MicrobesOnline Operon Predictions for Xylella fastidiosa Temecula1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 324818 324819 PD0001 PD0002 dnaA dnaN TRUE 0.903 282.000 0.328 1.000 Y NA
 324819 324820 PD0002 PD0003 dnaN recF TRUE 0.883 306.000 0.318 1.000 Y NA
 324820 324821 PD0003 PD0004 recF   FALSE 0.116 254.000 0.000 NA   NA
 324821 324822 PD0004 PD0005   gyrB TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 324822 324823 PD0005 PD0006 gyrB   FALSE 0.321 201.000 0.005 NA   NA
 324823 324824 PD0006 PD0007     TRUE 0.852 65.000 0.079 NA   NA
 324824 324825 PD0007 PD0008     TRUE 0.730 104.000 0.063 1.000 N NA
 324825 324826 PD0008 PD0009   tonB FALSE 0.186 444.000 0.095 1.000 N NA
 324826 324827 PD0009 PD0010 tonB exbB TRUE 0.979 96.000 0.600 0.019 N NA
 324827 324828 PD0010 PD0011 exbB exbD1 TRUE 0.996 57.000 0.600 0.040 Y NA
 324828 324829 PD0011 PD0012 exbD1 exbD2 TRUE 0.999 7.000 0.857 0.028 Y NA
 324829 324830 PD0012 PD0013 exbD2   FALSE 0.013 718.000 0.000 0.098 N NA
 324830 324831 PD0013 PD0014     FALSE 0.490 55.000 0.000 NA   NA
 324831 324832 PD0014 PD0015   hemF FALSE 0.281 230.000 0.006 NA   NA
 324835 324836 PD0019 PD0020 fimT pilV TRUE 0.989 10.000 0.139 NA Y NA
 324836 324837 PD0020 PD0021 pilV   TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA Y NA
 324837 324838 PD0021 PD0022   pilX TRUE 0.999 -3.000 0.615 NA Y NA
 324838 324839 PD0022 PD0023 pilX pilY1 TRUE 0.994 24.000 0.346 NA Y NA
 324839 324840 PD0023 PD0024 pilY1 pilE TRUE 0.994 27.000 0.346 1.000 Y NA
 324843 324844 PD0027 PD0028 mscL   FALSE 0.070 328.000 0.000 NA   NA
 324845 324846 PD0029 PD0030     TRUE 0.679 15.000 0.000 NA   NA
 324846 324847 PD0030 PD0031   comJ FALSE 0.234 183.000 0.000 NA   NA
 324847 324848 PD0031 PD0032 comJ   FALSE 0.050 594.000 0.007 1.000   NA
 324848 324849 PD0032 PD0033   mfd FALSE 0.427 68.000 0.002 1.000 N NA
 324849 2155319 PD0033 PD0034 mfd aroQ FALSE 0.006 622.000 0.000 1.000 N NA
 2155319 324851 PD0034 PD0035 aroQ accB TRUE 0.926 63.000 0.254 1.000 N NA
 324851 324852 PD0035 PD0036 accB accC TRUE 0.990 58.000 0.275 0.002 Y NA
 324854 324855 PD0038 PD0039 hmpA   FALSE 0.008 1850.000 0.000 NA   NA
 324855 324856 PD0039 PD0040   pdxJ TRUE 0.907 -3.000 0.009 NA   NA
 324857 324858 PD0041 PD0042 korB comF FALSE 0.010 1102.000 0.000 1.000   NA
 324859 324860 PD0043 PD0044 bioB   FALSE 0.054 395.000 0.000 1.000   NA
 324860 324861 PD0044 PD0045     FALSE 0.047 418.000 0.000 NA   NA
 398881 2155320 PD0047 PD0048 tRNA-Arg   FALSE 0.008 4067.000 0.000 NA   NA
 2155320 398882 PD0048 PD0049   tRNA-Ala FALSE 0.398 107.000 0.000 NA   NA
 398882 398883 PD0049 PD0050 tRNA-Ala tRNA-Ile TRUE 0.687 14.000 0.000 NA   NA
 398883 407064 PD0050 PD0051 tRNA-Ile rrl FALSE 0.209 193.000 0.000 NA   NA
 407064 2155321 PD0051 PD0052 rrl   FALSE 0.368 128.000 0.000 NA   NA
 2155321 324863 PD0052 PD0053   mutM FALSE 0.398 105.000 0.000 NA   NA
 324865 324866 PD0055 PD0056 ffh   FALSE 0.072 324.000 0.000 NA   NA
 324866 324867 PD0056 PD0057     FALSE 0.538 43.000 0.000 NA   NA
 2155322 10784588 PD0058 PD0059 mrkD   FALSE 0.020 654.000 0.000 NA   NA
 10784588 324869 PD0059 PD0060   fimD FALSE 0.149 232.000 0.000 NA   NA
 324869 324870 PD0060 PD0061 fimD   TRUE 0.981 219.000 0.667 1.000 Y NA
 324870 324871 PD0061 PD0062     TRUE 0.843 72.000 0.000 1.000 Y NA
 324871 324872 PD0062 PD0063     FALSE 0.008 1608.000 0.000 NA   NA
 324872 324873 PD0063 PD0064   kgtP FALSE 0.432 80.000 0.000 NA   NA
 324873 324874 PD0064 PD0065 kgtP   TRUE 0.643 49.000 0.000 0.066   NA
 324874 324875 PD0065 PD0066   hfq TRUE 0.957 15.000 0.141 1.000   NA
 324875 324876 PD0066 PD0067 hfq miaA TRUE 0.974 104.000 0.531 1.000   NA
 324876 324877 PD0067 PD0068 miaA folP TRUE 0.844 0.000 0.009 1.000 N NA
 324879 324880 PD0070 PD0071 hflB ftsJ TRUE 0.812 47.000 0.066 NA N NA
 324881 324882 PD0072 PD0073     TRUE 0.845 19.000 0.014 NA   NA
 2155323 324885 PD0075 PD0076     TRUE 0.955 1.000 0.058 NA   NA
 324885 324886 PD0076 PD0077     TRUE 0.966 -19.000 0.050 NA Y NA
 324888 324889 PD0079 PD0080 kdtA   FALSE 0.053 384.000 0.000 0.023 N NA
 324889 324890 PD0080 PD0081   rpsP FALSE 0.059 216.000 0.000 1.000 N NA
 324890 324891 PD0081 PD0082 rpsP rimM TRUE 0.993 44.000 0.342 0.031 Y NA
 324891 324892 PD0082 PD0083 rimM trmD TRUE 0.994 110.000 0.672 1.000 Y NA
 324892 324893 PD0083 PD0084 trmD rplS TRUE 0.986 165.000 0.567 1.000 Y NA
 324893 2155324 PD0084 PD0085 rplS map FALSE 0.244 424.000 0.000 1.000 Y NA
 2155324 2155325 PD0085 PD0086 map dapD FALSE 0.004 740.000 0.000 1.000 N NA
 2155325 324896 PD0086 PD0087 dapD   TRUE 0.893 15.000 0.061 1.000 N NA
 324896 324897 PD0087 PD0088   dapE TRUE 0.878 156.000 0.292 1.000 N NA
 324897 324898 PD0088 PD0089 dapE asnB FALSE 0.273 402.000 0.000 1.000 Y NA
 324900 324901 PD0091 PD0092   lexA FALSE 0.037 473.000 0.000 1.000   NA
 324901 324902 PD0092 PD0093 lexA recA FALSE 0.352 182.000 0.005 0.074 N NA
 324902 324903 PD0093 PD0094 recA alaS FALSE 0.114 488.000 0.054 1.000 N NA
 324903 324904 PD0094 PD0095 alaS csrA FALSE 0.501 139.000 0.020 1.000 N NA
 324904 398884 PD0095 PD0096 csrA tRNA-Ser FALSE 0.432 80.000 0.000 NA   NA
 324905 324906 PD0097 PD0098 prlC cysK TRUE 0.932 60.000 0.028 1.000 Y NA
 2155326 324908 PD0099 PD0100   copA TRUE 0.980 88.000 0.600 NA   NA
 324908 324909 PD0100 PD0101 copA copB TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.004 N NA
 324910 324911 PD0102 PD0103 valS   TRUE 0.651 53.000 0.002 1.000   NA
 324911 324912 PD0103 PD0104   holC TRUE 0.652 63.000 0.006 1.000   NA
 324912 324913 PD0104 PD0105 holC   TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 324913 324914 PD0105 PD0106   pepA TRUE 0.582 -21.000 0.000 NA   NA
 324915 324916 PD0107 PD0108     TRUE 0.997 -3.000 0.631 0.065   NA
 324918 324919 PD0110 PD0111 glmS   FALSE 0.031 274.000 0.000 1.000 N NA
 324922 2155327 PD0114 PD0115 ydfG   TRUE 0.645 129.000 0.018 NA   NA
 2155327 324924 PD0115 PD0116   argS TRUE 0.827 40.000 0.062 NA N NA
 324924 324925 PD0116 PD0117 argS radC FALSE 0.378 127.000 0.005 1.000 N NA
 324926 324927 PD0118 PD0119 dfp dnaS TRUE 0.978 -3.000 0.201 1.000 N NA
 324927 2155328 PD0119 PD0120 dnaS algC FALSE 0.029 1154.000 0.039 1.000 N NA
 324929 324930 PD0121 PD0122   pyrE TRUE 0.641 131.000 0.018 NA   NA
 324930 324931 PD0122 PD0123 pyrE   FALSE 0.191 201.000 0.000 NA   NA
 324934 324935 PD0126 PD0127     FALSE 0.212 192.000 0.000 NA   NA
 324935 324936 PD0127 PD0128   exoA FALSE 0.014 811.000 0.000 NA   NA
 324936 324937 PD0128 PD0129 exoA ampG TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 324938 2155329 PD0130 PD0131     TRUE 0.893 64.000 0.184 NA N NA
 324940 2155330 PD0132 PD0133 tyrS   FALSE 0.023 591.000 0.000 NA   NA
 2155330 398885 PD0133 PD0134   tRNA-Ala FALSE 0.398 107.000 0.000 NA   NA
 398885 398886 PD0134 PD0135 tRNA-Ala tRNA-Ile TRUE 0.687 14.000 0.000 NA   NA
 398886 407065 PD0135 PD0136 tRNA-Ile rrl FALSE 0.209 193.000 0.000 NA   NA
 407065 2155331 PD0136 PD0137 rrl   FALSE 0.368 128.000 0.000 NA   NA
 2155331 324941 PD0137 PD0138   mutM FALSE 0.398 105.000 0.000 NA   NA
 324945 324946 PD0142 PD0143 prfC   TRUE 0.639 83.000 0.008 1.000   NA
 324947 324948 PD0144 PD0145   yjjV FALSE 0.030 271.000 0.000 NA N NA
 324949 324950 PD0146 PD0147     FALSE 0.013 821.000 0.000 NA   NA
 324951 324952 PD0148 PD0149 gcvH gcvT TRUE 0.789 531.000 0.317 0.003 Y NA
 324952 324953 PD0149 PD0150 gcvT   FALSE 0.355 152.000 0.008 NA N NA
 324953 324954 PD0150 PD0151     TRUE 0.997 1.000 0.313 NA Y NA
 324954 324955 PD0151 PD0152     FALSE 0.079 311.000 0.000 1.000   NA
 324955 2155333 PD0152 PD0153   cysQ TRUE 0.757 34.000 0.007 1.000   NA
 2155333 324957 PD0153 PD0154 cysQ   TRUE 0.990 -3.000 0.373 1.000 N NA
 324958 324959 PD0155 PD0156 bioA   TRUE 0.906 -9.000 0.041 NA   NA
 324959 324960 PD0156 PD0157   rhlE FALSE 0.008 1603.000 0.000 NA   NA
 324960 324961 PD0157 PD0158 rhlE ygcM TRUE 0.683 81.000 0.035 1.000 N NA
 324964 324965 PD0161 PD0162     FALSE 0.089 291.000 0.000 NA   NA
 324967 324968 PD0164 PD0165 accA dnaE TRUE 0.814 95.000 0.122 1.000 N NA
 324968 324969 PD0165 PD0166 dnaE purC FALSE 0.028 289.000 0.000 1.000 N NA
 324970 324971 PD0167 PD0168   rpe TRUE 0.775 45.000 0.015 1.000   NA
 324973 324974 PD0170 PD0171 trpE trpD TRUE 0.973 158.000 0.230 0.003 Y NA
 324974 324975 PD0171 PD0172 trpD trpD TRUE 0.960 69.000 0.105 1.000 Y NA
 324975 324976 PD0172 PD0173 trpD trpC TRUE 0.983 79.000 0.293 1.000 Y NA
 324976 324977 PD0173 PD0174 trpC   TRUE 0.979 -3.000 0.010 NA Y NA
 324977 324978 PD0174 PD0175   prsX FALSE 0.003 993.000 0.000 NA N NA
 324979 324980 PD0177 PD0178 pepQ   TRUE 0.651 174.000 0.051 NA   NA
 324980 324981 PD0178 PD0179     TRUE 0.992 39.000 0.750 NA   NA
 324981 324982 PD0179 PD0180   tgt FALSE 0.039 452.000 0.000 NA   NA
 324982 324983 PD0180 PD0181 tgt yajC TRUE 0.900 150.000 0.325 NA N NA
 324983 324984 PD0181 PD0182 yajC secD TRUE 0.966 46.000 0.083 NA Y NA
 324984 324985 PD0182 PD0183 secD secF TRUE 0.987 20.000 0.084 0.001 Y NA
 324986 324987 PD0185 PD0186 pcnB folK TRUE 0.900 102.000 0.234 1.000 N NA
 324987 324988 PD0186 PD0187 folK panB TRUE 0.977 33.000 0.117 1.000 Y NA
 324988 324989 PD0187 PD0188 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 324989 324990 PD0188 PD0189 panC panD TRUE 0.987 83.000 0.342 1.000 Y NA
 324990 324991 PD0189 PD0190 panD pgi TRUE 0.827 4.000 0.011 1.000 N NA
 324991 398887 PD0190 PD0191 pgi tRNA-Met FALSE 0.010 1067.000 0.000 NA   NA
 398887 324992 PD0191 PD0192 tRNA-Met   FALSE 0.024 573.000 0.000 NA   NA
 324992 324993 PD0192 PD0193   nusA TRUE 0.997 -3.000 0.759 NA   NA
 324993 324994 PD0193 PD0194 nusA infB TRUE 0.938 96.000 0.342 1.000 N NA
 324994 324995 PD0194 PD0195 infB rbfA TRUE 0.991 110.000 0.530 1.000 Y NA
 324995 324996 PD0195 PD0196 rbfA truB TRUE 0.984 91.000 0.318 1.000 Y NA
 324996 324997 PD0196 PD0197 truB rpsO TRUE 0.948 179.000 0.211 1.000 Y NA
 324997 324998 PD0197 PD0198 rpsO pnp TRUE 0.985 96.000 0.335 1.000 Y NA
 325001 325002 PD0201 PD0202 yerP mexC TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA N NA
 325002 325003 PD0202 PD0203 mexC   FALSE 0.009 1303.000 0.000 NA   NA
 325005 325006 PD0205 PD0206 deaD etfA FALSE 0.026 298.000 0.000 1.000 N NA
 325006 325007 PD0206 PD0207 etfA etfB TRUE 0.998 -3.000 0.316 0.013 Y NA
 325008 325009 PD0208 PD0209 rfbB rfbA TRUE 0.977 63.000 0.143 0.007 Y NA
 325009 325010 PD0209 PD0210 rfbA rfbD TRUE 0.994 -3.000 0.163 1.000 Y NA
 325010 325011 PD0210 PD0211 rfbD rmlD TRUE 0.989 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 325012 325013 PD0212 PD0213 xanB xanA TRUE 0.974 53.000 0.500 1.000 N NA
 325016 325017 PD0216 PD0217     FALSE 0.018 688.000 0.000 NA   NA
 325017 2155334 PD0217 PD0218   pspB FALSE 0.008 1873.000 0.000 NA   NA
 325019 325020 PD0219 PD0220     FALSE 0.012 881.000 0.000 NA   NA
 325020 325021 PD0220 PD0221   pfkA FALSE 0.048 414.000 0.000 NA   NA
 325022 325023 PD0222 PD0223 adk mpL FALSE 0.027 295.000 0.000 1.000 N NA
 325026 325027 PD0226 PD0227 pepA yueF FALSE 0.380 124.000 0.000 NA   NA
 325027 325028 PD0227 PD0228 yueF   TRUE 0.988 20.000 0.455 NA   NA
 325028 325029 PD0228 PD0229     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 325029 325030 PD0229 PD0230     TRUE 0.991 57.000 0.857 NA   NA
 325030 2155335 PD0230 PD0231   htrA TRUE 0.658 255.000 0.192 NA   NA
 2155335 325032 PD0231 PD0232 htrA   FALSE 0.094 283.000 0.000 1.000   NA
 325032 325033 PD0232 PD0233   rpfB FALSE 0.018 704.000 0.000 1.000   NA
 325033 325034 PD0233 PD0234 rpfB rpfA FALSE 0.007 1487.000 0.000 0.042 N NA
 325035 325036 PD0235 PD0236   acnB TRUE 0.779 54.000 0.023 NA   NA
 325036 398888 PD0236 PD0237 acnB tRNA-Phe FALSE 0.054 387.000 0.000 NA   NA
 325037 2155336 PD0238 PD0239   hsdR FALSE 0.504 -202.000 0.000 NA   NA
 2155336 2155337 PD0239 PD0240 hsdR hsdS TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 2155337 2155338 PD0240 PD0241 hsdS hsdM FALSE 0.333 139.000 0.000 NA   NA
 325038 325039 PD0242 PD0243     FALSE 0.393 115.000 0.000 NA   NA
 325039 325040 PD0243 PD0244     TRUE 0.612 -16.000 0.000 NA   NA
 325040 325041 PD0244 PD0245   tpiA FALSE 0.089 291.000 0.000 NA   NA
 325041 325042 PD0245 PD0246 tpiA secG TRUE 0.923 42.000 0.184 1.000 N NA
 325042 398889 PD0246 PD0247 secG tRNA-Leu FALSE 0.511 48.000 0.000 NA   NA
 398889 325043 PD0247 PD0248 tRNA-Leu nuoA FALSE 0.383 123.000 0.000 NA   NA
 325043 325044 PD0248 PD0249 nuoA nuoB TRUE 0.996 -30.000 0.507 0.004 Y NA
 325044 325045 PD0249 PD0250 nuoB nuoC TRUE 0.992 52.000 0.328 0.004 Y NA
 325045 325046 PD0250 PD0251 nuoC nuoD TRUE 0.999 -3.000 0.483 0.010 Y NA
 325046 325047 PD0251 PD0252 nuoD nuoE TRUE 0.998 -3.000 0.355 0.010 Y NA
 325047 325048 PD0252 PD0253 nuoE nuoF TRUE 0.998 5.000 0.343 0.010 Y NA
 325048 325049 PD0253 PD0254 nuoF nuoG TRUE 0.998 -3.000 0.395 0.010 Y NA
 325049 325050 PD0254 PD0255 nuoG nuoH TRUE 0.997 30.000 0.515 0.010 Y NA
 325050 325051 PD0255 PD0256 nuoH nuoI TRUE 0.999 1.000 0.500 0.010 Y NA
 325051 325052 PD0256 PD0257 nuoI nuoJ TRUE 0.998 5.000 0.442 0.010 Y NA
 325052 325053 PD0257 PD0258 nuoJ nuoK TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.004 Y NA
 325053 325054 PD0258 PD0259 nuoK nuoL TRUE 0.998 8.000 0.451 0.010 Y NA
 325054 325055 PD0259 PD0260 nuoL nuoM TRUE 0.991 22.000 0.175 0.003 Y NA
 325055 325056 PD0260 PD0261 nuoM nuoN TRUE 0.995 35.000 0.340 0.003 Y NA
 325057 325058 PD0262 PD0263 fabG citN TRUE 0.827 59.000 0.094 1.000 N NA
 325058 325059 PD0263 PD0264 citN oprO TRUE 0.640 133.000 0.048 NA N NA
 325060 325061 PD0265 PD0266 tctD tctE TRUE 0.987 -16.000 0.190 1.000 Y NA
 325061 2155339 PD0266 PD0267 tctE afuA TRUE 0.965 9.000 0.190 1.000 N NA
 2155339 325063 PD0267 PD0268 afuA agmR FALSE 0.184 547.000 0.158 1.000 N NA
 325064 325065 PD0269 PD0270   oprO FALSE 0.004 738.000 0.000 NA N NA
 325066 325067 PD0271 PD0272 dctA maeB TRUE 0.887 168.000 0.058 1.000 Y NA
 2155340 325070 PD0274 PD0275   coaD TRUE 0.990 -3.000 0.367 1.000 N NA
