MicrobesOnline Operon Predictions for Mycoplasma agalactiae

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10135815 10135816 MAGa0010 MAGa0020 dnaA dnaN TRUE 0.236 134.000 0.004 1.000 Y NA
 10135816 10135817 MAGa0020 MAGa0030 dnaN   FALSE 0.014 292.000 0.000 NA   NA
 10135817 10135818 MAGa0030 MAGa0040     TRUE 0.944 4.000 0.000 NA   NA
 10135818 10135819 MAGa0040 MAGa0050   lip TRUE 0.186 80.000 0.000 NA   NA
 10135819 10135820 MAGa0050 MAGa0060 lip lip TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 10135821 10135822 MAGa0070 MAGa0080   lplA TRUE 0.964 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10135822 10135823 MAGa0080 MAGa0090 lplA lplA TRUE 0.185 70.000 0.000 0.006 Y NA
 10135823 10135824 MAGa0090 MAGa0100 lplA   TRUE 0.999 -22.000 0.107 1.000 N NA
 10135824 10135825 MAGa0100 MAGa0110   gcdH TRUE 0.999 2.000 0.214 1.000 N NA
 10135825 10135826 MAGa0110 MAGa0120 gcdH   TRUE 0.999 -16.000 0.571 NA N NA
 10135828 10135829 MAGa0140 MAGa0150     FALSE 0.062 122.000 0.000 NA   NA
 10135830 10135831 MAGa0160 MAGa0170     TRUE 0.965 -7.000 0.000 1.000   NA
 10135831 10135832 MAGa0170 MAGa0180     TRUE 0.962 0.000 0.000 0.046   NA
 10135832 10135833 MAGa0180 MAGa0190   dgk FALSE 0.014 299.000 0.000 1.000   NA
 10135833 10135834 MAGa0190 MAGa0200 dgk dgk TRUE 0.940 2.000 0.000 0.004 Y NA
 10135835 10135836 MAGa0210 MAGa0220     FALSE 0.024 155.000 0.000 NA   NA
 10135836 10135837 MAGa0220 MAGa0230     TRUE 0.096 104.000 0.000 NA   NA
 10135839 10135840 MAGa0250 MAGa0260     FALSE 0.018 184.000 0.000 NA   NA
 10135840 10135841 MAGa0260 MAGa0270     TRUE 0.997 2.000 0.019 NA N NA
 10135842 10135843 MAGa0280 MAGa0290     TRUE 0.494 40.000 0.000 NA   NA
 10135843 10135844 MAGa0290 MAGa0300     TRUE 0.393 183.000 0.667 NA   NA
 10135844 10135845 MAGa0300 MAGa0310     FALSE 0.089 107.000 0.000 NA   NA
 10135845 10135846 MAGa0310 MAGa0320     TRUE 0.963 -40.000 0.000 NA   NA
 10135846 10135847 MAGa0320 MAGa0330     TRUE 0.286 62.000 0.000 NA   NA
 10135848 10135849 MAGa0340 MAGa0350 oppF oppD TRUE 0.999 -7.000 0.769 0.008 N NA
 10135849 10135850 MAGa0350 MAGa0360 oppD oppC TRUE 0.997 8.000 0.692 1.000 Y NA
 10135850 10135851 MAGa0360 MAGa0370 oppC oppB TRUE 0.997 2.000 1.000 0.045 Y NA
 10135851 10135852 MAGa0370 MAGa0380 oppB oppA TRUE 0.997 9.000 0.167 0.045   NA
 10135852 10135853 MAGa0380 MAGa0390 oppA   TRUE 0.995 15.000 0.167 NA   NA
 10135854 10135855 MAGa0400 MAGa0410 cysS   TRUE 0.871 47.000 0.009 1.000 Y NA
 10135855 10135856 MAGa0410 MAGa0420     TRUE 0.965 -7.000 0.000 1.000   NA
 10135856 10135857 MAGa0420 MAGa0430   rpmG TRUE 0.430 46.000 0.000 1.000   NA
 10135857 10135858 MAGa0430 MAGa0440 rpmG   TRUE 0.999 0.000 0.080 1.000   NA
 10135858 10135859 MAGa0440 MAGa0450   nusG TRUE 0.933 6.000 0.000 1.000   NA
 10135859 10135860 MAGa0450 MAGa0460 nusG   FALSE 0.043 133.000 0.000 1.000   NA
 10135860 10135861 MAGa0460 MAGa0470   pyrH FALSE 0.017 190.000 0.000 1.000   NA
 10135861 10135862 MAGa0470 MAGa0480 pyrH rrf TRUE 0.999 0.000 0.626 NA N NA
 10135862 10135863 MAGa0480 MAGa0490 rrf   TRUE 0.144 90.000 0.000 NA   NA
 10135863 10135864 MAGa0490 MAGa0500     TRUE 0.927 7.000 0.000 NA   NA
 10135865 10135866 MAGa0510 MAGa0520     TRUE 0.994 -75.000 0.002 NA   NA
 10135866 10135867 MAGa0520 MAGa0530   gpsA TRUE 0.144 90.000 0.000 NA   NA
 10135867 10135868 MAGa0530 MAGa0540 gpsA ksgA TRUE 0.834 16.000 0.000 1.000 N NA
 10135868 10135869 MAGa0540 MAGa0550 ksgA   TRUE 0.995 -31.000 0.003 NA N NA
 10135869 10135870 MAGa0550 MAGa0560   trme TRUE 0.985 9.000 0.003 NA   NA
 10135872 10135873 MAGa0580 MAGa0590 gap serS FALSE 0.023 158.000 0.000 1.000 N NA
 10135873 10135874 MAGa0590 MAGa0600 serS epsG TRUE 0.664 28.000 0.000 NA N NA
 10135875 10135876 MAGa0610 MAGa0620 rpmH rnpA TRUE 0.995 14.000 0.787 1.000   NA
 10135876 10135877 MAGa0620 MAGa0630 rnpA   TRUE 0.985 14.000 0.007 1.000 N NA
 10135877 10135878 MAGa0630 MAGa0640   lplA FALSE 0.023 157.000 0.000 1.000 N NA
 10135878 10135879 MAGa0640 MAGa0650 lplA lip TRUE 0.999 3.000 0.400 NA   NA
 10135879 10135880 MAGa0650 MAGa0660 lip   TRUE 0.177 83.000 0.000 NA   NA
 10135880 10135881 MAGa0660 MAGa0670   asnA TRUE 0.997 -7.000 0.011 NA   NA
 10135881 10135882 MAGa0670 MAGa0680 asnA polC FALSE 0.053 127.000 0.000 0.082 N NA
 10135882 10135883 MAGa0680 MAGa0690 polC   TRUE 0.113 97.000 0.000 NA   NA
 10135883 10135884 MAGa0690 MAGa0700     TRUE 0.253 69.000 0.000 NA   NA
 10135884 10135885 MAGa0700 MAGa0710     TRUE 0.125 94.000 0.000 NA   NA
 10135885 10135886 MAGa0710 MAGa0720   pheS TRUE 0.995 0.000 0.004 1.000 N NA
 10135886 10135887 MAGa0720 MAGa0730 pheS ung TRUE 0.995 -10.000 0.003 1.000 N NA
 10135887 10135888 MAGa0730 MAGa0740 ung pheT TRUE 0.999 2.000 0.125 1.000 N NA
 10135888 10135889 MAGa0740 MAGa0750 pheT glyA TRUE 0.994 9.000 0.019 1.000 N NA
 10135889 10135890 MAGa0750 MAGa0760 glyA pip TRUE 0.895 10.000 0.000 1.000   NA
 10135890 10135891 MAGa0760 MAGa0770 pip nifS TRUE 0.962 0.000 0.000 1.000   NA
 10135891 10135892 MAGa0770 MAGa0780 nifS nifU TRUE 0.983 26.000 0.053 1.000 N NA
 10135892 10135893 MAGa0780 MAGa0790 nifU mucB TRUE 0.997 -10.000 0.008 1.000 N NA
 10135893 10135894 MAGa0790 MAGa0800 mucB nadD TRUE 0.991 7.000 0.006 1.000 N NA
 10135894 10135895 MAGa0800 MAGa0810 nadD rluB TRUE 0.975 15.000 0.002 1.000 N NA
 10135895 10135896 MAGa0810 MAGa0820 rluB   TRUE 0.965 -18.000 0.000 NA   NA
 10135896 10135897 MAGa0820 MAGa0830     TRUE 0.514 38.000 0.000 NA   NA
 10135897 10135898 MAGa0830 MAGa0840   fba TRUE 0.997 5.000 0.036 NA   NA
 10135898 10135899 MAGa0840 MAGa0850 fba   TRUE 0.823 86.000 0.048 1.000 N NA
 10135899 10135900 MAGa0850 MAGa0860   rplK FALSE 0.067 118.000 0.000 1.000 N NA
 10135900 10135901 MAGa0860 MAGa0870 rplK rplA TRUE 0.998 0.000 0.838 0.097 Y NA
 10135902 10135903 MAGa0880 MAGa0890     TRUE 0.965 -13.000 0.000 NA   NA
 10135903 10135904 MAGa0890 MAGa0900     TRUE 0.998 -21.000 1.000 NA   NA
 10135905 10135906 MAGa0910 MAGa0920 cspR   TRUE 0.997 -15.000 0.014 0.008 Y NA
 10135906 10135907 MAGa0920 MAGa0930     TRUE 0.927 7.000 0.000 NA   NA
 10135907 10135908 MAGa0930 MAGa0940     TRUE 0.963 0.000 0.000 NA   NA
 10135908 10135909 MAGa0940 MAGa0950     TRUE 0.626 30.000 0.000 NA   NA
 10135909 10135910 MAGa0950 MAGa0960   hprK FALSE 0.043 133.000 0.000 NA   NA
 10135910 10135911 MAGa0960 MAGa0970 hprK lgt TRUE 0.999 -7.000 0.064 1.000 N NA
 10135911 10135912 MAGa0970 MAGa0980 lgt trxB TRUE 0.998 2.000 0.101 1.000 N NA
 10135914 10135915 MAGa1000 MAGa1010 pdhA pdhB TRUE 0.974 36.000 0.458 0.004 Y NA
