MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter jejuni RM1221

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 833451 833452 CJE0001 CJE0002 dnaA dnaN TRUE 0.603 160.000 0.328 1.000 Y NA
 833452 833453 CJE0002 CJE0003 dnaN gyrB TRUE 0.838 29.000 0.114 1.000 Y NA
 833454 833455 CJE0004 CJE0005     TRUE 0.937 3.000 0.027 0.056   NA
 833456 833457 CJE0006 CJE0007   gltB FALSE 0.180 134.000 0.025 1.000   NA
 833457 833458 CJE0007 CJE0008 gltB gltD TRUE 0.986 10.000 0.222 0.002 Y NA
 833459 833460 CJE0009 CJE0010 rnhB comEA FALSE 0.433 33.000 0.002 1.000   NA
 833460 833461 CJE0010 CJE0011 comEA rbr FALSE 0.261 65.000 0.004 1.000   NA
 833463 833464 CJE0013 CJE0015     FALSE 0.163 92.000 0.000 NA   NA
 833466 833467 CJE0017 CJE0018     TRUE 0.967 12.000 0.667 NA   NA
 833467 833468 CJE0018 CJE0019     FALSE 0.422 106.000 0.143 NA   NA
 833468 833469 CJE0019 CJE0020   ccpA-1 TRUE 0.980 -10.000 0.800 1.000 N NA
 833469 833470 CJE0020 CJE0021 ccpA-1   FALSE 0.390 64.000 0.028 1.000 N NA
 833470 833471 CJE0021 CJE0022     FALSE 0.267 113.000 0.042 1.000 N NA
 833472 833473 CJE0023 CJE0024 purB-1 nrdA TRUE 0.724 16.000 0.012 1.000 Y NA
 833474 833475 CJE0025 CJE0026   thyX FALSE 0.143 120.000 0.009 1.000   NA
 833476 833477 CJE0027 CJE0028 pyrG recJ TRUE 0.779 -13.000 0.026 1.000 N NA
 833477 833478 CJE0028 CJE0029 recJ ansA FALSE 0.164 96.000 0.004 1.000 N NA
 833478 833479 CJE0029 CJE_Cj16SA ansA rrsA FALSE 0.077 603.000 0.000 NA   NA
 833479 833480 CJE_Cj16SA CJE_tRNA-Ala-1 rrsA   FALSE 0.141 105.000 0.000 NA   NA
 833480 833481 CJE_tRNA-Ala-1 CJE_tRNA-Ile-1     TRUE 0.761 9.000 0.000 NA   NA
 833481 833482 CJE_tRNA-Ile-1 CJE_Cj23SA   rrlA FALSE 0.078 537.000 0.000 NA   NA
 833482 3820335 CJE_Cj23SA CJE_r01 rrlA   FALSE 0.086 245.000 0.000 NA   NA
 3820335 833483 CJE_r01 CJE0030     FALSE 0.141 105.000 0.000 NA   NA
 833483 833484 CJE0030 CJE0031     FALSE 0.268 61.000 0.000 NA   NA
 833484 833485 CJE0031 CJE0032     TRUE 0.963 0.000 0.222 NA   NA
 833486 833487 CJE0033 CJE0034     TRUE 0.742 -3.000 0.019 NA   NA
 833489 833490 CJE0036 CJE0037     FALSE 0.357 178.000 0.182 NA   NA
 833490 833491 CJE0037 CJE0038   typA TRUE 0.784 0.000 0.006 NA   NA
 833492 833493 CJE0039 CJE0040     TRUE 0.970 19.000 1.000 1.000   NA
 833493 833494 CJE0040 CJE0041   flgD FALSE 0.515 53.000 0.053 NA   NA
 833494 833495 CJE0041 CJE0042 flgD flgE-1 TRUE 0.979 4.000 0.341 NA Y NA
 833496 833497 CJE0043 CJE0044     TRUE 0.965 -43.000 0.714 NA   NA
 833498 833499 CJE_CjSRP1 CJE0045     TRUE 0.609 -35.000 0.000 NA   NA
 833499 833500 CJE0045 CJE0046     FALSE 0.167 89.000 0.000 NA   NA
 833501 833502 CJE0048 CJE0049 trmU   TRUE 0.811 0.000 0.012 NA   NA
 833502 833503 CJE0049 CJE0050     FALSE 0.122 121.000 0.000 NA   NA
 833503 833504 CJE0050 CJE0051     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 833504 833505 CJE0051 CJE0052     FALSE 0.229 70.000 0.000 NA   NA
 833505 833506 CJE0052 CJE0053     FALSE 0.390 39.000 0.000 NA   NA
 833507 833508 CJE0054 CJE0055     TRUE 0.656 -15.000 0.000 NA   NA
 833509 833510 CJE0056 CJE0057 fliY fliM TRUE 0.956 18.000 0.142 0.003 Y NA
 833510 833511 CJE0057 CJE0058 fliM fliA TRUE 0.953 0.000 0.118 1.000 N NA
 833511 833512 CJE0058 CJE0059 fliA   TRUE 0.870 -19.000 0.112 NA   NA
 833512 833513 CJE0059 CJE0060     TRUE 0.836 19.000 0.159 NA   NA
 833513 833514 CJE0060 CJE0061   flhF TRUE 0.962 -7.000 0.382 1.000 N NA
 833514 833515 CJE0061 CJE0062 flhF folK TRUE 0.851 10.000 0.035 1.000 N NA
 833515 833516 CJE0062 CJE0063 folK aroQ TRUE 0.822 3.000 0.009 1.000 N NA
 833517 833518 CJE0064 CJE0065   sppA TRUE 0.818 -12.000 0.035 1.000 N NA
 833518 833519 CJE0065 CJE0066 sppA   FALSE 0.094 152.000 0.009 NA   NA
 833520 833521 CJE0067 CJE0068     FALSE 0.171 87.000 0.000 NA   NA
 833521 833522 CJE0068 CJE0069     FALSE 0.087 230.000 0.000 NA   NA
 833522 833523 CJE0069 CJE0070     TRUE 0.976 -7.000 0.209 0.002   NA
 833523 833524 CJE0070 CJE0071     TRUE 0.984 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 833524 833525 CJE0071 CJE0072   lctP FALSE 0.444 110.000 0.075 1.000 Y NA
 833525 833526 CJE0072 CJE0073 lctP cdtC FALSE 0.343 172.000 0.125 1.000   NA
 833526 833527 CJE0073 CJE0074 cdtC cdtB TRUE 0.986 11.000 0.500 0.003   NA
 833527 833528 CJE0074 CJE0075 cdtB cdtA TRUE 0.987 -3.000 0.421 0.003   NA
 833529 833530 CJE0076 CJE0077   cydA TRUE 0.991 1.000 0.887 NA   NA
 833530 833531 CJE0077 CJE0078 cydA cydB TRUE 0.997 0.000 0.962 0.055 Y NA
 833531 833532 CJE0078 CJE0079 cydB   TRUE 0.887 10.000 0.078 NA   NA
 833533 833534 CJE0080 CJE0081   ung FALSE 0.147 120.000 0.011 1.000 N NA
 833535 833536 CJE0082 CJE0083 aspA dcuA TRUE 0.807 26.000 0.127 1.000   NA
 833536 833537 CJE0083 CJE0084 dcuA   FALSE 0.224 106.000 0.027 1.000   NA
 833537 833538 CJE0084 CJE0085     TRUE 0.960 10.000 0.372 NA   NA
 833538 833539 CJE0085 CJE0086     TRUE 0.922 24.000 0.516 NA   NA
 833539 833540 CJE0086 CJE0087     FALSE 0.417 83.000 0.087 NA   NA
 833540 833541 CJE0087 CJE0088     TRUE 0.965 10.000 0.414 NA   NA
 833541 833542 CJE0088 CJE0089   rplU FALSE 0.086 159.000 0.005 NA   NA
 833542 833543 CJE0089 CJE0090 rplU rpmA TRUE 0.991 11.000 0.667 0.036 Y NA
 833543 833544 CJE0090 CJE0091 rpmA   TRUE 0.614 107.000 0.335 1.000   NA
 833544 833545 CJE0091 CJE0092   proB FALSE 0.524 105.000 0.206 1.000   NA
 833545 833546 CJE0092 CJE0093 proB fmt FALSE 0.267 74.000 0.014 1.000 N NA
 833546 833547 CJE0093 CJE0094 fmt   TRUE 0.748 -37.000 0.029 1.000 N NA
 833547 833548 CJE0094 CJE0095     TRUE 0.847 -3.000 0.040 1.000 N NA
 833548 833549 CJE0095 CJE0096     TRUE 0.989 6.000 0.827 1.000 N NA
 833549 833550 CJE0096 CJE0097     FALSE 0.456 61.000 0.037 1.000 N NA
 833550 833551 CJE0097 CJE0098     TRUE 0.968 11.000 0.110 0.008 Y NA
 833551 833552 CJE0098 CJE0099   atpH TRUE 0.985 3.000 0.132 0.008 Y NA
 833552 833553 CJE0099 CJE0100 atpH atpA TRUE 0.991 14.000 0.864 0.008 Y NA
 833553 833554 CJE0100 CJE0101 atpA atpG TRUE 0.996 9.000 0.846 0.008 Y NA
 833554 833555 CJE0101 CJE0102 atpG atpD TRUE 0.982 26.000 0.724 0.008 Y NA
 833555 833556 CJE0102 CJE0103 atpD atpC TRUE 0.996 4.000 0.837 0.008 Y NA
 833556 833557 CJE0103 CJE0104 atpC   TRUE 0.906 0.000 0.036 1.000 N NA
 833557 833558 CJE0104 CJE0105     TRUE 0.996 9.000 0.944 0.054 Y NA
 833558 833559 CJE0105 CJE0106     TRUE 0.972 3.000 0.343 NA   NA
 833559 833560 CJE0106 CJE0107     TRUE 0.939 10.000 0.213 NA   NA
 833560 833561 CJE0107 CJE0108     TRUE 0.843 77.000 0.702 1.000 N NA
 833561 833562 CJE0108 CJE0109     TRUE 0.988 4.000 0.794 1.000   NA
 833562 833563 CJE0109 CJE0110   slyD TRUE 0.954 15.000 0.543 1.000   NA
 833563 833564 CJE0110 CJE0111 slyD fabD TRUE 0.849 0.000 0.013 1.000 N NA
 833564 833565 CJE0111 CJE0112 fabD mtnA TRUE 0.842 -3.000 0.037 1.000 N NA
 833565 833566 CJE0112 CJE0113 mtnA   TRUE 0.824 -3.000 0.042 NA N NA
 833566 833567 CJE0113 CJE0114     TRUE 0.767 5.000 0.009 NA N NA
 833567 833568 CJE0114 CJE0115     TRUE 0.790 0.000 0.007 NA   NA
 833568 833569 CJE0115 CJE0116     TRUE 0.655 -3.000 0.003 NA   NA
 833569 833570 CJE0116 CJE0117     FALSE 0.099 124.000 0.003 NA   NA
 833571 833572 CJE0118 CJE0119 dusB   TRUE 0.749 -3.000 0.021 NA   NA
 833572 833573 CJE0119 CJE0120     TRUE 0.966 -10.000 0.523 NA   NA
 833573 833574 CJE0120 CJE0121     TRUE 0.736 12.000 0.029 NA   NA
 833574 833575 CJE0121 CJE0122   accD TRUE 0.793 -10.000 0.035 NA   NA
 833575 833576 CJE0122 CJE0123 accD   TRUE 0.816 9.000 0.016 1.000 N NA
 833576 833577 CJE0123 CJE0124     TRUE 0.831 0.000 0.008 1.000 N NA
 833578 833579 CJE0125 CJE0126 tyrA   FALSE 0.240 80.000 0.013 1.000 N NA
 833579 833580 CJE0126 CJE0127   lpxC TRUE 0.918 0.000 0.022 1.000 Y NA
 833580 833581 CJE0127 CJE0128 lpxC   FALSE 0.539 39.000 0.035 NA N NA
 833581 833582 CJE0128 CJE0129   thrB TRUE 0.845 9.000 0.032 NA N NA
 833582 833583 CJE0129 CJE0130 thrB   TRUE 0.645 25.000 0.044 NA N NA
 833583 833584 CJE0130 CJE0131   infB TRUE 0.910 -13.000 0.171 NA N NA
 833584 833585 CJE0131 CJE0132 infB rbfA TRUE 0.981 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 833585 833586 CJE0132 CJE0133 rbfA   TRUE 0.786 -10.000 0.033 NA   NA
 833586 833587 CJE0133 CJE0134     FALSE 0.117 105.000 0.002 NA   NA
 833587 833588 CJE0134 CJE0135     TRUE 0.978 -7.000 0.759 NA   NA
 833589 833590 CJE0136 CJE0137     TRUE 0.982 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 833590 833591 CJE0137 CJE0138     TRUE 0.970 13.000 0.509 1.000 Y NA
 833592 833593 CJE0139 CJE0140     FALSE 0.524 18.000 0.000 NA   NA
 833593 833594 CJE0140 CJE0141     FALSE 0.110 135.000 0.000 NA   NA
 833595 833596 CJE0142 CJE0143 trxB trx FALSE 0.300 134.000 0.035 1.000 Y NA
 833596 833597 CJE0143 CJE0144 trx   FALSE 0.419 57.000 0.027 1.000 N NA
 833597 833598 CJE0144 CJE0145   hom TRUE 0.821 0.000 0.003 1.000 N NA
 833598 833599 CJE0145 CJE0146 hom   TRUE 0.879 4.000 0.009 1.000 Y NA
 833599 833600 CJE0146 CJE0147     TRUE 0.859 12.000 0.098 NA   NA
 833600 833601 CJE0147 CJE0148     TRUE 0.983 -6.000 0.882 NA   NA
 833601 833602 CJE0148 CJE0149     TRUE 0.798 -7.000 0.033 NA   NA
 833602 833603 CJE0149 CJE0150     TRUE 0.733 14.000 0.031 1.000   NA
 833603 833604 CJE0150 CJE0151   rpmE TRUE 0.887 3.000 0.031 1.000   NA
 833604 833605 CJE0151 CJE0152 rpmE   FALSE 0.251 79.000 0.023 NA   NA
 833605 833606 CJE0152 CJE0153     TRUE 0.924 2.000 0.070 NA   NA
 833606 833607 CJE0153 CJE0154     TRUE 0.971 0.000 0.300 NA   NA
 833607 833608 CJE0154 CJE0155     TRUE 0.843 0.000 0.011 1.000   NA
 833608 833609 CJE0155 CJE0156     TRUE 0.925 -3.000 0.139 1.000 N NA
 833609 833610 CJE0156 CJE0157     TRUE 0.879 3.000 0.028 1.000 N NA
 833610 833611 CJE0157 CJE0158     TRUE 0.790 13.000 0.042 1.000   NA
 833611 833612 CJE0158 CJE0159     TRUE 0.965 -3.000 0.476 NA   NA
 833612 833613 CJE0159 CJE0160     TRUE 0.885 -9.000 0.100 NA   NA
 833619 833620 CJE0165 CJE0166     FALSE 0.557 42.000 0.014 1.000 Y NA
 833620 833621 CJE0166 CJE0167     TRUE 0.966 -16.000 0.529 1.000 N NA
 833621 833622 CJE0167 CJE0168     TRUE 0.995 0.000 0.618 0.043 Y NA
 833622 833623 CJE0168 CJE0169     TRUE 0.897 11.000 0.130 NA   NA
 833624 833625 CJE0170 CJE0171     TRUE 0.774 -3.000 0.027 NA   NA
 833625 833626 CJE0171 CJE0172   exbB-1 TRUE 0.990 12.000 1.000 0.053 N NA
 833626 833627 CJE0172 CJE0173 exbB-1   TRUE 0.994 -13.000 1.000 0.053 Y NA
 833627 833628 CJE0173 CJE0174     TRUE 0.968 2.000 0.217 1.000 N NA
 833628 833629 CJE0174 CJE0175     TRUE 0.737 52.000 0.174 1.000 N NA
 833629 833630 CJE0175 CJE0176     FALSE 0.316 171.000 0.103 1.000   NA
 833631 833632 CJE0177 CJE0178     TRUE 0.754 10.000 0.009 1.000   NA
 833632 833633 CJE0178 CJE0179     TRUE 0.820 -7.000 0.009 1.000 Y NA
 833633 833634 CJE0179 CJE0180   purN FALSE 0.250 72.000 0.009 1.000 N NA
 833634 833635 CJE0180 CJE0181 purN   TRUE 0.698 -9.000 0.014 NA N NA
 833635 833636 CJE0181 CJE0182     FALSE 0.602 -16.000 0.004 NA   NA
 833636 833637 CJE0182 CJE0183     TRUE 0.788 2.000 0.007 NA   NA
 833637 833638 CJE0183 CJE0184   def TRUE 0.874 -3.000 0.054 1.000 N NA
 833638 833639 CJE0184 CJE0185 def clpP FALSE 0.571 36.000 0.030 1.000 N NA
 833639 833640 CJE0185 CJE0186 clpP tig TRUE 0.984 0.000 0.351 1.000 Y NA
 833641 833642 CJE0187 CJE0188 folE fliI TRUE 0.988 0.000 0.378 0.064 N NA
 833643 833644 CJE0189 CJE0190 purF dapB TRUE 0.876 2.000 0.022 1.000 N NA
 833644 833645 CJE0190 CJE0191 dapB   FALSE 0.272 63.000 0.003 1.000 N NA
 833645 833646 CJE0191 CJE0192     TRUE 0.781 0.000 0.005 NA   NA
 833646 833647 CJE0192 CJE0193     TRUE 0.700 134.000 0.750 NA   NA
 833647 833648 CJE0193 CJE0194     FALSE 0.378 99.000 0.100 NA   NA
 833648 833649 CJE0194 CJE0195     TRUE 0.847 -31.000 0.100 NA   NA
 833650 833651 CJE0196 CJE0197     FALSE 0.093 185.000 0.000 NA   NA
 833651 833652 CJE0197 CJE0198     FALSE 0.355 74.000 0.043 NA   NA
 833652 833653 CJE0198 CJE0199   thrS FALSE 0.291 131.000 0.063 1.000 N NA
 833653 833654 CJE0199 CJE0200 thrS infC TRUE 0.916 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 833654 833655 CJE0200 CJE0201 infC   FALSE 0.407 39.000 0.004 1.000 N NA
 833655 833656 CJE0201 CJE0202     FALSE 0.379 40.000 0.000 NA   NA
 833656 833657 CJE0202 CJE0203     FALSE 0.599 -64.000 0.000 NA   NA
 833657 833658 CJE0203 CJE0204     FALSE 0.379 40.000 0.000 NA   NA
 833658 833659 CJE0204 CJE0205     TRUE 0.793 120.000 1.000 NA   NA
 833659 833660 CJE0205 CJE0206     TRUE 0.751 164.000 1.000 NA   NA
 833660 833661 CJE0206 CJE0207     FALSE 0.260 63.000 0.000 NA   NA
 833661 833662 CJE0207 CJE0208     FALSE 0.200 79.000 0.000 NA   NA
 833664 833665 CJE0210 CJE0211     TRUE 0.817 1.000 0.000 NA   NA
 833665 833666 CJE0211 CJE0212     FALSE 0.083 259.000 0.000 NA   NA
 833668 833669 CJE0214 CJE0215     FALSE 0.336 46.000 0.000 NA   NA
 833669 833670 CJE0215 CJE0216     FALSE 0.189 81.000 0.000 NA   NA
 833670 833671 CJE0216 CJE0217     TRUE 0.723 10.000 0.000 NA   NA
 833674 833675 CJE0220 CJE0221 dam   FALSE 0.090 202.000 0.000 NA   NA
 833675 833676 CJE0221 CJE0222     TRUE 0.786 4.000 0.000 NA   NA
 833678 833679 CJE0224 CJE0225     FALSE 0.453 27.000 0.000 NA   NA
 833679 833680 CJE0225 CJE0226     FALSE 0.103 153.000 0.000 NA   NA
 833680 833681 CJE0226 CJE0227     TRUE 0.832 27.000 0.217 NA   NA
 833681 833682 CJE0227 CJE0228     TRUE 0.868 11.000 0.087 NA   NA
 833682 833683 CJE0228 CJE0229     FALSE 0.564 100.000 0.286 NA   NA
 833683 833684 CJE0229 CJE0230     TRUE 0.946 -3.000 0.286 NA   NA
 833684 833685 CJE0230 CJE0231     TRUE 0.956 10.000 0.333 NA   NA
 833685 833686 CJE0231 CJE0232     TRUE 0.984 0.000 0.600 NA   NA
 833686 833687 CJE0232 CJE0233     TRUE 0.960 -3.000 0.400 NA   NA
 833687 833688 CJE0233 CJE0234     TRUE 0.967 -3.000 0.500 NA   NA
 833688 833689 CJE0234 CJE0235     TRUE 0.977 6.000 0.500 NA   NA
 833689 833690 CJE0235 CJE0236     TRUE 0.960 9.000 0.286 NA   NA
 833690 833691 CJE0236 CJE0237     TRUE 0.979 0.000 0.429 NA   NA
