MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus uberis 0140J

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5935209 5935210 SUB0001 SUB0002 dnaA dnaN TRUE 0.878 154.000 0.328 1.000 Y NA
 5935210 5935211 SUB0002 SUB0003 dnaN   FALSE 0.216 74.000 0.009 NA   NA
 5935211 5935212 SUB0003 SUB0004     FALSE 0.192 107.000 0.010 NA   NA
 5935212 5935213 SUB0004 SUB0005     FALSE 0.162 81.000 0.002 1.000 N NA
 5935213 5935214 SUB0005 SUB0006   pth TRUE 0.867 73.000 0.184 1.000 Y NA
 5935214 5935215 SUB0006 SUB0007 pth trcF TRUE 0.942 4.000 0.137 1.000 N NA
 5935215 5935216 SUB0007 SUB0008 trcF   TRUE 0.950 -13.000 0.033 1.000   NA
 5935216 5935217 SUB0008 SUB0009     TRUE 0.736 29.000 0.034 1.000   NA
 5935217 5935218 SUB0009 SUB0010     TRUE 0.956 -13.000 0.053 1.000 N NA
 5935218 5935219 SUB0010 SUB0011     TRUE 0.907 2.000 0.011 NA   NA
 5935219 5935220 SUB0011 SUB0012     TRUE 0.948 3.000 0.132 NA   NA
 5935220 5935221 SUB0012 SUB0013     TRUE 0.931 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5935221 5935222 SUB0013 SUB0014   hpt TRUE 0.889 5.000 0.067 0.066 N NA
 5935222 5935223 SUB0014 SUB0015 hpt ftsH TRUE 0.922 22.000 0.192 1.000 N NA
 5935223 5935224 SUB0015 SUB0016 ftsH   FALSE 0.172 105.000 0.009 1.000 N NA
 5935224 5935225 SUB0016 SUBr01   16S_rRNA FALSE 0.061 366.000 0.000 NA   NA
 5935225 5935226 SUBr01 SUBt17 16S_rRNA tRNA-Ala FALSE 0.168 72.000 0.000 NA   NA
 5935226 5935227 SUBt17 SUBr06 tRNA-Ala 23S_rRNA FALSE 0.096 195.000 0.000 NA   NA
 5935227 5935228 SUBr06 SUBr11 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.092 203.000 0.000 NA   NA
 5935228 5935229 SUBr11 SUBt73 5S_rRNA tRNA-Val TRUE 0.802 14.000 0.000 NA   NA
 5935229 5935230 SUBt73 SUBt31 tRNA-Val tRNA-Asp TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 5935230 5935231 SUBt31 SUBt51 tRNA-Asp tRNA-Lys FALSE 0.159 74.000 0.000 NA   NA
 5935231 5935232 SUBt51 SUBt46 tRNA-Lys tRNA-Leu TRUE 0.826 6.000 0.000 NA   NA
 5935232 5935233 SUBt46 SUBt66 tRNA-Leu tRNA-Thr TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 5935233 5935234 SUBt66 SUBt39 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.802 14.000 0.000 NA   NA
 5935234 5935235 SUBt39 SUBt47 tRNA-Gly tRNA-Leu TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 5935235 5935236 SUBt47 SUBt22 tRNA-Leu tRNA-Arg TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 5935236 5935237 SUBt22 SUBt60 tRNA-Arg tRNA-Pro TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 5935237 5935238 SUBt60 SUBt54 tRNA-Pro tRNA-Met TRUE 0.826 6.000 0.000 NA   NA
 5935238 5935239 SUBt54 SUBt55 tRNA-Met tRNA-Met TRUE 0.693 25.000 0.000 NA   NA
 5935239 5935240 SUBt55 SUBt61 tRNA-Met tRNA-Ser TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 5935240 5935241 SUBt61 SUBt56 tRNA-Ser tRNA-Met TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 5935241 5935242 SUBt56 SUBt58 tRNA-Met tRNA-Phe TRUE 0.734 22.000 0.000 NA   NA
 5935242 5935243 SUBt58 SUBt40 tRNA-Phe tRNA-Gly TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 5935243 5935244 SUBt40 SUBt43 tRNA-Gly tRNA-Ile TRUE 0.551 33.000 0.000 NA   NA
 5935244 5935245 SUBt43 SUBt62 tRNA-Ile tRNA-Ser TRUE 0.821 8.000 0.000 NA   NA
 5935245 5935246 SUBt62 SUB0017 tRNA-Ser   FALSE 0.175 70.000 0.000 NA   NA
 5935246 5935247 SUB0017 SUB0018     TRUE 0.982 4.000 0.550 0.005   NA
 5935247 5935248 SUB0018 SUB0019     FALSE 0.208 96.000 0.021 NA   NA
 5935248 5935249 SUB0019 SUB0020   prsA1 TRUE 0.307 109.000 0.107 NA   NA
 5935249 5935250 SUB0020 SUB0021 prsA1   TRUE 0.745 91.000 0.048 1.000 Y NA
 5935250 5935251 SUB0021 SUB0022   recO TRUE 0.940 -10.000 0.012 1.000 N NA
 5935251 5935252 SUB0022 SUB0023 recO plsX FALSE 0.176 100.000 0.011 1.000 N NA
 5935252 5935253 SUB0023 SUB0024 plsX   TRUE 0.993 -7.000 0.017 0.009 Y NA
 5935253 5935254 SUB0024 SUB0025   purC FALSE 0.179 146.000 0.017 1.000 N NA
 5935254 5935255 SUB0025 SUB0026 purC   TRUE 0.883 53.000 0.043 1.000 Y NA
 5935255 5935256 SUB0026 SUB0027   purF TRUE 0.949 34.000 0.024 1.000 Y NA
 5935256 5935257 SUB0027 SUB0028 purF purM TRUE 0.704 535.000 0.248 1.000 Y NA
 5935257 5935258 SUB0028 SUB0029 purM purN TRUE 0.997 -3.000 0.238 0.003 Y NA
 5935258 5935259 SUB0029 SUB0030 purN purH TRUE 0.893 70.000 0.225 1.000 Y NA
 5935261 5935262 SUB0032 SUB0033 ublA ublB TRUE 0.836 90.000 1.000 NA   NA
 5935262 5935263 SUB0033 SUB0034 ublB ublC TRUE 0.920 -19.000 0.000 NA   NA
 5935263 5935264 SUB0034 SUB0035 ublC ublD TRUE 0.886 0.000 0.000 NA   NA
 5935264 5935265 SUB0035 SUB0036 ublD ublE TRUE 0.902 -3.000 0.000 NA   NA
 5935265 5935266 SUB0036 SUB0037A ublE   TRUE 0.639 28.000 0.000 NA   NA
 5935266 5935267 SUB0037A SUB0038     FALSE 0.062 328.000 0.000 NA   NA
