MicrobesOnline Operon Predictions for Mycobacterium marinum M

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5929659 5929660 MMAR_0001 MMAR_0002 dnaA dnaN FALSE 0.053 541.000 0.328 1.000 Y NA
 5929660 5929661 MMAR_0002 MMAR_0003 dnaN recF TRUE 0.957 21.000 0.318 1.000 Y NA
 5929661 5929662 MMAR_0003 MMAR_0004 recF   TRUE 0.979 -3.000 0.099 NA   NA
 5929662 5929663 MMAR_0004 MMAR_0005   gyrB FALSE 0.021 210.000 0.022 NA   NA
 5929663 5929664 MMAR_0005 MMAR_0006 gyrB gyrA TRUE 0.959 40.000 0.306 0.001 Y NA
 5929664 5929665 MMAR_0006 MMAR_0007 gyrA   FALSE 0.200 84.000 0.009 NA   NA
 5929665 5929666 MMAR_0007 MMAR_5487   ileT FALSE 0.183 61.000 0.000 NA   NA
 5929666 5929667 MMAR_5487 MMAR_5488 ileT alaT FALSE 0.028 161.000 0.000 NA   NA
 5929667 5929668 MMAR_5488 MMAR_0008 alaT   FALSE 0.048 137.000 0.000 NA   NA
 5929669 5929670 MMAR_0009 MMAR_0010     FALSE 0.094 111.000 0.000 NA   NA
 5929672 5929673 MMAR_0012 MMAR_0013     FALSE 0.097 156.000 0.181 NA   NA
 5929674 5929675 MMAR_0014 MMAR_0015   trpG FALSE 0.574 38.000 0.098 NA   NA
 5929676 5929677 MMAR_0016 MMAR_0017 pknB pknA TRUE 0.999 -3.000 0.426 0.004 Y NA
 5929677 5929678 MMAR_0017 MMAR_0018 pknA pbpA TRUE 0.994 -3.000 0.574 1.000 N NA
 5929678 5929679 MMAR_0018 MMAR_0019 pbpA rodA TRUE 0.986 -3.000 0.250 1.000 N NA
 5929679 5929680 MMAR_0019 MMAR_0020 rodA pstP TRUE 0.979 -3.000 0.145 1.000 N NA
 5929680 5929681 MMAR_0020 MMAR_0021 pstP   TRUE 0.997 -3.000 0.216 NA Y NA
 5929681 5929682 MMAR_0021 MMAR_0022     FALSE 0.122 134.000 0.069 NA   NA
 5929683 5929684 MMAR_5489 MMAR_0023 leuT   FALSE 0.003 421.000 0.000 NA   NA
 5929684 5929685 MMAR_0023 MMAR_0024     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929686 5929687 MMAR_0025 MMAR_0026     TRUE 0.928 -19.000 0.000 NA   NA
 5929687 5929688 MMAR_0026 MMAR_0027   thyA_1 FALSE 0.528 14.000 0.000 NA   NA
 5929688 5929689 MMAR_0027 MMAR_0028 thyA_1   FALSE 0.147 78.000 0.000 NA   NA
 5929689 5929690 MMAR_0028 MMAR_0029     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5929690 5929691 MMAR_0029 MMAR_0030     FALSE 0.001 964.000 0.000 NA   NA
 5929693 5929694 MMAR_0032 MMAR_0033     TRUE 0.909 6.000 0.045 0.016 N NA
 5929694 5929695 MMAR_0033 MMAR_0034   proV_1 TRUE 0.998 -3.000 0.083 0.054 Y NA
 5929695 5929696 MMAR_0034 MMAR_0035 proV_1   TRUE 0.998 -7.000 0.138 0.054 Y NA
 5929700 5929701 MMAR_0039 MMAR_0040     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929701 5929702 MMAR_0040 MMAR_0041   whiB5 FALSE 0.086 114.000 0.000 NA   NA
 5929703 5929704 MMAR_0042 MMAR_0043     TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 5929704 5929705 MMAR_0043 MMAR_0044     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 5929705 5929706 MMAR_0044 MMAR_0045     TRUE 0.796 75.000 1.000 NA   NA
 5929706 5929707 MMAR_0045 MMAR_0046     TRUE 0.824 43.000 0.600 NA   NA
 5929707 5929708 MMAR_0046 MMAR_0047     TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA   NA
 5929708 5929709 MMAR_0047 MMAR_0048     FALSE 0.010 228.000 0.000 NA   NA
 5929709 5929710 MMAR_0048 MMAR_0049     TRUE 0.778 88.000 1.000 NA   NA
 5929710 5929711 MMAR_0049 MMAR_0050     FALSE 0.231 50.000 0.000 NA   NA
 5929712 5929713 MMAR_0051 MMAR_0052     TRUE 0.911 3.000 0.174 NA   NA
 5929715 5929716 MMAR_0054 MMAR_0055     FALSE 0.426 41.000 0.016 NA   NA
 5929716 5929717 MMAR_0055 MMAR_0056   mtc28 TRUE 0.760 85.000 0.875 NA   NA
 5929719 5929720 MMAR_0058 MMAR_0059     FALSE 0.530 41.000 0.039 1.000   NA
 5929720 5929721 MMAR_0059 MMAR_0060     FALSE 0.455 57.000 0.207 1.000 N NA
 5929721 5929722 MMAR_0060 MMAR_0061   glnQ TRUE 0.999 -3.000 0.538 1.000 Y NA
 5929722 5929723 MMAR_0061 MMAR_0062 glnQ   FALSE 0.387 82.000 0.231 1.000 N NA
 5929723 5929724 MMAR_0062 MMAR_0063     FALSE 0.397 111.000 0.412 NA N NA
 5929724 5929725 MMAR_0063 MMAR_0064     TRUE 0.654 32.000 0.235 NA N NA
 5929725 5929726 MMAR_0064 MMAR_0065   ino1 TRUE 0.687 91.000 0.059 NA Y NA
 5929726 5929727 MMAR_0065 MMAR_0066 ino1   TRUE 0.685 62.000 0.608 NA N NA
 5929727 5929728 MMAR_0066 MMAR_0067     FALSE 0.085 156.000 0.122 NA   NA
 5929729 5929730 MMAR_0068 MMAR_0069   ponA1 FALSE 0.009 458.000 0.200 NA   NA
 5929730 5929731 MMAR_0069 MMAR_0070 ponA1   TRUE 0.984 -3.000 0.204 NA   NA
 5929731 5929732 MMAR_0070 MMAR_0071     TRUE 0.933 0.000 0.061 NA   NA
 5929732 5929733 MMAR_0071 MMAR_0072   rpsF FALSE 0.094 124.000 0.002 NA   NA
 5929733 5929734 MMAR_0072 MMAR_0073 rpsF ssb FALSE 0.202 92.000 0.029 1.000 N NA
 5929734 5929735 MMAR_0073 MMAR_0074 ssb rpsR1 FALSE 0.375 46.000 0.030 1.000 N NA
 5929735 5929736 MMAR_0074 MMAR_0075 rpsR1 rplI TRUE 0.961 43.000 0.499 0.014 Y NA
 5929736 5929737 MMAR_0075 MMAR_0076 rplI dnaB FALSE 0.003 534.000 0.012 1.000 N NA
 5929737 5929738 MMAR_0076 MMAR_0077 dnaB   FALSE 0.140 105.000 0.000 1.000   NA
 5929738 5929739 MMAR_0077 MMAR_0078     FALSE 0.008 243.000 0.000 NA   NA
 5929739 5929740 MMAR_0078 MMAR_0079     FALSE 0.217 52.000 0.000 NA   NA
 5929741 5929742 MMAR_0080 MMAR_0081 coxL_2 coxM_2 TRUE 0.998 -3.000 0.133 0.001 Y NA
 5929742 5929743 MMAR_0081 MMAR_0082 coxM_2 coxS_2 TRUE 0.995 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5929743 5929744 MMAR_0082 MMAR_0083 coxS_2   TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5929745 5929746 MMAR_0084 MMAR_0085     FALSE 0.126 111.000 0.000 1.000   NA
 5929751 5929752 MMAR_0090 MMAR_0091     FALSE 0.595 42.000 0.000 0.053   NA
 5929754 5929755 MMAR_0093 MMAR_0094 ermB mmpL5_3 FALSE 0.351 90.000 0.000 0.054   NA
 5929755 5929756 MMAR_0094 MMAR_0095 mmpL5_3 mmpS5_3 TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929757 5929758 MMAR_0096 MMAR_0097     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5929758 5929759 MMAR_0097 MMAR_0098     FALSE 0.027 163.000 0.000 NA   NA
 5929759 5929760 MMAR_0098 MMAR_0099     TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 5929760 5929761 MMAR_0099 MMAR_0100     FALSE 0.131 48.000 0.000 NA N NA
 5929761 5929762 MMAR_0100 MMAR_0101     FALSE 0.017 148.000 0.000 NA N NA
 5929762 5929763 MMAR_0101 MMAR_0102     TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 5929763 5929764 MMAR_0102 MMAR_0103     FALSE 0.478 18.000 0.000 NA   NA
 5929764 5929765 MMAR_0103 MMAR_0104     FALSE 0.183 61.000 0.000 NA   NA
 5929766 5929767 MMAR_0105 MMAR_0106     FALSE 0.013 207.000 0.000 NA   NA
 5929768 5929769 MMAR_0107 MMAR_0108 celA   FALSE 0.059 142.000 0.000 1.000   NA
 5929769 5929770 MMAR_0108 MMAR_0109     FALSE 0.085 115.000 0.000 NA   NA
 5929770 5929771 MMAR_0109 MMAR_0110     FALSE 0.028 161.000 0.000 NA   NA
 5929774 5929775 MMAR_0113 MMAR_0115     FALSE 0.003 371.000 0.000 NA   NA
 5929775 5929776 MMAR_0115 MMAR_0116     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929776 5929777 MMAR_0116 MMAR_0117     TRUE 0.983 1.000 0.667 NA   NA
 5929777 5929778 MMAR_0117 MMAR_0118     FALSE 0.004 346.000 0.000 NA   NA
 5929779 5929780 MMAR_0119 MMAR_0120     FALSE 0.074 133.000 0.000 1.000   NA
 5929780 5929781 MMAR_0120 MMAR_0121     FALSE 0.038 162.000 0.000 1.000   NA
 5929786 5929787 MMAR_0126 MMAR_0127   adhD_1 FALSE 0.163 70.000 0.000 NA   NA
 5929787 5929788 MMAR_0127 MMAR_0128 adhD_1   FALSE 0.367 135.000 0.000 1.000 Y NA
 5929788 5929789 MMAR_0128 MMAR_0129     TRUE 0.707 9.000 0.000 1.000   NA
 5929789 5929790 MMAR_0129 MMAR_0130     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.012   NA
 5929790 5929791 MMAR_0130 MMAR_0131     TRUE 0.993 0.000 0.600 0.005   NA
 5929794 5929795 MMAR_0134 MMAR_0135     FALSE 0.612 10.000 0.000 NA   NA
 5929795 5929796 MMAR_0135 MMAR_0136     FALSE 0.029 159.000 0.000 NA   NA
 5929796 5929797 MMAR_0136 MMAR_0137     FALSE 0.217 52.000 0.000 NA   NA
 5929798 5929799 MMAR_0138 MMAR_0139   fadE6_1 FALSE 0.043 156.000 0.000 1.000   NA
 5929799 5929800 MMAR_0139 MMAR_0140 fadE6_1   TRUE 0.721 8.000 0.000 1.000   NA
 5929802 5929803 MMAR_0142 MMAR_0143 ltp1_1   TRUE 0.904 31.000 0.750 NA   NA
 5929803 5929804 MMAR_0143 MMAR_0144     FALSE 0.127 96.000 0.000 NA   NA
 5929804 5929805 MMAR_0144 MMAR_0145     TRUE 0.670 31.000 0.182 NA   NA
 5929807 5929808 MMAR_0147 MMAR_0148     FALSE 0.201 55.000 0.000 NA   NA
 5929808 5929809 MMAR_0148 MMAR_0149   fadE25_2 FALSE 0.136 69.000 0.000 1.000 N NA
 5929809 5929810 MMAR_0149 MMAR_0150 fadE25_2   FALSE 0.612 29.000 0.100 1.000 N NA
 5929810 5929811 MMAR_0150 MMAR_0151   eis1 FALSE 0.264 54.000 0.000 1.000   NA
 5929811 5929812 MMAR_0151 MMAR_0152 eis1   FALSE 0.045 140.000 0.000 NA   NA
 5929813 5929814 MMAR_0153 MMAR_0154     FALSE 0.323 59.000 0.038 NA   NA
 5929815 5929816 MMAR_0155 MMAR_0156 fadE36_1 fadE2_1 FALSE 0.469 19.000 0.000 NA   NA
 5929816 5929817 MMAR_0156 MMAR_0157 fadE2_1 cyaA FALSE 0.057 123.000 0.000 1.000 N NA
 5929817 5929818 MMAR_0157 MMAR_0158 cyaA icd2 FALSE 0.070 114.000 0.000 1.000 N NA
 5929818 5929819 MMAR_0158 MMAR_0159 icd2   FALSE 0.002 677.000 0.000 NA   NA
 5929819 5929820 MMAR_0159 MMAR_0160     TRUE 0.934 -10.000 0.000 NA   NA
 5929820 5929821 MMAR_0160 MMAR_0161     TRUE 0.946 12.000 0.667 NA   NA
 5929822 5929823 MMAR_0162 MMAR_0163     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5929823 5929824 MMAR_0163 MMAR_0164     TRUE 0.949 0.000 0.087 1.000   NA
 5929824 5929825 MMAR_0164 MMAR_0165     TRUE 0.968 -3.000 0.040 1.000 N NA
 5929825 5929826 MMAR_0165 MMAR_0166   gabT_2 TRUE 0.912 0.000 0.040 1.000 N NA
 5929826 5929827 MMAR_0166 MMAR_0167 gabT_2   TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.017 Y NA
 5929827 5929828 MMAR_0167 MMAR_0168     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5929828 5929829 MMAR_0168 MMAR_0169     TRUE 0.990 -3.000 0.333 NA   NA
 5929829 5929830 MMAR_0169 MMAR_0170     TRUE 0.889 12.000 0.333 NA   NA
 5929830 5929831 MMAR_0170 MMAR_0171     TRUE 0.989 -25.000 0.400 NA   NA
 5929831 5929832 MMAR_0171 MMAR_0172     TRUE 0.995 -3.000 0.400 0.091   NA
 5929832 5929833 MMAR_0172 MMAR_0173     TRUE 0.936 16.000 0.667 1.000   NA
 5929833 5929834 MMAR_0173 MMAR_0174   pks16_1 TRUE 0.993 9.000 1.000 1.000 Y NA
 5929834 5929835 MMAR_0174 MMAR_0175 pks16_1 yrbE6A TRUE 0.992 10.000 1.000 NA Y NA
 5929835 5929836 MMAR_0175 MMAR_0176 yrbE6A yrbE6B TRUE 0.996 2.000 1.000 NA Y NA
 5929836 5929837 MMAR_0176 MMAR_0177 yrbE6B mce6A TRUE 0.993 3.000 0.667 NA Y NA
 5929837 5929838 MMAR_0177 MMAR_0178 mce6A mce6B TRUE 0.977 19.000 0.667 NA Y NA
 5929838 5929839 MMAR_0178 MMAR_0179 mce6B mce6C TRUE 0.999 -7.000 1.000 0.012 Y NA
 5929839 5929840 MMAR_0179 MMAR_0180 mce6C mce6D TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.012 Y NA
 5929840 5929841 MMAR_0180 MMAR_0181 mce6D mce6E TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5929841 5929842 MMAR_0181 MMAR_0182 mce6E mce6F TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5929842 5929843 MMAR_0182 MMAR_0183 mce6F   FALSE 0.002 686.000 0.000 NA   NA
 5929843 5929844 MMAR_0183 MMAR_0184     FALSE 0.002 841.000 0.000 NA   NA
 5929844 5929845 MMAR_0184 MMAR_0185     FALSE 0.141 84.000 0.000 NA   NA
 5929845 5929846 MMAR_0185 MMAR_0186     FALSE 0.196 57.000 0.000 NA   NA
 5929846 5929847 MMAR_0186 MMAR_0187   esxB_1 FALSE 0.105 105.000 0.000 NA   NA
 5929847 5929848 MMAR_0187 MMAR_0188 esxB_1 esxA_1 TRUE 0.757 37.000 0.333 NA   NA
 5929848 5929849 MMAR_0188 MMAR_0189 esxA_1 esxA_3 FALSE 0.009 233.000 0.000 NA   NA
 5929849 5929850 MMAR_0189 MMAR_0190 esxA_3   FALSE 0.008 250.000 0.000 NA   NA
 5929850 5929851 MMAR_0190 MMAR_0191     FALSE 0.086 114.000 0.000 NA   NA
 5929851 5929852 MMAR_0191 MMAR_0193     FALSE 0.003 407.000 0.000 NA   NA
 5929852 5929853 MMAR_0193 MMAR_0194     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929853 5929854 MMAR_0194 MMAR_0195   esxB_2 FALSE 0.187 60.000 0.000 NA   NA
 5929854 5929855 MMAR_0195 MMAR_0196 esxB_2 esxA_2 TRUE 0.771 34.000 0.333 NA   NA
 5929855 5929856 MMAR_0196 MMAR_0197 esxA_2   FALSE 0.281 44.000 0.000 NA   NA
 5929856 5929857 MMAR_0197 MMAR_0198     TRUE 0.650 8.000 0.000 NA   NA
 5929857 5929858 MMAR_0198 MMAR_0199     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5929858 5929859 MMAR_0199 MMAR_0200     FALSE 0.086 114.000 0.000 NA   NA
 5929860 5929861 MMAR_0201 MMAR_0202     FALSE 0.152 75.000 0.000 NA   NA
 5929862 5929863 MMAR_0203 MMAR_0204     FALSE 0.141 84.000 0.000 NA   NA
 5929864 5929865 MMAR_0205 MMAR_0207   sdaA FALSE 0.108 118.000 0.000 1.000   NA
 5929865 5929866 MMAR_0207 MMAR_0208 sdaA glyA2 TRUE 0.997 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 5929866 5929867 MMAR_0208 MMAR_0209 glyA2 gcvH_1 TRUE 0.996 -3.000 0.081 1.000 Y NA
 5929867 5929868 MMAR_0209 MMAR_0210 gcvH_1 gcvT_1 TRUE 0.911 47.000 0.056 0.002 Y NA
 5929868 5929869 MMAR_0210 MMAR_0211 gcvT_1 gcvB_1 TRUE 0.963 18.000 0.032 0.001 Y NA
 5929871 5929872 MMAR_0212 MMAR_0213     TRUE 0.917 10.000 0.400 1.000 N NA
 5929872 5929873 MMAR_0213 MMAR_0214     FALSE 0.020 166.000 0.000 1.000 N NA
 5929874 5929875 MMAR_0215 MMAR_0216     TRUE 0.982 4.000 1.000 1.000 N NA
 5929876 5929877 MMAR_0217 MMAR_0218     FALSE 0.185 85.000 0.000 1.000   NA
 5929877 5929878 MMAR_0218 MMAR_0219     FALSE 0.061 129.000 0.000 NA   NA
 5929878 5929879 MMAR_0219 MMAR_0220     FALSE 0.156 73.000 0.000 NA   NA
 5929879 5929880 MMAR_0220 MMAR_0221     TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA   NA
 5929883 5929884 MMAR_0224 MMAR_0225     FALSE 0.074 121.000 0.000 NA   NA
 5929884 5929885 MMAR_0225 MMAR_0226     FALSE 0.003 356.000 0.000 NA   NA
 5929890 5929891 MMAR_0231 MMAR_0232 ctpA_1   TRUE 0.881 11.000 0.286 NA   NA
 5929891 5929892 MMAR_0232 MMAR_0233     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929894 5929895 MMAR_0235 MMAR_0236     FALSE 0.321 39.000 0.000 NA   NA
 5929895 5929896 MMAR_0236 MMAR_0237     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA N NA
 5929897 5929898 MMAR_0238 MMAR_0239     FALSE 0.090 103.000 0.000 1.000 N NA
 5929898 5929899 MMAR_0239 MMAR_0240     TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.025 Y NA
 5929907 5929908 MMAR_0248 MMAR_0249     FALSE 0.224 46.000 0.000 1.000 N NA
 5929908 5929909 MMAR_0249 MMAR_0250     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929909 5929910 MMAR_0250 MMAR_0251   mtn FALSE 0.094 111.000 0.000 NA   NA
 5929910 5929911 MMAR_0251 MMAR_0253 mtn   FALSE 0.003 358.000 0.000 NA   NA
 5929911 5929912 MMAR_0253 MMAR_0254     FALSE 0.112 102.000 0.000 NA   NA
 5929912 5929913 MMAR_0254 MMAR_0255   mmpL5_4 FALSE 0.187 82.000 0.000 1.000   NA
 5929914 5929915 MMAR_0256 MMAR_0257     TRUE 0.992 -3.000 0.364 1.000   NA
 5929915 5929916 MMAR_0257 MMAR_0258   fadD10 TRUE 0.997 -7.000 0.800 1.000   NA
 5929916 5929917 MMAR_0258 MMAR_0259 fadD10   TRUE 0.842 29.000 0.444 NA   NA
 5929917 5929918 MMAR_0259 MMAR_0260     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5929918 5929919 MMAR_0260 MMAR_0261     FALSE 0.036 194.000 0.167 NA N NA
 5929920 5929921 MMAR_0262 MMAR_0263 omt_1   FALSE 0.142 82.000 0.000 NA   NA
 5929926 5929927 MMAR_0268 MMAR_0269   ctpB TRUE 0.985 -7.000 0.000 0.005   NA
 5929927 5929928 MMAR_0269 MMAR_0271 ctpB   FALSE 0.006 245.000 0.000 1.000 N NA
 5929928 5929929 MMAR_0271 MMAR_0272   cyp226B1 FALSE 0.521 112.000 0.000 1.000 Y NA
 5929929 5929930 MMAR_0272 MMAR_0273 cyp226B1   FALSE 0.004 432.000 0.000 1.000   NA
 5929930 5929931 MMAR_0273 MMAR_0274   cyp271A1 TRUE 0.950 -13.000 0.000 1.000   NA
 5929931 5929932 MMAR_0274 MMAR_0275 cyp271A1 gcpE_2 TRUE 0.771 1.000 0.000 1.000 N NA
 5929932 5929933 MMAR_0275 MMAR_0276 gcpE_2 dxs2 TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 5929933 5929934 MMAR_0276 MMAR_0277 dxs2 lytB2 TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5929934 5929935 MMAR_0277 MMAR_0278 lytB2   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929935 5929936 MMAR_0278 MMAR_0279     FALSE 0.183 61.000 0.000 NA   NA
 5929936 5929937 MMAR_0279 MMAR_0280     FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 5929937 5929938 MMAR_0280 MMAR_0281   cyp183B1 TRUE 0.940 8.000 0.400 1.000   NA
 5929938 5929939 MMAR_0281 MMAR_0282 cyp183B1 idsB_3 FALSE 0.490 13.000 0.000 1.000 N NA
 5929940 5929941 MMAR_0283 MMAR_0284 cyp274A1 plcB_3 FALSE 0.155 60.000 0.000 1.000 N NA
 5929941 5929942 MMAR_0284 MMAR_0285 plcB_3   FALSE 0.044 154.000 0.000 1.000   NA
 5929943 5929944 MMAR_0286 MMAR_0287 lipJ   TRUE 0.916 3.000 0.125 1.000   NA
 5929946 5929947 MMAR_0289 MMAR_0290 rpsR2 rpsN2 TRUE 0.979 7.000 0.024 0.013 Y NA
 5929947 5929948 MMAR_0290 MMAR_0291 rpsN2 rpmG1 TRUE 0.991 1.000 0.052 0.013 Y NA
 5929948 5929949 MMAR_0291 MMAR_0292 rpmG1 rpmB2 TRUE 0.996 0.000 0.332 0.013 Y NA
 5929950 5929951 MMAR_0293 MMAR_0294   rpmE_1 TRUE 0.960 -3.000 0.004 NA   NA
 5929951 5929952 MMAR_0294 MMAR_0295 rpmE_1   FALSE 0.032 170.000 0.000 1.000   NA
 5929952 5929953 MMAR_0295 MMAR_0296   fadD12_2 TRUE 0.938 3.000 0.231 1.000   NA
 5929954 5929955 MMAR_0297 MMAR_0298 ctpI   FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 5929956 5929957 MMAR_0299 MMAR_0300     FALSE 0.164 125.000 0.091 NA   NA
 5929957 5929958 MMAR_0300 MMAR_0301     FALSE 0.348 35.000 0.000 NA   NA
 5929959 5929960 MMAR_0302 MMAR_0303     TRUE 0.991 2.000 0.375 1.000 Y NA
 5929960 5929961 MMAR_0303 MMAR_0304     TRUE 0.945 10.000 0.600 1.000 N NA
 5929961 5929962 MMAR_0304 MMAR_0305     TRUE 0.860 13.000 0.300 1.000 N NA
 5929963 5929964 MMAR_0306 MMAR_0307     TRUE 0.977 2.000 0.538 1.000   NA
 5929964 5929965 MMAR_0307 MMAR_0308     TRUE 0.831 15.000 0.222 1.000   NA
 5929965 5929966 MMAR_0308 MMAR_0309     TRUE 0.979 -3.000 0.143 1.000 N NA
 5929966 5929967 MMAR_0309 MMAR_0310     TRUE 0.981 0.000 0.500 1.000 N NA
 5929967 5929968 MMAR_0310 MMAR_0311     TRUE 0.996 -7.000 0.857 1.000 N NA
 5929968 5929969 MMAR_0311 MMAR_0312     FALSE 0.007 238.000 0.000 1.000 N NA
 5929971 5929972 MMAR_0314 MMAR_0315     FALSE 0.548 102.000 0.500 NA   NA
 5929977 5929978 MMAR_0320 MMAR_0321   fusA2 FALSE 0.496 16.000 0.000 NA   NA
 5929978 5929979 MMAR_0321 MMAR_0322 fusA2   FALSE 0.044 171.000 0.009 1.000   NA
 5929980 5929981 MMAR_0323 MMAR_0324   pepA FALSE 0.089 113.000 0.000 NA   NA
 5929981 5929982 MMAR_0324 MMAR_0325 pepA treS FALSE 0.105 119.000 0.013 1.000 N NA
 5929982 5929983 MMAR_0325 MMAR_0326 treS   TRUE 0.726 74.000 0.071 NA Y NA
 5929983 5929984 MMAR_0326 MMAR_0327     FALSE 0.217 115.000 0.136 NA   NA
 5929985 5929986 MMAR_0328 MMAR_0329 fbpC   FALSE 0.004 353.000 0.000 NA   NA
 5929990 5929991 MMAR_0333 MMAR_0334     FALSE 0.079 131.000 0.000 1.000   NA
 5929992 5929993 MMAR_0335 MMAR_0336   desA3_2 TRUE 0.894 36.000 0.800 1.000 N NA
 5929993 5929994 MMAR_0336 MMAR_0337 desA3_2   FALSE 0.006 270.000 0.000 NA   NA
 5929994 5929995 MMAR_0337 MMAR_0338     TRUE 0.990 0.000 0.800 NA   NA
 5929996 5929997 MMAR_0339 MMAR_0340     TRUE 0.992 -3.000 0.400 NA   NA
 5929998 5929999 MMAR_0341 MMAR_0342   ephF TRUE 0.634 39.000 0.200 NA   NA
 5930000 5930001 MMAR_0343 MMAR_0344     FALSE 0.615 7.000 0.000 1.000 N NA
 5930001 5930002 MMAR_0344 MMAR_0345     FALSE 0.546 46.000 0.200 1.000 N NA
 5930005 5930006 MMAR_0348 MMAR_0349     TRUE 0.994 -3.000 0.538 NA   NA
 5930006 5930007 MMAR_0349 MMAR_0350     FALSE 0.173 110.000 0.034 NA   NA
 5930011 5930012 MMAR_0354 MMAR_0355     TRUE 0.893 0.000 0.006 NA   NA
 5930012 5930013 MMAR_0355 MMAR_0356     FALSE 0.269 145.000 0.571 NA N NA
 5930013 5930014 MMAR_0356 MMAR_0357     TRUE 0.978 14.000 0.556 NA Y NA
 5930014 5930015 MMAR_0357 MMAR_0358     TRUE 0.982 0.000 0.000 NA Y NA
 5930015 5930016 MMAR_0358 MMAR_0359     FALSE 0.016 150.000 0.000 NA N NA
 5930016 5930017 MMAR_0359 MMAR_0360     TRUE 0.772 73.000 0.875 1.000 N NA
 5930017 5930018 MMAR_0360 MMAR_0361     TRUE 0.970 5.000 0.700 1.000 N NA
 5930019 5930020 MMAR_0362 MMAR_0363     TRUE 0.787 2.000 0.000 NA   NA
 5930021 5930022 MMAR_0364 MMAR_0365   pknK_2 FALSE 0.183 61.000 0.000 NA   NA
 5930022 5930023 MMAR_0365 MMAR_0366 pknK_2 pknK_3 FALSE 0.327 114.000 0.000 0.001   NA
 5930024 5930025 MMAR_0367 MMAR_0368     TRUE 0.959 6.000 0.000 1.000 Y NA
 5930025 5930026 MMAR_0368 MMAR_0369     FALSE 0.002 730.000 0.000 NA   NA
 5930026 5930027 MMAR_0369 MMAR_0370     FALSE 0.003 407.000 0.000 NA   NA
 5930027 5930028 MMAR_0370 MMAR_0371     FALSE 0.023 170.000 0.000 NA   NA
 5930028 5930029 MMAR_0371 MMAR_0372     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 5930029 5930030 MMAR_0372 MMAR_0373   ptpB FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 5930030 5930031 MMAR_0373 MMAR_0374 ptpB fadE2 TRUE 0.983 -7.000 0.226 1.000 N NA
 5930032 5930033 MMAR_0375 MMAR_0376     FALSE 0.171 66.000 0.000 NA   NA
 5930033 5930034 MMAR_0376 MMAR_0377   pntAa FALSE 0.008 244.000 0.000 NA   NA
 5930034 5930035 MMAR_0377 MMAR_0378 pntAa pntAb TRUE 0.975 16.000 0.829 0.001   NA
 5930035 5930036 MMAR_0378 MMAR_0379 pntAb pntB TRUE 0.996 -3.000 0.321 0.001   NA
 5930039 5930040 MMAR_0382 MMAR_0383     FALSE 0.012 210.000 0.000 NA   NA
 5930040 5930041 MMAR_0383 MMAR_0384     FALSE 0.034 152.000 0.000 NA   NA
 5930041 5930042 MMAR_0384 MMAR_0385     FALSE 0.062 128.000 0.000 NA   NA
 5930043 5930044 MMAR_0386 MMAR_0387   fabG3 TRUE 0.927 20.000 0.667 1.000   NA
 5930044 5930045 MMAR_0387 MMAR_0388 fabG3   TRUE 0.822 21.000 0.182 0.075 N NA
 5930046 5930047 MMAR_0389 MMAR_0390     FALSE 0.267 59.000 0.011 NA   NA
 5930047 5930048 MMAR_0390 MMAR_0391     TRUE 0.841 40.000 0.600 NA   NA
 5930049 5930050 MMAR_0392 MMAR_0393     TRUE 0.786 15.000 0.250 NA N NA
 5930051 5930052 MMAR_0394 MMAR_0395     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5930053 5930054 MMAR_0396 MMAR_0397     FALSE 0.131 143.000 0.182 NA   NA
 5930054 5930055 MMAR_0397 MMAR_0398     FALSE 0.471 38.000 0.026 NA   NA
 5930055 5930056 MMAR_0398 MMAR_0399   cyp191A3 TRUE 0.978 -3.000 0.078 NA   NA
 5930056 5930057 MMAR_0399 MMAR_0400 cyp191A3   TRUE 0.982 2.000 0.750 1.000 N NA
 5930057 5930058 MMAR_0400 MMAR_0401     TRUE 0.996 -3.000 0.750 1.000 N NA
 5930058 5930059 MMAR_0401 MMAR_0402     TRUE 0.995 -3.000 0.600 1.000 N NA
 5930059 5930060 MMAR_0402 MMAR_0403     TRUE 0.995 -3.000 0.600 1.000 N NA
 5930060 5930061 MMAR_0403 MMAR_0404   lipW TRUE 0.997 -3.000 0.833 1.000 N NA
 5930063 5930064 MMAR_0406 MMAR_0407     FALSE 0.323 52.000 0.020 NA   NA
 5930066 5930067 MMAR_0409 MMAR_0410 fadD5 yrbE1A FALSE 0.098 216.000 0.000 NA Y NA
 5930067 5930068 MMAR_0410 MMAR_0411 yrbE1A yrbE1B TRUE 0.996 2.000 1.000 NA Y NA
 5930068 5930069 MMAR_0411 MMAR_0412 yrbE1B mce1A TRUE 0.994 5.000 1.000 NA Y NA
 5930069 5930070 MMAR_0412 MMAR_0413 mce1A mce1B TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.012 Y NA
 5930070 5930071 MMAR_0413 MMAR_0414 mce1B mce1C TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.012 Y NA
 5930071 5930072 MMAR_0414 MMAR_0415 mce1C mce1D TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.012 Y NA
 5930072 5930073 MMAR_0415 MMAR_0416 mce1D lprK TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.012 Y NA
 5930073 5930074 MMAR_0416 MMAR_0417 lprK mce1F TRUE 0.999 -6.000 0.800 0.012 Y NA
 5930074 5930075 MMAR_0417 MMAR_0418 mce1F   FALSE 0.441 93.000 0.286 NA   NA
 5930075 5930076 MMAR_0418 MMAR_0419     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 5930076 5930077 MMAR_0419 MMAR_0420     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5930077 5930078 MMAR_0420 MMAR_0421     TRUE 0.996 -33.000 1.000 NA   NA
 5930079 5930080 MMAR_0422 MMAR_0423 lprO   TRUE 0.690 46.000 0.333 NA   NA
 5930080 5930081 MMAR_0423 MMAR_0424     FALSE 0.609 50.000 0.286 NA   NA
 5930081 5930082 MMAR_0424 MMAR_0425     FALSE 0.014 200.000 0.000 NA   NA
 5930082 5930083 MMAR_0425 MMAR_0426   sigG TRUE 0.895 3.000 0.095 NA   NA
 5930084 5930085 MMAR_0427 MMAR_0428     FALSE 0.466 47.000 0.068 NA   NA
 5930085 5930086 MMAR_0428 MMAR_0429     TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 5930086 5930087 MMAR_0429 MMAR_0430   bglS TRUE 0.988 -3.000 0.273 NA   NA
 5930088 5930089 MMAR_0431 MMAR_0432   ilvD FALSE 0.010 226.000 0.000 NA   NA
 5930090 5930091 MMAR_0433 MMAR_0434     FALSE 0.204 118.000 0.125 NA   NA
 5930091 5930092 MMAR_0434 MMAR_0435     FALSE 0.361 120.000 0.375 NA   NA
 5930092 5930093 MMAR_0435 MMAR_0436     FALSE 0.063 198.000 0.250 NA   NA
 5930093 5930094 MMAR_0436 MMAR_0437     TRUE 0.987 -13.000 0.276 1.000   NA
 5930096 5930097 MMAR_0439 MMAR_0440     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5930098 5930099 MMAR_0441 MMAR_0442   mmpL11 TRUE 0.997 -3.000 0.750 1.000   NA
 5930103 5930104 MMAR_0446 MMAR_0447 mmpL3   FALSE 0.308 106.000 0.217 NA   NA
 5930104 5930105 MMAR_0447 MMAR_0448     FALSE 0.501 38.000 0.040 NA   NA
 5930106 5930107 MMAR_0449 MMAR_0450     TRUE 0.994 -3.000 0.529 NA   NA
 5930107 5930108 MMAR_0450 MMAR_0451   pckA FALSE 0.025 203.000 0.026 NA   NA
 5930108 5930109 MMAR_0451 MMAR_0452 pckA fadD4 TRUE 0.672 10.000 0.009 1.000 N NA
 5930109 5930110 MMAR_0452 MMAR_0453 fadD4 echA8_4 TRUE 0.976 3.000 0.019 1.000 Y NA
 5930111 5930112 MMAR_0454 MMAR_0455   fadE3_2 FALSE 0.126 111.000 0.000 1.000   NA
 5930113 5930114 MMAR_0456 MMAR_0457     FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5930114 5930115 MMAR_0457 MMAR_0459     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5930115 5930116 MMAR_0459 MMAR_0460     FALSE 0.006 277.000 0.000 NA   NA
 5930116 5930117 MMAR_0460 MMAR_0461     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5930117 5930118 MMAR_0461 MMAR_0462     TRUE 0.787 2.000 0.000 NA   NA
 5930118 5930119 MMAR_0462 MMAR_0463   lipC FALSE 0.244 114.000 0.182 NA   NA
 5930119 5930120 MMAR_0463 MMAR_0464 lipC   TRUE 0.891 45.000 1.000 NA   NA
 5930120 5930121 MMAR_0464 MMAR_0465   echA1 TRUE 0.990 -3.000 0.333 NA   NA
 5930121 5930122 MMAR_0465 MMAR_0466 echA1   TRUE 0.744 99.000 0.222 1.000 Y NA
 5930122 5930123 MMAR_0466 MMAR_0467     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5930123 5930124 MMAR_0467 MMAR_0468     FALSE 0.002 551.000 0.000 NA   NA
 5930124 5930125 MMAR_0468 MMAR_0469     FALSE 0.521 112.000 0.000 1.000 Y NA
 5930128 5930129 MMAR_0472 MMAR_0473     FALSE 0.558 45.000 0.104 1.000   NA
 5930131 5930132 MMAR_0475 MMAR_0476     TRUE 0.871 11.000 0.265 NA   NA
 5930134 5930135 MMAR_0478 MMAR_0479     FALSE 0.007 266.000 0.000 NA   NA
 5930135 5930136 MMAR_0479 MMAR_0480     TRUE 0.808 1.000 0.000 NA   NA
 5930136 5930137 MMAR_0480 MMAR_0481     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 5930137 5930138 MMAR_0481 MMAR_0482     TRUE 0.930 -15.000 0.000 NA   NA
 5930138 5930139 MMAR_0482 MMAR_0483     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5930139 5930140 MMAR_0483 MMAR_0484     FALSE 0.005 290.000 0.000 NA   NA
 5930142 5930143 MMAR_5555 MMAR_0487   php FALSE 0.019 181.000 0.000 NA   NA
 5930144 5930145 MMAR_0488 MMAR_0489 fadE4   FALSE 0.362 99.000 0.250 1.000 N NA
 5930147 5930148 MMAR_0491 MMAR_0492     FALSE 0.017 190.000 0.000 NA   NA
 5930149 5930150 MMAR_0493 MMAR_0494   glpQ2 FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 5930152 5930153 MMAR_0496 MMAR_0497     FALSE 0.620 89.000 0.526 NA   NA
 5930153 5930154 MMAR_0497 MMAR_0498     FALSE 0.165 69.000 0.000 NA   NA
 5930155 5930156 MMAR_0499 MMAR_0500 lpqI   FALSE 0.337 87.000 0.185 1.000 N NA
 5930156 5930157 MMAR_0500 MMAR_0501     FALSE 0.130 128.000 0.067 1.000 N NA
 5930158 5930159 MMAR_0502 MMAR_0503   fabG4 TRUE 0.968 19.000 0.412 1.000 Y NA
 5930162 5930163 MMAR_0506 MMAR_0507     FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 5930163 5930164 MMAR_0507 MMAR_0508     TRUE 0.667 7.000 0.000 NA   NA
 5930165 5930166 MMAR_0509 MMAR_0510   sdhB_1 FALSE 0.469 48.000 0.087 NA   NA
 5930166 5930167 MMAR_0510 MMAR_0511 sdhB_1 sdhA_1 TRUE 0.999 0.000 0.826 0.002 Y NA
 5930167 5930168 MMAR_0511 MMAR_0512 sdhA_1   TRUE 0.868 47.000 0.860 NA   NA
 5930168 5930169 MMAR_0512 MMAR_0513     FALSE 0.359 79.000 0.171 NA   NA
 5930172 5930173 MMAR_0516 MMAR_0517 nirB nirD TRUE 0.886 26.000 0.286 0.001 N NA
 5930174 5930175 MMAR_0518 MMAR_0519     FALSE 0.431 57.000 0.071 1.000   NA
 5930175 5930176 MMAR_0519 MMAR_0520     TRUE 0.983 -9.000 0.173 1.000   NA
 5930176 5930177 MMAR_0520 MMAR_0521   narK3_2 FALSE 0.072 79.000 0.000 NA N NA
 5930177 5930178 MMAR_0521 MMAR_0522 narK3_2 aac FALSE 0.010 230.000 0.000 NA   NA
 5930178 5930179 MMAR_0522 MMAR_0523 aac   TRUE 0.652 27.000 0.101 NA   NA
 5930179 5930180 MMAR_0523 MMAR_0524     TRUE 0.975 16.000 0.551 NA Y NA
 5930180 5930181 MMAR_0524 MMAR_0525     FALSE 0.162 113.000 0.050 1.000 N NA
 5930185 5930186 MMAR_0529 MMAR_0530   fadE6 FALSE 0.010 227.000 0.000 NA   NA
 5930186 5930187 MMAR_0530 MMAR_0531 fadE6 serA3 FALSE 0.384 57.000 0.114 1.000 N NA
 5930187 5930188 MMAR_0531 MMAR_0532 serA3   TRUE 0.976 -3.000 0.057 NA   NA
 5930188 5930189 MMAR_0532 MMAR_0533     FALSE 0.237 137.000 0.333 NA   NA
 5930190 5930191 MMAR_0534 MMAR_0535     TRUE 0.817 7.000 0.048 NA   NA
 5930193 5930194 MMAR_0537 MMAR_0538     FALSE 0.008 244.000 0.000 NA   NA
 5930194 5930195 MMAR_0538 MMAR_0539     TRUE 0.909 19.000 0.667 NA N NA
 5930195 5930196 MMAR_0539 MMAR_0540     FALSE 0.062 128.000 0.000 NA   NA
 5930196 5930197 MMAR_0540 MMAR_0541     FALSE 0.026 165.000 0.000 NA   NA
 5930197 5930198 MMAR_0541 MMAR_0542     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5930198 5930199 MMAR_0542 MMAR_0543     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 5930199 5930200 MMAR_0543 MMAR_0544     TRUE 0.950 3.000 0.333 NA   NA
 5930200 5930201 MMAR_0544 MMAR_0545     TRUE 0.967 3.000 0.500 NA   NA
 5930201 5930202 MMAR_0545 MMAR_0546   esxG FALSE 0.336 37.000 0.000 NA   NA
 5930202 5930203 MMAR_0546 MMAR_0547 esxG esxH FALSE 0.388 29.000 0.000 NA   NA
 5930203 5930204 MMAR_0547 MMAR_0548 esxH   TRUE 0.855 9.000 0.182 NA   NA
 5930204 5930205 MMAR_0548 MMAR_0549     TRUE 0.769 72.000 0.818 NA   NA
 5930205 5930206 MMAR_0549 MMAR_0550   mycP3 TRUE 0.994 -3.000 0.556 NA   NA
 5930206 5930207 MMAR_0550 MMAR_0551 mycP3   TRUE 0.993 -10.000 0.556 NA   NA
 5930210 5930211 MMAR_0554 MMAR_0555     FALSE 0.209 67.000 0.009 1.000 N NA
 5930211 5930212 MMAR_0555 MMAR_5554     FALSE 0.289 43.000 0.000 NA   NA
 5930215 5930216 MMAR_0558 MMAR_0559     FALSE 0.222 106.000 0.067 NA   NA
 5930218 5930219 MMAR_0561 MMAR_0562     FALSE 0.172 153.000 0.333 NA   NA
 5930219 5930220 MMAR_0562 MMAR_0563     FALSE 0.010 222.000 0.000 NA   NA
 5930220 5930221 MMAR_0563 MMAR_0564     TRUE 0.657 68.000 0.500 NA   NA
 5930223 5930224 MMAR_0566 MMAR_0567     FALSE 0.016 212.000 0.000 1.000   NA
 5930224 5930225 MMAR_0567 MMAR_0568     FALSE 0.390 100.000 0.286 1.000 N NA
 5930225 5930226 MMAR_0568 MMAR_0569     FALSE 0.299 35.000 0.000 1.000 N NA
 5930227 5930228 MMAR_0570 MMAR_0571     TRUE 0.766 50.000 0.000 1.000 Y NA
 5930229 5930230 MMAR_0572 MMAR_0573     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 5930231 5930232 MMAR_0574 MMAR_0575     FALSE 0.123 98.000 0.000 NA   NA
 5930232 5930233 MMAR_0575 MMAR_0576     FALSE 0.219 30.000 0.000 NA N NA
 5930233 5930234 MMAR_0576 MMAR_0577     FALSE 0.037 119.000 0.000 NA N NA
 5930235 5930236 MMAR_0578 MMAR_0579 aroB_1   TRUE 0.820 0.000 0.000 1.000 N NA
 5930236 5930237 MMAR_0579 MMAR_0580     TRUE 0.665 11.000 0.000 1.000   NA
 5930237 5930238 MMAR_0580 MMAR_0581     TRUE 0.667 7.000 0.000 NA   NA
 5930238 5930239 MMAR_0581 MMAR_0582     TRUE 0.989 -3.000 0.286 NA   NA
 5930239 5930240 MMAR_0582 MMAR_0583     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5930240 5930241 MMAR_0583 MMAR_0584     FALSE 0.016 192.000 0.000 NA   NA
 5930242 5930243 MMAR_0585 MMAR_0586     FALSE 0.163 70.000 0.000 NA   NA
 5930244 5930245 MMAR_0587 MMAR_0588     FALSE 0.211 53.000 0.000 NA   NA
 5930245 5930246 MMAR_0588 MMAR_0589   pinR TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5930246 5930247 MMAR_0589 MMAR_0590 pinR   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5930247 5930248 MMAR_0590 MMAR_5581     TRUE 0.924 -58.000 0.000 NA   NA
 5930248 5930249 MMAR_5581 MMAR_0591     TRUE 0.927 -22.000 0.000 NA   NA
 5930249 5930250 MMAR_0591 MMAR_0592     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5930251 5930252 MMAR_0593 MMAR_0594     TRUE 0.989 -3.000 0.286 NA   NA
 5930252 5930253 MMAR_0594 MMAR_5490   glyU FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 5930253 5930254 MMAR_5490 MMAR_0595 glyU   FALSE 0.199 56.000 0.000 NA   NA
 5930255 5930256 MMAR_0596 MMAR_0597     FALSE 0.139 87.000 0.000 NA   NA
 5930256 5930257 MMAR_0597 MMAR_0598   pcp FALSE 0.426 24.000 0.000 NA   NA
 5930257 5930258 MMAR_0598 MMAR_0599 pcp   FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 5930258 5930259 MMAR_0599 MMAR_0600   dcd FALSE 0.353 46.000 0.007 NA   NA
 5930259 5930260 MMAR_0600 MMAR_0601 dcd   FALSE 0.136 90.000 0.000 NA   NA
 5930260 5930261 MMAR_0601 MMAR_0602     FALSE 0.031 156.000 0.000 NA   NA
 5930261 5930262 MMAR_0602 MMAR_0603   udgA FALSE 0.326 77.000 0.200 NA N NA
 5930262 5930263 MMAR_0603 MMAR_0604 udgA   FALSE 0.380 62.000 0.105 NA   NA
 5930263 5930264 MMAR_0604 MMAR_0605     TRUE 0.780 36.000 0.368 NA   NA
 5930264 5930265 MMAR_0605 MMAR_0606   rmlA TRUE 0.750 30.000 0.273 NA   NA
 5930266 5930267 MMAR_0607 MMAR_0608     FALSE 0.019 182.000 0.000 NA   NA
 5930269 5930270 MMAR_0610 MMAR_0611 aspC   FALSE 0.477 31.000 0.023 1.000 N NA
 5930270 5930271 MMAR_0611 MMAR_0612     FALSE 0.119 130.000 0.057 1.000 N NA
 5930272 5930273 MMAR_0613 MMAR_0614   iniB FALSE 0.031 277.000 0.286 NA   NA
 5930273 5930274 MMAR_0614 MMAR_0615 iniB iniA FALSE 0.553 101.000 0.500 NA   NA
 5930274 5930275 MMAR_0615 MMAR_0616 iniA iniC TRUE 0.997 -3.000 0.583 0.004   NA
 5930276 5930277 MMAR_0617 MMAR_0618     FALSE 0.133 92.000 0.000 NA   NA
 5930277 5930278 MMAR_0618 MMAR_0619     FALSE 0.099 108.000 0.000 NA   NA
 5930278 5930279 MMAR_0619 MMAR_0620   lpqJ FALSE 0.336 37.000 0.000 NA   NA
 5930279 5930280 MMAR_0620 MMAR_0621 lpqJ coxS_3 FALSE 0.133 92.000 0.000 NA   NA
 5930280 5930281 MMAR_0621 MMAR_0622 coxS_3 coxM_3 TRUE 0.999 -7.000 0.273 0.002 Y NA
 5930281 5930282 MMAR_0622 MMAR_0623 coxM_3 coxL_3 TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 5930284 5930285 MMAR_0625 MMAR_0627   ansP1_1 FALSE 0.028 161.000 0.000 NA   NA
 5930285 5930286 MMAR_0627 MMAR_0628 ansP1_1   FALSE 0.003 281.000 0.000 NA N NA
 5930286 5930287 MMAR_0628 MMAR_0629     FALSE 0.200 34.000 0.000 NA N NA
 5930288 5930289 MMAR_0630 MMAR_0631   kdpA FALSE 0.001 837.000 0.000 1.000 N NA
 5930289 5930290 MMAR_0631 MMAR_0632 kdpA kdpB TRUE 0.995 0.000 0.124 0.001 Y NA
 5930290 5930291 MMAR_0632 MMAR_0633 kdpB kdpC TRUE 0.992 3.000 0.877 0.001   NA
 5930291 5930292 MMAR_0633 MMAR_0634 kdpC kdpD TRUE 0.893 8.000 0.014 0.050   NA
 5930292 5930293 MMAR_0634 MMAR_0635 kdpD kdpE TRUE 0.998 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5930295 5930296 MMAR_0637 MMAR_0638 dnaK grpE TRUE 0.998 -3.000 0.074 0.004 Y NA
 5930296 5930297 MMAR_0638 MMAR_0639 grpE dnaJ TRUE 0.875 58.000 0.068 0.004 Y NA
 5930297 5930298 MMAR_0639 MMAR_0640 dnaJ hspR TRUE 0.907 1.000 0.074 1.000 N NA
 5930299 5930300 MMAR_0641 MMAR_0642     FALSE 0.038 331.000 0.000 NA Y NA
 5930300 5930301 MMAR_0642 MMAR_0643     FALSE 0.001 1208.000 0.000 NA N NA
 5930301 5930302 MMAR_0643 MMAR_0644     TRUE 0.693 75.000 0.667 1.000 N NA
 5930305 5930306 MMAR_0647 MMAR_0648     FALSE 0.569 45.000 0.188 NA   NA
 5930306 5930307 MMAR_0648 MMAR_0649   pyrE TRUE 0.969 -13.000 0.028 1.000   NA
 5930307 5930308 MMAR_0649 MMAR_0650 pyrE   TRUE 0.695 11.000 0.012 NA   NA
 5930308 5930309 MMAR_0650 MMAR_0651     TRUE 0.975 -3.000 0.055 NA   NA
 5930310 5930311 MMAR_0652 MMAR_0653 secE2   FALSE 0.478 18.000 0.000 NA   NA
 5930312 5930313 MMAR_0654 MMAR_0655   coxM FALSE 0.441 61.000 0.250 NA N NA
 5930313 5930314 MMAR_0655 MMAR_0656 coxM coxS TRUE 0.999 0.000 0.909 0.002 Y NA
 5930314 5930315 MMAR_0656 MMAR_0657 coxS coxL TRUE 1.000 -3.000 0.818 0.002 Y NA
 5930315 5930316 MMAR_0657 MMAR_0658 coxL   TRUE 0.955 10.000 0.750 NA N NA
 5930316 5930317 MMAR_0658 MMAR_0659     TRUE 0.990 -3.000 0.333 NA   NA
 5930317 5930318 MMAR_0659 MMAR_0660     TRUE 0.939 1.000 0.200 NA   NA
 5930318 5930319 MMAR_0660 MMAR_0661     TRUE 0.835 14.000 0.250 NA   NA
 5930319 5930320 MMAR_0661 MMAR_0662     TRUE 0.883 7.000 0.208 NA   NA
 5930321 5930322 MMAR_0663 MMAR_0664 eutC eutB TRUE 1.000 -3.000 0.859 0.001 Y NA
 5930322 5930323 MMAR_0664 MMAR_0665 eutB   TRUE 0.998 -3.000 0.407 1.000 Y NA
 5930324 5930325 MMAR_0666 MMAR_0667 cya_1   FALSE 0.099 99.000 0.000 1.000 N NA
 5930328 5930329 MMAR_0670 MMAR_0671 mgtE   FALSE 0.002 767.000 0.000 NA   NA
 5930330 5930331 MMAR_0672 MMAR_0673     FALSE 0.010 224.000 0.000 NA   NA
 5930331 5930332 MMAR_0673 MMAR_0674     FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5930332 5930333 MMAR_0674 MMAR_0675     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5930333 5930334 MMAR_0675 MMAR_0676     TRUE 0.808 1.000 0.000 NA   NA
 5930335 5930336 MMAR_0677 MMAR_0678     FALSE 0.431 45.000 0.011 1.000   NA
 5930336 5930337 MMAR_0678 MMAR_0679     FALSE 0.593 20.000 0.020 NA   NA
 5930338 5930339 MMAR_0680 MMAR_0681 purA   TRUE 0.975 -3.000 0.052 NA   NA
 5930342 5930343 MMAR_0684 MMAR_0685     FALSE 0.002 312.000 0.000 NA N NA
 5930344 5930345 MMAR_0686 MMAR_0687 purT   TRUE 0.948 -3.000 0.019 NA N NA
 5930345 5930346 MMAR_0687 MMAR_0688   metZ FALSE 0.239 88.000 0.092 NA N NA
 5930349 5930350 MMAR_0691 MMAR_0692   tauD_1 TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5930350 5930351 MMAR_0692 MMAR_0693 tauD_1 panD_1 TRUE 0.820 0.000 0.000 1.000 N NA
 5930351 5930352 MMAR_0693 MMAR_0694 panD_1   TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5930352 5930353 MMAR_0694 MMAR_0695     FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 5930353 5930354 MMAR_0695 MMAR_0696   lpqK TRUE 0.923 4.000 0.250 NA   NA
 5930354 5930355 MMAR_0696 MMAR_0697 lpqK   FALSE 0.193 50.000 0.000 1.000 N NA
 5930355 5930356 MMAR_0697 MMAR_0698   fadE7 TRUE 0.977 12.000 0.214 0.030 Y NA
 5930357 5930358 MMAR_0699 MMAR_0700     FALSE 0.021 174.000 0.000 NA   NA
 5930358 5930359 MMAR_0700 MMAR_0701     TRUE 0.985 -3.000 0.222 NA   NA
 5930359 5930360 MMAR_0701 MMAR_0702     TRUE 0.997 -3.000 0.250 NA Y NA
 5930360 5930361 MMAR_0702 MMAR_0703     TRUE 0.997 -3.000 0.250 NA Y NA
 5930362 5930363 MMAR_0704 MMAR_0705 mmpL1 mmpS1_1 TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5930364 5930365 MMAR_0706 MMAR_0707 fadD30 pks6 TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5930367 5930368 MMAR_0709 MMAR_0710 fgd1 pta TRUE 0.763 8.000 0.021 NA   NA
 5930368 5930369 MMAR_0710 MMAR_0711 pta ackA TRUE 0.983 -10.000 0.185 1.000   NA
 5930369 5930370 MMAR_0711 MMAR_0712 ackA   FALSE 0.046 179.000 0.029 1.000   NA
 5930371 5930372 MMAR_0713 MMAR_0714 pknG glnH TRUE 0.996 0.000 0.622 1.000 Y NA
 5930372 5930373 MMAR_0714 MMAR_0715 glnH   TRUE 0.991 0.000 0.895 NA   NA
 5930376 5930377 MMAR_0718 MMAR_0719 thiO thiS TRUE 0.995 -3.000 0.625 1.000 N NA
 5930377 5930378 MMAR_0719 MMAR_0720 thiS thiG TRUE 0.996 -7.000 0.104 1.000 Y NA
 5930378 5930379 MMAR_0720 MMAR_0721 thiG   TRUE 0.971 -3.000 0.009 1.000   NA
 5930381 5930382 MMAR_0723 MMAR_0724     FALSE 0.281 44.000 0.000 NA   NA
 5930382 5930383 MMAR_0724 MMAR_0725     FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5930383 5930384 MMAR_0725 MMAR_0726   lpqL FALSE 0.187 133.000 0.222 NA   NA
 5930384 5930385 MMAR_0726 MMAR_0727 lpqL lpqL_1 TRUE 0.998 -3.000 0.778 0.001   NA
 5930385 5930386 MMAR_0727 MMAR_0728 lpqL_1 lpqM FALSE 0.335 113.000 0.286 NA   NA
 5930389 5930390 MMAR_0731 MMAR_0732     TRUE 0.990 -3.000 0.333 NA   NA
 5930392 5930393 MMAR_0733 MMAR_0734   thiD TRUE 0.976 -3.000 0.059 NA   NA
 5930393 5930394 MMAR_0734 MMAR_0735 thiD thiC TRUE 0.998 -3.000 0.015 0.006 Y NA
 5930395 5930396 MMAR_0736 MMAR_0737     FALSE 0.525 104.000 0.429 1.000   NA
 5930396 5930397 MMAR_0737 MMAR_0738     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.085 Y NA
 5930398 5930399 MMAR_0739 MMAR_0740   ctpH TRUE 0.767 47.000 0.500 NA   NA
 5930399 5930400 MMAR_0740 MMAR_0741 ctpH   TRUE 0.792 20.000 0.250 NA   NA
 5930400 5930401 MMAR_0741 MMAR_0742   xthA FALSE 0.065 144.000 0.015 NA   NA
 5930401 5930402 MMAR_0742 MMAR_0743 xthA   TRUE 0.893 3.000 0.088 NA   NA
 5930402 5930403 MMAR_0743 MMAR_0744   def TRUE 0.981 0.000 0.488 NA   NA
 5930404 5930405 MMAR_0745 MMAR_0746     FALSE 0.410 65.000 0.176 NA   NA
 5930405 5930406 MMAR_0746 MMAR_0747   sodC TRUE 0.639 73.000 0.500 NA   NA
 5930406 5930407 MMAR_0747 MMAR_0748 sodC   TRUE 0.978 -19.000 0.128 1.000   NA
 5930409 5930410 MMAR_0750 MMAR_0751     FALSE 0.047 138.000 0.000 NA   NA
 5930411 5930412 MMAR_0752 MMAR_0753   pssA TRUE 0.964 -3.000 0.025 1.000 N NA
 5930412 5930413 MMAR_0753 MMAR_0754 pssA psd TRUE 0.904 54.000 0.466 1.000 Y NA
 5930413 5930414 MMAR_0754 MMAR_0755 psd   FALSE 0.140 86.000 0.000 NA   NA
 5930414 5930415 MMAR_0755 MMAR_0756   moeA2 FALSE 0.004 314.000 0.000 NA   NA
 5930415 5930416 MMAR_0756 MMAR_0757 moeA2   TRUE 0.737 19.000 0.188 1.000 N NA
 5930416 5930417 MMAR_0757 MMAR_0758     TRUE 0.662 47.000 0.333 1.000 N NA
 5930419 5930420 MMAR_0760 MMAR_0761     FALSE 0.169 67.000 0.000 NA   NA
 5930420 5930421 MMAR_0761 MMAR_0762     FALSE 0.338 96.000 0.250 NA N NA
 5930422 5930423 MMAR_0763 MMAR_0764     TRUE 0.745 10.000 0.027 NA   NA
 5930424 5930425 MMAR_0765 MMAR_0766   sigK TRUE 0.996 -3.000 0.778 NA   NA
 5930425 5930426 MMAR_0766 MMAR_0767 sigK   FALSE 0.522 46.000 0.065 1.000   NA
 5930426 5930427 MMAR_0767 MMAR_0768   ufaA1 TRUE 0.982 -3.000 0.081 1.000   NA
 5930427 5930428 MMAR_0768 MMAR_0769 ufaA1   TRUE 0.977 -3.000 0.067 NA   NA
 5930428 5930429 MMAR_0769 MMAR_0770     TRUE 0.996 -6.000 0.722 NA   NA
 5930429 5930430 MMAR_0770 MMAR_0771   mmpL5_2 FALSE 0.312 59.000 0.007 1.000   NA
 5930430 5930431 MMAR_0771 MMAR_0772 mmpL5_2 mmpS4_2 TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5930432 5930433 MMAR_0773 MMAR_0774     FALSE 0.007 259.000 0.000 NA   NA
