MicrobesOnline Operon Predictions for Mycoplasma hominis

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10135238 10135239 MHO_0010 MHO_0020   rnpA TRUE 0.988 -25.000 0.007 1.000 N NA
 10135239 10135240 MHO_0020 MHO_0030 rnpA rpmH TRUE 0.982 28.000 0.787 NA   NA
 10135241 10135242 MHO_0040 MHO_0050 dnaA dnaN TRUE 0.991 16.000 0.328 1.000 Y NA
 10135242 10135243 MHO_0050 MHO_0060 dnaN   TRUE 0.995 0.000 0.103 1.000   NA
 10135243 10135244 MHO_0060 MHO_0070   rpmB FALSE 0.336 69.000 0.002 NA   NA
 10135245 10135246 MHO_0080 MHO_0090 ksgA   TRUE 0.962 -7.000 0.003 NA N NA
 10135246 10135247 MHO_0090 MHO_0100     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA N NA
 10135248 10135249 MHO_t01 MHO_t02     FALSE 0.579 6.000 0.000 NA   NA
 10135250 10135251 MHO_0110 MHO_0120     FALSE 0.091 91.000 0.000 NA N NA
 10135251 10135252 MHO_0120 MHO_0130     TRUE 0.852 -13.000 0.000 NA   NA
 10135252 10135253 MHO_0130 MHO_0140     FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   NA
 10135255 10135256 MHO_0160 MHO_0170     FALSE 0.067 162.000 0.000 NA   NA
 10135256 10135257 MHO_0170 MHO_0180   clpB FALSE 0.069 126.000 0.000 NA   NA
 10135258 10135259 MHO_0190 MHO_0200   atpB TRUE 0.973 -7.000 0.005 NA   NA
 10135259 10135260 MHO_0200 MHO_0210 atpB atpE TRUE 0.989 14.000 0.085 0.028 Y NA
 10135260 10135261 MHO_0210 MHO_0220 atpE atpF TRUE 0.992 5.000 0.500 0.028 Y NA
 10135261 10135262 MHO_0220 MHO_0230 atpF atpH TRUE 0.989 2.000 0.022 0.028 Y NA
 10135262 10135263 MHO_0230 MHO_0240 atpH atpA TRUE 0.990 13.000 0.864 0.028 Y NA
 10135263 10135264 MHO_0240 MHO_0250 atpA atpG TRUE 0.998 -21.000 0.846 0.028 Y NA
 10135264 10135265 MHO_0250 MHO_0260 atpG atpD TRUE 0.991 17.000 0.724 0.028 Y NA
 10135265 10135266 MHO_0260 MHO_0270 atpD atpC TRUE 0.996 0.000 0.837 0.028 Y NA
 10135266 10135267 MHO_0270 MHO_0280 atpC   FALSE 0.074 258.000 0.000 NA   NA
 10135267 10135268 MHO_0280 MHO_0290     FALSE 0.072 242.000 0.000 NA   NA
 10135268 10135269 MHO_0290 MHO_0300     TRUE 0.857 -30.000 0.000 NA   NA
 10135269 10135270 MHO_0300 MHO_0310     FALSE 0.069 112.000 0.000 NA   NA
 10135271 10135272 MHO_0320 MHO_0330   ktrB TRUE 0.622 10.000 0.000 1.000   NA
 10135273 10135274 MHO_0340 MHO_0350 ktrA pepC FALSE 0.085 111.000 0.000 1.000 N NA
 10135274 10135275 MHO_0350 MHO_0360 pepC dcm FALSE 0.111 924.000 0.000 1.000 N NA
 10135277 10135278 MHO_0380 MHO_0390 acpS plsC TRUE 0.976 22.000 0.020 1.000 Y NA
 10135278 10135279 MHO_0390 MHO_0400 plsC scpA TRUE 0.979 4.000 0.019 NA   NA
 10135279 10135280 MHO_0400 MHO_0410 scpA scpB TRUE 0.997 -10.000 0.570 NA   NA
 10135280 10135281 MHO_0410 MHO_0420 scpB rluC TRUE 0.992 -13.000 0.011 NA N NA
 10135281 10135282 MHO_0420 MHO_0430 rluC gatC TRUE 0.941 20.000 0.007 1.000   NA
 10135282 10135283 MHO_0430 MHO_0440 gatC gatA TRUE 0.998 -10.000 0.643 0.008   NA
 10135283 10135284 MHO_0440 MHO_0450 gatA gatB TRUE 0.998 -7.000 0.492 0.008 Y NA
 10135284 10135285 MHO_0450 MHO_0460 gatB   TRUE 0.982 -7.000 0.006 1.000   NA
 10135285 10135286 MHO_0460 MHO_0470     TRUE 0.852 97.000 0.250 NA   NA
 10135286 10135287 MHO_0470 MHO_0480   valS FALSE 0.094 2328.000 0.000 NA   NA
 10135289 10135290 MHO_0500 MHO_0510     TRUE 0.823 140.000 0.200 NA   NA
 10135290 10135291 MHO_0510 MHO_0520   tuf FALSE 0.089 574.000 0.000 NA   NA
 10135291 10135292 MHO_0520 MHO_0530 tuf lmp1 FALSE 0.085 278.000 0.000 NA N NA
 10135292 10135293 MHO_0530 MHO_0540 lmp1   FALSE 0.070 209.000 0.000 NA   NA
 10135295 10135296 MHO_0560 MHO_0570     FALSE 0.081 329.000 0.000 NA   NA
 10135296 10135297 MHO_0570 MHO_0580     TRUE 0.990 12.000 0.667 NA   NA
 10135297 10135298 MHO_0580 MHO_0590     TRUE 0.779 0.000 0.000 NA   NA
 10135300 10135301 MHO_0610 MHO_0620 cysS   TRUE 0.995 0.000 0.088 1.000 Y NA
 10135302 10135303 MHO_0630 MHO_0640 arcC arcB TRUE 0.994 2.000 0.312 1.000 Y NA
 10135303 10135304 MHO_0640 MHO_0650 arcB mscL FALSE 0.084 194.000 0.000 1.000 N NA
 10135304 10135305 MHO_0650 MHO_t03 mscL   FALSE 0.117 72.000 0.000 NA   NA
 10135305 10135306 MHO_t03 MHO_0660     FALSE 0.140 68.000 0.000 NA   NA
 10135306 10135307 MHO_0660 MHO_0670   fba TRUE 0.996 -16.000 0.048 1.000 N NA
 10135307 10135308 MHO_0670 MHO_0680 fba   FALSE 0.113 73.000 0.000 NA   NA
 10135311 10135312 MHO_t04 MHO_0710     FALSE 0.067 162.000 0.000 NA   NA
 10135312 10135313 MHO_0710 MHO_0720     FALSE 0.083 362.000 0.000 NA   NA