 833691 833692 CJE0237 CJE0238     TRUE 0.985 3.000 0.667 NA   NA
 833692 833693 CJE0238 CJE0239     TRUE 0.929 -13.000 0.250 NA   NA
 833693 833694 CJE0239 CJE0240     TRUE 0.975 9.000 0.500 NA   NA
 833694 833695 CJE0240 CJE0241     TRUE 0.911 11.000 0.167 NA   NA
 833695 833696 CJE0241 CJE0242     FALSE 0.240 67.000 0.000 NA   NA
 833697 833698 CJE0243 CJE0244     TRUE 0.901 2.000 0.045 NA   NA
 833698 833699 CJE0244 CJE0245     FALSE 0.190 165.000 0.045 NA   NA
 833699 833700 CJE0245 CJE0246     TRUE 0.927 3.000 0.091 NA   NA
 833700 833701 CJE0246 CJE0247     FALSE 0.257 176.000 0.091 NA   NA
 833701 833702 CJE0247 CJE0248     TRUE 0.696 -7.000 0.000 NA   NA
 833702 833703 CJE0248 CJE0249     FALSE 0.427 87.000 0.103 NA   NA
 833703 833704 CJE0249 CJE0250     TRUE 0.980 10.000 0.750 NA   NA
 833704 833705 CJE0250 CJE0251     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 833705 833706 CJE0251 CJE0252     FALSE 0.328 126.000 0.105 NA   NA
 833706 833707 CJE0252 CJE0253     TRUE 0.918 -7.000 0.158 NA   NA
 833707 833708 CJE0253 CJE0254     TRUE 0.972 -6.000 0.600 NA   NA
 833711 833712 CJE0257 CJE0258     TRUE 0.835 47.000 0.400 NA   NA
 833712 833713 CJE0258 CJE0259     TRUE 0.960 -3.000 0.400 NA   NA
 833713 833714 CJE0259 CJE0260     TRUE 0.867 0.000 0.028 NA   NA
 833714 833715 CJE0260 CJE0261     TRUE 0.782 -3.000 0.028 NA   NA
 833715 833716 CJE0261 CJE0262     FALSE 0.134 109.000 0.000 NA   NA
 833716 833717 CJE0262 CJE0263     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 833717 833718 CJE0263 CJE0264     FALSE 0.254 64.000 0.000 NA   NA
 833718 833719 CJE0264 CJE0265     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 833719 833720 CJE0265 CJE0266     FALSE 0.137 107.000 0.000 NA   NA
 833720 833721 CJE0266 CJE0267     TRUE 0.752 96.000 0.667 NA   NA
 833721 833722 CJE0267 CJE0268     TRUE 0.776 -16.000 0.037 NA   NA
 833722 833723 CJE0268 CJE0269     TRUE 0.898 3.000 0.037 1.000   NA
 833723 833724 CJE0269 CJE0270     TRUE 0.680 70.000 0.083 0.052   NA
 833724 833725 CJE0270 CJE0271     TRUE 0.937 0.000 0.100 NA   NA
 833726 833727 CJE0272 CJE0273     TRUE 0.926 16.000 0.400 NA   NA
 833727 833728 CJE0273 CJE0274     FALSE 0.254 64.000 0.000 NA   NA
 833728 833729 CJE0274 CJE0275   argC FALSE 0.189 81.000 0.000 NA   NA
 833729 833730 CJE0275 CJE0276 argC   TRUE 0.798 10.000 0.019 1.000   NA
 833730 833731 CJE0276 CJE0277   argB TRUE 0.744 10.000 0.006 1.000   NA
 833731 833732 CJE0277 CJE0278 argB argD TRUE 0.889 10.000 0.030 1.000 Y NA
 833735 833736 CJE0281 CJE0282   nrdB TRUE 0.850 -10.000 0.048 1.000 N NA
 833736 833737 CJE0282 CJE0283 nrdB   TRUE 0.827 3.000 0.019 NA   NA
 833737 833738 CJE0283 CJE0284   pyrE TRUE 0.863 1.000 0.025 NA   NA
 833738 833739 CJE0284 CJE0285 pyrE frr TRUE 0.875 3.000 0.026 1.000 N NA
 833739 833740 CJE0285 CJE0286 frr secG TRUE 0.643 16.000 0.017 1.000 N NA
 833740 833741 CJE0286 CJE0287 secG   FALSE 0.128 104.000 0.007 NA   NA
 833742 833743 CJE0288 CJE0289 cynT   TRUE 0.896 -3.000 0.105 NA N NA
 833744 833745 CJE0290 CJE0291     TRUE 0.887 10.000 0.056 1.000 N NA
 833745 833746 CJE0291 CJE0292     FALSE 0.095 178.000 0.000 NA   NA
 833746 833747 CJE0292 CJE0293     FALSE 0.111 134.000 0.000 NA   NA
 833748 833749 CJE0294 CJE0295 rpmI rplT TRUE 0.933 94.000 0.928 0.033 Y NA
 833750 833751 CJE0296 CJE0297     FALSE 0.432 30.000 0.000 NA   NA
 833752 833753 CJE0298 CJE0299     TRUE 0.863 31.000 0.333 NA   NA
 833754 833755 CJE0300 CJE0301     TRUE 0.940 -16.000 0.333 NA   NA
 833756 833757 CJE0302 CJE0303 moaC   TRUE 0.811 -22.000 0.057 NA   NA
 833757 833758 CJE0303 CJE0304     TRUE 0.751 14.000 0.047 NA   NA
 833760 833761 CJE0306 CJE0307   dgkA TRUE 0.924 -3.000 0.136 1.000   NA
 833761 833762 CJE0307 CJE0308 dgkA   TRUE 0.951 -3.000 0.273 1.000   NA
 833762 833763 CJE0308 CJE0309   pyrC TRUE 0.788 9.000 0.009 1.000   NA
 833763 833764 CJE0309 CJE0310 pyrC   TRUE 0.655 -78.000 0.000 1.000   NA
 833765 833766 CJE0311 CJE0312     FALSE 0.568 81.000 0.154 1.000   NA
 833768 833769 CJE0314 CJE0315     FALSE 0.090 201.000 0.000 NA   NA
 833769 833770 CJE0315 CJE0316     TRUE 0.990 0.000 0.867 NA   NA
 833770 833771 CJE0316 CJE0317     TRUE 0.676 34.000 0.075 NA   NA
 833771 833772 CJE0317 CJE0318   ilvE TRUE 0.864 13.000 0.098 1.000 N NA
 833773 833774 CJE0319 CJE0320     TRUE 0.731 -3.000 0.008 1.000   NA
 833774 833775 CJE0320 CJE0321     TRUE 0.785 0.000 0.006 NA   NA
 833775 833776 CJE0321 CJE0322   fabZ FALSE 0.253 94.000 0.035 NA   NA
 833776 833777 CJE0322 CJE0323 fabZ lpxA TRUE 0.972 0.000 0.264 1.000 N NA
 833777 833778 CJE0323 CJE0324 lpxA clpX TRUE 0.806 -7.000 0.027 1.000 N NA
 833778 833779 CJE0324 CJE0325 clpX mreB TRUE 0.816 11.000 0.034 1.000 N NA
 833779 833780 CJE0325 CJE0326 mreB   TRUE 0.978 -10.000 0.689 1.000 N NA
 833780 833781 CJE0326 CJE0327   carB FALSE 0.114 261.000 0.016 1.000 N NA
 833781 833782 CJE0327 CJE0328 carB   TRUE 0.721 -3.000 0.016 NA N NA
 833783 833784 CJE0329 CJE0330 tal serB TRUE 0.893 0.000 0.029 1.000 N NA
 833784 833785 CJE0330 CJE0331 serB cheW TRUE 0.855 0.000 0.015 1.000 N NA
 833785 833786 CJE0331 CJE0332 cheW cheA TRUE 0.983 5.000 0.137 0.015 Y NA
 833786 833787 CJE0332 CJE0333 cheA cheV TRUE 0.985 4.000 0.147 0.009 Y NA
 833787 833788 CJE0333 CJE0334 cheV   TRUE 0.863 -7.000 0.065 NA   NA
 833788 833789 CJE0334 CJE0335   greA FALSE 0.113 133.000 0.012 NA   NA
 833789 833790 CJE0335 CJE0336 greA lpxB TRUE 0.811 12.000 0.042 1.000 N NA
 833790 833791 CJE0336 CJE0337 lpxB   FALSE 0.160 97.000 0.003 1.000   NA
 833791 833792 CJE0337 CJE0338     FALSE 0.106 142.000 0.000 NA   NA
 833793 833794 CJE0339 CJE0340 surE   TRUE 0.863 -7.000 0.051 1.000   NA
 833795 833796 CJE0341 CJE0342 panD panC TRUE 0.971 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 833796 833797 CJE0342 CJE0343 panC panB TRUE 0.989 11.000 0.395 0.001 Y NA
 833799 833800 CJE0345 CJE0346 modC modB TRUE 0.970 10.000 0.286 1.000 Y NA
 833800 833801 CJE0346 CJE0347 modB   TRUE 0.916 -7.000 0.122 1.000 N NA
 833801 833802 CJE0347 CJE0348   modA TRUE 0.906 -3.000 0.098 1.000 N NA
 833802 833803 CJE0348 CJE0349 modA   FALSE 0.331 54.000 0.008 1.000   NA
 833803 833804 CJE0349 CJE0350     TRUE 0.866 -3.000 0.065 NA   NA
 833804 833805 CJE0350 CJE0351   bioF TRUE 0.958 -3.000 0.389 NA   NA
 833807 833808 CJE0353 CJE0354 bioD   TRUE 0.838 10.000 0.030 1.000 N NA
 833808 833809 CJE0354 CJE0355     TRUE 0.992 3.000 0.444 0.070 Y NA
 833810 833811 CJE0356 CJE0357 rplY pth TRUE 0.988 -3.000 0.496 0.049 Y NA
 833811 833812 CJE0357 CJE0358 pth   TRUE 0.895 2.000 0.031 1.000   NA
 833812 833813 CJE0358 CJE0359   lysA FALSE 0.455 44.000 0.021 1.000   NA
 833813 833814 CJE0359 CJE0360 lysA   TRUE 0.853 2.000 0.015 1.000 N NA
 833814 833815 CJE0360 CJE0361   pheA TRUE 0.767 -12.000 0.021 1.000 N NA
 833815 833816 CJE0361 CJE0362 pheA hisC TRUE 0.860 -10.000 0.028 1.000 Y NA
 833816 833817 CJE0362 CJE0363 hisC fliF TRUE 0.632 52.000 0.084 1.000 N NA
 833817 833818 CJE0363 CJE0364 fliF fliG TRUE 0.994 0.000 0.477 0.013 Y NA
 833818 833819 CJE0364 CJE0365 fliG   TRUE 0.990 8.000 0.308 0.008 Y NA
 833819 833820 CJE0365 CJE0366   dxs TRUE 0.866 -7.000 0.052 1.000 N NA
 833820 833821 CJE0366 CJE0367 dxs   FALSE 0.233 86.000 0.017 1.000 N NA
 833821 833822 CJE0367 CJE0368     FALSE 0.467 46.000 0.033 NA   NA
 833822 833823 CJE0368 CJE0369   ubiE TRUE 0.776 3.000 0.008 NA   NA
 833823 833824 CJE0369 CJE0370 ubiE xseA TRUE 0.766 -3.000 0.016 1.000 N NA
 833824 833825 CJE0370 CJE0371 xseA serC TRUE 0.759 10.000 0.010 1.000 N NA
 833825 833826 CJE0371 CJE0372 serC   TRUE 0.660 -3.000 0.004 NA N NA
 833827 833828 CJE0373 CJE0374 fabH plsX TRUE 0.962 -7.000 0.058 0.007 Y NA
 833828 833829 CJE0374 CJE0375 plsX rpmF TRUE 0.977 6.000 0.418 1.000   NA
 833829 833830 CJE0375 CJE0376 rpmF   FALSE 0.600 24.000 0.032 NA   NA
 833830 833831 CJE0376 CJE0377   ndk TRUE 0.886 1.000 0.033 NA   NA
 833831 833832 CJE0377 CJE0378 ndk   FALSE 0.168 113.000 0.015 1.000   NA
 833833 833834 CJE0379 CJE0380   flhB FALSE 0.137 119.000 0.006 1.000 N NA
 833835 833836 CJE0381 CJE0382     TRUE 0.964 3.000 0.119 1.000 Y NA
 833836 833837 CJE0382 CJE0383   polA FALSE 0.565 17.000 0.006 1.000 N NA
 833838 833839 CJE0384 CJE0385     TRUE 0.890 -3.000 0.097 NA N NA
 833840 833841 CJE0386 CJE0387     TRUE 0.792 0.000 0.008 NA   NA
 833841 833842 CJE0387 CJE0388     TRUE 0.980 -19.000 1.000 NA   NA
 833842 833843 CJE0388 CJE0389     TRUE 0.935 44.000 1.000 NA   NA
 833843 833844 CJE0389 CJE0390   uvrA TRUE 0.776 2.000 0.002 NA   NA
 833844 833845 CJE0390 CJE0391 uvrA   FALSE 0.226 73.000 0.003 1.000   NA
 833848 833849 CJE0394 CJE0395 trpE trpD TRUE 0.946 -3.000 0.019 0.002 Y NA
 833849 833850 CJE0395 CJE0396 trpD trpF TRUE 0.894 -13.000 0.052 1.000 Y NA
 833850 833851 CJE0396 CJE0397 trpF trpB TRUE 0.989 -3.000 0.375 0.003 Y NA
 833851 833852 CJE0397 CJE0398 trpB trpA TRUE 0.985 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 833852 833853 CJE0398 CJE0399 trpA   FALSE 0.250 71.000 0.017 NA   NA
 833853 833854 CJE0399 CJE0400   fliN TRUE 0.985 0.000 0.625 NA   NA
 833854 833855 CJE0400 CJE0401 fliN   TRUE 0.984 1.000 0.531 NA   NA
 833856 833857 CJE0402 CJE0403     TRUE 0.990 0.000 0.806 1.000   NA
 833857 833858 CJE0403 CJE0404     FALSE 0.493 113.000 0.200 1.000   NA
 833858 833859 CJE0404 CJE0405     FALSE 0.455 79.000 0.067 1.000 N NA
 833859 833860 CJE0405 CJE0406     TRUE 0.884 -15.000 0.096 1.000   NA
 833863 833864 CJE0409 CJE0410 glmM lspA TRUE 0.849 -7.000 0.042 1.000 N NA
 833864 833865 CJE0410 CJE0411 lspA   TRUE 0.698 -16.000 0.020 NA   NA
 833868 833869 CJE0414 CJE0415 cmeC cmeB TRUE 0.970 -7.000 0.241 0.040 N NA
 833869 833870 CJE0415 CJE0416 cmeB cmeA TRUE 0.992 0.000 0.945 1.000 N NA
 833870 833871 CJE0416 CJE0417 cmeA   FALSE 0.505 94.000 0.145 1.000   NA
 833871 833872 CJE0417 CJE0418     TRUE 0.980 -13.000 0.818 1.000   NA
 833873 833874 CJE0419 CJE0420 rpsU   FALSE 0.122 120.000 0.012 NA   NA
 833874 833875 CJE0420 CJE0421     TRUE 0.980 10.000 0.763 NA   NA
 833875 833876 CJE0421 CJE0422     TRUE 0.948 3.000 0.118 1.000 N NA
 833876 833877 CJE0422 CJE0423     TRUE 0.732 -10.000 0.021 NA   NA
 833877 833878 CJE0423 CJE0424     TRUE 0.725 9.000 0.005 NA   NA
 833878 833879 CJE0424 CJE0425     TRUE 0.883 11.000 0.105 NA   NA
 833879 833880 CJE0425 CJE0426     TRUE 0.936 0.000 0.097 NA   NA
 833881 833882 CJE0427 CJE0428     TRUE 0.994 0.000 0.790 0.049   NA
 833882 833883 CJE0428 CJE0429     FALSE 0.293 56.000 0.013 NA   NA
 833883 833884 CJE0429 CJE0430   pyrF FALSE 0.599 -18.000 0.005 NA   NA
 833884 833885 CJE0430 CJE0431 pyrF nusB TRUE 0.797 -3.000 0.023 1.000 N NA
 833885 833886 CJE0431 CJE0432 nusB ribH TRUE 0.916 0.000 0.045 1.000 N NA
 833886 833887 CJE0432 CJE0433 ribH kdsA TRUE 0.812 -3.000 0.027 1.000 N NA
 833887 833888 CJE0433 CJE0434 kdsA   TRUE 0.720 -3.000 0.005 1.000   NA
 833889 833890 CJE0435 CJE0436   aroK TRUE 0.676 -13.000 0.002 1.000   NA
 833890 833891 CJE0436 CJE0437 aroK trpS TRUE 0.714 -3.000 0.002 1.000 N NA
 833891 833892 CJE0437 CJE0438 trpS serS TRUE 0.895 11.000 0.010 0.059 Y NA
 833892 833893 CJE0438 CJE0439 serS   TRUE 0.775 10.000 0.014 1.000   NA
 833894 833895 CJE0440 CJE0441   pyk FALSE 0.248 98.000 0.037 NA   NA
 833895 833896 CJE0441 CJE0442 pyk   TRUE 0.835 49.000 0.073 0.001   NA
 833896 833897 CJE0442 CJE0443     FALSE 0.138 118.000 0.007 1.000   NA
 833897 833898 CJE0443 CJE0444     TRUE 0.615 -13.000 0.003 NA   NA
 833898 833899 CJE0444 CJE0445     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 833899 833900 CJE0445 CJE0446     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 833901 833902 CJE0447 CJE0448 gatC   FALSE 0.247 68.000 0.003 1.000   NA
 833902 833903 CJE0448 CJE0449   fur TRUE 0.877 2.000 0.023 1.000   NA
 833903 833904 CJE0449 CJE0450 fur lysS TRUE 0.879 1.000 0.022 1.000 N NA
 833904 833905 CJE0450 CJE0451 lysS glyA TRUE 0.855 -3.000 0.044 1.000 N NA
 833905 833906 CJE0451 CJE0452 glyA   TRUE 0.943 -3.000 0.271 NA   NA
 833906 833907 CJE0452 CJE0453     TRUE 0.931 14.000 0.387 NA   NA
 833907 833908 CJE0453 CJE0454   aroE TRUE 0.745 -3.000 0.020 NA   NA
 833910 833911 CJE0456 CJE0457 lgt frdC FALSE 0.268 69.000 0.010 1.000 N NA
 833911 833912 CJE0457 CJE0458 frdC frdA TRUE 0.971 -16.000 0.128 0.004 Y NA
 833912 833913 CJE0458 CJE0459 frdA frdB TRUE 0.978 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 833913 833914 CJE0459 CJE0460 frdB   FALSE 0.564 28.000 0.022 1.000   NA
 833914 833915 CJE0460 CJE0461     TRUE 0.875 110.000 0.750 0.010   NA
 833915 833916 CJE0461 CJE0462     TRUE 0.968 0.000 0.222 1.000   NA
 833916 833917 CJE0462 CJE0463     FALSE 0.430 136.000 0.182 1.000   NA
 833917 833918 CJE0463 CJE0464     TRUE 0.994 2.000 0.500 0.001   NA
 833922 833923 CJE0468 CJE0469     FALSE 0.238 74.000 0.017 NA   NA
 833924 833925 CJE0470 CJE0471     TRUE 0.754 61.000 0.333 NA   NA
 833926 833927 CJE0472 CJE0473     FALSE 0.355 43.000 0.000 NA   NA
 833927 833928 CJE0473 CJE0474     TRUE 0.992 0.000 1.000 NA   NA
 833928 833929 CJE0474 CJE0475     FALSE 0.106 123.000 0.007 NA   NA
 833929 833930 CJE0475 CJE0476     TRUE 0.680 -7.000 0.010 NA   NA
 833930 833931 CJE0476 CJE0477     TRUE 0.876 77.000 1.000 NA   NA
 833933 833934 CJE0479 CJE0480     TRUE 0.672 11.000 0.000 NA   NA
 833934 833935 CJE0480 CJE0481     TRUE 0.935 -7.000 0.237 NA   NA
 833935 833936 CJE0481 CJE_Cj16SB   rrsB FALSE 0.079 462.000 0.000 NA   NA
 833936 833937 CJE_Cj16SB CJE_tRNA-Ala-2 rrsB   FALSE 0.141 105.000 0.000 NA   NA
 833937 833938 CJE_tRNA-Ala-2 CJE_tRNA-Ile-2     TRUE 0.761 9.000 0.000 NA   NA
 833938 833939 CJE_tRNA-Ile-2 CJE_Cj23SB   rrlB FALSE 0.078 537.000 0.000 NA   NA
 833939 3820336 CJE_Cj23SB CJE_r02 rrlB   FALSE 0.086 245.000 0.000 NA   NA
 833940 833941 CJE0482 CJE0483 murD mraY TRUE 0.996 0.000 0.647 0.007 Y NA
 833942 833943 CJE0484 CJE0485 pgm fabG FALSE 0.297 72.000 0.018 1.000 N NA
