Atu5293 Atu5294     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130862 130863 Atu5296 Atu5297     TRUE 0.865 101.000 0.500 0.007   NA
 130863 130864 Atu5297 Atu5299     FALSE 0.015 199.000 0.000 NA   NA
 3820176 130866 Atu5300 Atu5301     FALSE 0.001 507.000 0.000 NA   NA
 130866 130867 Atu5301 Atu5302     FALSE 0.031 146.000 0.000 NA   NA
 130868 130869 Atu5303 Atu5304 dgdR   FALSE 0.066 99.000 0.000 NA   NA
 3820177 130871 Atu5305 Atu5306     FALSE 0.002 480.000 0.000 NA   NA
 130873 3820178 Atu5307 Atu5308     FALSE 0.003 328.000 0.000 NA   NA
 3820178 130874 Atu5308 Atu5309     FALSE 0.008 242.000 0.000 NA   NA
 130874 130875 Atu5309 Atu5310     TRUE 0.942 87.000 1.000 NA N NA
 130875 130876 Atu5310 Atu5311     FALSE 0.439 121.000 0.000 NA Y NA
 130876 130877 Atu5311 Atu5312     TRUE 0.973 1.000 0.000 1.000 Y NA
 130877 130878 Atu5312 Atu5313     TRUE 0.976 0.000 0.000 NA Y NA
 130878 130879 Atu5313 Atu5314   fepD TRUE 0.998 -3.000 0.200 NA Y NA
 130879 130880 Atu5314 Atu5315 fepD fepG TRUE 0.849 120.000 0.250 0.093 Y NA
 130880 130881 Atu5315 Atu5316 fepG fepC TRUE 0.997 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 3820180 3820181 Atu5318 Atu5320     FALSE 0.002 467.000 0.000 NA   NA
 3820181 130886 Atu5320 Atu5321     TRUE 0.494 5.000 0.000 NA   NA
 130886 130887 Atu5321 Atu5322     TRUE 0.948 -7.000 0.000 1.000   NA
 130887 130888 Atu5322 Atu5323     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 130890 3820182 Atu5325 Atu5326     FALSE 0.137 36.000 0.000 NA   NA
 130893 130894 Atu5328 Atu5329   menG TRUE 0.653 136.000 0.111 NA Y NA
 130894 130895 Atu5329 Atu5330 menG   FALSE 0.074 90.000 0.000 NA   NA
 130895 130896 Atu5330 Atu5331     TRUE 0.968 0.000 0.091 NA   NA
 130896 130897 Atu5331 Atu5332     TRUE 0.949 12.000 0.400 NA   NA
 130897 130898 Atu5332 Atu5333     FALSE 0.091 70.000 0.000 NA   NA
 130898 130899 Atu5333 Atu5334     TRUE 0.759 3.000 0.000 1.000 N NA
 130899 130900 Atu5334 Atu5335     TRUE 0.723 4.000 0.000 1.000 N NA
 130904 3820183 Atu5339 Atu5340     FALSE 0.002 415.000 0.000 NA   NA
 130906 130907 Atu5342 Atu5343     TRUE 0.538 44.000 0.029 1.000   NA
 130907 130908 Atu5343 Atu5344     TRUE 0.991 -3.000 0.027 0.008 N NA
 130908 130909 Atu5344 Atu5345     TRUE 0.983 -3.000 0.027 1.000 N NA
 130909 130910 Atu5345 Atu5346     TRUE 0.988 5.000 0.167 0.093 Y NA
 130910 130911 Atu5346 Atu5347     TRUE 0.992 6.000 0.833 1.000   NA
 130911 130912 Atu5347 Atu5348     TRUE 0.991 -10.000 0.035 1.000   NA
 130915 130916 Atu5350 Atu5351     FALSE 0.167 25.000 0.000 NA   NA
 130920 3820184 Atu5355 Atu5356     FALSE 0.002 446.000 0.000 NA   NA
 130924 3820185 Atu5359 Atu5360     FALSE 0.135 37.000 0.000 NA   NA
 3820185 130926 Atu5360 Atu5361   aqpZ FALSE 0.040 162.000 0.000 1.000   NA
 130926 130927 Atu5361 Atu5362 aqpZ   FALSE 0.026 158.000 0.000 NA   NA
 130927 130928 Atu5362 Atu8205     FALSE 0.002 373.000 0.000 NA   NA