 10135915 10135916 MAGa1010 MAGa1020 pdhB   FALSE 0.036 140.000 0.000 NA   NA
 10135916 10135917 MAGa1020 MAGa1030   pdhC TRUE 0.963 0.000 0.000 NA   NA
 10135917 10135918 MAGa1030 MAGa1040 pdhC pdhD TRUE 0.956 2.000 0.000 1.000   NA
 10135918 10135919 MAGa1040 MAGa1050 pdhD rpmB FALSE 0.016 193.000 0.000 1.000 N NA
 10135920 10135921 MAGa1060 MAGa1070     TRUE 0.859 15.000 0.000 NA   NA
 10135922 10135923 MAGa1080 MAGa1090     FALSE 0.016 579.000 0.000 NA   NA
 10135923 10135924 MAGa1090 MAGa1100   oppB TRUE 0.569 33.000 0.000 NA   NA
 10135924 10135925 MAGa1100 MAGa1110 oppB oppC TRUE 0.998 0.000 0.889 0.043 Y NA
 10135925 10135926 MAGa1110 MAGa1120 oppC oppD TRUE 0.990 16.000 0.875 1.000 Y NA
 10135926 10135927 MAGa1120 MAGa1130 oppD oppF TRUE 0.999 -10.000 0.312 0.008 Y NA
 10135927 10135928 MAGa1130 MAGa1140 oppF   TRUE 0.896 10.000 0.000 NA   NA
 10135928 10135929 MAGa1140 MAGa1150     TRUE 0.163 87.000 0.000 NA   NA
 10135929 10135930 MAGa1150 MAGa1160     TRUE 0.186 80.000 0.000 NA   NA
 10135930 10135931 MAGa1160 MAGa1170     TRUE 0.459 43.000 0.000 NA   NA
 10135933 10135934 MAGa1190 MAGa1200     TRUE 0.964 -22.000 0.000 NA   NA
 10135934 10135935 MAGa1200 MAGa1210     TRUE 0.684 27.000 0.000 NA   NA
 10135935 10135936 MAGa1210 MAGa1220   cdd TRUE 0.994 3.000 0.004 NA   NA
 10135936 10135937 MAGa1220 MAGa1230 cdd era TRUE 0.988 12.000 0.009 1.000   NA
 10135937 10135938 MAGa1230 MAGa1240 era pepP TRUE 0.550 36.000 0.000 1.000   NA
 10135938 10135939 MAGa1240 MAGa1250 pepP proS FALSE 0.067 118.000 0.000 1.000 N NA
 10135939 10135940 MAGa1250 MAGa1260 proS   TRUE 0.312 57.000 0.000 NA   NA
 10135940 10135941 MAGa1260 MAGa1270     FALSE 0.080 112.000 0.000 NA   NA
 10135941 10135942 MAGa1270 MAGa1280     TRUE 0.785 102.000 0.121 NA   NA
 10135942 10135943 MAGa1280 MAGa1290     FALSE 0.018 188.000 0.000 NA   NA
 10135945 10135946 MAGa1310 MAGa1320 potA potB TRUE 0.998 -16.000 0.928 0.042 Y NA
 10135946 10135947 MAGa1320 MAGa1330 potB potC TRUE 0.999 -7.000 0.492 0.042 Y NA
 10135947 10135948 MAGa1330 MAGa1340 potC   TRUE 0.997 -13.000 0.010 NA   NA
 10135948 10135949 MAGa1340 MAGa1350   rpmF FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 10135949 10135950 MAGa1350 MAGa1360 rpmF   TRUE 0.273 64.000 0.000 NA   NA
 10135950 10135951 MAGa1360 MAGa1370   thiI TRUE 0.995 2.000 0.005 NA   NA
 10135952 10135953 MAGa1380 MAGa1390     FALSE 0.022 168.000 0.000 NA   NA
 10135953 10135954 MAGa1390 MAGa1397     FALSE 0.015 255.000 0.000 NA   NA
 10135955 10135956 MAGa1400 MAGa1410   valS FALSE 0.024 156.000 0.000 NA   NA
 10135956 10135957 MAGa1410 MAGa1420 valS folD TRUE 0.994 3.000 0.004 1.000 N NA
 10135957 10135958 MAGa1420 MAGa1430 folD pta TRUE 0.106 100.000 0.000 1.000 N NA
 10135958 10135959 MAGa1430 MAGa1440 pta ackA TRUE 0.998 4.000 0.111 1.000 Y NA
 10135959 10135960 MAGa1440 MAGa1450 ackA coaD TRUE 0.994 8.000 0.015 1.000 N NA
 10135960 10135961 MAGa1450 MAGa1460 coaD engB TRUE 0.994 0.000 0.002 1.000   NA
 10135961 10135962 MAGa1460 MAGa1470 engB   TRUE 0.710 26.000 0.000 NA   NA
 10135962 10135963 MAGa1470 MAGa1480   pyk FALSE 0.032 146.000 0.000 NA   NA
 10135966 10135967 MAGa1510 MAGa1520 gidA   FALSE 0.031 147.000 0.000 NA   NA
 10135967 10135968 MAGa1520 MAGa1530   ldhD FALSE 0.015 243.000 0.000 NA   NA
 10135968 10135969 MAGa1530 MAGa1540 ldhD lip FALSE 0.015 411.000 0.000 1.000   NA
 10135969 10135970 MAGa1540 MAGa1550 lip   FALSE 0.015 278.000 0.000 NA   NA
 10135970 10135971 MAGa1550 MAGa1560     FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 10135971 10135972 MAGa1560 MAGa1570     TRUE 0.965 -13.000 0.000 1.000   NA
 10135972 10135973 MAGa1570 MAGa1580     TRUE 0.315 50.000 0.000 0.009 Y NA
 10135976 10135977 MAGa1610 MAGa1620     FALSE 0.015 245.000 0.000 NA   NA
 10135979 10135980 MAGa1640 MAGa1650     TRUE 0.965 -7.000 0.000 1.000   NA
 10135981 10135982 MAGa1660 MAGa1670 polA dnaE TRUE 0.998 2.000 0.119 0.015 Y NA
 10135984 10135985 MAGa1690 MAGa1700     FALSE 0.016 471.000 0.000 NA   NA
 10135985 10135986 MAGa1700 MAGa1710     TRUE 0.963 -54.000 0.000 NA   NA
 10135986 10135987 MAGa1710 MAGa1720     FALSE 0.020 175.000 0.000 NA   NA
 10135988 10135989 MAGa1730 MAGa1740 gidA   TRUE 0.997 -13.000 0.010 NA   NA
 10135989 10135990 MAGa1740 MAGa1750     FALSE 0.085 110.000 0.000 NA   NA
 10135990 10135991 MAGa1750 MAGa1760     FALSE 0.027 149.000 0.000 NA   NA
 10135993 10135994 MAGa1780 MAGa1790 def   TRUE 0.896 10.000 0.000 NA   NA
 10135994 10135995 MAGa1790 MAGa1800   parE TRUE 0.093 105.000 0.000 NA   NA
 10135995 10135996 MAGa1800 MAGa1810 parE parC TRUE 0.994 16.000 0.552 0.007 Y NA
 10135996 10135997 MAGa1810 MAGa1820 parC   FALSE 0.033 144.000 0.000 1.000   NA
 10135997 10135998 MAGa1820 MAGa1830   rnhB TRUE 0.998 2.000 0.040 1.000   NA
 10135998 10135999 MAGa1830 MAGa1840 rnhB   FALSE 0.039 138.000 0.000 NA   NA
 10135999 10136000 MAGa1840 MAGa1850     FALSE 0.016 211.000 0.000 NA   NA
 10136000 10136001 MAGa1850 MAGa1860     FALSE 0.053 128.000 0.000 NA   NA
 10136002 10136003 MAGa1870 MAGa1880 gidB prs TRUE 0.997 -13.000 0.009 1.000 N NA
 10136003 10136004 MAGa1880 MAGa1890 prs   FALSE 0.015 215.000 0.000 NA   NA
 10136004 10136005 MAGa1890 MAGa1900     FALSE 0.015 382.000 0.000 NA   NA
 10136005 10136006 MAGa1900 MAGa1910     FALSE 0.015 340.000 0.000 NA   NA
 10136006 10136007 MAGa1910 MAGa1920   bsn FALSE 0.023 160.000 0.000 NA   NA
 10136012 10136013 MAGa1970 MAGa1980     TRUE 0.996 12.000 0.222 NA   NA
 10136013 10136014 MAGa1980 MAGa1990   hit TRUE 0.998 2.000 0.032 NA   NA
 10136014 10136015 MAGa1990 MAGa2000 hit   FALSE 0.068 118.000 0.000 NA   NA
 10136018 10136019 MAGa2030 MAGa2040   ftsY TRUE 0.999 -10.000 0.081 1.000   NA
 10136019 10136020 MAGa2040 MAGa2050 ftsY   TRUE 0.251 69.000 0.000 1.000   NA
 10136020 10136021 MAGa2050 MAGa2060   metS TRUE 0.995 -19.000 0.003 0.074   NA
 10136021 10136022 MAGa2060 MAGa2070 metS   TRUE 0.995 4.000 0.011 1.000   NA
 10136022 10136023 MAGa2070 MAGa2080   vacB TRUE 0.965 21.000 0.004 1.000   NA
 10136024 10136025 MAGa2090 MAGa2100   gmk FALSE 0.015 263.000 0.000 NA   NA
 10136025 10136026 MAGa2100 MAGa2110 gmk   TRUE 0.993 6.000 0.008 1.000 N NA
 10136026 10136027 MAGa2110 MAGa2120   pknB TRUE 0.987 24.000 0.130 1.000 Y NA
 10136027 10136028 MAGa2120 MAGa2130 pknB engC TRUE 0.993 11.000 0.024 1.000   NA
 10136028 10136029 MAGa2130 MAGa2140 engC rpe TRUE 0.997 -13.000 0.012 1.000   NA
 10136032 10136033 MAGa2170 MAGa2180     TRUE 0.747 22.000 0.000 NA   NA
