MicrobesOnline Operon Predictions for Desulfobacterium autotrophicum HRM2

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5907317 5907318 HRM2_00010 HRM2_00020 dnaN gyrB TRUE 0.996 14.000 0.114 1.000 Y NA
 5907319 5907320 HRM2_00030 HRM2_00040   tonB TRUE 0.993 8.000 0.100 1.000   NA
 5907320 5907321 HRM2_00040 HRM2_00050 tonB exbD TRUE 0.876 141.000 0.200 1.000 N NA
 5907321 5907322 HRM2_00050 HRM2_00060 exbD tolQ2 TRUE 1.000 16.000 0.750 0.077 Y NA
 5907322 5907323 HRM2_00060 HRM2_00070 tolQ2 tolQ3 TRUE 0.999 39.000 0.667 0.011 Y NA
 5907323 5907324 HRM2_00070 HRM2_00080 tolQ3   TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5907326 5907327 HRM2_00100 HRM2_00110     FALSE 0.196 107.000 0.000 NA   NA
 5907328 5907329 HRM2_00120 HRM2_00130   xerD1 FALSE 0.078 427.000 0.000 0.063 Y NA
 5907329 5907330 HRM2_00130 HRM2_00140 xerD1 hmrR1 TRUE 0.934 -18.000 0.000 0.012   NA
 5907330 5907331 HRM2_00140 HRM2_00150 hmrR1   TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.063   NA
 5907331 5907332 HRM2_00150 HRM2_00160     FALSE 0.008 504.000 0.000 NA   NA
 5907332 5907333 HRM2_00160 HRM2_00170     FALSE 0.184 112.000 0.000 NA   NA
 5907333 5907334 HRM2_00170 HRM2_00180   cbiC FALSE 0.056 198.000 0.000 NA   NA
 5907334 5907335 HRM2_00180 HRM2_00190 cbiC cbiA1 TRUE 0.997 -52.000 0.061 0.010 Y NA
 5907335 5907336 HRM2_00190 HRM2_00200 cbiA1 cbiD TRUE 0.999 -3.000 0.043 0.010 Y NA
 5907336 5907337 HRM2_00200 HRM2_00210 cbiD nthA TRUE 0.895 4.000 0.000 1.000 N NA
 5907337 5907338 HRM2_00210 HRM2_00220 nthA   FALSE 0.050 219.000 0.000 1.000   NA
 5907338 5907339 HRM2_00220 HRM2_00230   norM FALSE 0.041 237.000 0.000 1.000   NA
 5907339 5907340 HRM2_00230 HRM2_00240 norM   FALSE 0.026 270.000 0.000 NA   NA
 5907341 5907342 HRM2_00250 HRM2_00260   malT FALSE 0.082 169.000 0.000 NA   NA
 5907342 5907343 HRM2_00260 HRM2_00270 malT   TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 5907343 5907344 HRM2_00270 HRM2_00280     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.091 Y NA
 5907344 5907345 HRM2_00280 HRM2_00290     TRUE 1.000 -3.000 0.786 NA N NA
 5907347 5907348 HRM2_00310 HRM2_00320     TRUE 0.994 0.000 0.021 NA   NA
 5907348 5907349 HRM2_00320 HRM2_00330     TRUE 0.912 -9.000 0.000 NA   NA
 5907349 5907350 HRM2_00330 HRM2_00340     TRUE 0.998 -3.000 0.036 0.062 N NA
 5907350 5907351 HRM2_00340 HRM2_00350     TRUE 0.998 4.000 0.217 0.062   NA
 5907351 5907352 HRM2_00350 HRM2_00360     TRUE 0.985 -88.000 0.100 1.000   NA
 5907352 5907353 HRM2_00360 HRM2_00370     TRUE 0.996 -15.000 0.122 NA   NA
 5907356 5907357 HRM2_00400 HRM2_00410 rlgA1   FALSE 0.307 77.000 0.000 NA   NA
 5907357 5907358 HRM2_00410 HRM2_00420     FALSE 0.336 71.000 0.000 NA   NA
 5907358 5907359 HRM2_00420 HRM2_00430   silP TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5907360 5907361 HRM2_00440 HRM2_00450   rndA TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5907361 5907362 HRM2_00450 HRM2_00460 rndA rndB TRUE 0.993 13.000 0.200 1.000 N NA
 5907362 5907363 HRM2_00460 HRM2_00470 rndB   TRUE 0.875 26.000 0.000 1.000 Y NA
 5907363 5907364 HRM2_00470 HRM2_00480     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.062 Y NA
 5907365 5907366 HRM2_00490 HRM2_00500 mttB1   TRUE 0.423 51.000 0.000 1.000 N NA
 5907366 5907367 HRM2_00500 HRM2_00510   mttC FALSE 0.013 399.000 0.000 1.000   NA
 5907367 5907368 HRM2_00510 HRM2_00520 mttC metH1 TRUE 0.820 19.000 0.000 0.004   NA
 5907368 5907369 HRM2_00520 HRM2_00530 metH1   FALSE 0.014 383.000 0.000 1.000   NA
 5907371 5907372 HRM2_00550 HRM2_00560     TRUE 0.458 38.000 0.000 NA   NA
 5907373 5907374 HRM2_00570 HRM2_00580     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 5907374 5907375 HRM2_00580 HRM2_00590     TRUE 1.000 -19.000 0.465 1.000 Y NA
 5907377 5907378 HRM2_00610 HRM2_00620 ytfE   FALSE 0.374 52.000 0.000 NA N NA
 5907378 5907379 HRM2_00620 HRM2_00630   narI TRUE 0.977 -61.000 0.049 1.000 N NA
 5907379 5907380 HRM2_00630 HRM2_00640 narI narJ TRUE 0.999 30.000 0.667 0.002 Y NA
 5907380 5907381 HRM2_00640 HRM2_00650 narJ narH TRUE 0.999 23.000 0.667 0.002 Y NA
 5907381 5907382 HRM2_00650 HRM2_00660 narH narG TRUE 1.000 -10.000 1.000 0.001 Y NA
 5907383 5907384 HRM2_00670 HRM2_00680   hlyD TRUE 0.999 -3.000 0.158 1.000 N NA
 5907384 5907385 HRM2_00680 HRM2_00690 hlyD   TRUE 1.000 -3.000 0.842 NA   NA
 5907385 5907386 HRM2_00690 HRM2_00700     TRUE 1.000 2.000 0.827 NA   NA
 5907386 5907387 HRM2_00700 HRM2_00710     TRUE 0.958 46.000 0.106 1.000 N NA
 5907388 5907389 HRM2_00720 HRM2_00730     TRUE 0.501 30.000 0.000 NA   NA
 5907389 5907390 HRM2_00730 HRM2_00740     FALSE 0.008 473.000 0.000 NA   NA
 5907391 5907392 HRM2_00750 HRM2_00760     FALSE 0.006 655.000 0.000 NA   NA
 5907392 5907393 HRM2_00760 HRM2_00770     FALSE 0.061 193.000 0.000 NA   NA
 5907393 5907394 HRM2_00770 HRM2_00780     FALSE 0.026 286.000 0.000 1.000   NA
 5907396 5907397 HRM2_00800 HRM2_00810   hdrD1 FALSE 0.007 606.000 0.000 1.000 N NA
 5907398 5907399 HRM2_00820 HRM2_00830     TRUE 0.986 40.000 0.091 1.000 Y NA
 5907399 5907400 HRM2_00830 HRM2_00840     TRUE 0.463 37.000 0.000 NA   NA
 5907402 5907403 HRM2_00860 HRM2_00870 nnrR   FALSE 0.035 255.000 0.000 1.000   NA
 5907403 5907404 HRM2_00870 HRM2_00880   napC TRUE 0.443 42.000 0.000 NA   NA
 5907406 5907407 HRM2_00900 HRM2_00910     TRUE 1.000 -3.000 0.909 NA N NA
 5907407 5907408 HRM2_00910 HRM2_00920     TRUE 0.996 46.000 0.429 1.000 Y NA
 5907408 5907409 HRM2_00920 HRM2_00930     TRUE 0.589 23.000 0.000 1.000 N NA
 5907409 5907410 HRM2_00930 HRM2_00940     TRUE 0.967 1.000 0.000 0.050   NA
 5907410 5907411 HRM2_00940 HRM2_00950   fdx1 TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5907413 5907414 HRM2_00970 HRM2_00980 prsA1   TRUE 0.438 54.000 0.000 1.000   NA
 5907414 5907415 HRM2_00980 HRM2_00990     FALSE 0.283 92.000 0.000 1.000   NA
 5907416 5907417 HRM2_01000 HRM2_01010     TRUE 0.999 15.000 0.500 1.000 Y NA
 5907417 5907418 HRM2_01010 HRM2_01020     TRUE 1.000 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 5907418 5907419 HRM2_01020 HRM2_01030     FALSE 0.025 1120.000 0.000 1.000 Y NA
 5907419 5907420 HRM2_01030 HRM2_01040     TRUE 1.000 -22.000 0.667 1.000 Y NA
 5907420 5907421 HRM2_01040 HRM2_01050     TRUE 1.000 0.000 0.667 1.000 Y NA
 5907421 5907422 HRM2_01050 HRM2_01060     FALSE 0.257 99.000 0.000 1.000   NA
 5907422 5907423 HRM2_01060 HRM2_01070     FALSE 0.134 133.000 0.000 NA   NA
 5907424 5907425 HRM2_01080 HRM2_01090     FALSE 0.094 159.000 0.000 NA   NA
 5907426 5907427 HRM2_01100 HRM2_01110     FALSE 0.024 279.000 0.000 NA   NA
 5907427 5907428 HRM2_01110 HRM2_01120     FALSE 0.049 205.000 0.000 NA   NA
 5907428 5907429 HRM2_01120 HRM2_01130     FALSE 0.023 284.000 0.000 NA   NA
 5907429 5907430 HRM2_01130 HRM2_01140     FALSE 0.078 172.000 0.000 NA   NA
 5907430 5907431 HRM2_01140 HRM2_01150   fdx2 FALSE 0.072 180.000 0.000 NA   NA
 5907431 5907432 HRM2_01150 HRM2_01160 fdx2   TRUE 0.994 3.000 0.050 NA   NA
 5907432 5907433 HRM2_01160 HRM2_01170     TRUE 1.000 1.000 0.500 0.074   NA
 5907433 5907434 HRM2_01170 HRM2_01180     FALSE 0.009 455.000 0.000 NA   NA
 5907434 5907435 HRM2_01180 HRM2_01190   ilvD1 FALSE 0.172 119.000 0.000 NA   NA
 5907435 5907436 HRM2_01190 HRM2_01200 ilvD1   FALSE 0.008 486.000 0.000 1.000 N NA
 5907436 5907437 HRM2_01200 HRM2_01210     FALSE 0.047 217.000 0.000 1.000 N NA
 5907438 5907439 HRM2_01220 HRM2_01230 betL   FALSE 0.371 72.000 0.000 1.000   NA
 5907439 5907440 HRM2_01230 HRM2_01240   betT FALSE 0.029 278.000 0.000 1.000   NA
 5907440 5907441 HRM2_01240 HRM2_01250 betT mttB2 TRUE 0.423 51.000 0.000 1.000 N NA
 5907441 5907442 HRM2_01250 HRM2_01260 mttB2   FALSE 0.015 349.000 0.000 1.000 N NA
 5907442 5907443 HRM2_01260 HRM2_01270     TRUE 1.000 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 5907443 5907444 HRM2_01270 HRM2_01280     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5907444 5907445 HRM2_01280 HRM2_01290     FALSE 0.013 364.000 0.000 NA   NA
 5907446 5907447 HRM2_01300 HRM2_01310     FALSE 0.040 224.000 0.000 NA   NA
 5907447 5907448 HRM2_01310 HRM2_01320     TRUE 0.826 -22.000 0.000 NA   NA
 5907448 5907449 HRM2_01320 HRM2_01330     TRUE 0.433 104.000 0.000 0.002   NA
 5907449 5907450 HRM2_01330 HRM2_01340     FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5907452 5907453 HRM2_01360 HRM2_01370 furA catA TRUE 0.722 78.000 0.000 1.000 Y NA
 5907454 5907455 HRM2_01380 HRM2_01390 ubiE2 speB TRUE 0.513 31.000 0.000 1.000 N NA
 5907455 5907456 HRM2_01390 HRM2_01400 speB nspC TRUE 0.958 71.000 0.035 1.000 Y NA
 5907456 5907457 HRM2_01400 HRM2_01410 nspC lysA1 TRUE 0.999 -21.000 0.444 1.000 Y NA
 5907457 5907458 HRM2_01410 HRM2_01420 lysA1 speA TRUE 0.972 60.000 0.052 1.000 Y NA
 5907459 5907460 HRM2_01430 HRM2_01440     FALSE 0.394 54.000 0.000 NA   NA
 5907460 5907461 HRM2_01440 HRM2_01450     FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 5907461 5907462 HRM2_01450 HRM2_01460     FALSE 0.015 337.000 0.000 NA   NA
 5907462 5907463 HRM2_01460 HRM2_01470   msrA FALSE 0.312 76.000 0.000 NA   NA
 5907463 5907464 HRM2_01470 HRM2_01480 msrA   FALSE 0.121 133.000 0.000 NA N NA
 5907467 5907468 HRM2_01510 HRM2_01520     TRUE 0.997 5.000 0.171 1.000   NA
 5907468 5907469 HRM2_01520 HRM2_01530   bioB1 TRUE 0.997 -3.000 0.058 1.000 N NA
 5907469 5907470 HRM2_01530 HRM2_01540 bioB1   TRUE 0.823 -28.000 0.000 1.000 N NA
 5907470 5907471 HRM2_01540 HRM2_01550     TRUE 0.999 -6.000 0.111 1.000 Y NA
 5907471 5907472 HRM2_01550 HRM2_01560     TRUE 0.859 27.000 0.000 NA Y NA
 5907472 5907473 HRM2_01560 HRM2_01570     FALSE 0.403 45.000 0.000 NA N NA
 5907473 5907474 HRM2_01570 HRM2_01580   fdx3 TRUE 0.992 13.000 0.167 1.000 N NA
 5907474 5907475 HRM2_01580 HRM2_01590 fdx3 hydA1 TRUE 1.000 -7.000 0.417 0.021   NA
 5907475 5907476 HRM2_01590 HRM2_01600 hydA1 fdhB1 TRUE 0.982 96.000 0.400 0.021   NA
 5907476 5907477 HRM2_01600 HRM2_01610 fdhB1 fdhA1 TRUE 0.999 -7.000 0.400 0.074   NA
 5907479 5907480 HRM2_01630 HRM2_01640     TRUE 0.991 12.000 0.128 NA   NA
 5907482 5907483 HRM2_01660 HRM2_01670     TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5907483 5907484 HRM2_01670 HRM2_01680     FALSE 0.258 90.000 0.000 NA   NA
 5907484 5907485 HRM2_01680 HRM2_01690     TRUE 1.000 0.000 0.882 0.062 N NA
 5907485 5907486 HRM2_01690 HRM2_01700   modA3 TRUE 0.827 -27.000 0.000 1.000 N NA
 5907489 5907490 HRM2_01730 HRM2_01740     TRUE 0.619 102.000 0.000 1.000 Y NA
 5907490 5907491 HRM2_01740 HRM2_01750   pstC1 FALSE 0.341 73.000 0.000 1.000 N NA
 5907491 5907492 HRM2_01750 HRM2_01760 pstC1 pstA1 TRUE 1.000 -7.000 0.485 0.002 Y NA
 5907492 5907493 HRM2_01760 HRM2_01770 pstA1 pstS1 TRUE 0.958 41.000 0.012 NA Y NA
 5907493 5907494 HRM2_01770 HRM2_01780 pstS1   FALSE 0.267 81.000 0.000 NA N NA
 5907494 5907495 HRM2_01780 HRM2_01790   pstS2 TRUE 0.468 36.000 0.000 NA   NA
 5907495 5907496 HRM2_01790 HRM2_01800 pstS2 pstB1 TRUE 0.701 121.000 0.026 NA   NA
 5907496 5907497 HRM2_01800 HRM2_01810 pstB1 phoU1 TRUE 0.931 14.000 0.000 NA Y NA
 5907497 5907498 HRM2_01810 HRM2_01820 phoU1   FALSE 0.029 243.000 0.000 NA N NA
 5907498 5907499 HRM2_01820 HRM2_01830   ptsA1 TRUE 0.503 38.000 0.000 1.000   NA
 5907500 5907501 HRM2_01840 HRM2_01850     FALSE 0.286 82.000 0.000 NA   NA
 5907503 5907504 HRM2_01870 HRM2_01880   phoA FALSE 0.271 490.000 0.188 NA   NA
 5907505 5907506 HRM2_01890 HRM2_01900   psdD TRUE 0.979 25.000 0.143 NA   NA
 5907506 5907507 HRM2_01900 HRM2_01910 psdD   TRUE 0.999 0.000 0.143 1.000   NA
 5907507 5907508 HRM2_01910 HRM2_01920     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5907509 5907510 HRM2_01930 HRM2_01940 dksA1   FALSE 0.253 91.000 0.000 NA   NA
 5907510 5907511 HRM2_01940 HRM2_01950     FALSE 0.041 221.000 0.000 NA   NA
 5907512 5907513 HRM2_01960 HRM2_01970     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5907513 5907514 HRM2_01970 HRM2_01980     TRUE 0.976 10.000 0.000 0.009 Y NA
 5907517 5907518 HRM2_02010 HRM2_02020 fdx4 aor1 TRUE 0.419 179.000 0.000 0.044 Y NA
 5907518 5907519 HRM2_02020 HRM2_02030 aor1 adh3 TRUE 0.829 41.000 0.000 1.000 Y NA
 5907519 5907520 HRM2_02030 HRM2_02040 adh3 adh5 TRUE 0.967 -52.000 0.000 0.014 Y NA
 5907520 5907521 HRM2_02040 HRM2_02050 adh5   FALSE 0.294 80.000 0.000 NA   NA
 5907521 5907522 HRM2_02050 HRM2_02060     FALSE 0.134 133.000 0.000 NA   NA
 5907523 5907524 HRM2_02070 HRM2_02080     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5907525 5907526 HRM2_02090 HRM2_02100     TRUE 0.633 17.000 0.000 NA N NA
 5907526 5907527 HRM2_02100 HRM2_02110     TRUE 0.964 9.000 0.000 1.000 Y NA
 5907527 5907528 HRM2_02110 HRM2_02120     TRUE 0.535 124.000 0.000 1.000 Y NA
 5907529 5907530 HRM2_02130 HRM2_02140   hcp1 TRUE 0.575 27.000 0.000 1.000   NA
 5907531 5907532 HRM2_02150 HRM2_02160     FALSE 0.027 266.000 0.000 NA   NA
 5907532 5907533 HRM2_02160 HRM2_02170     FALSE 0.030 252.000 0.000 NA   NA
 5907533 5907534 HRM2_02170 HRM2_02180     FALSE 0.007 521.000 0.000 NA   NA
 5907534 5907535 HRM2_02180 HRM2_02190     TRUE 0.999 0.000 0.273 1.000   NA
 5907535 5907536 HRM2_02190 HRM2_02200     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 5907536 5907537 HRM2_02200 HRM2_02210     FALSE 0.037 231.000 0.000 NA   NA
 5907539 5907540 HRM2_02230 HRM2_02240 cobU cobQ TRUE 0.981 25.000 0.031 1.000 Y NA
 5907540 5907541 HRM2_02240 HRM2_02250 cobQ cobO TRUE 0.999 -3.000 0.003 0.010 Y NA
 5907541 5907542 HRM2_02250 HRM2_02260 cobO cobJ TRUE 0.955 16.000 0.000 0.010 Y NA
 5907542 5907543 HRM2_02260 HRM2_02270 cobJ cbiG TRUE 0.999 -135.000 0.352 0.010 Y NA
 5907543 5907544 HRM2_02270 HRM2_02280 cbiG cobM TRUE 1.000 -3.000 0.397 0.010 Y NA
 5907544 5907545 HRM2_02280 HRM2_02290 cobM cobL TRUE 0.999 -3.000 0.029 0.010 Y NA
 5907545 5907546 HRM2_02290 HRM2_02300 cobL   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5907546 5907547 HRM2_02300 HRM2_02310   cbiL TRUE 0.993 -3.000 0.005 NA   NA
 5907547 5907548 HRM2_02310 HRM2_02320 cbiL   TRUE 0.831 67.000 0.012 1.000 N NA
 5907548 5907549 HRM2_02320 HRM2_02330     TRUE 0.997 -61.000 0.140 1.000 Y NA
 5907549 5907550 HRM2_02330 HRM2_02340     TRUE 0.998 9.000 0.157 1.000 Y NA
 5907552 5907553 HRM2_02360 HRM2_02370     FALSE 0.193 103.000 0.000 NA N NA
 5907553 5907554 HRM2_02370 HRM2_02380     TRUE 1.000 -10.000 0.909 NA N NA
 5907554 5907555 HRM2_02380 HRM2_02390     TRUE 0.998 24.000 0.429 1.000 Y NA
 5907557 5907558 HRM2_02410 HRM2_02420     TRUE 0.998 -7.000 0.023 0.090 Y NA
 5907560 5907561 HRM2_02440 HRM2_02450 phoU2 pstB2 TRUE 0.998 11.000 0.231 NA Y NA
 5907561 5907562 HRM2_02450 HRM2_02460 pstB2 pstA2 TRUE 0.999 0.000 0.016 0.002 Y NA
 5907562 5907563 HRM2_02460 HRM2_02470 pstA2 pstC2 TRUE 1.000 1.000 0.198 0.002 Y NA
 5907563 5907564 HRM2_02470 HRM2_02480 pstC2 pstS3 TRUE 0.999 0.000 0.044 1.000 Y NA
 5907564 5907565 HRM2_02480 HRM2_02490 pstS3   FALSE 0.319 78.000 0.000 1.000 N NA
 5907565 5907566 HRM2_02490 HRM2_02500     TRUE 0.984 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5907566 5907567 HRM2_02500 HRM2_02510     TRUE 0.998 7.000 0.154 NA Y NA
 5907567 5907568 HRM2_02510 HRM2_02520     FALSE 0.294 80.000 0.000 NA   NA
 5907568 5907569 HRM2_02520 HRM2_02530   panB TRUE 0.997 -3.000 0.055 1.000   NA
 5907570 5907571 HRM2_02540 HRM2_02550 hisS aspS TRUE 1.000 -7.000 0.161 0.037 Y NA
 5907571 5907572 HRM2_02550 HRM2_02560 aspS xpt TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5907572 5907573 HRM2_02560 HRM2_02570 xpt   TRUE 0.841 7.000 0.000 NA   NA
 5907574 5907575 HRM2_02580 HRM2_02590 minE minD1 TRUE 0.999 11.000 0.347 NA Y NA
 5907575 5907576 HRM2_02590 HRM2_02600 minD1 minC TRUE 0.995 57.000 0.368 1.000 Y NA
 5907576 5907577 HRM2_02600 HRM2_02610 minC   FALSE 0.095 163.000 0.000 1.000 N NA
 5907577 5907578 HRM2_02610 HRM2_02620     TRUE 0.910 28.000 0.000 0.040 Y NA
 5907578 5907579 HRM2_02620 HRM2_02630     TRUE 0.874 6.000 0.000 1.000   NA
 5907579 5907580 HRM2_02630 HRM2_02640     TRUE 0.975 -22.000 0.010 NA   NA
 5907581 5907582 HRM2_02650 HRM2_02660   ksgA TRUE 0.994 -3.000 0.008 NA   NA
 5907582 5907583 HRM2_02660 HRM2_02670 ksgA   TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5907583 5907584 HRM2_02670 HRM2_02680     TRUE 0.538 28.000 0.000 1.000 N NA
 5907584 5907585 HRM2_02680 HRM2_02690   moeA1 TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5907585 5907586 HRM2_02690 HRM2_02700 moeA1 moeA2 TRUE 0.765 929.000 0.481 0.004 Y NA
 5907587 5907588 HRM2_02710 HRM2_02720 gltA1   FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 5907588 5907589 HRM2_02720 HRM2_02730   recN FALSE 0.253 91.000 0.000 NA   NA
 5907589 5907590 HRM2_02730 HRM2_02740 recN   TRUE 0.767 -43.000 0.000 NA   NA
 5907590 5907591 HRM2_02740 HRM2_02750   livF1 TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5907591 5907592 HRM2_02750 HRM2_02760 livF1 livG1 TRUE 1.000 -7.000 0.381 0.032 Y NA
 5907592 5907593 HRM2_02760 HRM2_02770 livG1 livM1 TRUE 1.000 -3.000 0.381 1.000 Y NA
 5907593 5907594 HRM2_02770 HRM2_02780 livM1 livH1 TRUE 1.000 16.000 0.882 0.061 Y NA
 5907594 5907595 HRM2_02780 HRM2_02790 livH1 livJ1 TRUE 0.992 126.000 0.667 1.000 Y NA
 5907597 5907598 HRM2_02810 HRM2_02820     TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5907598 5907599 HRM2_02820 HRM2_02830   fixL FALSE 0.331 72.000 0.000 NA   NA
 5907600 5907601 HRM2_02840 HRM2_02850     TRUE 0.898 -13.000 0.000 1.000   NA
 5907601 5907602 HRM2_02850 HRM2_02860     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5907602 5907603 HRM2_02860 HRM2_02870     FALSE 0.018 309.000 0.000 NA   NA
 5907603 5907604 HRM2_02870 HRM2_02880     FALSE 0.394 54.000 0.000 NA   NA
 5907605 5907606 HRM2_02890 HRM2_02900     FALSE 0.199 106.000 0.000 NA   NA
 5907606 5907607 HRM2_02900 HRM2_02910     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5907609 5907610 HRM2_02930 HRM2_02940     TRUE 0.848 -18.000 0.000 NA   NA
 5907610 5907611 HRM2_02940 HRM2_02950     TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5907613 5907614 HRM2_02970 HRM2_02980 etfA1 etfB1 TRUE 1.000 -3.000 0.500 0.021 Y NA
 5907615 5907616 HRM2_02990 HRM2_03000 pncB   FALSE 0.198 111.000 0.000 1.000 N NA
 5907616 5907617 HRM2_03000 HRM2_03010     TRUE 0.589 23.000 0.000 1.000 N NA
 5907617 5907618 HRM2_03010 HRM2_03020     TRUE 0.950 64.000 0.115 1.000 N NA
 5907618 5907619 HRM2_03020 HRM2_03030     TRUE 0.991 -9.000 0.021 NA   NA
 5907619 5907620 HRM2_03030 HRM2_03040     TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 5907620 5907621 HRM2_03040 HRM2_03050   fabG1 TRUE 0.937 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5907621 5907622 HRM2_03050 HRM2_03060 fabG1   FALSE 0.081 340.000 0.000 1.000 Y NA
 5907622 5907623 HRM2_03060 HRM2_03070     TRUE 0.600 44.000 0.000 0.073 N NA
 5907623 5907624 HRM2_03070 HRM2_03080     TRUE 0.406 91.000 0.000 0.049 N NA
 5907624 5907625 HRM2_03080 HRM2_03090   fabG2 TRUE 0.821 70.000 0.000 0.049 Y NA
 5907626 5907627 HRM2_03100 HRM2_03110   racD1 FALSE 0.302 82.000 0.000 1.000 N NA
 5907627 5907628 HRM2_03110 HRM2_03120 racD1   FALSE 0.170 111.000 0.000 NA N NA
 5907628 5907629 HRM2_03120 HRM2_03130     TRUE 0.553 22.000 0.000 NA N NA
 5907629 5907630 HRM2_03130 HRM2_03140   hisD1 TRUE 0.753 13.000 0.000 1.000 N NA
 5907630 5907631 HRM2_03140 HRM2_03150 hisD1 dctM1 FALSE 0.064 195.000 0.000 1.000 N NA
 5907631 5907632 HRM2_03150 HRM2_03160 dctM1 dctQ1 TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA Y NA
 5907632 5907633 HRM2_03160 HRM2_03170 dctQ1 dctP1 TRUE 0.998 58.000 0.769 NA Y NA
 5907633 5907634 HRM2_03170 HRM2_03180 dctP1   TRUE 0.728 -60.000 0.000 NA   NA
 5907634 5907635 HRM2_03180 HRM2_03190   hdrF1' FALSE 0.007 530.000 0.000 NA   NA
 5907635 5907636 HRM2_03190 HRM2_03200 hdrF1' hdrF1 TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.006   NA
 5907636 5907637 HRM2_03200 HRM2_03210 hdrF1 glpB1 TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5907637 5907638 HRM2_03210 HRM2_03220 glpB1 glpA1 TRUE 1.000 -3.000 0.650 0.002 N NA
 5907639 5907640 HRM2_03230 HRM2_03240   fadH FALSE 0.325 73.000 0.000 NA   NA
 5907641 5907642 HRM2_03250 HRM2_03260   gdhA1 FALSE 0.105 155.000 0.000 1.000 N NA
 5907642 5907643 HRM2_03260 HRM2_03270 gdhA1 ppsA1 TRUE 0.996 4.000 0.108 1.000   NA
 5907644 5907645 HRM2_03280 HRM2_03290     TRUE 0.483 33.000 0.000 NA   NA
 5907645 5907646 HRM2_03290 HRM2_03300   glgB1 TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5907646 5907647 HRM2_03300 HRM2_03310 glgB1   TRUE 0.415 61.000 0.000 1.000   NA
 5907647 5907648 HRM2_03310 HRM2_03320   argT FALSE 0.128 279.000 0.000 1.000 Y NA
 5907648 5907649 HRM2_03320 HRM2_03330 argT   TRUE 0.996 58.000 0.378 0.075 Y NA
 5907649 5907650 HRM2_03330 HRM2_03340   glnQ1 TRUE 1.000 3.000 0.600 1.000 Y NA
 5907650 5907651 HRM2_03340 HRM2_03350 glnQ1 glnP1 TRUE 1.000 -3.000 0.643 1.000 Y NA
 5907654 5907655 HRM2_03380 HRM2_03390     FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5907656 5907657 HRM2_03400 HRM2_03410 colR colS TRUE 1.000 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 5907659 5907660 HRM2_03430 HRM2_03440 fdhA2 fdhB2 TRUE 0.997 84.000 0.615 0.005 Y NA
 5907660 5907661 HRM2_03440 HRM2_03450 fdhB2 fdhE1 TRUE 0.967 142.000 0.462 0.005   NA
 5907662 5907663 HRM2_03460 HRM2_03470     TRUE 0.989 60.000 0.536 NA   NA
 5907663 5907664 HRM2_03470 HRM2_03480     FALSE 0.040 240.000 0.000 1.000   NA
 5907664 5907665 HRM2_03480 HRM2_03490     TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5907665 5907666 HRM2_03490 HRM2_03500   ppsA2 FALSE 0.128 187.000 0.000 0.089   NA
 5907668 5907669 HRM2_03520 HRM2_03530     FALSE 0.232 101.000 0.000 1.000 N NA
 5907669 5907670 HRM2_03530 HRM2_03540     FALSE 0.010 414.000 0.000 NA   NA
 5907670 5907671 HRM2_03540 HRM2_03550   eutC TRUE 0.404 51.000 0.000 NA   NA
 5907671 5907672 HRM2_03550 HRM2_03560 eutC eutB TRUE 1.000 -3.000 0.859 0.001 Y NA
 5907674 5907675 HRM2_03580 HRM2_03590     TRUE 0.772 13.000 0.000 1.000   NA
 5907675 5907676 HRM2_03590 HRM2_03600     FALSE 0.031 268.000 0.000 1.000   NA
 5907676 5907677 HRM2_03600 HRM2_03610     FALSE 0.007 620.000 0.000 1.000   NA
 5907677 5907678 HRM2_03610 HRM2_03620   algI1 FALSE 0.068 185.000 0.000 NA   NA
 5907680 5907681 HRM2_03640 HRM2_03650 aldA   FALSE 0.031 255.000 0.000 1.000 N NA
 5907681 5907682 HRM2_03650 HRM2_03660     FALSE 0.035 225.000 0.000 NA N NA
 5907682 5907683 HRM2_03660 HRM2_03670     FALSE 0.005 710.000 0.000 NA   NA
 5907683 5907684 HRM2_03670 HRM2_03680     FALSE 0.361 64.000 0.000 NA   NA
 5907684 5907685 HRM2_03680 HRM2_03690     FALSE 0.243 94.000 0.000 NA   NA
 5907687 5907688 HRM2_03710 HRM2_03720 ompA1   TRUE 0.489 32.000 0.000 NA   NA
 5907688 5907689 HRM2_03720 HRM2_03730     FALSE 0.008 485.000 0.000 NA   NA
 5907689 5907690 HRM2_03730 HRM2_03740     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5907690 5907691 HRM2_03740 HRM2_03750     FALSE 0.008 465.000 0.000 NA N NA
 5907691 5907692 HRM2_03750 HRM2_03760     TRUE 0.803 45.000 0.000 NA Y NA
 5907692 5907693 HRM2_03760 HRM2_03770     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5907693 5907694 HRM2_03770 HRM2_03780     FALSE 0.012 378.000 0.000 NA   NA
 5907694 5907695 HRM2_03780 HRM2_03790     FALSE 0.027 285.000 0.000 1.000   NA
 5907700 5907701 HRM2_03840 HRM2_03850     FALSE 0.005 913.000 0.000 NA   NA
 5907701 5907702 HRM2_03850 HRM2_03860     FALSE 0.155 126.000 0.000 NA   NA
 5907702 5907703 HRM2_03860 HRM2_03870   umuD1 FALSE 0.008 548.000 0.000 1.000   NA
 5907703 5907704 HRM2_03870 HRM2_03880 umuD1 umuC2 FALSE 0.298 89.000 0.000 1.000   NA
 5907704 5907705 HRM2_03880 HRM2_03890 umuC2 umuC3 TRUE 0.531 27.000 0.000 NA   NA
 5907705 5907706 HRM2_03890 HRM2_03900 umuC3   TRUE 0.443 42.000 0.000 NA   NA
 5907706 5907707 HRM2_03900 HRM2_03910     FALSE 0.040 239.000 0.000 1.000   NA
 5907707 5907708 HRM2_03910 HRM2_03920     FALSE 0.113 156.000 0.000 1.000   NA
 5907711 5907712 HRM2_03950 HRM2_03960     TRUE 0.410 49.000 0.000 NA   NA
 5907712 5907713 HRM2_03960 HRM2_03970   mltB TRUE 0.999 11.000 0.750 NA   NA
 5907714 5907715 HRM2_03980 HRM2_03990 radA   TRUE 0.891 21.000 0.003 NA N NA
 5907715 5907716 HRM2_03990 HRM2_04000     TRUE 0.966 13.000 0.018 NA   NA
 5907717 5907718 HRM2_04010 HRM2_04020     TRUE 0.677 -103.000 0.000 1.000 N NA
 5907718 5907719 HRM2_04020 HRM2_04030   dnaK1 FALSE 0.220 104.000 0.000 1.000 N NA
 5907719 5907720 HRM2_04030 HRM2_04040 dnaK1 grpE TRUE 0.998 18.000 0.224 0.007 Y NA
 5907720 5907721 HRM2_04040 HRM2_04050 grpE   FALSE 0.011 410.000 0.000 NA   NA
 5907721 5907722 HRM2_04050 HRM2_04060     TRUE 1.000 -3.000 0.405 NA   NA
 5907722 5907723 HRM2_04060 HRM2_04070     TRUE 0.998 0.000 0.083 NA   NA
 5907723 5907724 HRM2_04070 HRM2_04080     TRUE 0.995 13.000 0.311 NA   NA
 5907726 5907727 HRM2_04100 HRM2_04110   nifB1 TRUE 0.594 21.000 0.000 NA   NA
 5907728 5907729 HRM2_04120 HRM2_04130     FALSE 0.345 69.000 0.000 NA   NA
 5907731 5907732 HRM2_04150 HRM2_04160     FALSE 0.155 126.000 0.000 NA   NA
 5907732 5907733 HRM2_04160 HRM2_04170     FALSE 0.286 82.000 0.000 NA   NA
 5907733 5907734 HRM2_04170 HRM2_04180     TRUE 0.841 7.000 0.000 NA   NA
 5907734 5907735 HRM2_04180 HRM2_04190     TRUE 0.509 29.000 0.000 NA   NA
 5907735 5907736 HRM2_04190 HRM2_04200     FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 5907736 5907737 HRM2_04200 HRM2_04210     FALSE 0.056 198.000 0.000 NA   NA
 5907737 5907738 HRM2_04210 HRM2_04220     FALSE 0.011 385.000 0.000 NA   NA
 5907740 5907741 HRM2_04240 HRM2_04250   pflD1 TRUE 0.477 38.000 0.000 1.000 N NA
 5907741 5907742 HRM2_04250 HRM2_04260 pflD1 pflC1 TRUE 0.908 11.000 0.000 0.002 N NA
 5907745 5907746 HRM2_04290 HRM2_04300     TRUE 0.716 13.000 0.000 NA N NA
 5907746 5907747 HRM2_04300 HRM2_04310     TRUE 0.994 29.000 0.196 NA Y NA
 5907747 5907748 HRM2_04310 HRM2_04320     TRUE 1.000 -13.000 0.741 1.000 Y NA
 5907749 5907750 HRM2_04330 HRM2_04340     FALSE 0.232 91.000 0.000 NA N NA
 5907750 5907751 HRM2_04340 HRM2_04350     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5907753 5907754 HRM2_04370 HRM2_04380   clpP1 TRUE 0.994 55.000 0.351 1.000 Y NA
 5907754 5907755 HRM2_04380 HRM2_04390 clpP1 clpX1 TRUE 1.000 2.000 0.352 1.000 Y NA
 5907755 5907756 HRM2_04390 HRM2_04400 clpX1 lon1 TRUE 0.990 61.000 0.201 1.000 Y NA
 5907756 5907757 HRM2_04400 HRM2_04410 lon1   FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 5907757 5907758 HRM2_04410 HRM2_04420     TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5907759 5907760 HRM2_04430 HRM2_04440 leuB sucC2 TRUE 0.848 33.000 0.000 1.000 Y NA
 5907760 5907761 HRM2_04440 HRM2_04450 sucC2   TRUE 1.000 0.000 0.538 1.000 N NA
 5907763 5907764 HRM2_04470 HRM2_04480 cspL qmoC FALSE 0.065 199.000 0.000 1.000   NA
 5907764 5907765 HRM2_04480 HRM2_04490 qmoC qmoB TRUE 0.512 36.000 0.000 1.000   NA
 5907765 5907766 HRM2_04490 HRM2_04500 qmoB qmoA TRUE 1.000 8.000 0.333 0.006 Y NA
 5907766 5907767 HRM2_04500 HRM2_04510 qmoA aprA TRUE 0.792 281.000 0.189 1.000 Y NA
 5907767 5907768 HRM2_04510 HRM2_04520 aprA aprB TRUE 0.999 57.000 0.925 0.001 Y NA
 5907769 5907770 HRM2_04530 HRM2_04540   fabG3 TRUE 0.998 7.000 0.429 NA   NA
 5907771 5907772 HRM2_04550 HRM2_04560     TRUE 0.915 33.000 0.026 NA   NA
 5907773 5907774 HRM2_04570 HRM2_04580   infC TRUE 0.833 39.000 0.000 1.000 Y NA
 5907774 5907775 HRM2_04580 HRM2_04590 infC rpmI TRUE 0.976 196.000 0.652 1.000 Y NA
 5907775 5907776 HRM2_04590 HRM2_04600 rpmI rplT TRUE 1.000 27.000 0.928 0.012 Y NA
 5907776 5907777 HRM2_04600 HRM2_04610 rplT pheS TRUE 0.997 15.000 0.202 1.000 Y NA
 5907777 5907778 HRM2_04610 HRM2_04620 pheS pheT TRUE 1.000 2.000 0.574 0.001 Y NA
 5907778 5907779 HRM2_04620 HRM2_04630 pheT   FALSE 0.394 54.000 0.000 NA   NA
 5907779 5907780 HRM2_04630 HRM2_04640     FALSE 0.037 230.000 0.000 NA   NA
 5907780 5907781 HRM2_04640 HRM2_04650   nusA TRUE 0.998 18.000 0.759 NA   NA
 5907781 5907782 HRM2_04650 HRM2_04660 nusA infB TRUE 0.944 122.000 0.342 1.000 N NA
 5907782 5907783 HRM2_04660 HRM2_04670 infB rbfA TRUE 1.000 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 5907783 5907784 HRM2_04670 HRM2_04680 rbfA truB TRUE 1.000 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5907784 5907785 HRM2_04680 HRM2_04690 truB rpsO TRUE 0.953 151.000 0.211 1.000 Y NA
 5907785 5907786 HRM2_04690 HRM2_04700 rpsO pnpA TRUE 0.950 186.000 0.335 1.000 Y NA
 5907786 5907787 HRM2_04700 HRM2_04710 pnpA   TRUE 0.408 63.000 0.000 1.000   NA
 5907788 5907789 HRM2_04720 HRM2_04730     FALSE 0.325 73.000 0.000 NA   NA
 5907791 5907792 HRM2_04750 HRM2_04760     FALSE 0.074 177.000 0.000 NA   NA
 5907794 5907795 HRM2_04780 HRM2_04790     TRUE 0.826 -22.000 0.000 NA   NA
 5907795 5907796 HRM2_04790 HRM2_04800   mobB TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 5907797 5907798 HRM2_04810 HRM2_04820 aroK moeA TRUE 0.778 12.000 0.000 1.000 N NA
 5907799 5907800 HRM2_04830 HRM2_04840 alr pflA TRUE 0.814 10.000 0.000 1.000 N NA
 5907800 5907801 HRM2_04840 HRM2_04850 pflA nrdD TRUE 0.997 4.000 0.178 1.000 N NA
 5907801 5907802 HRM2_04850 HRM2_04860 nrdD   FALSE 0.013 404.000 0.000 1.000   NA
 5907802 5907803 HRM2_04860 HRM2_04870     FALSE 0.005 753.000 0.000 NA   NA
 5907803 5907804 HRM2_04870 HRM2_04880   aor2 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5907804 5907805 HRM2_04880 HRM2_04890 aor2 soxB1 TRUE 0.676 17.000 0.000 1.000 N NA
 5907805 5907806 HRM2_04890 HRM2_04900 soxB1 soxA1 TRUE 0.974 -7.000 0.000 0.001   NA
 5907806 5907807 HRM2_04900 HRM2_04910 soxA1 livF2 FALSE 0.207 114.000 0.000 1.000   NA
 5907807 5907808 HRM2_04910 HRM2_04920 livF2 livG2 TRUE 1.000 -7.000 0.280 0.031 Y NA
 5907808 5907809 HRM2_04920 HRM2_04930 livG2 livM2 TRUE 1.000 4.000 0.333 1.000 Y NA
 5907809 5907810 HRM2_04930 HRM2_04940 livM2 livH2 TRUE 1.000 -3.000 0.783 0.060 Y NA
 5907810 5907811 HRM2_04940 HRM2_04950 livH2 livJ2 TRUE 0.995 88.000 0.581 1.000 Y NA
 5907811 5907812 HRM2_04950 HRM2_04960 livJ2   TRUE 0.569 25.000 0.000 1.000 N NA
 5907813 5907814 HRM2_04970 HRM2_04980   divIVA TRUE 0.948 20.000 0.028 NA   NA
 5907814 5907815 HRM2_04980 HRM2_04990 divIVA pilT1 FALSE 0.388 48.000 0.000 NA N NA
 5907815 5907816 HRM2_04990 HRM2_05000 pilT1 pilT2 TRUE 0.998 29.000 0.400 0.032 Y NA
 5907816 5907817 HRM2_05000 HRM2_05010 pilT2   TRUE 0.999 0.000 0.300 NA   NA
 5907817 5907818 HRM2_05010 HRM2_05020     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5907819 5907820 HRM2_05030 HRM2_05040     TRUE 0.958 10.000 0.003 NA   NA
 5907820 5907821 HRM2_05040 HRM2_05050   folP TRUE 0.993 0.000 0.008 NA   NA
 5907821 5907822 HRM2_05050 HRM2_05060 folP ftsH TRUE 0.990 -7.000 0.008 1.000 N NA
 5907822 5907823 HRM2_05060 HRM2_05070 ftsH   TRUE 0.953 72.000 0.145 1.000 N NA
 5907826 5907827 HRM2_05100 HRM2_05110 ugpB ugpA TRUE 0.784 80.000 0.000 0.060 Y NA
 5907827 5907828 HRM2_05110 HRM2_05120 ugpA ugpE TRUE 0.981 6.000 0.000 0.060 Y NA
 5907829 5907830 HRM2_05130 HRM2_05140     TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5907830 5907831 HRM2_05140 HRM2_05150     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5907831 5907832 HRM2_05150 HRM2_05160     FALSE 0.319 78.000 0.000 1.000 N NA
 5907832 5907833 HRM2_05160 HRM2_05170     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA N NA
 5907833 5907834 HRM2_05170 HRM2_05180     FALSE 0.293 75.000 0.000 NA N NA
 5907835 5907836 HRM2_05190 HRM2_05200   apt1 TRUE 0.997 9.000 0.026 0.004 Y NA
 5907837 5907838 HRM2_05210 HRM2_05220   murI FALSE 0.103 151.000 0.000 NA   NA
 5907839 5907840 HRM2_05230 HRM2_05240 epd   FALSE 0.268 91.000 0.000 1.000 N NA
 5907840 5907841 HRM2_05240 HRM2_05250     TRUE 0.431 45.000 0.000 NA   NA
 5907841 5907842 HRM2_05250 HRM2_05260   mscC1 TRUE 0.996 13.000 0.354 NA   NA
 5907843 5907844 HRM2_05270 HRM2_05280 aor3 rtcB TRUE 0.483 33.000 0.000 NA   NA
 5907848 5907849 HRM2_05320 HRM2_05330 uraA upp TRUE 0.987 39.000 0.101 1.000 Y NA
 5907850 5907851 HRM2_05340 HRM2_05350 priA   FALSE 0.181 113.000 0.000 NA   NA
 5907851 5907852 HRM2_05350 HRM2_05360   ntrC1 FALSE 0.035 235.000 0.000 NA   NA
 5907855 5907856 HRM2_05390 HRM2_05400 aapP1 aapM TRUE 0.998 52.000 0.734 1.000 Y NA
 5907856 5907857 HRM2_05400 HRM2_05410 aapM aapQ TRUE 0.986 31.000 0.037 0.014 Y NA
 5907857 5907858 HRM2_05410 HRM2_05420 aapQ aapJ2 TRUE 0.849 91.000 0.022 0.060   NA
 5907858 5907859 HRM2_05420 HRM2_05430 aapJ2 aapJ1 TRUE 0.972 1.000 0.000 0.015   NA
 5907860 5907861 HRM2_05440 HRM2_05450     FALSE 0.275 79.000 0.000 NA N NA
 5907861 5907862 HRM2_05450 HRM2_05460     TRUE 0.997 10.000 0.077 NA Y NA
 5907862 5907863 HRM2_05460 HRM2_05470     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5907863 5907864 HRM2_05470 HRM2_05480     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5907864 5907865 HRM2_05480 HRM2_05490     TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5907865 5907866 HRM2_05490 HRM2_05500     TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5907866 5907867 HRM2_05500 HRM2_05510     TRUE 0.914 48.000 0.044 NA   NA
 5907867 5907868 HRM2_05510 HRM2_05520     TRUE 0.989 -13.000 0.032 NA   NA
 5907868 5907869 HRM2_05520 HRM2_05530     TRUE 0.594 21.000 0.000 NA   NA
 5907870 5907871 HRM2_05540 HRM2_05550     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 11538271 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 7944.000 0.000 NA   NA
 11680634 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 7944.000 0.000 NA   NA
 11823026 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 7944.000 0.000 NA   NA
 11538272 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 7981.000 0.000 NA   NA
 11680635 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 7981.000 0.000 NA   NA
 11823027 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 7981.000 0.000 NA   NA
 11538273 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 8015.000 0.000 NA   NA
 11680636 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 8015.000 0.000 NA   NA
 11823028 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 8015.000 0.000 NA   NA
 11538274 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 8052.000 0.000 NA   NA
 11680637 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 8052.000 0.000 NA   NA
 11823029 5907861   HRM2_05450     FALSE NA 8052.000 0.000 NA   NA
 5907871 5907872 HRM2_05550 HRM2_05560     FALSE 0.005 798.000 0.000 NA   NA
 5907872 5907873 HRM2_05560 HRM2_05570     TRUE 0.662 -102.000 0.000 NA   NA
 5907873 5907874 HRM2_05570 HRM2_05580     FALSE 0.384 58.000 0.000 NA   NA
 5907874 5907875 HRM2_05580 HRM2_05590     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5907875 5907876 HRM2_05590 HRM2_05600     FALSE 0.317 75.000 0.000 NA   NA
 5907876 5907877 HRM2_05600 HRM2_05610     FALSE 0.080 170.000 0.000 NA   NA
 5907877 5907878 HRM2_05610 HRM2_05620     FALSE 0.038 228.000 0.000 NA   NA
 5907878 5907879 HRM2_05620 HRM2_05630     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5907879 5907880 HRM2_05630 HRM2_05640     TRUE 0.594 21.000 0.000 NA   NA
 5907880 5907881 HRM2_05640 HRM2_05650     TRUE 0.680 -85.000 0.000 NA   NA
 5907881 5907882 HRM2_05650 HRM2_05660     FALSE 0.040 224.000 0.000 NA   NA
 5907882 5907883 HRM2_05660 HRM2_05670     FALSE 0.087 165.000 0.000 NA   NA
 5907883 5907884 HRM2_05670 HRM2_05680     FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 5907884 5907885 HRM2_05680 HRM2_05690     FALSE 0.013 362.000 0.000 NA   NA
 5907886 5907887 HRM2_05700 HRM2_05710     FALSE 0.151 130.000 0.000 1.000 N NA
 5907888 5907889 HRM2_05720 HRM2_05730     FALSE 0.014 342.000 0.000 NA   NA
 5907889 5907890 HRM2_05730 HRM2_05740     FALSE 0.005 1068.000 0.000 1.000   NA
 5907891 5907892 HRM2_05750 HRM2_05760     TRUE 0.944 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5907892 5907893 HRM2_05760 HRM2_05770   rpoE TRUE 0.622 46.000 0.000 0.035 N NA
 5907893 5907894 HRM2_05770 HRM2_05780 rpoE   FALSE 0.280 84.000 0.000 NA   NA
 5907894 5907895 HRM2_05780 HRM2_05790     FALSE 0.392 55.000 0.000 NA   NA
 5907895 5907896 HRM2_05790 HRM2_05800     FALSE 0.015 331.000 0.000 NA   NA
 5907896 5907897 HRM2_05800 HRM2_05810     TRUE 0.999 2.000 0.079 1.000 Y NA
 5907897 5907898 HRM2_05810 HRM2_05820     TRUE 1.000 -3.000 0.586 1.000 N NA
 5907898 5907899 HRM2_05820 HRM2_05830     TRUE 1.000 -13.000 0.471 NA Y NA
 5907900 5907901 HRM2_05840 HRM2_05850     FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 5907901 5907902 HRM2_05850 HRM2_05860     FALSE 0.021 293.000 0.000 NA   NA
 5907902 5907903 HRM2_05860 HRM2_05870     FALSE 0.156 133.000 0.000 1.000   NA
 5907904 5907905 HRM2_05880 HRM2_05890     FALSE 0.009 515.000 0.000 1.000   NA
 5907905 5907906 HRM2_05890 HRM2_05900   pntA TRUE 0.888 5.000 0.000 1.000   NA
 5907906 5907907 HRM2_05900 HRM2_05910 pntA pntA2 TRUE 0.973 201.000 0.829 0.001   NA
 5907907 5907908 HRM2_05910 HRM2_05920 pntA2 pntB TRUE 0.999 -7.000 0.321 0.001   NA
 5907908 5907909 HRM2_05920 HRM2_05930 pntB   FALSE 0.076 352.000 0.000 1.000 Y NA
 5907911 5907912 HRM2_05950 HRM2_05960     TRUE 0.859 -16.000 0.000 NA   NA
 5907912 5907913 HRM2_05960 HRM2_05970     FALSE 0.021 294.000 0.000 NA   NA
 5907913 5907914 HRM2_05970 HRM2_05980     FALSE 0.005 957.000 0.000 NA   NA
 5907916 5907917 HRM2_06000 HRM2_06010     FALSE 0.134 133.000 0.000 NA   NA
 5907918 5907919 HRM2_06020 HRM2_06030     FALSE 0.307 77.000 0.000 NA   NA
 5907919 5907920 HRM2_06030 HRM2_06040     TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 5907920 5907921 HRM2_06040 HRM2_06050     TRUE 0.509 29.000 0.000 NA   NA
 5907922 5907923 HRM2_06060 HRM2_06070   aroF FALSE 0.151 127.000 0.000 NA   NA
 5907923 5907924 HRM2_06070 HRM2_06080 aroF aroB1 TRUE 0.900 41.000 0.000 0.002 Y NA
 5907926 5907927 HRM2_06100 HRM2_06110     TRUE 0.410 49.000 0.000 NA   NA
 5907927 5907928 HRM2_06110 HRM2_06120     TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5907928 5907929 HRM2_06120 HRM2_06130   cls TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5907929 5907930 HRM2_06130 HRM2_06140 cls mcpB1 FALSE 0.140 134.000 0.000 1.000 N NA
 5907932 5907933 HRM2_06160 HRM2_06170 mdeA   FALSE 0.357 70.000 0.000 1.000 N NA
 5907934 5907935 HRM2_06180 HRM2_06190   rbr1 TRUE 0.863 14.000 0.000 0.017   NA
 5907935 5907936 HRM2_06190 HRM2_06200 rbr1   TRUE 0.967 14.000 0.027 NA   NA
 5907936 5907937 HRM2_06200 HRM2_06210     FALSE 0.151 127.000 0.000 NA   NA
 5907937 5907938 HRM2_06210 HRM2_06220     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5907940 5907941 HRM2_06240 HRM2_06250   speE1 TRUE 0.669 -94.000 0.000 NA   NA
 5907941 5907942 HRM2_06250 HRM2_06260 speE1 speD TRUE 0.879 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5907942 5907943 HRM2_06260 HRM2_06270 speD fadJ FALSE 0.089 168.000 0.000 1.000 N NA
 5907943 5907944 HRM2_06270 HRM2_06280 fadJ oadB1 TRUE 0.569 25.000 0.000 1.000 N NA
 5907944 5907945 HRM2_06280 HRM2_06290 oadB1   TRUE 0.966 41.000 0.057 0.001   NA
 5907945 5907946 HRM2_06290 HRM2_06300     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5907947 5907948 HRM2_06310 HRM2_06320   rbsA1 FALSE 0.027 285.000 0.000 1.000   NA
 5907948 5907949 HRM2_06320 HRM2_06330 rbsA1 rbsC1 TRUE 0.955 49.000 0.100 1.000   NA