 130928 130929 Atu8205 Atu5364     FALSE 0.113 52.000 0.000 NA   NA
 130930 130931 Atu5365 Atu5366     FALSE 0.002 398.000 0.000 NA   NA
 130931 130932 Atu5366 Atu5367     TRUE 0.999 -3.000 0.364 NA Y NA
 130934 130935 Atu5370 Atu5371 tnp tnp TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.037 Y NA
 130936 130937 Atu5372 Atu5373     FALSE 0.081 79.000 0.000 NA   NA
 130938 130939 Atu8064 Atu5374     FALSE 0.097 64.000 0.000 NA   NA
 130940 3820188 Atu5375 Atu5376     FALSE 0.030 148.000 0.000 NA   NA
 3820188 130941 Atu5376 Atu5377     FALSE 0.040 129.000 0.000 NA   NA
 130941 130942 Atu5377 Atu5378     TRUE 0.729 76.000 0.000 0.016 Y NA
 130943 3820189 Atu8206 Atu5380     FALSE 0.004 304.000 0.000 NA   NA
 3820189 130944 Atu5380 Atu5381     FALSE 0.002 723.000 0.000 NA N NA
 130944 130945 Atu5381 Atu5382     TRUE 0.935 26.000 0.583 NA N NA
 130945 130946 Atu5382 Atu5383     TRUE 0.708 60.000 0.188 1.000 N NA
 130946 130947 Atu5383 Atu5384     FALSE 0.002 762.000 0.000 1.000   NA
 130951 130952 Atu5386 Atu5387     TRUE 0.929 3.000 0.054 NA   NA
 130959 130960 Atu5394 Atu5395 dapA   FALSE 0.231 180.000 0.100 1.000 N NA
 130961 130962 Atu5396 Atu5397     FALSE 0.014 202.000 0.000 NA   NA
 130962 130963 Atu5397 Atu5398   dapA FALSE 0.002 427.000 0.000 NA   NA
 130963 130964 Atu5398 Atu5399 dapA   TRUE 0.755 63.000 0.000 0.063 Y NA
 130964 130965 Atu5399 Atu5400     FALSE 0.300 26.000 0.000 1.000 N NA
 130965 130966 Atu5400 Atu5401     FALSE 0.465 146.000 0.000 0.092 Y NA
 130966 130967 Atu5401 Atu5402     TRUE 0.970 18.000 0.267 0.092 Y NA
 130967 130968 Atu5402 Atu5403     TRUE 0.852 196.000 0.667 0.092 Y NA
 130968 130969 Atu5403 Atu5404     FALSE 0.008 303.000 0.000 1.000 N NA
 130971 130972 Atu5406 Atu5407     FALSE 0.312 146.000 0.108 NA N NA
 130972 130973 Atu5407 Atu5408     TRUE 0.901 104.000 0.833 NA N NA
 130973 130974 Atu5408 Atu5409     TRUE 0.998 4.000 0.714 0.092 Y NA
 130975 130976 Atu5410 Atu5411     TRUE 0.982 20.000 0.467 0.092 Y NA
 130976 130977 Atu5411 Atu5412     TRUE 0.996 10.000 0.714 0.092 Y NA
 130977 130978 Atu5412 Atu5413     TRUE 1.000 -7.000 0.833 0.092 Y NA
 130978 130979 Atu5413 Atu5414     TRUE 0.944 32.000 0.294 1.000 Y NA
 130979 130980 Atu5414 Atu5415     TRUE 0.998 -31.000 0.294 1.000   NA
 130985 130986 Atu5419 Atu5420   potF TRUE 0.637 55.000 0.087 1.000 N NA
 130986 130987 Atu5420 Atu5421 potF potH TRUE 0.978 85.000 0.833 0.092 Y NA
 130987 130988 Atu5421 Atu5422 potH potI TRUE 0.995 10.000 0.625 0.092 Y NA
 130988 130989 Atu5422 Atu5423 potI potG TRUE 0.997 4.000 0.625 1.000 Y NA
 130989 130990 Atu5423 Atu5424 potG   TRUE 0.574 61.000 0.059 1.000 N NA
 130990 130991 Atu5424 Atu5425   nahD TRUE 0.532 11.000 0.000 1.000 N NA
 130991 130992 Atu5425 Atu5426 nahD   FALSE 0.416 8.000 0.000 NA   NA
 130992 130993 Atu5426 Atu5427     TRUE 0.992 2.000 0.588 NA   NA
 130993 130994 Atu5427 Atu5428   dinF TRUE 0.663 1.000 0.000 NA   NA