 325070 325071 PD0275 PD0276 coaD   TRUE 0.670 59.000 0.007 NA   NA
 325071 325072 PD0276 PD0277     FALSE 0.538 174.000 0.020 NA   NA
 325072 325073 PD0277 PD0278   ggt TRUE 0.964 -3.000 0.076 1.000   NA
 325073 325074 PD0278 PD0279 ggt   FALSE 0.004 749.000 0.000 1.000 N NA
 325075 325076 PD0280 PD0281   pyrC TRUE 0.896 0.000 0.023 1.000 N NA
 325076 325077 PD0281 PD0282 pyrC   TRUE 0.908 -3.000 0.010 NA   NA
 2155341 10784589 PD0283 PD0284 dksA   FALSE 0.272 165.000 0.000 NA   NA
 325079 325080 PD0285 PD0286 tetV   TRUE 0.945 -3.000 0.034 NA   NA
 325080 325081 PD0286 PD0287   cysS TRUE 0.610 85.000 0.006 NA   NA
 325082 325083 PD0288 PD0289     TRUE 0.741 6.000 0.000 NA   NA
 325083 325084 PD0289 PD0290   argF FALSE 0.267 168.000 0.000 NA   NA
 325084 325085 PD0290 PD0291 argF argG TRUE 0.939 31.000 0.007 1.000 Y NA
 325085 325086 PD0291 PD0292 argG argE TRUE 0.885 71.000 0.004 1.000 Y NA
 325086 325087 PD0292 PD0293 argE argB TRUE 0.903 65.000 0.009 1.000 Y NA
 325087 325088 PD0293 PD0294 argB argC TRUE 0.987 3.000 0.022 0.004 Y NA
 325088 325089 PD0294 PD0295 argC argH TRUE 0.961 21.000 0.020 1.000 Y NA
 325089 325090 PD0295 PD0296 argH proB TRUE 0.813 120.000 0.000 1.000 Y NA
 325090 325091 PD0296 PD0297 proB proA TRUE 0.614 292.000 0.007 0.002 Y NA
 325091 325092 PD0297 PD0298 proA   FALSE 0.037 464.000 0.000 NA   NA
 325092 325093 PD0298 PD0299     TRUE 0.619 24.000 0.000 NA   NA
 325093 325094 PD0299 PD0300     TRUE 0.711 11.000 0.000 NA   NA
 325094 325095 PD0300 PD0301     TRUE 0.656 18.000 0.000 NA   NA
 325095 10784590 PD0301 PD0302     FALSE 0.562 37.000 0.000 NA   NA
 10784590 325096 PD0302 PD0303     TRUE 0.656 18.000 0.000 NA   NA
 325096 325097 PD0303 PD0304     TRUE 0.711 11.000 0.000 NA   NA
 325097 325098 PD0304 PD0305   frpC TRUE 0.656 18.000 0.000 NA   NA
 325099 325100 PD0306 PD0307 fcy1   TRUE 0.834 8.000 0.016 1.000 N NA
 325102 325103 PD0309 PD0310 ate1   FALSE 0.045 424.000 0.000 NA   NA
 325103 325104 PD0310 PD0311   tesB TRUE 0.924 4.000 0.026 NA   NA
 325104 325105 PD0311 PD0312 tesB   FALSE 0.011 956.000 0.000 NA   NA
 325107 325108 PD0314 PD0315   gaa FALSE 0.147 233.000 0.000 NA   NA
 325108 325109 PD0315 PD0316 gaa plsB FALSE 0.021 644.000 0.000 1.000   NA
 325110 325111 PD0317 PD0318     FALSE 0.053 499.000 0.000 0.091   NA
 325114 325115 PD0321 PD0322 rnhB lpxB TRUE 0.905 57.000 0.186 1.000 N NA
 325115 325116 PD0322 PD0323 lpxB lpxA TRUE 0.983 77.000 0.289 1.000 Y NA
 325116 325117 PD0323 PD0324 lpxA fabZ TRUE 0.784 22.000 0.022 1.000 N NA
 325117 325118 PD0324 PD0325 fabZ lpxD TRUE 0.888 -3.000 0.019 1.000 N NA
 325118 325119 PD0325 PD0326 lpxD oma TRUE 0.656 189.000 0.000 1.000 Y NA
 325119 325120 PD0326 PD0327 oma   TRUE 0.879 99.000 0.007 1.000 Y NA
 325120 325121 PD0327 PD0328   dxr TRUE 0.986 27.000 0.568 1.000 N NA
 325121 325122 PD0328 PD0329 dxr cdsA TRUE 0.997 3.000 0.372 1.000 Y NA
 325122 325123 PD0329 PD0330 cdsA uppS TRUE 0.998 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 325123 325124 PD0330 PD0331 uppS frr TRUE 0.990 3.000 0.409 1.000 N NA
 325124 325125 PD0331 PD0332 frr fadL FALSE 0.004 754.000 0.000 1.000 N NA
 325126 325127 PD0333 PD0334     TRUE 0.836 119.000 0.096 NA   NA
 325127 2155342 PD0334 PD0335   rnpB FALSE 0.036 467.000 0.000 NA   NA
 2155342 325128 PD0335 PD0336 rnpB   FALSE 0.461 62.000 0.000 NA   NA
 325129 325130 PD0337 PD0338 pyrH   FALSE 0.115 256.000 0.000 1.000   NA
 325130 398926 PD0338 PD0339   tRNA-Leu FALSE 0.540 -29.000 0.000 NA   NA
 398926 398925 PD0339 PD0340 tRNA-Leu tRNA-Glu FALSE 0.357 131.000 0.000 NA   NA
 398925 398924 PD0340 PD0341 tRNA-Glu tRNA-Ala FALSE 0.494 54.000 0.000 NA   NA
 398924 325131 PD0341 PD0342 tRNA-Ala eda FALSE 0.116 254.000 0.000 NA   NA
 325131 325132 PD0342 PD0343 eda edd TRUE 0.817 113.000 0.000 1.000 Y NA
 325132 325133 PD0343 PD0344 edd pgl TRUE 0.963 141.000 0.202 1.000 Y NA
 325133 325134 PD0344 PD0345 pgl glk TRUE 0.983 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 325134 325135 PD0345 PD0346 glk zwf TRUE 0.988 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 325138 325139 PD0349 PD0350     TRUE 0.890 25.000 0.047 NA   NA
 325139 325140 PD0350 PD0351   sdhD TRUE 0.998 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 325140 325141 PD0351 PD0352 sdhD sdhA TRUE 0.999 8.000 0.705 0.003 Y NA
 325141 325142 PD0352 PD0353 sdhA sdhB TRUE 0.998 21.000 0.604 0.003 Y NA
 325142 325143 PD0353 PD0354 sdhB   TRUE 0.897 76.000 0.151 NA   NA
 325143 325144 PD0354 PD0355     TRUE 0.837 23.000 0.016 NA   NA
 325144 325145 PD0355 PD0356   lolC TRUE 0.838 26.000 0.020 NA   NA
 325145 325146 PD0356 PD0357 lolC lolD TRUE 0.990 32.000 0.620 0.037 N NA
 325146 325147 PD0357 PD0358 lolD comA FALSE 0.092 456.000 0.010 1.000   NA
 325147 325148 PD0358 PD0359 comA tolQ TRUE 0.893 -15.000 0.045 1.000   NA
 325148 325149 PD0359 PD0360 tolQ tolR TRUE 0.999 5.000 0.746 0.037 Y NA
 325149 325150 PD0360 PD0361 tolR msbA TRUE 0.962 -3.000 0.120 1.000 N NA
 325150 325151 PD0361 PD0362 msbA lpxK TRUE 0.979 -3.000 0.205 1.000 N NA
 325152 2155343 PD0363 PD0364 D   FALSE 0.511 -115.000 0.000 NA   NA
 2155343 325154 PD0364 PD0365   I TRUE 0.729 8.000 0.000 NA   NA
 325154 325155 PD0365 PD0366 I J TRUE 0.685 -7.000 0.000 NA   NA
 325155 325156 PD0366 PD0367 J W TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 325157 325158 PD0368 PD0369 higA higB TRUE 0.956 11.000 0.115 NA   NA
 325158 325159 PD0369 PD0370 higB   FALSE 0.417 88.000 0.000 NA   NA
 325159 325160 PD0370 PD0371     TRUE 0.998 3.000 0.857 NA   NA
 325161 325162 PD0372 PD0373 V   TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 325162 325163 PD0373 PD0374     TRUE 0.980 -24.000 0.400 NA   NA
 325163 325164 PD0374 PD0375     TRUE 0.962 -3.000 0.071 NA   NA
 325164 325165 PD0375 PD0376     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325165 325166 PD0376 PD0377     TRUE 0.656 18.000 0.000 NA   NA
 325166 325167 PD0377 PD0378   gp4 TRUE 0.982 -3.000 0.180 NA   NA
 325168 325169 PD0379 PD0380 dpoL   TRUE 0.988 -3.000 0.250 NA   NA
 325171 325172 PD0382 PD0383     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325172 325173 PD0383 PD0384   int TRUE 0.655 -10.000 0.000 NA   NA
 325173 325174 PD0384 PD0385 int parA FALSE 0.004 773.000 0.000 1.000 N NA
 325174 325175 PD0385 PD0386 parA   TRUE 0.882 25.000 0.079 NA N NA
 325175 325176 PD0386 PD0387     TRUE 0.956 5.000 0.083 NA   NA
 325176 325177 PD0387 PD0388   cls TRUE 0.974 -3.000 0.128 NA   NA
 325178 325179 PD0389 PD0390     FALSE 0.014 804.000 0.000 NA   NA
 325179 325180 PD0390 PD0391     FALSE 0.112 257.000 0.000 NA   NA
 325180 325181 PD0391 PD0392   wrbA FALSE 0.135 243.000 0.000 1.000   NA
 325183 325184 PD0394 PD0395     FALSE 0.009 1354.000 0.000 NA   NA
 325185 325186 PD0396 PD0397 polA dapB FALSE 0.006 650.000 0.000 1.000 N NA
 325186 325187 PD0397 PD0398 dapB carA TRUE 0.807 198.000 0.034 1.000 Y NA
 325187 325188 PD0398 PD0399 carA carB TRUE 0.974 199.000 0.345 0.001 Y NA
 325188 325189 PD0399 PD0400 carB greA TRUE 0.982 -3.000 0.241 1.000 N NA
 325189 325190 PD0400 PD0401 greA rpfE TRUE 0.735 47.000 0.011 NA   NA
 325190 325191 PD0401 PD0402 rpfE recJ TRUE 0.742 -30.000 0.010 NA   NA
 325191 325192 PD0402 PD0403 recJ prfB FALSE 0.029 883.000 0.028 1.000 N NA
 325192 325193 PD0403 PD0404 prfB lysU TRUE 0.942 182.000 0.162 0.060 Y NA
 325193 325194 PD0404 PD0405 lysU rpfG FALSE 0.360 138.000 0.005 1.000 N NA
 325194 325195 PD0405 PD0406 rpfG rpfC TRUE 0.988 146.000 0.450 0.016 Y NA
 325197 325198 PD0408 PD0409 lysC   TRUE 0.936 1.000 0.029 NA   NA
 325198 325199 PD0409 PD0410   murD TRUE 0.826 -19.000 0.019 NA   NA
 325201 325202 PD0413 PD0414 metF omp28 FALSE 0.033 491.000 0.000 NA   NA
 325203 325204 PD0415 PD0416 maf cafA TRUE 0.991 1.000 0.417 NA N NA
 325204 2155344 PD0416 PD0417 cafA   TRUE 0.915 148.000 0.296 NA   NA
 2155344 325206 PD0417 PD0418   tldD TRUE 0.764 125.000 0.050 NA   NA
 325210 325211 PD0422 PD0423 wrbA adhP FALSE 0.044 432.000 0.000 1.000   NA
 325211 325212 PD0423 PD0424 adhP   FALSE 0.562 37.000 0.000 NA   NA
 325213 325214 PD0425 PD0426 glmU pheA FALSE 0.018 366.000 0.000 1.000 N NA
 325214 325215 PD0426 PD0427 pheA atpC FALSE 0.040 247.000 0.000 1.000 N NA
 325215 325216 PD0427 PD0428 atpC atpD TRUE 0.998 70.000 0.837 0.005 Y NA
 325216 325217 PD0428 PD0429 atpD atpG TRUE 0.997 83.000 0.724 0.005 Y NA
 325217 325218 PD0429 PD0430 atpG atpA TRUE 0.997 92.000 0.846 0.005 Y NA
 325218 325219 PD0430 PD0431 atpA atpH TRUE 0.998 50.000 0.864 0.005 Y NA
 325219 325220 PD0431 PD0432 atpH atpF TRUE 0.997 4.000 0.242 0.005 Y NA
 325220 325221 PD0432 PD0433 atpF atpE TRUE 0.986 120.000 0.666 0.005   NA
 325221 325222 PD0433 PD0434 atpE   TRUE 0.986 64.000 0.557 0.005   NA
 325222 325223 PD0434 PD0435     TRUE 0.811 30.000 0.014 NA   NA
 325224 325225 PD0436 PD0437 rpsJ rplC TRUE 0.996 15.000 0.307 0.038 Y NA
 325225 325226 PD0437 PD0438 rplC rplD TRUE 0.998 10.000 0.486 0.028 Y NA
 325226 325227 PD0438 PD0439 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.028 Y NA
 325227 325228 PD0439 PD0440 rplW rplB TRUE 0.999 12.000 0.849 0.030 Y NA
 325228 325229 PD0440 PD0441 rplB rpsS TRUE 0.999 8.000 0.820 0.038 Y NA
 325229 325230 PD0441 PD0442 rpsS rplV TRUE 0.999 13.000 0.769 0.038 Y NA
 325230 325231 PD0442 PD0443 rplV rpsC TRUE 0.998 19.000 0.719 0.038 Y NA
 325231 325232 PD0443 PD0444 rpsC rplP TRUE 0.999 6.000 0.828 0.038 Y NA
 325232 325233 PD0444 PD0445 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.028 Y NA
 325233 325234 PD0445 PD0446 rpmC rpsQ TRUE 0.999 -3.000 0.828 0.028 Y NA
 325234 325235 PD0446 PD0447 rpsQ rplN TRUE 0.999 24.000 0.791 0.038 Y NA
 325235 325236 PD0447 PD0448 rplN rplX TRUE 0.999 16.000 0.810 0.038 Y NA
 325236 325237 PD0448 PD0449 rplX rplE TRUE 0.999 12.000 0.758 0.028 Y NA
 325237 325238 PD0449 PD0450 rplE rpsN TRUE 0.995 17.000 0.309 0.028 Y NA
 325238 325239 PD0450 PD0451 rpsN rpsH TRUE 0.976 159.000 0.295 0.028 Y NA
 325239 325240 PD0451 PD0452 rpsH rplF TRUE 0.999 13.000 0.808 0.028 Y NA
 325240 325241 PD0452 PD0453 rplF rplR TRUE 0.997 87.000 0.815 0.028 Y NA
 325241 325242 PD0453 PD0454 rplR rpsE TRUE 0.993 179.000 0.814 0.038 Y NA
 325242 325243 PD0454 PD0455 rpsE rpmD TRUE 0.999 20.000 0.789 0.038 Y NA
 325243 325244 PD0455 PD0456 rpmD rplO TRUE 0.999 7.000 0.653 0.005 Y NA
 325244 325245 PD0456 PD0457 rplO secY TRUE 0.995 8.000 0.730 1.000 N NA
 325245 325246 PD0457 PD0458 secY rpsM FALSE 0.433 141.000 0.011 1.000 N NA
 325246 325247 PD0458 PD0459 rpsM rpsK TRUE 0.999 16.000 0.810 0.028 Y NA
 325247 325248 PD0459 PD0460 rpsK rpsD TRUE 0.998 15.000 0.509 0.038 Y NA
 325248 325249 PD0460 PD0461 rpsD rpoA TRUE 0.976 55.000 0.549 1.000 N NA
 325249 325250 PD0461 PD0462 rpoA rplQ TRUE 0.981 132.000 0.873 1.000 N NA
 325250 325251 PD0462 PD0463 rplQ   FALSE 0.014 768.000 0.000 NA   NA
 325251 325252 PD0463 PD0464   comM TRUE 0.941 11.000 0.074 NA   NA
 325252 325253 PD0464 PD0465 comM lip FALSE 0.008 2547.000 0.000 1.000   NA
 325253 325254 PD0465 PD0466 lip lipB TRUE 0.792 1.000 0.000 1.000   NA
 2155345 398921 PD0469 PD0470   tRNA-Leu FALSE 0.009 1405.000 0.000 NA   NA
 325257 325258 PD0471 PD0472 tig clpP TRUE 0.982 138.000 0.351 1.000 Y NA
 325258 325259 PD0472 PD0473 clpP clpX TRUE 0.984 128.000 0.352 1.000 Y NA
 325259 325260 PD0473 PD0474 clpX lon TRUE 0.967 131.000 0.201 1.000 Y NA
 325260 325261 PD0474 PD0475 lon hupB FALSE 0.204 221.000 0.008 1.000 N NA
 325261 398890 PD0475 PD0476 hupB tRNA-Val TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 398890 398891 PD0476 PD0477 tRNA-Val tRNA-Asp TRUE 0.588 31.000 0.000 NA   NA
 398891 325262 PD0477 PD0478 tRNA-Asp ppiD FALSE 0.053 388.000 0.000 NA   NA
 325262 325263 PD0478 PD0479 ppiD manA FALSE 0.009 1251.000 0.000 1.000   NA
 325263 325264 PD0479 PD0480 manA nrdA FALSE 0.010 1202.000 0.000 1.000   NA
 325264 325265 PD0480 PD0481 nrdA nrdB TRUE 0.968 78.000 0.079 0.001 Y NA
 325265 325266 PD0481 PD0482 nrdB   TRUE 0.972 12.000 0.250 1.000 N NA
 325266 325267 PD0482 PD0483   trxA TRUE 0.995 -28.000 0.484 1.000 Y NA
 325267 325268 PD0483 PD0484 trxA rsuA FALSE 0.015 406.000 0.000 1.000 N NA
 325268 325269 PD0484 PD0485 rsuA   TRUE 0.958 -3.000 0.053 1.000   NA
 325270 325271 PD0486 PD0487     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325272 325273 PD0488 PD0489 rpmB rpmG TRUE 0.996 14.000 0.332 0.028 Y NA
 325273 325274 PD0489 PD0490 rpmG cls FALSE 0.211 187.000 0.002 1.000 N NA
 325274 325275 PD0490 PD0491 cls gst FALSE 0.017 382.000 0.000 1.000 N NA
 325276 325277 PD0492 PD0493 mdh ppiB FALSE 0.508 133.000 0.018 1.000 N NA
 2155346 325279 PD0494 PD0495 typA   FALSE 0.275 230.000 0.006 NA   NA
 325279 325280 PD0495 PD0496   cvaA FALSE 0.129 244.000 0.000 NA   NA
 325280 325281 PD0496 PD0497 cvaA   FALSE 0.159 225.000 0.000 NA   NA
 325281 325282 PD0497 PD0498     FALSE 0.300 154.000 0.000 NA   NA
 325282 325283 PD0498 PD0499   cvaB FALSE 0.010 1132.000 0.000 NA   NA
 325284 325285 PD0500 PD0501 yadH yadG TRUE 0.995 80.000 0.688 1.000 Y NA
 325287 325288 PD0503 PD0504     FALSE 0.012 921.000 0.000 NA   NA
 325288 325289 PD0504 PD0505   hrpB FALSE 0.239 266.000 0.012 NA   NA
 325289 325290 PD0505 PD0506 hrpB   FALSE 0.009 501.000 0.000 NA N NA
 325291 2155347 PD0507 PD0508     TRUE 0.996 -3.000 0.575 NA   NA
 2155347 325293 PD0508 PD0509   prpB FALSE 0.015 760.000 0.000 NA   NA
 325294 325295 PD0511 PD0512     FALSE 0.011 1022.000 0.000 NA   NA
 325295 2155348 PD0512 PD0513   rpfA FALSE 0.031 501.000 0.000 NA   NA
 2155348 325296 PD0513 PD0514 rpfA   FALSE 0.065 348.000 0.000 NA   NA
 325297 325298 PD0515 PD0516     FALSE 0.082 301.000 0.000 NA   NA
 325299 325300 PD0517 PD0518 rocF   FALSE 0.033 498.000 0.000 1.000   NA
 325305 2155350 PD0523 PD0524 yggB ppsA TRUE 0.878 1.000 0.018 1.000 N NA
 325307 325308 PD0525 PD0526     TRUE 0.766 98.000 0.043 NA   NA
 325308 325309 PD0526 PD0527   mutT TRUE 0.762 68.000 0.030 NA   NA