 5907949 5907950 HRM2_06330 HRM2_06340 rbsC1 rbsC2 TRUE 0.999 1.000 0.273 0.051   NA
 5907951 5907952 HRM2_06350 HRM2_06360 uspA10   TRUE 0.983 73.000 0.444 NA   NA
 5907952 5907953 HRM2_06360 HRM2_06370     FALSE 0.151 127.000 0.000 NA   NA
 5907953 5907954 HRM2_06370 HRM2_06380     FALSE 0.009 439.000 0.000 NA   NA
 5907954 5907955 HRM2_06380 HRM2_06390     FALSE 0.277 85.000 0.000 NA   NA
 5907959 5907960 HRM2_06430 HRM2_06440   katG FALSE 0.369 62.000 0.000 NA   NA
 5907960 5907961 HRM2_06440 HRM2_06450 katG mvhD1 FALSE 0.119 152.000 0.000 1.000   NA
 5907961 5907962 HRM2_06450 HRM2_06460 mvhD1   TRUE 0.623 -253.000 0.000 NA   NA
 5907964 5907965 HRM2_06480 HRM2_06490     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5907965 5907966 HRM2_06490 HRM2_06500     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5907966 5907967 HRM2_06500 HRM2_06510   dnaG1 TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5907967 5907968 HRM2_06510 HRM2_06520 dnaG1   FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5907970 5907971 HRM2_06540 HRM2_06550     TRUE 0.999 -19.000 0.600 NA   NA
 5907971 5907972 HRM2_06550 HRM2_06560     TRUE 0.999 0.000 0.400 NA   NA
 5907973 5907974 HRM2_06570 HRM2_06580     FALSE 0.113 145.000 0.000 NA   NA
 5907975 5907976 HRM2_06590 HRM2_06600     FALSE 0.103 151.000 0.000 NA   NA
 5907976 5907977 HRM2_06600 HRM2_06610     FALSE 0.005 857.000 0.000 NA   NA
 5907977 5907978 HRM2_06610 HRM2_06620   prmA1 TRUE 0.893 -12.000 0.000 NA   NA
 5907978 5907979 HRM2_06620 HRM2_06630 prmA1   TRUE 0.995 -16.000 0.120 NA   NA
 5907979 5907980 HRM2_06630 HRM2_06640     TRUE 1.000 -7.000 0.667 NA   NA
 5907980 5907981 HRM2_06640 HRM2_06650   trmE TRUE 0.947 12.000 0.003 NA   NA
 5907981 5907982 HRM2_06650 HRM2_06660 trmE   TRUE 0.999 -3.000 0.116 1.000   NA
 5907982 5907983 HRM2_06660 HRM2_06670   oxaA TRUE 0.993 16.000 0.254 1.000   NA
 5907983 5907984 HRM2_06670 HRM2_06680 oxaA   TRUE 0.970 104.000 0.461 NA   NA
 5907984 5907985 HRM2_06680 HRM2_06690   rnpA TRUE 0.999 -7.000 0.540 NA   NA
 5907985 5907986 HRM2_06690 HRM2_06700 rnpA rpmH TRUE 0.999 15.000 0.787 1.000   NA
 5907986 5907987 HRM2_06700 HRM2_06710 rpmH rne1 FALSE 0.397 152.000 0.002 1.000   NA
 5907987 5907988 HRM2_06710 HRM2_06720 rne1   TRUE 0.996 -6.000 0.050 1.000 N NA
 5907989 5907990 HRM2_06730 HRM2_06740 asnS   TRUE 0.581 22.000 0.000 NA   NA
 5907991 5907992 HRM2_06750 HRM2_06760 cobT1 thiC TRUE 0.995 5.000 0.015 1.000 Y NA
 5907992 5907993 HRM2_06760 HRM2_06770 thiC   FALSE 0.389 56.000 0.000 NA   NA
 5907995 5907996 HRM2_06790 HRM2_06800     TRUE 0.998 -3.000 0.067 NA   NA
 5907996 5907997 HRM2_06800 HRM2_06810     TRUE 0.838 6.000 0.000 NA N NA
 5907997 5907998 HRM2_06810 HRM2_06820   glnA1 FALSE 0.024 264.000 0.000 NA N NA
 5907998 5907999 HRM2_06820 HRM2_06830 glnA1 glnB1 TRUE 0.840 36.000 0.000 1.000 Y NA
 5907999 5908000 HRM2_06830 HRM2_06840 glnB1 glnD TRUE 0.891 30.000 0.008 1.000 N NA
 5908000 5908001 HRM2_06840 HRM2_06850 glnD tatA FALSE 0.030 259.000 0.000 1.000 N NA
 5908002 5908003 HRM2_06860 HRM2_06870     TRUE 0.894 185.000 0.431 NA   NA
 5908005 5908006 HRM2_06890 HRM2_06900   cysE1 FALSE 0.311 86.000 0.000 1.000   NA
 5908006 5908007 HRM2_06900 HRM2_06910 cysE1 cysA1 TRUE 0.986 -16.000 0.000 0.001 Y NA
 5908007 5908008 HRM2_06910 HRM2_06920 cysA1 nqrA FALSE 0.179 121.000 0.000 1.000 N NA
 5908008 5908009 HRM2_06920 HRM2_06930 nqrA nqrB TRUE 0.999 -3.000 0.029 0.001 Y NA
 5908009 5908010 HRM2_06930 HRM2_06940 nqrB nqrC TRUE 1.000 -7.000 1.000 0.001 Y NA
 5908010 5908011 HRM2_06940 HRM2_06950 nqrC nqrD TRUE 0.979 34.000 0.010 0.001 Y NA
 5908011 5908012 HRM2_06950 HRM2_06960 nqrD nqrE TRUE 0.878 152.000 0.019 0.001 Y NA
 5908012 5908013 HRM2_06960 HRM2_06970 nqrE nqrF TRUE 0.993 22.000 0.056 0.001 Y NA
 5908013 5908014 HRM2_06970 HRM2_06980 nqrF   TRUE 0.795 12.000 0.000 1.000   NA
 5908014 5908015 HRM2_06980 HRM2_06990     TRUE 0.844 -25.000 0.000 1.000   NA
 5908016 5908017 HRM2_07000 HRM2_07010     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908017 5908018 HRM2_07010 HRM2_07020     TRUE 0.990 50.000 0.531 NA N NA
 5908018 5908019 HRM2_07020 HRM2_07030     TRUE 0.998 -34.000 0.358 0.043   NA
 5908019 5908020 HRM2_07030 HRM2_07040     TRUE 0.999 3.000 0.284 NA   NA
 5908020 5908021 HRM2_07040 HRM2_07050     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5908021 5908022 HRM2_07050 HRM2_07060     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5908022 5908023 HRM2_07060 HRM2_07070     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5908023 5908024 HRM2_07070 HRM2_07080   mop1 TRUE 0.995 116.000 0.607 0.037 Y NA
 5908024 5908025 HRM2_07080 HRM2_07090 mop1   TRUE 0.988 43.000 0.393 1.000 N NA
 5908026 5908027 HRM2_07100 HRM2_07110     FALSE 0.044 217.000 0.000 NA   NA
 5908027 5908028 HRM2_07110 HRM2_07120     TRUE 0.616 137.000 0.023 NA   NA
 5908028 5908029 HRM2_07120 HRM2_07130   cmk4 TRUE 0.958 29.000 0.067 1.000   NA
 5908029 5908030 HRM2_07130 HRM2_07140 cmk4 cmk5 TRUE 0.998 57.000 0.500 0.002 Y NA
 5908030 5908031 HRM2_07140 HRM2_07150 cmk5   TRUE 0.996 34.000 0.750 1.000   NA
 5908031 5908032 HRM2_07150 HRM2_07160     TRUE 0.951 140.000 0.500 NA   NA
 5908032 5908033 HRM2_07160 HRM2_07170     FALSE 0.015 327.000 0.000 NA   NA
 5908033 5908034 HRM2_07170 HRM2_07180   ppsA3 TRUE 0.995 33.000 0.667 1.000   NA
 5908034 5908035 HRM2_07180 HRM2_07190 ppsA3 mtrB FALSE 0.229 106.000 0.000 1.000   NA
 5908038 5908039 HRM2_07220 HRM2_07230   hutU1 FALSE 0.069 183.000 0.000 NA   NA
 5908040 5908041 HRM2_07240 HRM2_07250     FALSE 0.006 614.000 0.000 NA   NA
 5908041 5908042 HRM2_07250 HRM2_07260     TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5908042 5908043 HRM2_07260 HRM2_07270   cspG FALSE 0.068 197.000 0.000 1.000   NA
 5908043 5908044 HRM2_07270 HRM2_07280 cspG   FALSE 0.005 956.000 0.000 1.000   NA
 5908044 5908045 HRM2_07280 HRM2_07290     FALSE 0.361 64.000 0.000 NA   NA
 5908045 5908046 HRM2_07290 HRM2_07300     FALSE 0.009 443.000 0.000 NA   NA
 5908046 5908047 HRM2_07300 HRM2_07310     FALSE 0.320 74.000 0.000 NA   NA
 5908047 5908048 HRM2_07310 HRM2_07320     FALSE 0.011 404.000 0.000 NA   NA
 5908048 5908049 HRM2_07320 HRM2_07330     TRUE 0.717 125.000 0.036 NA   NA
 5908049 5908050 HRM2_07330 HRM2_07340     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5908050 5908051 HRM2_07340 HRM2_07350   mtbC1 FALSE 0.161 124.000 0.000 NA   NA
 5908052 5908053 HRM2_07360 HRM2_07370     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5908053 5908054 HRM2_07370 HRM2_07380     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5908054 5908055 HRM2_07380 HRM2_07390   dnaG2 TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5908055 5908056 HRM2_07390 HRM2_07400 dnaG2   FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5908057 5908058 HRM2_07410 HRM2_07420     FALSE 0.027 266.000 0.000 NA   NA
 5908059 5908060 HRM2_07430 HRM2_07440 dksA2   FALSE 0.239 95.000 0.000 NA   NA
 5908062 5908063 HRM2_07460 HRM2_07470 metH2 mtmC FALSE 0.166 188.000 0.000 0.003   NA
 5908063 5908064 HRM2_07470 HRM2_07480 mtmC mttB3 TRUE 0.795 12.000 0.000 1.000   NA
 5908064 5908065 HRM2_07480 HRM2_07490 mttB3 opuD1 FALSE 0.383 63.000 0.000 1.000 N NA
 5908065 5908066 HRM2_07490 HRM2_07500 opuD1 rocR FALSE 0.028 270.000 0.000 1.000 N NA
 5908067 5908068 HRM2_07510 HRM2_07520 opuD2   FALSE 0.006 631.000 0.000 NA   NA
 5908068 5908069 HRM2_07520 HRM2_07530     TRUE 0.852 6.000 0.000 NA   NA
 5908069 5908070 HRM2_07530 HRM2_07540     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908070 5908071 HRM2_07540 HRM2_07550     FALSE 0.325 73.000 0.000 NA   NA
 5908072 5908073 HRM2_07560 HRM2_07570 hflX   FALSE 0.016 323.000 0.000 NA   NA
 5908073 5908074 HRM2_07570 HRM2_07580     FALSE 0.008 468.000 0.000 NA   NA
 5908074 5908075 HRM2_07580 HRM2_07590   tyrA TRUE 0.655 -160.000 0.000 1.000 N NA
 5908075 5908076 HRM2_07590 HRM2_07600 tyrA   FALSE 0.137 132.000 0.000 NA   NA
 5908077 5908078 HRM2_07610 HRM2_07620 thiJ fba1 TRUE 0.531 27.000 0.000 NA   NA
 5908081 5908082 HRM2_07650 HRM2_07660     FALSE 0.007 534.000 0.000 NA   NA
 5908082 5908083 HRM2_07660 HRM2_07670   btuB1 TRUE 0.496 34.000 0.000 1.000 N NA
 5908084 5908085 HRM2_07680 HRM2_07690 cbiK1   FALSE 0.294 90.000 0.000 1.000   NA
 5908085 5908086 HRM2_07690 HRM2_07700   cbiK2 TRUE 0.697 -106.000 0.000 1.000   NA
 5908086 5908087 HRM2_07700 HRM2_07710 cbiK2 racD2 FALSE 0.165 126.000 0.000 1.000 N NA
 5908088 5908089 HRM2_07720 HRM2_07730 atoB1 acd1 TRUE 0.897 21.000 0.000 1.000 Y NA
 5908089 5908090 HRM2_07730 HRM2_07740 acd1   TRUE 0.569 25.000 0.000 1.000 N NA
 5908091 5908092 HRM2_07750 HRM2_07760   glpA2 FALSE 0.331 72.000 0.000 NA   NA
 5908092 5908093 HRM2_07760 HRM2_07770 glpA2 glpB2 TRUE 1.000 -3.000 0.650 0.002 N NA
 5908093 5908094 HRM2_07770 HRM2_07780 glpB2 hdrF2 TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5908094 5908095 HRM2_07780 HRM2_07790 hdrF2   FALSE 0.007 606.000 0.000 1.000 N NA
 5908095 5908096 HRM2_07790 HRM2_07800     TRUE 0.461 32.000 0.000 NA N NA
 5908096 5908097 HRM2_07800 HRM2_07810   uspA11 FALSE 0.332 65.000 0.000 NA N NA
 5908099 5908100 HRM2_07830 HRM2_07840     TRUE 0.951 12.000 0.000 1.000 Y NA
 5908101 5908102 HRM2_07850 HRM2_07860   mcpA1 FALSE 0.060 195.000 0.000 NA   NA
 5908102 5908103 HRM2_07860 HRM2_07870 mcpA1   TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5908103 5908104 HRM2_07870 HRM2_07880     FALSE 0.031 246.000 0.000 NA   NA
 5908104 5908105 HRM2_07880 HRM2_07890     TRUE 0.987 4.000 0.000 0.033 Y NA
 5908106 5908107 HRM2_07900 HRM2_07910   thrS1 FALSE 0.386 69.000 0.000 1.000   NA
 5908107 5908108 HRM2_07910 HRM2_07920 thrS1   FALSE 0.005 703.000 0.000 NA   NA
 5908108 5908109 HRM2_07920 HRM2_07930   opuD3 FALSE 0.004 1106.000 0.000 NA   NA
 5908109 5908110 HRM2_07930 HRM2_07940 opuD3   FALSE 0.010 399.000 0.000 NA N NA
 5908110 5908111 HRM2_07940 HRM2_07950     TRUE 0.968 40.000 0.143 NA N NA
 5908111 5908112 HRM2_07950 HRM2_07960     TRUE 0.999 6.000 0.343 NA Y NA
 5908112 5908113 HRM2_07960 HRM2_07970     TRUE 1.000 0.000 0.750 1.000 Y NA
 5908114 5908115 HRM2_07980 HRM2_07990     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5908115 5908116 HRM2_07990 HRM2_08000     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5908116 5908117 HRM2_08000 HRM2_08010   dnaG3 TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5908117 5908118 HRM2_08010 HRM2_08020 dnaG3   FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5908122 5908123 HRM2_08060 HRM2_08070     FALSE 0.181 113.000 0.000 NA   NA
 5908123 5908124 HRM2_08070 HRM2_08080     FALSE 0.008 486.000 0.000 NA   NA
 5908124 5908125 HRM2_08080 HRM2_08090   pabB FALSE 0.074 183.000 0.000 1.000 N NA
 5908125 5908126 HRM2_08090 HRM2_08100 pabB pabA TRUE 0.998 -13.000 0.029 0.014 Y NA
 5908126 5908127 HRM2_08100 HRM2_08110 pabA   FALSE 0.032 233.000 0.000 NA N NA
 5908128 5908129 HRM2_08120 HRM2_08130   aspC1 FALSE 0.036 232.000 0.000 NA   NA
 5908129 5908130 HRM2_08130 HRM2_08140 aspC1 rsbP FALSE 0.210 218.000 0.000 1.000 Y NA
 5908130 5908131 HRM2_08140 HRM2_08150 rsbP   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908131 5908132 HRM2_08150 HRM2_08160   rarD FALSE 0.211 103.000 0.000 NA   NA
 5908132 5908133 HRM2_08160 HRM2_08170 rarD   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908134 5908135 HRM2_08180 HRM2_08190     FALSE 0.056 208.000 0.000 1.000   NA
 5908135 5908136 HRM2_08190 HRM2_08200     TRUE 0.502 33.000 0.000 1.000 N NA
 5908137 5908138 HRM2_08210 HRM2_08220     TRUE 0.731 -57.000 0.000 NA   NA
 5908138 5908139 HRM2_08220 HRM2_08230     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5908140 5908141 HRM2_08240 HRM2_08250   ctpA1 FALSE 0.113 156.000 0.000 1.000   NA
 5908141 5908142 HRM2_08250 HRM2_08260 ctpA1   TRUE 0.888 5.000 0.000 1.000   NA
 5908142 5908143 HRM2_08260 HRM2_08270     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5908143 5908144 HRM2_08270 HRM2_08280     TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5908144 5908145 HRM2_08280 HRM2_08290     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5908145 5908146 HRM2_08290 HRM2_08300     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5908146 5908147 HRM2_08300 HRM2_08310     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908147 5908148 HRM2_08310 HRM2_08320     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5908150 5908151 HRM2_08340 HRM2_08350     FALSE 0.151 127.000 0.000 NA   NA
 5908151 5908152 HRM2_08350 HRM2_08360     TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA   NA
 5908152 5908153 HRM2_08360 HRM2_08370     FALSE 0.179 114.000 0.000 NA   NA
 5908153 5908154 HRM2_08370 HRM2_08380     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908154 5908155 HRM2_08380 HRM2_08390     FALSE 0.013 366.000 0.000 NA   NA
 5908155 5908156 HRM2_08390 HRM2_08400     FALSE 0.196 107.000 0.000 NA   NA
 5908158 5908159 HRM2_08420 HRM2_08430 gltL1 gltK1 TRUE 0.988 1.000 0.000 1.000 Y NA
 5908159 5908160 HRM2_08430 HRM2_08440 gltK1 gltJ1 TRUE 0.994 0.000 0.000 0.012 Y NA
 5908160 5908161 HRM2_08440 HRM2_08450 gltJ1 gltB1 TRUE 0.804 75.000 0.000 0.050 Y NA
 5908161 5908162 HRM2_08450 HRM2_08460 gltB1   FALSE 0.007 586.000 0.000 1.000 N NA
 5908162 5908163 HRM2_08460 HRM2_08470     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5908163 5908164 HRM2_08470 HRM2_08480   glcF1 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908164 5908165 HRM2_08480 HRM2_08490 glcF1 glcD1 TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 5908165 5908166 HRM2_08490 HRM2_08500 glcD1 dctM2 TRUE 0.814 10.000 0.000 1.000 N NA
 5908166 5908167 HRM2_08500 HRM2_08510 dctM2 dctQ2 TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA Y NA
 5908167 5908168 HRM2_08510 HRM2_08520 dctQ2 dctP2 TRUE 0.997 70.000 0.667 NA Y NA
 5908168 5908169 HRM2_08520 HRM2_08530 dctP2   FALSE 0.022 291.000 0.000 1.000 N NA
 5908171 5908172 HRM2_08550 HRM2_08560     TRUE 0.494 31.000 0.000 NA   NA
 5908175 5908176 HRM2_08590 HRM2_08600     FALSE 0.108 148.000 0.000 NA   NA
 5908177 5908178 HRM2_08610 HRM2_08620 fbp1 glgC2 TRUE 0.908 19.000 0.000 1.000 Y NA
 5908178 5908179 HRM2_08620 HRM2_08630 glgC2 gap1 TRUE 0.875 26.000 0.000 1.000 Y NA
 5908179 5908180 HRM2_08630 HRM2_08640 gap1 fba2 TRUE 0.766 96.000 0.000 0.004 Y NA
 5908180 5908181 HRM2_08640 HRM2_08650 fba2 pfkB1 TRUE 0.973 26.000 0.012 1.000 Y NA
 5908181 5908182 HRM2_08650 HRM2_08660 pfkB1   TRUE 0.877 5.000 0.000 1.000 N NA
 5908182 5908183 HRM2_08660 HRM2_08670   mtp TRUE 0.935 35.000 0.048 1.000 N NA
 5908184 5908185 HRM2_08680 HRM2_08690   pgm TRUE 0.439 47.000 0.000 1.000 N NA
 5908185 5908186 HRM2_08690 HRM2_08700 pgm dcuA FALSE 0.046 226.000 0.000 1.000   NA
 5908186 5908187 HRM2_08700 HRM2_08710 dcuA   FALSE 0.024 279.000 0.000 NA   NA
 5908187 5908188 HRM2_08710 HRM2_08720   nifH1 FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 5908188 5908189 HRM2_08720 HRM2_08730 nifH1 nifD1 TRUE 1.000 -10.000 0.900 0.040 Y NA
 5908189 5908190 HRM2_08730 HRM2_08740 nifD1 msrAB FALSE 0.126 142.000 0.000 1.000 N NA
 5908192 5908193 HRM2_08760 HRM2_08770     TRUE 0.970 2.000 0.000 0.009   NA
 5908193 5908194 HRM2_08770 HRM2_08780   folA FALSE 0.095 170.000 0.000 1.000   NA
 5908194 5908195 HRM2_08780 HRM2_08790 folA   FALSE 0.069 372.000 0.000 1.000 Y NA
 5908195 5908196 HRM2_08790 HRM2_08800   gltA2 TRUE 0.981 22.000 0.093 0.060 N NA
 5908197 5908198 HRM2_08810 HRM2_08820     TRUE 0.995 -7.000 0.055 NA   NA
 5908199 5908200 HRM2_08830 HRM2_08840   cat4 TRUE 0.636 21.000 0.000 1.000   NA
 5908201 5908202 HRM2_08850 HRM2_08860 acsM1 acd2 FALSE 0.138 269.000 0.000 1.000 Y NA
 5908202 5908203 HRM2_08860 HRM2_08870 acd2   TRUE 0.502 33.000 0.000 1.000 N NA
 5908206 5908207 HRM2_08900 HRM2_08910     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5908207 5908208 HRM2_08910 HRM2_08920     FALSE 0.004 1346.000 0.000 NA   NA
 5908209 5908210 HRM2_08930 HRM2_08940     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA N NA
 5908210 5908211 HRM2_08940 HRM2_08950     TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5908211 5908212 HRM2_08950 HRM2_08960     FALSE 0.034 239.000 0.000 NA   NA
 5908212 5908213 HRM2_08960 HRM2_08970   uvrA1 TRUE 0.539 31.000 0.000 1.000   NA
 5908214 5908215 HRM2_08980 HRM2_08990     FALSE 0.022 287.000 0.000 NA   NA
 5908217 5908218 HRM2_09010 HRM2_09020   dhs2 FALSE 0.401 52.000 0.000 NA   NA
 5908218 5908219 HRM2_09020 HRM2_09030 dhs2   TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 5908219 5908220 HRM2_09030 HRM2_09040   bioF TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5908220 5908221 HRM2_09040 HRM2_09050 bioF   TRUE 0.413 54.000 0.000 1.000 N NA
 5908221 5908222 HRM2_09050 HRM2_09060     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5908222 5908223 HRM2_09060 HRM2_09070   rho1 FALSE 0.015 342.000 0.000 1.000 N NA
 5908223 5908224 HRM2_09070 HRM2_09080 rho1   TRUE 0.937 -7.000 0.000 1.000   NA
 5908224 5908225 HRM2_09080 HRM2_09090     FALSE 0.010 477.000 0.000 1.000   NA
 5908225 5908226 HRM2_09090 HRM2_09100     FALSE 0.283 77.000 0.000 NA N NA
 5908228 5908229 HRM2_09120 HRM2_09130 mttB4 opuD4 FALSE 0.235 100.000 0.000 1.000 N NA
 5908231 5908232 HRM2_09150 HRM2_09160 engD   TRUE 0.569 25.000 0.000 1.000 N NA
 5908232 5908233 HRM2_09160 HRM2_09170     FALSE 0.137 132.000 0.000 NA   NA
 5908234 5908235 HRM2_09180 HRM2_09190     FALSE 0.161 124.000 0.000 NA   NA
 5908235 5908236 HRM2_09190 HRM2_09200   moaB FALSE 0.248 92.000 0.000 NA   NA
 5908236 5908237 HRM2_09200 HRM2_09210 moaB pyrR TRUE 0.988 2.000 0.004 1.000 N NA
 5908238 5908239 HRM2_09220 HRM2_09230 mobA moaE TRUE 0.988 -13.000 0.002 0.003   NA
 5908239 5908240 HRM2_09230 HRM2_09240 moaE moaC FALSE 0.341 282.000 0.025 0.003   NA
 5908240 5908241 HRM2_09240 HRM2_09250 moaC   TRUE 0.787 -37.000 0.000 NA   NA
 5908241 5908242 HRM2_09250 HRM2_09260     FALSE 0.258 90.000 0.000 NA   NA
 5908242 5908243 HRM2_09260 HRM2_09270     FALSE 0.303 78.000 0.000 NA   NA
 5908243 5908244 HRM2_09270 HRM2_09280     TRUE 0.983 6.000 0.019 NA   NA
 5908244 5908245 HRM2_09280 HRM2_09290   ddlA FALSE 0.397 154.000 0.004 NA   NA
 5908245 5908246 HRM2_09290 HRM2_09300 ddlA purD TRUE 0.404 145.000 0.002 1.000 N NA
 5908246 5908247 HRM2_09300 HRM2_09310 purD   TRUE 0.974 -16.000 0.005 NA N NA
 5908247 5908248 HRM2_09310 HRM2_09320     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5908248 5908249 HRM2_09320 HRM2_09330     FALSE 0.389 56.000 0.000 NA   NA
 5908250 5908251 HRM2_09340 HRM2_09350     FALSE 0.196 107.000 0.000 NA   NA
 5908251 5908252 HRM2_09350 HRM2_09360     FALSE 0.005 713.000 0.000 NA   NA
 5908252 5908253 HRM2_09360 HRM2_09370     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908255 5908256 HRM2_09390 HRM2_09400     FALSE 0.007 632.000 0.000 1.000   NA
 5908256 5908257 HRM2_09400 HRM2_09410     TRUE 0.999 9.000 0.667 NA   NA
 5908261 5908262 HRM2_09450 HRM2_09460     FALSE 0.007 557.000 0.000 NA   NA
 5908262 5908263 HRM2_09460 HRM2_09470     FALSE 0.006 594.000 0.000 NA   NA
 5908263 5908264 HRM2_09470 HRM2_09480     FALSE 0.006 697.000 0.000 NA   NA
 5908264 5908265 HRM2_09480 HRM2_09490     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5908265 5908266 HRM2_09490 HRM2_09500     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5908266 5908267 HRM2_09500 HRM2_09510   dnaG4 TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5908267 5908268 HRM2_09510 HRM2_09520 dnaG4   FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5908268 5908269 HRM2_09520 HRM2_09530     FALSE 0.007 523.000 0.000 NA   NA
 5908269 5908270 HRM2_09530 HRM2_09540     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 5908270 5908271 HRM2_09540 HRM2_09550   napH FALSE 0.219 101.000 0.000 NA   NA
 5908273 5908274 HRM2_09570 HRM2_09580 nagD aroH FALSE 0.056 201.000 0.000 1.000 N NA
 5908274 5908275 HRM2_09580 HRM2_09590 aroH lon2 FALSE 0.022 297.000 0.000 1.000 N NA
 5908277 5908278 HRM2_09610 HRM2_09620   chrA1 FALSE 0.089 174.000 0.000 1.000   NA
 5908278 5908279 HRM2_09620 HRM2_09630 chrA1 chrA2 TRUE 0.716 42.000 0.000 0.000   NA
 5908279 5908280 HRM2_09630 HRM2_09640 chrA2   TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5908280 5908281 HRM2_09640 HRM2_09650   ushA FALSE 0.331 72.000 0.000 NA   NA
 5908282 5908283 HRM2_09660 HRM2_09670   nifH2 FALSE 0.011 676.000 0.000 0.099   NA
 5908283 5908284 HRM2_09670 HRM2_09680 nifH2 glnB2 TRUE 0.995 29.000 0.580 1.000 N NA
 5908284 5908285 HRM2_09680 HRM2_09690 glnB2 glnB3 TRUE 1.000 -3.000 0.860 0.001 Y NA
 5908285 5908286 HRM2_09690 HRM2_09700 glnB3 nifD2 TRUE 0.987 28.000 0.294 1.000 N NA
 5908286 5908287 HRM2_09700 HRM2_09710 nifD2 nifK1 TRUE 0.999 69.000 0.902 0.001 Y NA
 5908287 5908288 HRM2_09710 HRM2_09720 nifK1 nifE TRUE 0.994 96.000 0.380 0.001 Y NA
 5908288 5908289 HRM2_09720 HRM2_09730 nifE nifK2 TRUE 1.000 7.000 0.342 0.001 Y NA
 5908289 5908290 HRM2_09730 HRM2_09740 nifK2 nifB2 TRUE 0.967 77.000 0.131 0.002   NA
 5908290 5908291 HRM2_09740 HRM2_09750 nifB2 thx TRUE 0.945 53.000 0.082 1.000   NA
 5908291 5908292 HRM2_09750 HRM2_09760 thx nifV1 TRUE 0.449 198.000 0.035 1.000 N NA
 5908293 5908294 HRM2_09770 HRM2_09780     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5908294 5908295 HRM2_09780 HRM2_09790   iciA TRUE 0.675 90.000 0.000 1.000 Y NA
 5908297 5908298 HRM2_09810 HRM2_09820 galT draG1 FALSE 0.333 75.000 0.000 1.000 N NA
 5908298 5908299 HRM2_09820 HRM2_09830 draG1 draT TRUE 0.981 21.000 0.118 1.000   NA
 5908300 5908301 HRM2_09840 HRM2_09850   modA4 FALSE 0.013 367.000 0.000 NA   NA
 5908301 5908302 HRM2_09850 HRM2_09860 modA4 modB TRUE 1.000 0.000 0.627 0.001 Y NA
 5908302 5908303 HRM2_09860 HRM2_09870 modB modC TRUE 0.999 -136.000 0.537 0.001 Y NA
 5908303 5908304 HRM2_09870 HRM2_09880 modC   TRUE 0.861 48.000 0.008 1.000   NA
 5908306 5908307 HRM2_09900 HRM2_09910   nhaD2 FALSE 0.028 399.000 0.000 0.011   NA
 5908307 5908308 HRM2_09910 HRM2_09920 nhaD2   FALSE 0.004 1050.000 0.000 NA   NA
 5908308 5908309 HRM2_09920 HRM2_09930     FALSE 0.050 204.000 0.000 NA   NA
 5908310 5908311 HRM2_09940 HRM2_09950   aac TRUE 0.809 73.000 0.000 0.055 Y NA
 5908311 5908312 HRM2_09950 HRM2_09960 aac   FALSE 0.053 214.000 0.000 1.000   NA
 5908312 5908313 HRM2_09960 HRM2_09970   hmgL FALSE 0.238 104.000 0.000 1.000   NA
 5908313 5908314 HRM2_09970 HRM2_09980 hmgL mmc TRUE 0.704 93.000 0.006 1.000 N NA
 5908314 5908315 HRM2_09980 HRM2_09990 mmc   TRUE 0.995 4.000 0.006 1.000 Y NA
 5908315 5908316 HRM2_09990 HRM2_10000   acsL2 TRUE 0.909 27.000 0.000 0.055 Y NA
 5908316 5908317 HRM2_10000 HRM2_10010 acsL2 acd3 TRUE 0.987 30.000 0.074 1.000 Y NA
 5908318 5908319 HRM2_10020 HRM2_10030   mcmL TRUE 0.947 78.000 0.146 1.000 N NA
 5908319 5908320 HRM2_10030 HRM2_10040 mcmL atoB2 TRUE 0.928 83.000 0.015 1.000 Y NA
 5908320 5908321 HRM2_10040 HRM2_10050 atoB2   FALSE 0.042 511.000 0.000 1.000 Y NA
 5908321 5908322 HRM2_10050 HRM2_10060   pepP TRUE 0.549 27.000 0.000 1.000 N NA
 5908322 5908323 HRM2_10060 HRM2_10070 pepP   FALSE 0.343 62.000 0.000 NA N NA
 5908325 5908326 HRM2_10090 HRM2_10100 nemA   FALSE 0.020 297.000 0.000 NA   NA
 5908327 5908328 HRM2_10110 HRM2_10120     TRUE 0.631 46.000 0.000 0.040   NA
 5908328 5908329 HRM2_10120 HRM2_10130     TRUE 0.691 16.000 0.000 1.000 N NA
 5908329 5908330 HRM2_10130 HRM2_10140     FALSE 0.168 125.000 0.000 1.000 N NA
 5908332 5908333 HRM2_10160 HRM2_10170 spk   TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5908336 5908337 HRM2_10200 HRM2_10210     TRUE 0.531 27.000 0.000 NA   NA
 5908338 5908339 HRM2_10220 HRM2_10230 mcpA2   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908340 5908341 HRM2_10240 HRM2_10250     FALSE 0.337 79.000 0.000 1.000   NA
 5908341 5908342 HRM2_10250 HRM2_10260   corA1 TRUE 0.689 -124.000 0.000 1.000   NA
 5908346 5908347 HRM2_10300 HRM2_10310 tpx fumC TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5908347 5908348 HRM2_10310 HRM2_10320 fumC nfnB1 TRUE 0.854 31.000 0.000 1.000 Y NA
 5908348 5908349 HRM2_10320 HRM2_10330 nfnB1   TRUE 0.691 14.000 0.000 NA N NA
 5908349 5908350 HRM2_10330 HRM2_10340   pldA TRUE 0.950 -3.000 0.000 NA N NA
 5908350 5908351 HRM2_10340 HRM2_10350 pldA   FALSE 0.083 168.000 0.000 NA   NA
 5908351 5908352 HRM2_10350 HRM2_10360     FALSE 0.299 79.000 0.000 NA   NA
 5908352 5908353 HRM2_10360 HRM2_10370     FALSE 0.227 98.000 0.000 NA   NA
 5908354 5908355 HRM2_10380 HRM2_10390     FALSE 0.100 153.000 0.000 NA   NA
 5908357 5908358 HRM2_10410 HRM2_10420     TRUE 0.648 20.000 0.000 1.000   NA
 5908358 5908359 HRM2_10420 HRM2_10430     TRUE 1.000 -3.000 0.107 1.000 Y NA
 5908359 5908360 HRM2_10430 HRM2_10440   dgkA TRUE 0.857 -18.000 0.000 1.000 N NA
 5908360 5908361 HRM2_10440 HRM2_10450 dgkA   TRUE 0.938 -63.000 0.000 1.000 Y NA
 5908361 5908362 HRM2_10450 HRM2_10460     TRUE 0.857 150.000 0.182 1.000   NA
 5908362 5908363 HRM2_10460 HRM2_10470     FALSE 0.121 151.000 0.000 1.000   NA
 5908363 5908364 HRM2_10470 HRM2_10480     FALSE 0.307 77.000 0.000 NA   NA
 5908365 5908366 HRM2_10490 HRM2_10500     FALSE 0.095 157.000 0.000 NA   NA
 5908366 5908367 HRM2_10500 HRM2_10510   argH1 TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5908367 5908368 HRM2_10510 HRM2_10520 argH1 lysA2 TRUE 0.996 3.000 0.071 1.000 N NA
 5908369 5908370 HRM2_10530 HRM2_10540     FALSE 0.017 339.000 0.000 1.000   NA
 5908371 5908372 HRM2_10550 HRM2_10560     FALSE 0.305 110.000 0.000 0.099 N NA
 5908373 5908374 HRM2_10570 HRM2_10580     FALSE 0.321 83.000 0.000 1.000   NA
 5908377 5908378 HRM2_10610 HRM2_10620 acnA   FALSE 0.376 60.000 0.000 NA   NA
 5908378 5908379 HRM2_10620 HRM2_10630   lysA3 TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5908380 5908381 HRM2_10640 HRM2_10650   gpsA1 TRUE 0.905 4.000 0.000 1.000   NA
 5908382 5908383 HRM2_10660 HRM2_10670     FALSE 0.111 146.000 0.000 NA   NA
 5908383 5908384 HRM2_10670 HRM2_10680     TRUE 0.959 16.000 0.024 NA   NA
 5908384 5908385 HRM2_10680 HRM2_10690     TRUE 0.999 0.000 0.021 0.001 Y NA
 5908385 5908386 HRM2_10690 HRM2_10700     TRUE 1.000 27.000 0.822 0.001 Y NA
 5908386 5908387 HRM2_10700 HRM2_10710     TRUE 0.999 36.000 0.797 0.003 Y NA
 5908387 5908388 HRM2_10710 HRM2_10720     TRUE 0.564 28.000 0.000 1.000   NA
 5908389 5908390 HRM2_10730 HRM2_10740 acd4   TRUE 0.996 19.000 0.500 1.000   NA
 5908390 5908391 HRM2_10740 HRM2_10750     FALSE 0.051 218.000 0.000 1.000   NA
 5908393 5908394 HRM2_10770 HRM2_10780   era TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 5908394 5908395 HRM2_10780 HRM2_10790 era engB TRUE 0.932 27.000 0.004 0.003   NA
 5908395 5908396 HRM2_10790 HRM2_10800 engB aspC2 TRUE 0.993 -3.000 0.004 1.000   NA
 5908396 5908397 HRM2_10800 HRM2_10810 aspC2 hisG TRUE 0.997 0.000 0.002 1.000 Y NA
 5908397 5908398 HRM2_10810 HRM2_10820 hisG hisI TRUE 0.999 -3.000 0.035 0.004 Y NA
 5908400 5908401 HRM2_10840 HRM2_10850     TRUE 0.905 4.000 0.000 1.000   NA
 5908401 5908402 HRM2_10850 HRM2_10860   dksA3 TRUE 0.954 14.000 0.007 1.000   NA
 5908402 5908403 HRM2_10860 HRM2_10870 dksA3 hemA FALSE 0.146 132.000 0.000 1.000 N NA
 5908403 5908404 HRM2_10870 HRM2_10880 hemA ccmC1 TRUE 0.897 103.000 0.112 1.000 N NA
 5908404 5908405 HRM2_10880 HRM2_10890 ccmC1 cysG TRUE 0.951 54.000 0.104 1.000 N NA
 5908408 5908409 HRM2_10920 HRM2_10930 fur feoB1 TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5908409 5908410 HRM2_10930 HRM2_10940 feoB1   FALSE 0.403 45.000 0.000 NA N NA
 5908410 5908411 HRM2_10940 HRM2_10950     TRUE 0.458 38.000 0.000 NA   NA
 5908412 5908413 HRM2_10960 HRM2_10970     TRUE 0.509 29.000 0.000 NA   NA
 5908413 5908414 HRM2_10970 HRM2_10980     TRUE 0.990 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5908415 5908416 HRM2_10990 HRM2_11000 pilM pilN TRUE 1.000 -3.000 0.143 NA Y NA
 5908416 5908417 HRM2_11000 HRM2_11010 pilN pilO TRUE 1.000 -54.000 0.770 NA Y NA
 5908417 5908418 HRM2_11010 HRM2_11020 pilO pilP TRUE 1.000 -3.000 0.680 NA Y NA
 5908418 5908419 HRM2_11020 HRM2_11030 pilP pilQ TRUE 0.997 64.000 0.668 NA Y NA
 5908420 5908421 HRM2_11040 HRM2_11050     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5908421 5908422 HRM2_11050 HRM2_11060   thrC TRUE 0.993 -3.000 0.005 NA   NA
 5908422 5908423 HRM2_11060 HRM2_11070 thrC serS TRUE 0.979 -13.000 0.004 1.000 N NA
 5908426 5908427 HRM2_11100 HRM2_11110 pcm   TRUE 0.997 3.000 0.102 NA   NA
 5908427 5908428 HRM2_11110 HRM2_11120     TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5908429 5908430 HRM2_11130 HRM2_11140 lysR coaD TRUE 0.983 3.000 0.002 1.000 N NA
 5908430 5908431 HRM2_11140 HRM2_11150 coaD   TRUE 0.995 16.000 0.367 1.000 N NA
 5908431 5908432 HRM2_11150 HRM2_11160     TRUE 0.993 -3.000 0.004 1.000 N NA
 5908432 5908433 HRM2_11160 HRM2_11170     TRUE 0.998 43.000 0.533 0.072 Y NA
 5908433 5908434 HRM2_11170 HRM2_11180     TRUE 0.953 21.000 0.037 NA   NA
 5908434 5908435 HRM2_11180 HRM2_11190   lpxC TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908436 5908437 HRM2_11200 HRM2_11210   hslO TRUE 0.931 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5908437 5908438 HRM2_11210 HRM2_11220 hslO   FALSE 0.161 124.000 0.000 NA   NA
 5908438 5908439 HRM2_11220 HRM2_11230   iorA1 TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5908439 5908440 HRM2_11230 HRM2_11240 iorA1 iorB1 TRUE 0.997 29.000 0.237 0.002 Y NA
 5908440 5908441 HRM2_11240 HRM2_11250 iorB1 gspF1 TRUE 0.580 24.000 0.000 1.000 N NA
 5908442 5908443 HRM2_11260 HRM2_11270     TRUE 0.971 104.000 0.436 1.000   NA
 5908443 5908444 HRM2_11270 HRM2_11280     FALSE 0.179 126.000 0.000 1.000   NA
 5908444 5908445 HRM2_11280 HRM2_11290     TRUE 0.443 42.000 0.000 NA   NA
 5908445 5908446 HRM2_11290 HRM2_11300   gspE1 TRUE 0.970 -16.000 0.002 NA   NA
 5908446 5908447 HRM2_11300 HRM2_11310 gspE1 gspD1 TRUE 1.000 -3.000 0.085 0.003 Y NA
 5908447 5908448 HRM2_11310 HRM2_11320 gspD1 gspC TRUE 0.997 -10.000 0.029 1.000 Y NA
 5908448 5908449 HRM2_11320 HRM2_11330 gspC   TRUE 0.996 -3.000 0.022 NA   NA
 5908449 5908450 HRM2_11330 HRM2_11340     TRUE 0.999 -3.000 0.158 NA   NA
 5908450 5908451 HRM2_11340 HRM2_11350     TRUE 0.986 12.000 0.068 1.000   NA
 5908451 5908452 HRM2_11350 HRM2_11360   gspK1 TRUE 0.997 1.000 0.034 0.045   NA
 5908452 5908453 HRM2_11360 HRM2_11370 gspK1 gspJ1 TRUE 0.999 6.000 0.417 1.000   NA
 5908453 5908454 HRM2_11370 HRM2_11380 gspJ1   TRUE 0.745 -52.000 0.000 NA   NA
 5908454 5908455 HRM2_11380 HRM2_11390     TRUE 0.859 -16.000 0.000 NA   NA
 5908455 5908456 HRM2_11390 HRM2_11400   gspG1 TRUE 0.676 -88.000 0.000 NA   NA
 5908459 5908460 HRM2_11430 HRM2_11440 dnaJ2 ptpS TRUE 0.841 46.000 0.005 1.000 N NA
 5908462 5908463 HRM2_11460 HRM2_11470 ftsE ftsX TRUE 0.999 15.000 0.431 1.000 Y NA
 5908463 5908464 HRM2_11470 HRM2_11480 ftsX   TRUE 0.997 -36.000 0.075 1.000 Y NA
 5908464 5908465 HRM2_11480 HRM2_11490   ctpA2 TRUE 1.000 2.000 0.408 0.015 N NA
 5908465 5908466 HRM2_11490 HRM2_11500 ctpA2   TRUE 0.966 72.000 0.210 1.000   NA
 5908471 5908472 HRM2_11550 HRM2_11560     FALSE 0.320 74.000 0.000 NA   NA
 5908473 5908474 HRM2_11570 HRM2_11580     TRUE 0.501 30.000 0.000 NA   NA
 5908474 5908475 HRM2_11580 HRM2_11590   hypC FALSE 0.142 130.000 0.000 NA   NA
 5908475 5908476 HRM2_11590 HRM2_11600 hypC hypF TRUE 0.909 118.000 0.046 NA Y NA
 5908476 5908477 HRM2_11600 HRM2_11610 hypF hypD TRUE 0.998 1.000 0.023 1.000 Y NA
 5908477 5908478 HRM2_11610 HRM2_11620 hypD hypE TRUE 0.950 190.000 0.353 1.000 Y NA
 5908479 5908480 HRM2_11630 HRM2_11640     TRUE 0.575 27.000 0.000 1.000   NA
 5908481 5908482 HRM2_11650 HRM2_11660 trxA1   FALSE 0.016 326.000 0.000 NA   NA
 5908483 5908484 HRM2_11670 HRM2_11680 hyaD1 hysA TRUE 0.986 81.000 0.214 1.000 Y NA
 5908484 5908485 HRM2_11680 HRM2_11690 hysA hysB TRUE 0.999 37.000 0.571 0.001 Y NA
 5908486 5908487 HRM2_11700 HRM2_11710 hyaD2 hdrA1 TRUE 0.625 101.000 0.000 1.000 Y NA
 5908487 5908488 HRM2_11710 HRM2_11720 hdrA1 mvhD2 TRUE 0.997 28.000 0.400 1.000 Y NA
 5908488 5908489 HRM2_11720 HRM2_11730 mvhD2 mvhG TRUE 0.990 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5908489 5908490 HRM2_11730 HRM2_11740 mvhG mvhA TRUE 1.000 3.000 0.778 1.000 Y NA
 5908492 5908493 HRM2_11760 HRM2_11770     FALSE 0.013 357.000 0.000 NA   NA
 5908493 5908494 HRM2_11770 HRM2_11780     FALSE 0.005 801.000 0.000 NA   NA
 5908494 5908495 HRM2_11780 HRM2_11790     FALSE 0.030 253.000 0.000 NA   NA
 5908495 5908496 HRM2_11790 HRM2_11800     TRUE 0.562 24.000 0.000 NA   NA
 5908496 5908497 HRM2_11800 HRM2_11810     FALSE 0.019 320.000 0.000 1.000   NA
 5908497 5908498 HRM2_11810 HRM2_11820     FALSE 0.144 317.000 0.000 0.032 Y NA
 5908498 5908499 HRM2_11820 HRM2_11830     TRUE 0.799 52.000 0.000 1.000 Y NA
 5908499 5908500 HRM2_11830 HRM2_11840     TRUE 0.750 14.000 0.000 1.000   NA
 5908500 5908501 HRM2_11840 HRM2_11850   hdrA2 TRUE 0.648 20.000 0.000 1.000   NA
 5908501 5908502 HRM2_11850 HRM2_11860 hdrA2 mvhD3 TRUE 0.741 73.000 0.000 1.000 Y NA
 5908502 5908503 HRM2_11860 HRM2_11870 mvhD3 fdhB3 TRUE 0.850 -22.000 0.000 1.000   NA
 5908503 5908504 HRM2_11870 HRM2_11880 fdhB3 fdhA3 TRUE 0.832 18.000 0.000 0.004   NA
 5908504 5908505 HRM2_11880 HRM2_11890 fdhA3   FALSE 0.098 168.000 0.000 1.000   NA
 5908505 5908506 HRM2_11890 HRM2_11900     TRUE 0.925 16.000 0.000 1.000 Y NA
 5908506 5908507 HRM2_11900 HRM2_11910     TRUE 0.816 40.000 0.000 NA Y NA
 5908507 5908508 HRM2_11910 HRM2_11920   gloB FALSE 0.262 89.000 0.000 NA   NA
 5908511 5908512 HRM2_11950 HRM2_11960 acsM2   TRUE 1.000 -13.000 0.750 1.000   NA
 5908512 5908513 HRM2_11960 HRM2_11970   tatD2 FALSE 0.253 91.000 0.000 NA   NA
 5908513 5908514 HRM2_11970 HRM2_11980 tatD2 gpsA2 FALSE 0.311 71.000 0.000 NA N NA
 5908514 5908515 HRM2_11980 HRM2_11990 gpsA2   FALSE 0.009 457.000 0.000 NA   NA
 5908515 5908516 HRM2_11990 HRM2_12000     TRUE 1.000 0.000 0.714 NA   NA
 5908516 5908517 HRM2_12000 HRM2_12010     TRUE 0.797 11.000 0.000 1.000 N NA
 5908517 5908518 HRM2_12010 HRM2_12020     FALSE 0.013 380.000 0.000 1.000 N NA
 5908518 5908519 HRM2_12020 HRM2_12030     FALSE 0.253 91.000 0.000 NA   NA
 5908519 5908520 HRM2_12030 HRM2_12040     FALSE 0.019 302.000 0.000 NA   NA
 5908520 5908521 HRM2_12040 HRM2_12050     FALSE 0.072 180.000 0.000 NA   NA
 5908521 5908522 HRM2_12050 HRM2_12060     FALSE 0.012 381.000 0.000 NA   NA
 5908522 5908523 HRM2_12060 HRM2_12070     TRUE 0.553 29.000 0.000 1.000   NA
 5908523 5908524 HRM2_12070 HRM2_12080   atoS1 TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.072 Y NA
 5908524 5908525 HRM2_12080 HRM2_12090 atoS1   TRUE 1.000 -3.000 0.800 NA   NA
 5908525 5908526 HRM2_12090 HRM2_12100     TRUE 0.852 6.000 0.000 NA   NA
 5908526 5908527 HRM2_12100 HRM2_12110     TRUE 0.989 115.000 1.000 NA   NA
 5908529 5908530 HRM2_12130 HRM2_12140     TRUE 1.000 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 5908530 5908531 HRM2_12140 HRM2_12150     FALSE 0.284 87.000 0.000 1.000 N NA
 5908531 5908532 HRM2_12150 HRM2_12160   leuA1 TRUE 0.777 62.000 0.000 1.000 Y NA
 5908535 5908536 HRM2_12190 HRM2_12200 dctP3 dctQ3 TRUE 0.999 -16.000 0.667 NA N NA
 5908536 5908537 HRM2_12200 HRM2_12210 dctQ3 dctM3 TRUE 0.999 12.000 1.000 NA N NA
 5908538 5908539 HRM2_12220 HRM2_12230     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5908539 5908540 HRM2_12230 HRM2_12240     TRUE 0.999 3.000 0.067 0.012 Y NA
 5908540 5908541 HRM2_12240 HRM2_12250     TRUE 0.816 71.000 0.000 0.060 Y NA
 5908541 5908542 HRM2_12250 HRM2_12260   hisP TRUE 0.806 49.000 0.000 1.000 Y NA
 5908543 5908544 HRM2_12270 HRM2_12280 ispG proS TRUE 0.919 18.000 0.004 1.000 N NA
 5908544 5908545 HRM2_12280 HRM2_12290 proS relA TRUE 0.921 20.000 0.007 1.000 N NA
 5908546 5908547 HRM2_12300 HRM2_12310 rpmB   FALSE 0.385 162.000 0.003 1.000   NA
 5908547 5908548 HRM2_12310 HRM2_12320   trxB TRUE 0.799 81.000 0.013 1.000   NA
 5908548 5908549 HRM2_12320 HRM2_12330 trxB trxA2 TRUE 0.966 36.000 0.107 1.000   NA
 5908555 5908556 HRM2_12390 HRM2_12400 rpsA1 gap2 FALSE 0.387 62.000 0.000 1.000 N NA
 5908556 5908557 HRM2_12400 HRM2_12410 gap2   TRUE 0.985 10.000 0.042 1.000   NA
 5908557 5908558 HRM2_12410 HRM2_12420     FALSE 0.183 125.000 0.000 1.000   NA
 5908558 5908559 HRM2_12420 HRM2_12430     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5908559 5908560 HRM2_12430 HRM2_12440     TRUE 1.000 3.000 0.674 NA   NA
 5908560 5908561 HRM2_12440 HRM2_12450   ltaE TRUE 0.682 18.000 0.000 1.000   NA
 5908561 5908562 HRM2_12450 HRM2_12460 ltaE putA1 TRUE 0.897 21.000 0.000 1.000 Y NA
 5908562 5908563 HRM2_12460 HRM2_12470 putA1 lldD TRUE 0.941 -6.000 0.000 1.000 N NA
 5908563 5908564 HRM2_12470 HRM2_12480 lldD   TRUE 0.845 62.000 0.000 0.040 Y NA
 5908565 5908566 HRM2_12490 HRM2_12500     TRUE 0.997 3.000 0.111 NA   NA
 5908567 5908568 HRM2_12510 HRM2_12520     FALSE 0.018 331.000 0.000 1.000   NA
 5908568 5908569 HRM2_12520 HRM2_12530   hmrR2 FALSE 0.270 129.000 0.000 0.049   NA
 5908569 5908570 HRM2_12530 HRM2_12540 hmrR2 xerD2 TRUE 0.936 -18.000 0.000 0.009   NA
 5908573 5908574 HRM2_12570 HRM2_12580 azlC   TRUE 0.999 -7.000 0.254 NA   NA
 5908578 5908579 HRM2_12620 HRM2_12630 mraZ mraW TRUE 0.995 31.000 0.635 NA   NA
 5908579 5908580 HRM2_12630 HRM2_12640 mraW   TRUE 0.998 5.000 0.227 1.000   NA
 5908580 5908581 HRM2_12640 HRM2_12650   ftsI TRUE 0.743 119.000 0.032 1.000   NA
 5908581 5908582 HRM2_12650 HRM2_12660 ftsI murE TRUE 0.999 4.000 0.107 1.000 Y NA
 5908582 5908583 HRM2_12660 HRM2_12670 murE murF TRUE 1.000 -3.000 0.099 0.002 Y NA
 5908583 5908584 HRM2_12670 HRM2_12680 murF mraY TRUE 1.000 4.000 0.309 0.005 Y NA
 5908584 5908585 HRM2_12680 HRM2_12690 mraY murD TRUE 1.000 11.000 0.647 0.005 Y NA
 5908585 5908586 HRM2_12690 HRM2_12700 murD ftsW TRUE 1.000 -3.000 0.297 0.002 N NA
 5908586 5908587 HRM2_12700 HRM2_12710 ftsW murG1 TRUE 0.997 -7.000 0.098 1.000 N NA
 5908587 5908588 HRM2_12710 HRM2_12720 murG1 murC TRUE 1.000 1.000 0.270 1.000 Y NA
 5908588 5908589 HRM2_12720 HRM2_12730 murC murB TRUE 0.999 9.000 0.136 0.005 Y NA
 5908589 5908590 HRM2_12730 HRM2_12740 murB ftsQ TRUE 0.921 65.000 0.070 NA   NA
 5908590 5908591 HRM2_12740 HRM2_12750 ftsQ ftsA TRUE 0.996 13.000 0.389 NA   NA
 5908591 5908592 HRM2_12750 HRM2_12760 ftsA ftsZ TRUE 0.998 20.000 0.460 1.000 Y NA
 5908592 5908593 HRM2_12760 HRM2_12770 ftsZ   TRUE 0.987 4.000 0.015 1.000 N NA
 5908593 5908594 HRM2_12770 HRM2_12780   trmH1 FALSE 0.284 87.000 0.000 1.000 N NA
 5908594 5908595 HRM2_12780 HRM2_12790 trmH1   FALSE 0.312 76.000 0.000 NA   NA
 5908596 5908597 HRM2_12800 HRM2_12810   sseA FALSE 0.094 159.000 0.000 NA   NA
 5908597 5908598 HRM2_12810 HRM2_12820 sseA   TRUE 0.486 36.000 0.000 1.000 N NA
 5908599 5908600 HRM2_12830 HRM2_12840     FALSE 0.055 199.000 0.000 NA   NA
 5908602 5908603 HRM2_12860 HRM2_12870     FALSE 0.035 234.000 0.000 NA   NA
 5908604 5908605 HRM2_12880 HRM2_12890     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5908605 5908606 HRM2_12890 HRM2_12900   appF1 TRUE 0.956 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5908606 5908607 HRM2_12900 HRM2_12910 appF1 appD TRUE 0.995 0.000 0.000 0.002 Y NA
 5908607 5908608 HRM2_12910 HRM2_12920 appD appC TRUE 1.000 -3.000 0.528 1.000 Y NA
 5908608 5908609 HRM2_12920 HRM2_12930 appC appB TRUE 1.000 4.000 0.694 0.049 Y NA