 130995 130996 Atu5429 Atu5430     FALSE 0.002 416.000 0.000 NA   NA
 130996 130997 Atu5430 Atu5431     FALSE 0.003 331.000 0.000 NA   NA
 130997 3820193 Atu5431 Atu5432     FALSE 0.020 179.000 0.000 NA   NA
 3820193 130999 Atu5432 Atu5433     FALSE 0.002 425.000 0.000 NA   NA
 131000 131001 Atu5434 Atu5435     TRUE 0.919 20.000 0.412 1.000   NA
 131001 131002 Atu5435 Atu5436   iolH FALSE 0.007 244.000 0.000 NA   NA
 131007 131008 Atu5441 Atu5442     FALSE 0.032 178.000 0.000 1.000   NA
 131010 131011 Atu5444 Atu5445     TRUE 0.879 58.000 0.378 0.044   NA
 131011 131012 Atu5445 Atu5446     FALSE 0.084 112.000 0.000 1.000   NA
 131012 131013 Atu5446 Atu5447     TRUE 0.756 32.000 0.167 1.000   NA
 131013 131014 Atu5447 Atu5448     FALSE 0.009 236.000 0.000 NA   NA
 131014 131015 Atu5448 Atu5449   hspAT2 FALSE 0.004 301.000 0.000 NA   NA
 131015 131016 Atu5449 Atu5450 hspAT2   FALSE 0.099 63.000 0.000 NA   NA
 131016 131017 Atu5450 Atu5451     FALSE 0.035 138.000 0.000 NA   NA
 131017 131018 Atu5451 Atu5452   attE FALSE 0.004 296.000 0.000 NA   NA
 131018 131019 Atu5452 Atu5453 attE attG TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA N NA
 131019 131020 Atu5453 Atu5454 attG attH TRUE 0.999 -10.000 0.627 NA   NA
 131021 131022 Atu5455 Atu5456     FALSE 0.170 48.000 0.000 NA N NA
 131023 131024 Atu5457 Atu5458 dapA   TRUE 0.999 -3.000 0.250 0.062 Y NA
 131024 131025 Atu5458 Atu5459     TRUE 0.819 25.000 0.200 1.000 N NA
 131025 131026 Atu5459 Atu5460     TRUE 0.984 84.000 1.000 0.092 Y NA
 131026 131027 Atu5460 Atu5461     TRUE 0.997 11.000 1.000 0.092 Y NA
 131027 131028 Atu5461 Atu5462     TRUE 0.988 3.000 0.056 0.092 Y NA
 131028 131029 Atu5462 Atu5463   galE TRUE 0.987 -3.000 0.056 1.000 N NA
 131029 131030 Atu5463 Atu5464 galE   TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 N NA
 131030 131031 Atu5464 Atu5465   fabG TRUE 0.961 4.000 0.182 1.000 N NA
 131035 131036 Atu5469 Atu5470 dinP   FALSE 0.206 18.000 0.000 NA   NA
 131036 131037 Atu5470 Atu5471     FALSE 0.005 270.000 0.000 NA   NA
 3820196 131040 Atu5472 Atu5473 tnp dat FALSE 0.021 174.000 0.000 NA   NA
 131040 131041 Atu5473 Atu5474 dat   TRUE 0.816 62.000 0.043 1.000 Y NA
 131041 131042 Atu5474 Atu5475     TRUE 0.650 32.000 0.072 NA   NA
 131042 131043 Atu5475 Atu5476   pyrG FALSE 0.418 40.000 0.002 NA   NA
 131043 131044 Atu5476 Atu5477 pyrG   TRUE 0.554 27.000 0.002 1.000 N NA
 131044 131045 Atu5477 Atu5478     TRUE 0.991 -3.000 0.125 1.000 N NA
 131045 131047 Atu5478 Atu5479   argE TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 N NA
 131047 131048 Atu5479 Atu5480 argE   TRUE 0.987 14.000 0.600 1.000 Y NA
 131048 131049 Atu5480 Atu5481     TRUE 0.999 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 131049 131050 Atu5481 Atu5482     TRUE 0.992 34.000 1.000 0.092 Y NA
 131054 3820198 Atu5487 Atu5488     FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 3820198 3820199 Atu5488 Atu5489     FALSE 0.033 142.000 0.000 NA   NA