 833943 833944 CJE0485 CJE0486 fabG   TRUE 0.740 10.000 0.005 1.000   NA
 833944 833945 CJE0486 CJE0487     FALSE 0.089 219.000 0.000 NA   NA
 833945 833946 CJE0487 CJE0488   sdhA FALSE 0.115 129.000 0.000 NA   NA
 833946 833947 CJE0488 CJE0489 sdhA sdhB TRUE 0.986 -3.000 0.279 0.004 Y NA
 833947 833948 CJE0489 CJE0490 sdhB sdhC TRUE 0.965 4.000 0.175 NA Y NA
 833950 833951 CJE0492 CJE0493   acpP FALSE 0.455 19.000 0.003 NA   NA
 833951 833952 CJE0493 CJE0494 acpP fabF TRUE 0.803 27.000 0.066 1.000 Y NA
 833952 833953 CJE0494 CJE0495 fabF accA TRUE 0.944 2.000 0.046 1.000 Y NA
 833953 833954 CJE0495 CJE0496 accA   FALSE 0.163 92.000 0.000 NA   NA
 833954 833955 CJE0496 CJE0497     FALSE 0.182 83.000 0.000 NA   NA
 833956 833957 CJE0498 CJE0499     TRUE 0.886 10.000 0.077 NA   NA
 833957 833958 CJE0499 CJE0500   rpmB FALSE 0.077 185.000 0.004 NA   NA
 833959 833960 CJE0501 CJE0502 rpe   TRUE 0.733 66.000 0.279 1.000 N NA
 833960 833961 CJE0502 CJE0503   thiC FALSE 0.108 175.000 0.007 1.000 N NA
 833962 833963 CJE0504 CJE0505     TRUE 0.960 -10.000 0.448 NA   NA
 833963 833964 CJE0505 CJE0506     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 833964 833965 CJE0506 CJE0507     TRUE 0.980 2.000 0.462 NA   NA
 833965 833966 CJE0507 CJE0508   miaB TRUE 0.709 -37.000 0.029 NA   NA
 833966 833967 CJE0508 CJE0509 miaB   TRUE 0.804 -3.000 0.033 NA   NA
 833970 833971 CJE0512 CJE0513     TRUE 0.955 0.000 0.130 1.000   NA
 833971 833972 CJE0513 CJE0514   recG TRUE 0.887 -10.000 0.084 1.000   NA
 833974 833975 CJE0516 CJE0517     TRUE 0.731 16.000 0.048 NA N NA
 833975 833976 CJE0517 CJE0518     TRUE 0.994 -7.000 0.841 0.013 Y NA
 833976 833977 CJE0518 CJE0519     TRUE 0.993 2.000 0.773 1.000 Y NA
 833977 833978 CJE0519 CJE_tRNA-Thr-1     FALSE 0.128 115.000 0.000 NA   NA
 833978 833979 CJE_tRNA-Thr-1 CJE_tRNA-Tyr-1     FALSE 0.321 51.000 0.000 NA   NA
 833979 833980 CJE_tRNA-Tyr-1 CJE_tRNA-Gly-1     TRUE 0.774 7.000 0.000 NA   NA
 833980 833981 CJE_tRNA-Gly-1 CJE_tRNA-Thr-2     FALSE 0.145 102.000 0.000 NA   NA
 833981 833982 CJE_tRNA-Thr-2 CJE0520   tuf FALSE 0.234 69.000 0.000 NA   NA
 833982 833983 CJE0520 CJE0521 tuf rpmG TRUE 0.730 53.000 0.099 1.000 Y NA
 833983 833984 CJE0521 CJE_tRNA-Trp-1 rpmG   TRUE 0.607 13.000 0.000 NA   NA
 833984 833985 CJE_tRNA-Trp-1 CJE0522   secE FALSE 0.508 19.000 0.000 NA   NA
 833985 833986 CJE0522 CJE0523 secE nusG TRUE 0.985 10.000 0.843 1.000   NA
 833986 833987 CJE0523 CJE0524 nusG rplK TRUE 0.945 26.000 0.681 1.000 N NA
 833987 833988 CJE0524 CJE0525 rplK rplA TRUE 0.965 55.000 0.838 0.041 Y NA
 833988 833989 CJE0525 CJE0526 rplA rplJ TRUE 0.736 152.000 0.302 0.041 Y NA
 833989 833990 CJE0526 CJE0527 rplJ rplL TRUE 0.986 21.000 0.884 0.031 Y NA
 833990 833991 CJE0527 CJE0528 rplL rpoB FALSE 0.525 109.000 0.223 1.000   NA
 833991 833992 CJE0528 CJE0529 rpoB rpoC TRUE 0.994 -7.000 0.851 0.001   NA
 833993 833994 CJE0530 CJE0531     TRUE 0.771 8.000 0.000 NA   NA
 833995 833996 CJE0532 CJE0533   uxaA TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 833996 833997 CJE0533 CJE0534 uxaA   TRUE 0.639 12.000 0.000 NA   NA
 833997 833998 CJE0534 CJE0535     TRUE 0.852 1.000 0.000 1.000 N NA
 833998 833999 CJE0535 CJE0536   fucP TRUE 0.956 11.000 0.364 1.000 N NA
 833999 834000 CJE0536 CJE0537 fucP   TRUE 0.939 -16.000 0.273 1.000   NA
 834000 834001 CJE0537 CJE0538     TRUE 0.914 1.000 0.053 NA   NA
 834001 834002 CJE0538 CJE0539   aldA TRUE 0.767 14.000 0.053 NA   NA
 834002 834003 CJE0539 CJE0540 aldA rpsL FALSE 0.101 328.000 0.000 1.000 N NA
 834003 834004 CJE0540 CJE0541 rpsL rpsG TRUE 0.943 70.000 0.620 0.006 Y NA
 834004 834005 CJE0541 CJE0542 rpsG fusA TRUE 0.973 13.000 0.579 1.000 Y NA
 834005 834006 CJE0542 CJE_tRNA-Arg-1 fusA   FALSE 0.432 30.000 0.000 NA   NA
 834006 834007 CJE_tRNA-Arg-1 CJE0544     FALSE 0.094 183.000 0.000 NA   NA
 834008 834009 CJE0545 CJE0546     TRUE 0.696 -7.000 0.000 NA   NA
 834009 834010 CJE0546 CJE0547     TRUE 0.723 10.000 0.000 NA   NA
 834010 834011 CJE0547 CJE0548     FALSE 0.080 377.000 0.000 NA   NA
 834011 834012 CJE0548 CJE0549     FALSE 0.109 136.000 0.000 NA   NA
 834012 834013 CJE0549 CJE0550     TRUE 0.613 44.000 0.000 0.048   NA
 834013 834014 CJE0550 CJE0551     TRUE 0.638 -19.000 0.000 NA   NA
 834014 834015 CJE0551 CJE0552     FALSE 0.211 75.000 0.000 NA   NA
 834015 834016 CJE0552 CJE0553     FALSE 0.278 58.000 0.000 NA   NA
 834016 834017 CJE0553 CJE0554     TRUE 0.980 -19.000 1.000 NA   NA
 834017 834018 CJE0554 CJE0555     TRUE 0.986 0.000 0.667 NA   NA
 834018 834019 CJE0555 CJE0556     TRUE 0.946 2.000 0.125 NA   NA
 834019 834020 CJE0556 CJE0557     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 834020 834021 CJE0557 CJE0558     TRUE 0.686 -9.000 0.000 NA   NA
 834021 834022 CJE0558 CJE0559     TRUE 0.983 -9.000 1.000 NA   NA
 834022 834023 CJE0559 CJE0560     FALSE 0.088 227.000 0.000 NA   NA
 834023 834024 CJE0560 CJE0561     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 834026 834027 CJE0563 CJE0564     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 834027 834028 CJE0564 CJE0565     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834028 834029 CJE0565 CJE0566     FALSE 0.194 80.000 0.000 NA   NA
 834029 834030 CJE0566 CJE0567     TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 834030 834031 CJE0567 CJE0568     TRUE 0.771 8.000 0.000 NA   NA
 834031 834032 CJE0568 CJE0569     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834033 834034 CJE0570 CJE0571     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834034 834035 CJE0571 CJE0572     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834035 834036 CJE0572 CJE0573     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834036 834037 CJE0573 CJE0574     TRUE 0.672 11.000 0.000 NA   NA
 834037 834038 CJE0574 CJE0575     TRUE 0.830 18.000 0.111 1.000   NA
 834038 834039 CJE0575 CJE0576     TRUE 0.942 0.000 0.111 NA   NA
 834039 834040 CJE0576 CJE0577     TRUE 0.952 -3.000 0.333 NA   NA
 834040 834041 CJE0577 CJE0578     TRUE 0.956 -10.000 0.400 NA   NA
 834041 834042 CJE0578 CJE0579     TRUE 0.956 -19.000 0.500 NA   NA
 834042 834043 CJE0579 CJE0580     TRUE 0.966 -7.000 0.500 NA   NA
 834043 834044 CJE0580 CJE0581     TRUE 0.983 -10.000 1.000 NA   NA
 834044 834045 CJE0581 CJE0582     TRUE 0.971 11.000 0.667 NA   NA
 834045 834046 CJE0582 CJE0583     FALSE 0.599 265.000 0.667 NA   NA
 834046 834047 CJE0583 CJE0584     TRUE 0.811 0.000 0.000 NA   NA
 834048 834049 CJE0585 CJE0586     TRUE 0.723 10.000 0.000 NA   NA
 834050 834051 CJE0587 CJE0588     TRUE 0.966 0.000 0.250 NA   NA
 834051 834052 CJE0588 CJE0589     TRUE 0.966 -22.000 0.667 NA   NA
 834052 834053 CJE0589 CJE0590     TRUE 0.796 3.000 0.000 NA   NA
 834053 834054 CJE0590 CJE0591     TRUE 0.823 101.000 1.000 NA   NA
 834054 834055 CJE0591 CJE0592     TRUE 0.928 13.000 0.333 NA   NA
 834055 834056 CJE0592 CJE0593     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834056 834057 CJE0593 CJE0594     TRUE 0.696 -7.000 0.000 NA   NA
 834057 834058 CJE0594 CJE0595     TRUE 0.946 -3.000 0.286 NA   NA
 834058 834059 CJE0595 CJE0596     FALSE 0.601 -58.000 0.000 NA   NA
 834059 834060 CJE0596 CJE0597     TRUE 0.811 0.000 0.000 NA   NA
 834060 834061 CJE0597 CJE0598     FALSE 0.265 62.000 0.000 NA   NA
 834061 834062 CJE0598 CJE0599     FALSE 0.596 -82.000 0.000 NA   NA
 834062 834063 CJE0599 CJE0600     TRUE 0.974 -7.000 0.667 NA   NA
 834063 834064 CJE0600 CJE0601     TRUE 0.800 114.000 1.000 NA   NA
 834064 834065 CJE0601 CJE0602     FALSE 0.126 117.000 0.000 NA   NA
 834065 834066 CJE0602 CJE0603     TRUE 0.749 6.000 0.006 NA   NA
 834066 834067 CJE0603 CJE0604     TRUE 0.852 -10.000 0.064 NA   NA
 834067 834068 CJE0604 CJE0605     TRUE 0.909 -27.000 0.228 NA   NA
 834068 834069 CJE0605 CJE0606   trpC TRUE 0.856 -3.000 0.044 1.000   NA
 834069 834070 CJE0606 CJE0607 trpC   TRUE 0.824 10.000 0.026 1.000 N NA
 834070 834071 CJE0607 CJE0608     TRUE 0.773 -10.000 0.030 NA   NA
 834071 834072 CJE0608 CJE0609     FALSE 0.082 286.000 0.000 NA   NA
 834073 834074 CJE0610 CJE0611 hemH   TRUE 0.720 -3.000 0.005 1.000   NA
 834074 834075 CJE0611 CJE0612     TRUE 0.943 5.000 0.117 1.000   NA
 834076 834077 CJE0613 CJE0614 alaS   TRUE 0.824 0.000 0.015 NA N NA
 834077 834078 CJE0614 CJE0615   pbpA TRUE 0.771 -3.000 0.026 NA N NA
 834079 834080 CJE0616 CJE0617 clpB   FALSE 0.360 112.000 0.108 NA   NA
 834081 834082 CJE0618 CJE0619 ctpA purC TRUE 0.916 2.000 0.045 1.000 N NA
 834082 834083 CJE0619 CJE0620 purC purS TRUE 0.984 9.000 0.460 1.000 Y NA
 834083 834084 CJE0620 CJE0621 purS purQ TRUE 0.996 2.000 0.656 0.002 Y NA
 834084 834085 CJE0621 CJE0622 purQ   FALSE 0.291 84.000 0.038 NA   NA
 834085 834086 CJE0622 CJE0623     TRUE 0.976 -19.000 0.846 NA   NA
 834086 834087 CJE0623 CJE0624     TRUE 0.914 -6.000 0.038 0.091 N NA
 834087 834088 CJE0624 CJE0625   htpG FALSE 0.239 73.000 0.007 1.000 N NA
 834088 834089 CJE0625 CJE0626 htpG   TRUE 0.674 -3.000 0.007 NA N NA
 834089 834090 CJE0626 CJE0627     TRUE 0.978 0.000 0.400 NA   NA
 834090 834091 CJE0627 CJE0628     FALSE 0.435 121.000 0.200 NA   NA
 834092 834093 CJE0629 CJE0630   fliE TRUE 0.778 58.000 0.303 1.000 N NA
 834093 834094 CJE0630 CJE0631 fliE flgC TRUE 0.989 7.000 0.271 0.008 Y NA
 834094 834095 CJE0631 CJE0632 flgC flgB TRUE 0.989 10.000 0.804 1.000 Y NA
 834095 834096 CJE0632 CJE0633 flgB   FALSE 0.168 80.000 0.005 NA   NA
 834097 834098 CJE0634 CJE0635   icd FALSE 0.120 117.000 0.011 NA   NA
 834098 834099 CJE0635 CJE0636 icd mdh TRUE 0.866 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 834099 834100 CJE0636 CJE0637 mdh sucC TRUE 0.922 1.000 0.022 1.000 Y NA
 834100 834101 CJE0637 CJE0638 sucC sucD TRUE 0.984 10.000 0.169 0.001 Y NA
 834101 834102 CJE0638 CJE0639 sucD oorD TRUE 0.892 14.000 0.097 1.000 Y NA
 834102 834103 CJE0639 CJE0640 oorD oorA TRUE 0.991 9.000 0.316 0.003 Y NA
 834103 834104 CJE0640 CJE0641 oorA oorB TRUE 0.997 1.000 0.771 0.003 Y NA
 834104 834105 CJE0641 CJE0642 oorB oorC TRUE 0.987 -3.000 0.324 0.003 Y NA
 834105 834106 CJE0642 CJE0643 oorC   FALSE 0.270 139.000 0.083 NA   NA
 834106 834107 CJE0643 CJE0644     TRUE 0.981 3.000 0.514 NA   NA
 834107 834108 CJE0644 CJE0645     TRUE 0.688 14.000 0.030 NA   NA
 834108 834109 CJE0645 CJE0646   hemA TRUE 0.948 0.000 0.051 1.000 Y NA
 834109 834110 CJE0646 CJE0647 hemA proS TRUE 0.899 -16.000 0.040 0.054 N NA
 834110 834111 CJE0647 CJE0648 proS   TRUE 0.792 -3.000 0.022 1.000   NA
 834111 834112 CJE0648 CJE0649   hemC TRUE 0.751 -3.000 0.013 1.000   NA
 834112 834113 CJE0649 CJE0650 hemC   TRUE 0.794 -3.000 0.009 NA Y NA
 834113 834114 CJE0650 CJE0651   flaG FALSE 0.118 156.000 0.018 NA N NA
 834114 834115 CJE0651 CJE0652 flaG fliD TRUE 0.951 3.000 0.092 NA Y NA
 834115 834116 CJE0652 CJE0653 fliD fliS TRUE 0.990 12.000 0.608 0.005 Y NA
 834116 834117 CJE0653 CJE0654 fliS   TRUE 0.801 -19.000 0.051 NA   NA
 834119 834120 CJE0655 CJE0656 efp   FALSE 0.083 160.000 0.002 NA   NA
 834120 834121 CJE0656 CJE0657     TRUE 0.980 -13.000 0.939 NA   NA
 834121 834122 CJE0657 CJE0658     TRUE 0.937 10.000 0.202 NA   NA
 834122 834123 CJE0658 CJE0659     FALSE 0.125 125.000 0.014 NA   NA
 834123 834124 CJE0659 CJE0660     TRUE 0.762 11.000 0.029 NA   NA
 834125 834126 CJE0661 CJE0662   proA TRUE 0.656 -3.000 0.003 NA   NA
 834127 834128 CJE0663 CJE0665     FALSE 0.094 181.000 0.000 NA   NA
 834130 834131 CJE0667 CJE0668 dnaB   FALSE 0.140 105.000 0.012 NA   NA
 834131 834132 CJE0668 CJE0669     TRUE 0.983 -9.000 1.000 NA   NA
 834132 834133 CJE0669 CJE0670     FALSE 0.114 130.000 0.000 NA   NA
 834133 834134 CJE0670 CJE0671     TRUE 0.672 11.000 0.000 NA   NA
 834134 834135 CJE0671 CJE0672     FALSE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 834135 834136 CJE0672 CJE0673     TRUE 0.761 9.000 0.000 NA   NA
 834136 834137 CJE0673 CJE0674     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834138 834139 CJE_tRNA-Met-1 CJE_tRNA-Gln-1     FALSE 0.412 35.000 0.000 NA   NA
 834140 834141 CJE0675 CJE0676 ribB   TRUE 0.653 12.000 0.004 1.000   NA
 834141 834142 CJE0676 CJE0677   ilvB FALSE 0.540 18.000 0.004 1.000   NA
 834142 834143 CJE0677 CJE0678 ilvB ilvH TRUE 0.986 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 834143 834144 CJE0678 CJE0679 ilvH lpxD TRUE 0.869 -3.000 0.052 1.000 N NA
 834145 834146 CJE0680 CJE0681 queA tatC TRUE 0.808 -7.000 0.036 NA N NA
 834146 834147 CJE0681 CJE0682 tatC tatB TRUE 0.978 -7.000 0.535 NA Y NA
 834147 834148 CJE0682 CJE0683 tatB   FALSE 0.321 58.000 0.011 1.000 N NA
 834149 834150 CJE0684 CJE0685 nidH   TRUE 0.923 2.000 0.051 1.000 N NA
 834150 834151 CJE0685 CJE0686     TRUE 0.910 1.000 0.050 NA   NA
 834151 834152 CJE0686 CJE0687     TRUE 0.893 6.000 0.053 NA   NA
 834152 834153 CJE0687 CJE0688   folP TRUE 0.926 2.000 0.054 1.000   NA
 834153 834154 CJE0688 CJE0689 folP ligA TRUE 0.834 1.000 0.006 1.000 N NA
 834154 834155 CJE0689 CJE0690 ligA   FALSE 0.588 -19.000 0.003 NA   NA
 834155 834156 CJE0690 CJE0691   tlyA TRUE 0.661 -3.000 0.005 NA   NA
 834156 834157 CJE0691 CJE0692 tlyA   TRUE 0.751 -34.000 0.029 1.000 N NA
 834157 834158 CJE0692 CJE0693     TRUE 0.899 -10.000 0.051 1.000 Y NA
 834159 834160 CJE0694 CJE0695     TRUE 0.980 3.000 0.500 NA   NA
 834160 834161 CJE0695 CJE0696     FALSE 0.302 58.000 0.017 NA   NA
 834161 834162 CJE0696 CJE0697     TRUE 0.782 11.000 0.033 NA   NA
 834162 834163 CJE0697 CJE0698   nth TRUE 0.893 -3.000 0.004 0.005 N NA
 834164 834165 CJE0699 CJE0700   fbaA TRUE 0.906 0.000 0.036 1.000 N NA
 834165 834166 CJE0700 CJE0701 fbaA   FALSE 0.254 95.000 0.027 1.000   NA
 834166 834167 CJE0701 CJE0702     TRUE 0.948 -3.000 0.250 1.000   NA
 834167 834168 CJE0702 CJE0703     TRUE 0.861 -13.000 0.060 1.000 N NA
 834169 834170 CJE0704 CJE0705     TRUE 0.733 51.000 0.160 1.000   NA