 325310 325311 PD0528 PD0529   guxA FALSE 0.017 716.000 0.000 NA   NA
 325311 325312 PD0529 PD0530 guxA lipA FALSE 0.003 1207.000 0.000 1.000 N NA
 325312 325313 PD0530 PD0531 lipA lipB TRUE 0.994 37.000 0.319 0.001 Y NA
 325313 325314 PD0531 PD0532 lipB   TRUE 0.969 -12.000 0.219 NA   NA
 325314 2155351 PD0532 PD0533     FALSE 0.272 165.000 0.000 NA   NA
 325316 2155352 PD0534 PD0535 phaF   FALSE 0.013 822.000 0.000 NA   NA
 325318 325319 PD0536 PD0537 tlyC   FALSE 0.016 734.000 0.000 1.000   NA
 325322 325323 PD0540 PD0541   pyrG FALSE 0.305 151.000 0.000 NA   NA
 325323 2155353 PD0541 PD0542 pyrG kdsA TRUE 0.736 161.000 0.138 1.000 N NA
 2155353 325325 PD0542 PD0543 kdsA eno FALSE 0.216 451.000 0.125 1.000 N NA
 325325 325326 PD0543 PD0544 eno   TRUE 0.978 4.000 0.241 1.000 N NA
 325326 325327 PD0544 PD0545   ispD TRUE 0.976 -3.000 0.185 1.000 N NA
 325327 325328 PD0545 PD0546 ispD ispF TRUE 0.996 21.000 0.419 1.000 Y NA
 325329 325330 PD0547 PD0548     FALSE 0.034 482.000 0.000 NA   NA
 325330 325331 PD0548 PD0549   etfD FALSE 0.104 160.000 0.000 1.000 N NA
 325333 325334 PD0551 PD0552     TRUE 0.984 -3.000 0.201 NA   NA
 325334 325335 PD0552 PD0553     TRUE 0.996 4.000 0.275 NA Y NA
 325335 325336 PD0553 PD0554   yrbE TRUE 0.998 -3.000 0.472 NA Y NA
 325337 325338 PD0555 PD0556     FALSE 0.060 365.000 0.000 NA   NA
 325338 325339 PD0556 PD0557   mreB FALSE 0.008 3124.000 0.000 NA   NA
 325339 325340 PD0557 PD0558 mreB mreC TRUE 0.941 198.000 0.689 1.000 N NA
 325340 325341 PD0558 PD0559 mreC mreD TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.005 Y NA
 325341 325342 PD0559 PD0560 mreD mrdA TRUE 0.951 -16.000 0.013 1.000 Y NA
 325342 325343 PD0560 PD0561 mrdA mrdB TRUE 0.867 -3.000 0.013 1.000 N NA
 325343 325344 PD0561 PD0562 mrdB queA FALSE 0.165 96.000 0.000 1.000 N NA
 325344 325345 PD0562 PD0563 queA relA FALSE 0.005 728.000 0.000 1.000 N NA
 325345 325346 PD0563 PD0564 relA   FALSE 0.510 235.000 0.065 1.000   NA
 325347 325348 PD0565 PD0566   minE TRUE 0.718 63.000 0.015 NA   NA
 325348 325349 PD0566 PD0567 minE minD TRUE 0.999 3.000 0.618 NA Y NA
 325349 325350 PD0567 PD0568 minD minC TRUE 0.995 37.000 0.466 1.000 Y NA
 325350 2155354 PD0568 PD0569 minC   TRUE 0.854 16.000 0.013 1.000   NA
 325352 325353 PD0570 PD0571     FALSE 0.368 128.000 0.000 NA   NA
 325353 325354 PD0571 PD0572   alkA FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 325355 325356 PD0573 PD0574   cybB TRUE 0.931 18.000 0.080 NA   NA
 325356 325357 PD0574 PD0575 cybB   TRUE 0.976 13.000 0.222 NA   NA
 325359 325360 PD0577 PD0578 dcm   TRUE 0.965 -3.000 0.078 NA   NA
 325360 325361 PD0578 PD0579     TRUE 0.948 42.000 0.200 NA   NA
 325361 325362 PD0579 PD0580   hemE FALSE 0.362 130.000 0.000 NA   NA
 325362 325363 PD0580 PD0581 hemE aroB FALSE 0.017 376.000 0.000 1.000 N NA
 325363 325364 PD0581 PD0582 aroB aroK TRUE 0.965 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 325367 325368 PD0585 PD0586   cutC TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325368 325369 PD0586 PD0587 cutC   FALSE 0.110 258.000 0.000 NA   NA
 325369 325370 PD0587 PD0588   sbp FALSE 0.321 144.000 0.000 NA   NA
 325370 325371 PD0588 PD0589 sbp cysU TRUE 0.926 4.000 0.020 0.002 N NA
 325371 325372 PD0589 PD0590 cysU cysW TRUE 0.998 -3.000 0.935 0.001 N NA
 325372 325373 PD0590 PD0591 cysW cysA TRUE 0.978 14.000 0.050 1.000 Y NA
 325377 325378 PD0595 PD0596 yybA   FALSE 0.025 561.000 0.000 NA   NA
 325379 325380 PD0597 PD0598 bioH bioF TRUE 0.836 157.000 0.096 0.004   NA
 325381 325382 PD0599 PD0600 ctaA cyoE TRUE 0.997 -3.000 0.321 1.000 Y NA
 325382 10784591 PD0600 PD0601 cyoE   FALSE 0.019 681.000 0.000 NA   NA
 325383 325384 PD0602 PD0603 cca slt TRUE 0.651 93.000 0.034 1.000 N NA
 325384 325385 PD0603 PD0604 slt psd FALSE 0.008 559.000 0.000 1.000 N NA
 325385 325386 PD0604 PD0605 psd   TRUE 0.956 -3.000 0.051 1.000   NA
 2155355 325388 PD0606 PD0607 yfcB aroC TRUE 0.920 12.000 0.081 1.000 N NA
 325388 325389 PD0607 PD0608 aroC asd FALSE 0.127 642.000 0.000 1.000 Y NA
 325389 325390 PD0608 PD0609 asd   TRUE 0.617 38.000 0.008 NA N NA
 325390 325391 PD0609 PD0610   truA TRUE 0.617 39.000 0.008 NA N NA
 325391 325392 PD0610 PD0611 truA trpF TRUE 0.892 -30.000 0.139 1.000 N NA
 325392 325393 PD0611 PD0612 trpF trpB TRUE 0.840 502.000 0.375 0.003 Y NA
 325393 325394 PD0612 PD0613 trpB trpA TRUE 0.989 126.000 0.344 0.001 Y NA
 325397 325398 PD0616 PD0617   recQ TRUE 0.621 123.000 0.011 NA   NA
 325398 325399 PD0617 PD0618 recQ dps FALSE 0.255 181.000 0.005 1.000 N NA
 2155356 325401 PD0619 PD0620 hrpA gcvP FALSE 0.018 366.000 0.000 1.000 N NA
 325402 325403 PD0621 PD0622 cyoD cyoC TRUE 1.000 0.000 0.917 0.038 Y NA
 325403 325404 PD0622 PD0623 cyoC cyoB TRUE 0.998 6.000 0.385 0.038 Y NA
 325404 325405 PD0623 PD0624 cyoB cyoA TRUE 0.997 -6.000 0.385 0.007 Y NA
 325405 325406 PD0624 PD0625 cyoA ispB FALSE 0.011 469.000 0.000 1.000 N NA
 325407 325408 PD0626 PD0627 ssb ubiG FALSE 0.002 1649.000 0.000 1.000 N NA
 325408 325409 PD0627 PD0628 ubiG napA FALSE 0.025 301.000 0.000 1.000 N NA
 325410 10784592 PD0629 PD0630 gloA   FALSE 0.028 535.000 0.000 NA   NA
 10784592 325411 PD0630 PD0631   ptsA FALSE 0.234 183.000 0.000 NA   NA
 325411 325412 PD0631 PD0632 ptsA ptsH TRUE 0.986 61.000 0.205 0.002 Y NA
 325412 325413 PD0632 PD0633 ptsH   TRUE 0.995 -7.000 0.261 0.003 Y NA
 325413 325414 PD0633 PD0634     FALSE 0.438 373.000 0.171 NA   NA
 325414 325415 PD0634 PD0635   ptsK TRUE 0.984 -3.000 0.194 NA   NA
 325415 325416 PD0635 PD0636 ptsK   FALSE 0.193 266.000 0.021 NA N NA
 325416 325417 PD0636 PD0637   rpoN TRUE 0.705 91.000 0.050 NA N NA
 325417 325418 PD0637 PD0638 rpoN yhbG TRUE 0.935 42.000 0.163 1.000   NA
 325418 325419 PD0638 PD0639 yhbG   TRUE 0.996 0.000 0.543 NA   NA
 325419 325420 PD0639 PD0640     TRUE 0.984 -22.000 0.459 NA   NA
 325420 325421 PD0640 PD0641     TRUE 0.997 -3.000 0.617 NA   NA
 325421 325422 PD0641 PD0642   kpsF TRUE 0.992 18.000 0.598 1.000   NA
 325423 325424 PD0643 PD0644   murA TRUE 0.842 70.000 0.129 NA N NA
 325424 325425 PD0644 PD0645 murA   TRUE 0.921 -3.000 0.013 1.000   NA
 325427 325428 PD0647 PD0648 lpxD   FALSE 0.548 -28.000 0.000 NA   NA
 325429 325430 PD0649 PD0650   purL TRUE 0.788 1.000 0.000 NA   NA
 325430 325431 PD0650 PD0651 purL dsbC FALSE 0.273 197.000 0.011 1.000 N NA
 325431 325432 PD0651 PD0652 dsbC xerD FALSE 0.353 132.000 0.004 1.000 N NA
 325432 325433 PD0652 PD0653 xerD   FALSE 0.035 258.000 0.000 1.000 N NA
 325435 325436 PD0655 PD0656 gshI engB FALSE 0.173 220.000 0.000 1.000   NA
 325436 325437 PD0656 PD0657 engB   FALSE 0.012 954.000 0.000 1.000   NA
 325438 325439 PD0658 PD0659 dsbA dsbA TRUE 0.988 92.000 0.714 0.009   NA
 325439 325440 PD0659 PD0660 dsbA   TRUE 0.877 46.000 0.074 NA   NA
 325441 325442 PD0661 PD0662   trmU TRUE 0.982 -3.000 0.180 NA   NA
 325442 325443 PD0662 PD0663 trmU mutT TRUE 0.971 -3.000 0.158 1.000 N NA
 325444 325445 PD0664 PD0665   clpA TRUE 0.972 133.000 0.596 NA   NA
 325446 325447 PD0666 PD0667 infA aat FALSE 0.570 117.000 0.020 1.000 N NA
 325447 325448 PD0667 PD0668 aat   TRUE 0.877 12.000 0.015 NA   NA
 325448 325449 PD0668 PD0669   trxB FALSE 0.103 428.000 0.010 NA   NA
 325450 325451 PD0670 PD0671 ftsK   FALSE 0.554 185.000 0.033 NA   NA
 325451 325452 PD0671 PD0672   lolA FALSE 0.063 562.000 0.011 NA   NA
 325452 325453 PD0672 PD0673 lolA   TRUE 0.810 142.000 0.167 1.000 N NA
 325453 325454 PD0673 PD0674     FALSE 0.269 161.000 0.002 1.000 N NA
 325454 325455 PD0674 PD0675     FALSE 0.016 674.000 0.000 0.085 N NA
 325455 325456 PD0675 PD0676   folK FALSE 0.260 41.000 0.000 1.000 N NA
 2155357 325459 PD0678 PD0679     TRUE 0.828 -12.000 0.012 NA   NA
 325461 325462 PD0681 PD0682 gluP   TRUE 0.959 4.000 0.140 1.000 N NA
 325462 325463 PD0682 PD0683   glmS TRUE 0.952 -3.000 0.083 1.000 N NA
 325463 325464 PD0683 PD0684 glmS nagA TRUE 0.910 -3.000 0.031 1.000 N NA
 325464 325465 PD0684 PD0685 nagA accD FALSE 0.005 691.000 0.000 1.000 N NA
 325465 325466 PD0685 PD0686 accD mrsA TRUE 0.839 -3.000 0.008 1.000 N NA
 325467 325468 PD0687 PD0688   murG TRUE 0.981 -3.000 0.222 1.000 N NA
 325468 325469 PD0688 PD0689 murG bedB FALSE 0.009 528.000 0.000 1.000 N NA
 325469 325470 PD0689 PD0690 bedB csdB FALSE 0.162 104.000 0.000 1.000 N NA
 325470 325471 PD0690 PD0691 csdB sufD TRUE 0.849 -12.000 0.041 1.000 N NA
 325471 325472 PD0691 PD0692 sufD ynhD TRUE 0.998 0.000 0.482 1.000 Y NA
 325472 325473 PD0692 PD0693 ynhD ynhE TRUE 0.985 147.000 0.466 1.000 Y NA
 325473 325474 PD0693 PD0694 ynhE   TRUE 0.891 21.000 0.078 1.000 N NA
 325475 325476 PD0695 PD0696   ptrB FALSE 0.013 847.000 0.000 1.000   NA
 325476 325477 PD0696 PD0697 ptrB   TRUE 0.735 7.000 0.000 NA   NA
 325477 325478 PD0697 PD0698   dapF FALSE 0.562 37.000 0.000 NA   NA
 325478 325479 PD0698 PD0699 dapF   TRUE 0.959 -12.000 0.175 NA   NA
 325479 325480 PD0699 PD0700   sss TRUE 0.993 24.000 0.714 NA   NA
 325480 2155358 PD0700 PD0701 sss hslV FALSE 0.046 589.000 0.020 1.000 N NA
 2155358 2155359 PD0701 PD0702 hslV hslU FALSE 0.445 68.000 0.000 NA   NA
 325482 325483 PD0704 PD0705 ubiE pepN FALSE 0.019 357.000 0.000 1.000 N NA
 325483 325484 PD0705 PD0706 pepN   FALSE 0.029 526.000 0.000 NA   NA
 325487 325488 PD0709 PD0710     TRUE 0.770 52.000 0.020 NA   NA
 325489 325490 PD0711 PD0712 yncD   FALSE 0.070 331.000 0.000 NA   NA
 325491 325492 PD0713 PD0714   cysH FALSE 0.055 382.000 0.000 NA   NA
 325492 2155361 PD0714 PD0715 cysH cysI TRUE 0.961 -3.000 0.116 1.000 N NA
 2155361 325494 PD0715 PD0716 cysI cysJ TRUE 0.997 124.000 0.791 0.001 Y NA
 325495 325496 PD0717 PD0718 cysD nodQ TRUE 0.941 60.000 0.203 0.001 N NA
 325497 325498 PD0719 PD0720 rpoZ gmk FALSE 0.330 232.000 0.035 1.000 N NA
 325498 325499 PD0720 PD0721 gmk   TRUE 0.943 82.000 0.276 NA   NA
 325500 325501 PD0722 PD0723 rph   TRUE 0.911 96.000 0.262 1.000 N NA
 325501 325502 PD0723 PD0724   hemN TRUE 0.710 223.000 0.218 1.000 N NA
 325502 325503 PD0724 PD0725 hemN   TRUE 0.631 70.000 0.006 NA   NA
 325503 325504 PD0725 PD0726     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 325505 325506 PD0727 PD0728 pip hemK FALSE 0.216 348.000 0.012 0.057   NA
 325507 325508 PD0729 PD0730     TRUE 0.804 -3.000 0.000 1.000   NA
 325508 325509 PD0730 PD0731   xadA FALSE 0.019 686.000 0.000 1.000   NA
 325509 325510 PD0731 PD0732 xadA xpsE FALSE 0.509 243.000 0.000 1.000 Y NA
 325510 325511 PD0732 PD0733 xpsE xpsF TRUE 0.992 36.000 0.255 0.006 Y NA
 325511 325512 PD0733 PD0734 xpsF xpsG TRUE 0.946 164.000 0.125 0.006 Y NA
 325512 325513 PD0734 PD0735 xpsG xpsH TRUE 0.997 6.000 0.348 NA Y NA
 325513 325514 PD0735 PD0736 xpsH xpsI TRUE 0.975 -3.000 0.130 NA   NA
 325514 325515 PD0736 PD0737 xpsI xpsJ TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325515 325516 PD0737 PD0738 xpsJ pefK TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 325516 325517 PD0738 PD0739 pefK pefL TRUE 0.894 -27.000 0.000 NA Y NA
 325517 325518 PD0739 PD0740 pefL xpsM TRUE 0.593 -19.000 0.000 NA   NA
 325518 325519 PD0740 PD0741 xpsM xpsN TRUE 0.994 -10.000 0.700 NA   NA
 325519 325520 PD0741 PD0742 xpsN xpsD TRUE 0.971 45.000 0.333 NA   NA
 325520 325521 PD0742 PD0743 xpsD   FALSE 0.022 606.000 0.000 NA   NA
 325521 2155362 PD0743 PD0744   hsf TRUE 0.640 -12.000 0.000 NA   NA
 2155362 325523 PD0744 PD0745 hsf ahpC FALSE 0.019 364.000 0.000 1.000 N NA
 325523 325524 PD0745 PD0746 ahpC ahpF TRUE 0.978 198.000 0.551 1.000 Y NA
 325524 325525 PD0746 PD0747 ahpF oxyR TRUE 0.676 105.000 0.041 1.000 N NA
 325525 325526 PD0747 PD0748 oxyR   FALSE 0.151 125.000 0.000 1.000 N NA
 325526 325527 PD0748 PD0749   rpmE FALSE 0.008 537.000 0.000 1.000 N NA
 325527 325528 PD0749 PD0750 rpmE gltA FALSE 0.155 227.000 0.004 1.000 N NA
 325529 325530 PD0751 PD0752 rpsI rplM TRUE 0.999 5.000 0.601 0.027 Y NA
 325536 325537 PD0758 PD0759 lpd sucB TRUE 0.743 437.000 0.253 1.000 Y NA
 325537 325538 PD0759 PD0760 sucB odhA TRUE 0.997 42.000 0.667 1.000 Y NA
 325538 325539 PD0760 PD0761 odhA   FALSE 0.009 1203.000 0.000 NA   NA
 325539 325540 PD0761 PD0762   purB TRUE 0.580 171.000 0.029 NA   NA
 325542 325543 PD0764 PD0765 int   TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 325544 325545 PD0766 PD0767     TRUE 0.655 -10.000 0.000 NA   NA
 325545 325546 PD0767 PD0768     TRUE 0.685 -7.000 0.000 NA   NA
 325546 325547 PD0768 PD0769     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 325547 325548 PD0769 PD0770     FALSE 0.437 76.000 0.000 NA   NA
 325550 325551 PD0773 PD0774 gidA   FALSE 0.028 540.000 0.000 NA   NA
 325552 325553 PD0775 PD0776     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325554 325555 PD0777 PD0778 aspH bioC FALSE 0.186 75.000 0.000 1.000 N NA
 325558 325559 PD0781 PD0782   cynT TRUE 0.939 -3.000 0.026 1.000   NA
 325560 325561 PD0783 PD0784 acrF acrA TRUE 0.996 15.000 1.000 1.000 N NA
 2155364 2155365 PD0785 PD0786 gdhA ppnK TRUE 0.705 85.000 0.022 0.038 N NA
 2155365 325564 PD0786 PD0787 ppnK ushA TRUE 0.770 86.000 0.036 1.000   NA
 325564 2155366 PD0787 PD0788 ushA   FALSE 0.093 290.000 0.000 1.000   NA
 2155366 2155367 PD0788 PD0789     FALSE 0.047 420.000 0.000 1.000   NA
 325567 325568 PD0790 PD0791 traC   FALSE 0.452 68.000 0.000 1.000   NA
 325568 325569 PD0791 PD0792     FALSE 0.352 132.000 0.000 NA   NA
 325569 325570 PD0792 PD0793   sbcB TRUE 0.945 -3.000 0.034 NA   NA
 2155368 2155369 PD0794 PD0795   yjcE FALSE 0.011 968.000 0.000 NA   NA
 2155369 325573 PD0795 PD0796 yjcE   FALSE 0.065 351.000 0.000 NA   NA
 325574 325575 PD0797 PD0798 rpiA   TRUE 0.685 63.000 0.011 NA   NA
 325575 325576 PD0798 PD0799     TRUE 0.913 -3.000 0.011 NA   NA
 325576 325577 PD0799 PD0800     FALSE 0.134 474.000 0.034 NA   NA
 325577 325578 PD0800 PD0801     TRUE 0.957 -3.000 0.053 NA   NA
 325579 325580 PD0802 PD0803   pepP TRUE 0.991 -3.000 0.329 NA   NA
 325581 325582 PD0804 PD0805     FALSE 0.040 249.000 0.000 1.000 N NA
 325584 325585 PD0807 PD0808     FALSE 0.010 1056.000 0.000 NA   NA