 5935267 5935268 SUB0038 SUB0039   agaS TRUE 0.927 19.000 0.178 1.000 N NA
 5935268 5935269 SUB0039 SUB0040 agaS lacD3 TRUE 0.870 11.000 0.033 1.000 N NA
 5935271 5935272 SUB0042 SUB0043     TRUE 0.996 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 5935272 5935273 SUB0043 SUB0044     TRUE 0.996 26.000 0.810 0.037 Y NA
 5935273 5935274 SUB0044 SUB0045     TRUE 0.997 -13.000 0.176 0.037 Y NA
 5935274 5935275 SUB0045 SUB0046     TRUE 0.993 2.000 0.136 0.025 Y NA
 5935276 5935277 SUB0048 SUB0049     FALSE 0.171 71.000 0.000 NA   NA
 5935278 5935279 SUB0051 SUB0052     TRUE 0.620 29.000 0.000 NA   NA
 5935279 5935280 SUB0052 SUB0053   purD FALSE 0.136 118.000 0.000 NA   NA
 5935280 5935281 SUB0053 SUB0054 purD purE TRUE 0.923 46.000 0.044 1.000 Y NA
 5935281 5935282 SUB0054 SUB0055 purE purK TRUE 0.992 -13.000 0.008 0.002 Y NA
 5935282 5935283 SUB0055 SUB0056 purK purB TRUE 0.458 314.000 0.000 1.000 Y NA
 5935283 5935284 SUB0056 SUB0057 purB   FALSE 0.159 98.000 0.005 1.000   NA
 5935284 5935285 SUB0057 SUB0058     TRUE 0.639 28.000 0.000 NA   NA
 5935285 5935286 SUB0058 SUB0059   ruvB TRUE 0.578 32.000 0.000 NA   NA
 5935286 5935287 SUB0059 SUB0060 ruvB   FALSE 0.090 251.000 0.005 1.000 N NA
 5935287 5935288 SUB0060 SUB0061     TRUE 0.893 5.000 0.019 NA   NA
 5935288 5935289 SUB0061 SUB0062     TRUE 0.987 -3.000 0.351 NA   NA
 5935289 5935290 SUB0062 SUB0063   adhE FALSE 0.110 153.000 0.000 1.000 N NA
 5935290 5935291 SUB0063 SUB0064 adhE   TRUE 0.287 54.000 0.000 NA   NA
 5935291 5935292 SUB0064 SUB0065     FALSE 0.136 117.000 0.000 NA   NA
 5935292 5935293 SUB0065 SUB0066     TRUE 0.524 37.000 0.003 1.000 N NA
 5935293 5935294 SUB0066 SUB0067   rpsJ FALSE 0.087 194.000 0.000 1.000 N NA
 5935294 5935295 SUB0067 SUB0068 rpsJ rplC TRUE 0.909 105.000 0.467 0.043 Y NA
 5935295 5935296 SUB0068 SUB0069 rplC rplD TRUE 0.994 24.000 0.544 0.032 Y NA
 5935296 5935297 SUB0069 SUB0070 rplD rplW TRUE 0.997 0.000 0.307 0.032 Y NA
 5935297 5935298 SUB0070 SUB0071 rplW rplB TRUE 0.998 18.000 0.849 0.037 Y NA
 5935298 5935299 SUB0071 SUB0072 rplB rpsS TRUE 0.952 97.000 0.820 0.043 Y NA
 5935299 5935300 SUB0072 SUB0073 rpsS rplV TRUE 0.998 16.000 0.769 0.043 Y NA
 5935300 5935301 SUB0073 SUB0074 rplV rpsC TRUE 0.998 13.000 0.719 0.043 Y NA
 5935301 5935302 SUB0074 SUB0075 rpsC rplP TRUE 0.999 4.000 0.828 0.043 Y NA
 5935302 5935303 SUB0075 SUB0076 rplP rpmC TRUE 0.998 10.000 0.802 0.032 Y NA
 5935303 5935304 SUB0076 SUB0077 rpmC rpsQ TRUE 0.996 28.000 0.828 0.032 Y NA
 5935304 5935305 SUB0077 SUB0078 rpsQ rplN TRUE 0.996 25.000 0.791 0.043 Y NA
 5935305 5935306 SUB0078 SUB0079 rplN rplX TRUE 0.953 84.000 0.810 0.043 Y NA
 5935306 5935307 SUB0079 SUB0080 rplX rplE TRUE 0.996 24.000 0.758 0.032 Y NA
 5935307 5935308 SUB0080 SUB0081 rplE rpsN TRUE 0.996 16.000 0.496 0.032 Y NA
 5935308 5935309 SUB0081 SUB0082 rpsN rpsH TRUE 0.896 156.000 0.473 0.032 Y NA
 5935309 5935310 SUB0082 SUB0083 rpsH rplF TRUE 0.937 167.000 0.808 0.032 Y NA
 5935310 5935311 SUB0083 SUB0084 rplF rplR TRUE 0.952 89.000 0.815 0.032 Y NA
 5935311 5935312 SUB0084 SUB0085 rplR rpsE TRUE 0.997 19.000 0.814 0.043 Y NA
 5935312 5935313 SUB0085 SUB0086 rpsE rpmD TRUE 0.998 15.000 0.789 0.043 Y NA
 5935313 5935314 SUB0086 SUB0087 rpmD rplO TRUE 0.934 123.000 0.653 0.005 Y NA
 5935314 5935315 SUB0087 SUB0088 rplO secY TRUE 0.986 17.000 0.730 1.000 N NA
 5935315 5935316 SUB0088 SUB0089 secY adk TRUE 0.452 139.000 0.241 1.000 N NA
 5935316 5935317 SUB0089 SUB0090 adk infA FALSE 0.240 119.000 0.059 1.000 N NA
 5935317 5935318 SUB0090 SUB0091 infA rpmJ TRUE 0.976 26.000 0.067 1.000 Y NA
 5935318 5935319 SUB0091 SUB0092 rpmJ rpsM TRUE 0.984 18.000 0.086 0.032 Y NA
 5935319 5935320 SUB0092 SUB0093 rpsM rpsK TRUE 0.998 18.000 0.810 0.032 Y NA
 5935320 5935321 SUB0093 SUB0094 rpsK rpoA TRUE 0.816 46.000 0.308 1.000 N NA
 5935321 5935322 SUB0094 SUB0095 rpoA rplQ TRUE 0.991 15.000 0.873 1.000 N NA
 5935322 5935323 SUB0095 SUBr02 rplQ 16S_rRNA FALSE 0.053 597.000 0.000 NA   NA
 5935323 5935324 SUBr02 SUBt18 16S_rRNA tRNA-Ala FALSE 0.168 72.000 0.000 NA   NA
 5935324 5935325 SUBt18 SUBr07 tRNA-Ala 23S_rRNA FALSE 0.096 195.000 0.000 NA   NA
 5935325 5935326 SUBr07 SUBr12 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.092 203.000 0.000 NA   NA
 5935326 5935327 SUBr12 SUBt74 5S_rRNA tRNA-Val TRUE 0.802 14.000 0.000 NA   NA
 5935327 5935328 SUBt74 SUBt41 tRNA-Val tRNA-Gly TRUE 0.810 10.000 0.000 NA   NA
 5935328 5935329 SUBt41 SUBt44 tRNA-Gly tRNA-Ile TRUE 0.578 32.000 0.000 NA   NA
 5935329 5935330 SUBt44 SUBt36 tRNA-Ile tRNA-Glu TRUE 0.782 17.000 0.000 NA   NA
 5935330 5935331 SUBt36 SUBt63 tRNA-Glu tRNA-Ser TRUE 0.826 6.000 0.000 NA   NA