 10135313 10135314 MHO_0720 MHO_0730     TRUE 0.843 86.000 0.091 NA   NA
 10135314 10135315 MHO_0730 MHO_0740     TRUE 0.990 12.000 0.200 1.000 N NA
 10135315 10135316 MHO_0740 MHO_0750     TRUE 0.996 0.000 0.611 0.034 N NA
 10135316 10135317 MHO_0750 MHO_0760     TRUE 0.998 -58.000 0.204 0.034 Y NA
 10135317 10135318 MHO_0760 MHO_0770     FALSE 0.079 292.000 0.000 NA   NA
 10135319 10135320 MHO_0780 MHO_0790     FALSE 0.075 259.000 0.000 NA   NA
 10135322 10135323 MHO_0810 MHO_0820     FALSE 0.073 100.000 0.000 NA   NA
 10135323 10135324 MHO_0820 MHO_0830     FALSE 0.082 355.000 0.000 NA   NA
 10135325 10135326 MHO_0840 MHO_0850   uvrC TRUE 0.944 -10.000 0.002 NA   NA
 10135326 10135327 MHO_0850 MHO_t05 uvrC   FALSE 0.158 65.000 0.000 NA   NA
 10135327 10135328 MHO_t05 MHO_t06     FALSE 0.127 70.000 0.000 NA   NA
 10135328 10135329 MHO_t06 MHO_t07     TRUE 0.623 3.000 0.000 NA   NA
 10135329 10135330 MHO_t07 MHO_0860   acpD FALSE 0.086 445.000 0.000 NA   NA
 10135330 10135331 MHO_0860 MHO_0870 acpD rplk FALSE 0.087 103.000 0.000 1.000 N NA
 10135331 10135332 MHO_0870 MHO_0880 rplk rplA TRUE 0.996 0.000 0.838 1.000 Y NA
 10135334 10135335 MHO_0900 MHO_0910   tig TRUE 0.591 43.000 0.002 NA   NA
 10135335 10135336 MHO_0910 MHO_0920 tig secA FALSE 0.266 92.000 0.002 1.000 N NA
 10135337 10135338 MHO_0930 MHO_0940     FALSE 0.089 87.000 0.000 NA   NA
 10135339 10135340 MHO_0950 MHO_0960 dnaX   TRUE 0.980 24.000 0.100 NA   NA
 10135340 10135341 MHO_0960 MHO_0970   recR TRUE 0.996 0.000 0.604 NA   NA
 10135341 10135342 MHO_0970 MHO_0980 recR tmk TRUE 0.977 15.000 0.015 1.000 N NA
 10135342 10135343 MHO_0980 MHO_0990 tmk dnaH TRUE 0.974 38.000 0.254 1.000   NA
 10135343 10135344 MHO_0990 MHO_1000 dnaH   TRUE 0.993 -7.000 0.016 1.000   NA
 10135346 10135347 MHO_1020 MHO_1030     TRUE 0.593 13.000 0.000 NA   NA
 10135347 10135348 MHO_1030 MHO_1040     FALSE 0.067 158.000 0.000 NA   NA
 10135349 10135350 MHO_1050 MHO_1060 thrS trpS TRUE 0.991 0.000 0.014 1.000 Y NA
 10135351 10135352 MHO_1070 MHO_1080     TRUE 0.997 -7.000 0.304 NA   NA
 10135352 10135353 MHO_1080 MHO_1090     TRUE 0.857 -49.000 0.000 NA   NA
 10135355 10135356 MHO_1110 MHO_1120 hlyC rpsF FALSE 0.068 175.000 0.000 NA   NA
 10135356 10135357 MHO_1120 MHO_1130 rpsF ssb TRUE 0.895 29.000 0.006 1.000 N NA
 10135357 10135358 MHO_1130 MHO_1140 ssb rpsR TRUE 0.955 9.000 0.008 1.000 N NA
 10135358 10135359 MHO_1140 MHO_1150 rpsR   FALSE 0.085 400.000 0.000 NA   NA
 10135359 10135360 MHO_1150 MHO_1160     FALSE 0.205 56.000 0.000 NA   NA
 10135360 10135361 MHO_1160 MHO_1170   pheS TRUE 0.928 2.000 0.004 1.000 N NA
 10135361 10135362 MHO_1170 MHO_1180 pheS pheT TRUE 0.908 12.000 0.004 0.005 Y NA
 10135362 10135363 MHO_1180 MHO_1190 pheT recA FALSE 0.246 98.000 0.002 0.013 N NA
 10135363 10135364 MHO_1190 MHO_1200 recA   TRUE 0.830 40.000 0.006 NA   NA
 10135364 10135365 MHO_1200 MHO_1210   nusB TRUE 0.948 2.000 0.005 NA   NA
 10135365 10135366 MHO_1210 MHO_1220 nusB tlyA TRUE 0.970 -16.000 0.003 0.070 N NA
 10135366 10135367 MHO_1220 MHO_1230 tlyA nifS TRUE 0.986 0.000 0.010 1.000 N NA
 10135367 10135368 MHO_1230 MHO_1240 nifS nifU TRUE 0.997 -13.000 0.053 1.000 N NA
 10135368 10135369 MHO_1240 MHO_1250 nifU mucB TRUE 0.988 -7.000 0.008 1.000 N NA
 10135369 10135370 MHO_1250 MHO_1260 mucB   TRUE 0.974 0.000 0.006 1.000 N NA
 10135370 10135371 MHO_1260 MHO_1270   infC FALSE 0.180 66.000 0.000 1.000 N NA
 10135371 10135372 MHO_1270 MHO_1280 infC rpml TRUE 0.985 27.000 0.652 1.000 Y NA
 10135372 10135373 MHO_1280 MHO_1290 rpml rplT TRUE 0.989 13.000 0.928 0.088 Y NA
 10135373 10135374 MHO_1290 MHO_1300 rplT trmU FALSE 0.258 99.000 0.002 1.000 Y NA
 10135374 10135375 MHO_1300 MHO_1310 trmU alaS TRUE 0.951 17.000 0.007 1.000 Y NA
 10135375 10135376 MHO_1310 MHO_1320 alaS   TRUE 0.874 -12.000 0.000 1.000 N NA
 10135376 10135377 MHO_1320 MHO_1330     TRUE 0.829 -7.000 0.000 NA   NA
 10135377 10135378 MHO_1330 MHO_1340     TRUE 0.845 -10.000 0.000 NA   NA
 10135378 10135379 MHO_1340 MHO_1350   greA TRUE 0.993 0.000 0.031 NA   NA
 10135379 10135380 MHO_1350 MHO_1360 greA   FALSE 0.084 105.000 0.000 0.085   NA
 10135380 10135381 MHO_1360 MHO_1370   metG (metS) TRUE 0.956 23.000 0.011 0.100   NA
 10135381 10135382 MHO_1370 MHO_1380 metG (metS) obg FALSE 0.577 21.000 0.000 1.000   NA
 10135382 10135383 MHO_1380 MHO_t08 obg   FALSE 0.067 147.000 0.000 NA   NA