 2155371 325587 PD0809 PD0810   ilvE TRUE 0.684 94.000 0.017 1.000   NA
 325588 325589 PD0811 PD0812 fis   TRUE 0.771 86.000 0.037 NA   NA
 325589 325590 PD0812 PD0813     FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 325591 325592 PD0814 PD0815     TRUE 0.921 84.000 0.029 NA Y NA
 325592 325593 PD0815 PD0816     TRUE 0.986 -3.000 0.040 NA Y NA
 325595 325596 PD0818 PD0819 yneN   FALSE 0.081 302.000 0.000 NA   NA
 325596 2155372 PD0819 PD0820   vacB FALSE 0.247 179.000 0.000 NA   NA
 2155372 325598 PD0820 PD0821 vacB yjfH FALSE 0.288 460.000 0.147 0.028 N NA
 325599 325600 PD0822 PD0823 yrdA folE FALSE 0.021 655.000 0.000 1.000   NA
 2155373 325602 PD0824 PD0825 hsf ampE FALSE 0.006 686.000 0.000 1.000 N NA
 325603 325604 PD0826 PD0827   purD FALSE 0.026 549.000 0.000 NA   NA
 325604 325605 PD0827 PD0828 purD purH TRUE 0.943 193.000 0.238 1.000 Y NA
 325605 325606 PD0828 PD0829 purH   FALSE 0.021 621.000 0.000 NA   NA
 325606 325607 PD0829 PD0830   yibK FALSE 0.204 195.000 0.000 NA   NA
 325608 325609 PD0831 PD0832   fabH TRUE 0.735 158.000 0.078 NA   NA
 325609 325610 PD0832 PD0833 fabH mod FALSE 0.006 666.000 0.000 NA N NA
 325610 325611 PD0833 PD0834 mod   TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325611 325612 PD0834 PD0835     TRUE 0.612 -16.000 0.000 NA   NA
 325612 325613 PD0835 PD0836   dhaA TRUE 0.958 -3.000 0.054 1.000   NA
 325615 325616 PD0838 PD0839   nadE FALSE 0.039 453.000 0.000 NA   NA
 325616 325617 PD0839 PD0840 nadE glyQ FALSE 0.024 311.000 0.000 1.000 N NA
 325617 325618 PD0840 PD0841 glyQ glyS TRUE 0.996 92.000 0.651 0.001 Y NA
 325619 325620 PD0842 PD0843   tonB FALSE 0.075 315.000 0.000 NA   NA
 325620 325621 PD0843 PD0844 tonB gshB TRUE 0.878 -22.000 0.089 1.000 N NA
 2155374 325623 PD0845 PD0846 pilG pilI TRUE 0.931 17.000 0.000 1.000 Y NA
 325623 325624 PD0846 PD0847 pilI pilJ TRUE 0.999 1.000 0.795 0.003 Y NA
 325624 325625 PD0847 PD0848 pilJ cheA TRUE 0.999 -3.000 0.554 0.003 Y NA
 325625 325626 PD0848 PD0849 cheA cheB TRUE 0.955 17.000 0.000 0.003 Y NA
 325626 325627 PD0849 PD0850 cheB   TRUE 0.795 22.000 0.000 0.003   NA
 325628 325629 PD0851 PD0852 purF   TRUE 0.932 115.000 0.262 1.000   NA
 325629 325630 PD0852 PD0853     TRUE 0.638 78.000 0.007 NA   NA
 325630 325631 PD0853 PD0854   folC TRUE 0.778 39.000 0.013 NA   NA
 325633 325634 PD0856 PD0857 dcp   FALSE 0.014 792.000 0.000 1.000   NA
 325635 325636 PD0858 PD0859   msrA TRUE 0.651 104.000 0.013 NA   NA
 325636 325637 PD0859 PD0860 msrA gltP FALSE 0.007 596.000 0.000 1.000 N NA
 325637 325638 PD0860 PD0861 gltP tktA TRUE 0.838 107.000 0.150 1.000 N NA
 325639 325640 PD0862 PD0863 gidB hetI FALSE 0.151 227.000 0.003 1.000 N NA
 325640 325641 PD0863 PD0864 hetI xthA FALSE 0.163 101.000 0.000 1.000 N NA
 325641 10784593 PD0864 PD0865 xthA   FALSE 0.025 572.000 0.000 NA   NA
 10784593 325642 PD0865 PD0866     FALSE 0.458 63.000 0.000 NA   NA
 325642 325643 PD0866 PD0867   nadC FALSE 0.063 358.000 0.000 NA   NA
 325643 325644 PD0867 PD0868 nadC nadB TRUE 0.997 2.000 0.223 0.003 Y NA
 325644 2155375 PD0868 PD0869 nadB nadA TRUE 0.995 13.000 0.210 0.003 Y NA
 2155375 325646 PD0869 PD0870 nadA sodA FALSE 0.012 451.000 0.000 1.000 N NA
 325648 325649 PD0872 PD0873 isf   FALSE 0.119 252.000 0.000 NA   NA
 325649 325650 PD0873 PD0874     FALSE 0.380 124.000 0.000 NA   NA
 325650 10784594 PD0874 PD0875     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 10784594 325651 PD0875 PD0876   trpD TRUE 0.612 -16.000 0.000 NA   NA
 325651 2155376 PD0876 PD0877 trpD trpE FALSE 0.568 -24.000 0.000 NA   NA
 325653 325654 PD0879 PD0880     FALSE 0.080 305.000 0.000 NA   NA
 325655 325656 PD0881 PD0882 ftsY mutY FALSE 0.395 100.000 0.004 1.000 N NA
 325656 325657 PD0882 PD0883 mutY   TRUE 0.912 35.000 0.150 NA N NA
 325657 325658 PD0883 PD0884     FALSE 0.554 39.000 0.000 NA   NA
 325658 325659 PD0884 PD0885     FALSE 0.365 129.000 0.000 NA   NA
 325659 325660 PD0885 PD0886   ruvC TRUE 0.934 120.000 0.277 NA   NA
 325660 325661 PD0886 PD0887 ruvC ruvA TRUE 0.993 86.000 0.451 0.019 Y NA
 325661 325662 PD0887 PD0888 ruvA kup FALSE 0.534 55.000 0.007 1.000 N NA
 325662 325663 PD0888 PD0889 kup ruvB FALSE 0.474 61.000 0.005 1.000 N NA
 325663 325664 PD0889 PD0890 ruvB   TRUE 0.933 18.000 0.082 1.000   NA
 325664 325665 PD0890 PD0891   tolQ TRUE 0.991 24.000 0.593 1.000   NA
 325665 325666 PD0891 PD0892 tolQ tolR TRUE 0.997 34.000 0.556 0.033 Y NA
 325666 325667 PD0892 PD0893 tolR tolA TRUE 0.989 -10.000 0.460 NA   NA
 325667 325668 PD0893 PD0894 tolA tolB FALSE 0.552 343.000 0.215 NA   NA
 325668 325669 PD0894 PD0895 tolB   TRUE 0.983 42.000 0.592 1.000 N NA
 325669 325670 PD0895 PD0896     TRUE 0.986 4.000 0.278 1.000   NA
 325670 325671 PD0896 PD0897     TRUE 0.842 58.000 0.059 1.000   NA
 325676 2155377 PD0902 PD0903 fpr thiC FALSE 0.123 142.000 0.000 1.000 N NA
 325678 325679 PD0904 PD0905   gpmA FALSE 0.427 87.000 0.000 1.000   NA
 325681 325682 PD0907 PD0908     FALSE 0.051 404.000 0.000 NA   NA
 325682 325683 PD0908 PD0909     FALSE 0.159 225.000 0.000 NA   NA
 325683 325684 PD0909 PD0910     TRUE 0.741 6.000 0.000 NA   NA
 325684 325685 PD0910 PD0911     TRUE 0.991 45.000 0.750 1.000   NA
 325685 325686 PD0911 PD0912     FALSE 0.142 236.000 0.000 NA   NA
 325686 325687 PD0912 PD0913     FALSE 0.289 158.000 0.000 NA   NA
 325687 325688 PD0913 PD0914     TRUE 0.998 6.000 1.000 NA   NA
 325688 325689 PD0914 PD0915     TRUE 0.994 -28.000 1.000 NA   NA
 325690 325691 PD0916 PD0917     FALSE 0.466 60.000 0.000 NA   NA
 325691 325692 PD0917 PD0918     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325693 325694 PD0919 PD0920     FALSE 0.525 -31.000 0.000 NA   NA
 325694 325695 PD0920 PD0921     TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 325695 325696 PD0921 PD0922     FALSE 0.061 364.000 0.000 NA   NA
 325696 325697 PD0922 PD0923     TRUE 0.741 6.000 0.000 NA   NA
 325697 325698 PD0923 PD0924     TRUE 0.991 45.000 0.750 1.000   NA
 325698 325699 PD0924 PD0925     FALSE 0.179 212.000 0.000 NA   NA
 325699 325700 PD0925 PD0926     FALSE 0.289 158.000 0.000 NA   NA
 325700 325701 PD0926 PD0927     TRUE 0.998 6.000 1.000 NA   NA
 325701 325702 PD0927 PD0928     TRUE 0.994 -28.000 1.000 NA   NA
 325703 325704 PD0929 PD0930     FALSE 0.466 60.000 0.000 NA   NA
 325704 325705 PD0930 PD0931     FALSE 0.411 91.000 0.000 NA   NA
 325707 325708 PD0933 PD0934     FALSE 0.397 109.000 0.000 NA   NA
 325708 325709 PD0934 PD0935     TRUE 0.695 13.000 0.000 NA   NA
 325709 325710 PD0935 PD0936     FALSE 0.357 131.000 0.000 NA   NA
 325710 325711 PD0936 PD0937     TRUE 0.643 20.000 0.000 NA   NA
 325711 325712 PD0937 PD0938     FALSE 0.374 126.000 0.000 NA   NA
 325712 325713 PD0938 PD0939     TRUE 0.991 41.000 0.750 1.000   NA
 325713 325714 PD0939 PD0940     FALSE 0.417 88.000 0.000 NA   NA
 325714 325715 PD0940 PD0941     FALSE 0.159 225.000 0.000 NA   NA
 325715 325716 PD0941 PD0942     FALSE 0.333 139.000 0.000 NA   NA
 398918 325718 PD0944 PD0945 tRNA-Lys exsB FALSE 0.542 42.000 0.000 NA   NA
 325720 2155378 PD0947 PD0948 fumB ctp FALSE 0.043 241.000 0.000 1.000 N NA
 2155378 2155379 PD0948 PD0949 ctp ctp TRUE 0.857 115.000 0.000 0.037 Y NA
 2155379 2155380 PD0949 PD0950 ctp   FALSE 0.016 1267.000 0.000 0.037   NA
 325724 10784596 PD0952 PD0953 traD   TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 10784596 325725 PD0953 PD0954     FALSE 0.165 222.000 0.000 NA   NA
 325725 325726 PD0954 PD0955     FALSE 0.017 726.000 0.000 1.000   NA
 325726 325727 PD0955 PD0956     FALSE 0.063 487.000 0.000 0.024   NA
 325727 325728 PD0956 PD0957     FALSE 0.031 505.000 0.000 NA   NA
 325728 325729 PD0957 PD0958     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 325729 325730 PD0958 PD0959     TRUE 0.980 -3.000 0.167 NA   NA
 325730 325731 PD0959 PD0960   parE FALSE 0.308 150.000 0.000 NA   NA
 325731 325732 PD0960 PD0961 parE parD TRUE 0.985 9.000 0.300 NA   NA
 325732 325733 PD0961 PD0962 parD   FALSE 0.337 138.000 0.000 NA   NA
 325733 325734 PD0962 PD0963     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 325734 325735 PD0963 PD0964     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 325735 325736 PD0964 PD0965     TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 325736 325737 PD0965 PD0966     TRUE 0.995 0.000 0.500 NA   NA
 325738 325739 PD0967 PD0968     TRUE 0.996 -3.000 0.588 NA   NA
 2155381 325741 PD0969 PD0970     FALSE 0.311 148.000 0.000 NA   NA
 325741 325742 PD0970 PD0971     TRUE 0.996 -3.000 0.571 NA   NA
 325742 325743 PD0971 PD0972     TRUE 0.991 10.000 0.429 NA   NA
 325743 325744 PD0972 PD0973     TRUE 0.997 1.000 0.800 NA   NA
 325744 325745 PD0973 PD0974     TRUE 0.994 -13.000 0.800 NA   NA
 325745 325746 PD0974 PD0975     TRUE 0.973 -19.000 0.300 NA   NA
 325746 325747 PD0975 PD0976     TRUE 0.990 -3.000 0.300 NA   NA
 325747 325748 PD0976 PD0977     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 325748 325749 PD0977 PD0978     FALSE 0.454 64.000 0.000 NA   NA
 325749 325750 PD0978 PD0979     TRUE 0.973 10.000 0.182 NA   NA
 325750 325751 PD0979 PD0980     TRUE 0.963 10.000 0.139 NA   NA
 325751 325752 PD0980 PD0981   traN TRUE 0.972 -3.000 0.111 NA   NA
 325753 325754 PD0982 PD0983     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325755 325756 PD0984 PD0985     FALSE 0.073 320.000 0.000 NA   NA
 325756 325757 PD0985 PD0986   pspA TRUE 0.695 13.000 0.000 NA   NA
 325757 325758 PD0986 PD0987 pspA   TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325758 10784597 PD0987 PD0988     TRUE 0.695 13.000 0.000 NA   NA
 10784597 325759 PD0988 PD0989     FALSE 0.012 888.000 0.000 NA   NA
 325759 325760 PD0989 PD0990   int FALSE 0.203 56.000 0.000 NA N NA
 325760 325761 PD0990 PD0991 int   FALSE 0.325 142.000 0.000 NA   NA
 325761 325762 PD0991 PD0992     TRUE 0.909 -18.000 0.074 NA   NA
 325762 325763 PD0992 PD0993     TRUE 0.954 -10.000 0.148 NA   NA
 325763 325764 PD0993 PD0994     FALSE 0.079 306.000 0.000 NA   NA
 325764 325765 PD0994 PD0995     TRUE 0.996 -10.000 1.000 NA   NA
 325765 325766 PD0995 PD0996   lycV TRUE 0.685 -7.000 0.000 NA   NA
 325766 325767 PD0996 PD0997 lycV   FALSE 0.415 90.000 0.000 NA   NA
 325767 325768 PD0997 PD0998     TRUE 0.629 -13.000 0.000 NA   NA
 325768 325769 PD0998 PD0999     FALSE 0.218 189.000 0.000 NA   NA
 325769 325770 PD0999 PD1000     FALSE 0.009 1257.000 0.000 NA   NA
 325770 325771 PD1000 PD1001     TRUE 0.582 -21.000 0.000 NA   NA
 325771 325772 PD1001 PD1002     TRUE 0.964 -3.000 0.000 NA Y NA
 325772 325773 PD1002 PD1003     FALSE 0.098 278.000 0.000 NA   NA
 325774 325775 PD1004 PD1005     FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 325777 325778 PD1007 PD1008     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325778 325779 PD1008 PD1009     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325779 325780 PD1009 PD1010     FALSE 0.576 34.000 0.000 NA   NA
 325780 325781 PD1010 PD1011     FALSE 0.144 235.000 0.000 NA   NA
 325781 325782 PD1011 PD1012     TRUE 0.924 40.000 0.133 NA   NA
 325782 325783 PD1012 PD1013     TRUE 0.670 16.000 0.000 NA   NA
 325783 325784 PD1013 PD1014     TRUE 0.974 -3.000 0.080 0.060   NA
 325784 325785 PD1014 PD1015   lpxD TRUE 0.605 29.000 0.000 1.000   NA
 325785 2155382 PD1015 PD1016 lpxD   FALSE 0.107 261.000 0.000 NA   NA
 2155382 325787 PD1016 PD1017   ssb FALSE 0.181 67.000 0.000 NA N NA
 325787 325788 PD1017 PD1018 ssb   TRUE 0.647 19.000 0.000 NA   NA
 325788 325789 PD1018 PD1019   int TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 325789 325790 PD1019 PD1020 int ntrB FALSE 0.133 135.000 0.000 1.000 N NA
 325790 325791 PD1020 PD1021 ntrB ntrC TRUE 0.998 -7.000 0.587 1.000 Y NA
 325793 325794 PD1024 PD1025 amtB glnB TRUE 0.865 -10.000 0.048 1.000 N NA
 325794 325795 PD1025 PD1026 glnB glnA FALSE 0.473 254.000 0.000 1.000 Y NA
 325798 325799 PD1029 PD1030     TRUE 0.910 36.000 0.088 NA   NA
 325799 325800 PD1030 PD1031     TRUE 0.968 -3.000 0.088 NA   NA
 325800 2155383 PD1031 PD1032     FALSE 0.042 439.000 0.000 NA   NA
 2155383 325802 PD1032 PD1033     FALSE 0.194 199.000 0.000 NA   NA
 325803 325804 PD1034 PD1035 ubiB   TRUE 0.994 -3.000 0.432 1.000   NA
 325805 325806 PD1036 PD1037 purU   FALSE 0.073 319.000 0.000 NA   NA
 325806 325807 PD1037 PD1038     FALSE 0.553 138.000 0.009 NA   NA
 325807 325808 PD1038 PD1039     TRUE 0.816 43.000 0.026 NA   NA
 325808 325809 PD1039 PD1040   ohr FALSE 0.218 189.000 0.000 NA   NA
 325809 325810 PD1040 PD1041 ohr wcaG FALSE 0.039 250.000 0.000 1.000 N NA
 325810 325811 PD1041 PD1042 wcaG prc FALSE 0.292 375.000 0.000 1.000 Y NA
 325811 2155384 PD1042 PD1043 prc ilvC FALSE 0.007 578.000 0.000 1.000 N NA
 2155384 325813 PD1043 PD1044 ilvC ilvG TRUE 0.953 47.000 0.012 0.002 Y NA
 325813 325814 PD1044 PD1045 ilvG ilvM TRUE 0.997 -16.000 0.943 0.001   NA
 325814 325815 PD1045 PD1046 ilvM tdcB TRUE 0.671 118.000 0.017 1.000   NA
 325815 325816 PD1046 PD1047 tdcB leuA TRUE 0.924 55.000 0.013 1.000 Y NA
 325817 325818 PD1048 PD1049 fabH rpmF FALSE 0.544 95.000 0.014 1.000 N NA
 325818 325819 PD1049 PD1050 rpmF   TRUE 0.977 117.000 0.599 NA   NA
 325819 325820 PD1050 PD1051     FALSE 0.119 252.000 0.000 NA   NA
 325821 325822 PD1052 PD1053 moxR   TRUE 0.997 3.000 0.739 NA   NA
 325822 325823 PD1053 PD1054     TRUE 0.995 -7.000 0.727 NA   NA
 325823 325824 PD1054 PD1055   slp TRUE 0.707 -67.000 0.025 NA N NA
 325825 325826 PD1056 PD1057   recR FALSE 0.569 66.000 0.013 1.000 N NA
 325826 325827 PD1057 PD1058 recR   TRUE 0.949 193.000 0.604 NA   NA
 325827 325828 PD1058 PD1059   dnaX TRUE 0.991 7.000 0.411 NA   NA
 398892 325829 PD1060 PD1061 tRNA-Ser dinD FALSE 0.069 332.000 0.000 NA   NA
 325831 325832 PD1064 PD1065 gpsA secB TRUE 0.760 21.000 0.015 1.000 N NA
 325832 325833 PD1065 PD1066 secB   TRUE 0.831 126.000 0.158 NA N NA
 325833 325834 PD1066 PD1067     TRUE 0.714 79.000 0.019 NA   NA