 10136033 10136034 MAGa2180 MAGa2190     FALSE 0.015 220.000 0.000 NA   NA
 10136035 10136036 MAGa2200 MAGa2210     TRUE 0.998 2.000 0.103 1.000   NA
 10136036 10136037 MAGa2210 MAGa2220     FALSE 0.016 475.000 0.000 NA   NA
 10136037 10136038 MAGa2220 MAGa2230     TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 10136038 10136039 MAGa2230 MAGa2240     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 10136039 10136040 MAGa2240 MAGa2250     TRUE 0.684 27.000 0.000 NA   NA
 10136040 10136041 MAGa2250 MAGa2260     TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 10136041 10136042 MAGa2260 MAGa2270     TRUE 0.653 29.000 0.000 NA   NA
 10136042 10136043 MAGa2270 MAGa2280     TRUE 0.939 5.000 0.000 NA   NA
 10136043 10136044 MAGa2280 MAGa2290     TRUE 0.939 5.000 0.000 NA   NA
 10136044 10136045 MAGa2290 MAGa2300   pyrG TRUE 0.120 95.000 0.000 NA   NA
 10136045 10136046 MAGa2300 MAGa2310 pyrG ileS FALSE 0.079 244.000 0.002 1.000 N NA
 10136046 10136047 MAGa2310 MAGa2320 ileS lsp TRUE 0.997 2.000 0.019 1.000 N NA
 10136047 10136048 MAGa2320 MAGa2330 lsp   FALSE 0.018 184.000 0.000 NA   NA
 10136048 10136049 MAGa2330 MAGa2340     FALSE 0.018 189.000 0.000 NA   NA
 10136049 10136050 MAGa2340 MAGa2350     TRUE 0.934 6.000 0.000 NA   NA
 10136050 10136051 MAGa2350 MAGa2360     TRUE 0.939 5.000 0.000 NA   NA
 10136051 10136052 MAGa2360 MAGa2370     TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 10136052 10136053 MAGa2370 MAGa2380     TRUE 0.908 9.000 0.000 NA   NA
 10136053 10136054 MAGa2380 MAGa2390   ruvA FALSE 0.015 352.000 0.000 NA   NA
 10136054 10136055 MAGa2390 MAGa2400 ruvA ruvB TRUE 0.999 -19.000 0.549 0.007 Y NA
 10136055 10136056 MAGa2400 MAGa2410 ruvB secD TRUE 0.876 37.000 0.002 1.000   NA
 10136056 10136057 MAGa2410 MAGa2420 secD truB TRUE 0.225 73.000 0.000 1.000   NA
 10136057 10136058 MAGa2420 MAGa2430 truB   TRUE 0.998 -7.000 0.022 1.000   NA
 10136058 10136059 MAGa2430 MAGa2440   ribF TRUE 0.969 32.000 0.037 1.000   NA
 10136059 10136060 MAGa2440 MAGa2450 ribF rpsO TRUE 0.668 92.000 0.013 1.000 N NA
 10136060 10136061 MAGa2450 MAGa2460 rpsO lip FALSE 0.027 149.000 0.000 NA   NA
 10136061 10136062 MAGa2460 MAGa2470 lip gtsA FALSE 0.045 132.000 0.000 NA   NA
 10136062 10136063 MAGa2470 MAGa2480 gtsA gtsB TRUE 0.260 68.000 0.000 NA N NA
 10136063 10136064 MAGa2480 MAGa2490 gtsB gtsC TRUE 0.953 -13.000 0.000 NA Y NA
 10136064 10136065 MAGa2490 MAGa2500 gtsC   FALSE 0.026 150.000 0.000 NA   NA
 10136067 10136068 MAGa2520 MAGa2530   rplI TRUE 0.999 -19.000 0.119 1.000 N NA
 10136068 10136069 MAGa2530 MAGa2540 rplI dnaB TRUE 0.999 -10.000 0.100 1.000 N NA
 10136069 10136070 MAGa2540 MAGa2550 dnaB   TRUE 0.998 0.000 0.024 1.000   NA
 10136070 10136071 MAGa2550 MAGa2560     FALSE 0.080 112.000 0.000 NA   NA
 10136071 10136072 MAGa2560 MAGa2570     FALSE 0.020 173.000 0.000 NA   NA
 10136072 10136073 MAGa2570 MAGa2580     FALSE 0.035 141.000 0.000 NA   NA
 10136073 10136074 MAGa2580 MAGa2590     FALSE 0.020 178.000 0.000 NA   NA
 10136074 10136075 MAGa2590 MAGa2600     FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 10136077 10136078 MAGa2620 MAGa2630   nox FALSE 0.016 207.000 0.000 NA   NA
 10136078 10136079 MAGa2630 MAGa2640 nox   TRUE 0.999 -7.000 0.085 1.000   NA
 10136080 10136081 MAGa2650 MAGa2660 rmuC   FALSE 0.062 122.000 0.000 NA   NA
 10136081 10136082 MAGa2660 MAGa2670     TRUE 0.963 -36.000 0.000 NA   NA
 10136082 10136083 MAGa2670 MAGa2680     TRUE 0.785 20.000 0.000 NA   NA
 10136083 10136084 MAGa2680 MAGa2690     TRUE 0.710 26.000 0.000 NA   NA
 10136085 10136086 MAGa2700 MAGa2710     TRUE 0.999 0.000 0.146 1.000   NA
 10136086 10136087 MAGa2710 MAGa2720   rpsB FALSE 0.017 191.000 0.000 1.000   NA
 10136087 10136088 MAGa2720 MAGa2730 rpsB tsf TRUE 0.938 53.000 0.748 1.000 Y NA
 10136089 10136090 MAGa2740 MAGa2750     TRUE 0.800 19.000 0.000 NA   NA
 10136090 10136091 MAGa2750 MAGa2760   nox FALSE 0.015 347.000 0.000 NA   NA
 10136091 10136092 MAGa2760 MAGa2770 nox   FALSE 0.088 108.000 0.000 NA   NA
 10136092 10136093 MAGa2770 MAGa2780   rpoD TRUE 0.995 6.000 0.016 NA   NA
 10136093 10136094 MAGa2780 MAGa2790 rpoD dnaG TRUE 0.999 -7.000 0.205 1.000 N NA
 10136094 10136095 MAGa2790 MAGa2800 dnaG glyS TRUE 0.934 42.000 0.019 1.000 N NA
 10136095 10136096 MAGa2800 MAGa2810 glyS   FALSE 0.077 114.000 0.000 NA   NA
 10136097 10136098 MAGa2820 MAGa2830 phnD phnC TRUE 0.999 0.000 0.467 1.000   NA
 10136098 10136099 MAGa2830 MAGa2840 phnC phnB TRUE 0.999 -36.000 0.385 1.000 Y NA
 10136100 10136101 MAGa2850 MAGa2860   secA TRUE 0.130 92.000 0.000 NA   NA
 10136104 10136105 MAGa2890 MAGa2900 rpsF ssb TRUE 0.508 38.000 0.000 1.000 N NA
 10136105 10136106 MAGa2900 MAGa2910 ssb rpsR TRUE 0.781 20.000 0.000 1.000 N NA
 10136107 10136108 MAGa2920 MAGa2930   deoB TRUE 0.130 92.000 0.000 NA   NA
 10136108 10136109 MAGa2930 MAGa2940 deoB   FALSE 0.049 130.000 0.000 NA   NA
 10136110 10136111 MAGa2950 MAGa2960 ligA   FALSE 0.016 196.000 0.000 NA   NA
 10136111 10136112 MAGa2960 MAGa2970     TRUE 0.586 32.000 0.000 NA   NA
 10136112 10136113 MAGa2970 MAGa2980     FALSE 0.020 177.000 0.000 NA   NA
 10136113 10136114 MAGa2980 MAGa2990     FALSE 0.017 1240.000 0.000 NA   NA
 10136114 10136115 MAGa2990 MAGa3000     TRUE 0.934 6.000 0.000 NA   NA
 10136115 10136116 MAGa3000 MAGa3010     TRUE 0.837 16.000 0.000 NA   NA
 10136116 10136117 MAGa3010 MAGa3030     TRUE 0.533 37.000 0.000 NA   NA
 10136117 10136118 MAGa3030 MAGa3040     TRUE 0.150 89.000 0.000 NA   NA
 10136118 10136119 MAGa3040 MAGa3050     TRUE 0.359 53.000 0.000 NA   NA
 10136119 10136120 MAGa3050 MAGa3060     TRUE 0.120 95.000 0.000 NA   NA
 10136120 10136121 MAGa3060 MAGa3070     TRUE 0.395 50.000 0.000 NA   NA
 10136121 10136122 MAGa3070 MAGa3080     FALSE 0.027 149.000 0.000 NA   NA
 10136122 10136123 MAGa3080 MAGa3090     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 10136123 10136124 MAGa3090 MAGa3100     TRUE 0.939 5.000 0.000 NA   NA
 10136124 10136125 MAGa3100 MAGa3110     TRUE 0.963 -36.000 0.000 NA   NA
 10136125 10136126 MAGa3110 MAGa3120     FALSE 0.031 147.000 0.000 NA   NA
 10136126 10136127 MAGa3120 MAGa3130     TRUE 0.965 -13.000 0.000 NA   NA
 10136127 10136128 MAGa3130 MAGa3140     TRUE 0.934 6.000 0.000 NA   NA
 10136128 10136129 MAGa3140 MAGa3150     FALSE 0.015 375.000 0.000 NA   NA
 10136129 10136130 MAGa3150 MAGa3160     FALSE 0.014 318.000 0.000 NA   NA
 10136131 10136132 MAGa3170 MAGa3180     FALSE 0.021 171.000 0.000 NA   NA