 10135383 10135384 MHO_t08 MHO_t09     FALSE 0.579 6.000 0.000 NA   NA
 10135384 10135385 MHO_t09 MHO_t10     TRUE 0.582 5.000 0.000 NA   NA
 10135385 10135386 MHO_t10 MHO_t11     FALSE 0.469 25.000 0.000 NA   NA
 10135386 10135387 MHO_t11 MHO_t12     TRUE 0.623 3.000 0.000 NA   NA
 10135387 10135388 MHO_t12 MHO_t13     TRUE 0.581 7.000 0.000 NA   NA
 10135388 10135389 MHO_t13 MHO_t14     TRUE 0.676 2.000 0.000 NA   NA
 10135389 10135390 MHO_t14 MHO_t15     TRUE 0.676 2.000 0.000 NA   NA
 10135390 10135391 MHO_t15 MHO_1390     FALSE 0.086 88.000 0.000 NA   NA
 10135393 10135394 MHO_1410 MHO_1420 rluD   FALSE 0.368 59.000 0.002 NA   NA
 10135394 10135395 MHO_1420 MHO_1430     TRUE 0.966 43.000 0.667 NA   NA
 10135395 10135396 MHO_1430 MHO_1440     TRUE 0.590 10.000 0.000 NA   NA
 10135396 10135397 MHO_1440 MHO_1450   rpsL FALSE 0.067 162.000 0.000 NA   NA
 10135397 10135398 MHO_1450 MHO_1460 rpsL rpsG TRUE 0.982 31.000 0.224 0.019 Y NA
 10135398 10135399 MHO_1460 MHO_1470 rpsG fusA TRUE 0.992 13.000 0.579 1.000 Y NA
 10135399 10135400 MHO_1470 MHO_1480 fusA   FALSE 0.105 76.000 0.000 NA   NA
 10135400 10135401 MHO_1480 MHO_1490     TRUE 0.588 12.000 0.000 NA   NA
 10135403 10135404 MHO_1510 MHO_1520 oppA oppB TRUE 0.585 16.000 0.000 NA   NA
 10135404 10135405 MHO_1520 MHO_1530 oppB oppC TRUE 0.993 2.000 0.889 0.031 Y NA
 10135405 10135406 MHO_1530 MHO_1540 oppC oppD TRUE 0.993 2.000 0.875 1.000 Y NA
 10135406 10135407 MHO_1540 MHO_1550 oppD oppF TRUE 0.868 -7.000 0.000 0.005 N NA
 10135409 10135410 MHO_1570 MHO_1580     TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 10135410 10135411 MHO_1580 MHO_1590     FALSE 0.073 246.000 0.000 NA   NA
 10135411 10135412 MHO_1590 MHO_t16     FALSE 0.076 266.000 0.000 NA   NA
 10135414 10135415 MHO_1600 MHO_1610 prfA hemK TRUE 0.995 0.000 0.081 0.095 Y NA
 10135415 10135416 MHO_1610 MHO_1620 hemK dnaJ TRUE 0.782 35.000 0.004 1.000 N NA
 10135416 10135417 MHO_1620 MHO_1630 dnaJ topA FALSE 0.240 168.000 0.002 1.000 N NA
 10135419 10135420 MHO_1650 MHO_1660     TRUE 0.676 2.000 0.000 NA   NA
 10135420 10135421 MHO_1660 MHO_1670   cmk FALSE 0.122 71.000 0.000 NA   NA
 10135421 10135422 MHO_1670 MHO_1680 cmk engA TRUE 0.997 -13.000 0.060 1.000   NA
 10135422 10135423 MHO_1680 MHO_1690 engA gpsA TRUE 0.988 3.000 0.068 1.000   NA
 10135424 10135425 MHO_1700 MHO_1710 recU   FALSE 0.342 38.000 0.000 NA   NA
 10135425 10135426 MHO_1710 MHO_1720     TRUE 0.997 -13.000 0.267 NA   NA
 10135427 10135428 MHO_1730 MHO_1740   oppB FALSE 0.491 23.000 0.000 NA   NA
 10135428 10135429 MHO_1740 MHO_1750 oppB oppC TRUE 0.998 -16.000 0.500 0.030 Y NA
 10135429 10135430 MHO_1750 MHO_1760 oppC   FALSE 0.096 96.000 0.000 1.000 N NA
 10135431 10135432 MHO_1770 MHO_1780 tktA   TRUE 0.997 -10.000 0.333 NA   NA
 10135432 10135433 MHO_1780 MHO_1790   efp TRUE 0.773 4.000 0.002 NA   NA
 10135435 10135436 MHO_1810 MHO_1820     FALSE 0.076 270.000 0.000 NA   NA
 10135436 10135437 MHO_1820 MHO_1830   ppa FALSE 0.067 142.000 0.000 NA   NA
 10135438 10135439 MHO_1840 MHO_1850 ruvA ruvB TRUE 0.998 -25.000 0.549 0.016 Y NA
 10135439 10135440 MHO_1850 MHO_1860 ruvB secD FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 10135440 10135441 MHO_1860 MHO_1870 secD hisS TRUE 0.595 15.000 0.000 NA   NA
 10135441 10135442 MHO_1870 MHO_1880 hisS aspS TRUE 0.998 -16.000 0.161 0.093 Y NA
 10135442 10135443 MHO_1880 MHO_1890 aspS   FALSE 0.185 92.000 0.002 1.000   NA
 10135443 10135444 MHO_1890 MHO_1900   vacB TRUE 0.986 16.000 0.064 1.000   NA
 10135444 10135445 MHO_1900 MHO_1910 vacB smpB TRUE 0.913 69.000 0.143 0.065 N NA
 10135445 10135446 MHO_1910 MHO_1920 smpB folD FALSE 0.110 765.000 0.000 1.000 N NA
 10135446 10135447 MHO_1920 MHO_1930 folD dgk FALSE 0.092 99.000 0.000 1.000 N NA
 10135447 10135448 MHO_1930 MHO_1940 dgk hpt TRUE 0.996 -12.000 0.021 1.000 Y NA
 10135448 10135449 MHO_1940 MHO_1950 hpt   TRUE 0.589 11.000 0.000 NA   NA
 10135449 10135450 MHO_1950 MHO_1960     FALSE 0.067 149.000 0.000 NA   NA
 10135450 10135451 MHO_1960 MHO_1970   cbiO1 FALSE 0.069 201.000 0.000 NA   NA
 10135451 10135452 MHO_1970 MHO_1980 cbiO1 cbiO2 TRUE 0.994 -9.000 0.014 0.028 Y NA
 10135452 10135453 MHO_1980 MHO_1990 cbiO2 cbiQ TRUE 0.996 -7.000 0.060 1.000 Y NA
 10135453 10135454 MHO_1990 MHO_2000 cbiQ ligA TRUE 0.955 2.000 0.005 1.000 N NA
 10135455 10135456 MHO_2010 MHO_2020     TRUE 0.857 -75.000 0.000 NA   NA