 5908609 5908610 HRM2_12930 HRM2_12940 appB appA TRUE 0.998 82.000 0.697 0.049 Y NA
 5908610 5908611 HRM2_12940 HRM2_12950 appA   FALSE 0.332 80.000 0.000 1.000   NA
 5908611 5908612 HRM2_12950 HRM2_12960     TRUE 0.713 16.000 0.000 1.000   NA
 5908612 5908613 HRM2_12960 HRM2_12970     FALSE 0.010 423.000 0.000 NA   NA
 5908614 5908615 HRM2_12980 HRM2_12990 lysM1   TRUE 0.948 24.000 0.034 1.000   NA
 5908620 5908621 HRM2_13040 HRM2_13050     TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 5908621 5908622 HRM2_13050 HRM2_13060     FALSE 0.194 121.000 0.000 1.000   NA
 5908622 5908623 HRM2_13060 HRM2_13070     TRUE 0.974 22.000 0.083 1.000   NA
 5908623 5908624 HRM2_13070 HRM2_13080     FALSE 0.317 75.000 0.000 NA   NA
 5908624 5908625 HRM2_13080 HRM2_13090     TRUE 0.994 7.000 0.111 NA   NA
 5908625 5908626 HRM2_13090 HRM2_13100     TRUE 0.489 32.000 0.000 NA   NA
 5908626 5908627 HRM2_13100 HRM2_13110     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908627 5908628 HRM2_13110 HRM2_13120     TRUE 0.998 -3.000 0.069 NA   NA
 5908628 5908629 HRM2_13120 HRM2_13130     TRUE 0.981 42.000 0.276 NA   NA
 5908629 5908630 HRM2_13130 HRM2_13140     TRUE 0.996 13.000 0.385 NA   NA
 5908630 5908631 HRM2_13140 HRM2_13150     TRUE 1.000 -3.000 0.500 NA   NA
 5908631 5908632 HRM2_13150 HRM2_13160     TRUE 0.993 26.000 0.444 NA   NA
 5908632 5908633 HRM2_13160 HRM2_13170     TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5908633 5908634 HRM2_13170 HRM2_13180     TRUE 0.797 22.000 0.000 0.003   NA
 5908634 5908635 HRM2_13180 HRM2_13190     TRUE 0.989 100.000 0.800 NA   NA
 5908635 5908636 HRM2_13190 HRM2_13200     TRUE 0.985 24.000 0.200 NA   NA
 5908636 5908637 HRM2_13200 HRM2_13210     TRUE 0.941 87.000 0.167 NA   NA
 5908637 5908638 HRM2_13210 HRM2_13220     FALSE 0.032 245.000 0.000 NA   NA
 5908638 5908639 HRM2_13220 HRM2_13230   ddlB1 TRUE 0.930 42.000 0.050 1.000 N NA
 5908639 5908640 HRM2_13230 HRM2_13240 ddlB1 ddlB2 TRUE 1.000 -3.000 0.200 0.001 Y NA
 5908640 5908641 HRM2_13240 HRM2_13250 ddlB2 kamA2 TRUE 0.968 101.000 0.400 1.000 N NA
 5908641 5908642 HRM2_13250 HRM2_13260 kamA2   FALSE 0.017 321.000 0.000 1.000 N NA
 5908642 5908643 HRM2_13260 HRM2_13270     FALSE 0.177 115.000 0.000 NA   NA
 5908644 5908645 HRM2_13280 HRM2_13290 sulP1   TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5908645 5908646 HRM2_13290 HRM2_13300     FALSE 0.005 716.000 0.000 NA   NA
 5908647 5908648 HRM2_13310 HRM2_13320 atpG atpA1 TRUE 0.999 -34.000 0.152 0.004 Y NA
 5908648 5908649 HRM2_13320 HRM2_13330 atpA1 atpF1 TRUE 1.000 -6.000 0.697 0.004 Y NA
 5908649 5908650 HRM2_13330 HRM2_13340 atpF1 atpE1 TRUE 1.000 0.000 0.727 0.004 Y NA
 5908650 5908651 HRM2_13340 HRM2_13350 atpE1 atpB1 TRUE 0.993 -7.000 0.000 0.004 Y NA
 5908651 5908652 HRM2_13350 HRM2_13360 atpB1   TRUE 0.999 -34.000 0.767 NA   NA
 5908652 5908653 HRM2_13360 HRM2_13370   atpI1 TRUE 0.999 3.000 0.491 NA   NA
 5908653 5908654 HRM2_13370 HRM2_13380 atpI1 atpC1 TRUE 1.000 -3.000 0.671 0.004   NA
 5908654 5908655 HRM2_13380 HRM2_13390 atpC1 atpD1 TRUE 1.000 -10.000 0.443 0.004 Y NA
 5908655 5908656 HRM2_13390 HRM2_13400 atpD1   FALSE 0.160 132.000 0.000 1.000   NA
 5908656 5908657 HRM2_13400 HRM2_13410     FALSE 0.324 82.000 0.000 1.000   NA
 5908657 5908658 HRM2_13410 HRM2_13420     FALSE 0.013 370.000 0.000 NA   NA
 5908659 5908660 HRM2_13430 HRM2_13440 fbp2   TRUE 1.000 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 5908660 5908661 HRM2_13440 HRM2_13450     TRUE 1.000 -9.000 0.857 1.000 Y NA
 5908661 5908662 HRM2_13450 HRM2_13460     TRUE 0.753 13.000 0.000 1.000 N NA
 5908662 5908663 HRM2_13460 HRM2_13470     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908663 5908664 HRM2_13470 HRM2_13480     TRUE 0.999 12.000 1.000 NA   NA
 5908664 5908665 HRM2_13480 HRM2_13490     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908668 5908669 HRM2_13520 HRM2_13530     TRUE 0.562 24.000 0.000 NA   NA
 5908669 5908670 HRM2_13530 HRM2_13540     FALSE 0.372 61.000 0.000 NA   NA
 5908670 5908671 HRM2_13540 HRM2_13550     TRUE 0.947 0.000 0.000 1.000 N NA
 5908671 5908672 HRM2_13550 HRM2_13560   hom TRUE 0.965 28.000 0.006 1.000 Y NA
 5908673 5908674 HRM2_13570 HRM2_13580 purM   TRUE 0.640 19.000 0.000 1.000 N NA
 5908677 5908678 HRM2_13610 HRM2_13620     TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5908678 5908679 HRM2_13620 HRM2_13630   fucA TRUE 0.626 -214.000 0.000 NA   NA
 5908685 5908686 HRM2_13690 HRM2_13700     FALSE 0.274 86.000 0.000 NA   NA
 5908687 5908688 HRM2_13710 HRM2_13720     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 5908688 5908689 HRM2_13720 HRM2_13730   mae FALSE 0.158 128.000 0.000 1.000 N NA
 5908689 5908690 HRM2_13730 HRM2_13740 mae potA2 FALSE 0.092 166.000 0.000 1.000 N NA
 5908690 5908691 HRM2_13740 HRM2_13750 potA2 potB2 TRUE 1.000 -7.000 0.789 1.000 Y NA
 5908691 5908692 HRM2_13750 HRM2_13760 potB2 potC2 TRUE 1.000 -3.000 0.286 0.048 Y NA
 5908692 5908693 HRM2_13760 HRM2_13770 potC2 potD1 TRUE 0.999 -3.000 0.047 0.048 Y NA
 5908693 5908694 HRM2_13770 HRM2_13780 potD1 gspE2 TRUE 0.832 14.000 0.000 0.059 N NA
 5908694 5908695 HRM2_13780 HRM2_13790 gspE2   FALSE 0.014 345.000 0.000 NA   NA
 5908695 5908696 HRM2_13790 HRM2_13800     TRUE 1.000 -7.000 0.805 NA   NA
 5908698 5908699 HRM2_13820 HRM2_13830     TRUE 0.942 180.000 0.667 NA   NA
 5908699 5908700 HRM2_13830 HRM2_13840     TRUE 1.000 -10.000 0.734 NA   NA
 5908700 5908701 HRM2_13840 HRM2_13850   rhdA FALSE 0.084 159.000 0.000 NA N NA
 5908705 5908706 HRM2_13890 HRM2_13900     TRUE 0.715 14.000 0.000 NA   NA
 5908708 5908709 HRM2_13920 HRM2_13930     FALSE 0.245 93.000 0.000 NA   NA
 5908710 5908711 HRM2_13940 HRM2_13950     FALSE 0.312 76.000 0.000 NA   NA
 5908711 5908712 HRM2_13950 HRM2_13960     TRUE 0.916 126.000 0.250 NA   NA
 5908713 5908714 HRM2_13970 HRM2_13980     FALSE 0.119 276.000 0.000 NA Y NA
 5908714 5908715 HRM2_13980 HRM2_13990     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 5908715 5908716 HRM2_13990 HRM2_14000     FALSE 0.008 451.000 0.000 NA N NA
 5908716 5908717 HRM2_14000 HRM2_14010     TRUE 0.999 13.000 0.444 NA Y NA
 5908717 5908718 HRM2_14010 HRM2_14020     TRUE 0.999 0.000 0.138 0.001   NA
 5908718 5908719 HRM2_14020 HRM2_14030     FALSE 0.015 369.000 0.000 1.000   NA
 5908720 5908721 HRM2_14040 HRM2_14050 glnP2 glnQ2 TRUE 0.998 33.000 0.643 1.000 Y NA
 5908721 5908722 HRM2_14050 HRM2_14060 glnQ2 glnP3 TRUE 1.000 8.000 0.600 1.000 Y NA
 5908722 5908723 HRM2_14060 HRM2_14070 glnP3 glnH1 TRUE 0.587 132.000 0.000 0.048 Y NA
 5908723 5908724 HRM2_14070 HRM2_14080 glnH1   FALSE 0.026 267.000 0.000 NA   NA
 5908725 5908726 HRM2_14090 HRM2_14100 glpC   FALSE 0.014 323.000 0.000 NA N NA
 5908727 5908728 HRM2_14110 HRM2_14120 potD2 potC3 TRUE 0.967 54.000 0.013 0.048 Y NA
 5908728 5908729 HRM2_14120 HRM2_14130 potC3 potB3 TRUE 0.999 -3.000 0.027 0.048 Y NA
 5908729 5908730 HRM2_14130 HRM2_14140 potB3 potA3 TRUE 1.000 -7.000 0.545 0.048 Y NA
 5908730 5908731 HRM2_14140 HRM2_14150 potA3   FALSE 0.353 71.000 0.000 1.000 N NA
 5908731 5908732 HRM2_14150 HRM2_14160     TRUE 0.999 47.000 0.667 0.035 Y NA
 5908732 5908733 HRM2_14160 HRM2_14170     FALSE 0.243 158.000 0.000 0.001   NA
 5908734 5908735 HRM2_14180 HRM2_14190   hemE FALSE 0.031 256.000 0.000 1.000 N NA
 5908735 5908736 HRM2_14190 HRM2_14200 hemE   TRUE 0.479 44.000 0.000 1.000   NA
 5908736 5908737 HRM2_14200 HRM2_14210     TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5908738 5908739 HRM2_14220 HRM2_14230     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.039 N NA
 5908739 5908740 HRM2_14230 HRM2_14240     FALSE 0.007 579.000 0.000 1.000 N NA
 5908740 5908741 HRM2_14240 HRM2_14250     FALSE 0.329 76.000 0.000 1.000 N NA
 5908741 5908742 HRM2_14250 HRM2_14260     FALSE 0.078 179.000 0.000 1.000 N NA
 5908743 5908744 HRM2_14270 HRM2_14280 moaA1   TRUE 0.895 4.000 0.000 1.000 N NA
 5908744 5908745 HRM2_14280 HRM2_14290     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 5908745 5908746 HRM2_14290 HRM2_14300     FALSE 0.007 485.000 0.000 NA N NA
 5908746 5908747 HRM2_14300 HRM2_14310   aor4 TRUE 1.000 3.000 0.500 NA Y NA
 5908747 5908748 HRM2_14310 HRM2_14320 aor4 fdx5 TRUE 0.601 101.000 0.000 NA Y NA
 5908748 5908749 HRM2_14320 HRM2_14330 fdx5 hdrA3 TRUE 0.989 0.000 0.000 NA Y NA
 5908749 5908750 HRM2_14330 HRM2_14340 hdrA3 hdrA3' TRUE 0.988 -13.000 0.000 0.002 Y NA
 5908750 5908751 HRM2_14340 HRM2_14350 hdrA3' mvhD4 TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5908751 5908752 HRM2_14350 HRM2_14360 mvhD4 fdhB4 TRUE 0.923 3.000 0.000 1.000   NA
 5908752 5908753 HRM2_14360 HRM2_14370 fdhB4 fdhA4 TRUE 0.885 -55.000 0.000 0.004   NA
 5908753 5908754 HRM2_14370 HRM2_14380 fdhA4   TRUE 0.862 -19.000 0.000 1.000   NA
 5908754 5908755 HRM2_14380 HRM2_14390     FALSE 0.365 63.000 0.000 NA   NA
 5908755 5908756 HRM2_14390 HRM2_14400   aor5 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908759 5908760 HRM2_14430 HRM2_14440     FALSE 0.056 208.000 0.000 1.000   NA
 5908760 5908761 HRM2_14440 HRM2_14450     FALSE 0.048 297.000 0.000 0.032   NA
 5908761 5908762 HRM2_14450 HRM2_14460     FALSE 0.012 371.000 0.000 NA   NA
 5908762 5908763 HRM2_14460 HRM2_14470   lolD1 TRUE 0.819 9.000 0.000 NA   NA
 5908763 5908764 HRM2_14470 HRM2_14480 lolD1   TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5908764 5908765 HRM2_14480 HRM2_14490     FALSE 0.108 141.000 0.000 NA N NA
 5908767 5908768 HRM2_14510 HRM2_14520     FALSE 0.013 370.000 0.000 NA   NA
 5908768 5908769 HRM2_14520 HRM2_14530   cydB1 FALSE 0.172 128.000 0.000 1.000   NA
 5908769 5908770 HRM2_14530 HRM2_14540 cydB1 cydA1 TRUE 0.999 -7.000 0.095 0.058 Y NA
 5908771 5908772 HRM2_14550 HRM2_14560   aroB2 TRUE 0.899 3.000 0.000 NA N NA
 5908775 5908776 HRM2_14590 HRM2_14600     TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5908776 5908777 HRM2_14600 HRM2_14610     TRUE 0.998 -3.000 0.083 NA   NA
 5908777 5908778 HRM2_14610 HRM2_14620     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5908778 5908779 HRM2_14620 HRM2_14630     TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5908781 5908782 HRM2_14650 HRM2_14660 dbp   TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5908783 5908784 HRM2_14670 HRM2_14680   hsdR1 TRUE 0.496 34.000 0.000 1.000 N NA
 5908784 5908785 HRM2_14680 HRM2_14690 hsdR1 hsdM1 TRUE 0.988 63.000 0.112 0.048 Y NA
 5908785 5908786 HRM2_14690 HRM2_14700 hsdM1 hsdS1 TRUE 0.999 -3.000 0.061 0.048 Y NA
 5908786 5908787 HRM2_14700 HRM2_14710 hsdS1   TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5908787 5908788 HRM2_14710 HRM2_14720     TRUE 1.000 0.000 0.500 NA   NA
 5908788 5908789 HRM2_14720 HRM2_14730     FALSE 0.040 224.000 0.000 NA   NA
 5908789 5908790 HRM2_14730 HRM2_14740     FALSE 0.015 329.000 0.000 NA   NA
 5908790 5908791 HRM2_14740 HRM2_14750     TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5908791 5908792 HRM2_14750 HRM2_14760     TRUE 0.999 3.000 0.333 1.000   NA
 5908792 5908793 HRM2_14760 HRM2_14770     TRUE 0.998 9.000 0.375 1.000   NA
 5908793 5908794 HRM2_14770 HRM2_14780     TRUE 0.999 -16.000 0.750 NA   NA
 5908794 5908795 HRM2_14780 HRM2_14790     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5908795 5908796 HRM2_14790 HRM2_14800     FALSE 0.303 78.000 0.000 NA   NA
 5908796 5908797 HRM2_14800 HRM2_14810     FALSE 0.012 383.000 0.000 NA   NA
 5908797 5908798 HRM2_14810 HRM2_14820     TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5908799 5908800 HRM2_14830 HRM2_14840     TRUE 0.999 -3.000 0.118 NA   NA
 5908800 5908801 HRM2_14840 HRM2_14850     FALSE 0.113 145.000 0.000 NA   NA
 5908802 5908803 HRM2_14860 HRM2_14870   fdx6 FALSE 0.068 184.000 0.000 NA   NA
 5908803 5908804 HRM2_14870 HRM2_14880 fdx6   TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5908804 5908805 HRM2_14880 HRM2_14890     FALSE 0.401 52.000 0.000 NA   NA
 5908805 5908806 HRM2_14890 HRM2_14900     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5908806 5908807 HRM2_14900 HRM2_14910     FALSE 0.375 65.000 0.000 1.000 N NA
 5908807 5908808 HRM2_14910 HRM2_14920     FALSE 0.012 376.000 0.000 NA   NA
 5908808 5908809 HRM2_14920 HRM2_14930     FALSE 0.280 84.000 0.000 NA   NA
 5908809 5908810 HRM2_14930 HRM2_14940     FALSE 0.168 121.000 0.000 NA   NA
 5908811 5908812 HRM2_14950 HRM2_14960 hemN1   TRUE 0.691 16.000 0.000 1.000 N NA
 5908812 5908813 HRM2_14960 HRM2_14970     FALSE 0.303 121.000 0.000 0.039 N NA
 5908814 5908815 HRM2_14980 HRM2_14990     FALSE 0.028 262.000 0.000 NA   NA
 5908815 5908816 HRM2_14990 HRM2_15000     FALSE 0.052 202.000 0.000 NA   NA
 5908816 5908817 HRM2_15000 HRM2_15010     TRUE 0.439 43.000 0.000 NA   NA
 5908817 5908818 HRM2_15010 HRM2_15020     TRUE 0.999 -7.000 0.396 NA   NA
 5908818 5908819 HRM2_15020 HRM2_15030     TRUE 0.998 -3.000 0.104 NA   NA
 5908819 5908820 HRM2_15030 HRM2_15040     FALSE 0.048 207.000 0.000 NA   NA
 5908821 5908822 HRM2_15050 HRM2_15060 zntA   FALSE 0.126 149.000 0.000 1.000   NA
 5908822 5908823 HRM2_15060 HRM2_15070     TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5908823 5908824 HRM2_15070 HRM2_15080     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5908824 5908825 HRM2_15080 HRM2_15090     FALSE 0.392 55.000 0.000 NA   NA
 5908825 5908826 HRM2_15090 HRM2_15100   fixO TRUE 0.894 29.000 0.010 NA   NA
 5908826 5908827 HRM2_15100 HRM2_15110 fixO fixN TRUE 1.000 -3.000 0.600 0.000 N NA
 5908827 5908828 HRM2_15110 HRM2_15120 fixN   TRUE 0.828 98.000 0.051 NA   NA
 5908828 5908829 HRM2_15120 HRM2_15130   mopC TRUE 0.994 -9.000 0.051 NA   NA
 5908829 5908830 HRM2_15130 HRM2_15140 mopC   TRUE 0.996 -3.000 0.028 NA   NA
 5908830 5908831 HRM2_15140 HRM2_15150   mopB TRUE 0.997 4.000 0.182 NA   NA
 5908831 5908832 HRM2_15150 HRM2_15160 mopB mopA TRUE 0.906 250.000 0.400 NA Y NA
 5908832 5908833 HRM2_15160 HRM2_15170 mopA ubiE4 FALSE 0.057 200.000 0.000 1.000 N NA
 5908833 5908834 HRM2_15170 HRM2_15180 ubiE4 ubiB1 FALSE 0.283 83.000 0.000 NA   NA
 5908834 5908835 HRM2_15180 HRM2_15190 ubiB1   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908837 5908838 HRM2_15210 HRM2_15220     FALSE 0.007 563.000 0.000 NA   NA
 5908839 5908840 HRM2_15230 HRM2_15240   bioB2 FALSE 0.018 312.000 0.000 NA   NA
 5908841 5908842 HRM2_15250 HRM2_15260 acd5   TRUE 0.594 21.000 0.000 NA   NA
 5908842 5908843 HRM2_15260 HRM2_15270     FALSE 0.243 94.000 0.000 NA   NA
 5908844 5908845 HRM2_15280 HRM2_15290     TRUE 0.502 435.000 0.400 1.000 N NA
 5908845 5908846 HRM2_15290 HRM2_15300     TRUE 0.987 143.000 0.600 1.000 Y NA
 5908846 5908847 HRM2_15300 HRM2_15310     TRUE 0.994 105.000 0.500 0.058 Y NA
 5908847 5908848 HRM2_15310 HRM2_15320     TRUE 1.000 3.000 0.667 0.011 Y NA
 5908848 5908849 HRM2_15320 HRM2_15330   glnQ3 TRUE 0.998 19.000 0.333 1.000 Y NA
 5908849 5908850 HRM2_15330 HRM2_15340 glnQ3 dcyD1 TRUE 0.897 21.000 0.000 1.000 Y NA
 5908851 5908852 HRM2_15350 HRM2_15360   mrcB TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5908852 5908853 HRM2_15360 HRM2_15370 mrcB thiE FALSE 0.081 174.000 0.000 1.000 N NA
 5908853 5908854 HRM2_15370 HRM2_15380 thiE   FALSE 0.124 139.000 0.000 NA   NA
 5908855 5908856 HRM2_15390 HRM2_15400     FALSE 0.096 156.000 0.000 NA   NA
 5908859 5908860 HRM2_15430 HRM2_15440     TRUE 1.000 -16.000 1.000 0.037 Y NA
 5908860 5908861 HRM2_15440 HRM2_15450   adh6 TRUE 0.999 0.000 0.214 1.000 N NA
 5908862 5908863 HRM2_15460 HRM2_15470   clcA FALSE 0.009 939.000 0.000 0.095   NA
 5908863 5908864 HRM2_15470 HRM2_15480 clcA gap3 TRUE 0.813 11.000 0.000 1.000   NA
 5908864 5908865 HRM2_15480 HRM2_15490 gap3 gpmA1 TRUE 0.893 -49.000 0.000 0.004   NA
 5908865 5908866 HRM2_15490 HRM2_15500 gpmA1 pdxK FALSE 0.091 167.000 0.000 1.000 N NA
 5908866 5908867 HRM2_15500 HRM2_15510 pdxK   FALSE 0.239 95.000 0.000 NA   NA
 5908867 5908868 HRM2_15510 HRM2_15520     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5908869 5908870 HRM2_15530 HRM2_15540 mscC2   FALSE 0.362 69.000 0.000 1.000 N NA
 5908871 5908872 HRM2_15550 HRM2_15560     FALSE 0.008 496.000 0.000 NA   NA
 5908872 5908873 HRM2_15560 HRM2_15570     FALSE 0.004 1150.000 0.000 NA   NA
 5908873 5908874 HRM2_15570 HRM2_15580     TRUE 0.960 -7.000 0.000 0.095 N NA
 5908874 5908875 HRM2_15580 HRM2_15590     TRUE 0.998 13.000 0.545 1.000   NA
 5908875 5908876 HRM2_15590 HRM2_15600     TRUE 1.000 -7.000 0.547 1.000   NA
 5908876 5908877 HRM2_15600 HRM2_15610     TRUE 1.000 0.000 0.609 0.003 N NA
 5908877 5908878 HRM2_15610 HRM2_15620   dcyD2 FALSE 0.012 397.000 0.000 1.000 N NA
 5908878 5908879 HRM2_15620 HRM2_15630 dcyD2   FALSE 0.007 557.000 0.000 1.000 N NA
 5908880 5908881 HRM2_15640 HRM2_15650     TRUE 0.998 -54.000 0.095 0.003 Y NA
 5908881 5908882 HRM2_15650 HRM2_15660     TRUE 0.994 7.000 0.095 1.000   NA
 5908882 5908883 HRM2_15660 HRM2_15670     TRUE 0.864 7.000 0.000 1.000   NA
 5908883 5908884 HRM2_15670 HRM2_15680     FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 5908884 5908885 HRM2_15680 HRM2_15690     TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5908885 5908886 HRM2_15690 HRM2_15700     TRUE 0.836 69.000 0.000 0.031 Y NA
 5908886 5908887 HRM2_15700 HRM2_15710     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.021   NA
 5908887 5908888 HRM2_15710 HRM2_15720   pstS4 TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5908888 5908889 HRM2_15720 HRM2_15730 pstS4   TRUE 0.522 25.000 0.000 NA N NA
 5908889 5908890 HRM2_15730 HRM2_15740     FALSE 0.380 59.000 0.000 NA   NA
 5908890 5908891 HRM2_15740 HRM2_15750     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908891 5908892 HRM2_15750 HRM2_15760     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908892 5908893 HRM2_15760 HRM2_15770     TRUE 1.000 -19.000 1.000 NA Y NA
 5908893 5908894 HRM2_15770 HRM2_15780     TRUE 0.842 67.000 0.021 NA N NA
 5908894 5908895 HRM2_15780 HRM2_15790     FALSE 0.054 194.000 0.000 NA N NA
 5908896 5908897 HRM2_15800 HRM2_15810     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5908897 5908898 HRM2_15810 HRM2_15820     TRUE 0.940 105.000 0.250 1.000 N NA
 5908898 5908899 HRM2_15820 HRM2_15830     TRUE 1.000 -10.000 0.667 0.047 N NA
 5908899 5908900 HRM2_15830 HRM2_15840     FALSE 0.008 470.000 0.000 NA   NA
 5908900 5908901 HRM2_15840 HRM2_15850     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5908902 5908903 HRM2_15860 HRM2_15870     FALSE 0.109 152.000 0.000 1.000 N NA
 5908903 5908904 HRM2_15870 HRM2_15880     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5908905 5908906 HRM2_15890 HRM2_15900     FALSE 0.021 292.000 0.000 NA   NA
 5908906 5908907 HRM2_15900 HRM2_15910   mttB5 FALSE 0.113 156.000 0.000 1.000   NA
 5908907 5908908 HRM2_15910 HRM2_15920 mttB5   FALSE 0.275 79.000 0.000 NA N NA
 5908908 5908909 HRM2_15920 HRM2_15930   mttB6 FALSE 0.288 76.000 0.000 NA N NA
 5908910 5908911 HRM2_15940 HRM2_15950   norV FALSE 0.310 80.000 0.000 1.000 N NA
 5908912 5908913 HRM2_15960 HRM2_15970   ach1 FALSE 0.294 80.000 0.000 NA   NA
 5908915 5908916 HRM2_15990 HRM2_16000   trpD1 TRUE 0.473 35.000 0.000 NA   NA
 5908916 5908917 HRM2_16000 HRM2_16010 trpD1   TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5908917 5908918 HRM2_16010 HRM2_16020   cobT2 TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5908919 5908920 HRM2_16030 HRM2_16040     TRUE 0.581 22.000 0.000 NA   NA
 5908921 5908922 HRM2_16050 HRM2_16060   cat1 FALSE 0.008 479.000 0.000 NA   NA
 5908922 5908923 HRM2_16060 HRM2_16070 cat1 acd6 FALSE 0.370 67.000 0.000 1.000 N NA
 5908923 5908924 HRM2_16070 HRM2_16080 acd6 hbd1 TRUE 0.837 37.000 0.000 1.000 Y NA
 5908924 5908925 HRM2_16080 HRM2_16090 hbd1   FALSE 0.106 154.000 0.000 1.000 N NA
 5908925 5908926 HRM2_16090 HRM2_16100     FALSE 0.005 719.000 0.000 NA N NA
 5908926 5908927 HRM2_16100 HRM2_16110     TRUE 0.990 73.000 0.667 NA   NA
 5908927 5908928 HRM2_16110 HRM2_16120     TRUE 0.477 34.000 0.000 NA   NA
 5908928 5908929 HRM2_16120 HRM2_16130     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 5908930 5908931 HRM2_16140 HRM2_16150     TRUE 0.954 77.000 0.182 NA   NA
 5908933 5908934 HRM2_16170 HRM2_16180     TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5908934 5908935 HRM2_16180 HRM2_16190     TRUE 1.000 11.000 0.750 1.000 Y NA
 5908935 5908936 HRM2_16190 HRM2_16200     TRUE 0.916 7.000 0.000 0.047 N NA
 5908937 5908938 HRM2_16210 HRM2_16220   phnD FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 5908938 5908939 HRM2_16220 HRM2_16230 phnD   TRUE 1.000 4.000 0.867 NA N NA
 5908939 5908940 HRM2_16230 HRM2_16240     TRUE 0.981 96.000 0.400 0.037   NA
 5908941 5908942 HRM2_16250 HRM2_16260   ppsA4 TRUE 0.731 15.000 0.000 1.000   NA
 5908943 5908944 HRM2_16270 HRM2_16280     FALSE 0.025 381.000 0.000 0.058   NA
 5908944 5908945 HRM2_16280 HRM2_16290     TRUE 0.997 65.000 0.500 0.095 Y NA
 5908945 5908946 HRM2_16290 HRM2_16300     TRUE 1.000 -3.000 0.929 1.000 N NA
 5908946 5908947 HRM2_16300 HRM2_16310     TRUE 1.000 -3.000 0.459 1.000 Y NA
 5908947 5908948 HRM2_16310 HRM2_16320     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5908949 5908950 HRM2_16330 HRM2_16340 trkA2 trkB TRUE 1.000 -3.000 0.270 0.004 Y NA
 5908950 5908951 HRM2_16340 HRM2_16350 trkB lysM2 TRUE 0.698 17.000 0.000 1.000   NA
 5908952 5908953 HRM2_16360 HRM2_16370   motA1 TRUE 0.929 2.000 0.000 1.000 N NA
 5908953 5908954 HRM2_16370 HRM2_16380 motA1 motB1 TRUE 0.819 45.000 0.000 1.000 Y NA
 5908954 5908955 HRM2_16380 HRM2_16390 motB1 ptsN1 TRUE 0.439 47.000 0.000 1.000 N NA
 5908955 5908956 HRM2_16390 HRM2_16400 ptsN1 eriC1 TRUE 0.990 10.000 0.077 1.000 N NA
 5908956 5908957 HRM2_16400 HRM2_16410 eriC1 uspA12 TRUE 0.819 9.000 0.000 NA   NA
 5908958 5908959 HRM2_16420 HRM2_16430   kamA3 FALSE 0.044 221.000 0.000 1.000 N NA
 5908959 5908960 HRM2_16430 HRM2_16440 kamA3   FALSE 0.047 209.000 0.000 NA   NA
 5908960 5908961 HRM2_16440 HRM2_16450   recR TRUE 0.982 -10.000 0.003 NA   NA
 5908961 5908962 HRM2_16450 HRM2_16460 recR   TRUE 0.999 6.000 0.604 NA   NA
 5908962 5908963 HRM2_16460 HRM2_16470   dnaX TRUE 0.998 6.000 0.411 NA   NA
 5908963 5908964 HRM2_16470 HRM2_16480 dnaX   TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5908964 5908965 HRM2_16480 HRM2_16490     TRUE 0.594 21.000 0.000 NA   NA
 5908965 5908966 HRM2_16490 HRM2_16500     TRUE 0.918 26.000 0.016 NA   NA
 5908966 5908967 HRM2_16500 HRM2_16510   acsM3 FALSE 0.345 69.000 0.000 NA   NA
 5908967 5908968 HRM2_16510 HRM2_16520 acsM3   TRUE 0.507 37.000 0.000 1.000   NA
 5908968 5908969 HRM2_16520 HRM2_16530     TRUE 0.829 10.000 0.000 1.000   NA
 5908969 5908970 HRM2_16530 HRM2_16540     TRUE 0.995 4.000 0.087 1.000   NA
 5908970 5908971 HRM2_16540 HRM2_16550     FALSE 0.328 81.000 0.000 1.000   NA
 5908971 5908972 HRM2_16550 HRM2_16560   rsbW2 TRUE 1.000 -3.000 0.825 NA   NA
 5908972 5908973 HRM2_16560 HRM2_16570 rsbW2   TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5908974 5908975 HRM2_16580 HRM2_16590   nuoE FALSE 0.223 108.000 0.000 1.000   NA
 5908975 5908976 HRM2_16590 HRM2_16600 nuoE nuoF TRUE 0.994 22.000 0.073 0.004 Y NA
 5908976 5908977 HRM2_16600 HRM2_16610 nuoF   FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 5908978 5908979 HRM2_16620 HRM2_16630 cooC   TRUE 0.562 24.000 0.000 NA   NA
 5908979 5908980 HRM2_16630 HRM2_16640   metH3 FALSE 0.087 165.000 0.000 NA   NA
 5908980 5908981 HRM2_16640 HRM2_16650 metH3 cdhE FALSE 0.280 93.000 0.000 1.000   NA
 5908981 5908982 HRM2_16650 HRM2_16660 cdhE cdhC TRUE 0.996 91.000 0.474 0.002 Y NA
 5908982 5908983 HRM2_16660 HRM2_16670 cdhC cdhA TRUE 0.995 70.000 0.263 0.002 Y NA
 5908983 5908984 HRM2_16670 HRM2_16680 cdhA   FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 5908984 5908985 HRM2_16680 HRM2_16690   cdhD TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5908987 5908988 HRM2_16710 HRM2_16720 folD fchA TRUE 0.991 14.000 0.082 0.000 N NA
 5908989 5908990 HRM2_16730 HRM2_16740 metF1   TRUE 0.612 21.000 0.000 1.000 N NA
 5908990 5908991 HRM2_16740 HRM2_16750     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5908991 5908992 HRM2_16750 HRM2_16760   acsF TRUE 0.483 33.000 0.000 NA   NA
 5908992 5908993 HRM2_16760 HRM2_16770 acsF sucD3 TRUE 0.931 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5908993 5908994 HRM2_16770 HRM2_16780 sucD3   FALSE 0.045 213.000 0.000 NA   NA
 5908994 5908995 HRM2_16780 HRM2_16790   ispE TRUE 0.994 -3.000 0.011 NA   NA
 5908995 5908996 HRM2_16790 HRM2_16800 ispE   TRUE 0.715 14.000 0.000 NA   NA
 5908996 5908997 HRM2_16800 HRM2_16810   prsA2 FALSE 0.174 118.000 0.000 NA   NA
 5908997 5908998 HRM2_16810 HRM2_16820 prsA2 rplY TRUE 0.925 51.000 0.056 1.000 N NA
 5908998 5908999 HRM2_16820 HRM2_16830 rplY pth TRUE 1.000 10.000 0.496 0.015 Y NA
 5908999 5909000 HRM2_16830 HRM2_16840 pth   FALSE 0.347 195.000 0.010 1.000 N NA
 5909000 5909001 HRM2_16840 HRM2_16850   rluD1 TRUE 0.637 105.000 0.005 1.000 N NA
 5909003 5909004 HRM2_16870 HRM2_16880 fdhA5 putA2 FALSE 0.162 131.000 0.000 1.000   NA
 5909006 5909007 HRM2_16900 HRM2_16910     TRUE 0.474 39.000 0.000 1.000 N NA
 5909009 5909010 HRM2_16930 HRM2_16940     TRUE 0.981 18.000 0.103 NA   NA
 5909010 5909011 HRM2_16940 HRM2_16950   ftsK1 TRUE 0.998 -3.000 0.072 1.000   NA
 5909011 5909012 HRM2_16950 HRM2_16960 ftsK1   TRUE 0.990 -10.000 0.024 NA   NA
 5909012 5909013 HRM2_16960 HRM2_16970     FALSE 0.239 95.000 0.000 NA   NA
 5909013 5909014 HRM2_16970 HRM2_16980     TRUE 0.962 40.000 0.111 NA   NA
 5909014 5909015 HRM2_16980 HRM2_16990   mcpA3 FALSE 0.005 925.000 0.000 NA   NA
 5909016 5909017 HRM2_17000 HRM2_17010     TRUE 1.000 -3.000 0.700 1.000   NA
 5909017 5909018 HRM2_17010 HRM2_17020     TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 5909018 5909019 HRM2_17020 HRM2_17030   folC TRUE 0.463 37.000 0.000 NA   NA
 5909019 5909020 HRM2_17030 HRM2_17040 folC   TRUE 0.925 64.000 0.067 1.000   NA
 5909020 5909021 HRM2_17040 HRM2_17050   adk FALSE 0.044 230.000 0.000 1.000   NA
 5909022 5909023 HRM2_17060 HRM2_17070 rho2 rpmE TRUE 0.965 40.000 0.115 1.000 N NA
 5909023 5909024 HRM2_17070 HRM2_17080 rpmE prfA TRUE 0.997 -40.000 0.110 1.000 Y NA
 5909024 5909025 HRM2_17080 HRM2_17090 prfA hemK TRUE 0.997 4.000 0.040 1.000 Y NA
 5909025 5909026 HRM2_17090 HRM2_17100 hemK rpsB FALSE 0.334 172.000 0.000 1.000 Y NA
 5909026 5909027 HRM2_17100 HRM2_17110 rpsB tsf TRUE 0.997 27.000 0.748 1.000   NA
 5909027 5909028 HRM2_17110 HRM2_17120 tsf pyrH TRUE 0.999 3.000 0.416 1.000   NA
 5909028 5909029 HRM2_17120 HRM2_17130 pyrH frr TRUE 0.996 24.000 0.626 1.000 N NA
 5909029 5909030 HRM2_17130 HRM2_17140 frr uppS TRUE 0.999 -10.000 0.409 1.000 N NA
 5909030 5909031 HRM2_17140 HRM2_17150 uppS cdsA TRUE 0.999 -30.000 0.400 1.000 Y NA
 5909031 5909032 HRM2_17150 HRM2_17160 cdsA dxr TRUE 0.999 11.000 0.372 1.000 Y NA
 5909032 5909033 HRM2_17160 HRM2_17170 dxr   TRUE 0.998 14.000 0.568 1.000 N NA
 5909033 5909034 HRM2_17170 HRM2_17180   purL TRUE 0.986 2.000 0.002 1.000 N NA
 5909034 5909035 HRM2_17180 HRM2_17190 purL purQ TRUE 0.999 0.000 0.047 0.000 Y NA
 5909035 5909036 HRM2_17190 HRM2_17200 purQ   TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5909036 5909037 HRM2_17200 HRM2_17210     FALSE 0.030 250.000 0.000 NA   NA
 5909037 5909038 HRM2_17210 HRM2_17220     TRUE 0.451 40.000 0.000 NA   NA
 5909038 5909039 HRM2_17220 HRM2_17230     FALSE 0.144 139.000 0.000 1.000   NA
 5909039 5909040 HRM2_17230 HRM2_17240     TRUE 0.999 -3.000 0.200 1.000   NA
 5909040 5909041 HRM2_17240 HRM2_17250     FALSE 0.007 584.000 0.000 1.000 N NA
 5909041 5909042 HRM2_17250 HRM2_17260     FALSE 0.010 437.000 0.000 1.000 N NA
 5909045 5909046 HRM2_17290 HRM2_17300     FALSE 0.005 884.000 0.000 NA   NA
 5909047 5909048 HRM2_17310 HRM2_17320 endA1   FALSE 0.097 310.000 0.000 1.000 Y NA
 5909048 5909049 HRM2_17320 HRM2_17330     TRUE 0.999 -10.000 0.500 NA   NA
 5909049 5909050 HRM2_17330 HRM2_17340     FALSE 0.033 242.000 0.000 NA   NA
 5909050 5909051 HRM2_17340 HRM2_17350     FALSE 0.188 110.000 0.000 NA   NA
 5909051 5909052 HRM2_17350 HRM2_17360     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5909052 5909053 HRM2_17360 HRM2_17370     FALSE 0.065 189.000 0.000 NA   NA
 5909053 5909054 HRM2_17370 HRM2_17380     FALSE 0.005 759.000 0.000 NA   NA
 5909055 5909056 HRM2_17390 HRM2_17410     FALSE 0.005 777.000 0.000 NA   NA
 5909057 5909058 HRM2_17420 HRM2_17430   purA TRUE 0.997 3.000 0.012 1.000 Y NA
 5909058 5909059 HRM2_17430 HRM2_17440 purA   TRUE 0.431 45.000 0.000 NA   NA
 5909059 5909060 HRM2_17440 HRM2_17450     FALSE 0.380 59.000 0.000 NA   NA
 5909060 5909061 HRM2_17450 HRM2_17460     FALSE 0.008 493.000 0.000 NA   NA
 5909061 5909062 HRM2_17460 HRM2_17470     FALSE 0.145 129.000 0.000 NA   NA
 5909062 5909063 HRM2_17470 HRM2_17480     FALSE 0.006 642.000 0.000 NA   NA
 5909064 5909065 HRM2_17490 HRM2_17500 ppc mscC3 TRUE 0.799 -37.000 0.000 1.000 N NA
 5909066 5909067 HRM2_17510 HRM2_17520     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909067 5909068 HRM2_17520 HRM2_17530   acd7 FALSE 0.336 71.000 0.000 NA   NA
 5909069 5909070 HRM2_17540 HRM2_17550     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5909070 5909071 HRM2_17550 HRM2_17560     TRUE 0.909 124.000 0.203 NA   NA
 5909071 5909072 HRM2_17560 HRM2_17570     TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5909073 5909074 HRM2_17580 HRM2_17590     TRUE 0.837 -22.000 0.000 1.000 N NA
 5909075 5909076 HRM2_17600 HRM2_17610     TRUE 1.000 0.000 0.389 0.047 N NA
 5909076 5909077 HRM2_17610 HRM2_17620     TRUE 0.999 17.000 0.524 NA Y NA
 5909077 5909078 HRM2_17620 HRM2_17630     FALSE 0.111 146.000 0.000 NA   NA
 5909078 5909079 HRM2_17630 HRM2_17640     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5909083 5909084 HRM2_17680 HRM2_17690 trpC trpD2 TRUE 0.997 2.000 0.007 1.000 Y NA
 5909084 5909085 HRM2_17690 HRM2_17700 trpD2 trpG TRUE 0.996 3.000 0.004 1.000 Y NA
 5909085 5909086 HRM2_17700 HRM2_17710 trpG trpE TRUE 0.999 -6.000 0.012 0.001 Y NA
 5909087 5909088 HRM2_17720 HRM2_17730     TRUE 0.451 40.000 0.000 NA   NA
 5909088 5909089 HRM2_17730 HRM2_17740   clpP2 FALSE 0.199 119.000 0.000 1.000   NA
 5909089 5909090 HRM2_17740 HRM2_17750 clpP2   TRUE 0.999 -3.000 0.143 NA   NA
 5909090 5909091 HRM2_17750 HRM2_17760     TRUE 0.880 150.000 0.258 NA   NA
 5909091 5909092 HRM2_17760 HRM2_17770     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5909092 5909093 HRM2_17770 HRM2_17780     TRUE 0.473 35.000 0.000 NA   NA
 5909093 5909094 HRM2_17780 HRM2_17790     FALSE 0.310 80.000 0.000 1.000 N NA
 5909095 5909096 HRM2_17800 HRM2_17810   atpE2 FALSE 0.239 95.000 0.000 NA   NA
 5909096 5909097 HRM2_17810 HRM2_17820 atpE2 atpB2 TRUE 0.979 106.000 0.119 0.004 Y NA
 5909097 5909098 HRM2_17820 HRM2_17830 atpB2   TRUE 0.996 1.000 0.058 1.000   NA
 5909098 5909099 HRM2_17830 HRM2_17840   atpI2 TRUE 0.994 6.000 0.094 NA   NA
 5909099 5909100 HRM2_17840 HRM2_17850 atpI2 selD1 TRUE 0.483 33.000 0.000 NA   NA
 5909100 5909101 HRM2_17850 HRM2_17860 selD1   FALSE 0.122 140.000 0.000 NA   NA
 5909101 5909102 HRM2_17860 HRM2_17870     TRUE 0.914 17.000 0.003 NA   NA
 5909102 5909103 HRM2_17870 HRM2_17880     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5909104 5909105 HRM2_17890 HRM2_17900   resR FALSE 0.004 969.000 0.000 NA   NA
 5909105 5909106 HRM2_17900 HRM2_17910 resR   FALSE 0.012 373.000 0.000 NA   NA
 5909106 5909107 HRM2_17910 HRM2_17920     FALSE 0.004 968.000 0.000 NA   NA
 5909108 5909109 HRM2_17930 HRM2_17940     FALSE 0.085 167.000 0.000 NA   NA
 5909116 5909117 HRM2_18010 HRM2_18020     FALSE 0.099 154.000 0.000 NA   NA
 5909117 5909118 HRM2_18020 HRM2_18030   leuC1 TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000   NA
 5909118 5909119 HRM2_18030 HRM2_18040 leuC1 leuD1 TRUE 0.999 -3.000 0.038 0.001 Y NA
 5909119 5909120 HRM2_18040 HRM2_18050 leuD1 thyX TRUE 0.753 13.000 0.000 1.000 N NA
 5909121 5909122 HRM2_18060 HRM2_18070 thiN   FALSE 0.361 64.000 0.000 NA   NA
 5909123 5909124 HRM2_18080 HRM2_18090     TRUE 0.473 35.000 0.000 NA   NA
 5909124 5909125 HRM2_18090 HRM2_18100     TRUE 0.999 5.000 0.631 0.043   NA
 5909125 5909126 HRM2_18100 HRM2_18110   lpxK TRUE 0.937 -7.000 0.000 1.000   NA
 5909126 5909127 HRM2_18110 HRM2_18120 lpxK msbB FALSE 0.038 568.000 0.000 1.000 Y NA
 5909127 5909128 HRM2_18120 HRM2_18130 msbB kdtX TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 5909128 5909129 HRM2_18130 HRM2_18140 kdtX tagB1 TRUE 0.994 -39.000 0.040 NA Y NA
 5909130 5909131 HRM2_18150 HRM2_18160   rfaG1 TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 5909132 5909133 HRM2_18170 HRM2_18180 hldE tagB2 TRUE 0.999 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 5909133 5909134 HRM2_18180 HRM2_18190 tagB2   TRUE 0.570 23.000 0.000 NA   NA
 5909134 5909135 HRM2_18190 HRM2_18200     FALSE 0.085 167.000 0.000 NA   NA
 5909140 5909141 HRM2_18250 HRM2_18260 kdkA kdsB TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.002   NA
 5909141 5909142 HRM2_18260 HRM2_18270 kdsB kdtA TRUE 0.908 19.000 0.000 1.000 Y NA
 5909143 5909144 HRM2_18280 HRM2_18290 msbA1   FALSE 0.007 511.000 0.000 NA   NA
 5909145 5909146 HRM2_18300 HRM2_18310 rfaF arnT TRUE 0.977 4.000 0.000 NA Y NA
 5909146 5909147 HRM2_18310 HRM2_18320 arnT   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909147 5909148 HRM2_18320 HRM2_18330   arnC TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5909149 5909150 HRM2_18340 HRM2_18350 glpK   TRUE 0.599 22.000 0.000 1.000 N NA
 5909150 5909151 HRM2_18350 HRM2_18360     TRUE 1.000 18.000 0.865 0.002 Y NA
 5909151 5909152 HRM2_18360 HRM2_18370   malK TRUE 0.999 53.000 0.847 0.046 Y NA
 5909152 5909153 HRM2_18370 HRM2_18380 malK malG TRUE 1.000 -3.000 0.922 0.046 Y NA
 5909153 5909154 HRM2_18380 HRM2_18390 malG   TRUE 0.999 10.000 0.854 NA   NA
 5909154 5909155 HRM2_18390 HRM2_18400   malE TRUE 0.980 104.000 0.640 NA   NA
 5909157 5909158 HRM2_18420 HRM2_18430     TRUE 0.994 -3.000 0.007 NA   NA
 5909158 5909159 HRM2_18430 HRM2_18440     TRUE 0.995 -3.000 0.017 NA   NA
 5909159 5909160 HRM2_18440 HRM2_18450     TRUE 0.983 25.000 0.189 NA   NA
 5909160 5909161 HRM2_18450 HRM2_18460   gmk TRUE 0.978 27.000 0.143 NA   NA
 5909161 5909162 HRM2_18460 HRM2_18470 gmk   TRUE 0.993 -3.000 0.005 1.000 N NA
 5909162 5909163 HRM2_18470 HRM2_18480   citC FALSE 0.006 640.000 0.000 1.000 N NA
 5909163 5909164 HRM2_18480 HRM2_18490 citC comF TRUE 0.950 -57.000 0.004 1.000   NA
 5909164 5909165 HRM2_18490 HRM2_18500 comF   FALSE 0.294 90.000 0.000 1.000   NA
 5909165 5909166 HRM2_18500 HRM2_18510   nahJ TRUE 0.517 35.000 0.000 1.000   NA
 5909166 5909167 HRM2_18510 HRM2_18520 nahJ   FALSE 0.013 396.000 0.000 1.000   NA
 5909168 5909169 HRM2_18530 HRM2_18540   uvrA2 TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5909169 5909170 HRM2_18540 HRM2_18550 uvrA2 pdxA TRUE 0.993 -3.000 0.005 1.000 N NA
 5909171 5909172 HRM2_18560 HRM2_18570 dnaA glcD2 TRUE 0.993 -3.000 0.004 1.000 N NA
 5909173 5909174 HRM2_18580 HRM2_18590     FALSE 0.392 55.000 0.000 NA   NA
 5909174 5909175 HRM2_18590 HRM2_18600   dnaB TRUE 0.992 -3.000 0.002 1.000   NA
 5909175 5909176 HRM2_18600 HRM2_18610 dnaB rplI TRUE 0.792 77.000 0.010 1.000 N NA
 5909176 5909177 HRM2_18610 HRM2_18620 rplI   TRUE 0.888 75.000 0.055 NA   NA
 5909177 5909178 HRM2_18620 HRM2_18630   rpsR TRUE 0.910 73.000 0.069 NA   NA
 5909178 5909179 HRM2_18630 HRM2_18640 rpsR rpsF TRUE 1.000 2.000 0.319 0.009 Y NA
 5909179 5909180 HRM2_18640 HRM2_18650 rpsF   FALSE 0.061 202.000 0.000 1.000   NA
 5909180 5909181 HRM2_18650 HRM2_18660     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5909182 5909183 HRM2_18670 HRM2_18680     TRUE 1.000 -31.000 0.529 1.000 Y NA
 5909183 5909184 HRM2_18680 HRM2_18690   degP FALSE 0.315 79.000 0.000 1.000 N NA
 5909186 5909187 HRM2_18710 HRM2_18720 ppiD1   TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 5909188 5909189 HRM2_18730 HRM2_18740   aspG FALSE 0.044 217.000 0.000 NA   NA
 5909189 5909190 HRM2_18740 HRM2_18750 aspG recX TRUE 0.918 -10.000 0.000 1.000   NA
 5909190 5909191 HRM2_18750 HRM2_18760 recX   TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5909191 5909192 HRM2_18760 HRM2_18770     TRUE 0.855 8.000 0.000 1.000   NA
 5909192 5909193 HRM2_18770 HRM2_18780     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5909193 5909194 HRM2_18780 HRM2_18790   ppiC1 TRUE 0.501 30.000 0.000 NA   NA
 5909194 5909195 HRM2_18790 HRM2_18800 ppiC1 prc FALSE 0.226 107.000 0.000 1.000   NA
 5909195 5909196 HRM2_18800 HRM2_18810 prc   TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000   NA
 5909196 5909197 HRM2_18810 HRM2_18820     TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 5909199 5909200 HRM2_18840 HRM2_18850     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 5909200 5909201 HRM2_18850 HRM2_18860     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5909201 5909202 HRM2_18860 HRM2_18870   guaA1 TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5909203 5909204 HRM2_18880 HRM2_18890 efp1   TRUE 0.851 7.000 0.000 1.000 N NA
 5909204 5909205 HRM2_18890 HRM2_18900     FALSE 0.262 89.000 0.000 NA   NA
 5909205 5909206 HRM2_18900 HRM2_18910   resB TRUE 0.435 44.000 0.000 NA   NA
 5909206 5909207 HRM2_18910 HRM2_18920 resB ccmC2 TRUE 1.000 -3.000 0.120 NA Y NA
 5909207 5909208 HRM2_18920 HRM2_18930 ccmC2   FALSE 0.055 210.000 0.000 1.000   NA
 5909208 5909209 HRM2_18930 HRM2_18940     TRUE 0.995 49.000 0.750 1.000   NA
 5909209 5909210 HRM2_18940 HRM2_18950     TRUE 0.999 33.000 0.800 NA Y NA
 5909210 5909211 HRM2_18950 HRM2_18960     TRUE 0.999 28.000 0.941 NA Y NA
 5909211 5909212 HRM2_18960 HRM2_18970     TRUE 0.965 59.000 0.176 NA   NA
 5909212 5909213 HRM2_18970 HRM2_18980     FALSE 0.184 112.000 0.000 NA   NA
 5909214 5909215 HRM2_18990 HRM2_19000   glpQ1 TRUE 0.570 23.000 0.000 NA   NA
 5909215 5909216 HRM2_19000 HRM2_19010 glpQ1   FALSE 0.020 296.000 0.000 NA   NA
 5909217 5909218 HRM2_19020 HRM2_19030 ptsH ptsA2 TRUE 1.000 -7.000 0.163 0.002 Y NA
 5909218 5909219 HRM2_19030 HRM2_19040 ptsA2 smpB TRUE 0.943 19.000 0.017 1.000 N NA
 5909220 5909221 HRM2_19050 HRM2_19060     TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5909221 5909222 HRM2_19060 HRM2_19070     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5909222 5909223 HRM2_19070 HRM2_19080     TRUE 0.923 3.000 0.000 1.000   NA
 5909223 5909224 HRM2_19080 HRM2_19090     FALSE 0.009 453.000 0.000 NA   NA
 5909224 5909225 HRM2_19090 HRM2_19100     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5909225 5909226 HRM2_19100 HRM2_19110     FALSE 0.013 353.000 0.000 NA   NA
 5909227 5909228 HRM2_19120 HRM2_19130     FALSE 0.018 306.000 0.000 NA   NA
 5909231 5909232 HRM2_19160 HRM2_19170     TRUE 0.813 11.000 0.000 1.000   NA
 5909232 5909233 HRM2_19170 HRM2_19180     TRUE 0.937 -7.000 0.000 1.000   NA
 5909233 5909234 HRM2_19180 HRM2_19190     TRUE 0.404 51.000 0.000 NA   NA
 5909235 5909236 HRM2_19200 HRM2_19210   parB FALSE 0.269 87.000 0.000 NA   NA
 5909236 5909237 HRM2_19210 HRM2_19220 parB   TRUE 0.881 -43.000 0.000 0.046   NA
 5909237 5909238 HRM2_19220 HRM2_19230   istB1 TRUE 0.999 -7.000 0.500 NA   NA