 5930433 5930434 MMAR_0774 MMAR_0775     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5930435 5930436 MMAR_0776 MMAR_0777     FALSE 0.006 276.000 0.000 NA   NA
 5930436 5930437 MMAR_0777 MMAR_0778   echA2 FALSE 0.293 67.000 0.039 NA   NA
 5930437 5930438 MMAR_0778 MMAR_0779 echA2   FALSE 0.110 92.000 0.000 1.000 N NA
 5930439 5930440 MMAR_0780 MMAR_0781 putA_1   TRUE 0.908 0.000 0.021 NA   NA
 5930440 5930441 MMAR_0781 MMAR_0782     TRUE 0.632 21.000 0.042 NA   NA
 5930441 5930442 MMAR_0782 MMAR_0783     TRUE 0.997 -7.000 1.000 NA   NA
 5930444 5930445 MMAR_0785 MMAR_0786 lpd   TRUE 0.853 3.000 0.028 NA   NA
 5930446 5930447 MMAR_5564 MMAR_0787     FALSE 0.156 73.000 0.000 NA   NA
 5930447 5930448 MMAR_0787 MMAR_0789     FALSE 0.010 231.000 0.000 NA   NA
 5930448 5930449 MMAR_0789 MMAR_0790     TRUE 0.989 -3.000 0.286 NA   NA
 5930450 5930451 MMAR_0791 MMAR_0792   icl FALSE 0.004 308.000 0.000 1.000 N NA
 5930451 5930452 MMAR_0792 MMAR_0793 icl fadB2 FALSE 0.045 164.000 0.036 1.000 N NA
 5930452 5930453 MMAR_0793 MMAR_0794 fadB2 umaA FALSE 0.121 136.000 0.130 1.000 N NA
 5930454 5930455 MMAR_0795 MMAR_0796   pcaA FALSE 0.105 119.000 0.000 1.000   NA
 5930455 5930456 MMAR_0796 MMAR_0797 pcaA   FALSE 0.061 158.000 0.056 1.000 N NA
 5930457 5930458 MMAR_0798 MMAR_0799     FALSE 0.259 86.000 0.017 1.000   NA
 5930458 5930459 MMAR_0799 MMAR_0800   hbhA FALSE 0.005 355.000 0.012 NA   NA
 5930459 5930460 MMAR_0800 MMAR_0801 hbhA   FALSE 0.141 153.000 0.270 NA   NA
 5930460 5930461 MMAR_0801 MMAR_0802     TRUE 0.879 5.000 0.143 NA   NA
 5930461 5930462 MMAR_0802 MMAR_0803   deoC TRUE 0.916 0.000 0.030 NA   NA
 5930463 5930464 MMAR_0804 MMAR_0805     TRUE 0.979 -3.000 0.091 NA   NA
 5930464 5930465 MMAR_0805 MMAR_0806     FALSE 0.374 31.000 0.000 NA   NA
 5930465 5930466 MMAR_0806 MMAR_0807     FALSE 0.003 417.000 0.000 NA   NA
 11425288 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 1953.000 0.000 NA   NA
 11567651 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 1953.000 0.000 NA   NA
 11710043 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 1953.000 0.000 NA   NA
 11425289 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 1974.000 0.000 NA   NA
 11567652 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 1974.000 0.000 NA   NA
 11710044 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 1974.000 0.000 NA   NA
 11425290 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2049.000 0.000 NA   NA
 11567653 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2049.000 0.000 NA   NA
 11710045 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2049.000 0.000 NA   NA
 11425291 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2070.000 0.000 NA   NA
 11567654 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2070.000 0.000 NA   NA
 11710046 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2070.000 0.000 NA   NA
 11425292 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2160.000 0.000 NA   NA
 11567655 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2160.000 0.000 NA   NA
 11710047 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2160.000 0.000 NA   NA
 11425293 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2181.000 0.000 NA   NA
 11567656 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2181.000 0.000 NA   NA
 11710048 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2181.000 0.000 NA   NA
 11425294 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2262.000 0.000 NA   NA
 11567657 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2262.000 0.000 NA   NA
 11710049 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2262.000 0.000 NA   NA
 11425295 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2283.000 0.000 NA   NA
 11567658 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2283.000 0.000 NA   NA
 11710050 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2283.000 0.000 NA   NA
 11425296 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2367.000 0.000 NA   NA
 11567659 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2367.000 0.000 NA   NA
 11710051 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2367.000 0.000 NA   NA
 11425297 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2388.000 0.000 NA   NA
 11567660 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2388.000 0.000 NA   NA
 11710052 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2388.000 0.000 NA   NA
 11425298 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2478.000 0.000 NA   NA
 11567661 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2478.000 0.000 NA   NA
 11710053 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2478.000 0.000 NA   NA
 11425299 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2499.000 0.000 NA   NA
 11567662 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2499.000 0.000 NA   NA
 11710054 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2499.000 0.000 NA   NA
 11425300 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2580.000 0.000 NA   NA
 11567663 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2580.000 0.000 NA   NA
 11710055 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2580.000 0.000 NA   NA
 11425301 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2601.000 0.000 NA   NA
 11567664 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2601.000 0.000 NA   NA
 11710056 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2601.000 0.000 NA   NA
 11425302 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2667.000 0.000 NA   NA
 11567665 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2667.000 0.000 NA   NA
 11710057 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2667.000 0.000 NA   NA
 11425303 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2688.000 0.000 NA   NA
 11567666 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2688.000 0.000 NA   NA
 11710058 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2688.000 0.000 NA   NA
 11425304 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2727.000 0.000 NA   NA
 11567667 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2727.000 0.000 NA   NA
 11710059 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2727.000 0.000 NA   NA
 11425305 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2748.000 0.000 NA   NA
 11567668 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2748.000 0.000 NA   NA
 11710060 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2748.000 0.000 NA   NA
 11425306 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2781.000 0.000 NA   NA
 11567669 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2781.000 0.000 NA   NA
 11710061 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2781.000 0.000 NA   NA
 11425307 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2802.000 0.000 NA   NA
 11567670 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2802.000 0.000 NA   NA
 11710062 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2802.000 0.000 NA   NA
 11425308 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2847.000 0.000 NA   NA
 11567671 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2847.000 0.000 NA   NA
 11710063 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2847.000 0.000 NA   NA
 11425309 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2868.000 0.000 NA   NA
 11567672 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2868.000 0.000 NA   NA
 11710064 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2868.000 0.000 NA   NA
 11425310 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2901.000 0.000 NA   NA
 11567673 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2901.000 0.000 NA   NA
 11710065 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2901.000 0.000 NA   NA
 11425311 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2922.000 0.000 NA   NA
 11567674 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2922.000 0.000 NA   NA
 11710066 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2922.000 0.000 NA   NA
 11425312 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2967.000 0.000 NA   NA
 11567675 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2967.000 0.000 NA   NA
 11710067 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2967.000 0.000 NA   NA
 11425313 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2988.000 0.000 NA   NA
 11567676 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2988.000 0.000 NA   NA
 11710068 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 2988.000 0.000 NA   NA
 11425314 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3012.000 0.000 NA   NA
 11567677 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3012.000 0.000 NA   NA
 11710069 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3012.000 0.000 NA   NA
 11425315 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3033.000 0.000 NA   NA
 11567678 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3033.000 0.000 NA   NA
 11710070 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3033.000 0.000 NA   NA
 11425316 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3069.000 0.000 NA   NA
 11567679 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3069.000 0.000 NA   NA
 11710071 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3069.000 0.000 NA   NA
 11425317 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3090.000 0.000 NA   NA
 11567680 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3090.000 0.000 NA   NA
 11710072 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3090.000 0.000 NA   NA
 11425318 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3126.000 0.000 NA   NA
 11567681 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3126.000 0.000 NA   NA
 11710073 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3126.000 0.000 NA   NA
 11425319 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3147.000 0.000 NA   NA
 11567682 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3147.000 0.000 NA   NA
 11710074 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3147.000 0.000 NA   NA
 11425320 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3171.000 0.000 NA   NA
 11567683 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3171.000 0.000 NA   NA
 11710075 5930462   MMAR_0803   deoC FALSE NA 3171.000 0.000 NA   NA
 5930467 5930468 MMAR_0808 MMAR_0809 murB lprQ FALSE 0.509 36.000 0.036 NA   NA
 5930470 5930471 MMAR_0811 MMAR_0812     TRUE 0.712 12.000 0.082 NA N NA
 5930471 5930472 MMAR_0812 MMAR_0813     TRUE 0.994 -3.000 0.541 NA   NA
 5930472 5930473 MMAR_0813 MMAR_0814   gpm1 TRUE 0.800 14.000 0.196 NA   NA
 5930473 5930474 MMAR_0814 MMAR_0815 gpm1 senX3 FALSE 0.144 136.000 0.196 1.000 N NA
 5930474 5930475 MMAR_0815 MMAR_0816 senX3 regX3 FALSE 0.531 156.000 0.437 1.000 Y NA
 5930476 5930477 MMAR_0817 MMAR_0818     TRUE 0.989 -3.000 0.300 NA   NA
 5930477 5930478 MMAR_0818 MMAR_0819     TRUE 0.673 33.000 0.200 NA   NA
 5930481 5930482 MMAR_0822 MMAR_0823     TRUE 0.989 -3.000 0.286 NA   NA
 5930482 5930483 MMAR_0823 MMAR_0824     TRUE 0.735 17.000 0.127 NA   NA
 5930483 5930484 MMAR_0824 MMAR_0825     TRUE 0.906 2.000 0.076 NA   NA
 5930484 5930485 MMAR_0825 MMAR_0826   proC TRUE 0.722 25.000 0.143 1.000   NA
 5930485 5930486 MMAR_0826 MMAR_0827 proC   FALSE 0.157 142.000 0.186 1.000   NA
 5930486 5930487 MMAR_0827 MMAR_0828     FALSE 0.169 139.000 0.233 NA   NA
 5930487 5930488 MMAR_0828 MMAR_0829   galE2 FALSE 0.529 79.000 0.356 NA   NA
 5930488 5930489 MMAR_0829 MMAR_0830 galE2   TRUE 0.972 6.000 0.796 1.000 N NA
 5930490 5930491 MMAR_0831 MMAR_0832 cmaA2   TRUE 0.842 23.000 0.400 1.000 N NA
 5930491 5930492 MMAR_0832 MMAR_0833   serB1 FALSE 0.512 45.000 0.145 1.000 N NA
 5930493 5930494 MMAR_0834 MMAR_0835 coxS_1 coxM_1 TRUE 0.997 4.000 1.000 0.090 Y NA
 5930494 5930495 MMAR_0835 MMAR_0836 coxM_1 coxL_1 TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.001 Y NA
 5930496 5930497 MMAR_0837 MMAR_0838     FALSE 0.002 438.000 0.000 NA   NA
 5930497 5930498 MMAR_0838 MMAR_5582   mimJ FALSE 0.022 173.000 0.000 NA   NA
 5930499 5930500 MMAR_0839 MMAR_0840   mmpL2 TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5930500 5930501 MMAR_0840 MMAR_0841 mmpL2   TRUE 0.895 0.000 0.007 NA   NA
 5930501 5930502 MMAR_0841 MMAR_0842   hemA FALSE 0.141 111.000 0.012 NA   NA
 5930502 5930503 MMAR_0842 MMAR_0843 hemA hemC TRUE 0.975 14.000 0.178 0.002 Y NA
 5930503 5930504 MMAR_0843 MMAR_0844 hemC hemD TRUE 0.957 22.000 0.044 0.002 Y NA
 5930504 5930505 MMAR_0844 MMAR_0845 hemD hemB TRUE 0.967 40.000 0.429 0.002 Y NA
 5930505 5930506 MMAR_0845 MMAR_0846 hemB   TRUE 0.727 12.000 0.039 NA   NA
 5930506 5930507 MMAR_0846 MMAR_0847     TRUE 0.992 -3.000 0.389 NA   NA
 5930508 5930509 MMAR_0848 MMAR_0851     TRUE 0.808 1.000 0.000 NA   NA
 5930509 5930510 MMAR_0851 MMAR_0852   cyp185A4 FALSE 0.016 1254.000 0.000 1.000 Y NA
 5930510 5930511 MMAR_0852 MMAR_0853 cyp185A4   FALSE 0.001 962.000 0.000 NA N NA
 5930512 5930513 MMAR_0854 MMAR_0855     FALSE 0.274 106.000 0.200 1.000 N NA
 5930514 5930515 MMAR_0856 MMAR_0857     FALSE 0.268 112.000 0.200 NA   NA
 5930515 5930516 MMAR_0857 MMAR_0858     FALSE 0.400 52.000 0.167 NA N NA
 5930517 5930518 MMAR_0859 MMAR_0860   ctpF FALSE 0.057 123.000 0.000 1.000 N NA
 5930518 5930519 MMAR_0860 MMAR_0861 ctpF   FALSE 0.005 271.000 0.000 1.000 N NA
 5930519 5930520 MMAR_0861 MMAR_0862   gabP FALSE 0.019 170.000 0.000 1.000 N NA
 5930521 5930522 MMAR_0863 MMAR_0864 apbA   TRUE 0.925 16.000 0.667 1.000 N NA
 5930524 5930525 MMAR_0867 MMAR_0868     FALSE 0.147 103.000 0.000 1.000   NA
 5930526 5930527 MMAR_0869 MMAR_0870   hemL FALSE 0.127 74.000 0.000 1.000 N NA
 5930527 5930528 MMAR_0870 MMAR_0871 hemL   TRUE 0.942 0.000 0.204 NA N NA
 5930528 5930529 MMAR_0871 MMAR_0872     TRUE 0.802 3.000 0.035 NA N NA
 5930529 5930530 MMAR_0872 MMAR_0873   ccsA TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5930530 5930531 MMAR_0873 MMAR_0874 ccsA   TRUE 0.666 102.000 0.131 NA Y NA
 5930531 5930532 MMAR_0874 MMAR_0875   ccsB TRUE 0.996 -3.000 0.082 NA Y NA
 5930532 5930533 MMAR_0875 MMAR_0876 ccsB   TRUE 0.691 42.000 0.308 1.000 N NA
 5930536 5930537 MMAR_0879 MMAR_0880 fabH menA FALSE 0.155 99.000 0.011 1.000 N NA
 5930538 5930539 MMAR_0881 MMAR_0882 pnp galE3 TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5930541 5930542 MMAR_0884 MMAR_0885     FALSE 0.577 30.000 0.048 NA   NA
 5930542 5930543 MMAR_0885 MMAR_0886     TRUE 0.979 -3.000 0.109 NA   NA
 5930544 5930545 MMAR_0887 MMAR_0888   menE TRUE 0.663 12.000 0.008 NA   NA
 5930545 5930546 MMAR_0888 MMAR_0889 menE   FALSE 0.403 45.000 0.024 NA   NA
 5930546 5930547 MMAR_0889 MMAR_0890     FALSE 0.411 61.000 0.150 NA   NA
 5930547 5930548 MMAR_0890 MMAR_0891   pitA TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5930548 5930549 MMAR_0891 MMAR_0892 pitA   FALSE 0.313 98.000 0.167 NA   NA
 5930549 5930550 MMAR_0892 MMAR_0893     FALSE 0.528 14.000 0.000 NA   NA
 5930550 5930551 MMAR_0893 MMAR_0894     FALSE 0.469 19.000 0.000 NA   NA
 5930551 5930552 MMAR_0894 MMAR_0895   menB FALSE 0.426 44.000 0.005 1.000   NA
 5930552 5930553 MMAR_0895 MMAR_0896 menB   TRUE 0.961 -3.000 0.005 NA   NA
 5930553 5930554 MMAR_0896 MMAR_0897   fadD8 FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 5930555 5930556 MMAR_0898 MMAR_0899   menC TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5930556 5930557 MMAR_0899 MMAR_0900 menC bpoC TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5930557 5930558 MMAR_0900 MMAR_0901 bpoC menD FALSE 0.271 64.000 0.022 NA   NA
 5930558 5930559 MMAR_0901 MMAR_0902 menD   TRUE 0.975 -3.000 0.055 NA   NA
 5930559 5930560 MMAR_0902 MMAR_0903   pimB FALSE 0.453 76.000 0.259 NA   NA
 5930562 5930563 MMAR_0905 MMAR_0906     TRUE 0.934 -10.000 0.000 NA   NA
 5930563 5930564 MMAR_0906 MMAR_0907   menH FALSE 0.388 29.000 0.000 NA   NA
 5930565 5930566 MMAR_0908 MMAR_0909     TRUE 0.694 33.000 0.222 NA   NA
 5930566 5930567 MMAR_0909 MMAR_0910     FALSE 0.377 54.000 0.029 1.000   NA
 5930568 5930569 MMAR_0911 MMAR_0912 grcC1 hspX FALSE 0.225 91.000 0.042 1.000 N NA
 5930570 5930571 MMAR_0913 MMAR_0914 sulP sulP_1 FALSE 0.086 293.000 0.000 0.014 Y NA
 5930571 5930572 MMAR_0914 MMAR_0915 sulP_1 gpdA1 FALSE 0.007 233.000 0.000 1.000 N NA
 5930574 5930575 MMAR_0917 MMAR_0918     FALSE 0.002 450.000 0.000 1.000 N NA
 5930575 5930576 MMAR_0918 MMAR_0919   rimL FALSE 0.028 149.000 0.000 1.000 N NA
 5930576 5930577 MMAR_0919 MMAR_0920 rimL   FALSE 0.112 102.000 0.000 NA   NA
 5930579 5930580 MMAR_0921 MMAR_0922     TRUE 0.996 -3.000 0.028 1.000 Y NA
 5930580 5930581 MMAR_0922 MMAR_0923     TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5930581 5930582 MMAR_0923 MMAR_0924     FALSE 0.096 123.000 0.000 1.000   NA
 5930582 5930583 MMAR_0924 MMAR_0925   nhaP FALSE 0.059 122.000 0.000 1.000 N NA
 5930583 5930584 MMAR_0925 MMAR_0926 nhaP   FALSE 0.014 158.000 0.000 NA N NA
 5930589 5930590 MMAR_0931 MMAR_0932     FALSE 0.005 294.000 0.000 NA   NA
 5930590 5930591 MMAR_0932 MMAR_0933     FALSE 0.397 28.000 0.000 NA   NA
 5930591 5930592 MMAR_0933 MMAR_0934     FALSE 0.105 105.000 0.000 NA   NA
 5930592 5930593 MMAR_0934 MMAR_0935     FALSE 0.314 48.000 0.000 1.000   NA
 5930593 5930594 MMAR_0935 MMAR_0936   atsA_1 FALSE 0.055 125.000 0.000 1.000 N NA
 5930594 5930595 MMAR_0936 MMAR_0937 atsA_1 gatA_1 FALSE 0.134 70.000 0.000 1.000 N NA
 5930595 5930596 MMAR_0937 MMAR_0938 gatA_1 cyp135B4 FALSE 0.011 199.000 0.000 1.000 N NA
 5930598 5930599 MMAR_0940 MMAR_0941 galT galK TRUE 0.996 -3.000 0.370 0.001 N NA
 5930599 5930600 MMAR_0941 MMAR_0942 galK   FALSE 0.143 81.000 0.000 NA   NA
 5930605 5930606 MMAR_0947 MMAR_0948     FALSE 0.179 62.000 0.000 NA   NA
 5930606 5930607 MMAR_0948 MMAR_0949   lppF FALSE 0.086 114.000 0.000 NA   NA
 5930607 5930608 MMAR_0949 MMAR_0950 lppF lpqN FALSE 0.013 204.000 0.000 NA   NA
 5930609 5930610 MMAR_0951 MMAR_0952     FALSE 0.587 11.000 0.000 NA   NA
 5930611 5930612 MMAR_0953 MMAR_5583     TRUE 0.934 -10.000 0.000 NA   NA
 5930612 5930613 MMAR_5583 MMAR_0954     FALSE 0.135 91.000 0.000 NA   NA
 5930615 5930616 MMAR_0956 MMAR_0957 recD recB TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 5930616 5930617 MMAR_0957 MMAR_0958 recB recC TRUE 0.998 0.000 0.542 0.001 Y NA
 5930618 5930619 MMAR_0959 MMAR_0960   cynS FALSE 0.127 74.000 0.000 1.000 N NA
 5930619 5930620 MMAR_0960 MMAR_0961 cynS   FALSE 0.606 23.000 0.011 1.000   NA
 5930621 5930622 MMAR_0962 MMAR_0963 echA3   FALSE 0.294 82.000 0.067 NA   NA
 5930622 5930623 MMAR_0963 MMAR_0965   gloB FALSE 0.023 194.000 0.006 NA   NA
 5930624 5930625 MMAR_0966 MMAR_5492   thrT FALSE 0.043 142.000 0.000 NA   NA
 5930625 5930626 MMAR_5492 MMAR_5493 thrT metT FALSE 0.211 53.000 0.000 NA   NA
 5930626 5930627 MMAR_5493 MMAR_0967 metT rpmG2 FALSE 0.273 45.000 0.000 NA   NA
 5930627 5930628 MMAR_0967 MMAR_0968 rpmG2   FALSE 0.431 51.000 0.079 NA   NA
 5930628 5930629 MMAR_0968 MMAR_0969     TRUE 0.996 -13.000 0.818 NA   NA
 5930629 5930630 MMAR_0969 MMAR_0970     TRUE 0.993 11.000 0.818 0.068 Y NA
 5930630 5930631 MMAR_0970 MMAR_5494   trpT FALSE 0.036 148.000 0.000 NA   NA
 5930631 5930632 MMAR_5494 MMAR_0971 trpT secE FALSE 0.035 149.000 0.000 NA   NA
 5930632 5930633 MMAR_0971 MMAR_0972 secE nusG FALSE 0.424 32.000 0.006 1.000 N NA
 5930633 5930634 MMAR_0972 MMAR_0973 nusG rplK TRUE 0.821 47.000 0.681 1.000 N NA
 5930634 5930635 MMAR_0973 MMAR_0974 rplK rplA TRUE 0.946 88.000 0.838 0.016 Y NA
 5930636 5930637 MMAR_0975 MMAR_0976     TRUE 0.942 16.000 0.778 NA   NA
 5930637 5930638 MMAR_0976 MMAR_0977   mmaA4 FALSE 0.320 105.000 0.222 NA   NA
 5930638 5930639 MMAR_0977 MMAR_0978 mmaA4 mmaA3 TRUE 0.661 143.000 0.286 0.005 Y NA
 5930639 5930640 MMAR_0978 MMAR_0979 mmaA3 mmaA5_1 TRUE 0.838 133.000 0.667 0.005 Y NA
 5930640 5930641 MMAR_0979 MMAR_0980 mmaA5_1 mmaA1 TRUE 0.686 147.000 0.400 0.005 Y NA
 5930641 5930642 MMAR_0980 MMAR_0981 mmaA1 lipG1 FALSE 0.547 97.000 0.444 NA   NA
 5930642 5930643 MMAR_0981 MMAR_0982 lipG1   TRUE 0.873 10.000 0.243 NA   NA
 5930643 5930644 MMAR_0982 MMAR_0983   lipG2 FALSE 0.160 120.000 0.054 NA   NA
 5930644 5930645 MMAR_0983 MMAR_0984 lipG2 amiD FALSE 0.223 51.000 0.000 NA   NA
 5930646 5930647 MMAR_0985 MMAR_0986   fabD2 TRUE 0.997 -3.000 0.857 1.000   NA
 5930647 5930648 MMAR_0986 MMAR_0987 fabD2   TRUE 0.736 7.000 0.000 1.000   NA
 5930650 5930651 MMAR_0989 MMAR_0990   rplJ FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   NA
 5930651 5930652 MMAR_0990 MMAR_0991 rplJ rplL TRUE 0.959 68.000 0.884 0.012 Y NA
 5930654 5930655 MMAR_0993 MMAR_0994   mkl FALSE 0.027 179.000 0.038 NA N NA
 5930655 5930656 MMAR_0994 MMAR_0995 mkl rpoB FALSE 0.001 593.000 0.000 1.000 N NA
 5930656 5930657 MMAR_0995 MMAR_0996 rpoB rpoC TRUE 0.972 53.000 0.851 0.001 Y NA
 5930657 5930658 MMAR_0996 MMAR_5546 rpoC   FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 5930660 5930661 MMAR_0998 MMAR_0999   end FALSE 0.143 81.000 0.000 NA   NA
 5930661 5930662 MMAR_0999 MMAR_1000 end lpqP FALSE 0.202 65.000 0.004 1.000 N NA
 5930662 5930663 MMAR_1000 MMAR_1001 lpqP   FALSE 0.335 62.000 0.071 1.000 N NA
 5930663 5930664 MMAR_1001 MMAR_1002   echA4 TRUE 0.977 9.000 0.286 1.000 Y NA
 5930664 5930665 MMAR_1002 MMAR_1003 echA4   TRUE 0.828 14.000 0.292 NA N NA
 5930665 5930666 MMAR_1003 MMAR_1004   echA5 TRUE 0.970 -3.000 0.083 NA N NA
 5930667 5930668 MMAR_1005 MMAR_1006 mmpL5 mmpS5 TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5930670 5930671 MMAR_1008 MMAR_1009     TRUE 0.833 50.000 0.778 NA   NA
 5930672 5930673 MMAR_1010 MMAR_1011   rpsL FALSE 0.004 376.000 0.000 1.000   NA
 5930673 5930674 MMAR_1011 MMAR_1012 rpsL rpsG TRUE 0.998 0.000 0.620 0.002 Y NA
 5930674 5930675 MMAR_1012 MMAR_1013 rpsG fusA1 TRUE 0.883 81.000 0.579 1.000 Y NA
 5930675 5930676 MMAR_1013 MMAR_1014 fusA1 tuf FALSE 0.536 187.000 0.400 0.001 Y NA
 5930676 5930677 MMAR_1014 MMAR_1015 tuf   FALSE 0.008 250.000 0.000 NA   NA
 5930677 5930678 MMAR_1015 MMAR_1016     FALSE 0.252 134.000 0.333 NA   NA
 5930678 5930679 MMAR_1016 MMAR_1017     TRUE 0.925 10.000 0.214 0.067   NA
 5930680 5930681 MMAR_1018 MMAR_1019     TRUE 0.939 0.000 0.088 NA   NA
 5930682 5930683 MMAR_1020 MMAR_1021   pqqE TRUE 0.993 -3.000 0.484 NA   NA
 5930683 5930684 MMAR_1021 MMAR_1022 pqqE lldD1 TRUE 0.973 3.000 0.548 1.000   NA
 5930684 5930685 MMAR_1022 MMAR_1023 lldD1   FALSE 0.219 155.000 0.464 NA   NA
 5930685 5930686 MMAR_1023 MMAR_1024     TRUE 0.993 -3.000 0.440 NA   NA
 5930686 5930687 MMAR_1024 MMAR_1025     TRUE 0.951 9.000 0.667 NA N NA
 5930688 5930689 MMAR_1026 MMAR_1027     FALSE 0.051 135.000 0.000 NA   NA
 5930690 5930691 MMAR_1028 MMAR_1029     FALSE 0.002 556.000 0.000 NA   NA
 5930691 5930692 MMAR_1029 MMAR_5549     TRUE 0.923 -67.000 0.000 NA   NA
 5930692 5930693 MMAR_5549 MMAR_1030   rpsJ FALSE 0.005 291.000 0.000 NA   NA
 5930693 5930694 MMAR_1030 MMAR_1031 rpsJ rplC TRUE 0.984 15.000 0.467 0.016 Y NA
 5930694 5930695 MMAR_1031 MMAR_1032 rplC rplD TRUE 0.996 0.000 0.361 0.012 Y NA
 5930695 5930696 MMAR_1032 MMAR_1033 rplD rplW TRUE 0.997 0.000 0.513 0.012 Y NA
 5930696 5930697 MMAR_1033 MMAR_1034 rplW rplB TRUE 0.986 30.000 0.849 0.011 Y NA
 5930697 5930698 MMAR_1034 MMAR_1035 rplB rpsS TRUE 0.988 22.000 0.820 0.016 Y NA
 5930698 5930699 MMAR_1035 MMAR_1036 rpsS rplV TRUE 0.984 29.000 0.769 0.016 Y NA
 5930699 5930700 MMAR_1036 MMAR_1037 rplV rpsC TRUE 0.998 0.000 0.719 0.016 Y NA
 5930700 5930701 MMAR_1037 MMAR_1038 rpsC rplP TRUE 0.996 4.000 0.828 0.016 Y NA
 5930701 5930702 MMAR_1038 MMAR_1039 rplP rpmC TRUE 0.998 0.000 0.802 0.012 Y NA
 5930702 5930703 MMAR_1039 MMAR_1040 rpmC rpsQ TRUE 0.998 0.000 0.828 0.012 Y NA
 5930703 5930704 MMAR_1040 MMAR_1041 rpsQ atsA FALSE 0.050 144.000 0.005 1.000 N NA
 5930704 5930705 MMAR_1041 MMAR_1042 atsA   TRUE 0.982 -46.000 0.250 NA   NA
 5930705 5930706 MMAR_1042 MMAR_1043     TRUE 0.703 5.000 0.000 NA   NA
 5930706 5930707 MMAR_1043 MMAR_1044     FALSE 0.422 130.000 0.600 NA   NA
 5930707 5930708 MMAR_1044 MMAR_1045   rplN FALSE 0.008 251.000 0.000 NA   NA
 5930708 5930709 MMAR_1045 MMAR_1046 rplN rplX TRUE 0.998 1.000 0.810 0.016 Y NA
 5930709 5930710 MMAR_1046 MMAR_1047 rplX rplE TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.012 Y NA
 5930710 5930711 MMAR_1047 MMAR_1048 rplE rpsN TRUE 0.993 5.000 0.496 0.012 Y NA
 5930711 5930712 MMAR_1048 MMAR_1049 rpsN rpsH TRUE 0.913 77.000 0.473 0.012 Y NA
 5930712 5930713 MMAR_1049 MMAR_1050 rpsH rplF TRUE 0.993 11.000 0.808 0.012 Y NA
 5930713 5930714 MMAR_1050 MMAR_1051 rplF rplR TRUE 0.997 3.000 0.815 0.012 Y NA
 5930714 5930715 MMAR_1051 MMAR_1052 rplR rpsE TRUE 0.981 38.000 0.814 0.016 Y NA
 5930715 5930716 MMAR_1052 MMAR_1053 rpsE rpmD TRUE 0.999 -3.000 0.789 0.016 Y NA
 5930716 5930717 MMAR_1053 MMAR_1054 rpmD rplO TRUE 0.999 -3.000 0.653 0.002 Y NA
 5930720 5930721 MMAR_1057 MMAR_1058     TRUE 0.891 20.000 0.000 NA Y NA
 5930721 5930722 MMAR_1058 MMAR_1059     TRUE 0.998 -3.000 0.400 NA Y NA
 5930726 5930727 MMAR_1064 MMAR_1065 fucA serA2 TRUE 0.973 -3.000 0.058 1.000 N NA
 5930728 5930729 MMAR_1066 MMAR_1067 xylB   FALSE 0.075 148.000 0.018 1.000   NA
 5930730 5930731 MMAR_1068 MMAR_1069     TRUE 0.902 17.000 0.000 NA Y NA
 5930732 5930733 MMAR_1070 MMAR_1071 secY adk TRUE 0.973 -3.000 0.057 1.000 N NA
 5930733 5930734 MMAR_1071 MMAR_1072 adk mapA TRUE 0.972 3.000 0.606 1.000 N NA
 5930734 5930735 MMAR_1072 MMAR_1073 mapA sigL FALSE 0.398 53.000 0.099 1.000 N NA
 5930735 5930736 MMAR_1073 MMAR_1074 sigL   TRUE 0.897 79.000 0.697 NA Y NA
 5930736 5930737 MMAR_1074 MMAR_1075     TRUE 0.699 87.000 0.065 NA Y NA
 5930737 5930738 MMAR_1075 MMAR_1076     FALSE 0.426 24.000 0.000 NA   NA
 5930739 5930740 MMAR_1077 MMAR_1078 mmsB fadE9 TRUE 0.948 13.000 0.051 1.000 Y NA
 5930740 5930741 MMAR_1078 MMAR_1079 fadE9 mmsA TRUE 0.876 6.000 0.197 1.000 N NA
 5930741 5930742 MMAR_1079 MMAR_1080 mmsA   FALSE 0.016 180.000 0.000 1.000 N NA
 5930742 5930743 MMAR_1080 MMAR_1081   rmlC FALSE 0.021 164.000 0.000 1.000 N NA
 5930743 5930744 MMAR_1081 MMAR_1082 rmlC rmlB TRUE 0.988 2.000 0.250 1.000 Y NA
 5930744 5930745 MMAR_1082 MMAR_1083 rmlB   TRUE 0.806 10.000 0.188 NA N NA
 5930745 5930746 MMAR_1083 MMAR_1084     TRUE 0.867 27.000 0.000 NA Y NA
 5930747 5930748 MMAR_1085 MMAR_1086 infA rpmJ TRUE 0.898 34.000 0.067 1.000 Y NA
 5930748 5930749 MMAR_1086 MMAR_1087 rpmJ rpsM FALSE 0.316 191.000 0.086 0.012 Y NA
 5930749 5930750 MMAR_1087 MMAR_1088 rpsM rpsK TRUE 0.996 4.000 0.810 0.012 Y NA
 5930750 5930751 MMAR_1088 MMAR_1089 rpsK rpsD TRUE 0.983 19.000 0.509 0.016 Y NA
 5930751 5930752 MMAR_1089 MMAR_1090 rpsD rpoA FALSE 0.617 86.000 0.549 1.000 N NA
 5930752 5930753 MMAR_1090 MMAR_1091 rpoA rplQ TRUE 0.803 61.000 0.873 1.000 N NA
 5930753 5930754 MMAR_1091 MMAR_1092 rplQ truA FALSE 0.512 131.000 0.102 1.000 Y NA
 5930755 5930756 MMAR_1093 MMAR_1094 cycA   FALSE 0.003 271.000 0.000 NA N NA
 5930756 5930757 MMAR_1094 MMAR_1095     TRUE 0.664 67.000 0.000 NA Y NA
 5930757 5930758 MMAR_1095 MMAR_1096     FALSE 0.029 129.000 0.000 NA N NA
 5930758 5930759 MMAR_1096 MMAR_1097   cut4 FALSE 0.007 260.000 0.000 NA   NA
 5930759 5930760 MMAR_1097 MMAR_1098 cut4 cut3 TRUE 0.928 32.000 0.500 0.001   NA
 5930762 5930763 MMAR_1100 MMAR_1101 mycP4   TRUE 0.996 -3.000 0.727 NA   NA
 5930764 5930765 MMAR_1102 MMAR_1103     TRUE 0.990 -3.000 0.333 NA   NA
 5930765 5930766 MMAR_1103 MMAR_1104   esxU FALSE 0.551 63.000 0.310 NA   NA
 5930766 5930767 MMAR_1104 MMAR_1105 esxU esxT TRUE 0.777 16.000 0.190 NA   NA
 5930767 5930768 MMAR_1105 MMAR_1106 esxT rplM FALSE 0.009 239.000 0.000 NA   NA
 5930768 5930769 MMAR_1106 MMAR_1107 rplM rpsI TRUE 0.999 -3.000 0.601 0.012 Y NA
 5930769 5930770 MMAR_1107 MMAR_1108 rpsI mrsA FALSE 0.074 151.000 0.068 1.000 N NA
 5930770 5930771 MMAR_1108 MMAR_1109 mrsA   FALSE 0.152 105.000 0.009 NA   NA
 5930771 5930772 MMAR_1109 MMAR_1110     TRUE 0.984 3.000 0.875 NA   NA
 5930773 5930774 MMAR_1111 MMAR_1112     TRUE 0.807 16.000 0.238 NA   NA
 5930774 5930775 MMAR_1112 MMAR_1113     TRUE 0.813 10.000 0.095 NA   NA
 5930776 5930777 MMAR_1114 MMAR_1115 glmS   FALSE 0.233 65.000 0.005 NA   NA
 5930777 5930778 MMAR_1115 MMAR_1116     FALSE 0.604 52.000 0.300 NA   NA
 5930778 5930779 MMAR_1116 MMAR_1117     FALSE 0.559 19.000 0.004 NA   NA
 5930779 5930780 MMAR_1117 MMAR_1118   gadB FALSE 0.317 37.000 0.009 NA N NA
 5930780 5930781 MMAR_1118 MMAR_1119 gadB alr FALSE 0.230 87.000 0.041 1.000 N NA
 5930781 5930782 MMAR_1119 MMAR_1120 alr   TRUE 0.976 -10.000 0.055 1.000   NA
 5930782 5930783 MMAR_1120 MMAR_1121     TRUE 0.960 -7.000 0.011 NA   NA
 5930783 5930784 MMAR_1121 MMAR_1122     TRUE 0.985 -3.000 0.217 NA   NA
 5930784 5930785 MMAR_1122 MMAR_1123   rimI TRUE 0.980 -3.000 0.062 1.000   NA
 5930785 5930786 MMAR_1123 MMAR_1124 rimI gcp TRUE 0.924 1.000 0.056 1.000   NA
 5930786 5930787 MMAR_1124 MMAR_1125 gcp groES FALSE 0.052 314.000 0.004 1.000 Y NA
 5930787 5930788 MMAR_1125 MMAR_1126 groES groEL1 TRUE 0.909 93.000 0.592 0.079 Y NA
 5930788 5930789 MMAR_1126 MMAR_1127 groEL1   FALSE 0.003 251.000 0.000 NA N NA
 5930790 5930791 MMAR_1128 MMAR_1129     FALSE 0.007 266.000 0.000 NA   NA
 5930796 5930797 MMAR_1133 MMAR_1134   sigD TRUE 0.720 76.000 0.706 NA   NA
 5930797 5930798 MMAR_1134 MMAR_1135 sigD   TRUE 0.995 -7.000 0.615 NA   NA
 5930800 5930801 MMAR_1137 MMAR_1138 guaB2 guaB3 TRUE 0.910 10.000 0.056 0.001 N NA
 5930801 5930802 MMAR_1138 MMAR_1139 guaB3   FALSE 0.009 181.000 0.000 NA N NA
 5930802 5930803 MMAR_1139 MMAR_1140   choD FALSE 0.068 89.000 0.000 NA N NA
 5930806 5930807 MMAR_1143 MMAR_1144     TRUE 0.994 -3.000 0.286 0.049   NA
 5930808 5930809 MMAR_5486 MMAR_1145     FALSE 0.321 39.000 0.000 NA   NA
 5930811 5930812 MMAR_1147 MMAR_1148   guaA FALSE 0.072 79.000 0.000 NA N NA
 5930814 5930815 MMAR_1150 MMAR_1151     TRUE 0.961 7.000 0.636 NA   NA
 5930816 5930817 MMAR_1152 MMAR_1153 iunH acrA1 FALSE 0.431 45.000 0.103 NA N NA
 5930817 5930818 MMAR_1153 MMAR_1154 acrA1 lpqD FALSE 0.462 40.000 0.077 NA N NA
 5930820 5930821 MMAR_1156 MMAR_1157 otsB2   FALSE 0.316 52.000 0.016 NA   NA
 5930825 5930826 MMAR_1161 MMAR_1162     FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 5930826 5930827 MMAR_1162 MMAR_1163   spoU FALSE 0.019 181.000 0.000 NA   NA
 5930828 5930829 MMAR_1164 MMAR_1165     FALSE 0.009 217.000 0.000 1.000 N NA
 5930829 5930830 MMAR_1165 MMAR_1166     TRUE 0.995 -3.000 0.636 NA   NA
 5930830 5930831 MMAR_1166 MMAR_1167     TRUE 0.996 -24.000 0.818 NA   NA
 5930831 5930832 MMAR_1167 MMAR_1168     TRUE 0.992 -19.000 0.529 NA   NA
 5930832 5930833 MMAR_1168 MMAR_1169     TRUE 0.931 9.000 0.412 NA   NA
 5930833 5930834 MMAR_1169 MMAR_1170   fadD29_1 FALSE 0.002 644.000 0.000 NA   NA
 5930834 5930835 MMAR_1170 MMAR_1171 fadD29_1 bioF2_5 FALSE 0.280 38.000 0.000 1.000 N NA
 5930835 5930836 MMAR_1171 MMAR_1172 bioF2_5   TRUE 0.655 5.000 0.000 1.000 N NA
 5930837 5930838 MMAR_1173 MMAR_1174     TRUE 0.739 25.000 0.000 0.012   NA
 5930838 5930839 MMAR_1174 MMAR_1175     FALSE 0.003 377.000 0.000 1.000 N NA
 5930840 5930841 MMAR_1176 MMAR_1177 folD   TRUE 0.993 -3.000 0.453 NA   NA
 5930843 5930844 MMAR_1179 MMAR_1180     FALSE 0.019 248.000 0.000 0.066 N NA
 5930845 5930846 MMAR_1181 MMAR_1182     FALSE 0.179 62.000 0.000 NA   NA
 5930846 5930847 MMAR_1182 MMAR_1183     FALSE 0.190 59.000 0.000 NA   NA
 5930847 5930848 MMAR_1183 MMAR_1184   metA TRUE 0.978 -3.000 0.136 1.000 N NA
 5930848 5930849 MMAR_1184 MMAR_1185 metA metC TRUE 0.982 12.000 0.542 1.000 Y NA
 5930852 5930853 MMAR_1188 MMAR_1189 trpS   TRUE 0.865 5.000 0.045 1.000   NA
 5930854 5930855 MMAR_1190 MMAR_1191 nagA sugI TRUE 0.996 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 5930855 5930856 MMAR_1191 MMAR_1192 sugI dacC FALSE 0.032 202.000 0.074 1.000 N NA
 5930857 5930858 MMAR_1193 MMAR_1194     TRUE 0.934 -10.000 0.000 NA   NA
 5930862 5930863 MMAR_1198 MMAR_1199     FALSE 0.011 214.000 0.000 NA   NA
 5930864 5930865 MMAR_1200 MMAR_1201 sdhB sdhA TRUE 0.998 0.000 0.604 0.002 Y NA
 5930865 5930866 MMAR_1201 MMAR_1202 sdhA sdhD TRUE 0.985 29.000 0.705 0.002 Y NA
 5930866 5930867 MMAR_1202 MMAR_1203 sdhD sdhC TRUE 0.998 -3.000 0.157 0.001 Y NA
 5930868 5930869 MMAR_1204 MMAR_1205 cdd deoA TRUE 0.997 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 5930869 5930870 MMAR_1205 MMAR_1206 deoA add TRUE 0.996 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 5930871 5930872 MMAR_1207 MMAR_1208     FALSE 0.006 270.000 0.000 NA   NA
 5930873 5930874 MMAR_1209 MMAR_1210   alc TRUE 0.978 -3.000 0.133 1.000 N NA
 5930874 5930875 MMAR_1210 MMAR_1211 alc   TRUE 0.968 -3.000 0.039 1.000 N NA
 5930876 5930877 MMAR_1212 MMAR_1213     FALSE 0.131 109.000 0.000 1.000   NA
 5930879 5930880 MMAR_1215 MMAR_1216     FALSE 0.467 49.000 0.100 NA   NA
 5930882 5930883 MMAR_1218 MMAR_1219 pmmB deoD TRUE 0.982 -10.000 0.235 1.000 N NA
 5930884 5930885 MMAR_1220 MMAR_1221 amiB1 amiA1 TRUE 0.993 -3.000 0.132 0.002   NA
 5930885 5930886 MMAR_1221 MMAR_1222 amiA1   FALSE 0.122 112.000 0.000 1.000   NA
 5930888 5930889 MMAR_1224 MMAR_1225 lpdA glpD2 TRUE 0.797 85.000 0.071 0.087 Y NA
 5930889 5930890 MMAR_1225 MMAR_1226 glpD2 gltB_1 FALSE 0.002 408.000 0.000 1.000 N NA
 5930891 5930892 MMAR_1227 MMAR_1228   ctpH_1 FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 5930893 5930894 MMAR_1229 MMAR_1230 phoY1 corA_1 TRUE 0.805 42.000 0.000 NA Y NA
 5930894 5930895 MMAR_1230 MMAR_1231 corA_1   FALSE 0.011 205.000 0.000 1.000 N NA
 5930895 5930896 MMAR_1231 MMAR_1232   atsB FALSE 0.528 22.000 0.015 1.000 N NA
 5930898 5930899 MMAR_1234 MMAR_1235 phoS2_1   FALSE 0.069 86.000 0.000 NA N NA
 5930899 5930900 MMAR_1235 MMAR_1236   lpqC FALSE 0.109 53.000 0.000 NA N NA
 5930901 5930902 MMAR_1237 MMAR_1238 nei lhr TRUE 0.952 4.000 0.352 1.000   NA
 5930902 5930903 MMAR_1238 MMAR_1239 lhr   FALSE 0.591 33.000 0.040 1.000   NA
 5930903 5930904 MMAR_1239 MMAR_1240   pcd FALSE 0.391 49.000 0.052 1.000 N NA
 5930904 5930905 MMAR_1240 MMAR_1241 pcd   FALSE 0.325 78.000 0.103 NA   NA
 5930906 5930907 MMAR_1242 MMAR_1243   lat FALSE 0.492 54.000 0.224 1.000 N NA
 5930907 5930908 MMAR_1243 MMAR_1244 lat   FALSE 0.310 80.000 0.083 NA   NA
 5930908 5930909 MMAR_1244 MMAR_1245   usfY FALSE 0.374 113.000 0.333 NA   NA
 5930909 5930910 MMAR_1245 MMAR_1246 usfY   FALSE 0.015 196.000 0.000 NA   NA
 5930910 5930911 MMAR_1246 MMAR_1247   rsbW TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5930911 5930912 MMAR_1247 MMAR_1248 rsbW sigF TRUE 0.994 -3.000 0.636 NA N NA
 5930915 5930916 MMAR_1251 MMAR_1252 accA3 sufE FALSE 0.184 111.000 0.045 NA   NA
 5930916 5930917 MMAR_1252 MMAR_1253 sufE sseA TRUE 0.991 -3.000 0.351 NA   NA
 5930917 5930918 MMAR_1253 MMAR_1254 sseA   FALSE 0.303 40.000 0.011 NA N NA
 5930918 5930919 MMAR_1254 MMAR_1255     TRUE 0.965 -3.000 0.015 NA   NA
 5930919 5930920 MMAR_1255 MMAR_1256   accD5 TRUE 0.996 -3.000 0.692 NA   NA
 5930921 5930922 MMAR_1257 MMAR_1258 birA   FALSE 0.265 63.000 0.016 NA   NA
 5930924 5930925 MMAR_1260 MMAR_1261 purK purE TRUE 0.998 -7.000 0.141 0.001 Y NA
 5930925 5930926 MMAR_1261 MMAR_1262 purE fadE25 FALSE 0.482 25.000 0.009 1.000 N NA
 5930926 5930927 MMAR_1262 MMAR_1263 fadE25   FALSE 0.027 194.000 0.037 1.000 N NA
 5930927 5930928 MMAR_1263 MMAR_1264     TRUE 0.999 -3.000 0.636 1.000 Y NA
 5930928 5930929 MMAR_1264 MMAR_1265     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5930930 5930931 MMAR_1266 MMAR_1267 sulP_2   FALSE 0.005 278.000 0.000 1.000 N NA
 5930931 5930932 MMAR_1267 MMAR_1268     FALSE 0.028 177.000 0.000 1.000   NA
 5930933 5930934 MMAR_1269 MMAR_1270     FALSE 0.238 61.000 0.000 1.000   NA
 5930935 5930936 MMAR_1271 MMAR_1272 ctpC   TRUE 0.938 10.000 0.500 NA   NA
 5930936 5930937 MMAR_1272 MMAR_1273     FALSE 0.202 116.000 0.103 NA   NA
 5930937 5930938 MMAR_1273 MMAR_1274     TRUE 0.862 30.000 0.517 NA   NA
 5930939 5930940 MMAR_1275 MMAR_1276 rmlD wbbL1 TRUE 0.990 -7.000 0.354 NA   NA
 5930940 5930941 MMAR_1276 MMAR_1277 wbbL1 manB TRUE 0.920 2.000 0.151 NA   NA
 5930942 5930943 MMAR_1278 MMAR_1279     TRUE 0.965 -3.000 0.028 1.000 N NA
 5930943 5930944 MMAR_1279 MMAR_1280   fbiB FALSE 0.579 29.000 0.018 1.000   NA
 5930944 5930945 MMAR_1280 MMAR_1281 fbiB fbiA TRUE 0.991 -3.000 0.371 NA   NA
 5930948 5930949 MMAR_1284 MMAR_1285   pmmA FALSE 0.249 147.000 0.460 NA   NA
 5930949 5930950 MMAR_1285 MMAR_1286 pmmA   TRUE 0.978 -3.000 0.080 NA   NA
 5930950 5930951 MMAR_1286 MMAR_1287   manA TRUE 0.860 8.000 0.174 NA   NA
 5930952 5930953 MMAR_1288 MMAR_1289     TRUE 0.853 31.000 0.000 NA Y NA
 5930954 5930955 MMAR_1290 MMAR_1291   alkB TRUE 0.656 111.000 0.778 1.000   NA
 5930955 5930956 MMAR_1291 MMAR_1292 alkB rubA TRUE 0.991 0.000 0.778 1.000   NA
 5930956 5930957 MMAR_1292 MMAR_1293 rubA rubB TRUE 0.994 1.000 0.250 0.011 Y NA
 5930957 5930958 MMAR_1293 MMAR_1294 rubB   TRUE 0.988 -3.000 0.300 1.000 N NA
 5930958 5930959 MMAR_1294 MMAR_1295   sahH FALSE 0.138 105.000 0.012 1.000 N NA
 5930959 5930960 MMAR_1295 MMAR_1296 sahH   FALSE 0.004 344.000 0.000 NA   NA
 5930960 5930961 MMAR_1296 MMAR_1297     FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   NA
 5930961 5930962 MMAR_1297 MMAR_1298   tmk FALSE 0.088 64.000 0.000 NA N NA
 11425321 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -635.000 0.000 NA   NA
 11567684 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -635.000 0.000 NA   NA
 11710076 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -635.000 0.000 NA   NA
 11425322 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -674.000 0.000 NA   NA
 11567685 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -674.000 0.000 NA   NA
 11710077 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -674.000 0.000 NA   NA
 11425323 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -695.000 0.000 NA   NA
 11567686 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -695.000 0.000 NA   NA
 11710078 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -695.000 0.000 NA   NA
 11425324 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -740.000 0.000 NA   NA
 11567687 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -740.000 0.000 NA   NA
 11710079 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -740.000 0.000 NA   NA
 11425325 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -761.000 0.000 NA   NA
 11567688 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -761.000 0.000 NA   NA
 11710080 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -761.000 0.000 NA   NA
 11425326 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -800.000 0.000 NA   NA
 11567689 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -800.000 0.000 NA   NA
 11710081 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -800.000 0.000 NA   NA
 11425327 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -821.000 0.000 NA   NA
 11567690 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -821.000 0.000 NA   NA
 11710082 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -821.000 0.000 NA   NA
 11425328 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -860.000 0.000 NA   NA
 11567691 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -860.000 0.000 NA   NA
 11710083 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -860.000 0.000 NA   NA
 11425329 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -881.000 0.000 NA   NA
 11567692 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -881.000 0.000 NA   NA
 11710084 5930961   MMAR_1297     FALSE NA -881.000 0.000 NA   NA
 5930962 5930963 MMAR_1298 MMAR_1299 tmk mtrA FALSE 0.203 80.000 0.021 1.000 N NA
 5930963 5930964 MMAR_1299 MMAR_1300 mtrA mtrB TRUE 0.950 50.000 0.772 1.000 Y NA
 5930964 5930965 MMAR_1300 MMAR_1301 mtrB lpqB TRUE 0.978 0.000 0.418 NA   NA
 5930965 5930966 MMAR_1301 MMAR_1302 lpqB   FALSE 0.353 61.000 0.061 NA   NA
 5930966 5930967 MMAR_1302 MMAR_1303     FALSE 0.416 43.000 0.022 NA   NA
 5930967 5930968 MMAR_1303 MMAR_1304     FALSE 0.010 342.000 0.072 NA   NA
 5930968 5930969 MMAR_1304 MMAR_1305   secA1 FALSE 0.220 97.000 0.094 NA N NA
 5930969 5930970 MMAR_1305 MMAR_1306 secA1   FALSE 0.196 85.000 0.020 1.000 N NA
 5930970 5930971 MMAR_1306 MMAR_1307     FALSE 0.322 57.000 0.091 NA N NA
 5930971 5930972 MMAR_1307 MMAR_1308     FALSE 0.292 72.000 0.136 NA N NA
 5930972 5930973 MMAR_1308 MMAR_1309     TRUE 0.994 5.000 0.889 1.000 Y NA
 5930975 5930976 MMAR_1311 MMAR_1312   pvdS FALSE 0.417 43.000 0.022 NA   NA
 5930976 5930977 MMAR_1312 MMAR_1313 pvdS   FALSE 0.281 66.000 0.029 NA   NA
 5930977 5930978 MMAR_1313 MMAR_1314     FALSE 0.149 141.000 0.208 NA   NA
 5930978 5930979 MMAR_1314 MMAR_1315   desA3 TRUE 0.625 89.000 0.583 1.000 N NA
 5930979 5930980 MMAR_1315 MMAR_1316 desA3 desA3_1 FALSE 0.179 230.000 0.000 0.001 Y NA
 5930983 5930984 MMAR_1319 MMAR_1320   aroA TRUE 0.981 -3.000 0.063 1.000   NA
 5930985 5930986 MMAR_1321 MMAR_1322   fadB3 FALSE 0.123 98.000 0.000 NA   NA
 5930986 5930987 MMAR_1322 MMAR_1323 fadB3   FALSE 0.225 65.000 0.000 1.000   NA
 5930987 5930988 MMAR_1323 MMAR_5565     FALSE 0.105 105.000 0.000 NA   NA
 5930988 5930989 MMAR_5565 MMAR_1324     FALSE 0.003 383.000 0.000 NA   NA
 5930989 5930990 MMAR_1324 MMAR_1325     FALSE 0.002 788.000 0.000 NA   NA
 5930990 5930991 MMAR_1325 MMAR_1326     FALSE 0.150 76.000 0.000 NA   NA
 5930991 5930992 MMAR_1326 MMAR_1327     FALSE 0.416 25.000 0.000 NA   NA
 5930992 5930993 MMAR_1327 MMAR_1328     FALSE 0.010 223.000 0.000 NA   NA
 5930993 5930994 MMAR_1328 MMAR_1329     FALSE 0.146 79.000 0.000 NA   NA
 5930994 5930995 MMAR_1329 MMAR_1330     TRUE 0.959 -3.000 0.002 NA   NA
 5930995 5930996 MMAR_1330 MMAR_1331     FALSE 0.023 171.000 0.000 NA   NA
 5930997 5930998 MMAR_1332 MMAR_1333     FALSE 0.565 12.000 0.000 NA   NA
 5930999 5931000 MMAR_1334 MMAR_1335 sigH   TRUE 0.997 -3.000 0.808 NA   NA
 5931000 5931001 MMAR_1335 MMAR_1336     FALSE 0.007 362.000 0.046 NA   NA