 10135456 10135457 MHO_2020 MHO_2030     FALSE 0.069 120.000 0.000 NA   NA
 10135458 10135459 MHO_2040 MHO_2050   dexB TRUE 0.878 11.000 0.003 1.000 N NA
 10135459 10135460 MHO_2050 MHO_2060 dexB   FALSE 0.227 52.000 0.000 NA   NA
 10135460 10135461 MHO_2060 MHO_2070   pgsA TRUE 0.985 -10.000 0.007 NA   NA
 10135461 10135462 MHO_2070 MHO_2080 pgsA   FALSE 0.076 156.000 0.000 1.000   NA
 10135463 10135464 MHO_2090 MHO_2100     TRUE 0.882 83.000 0.400 NA   NA
 10135465 10135466 MHO_2110 MHO_2120 rpmG pepQ TRUE 0.908 47.000 0.014 1.000 N NA
 10135466 10135467 MHO_2120 MHO_2130 pepQ smf FALSE 0.084 115.000 0.000 1.000 N NA
 10135468 10135469 MHO_2140 MHO_2150 nfo rpoD FALSE 0.082 166.000 0.000 1.000 N NA
 10135469 10135470 MHO_2150 MHO_2160 rpoD dnaG TRUE 0.991 3.000 0.205 1.000 N NA
 10135470 10135471 MHO_2160 MHO_2170 dnaG glyQS TRUE 0.639 11.000 0.000 1.000 N NA
 10135473 10135474 MHO_2190 MHO_2200     TRUE 0.975 -7.000 0.005 1.000   NA
 10135474 10135475 MHO_2200 MHO_2210     TRUE 0.912 6.000 0.005 1.000   NA
 10135475 10135476 MHO_2210 MHO_2220   rpsO FALSE 0.105 265.000 0.000 1.000 Y NA
 10135476 10135477 MHO_2220 MHO_t18 rpsO   FALSE 0.069 124.000 0.000 NA   NA
 10135477 10135478 MHO_t18 MHO_2230   rpsI FALSE 0.246 49.000 0.000 NA   NA
 10135478 10135479 MHO_2230 MHO_2240 rpsI rplM TRUE 0.993 3.000 0.601 0.080 Y NA
 10135479 10135480 MHO_2240 MHO_2250 rplM   FALSE 0.301 113.000 0.004 NA   NA
 10135480 10135481 MHO_2250 MHO_2260     FALSE 0.068 138.000 0.000 NA   NA
 10135481 10135482 MHO_2260 MHO_2270   ftsZ FALSE 0.076 270.000 0.000 NA   NA
 10135482 10135483 MHO_2270 MHO_2280 ftsZ   TRUE 0.841 8.000 0.002 NA   NA
 10135483 10135484 MHO_2280 MHO_2290   mraW TRUE 0.820 5.000 0.002 NA   NA
 10135484 10135485 MHO_2290 MHO_2300 mraW mraZ TRUE 0.995 1.000 0.635 NA   NA
 10135486 10135487 MHO_t19 MHO_t20     FALSE 0.084 91.000 0.000 NA   NA
 10135487 10135488 MHO_t20 MHO_t21     TRUE 0.582 5.000 0.000 NA   NA
 10135488 10135489 MHO_t21 MHO_t22     TRUE 0.623 3.000 0.000 NA   NA
 10135490 10135491 MHO_2310 MHO_2320     TRUE 0.989 15.000 1.000 0.011 Y NA
 10135491 10135492 MHO_2320 MHO_2330     FALSE 0.068 138.000 0.000 NA   NA
 10135492 10135493 MHO_2330 MHO_2340     TRUE 0.856 -19.000 0.000 NA   NA
 10135493 10135494 MHO_2340 MHO_t23     FALSE 0.079 279.000 0.000 NA   NA
 10135494 10135495 MHO_t23 MHO_t24     FALSE 0.072 101.000 0.000 NA   NA
 10135495 10135496 MHO_t24 MHO_t25     TRUE 0.593 4.000 0.000 NA   NA
 10135497 10135498 MHO_2350 MHO_2360 truB   TRUE 0.982 9.000 0.022 1.000   NA
 10135498 10135499 MHO_2360 MHO_2370     FALSE 0.142 70.000 0.000 1.000   NA
 10135499 10135500 MHO_2370 MHO_2380   ribF TRUE 0.813 0.000 0.000 1.000 N NA
 10135501 10135502 MHO_2390 MHO_2400   tpiA FALSE 0.087 240.000 0.000 1.000 N NA
 10135502 10135503 MHO_2400 MHO_2410 tpiA   TRUE 0.991 15.000 0.667 1.000   NA
 10135503 10135504 MHO_2410 MHO_2420     FALSE 0.069 119.000 0.000 NA   NA
 10135504 10135505 MHO_2420 MHO_2430     FALSE 0.069 133.000 0.000 NA   NA
 10135505 10135506 MHO_2430 MHO_2440     FALSE 0.071 214.000 0.000 NA   NA
 10135506 10135507 MHO_2440 MHO_2450     TRUE 0.676 2.000 0.000 NA   NA
 10135507 10135508 MHO_2450 MHO_2460     TRUE 0.779 0.000 0.000 NA   NA
 10135508 10135509 MHO_2460 MHO_2470     TRUE 0.590 10.000 0.000 NA   NA
 10135509 10135510 MHO_2470 MHO_2480     FALSE 0.365 37.000 0.000 NA   NA
 10135510 10135511 MHO_2480 MHO_2490     TRUE 0.589 11.000 0.000 NA   NA
 10135512 10135513 MHO_2500 MHO_2510     TRUE 0.991 3.000 0.667 NA   NA
 10135513 10135514 MHO_2510 MHO_2520     FALSE 0.069 128.000 0.000 NA   NA
 10135514 10135515 MHO_2520 MHO_2530     FALSE 0.072 244.000 0.000 NA   NA
 10135517 10135518 MHO_2550 MHO_2560     FALSE 0.076 99.000 0.000 NA   NA
 10135519 10135520 MHO_2570 MHO_2580   cdd FALSE 0.077 174.000 0.000 1.000   NA
 10135521 10135522 MHO_2590 MHO_2600 rpsP trmD TRUE 0.986 13.000 0.033 1.000 Y NA
 10135522 10135523 MHO_2600 MHO_2610 trmD rplS TRUE 0.994 2.000 0.567 1.000 Y NA
 10135523 10135524 MHO_2610 MHO_2620 rplS   FALSE 0.071 211.000 0.000 NA   NA
 10135527 10135528 MHO_2650 MHO_2660 rpmA rplU TRUE 0.993 3.000 0.667 0.073 Y NA
 10135528 10135529 MHO_2660 MHO_2670 rplU rpoC FALSE 0.102 614.000 0.000 1.000   NA
 10135529 10135530 MHO_2670 MHO_2680 rpoC rpoB TRUE 0.993 2.000 0.851 0.004   NA
 10135530 10135531 MHO_2680 MHO_2690 rpoB rplL TRUE 0.840 134.000 0.223 1.000 N NA
 10135531 10135532 MHO_2690 MHO_2700 rplL rplJ TRUE 0.984 23.000 0.884 1.000 Y NA