 5935331 5935332 SUBt63 SUBt57 tRNA-Ser tRNA-Met TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 5935332 5935333 SUBt57 SUBt59 tRNA-Met tRNA-Phe TRUE 0.734 22.000 0.000 NA   NA
 5935333 5935334 SUBt59 SUBt71 tRNA-Phe tRNA-Tyr TRUE 0.773 18.000 0.000 NA   NA
 5935334 5935335 SUBt71 SUBt70 tRNA-Tyr tRNA-Trp TRUE 0.826 6.000 0.000 NA   NA
 5935335 5935336 SUBt70 SUBt42 tRNA-Trp tRNA-His TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 5935336 5935337 SUBt42 SUBt34 tRNA-His tRNA-Gln TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 5935337 5935338 SUBt34 SUBt48 tRNA-Gln tRNA-Leu TRUE 0.720 23.000 0.000 NA   NA
 5935338 5935339 SUBt48 SUB0096 tRNA-Leu   FALSE 0.159 74.000 0.000 NA   NA
 5935341 5935342 SUB0099 SUB0100     FALSE 0.062 335.000 0.000 NA   NA
 5935342 5935343 SUB0100 SUB0101     FALSE 0.108 174.000 0.000 NA   NA
 5935343 5935344 SUB0101 SUB0102     FALSE 0.079 211.000 0.000 1.000 N NA
 5935344 5935345 SUB0102 SUB0103     TRUE 0.876 33.000 0.261 1.000 N NA
 5935345 5935346 SUB0103 SUB0104   cydA TRUE 0.841 82.000 0.174 1.000 Y NA
 5935346 5935347 SUB0104 SUB0105 cydA cydB TRUE 0.999 0.000 0.950 0.021 Y NA
 5935347 5935348 SUB0105 SUB0106 cydB cydC TRUE 0.993 0.000 0.061 1.000 Y NA
 5935348 5935349 SUB0106 SUB0107 cydC cydD TRUE 0.996 -7.000 0.168 0.009 Y NA
 5935351 5935352 SUB0109 SUB0110 ispE   FALSE 0.273 61.000 0.008 1.000 N NA
 5935352 5935353 SUB0110 SUB0111     TRUE 0.955 5.000 0.192 1.000 N NA
 5935353 5935354 SUB0111 SUB0112     TRUE 0.999 0.000 0.673 1.000 Y NA
 5935356 5935357 SUB0114 SUB0115 pbp1B rpoB FALSE 0.065 264.000 0.000 1.000 N NA
 5935357 5935358 SUB0115 SUB0116 rpoB rpoC TRUE 0.954 92.000 0.851 0.002 Y NA
 5935358 5935359 SUB0116 SUB0117 rpoC   TRUE 0.350 55.000 0.007 NA   NA
 5935359 5935360 SUB0117 SUB0118     TRUE 0.326 73.000 0.083 NA   NA
 5935360 5935361 SUB0118 SUB0119     TRUE 0.995 -124.000 0.639 NA   NA
 5935361 5935362 SUB0119 SUB0120   comYC TRUE 0.999 1.000 0.861 NA Y NA
 5935362 5935363 SUB0120 SUB0121 comYC   TRUE 0.956 -46.000 0.040 NA   NA
 5935363 5935364 SUB0121 SUB0122     TRUE 0.983 -28.000 0.214 NA   NA
 5935364 5935365 SUB0122 SUB0123     TRUE 0.986 -40.000 0.250 NA   NA
 5935365 5935366 SUB0123 SUB0124     TRUE 0.985 -22.000 0.232 NA   NA
 5935366 5935367 SUB0124 SUB0125     TRUE 0.642 45.000 0.087 NA   NA
 5935367 5935368 SUB0125 SUB0126   ackA TRUE 0.522 56.000 0.130 1.000 N NA
 5935368 5935369 SUB0126 SUB0127 ackA   FALSE 0.275 118.000 0.094 1.000 N NA
 5935369 5935370 SUB0127 SUB0128     TRUE 0.935 2.000 0.062 NA   NA
 5935370 5935371 SUB0128 SUB0129     TRUE 0.990 9.000 0.800 NA   NA
 5935372 5935373 SUB0130 SUB0131 proC pepA TRUE 0.828 22.000 0.041 1.000 N NA
 5935374 5935375 SUB0132 SUB0133     TRUE 0.973 -7.000 0.140 NA   NA
 5935375 5935376 SUB0133 SUB0134     TRUE 0.946 19.000 0.239 1.000   NA
 5935376 5935377 SUB0134 SUB0135   fruA FALSE 0.090 194.000 0.000 1.000   NA
 5935377 5935378 SUB0135 SUB0136 fruA   FALSE 0.103 164.000 0.000 1.000 N NA
 5935378 5935379 SUB0136 SUB0137     FALSE 0.055 491.000 0.000 NA   NA
 5935379 5935380 SUB0137 SUB0138     TRUE 0.966 17.000 0.333 NA   NA
 5935380 5935381 SUB0138 SUB0139     TRUE 0.835 37.000 0.222 NA   NA
 5935381 5935382 SUB0139 SUB0140     TRUE 0.936 9.000 0.143 1.000   NA
 5935383 5935384 SUB0141 SUB0142     TRUE 0.795 19.000 0.005 1.000 N NA
 5935384 5935385 SUB0142 SUB0143     TRUE 0.950 -13.000 0.034 1.000 N NA
 5935385 5935386 SUB0143 SUB0144     FALSE 0.129 141.000 0.000 NA   NA
 5935388 5935389 SUB0146 SUB0147 gshA   FALSE 0.094 197.000 0.000 NA   NA
 5935389 5935390 SUB0147 SUB0148     TRUE 0.916 -9.000 0.000 NA   NA
 5935390 5935391 SUB0148 SUB0149     TRUE 0.593 31.000 0.000 NA   NA
 5935391 5935392 SUB0149 SUB0150     TRUE 0.593 31.000 0.000 NA   NA
 5935392 5935393 SUB0150 SUB0151     TRUE 0.991 9.000 0.818 NA   NA
 5935394 5935395 SUB0152 SUB0153 purA   FALSE 0.137 124.000 0.000 NA   NA
 5935395 5935396 SUB0153 SUB0154     FALSE 0.144 82.000 0.000 NA   NA
 5935396 5935397 SUB0154 SUB0155     FALSE 0.083 227.000 0.000 NA   NA
 5935399 5935400 SUB0157 SUB0158     TRUE 0.992 16.000 0.188 1.000 Y NA
 5935400 5935401 SUB0158 SUB0159     FALSE 0.051 635.000 0.000 NA N NA
 5935401 5935402 SUB0159 SUB0160   pflD FALSE 0.083 223.000 0.000 NA N NA
 5935402 5935403 SUB0160 SUB0161 pflD fsaA TRUE 0.971 15.000 0.368 1.000 N NA
 5935403 5935404 SUB0161 SUB0162 fsaA qacH FALSE 0.072 237.000 0.000 1.000 N NA
 5935404 5935405 SUB0162 SUB0163 qacH   TRUE 0.821 4.000 0.000 1.000 N NA
 5935405 5935406 SUB0163 SUB0164     TRUE 0.810 10.000 0.000 NA   NA
 5935408 5935409 SUB0166 SUB0167     FALSE 0.133 137.000 0.000 NA   NA
 5935409 5935410 SUB0167 SUB0169     FALSE 0.159 74.000 0.000 NA   NA
 5935410 5935411 SUB0169 SUB0170     FALSE 0.170 69.000 0.000 1.000   NA