 5931001 5931002 MMAR_1336 MMAR_1337     FALSE 0.455 50.000 0.102 NA   NA
 5931003 5931004 MMAR_1338 MMAR_1339 whiB1   FALSE 0.008 284.000 0.000 1.000   NA
 5931006 5931007 MMAR_1341 MMAR_1342   entC TRUE 0.985 -3.000 0.170 1.000   NA
 5931007 5931008 MMAR_1342 MMAR_1343 entC gpm2 TRUE 0.980 -3.000 0.167 1.000 N NA
 5931010 5931011 MMAR_1345 MMAR_1346   rhlE FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5931016 5931017 MMAR_1351 MMAR_1352   moeB1 FALSE 0.102 172.000 0.236 1.000   NA
 5931017 5931018 MMAR_1352 MMAR_1353 moeB1   FALSE 0.502 66.000 0.273 NA   NA
 5931019 5931020 MMAR_1354 MMAR_1355   lipV TRUE 0.913 3.000 0.111 1.000   NA
 5931020 5931021 MMAR_1355 MMAR_1356 lipV   FALSE 0.374 65.000 0.115 NA   NA
 5931022 5931023 MMAR_1357 MMAR_1358     FALSE 0.038 146.000 0.000 NA   NA
 5931023 5931024 MMAR_1358 MMAR_1359     TRUE 0.999 -3.000 0.493 0.002 Y NA
 5931024 5931025 MMAR_1359 MMAR_1360     FALSE 0.357 62.000 0.110 1.000 N NA
 5931025 5931026 MMAR_1360 MMAR_1361   nudC FALSE 0.048 166.000 0.048 1.000 N NA
 5931027 5931028 MMAR_1362 MMAR_1363 lpqQ   FALSE 0.018 185.000 0.000 NA   NA
 5931029 5931030 MMAR_1364 MMAR_1365 uvrD2 whiB7 FALSE 0.004 419.000 0.000 1.000   NA
 5931033 5931034 MMAR_1368 MMAR_1369     FALSE 0.571 39.000 0.108 NA   NA
 5931035 5931036 MMAR_1370 MMAR_1371     FALSE 0.195 122.000 0.069 1.000   NA
 5931038 5931039 MMAR_5495 MMAR_1373 metU   FALSE 0.007 262.000 0.000 NA   NA
 5931039 5931040 MMAR_1373 MMAR_1374     FALSE 0.007 304.000 0.000 1.000   NA
 5931040 5931041 MMAR_1374 MMAR_1375   atsD_1 FALSE 0.007 300.000 0.000 1.000   NA
 5931041 5931042 MMAR_1375 MMAR_1376 atsD_1   FALSE 0.089 113.000 0.000 NA   NA
 5931042 5931043 MMAR_1376 MMAR_1377     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931045 5931046 MMAR_1379 MMAR_1380     TRUE 0.963 0.000 0.218 1.000   NA
 5931046 5931047 MMAR_1380 MMAR_1381   gltA1 TRUE 0.994 -3.000 0.502 1.000 N NA
 5931047 5931048 MMAR_1381 MMAR_1382 gltA1   FALSE 0.003 400.000 0.000 NA   NA
 5931048 5931049 MMAR_1382 MMAR_1383     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 5931049 5931050 MMAR_1383 MMAR_1384     FALSE 0.160 71.000 0.000 NA   NA
 5931050 5931051 MMAR_1384 MMAR_1385     FALSE 0.240 49.000 0.000 NA   NA
 5931051 5931052 MMAR_1385 MMAR_1386     FALSE 0.163 70.000 0.000 NA   NA
 5931057 5931058 MMAR_1391 MMAR_1392     FALSE 0.032 154.000 0.000 NA   NA
 5931058 5931059 MMAR_1392 MMAR_1393     TRUE 0.980 0.000 0.444 NA   NA
 5931060 5931061 MMAR_1394 MMAR_1395     TRUE 0.990 -3.000 0.333 1.000 N NA
 5931063 5931064 MMAR_1397 MMAR_1398     TRUE 0.991 -3.000 0.345 NA   NA
 5931064 5931065 MMAR_1398 MMAR_1399   moxR3 FALSE 0.568 49.000 0.231 NA   NA
 5931065 5931066 MMAR_1399 MMAR_1400 moxR3   TRUE 0.945 14.000 0.744 NA   NA
 5931066 5931067 MMAR_1400 MMAR_1401     TRUE 0.934 2.000 0.212 NA   NA
 5931067 5931068 MMAR_1401 MMAR_1402     FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 5931071 5931072 MMAR_1405 MMAR_1406     FALSE 0.496 16.000 0.000 NA   NA
 5931073 5931074 MMAR_1407 MMAR_5541     FALSE 0.002 880.000 0.000 NA   NA
 5931074 5931075 MMAR_5541 MMAR_1408     TRUE 0.682 87.000 0.385 0.044   NA
 5931077 5931078 MMAR_1410 MMAR_1411     FALSE 0.078 119.000 0.000 NA   NA
 5931079 5931080 MMAR_1412 MMAR_1413     FALSE 0.002 523.000 0.000 NA   NA
 5931081 5931082 MMAR_1414 MMAR_1415 cyaA_1   FALSE 0.568 17.000 0.000 1.000   NA
 5931082 5931083 MMAR_1415 MMAR_1418     FALSE 0.002 717.000 0.000 NA   NA
 5931084 5931085 MMAR_1419 MMAR_1420   cynT FALSE 0.002 629.000 0.000 NA   NA
 5931085 5931086 MMAR_1420 MMAR_1421 cynT   FALSE 0.002 564.000 0.000 NA   NA
 5931086 5931087 MMAR_1421 MMAR_1422     FALSE 0.002 588.000 0.000 NA   NA
 5931087 5931088 MMAR_1422 MMAR_1423     FALSE 0.434 23.000 0.000 NA   NA
 5931088 5931089 MMAR_1423 MMAR_1424     FALSE 0.010 224.000 0.000 NA   NA
 5931089 5931090 MMAR_1424 MMAR_1425     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931090 5931091 MMAR_1425 MMAR_1426     FALSE 0.008 250.000 0.000 NA   NA
 5931092 5931093 MMAR_1427 MMAR_1428     FALSE 0.024 168.000 0.000 NA   NA
 5931093 5931094 MMAR_1428 MMAR_1429     FALSE 0.049 136.000 0.000 NA   NA
 5931094 5931095 MMAR_1429 MMAR_1430     FALSE 0.123 98.000 0.000 NA   NA
 5931095 5931096 MMAR_1430 MMAR_1431   zntA TRUE 0.993 -10.000 0.500 NA   NA
 5931096 5931097 MMAR_1431 MMAR_1432 zntA   TRUE 0.737 65.000 0.667 NA   NA
 5931097 5931098 MMAR_1432 MMAR_1433     FALSE 0.005 291.000 0.000 NA   NA
 5931098 5931099 MMAR_1433 MMAR_1435     TRUE 0.925 -34.000 0.000 NA   NA
 5931099 5931100 MMAR_1435 MMAR_1436     TRUE 0.926 -24.000 0.000 NA   NA
 5931100 5931101 MMAR_1436 MMAR_1437     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5931101 5931102 MMAR_1437 MMAR_1438     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931102 5931103 MMAR_1438 MMAR_1439     TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA   NA
 5931104 5931105 MMAR_1440 MMAR_1441     FALSE 0.018 183.000 0.000 NA   NA
 5931105 5931106 MMAR_1441 MMAR_1442     FALSE 0.307 41.000 0.000 NA   NA
 5931106 5931107 MMAR_1442 MMAR_1443     FALSE 0.008 247.000 0.000 NA   NA
 5931108 5931109 MMAR_1444 MMAR_1445     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 5931110 5931111 MMAR_1447 MMAR_1448     FALSE 0.006 285.000 0.000 NA   NA
 5931117 5931118 MMAR_1452 MMAR_1453     FALSE 0.600 42.000 0.000 0.044   NA
 5931118 5931119 MMAR_1453 MMAR_1454     FALSE 0.004 344.000 0.000 NA   NA
 5931119 5931120 MMAR_1454 MMAR_1455     FALSE 0.265 46.000 0.000 NA   NA
 5931120 5931121 MMAR_1455 MMAR_1456     TRUE 0.682 87.000 0.385 0.044   NA
 5931121 5931122 MMAR_1456 MMAR_1457     FALSE 0.194 78.000 0.000 1.000   NA
 5931122 5931123 MMAR_1457 MMAR_1458     FALSE 0.612 10.000 0.000 NA   NA
 5931123 5931124 MMAR_1458 MMAR_1459     FALSE 0.008 245.000 0.000 NA   NA
 5931124 5931125 MMAR_1459 MMAR_1460     FALSE 0.061 129.000 0.000 NA   NA
 5931125 5931126 MMAR_1460 MMAR_1461     TRUE 0.890 80.000 0.667 NA Y NA
 5931126 5931127 MMAR_1461 MMAR_1462     FALSE 0.015 153.000 0.000 NA N NA
 5931127 5931128 MMAR_1462 MMAR_1464     FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 5931130 5931131 MMAR_1466 MMAR_1467     FALSE 0.007 262.000 0.000 NA   NA
 5931131 5931132 MMAR_1467 MMAR_1468     FALSE 0.028 162.000 0.000 NA   NA
 5931134 5931135 MMAR_1470 MMAR_1471 nuoN nuoM TRUE 0.999 -3.000 0.257 0.002 Y NA
 5931135 5931136 MMAR_1471 MMAR_1472 nuoM nuoL TRUE 0.999 -3.000 0.373 0.002 Y NA
 5931136 5931137 MMAR_1472 MMAR_1473 nuoL nuoK TRUE 0.994 11.000 0.790 0.005 Y NA
 5931137 5931138 MMAR_1473 MMAR_1474 nuoK nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.306 0.003 Y NA
 5931138 5931139 MMAR_1474 MMAR_1475 nuoJ nuoI TRUE 0.998 -3.000 0.210 0.005 Y NA
 5931139 5931140 MMAR_1475 MMAR_1476 nuoI nuoH TRUE 0.998 -7.000 0.221 0.005 Y NA
 5931140 5931141 MMAR_1476 MMAR_1477 nuoH nuoG TRUE 0.907 50.000 0.151 0.005 Y NA
 5931141 5931142 MMAR_1477 MMAR_1478 nuoG nuoF TRUE 0.999 -3.000 0.753 0.005 Y NA
 5931142 5931143 MMAR_1478 MMAR_1479 nuoF nuoE TRUE 0.995 0.000 0.163 0.005 Y NA
 5931143 5931144 MMAR_1479 MMAR_1480 nuoE nuoD TRUE 0.998 -3.000 0.161 0.005 Y NA
 5931144 5931145 MMAR_1480 MMAR_1481 nuoD nuoC TRUE 0.975 20.000 0.299 0.005 Y NA
 5931145 5931146 MMAR_1481 MMAR_1482 nuoC nuoB TRUE 0.999 -3.000 0.691 0.003 Y NA
 5931146 5931147 MMAR_1482 MMAR_1483 nuoB nuoA TRUE 0.991 9.000 0.498 0.003 Y NA
 5931148 5931149 MMAR_1484 MMAR_1485   plcB_2 FALSE 0.009 182.000 0.000 NA N NA
 5931150 5931151 MMAR_1486 MMAR_1487     FALSE 0.589 27.000 0.043 NA   NA
 5931151 5931152 MMAR_1487 MMAR_1488     FALSE 0.564 36.000 0.064 NA   NA
 5931152 5931153 MMAR_1488 MMAR_1489     FALSE 0.565 12.000 0.000 NA   NA
 5931153 5931154 MMAR_1489 MMAR_1490     TRUE 0.941 0.000 0.102 NA   NA
 5931154 5931155 MMAR_1490 MMAR_1491   fadE12_3 TRUE 0.989 -3.000 0.302 NA   NA
 5931155 5931156 MMAR_1491 MMAR_1492 fadE12_3   TRUE 0.646 25.000 0.113 1.000 N NA
 5931156 5931157 MMAR_1492 MMAR_1493     TRUE 0.949 0.000 0.194 1.000 N NA
 5931157 5931158 MMAR_1493 MMAR_1494     TRUE 0.981 -3.000 0.182 1.000 N NA
 5931158 5931159 MMAR_1494 MMAR_1495     TRUE 0.974 -3.000 0.045 NA   NA
 5931159 5931160 MMAR_1495 MMAR_1496     TRUE 0.833 3.000 0.013 NA   NA
 5931162 5931163 MMAR_1498 MMAR_1499 fadB4   TRUE 0.881 43.000 0.000 0.017 Y NA
 5931163 5931164 MMAR_1499 MMAR_1500     FALSE 0.218 68.000 0.000 1.000   NA
 5931164 5931165 MMAR_1500 MMAR_1501     TRUE 0.977 -30.000 0.182 NA   NA
 5931165 5931166 MMAR_1501 MMAR_1502     TRUE 0.993 -3.000 0.455 NA   NA
 5931166 5931167 MMAR_1502 MMAR_1503     TRUE 0.992 -3.000 0.375 1.000   NA
 5931168 5931169 MMAR_1504 MMAR_1505   mhpF TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5931169 5931170 MMAR_1505 MMAR_1506 mhpF   TRUE 0.997 -3.000 1.000 1.000 N NA
 5931170 5931171 MMAR_1506 MMAR_1507     FALSE 0.202 49.000 0.000 1.000 N NA
 5931171 5931172 MMAR_1507 MMAR_1508   ilvB1_1 TRUE 0.944 3.000 0.323 1.000 N NA
 5931173 5931174 MMAR_1509 MMAR_1510 fadE23 fadE24 TRUE 0.949 55.000 0.604 0.018 Y NA
 5931174 5931175 MMAR_1510 MMAR_1511 fadE24   FALSE 0.290 82.000 0.096 1.000 N NA
 5931177 5931178 MMAR_1513 MMAR_1514     FALSE 0.019 541.000 0.000 NA Y NA
 5931179 5931180 MMAR_1515 MMAR_1516   devR TRUE 0.947 24.000 1.000 1.000   NA
 5931180 5931181 MMAR_1516 MMAR_1517 devR devS TRUE 0.974 12.000 0.091 0.008 Y NA
 5931183 5931184 MMAR_1519 MMAR_1520     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5931185 5931186 MMAR_1521 MMAR_1522     TRUE 0.768 5.000 0.000 1.000   NA
 5931187 5931188 MMAR_1523 MMAR_1524     FALSE 0.388 29.000 0.000 NA   NA
 5931188 5931189 MMAR_1524 MMAR_1525   agpS FALSE 0.612 10.000 0.000 NA   NA
 5931191 5931192 MMAR_1527 MMAR_1528 prfB   TRUE 0.951 -10.000 0.013 1.000 N NA
 5931192 5931193 MMAR_1528 MMAR_1529     TRUE 0.895 3.000 0.096 NA   NA
 5931193 5931194 MMAR_1529 MMAR_1530   ftsE FALSE 0.368 45.000 0.010 NA   NA
 5931194 5931195 MMAR_1530 MMAR_1531 ftsE ftsX TRUE 0.993 1.000 0.431 1.000 Y NA
 5931195 5931196 MMAR_1531 MMAR_1532 ftsX smpB TRUE 0.847 3.000 0.038 1.000 N NA
 5931197 5931198 MMAR_1533 MMAR_1534     TRUE 0.993 -3.000 0.429 NA   NA
 5931199 5931200 MMAR_1535 MMAR_1536     TRUE 0.929 0.000 0.025 1.000   NA
 5931200 5931201 MMAR_1536 MMAR_1537     FALSE 0.416 25.000 0.000 NA   NA
 5931201 5931202 MMAR_1537 MMAR_5496   ssr TRUE 0.941 -6.000 0.000 NA   NA
 5931203 5931204 MMAR_1538 MMAR_1539     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5931208 5931209 MMAR_1542 MMAR_1543     FALSE 0.169 67.000 0.000 NA   NA
 5931209 5931210 MMAR_1543 MMAR_1544     FALSE 0.289 43.000 0.000 NA   NA
 5931213 5931214 MMAR_1547 MMAR_1548   glsA FALSE 0.138 68.000 0.000 1.000 N NA
 5931214 5931215 MMAR_1548 MMAR_1549 glsA   FALSE 0.172 94.000 0.000 1.000   NA
 5931216 5931217 MMAR_1550 MMAR_1551     FALSE 0.002 329.000 0.000 NA N NA
 5931218 5931219 MMAR_1552 MMAR_1553     FALSE 0.013 207.000 0.000 NA   NA
 5931220 5931221 MMAR_1554 MMAR_1555     FALSE 0.010 261.000 0.000 1.000   NA
 5931222 5931223 MMAR_1556 MMAR_1557     TRUE 0.982 -3.000 0.231 NA N NA
 5931223 5931224 MMAR_1557 MMAR_1558     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931225 5931226 MMAR_1559 MMAR_1560     FALSE 0.299 42.000 0.000 NA   NA
 5931226 5931227 MMAR_1560 MMAR_1561   miaA_1 FALSE 0.139 87.000 0.000 NA   NA
 5931227 5931228 MMAR_1561 MMAR_1562 miaA_1   FALSE 0.024 169.000 0.000 NA   NA
 5931228 5931229 MMAR_1562 MMAR_1563     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931229 5931230 MMAR_1563 MMAR_1564   cyp276A1 TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5931230 5931231 MMAR_1564 MMAR_1565 cyp276A1   FALSE 0.132 71.000 0.000 1.000 N NA
 5931231 5931232 MMAR_1565 MMAR_1566   miaB FALSE 0.004 292.000 0.000 1.000 N NA
 5931234 5931235 MMAR_1568 MMAR_1569     TRUE 0.921 33.000 1.000 1.000 N NA
 5931235 5931236 MMAR_1569 MMAR_1570     FALSE 0.205 54.000 0.000 NA   NA
 5931236 5931237 MMAR_1570 MMAR_1571     FALSE 0.223 51.000 0.000 NA   NA
 5931237 5931238 MMAR_1571 MMAR_1572     FALSE 0.336 37.000 0.000 NA   NA
 5931238 5931239 MMAR_1572 MMAR_1573     FALSE 0.028 161.000 0.000 NA   NA
 5931240 5931241 MMAR_1574 MMAR_1575     TRUE 0.634 9.000 0.000 NA   NA
 5931241 5931242 MMAR_1575 MMAR_1576     FALSE 0.012 210.000 0.000 NA   NA
 5931243 5931244 MMAR_1577 MMAR_1578     TRUE 0.989 -7.000 0.333 NA   NA
 5931244 5931245 MMAR_1578 MMAR_1579     FALSE 0.041 144.000 0.000 NA   NA
 5931245 5931246 MMAR_1579 MMAR_1580     FALSE 0.228 64.000 0.000 1.000   NA
 5931246 5931247 MMAR_1580 MMAR_1581     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5931248 5931249 MMAR_1582 MMAR_1583   citE_2 FALSE 0.111 91.000 0.000 1.000 N NA
 5931251 5931252 MMAR_1585 MMAR_1586     FALSE 0.299 42.000 0.000 NA   NA
 5931252 5931253 MMAR_1586 MMAR_1587     FALSE 0.528 14.000 0.000 NA   NA
 5931254 5931255 MMAR_1588 MMAR_1589     TRUE 0.986 -3.000 0.226 NA   NA
 5931255 5931256 MMAR_1589 MMAR_1590     TRUE 0.996 0.000 0.290 0.044 Y NA
 5931257 5931258 MMAR_1591 MMAR_5497 pgmA alaU FALSE 0.171 66.000 0.000 NA   NA
 5931258 5931259 MMAR_5497 MMAR_1592 alaU   FALSE 0.085 115.000 0.000 NA   NA
 5931260 5931261 MMAR_1593 MMAR_1594     TRUE 0.808 1.000 0.000 NA   NA
 5931262 5931263 MMAR_1595 MMAR_1596     TRUE 0.874 -7.000 0.000 NA N NA
 5931263 5931264 MMAR_1596 MMAR_1597     FALSE 0.024 158.000 0.000 1.000 N NA
 5931264 5931265 MMAR_1597 MMAR_1598     FALSE 0.003 465.000 0.000 1.000   NA
 5931265 5931266 MMAR_1598 MMAR_1599     FALSE 0.131 144.000 0.000 0.043   NA
 5931266 5931267 MMAR_1599 MMAR_1600     FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 5931271 5931272 MMAR_1604 MMAR_1605     TRUE 0.667 7.000 0.000 NA   NA
 5931272 5931273 MMAR_1605 MMAR_1606     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931273 5931274 MMAR_1606 MMAR_1607   putA_2 FALSE 0.108 93.000 0.000 1.000 N NA
 5931275 5931276 MMAR_1608 MMAR_1609     FALSE 0.343 36.000 0.000 NA   NA
 5931276 5931277 MMAR_1609 MMAR_1610     FALSE 0.139 87.000 0.000 NA   NA
 5931277 5931278 MMAR_1610 MMAR_1611     FALSE 0.030 157.000 0.000 NA   NA
 5931278 5931279 MMAR_1611 MMAR_1612   mmr TRUE 0.984 -3.000 0.143 1.000   NA
 5931279 5931280 MMAR_1612 MMAR_1613 mmr   FALSE 0.165 69.000 0.000 NA   NA
 5931280 5931281 MMAR_1613 MMAR_1614     FALSE 0.136 90.000 0.000 NA   NA
 5931281 5931282 MMAR_1614 MMAR_1615   dnaK1 FALSE 0.362 25.000 0.000 1.000 N NA
 5931282 5931283 MMAR_1615 MMAR_1616 dnaK1 cstA FALSE 0.236 83.000 0.043 1.000 N NA
 5931284 5931285 MMAR_1618 MMAR_1619 cueO   TRUE 0.977 -3.000 0.071 NA   NA
 5931285 5931286 MMAR_1619 MMAR_1620     FALSE 0.008 246.000 0.000 NA   NA
 5931290 5931291 MMAR_1624 MMAR_1625   fadE22 FALSE 0.621 111.000 0.062 1.000 Y NA
 5931295 5931296 MMAR_1629 MMAR_1630     TRUE 0.847 14.000 0.333 NA N NA
 5931296 5931297 MMAR_1630 MMAR_1631     FALSE 0.348 123.000 0.333 1.000   NA
 5931301 5931302 MMAR_1635 MMAR_1636     FALSE 0.550 73.000 0.316 1.000   NA
 5931304 5931305 MMAR_1638 MMAR_1639     FALSE 0.002 483.000 0.000 NA   NA
 5931305 5931306 MMAR_1639 MMAR_1640   nrdH FALSE 0.001 512.000 0.000 NA N NA
 5931306 5931307 MMAR_1640 MMAR_1641 nrdH nrdI TRUE 0.755 44.000 0.500 NA N NA
 5931307 5931308 MMAR_1641 MMAR_1642 nrdI nrdE TRUE 0.997 -30.000 0.300 NA Y NA
 5931308 5931309 MMAR_1642 MMAR_1643 nrdE   FALSE 0.187 115.000 0.100 1.000 N NA
 5931309 5931310 MMAR_1643 MMAR_1644     FALSE 0.370 119.000 0.400 1.000 N NA
 5931311 5931312 MMAR_1645 MMAR_1646     TRUE 0.987 -22.000 0.333 NA   NA
 5931313 5931314 MMAR_1647 MMAR_1648 nrdF2   FALSE 0.596 35.000 0.100 NA   NA
 5931315 5931316 MMAR_1649 MMAR_1650 adh fecB FALSE 0.144 134.000 0.068 1.000   NA
 5931317 5931318 MMAR_1651 MMAR_1652 ctaD serB2 FALSE 0.254 53.000 0.007 1.000 N NA
 5931318 5931319 MMAR_1652 MMAR_1653 serB2   FALSE 0.015 182.000 0.000 1.000 N NA
 5931319 5931320 MMAR_1653 MMAR_1654     TRUE 0.662 15.000 0.043 1.000 N NA
 5931320 5931321 MMAR_1654 MMAR_1655     TRUE 0.998 -3.000 0.085 0.005 Y NA
 5931321 5931322 MMAR_1655 MMAR_1656   hycD TRUE 0.998 -3.000 0.398 1.000 Y NA
 5931322 5931323 MMAR_1656 MMAR_1657 hycD hycP TRUE 0.992 5.000 0.679 NA Y NA
 5931323 5931324 MMAR_1657 MMAR_1658 hycP hycQ TRUE 0.997 0.000 0.864 NA Y NA
 5931324 5931325 MMAR_1658 MMAR_1659 hycQ hycE TRUE 0.998 0.000 0.659 0.005 Y NA
 5931325 5931326 MMAR_1659 MMAR_1660 hycE   FALSE 0.099 99.000 0.000 1.000 N NA
 5931326 5931327 MMAR_1660 MMAR_1661     TRUE 0.974 -3.000 0.024 1.000   NA
 5931327 5931328 MMAR_1661 MMAR_1662   echA17 TRUE 0.978 -3.000 0.043 1.000   NA
 5931328 5931329 MMAR_1662 MMAR_1663 echA17   TRUE 0.877 11.000 0.292 1.000 N NA
 5931329 5931330 MMAR_1663 MMAR_1664     FALSE 0.070 165.000 0.112 NA   NA
 5931330 5931331 MMAR_1664 MMAR_1665     FALSE 0.243 84.000 0.034 NA   NA
 5931332 5931333 MMAR_1666 MMAR_1667     FALSE 0.486 17.000 0.000 NA   NA
 5931335 5931336 MMAR_1669 MMAR_1670     FALSE 0.416 25.000 0.000 NA   NA
 5931336 5931337 MMAR_1670 MMAR_1671   phrI FALSE 0.064 127.000 0.000 NA   NA
 5931337 5931338 MMAR_1671 MMAR_1672 phrI   TRUE 0.690 9.000 0.008 1.000 N NA
 5931338 5931339 MMAR_1672 MMAR_1673     TRUE 0.988 -3.000 0.027 0.043   NA
 5931340 5931341 MMAR_1674 MMAR_1675     FALSE 0.076 111.000 0.000 1.000 N NA
 5931343 5931344 MMAR_1677 MMAR_1678     FALSE 0.017 189.000 0.000 NA   NA
 5931347 5931348 MMAR_1681 MMAR_1682     FALSE 0.330 92.000 0.082 1.000   NA
 5931348 5931349 MMAR_1682 MMAR_1683     TRUE 0.982 -3.000 0.095 1.000   NA
 5931350 5931351 MMAR_1684 MMAR_1685 fixA fixB TRUE 0.975 48.000 0.877 0.012 Y NA
 5931351 5931352 MMAR_1685 MMAR_1686 fixB   FALSE 0.095 144.000 0.062 NA   NA
 5931352 5931353 MMAR_1686 MMAR_1687     TRUE 0.968 0.000 0.286 NA   NA
 5931353 5931354 MMAR_1687 MMAR_1688     FALSE 0.144 80.000 0.000 NA   NA
 5931354 5931355 MMAR_1688 MMAR_1689   iscS FALSE 0.183 61.000 0.000 NA   NA
 5931355 5931356 MMAR_1689 MMAR_1690 iscS trmU TRUE 0.719 15.000 0.094 1.000 N NA
 5931358 5931359 MMAR_1692 MMAR_1693     FALSE 0.003 326.000 0.000 1.000 N NA
 5931359 5931360 MMAR_1693 MMAR_1694   ligA FALSE 0.004 290.000 0.000 1.000 N NA
 5931360 5931361 MMAR_1694 MMAR_1695 ligA   FALSE 0.186 70.000 0.002 1.000 N NA
 5931361 5931362 MMAR_1695 MMAR_1696     FALSE 0.154 173.000 0.429 NA   NA
 5931362 5931363 MMAR_1696 MMAR_1697   mmpL4_9 TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931363 5931364 MMAR_1697 MMAR_1698 mmpL4_9   TRUE 0.923 -655.000 0.000 NA   NA
 5931364 5931365 MMAR_1698 MMAR_1699     FALSE 0.602 42.000 0.000 0.043   NA
 5931367 5931368 MMAR_1701 MMAR_1702 gatC gatA TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.001 Y NA
 5931368 5931369 MMAR_1702 MMAR_1703 gatA pfkA FALSE 0.146 100.000 0.007 1.000 N NA
 5931369 5931370 MMAR_1703 MMAR_1704 pfkA gatB FALSE 0.008 283.000 0.011 1.000 N NA
 5931370 5931371 MMAR_1704 MMAR_1705 gatB   FALSE 0.413 37.000 0.000 1.000   NA
 5931375 5931376 MMAR_1709 MMAR_1710   ilvB1 FALSE 0.041 144.000 0.000 NA   NA
 5931376 5931377 MMAR_1710 MMAR_1711 ilvB1 ilvN TRUE 0.997 0.000 0.380 0.001 Y NA
 5931377 5931378 MMAR_1711 MMAR_1712 ilvN ilvC TRUE 0.929 43.000 0.071 0.001 Y NA
 5931379 5931380 MMAR_1713 MMAR_1714     TRUE 0.980 -3.000 0.060 1.000   NA
 5931381 5931382 MMAR_1715 MMAR_1716 serA1 leuB TRUE 0.782 56.000 0.039 1.000 Y NA
 5931384 5931385 MMAR_1718 MMAR_1719   gltS TRUE 0.975 -3.000 0.070 1.000 N NA
 5931385 5931386 MMAR_1719 MMAR_5498 gltS glnU FALSE 0.041 144.000 0.000 NA   NA
 5931386 5931387 MMAR_5498 MMAR_5499 glnU gluU FALSE 0.163 70.000 0.000 NA   NA
 5931390 5931391 MMAR_1722 MMAR_1723 mmpL1_1 mmpS1 TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931391 5931392 MMAR_1723 MMAR_1724 mmpS1 bioF2_2 FALSE 0.011 219.000 0.000 NA   NA
 5931392 5931393 MMAR_1724 MMAR_1725 bioF2_2   FALSE 0.002 551.000 0.000 1.000 N NA
 5931394 5931395 MMAR_1726 MMAR_1727 leuC leuD TRUE 0.981 25.000 0.477 0.000 Y NA
 5931395 5931396 MMAR_1727 MMAR_1728 leuD hupB FALSE 0.022 225.000 0.066 1.000 N NA
 5931397 5931398 MMAR_1729 MMAR_1730 mutT1 ppk FALSE 0.119 80.000 0.000 1.000 N NA
 5931398 5931399 MMAR_1730 MMAR_1731 ppk   FALSE 0.238 79.000 0.026 NA   NA
 5931400 5931401 MMAR_1732 MMAR_1733 gpdA2 ddlA FALSE 0.271 92.000 0.088 1.000 N NA
 5931403 5931404 MMAR_1735 MMAR_1736 thiL   FALSE 0.407 26.000 0.000 NA   NA
 5931404 5931405 MMAR_1736 MMAR_1737   ung TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931405 5931406 MMAR_1737 MMAR_1738 ung   TRUE 0.633 6.000 0.000 1.000 N NA
 5931406 5931407 MMAR_1738 MMAR_1739     TRUE 0.836 50.000 0.000 0.062 Y NA
 5931409 5931410 MMAR_1741 MMAR_1742   recG TRUE 0.889 3.000 0.040 1.000   NA
 5931410 5931411 MMAR_1742 MMAR_1743 recG   TRUE 0.801 5.000 0.018 NA   NA
 5931412 5931413 MMAR_1744 MMAR_1745     FALSE 0.017 190.000 0.000 NA   NA
 5931414 5931415 MMAR_1746 MMAR_1747 lipN   FALSE 0.105 187.000 0.421 NA N NA
 5931415 5931416 MMAR_1747 MMAR_1748     TRUE 0.910 6.000 0.257 NA   NA
 5931416 5931417 MMAR_1748 MMAR_1749   pca FALSE 0.415 43.000 0.021 NA   NA
 5931417 5931418 MMAR_1749 MMAR_1750 pca   FALSE 0.195 78.000 0.014 1.000 N NA
 5931418 5931419 MMAR_1750 MMAR_1751   kdtB FALSE 0.533 74.000 0.367 1.000 N NA
 5931420 5931421 MMAR_1752 MMAR_1753   purU FALSE 0.030 157.000 0.000 NA   NA
 5931421 5931422 MMAR_1753 MMAR_1754 purU   FALSE 0.467 34.000 0.012 NA   NA
 5931423 5931424 MMAR_1755 MMAR_1756     FALSE 0.028 161.000 0.000 NA   NA
 5931426 5931427 MMAR_1758 MMAR_1759   fadD29 FALSE 0.001 829.000 0.000 NA N NA
 5931427 5931428 MMAR_1759 MMAR_1760 fadD29   TRUE 0.688 5.000 0.010 NA N NA
 5931428 5931429 MMAR_1760 MMAR_1761   fadD22 FALSE 0.073 119.000 0.010 NA N NA
 5931429 5931430 MMAR_1761 MMAR_1762 fadD22 pks15/1 TRUE 0.989 17.000 0.750 0.012 Y NA
 5931430 5931431 MMAR_1762 MMAR_1763 pks15/1 lppX FALSE 0.026 415.000 0.500 NA   NA
 5931432 5931433 MMAR_1764 MMAR_1765 mmpL7 fadD28 TRUE 0.979 2.000 0.600 1.000   NA
 5931434 5931435 MMAR_1766 MMAR_1767   mas FALSE 0.002 561.000 0.000 1.000 N NA
 5931436 5931437 MMAR_1768 MMAR_1769 papA5 drrC TRUE 0.786 34.000 0.364 NA   NA
 5931437 5931438 MMAR_1769 MMAR_1770 drrC drrB TRUE 0.997 6.000 0.857 0.001 Y NA
 5931438 5931439 MMAR_1770 MMAR_1771 drrB drrA TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 5931439 5931440 MMAR_1771 MMAR_1772 drrA ppsE TRUE 0.927 11.000 0.500 1.000 N NA
 5931440 5931441 MMAR_1772 MMAR_1773 ppsE ppsD TRUE 0.992 6.000 0.417 0.008 Y NA
 5931441 5931442 MMAR_1773 MMAR_1774 ppsD ppsC TRUE 0.998 0.000 0.833 0.008 Y NA
 5931442 5931443 MMAR_1774 MMAR_1775 ppsC ppsB TRUE 0.997 0.000 0.500 0.008 Y NA
 5931443 5931444 MMAR_1775 MMAR_1776 ppsB ppsA TRUE 0.991 0.000 0.000 0.008 Y NA
 5931444 5931445 MMAR_1776 MMAR_1777 ppsA fadD26 TRUE 0.995 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5931445 5931446 MMAR_1777 MMAR_1778 fadD26 tesA FALSE 0.018 679.000 0.000 1.000 Y NA
 5931446 5931447 MMAR_1778 MMAR_1779 tesA   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931448 5931449 MMAR_1780 MMAR_1781     FALSE 0.254 75.000 0.029 NA   NA
 5931449 5931450 MMAR_1781 MMAR_1782   rnc TRUE 0.850 3.000 0.026 NA   NA
 5931450 5931451 MMAR_1782 MMAR_1783 rnc fpg TRUE 0.905 1.000 0.068 1.000 N NA
 5931451 5931452 MMAR_1783 MMAR_1784 fpg   FALSE 0.171 91.000 0.010 1.000 N NA
 5931452 5931453 MMAR_1784 MMAR_1785   smc FALSE 0.099 99.000 0.000 1.000 N NA
 5931453 5931454 MMAR_1785 MMAR_1786 smc ftsY FALSE 0.593 60.000 0.165 0.012 N NA
 5931454 5931455 MMAR_1786 MMAR_1787 ftsY amt FALSE 0.122 144.000 0.004 0.043 N NA
 5931455 5931456 MMAR_1787 MMAR_1788 amt glnB TRUE 0.993 -3.000 0.467 1.000 N NA
 5931456 5931457 MMAR_1788 MMAR_1789 glnB glnD FALSE 0.238 94.000 0.055 1.000 N NA
 5931458 5931459 MMAR_1790 MMAR_1791     FALSE 0.011 216.000 0.000 NA   NA
 5931460 5931461 MMAR_1792 MMAR_1793 ffh   TRUE 0.760 7.000 0.025 1.000 N NA
 5931461 5931462 MMAR_1793 MMAR_1794   pknI FALSE 0.202 49.000 0.000 1.000 N NA
 5931462 5931463 MMAR_1794 MMAR_1795 pknI   FALSE 0.085 105.000 0.000 1.000 N NA
 5931463 5931464 MMAR_1795 MMAR_1796     TRUE 0.955 2.000 0.278 1.000   NA
 5931466 5931467 MMAR_1798 MMAR_1799   rpsP FALSE 0.018 206.000 0.002 NA   NA
 5931467 5931468 MMAR_1799 MMAR_1800 rpsP   TRUE 0.933 9.000 0.385 1.000   NA
 5931468 5931469 MMAR_1800 MMAR_1801   rimM TRUE 0.827 25.000 0.324 1.000   NA
 5931469 5931470 MMAR_1801 MMAR_1802 rimM trmD TRUE 0.989 10.000 0.672 1.000 Y NA
 5931472 5931473 MMAR_1804 MMAR_1805 rplS lepB FALSE 0.128 112.000 0.018 1.000 N NA
 5931473 5931474 MMAR_1805 MMAR_1806 lepB rnhB TRUE 0.827 3.000 0.024 1.000 N NA
 5931474 5931475 MMAR_1806 MMAR_1807 rnhB   FALSE 0.134 131.000 0.067 NA   NA
 5931476 5931477 MMAR_1808 MMAR_1809     FALSE 0.147 78.000 0.000 NA   NA
 5931478 5931479 MMAR_1810 MMAR_1811 galE4 fdhD FALSE 0.128 135.000 0.143 1.000 N NA
 5931479 5931480 MMAR_1811 MMAR_1812 fdhD   FALSE 0.096 117.000 0.003 1.000 N NA
 5931480 5931481 MMAR_1812 MMAR_1813     TRUE 0.919 0.000 0.050 1.000 N NA
 5931481 5931482 MMAR_1813 MMAR_1814     TRUE 0.972 -3.000 0.053 1.000 N NA
 5931482 5931483 MMAR_1814 MMAR_1815   viuB FALSE 0.334 33.000 0.007 NA N NA
 5931483 5931484 MMAR_1815 MMAR_1816 viuB lldD1_1 FALSE 0.601 24.000 0.107 NA N NA
 5931484 5931485 MMAR_1816 MMAR_1817 lldD1_1 xerC FALSE 0.444 32.000 0.013 1.000 N NA
 5931487 5931488 MMAR_1819 MMAR_1820 rpsB tsf TRUE 0.995 2.000 0.748 1.000 Y NA
 5931488 5931489 MMAR_1820 MMAR_1821 tsf amiC TRUE 0.911 21.000 0.006 1.000 Y NA
 5931491 5931492 MMAR_1823 MMAR_1824     FALSE 0.559 119.000 0.667 1.000   NA
 5931494 5931495 MMAR_1826 MMAR_1827 pyrH frr TRUE 0.705 65.000 0.626 1.000 N NA
 5931495 5931496 MMAR_1827 MMAR_1828 frr cdsA FALSE 0.568 33.000 0.076 1.000 N NA
 5931496 5931497 MMAR_1828 MMAR_1829 cdsA   FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 5931497 5931498 MMAR_1829 MMAR_1830     FALSE 0.314 40.000 0.000 NA   NA
 5931498 5931499 MMAR_1830 MMAR_1831   mpt53 FALSE 0.252 74.000 0.003 1.000   NA
 5931499 5931500 MMAR_1831 MMAR_1832 mpt53   TRUE 0.989 14.000 1.000 1.000 Y NA
 5931500 5931501 MMAR_1832 MMAR_1833     TRUE 0.880 16.000 0.400 NA   NA
 5931502 5931503 MMAR_1834 MMAR_1835 mpt70 dipZ FALSE 0.114 88.000 0.000 1.000 N NA
 5931504 5931505 MMAR_1836 MMAR_1837 dxr   TRUE 0.671 20.000 0.088 1.000 N NA
 5931505 5931506 MMAR_1837 MMAR_1838   ispG TRUE 0.638 23.000 0.072 1.000 N NA
 5931506 5931507 MMAR_1838 MMAR_1839 ispG   FALSE 0.373 52.000 0.018 1.000   NA
 5931507 5931508 MMAR_1839 MMAR_1840     FALSE 0.391 111.000 0.292 1.000   NA
 5931508 5931509 MMAR_1840 MMAR_1841     FALSE 0.443 76.000 0.250 NA   NA
 5931509 5931510 MMAR_1841 MMAR_1842   mapB FALSE 0.198 105.000 0.042 NA   NA
 5931510 5931511 MMAR_1842 MMAR_1843 mapB   FALSE 0.012 210.000 0.000 NA   NA
 5931511 5931512 MMAR_1843 MMAR_1844     FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 5931513 5931514 MMAR_1845 MMAR_1846     FALSE 0.006 282.000 0.000 NA   NA
 5931514 5931515 MMAR_1846 MMAR_1847     FALSE 0.201 55.000 0.000 NA   NA
 5931515 5931516 MMAR_1847 MMAR_1848     FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 5931516 5931517 MMAR_1848 MMAR_1849     FALSE 0.098 109.000 0.000 NA   NA
 5931517 5931518 MMAR_1849 MMAR_1850     FALSE 0.002 813.000 0.000 NA   NA
 5931518 5931519 MMAR_1850 MMAR_1851     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 5931519 5931520 MMAR_1851 MMAR_1852   bioF2_3 FALSE 0.010 228.000 0.000 NA   NA
 5931520 5931521 MMAR_1852 MMAR_1853 bioF2_3   FALSE 0.183 61.000 0.000 NA   NA
 5931521 5931522 MMAR_1853 MMAR_1854   aroG_1 FALSE 0.006 285.000 0.000 NA   NA
 5931522 5931523 MMAR_1854 MMAR_1855 aroG_1   FALSE 0.002 735.000 0.000 1.000   NA
 5931523 5931524 MMAR_1855 MMAR_1856     FALSE 0.441 22.000 0.000 NA   NA
 5931524 5931525 MMAR_1856 MMAR_1857   hypD TRUE 0.810 4.000 0.013 NA   NA
 5931525 5931526 MMAR_1857 MMAR_1858 hypD hypC TRUE 0.939 12.000 0.017 NA Y NA
 5931526 5931527 MMAR_1858 MMAR_1859 hypC hypE TRUE 0.896 23.000 0.008 NA Y NA
 5931527 5931528 MMAR_1859 MMAR_1860 hypE   TRUE 0.961 -3.000 0.019 1.000 N NA
 5931528 5931529 MMAR_1860 MMAR_1861     TRUE 0.989 -3.000 0.286 NA   NA
 5931529 5931530 MMAR_1861 MMAR_1862   hypF TRUE 0.961 -3.000 0.005 NA   NA
 5931530 5931531 MMAR_1862 MMAR_1863 hypF   TRUE 0.977 2.000 0.015 NA Y NA
 5931531 5931532 MMAR_1863 MMAR_1864   hyaD TRUE 0.882 3.000 0.167 NA N NA
 5931532 5931533 MMAR_1864 MMAR_1865 hyaD   FALSE 0.187 123.000 0.139 NA   NA
 5931533 5931534 MMAR_1865 MMAR_1866     TRUE 0.991 -3.000 0.368 NA   NA
 5931534 5931535 MMAR_1866 MMAR_1867     TRUE 0.996 -3.000 0.696 NA   NA
 5931535 5931536 MMAR_1867 MMAR_1868     TRUE 0.971 -3.000 0.037 NA   NA
 5931536 5931537 MMAR_1868 MMAR_1869   hyaB TRUE 0.818 4.000 0.033 1.000 N NA
 5931537 5931538 MMAR_1869 MMAR_1870 hyaB hyaA TRUE 0.965 50.000 0.625 0.000 Y NA
 5931538 5931539 MMAR_1870 MMAR_1871 hyaA hypB FALSE 0.003 320.000 0.000 1.000 N NA
 5931539 5931540 MMAR_1871 MMAR_1872 hypB hypA TRUE 0.823 29.000 0.062 0.003   NA
 5931540 5931541 MMAR_1872 MMAR_1873 hypA hoxN FALSE 0.426 35.000 0.000 1.000   NA
 5931546 5931547 MMAR_1878 MMAR_1879     FALSE 0.449 21.000 0.000 NA   NA
 5931549 5931550 MMAR_1881 MMAR_1882 mqo elaA TRUE 0.983 -3.000 0.119 1.000   NA
 5931550 5931551 MMAR_1882 MMAR_1883 elaA   TRUE 0.991 -3.000 0.314 1.000   NA
 5931551 5931552 MMAR_1883 MMAR_1884   cobO TRUE 0.949 22.000 0.057 0.072 Y NA
 5931552 5931553 MMAR_1884 MMAR_1885 cobO cobB TRUE 0.817 95.000 0.114 0.007 Y NA
 5931553 5931554 MMAR_1885 MMAR_1886 cobB cysG FALSE 0.594 120.000 0.145 1.000 Y NA
 5931554 5931555 MMAR_1886 MMAR_1887 cysG efpA TRUE 0.633 34.000 0.156 NA   NA
 5931555 5931556 MMAR_1887 MMAR_1888 efpA proS FALSE 0.138 107.000 0.004 NA   NA
 5931557 5931558 MMAR_1889 MMAR_1890     TRUE 0.981 -3.000 0.139 NA   NA
 5931559 5931560 MMAR_1891 MMAR_1892   nusA TRUE 0.996 -3.000 0.759 NA   NA
 5931560 5931561 MMAR_1892 MMAR_1893 nusA   TRUE 0.801 86.000 0.323 NA Y NA
 5931561 5931562 MMAR_1893 MMAR_1894   infB FALSE 0.338 65.000 0.171 NA N NA
 5931562 5931563 MMAR_1894 MMAR_1895 infB rbfA TRUE 0.981 13.000 0.530 1.000 Y NA
 5931563 5931564 MMAR_1895 MMAR_1896 rbfA   TRUE 0.903 5.000 0.173 1.000   NA
 5931564 5931565 MMAR_1896 MMAR_1897   dinF TRUE 0.738 16.000 0.054 1.000   NA
 5931565 5931566 MMAR_1897 MMAR_1898 dinF ugpA FALSE 0.412 65.000 0.006 0.043 N NA
 5931566 5931567 MMAR_1898 MMAR_1899 ugpA ugpE TRUE 0.997 0.000 0.389 0.012 Y NA
 5931567 5931568 MMAR_1899 MMAR_1900 ugpE   TRUE 0.992 7.000 0.467 0.012 Y NA
 5931568 5931569 MMAR_1900 MMAR_1901     TRUE 0.999 -7.000 0.467 0.012 Y NA
 5931570 5931571 MMAR_1902 MMAR_1903 trxB2_2 echA16_2 FALSE 0.193 50.000 0.000 1.000 N NA
 5931572 5931573 MMAR_1904 MMAR_1905     FALSE 0.357 133.000 0.000 NA Y NA
 5931573 5931574 MMAR_1905 MMAR_1906     FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5931574 5931575 MMAR_1906 MMAR_1907     TRUE 0.972 -3.000 0.041 NA   NA
 5931576 5931577 MMAR_1908 MMAR_1909     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931577 5931578 MMAR_1909 MMAR_1910     FALSE 0.248 48.000 0.000 NA   NA
 5931578 5931579 MMAR_1910 MMAR_1911     TRUE 0.801 32.000 0.375 NA   NA
 5931580 5931581 MMAR_1912 MMAR_1913     TRUE 0.956 -9.000 0.006 NA   NA
 5931581 5931582 MMAR_1913 MMAR_1914   lppV_1 TRUE 0.895 0.000 0.006 NA   NA
 5931582 5931583 MMAR_1914 MMAR_1915 lppV_1   FALSE 0.307 91.000 0.111 NA   NA
 5931583 5931584 MMAR_1915 MMAR_1916   pptII TRUE 0.987 -3.000 0.203 1.000   NA
 5931584 5931585 MMAR_1916 MMAR_1917 pptII truB TRUE 0.966 -3.000 0.034 1.000 N NA
 5931585 5931586 MMAR_1917 MMAR_1918 truB ltp1 FALSE 0.084 107.000 0.003 NA N NA
 5931586 5931587 MMAR_1918 MMAR_1919 ltp1 fadE21 TRUE 0.879 29.000 0.011 NA Y NA
 5931589 5931590 MMAR_1921 MMAR_1922 ribF rpsO FALSE 0.154 126.000 0.119 1.000 N NA
 5931590 5931591 MMAR_1922 MMAR_1923 rpsO lppU TRUE 0.651 12.000 0.004 NA   NA
 5931591 5931592 MMAR_1923 MMAR_1924 lppU   FALSE 0.348 35.000 0.000 NA   NA
 5931592 5931593 MMAR_1924 MMAR_1925   gpsI FALSE 0.003 371.000 0.000 NA   NA
 5931593 5931594 MMAR_1925 MMAR_1926 gpsI pepR TRUE 0.980 -22.000 0.171 1.000   NA
 5931594 5931595 MMAR_1926 MMAR_1927 pepR   TRUE 0.825 5.000 0.010 1.000   NA
 5931597 5931598 MMAR_1929 MMAR_1930     TRUE 0.623 29.000 0.074 NA   NA
 5931598 5931599 MMAR_1930 MMAR_1931     FALSE 0.486 105.000 0.429 NA   NA
 5931599 5931600 MMAR_1931 MMAR_1932   ephD_1 TRUE 0.967 6.000 0.667 NA   NA
 5931600 5931601 MMAR_1932 MMAR_1933 ephD_1   FALSE 0.609 14.000 0.000 1.000   NA
 5931603 5931604 MMAR_1935 MMAR_1936     TRUE 0.977 6.000 0.900 NA   NA
 5931606 5931607 MMAR_1938 MMAR_1939 dapB   TRUE 0.811 8.000 0.027 1.000   NA
 5931607 5931608 MMAR_1939 MMAR_1940     TRUE 0.977 -3.000 0.069 NA   NA
 5931608 5931609 MMAR_1940 MMAR_1941     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5931609 5931610 MMAR_1941 MMAR_1942     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931610 5931611 MMAR_1942 MMAR_1943     FALSE 0.190 59.000 0.000 NA   NA
 5931611 5931612 MMAR_1943 MMAR_1944     FALSE 0.348 35.000 0.000 NA   NA
 5931614 5931615 MMAR_1946 MMAR_1947     FALSE 0.029 159.000 0.000 NA   NA
 5931615 5931616 MMAR_1947 MMAR_1948   fadD13_1 FALSE 0.058 100.000 0.000 NA N NA
 5931616 5931617 MMAR_1948 MMAR_1949 fadD13_1   FALSE 0.005 299.000 0.000 NA   NA
 5931617 5931618 MMAR_1949 MMAR_1950     TRUE 0.809 70.000 1.000 NA   NA
 5931618 5931619 MMAR_1950 MMAR_1951   accA3_1 FALSE 0.210 32.000 0.000 NA N NA
 5931621 5931622 MMAR_1952 MMAR_1953   fadE34_1 TRUE 0.995 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5931622 5931623 MMAR_1953 MMAR_1954 fadE34_1 fadE18_1 TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.017 Y NA
 5931625 5931626 MMAR_1956 MMAR_1957 thyA dfrA TRUE 0.903 8.000 0.295 1.000 N NA
 5931626 5931627 MMAR_1957 MMAR_1958 dfrA   TRUE 0.964 -3.000 0.012 NA   NA
 5931627 5931628 MMAR_1958 MMAR_1959   hsdM TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5931628 5931629 MMAR_1959 MMAR_1960 hsdM hsdS TRUE 0.988 -3.000 0.033 0.042   NA
 5931629 5931630 MMAR_1960 MMAR_1961 hsdS thyX TRUE 0.665 11.000 0.000 1.000   NA
 5931630 5931631 MMAR_1961 MMAR_1962 thyX dapA FALSE 0.133 118.000 0.037 1.000 N NA
 5931631 5931632 MMAR_1962 MMAR_1963 dapA   TRUE 0.910 20.000 0.550 1.000   NA
 5931633 5931634 MMAR_1964 MMAR_1965     TRUE 0.991 4.000 0.600 NA Y NA
 5931634 5931635 MMAR_1965 MMAR_1966     TRUE 0.981 0.000 0.250 0.061   NA
 5931638 5931639 MMAR_1969 MMAR_1970 pgsA3   FALSE 0.084 140.000 0.006 1.000   NA
 5931639 5931640 MMAR_1970 MMAR_1971     FALSE 0.124 159.000 0.260 NA   NA
 5931640 5931641 MMAR_1971 MMAR_1972     TRUE 0.848 16.000 0.306 NA   NA
 5931643 5931644 MMAR_1974 MMAR_1975     TRUE 0.698 24.000 0.152 NA   NA
 5931646 5931647 MMAR_1977 MMAR_1978 recA recX TRUE 0.987 -34.000 0.296 1.000   NA
 5931647 5931648 MMAR_1978 MMAR_1979 recX   FALSE 0.276 75.000 0.016 1.000   NA
 5931648 5931649 MMAR_1979 MMAR_1980     TRUE 0.968 -3.000 0.024 NA   NA
 5931650 5931651 MMAR_1981 MMAR_1982   pknH_2 FALSE 0.008 241.000 0.000 NA   NA
 5931652 5931653 MMAR_1983 MMAR_1984     FALSE 0.011 220.000 0.000 NA   NA
 5931653 5931654 MMAR_1984 MMAR_1985     FALSE 0.454 47.000 0.059 NA   NA
 5931654 5931655 MMAR_1985 MMAR_1986   miaA TRUE 0.973 -3.000 0.043 NA   NA
 5931655 5931656 MMAR_1986 MMAR_1987 miaA dapF TRUE 0.838 5.000 0.062 1.000 N NA
 5931656 5931657 MMAR_1987 MMAR_1988 dapF hflX FALSE 0.438 47.000 0.025 1.000   NA
 5931657 5931658 MMAR_1988 MMAR_1989 hflX fadE20 FALSE 0.073 144.000 0.003 1.000   NA
 5931662 5931663 MMAR_1993 MMAR_1994     TRUE 0.716 10.000 0.012 NA   NA
 5931663 5931664 MMAR_1994 MMAR_1995     FALSE 0.482 29.000 0.005 NA   NA
 5931665 5931666 MMAR_1996 MMAR_1997     TRUE 0.782 46.000 0.280 0.045   NA
 5931666 5931667 MMAR_1997 MMAR_1998     TRUE 0.786 49.000 0.538 1.000   NA
 5931671 5931672 MMAR_2002 MMAR_2003 ideR sigB FALSE 0.480 152.000 0.134 0.061 Y NA
 5931672 5931673 MMAR_2003 MMAR_2004 sigB   FALSE 0.230 135.000 0.303 NA   NA
 5931675 5931676 MMAR_2006 MMAR_2007     FALSE 0.416 66.000 0.185 NA   NA
 5931678 5931679 MMAR_2009 MMAR_2010     FALSE 0.102 106.000 0.000 NA   NA
 5931679 5931680 MMAR_2010 MMAR_2011   sigA FALSE 0.017 210.000 0.000 1.000   NA
 5931680 5931681 MMAR_2011 MMAR_2012 sigA ppgK FALSE 0.251 179.000 0.075 1.000 Y NA
 5931686 5931687 MMAR_2017 MMAR_2018 dut   TRUE 0.937 0.000 0.078 NA   NA
 5931689 5931690 MMAR_2020 MMAR_2021     TRUE 0.670 28.000 0.145 NA   NA
 5931691 5931692 MMAR_2022 MMAR_2023 ceoC ceoB TRUE 0.902 53.000 0.162 0.002 Y NA
 5931693 5931694 MMAR_2024 MMAR_2025     TRUE 0.970 -3.000 0.082 NA N NA
 5931694 5931695 MMAR_2025 MMAR_2026     FALSE 0.056 125.000 0.004 NA N NA
 5931695 5931696 MMAR_2026 MMAR_2027     TRUE 0.985 -3.000 0.222 NA   NA
 5931696 5931697 MMAR_2027 MMAR_2028     TRUE 0.982 -3.000 0.176 NA   NA
 5931698 5931699 MMAR_2029 MMAR_2030 arsB1 arsA TRUE 0.916 39.000 0.000 0.000 Y NA
 5931699 5931700 MMAR_2030 MMAR_2031 arsA   FALSE 0.199 56.000 0.000 NA   NA
 11425330 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -961.000 0.000 NA   NA
 11567693 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -961.000 0.000 NA   NA
 11710085 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -961.000 0.000 NA   NA
 11425331 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -999.000 0.000 NA   NA
 11567694 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -999.000 0.000 NA   NA
 11710086 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -999.000 0.000 NA   NA
 11425332 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1033.000 0.000 NA   NA
 11567695 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1033.000 0.000 NA   NA
 11710087 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1033.000 0.000 NA   NA
 11425333 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1053.000 0.000 NA   NA
 11567696 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1053.000 0.000 NA   NA
 11710088 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1053.000 0.000 NA   NA
 11425334 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1087.000 0.000 NA   NA
 11567697 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1087.000 0.000 NA   NA
 11710089 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1087.000 0.000 NA   NA
 11425335 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1134.000 0.000 NA   NA
 11567698 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1134.000 0.000 NA   NA
 11710090 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1134.000 0.000 NA   NA
 11425336 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1168.000 0.000 NA   NA
 11567699 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1168.000 0.000 NA   NA
 11710091 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1168.000 0.000 NA   NA
 11425337 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1197.000 0.000 NA   NA
 11567700 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1197.000 0.000 NA   NA
 11710092 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1197.000 0.000 NA   NA
 11425338 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1231.000 0.000 NA   NA
 11567701 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1231.000 0.000 NA   NA
 11710093 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1231.000 0.000 NA   NA
 11425339 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1260.000 0.000 NA   NA
 11567702 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1260.000 0.000 NA   NA
 11710094 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1260.000 0.000 NA   NA
 11425340 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1294.000 0.000 NA   NA
 11567703 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1294.000 0.000 NA   NA
 11710095 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1294.000 0.000 NA   NA
 11425341 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1323.000 0.000 NA   NA
 11567704 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1323.000 0.000 NA   NA
 11710096 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1323.000 0.000 NA   NA
 11425342 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1357.000 0.000 NA   NA
 11567705 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1357.000 0.000 NA   NA
 11710097 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1357.000 0.000 NA   NA
 11425343 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1377.000 0.000 NA   NA
 11567706 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1377.000 0.000 NA   NA
 11710098 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1377.000 0.000 NA   NA
 11425344 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1411.000 0.000 NA   NA
 11567707 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1411.000 0.000 NA   NA
 11710099 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1411.000 0.000 NA   NA
 11425345 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1431.000 0.000 NA   NA
 11567708 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1431.000 0.000 NA   NA
 11710100 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1431.000 0.000 NA   NA
 11425346 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1465.000 0.000 NA   NA
 11567709 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1465.000 0.000 NA   NA
 11710101 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1465.000 0.000 NA   NA
 11425347 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1497.000 0.000 NA   NA
 11567710 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1497.000 0.000 NA   NA
 11710102 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1497.000 0.000 NA   NA
 11425348 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1531.000 0.000 NA   NA
 11567711 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1531.000 0.000 NA   NA
 11710103 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1531.000 0.000 NA   NA
 11425349 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1560.000 0.000 NA   NA
 11567712 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1560.000 0.000 NA   NA
 11710104 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1560.000 0.000 NA   NA