 5909238 5909239 HRM2_19230 HRM2_19240 istB1   TRUE 0.819 9.000 0.000 NA   NA
 5909241 5909242 HRM2_19260 HRM2_19270     TRUE 0.955 162.000 0.667 NA   NA
 5909242 5909243 HRM2_19270 HRM2_19280   exeA1 TRUE 0.997 -7.000 0.071 1.000   NA
 5909244 5909245 HRM2_19290 HRM2_19300     FALSE 0.280 84.000 0.000 NA   NA
 5909245 5909246 HRM2_19300 HRM2_19310     FALSE 0.008 479.000 0.000 NA   NA
 5909246 5909247 HRM2_19310 HRM2_19320   cueR TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5909248 5909249 HRM2_19330 HRM2_19340     FALSE 0.021 289.000 0.000 NA   NA
 5909249 5909250 HRM2_19340 HRM2_19350   cyaA1 TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5909251 5909252 HRM2_19360 HRM2_19370     TRUE 0.715 14.000 0.000 NA   NA
 5909252 5909253 HRM2_19370 HRM2_19380     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5909253 5909254 HRM2_19380 HRM2_19390     FALSE 0.219 101.000 0.000 NA   NA
 5909254 5909255 HRM2_19390 HRM2_19400     FALSE 0.014 350.000 0.000 NA   NA
 5909255 5909256 HRM2_19400 HRM2_19410   radC1 FALSE 0.277 85.000 0.000 NA   NA
 5909256 5909257 HRM2_19410 HRM2_19420 radC1   FALSE 0.207 104.000 0.000 NA   NA
 5909257 5909258 HRM2_19420 HRM2_19430     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909258 5909259 HRM2_19430 HRM2_19440     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 5909259 5909260 HRM2_19440 HRM2_19450     TRUE 0.448 41.000 0.000 NA   NA
 5909261 5909262 HRM2_19460 HRM2_19470     FALSE 0.294 80.000 0.000 NA   NA
 5909262 5909263 HRM2_19470 HRM2_19480     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 5909263 5909264 HRM2_19480 HRM2_19490   hsdM2 FALSE 0.007 536.000 0.000 NA   NA
 5909264 5909265 HRM2_19490 HRM2_19500 hsdM2 hsdS2 TRUE 0.999 2.000 0.054 0.046 Y NA
 5909265 5909266 HRM2_19500 HRM2_19510 hsdS2 hsdR2 TRUE 0.996 25.000 0.126 0.002 Y NA
 5909266 5909267 HRM2_19510 HRM2_19520 hsdR2   TRUE 0.994 4.000 0.068 NA   NA
 5909268 5909269 HRM2_19530 HRM2_19540     TRUE 0.594 21.000 0.000 NA   NA
 5909269 5909270 HRM2_19540 HRM2_19550     FALSE 0.004 1003.000 0.000 NA   NA
 5909272 5909273 HRM2_19570 HRM2_19580     FALSE 0.050 210.000 0.000 1.000 N NA
 5909273 5909274 HRM2_19580 HRM2_19590     TRUE 0.928 -79.000 0.000 1.000 Y NA
 5909275 5909276 HRM2_19600 HRM2_19610     TRUE 0.787 -37.000 0.000 NA   NA
 5909278 5909279 HRM2_19630 HRM2_19640     TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 5909279 5909280 HRM2_19640 HRM2_19650     FALSE 0.050 204.000 0.000 NA   NA
 5909280 5909281 HRM2_19650 HRM2_19660     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909281 5909282 HRM2_19660 HRM2_19670   gumC1 FALSE 0.010 415.000 0.000 NA   NA
 5909282 5909283 HRM2_19670 HRM2_19680 gumC1   TRUE 0.486 36.000 0.000 1.000 N NA
 5909283 5909284 HRM2_19680 HRM2_19690   cpsE TRUE 0.435 37.000 0.000 NA N NA
 5909284 5909285 HRM2_19690 HRM2_19700 cpsE   TRUE 0.988 64.000 0.185 NA Y NA
 5909285 5909286 HRM2_19700 HRM2_19710     TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5909287 5909288 HRM2_19720 HRM2_19730     FALSE 0.275 129.000 0.000 0.046   NA
 5909288 5909289 HRM2_19730 HRM2_19740   xerD3 TRUE 0.936 -18.000 0.000 0.009   NA
 5909290 5909291 HRM2_19750 HRM2_19760     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909291 5909292 HRM2_19760 HRM2_19770     TRUE 0.998 -25.000 0.478 NA   NA
 5909292 5909293 HRM2_19770 HRM2_19780     TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5909293 5909294 HRM2_19780 HRM2_19790     FALSE 0.130 135.000 0.000 NA   NA
 5909294 5909295 HRM2_19790 HRM2_19800     TRUE 1.000 -9.000 1.000 NA   NA
 5909295 5909296 HRM2_19800 HRM2_19810     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5909296 5909297 HRM2_19810 HRM2_19820     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909297 5909298 HRM2_19820 HRM2_19830     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5909298 5909299 HRM2_19830 HRM2_19840     FALSE 0.043 218.000 0.000 NA   NA
 5909299 5909300 HRM2_19840 HRM2_19850     TRUE 0.997 16.000 0.509 1.000   NA
 5909300 5909301 HRM2_19850 HRM2_19860   tuaH TRUE 0.990 3.000 0.000 0.012 Y NA
 5909301 5909302 HRM2_19860 HRM2_19870 tuaH   TRUE 0.403 64.000 0.000 1.000   NA
 5909302 5909303 HRM2_19870 HRM2_19880     TRUE 0.553 29.000 0.000 1.000   NA
 5909303 5909304 HRM2_19880 HRM2_19890     FALSE 0.301 88.000 0.000 1.000   NA
 5909304 5909305 HRM2_19890 HRM2_19900     FALSE 0.190 123.000 0.000 1.000   NA
 5909305 5909306 HRM2_19900 HRM2_19910     FALSE 0.147 138.000 0.000 1.000   NA
 5909306 5909307 HRM2_19910 HRM2_19920     FALSE 0.012 377.000 0.000 NA   NA
 5909307 5909308 HRM2_19920 HRM2_19930     FALSE 0.029 256.000 0.000 NA   NA
 5909308 5909309 HRM2_19930 HRM2_19940     FALSE 0.082 169.000 0.000 NA   NA
 5909309 5909310 HRM2_19940 HRM2_19950   rfaL TRUE 0.996 5.000 0.033 NA Y NA
 5909310 5909311 HRM2_19950 HRM2_19960 rfaL   TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5909311 5909312 HRM2_19960 HRM2_19970   rfaG2 TRUE 0.503 38.000 0.000 1.000   NA
 5909312 5909313 HRM2_19970 HRM2_19980 rfaG2   TRUE 0.983 6.000 0.000 0.012 Y NA
 5909313 5909314 HRM2_19980 HRM2_19990     TRUE 0.715 14.000 0.000 NA   NA
 5909314 5909315 HRM2_19990 HRM2_20000     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909315 5909316 HRM2_20000 HRM2_20010   carB1 TRUE 0.509 29.000 0.000 NA   NA
 5909316 5909317 HRM2_20010 HRM2_20020 carB1   TRUE 0.995 12.000 0.208 1.000   NA
 5909317 5909318 HRM2_20020 HRM2_20030     TRUE 0.963 25.000 0.069 1.000 N NA
 5909322 5909323 HRM2_20070 HRM2_20080   capA TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5909323 5909324 HRM2_20080 HRM2_20090 capA pyrK TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909324 5909325 HRM2_20090 HRM2_20100 pyrK cysK TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5909325 5909326 HRM2_20100 HRM2_20110 cysK   FALSE 0.318 84.000 0.000 1.000   NA
 5909326 5909327 HRM2_20110 HRM2_20120   istA1 TRUE 0.921 -19.000 0.000 0.046   NA
 5909327 5909328 HRM2_20120 HRM2_20130 istA1 cysS1 FALSE 0.010 441.000 0.000 1.000 N NA
 5909328 5909329 HRM2_20130 HRM2_20140 cysS1   TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5909329 5909330 HRM2_20140 HRM2_20150     TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5909330 5909331 HRM2_20150 HRM2_20160     FALSE 0.023 283.000 0.000 NA   NA
 5909333 5909334 HRM2_20180 HRM2_20190   lolD2 TRUE 0.520 30.000 0.000 1.000 N NA
 5909334 5909335 HRM2_20190 HRM2_20200 lolD2 lolE TRUE 0.862 6.000 0.000 1.000 N NA
 5909335 5909336 HRM2_20200 HRM2_20210 lolE lolF TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 5909336 5909337 HRM2_20210 HRM2_20220 lolF   TRUE 0.581 22.000 0.000 NA   NA
 5909338 5909339 HRM2_20230 HRM2_20240     FALSE 0.269 87.000 0.000 NA   NA
 5909340 5909341 HRM2_20250 HRM2_20260     FALSE 0.041 220.000 0.000 NA   NA
 5909341 5909342 HRM2_20260 HRM2_20270     FALSE 0.052 202.000 0.000 NA   NA
 5909344 5909345 HRM2_20290 HRM2_20300     TRUE 0.723 -61.000 0.000 NA   NA
 5909345 5909346 HRM2_20300 HRM2_20310   gyaR TRUE 0.814 10.000 0.000 1.000 N NA
 5909348 5909349 HRM2_20330 HRM2_20340   hisC1 FALSE 0.013 360.000 0.000 NA   NA
 5909349 5909350 HRM2_20340 HRM2_20350 hisC1 glnH2 TRUE 0.734 75.000 0.000 1.000 Y NA
 5909350 5909351 HRM2_20350 HRM2_20360 glnH2 glnP4 TRUE 0.997 11.000 0.067 0.046 Y NA
 5909351 5909352 HRM2_20360 HRM2_20370 glnP4 glnQ4 TRUE 0.997 60.000 0.600 1.000 Y NA
 5909352 5909353 HRM2_20370 HRM2_20380 glnQ4 glnP5 TRUE 1.000 -3.000 0.643 1.000 Y NA
 5909353 5909354 HRM2_20380 HRM2_20390 glnP5 glcD3 FALSE 0.373 66.000 0.000 1.000 N NA
 5909354 5909355 HRM2_20390 HRM2_20400 glcD3 glcF2 TRUE 0.933 21.000 0.000 0.037 Y NA
 5909358 5909359 HRM2_20430 HRM2_20440 fadD4   FALSE 0.027 367.000 0.000 0.038 N NA
 5909359 5909360 HRM2_20440 HRM2_20450     TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5909360 5909361 HRM2_20450 HRM2_20460     FALSE 0.023 283.000 0.000 NA   NA
 5909362 5909363 HRM2_20470 HRM2_20480 hemL mpl TRUE 0.993 2.000 0.007 0.012 N NA
 5909363 5909364 HRM2_20480 HRM2_20490 mpl   TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5909364 5909365 HRM2_20490 HRM2_20500     TRUE 0.581 22.000 0.000 NA   NA
 5909365 5909366 HRM2_20500 HRM2_20510     TRUE 0.589 23.000 0.000 1.000 N NA
 5909366 5909367 HRM2_20510 HRM2_20520     FALSE 0.296 84.000 0.000 1.000 N NA
 5909368 5909369 HRM2_20530 HRM2_20540     FALSE 0.384 58.000 0.000 NA   NA
 5909369 5909370 HRM2_20540 HRM2_20550     FALSE 0.067 186.000 0.000 NA   NA
 5909370 5909371 HRM2_20550 HRM2_20560     TRUE 0.439 43.000 0.000 NA   NA
 5909371 5909372 HRM2_20560 HRM2_20570     TRUE 0.716 -63.000 0.000 NA   NA
 5909372 5909373 HRM2_20570 HRM2_20580     FALSE 0.190 109.000 0.000 NA   NA
 5909373 5909374 HRM2_20580 HRM2_20590     FALSE 0.164 123.000 0.000 NA   NA
 5909374 5909375 HRM2_20590 HRM2_20600     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5909375 5909376 HRM2_20600 HRM2_20610     FALSE 0.015 336.000 0.000 NA   NA
 5909376 5909377 HRM2_20610 HRM2_20620     TRUE 1.000 0.000 0.727 NA   NA
 5909377 5909378 HRM2_20620 HRM2_20630     TRUE 0.997 12.000 0.434 NA   NA
 5909379 5909380 HRM2_20640 HRM2_20650     TRUE 0.666 -96.000 0.000 NA   NA
 5909380 5909381 HRM2_20650 HRM2_20660     TRUE 0.448 41.000 0.000 NA   NA
 5909381 5909382 HRM2_20660 HRM2_20670     FALSE 0.072 180.000 0.000 NA   NA
 5909382 5909383 HRM2_20670 HRM2_20680   radC2 FALSE 0.126 138.000 0.000 NA   NA
 5909383 5909384 HRM2_20680 HRM2_20690 radC2   FALSE 0.277 85.000 0.000 NA   NA
 5909384 5909385 HRM2_20690 HRM2_20700     FALSE 0.015 329.000 0.000 NA   NA
 5909385 5909386 HRM2_20700 HRM2_20710   dnaG10 FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5909386 5909387 HRM2_20710 HRM2_20720 dnaG10   TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5909387 5909388 HRM2_20720 HRM2_20730     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5909388 5909389 HRM2_20730 HRM2_20740     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5909389 5909390 HRM2_20740 HRM2_20750     FALSE 0.006 619.000 0.000 NA   NA
 5909390 5909391 HRM2_20750 HRM2_20760     FALSE 0.009 463.000 0.000 NA   NA
 5909391 5909392 HRM2_20760 HRM2_20770     TRUE 0.819 9.000 0.000 NA   NA
 5909393 5909394 HRM2_20780 HRM2_20790     FALSE 0.106 150.000 0.000 NA   NA
 5909394 5909395 HRM2_20790 HRM2_20800     FALSE 0.005 959.000 0.000 NA   NA
 5909396 5909397 HRM2_20810 HRM2_20820     FALSE 0.017 318.000 0.000 NA   NA
 5909397 5909398 HRM2_20820 HRM2_20830     FALSE 0.005 791.000 0.000 NA   NA
 5909398 5909399 HRM2_20830 HRM2_20840     FALSE 0.030 260.000 0.000 1.000 N NA
 5909399 5909400 HRM2_20840 HRM2_20850     FALSE 0.023 285.000 0.000 NA   NA
 5909400 5909401 HRM2_20850 HRM2_20860     FALSE 0.079 171.000 0.000 NA   NA
 5909402 5909403 HRM2_20870 HRM2_20880     TRUE 0.431 45.000 0.000 NA   NA
 5909404 5909405 HRM2_20890 HRM2_20900   valS FALSE 0.099 154.000 0.000 NA   NA
 5909407 5909408 HRM2_20920 HRM2_20930 lepA   FALSE 0.034 238.000 0.000 NA   NA
 5909408 5909409 HRM2_20930 HRM2_20940     TRUE 0.982 13.000 0.065 NA   NA
 5909409 5909410 HRM2_20940 HRM2_20950   uspA1 TRUE 0.995 -3.000 0.016 NA   NA
 5909411 5909412 HRM2_20960 HRM2_20970 leuA2 leuA3 TRUE 0.961 88.000 0.023 0.001 Y NA
 5909412 5909413 HRM2_20970 HRM2_20980 leuA3 ilvH FALSE 0.242 203.000 0.000 1.000 Y NA
 5909413 5909414 HRM2_20980 HRM2_20990 ilvH ilvG TRUE 0.993 24.000 0.063 0.001 Y NA
 5909414 5909415 HRM2_20990 HRM2_21000 ilvG ilvD2 TRUE 0.995 23.000 0.089 0.001 Y NA
 5909415 5909416 HRM2_21000 HRM2_21010 ilvD2 purE FALSE 0.030 271.000 0.000 1.000   NA
 5909416 5909417 HRM2_21010 HRM2_21020 purE   TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5909419 5909420 HRM2_21040 HRM2_21050     FALSE 0.095 170.000 0.000 1.000   NA
 5909420 5909421 HRM2_21050 HRM2_21060   modF FALSE 0.026 288.000 0.000 1.000   NA
 5909421 5909422 HRM2_21060 HRM2_21070 modF ilvC FALSE 0.165 264.000 0.004 1.000   NA
 5909425 5909426 HRM2_21100 HRM2_21110     FALSE 0.092 160.000 0.000 NA   NA
 5909428 5909429 HRM2_21130 HRM2_21140     TRUE 0.986 19.000 0.167 NA   NA
 5909429 5909430 HRM2_21140 HRM2_21150     FALSE 0.024 277.000 0.000 NA   NA
 5909431 5909432 HRM2_21160 HRM2_21170     TRUE 0.974 74.000 0.333 NA   NA
 5909432 5909433 HRM2_21170 HRM2_21180     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5909433 5909434 HRM2_21180 HRM2_21190     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5909434 5909435 HRM2_21190 HRM2_21200     FALSE 0.384 58.000 0.000 NA   NA
 5909436 5909437 HRM2_21210 HRM2_21220     FALSE 0.011 385.000 0.000 NA   NA
 5909437 5909438 HRM2_21220 HRM2_21230     FALSE 0.010 431.000 0.000 1.000 N NA
 5909438 5909439 HRM2_21230 HRM2_21240     TRUE 0.539 31.000 0.000 1.000   NA
 5909441 5909442 HRM2_21260 HRM2_21270     FALSE 0.036 233.000 0.000 NA   NA
 5909442 5909443 HRM2_21270 HRM2_21280   livJ3 FALSE 0.010 430.000 0.000 NA   NA
 5909443 5909444 HRM2_21280 HRM2_21290 livJ3 livH3 TRUE 0.995 94.000 0.679 NA Y NA
 5909444 5909445 HRM2_21290 HRM2_21300 livH3 livM3 TRUE 1.000 6.000 0.957 0.045 Y NA
 5909445 5909446 HRM2_21300 HRM2_21310 livM3 livG3 TRUE 1.000 2.000 0.913 1.000 Y NA
 5909446 5909447 HRM2_21310 HRM2_21320 livG3 livF3 TRUE 0.999 -19.000 0.273 0.023 Y NA
 5909448 5909449 HRM2_21330 HRM2_21340 mip1 mvaB FALSE 0.015 350.000 0.000 1.000 N NA
 5909449 5909450 HRM2_21340 HRM2_21350 mvaB   FALSE 0.011 444.000 0.000 1.000   NA
 5909450 5909451 HRM2_21350 HRM2_21360     FALSE 0.005 887.000 0.000 NA   NA
 5909451 5909452 HRM2_21360 HRM2_21370     TRUE 0.715 14.000 0.000 NA   NA
 5909453 5909454 HRM2_21380 HRM2_21390     TRUE 0.855 61.000 0.000 0.015 Y NA
 5909454 5909455 HRM2_21390 HRM2_21400   fadD6 TRUE 0.558 26.000 0.000 1.000 N NA
 5909456 5909457 HRM2_21410 HRM2_21420     TRUE 0.959 17.000 0.029 NA   NA
 5909457 5909458 HRM2_21420 HRM2_21430     FALSE 0.158 125.000 0.000 NA   NA
 5909458 5909459 HRM2_21430 HRM2_21440   dnaJ3 FALSE 0.248 92.000 0.000 NA   NA
 5909459 5909460 HRM2_21440 HRM2_21450 dnaJ3   FALSE 0.222 94.000 0.000 NA N NA
 5909461 5909462 HRM2_21460 HRM2_21470   iorA2 TRUE 0.868 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5909462 5909463 HRM2_21470 HRM2_21480 iorA2 iorB2 TRUE 1.000 -10.000 0.246 0.002 Y NA
 5909463 5909464 HRM2_21480 HRM2_21490 iorB2 paaK1 TRUE 1.000 0.000 0.569 1.000 N NA
 5909464 5909465 HRM2_21490 HRM2_21500 paaK1 dctP4 TRUE 0.977 11.000 0.031 NA N NA
 5909465 5909466 HRM2_21500 HRM2_21510 dctP4 dctQ4 TRUE 1.000 0.000 0.818 NA   NA
 5909466 5909467 HRM2_21510 HRM2_21520 dctQ4 dctM4 TRUE 1.000 -3.000 0.889 NA   NA
 5909467 5909468 HRM2_21520 HRM2_21530 dctM4 iadA FALSE 0.041 229.000 0.000 1.000 N NA
 5909468 5909469 HRM2_21530 HRM2_21540 iadA dppD1 TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 5909469 5909470 HRM2_21540 HRM2_21550 dppD1 dppA2 TRUE 0.488 42.000 0.000 1.000   NA
 5909470 5909471 HRM2_21550 HRM2_21560 dppA2 dppB1 TRUE 0.992 169.000 0.803 0.045 Y NA
 5909471 5909472 HRM2_21560 HRM2_21570 dppB1 dppC1 TRUE 0.997 10.000 0.066 0.045 Y NA
 5909472 5909473 HRM2_21570 HRM2_21580 dppC1   TRUE 0.517 35.000 0.000 1.000   NA
 5909473 5909474 HRM2_21580 HRM2_21590   dat FALSE 0.390 68.000 0.000 1.000   NA
 5909474 5909475 HRM2_21590 HRM2_21600 dat   TRUE 0.616 46.000 0.000 0.050   NA
 5909476 5909477 HRM2_21610 HRM2_21620     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5909477 5909478 HRM2_21620 HRM2_21630     FALSE 0.222 100.000 0.000 NA   NA
 5909479 5909480 HRM2_21640 HRM2_21650 rfbD glgP1 FALSE 0.379 64.000 0.000 1.000 N NA
 5909480 5909481 HRM2_21650 HRM2_21660 glgP1   FALSE 0.110 151.000 0.000 1.000 N NA
 5909482 5909483 HRM2_21670 HRM2_21680     FALSE 0.017 318.000 0.000 NA   NA
 5909483 5909484 HRM2_21680 HRM2_21690   recJ TRUE 0.580 112.000 0.004 NA   NA
 5909485 5909486 HRM2_21700 HRM2_21710   miaB TRUE 0.981 -10.000 0.003 NA   NA
 5909486 5909487 HRM2_21710 HRM2_21720 miaB map TRUE 0.975 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5909487 5909488 HRM2_21720 HRM2_21730 map cstA FALSE 0.047 217.000 0.000 1.000 N NA
 5909488 5909489 HRM2_21730 HRM2_21740 cstA   TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5909489 5909490 HRM2_21740 HRM2_21750     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5909490 5909491 HRM2_21750 HRM2_21760   arsA TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5909492 5909493 HRM2_21770 HRM2_21780   fsr FALSE 0.026 256.000 0.000 NA N NA
 5909493 5909494 HRM2_21780 HRM2_21790 fsr   FALSE 0.325 73.000 0.000 NA   NA
 5909494 5909495 HRM2_21790 HRM2_21800     TRUE 0.952 16.000 0.016 NA   NA
 5909496 5909497 HRM2_21810 HRM2_21820     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909499 5909500 HRM2_21840 HRM2_21850   fusA1 TRUE 1.000 -3.000 0.904 NA   NA
 5909502 5909503 HRM2_21870 HRM2_21880     FALSE 0.376 60.000 0.000 NA   NA
 5909503 5909504 HRM2_21880 HRM2_21890   glpX TRUE 0.783 -39.000 0.000 NA   NA
 5909505 5909506 HRM2_21900 HRM2_21910     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5909507 5909508 HRM2_21920 HRM2_21930   murA FALSE 0.008 497.000 0.000 NA   NA
 5909508 5909509 HRM2_21930 HRM2_21940 murA comE FALSE 0.329 199.000 0.008 1.000   NA
 5909509 5909510 HRM2_21940 HRM2_21950 comE   FALSE 0.215 111.000 0.000 1.000   NA
 5909511 5909512 HRM2_21960 HRM2_21970     TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5909513 5909514 HRM2_21980 HRM2_21990     TRUE 0.998 8.000 0.095 NA Y NA
 5909514 5909515 HRM2_21990 HRM2_22000     TRUE 0.951 29.000 0.063 NA   NA
 5909515 5909516 HRM2_22000 HRM2_22010     TRUE 0.955 34.000 0.077 NA   NA
 5909516 5909517 HRM2_22010 HRM2_22020   vacJ TRUE 1.000 -3.000 0.684 NA N NA
 5909518 5909519 HRM2_22030 HRM2_22040   nirD TRUE 0.998 -3.000 0.111 NA   NA
 5909519 5909520 HRM2_22040 HRM2_22050 nirD dsrC TRUE 0.842 93.000 0.056 NA N NA
 5909520 5909521 HRM2_22050 HRM2_22060 dsrC dsrB1 FALSE 0.297 136.000 0.000 0.001 N NA
 5909521 5909522 HRM2_22060 HRM2_22070 dsrB1 dsrA1 TRUE 0.798 19.000 0.000 0.036   NA
 5909522 5909523 HRM2_22070 HRM2_22080 dsrA1 fdhB5 TRUE 0.490 83.000 0.000 0.032   NA
 5909523 5909524 HRM2_22080 HRM2_22090 fdhB5 mvhD5 TRUE 0.992 12.000 0.118 1.000   NA
 5909524 5909525 HRM2_22090 HRM2_22100 mvhD5 hdrL1 TRUE 0.711 15.000 0.000 1.000 N NA
 5909526 5909527 HRM2_22110 HRM2_22120 miaA pfkA1 TRUE 0.829 48.000 0.004 1.000 N NA
 5909528 5909529 HRM2_22130 HRM2_22140   kdsD TRUE 0.959 13.000 0.008 1.000 N NA
 5909530 5909531 HRM2_22150 HRM2_22160   aspC3 FALSE 0.253 91.000 0.000 NA   NA
 5909531 5909532 HRM2_22160 HRM2_22170 aspC3 eriC2 TRUE 0.981 9.000 0.022 1.000 N NA
 5909534 5909535 HRM2_22190 HRM2_22200 argJ rluB TRUE 0.993 -3.000 0.004 1.000 N NA
 5909535 5909536 HRM2_22200 HRM2_22210 rluB   FALSE 0.209 113.000 0.000 1.000   NA
 5909536 5909537 HRM2_22210 HRM2_22220     TRUE 0.999 0.000 0.400 1.000   NA
 5909537 5909538 HRM2_22220 HRM2_22230     TRUE 0.992 -7.000 0.000 0.029 Y NA
 5909538 5909539 HRM2_22230 HRM2_22240     TRUE 0.936 1.000 0.000 1.000 N NA
 5909539 5909540 HRM2_22240 HRM2_22250     FALSE 0.193 113.000 0.000 1.000 N NA
 5909542 5909543 HRM2_22270 HRM2_22280     TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5909543 5909544 HRM2_22280 HRM2_22290     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909545 5909546 HRM2_22300 HRM2_22310 trpS   TRUE 0.782 60.000 0.000 1.000 Y NA
 5909546 5909547 HRM2_22310 HRM2_22320     FALSE 0.082 173.000 0.000 1.000 N NA
 5909548 5909549 HRM2_22330 HRM2_22340 pilC   TRUE 0.797 11.000 0.000 1.000 N NA
 5909549 5909550 HRM2_22340 HRM2_22350   hynB FALSE 0.007 591.000 0.000 1.000 N NA
 5909550 5909551 HRM2_22350 HRM2_22360 hynB hynA TRUE 1.000 4.000 0.750 0.001 Y NA
 5909551 5909552 HRM2_22360 HRM2_22370 hynA hynC TRUE 0.976 91.000 0.136 1.000 Y NA
 5909552 5909553 HRM2_22370 HRM2_22380 hynC lysS1 FALSE 0.032 254.000 0.000 1.000 N NA
 5909553 5909554 HRM2_22380 HRM2_22390 lysS1 lolC TRUE 0.993 4.000 0.052 1.000 N NA
 5909554 5909555 HRM2_22390 HRM2_22400 lolC lolD3 TRUE 1.000 -7.000 0.620 1.000 N NA
 5909555 5909556 HRM2_22400 HRM2_22410 lolD3   TRUE 0.998 -3.000 0.075 1.000 N NA
 5909556 5909557 HRM2_22410 HRM2_22420     TRUE 0.914 133.000 0.068 1.000 Y NA
 5909557 5909558 HRM2_22420 HRM2_22430   lpxD TRUE 0.996 10.000 0.060 1.000 Y NA
 5909558 5909559 HRM2_22430 HRM2_22440 lpxD lpxA TRUE 0.998 -3.000 0.008 1.000 Y NA
 5909559 5909560 HRM2_22440 HRM2_22450 lpxA   TRUE 0.994 5.000 0.086 NA   NA
 5909560 5909561 HRM2_22450 HRM2_22460   lpxB TRUE 0.999 -3.000 0.173 NA   NA
 5909561 5909562 HRM2_22460 HRM2_22470 lpxB   FALSE 0.151 127.000 0.000 NA   NA
 5909562 5909563 HRM2_22470 HRM2_22480   pheA FALSE 0.027 263.000 0.000 NA   NA
 5909563 5909564 HRM2_22480 HRM2_22490 pheA aroE1 TRUE 0.979 22.000 0.003 0.027 Y NA
 5909564 5909565 HRM2_22490 HRM2_22500 aroE1 aroA TRUE 0.998 -3.000 0.004 1.000 Y NA
 5909565 5909566 HRM2_22500 HRM2_22510 aroA aroL TRUE 0.998 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 5909566 5909567 HRM2_22510 HRM2_22520 aroL aroC2 TRUE 0.996 -10.000 0.005 1.000 Y NA
 5909567 5909568 HRM2_22520 HRM2_22530 aroC2 rrsA FALSE 0.020 297.000 0.000 NA   NA
 5909568 5909569 HRM2_22530 HRM2_22540 rrsA rrlA FALSE 0.017 319.000 0.000 NA   NA
 5909569 5909570 HRM2_22540 HRM2_22550 rrlA rrfA FALSE 0.168 121.000 0.000 NA   NA
 5909570 5909571 HRM2_22550 HRM2_22560 rrfA   FALSE 0.006 687.000 0.000 NA   NA
 5909572 5909573 HRM2_22570 HRM2_22580   lon3 FALSE 0.008 562.000 0.000 1.000   NA
 5909573 5909574 HRM2_22580 HRM2_22590 lon3   FALSE 0.044 217.000 0.000 NA   NA
 5909575 5909576 HRM2_22600 HRM2_22610 tbpA thiP TRUE 0.998 27.000 0.697 0.045 N NA
 5909576 5909577 HRM2_22610 HRM2_22620 thiP   TRUE 0.999 0.000 0.112 0.045 N NA
 5909578 5909579 HRM2_22630 HRM2_22640 glpA   FALSE 0.289 86.000 0.000 1.000 N NA
 5909580 5909581 HRM2_22650 HRM2_22660     TRUE 0.808 -40.000 0.000 1.000   NA
 5909582 5909583 HRM2_22670 HRM2_22680 acoB acoA TRUE 0.994 13.000 0.016 0.001 Y NA
 5909584 5909585 HRM2_22690 HRM2_22700     FALSE 0.062 192.000 0.000 NA   NA
 5909585 5909586 HRM2_22700 HRM2_22710     FALSE 0.131 317.000 0.000 0.065 Y NA
 5909586 5909587 HRM2_22710 HRM2_22720   hdrL2 TRUE 0.929 2.000 0.000 1.000 N NA
 5909587 5909588 HRM2_22720 HRM2_22730 hdrL2 mvhD6 TRUE 0.998 13.000 0.500 1.000 N NA
 5909588 5909589 HRM2_22730 HRM2_22740 mvhD6 fdhB6 TRUE 0.996 13.000 0.375 1.000   NA
 5909589 5909590 HRM2_22740 HRM2_22750 fdhB6 hdrA4 TRUE 0.988 66.000 0.375 0.032   NA
 5909590 5909591 HRM2_22750 HRM2_22760 hdrA4 hdrD2 TRUE 0.999 11.000 0.400 0.005   NA
 5909591 5909592 HRM2_22760 HRM2_22770 hdrD2 hdrD2' TRUE 1.000 -3.000 0.812 0.005   NA
 5909599 5909600 HRM2_22840 HRM2_22850     FALSE 0.013 358.000 0.000 NA   NA
 5909600 5909601 HRM2_22850 HRM2_22860   mscC4 TRUE 0.612 21.000 0.000 1.000 N NA
 5909602 5909603 HRM2_22870 HRM2_22880     TRUE 0.441 53.000 0.000 1.000   NA
 5909603 5909604 HRM2_22880 HRM2_22890     TRUE 0.531 27.000 0.000 NA   NA
 5909604 5909605 HRM2_22890 HRM2_22900   trkA3 TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5909605 5909606 HRM2_22900 HRM2_22910 trkA3 dtd TRUE 0.699 -81.000 0.000 1.000 N NA
 5909606 5909607 HRM2_22910 HRM2_22920 dtd pit TRUE 0.408 63.000 0.000 1.000   NA
 5909608 5909609 HRM2_22930 HRM2_22940     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909612 5909613 HRM2_22970 HRM2_22980 acd8   TRUE 0.448 41.000 0.000 NA   NA
 5909613 5909614 HRM2_22980 HRM2_22990   glnH3 FALSE 0.061 193.000 0.000 NA   NA
 5909614 5909615 HRM2_22990 HRM2_23000 glnH3 glnP6 TRUE 0.985 84.000 0.141 0.055 Y NA
 5909615 5909616 HRM2_23000 HRM2_23010 glnP6 glnQ5 TRUE 0.995 22.000 0.179 1.000 Y NA
 5909616 5909617 HRM2_23010 HRM2_23020 glnQ5   TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5909617 5909618 HRM2_23020 HRM2_23030   exeA2 TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5909618 5909619 HRM2_23030 HRM2_23040 exeA2 rfbB TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5909621 5909622 HRM2_23060 HRM2_23070     TRUE 0.653 -115.000 0.000 NA   NA
 5909622 5909623 HRM2_23070 HRM2_23080   pilB TRUE 0.448 41.000 0.000 NA   NA
 5909623 5909624 HRM2_23080 HRM2_23090 pilB wecB TRUE 0.462 42.000 0.000 1.000 N NA
 5909624 5909625 HRM2_23090 HRM2_23100 wecB wecC TRUE 0.982 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 5909625 5909626 HRM2_23100 HRM2_23110 wecC ispL TRUE 0.992 49.000 0.212 1.000 Y NA
 5909627 5909628 HRM2_23120 HRM2_23130     TRUE 0.994 -3.000 0.010 NA   NA
 5909628 5909629 HRM2_23130 HRM2_23140   maf TRUE 0.995 -7.000 0.049 NA   NA
 5909629 5909630 HRM2_23140 HRM2_23150 maf rbr2 TRUE 0.501 30.000 0.000 NA   NA
 5909631 5909632 HRM2_23160 HRM2_23170 rhlE2   TRUE 0.425 46.000 0.000 NA   NA
 5909632 5909633 HRM2_23170 HRM2_23180     TRUE 0.975 13.000 0.038 NA   NA
 5909633 5909634 HRM2_23180 HRM2_23190   cbiP FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 5909634 5909635 HRM2_23190 HRM2_23200 cbiP cbiM TRUE 1.000 2.000 0.388 NA Y NA
 5909635 5909636 HRM2_23200 HRM2_23210 cbiM cbiN TRUE 0.999 -3.000 0.175 NA   NA
 5909636 5909637 HRM2_23210 HRM2_23220 cbiN cbiQ1 TRUE 0.996 -7.000 0.075 NA   NA
 5909637 5909638 HRM2_23220 HRM2_23230 cbiQ1 cbiO1 TRUE 0.999 5.000 0.247 1.000 Y NA
 5909639 5909640 HRM2_23240 HRM2_23250 ahcY metK TRUE 0.995 29.000 0.114 0.000 Y NA
 5909643 5909644 HRM2_23280 HRM2_23290 gatA1 ispF FALSE 0.081 174.000 0.000 1.000 N NA
 5909644 5909645 HRM2_23290 HRM2_23300 ispF cysS2 TRUE 0.898 58.000 0.037 1.000 N NA
 5909647 5909648 HRM2_23320 HRM2_23330 uvrB1 uvrC TRUE 0.998 5.000 0.020 0.001 Y NA
 5909648 5909649 HRM2_23330 HRM2_23340 uvrC   TRUE 0.905 4.000 0.000 1.000   NA
 5909650 5909651 HRM2_23350 HRM2_23360   parC TRUE 0.405 57.000 0.000 1.000 N NA
 5909651 5909652 HRM2_23360 HRM2_23370 parC parE TRUE 1.000 1.000 0.106 0.001 Y NA
 5909653 5909654 HRM2_23380 HRM2_23390   cyaA2 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909655 5909656 HRM2_23400 HRM2_23410 mthZ   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909657 5909658 HRM2_23420 HRM2_23430     TRUE 0.483 33.000 0.000 NA   NA
 5909658 5909659 HRM2_23430 HRM2_23440   lonB TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5909661 5909662 HRM2_23460 HRM2_23470 cspB1   FALSE 0.023 285.000 0.000 NA   NA
 5909663 5909664 HRM2_23480 HRM2_23490 efp2 dhaA TRUE 0.855 8.000 0.000 1.000   NA
 5909664 5909665 HRM2_23490 HRM2_23500 dhaA fabH1 TRUE 0.999 -6.000 0.377 1.000   NA
 5909665 5909666 HRM2_23500 HRM2_23510 fabH1   TRUE 0.992 8.000 0.078 1.000 N NA
 5909666 5909667 HRM2_23510 HRM2_23520     FALSE 0.033 260.000 0.000 1.000   NA
 5909667 5909668 HRM2_23520 HRM2_23530     FALSE 0.346 77.000 0.000 1.000   NA
 5909668 5909669 HRM2_23530 HRM2_23540     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909670 5909671 HRM2_23550 HRM2_23560 moeD moeB1 TRUE 0.905 4.000 0.000 1.000   NA
 5909671 5909672 HRM2_23560 HRM2_23570 moeB1   TRUE 0.640 19.000 0.000 1.000 N NA
 5909672 5909673 HRM2_23570 HRM2_23580   rocD1 FALSE 0.084 171.000 0.000 1.000 N NA
 5909673 5909674 HRM2_23580 HRM2_23590 rocD1   TRUE 0.569 25.000 0.000 1.000 N NA
 5909674 5909675 HRM2_23590 HRM2_23600   glgP2 TRUE 0.984 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5909675 5909676 HRM2_23600 HRM2_23610 glgP2 glgA1 TRUE 0.669 91.000 0.000 1.000 Y NA
 5909676 5909677 HRM2_23610 HRM2_23620 glgA1 glgB2 TRUE 0.993 -34.000 0.025 1.000 Y NA
 5909677 5909678 HRM2_23620 HRM2_23630 glgB2   FALSE 0.184 112.000 0.000 NA   NA
 5909678 5909679 HRM2_23630 HRM2_23640     TRUE 0.715 14.000 0.000 NA   NA
 5909679 5909680 HRM2_23640 HRM2_23650     TRUE 0.676 17.000 0.000 1.000 N NA
 5909680 5909681 HRM2_23650 HRM2_23660     TRUE 0.999 0.000 0.271 1.000 N NA
 5909681 5909682 HRM2_23660 HRM2_23670     TRUE 1.000 0.000 0.626 1.000 N NA
 5909683 5909684 HRM2_23680 HRM2_23690     FALSE 0.286 82.000 0.000 NA   NA
 5909685 5909686 HRM2_23700 HRM2_23710 nfnB2   TRUE 0.490 82.000 0.000 0.036   NA
 5909686 5909687 HRM2_23710 HRM2_23720     TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5909688 5909689 HRM2_23730 HRM2_23740 lguL tpxA TRUE 0.711 15.000 0.000 1.000 N NA
 5909689 5909690 HRM2_23740 HRM2_23750 tpxA   FALSE 0.040 224.000 0.000 NA   NA
 5909691 5909692 HRM2_23760 HRM2_23770 uspA13 rnfC1 FALSE 0.149 131.000 0.000 1.000 N NA
 5909692 5909693 HRM2_23770 HRM2_23780 rnfC1 rnfD1 TRUE 0.999 13.000 0.284 0.053 Y NA
 5909693 5909694 HRM2_23780 HRM2_23790 rnfD1 rnfG1 TRUE 0.998 2.000 0.020 1.000 Y NA
 5909694 5909695 HRM2_23790 HRM2_23800 rnfG1 rnfE1 TRUE 1.000 0.000 0.667 0.089 Y NA
 5909695 5909696 HRM2_23800 HRM2_23810 rnfE1 rnfA1 TRUE 1.000 -3.000 0.667 0.053 Y NA
 5909696 5909697 HRM2_23810 HRM2_23820 rnfA1 rnfB TRUE 0.999 -3.000 0.012 0.053 Y NA
 5909697 5909698 HRM2_23820 HRM2_23830 rnfB   FALSE 0.006 783.000 0.000 1.000   NA
 5909698 5909699 HRM2_23830 HRM2_23840     FALSE 0.064 190.000 0.000 NA   NA
 5909699 5909700 HRM2_23840 HRM2_23850   dnaG7 FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5909700 5909701 HRM2_23850 HRM2_23860 dnaG7   TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5909701 5909702 HRM2_23860 HRM2_23870     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5909702 5909703 HRM2_23870 HRM2_23880     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5909703 5909704 HRM2_23880 HRM2_23890   cat2 FALSE 0.008 502.000 0.000 NA   NA
 5909705 5909706 HRM2_23900 HRM2_23910   paaK2 TRUE 0.981 60.000 0.233 0.049   NA
 5909706 5909707 HRM2_23910 HRM2_23920 paaK2 crtA2 FALSE 0.032 320.000 0.000 0.049 N NA
 5909707 5909708 HRM2_23920 HRM2_23930 crtA2 amiC TRUE 0.520 30.000 0.000 1.000 N NA
 5909708 5909709 HRM2_23930 HRM2_23940 amiC mutS TRUE 0.995 5.000 0.095 1.000 N NA
 5909709 5909710 HRM2_23940 HRM2_23950 mutS   TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5909710 5909711 HRM2_23950 HRM2_23960     FALSE 0.219 101.000 0.000 NA   NA
 5909711 5909712 HRM2_23960 HRM2_23970     TRUE 0.841 7.000 0.000 NA   NA
 5909712 5909713 HRM2_23970 HRM2_23980     TRUE 0.473 35.000 0.000 NA   NA
 5909713 5909714 HRM2_23980 HRM2_23990     TRUE 0.772 13.000 0.000 1.000   NA
 5909714 5909715 HRM2_23990 HRM2_24000     TRUE 0.996 -3.000 0.017 1.000   NA
 5909715 5909716 HRM2_24000 HRM2_24010     TRUE 0.778 12.000 0.000 1.000 N NA
 5909716 5909717 HRM2_24010 HRM2_24020     FALSE 0.380 59.000 0.000 NA   NA
 5909717 5909718 HRM2_24020 HRM2_24030     TRUE 0.473 35.000 0.000 NA   NA
 5909718 5909719 HRM2_24030 HRM2_24040   rpoH TRUE 0.973 -43.000 0.022 1.000 N NA
 5909721 5909722 HRM2_24060 HRM2_24070 pspA1   FALSE 0.006 624.000 0.000 NA   NA
 5909722 5909723 HRM2_24070 HRM2_24080   tag FALSE 0.005 923.000 0.000 NA   NA
 5909723 5909724 HRM2_24080 HRM2_24090 tag   FALSE 0.056 208.000 0.000 1.000   NA
 5909725 5909726 HRM2_24100 HRM2_24110 crp isf TRUE 0.925 112.000 0.222 NA   NA
 5909726 5909727 HRM2_24110 HRM2_24120 isf   TRUE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 5909729 5909730 HRM2_24140 HRM2_24150   cspA FALSE 0.075 190.000 0.000 1.000   NA
 5909730 5909731 HRM2_24150 HRM2_24160 cspA glgP3 FALSE 0.011 421.000 0.000 1.000 N NA
 5909731 5909732 HRM2_24160 HRM2_24170 glgP3   FALSE 0.053 205.000 0.000 1.000 N NA
 5909733 5909734 HRM2_24180 HRM2_24190     TRUE 0.410 49.000 0.000 NA   NA
 5909734 5909735 HRM2_24190 HRM2_24200   gltT FALSE 0.014 341.000 0.000 NA   NA
 5909737 5909738 HRM2_24220 HRM2_24230     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.035 Y NA
 5909739 5909740 HRM2_24240 HRM2_24250 putP   FALSE 0.019 303.000 0.000 NA   NA
 5909741 5909742 HRM2_24260 HRM2_24270   pfkB2 TRUE 0.987 26.000 0.065 1.000 Y NA
 5909742 5909743 HRM2_24270 HRM2_24280 pfkB2   TRUE 0.998 -3.000 0.083 1.000   NA
 5909743 5909744 HRM2_24280 HRM2_24290   spsA TRUE 0.993 -151.000 0.156 0.000   NA
 5909744 5909745 HRM2_24290 HRM2_24300 spsA   FALSE 0.005 895.000 0.000 NA   NA
 5909745 5909746 HRM2_24300 HRM2_24310     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5909746 5909747 HRM2_24310 HRM2_24320     TRUE 0.852 6.000 0.000 NA   NA
 5909747 5909748 HRM2_24320 HRM2_24330     FALSE 0.021 309.000 0.000 1.000   NA
 5909748 5909749 HRM2_24330 HRM2_24340     TRUE 0.946 -13.000 0.000 0.036   NA
 5909750 5909751 HRM2_24350 HRM2_24360     TRUE 0.767 -43.000 0.000 NA   NA
 5909751 5909752 HRM2_24360 HRM2_24370     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5909755 5909756 HRM2_24400 HRM2_24410     FALSE 0.047 224.000 0.000 1.000   NA
 5909756 5909757 HRM2_24410 HRM2_24420     FALSE 0.009 453.000 0.000 NA   NA
 5909757 5909758 HRM2_24420 HRM2_24430     FALSE 0.258 90.000 0.000 NA   NA
 5909758 5909759 HRM2_24430 HRM2_24440     TRUE 0.937 0.000 0.000 NA N NA
 5909759 5909760 HRM2_24440 HRM2_24450     TRUE 0.542 23.000 0.000 NA N NA
 5909760 5909761 HRM2_24450 HRM2_24460     TRUE 0.950 -3.000 0.000 NA N NA
 5909761 5909762 HRM2_24460 HRM2_24470     FALSE 0.246 102.000 0.000 1.000   NA
 5909763 5909764 HRM2_24480 HRM2_24490     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5909768 5909769 HRM2_24530 HRM2_24540     FALSE 0.031 249.000 0.000 NA   NA
 5909772 5909773 HRM2_24570 HRM2_24580     FALSE 0.215 105.000 0.000 1.000 N NA
 5909773 5909774 HRM2_24580 HRM2_24590   acuB1 TRUE 0.874 6.000 0.000 1.000   NA
 5909774 5909775 HRM2_24590 HRM2_24600 acuB1 zupT TRUE 0.499 39.000 0.000 1.000   NA
 5909775 5909776 HRM2_24600 HRM2_24610 zupT   TRUE 0.648 20.000 0.000 1.000   NA
 5909777 5909778 HRM2_24620 HRM2_24630 adeC manC TRUE 0.457 43.000 0.000 1.000 N NA
 5909778 5909779 HRM2_24630 HRM2_24640 manC   FALSE 0.131 129.000 0.000 NA N NA
 5909779 5909780 HRM2_24640 HRM2_24650     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5909780 5909781 HRM2_24650 HRM2_24660   uspA2 TRUE 0.488 42.000 0.000 1.000   NA
 5909782 5909783 HRM2_24670 HRM2_24680   dnaJ4 TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5909783 5909784 HRM2_24680 HRM2_24690 dnaJ4 dapB TRUE 0.838 -28.000 0.000 1.000   NA
 5909784 5909785 HRM2_24690 HRM2_24700 dapB   TRUE 0.663 19.000 0.000 1.000   NA
 5909785 5909786 HRM2_24700 HRM2_24710   plsB TRUE 0.995 -3.000 0.009 1.000   NA
 5909788 5909789 HRM2_24730 HRM2_24740 rnhA1   TRUE 0.934 38.000 0.054 NA   NA
 5909790 5909791 HRM2_24750 HRM2_24760 hisC2 cmk1 TRUE 0.994 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5909791 5909792 HRM2_24760 HRM2_24770 cmk1 rpsA2 TRUE 0.853 173.000 0.281 1.000 N NA
 5909792 5909793 HRM2_24770 HRM2_24780 rpsA2 sppA TRUE 0.701 145.000 0.057 1.000 N NA
 5909795 5909796 HRM2_24800 HRM2_24810 guaB dnaE TRUE 0.992 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5909797 5909798 HRM2_24820 HRM2_24830 osmY   TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5909799 5909800 HRM2_24840 HRM2_24850 djlA estA TRUE 0.636 21.000 0.000 1.000   NA
 5909801 5909802 HRM2_24860 HRM2_24870   fusA2 TRUE 0.875 31.000 0.006 NA   NA
 5909803 5909804 HRM2_24880 HRM2_24890 gidB ileS TRUE 0.492 127.000 0.002 1.000 N NA
 5909804 5909805 HRM2_24890 HRM2_24900 ileS lspA TRUE 0.991 5.000 0.049 1.000 N NA
 5909805 5909806 HRM2_24900 HRM2_24910 lspA lgt TRUE 0.995 9.000 0.011 0.088 Y NA
 5909806 5909807 HRM2_24910 HRM2_24920 lgt holA TRUE 0.978 -13.000 0.003 1.000 N NA
 5909807 5909808 HRM2_24920 HRM2_24930 holA pyk TRUE 0.931 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5909809 5909810 HRM2_24940 HRM2_24950   lipA FALSE 0.109 147.000 0.000 NA   NA
 5909810 5909811 HRM2_24950 HRM2_24960 lipA lipB TRUE 1.000 9.000 0.319 0.000 Y NA
 5909811 5909812 HRM2_24960 HRM2_24970 lipB gcvP2 TRUE 0.977 -15.000 0.004 1.000 N NA
 5909812 5909813 HRM2_24970 HRM2_24980 gcvP2 gcvP1 TRUE 1.000 0.000 0.316 0.000 Y NA
 5909813 5909814 HRM2_24980 HRM2_24990 gcvP1 gcvH TRUE 0.997 17.000 0.249 1.000 Y NA
 5909814 5909815 HRM2_24990 HRM2_25000 gcvH gcvT TRUE 0.990 112.000 0.317 0.001 Y NA
 5909817 5909818 HRM2_25020 HRM2_25030   livF4 FALSE 0.362 69.000 0.000 1.000 N NA
 5909818 5909819 HRM2_25030 HRM2_25040 livF4 livG4 TRUE 1.000 0.000 0.165 0.023 Y NA
 5909819 5909820 HRM2_25040 HRM2_25050 livG4 livM4 TRUE 1.000 0.000 0.229 1.000 Y NA
 5909820 5909821 HRM2_25050 HRM2_25060 livM4 livH4 TRUE 0.997 29.000 0.239 0.044 Y NA
 5909821 5909822 HRM2_25060 HRM2_25070 livH4 livK1 TRUE 0.600 343.000 0.124 NA Y NA
 5909824 5909825 HRM2_25090 HRM2_25100     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.065 Y NA
 5909825 5909826 HRM2_25100 HRM2_25110   kncA FALSE 0.289 86.000 0.000 1.000 N NA
 5909827 5909828 HRM2_25120 HRM2_25130 fabH2 glmU TRUE 0.797 -43.000 0.000 1.000   NA
 5909828 5909829 HRM2_25130 HRM2_25140 glmU glmM TRUE 0.906 25.000 0.006 1.000   NA
 5909829 5909830 HRM2_25140 HRM2_25150 glmM   TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5909830 5909831 HRM2_25150 HRM2_25160   sat1 FALSE 0.165 122.000 0.000 NA   NA
 5909831 5909832 HRM2_25160 HRM2_25170 sat1   FALSE 0.156 133.000 0.000 1.000   NA
 5909832 5909833 HRM2_25170 HRM2_25180     TRUE 1.000 -3.000 0.636 NA   NA
 5909833 5909834 HRM2_25180 HRM2_25190     FALSE 0.331 72.000 0.000 NA   NA
 5909834 5909835 HRM2_25190 HRM2_25200   cysC FALSE 0.055 199.000 0.000 NA   NA
 5909835 5909836 HRM2_25200 HRM2_25210 cysC   FALSE 0.257 99.000 0.000 1.000   NA
 5909836 5909837 HRM2_25210 HRM2_25220     TRUE 0.998 -3.000 0.057 1.000   NA
 5909837 5909838 HRM2_25220 HRM2_25230   rfbA1 FALSE 0.352 76.000 0.000 1.000   NA
 5909838 5909839 HRM2_25230 HRM2_25240 rfbA1 rfbC1 TRUE 0.975 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5909839 5909840 HRM2_25240 HRM2_25250 rfbC1   FALSE 0.273 95.000 0.000 1.000   NA
 5909840 5909841 HRM2_25250 HRM2_25260   rfbA2 FALSE 0.009 504.000 0.000 1.000   NA
 5909841 5909842 HRM2_25260 HRM2_25270 rfbA2 rfbC2 TRUE 0.888 5.000 0.000 1.000   NA
 5909842 5909843 HRM2_25270 HRM2_25280 rfbC2   FALSE 0.316 180.000 0.000 1.000 Y NA
 5909843 5909844 HRM2_25280 HRM2_25290     FALSE 0.360 74.000 0.000 1.000   NA
 5909844 5909845 HRM2_25290 HRM2_25300     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 5909845 5909846 HRM2_25300 HRM2_25310     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5909846 5909847 HRM2_25310 HRM2_25320     FALSE 0.028 258.000 0.000 NA   NA
 5909847 5909848 HRM2_25320 HRM2_25330     FALSE 0.226 107.000 0.000 1.000   NA
 5909848 5909849 HRM2_25330 HRM2_25340   cysE2 TRUE 0.444 52.000 0.000 1.000   NA
 5909849 5909850 HRM2_25340 HRM2_25350 cysE2   FALSE 0.004 1547.000 0.000 NA   NA
 5909850 5909851 HRM2_25350 HRM2_25360     FALSE 0.010 427.000 0.000 NA   NA
 5909851 5909852 HRM2_25360 HRM2_25370     TRUE 0.987 15.000 0.108 1.000   NA
 5909852 5909853 HRM2_25370 HRM2_25380     TRUE 0.997 4.000 0.138 1.000   NA
 5909853 5909854 HRM2_25380 HRM2_25390     FALSE 0.005 924.000 0.000 NA   NA
 5909854 5909855 HRM2_25390 HRM2_25400     FALSE 0.048 208.000 0.000 NA   NA
 5909855 5909856 HRM2_25400 HRM2_25410     FALSE 0.112 212.000 0.000 0.008   NA
 5909856 5909857 HRM2_25410 HRM2_25420     TRUE 0.643 51.000 0.000 0.008   NA
 5909857 5909858 HRM2_25420 HRM2_25430     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 5909860 5909861 HRM2_25450 HRM2_25460   rfbP TRUE 0.517 35.000 0.000 1.000   NA
 5909863 5909864 HRM2_25480 HRM2_25490     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909864 5909865 HRM2_25490 HRM2_25500     TRUE 0.898 -13.000 0.000 1.000   NA
 5909865 5909866 HRM2_25500 HRM2_25510     TRUE 0.812 -28.000 0.000 NA   NA
 5909866 5909867 HRM2_25510 HRM2_25520     FALSE 0.089 163.000 0.000 NA   NA