 5935411 5935412 SUB0170 SUB0172     TRUE 0.411 135.000 0.200 1.000   NA
 5935412 5935413 SUB0172 SUB0173     FALSE 0.126 63.000 0.000 0.029   NA
 5935416 5935417 SUB0176 SUB0177     TRUE 0.989 -13.000 0.333 NA   NA
 5935420 5935421 SUB0180 SUB0181     FALSE 0.136 103.000 0.000 NA   NA
 5935421 5935422 SUB0181 SUB0182     TRUE 0.993 3.000 0.833 NA N NA
 5935422 5935423 SUB0182 SUB0183     TRUE 0.999 -22.000 0.941 0.012 Y NA
 5935423 5935424 SUB0183 SUB0184     TRUE 0.995 -7.000 0.696 1.000 N NA
 5935424 5935425 SUB0184 SUB0185     TRUE 0.844 146.000 0.217 1.000 Y NA
 5935425 5935426 SUB0185 SUB0186     TRUE 0.996 23.000 0.643 0.029 Y NA
 5935426 5935427 SUB0186 SUB0187     TRUE 0.997 19.000 0.643 0.035 Y NA
 5935427 5935428 SUB0187 SUB0188   manZ TRUE 0.999 2.000 0.905 0.035 Y NA
 5935428 5935429 SUB0188 SUB0189 manZ   TRUE 0.966 24.000 0.476 NA   NA
 5935430 5935431 SUB0190 SUB0191     FALSE 0.238 102.000 0.049 NA   NA
 5935431 5935432 SUB0191 SUB0192     TRUE 0.999 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 5935432 5935433 SUB0192 SUB0193     FALSE 0.258 57.000 0.000 NA   NA
 5935434 5935435 SUB0194 SUB0195     FALSE 0.057 175.000 0.000 0.023 N NA
 5935435 5935436 SUB0195 SUB0196     TRUE 0.975 12.000 0.000 0.023 Y NA
 5935436 5935437 SUB0196 SUB0197     TRUE 0.969 19.000 0.000 0.023 Y NA
 5935437 5935438 SUB0197 SUB0198     TRUE 0.997 9.000 0.480 1.000 Y NA
 5935438 5935439 SUB0198 SUB0199     TRUE 0.660 121.000 0.000 1.000 Y NA
 5935439 5935440 SUB0199 SUB0200     TRUE 0.980 12.000 0.000 1.000 Y NA
 5935440 5935441 SUB0200 SUB0201     TRUE 0.976 11.000 0.000 0.036 Y NA
 5935442 5935443 SUB0202 SUB0203     TRUE 0.999 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 5935443 5935444 SUB0203 SUB0204     TRUE 0.761 35.000 0.133 1.000 N NA
 5935444 5935445 SUB0204 SUB0205     TRUE 0.990 2.000 0.591 1.000   NA
 5935445 5935446 SUB0205 SUB0206     FALSE 0.136 103.000 0.000 NA   NA
 5935446 5935447 SUB0206 SUB0207     FALSE 0.124 150.000 0.000 NA   NA
 5935447 5935448 SUB0207 SUB0208     FALSE 0.093 202.000 0.000 NA   NA
 5935448 5935449 SUB0208 SUB0209     TRUE 0.913 -7.000 0.000 NA   NA
 5935449 5935450 SUB0209 SUB0210     FALSE 0.125 147.000 0.000 NA   NA
 5935450 5935451 SUB0210 SUB0211     FALSE 0.127 144.000 0.000 NA   NA
 5935452 5935453 SUB0212 SUB0213     TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 5935454 5935455 SUBt52 SUB0214 tRNA-Lys   FALSE 0.067 295.000 0.000 NA   NA
 5935455 5935456 SUB0214 SUB0215     FALSE 0.074 258.000 0.000 NA   NA
 5935456 5935457 SUB0215 SUB0216     TRUE 0.529 34.000 0.000 NA   NA
 5935457 5935458 SUB0216 SUB0217     FALSE 0.051 1619.000 0.000 NA   NA
 5935458 5935459 SUB0217 SUB0218     FALSE 0.137 92.000 0.000 NA   NA
 5935459 5935460 SUB0218 SUB0219     TRUE 0.851 3.000 0.000 NA   NA
 5935460 5935461 SUB0219 SUB0220     FALSE 0.062 345.000 0.000 NA   NA
 5935461 5935462 SUB0220 SUB0221     TRUE 0.663 60.000 0.286 NA   NA
 5935462 5935463 SUB0221 SUB0222     TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5935463 5935464 SUB0222 SUB0223     TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 5935464 5935465 SUB0223 SUB0224     TRUE 0.918 -12.000 0.000 NA   NA
 5935465 5935466 SUB0224 SUB0225     TRUE 0.913 -7.000 0.000 NA   NA
 5935466 5935467 SUB0225 SUB0227     FALSE 0.068 293.000 0.000 NA   NA
 5935467 5935468 SUB0227 SUB0228     TRUE 0.381 47.000 0.000 NA   NA
 5935469 5935470 SUB0229 SUB0230     TRUE 0.310 52.000 0.000 NA   NA
 5935470 5935471 SUB0230 SUB0231     FALSE 0.213 63.000 0.000 NA   NA
 5935471 5935472 SUB0231 SUB0232     FALSE 0.134 95.000 0.000 NA   NA
 5935472 5935473 SUB0232 SUB0233     TRUE 0.844 18.000 0.013 NA   NA
 5935473 5935474 SUB0233 SUB0234     TRUE 0.977 0.000 0.227 NA   NA
 5935474 5935475 SUB0234 SUB0235     FALSE 0.182 96.000 0.008 NA   NA
 5935475 5935476 SUB0235 SUB0236     FALSE 0.216 138.000 0.048 1.000 N NA
 5935476 5935477 SUB0236 SUB0237     TRUE 0.734 82.000 0.610 NA   NA
 5935478 5935479 SUB0238 SUB0239     TRUE 0.500 36.000 0.000 NA   NA
 5935479 5935480 SUB0239 SUB0240     TRUE 0.495 47.000 0.027 1.000 N NA
 5935480 5935481 SUB0240 SUB0241     TRUE 0.720 135.000 0.022 1.000 Y NA
 5935482 5935483 SUB0242 SUB0243 relA   TRUE 0.939 12.000 0.177 1.000 N NA
 5935483 5935484 SUB0243 SUB0244   lrp FALSE 0.168 90.000 0.003 NA N NA
 5935484 5935485 SUB0244 SUB0245 lrp msmK FALSE 0.264 102.000 0.071 NA N NA
 5935485 5935486 SUB0245 SUB0246 msmK dexB TRUE 0.830 93.000 0.171 1.000 Y NA
 5935486 5935487 SUB0246 SUB0247 dexB   FALSE 0.136 116.000 0.000 NA   NA
 5935487 5935488 SUB0247 SUB0248     TRUE 0.933 3.000 0.080 NA   NA
 5935488 5935489 SUB0248 SUB0249   galE FALSE 0.067 299.000 0.000 NA   NA
 5935489 5935490 SUB0249 SUB0250 galE   FALSE 0.191 67.000 0.000 NA   NA