 325835 325836 PD1068 PD1069 hemD   TRUE 0.999 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 325836 325837 PD1069 PD1070   hemY TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 325837 325838 PD1070 PD1071 hemY birA FALSE 0.265 405.000 0.000 1.000 Y NA
 325838 325839 PD1071 PD1072 birA baf TRUE 0.968 -3.000 0.147 1.000 N NA
 325839 325840 PD1072 PD1073 baf   TRUE 0.846 11.000 0.007 NA   NA
 325840 398893 PD1073 PD1074   tRNA-Thr FALSE 0.277 163.000 0.000 NA   NA
 325841 325842 PD1075 PD1076 int   TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 325842 325843 PD1076 PD1077     FALSE 0.010 1069.000 0.000 NA   NA
 325846 325847 PD1081 PD1082 mutS mtgA FALSE 0.043 433.000 0.000 1.000   NA
 325848 325849 PD1083 PD1084 hslO   TRUE 0.670 73.000 0.010 1.000   NA
 398916 325850 PD1085 PD1086 tRNA-Arg   FALSE 0.082 301.000 0.000 NA   NA
 325850 325851 PD1086 PD1087     FALSE 0.059 203.000 0.000 NA N NA
 325851 325852 PD1087 PD1088   D FALSE 0.212 192.000 0.000 NA   NA
 325852 325853 PD1088 PD1089 D X TRUE 0.669 -9.000 0.000 NA   NA
 325853 325854 PD1089 PD1090 X U TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 325854 325855 PD1090 PD1091 U   TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325855 325856 PD1091 PD1092     FALSE 0.371 127.000 0.000 NA   NA
 325856 325857 PD1092 PD1093   FII TRUE 0.975 3.000 0.154 NA   NA
 325857 325858 PD1093 PD1094 FII FI TRUE 0.990 0.000 0.308 NA   NA
 325858 2155385 PD1094 PD1095 FI   FALSE 0.451 65.000 0.000 NA   NA
 2155385 325860 PD1095 PD1096   I TRUE 0.997 8.000 0.833 NA   NA
 325860 325861 PD1096 PD1097 I J TRUE 0.685 -7.000 0.000 NA   NA
 325861 325862 PD1097 PD1098 J W TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325863 325864 PD1099 PD1100 dinJ   TRUE 0.977 -13.000 0.308 NA   NA
 325865 325866 PD1101 PD1102 V   TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 325866 325867 PD1102 PD1103     TRUE 0.980 -24.000 0.400 NA   NA
 325867 325868 PD1103 PD1104     TRUE 0.962 -3.000 0.071 NA   NA
 325868 325869 PD1104 PD1105     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 325869 325870 PD1105 PD1106     TRUE 0.656 18.000 0.000 NA   NA
 325870 325871 PD1106 PD1107   B TRUE 0.928 56.000 0.180 NA   NA
 325871 325872 PD1107 PD1108 B   TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 325872 325873 PD1108 PD1109     TRUE 0.977 4.000 0.176 NA   NA
 325873 325874 PD1109 PD1110   nohA TRUE 0.967 -7.000 0.176 NA   NA
 325874 325875 PD1110 PD1111 nohA   FALSE 0.063 357.000 0.000 NA   NA
 325875 325876 PD1111 PD1112     TRUE 0.996 -10.000 1.000 NA   NA
 325876 325877 PD1112 PD1113     TRUE 0.711 11.000 0.000 NA   NA
 325877 325878 PD1113 PD1114     FALSE 0.521 -33.000 0.000 NA   NA
 325878 325879 PD1114 PD1115     FALSE 0.047 419.000 0.000 NA   NA
 325879 325880 PD1115 PD1116     FALSE 0.184 208.000 0.000 NA   NA
 325880 325881 PD1116 PD1117     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325881 325882 PD1117 PD1118     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325882 325883 PD1118 PD1119     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325883 325884 PD1119 PD1120     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325887 325888 PD1123 PD1124     FALSE 0.138 239.000 0.000 NA   NA
 325888 325889 PD1124 PD1125     FALSE 0.281 161.000 0.000 NA   NA
 325889 325890 PD1125 PD1126     FALSE 0.154 229.000 0.000 NA   NA
 325890 325891 PD1126 PD1127     FALSE 0.173 218.000 0.000 NA   NA
 325891 325892 PD1127 PD1128     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325892 325893 PD1128 PD1129     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325893 325894 PD1129 PD1130     FALSE 0.012 907.000 0.000 NA   NA
 325894 325895 PD1130 PD1131     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325895 325896 PD1131 PD1132     TRUE 0.998 0.000 0.875 NA   NA
 325896 2155386 PD1132 PD1133     TRUE 0.798 87.000 0.051 NA   NA
 2155386 325898 PD1133 PD1134   dpoL TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 325898 325899 PD1134 PD1135 dpoL   TRUE 0.990 -3.000 0.250 0.057   NA
 325899 325900 PD1135 PD1136     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325900 325901 PD1136 PD1137     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325901 325902 PD1137 PD1138     FALSE 0.300 154.000 0.000 NA   NA
 325902 325903 PD1138 PD1139   int TRUE 0.655 -10.000 0.000 NA   NA
 325903 325904 PD1139 PD1140 int   FALSE 0.061 364.000 0.000 NA   NA
 325906 325907 PD1142 PD1143 fabB   TRUE 0.990 -3.000 0.303 NA   NA
 325907 325908 PD1143 PD1144     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325909 325910 PD1145 PD1146   spsQ TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 325911 325912 PD1147 PD1148 pilT pilU TRUE 0.985 166.000 0.436 0.030 Y NA
 325914 325915 PD1150 PD1151     FALSE 0.114 255.000 0.000 NA   NA
 325916 325917 PD1152 PD1153 hemC algR TRUE 0.876 8.000 0.032 1.000 N NA
 325917 325918 PD1153 PD1154 algR algZ TRUE 0.998 26.000 0.775 0.015 Y NA
 325918 325919 PD1154 PD1155 algZ estA TRUE 0.909 14.000 0.037 NA   NA
 325919 2155387 PD1155 PD1156 estA mdoH TRUE 0.883 29.000 0.046 NA   NA
 325923 10784600 PD1159 PD1160     FALSE 0.127 246.000 0.000 NA   NA
 325924 325925 PD1162 PD1163     TRUE 0.987 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 325925 325926 PD1163 PD1164   gluP TRUE 0.997 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 325926 325927 PD1164 PD1165 gluP   FALSE 0.013 866.000 0.000 NA   NA
 325927 325928 PD1165 PD1166     TRUE 0.801 46.000 0.024 NA   NA
 325928 325929 PD1166 PD1167   ugd TRUE 0.880 -7.000 0.020 NA   NA
 325929 325930 PD1167 PD1168 ugd   TRUE 0.974 27.000 0.357 1.000 N NA
 325930 325931 PD1168 PD1169   btuE FALSE 0.182 916.000 0.042 1.000 Y NA
 325932 325933 PD1170 PD1171     TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000   NA
 325933 325934 PD1171 PD1172     FALSE 0.109 259.000 0.000 NA   NA
 325935 325936 PD1173 PD1174     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 325936 325937 PD1174 PD1175     TRUE 0.980 -3.000 0.167 NA   NA
 325938 325939 PD1176 PD1177     TRUE 0.986 4.000 0.286 NA   NA
 325940 325941 PD1178 PD1179     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 325941 325942 PD1179 PD1180     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 325942 325943 PD1180 PD1181     TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 325943 325944 PD1181 PD1182     TRUE 0.995 0.000 0.500 NA   NA
 325945 325946 PD1183 PD1184     TRUE 0.987 -16.000 0.490 NA   NA
 2155388 325948 PD1185 PD1186     FALSE 0.311 148.000 0.000 NA   NA
 325948 325949 PD1186 PD1187     TRUE 0.996 -3.000 0.571 NA   NA
 325949 325950 PD1187 PD1188     TRUE 0.991 10.000 0.429 NA   NA
 325950 10784601 PD1188 PD1189     TRUE 0.665 17.000 0.000 NA   NA
 325951 325952 PD1190 PD1192 dpoL   TRUE 0.988 -3.000 0.250 NA   NA
 325952 325953 PD1192 PD1193     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325953 325954 PD1193 PD1194     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325954 325955 PD1194 PD1195     FALSE 0.300 154.000 0.000 NA   NA
 325955 325956 PD1195 PD1196   int TRUE 0.655 -10.000 0.000 NA   NA
 325960 325961 PD1200 PD1201 bfeA ybaL FALSE 0.068 1022.000 0.000 1.000 Y NA
 325961 325962 PD1201 PD1202 ybaL phoX FALSE 0.292 375.000 0.000 1.000 Y NA
 325962 325963 PD1202 PD1203 phoX pstC TRUE 0.943 112.000 0.033 0.002 Y NA
 325963 325964 PD1203 PD1204 pstC pstA TRUE 0.999 0.000 0.537 0.002 Y NA
 325964 2155390 PD1204 PD1205 pstA pstB TRUE 0.998 21.000 0.526 0.002 Y NA
 2155390 325966 PD1205 PD1206 pstB phoU TRUE 0.970 18.000 0.034 NA Y NA
 325966 325967 PD1206 PD1207 phoU rnt FALSE 0.053 219.000 0.000 NA N NA
 325967 325968 PD1207 PD1208 rnt ksgA FALSE 0.010 482.000 0.000 1.000 N NA
 325968 325969 PD1208 PD1209 ksgA apaG TRUE 0.855 37.000 0.078 NA N NA
 325969 325970 PD1209 PD1210 apaG apaH TRUE 0.970 15.000 0.267 NA N NA
 325970 325971 PD1210 PD1211 apaH   FALSE 0.027 544.000 0.000 NA   NA
 325974 398915 PD1214 PD1215   tRNA-Ser FALSE 0.020 668.000 0.000 NA   NA
 325976 325977 PD1217 PD1218 dnaQ rnhA TRUE 0.996 -3.000 0.248 1.000 Y NA
 325977 325978 PD1218 PD1219 rnhA   TRUE 0.693 14.000 0.000 1.000   NA
 325979 325980 PD1220 PD1221 gloB   FALSE 0.044 425.000 0.000 NA   NA
 325980 325981 PD1221 PD1222     FALSE 0.013 846.000 0.000 NA   NA
 325981 325982 PD1222 PD1223   tex TRUE 0.611 123.000 0.010 NA   NA
 325982 325983 PD1223 PD1224 tex   FALSE 0.004 816.000 0.000 1.000 N NA
 325983 325984 PD1224 PD1225     FALSE 0.411 91.000 0.000 NA   NA
 325984 325985 PD1225 PD1226   ppa FALSE 0.234 183.000 0.000 NA   NA
 325985 325986 PD1226 PD1227 ppa   FALSE 0.046 420.000 0.000 NA   NA
 325988 325989 PD1228 PD1230   leuS FALSE 0.554 122.000 0.005 NA   NA
 325989 325990 PD1230 PD1231 leuS   TRUE 0.874 91.000 0.182 NA N NA
 325990 325991 PD1231 PD1232   holA TRUE 0.964 11.000 0.199 NA N NA
 325991 325992 PD1232 PD1233 holA nadD TRUE 0.630 30.000 0.006 1.000 N NA
 325992 325993 PD1233 PD1234 nadD   TRUE 0.904 18.000 0.044 NA   NA
 325993 325994 PD1234 PD1235   mltB FALSE 0.009 1352.000 0.000 NA   NA
 325994 325995 PD1235 PD1236 mltB rlpA TRUE 0.997 -3.000 0.298 NA Y NA
 325998 325999 PD1239 PD1240     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 325999 326000 PD1240 PD1241     FALSE 0.163 223.000 0.000 NA   NA
 326000 326001 PD1241 PD1242     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326001 326002 PD1242 PD1243     FALSE 0.076 314.000 0.000 NA   NA
 326002 326003 PD1243 PD1244     TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 326003 326004 PD1244 PD1245     TRUE 0.768 268.000 0.333 NA   NA
 326004 10784602 PD1245 PD1246     FALSE 0.340 137.000 0.000 NA   NA
 326006 326007 PD1248 PD1249     TRUE 0.749 5.000 0.000 NA   NA
 326007 326008 PD1249 PD1250     FALSE 0.490 55.000 0.000 NA   NA
 326009 326010 PD1251 PD1252 prmA   FALSE 0.402 98.000 0.000 NA   NA
 326010 326011 PD1252 PD1253   efp FALSE 0.429 82.000 0.000 NA   NA
 326013 326014 PD1255 PD1256 serA potE TRUE 0.788 132.000 0.000 1.000 Y NA
 326014 326015 PD1256 PD1257 potE potE TRUE 0.998 78.000 0.833 0.002 Y NA
 326015 326016 PD1257 PD1258 potE fucA2 TRUE 0.902 5.000 0.041 1.000 N NA
 326016 326017 PD1258 PD1259 fucA2   TRUE 0.934 37.000 0.148 1.000   NA
 326017 326018 PD1259 PD1260   masA TRUE 0.985 3.000 0.231 1.000   NA
 326019 326020 PD1261 PD1262 hisI hisF TRUE 0.998 -7.000 0.430 0.004 Y NA
 326020 326021 PD1262 PD1263 hisF hisA TRUE 0.992 113.000 0.433 0.004 Y NA
 326021 326022 PD1263 PD1264 hisA hisH TRUE 0.997 -3.000 0.210 0.004 Y NA
 326022 326023 PD1264 PD1265 hisH hisB TRUE 0.995 -3.000 0.128 0.004 Y NA
 326023 326024 PD1265 PD1266 hisB hisC TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.004 Y NA
 326024 326025 PD1266 PD1267 hisC hisD TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.004 Y NA
 326025 326026 PD1267 PD1268 hisD hisG TRUE 0.996 -3.000 0.171 0.004 Y NA
 326026 326027 PD1268 PD1269 hisG   TRUE 0.921 -3.000 0.013 1.000   NA
 326027 326028 PD1269 PD1270   hisS FALSE 0.027 546.000 0.000 1.000   NA
 326028 326029 PD1270 PD1271 hisS thrC FALSE 0.023 316.000 0.000 1.000 N NA
 326029 326030 PD1271 PD1272 thrC thrB TRUE 0.984 50.000 0.233 1.000 Y NA
 326030 326031 PD1272 PD1273 thrB lysC TRUE 0.978 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 326031 326032 PD1273 PD1274 lysC pyrB FALSE 0.034 515.000 0.000 0.004 N NA
 326032 326033 PD1274 PD1275 pyrB   TRUE 0.865 5.000 0.022 1.000 N NA
 326033 326034 PD1275 PD1276   algH TRUE 0.971 -7.000 0.263 NA N NA
 326034 326035 PD1276 PD1277 algH dacC FALSE 0.010 482.000 0.000 NA N NA
 326035 2155392 PD1277 PD1278 dacC cpeB FALSE 0.007 612.000 0.000 1.000 N NA
 2155392 326037 PD1278 PD1279 cpeB dnaJ FALSE 0.008 546.000 0.000 1.000 N NA
 326037 326038 PD1279 PD1280 dnaJ hspA TRUE 0.941 145.000 0.133 NA Y NA
 326038 326039 PD1280 PD1281 hspA pbpC FALSE 0.029 277.000 0.000 NA N NA
 326039 326040 PD1281 PD1282 pbpC   FALSE 0.242 180.000 0.000 NA   NA
 326041 326042 PD1283 PD1284   algU FALSE 0.003 955.000 0.000 1.000 N NA
 326042 326043 PD1284 PD1285 algU   TRUE 0.996 -3.000 0.705 NA N NA
 326043 326044 PD1285 PD1286   mucD TRUE 0.654 98.000 0.035 NA N NA
 326044 326045 PD1286 PD1287 mucD lepA FALSE 0.263 184.000 0.007 1.000 N NA
 326045 326046 PD1287 PD1288 lepA lepB TRUE 0.874 101.000 0.187 1.000 N NA
 326046 326047 PD1288 PD1289 lepB   TRUE 0.957 -3.000 0.053 NA   NA
 326047 326048 PD1289 PD1290   rnc TRUE 0.826 -13.000 0.013 NA   NA
 326048 326049 PD1290 PD1291 rnc era TRUE 0.949 -3.000 0.017 0.029   NA
 326049 326050 PD1291 PD1292 era recO FALSE 0.389 206.000 0.012 1.000   NA
 326051 326052 PD1293 PD1294 dxs ppa FALSE 0.019 690.000 0.000 1.000   NA
 326052 326053 PD1294 PD1295 ppa   TRUE 0.997 -3.000 0.684 NA   NA
 326054 326055 PD1296 PD1297 acs   FALSE 0.032 497.000 0.000 NA   NA
 326055 326056 PD1297 PD1298     FALSE 0.038 457.000 0.000 NA   NA
 326056 326057 PD1298 PD1299     FALSE 0.015 738.000 0.000 NA   NA
 2155393 326059 PD1300 PD1301     FALSE 0.245 361.000 0.043 NA   NA
 326060 326061 PD1302 PD1303 glpD glpF TRUE 0.814 117.000 0.129 1.000 N NA
 326061 326062 PD1303 PD1304 glpF glpK FALSE 0.546 56.000 0.008 1.000 N NA
 326064 326065 PD1306 PD1307     FALSE 0.191 201.000 0.000 NA   NA
 326065 326066 PD1307 PD1308   metE TRUE 0.679 15.000 0.000 NA   NA
 326066 326067 PD1308 PD1309 metE   FALSE 0.447 67.000 0.000 NA   NA
 326067 326068 PD1309 PD1310   pncA TRUE 0.765 22.000 0.004 NA   NA
 2155394 326070 PD1311 PD1312     FALSE 0.090 294.000 0.000 1.000   NA
 326070 326071 PD1312 PD1313   dpm1 TRUE 0.989 -3.000 0.273 1.000   NA
 326071 326072 PD1313 PD1314 dpm1 wbnF TRUE 0.987 39.000 0.227 1.000 Y NA
 326072 326073 PD1314 PD1315 wbnF   FALSE 0.074 307.000 0.002 1.000 N NA
 326073 326074 PD1315 PD1316   parA TRUE 0.997 0.000 0.827 1.000 N NA
 326074 326075 PD1316 PD1317 parA   FALSE 0.086 299.000 0.000 1.000   NA
 326075 326076 PD1317 PD1318   serS FALSE 0.014 801.000 0.000 1.000   NA