 10136132 10136133 MAGa3180 MAGa3190     TRUE 0.137 91.000 0.000 NA   NA
 10136133 10136134 MAGa3190 MAGa3200     FALSE 0.017 191.000 0.000 1.000 N NA
 10136134 10136135 MAGa3200 MAGa3210     TRUE 0.965 -13.000 0.000 1.000   NA
 10136136 10136137 MAGa3220 MAGa3230     FALSE 0.015 242.000 0.000 NA   NA
 10136137 10136138 MAGa3230 MAGa3240     FALSE 0.016 208.000 0.000 NA   NA
 10136138 10136139 MAGa3240 MAGa3250     TRUE 0.626 30.000 0.000 NA   NA
 10136139 10136140 MAGa3250 MAGa3260     TRUE 0.330 54.000 0.000 NA   NA
 10136140 10136141 MAGa3260 MAGa3270     TRUE 0.999 -13.000 0.500 NA   NA
 10136141 10136142 MAGa3270 MAGa3280     TRUE 0.999 0.000 0.500 NA   NA
 10136142 10136143 MAGa3280 MAGa3290     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 10136143 10136144 MAGa3290 MAGa3300     TRUE 0.999 -10.000 0.375 NA   NA
 10136144 10136145 MAGa3300 MAGa3310   atpA TRUE 0.998 4.000 0.429 NA   NA
 10136145 10136146 MAGa3310 MAGa3320 atpA atpD TRUE 0.998 0.000 1.000 0.016 Y NA
 10136146 10136147 MAGa3320 MAGa3330 atpD   TRUE 0.747 22.000 0.000 NA   NA
 10136147 10136148 MAGa3330 MAGa3340     TRUE 0.880 12.000 0.000 NA   NA
 10136149 10136150 MAGa3350 MAGa3360     TRUE 0.244 70.000 0.000 NA   NA
 10136150 10136151 MAGa3360 MAGa3370     TRUE 0.479 41.000 0.000 NA   NA
 10136151 10136152 MAGa3370 MAGa3380   pcrA TRUE 0.979 16.000 0.005 NA   NA
 10136152 10136153 MAGa3380 MAGa3390 pcrA   TRUE 0.973 26.000 0.015 NA   NA
 10136153 10136154 MAGa3390 MAGa3400     TRUE 0.999 2.000 0.500 NA   NA
 10136154 10136155 MAGa3400 MAGa3410   asnS TRUE 0.989 10.000 0.007 NA   NA
 10136158 10136159 MAGa3440 MAGa3450     TRUE 0.999 3.000 0.600 NA   NA
 10136160 10136161 MAGa3460 MAGa3470   efp TRUE 0.994 0.000 0.002 NA   NA
 10136162 10136163 MAGa3480 MAGa3490     TRUE 0.330 54.000 0.000 NA   NA
 10136164 10136165 MAGa3500 MAGa3510     TRUE 0.999 -7.000 0.800 0.009 Y NA
 10136165 10136166 MAGa3510 MAGa3520     FALSE 0.065 120.000 0.000 NA   NA
 10136166 10136167 MAGa3520 MAGa3530   msrA TRUE 0.494 40.000 0.000 NA   NA
 10136167 10136168 MAGa3530 MAGa3540 msrA   TRUE 0.157 88.000 0.000 NA   NA
 10136168 10136169 MAGa3540 MAGa3550   mutM TRUE 0.995 -16.000 0.003 NA   NA
 10136169 10136170 MAGa3550 MAGa3560 mutM pgiB TRUE 0.949 3.000 0.000 1.000 N NA
 10136170 10136171 MAGa3560 MAGa3570 pgiB pgiB TRUE 0.940 2.000 0.000 0.003 Y NA
 10136171 10136172 MAGa3570 MAGa3580 pgiB rpsA TRUE 0.962 0.000 0.000 1.000   NA
 10136172 10136173 MAGa3580 MAGa3590 rpsA eno FALSE 0.027 149.000 0.000 1.000   NA
 10136174 10136175 MAGa3600 MAGa3610 tufA   FALSE 0.016 195.000 0.000 1.000   NA
 10136175 10136176 MAGa3610 MAGa3620     TRUE 0.999 0.000 0.217 1.000   NA
 10136176 10136177 MAGa3620 MAGa3630   gcp TRUE 0.996 2.000 0.012 0.003 Y NA
 10136177 10136178 MAGa3630 MAGa3640 gcp   TRUE 0.729 24.000 0.000 NA   NA
 10136179 10136180 MAGa3650 MAGa3660 ptsG   TRUE 0.286 62.000 0.000 NA   NA
 10136182 10136183 MAGa3680 MAGa3690     FALSE 0.015 426.000 0.000 NA   NA
 10136185 10136186 MAGa3710 MAGa3720     FALSE 0.073 115.000 0.000 NA   NA
 10136186 10136187 MAGa3720 MAGa3730     TRUE 0.684 27.000 0.000 NA   NA
 10136187 10136188 MAGa3730 MAGa3740     TRUE 0.110 98.000 0.000 NA   NA
 10136189 10136190 MAGa3750 MAGa3760     FALSE 0.014 328.000 0.000 NA   NA
 10136190 10136191 MAGa3760 MAGa3770     TRUE 0.964 -22.000 0.000 NA   NA
 10136193 10136194 MAGa3790 MAGa3800   thrS TRUE 0.993 8.000 0.014 0.063 Y NA
 10136194 10136195 MAGa3800 MAGa3810 thrS   TRUE 0.965 -7.000 0.000 NA   NA
 10136196 10136197 MAGa3820 MAGa3830   p30 FALSE 0.015 466.000 0.000 NA   NA
 10136197 10136198 MAGa3830 MAGa3840 p30   FALSE 0.015 337.000 0.000 NA   NA
 10136199 10136200 MAGa3850 MAGa3860   atpB TRUE 0.995 1.000 0.005 NA   NA
 10136200 10136201 MAGa3860 MAGa3870 atpB   TRUE 0.996 10.000 0.085 0.015   NA
 10136201 10136202 MAGa3870 MAGa3880   atpF TRUE 0.998 4.000 0.500 0.015   NA
 10136202 10136203 MAGa3880 MAGa3890 atpF atpH TRUE 0.997 3.000 0.022 0.015 Y NA
 10136203 10136204 MAGa3890 MAGa3900 atpH atpA TRUE 0.998 -7.000 0.864 0.015 Y NA
 10136204 10136205 MAGa3900 MAGa3910 atpA atpG TRUE 0.998 -7.000 0.846 0.015 Y NA
 10136205 10136206 MAGa3910 MAGa3920 atpG atpD TRUE 0.930 54.000 0.724 0.015 Y NA
 10136206 10136207 MAGa3920 MAGa3930 atpD atpC TRUE 0.991 16.000 0.837 0.015 Y NA
 10136207 10136208 MAGa3930 MAGa3940 atpC   FALSE 0.057 126.000 0.000 NA   NA
 10136208 10136209 MAGa3940 MAGa3950   dcm FALSE 0.015 384.000 0.000 NA   NA
 10136209 10136210 MAGa3950 MAGa3960 dcm   FALSE 0.015 436.000 0.000 0.093   NA
 10136210 10136211 MAGa3960 MAGa3970     TRUE 0.093 105.000 0.000 NA   NA
 10136211 10136212 MAGa3970 MAGa3980     FALSE 0.015 386.000 0.000 NA   NA
 10136212 10136213 MAGa3980 MAGa3990     FALSE 0.016 560.000 0.000 NA   NA
 10136214 10136215 MAGa4000 MAGa4010     FALSE 0.022 170.000 0.000 NA   NA
 10136215 10136216 MAGa4010 MAGa4020     TRUE 0.735 23.000 0.000 NA   NA
 10136216 10136217 MAGa4020 MAGa4030     FALSE 0.016 616.000 0.000 NA   NA
 10136217 10136218 MAGa4030 MAGa4040     FALSE 0.014 312.000 0.000 1.000   NA
 10136218 10136219 MAGa4040 MAGa4050     FALSE 0.015 238.000 0.000 NA   NA
 10136221 10136222 MAGa4070 MAGa4080     FALSE 0.018 190.000 0.000 NA   NA
 10136222 10136223 MAGa4080 MAGa4090   lon TRUE 0.103 102.000 0.000 1.000   NA
 10136223 10136224 MAGa4090 MAGa4100 lon leuS FALSE 0.085 209.000 0.002 1.000 N NA
 10136224 10136225 MAGa4100 MAGa4110 leuS   TRUE 0.956 22.000 0.003 NA   NA
 10136225 10136226 MAGa4110 MAGa4120   upp TRUE 0.996 -31.000 0.006 NA   NA
 10136226 10136227 MAGa4120 MAGa4130 upp ssb FALSE 0.059 123.000 0.000 1.000 N NA
 10136227 10136228 MAGa4130 MAGa4140 ssb pepO TRUE 0.894 10.000 0.000 1.000 N NA
 10136228 10136229 MAGa4140 MAGa4150 pepO   TRUE 0.896 10.000 0.000 NA   NA
 10136230 10136231 MAGa4160 MAGa4170     TRUE 0.200 77.000 0.000 1.000   NA
 10136232 10136233 MAGa4180 MAGa4190 ftsZ   TRUE 0.533 37.000 0.000 NA   NA
 10136233 10136234 MAGa4190 MAGa4200   mraW TRUE 0.569 33.000 0.000 NA   NA
 10136234 10136235 MAGa4200 MAGa4210 mraW mraZ TRUE 0.999 2.000 0.635 NA   NA
 10136235 10136236 MAGa4210 MAGa4220 mraZ ktrA FALSE 0.019 182.000 0.000 NA   NA
 10136237 10136238 MAGa4230 MAGa4240 ktrB   TRUE 0.871 13.000 0.000 NA   NA
 10136240 10136241 MAGa4260 MAGa4270   uvrB TRUE 0.412 49.000 0.000 NA   NA
 10136241 10136242 MAGa4270 MAGa4280 uvrB uvrA TRUE 0.998 2.000 0.154 0.004 Y NA
 10136242 10136243 MAGa4280 MAGa4290 uvrA   TRUE 0.837 16.000 0.000 NA   NA
 10136243 10136244 MAGa4290 MAGa4300     TRUE 0.963 -28.000 0.000 NA   NA