 5935490 5935491 SUB0250 SUB0251     FALSE 0.150 76.000 0.000 NA N NA
 5935491 5935492 SUB0251 SUB0252   uppS FALSE 0.152 164.000 0.007 NA N NA
 5935492 5935493 SUB0252 SUB0253 uppS   TRUE 0.989 12.000 0.113 1.000 Y NA
 5935493 5935494 SUB0253 SUB0254   eep TRUE 0.647 35.000 0.040 1.000 N NA
 5935494 5935495 SUB0254 SUB0255 eep proS TRUE 0.862 23.000 0.095 1.000 N NA
 5935495 5935496 SUB0255 SUB0256 proS   FALSE 0.186 79.000 0.004 NA   NA
 5935496 5935497 SUB0256 SUB0257   polC FALSE 0.180 129.000 0.007 NA   NA
 5935497 5935498 SUB0257 SUB0258 polC   FALSE 0.212 80.000 0.020 1.000 N NA
 5935498 5935499 SUB0258 SUB0259     TRUE 0.520 190.000 0.414 1.000   NA
 5935500 5935501 SUB0260 SUB0261 def   FALSE 0.128 91.000 0.000 1.000   NA
 5935501 5935502 SUB0261 SUB0262   ppk FALSE 0.064 287.000 0.000 1.000   NA
 5935502 5935503 SUB0262 SUB0263 ppk   TRUE 0.976 27.000 0.070 NA Y NA
 5935503 5935504 SUB0263 SUB0264     FALSE 0.125 143.000 0.000 NA N NA
 5935505 5935506 SUB0265 SUB0266   rpsO FALSE 0.166 113.000 0.003 NA N NA
 5935506 5935507 SUB0266 SUBp01 rpsO   TRUE 0.751 746.000 0.335 1.000 Y NA
 5935507 5935508 SUBp01 SUB0268     TRUE 0.851 12.000 0.009 NA   NA
 5935508 5935509 SUB0268 SUB0269   cysE TRUE 0.914 13.000 0.097 NA   NA
 5935509 5935510 SUB0269 SUB0270 cysE cysS TRUE 0.721 26.000 0.035 0.060 N NA
 5935510 5935511 SUB0270 SUB0271 cysS   TRUE 0.969 -7.000 0.129 1.000   NA
 5935511 5935512 SUB0271 SUB0272     FALSE 0.132 138.000 0.000 NA   NA
 5935512 5935513 SUB0272 SUB0273     FALSE 0.134 95.000 0.000 NA   NA
 5935513 5935514 SUB0273 SUB0274     TRUE 0.926 9.000 0.109 NA   NA
 5935514 5935515 SUB0274 SUB0275     FALSE 0.202 156.000 0.036 NA   NA
 5935515 5935516 SUB0275 SUB0276   rplM FALSE 0.118 196.000 0.003 NA   NA
 5935516 5935517 SUB0276 SUB0277 rplM rpsI TRUE 0.996 22.000 0.601 0.030 Y NA
 5935517 5935518 SUB0277 SUB0278 rpsI   FALSE 0.057 442.000 0.000 NA   NA
 5935518 5935519 SUB0278 SUB0279     FALSE 0.063 321.000 0.000 NA   NA
 5935519 5935520 SUB0279 SUB0280     TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 5935520 5935521 SUB0280 SUB0282     TRUE 0.620 29.000 0.000 NA   NA
 5935521 5935522 SUB0282 SUB0283     FALSE 0.196 66.000 0.000 NA   NA
 5935524 5935525 SUB0285 SUB0286 RPE   TRUE 0.995 -7.000 0.833 0.035 N NA
 5935525 5935526 SUB0286 SUB0287     TRUE 0.864 11.000 0.025 1.000 N NA
 5935526 5935527 SUB0287 SUB0288     TRUE 0.995 -10.000 0.019 1.000 Y NA
 5935527 5935528 SUB0288 SUB0289     TRUE 0.990 3.000 0.083 0.022 Y NA
 5935528 5935529 SUB0289 SUB0290   tal2 TRUE 0.980 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5935529 5935530 SUB0290 SUB0291 tal2 tkt2 TRUE 0.968 56.000 0.500 1.000 Y NA
 5935530 5935531 SUB0291 SUB0292 tkt2   TRUE 0.413 45.000 0.000 NA   NA
 5935531 5935532 SUB0292 SUB0292A     FALSE 0.136 93.000 0.000 NA   NA
 5935532 5935533 SUB0292A SUB0293     TRUE 0.656 27.000 0.000 NA   NA
 5935533 5935534 SUB0293 SUB0295     FALSE 0.101 186.000 0.000 NA   NA
 5935534 5935535 SUB0295 SUB0296     FALSE 0.258 57.000 0.000 NA   NA
 5935535 5935536 SUB0296 SUB0297     TRUE 0.995 -19.000 0.600 NA   NA
 5935536 5935537 SUB0297 SUB0298     TRUE 0.902 -3.000 0.000 NA   NA
 5935537 5935538 SUB0298 SUB0299     TRUE 0.851 3.000 0.000 NA   NA
 5935538 5935539 SUB0299 SUB0300     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 5935539 5935540 SUB0300 SUB0301     FALSE 0.137 113.000 0.000 NA   NA
 5935540 5935541 SUB0301 SUB0302     TRUE 0.720 23.000 0.000 NA   NA
 5935541 5935542 SUB0302 SUB0303     FALSE 0.111 165.000 0.000 NA N NA
 5935542 5935543 SUB0303 SUB0304     TRUE 0.385 163.000 0.214 1.000 N NA
 5935543 5935544 SUB0304 SUB0305     TRUE 0.999 8.000 0.933 0.039 Y NA
 5935544 5935545 SUB0305 SUB0306     TRUE 0.991 36.000 0.733 0.039 Y NA
 5935545 5935546 SUB0306 SUB0307     TRUE 0.996 4.000 0.273 1.000 Y NA
 5935546 5935547 SUB0307 SUB0308   scrK2 TRUE 0.980 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5935547 5935548 SUB0308 SUB0309 scrK2   TRUE 0.586 183.000 0.000 1.000 Y NA
 5935548 5935549 SUB0309 SUB0310     FALSE 0.126 127.000 0.000 1.000   NA
 5935550 5935551 SUB0311 SUB0312     TRUE 0.993 -34.000 0.530 1.000   NA
 5935551 5935552 SUB0312 SUB0313     TRUE 0.977 13.000 0.435 NA   NA
 5935552 5935553 SUB0313 SUB0314     TRUE 0.899 12.000 0.068 NA   NA
 5935554 5935555 SUB0315 SUBr03   16S_rRNA FALSE 0.069 288.000 0.000 NA   NA
 5935555 5935556 SUBr03 SUBt19 16S_rRNA tRNA-Ala FALSE 0.168 72.000 0.000 NA   NA
 5935556 5935557 SUBt19 SUBr08 tRNA-Ala 23S_rRNA FALSE 0.096 195.000 0.000 NA   NA
 5935557 5935558 SUBr08 SUBr13 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.092 203.000 0.000 NA   NA
 5935558 5935559 SUBr13 SUBt28 5S_rRNA tRNA-Asn TRUE 0.920 -19.000 0.000 NA   NA