 834170 834171 CJE0705 CJE0706   dsbD TRUE 0.937 -3.000 0.185 1.000   NA
 834172 834173 CJE0707 CJE0708     TRUE 0.802 9.000 0.000 1.000   NA
 834173 834174 CJE0708 CJE0709     FALSE 0.590 79.000 0.158 1.000   NA
 834174 834175 CJE0709 CJE0710     TRUE 0.984 0.000 0.258 0.089 N NA
 834175 834176 CJE0710 CJE0711     TRUE 0.977 2.000 0.152 0.089 N NA
 834177 834178 CJE0712 CJE0713     TRUE 0.944 -13.000 0.280 1.000   NA
 834178 834179 CJE0713 CJE0714   algI TRUE 0.966 1.000 0.244 NA   NA
 834179 834180 CJE0714 CJE0715 algI ftn FALSE 0.545 43.000 0.047 NA N NA
 834181 834182 CJE0716 CJE0717     TRUE 0.923 10.000 0.079 NA Y NA
 834182 834183 CJE0717 CJE0718     TRUE 0.991 -3.000 0.485 0.003 Y NA
 834183 834184 CJE0718 CJE0719   pstB TRUE 0.990 -3.000 0.402 0.003 Y NA
 834184 834185 CJE0719 CJE0720 pstB   FALSE 0.265 62.000 0.000 NA   NA
 834187 834188 CJE0722 CJE0723     TRUE 0.829 -39.000 0.085 NA   NA
 834188 834189 CJE0723 CJE0724     TRUE 0.768 42.000 0.211 NA   NA
 834189 834190 CJE0724 CJE0725   hypF TRUE 0.673 -19.000 0.018 NA   NA
 834190 834191 CJE0725 CJE0726 hypF hypB TRUE 0.737 77.000 0.064 0.015 Y NA
 834191 834192 CJE0726 CJE0727 hypB hypC TRUE 0.986 0.000 0.463 NA Y NA
 834192 834193 CJE0727 CJE0728 hypC hypD TRUE 0.918 -16.000 0.123 NA Y NA
 834193 834194 CJE0728 CJE0729 hypD hypE TRUE 0.852 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 834194 834195 CJE0729 CJE0730 hypE hypA TRUE 0.939 0.000 0.080 1.000   NA
 834195 834196 CJE0730 CJE0731 hypA   FALSE 0.192 95.000 0.000 1.000   NA
 834196 834197 CJE0731 CJE0732     TRUE 0.956 -19.000 0.200 0.045   NA
 834198 834199 CJE0733 CJE0734     TRUE 0.798 -7.000 0.024 1.000 N NA
 834200 834201 CJE0735 CJE0736 ilvC   TRUE 0.828 4.000 0.013 1.000   NA
 834201 834202 CJE0736 CJE0737   dprA TRUE 0.775 -10.000 0.022 1.000   NA
 834202 834203 CJE0737 CJE0738 dprA   TRUE 0.870 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 834203 834204 CJE0738 CJE0739     FALSE 0.411 29.000 0.008 NA N NA
 834205 834206 CJE0740 CJE0741 msrA ppa FALSE 0.390 42.000 0.006 1.000 N NA
 834206 834207 CJE0741 CJE0742 ppa adk TRUE 0.781 10.000 0.015 1.000 N NA
 834207 834208 CJE0742 CJE0743 adk aspS TRUE 0.804 -3.000 0.025 1.000 N NA
 834209 834210 CJE0744 CJE0745   recN TRUE 0.934 0.000 0.066 1.000 N NA
 834210 834211 CJE0745 CJE0746 recN   FALSE 0.459 106.000 0.141 1.000 N NA
 834211 834212 CJE0746 CJE0747     TRUE 0.694 -9.000 0.013 NA N NA
 834212 834213 CJE0747 CJE0748     TRUE 0.866 0.000 0.028 NA N NA
 834213 834214 CJE0748 CJE0749   rlpA TRUE 0.898 -40.000 0.115 NA Y NA
 834214 834215 CJE0749 CJE0750 rlpA   TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 834215 834216 CJE0750 CJE0751     FALSE 0.221 72.000 0.000 NA   NA
 834216 834217 CJE0751 CJE0752     TRUE 0.650 -18.000 0.013 NA   NA
 834217 834218 CJE0752 CJE0753     TRUE 0.821 -3.000 0.041 NA   NA
 834218 834219 CJE0753 CJE0754     TRUE 0.673 -3.000 0.007 NA   NA
 834219 834220 CJE0754 CJE0755   pbpC TRUE 0.874 7.000 0.043 NA   NA
 834221 834222 CJE0756 CJE0757     TRUE 0.839 16.000 0.051 1.000 Y NA
 834222 834223 CJE0757 CJE0758     FALSE 0.091 198.000 0.000 NA   NA
 834223 834224 CJE0758 CJE0759     FALSE 0.390 39.000 0.000 NA   NA
 834224 834225 CJE0759 CJE0761     FALSE 0.076 658.000 0.000 NA   NA
 834225 834226 CJE0761 CJE0762     FALSE 0.590 389.000 0.667 NA   NA
 834226 834227 CJE0762 CJE0763   era TRUE 0.723 -13.000 0.022 NA   NA
 834227 834228 CJE0763 CJE0764 era hslU TRUE 0.867 -3.000 0.051 1.000   NA
 834228 834229 CJE0764 CJE0765 hslU hslV TRUE 0.986 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 834229 834230 CJE0765 CJE0766 hslV rplI TRUE 0.903 0.000 0.034 1.000 N NA
 834230 834231 CJE0766 CJE0767 rplI argG TRUE 0.646 13.000 0.009 1.000 N NA
 834232 834233 CJE0768 CJE0769     TRUE 0.693 -3.000 0.011 NA   NA
 834233 834234 CJE0769 CJE0770     TRUE 0.779 -16.000 0.039 NA   NA
 834234 834235 CJE0770 CJE0771   rpoN TRUE 0.915 0.000 0.044 1.000   NA
 834235 834236 CJE0771 CJE0772 rpoN dcuB FALSE 0.191 164.000 0.033 1.000   NA
 834236 834237 CJE0772 CJE0773 dcuB   FALSE 0.134 142.000 0.022 NA   NA
 834237 834238 CJE0773 CJE0774     FALSE 0.179 84.000 0.000 NA   NA
 834238 834239 CJE0774 CJE0775     TRUE 0.723 10.000 0.000 NA   NA
 834239 834240 CJE0775 CJE0776     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 834240 834241 CJE0776 CJE0777     FALSE 0.114 131.000 0.000 NA   NA
 834243 834244 CJE0779 CJE0780     TRUE 0.975 -10.000 0.714 NA   NA
 834244 834245 CJE0780 CJE0781     TRUE 0.949 -3.000 0.316 NA   NA
 834245 834246 CJE0781 CJE0782   priA TRUE 0.667 -18.000 0.016 NA N NA
 834250 834251 CJE0787 CJE0788 pta ackA TRUE 0.896 14.000 0.103 1.000 Y NA
 834254 834255 CJE0791 CJE0792   mraW TRUE 0.877 0.000 0.031 NA   NA
 834256 834257 CJE0793 CJE0794   ftsA TRUE 0.961 3.000 0.184 1.000   NA
 834257 834258 CJE0794 CJE0795 ftsA ftsZ TRUE 0.891 16.000 0.114 1.000 Y NA
 834258 834259 CJE0795 CJE0796 ftsZ   FALSE 0.109 156.000 0.002 1.000 N NA
 834259 834260 CJE0796 CJE0797   flgG TRUE 0.964 29.000 0.377 0.008 Y NA
 834261 834262 CJE0798 CJE0799 glnA   FALSE 0.167 89.000 0.000 NA   NA
 834263 834264 CJE0800 CJE0801     TRUE 0.869 -3.000 0.068 NA   NA
 834264 834265 CJE0801 CJE0802   purE TRUE 0.870 1.000 0.018 1.000 N NA
 834265 834266 CJE0802 CJE0803 purE   TRUE 0.723 10.000 0.000 NA   NA
 834266 834267 CJE0803 CJE0804   glyQ TRUE 0.639 12.000 0.000 NA   NA
 834267 834268 CJE0804 CJE0805 glyQ   TRUE 0.795 -13.000 0.041 NA   NA
 834268 834269 CJE0805 CJE0806     TRUE 0.958 10.000 0.342 NA   NA
 834269 834270 CJE0806 CJE0807   waaA TRUE 0.905 -3.000 0.122 NA   NA
 834270 834271 CJE0807 CJE0808 waaA   TRUE 0.900 -19.000 0.133 1.000 N NA
 834271 834272 CJE0808 CJE0809   ffh FALSE 0.290 68.000 0.013 1.000 N NA
 834272 834273 CJE0809 CJE0810 ffh rpsP TRUE 0.773 66.000 0.361 1.000 N NA
 834273 834274 CJE0810 CJE0811 rpsP   TRUE 0.978 3.000 0.385 1.000   NA
 834274 834275 CJE0811 CJE0812   rimM TRUE 0.956 -7.000 0.324 1.000   NA
 834275 834276 CJE0812 CJE0813 rimM trmD TRUE 0.985 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 834276 834277 CJE0813 CJE0814 trmD rplS TRUE 0.979 11.000 0.567 1.000 Y NA
 834277 834278 CJE0814 CJE0815 rplS   FALSE 0.117 134.000 0.003 1.000   NA
 834278 834279 CJE0815 CJE0816     FALSE 0.572 24.000 0.018 1.000   NA
 834279 834280 CJE0816 CJE0817     TRUE 0.757 -3.000 0.014 1.000 N NA
 834280 834281 CJE0817 CJE0818   dnaE FALSE 0.084 448.000 0.002 1.000 N NA
 834282 834283 CJE0819 CJE0820   flaC FALSE 0.392 35.000 0.009 NA   NA
 834283 834284 CJE0820 CJE0821 flaC   TRUE 0.767 39.000 0.172 NA   NA
 834284 834285 CJE0821 CJE0822     TRUE 0.726 13.000 0.033 NA   NA
 834285 834286 CJE0822 CJE0823     TRUE 0.887 -3.000 0.068 1.000 N NA
 834288 834289 CJE0825 CJE0826 mog corA FALSE 0.550 21.000 0.011 1.000 N NA
 834290 834291 CJE0827 CJE0828     TRUE 0.856 11.000 0.073 NA   NA
 834291 834292 CJE0828 CJE0829     TRUE 0.921 0.000 0.065 NA   NA
 834292 834293 CJE0829 CJE0830     TRUE 0.954 -3.000 0.290 1.000   NA
 834293 834294 CJE0830 CJE0831     TRUE 0.995 1.000 0.774 0.035   NA
 834294 834295 CJE0831 CJE0832     TRUE 0.943 41.000 0.360 0.035 Y NA
 834295 834296 CJE0832 CJE0833     TRUE 0.939 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 834298 834299 CJE0835 CJE0836     FALSE 0.390 39.000 0.000 NA   NA
 834299 834300 CJE0836 CJE0837     TRUE 0.639 12.000 0.000 NA   NA
 834300 834301 CJE0837 CJE0838     FALSE 0.083 273.000 0.000 NA   NA
 834301 834302 CJE0838 CJE0839     TRUE 0.636 81.000 0.286 NA   NA
 834302 834303 CJE0839 CJE0840     FALSE 0.155 96.000 0.000 NA   NA
 834303 834304 CJE0840 CJE0841     FALSE 0.078 481.000 0.000 NA   NA
 834304 834305 CJE0841 CJE0842     FALSE 0.084 252.000 0.000 NA   NA
 834305 834306 CJE0842 CJE0843     FALSE 0.084 251.000 0.000 NA   NA
 834306 834307 CJE0843 CJE_Cj16SC   hypothetical rRNA FALSE 0.078 501.000 0.000 NA   NA
 834307 834308 CJE_Cj16SC CJE_tRNA-Ala-3 hypothetical rRNA   FALSE 0.141 105.000 0.000 NA   NA
 834308 834309 CJE_tRNA-Ala-3 CJE_tRNA-Ile-3     TRUE 0.761 9.000 0.000 NA   NA
 834309 834310 CJE_tRNA-Ile-3 CJE_Cj23SC   rrlC FALSE 0.078 537.000 0.000 NA   NA
 834310 3820337 CJE_Cj23SC CJE_r03 rrlC   FALSE 0.086 245.000 0.000 NA   NA
 3820337 834311 CJE_r03 CJE0844     FALSE 0.077 648.000 0.000 NA   NA
 834313 834314 CJE0846 CJE0847   cfrA FALSE 0.136 108.000 0.000 NA   NA
 834314 834315 CJE0847 CJE0848 cfrA hrcA FALSE 0.082 302.000 0.000 NA N NA
 834315 834316 CJE0848 CJE0849 hrcA grpE TRUE 0.817 -3.000 0.038 NA N NA
 834316 834317 CJE0849 CJE0850 grpE dnaK TRUE 0.873 22.000 0.029 0.010 Y NA
 834317 834318 CJE0850 CJE0851 dnaK   FALSE 0.081 320.000 0.000 NA   NA
 834318 834319 CJE0851 CJE0852     FALSE 0.385 70.000 0.045 NA   NA
 834320 834321 CJE0853 CJE0854 aspC cysE FALSE 0.397 173.000 0.102 1.000 Y NA
 834321 834322 CJE0854 CJE0855 cysE speA TRUE 0.952 1.000 0.055 1.000 Y NA
 834322 834323 CJE0855 CJE0856 speA hisS TRUE 0.789 -3.000 0.021 1.000 N NA
 834323 834324 CJE0856 CJE0857 hisS tmk TRUE 0.879 -3.000 0.018 0.097 N NA
 834324 834325 CJE0857 CJE0858 tmk coaD TRUE 0.826 -9.000 0.034 1.000 N NA
 834325 834326 CJE0858 CJE0859 coaD   TRUE 0.663 40.000 0.032 1.000 Y NA
 834326 834327 CJE0859 CJE0860     TRUE 0.928 -3.000 0.191 NA N NA
 834327 834328 CJE0860 CJE0861     FALSE 0.252 84.000 0.028 NA N NA
 834328 834329 CJE0861 CJE0862     TRUE 0.990 10.000 1.000 NA Y NA
 834329 834330 CJE0862 CJE0863     TRUE 0.933 49.000 0.800 NA Y NA
 834330 834331 CJE0863 CJE0864     FALSE 0.417 190.000 0.154 NA Y NA
 834331 834332 CJE0864 CJE0865     TRUE 0.980 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 834332 834333 CJE0865 CJE0866   valS TRUE 0.899 5.000 0.007 0.097 N NA
 834333 834334 CJE0866 CJE0867 valS   FALSE 0.436 23.000 0.005 NA   NA
 834335 834336 CJE0868 CJE0869     FALSE 0.369 41.000 0.012 NA   NA
 834336 834337 CJE0869 CJE0870   tpx FALSE 0.126 99.000 0.004 NA   NA
 834337 834338 CJE0870 CJE0871 tpx napA FALSE 0.107 247.000 0.000 1.000 N NA
 834338 834339 CJE0871 CJE0872 napA napG TRUE 0.944 18.000 0.270 0.043   NA
 834339 834340 CJE0872 CJE0873 napG napH TRUE 0.995 0.000 0.795 0.022   NA
 834340 834341 CJE0873 CJE0874 napH napB TRUE 0.983 0.000 0.385 NA Y NA
 834341 834342 CJE0874 CJE0875 napB napL TRUE 0.938 5.000 0.132 NA   NA
 834342 834343 CJE0875 CJE0876 napL napD TRUE 0.911 -7.000 0.139 NA   NA
 834343 834344 CJE0876 CJE0877 napD   TRUE 0.853 13.000 0.111 NA   NA
 834344 834345 CJE0877 CJE0878     TRUE 0.738 82.000 0.500 NA   NA
 834345 834346 CJE0878 CJE0879     TRUE 0.911 -3.000 0.133 NA   NA
 834346 834347 CJE0879 CJE0880     TRUE 0.769 56.000 0.325 NA   NA
 834347 834348 CJE0880 CJE0881   purU TRUE 0.884 -3.000 0.064 1.000 N NA
 834350 834351 CJE0883 CJE0884     TRUE 0.973 4.000 0.333 1.000   NA
 834351 834352 CJE0884 CJE0885     FALSE 0.595 99.000 0.333 NA   NA
 834353 834354 CJE0886 CJE0887     TRUE 0.950 1.000 0.129 NA   NA
 834354 834355 CJE0887 CJE0888     TRUE 0.908 2.000 0.052 NA   NA
 834355 834356 CJE0888 CJE0889   ddlA FALSE 0.301 60.000 0.018 NA   NA
 834356 834357 CJE0889 CJE0890 ddlA ruvA TRUE 0.881 10.000 0.014 0.096 N NA
 834357 834358 CJE0890 CJE0891 ruvA   TRUE 0.641 -24.000 0.004 1.000   NA
 834359 834360 CJE0892 CJE0893 mviN cysS TRUE 0.886 0.000 0.027 1.000   NA
 834360 834361 CJE0893 CJE0894 cysS   TRUE 0.863 -7.000 0.013 0.096 N NA
 834361 834362 CJE0894 CJE0895   pyrD FALSE 0.516 32.000 0.017 1.000 N NA
 834362 834363 CJE0895 CJE0896 pyrD   TRUE 0.863 -3.000 0.048 1.000   NA
 834363 834364 CJE0896 CJE0897   dapA TRUE 0.941 -7.000 0.217 1.000   NA
 834364 834365 CJE0897 CJE0898 dapA   TRUE 0.969 0.000 0.238 1.000 N NA
 834366 834367 CJE0899 CJE0900     TRUE 0.762 12.000 0.035 NA   NA
 834368 834369 CJE0901 CJE0902 nadE lpxK TRUE 0.862 4.000 0.024 1.000 N NA
 834369 834370 CJE0902 CJE0903 lpxK thrC TRUE 0.737 -3.000 0.009 1.000 N NA
 834370 834371 CJE0903 CJE0904 thrC kdsB TRUE 0.772 -3.000 0.017 1.000 N NA
 834371 834372 CJE0904 CJE0905 kdsB   FALSE 0.146 87.000 0.005 NA   NA
 834372 834373 CJE0905 CJE0906     FALSE 0.159 94.000 0.000 NA   NA
 834375 834376 CJE0908 CJE0909 glmU coaBC TRUE 0.769 -3.000 0.016 1.000 N NA
 834376 834377 CJE0909 CJE0910 coaBC   TRUE 0.843 3.000 0.024 NA   NA
 834377 834378 CJE0910 CJE0911   uppS TRUE 0.782 4.000 0.012 NA   NA
 834378 834379 CJE0911 CJE0912 uppS   TRUE 0.772 -3.000 0.017 1.000 N NA
 834379 834380 CJE0912 CJE0913     TRUE 0.909 0.000 0.039 1.000   NA
 834380 834381 CJE0913 CJE0914   truA TRUE 0.929 0.000 0.059 1.000   NA
 834382 834383 CJE0915 CJE0916 ilvA   TRUE 0.874 0.000 0.030 NA   NA
 834385 834386 CJE0918 CJE0919 trmA   TRUE 0.875 -3.000 0.056 1.000 N NA
 834386 834387 CJE0919 CJE0920     TRUE 0.860 -3.000 0.047 1.000   NA
 834387 834388 CJE0920 CJE0921     TRUE 0.774 -3.000 0.018 1.000   NA
 834388 834389 CJE0921 CJE0922   acnB FALSE 0.307 60.000 0.010 1.000   NA
 834391 834392 CJE0924 CJE0925   metS TRUE 0.905 4.000 0.046 1.000   NA
 834392 834393 CJE0925 CJE0926 metS   TRUE 0.781 10.000 0.024 NA   NA
 834393 834394 CJE0926 CJE0927   fbp TRUE 0.978 -7.000 0.778 NA   NA
 834394 834395 CJE0927 CJE0928 fbp mobB TRUE 0.822 2.000 0.005 1.000 N NA
 834397 834398 CJE0930 CJE0931     TRUE 0.878 -3.000 0.080 NA   NA
 834398 834399 CJE0931 CJE0932   gltX-1 TRUE 0.937 3.000 0.088 1.000   NA
 834400 834401 CJE0933 CJE0934   psd TRUE 0.815 -3.000 0.028 1.000   NA
 834402 834403 CJE0935 CJE0936     TRUE 0.849 -3.000 0.042 1.000   NA
 834403 834404 CJE0936 CJE0937     TRUE 0.899 -7.000 0.091 1.000   NA
 834404 834405 CJE0937 CJE0938     TRUE 0.931 -22.000 0.318 NA   NA
 834405 834406 CJE0938 CJE0939     TRUE 0.968 0.000 0.269 NA   NA
 834406 834407 CJE0939 CJE0940   hemL TRUE 0.969 -3.000 0.462 1.000   NA
 834407 834408 CJE0940 CJE0941 hemL   TRUE 0.941 -3.000 0.212 1.000   NA
 834409 834410 CJE0942 CJE0943 folD lepB TRUE 0.924 10.000 0.117 1.000 N NA
 834411 834412 CJE0944 CJE0945   murA TRUE 0.801 -3.000 0.024 1.000 N NA