 10136244 10136245 MAGa4300 MAGa4310     TRUE 0.444 45.000 0.000 NA   NA
 10136245 10136246 MAGa4310 MAGa4320     TRUE 0.871 13.000 0.000 NA   NA
 10136246 10136247 MAGa4320 MAGa4330     TRUE 0.104 102.000 0.000 NA   NA
 10136248 10136249 MAGa4340 MAGa4350 hpt greA TRUE 0.998 -10.000 0.032 1.000 N NA
 10136249 10136250 MAGa4350 MAGa4360 greA   TRUE 0.228 285.000 0.031 1.000   NA
 10136250 10136251 MAGa4360 MAGa4370     FALSE 0.020 174.000 0.000 NA   NA
 10136251 10136252 MAGa4370 MAGa4380     FALSE 0.014 300.000 0.000 NA   NA
 10136252 10136253 MAGa4380 MAGa4390     TRUE 0.996 -10.000 0.004 NA   NA
 10136253 10136254 MAGa4390 MAGa4400   alaS TRUE 0.998 -7.000 0.032 1.000 N NA
 10136254 10136255 MAGa4400 MAGa4410 alaS trmU TRUE 0.983 13.000 0.007 0.061 Y NA
 10136256 10136257 MAGa4420 MAGa4430 deoD   FALSE 0.020 178.000 0.000 NA   NA
 10136261 10136262 MAGa4470 MAGa4480     TRUE 0.962 -75.000 0.000 NA   NA
 10136262 10136263 MAGa4480 MAGa4490     TRUE 0.964 -21.000 0.000 NA   NA
 10136264 10136265 MAGa4500 MAGa4510   adhT FALSE 0.014 317.000 0.000 NA   NA
 10136265 10136266 MAGa4510 MAGa4520 adhT   FALSE 0.015 442.000 0.000 NA   NA
 10136266 10136267 MAGa4520 MAGa4530     FALSE 0.015 340.000 0.000 NA   NA
 10136267 10136268 MAGa4530 MAGa4540     FALSE 0.016 494.000 0.000 NA   NA
 10136268 10136269 MAGa4540 MAGa4550     FALSE 0.015 402.000 0.000 NA   NA
 10136269 10136270 MAGa4550 MAGa4560   adhT FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 10136274 10136275 MAGa4600 MAGa4610   rnc TRUE 0.804 67.000 0.009 1.000 N NA
 10136275 10136276 MAGa4610 MAGa4620 rnc plsX TRUE 0.998 -7.000 0.020 1.000 N NA
 10136276 10136277 MAGa4620 MAGa4630 plsX   TRUE 0.996 7.000 0.021 1.000   NA
 10136277 10136278 MAGa4630 MAGa4640     TRUE 0.965 -7.000 0.000 NA   NA
 10136279 10136280 MAGa4650 MAGa4660     FALSE 0.072 115.000 0.000 1.000   NA
 10136280 10136281 MAGa4660 MAGa4670     TRUE 0.995 15.000 0.583 0.009   NA
 10136281 10136282 MAGa4670 MAGa4680     FALSE 0.036 140.000 0.000 1.000   NA
 10136282 10136283 MAGa4680 MAGa4690   glpK FALSE 0.014 274.000 0.000 1.000   NA
 10136283 10136284 MAGa4690 MAGa4700 glpK glpF TRUE 0.997 8.000 0.125 1.000 N NA
 10136285 10136286 MAGa4710 MAGa4720 aspS hisS TRUE 0.877 77.000 0.161 0.060 Y NA
 10136287 10136288 MAGa4730 MAGa4740     TRUE 0.430 46.000 0.000 NA N NA
 10136288 10136289 MAGa4740 MAGa4750     TRUE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 10136289 10136290 MAGa4750 MAGa4760     FALSE 0.018 187.000 0.000 NA   NA
 10136290 10136291 MAGa4760 MAGa4765   rnpB TRUE 0.747 22.000 0.000 NA   NA
 10136291 10136292 MAGa4765 MAGa4770 rnpB rplM FALSE 0.018 190.000 0.000 NA   NA
 10136292 10136293 MAGa4770 MAGa4780 rplM rpsI TRUE 0.998 2.000 0.601 0.051 Y NA
 10136293 10136294 MAGa4780 MAGa4790 rpsI   TRUE 0.277 63.000 0.000 NA   NA
 10136294 10136295 MAGa4790 MAGa4800     TRUE 0.964 -26.000 0.000 NA   NA
 10136295 10136296 MAGa4800 MAGa4810   gtaB TRUE 0.965 -16.000 0.000 NA   NA
 10136296 10136297 MAGa4810 MAGa4820 gtaB   FALSE 0.015 462.000 0.000 1.000   NA
 10136297 10136298 MAGa4820 MAGa4830     FALSE 0.015 230.000 0.000 NA   NA
 10136298 10136299 MAGa4830 MAGa4840     TRUE 0.093 105.000 0.000 NA   NA
 10136299 10136300 MAGa4840 MAGa4850     FALSE 0.016 199.000 0.000 NA   NA
 10136300 10136301 MAGa4850 MAGa4860     FALSE 0.017 1240.000 0.000 NA   NA
 10136301 10136302 MAGa4860 MAGa4870     TRUE 0.934 6.000 0.000 NA   NA
 10136302 10136303 MAGa4870 MAGa4880     TRUE 0.837 16.000 0.000 NA   NA
 10136303 10136304 MAGa4880 MAGa4890     TRUE 0.533 37.000 0.000 NA   NA
 10136304 10136305 MAGa4890 MAGa4900     TRUE 0.150 89.000 0.000 NA   NA
 10136305 10136306 MAGa4900 MAGa4910     TRUE 0.359 53.000 0.000 NA   NA
 10136306 10136307 MAGa4910 MAGa4920     TRUE 0.120 95.000 0.000 NA   NA
 10136307 10136308 MAGa4920 MAGa4930     TRUE 0.395 50.000 0.000 NA   NA
 10136308 10136309 MAGa4930 MAGa4940     FALSE 0.027 149.000 0.000 NA   NA
 10136309 10136310 MAGa4940 MAGa4950     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 10136310 10136311 MAGa4950 MAGa4960     TRUE 0.939 5.000 0.000 NA   NA
 10136311 10136312 MAGa4960 MAGa4965     FALSE 0.014 333.000 0.000 NA   NA
 10136312 10136313 MAGa4965 MAGa4980     TRUE 0.965 -13.000 0.000 NA   NA
 10136313 10136314 MAGa4980 MAGa4990     TRUE 0.934 6.000 0.000 NA   NA
 10136314 10136315 MAGa4990 MAGa5000     FALSE 0.015 375.000 0.000 NA   NA
 10136315 10136316 MAGa5000 MAGa5010     FALSE 0.014 318.000 0.000 NA   NA
 10136317 10136318 MAGa5020 MAGa5030     FALSE 0.021 171.000 0.000 NA   NA
 10136318 10136319 MAGa5030 MAGa5040     TRUE 0.137 91.000 0.000 NA   NA
 10136319 10136320 MAGa5040 MAGa5050     FALSE 0.017 191.000 0.000 1.000 N NA
 10136321 10136322 MAGa5060 MAGa5070     FALSE 0.014 325.000 0.000 NA   NA
 10136322 10136323 MAGa5070 MAGa5080     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 10136323 10136324 MAGa5080 MAGa5090     TRUE 0.213 76.000 0.000 NA   NA
 10136324 10136325 MAGa5090 MAGa5100     TRUE 0.966 -10.000 0.000 NA   NA
 10136325 10136326 MAGa5100 MAGa5110     TRUE 0.965 -13.000 0.000 NA   NA
 10136328 10136329 MAGa5130 MAGa5140   nusB TRUE 0.988 20.000 0.041 NA   NA
 10136331 10136332 MAGa5160 MAGa5170 ptsH oppB TRUE 0.679 27.000 0.000 1.000 N NA
 10136332 10136333 MAGa5170 MAGa5180 oppB   TRUE 0.959 1.000 0.000 0.031   NA
 10136333 10136334 MAGa5180 MAGa5190     TRUE 0.944 4.000 0.000 NA   NA
 10136334 10136335 MAGa5190 MAGa5200     TRUE 0.603 31.000 0.000 NA   NA
 10136337 10136338 MAGa5220 MAGa5230 infC   TRUE 0.999 -19.000 0.652 1.000 Y NA
 10136338 10136339 MAGa5230 MAGa5240   rplT TRUE 0.976 27.000 0.928 0.049 Y NA
 10136340 10136341 MAGa5250 MAGa5260     FALSE 0.015 227.000 0.000 NA   NA
 10136341 10136342 MAGa5260 MAGa5270   licA TRUE 0.359 53.000 0.000 NA   NA
 10136343 10136344 MAGa5280 MAGa5290 lepA   TRUE 0.124 87.000 0.000 NA Y NA
 10136344 10136345 MAGa5290 MAGa5300     TRUE 0.156 88.000 0.000 NA N NA
 10136345 10136346 MAGa5300 MAGa5310   lip TRUE 0.177 83.000 0.000 NA   NA
 10136346 10136347 MAGa5310 MAGa5320 lip   FALSE 0.057 126.000 0.000 NA   NA
 10136350 10136351 MAGa5350 MAGa5360 argS   FALSE 0.084 110.000 0.000 1.000   NA
 10136351 10136352 MAGa5360 MAGa5370   ldh FALSE 0.019 183.000 0.000 1.000   NA
 10136352 10136353 MAGa5370 MAGa5380 ldh   FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 10136354 10136355 MAGa5390 MAGa5400 pta ackA TRUE 0.755 18.000 0.000 1.000 Y NA
 10136355 10136356 MAGa5400 MAGa5410 ackA   TRUE 0.895 10.000 0.000 1.000   NA