 5935559 5935560 SUBt28 SUBt23 tRNA-Asn tRNA-Arg FALSE 0.175 70.000 0.000 NA   NA
 5935562 5935563 SUB0317 SUB0318 truA thiD TRUE 0.957 -13.000 0.058 1.000 N NA
 5935563 5935564 SUB0318 SUB0319 thiD   TRUE 0.986 -13.000 0.276 NA   NA
 5935564 5935565 SUB0319 SUB0320     TRUE 0.920 19.000 0.149 NA   NA
 5935567 5935568 SUB0323 SUB0324 tig   FALSE 0.147 74.000 0.000 1.000   NA
 5935568 5935569 SUB0324 SUB0325   rpoE TRUE 0.315 50.000 0.000 1.000   NA
 5935569 5935570 SUB0325 SUB0326 rpoE pyrG FALSE 0.111 270.000 0.029 1.000 N NA
 5935570 5935571 SUB0326 SUB0327 pyrG   FALSE 0.246 58.000 0.000 NA   NA
 5935571 5935572 SUB0327 SUB0327A     TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5935572 5935573 SUB0327A SUB0329     FALSE 0.191 67.000 0.000 NA   NA
 5935573 5935574 SUB0329 SUBt49   tRNA-Leu FALSE 0.258 57.000 0.000 NA   NA
 5935574 5935575 SUBt49 SUB0330 tRNA-Leu fba FALSE 0.106 179.000 0.000 NA   NA
 5935575 5935576 SUB0330 SUB0331 fba rpmB FALSE 0.076 224.000 0.000 1.000 N NA
 5935576 5935577 SUB0331 SUB0332 rpmB   FALSE 0.224 139.000 0.044 NA   NA
 5935577 5935578 SUB0332 SUB0333     TRUE 0.991 0.000 0.567 NA   NA
 5935578 5935579 SUB0333 SUB0334     FALSE 0.137 169.000 0.006 1.000   NA
 5935580 5935581 SUB0335 SUB0336   glnQ2 FALSE 0.192 162.000 0.032 NA   NA
 5935581 5935582 SUB0336 SUB0337 glnQ2   TRUE 0.998 14.000 0.758 1.000 Y NA
 5935583 5935584 SUB0338 SUB0339   bacA TRUE 0.387 70.000 0.118 NA   NA
 5935584 5935585 SUB0339 SUB0340 bacA mecA TRUE 0.332 115.000 0.132 NA N NA
 5935585 5935586 SUB0340 SUB0341 mecA rgpG TRUE 0.966 7.000 0.267 NA N NA
 5935586 5935587 SUB0341 SUB0342 rgpG   FALSE 0.070 283.000 0.000 NA   NA
 5935587 5935588 SUB0342 SUB0343   sufC FALSE 0.094 198.000 0.000 NA   NA
 5935588 5935589 SUB0343 SUB0344 sufC sufD TRUE 0.809 106.000 0.139 1.000 Y NA
 5935589 5935590 SUB0344 SUB0345 sufD csdB TRUE 0.984 11.000 0.606 1.000 N NA
 5935590 5935591 SUB0345 SUB0346 csdB iscU TRUE 0.986 -13.000 0.292 1.000 N NA
 5935591 5935592 SUB0346 SUB0347 iscU sufB TRUE 0.877 21.000 0.152 0.002 N NA
 5935592 5935593 SUB0347 SUB0348 sufB   FALSE 0.064 314.000 0.000 NA   NA
 5935594 5935595 SUB0349 SUB0350     TRUE 0.799 93.000 0.182 0.004 Y NA
 5935595 5935596 SUB0350 SUB0351     TRUE 0.678 69.000 0.000 0.004 Y NA
 5935597 5935598 SUBr04 SUBt20 16S_rRNA tRNA-Ala FALSE 0.168 72.000 0.000 NA   NA
 5935598 5935599 SUBt20 SUBr09 tRNA-Ala 23S_rRNA FALSE 0.096 195.000 0.000 NA   NA
 5935599 5935600 SUBr09 SUBr14 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.092 203.000 0.000 NA   NA
 5935600 5935601 SUBr14 SUBt29 5S_rRNA tRNA-Asn TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5935601 5935602 SUBt29 SUBt24 tRNA-Asn tRNA-Arg FALSE 0.175 70.000 0.000 NA   NA
 5935602 5935603 SUBt24 SUB0352 tRNA-Arg comX FALSE 0.138 91.000 0.000 NA   NA
 5935603 5935604 SUB0352 SUB0353 comX   FALSE 0.081 234.000 0.000 NA   NA
 5935604 5935605 SUB0353 SUB0354     TRUE 0.991 0.000 0.555 1.000   NA
 5935605 5935606 SUB0354 SUB0355     TRUE 0.469 55.000 0.068 NA   NA
 5935606 5935607 SUB0355 SUB0356     TRUE 0.485 64.000 0.150 NA N NA
 5935607 5935608 SUB0356 SUB0357     TRUE 0.997 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 5935608 5935609 SUB0357 SUB0358     TRUE 0.939 10.000 0.149 NA   NA
 5935609 5935610 SUB0358 SUB0359     TRUE 0.548 51.000 0.085 NA   NA
 5935610 5935611 SUB0359 SUB0360     TRUE 0.884 21.000 0.094 NA   NA
 5935611 5935612 SUB0360 SUB0361     FALSE 0.140 89.000 0.000 NA   NA
 5935612 5935613 SUB0361 SUB0362     TRUE 0.428 44.000 0.000 NA   NA
 5935613 5935614 SUB0362 SUB0363     FALSE 0.224 61.000 0.000 NA   NA
 5935614 5935615 SUB0363 SUB0364     FALSE 0.134 135.000 0.000 NA   NA
 5935615 5935616 SUB0364 SUB0365     FALSE 0.133 136.000 0.000 NA   NA
 5935616 5935617 SUB0365 SUB0366     TRUE 0.398 167.000 0.222 NA N NA
 5935617 5935618 SUB0366 SUB0367     FALSE 0.134 105.000 0.000 NA N NA
 5935618 5935619 SUB0367 SUB0368     TRUE 0.964 -7.000 0.104 1.000 N NA
 5935619 5935620 SUB0368 SUB0369     TRUE 0.999 1.000 0.938 1.000 Y NA
 5935621 5935622 SUB0370 SUB0371     FALSE 0.080 209.000 0.000 1.000 N NA
 5935622 5935623 SUB0371 SUB0372     TRUE 0.996 11.000 0.490 0.005 Y NA
 5935623 5935624 SUB0372 SUB0373   gidB FALSE 0.169 87.000 0.006 1.000 N NA
 5935625 5935626 SUB0375 SUB0376   htpX TRUE 0.847 35.000 0.222 NA   NA
 5935626 5935627 SUB0376 SUB0377 htpX   FALSE 0.109 213.000 0.002 NA   NA
 5935627 5935628 SUB0377 SUB0378     FALSE 0.138 110.000 0.000 NA   NA
 5935628 5935629 SUB0378 SUB0379   csrR TRUE 0.902 -3.000 0.000 NA   NA
 5935629 5935630 SUB0379 SUB0380 csrR csrS TRUE 0.997 4.000 0.438 1.000 Y NA
 5935630 5935631 SUB0380 SUB0381 csrS   FALSE 0.151 163.000 0.007 NA N NA