 834412 834413 CJE0945 CJE0946 murA   FALSE 0.211 66.000 0.004 NA   NA
 834415 834416 CJE0948 CJE0949 pabA pabB TRUE 0.955 -3.000 0.048 0.017 Y NA
 834416 834417 CJE0949 CJE0950 pabB   TRUE 0.716 -10.000 0.009 1.000 N NA
 834418 834419 CJE0951 CJE0952 dsbA dsbB TRUE 0.937 12.000 0.333 NA   NA
 834419 834420 CJE0952 CJE0953 dsbB   FALSE 0.169 88.000 0.000 NA   NA
 834420 834421 CJE0953 CJE0954     FALSE 0.301 54.000 0.000 NA   NA
 834424 834425 CJE0959 CJE0960     TRUE 0.948 -3.000 0.294 NA   NA
 834425 834426 CJE0960 CJE0961     TRUE 0.900 -16.000 0.154 NA   NA
 834426 834427 CJE0961 CJE0962   flhA TRUE 0.933 9.000 0.106 1.000   NA
 834427 834428 CJE0962 CJE0963 flhA   TRUE 0.828 -13.000 0.053 NA N NA
 834430 834431 CJE0965 CJE0966     FALSE 0.421 125.000 0.145 1.000   NA
 834432 834433 CJE_tRNA-Leu-1 CJE_tRNA-Gly-2     TRUE 0.672 11.000 0.000 NA   NA
 834434 834435 CJE0967 CJE0968     TRUE 0.902 4.000 0.007 0.095   NA
 834435 834436 CJE0968 CJE0969     TRUE 0.961 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 834436 834437 CJE0969 CJE0970   serA TRUE 0.688 -13.000 0.006 1.000 N NA
 834437 834438 CJE0970 CJE0971 serA   TRUE 0.767 -3.000 0.025 NA   NA
 834438 834439 CJE0971 CJE0972   rpsA TRUE 0.974 0.000 0.343 NA   NA
 834439 834440 CJE0972 CJE0973 rpsA ispH FALSE 0.374 132.000 0.118 1.000 N NA
 834440 834441 CJE0973 CJE0974 ispH aroA TRUE 0.813 -10.000 0.032 1.000 N NA
 834441 834442 CJE0974 CJE0975 aroA pheT TRUE 0.814 -3.000 0.028 1.000 N NA
 834442 834443 CJE0975 CJE0976 pheT pheS TRUE 0.993 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 834445 834446 CJE0978 CJE0979 thiJ   TRUE 0.695 -7.000 0.012 NA   NA
 834447 834448 CJE0980 CJE0981     TRUE 0.931 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 834449 834450 CJE0982 CJE0983     FALSE 0.166 104.000 0.009 1.000 N NA
 834450 834451 CJE0983 CJE0984   alr TRUE 0.809 3.000 0.005 1.000 N NA
 834451 834452 CJE0984 CJE0985 alr   TRUE 0.850 1.000 0.021 NA   NA
 834453 834454 CJE0986 CJE0987     FALSE 0.296 86.000 0.042 NA   NA
 834454 834455 CJE0987 CJE0988     TRUE 0.913 4.000 0.069 NA   NA
 834455 834456 CJE0988 CJE0989     TRUE 0.927 -3.000 0.192 NA   NA
 834457 834458 CJE0990 CJE0991 cysK hup FALSE 0.182 127.000 0.024 1.000 N NA
 834458 834459 CJE0991 CJE0992 hup ciaB FALSE 0.499 102.000 0.167 1.000   NA
 834461 834462 CJE0994 CJE0995   cstA TRUE 0.916 -19.000 0.229 NA   NA
 834462 834463 CJE0995 CJE0996 cstA prsA FALSE 0.128 167.000 0.014 1.000 N NA
 834463 834464 CJE0996 CJE0997 prsA   FALSE 0.324 107.000 0.029 1.000 Y NA
 834464 834465 CJE0997 CJE0998     TRUE 0.994 11.000 0.947 0.011 Y NA
 834465 834466 CJE0998 CJE0999   pebA TRUE 0.993 2.000 0.400 0.034 Y NA
 834466 834467 CJE0999 CJE1000 pebA pebC TRUE 0.957 22.000 0.594 1.000 Y NA
 834467 834468 CJE1000 CJE1001 pebC cheR FALSE 0.395 136.000 0.143 1.000 N NA
 834468 834469 CJE1001 CJE1002 cheR cheB TRUE 0.875 16.000 0.154 1.000   NA
 834470 834471 CJE1003 CJE1004 rpiB   TRUE 0.939 0.000 0.103 NA   NA
 834471 834472 CJE1004 CJE1005   apt TRUE 0.780 -3.000 0.028 NA   NA
 834472 834473 CJE1005 CJE1006 apt   FALSE 0.596 19.000 0.026 NA   NA
 834473 834474 CJE1006 CJE1007     TRUE 0.940 -3.000 0.250 NA   NA
 834474 834475 CJE1007 CJE1008     TRUE 0.808 -3.000 0.026 1.000 N NA
 834476 834477 CJE1009 CJE1010 argH pckA TRUE 0.745 10.000 0.006 1.000 N NA
 834477 834478 CJE1010 CJE1011 pckA   TRUE 0.780 13.000 0.016 1.000 Y NA
 834478 834479 CJE1011 CJE1012     TRUE 0.752 32.000 0.100 1.000   NA
 834479 834480 CJE1012 CJE1013     TRUE 0.981 13.000 0.444 0.002   NA
 834481 834482 CJE1014 CJE_tRNA-Leu-2 atpE   FALSE 0.405 36.000 0.000 NA   NA
 834482 834483 CJE_tRNA-Leu-2 CJE1015     FALSE 0.091 197.000 0.000 NA   NA
 834484 834485 CJE1016 CJE1017 aas   FALSE 0.332 45.000 0.011 NA   NA
 834485 834486 CJE1017 CJE_tRNA-Asp-1     FALSE 0.240 67.000 0.000 NA   NA
 834486 834487 CJE_tRNA-Asp-1 CJE_tRNA-Val-1     FALSE 0.316 52.000 0.000 NA   NA
 834487 834488 CJE_tRNA-Val-1 CJE_tRNA-Arg-2     TRUE 0.774 7.000 0.000 NA   NA
 834488 834489 CJE_tRNA-Arg-2 CJE_tRNA-Lys-1     FALSE 0.500 20.000 0.000 NA   NA
 834489 834490 CJE_tRNA-Lys-1 CJE_tRNA-Asp-2     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 834490 834491 CJE_tRNA-Asp-2 CJE_tRNA-Val-2     FALSE 0.316 52.000 0.000 NA   NA
 834491 834492 CJE_tRNA-Val-2 CJE_tRNA-Lys-2     TRUE 0.771 8.000 0.000 NA   NA
 834492 834493 CJE_tRNA-Lys-2 CJE1018     FALSE 0.260 63.000 0.000 NA   NA
 834493 834494 CJE1018 CJE1019     FALSE 0.555 23.000 0.015 1.000 N NA
 834494 834495 CJE1019 CJE1020   secA TRUE 0.966 -3.000 0.201 0.083 N NA
 834497 834498 CJE1022 CJE1023     TRUE 0.972 10.000 0.529 NA   NA
 834500 834501 CJE1025 CJE1026     TRUE 0.784 -3.000 0.020 1.000   NA
 834501 834502 CJE1026 CJE1027     TRUE 0.771 -3.000 0.025 NA N NA
 834502 834503 CJE1027 CJE1028     FALSE 0.203 99.000 0.026 NA N NA
 834503 834504 CJE1028 CJE1029     TRUE 0.945 16.000 0.556 NA   NA
 834504 834505 CJE1029 CJE1030     FALSE 0.553 16.000 0.000 NA   NA
 834505 834506 CJE1030 CJE1032     FALSE 0.087 232.000 0.000 NA   NA
 834506 834507 CJE1032 CJE1033   purH FALSE 0.149 99.000 0.000 NA   NA
 834507 834508 CJE1033 CJE1034 purH   TRUE 0.811 3.000 0.005 1.000 N NA
 834508 834509 CJE1034 CJE1035   purL FALSE 0.139 129.000 0.011 1.000 N NA
 834509 834510 CJE1035 CJE1036 purL trmE TRUE 0.700 11.000 0.008 1.000   NA
 834510 834511 CJE1036 CJE1037 trmE   TRUE 0.836 -7.000 0.049 NA   NA
 834511 834512 CJE1037 CJE1038     TRUE 0.860 -3.000 0.061 NA   NA
 834512 834513 CJE1038 CJE1039     TRUE 0.964 -3.000 0.461 NA   NA
 834513 834514 CJE1039 CJE1040   rnpA TRUE 0.970 -3.000 0.540 NA   NA
 834514 834515 CJE1040 CJE1041 rnpA rpmH TRUE 0.982 -3.000 0.787 1.000   NA
 834516 834517 CJE1042 CJE1043     TRUE 0.907 -3.000 0.102 1.000   NA
 834517 834518 CJE1043 CJE1044     TRUE 0.950 -3.000 0.323 NA   NA
 834519 834520 CJE1045 CJE1046     FALSE 0.136 108.000 0.000 NA   NA
 834521 834522 CJE1047 CJE1048     FALSE 0.102 158.000 0.000 NA   NA
 834522 834523 CJE1048 CJE1049     FALSE 0.153 97.000 0.000 NA   NA
 834523 834524 CJE1049 CJE1050     FALSE 0.524 18.000 0.000 NA   NA
 834526 834527 CJE1052 CJE1053     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 834527 834528 CJE1053 CJE1054     FALSE 0.106 141.000 0.000 NA   NA
 834530 834531 CJE1056 CJE1058     FALSE 0.151 98.000 0.000 NA   NA
 834531 834532 CJE1058 CJE1059     FALSE 0.402 73.000 0.053 NA N NA
 834533 834534 CJE1060 CJE1061     TRUE 0.967 9.000 0.375 NA   NA
 834536 834537 CJE1063 CJE1064 cjaB   TRUE 0.773 41.000 0.049 0.033 N NA
 834538 834539 CJE1065 CJE1066 jlpA   FALSE 0.150 92.000 0.009 NA   NA
 834540 834541 CJE1067 CJE1068 hipO   TRUE 0.973 2.000 0.333 NA   NA
 834543 834544 CJE1070 CJE1071     TRUE 0.853 -3.000 0.056 NA   NA
 834544 834545 CJE1071 CJE1072   hemN TRUE 0.991 2.000 0.419 0.021 N NA
 834545 834546 CJE1072 CJE1073 hemN   TRUE 0.955 -13.000 0.419 NA   NA
 834546 834547 CJE1073 CJE1074   argF TRUE 0.768 -3.000 0.025 NA   NA
 834547 834548 CJE1074 CJE1075 argF hemB TRUE 0.785 -3.000 0.020 1.000 N NA
 834549 834550 CJE1076 CJE1077 ribA gidB TRUE 0.864 1.000 0.017 1.000 N NA
 834551 834552 CJE1078 CJE1079     FALSE 0.187 95.000 0.020 NA   NA
 834553 834554 CJE1080 CJE1081   rpoD FALSE 0.542 80.000 0.006 0.010 Y NA
 834555 834556 CJE1082 CJE1083 sixA   TRUE 0.819 -3.000 0.040 NA   NA
 834558 834559 CJE1085 CJE1086     TRUE 0.925 4.000 0.067 1.000 N NA
 834559 834560 CJE1086 CJE1087     TRUE 0.883 -3.000 0.063 1.000 N NA
 834560 834561 CJE1087 CJE1088   aroB TRUE 0.849 -3.000 0.041 1.000 N NA
 834561 834562 CJE1088 CJE1089 aroB   FALSE 0.505 46.000 0.031 1.000   NA
 834563 834564 CJE1090 CJE1091 tgt   TRUE 0.982 2.000 0.444 1.000 N NA
 834564 834565 CJE1091 CJE_tRNA-Arg-3     FALSE 0.309 53.000 0.000 NA   NA
 834565 834566 CJE_tRNA-Arg-3 CJE1092     FALSE 0.092 190.000 0.000 NA   NA
 834566 834567 CJE1092 CJE1093     FALSE 0.117 126.000 0.000 NA   NA
 834568 834569 CJE1094 CJE1095     TRUE 0.913 6.000 0.000 0.042   NA
 834571 834572 CJE1097 CJE1098     FALSE 0.559 188.000 0.500 NA   NA
 834572 834573 CJE1098 CJE1099     TRUE 0.898 44.000 0.667 NA   NA
 834573 834574 CJE1099 CJE1100     FALSE 0.495 21.000 0.000 NA   NA
 834574 834575 CJE1100 CJE1101     TRUE 0.679 -3.000 0.009 NA   NA
 834576 834577 CJE1102 CJE1103     TRUE 0.613 -31.000 0.000 NA   NA
 834577 834578 CJE1103 CJE1104     FALSE 0.200 79.000 0.000 NA   NA
 834579 834580 CJE1105 CJE1106     TRUE 0.613 -31.000 0.000 NA   NA
 834580 834581 CJE1106 CJE1107     FALSE 0.094 182.000 0.000 NA   NA
 834581 834582 CJE1107 CJE1108     FALSE 0.390 39.000 0.000 NA   NA
 834582 834583 CJE1108 CJE1109     FALSE 0.085 248.000 0.000 NA   NA
 834583 834584 CJE1109 CJE1110     FALSE 0.301 54.000 0.000 NA   NA
 834584 834585 CJE1110 CJE1111     FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 834585 834586 CJE1111 CJE1112     TRUE 0.672 11.000 0.000 NA   NA
 834586 834587 CJE1112 CJE1113     FALSE 0.121 122.000 0.000 NA   NA
 834587 834588 CJE1113 CJE1114     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834588 834589 CJE1114 CJE1115     TRUE 0.771 8.000 0.000 NA   NA
 834589 834590 CJE1115 CJE1116     TRUE 0.723 10.000 0.000 NA   NA
 834590 834591 CJE1116 CJE1117     FALSE 0.321 51.000 0.000 NA   NA
 834591 834592 CJE1117 CJE1118     FALSE 0.077 629.000 0.000 NA   NA
 834593 834594 CJE1119 CJE1120     FALSE 0.260 63.000 0.000 NA   NA
 834595 834596 CJE1121 CJE1122     FALSE 0.167 89.000 0.000 NA   NA
 834596 834597 CJE1122 CJE1123     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834597 834598 CJE1123 CJE1124     FALSE 0.105 148.000 0.000 NA   NA
 834598 834599 CJE1124 CJE1125     FALSE 0.086 242.000 0.000 NA   NA
 834599 834600 CJE1125 CJE1126     FALSE 0.539 17.000 0.000 NA   NA
 834600 834601 CJE1126 CJE1127     TRUE 0.796 3.000 0.000 NA   NA
 834601 834602 CJE1127 CJE1128     FALSE 0.379 40.000 0.000 NA   NA
 834602 834603 CJE1128 CJE1129     FALSE 0.080 412.000 0.000 NA   NA
 834604 834605 CJE1130 CJE1131     FALSE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 834605 834606 CJE1131 CJE1132     TRUE 0.904 42.000 0.667 NA   NA
 834606 834607 CJE1132 CJE1133     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834607 834608 CJE1133 CJE1134     TRUE 0.796 3.000 0.000 NA   NA
 834608 834609 CJE1134 CJE1135     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 834609 834610 CJE1135 CJE1136     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 834610 834611 CJE1136 CJE1137     FALSE 0.342 45.000 0.000 NA   NA
 834611 834612 CJE1137 CJE1138     TRUE 0.966 19.000 1.000 NA   NA
 834614 834615 CJE1140 CJE1141     FALSE 0.104 150.000 0.000 NA   NA
 834615 834616 CJE1141 CJE1142     FALSE 0.092 192.000 0.000 NA   NA
 834616 834617 CJE1142 CJE1143     FALSE 0.194 80.000 0.000 NA   NA
 834617 834618 CJE1143 CJE1144     TRUE 0.664 -13.000 0.000 NA   NA
 834618 834619 CJE1144 CJE1145     TRUE 0.817 1.000 0.000 NA   NA
 834619 834620 CJE1145 CJE1146     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 834620 834621 CJE1146 CJE1147     TRUE 0.991 3.000 1.000 NA   NA
 834621 834622 CJE1147 CJE1148     FALSE 0.336 46.000 0.000 NA   NA
 834622 834623 CJE1148 CJE1149     TRUE 0.696 -7.000 0.000 NA   NA
 834623 834624 CJE1149 CJE1150     TRUE 0.621 -25.000 0.000 NA   NA
 834624 834625 CJE1150 CJE1151     TRUE 0.650 -16.000 0.000 NA   NA
 834625 834626 CJE1151 CJE1152     TRUE 0.696 -7.000 0.000 NA   NA
 834626 834627 CJE1152 CJE1153     TRUE 0.811 0.000 0.000 NA   NA
 834627 834628 CJE1153 CJE1154     TRUE 0.977 13.000 1.000 NA   NA
 834628 834629 CJE1154 CJE1155     FALSE 0.077 607.000 0.000 NA   NA
 834630 834631 CJE1156 CJE1157     TRUE 0.978 1.000 0.400 NA   NA
 834631 834632 CJE1157 CJE1158   livF TRUE 0.904 18.000 0.280 1.000 N NA
 834632 834633 CJE1158 CJE1159 livF livG TRUE 0.985 -13.000 0.381 0.015 Y NA
 834633 834634 CJE1159 CJE1160 livG livM TRUE 0.957 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 834634 834635 CJE1160 CJE1161 livM livH TRUE 0.996 0.000 0.771 0.032 Y NA
 834635 834636 CJE1161 CJE1162 livH   TRUE 0.830 19.000 0.085 NA Y NA
 834636 834637 CJE1162 CJE1163     TRUE 0.973 22.000 1.000 NA Y NA
 834637 834638 CJE1163 CJE1164     TRUE 0.856 31.000 0.312 NA N NA
 834638 834639 CJE1164 CJE1165     TRUE 0.955 9.000 0.250 NA   NA
 834639 834640 CJE1165 CJE1166     FALSE 0.540 53.000 0.062 NA   NA
 834640 834641 CJE1166 CJE1167   asd TRUE 0.816 9.000 0.025 NA   NA
 834641 834642 CJE1167 CJE1168 asd   TRUE 0.882 0.000 0.025 1.000 N NA
 834642 834643 CJE1168 CJE1169     TRUE 0.694 57.000 0.205 NA   NA
 834643 834644 CJE1169 CJE1170     TRUE 0.976 -24.000 0.900 NA   NA
 834644 834645 CJE1170 CJE1171   gyrA FALSE 0.219 67.000 0.008 NA   NA
 834645 834646 CJE1171 CJE1172 gyrA ctsW FALSE 0.398 41.000 0.007 1.000   NA
 834646 834647 CJE1172 CJE1173 ctsW mapA TRUE 0.918 -3.000 0.152 NA   NA
 834647 834648 CJE1173 CJE1174 mapA lepA FALSE 0.174 77.000 0.003 NA   NA
 834649 834650 CJE1175 CJE1176     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834650 834651 CJE1176 CJE1177     TRUE 0.992 3.000 0.844 NA Y NA
 834652 834653 CJE1178 CJE1179     TRUE 0.878 1.000 0.022 1.000   NA
 834653 834654 CJE1179 CJE1180     TRUE 0.827 0.000 0.016 NA   NA
 834654 834655 CJE1180 CJE1181   accC-1 TRUE 0.974 4.000 0.400 NA   NA
 834656 834657 CJE1182 CJE1183   murG TRUE 0.977 -3.000 0.647 1.000 N NA
 834658 834659 CJE1184 CJE1185     TRUE 0.952 8.000 0.214 NA   NA
 834659 834660 CJE1185 CJE1186     TRUE 0.758 63.000 0.357 NA   NA
 834660 834661 CJE1186 CJE1187     TRUE 0.825 -3.000 0.031 1.000 N NA
 834661 834662 CJE1187 CJE1188   thiH TRUE 0.974 -10.000 0.128 0.004 Y NA
 834662 834663 CJE1188 CJE1189 thiH thiG TRUE 0.991 3.000 0.277 0.004 Y NA
 834663 834664 CJE1189 CJE1190 thiG thiF TRUE 0.945 3.000 0.003 0.026 Y NA
 834664 834665 CJE1190 CJE1191 thiF thiS TRUE 0.899 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 834665 834666 CJE1191 CJE1192 thiS dapE TRUE 0.741 10.000 0.005 1.000 N NA