 10136356 10136357 MAGa5410 MAGa5420     TRUE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 10136357 10136358 MAGa5420 MAGa5430   uhpT FALSE 0.015 267.000 0.000 NA   NA
 10136358 10136359 MAGa5430 MAGa5440 uhpT   FALSE 0.036 140.000 0.000 NA   NA
 10136359 10136360 MAGa5440 MAGa5450   nfo TRUE 0.956 2.000 0.000 1.000   NA
 10136360 10136361 MAGa5450 MAGa5460 nfo   TRUE 0.586 32.000 0.000 NA   NA
 10136361 10136362 MAGa5460 MAGa5470   trxA TRUE 0.837 16.000 0.000 NA   NA
 10136362 10136363 MAGa5470 MAGa5480 trxA uvrC TRUE 0.934 6.000 0.000 NA   NA
 10136365 10136366 MAGa5500 MAGa5510     TRUE 0.238 71.000 0.000 NA   NA
 10136366 10136367 MAGa5510 MAGa5520     TRUE 0.997 9.000 0.200 1.000 N NA
 10136367 10136368 MAGa5520 MAGa5530     TRUE 0.999 -16.000 0.611 0.030 N NA
 10136368 10136369 MAGa5530 MAGa5540     TRUE 0.999 -61.000 0.204 0.030 Y NA
 10136369 10136370 MAGa5540 MAGa5550     TRUE 0.837 16.000 0.000 NA   NA
 10136370 10136371 MAGa5550 MAGa5560     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 10136372 10136373 MAGa5570 MAGa5580     FALSE 0.079 112.000 0.000 1.000   NA
 10136374 10136375 MAGa5590 MAGa5600 deoD deoA TRUE 0.981 21.000 0.022 1.000 Y NA
 10136375 10136376 MAGa5600 MAGa5610 deoA deoC TRUE 0.990 19.000 0.106 1.000 Y NA
 10136379 10136380 MAGa5640 MAGa5650     FALSE 0.030 147.000 0.000 1.000 N NA
 10136380 10136381 MAGa5650 MAGa5660     TRUE 0.998 -10.000 0.095 1.000 Y NA
 10136381 10136382 MAGa5660 MAGa5670     TRUE 0.999 -9.000 0.713 0.025 Y NA
 10136382 10136383 MAGa5670 MAGa5680   rplQ TRUE 0.356 170.000 0.074 1.000 N NA
 10136383 10136384 MAGa5680 MAGa5690 rplQ rpoA TRUE 0.998 0.000 0.873 1.000 N NA
 10136384 10136385 MAGa5690 MAGa5700 rpoA rpsK TRUE 0.993 19.000 0.308 1.000 N NA
 10136385 10136386 MAGa5700 MAGa5710 rpsK rpsM TRUE 0.987 21.000 0.810 0.048 Y NA
 10136386 10136387 MAGa5710 MAGa5720 rpsM infA TRUE 0.478 135.000 0.075 0.041 Y NA
 10136387 10136388 MAGa5720 MAGa5730 infA map TRUE 0.996 8.000 0.051 1.000 Y NA
 10136388 10136389 MAGa5730 MAGa5740 map adk TRUE 0.951 42.000 0.041 1.000 N NA
 10136389 10136390 MAGa5740 MAGa5750 adk secY TRUE 0.966 30.000 0.019 1.000 N NA
 10136390 10136391 MAGa5750 MAGa5760 secY   FALSE 0.015 351.000 0.000 NA   NA
 10136391 10136392 MAGa5760 MAGa5770     FALSE 0.016 731.000 0.000 NA   NA
 10136392 10136393 MAGa5770 MAGa5780     FALSE 0.014 287.000 0.000 NA   NA
 10136393 10136394 MAGa5780 MAGa5790     FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 10136395 10136396 MAGa5800 MAGa5810   vpmaA FALSE 0.016 560.000 0.000 NA   NA
 10136397 10136398 MAGa5820 MAGa5830 vpmaB vpmaC FALSE 0.049 130.000 0.000 NA   NA
 10136398 10136399 MAGa5830 MAGa5840 vpmaC vpmaD1 FALSE 0.029 148.000 0.000 NA   NA
 10136399 10136400 MAGa5840 MAGa5850 vpmaD1 vpmaE FALSE 0.031 147.000 0.000 NA   NA
 10136400 10136401 MAGa5850 MAGa5860 vpmaE vpmaF1 FALSE 0.049 130.000 0.000 NA   NA
 10136401 10136402 MAGa5860 MAGa5870 vpmaF1 vpmaD2 FALSE 0.027 149.000 0.000 NA   NA
 10136403 10136404 MAGa5880 MAGa5890 xer1   FALSE 0.014 371.000 0.000 0.024   NA
 10136404 10136405 MAGa5890 MAGa5900     FALSE 0.014 281.000 0.000 1.000   NA
 10136406 10136407 MAGa5910 MAGa5920   rplO FALSE 0.052 128.000 0.000 1.000   NA
 10136407 10136408 MAGa5920 MAGa5930 rplO rpsE TRUE 0.989 21.000 0.148 0.066 Y NA
 10136408 10136409 MAGa5930 MAGa5940 rpsE rplR TRUE 0.998 3.000 0.814 0.066 Y NA
 10136409 10136410 MAGa5940 MAGa5950 rplR rplF TRUE 0.984 25.000 0.815 0.047 Y NA
 10136410 10136411 MAGa5950 MAGa5960 rplF rpsH TRUE 0.995 10.000 0.808 0.047 Y NA
 10136411 10136412 MAGa5960 MAGa5970 rpsH rpsN TRUE 0.999 2.000 0.473 0.047 Y NA
 10136412 10136413 MAGa5970 MAGa5980 rpsN rplE TRUE 0.998 3.000 0.496 0.047 Y NA
 10136413 10136414 MAGa5980 MAGa5990 rplE   TRUE 0.998 3.000 0.758 0.047 Y NA
 10136414 10136415 MAGa5990 MAGa6000   rplN TRUE 0.994 13.000 0.810 0.066 Y NA
 10136415 10136416 MAGa6000 MAGa6010 rplN rpsQ TRUE 0.998 4.000 0.791 0.066 Y NA
 10136416 10136417 MAGa6010 MAGa6020 rpsQ rpmC TRUE 0.998 0.000 0.828 0.047 Y NA
 10136417 10136418 MAGa6020 MAGa6030 rpmC rplP TRUE 0.998 0.000 0.802 0.047 Y NA
 10136418 10136419 MAGa6030 MAGa6040 rplP rpsC TRUE 0.998 0.000 0.828 0.066 Y NA
 10136419 10136420 MAGa6040 MAGa6050 rpsC rplV TRUE 0.998 3.000 0.719 0.066 Y NA
 10136420 10136421 MAGa6050 MAGa6060 rplV rpsS TRUE 0.998 3.000 0.769 0.066 Y NA
 10136421 10136422 MAGa6060 MAGa6070 rpsS rplB TRUE 0.998 0.000 0.820 0.066 Y NA
 10136422 10136423 MAGa6070 MAGa6080 rplB rplW TRUE 0.865 72.000 0.849 1.000 Y NA
 10136423 10136424 MAGa6080 MAGa6090 rplW rplD TRUE 0.997 0.000 0.013 1.000 Y NA
 10136424 10136425 MAGa6090 MAGa6100 rplD rplC TRUE 0.970 21.000 0.010 0.047 Y NA
 10136425 10136426 MAGa6100 MAGa6110 rplC rpsJ TRUE 0.934 57.000 0.467 0.066 Y NA
 10136429 10136430 MAGa6140 MAGa6150 recA   TRUE 0.666 86.000 0.006 NA   NA
 10136433 10136434 MAGa6180 MAGa6190 rpmA rplU TRUE 0.997 7.000 0.667 0.047 Y NA
 10136434 10136435 MAGa6190 MAGa6200 rplU   FALSE 0.018 186.000 0.000 NA   NA
 10136435 10136436 MAGa6200 MAGa6210   mscL TRUE 0.113 97.000 0.000 NA   NA
 10136436 10136437 MAGa6210 MAGa6220 mscL grpE FALSE 0.016 204.000 0.000 1.000 N NA
 10136437 10136438 MAGa6220 MAGa6230 grpE hrcA TRUE 0.999 -16.000 0.286 1.000 N NA
 10136438 10136439 MAGa6230 MAGa6240 hrcA rpmE FALSE 0.021 170.000 0.000 1.000 N NA
 10136439 10136440 MAGa6240 MAGa6250 rpmE rpsD TRUE 0.946 22.000 0.003 0.066 Y NA
 10136440 10136441 MAGa6250 MAGa6260 rpsD   FALSE 0.015 284.000 0.000 NA   NA
 10136441 10136442 MAGa6260 MAGa6270   gyrA TRUE 0.964 18.000 0.002 NA   NA
 10136442 10136443 MAGa6270 MAGa6280 gyrA hsdS FALSE 0.016 801.000 0.000 1.000 N NA
 10136443 10136444 MAGa6280 MAGa6290 hsdS hsdM TRUE 0.994 4.000 0.011 0.082 Y NA
 10136445 10136446 MAGa6300 MAGa6310   hsdS FALSE 0.016 471.000 0.000 NA   NA
 10136446 10136447 MAGa6310 MAGa6320 hsdS   TRUE 0.833 16.000 0.000 0.081 N NA
 10136448 10136449 MAGa6330 MAGa6340     TRUE 0.889 8.000 0.000 0.081 Y NA
 10136449 10136450 MAGa6340 MAGa6350   hsdM TRUE 0.994 5.000 0.011 0.081 Y NA
 10136451 10136452 MAGa6360 MAGa6370     FALSE 0.015 334.000 0.000 NA   NA
 10136453 10136454 MAGa6380 MAGa6390     TRUE 0.907 9.000 0.000 1.000   NA
 10136454 10136455 MAGa6390 MAGa6400     TRUE 0.995 9.000 1.000 0.007   NA
 10136456 10136457 MAGa6410 MAGa6420 gltX   TRUE 0.965 -9.000 0.000 NA   NA
 10136458 10136459 MAGa6430 MAGa6440 metK   FALSE 0.016 211.000 0.000 NA   NA
 10136459 10136460 MAGa6440 MAGa6450   ffh TRUE 0.800 19.000 0.000 NA   NA