 11425350 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1594.000 0.000 NA   NA
 11567713 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1594.000 0.000 NA   NA
 11710105 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1594.000 0.000 NA   NA
 11425351 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1641.000 0.000 NA   NA
 11567714 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1641.000 0.000 NA   NA
 11710106 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1641.000 0.000 NA   NA
 11425352 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1675.000 0.000 NA   NA
 11567715 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1675.000 0.000 NA   NA
 11710107 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1675.000 0.000 NA   NA
 11425353 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1740.000 0.000 NA   NA
 11567716 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1740.000 0.000 NA   NA
 11710108 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1740.000 0.000 NA   NA
 11425354 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1774.000 0.000 NA   NA
 11567717 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1774.000 0.000 NA   NA
 11710109 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1774.000 0.000 NA   NA
 11425355 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1842.000 0.000 NA   NA
 11567718 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1842.000 0.000 NA   NA
 11710110 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1842.000 0.000 NA   NA
 11425356 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1876.000 0.000 NA   NA
 11567719 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1876.000 0.000 NA   NA
 11710111 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1876.000 0.000 NA   NA
 11425357 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1959.000 0.000 NA   NA
 11567720 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1959.000 0.000 NA   NA
 11710112 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1959.000 0.000 NA   NA
 11425358 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1909.000 0.000 NA   NA
 11567721 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1909.000 0.000 NA   NA
 11710113 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1909.000 0.000 NA   NA
 11425359 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1875.000 0.000 NA   NA
 11567722 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1875.000 0.000 NA   NA
 11710114 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1875.000 0.000 NA   NA
 11425360 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1810.000 0.000 NA   NA
 11567723 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1810.000 0.000 NA   NA
 11710115 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1810.000 0.000 NA   NA
 11425361 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1776.000 0.000 NA   NA
 11567724 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1776.000 0.000 NA   NA
 11710116 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1776.000 0.000 NA   NA
 11425362 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1717.000 0.000 NA   NA
 11567725 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1717.000 0.000 NA   NA
 11710117 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1717.000 0.000 NA   NA
 11425363 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1683.000 0.000 NA   NA
 11567726 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1683.000 0.000 NA   NA
 11710118 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1683.000 0.000 NA   NA
 11425364 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1618.000 0.000 NA   NA
 11567727 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1618.000 0.000 NA   NA
 11710119 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1618.000 0.000 NA   NA
 11425365 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1584.000 0.000 NA   NA
 11567728 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1584.000 0.000 NA   NA
 11710120 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1584.000 0.000 NA   NA
 11425366 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1537.000 0.000 NA   NA
 11567729 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1537.000 0.000 NA   NA
 11710121 5931702   MMAR_2033     FALSE NA -1537.000 0.000 NA   NA
 5931704 5931705 MMAR_2035 MMAR_2036     TRUE 0.914 2.000 0.115 NA   NA
 5931705 5931706 MMAR_2036 MMAR_2037   echA15 FALSE 0.090 139.000 0.038 NA   NA
 5931707 5931708 MMAR_2038 MMAR_2039 hemE hemY TRUE 0.998 -3.000 0.049 0.001 Y NA
 5931708 5931709 MMAR_2039 MMAR_2040 hemY   TRUE 0.873 6.000 0.158 NA   NA
 5931709 5931710 MMAR_2040 MMAR_2041     TRUE 0.965 -3.000 0.014 NA   NA
 5931711 5931712 MMAR_2042 MMAR_2043     TRUE 0.985 -3.000 0.217 NA   NA
 5931712 5931713 MMAR_2043 MMAR_2044     TRUE 0.877 20.000 0.444 NA   NA
 5931713 5931714 MMAR_2044 MMAR_2045   ribD FALSE 0.610 49.000 0.275 NA   NA
 5931716 5931717 MMAR_5575 MMAR_2047     FALSE 0.439 47.000 0.051 NA   NA
 5931717 5931718 MMAR_2047 MMAR_2048   clpC2 FALSE 0.347 79.000 0.150 NA   NA
 5931719 5931720 MMAR_2049 MMAR_2050     FALSE 0.205 54.000 0.000 NA   NA
 5931720 5931721 MMAR_2050 MMAR_2051     FALSE 0.447 32.000 0.000 1.000   NA
 5931722 5931723 MMAR_2052 MMAR_5500   valU FALSE 0.058 131.000 0.000 NA   NA
 5931723 5931724 MMAR_5500 MMAR_5501 valU cysU FALSE 0.496 16.000 0.000 NA   NA
 5931724 5931725 MMAR_5501 MMAR_5502 cysU glyT FALSE 0.402 27.000 0.000 NA   NA
 5931727 5931728 MMAR_2053 MMAR_2054     FALSE 0.002 540.000 0.000 NA   NA
 5931728 5931729 MMAR_2054 MMAR_2055   arsC FALSE 0.062 128.000 0.000 NA   NA
 5931729 5931730 MMAR_2055 MMAR_2056 arsC   TRUE 0.995 -3.000 0.600 1.000 N NA
 5931730 5931731 MMAR_2056 MMAR_2057   cadI FALSE 0.557 80.000 0.400 NA   NA
 5931732 5931733 MMAR_2058 MMAR_2059     FALSE 0.123 98.000 0.000 NA   NA
 5931733 5931734 MMAR_2059 MMAR_2060     FALSE 0.289 43.000 0.000 NA   NA
 5931739 5931740 MMAR_2065 MMAR_2066     FALSE 0.003 452.000 0.000 1.000   NA
 5931741 5931742 MMAR_2067 MMAR_2068     FALSE 0.115 101.000 0.000 NA   NA
 5931743 5931744 MMAR_2069 MMAR_2070     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 5931744 5931745 MMAR_2070 MMAR_2071   fadD11_1 FALSE 0.177 63.000 0.000 NA   NA
 5931746 5931747 MMAR_2072 MMAR_2073     TRUE 0.880 16.000 0.400 NA   NA
 5931747 5931748 MMAR_2073 MMAR_2074     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5931748 5931749 MMAR_2074 MMAR_2075     FALSE 0.343 36.000 0.000 NA   NA
 5931749 5931750 MMAR_2075 MMAR_2076     FALSE 0.264 54.000 0.000 1.000   NA
 5931751 5931752 MMAR_2077 MMAR_2078     FALSE 0.116 130.000 0.013 1.000   NA
 5931752 5931753 MMAR_2078 MMAR_2079   narK3 FALSE 0.017 190.000 0.000 NA   NA
 5931754 5931755 MMAR_2080 MMAR_2081 fdxA_1   TRUE 0.840 10.000 0.200 1.000 N NA
 5931755 5931756 MMAR_2081 MMAR_2082     TRUE 0.980 -3.000 0.129 NA   NA
 5931756 5931757 MMAR_2082 MMAR_2083     TRUE 0.765 13.000 0.090 NA   NA
 5931757 5931758 MMAR_2083 MMAR_2084     TRUE 0.855 3.000 0.030 NA   NA
 5931760 5931761 MMAR_2086 MMAR_2087     FALSE 0.250 87.000 0.039 NA   NA
 5931761 5931762 MMAR_2087 MMAR_2088   thrS FALSE 0.062 128.000 0.000 NA   NA
 5931762 5931763 MMAR_2088 MMAR_2089 thrS   TRUE 0.915 3.000 0.208 1.000 N NA
 5931763 5931764 MMAR_2089 MMAR_2090   pgsA1 TRUE 0.835 8.000 0.140 1.000 N NA
 5931764 5931765 MMAR_2090 MMAR_2091 pgsA1   TRUE 0.996 -3.000 0.737 1.000 N NA
 5931765 5931766 MMAR_2091 MMAR_2092   pimA TRUE 0.997 0.000 0.831 1.000 Y NA
 5931766 5931767 MMAR_2092 MMAR_2093 pimA   TRUE 0.888 0.000 0.000 1.000   NA
 5931767 5931768 MMAR_2093 MMAR_2094   snzP FALSE 0.022 192.000 0.000 1.000   NA
 5931768 5931769 MMAR_2094 MMAR_2095 snzP tesB2 TRUE 0.690 10.000 0.014 1.000 N NA
 5931769 5931770 MMAR_2095 MMAR_2096 tesB2 snoP TRUE 0.690 8.000 0.027 NA N NA
 5931774 5931775 MMAR_2100 MMAR_2101     FALSE 0.019 182.000 0.000 NA   NA
 5931775 5931776 MMAR_2101 MMAR_2102     FALSE 0.013 205.000 0.000 NA   NA
 5931776 5931777 MMAR_2102 MMAR_2103     FALSE 0.026 164.000 0.000 NA   NA
 5931778 5931779 MMAR_2104 MMAR_2105 speE   TRUE 0.977 -3.000 0.065 NA   NA
 5931779 5931780 MMAR_2105 MMAR_2106     TRUE 0.821 34.000 0.444 NA   NA
 5931780 5931781 MMAR_2106 MMAR_2107     TRUE 0.986 -3.000 0.242 NA   NA
 5931781 5931782 MMAR_2107 MMAR_2108     TRUE 0.931 10.000 0.455 NA   NA
 5931783 5931784 MMAR_2109 MMAR_2110 ruvC ruvA TRUE 0.999 -3.000 0.451 0.007 Y NA
 5931784 5931785 MMAR_2110 MMAR_2111 ruvA ruvB TRUE 0.995 4.000 0.549 0.001 Y NA
 5931786 5931787 MMAR_2112 MMAR_2113     FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 5931788 5931789 MMAR_2114 MMAR_2115     FALSE 0.136 90.000 0.000 NA   NA
 5931790 5931791 MMAR_2116 MMAR_2117   fadD9 FALSE 0.032 154.000 0.000 NA   NA
 5931791 5931792 MMAR_2117 MMAR_2118 fadD9 gabT FALSE 0.134 181.000 0.444 1.000 N NA
 5931793 5931794 MMAR_2119 MMAR_2120 yajC secD FALSE 0.586 112.000 0.062 NA Y NA
 5931794 5931795 MMAR_2120 MMAR_2121 secD secF TRUE 0.993 5.000 0.336 0.000 Y NA
 5931795 5931796 MMAR_2121 MMAR_2122 secF   TRUE 0.837 6.000 0.083 1.000 N NA
 5931796 5931797 MMAR_2122 MMAR_2123   apt TRUE 0.963 -3.000 0.023 1.000 N NA
 5931797 5931798 MMAR_2123 MMAR_2124 apt relA FALSE 0.260 77.000 0.051 1.000 N NA
 5931800 5931801 MMAR_2126 MMAR_2127   hisS TRUE 0.979 -3.000 0.051 1.000   NA
 5931801 5931802 MMAR_2127 MMAR_2128 hisS   FALSE 0.173 65.000 0.000 NA   NA
 5931802 5931803 MMAR_2128 MMAR_2129     FALSE 0.612 10.000 0.000 NA   NA
 5931804 5931805 MMAR_2130 MMAR_2131     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5931805 5931806 MMAR_2131 MMAR_2132     FALSE 0.123 98.000 0.000 NA   NA
 5931807 5931808 MMAR_2133 MMAR_2134     TRUE 0.991 -13.000 0.400 1.000   NA
 5931810 5931811 MMAR_2137 MMAR_2138     FALSE 0.009 213.000 0.000 1.000 N NA
 5931811 5931812 MMAR_2138 MMAR_2139     FALSE 0.055 125.000 0.000 1.000 N NA
 5931812 5931813 MMAR_2139 MMAR_2140     FALSE 0.134 70.000 0.000 1.000 N NA
 5931814 5931815 MMAR_2141 MMAR_2142     FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 5931815 5931816 MMAR_2142 MMAR_2143     FALSE 0.546 13.000 0.000 NA   NA
 5931817 5931818 MMAR_2144 MMAR_2145     FALSE 0.003 419.000 0.000 NA   NA
 5931818 5931819 MMAR_2145 MMAR_2146     FALSE 0.009 238.000 0.000 NA   NA
 5931819 5931820 MMAR_2146 MMAR_2147     TRUE 0.634 9.000 0.000 NA   NA
 5931820 5931821 MMAR_2147 MMAR_2148     FALSE 0.001 1333.000 0.000 1.000 N NA
 5931822 5931823 MMAR_2149 MMAR_2150     FALSE 0.397 39.000 0.000 1.000   NA
 5931826 5931827 MMAR_2153 MMAR_2154   dapA_1 TRUE 0.736 38.000 0.333 1.000 N NA
 5931828 5931829 MMAR_2155 MMAR_2156     FALSE 0.276 62.000 0.021 NA   NA
 5931829 5931830 MMAR_2156 MMAR_2157   apbA_1 TRUE 0.709 19.000 0.098 NA   NA
 5931831 5931832 MMAR_2158 MMAR_2159 aspS   TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5931832 5931833 MMAR_2159 MMAR_2160     TRUE 0.919 20.000 0.667 NA   NA
 5931835 5931836 MMAR_2162 MMAR_2163     TRUE 0.971 -7.000 0.046 NA   NA
 5931837 5931838 MMAR_2164 MMAR_2165     TRUE 0.829 46.000 0.667 NA   NA
 5931838 5931839 MMAR_2165 MMAR_2166     FALSE 0.046 139.000 0.000 NA   NA
 5931842 5931843 MMAR_2169 MMAR_2170   alaS FALSE 0.117 119.000 0.011 NA   NA
 5931843 5931844 MMAR_2170 MMAR_2171 alaS   TRUE 0.913 1.000 0.103 1.000 N NA
 5931844 5931845 MMAR_2171 MMAR_2172     TRUE 0.969 -7.000 0.039 NA   NA
 5931845 5931846 MMAR_2172 MMAR_2173   aroE TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5931846 5931847 MMAR_2173 MMAR_2174 aroE   TRUE 0.742 12.000 0.022 1.000   NA
 5931847 5931848 MMAR_2174 MMAR_2175   aroF FALSE 0.270 77.000 0.016 1.000   NA
 5931848 5931849 MMAR_2175 MMAR_2176 aroF aroK TRUE 0.962 9.000 0.041 1.000 Y NA
 5931849 5931850 MMAR_2176 MMAR_2177 aroK aroB TRUE 0.997 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 5931850 5931851 MMAR_2177 MMAR_2178 aroB aroD TRUE 0.998 -3.000 0.052 0.002 Y NA
 5931853 5931854 MMAR_2180 MMAR_2181 pepQ efp TRUE 0.750 15.000 0.160 1.000 N NA
 5931854 5931855 MMAR_2181 MMAR_2182 efp nusB TRUE 0.879 3.000 0.078 1.000 N NA
 5931855 5931856 MMAR_2182 MMAR_2183 nusB   TRUE 0.891 0.000 0.004 NA   NA
 5931856 5931857 MMAR_2183 MMAR_2184     FALSE 0.055 182.000 0.143 NA   NA
 5931858 5931859 MMAR_2185 MMAR_2186     FALSE 0.224 46.000 0.000 1.000 N NA
 5931859 5931860 MMAR_2186 MMAR_2187     TRUE 0.784 16.000 0.222 1.000 N NA
 5931861 5931862 MMAR_2188 MMAR_2189 lprF   FALSE 0.018 267.000 0.100 NA   NA
 5931862 5931863 MMAR_2189 MMAR_2190     TRUE 0.965 -3.000 0.028 1.000 N NA
 5931863 5931864 MMAR_2190 MMAR_2191     TRUE 0.888 0.000 0.000 1.000   NA
 5931864 5931865 MMAR_2191 MMAR_2192     TRUE 0.967 0.000 0.000 0.001   NA
 5931867 5931868 MMAR_2194 MMAR_2195 pyrR pyrB TRUE 0.997 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 5931868 5931869 MMAR_2195 MMAR_2196 pyrB pyrC TRUE 0.998 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 5931869 5931870 MMAR_2196 MMAR_2197 pyrC   TRUE 0.976 -3.000 0.057 NA   NA
 5931870 5931871 MMAR_2197 MMAR_2198   carA TRUE 0.974 -3.000 0.050 NA   NA
 5931871 5931872 MMAR_2198 MMAR_2199 carA carB TRUE 0.980 20.000 0.345 0.000 Y NA
 5931872 5931873 MMAR_2199 MMAR_2200 carB pyrF TRUE 0.996 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 5931873 5931874 MMAR_2200 MMAR_2201 pyrF mihF FALSE 0.004 957.000 0.029 1.000   NA
 5931874 5931875 MMAR_2201 MMAR_2202 mihF gmk FALSE 0.154 130.000 0.054 1.000   NA
 5931875 5931876 MMAR_2202 MMAR_2203 gmk rpoZ FALSE 0.571 87.000 0.471 1.000 N NA
 5931876 5931877 MMAR_2203 MMAR_2204 rpoZ dfp TRUE 0.761 16.000 0.192 1.000 N NA
 5931877 5931878 MMAR_2204 MMAR_2205 dfp metK FALSE 0.504 129.000 0.059 1.000 Y NA
 5931879 5931880 MMAR_2206 MMAR_2207     FALSE 0.177 92.000 0.000 1.000   NA
 5931880 5931881 MMAR_2207 MMAR_2208   lipH FALSE 0.031 145.000 0.000 1.000 N NA
 5931881 5931882 MMAR_2208 MMAR_2209 lipH lipI TRUE 0.961 27.000 0.250 0.016 Y NA
 5931883 5931884 MMAR_2210 MMAR_2211   priA FALSE 0.222 111.000 0.050 1.000   NA
 5931888 5931889 MMAR_2215 MMAR_2216 fmt fmu TRUE 0.998 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 5931889 5931890 MMAR_2216 MMAR_2217 fmu rpe FALSE 0.300 67.000 0.056 1.000 N NA
 5931890 5931891 MMAR_2217 MMAR_2218 rpe ribG TRUE 0.751 8.000 0.028 1.000 N NA
 5931892 5931893 MMAR_2219 MMAR_2220   lprG TRUE 0.982 0.000 0.500 NA   NA
 5931894 5931895 MMAR_2221 MMAR_2222 ribC ribA2 FALSE 0.403 139.000 0.029 1.000 Y NA
 5931895 5931896 MMAR_2222 MMAR_2223 ribA2 ribH TRUE 0.998 -3.000 0.041 0.002 Y NA
 5931896 5931897 MMAR_2223 MMAR_2224 ribH   TRUE 0.965 -3.000 0.014 NA   NA
 5931897 5931898 MMAR_2224 MMAR_2225   lprH TRUE 0.721 20.000 0.143 NA   NA
 5931898 5931899 MMAR_2225 MMAR_2226 lprH   FALSE 0.265 46.000 0.000 NA   NA
 5931899 5931900 MMAR_2226 MMAR_2227   uvrC FALSE 0.458 20.000 0.000 NA   NA
 5931900 5931901 MMAR_2227 MMAR_2228 uvrC   TRUE 0.978 -3.000 0.073 NA   NA
 5931901 5931902 MMAR_2228 MMAR_2229     TRUE 0.987 -3.000 0.259 NA   NA
 5931902 5931903 MMAR_2229 MMAR_2230   whiA TRUE 0.993 -3.000 0.470 NA   NA
 5931903 5931904 MMAR_2230 MMAR_2231 whiA   FALSE 0.110 103.000 0.000 NA   NA
 5931905 5931906 MMAR_2232 MMAR_2233 lipO fadD12 TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 5931906 5931907 MMAR_2233 MMAR_2234 fadD12   TRUE 0.989 4.000 0.429 1.000 Y NA
 5931908 5931909 MMAR_2235 MMAR_2236     FALSE 0.013 204.000 0.000 NA   NA
 5931909 5931910 MMAR_2236 MMAR_2237     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5931912 5931913 MMAR_2239 MMAR_2240 gap pgk TRUE 0.972 13.000 0.055 0.003 Y NA
 5931913 5931914 MMAR_2240 MMAR_2241 pgk tpi TRUE 0.996 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 5931915 5931916 MMAR_2242 MMAR_2243 gabT_1   TRUE 0.995 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5931918 5931919 MMAR_2245 MMAR_2246   secG FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5931921 5931922 MMAR_2248 MMAR_2249     FALSE 0.127 96.000 0.000 NA   NA
 5931922 5931923 MMAR_2249 MMAR_2250   devB FALSE 0.231 50.000 0.000 NA   NA
 5931923 5931924 MMAR_2250 MMAR_2251 devB opcA TRUE 0.997 -3.000 0.179 NA Y NA
 5931924 5931925 MMAR_2251 MMAR_2252 opcA zwf2 TRUE 0.654 103.000 0.104 NA Y NA
 5931925 5931926 MMAR_2252 MMAR_2253 zwf2 tal TRUE 0.996 -3.000 0.067 1.000 Y NA
 5931926 5931927 MMAR_2253 MMAR_2254 tal tkt TRUE 0.943 16.000 0.090 1.000 Y NA
 5931930 5931931 MMAR_2257 MMAR_2258 otsB1   FALSE 0.030 128.000 0.000 NA N NA
 5931934 5931935 MMAR_2261 MMAR_2262     TRUE 0.652 44.000 0.022 0.040   NA
 5931935 5931936 MMAR_2262 MMAR_2263     TRUE 0.986 -3.000 0.186 1.000   NA
 5931936 5931937 MMAR_2263 MMAR_2264     TRUE 0.991 -3.000 0.357 NA   NA
 5931938 5931939 MMAR_2265 MMAR_2266     TRUE 0.977 -3.000 0.100 1.000 N NA
 5931939 5931940 MMAR_2266 MMAR_2267     TRUE 0.999 -3.000 0.266 0.001 Y NA
 5931940 5931941 MMAR_2267 MMAR_2268     TRUE 0.998 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 5931941 5931942 MMAR_2268 MMAR_2269   csd TRUE 0.884 3.000 0.093 1.000 N NA
 5931942 5931943 MMAR_2269 MMAR_2270 csd   TRUE 0.925 3.000 0.249 1.000 N NA
 5931943 5931944 MMAR_2270 MMAR_2271     TRUE 0.979 -7.000 0.152 NA   NA
 5931944 5931945 MMAR_2271 MMAR_2272     FALSE 0.018 184.000 0.000 NA   NA
 5931946 5931947 MMAR_2273 MMAR_2274 fadE15   FALSE 0.314 106.000 0.222 NA   NA
 5931948 5931949 MMAR_2275 MMAR_2276 ctpD trxA FALSE 0.241 95.000 0.018 1.000   NA
 5931949 5931950 MMAR_2276 MMAR_2277 trxA trxB1 TRUE 0.721 57.000 0.222 0.002   NA
 5931950 5931951 MMAR_2277 MMAR_2278 trxB1 echA12 TRUE 0.657 84.000 0.636 1.000 N NA
 5931951 5931952 MMAR_2278 MMAR_2279 echA12   TRUE 0.699 25.000 0.090 1.000   NA
 5931952 5931953 MMAR_2279 MMAR_2280     FALSE 0.367 85.000 0.191 NA   NA
 5931954 5931955 MMAR_2281 MMAR_2282   acn TRUE 0.871 10.000 0.256 1.000 N NA
 5931956 5931957 MMAR_2283 MMAR_2284   iipA FALSE 0.009 232.000 0.000 NA   NA
 5931957 5931958 MMAR_2284 MMAR_2285 iipA iipB TRUE 0.915 5.000 0.250 NA   NA
 5931958 5931959 MMAR_2285 MMAR_2286 iipB moxR1 FALSE 0.041 199.000 0.120 NA   NA
 5931959 5931960 MMAR_2286 MMAR_2287 moxR1   TRUE 0.955 15.000 0.920 NA   NA
 5931960 5931961 MMAR_2287 MMAR_2288     TRUE 0.897 35.000 0.760 NA   NA
 5931961 5931962 MMAR_2288 MMAR_2289   fabG1 FALSE 0.094 114.000 0.020 NA N NA
 5931962 5931963 MMAR_2289 MMAR_2290 fabG1 inhA TRUE 0.735 80.000 0.078 1.000 Y NA
 5931963 5931964 MMAR_2290 MMAR_2291 inhA hemZ TRUE 0.781 7.000 0.038 1.000 N NA
 5931966 5931967 MMAR_2293 MMAR_2294     TRUE 0.943 22.000 0.259 NA Y NA
 5931967 5931968 MMAR_2294 MMAR_2295     TRUE 0.974 -3.000 0.049 NA   NA
 5931969 5931970 MMAR_2296 MMAR_2297     FALSE 0.360 33.000 0.000 NA   NA
 5931971 5931972 MMAR_2298 MMAR_2299     TRUE 0.996 0.000 0.545 1.000 Y NA
 5931973 5931974 MMAR_2300 MMAR_2301     FALSE 0.333 65.000 0.057 NA   NA
 5931975 5931976 MMAR_2302 MMAR_2303 mutA mutB TRUE 0.987 6.000 0.115 0.001 Y NA
 5931976 5931977 MMAR_2303 MMAR_2304 mutB   FALSE 0.556 68.000 0.366 1.000 N NA
 5931977 5931978 MMAR_2304 MMAR_2305   lipL FALSE 0.222 64.000 0.011 1.000 N NA
 5931979 5931980 MMAR_2306 MMAR_2307     FALSE 0.062 128.000 0.000 NA   NA
 5931980 5931981 MMAR_2307 MMAR_2308     FALSE 0.458 20.000 0.000 NA   NA
 5931982 5931983 MMAR_2309 MMAR_2310 udgL galE5 TRUE 0.998 -3.000 0.364 1.000 Y NA
 5931983 5931984 MMAR_2310 MMAR_2311 galE5   TRUE 0.921 30.000 0.182 1.000 Y NA
 5931984 5931985 MMAR_2311 MMAR_2312     TRUE 0.640 86.000 0.000 1.000 Y NA
 5931985 5931986 MMAR_2312 MMAR_2313   losA FALSE 0.046 294.000 0.000 NA Y NA
 5931986 5931987 MMAR_2313 MMAR_2314 losA   TRUE 0.976 -3.000 0.167 NA N NA
 5931987 5931988 MMAR_2314 MMAR_2315     FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 5931988 5931989 MMAR_2315 MMAR_2316     FALSE 0.116 114.000 0.000 1.000   NA
 5931989 5931990 MMAR_2316 MMAR_2317     TRUE 0.684 6.000 0.000 NA   NA
 5931990 5931991 MMAR_2317 MMAR_2318     FALSE 0.007 261.000 0.000 NA   NA
 5931992 5931993 MMAR_2319 MMAR_2320   wecE FALSE 0.546 13.000 0.000 NA   NA
 5931993 5931994 MMAR_2320 MMAR_2321 wecE   FALSE 0.095 142.000 0.027 1.000   NA
 5931994 5931995 MMAR_2321 MMAR_2322     TRUE 0.969 -3.000 0.004 1.000   NA
 5931995 5931996 MMAR_2322 MMAR_2323     FALSE 0.004 332.000 0.000 NA   NA
 5931999 5932000 MMAR_2326 MMAR_2327     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932001 5932002 MMAR_2328 MMAR_2329   aroB_2 TRUE 0.909 -28.000 0.000 1.000 N NA
 5932002 5932003 MMAR_2329 MMAR_2330 aroB_2   TRUE 0.986 -3.000 0.263 1.000 N NA
 5932003 5932004 MMAR_2330 MMAR_2331     FALSE 0.064 138.000 0.000 1.000   NA
 5932004 5932005 MMAR_2331 MMAR_2332   ilvB1_3 FALSE 0.032 169.000 0.000 1.000   NA
 5932005 5932006 MMAR_2332 MMAR_2333 ilvB1_3 wcaA TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA N NA
 5932006 5932007 MMAR_2333 MMAR_2334 wcaA   TRUE 0.994 -3.000 0.000 NA Y NA
 5932008 5932009 MMAR_2335 MMAR_2336   galE6 TRUE 0.986 3.000 0.247 1.000 Y NA
 5932009 5932010 MMAR_2336 MMAR_2337 galE6   TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5932011 5932012 MMAR_2338 MMAR_2339     FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 5932012 5932013 MMAR_2339 MMAR_2340   pks5 FALSE 0.170 54.000 0.000 1.000 N NA
 5932015 5932016 MMAR_2342 MMAR_2343     FALSE 0.003 386.000 0.000 NA   NA
 5932016 5932017 MMAR_2343 MMAR_2344   pks5_1 FALSE 0.211 53.000 0.000 NA   NA
 5932018 5932019 MMAR_2345 MMAR_2346     FALSE 0.139 133.000 0.111 NA   NA
 5932019 5932020 MMAR_2346 MMAR_2347     FALSE 0.006 277.000 0.000 NA   NA
 5932020 5932021 MMAR_2347 MMAR_2348     FALSE 0.017 189.000 0.000 NA   NA
 5932021 5932022 MMAR_2348 MMAR_2349   wbbL2 FALSE 0.007 258.000 0.000 NA   NA
 5932025 5932026 MMAR_2352 MMAR_2353     FALSE 0.416 25.000 0.000 NA   NA
 5932026 5932027 MMAR_2353 MMAR_2354     FALSE 0.175 64.000 0.000 NA   NA
 5932027 5932028 MMAR_2354 MMAR_2355   papA3 FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5932030 5932031 MMAR_2357 MMAR_2358     FALSE 0.199 56.000 0.000 NA   NA
 5932034 5932035 MMAR_2361 MMAR_2362 lspA   TRUE 0.707 15.000 0.073 1.000 N NA
 5932036 5932037 MMAR_2363 MMAR_2364   lprL FALSE 0.005 294.000 0.000 NA   NA
 5932037 5932038 MMAR_2364 MMAR_2365 lprL glbN FALSE 0.270 84.000 0.050 NA   NA
 5932039 5932040 MMAR_2366 MMAR_2367     TRUE 0.984 5.000 0.750 0.057   NA
 5932040 5932041 MMAR_2367 MMAR_2368     FALSE 0.269 120.000 0.250 NA   NA
 5932041 5932042 MMAR_2368 MMAR_2369   dnaE1 FALSE 0.224 67.000 0.003 NA   NA
 5932042 5932043 MMAR_2369 MMAR_2370 dnaE1 fadD11 FALSE 0.052 127.000 0.000 1.000 N NA
 5932043 5932044 MMAR_2370 MMAR_2371 fadD11 plsB1 TRUE 0.967 15.000 0.333 1.000 Y NA
 5932046 5932047 MMAR_2373 MMAR_2374   ilvA FALSE 0.515 34.000 0.033 NA   NA
 5932050 5932051 MMAR_2377 MMAR_2378 treZ treY TRUE 0.999 -3.000 0.263 0.004 Y NA
 5932051 5932052 MMAR_2378 MMAR_2379 treY treX TRUE 0.987 4.000 0.061 0.004 Y NA
 5932052 5932053 MMAR_2379 MMAR_2380 treX   FALSE 0.236 100.000 0.073 1.000 N NA
 5932053 5932054 MMAR_2380 MMAR_2381     FALSE 0.452 108.000 0.400 NA   NA
 5932054 5932055 MMAR_2381 MMAR_2382     FALSE 0.004 346.000 0.000 NA   NA
 5932056 5932057 MMAR_2383 MMAR_2384 bioA bioF1 TRUE 0.983 7.000 0.033 0.001 Y NA
 5932057 5932058 MMAR_2384 MMAR_2385 bioF1 bioD TRUE 0.999 -3.000 0.214 0.001 Y NA
 5932058 5932059 MMAR_2385 MMAR_2386 bioD   TRUE 0.901 2.000 0.036 1.000   NA
 5932059 5932060 MMAR_2386 MMAR_2387   bioB FALSE 0.045 153.000 0.000 1.000   NA
 5932060 5932061 MMAR_2387 MMAR_5574 bioB   TRUE 0.673 16.000 0.041 NA   NA
 5932061 5932062 MMAR_5574 MMAR_2388     FALSE 0.335 123.000 0.361 NA   NA
 5932063 5932064 MMAR_2389 MMAR_2390     FALSE 0.020 330.000 0.273 NA   NA
 5932065 5932066 MMAR_2391 MMAR_2392 nadA nadB TRUE 0.998 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 5932066 5932067 MMAR_2392 MMAR_2393 nadB nadC TRUE 0.996 0.000 0.223 0.002 Y NA
 5932069 5932070 MMAR_2395 MMAR_2396 hisD hisC1 TRUE 0.998 -3.000 0.112 0.002 Y NA
 5932070 5932071 MMAR_2396 MMAR_2397 hisC1 hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.002 Y NA
 5932071 5932072 MMAR_2397 MMAR_2398 hisB hisH TRUE 0.998 -3.000 0.046 0.002 Y NA
 5932072 5932073 MMAR_2398 MMAR_2399 hisH hisA TRUE 0.999 -3.000 0.491 0.002 Y NA
 5932073 5932074 MMAR_2399 MMAR_2400 hisA impA TRUE 0.898 7.000 0.266 1.000 N NA
 5932074 5932075 MMAR_2400 MMAR_2401 impA hisF TRUE 0.847 2.000 0.021 1.000 N NA
 5932075 5932076 MMAR_2401 MMAR_2402 hisF hisI TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.002 Y NA
 5932077 5932078 MMAR_2403 MMAR_2404     TRUE 0.958 5.000 0.500 NA   NA
 5932078 5932079 MMAR_2404 MMAR_2405   cphB TRUE 0.674 22.000 0.077 NA   NA
 5932079 5932080 MMAR_2405 MMAR_2406 cphB   TRUE 0.977 -3.000 0.115 1.000 N NA
 5932085 5932086 MMAR_2411 MMAR_2412 trpE   TRUE 0.863 41.000 0.690 NA   NA
 5932086 5932087 MMAR_2412 MMAR_2413   trpC FALSE 0.288 90.000 0.070 NA   NA
 5932087 5932088 MMAR_2413 MMAR_2414 trpC trpB TRUE 0.944 36.000 0.070 0.001 Y NA
 5932088 5932089 MMAR_2414 MMAR_2415 trpB trpA TRUE 0.991 3.000 0.153 0.000 Y NA
 5932089 5932090 MMAR_2415 MMAR_2416 trpA lgt TRUE 0.957 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5932090 5932091 MMAR_2416 MMAR_2417 lgt   FALSE 0.175 64.000 0.000 NA   NA
 5932091 5932092 MMAR_2417 MMAR_2418     TRUE 0.975 -13.000 0.111 NA   NA
 5932094 5932095 MMAR_2420 MMAR_2421 pykA tesB1 FALSE 0.451 100.000 0.361 1.000 N NA
 5932095 5932096 MMAR_2421 MMAR_2422 tesB1   FALSE 0.213 126.000 0.214 NA   NA
 5932097 5932098 MMAR_2423 MMAR_2424 cydC cydD TRUE 0.999 -13.000 0.631 0.003 Y NA
 5932098 5932099 MMAR_2424 MMAR_2425 cydD cydB TRUE 0.745 87.000 0.151 1.000 Y NA
 5932099 5932100 MMAR_2425 MMAR_2426 cydB cydA TRUE 0.974 48.000 0.925 0.040 Y NA
 5932100 5932101 MMAR_2426 MMAR_2427 cydA   FALSE 0.252 104.000 0.104 NA   NA
 5932101 5932102 MMAR_2427 MMAR_2428   cya FALSE 0.417 63.000 0.176 NA   NA
 5932102 5932103 MMAR_2428 MMAR_5504 cya leuV FALSE 0.121 99.000 0.000 NA   NA
 5932105 5932106 MMAR_2430 MMAR_2431     TRUE 0.991 0.000 0.850 NA   NA
 5932107 5932108 MMAR_2432 MMAR_2433 polA rpsA FALSE 0.004 381.000 0.005 1.000 N NA
 5932108 5932109 MMAR_2433 MMAR_2434 rpsA coaE TRUE 0.649 13.000 0.024 1.000 N NA
 5932110 5932111 MMAR_2435 MMAR_2436     FALSE 0.177 63.000 0.000 NA   NA
 5932112 5932113 MMAR_2437 MMAR_2438 uvrB   FALSE 0.429 37.000 0.006 NA   NA
 5932115 5932116 MMAR_2440 MMAR_2441     FALSE 0.003 368.000 0.000 NA   NA
 5932119 5932120 MMAR_2444 MMAR_2445     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5932120 5932121 MMAR_2445 MMAR_2446     FALSE 0.048 137.000 0.000 NA   NA
 5932121 5932122 MMAR_2446 MMAR_2447   lysX FALSE 0.344 62.000 0.057 NA   NA
 5932123 5932124 MMAR_2448 MMAR_2449 infC rpmL TRUE 0.968 31.000 0.652 1.000 Y NA
 5932124 5932125 MMAR_2449 MMAR_2450 rpmL rplT TRUE 0.959 71.000 0.928 0.010 Y NA
 5932125 5932126 MMAR_2450 MMAR_2451 rplT tsnR TRUE 0.822 78.000 0.057 0.010 Y NA
 5932128 5932129 MMAR_2453 MMAR_2454     FALSE 0.353 75.000 0.143 NA   NA
 5932129 5932130 MMAR_2454 MMAR_2455     TRUE 0.859 10.000 0.214 NA   NA
 5932130 5932131 MMAR_2455 MMAR_2456   pheS FALSE 0.010 258.000 0.002 NA   NA
 5932131 5932132 MMAR_2456 MMAR_2457 pheS pheT TRUE 0.998 0.000 0.574 0.000 Y NA
 5932132 5932133 MMAR_2457 MMAR_2458 pheT   FALSE 0.009 236.000 0.000 NA   NA
 5932133 5932134 MMAR_2458 MMAR_2459     FALSE 0.005 294.000 0.000 NA   NA
 5932134 5932135 MMAR_2459 MMAR_2460     FALSE 0.007 257.000 0.000 NA   NA
 5932135 5932136 MMAR_2460 MMAR_2461     FALSE 0.002 946.000 0.000 NA   NA
 5932136 5932137 MMAR_2461 MMAR_2462   argC FALSE 0.133 92.000 0.000 NA   NA
 5932137 5932138 MMAR_2462 MMAR_2463 argC argJ TRUE 0.904 73.000 0.303 0.001 Y NA
 5932138 5932139 MMAR_2463 MMAR_2464 argJ argB TRUE 0.999 -3.000 0.239 0.001 Y NA
 5932139 5932140 MMAR_2464 MMAR_2465 argB argD TRUE 0.997 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 5932140 5932141 MMAR_2465 MMAR_2466 argD argF TRUE 0.996 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 5932141 5932142 MMAR_2466 MMAR_2467 argF argR TRUE 0.976 -3.000 0.088 1.000 N NA
 5932142 5932143 MMAR_2467 MMAR_2468 argR argG FALSE 0.395 49.000 0.054 1.000 N NA
 5932143 5932144 MMAR_2468 MMAR_2469 argG argH TRUE 0.722 110.000 0.278 1.000 Y NA
 5932144 5932145 MMAR_2469 MMAR_2470 argH pks10 FALSE 0.126 104.000 0.003 1.000 N NA
 5932145 5932146 MMAR_2470 MMAR_2471 pks10 pks7 TRUE 0.869 135.000 1.000 0.020 Y NA
 5932146 5932147 MMAR_2471 MMAR_2472 pks7 pks8 TRUE 0.991 21.000 1.000 0.008 Y NA
 5932147 5932148 MMAR_2472 MMAR_2473 pks8 pks9 TRUE 0.993 6.000 0.500 0.008 Y NA
 5932148 5932149 MMAR_2473 MMAR_2474 pks9 pks11_1 TRUE 0.753 155.000 0.750 0.020 Y NA
 5932150 5932151 MMAR_2475 MMAR_2476 cyp139A3   TRUE 0.970 -3.000 0.008 1.000   NA
 5932152 5932153 MMAR_2477 MMAR_2478 aao_1   FALSE 0.028 150.000 0.000 1.000 N NA
 5932153 5932154 MMAR_2478 MMAR_2479     TRUE 0.961 -7.000 0.013 NA   NA
 5932154 5932155 MMAR_2479 MMAR_2480   gloA FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 5932156 5932157 MMAR_2481 MMAR_2482     FALSE 0.003 396.000 0.000 NA   NA
 5932157 5932158 MMAR_2482 MMAR_2483     TRUE 0.965 2.000 0.400 NA   NA
 5932158 5932159 MMAR_2483 MMAR_2484     FALSE 0.013 668.000 0.400 NA   NA
 5932159 5932160 MMAR_2484 MMAR_2485     TRUE 0.969 2.000 0.400 1.000   NA
 5932160 5932161 MMAR_2485 MMAR_2486     TRUE 0.825 72.000 0.089 0.067 Y NA
 5932162 5932163 MMAR_2487 MMAR_2488 mpg tyrS TRUE 0.745 12.000 0.067 1.000 N NA
 5932163 5932164 MMAR_2488 MMAR_5562 tyrS   FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 5932165 5932166 MMAR_2489 MMAR_2490     FALSE 0.071 123.000 0.000 NA   NA
 5932166 5932167 MMAR_2490 MMAR_2491     FALSE 0.004 342.000 0.000 NA   NA
 5932167 5932168 MMAR_2491 MMAR_2492     FALSE 0.002 439.000 0.000 NA   NA
 5932168 5932169 MMAR_2492 MMAR_2493     FALSE 0.021 176.000 0.000 NA   NA
 5932169 5932170 MMAR_2493 MMAR_2494     TRUE 0.988 -3.000 0.282 NA   NA
 5932171 5932172 MMAR_2495 MMAR_2496 lprJ   FALSE 0.183 61.000 0.000 NA   NA
 5932172 5932173 MMAR_2496 MMAR_2497     TRUE 0.971 3.000 0.500 1.000   NA
 5932173 5932174 MMAR_2497 MMAR_2498     TRUE 0.655 25.000 0.083 NA   NA
 5932174 5932175 MMAR_2498 MMAR_2499   tlyA TRUE 0.753 8.000 0.014 NA   NA
 5932175 5932176 MMAR_2499 MMAR_2500 tlyA ppnK TRUE 0.978 -3.000 0.120 1.000 N NA
 5932176 5932177 MMAR_2500 MMAR_2501 ppnK recN TRUE 0.747 13.000 0.094 1.000 N NA
 5932177 5932178 MMAR_2501 MMAR_2502 recN   FALSE 0.119 166.000 0.049 0.067   NA
 5932178 5932179 MMAR_2502 MMAR_2503     TRUE 0.930 22.000 0.798 NA   NA
 5932179 5932180 MMAR_2503 MMAR_2504   pyrG FALSE 0.075 138.000 0.014 NA   NA
 5932180 5932181 MMAR_2504 MMAR_2505 pyrG   TRUE 0.978 -7.000 0.055 1.000   NA
 5932181 5932182 MMAR_2505 MMAR_2506   xerD TRUE 0.981 -3.000 0.063 1.000   NA
 5932184 5932185 MMAR_2508 MMAR_2509     TRUE 0.971 -3.000 0.051 1.000 N NA
 5932185 5932186 MMAR_2509 MMAR_2510     TRUE 0.895 0.000 0.045 NA N NA
 5932186 5932187 MMAR_2510 MMAR_2511     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932187 5932188 MMAR_2511 MMAR_2512     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932188 5932189 MMAR_2512 MMAR_2513     TRUE 0.991 -3.000 0.364 NA   NA
 5932189 5932190 MMAR_2513 MMAR_2514     FALSE 0.115 101.000 0.000 NA   NA
 5932191 5932192 MMAR_2515 MMAR_2516     FALSE 0.020 142.000 0.000 NA N NA
 5932192 5932193 MMAR_2516 MMAR_2517     FALSE 0.084 232.000 0.000 NA Y NA
 5932193 5932194 MMAR_2517 MMAR_2518     FALSE 0.001 428.000 0.000 NA N NA
 5932194 5932195 MMAR_2518 MMAR_2519   mbtH_2 FALSE 0.240 49.000 0.000 NA   NA
 5932195 5932196 MMAR_2519 MMAR_2520 mbtH_2   FALSE 0.449 21.000 0.000 NA   NA
 5932196 5932197 MMAR_2520 MMAR_2521     TRUE 0.667 7.000 0.000 NA   NA
 5932198 5932199 MMAR_2522 MMAR_2523     FALSE 0.143 81.000 0.000 NA   NA
 5932199 5932200 MMAR_2523 MMAR_2524     TRUE 0.977 -3.000 0.065 NA   NA
 5932200 5932201 MMAR_2524 MMAR_2525     TRUE 0.984 0.000 0.570 NA   NA
 5932201 5932202 MMAR_2525 MMAR_2526     TRUE 0.947 0.000 0.224 NA N NA
 5932202 5932203 MMAR_2526 MMAR_2527   cmk FALSE 0.452 41.000 0.042 1.000 N NA
 5932203 5932204 MMAR_2527 MMAR_2528 cmk engA TRUE 0.980 -3.000 0.060 1.000   NA
 5932204 5932205 MMAR_2528 MMAR_5505 engA proT FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5932206 5932207 MMAR_2529 MMAR_2530     FALSE 0.019 181.000 0.000 NA   NA
 5932208 5932209 MMAR_2531 MMAR_2532     TRUE 0.684 87.000 0.385 0.039   NA
 5932209 5932210 MMAR_2532 MMAR_2533     FALSE 0.003 429.000 0.000 NA   NA
 5932211 5932212 MMAR_2534 MMAR_2535     FALSE 0.002 528.000 0.000 NA   NA
 5932212 5932213 MMAR_2535 MMAR_2536     FALSE 0.167 68.000 0.000 NA   NA
 5932213 5932214 MMAR_2536 MMAR_2537     TRUE 0.677 62.000 0.500 NA   NA
 5932214 5932215 MMAR_2537 MMAR_2538     FALSE 0.268 60.000 0.012 NA   NA
 5932216 5932217 MMAR_2539 MMAR_2540     FALSE 0.496 16.000 0.000 NA   NA
 5932217 5932218 MMAR_2540 MMAR_2541     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 5932220 5932221 MMAR_2543 MMAR_2544     FALSE 0.434 23.000 0.000 NA   NA
 5932221 5932222 MMAR_2544 MMAR_2545     FALSE 0.612 10.000 0.000 NA   NA
 5932224 5932225 MMAR_2547 MMAR_2548     TRUE 0.684 87.000 0.385 0.039   NA
 5932225 5932226 MMAR_2548 MMAR_2549     FALSE 0.314 40.000 0.000 NA   NA
 5932226 5932227 MMAR_2549 MMAR_2550     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 5932227 5932228 MMAR_2550 MMAR_2551     FALSE 0.005 288.000 0.000 NA   NA
 5932229 5932230 MMAR_2552 MMAR_2553     FALSE 0.011 220.000 0.000 NA   NA
 5932230 5932231 MMAR_2553 MMAR_2554     FALSE 0.187 60.000 0.000 NA   NA
 5932231 5932232 MMAR_2554 MMAR_2555     FALSE 0.018 188.000 0.000 NA   NA
 5932232 5932233 MMAR_2555 MMAR_2556     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932235 5932236 MMAR_2558 MMAR_2559     FALSE 0.364 61.000 0.070 NA   NA
 5932236 5932237 MMAR_2559 MMAR_2560     TRUE 0.859 9.000 0.250 NA N NA
 5932239 5932240 MMAR_2562 MMAR_2563     FALSE 0.201 55.000 0.000 NA   NA
 5932241 5932242 MMAR_2564 MMAR_2565 idsB   TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5932245 5932246 MMAR_2568 MMAR_2569     FALSE 0.049 136.000 0.000 NA   NA
 5932247 5932248 MMAR_2570 MMAR_2571   gabD2 FALSE 0.019 169.000 0.000 1.000 N NA
 5932249 5932250 MMAR_2572 MMAR_2573     FALSE 0.005 302.000 0.000 NA   NA
 5932251 5932252 MMAR_2574 MMAR_2575     FALSE 0.058 131.000 0.000 NA   NA
 5932253 5932254 MMAR_2576 MMAR_2577 pknK   FALSE 0.115 101.000 0.000 NA   NA
 5932255 5932256 MMAR_2578 MMAR_2579   potE TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.039 N NA
 5932256 5932257 MMAR_2579 MMAR_2580 potE   FALSE 0.132 93.000 0.000 NA   NA
 5932257 5932258 MMAR_2580 MMAR_2581   pknE FALSE 0.010 229.000 0.000 NA   NA
 5932258 5932259 MMAR_2581 MMAR_2582 pknE   FALSE 0.213 70.000 0.000 1.000   NA
 5932261 5932262 MMAR_2584 MMAR_2585 ceoC1 tex FALSE 0.134 70.000 0.000 1.000 N NA
 5932262 5932263 MMAR_2585 MMAR_2586 tex   FALSE 0.011 216.000 0.000 NA   NA
 5932264 5932265 MMAR_2587 MMAR_2588 ndh1   TRUE 0.974 -3.000 0.048 NA   NA
 5932265 5932266 MMAR_2588 MMAR_2589     FALSE 0.007 264.000 0.000 NA   NA
 5932266 5932267 MMAR_2589 MMAR_2590     FALSE 0.002 483.000 0.000 NA   NA
 5932271 5932272 MMAR_2594 MMAR_2595     FALSE 0.223 51.000 0.000 NA   NA
 5932274 5932275 MMAR_2597 MMAR_2598 fadD13   TRUE 0.912 39.000 1.000 NA   NA
 5932275 5932276 MMAR_2598 MMAR_2599     TRUE 0.989 -3.000 0.286 NA   NA
 5932276 5932277 MMAR_2599 MMAR_2600     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932278 5932279 MMAR_2601 MMAR_2602     FALSE 0.069 124.000 0.000 NA   NA
 5932279 5932280 MMAR_2602 MMAR_2603     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5932280 5932281 MMAR_2603 MMAR_2604     FALSE 0.011 220.000 0.000 NA   NA
 5932281 5932282 MMAR_2604 MMAR_2605     FALSE 0.420 10.000 0.000 NA N NA
 5932282 5932283 MMAR_2605 MMAR_2606   pknF_3 FALSE 0.039 137.000 0.000 1.000 N NA
 5932285 5932286 MMAR_2608 MMAR_2609 maoX   TRUE 0.771 1.000 0.000 1.000 N NA
 5932286 5932287 MMAR_2609 MMAR_2610     FALSE 0.362 25.000 0.000 1.000 N NA
 5932290 5932291 MMAR_2613 MMAR_2614     FALSE 0.160 71.000 0.000 NA   NA
 5932291 5932292 MMAR_2614 MMAR_2615     FALSE 0.053 145.000 0.000 1.000   NA
 5932293 5932294 MMAR_2616 MMAR_2617   araD TRUE 0.992 -13.000 0.500 1.000 N NA
 5932294 5932295 MMAR_2617 MMAR_2618 araD   TRUE 0.736 48.000 0.400 1.000   NA
 5932295 5932296 MMAR_2618 MMAR_2619     FALSE 0.032 169.000 0.000 1.000   NA
 5932300 5932301 MMAR_2623 MMAR_2624     FALSE 0.187 60.000 0.000 NA   NA
 5932303 5932304 MMAR_2626 MMAR_2627     FALSE 0.002 445.000 0.000 NA   NA
 5932304 5932305 MMAR_2627 MMAR_2628     FALSE 0.344 45.000 0.000 1.000   NA
 5932306 5932307 MMAR_2629 MMAR_2630     FALSE 0.110 103.000 0.000 NA   NA
 5932307 5932308 MMAR_2630 MMAR_2631   cyp143A3 FALSE 0.211 53.000 0.000 NA   NA
 5932308 5932309 MMAR_2631 MMAR_2632 cyp143A3   FALSE 0.028 162.000 0.000 NA   NA
 5932310 5932311 MMAR_2633 MMAR_2634     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 5932311 5932312 MMAR_2634 MMAR_2635     FALSE 0.038 146.000 0.000 NA   NA
 5932312 5932313 MMAR_2635 MMAR_2636     TRUE 0.992 0.000 1.000 NA   NA
 5932319 5932320 MMAR_2642 MMAR_2643     FALSE 0.354 34.000 0.000 NA   NA
 5932320 5932321 MMAR_2643 MMAR_2644     FALSE 0.201 55.000 0.000 NA   NA
 5932321 5932322 MMAR_2644 MMAR_2645     FALSE 0.039 197.000 0.087 NA   NA
 5932322 5932323 MMAR_2645 MMAR_2646     FALSE 0.052 159.000 0.025 NA   NA
 5932323 5932324 MMAR_2646 MMAR_2647     FALSE 0.250 68.000 0.016 NA   NA
 5932324 5932325 MMAR_2647 MMAR_2648     TRUE 0.973 -3.000 0.016 1.000   NA
 5932325 5932326 MMAR_2648 MMAR_2649     FALSE 0.098 109.000 0.000 NA   NA
 5932326 5932327 MMAR_2649 MMAR_2650     FALSE 0.002 843.000 0.000 NA   NA
 5932329 5932330 MMAR_2652 MMAR_2653     TRUE 0.787 2.000 0.000 NA   NA
 5932330 5932331 MMAR_2653 MMAR_2654   cyp144A4 FALSE 0.009 232.000 0.000 NA   NA
 5932334 5932335 MMAR_2657 MMAR_2659     FALSE 0.009 234.000 0.000 NA   NA
 5932335 5932336 MMAR_2659 MMAR_2660     FALSE 0.011 219.000 0.000 NA   NA
 5932337 5932338 MMAR_2661 MMAR_2662     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 5932340 5932341 MMAR_2664 MMAR_2665     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5932343 5932344 MMAR_2667 MMAR_2668     FALSE 0.015 197.000 0.000 NA   NA
 5932344 5932345 MMAR_2668 MMAR_2669     FALSE 0.035 149.000 0.000 NA   NA
 5932345 5932346 MMAR_2669 MMAR_2670     FALSE 0.163 199.000 0.667 NA   NA
 5932346 5932347 MMAR_2670 MMAR_2671     TRUE 0.946 12.000 0.667 NA   NA
 5932347 5932348 MMAR_2671 MMAR_2672     FALSE 0.154 74.000 0.000 NA   NA
 5932348 5932349 MMAR_2672 MMAR_2673     FALSE 0.002 565.000 0.000 NA   NA
 5932349 5932350 MMAR_2673 MMAR_2674   esxM FALSE 0.004 344.000 0.000 NA   NA
 5932350 5932351 MMAR_2674 MMAR_2675 esxM esxN FALSE 0.217 52.000 0.000 NA   NA
 5932351 5932352 MMAR_2675 MMAR_2676 esxN   FALSE 0.563 89.000 0.429 NA   NA
 5932352 5932353 MMAR_2676 MMAR_2677     FALSE 0.006 286.000 0.000 NA   NA
 5932353 5932354 MMAR_2677 MMAR_2678   mycP5 TRUE 0.996 -22.000 1.000 NA   NA
 5932354 5932355 MMAR_2678 MMAR_2679 mycP5   TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5932355 5932356 MMAR_2679 MMAR_2680     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5932356 5932357 MMAR_2680 MMAR_2681     FALSE 0.001 901.000 0.000 NA N NA
 5932357 5932358 MMAR_2681 MMAR_2682     FALSE 0.586 96.000 0.000 NA Y NA
 5932358 5932359 MMAR_2682 MMAR_2683     FALSE 0.015 841.000 0.000 NA Y NA
 5932359 5932360 MMAR_2683 MMAR_2684     FALSE 0.014 1085.000 0.000 NA Y NA
 5932360 5932361 MMAR_2684 MMAR_2685     TRUE 0.886 87.000 0.667 NA Y NA
 5932361 5932362 MMAR_2685 MMAR_2686     FALSE 0.005 301.000 0.000 NA   NA
 5932362 5932363 MMAR_2686 MMAR_2687   mgtC FALSE 0.013 208.000 0.000 NA   NA
 5932364 5932365 MMAR_2688 MMAR_2689     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932365 5932366 MMAR_2689 MMAR_2690     TRUE 0.787 2.000 0.000 NA   NA
 5932367 5932368 MMAR_2691 MMAR_2692 erg3   FALSE 0.149 121.000 0.045 NA   NA
 5932368 5932369 MMAR_2692 MMAR_2693     FALSE 0.016 192.000 0.000 NA   NA
 5932369 5932370 MMAR_2693 MMAR_2694     TRUE 0.883 36.000 0.700 NA   NA
 5932371 5932372 MMAR_2695 MMAR_2696     FALSE 0.002 567.000 0.000 NA   NA
 5932373 5932374 MMAR_2697 MMAR_2698 ilvG secA2 FALSE 0.586 31.000 0.082 1.000 N NA
 5932374 5932375 MMAR_2698 MMAR_2699 secA2 pgsA2 FALSE 0.122 122.000 0.038 1.000 N NA
 5932375 5932376 MMAR_2699 MMAR_2700 pgsA2   TRUE 0.977 -7.000 0.114 NA   NA
 5932376 5932377 MMAR_2700 MMAR_2701     TRUE 0.629 62.000 0.409 NA   NA
 5932377 5932378 MMAR_2701 MMAR_2702     FALSE 0.204 154.000 0.409 NA   NA
 5932378 5932379 MMAR_2702 MMAR_2703   gcvH TRUE 0.814 35.000 0.434 NA   NA
 5932379 5932380 MMAR_2703 MMAR_2704 gcvH   FALSE 0.024 258.000 0.242 NA N NA
 5932380 5932381 MMAR_2704 MMAR_2705     TRUE 0.995 -3.000 0.707 NA N NA
 5932381 5932382 MMAR_2705 MMAR_2706     FALSE 0.121 141.000 0.133 NA   NA
 5932382 5932383 MMAR_2706 MMAR_2707     FALSE 0.024 212.000 0.043 NA   NA
 5932383 5932384 MMAR_2707 MMAR_2708   gcvB FALSE 0.004 363.000 0.002 1.000 N NA
 5932385 5932386 MMAR_2709 MMAR_2710     FALSE 0.006 280.000 0.000 NA   NA
 5932388 5932389 MMAR_2712 MMAR_2713   glcB FALSE 0.437 51.000 0.089 NA   NA
 5932389 5932390 MMAR_2713 MMAR_2714 glcB   FALSE 0.011 219.000 0.000 NA   NA
 5932390 5932391 MMAR_2714 MMAR_2715     FALSE 0.015 194.000 0.000 NA   NA
 5932391 5932392 MMAR_2715 MMAR_2716     TRUE 0.997 -3.000 0.815 NA   NA
 5932392 5932393 MMAR_2716 MMAR_2717   guaB1 FALSE 0.030 195.000 0.038 NA   NA
 5932393 5932394 MMAR_2717 MMAR_2718 guaB1 gnd1 FALSE 0.471 32.000 0.023 1.000 N NA
 5932394 5932395 MMAR_2718 MMAR_2719 gnd1   FALSE 0.140 110.000 0.023 1.000 N NA
 5932395 5932396 MMAR_2719 MMAR_2720     TRUE 0.948 15.000 0.850 1.000 N NA
 5932397 5932398 MMAR_2721 MMAR_2722   ureA TRUE 0.981 -3.000 0.222 NA N NA
 5932398 5932399 MMAR_2722 MMAR_2723 ureA ureB TRUE 0.998 -3.000 0.052 0.001 Y NA