 10784603 326078 PD1320 PD1321     FALSE 0.074 318.000 0.000 NA   NA
 326080 326081 PD1323 PD1324 lycV   FALSE 0.504 53.000 0.000 1.000   NA
 326082 326083 PD1325 PD1326 uvrC pgsA TRUE 0.981 -3.000 0.227 1.000 N NA
 2155395 326086 PD1329 PD1330     FALSE 0.182 209.000 0.000 NA   NA
 326088 326089 PD1332 PD1334     FALSE 0.305 151.000 0.000 NA   NA
 326090 326091 PD1333 PD1335 tnp hemL FALSE 0.022 326.000 0.000 1.000 N NA
 2155397 326094 PD1337 PD1338 kdsB   TRUE 0.933 -3.000 0.050 1.000 N NA
 326096 326097 PD1340 PD1341 higA vapI TRUE 0.967 10.000 0.157 NA   NA
 326098 326099 PD1342 PD1343 hicB hicA FALSE 0.533 -30.000 0.000 NA   NA
 326099 326100 PD1343 PD1344 hicA   FALSE 0.498 53.000 0.000 NA   NA
 326100 326101 PD1344 PD1345     FALSE 0.371 129.000 0.000 1.000   NA
 326101 326102 PD1345 PD1346     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326102 326103 PD1346 PD1347     TRUE 0.593 -19.000 0.000 NA   NA
 326103 2155398 PD1347 PD1349     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326105 326106 PD1348 PD1350 trbL trbN TRUE 0.972 6.000 0.167 NA   NA
 326106 326107 PD1350 PD1351 trbN   FALSE 0.022 602.000 0.000 NA   NA
 326107 326108 PD1351 PD1352     TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 326109 326110 PD1353 PD1354     FALSE 0.142 236.000 0.000 NA   NA
 326110 326111 PD1354 PD1355     FALSE 0.030 508.000 0.000 NA   NA
 326111 326112 PD1355 PD1356   aroA FALSE 0.038 460.000 0.000 NA   NA
 326112 326113 PD1356 PD1357 aroA pheA TRUE 0.945 53.000 0.035 1.000 Y NA
 326113 326114 PD1357 PD1358 pheA serC TRUE 0.960 80.000 0.121 1.000 Y NA
 326116 326117 PD1360 PD1361 natB natA TRUE 0.996 -3.000 0.271 NA Y NA
 326117 326118 PD1361 PD1362 natA slpD TRUE 0.989 -3.000 0.292 1.000   NA
 326118 326119 PD1362 PD1363 slpD folA FALSE 0.289 160.000 0.000 1.000   NA
 326119 326120 PD1363 PD1364 folA thyA TRUE 0.823 109.000 0.134 1.000 N NA
 326120 326121 PD1364 PD1365 thyA lgt TRUE 0.972 -3.000 0.164 1.000 N NA
 326121 326122 PD1365 PD1366 lgt dgkA TRUE 0.867 87.000 0.000 0.070 Y NA
 326122 326123 PD1366 PD1367 dgkA colR FALSE 0.071 295.000 0.000 0.070 N NA
 326123 326124 PD1367 PD1368 colR tyrA FALSE 0.010 480.000 0.000 1.000 N NA
 326124 326125 PD1368 PD1369 tyrA dnaJ FALSE 0.189 69.000 0.000 1.000 N NA
 326125 326126 PD1369 PD1370 dnaJ dnaK TRUE 0.977 141.000 0.236 0.006 Y NA
 326126 326127 PD1370 PD1371 dnaK grpE TRUE 0.936 134.000 0.049 0.010 Y NA
 326127 326128 PD1371 PD1372 grpE hrcA TRUE 0.741 39.000 0.025 1.000 N NA
 326132 326133 PD1376 PD1377     TRUE 0.956 2.000 0.063 NA   NA
 326135 326136 PD1379 PD1380     FALSE 0.012 908.000 0.000 NA   NA
 326136 326137 PD1380 PD1381   deoD FALSE 0.541 90.000 0.013 1.000 N NA
 326137 326138 PD1381 PD1382 deoD hpt TRUE 0.992 2.000 0.067 0.003 Y NA
 326138 326139 PD1382 PD1383 hpt exoII TRUE 0.917 -3.000 0.034 1.000 N NA
 326139 326140 PD1383 PD1384 exoII   FALSE 0.483 157.000 0.006 1.000   NA
 326140 326141 PD1384 PD1385   trmA TRUE 0.664 62.000 0.007 1.000   NA
 326143 2155399 PD1387 PD1388 gumM gumK TRUE 0.635 171.000 0.043 NA   NA
 2155399 326145 PD1388 PD1389 gumK gumJ TRUE 0.898 121.000 0.182 NA   NA
 326145 326146 PD1389 PD1390 gumJ   TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326146 326147 PD1390 PD1391   gumH FALSE 0.400 101.000 0.000 NA   NA
 326147 2155400 PD1391 PD1392 gumH gumF FALSE 0.011 477.000 0.000 1.000 N NA
 2155400 326149 PD1392 PD1393 gumF gumE TRUE 0.656 18.000 0.000 NA   NA
 326149 326150 PD1393 PD1394 gumE gumD TRUE 0.941 46.000 0.188 NA   NA
 326150 326151 PD1394 PD1395 gumD gumC TRUE 0.595 212.000 0.000 NA Y NA
 326151 326152 PD1395 PD1396 gumC gumB TRUE 0.996 3.000 0.200 0.070 Y NA
 326152 326153 PD1396 PD1397 gumB leuB FALSE 0.005 711.000 0.000 1.000 N NA
 326153 326154 PD1397 PD1398 leuB leuD TRUE 0.592 585.000 0.159 0.002 Y NA
 326154 326155 PD1398 PD1399 leuD leuC TRUE 0.980 211.000 0.463 0.001 Y NA
 326158 326159 PD1402 PD1403 mtrC yegN TRUE 0.913 48.000 0.148 0.070 N NA
 326159 326160 PD1403 PD1404 yegN acrD TRUE 0.996 95.000 0.963 NA Y NA
 326161 326162 PD1405 PD1406   yahK FALSE 0.097 279.000 0.000 NA   NA
 326162 326163 PD1406 PD1407 yahK   FALSE 0.093 282.000 0.000 NA   NA
 326163 326164 PD1407 PD1408     FALSE 0.038 456.000 0.000 NA   NA
 326164 326165 PD1408 PD1409   grx FALSE 0.020 667.000 0.000 1.000   NA
 326168 326169 PD1412 PD1413 hlyB hlyD TRUE 0.994 -3.000 0.426 0.010 N NA
 326169 326170 PD1413 PD1414 hlyD   FALSE 0.022 616.000 0.000 NA   NA
 326170 326171 PD1414 PD1415     FALSE 0.398 105.000 0.000 NA   NA
 326171 326172 PD1415 PD1416     TRUE 0.776 3.000 0.000 NA   NA
 326172 326173 PD1416 PD1417     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326173 326174 PD1417 PD1418     TRUE 0.776 3.000 0.000 NA   NA
 326174 326175 PD1418 PD1419     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326175 326176 PD1419 PD1420     TRUE 0.776 3.000 0.000 NA   NA
 326176 326177 PD1420 PD1421     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326177 326178 PD1421 PD1422     TRUE 0.776 3.000 0.000 NA   NA
 326178 326179 PD1422 PD1423     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326179 326180 PD1423 PD1424     TRUE 0.776 3.000 0.000 NA   NA
 326180 326181 PD1424 PD1425     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326181 326182 PD1425 PD1426     TRUE 0.776 3.000 0.000 NA   NA
 326182 2155403 PD1426 PD1427   frpC TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 2155403 326184 PD1427 PD1428 frpC   TRUE 0.685 -7.000 0.000 NA   NA
 326184 326185 PD1428 PD1429     TRUE 0.729 8.000 0.000 NA   NA
 10784605 398914 PD1432 PD1433   tRNA-Thr FALSE 0.396 111.000 0.000 NA   NA
 326188 326189 PD1435 PD1436 lytB lspA TRUE 0.962 58.000 0.095 1.000 Y NA
 326189 326190 PD1436 PD1437 lspA ileS TRUE 0.799 135.000 0.147 1.000 N NA
 326190 326191 PD1437 PD1438 ileS ribF TRUE 0.983 -3.000 0.254 1.000 N NA
 326191 326192 PD1438 PD1439 ribF mviN TRUE 0.831 162.000 0.169 1.000   NA
 326194 326195 PD1441 PD1442   rpmA TRUE 0.916 169.000 0.335 1.000   NA
 326195 326196 PD1442 PD1443 rpmA rplU TRUE 0.998 24.000 0.667 0.022 Y NA
 326198 326199 PD1445 PD1446     FALSE 0.026 551.000 0.000 NA   NA
 326199 326200 PD1446 PD1447   guaA FALSE 0.472 59.000 0.000 NA   NA
 326200 326201 PD1447 PD1448 guaA guaB TRUE 0.788 239.000 0.190 0.001   NA
 326201 326202 PD1448 PD1449 guaB folD FALSE 0.562 117.000 0.004 1.000   NA
 326202 326203 PD1449 PD1450 folD gtaB FALSE 0.048 233.000 0.000 1.000 N NA
 326203 326204 PD1450 PD1451 gtaB capD TRUE 0.998 0.000 0.350 0.013 Y NA
 326204 326205 PD1451 PD1452 capD   TRUE 0.978 13.000 0.048 1.000 Y NA
 326205 326206 PD1452 PD1453     TRUE 0.921 0.000 0.038 1.000 N NA
 326206 326207 PD1453 PD1454     TRUE 0.995 5.000 0.576 NA   NA
 326207 326208 PD1454 PD1455   himD TRUE 0.952 40.000 0.208 NA   NA
 326208 326209 PD1455 PD1456 himD rpsA TRUE 0.917 110.000 0.292 1.000 N NA
 326209 326210 PD1456 PD1457 rpsA cmk TRUE 0.751 227.000 0.281 1.000 N NA
 326211 326212 PD1458 PD1459 rpmJ   FALSE 0.500 174.000 0.014 NA   NA
 326212 326213 PD1459 PD1460     TRUE 0.973 0.000 0.123 NA   NA
 326213 326214 PD1460 PD1461     TRUE 0.960 89.000 0.364 NA   NA
 326214 326215 PD1461 PD1462   traB TRUE 0.656 123.000 0.016 NA   NA
 326216 326217 PD1463 PD1464   malG TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000   NA
 326217 326218 PD1464 PD1465 malG malF TRUE 0.995 -3.000 0.160 0.020 Y NA
 326218 326219 PD1465 PD1466 malF malE TRUE 0.999 -3.000 0.660 0.020 Y NA
 326219 2155404 PD1466 PD1467 malE   TRUE 0.973 4.000 0.156 NA   NA
 2155404 326221 PD1467 PD1468   bolA FALSE 0.025 556.000 0.000 NA   NA
 326222 326223 PD1469 PD1470     TRUE 0.925 -13.000 0.083 NA   NA
 326223 326224 PD1470 PD1471   yciL TRUE 0.813 168.000 0.210 NA N NA
 326225 326226 PD1472 PD1473     TRUE 0.620 146.000 0.022 NA   NA
 326226 326227 PD1473 PD1474   aspC TRUE 0.953 11.000 0.099 1.000   NA
 326228 326229 PD1475 PD1476 ccmA ccmB TRUE 0.993 -3.000 0.074 0.004 Y NA
 326229 326230 PD1476 PD1477 ccmB ccmC TRUE 0.977 34.000 0.051 0.002 Y NA
 326230 326231 PD1477 PD1478 ccmC ccmE TRUE 0.931 158.000 0.067 0.004 Y NA
 326231 326232 PD1478 PD1479 ccmE ccmF TRUE 0.925 120.000 0.016 0.004 Y NA
 326232 326233 PD1479 PD1480 ccmF ccmG TRUE 0.999 -7.000 1.000 0.004 Y NA
 326233 326234 PD1480 PD1481 ccmG ccmH TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 326234 326235 PD1481 PD1482 ccmH cycH TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 326235 326236 PD1482 PD1483 cycH   FALSE 0.406 93.000 0.000 NA   NA
 326236 326237 PD1483 PD1484   met2 FALSE 0.251 176.000 0.000 NA   NA
 2155405 326239 PD1485 PD1486 pglA   FALSE 0.029 733.000 0.018 NA N NA
 326239 326240 PD1486 PD1487     TRUE 0.828 34.000 0.022 NA   NA
 326240 326241 PD1487 PD1488   ubiG TRUE 0.972 -13.000 0.259 1.000   NA
 326241 326242 PD1488 PD1489 ubiG   TRUE 0.891 31.000 0.104 1.000 N NA
 326242 326243 PD1489 PD1490   efp FALSE 0.237 174.000 0.002 1.000 N NA
 326246 326247 PD1493 PD1494 suhB bioD FALSE 0.095 170.000 0.000 1.000 N NA
 326247 326248 PD1494 PD1495 bioD int TRUE 0.804 -3.000 0.000 1.000   NA
 398913 326249 PD1496 PD1497 tRNA-Val pilZ FALSE 0.466 60.000 0.000 NA   NA
 326249 2155406 PD1497 PD1498 pilZ holB TRUE 0.980 18.000 0.382 NA N NA
 2155406 326251 PD1498 PD1499 holB   TRUE 0.749 30.000 0.005 NA   NA
 326251 326252 PD1499 PD1500   trpE TRUE 0.633 99.000 0.010 NA   NA
 326252 326253 PD1500 PD1501 trpE fabB FALSE 0.458 217.000 0.030 0.013 N NA
 326253 326254 PD1501 PD1502 fabB acpP TRUE 0.977 157.000 0.346 1.000 Y NA
 326254 326255 PD1502 PD1503 acpP fabG TRUE 0.978 171.000 0.321 0.005 Y NA
 326255 326256 PD1503 PD1504 fabG fabD TRUE 0.992 108.000 0.432 0.005 Y NA
 2155407 326259 PD1506 PD1507     TRUE 0.656 18.000 0.000 NA   NA
 326259 326260 PD1507 PD1508     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 326260 326261 PD1508 PD1509     FALSE 0.161 224.000 0.000 NA   NA
 326261 326262 PD1509 PD1510     FALSE 0.386 122.000 0.000 NA   NA
 326262 326263 PD1510 PD1511     FALSE 0.289 158.000 0.000 NA   NA
 326263 326264 PD1511 PD1512   ispA FALSE 0.022 616.000 0.000 NA   NA
 326264 326265 PD1512 PD1513 ispA xseB TRUE 0.975 -3.000 0.177 1.000 N NA
 326265 326266 PD1513 PD1514 xseB mesJ TRUE 0.615 32.000 0.006 1.000 N NA
 326266 2155408 PD1514 PD1515 mesJ phoA FALSE 0.039 431.000 0.002 1.000 N NA
 326269 326270 PD1517 PD1518     TRUE 0.998 46.000 1.000 NA Y NA
 326271 326272 PD1519 PD1520 slyD yxaH TRUE 0.871 63.000 0.098 NA   NA
 326272 326273 PD1520 PD1521 yxaH glpG FALSE 0.041 442.000 0.000 NA   NA
 326274 326275 PD1522 PD1523   nth FALSE 0.395 112.000 0.000 NA   NA
 326275 326276 PD1523 PD1524 nth   TRUE 0.699 45.000 0.005 NA   NA
 326277 398895 PD1525 PD1526   tRNA-Ser FALSE 0.012 923.000 0.000 NA   NA
 398895 326278 PD1526 PD1527 tRNA-Ser   TRUE 0.625 23.000 0.000 NA   NA
 326278 326279 PD1527 PD1528     TRUE 0.904 15.000 0.036 NA   NA
 326279 326280 PD1528 PD1529     FALSE 0.049 411.000 0.000 NA   NA
 326280 326281 PD1529 PD1530     FALSE 0.182 209.000 0.000 NA   NA
 326281 326282 PD1530 PD1531     FALSE 0.083 300.000 0.000 NA   NA
 326283 326284 PD1532 PD1533 aroE   FALSE 0.068 338.000 0.000 NA   NA
 326286 326287 PD1535 PD1536 dsbD cutA TRUE 0.875 -3.000 0.014 1.000 N NA
 326288 326289 PD1537 PD1538 groES mopA TRUE 0.984 111.000 0.269 0.010 Y NA
 326290 326291 PD1539 PD1540     TRUE 0.669 -9.000 0.000 NA   NA
 326291 326292 PD1540 PD1541     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326292 326293 PD1541 PD1542   dmt FALSE 0.525 -31.000 0.000 NA   NA
 326293 326294 PD1542 PD1543 dmt rfbB TRUE 0.776 3.000 0.000 NA   NA
 326294 326295 PD1543 PD1544 rfbB rmd TRUE 0.938 31.000 0.000 0.003 Y NA
 326295 326296 PD1544 PD1545 rmd gmd TRUE 0.993 1.000 0.095 0.004 Y NA
 326296 326297 PD1545 PD1546 gmd mtfA TRUE 0.825 92.000 0.000 1.000 Y NA
 326297 326298 PD1546 PD1547 mtfA   TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 326298 326299 PD1547 PD1548   cysM FALSE 0.018 691.000 0.000 NA   NA
 326299 326300 PD1548 PD1549 cysM uptF TRUE 0.802 130.000 0.081 NA   NA
 326300 326301 PD1549 PD1550 uptF uptE FALSE 0.074 318.000 0.000 NA   NA
 326301 326302 PD1550 PD1551 uptE uptD TRUE 0.998 3.000 0.857 NA   NA
 326303 326304 PD1552 PD1553 fhuA   TRUE 0.935 45.000 0.171 1.000   NA
 326304 326305 PD1553 PD1554     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 326305 326306 PD1554 PD1555     TRUE 0.995 26.000 0.848 NA   NA
 326306 326307 PD1555 PD1556     TRUE 0.994 25.000 0.808 NA   NA
 326307 326308 PD1556 PD1557   apbE TRUE 0.956 112.000 0.462 NA N NA
 326310 326311 PD1559 PD1560     TRUE 0.997 -3.000 0.642 NA   NA
 326312 326313 PD1561 PD1562   perM TRUE 0.986 -3.000 0.217 NA   NA
 326313 326314 PD1562 PD1563 perM   TRUE 0.968 -3.000 0.087 NA   NA
 326315 326316 PD1564 PD1565 purM   FALSE 0.548 -28.000 0.000 NA   NA
 326316 326317 PD1565 PD1566   purN FALSE 0.399 103.000 0.000 NA   NA
 326317 326318 PD1566 PD1567 purN   TRUE 0.737 65.000 0.020 NA   NA
 326318 2155409 PD1567 PD1568     TRUE 0.998 4.000 1.000 NA   NA
 326323 2155410 PD1572 PD1573 fabA   FALSE 0.003 995.000 0.000 NA N NA
 2155410 326325 PD1573 PD1574   rdgC TRUE 0.662 39.000 0.012 NA N NA
 326325 326326 PD1574 PD1575 rdgC   TRUE 0.928 32.000 0.121 1.000   NA
 326328 326329 PD1577 PD1578   tatA TRUE 0.835 75.000 0.073 NA   NA
 326329 326330 PD1578 PD1579 tatA tatB TRUE 0.970 18.000 0.157 0.009   NA
 326330 326331 PD1579 PD1580 tatB tatC TRUE 0.997 -3.000 0.314 NA Y NA
 2155411 326333 PD1581 PD1582   guaA FALSE 0.411 273.000 0.070 NA   NA
 326334 326335 PD1583 PD1584   az1 FALSE 0.313 147.000 0.000 NA   NA
 326336 326337 PD1585 PD1586     FALSE 0.073 327.000 0.000 1.000   NA
 326337 326338 PD1586 PD1587     TRUE 0.977 4.000 0.172 NA   NA
 326339 326340 PD1588 PD1589   btuB FALSE 0.054 515.000 0.000 0.031   NA
 326340 2155412 PD1589 PD1590 btuB metG TRUE 0.763 180.000 0.133 1.000   NA
 2155412 326342 PD1590 PD1591 metG ydgM FALSE 0.004 763.000 0.000 1.000 N NA