 10136460 10136461 MAGa6450 MAGa6460 ffh   TRUE 0.707 26.000 0.000 1.000   NA
 10136461 10136462 MAGa6460 MAGa6470     TRUE 0.227 73.000 0.000 NA   NA
 10136462 10136463 MAGa6470 MAGa6480     FALSE 0.022 166.000 0.000 NA   NA
 10136466 10136467 MAGa6510 MAGa6520     TRUE 0.999 -54.000 0.667 NA   NA
 10136467 10136468 MAGa6520 MAGa6530     TRUE 0.963 0.000 0.000 NA   NA
 10136471 10136472 MAGa6560 MAGa6570   fusA FALSE 0.023 160.000 0.000 1.000 N NA
 10136472 10136473 MAGa6570 MAGa6580 fusA rpsG TRUE 0.981 30.000 0.579 1.000 Y NA
 10136473 10136474 MAGa6580 MAGa6590 rpsG rpsL TRUE 0.979 31.000 0.224 0.011 Y NA
 10136475 10136476 MAGa6600 MAGa6610     TRUE 0.502 39.000 0.000 1.000   NA
 10136476 10136477 MAGa6610 MAGa6620     FALSE 0.014 316.000 0.000 1.000   NA
 10136477 10136478 MAGa6620 MAGa6630     FALSE 0.041 135.000 0.000 NA   NA
 10136478 10136479 MAGa6630 MAGa6640     TRUE 0.626 30.000 0.000 NA   NA
 10136480 10136481 MAGa6650 MAGa6660     TRUE 0.992 12.000 1.000 0.008 Y NA
 10136481 10136482 MAGa6660 MAGa6670     FALSE 0.015 223.000 0.000 NA   NA
 10136482 10136483 MAGa6670 MAGa6680     FALSE 0.015 389.000 0.000 NA   NA
 10136483 10136484 MAGa6680 MAGa6690     TRUE 0.966 -10.000 0.000 NA   NA
 10136484 10136485 MAGa6690 MAGa6700     FALSE 0.015 268.000 0.000 NA   NA
 10136485 10136486 MAGa6700 MAGa6710     FALSE 0.024 155.000 0.000 NA   NA
 10136486 10136487 MAGa6710 MAGa6720     TRUE 0.213 76.000 0.000 NA   NA
 10136487 10136488 MAGa6720 MAGa6730     FALSE 0.034 142.000 0.000 NA   NA
 10136488 10136489 MAGa6730 MAGa6740     FALSE 0.036 140.000 0.000 NA   NA
 10136489 10136490 MAGa6740 MAGa6750     FALSE 0.073 115.000 0.000 NA   NA
 10136490 10136491 MAGa6750 MAGa6760     FALSE 0.016 203.000 0.000 NA   NA
 10136491 10136492 MAGa6760 MAGa6770     FALSE 0.014 327.000 0.000 NA   NA
 10136492 10136493 MAGa6770 MAGa6780     TRUE 0.361 195.000 0.667 NA   NA
 10136493 10136494 MAGa6780 MAGa6790     FALSE 0.014 319.000 0.000 NA   NA
 10136494 10136495 MAGa6790 MAGa6800     FALSE 0.015 246.000 0.000 NA   NA
 10136495 10136496 MAGa6800 MAGa6810     TRUE 0.974 29.000 0.026 NA   NA
 10136496 10136497 MAGa6810 MAGa6820     TRUE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 10136497 10136498 MAGa6820 MAGa6830     FALSE 0.015 393.000 0.000 NA   NA
 10136498 10136499 MAGa6830 MAGa6840   rpoC FALSE 0.025 151.000 0.000 1.000   NA
 10136499 10136500 MAGa6840 MAGa6850 rpoC rpoB TRUE 0.999 -7.000 0.851 0.003   NA
 10136501 10136502 MAGa6860 MAGa6870     FALSE 0.016 666.000 0.000 NA   NA
 10136504 10136505 MAGa6890 MAGa6900     TRUE 0.965 -13.000 0.000 1.000   NA
 10136505 10136506 MAGa6900 MAGa6910     FALSE 0.017 191.000 0.000 1.000 N NA
 10136506 10136507 MAGa6910 MAGa6920     TRUE 0.137 91.000 0.000 NA   NA
 10136507 10136508 MAGa6920 MAGa6930     FALSE 0.021 171.000 0.000 NA   NA
 10136509 10136510 MAGa6940 MAGa6950     FALSE 0.014 318.000 0.000 NA   NA
 10136510 10136511 MAGa6950 MAGa6960     FALSE 0.015 375.000 0.000 NA   NA
 10136511 10136512 MAGa6960 MAGa6970     TRUE 0.934 6.000 0.000 NA   NA
 10136512 10136513 MAGa6970 MAGa6980     TRUE 0.965 -13.000 0.000 NA   NA
 10136513 10136514 MAGa6980 MAGa6990     FALSE 0.031 147.000 0.000 NA   NA
 10136514 10136515 MAGa6990 MAGa7000     TRUE 0.939 5.000 0.000 NA   NA
 10136515 10136516 MAGa7000 MAGa7010     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 10136516 10136517 MAGa7010 MAGa7020     FALSE 0.027 149.000 0.000 NA   NA
 10136517 10136518 MAGa7020 MAGa7030     TRUE 0.395 50.000 0.000 NA   NA
 10136518 10136519 MAGa7030 MAGa7040     TRUE 0.120 95.000 0.000 NA   NA
 10136519 10136520 MAGa7040 MAGa7050     TRUE 0.359 53.000 0.000 NA   NA
 10136520 10136521 MAGa7050 MAGa7060     TRUE 0.150 89.000 0.000 NA   NA
 10136521 10136522 MAGa7060 MAGa7070     TRUE 0.533 37.000 0.000 NA   NA
 10136522 10136523 MAGa7070 MAGa7080     TRUE 0.837 16.000 0.000 NA   NA
 10136523 10136524 MAGa7080 MAGa7090     TRUE 0.934 6.000 0.000 NA   NA
 10136524 10136525 MAGa7090 MAGa7100     FALSE 0.017 1240.000 0.000 NA   NA
 10136526 10136527 MAGa7110 MAGa7120     TRUE 0.965 -18.000 0.000 NA   NA
 10136527 10136528 MAGa7120 MAGa7130     FALSE 0.016 494.000 0.000 NA   NA
 10136529 10136530 MAGa7140 MAGa7150 rplL rplJ TRUE 0.977 27.000 0.884 0.044 Y NA
 10136533 10136534 MAGa7180 MAGa7190     TRUE 0.441 45.000 0.000 1.000   NA
 10136534 10136535 MAGa7190 MAGa7200   clp FALSE 0.056 126.000 0.000 1.000 N NA
 10136535 10136536 MAGa7200 MAGa7210 clp rpsP FALSE 0.045 131.000 0.000 1.000 N NA
 10136536 10136537 MAGa7210 MAGa7220 rpsP trmD TRUE 0.997 4.000 0.033 1.000 Y NA
 10136537 10136538 MAGa7220 MAGa7230 trmD rplS TRUE 0.999 -10.000 0.567 1.000 Y NA
 10136543 10136544 MAGa7280 MAGa7290     TRUE 0.927 7.000 0.000 NA   NA
 10136544 10136545 MAGa7290 MAGa7300     TRUE 0.998 2.000 0.750 1.000 Y NA
 10136545 10136546 MAGa7300 MAGa7310     TRUE 0.999 -25.000 0.750 1.000 Y NA
 10136546 10136547 MAGa7310 MAGa7320     TRUE 0.989 18.000 0.066 1.000 Y NA
 10136547 10136548 MAGa7320 MAGa7330   sgaB TRUE 0.999 0.000 0.279 0.003 Y NA
 10136548 10136549 MAGa7330 MAGa7340 sgaB   TRUE 0.800 103.000 0.431 0.009   NA
 10136549 10136550 MAGa7340 MAGa7350     TRUE 0.948 51.000 0.118 1.000   NA
 10136552 10136553 MAGa7370 MAGa7380     TRUE 0.286 62.000 0.000 NA   NA
 10136554 10136555 MAGa7390 MAGa7400     FALSE 0.014 324.000 0.000 NA   NA
 10136555 10136556 MAGa7400 MAGa7410     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 10136556 10136557 MAGa7410 MAGa7420     FALSE 0.016 675.000 0.000 NA   NA
 10136558 10136559 MAGa7430 MAGa7440     FALSE 0.073 115.000 0.000 NA   NA
 10136559 10136560 MAGa7440 MAGa7450     FALSE 0.039 136.000 0.000 NA   NA
 10136561 10136562 MAGa7460 MAGa7470     TRUE 0.880 12.000 0.000 NA   NA
 10136562 10136563 MAGa7470 MAGa7480     FALSE 0.015 413.000 0.000 NA   NA
 10136564 10136565 MAGa7490 MAGa7500   gtsC TRUE 0.897 61.000 1.000 NA   NA
 10136565 10136566 MAGa7500 MAGa7510 gtsC gtsB TRUE 0.998 -10.000 1.000 NA Y NA
 10136566 10136567 MAGa7510 MAGa7520 gtsB gtsA TRUE 0.998 -28.000 0.018 NA N NA
 10136567 10136568 MAGa7520 MAGa7530 gtsA   FALSE 0.018 183.000 0.000 1.000 N NA
 10136568 10136569 MAGa7530 MAGa7540     FALSE 0.081 111.000 0.000 1.000 N NA
 10136569 10136570 MAGa7540 MAGa7550     TRUE 0.993 3.000 0.003 NA   NA
 10136570 10136571 MAGa7550 MAGa7560   nadE TRUE 0.997 3.000 0.015 NA   NA
 10136571 10136572 MAGa7560 MAGa7570 nadE   FALSE 0.073 115.000 0.000 NA   NA