 5909867 5909868 HRM2_25520 HRM2_25530   msbA2 FALSE 0.299 79.000 0.000 NA   NA
 5909868 5909869 HRM2_25530 HRM2_25540 msbA2   FALSE 0.193 108.000 0.000 NA   NA
 5909869 5909870 HRM2_25540 HRM2_25550     FALSE 0.126 138.000 0.000 NA   NA
 5909870 5909871 HRM2_25550 HRM2_25560   gumA TRUE 0.996 4.000 0.079 0.088   NA
 5909871 5909872 HRM2_25560 HRM2_25570 gumA gumC2 TRUE 1.000 3.000 1.000 0.088 Y NA
 5909872 5909873 HRM2_25570 HRM2_25580 gumC2   TRUE 0.920 17.000 0.000 1.000 Y NA
 5909874 5909875 HRM2_25590 HRM2_25600     TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5909875 5909876 HRM2_25600 HRM2_25610     TRUE 0.923 3.000 0.000 1.000   NA
 5909878 5909879 HRM2_25630 HRM2_25640     FALSE 0.202 105.000 0.000 NA   NA
 5909880 5909881 HRM2_25650 HRM2_25660 xseA xseB TRUE 1.000 -22.000 0.412 0.000 Y NA
 5909881 5909882 HRM2_25660 HRM2_25670 xseB   TRUE 0.980 -43.000 0.041 1.000 N NA
 5909882 5909883 HRM2_25670 HRM2_25680   dxs TRUE 0.994 21.000 0.122 1.000 Y NA
 5909883 5909884 HRM2_25680 HRM2_25690 dxs   TRUE 0.994 -3.000 0.006 1.000 N NA
 5909884 5909885 HRM2_25690 HRM2_25700   fusA3 TRUE 0.952 34.000 0.003 1.000 Y NA
 5909886 5909887 HRM2_25710 HRM2_25720 fabG4   TRUE 0.501 30.000 0.000 NA   NA
 5909887 5909888 HRM2_25720 HRM2_25730     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5909889 5909890 HRM2_25740 HRM2_25750     TRUE 0.909 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5909890 5909891 HRM2_25750 HRM2_25760     TRUE 0.829 10.000 0.000 1.000   NA
 5909893 5909894 HRM2_25780 HRM2_25790   tmcC1 TRUE 0.998 19.000 0.867 NA   NA
 5909894 5909895 HRM2_25790 HRM2_25800 tmcC1 tmcB1 TRUE 0.996 61.000 0.933 1.000   NA
 5909895 5909896 HRM2_25800 HRM2_25810 tmcB1 tmcA1 TRUE 0.874 6.000 0.000 1.000   NA
 5909896 5909897 HRM2_25810 HRM2_25820 tmcA1   TRUE 0.418 60.000 0.000 1.000   NA
 5909897 5909898 HRM2_25820 HRM2_25830     TRUE 0.872 48.000 0.000 0.034 Y NA
 5909898 5909899 HRM2_25830 HRM2_25840     TRUE 0.984 -16.000 0.000 0.019 Y NA
 5909899 5909900 HRM2_25840 HRM2_25850     TRUE 0.698 17.000 0.000 1.000   NA
 5909900 5909901 HRM2_25850 HRM2_25860     TRUE 0.859 -16.000 0.000 NA   NA
 5909901 5909902 HRM2_25860 HRM2_25870     TRUE 0.999 -3.000 0.321 NA   NA
 5909902 5909903 HRM2_25870 HRM2_25880     FALSE 0.269 87.000 0.000 NA   NA
 5909903 5909904 HRM2_25880 HRM2_25890     FALSE 0.036 233.000 0.000 NA   NA
 5909905 5909906 HRM2_25900 HRM2_25910 topB   FALSE 0.030 250.000 0.000 NA   NA
 5909906 5909907 HRM2_25910 HRM2_25920     TRUE 0.775 -42.000 0.000 NA   NA
 5909908 5909909 HRM2_25930 HRM2_25940   fabG5 TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5909910 5909911 HRM2_25950 HRM2_25960 mtgA   FALSE 0.028 262.000 0.000 NA   NA
 5909911 5909912 HRM2_25960 HRM2_25970     FALSE 0.010 414.000 0.000 NA   NA
 5909915 5909916 HRM2_26000 HRM2_26010     FALSE 0.006 611.000 0.000 NA   NA
 5909917 5909918 HRM2_26020 HRM2_26030     FALSE 0.131 134.000 0.000 NA   NA
 5909918 5909919 HRM2_26030 HRM2_26040     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5909920 5909921 HRM2_26050 HRM2_26060     TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 5909921 5909922 HRM2_26060 HRM2_26070     FALSE 0.115 144.000 0.000 NA   NA
 5909923 5909924 HRM2_26080 HRM2_26090     FALSE 0.010 420.000 0.000 NA   NA
 5909924 5909925 HRM2_26090 HRM2_26100     FALSE 0.044 216.000 0.000 NA   NA
 5909925 5909926 HRM2_26100 HRM2_26110     TRUE 0.663 19.000 0.000 1.000   NA
 5909926 5909927 HRM2_26110 HRM2_26120     FALSE 0.008 487.000 0.000 NA   NA
 5909927 5909928 HRM2_26120 HRM2_26130     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5909928 5909929 HRM2_26130 HRM2_26140     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5909929 5909930 HRM2_26140 HRM2_26150   dnaG8 TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5909930 5909931 HRM2_26150 HRM2_26160 dnaG8   FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5909931 5909932 HRM2_26160 HRM2_26170     FALSE 0.064 190.000 0.000 NA   NA
 5909932 5909933 HRM2_26170 HRM2_26180     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5909934 5909935 HRM2_26190 HRM2_26200     FALSE 0.106 150.000 0.000 NA   NA
 5909935 5909936 HRM2_26200 HRM2_26210     FALSE 0.092 161.000 0.000 NA   NA
 5909936 5909937 HRM2_26210 HRM2_26220     TRUE 0.999 0.000 0.429 NA   NA
 5909937 5909938 HRM2_26220 HRM2_26230     TRUE 0.998 -21.000 0.429 NA   NA
 5909938 5909939 HRM2_26230 HRM2_26240   uvrB2 FALSE 0.032 244.000 0.000 NA   NA
 5909939 5909940 HRM2_26240 HRM2_26250 uvrB2 uvrB3 TRUE 0.983 4.000 0.007 NA   NA
 5909940 5909941 HRM2_26250 HRM2_26260 uvrB3 uvrB4 TRUE 0.976 -18.000 0.007 NA   NA
 5909941 5909942 HRM2_26260 HRM2_26270 uvrB4 uvrB5 FALSE 0.371 72.000 0.000 1.000   NA
 5909942 5909943 HRM2_26270 HRM2_26280 uvrB5   FALSE 0.004 1333.000 0.000 NA   NA
 5909944 5909945 HRM2_26290 HRM2_26300     FALSE 0.026 268.000 0.000 NA   NA
 5909945 5909946 HRM2_26300 HRM2_26310     TRUE 0.753 -48.000 0.000 NA   NA
 5909946 5909947 HRM2_26310 HRM2_26320     FALSE 0.043 218.000 0.000 NA   NA
 5909947 5909948 HRM2_26320 HRM2_26330     TRUE 0.941 -19.000 0.000 0.001   NA
 5909949 5909950 HRM2_26340 HRM2_26350 xerC   TRUE 1.000 -33.000 0.545 0.008 Y NA
 5909950 5909951 HRM2_26350 HRM2_26360     TRUE 1.000 -13.000 0.364 0.008 Y NA
 5909951 5909952 HRM2_26360 HRM2_26370     FALSE 0.006 736.000 0.000 1.000   NA
 5909956 5909957 HRM2_26410 HRM2_26420     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5909958 5909959 HRM2_26430 HRM2_26440     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5909959 5909960 HRM2_26440 HRM2_26450     FALSE 0.010 412.000 0.000 NA   NA
 5909962 5909963 HRM2_26470 HRM2_26480   recD2 TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5909963 5909964 HRM2_26480 HRM2_26490 recD2 recB TRUE 1.000 -16.000 0.688 0.001 Y NA
 5909964 5909965 HRM2_26490 HRM2_26500 recB recC TRUE 1.000 3.000 0.542 0.001 Y NA
 5909967 5909968 HRM2_26520 HRM2_26530 rluD2   TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5909968 5909969 HRM2_26530 HRM2_26540   hrpB FALSE 0.039 227.000 0.000 NA   NA
 5909969 5909970 HRM2_26540 HRM2_26550 hrpB ssuB FALSE 0.044 220.000 0.000 1.000 N NA
 5909970 5909971 HRM2_26550 HRM2_26560 ssuB ssuC TRUE 0.843 35.000 0.000 1.000 Y NA
 5909971 5909972 HRM2_26560 HRM2_26570 ssuC ssuA TRUE 0.942 -49.000 0.000 NA Y NA
 5909972 5909973 HRM2_26570 HRM2_26580 ssuA hydA2 TRUE 0.816 -27.000 0.000 NA   NA
 5909973 5909974 HRM2_26580 HRM2_26590 hydA2 gltD1 TRUE 0.863 15.000 0.000 0.004   NA
 5909974 5909975 HRM2_26590 HRM2_26600 gltD1 trmA FALSE 0.016 329.000 0.000 1.000 N NA
 5909978 5909979 HRM2_26630 HRM2_26640 argC   FALSE 0.402 58.000 0.000 1.000 N NA
 5909979 5909980 HRM2_26640 HRM2_26650   secA FALSE 0.023 287.000 0.000 1.000 N NA
 5909980 5909981 HRM2_26650 HRM2_26660 secA clpS TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 5909981 5909982 HRM2_26660 HRM2_26670 clpS clpA TRUE 0.999 3.000 0.596 NA   NA
 5909982 5909983 HRM2_26670 HRM2_26680 clpA aat TRUE 0.999 1.000 0.087 1.000 Y NA
 5909984 5909985 HRM2_26690 HRM2_26700 uspA14   TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5909985 5909986 HRM2_26700 HRM2_26710     TRUE 0.941 78.000 0.136 NA   NA
 5909986 5909987 HRM2_26710 HRM2_26720     FALSE 0.007 684.000 0.000 1.000   NA
 5909987 5909988 HRM2_26720 HRM2_26730     FALSE 0.245 93.000 0.000 NA   NA
 5909988 5909989 HRM2_26730 HRM2_26740   cysS3 TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5909989 5909990 HRM2_26740 HRM2_26750 cysS3 tmk TRUE 0.851 7.000 0.000 1.000 N NA
 5909991 5909992 HRM2_26760 HRM2_26770 ostA   TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5909992 5909993 HRM2_26770 HRM2_26780   ihfB FALSE 0.139 135.000 0.000 1.000 N NA
 5909993 5909994 HRM2_26780 HRM2_26790 ihfB holB TRUE 0.995 4.000 0.005 1.000 Y NA
 5909994 5909995 HRM2_26790 HRM2_26800 holB   TRUE 0.990 28.000 0.372 NA   NA
 5909995 5909996 HRM2_26800 HRM2_26810   metS TRUE 0.993 -13.000 0.059 NA   NA
 5909996 5909997 HRM2_26810 HRM2_26820 metS pbpA FALSE 0.014 382.000 0.000 1.000   NA
 5909997 5909998 HRM2_26820 HRM2_26830 pbpA glmS TRUE 0.636 21.000 0.000 1.000   NA
 5909999 5910000 HRM2_26840 HRM2_26850 pyrG eno FALSE 0.306 81.000 0.000 1.000 N NA
 5910000 5910001 HRM2_26850 HRM2_26860 eno   FALSE 0.248 92.000 0.000 NA   NA
 5910002 5910003 HRM2_26870 HRM2_26880 galE1   TRUE 0.855 8.000 0.000 1.000   NA
 5910003 5910004 HRM2_26880 HRM2_26890   rimK1 TRUE 0.674 -178.000 0.000 1.000   NA
 5910004 5910005 HRM2_26890 HRM2_26900 rimK1   FALSE 0.031 249.000 0.000 NA   NA
 5910007 5910008 HRM2_26920 HRM2_26930 birA   TRUE 0.994 -3.000 0.012 NA   NA
 5910008 5910009 HRM2_26930 HRM2_26940   cbiO2 TRUE 1.000 -3.000 0.667 NA   NA
 5910009 5910010 HRM2_26940 HRM2_26950 cbiO2 cbiQ2 TRUE 0.999 -12.000 0.159 1.000 Y NA
 5910011 5910012 HRM2_26960 HRM2_26970     TRUE 0.473 35.000 0.000 NA   NA
 5910013 5910014 HRM2_26980 HRM2_26990 ribF def TRUE 0.563 119.000 0.003 1.000 N NA
 5910014 5910015 HRM2_26990 HRM2_27000 def fmt TRUE 0.999 -3.000 0.033 0.014 Y NA
 5910015 5910016 HRM2_27000 HRM2_27010 fmt rsmB TRUE 1.000 -7.000 0.305 1.000 Y NA
 5910016 5910017 HRM2_27010 HRM2_27020 rsmB rpe TRUE 0.599 22.000 0.000 1.000 N NA
 5910017 5910018 HRM2_27020 HRM2_27030 rpe aroQ TRUE 0.987 2.000 0.004 1.000 N NA
 5910018 5910019 HRM2_27030 HRM2_27040 aroQ   TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5910019 5910020 HRM2_27040 HRM2_27050     TRUE 0.647 39.000 0.000 0.037 N NA
 5910023 5910024 HRM2_27080 HRM2_27090   purB TRUE 0.851 7.000 0.000 1.000 N NA
 5910025 5910026 HRM2_27100 HRM2_27110 acd9 ihfA FALSE 0.227 102.000 0.000 1.000 N NA
 5910027 5910028 HRM2_27120 HRM2_27130 mauE   TRUE 0.996 -13.000 0.114 1.000   NA
 5910028 5910029 HRM2_27130 HRM2_27140     TRUE 0.751 -63.000 0.000 1.000   NA
 5910029 5910030 HRM2_27140 HRM2_27150   ftsB TRUE 0.772 13.000 0.000 1.000   NA
 5910030 5910031 HRM2_27150 HRM2_27160 ftsB mviN TRUE 0.992 0.000 0.006 1.000   NA
 5910033 5910034 HRM2_27180 HRM2_27190   leuS TRUE 0.983 3.000 0.003 NA   NA
 5910035 5910036 HRM2_27200 HRM2_27210 rne2   TRUE 0.805 60.000 0.005 NA   NA
 5910036 5910037 HRM2_27210 HRM2_27220     TRUE 0.946 12.000 0.002 NA   NA
 5910037 5910038 HRM2_27220 HRM2_27230   secD TRUE 0.984 24.000 0.044 NA Y NA
 5910038 5910039 HRM2_27230 HRM2_27240 secD secF TRUE 0.999 18.000 0.370 0.001 Y NA
 5910039 5910040 HRM2_27240 HRM2_27250 secF   TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000   NA
 5910040 5910041 HRM2_27250 HRM2_27260   dprA TRUE 0.970 12.000 0.014 1.000   NA
 5910041 5910042 HRM2_27260 HRM2_27270 dprA topA TRUE 0.999 3.000 0.238 1.000 Y NA
 5910042 5910043 HRM2_27270 HRM2_27280 topA ompA2 TRUE 0.791 -45.000 0.000 1.000   NA
 5910043 5910044 HRM2_27280 HRM2_27290 ompA2 prmA4 FALSE 0.115 144.000 0.000 NA   NA
 5910044 5910045 HRM2_27290 HRM2_27300 prmA4   FALSE 0.103 151.000 0.000 NA   NA
 5910046 5910047 HRM2_27310 HRM2_27320     TRUE 1.000 -3.000 0.742 0.043   NA
 5910047 5910048 HRM2_27320 HRM2_27330   alaS1 TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5910048 5910049 HRM2_27330 HRM2_27340 alaS1 recA TRUE 0.942 33.000 0.054 1.000 N NA
 5910049 5910050 HRM2_27340 HRM2_27350 recA pgpA TRUE 0.889 27.000 0.005 1.000 N NA
 5910050 5910051 HRM2_27350 HRM2_27360 pgpA   TRUE 0.973 12.000 0.024 NA   NA
 5910051 5910052 HRM2_27360 HRM2_27370   pepT TRUE 0.982 5.000 0.010 NA   NA
 5910053 5910054 HRM2_27380 HRM2_27390   dctP5 FALSE 0.040 216.000 0.000 NA N NA
 5910054 5910055 HRM2_27390 HRM2_27400 dctP5 dctQ5 TRUE 0.988 99.000 0.375 NA Y NA
 5910055 5910056 HRM2_27400 HRM2_27410 dctQ5 dctM5 TRUE 1.000 -7.000 0.429 NA Y NA
 5910056 5910057 HRM2_27410 HRM2_27420 dctM5 fabG6 TRUE 0.884 24.000 0.000 1.000 Y NA
 5910057 5910058 HRM2_27420 HRM2_27430 fabG6   FALSE 0.384 58.000 0.000 NA   NA
 5910058 5910059 HRM2_27430 HRM2_27440     FALSE 0.082 169.000 0.000 NA   NA
 5910059 5910060 HRM2_27440 HRM2_27450     FALSE 0.037 230.000 0.000 NA   NA
 5910060 5910061 HRM2_27450 HRM2_27460     FALSE 0.361 64.000 0.000 NA   NA
 5910061 5910062 HRM2_27460 HRM2_27470     TRUE 0.795 54.000 0.000 1.000 Y NA
 5910063 5910064 HRM2_27480 HRM2_27490     TRUE 0.852 6.000 0.000 NA   NA
 5910064 5910065 HRM2_27490 HRM2_27500   pgsA FALSE 0.384 58.000 0.000 NA   NA
 5910065 5910066 HRM2_27500 HRM2_27510 pgsA talC TRUE 0.746 81.000 0.006 1.000 N NA
 5910066 5910067 HRM2_27510 HRM2_27520 talC folK TRUE 0.947 0.000 0.000 1.000 N NA
 5910067 5910068 HRM2_27520 HRM2_27530 folK   TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5910068 5910069 HRM2_27530 HRM2_27540   argH2 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910069 5910070 HRM2_27540 HRM2_27550 argH2 argG TRUE 0.998 -94.000 0.278 1.000 Y NA
 5910070 5910071 HRM2_27550 HRM2_27560 argG argF TRUE 0.985 45.000 0.088 1.000 Y NA
 5910071 5910072 HRM2_27560 HRM2_27570 argF argD TRUE 0.993 12.000 0.035 1.000 Y NA
 5910072 5910073 HRM2_27570 HRM2_27580 argD argB TRUE 0.995 12.000 0.052 1.000 Y NA
 5910073 5910074 HRM2_27580 HRM2_27590 argB hslU TRUE 0.996 -3.000 0.021 1.000 N NA
 5910074 5910075 HRM2_27590 HRM2_27600 hslU hslV TRUE 1.000 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 5910075 5910076 HRM2_27600 HRM2_27610 hslV   TRUE 0.976 19.000 0.080 1.000 N NA
 5910076 5910077 HRM2_27610 HRM2_27620     TRUE 0.986 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5910077 5910078 HRM2_27620 HRM2_27630   coaBC TRUE 0.996 -3.000 0.027 1.000 N NA
 5910078 5910079 HRM2_27630 HRM2_27640 coaBC   TRUE 0.974 9.000 0.011 NA   NA
 5910079 5910080 HRM2_27640 HRM2_27650   pilY1 FALSE 0.115 144.000 0.000 NA   NA
 5910080 5910081 HRM2_27650 HRM2_27660 pilY1 pilX FALSE 0.380 59.000 0.000 NA   NA
 5910081 5910082 HRM2_27660 HRM2_27670 pilX pilV TRUE 0.562 24.000 0.000 NA   NA
 5910082 5910083 HRM2_27670 HRM2_27680 pilV pilW TRUE 0.996 -3.000 0.034 NA   NA
 5910083 5910084 HRM2_27680 HRM2_27690 pilW fimT TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5910085 5910086 HRM2_27700 HRM2_27710     TRUE 0.410 49.000 0.000 NA   NA
 5910086 5910087 HRM2_27710 HRM2_27720     FALSE 0.190 109.000 0.000 NA   NA
 5910087 5910088 HRM2_27720 HRM2_27730     TRUE 0.999 -3.000 0.133 NA   NA
 5910088 5910089 HRM2_27730 HRM2_27740     TRUE 0.995 12.000 0.242 NA   NA
 5910090 5910091 HRM2_27750 HRM2_27760     FALSE 0.227 98.000 0.000 NA   NA
 5910091 5910092 HRM2_27760 HRM2_27770   pyrC TRUE 0.989 1.000 0.004 1.000 N NA
 5910092 5910093 HRM2_27770 HRM2_27780 pyrC pyrB TRUE 1.000 -16.000 0.452 1.000 Y NA
 5910093 5910094 HRM2_27780 HRM2_27790 pyrB lepB TRUE 0.833 45.000 0.004 1.000 N NA
 5910094 5910095 HRM2_27790 HRM2_27800 lepB   TRUE 0.617 132.000 0.019 NA   NA
 5910095 5910096 HRM2_27800 HRM2_27810     TRUE 0.495 164.000 0.019 NA   NA
 5910097 5910098 HRM2_27820 HRM2_27830 kdsA kdsC TRUE 0.994 2.000 0.032 1.000   NA
 5910098 5910099 HRM2_27830 HRM2_27840 kdsC   TRUE 0.975 10.000 0.016 NA   NA
 5910099 5910100 HRM2_27840 HRM2_27850     TRUE 0.982 -43.000 0.051 NA   NA
 5910100 5910101 HRM2_27850 HRM2_27860     TRUE 1.000 -3.000 0.543 NA   NA
 5910101 5910102 HRM2_27860 HRM2_27870   rpoN TRUE 0.995 3.000 0.059 1.000   NA
 5910102 5910103 HRM2_27870 HRM2_27880 rpoN smpA TRUE 0.998 14.000 0.632 NA N NA
 5910103 5910104 HRM2_27880 HRM2_27890 smpA ptsN2 TRUE 0.996 18.000 0.561 NA N NA
 5910104 5910105 HRM2_27890 HRM2_27900 ptsN2   TRUE 0.874 64.000 0.030 NA   NA
 5910105 5910106 HRM2_27900 HRM2_27910   manX TRUE 0.999 -3.000 0.171 NA   NA
 5910106 5910107 HRM2_27910 HRM2_27920 manX gap4 TRUE 0.730 76.000 0.000 1.000 Y NA
 5910107 5910108 HRM2_27920 HRM2_27930 gap4 tpi FALSE 0.163 245.000 0.000 1.000 Y NA
 5910108 5910109 HRM2_27930 HRM2_27940 tpi secG TRUE 0.984 7.000 0.024 1.000 N NA
 5910109 5910110 HRM2_27940 HRM2_27950 secG   TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5910110 5910111 HRM2_27950 HRM2_27960     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 5910111 5910112 HRM2_27960 HRM2_27970   clpX2 TRUE 0.841 7.000 0.000 NA   NA
 5910112 5910113 HRM2_27970 HRM2_27980 clpX2 ppqE1 TRUE 0.995 -3.000 0.008 1.000   NA
 5910113 5910114 HRM2_27980 HRM2_27990 ppqE1 hemB TRUE 0.995 3.000 0.056 1.000   NA
 5910114 5910115 HRM2_27990 HRM2_28000 hemB ppqE2 TRUE 0.993 5.000 0.070 1.000   NA
 5910116 5910117 HRM2_28010 HRM2_28020 pfp   TRUE 0.660 18.000 0.000 1.000 N NA
 5910118 5910119 HRM2_28030 HRM2_28040 srp   TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5910119 5910120 HRM2_28040 HRM2_28050     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 5910120 5910121 HRM2_28050 HRM2_28060     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5910121 5910122 HRM2_28060 HRM2_28070     FALSE 0.039 227.000 0.000 NA   NA
 5910122 5910123 HRM2_28070 HRM2_28080     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.034 Y NA
 5910124 5910125 HRM2_28090 HRM2_28100   ligA1 FALSE 0.062 192.000 0.000 NA   NA
 5910125 5910126 HRM2_28100 HRM2_28110 ligA1   TRUE 0.933 86.000 0.133 1.000 N NA
 5910126 5910127 HRM2_28110 HRM2_28120     TRUE 0.804 -31.000 0.000 NA   NA
 5910127 5910128 HRM2_28120 HRM2_28130   glyS TRUE 0.850 31.000 0.003 NA   NA
 5910128 5910129 HRM2_28130 HRM2_28140 glyS glyQ TRUE 1.000 -3.000 0.651 0.000 Y NA
 5910129 5910130 HRM2_28140 HRM2_28150 glyQ   TRUE 0.921 18.000 0.003 1.000   NA
 5910130 5910131 HRM2_28150 HRM2_28160   recO TRUE 0.992 -3.000 0.002 1.000   NA
 5910131 5910132 HRM2_28160 HRM2_28170 recO mgtE2 TRUE 0.978 6.000 0.007 1.000 N NA
 5910132 5910133 HRM2_28170 HRM2_28180 mgtE2 ppiD2 TRUE 0.553 29.000 0.000 1.000   NA
 5910133 5910134 HRM2_28180 HRM2_28190 ppiD2 ppiC2 TRUE 0.957 4.000 0.000 0.003   NA
 5910137 5910138 HRM2_28220 HRM2_28230     FALSE 0.392 55.000 0.000 NA   NA
 5910139 5910140 HRM2_28240 HRM2_28250     FALSE 0.171 120.000 0.000 NA   NA
 5910140 5910141 HRM2_28250 HRM2_28260     FALSE 0.013 358.000 0.000 NA   NA
 5910141 5910142 HRM2_28260 HRM2_28270   ldhB FALSE 0.273 90.000 0.000 1.000 N NA
 5910142 5910143 HRM2_28270 HRM2_28280 ldhB ldhA TRUE 1.000 4.000 0.260 0.035 Y NA
 5910143 5910144 HRM2_28280 HRM2_28290 ldhA   TRUE 0.859 -16.000 0.000 NA   NA
 5910144 5910145 HRM2_28290 HRM2_28300     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 5910146 5910147 HRM2_28310 HRM2_28320 lldP   FALSE 0.041 236.000 0.000 1.000   NA
 5910147 5910148 HRM2_28320 HRM2_28330   hdrD3 TRUE 1.000 0.000 0.537 0.001   NA
 5910148 5910149 HRM2_28330 HRM2_28340 hdrD3   TRUE 0.746 -57.000 0.000 1.000 N NA
 5910153 5910154 HRM2_28380 HRM2_28390     FALSE 0.033 241.000 0.000 NA   NA
 5910155 5910156 HRM2_28400 HRM2_28410     FALSE 0.049 205.000 0.000 NA   NA
 5910156 5910157 HRM2_28410 HRM2_28420     FALSE 0.100 153.000 0.000 NA   NA
 5910158 5910159 HRM2_28430 HRM2_28440     FALSE 0.037 230.000 0.000 NA   NA
 5910160 5910161 HRM2_28450 HRM2_28460 alsT guaD FALSE 0.009 465.000 0.000 1.000 N NA
 5910161 5910162 HRM2_28460 HRM2_28470 guaD   TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000   NA
 5910162 5910163 HRM2_28470 HRM2_28480     FALSE 0.009 518.000 0.000 1.000   NA
 5910163 5910164 HRM2_28480 HRM2_28490     FALSE 0.008 485.000 0.000 NA   NA
 5910165 5910166 HRM2_28500 HRM2_28510 pstS5 pstC3 TRUE 1.000 3.000 0.615 0.053 Y NA
 5910166 5910167 HRM2_28510 HRM2_28520 pstC3 pstA3 TRUE 1.000 -7.000 0.432 0.043 Y NA
 5910167 5910168 HRM2_28520 HRM2_28530 pstA3 pstB3 TRUE 0.997 15.000 0.135 0.086 Y NA
 5910168 5910169 HRM2_28530 HRM2_28540 pstB3   FALSE 0.041 236.000 0.000 1.000   NA
 5910169 5910170 HRM2_28540 HRM2_28550   ppiB1 TRUE 0.613 23.000 0.000 1.000   NA
 5910171 5910172 HRM2_28560 HRM2_28570     TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 5910172 5910173 HRM2_28570 HRM2_28580     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910173 5910174 HRM2_28580 HRM2_28590   dppF1 TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5910174 5910175 HRM2_28590 HRM2_28600 dppF1 dppD2 TRUE 1.000 0.000 0.400 0.002 Y NA
 5910175 5910176 HRM2_28600 HRM2_28610 dppD2 dppE TRUE 0.999 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 5910177 5910178 HRM2_28620 HRM2_28630   motA2 FALSE 0.325 73.000 0.000 NA   NA
 5910178 5910179 HRM2_28630 HRM2_28640 motA2 motB2 TRUE 1.000 6.000 0.750 1.000 Y NA
 5910179 5910180 HRM2_28640 HRM2_28650 motB2   TRUE 0.804 -31.000 0.000 NA   NA
 5910180 5910181 HRM2_28650 HRM2_28660   dinP TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910181 5910182 HRM2_28660 HRM2_28670 dinP   FALSE 0.129 136.000 0.000 NA   NA
 5910182 5910183 HRM2_28670 HRM2_28680     TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5910183 5910184 HRM2_28680 HRM2_28690   faa TRUE 0.425 46.000 0.000 NA   NA
 5910185 5910186 HRM2_28700 HRM2_28710     FALSE 0.153 134.000 0.000 1.000   NA
 5910187 5910188 HRM2_28720 HRM2_28730 acsA1 acsA2 TRUE 0.831 77.000 0.000 0.002 Y NA
 5910188 5910189 HRM2_28730 HRM2_28740 acsA2 oxlT TRUE 0.448 41.000 0.000 NA   NA
 5910189 5910190 HRM2_28740 HRM2_28750 oxlT   TRUE 0.714 85.000 0.004 NA   NA
 5910191 5910192 HRM2_28760 HRM2_28770   vdcC TRUE 0.542 23.000 0.000 NA N NA
 5910192 5910193 HRM2_28770 HRM2_28780 vdcC   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910193 5910194 HRM2_28780 HRM2_28790     TRUE 0.788 -46.000 0.000 1.000   NA
 5910194 5910195 HRM2_28790 HRM2_28800     TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5910196 5910197 HRM2_28810 HRM2_28820   acuC FALSE 0.158 125.000 0.000 NA   NA
 5910197 5910198 HRM2_28820 HRM2_28830 acuC acuB2 TRUE 0.924 52.000 0.059 NA   NA
 5910199 5910200 HRM2_28840 HRM2_28850 dnaK2   FALSE 0.106 150.000 0.000 NA   NA
 5910200 5910201 HRM2_28850 HRM2_28860     FALSE 0.016 353.000 0.000 1.000   NA
 5910201 5910202 HRM2_28860 HRM2_28870     TRUE 0.479 44.000 0.000 1.000   NA
 5910202 5910203 HRM2_28870 HRM2_28880     TRUE 0.448 51.000 0.000 1.000   NA
 5910203 5910204 HRM2_28880 HRM2_28890   argA1 TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5910205 5910206 HRM2_28900 HRM2_28910     FALSE 0.389 56.000 0.000 NA   NA
 5910207 5910208 HRM2_28920 HRM2_28930     TRUE 0.998 5.000 0.315 NA   NA
 5910208 5910209 HRM2_28930 HRM2_28940   moeB2 FALSE 0.365 73.000 0.000 1.000   NA
 5910209 5910210 HRM2_28940 HRM2_28950 moeB2   FALSE 0.031 249.000 0.000 NA   NA
 5910210 5910211 HRM2_28950 HRM2_28960     FALSE 0.076 174.000 0.000 NA   NA
 5910211 5910212 HRM2_28960 HRM2_28970     FALSE 0.009 435.000 0.000 NA   NA
 5910212 5910213 HRM2_28970 HRM2_28980     TRUE 0.881 12.000 0.000 0.028 N NA
 5910213 5910214 HRM2_28980 HRM2_28990   kefA TRUE 0.660 18.000 0.000 1.000 N NA
 5910214 5910215 HRM2_28990 HRM2_29000 kefA glgA2 FALSE 0.375 65.000 0.000 1.000 N NA
 5910215 5910216 HRM2_29000 HRM2_29010 glgA2 glgC3 TRUE 0.999 0.000 0.063 1.000 Y NA
 5910216 5910217 HRM2_29010 HRM2_29020 glgC3   FALSE 0.130 140.000 0.000 1.000 N NA
 5910218 5910219 HRM2_29030 HRM2_29040 ilvB   TRUE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 5910219 5910220 HRM2_29040 HRM2_29050     FALSE 0.280 84.000 0.000 NA   NA
 5910220 5910221 HRM2_29050 HRM2_29060   soxB2 TRUE 0.425 46.000 0.000 NA   NA
 5910221 5910222 HRM2_29060 HRM2_29070 soxB2 soxA2 TRUE 0.974 -7.000 0.000 0.001   NA
 5910222 5910223 HRM2_29070 HRM2_29080 soxA2 ooxA TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910223 5910224 HRM2_29080 HRM2_29090 ooxA   FALSE 0.262 89.000 0.000 NA   NA
 5910224 5910225 HRM2_29090 HRM2_29100   rbr3 FALSE 0.016 326.000 0.000 NA   NA
 5910225 5910226 HRM2_29100 HRM2_29110 rbr3   FALSE 0.056 208.000 0.000 1.000   NA
 5910226 5910227 HRM2_29110 HRM2_29120   patB TRUE 0.731 15.000 0.000 1.000   NA
 5910229 5910230 HRM2_29140 HRM2_29150     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5910230 5910231 HRM2_29150 HRM2_29160     TRUE 0.848 -18.000 0.000 NA   NA
 5910232 5910233 HRM2_29170 HRM2_29180   asd TRUE 0.416 53.000 0.000 1.000 N NA
 5910235 5910236 HRM2_29200 HRM2_29210     TRUE 0.994 1.000 0.032 NA   NA
 5910236 5910237 HRM2_29210 HRM2_29220     TRUE 0.997 23.000 0.761 NA   NA
 5910237 5910238 HRM2_29220 HRM2_29230   prkA2 TRUE 1.000 1.000 0.683 NA   NA
 5910242 5910243 HRM2_29270 HRM2_29280   fabG7 TRUE 0.471 162.000 0.000 0.048 Y NA
 5910244 5910245 HRM2_29290 HRM2_29300     TRUE 0.711 -67.000 0.000 NA   NA
 5910246 5910247 HRM2_29310 HRM2_29320 ispD   TRUE 0.829 10.000 0.000 1.000   NA
 5910247 5910248 HRM2_29320 HRM2_29330     TRUE 0.915 28.000 0.014 1.000   NA
 5910248 5910249 HRM2_29330 HRM2_29340   sufC TRUE 0.999 -12.000 0.092 1.000 Y NA
 5910249 5910250 HRM2_29340 HRM2_29350 sufC   FALSE 0.008 481.000 0.000 NA   NA
 5910250 5910251 HRM2_29350 HRM2_29360     TRUE 0.931 53.000 0.067 NA   NA
 5910251 5910252 HRM2_29360 HRM2_29370     FALSE 0.089 163.000 0.000 NA   NA
 5910252 5910253 HRM2_29370 HRM2_29380   rpoD FALSE 0.384 58.000 0.000 NA   NA
 5910253 5910254 HRM2_29380 HRM2_29390 rpoD dnaG9 TRUE 0.988 27.000 0.299 1.000 N NA
 5910254 5910255 HRM2_29390 HRM2_29400 dnaG9 hisB FALSE 0.302 82.000 0.000 1.000 N NA
 5910256 5910257 HRM2_29410 HRM2_29420   rimK2 TRUE 0.494 31.000 0.000 NA   NA
 5910257 5910258 HRM2_29420 HRM2_29430 rimK2 mptN TRUE 0.985 9.000 0.039 1.000 N NA
 5910258 5910259 HRM2_29430 HRM2_29440 mptN aspA TRUE 0.998 7.000 0.300 1.000   NA
 5910259 5910260 HRM2_29440 HRM2_29450 aspA   FALSE 0.222 100.000 0.000 NA   NA
 5910261 5910262 HRM2_29460 HRM2_29470   pyrD TRUE 0.589 23.000 0.000 1.000 N NA
 5910262 5910263 HRM2_29470 HRM2_29480 pyrD   FALSE 0.207 114.000 0.000 1.000   NA
 5910263 5910264 HRM2_29480 HRM2_29490     TRUE 0.944 5.000 0.000 0.012   NA
 5910264 5910265 HRM2_29490 HRM2_29500     TRUE 0.819 9.000 0.000 NA   NA
 5910265 5910266 HRM2_29500 HRM2_29510     TRUE 0.993 -7.000 0.022 NA   NA
 5910266 5910267 HRM2_29510 HRM2_29520     TRUE 1.000 1.000 0.541 NA   NA
 5910267 5910268 HRM2_29520 HRM2_29530     TRUE 0.999 6.000 0.764 NA   NA
 5910268 5910269 HRM2_29530 HRM2_29540     FALSE 0.168 129.000 0.000 1.000   NA
 5910269 5910270 HRM2_29540 HRM2_29550     FALSE 0.331 72.000 0.000 NA   NA
 5910271 5910272 HRM2_29560 HRM2_29570     FALSE 0.074 354.000 0.000 1.000 Y NA
 5910272 5910273 HRM2_29570 HRM2_29580     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910275 5910276 HRM2_29600 HRM2_29610     TRUE 0.998 -3.000 0.065 0.043   NA
 5910276 5910277 HRM2_29610 HRM2_29620     TRUE 0.708 145.000 0.030 0.043 N NA
 5910277 5910278 HRM2_29620 HRM2_29630   adh2 FALSE 0.140 141.000 0.000 1.000   NA
 5910278 5910279 HRM2_29630 HRM2_29640 adh2   FALSE 0.011 452.000 0.000 1.000   NA
 5910280 5910281 HRM2_29660 HRM2_29670 rrfB rrlB FALSE 0.140 131.000 0.000 NA   NA
 5910281 5910282 HRM2_29670 HRM2_29680 rrlB rrsB FALSE 0.017 319.000 0.000 NA   NA
 5910282 5910283 HRM2_29680 HRM2_29690 rrsB dnaK3 FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 5910283 5910284 HRM2_29690 HRM2_29700 dnaK3 dnaK4 TRUE 0.992 12.000 0.032 NA Y NA
 5910284 5910285 HRM2_29700 HRM2_29710 dnaK4   TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5910285 5910286 HRM2_29710 HRM2_29720     TRUE 0.659 17.000 0.000 NA   NA
 5910286 5910287 HRM2_29720 HRM2_29730     FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 5910287 5910288 HRM2_29730 HRM2_29740   ugd FALSE 0.047 225.000 0.000 1.000   NA
 5910288 5910289 HRM2_29740 HRM2_29750 ugd capD1 TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5910289 5910290 HRM2_29750 HRM2_29760 capD1 capD2 TRUE 0.958 -34.000 0.000 1.000 Y NA
 5910290 5910291 HRM2_29760 HRM2_29770 capD2 wecA TRUE 0.996 -13.000 0.014 1.000 Y NA
 5910291 5910292 HRM2_29770 HRM2_29780 wecA galE2 TRUE 0.990 12.000 0.014 1.000 Y NA
 5910292 5910293 HRM2_29780 HRM2_29790 galE2   TRUE 0.833 -21.000 0.000 NA   NA
 5910293 5910294 HRM2_29790 HRM2_29800   pgaC TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5910294 5910295 HRM2_29800 HRM2_29810 pgaC   TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5910295 5910296 HRM2_29810 HRM2_29820     FALSE 0.087 165.000 0.000 NA   NA
 5910297 5910298 HRM2_29830 HRM2_29840     FALSE 0.142 130.000 0.000 NA   NA
 5910298 5910299 HRM2_29840 HRM2_29850   glgA3 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910299 5910300 HRM2_29850 HRM2_29860 glgA3   TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5910301 5910302 HRM2_29870 HRM2_29880 algJ algI2 TRUE 0.994 9.000 0.133 NA   NA
 5910302 5910303 HRM2_29880 HRM2_29890 algI2   FALSE 0.265 88.000 0.000 NA   NA
 5910303 5910304 HRM2_29890 HRM2_29900     FALSE 0.122 140.000 0.000 NA   NA
 5910304 5910305 HRM2_29900 HRM2_29910     TRUE 0.990 -61.000 0.143 NA   NA
 5910305 5910306 HRM2_29910 HRM2_29920     FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 5910306 5910307 HRM2_29920 HRM2_29930     FALSE 0.376 60.000 0.000 NA   NA
 5910307 5910308 HRM2_29930 HRM2_29940     FALSE 0.214 102.000 0.000 NA   NA
 5910308 5910309 HRM2_29940 HRM2_29950     FALSE 0.051 286.000 0.000 0.036   NA
 5910309 5910310 HRM2_29950 HRM2_29960     TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 5910310 5910311 HRM2_29960 HRM2_29970     TRUE 0.713 16.000 0.000 1.000   NA
 5910311 5910312 HRM2_29970 HRM2_29980     TRUE 0.888 5.000 0.000 1.000   NA
 5910312 5910313 HRM2_29980 HRM2_29990     TRUE 0.901 145.000 0.070 1.000 Y NA
 5910313 5910314 HRM2_29990 HRM2_30000     FALSE 0.186 111.000 0.000 NA   NA
 5910314 5910315 HRM2_30000 HRM2_30010     FALSE 0.369 62.000 0.000 NA   NA
 5910315 5910316 HRM2_30010 HRM2_30020     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910316 5910317 HRM2_30020 HRM2_30030     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5910317 5910318 HRM2_30030 HRM2_30040     FALSE 0.299 79.000 0.000 NA   NA
 5910318 5910319 HRM2_30040 HRM2_30050     FALSE 0.126 138.000 0.000 NA   NA
 5910319 5910320 HRM2_30050 HRM2_30060     FALSE 0.066 188.000 0.000 NA   NA
 5910320 5910321 HRM2_30060 HRM2_30070   btuB2 FALSE 0.034 238.000 0.000 NA   NA
 5910321 5910322 HRM2_30070 HRM2_30080 btuB2   TRUE 0.842 8.000 0.000 1.000 N NA
 5910322 5910323 HRM2_30080 HRM2_30090   atoS2 TRUE 0.975 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5910323 5910324 HRM2_30090 HRM2_30100 atoS2   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910324 5910325 HRM2_30100 HRM2_30110   gspD2 FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 5910325 5910326 HRM2_30110 HRM2_30120 gspD2   TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5910326 5910327 HRM2_30120 HRM2_30130     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910327 5910328 HRM2_30130 HRM2_30140   gspL TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5910328 5910329 HRM2_30140 HRM2_30150 gspL gspK2 TRUE 0.735 70.000 0.000 NA Y NA
 5910329 5910330 HRM2_30150 HRM2_30160 gspK2 gspJ2 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910330 5910331 HRM2_30160 HRM2_30170 gspJ2 gspI TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5910331 5910332 HRM2_30170 HRM2_30180 gspI   TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5910332 5910333 HRM2_30180 HRM2_30190     FALSE 0.113 145.000 0.000 NA   NA
 5910333 5910334 HRM2_30190 HRM2_30200     TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5910336 5910337 HRM2_30220 HRM2_30230   gspH FALSE 0.068 185.000 0.000 NA   NA
 5910337 5910338 HRM2_30230 HRM2_30240 gspH gspG2 TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5910338 5910339 HRM2_30240 HRM2_30250 gspG2 gspF2 TRUE 0.991 43.000 0.083 0.002 Y NA
 5910339 5910340 HRM2_30250 HRM2_30260 gspF2 gspE3 TRUE 1.000 2.000 0.125 0.002 Y NA
 5910340 5910341 HRM2_30260 HRM2_30270 gspE3 speE2 FALSE 0.179 126.000 0.000 1.000   NA
 5910341 5910342 HRM2_30270 HRM2_30280 speE2   TRUE 0.970 -55.000 0.026 NA   NA
 5910342 5910343 HRM2_30280 HRM2_30290     TRUE 0.998 -3.000 0.080 NA   NA
 5910343 5910344 HRM2_30290 HRM2_30300     TRUE 0.562 24.000 0.000 NA   NA
 5910345 5910346 HRM2_30310 HRM2_30320     TRUE 0.581 22.000 0.000 NA   NA
 5910346 5910347 HRM2_30320 HRM2_30330   dacB TRUE 0.989 -16.000 0.014 0.013 N NA
 5910348 5910349 HRM2_30340 HRM2_30350     TRUE 0.994 -3.000 0.007 NA   NA
 5910349 5910350 HRM2_30350 HRM2_30360   rpoZ TRUE 0.964 9.000 0.004 NA N NA
 5910350 5910351 HRM2_30360 HRM2_30370 rpoZ greA1 TRUE 0.986 16.000 0.004 0.042 Y NA
 5910351 5910352 HRM2_30370 HRM2_30380 greA1 psd FALSE 0.227 102.000 0.000 1.000 N NA
 5910352 5910353 HRM2_30380 HRM2_30390 psd   TRUE 0.849 33.000 0.003 1.000 N NA
 5910353 5910354 HRM2_30390 HRM2_30400   lon4 TRUE 0.998 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 5910357 5910358 HRM2_30430 HRM2_30440 hbp   FALSE 0.303 78.000 0.000 NA   NA
 5910359 5910360 HRM2_30450 HRM2_30460 sbcB rpsI FALSE 0.390 61.000 0.000 1.000 N NA
 5910360 5910361 HRM2_30460 HRM2_30470 rpsI rplM TRUE 0.990 27.000 0.051 0.008 Y NA
 5910361 5910362 HRM2_30470 HRM2_30480 rplM   FALSE 0.296 74.000 0.000 NA N NA
 5910362 5910363 HRM2_30480 HRM2_30490     TRUE 0.839 -19.000 0.000 NA   NA
 5910363 5910364 HRM2_30490 HRM2_30500     TRUE 0.886 46.000 0.021 NA   NA
 5910364 5910365 HRM2_30500 HRM2_30510   ruvB TRUE 0.981 3.000 0.002 NA   NA
 5910365 5910366 HRM2_30510 HRM2_30520 ruvB ruvA TRUE 1.000 -3.000 0.549 0.008 Y NA
 5910366 5910367 HRM2_30520 HRM2_30530 ruvA ruvC TRUE 1.000 -3.000 0.451 0.008 Y NA
 5910367 5910368 HRM2_30530 HRM2_30540 ruvC   TRUE 0.888 26.000 0.004 1.000   NA
 5910368 5910369 HRM2_30540 HRM2_30550   pal TRUE 0.485 220.000 0.067 1.000   NA
 5910369 5910370 HRM2_30550 HRM2_30560 pal aglW TRUE 0.860 36.000 0.005 1.000 N NA
 5910370 5910371 HRM2_30560 HRM2_30570 aglW   TRUE 0.992 8.000 0.039 0.003 N NA
 5910371 5910372 HRM2_30570 HRM2_30580   tolR TRUE 0.998 10.000 0.389 0.085 N NA
 5910372 5910373 HRM2_30580 HRM2_30590 tolR tolQ1 TRUE 1.000 0.000 0.102 0.052 Y NA
 5910373 5910374 HRM2_30590 HRM2_30600 tolQ1 groEL FALSE 0.113 150.000 0.000 1.000 N NA
 5910374 5910375 HRM2_30600 HRM2_30610 groEL groES TRUE 0.989 80.000 0.286 1.000 Y NA
 5910375 5910376 HRM2_30610 HRM2_30620 groES   TRUE 0.762 79.000 0.007 NA   NA
 5910376 5910377 HRM2_30620 HRM2_30630     TRUE 0.754 99.000 0.022 NA   NA
 5910379 5910380 HRM2_30650 HRM2_30660 hflC hflK TRUE 1.000 -3.000 0.947 0.005 Y NA
 5910380 5910381 HRM2_30660 HRM2_30670 hflK   FALSE 0.007 509.000 0.000 NA   NA
 5910382 5910383 HRM2_30680 HRM2_30690   hisK FALSE 0.325 73.000 0.000 NA   NA
 5910383 5910384 HRM2_30690 HRM2_30700 hisK trmH2 TRUE 0.915 3.000 0.000 1.000 N NA
 5910384 5910385 HRM2_30700 HRM2_30710 trmH2 ftn TRUE 0.457 43.000 0.000 1.000 N NA
 5910386 5910387 HRM2_30720 HRM2_30730 fdx7 fdx8 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910388 5910389 HRM2_30740 HRM2_30750 glcD4   TRUE 0.900 33.000 0.000 0.034 Y NA
 5910389 5910390 HRM2_30750 HRM2_30760     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5910391 5910392 HRM2_30770 HRM2_30780     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 5910392 5910393 HRM2_30780 HRM2_30790   metF2 TRUE 0.991 21.000 0.286 1.000 N NA
 5910393 5910394 HRM2_30790 HRM2_30800 metF2   TRUE 0.420 47.000 0.000 NA   NA
 5910395 5910396 HRM2_30810 HRM2_30820     FALSE 0.288 222.000 0.000 0.033 Y NA
 5910396 5910397 HRM2_30820 HRM2_30830   aroE2 FALSE 0.028 270.000 0.000 1.000 N NA
 5910397 5910398 HRM2_30830 HRM2_30840 aroE2 phoR TRUE 0.895 4.000 0.000 1.000 N NA
 5910399 5910400 HRM2_30850 HRM2_30860 flgG1 metF3 FALSE 0.027 285.000 0.000 1.000   NA
 5910400 5910401 HRM2_30860 HRM2_30870 metF3   TRUE 0.999 -3.000 0.286 NA   NA
 5910401 5910402 HRM2_30870 HRM2_30880   mvhD7 TRUE 0.989 36.000 0.400 NA   NA
 5910402 5910403 HRM2_30880 HRM2_30890 mvhD7 hdrL3 FALSE 0.296 84.000 0.000 1.000 N NA
 5910403 5910404 HRM2_30890 HRM2_30900 hdrL3 metF4 TRUE 0.960 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5910405 5910406 HRM2_30910 HRM2_30920   parA FALSE 0.205 108.000 0.000 1.000 N NA
 5910407 5910408 HRM2_30930 HRM2_30940     TRUE 0.996 -19.000 0.165 1.000   NA
 5910408 5910409 HRM2_30940 HRM2_30950   rnhB TRUE 0.999 0.000 0.111 1.000 Y NA
 5910409 5910410 HRM2_30950 HRM2_30960 rnhB rplS TRUE 0.983 13.000 0.066 1.000 N NA
 5910410 5910411 HRM2_30960 HRM2_30970 rplS   TRUE 0.898 55.000 0.037 NA   NA
 5910411 5910412 HRM2_30970 HRM2_30980   trmD TRUE 0.995 -7.000 0.041 NA   NA
 5910412 5910413 HRM2_30980 HRM2_30990 trmD rimM TRUE 1.000 0.000 0.672 1.000 Y NA
 5910413 5910414 HRM2_30990 HRM2_31000 rimM   TRUE 0.998 5.000 0.324 1.000   NA
 5910414 5910415 HRM2_31000 HRM2_31010   rpsP TRUE 0.986 52.000 0.385 1.000   NA
 5910415 5910416 HRM2_31010 HRM2_31020 rpsP ffh TRUE 0.995 15.000 0.361 1.000 N NA
 5910418 5910419 HRM2_31040 HRM2_31050     TRUE 0.932 1.000 0.000 NA   NA
 5910419 5910420 HRM2_31050 HRM2_31060     TRUE 0.425 46.000 0.000 NA   NA
 5910420 5910421 HRM2_31060 HRM2_31070   ntrB TRUE 0.730 76.000 0.000 1.000 Y NA
 5910421 5910422 HRM2_31070 HRM2_31080 ntrB ntrA TRUE 1.000 -67.000 0.973 NA Y NA
 5910422 5910423 HRM2_31080 HRM2_31090 ntrA ntrC2 TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 5910423 5910424 HRM2_31090 HRM2_31100 ntrC2   TRUE 0.998 4.000 0.065 NA Y NA
 5910424 5910425 HRM2_31100 HRM2_31110   ubiB2 FALSE 0.073 179.000 0.000 NA   NA
 5910425 5910426 HRM2_31110 HRM2_31120 ubiB2   TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5910426 5910427 HRM2_31120 HRM2_31130   acd10 TRUE 0.605 24.000 0.000 1.000   NA
 5910428 5910429 HRM2_31140 HRM2_31150     TRUE 1.000 -6.000 0.255 NA Y NA
 5910429 5910430 HRM2_31150 HRM2_31160   lysS2 TRUE 0.936 17.000 0.009 NA N NA
 5910431 5910432 HRM2_31170 HRM2_31180   sat2 FALSE 0.144 139.000 0.000 1.000   NA
 5910432 5910433 HRM2_31180 HRM2_31190 sat2   FALSE 0.061 202.000 0.000 1.000   NA
 5910433 5910434 HRM2_31190 HRM2_31200     TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5910434 5910435 HRM2_31200 HRM2_31210     FALSE 0.071 181.000 0.000 NA   NA
 5910435 5910436 HRM2_31210 HRM2_31220     FALSE 0.058 197.000 0.000 NA   NA
 5910436 5910437 HRM2_31220 HRM2_31230   nusB TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5910437 5910438 HRM2_31230 HRM2_31240 nusB ribH TRUE 0.998 6.000 0.347 1.000 N NA
 5910438 5910439 HRM2_31240 HRM2_31250 ribH ribAB TRUE 0.990 31.000 0.051 0.001 Y NA
 5910439 5910440 HRM2_31250 HRM2_31260 ribAB ribE TRUE 0.987 19.000 0.037 1.000 Y NA
 5910440 5910441 HRM2_31260 HRM2_31270 ribE ribD TRUE 0.999 15.000 0.456 1.000 Y NA
 5910441 5910442 HRM2_31270 HRM2_31280 ribD   TRUE 0.996 -40.000 0.277 NA N NA
 5910442 5910443 HRM2_31280 HRM2_31290     TRUE 0.995 -3.000 0.016 NA N NA
 5910443 5910444 HRM2_31290 HRM2_31300   glyA TRUE 0.982 -43.000 0.049 1.000 N NA
 5910444 5910445 HRM2_31300 HRM2_31310 glyA rpiB TRUE 0.921 24.000 0.012 1.000 N NA
 5910445 5910446 HRM2_31310 HRM2_31320 rpiB acpP TRUE 0.691 16.000 0.000 1.000 N NA
 5910446 5910447 HRM2_31320 HRM2_31330 acpP rpmF TRUE 0.804 45.000 0.002 1.000 N NA
 5910449 5910450 HRM2_31350 HRM2_31360   hypB TRUE 0.967 -33.000 0.007 NA   NA
 5910450 5910451 HRM2_31360 HRM2_31370 hypB hypA TRUE 0.917 60.000 0.015 0.002   NA
 5910451 5910452 HRM2_31370 HRM2_31380 hypA   TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 5910452 5910453 HRM2_31380 HRM2_31390   tgt TRUE 0.895 4.000 0.000 1.000 N NA
 5910453 5910454 HRM2_31390 HRM2_31400 tgt queA TRUE 1.000 8.000 0.360 0.000 Y NA
 5910454 5910455 HRM2_31400 HRM2_31410 queA   TRUE 0.992 0.000 0.007 NA   NA
 5910456 5910457 HRM2_31420 HRM2_31430 gatB   TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5910458 5910459 HRM2_31440 HRM2_31450     FALSE 0.027 264.000 0.000 NA   NA