 131055 131056 Atu5490 Atu8052 ecfR   FALSE 0.027 192.000 0.000 1.000   NA
 131056 131057 Atu8052 Atu5491   catE FALSE 0.194 41.000 0.000 1.000   NA
 131057 131058 Atu5491 Atu5492 catE   FALSE 0.082 77.000 0.000 NA   NA
 131058 131059 Atu5492 Atu5493     FALSE 0.167 25.000 0.000 NA   NA
 131060 131061 Atu5494 Atu5495     FALSE 0.002 703.000 0.000 1.000   NA
 131063 131064 Atu5497 Atu5498     FALSE 0.061 128.000 0.000 NA N NA
 131064 131065 Atu5498 Atu5499     TRUE 0.999 -3.000 0.231 0.039 Y NA
 131065 131066 Atu5499 Atu5500     TRUE 0.998 -3.000 0.192 0.039 Y NA
 131067 131068 Atu5501 Atu5502     FALSE 0.049 115.000 0.000 NA   NA
 131068 131069 Atu5502 Atu5503     FALSE 0.055 110.000 0.000 NA   NA
 131070 131071 Atu5504 Atu5505     TRUE 0.660 4.000 0.000 1.000   NA
 131071 131072 Atu5505 Atu5506     TRUE 1.000 -3.000 0.963 1.000 Y NA
 131072 131073 Atu5506 Atu5507   ggt FALSE 0.016 247.000 0.000 1.000 N NA
 131073 131074 Atu5507 Atu5508 ggt gst FALSE 0.107 56.000 0.000 NA   NA
 131076 131077 Atu5509 Atu5510     TRUE 0.999 -16.000 0.304 0.086 Y NA
 131077 131078 Atu5510 Atu5511     FALSE 0.003 323.000 0.000 NA   NA
 131078 131079 Atu5511 Atu5512     FALSE 0.077 85.000 0.000 NA   NA
 131079 131080 Atu5512 Atu5513   cspA TRUE 0.836 117.000 0.714 NA   NA
 3820200 131083 Atu5515 Atu5516     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 131083 131084 Atu5516 Atu5517     FALSE 0.002 368.000 0.000 NA   NA
 131084 131085 Atu5517 Atu5518     FALSE 0.137 36.000 0.000 NA   NA
 131087 131088 Atu5520 Atu5521 acd   TRUE 0.768 27.000 0.138 1.000 N NA
 131088 131089 Atu5521 Atu5522     TRUE 0.936 73.000 0.444 1.000 Y NA
 131089 131090 Atu5522 Atu5523     TRUE 0.999 -3.000 0.556 1.000 Y NA
 131090 131091 Atu5523 Atu5524     TRUE 0.999 2.000 0.818 0.091 Y NA
 131091 131092 Atu5524 Atu5525     TRUE 0.999 0.000 0.900 1.000 Y NA
 131092 131094 Atu5525 Atu5526     FALSE 0.410 109.000 0.057 1.000 N NA
 131094 131095 Atu5526 Atu5527     FALSE 0.257 23.000 0.000 1.000   NA
 131095 131096 Atu5527 Atu5528     FALSE 0.002 740.000 0.000 1.000   NA
 131097 131098 Atu5529 Atu5530 amiC amiR TRUE 0.982 13.000 0.833 NA N NA
 131098 131099 Atu5530 Atu5531 amiR   FALSE 0.011 248.000 0.000 NA N NA
 131099 131100 Atu5531 Atu5532     TRUE 0.735 239.000 0.750 1.000 Y NA
 131100 131101 Atu5532 Atu5533     TRUE 0.998 2.000 0.500 0.091 Y NA
 131101 131102 Atu5533 Atu5534     TRUE 0.988 2.000 0.429 1.000   NA
 131102 131103 Atu5534 Atu5535     TRUE 0.996 0.000 0.500 0.027   NA
 131103 131104 Atu5535 Atu5536     TRUE 0.630 38.000 0.061 1.000   NA
 131106 131107 Atu5537 Atu5538     TRUE 0.996 -3.000 0.364 NA   NA
 131107 131108 Atu5538 Atu5539     FALSE 0.010 226.000 0.000 NA   NA
 131108 3820201 Atu5539 Atu5540     TRUE 0.996 -3.000 0.353 NA   NA
 3820201 131109 Atu5540 Atu5541     TRUE 0.987 -3.000 0.088 NA   NA
 131109 131110 Atu5541 Atu5542     FALSE 0.099 63.000 0.000 NA   NA