 834666 834667 CJE1192 CJE1193 dapE   TRUE 0.894 5.000 0.018 1.000 Y NA
 834667 834668 CJE1193 CJE1194     TRUE 0.966 -7.000 0.417 1.000 N NA
 834668 834669 CJE1194 CJE1195     TRUE 0.891 43.000 0.250 0.040 N NA
 834669 834670 CJE1195 CJE1196   mutS TRUE 0.888 9.000 0.043 1.000 N NA
 834670 834671 CJE1196 CJE1197 mutS   TRUE 0.932 -7.000 0.217 NA   NA
 834671 834672 CJE1197 CJE1198   murC TRUE 0.703 -7.000 0.014 NA   NA
 834672 834673 CJE1198 CJE1199 murC   FALSE 0.127 124.000 0.004 1.000   NA
 834673 834674 CJE1199 CJE1200     TRUE 0.827 -7.000 0.032 1.000   NA
 834674 834675 CJE1200 CJE1201   guaB TRUE 0.726 -3.000 0.007 1.000   NA
 834675 834676 CJE1201 CJE1202 guaB gatA TRUE 0.843 10.000 0.032 1.000 N NA
 834676 834677 CJE1202 CJE1203 gatA   TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834677 834678 CJE1203 CJE1204   ileS TRUE 0.705 -6.000 0.000 NA   NA
 834679 834680 CJE1205 CJE1206     TRUE 0.869 12.000 0.111 NA   NA
 834680 834681 CJE1206 CJE1208     FALSE 0.254 64.000 0.000 NA   NA
 834681 834682 CJE1208 CJE1209     TRUE 0.811 0.000 0.000 NA   NA
 834682 834683 CJE1209 CJE1210   pgsA FALSE 0.124 126.000 0.003 1.000 N NA
 834683 834684 CJE1210 CJE1211 pgsA   TRUE 0.894 -3.000 0.023 0.055 N NA
 834684 834685 CJE1211 CJE1212     TRUE 0.649 -7.000 0.002 NA   NA
 834685 834686 CJE1212 CJE1213   rpsF FALSE 0.144 87.000 0.002 NA   NA
 834686 834687 CJE1213 CJE1214 rpsF ssb TRUE 0.871 9.000 0.033 1.000 N NA
 834687 834688 CJE1214 CJE1215 ssb rpsR TRUE 0.817 11.000 0.034 1.000 N NA
 834689 834690 CJE1216 CJE1217 lon   TRUE 0.755 17.000 0.062 NA   NA
 834691 834692 CJE1218 CJE1219   proC TRUE 0.927 0.000 0.075 NA   NA
 834692 834693 CJE1219 CJE1220 proC ctsT TRUE 0.874 -3.000 0.075 NA   NA
 834693 834694 CJE1220 CJE1221 ctsT   TRUE 0.980 -3.000 0.800 NA   NA
 834694 834695 CJE1221 CJE1222     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 834696 834697 CJE1223 CJE1224 hemD thiE TRUE 0.845 -22.000 0.032 1.000 Y NA
 834697 834698 CJE1224 CJE1225 thiE thiD TRUE 0.966 -10.000 0.079 0.004 Y NA
 834698 834699 CJE1225 CJE1226 thiD   TRUE 0.765 -3.000 0.016 1.000 N NA
 834699 834700 CJE1226 CJE1227     TRUE 0.776 -3.000 0.018 1.000   NA
 834700 834701 CJE1227 CJE1228   mfd TRUE 0.826 2.000 0.006 1.000   NA
 834701 834702 CJE1228 CJE1229 mfd   TRUE 0.854 0.000 0.023 NA N NA
 834702 834703 CJE1229 CJE1230     TRUE 0.920 -63.000 0.178 NA Y NA
 834703 834704 CJE1230 CJE1231   folC TRUE 0.807 -13.000 0.032 1.000 N NA
 834704 834705 CJE1231 CJE1232 folC   TRUE 0.879 -22.000 0.104 1.000   NA
 834705 834706 CJE1232 CJE1233     TRUE 0.955 -16.000 0.455 NA   NA
 834706 834707 CJE1233 CJE1234   leuS TRUE 0.795 -3.000 0.031 NA   NA
 834707 834708 CJE1234 CJE1235 leuS secF TRUE 0.750 10.000 0.008 1.000 N NA
 834708 834709 CJE1235 CJE1236 secF secD TRUE 0.995 0.000 0.436 0.002 Y NA
 834709 834710 CJE1236 CJE1237 secD yajC TRUE 0.907 -7.000 0.068 NA Y NA
 834713 834714 CJE1240 CJE1241   pyrB TRUE 0.741 10.000 0.005 1.000 N NA
 834714 834715 CJE1241 CJE1242 pyrB pepF TRUE 0.801 4.000 0.005 1.000 N NA
 834715 834716 CJE1242 CJE1243 pepF   TRUE 0.902 -6.000 0.115 NA   NA
 834716 834717 CJE1243 CJE1244     TRUE 0.773 -3.000 0.026 NA   NA
 834717 834718 CJE1244 CJE1245   truB TRUE 0.859 -3.000 0.046 1.000 N NA
 834718 834719 CJE1245 CJE1246 truB csrA TRUE 0.936 -6.000 0.046 0.022 N NA
 834719 834720 CJE1246 CJE1247 csrA ispE TRUE 0.841 -3.000 0.036 1.000 N NA
 834720 834721 CJE1247 CJE1248 ispE smpB TRUE 0.817 -3.000 0.028 1.000 N NA
 834721 834722 CJE1248 CJE1249 smpB   TRUE 0.707 11.000 0.009 1.000   NA
 834722 834723 CJE1249 CJE1250     TRUE 0.854 0.000 0.024 NA   NA
 834723 834724 CJE1250 CJE1251   clpA TRUE 0.971 -3.000 0.596 NA   NA
 834724 834725 CJE1251 CJE1252 clpA aat TRUE 0.902 -25.000 0.087 1.000 Y NA
 834726 834727 CJE1253 CJE1254     TRUE 0.637 81.000 0.286 NA N NA
 834727 834728 CJE1254 CJE1255   msrB TRUE 0.720 15.000 0.041 NA N NA
 834730 834731 CJE1257 CJE1258 pssA   TRUE 0.980 10.000 0.466 1.000 Y NA
 834731 834732 CJE1258 CJE1259   ftsH TRUE 0.853 -3.000 0.043 1.000 N NA
 834732 834733 CJE1259 CJE1260 ftsH   TRUE 0.963 4.000 0.217 1.000 N NA
 834733 834734 CJE1260 CJE1261   cheY TRUE 0.834 23.000 0.146 1.000 N NA
 834734 834735 CJE1261 CJE1262 cheY pglG FALSE 0.322 113.000 0.062 1.000   NA
 834735 834736 CJE1262 CJE1263 pglG pglF TRUE 0.970 0.000 0.242 1.000   NA
 834736 834737 CJE1263 CJE1264 pglF pglE TRUE 0.969 2.000 0.133 1.000 Y NA
 834737 834738 CJE1264 CJE1265 pglE pglD FALSE 0.378 98.000 0.070 1.000   NA
 834738 834739 CJE1265 CJE1266 pglD pglC TRUE 0.845 -34.000 0.074 1.000   NA
 834739 834740 CJE1266 CJE1267 pglC pglA TRUE 0.943 -7.000 0.128 1.000 Y NA
 834740 834741 CJE1267 CJE1268 pglA pglB TRUE 0.869 10.000 0.045 1.000   NA
 834741 834742 CJE1268 CJE1269 pglB pglJ TRUE 0.975 4.000 0.375 1.000   NA
 834742 834743 CJE1269 CJE1270 pglJ pglI TRUE 0.945 -12.000 0.208 NA Y NA
 834743 834744 CJE1270 CJE1271 pglI pglH TRUE 0.958 -7.000 0.267 NA Y NA
 834744 834745 CJE1271 CJE1272 pglH wlaB TRUE 0.964 0.000 0.179 1.000 N NA
 834745 834746 CJE1272 CJE1273 wlaB galE TRUE 0.900 -6.000 0.086 1.000 N NA
 834746 834747 CJE1273 CJE1274 galE wlaX FALSE 0.587 59.000 0.086 1.000 N NA
 834748 834749 CJE1275 CJE1276 waaC waaM TRUE 0.957 -10.000 0.231 1.000 Y NA
 834749 834750 CJE1276 CJE1277 waaM   TRUE 0.907 -3.000 0.050 1.000 Y NA
 834751 834752 CJE1278 CJE1279     TRUE 0.799 -7.000 0.000 NA Y NA
 834752 834753 CJE1279 CJE1280     FALSE 0.309 78.000 0.000 NA Y NA
 834753 834754 CJE1280 CJE1281     TRUE 0.696 -7.000 0.000 NA   NA
 834754 834755 CJE1281 CJE1282   waaV FALSE 0.301 54.000 0.000 NA   NA
 834757 834758 CJE1284 CJE1285   gmhA-1 TRUE 0.866 0.000 0.019 1.000 N NA
 834758 834759 CJE1285 CJE1286 gmhA-1 hldE TRUE 0.926 -3.000 0.142 1.000 N NA
 834759 834760 CJE1286 CJE1287 hldE waaD TRUE 0.968 -7.000 0.096 0.009 Y NA
 834760 834761 CJE1287 CJE1288 waaD   TRUE 0.947 1.000 0.093 1.000 N NA
 834763 834764 CJE1290 CJE1291     TRUE 0.983 -3.000 0.713 NA Y NA
 834765 834766 CJE1292 CJE1293 rho dnaX TRUE 0.907 4.000 0.009 0.087 N NA
 834767 834768 CJE1294 CJE1295     FALSE 0.221 72.000 0.000 NA   NA
 834768 834769 CJE1295 CJE1296     TRUE 0.975 0.000 0.067 0.003   NA
 834769 834770 CJE1296 CJE1297     TRUE 0.860 -10.000 0.053 1.000   NA
 834770 834771 CJE1297 CJE1298     FALSE 0.406 76.000 0.059 NA   NA
 834771 834772 CJE1298 CJE1299     FALSE 0.356 70.000 0.037 NA   NA
 834772 834773 CJE1299 CJE1300     TRUE 0.879 -3.000 0.083 NA   NA
 834775 834776 CJE1302 CJE1303     FALSE 0.320 81.000 0.043 NA   NA
 834776 834777 CJE1303 CJE1304     TRUE 0.854 11.000 0.070 NA   NA
 834777 834778 CJE1304 CJE1305   ppiB FALSE 0.105 164.000 0.015 NA   NA
 834778 834779 CJE1305 CJE1306 ppiB   TRUE 0.710 10.000 0.010 NA   NA
 834780 834781 CJE1307 CJE1308     TRUE 0.997 0.000 0.869 0.054 Y NA
 834782 834783 CJE1309 CJE1310 argS   TRUE 0.686 12.000 0.011 1.000 N NA
 834783 834784 CJE1310 CJE1311     TRUE 0.833 2.000 0.009 1.000 N NA
 834784 834785 CJE1311 CJE1312     TRUE 0.760 3.000 0.002 NA   NA
 834785 834786 CJE1312 CJE1313   fliR FALSE 0.312 57.000 0.017 NA   NA
 834786 834787 CJE1313 CJE1314 fliR   TRUE 0.803 -13.000 0.032 1.000 N NA
 834787 834788 CJE1314 CJE1315   tsf TRUE 0.701 13.000 0.019 1.000 N NA
 834788 834789 CJE1315 CJE1316 tsf rpsB TRUE 0.992 0.000 0.748 1.000 Y NA
 834789 834790 CJE1316 CJE1317 rpsB   FALSE 0.135 116.000 0.003 1.000 N NA
 834790 834791 CJE1317 CJE1318   petC FALSE 0.333 128.000 0.087 1.000 N NA
 834791 834792 CJE1318 CJE1319 petC petB TRUE 0.975 -3.000 0.103 0.002 Y NA
 834792 834793 CJE1319 CJE1320 petB petA TRUE 0.985 2.000 0.093 0.002 Y NA
 834793 834794 CJE1320 CJE1321 petA arsB FALSE 0.421 91.000 0.083 1.000 N NA
 834794 834795 CJE1321 CJE1322 arsB gidA TRUE 0.827 1.000 0.003 1.000 N NA
 834795 834796 CJE1322 CJE1323 gidA   FALSE 0.179 88.000 0.004 1.000   NA
 834796 834797 CJE1323 CJE1324     TRUE 0.975 18.000 0.556 0.008   NA
 834797 834798 CJE1324 CJE1325     TRUE 0.806 117.000 0.444 0.008   NA
 834802 834803 CJE1329 CJE1330   gpsA TRUE 0.746 10.000 0.007 1.000 N NA
 834803 834804 CJE1330 CJE1331 gpsA gatB TRUE 0.840 0.000 0.011 1.000 N NA
 834805 834806 CJE1332 CJE1333 luxS   FALSE 0.236 311.000 0.000 0.016   NA
 834806 834807 CJE1333 CJE1334     TRUE 0.824 -7.000 0.043 NA   NA
 834807 834808 CJE1334 CJE1335   metE FALSE 0.601 12.000 0.006 NA N NA
 834808 834809 CJE1335 CJE1336 metE metF TRUE 0.968 10.000 0.050 0.002 Y NA
 834810 834811 CJE1337 CJE1338   atpB TRUE 0.681 -3.000 0.009 NA   NA
 834811 834812 CJE1338 CJE1339 atpB radA FALSE 0.246 69.000 0.003 1.000 N NA
 834812 834813 CJE1339 CJE1340 radA ftsY TRUE 0.941 0.000 0.015 0.017 N NA
 834813 834814 CJE1340 CJE1341 ftsY   TRUE 0.821 0.000 0.003 1.000 N NA
 834815 834816 CJE1342 CJE1343     TRUE 0.820 -79.000 0.059 1.000   NA
 834816 834817 CJE1343 CJE1344     TRUE 0.748 9.000 0.010 NA   NA
 834817 834818 CJE1344 CJE1345     TRUE 0.784 0.000 0.005 NA   NA
 834819 834820 CJE1346 CJE1347 rbn glcD TRUE 0.882 4.000 0.031 1.000   NA
 834820 834821 CJE1347 CJE1348 glcD   TRUE 0.976 3.000 0.404 NA   NA
 834821 834822 CJE1348 CJE1349     TRUE 0.771 8.000 0.000 NA   NA
 834824 834825 CJE1351 CJE1352     TRUE 0.781 2.000 0.005 NA   NA
 834825 834826 CJE1352 CJE1353   ribE FALSE 0.595 -36.000 0.011 NA   NA
 834826 834827 CJE1353 CJE1354 ribE   TRUE 0.723 9.000 0.004 NA   NA
 834828 834829 CJE1355 CJE1356 groES groEL TRUE 0.969 21.000 0.356 0.009 Y NA
 834830 834831 CJE1357 CJE1358     TRUE 0.988 -7.000 0.846 1.000 Y NA
 834832 834833 CJE1359 CJE1360     TRUE 0.806 11.000 0.031 1.000   NA
 834834 834835 CJE_tRNA-Asn-1 CJE1361     FALSE 0.161 93.000 0.000 NA   NA
 834835 834836 CJE1361 CJE1362     TRUE 0.988 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 834836 834837 CJE1362 CJE1363   htrA TRUE 0.704 76.000 0.294 1.000 N NA
 834838 834839 CJE1364 CJE1365 dnaJ-1   TRUE 0.914 16.000 0.282 1.000 N NA
 834839 834840 CJE1365 CJE1366     TRUE 0.866 7.000 0.028 1.000 N NA
 834840 834841 CJE1366 CJE1367     TRUE 0.946 10.000 0.250 NA   NA
 834841 834842 CJE1367 CJE1368     TRUE 0.955 -3.000 0.364 NA   NA
 834842 834843 CJE1368 CJE1369   glyS FALSE 0.312 56.000 0.006 1.000   NA
 834843 834844 CJE1369 CJE1370 glyS   TRUE 0.731 -3.000 0.008 1.000 N NA
 834844 834845 CJE1370 CJE1371     TRUE 0.697 -3.000 0.012 NA   NA
 834847 834848 CJE1373 CJE1374 pdxJ pdxA TRUE 0.965 -3.000 0.048 0.001 Y NA
 834849 834850 CJE1375 CJE1376     TRUE 0.617 -27.000 0.000 NA   NA
 834851 834852 CJE1377 CJE1378     TRUE 0.807 56.000 0.400 NA   NA
 834852 834853 CJE1378 CJE1379   hemE FALSE 0.077 184.000 0.004 NA   NA
 834853 834854 CJE1379 CJE1380 hemE   TRUE 0.773 -3.000 0.017 1.000 N NA
 834855 834856 CJE1381 CJE1382   uvrC TRUE 0.781 2.000 0.005 NA   NA
 834856 834857 CJE1382 CJE1383 uvrC   TRUE 0.728 -7.000 0.018 NA   NA
 834858 834859 CJE1384 CJE1385   guaA TRUE 0.749 4.000 0.002 NA   NA
 834859 834860 CJE1385 CJE1386 guaA   FALSE 0.147 86.000 0.002 NA   NA
 834860 834861 CJE1386 CJE1387   purD FALSE 0.086 240.000 0.000 NA   NA
 834861 834862 CJE1387 CJE1388 purD   TRUE 0.727 -3.000 0.017 NA   NA
 834862 834863 CJE1388 CJE1389     TRUE 0.909 -10.000 0.149 NA   NA
 834863 834864 CJE1389 CJE1390   pnp FALSE 0.251 70.000 0.007 1.000 N NA
 834864 834865 CJE1390 CJE1391 pnp   TRUE 0.657 -3.000 0.002 NA N NA
 834866 834867 CJE1392 CJE1393     FALSE 0.524 18.000 0.000 NA   NA
 834868 834869 CJE1394 CJE1395   porA FALSE 0.084 252.000 0.000 NA   NA
 834871 834872 CJE1397 CJE1398 racR racS TRUE 0.978 -3.000 0.448 1.000 Y NA
 834872 834873 CJE1398 CJE1399 racS recR TRUE 0.844 0.000 0.011 1.000 N NA
 834874 834875 CJE1400 CJE1401 hydD hydC TRUE 0.966 -3.000 0.277 1.000 Y NA
 834875 834876 CJE1401 CJE1402 hydC hydB TRUE 0.978 -13.000 0.270 0.038 Y NA
 834876 834877 CJE1402 CJE1403 hydB hydA TRUE 0.997 3.000 0.951 0.002 Y NA
 834877 834878 CJE1403 CJE1404 hydA   FALSE 0.109 178.000 0.009 1.000 N NA
 834878 834879 CJE1404 CJE1405     TRUE 0.785 -3.000 0.020 1.000 N NA
 834879 834880 CJE1405 CJE1406     TRUE 0.922 0.000 0.050 1.000   NA
 834880 834881 CJE1406 CJE1407   tyrS TRUE 0.853 -3.000 0.043 1.000   NA
 834881 834882 CJE1407 CJE1408 tyrS   TRUE 0.818 12.000 0.045 1.000 N NA
 834882 834883 CJE1408 CJE1409   rpoZ TRUE 0.818 -16.000 0.018 1.000 Y NA
 834883 834884 CJE1409 CJE1410 rpoZ pyrH TRUE 0.689 11.000 0.004 1.000 N NA
 834884 834885 CJE1410 CJE1411 pyrH   FALSE 0.329 52.000 0.002 1.000 N NA
 834885 834886 CJE1411 CJE1412     TRUE 0.750 -3.000 0.000 1.000   NA
 834886 834887 CJE1412 CJE1413   lolD TRUE 0.771 -13.000 0.024 1.000   NA
 834887 834888 CJE1413 CJE1414 lolD trmB FALSE 0.427 70.000 0.044 1.000   NA
 834888 834889 CJE1414 CJE1415 trmB   TRUE 0.918 0.000 0.060 NA   NA
 834889 834890 CJE1415 CJE1416     TRUE 0.716 -52.000 0.031 NA   NA
 834891 834892 CJE1417 CJE_tRNA-Met-2     FALSE 0.301 54.000 0.000 NA   NA
 834892 834893 CJE_tRNA-Met-2 CJE1418     FALSE 0.089 209.000 0.000 NA   NA
 834894 834895 CJE1419 CJE1420     TRUE 0.991 2.000 1.000 NA   NA
 834895 834896 CJE1420 CJE1421     FALSE 0.524 18.000 0.000 NA   NA
 834896 834897 CJE1421 CJE1422     TRUE 0.629 -22.000 0.000 NA   NA
 834897 834898 CJE1422 CJE1423     TRUE 0.981 -16.000 1.000 NA   NA
 834898 834899 CJE1423 CJE1424     TRUE 0.817 1.000 0.000 NA   NA
 834899 834900 CJE1424 CJE1425     TRUE 0.761 9.000 0.000 NA   NA
 834900 834901 CJE1425 CJE1426     TRUE 0.620 204.000 0.667 NA   NA
 834901 834902 CJE1426 CJE1427     FALSE 0.200 79.000 0.000 NA   NA
 834902 834903 CJE1427 CJE1428     TRUE 0.696 -7.000 0.000 NA   NA
 834903 834904 CJE1428 CJE1429     FALSE 0.082 291.000 0.000 NA   NA
 834904 834905 CJE1429 CJE1430     FALSE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 834905 834906 CJE1430 CJE1431     FALSE 0.539 17.000 0.000 NA   NA
 834906 834907 CJE1431 CJE1432     TRUE 0.616 -28.000 0.000 NA   NA