 5910459 5910460 HRM2_31450 HRM2_31460     FALSE 0.018 310.000 0.000 NA   NA
 5910460 5910461 HRM2_31460 HRM2_31470     FALSE 0.007 537.000 0.000 NA   NA
 5910462 5910463 HRM2_31480 HRM2_31490     FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5910464 5910465 HRM2_31500 HRM2_31510 mutL   TRUE 0.841 7.000 0.000 NA   NA
 5910465 5910466 HRM2_31510 HRM2_31520   gatA2 TRUE 0.581 22.000 0.000 NA   NA
 5910466 5910467 HRM2_31520 HRM2_31530 gatA2 gatC TRUE 1.000 13.000 0.643 0.001 Y NA
 5910467 5910468 HRM2_31530 HRM2_31540 gatC   TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5910468 5910469 HRM2_31540 HRM2_31550   argS TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5910469 5910470 HRM2_31550 HRM2_31560 argS   TRUE 0.819 9.000 0.000 NA   NA
 5910471 5910472 HRM2_31570 HRM2_31580     TRUE 0.819 9.000 0.000 NA   NA
 5910473 5910474 HRM2_31590 HRM2_31600   pgi TRUE 0.893 -12.000 0.000 NA   NA
 5910475 5910476 HRM2_31610 HRM2_31620     TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 5910476 5910477 HRM2_31620 HRM2_31630     FALSE 0.260 98.000 0.000 1.000   NA
 5910477 5910478 HRM2_31630 HRM2_31640   hmeC FALSE 0.371 72.000 0.000 1.000   NA
 5910478 5910479 HRM2_31640 HRM2_31650 hmeC hmeD TRUE 1.000 4.000 0.766 1.000 Y NA
 5910479 5910480 HRM2_31650 HRM2_31660 hmeD hmeE1 TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5910480 5910481 HRM2_31660 HRM2_31670 hmeE1 hmeE2 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910481 5910482 HRM2_31670 HRM2_31680 hmeE2 hmeB TRUE 0.999 12.000 0.613 NA Y NA
 5910482 5910483 HRM2_31680 HRM2_31690 hmeB   FALSE 0.117 143.000 0.000 NA   NA
 5910483 5910484 HRM2_31690 HRM2_31700   rplU FALSE 0.080 170.000 0.000 NA   NA
 5910484 5910485 HRM2_31700 HRM2_31710 rplU rpmA TRUE 0.999 29.000 0.667 0.008 Y NA
 5910485 5910486 HRM2_31710 HRM2_31720 rpmA   TRUE 0.999 -3.000 0.335 1.000   NA
 5910486 5910487 HRM2_31720 HRM2_31730   proB TRUE 0.998 -13.000 0.206 1.000   NA
 5910487 5910488 HRM2_31730 HRM2_31740 proB proA TRUE 0.999 10.000 0.281 0.001 Y NA
 5910488 5910489 HRM2_31740 HRM2_31750 proA   TRUE 0.995 10.000 0.170 1.000 N NA
 5910489 5910490 HRM2_31750 HRM2_31760     TRUE 0.999 -3.000 0.221 NA   NA
 5910490 5910491 HRM2_31760 HRM2_31770   gpmA2 TRUE 0.944 19.000 0.020 NA   NA
 5910491 5910492 HRM2_31770 HRM2_31780 gpmA2   FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 5910493 5910494 HRM2_31790 HRM2_31800   pcb FALSE 0.026 270.000 0.000 NA   NA
 5910494 5910495 HRM2_31800 HRM2_31810 pcb   TRUE 0.977 62.000 0.300 NA   NA
 5910495 5910496 HRM2_31810 HRM2_31820   pccB TRUE 0.977 10.000 0.020 NA   NA
 5910496 5910497 HRM2_31820 HRM2_31830 pccB coaE FALSE 0.117 147.000 0.000 1.000 N NA
 5910497 5910498 HRM2_31830 HRM2_31840 coaE   FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 5910501 5910502 HRM2_31870 HRM2_31880     TRUE 0.999 10.000 0.827 1.000 N NA
 5910502 5910503 HRM2_31880 HRM2_31890   ispH TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5910503 5910504 HRM2_31890 HRM2_31900 ispH   FALSE 0.185 105.000 0.000 NA N NA
 5910505 5910506 HRM2_31910 HRM2_31920     TRUE 0.569 25.000 0.000 1.000 N NA
 5910507 5910508 HRM2_31930 HRM2_31940     TRUE 0.895 4.000 0.000 1.000 N NA
 5910508 5910509 HRM2_31940 HRM2_31950     FALSE 0.137 132.000 0.000 NA   NA
 5910510 5910511 HRM2_31960 HRM2_31970 pncA   FALSE 0.128 141.000 0.000 1.000 N NA
 5910511 5910512 HRM2_31970 HRM2_31980     TRUE 0.999 -33.000 0.413 1.000 Y NA
 5910512 5910513 HRM2_31980 HRM2_31990     TRUE 0.951 -100.000 0.000 0.018 Y NA
 5910513 5910514 HRM2_31990 HRM2_32000     TRUE 0.992 -7.000 0.000 0.018 Y NA
 5910514 5910515 HRM2_32000 HRM2_32010     TRUE 0.439 43.000 0.000 NA   NA
 5910515 5910516 HRM2_32010 HRM2_32020     FALSE 0.032 243.000 0.000 NA   NA
 5910517 5910518 HRM2_32030 HRM2_32040     TRUE 0.489 32.000 0.000 NA   NA
 5910518 5910519 HRM2_32040 HRM2_32050   sigE FALSE 0.067 186.000 0.000 NA   NA
 5910519 5910520 HRM2_32050 HRM2_32060 sigE   FALSE 0.131 134.000 0.000 NA   NA
 5910520 5910521 HRM2_32060 HRM2_32070   rnfC2 TRUE 0.523 71.000 0.000 0.050   NA
 5910521 5910522 HRM2_32070 HRM2_32080 rnfC2 rnfD2 TRUE 1.000 -7.000 0.750 0.050 Y NA
 5910522 5910523 HRM2_32080 HRM2_32090 rnfD2 rnfG2 TRUE 0.999 -7.000 0.071 0.050 Y NA
 5910523 5910524 HRM2_32090 HRM2_32100 rnfG2 rnfE2 TRUE 0.997 13.000 0.071 0.050 Y NA
 5910524 5910525 HRM2_32100 HRM2_32110 rnfE2 rnfA2 TRUE 0.996 12.000 0.058 0.050 Y NA
 5910525 5910526 HRM2_32110 HRM2_32120 rnfA2   TRUE 0.905 76.000 0.038 0.050 N NA
 5910526 5910527 HRM2_32120 HRM2_32130     TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5910527 5910528 HRM2_32130 HRM2_32140   apbE FALSE 0.376 60.000 0.000 NA   NA
 5910530 5910531 HRM2_32160 HRM2_32170 gidA dnaJ5 FALSE 0.323 77.000 0.000 1.000 N NA
 5910531 5910532 HRM2_32170 HRM2_32180 dnaJ5 hpt TRUE 0.971 9.000 0.006 1.000 N NA
 5910532 5910533 HRM2_32180 HRM2_32190 hpt   TRUE 0.951 18.000 0.023 NA   NA
 5910533 5910534 HRM2_32190 HRM2_32200     FALSE 0.380 59.000 0.000 NA   NA
 5910535 5910536 HRM2_32210 HRM2_32220     FALSE 0.024 279.000 0.000 NA   NA
 5910537 5910538 HRM2_32230 HRM2_32240     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5910539 5910540 HRM2_32250 HRM2_32260     TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5910540 5910541 HRM2_32260 HRM2_32270   rnhA2 FALSE 0.016 304.000 0.000 NA N NA
 5910541 5910542 HRM2_32270 HRM2_32280 rnhA2   TRUE 0.947 0.000 0.000 1.000 N NA
 5910542 5910543 HRM2_32280 HRM2_32290     FALSE 0.214 102.000 0.000 NA   NA
 5910546 5910547 HRM2_32320 HRM2_32330     FALSE 0.239 95.000 0.000 NA   NA
 5910548 5910549 HRM2_32340 HRM2_32350 ligA2   FALSE 0.299 79.000 0.000 NA   NA
 5910550 5910551 HRM2_32360 HRM2_32370 gltB2 gltD2 TRUE 0.998 12.000 0.118 0.001 Y NA
 5910554 5910555 HRM2_32400 HRM2_32410 fumA sdhB TRUE 0.944 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5910555 5910556 HRM2_32410 HRM2_32420 sdhB sdhA TRUE 1.000 0.000 0.153 0.001 Y NA
 5910556 5910557 HRM2_32420 HRM2_32430 sdhA sdhC TRUE 0.999 4.000 0.128 0.001 Y NA
 5910557 5910558 HRM2_32430 HRM2_32440 sdhC sucD2 TRUE 0.610 104.000 0.000 1.000 Y NA
 5910558 5910559 HRM2_32440 HRM2_32450 sucD2 sucC1 TRUE 0.970 93.000 0.051 0.001 Y NA
 5910559 5910560 HRM2_32450 HRM2_32460 sucC1 argK TRUE 0.549 27.000 0.000 1.000 N NA
 5910560 5910561 HRM2_32460 HRM2_32470 argK sbm TRUE 0.998 9.000 0.366 1.000 N NA
 5910561 5910562 HRM2_32470 HRM2_32480 sbm   TRUE 0.917 46.000 0.041 1.000 N NA
 5910562 5910563 HRM2_32480 HRM2_32490     FALSE 0.036 240.000 0.000 1.000 N NA
 5910565 5910566 HRM2_32510 HRM2_32520     TRUE 0.998 6.000 0.304 1.000   NA
 5910566 5910567 HRM2_32520 HRM2_32530     TRUE 0.594 25.000 0.000 1.000   NA
 5910567 5910568 HRM2_32530 HRM2_32540   cysA FALSE 0.372 101.000 0.000 0.042 N NA
 5910568 5910569 HRM2_32540 HRM2_32550 cysA cysT TRUE 0.999 -3.000 0.127 0.042 N NA
 5910569 5910570 HRM2_32550 HRM2_32560 cysT   TRUE 0.583 53.000 0.000 0.042 N NA
 5910570 5910571 HRM2_32560 HRM2_32570   plsC FALSE 0.154 129.000 0.000 1.000 N NA
 5910571 5910572 HRM2_32570 HRM2_32580 plsC   TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5910572 5910573 HRM2_32580 HRM2_32590     TRUE 0.852 6.000 0.000 NA   NA
 5910573 5910574 HRM2_32590 HRM2_32600     TRUE 0.981 17.000 0.098 NA   NA
 5910574 5910575 HRM2_32600 HRM2_32610     TRUE 0.997 4.000 0.176 NA   NA
 5910575 5910576 HRM2_32610 HRM2_32620     FALSE 0.317 75.000 0.000 NA   NA
 5910576 5910577 HRM2_32620 HRM2_32630     FALSE 0.023 282.000 0.000 NA   NA
 5910577 5910578 HRM2_32630 HRM2_32640     TRUE 0.841 7.000 0.000 NA   NA
 5910579 5910580 HRM2_32650 HRM2_32660     TRUE 0.999 32.000 0.750 NA Y NA
 5910581 5910582 HRM2_32670 HRM2_32680     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5910582 5910583 HRM2_32680 HRM2_32690     TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5910583 5910584 HRM2_32690 HRM2_32700     FALSE 0.277 94.000 0.000 1.000   NA
 5910585 5910586 HRM2_32710 HRM2_32720   nox1 TRUE 0.584 64.000 0.000 0.025   NA
 5910586 5910587 HRM2_32720 HRM2_32730 nox1 fsxA FALSE 0.083 181.000 0.000 1.000   NA
 5910587 5910588 HRM2_32730 HRM2_32740 fsxA   TRUE 0.682 18.000 0.000 1.000   NA
 5910588 5910589 HRM2_32740 HRM2_32750     TRUE 0.909 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5910590 5910591 HRM2_32760 HRM2_32770     TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5910592 5910593 HRM2_32780 HRM2_32790   acsL3 FALSE 0.224 99.000 0.000 NA   NA
 5910593 5910594 HRM2_32790 HRM2_32800 acsL3   FALSE 0.046 211.000 0.000 NA   NA
 5910596 5910597 HRM2_32820 HRM2_32830     FALSE 0.018 312.000 0.000 NA   NA
 5910598 5910599 HRM2_32840 HRM2_32850   prxU FALSE 0.024 281.000 0.000 NA   NA
 5910599 5910600 HRM2_32850 HRM2_32860 prxU   FALSE 0.012 383.000 0.000 NA   NA
 5910601 5910602 HRM2_32870 HRM2_32880     TRUE 0.852 6.000 0.000 NA   NA
 5910604 5910605 HRM2_32900 HRM2_32910     TRUE 0.539 26.000 0.000 NA   NA
 5910606 5910607 HRM2_32920 HRM2_32930     FALSE 0.258 90.000 0.000 NA   NA
 5910607 5910608 HRM2_32930 HRM2_32940     TRUE 0.594 21.000 0.000 NA   NA
 5910609 5910610 HRM2_32950 HRM2_32960     FALSE 0.056 198.000 0.000 NA   NA
 5910610 5910611 HRM2_32960 HRM2_32970   selB TRUE 0.941 16.000 0.008 NA   NA
 5910611 5910612 HRM2_32970 HRM2_32980 selB   TRUE 0.477 38.000 0.000 1.000 N NA
 5910613 5910614 HRM2_32990 HRM2_33000 hemN2   TRUE 0.968 -7.000 0.000 0.030   NA
 5910616 5910617 HRM2_33020 HRM2_33030   ftsK2 FALSE 0.140 131.000 0.000 NA   NA
 5910619 5910620 HRM2_33050 HRM2_33060 purH1 purH2 TRUE 0.996 4.000 0.041 0.000   NA
 5910623 5910624 HRM2_33090 HRM2_33100     FALSE 0.155 126.000 0.000 NA   NA
 5910627 5910628 HRM2_33130 HRM2_33140     TRUE 0.993 -7.000 0.025 NA   NA
 5910628 5910629 HRM2_33140 HRM2_33150   fbiC1 TRUE 0.998 -3.000 0.062 1.000 N NA
 5910629 5910630 HRM2_33150 HRM2_33160 fbiC1 fbiC2 TRUE 0.999 -3.000 0.144 0.035   NA
 5910630 5910631 HRM2_33160 HRM2_33170 fbiC2   FALSE 0.005 850.000 0.000 NA   NA
 5910631 5910632 HRM2_33170 HRM2_33180     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910632 5910633 HRM2_33180 HRM2_33190     TRUE 0.958 14.000 0.014 NA   NA
 5910634 5910635 HRM2_33200 HRM2_33210   pepQ FALSE 0.325 73.000 0.000 NA   NA
 5910635 5910636 HRM2_33210 HRM2_33220 pepQ   TRUE 0.990 1.000 0.007 1.000 N NA
 5910636 5910637 HRM2_33220 HRM2_33230     FALSE 0.337 79.000 0.000 1.000   NA
 5910637 5910638 HRM2_33230 HRM2_33240     TRUE 0.906 99.000 0.111 1.000   NA
 11538446 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1537.000 0.000 NA   NA
 11680809 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1537.000 0.000 NA   NA
 11823201 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1537.000 0.000 NA   NA
 11538447 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1556.000 0.000 NA   NA
 11680810 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1556.000 0.000 NA   NA
 11823202 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1556.000 0.000 NA   NA
 11538448 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1590.000 0.000 NA   NA
 11680811 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1590.000 0.000 NA   NA
 11823203 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1590.000 0.000 NA   NA
 11538449 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1609.000 0.000 NA   NA
 11680812 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1609.000 0.000 NA   NA
 11823204 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1609.000 0.000 NA   NA
 11538450 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1645.000 0.000 NA   NA
 11680813 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1645.000 0.000 NA   NA
 11823205 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1645.000 0.000 NA   NA
 11538451 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1664.000 0.000 NA   NA
 11680814 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1664.000 0.000 NA   NA
 11823206 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1664.000 0.000 NA   NA
 11538452 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1688.000 0.000 NA   NA
 11680815 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1688.000 0.000 NA   NA
 11823207 5910638   HRM2_33240     FALSE NA 1688.000 0.000 NA   NA
 5910641 5910642 HRM2_33270 HRM2_33280 argA2   TRUE 0.797 11.000 0.000 1.000 N NA
 5910642 5910643 HRM2_33280 HRM2_33290     TRUE 1.000 -3.000 0.565 NA Y NA
 5910643 5910644 HRM2_33290 HRM2_33300     TRUE 0.999 5.000 0.308 NA Y NA
 5910644 5910645 HRM2_33300 HRM2_33310     TRUE 0.987 43.000 0.385 NA   NA
 5910646 5910647 HRM2_33320 HRM2_33330     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5910647 5910648 HRM2_33330 HRM2_33340     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910649 5910650 HRM2_33350 HRM2_33360     TRUE 0.653 -115.000 0.000 NA   NA
 5910650 5910651 HRM2_33360 HRM2_33370     FALSE 0.016 321.000 0.000 NA   NA
 5910651 5910652 HRM2_33370 HRM2_33380     TRUE 0.999 -3.000 0.051 0.003 Y NA
 5910652 5910653 HRM2_33380 HRM2_33390     FALSE 0.065 194.000 0.000 1.000 N NA
 5910653 5910654 HRM2_33390 HRM2_33400     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.032 Y NA
 5910654 5910655 HRM2_33400 HRM2_33410     TRUE 0.989 -10.000 0.000 0.032 Y NA
 5910655 5910656 HRM2_33410 HRM2_33420     TRUE 0.875 47.000 0.000 0.032 Y NA
 5910656 5910657 HRM2_33420 HRM2_33430   trpA FALSE 0.249 96.000 0.000 1.000 N NA
 5910657 5910658 HRM2_33430 HRM2_33440 trpA trpB TRUE 1.000 -7.000 0.146 0.000 Y NA
 5910658 5910659 HRM2_33440 HRM2_33450 trpB   TRUE 0.991 -7.000 0.011 1.000 N NA
 5910661 5910662 HRM2_33470 HRM2_33480   dsbC FALSE 0.099 167.000 0.000 1.000   NA
 5910663 5910664 HRM2_33490 HRM2_33500 sulP2   FALSE 0.083 172.000 0.000 1.000 N NA
 5910664 5910665 HRM2_33500 HRM2_33510   iorA3 TRUE 0.963 160.000 0.333 1.000 Y NA
 5910665 5910666 HRM2_33510 HRM2_33520 iorA3 iorB3 TRUE 1.000 -3.000 0.444 0.002 Y NA
 5910666 5910667 HRM2_33520 HRM2_33530 iorB3   FALSE 0.143 133.000 0.000 1.000 N NA
 5910667 5910668 HRM2_33530 HRM2_33540     TRUE 0.996 -10.000 0.008 1.000 Y NA
 5910668 5910669 HRM2_33540 HRM2_33550     TRUE 0.998 -13.000 0.071 NA Y NA
 5910671 5910672 HRM2_33570 HRM2_33580     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5910672 5910673 HRM2_33580 HRM2_33590     FALSE 0.041 220.000 0.000 NA   NA
 5910673 5910674 HRM2_33590 HRM2_33600     FALSE 0.274 86.000 0.000 NA   NA
 5910674 5910675 HRM2_33600 HRM2_33610   exeA3 TRUE 0.923 3.000 0.000 1.000   NA
 5910675 5910676 HRM2_33610 HRM2_33620 exeA3   FALSE 0.039 232.000 0.000 1.000 N NA
 5910676 5910677 HRM2_33620 HRM2_33630     TRUE 0.998 -18.000 0.071 0.050 Y NA
 5910678 5910679 HRM2_33640 HRM2_33650     TRUE 0.594 21.000 0.000 NA   NA
 5910679 5910680 HRM2_33650 HRM2_33660     FALSE 0.181 113.000 0.000 NA   NA
 5910680 5910681 HRM2_33660 HRM2_33670     FALSE 0.053 215.000 0.000 1.000   NA
 5910681 5910682 HRM2_33670 HRM2_33680     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910682 5910683 HRM2_33680 HRM2_33690     TRUE 0.994 -13.000 0.074 NA   NA
 5910683 5910684 HRM2_33690 HRM2_33700     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910684 5910685 HRM2_33700 HRM2_33710     TRUE 0.562 24.000 0.000 NA   NA
 5910687 5910688 HRM2_33730 HRM2_33740     TRUE 0.443 42.000 0.000 NA   NA
 5910688 5910689 HRM2_33740 HRM2_33750   aor6 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910689 5910690 HRM2_33750 HRM2_33760 aor6   TRUE 1.000 0.000 0.500 NA Y NA
 5910690 5910691 HRM2_33760 HRM2_33770     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5910691 5910692 HRM2_33770 HRM2_33780     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5910692 5910693 HRM2_33780 HRM2_33790     TRUE 0.991 -52.000 0.074 0.021 N NA
 5910693 5910694 HRM2_33790 HRM2_33800     TRUE 0.940 -13.000 0.000 0.041 N NA
 5910694 5910695 HRM2_33800 HRM2_33810     TRUE 0.705 77.000 0.000 NA Y NA
 5910695 5910696 HRM2_33810 HRM2_33820     FALSE 0.320 69.000 0.000 NA N NA
 5910697 5910698 HRM2_33830 HRM2_33840     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5910698 5910699 HRM2_33840 HRM2_33850     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910699 5910700 HRM2_33850 HRM2_33860     FALSE 0.059 196.000 0.000 NA   NA
 5910700 5910701 HRM2_33860 HRM2_33870   greA2 FALSE 0.010 466.000 0.000 1.000   NA
 5910701 5910702 HRM2_33870 HRM2_33880 greA2   FALSE 0.063 191.000 0.000 NA   NA
 5910702 5910703 HRM2_33880 HRM2_33890     FALSE 0.070 182.000 0.000 NA   NA
 5910703 5910704 HRM2_33890 HRM2_33900     FALSE 0.009 436.000 0.000 NA   NA
 5910704 5910705 HRM2_33900 HRM2_33910     FALSE 0.171 120.000 0.000 NA   NA
 5910705 5910706 HRM2_33910 HRM2_33920     TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 5910706 5910707 HRM2_33920 HRM2_33930     FALSE 0.365 63.000 0.000 NA   NA
 5910707 5910708 HRM2_33930 HRM2_33940     FALSE 0.022 287.000 0.000 NA   NA
 5910709 5910710 HRM2_33950 HRM2_33960     FALSE 0.046 211.000 0.000 NA   NA
 5910710 5910711 HRM2_33960 HRM2_33970     FALSE 0.174 118.000 0.000 NA   NA
 5910712 5910713 HRM2_33980 HRM2_33990     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5910714 5910715 HRM2_34000 HRM2_34010     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5910715 5910716 HRM2_34010 HRM2_34020   namA TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 5910716 5910717 HRM2_34020 HRM2_34030 namA nfo TRUE 0.419 52.000 0.000 1.000 N NA
 5910717 5910718 HRM2_34030 HRM2_34040 nfo mdtQ TRUE 0.624 20.000 0.000 1.000 N NA
 5910718 5910719 HRM2_34040 HRM2_34050 mdtQ mdtC TRUE 0.992 12.000 0.154 NA N NA
 5910719 5910720 HRM2_34050 HRM2_34060 mdtC mdtA TRUE 0.999 -3.000 0.276 NA N NA
 5910720 5910721 HRM2_34060 HRM2_34070 mdtA   TRUE 0.978 17.000 0.069 1.000   NA
 5910721 5910722 HRM2_34070 HRM2_34080     FALSE 0.077 188.000 0.000 1.000   NA
 5910722 5910723 HRM2_34080 HRM2_34090     TRUE 0.527 80.000 0.000 0.007   NA
 5910723 5910724 HRM2_34090 HRM2_34100     FALSE 0.025 290.000 0.000 1.000   NA
 5910724 5910725 HRM2_34100 HRM2_34110     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5910726 5910727 HRM2_34120 HRM2_34130     FALSE 0.005 903.000 0.000 1.000 N NA
 5910727 5910728 HRM2_34130 HRM2_34140     TRUE 0.999 8.000 0.571 NA   NA
 5910728 5910729 HRM2_34140 HRM2_34150     TRUE 1.000 -10.000 0.800 NA   NA
 5910729 5910730 HRM2_34150 HRM2_34160     TRUE 0.999 0.000 0.050 1.000 Y NA
 5910730 5910731 HRM2_34160 HRM2_34170     FALSE 0.037 236.000 0.000 1.000 N NA
 5910731 5910732 HRM2_34170 HRM2_34180     TRUE 0.685 107.000 0.000 0.049 Y NA
 5910733 5910734 HRM2_34190 HRM2_34200     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5910734 5910735 HRM2_34200 HRM2_34210     FALSE 0.037 230.000 0.000 NA   NA
 5910738 5910739 HRM2_34240 HRM2_34250 mcpB2   FALSE 0.006 751.000 0.000 1.000 N NA
 5910739 5910740 HRM2_34250 HRM2_34260     FALSE 0.010 475.000 0.000 1.000   NA
 5910740 5910741 HRM2_34260 HRM2_34270     FALSE 0.018 508.000 0.000 0.027   NA
 5910741 5910742 HRM2_34270 HRM2_34280     TRUE 0.486 155.000 0.000 0.060 Y NA
 5910742 5910743 HRM2_34280 HRM2_34290     FALSE 0.375 218.000 0.036 NA   NA
 5910743 5910744 HRM2_34290 HRM2_34300     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5910744 5910745 HRM2_34300 HRM2_34310   mtbC2 FALSE 0.161 124.000 0.000 NA   NA
 5910746 5910747 HRM2_34320 HRM2_34330     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5910747 5910748 HRM2_34330 HRM2_34340     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5910748 5910749 HRM2_34340 HRM2_34350   dnaG5 TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5910749 5910750 HRM2_34350 HRM2_34360 dnaG5   FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5910751 5910752 HRM2_34370 HRM2_34380   cheW1 TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5910752 5910753 HRM2_34380 HRM2_34390 cheW1 cheT TRUE 0.867 58.000 0.000 0.006 Y NA
 5910753 5910754 HRM2_34390 HRM2_34400 cheT cheA1 FALSE 0.071 517.000 0.000 0.006 Y NA
 5910754 5910755 HRM2_34400 HRM2_34410 cheA1   FALSE 0.387 62.000 0.000 1.000 N NA
 5910755 5910756 HRM2_34410 HRM2_34420   cheD1 TRUE 0.538 28.000 0.000 1.000 N NA
 5910756 5910757 HRM2_34420 HRM2_34430 cheD1   TRUE 1.000 -3.000 0.333 NA Y NA
 5910757 5910758 HRM2_34430 HRM2_34440     TRUE 0.996 19.000 0.222 NA Y NA
 5910758 5910759 HRM2_34440 HRM2_34450     TRUE 0.767 -43.000 0.000 NA   NA
 5910759 5910760 HRM2_34450 HRM2_34460   cheB1 TRUE 0.562 24.000 0.000 NA   NA
 5910760 5910761 HRM2_34460 HRM2_34470 cheB1 cheR1 TRUE 0.879 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5910761 5910762 HRM2_34470 HRM2_34480 cheR1 cheD2 TRUE 0.806 49.000 0.000 1.000 Y NA
 5910762 5910763 HRM2_34480 HRM2_34490 cheD2   FALSE 0.370 67.000 0.000 1.000 N NA
 5910763 5910764 HRM2_34490 HRM2_34500     FALSE 0.186 162.000 0.000 0.027 N NA
 5910764 5910765 HRM2_34500 HRM2_34510     FALSE 0.080 170.000 0.000 NA   NA
 5910766 5910767 HRM2_34520 HRM2_34530   rlgA2 FALSE 0.277 85.000 0.000 NA   NA
 5910770 5910771 HRM2_34560 HRM2_34570   narK FALSE 0.017 319.000 0.000 NA   NA
 5910773 5910774 HRM2_34590 HRM2_34600     FALSE 0.114 138.000 0.000 NA N NA
 5910774 5910775 HRM2_34600 HRM2_34610   rbsC TRUE 0.674 198.000 0.018 1.000 Y NA
 5910775 5910776 HRM2_34610 HRM2_34620 rbsC rbsB TRUE 0.997 36.000 0.286 0.001 Y NA
 5910776 5910777 HRM2_34620 HRM2_34630 rbsB rbsA2 TRUE 0.983 19.000 0.056 0.001   NA
 5910778 5910779 HRM2_34640 HRM2_34650     FALSE 0.369 62.000 0.000 NA   NA
 5910779 5910780 HRM2_34650 HRM2_34660     FALSE 0.032 243.000 0.000 NA   NA
 5910780 5910781 HRM2_34660 HRM2_34670     TRUE 0.483 33.000 0.000 NA   NA
 5910783 5910784 HRM2_34690 HRM2_34700     FALSE 0.048 208.000 0.000 NA   NA
 5910784 5910785 HRM2_34700 HRM2_34710     FALSE 0.082 182.000 0.000 1.000   NA
 5910785 5910786 HRM2_34710 HRM2_34720     FALSE 0.222 100.000 0.000 NA   NA
 5910786 5910787 HRM2_34720 HRM2_34730     FALSE 0.005 699.000 0.000 NA   NA
 5910787 5910788 HRM2_34730 HRM2_34740     FALSE 0.046 211.000 0.000 NA   NA
 5910789 5910790 HRM2_34750 HRM2_34760   metE FALSE 0.263 92.000 0.000 1.000 N NA
 5910790 5910791 HRM2_34760 HRM2_34770 metE   FALSE 0.260 98.000 0.000 1.000   NA
 5910791 5910792 HRM2_34770 HRM2_34780     FALSE 0.007 526.000 0.000 NA   NA
 5910792 5910793 HRM2_34780 HRM2_34790     FALSE 0.028 260.000 0.000 NA   NA
 5910794 5910795 HRM2_34800 HRM2_34810     TRUE 0.923 -19.000 0.000 0.041   NA
 5910797 5910798 HRM2_34830 HRM2_34840 selD2   FALSE 0.142 130.000 0.000 NA   NA
 5910800 5910801 HRM2_34860 HRM2_34870 rrfG   FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 5910801 5910802 HRM2_34870 HRM2_34880   rrfC FALSE 0.004 1567.000 0.000 NA   NA
 5910802 5910803 HRM2_34880 HRM2_34890 rrfC rrlC FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 5910803 5910804 HRM2_34890 HRM2_34900 rrlC rrsC FALSE 0.016 321.000 0.000 NA   NA
 5910804 5910805 HRM2_34900 HRM2_34910 rrsC   FALSE 0.009 440.000 0.000 NA   NA
 5910807 5910808 HRM2_34930 HRM2_34940     TRUE 0.996 132.000 0.800 0.041 Y NA
 5910808 5910809 HRM2_34940 HRM2_34950     TRUE 0.998 96.000 0.800 0.041 Y NA
 5910809 5910810 HRM2_34950 HRM2_34960     TRUE 1.000 6.000 0.909 0.041 Y NA
 5910810 5910811 HRM2_34960 HRM2_34970     TRUE 0.507 37.000 0.000 1.000   NA
 5910811 5910812 HRM2_34970 HRM2_34980   prdF1 TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000   NA
 5910814 5910815 HRM2_35000 HRM2_35010     TRUE 1.000 -7.000 0.800 NA Y NA
 5910815 5910816 HRM2_35010 HRM2_35020     FALSE 0.389 150.000 0.000 NA Y NA
 5910817 5910818 HRM2_35030 HRM2_35040   alkA TRUE 0.791 -256.000 0.000 0.041   NA
 5910818 5910819 HRM2_35040 HRM2_35050 alkA   TRUE 0.715 14.000 0.000 NA   NA
 5910820 5910821 HRM2_35060 HRM2_35070   rrfD FALSE 0.005 961.000 0.000 NA   NA
 5910821 5910822 HRM2_35070 HRM2_35080 rrfD rrlD FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 5910822 5910823 HRM2_35080 HRM2_35090 rrlD   FALSE 0.036 233.000 0.000 NA   NA
 5910823 5910824 HRM2_35090 HRM2_35100     TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5910824 5910825 HRM2_35100 HRM2_35110   rrsD FALSE 0.248 92.000 0.000 NA   NA
 5910825 5910826 HRM2_35110 HRM2_35120 rrsD tyrS FALSE 0.022 286.000 0.000 NA   NA
 5910826 5910827 HRM2_35120 HRM2_35130 tyrS   TRUE 0.972 8.000 0.004 1.000   NA
 5910827 5910828 HRM2_35130 HRM2_35140     FALSE 0.170 411.000 0.064 NA   NA
 5910828 5910829 HRM2_35140 HRM2_35150     FALSE 0.017 316.000 0.000 NA   NA
 5910829 5910830 HRM2_35150 HRM2_35160   atpC2 TRUE 0.734 73.000 0.002 1.000   NA
 5910830 5910831 HRM2_35160 HRM2_35170 atpC2 atpD2 TRUE 1.000 15.000 0.837 0.003 Y NA
 5910831 5910832 HRM2_35170 HRM2_35180 atpD2 atpG2 TRUE 0.999 50.000 0.724 0.003 Y NA
 5910832 5910833 HRM2_35180 HRM2_35190 atpG2 atpA2 TRUE 0.999 71.000 0.846 0.003 Y NA
 5910833 5910834 HRM2_35190 HRM2_35200 atpA2 atpH TRUE 1.000 0.000 0.864 0.003 Y NA
 5910834 5910835 HRM2_35200 HRM2_35210 atpH atpF2 TRUE 1.000 0.000 0.132 0.003 Y NA
 5910835 5910836 HRM2_35210 HRM2_35220 atpF2 atpF3 TRUE 1.000 0.000 0.569 0.003 Y NA
 5910836 5910837 HRM2_35220 HRM2_35230 atpF3 rodA FALSE 0.092 166.000 0.000 1.000 N NA
 5910837 5910838 HRM2_35230 HRM2_35240 rodA mrdA TRUE 0.997 -7.000 0.075 1.000 N NA
 5910838 5910839 HRM2_35240 HRM2_35250 mrdA   TRUE 0.948 22.000 0.035 NA   NA
 5910839 5910840 HRM2_35250 HRM2_35260   mreC TRUE 0.991 -3.000 0.003 NA   NA
 5910840 5910841 HRM2_35260 HRM2_35270 mreC mreB TRUE 0.999 5.000 0.689 1.000 N NA
 5910841 5910842 HRM2_35270 HRM2_35280 mreB   TRUE 0.588 109.000 0.003 1.000 N NA
 5910842 5910843 HRM2_35280 HRM2_35290     TRUE 0.999 0.000 0.074 NA Y NA
 5910843 5910844 HRM2_35290 HRM2_35300   mnhD1 FALSE 0.046 203.000 0.000 NA N NA
 5910846 5910847 HRM2_35320 HRM2_35330   mnhA1 TRUE 0.952 25.000 0.054 NA N NA
 5910847 5910848 HRM2_35330 HRM2_35340 mnhA1   TRUE 0.998 -7.000 0.189 NA   NA
 5910848 5910849 HRM2_35340 HRM2_35350   mnhA2 FALSE 0.094 159.000 0.000 NA   NA
 5910849 5910850 HRM2_35350 HRM2_35360 mnhA2 mnhD2 TRUE 0.999 2.000 0.038 0.001 Y NA
 5910850 5910851 HRM2_35360 HRM2_35370 mnhD2 mnhC TRUE 1.000 -12.000 0.426 0.003 Y NA
 5910851 5910852 HRM2_35370 HRM2_35380 mnhC mnhB TRUE 0.999 3.000 0.093 NA Y NA
 5910852 5910853 HRM2_35380 HRM2_35390 mnhB mnhG TRUE 0.972 125.000 0.253 NA Y NA
 5910853 5910854 HRM2_35390 HRM2_35400 mnhG mnhF TRUE 1.000 -3.000 0.655 1.000 Y NA
 5910854 5910855 HRM2_35400 HRM2_35410 mnhF mnhE TRUE 1.000 0.000 0.119 0.037 Y NA
 5910855 5910856 HRM2_35410 HRM2_35420 mnhE   FALSE 0.154 129.000 0.000 1.000 N NA
 5910856 5910857 HRM2_35420 HRM2_35430     TRUE 0.473 35.000 0.000 NA   NA
 5910857 5910858 HRM2_35430 HRM2_35440   deaD FALSE 0.345 69.000 0.000 NA   NA
 5910859 5910860 HRM2_35450 HRM2_35460     FALSE 0.017 340.000 0.000 1.000   NA
 5910860 5910861 HRM2_35460 HRM2_35470   rhaT FALSE 0.386 69.000 0.000 1.000   NA
 5910861 5910862 HRM2_35470 HRM2_35480 rhaT prfC FALSE 0.264 97.000 0.000 1.000   NA
 5910862 5910863 HRM2_35480 HRM2_35490 prfC serC TRUE 0.470 40.000 0.000 1.000 N NA
 5910863 5910864 HRM2_35490 HRM2_35500 serC serA1 TRUE 0.998 3.000 0.018 0.001 Y NA
 5910864 5910865 HRM2_35500 HRM2_35510 serA1   TRUE 0.851 7.000 0.000 1.000 N NA
 5910865 5910866 HRM2_35510 HRM2_35520     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5910866 5910867 HRM2_35520 HRM2_35530     FALSE 0.269 87.000 0.000 NA   NA
 5910868 5910869 HRM2_35540 HRM2_35550     TRUE 0.581 22.000 0.000 NA   NA
 5910869 5910870 HRM2_35550 HRM2_35560     TRUE 0.431 45.000 0.000 NA   NA
 5910870 5910871 HRM2_35560 HRM2_35570     FALSE 0.235 96.000 0.000 NA   NA
 5910871 5910872 HRM2_35570 HRM2_35580   mglA TRUE 0.998 11.000 0.500 NA   NA
 5910872 5910873 HRM2_35580 HRM2_35590 mglA mglB TRUE 0.949 70.000 0.135 NA   NA
 5910874 5910875 HRM2_35600 HRM2_35610     TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5910876 5910877 HRM2_35620 HRM2_35630     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5910879 5910880 HRM2_35650 HRM2_35660 etfA2 etfB2 TRUE 1.000 3.000 0.800 0.014 Y NA
 5910880 5910881 HRM2_35660 HRM2_35670 etfB2 hdrF3 TRUE 0.961 145.000 0.241 1.000 Y NA
 5910881 5910882 HRM2_35670 HRM2_35680 hdrF3   FALSE 0.140 134.000 0.000 1.000 N NA
 5910883 5910884 HRM2_35690 HRM2_35700     FALSE 0.365 63.000 0.000 NA   NA
 5910884 5910885 HRM2_35700 HRM2_35710   flgM TRUE 0.994 8.000 0.130 NA   NA
 5910885 5910886 HRM2_35710 HRM2_35720 flgM   FALSE 0.059 196.000 0.000 NA   NA
 5910887 5910888 HRM2_35730 HRM2_35740 hisF1 hisH1 TRUE 0.999 -6.000 0.028 0.003 Y NA
 5910888 5910889 HRM2_35740 HRM2_35750 hisH1   TRUE 0.987 -16.000 0.004 0.003   NA
 5910889 5910890 HRM2_35750 HRM2_35760     TRUE 0.978 -39.000 0.025 1.000   NA
 5910891 5910892 HRM2_35770 HRM2_35780 phoH1   TRUE 0.999 -3.000 0.172 1.000   NA
 5910892 5910893 HRM2_35780 HRM2_35790     TRUE 0.989 -106.000 0.182 NA   NA
 5910893 5910894 HRM2_35790 HRM2_35800   pdxJ TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5910894 5910895 HRM2_35800 HRM2_35810 pdxJ truC TRUE 0.492 35.000 0.000 1.000 N NA
 5910895 5910896 HRM2_35810 HRM2_35820 truC   FALSE 0.055 199.000 0.000 NA   NA
 5910898 5910899 HRM2_35840 HRM2_35850     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5910899 5910900 HRM2_35850 HRM2_35860     TRUE 0.983 -9.000 0.003 NA   NA
 5910900 5910901 HRM2_35860 HRM2_35870   lysC TRUE 0.501 30.000 0.000 NA   NA
 5910903 5910904 HRM2_35890 HRM2_35900 cheD3 selA TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5910904 5910905 HRM2_35900 HRM2_35910 selA   TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5910905 5910906 HRM2_35910 HRM2_35920   gmhA TRUE 0.569 25.000 0.000 1.000 N NA
 5910906 5910907 HRM2_35920 HRM2_35930 gmhA   TRUE 0.995 -7.000 0.037 1.000   NA
 5910907 5910908 HRM2_35930 HRM2_35940     TRUE 0.839 -19.000 0.000 NA   NA
 5910908 5910909 HRM2_35940 HRM2_35950   hemC FALSE 0.045 212.000 0.000 NA   NA
 5910909 5910910 HRM2_35950 HRM2_35960 hemC hemD TRUE 0.999 0.000 0.056 1.000 Y NA
 5910910 5910911 HRM2_35960 HRM2_35970 hemD moaA2 TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5910911 5910912 HRM2_35970 HRM2_35980 moaA2   TRUE 0.612 21.000 0.000 1.000 N NA
 5910913 5910914 HRM2_35990 HRM2_36000 rplQ rpoA TRUE 0.999 9.000 0.873 1.000 N NA
 5910914 5910915 HRM2_36000 HRM2_36010 rpoA rpsD TRUE 0.992 45.000 0.549 1.000 N NA
 5910915 5910916 HRM2_36010 HRM2_36020 rpsD rpsK TRUE 0.997 79.000 0.509 0.011 Y NA
 5910916 5910917 HRM2_36020 HRM2_36030 rpsK rpsM TRUE 0.999 51.000 0.810 0.008 Y NA
 5910917 5910918 HRM2_36030 HRM2_36040 rpsM rpmJ TRUE 0.996 12.000 0.194 0.008   NA
 5910918 5910919 HRM2_36040 HRM2_36050 rpmJ infA TRUE 0.956 49.000 0.104 1.000   NA
 5910919 5910920 HRM2_36050 HRM2_36060 infA secY TRUE 0.941 56.000 0.083 1.000 N NA
 5910920 5910921 HRM2_36060 HRM2_36070 secY rplO TRUE 0.997 21.000 0.730 1.000 N NA
 5910921 5910922 HRM2_36070 HRM2_36080 rplO rpmD TRUE 1.000 1.000 0.653 0.001 Y NA
 5910922 5910923 HRM2_36080 HRM2_36090 rpmD rpsE TRUE 1.000 14.000 0.789 0.011 Y NA
 5910923 5910924 HRM2_36090 HRM2_36100 rpsE rplR TRUE 1.000 16.000 0.814 0.011 Y NA
 5910924 5910925 HRM2_36100 HRM2_36110 rplR rplF TRUE 1.000 22.000 0.815 0.008 Y NA
 5910925 5910926 HRM2_36110 HRM2_36120 rplF rpsH TRUE 1.000 15.000 0.808 0.008 Y NA
 5910926 5910927 HRM2_36120 HRM2_36130 rpsH rpsN TRUE 0.997 67.000 0.473 0.008 Y NA
 5910927 5910928 HRM2_36130 HRM2_36140 rpsN rplE TRUE 0.998 39.000 0.496 0.008 Y NA
 5910928 5910929 HRM2_36140 HRM2_36150 rplE rplX TRUE 1.000 19.000 0.758 0.008 Y NA
 5910929 5910930 HRM2_36150 HRM2_36160 rplX rplN TRUE 1.000 24.000 0.810 0.011 Y NA
 5910930 5910931 HRM2_36160 HRM2_36170 rplN rpsQ TRUE 1.000 19.000 0.791 0.011 Y NA
 5910931 5910932 HRM2_36170 HRM2_36180 rpsQ rpmC TRUE 1.000 20.000 0.828 0.008 Y NA
 5910932 5910933 HRM2_36180 HRM2_36190 rpmC rplP TRUE 1.000 5.000 0.802 0.008 Y NA
 5910933 5910934 HRM2_36190 HRM2_36200 rplP rpsC TRUE 1.000 25.000 0.828 0.011 Y NA
 5910934 5910935 HRM2_36200 HRM2_36210 rpsC rplV TRUE 1.000 19.000 0.719 0.011 Y NA
 5910935 5910936 HRM2_36210 HRM2_36220 rplV rpsS TRUE 0.999 33.000 0.769 0.011 Y NA
 5910936 5910937 HRM2_36220 HRM2_36230 rpsS rplB TRUE 1.000 14.000 0.820 0.011 Y NA
 5910937 5910938 HRM2_36230 HRM2_36240 rplB rplW TRUE 1.000 13.000 0.849 1.000 Y NA
 5910938 5910939 HRM2_36240 HRM2_36250 rplW rplD TRUE 1.000 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 5910939 5910940 HRM2_36250 HRM2_36260 rplD rplC TRUE 0.963 201.000 0.361 0.008 Y NA
 5910940 5910941 HRM2_36260 HRM2_36270 rplC rpsJ TRUE 0.999 22.000 0.467 0.011 Y NA
 5910941 5910942 HRM2_36270 HRM2_36280 rpsJ tufA TRUE 0.997 20.000 0.318 1.000 Y NA
 5910942 5910943 HRM2_36280 HRM2_36290 tufA rpsG FALSE 0.367 289.000 0.007 1.000 Y NA
 5910943 5910944 HRM2_36290 HRM2_36300 rpsG rpsL TRUE 0.998 66.000 0.620 0.002 Y NA
 5910944 5910945 HRM2_36300 HRM2_36310 rpsL rpoC TRUE 0.882 117.000 0.122 1.000 N NA
 5910945 5910946 HRM2_36310 HRM2_36320 rpoC rpoB TRUE 0.959 242.000 0.851 0.000   NA
 5910946 5910947 HRM2_36320 HRM2_36330 rpoB rplL TRUE 0.924 121.000 0.223 1.000   NA
 5910947 5910948 HRM2_36330 HRM2_36340 rplL rplJ TRUE 0.999 76.000 0.884 0.008 Y NA
 5910948 5910949 HRM2_36340 HRM2_36350 rplJ rplA TRUE 0.992 95.000 0.302 0.011 Y NA
 5910949 5910950 HRM2_36350 HRM2_36360 rplA rplK TRUE 1.000 26.000 0.838 0.011 Y NA
 5910950 5910951 HRM2_36360 HRM2_36370 rplK nusG TRUE 0.995 39.000 0.681 1.000 N NA
 5910951 5910952 HRM2_36370 HRM2_36380 nusG secE TRUE 0.999 15.000 0.843 1.000 N NA
 5910952 5910953 HRM2_36380 HRM2_36390 secE   FALSE 0.294 80.000 0.000 NA   NA
 5910953 5910954 HRM2_36390 HRM2_36400   rpmG TRUE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 5910954 5910955 HRM2_36400 HRM2_36410 rpmG tuf TRUE 0.993 19.000 0.099 1.000 Y NA
 5910955 5910956 HRM2_36410 HRM2_36420 tuf   TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5910956 5910957 HRM2_36420 HRM2_36430     TRUE 0.410 49.000 0.000 NA   NA
 5910957 5910958 HRM2_36430 HRM2_36450     FALSE 0.188 110.000 0.000 NA   NA
 5910958 5910959 HRM2_36450 HRM2_36460     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5910960 5910961 HRM2_36470 HRM2_36480 mltD2   TRUE 0.852 6.000 0.000 NA   NA
 5910961 5910962 HRM2_36480 HRM2_36490     FALSE 0.174 118.000 0.000 NA   NA
 5910962 5910963 HRM2_36490 HRM2_36500   cheA2 TRUE 0.722 87.000 0.005 1.000 N NA
 5910963 5910964 HRM2_36500 HRM2_36510 cheA2 cheW2 TRUE 0.972 53.000 0.014 0.006 Y NA
 5910964 5910965 HRM2_36510 HRM2_36520 cheW2 cheB2 TRUE 0.999 1.000 0.042 0.006 Y NA
 5910965 5910966 HRM2_36520 HRM2_36530 cheB2 cheR2 TRUE 0.996 14.000 0.099 1.000 Y NA
 5910966 5910967 HRM2_36530 HRM2_36540 cheR2   TRUE 0.558 26.000 0.000 1.000 N NA
 5910968 5910969 HRM2_36550 HRM2_36560   pgk TRUE 0.901 18.000 0.002 NA   NA
 5910969 5910970 HRM2_36560 HRM2_36570 pgk   TRUE 0.813 37.000 0.002 NA   NA
 5910970 5910971 HRM2_36570 HRM2_36580   radC3 FALSE 0.397 53.000 0.000 NA   NA
 5910971 5910972 HRM2_36580 HRM2_36590 radC3 gyrA TRUE 0.926 -88.000 0.000 1.000 Y NA
 5910972 5910973 HRM2_36590 HRM2_36600 gyrA   TRUE 0.936 -6.000 0.000 NA   NA
 5910973 5910974 HRM2_36600 HRM2_36610   atoB3 FALSE 0.010 414.000 0.000 NA   NA
 5910976 5910977 HRM2_36630 HRM2_36640   engA2 TRUE 0.971 6.000 0.002 1.000   NA
 5910977 5910978 HRM2_36640 HRM2_36641 engA2   FALSE 0.179 114.000 0.000 NA   NA
 5910978 5910979 HRM2_36641 HRM2_36650     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5910979 5910980 HRM2_36650 HRM2_36660   trkH FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 5910980 5910981 HRM2_36660 HRM2_36670 trkH trkA4 TRUE 0.993 1.000 0.000 0.004 Y NA
 5910981 5910982 HRM2_36670 HRM2_36680 trkA4 motA3 FALSE 0.232 101.000 0.000 1.000 N NA
 5910982 5910983 HRM2_36680 HRM2_36690 motA3 motB3 TRUE 0.999 -7.000 0.113 1.000 Y NA
 5910984 5910985 HRM2_36700 HRM2_36710     FALSE 0.027 266.000 0.000 NA   NA
 5910985 5910986 HRM2_36710 HRM2_36720   arnB TRUE 1.000 -3.000 0.678 1.000   NA
 5910986 5910987 HRM2_36720 HRM2_36730 arnB murG2 TRUE 0.999 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 5910987 5910988 HRM2_36730 HRM2_36740 murG2 neuB TRUE 0.999 5.000 0.236 1.000 Y NA
 5910988 5910989 HRM2_36740 HRM2_36750 neuB   FALSE 0.007 542.000 0.000 NA   NA
 5910989 5910990 HRM2_36750 HRM2_36760     TRUE 0.404 51.000 0.000 NA   NA
 5910990 5910991 HRM2_36760 HRM2_36770     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5910991 5910992 HRM2_36770 HRM2_36780     FALSE 0.020 299.000 0.000 NA   NA
 5910992 5910993 HRM2_36780 HRM2_36790   hisH2 FALSE 0.055 199.000 0.000 NA   NA
 5910994 5910995 HRM2_36800 HRM2_36810 exeA4   TRUE 0.923 3.000 0.000 1.000   NA
 5910995 5910996 HRM2_36810 HRM2_36820     FALSE 0.274 86.000 0.000 NA   NA
 5910997 5910998 HRM2_36830 HRM2_36840   hisF2 FALSE 0.269 87.000 0.000 NA   NA
 5910998 5910999 HRM2_36840 HRM2_36850 hisF2 neuA FALSE 0.062 197.000 0.000 1.000 N NA
 5910999 5911000 HRM2_36850 HRM2_36860 neuA   FALSE 0.030 272.000 0.000 1.000   NA
 5911002 5911003 HRM2_36880 HRM2_36890   fliD FALSE 0.334 172.000 0.000 1.000 Y NA
 5911003 5911004 HRM2_36890 HRM2_36900 fliD fliS TRUE 1.000 14.000 0.608 0.001 Y NA
 5911004 5911005 HRM2_36900 HRM2_36910 fliS   TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 5911005 5911006 HRM2_36910 HRM2_36920   flaG TRUE 0.494 31.000 0.000 NA   NA
 5911007 5911008 HRM2_36930 HRM2_36940   csrA TRUE 0.962 13.000 0.013 NA   NA
 5911008 5911009 HRM2_36940 HRM2_36950 csrA   TRUE 0.797 11.000 0.000 1.000 N NA
 5911009 5911010 HRM2_36950 HRM2_36960     TRUE 0.998 14.000 0.143 0.001 Y NA
 5911010 5911011 HRM2_36960 HRM2_36970     TRUE 0.997 3.000 0.063 0.001   NA
 5911011 5911012 HRM2_36970 HRM2_36980   flgJ FALSE 0.033 241.000 0.000 NA   NA
 5911012 5911013 HRM2_36980 HRM2_36990 flgJ flgI TRUE 0.958 69.000 0.167 NA   NA
 5911013 5911014 HRM2_36990 HRM2_37000 flgI flgH TRUE 0.997 55.000 0.394 0.004 Y NA
 5911014 5911015 HRM2_37000 HRM2_37010 flgH flgA TRUE 0.995 9.000 0.035 NA Y NA
 5911015 5911016 HRM2_37010 HRM2_37020 flgA flgG2 TRUE 0.995 33.000 0.319 NA Y NA
 5911016 5911017 HRM2_37020 HRM2_37030 flgG2 flgF TRUE 0.991 116.000 0.377 0.002 Y NA
 5911017 5911018 HRM2_37030 HRM2_37040 flgF flhB1 FALSE 0.041 235.000 0.000 1.000   NA
 5911018 5911019 HRM2_37040 HRM2_37050 flhB1   TRUE 0.905 4.000 0.000 1.000   NA
 5911019 5911020 HRM2_37050 HRM2_37060     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911020 5911021 HRM2_37060 HRM2_37070     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911021 5911022 HRM2_37070 HRM2_37080     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5911022 5911023 HRM2_37080 HRM2_37090   fliA TRUE 0.942 1.000 0.000 1.000   NA
 5911023 5911024 HRM2_37090 HRM2_37100 fliA flhG TRUE 0.848 108.000 0.074 1.000 N NA
 5911024 5911025 HRM2_37100 HRM2_37110 flhG flhF TRUE 0.767 113.000 0.040 1.000 N NA
 5911025 5911026 HRM2_37110 HRM2_37120 flhF flhA TRUE 1.000 -3.000 0.440 1.000 Y NA
 5911026 5911027 HRM2_37120 HRM2_37130 flhA flhB2 TRUE 0.990 80.000 0.171 0.006 Y NA
 5911027 5911028 HRM2_37130 HRM2_37140 flhB2 fliR TRUE 1.000 3.000 0.353 1.000 Y NA
 5911028 5911029 HRM2_37140 HRM2_37150 fliR fliQ TRUE 0.998 10.000 0.060 0.001 Y NA
 5911029 5911030 HRM2_37150 HRM2_37160 fliQ fliP TRUE 0.999 3.000 0.085 0.006 Y NA
 5911030 5911031 HRM2_37160 HRM2_37170 fliP fliO TRUE 1.000 -10.000 0.386 1.000 Y NA