 326343 326344 PD1592 PD1593     FALSE 0.050 405.000 0.000 NA   NA
 326344 326345 PD1593 PD1594     FALSE 0.371 127.000 0.000 NA   NA
 326345 326346 PD1594 PD1595     FALSE 0.519 -58.000 0.000 NA   NA
 326346 326347 PD1595 PD1596     FALSE 0.506 -163.000 0.000 NA   NA
 326347 326348 PD1596 PD1597     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326348 326349 PD1597 PD1598     FALSE 0.515 47.000 0.000 NA   NA
 326349 326350 PD1598 PD1599     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326350 326351 PD1599 PD1600   vapE FALSE 0.048 415.000 0.000 NA   NA
 326351 326352 PD1600 PD1601 vapE   TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326353 326354 PD1602 PD1603   ssb TRUE 0.612 -16.000 0.000 NA   NA
 326354 326355 PD1603 PD1604 ssb   TRUE 0.647 19.000 0.000 NA   NA
 326355 10784606 PD1604 PD1605     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 10784606 326356 PD1605 PD1606     FALSE 0.014 816.000 0.000 NA   NA
 326357 326358 PD1607 PD1608   nspV TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326358 398912 PD1608 PD1609 nspV tRNA-Asn FALSE 0.061 364.000 0.000 NA   NA
 398912 326359 PD1609 PD1610 tRNA-Asn pilE FALSE 0.398 105.000 0.000 NA   NA
 326359 326360 PD1610 PD1611 pilE pilY1 TRUE 0.994 24.000 0.346 NA Y NA
 326360 326361 PD1611 PD1612 pilY1   TRUE 0.914 151.000 0.077 NA Y NA
 326361 326362 PD1612 PD1613     TRUE 0.993 3.000 0.171 NA Y NA
 326362 326363 PD1613 PD1614     TRUE 0.992 3.000 0.143 NA Y NA
 326363 326364 PD1614 PD1615     TRUE 0.984 -9.000 0.119 NA Y NA
 326364 326365 PD1615 PD1616     FALSE 0.575 146.000 0.014 NA   NA
 326365 2155413 PD1616 PD1617     FALSE 0.043 431.000 0.000 NA   NA
 326368 326369 PD1619 PD1620 engA   TRUE 0.962 26.000 0.203 1.000   NA
 326369 326370 PD1620 PD1621     TRUE 0.991 13.000 0.492 1.000   NA
 326370 326371 PD1621 PD1622     TRUE 0.700 79.000 0.015 1.000   NA
 326371 326372 PD1622 PD1623     TRUE 0.978 7.000 0.204 1.000   NA
 326372 326373 PD1623 PD1624     TRUE 0.876 56.000 0.086 1.000   NA
 326373 326374 PD1624 PD1625   ndk TRUE 0.966 11.000 0.156 1.000   NA
 326376 326377 PD1627 PD1628 purA   FALSE 0.536 214.000 0.051 NA   NA
 326377 326378 PD1628 PD1629   hflC TRUE 0.962 73.000 0.348 NA   NA
 326378 326379 PD1629 PD1630 hflC hflK TRUE 1.000 -3.000 0.947 0.011 Y NA
 326380 326381 PD1631 PD1632   pilH TRUE 0.855 81.000 0.150 1.000 N NA
 326382 326383 PD1633 PD1634   bbh3 FALSE 0.010 1099.000 0.000 NA   NA
 326383 326384 PD1634 PD1635 bbh3 proS FALSE 0.480 144.000 0.004 1.000   NA
 326384 326385 PD1635 PD1636 proS   TRUE 0.580 85.000 0.002 NA   NA
 326386 326387 PD1637 PD1638 pssA   TRUE 0.894 -3.000 0.005 1.000   NA
 326387 326388 PD1638 PD1639   rimI TRUE 0.886 1.000 0.005 1.000   NA
 326389 326390 PD1640 PD1641 bglX   FALSE 0.010 483.000 0.000 1.000 N NA
 326390 326391 PD1641 PD1642   folB TRUE 0.594 114.000 0.023 1.000 N NA
 326391 326392 PD1642 PD1643 folB gcp FALSE 0.561 83.000 0.014 1.000 N NA
 326393 326394 PD1644 PD1645 rpsU   TRUE 0.835 187.000 0.173 0.032   NA
 326394 326395 PD1645 PD1646   rbn FALSE 0.132 244.000 0.000 1.000   NA
 326395 326396 PD1646 PD1647 rbn dnaG FALSE 0.183 281.000 0.006 1.000   NA
 326397 326398 PD1648 PD1649     FALSE 0.066 346.000 0.000 NA   NA
 326398 326399 PD1649 PD1650   trpS FALSE 0.003 1294.000 0.000 1.000 N NA
 326399 326400 PD1650 PD1651 trpS recD FALSE 0.021 716.000 0.008 1.000 N NA
 326400 326401 PD1651 PD1652 recD recB TRUE 0.986 230.000 0.688 0.002 Y NA
 326401 326402 PD1652 PD1653 recB recC TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.002 Y NA
 326403 326404 PD1654 PD1655 ttg2A ttg2B TRUE 0.999 0.000 0.530 NA Y NA
 326404 326405 PD1655 PD1656 ttg2B ttg2C TRUE 0.966 143.000 0.562 NA   NA
 326405 326406 PD1656 PD1657 ttg2C ttg2D TRUE 0.936 -3.000 0.024 NA   NA
 326406 326407 PD1657 PD1658 ttg2D   TRUE 0.901 -10.000 0.041 NA   NA
 326407 326408 PD1658 PD1659   vacJ TRUE 0.903 15.000 0.035 NA   NA
 326409 326410 PD1660 PD1661   ccs50 FALSE 0.139 238.000 0.000 NA   NA
 326410 326411 PD1661 PD1662 ccs50 nrtD FALSE 0.054 385.000 0.000 NA   NA
 326411 326412 PD1662 PD1663 nrtD nrtB TRUE 0.997 43.000 0.667 1.000 Y NA
 326416 326417 PD1667 PD1668 adr   TRUE 0.902 35.000 0.079 NA   NA
 326417 2155415 PD1668 PD1669     TRUE 0.847 -25.000 0.034 NA   NA
 2155415 326419 PD1669 PD1670     FALSE 0.509 -154.000 0.000 NA   NA
 326421 326422 PD1672 PD1673 bfr   TRUE 0.945 82.000 0.070 NA Y NA
 326422 326423 PD1673 PD1674   nudh FALSE 0.538 103.000 0.015 NA N NA
 398896 398897 PD1675 PD1676 tRNA-Met tRNA-Gln FALSE 0.523 46.000 0.000 NA   NA
 326424 326425 PD1677 PD1678 metK phoQ FALSE 0.007 1245.000 0.000 0.089 N NA
 326425 326426 PD1678 PD1679 phoQ popP TRUE 0.991 16.000 0.214 1.000 Y NA
 326426 326427 PD1679 PD1680 popP   TRUE 0.880 91.000 0.143 NA   NA
 326427 326428 PD1680 PD1681     FALSE 0.135 240.000 0.000 NA   NA
 326428 326429 PD1681 PD1682   phuR FALSE 0.002 1638.000 0.000 1.000 N NA
 326430 326431 PD1683 PD1684     TRUE 0.987 135.000 1.000 NA   NA
 326432 326433 PD1685 PD1686 clpB   FALSE 0.009 510.000 0.000 1.000 N NA
 326434 326435 PD1687 PD1688 thiE bioI FALSE 0.004 878.000 0.000 1.000 N NA
 326436 326437 PD1689 PD1690 yjdB   TRUE 0.978 -3.000 0.152 1.000   NA
 326437 326438 PD1690 PD1691   pilQ FALSE 0.009 1382.000 0.000 1.000   NA
 326438 326439 PD1691 PD1692 pilQ pilP TRUE 0.999 0.000 0.668 NA Y NA
 326439 326440 PD1692 PD1693 pilP pilO TRUE 0.999 -3.000 0.680 NA Y NA
 326440 326441 PD1693 PD1694 pilO pilN TRUE 0.999 0.000 0.770 NA Y NA
 326441 326442 PD1694 PD1695 pilN pilM TRUE 0.999 0.000 0.616 NA Y NA
 326448 326449 PD1701 PD1702 dnaB   FALSE 0.017 712.000 0.000 NA   NA
 326449 326450 PD1702 PD1703     FALSE 0.010 1105.000 0.000 NA   NA
 326450 326451 PD1703 PD1704   cypX FALSE 0.018 701.000 0.000 NA   NA
 326451 326452 PD1704 PD1705 cypX recG FALSE 0.026 584.000 0.000 0.005 N NA
 326452 326453 PD1705 PD1706 recG   TRUE 0.922 9.000 0.076 NA N NA
 326453 326454 PD1706 PD1707   spoT TRUE 0.740 203.000 0.215 NA N NA
 326455 326456 PD1708 PD1709   mopB FALSE 0.002 1882.000 0.000 1.000 N NA
 326456 326457 PD1709 PD1710 mopB dsbB FALSE 0.003 958.000 0.000 1.000 N NA
 326459 326460 PD1712 PD1713     FALSE 0.008 1694.000 0.000 NA   NA
 326460 326461 PD1713 PD1714     FALSE 0.466 60.000 0.000 NA   NA
 326461 326462 PD1714 PD1715     FALSE 0.347 134.000 0.000 NA   NA
 326462 326463 PD1715 PD1716     TRUE 0.625 23.000 0.000 NA   NA
 326463 326464 PD1716 PD1717     TRUE 0.959 126.000 0.417 NA   NA
 326464 326465 PD1717 PD1718     FALSE 0.144 235.000 0.000 NA   NA
 326465 326466 PD1718 PD1719     FALSE 0.105 264.000 0.000 NA   NA
 326466 326467 PD1719 PD1720     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326467 326468 PD1720 PD1721     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326468 326469 PD1721 PD1722     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326469 326470 PD1722 PD1723     FALSE 0.012 907.000 0.000 NA   NA
 326470 326471 PD1723 PD1724     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326471 326472 PD1724 PD1725     TRUE 0.998 0.000 0.875 NA   NA
 326472 326473 PD1725 PD1726     TRUE 0.798 87.000 0.051 NA   NA
 326473 326474 PD1726 PD1727   dpoL TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 326474 326475 PD1727 PD1728 dpoL   TRUE 0.990 -3.000 0.250 0.050   NA
 326477 326478 PD1730 PD1731     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326478 10784607 PD1731 PD1732     FALSE 0.277 163.000 0.000 NA   NA
 398911 326479 PD1733 PD1734 tRNA-Val uvrB FALSE 0.398 105.000 0.000 NA   NA
 326481 326482 PD1736 PD1737   dapA TRUE 0.874 20.000 0.028 NA   NA
 326483 326484 PD1738 PD1739 gcvR bcp TRUE 0.856 47.000 0.102 NA N NA
 326484 10784608 PD1739 PD1740 bcp   FALSE 0.451 65.000 0.000 NA   NA
 326485 326486 PD1741 PD1742   thiL FALSE 0.018 701.000 0.000 NA   NA
 326486 326487 PD1742 PD1743 thiL nusB TRUE 0.901 91.000 0.225 1.000 N NA
 326487 326488 PD1743 PD1744 nusB ribH TRUE 0.858 -3.000 0.011 1.000 N NA
 326488 326489 PD1744 PD1745 ribH ribA TRUE 0.996 31.000 0.417 0.003 Y NA
 326489 326490 PD1745 PD1746 ribA ribC TRUE 0.979 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 326490 326491 PD1746 PD1747 ribC ribD TRUE 0.771 588.000 0.456 1.000 Y NA
 326491 326492 PD1747 PD1748 ribD   FALSE 0.428 424.000 0.277 NA N NA
 326492 10784609 PD1748 PD1749     TRUE 0.602 28.000 0.000 NA   NA
 10784609 326493 PD1749 PD1750   glyA FALSE 0.260 171.000 0.000 NA   NA
 326494 326495 PD1751 PD1752 yjjK yojH FALSE 0.026 553.000 0.000 1.000   NA
 326496 326497 PD1753 PD1754     FALSE 0.037 466.000 0.000 NA   NA
 326497 326498 PD1754 PD1755   rluD TRUE 0.978 2.000 0.168 NA   NA
 326500 326501 PD1757 PD1758   feoB TRUE 0.926 4.000 0.028 NA   NA
 326501 326502 PD1758 PD1759 feoB   TRUE 0.997 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 326502 2155416 PD1759 PD1760     FALSE 0.003 929.000 0.000 1.000 N NA
 2155416 326504 PD1760 PD1761     FALSE 0.577 51.000 0.008 1.000 N NA
 326504 326505 PD1761 PD1762   fmt TRUE 0.997 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 326505 326506 PD1762 PD1763 fmt def TRUE 0.962 106.000 0.105 0.031 Y NA
 326507 326508 PD1764 PD1765   smf TRUE 0.747 91.000 0.033 1.000   NA
 326508 326509 PD1765 PD1766 smf   TRUE 0.912 46.000 0.124 NA   NA
 326509 326510 PD1766 PD1767   topA FALSE 0.050 974.000 0.040 NA   NA
 326510 326511 PD1767 PD1768 topA   FALSE 0.494 115.000 0.011 NA N NA
 326512 326513 PD1769 PD1770 lpxA   TRUE 0.937 -3.000 0.006 0.005   NA
 326513 326514 PD1770 PD1771     FALSE 0.018 705.000 0.000 1.000   NA
 326514 326515 PD1771 PD1772     FALSE 0.171 221.000 0.000 1.000   NA
 326515 326516 PD1772 PD1773   sspB TRUE 0.711 11.000 0.000 NA   NA
 326516 326517 PD1773 PD1774 sspB sspA TRUE 0.994 31.000 0.831 NA   NA
 326517 326518 PD1774 PD1775 sspA petC TRUE 0.923 142.000 0.370 NA N NA
 326518 326519 PD1775 PD1776 petC petB TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.001 Y NA
 326519 326520 PD1776 PD1777 petB petA TRUE 0.996 5.000 0.233 0.001 Y NA
 326520 326521 PD1777 PD1778 petA yjbJ TRUE 0.682 138.000 0.033 NA   NA
 2155417 326523 PD1779 PD1780     TRUE 0.596 265.000 0.220 1.000 N NA
 326523 326524 PD1780 PD1781     TRUE 0.972 71.000 0.457 NA   NA
 326524 326525 PD1781 PD1782     TRUE 0.887 0.000 0.005 NA   NA
 326525 326526 PD1782 PD1783   corC TRUE 0.905 9.000 0.024 NA   NA
 326526 326527 PD1783 PD1784 corC   TRUE 0.712 120.000 0.029 NA   NA
 326527 326528 PD1784 PD1785   corA TRUE 0.969 -3.000 0.095 NA   NA
 326528 326529 PD1785 PD1786 corA   FALSE 0.056 380.000 0.000 NA   NA
 326530 326531 PD1787 PD1788     FALSE 0.490 55.000 0.000 NA   NA
 326531 326532 PD1788 PD1789     TRUE 0.687 14.000 0.000 NA   NA
 326532 326533 PD1789 PD1790     TRUE 0.695 13.000 0.000 NA   NA
 326533 326534 PD1790 PD1791     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326534 326535 PD1791 PD1792   pspA TRUE 0.695 13.000 0.000 NA   NA
 326535 326536 PD1792 PD1793 pspA mtfA FALSE 0.206 197.000 0.000 1.000   NA
 326536 326537 PD1793 PD1794 mtfA   TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326537 2155418 PD1794 PD1795     TRUE 0.630 22.000 0.000 NA   NA
 2155419 326540 PD1796 PD1797 ponB   TRUE 0.933 -3.000 0.021 1.000   NA
 326540 326541 PD1797 PD1798   yoaA FALSE 0.384 125.000 0.000 1.000   NA
 326542 326543 PD1799 PD1800   yadF FALSE 0.184 78.000 0.000 1.000 N NA
 326543 326544 PD1800 PD1801 yadF rfbU FALSE 0.133 135.000 0.000 1.000 N NA
 326544 326545 PD1801 PD1802 rfbU   TRUE 0.977 -3.000 0.195 1.000 N NA
 326545 326546 PD1802 PD1803     FALSE 0.523 46.000 0.000 NA   NA
 326547 326548 PD1804 PD1805 yusC yecS TRUE 0.997 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 326548 326549 PD1805 PD1806 yecS   TRUE 0.981 94.000 0.294 NA Y NA
 326550 326551 PD1807 PD1808 ompW   TRUE 0.636 21.000 0.000 NA   NA
 326552 326553 PD1809 PD1810 pdhB lpdA TRUE 0.994 46.000 0.463 1.000 Y NA
 326554 326555 PD1811 PD1812 czcD metB FALSE 0.015 409.000 0.000 1.000 N NA
 326555 326556 PD1812 PD1813 metB met2 TRUE 0.991 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 326559 326560 PD1816 PD1817   surE FALSE 0.107 261.000 0.000 NA   NA
 326560 326561 PD1817 PD1818 surE pcm TRUE 0.993 -3.000 0.353 1.000   NA
 326561 326562 PD1818 PD1819 pcm   TRUE 0.911 20.000 0.055 NA   NA
 326562 326563 PD1819 PD1820   nlpD TRUE 0.962 0.000 0.074 NA   NA
 326563 398898 PD1820 PD1821 nlpD tRNA-Pro FALSE 0.029 523.000 0.000 NA   NA
 326564 326565 PD1822 PD1823 phs alr FALSE 0.008 543.000 0.000 1.000 N NA
 326565 326566 PD1823 PD1824 alr dadA TRUE 0.865 -30.000 0.099 1.000 N NA
 326567 326568 PD1825 PD1826     FALSE 0.234 184.000 0.000 1.000   NA
 326568 326569 PD1826 PD1827   nahA TRUE 0.962 76.000 0.286 0.005   NA
 326569 326570 PD1827 PD1828 nahA   TRUE 0.997 15.000 0.417 0.005 Y NA
 326570 326571 PD1828 PD1829   xylA TRUE 0.994 73.000 0.500 0.015 Y NA
 10784610 326573 PD1830 PD1832     FALSE 0.476 58.000 0.000 NA   NA
 326573 326574 PD1832 PD1833   bga TRUE 0.942 220.000 0.300 1.000 Y NA
 326575 326576 PD1834 PD1835 pdxA surA TRUE 0.993 4.000 0.561 1.000 N NA
 326576 326577 PD1835 PD1836 surA imp TRUE 0.889 -3.000 0.020 1.000 N NA
 326578 326579 PD1837 PD1838 ubiH ubiF TRUE 0.999 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 326581 326582 PD1840 PD1841 cysG cysK TRUE 0.753 59.000 0.048 1.000 N NA
 326582 326583 PD1841 PD1842 cysK   TRUE 0.711 11.000 0.000 NA   NA
 326586 326587 PD1845 PD1846 fbaB pykA FALSE 0.178 849.000 0.010 0.006 Y NA
 326587 326588 PD1846 PD1847 pykA pgk FALSE 0.536 417.000 0.032 0.006 Y NA
 326589 326590 PD1848 PD1849 gltX zur TRUE 0.757 17.000 0.012 1.000 N NA
 326597 326598 PD1856 PD1857 engXCA secA FALSE 0.006 678.000 0.000 1.000 N NA
 326598 326599 PD1857 PD1858 secA   TRUE 0.647 151.000 0.068 1.000 N NA
 326601 326602 PD1860 PD1861 lpxC ftsZ FALSE 0.304 372.000 0.134 1.000 N NA
 326602 326603 PD1861 PD1862 ftsZ ftsA TRUE 0.980 176.000 0.460 1.000 Y NA
 326603 326604 PD1862 PD1863 ftsA ftsQ TRUE 0.991 -3.000 0.389 NA N NA