 5932399 5932400 MMAR_2723 MMAR_2724 ureB ureC TRUE 0.998 0.000 0.486 0.001 Y NA
 5932400 5932401 MMAR_2724 MMAR_2725 ureC ureF TRUE 0.972 0.000 0.061 0.002 N NA
 5932401 5932402 MMAR_2725 MMAR_2726 ureF ureG TRUE 0.989 11.000 0.439 0.002 Y NA
 5932402 5932403 MMAR_2726 MMAR_2727 ureG ureD TRUE 0.980 0.000 0.115 0.002   NA
 5932404 5932405 MMAR_2728 MMAR_2729 ndh   FALSE 0.496 164.000 0.500 NA Y NA
 5932405 5932406 MMAR_2729 MMAR_2730     TRUE 0.723 51.000 0.571 NA N NA
 5932407 5932408 MMAR_2731 MMAR_2732 modA modB TRUE 0.972 10.000 0.578 0.000 N NA
 5932410 5932411 MMAR_2734 MMAR_2735     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932411 5932412 MMAR_2735 MMAR_2736   modC FALSE 0.175 64.000 0.000 NA   NA
 5932412 5932413 MMAR_2736 MMAR_2737 modC apa FALSE 0.313 87.000 0.052 1.000   NA
 5932413 5932414 MMAR_2737 MMAR_2738 apa   FALSE 0.137 156.000 0.238 1.000   NA
 5932414 5932415 MMAR_2738 MMAR_2739   adhA FALSE 0.387 93.000 0.189 1.000   NA
 5932416 5932417 MMAR_2740 MMAR_2741     FALSE 0.005 297.000 0.000 NA   NA
 5932417 5932418 MMAR_2741 MMAR_2742   xfp FALSE 0.014 225.000 0.000 1.000   NA
 5932418 5932419 MMAR_2742 MMAR_2743 xfp   FALSE 0.471 46.000 0.036 1.000   NA
 5932420 5932421 MMAR_2744 MMAR_2745     FALSE 0.131 109.000 0.000 1.000   NA
 5932421 5932422 MMAR_2745 MMAR_2746     FALSE 0.310 86.000 0.143 1.000 N NA
 5932422 5932423 MMAR_2746 MMAR_2747     FALSE 0.222 113.000 0.214 NA N NA
 5932424 5932425 MMAR_2748 MMAR_2749     FALSE 0.069 124.000 0.000 NA   NA
 5932425 5932426 MMAR_2749 MMAR_2750     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5932426 5932427 MMAR_2750 MMAR_2751   lon FALSE 0.227 105.000 0.038 1.000   NA
 5932427 5932428 MMAR_2751 MMAR_2752 lon lldD2 FALSE 0.122 122.000 0.038 1.000 N NA
 5932428 5932429 MMAR_2752 MMAR_2753 lldD2 treS_1 FALSE 0.023 161.000 0.000 1.000 N NA
 5932429 5932430 MMAR_2753 MMAR_2754 treS_1 ahpD FALSE 0.599 29.000 0.029 1.000   NA
 5932430 5932431 MMAR_2754 MMAR_2755 ahpD ahpC FALSE 0.594 41.000 0.095 1.000   NA
 5932432 5932433 MMAR_2756 MMAR_2757 oxyR   FALSE 0.472 35.000 0.016 NA   NA
 5932433 5932434 MMAR_2757 MMAR_2758     TRUE 0.983 -3.000 0.188 NA   NA
 5932434 5932435 MMAR_2758 MMAR_2759   echA8_6 TRUE 0.849 10.000 0.133 1.000   NA
 5932437 5932438 MMAR_2761 MMAR_2762 bfrA   FALSE 0.002 442.000 0.000 NA   NA
 5932438 5932439 MMAR_2762 MMAR_2763   glnA3 TRUE 0.659 40.000 0.235 NA   NA
 5932439 5932440 MMAR_2763 MMAR_2764 glnA3   TRUE 0.953 4.000 0.364 1.000   NA
 5932440 5932441 MMAR_2764 MMAR_2765     TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5932441 5932442 MMAR_2765 MMAR_2766     FALSE 0.001 625.000 0.000 1.000 N NA
 5932443 5932444 MMAR_2767 MMAR_2768   cyp140A5 FALSE 0.539 104.000 0.000 NA Y NA
 5932444 5932445 MMAR_2768 MMAR_2769 cyp140A5 lppE FALSE 0.336 111.000 0.273 NA   NA
 5932445 5932446 MMAR_2769 MMAR_2770 lppE   FALSE 0.521 42.000 0.070 NA   NA
 5932446 5932447 MMAR_2770 MMAR_2771     TRUE 0.741 15.000 0.093 NA   NA
 5932447 5932448 MMAR_2771 MMAR_2772     FALSE 0.144 80.000 0.000 NA   NA
 5932448 5932449 MMAR_2772 MMAR_2773     FALSE 0.105 119.000 0.000 1.000   NA
 5932449 5932450 MMAR_2773 MMAR_2774     FALSE 0.486 17.000 0.000 NA   NA
 5932450 5932451 MMAR_2774 MMAR_2775     FALSE 0.144 80.000 0.000 NA   NA
 5932453 5932454 MMAR_2777 MMAR_2778 fbpB   FALSE 0.135 91.000 0.000 NA   NA
 5932456 5932457 MMAR_2780 MMAR_2781     FALSE 0.021 175.000 0.000 NA   NA
 5932457 5932458 MMAR_2781 MMAR_2782   adhC TRUE 0.978 -3.000 0.087 NA   NA
 5932458 5932459 MMAR_2782 MMAR_2783 adhC cyp125A6 TRUE 0.754 25.000 0.200 1.000   NA
 5932460 5932461 MMAR_2784 MMAR_2785     TRUE 0.849 18.000 0.333 NA   NA
 5932461 5932462 MMAR_2785 MMAR_2786     FALSE 0.557 74.000 0.375 NA   NA
 5932463 5932464 MMAR_2787 MMAR_2788     FALSE 0.035 150.000 0.000 NA   NA
 5932465 5932466 MMAR_2789 MMAR_2790     TRUE 0.819 11.000 0.188 1.000 N NA
 5932467 5932468 MMAR_2791 MMAR_2792     FALSE 0.263 42.000 0.004 NA N NA
 5932471 5932472 MMAR_2795 MMAR_2796   cinA FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5932474 5932475 MMAR_2798 MMAR_2799     FALSE 0.614 17.000 0.017 NA   NA
 5932475 5932476 MMAR_2799 MMAR_2800     FALSE 0.006 285.000 0.000 NA   NA
 5932477 5932478 MMAR_2801 MMAR_2802 aao   TRUE 0.786 13.000 0.143 NA   NA
 5932478 5932479 MMAR_2802 MMAR_2803     TRUE 0.808 1.000 0.000 NA   NA
 5932479 5932480 MMAR_2803 MMAR_2804     TRUE 0.933 -12.000 0.000 NA   NA
 5932480 5932481 MMAR_2804 MMAR_2805     FALSE 0.003 424.000 0.000 NA   NA
 5932481 5932482 MMAR_2805 MMAR_2806     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932482 5932483 MMAR_2806 MMAR_2807     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 5932486 5932487 MMAR_2810 MMAR_2811     TRUE 0.965 0.000 0.273 NA   NA
 5932490 5932491 MMAR_2814 MMAR_2815 fadB5   FALSE 0.289 43.000 0.000 NA   NA
 5932491 5932492 MMAR_2815 MMAR_2816     TRUE 0.988 -3.000 0.267 NA   NA
 5932492 5932493 MMAR_2816 MMAR_2817     FALSE 0.190 59.000 0.000 NA   NA
 5932493 5932494 MMAR_2817 MMAR_2818     FALSE 0.565 12.000 0.000 NA   NA
 5932499 5932500 MMAR_2823 MMAR_2824     FALSE 0.140 145.000 0.222 NA   NA
 5932502 5932503 MMAR_2826 MMAR_2827     FALSE 0.021 165.000 0.000 1.000 N NA
 5932503 5932504 MMAR_2827 MMAR_2828   lipD TRUE 0.799 122.000 0.333 0.003 Y NA
 5932505 5932506 MMAR_2829 MMAR_2830     FALSE 0.051 147.000 0.000 1.000   NA
 5932506 5932507 MMAR_2830 MMAR_2831     FALSE 0.006 699.000 0.000 0.028   NA
 5932507 5932508 MMAR_2831 MMAR_2832     FALSE 0.017 209.000 0.000 1.000   NA
 5932508 5932509 MMAR_2832 MMAR_2833     TRUE 0.812 3.000 0.000 1.000   NA
 5932509 5932510 MMAR_2833 MMAR_2834     FALSE 0.002 553.000 0.000 NA   NA
 5932512 5932513 MMAR_2836 MMAR_2837     FALSE 0.143 81.000 0.000 NA   NA
 5932513 5932514 MMAR_2837 MMAR_2838     FALSE 0.135 91.000 0.000 NA   NA
 5932514 5932515 MMAR_2838 MMAR_2839     FALSE 0.190 59.000 0.000 NA   NA
 5932516 5932517 MMAR_2840 MMAR_2841 atsD_2   FALSE 0.129 95.000 0.000 NA   NA
 5932518 5932519 MMAR_2842 MMAR_2843     FALSE 0.213 70.000 0.000 1.000   NA
 5932522 5932523 MMAR_2846 MMAR_2847     FALSE 0.160 71.000 0.000 NA   NA
 5932523 5932524 MMAR_2847 MMAR_2848     FALSE 0.126 97.000 0.000 NA   NA
 5932526 5932527 MMAR_2850 MMAR_2851     FALSE 0.367 32.000 0.000 NA   NA
 5932530 5932531 MMAR_2854 MMAR_2855     TRUE 0.970 19.000 0.500 NA Y NA
 5932531 5932532 MMAR_2855 MMAR_2857     FALSE 0.022 162.000 0.000 1.000 N NA
 5932532 5932533 MMAR_2857 MMAR_5580     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932534 5932535 MMAR_2858 MMAR_2859     FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5932535 5932536 MMAR_2859 MMAR_2860   tpx FALSE 0.183 88.000 0.000 1.000   NA
 5932537 5932538 MMAR_2861 MMAR_2862 fadE18 fadE17 TRUE 0.997 2.000 0.800 0.015 Y NA
 5932538 5932539 MMAR_2862 MMAR_2863 fadE17 echA13 TRUE 0.977 18.000 0.600 1.000 Y NA
 5932540 5932541 MMAR_2864 MMAR_2865     TRUE 0.960 28.000 0.500 NA Y NA
 5932541 5932542 MMAR_2865 MMAR_2866   ephB TRUE 0.969 12.000 1.000 1.000   NA
 5932542 5932543 MMAR_2866 MMAR_2867 ephB   TRUE 0.992 -3.000 0.333 1.000   NA
 5932543 5932544 MMAR_2867 MMAR_2868   ribA1 TRUE 0.977 -3.000 0.036 1.000   NA
 5932544 5932545 MMAR_2868 MMAR_2869 ribA1   TRUE 0.822 4.000 0.036 1.000 N NA
 5932547 5932548 MMAR_2871 MMAR_2872     FALSE 0.003 385.000 0.000 NA   NA
 5932550 5932551 MMAR_2874 MMAR_2875     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   NA
 5932553 5932554 MMAR_2877 MMAR_2878 cyp278A1   TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 5932554 5932555 MMAR_2878 MMAR_2879     TRUE 0.992 -3.000 0.400 NA   NA
 5932555 5932556 MMAR_2879 MMAR_2880   yrbE3A FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 5932556 5932557 MMAR_2880 MMAR_2881 yrbE3A yrbE3B TRUE 0.992 10.000 1.000 NA Y NA
 5932557 5932558 MMAR_2881 MMAR_2882 yrbE3B mce3A TRUE 0.992 5.000 0.750 NA Y NA
 5932558 5932559 MMAR_2882 MMAR_2883 mce3A mce3B TRUE 0.947 76.000 0.750 0.008 Y NA
 5932559 5932560 MMAR_2883 MMAR_2884 mce3B mce3C TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.008 Y NA
 5932560 5932561 MMAR_2884 MMAR_2885 mce3C mce3D TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.008 Y NA
 5932561 5932562 MMAR_2885 MMAR_2886 mce3D lprM TRUE 0.997 0.000 0.500 0.008 Y NA
 5932562 5932563 MMAR_2886 MMAR_2887 lprM mce3F TRUE 0.996 1.000 0.400 0.008 Y NA
 5932563 5932564 MMAR_2887 MMAR_2888 mce3F   TRUE 0.745 44.000 0.400 NA   NA
 5932564 5932565 MMAR_2888 MMAR_2889     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5932565 5932566 MMAR_2889 MMAR_2890     FALSE 0.179 62.000 0.000 NA   NA
 5932567 5932568 MMAR_2891 MMAR_2892     FALSE 0.132 93.000 0.000 NA   NA
 5932568 5932569 MMAR_2892 MMAR_2893     FALSE 0.211 78.000 0.010 NA   NA
 5932569 5932570 MMAR_2893 MMAR_2894     FALSE 0.324 174.000 1.000 NA   NA
 5932571 5932572 MMAR_2895 MMAR_2896     FALSE 0.002 580.000 0.000 NA   NA
 5932572 5932573 MMAR_2896 MMAR_2897     FALSE 0.020 179.000 0.000 NA   NA
 5932573 5932574 MMAR_2897 MMAR_2898     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5932575 5932576 MMAR_2899 MMAR_2900     FALSE 0.029 160.000 0.000 NA   NA
 5932578 5932579 MMAR_2902 MMAR_2903     FALSE 0.215 69.000 0.000 1.000   NA
 5932580 5932581 MMAR_2904 MMAR_2905     FALSE 0.006 270.000 0.000 NA   NA
 5932581 5932582 MMAR_2905 MMAR_2906     FALSE 0.110 103.000 0.000 NA   NA
 5932583 5932584 MMAR_2907 MMAR_2908     TRUE 0.626 13.000 0.000 1.000   NA
 5932585 5932586 MMAR_2909 MMAR_2910     FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5932586 5932587 MMAR_2910 MMAR_2911     FALSE 0.281 44.000 0.000 NA   NA
 5932587 5932588 MMAR_2911 MMAR_2912     FALSE 0.033 153.000 0.000 NA   NA
 5932588 5932589 MMAR_2912 MMAR_2913   betP FALSE 0.003 360.000 0.000 NA   NA
 5932590 5932591 MMAR_2914 MMAR_2915 katG furA TRUE 0.953 37.000 0.500 1.000 Y NA
 5932592 5932593 MMAR_2916 MMAR_2917     FALSE 0.024 168.000 0.000 NA   NA
 5932594 5932595 MMAR_2918 MMAR_2919     FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 5932596 5932597 MMAR_2920 MMAR_2921 mmaA2_1   FALSE 0.002 534.000 0.000 NA   NA
 5932597 5932598 MMAR_2921 MMAR_2922     FALSE 0.101 107.000 0.000 NA   NA
 5932599 5932600 MMAR_2923 MMAR_2924     TRUE 0.944 11.000 0.543 1.000   NA
 5932600 5932601 MMAR_2924 MMAR_2925     TRUE 0.996 -6.000 0.700 1.000   NA
 5932601 5932602 MMAR_2925 MMAR_2926     FALSE 0.021 165.000 0.000 1.000 N NA
 5932602 5932603 MMAR_2926 MMAR_2927     FALSE 0.205 165.000 0.000 NA Y NA
 5932604 5932605 MMAR_2928 MMAR_2929     FALSE 0.003 354.000 0.000 NA   NA
 5932606 5932607 MMAR_2930 MMAR_2931 cyp147G1   TRUE 0.637 43.000 0.200 1.000   NA
 5932607 5932608 MMAR_2931 MMAR_2932     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5932610 5932611 MMAR_2934 MMAR_2935 cfp21   FALSE 0.105 105.000 0.000 NA   NA
 5932613 5932614 MMAR_2937 MMAR_2938     FALSE 0.215 110.000 0.000 0.054 N NA
 5932615 5932616 MMAR_2939 MMAR_2940     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5932616 5932617 MMAR_2940 MMAR_2941     FALSE 0.044 141.000 0.000 NA   NA
 5932623 5932624 MMAR_2947 MMAR_2948     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5932626 5932627 MMAR_2950 MMAR_2951     FALSE 0.022 193.000 0.000 1.000   NA
 5932627 5932628 MMAR_2951 MMAR_2952     FALSE 0.011 246.000 0.000 1.000   NA
 5932629 5932630 MMAR_2953 MMAR_2954     FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 5932631 5932632 MMAR_2955 MMAR_2956     TRUE 0.934 -10.000 0.000 NA   NA
 5932636 5932637 MMAR_2960 MMAR_2961     FALSE 0.531 21.000 0.000 1.000   NA
 5932639 5932640 MMAR_2963 MMAR_2964     TRUE 0.968 -49.000 0.036 1.000   NA
 5932640 5932641 MMAR_2964 MMAR_2965   nadR FALSE 0.002 415.000 0.000 1.000 N NA
 5932641 5932642 MMAR_2965 MMAR_2966 nadR   FALSE 0.232 110.000 0.000 0.019 N NA
 5932642 5932643 MMAR_2966 MMAR_2967     FALSE 0.170 54.000 0.000 1.000 N NA
 5932643 5932644 MMAR_2967 MMAR_2968     FALSE 0.402 27.000 0.000 NA   NA
 5932644 5932645 MMAR_2968 MMAR_2969     FALSE 0.002 603.000 0.000 NA   NA
 5932646 5932647 MMAR_2970 MMAR_2971     FALSE 0.003 422.000 0.000 NA   NA
 5932648 5932649 MMAR_2972 MMAR_2973     FALSE 0.038 146.000 0.000 NA   NA
 5932650 5932651 MMAR_2974 MMAR_2975     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932652 5932653 MMAR_2976 MMAR_2977   fatA TRUE 0.768 10.000 0.118 NA N NA
 5932653 5932654 MMAR_2977 MMAR_2978 fatA cyp135B6 FALSE 0.002 425.000 0.000 1.000 N NA
 5932654 5932655 MMAR_2978 MMAR_2979 cyp135B6   FALSE 0.006 307.000 0.000 1.000   NA
 5932655 5932656 MMAR_2979 MMAR_2980     FALSE 0.449 21.000 0.000 NA   NA
 5932656 5932657 MMAR_2980 MMAR_2981   fabG3_1 FALSE 0.169 41.000 0.000 NA N NA
 5932657 5932658 MMAR_2981 MMAR_2982 fabG3_1   TRUE 0.951 -12.000 0.000 1.000   NA
 5932658 5932659 MMAR_2982 MMAR_2983     FALSE 0.035 166.000 0.000 1.000   NA
 5932661 5932662 MMAR_2985 MMAR_2986 bphC_1   TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5932662 5932663 MMAR_2986 MMAR_2987     TRUE 0.983 -3.000 0.208 1.000 N NA
 5932663 5932664 MMAR_2987 MMAR_2988     FALSE 0.225 65.000 0.000 1.000   NA
 5932664 5932665 MMAR_2988 MMAR_2989     FALSE 0.011 215.000 0.000 NA   NA
 5932667 5932668 MMAR_2991 MMAR_2992   folE_1 FALSE 0.001 428.000 0.000 NA N NA
 5932669 5932670 MMAR_2993 MMAR_2994   fdxA_2 FALSE 0.430 17.000 0.000 1.000 N NA
 5932670 5932671 MMAR_2994 MMAR_2995 fdxA_2   FALSE 0.112 90.000 0.000 1.000 N NA
 5932671 5932672 MMAR_2995 MMAR_2996     FALSE 0.024 169.000 0.000 NA   NA
 5932672 5932673 MMAR_2996 MMAR_2997     TRUE 0.972 -3.000 0.040 NA   NA
 5932673 5932674 MMAR_2997 MMAR_2998     TRUE 0.626 20.000 0.048 1.000 N NA
 5932674 5932675 MMAR_2998 MMAR_2999     FALSE 0.058 172.000 0.129 1.000 N NA
 5932677 5932678 MMAR_3000 MMAR_3001 esxR esxG_1 FALSE 0.343 36.000 0.000 NA   NA
 5932678 5932679 MMAR_3001 MMAR_3002 esxG_1   FALSE 0.336 37.000 0.000 NA   NA
 5932679 5932680 MMAR_3002 MMAR_3003     FALSE 0.587 11.000 0.000 NA   NA
 5932680 5932681 MMAR_3003 MMAR_3005     FALSE 0.002 439.000 0.000 NA   NA
 5932681 5932682 MMAR_3005 MMAR_3006     FALSE 0.021 478.000 0.000 NA Y NA
 5932682 5932683 MMAR_3006 MMAR_3007     FALSE 0.002 674.000 0.000 NA   NA
 5932683 5932684 MMAR_3007 MMAR_3008     FALSE 0.012 210.000 0.000 NA   NA
 5932684 5932685 MMAR_3008 MMAR_3010     FALSE 0.027 163.000 0.000 NA   NA
 5932685 5932686 MMAR_3010 MMAR_3011     FALSE 0.540 103.000 0.444 1.000   NA
 5932686 5932687 MMAR_3011 MMAR_3012     TRUE 0.987 6.000 0.211 0.011 Y NA
 5932687 5932688 MMAR_3012 MMAR_3013     TRUE 0.998 -13.000 0.211 0.011 Y NA
 5932688 5932689 MMAR_3013 MMAR_3014     TRUE 0.998 -3.000 0.235 0.011 Y NA
 5932689 5932690 MMAR_3014 MMAR_3015     FALSE 0.531 82.000 0.118 0.019   NA
 5932690 5932691 MMAR_3015 MMAR_3016   pncA TRUE 0.915 0.000 0.005 1.000   NA
 5932693 5932694 MMAR_3018 MMAR_3019     TRUE 0.976 -3.000 0.059 NA   NA
 5932694 5932695 MMAR_3019 MMAR_3020   lipT TRUE 0.937 6.000 0.375 NA   NA
 5932696 5932697 MMAR_3021 MMAR_3022 lppI   FALSE 0.004 332.000 0.000 NA   NA
 5932697 5932698 MMAR_3022 MMAR_3023     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5932699 5932700 MMAR_3024 MMAR_3025   pks12 TRUE 0.792 73.000 1.000 1.000 N NA
 5932700 5932701 MMAR_3025 MMAR_3026 pks12   FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 5932703 5932704 MMAR_3028 MMAR_3029 ppm1B ppm1A FALSE 0.516 26.000 0.010 NA   NA
 5932704 5932705 MMAR_3029 MMAR_3030 ppm1A   TRUE 0.990 -7.000 0.041 0.003   NA
 5932705 5932706 MMAR_3030 MMAR_3031     FALSE 0.598 31.000 0.037 1.000   NA
 5932707 5932708 MMAR_3032 MMAR_3033     FALSE 0.011 218.000 0.000 NA   NA
 5932709 5932710 MMAR_3034 MMAR_3035     FALSE 0.307 41.000 0.000 NA   NA
 5932710 5932711 MMAR_3035 MMAR_3036     FALSE 0.587 11.000 0.000 NA   NA
 5932711 5932712 MMAR_3036 MMAR_3037   cobN FALSE 0.238 105.000 0.045 1.000   NA
 5932712 5932713 MMAR_3037 MMAR_3038 cobN   TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5932713 5932714 MMAR_3038 MMAR_3039     FALSE 0.256 47.000 0.000 NA   NA
 5932715 5932716 MMAR_3040 MMAR_3041     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932718 5932719 MMAR_3043 MMAR_3044     FALSE 0.115 86.000 0.000 1.000 N NA
 5932719 5932720 MMAR_3044 MMAR_3045   cobH TRUE 0.797 18.000 0.255 1.000 N NA
 5932720 5932721 MMAR_3045 MMAR_3046 cobH cobI TRUE 0.998 -3.000 0.096 0.006 Y NA
 5932722 5932723 MMAR_3047 MMAR_3048   mmpL5_5 FALSE 0.440 33.000 0.000 1.000   NA
 5932723 5932724 MMAR_3048 MMAR_3049 mmpL5_5 mmpS4_1 TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5932724 5932725 MMAR_3049 MMAR_3050 mmpS4_1 blaC FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 5932727 5932728 MMAR_3052 MMAR_3053 cobK cobM TRUE 0.998 -3.000 0.076 0.006 Y NA
 5932728 5932729 MMAR_3053 MMAR_3054 cobM cobL TRUE 0.998 -3.000 0.065 0.006 Y NA
 5932729 5932730 MMAR_3054 MMAR_3055 cobL   TRUE 0.992 -3.000 0.364 1.000   NA
 5932731 5932732 MMAR_3056 MMAR_3057     FALSE 0.017 190.000 0.000 NA   NA
 5932733 5932734 MMAR_3058 MMAR_3059     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 5932734 5932735 MMAR_3059 MMAR_3060     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932735 5932736 MMAR_3060 MMAR_3061     TRUE 0.967 0.000 0.286 NA   NA
 5932737 5932738 MMAR_3062 MMAR_3063     FALSE 0.007 259.000 0.000 NA   NA
 5932738 5932739 MMAR_3063 MMAR_3064     TRUE 0.931 -13.000 0.000 NA   NA
 5932739 5932740 MMAR_3064 MMAR_3065     FALSE 0.002 648.000 0.000 NA   NA
 5932740 5932741 MMAR_3065 MMAR_3066     TRUE 0.934 -10.000 0.000 NA   NA
 5932741 5932742 MMAR_3066 MMAR_3067     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5932743 5932744 MMAR_3068 MMAR_3069     TRUE 0.994 -7.000 0.561 NA   NA
 5932744 5932745 MMAR_3069 MMAR_3070     TRUE 0.986 -3.000 0.241 NA   NA
 5932745 5932746 MMAR_3070 MMAR_3071     FALSE 0.002 700.000 0.000 NA   NA
 5932746 5932747 MMAR_3071 MMAR_3072     TRUE 0.667 7.000 0.000 NA   NA
 5932749 5932750 MMAR_3074 MMAR_3075   pepE FALSE 0.336 37.000 0.000 NA   NA
 5932752 5932753 MMAR_3077 MMAR_3078   helY FALSE 0.273 107.000 0.105 1.000   NA
 5932753 5932754 MMAR_3078 MMAR_3079 helY tatC FALSE 0.276 88.000 0.166 NA N NA
 5932754 5932755 MMAR_3079 MMAR_3080 tatC tatA TRUE 0.836 43.000 0.031 NA Y NA
 5932755 5932756 MMAR_3080 MMAR_3081 tatA   FALSE 0.123 127.000 0.110 NA N NA
 5932756 5932757 MMAR_3081 MMAR_3082     TRUE 0.945 50.000 0.767 NA Y NA
 5932757 5932758 MMAR_3082 MMAR_3083     FALSE 0.475 54.000 0.188 NA   NA
 5932758 5932759 MMAR_3083 MMAR_3084   prcA FALSE 0.536 58.000 0.271 NA   NA
 5932759 5932760 MMAR_3084 MMAR_3085 prcA prcB TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.000 Y NA
 5932760 5932761 MMAR_3085 MMAR_3086 prcB   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932761 5932762 MMAR_3086 MMAR_3087     FALSE 0.252 172.000 0.706 NA   NA
 5932763 5932764 MMAR_3088 MMAR_3089     FALSE 0.307 41.000 0.000 NA   NA
 5932764 5932765 MMAR_3089 MMAR_3090     TRUE 0.979 -28.000 0.200 NA   NA
 5932767 5932768 MMAR_3092 MMAR_3093 lppK   TRUE 0.634 9.000 0.000 NA   NA
 5932770 5932771 MMAR_3095 MMAR_3096     TRUE 0.979 -3.000 0.094 NA   NA
 5932772 5932773 MMAR_3097 MMAR_3098     FALSE 0.620 119.000 0.000 0.010 Y NA
 5932773 5932774 MMAR_3098 MMAR_3099     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.007 Y NA
 5932776 5932777 MMAR_3101 MMAR_3102 lpd_1   TRUE 0.991 -3.000 0.364 NA   NA
 5932777 5932778 MMAR_3102 MMAR_3103   hisG FALSE 0.118 117.000 0.006 NA   NA
 5932778 5932779 MMAR_3103 MMAR_3104 hisG hisE TRUE 0.998 -3.000 0.081 0.002 Y NA
 5932779 5932780 MMAR_3104 MMAR_3105 hisE   FALSE 0.078 119.000 0.000 NA   NA
 5932781 5932782 MMAR_3106 MMAR_3107     FALSE 0.002 555.000 0.000 NA   NA
 5932783 5932784 MMAR_3108 MMAR_3109     FALSE 0.390 40.000 0.000 1.000   NA
 5932784 5932785 MMAR_3109 MMAR_3110   mshC TRUE 0.711 24.000 0.096 1.000   NA
 5932787 5932788 MMAR_3112 MMAR_3113 cysQ   FALSE 0.257 112.000 0.119 1.000   NA
 5932788 5932789 MMAR_3113 MMAR_3114     TRUE 0.996 -16.000 0.810 NA   NA
 5932789 5932790 MMAR_3114 MMAR_3115     TRUE 0.654 89.000 0.608 NA   NA
 5932790 5932791 MMAR_3115 MMAR_3116     TRUE 0.968 -3.000 0.071 NA N NA
 5932791 5932792 MMAR_3116 MMAR_3117     FALSE 0.416 44.000 0.026 NA   NA
 5932793 5932794 MMAR_3118 MMAR_3119 lppL   TRUE 0.976 -3.000 0.062 NA   NA
 5932794 5932795 MMAR_3119 MMAR_3120   pyrD TRUE 0.705 33.000 0.236 NA   NA
 5932796 5932797 MMAR_3121 MMAR_3122     FALSE 0.066 126.000 0.000 NA   NA
 5932797 5932798 MMAR_3122 MMAR_3123     TRUE 0.735 27.000 0.224 NA   NA
 5932800 5932801 MMAR_3124 MMAR_3125     FALSE 0.068 187.000 0.222 NA   NA
 5932801 5932802 MMAR_3125 MMAR_3126     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5932802 5932803 MMAR_3126 MMAR_3127     TRUE 0.775 90.000 1.000 NA   NA
 5932804 5932805 MMAR_3128 MMAR_3129     TRUE 0.981 6.000 1.000 1.000   NA
 5932808 5932809 MMAR_3132 MMAR_3133   fadD14_1 TRUE 0.920 43.000 0.333 1.000 Y NA
 5932809 5932810 MMAR_3133 MMAR_3134 fadD14_1   TRUE 0.632 27.000 0.070 NA   NA
 5932810 5932811 MMAR_3134 MMAR_3135   cyp136B2 TRUE 0.977 -3.000 0.070 NA   NA
 5932811 5932812 MMAR_3135 MMAR_3136 cyp136B2   FALSE 0.207 116.000 0.000 0.017 N NA
 5932812 5932813 MMAR_3136 MMAR_3137     FALSE 0.149 62.000 0.000 1.000 N NA
 5932813 5932814 MMAR_3137 MMAR_3138     TRUE 0.996 -3.000 0.750 1.000 N NA
 5932814 5932815 MMAR_3138 MMAR_3139     TRUE 0.857 48.000 0.000 0.017 Y NA
 5932815 5932816 MMAR_3139 MMAR_3140     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000   NA
 5932816 5932817 MMAR_3140 MMAR_3141     TRUE 0.990 2.000 0.750 0.053   NA
 5932823 5932824 MMAR_3147 MMAR_3148     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932824 5932825 MMAR_3148 MMAR_3149     FALSE 0.606 42.000 0.000 0.036   NA
 5932825 5932826 MMAR_3149 MMAR_3150     FALSE 0.004 426.000 0.000 1.000   NA
 5932826 5932827 MMAR_3150 MMAR_3151     TRUE 0.722 47.000 0.429 1.000 N NA
 5932827 5932828 MMAR_3151 MMAR_3152     TRUE 0.800 37.000 0.375 1.000   NA
 5932828 5932829 MMAR_3152 MMAR_3153     FALSE 0.011 250.000 0.000 1.000   NA
 5932829 5932830 MMAR_3153 MMAR_3154   cyp153A16 TRUE 0.995 -3.000 0.600 1.000   NA
 5932830 5932831 MMAR_3154 MMAR_3155 cyp153A16   TRUE 0.961 21.000 1.000 0.070 N NA
 5932833 5932834 MMAR_3157 MMAR_3158     FALSE 0.015 198.000 0.000 NA   NA
 5932834 5932835 MMAR_3158 MMAR_3159     TRUE 0.711 54.000 0.500 NA   NA
 5932835 5932836 MMAR_3159 MMAR_3160     TRUE 0.987 0.000 0.750 NA N NA
 5932836 5932837 MMAR_3160 MMAR_3161     TRUE 0.859 48.000 1.000 NA N NA
 5932838 5932839 MMAR_3162 MMAR_3163     TRUE 0.989 -3.000 0.300 NA   NA
 5932839 5932840 MMAR_3163 MMAR_3164     TRUE 0.989 -37.000 0.400 NA   NA
 5932843 5932844 MMAR_3167 MMAR_3169     FALSE 0.006 273.000 0.000 NA   NA
 5932846 5932847 MMAR_3170 MMAR_3171     FALSE 0.108 104.000 0.000 NA   NA
 5932847 5932848 MMAR_3171 MMAR_5571     FALSE 0.354 34.000 0.000 NA   NA
 5932850 5932851 MMAR_3173 MMAR_3174 mbtH mmpL4_5 FALSE 0.005 292.000 0.000 NA   NA
 5932851 5932852 MMAR_3174 MMAR_3175 mmpL4_5 mmpS4 TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5932852 5932853 MMAR_3175 MMAR_3176 mmpS4   FALSE 0.039 145.000 0.000 NA   NA
 5932853 5932854 MMAR_3176 MMAR_3177   panD_2 FALSE 0.268 40.000 0.000 1.000 N NA
 5932854 5932855 MMAR_3177 MMAR_3178 panD_2   FALSE 0.008 244.000 0.000 NA   NA
 5932855 5932856 MMAR_3178 MMAR_3179     TRUE 0.787 2.000 0.000 NA   NA
 5932857 5932858 MMAR_3180 MMAR_3182     FALSE 0.022 173.000 0.000 NA   NA
 5932858 5932859 MMAR_3182 MMAR_3183     FALSE 0.038 146.000 0.000 NA   NA
 5932860 5932861 MMAR_3184 MMAR_3185   wag31 FALSE 0.337 85.000 0.149 NA   NA
 5932861 5932862 MMAR_3185 MMAR_3186 wag31   FALSE 0.021 257.000 0.114 NA   NA
 5932862 5932863 MMAR_3186 MMAR_3187     FALSE 0.060 181.000 0.165 NA   NA
 5932863 5932864 MMAR_3187 MMAR_3188     TRUE 0.699 65.000 0.581 NA   NA
 5932864 5932865 MMAR_3188 MMAR_3189   yfiH TRUE 0.976 -3.000 0.061 NA   NA
 5932865 5932866 MMAR_3189 MMAR_3190 yfiH ftsZ TRUE 0.791 11.000 0.082 NA   NA
 5932866 5932867 MMAR_3190 MMAR_3191 ftsZ ftsQ FALSE 0.014 250.000 0.067 NA N NA
 5932867 5932868 MMAR_3191 MMAR_3192 ftsQ murC TRUE 0.996 -3.000 0.134 NA Y NA
 5932868 5932869 MMAR_3192 MMAR_3193 murC murG TRUE 0.998 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 5932869 5932870 MMAR_3193 MMAR_3194 murG ftsW TRUE 0.980 -3.000 0.167 1.000 N NA
 5932870 5932871 MMAR_3194 MMAR_3195 ftsW murD TRUE 0.926 7.000 0.081 0.003 N NA
 5932871 5932872 MMAR_3195 MMAR_3196 murD murX TRUE 0.997 2.000 0.647 0.003 Y NA
 5932872 5932873 MMAR_3196 MMAR_3197 murX murF TRUE 0.998 -3.000 0.071 0.003 Y NA
 5932873 5932874 MMAR_3197 MMAR_3198 murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.367 0.001 Y NA
 5932874 5932875 MMAR_3198 MMAR_3199 murE   FALSE 0.003 404.000 0.000 NA   NA
 5932875 5932876 MMAR_3199 MMAR_3200   pbpB FALSE 0.007 252.000 0.000 NA   NA
 5932876 5932877 MMAR_3200 MMAR_3201 pbpB   TRUE 0.981 -3.000 0.144 NA   NA
 5932877 5932878 MMAR_3201 MMAR_3202     TRUE 0.969 -3.000 0.028 NA   NA
 5932878 5932879 MMAR_3202 MMAR_3203     FALSE 0.299 152.000 0.635 NA   NA
 5932879 5932880 MMAR_3203 MMAR_3204     FALSE 0.003 385.000 0.000 NA   NA
 5932881 5932882 MMAR_3205 MMAR_3206   lppM FALSE 0.471 69.000 0.250 NA   NA
 5932884 5932885 MMAR_3208 MMAR_3209 idsA2   TRUE 0.928 5.000 0.298 NA   NA
 5932888 5932889 MMAR_3212 MMAR_3213 idsB_2 pksG TRUE 0.773 17.000 0.000 0.003 N NA
 5932889 5932890 MMAR_3213 MMAR_3214 pksG   TRUE 0.844 46.000 0.047 1.000 Y NA
 5932890 5932891 MMAR_3214 MMAR_3215     TRUE 0.908 24.000 0.020 1.000 Y NA
 5932891 5932892 MMAR_3215 MMAR_3216     TRUE 0.999 -3.000 0.312 0.002 Y NA
 5932892 5932893 MMAR_3216 MMAR_3217   erg12 TRUE 0.999 -3.000 0.281 0.002 Y NA
 5932893 5932894 MMAR_3217 MMAR_3218 erg12 idi TRUE 0.962 15.000 0.013 0.003 Y NA
 5932894 5932895 MMAR_3218 MMAR_3219 idi idsB_1 FALSE 0.052 196.000 0.000 0.003 N NA
 5932896 5932897 MMAR_3220 MMAR_3221   fabH_1 FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 5932898 5932899 MMAR_3222 MMAR_3223 aroG   TRUE 0.669 49.000 0.301 1.000   NA
 5932899 5932900 MMAR_3223 MMAR_3224     TRUE 0.824 10.000 0.132 NA   NA
 5932902 5932903 MMAR_3226 MMAR_3227     FALSE 0.558 88.000 0.417 NA   NA
 5932903 5932904 MMAR_3227 MMAR_3228     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5932904 5932905 MMAR_3228 MMAR_3229     FALSE 0.393 72.000 0.184 NA   NA
 5932905 5932906 MMAR_3229 MMAR_3230     FALSE 0.315 97.000 0.164 NA   NA
 5932908 5932909 MMAR_3232 MMAR_3233     FALSE 0.468 72.000 0.258 NA   NA
 5932909 5932910 MMAR_3233 MMAR_3234     TRUE 0.908 14.000 0.471 NA   NA
 5932910 5932911 MMAR_3234 MMAR_5560     FALSE 0.124 175.000 0.353 NA   NA
 5932914 5932915 MMAR_3237 MMAR_3238 ctaE qcrC TRUE 0.869 53.000 0.088 0.069 Y NA
 5932915 5932916 MMAR_3238 MMAR_3239 qcrC qcrA TRUE 0.998 -3.000 0.421 NA Y NA
 5932916 5932917 MMAR_3239 MMAR_3240 qcrA qcrB TRUE 0.999 -3.000 0.660 NA Y NA
 5932918 5932919 MMAR_3241 MMAR_3242   mmpS3 TRUE 0.991 0.000 0.900 NA   NA
 5932919 5932920 MMAR_3242 MMAR_3243 mmpS3   FALSE 0.049 183.000 0.092 NA   NA
 5932920 5932921 MMAR_3243 MMAR_3244   ctaC TRUE 0.918 9.000 0.342 NA   NA
 5932925 5932926 MMAR_3248 MMAR_3249     FALSE 0.213 86.000 0.016 NA   NA
 5932927 5932928 MMAR_3250 MMAR_3251   cobU FALSE 0.571 29.000 0.041 NA   NA
 5932928 5932929 MMAR_3251 MMAR_3252 cobU cobT TRUE 0.996 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 5932929 5932930 MMAR_3252 MMAR_3253 cobT cobS TRUE 0.998 -3.000 0.039 0.006 Y NA
 5932930 5932931 MMAR_3253 MMAR_3254 cobS   FALSE 0.024 190.000 0.003 NA   NA
 5932932 5932933 MMAR_3255 MMAR_3256 ilvE gcvT TRUE 0.774 55.000 0.025 1.000 Y NA
 5932934 5932935 MMAR_3257 MMAR_3258   pepB TRUE 0.706 12.000 0.041 1.000 N NA
 5932937 5932938 MMAR_3260 MMAR_3261 sucB   TRUE 0.943 5.000 0.333 1.000   NA
 5932939 5932940 MMAR_3262 MMAR_3263     FALSE 0.346 90.000 0.000 0.062   NA
 5932940 5932941 MMAR_3263 MMAR_3264     FALSE 0.062 140.000 0.000 1.000   NA
 5932941 5932942 MMAR_3264 MMAR_3265     FALSE 0.003 435.000 0.000 NA   NA
 5932942 5932943 MMAR_3265 MMAR_3266     FALSE 0.006 283.000 0.000 NA   NA
 5932943 5932944 MMAR_3266 MMAR_3267     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5932945 5932946 MMAR_3268 MMAR_3269     FALSE 0.002 620.000 0.000 NA   NA
 5932946 5932947 MMAR_3269 MMAR_3270     FALSE 0.001 1761.000 0.000 NA   NA
 5932947 5932948 MMAR_3270 MMAR_3271     TRUE 0.721 102.000 0.000 0.005 Y NA
 5932949 5932950 MMAR_3272 MMAR_3273     FALSE 0.004 373.000 0.000 1.000   NA
 5932953 5932954 MMAR_3276 MMAR_3277     TRUE 0.934 -10.000 0.000 NA   NA
 5932954 5932955 MMAR_3277 MMAR_3278   wrbA FALSE 0.002 527.000 0.000 NA   NA
 5932955 5932956 MMAR_3278 MMAR_3279 wrbA   FALSE 0.360 33.000 0.000 NA   NA
 5932956 5932957 MMAR_3279 MMAR_3280     FALSE 0.367 32.000 0.000 NA   NA
 5932957 5932958 MMAR_3280 MMAR_3281   ilvB1_2 TRUE 0.982 0.000 0.000 NA Y NA
 5932959 5932960 MMAR_3282 MMAR_3283     FALSE 0.141 84.000 0.000 NA   NA
 5932960 5932961 MMAR_3283 MMAR_3284     FALSE 0.320 173.000 0.000 0.003 Y NA
 5932962 5932963 MMAR_3285 MMAR_3286 lipB lipA TRUE 0.999 -3.000 0.319 0.000 Y NA
 5932963 5932964 MMAR_3286 MMAR_3287 lipA   FALSE 0.620 27.000 0.059 NA   NA
 5932966 5932967 MMAR_3289 MMAR_3290 glnA1   FALSE 0.007 264.000 0.000 NA   NA
 5932968 5932969 MMAR_3291 MMAR_3292     TRUE 0.993 -3.000 0.444 NA   NA
 5932969 5932970 MMAR_3292 MMAR_3293   glnE TRUE 0.632 14.000 0.009 NA   NA
 5932970 5932971 MMAR_3293 MMAR_3294 glnE glnA2 FALSE 0.297 71.000 0.065 1.000 N NA
 5932971 5932972 MMAR_3294 MMAR_3295 glnA2   FALSE 0.306 90.000 0.104 NA   NA
 5932972 5932973 MMAR_3295 MMAR_3296   ctaD_1 FALSE 0.240 49.000 0.000 NA   NA
 5932973 5932974 MMAR_3296 MMAR_3297 ctaD_1   FALSE 0.041 144.000 0.000 NA   NA
 5932974 5932975 MMAR_3297 MMAR_3298     TRUE 0.755 60.000 0.667 NA   NA
 5932978 5932979 MMAR_3301 MMAR_3302     FALSE 0.003 594.000 0.000 1.000   NA
 5932980 5932981 MMAR_3303 MMAR_5507   rnpB FALSE 0.002 497.000 0.000 NA   NA
 5932981 5932982 MMAR_5507 MMAR_3304 rnpB   FALSE 0.033 153.000 0.000 NA   NA
 5932982 5932983 MMAR_3304 MMAR_3305     TRUE 0.993 -3.000 0.422 NA   NA
 5932983 5932984 MMAR_3305 MMAR_3306     TRUE 0.870 23.000 0.468 NA   NA
 5932984 5932985 MMAR_3306 MMAR_3307   cobC TRUE 0.980 -3.000 0.121 NA   NA
 5932986 5932987 MMAR_3308 MMAR_3309   ptpA TRUE 0.973 -7.000 0.029 1.000   NA
 5932987 5932988 MMAR_3309 MMAR_3310 ptpA   TRUE 0.902 0.000 0.013 NA   NA
 5932991 5932992 MMAR_3313 MMAR_3314     FALSE 0.365 89.000 0.000 0.036   NA
 5932993 5932994 MMAR_3315 MMAR_3316     FALSE 0.006 282.000 0.000 NA   NA
 5932994 5932995 MMAR_3316 MMAR_3317     FALSE 0.075 120.000 0.000 NA   NA
 5932996 5932997 MMAR_3318 MMAR_3319     FALSE 0.051 135.000 0.000 NA   NA
 5932997 5932998 MMAR_3319 MMAR_3320     FALSE 0.088 104.000 0.000 1.000 N NA
 5932998 5932999 MMAR_3320 MMAR_3321     FALSE 0.156 73.000 0.000 NA   NA
 5932999 5933000 MMAR_3321 MMAR_3322     FALSE 0.587 11.000 0.000 NA   NA
 5933000 5933001 MMAR_3322 MMAR_3323     TRUE 0.999 -3.000 0.698 0.096 Y NA
 5933001 5933002 MMAR_3323 MMAR_3324     FALSE 0.155 60.000 0.000 1.000 N NA
 5933003 5933004 MMAR_3325 MMAR_3326     FALSE 0.003 421.000 0.000 NA   NA
 5933004 5933005 MMAR_3326 MMAR_3327     FALSE 0.020 177.000 0.000 NA   NA
 5933005 5933006 MMAR_3327 MMAR_3328   adhE2_1 TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5933006 5933007 MMAR_3328 MMAR_3329 adhE2_1   FALSE 0.336 37.000 0.000 NA   NA
 5933007 5933008 MMAR_3329 MMAR_3330     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933009 5933010 MMAR_5508 MMAR_3331 valV ahpE FALSE 0.196 57.000 0.000 NA   NA
 5933010 5933011 MMAR_3331 MMAR_3332 ahpE   TRUE 0.984 0.000 0.575 NA   NA
 5933011 5933012 MMAR_3332 MMAR_3333     FALSE 0.409 57.000 0.113 NA   NA
 5933013 5933014 MMAR_3334 MMAR_3335 aceE   FALSE 0.118 134.000 0.169 NA N NA
 5933014 5933015 MMAR_3335 MMAR_3336   fabD FALSE 0.162 162.000 0.441 NA N NA
 5933015 5933016 MMAR_3336 MMAR_3337 fabD acpM TRUE 0.764 73.000 0.127 1.000 Y NA
 5933016 5933017 MMAR_3337 MMAR_3338 acpM kasA TRUE 0.996 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 5933017 5933018 MMAR_3338 MMAR_3339 kasA kasB TRUE 0.895 82.000 0.400 0.019 Y NA
 5933018 5933019 MMAR_3339 MMAR_3340 kasB accD6 TRUE 0.912 38.000 0.222 1.000 Y NA
 5933019 5933020 MMAR_3340 MMAR_3341 accD6   FALSE 0.192 126.000 0.111 1.000   NA
 5933021 5933022 MMAR_3342 MMAR_3343 glpD1   TRUE 0.988 0.000 0.727 1.000 N NA
 5933023 5933024 MMAR_3344 MMAR_3345     TRUE 0.983 -3.000 0.204 1.000 N NA
 5933024 5933025 MMAR_3345 MMAR_3346     FALSE 0.141 123.000 0.043 NA   NA
 5933026 5933027 MMAR_3347 MMAR_3348     FALSE 0.108 154.000 0.200 NA   NA
 5933027 5933028 MMAR_3348 MMAR_3349     TRUE 0.820 13.000 0.163 1.000   NA
 5933029 5933030 MMAR_3350 MMAR_3351 adhE2   TRUE 0.985 0.000 0.538 1.000   NA
 5933031 5933032 MMAR_3352 MMAR_3353     FALSE 0.018 186.000 0.000 NA   NA
 5933032 5933033 MMAR_3353 MMAR_3354   lnt TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933034 5933035 MMAR_3355 MMAR_3356     TRUE 0.787 2.000 0.000 NA   NA
 5933035 5933036 MMAR_3356 MMAR_3357     FALSE 0.282 95.000 0.083 NA   NA
 5933037 5933038 MMAR_3358 MMAR_3359     FALSE 0.423 132.000 0.571 1.000   NA
 5933039 5933040 MMAR_3360 MMAR_3361 mmpS5_2 cyp124A1 FALSE 0.371 106.000 0.286 NA   NA
 5933040 5933041 MMAR_3361 MMAR_3362 cyp124A1 aofH_1 FALSE 0.574 34.000 0.000 0.068 N NA
 5933042 5933043 MMAR_3363 MMAR_3364     FALSE 0.130 94.000 0.000 NA   NA
 5933044 5933045 MMAR_3365 MMAR_3366   lppN FALSE 0.401 69.000 0.182 NA   NA
 5933045 5933046 MMAR_3366 MMAR_3367 lppN   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933046 5933047 MMAR_3367 MMAR_3368     FALSE 0.014 199.000 0.000 NA   NA
 5933047 5933048 MMAR_3368 MMAR_3369     TRUE 0.983 -3.000 0.190 NA   NA
 5933049 5933050 MMAR_3370 MMAR_3371     FALSE 0.046 152.000 0.000 1.000   NA
 5933051 5933052 MMAR_3372 MMAR_3373     FALSE 0.606 42.000 0.000 0.036   NA
 5933053 5933054 MMAR_3374 MMAR_3375     FALSE 0.426 24.000 0.000 NA   NA
 5933054 5933055 MMAR_3375 MMAR_3376     FALSE 0.001 698.000 0.000 NA N NA
 5933055 5933056 MMAR_3376 MMAR_3377     FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 5933056 5933057 MMAR_3377 MMAR_3378     FALSE 0.017 190.000 0.000 NA   NA
 5933057 5933058 MMAR_3378 MMAR_3379     TRUE 0.769 47.000 0.000 NA Y NA
 5933058 5933059 MMAR_3379 MMAR_5542     FALSE 0.002 549.000 0.000 NA   NA
 5933059 5933060 MMAR_5542 MMAR_3380     FALSE 0.098 109.000 0.000 NA   NA
 5933060 5933061 MMAR_3380 MMAR_3381     FALSE 0.021 176.000 0.000 NA   NA
 5933061 5933062 MMAR_3381 MMAR_3382     FALSE 0.196 57.000 0.000 NA   NA
 5933063 5933064 MMAR_3383 MMAR_3384     FALSE 0.263 101.000 0.143 1.000 N NA
 5933064 5933065 MMAR_3384 MMAR_3385     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933065 5933066 MMAR_3385 MMAR_3386   pmiA FALSE 0.001 960.000 0.000 NA   NA
 5933067 5933068 MMAR_3387 MMAR_3388     TRUE 0.978 -3.000 0.121 1.000 N NA
 5933069 5933070 MMAR_3389 MMAR_3390     FALSE 0.289 43.000 0.000 NA   NA
 5933070 5933071 MMAR_3390 MMAR_3391     FALSE 0.007 259.000 0.000 NA   NA
 5933071 5933072 MMAR_3391 MMAR_3392     FALSE 0.030 158.000 0.000 NA   NA
 5933072 5933073 MMAR_3392 MMAR_3393     FALSE 0.026 165.000 0.000 NA   NA
 5933073 5933074 MMAR_3393 MMAR_3394     FALSE 0.096 230.000 0.000 1.000 Y NA
 5933074 5933075 MMAR_3394 MMAR_3395     TRUE 0.878 28.000 0.000 1.000 Y NA
 5933077 5933078 MMAR_3397 MMAR_3398     FALSE 0.575 103.000 0.000 1.000 Y NA
 5933080 5933081 MMAR_3400 MMAR_3401     FALSE 0.080 118.000 0.000 NA   NA
 11425367 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7415.000 0.000 NA   NA
 11567730 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7415.000 0.000 NA   NA
 11710122 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7415.000 0.000 NA   NA
 11425368 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7437.000 0.000 NA   NA
 11567731 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7437.000 0.000 NA   NA
 11710123 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7437.000 0.000 NA   NA
 11425369 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7493.000 0.000 NA   NA
 11567732 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7493.000 0.000 NA   NA
 11710124 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7493.000 0.000 NA   NA
 11425370 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7515.000 0.000 NA   NA
 11567733 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7515.000 0.000 NA   NA
 11710125 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7515.000 0.000 NA   NA
 11425371 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7550.000 0.000 NA   NA
 11567734 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7550.000 0.000 NA   NA
 11710126 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7550.000 0.000 NA   NA
 11425372 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7572.000 0.000 NA   NA
 11567735 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7572.000 0.000 NA   NA
 11710127 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7572.000 0.000 NA   NA
 11425373 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7598.000 0.000 NA   NA
 11567736 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7598.000 0.000 NA   NA
 11710128 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7598.000 0.000 NA   NA
 11425374 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7620.000 0.000 NA   NA
 11567737 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7620.000 0.000 NA   NA
 11710129 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7620.000 0.000 NA   NA
 11425375 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7658.000 0.000 NA   NA
 11567738 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7658.000 0.000 NA   NA
 11710130 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7658.000 0.000 NA   NA
 11425376 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7680.000 0.000 NA   NA
 11567739 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7680.000 0.000 NA   NA
 11710131 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7680.000 0.000 NA   NA
 11425377 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7703.000 0.000 NA   NA
 11567740 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7703.000 0.000 NA   NA
 11710132 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7703.000 0.000 NA   NA
 11425378 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7725.000 0.000 NA   NA
 11567741 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7725.000 0.000 NA   NA
 11710133 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7725.000 0.000 NA   NA
 11425379 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7775.000 0.000 NA   NA
 11567742 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7775.000 0.000 NA   NA
 11710134 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7775.000 0.000 NA   NA
 11425380 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7797.000 0.000 NA   NA
 11567743 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7797.000 0.000 NA   NA
 11710135 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7797.000 0.000 NA   NA
 11425381 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7820.000 0.000 NA   NA
 11567744 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7820.000 0.000 NA   NA
 11710136 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7820.000 0.000 NA   NA
 11425382 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7842.000 0.000 NA   NA
 11567745 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7842.000 0.000 NA   NA
 11710137 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7842.000 0.000 NA   NA
 11425383 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7886.000 0.000 NA   NA
 11567746 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7886.000 0.000 NA   NA
 11710138 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7886.000 0.000 NA   NA
 11425384 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7908.000 0.000 NA   NA
 11567747 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7908.000 0.000 NA   NA
 11710139 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7908.000 0.000 NA   NA
 11425385 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7931.000 0.000 NA   NA
 11567748 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7931.000 0.000 NA   NA
 11710140 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7931.000 0.000 NA   NA
 11425386 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7953.000 0.000 NA   NA
 11567749 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7953.000 0.000 NA   NA
 11710141 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 7953.000 0.000 NA   NA
 11425387 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 8003.000 0.000 NA   NA
 11567750 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 8003.000 0.000 NA   NA
 11710142 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 8003.000 0.000 NA   NA
 11425388 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 8025.000 0.000 NA   NA
 11567751 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 8025.000 0.000 NA   NA
 11710143 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 8025.000 0.000 NA   NA
 11425389 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 8048.000 0.000 NA   NA
 11567752 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 8048.000 0.000 NA   NA
 11710144 5933075   MMAR_3395     FALSE NA 8048.000 0.000 NA   NA
 5933083 5933084 MMAR_3403 MMAR_3405     FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 5933086 5933087 MMAR_3407 MMAR_3408 gltD_1   TRUE 0.992 -3.000 0.219 0.009 N NA
 5933087 5933088 MMAR_3408 MMAR_3409     TRUE 0.965 0.000 0.286 1.000 N NA
 5933088 5933089 MMAR_3409 MMAR_3410     FALSE 0.344 28.000 0.000 1.000 N NA
 5933090 5933091 MMAR_3411 MMAR_3412 pfkA_1   FALSE 0.063 96.000 0.000 NA N NA