 5911031 5911032 HRM2_37170 HRM2_37180 fliO fliN TRUE 0.999 0.000 0.090 1.000 Y NA
 5911032 5911033 HRM2_37180 HRM2_37190 fliN fliM TRUE 0.995 26.000 0.112 0.001 Y NA
 5911033 5911034 HRM2_37190 HRM2_37200 fliM fliL TRUE 0.999 8.000 0.096 0.001 Y NA
 5911034 5911035 HRM2_37200 HRM2_37210 fliL flgE TRUE 0.502 165.000 0.000 0.004 Y NA
 5911035 5911036 HRM2_37210 HRM2_37220 flgE flgD FALSE 0.258 90.000 0.000 NA   NA
 5911036 5911037 HRM2_37220 HRM2_37230 flgD fliK FALSE 0.007 511.000 0.000 NA   NA
 5911037 5911038 HRM2_37230 HRM2_37240 fliK   FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 5911038 5911039 HRM2_37240 HRM2_37250   fliJ TRUE 0.991 -13.000 0.041 NA   NA
 5911039 5911040 HRM2_37250 HRM2_37260 fliJ fliI TRUE 0.997 -3.000 0.048 1.000   NA
 5911040 5911041 HRM2_37260 HRM2_37270 fliI fliH TRUE 0.989 0.000 0.000 NA Y NA
 5911041 5911042 HRM2_37270 HRM2_37280 fliH fliG TRUE 0.995 -16.000 0.019 NA Y NA
 5911042 5911043 HRM2_37280 HRM2_37290 fliG fliF TRUE 1.000 0.000 0.477 0.004 Y NA
 5911043 5911044 HRM2_37290 HRM2_37300 fliF fliE TRUE 0.998 14.000 0.180 0.004 Y NA
 5911044 5911045 HRM2_37300 HRM2_37310 fliE flgC TRUE 0.967 177.000 0.271 0.002 Y NA
 5911045 5911046 HRM2_37310 HRM2_37320 flgC flgB TRUE 0.998 0.000 0.010 1.000 Y NA
 5911046 5911047 HRM2_37320 HRM2_37330 flgB   TRUE 0.866 82.000 0.048 1.000 N NA
 5911047 5911048 HRM2_37330 HRM2_37340     TRUE 0.648 20.000 0.000 1.000   NA
 5911048 5911049 HRM2_37340 HRM2_37350     FALSE 0.051 218.000 0.000 1.000   NA
 5911049 5911050 HRM2_37350 HRM2_37360   cheY TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.059 Y NA
 5911050 5911051 HRM2_37360 HRM2_37370 cheY cheX2 TRUE 0.935 38.000 0.058 NA N NA
 5911051 5911052 HRM2_37370 HRM2_37380 cheX2   FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 5911052 5911053 HRM2_37380 HRM2_37390     FALSE 0.055 199.000 0.000 NA   NA
 5911054 5911055 HRM2_37400 HRM2_37410   lysA4 TRUE 0.991 3.000 0.024 1.000 N NA
 5911055 5911056 HRM2_37410 HRM2_37420 lysA4 nadE FALSE 0.284 87.000 0.000 1.000 N NA
 5911059 5911060 HRM2_37450 HRM2_37460   ampG TRUE 0.859 -16.000 0.000 NA   NA
 5911060 5911061 HRM2_37460 HRM2_37470 ampG   TRUE 0.812 -28.000 0.000 NA   NA
 5911061 5911062 HRM2_37470 HRM2_37480     TRUE 0.866 28.000 0.000 1.000 Y NA
 5911062 5911063 HRM2_37480 HRM2_37490   ham TRUE 0.992 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5911063 5911064 HRM2_37490 HRM2_37500 ham   FALSE 0.067 186.000 0.000 NA   NA
 5911064 5911065 HRM2_37500 HRM2_37510     TRUE 0.999 0.000 0.302 NA   NA
 5911069 5911070 HRM2_37550 HRM2_37560 porA1' porB1 TRUE 1.000 -3.000 0.505 0.003 Y NA
 5911070 5911071 HRM2_37560 HRM2_37570 porB1 porC1 TRUE 1.000 2.000 0.771 0.003 Y NA
 5911071 5911072 HRM2_37570 HRM2_37580 porC1 fdx9 TRUE 1.000 -7.000 0.469 0.003 Y NA
 5911074 5911075 HRM2_37600 HRM2_37610     TRUE 0.944 -13.000 0.000 0.027 N NA
 5911075 5911076 HRM2_37610 HRM2_37620   hrpA FALSE 0.076 181.000 0.000 1.000 N NA
 5911077 5911078 HRM2_37630 HRM2_37640   hdrD4 FALSE 0.286 82.000 0.000 NA   NA
 5911079 5911080 HRM2_37650 HRM2_37660   thrS2 FALSE 0.389 56.000 0.000 NA   NA
 5911081 5911082 HRM2_37670 HRM2_37680 rnd dapF TRUE 0.520 30.000 0.000 1.000 N NA
 5911085 5911086 HRM2_37710 HRM2_37720     FALSE 0.274 86.000 0.000 NA   NA
 5911087 5911088 HRM2_37730 HRM2_37740   tlpB TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911088 5911089 HRM2_37740 HRM2_37750 tlpB spoU TRUE 0.937 -7.000 0.000 1.000   NA
 5911089 5911090 HRM2_37750 HRM2_37760 spoU   FALSE 0.207 104.000 0.000 NA   NA
 5911090 5911091 HRM2_37760 HRM2_37770     TRUE 0.991 8.000 0.072 NA   NA
 5911091 5911092 HRM2_37770 HRM2_37780     TRUE 1.000 -3.000 0.444 1.000   NA
 5911092 5911093 HRM2_37780 HRM2_37790   typA TRUE 0.613 23.000 0.000 1.000   NA
 5911093 5911094 HRM2_37790 HRM2_37800 typA   TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5911095 5911096 HRM2_37810 HRM2_37820   usp3 FALSE 0.336 71.000 0.000 NA   NA
 5911096 5911097 HRM2_37820 HRM2_37830 usp3 sucC4 TRUE 0.806 -34.000 0.000 1.000 N NA
 5911098 5911099 HRM2_37840 HRM2_37850     TRUE 1.000 -3.000 0.154 0.099 Y NA
 5911099 5911100 HRM2_37850 HRM2_37860   draG2 TRUE 0.916 2.000 0.000 NA N NA
 5911100 5911101 HRM2_37860 HRM2_37870 draG2   FALSE 0.030 250.000 0.000 NA   NA
 5911101 5911102 HRM2_37870 HRM2_37880     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5911102 5911103 HRM2_37880 HRM2_37890     TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5911103 5911104 HRM2_37890 HRM2_37900     FALSE 0.018 309.000 0.000 NA   NA
 5911104 5911105 HRM2_37900 HRM2_37910   hisC3 TRUE 0.999 -193.000 0.933 NA   NA
 5911105 5911106 HRM2_37910 HRM2_37920 hisC3 matE TRUE 0.909 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5911106 5911107 HRM2_37920 HRM2_37930 matE   TRUE 0.648 20.000 0.000 1.000   NA
 5911107 5911108 HRM2_37930 HRM2_37940     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911108 5911109 HRM2_37940 HRM2_37950   srf TRUE 0.531 27.000 0.000 NA   NA
 5911109 5911110 HRM2_37950 HRM2_37960 srf   TRUE 0.915 3.000 0.000 1.000 N NA
 5911110 5911111 HRM2_37960 HRM2_37970     TRUE 0.989 4.000 0.000 0.000 Y NA
 5911111 5911112 HRM2_37970 HRM2_37980     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5911113 5911114 HRM2_37990 HRM2_38000   coxS TRUE 1.000 -3.000 0.727 0.002 Y NA
 5911114 5911115 HRM2_38000 HRM2_38010 coxS coxL TRUE 1.000 -9.000 0.500 0.048 Y NA
 5911115 5911116 HRM2_38010 HRM2_38020 coxL   TRUE 0.570 23.000 0.000 NA   NA
 5911117 5911118 HRM2_38030 HRM2_38040   lysE2 TRUE 0.443 42.000 0.000 NA   NA
 5911119 5911120 HRM2_38050 HRM2_38060 pfkA2 caiB FALSE 0.041 229.000 0.000 1.000 N NA
 5911121 5911122 HRM2_38070 HRM2_38080   proX TRUE 0.711 15.000 0.000 1.000 N NA
 5911122 5911123 HRM2_38080 HRM2_38090 proX proW TRUE 0.999 10.000 0.267 0.040 Y NA
 5911123 5911124 HRM2_38090 HRM2_38100 proW proV TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.080 Y NA
 5911125 5911126 HRM2_38110 HRM2_38120 mntH thiM FALSE 0.202 109.000 0.000 1.000 N NA
 5911127 5911128 HRM2_38130 HRM2_38140     TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5911128 5911129 HRM2_38140 HRM2_38150     TRUE 0.522 34.000 0.000 1.000   NA
 5911129 5911130 HRM2_38150 HRM2_38160     TRUE 1.000 -3.000 0.955 NA   NA
 5911130 5911131 HRM2_38160 HRM2_38170   ppsA7 TRUE 0.494 31.000 0.000 NA   NA
 5911131 5911132 HRM2_38170 HRM2_38180 ppsA7   TRUE 0.936 2.000 0.000 1.000   NA
 5911132 5911133 HRM2_38180 HRM2_38190     TRUE 0.422 98.000 0.000 0.026   NA
 5911134 5911135 HRM2_38200 HRM2_38210     FALSE 0.389 56.000 0.000 NA   NA
 5911135 5911136 HRM2_38210 HRM2_38220     TRUE 0.795 12.000 0.000 1.000   NA
 5911136 5911137 HRM2_38220 HRM2_38230   nadC1 TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.080 N NA
 5911138 5911139 HRM2_38240 HRM2_38250     FALSE 0.048 222.000 0.000 1.000   NA
 5911139 5911140 HRM2_38250 HRM2_38260     TRUE 0.423 59.000 0.000 1.000   NA
 5911140 5911141 HRM2_38260 HRM2_38270   nadC2 TRUE 0.983 54.000 0.333 1.000   NA
 5911141 5911142 HRM2_38270 HRM2_38280 nadC2   FALSE 0.026 271.000 0.000 NA   NA
 5911142 5911143 HRM2_38280 HRM2_38290     FALSE 0.004 1101.000 0.000 NA   NA
 5911143 5911144 HRM2_38290 HRM2_38300   nadC3 TRUE 0.589 23.000 0.000 1.000 N NA
 5911144 5911145 HRM2_38300 HRM2_38310 nadC3 uspA3 FALSE 0.025 280.000 0.000 1.000 N NA
 5911147 5911148 HRM2_38330 HRM2_38340   uspA4 FALSE 0.012 390.000 0.000 1.000 N NA
 5911149 5911150 HRM2_38350 HRM2_38360 dctM6 dctQ6 TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 5911150 5911151 HRM2_38360 HRM2_38370 dctQ6 dctP6 TRUE 0.665 87.000 0.000 NA Y NA
 5911151 5911152 HRM2_38370 HRM2_38380 dctP6   FALSE 0.008 479.000 0.000 NA   NA
 5911153 5911154 HRM2_38390 HRM2_38400     FALSE 0.071 194.000 0.000 1.000   NA
 5911154 5911155 HRM2_38400 HRM2_38410   gdhA3 FALSE 0.017 347.000 0.000 1.000   NA
 5911155 5911156 HRM2_38410 HRM2_38420 gdhA3 hit TRUE 0.623 22.000 0.000 1.000   NA
 5911156 5911157 HRM2_38420 HRM2_38430 hit corA2 FALSE 0.043 222.000 0.000 1.000 N NA
 5911157 5911158 HRM2_38430 HRM2_38440 corA2   FALSE 0.023 285.000 0.000 NA   NA
 5911158 5911159 HRM2_38440 HRM2_38450   etfB3 FALSE 0.087 165.000 0.000 NA   NA
 5911159 5911160 HRM2_38450 HRM2_38460 etfB3 etfA3 TRUE 0.819 76.000 0.000 0.014 Y NA
 5911160 5911161 HRM2_38460 HRM2_38470 etfA3 etfO TRUE 0.978 8.000 0.000 0.048 Y NA
 5911161 5911162 HRM2_38470 HRM2_38480 etfO   FALSE 0.398 59.000 0.000 1.000 N NA
 5911163 5911164 HRM2_38490 HRM2_38500   gltA3 FALSE 0.128 147.000 0.000 1.000   NA
 5911164 5911165 HRM2_38500 HRM2_38510 gltA3 gcdA1 FALSE 0.089 168.000 0.000 1.000 N NA
 5911165 5911166 HRM2_38510 HRM2_38520 gcdA1   FALSE 0.202 105.000 0.000 NA   NA
 5911166 5911167 HRM2_38520 HRM2_38530   oadB2 FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 5911167 5911168 HRM2_38530 HRM2_38540 oadB2 pcaC FALSE 0.103 164.000 0.000 1.000   NA
 5911168 5911169 HRM2_38540 HRM2_38550 pcaC acd11 TRUE 0.795 12.000 0.000 1.000   NA
 5911169 5911170 HRM2_38550 HRM2_38560 acd11 porB2 TRUE 0.439 85.000 0.000 0.048 N NA
 5911170 5911171 HRM2_38560 HRM2_38570 porB2 porC2 TRUE 1.000 -7.000 1.000 0.003 Y NA
 5911172 5911173 HRM2_38580 HRM2_38590     FALSE 0.300 178.000 0.000 NA Y NA
 5911173 5911174 HRM2_38590 HRM2_38600     TRUE 0.924 1.000 0.000 NA N NA
 5911174 5911175 HRM2_38600 HRM2_38610     FALSE 0.019 322.000 0.000 1.000   NA
 5911175 5911176 HRM2_38610 HRM2_38620   aor7 FALSE 0.022 304.000 0.000 1.000   NA
 5911177 5911178 HRM2_38630 HRM2_38640   gcdA2 FALSE 0.013 353.000 0.000 NA   NA
 5911178 5911179 HRM2_38640 HRM2_38650 gcdA2   FALSE 0.233 105.000 0.000 1.000   NA
 5911179 5911180 HRM2_38650 HRM2_38660   oadB3 FALSE 0.059 205.000 0.000 1.000   NA
 5911180 5911181 HRM2_38660 HRM2_38670 oadB3 acd12 FALSE 0.048 216.000 0.000 1.000 N NA
 5911181 5911182 HRM2_38670 HRM2_38680 acd12 gctB TRUE 0.597 106.000 0.000 1.000 Y NA
 5911182 5911183 HRM2_38680 HRM2_38690 gctB gctA TRUE 0.998 16.000 0.188 0.000 Y NA
 5911183 5911184 HRM2_38690 HRM2_38700 gctA aor8 FALSE 0.005 868.000 0.000 1.000 N NA
 5911184 5911185 HRM2_38700 HRM2_38710 aor8 gdhA4 TRUE 0.623 22.000 0.000 1.000   NA
 5911185 5911186 HRM2_38710 HRM2_38720 gdhA4 dctM7 TRUE 0.539 31.000 0.000 1.000   NA
 5911186 5911187 HRM2_38720 HRM2_38730 dctM7 dctQ7 TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 5911187 5911188 HRM2_38730 HRM2_38740 dctQ7 dctP7 FALSE 0.293 75.000 0.000 NA N NA
 5911189 5911190 HRM2_38750 HRM2_38760   gabT TRUE 0.425 46.000 0.000 NA   NA
 5911190 5911191 HRM2_38760 HRM2_38770 gabT mop2 FALSE 0.151 130.000 0.000 1.000 N NA
 5911195 5911196 HRM2_38810 HRM2_38820   apt2 FALSE 0.265 88.000 0.000 NA   NA
 5911197 5911198 HRM2_38830 HRM2_38840 dctP8 dctM8 TRUE 0.747 72.000 0.000 1.000 Y NA
 5911198 5911199 HRM2_38840 HRM2_38850 dctM8 dctQ8 TRUE 0.899 19.000 0.000 NA Y NA
 5911199 5911200 HRM2_38850 HRM2_38860 dctQ8   FALSE 0.111 146.000 0.000 NA   NA
 5911204 5911205 HRM2_38900 HRM2_38910     TRUE 0.801 9.000 0.000 NA N NA
 5911207 5911208 HRM2_38930 HRM2_38940     FALSE 0.009 497.000 0.000 1.000   NA
 5911208 5911209 HRM2_38940 HRM2_38950     FALSE 0.233 105.000 0.000 1.000   NA
 5911209 5911210 HRM2_38950 HRM2_38960     FALSE 0.011 397.000 0.000 NA   NA
 5911211 5911212 HRM2_38970 HRM2_38980 hyfB hyfC TRUE 0.995 14.000 0.078 1.000 Y NA
 5911212 5911213 HRM2_38980 HRM2_38990 hyfC hyfE TRUE 1.000 6.000 0.679 NA Y NA
 5911213 5911214 HRM2_38990 HRM2_39000 hyfE hyfF TRUE 1.000 -3.000 0.864 NA Y NA
 5911214 5911215 HRM2_39000 HRM2_39010 hyfF hyfG TRUE 1.000 0.000 0.659 0.003 Y NA
 5911215 5911216 HRM2_39010 HRM2_39020 hyfG hyfI TRUE 0.998 18.000 0.233 0.002 Y NA
 5911216 5911217 HRM2_39020 HRM2_39030 hyfI   TRUE 0.564 28.000 0.000 1.000   NA
 5911217 5911218 HRM2_39030 HRM2_39040   dbpA TRUE 0.930 -19.000 0.000 0.012   NA
 5911218 5911219 HRM2_39040 HRM2_39050 dbpA rscR FALSE 0.294 90.000 0.000 1.000   NA
 5911222 5911223 HRM2_39080 HRM2_39090   ahpC FALSE 0.007 534.000 0.000 NA   NA
 5911223 5911224 HRM2_39090 HRM2_39100 ahpC   FALSE 0.074 177.000 0.000 NA   NA
 5911224 5911225 HRM2_39100 HRM2_39110   thiF TRUE 0.420 47.000 0.000 NA   NA
 5911225 5911226 HRM2_39110 HRM2_39120 thiF   FALSE 0.006 671.000 0.000 NA   NA
 5911227 5911228 HRM2_39130 HRM2_39140     TRUE 0.623 22.000 0.000 1.000   NA
 5911229 5911230 HRM2_39150 HRM2_39160     TRUE 0.455 39.000 0.000 NA   NA
 5911231 5911232 HRM2_39170 HRM2_39180     FALSE 0.207 104.000 0.000 NA   NA
 5911232 5911233 HRM2_39180 HRM2_39190     TRUE 1.000 -7.000 0.636 1.000 N NA
 5911233 5911234 HRM2_39190 HRM2_39200     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5911234 5911235 HRM2_39200 HRM2_39210     TRUE 0.804 -31.000 0.000 NA   NA
 5911235 5911236 HRM2_39210 HRM2_39220     TRUE 0.998 -49.000 0.667 NA   NA
 5911237 5911238 HRM2_39230 HRM2_39240 cmk2   FALSE 0.015 329.000 0.000 NA   NA
 5911239 5911240 HRM2_39250 HRM2_39260 rlpA ccaA FALSE 0.031 247.000 0.000 NA   NA
 5911241 5911242 HRM2_39270 HRM2_39280     TRUE 0.458 38.000 0.000 NA   NA
 5911244 5911245 HRM2_39300 HRM2_39310   truA2 TRUE 0.434 48.000 0.000 1.000 N NA
 5911245 5911246 HRM2_39310 HRM2_39320 truA2   TRUE 0.636 21.000 0.000 1.000   NA
 5911247 5911248 HRM2_39330 HRM2_39340     FALSE 0.164 123.000 0.000 NA   NA
 5911248 5911249 HRM2_39340 HRM2_39350     FALSE 0.030 251.000 0.000 NA   NA
 5911251 5911252 HRM2_39370 HRM2_39380     FALSE 0.020 299.000 0.000 NA   NA
 5911252 5911253 HRM2_39380 HRM2_39390     FALSE 0.145 129.000 0.000 NA   NA
 5911255 5911256 HRM2_39410 HRM2_39420     FALSE 0.140 131.000 0.000 NA   NA
 5911256 5911257 HRM2_39420 HRM2_39430     FALSE 0.035 234.000 0.000 NA   NA
 5911257 5911258 HRM2_39430 HRM2_39440     FALSE 0.009 439.000 0.000 NA   NA
 5911258 5911259 HRM2_39440 HRM2_39450     TRUE 0.898 -13.000 0.000 1.000   NA
 5911259 5911260 HRM2_39450 HRM2_39460     FALSE 0.007 537.000 0.000 NA   NA
 5911260 5911261 HRM2_39460 HRM2_39470     FALSE 0.021 288.000 0.000 NA   NA
 5911262 5911263 HRM2_39480 HRM2_39490     FALSE 0.005 903.000 0.000 NA   NA
 5911263 5911264 HRM2_39490 HRM2_39500     FALSE 0.028 262.000 0.000 NA   NA
 5911264 5911265 HRM2_39500 HRM2_39510   istA2 TRUE 1.000 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 5911265 5911266 HRM2_39510 HRM2_39520 istA2   TRUE 0.471 130.000 0.000 NA Y NA
 5911266 5911267 HRM2_39520 HRM2_39530     TRUE 0.803 45.000 0.000 NA Y NA
 5911267 5911268 HRM2_39530 HRM2_39540     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911269 5911270 HRM2_39550 HRM2_39560     FALSE 0.015 364.000 0.000 1.000   NA
 5911270 5911271 HRM2_39560 HRM2_39570     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5911271 5911272 HRM2_39570 HRM2_39580     TRUE 0.439 43.000 0.000 NA   NA
 5911273 5911274 HRM2_39590 HRM2_39600     FALSE 0.299 79.000 0.000 NA   NA
 5911274 5911275 HRM2_39600 HRM2_39610     FALSE 0.013 356.000 0.000 NA   NA
 5911275 5911276 HRM2_39610 HRM2_39620     FALSE 0.010 413.000 0.000 NA   NA
 5911276 5911277 HRM2_39620 HRM2_39630     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911277 5911278 HRM2_39630 HRM2_39640     FALSE 0.059 196.000 0.000 NA   NA
 5911279 5911280 HRM2_39650 HRM2_39660   ligB FALSE 0.056 208.000 0.000 1.000   NA
 5911281 5911282 HRM2_39670 HRM2_39680 recQ1   FALSE 0.006 683.000 0.000 NA   NA
 5911283 5911284 HRM2_39690 HRM2_39700     FALSE 0.009 461.000 0.000 NA   NA
 5911284 5911285 HRM2_39700 HRM2_39710     FALSE 0.098 155.000 0.000 NA   NA
 5911285 5911286 HRM2_39710 HRM2_39720     FALSE 0.179 114.000 0.000 NA   NA
 5911286 5911287 HRM2_39720 HRM2_39730     FALSE 0.010 412.000 0.000 NA   NA
 5911287 5911288 HRM2_39730 HRM2_39740     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5911288 5911289 HRM2_39740 HRM2_39750     FALSE 0.113 145.000 0.000 NA   NA
 5911289 5911290 HRM2_39750 HRM2_39760     FALSE 0.006 710.000 0.000 1.000   NA
 5911290 5911291 HRM2_39760 HRM2_39770   hsdR3 FALSE 0.242 103.000 0.000 1.000   NA
 5911292 5911293 HRM2_39780 HRM2_39790     TRUE 0.494 31.000 0.000 NA   NA
 5911294 5911295 HRM2_39800 HRM2_39810     FALSE 0.033 241.000 0.000 NA   NA
 5911295 5911296 HRM2_39810 HRM2_39820     TRUE 0.804 -31.000 0.000 NA   NA
 5911296 5911297 HRM2_39820 HRM2_39830     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5911297 5911298 HRM2_39830 HRM2_39840     TRUE 0.539 26.000 0.000 NA   NA
 5911299 5911300 HRM2_39850 HRM2_39860 mcp   FALSE 0.030 251.000 0.000 NA   NA
 5911300 5911301 HRM2_39860 HRM2_39870   smuG FALSE 0.036 233.000 0.000 NA   NA
 5911301 5911302 HRM2_39870 HRM2_39880 smuG   FALSE 0.384 58.000 0.000 NA   NA
 5911302 5911303 HRM2_39880 HRM2_39890     TRUE 0.893 -12.000 0.000 NA   NA
 5911303 5911304 HRM2_39890 HRM2_39900   fabG8 FALSE 0.175 170.000 0.000 0.032   NA
 5911304 5911305 HRM2_39900 HRM2_39910 fabG8 atoB4 FALSE 0.294 90.000 0.000 1.000   NA
 5911305 5911306 HRM2_39910 HRM2_39920 atoB4 acd13 TRUE 0.848 33.000 0.000 1.000 Y NA
 5911306 5911307 HRM2_39920 HRM2_39930 acd13 caiC1 TRUE 0.975 37.000 0.154 1.000   NA
 5911307 5911308 HRM2_39930 HRM2_39940 caiC1   FALSE 0.010 421.000 0.000 NA   NA
 5911308 5911309 HRM2_39940 HRM2_39950     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5911309 5911310 HRM2_39950 HRM2_39960     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5911310 5911311 HRM2_39960 HRM2_39970   dnaG11 TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911311 5911312 HRM2_39970 HRM2_39980 dnaG11   FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5911312 5911313 HRM2_39980 HRM2_39990   caiC2 FALSE 0.064 190.000 0.000 NA   NA
 5911313 5911314 HRM2_39990 HRM2_40000 caiC2   FALSE 0.068 197.000 0.000 1.000   NA
 5911315 5911316 HRM2_40010 HRM2_40020     FALSE 0.039 242.000 0.000 1.000   NA
 5911318 5911319 HRM2_40040 HRM2_40050 cinA atoS3 FALSE 0.017 343.000 0.000 1.000   NA
 5911319 5911320 HRM2_40050 HRM2_40060 atoS3   TRUE 0.979 29.000 0.154 1.000   NA
 5911323 5911324 HRM2_40090 HRM2_40100 arcD arcE TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA N NA
 5911324 5911325 HRM2_40100 HRM2_40110 arcE mdtP1 TRUE 0.969 7.000 0.000 1.000 Y NA
 5911325 5911326 HRM2_40110 HRM2_40120 mdtP1   TRUE 0.736 -55.000 0.000 NA   NA
 5911326 5911327 HRM2_40120 HRM2_40130     TRUE 1.000 -10.000 0.950 NA   NA
 5911327 5911328 HRM2_40130 HRM2_40140     TRUE 1.000 -7.000 0.947 NA   NA
 5911328 5911329 HRM2_40140 HRM2_40150   uspA5 TRUE 0.435 44.000 0.000 NA   NA
 5911329 5911330 HRM2_40150 HRM2_40160 uspA5 mdtP2 TRUE 0.778 -52.000 0.000 1.000   NA
 5911330 5911331 HRM2_40160 HRM2_40170 mdtP2 acrB TRUE 1.000 -3.000 0.421 0.040 N NA
 5911331 5911332 HRM2_40170 HRM2_40180 acrB arcA TRUE 1.000 0.000 0.500 1.000 N NA
 5911333 5911334 HRM2_40190 HRM2_40200     FALSE 0.089 174.000 0.000 1.000   NA
 5911335 5911336 HRM2_40210 HRM2_40220 uspA6 uspA7 TRUE 0.960 15.000 0.000 0.004 Y NA
 5911336 5911337 HRM2_40220 HRM2_40230 uspA7 acuB3 TRUE 0.534 32.000 0.000 1.000   NA
 5911337 5911338 HRM2_40230 HRM2_40240 acuB3   FALSE 0.095 170.000 0.000 1.000   NA
 5911338 5911339 HRM2_40240 HRM2_40250     TRUE 1.000 -22.000 1.000 0.097 Y NA
 5911339 5911340 HRM2_40250 HRM2_40260     TRUE 0.682 18.000 0.000 1.000   NA
 5911340 5911341 HRM2_40260 HRM2_40270     TRUE 0.663 19.000 0.000 1.000   NA
 5911342 5911343 HRM2_40280 HRM2_40290     FALSE 0.095 158.000 0.000 NA   NA
 5911343 5911344 HRM2_40290 HRM2_40300     FALSE 0.219 109.000 0.000 1.000   NA
 5911345 5911346 HRM2_40310 HRM2_40320     TRUE 0.971 59.000 0.200 1.000   NA
 5911346 5911347 HRM2_40320 HRM2_40330     TRUE 0.994 21.000 0.400 1.000   NA
 5911347 5911348 HRM2_40330 HRM2_40340     TRUE 0.999 -15.000 0.421 1.000   NA
 5911348 5911349 HRM2_40340 HRM2_40350     TRUE 0.642 97.000 0.000 1.000 Y NA
 5911349 5911350 HRM2_40350 HRM2_40360   sulP3 TRUE 0.757 -61.000 0.000 1.000   NA
 5911350 5911351 HRM2_40360 HRM2_40370 sulP3   TRUE 0.993 36.000 0.538 1.000   NA
 5911351 5911352 HRM2_40370 HRM2_40380     FALSE 0.330 106.000 0.000 0.058 N NA
 5911353 5911354 HRM2_40390 HRM2_40400   rluC TRUE 0.686 -94.000 0.000 1.000 N NA
 5911355 5911356 HRM2_40410 HRM2_40420     TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5911357 5911358 HRM2_40430 HRM2_40440     TRUE 0.868 5.000 0.000 NA   NA
 5911360 5911361 HRM2_40460 HRM2_40470     FALSE 0.025 274.000 0.000 NA   NA
 5911361 5911362 HRM2_40470 HRM2_40480     FALSE 0.235 96.000 0.000 NA   NA
 5911363 5911364 HRM2_40490 HRM2_40500   rapA FALSE 0.067 198.000 0.000 1.000   NA
 5911364 5911365 HRM2_40500 HRM2_40510 rapA   FALSE 0.300 112.000 0.000 0.097 N NA
 5911365 5911366 HRM2_40510 HRM2_40520   alaS2 FALSE 0.087 178.000 0.000 1.000   NA
 5911367 5911368 HRM2_40530 HRM2_40540     FALSE 0.161 124.000 0.000 NA   NA
 5911369 5911370 HRM2_40550 HRM2_40560     TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 5911370 5911371 HRM2_40560 HRM2_40570   pcrA1 FALSE 0.366 68.000 0.000 1.000 N NA
 5911371 5911372 HRM2_40570 HRM2_40580 pcrA1 algC TRUE 0.589 23.000 0.000 1.000 N NA
 5911372 5911373 HRM2_40580 HRM2_40590 algC uppP TRUE 0.856 49.000 0.010 1.000 N NA
 5911374 5911375 HRM2_40600 HRM2_40610 hcp   FALSE 0.346 77.000 0.000 1.000   NA
 5911375 5911376 HRM2_40610 HRM2_40620     TRUE 0.819 104.000 0.056 NA   NA
 5911377 5911378 HRM2_40630 HRM2_40640   ttuD FALSE 0.220 104.000 0.000 1.000 N NA
 5911378 5911379 HRM2_40640 HRM2_40650 ttuD sfsA FALSE 0.286 82.000 0.000 NA   NA
 5911379 5911380 HRM2_40650 HRM2_40660 sfsA   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911382 5911383 HRM2_40680 HRM2_40690     TRUE 0.826 -22.000 0.000 NA   NA
 5911383 5911384 HRM2_40690 HRM2_40700     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5911385 5911386 HRM2_40710 HRM2_40720   cydA2 FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 5911386 5911387 HRM2_40720 HRM2_40730 cydA2 cydB2 TRUE 0.999 34.000 0.939 0.047 Y NA
 5911387 5911388 HRM2_40730 HRM2_40740 cydB2   FALSE 0.158 125.000 0.000 NA   NA
 5911388 5911389 HRM2_40740 HRM2_40750   hbr1 TRUE 0.501 30.000 0.000 NA   NA
 5911390 5911391 HRM2_40760 HRM2_40770     FALSE 0.372 61.000 0.000 NA   NA
 5911391 5911392 HRM2_40770 HRM2_40780   iorB4 TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5911392 5911393 HRM2_40780 HRM2_40790 iorB4 iorA4 TRUE 1.000 0.000 1.000 0.002 Y NA
 5911393 5911394 HRM2_40790 HRM2_40800 iorA4   FALSE 0.168 121.000 0.000 NA   NA
 5911394 5911395 HRM2_40800 HRM2_40810     FALSE 0.317 75.000 0.000 NA   NA
 5911395 5911396 HRM2_40810 HRM2_40820     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5911396 5911397 HRM2_40820 HRM2_40830     TRUE 0.995 6.000 0.118 NA   NA
 5911398 5911399 HRM2_40840 HRM2_40850     TRUE 0.998 85.000 0.771 0.048 Y NA
 5911399 5911400 HRM2_40850 HRM2_40860     TRUE 1.000 -3.000 0.771 0.048 Y NA
 5911400 5911401 HRM2_40860 HRM2_40870     FALSE 0.032 244.000 0.000 NA   NA
 5911401 5911402 HRM2_40870 HRM2_40880     FALSE 0.174 118.000 0.000 NA   NA
 5911402 5911403 HRM2_40880 HRM2_40890   umuD2 FALSE 0.211 103.000 0.000 NA   NA
 5911403 5911404 HRM2_40890 HRM2_40900 umuD2 umuC1 TRUE 0.895 4.000 0.000 1.000 N NA
 5911404 5911405 HRM2_40900 HRM2_40910 umuC1   TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5911405 5911406 HRM2_40910 HRM2_40920     TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5911407 5911408 HRM2_40930 HRM2_40940   ubiE5 FALSE 0.117 143.000 0.000 NA   NA
 5911408 5911409 HRM2_40940 HRM2_40950 ubiE5   FALSE 0.277 89.000 0.000 1.000 N NA
 5911409 5911410 HRM2_40950 HRM2_40960   resA TRUE 0.999 3.000 0.133 0.001   NA
 5911410 5911411 HRM2_40960 HRM2_40970 resA fdhB7 FALSE 0.365 73.000 0.000 1.000   NA
 5911411 5911412 HRM2_40970 HRM2_40980 fdhB7 fdhA7 TRUE 0.964 14.000 0.000 0.003 Y NA
 5911413 5911414 HRM2_40990 HRM2_41000 exoA   TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5911417 5911418 HRM2_41030 HRM2_41040 icd hbr2 TRUE 0.809 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5911418 5911419 HRM2_41040 HRM2_41050 hbr2 gltA4 TRUE 0.840 36.000 0.000 1.000 Y NA
 5911419 5911420 HRM2_41050 HRM2_41060 gltA4 ftrB TRUE 0.937 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5911420 5911421 HRM2_41060 HRM2_41070 ftrB   TRUE 0.999 -10.000 0.318 1.000 N NA
 5911421 5911422 HRM2_41070 HRM2_41080     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5911423 5911424 HRM2_41090 HRM2_41100 porA2 porB3 TRUE 1.000 3.000 0.724 0.003 Y NA
 5911424 5911425 HRM2_41100 HRM2_41110 porB3   TRUE 0.884 24.000 0.000 1.000 Y NA
 5911425 5911426 HRM2_41110 HRM2_41120     TRUE 0.619 102.000 0.000 1.000 Y NA
 5911426 5911427 HRM2_41120 HRM2_41130   iscS2 TRUE 0.998 18.000 0.716 1.000 N NA
 5911428 5911429 HRM2_41140 HRM2_41150     FALSE 0.161 127.000 0.000 1.000 N NA
 5911429 5911430 HRM2_41150 HRM2_41160   pckG FALSE 0.056 201.000 0.000 1.000 N NA
 5911431 5911432 HRM2_41170 HRM2_41180   rsbU1 FALSE 0.034 238.000 0.000 NA   NA
 5911432 5911433 HRM2_41180 HRM2_41190 rsbU1   TRUE 0.513 31.000 0.000 1.000 N NA
 5911433 5911434 HRM2_41190 HRM2_41200     TRUE 0.997 -22.000 0.273 NA N NA
 5911434 5911435 HRM2_41200 HRM2_41210   rsbW1 TRUE 0.993 14.000 0.062 NA Y NA
 5911435 5911436 HRM2_41210 HRM2_41220 rsbW1 rsbV TRUE 0.997 17.000 0.188 1.000 Y NA
 5911437 5911438 HRM2_41230 HRM2_41240     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5911438 5911439 HRM2_41240 HRM2_41250     TRUE 0.979 38.000 0.222 NA   NA
 5911440 5911441 HRM2_41260 HRM2_41270 livF5 paaK TRUE 0.998 -3.000 0.106 1.000 N NA
 5911444 5911445 HRM2_41300 HRM2_41310     FALSE 0.361 64.000 0.000 NA   NA
 5911445 5911446 HRM2_41310 HRM2_41320     TRUE 0.944 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5911446 5911447 HRM2_41320 HRM2_41330     TRUE 0.439 43.000 0.000 NA   NA
 5911447 5911448 HRM2_41330 HRM2_41340     TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5911448 5911449 HRM2_41340 HRM2_41350     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911450 5911451 HRM2_41360 HRM2_41370 glpR1   TRUE 0.820 -24.000 0.000 NA   NA
 5911453 5911454 HRM2_41390 HRM2_41400     TRUE 0.816 -27.000 0.000 NA   NA
 5911455 5911456 HRM2_41410 HRM2_41420     FALSE 0.365 63.000 0.000 NA   NA
 5911456 5911457 HRM2_41420 HRM2_41430     TRUE 0.575 27.000 0.000 1.000   NA
 5911458 5911459 HRM2_41440 HRM2_41460     FALSE 0.092 161.000 0.000 NA   NA
 5911460 5911461 HRM2_41470 HRM2_41480     FALSE 0.239 95.000 0.000 NA   NA
 5911461 5911462 HRM2_41480 HRM2_41490     FALSE 0.312 76.000 0.000 NA   NA
 5911462 5911463 HRM2_41490 HRM2_41500     TRUE 0.989 96.000 0.769 NA   NA
 5911463 5911464 HRM2_41500 HRM2_41510     TRUE 0.999 -127.000 0.923 NA   NA
 5911464 5911465 HRM2_41510 HRM2_41520     TRUE 0.999 27.000 0.857 1.000 Y NA
 5911465 5911466 HRM2_41520 HRM2_41530     TRUE 0.995 42.000 0.714 1.000   NA
 5911466 5911467 HRM2_41530 HRM2_41540     TRUE 0.757 -61.000 0.000 1.000   NA
 5911467 5911468 HRM2_41540 HRM2_41550     TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5911468 5911469 HRM2_41550 HRM2_41560     FALSE 0.005 823.000 0.000 NA   NA
 5911470 5911471 HRM2_41570 HRM2_41580     FALSE 0.010 425.000 0.000 NA   NA
 5911471 5911472 HRM2_41580 HRM2_41590   comA FALSE 0.109 147.000 0.000 NA   NA
 5911472 5911473 HRM2_41590 HRM2_41600 comA   TRUE 0.809 -22.000 0.000 NA N NA
 5911474 5911475 HRM2_41610 HRM2_41620     FALSE 0.168 121.000 0.000 NA   NA
 5911475 5911476 HRM2_41620 HRM2_41630   fabH3 FALSE 0.096 156.000 0.000 NA   NA
 5911476 5911477 HRM2_41630 HRM2_41640 fabH3 caiD1 TRUE 0.925 16.000 0.000 1.000 Y NA
 5911479 5911480 HRM2_41660 HRM2_41670     FALSE 0.233 105.000 0.000 1.000   NA
 5911480 5911481 HRM2_41670 HRM2_41680     TRUE 0.855 8.000 0.000 1.000   NA
 5911481 5911482 HRM2_41680 HRM2_41690     TRUE 0.999 -3.000 0.081 0.007   NA
 5911482 5911483 HRM2_41690 HRM2_41700   gpmB TRUE 0.999 -3.000 0.328 1.000   NA
 5911483 5911484 HRM2_41700 HRM2_41710 gpmB   TRUE 0.998 -13.000 0.276 1.000 N NA
 5911484 5911485 HRM2_41710 HRM2_41720     TRUE 1.000 10.000 0.477 0.011 Y NA
 5911485 5911486 HRM2_41720 HRM2_41730   cydA3 FALSE 0.094 159.000 0.000 NA   NA
 5911487 5911488 HRM2_41740 HRM2_41750     TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5911489 5911490 HRM2_41760 HRM2_41770     TRUE 1.000 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5911490 5911491 HRM2_41770 HRM2_41780     TRUE 0.999 8.000 0.200 1.000 Y NA
 5911491 5911492 HRM2_41780 HRM2_41790     FALSE 0.073 193.000 0.000 1.000   NA
 5911492 5911493 HRM2_41790 HRM2_41800     FALSE 0.009 436.000 0.000 NA   NA
 5911494 5911495 HRM2_41810 HRM2_41820   acsL4 TRUE 0.998 13.000 0.500 1.000   NA
 5911496 5911497 HRM2_41830 HRM2_41840     TRUE 0.994 0.000 0.000 0.031 Y NA
 5911499 5911500 HRM2_41860 HRM2_41870     FALSE 0.401 52.000 0.000 NA   NA
 5911500 5911501 HRM2_41870 HRM2_41880     TRUE 0.899 34.000 0.000 0.031 Y NA
 5911501 5911502 HRM2_41880 HRM2_41890     TRUE 0.892 22.000 0.000 1.000 Y NA
 5911503 5911504 HRM2_41900 HRM2_41910     TRUE 0.998 -7.000 0.208 NA   NA
 5911504 5911505 HRM2_41910 HRM2_41920     TRUE 0.996 12.000 0.333 NA   NA
 5911506 5911507 HRM2_41930 HRM2_41940   arsC2 FALSE 0.345 69.000 0.000 NA   NA
 5911510 5911511 HRM2_41970 HRM2_41980 gdhA5 hbr3 TRUE 0.408 63.000 0.000 1.000   NA
 5911511 5911512 HRM2_41980 HRM2_41990 hbr3   FALSE 0.243 138.000 0.000 0.047   NA
 5911513 5911514 HRM2_42000 HRM2_42010 dfx rbr4 TRUE 0.976 108.000 0.129 0.047 Y NA
 5911515 5911516 HRM2_42020 HRM2_42030     TRUE 0.929 2.000 0.000 1.000 N NA
 5911517 5911518 HRM2_42040 HRM2_42050     FALSE 0.365 63.000 0.000 NA   NA
 5911518 5911519 HRM2_42050 HRM2_42060     TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5911519 5911520 HRM2_42060 HRM2_42070     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 5911521 5911522 HRM2_42080 HRM2_42090   phaE TRUE 0.435 44.000 0.000 NA   NA
 5911522 5911523 HRM2_42090 HRM2_42100 phaE phaC TRUE 0.977 51.000 0.258 NA   NA
 5911523 5911524 HRM2_42100 HRM2_42110 phaC   TRUE 0.466 31.000 0.000 NA N NA
 5911524 5911525 HRM2_42110 HRM2_42120   maoC TRUE 0.461 32.000 0.000 NA N NA
 5911525 5911526 HRM2_42120 HRM2_42130 maoC   FALSE 0.219 109.000 0.000 1.000   NA
 5911526 5911527 HRM2_42130 HRM2_42140     TRUE 0.812 -28.000 0.000 NA   NA
 5911527 5911528 HRM2_42140 HRM2_42150   caiD2 FALSE 0.030 250.000 0.000 NA   NA
 5911529 5911530 HRM2_42160 HRM2_42170   pspC TRUE 0.542 23.000 0.000 NA N NA
 5911530 5911531 HRM2_42170 HRM2_42180 pspC   TRUE 0.999 6.000 0.600 NA   NA
 5911531 5911532 HRM2_42180 HRM2_42190   pspA2 TRUE 0.972 68.000 0.273 NA   NA
 5911533 5911534 HRM2_42200 HRM2_42210 pspF dsbD FALSE 0.289 86.000 0.000 1.000 N NA
 5911534 5911535 HRM2_42210 HRM2_42220 dsbD   TRUE 0.902 20.000 0.000 1.000 Y NA
 5911535 5911536 HRM2_42220 HRM2_42230     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5911536 5911537 HRM2_42230 HRM2_42240   ppiB2 FALSE 0.129 136.000 0.000 NA   NA
 5911537 5911538 HRM2_42240 HRM2_42250 ppiB2   FALSE 0.071 181.000 0.000 NA   NA
 5911540 5911541 HRM2_42270 HRM2_42280   rocD2 TRUE 0.616 18.000 0.000 NA N NA
 5911542 5911543 HRM2_42290 HRM2_42300 glpR2   TRUE 0.772 13.000 0.000 1.000   NA
 5911544 5911545 HRM2_42310 HRM2_42320 glpA3 glpB3 TRUE 1.000 -10.000 0.650 0.002 N NA
 5911545 5911546 HRM2_42320 HRM2_42330 glpB3 recQ2 FALSE 0.062 197.000 0.000 1.000 N NA
 5911546 5911547 HRM2_42330 HRM2_42340 recQ2 tatB FALSE 0.337 74.000 0.000 1.000 N NA
 5911547 5911548 HRM2_42340 HRM2_42350 tatB tatC TRUE 0.998 -3.000 0.014 NA Y NA
 5911548 5911549 HRM2_42350 HRM2_42360 tatC   FALSE 0.019 303.000 0.000 NA   NA
 5911550 5911551 HRM2_42370 HRM2_42380 cbiA2 dsrD TRUE 0.935 21.000 0.017 NA   NA
 5911551 5911552 HRM2_42380 HRM2_42390 dsrD dsrB2 TRUE 0.826 96.000 0.048 NA   NA
 5911552 5911553 HRM2_42390 HRM2_42400 dsrB2 dsrA2 TRUE 1.000 17.000 0.879 0.001 Y NA
 5911553 5911554 HRM2_42400 HRM2_42410 dsrA2   TRUE 0.506 181.000 0.030 1.000   NA
 5911557 5911558 HRM2_42440 HRM2_42450 minD2   TRUE 1.000 -3.000 0.838 0.003 Y NA
 5911558 5911559 HRM2_42450 HRM2_42460     TRUE 0.458 38.000 0.000 NA   NA
 5911559 5911560 HRM2_42460 HRM2_42470     TRUE 0.463 37.000 0.000 NA   NA
 5911560 5911561 HRM2_42470 HRM2_42480     FALSE 0.006 595.000 0.000 NA   NA
 5911564 5911565 HRM2_42510 HRM2_42520   nox2 FALSE 0.004 1015.000 0.000 NA   NA
 5911565 5911566 HRM2_42520 HRM2_42530 nox2   TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5911568 5911569 HRM2_42550 HRM2_42560     TRUE 0.993 9.000 0.111 NA   NA
 5911569 5911570 HRM2_42560 HRM2_42570   pcrA2 TRUE 0.489 32.000 0.000 NA   NA
 5911573 5911574 HRM2_42600 HRM2_42610     TRUE 0.888 4.000 0.000 NA   NA
 5911575 5911576 HRM2_42620 HRM2_42630   crcB TRUE 0.946 15.000 0.008 NA   NA
 5911577 5911578 HRM2_42640 HRM2_42650 cmk3   TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5911578 5911579 HRM2_42650 HRM2_42660     TRUE 0.468 36.000 0.000 NA   NA
 5911579 5911580 HRM2_42660 HRM2_42670   asmA TRUE 0.954 15.000 0.015 NA   NA
 5911580 5911581 HRM2_42670 HRM2_42680 asmA   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911584 5911585 HRM2_42710 HRM2_42720   feoB2 FALSE 0.021 294.000 0.000 NA   NA
 5911585 5911586 HRM2_42720 HRM2_42730 feoB2 feoA TRUE 0.986 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5911587 5911588 HRM2_42740 HRM2_42750     TRUE 0.645 -130.000 0.000 NA   NA
 5911588 5911589 HRM2_42750 HRM2_42760     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5911589 5911590 HRM2_42760 HRM2_42770   gltD3 FALSE 0.044 230.000 0.000 1.000   NA
 5911590 5911591 HRM2_42770 HRM2_42780 gltD3 porA3 TRUE 1.000 -3.000 0.404 0.047 N NA
 5911591 5911592 HRM2_42780 HRM2_42790 porA3 porB4 TRUE 1.000 -3.000 0.345 0.003 Y NA
 5911592 5911593 HRM2_42790 HRM2_42800 porB4 glpQ2 TRUE 0.664 92.000 0.000 1.000 Y NA
 5911593 5911594 HRM2_42800 HRM2_42810 glpQ2   FALSE 0.063 196.000 0.000 1.000 N NA
 5911595 5911596 HRM2_42820 HRM2_42830 ecaB   FALSE 0.046 211.000 0.000 NA   NA
 5911597 5911598 HRM2_42840 HRM2_42850 dctP9 dctQ9 TRUE 0.991 62.000 0.250 NA Y NA
 5911598 5911599 HRM2_42850 HRM2_42860 dctQ9 dctM9 TRUE 0.997 40.000 0.500 NA Y NA
 5911599 5911600 HRM2_42860 HRM2_42870 dctM9 aspC5 TRUE 0.842 8.000 0.000 1.000 N NA
 5911600 5911601 HRM2_42870 HRM2_42880 aspC5   TRUE 0.673 -93.000 0.000 NA   NA
 5911602 5911603 HRM2_42890 HRM2_42900     FALSE 0.044 230.000 0.000 1.000   NA
 5911603 5911604 HRM2_42900 HRM2_42910     TRUE 0.969 44.000 0.026 1.000 Y NA
 5911605 5911606 HRM2_42920 HRM2_42930     FALSE 0.010 415.000 0.000 NA   NA
 5911606 5911607 HRM2_42930 HRM2_42940   gspA TRUE 0.841 7.000 0.000 NA   NA
 5911609 5911610 HRM2_42960 HRM2_42970     TRUE 0.999 0.000 0.210 1.000 N NA
 5911610 5911611 HRM2_42970 HRM2_42980     TRUE 0.996 7.000 0.152 1.000   NA
 5911612 5911613 HRM2_42990 HRM2_43000 ppsA8   TRUE 0.998 -3.000 0.082 1.000   NA
 5911615 5911616 HRM2_43020 HRM2_43030 hgdC1 hgdA TRUE 0.979 34.000 0.222 NA N NA
 5911616 5911617 HRM2_43030 HRM2_43040 hgdA hgdB1 TRUE 0.999 16.000 0.800 NA Y NA
 5911619 5911620 HRM2_43060 HRM2_43070     FALSE 0.017 347.000 0.000 1.000   NA
 5911620 5911621 HRM2_43070 HRM2_43080   atoE TRUE 0.665 -234.000 0.000 1.000   NA
 5911621 5911622 HRM2_43080 HRM2_43090 atoE   FALSE 0.005 801.000 0.000 1.000 N NA
 5911622 5911623 HRM2_43090 HRM2_43100     TRUE 0.999 -3.000 0.349 1.000 N NA
 5911623 5911624 HRM2_43100 HRM2_43110   marR TRUE 0.528 29.000 0.000 1.000 N NA
 5911624 5911625 HRM2_43110 HRM2_43120 marR ffp FALSE 0.093 165.000 0.000 1.000 N NA
 5911626 5911627 HRM2_43130 HRM2_43140   motB4 TRUE 0.739 13.000 0.000 NA   NA
 5911628 5911629 HRM2_43150 HRM2_43160   ftcD1 TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000   NA
 5911629 5911630 HRM2_43160 HRM2_43170 ftcD1 hutI TRUE 0.954 15.000 0.013 1.000 N NA
 5911630 5911631 HRM2_43170 HRM2_43180 hutI   FALSE 0.046 227.000 0.000 1.000   NA
 5911631 5911632 HRM2_43180 HRM2_43190     FALSE 0.286 82.000 0.000 NA   NA
 5911633 5911634 HRM2_43200 HRM2_43210 copA   FALSE 0.007 646.000 0.000 1.000   NA
 5911634 5911635 HRM2_43210 HRM2_43220     TRUE 0.494 31.000 0.000 NA   NA
 5911635 5911636 HRM2_43220 HRM2_43230     FALSE 0.076 174.000 0.000 NA   NA
 5911637 5911638 HRM2_43240 HRM2_43250     TRUE 0.986 -13.000 0.000 0.019 Y NA
 5911638 5911639 HRM2_43250 HRM2_43260     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911639 5911640 HRM2_43260 HRM2_43270     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 5911640 5911641 HRM2_43270 HRM2_43280     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911641 5911642 HRM2_43280 HRM2_43290     FALSE 0.007 548.000 0.000 NA   NA
 5911642 5911643 HRM2_43290 HRM2_43300     TRUE 0.916 10.000 0.000 0.007   NA
 5911644 5911645 HRM2_43310 HRM2_43320     TRUE 0.890 -54.000 0.000 0.003   NA
 5911646 5911647 HRM2_43330 HRM2_43340     FALSE 0.066 187.000 0.000 NA   NA
 5911647 5911648 HRM2_43340 HRM2_43350     TRUE 0.996 -3.000 0.032 NA N NA
 5911648 5911649 HRM2_43350 HRM2_43360     FALSE 0.202 105.000 0.000 NA   NA
 5911649 5911650 HRM2_43360 HRM2_43370     FALSE 0.010 414.000 0.000 NA   NA
 5911650 5911651 HRM2_43370 HRM2_43380     FALSE 0.161 124.000 0.000 NA   NA
 5911651 5911652 HRM2_43380 HRM2_43390     TRUE 0.809 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5911652 5911653 HRM2_43390 HRM2_43400     FALSE 0.047 201.000 0.000 NA N NA
 5911653 5911654 HRM2_43400 HRM2_43410     FALSE 0.290 81.000 0.000 NA   NA
 5911654 5911655 HRM2_43410 HRM2_43420   nox3 FALSE 0.028 260.000 0.000 NA   NA
 5911655 5911656 HRM2_43420 HRM2_43430 nox3   TRUE 0.734 -76.000 0.000 1.000   NA
 5911656 5911657 HRM2_43430 HRM2_43440   cdh2 TRUE 0.998 36.000 0.400 0.046 Y NA
 5911658 5911659 HRM2_43450 HRM2_43460   hgdC2 FALSE 0.267 81.000 0.000 NA N NA
 5911660 5911661 HRM2_43470 HRM2_43480     FALSE 0.072 180.000 0.000 NA   NA
 5911661 5911662 HRM2_43480 HRM2_43490   leuD2 FALSE 0.045 212.000 0.000 NA   NA
 5911662 5911663 HRM2_43490 HRM2_43500 leuD2 leuC2 TRUE 0.998 43.000 0.477 0.001 Y NA
 5911663 5911664 HRM2_43500 HRM2_43510 leuC2 aroC3 TRUE 0.747 72.000 0.000 1.000 Y NA
 5911664 5911665 HRM2_43510 HRM2_43520 aroC3   FALSE 0.006 739.000 0.000 1.000 N NA
 5911665 5911666 HRM2_43520 HRM2_43530     TRUE 0.997 -46.000 0.136 1.000 Y NA
 5911666 5911667 HRM2_43530 HRM2_43540   glpV TRUE 0.964 78.000 0.250 1.000 N NA
 5911667 5911668 HRM2_43540 HRM2_43550 glpV   TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5911668 5911669 HRM2_43550 HRM2_43560     TRUE 0.733 101.000 0.000 0.025 Y NA
 5911669 5911670 HRM2_43560 HRM2_43570     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5911670 5911671 HRM2_43570 HRM2_43580     FALSE 0.325 73.000 0.000 NA   NA
 5911675 5911676 HRM2_43620 HRM2_43630     TRUE 0.715 14.000 0.000 NA   NA
 5911676 5911677 HRM2_43630 HRM2_43640     FALSE 0.011 408.000 0.000 NA   NA
 5911678 5911679 HRM2_43650 HRM2_43660 gltI gltJ2 TRUE 0.999 77.000 1.000 0.048 Y NA
 5911679 5911680 HRM2_43660 HRM2_43670 gltJ2 gltK2 TRUE 1.000 2.000 1.000 0.009 Y NA
 5911680 5911681 HRM2_43670 HRM2_43680 gltK2 gltL2 TRUE 1.000 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 5911681 5911682 HRM2_43680 HRM2_43690 gltL2   FALSE 0.306 87.000 0.000 1.000   NA
 5911683 5911684 HRM2_43700 HRM2_43710     TRUE 0.803 45.000 0.000 NA Y NA
 5911684 5911685 HRM2_43710 HRM2_43720     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911685 5911686 HRM2_43720 HRM2_43730     FALSE 0.199 106.000 0.000 NA   NA