 326604 326605 PD1863 PD1864 ftsQ ddlB TRUE 0.986 107.000 0.372 NA Y NA
 326605 326606 PD1864 PD1865 ddlB murC TRUE 0.982 51.000 0.153 0.006 Y NA
 326606 326607 PD1865 PD1866 murC murG TRUE 0.986 56.000 0.283 1.000 Y NA
 326607 326608 PD1866 PD1867 murG ftsW TRUE 0.994 6.000 0.647 1.000 N NA
 326608 326609 PD1867 PD1868 ftsW mraY TRUE 0.927 0.000 0.018 0.006 N NA
 326609 326610 PD1868 PD1869 mraY murF TRUE 0.996 -10.000 0.309 0.006 Y NA
 326610 326611 PD1869 PD1870 murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.003 Y NA
 326611 326612 PD1870 PD1871 murE ftsI TRUE 0.980 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 326612 326613 PD1871 PD1872 ftsI ftsL TRUE 0.901 -3.000 0.024 1.000 N NA
 326613 326614 PD1872 PD1873 ftsL   TRUE 0.981 -3.000 0.227 1.000 N NA
 326614 326615 PD1873 PD1874     TRUE 0.991 29.000 0.635 NA   NA
 326615 326616 PD1874 PD1875   sac1 FALSE 0.009 1352.000 0.000 NA   NA
 326616 326617 PD1875 PD1876 sac1 micA TRUE 0.792 34.000 0.012 1.000   NA
 326617 326618 PD1876 PD1877 micA thiG TRUE 0.958 0.000 0.060 1.000   NA
 326618 326619 PD1877 PD1878 thiG   TRUE 0.986 16.000 0.130 1.000 Y NA
 326620 398899 PD1879 PD1880 estA tRNA-Gly FALSE 0.400 101.000 0.000 NA   NA
 326621 326622 PD1881 PD1882   actII TRUE 0.943 -25.000 0.171 NA   NA
 326622 326623 PD1882 PD1883 actII acs TRUE 0.977 146.000 0.727 NA   NA
 326623 326624 PD1883 PD1884 acs   TRUE 0.941 -76.000 0.196 NA   NA
 326624 326625 PD1884 PD1885     TRUE 0.990 -3.000 0.297 NA   NA
 326625 326626 PD1885 PD1886     FALSE 0.129 244.000 0.000 NA   NA
 326626 326627 PD1886 PD1887   acpP FALSE 0.560 -25.000 0.000 NA   NA
 326628 2155422 PD1888 PD1889   fkbO FALSE 0.484 56.000 0.000 NA   NA
 2155422 326630 PD1889 PD1890 fkbO   FALSE 0.044 426.000 0.000 NA   NA
 326630 326631 PD1890 PD1891   hlyU TRUE 0.705 -6.000 0.000 1.000   NA
 326631 326632 PD1891 PD1892 hlyU   TRUE 0.942 -3.000 0.031 NA   NA
 326632 326633 PD1892 PD1893     TRUE 0.967 -3.000 0.083 NA   NA
 326633 326634 PD1893 PD1894   scf56 TRUE 0.972 -3.000 0.115 NA   NA
 326634 326635 PD1894 PD1895 scf56 dcd FALSE 0.025 574.000 0.000 1.000   NA
 326636 326637 PD1896 PD1897   mutL TRUE 0.723 45.000 0.007 NA   NA
 326637 326638 PD1897 PD1898 mutL amiC FALSE 0.512 130.000 0.016 1.000 N NA
 326638 326639 PD1898 PD1899 amiC   FALSE 0.478 59.000 0.000 1.000   NA
 326639 326640 PD1899 PD1900     TRUE 0.804 -3.000 0.000 1.000   NA
 2155423 2155424 PD1902 PD1903 acvB   FALSE 0.335 141.000 0.000 1.000   NA
 326644 326645 PD1904 PD1905 rnd xrvA FALSE 0.099 279.000 0.000 1.000   NA
 398910 326648 PD1908 PD1909 tRNA-Pro   FALSE 0.362 130.000 0.000 NA   NA
 326648 326649 PD1909 PD1910   himA TRUE 0.981 -25.000 0.535 1.000 N NA
 326649 326650 PD1910 PD1911 himA pheT TRUE 0.950 25.000 0.208 1.000 N NA
 326650 326651 PD1911 PD1912 pheT pheS TRUE 0.995 84.000 0.574 0.001 Y NA
 326651 326652 PD1912 PD1913 pheS rplT TRUE 0.833 295.000 0.202 1.000 Y NA
 326652 326653 PD1913 PD1914 rplT rpmI TRUE 0.999 11.000 0.928 0.020 Y NA
 326653 326654 PD1914 PD1915 rpmI infC TRUE 0.972 246.000 0.652 1.000 Y NA
 326654 326655 PD1915 PD1916 infC thrS TRUE 0.964 131.000 0.186 1.000 Y NA
 326656 326657 PD1917 PD1918   rimK FALSE 0.010 1143.000 0.000 NA   NA
 326657 326658 PD1918 PD1919 rimK colR FALSE 0.006 685.000 0.000 1.000 N NA
 326658 326659 PD1919 PD1920 colR colS TRUE 0.996 -7.000 0.400 1.000 Y NA
 326660 326661 PD1921 PD1922 coaE pilD TRUE 0.963 -3.000 0.122 1.000 N NA
 326661 2155425 PD1922 PD1923 pilD pilC TRUE 0.997 7.000 0.454 1.000 Y NA
 326665 326666 PD1926 PD1927   pilB FALSE 0.115 843.000 0.000 0.012 Y NA
 326667 326668 PD1928 PD1929 pilR pilS TRUE 0.985 186.000 0.556 0.085 Y NA
 326669 326670 PD1930 PD1931 sucC sucD TRUE 0.999 29.000 0.806 0.001 Y NA
 326670 326671 PD1931 PD1932 sucD   FALSE 0.051 403.000 0.000 NA   NA
 326672 2155426 PD1933 PD1934 hecB   FALSE 0.007 576.000 0.000 NA N NA
 2155426 326674 PD1934 PD1935   gyrA FALSE 0.038 253.000 0.000 1.000 N NA
 326674 326675 PD1935 PD1936 gyrA   FALSE 0.238 194.000 0.007 1.000 N NA
 326675 326676 PD1936 PD1937     TRUE 0.578 131.000 0.009 NA   NA
 326676 326677 PD1937 PD1938   lysS FALSE 0.463 204.000 0.026 NA   NA
 326677 326678 PD1938 PD1939 lysS   TRUE 0.907 -3.000 0.009 1.000   NA
 326678 326679 PD1939 PD1940   ligA TRUE 0.823 11.000 0.002 1.000   NA
 326679 326680 PD1940 PD1941 ligA zipA FALSE 0.079 770.000 0.106 1.000 N NA
 326680 326681 PD1941 PD1942 zipA smc TRUE 0.974 59.000 0.115 0.011 Y NA
 326681 326682 PD1942 PD1943 smc rplI FALSE 0.058 217.000 0.000 1.000 N NA
 326682 326683 PD1943 PD1944 rplI rpsR TRUE 0.989 157.000 0.499 0.020 Y NA
 326683 326684 PD1944 PD1945 rpsR rpsF TRUE 0.996 12.000 0.319 0.020 Y NA
 326684 326685 PD1945 PD1946 rpsF   FALSE 0.135 240.000 0.000 NA   NA
 326688 326689 PD1949 PD1950 rfbD rfbE TRUE 0.985 7.000 0.045 0.085 Y NA
 326689 326690 PD1950 PD1951 rfbE   FALSE 0.066 346.000 0.000 NA   NA
 326690 326691 PD1951 PD1952   pyrD FALSE 0.094 281.000 0.000 NA   NA
 326691 326692 PD1952 PD1953 pyrD murB TRUE 0.846 -3.000 0.009 1.000 N NA
 326692 326693 PD1953 PD1954 murB   TRUE 0.757 -6.000 0.008 1.000 N NA
 326694 2155427 PD1955 PD1956 pgpB gcpE TRUE 0.761 -19.000 0.006 1.000   NA
 326696 326697 PD1957 PD1958 actS actR TRUE 0.995 -3.000 0.197 1.000 Y NA
 326698 326699 PD1959 PD1960 tsf rpsB TRUE 0.988 189.000 0.748 1.000 Y NA
 398900 326700 PD1961 PD1962 tRNA-Arg msbA FALSE 0.106 263.000 0.000 NA   NA
 326700 326701 PD1962 PD1963 msbA pcm FALSE 0.002 1597.000 0.000 1.000 N NA
 326701 326702 PD1963 PD1964 pcm tolC TRUE 0.802 23.000 0.028 1.000 N NA
 326705 326706 PD1967 PD1968 ppx ppk TRUE 0.955 60.000 0.076 1.000 Y NA
 326706 326707 PD1968 PD1969 ppk phoR TRUE 0.681 113.000 0.045 1.000 N NA
 326707 326708 PD1969 PD1970 phoR phoB TRUE 0.997 18.000 0.453 0.031 Y NA
 326708 2155428 PD1970 PD1971 phoB   TRUE 0.698 83.000 0.016 1.000   NA
 326710 326711 PD1972 PD1973 grxC icdA FALSE 0.005 697.000 0.000 1.000 N NA
 326713 326714 PD1975 PD1976 ogt enpP TRUE 0.814 29.000 0.013 1.000   NA
 326714 326715 PD1976 PD1977 enpP fdx FALSE 0.028 543.000 0.000 1.000   NA
 326716 326717 PD1978 PD1979     TRUE 0.720 117.000 0.030 NA   NA
 326718 326719 PD1980 PD1981 phhB tonB TRUE 0.910 8.000 0.025 1.000   NA
 326722 326723 PD1984 PD1985 gacA sseA FALSE 0.123 250.000 0.000 NA   NA
 326725 326726 PD1987 PD1988   sodM FALSE 0.050 405.000 0.000 NA   NA
 326727 326728 PD1989 PD1990 rnaSA3   TRUE 0.941 -3.000 0.031 NA   NA
 326729 326730 PD1991 PD1992 uup1   FALSE 0.096 280.000 0.000 NA   NA
 326730 326731 PD1992 PD1993     FALSE 0.052 402.000 0.000 NA   NA
 326733 326734 PD1995 PD1996 htpX tuf FALSE 0.002 1685.000 0.000 1.000 N NA
 326734 326735 PD1996 PD1997 tuf fusA TRUE 0.992 107.000 0.400 0.001 Y NA
 326735 326736 PD1997 PD1998 fusA rpsG TRUE 0.990 136.000 0.579 1.000 Y NA
 326736 326737 PD1998 PD1999 rpsG rpsL TRUE 0.998 16.000 0.620 0.004 Y NA
 326737 326738 PD1999 PD2000 rpsL rpoC FALSE 0.473 250.000 0.122 1.000 N NA
 326738 326739 PD2000 PD2001 rpoC rpoB TRUE 0.992 99.000 0.851 0.001   NA
 326739 326740 PD2001 PD2002 rpoB rplL TRUE 0.739 240.000 0.223 1.000   NA
 326740 326741 PD2002 PD2003 rplL rplJ TRUE 0.998 56.000 0.884 0.020 Y NA
 326741 326742 PD2003 PD2004 rplJ rplA TRUE 0.773 504.000 0.302 0.027 Y NA
 326742 326743 PD2004 PD2005 rplA rplK TRUE 0.999 5.000 0.838 0.027 Y NA
 326743 326744 PD2005 PD2006 rplK nusG TRUE 0.939 198.000 0.681 1.000 N NA
 326744 326745 PD2006 PD2007 nusG secE TRUE 0.995 14.000 0.843 1.000 N NA
 326745 398909 PD2007 PD2008 secE tRNA-Trp FALSE 0.510 49.000 0.000 NA   NA
 398909 326746 PD2008 PD2009 tRNA-Trp tuf FALSE 0.393 116.000 0.000 NA   NA
 326746 398908 PD2009 PD2010 tuf tRNA-Thr FALSE 0.523 46.000 0.000 NA   NA
 398908 398907 PD2010 PD2011 tRNA-Thr tRNA-Gly FALSE 0.538 43.000 0.000 NA   NA
 398907 398906 PD2011 PD2012 tRNA-Gly tRNA-Tyr FALSE 0.576 34.000 0.000 NA   NA
 398906 326747 PD2012 PD2013 tRNA-Tyr ychF FALSE 0.218 189.000 0.000 NA   NA
 326747 326748 PD2013 PD2014 ychF pth TRUE 0.991 13.000 0.184 1.000 Y NA
 326748 326749 PD2014 PD2015 pth rplY TRUE 0.995 55.000 0.496 0.030 Y NA
 326749 326750 PD2015 PD2016 rplY prsA TRUE 0.811 109.000 0.122 1.000 N NA
 326750 398905 PD2016 PD2017 prsA tRNA-Gln FALSE 0.383 123.000 0.000 NA   NA
 398905 326751 PD2017 PD2018 tRNA-Gln ispE TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 326751 326752 PD2018 PD2019 ispE lolB TRUE 0.919 -21.000 0.157 1.000 N NA
 326752 326753 PD2019 PD2020 lolB   TRUE 0.941 -3.000 0.062 1.000 N NA
 326754 326755 PD2021 PD2022 hemA prfA TRUE 0.942 -22.000 0.171 0.042 N NA
 2155429 326757 PD2023 PD2024     FALSE 0.064 356.000 0.000 NA   NA
 326758 326759 PD2025 PD2026     FALSE 0.417 88.000 0.000 NA   NA
 326761 326762 PD2027 PD2029     FALSE 0.214 190.000 0.000 NA   NA
 326762 326763 PD2029 PD2030     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 326763 326764 PD2030 PD2031     TRUE 0.984 66.000 0.643 NA   NA
 326767 326768 PD2034 PD2035   purK FALSE 0.021 332.000 0.000 1.000 N NA
 326768 326769 PD2035 PD2036 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 326770 326771 PD2037 PD2038     FALSE 0.028 538.000 0.000 NA   NA
 326772 326773 PD2039 PD2040   acvB FALSE 0.003 1087.000 0.000 NA N NA
 326773 326774 PD2040 PD2041 acvB rep FALSE 0.036 251.000 0.000 NA N NA
 326774 326775 PD2041 PD2042 rep mdoG FALSE 0.004 830.000 0.000 1.000 N NA
 326775 326776 PD2042 PD2043 mdoG sppA FALSE 0.005 715.000 0.000 1.000 N NA
 326776 326777 PD2043 PD2044 sppA norM FALSE 0.555 83.000 0.013 1.000 N NA
 326777 326778 PD2044 PD2045 norM   FALSE 0.068 337.000 0.000 NA   NA
 326778 326779 PD2045 PD2046     TRUE 0.990 39.000 0.667 NA   NA
 326781 326782 PD2048 PD2049 rpoH ung FALSE 0.416 111.000 0.005 1.000 N NA
 326782 326783 PD2049 PD2050 ung   TRUE 0.862 6.000 0.022 1.000 N NA
 326783 326784 PD2050 PD2051   ftsX TRUE 0.891 65.000 0.182 1.000 N NA
 326784 326785 PD2051 PD2052 ftsX ftsE TRUE 0.979 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 326785 326786 PD2052 PD2053 ftsE rhlB TRUE 0.613 68.000 0.007 0.084 N NA
 326787 326788 PD2054 PD2055 trxA rho FALSE 0.100 637.000 0.087 1.000 N NA
 326789 326790 PD2056 PD2057 icd ctpA FALSE 0.003 1085.000 0.000 1.000 N NA
 326790 326791 PD2057 PD2058 ctpA   TRUE 0.916 186.000 0.408 0.029 N NA
 326795 326796 PD2062 PD2063 gltD gltB TRUE 0.927 140.000 0.032 0.001 Y NA
 326797 326798 PD2064 PD2065 proC cirA FALSE 0.005 738.000 0.000 1.000 N NA
 326798 326799 PD2065 PD2066 cirA fucA1 TRUE 0.973 87.000 0.600 1.000 N NA
 326799 408281 PD2066 PD2067 fucA1 ssrA FALSE 0.083 300.000 0.000 NA   NA
 326800 326801 PD2068 PD2069     FALSE 0.037 463.000 0.000 NA   NA
 326801 326802 PD2069 PD2070   hsdR FALSE 0.015 739.000 0.000 NA   NA
 326802 326803 PD2070 PD2071 hsdR hsdS TRUE 0.990 -13.000 0.150 0.002 Y NA
 326803 326804 PD2071 PD2072 hsdS hsdM TRUE 0.993 0.000 0.104 0.048 Y NA
 326804 326805 PD2072 PD2073 hsdM   TRUE 0.703 12.000 0.000 NA   NA
 326805 2155430 PD2073 PD2074   hsdR FALSE 0.515 47.000 0.000 NA   NA
 2155430 326807 PD2074 PD2075 hsdR hsdS TRUE 0.968 36.000 0.025 0.002 Y NA
 326807 326808 PD2075 PD2076 hsdS hsdM TRUE 0.699 260.000 0.022 0.048 Y NA
 326811 326812 PD2079 PD2080     TRUE 0.974 -19.000 0.311 NA   NA
 326812 326813 PD2080 PD2081     TRUE 0.941 -7.000 0.083 NA   NA
 326813 326814 PD2081 PD2082     TRUE 0.994 -3.000 0.405 NA   NA
 326815 326816 PD2083 PD2084     FALSE 0.234 183.000 0.000 NA   NA
 326816 326817 PD2084 PD2085     FALSE 0.016 721.000 0.000 NA   NA
 326817 326818 PD2085 PD2086     FALSE 0.019 687.000 0.000 NA   NA
 326819 326820 PD2087 PD2088     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 326820 326821 PD2088 PD2089     FALSE 0.398 107.000 0.000 NA   NA
 326821 326822 PD2089 PD2090     TRUE 0.636 21.000 0.000 NA   NA
 326822 326823 PD2090 PD2091     TRUE 0.997 2.000 0.667 NA   NA
 326823 326824 PD2091 PD2092     TRUE 0.670 16.000 0.000 NA   NA
 326824 326825 PD2092 PD2093     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 326825 326826 PD2093 PD2094   frpC TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326826 326827 PD2094 PD2095 frpC   FALSE 0.150 231.000 0.000 NA   NA
 326827 326828 PD2095 PD2096     TRUE 0.762 4.000 0.000 NA   NA
 326828 326829 PD2096 PD2097   frpC TRUE 0.776 3.000 0.000 NA   NA
 398901 398902 PD2099 PD2100 tRNA-Pro tRNA-Arg FALSE 0.454 64.000 0.000 NA   NA
 398902 398903 PD2100 PD2101 tRNA-Arg tRNA-His FALSE 0.548 40.000 0.000 NA   NA
 398903 398904 PD2101 PD2102 tRNA-His tRNA-Lys FALSE 0.396 111.000 0.000 NA   NA
 398904 326831 PD2102 PD2103 tRNA-Lys   FALSE 0.033 495.000 0.000 NA   NA
 326832 326833 PD2104 PD2105     TRUE 0.991 4.000 0.364 NA   NA
 326835 326836 PD2107 PD2108     TRUE 0.749 5.000 0.000 NA   NA
 326836 326837 PD2108 PD2109     FALSE 0.078 308.000 0.000 NA   NA
 326837 326838 PD2109 PD2110   pspA TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 326838 326839 PD2110 PD2111 pspA   FALSE 0.041 440.000 0.000 NA   NA
 326839 326840 PD2111 PD2112     TRUE 0.987 10.000 0.333 NA   NA
 326840 326841 PD2112 PD2113     FALSE 0.140 237.000 0.000 NA   NA
 326841 326842 PD2113 PD2114     TRUE 0.593 -19.000 0.000 NA   NA
 326842 326843 PD2114 PD2115     TRUE 0.851 223.000 0.333 NA   NA
 326843 326844 PD2115 PD2116   pspA TRUE 0.703 12.000 0.000 NA   NA
 326844 326845 PD2116 PD2117 pspA   FALSE 0.041 440.000 0.000 NA   NA
 326845 326846 PD2117 PD2118   pspA TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 326846 326847 PD2118 PD2119 pspA thdF FALSE 0.012 901.000 0.000 1.000   NA
 326847 326848 PD2119 PD2120 thdF   TRUE 0.892 -3.000 0.005 1.000   NA
 326848 326849 PD2120 PD2121     TRUE 0.595 90.000 0.005 1.000   NA
 326849 326850 PD2121 PD2122   rnpA TRUE 0.869 45.000 0.105 1.000 N NA
 326850 326851 PD2122 PD2123 rnpA rpmH TRUE 0.989 59.000 0.787 1.000   NA
 324816 324817 PDa0001 PDa0002     FALSE 0.247 179.000 0.000 NA   NA
 324817 324816 PDa0002 PDa0001     FALSE 0.247 179.000 0.000 NA   NA