 5935631 5935632 SUB0381 SUB0382     TRUE 0.969 -16.000 0.109 NA N NA
 5935632 5935633 SUB0382 SUB0383   dnaI TRUE 0.999 1.000 0.817 NA Y NA
 5935633 5935634 SUB0383 SUB0384 dnaI engA TRUE 0.413 49.000 0.008 1.000   NA
 5935634 5935635 SUB0384 SUB0385 engA   FALSE 0.146 150.000 0.004 1.000   NA
 5935636 5935637 SUB0386 SUB0387     TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 5935638 5935639 SUB0388 SUB0389   murC TRUE 0.599 37.000 0.013 NA   NA
 5935639 5935640 SUB0389 SUB0390 murC   TRUE 0.513 45.000 0.014 1.000   NA
 5935640 5935641 SUB0390 SUB0391     TRUE 0.317 100.000 0.120 NA   NA
 5935641 5935642 SUB0391 SUB0392   greA TRUE 0.352 69.000 0.079 NA   NA
 5935643 5935644 SUB0393 SUB0394     TRUE 0.370 84.000 0.154 1.000 N NA
 5935645 5935646 SUB0395 SUB0396     TRUE 0.463 37.000 0.000 1.000   NA
 5935646 5935647 SUB0396 SUB0397     TRUE 0.795 16.000 0.000 NA   NA
 5935647 5935648 SUB0397 SUB0398     FALSE 0.240 110.000 0.048 NA   NA
 5935648 5935649 SUB0398 SUB0399     FALSE 0.239 99.000 0.051 NA   NA
 5935649 5935650 SUB0399 SUB0400   glr FALSE 0.180 157.000 0.014 NA   NA
 5935650 5935651 SUB0400 SUB0401 glr   TRUE 0.939 -3.000 0.034 1.000 N NA
 5935651 5935652 SUB0401 SUB0402     TRUE 0.938 -21.000 0.005 NA   NA
 5935652 5935653 SUB0402 SUB0403     TRUE 0.944 -3.000 0.034 NA   NA
 5935653 5935654 SUB0403 SUB0404   xerD TRUE 0.968 -7.000 0.111 NA   NA
 5935654 5935655 SUB0404 SUB0405 xerD scpA TRUE 0.928 0.000 0.017 NA   NA
 5935655 5935656 SUB0405 SUB0406 scpA scpB TRUE 0.993 -3.000 0.570 NA   NA
 5935656 5935657 SUB0406 SUB0407 scpB rluB TRUE 0.868 33.000 0.224 NA N NA
 5935657 5935658 SUB0407 SUB0408 rluB   TRUE 0.926 0.000 0.014 NA   NA
 5935658 5935659 SUB0408 SUB0409     FALSE 0.122 193.000 0.002 NA   NA
 5935659 5935660 SUB0409 SUBs01     FALSE 0.107 175.000 0.000 NA   NA
 5935660 5935661 SUBs01 SUB0410     FALSE 0.151 78.000 0.000 NA   NA
 5935661 5935662 SUB0410 SUB0411     TRUE 0.988 4.000 0.600 NA   NA
 5935662 5935663 SUB0411 SUB0412     TRUE 0.368 59.000 0.050 1.000   NA
 5935663 5935664 SUB0412 SUB0413     TRUE 0.477 36.000 0.000 1.000   NA
 5935664 5935665 SUB0413 SUB0414     TRUE 0.964 -3.000 0.114 NA   NA
 5935665 5935666 SUB0414 SUB0415     TRUE 0.810 10.000 0.000 NA   NA
 5935666 5935667 SUB0415 SUB0416     FALSE 0.214 119.000 0.024 NA   NA
 5935667 5935668 SUB0416 SUB0417   pflC FALSE 0.240 77.000 0.028 NA   NA
 5935668 5935669 SUB0417 SUB0418 pflC ppaC FALSE 0.198 115.000 0.023 1.000 N NA
 5935669 5935670 SUB0418 SUB0419 ppaC   TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 5935670 5935671 SUB0419 SUB0420     FALSE 0.201 65.000 0.000 NA   NA
 5935672 5935673 SUB0421 SUB0422 fhuG fhuB TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.038 Y NA
 5935673 5935674 SUB0422 SUB0423 fhuB fhuD TRUE 0.992 11.000 0.179 1.000 Y NA
 5935674 5935675 SUB0423 SUB0424 fhuD fhuC TRUE 0.998 25.000 0.889 1.000 Y NA
 5935675 5935676 SUB0424 SUB0425 fhuC murE FALSE 0.168 205.000 0.062 1.000 N NA
 5935677 5935678 SUB0426 SUB0427     FALSE 0.124 98.000 0.000 1.000   NA
 5935678 5935679 SUB0427 SUB0428   upp FALSE 0.157 92.000 0.004 1.000 N NA
 5935679 5935680 SUB0428 SUB0429 upp clpP FALSE 0.077 424.000 0.010 1.000 N NA
 5935680 5935681 SUB0429 SUB0430 clpP   FALSE 0.148 243.000 0.055 NA   NA
 5935681 5935682 SUB0430 SUB0431     TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   NA
 5935682 5935683 SUB0431 SUB0432     TRUE 0.295 140.000 0.109 NA   NA
 5935683 5935684 SUB0432 SUB0433     TRUE 0.961 41.000 0.150 NA Y NA
 5935684 5935685 SUB0433 SUB0434     TRUE 0.996 3.000 0.363 0.037 Y NA
 5935685 5935686 SUB0434 SUB0435     TRUE 0.998 0.000 0.349 1.000 Y NA
 5935686 5935687 SUB0435 SUB0436     TRUE 0.994 0.000 0.128 0.033 Y NA
 5935687 5935688 SUB0436 SUB0437     TRUE 0.503 70.000 0.214 1.000 N NA
 5935688 5935689 SUB0437 SUB0438   tmk FALSE 0.169 84.000 0.006 1.000 N NA
 5935689 5935690 SUB0438 SUB0439 tmk holB TRUE 0.957 16.000 0.254 1.000 N NA
 5935690 5935691 SUB0439 SUB0440 holB   TRUE 0.988 -3.000 0.372 NA   NA
 5935691 5935692 SUB0440 SUB0441     TRUE 0.980 -10.000 0.183 NA   NA
 5935692 5935693 SUB0441 SUB0442     TRUE 0.954 -22.000 0.043 1.000   NA
 5935693 5935694 SUB0442 SUB0443     FALSE 0.175 126.000 0.005 NA   NA
 5935696 5935697 SUB0445 SUB0446 serC   TRUE 0.848 16.000 0.012 1.000   NA
 5935697 5935698 SUB0446 SUB0447     FALSE 0.262 58.000 0.013 0.064   NA
 5935698 5935699 SUB0447 SUB0448   ogt TRUE 0.413 49.000 0.009 1.000 N NA
 5935699 5935700 SUB0448 SUB0449 ogt   TRUE 0.913 3.000 0.050 1.000 N NA
 5935701 5935702 SUB0450 SUB0451     FALSE 0.060 398.000 0.000 NA   NA
 5935702 5935703 SUB0451 SUB0452     TRUE 0.972 22.000 0.500 NA   NA
 5935703 5935704 SUB0452 SUB0453     FALSE 0.129 140.000 0.000 NA   NA