 5933094 5933095 MMAR_3415 MMAR_3416 pitB nirA FALSE 0.004 420.000 0.000 1.000   NA
 5933095 5933096 MMAR_3416 MMAR_3417 nirA cysH_1 FALSE 0.531 30.000 0.041 1.000 N NA
 5933096 5933097 MMAR_3417 MMAR_3418 cysH_1   TRUE 0.969 -3.000 0.003 1.000   NA
 5933099 5933100 MMAR_3420 MMAR_3421 fprA fdxC_1 TRUE 0.655 23.000 0.000 0.067 N NA
 5933100 5933101 MMAR_3421 MMAR_3422 fdxC_1   FALSE 0.002 465.000 0.000 NA   NA
 5933102 5933103 MMAR_3423 MMAR_3424     FALSE 0.018 185.000 0.000 NA   NA
 5933105 5933106 MMAR_3426 MMAR_3427     FALSE 0.005 291.000 0.000 NA   NA
 5933106 5933107 MMAR_3427 MMAR_3428     FALSE 0.003 435.000 0.000 NA   NA
 5933108 5933109 MMAR_3429 MMAR_3430 lipM   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933109 5933110 MMAR_3430 MMAR_3431     FALSE 0.017 189.000 0.000 NA   NA
 5933113 5933114 MMAR_3434 MMAR_3435     FALSE 0.039 145.000 0.000 NA   NA
 5933115 5933116 MMAR_3436 MMAR_3437   yjcE FALSE 0.127 96.000 0.000 NA   NA
 5933116 5933117 MMAR_3437 MMAR_3438 yjcE   FALSE 0.230 63.000 0.000 1.000   NA
 5933117 5933118 MMAR_3438 MMAR_3439     TRUE 0.986 -7.000 0.222 1.000   NA
 5933118 5933119 MMAR_3439 MMAR_3440     FALSE 0.614 84.000 0.000 NA Y NA
 5933119 5933120 MMAR_3440 MMAR_3441     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933122 5933123 MMAR_3443 MMAR_3444     FALSE 0.041 315.000 0.000 NA Y NA
 5933124 5933125 MMAR_3445 MMAR_3446 cdh   FALSE 0.012 211.000 0.000 NA   NA
 5933125 5933126 MMAR_3446 MMAR_3447     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933127 5933128 MMAR_3448 MMAR_3449     FALSE 0.256 47.000 0.000 NA   NA
 5933130 5933131 MMAR_3451 MMAR_3452     FALSE 0.007 263.000 0.000 NA   NA
 5933131 5933132 MMAR_3452 MMAR_3453     FALSE 0.167 68.000 0.000 NA   NA
 5933135 5933136 MMAR_3456 MMAR_3457 cysQ_1   FALSE 0.092 102.000 0.000 1.000 N NA
 5933136 5933137 MMAR_3457 MMAR_3458     FALSE 0.478 18.000 0.000 NA   NA
 5933137 5933138 MMAR_3458 MMAR_3459     TRUE 0.703 5.000 0.000 NA   NA
 5933138 5933139 MMAR_3459 MMAR_3460     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5933139 5933140 MMAR_3460 MMAR_3461     FALSE 0.024 168.000 0.000 NA   NA
 5933141 5933142 MMAR_3462 MMAR_3463     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 5933142 5933143 MMAR_3463 MMAR_3464     FALSE 0.002 703.000 0.000 NA   NA
 5933148 5933149 MMAR_3469 MMAR_3470     FALSE 0.036 148.000 0.000 NA   NA
 5933149 5933150 MMAR_3470 MMAR_3471     FALSE 0.612 10.000 0.000 NA   NA
 5933152 5933153 MMAR_3473 MMAR_3474     TRUE 0.995 -16.000 0.078 NA Y NA
 5933153 5933154 MMAR_3474 MMAR_3475     FALSE 0.388 29.000 0.000 NA   NA
 5933154 5933155 MMAR_3475 MMAR_3476     FALSE 0.144 104.000 0.000 1.000   NA
 5933155 5933156 MMAR_3476 MMAR_3477     FALSE 0.077 132.000 0.000 1.000   NA
 5933158 5933159 MMAR_3479 MMAR_3480     FALSE 0.144 241.000 0.000 0.007 Y NA
 5933159 5933160 MMAR_3480 MMAR_3481     FALSE 0.122 209.000 0.000 1.000 Y NA
 5933160 5933161 MMAR_3481 MMAR_3482   pfkB_1 FALSE 0.035 142.000 0.000 1.000 N NA
 5933161 5933162 MMAR_3482 MMAR_3483 pfkB_1   TRUE 0.637 29.000 0.050 1.000   NA
 5933162 5933163 MMAR_3483 MMAR_3484   hspX_1 TRUE 0.830 19.000 0.300 NA   NA
 5933163 5933164 MMAR_3484 MMAR_3485 hspX_1   FALSE 0.015 196.000 0.000 NA   NA
 5933164 5933165 MMAR_3485 MMAR_3486     FALSE 0.064 127.000 0.000 NA   NA
 5933165 5933166 MMAR_3486 MMAR_3487     FALSE 0.012 210.000 0.000 NA   NA
 5933167 5933168 MMAR_3488 MMAR_3489 acs_1   TRUE 0.959 0.000 0.052 0.093 N NA
 5933168 5933169 MMAR_3489 MMAR_3490     TRUE 0.999 -3.000 0.456 0.002 Y NA
 5933169 5933170 MMAR_3490 MMAR_3491     TRUE 0.997 -3.000 0.053 0.093 Y NA
 5933170 5933171 MMAR_3491 MMAR_3492     TRUE 0.935 8.000 0.371 1.000   NA
 5933171 5933172 MMAR_3492 MMAR_3493     FALSE 0.150 102.000 0.000 1.000   NA
 5933172 5933173 MMAR_3493 MMAR_3494     FALSE 0.022 173.000 0.000 NA   NA
 5933173 5933174 MMAR_3494 MMAR_3495     FALSE 0.007 260.000 0.000 NA   NA
 5933175 5933176 MMAR_3496 MMAR_3497     TRUE 0.998 -3.000 0.471 1.000 Y NA
 5933176 5933177 MMAR_3497 MMAR_3498     TRUE 0.996 0.000 0.635 1.000 Y NA
 5933177 5933178 MMAR_3498 MMAR_3499     TRUE 0.994 1.000 0.470 1.000 Y NA
 5933178 5933179 MMAR_3499 MMAR_3500     TRUE 0.993 -7.000 0.273 0.051   NA
 5933179 5933180 MMAR_3500 MMAR_3501     FALSE 0.133 92.000 0.000 NA   NA
 5933180 5933181 MMAR_3501 MMAR_3502     FALSE 0.179 62.000 0.000 NA   NA
 5933181 5933182 MMAR_3502 MMAR_3503     FALSE 0.048 149.000 0.000 1.000   NA
 5933182 5933183 MMAR_3503 MMAR_3504     FALSE 0.022 173.000 0.000 NA   NA
 5933186 5933187 MMAR_3507 MMAR_3508     FALSE 0.024 167.000 0.000 NA   NA
 5933189 5933190 MMAR_3510 MMAR_3511 echA8_5   TRUE 0.993 -15.000 0.000 1.000 Y NA
 5933190 5933191 MMAR_3511 MMAR_3512     TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 5933192 5933193 MMAR_3513 MMAR_3514     FALSE 0.499 51.000 0.000 0.050   NA
 5933193 5933194 MMAR_3514 MMAR_3515   treX_1 FALSE 0.111 188.000 0.333 1.000   NA
 5933195 5933196 MMAR_3516 MMAR_3517 alkB_1 rubA_1 TRUE 0.996 -3.000 0.667 1.000   NA
 5933196 5933197 MMAR_3517 MMAR_3518 rubA_1 rubB_1 TRUE 0.986 2.000 0.000 0.009 Y NA
 5933197 5933198 MMAR_3518 MMAR_3519 rubB_1   FALSE 0.009 211.000 0.000 1.000 N NA
 5933198 5933199 MMAR_3519 MMAR_3520     FALSE 0.067 117.000 0.000 1.000 N NA
 5933206 5933207 MMAR_3527 MMAR_3528     FALSE 0.052 134.000 0.000 NA   NA
 5933210 5933211 MMAR_3531 MMAR_3532     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5933212 5933213 MMAR_3533 MMAR_3534     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA N NA
 5933214 5933215 MMAR_3535 MMAR_3536     FALSE 0.144 80.000 0.000 NA   NA
 5933216 5933217 MMAR_3537 MMAR_3538     TRUE 0.996 -7.000 0.750 NA   NA
 5933218 5933219 MMAR_3539 MMAR_3540     FALSE 0.002 540.000 0.000 NA   NA
 5933219 5933220 MMAR_3540 MMAR_3541     FALSE 0.205 54.000 0.000 NA   NA
 5933220 5933221 MMAR_3541 MMAR_3542     FALSE 0.110 103.000 0.000 NA   NA
 5933223 5933224 MMAR_3544 MMAR_3545   embR_1 FALSE 0.240 49.000 0.000 NA   NA
 5933226 5933227 MMAR_3547 MMAR_3548     FALSE 0.003 576.000 0.000 1.000   NA
 5933227 5933228 MMAR_3548 MMAR_3549     FALSE 0.004 399.000 0.000 1.000   NA
 5933233 5933234 MMAR_3554 MMAR_3555     FALSE 0.614 84.000 0.000 NA Y NA
 5933234 5933235 MMAR_3555 MMAR_3556     FALSE 0.002 290.000 0.000 NA N NA
 5933236 5933237 MMAR_3557 MMAR_3558     TRUE 0.994 -3.000 0.590 1.000 N NA
 5933238 5933239 MMAR_3559 MMAR_3560     FALSE 0.105 105.000 0.000 NA   NA
 5933240 5933241 MMAR_3561 MMAR_3562     FALSE 0.454 31.000 0.000 1.000   NA
 5933242 5933243 MMAR_3563 MMAR_3564   qor_1 TRUE 0.787 2.000 0.000 NA   NA
 5933248 5933249 MMAR_3570 MMAR_3571     FALSE 0.039 145.000 0.000 NA   NA
 5933249 5933250 MMAR_3571 MMAR_3572     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5933250 5933251 MMAR_3572 MMAR_3573     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933252 5933253 MMAR_3574 MMAR_3575     FALSE 0.003 408.000 0.000 NA   NA
 5933253 5933254 MMAR_3575 MMAR_3576     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5933254 5933255 MMAR_3576 MMAR_3577     FALSE 0.016 193.000 0.000 NA   NA
 5933256 5933257 MMAR_3578 MMAR_3579   esxK FALSE 0.071 123.000 0.000 NA   NA
 5933257 5933258 MMAR_3579 MMAR_3580 esxK esxN_6 FALSE 0.080 118.000 0.000 NA   NA
 5933258 5933259 MMAR_3580 MMAR_3581 esxN_6   FALSE 0.009 237.000 0.000 NA   NA
 5933259 5933260 MMAR_3581 MMAR_3582     FALSE 0.004 336.000 0.000 NA   NA
 5933260 5933261 MMAR_3582 MMAR_3583     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 5933261 5933262 MMAR_3583 MMAR_3584     FALSE 0.060 130.000 0.000 NA   NA
 5933262 5933263 MMAR_3584 MMAR_3585     TRUE 0.840 13.000 0.000 0.006   NA
 5933263 5933264 MMAR_3585 MMAR_3586     FALSE 0.003 398.000 0.000 NA   NA
 5933264 5933265 MMAR_3586 MMAR_3587     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933265 5933266 MMAR_3587 MMAR_3588     FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5933267 5933268 MMAR_3589 MMAR_3590     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5933268 5933269 MMAR_3590 MMAR_3591     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5933269 5933270 MMAR_3591 MMAR_3592     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933271 5933272 MMAR_3593 MMAR_3594     FALSE 0.002 452.000 0.000 NA   NA
 5933272 5933273 MMAR_3594 MMAR_3595     TRUE 0.987 -3.000 0.250 NA   NA
 5933273 5933274 MMAR_3595 MMAR_3596     FALSE 0.004 353.000 0.000 NA   NA
 5933274 5933275 MMAR_3596 MMAR_3597     FALSE 0.115 101.000 0.000 NA   NA
 5933275 5933276 MMAR_3597 MMAR_3598     TRUE 0.996 -13.000 0.514 0.059   NA
 5933277 5933278 MMAR_3599 MMAR_3600     TRUE 0.999 -3.000 0.669 1.000 Y NA
 5933278 5933279 MMAR_3600 MMAR_3601     TRUE 0.966 -3.000 0.019 NA   NA
 5933279 5933280 MMAR_3601 MMAR_3602     TRUE 0.865 14.000 0.310 NA   NA
 5933281 5933282 MMAR_3603 MMAR_3604     TRUE 0.835 22.000 0.338 NA   NA
 5933284 5933285 MMAR_3606 MMAR_3607     TRUE 0.687 34.000 0.182 1.000   NA
 5933287 5933288 MMAR_3608 MMAR_3609   mmpL4 FALSE 0.006 270.000 0.000 NA   NA
 5933288 5933289 MMAR_3609 MMAR_3610 mmpL4   FALSE 0.003 374.000 0.000 NA   NA
 5933292 5933293 MMAR_5561 MMAR_3613     FALSE 0.021 174.000 0.000 NA   NA
 5933293 5933294 MMAR_3613 MMAR_3614     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933294 5933295 MMAR_3614 MMAR_3615     FALSE 0.563 41.000 0.121 NA   NA
 5933295 5933296 MMAR_3615 MMAR_3616     TRUE 0.997 -3.000 0.914 NA   NA
 5933297 5933298 MMAR_3617 MMAR_3618 uspA uspB TRUE 0.999 -13.000 0.818 0.010 Y NA
 5933298 5933299 MMAR_3618 MMAR_3619 uspB uspC TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.010 Y NA
 5933300 5933301 MMAR_3620 MMAR_3621   rocE TRUE 0.992 -3.000 0.444 1.000 N NA
 5933301 5933302 MMAR_3621 MMAR_3622 rocE rocD TRUE 0.889 30.000 0.015 1.000 Y NA
 5933302 5933303 MMAR_3622 MMAR_3623 rocD   TRUE 0.996 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5933305 5933306 MMAR_3625 MMAR_3626     TRUE 0.988 -3.000 0.240 1.000   NA
 5933307 5933308 MMAR_3627 MMAR_3628     FALSE 0.020 167.000 0.000 1.000 N NA
 5933309 5933310 MMAR_3629 MMAR_3630     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933312 5933313 MMAR_3632 MMAR_5573     TRUE 0.684 6.000 0.000 NA   NA
 5933314 5933315 MMAR_3633 MMAR_3634     TRUE 0.739 20.000 0.000 0.065   NA
 5933315 5933316 MMAR_3634 MMAR_3635     FALSE 0.199 75.000 0.000 1.000   NA
 5933316 5933317 MMAR_3635 MMAR_3636     FALSE 0.123 76.000 0.000 1.000 N NA
 5933318 5933319 MMAR_3637 MMAR_3638 narK1 lppP FALSE 0.010 224.000 0.000 NA   NA
 5933320 5933321 MMAR_3639 MMAR_3640 fdhF   FALSE 0.006 325.000 0.000 1.000   NA
 5933321 5933322 MMAR_3640 MMAR_3641     FALSE 0.001 906.000 0.000 NA N NA
 5933324 5933325 MMAR_3643 MMAR_3644 mez   FALSE 0.005 308.000 0.000 NA   NA
 5933325 5933326 MMAR_3644 MMAR_3645   cysK1 TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933326 5933327 MMAR_3645 MMAR_3646 cysK1 cysE TRUE 0.998 -3.000 0.133 0.001 Y NA
 5933327 5933328 MMAR_3646 MMAR_3647 cysE thiX FALSE 0.532 11.000 0.000 1.000 N NA
 5933328 5933329 MMAR_3647 MMAR_3648 thiX   FALSE 0.397 28.000 0.000 NA   NA
 5933332 5933333 MMAR_3650 MMAR_3651 dnaG dgt FALSE 0.427 42.000 0.037 1.000 N NA
 5933335 5933336 MMAR_3653 MMAR_3654 esxN_3 esxP_2 FALSE 0.177 63.000 0.000 NA   NA
 5933336 5933337 MMAR_3654 MMAR_3655 esxP_2   FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 5933337 5933338 MMAR_3655 MMAR_3656   plcB_5 FALSE 0.005 287.000 0.000 NA   NA
 5933338 5933339 MMAR_3656 MMAR_3657 plcB_5 plcB_4 FALSE 0.062 397.000 0.000 0.001 Y NA
 5933341 5933342 MMAR_3659 MMAR_3660 esxN_4 esxP_3 FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5933342 5933343 MMAR_3660 MMAR_3661 esxP_3   FALSE 0.144 80.000 0.000 NA   NA
 5933343 5933344 MMAR_3661 MMAR_3662   esxN_5 FALSE 0.006 275.000 0.000 NA   NA
 5933344 5933345 MMAR_3662 MMAR_3663 esxN_5 esxP_4 FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5933345 5933346 MMAR_3663 MMAR_3664 esxP_4   FALSE 0.144 80.000 0.000 NA   NA
 5933346 5933347 MMAR_3664 MMAR_3665     FALSE 0.018 564.000 0.000 NA Y NA
 5933347 5933348 MMAR_3665 MMAR_3666     FALSE 0.049 290.000 0.000 NA Y NA
 5933348 5933349 MMAR_3666 MMAR_3667   glyS FALSE 0.004 237.000 0.000 NA N NA
 5933350 5933351 MMAR_3668 MMAR_3669   zur TRUE 0.984 -3.000 0.021 0.050 N NA
 5933352 5933353 MMAR_3670 MMAR_3671     TRUE 0.906 0.000 0.017 NA   NA
 5933353 5933354 MMAR_3671 MMAR_3672   recO TRUE 0.973 -7.000 0.076 1.000 N NA
 5933356 5933357 MMAR_3674 MMAR_3675 era   TRUE 0.954 -10.000 0.005 NA   NA
 5933357 5933358 MMAR_3675 MMAR_3676     TRUE 0.948 -31.000 0.006 NA   NA
 5933358 5933359 MMAR_3676 MMAR_3677     TRUE 0.985 -3.000 0.222 NA   NA
 5933359 5933360 MMAR_3677 MMAR_3678   phoH1 TRUE 0.884 19.000 0.457 NA   NA
 5933360 5933361 MMAR_3678 MMAR_3679 phoH1   FALSE 0.218 68.000 0.000 1.000   NA
 5933362 5933363 MMAR_3680 MMAR_3681     FALSE 0.138 88.000 0.000 NA   NA
 5933364 5933365 MMAR_3682 MMAR_3683   dnaJ2 TRUE 0.622 29.000 0.073 NA   NA
 5933365 5933366 MMAR_3683 MMAR_3684 dnaJ2 hrcA FALSE 0.283 75.000 0.064 1.000 N NA
 5933367 5933368 MMAR_3685 MMAR_3686     FALSE 0.236 95.000 0.041 NA   NA
 5933368 5933369 MMAR_3686 MMAR_3687     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5933370 5933371 MMAR_3688 MMAR_3689 cfp2 mbtB FALSE 0.006 284.000 0.000 NA   NA
 5933371 5933372 MMAR_3689 MMAR_3690 mbtB mbtF TRUE 0.955 36.000 0.250 0.004 Y NA
 5933372 5933373 MMAR_3690 MMAR_3691 mbtF mbtE TRUE 0.999 -3.000 0.308 0.004 Y NA
 5933374 5933375 MMAR_3692 MMAR_3693     FALSE 0.078 110.000 0.000 1.000 N NA
 5933375 5933376 MMAR_3693 MMAR_3694   mbtC TRUE 0.996 -3.000 0.444 0.018   NA
 5933376 5933377 MMAR_3694 MMAR_3695 mbtC mbtD TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.018   NA
 5933378 5933379 MMAR_3696 MMAR_3697 mbtH_1 mbtG TRUE 0.984 -19.000 0.267 NA   NA
 5933380 5933381 MMAR_3698 MMAR_3699 mbtA mbtJ FALSE 0.284 119.000 0.095 0.091 N NA
 5933381 5933382 MMAR_3699 MMAR_3700 mbtJ   TRUE 0.973 2.000 0.286 0.091   NA
 5933382 5933383 MMAR_3700 MMAR_3701     TRUE 0.900 32.000 0.455 0.050   NA
 5933383 5933384 MMAR_3701 MMAR_3702     TRUE 0.997 -3.000 0.636 0.050   NA
 5933384 5933385 MMAR_3702 MMAR_3703     TRUE 0.986 -3.000 0.200 1.000   NA
 5933386 5933387 MMAR_3704 MMAR_3705 desA1_1   FALSE 0.163 70.000 0.000 NA   NA
 5933387 5933388 MMAR_3705 MMAR_3706   mbtI FALSE 0.014 201.000 0.000 NA   NA
 5933389 5933390 MMAR_3707 MMAR_3708     FALSE 0.005 290.000 0.000 NA   NA
 5933392 5933393 MMAR_3710 MMAR_3711 nirA_2 cysH TRUE 0.969 -3.000 0.041 1.000 N NA
 5933393 5933394 MMAR_3711 MMAR_3712 cysH   TRUE 0.971 -3.000 0.010 1.000   NA
 5933394 5933395 MMAR_3712 MMAR_3713   ggtB TRUE 0.763 15.000 0.069 1.000   NA
 5933395 5933396 MMAR_3713 MMAR_3714 ggtB   FALSE 0.224 92.000 0.029 NA   NA
 5933397 5933398 MMAR_3715 MMAR_3716 cysA1 cysW TRUE 0.996 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5933398 5933399 MMAR_3716 MMAR_3717 cysW cysT TRUE 0.993 -3.000 0.177 0.000 N NA
 5933399 5933400 MMAR_3717 MMAR_3718 cysT subI TRUE 0.993 -3.000 0.188 0.001 N NA
 5933400 5933401 MMAR_3718 MMAR_3719 subI   FALSE 0.004 350.000 0.000 NA   NA
 5933402 5933403 MMAR_3720 MMAR_3721     FALSE 0.132 71.000 0.000 1.000 N NA
 5933404 5933405 MMAR_3722 MMAR_3723 lppR lppR_1 TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5933405 5933406 MMAR_3723 MMAR_3724 lppR_1 lepA TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5933409 5933410 MMAR_3727 MMAR_3728     FALSE 0.027 163.000 0.000 NA   NA
 5933410 5933411 MMAR_3728 MMAR_3729     FALSE 0.108 104.000 0.000 NA   NA
 5933412 5933413 MMAR_3730 MMAR_3731     TRUE 0.939 0.000 0.089 NA   NA
 5933413 5933414 MMAR_3731 MMAR_3732     TRUE 0.925 0.000 0.044 NA   NA
 5933416 5933417 MMAR_3734 MMAR_3735 holA comEC TRUE 0.793 13.000 0.163 NA   NA
 5933417 5933418 MMAR_3735 MMAR_3736 comEC comEA TRUE 0.730 18.000 0.130 NA   NA
 5933419 5933420 MMAR_3737 MMAR_3738 fadE17_1 fadE18_2 TRUE 0.991 8.000 0.444 0.014 Y NA
 5933420 5933421 MMAR_3738 MMAR_3739 fadE18_2   FALSE 0.007 256.000 0.000 NA   NA
 5933423 5933424 MMAR_3741 MMAR_3742     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5933424 5933425 MMAR_3742 MMAR_3743   mmpS5_1 FALSE 0.004 316.000 0.000 NA   NA
 5933425 5933426 MMAR_3743 MMAR_3744 mmpS5_1 mmpL4_1 TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 5933427 5933428 MMAR_3745 MMAR_3746     TRUE 0.959 4.000 0.484 NA   NA
 5933428 5933429 MMAR_3746 MMAR_3747   gpm_1 TRUE 0.986 -10.000 0.245 1.000   NA
 5933429 5933430 MMAR_3747 MMAR_3748 gpm_1   TRUE 0.973 -3.000 0.045 NA   NA
 5933430 5933431 MMAR_3748 MMAR_3749   nadD TRUE 0.985 -3.000 0.221 NA   NA
 5933433 5933434 MMAR_3751 MMAR_3752     TRUE 0.955 14.000 0.862 NA   NA
 5933434 5933435 MMAR_3752 MMAR_3753   proA FALSE 0.544 34.000 0.019 1.000   NA
 5933435 5933436 MMAR_3753 MMAR_3754 proA   FALSE 0.110 92.000 0.000 1.000 N NA
 5933436 5933437 MMAR_3754 MMAR_3755     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.034 N NA
 5933437 5933438 MMAR_3755 MMAR_3756     FALSE 0.066 166.000 0.000 0.034 N NA
 5933438 5933439 MMAR_3756 MMAR_3757     TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.034 N NA
 5933445 5933446 MMAR_3763 MMAR_3764   proB FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 5933446 5933447 MMAR_3764 MMAR_3765 proB obg TRUE 0.962 0.000 0.206 1.000   NA
 5933447 5933448 MMAR_3765 MMAR_3766 obg rpmA FALSE 0.468 104.000 0.335 1.000   NA
 5933448 5933449 MMAR_3766 MMAR_3767 rpmA rplU TRUE 0.988 18.000 0.667 0.009 Y NA
 5933449 5933450 MMAR_3767 MMAR_3768 rplU rne FALSE 0.132 273.000 0.027 0.008 Y NA
 5933450 5933451 MMAR_3768 MMAR_3769 rne ndkA FALSE 0.003 327.000 0.000 1.000 N NA
 5933451 5933452 MMAR_3769 MMAR_3770 ndkA   FALSE 0.257 64.000 0.014 NA   NA
 5933452 5933453 MMAR_3770 MMAR_3771   folC TRUE 0.983 -3.000 0.188 NA   NA
 5933453 5933454 MMAR_3771 MMAR_3772 folC valS TRUE 0.991 -3.000 0.208 0.058 N NA
 5933454 5933455 MMAR_3772 MMAR_3773 valS   FALSE 0.199 75.000 0.000 1.000   NA
 5933455 5933456 MMAR_3773 MMAR_3774     FALSE 0.147 78.000 0.000 NA   NA
 5933456 5933457 MMAR_3774 MMAR_3775     FALSE 0.202 108.000 0.051 NA   NA
 5933457 5933458 MMAR_3775 MMAR_3776   rpfE FALSE 0.133 167.000 0.333 NA   NA
 5933460 5933461 MMAR_3778 MMAR_3779     FALSE 0.046 110.000 0.000 NA N NA
 5933461 5933462 MMAR_3779 MMAR_3780     FALSE 0.025 423.000 0.000 NA Y NA
 5933466 5933467 MMAR_3784 MMAR_3785     TRUE 0.936 30.000 0.667 0.034   NA
 5933468 5933469 MMAR_3786 MMAR_3787     FALSE 0.546 13.000 0.000 NA   NA
 5933469 5933470 MMAR_3787 MMAR_3788     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933471 5933472 MMAR_3790 MMAR_3791     FALSE 0.003 386.000 0.000 NA   NA
 5933474 5933475 MMAR_3793 MMAR_3794     FALSE 0.160 99.000 0.000 1.000   NA
 5933475 5933476 MMAR_3794 MMAR_3795     FALSE 0.006 262.000 0.000 1.000 N NA
 5933477 5933478 MMAR_3796 MMAR_3797     TRUE 0.951 16.000 0.000 0.007 Y NA
 5933478 5933479 MMAR_3797 MMAR_3798     TRUE 0.907 38.000 0.000 0.007 Y NA
 5933479 5933480 MMAR_3798 MMAR_3799     TRUE 0.998 -10.000 0.286 0.007 Y NA
 5933480 5933481 MMAR_3799 MMAR_3800     FALSE 0.246 25.000 0.000 NA N NA
 5933482 5933483 MMAR_3801 MMAR_3802 mobA porB TRUE 0.884 2.000 0.053 1.000 N NA
 5933483 5933484 MMAR_3802 MMAR_3803 porB porA TRUE 0.976 49.000 0.832 0.000 Y NA
 5933484 5933485 MMAR_3803 MMAR_3804 porA   FALSE 0.002 333.000 0.000 NA N NA
 5933485 5933486 MMAR_3804 MMAR_3805   clpX FALSE 0.559 10.000 0.002 NA N NA
 5933488 5933489 MMAR_3807 MMAR_3808 clpP2 clpP1 TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.000 Y NA
 5933489 5933490 MMAR_3808 MMAR_3809 clpP1 tig FALSE 0.503 123.000 0.018 1.000 Y NA
 5933490 5933491 MMAR_3809 MMAR_5511 tig proU FALSE 0.336 37.000 0.000 NA   NA
 5933492 5933493 MMAR_5512 MMAR_3810 glyV lipP FALSE 0.374 31.000 0.000 NA   NA
 5933494 5933495 MMAR_3811 MMAR_3812     FALSE 0.062 128.000 0.000 NA   NA
 5933495 5933496 MMAR_3812 MMAR_3813   rpiB TRUE 0.921 9.000 0.398 1.000 N NA
 5933496 5933497 MMAR_3813 MMAR_3814 rpiB dctA FALSE 0.115 86.000 0.000 1.000 N NA
 5933497 5933498 MMAR_3814 MMAR_3815 dctA   FALSE 0.077 132.000 0.000 1.000   NA
 5933498 5933499 MMAR_3815 MMAR_3816     FALSE 0.115 101.000 0.000 NA   NA
 5933501 5933502 MMAR_3818 MMAR_3819     TRUE 0.983 -49.000 0.265 NA   NA
 5933502 5933503 MMAR_3819 MMAR_3820     FALSE 0.324 93.000 0.157 NA   NA
 5933504 5933505 MMAR_3821 MMAR_3822 glbO aglA TRUE 0.943 0.000 0.055 1.000   NA
 5933505 5933506 MMAR_3822 MMAR_3823 aglA plcB_1 FALSE 0.009 213.000 0.000 1.000 N NA
 5933507 5933508 MMAR_3824 MMAR_3825 choD_1   FALSE 0.186 84.000 0.000 1.000   NA
 5933508 5933509 MMAR_3825 MMAR_3826   moeY_1 TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5933509 5933510 MMAR_3826 MMAR_3827 moeY_1   FALSE 0.002 512.000 0.000 NA   NA
 5933510 5933511 MMAR_3827 MMAR_3828     TRUE 0.990 -3.000 0.305 NA   NA
 5933511 5933512 MMAR_3828 MMAR_3829   gdh TRUE 0.981 -3.000 0.153 NA   NA
 5933512 5933513 MMAR_3829 MMAR_3830 gdh   FALSE 0.059 161.000 0.018 1.000   NA
 5933513 5933514 MMAR_3830 MMAR_3831     FALSE 0.362 68.000 0.053 1.000   NA
 5933516 5933517 MMAR_3833 MMAR_3834 plsB2 plsC TRUE 0.997 -3.000 0.044 0.090 Y NA
 5933517 5933518 MMAR_3834 MMAR_3835 plsC   TRUE 0.973 -3.000 0.044 NA   NA
 5933518 5933519 MMAR_3835 MMAR_3836   lipQ FALSE 0.040 233.000 0.250 NA   NA
 5933520 5933521 MMAR_5513 MMAR_3837 argW   FALSE 0.008 244.000 0.000 NA   NA
 5933522 5933523 MMAR_5558 MMAR_3838   cobQ1 FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 5933524 5933525 MMAR_3839 MMAR_3840     FALSE 0.004 312.000 0.000 NA   NA
 5933526 5933527 MMAR_3841 MMAR_3842 mmaA5 pdhC FALSE 0.003 319.000 0.000 1.000 N NA
 5933527 5933528 MMAR_3842 MMAR_3843 pdhC pdhB TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.090 Y NA
 5933528 5933529 MMAR_3843 MMAR_3844 pdhB pdhA TRUE 0.995 11.000 1.000 0.002 Y NA
 5933529 5933530 MMAR_3844 MMAR_3845 pdhA citE FALSE 0.009 341.000 0.083 1.000 N NA
 5933530 5933531 MMAR_3845 MMAR_3846 citE   TRUE 0.989 -3.000 0.326 1.000 N NA
 5933531 5933532 MMAR_3846 MMAR_3847   fadE19 TRUE 0.997 -3.000 0.117 1.000 Y NA
 5933532 5933533 MMAR_3847 MMAR_3848 fadE19 accA1 TRUE 0.975 7.000 0.190 1.000 Y NA
 5933533 5933534 MMAR_3848 MMAR_3849 accA1 accD1 TRUE 0.979 4.000 0.136 1.000 Y NA
 5933534 5933535 MMAR_3849 MMAR_3850 accD1 scoB TRUE 0.995 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 5933535 5933536 MMAR_3850 MMAR_3851 scoB scoA TRUE 0.910 103.000 0.538 0.000 Y NA
 5933536 5933537 MMAR_3851 MMAR_3852 scoA fadD35 TRUE 0.647 121.000 0.054 0.090 Y NA
 5933538 5933539 MMAR_3853 MMAR_3854     FALSE 0.030 231.000 0.167 NA   NA
 5933541 5933542 MMAR_3856 MMAR_3857     FALSE 0.137 106.000 0.000 1.000   NA
 5933544 5933545 MMAR_3859 MMAR_5514 orn hisT FALSE 0.231 50.000 0.000 NA   NA
 5933546 5933547 MMAR_3860 MMAR_3861     FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 5933548 5933549 MMAR_3862 MMAR_3863 yrbE5A   TRUE 0.994 2.000 0.667 NA Y NA
 5933549 5933550 MMAR_3863 MMAR_3864   mce5A TRUE 0.957 24.000 0.400 NA Y NA
 5933550 5933551 MMAR_3864 MMAR_3865 mce5A mce5B TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5933551 5933552 MMAR_3865 MMAR_3866 mce5B mce5C TRUE 0.999 -7.000 0.333 0.008 Y NA
 5933552 5933553 MMAR_3866 MMAR_3867 mce5C mce5D TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.008 Y NA
 5933553 5933554 MMAR_3867 MMAR_3868 mce5D mce5E TRUE 0.998 0.000 1.000 NA Y NA
 5933554 5933555 MMAR_3868 MMAR_3869 mce5E mce5F TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA Y NA
 5933555 5933556 MMAR_3869 MMAR_3870 mce5F   FALSE 0.397 28.000 0.000 NA   NA
 5933556 5933557 MMAR_3870 MMAR_3871     FALSE 0.469 19.000 0.000 NA   NA
 5933559 5933560 MMAR_5557 MMAR_5515   lysU FALSE 0.173 65.000 0.000 NA   NA
 5933560 5933561 MMAR_5515 MMAR_3873 lysU   FALSE 0.011 218.000 0.000 NA   NA
 5933561 5933562 MMAR_3873 MMAR_3874     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933562 5933563 MMAR_3874 MMAR_3875     FALSE 0.478 18.000 0.000 NA   NA
 5933564 5933565 MMAR_3876 MMAR_3877     FALSE 0.486 17.000 0.000 NA   NA
 5933565 5933566 MMAR_3877 MMAR_3878     FALSE 0.004 339.000 0.000 NA   NA
 5933566 5933567 MMAR_3878 MMAR_3879     FALSE 0.016 212.000 0.000 1.000   NA
 5933567 5933568 MMAR_3879 MMAR_3880     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5933568 5933569 MMAR_3880 MMAR_3881     FALSE 0.004 318.000 0.000 NA   NA
 5933569 5933570 MMAR_3881 MMAR_3882     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5933570 5933571 MMAR_3882 MMAR_3883     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933571 5933572 MMAR_3883 MMAR_3884     FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 5933572 5933573 MMAR_3884 MMAR_3885     FALSE 0.144 80.000 0.000 NA   NA
 5933573 5933574 MMAR_3885 MMAR_3886     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5933574 5933575 MMAR_3886 MMAR_3887     FALSE 0.005 287.000 0.000 NA   NA
 5933575 5933576 MMAR_3887 MMAR_3888     FALSE 0.314 40.000 0.000 NA   NA
 5933576 5933577 MMAR_3888 MMAR_3889     TRUE 0.808 1.000 0.000 NA   NA
 5933577 5933578 MMAR_3889 MMAR_3890     FALSE 0.458 20.000 0.000 NA   NA
 5933578 5933579 MMAR_3890 MMAR_3891     FALSE 0.367 32.000 0.000 NA   NA
 5933579 5933580 MMAR_3891 MMAR_3892     TRUE 0.684 6.000 0.000 NA   NA
 5933580 5933581 MMAR_3892 MMAR_3893     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5933581 5933582 MMAR_3893 MMAR_3894     TRUE 0.667 7.000 0.000 NA   NA
 5933582 5933583 MMAR_3894 MMAR_3895     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933583 5933584 MMAR_3895 MMAR_3896     FALSE 0.426 24.000 0.000 NA   NA
 5933584 5933585 MMAR_3896 MMAR_3897     FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5933585 5933586 MMAR_3897 MMAR_3898     FALSE 0.478 18.000 0.000 NA   NA
 5933586 5933587 MMAR_3898 MMAR_3899     FALSE 0.112 102.000 0.000 NA   NA
 5933587 5933588 MMAR_3899 MMAR_3900     TRUE 0.985 -16.000 0.273 NA   NA
 5933588 5933589 MMAR_3900 MMAR_3901     TRUE 0.792 14.000 0.182 NA   NA
 5933589 5933590 MMAR_3901 MMAR_3902     TRUE 0.956 7.000 0.571 NA   NA
 5933590 5933591 MMAR_3902 MMAR_3903     FALSE 0.009 234.000 0.000 NA   NA
 5933591 5933592 MMAR_3903 MMAR_3904     FALSE 0.367 32.000 0.000 NA   NA
 5933592 5933593 MMAR_3904 MMAR_3905     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5933593 5933594 MMAR_3905 MMAR_3906     FALSE 0.407 26.000 0.000 NA   NA
 5933596 5933597 MMAR_3909 MMAR_3910     FALSE 0.458 20.000 0.000 NA   NA
 5933597 5933598 MMAR_3910 MMAR_3911     FALSE 0.380 30.000 0.000 NA   NA
 5933598 5933599 MMAR_3911 MMAR_3912     FALSE 0.001 1256.000 0.000 NA   NA
 5933599 5933600 MMAR_3912 MMAR_3913     FALSE 0.002 643.000 0.000 NA   NA
 5933600 5933601 MMAR_3913 MMAR_3914     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933601 5933602 MMAR_3914 MMAR_3915     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933602 5933603 MMAR_3915 MMAR_3916     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5933603 5933604 MMAR_3916 MMAR_3917     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5933604 5933605 MMAR_3917 MMAR_3919     FALSE 0.004 318.000 0.000 NA   NA
 5933605 5933606 MMAR_3919 MMAR_3921     FALSE 0.003 383.000 0.000 NA   NA
 5933606 5933607 MMAR_3921 MMAR_3923     FALSE 0.066 182.000 0.000 0.033   NA
 5933607 5933608 MMAR_3923 MMAR_3924     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933608 5933609 MMAR_3924 MMAR_3925     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5933609 5933610 MMAR_3925 MMAR_3926   dnaN_1 TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5933610 5933611 MMAR_3926 MMAR_3927 dnaN_1   FALSE 0.013 209.000 0.000 NA   NA
 5933611 5933612 MMAR_3927 MMAR_3928     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933612 5933613 MMAR_3928 MMAR_3929     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933613 5933614 MMAR_3929 MMAR_3930     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933614 5933615 MMAR_3930 MMAR_3931     FALSE 0.030 158.000 0.000 NA   NA
 5933615 5933616 MMAR_3931 MMAR_3932     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933616 5933617 MMAR_3932 MMAR_3933     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5933617 5933618 MMAR_3933 MMAR_3934     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933618 5933619 MMAR_3934 MMAR_3935     FALSE 0.177 63.000 0.000 NA   NA
 5933619 5933620 MMAR_3935 MMAR_3936     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933620 5933621 MMAR_3936 MMAR_3937     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933621 5933622 MMAR_3937 MMAR_3938     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933622 5933623 MMAR_3938 MMAR_3939     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933623 5933624 MMAR_3939 MMAR_3940     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933624 5933625 MMAR_3940 MMAR_3941     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933625 5933626 MMAR_3941 MMAR_3942     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933626 5933627 MMAR_3942 MMAR_3943     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933627 5933628 MMAR_3943 MMAR_3944     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933628 5933629 MMAR_3944 MMAR_3945     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933630 5933631 MMAR_3946 MMAR_3947     FALSE 0.010 222.000 0.000 NA   NA
 5933634 5933635 MMAR_3950 MMAR_3951     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933635 5933636 MMAR_3951 MMAR_3952     FALSE 0.015 194.000 0.000 NA   NA
 5933637 5933638 MMAR_3953 MMAR_3954     FALSE 0.016 193.000 0.000 NA   NA
 5933642 5933643 MMAR_3958 MMAR_3959     TRUE 0.999 -3.000 0.906 1.000 Y NA
 5933643 5933644 MMAR_3959 MMAR_3960     FALSE 0.379 62.000 0.103 NA   NA
 5933645 5933646 MMAR_3961 MMAR_3962 acpS fas TRUE 0.955 29.000 0.138 0.002 Y NA
 5933646 5933647 MMAR_3962 MMAR_3963 fas   FALSE 0.002 512.000 0.000 NA   NA
 5933648 5933649 MMAR_3964 MMAR_3965     FALSE 0.053 126.000 0.000 1.000 N NA
 5933650 5933651 MMAR_3966 MMAR_3967 maoC   TRUE 0.987 -3.000 0.250 NA   NA
 5933651 5933652 MMAR_3967 MMAR_3968     TRUE 0.907 6.000 0.250 NA   NA
 5933653 5933654 MMAR_3969 MMAR_3970 cyp269A1   FALSE 0.323 31.000 0.000 1.000 N NA
 5933655 5933656 MMAR_3971 MMAR_3972     FALSE 0.006 282.000 0.000 NA   NA
 5933656 5933657 MMAR_3972 MMAR_3973   fdxD_1 FALSE 0.001 1053.000 0.000 1.000 N NA
 5933657 5933658 MMAR_3973 MMAR_3974 fdxD_1   TRUE 0.973 18.000 0.500 1.000 Y NA
 5933659 5933660 MMAR_3975 MMAR_3976   cyp138A4 FALSE 0.001 672.000 0.000 1.000 N NA
 5933660 5933661 MMAR_3976 MMAR_3977 cyp138A4   FALSE 0.180 90.000 0.000 1.000   NA
 5933663 5933664 MMAR_3979 MMAR_3980     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.014 Y NA
 5933664 5933665 MMAR_3980 MMAR_3981   fadE17_2 TRUE 0.988 4.000 0.182 0.014 Y NA
 5933665 5933666 MMAR_3981 MMAR_3982 fadE17_2   TRUE 0.997 -3.000 0.636 0.063   NA
 5933666 5933667 MMAR_3982 MMAR_3983     TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5933667 5933668 MMAR_3983 MMAR_3984     FALSE 0.013 205.000 0.000 NA   NA
 5933668 5933669 MMAR_3984 MMAR_3985     FALSE 0.005 301.000 0.000 NA   NA
 5933669 5933670 MMAR_3985 MMAR_3986     FALSE 0.011 220.000 0.000 NA   NA
 5933670 5933671 MMAR_3986 MMAR_3987     FALSE 0.024 167.000 0.000 NA   NA
 5933671 5933672 MMAR_3987 MMAR_3988     TRUE 0.819 72.000 1.000 1.000   NA
 5933673 5933674 MMAR_3989 MMAR_3990     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933676 5933677 MMAR_3992 MMAR_3993     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.014 Y NA
 5933678 5933679 MMAR_3994 MMAR_3995     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933679 5933680 MMAR_3995 MMAR_3996   cyp187A4 FALSE 0.006 284.000 0.000 NA   NA
 5933680 5933681 MMAR_3996 MMAR_3997 cyp187A4 adhB_1 TRUE 0.997 -3.000 1.000 1.000 N NA
 5933682 5933683 MMAR_3998 MMAR_3999   cyp108B4 FALSE 0.219 106.000 0.095 1.000 N NA
 5933685 5933686 MMAR_4001 MMAR_4002     FALSE 0.449 21.000 0.000 NA   NA
 5933686 5933687 MMAR_4002 MMAR_4003     FALSE 0.027 163.000 0.000 NA   NA
 5933687 5933688 MMAR_4003 MMAR_4004     TRUE 0.996 -3.000 0.714 NA   NA
 5933688 5933689 MMAR_4004 MMAR_4005     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933690 5933691 MMAR_4006 MMAR_4007   fadD19_2 FALSE 0.497 88.000 0.333 NA   NA
 5933691 5933692 MMAR_4007 MMAR_4008 fadD19_2 cyp187A5 TRUE 0.651 79.000 0.000 1.000 Y NA
 5933692 5933693 MMAR_4008 MMAR_4009 cyp187A5   TRUE 0.908 9.000 0.333 1.000 N NA
 5933694 5933695 MMAR_4010 MMAR_4011     TRUE 0.991 15.000 0.857 0.014 Y NA
 5933695 5933696 MMAR_4011 MMAR_4012     TRUE 0.997 -3.000 0.857 1.000   NA
 5933696 5933697 MMAR_4012 MMAR_4013     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.036   NA
 5933697 5933698 MMAR_4013 MMAR_4014     TRUE 0.973 14.000 0.857 0.036   NA
 5933698 5933699 MMAR_4014 MMAR_4015   echA12_1 TRUE 0.951 29.000 0.857 0.089   NA
 5933699 5933700 MMAR_4015 MMAR_4016 echA12_1   FALSE 0.002 543.000 0.000 NA   NA
 5933700 5933701 MMAR_4016 MMAR_4017     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933702 5933703 MMAR_4018 MMAR_4019     FALSE 0.003 405.000 0.000 NA   NA
 5933704 5933705 MMAR_4020 MMAR_4021 echA4_2   TRUE 0.993 -3.000 0.429 NA   NA
 5933706 5933707 MMAR_4022 MMAR_4023 echA10_1 echA11_1 TRUE 0.996 3.000 0.750 0.088 Y NA
 5933707 5933708 MMAR_4023 MMAR_4024 echA11_1 echA16_1 TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.036 Y NA
 5933708 5933709 MMAR_4024 MMAR_4025 echA16_1   TRUE 0.998 0.000 0.857 0.036 Y NA
 5933709 5933710 MMAR_4025 MMAR_4026   fadD35_1 TRUE 0.999 -10.000 1.000 0.036 Y NA
 5933710 5933711 MMAR_4026 MMAR_4027 fadD35_1   TRUE 0.999 -7.000 1.000 0.036 Y NA
 5933712 5933713 MMAR_4028 MMAR_4029     FALSE 0.014 201.000 0.000 NA   NA
 5933713 5933714 MMAR_4029 MMAR_4030     TRUE 0.784 14.000 0.194 1.000 N NA
 5933714 5933715 MMAR_4030 MMAR_4031     TRUE 0.966 -3.000 0.034 1.000 N NA
 5933715 5933716 MMAR_4031 MMAR_4032     TRUE 0.841 3.000 0.034 1.000 N NA
 5933716 5933717 MMAR_4032 MMAR_4033   fab TRUE 0.998 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 5933719 5933720 MMAR_4035 MMAR_4036     FALSE 0.382 54.000 0.057 NA   NA
 5933720 5933721 MMAR_4036 MMAR_4037     TRUE 0.999 -3.000 0.686 0.003 Y NA
 5933721 5933722 MMAR_4037 MMAR_5516   leuW FALSE 0.002 501.000 0.000 NA   NA
 5933723 5933724 MMAR_4038 MMAR_4039 lprD   TRUE 0.989 -3.000 0.286 NA   NA
 5933725 5933726 MMAR_4040 MMAR_4041     FALSE 0.031 156.000 0.000 NA   NA
 5933726 5933727 MMAR_4041 MMAR_4042   rphA FALSE 0.006 281.000 0.000 NA   NA
 5933727 5933728 MMAR_4042 MMAR_4043 rphA   FALSE 0.449 51.000 0.053 1.000   NA
 5933728 5933729 MMAR_4043 MMAR_4044     TRUE 0.684 6.000 0.000 NA   NA
 5933732 5933733 MMAR_4047 MMAR_4048     FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 5933733 5933734 MMAR_4048 MMAR_4049   yrbE3A_1 FALSE 0.002 763.000 0.000 NA   NA
 5933734 5933735 MMAR_4049 MMAR_4050 yrbE3A_1 yrbE3B_1 TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5933735 5933736 MMAR_4050 MMAR_4051 yrbE3B_1 mce3A_1 TRUE 0.994 5.000 1.000 NA Y NA
 5933736 5933737 MMAR_4051 MMAR_4052 mce3A_1 mce3B_1 TRUE 0.944 80.000 0.750 0.008 Y NA
 5933737 5933738 MMAR_4052 MMAR_4053 mce3B_1 mce3C_1 TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.008 Y NA
 5933738 5933739 MMAR_4053 MMAR_4054 mce3C_1 mce3D_1 TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.008 Y NA
 5933739 5933740 MMAR_4054 MMAR_4055 mce3D_1 lprM_1 TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.008 Y NA
 5933740 5933741 MMAR_4055 MMAR_4056 lprM_1 mce3F_1 TRUE 0.996 2.000 0.600 0.008 Y NA
 5933741 5933742 MMAR_4056 MMAR_4057 mce3F_1   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933743 5933744 MMAR_4058 MMAR_4059 murI   TRUE 0.974 -3.000 0.024 1.000   NA
 5933745 5933746 MMAR_4060 MMAR_4061     TRUE 0.983 1.000 0.667 NA   NA
 5933746 5933747 MMAR_4061 MMAR_4062     TRUE 0.703 5.000 0.000 NA   NA
 5933748 5933749 MMAR_4063 MMAR_4064 cfp10A   TRUE 0.683 22.000 0.093 NA   NA
 5933749 5933750 MMAR_4064 MMAR_4065   dmpA TRUE 0.889 2.000 0.044 NA   NA
 5933750 5933751 MMAR_4065 MMAR_4066 dmpA   TRUE 0.979 -3.000 0.093 NA   NA
 5933751 5933752 MMAR_4066 MMAR_4067     TRUE 0.927 25.000 0.823 NA   NA
 5933753 5933754 MMAR_4068 MMAR_4069 pncB dinG FALSE 0.552 36.000 0.080 1.000 N NA
 5933756 5933757 MMAR_4071 MMAR_4072   glgB TRUE 0.985 7.000 0.159 0.003 Y NA
 5933758 5933759 MMAR_4073 MMAR_4074     FALSE 0.029 176.000 0.000 1.000   NA
 5933759 5933760 MMAR_4074 MMAR_4075   fadA4 FALSE 0.034 178.000 0.035 1.000 N NA
 5933763 5933764 MMAR_4078 MMAR_4079     FALSE 0.458 145.000 0.000 0.003 Y NA
 5933764 5933765 MMAR_4079 MMAR_4080     FALSE 0.555 132.000 0.000 0.003 Y NA
 5933765 5933766 MMAR_4080 MMAR_4081   alkA FALSE 0.176 53.000 0.000 1.000 N NA
 5933766 5933767 MMAR_4081 MMAR_4082 alkA ogt TRUE 0.996 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 5933768 5933769 MMAR_5517 MMAR_5518 rrf rrl FALSE 0.139 87.000 0.000 NA   NA
 5933769 5933770 MMAR_5518 MMAR_5519 rrl rrs FALSE 0.006 273.000 0.000 NA   NA
 5933770 5933771 MMAR_5519 MMAR_4083 rrs murA FALSE 0.006 286.000 0.000 NA   NA
 5933773 5933774 MMAR_4085 MMAR_4086   atpC TRUE 0.813 8.000 0.054 NA   NA
 5933774 5933775 MMAR_4086 MMAR_4087 atpC atpD TRUE 0.984 37.000 0.837 0.002 Y NA
 5933775 5933776 MMAR_4087 MMAR_4088 atpD atpG TRUE 0.985 29.000 0.724 0.002 Y NA
 5933776 5933777 MMAR_4088 MMAR_4089 atpG atpA TRUE 0.991 19.000 0.846 0.002 Y NA
 5933777 5933778 MMAR_4089 MMAR_4090 atpA atpH TRUE 0.966 62.000 0.864 0.002 Y NA
 5933778 5933779 MMAR_4090 MMAR_4091 atpH atpF TRUE 0.980 7.000 0.008 0.002 Y NA
 5933779 5933780 MMAR_4091 MMAR_4092 atpF atpE TRUE 0.914 42.000 0.012 0.002 Y NA
 5933780 5933781 MMAR_4092 MMAR_4093 atpE atpB TRUE 0.925 91.000 0.557 0.002 Y NA
 5933781 5933782 MMAR_4093 MMAR_4094 atpB   TRUE 0.971 -7.000 0.021 1.000   NA
 5933782 5933783 MMAR_4094 MMAR_4095   rfe FALSE 0.011 251.000 0.000 1.000   NA
 5933783 5933784 MMAR_4095 MMAR_4096 rfe   FALSE 0.359 82.000 0.248 NA N NA
 5933784 5933785 MMAR_4096 MMAR_4097   hemK TRUE 0.916 53.000 0.583 NA Y NA
 5933785 5933786 MMAR_4097 MMAR_4098 hemK prfA TRUE 0.998 -3.000 0.069 0.022 Y NA
 5933786 5933787 MMAR_4098 MMAR_4099 prfA rpmE TRUE 0.733 88.000 0.110 1.000 Y NA
 5933787 5933788 MMAR_4099 MMAR_4100 rpmE rho FALSE 0.040 192.000 0.115 1.000 N NA
 5933788 5933789 MMAR_4100 MMAR_4101 rho thrB FALSE 0.017 267.000 0.000 0.057 N NA
 5933789 5933790 MMAR_4101 MMAR_4102 thrB thrC TRUE 0.838 56.000 0.221 1.000 Y NA
 5933790 5933791 MMAR_4102 MMAR_4103 thrC thrA TRUE 0.997 -3.000 0.194 1.000 Y NA
 5933791 5933792 MMAR_4103 MMAR_4104 thrA lysA TRUE 0.977 4.000 0.071 1.000 Y NA
 5933792 5933793 MMAR_4104 MMAR_4105 lysA argS TRUE 0.975 -3.000 0.071 1.000 N NA
 5933794 5933795 MMAR_5520 MMAR_4106 argV   FALSE 0.006 285.000 0.000 NA   NA
 5933795 5933796 MMAR_4106 MMAR_4107     FALSE 0.002 891.000 0.000 NA   NA
 5933796 5933797 MMAR_4107 MMAR_4108     TRUE 0.808 1.000 0.000 NA   NA
 5933797 5933798 MMAR_4108 MMAR_5576     TRUE 0.931 -13.000 0.000 NA   NA
 5933801 5933802 MMAR_4111 MMAR_4112     FALSE 0.171 66.000 0.000 NA   NA
 5933802 5933803 MMAR_4112 MMAR_4113   dhaA TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5933803 5933804 MMAR_4113 MMAR_5521 dhaA   FALSE 0.285 51.000 0.000 1.000   NA
 5933806 5933807 MMAR_4116 MMAR_4117     FALSE 0.058 131.000 0.000 NA   NA
 5933808 5933809 MMAR_4118 MMAR_4119     TRUE 0.923 -115.000 0.000 NA   NA
 5933809 5933810 MMAR_4119 MMAR_4120     FALSE 0.015 198.000 0.000 NA   NA
 5933810 5933811 MMAR_4120 MMAR_4121     FALSE 0.025 166.000 0.000 NA   NA
 5933811 5933812 MMAR_4121 MMAR_4122     FALSE 0.009 232.000 0.000 NA   NA
 5933813 5933814 MMAR_4123 MMAR_4124     FALSE 0.132 93.000 0.000 NA   NA
 5933814 5933815 MMAR_4124 MMAR_4125     FALSE 0.065 151.000 0.034 NA   NA
 5933817 5933818 MMAR_4127 MMAR_4128     FALSE 0.123 98.000 0.000 NA   NA
 5933819 5933820 MMAR_4129 MMAR_4130 gloA_2   FALSE 0.239 93.000 0.040 NA   NA
 5933821 5933822 MMAR_4131 MMAR_4132   cysN FALSE 0.216 94.000 0.073 NA N NA
 5933822 5933823 MMAR_4132 MMAR_4133 cysN cysD TRUE 0.990 0.000 0.483 0.001 N NA
 5933826 5933827 MMAR_4136 MMAR_4137 oppB oppC TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.010 Y NA
 5933827 5933828 MMAR_4137 MMAR_4138 oppC oppD TRUE 0.998 -3.000 0.303 1.000 Y NA
 5933828 5933829 MMAR_4138 MMAR_4139 oppD oppA TRUE 0.997 -10.000 0.242 1.000 Y NA
 5933830 5933831 MMAR_4140 MMAR_4141     FALSE 0.136 90.000 0.000 NA   NA
 5933831 5933832 MMAR_4141 MMAR_4142     FALSE 0.240 50.000 0.017 NA N NA
 5933832 5933833 MMAR_4142 MMAR_4143   sbcD TRUE 0.998 -3.000 0.312 NA Y NA
 5933835 5933836 MMAR_4145 MMAR_4146 lprC lprB TRUE 0.996 -3.000 0.692 NA   NA
 5933837 5933838 MMAR_4147 MMAR_4148     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.003 Y NA
 5933840 5933841 MMAR_4150 MMAR_4151     FALSE 0.009 232.000 0.000 NA   NA
 5933841 5933842 MMAR_4151 MMAR_4152   lprA FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 5933842 5933843 MMAR_4152 MMAR_4153 lprA   TRUE 0.688 84.000 0.667 NA   NA
 5933843 5933844 MMAR_4153 MMAR_4154     FALSE 0.041 144.000 0.000 NA   NA
 5933844 5933845 MMAR_4154 MMAR_4155   embR FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 5933845 5933846 MMAR_4155 MMAR_4156 embR pknH FALSE 0.037 353.000 0.000 1.000 Y NA
 5933848 5933849 MMAR_4158 MMAR_4159 citE_1   TRUE 0.917 -12.000 0.000 1.000 N NA
 5933849 5933850 MMAR_4159 MMAR_4160     TRUE 0.977 0.000 0.417 1.000 N NA
 5933850 5933851 MMAR_4160 MMAR_4161   fadE3 FALSE 0.422 18.000 0.000 1.000 N NA
 5933852 5933853 MMAR_4162 MMAR_4163 gdpD   FALSE 0.013 193.000 0.000 1.000 N NA
 5933856 5933857 MMAR_4166 MMAR_4167 espA   TRUE 0.830 61.000 1.000 NA   NA
 5933857 5933858 MMAR_4167 MMAR_4168     TRUE 0.961 14.000 1.000 NA   NA
 5933858 5933859 MMAR_4168 MMAR_4169   pknH_1 FALSE 0.019 182.000 0.000 NA   NA
 5933859 5933860 MMAR_4169 MMAR_4170 pknH_1   FALSE 0.480 46.000 0.000 0.056 N NA