 834907 834908 CJE1432 CJE1433     FALSE 0.237 68.000 0.000 NA   NA
 834908 834909 CJE1433 CJE1434     FALSE 0.284 57.000 0.000 NA   NA
 834909 834910 CJE1434 CJE1435     FALSE 0.309 53.000 0.000 NA   NA
 834910 834911 CJE1435 CJE1436     FALSE 0.079 431.000 0.000 NA   NA
 834914 834915 CJE1439 CJE1440     FALSE 0.087 235.000 0.000 NA   NA
 834915 834916 CJE1440 CJE1441     TRUE 0.816 6.000 0.000 1.000   NA
 834916 834917 CJE1441 CJE1442     FALSE 0.539 17.000 0.000 NA   NA
 834918 834919 CJE1443 CJE1444     FALSE 0.596 -82.000 0.000 NA   NA
 834919 834920 CJE1444 CJE1445     FALSE 0.088 229.000 0.000 NA   NA
 834920 834921 CJE1445 CJE1446     TRUE 0.811 0.000 0.000 NA   NA
 834921 834922 CJE1446 CJE1447     FALSE 0.601 -58.000 0.000 NA   NA
 834922 834923 CJE1447 CJE1448     TRUE 0.946 -3.000 0.286 NA   NA
 834923 834924 CJE1448 CJE1449     TRUE 0.696 -7.000 0.000 NA   NA
 834924 834925 CJE1449 CJE1450     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834925 834926 CJE1450 CJE1451     TRUE 0.928 13.000 0.333 NA   NA
 834926 834927 CJE1451 CJE1452     TRUE 0.823 101.000 1.000 NA   NA
 834927 834928 CJE1452 CJE1453     TRUE 0.984 -7.000 1.000 NA   NA
 834928 834929 CJE1453 CJE1454     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 834929 834930 CJE1454 CJE1455     TRUE 0.977 13.000 1.000 NA   NA
 834932 834933 CJE1457 CJE1458     TRUE 0.982 11.000 1.000 NA   NA
 834933 834934 CJE1458 CJE1459     TRUE 0.969 17.000 1.000 NA   NA
 834934 834935 CJE1459 CJE1460     TRUE 0.778 86.000 0.667 NA   NA
 834935 834936 CJE1460 CJE1461     TRUE 0.951 13.000 0.500 NA   NA
 834936 834937 CJE1461 CJE1462     TRUE 0.639 12.000 0.000 NA   NA
 834939 834940 CJE1464 CJE1465     TRUE 0.863 81.000 1.000 NA   NA
 834940 834941 CJE1465 CJE1466     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 834941 834942 CJE1466 CJE1467     TRUE 0.745 172.000 1.000 NA   NA
 834942 834943 CJE1467 CJE1468     TRUE 0.987 1.000 0.667 NA   NA
 834943 834944 CJE1468 CJE1469     TRUE 0.940 -3.000 0.250 NA   NA
 834944 834945 CJE1469 CJE1470     FALSE 0.101 160.000 0.000 NA   NA
 834945 834946 CJE1470 CJE1471     FALSE 0.296 55.000 0.000 NA   NA
 834946 834947 CJE1471 CJE1472     TRUE 0.961 4.000 0.250 NA   NA
 834947 834948 CJE1472 CJE1473     FALSE 0.084 251.000 0.000 NA   NA
 834948 834949 CJE1473 CJE1474     TRUE 0.664 -13.000 0.000 NA   NA
 834949 834950 CJE1474 CJE_tRNA-Phe-1     FALSE 0.078 536.000 0.000 NA   NA
 834951 834952 CJE1475 CJE1476     TRUE 0.992 11.000 0.647 0.004 Y NA
 834953 834954 CJE1477 CJE1478   upp TRUE 0.743 6.000 0.005 NA   NA
 834954 834955 CJE1478 CJE1479 upp   TRUE 0.732 -3.000 0.008 1.000 N NA
 834955 834956 CJE1479 CJE1480   gltX-2 TRUE 0.873 2.000 0.021 1.000 N NA
 834958 834959 CJE1482 CJE1483 accC-2 accB TRUE 0.983 2.000 0.071 0.003 Y NA
 834960 834961 CJE1484 CJE1485   flmA FALSE 0.392 49.000 0.014 1.000   NA
 834961 834962 CJE1485 CJE1486 flmA   TRUE 0.988 2.000 0.678 1.000   NA
 834962 834963 CJE1486 CJE1487     TRUE 0.701 -7.000 0.013 NA   NA
 834963 834964 CJE1487 CJE1488     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834964 834965 CJE1488 CJE1489     TRUE 0.811 0.000 0.000 NA   NA
 834965 834966 CJE1489 CJE1490     TRUE 0.702 -6.000 0.012 NA   NA
 834966 834967 CJE1490 CJE1491     TRUE 0.796 0.000 0.009 NA   NA
 834967 834968 CJE1491 CJE1492     TRUE 0.934 -10.000 0.250 NA N NA
 834968 834969 CJE1492 CJE1493     TRUE 0.964 0.000 0.188 1.000   NA
 834970 834971 CJE1494 CJE1495     FALSE 0.495 21.000 0.000 NA   NA
 834972 834973 CJE1496 CJE1497     TRUE 0.950 -7.000 0.093 0.029   NA
 834973 834974 CJE1497 CJE1498     TRUE 0.948 0.000 0.103 1.000   NA
 834974 834975 CJE1498 CJE1499     TRUE 0.950 2.000 0.138 NA   NA
 834975 834976 CJE1499 CJE1500     TRUE 0.761 9.000 0.000 NA   NA
 834976 834977 CJE1500 CJE1501     TRUE 0.929 -3.000 0.200 NA   NA
 834977 834978 CJE1501 CJE1502     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 834978 834979 CJE1502 CJE1503     FALSE 0.081 299.000 0.000 NA   NA
 834981 834982 CJE1506 CJE1507 neuA   TRUE 0.959 -16.000 0.355 NA Y NA
 834982 834983 CJE1507 CJE1508     TRUE 0.912 -3.000 0.137 NA N NA
 834984 834985 CJE1509 CJE1510 hisF-1 hisH-1 TRUE 0.962 1.000 0.011 0.006 Y NA
 834985 834986 CJE1510 CJE1511 hisH-1   TRUE 0.973 -3.000 0.625 NA N NA
 834987 834988 CJE1512 CJE1513 neuB   TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 834988 834989 CJE1513 CJE1514     TRUE 0.988 -7.000 0.418 0.024 Y NA
 834989 834990 CJE1514 CJE1515     FALSE 0.180 220.000 0.037 1.000   NA
 834990 834991 CJE1515 CJE1516   ptmC FALSE 0.179 159.000 0.029 1.000   NA
 834991 834992 CJE1516 CJE1517 ptmC neuC TRUE 0.975 -19.000 0.549 1.000 Y NA
 834992 834993 CJE1517 CJE1518 neuC   TRUE 0.871 9.000 0.000 1.000 Y NA
 834993 834994 CJE1518 CJE1519     TRUE 0.750 -3.000 0.000 1.000   NA
 834994 834995 CJE1519 CJE1520   ptmB TRUE 0.925 -7.000 0.144 1.000   NA
 834995 834996 CJE1520 CJE1521 ptmB ptmA TRUE 0.956 0.000 0.131 1.000 N NA
 834996 834997 CJE1521 CJE1522 ptmA maf-1 TRUE 0.672 -12.000 0.000 NA   NA
 834997 834998 CJE1522 CJE1523 maf-1 maf-2 TRUE 0.625 -24.000 0.000 NA   NA
 834998 834999 CJE1523 CJE1524 maf-2 maf-3 TRUE 0.607 13.000 0.000 NA   NA
 834999 835000 CJE1524 CJE1525 maf-3 maf-4 TRUE 0.625 -24.000 0.000 NA   NA
 835001 835002 CJE1526 CJE1527 flaB   TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 835002 835003 CJE1527 CJE1528   flaA FALSE 0.363 42.000 0.000 NA   NA
 835003 835004 CJE1528 CJE1529 flaA maf-5 TRUE 0.749 97.000 0.667 NA   NA
 835004 835005 CJE1529 CJE1530 maf-5 maf-6 TRUE 0.975 -3.000 0.667 NA   NA
 835005 835006 CJE1530 CJE1531 maf-6   TRUE 0.723 10.000 0.000 NA   NA
 835006 835007 CJE1531 CJE1532   ctsG TRUE 0.984 0.000 0.600 NA   NA
 835007 835008 CJE1532 CJE1533 ctsG gcp TRUE 0.829 1.000 0.005 1.000   NA
 835008 835009 CJE1533 CJE1534 gcp   TRUE 0.729 -3.000 0.008 1.000   NA
 835009 835010 CJE1534 CJE1535   dxr TRUE 0.825 2.000 0.006 1.000   NA
 835010 835011 CJE1535 CJE1536 dxr cdsA TRUE 0.973 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 835011 835012 CJE1536 CJE1537 cdsA   TRUE 0.733 9.000 0.007 NA   NA
 835012 835013 CJE1537 CJE1538     TRUE 0.864 2.000 0.028 NA   NA
 835014 835015 CJE1539 CJE1540   pldA TRUE 0.759 -3.000 0.014 1.000 N NA
 835015 835016 CJE1540 CJE1541 pldA ceuB FALSE 0.406 86.000 0.019 0.073 N NA
 835016 835017 CJE1541 CJE1542 ceuB ceuC TRUE 0.994 -7.000 0.870 0.030 Y NA
 835017 835018 CJE1542 CJE1543 ceuC ceuD TRUE 0.989 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 835018 835019 CJE1543 CJE1544 ceuD   TRUE 0.607 13.000 0.000 NA   NA
 835020 835021 CJE_tRNA-Ser-1 CJE1545     FALSE 0.254 64.000 0.000 NA   NA
 835021 835022 CJE1545 CJE1546   nrfA FALSE 0.535 135.000 0.375 NA   NA
 835022 835023 CJE1546 CJE1547 nrfA nrfH TRUE 0.912 15.000 0.043 0.001 N NA
 835025 835026 CJE1549 CJE1550     FALSE 0.082 281.000 0.000 NA   NA
 835026 835027 CJE1550 CJE1551     FALSE 0.091 195.000 0.000 NA   NA
 835027 835028 CJE1551 CJE1552     FALSE 0.379 40.000 0.000 NA   NA
 835028 835029 CJE1552 CJE_CjtmRNA1     FALSE 0.089 206.000 0.000 NA   NA
 835029 835030 CJE_CjtmRNA1 CJE1553     TRUE 0.817 1.000 0.000 NA   NA
 835031 835032 CJE1554 CJE1555 ruvB   TRUE 0.817 4.000 0.019 NA   NA
 835033 835034 CJE1556 CJE1557 fumC   FALSE 0.303 56.000 0.003 1.000   NA
 835034 835035 CJE1557 CJE1558   glmS TRUE 0.904 3.000 0.042 1.000   NA
 835035 835036 CJE1558 CJE1559 glmS   TRUE 0.970 5.000 0.312 1.000 N NA
 835037 835038 CJE1560 CJE1561     TRUE 0.884 10.000 0.053 1.000   NA
 835038 835039 CJE1561 CJE1562     TRUE 0.787 14.000 0.048 1.000   NA
 835039 835040 CJE1562 CJE1563     FALSE 0.420 45.000 0.016 1.000   NA
 835040 835041 CJE1563 CJE1564     TRUE 0.979 10.000 0.684 NA N NA
 835041 835042 CJE1564 CJE1565     TRUE 0.967 0.000 0.263 NA   NA
 835046 835047 CJE1569 CJE1570 selA selB TRUE 0.990 -3.000 0.569 0.001 N NA
 835047 835048 CJE1570 CJE1571 selB   FALSE 0.493 49.000 0.031 1.000 N NA
 835048 835049 CJE1571 CJE1572     TRUE 0.919 6.000 0.091 NA   NA
 835050 835051 CJE1573 CJE1574 fldA   TRUE 0.977 0.000 0.391 NA   NA
 835051 835052 CJE1574 CJE1575     TRUE 0.929 3.000 0.094 NA   NA
 835053 835054 CJE1576 CJE1577 katA   FALSE 0.564 57.000 0.091 NA   NA
 835056 835057 CJE1579 CJE1580     TRUE 0.786 4.000 0.000 NA   NA
 835057 835058 CJE1580 CJE1581   metC TRUE 0.607 13.000 0.000 NA   NA
 835058 835059 CJE1581 CJE1582 metC purB-2 TRUE 0.737 10.000 0.004 1.000 N NA
 835059 835060 CJE1582 CJE1583 purB-2   TRUE 0.770 9.000 0.003 1.000   NA
 835060 835061 CJE1583 CJE1584     FALSE 0.472 82.000 0.094 1.000   NA
 835061 835062 CJE1584 CJE1585     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 835063 835064 CJE1586 CJE1587   fabI TRUE 0.934 4.000 0.088 1.000 N NA
 835064 835065 CJE1587 CJE1588 fabI tpiA TRUE 0.965 4.000 0.071 0.028 N NA
 835065 835066 CJE1588 CJE1589 tpiA pgk TRUE 0.860 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 835066 835067 CJE1589 CJE1590 pgk gapA TRUE 0.964 3.000 0.020 0.005 Y NA
 835068 835069 CJE1591 CJE1592 nadD   TRUE 0.829 28.000 0.221 NA   NA
 835070 835071 CJE1593 CJE1594   algC FALSE 0.299 48.000 0.007 NA   NA
 835072 835073 CJE1595 CJE1596 fliL acpS TRUE 0.919 0.000 0.047 1.000 N NA
 835074 835075 CJE1597 CJE1598     TRUE 0.972 -3.000 0.600 NA   NA
 835075 835076 CJE1598 CJE1599     TRUE 0.922 -3.000 0.132 1.000   NA
 835076 835077 CJE1599 CJE1600   kpsS FALSE 0.417 73.000 0.046 1.000   NA
 835077 835078 CJE1600 CJE1601 kpsS kpsC TRUE 0.968 -3.000 0.056 0.001 Y NA
 835078 835079 CJE1601 CJE1602 kpsC   TRUE 0.629 -22.000 0.000 NA   NA
 835079 835080 CJE1602 CJE1603     TRUE 0.613 -31.000 0.000 NA   NA
 835080 835081 CJE1603 CJE1604     TRUE 0.811 0.000 0.000 NA   NA
 835081 835082 CJE1604 CJE1605     TRUE 0.952 2.000 0.118 1.000 N NA
 835082 835083 CJE1605 CJE1606     TRUE 0.790 -13.000 0.029 1.000   NA
 835083 835084 CJE1606 CJE1607     TRUE 0.780 -7.000 0.029 NA   NA
 835084 835085 CJE1607 CJE1608     TRUE 0.621 -25.000 0.000 NA   NA
 835085 835086 CJE1608 CJE1609   gmhA-2 TRUE 0.922 -12.000 0.154 1.000 N NA
 835086 835087 CJE1609 CJE1610 gmhA-2   TRUE 0.919 -12.000 0.148 1.000   NA
 835087 835088 CJE1610 CJE1611   wcbK TRUE 0.951 -3.000 0.275 1.000   NA
 835088 835089 CJE1611 CJE1612 wcbK fcl TRUE 0.968 -3.000 0.067 0.003 Y NA
 835089 835090 CJE1612 CJE1613 fcl   TRUE 0.790 12.000 0.000 1.000 Y NA
 835090 835091 CJE1613 CJE1614     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 835091 835092 CJE1614 CJE1615     FALSE 0.405 36.000 0.000 NA   NA
 835092 835093 CJE1615 CJE1616     TRUE 0.893 3.000 0.000 1.000 Y NA
 835093 835094 CJE1616 CJE1617   kpsF TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 835094 835095 CJE1617 CJE1618 kpsF kpsD TRUE 0.921 10.000 0.056 1.000 Y NA
 835095 835096 CJE1618 CJE1619 kpsD kpsE TRUE 0.986 2.000 0.200 0.072 Y NA
 835096 835097 CJE1619 CJE1620 kpsE kpsT TRUE 0.980 0.000 0.257 1.000 Y NA
 835097 835098 CJE1620 CJE1621 kpsT kpsM TRUE 0.982 -3.000 0.306 0.081 Y NA
 835098 835099 CJE1621 CJE1622 kpsM   FALSE 0.431 72.000 0.048 1.000   NA
 835100 835101 CJE1623 CJE1624     TRUE 0.732 36.000 0.120 NA   NA
 835101 835102 CJE1624 CJE1625     TRUE 0.934 2.000 0.092 NA   NA
 835103 835104 CJE1626 CJE1627   yliG TRUE 0.765 -10.000 0.019 1.000 N NA
 835108 835109 CJE1631 CJE1632     TRUE 0.723 -31.000 0.022 1.000   NA
 835110 835111 CJE1633 CJE1634     TRUE 0.915 -3.000 0.143 NA   NA
 835111 835112 CJE1634 CJE1635     TRUE 0.783 -10.000 0.032 NA   NA
 835112 835113 CJE1635 CJE1636   flgI FALSE 0.321 59.000 0.012 1.000 N NA
 835113 835114 CJE1636 CJE1637 flgI   TRUE 0.984 0.000 0.569 NA   NA
 835114 835115 CJE1637 CJE1638     TRUE 0.806 63.000 0.469 NA   NA
 835115 835116 CJE1638 CJE1639     TRUE 0.964 43.000 0.677 0.003   NA
 835116 835117 CJE1639 CJE1640     TRUE 0.990 10.000 0.558 0.004   NA
 835117 835118 CJE1640 CJE1641     TRUE 0.812 17.000 0.084 1.000   NA
 835118 835119 CJE1641 CJE1642     TRUE 0.890 4.000 0.035 1.000   NA
 835120 835121 CJE1643 CJE1644 ctsF ctsE TRUE 0.957 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 835121 835122 CJE1644 CJE1645 ctsE ctsX TRUE 0.947 -10.000 0.333 NA   NA
 835122 835123 CJE1645 CJE1646 ctsX ctsP TRUE 0.984 4.000 0.667 NA   NA
 835123 835124 CJE1646 CJE1647 ctsP ctsD TRUE 0.931 -7.000 0.167 1.000   NA
 835124 835125 CJE1647 CJE1648 ctsD ctsR TRUE 0.895 -22.000 0.167 NA   NA
 835125 835126 CJE1648 CJE1649 ctsR   FALSE 0.603 24.000 0.032 NA   NA
 835126 835127 CJE1649 CJE1650     FALSE 0.366 93.000 0.056 1.000   NA
 835127 835128 CJE1650 CJE1651   cadF TRUE 0.935 0.000 0.068 1.000   NA
 835128 835129 CJE1651 CJE1652 cadF rpsI FALSE 0.189 125.000 0.024 1.000 N NA
 835129 835130 CJE1652 CJE1653 rpsI rplM TRUE 0.988 3.000 0.231 0.024 Y NA
 835130 835131 CJE1653 CJE1654 rplM   FALSE 0.202 84.000 0.009 1.000 N NA
 835131 835132 CJE1654 CJE1655     TRUE 0.968 -3.000 0.117 0.037 Y NA
 835132 835133 CJE1655 CJE1656     TRUE 0.885 -3.000 0.091 NA   NA
 835133 835134 CJE1656 CJE1657     TRUE 0.875 -13.000 0.102 NA   NA
 835134 835135 CJE1657 CJE1658     TRUE 0.940 -3.000 0.250 NA   NA
 835135 835136 CJE1658 CJE1659     TRUE 0.932 -3.000 0.211 NA   NA
 835136 835137 CJE1659 CJE1660   ccoP TRUE 0.984 0.000 0.579 NA   NA
 835137 835138 CJE1660 CJE1661 ccoP ccoQ TRUE 0.990 0.000 0.286 0.002 N NA
 835138 835139 CJE1661 CJE1662 ccoQ ccoO TRUE 0.996 2.000 0.738 0.002 N NA
 835139 835140 CJE1662 CJE1663 ccoO ccoN TRUE 0.972 13.000 0.283 0.002 N NA
 835140 835141 CJE1663 CJE1664 ccoN   FALSE 0.297 126.000 0.062 1.000 N NA
 835141 835142 CJE1664 CJE1665     TRUE 0.988 3.000 0.200 0.007 Y NA
 835142 835143 CJE1665 CJE1666     TRUE 0.692 -3.000 0.011 NA   NA
 835143 835144 CJE1666 CJE1667   carA TRUE 0.690 -3.000 0.011 NA   NA
 835144 835145 CJE1667 CJE1668 carA   TRUE 0.893 0.000 0.041 NA   NA
 835145 835146 CJE1668 CJE1669     FALSE 0.436 93.000 0.120 NA   NA