 131111 131112 Atu5543 Atu5544     FALSE 0.128 41.000 0.000 NA   NA
 131112 3820202 Atu5544 Atu5545     FALSE 0.023 166.000 0.000 NA   NA
 3820202 131114 Atu5545 Atu8053     FALSE 0.152 30.000 0.000 NA   NA
 131116 131117 Atu5547 Atu5548     FALSE 0.210 35.000 0.000 1.000   NA
 131117 3820203 Atu5548 Atu5549     FALSE 0.099 63.000 0.000 NA   NA
 3820203 130571 Atu5549 Atu5000   repA FALSE 0.045 122.000 0.000 NA   NA
 131153 3820204 Atu6003 Atu8061 rolB   FALSE 0.006 263.000 0.000 NA   NA
 3820204 131154 Atu8061 Atu6004     FALSE 0.020 179.000 0.000 NA   NA
 131154 131155 Atu6004 Atu6005     FALSE 0.002 479.000 0.000 NA   NA
 131155 3820205 Atu6005 Atu6006     FALSE 0.001 592.000 0.000 NA   NA
 131156 131157 Atu6007 Atu6008 mas1 acsx FALSE 0.022 208.000 0.000 1.000   NA
 131160 2152580 Atu6011 Atu6012 tms1 ipt FALSE 0.003 698.000 0.000 1.000 N NA
 2152580 131162 Atu6012 Atu6013 ipt   FALSE 0.001 516.000 0.000 NA   NA
 131163 3820206 Atu6014 Atu8062     FALSE 0.215 17.000 0.000 NA   NA
 3820206 3820207 Atu8062 Atu8054     FALSE 0.001 553.000 0.000 NA   NA
 3820207 131164 Atu8054 Atu6015   nos FALSE 0.416 8.000 0.000 NA   NA
 131164 2152581 Atu6015 Atu6016 nos ocd FALSE 0.002 508.000 0.000 1.000   NA
 2152581 2152582 Atu6016 Atu6017 ocd odh TRUE 0.980 -3.000 0.024 1.000   NA
 2152582 2152583 Atu6017 Atu6018 odh arc FALSE 0.368 77.000 0.011 1.000   NA
 2152583 131168 Atu6018 Atu6019 arc noxA FALSE 0.466 48.000 0.011 1.000   NA
 131168 131169 Atu6019 Atu6020 noxA   TRUE 0.997 -3.000 0.333 0.039   NA
 131169 131170 Atu6020 Atu6021   noxB TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000   NA
 131171 131172 Atu6022 Atu6023 hyuA hyuB TRUE 0.998 4.000 1.000 1.000 Y NA
 131173 131174 Atu6024 Atu6025   nocM TRUE 0.716 115.000 0.400 1.000 N NA
 131174 131175 Atu6025 Atu6026 nocM nocQ TRUE 0.998 2.000 0.625 0.011 Y NA
 131175 2152584 Atu6026 Atu6027 nocQ nocT TRUE 0.889 74.000 0.250 1.000 Y NA
 2152584 2152585 Atu6027 Atu6028 nocT nocP TRUE 0.967 65.000 0.667 1.000 Y NA
 131179 131180 Atu6030 Atu6031   trbI TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA   NA
 131180 2152587 Atu6031 Atu6032 trbI trbH TRUE 0.986 13.000 1.000 NA   NA
 2152587 2152588 Atu6032 Atu6033 trbH trbG TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 2152588 131183 Atu6033 Atu6034 trbG trbF TRUE 0.993 18.000 1.000 NA Y NA
 131183 131184 Atu6034 Atu6035 trbF trbL TRUE 0.994 15.000 1.000 1.000 Y NA
 131184 131185 Atu6035 Atu6036 trbL trbK TRUE 0.999 -6.000 1.000 NA   NA
 131185 131186 Atu6036 Atu6037 trbK trbJ TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 131186 131187 Atu6037 Atu6038 trbJ trbE TRUE 1.000 -28.000 1.000 NA Y NA
 131187 131188 Atu6038 Atu6039 trbE trbD TRUE 0.896 11.000 0.000 NA Y NA
 131188 131189 Atu6039 Atu6040 trbD trbC TRUE 0.995 -7.000 0.000 NA Y NA
 131189 131190 Atu6040 Atu6041 trbC trbB TRUE 1.000 -10.000 1.000 NA Y NA
 131190 131191 Atu6041 Atu6042 trbB traI TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 N NA