 5933860 5933861 MMAR_4170 MMAR_4171     FALSE 0.006 435.000 0.000 0.056 N NA
 5933862 5933863 MMAR_4172 MMAR_4173     FALSE 0.005 291.000 0.000 NA   NA
 5933864 5933865 MMAR_4174 MMAR_4175 pknF   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933867 5933868 MMAR_4177 MMAR_4178     TRUE 0.810 11.000 0.136 NA   NA
 5933869 5933870 MMAR_4179 MMAR_4180     TRUE 0.849 47.000 0.154 NA Y NA
 5933870 5933871 MMAR_4180 MMAR_4181     TRUE 0.733 4.000 0.016 NA N NA
 5933872 5933873 MMAR_4182 MMAR_4183     FALSE 0.421 58.000 0.143 NA   NA
 5933873 5933874 MMAR_4183 MMAR_4184   cyp130A4 FALSE 0.106 206.000 0.500 1.000 N NA
 5933874 5933875 MMAR_4184 MMAR_4185 cyp130A4   TRUE 0.991 0.000 0.833 1.000   NA
 5933875 5933876 MMAR_4185 MMAR_4186     FALSE 0.002 516.000 0.000 NA   NA
 5933879 5933880 MMAR_4188 MMAR_4189   deaD TRUE 0.955 -3.000 0.006 1.000 N NA
 5933881 5933882 MMAR_4190 MMAR_4191 lprE   FALSE 0.351 74.000 0.133 NA   NA
 5933884 5933885 MMAR_4193 MMAR_4194   kgd FALSE 0.043 163.000 0.013 NA   NA
 5933885 5933886 MMAR_4194 MMAR_4195 kgd   FALSE 0.042 157.000 0.000 1.000   NA
 5933887 5933888 MMAR_4196 MMAR_4197 lpqZ mez_1 TRUE 0.751 12.000 0.073 1.000 N NA
 5933888 5933889 MMAR_4197 MMAR_4198 mez_1 mdh FALSE 0.436 159.000 0.009 0.001 Y NA
 5933891 5933892 MMAR_4200 MMAR_4201 fgd2 gabP_1 FALSE 0.007 242.000 0.000 1.000 N NA
 5933892 5933893 MMAR_4201 MMAR_4202 gabP_1   FALSE 0.006 282.000 0.000 NA   NA
 5933893 5933894 MMAR_4202 MMAR_4203   sugC TRUE 0.982 -3.000 0.167 NA   NA
 5933894 5933895 MMAR_4203 MMAR_4204 sugC sugB TRUE 0.987 5.000 0.191 0.010 Y NA
 5933895 5933896 MMAR_4204 MMAR_4205 sugB sugA TRUE 0.993 11.000 0.723 0.010 Y NA
 5933896 5933897 MMAR_4205 MMAR_4206 sugA lpqY TRUE 0.998 -3.000 0.252 0.010 Y NA
 5933897 5933898 MMAR_4206 MMAR_4207 lpqY   TRUE 0.845 11.000 0.211 NA   NA
 5933899 5933900 MMAR_4208 MMAR_4209     FALSE 0.205 100.000 0.032 NA   NA
 5933900 5933901 MMAR_4209 MMAR_4210     TRUE 0.997 -3.000 0.806 NA   NA
 5933901 5933902 MMAR_4210 MMAR_4211     FALSE 0.203 119.000 0.139 NA   NA
 5933902 5933903 MMAR_4211 MMAR_4212   mrp FALSE 0.401 52.000 0.089 1.000 N NA
 5933904 5933905 MMAR_4213 MMAR_4214 tatB htrA TRUE 0.692 27.000 0.242 NA N NA
 5933905 5933906 MMAR_4214 MMAR_4215 htrA   FALSE 0.215 172.000 0.607 NA   NA
 5933906 5933907 MMAR_4215 MMAR_4216   sigE FALSE 0.138 146.000 0.224 NA   NA
 5933910 5933911 MMAR_4219 MMAR_4220     TRUE 0.989 -10.000 0.375 1.000 N NA
 5933911 5933912 MMAR_4220 MMAR_4221     TRUE 0.978 -3.000 0.185 NA N NA
 5933912 5933913 MMAR_4221 MMAR_4222     FALSE 0.566 29.000 0.111 NA N NA
 5933913 5933914 MMAR_4222 MMAR_4223     FALSE 0.011 213.000 0.000 NA   NA
 5933914 5933915 MMAR_4223 MMAR_4224     FALSE 0.008 244.000 0.000 NA   NA
 5933918 5933919 MMAR_4227 MMAR_4228   tagA TRUE 0.967 -3.000 0.021 NA   NA
 5933919 5933920 MMAR_4228 MMAR_4229 tagA   TRUE 0.965 -3.000 0.013 NA   NA
 5933920 5933921 MMAR_4229 MMAR_4230     FALSE 0.410 49.000 0.045 NA   NA
 5933921 5933922 MMAR_4230 MMAR_4231   folP2 TRUE 0.981 -3.000 0.136 NA   NA
 5933922 5933923 MMAR_4231 MMAR_4232 folP2 fadD6 FALSE 0.320 90.000 0.172 1.000 N NA
 5933923 5933924 MMAR_4232 MMAR_4233 fadD6   FALSE 0.528 71.000 0.324 NA   NA
 5933928 5933929 MMAR_4237 MMAR_4238     FALSE 0.001 885.000 0.000 1.000 N NA
 5933931 5933932 MMAR_4240 MMAR_4241     TRUE 0.909 40.000 1.000 NA   NA
 5933934 5933935 MMAR_4243 MMAR_4244 fadD36   FALSE 0.273 45.000 0.000 NA   NA
 5933935 5933936 MMAR_4244 MMAR_4245     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5933936 5933937 MMAR_4245 MMAR_4246   aldA_1 FALSE 0.019 182.000 0.000 NA   NA
 5933938 5933939 MMAR_4247 MMAR_4248     TRUE 0.992 0.000 1.000 NA   NA
 5933939 5933940 MMAR_4248 MMAR_4249     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5933940 5933941 MMAR_4249 MMAR_4250   ltp2 TRUE 0.987 -3.000 0.250 NA   NA
 5933941 5933942 MMAR_4250 MMAR_4251 ltp2   TRUE 0.867 8.000 0.250 NA N NA
 5933943 5933944 MMAR_4252 MMAR_4253 putA rocA TRUE 0.945 0.000 0.181 1.000 N NA
 5933945 5933946 MMAR_4254 MMAR_4255     FALSE 0.138 88.000 0.000 NA   NA
 5933946 5933947 MMAR_4255 MMAR_4256     FALSE 0.217 52.000 0.000 NA   NA
 5933947 5933948 MMAR_4256 MMAR_5553     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 5933948 5933949 MMAR_5553 MMAR_4257   narK3_3 FALSE 0.086 114.000 0.000 NA   NA
 5933949 5933950 MMAR_4257 MMAR_4258 narK3_3   TRUE 0.694 59.000 0.000 NA Y NA
 5933950 5933951 MMAR_4258 MMAR_4259     FALSE 0.024 483.000 0.000 1.000 Y NA
 5933951 5933952 MMAR_4259 MMAR_4260     FALSE 0.188 81.000 0.000 1.000   NA
 5933952 5933953 MMAR_4260 MMAR_4261     TRUE 0.931 -13.000 0.000 NA   NA
 5933953 5933954 MMAR_4261 MMAR_4262     FALSE 0.587 11.000 0.000 NA   NA
 5933954 5933955 MMAR_4262 MMAR_4263     FALSE 0.620 94.000 0.000 1.000 Y NA
 5933955 5933956 MMAR_4263 MMAR_4264     TRUE 0.972 -3.000 0.040 NA   NA
 5933957 5933958 MMAR_4265 MMAR_4266 narK3_4   FALSE 0.001 955.000 0.000 NA N NA
 5933958 5933959 MMAR_4266 MMAR_4267   narK3_1 FALSE 0.002 727.000 0.000 NA   NA
 5933960 5933961 MMAR_4268 MMAR_4269     TRUE 0.925 82.000 1.000 NA Y NA
 5933961 5933962 MMAR_4269 MMAR_4270     FALSE 0.003 427.000 0.000 NA   NA
 5933965 5933966 MMAR_4273 MMAR_4274   fdxC FALSE 0.503 30.000 0.029 1.000 N NA
 5933967 5933968 MMAR_4275 MMAR_4276   fadH TRUE 0.918 0.000 0.093 NA N NA
 5933968 5933969 MMAR_4276 MMAR_4277 fadH   FALSE 0.012 212.000 0.000 NA   NA
 5933970 5933971 MMAR_4278 MMAR_4279   fbiC FALSE 0.003 572.000 0.000 1.000   NA
 5933973 5933974 MMAR_4281 MMAR_4283   mshB FALSE 0.078 211.000 0.387 NA   NA
 5933976 5933977 MMAR_4285 MMAR_4287     FALSE 0.018 188.000 0.000 NA   NA
 5933977 5933978 MMAR_4287 MMAR_4288   lpqW FALSE 0.012 211.000 0.000 NA   NA
 5933978 5933979 MMAR_4288 MMAR_4289 lpqW typA FALSE 0.180 98.000 0.025 1.000 N NA
 5933979 5933980 MMAR_4289 MMAR_4290 typA mutT2 FALSE 0.014 252.000 0.004 1.000   NA
 5933983 5933984 MMAR_4293 MMAR_4294     FALSE 0.547 50.000 0.222 NA   NA
 5933985 5933986 MMAR_4295 MMAR_4296     TRUE 0.656 25.000 0.085 NA   NA
 5933986 5933987 MMAR_4296 MMAR_4297     FALSE 0.311 74.000 0.064 NA   NA
 5933987 5933988 MMAR_4297 MMAR_4298     TRUE 0.867 23.000 0.455 NA   NA
 5933989 5933990 MMAR_4299 MMAR_4300   omt_2 TRUE 0.740 15.000 0.091 NA   NA
 5933993 5933994 MMAR_4303 MMAR_4304     TRUE 0.984 -3.000 0.160 1.000   NA
 5933994 5933995 MMAR_4304 MMAR_4305   mmpL13 TRUE 0.837 2.000 0.000 1.000   NA
 5933997 5933998 MMAR_4307 MMAR_4308   mcr TRUE 0.808 58.000 0.636 0.086 N NA
 5933999 5934000 MMAR_4309 MMAR_4310 echA10   FALSE 0.129 73.000 0.000 1.000 N NA
 5934001 5934002 MMAR_4311 MMAR_4312     TRUE 0.979 -3.000 0.096 NA   NA
 5934003 5934004 MMAR_4313 MMAR_4314     TRUE 0.977 -6.000 0.044 1.000   NA
 5934004 5934005 MMAR_4314 MMAR_4315     TRUE 0.985 -3.000 0.176 1.000   NA
 5934006 5934007 MMAR_4316 MMAR_4317   echA1_1 FALSE 0.003 428.000 0.000 NA   NA
 5934007 5934008 MMAR_4317 MMAR_4318 echA1_1 fadA6_3 TRUE 0.994 -3.000 0.000 NA Y NA
 5934009 5934010 MMAR_4319 MMAR_4320     FALSE 0.022 467.000 0.000 NA Y NA
 5934011 5934012 MMAR_4321 MMAR_4322   aldA_2 FALSE 0.002 499.000 0.000 NA   NA
 5934012 5934013 MMAR_4322 MMAR_4323 aldA_2   FALSE 0.002 589.000 0.000 NA   NA
 5934016 5934017 MMAR_4325 MMAR_4326     FALSE 0.400 105.000 0.333 1.000 N NA
 5934017 5934018 MMAR_4326 MMAR_4327     TRUE 0.689 17.000 0.077 1.000 N NA
 5934018 5934019 MMAR_4327 MMAR_4328   metE FALSE 0.002 417.000 0.000 1.000 N NA
 5934020 5934021 MMAR_4329 MMAR_4330     FALSE 0.614 60.000 0.375 NA   NA
 5934022 5934023 MMAR_4331 MMAR_4332 ppdK   TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 5934024 5934025 MMAR_4333 MMAR_4334   ephC TRUE 0.858 5.000 0.070 NA   NA
 5934029 5934030 MMAR_4338 MMAR_4339 gnd2 zwf1 TRUE 0.943 15.000 0.062 1.000 Y NA
 5934031 5934032 MMAR_4340 MMAR_4341     FALSE 0.360 33.000 0.000 NA   NA
 5934032 5934033 MMAR_4341 MMAR_4342     TRUE 0.928 -18.000 0.000 NA   NA
 5934034 5934035 MMAR_4343 MMAR_4344     FALSE 0.197 76.000 0.000 1.000   NA
 5934035 5934036 MMAR_4344 MMAR_4345     FALSE 0.004 315.000 0.000 NA   NA
 5934036 5934037 MMAR_4345 MMAR_4346     FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 5934038 5934039 MMAR_4347 MMAR_4348     TRUE 0.818 3.000 0.004 NA   NA
 5934039 5934040 MMAR_4348 MMAR_4349     FALSE 0.148 77.000 0.000 NA   NA
 5934040 5934041 MMAR_4349 MMAR_4350     FALSE 0.078 119.000 0.000 NA   NA
 5934041 5934042 MMAR_4350 MMAR_4351     TRUE 0.926 -25.000 0.000 NA   NA
 5934043 5934044 MMAR_4352 MMAR_4353     FALSE 0.002 455.000 0.000 NA   NA
 5934047 5934048 MMAR_4356 MMAR_4357   xseA TRUE 0.968 -3.000 0.024 NA   NA
 5934048 5934049 MMAR_4357 MMAR_4358 xseA xseB TRUE 0.999 -10.000 0.412 0.000 Y NA
 5934049 5934050 MMAR_4358 MMAR_4359 xseB   FALSE 0.248 55.000 0.009 1.000 N NA
 5934050 5934051 MMAR_4359 MMAR_4360     FALSE 0.027 180.000 0.000 1.000   NA
 5934056 5934057 MMAR_4365 MMAR_4366     TRUE 0.680 28.000 0.167 NA   NA
 5934058 5934059 MMAR_4367 MMAR_4368 glpX fum FALSE 0.529 38.000 0.071 1.000 N NA
 5934059 5934060 MMAR_4368 MMAR_4369 fum   FALSE 0.191 97.000 0.014 NA   NA
 5934061 5934062 MMAR_4370 MMAR_4371     TRUE 0.986 -7.000 0.286 1.000 N NA
 5934062 5934063 MMAR_4371 MMAR_4372   phoH2 FALSE 0.322 72.000 0.108 1.000 N NA
 5934063 5934064 MMAR_4372 MMAR_4373 phoH2   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934064 5934065 MMAR_4373 MMAR_4374   desA2 FALSE 0.469 19.000 0.000 NA   NA
 5934065 5934066 MMAR_4374 MMAR_4375 desA2 glyA1 FALSE 0.470 57.000 0.143 1.000   NA
 5934068 5934069 MMAR_4377 MMAR_4378     FALSE 0.013 206.000 0.000 NA   NA
 5934069 5934070 MMAR_4378 MMAR_4379     FALSE 0.017 190.000 0.000 NA   NA
 5934070 5934071 MMAR_4379 MMAR_4380   uppS FALSE 0.020 239.000 0.058 NA   NA
 5934073 5934074 MMAR_4382 MMAR_4383     TRUE 0.731 14.000 0.034 1.000   NA
 5934074 5934075 MMAR_4383 MMAR_4384     TRUE 0.965 -13.000 0.039 NA   NA
 5934075 5934076 MMAR_4384 MMAR_4385   mca TRUE 0.981 -3.000 0.141 NA   NA
 5934077 5934078 MMAR_4386 MMAR_4387   greA FALSE 0.041 232.000 0.250 NA   NA
 5934079 5934080 MMAR_4388 MMAR_4389 metB pra FALSE 0.199 100.000 0.028 NA   NA
 5934080 5934081 MMAR_4389 MMAR_4390 pra cbs FALSE 0.029 196.000 0.034 NA   NA
 5934081 5934082 MMAR_4390 MMAR_4391 cbs lipU FALSE 0.254 59.000 0.017 1.000 N NA
 5934083 5934084 MMAR_4392 MMAR_4393   fadA3 FALSE 0.441 78.000 0.275 1.000 N NA
 5934086 5934087 MMAR_4395 MMAR_4396 echA9 echA8 TRUE 0.976 12.000 0.128 0.006 Y NA
 5934087 5934088 MMAR_4396 MMAR_4397 echA8   TRUE 0.860 12.000 0.259 NA   NA
 5934088 5934089 MMAR_4397 MMAR_4398     FALSE 0.007 252.000 0.000 NA   NA
 5934089 5934090 MMAR_4398 MMAR_4399     FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 5934091 5934092 MMAR_4400 MMAR_4401     TRUE 0.979 0.000 0.429 NA   NA
 5934093 5934094 MMAR_4402 MMAR_4403 lpqV   FALSE 0.171 103.000 0.016 NA   NA
 5934095 5934096 MMAR_4404 MMAR_4405     TRUE 0.795 24.000 0.250 1.000   NA
 5934096 5934097 MMAR_4405 MMAR_4406     TRUE 0.776 33.000 0.333 NA   NA
 5934097 5934098 MMAR_4406 MMAR_4407     FALSE 0.035 150.000 0.000 NA   NA
 5934098 5934099 MMAR_4407 MMAR_4408     FALSE 0.002 561.000 0.000 NA   NA
 5934099 5934100 MMAR_4408 MMAR_4409     TRUE 0.977 -7.000 0.100 NA   NA
 5934100 5934101 MMAR_4409 MMAR_4410   aslA TRUE 0.808 1.000 0.000 NA   NA
 5934101 5934102 MMAR_4410 MMAR_4411 aslA   FALSE 0.122 112.000 0.000 1.000   NA
 5934102 5934103 MMAR_4411 MMAR_4412   fadD14 FALSE 0.398 108.000 0.286 1.000   NA
 5934103 5934104 MMAR_4412 MMAR_4413 fadD14   FALSE 0.187 122.000 0.125 NA   NA
 5934104 5934105 MMAR_4413 MMAR_4414     FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 5934107 5934108 MMAR_4416 MMAR_4417     FALSE 0.187 60.000 0.000 NA   NA
 5934108 5934109 MMAR_4417 MMAR_4418     FALSE 0.141 84.000 0.000 NA   NA
 5934110 5934111 MMAR_4419 MMAR_4420   gcvT_2 FALSE 0.007 197.000 0.000 NA N NA
 5934111 5934112 MMAR_4420 MMAR_4421 gcvT_2   TRUE 0.979 7.000 0.250 1.000 Y NA
 5934112 5934113 MMAR_4421 MMAR_4422     TRUE 0.981 -3.000 0.185 1.000 N NA
 5934113 5934114 MMAR_4422 MMAR_4423     TRUE 0.792 12.000 0.000 0.015 N NA
 5934114 5934115 MMAR_4423 MMAR_4424     FALSE 0.025 166.000 0.000 NA   NA
 5934116 5934117 MMAR_4425 MMAR_4426     FALSE 0.152 61.000 0.000 1.000 N NA
 5934119 5934120 MMAR_4428 MMAR_4429     FALSE 0.004 414.000 0.000 1.000   NA
 5934120 5934121 MMAR_4429 MMAR_4430   cyp138B1 FALSE 0.003 554.000 0.000 1.000   NA
 5934121 5934122 MMAR_4430 MMAR_4431 cyp138B1   FALSE 0.354 34.000 0.000 NA   NA
 5934122 5934123 MMAR_4431 MMAR_4432     TRUE 0.911 23.000 0.667 NA   NA
 5934123 5934124 MMAR_4432 MMAR_4433     FALSE 0.240 49.000 0.000 NA   NA
 5934127 5934128 MMAR_4436 MMAR_4437     FALSE 0.025 166.000 0.000 NA   NA
 5934129 5934130 MMAR_4438 MMAR_4439     FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 5934130 5934131 MMAR_4439 MMAR_4440     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5934133 5934134 MMAR_4442 MMAR_4443     TRUE 0.687 109.000 0.000 0.006 Y NA
 5934134 5934135 MMAR_4443 MMAR_4444     FALSE 0.587 11.000 0.000 NA   NA
 5934135 5934136 MMAR_4444 MMAR_4445     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934136 5934137 MMAR_4445 MMAR_4446     FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 5934137 5934138 MMAR_4446 MMAR_4447     FALSE 0.005 311.000 0.000 NA   NA
 5934139 5934140 MMAR_4448 MMAR_4449     TRUE 0.881 13.000 0.333 NA   NA
 5934141 5934142 MMAR_4450 MMAR_5522   leuX FALSE 0.026 164.000 0.000 NA   NA
 5934143 5934144 MMAR_4451 MMAR_4452     TRUE 0.723 70.000 0.667 NA   NA
 5934144 5934145 MMAR_4452 MMAR_4453   esxP FALSE 0.036 148.000 0.000 NA   NA
 5934145 5934146 MMAR_4453 MMAR_4454 esxP esxN_1 FALSE 0.321 39.000 0.000 NA   NA
 5934146 5934147 MMAR_4454 MMAR_4455 esxN_1 trcR FALSE 0.006 270.000 0.000 NA   NA
 5934147 5934148 MMAR_4455 MMAR_4456 trcR trcS TRUE 0.988 8.000 0.556 1.000 Y NA
 5934148 5934149 MMAR_4456 MMAR_4457 trcS   FALSE 0.183 38.000 0.000 NA N NA
 5934150 5934151 MMAR_4458 MMAR_4459     FALSE 0.154 104.000 0.007 NA   NA
 5934151 5934152 MMAR_4459 MMAR_4460     TRUE 0.786 20.000 0.243 NA   NA
 5934152 5934153 MMAR_4460 MMAR_4461     TRUE 0.986 -7.000 0.252 NA   NA
 5934153 5934154 MMAR_4461 MMAR_4462   eno FALSE 0.509 34.000 0.043 1.000 N NA
 5934154 5934155 MMAR_4462 MMAR_4463 eno lpqU FALSE 0.139 81.000 0.012 NA N NA
 5934155 5934156 MMAR_4463 MMAR_4464 lpqU   FALSE 0.003 355.000 0.000 NA   NA
 5934156 5934157 MMAR_4464 MMAR_4465   mfd TRUE 0.975 -3.000 0.026 1.000   NA
 5934157 5934158 MMAR_4465 MMAR_4466 mfd   TRUE 0.806 67.000 0.013 0.047 Y NA
 5934159 5934160 MMAR_5523 MMAR_4467 glnT glmU FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 5934160 5934161 MMAR_4467 MMAR_4468 glmU prsA FALSE 0.134 113.000 0.026 1.000 N NA
 5934161 5934162 MMAR_4468 MMAR_4469 prsA   TRUE 0.885 1.000 0.040 1.000 N NA
 5934162 5934163 MMAR_4469 MMAR_4470   lpqT TRUE 0.972 -3.000 0.040 NA   NA
 5934163 5934164 MMAR_4470 MMAR_4471 lpqT   TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5934164 5934165 MMAR_4471 MMAR_4472   rplY FALSE 0.013 204.000 0.000 NA   NA
 5934165 5934166 MMAR_4472 MMAR_4473 rplY pth TRUE 0.986 13.000 0.496 0.013 Y NA
 5934169 5934170 MMAR_4476 MMAR_4477 pks16 ispE FALSE 0.035 366.000 0.000 1.000 Y NA
 5934170 5934171 MMAR_4477 MMAR_4478 ispE ksgA FALSE 0.241 98.000 0.068 1.000 N NA
 5934171 5934172 MMAR_4478 MMAR_4479 ksgA rpfB FALSE 0.186 105.000 0.008 1.000   NA
 5934172 5934173 MMAR_4479 MMAR_4480 rpfB tatD FALSE 0.018 210.000 0.008 NA   NA
 5934174 5934175 MMAR_4481 MMAR_4482 metS   FALSE 0.009 275.000 0.000 1.000   NA
 5934179 5934180 MMAR_4486 MMAR_4487     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000 N NA
 5934180 5934181 MMAR_4487 MMAR_4488   pabD FALSE 0.216 62.000 0.006 1.000 N NA
 5934181 5934182 MMAR_4488 MMAR_4489 pabD   FALSE 0.143 107.000 0.006 NA   NA
 5934187 5934188 MMAR_4494 MMAR_4495     TRUE 0.888 28.000 0.625 NA   NA
 5934188 5934189 MMAR_4495 MMAR_4496     FALSE 0.332 73.000 0.087 NA   NA
 5934191 5934192 MMAR_4498 MMAR_4499     FALSE 0.085 115.000 0.000 NA   NA
 5934193 5934194 MMAR_4500 MMAR_4501     FALSE 0.005 311.000 0.000 NA   NA
 5934194 5934195 MMAR_4501 MMAR_4502     FALSE 0.008 189.000 0.000 NA N NA
 5934195 5934196 MMAR_4502 MMAR_4503     TRUE 0.902 17.000 0.000 NA Y NA
 5934196 5934197 MMAR_4503 MMAR_4504     TRUE 0.808 15.000 0.222 NA   NA
 5934197 5934198 MMAR_4504 MMAR_4505     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   NA
 5934198 5934199 MMAR_4505 MMAR_4506     TRUE 0.998 -3.000 0.375 NA Y NA
 5934200 5934201 MMAR_4507 MMAR_4508     FALSE 0.348 35.000 0.000 NA   NA
 5934203 5934204 MMAR_4510 MMAR_4511     FALSE 0.115 101.000 0.000 NA   NA
 5934206 5934207 MMAR_4513 MMAR_4514     FALSE 0.107 94.000 0.000 1.000 N NA
 5934207 5934208 MMAR_4514 MMAR_4515     TRUE 0.967 -3.000 0.022 NA   NA
 5934208 5934209 MMAR_4515 MMAR_4516     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5934211 5934212 MMAR_5524 MMAR_4518 alaV   FALSE 0.211 53.000 0.000 NA   NA
 5934212 5934213 MMAR_4518 MMAR_4519   rimJ FALSE 0.043 207.000 0.183 NA   NA
 5934213 5934214 MMAR_4519 MMAR_4520 rimJ moeA1 TRUE 0.851 23.000 0.427 1.000 N NA
 5934214 5934215 MMAR_4520 MMAR_4521 moeA1 galU FALSE 0.475 52.000 0.196 1.000 N NA
 5934216 5934217 MMAR_4522 MMAR_4523     FALSE 0.273 75.000 0.041 NA   NA
 5934217 5934218 MMAR_4523 MMAR_4524     FALSE 0.262 67.000 0.022 NA   NA
 5934218 5934219 MMAR_4524 MMAR_4525   mscL FALSE 0.273 77.000 0.043 NA   NA
 5934220 5934221 MMAR_4526 MMAR_4527 moaB2 pepD TRUE 0.992 -3.000 0.423 1.000 N NA
 5934221 5934222 MMAR_4527 MMAR_4528 pepD mprB FALSE 0.498 100.000 0.424 1.000 N NA
 5934222 5934223 MMAR_4528 MMAR_4529 mprB mprA TRUE 0.998 0.000 0.655 0.006 Y NA
 5934223 5934224 MMAR_4529 MMAR_4530 mprA rpmF FALSE 0.013 267.000 0.009 1.000   NA
 5934225 5934226 MMAR_4531 MMAR_4532   fadE13 TRUE 0.995 -3.000 0.562 NA   NA
 5934226 5934227 MMAR_4532 MMAR_4533 fadE13 accD2 TRUE 0.928 50.000 0.548 1.000 Y NA
 5934227 5934228 MMAR_4533 MMAR_4534 accD2 accA2 TRUE 0.999 0.000 0.875 0.004 Y NA
 5934228 5934229 MMAR_4534 MMAR_4535 accA2 fadE12 TRUE 0.997 0.000 0.812 1.000 Y NA
 5934229 5934230 MMAR_4535 MMAR_4536 fadE12 echA7 TRUE 0.966 11.000 0.203 1.000 Y NA
 5934230 5934231 MMAR_4536 MMAR_4537 echA7   FALSE 0.223 51.000 0.000 NA   NA
 5934231 5934232 MMAR_4537 MMAR_4538     FALSE 0.183 61.000 0.000 NA   NA
 5934232 5934233 MMAR_4538 MMAR_4539     FALSE 0.101 107.000 0.000 NA   NA
 5934234 5934235 MMAR_4540 MMAR_4541     TRUE 0.995 -7.000 0.645 NA   NA
 5934235 5934236 MMAR_4541 MMAR_4542   purH FALSE 0.166 80.000 0.002 1.000 N NA
 5934236 5934237 MMAR_4542 MMAR_4543 purH purN TRUE 0.997 -3.000 0.225 1.000 Y NA
 5934237 5934238 MMAR_4543 MMAR_4544 purN   FALSE 0.365 53.000 0.044 NA   NA
 5934238 5934239 MMAR_4544 MMAR_4545     TRUE 0.643 40.000 0.218 NA   NA
 5934243 5934244 MMAR_4549 MMAR_4550 sucD sucC TRUE 0.985 15.000 0.382 0.000 Y NA
 5934245 5934246 MMAR_4551 MMAR_4552     FALSE 0.554 115.000 0.667 NA   NA
 5934247 5934248 MMAR_4553 MMAR_4554 uvrD1   FALSE 0.071 81.000 0.000 NA N NA
 5934249 5934250 MMAR_4555 MMAR_4556   fbpC_2 FALSE 0.177 63.000 0.000 NA   NA
 5934250 5934251 MMAR_4556 MMAR_4557 fbpC_2 pgi FALSE 0.289 43.000 0.000 NA   NA
 5934252 5934253 MMAR_4558 MMAR_4559     FALSE 0.338 89.000 0.082 1.000   NA
 5934253 5934254 MMAR_4559 MMAR_4560     FALSE 0.248 48.000 0.000 NA   NA
 5934254 5934255 MMAR_4560 MMAR_4561     FALSE 0.078 119.000 0.000 NA   NA
 5934255 5934256 MMAR_4561 MMAR_4562     FALSE 0.150 76.000 0.000 NA   NA
 5934256 5934257 MMAR_4562 MMAR_4563     FALSE 0.023 171.000 0.000 NA   NA
 5934258 5934259 MMAR_4564 MMAR_4565     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5934259 5934260 MMAR_4565 MMAR_4567     FALSE 0.002 557.000 0.000 NA   NA
 5934260 5934261 MMAR_4567 MMAR_4568     FALSE 0.121 145.000 0.182 NA   NA
 5934263 5934264 MMAR_4570 MMAR_4571     FALSE 0.075 120.000 0.000 NA   NA
 5934265 5934266 MMAR_4572 MMAR_4573     TRUE 0.969 -3.000 0.043 1.000 N NA
 5934267 5934268 MMAR_4574 MMAR_4575 pfkB   FALSE 0.073 172.000 0.111 1.000   NA
 5934268 5934269 MMAR_4575 MMAR_4576   pstS2 FALSE 0.259 55.000 0.000 1.000   NA
 5934269 5934270 MMAR_4576 MMAR_4577 pstS2 pknD FALSE 0.051 321.000 0.667 1.000 N NA
 5934271 5934272 MMAR_4578 MMAR_4579 pstA1 pstC2 TRUE 0.998 -3.000 0.037 0.002 Y NA
 5934272 5934273 MMAR_4579 MMAR_4580 pstC2 phoS2 TRUE 0.978 13.000 0.200 0.002 Y NA
 5934274 5934275 MMAR_4581 MMAR_4582     TRUE 0.881 26.000 0.500 1.000   NA
 5934275 5934276 MMAR_4582 MMAR_4583     FALSE 0.145 112.000 0.018 NA   NA
 5934276 5934277 MMAR_4583 MMAR_4584   mntH FALSE 0.217 80.000 0.014 NA   NA
 5934277 5934278 MMAR_4584 MMAR_4585 mntH   FALSE 0.025 166.000 0.000 NA   NA
 5934278 5934279 MMAR_4585 MMAR_4586     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5934279 5934280 MMAR_4586 MMAR_4587     TRUE 0.726 28.000 0.222 NA   NA
 5934280 5934281 MMAR_4587 MMAR_5525   argT FALSE 0.388 29.000 0.000 NA   NA
 5934281 5934282 MMAR_5525 MMAR_4588 argT   FALSE 0.147 78.000 0.000 NA   NA
 5934282 5934283 MMAR_4588 MMAR_4589     FALSE 0.546 13.000 0.000 NA   NA
 5934283 5934284 MMAR_4589 MMAR_4590     FALSE 0.019 181.000 0.000 NA   NA
 5934284 5934285 MMAR_4590 MMAR_4591     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934286 5934287 MMAR_4592 MMAR_4594     FALSE 0.142 82.000 0.000 NA   NA
 5934287 5934288 MMAR_4594 MMAR_4595     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934288 5934289 MMAR_4595 MMAR_4596     FALSE 0.010 227.000 0.000 NA   NA
 5934289 5934290 MMAR_4596 MMAR_4597     TRUE 0.703 5.000 0.000 NA   NA
 5934291 5934292 MMAR_4598 MMAR_4599     FALSE 0.610 42.000 0.000 0.032   NA
 5934293 5934294 MMAR_4600 MMAR_4601     FALSE 0.030 157.000 0.000 NA   NA
 5934294 5934295 MMAR_4601 MMAR_4602     FALSE 0.002 444.000 0.000 NA   NA
 5934295 5934296 MMAR_4602 MMAR_4603     TRUE 0.930 -15.000 0.000 NA   NA
 5934298 5934299 MMAR_4605 MMAR_4606     FALSE 0.006 277.000 0.000 NA   NA
 5934300 5934301 MMAR_4607 MMAR_4608     FALSE 0.006 273.000 0.000 NA   NA
 5934301 5934302 MMAR_4608 MMAR_4609     FALSE 0.007 266.000 0.000 NA   NA
 5934302 5934303 MMAR_4609 MMAR_4610     FALSE 0.002 660.000 0.000 NA   NA
 5934303 5934304 MMAR_4610 MMAR_4611     FALSE 0.004 314.000 0.000 NA   NA
 5934304 5934305 MMAR_4611 MMAR_4612     TRUE 0.634 9.000 0.000 NA   NA
 5934305 5934306 MMAR_4612 MMAR_4613     FALSE 0.003 254.000 0.000 NA N NA
 5934306 5934307 MMAR_4613 MMAR_4614     TRUE 0.959 2.000 0.417 NA N NA
 5934307 5934308 MMAR_4614 MMAR_4615     FALSE 0.486 17.000 0.000 NA   NA
 5934309 5934310 MMAR_4616 MMAR_4617     FALSE 0.329 71.000 0.071 NA   NA
 5934312 5934313 MMAR_4619 MMAR_4620     TRUE 0.921 5.000 0.273 NA   NA
 5934313 5934314 MMAR_4620 MMAR_4621     FALSE 0.112 102.000 0.000 NA   NA
 5934314 5934315 MMAR_4621 MMAR_4622   ctpE FALSE 0.002 365.000 0.000 NA N NA
 5934315 5934316 MMAR_4622 MMAR_4623 ctpE   TRUE 0.978 -3.000 0.119 1.000 N NA
 5934316 5934317 MMAR_4623 MMAR_4624     FALSE 0.028 239.000 0.171 NA   NA
 5934317 5934318 MMAR_4624 MMAR_4625   echA6 TRUE 0.920 7.000 0.314 NA   NA
 5934319 5934320 MMAR_4626 MMAR_4627 accD3   FALSE 0.001 1048.000 0.000 NA   NA
 5934320 5934321 MMAR_4627 MMAR_4628   bioF2_1 TRUE 0.928 -18.000 0.000 NA   NA
 5934321 5934322 MMAR_4628 MMAR_4629 bioF2_1 cysM FALSE 0.036 212.000 0.000 0.010 N NA
 5934322 5934323 MMAR_4629 MMAR_4630 cysM erg3_1 FALSE 0.004 245.000 0.000 NA N NA
 5934325 5934326 MMAR_4632 MMAR_4633   prrA FALSE 0.047 151.000 0.000 1.000   NA
 5934326 5934327 MMAR_4633 MMAR_4634 prrA prrB TRUE 0.984 6.000 0.333 1.000 Y NA
 5934328 5934329 MMAR_4635 MMAR_4636     TRUE 0.987 0.000 0.667 NA   NA
 5934329 5934330 MMAR_4636 MMAR_4637   ompA TRUE 0.862 13.000 0.286 NA   NA
 5934331 5934332 MMAR_4638 MMAR_4639     TRUE 0.668 24.000 0.091 NA   NA
 5934333 5934334 MMAR_4640 MMAR_4641 gltA2   FALSE 0.002 388.000 0.000 1.000 N NA
 5934334 5934335 MMAR_4641 MMAR_4642   pdxH FALSE 0.005 264.000 0.000 1.000 N NA
 5934339 5934340 MMAR_4646 MMAR_4647 fprB   TRUE 0.948 19.000 0.846 1.000   NA
 5934341 5934342 MMAR_4648 MMAR_4649 serC   FALSE 0.233 122.000 0.214 NA   NA
 5934343 5934344 MMAR_4650 MMAR_4651     TRUE 0.978 -3.000 0.075 NA   NA
 5934344 5934345 MMAR_4651 MMAR_4652     TRUE 0.965 -3.000 0.029 1.000 N NA
 5934346 5934347 MMAR_4653 MMAR_4654     TRUE 0.797 21.000 0.269 NA   NA
 5934349 5934350 MMAR_4656 MMAR_4657     TRUE 0.993 -3.000 0.432 NA   NA
 5934350 5934351 MMAR_4657 MMAR_4658     FALSE 0.217 109.000 0.069 NA   NA
 5934352 5934353 MMAR_4659 MMAR_4660   fadE10 FALSE 0.599 13.000 0.030 NA N NA
 5934353 5934354 MMAR_4660 MMAR_4661 fadE10 cspB FALSE 0.028 188.000 0.027 1.000 N NA
 5934355 5934356 MMAR_4662 MMAR_4663   moaA2 TRUE 0.968 -3.000 0.026 NA   NA
 5934356 5934357 MMAR_4663 MMAR_4664 moaA2 moaD2 TRUE 0.974 14.000 0.410 1.000 Y NA
 5934357 5934358 MMAR_4664 MMAR_4665 moaD2 rpfA FALSE 0.003 436.000 0.000 1.000   NA
 5934359 5934360 MMAR_4666 MMAR_4667 moaE2 mog TRUE 0.998 -3.000 0.015 0.002 Y NA
 5934360 5934361 MMAR_4667 MMAR_4668 mog moaC2 TRUE 0.998 -3.000 0.016 0.002 Y NA
 5934361 5934362 MMAR_4668 MMAR_4669 moaC2   TRUE 0.732 9.000 0.012 NA   NA
 5934363 5934364 MMAR_4670 MMAR_4671   ercc3 FALSE 0.383 83.000 0.206 NA   NA
 5934367 5934368 MMAR_4673 MMAR_4674     FALSE 0.270 70.000 0.083 NA N NA
 5934370 5934371 MMAR_4676 MMAR_4677 fadB fadA TRUE 0.993 5.000 0.750 1.000 Y NA
 5934373 5934374 MMAR_4679 MMAR_4680     TRUE 0.937 26.000 1.000 NA   NA
 5934374 5934375 MMAR_4680 MMAR_4681   far TRUE 0.649 50.000 0.333 NA   NA
 5934375 5934376 MMAR_4681 MMAR_4682 far   TRUE 0.907 10.000 0.333 NA   NA
 5934378 5934379 MMAR_4684 MMAR_4685   fadD16 TRUE 0.714 14.000 0.048 NA   NA
 5934379 5934380 MMAR_4685 MMAR_4686 fadD16   FALSE 0.217 52.000 0.000 NA   NA
 5934380 5934381 MMAR_4686 MMAR_4687     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934381 5934382 MMAR_4687 MMAR_4688   fadD3_2 FALSE 0.006 273.000 0.000 NA   NA
 5934382 5934383 MMAR_4688 MMAR_4689 fadD3_2   TRUE 0.998 -3.000 0.875 0.034   NA
 5934383 5934384 MMAR_4689 MMAR_4690     FALSE 0.472 94.000 0.286 1.000   NA
 5934385 5934386 MMAR_4691 MMAR_4692 echA8_2   TRUE 0.977 -3.000 0.069 NA   NA
 5934389 5934390 MMAR_4695 MMAR_4696     TRUE 0.806 4.000 0.011 NA   NA
 5934390 5934391 MMAR_4696 MMAR_4697     TRUE 0.963 -3.000 0.011 NA   NA
 5934391 5934392 MMAR_4697 MMAR_4698     TRUE 0.973 3.000 0.600 NA   NA
 5934393 5934394 MMAR_4699 MMAR_4700     FALSE 0.014 200.000 0.000 NA   NA
 5934396 5934397 MMAR_4702 MMAR_4703     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5934397 5934398 MMAR_4703 MMAR_4704     TRUE 0.629 102.000 0.667 NA   NA
 5934399 5934400 MMAR_4705 MMAR_4706     TRUE 0.996 1.000 0.400 0.007 Y NA
 5934400 5934401 MMAR_4706 MMAR_4707     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.007 Y NA
 5934401 5934402 MMAR_4707 MMAR_4708     TRUE 0.999 -3.000 0.400 0.007 Y NA
 5934402 5934403 MMAR_4708 MMAR_4709     TRUE 0.999 -7.000 0.833 0.007 Y NA
 5934403 5934404 MMAR_4709 MMAR_4710     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.007 Y NA
 5934404 5934405 MMAR_4710 MMAR_4711     TRUE 0.956 20.000 0.333 NA Y NA
 5934405 5934406 MMAR_4711 MMAR_4712     TRUE 0.798 43.000 0.000 NA Y NA
 5934406 5934407 MMAR_4712 MMAR_4713     FALSE 0.002 318.000 0.000 NA N NA
 5934407 5934408 MMAR_4713 MMAR_4714     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.083 Y NA
 5934409 5934410 MMAR_4715 MMAR_4716     FALSE 0.343 109.000 0.286 1.000 N NA
 5934410 5934411 MMAR_4716 MMAR_4717   cyp188A3 TRUE 0.972 15.000 1.000 0.014 N NA
 5934412 5934413 MMAR_4718 MMAR_4719     TRUE 0.999 -16.000 0.857 0.013 Y NA
 5934416 5934417 MMAR_4722 MMAR_4723 plcB_6   FALSE 0.021 175.000 0.000 NA   NA
 5934417 5934418 MMAR_4723 MMAR_4724     FALSE 0.005 293.000 0.000 NA   NA
 5934418 5934419 MMAR_4724 MMAR_4725     TRUE 0.755 48.000 0.250 0.034   NA
 5934419 5934420 MMAR_4725 MMAR_4726     TRUE 0.943 2.000 0.250 NA   NA
 5934420 5934421 MMAR_4726 MMAR_4727     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 5934423 5934424 MMAR_4729 MMAR_4730 nuoF_1   TRUE 0.999 -3.000 0.778 NA Y NA
 5934424 5934425 MMAR_4730 MMAR_4731     FALSE 0.315 136.000 0.556 NA N NA
 5934425 5934426 MMAR_4731 MMAR_4732     TRUE 0.999 -3.000 0.600 NA Y NA
 5934426 5934427 MMAR_4732 MMAR_4733   cyp190A3 FALSE 0.030 128.000 0.000 NA N NA
 5934427 5934428 MMAR_4733 MMAR_4734 cyp190A3 fdxD_2 FALSE 0.395 11.000 0.000 NA N NA
 5934428 5934429 MMAR_4734 MMAR_4735 fdxD_2   FALSE 0.013 207.000 0.000 NA   NA
 5934430 5934431 MMAR_4736 MMAR_4737   cyp150A5 TRUE 0.996 -3.000 0.429 0.014 N NA
 5934431 5934432 MMAR_4737 MMAR_4738 cyp150A5   FALSE 0.361 109.000 0.286 NA   NA
 5934432 5934433 MMAR_4738 MMAR_4739     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 5934433 5934434 MMAR_4739 MMAR_4740   fadA6_2 FALSE 0.235 104.000 0.182 NA N NA
 5934434 5934435 MMAR_4740 MMAR_4741 fadA6_2 fadE12_1 TRUE 0.714 96.000 0.182 NA Y NA
 5934435 5934436 MMAR_4741 MMAR_4742 fadE12_1   FALSE 0.293 111.000 0.182 1.000   NA
 5934437 5934438 MMAR_4743 MMAR_4744     TRUE 0.972 8.000 0.857 NA   NA
 5934438 5934439 MMAR_4744 MMAR_4745     TRUE 0.997 -16.000 1.000 NA   NA
 5934439 5934440 MMAR_4745 MMAR_4746     TRUE 0.983 4.000 1.000 NA   NA
 5934440 5934441 MMAR_4746 MMAR_4747     TRUE 0.995 -16.000 0.714 NA   NA
 5934441 5934442 MMAR_4747 MMAR_4748     TRUE 0.994 -3.000 0.556 NA   NA
 5934442 5934443 MMAR_4748 MMAR_4749     TRUE 0.967 21.000 1.000 0.059   NA
 5934444 5934445 MMAR_4750 MMAR_4751     FALSE 0.003 364.000 0.000 1.000 N NA
 5934446 5934447 MMAR_4752 MMAR_4753   cyp189A7 FALSE 0.012 234.000 0.000 1.000   NA
 5934447 5934448 MMAR_4753 MMAR_4754 cyp189A7   TRUE 0.867 31.000 0.000 1.000 Y NA
 5934448 5934449 MMAR_4754 MMAR_4755     TRUE 0.947 12.000 0.400 0.045   NA
 5934450 5934451 MMAR_4756 MMAR_4757     TRUE 0.978 9.000 0.857 0.083 N NA
 5934451 5934452 MMAR_4757 MMAR_4758   echA4_1 TRUE 0.992 0.000 0.714 0.034 N NA
 5934452 5934453 MMAR_4758 MMAR_4759 echA4_1   TRUE 0.982 3.000 0.833 1.000 N NA
 5934453 5934454 MMAR_4759 MMAR_4760     TRUE 1.000 -10.000 1.000 0.001 Y NA
 5934454 5934455 MMAR_4760 MMAR_4761     TRUE 0.971 10.000 0.857 1.000   NA
 5934455 5934456 MMAR_4761 MMAR_4762   cyp105Q4 TRUE 0.745 38.000 0.286 1.000   NA
 5934456 5934457 MMAR_4762 MMAR_4763 cyp105Q4   TRUE 0.901 3.000 0.000 0.014 N NA
 5934457 5934458 MMAR_4763 MMAR_4764     TRUE 0.850 13.000 0.222 1.000   NA
 5934458 5934459 MMAR_4764 MMAR_4765     FALSE 0.488 89.000 0.286 1.000   NA
 5934461 5934462 MMAR_4767 MMAR_4768   cysK2 TRUE 0.982 0.000 0.500 NA   NA
 5934462 5934463 MMAR_4768 MMAR_4769 cysK2 lpqS FALSE 0.108 104.000 0.000 NA   NA
 5934465 5934466 MMAR_4771 MMAR_4772     TRUE 0.972 0.000 0.333 NA   NA
 5934466 5934467 MMAR_4772 MMAR_4773     TRUE 0.989 0.000 0.750 NA   NA
 5934467 5934468 MMAR_4773 MMAR_4774     TRUE 0.836 35.000 0.600 NA N NA
 5934468 5934469 MMAR_4774 MMAR_4775     TRUE 0.973 3.000 0.600 NA   NA
 5934469 5934470 MMAR_4775 MMAR_4776   mhpB TRUE 0.998 -3.000 0.750 0.059   NA
 5934470 5934471 MMAR_4776 MMAR_4777 mhpB   TRUE 0.998 -52.000 0.875 0.007   NA
 5934471 5934472 MMAR_4777 MMAR_4778   bphD_1 TRUE 0.980 0.000 0.467 NA   NA
 5934473 5934474 MMAR_4779 MMAR_4780     TRUE 0.918 15.000 0.500 1.000   NA
 5934477 5934478 MMAR_4783 MMAR_4784     TRUE 0.913 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5934478 5934479 MMAR_4784 MMAR_4785     FALSE 0.009 232.000 0.000 NA   NA
 5934479 5934480 MMAR_4785 MMAR_4786     FALSE 0.004 350.000 0.000 NA   NA
 5934480 5934481 MMAR_4786 MMAR_4787     FALSE 0.137 89.000 0.000 NA   NA
 5934481 5934482 MMAR_4787 MMAR_4788     FALSE 0.574 18.000 0.019 1.000 N NA
 5934484 5934485 MMAR_4790 MMAR_4791     TRUE 0.996 2.000 0.857 1.000 Y NA
 5934485 5934486 MMAR_4791 MMAR_4792     TRUE 0.981 -13.000 0.000 0.019   NA
 5934486 5934487 MMAR_4792 MMAR_4793     TRUE 0.946 -22.000 0.000 1.000   NA
 5934489 5934490 MMAR_4795 MMAR_4796     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 5934490 5934491 MMAR_4796 MMAR_4797   mcmA2b TRUE 0.958 -15.000 0.061 NA N NA
 5934491 5934492 MMAR_4797 MMAR_4798 mcmA2b mcmA2a TRUE 0.993 1.000 0.122 0.001 Y NA
 5934492 5934493 MMAR_4798 MMAR_4799 mcmA2a   FALSE 0.055 125.000 0.000 1.000 N NA
 5934493 5934494 MMAR_4799 MMAR_4800   lpqR FALSE 0.275 61.000 0.033 1.000 N NA
 5934495 5934496 MMAR_4801 MMAR_4802     FALSE 0.441 22.000 0.000 NA   NA
 5934497 5934498 MMAR_4803 MMAR_4804     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934499 5934500 MMAR_4805 MMAR_4806 crtE crtI FALSE 0.613 25.000 0.065 1.000 N NA
 5934500 5934501 MMAR_4806 MMAR_4807 crtI crtB TRUE 0.989 -3.000 0.332 1.000 N NA
 5934501 5934502 MMAR_4807 MMAR_4808 crtB crtYc TRUE 0.971 -3.000 0.036 NA   NA
 5934502 5934503 MMAR_4808 MMAR_4809 crtYc crtYd TRUE 0.989 -3.000 0.303 NA   NA
 5934503 5934504 MMAR_4809 MMAR_4810 crtYd mmpL13_1 TRUE 0.941 -6.000 0.000 NA   NA
 5934504 5934505 MMAR_4810 MMAR_4811 mmpL13_1   FALSE 0.295 50.000 0.000 1.000   NA
 5934506 5934507 MMAR_4812 MMAR_4813 idi2   FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5934507 5934508 MMAR_4813 MMAR_4814     TRUE 0.988 -6.000 0.286 NA   NA
 5934508 5934509 MMAR_4814 MMAR_4815   ansP1 FALSE 0.142 82.000 0.000 NA   NA
 5934509 5934510 MMAR_4815 MMAR_4816 ansP1   FALSE 0.281 44.000 0.000 NA   NA
 5934510 5934511 MMAR_4816 MMAR_4817     FALSE 0.017 190.000 0.000 NA   NA
 5934512 5934513 MMAR_4818 MMAR_4819     TRUE 0.992 -3.000 0.364 1.000   NA
 5934513 5934514 MMAR_4819 MMAR_4820     TRUE 0.926 3.000 0.182 1.000   NA
 5934514 5934515 MMAR_4820 MMAR_4821     TRUE 0.937 15.000 0.400 0.033   NA
 5934515 5934516 MMAR_4821 MMAR_4822     FALSE 0.005 298.000 0.000 NA   NA
 5934517 5934518 MMAR_4823 MMAR_4824 cspA rhlE1 TRUE 0.623 93.000 0.000 1.000 Y NA
 5934519 5934520 MMAR_5579 MMAR_4825   metH FALSE 0.002 489.000 0.000 NA   NA
 5934520 5934521 MMAR_4825 MMAR_4826 metH   FALSE 0.004 408.000 0.000 1.000   NA
 5934521 5934522 MMAR_4826 MMAR_4827     TRUE 0.982 0.000 0.500 NA   NA
 5934522 5934523 MMAR_4827 MMAR_4828     FALSE 0.002 480.000 0.000 NA   NA
 5934525 5934526 MMAR_4830 MMAR_4831     FALSE 0.205 54.000 0.000 NA   NA
 5934530 5934531 MMAR_4835 MMAR_4836     FALSE 0.008 244.000 0.000 NA   NA
 5934531 5934532 MMAR_4836 MMAR_4837     TRUE 0.924 -36.000 0.000 NA   NA
 5934533 5934534 MMAR_4838 MMAR_4839     TRUE 0.798 46.000 0.571 NA   NA
 5934537 5934538 MMAR_4842 MMAR_4843     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 5934538 5934539 MMAR_4843 MMAR_4844     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934539 5934540 MMAR_4844 MMAR_4845     TRUE 0.923 -1233.000 0.000 NA   NA
 5934540 5934541 MMAR_4845 MMAR_4846     FALSE 0.610 42.000 0.000 0.031   NA
 5934541 5934542 MMAR_4846 MMAR_4847     FALSE 0.003 532.000 0.000 1.000   NA
 5934542 5934543 MMAR_4847 MMAR_4848     TRUE 0.854 1.000 0.000 1.000   NA
 5934544 5934545 MMAR_5526 MMAR_5527 pheU aspT FALSE 0.397 28.000 0.000 NA   NA
 5934545 5934546 MMAR_5527 MMAR_5528 aspT gluT FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5934547 5934548 MMAR_5529 MMAR_4849 lysT   FALSE 0.013 205.000 0.000 NA   NA
 5934550 5934551 MMAR_4851 MMAR_4852     FALSE 0.533 58.000 0.286 1.000 N NA
 5934551 5934552 MMAR_4852 MMAR_4853     FALSE 0.196 57.000 0.000 NA   NA
 5934554 5934555 MMAR_4855 MMAR_4856   desA1 FALSE 0.162 168.000 0.375 1.000   NA
 5934555 5934556 MMAR_4856 MMAR_4857 desA1   TRUE 0.764 9.000 0.004 1.000   NA
 5934556 5934557 MMAR_4857 MMAR_4858     FALSE 0.006 267.000 0.005 NA N NA
 5934557 5934558 MMAR_4858 MMAR_4859   phoY2 TRUE 0.688 58.000 0.579 NA N NA
 5934559 5934560 MMAR_4860 MMAR_4861 phoT pstA TRUE 0.979 20.000 0.373 0.002 Y NA
 5934560 5934561 MMAR_4861 MMAR_4862 pstA pstC2_1 TRUE 0.998 -3.000 0.063 0.002 Y NA
 5934561 5934562 MMAR_4862 MMAR_4863 pstC2_1 phoS3 TRUE 0.917 57.000 0.278 0.002 Y NA
 5934562 5934563 MMAR_4863 MMAR_4864 phoS3 mshD FALSE 0.127 137.000 0.054 1.000   NA
 5934563 5934564 MMAR_4864 MMAR_4865 mshD   TRUE 0.986 -3.000 0.196 1.000   NA
 5934565 5934566 MMAR_4866 MMAR_4867     FALSE 0.005 300.000 0.000 NA   NA
 5934566 5934567 MMAR_4867 MMAR_4868   cysA2 FALSE 0.575 38.000 0.100 NA   NA
 5934567 5934568 MMAR_4868 MMAR_4869 cysA2 sseC2 TRUE 0.978 2.000 0.557 1.000   NA
 5934568 5934569 MMAR_4869 MMAR_4870 sseC2   FALSE 0.395 57.000 0.087 NA   NA
 5934569 5934570 MMAR_4870 MMAR_4871     TRUE 0.984 -3.000 0.194 NA   NA
 5934570 5934571 MMAR_4871 MMAR_4872     FALSE 0.066 126.000 0.000 NA   NA
 5934573 5934574 MMAR_4874 MMAR_4875     FALSE 0.168 102.000 0.012 NA   NA
 5934574 5934575 MMAR_4875 MMAR_4876   ctpV TRUE 0.992 -13.000 0.500 NA   NA
 5934575 5934576 MMAR_4876 MMAR_4877 ctpV   TRUE 0.872 37.000 0.667 NA   NA
 5934576 5934577 MMAR_4877 MMAR_4878     FALSE 0.441 22.000 0.000 NA   NA
 5934577 5934578 MMAR_4878 MMAR_4879     FALSE 0.048 159.000 0.017 NA   NA
 5934579 5934580 MMAR_4880 MMAR_4881 purM purF TRUE 0.825 64.000 0.248 1.000 Y NA
 5934580 5934581 MMAR_4881 MMAR_4882 purF   FALSE 0.087 139.000 0.034 NA   NA
 5934582 5934583 MMAR_4883 MMAR_4884 mce2A   FALSE 0.174 40.000 0.000 NA N NA
 5934583 5934584 MMAR_4884 MMAR_4885   cpsY FALSE 0.010 223.000 0.000 NA   NA
 5934585 5934586 MMAR_4886 MMAR_4887     FALSE 0.217 52.000 0.000 NA   NA
 5934586 5934587 MMAR_4887 MMAR_4888   purL FALSE 0.360 33.000 0.000 NA   NA
 5934589 5934590 MMAR_4890 MMAR_4891   pepC FALSE 0.592 25.000 0.038 NA   NA
 5934591 5934592 MMAR_4892 MMAR_4893   cfp29 TRUE 0.988 -3.000 0.267 NA   NA
 5934592 5934593 MMAR_4893 MMAR_4894 cfp29 lpdB FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 5934593 5934594 MMAR_4894 MMAR_4895 lpdB   FALSE 0.354 26.000 0.000 1.000 N NA
 5934594 5934595 MMAR_4895 MMAR_4896     FALSE 0.115 101.000 0.000 NA   NA
 5934596 5934597 MMAR_4897 MMAR_4898 purQ   TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 5934607 5934608 MMAR_4908 MMAR_4909 ptrB purC TRUE 0.967 -3.000 0.035 1.000 N NA
 5934610 5934611 MMAR_4911 MMAR_4912 adhX   FALSE 0.278 52.000 0.000 1.000   NA
 5934611 5934612 MMAR_4912 MMAR_4913     FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 5934612 5934613 MMAR_4913 MMAR_4914     FALSE 0.012 210.000 0.000 NA   NA
 5934613 5934614 MMAR_4914 MMAR_4915   cyp126A3 FALSE 0.005 287.000 0.000 NA   NA
 5934614 5934615 MMAR_4915 MMAR_4916 cyp126A3 purB TRUE 0.954 -3.000 0.006 1.000 N NA
 5934618 5934619 MMAR_4919 MMAR_4920   ggtA FALSE 0.342 68.000 0.073 NA   NA
 5934619 5934620 MMAR_4920 MMAR_4921 ggtA moeY FALSE 0.002 448.000 0.000 1.000 N NA
 5934623 5934624 MMAR_4924 MMAR_4925 purD   FALSE 0.465 39.000 0.003 1.000   NA
 5934624 5934625 MMAR_4925 MMAR_4926     TRUE 0.986 0.000 0.560 1.000   NA
 5934625 5934626 MMAR_4926 MMAR_4927     TRUE 0.928 47.000 0.480 1.000 Y NA
 5934626 5934627 MMAR_4927 MMAR_4928   aldA TRUE 0.972 11.000 0.812 0.082 N NA
 5934628 5934629 MMAR_4929 MMAR_4930   cyp123A3 TRUE 0.994 -3.000 0.571 1.000 N NA
 5934629 5934630 MMAR_4930 MMAR_4931 cyp123A3   TRUE 0.965 0.000 0.231 1.000   NA
 5934630 5934631 MMAR_4931 MMAR_4932   cyp51B1 TRUE 0.987 -3.000 0.212 1.000   NA
 5934631 5934632 MMAR_4932 MMAR_4933 cyp51B1   TRUE 0.986 0.000 0.733 NA N NA
 5934632 5934633 MMAR_4933 MMAR_4934     TRUE 0.974 6.000 0.800 NA   NA
 5934633 5934634 MMAR_4934 MMAR_4935   adhB FALSE 0.172 163.000 0.400 NA   NA
 5934634 5934635 MMAR_4935 MMAR_4936 adhB   FALSE 0.460 30.000 0.000 1.000   NA
 5934635 5934636 MMAR_4936 MMAR_4937     TRUE 0.812 3.000 0.000 1.000   NA
 5934638 5934639 MMAR_4939 MMAR_4940     TRUE 0.703 5.000 0.000 NA   NA
 5934640 5934641 MMAR_4941 MMAR_4942 phoR phoP TRUE 0.981 41.000 0.824 0.006 Y NA
 5934642 5934643 MMAR_4943 MMAR_5530   thrV FALSE 0.397 28.000 0.000 NA   NA
 5934643 5934644 MMAR_5530 MMAR_4944 thrV   FALSE 0.014 202.000 0.000 NA   NA
 5934645 5934646 MMAR_4945 MMAR_4946     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.059 Y NA
 5934646 5934647 MMAR_4946 MMAR_4947     TRUE 0.888 0.000 0.000 1.000   NA
 5934647 5934648 MMAR_4947 MMAR_4948     TRUE 0.777 38.000 0.389 NA   NA
 5934648 5934649 MMAR_4948 MMAR_4949     TRUE 0.929 1.000 0.152 NA   NA
 5934649 5934650 MMAR_4949 MMAR_4950   atsD FALSE 0.117 81.000 0.000 1.000 N NA
 5934652 5934653 MMAR_4952 MMAR_4953 echA8_3   FALSE 0.239 26.000 0.000 NA N NA
 5934658 5934659 MMAR_4958 MMAR_4959     FALSE 0.074 121.000 0.000 NA   NA
 5934660 5934661 MMAR_4960 MMAR_4961 bpoA   FALSE 0.105 105.000 0.000 NA   NA
 5934661 5934662 MMAR_4961 MMAR_4962     FALSE 0.142 83.000 0.000 NA   NA
 5934664 5934665 MMAR_4964 MMAR_4965     TRUE 0.811 69.000 1.000 NA   NA
 5934667 5934668 MMAR_4967 MMAR_4968     TRUE 0.986 4.000 0.087 0.045 Y NA
 5934668 5934669 MMAR_4968 MMAR_4969     FALSE 0.133 92.000 0.000 NA   NA
 5934669 5934670 MMAR_4969 MMAR_4970     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934670 5934671 MMAR_4970 MMAR_4971   bioF2 FALSE 0.036 141.000 0.000 1.000 N NA
 5934671 5934672 MMAR_4971 MMAR_4972 bioF2 echA13_1 FALSE 0.013 191.000 0.000 1.000 N NA
 5934672 5934673 MMAR_4972 MMAR_4973 echA13_1   FALSE 0.233 67.000 0.006 NA   NA
 5934673 5934674 MMAR_4973 MMAR_4974   pstB TRUE 0.901 0.000 0.012 NA   NA
 5934675 5934676 MMAR_4975 MMAR_4976     FALSE 0.178 91.000 0.000 1.000   NA
 5934676 5934677 MMAR_4976 MMAR_4977     FALSE 0.295 68.000 0.041 NA   NA
 5934677 5934678 MMAR_4977 MMAR_4978   otsA TRUE 0.986 1.000 0.800 NA   NA
 5934678 5934679 MMAR_4978 MMAR_4979 otsA   FALSE 0.370 88.000 0.200 NA   NA
 5934680 5934681 MMAR_4980 MMAR_4981     TRUE 0.990 0.000 0.800 NA   NA
 5934681 5934682 MMAR_4981 MMAR_4982   mce4F TRUE 0.883 33.000 0.667 NA   NA
 5934682 5934683 MMAR_4982 MMAR_4983 mce4F lprN TRUE 0.991 12.000 0.667 0.007 Y NA
 5934683 5934684 MMAR_4983 MMAR_4984 lprN mce4D TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.007 Y NA
 5934684 5934685 MMAR_4984 MMAR_4985 mce4D mce4C TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.007 Y NA