 10135532 10135533 MHO_2700 MHO_r01 rplJ   FALSE 0.071 221.000 0.000 NA   NA
 10135533 10135534 MHO_r01 MHO_r02     FALSE 0.068 183.000 0.000 NA   NA
 10135534 10135535 MHO_r02 MHO_2710   rpmF FALSE 0.078 276.000 0.000 NA   NA
 10135535 10135536 MHO_2710 MHO_2720 rpmF rplQ TRUE 0.739 25.000 0.002 1.000 Y NA
 10135536 10135537 MHO_2720 MHO_2730 rplQ rpoA TRUE 0.990 3.000 0.873 1.000 N NA
 10135537 10135538 MHO_2730 MHO_2740 rpoA rpsK TRUE 0.982 30.000 0.308 1.000 N NA
 10135538 10135539 MHO_2740 MHO_2750 rpsK rpsM TRUE 0.992 3.000 0.810 0.072 Y NA
 10135539 10135540 MHO_2750 MHO_5380 rpsM rpmJ TRUE 0.990 4.000 0.194 0.072   NA
 10135540 10135541 MHO_5380 MHO_2760 rpmJ infA TRUE 0.988 12.000 0.104 1.000   NA
 10135541 10135542 MHO_2760 MHO_2770 infA map TRUE 0.995 0.000 0.051 1.000 Y NA
 10135542 10135543 MHO_2770 MHO_2780 map adk TRUE 0.996 -9.000 0.041 1.000 N NA
 10135543 10135544 MHO_2780 MHO_2790 adk secY TRUE 0.993 -6.000 0.019 1.000 N NA
 10135544 10135545 MHO_2790 MHO_2800 secY rplO TRUE 0.972 0.000 0.005 1.000 N NA
 10135545 10135546 MHO_2800 MHO_2810 rplO rpsE TRUE 0.990 10.000 0.148 1.000 Y NA
 10135546 10135547 MHO_2810 MHO_2820 rpsE rplR TRUE 0.996 0.000 0.814 1.000 Y NA
 10135547 10135548 MHO_2820 MHO_2830 rplR rplF TRUE 0.988 22.000 0.815 0.072 Y NA
 10135548 10135549 MHO_2830 MHO_2840 rplF rpsH TRUE 0.988 22.000 0.808 0.072 Y NA
 10135549 10135550 MHO_2840 MHO_2850 rpsH rpsN TRUE 0.993 3.000 0.473 0.072 Y NA
 10135550 10135551 MHO_2850 MHO_2860 rpsN rplE TRUE 0.992 9.000 0.496 0.072 Y NA
 10135551 10135552 MHO_2860 MHO_2870 rplE rplX TRUE 0.992 15.000 0.758 0.072 Y NA
 10135552 10135553 MHO_2870 MHO_2880 rplX rplN TRUE 0.994 2.000 0.810 1.000 Y NA
 10135553 10135554 MHO_2880 MHO_2890 rplN rpsQ TRUE 0.997 -7.000 0.791 1.000 Y NA
 10135554 10135555 MHO_2890 MHO_2900 rpsQ rpmC TRUE 0.996 0.000 0.828 0.072 Y NA
 10135555 10135556 MHO_2900 MHO_2910 rpmC rplP TRUE 0.991 6.000 0.802 0.072 Y NA
 10135556 10135557 MHO_2910 MHO_2920 rplP rpsC TRUE 0.998 -22.000 0.828 1.000 Y NA
 10135557 10135558 MHO_2920 MHO_2930 rpsC rplV TRUE 0.996 0.000 0.719 1.000 Y NA
 10135558 10135559 MHO_2930 MHO_2940 rplV rpsS TRUE 0.991 4.000 0.769 1.000 Y NA
 10135559 10135560 MHO_2940 MHO_2950 rpsS rplB TRUE 0.996 0.000 0.820 1.000 Y NA
 10135560 10135561 MHO_2950 MHO_2960 rplB rplW TRUE 0.856 95.000 0.849 1.000 Y NA
 10135561 10135562 MHO_2960 MHO_2970 rplW rplD TRUE 0.990 0.000 0.013 1.000 Y NA
 10135562 10135563 MHO_2970 MHO_2980 rplD rplC TRUE 0.988 0.000 0.010 0.072 Y NA
 10135563 10135564 MHO_2980 MHO_2990 rplC rpsJ TRUE 0.916 72.000 0.467 1.000 Y NA
 10135564 10135565 MHO_2990 MHO_3000 rpsJ   FALSE 0.088 547.000 0.000 NA   NA
 10135566 10135567 MHO_3010 MHO_3020   rpmE FALSE 0.396 77.000 0.004 1.000 N NA
 10135568 10135569 MHO_3030 MHO_3040   lspA FALSE 0.087 502.000 0.000 NA   NA
 10135569 10135570 MHO_3040 MHO_3050 lspA ileS TRUE 0.995 -10.000 0.019 1.000 N NA
 10135570 10135571 MHO_3050 MHO_3060 ileS leuS TRUE 0.621 22.000 0.000 0.082 Y NA
 10135572 10135573 MHO_3070 MHO_3080     FALSE 0.070 209.000 0.000 NA   NA
 10135573 10135574 MHO_3080 MHO_3090     TRUE 0.852 -13.000 0.000 NA   NA
 10135576 10135577 MHO_t26 MHO_t27     TRUE 0.593 4.000 0.000 NA   NA
 10135578 10135579 MHO_3110 MHO_3120   atpD FALSE 0.080 256.000 0.000 NA N NA
 10135579 10135580 MHO_3120 MHO_3130 atpD atpA TRUE 0.995 0.000 1.000 0.020 Y NA
 10135580 10135581 MHO_3130 MHO_3140 atpA   TRUE 0.990 16.000 0.286 NA   NA
 10135581 10135582 MHO_3140 MHO_3150     TRUE 0.997 -7.000 0.500 NA   NA
 10135582 10135583 MHO_3150 MHO_3160     TRUE 0.997 -22.000 1.000 NA   NA
 10135583 10135584 MHO_3160 MHO_3170     TRUE 0.676 2.000 0.000 NA   NA
 10135584 10135585 MHO_3170 MHO_3180     TRUE 0.856 -19.000 0.000 NA   NA
 10135585 10135586 MHO_3180 MHO_3190     TRUE 0.585 16.000 0.000 NA   NA
 10135586 10135587 MHO_3190 MHO_3200     FALSE 0.422 30.000 0.000 NA   NA
 10135589 10135590 MHO_3220 MHO_3230 hsdS hsdS TRUE 0.903 -22.000 0.000 0.010 Y NA
 10135590 10135591 MHO_3230 MHO_3240 hsdS hsdM TRUE 0.623 3.000 0.000 NA   NA
 10135591 10135592 MHO_3240 MHO_3250 hsdM hsdM FALSE 0.560 18.000 0.000 NA   NA
 10135592 10135593 MHO_3250 MHO_3260 hsdM   FALSE 0.069 194.000 0.000 NA   NA
 10135593 10135594 MHO_3260 MHO_3270     FALSE 0.067 153.000 0.000 NA   NA
 10135594 10135595 MHO_3270 MHO_3280     FALSE 0.151 66.000 0.000 NA   NA