 131192 131193 Atu6043 Atu6044 repA repB TRUE 0.831 128.000 0.714 1.000 N NA
 131193 131194 Atu6044 Atu6045 repB repC FALSE 0.012 215.000 0.000 NA   NA
 131197 131198 Atu6048 Atu6049     FALSE 0.023 203.000 0.000 1.000   NA
 131199 131200 Atu6050 Atu6051     TRUE 0.983 9.000 0.667 NA   NA
 131200 131201 Atu6051 Atu6052     FALSE 0.391 168.000 0.286 NA   NA
 131201 2152590 Atu6052 Atu6053     TRUE 0.669 97.000 0.286 NA   NA
 131203 2152591 Atu6054 Atu6055   gcvA FALSE 0.003 324.000 0.000 NA   NA
 2152592 131209 Atu6057 Atu6058 ssuC ssuB TRUE 0.999 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 131209 131210 Atu6058 Atu6059 ssuB ssuA TRUE 0.963 27.000 0.400 1.000 Y NA
 131210 3820208 Atu6059 Atu6060 ssuA   FALSE 0.032 171.000 0.000 NA N NA
 3820208 131212 Atu6060 Atu6061     TRUE 0.997 -3.000 0.133 NA Y NA
 131212 131213 Atu6061 Atu6062   kduD FALSE 0.290 158.000 0.133 NA N NA
 131213 131214 Atu6062 Atu6063 kduD   FALSE 0.457 160.000 0.286 1.000 N NA
 131215 131216 Atu6064 Atu6065 dha   TRUE 0.949 69.000 1.000 NA   NA
 131216 131217 Atu6065 Atu6066   acd FALSE 0.221 140.000 0.040 NA   NA
 131217 131218 Atu6066 Atu6067 acd   FALSE 0.435 54.000 0.019 NA   NA
 131218 2152593 Atu6067 Atu6068   rbsC FALSE 0.143 157.000 0.019 NA   NA
 2152593 131220 Atu6068 Atu6069 rbsC rbsA TRUE 0.997 11.000 1.000 1.000 Y NA
 131220 131221 Atu6069 Atu6070 rbsA rbsB TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 131221 131222 Atu6070 Atu6071 rbsB aiiB FALSE 0.037 134.000 0.000 NA   NA
 131222 131223 Atu6071 Atu6072 aiiB   TRUE 0.572 80.000 0.125 1.000   NA
 131223 131224 Atu6072 Atu6073   dfpA TRUE 0.892 89.000 0.667 1.000 N NA
 131224 131225 Atu6073 Atu6074 dfpA dfpD TRUE 0.918 58.000 0.667 1.000   NA
 131225 131226 Atu6074 Atu6075 dfpD dfpC TRUE 0.996 0.000 0.667 1.000   NA
 131226 2152594 Atu6075 Atu6076 dfpC dfpB TRUE 0.999 0.000 1.000 0.091 Y NA
 2152594 2152595 Atu6076 Atu6077 dfpB   TRUE 0.999 -18.000 0.250 1.000 Y NA
 2152595 131229 Atu6077 Atu6078     TRUE 0.931 11.000 0.250 NA N NA
 131229 131230 Atu6078 Atu6079     TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA Y NA
 2152596 131232 Atu6080 Atu6081     TRUE 0.512 82.000 0.095 NA   NA
 131232 2152597 Atu6081 Atu6082     FALSE 0.015 199.000 0.000 NA   NA
 2152597 131234 Atu6082 Atu6083     TRUE 0.989 4.000 0.565 1.000   NA
 131234 131235 Atu6083 Atu6084     FALSE 0.004 352.000 0.000 1.000   NA
 131235 131236 Atu6084 Atu6085     TRUE 0.827 23.000 0.200 1.000 N NA
 131236 131237 Atu6085 Atu6086   nrtB TRUE 0.923 19.000 0.019 0.091 Y NA
 131237 131238 Atu6086 Atu6087 nrtB nrtC TRUE 0.817 49.000 0.019 1.000 Y NA
 131238 131239 Atu6087 Atu6088 nrtC   TRUE 0.993 -3.000 0.182 1.000 N NA
 131239 131240 Atu6088 Atu6089     TRUE 0.721 32.000 0.125 NA N NA
 131242 131243 Atu6091 Atu6092     TRUE 0.968 14.000 0.667 NA   NA
 131243 131244 Atu6092 Atu6093   dnaE TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 131244 131245 Atu6093 Atu6094 dnaE   FALSE 0.009 235.000 0.000 NA   NA