 10136572 10136573 MAGa7570 MAGa7580   lip TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 10136573 10136574 MAGa7580 MAGa7590 lip   TRUE 0.586 32.000 0.000 NA   NA
 10136574 10136575 MAGa7590 MAGa7600   dnaI TRUE 0.450 44.000 0.000 1.000   NA
 10136575 10136576 MAGa7600 MAGa7610 dnaI   TRUE 0.908 9.000 0.000 NA   NA
 10136576 10136577 MAGa7610 MAGa7620     TRUE 0.900 50.000 0.013 NA   NA
 10136577 10136578 MAGa7620 MAGa7630     TRUE 0.994 3.000 0.005 NA   NA
 10136578 10136579 MAGa7630 MAGa7640     TRUE 0.298 61.000 0.000 NA   NA
 10136581 10136582 MAGa7660 MAGa7670     TRUE 0.999 -18.000 0.182 NA   NA
 10136582 10136583 MAGa7670 MAGa7680     TRUE 0.213 76.000 0.000 NA   NA
 10136583 10136584 MAGa7680 MAGa7690   rnhB FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 10136584 10136585 MAGa7690 MAGa7700 rnhB   TRUE 0.653 29.000 0.000 NA   NA
 10136585 10136586 MAGa7700 MAGa7710     TRUE 0.815 47.000 0.002 NA   NA
 10136586 10136587 MAGa7710 MAGa7720   chrA TRUE 0.556 34.000 0.000 1.000 N NA
 10136587 10136588 MAGa7720 MAGa7730 chrA chrA TRUE 0.999 0.000 0.273 0.002 Y NA
 10136588 10136589 MAGa7730 MAGa7740 chrA   TRUE 0.943 4.000 0.000 1.000   NA
 10136589 10136590 MAGa7740 MAGa7750     TRUE 0.838 54.000 0.007 NA   NA
 10136592 10136593 MAGa7770 MAGa7780     FALSE 0.015 247.000 0.000 NA   NA
 10136593 10136594 MAGa7780 MAGa7790     TRUE 0.099 103.000 0.000 NA   NA
 10136594 10136595 MAGa7790 MAGa7800   dnaH TRUE 0.998 -7.000 0.016 1.000   NA
 10136595 10136596 MAGa7800 MAGa7810 dnaH tmk TRUE 0.999 0.000 0.254 1.000 N NA
 10136596 10136597 MAGa7810 MAGa7820 tmk recR TRUE 0.987 16.000 0.015 1.000 N NA
 10136597 10136598 MAGa7820 MAGa7830 recR   TRUE 0.999 3.000 0.604 NA   NA
 10136598 10136599 MAGa7830 MAGa7840   dnaX TRUE 0.963 41.000 0.100 NA   NA
 10136600 10136601 MAGa7850 MAGa7860   pgm FALSE 0.057 126.000 0.000 NA   NA
 10136601 10136602 MAGa7860 MAGa7870 pgm   TRUE 0.949 3.000 0.000 1.000   NA
 10136602 10136603 MAGa7870 MAGa7880     FALSE 0.017 192.000 0.000 NA   NA
 10136605 10136606 MAGa7900 MAGa7910   pgsA TRUE 0.965 -13.000 0.000 NA   NA
 10136607 10136608 MAGa7920 MAGa7930 cdsA   FALSE 0.015 213.000 0.000 1.000   NA
 10136608 10136609 MAGa7930 MAGa7940     FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 10136609 10136610 MAGa7940 MAGa7950   apt FALSE 0.033 144.000 0.000 NA   NA
 10136610 10136611 MAGa7950 MAGa7960 apt infB TRUE 0.931 29.000 0.003 1.000 N NA
 10136611 10136612 MAGa7960 MAGa7970 infB   TRUE 0.999 -21.000 0.171 NA N NA
 10136612 10136613 MAGa7970 MAGa7980   nusA TRUE 0.999 -25.000 0.323 NA Y NA
 10136613 10136614 MAGa7980 MAGa7990 nusA   TRUE 0.997 8.000 0.759 NA   NA
 10136614 10136615 MAGa7990 MAGa8000   tdk FALSE 0.025 151.000 0.000 NA   NA
 10136615 10136616 MAGa8000 MAGa8010 tdk pepA TRUE 0.189 79.000 0.000 1.000 N NA
 10136619 10136620 MAGa8040 MAGa8050 vpmaG vpmaF2 FALSE 0.018 190.000 0.000 NA   NA
 10136620 10136621 MAGa8050 MAGa8060 vpmaF2 vpmaX FALSE 0.045 132.000 0.000 NA   NA
 10136622 10136623 MAGa8070 MAGa8080 vpmaW vpmaC FALSE 0.049 130.000 0.000 NA   NA
 10136623 10136624 MAGa8080 MAGa8090 vpmaC vpmaE FALSE 0.032 146.000 0.000 NA   NA
 10136626 10136627 MAGa8110 MAGa8120 vpmaA vpmaD2 FALSE 0.029 148.000 0.000 NA   NA
 10136627 10136628 MAGa8120 MAGa8130 vpmaD2   FALSE 0.051 129.000 0.000 NA   NA
 10136628 10136629 MAGa8130 MAGa8140     TRUE 0.999 -7.000 0.286 NA   NA
 10136630 10136631 MAGa8150 MAGa8160 vpmaH vpmaI FALSE 0.034 142.000 0.000 NA   NA
 10136631 10136632 MAGa8160 MAGa8170 vpmaI vpmaF1 FALSE 0.022 169.000 0.000 NA   NA
 10136632 10136633 MAGa8170 MAGa8180 vpmaF1 vpmaJ FALSE 0.049 130.000 0.000 NA   NA
 10136633 10136634 MAGa8180 MAGa8190 vpmaJ vpmaK FALSE 0.041 135.000 0.000 NA   NA
 10136635 10136636 MAGa8200 MAGa8210 vpmaL vpmaD1 FALSE 0.027 149.000 0.000 NA   NA
 10136637 10136638 MAGa8220 MAGa8230 xer1   FALSE 0.014 371.000 0.000 0.021   NA
 10136638 10136639 MAGa8230 MAGa8240     FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 10136639 10136640 MAGa8240 MAGa8250     FALSE 0.021 171.000 0.000 NA   NA
 10136640 10136641 MAGa8250 MAGa8260     FALSE 0.038 139.000 0.000 NA   NA
 10136641 10136642 MAGa8260 MAGa8270     FALSE 0.065 120.000 0.000 NA   NA
 10136643 10136644 MAGa8280 MAGa8290   gatB FALSE 0.023 165.000 0.000 NA   NA
 10136644 10136645 MAGa8290 MAGa8300 gatB gatA TRUE 0.999 -7.000 0.492 0.004 Y NA
 10136645 10136646 MAGa8300 MAGa8310 gatA   TRUE 0.999 0.000 0.643 0.004   NA
 10136646 10136647 MAGa8310 MAGa8320   rluC TRUE 0.993 6.000 0.007 1.000   NA
 10136647 10136648 MAGa8320 MAGa8330 rluC spcB TRUE 0.989 12.000 0.011 NA N NA
 10136648 10136649 MAGa8330 MAGa8340 spcB scpA TRUE 0.999 -10.000 0.570 NA   NA
 10136649 10136650 MAGa8340 MAGa8350 scpA plsC TRUE 0.998 -7.000 0.019 NA   NA
 10136650 10136651 MAGa8350 MAGa8360 plsC acpS TRUE 0.992 10.000 0.020 1.000 Y NA
 10136651 10136652 MAGa8360 MAGa8370 acpS engA FALSE 0.025 151.000 0.000 1.000   NA
 10136652 10136653 MAGa8370 MAGa8380 engA cmk TRUE 0.998 3.000 0.060 1.000   NA
 10136653 10136654 MAGa8380 MAGa8390 cmk   TRUE 0.193 79.000 0.000 NA   NA
 10136654 10136655 MAGa8390 MAGa8400     FALSE 0.027 149.000 0.000 NA   NA
 10136655 10136656 MAGa8400 MAGa8410     TRUE 0.785 20.000 0.000 NA   NA
 10136656 10136657 MAGa8410 MAGa8420   dnaJ FALSE 0.017 194.000 0.000 NA   NA
 10136658 10136659 MAGa8430 MAGa8440   rbfA TRUE 0.177 83.000 0.000 NA   NA
 10136660 10136661 MAGa8450 MAGa8460   tyrS TRUE 0.330 54.000 0.000 NA   NA
 10136661 10136662 MAGa8460 MAGa8470 tyrS   TRUE 0.886 11.000 0.000 1.000   NA
 10136664 10136665 MAGa8490 MAGa8500     TRUE 0.626 30.000 0.000 NA   NA
 10136665 10136666 MAGa8500 MAGa8510     TRUE 0.491 40.000 0.000 1.000   NA
 10136666 10136667 MAGa8510 MAGa8520   prfA TRUE 0.998 0.000 0.081 0.047 Y NA
 10136667 10136668 MAGa8520 MAGa8530 prfA   FALSE 0.024 155.000 0.000 NA   NA
 10136669 10136670 MAGa8540 MAGa8550 gyrB trxA FALSE 0.058 125.000 0.000 1.000 N NA
 10136670 10136671 MAGa8550 MAGa8560 trxA smpB TRUE 0.286 53.000 0.000 1.000 Y NA
 10136673 10136674 MAGa8580 MAGa8590     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 10136675 10136676 MAGa8600 MAGa8610 mgtA   FALSE 0.061 122.000 0.000 1.000 N NA
 10136676 10136677 MAGa8610 MAGa8620     TRUE 0.997 8.000 0.333 1.000 Y NA
 10136677 10136678 MAGa8620 MAGa8630   ftsH TRUE 0.155 182.000 0.006 0.054 N NA
 10136678 10136679 MAGa8630 MAGa8640 ftsH   TRUE 0.869 75.000 0.051 1.000 N NA
 10136679 10136680 MAGa8640 MAGa8650   pth TRUE 0.998 0.000 0.025 0.066 N NA
 10136680 10136681 MAGa8650 MAGa8660 pth recD TRUE 0.996 0.000 0.006 1.000   NA