 10135595 10135596 MHO_3280 MHO_3290     TRUE 0.779 0.000 0.000 NA   NA
 10135596 10135597 MHO_3290 MHO_3300   rnhB FALSE 0.085 408.000 0.000 NA   NA
 10135597 10135598 MHO_3300 MHO_3310 rnhB   TRUE 0.995 -7.000 0.040 1.000   NA
 10135598 10135599 MHO_3310 MHO_3320   upp FALSE 0.077 182.000 0.000 1.000   NA
 10135599 10135600 MHO_3320 MHO_3330 upp deoC TRUE 0.928 35.000 0.010 1.000 Y NA
 10135600 10135601 MHO_3330 MHO_3340 deoC deoA TRUE 0.981 27.000 0.106 1.000 Y NA
 10135601 10135602 MHO_3340 MHO_3350 deoA deoD TRUE 0.982 17.000 0.022 1.000 Y NA
 10135602 10135603 MHO_3350 MHO_r03 deoD   FALSE 0.071 104.000 0.000 NA   NA
 10135605 10135606 MHO_3370 MHO_3380     FALSE 0.197 58.000 0.000 NA   NA
 10135608 10135609 MHO_3400 MHO_3410 trxB Igt TRUE 0.975 34.000 0.101 1.000 N NA
 10135609 10135610 MHO_3410 MHO_3420 Igt uvrA FALSE 0.262 82.000 0.002 1.000 N NA
 10135610 10135611 MHO_3420 MHO_3430 uvrA   TRUE 0.845 -10.000 0.000 NA   NA
 10135611 10135612 MHO_3430 MHO_3440     TRUE 0.583 8.000 0.000 NA   NA
 10135612 10135613 MHO_3440 MHO_3450     TRUE 0.857 -37.000 0.000 NA   NA
 10135613 10135614 MHO_3450 MHO_3460     FALSE 0.570 17.000 0.000 NA   NA
 10135616 10135617 MHO_t28 MHO_3480   hit FALSE 0.084 389.000 0.000 NA   NA
 10135617 10135618 MHO_3480 MHO_3490 hit   TRUE 0.992 2.000 0.111 NA   NA
 10135618 10135619 MHO_3490 MHO_3500     TRUE 0.990 12.000 0.778 NA   NA
 10135621 10135622 MHO_3520 MHO_3530     TRUE 0.994 2.000 0.333 1.000   NA
 10135622 10135623 MHO_3530 MHO_3540   gidB FALSE 0.076 149.000 0.000 1.000   NA
 10135623 10135624 MHO_3540 MHO_3550 gidB prs TRUE 0.991 -25.000 0.009 1.000 N NA
 10135624 10135625 MHO_3550 MHO_3560 prs mgtA FALSE 0.085 110.000 0.000 1.000 N NA
 10135625 10135626 MHO_3560 MHO_3570 mgtA phnC TRUE 0.828 191.000 0.111 1.000 Y NA
 10135626 10135627 MHO_3570 MHO_3580 phnC ldh TRUE 0.830 117.000 0.133 1.000 N NA
 10135627 10135628 MHO_3580 MHO_3590 ldh pgi TRUE 0.974 -7.000 0.005 0.014 N NA
 10135628 10135629 MHO_3590 MHO_3600 pgi rpsA TRUE 0.862 -10.000 0.000 1.000   NA
 10135630 10135631 MHO_3610 MHO_3620     FALSE 0.082 146.000 0.000 0.025   NA
 10135631 10135632 MHO_3620 MHO_3630     TRUE 0.991 3.000 0.133 0.025   NA
 10135632 10135633 MHO_3630 MHO_t29     FALSE 0.068 138.000 0.000 NA   NA
 10135634 10135635 MHO_3640 MHO_3650 metK asnA FALSE 0.084 194.000 0.000 1.000 N NA
 10135635 10135636 MHO_3650 MHO_3660 asnA p120 FALSE 0.068 134.000 0.000 NA   NA
 10135638 10135639 MHO_3670 MHO_3680 pepF apt TRUE 0.969 0.000 0.005 1.000 N NA
 10135640 10135641 MHO_3690 MHO_3700     TRUE 0.952 41.000 0.052 NA   NA
 10135641 10135642 MHO_3700 MHO_3710     FALSE 0.084 365.000 0.000 NA   NA
 10135642 10135643 MHO_3710 MHO_3720   p75 FALSE 0.070 207.000 0.000 NA   NA
 10135645 10135646 MHO_3740 MHO_3750     TRUE 0.852 87.000 0.121 NA   NA
 10135646 10135647 MHO_3750 MHO_3760   gyrB FALSE 0.239 86.000 0.002 NA   NA
 10135647 10135648 MHO_3760 MHO_3770 gyrB licA TRUE 0.904 2.000 0.003 NA N NA
 10135648 10135649 MHO_3770 MHO_3780 licA   TRUE 0.728 2.000 0.000 NA Y NA
 10135649 10135650 MHO_3780 MHO_3790     TRUE 0.589 11.000 0.000 NA   NA
 10135651 10135652 MHO_3800 MHO_t30 p120'   FALSE 0.073 248.000 0.000 NA   NA
 10135654 10135655 MHO_3820 MHO_3830 md2 md1 TRUE 0.997 -7.000 0.800 0.009 Y NA
 10135655 10135656 MHO_3830 MHO_3840 md1 ackA TRUE 0.936 49.000 0.032 1.000 N NA
 10135656 10135657 MHO_3840 MHO_r05 ackA   FALSE 0.089 87.000 0.000 NA   NA
 10135657 10135658 MHO_r05 MHO_3850     FALSE 0.215 54.000 0.000 NA   NA
 10135658 10135659 MHO_3850 MHO_3860   mutM TRUE 0.918 1.000 0.003 NA   NA
 10135660 10135661 MHO_3870 MHO_3880   rpiB TRUE 0.980 2.000 0.012 NA N NA
 10135662 10135663 MHO_3890 MHO_3900     TRUE 0.806 100.000 1.000 NA   NA
 10135663 10135664 MHO_3900 MHO_3910   dnaB TRUE 0.913 40.000 0.012 NA   NA
 10135664 10135665 MHO_3910 MHO_3920 dnaB rpII TRUE 0.980 26.000 0.100 1.000 N NA
 10135665 10135666 MHO_3920 MHO_3930 rpII   TRUE 0.997 -19.000 0.119 1.000 N NA
 10135666 10135667 MHO_3930 MHO_3940   engB FALSE 0.239 54.000 0.000 1.000   NA
 10135667 10135668 MHO_3940 MHO_3950 engB gcp TRUE 0.801 0.000 0.000 1.000   NA
 10135668 10135669 MHO_3950 MHO_3960 gcp   TRUE 0.991 -6.000 0.012 0.004 Y NA
 10135669 10135670 MHO_3960 MHO_3970     TRUE 0.779 0.000 0.000 NA   NA
 10135670 10135671 MHO_3970 MHO_3980     FALSE 0.068 163.000 0.000 NA   NA
 10135671 10135672 MHO_3980 MHO_r06     FALSE 0.069 131.000 0.000 NA   NA