 131248 131249 Atu6097 Atu6098 fic   TRUE 0.913 -3.000 0.000 1.000   NA
 2152600 131252 Atu6099 Atu6100     FALSE 0.307 12.000 0.000 NA   NA
 131252 131253 Atu6100 Atu6101     FALSE 0.040 129.000 0.000 NA   NA
 131253 131254 Atu6101 Atu6103   parB FALSE 0.072 356.000 0.000 0.036 Y NA
 131254 131255 Atu6103 Atu6104 parB   TRUE 0.638 97.000 0.250 NA   NA
 131255 2152601 Atu6104 Atu6105     TRUE 0.994 -3.000 0.250 NA   NA
 2152601 131258 Atu6105 Atu6106     TRUE 0.996 -3.000 0.375 NA   NA
 131258 131259 Atu6106 Atu6107     TRUE 0.997 -28.000 0.250 NA   NA
 131261 2152602 Atu6109 Atu6110   ardC FALSE 0.004 312.000 0.000 NA   NA
 2152602 131263 Atu6110 Atu6111 ardC   TRUE 0.996 0.000 0.667 NA   NA
 131263 2152603 Atu6111 Atu6112     FALSE 0.003 362.000 0.000 NA   NA
 2152604 131266 Atu6113 Atu6114     TRUE 0.918 14.000 0.333 NA   NA
 131266 131267 Atu6114 Atu6115   apeA FALSE 0.079 81.000 0.000 NA   NA
 131267 2152605 Atu6115 Atu6116 apeA ycf FALSE 0.099 63.000 0.000 NA   NA
 131269 2152606 Atu6117 Atu6119     FALSE 0.002 429.000 0.000 NA   NA
 2152607 131275 Atu6120 Atu6121 hupT ych FALSE 0.034 140.000 0.000 NA   NA
 131275 131277 Atu6121 Atu6122 ych yci FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 131277 131278 Atu6122 Atu6123 yci   TRUE 0.620 153.000 0.500 NA   NA
 131278 131279 Atu6123 Atu6124   traG TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 131279 131280 Atu6124 Atu6125 traG traD TRUE 1.000 -13.000 1.000 1.000   NA
 131280 131281 Atu6125 Atu6126 traD traC TRUE 1.000 -25.000 1.000 NA   NA
 131282 131283 Atu6127 Atu6128 traA traF TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 N NA
 131283 2152608 Atu6128 Atu6129 traF traB TRUE 0.999 -10.000 0.667 0.045   NA
 2152608 131285 Atu6129 Atu6130 traB traH TRUE 0.984 14.000 1.000 NA   NA
 131285 131286 Atu6130 Atu6131 traH traM FALSE 0.001 526.000 0.000 NA   NA
 131287 131288 Atu6132 Atu6133 mcpA   FALSE 0.061 103.000 0.000 NA   NA
 131288 131289 Atu6133 Atu6134   traR TRUE 0.733 30.000 0.154 NA   NA
 131289 2152609 Atu6134 Atu6135 traR   FALSE 0.024 218.000 0.000 1.000 N NA
 2152609 2152610 Atu6135 Atu6136     FALSE 0.219 52.000 0.000 1.000 N NA
 2152610 3820209 Atu6136 Atu6137     FALSE 0.251 14.000 0.000 NA   NA
 2152611 131294 Atu6138 Atu6139 accR accA FALSE 0.204 58.000 0.000 1.000 N NA
 131294 131295 Atu6139 Atu6140 accA accB TRUE 0.729 100.000 0.040 1.000 Y NA
 131295 131296 Atu6140 Atu6141 accB accC TRUE 0.998 -3.000 0.040 0.002 Y NA
 131296 131297 Atu6141 Atu6142 accC accD TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 131297 131298 Atu6142 Atu6143 accD accE TRUE 0.999 -7.000 0.143 0.090 Y NA
 131298 131299 Atu6143 Atu6144 accE accF TRUE 0.861 16.000 0.190 1.000 N NA
 131299 2152612 Atu6144 Atu6145 accF accG TRUE 0.995 -7.000 0.150 1.000 N NA
 2152612 131301 Atu6145 Atu6146 accG   TRUE 0.803 0.000 0.000 1.000   NA