 5911686 5911687 HRM2_43730 HRM2_43740     FALSE 0.076 174.000 0.000 NA   NA
 5911687 5911688 HRM2_43740 HRM2_43750   pacL FALSE 0.076 189.000 0.000 1.000   NA
 5911692 5911693 HRM2_43790 HRM2_43800     TRUE 0.999 3.000 0.338 NA   NA
 5911693 5911694 HRM2_43800 HRM2_43810     TRUE 0.995 -40.000 0.257 NA   NA
 5911694 5911695 HRM2_43810 HRM2_43820     FALSE 0.011 410.000 0.000 NA   NA
 5911695 5911696 HRM2_43820 HRM2_43830     FALSE 0.014 344.000 0.000 NA   NA
 5911696 5911697 HRM2_43830 HRM2_43840     FALSE 0.006 656.000 0.000 1.000 N NA
 5911697 5911698 HRM2_43840 HRM2_43850     FALSE 0.007 561.000 0.000 1.000 N NA
 5911698 5911699 HRM2_43850 HRM2_43860     TRUE 0.487 192.000 0.012 0.033 N NA
 5911699 5911700 HRM2_43860 HRM2_43870     FALSE 0.389 56.000 0.000 NA   NA
 5911700 5911701 HRM2_43870 HRM2_43880     FALSE 0.070 182.000 0.000 NA   NA
 5911701 5911702 HRM2_43880 HRM2_43890     FALSE 0.030 253.000 0.000 NA   NA
 5911702 5911703 HRM2_43890 HRM2_43900     FALSE 0.061 193.000 0.000 NA   NA
 5911703 5911704 HRM2_43900 HRM2_43910     FALSE 0.058 206.000 0.000 1.000   NA
 5911704 5911705 HRM2_43910 HRM2_43920     TRUE 0.564 28.000 0.000 1.000   NA
 5911705 5911706 HRM2_43920 HRM2_43930     FALSE 0.280 84.000 0.000 NA   NA
 5911706 5911707 HRM2_43930 HRM2_43940     FALSE 0.193 108.000 0.000 NA   NA
 5911707 5911708 HRM2_43940 HRM2_43950     TRUE 0.420 47.000 0.000 NA   NA
 5911708 5911709 HRM2_43950 HRM2_43960     FALSE 0.106 150.000 0.000 NA   NA
 5911709 5911710 HRM2_43960 HRM2_43970     FALSE 0.012 387.000 0.000 1.000 N NA
 5911710 5911711 HRM2_43970 HRM2_43980     FALSE 0.004 1373.000 0.000 NA   NA
 5911711 5911712 HRM2_43980 HRM2_43990     FALSE 0.068 184.000 0.000 NA   NA
 5911712 5911713 HRM2_43990 HRM2_44000     FALSE 0.074 178.000 0.000 NA   NA
 5911713 5911714 HRM2_44000 HRM2_44010   mazF TRUE 0.859 -16.000 0.000 NA   NA
 5911714 5911715 HRM2_44010 HRM2_44020 mazF   TRUE 0.998 18.000 0.714 NA   NA
 5911715 5911716 HRM2_44020 HRM2_44030     FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 5911716 5911717 HRM2_44030 HRM2_44040     FALSE 0.015 331.000 0.000 NA   NA
 5911717 5911718 HRM2_44040 HRM2_44050     FALSE 0.008 466.000 0.000 NA   NA
 5911718 5911719 HRM2_44050 HRM2_44060   ftcD2 TRUE 0.682 18.000 0.000 1.000   NA
 5911719 5911720 HRM2_44060 HRM2_44070 ftcD2 hutU2 TRUE 0.644 290.000 0.086 1.000 Y NA
 5911720 5911721 HRM2_44070 HRM2_44080 hutU2   FALSE 0.109 152.000 0.000 1.000 N NA
 5911721 5911722 HRM2_44080 HRM2_44090   mttB7 FALSE 0.047 217.000 0.000 1.000 N NA
 5911722 5911723 HRM2_44090 HRM2_44100 mttB7 hutC TRUE 0.549 27.000 0.000 1.000 N NA
 5911723 5911724 HRM2_44100 HRM2_44110 hutC   TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911724 5911725 HRM2_44110 HRM2_44120   hutH TRUE 0.473 35.000 0.000 NA   NA
 5911725 5911726 HRM2_44120 HRM2_44130 hutH mttB8 TRUE 0.778 12.000 0.000 1.000 N NA
 5911726 5911727 HRM2_44130 HRM2_44140 mttB8   FALSE 0.289 86.000 0.000 1.000 N NA
 5911727 5911728 HRM2_44140 HRM2_44150     TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5911728 5911729 HRM2_44150 HRM2_44160     TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5911729 5911730 HRM2_44160 HRM2_44170     TRUE 0.998 72.000 0.667 0.039 Y NA
 5911733 5911734 HRM2_44200 HRM2_44210   mttB10 FALSE 0.120 141.000 0.000 NA   NA
 5911735 5911736 HRM2_44220 HRM2_44230     FALSE 0.009 440.000 0.000 NA   NA
 5911736 5911737 HRM2_44230 HRM2_44240   gph2 FALSE 0.058 197.000 0.000 NA   NA
 5911737 5911738 HRM2_44240 HRM2_44250 gph2   FALSE 0.366 105.000 0.000 0.043   NA
 5911738 5911739 HRM2_44250 HRM2_44260     TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5911739 5911740 HRM2_44260 HRM2_44270     FALSE 0.007 659.000 0.000 1.000   NA
 5911741 5911742 HRM2_44280 HRM2_44290     FALSE 0.068 184.000 0.000 NA   NA
 5911742 5911743 HRM2_44290 HRM2_44300     FALSE 0.011 409.000 0.000 NA   NA
 5911743 5911744 HRM2_44300 HRM2_44310     FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5911744 5911745 HRM2_44310 HRM2_44320     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911745 5911746 HRM2_44320 HRM2_44330     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5911746 5911747 HRM2_44330 HRM2_44340     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5911747 5911748 HRM2_44340 HRM2_44350   istA3 FALSE 0.007 535.000 0.000 NA   NA
 5911748 5911749 HRM2_44350 HRM2_44360 istA3 istB2 TRUE 0.937 -7.000 0.000 1.000   NA
 5911749 5911750 HRM2_44360 HRM2_44370 istB2   TRUE 0.879 -40.000 0.000 0.095   NA
 5911751 5911752 HRM2_44380 HRM2_44390   istA4 FALSE 0.141 326.000 0.000 0.007 Y NA
 5911752 5911753 HRM2_44390 HRM2_44400 istA4   TRUE 0.925 -19.000 0.000 0.038   NA
 5911753 5911754 HRM2_44400 HRM2_44410     TRUE 0.709 -70.000 0.000 NA   NA
 5911754 5911755 HRM2_44410 HRM2_44420     FALSE 0.006 588.000 0.000 NA   NA
 5911755 5911756 HRM2_44420 HRM2_44430     FALSE 0.214 102.000 0.000 NA   NA
 5911756 5911757 HRM2_44430 HRM2_44440     TRUE 0.912 -9.000 0.000 NA   NA
 5911758 5911759 HRM2_44450 HRM2_44460 xerD4 hmrR3 TRUE 0.937 -18.000 0.000 0.007   NA
 5911759 5911760 HRM2_44460 HRM2_44470 hmrR3   FALSE 0.284 129.000 0.000 0.038   NA
 5911761 5911762 HRM2_44480 HRM2_44490     FALSE 0.083 168.000 0.000 NA   NA
 5911762 5911763 HRM2_44490 HRM2_44500     TRUE 0.998 0.000 0.115 NA   NA
 5911765 5911766 HRM2_44520 HRM2_44530     TRUE 1.000 -3.000 0.833 1.000   NA
 5911766 5911767 HRM2_44530 HRM2_44540     TRUE 0.999 -46.000 0.844 NA   NA
 5911769 5911770 HRM2_44560 HRM2_44570 ubiE6   FALSE 0.034 237.000 0.000 NA   NA
 5911770 5911771 HRM2_44570 HRM2_44580     TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 5911771 5911772 HRM2_44580 HRM2_44590     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911772 5911773 HRM2_44590 HRM2_44600     FALSE 0.009 464.000 0.000 NA   NA
 5911773 5911774 HRM2_44600 HRM2_44610     FALSE 0.196 107.000 0.000 NA   NA
 5911775 5911776 HRM2_44620 HRM2_44630     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911776 5911777 HRM2_44630 HRM2_44640     FALSE 0.124 139.000 0.000 NA   NA
 5911777 5911778 HRM2_44640 HRM2_44650     TRUE 0.632 -186.000 0.000 NA   NA
 5911778 5911779 HRM2_44650 HRM2_44660     TRUE 0.955 162.000 0.667 NA   NA
 5911779 5911780 HRM2_44660 HRM2_44670   exeA5 TRUE 0.997 -7.000 0.071 1.000   NA
 5911780 5911781 HRM2_44670 HRM2_44680 exeA5   FALSE 0.010 409.000 0.000 NA N NA
 5911782 5911783 HRM2_44690 HRM2_44700     FALSE 0.269 87.000 0.000 NA   NA
 5911785 5911786 HRM2_44720 HRM2_44730     FALSE 0.031 247.000 0.000 NA   NA
 5911786 5911787 HRM2_44730 HRM2_44740     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5911787 5911788 HRM2_44740 HRM2_44750     FALSE 0.009 432.000 0.000 NA   NA
 5911788 5911789 HRM2_44750 HRM2_44760     TRUE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 5911789 5911790 HRM2_44760 HRM2_44770     FALSE 0.010 419.000 0.000 NA   NA
 5911790 5911791 HRM2_44770 HRM2_44780     TRUE 0.979 -204.000 0.047 0.007   NA
 5911791 5911792 HRM2_44780 HRM2_44790     TRUE 0.998 -3.000 0.047 0.038   NA
 5911794 5911795 HRM2_44810 HRM2_44820     TRUE 0.990 -12.000 0.028 NA   NA
 5911795 5911796 HRM2_44820 HRM2_44830     TRUE 0.983 37.000 0.282 NA   NA
 5911796 5911797 HRM2_44830 HRM2_44840     TRUE 0.990 27.000 0.352 NA   NA
 5911798 5911799 HRM2_44850 HRM2_44860     TRUE 0.814 10.000 0.000 1.000 N NA
 5911799 5911800 HRM2_44860 HRM2_44870     FALSE 0.283 92.000 0.000 1.000   NA
 5911801 5911802 HRM2_44880 HRM2_44890     TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000   NA
 5911805 5911806 HRM2_44920 HRM2_44930   ywkC TRUE 0.697 -85.000 0.000 1.000 N NA
 5911808 5911809 HRM2_44950 HRM2_44960   pdp TRUE 0.893 -10.000 0.000 NA N NA
 5911810 5911811 HRM2_44970 HRM2_44980   tmcA2 TRUE 0.519 28.000 0.000 NA   NA
 5911811 5911812 HRM2_44980 HRM2_44990 tmcA2 tmcB2 TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5911812 5911813 HRM2_44990 HRM2_45000 tmcB2 tmcC2 TRUE 0.998 22.000 1.000 NA   NA
 5911815 5911816 HRM2_45020 HRM2_45030     FALSE 0.007 571.000 0.000 NA   NA
 5911816 5911817 HRM2_45030 HRM2_45040     TRUE 0.999 0.000 0.143 1.000   NA
 5911817 5911818 HRM2_45040 HRM2_45050     TRUE 0.987 17.000 0.143 NA   NA
 5911818 5911819 HRM2_45050 HRM2_45060     FALSE 0.005 708.000 0.000 NA   NA
 5911820 5911821 HRM2_45070 HRM2_45080     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5911821 5911822 HRM2_45080 HRM2_45090     FALSE 0.227 98.000 0.000 NA   NA
 5911824 5911825 HRM2_45110 HRM2_45120     FALSE 0.124 139.000 0.000 NA   NA
 5911825 5911826 HRM2_45120 HRM2_45130     FALSE 0.243 94.000 0.000 NA   NA
 5911826 5911827 HRM2_45130 HRM2_45140     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911828 5911829 HRM2_45150 HRM2_45160     TRUE 0.448 41.000 0.000 NA   NA
 5911829 5911830 HRM2_45160 HRM2_45170     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5911830 5911831 HRM2_45170 HRM2_45180     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911831 5911832 HRM2_45180 HRM2_45190     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5911832 5911833 HRM2_45190 HRM2_45200   barA TRUE 0.951 3.000 0.000 0.077 N NA
 5911833 5911834 HRM2_45200 HRM2_45210 barA   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911834 5911835 HRM2_45210 HRM2_45220     FALSE 0.064 190.000 0.000 NA   NA
 5911835 5911836 HRM2_45220 HRM2_45230     TRUE 0.998 -3.000 0.085 NA N NA
 5911836 5911837 HRM2_45230 HRM2_45240     TRUE 0.970 18.000 0.064 NA N NA
 5911839 5911840 HRM2_45260 HRM2_45270 fabG9 acd14 TRUE 0.984 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5911840 5911841 HRM2_45270 HRM2_45280 acd14   FALSE 0.369 62.000 0.000 NA   NA
 5911841 5911842 HRM2_45280 HRM2_45290   atoB5 TRUE 0.999 0.000 0.429 NA   NA
 5911842 5911843 HRM2_45290 HRM2_45300 atoB5 alkK1 TRUE 0.499 39.000 0.000 1.000   NA
 5911843 5911844 HRM2_45300 HRM2_45310 alkK1 alkK2 TRUE 0.885 -45.000 0.000 0.032   NA
 5911844 5911845 HRM2_45310 HRM2_45320 alkK2   FALSE 0.011 452.000 0.000 1.000   NA
 5911845 5911846 HRM2_45320 HRM2_45330     FALSE 0.084 171.000 0.000 1.000 N NA
 5911847 5911848 HRM2_45340 HRM2_45350     FALSE 0.299 79.000 0.000 NA   NA
 5911849 5911850 HRM2_45360 HRM2_45370     FALSE 0.257 199.000 0.000 1.000 Y NA
 5911851 5911852 HRM2_45380 HRM2_45390     FALSE 0.060 194.000 0.000 NA   NA
 5911853 5911854 HRM2_45400 HRM2_45410     FALSE 0.268 91.000 0.000 1.000 N NA
 5911854 5911855 HRM2_45410 HRM2_45420   potC1 FALSE 0.033 314.000 0.000 0.076 N NA
 5911855 5911856 HRM2_45420 HRM2_45430 potC1 potB1 TRUE 1.000 -3.000 0.909 0.038 Y NA
 5911856 5911857 HRM2_45430 HRM2_45440 potB1 potA1 TRUE 1.000 -3.000 0.905 0.038 Y NA
 5911857 5911858 HRM2_45440 HRM2_45450 potA1 potD TRUE 0.997 111.000 0.783 0.038 Y NA
 5911859 5911860 HRM2_45460 HRM2_45470 dppA3 dppB2 TRUE 0.962 79.000 0.026 0.038 Y NA
 5911860 5911861 HRM2_45470 HRM2_45480 dppB2 dppC2 TRUE 0.999 45.000 0.779 0.038 Y NA
 5911861 5911862 HRM2_45480 HRM2_45490 dppC2 dppD3 TRUE 0.999 23.000 0.560 1.000 Y NA
 5911862 5911863 HRM2_45490 HRM2_45500 dppD3 dppF2 TRUE 1.000 -10.000 0.377 0.002 Y NA
 5911867 5911868 HRM2_45540 HRM2_45550     FALSE 0.202 105.000 0.000 NA   NA
 5911868 5911869 HRM2_45550 HRM2_45560   hisD2 TRUE 0.531 27.000 0.000 NA   NA
 5911870 5911871 HRM2_45570 HRM2_45580   dctM10 FALSE 0.020 305.000 0.000 1.000 N NA
 5911871 5911872 HRM2_45580 HRM2_45590 dctM10 dctQ10 TRUE 1.000 0.000 0.971 NA Y NA
 5911872 5911873 HRM2_45590 HRM2_45600 dctQ10 dctP10 TRUE 0.998 33.000 0.568 NA Y NA
 5911873 5911874 HRM2_45600 HRM2_45610 dctP10 amt FALSE 0.032 324.000 0.000 0.047 N NA
 5911874 5911875 HRM2_45610 HRM2_45620 amt glnB4 TRUE 0.932 68.000 0.083 1.000 N NA
 5911875 5911876 HRM2_45620 HRM2_45630 glnB4   FALSE 0.035 254.000 0.000 1.000   NA
 5911876 5911877 HRM2_45630 HRM2_45640     TRUE 0.819 9.000 0.000 NA   NA
 5911877 5911878 HRM2_45640 HRM2_45650   cbiB TRUE 0.670 15.000 0.000 NA N NA
 5911878 5911879 HRM2_45650 HRM2_45660 cbiB   TRUE 0.992 2.000 0.017 1.000 N NA
 5911879 5911880 HRM2_45660 HRM2_45670   cobS TRUE 0.955 14.000 0.010 1.000 N NA
 5911880 5911881 HRM2_45670 HRM2_45680 cobS   TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5911881 5911882 HRM2_45680 HRM2_45690     TRUE 0.477 34.000 0.000 NA   NA
 5911882 5911883 HRM2_45690 HRM2_45700     FALSE 0.142 140.000 0.000 1.000   NA
 5911883 5911884 HRM2_45700 HRM2_45710     TRUE 0.420 47.000 0.000 NA   NA
 5911884 5911885 HRM2_45710 HRM2_45720     FALSE 0.109 147.000 0.000 NA   NA
 5911885 5911886 HRM2_45720 HRM2_45730     FALSE 0.021 290.000 0.000 NA   NA
 5911886 5911887 HRM2_45730 HRM2_45740   glnA2 FALSE 0.022 287.000 0.000 NA   NA
 5911889 5911890 HRM2_45760 HRM2_45770 mip2   FALSE 0.103 164.000 0.000 1.000   NA
 5911891 5911892 HRM2_45780 HRM2_45790   cbiK3 FALSE 0.294 80.000 0.000 NA   NA
 5911893 5911894 HRM2_45800 HRM2_45810     FALSE 0.027 272.000 0.000 1.000 N NA
 5911894 5911895 HRM2_45810 HRM2_45820     FALSE 0.015 351.000 0.000 1.000 N NA
 5911895 5911896 HRM2_45820 HRM2_45830     TRUE 1.000 -7.000 0.200 0.094 Y NA
 5911896 5911897 HRM2_45830 HRM2_45840     TRUE 0.967 8.000 0.000 1.000 Y NA
 5911897 5911898 HRM2_45840 HRM2_45850     TRUE 0.660 18.000 0.000 1.000 N NA
 5911898 5911899 HRM2_45850 HRM2_45860     TRUE 0.999 -3.000 0.035 1.000 Y NA
 5911899 5911900 HRM2_45860 HRM2_45870     TRUE 0.702 -78.000 0.000 1.000 N NA
 5911901 5911902 HRM2_45880 HRM2_45890     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911902 5911903 HRM2_45890 HRM2_45900     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5911904 5911905 HRM2_45910 HRM2_45920     FALSE 0.005 717.000 0.000 NA   NA
 5911906 5911907 HRM2_45930 HRM2_45940     TRUE 0.987 -31.000 0.026 0.042 N NA
 5911907 5911908 HRM2_45940 HRM2_45950   ubiA TRUE 0.778 12.000 0.000 1.000 N NA
 5911908 5911909 HRM2_45950 HRM2_45960 ubiA   TRUE 0.999 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 5911909 5911910 HRM2_45960 HRM2_45970     TRUE 0.947 0.000 0.000 1.000 N NA
 5911911 5911912 HRM2_45980 HRM2_45990 opuD5 mttB711 TRUE 0.612 21.000 0.000 1.000 N NA
 5911913 5911914 HRM2_46000 HRM2_46010   ntrC3 TRUE 0.988 77.000 0.154 0.094 Y NA
 5911914 5911915 HRM2_46010 HRM2_46020 ntrC3   FALSE 0.018 318.000 0.000 1.000 N NA
 5911915 5911916 HRM2_46020 HRM2_46030     FALSE 0.264 97.000 0.000 1.000   NA
 5911916 5911917 HRM2_46030 HRM2_46040   metH4 FALSE 0.160 193.000 0.000 0.002   NA
 5911918 5911919 HRM2_46050 HRM2_46060 ppsA9   FALSE 0.007 645.000 0.000 1.000   NA
 5911921 5911922 HRM2_46080 HRM2_46090   ald2 TRUE 0.915 3.000 0.000 1.000 N NA
 5911922 5911923 HRM2_46090 HRM2_46100 ald2   FALSE 0.023 287.000 0.000 1.000 N NA
 5911923 5911924 HRM2_46100 HRM2_46110     TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000   NA
 5911926 5911927 HRM2_46130 HRM2_46140     TRUE 0.483 43.000 0.000 1.000   NA
 5911928 5911929 HRM2_46150 HRM2_46160     FALSE 0.082 169.000 0.000 NA   NA
 5911930 5911931 HRM2_46170 HRM2_46180     FALSE 0.106 150.000 0.000 NA   NA
 5911933 5911934 HRM2_46200 HRM2_46210     FALSE 0.149 137.000 0.000 1.000   NA
 5911934 5911935 HRM2_46210 HRM2_46220     FALSE 0.007 607.000 0.000 1.000   NA
 5911937 5911938 HRM2_46240 HRM2_46250 codA   TRUE 0.998 3.000 0.151 1.000   NA
 5911938 5911939 HRM2_46250 HRM2_46260     TRUE 1.000 6.000 0.976 0.038   NA
 5911939 5911940 HRM2_46260 HRM2_46270     TRUE 1.000 -10.000 0.864 1.000   NA
 5911940 5911941 HRM2_46270 HRM2_46280     TRUE 0.993 45.000 0.591 1.000   NA
 5911941 5911942 HRM2_46280 HRM2_46290     FALSE 0.011 387.000 0.000 NA   NA
 5911942 5911943 HRM2_46290 HRM2_46300     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5911943 5911944 HRM2_46300 HRM2_46310     FALSE 0.014 346.000 0.000 NA   NA
 5911944 5911945 HRM2_46310 HRM2_46320   luxR2 FALSE 0.158 125.000 0.000 NA   NA
 5911946 5911947 HRM2_46330 HRM2_46340   dnaG6 FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 5911947 5911948 HRM2_46340 HRM2_46350 dnaG6   TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5911948 5911949 HRM2_46350 HRM2_46360     TRUE 0.881 -13.000 0.000 NA   NA
 5911949 5911950 HRM2_46360 HRM2_46370     TRUE 0.698 -76.000 0.000 NA   NA
 5911951 5911952 HRM2_46380 HRM2_46390     FALSE 0.100 153.000 0.000 NA   NA
 5911952 5911953 HRM2_46390 HRM2_46400     FALSE 0.037 230.000 0.000 NA   NA
 5911953 5911954 HRM2_46400 HRM2_46410   aapP2 TRUE 0.623 22.000 0.000 1.000   NA
 5911954 5911955 HRM2_46410 HRM2_46420 aapP2   TRUE 0.920 17.000 0.000 1.000 Y NA
 5911955 5911956 HRM2_46420 HRM2_46430     TRUE 0.990 3.000 0.000 0.009 Y NA
 5911956 5911957 HRM2_46430 HRM2_46440     TRUE 0.999 2.000 0.048 0.038 Y NA
 5911957 5911958 HRM2_46440 HRM2_46450   nodC FALSE 0.070 188.000 0.000 1.000 N NA
 5911960 5911961 HRM2_46470 HRM2_46480   ompA3 TRUE 0.980 22.000 0.125 1.000 N NA
 5911961 5911962 HRM2_46480 HRM2_46490 ompA3   TRUE 0.996 13.000 0.357 NA   NA
 5911962 5911963 HRM2_46490 HRM2_46500     FALSE 0.098 155.000 0.000 NA   NA
 5911963 5911964 HRM2_46500 HRM2_46510     TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 5911964 5911965 HRM2_46510 HRM2_46520   metX TRUE 0.999 -10.000 0.509 NA N NA
 5911966 5911967 HRM2_46530 HRM2_46540     TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5911967 5911968 HRM2_46540 HRM2_46550     TRUE 1.000 -22.000 0.780 0.002 Y NA
 5911968 5911969 HRM2_46550 HRM2_46560   rseC FALSE 0.200 101.000 0.000 NA N NA
 5911969 5911970 HRM2_46560 HRM2_46570 rseC   TRUE 0.636 -175.000 0.000 NA   NA
 5911971 5911972 HRM2_46580 HRM2_46590   uspA8 FALSE 0.174 118.000 0.000 NA   NA
 5911977 5911978 HRM2_46640 HRM2_46650     TRUE 1.000 -3.000 0.818 NA N NA
 5911978 5911979 HRM2_46650 HRM2_46660     TRUE 1.000 -3.000 0.818 NA Y NA
 5911979 5911980 HRM2_46660 HRM2_46670   mutY TRUE 0.482 37.000 0.000 1.000 N NA
 5911981 5911982 HRM2_46680 HRM2_46690 nrdA   FALSE 0.118 142.000 0.000 NA   NA
 5911984 5911985 HRM2_46710 HRM2_46720     TRUE 0.715 14.000 0.000 NA   NA
 5911985 5911986 HRM2_46720 HRM2_46730   braF FALSE 0.055 199.000 0.000 NA   NA
 5911986 5911987 HRM2_46730 HRM2_46740 braF   TRUE 0.999 -28.000 0.478 1.000 Y NA
 5911987 5911988 HRM2_46740 HRM2_46750     TRUE 1.000 -3.000 0.688 0.038 Y NA
 5911988 5911989 HRM2_46750 HRM2_46760     TRUE 0.998 11.000 0.188 1.000 Y NA
 5911992 5911993 HRM2_46790 HRM2_46800     FALSE 0.151 127.000 0.000 NA   NA
 5911994 5911995 HRM2_46810 HRM2_46820     TRUE 0.695 15.000 0.000 NA   NA
 5911995 5911996 HRM2_46820 HRM2_46830     FALSE 0.027 266.000 0.000 NA   NA
 5911996 5911997 HRM2_46830 HRM2_46840     FALSE 0.108 148.000 0.000 NA   NA
 5911997 5911998 HRM2_46840 HRM2_46850     TRUE 0.994 57.000 0.750 1.000   NA
 5911998 5911999 HRM2_46850 HRM2_46860     TRUE 1.000 16.000 0.750 0.093 Y NA
 5912000 5912001 HRM2_46870 HRM2_46880     FALSE 0.209 113.000 0.000 1.000   NA
 5912001 5912002 HRM2_46880 HRM2_46890     FALSE 0.017 314.000 0.000 NA   NA
 5912002 5912003 HRM2_46890 HRM2_46900     TRUE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 5912003 5912004 HRM2_46900 HRM2_46910     TRUE 0.991 6.000 0.062 NA   NA
 5912005 5912006 HRM2_46920 HRM2_46930     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5912006 5912007 HRM2_46930 HRM2_46940     FALSE 0.035 234.000 0.000 NA   NA
 5912009 5912010 HRM2_46960 HRM2_46970 rrfE rrlE FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 5912010 5912011 HRM2_46970 HRM2_46980 rrlE rrsE FALSE 0.017 319.000 0.000 NA   NA
 5912011 5912012 HRM2_46980 HRM2_46990 rrsE hdrD5 FALSE 0.007 507.000 0.000 NA   NA
 5912012 5912013 HRM2_46990 HRM2_47000 hdrD5   TRUE 0.868 51.000 0.000 0.031 Y NA
 5912013 5912014 HRM2_47000 HRM2_47010     TRUE 0.432 56.000 0.000 1.000   NA
 5912014 5912015 HRM2_47010 HRM2_47020     FALSE 0.021 314.000 0.000 1.000   NA
 5912015 5912016 HRM2_47020 HRM2_47030   rrfF FALSE 0.004 3069.000 0.000 NA   NA
 5912016 5912017 HRM2_47030 HRM2_47040 rrfF rrlF FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 5912017 5912018 HRM2_47040 HRM2_47050 rrlF rrsF FALSE 0.017 319.000 0.000 NA   NA
 5912019 5912020 HRM2_47060 HRM2_47070     TRUE 0.753 13.000 0.000 1.000 N NA
 5912020 5912021 HRM2_47070 HRM2_47080     TRUE 0.640 19.000 0.000 1.000 N NA
 5912021 5912022 HRM2_47080 HRM2_47090     FALSE 0.280 88.000 0.000 1.000 N NA
 5912022 5912023 HRM2_47090 HRM2_47100     TRUE 0.999 3.000 0.500 1.000   NA
 5912023 5912024 HRM2_47100 HRM2_47110     FALSE 0.352 76.000 0.000 1.000   NA
 5912026 5912027 HRM2_47130 HRM2_47140 fdhE2 fdhA8 FALSE 0.038 219.000 0.000 NA N NA
 5912027 5912028 HRM2_47140 HRM2_47150 fdhA8 fdhB8 TRUE 1.000 0.000 0.400 0.003 Y NA
 5912028 5912029 HRM2_47150 HRM2_47160 fdhB8   TRUE 0.594 25.000 0.000 1.000   NA
 5912029 5912030 HRM2_47160 HRM2_47170     FALSE 0.187 124.000 0.000 1.000   NA
 5912033 5912034 HRM2_47200 HRM2_47210 sucD4 acsM4 TRUE 0.610 46.000 0.000 0.042 N NA
 5912035 5912036 HRM2_47220 HRM2_47230 tapB   TRUE 0.838 6.000 0.000 NA N NA
 5912036 5912037 HRM2_47230 HRM2_47240     FALSE 0.010 413.000 0.000 NA   NA
 5912037 5912038 HRM2_47240 HRM2_47250     TRUE 0.997 3.000 0.103 NA   NA
 5912038 5912039 HRM2_47250 HRM2_47260   cbiQ3 TRUE 0.995 28.000 0.605 NA   NA
 5912039 5912040 HRM2_47260 HRM2_47270 cbiQ3 cbiO3 TRUE 1.000 -3.000 0.326 1.000 Y NA
 5912040 5912041 HRM2_47270 HRM2_47280 cbiO3 cbiO4 TRUE 1.000 -114.000 0.667 0.020 Y NA
 5912043 5912044 HRM2_47300 HRM2_47310     TRUE 0.528 29.000 0.000 1.000 N NA
 5912044 5912045 HRM2_47310 HRM2_47320     FALSE 0.198 111.000 0.000 1.000 N NA
 5912045 5912046 HRM2_47320 HRM2_47330     TRUE 0.992 21.000 0.093 1.000 Y NA
 5912046 5912047 HRM2_47330 HRM2_47340     TRUE 1.000 -3.000 0.640 1.000 Y NA
 5912047 5912048 HRM2_47340 HRM2_47350     TRUE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 5912048 5912049 HRM2_47350 HRM2_47360     FALSE 0.312 76.000 0.000 NA   NA
 5912051 5912052 HRM2_47380 HRM2_47390 uroD cobW TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000   NA
 5912052 5912053 HRM2_47390 HRM2_47400 cobW npdA FALSE 0.012 413.000 0.000 1.000   NA
 5912053 5912054 HRM2_47400 HRM2_47410 npdA   TRUE 0.663 19.000 0.000 1.000   NA
 5912055 5912056 HRM2_47420 HRM2_47430     FALSE 0.012 407.000 0.000 1.000 N NA
 5912056 5912057 HRM2_47430 HRM2_47440     TRUE 0.627 121.000 0.013 NA N NA
 5912057 5912058 HRM2_47440 HRM2_47450     TRUE 1.000 -3.000 0.449 NA N NA
 5912060 5912061 HRM2_47470 HRM2_47480 perM acd15 FALSE 0.331 72.000 0.000 NA   NA
 5912062 5912063 HRM2_47490 HRM2_47500 dctP11 dctQ11 FALSE 0.190 219.000 0.000 NA Y NA
 5912063 5912064 HRM2_47500 HRM2_47510 dctQ11 dctM11 TRUE 0.985 2.000 0.000 NA Y NA
 5912064 5912065 HRM2_47510 HRM2_47520 dctM11 prdF2 TRUE 0.711 15.000 0.000 1.000 N NA
 5912067 5912068 HRM2_47540 HRM2_47550     FALSE 0.089 163.000 0.000 NA   NA
 5912068 5912069 HRM2_47550 HRM2_47560     FALSE 0.294 80.000 0.000 NA   NA
 5912069 5912070 HRM2_47560 HRM2_47570   lplA FALSE 0.015 338.000 0.000 NA   NA
 5912070 5912071 HRM2_47570 HRM2_47580 lplA   FALSE 0.042 219.000 0.000 NA   NA
 5912072 5912073 HRM2_47590 HRM2_47600     TRUE 0.896 88.000 0.081 NA   NA
 5912073 5912074 HRM2_47600 HRM2_47610   pdhB TRUE 0.989 23.000 0.162 0.042   NA
 5912074 5912075 HRM2_47610 HRM2_47620 pdhB pdhA TRUE 0.991 40.000 0.076 0.001 Y NA
 5912075 5912076 HRM2_47620 HRM2_47630 pdhA   TRUE 0.982 13.000 0.065 NA   NA
 5912076 5912077 HRM2_47630 HRM2_47640   pdhC TRUE 0.928 48.000 0.059 NA   NA
 5912080 5912081 HRM2_47670 HRM2_47680     TRUE 0.860 14.000 0.000 0.030   NA
 5912081 5912082 HRM2_47680 HRM2_47690     FALSE 0.190 109.000 0.000 NA   NA
 5912082 5912083 HRM2_47690 HRM2_47700     TRUE 0.458 38.000 0.000 NA   NA
 5912084 5912085 HRM2_47710 HRM2_47720 nudC serA2 TRUE 0.486 36.000 0.000 1.000 N NA
 5912085 5912086 HRM2_47720 HRM2_47730 serA2   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5912086 5912087 HRM2_47730 HRM2_47740     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5912087 5912088 HRM2_47740 HRM2_47750   purF TRUE 0.844 9.000 0.000 1.000   NA
 5912088 5912089 HRM2_47750 HRM2_47760 purF carB2 TRUE 0.998 2.000 0.023 1.000 Y NA
 5912089 5912090 HRM2_47760 HRM2_47770 carB2 carA TRUE 1.000 0.000 0.345 0.001 Y NA
 5912090 5912091 HRM2_47770 HRM2_47780 carA   TRUE 0.848 33.000 0.000 1.000 Y NA
 5912091 5912092 HRM2_47780 HRM2_47790     TRUE 1.000 14.000 0.727 0.027 Y NA
 5912092 5912093 HRM2_47790 HRM2_47800     TRUE 0.999 -36.000 0.758 1.000   NA
 5912094 5912095 HRM2_47810 HRM2_47820 glnE fadD7 FALSE 0.280 88.000 0.000 1.000 N NA
 5912095 5912096 HRM2_47820 HRM2_47830 fadD7 fadD8 TRUE 0.776 94.000 0.000 0.003 Y NA
 5912097 5912098 HRM2_47840 HRM2_47850     FALSE 0.046 227.000 0.000 1.000   NA
 5912098 5912099 HRM2_47850 HRM2_47860   prfB TRUE 0.966 8.000 0.002 1.000   NA
 5912099 5912100 HRM2_47860 HRM2_47870 prfB   TRUE 0.560 137.000 0.011 1.000 N NA
 5912100 5912101 HRM2_47870 HRM2_47880     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5912101 5912102 HRM2_47880 HRM2_47890     FALSE 0.023 282.000 0.000 NA   NA
 5912103 5912104 HRM2_47900 HRM2_47910     FALSE 0.331 72.000 0.000 NA   NA
 5912110 5912111 HRM2_47970 HRM2_47980     FALSE 0.164 123.000 0.000 NA   NA
 5912111 5912112 HRM2_47980 HRM2_47990     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5912112 5912113 HRM2_47990 HRM2_48000     TRUE 0.819 9.000 0.000 NA   NA
 5912113 5912114 HRM2_48000 HRM2_48010     FALSE 0.004 1068.000 0.000 NA   NA
 5912114 5912115 HRM2_48010 HRM2_48020     FALSE 0.025 276.000 0.000 NA   NA
 5912115 5912116 HRM2_48020 HRM2_48050     FALSE 0.006 634.000 0.000 NA   NA
 5912116 5912117 HRM2_48050 HRM2_48060     FALSE 0.027 263.000 0.000 NA   NA
 5912117 5912118 HRM2_48060 HRM2_48070     FALSE 0.214 102.000 0.000 NA   NA
 5912119 5912120 HRM2_48080 HRM2_48090     FALSE 0.376 60.000 0.000 NA   NA
 5912120 5912121 HRM2_48090 HRM2_48100   ispB TRUE 0.961 10.000 0.004 NA   NA
 5912121 5912122 HRM2_48100 HRM2_48110 ispB   TRUE 0.994 -3.000 0.007 1.000 N NA
 5912122 5912123 HRM2_48110 HRM2_48120   htpG TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5912124 5912125 HRM2_48130 HRM2_48140   tkt1 TRUE 0.444 90.000 0.000 0.042   NA
 5912127 5912128 HRM2_48160 HRM2_48170     FALSE 0.036 233.000 0.000 NA   NA
 5912128 5912129 HRM2_48170 HRM2_48180     TRUE 0.999 13.000 0.500 NA Y NA
 5912129 5912130 HRM2_48180 HRM2_48190     TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA Y NA
 5912130 5912131 HRM2_48190 HRM2_48200     FALSE 0.400 65.000 0.000 1.000   NA
 5912133 5912134 HRM2_48220 HRM2_48230 zitB   FALSE 0.018 319.000 0.000 1.000 N NA
 5912134 5912135 HRM2_48230 HRM2_48240     TRUE 0.637 120.000 0.011 NA   NA
 5912135 5912136 HRM2_48240 HRM2_48250     TRUE 0.746 126.000 0.051 NA   NA
 5912136 5912137 HRM2_48250 HRM2_48260     TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5912137 5912138 HRM2_48260 HRM2_48270   trxA3 TRUE 0.583 26.000 0.000 1.000   NA
 5912138 5912139 HRM2_48270 HRM2_48280 trxA3   TRUE 0.999 2.000 0.202 1.000   NA
 5912140 5912141 HRM2_48290 HRM2_48300 istB3 istA5 TRUE 0.987 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5912141 5912142 HRM2_48300 HRM2_48310 istA5   TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5912142 5912143 HRM2_48310 HRM2_48320     TRUE 0.804 -31.000 0.000 NA   NA
 5912143 5912144 HRM2_48320 HRM2_48330   blc FALSE 0.020 295.000 0.000 NA   NA
 5912144 5912145 HRM2_48330 HRM2_48340 blc   FALSE 0.176 117.000 0.000 NA   NA
 5912145 5912146 HRM2_48340 HRM2_48350     FALSE 0.129 136.000 0.000 NA   NA
 5912146 5912147 HRM2_48350 HRM2_48360   tolC FALSE 0.033 242.000 0.000 NA   NA
 5912147 5912148 HRM2_48360 HRM2_48370 tolC nolG TRUE 0.973 36.000 0.152 1.000 N NA
 5912148 5912149 HRM2_48370 HRM2_48380 nolG   TRUE 0.997 49.000 0.853 0.075 N NA
 5912149 5912150 HRM2_48380 HRM2_48390     FALSE 0.015 370.000 0.000 1.000   NA
 5912150 5912151 HRM2_48390 HRM2_48400     TRUE 0.988 8.000 0.043 1.000   NA
 5912152 5912153 HRM2_48410 HRM2_48420 fadB fadA TRUE 0.999 13.000 0.588 1.000 Y NA
 5912153 5912154 HRM2_48420 HRM2_48430 fadA   FALSE 0.130 140.000 0.000 1.000 N NA
 5912156 5912157 HRM2_48450 HRM2_48460     FALSE 0.235 100.000 0.000 1.000 N NA
 5912157 5912158 HRM2_48460 HRM2_48470     FALSE 0.044 206.000 0.000 NA N NA
 5912158 5912159 HRM2_48470 HRM2_48480   hgdB2 FALSE 0.026 257.000 0.000 NA N NA
 5912160 5912161 HRM2_48490 HRM2_48500     TRUE 0.494 74.000 0.000 0.046 N NA
 5912161 5912162 HRM2_48500 HRM2_48510     TRUE 0.966 3.000 0.000 0.003   NA
 5912162 5912163 HRM2_48510 HRM2_48520     TRUE 0.999 -3.000 0.071 0.075   NA
 5912164 5912165 HRM2_48530 HRM2_48540     TRUE 0.501 30.000 0.000 NA   NA
 5912165 5912166 HRM2_48540 HRM2_48550     TRUE 0.550 25.000 0.000 NA   NA
 5912166 5912167 HRM2_48550 HRM2_48560     FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 5912167 5912168 HRM2_48560 HRM2_48570     TRUE 0.463 37.000 0.000 NA   NA
 5912168 5912169 HRM2_48570 HRM2_48580     FALSE 0.190 109.000 0.000 NA   NA
 5912169 5912170 HRM2_48580 HRM2_48590     FALSE 0.110 159.000 0.000 1.000   NA
 5912173 5912174 HRM2_48620 HRM2_48630     TRUE 0.994 -3.000 0.007 1.000   NA
 5912174 5912175 HRM2_48630 HRM2_48640     FALSE 0.061 193.000 0.000 NA   NA
 5912177 5912178 HRM2_48660 HRM2_48670     TRUE 0.420 47.000 0.000 NA   NA
 5912178 5912179 HRM2_48670 HRM2_48680   etfA4 TRUE 0.784 11.000 0.000 NA   NA
 5912179 5912180 HRM2_48680 HRM2_48690 etfA4 etfB4 TRUE 1.000 -3.000 0.250 0.013 Y NA
 5912180 5912181 HRM2_48690 HRM2_48700 etfB4 acd16 TRUE 0.997 12.000 0.250 0.045 N NA
 5912181 5912182 HRM2_48700 HRM2_48710 acd16   FALSE 0.113 145.000 0.000 NA   NA
 5912182 5912183 HRM2_48710 HRM2_48720   livF6 FALSE 0.214 102.000 0.000 NA   NA
 5912183 5912184 HRM2_48720 HRM2_48730 livF6 livG5 TRUE 0.984 -16.000 0.000 0.019 Y NA
 5912184 5912185 HRM2_48730 HRM2_48740 livG5 livM5 TRUE 0.975 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5912185 5912186 HRM2_48740 HRM2_48750 livM5 livH5 TRUE 0.990 3.000 0.000 0.037 Y NA
 5912186 5912187 HRM2_48750 HRM2_48760 livH5 livK2 TRUE 0.843 35.000 0.000 1.000 Y NA
 5912187 5912188 HRM2_48760 HRM2_48770 livK2 argE TRUE 0.826 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5912188 5912189 HRM2_48770 HRM2_48780 argE   TRUE 0.496 40.000 0.000 1.000   NA
 5912189 5912190 HRM2_48780 HRM2_48790     FALSE 0.011 396.000 0.000 NA   NA
 5912190 5912191 HRM2_48790 HRM2_48800     FALSE 0.012 380.000 0.000 NA   NA
 5912191 5912192 HRM2_48800 HRM2_48810     TRUE 0.448 41.000 0.000 NA   NA
 5912192 5912193 HRM2_48810 HRM2_48820     TRUE 0.443 42.000 0.000 NA   NA
 5912196 5912197 HRM2_48850 HRM2_48860     FALSE 0.021 290.000 0.000 NA   NA
 5912197 5912198 HRM2_48860 HRM2_48870     TRUE 0.909 3.000 0.000 NA   NA
 5912198 5912199 HRM2_48870 HRM2_48880     TRUE 0.944 0.000 0.000 NA   NA
 5912199 5912200 HRM2_48880 HRM2_48890     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5912201 5912202 HRM2_48900 HRM2_48910     TRUE 0.455 39.000 0.000 NA   NA
 5912202 5912203 HRM2_48910 HRM2_48920     TRUE 0.649 -124.000 0.000 NA   NA
 5912204 5912205 HRM2_48930 HRM2_48940   hipA TRUE 0.999 -3.000 0.200 NA   NA
 5912205 5912206 HRM2_48940 HRM2_48950 hipA   TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5912208 5912209 HRM2_48970 HRM2_48980 higA   TRUE 0.996 13.000 0.338 NA   NA
 5912210 5912211 HRM2_48990 HRM2_49000     FALSE 0.020 298.000 0.000 NA   NA
 5912211 5912212 HRM2_49000 HRM2_49010   prkC FALSE 0.074 340.000 0.000 NA Y NA
 5912212 5912213 HRM2_49010 HRM2_49020 prkC   TRUE 0.997 2.000 0.111 NA   NA
 5912213 5912214 HRM2_49020 HRM2_49030     TRUE 1.000 -7.000 0.750 NA   NA
 5912214 5912215 HRM2_49030 HRM2_49040     TRUE 1.000 4.000 0.875 NA   NA
 5912215 5912216 HRM2_49040 HRM2_49050     TRUE 1.000 0.000 0.714 NA   NA
 5912216 5912217 HRM2_49050 HRM2_49060     TRUE 1.000 2.000 0.667 NA   NA
 5912217 5912218 HRM2_49060 HRM2_49070     TRUE 1.000 -3.000 0.500 NA   NA
 5912218 5912219 HRM2_49070 HRM2_49080     TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 5912219 5912220 HRM2_49080 HRM2_49090   hsdS3 TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5912220 5912221 HRM2_49090 HRM2_49100 hsdS3 hsdM3 TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.037   NA
 5912221 5912222 HRM2_49100 HRM2_49110 hsdM3   TRUE 0.969 58.000 0.200 NA   NA
 5912222 5912223 HRM2_49110 HRM2_49120     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   NA
 5912223 5912224 HRM2_49120 HRM2_49130     FALSE 0.016 324.000 0.000 NA   NA
 5912224 5912225 HRM2_49130 HRM2_49140     TRUE 0.985 25.000 0.214 NA   NA
 5912225 5912226 HRM2_49140 HRM2_49150     TRUE 0.998 18.000 0.750 NA   NA
 5912226 5912227 HRM2_49150 HRM2_49160     TRUE 0.999 -3.000 0.333 NA   NA
 5912227 5912228 HRM2_49160 HRM2_49170     FALSE 0.005 756.000 0.000 NA   NA
 5912231 5912232 HRM2_49200 HRM2_49210 dppA4 dppB3 TRUE 0.952 381.000 0.848 0.037 Y NA
 5912232 5912233 HRM2_49210 HRM2_49220 dppB3 dppC3 TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.037 Y NA
 5912233 5912234 HRM2_49220 HRM2_49230 dppC3 oppD TRUE 1.000 7.000 0.543 1.000 Y NA
 5912234 5912235 HRM2_49230 HRM2_49240 oppD appF2 TRUE 1.000 4.000 0.667 0.002 Y NA
 5912235 5912236 HRM2_49240 HRM2_49250 appF2   TRUE 0.633 17.000 0.000 NA N NA
 5912236 5912237 HRM2_49250 HRM2_49260     TRUE 1.000 5.000 0.875 NA Y NA
 5912237 5912238 HRM2_49260 HRM2_49270     TRUE 1.000 14.000 0.854 NA Y NA
 5912238 5912239 HRM2_49270 HRM2_49280     TRUE 0.996 -10.000 0.089 NA   NA
 5912240 5912241 HRM2_49290 HRM2_49300     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 5912241 5912242 HRM2_49300 HRM2_49310     FALSE 0.034 310.000 0.000 0.075 N NA
 5912244 5912245 HRM2_49330 HRM2_49340 pflD2 pflC2 TRUE 0.998 37.000 0.889 0.001 N NA
 5912245 5912246 HRM2_49340 HRM2_49350 pflC2 ogt TRUE 0.624 20.000 0.000 1.000 N NA
 5912246 5912247 HRM2_49350 HRM2_49360 ogt   TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 5912247 5912248 HRM2_49360 HRM2_49370   recD3 FALSE 0.283 83.000 0.000 NA   NA
 5912248 5912249 HRM2_49370 HRM2_49380 recD3 gmhB TRUE 0.975 -42.000 0.023 1.000 N NA
 5912249 5912250 HRM2_49380 HRM2_49390 gmhB   TRUE 0.986 4.000 0.016 NA N NA
 5912250 5912251 HRM2_49390 HRM2_49400   lonA TRUE 0.992 0.000 0.010 NA N NA
 5912251 5912252 HRM2_49400 HRM2_49410 lonA   TRUE 0.989 26.000 0.089 NA Y NA
 5912252 5912253 HRM2_49410 HRM2_49420     FALSE 0.193 103.000 0.000 NA N NA
 5912253 5912254 HRM2_49420 HRM2_49430   porA4 FALSE 0.293 75.000 0.000 NA N NA
 5912255 5912256 HRM2_49440 HRM2_49450     TRUE 0.998 6.000 0.343 NA   NA
 5912256 5912257 HRM2_49450 HRM2_49460     FALSE 0.006 622.000 0.000 NA   NA
 5912257 5907317 HRM2_49460 HRM2_00010   dnaN FALSE 0.005 759.000 0.000 NA   NA
 5907241 5907242 HRM2_p00010 HRM2_p00020 parA   TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 5907243 5907244 HRM2_p00030 HRM2_p00040     TRUE 0.713 -66.000 0.000 NA   NA
 5907247 5907248 HRM2_p00070 HRM2_p00080     FALSE 0.235 96.000 0.000 NA   NA
 5907249 5907250 HRM2_p00090 HRM2_p00100     FALSE 0.010 413.000 0.000 NA   NA
 5907252 5907253 HRM2_p00120 HRM2_p00130     FALSE 0.048 208.000 0.000 NA   NA
 5907254 5907255 HRM2_p00140 HRM2_p00150     TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5907256 5907257 HRM2_p00160 HRM2_p00170   istB TRUE 0.844 9.000 0.000 1.000   NA
 5907257 5907258 HRM2_p00170 HRM2_p00180 istB istA TRUE 0.999 -7.000 0.500 1.000   NA
 5907258 5907259 HRM2_p00180 HRM2_p00190 istA parB TRUE 0.887 -43.000 0.000 0.037   NA
 5907259 5907260 HRM2_p00190 HRM2_p00200 parB   FALSE 0.269 87.000 0.000 NA   NA
 5907261 5907262 HRM2_p00210 HRM2_p00220     FALSE 0.007 571.000 0.000 NA   NA
 5907262 5907263 HRM2_p00220 HRM2_p00230     TRUE 0.675 16.000 0.000 NA   NA
 5907263 5907264 HRM2_p00230 HRM2_p00240   resE TRUE 0.969 -7.000 0.000 0.018   NA
 5907264 5907265 HRM2_p00240 HRM2_p00250 resE   FALSE 0.016 585.000 0.000 0.018   NA
 5907265 5907266 HRM2_p00250 HRM2_p00260   cin FALSE 0.010 423.000 0.000 1.000 N NA
 5907267 5907268 HRM2_p00270 HRM2_p00280     TRUE 0.999 6.000 0.571 NA   NA
 5907268 5907269 HRM2_p00280 HRM2_p00290     TRUE 0.483 33.000 0.000 NA   NA
 5907269 5907270 HRM2_p00290 HRM2_p00300     FALSE 0.171 120.000 0.000 NA   NA
 5907270 5907271 HRM2_p00300 HRM2_p00310     TRUE 0.616 61.000 0.000 0.006   NA
 5907273 5907274 HRM2_p00330 HRM2_p00340   rpfC TRUE 0.644 126.000 0.000 0.018 Y NA
 5907274 5907275 HRM2_p00340 HRM2_p00350 rpfC   TRUE 0.622 19.000 0.000 NA   NA
 5907275 5907276 HRM2_p00350 HRM2_p00360     FALSE 0.079 171.000 0.000 NA   NA
 5907277 5907278 HRM2_p00370 HRM2_p00380 resR   FALSE 0.015 594.000 0.000 0.037   NA
 5907278 5907279 HRM2_p00380 HRM2_p00390     TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.037   NA
 5907279 5907280 HRM2_p00390 HRM2_p00400     TRUE 0.999 -10.000 0.565 NA   NA
 5907280 5907281 HRM2_p00400 HRM2_p00410     TRUE 0.992 17.000 0.253 NA   NA
 5907281 5907282 HRM2_p00410 HRM2_p00420     TRUE 1.000 2.000 0.418 0.037   NA
 5907283 5907284 HRM2_p00430 HRM2_p00440     FALSE 0.076 189.000 0.000 1.000   NA
 5907286 5907287 HRM2_p00460 HRM2_p00470 parE   TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 5907287 5907288 HRM2_p00470 HRM2_p00480     FALSE 0.380 59.000 0.000 NA   NA
 5907288 5907289 HRM2_p00480 HRM2_p00490     FALSE 0.012 378.000 0.000 NA   NA
 5907289 5907290 HRM2_p00490 HRM2_p00500     FALSE 0.018 304.000 0.000 NA   NA
 5907290 5907291 HRM2_p00500 HRM2_p00510     FALSE 0.005 771.000 0.000 NA   NA
 5907291 5907292 HRM2_p00510 HRM2_p00520     FALSE 0.076 189.000 0.000 1.000   NA
 5907292 5907293 HRM2_p00520 HRM2_p00530     FALSE 0.015 328.000 0.000 NA   NA
 5907293 5907294 HRM2_p00530 HRM2_p00540     TRUE 0.903 -10.000 0.000 NA   NA
 5907294 5907295 HRM2_p00540 HRM2_p00550   binR FALSE 0.380 59.000 0.000 NA   NA
 5907295 5907296 HRM2_p00550 HRM2_p00560 binR   FALSE 0.012 378.000 0.000 NA   NA
 5907296 5907297 HRM2_p00560 HRM2_p00570     FALSE 0.018 304.000 0.000 NA   NA
 5907297 5907298 HRM2_p00570 HRM2_p00580     FALSE 0.165 122.000 0.000 NA   NA
 5907298 5907299 HRM2_p00580 HRM2_p00590     FALSE 0.336 71.000 0.000 NA   NA
 5907299 5907300 HRM2_p00590 HRM2_p00600     FALSE 0.262 89.000 0.000 NA   NA
 5907300 5907301 HRM2_p00600 HRM2_p00610     TRUE 0.859 -16.000 0.000 NA   NA
 5907301 5907302 HRM2_p00610 HRM2_p00620     FALSE 0.196 107.000 0.000 NA   NA
 5907302 5907303 HRM2_p00620 HRM2_p00630     TRUE 0.642 18.000 0.000 NA   NA
 5907303 5907304 HRM2_p00630 HRM2_p00640     FALSE 0.090 162.000 0.000 NA   NA
 5907304 5907305 HRM2_p00640 HRM2_p00650     TRUE 0.997 10.000 0.303 NA   NA
 5907305 5907306 HRM2_p00650 HRM2_p00660     FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5907308 5907309 HRM2_p00680 HRM2_p00690     FALSE 0.079 171.000 0.000 NA   NA
 5907309 5907310 HRM2_p00690 HRM2_p00700     TRUE 0.983 10.000 0.041 NA   NA
 5907310 5907311 HRM2_p00700 HRM2_p00710     FALSE 0.006 619.000 0.000 NA   NA
 5907311 5907312 HRM2_p00710 HRM2_p00720   linF FALSE 0.030 253.000 0.000 NA   NA
 5907312 5907313 HRM2_p00720 HRM2_p00730 linF polC FALSE 0.138 142.000 0.000 1.000   NA
 5907313 5907314 HRM2_p00730 HRM2_p00740 polC   FALSE 0.008 473.000 0.000 NA   NA
 5907314 5907315 HRM2_p00740 HRM2_p00750     FALSE 0.006 616.000 0.000 NA   NA
 5907315 5907316 HRM2_p00750 HRM2_p00760     FALSE 0.024 277.000 0.000 NA   NA