 10135672 10135673 MHO_r06 MHO_r07     FALSE 0.069 184.000 0.000 NA   NA
 10135673 10135674 MHO_r07 MHO_3990   nusG FALSE 0.078 277.000 0.000 NA   NA
 10135674 10135675 MHO_3990 MHO_4000 nusG   TRUE 0.989 13.000 0.843 1.000   NA
 10135675 10135676 MHO_4000 MHO_4010   rpmG TRUE 0.995 0.000 0.080 1.000   NA
 10135677 10135678 MHO_4020 MHO_4030   thiI TRUE 0.589 11.000 0.000 NA   NA
 10135681 10135682 MHO_4050 MHO_4060   lepA TRUE 0.754 7.000 0.002 NA   NA
 10135682 10135683 MHO_4060 MHO_4070 lepA lon FALSE 0.088 101.000 0.000 1.000 N NA
 10135683 10135684 MHO_4070 MHO_4080 lon grpE FALSE 0.195 67.000 0.000 1.000 Y NA
 10135684 10135685 MHO_4080 MHO_4090 grpE hrcA TRUE 0.987 1.000 0.015 1.000 N NA
 10135685 10135686 MHO_4090 MHO_t32 hrcA   FALSE 0.069 127.000 0.000 NA   NA
 10135686 10135687 MHO_t32 MHO_t33     TRUE 0.623 3.000 0.000 NA   NA
 10135687 10135688 MHO_t33 MHO_4100     FALSE 0.070 202.000 0.000 NA   NA
 10135688 10135689 MHO_4100 MHO_4110     TRUE 0.972 20.000 0.016 NA   NA
 10135690 10135691 MHO_4120 MHO_4130 dnaE polA TRUE 0.997 -13.000 0.119 0.015 Y NA
 10135692 10135693 MHO_4140 MHO_4150   trxA TRUE 0.990 8.000 0.333 1.000   NA
 10135693 10135694 MHO_4150 MHO_4160 trxA proS TRUE 0.913 14.000 0.004 1.000 N NA
 10135694 10135695 MHO_4160 MHO_4170 proS deoB FALSE 0.215 60.000 0.000 0.073 N NA
 10135698 10135699 MHO_4200 MHO_4210 recD pth TRUE 0.974 0.000 0.006 1.000 N NA
 10135699 10135700 MHO_4210 MHO_4220 pth tilS TRUE 0.996 -13.000 0.025 1.000 N NA
 10135700 10135701 MHO_4220 MHO_4230 tilS ftsH TRUE 0.945 48.000 0.051 1.000 N NA
 10135703 10135704 MHO_4250 MHO_4260 trmB gyrA FALSE 0.124 75.000 0.000 1.000   NA
 10135705 10135706 MHO_4270 MHO_4280     FALSE 0.105 76.000 0.000 NA   NA
 10135706 10135707 MHO_4280 MHO_4290     FALSE 0.068 170.000 0.000 NA   NA
 10135707 10135708 MHO_4290 MHO_4300   pepA FALSE 0.068 175.000 0.000 NA   NA
 10135708 10135709 MHO_4300 MHO_4310 pepA pepA TRUE 0.992 14.000 0.333 0.004 Y NA
 10135711 10135712 MHO_4330 MHO_4340 ung fmt TRUE 0.835 3.000 0.002 1.000 N NA
 10135712 10135713 MHO_4340 MHO_4350 fmt   FALSE 0.342 38.000 0.000 NA   NA
 10135713 10135714 MHO_4350 MHO_4360     TRUE 0.582 5.000 0.000 NA   NA
 10135714 10135715 MHO_4360 MHO_4370     FALSE 0.079 198.000 0.000 1.000   NA
 10135715 10135716 MHO_4370 MHO_4380     FALSE 0.110 75.000 0.000 NA   NA
 10135716 10135717 MHO_4380 MHO_4390   gltX TRUE 0.989 -19.000 0.008 NA   NA
 10135717 10135718 MHO_4390 MHO_4400 gltX   TRUE 0.956 14.000 0.008 NA   NA
 10135719 10135720 MHO_4410 MHO_4420     TRUE 0.763 59.000 0.008 NA   NA
 10135720 10135721 MHO_4420 MHO_4430   era TRUE 0.983 14.000 0.026 NA   NA
 10135721 10135722 MHO_4430 MHO_4440 era   TRUE 0.942 2.000 0.005 NA   NA
 10135722 10135723 MHO_4440 MHO_4450   potA FALSE 0.435 29.000 0.000 NA   NA
 10135723 10135724 MHO_4450 MHO_4460 potA potB TRUE 0.997 -31.000 0.928 0.023 Y NA
 10135724 10135725 MHO_4460 MHO_4470 potB potC TRUE 0.998 -7.000 0.492 0.023 Y NA
 10135725 10135726 MHO_4470 MHO_4480 potC   TRUE 0.924 22.000 0.007 NA   NA
 10135726 10135727 MHO_4480 MHO_4490   asnS FALSE 0.076 99.000 0.000 NA   NA
 10135727 10135728 MHO_4490 MHO_4500 asnS   TRUE 0.905 7.000 0.005 NA   NA
 10135728 10135729 MHO_4500 MHO_4510     TRUE 0.997 -6.000 0.222 NA   NA
 10135729 10135730 MHO_4510 MHO_4520   pcrA TRUE 0.669 132.000 0.015 NA   NA
 10135730 10135731 MHO_4520 MHO_4530 pcrA   TRUE 0.946 2.000 0.005 NA   NA
 10135731 10135732 MHO_4530 MHO_4540   pepO TRUE 0.941 50.000 1.000 NA   NA
 10135734 10135735 MHO_4560 MHO_4570 trme   TRUE 0.902 2.000 0.003 1.000   NA
 10135737 10135738 MHO_4590 MHO_4600 ftsY pyrH FALSE 0.098 324.000 0.000 1.000 N NA
 10135738 10135739 MHO_4600 MHO_4610 pyrH frr TRUE 0.996 0.000 0.626 NA N NA
 10135739 10135740 MHO_4610 MHO_4620 frr cdsA TRUE 0.895 58.000 0.020 NA N NA
 10135740 10135741 MHO_4620 MHO_4630 cdsA polC TRUE 0.630 103.000 0.011 1.000 N NA
 10135741 10135742 MHO_4630 MHO_4640 polC   FALSE 0.090 604.000 0.000 NA   NA
 10135742 10135743 MHO_4640 MHO_4650   glyA TRUE 0.929 41.000 0.019 NA   NA
 10135743 10135744 MHO_4650 MHO_4660 glyA   TRUE 0.589 11.000 0.000 NA   NA
 10135744 10135745 MHO_4660 MHO_4670     TRUE 0.779 0.000 0.000 NA   NA
 10135745 10135746 MHO_4670 MHO_4680   plsX TRUE 0.981 10.000 0.021 1.000   NA
 10135746 10135747 MHO_4680 MHO_4690 plsX rnc TRUE 0.995 -10.000 0.020 1.000 N NA