 5934685 5934686 MMAR_4985 MMAR_4986 mce4C mce4B TRUE 0.999 -10.000 0.667 0.007 Y NA
 5934686 5934687 MMAR_4986 MMAR_4987 mce4B mce4A TRUE 0.998 0.000 0.667 0.007 Y NA
 5934687 5934688 MMAR_4987 MMAR_4988 mce4A yrbE4B TRUE 0.986 16.000 1.000 NA Y NA
 5934688 5934689 MMAR_4988 MMAR_4989 yrbE4B yrbE4A TRUE 0.975 35.000 1.000 NA Y NA
 5934689 5934690 MMAR_4989 MMAR_4990 yrbE4A   FALSE 0.050 288.000 0.000 NA Y NA
 5934690 5934691 MMAR_4990 MMAR_4991   fdxD FALSE 0.558 71.000 0.429 NA N NA
 5934692 5934693 MMAR_4992 MMAR_4993 fadE26 fadE27 TRUE 0.986 31.000 0.882 0.012 Y NA
 5934693 5934694 MMAR_4993 MMAR_4994 fadE27 fadD17 TRUE 0.915 63.000 0.647 1.000 Y NA
 5934694 5934695 MMAR_4994 MMAR_4995 fadD17   FALSE 0.099 108.000 0.000 NA   NA
 5934695 5934696 MMAR_4995 MMAR_4996     TRUE 0.756 3.000 0.000 NA   NA
 5934697 5934698 MMAR_4997 MMAR_4998 ilvX   TRUE 0.822 13.000 0.167 1.000   NA
 5934700 5934701 MMAR_5000 MMAR_5001   fadD19_1 FALSE 0.601 14.000 0.038 NA N NA
 5934706 5934707 MMAR_5006 MMAR_5007   ltp4 TRUE 0.951 16.000 0.880 NA   NA
 5934707 5934708 MMAR_5007 MMAR_5008 ltp4 ltp3 TRUE 0.997 0.000 0.880 NA Y NA
 5934708 5934709 MMAR_5008 MMAR_5009 ltp3   TRUE 0.980 -3.000 0.217 NA N NA
 5934709 5934710 MMAR_5009 MMAR_5010     TRUE 0.992 -3.000 0.400 NA   NA
 5934710 5934711 MMAR_5010 MMAR_5011     FALSE 0.115 101.000 0.000 NA   NA
 5934711 5934712 MMAR_5011 MMAR_5012     FALSE 0.013 207.000 0.000 NA   NA
 5934712 5934713 MMAR_5012 MMAR_5013     FALSE 0.108 104.000 0.000 NA   NA
 5934715 5934716 MMAR_5015 MMAR_5016     TRUE 0.970 6.000 0.727 NA   NA
 5934717 5934718 MMAR_5017 MMAR_5018     TRUE 0.987 0.000 0.625 1.000   NA
 5934718 5934719 MMAR_5018 MMAR_5019     TRUE 0.846 14.000 0.273 NA   NA
 5934721 5934722 MMAR_5021 MMAR_5022   mhpF_1 TRUE 0.990 -3.000 0.333 1.000 N NA
 5934722 5934723 MMAR_5022 MMAR_5023 mhpF_1   TRUE 0.894 44.000 0.231 1.000 Y NA
 5934724 5934725 MMAR_5024 MMAR_5025     TRUE 0.985 2.000 0.625 0.044 N NA
 5934726 5934727 MMAR_5026 MMAR_5027   ltp2_1 FALSE 0.058 131.000 0.000 NA   NA
 5934727 5934728 MMAR_5027 MMAR_5028 ltp2_1   TRUE 0.982 0.000 0.500 NA   NA
 5934728 5934729 MMAR_5028 MMAR_5029     TRUE 0.997 -3.000 0.889 NA   NA
 5934729 5934730 MMAR_5029 MMAR_5030   fadE29 TRUE 0.995 -3.000 0.652 NA   NA
 5934730 5934731 MMAR_5030 MMAR_5031 fadE29 fadE28 TRUE 0.999 -15.000 0.696 0.012 Y NA
 5934731 5934732 MMAR_5031 MMAR_5032 fadE28 cyp125A7 TRUE 0.908 18.000 0.381 0.058 N NA
 5934733 5934734 MMAR_5033 MMAR_5034 fadA5   TRUE 0.914 8.000 0.312 NA   NA
 5934734 5934735 MMAR_5034 MMAR_5035     FALSE 0.234 64.000 0.004 NA   NA
 5934736 5934737 MMAR_5036 MMAR_5037     TRUE 0.981 21.000 0.515 0.044 Y NA
 5934737 5934738 MMAR_5037 MMAR_5038     FALSE 0.136 90.000 0.000 NA   NA
 5934739 5934740 MMAR_5039 MMAR_5040 echA20   TRUE 0.999 -3.000 0.647 0.082 Y NA
 5934740 5934741 MMAR_5040 MMAR_5041     TRUE 1.000 -3.000 0.912 0.000 Y NA
 5934741 5934742 MMAR_5041 MMAR_5042     TRUE 0.995 -3.000 0.561 1.000   NA
 5934742 5934743 MMAR_5042 MMAR_5043   fdxB TRUE 0.749 31.000 0.037 0.058   NA
 5934744 5934745 MMAR_5044 MMAR_5045   fadA6_1 FALSE 0.013 204.000 0.000 NA   NA
 5934745 5934746 MMAR_5045 MMAR_5046 fadA6_1   TRUE 0.958 3.000 0.423 1.000 N NA
 5934748 5934749 MMAR_5048 MMAR_5049   fadE30 TRUE 0.999 -3.000 0.629 1.000 Y NA
 5934750 5934751 MMAR_5050 MMAR_5051 fadD3 fadE31 TRUE 0.989 1.000 0.242 1.000 Y NA
 5934751 5934752 MMAR_5051 MMAR_5052 fadE31 fadE32 TRUE 0.997 4.000 0.879 0.012 Y NA
 5934752 5934753 MMAR_5052 MMAR_5053 fadE32 fadE33 TRUE 0.948 50.000 0.484 0.012 Y NA
 5934753 5934754 MMAR_5053 MMAR_5054 fadE33 aspB TRUE 0.963 -3.000 0.024 1.000 N NA
 5934756 5934757 MMAR_5056 MMAR_5057   dsbF FALSE 0.022 300.000 0.000 0.003   NA
 5934757 5934758 MMAR_5057 MMAR_5058 dsbF   TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5934759 5934760 MMAR_5059 MMAR_5060     TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5934762 5934763 MMAR_5062 MMAR_5063   bphC TRUE 0.937 12.000 0.520 1.000   NA
 5934763 5934764 MMAR_5063 MMAR_5064 bphC bphD TRUE 0.996 -3.000 0.733 1.000   NA
 5934764 5934765 MMAR_5064 MMAR_5065 bphD   TRUE 0.990 0.000 0.733 1.000   NA
 5934766 5934767 MMAR_5066 MMAR_5067 hmp   TRUE 0.844 46.000 0.727 NA   NA
 5934771 5934772 MMAR_5071 MMAR_5072     TRUE 0.972 9.000 0.204 1.000 Y NA
 5934772 5934773 MMAR_5072 MMAR_5073     TRUE 0.998 -3.000 0.291 0.052 Y NA
 5934773 5934774 MMAR_5073 MMAR_5074   lppH FALSE 0.139 87.000 0.000 NA   NA
 5934774 5934775 MMAR_5074 MMAR_5075 lppH   FALSE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 5934775 5934776 MMAR_5075 MMAR_5076   lamB FALSE 0.469 19.000 0.000 NA   NA
 5934776 5934777 MMAR_5076 MMAR_5077 lamB   TRUE 0.921 0.000 0.039 NA   NA
 5934777 5934778 MMAR_5077 MMAR_5078   arsB2 TRUE 0.668 23.000 0.078 NA   NA
 5934779 5934780 MMAR_5079 MMAR_5080   cysS1 TRUE 0.986 1.000 0.088 1.000 Y NA
 5934780 5934781 MMAR_5080 MMAR_5081 cysS1 ispF FALSE 0.294 58.000 0.037 1.000 N NA
 5934781 5934782 MMAR_5081 MMAR_5082 ispF ispD TRUE 0.998 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 5934782 5934783 MMAR_5082 MMAR_5083 ispD   TRUE 0.682 17.000 0.068 1.000 N NA
 5934784 5934785 MMAR_5084 MMAR_5085 lpqE radA FALSE 0.410 42.000 0.014 NA   NA
 5934785 5934786 MMAR_5085 MMAR_5086 radA   TRUE 0.722 19.000 0.126 NA   NA
 5934787 5934788 MMAR_5087 MMAR_5088     FALSE 0.493 90.000 0.333 NA   NA
 5934791 5934792 MMAR_5091 MMAR_5092   lpqF TRUE 0.975 -25.000 0.160 NA   NA
 5934793 5934794 MMAR_5093 MMAR_5094 ppm1_2   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934794 5934795 MMAR_5094 MMAR_5095   idsA1 TRUE 0.665 11.000 0.000 1.000   NA
 5934795 5934796 MMAR_5095 MMAR_5096 idsA1 gpmB FALSE 0.005 226.000 0.000 NA N NA
 5934796 5934797 MMAR_5096 MMAR_5097 gpmB   TRUE 0.650 8.000 0.000 NA   NA
 5934797 5934798 MMAR_5097 MMAR_5098     TRUE 0.936 -9.000 0.000 NA   NA
 5934798 5934799 MMAR_5098 MMAR_5099     FALSE 0.020 177.000 0.000 NA   NA
 5934799 5934800 MMAR_5099 MMAR_5100   clpC1 FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 5934800 5934801 MMAR_5100 MMAR_5101 clpC1 lsr2 FALSE 0.003 378.000 0.000 NA   NA
 5934801 5934802 MMAR_5101 MMAR_5102 lsr2 lysS FALSE 0.287 115.000 0.247 NA   NA
 5934802 5934803 MMAR_5102 MMAR_5103 lysS   FALSE 0.100 122.000 0.015 1.000 N NA
 5934803 5934804 MMAR_5103 MMAR_5104   panD TRUE 0.838 3.000 0.030 1.000 N NA
 5934804 5934805 MMAR_5104 MMAR_5105 panD panC TRUE 0.994 0.000 0.342 1.000 Y NA
 5934805 5934806 MMAR_5105 MMAR_5106 panC   TRUE 0.981 -3.000 0.067 1.000   NA
 5934806 5934807 MMAR_5106 MMAR_5107     FALSE 0.274 88.000 0.054 NA   NA
 5934807 5934808 MMAR_5107 MMAR_5108     FALSE 0.298 112.000 0.237 NA   NA
 5934808 5934809 MMAR_5108 MMAR_5109   folK TRUE 0.938 0.000 0.081 NA   NA
 5934809 5934810 MMAR_5109 MMAR_5110 folK folB TRUE 0.996 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 5934810 5934811 MMAR_5110 MMAR_5111 folB folP1 TRUE 0.998 -7.000 0.471 1.000 Y NA
 5934811 5934812 MMAR_5111 MMAR_5112 folP1 folE TRUE 0.999 -3.000 0.609 1.000 Y NA
 5934812 5934813 MMAR_5112 MMAR_5113 folE ftsH TRUE 0.768 17.000 0.212 1.000 N NA
 5934814 5934815 MMAR_5114 MMAR_5115 ephA   TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5934815 5934816 MMAR_5115 MMAR_5116     TRUE 0.983 0.000 0.625 NA N NA
 5934817 5934818 MMAR_5117 MMAR_5118     FALSE 0.546 13.000 0.000 NA   NA
 5934818 5934819 MMAR_5118 MMAR_5119   esxN_2 FALSE 0.002 697.000 0.000 NA   NA
 5934819 5934820 MMAR_5119 MMAR_5120 esxN_2 esxP_1 FALSE 0.321 39.000 0.000 NA   NA
 5934820 5934821 MMAR_5120 MMAR_5121 esxP_1   FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 5934821 5934822 MMAR_5121 MMAR_5122     TRUE 0.938 14.000 0.667 NA   NA
 5934824 5934825 MMAR_5124 MMAR_5125 hpt mesJ FALSE 0.595 54.000 0.137 0.020 N NA
 5934825 5934826 MMAR_5125 MMAR_5126 mesJ   TRUE 0.967 -21.000 0.050 NA   NA
 5934826 5934827 MMAR_5126 MMAR_5127   dacB1 TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5934830 5934831 MMAR_5130 MMAR_5131     FALSE 0.491 48.000 0.125 NA   NA
 5934831 5934832 MMAR_5131 MMAR_5132     TRUE 0.980 -3.000 0.135 NA   NA
 5934834 5934835 MMAR_5134 MMAR_5135     FALSE 0.043 142.000 0.000 NA   NA
 5934836 5934837 MMAR_5531 MMAR_5136 thrU   FALSE 0.144 80.000 0.000 NA   NA
 5934839 5934840 MMAR_5138 MMAR_5139 topA   FALSE 0.020 204.000 0.008 NA   NA
 5934840 5934841 MMAR_5139 MMAR_5140   cspA_1 FALSE 0.325 145.000 0.611 NA   NA
 5934842 5934843 MMAR_5141 MMAR_5142     FALSE 0.005 492.000 0.043 NA   NA
 5934844 5934845 MMAR_5143 MMAR_5577     TRUE 0.625 32.000 0.118 NA   NA
 5934845 5934846 MMAR_5577 MMAR_5144     FALSE 0.413 57.000 0.119 NA   NA
 5934846 5934847 MMAR_5144 MMAR_5145     TRUE 0.716 25.000 0.190 NA   NA
 5934847 5934848 MMAR_5145 MMAR_5146     TRUE 0.801 26.000 0.323 NA   NA
 5934848 5934849 MMAR_5146 MMAR_5147     TRUE 0.999 -3.000 0.659 NA Y NA
 5934849 5934850 MMAR_5147 MMAR_5148     TRUE 0.996 -3.000 0.776 1.000 N NA
 5934852 5934853 MMAR_5556 MMAR_5150     FALSE 0.211 53.000 0.000 NA   NA
 5934853 5934854 MMAR_5150 MMAR_5151   dppD TRUE 0.814 12.000 0.104 1.000   NA
 5934854 5934855 MMAR_5151 MMAR_5152 dppD dppC TRUE 0.996 -3.000 0.725 1.000   NA
 5934855 5934856 MMAR_5152 MMAR_5153 dppC dppB TRUE 0.999 -7.000 0.811 0.009 Y NA
 5934856 5934857 MMAR_5153 MMAR_5154 dppB dppA TRUE 0.991 2.000 0.147 0.009 Y NA
 5934860 5934861 MMAR_5157 MMAR_5158   ephE TRUE 0.974 1.000 0.494 NA   NA
 5934862 5934863 MMAR_5159 MMAR_5160     TRUE 0.992 -3.000 0.367 1.000   NA
 5934863 5934864 MMAR_5160 MMAR_5161     TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5934864 5934865 MMAR_5161 MMAR_5162   nth FALSE 0.532 11.000 0.000 1.000 N NA
 5934866 5934867 MMAR_5163 MMAR_5164     FALSE 0.282 99.000 0.116 NA   NA
 5934868 5934869 MMAR_5165 MMAR_5166     TRUE 0.816 6.000 0.039 NA   NA
 5934869 5934870 MMAR_5166 MMAR_5167     TRUE 0.684 22.000 0.094 NA   NA
 5934871 5934872 MMAR_5168 MMAR_5169     TRUE 0.999 -3.000 0.709 0.001 Y NA
 5934874 5934875 MMAR_5171 MMAR_5172 ponA2   FALSE 0.389 67.000 0.072 1.000   NA
 5934875 5934876 MMAR_5172 MMAR_5173   cysK TRUE 0.980 -3.000 0.057 1.000   NA
 5934876 5934877 MMAR_5173 MMAR_5532 cysK proY FALSE 0.183 61.000 0.000 NA   NA
 5934878 5934879 MMAR_5174 MMAR_5175   cyp137A2 FALSE 0.160 71.000 0.000 NA   NA
 5934879 5934880 MMAR_5175 MMAR_5176 cyp137A2   FALSE 0.314 40.000 0.000 NA   NA
 5934880 5934881 MMAR_5176 MMAR_5177     FALSE 0.136 90.000 0.000 NA   NA
 5934881 5934882 MMAR_5177 MMAR_5178     FALSE 0.044 141.000 0.000 NA   NA
 5934882 5934883 MMAR_5178 MMAR_5180     FALSE 0.005 291.000 0.000 NA   NA
 5934883 5934884 MMAR_5180 MMAR_5181     FALSE 0.459 72.000 0.250 NA   NA
 5934885 5934886 MMAR_5182 MMAR_5183     TRUE 0.884 32.000 0.041 NA Y NA
 5934886 5934887 MMAR_5183 MMAR_5184     TRUE 0.970 5.000 0.052 NA Y NA
 5934887 5934888 MMAR_5184 MMAR_5185     TRUE 0.978 -7.000 0.058 1.000   NA
 5934888 5934889 MMAR_5185 MMAR_5186     TRUE 0.991 -3.000 0.029 0.001   NA
 5934890 5934891 MMAR_5187 MMAR_5188     FALSE 0.281 44.000 0.000 NA   NA
 5934891 5934892 MMAR_5188 MMAR_5189     FALSE 0.022 192.000 0.000 1.000   NA
 5934893 5934894 MMAR_5533 MMAR_5190 selC selA FALSE 0.469 19.000 0.000 NA   NA
 5934894 5934895 MMAR_5190 MMAR_5191 selA selB TRUE 0.997 -12.000 0.569 0.000 N NA
 5934897 5934898 MMAR_5193 MMAR_5194     FALSE 0.187 83.000 0.000 1.000   NA
 5934898 5934899 MMAR_5194 MMAR_5195     TRUE 0.761 97.000 0.500 0.001   NA
 5934899 5934900 MMAR_5195 MMAR_5196   hybA TRUE 0.978 -3.000 0.083 NA   NA
 5934900 5934901 MMAR_5196 MMAR_5197 hybA nrfD TRUE 0.996 -3.000 0.806 NA N NA
 5934903 5934904 MMAR_5199 MMAR_5200     TRUE 0.909 21.000 0.628 NA   NA
 5934904 5934905 MMAR_5200 MMAR_5201     TRUE 0.991 0.000 0.841 NA   NA
 5934905 5934906 MMAR_5201 MMAR_5202   moxR2 TRUE 0.989 -3.000 0.302 NA   NA
 5934906 5934907 MMAR_5202 MMAR_5203 moxR2   TRUE 0.986 0.000 0.648 NA   NA
 5934909 5934910 MMAR_5205 MMAR_5206     FALSE 0.052 134.000 0.000 NA   NA
 5934910 5934911 MMAR_5206 MMAR_5207     FALSE 0.029 160.000 0.000 NA   NA
 11425390 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 2088.000 0.000 NA   NA
 11567753 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 2088.000 0.000 NA   NA
 11710145 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 2088.000 0.000 NA   NA
 11425391 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1978.000 0.000 NA   NA
 11567754 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1978.000 0.000 NA   NA
 11710146 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1978.000 0.000 NA   NA
 11425392 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1959.000 0.000 NA   NA
 11567755 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1959.000 0.000 NA   NA
 11710147 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1959.000 0.000 NA   NA
 11425393 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1873.000 0.000 NA   NA
 11567756 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1873.000 0.000 NA   NA
 11710148 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1873.000 0.000 NA   NA
 11425394 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1854.000 0.000 NA   NA
 11567757 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1854.000 0.000 NA   NA
 11710149 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1854.000 0.000 NA   NA
 11425395 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1780.000 0.000 NA   NA
 11567758 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1780.000 0.000 NA   NA
 11710150 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1780.000 0.000 NA   NA
 11425396 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1761.000 0.000 NA   NA
 11567759 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1761.000 0.000 NA   NA
 11710151 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1761.000 0.000 NA   NA
 11425397 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1699.000 0.000 NA   NA
 11567760 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1699.000 0.000 NA   NA
 11710152 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1699.000 0.000 NA   NA
 11425398 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1680.000 0.000 NA   NA
 11567761 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1680.000 0.000 NA   NA
 11710153 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1680.000 0.000 NA   NA
 11425399 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1651.000 0.000 NA   NA
 11567762 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1651.000 0.000 NA   NA
 11710154 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1651.000 0.000 NA   NA
 11425400 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1632.000 0.000 NA   NA
 11567763 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1632.000 0.000 NA   NA
 11710155 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1632.000 0.000 NA   NA
 11425401 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1591.000 0.000 NA   NA
 11567764 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1591.000 0.000 NA   NA
 11710156 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1591.000 0.000 NA   NA
 11425402 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1572.000 0.000 NA   NA
 11567765 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1572.000 0.000 NA   NA
 11710157 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1572.000 0.000 NA   NA
 11425403 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1552.000 0.000 NA   NA
 11567766 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1552.000 0.000 NA   NA
 11710158 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1552.000 0.000 NA   NA
 11425404 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1533.000 0.000 NA   NA
 11567767 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1533.000 0.000 NA   NA
 11710159 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1533.000 0.000 NA   NA
 11425405 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1495.000 0.000 NA   NA
 11567768 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1495.000 0.000 NA   NA
 11710160 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1495.000 0.000 NA   NA
 11425406 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1476.000 0.000 NA   NA
 11567769 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1476.000 0.000 NA   NA
 11710161 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1476.000 0.000 NA   NA
 11425407 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1450.000 0.000 NA   NA
 11567770 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1450.000 0.000 NA   NA
 11710162 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1450.000 0.000 NA   NA
 11425408 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1431.000 0.000 NA   NA
 11567771 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1431.000 0.000 NA   NA
 11710163 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1431.000 0.000 NA   NA
 11425409 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1381.000 0.000 NA   NA
 11567772 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1381.000 0.000 NA   NA
 11710164 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1381.000 0.000 NA   NA
 11425410 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1362.000 0.000 NA   NA
 11567773 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1362.000 0.000 NA   NA
 11710165 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1362.000 0.000 NA   NA
 11425411 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1330.000 0.000 NA   NA
 11567774 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1330.000 0.000 NA   NA
 11710166 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1330.000 0.000 NA   NA
 11425412 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1311.000 0.000 NA   NA
 11567775 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1311.000 0.000 NA   NA
 11710167 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1311.000 0.000 NA   NA
 11425413 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1276.000 0.000 NA   NA
 11567776 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1276.000 0.000 NA   NA
 11710168 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1276.000 0.000 NA   NA
 11425414 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1257.000 0.000 NA   NA
 11567777 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1257.000 0.000 NA   NA
 11710169 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1257.000 0.000 NA   NA
 11425415 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1231.000 0.000 NA   NA
 11567778 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1231.000 0.000 NA   NA
 11710170 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1231.000 0.000 NA   NA
 11425416 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1212.000 0.000 NA   NA
 11567779 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1212.000 0.000 NA   NA
 11710171 5934912   MMAR_5208   glpK FALSE NA 1212.000 0.000 NA   NA
 5934913 5934914 MMAR_5209 MMAR_5210     TRUE 0.860 11.000 0.200 1.000   NA
 5934915 5934916 MMAR_5211 MMAR_5212 csdB   TRUE 0.978 -3.000 0.077 NA   NA
 5934916 5934917 MMAR_5212 MMAR_5213     TRUE 0.990 -3.000 0.316 NA   NA
 5934917 5934918 MMAR_5213 MMAR_5214     TRUE 0.985 0.000 0.597 NA   NA
 5934918 5934919 MMAR_5214 MMAR_5215   gshA TRUE 0.991 -3.000 0.337 NA   NA
 5934919 5934920 MMAR_5215 MMAR_5216 gshA   FALSE 0.085 148.000 0.063 NA   NA
 5934920 5934921 MMAR_5216 MMAR_5217   katE FALSE 0.380 30.000 0.000 NA   NA
 5934921 5934922 MMAR_5217 MMAR_5218 katE   FALSE 0.021 175.000 0.000 NA   NA
 5934922 5934923 MMAR_5218 MMAR_5219     FALSE 0.531 119.000 0.667 NA   NA
 5934923 5934924 MMAR_5219 MMAR_5220     FALSE 0.151 143.000 0.222 NA   NA
 5934924 5934925 MMAR_5220 MMAR_5221   asd TRUE 0.748 8.000 0.012 NA   NA
 5934925 5934926 MMAR_5221 MMAR_5222 asd ask TRUE 0.985 2.000 0.119 1.000 Y NA
 5934930 5934931 MMAR_5226 MMAR_5227     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5934931 5934932 MMAR_5227 MMAR_5228   dnaQ FALSE 0.256 47.000 0.000 NA   NA
 5934933 5934934 MMAR_5229 MMAR_5230   cobQ2 TRUE 0.996 -7.000 0.796 1.000   NA
 5934935 5934936 MMAR_5231 MMAR_5232 recR   TRUE 0.945 12.000 0.604 1.000   NA
 5934939 5934940 MMAR_5235 MMAR_5236     TRUE 0.995 -3.000 0.633 1.000 N NA
 5934940 5934941 MMAR_5236 MMAR_5237     FALSE 0.546 13.000 0.000 NA   NA
 5934941 5934942 MMAR_5237 MMAR_5238     FALSE 0.321 39.000 0.000 NA   NA
 5934942 5934943 MMAR_5238 MMAR_5239     TRUE 0.995 -3.000 0.571 NA   NA
 5934944 5934945 MMAR_5240 MMAR_5241 dnaZX   FALSE 0.336 59.000 0.061 1.000 N NA
 5934946 5934947 MMAR_5534 MMAR_5242 serV   FALSE 0.142 83.000 0.000 NA   NA
 5934949 5934950 MMAR_5244 MMAR_5245     TRUE 0.888 0.000 0.000 1.000   NA
 5934950 5934951 MMAR_5245 MMAR_5246     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5934953 5934954 MMAR_5248 MMAR_5249     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5934954 5934955 MMAR_5249 MMAR_5250     TRUE 0.697 41.000 0.286 NA   NA
 5934955 5934956 MMAR_5250 MMAR_5251   cut5 FALSE 0.119 113.000 0.000 1.000   NA
 5934956 5934957 MMAR_5251 MMAR_5252 cut5   FALSE 0.381 41.000 0.000 1.000   NA
 5934958 5934959 MMAR_5253 MMAR_5254     FALSE 0.153 101.000 0.000 1.000   NA
 5934960 5934961 MMAR_5255 MMAR_5256     TRUE 0.981 -3.000 0.143 NA   NA
 5934963 5934964 MMAR_5258 MMAR_5259     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5934966 5934967 MMAR_5261 MMAR_5262     FALSE 0.167 68.000 0.000 NA   NA
 5934967 5934968 MMAR_5262 MMAR_5263     FALSE 0.045 140.000 0.000 NA   NA
 5934970 5934971 MMAR_5266 MMAR_5267 ligC   FALSE 0.121 99.000 0.000 NA   NA
 5934974 5934975 MMAR_5270 MMAR_5271     TRUE 0.778 8.000 0.029 NA   NA
 5934975 5934976 MMAR_5271 MMAR_5272   acrA1_1 FALSE 0.163 70.000 0.000 NA   NA
 5934977 5934978 MMAR_5273 MMAR_5274     FALSE 0.273 45.000 0.000 NA   NA
 5934981 5934982 MMAR_5277 MMAR_5278     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 5934982 5934983 MMAR_5278 MMAR_5279     FALSE 0.281 44.000 0.000 NA   NA
 5934984 5934985 MMAR_5280 MMAR_5281     TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   NA
 5934987 5934988 MMAR_5283 MMAR_5284   pepN_1 TRUE 0.996 -3.000 0.667 1.000   NA
 5934989 5934990 MMAR_5285 MMAR_5286     FALSE 0.248 65.000 0.012 NA   NA
 5934992 5934993 MMAR_5288 MMAR_5289     TRUE 0.982 -3.000 0.091 1.000   NA
 5934993 5934994 MMAR_5289 MMAR_5290     TRUE 0.879 15.000 0.375 NA   NA
 5934995 5934996 MMAR_5291 MMAR_5292     FALSE 0.158 72.000 0.000 NA   NA
 5934996 5934997 MMAR_5292 MMAR_5293     FALSE 0.187 60.000 0.000 NA   NA
 5934998 5934999 MMAR_5294 MMAR_5535   serX FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 5934999 5935000 MMAR_5535 MMAR_5295 serX   FALSE 0.380 30.000 0.000 NA   NA
 5935000 5935001 MMAR_5295 MMAR_5296     TRUE 0.975 -3.000 0.053 NA   NA
 5935003 5935004 MMAR_5298 MMAR_5299   proZ TRUE 0.876 5.000 0.136 NA   NA
 5935004 5935005 MMAR_5299 MMAR_5300 proZ proW TRUE 1.000 -3.000 0.918 0.009 Y NA
 5935005 5935006 MMAR_5300 MMAR_5301 proW proV TRUE 0.989 10.000 0.694 1.000 Y NA
 5935006 5935007 MMAR_5301 MMAR_5302 proV proX TRUE 0.669 20.000 0.085 1.000 N NA
 5935009 5935010 MMAR_5304 MMAR_5305 fadE36   FALSE 0.438 86.000 0.267 NA   NA
 5935011 5935012 MMAR_5306 MMAR_5307     FALSE 0.017 189.000 0.000 NA   NA
 5935012 5935013 MMAR_5307 MMAR_5308     FALSE 0.007 263.000 0.000 NA   NA
 5935013 5935014 MMAR_5308 MMAR_5309     FALSE 0.142 82.000 0.000 NA   NA
 5935014 5935015 MMAR_5309 MMAR_5310     TRUE 0.934 2.000 0.214 NA   NA
 5935015 5935016 MMAR_5310 MMAR_5311   fadE1_1 TRUE 0.950 18.000 0.214 1.000 Y NA
 5935016 5935017 MMAR_5311 MMAR_5312 fadE1_1   TRUE 0.993 -3.000 0.400 1.000   NA
 5935017 5935018 MMAR_5312 MMAR_5313     TRUE 0.973 1.000 0.400 1.000   NA
 5935021 5935022 MMAR_5316 MMAR_5317 tcrY tcrX TRUE 0.999 -22.000 0.742 1.000 Y NA
 5935022 5935023 MMAR_5317 MMAR_5318 tcrX   FALSE 0.179 118.000 0.065 NA   NA
 5935023 5935024 MMAR_5318 MMAR_5319     TRUE 0.915 12.000 0.438 NA   NA
 5935024 5935025 MMAR_5319 MMAR_5320     FALSE 0.281 44.000 0.000 NA   NA
 5935025 5935026 MMAR_5320 MMAR_5321     FALSE 0.169 67.000 0.000 NA   NA
 5935026 5935027 MMAR_5321 MMAR_5322     FALSE 0.041 144.000 0.000 NA   NA
 5935027 5935028 MMAR_5322 MMAR_5323     FALSE 0.021 175.000 0.000 NA   NA
 5935029 5935030 MMAR_5324 MMAR_5325     TRUE 0.684 6.000 0.000 NA   NA
 5935031 5935032 MMAR_5536 MMAR_5537 argU serT FALSE 0.360 33.000 0.000 NA   NA
 5935033 5935034 MMAR_5326 MMAR_5327 hisC2   TRUE 0.977 -3.000 0.065 NA   NA
 5935036 5935037 MMAR_5329 MMAR_5330 echA21 lipE FALSE 0.586 37.000 0.148 1.000 N NA
 5935038 5935039 MMAR_5331 MMAR_5538   serU FALSE 0.003 419.000 0.000 NA   NA
 5935042 5935043 MMAR_5334 MMAR_5335     TRUE 0.766 13.000 0.093 NA   NA
 5935043 5935044 MMAR_5335 MMAR_5336   rfbE TRUE 0.888 4.000 0.136 NA   NA
 5935044 5935045 MMAR_5336 MMAR_5337 rfbE   TRUE 0.988 -7.000 0.303 NA   NA
 5935045 5935046 MMAR_5337 MMAR_5338   rfbD TRUE 0.985 -3.000 0.220 NA   NA
 5935046 5935047 MMAR_5338 MMAR_5339 rfbD   FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 5935050 5935051 MMAR_5342 MMAR_5343     TRUE 0.986 -3.000 0.286 NA N NA
 11425417 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2739.000 0.000 NA   NA
 11567780 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2739.000 0.000 NA   NA
 11710172 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2739.000 0.000 NA   NA
 11425418 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2759.000 0.000 NA   NA
 11567781 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2759.000 0.000 NA   NA
 11710173 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2759.000 0.000 NA   NA
 11425419 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2796.000 0.000 NA   NA
 11567782 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2796.000 0.000 NA   NA
 11710174 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2796.000 0.000 NA   NA
 11425420 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2816.000 0.000 NA   NA
 11567783 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2816.000 0.000 NA   NA
 11710175 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2816.000 0.000 NA   NA
 11425421 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2880.000 0.000 NA   NA
 11567784 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2880.000 0.000 NA   NA
 11710176 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2880.000 0.000 NA   NA
 11425422 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2900.000 0.000 NA   NA
 11567785 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2900.000 0.000 NA   NA
 11710177 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2900.000 0.000 NA   NA
 11425423 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2955.000 0.000 NA   NA
 11567786 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2955.000 0.000 NA   NA
 11710178 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2955.000 0.000 NA   NA
 11425424 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2975.000 0.000 NA   NA
 11567787 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2975.000 0.000 NA   NA
 11710179 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 2975.000 0.000 NA   NA
 11425425 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3003.000 0.000 NA   NA
 11567788 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3003.000 0.000 NA   NA
 11710180 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3003.000 0.000 NA   NA
 11425426 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3023.000 0.000 NA   NA
 11567789 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3023.000 0.000 NA   NA
 11710181 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3023.000 0.000 NA   NA
 11425427 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3051.000 0.000 NA   NA
 11567790 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3051.000 0.000 NA   NA
 11710182 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3051.000 0.000 NA   NA
 11425428 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3071.000 0.000 NA   NA
 11567791 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3071.000 0.000 NA   NA
 11710183 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3071.000 0.000 NA   NA
 11425429 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3093.000 0.000 NA   NA
 11567792 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3093.000 0.000 NA   NA
 11710184 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3093.000 0.000 NA   NA
 11425430 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3113.000 0.000 NA   NA
 11567793 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3113.000 0.000 NA   NA
 11710185 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3113.000 0.000 NA   NA
 11425431 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3147.000 0.000 NA   NA
 11567794 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3147.000 0.000 NA   NA
 11710186 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3147.000 0.000 NA   NA
 11425432 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3167.000 0.000 NA   NA
 11567795 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3167.000 0.000 NA   NA
 11710187 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3167.000 0.000 NA   NA
 11425433 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3192.000 0.000 NA   NA
 11567796 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3192.000 0.000 NA   NA
 11710188 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3192.000 0.000 NA   NA
 11425434 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3212.000 0.000 NA   NA
 11567797 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3212.000 0.000 NA   NA
 11710189 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3212.000 0.000 NA   NA
 11425435 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3246.000 0.000 NA   NA
 11567798 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3246.000 0.000 NA   NA
 11710190 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3246.000 0.000 NA   NA
 11425436 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3266.000 0.000 NA   NA
 11567799 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3266.000 0.000 NA   NA
 11710191 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3266.000 0.000 NA   NA
 11425437 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3309.000 0.000 NA   NA
 11567800 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3309.000 0.000 NA   NA
 11710192 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3309.000 0.000 NA   NA
 11425438 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3329.000 0.000 NA   NA
 11567801 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3329.000 0.000 NA   NA
 11710193 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3329.000 0.000 NA   NA
 11425439 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3354.000 0.000 NA   NA
 11567802 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3354.000 0.000 NA   NA
 11710194 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3354.000 0.000 NA   NA
 11425440 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3374.000 0.000 NA   NA
 11567803 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3374.000 0.000 NA   NA
 11710195 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3374.000 0.000 NA   NA
 11425441 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3426.000 0.000 NA   NA
 11567804 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3426.000 0.000 NA   NA
 11710196 5935049   MMAR_5341     FALSE NA 3426.000 0.000 NA   NA
 5935056 5935057 MMAR_5348 MMAR_5349     FALSE 0.360 33.000 0.000 NA   NA
 5935057 5935058 MMAR_5349 MMAR_5350     FALSE 0.015 195.000 0.000 NA   NA
 5935058 5935059 MMAR_5350 MMAR_5351     FALSE 0.593 60.000 0.300 1.000   NA
 5935059 5935060 MMAR_5351 MMAR_5352     FALSE 0.244 100.000 0.033 1.000   NA
 5935060 5935061 MMAR_5352 MMAR_5353     TRUE 0.955 1.000 0.242 1.000   NA
 5935061 5935062 MMAR_5353 MMAR_5354     TRUE 0.970 3.000 0.543 NA   NA
 5935062 5935063 MMAR_5354 MMAR_5355   embC TRUE 0.974 0.000 0.360 NA   NA
 5935063 5935064 MMAR_5355 MMAR_5356 embC embA FALSE 0.199 210.000 0.455 0.001   NA
 5935064 5935065 MMAR_5356 MMAR_5357 embA embB TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.001   NA
 5935065 5935066 MMAR_5357 MMAR_5358 embB   FALSE 0.450 67.000 0.182 1.000   NA
 5935066 5935067 MMAR_5358 MMAR_5359     FALSE 0.022 173.000 0.000 NA   NA
 5935067 5935068 MMAR_5359 MMAR_5360     FALSE 0.042 143.000 0.000 NA   NA
 5935068 5935069 MMAR_5360 MMAR_5361   fadE35 FALSE 0.211 53.000 0.000 NA   NA
 5935069 5935070 MMAR_5361 MMAR_5362 fadE35   FALSE 0.052 134.000 0.000 NA   NA
 5935071 5935072 MMAR_5363 MMAR_5364 accD4_1 pks13 TRUE 0.989 0.000 0.800 1.000 N NA
 5935072 5935073 MMAR_5364 MMAR_5365 pks13 fadD32 TRUE 0.970 23.000 0.520 1.000 Y NA
 5935073 5935074 MMAR_5365 MMAR_5366 fadD32   FALSE 0.025 317.000 0.091 0.077   NA
 5935074 5935075 MMAR_5366 MMAR_5367   fbpD FALSE 0.026 237.000 0.136 NA   NA
 5935075 5935076 MMAR_5367 MMAR_5368 fbpD fbpA FALSE 0.079 176.000 0.222 NA   NA
 5935076 5935077 MMAR_5368 MMAR_5369 fbpA   FALSE 0.003 397.000 0.000 NA   NA
 5935077 5935078 MMAR_5369 MMAR_5370     FALSE 0.479 47.000 0.086 NA   NA
 5935078 5935079 MMAR_5370 MMAR_5371     TRUE 0.978 -3.000 0.136 1.000 N NA
 5935079 5935080 MMAR_5371 MMAR_5372   glfT TRUE 0.993 -7.000 0.500 NA   NA
 5935080 5935081 MMAR_5372 MMAR_5373 glfT glf TRUE 0.979 -3.000 0.105 NA   NA
 5935082 5935083 MMAR_5374 MMAR_5375 erp   FALSE 0.096 174.000 0.269 NA   NA
 5935084 5935085 MMAR_5376 MMAR_5377     TRUE 0.654 51.000 0.154 0.077   NA
 5935085 5935086 MMAR_5377 MMAR_5378     TRUE 0.983 34.000 0.750 0.003 Y NA
 5935086 5935087 MMAR_5378 MMAR_5379     TRUE 0.991 4.000 0.267 0.003 Y NA
 5935088 5935089 MMAR_5380 MMAR_5381     FALSE 0.366 61.000 0.071 NA   NA
 5935089 5935090 MMAR_5381 MMAR_5382     TRUE 0.963 0.000 0.250 NA   NA
 5935091 5935092 MMAR_5383 MMAR_5384     TRUE 0.842 51.000 1.000 NA N NA
 5935095 5935096 MMAR_5387 MMAR_5388     TRUE 0.944 5.000 0.387 NA   NA
 5935097 5935098 MMAR_5389 MMAR_5390   pheA TRUE 0.975 -3.000 0.079 1.000 N NA
 5935099 5935100 MMAR_5391 MMAR_5392     FALSE 0.271 81.000 0.048 NA   NA
 5935100 5935101 MMAR_5392 MMAR_5393   bfrB FALSE 0.051 148.000 0.042 NA N NA
 5935102 5935103 MMAR_5394 MMAR_5395 glpQ1   TRUE 0.939 0.000 0.087 NA   NA
 5935104 5935105 MMAR_5547 MMAR_5396   sodA FALSE 0.259 149.000 0.500 NA   NA
 5935105 5935106 MMAR_5396 MMAR_5397 sodA   FALSE 0.011 217.000 0.000 NA   NA
 5935106 5935107 MMAR_5397 MMAR_5398     FALSE 0.011 254.000 0.008 NA   NA
 5935107 5935108 MMAR_5398 MMAR_5399     FALSE 0.003 463.000 0.000 1.000   NA
 5935108 5935109 MMAR_5399 MMAR_5400     FALSE 0.183 125.000 0.148 NA   NA
 5935109 5935110 MMAR_5400 MMAR_5401     TRUE 0.667 7.000 0.000 NA   NA
 5935110 5935111 MMAR_5401 MMAR_5402   hns FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5935111 5935112 MMAR_5402 MMAR_5403 hns menG TRUE 0.863 4.000 0.056 NA   NA
 5935114 5935115 MMAR_5405 MMAR_5406 ethR dinP TRUE 0.674 32.000 0.217 1.000 N NA
 5935116 5935117 MMAR_5407 MMAR_5408     TRUE 0.800 11.000 0.105 NA   NA
 5935118 5935119 MMAR_5548 MMAR_5409   mpt64 FALSE 0.012 212.000 0.000 NA   NA
 5935122 5935123 MMAR_5572 MMAR_5412   gltD FALSE 0.028 184.000 0.010 NA   NA
 5935123 5935124 MMAR_5412 MMAR_5413 gltD gltB TRUE 0.998 -7.000 0.043 0.000 Y NA
 5935125 5935126 MMAR_5414 MMAR_5415     FALSE 0.009 232.000 0.000 NA   NA
 5935126 5935127 MMAR_5415 MMAR_5416     FALSE 0.169 67.000 0.000 NA   NA
 5935129 5935130 MMAR_5418 MMAR_5419     TRUE 0.960 -3.000 0.004 NA   NA
 5935130 5935131 MMAR_5419 MMAR_5420     FALSE 0.374 31.000 0.000 NA   NA
 5935131 5935132 MMAR_5420 MMAR_5421     FALSE 0.129 95.000 0.000 NA   NA
 5935132 5935133 MMAR_5421 MMAR_5422     FALSE 0.123 98.000 0.000 NA   NA
 5935133 5935134 MMAR_5422 MMAR_5423     TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5935134 5935135 MMAR_5423 MMAR_5424     TRUE 0.934 -10.000 0.000 NA   NA
 5935135 5935136 MMAR_5424 MMAR_5425     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 5935138 5935139 MMAR_5427 MMAR_5428     FALSE 0.018 185.000 0.000 NA   NA
 5935139 5935140 MMAR_5428 MMAR_5429     FALSE 0.140 86.000 0.000 NA   NA
 5935140 5935141 MMAR_5429 MMAR_5430     FALSE 0.156 73.000 0.000 NA   NA
 5935141 5935142 MMAR_5430 MMAR_5431     FALSE 0.165 69.000 0.000 NA   NA
 5935143 5935144 MMAR_5432 MMAR_5433     FALSE 0.130 94.000 0.000 NA   NA
 5935144 5935145 MMAR_5433 MMAR_5434     FALSE 0.217 52.000 0.000 NA   NA
 5935145 5935146 MMAR_5434 MMAR_5435     TRUE 0.960 -3.000 0.004 NA   NA
 5935149 5935150 MMAR_5438 MMAR_5439     FALSE 0.009 235.000 0.000 NA   NA
 5935150 5935151 MMAR_5439 MMAR_5440     TRUE 0.754 98.000 1.000 NA   NA
 5935151 5935152 MMAR_5440 MMAR_5441     TRUE 0.931 2.000 0.200 NA   NA
 5935152 5935153 MMAR_5441 MMAR_5442     FALSE 0.618 41.000 0.200 NA   NA
 5935153 5935154 MMAR_5442 MMAR_5443     TRUE 0.962 4.000 0.500 NA   NA
 5935154 5935155 MMAR_5443 MMAR_5444     TRUE 0.942 4.000 0.333 NA   NA
 5935155 5935156 MMAR_5444 MMAR_5445     TRUE 0.989 -3.000 0.286 NA   NA
 5935156 5935157 MMAR_5445 MMAR_5446     TRUE 0.931 50.000 1.000 0.002   NA
 5935157 5935158 MMAR_5446 MMAR_5447     FALSE 0.212 136.000 0.286 NA   NA
 5935158 5935159 MMAR_5447 MMAR_5448     TRUE 0.835 45.000 0.667 NA   NA
 5935159 5935160 MMAR_5448 MMAR_5449   esxB FALSE 0.410 92.000 0.250 NA   NA
 5935160 5935161 MMAR_5449 MMAR_5450 esxB esxA TRUE 0.757 37.000 0.333 NA   NA
 5935161 5935162 MMAR_5450 MMAR_5451 esxA   FALSE 0.291 116.000 0.250 NA   NA
 5935162 5935163 MMAR_5451 MMAR_5452     FALSE 0.551 93.000 0.429 NA   NA
 5935163 5935164 MMAR_5452 MMAR_5453     FALSE 0.429 127.000 0.571 NA   NA
 5935165 5935166 MMAR_5454 MMAR_5455     FALSE 0.003 417.000 0.000 NA   NA
 5935166 5935167 MMAR_5455 MMAR_5456     FALSE 0.003 409.000 0.000 NA   NA
 5935167 5935168 MMAR_5456 MMAR_5457   espB FALSE 0.415 37.000 0.002 NA   NA
 5935168 5935169 MMAR_5457 MMAR_5458 espB   FALSE 0.416 99.000 0.286 NA   NA
 5935169 5935170 MMAR_5458 MMAR_5459   mycP3_1 TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5935170 5935171 MMAR_5459 MMAR_5460 mycP3_1   FALSE 0.016 191.000 0.000 NA   NA
 5935171 5935172 MMAR_5460 MMAR_5461     FALSE 0.126 97.000 0.000 NA   NA
 5935172 5935173 MMAR_5461 MMAR_5462     FALSE 0.002 649.000 0.000 NA   NA
 5935173 5935174 MMAR_5462 MMAR_5463     FALSE 0.612 10.000 0.000 NA   NA
 5935174 5935175 MMAR_5463 MMAR_5464     FALSE 0.002 524.000 0.000 NA   NA
 5935175 5935176 MMAR_5464 MMAR_5465   esxE TRUE 0.950 5.000 0.429 NA   NA
 5935176 5935177 MMAR_5465 MMAR_5466 esxE esxF TRUE 0.992 -7.000 0.429 NA   NA
 5935177 5935178 MMAR_5466 MMAR_5467 esxF lppJ FALSE 0.094 111.000 0.000 NA   NA
 5935178 5935179 MMAR_5467 MMAR_5468 lppJ   FALSE 0.144 80.000 0.000 NA   NA
 5935179 5935180 MMAR_5468 MMAR_5469     FALSE 0.005 296.000 0.000 NA   NA
 5935180 5935181 MMAR_5469 MMAR_5470     FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 5935181 5935182 MMAR_5470 MMAR_5471   pcnA TRUE 0.652 25.000 0.078 NA   NA
 5935183 5935184 MMAR_5472 MMAR_5473     TRUE 0.991 -3.000 0.351 NA   NA
 5935184 5935185 MMAR_5473 MMAR_5474     FALSE 0.410 117.000 0.411 NA   NA
 5935185 5935186 MMAR_5474 MMAR_5475   sigM FALSE 0.587 62.000 0.306 1.000   NA
 5935186 5935187 MMAR_5475 MMAR_5476 sigM   FALSE 0.456 76.000 0.265 NA   NA
 5935187 5935188 MMAR_5476 MMAR_5477   trxB2 FALSE 0.207 90.000 0.015 NA   NA
 5935188 5935189 MMAR_5477 MMAR_5478 trxB2 trxC TRUE 0.996 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 5935189 5935190 MMAR_5478 MMAR_5479 trxC   FALSE 0.188 132.000 0.237 1.000 N NA
 5935191 5935192 MMAR_5480 MMAR_5481   parB FALSE 0.004 471.000 0.013 NA   NA
 5935192 5935193 MMAR_5481 MMAR_5482 parB parA TRUE 0.996 -3.000 0.827 1.000 N NA
 5935193 5935194 MMAR_5482 MMAR_5483 parA gid TRUE 0.990 -3.000 0.339 1.000 N NA
 5935194 5935195 MMAR_5483 MMAR_5484 gid   FALSE 0.095 153.000 0.070 1.000   NA
 5935195 5935196 MMAR_5484 MMAR_5485     FALSE 0.179 113.000 0.024 1.000   NA
 5935196 5935197 MMAR_5485 MMAR_5578     TRUE 0.953 -16.000 0.010 NA   NA
 5935197 5935198 MMAR_5578 MMAR_5569   rnpA TRUE 0.875 27.000 0.540 NA   NA
 5935198 5935199 MMAR_5569 MMAR_5568 rnpA rpmH TRUE 0.932 24.000 0.787 1.000   NA
 5929630 5929631 MMAR_p01 MMAR_p03 repA   FALSE 0.004 317.000 0.000 NA   NA
 5929632 5929633 MMAR_p04 MMAR_p05     TRUE 0.992 -3.000 0.400 NA   NA
 5929633 5929634 MMAR_p05 MMAR_p06     TRUE 0.977 0.000 0.400 NA   NA
 5929634 5929635 MMAR_p06 MMAR_p07     FALSE 0.193 167.000 0.500 NA   NA
 5929635 5929636 MMAR_p07 MMAR_p08     TRUE 0.790 58.000 0.750 NA   NA
 5929636 5929637 MMAR_p08 MMAR_p09     FALSE 0.034 199.000 0.083 1.000 N NA
 5929637 5929638 MMAR_p09 MMAR_p10   merB TRUE 0.979 -3.000 0.053 1.000   NA
 5929638 5929639 MMAR_p10 MMAR_p11 merB merH FALSE 0.443 47.000 0.053 NA   NA
 5929639 5929640 MMAR_p11 MMAR_p12 merH merA FALSE 0.592 29.000 0.051 NA   NA
 5929641 5929642 MMAR_p13 MMAR_p14   merT TRUE 0.851 0.000 0.000 NA   NA
 5929642 5929643 MMAR_p14 MMAR_p15 merT   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929643 5929644 MMAR_p15 MMAR_p16     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 5929644 5929645 MMAR_p16 MMAR_p17     TRUE 0.650 8.000 0.000 NA   NA
 5929646 5929647 MMAR_p18 MMAR_p19     TRUE 0.982 0.000 0.500 NA   NA
 5929647 5929648 MMAR_p19 MMAR_p20     TRUE 0.647 89.000 0.600 NA   NA
 5929648 5929649 MMAR_p20 MMAR_p21     TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 5929650 5929651 MMAR_p22 MMAR_p23   parA FALSE 0.187 98.000 0.014 NA   NA
 5929651 5929652 MMAR_p23 MMAR_p24 parA   TRUE 0.967 -3.000 0.021 NA   NA
 5929652 5929653 MMAR_p24 MMAR_p25     FALSE 0.002 477.000 0.000 NA   NA
 5929655 5929656 MMAR_p30 MMAR_p31     FALSE 0.565 12.000 0.000 NA   NA
 5929657 5929658 MMAR_p32 MMAR_p33     TRUE 0.941 -6.000 0.000 NA   NA