 835146 835147 CJE1669 CJE1670     TRUE 0.914 -7.000 0.147 NA   NA
 835147 835148 CJE1670 CJE1671   purA TRUE 0.713 -3.000 0.014 NA   NA
 835148 835149 CJE1671 CJE_tRNA-SeC-1 purA   FALSE 0.445 28.000 0.000 NA   NA
 835150 835151 CJE1672 CJE1673     FALSE 0.398 38.000 0.000 NA   NA
 835151 835152 CJE1673 CJE1674     TRUE 0.988 4.000 0.844 NA   NA
 835153 835154 CJE1675 CJE1676 putP   TRUE 0.854 18.000 0.141 1.000 N NA
 835154 835155 CJE1676 CJE1677   selD FALSE 0.137 131.000 0.011 1.000 N NA
 835155 835156 CJE1677 CJE1678 selD   TRUE 0.919 10.000 0.104 1.000 N NA
 835156 835157 CJE1678 CJE1679     FALSE 0.173 111.000 0.015 1.000 N NA
 835157 835158 CJE1679 CJE1680     FALSE 0.308 113.000 0.077 NA   NA
 835158 835159 CJE1680 CJE1681   fdhD TRUE 0.922 -7.000 0.172 NA   NA
 835159 835160 CJE1681 CJE1682 fdhD fdhC TRUE 0.689 167.000 0.138 0.002 Y NA
 835160 835161 CJE1682 CJE1683 fdhC fdhB TRUE 0.983 -3.000 0.200 0.002 Y NA
 835161 835162 CJE1683 CJE1684 fdhB fdhA TRUE 0.988 -3.000 0.333 0.002 Y NA
 835162 835163 CJE1684 CJE1685 fdhA   TRUE 0.811 0.000 0.000 NA   NA
 835163 835164 CJE1685 CJE1686     TRUE 0.938 -25.000 0.375 NA   NA
 835164 835165 CJE1686 CJE1687     FALSE 0.098 168.000 0.000 NA   NA
 835165 835166 CJE1687 CJE1688   nspC FALSE 0.405 36.000 0.000 NA   NA
 835167 835168 CJE1689 CJE1690     TRUE 0.838 2.000 0.010 1.000 N NA
 835168 835169 CJE1690 CJE1691     TRUE 0.989 1.000 0.501 1.000 Y NA
 835169 835170 CJE1691 CJE1692     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 835170 835171 CJE1692 CJE1693     TRUE 0.796 3.000 0.000 NA   NA
 835172 835173 CJE1694 CJE1695 cas2 cas1 TRUE 0.982 -7.000 0.876 NA   NA
 835173 835174 CJE1695 CJE1697 cas1   TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 835175 835176 CJE1698 CJE1699     TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 835178 835179 CJE1701 CJE1702   dapF TRUE 0.769 -3.000 0.016 1.000 N NA
 835179 835180 CJE1702 CJE1703 dapF   TRUE 0.662 -25.000 0.010 1.000   NA
 835181 835182 CJE1704 CJE1705     FALSE 0.348 65.000 0.030 NA   NA
 835182 835183 CJE1705 CJE1706   pgi FALSE 0.141 127.000 0.011 1.000 N NA
 835183 835184 CJE1706 CJE1707 pgi galU TRUE 0.800 -6.000 0.023 1.000 N NA
 835184 835185 CJE1707 CJE1708 galU acs FALSE 0.320 82.000 0.032 1.000 N NA
 835185 835186 CJE1708 CJE1709 acs   FALSE 0.200 139.000 0.032 1.000 N NA
 835186 835187 CJE1709 CJE1710     TRUE 0.980 2.000 0.389 1.000 N NA
 835188 835189 CJE1711 CJE1712     FALSE 0.100 142.000 0.010 NA   NA
 835189 835190 CJE1712 CJE1713     TRUE 0.882 10.000 0.053 1.000   NA
 835190 835191 CJE1713 CJE1714     TRUE 0.913 -19.000 0.122 NA Y NA
 835192 835193 CJE1715 CJE1716     TRUE 0.610 33.000 0.034 1.000   NA
 835194 835195 CJE1717 CJE1718     TRUE 0.604 -42.000 0.000 NA   NA
 835197 835198 CJE1720 CJE1721     TRUE 0.786 4.000 0.000 NA   NA
 835198 835199 CJE1721 CJE1722     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 835199 835200 CJE1722 CJE1723     FALSE 0.123 120.000 0.000 NA   NA
 835200 835201 CJE1723 CJE1724   hsdM TRUE 0.942 1.000 0.083 1.000   NA
 835204 835205 CJE1727 CJE1728     TRUE 0.714 58.000 0.200 1.000   NA
 835205 835206 CJE1728 CJE1729     FALSE 0.096 176.000 0.000 NA   NA
 835207 835208 CJE1730 CJE1731   arsR TRUE 0.869 10.000 0.057 NA   NA
 835208 835209 CJE1731 CJE1732 arsR arsC TRUE 0.837 -3.000 0.034 1.000 N NA
 835209 835210 CJE1732 CJE1733 arsC   TRUE 0.921 -6.000 0.125 1.000 N NA
 835213 835214 CJE1736 CJE1737 pflA nuoN FALSE 0.596 22.000 0.020 1.000   NA
 835214 835215 CJE1737 CJE1738 nuoN nuoM TRUE 0.945 -10.000 0.024 0.002 Y NA
 835215 835216 CJE1738 CJE1739 nuoM nuoL TRUE 0.982 2.000 0.056 0.002 Y NA
 835216 835217 CJE1739 CJE1740 nuoL nuoK TRUE 0.979 2.000 0.056 0.008 Y NA
 835217 835218 CJE1740 CJE1741 nuoK nuoJ TRUE 0.966 -3.000 0.064 0.004 Y NA
 835218 835219 CJE1741 CJE1742 nuoJ nuoI TRUE 0.989 -3.000 0.442 0.008 Y NA
 835219 835220 CJE1742 CJE1743 nuoI nuoH TRUE 0.992 10.000 0.500 0.008 Y NA
 835220 835221 CJE1743 CJE1744 nuoH nuoG TRUE 0.963 -7.000 0.065 0.008 Y NA
 835221 835222 CJE1744 CJE1745 nuoG   TRUE 0.985 -3.000 0.444 0.008   NA
 835222 835223 CJE1745 CJE1746     TRUE 0.986 -3.000 0.464 0.008   NA
 835223 835224 CJE1746 CJE1747   nuoD TRUE 0.989 -3.000 0.650 0.008   NA
 835224 835225 CJE1747 CJE1748 nuoD nuoC TRUE 0.996 2.000 0.650 0.008 Y NA
 835225 835226 CJE1748 CJE1749 nuoC nuoB TRUE 0.997 0.000 0.703 0.004 Y NA
 835226 835227 CJE1749 CJE1750 nuoB nuoA TRUE 0.990 -18.000 0.571 0.004 Y NA
 835227 835228 CJE1750 CJE1751 nuoA   FALSE 0.300 113.000 0.053 1.000 N NA
 835228 835229 CJE1751 CJE1752     TRUE 0.950 -7.000 0.039 0.013 Y NA
 835229 835230 CJE1752 CJE1753     TRUE 0.966 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 835230 835231 CJE1753 CJE1754     TRUE 0.991 -7.000 0.647 0.028 Y NA
 835231 835232 CJE1754 CJE1755     TRUE 0.993 0.000 0.412 0.028 Y NA
 835232 835233 CJE1755 CJE1756     FALSE 0.547 109.000 0.250 1.000 N NA
 835235 835236 CJE1758 CJE1759     FALSE 0.324 50.000 0.000 NA   NA
 835237 835238 CJE1760 CJE1761     TRUE 0.923 33.000 0.667 NA   NA
 835238 835239 CJE1761 CJE1762   infA FALSE 0.177 88.000 0.002 1.000   NA
 835239 835240 CJE1762 CJE1763 infA rpmJ FALSE 0.316 172.000 0.104 1.000   NA
 835240 835241 CJE1763 CJE1764 rpmJ rpsM TRUE 0.981 3.000 0.194 0.023   NA
 835241 835242 CJE1764 CJE1765 rpsM rpsK TRUE 0.994 10.000 0.810 0.023 Y NA
 835242 835243 CJE1765 CJE1766 rpsK rpsD TRUE 0.970 28.000 0.509 0.030 Y NA
 835243 835244 CJE1766 CJE1767 rpsD rpoA TRUE 0.961 13.000 0.549 1.000 N NA
 835244 835245 CJE1767 CJE1768 rpoA rplQ TRUE 0.990 4.000 0.873 1.000 N NA
 835245 835246 CJE1768 CJE1769 rplQ hisG FALSE 0.103 173.000 0.004 1.000 N NA
 835246 835247 CJE1769 CJE1770 hisG hisD TRUE 0.986 8.000 0.171 0.006 Y NA
 835247 835248 CJE1770 CJE1771 hisD hisB TRUE 0.929 -3.000 0.010 0.006 Y NA
 835248 835249 CJE1771 CJE1772 hisB hisH-2 TRUE 0.976 -3.000 0.128 0.006 Y NA
 835249 835250 CJE1772 CJE1773 hisH-2 hisA TRUE 0.982 -3.000 0.210 0.006 Y NA
 835250 835251 CJE1773 CJE1774 hisA   TRUE 0.610 -15.000 0.004 NA   NA
 835251 835252 CJE1774 CJE1775   hisF-2 TRUE 0.784 1.000 0.003 NA   NA
 835252 835253 CJE1775 CJE1776 hisF-2 hisI TRUE 0.994 2.000 0.430 0.006 Y NA
 835254 835255 CJE1777 CJE1778   mrp TRUE 0.657 26.000 0.036 1.000 N NA
 835256 835257 CJE1779 CJE1780     TRUE 0.811 -3.000 0.027 1.000 N NA
 835257 835258 CJE1780 CJE1781     TRUE 0.746 -22.000 0.025 1.000 N NA
 835258 835259 CJE1781 CJE1782   pgpA TRUE 0.910 5.000 0.052 1.000 N NA
 835259 835260 CJE1782 CJE1783 pgpA rpsT FALSE 0.212 79.000 0.004 1.000 N NA
 835260 835261 CJE1783 CJE1784 rpsT prfA TRUE 0.759 19.000 0.029 1.000 Y NA
 835263 835264 CJE1786 CJE1787 chuA   TRUE 0.973 -25.000 0.250 0.028 Y NA
 835264 835265 CJE1787 CJE1788     TRUE 0.978 0.000 0.226 1.000 Y NA
 835265 835266 CJE1788 CJE1789     TRUE 0.940 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 835270 835271 CJE1793 CJE_tRNA-Gly-3     FALSE 0.221 72.000 0.000 NA   NA
 835271 835272 CJE_tRNA-Gly-3 CJE_tRNA-Leu-3     TRUE 0.723 10.000 0.000 NA   NA
 835272 835273 CJE_tRNA-Leu-3 CJE_tRNA-Cys-1     FALSE 0.508 19.000 0.000 NA   NA
 835273 835274 CJE_tRNA-Cys-1 CJE_tRNA-Ser-2     FALSE 0.487 22.000 0.000 NA   NA
 835274 835275 CJE_tRNA-Ser-2 CJE1794     FALSE 0.087 235.000 0.000 NA   NA
 835275 835276 CJE1794 CJE1795     FALSE 0.593 -19.000 0.005 NA   NA
 835277 835278 CJE1796 CJE1797 sdaA sdaC TRUE 0.907 15.000 0.133 1.000 Y NA
 835278 835279 CJE1797 CJE1798 sdaC   FALSE 0.083 259.000 0.000 NA   NA
 835279 835280 CJE1798 CJE1799     TRUE 0.767 66.000 0.400 NA   NA
 835281 835282 CJE1800 CJE1801 exbB-2 exbD TRUE 0.990 -28.000 0.815 0.035 Y NA
 835282 835283 CJE1801 CJE1802 exbD   TRUE 0.702 -3.000 0.000 NA   NA
 835284 835285 CJE1803 CJE1804     TRUE 0.864 54.000 0.600 NA   NA
 835287 835288 CJE1806 CJE1807 aroC rnc TRUE 0.895 0.000 0.030 1.000 N NA
 835288 835289 CJE1807 CJE1808 rnc rnhA TRUE 0.804 -13.000 0.032 1.000 N NA
 835289 835290 CJE1808 CJE1809 rnhA   TRUE 0.701 -13.000 0.009 1.000   NA
 835291 835292 CJE1810 CJE1811 dnaG   FALSE 0.219 82.000 0.011 1.000 N NA
 835292 835293 CJE1811 CJE1812     TRUE 0.896 -13.000 0.107 1.000   NA
 835293 835294 CJE1812 CJE1813   murE TRUE 0.849 -16.000 0.057 1.000   NA
 835294 835295 CJE1813 CJE1814 murE   TRUE 0.757 4.000 0.006 NA   NA
 835295 835296 CJE1814 CJE1815     TRUE 0.687 -3.000 0.010 NA   NA
 835296 835297 CJE1815 CJE1816   ispA TRUE 0.933 -3.000 0.167 1.000   NA
 835297 835298 CJE1816 CJE1817 ispA tkt TRUE 0.966 10.000 0.375 1.000 N NA
 835298 835299 CJE1817 CJE1818 tkt   TRUE 0.948 2.000 0.132 NA N NA
 835299 835300 CJE1818 CJE1819     TRUE 0.994 1.000 0.912 NA Y NA
 835300 835301 CJE1819 CJE1820     TRUE 0.993 3.000 0.912 NA Y NA
 835301 835302 CJE1820 CJE1821     TRUE 0.945 0.000 0.120 NA   NA
 835302 835303 CJE1821 CJE1822     FALSE 0.377 56.000 0.027 NA   NA
 835304 835305 CJE1823 CJE1824 map murI TRUE 0.740 10.000 0.005 1.000 N NA
 835305 835306 CJE1824 CJE1825 murI nlpC TRUE 0.865 2.000 0.005 NA Y NA
 835306 835307 CJE1825 CJE1826 nlpC nhaA-1 TRUE 0.949 9.000 0.211 NA N NA
 835307 835308 CJE1826 CJE1827 nhaA-1 nhaA-2 TRUE 0.992 -3.000 0.571 0.003 Y NA
 835308 835309 CJE1827 CJE1828 nhaA-2   TRUE 0.633 143.000 0.600 NA   NA
 835310 835311 CJE1829 CJE1830     FALSE 0.079 445.000 0.000 NA   NA
 835311 835312 CJE1830 CJE1831     TRUE 0.956 -3.000 0.238 NA Y NA
 835312 835313 CJE1831 CJE1832     TRUE 0.682 83.000 0.386 NA   NA
 835313 835314 CJE1832 CJE1833     TRUE 0.970 -10.000 0.625 NA   NA
 835314 835315 CJE1833 CJE1834     TRUE 0.990 -10.000 0.878 0.069 N NA
 835315 835316 CJE1834 CJE1835     TRUE 0.935 -3.000 0.175 1.000 N NA
 835316 835317 CJE1835 CJE1836     TRUE 0.893 -3.000 0.078 1.000   NA
 835317 835318 CJE1836 CJE1837     TRUE 0.956 -39.000 0.147 0.003   NA
 835319 835320 CJE1838 CJE1839     FALSE 0.568 91.000 0.250 NA   NA
 835320 835321 CJE1839 CJE1840     FALSE 0.245 66.000 0.000 NA   NA
 835321 835322 CJE1840 CJE_tRNA-Leu-4     FALSE 0.082 280.000 0.000 NA   NA
 835322 835323 CJE_tRNA-Leu-4 CJE_tRNA-Arg-4     TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 835323 835324 CJE_tRNA-Arg-4 CJE_tRNA-Arg-5     FALSE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 835324 835325 CJE_tRNA-Arg-5 CJE_tRNA-His-1     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 835325 835326 CJE_tRNA-His-1 CJE_tRNA-Pro-1     FALSE 0.466 25.000 0.000 NA   NA
 835326 835327 CJE_tRNA-Pro-1 CJE1841     FALSE 0.355 43.000 0.000 NA   NA
 835327 835328 CJE1841 CJE1842     TRUE 0.860 0.000 0.026 NA   NA
 835328 835329 CJE1842 CJE1843     TRUE 0.977 -10.000 0.788 NA   NA
 835329 835330 CJE1843 CJE1844   eno FALSE 0.497 66.000 0.080 NA   NA
 835330 835331 CJE1844 CJE1845 eno recA TRUE 0.903 0.000 0.033 1.000 N NA
 835332 835333 CJE1846 CJE1847   fliQ TRUE 0.833 12.000 0.068 NA   NA
 835333 835334 CJE1847 CJE1848 fliQ murB TRUE 0.886 -3.000 0.066 1.000 N NA
 835335 835336 CJE1849 CJE1850   cysQ FALSE 0.491 46.000 0.039 NA   NA
 835336 835337 CJE1850 CJE1851 cysQ gltA FALSE 0.283 80.000 0.022 1.000 N NA
 835337 835338 CJE1851 CJE1852 gltA   FALSE 0.183 115.000 0.019 1.000 N NA
 835338 835339 CJE1852 CJE1853   bioB TRUE 0.717 -19.000 0.017 1.000 N NA
 835339 835340 CJE1853 CJE1854 bioB topA TRUE 0.834 2.000 0.009 1.000 N NA
 835342 835343 CJE1856 CJE1857 secY rplO TRUE 0.989 0.000 0.730 1.000 N NA
 835343 835344 CJE1857 CJE1858 rplO rpsE TRUE 0.983 5.000 0.148 0.029 Y NA
 835344 835345 CJE1858 CJE1859 rpsE rplR TRUE 0.991 12.000 0.814 0.029 Y NA
 835345 835346 CJE1859 CJE1860 rplR rplF TRUE 0.994 10.000 0.815 0.023 Y NA
 835346 835347 CJE1860 CJE1861 rplF rpsH TRUE 0.944 79.000 0.808 0.023 Y NA
 835347 835348 CJE1861 CJE1862 rpsH rpsN TRUE 0.990 10.000 0.473 0.023 Y NA
 835348 835349 CJE1862 CJE1863 rpsN rplE TRUE 0.994 2.000 0.496 0.023 Y NA
 835349 835350 CJE1863 CJE1864 rplE rplX TRUE 0.996 4.000 0.758 0.023 Y NA
 835350 835351 CJE1864 CJE1865 rplX rplN TRUE 0.996 0.000 0.810 0.029 Y NA
 835351 835352 CJE1865 CJE1866 rplN rpsQ TRUE 0.996 0.000 0.791 0.029 Y NA
 835352 835353 CJE1866 CJE1867 rpsQ rpmC TRUE 0.992 10.000 0.828 0.023   NA
 835353 835354 CJE1867 CJE1868 rpmC rplP TRUE 0.989 -13.000 0.802 0.023   NA
 835354 835355 CJE1868 CJE1869 rplP rpsC TRUE 0.996 3.000 0.828 0.029 Y NA
 835355 835356 CJE1869 CJE1870 rpsC rplV TRUE 0.996 0.000 0.719 0.029 Y NA
 835356 835357 CJE1870 CJE1871 rplV rpsS TRUE 0.992 11.000 0.769 0.029 Y NA
 835357 835358 CJE1871 CJE1872 rpsS rplB TRUE 0.996 2.000 0.820 0.029 Y NA
 835358 835359 CJE1872 CJE1873 rplB rplW TRUE 0.997 2.000 0.849 0.019 Y NA
 835359 835360 CJE1873 CJE1874 rplW rplD TRUE 0.994 3.000 0.513 0.023 Y NA
 835360 835361 CJE1874 CJE1875 rplD rplC TRUE 0.986 -3.000 0.361 0.023 Y NA
 835361 835362 CJE1875 CJE1876 rplC rpsJ TRUE 0.990 10.000 0.467 0.029 Y NA
 835364 835365 CJE1878 CJE1879     TRUE 0.759 36.000 0.118 1.000   NA
 835365 835366 CJE1879 CJE1880   ksgA TRUE 0.751 -25.000 0.028 1.000   NA
 835367 835368 CJE1881 CJE1882     TRUE 0.747 24.000 0.011 0.023   NA
 835368 835369 CJE1882 CJE1883     TRUE 0.655 -3.000 0.002 NA   NA
 835371 835372 CJE_tRNA-Ser-3 CJE1884     FALSE 0.110 135.000 0.000 NA   NA
 835372 835373 CJE1884 CJE_tRNA-Ala-4     FALSE 0.107 140.000 0.000 NA   NA
 835373 835374 CJE_tRNA-Ala-4 CJE_tRNA-Val-3     TRUE 0.786 4.000 0.000 NA   NA
 835374 835375 CJE_tRNA-Val-3 CJE1885     FALSE 0.445 28.000 0.000 NA   NA
 835376 835377 CJE1886 CJE1887 leuD leuC TRUE 0.993 2.000 0.309 0.001 Y NA
 835377 835378 CJE1887 CJE1888 leuC leuB TRUE 0.986 -7.000 0.275 0.002 Y NA
 835378 835379 CJE1888 CJE1889 leuB leuA TRUE 0.978 -3.000 0.126 0.002 Y NA
 835381 835382 CJE1891 CJE1892     FALSE 0.116 138.000 0.005 1.000   NA
 835384 835385 CJE1894 CJE1895 metA metX FALSE 0.434 84.000 0.037 1.000 Y NA
 835385 835386 CJE1895 CJE1896 metX flgE-2 FALSE 0.100 425.000 0.000 1.000 N NA
 835386 835387 CJE1896 CJE1897 flgE-2 ruvC FALSE 0.095 204.000 0.002 1.000 N NA