 10135747 10135748 MHO_4690 MHO_4700 rnc   TRUE 0.951 22.000 0.009 1.000 N NA
 10135748 10135749 MHO_4700 MHO_4710   vapD FALSE 0.075 259.000 0.000 NA   NA
 10135751 10135752 MHO_4730 MHO_4740 uvrB   FALSE 0.093 954.000 0.000 NA   NA
 10135752 10135753 MHO_4740 MHO_4750     FALSE 0.081 352.000 0.000 NA   NA
 10135753 10135754 MHO_4750 MHO_4760     TRUE 0.997 -9.000 0.727 NA   NA
 10135754 10135755 MHO_4760 MHO_4770     TRUE 0.998 -25.000 0.455 NA   NA
 10135755 10135756 MHO_4770 MHO_4780     TRUE 0.727 1.000 0.000 NA   NA
 10135756 10135757 MHO_4780 MHO_4790     FALSE 0.113 1399.000 0.000 1.000 N NA
 10135757 10135758 MHO_4790 MHO_4800     FALSE 0.365 37.000 0.000 NA   NA
 10135758 10135759 MHO_4800 MHO_4810     TRUE 0.727 1.000 0.000 NA   NA
 10135760 10135761 MHO_4820 MHO_4830     FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 10135761 10135762 MHO_4830 MHO_4840     FALSE 0.070 110.000 0.000 NA   NA
 10135763 10135764 MHO_4850 MHO_4860   gmk TRUE 0.838 52.000 0.009 1.000 N NA
 10135764 10135765 MHO_4860 MHO_4870 gmk   TRUE 0.955 4.000 0.008 1.000 N NA
 10135765 10135766 MHO_4870 MHO_4880   sps1 TRUE 0.997 -7.000 0.130 1.000 Y NA
 10135766 10135767 MHO_4880 MHO_4890 sps1 engC TRUE 0.991 1.000 0.024 1.000   NA
 10135767 10135768 MHO_4890 MHO_4900 engC rpe TRUE 0.970 9.000 0.012 1.000   NA
 10135768 10135769 MHO_4900 MHO_4910 rpe   FALSE 0.579 6.000 0.000 NA   NA
 10135769 10135770 MHO_4910 MHO_4920     FALSE 0.087 473.000 0.000 NA   NA
 10135770 10135771 MHO_4920 MHO_4930     FALSE 0.273 46.000 0.000 NA   NA
 10135771 10135772 MHO_4930 MHO_4940   dnaK FALSE 0.077 273.000 0.000 NA   NA
 10135772 10135773 MHO_4940 MHO_4950 dnaK   FALSE 0.070 206.000 0.000 NA   NA
 10135773 10135774 MHO_4950 MHO_4960   bcrA TRUE 0.996 0.000 0.250 NA   NA
 10135774 10135775 MHO_4960 MHO_4970 bcrA   TRUE 0.998 -22.000 0.250 NA   NA
 10135775 10135776 MHO_4970 MHO_4980     TRUE 0.829 -7.000 0.000 NA   NA
 10135776 10135777 MHO_4980 MHO_4990     TRUE 0.857 -22.000 0.000 NA   NA
 10135777 10135778 MHO_4990 MHO_5000   rpsB FALSE 0.083 359.000 0.000 NA   NA
 10135778 10135779 MHO_5000 MHO_5010 rpsB tsf TRUE 0.989 21.000 0.748 1.000 Y NA
 10135780 10135781 MHO_5020 MHO_5030     FALSE 0.246 49.000 0.000 NA   NA
 10135782 10135783 MHO_5040 MHO_5050     FALSE 0.069 120.000 0.000 NA   NA
 10135783 10135784 MHO_5050 MHO_5060     TRUE 0.852 -13.000 0.000 NA   NA
 10135785 10135786 MHO_5070 MHO_5080     FALSE 0.069 121.000 0.000 NA   NA
 10135786 10135787 MHO_5080 MHO_5090     TRUE 0.643 4.000 0.000 1.000 N NA
 10135787 10135788 MHO_5090 MHO_5100   bsn FALSE 0.105 76.000 0.000 NA   NA
 10135788 10135789 MHO_5100 MHO_5110 bsn bsn TRUE 0.727 1.000 0.000 NA   NA
 10135789 10135790 MHO_5110 MHO_5120 bsn parC FALSE 0.080 307.000 0.000 NA   NA
 10135790 10135791 MHO_5120 MHO_5130 parC parE TRUE 0.992 6.000 0.552 0.007 Y NA
 10135791 10135792 MHO_5130 MHO_5140 parE   FALSE 0.239 54.000 0.000 1.000   NA
 10135793 10135794 MHO_5150 MHO_5160 gap   FALSE 0.491 23.000 0.000 NA   NA
 10135794 10135795 MHO_5160 MHO_5170     FALSE 0.073 247.000 0.000 NA   NA
 10135795 10135796 MHO_5170 MHO_5180     TRUE 0.987 22.000 0.667 NA   NA
 10135796 10135797 MHO_5180 MHO_5190   pip TRUE 0.628 15.000 0.000 1.000   NA
 10135797 10135798 MHO_5190 MHO_5200 pip   FALSE 0.100 87.000 0.000 1.000   NA
 10135798 10135799 MHO_5200 MHO_5210   hsdM FALSE 0.085 108.000 0.000 1.000 N NA
 10135799 10135800 MHO_5210 MHO_5220 hsdM hsdS TRUE 0.986 3.000 0.022 0.058 Y NA
 10135800 10135801 MHO_5220 MHO_5230 hsdS hsdS FALSE 0.147 78.000 0.000 0.009 Y NA
 10135801 10135802 MHO_5230 MHO_5240 hsdS hsdR TRUE 0.960 32.000 0.017 0.009 Y NA
 10135802 10135803 MHO_5240 MHO_5250 hsdR nusA FALSE 0.194 64.000 0.000 1.000 N NA
 10135803 10135804 MHO_5250 MHO_5260 nusA   TRUE 0.997 -6.000 0.323 NA Y NA
 10135804 10135805 MHO_5260 MHO_5270   infB TRUE 0.997 -48.000 0.171 NA N NA
 10135805 10135806 MHO_5270 MHO_5280 infB rbfA TRUE 0.998 -13.000 0.530 1.000 Y NA
 10135806 10135807 MHO_5280 MHO_5290 rbfA gidA TRUE 0.857 21.000 0.003 1.000 N NA
 10135807 10135808 MHO_5290 MHO_5300 gidA   TRUE 0.969 3.000 0.010 NA   NA
 10135808 10135809 MHO_5300 MHO_5310     FALSE 0.305 131.000 0.004 NA   NA
 10135809 10135810 MHO_5310 MHO_5320     TRUE 0.997 -7.000 0.583 0.010   NA
 10135811 10135812 MHO_5330 MHO_5340     TRUE 0.988 0.000 0.013 NA   NA
 10135814 10135238 MHO_5360 MHO_0010     FALSE 0.098 81.000 0.000 NA   NA