 131301 131302 Atu6146 Atu6147     FALSE 0.186 21.000 0.000 NA   NA
 3820211 131304 Atu6149 Atu6150   virH1 TRUE 0.589 3.000 0.000 NA   NA
 131304 131305 Atu6150 Atu6151 virH1 virH2 TRUE 0.741 77.000 0.000 0.003 Y NA
 131305 3820212 Atu6151 Atu6152 virH2 tnp FALSE 0.011 276.000 0.000 1.000 N NA
 131308 3820214 Atu6154 Atu6155 virF   FALSE 0.002 451.000 0.000 NA   NA
 3820214 3820215 Atu6155 Atu6156   virK FALSE 0.180 22.000 0.000 NA   NA
 3820215 3820216 Atu6156 Atu6157 virK   FALSE 0.123 44.000 0.000 NA   NA
 131310 131311 Atu6158 Atu6159     FALSE 0.039 130.000 0.000 NA   NA
 3820217 3820218 Atu6160 Atu8063 ynh   FALSE 0.005 268.000 0.000 NA   NA
 3820220 131118 Atu6165 Atu6166   virA FALSE 0.003 361.000 0.000 NA   NA
 131118 2152571 Atu6166 Atu6167 virA virB1 FALSE 0.001 545.000 0.000 NA   NA
 2152571 131120 Atu6167 Atu6168 virB1 virB2 TRUE 0.995 0.000 0.600 NA   NA
 131120 131121 Atu6168 Atu6169 virB2 virB3 TRUE 0.997 0.000 0.400 NA Y NA
 131121 131123 Atu6169 Atu6170 virB3 virB4 TRUE 0.998 0.000 0.600 NA Y NA
 131123 131124 Atu6170 Atu6171 virB4 virB5 TRUE 0.964 17.000 0.667 1.000   NA
 131124 2152572 Atu6171 Atu6172 virB5 virB6 TRUE 0.806 101.000 0.500 1.000   NA
 2152572 3820221 Atu6172 Atu6173 virB6 virB7 TRUE 0.869 36.000 0.375 1.000   NA
 3820221 2152573 Atu6173 Atu6174 virB7 virB8 TRUE 0.999 -13.000 0.600 NA   NA
 2152573 131128 Atu6174 Atu6175 virB8 virB9 TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA Y NA
 131128 131129 Atu6175 Atu6176 virB9 virB10 TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA Y NA
 131129 2152574 Atu6176 Atu6177 virB10 virB11 TRUE 0.976 41.000 0.667 1.000 Y NA
 2152574 131131 Atu6177 Atu6178 virB11 virG FALSE 0.023 219.000 0.000 1.000 N NA
 131132 131133 Atu6179 Atu6180 virC2 virC1 TRUE 0.981 3.000 0.357 NA   NA
 2152575 131135 Atu6181 Atu6182 virD1 virD2 TRUE 0.953 34.000 0.800 NA   NA
 131135 131136 Atu6182 Atu6183 virD2 virD3 TRUE 0.927 15.000 0.400 NA   NA
 131136 2152576 Atu6183 Atu6184 virD3 virD4 TRUE 0.757 74.000 0.333 NA   NA
 2152576 131138 Atu6184 Atu6185 virD4 virD5 TRUE 0.651 112.000 0.333 NA   NA
 131138 3820222 Atu6185 Atu6186 virD5 virE3 FALSE 0.091 70.000 0.000 NA   NA
 3820222 131140 Atu6186 Atu6188 virE3 virE0 FALSE 0.002 452.000 0.000 NA   NA
 131140 131141 Atu6188 Atu6189 virE0 virE1 FALSE 0.048 116.000 0.000 NA   NA
 131141 131142 Atu6189 Atu6190 virE1 virE2 TRUE 0.974 14.000 0.750 NA   NA
 131142 131143 Atu6190 Atu6191 virE2 virE3 TRUE 0.855 67.000 0.500 NA   NA
 3820223 131146 Atu6192 Atu6193 trlP   TRUE 0.928 -24.000 0.000 NA   NA
 131146 131147 Atu6193 Atu6194     TRUE 0.711 24.000 0.091 NA   NA
 131147 3820224 Atu6194 Atu6195     TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 3820224 131148 Atu6195 Atu6196   accG FALSE 0.215 17.000 0.000 NA   NA
 131148 131149 Atu6196 Atu6197 accG accF FALSE 0.127 42.000 0.000 NA   NA
 131149 2152579 Atu6197 Atu6000 accF torf6 FALSE 0.001 865.000 0.000 NA   NA