 5935704 5935705 SUB0453 SUB0454   exoA TRUE 0.988 2.000 0.000 NA Y NA
 5935706 5935707 SUB0455 SUB0456     TRUE 0.995 -13.000 0.667 NA   NA
 5935707 5935708 SUB0456 SUB0457     FALSE 0.134 98.000 0.000 NA   NA
 5935708 5935709 SUB0457 SUBt64   tRNA-Ser FALSE 0.136 103.000 0.000 NA   NA
 5935709 5935710 SUBt64 SUB0458 tRNA-Ser   FALSE 0.236 59.000 0.000 NA   NA
 5935710 5935711 SUB0458 SUBp02     FALSE 0.134 99.000 0.000 NA   NA
 5935711 5935712 SUBp02 SUB0460     FALSE 0.134 98.000 0.000 NA   NA
 5935712 5935713 SUB0460 SUB0461     TRUE 0.920 -27.000 0.000 NA   NA
 5935713 5935714 SUB0461 SUB0462   brnQ FALSE 0.075 253.000 0.000 NA   NA
 5935716 5935717 SUB0464 SUB0465     TRUE 0.995 -7.000 0.710 NA   NA
 5935717 5935718 SUB0465 SUB0466     FALSE 0.248 97.000 0.067 1.000   NA
 5935718 5935719 SUB0466 SUB0468   gcaD FALSE 0.155 131.000 0.002 1.000   NA
 5935719 5935720 SUB0468 SUB0469 gcaD   TRUE 0.813 21.000 0.015 1.000 N NA
 5935720 5935721 SUB0469 SUB0470     TRUE 0.941 -3.000 0.025 NA   NA
 5935721 5935722 SUB0470 SUB0471   mtnN TRUE 0.881 16.000 0.041 NA   NA
 5935724 5935725 SUB0473 SUB0474 mtuA mtsB TRUE 0.886 60.000 0.135 1.000 Y NA
 5935725 5935726 SUB0474 SUB0475 mtsB mtsC TRUE 0.992 4.000 0.130 1.000 Y NA
 5935726 5935727 SUB0475 SUB0476 mtsC   FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 5935729 5935730 SUB0478 SUB0479     FALSE 0.137 127.000 0.000 NA   NA
 5935732 5935733 SUB0481 SUB0482 rplK rplA TRUE 0.955 106.000 0.838 0.038 Y NA
 5935733 5935734 SUB0482 SUB0483 rplA pyrH FALSE 0.143 140.000 0.002 1.000 N NA
 5935734 5935735 SUB0483 SUB0484 pyrH rrf TRUE 0.940 36.000 0.626 1.000 N NA
 5935735 5935736 SUB0484 SUB0485 rrf   FALSE 0.194 115.000 0.012 NA   NA
 5935736 5935737 SUB0485 SUB0486   msrA FALSE 0.215 84.000 0.016 NA   NA
 5935737 5935738 SUB0486 SUB0487 msrA   TRUE 0.957 -3.000 0.080 NA   NA
 5935738 5935739 SUB0487 SUB0488     FALSE 0.147 181.000 0.010 NA   NA
 5935739 5935740 SUB0488 SUB0489     TRUE 0.478 45.000 0.005 NA N NA
 5935740 5935741 SUB0489 SUB0490     FALSE 0.169 93.000 0.003 NA   NA
 5935741 5935742 SUB0490 SUB0491   dgk TRUE 0.955 -22.000 0.035 NA   NA
 5935742 5935743 SUB0491 SUB0492 dgk era TRUE 0.852 22.000 0.063 1.000   NA
 5935743 5935744 SUB0492 SUB0494 era   FALSE 0.060 374.000 0.000 NA   NA
 5935744 5935745 SUB0494 SUB0495     TRUE 0.849 59.000 0.667 NA   NA
 5935745 5935746 SUB0495 SUB0496     TRUE 0.995 -13.000 0.667 NA   NA
 5935746 5935747 SUB0496 SUB0497     TRUE 0.920 -37.000 0.000 NA   NA
 5935747 5935748 SUB0497 SUB0498     FALSE 0.052 428.000 0.000 1.000 N NA
 5935748 5935749 SUB0498 SUB0499     TRUE 0.971 23.000 0.000 NA Y NA
 5935749 5935750 SUB0499 SUB0500     TRUE 0.913 -7.000 0.000 NA   NA
 5935752 5935753 SUB0502 SUB0504     TRUE 0.782 17.000 0.000 NA   NA
 5935753 5935754 SUB0504 SUB0505     FALSE 0.137 126.000 0.000 NA   NA
 5935754 5935755 SUB0505 SUB0506     TRUE 0.969 11.000 0.333 NA   NA
 5935755 5935756 SUB0506 SUB0508     FALSE 0.097 194.000 0.000 NA   NA
 5935756 5935757 SUB0508 SUB0509     FALSE 0.109 172.000 0.000 NA   NA
 5935757 5935758 SUB0509 SUB0510     TRUE 0.851 3.000 0.000 NA   NA
 5935758 5935759 SUB0510 SUB0510A     TRUE 0.826 6.000 0.000 NA   NA
 5935759 5935760 SUB0510A SUB0511     TRUE 0.620 29.000 0.000 NA   NA
 5935760 5935761 SUB0511 SUB0512   pedA FALSE 0.079 239.000 0.000 NA   NA
 5935761 5935762 SUB0512 SUB0513 pedA   TRUE 0.310 52.000 0.000 NA   NA
 5935762 5935763 SUB0513 SUB0514     TRUE 0.551 33.000 0.000 NA   NA
 5935763 5935764 SUB0514 SUB0515     FALSE 0.164 73.000 0.000 NA   NA
 5935764 5935765 SUB0515 SUB0516     FALSE 0.137 121.000 0.000 NA   NA
 5935765 10140081 SUB0516 SUB0517   fpg FALSE 0.106 180.000 0.000 NA   NA
 10140081 5935766 SUB0517 SUB0518 fpg coaE TRUE 0.950 -3.000 0.066 1.000 N NA
 5935766 5935767 SUB0518 SUB0519 coaE   TRUE 0.810 10.000 0.000 NA   NA
 5935767 5935768 SUB0519 SUB0520     FALSE 0.137 112.000 0.000 NA   NA
 5935768 5935769 SUB0520 SUB0521   pmrA FALSE 0.171 120.000 0.007 1.000   NA
 5935769 5935770 SUB0521 SUB0521A pmrA rpmGB TRUE 0.929 -3.000 0.012 1.000 N NA
 5935770 5935771 SUB0521A SUB0522 rpmGB secG TRUE 0.480 46.000 0.012 1.000 N NA
 5935771 5935772 SUB0522 SUB0523 secG rnr FALSE 0.262 81.000 0.064 1.000 N NA
 5935772 5935773 SUB0523 SUB0524 rnr smpB TRUE 0.935 3.000 0.143 0.032 N NA
 5935774 5935775 SUB0525 SUB0526 csbB gloA FALSE 0.193 101.000 0.012 NA N NA
 5935775 5935776 SUB0526 SUB0527 gloA   TRUE 0.861 13.000 0.019 1.000 N NA
 5935777 5935778 SUB0528 SUB0529     FALSE 0.114 164.000 0.000 NA   NA
 5935778 5935779 SUB0529 SUB0530     TRUE 0.379 61.000 0.128 0.021 N NA
 5935779 5935780 SUB0530 SUB0531     TRUE 0.877 10.000 0.085 0.021 N NA
 5935780 5935781 SUB0531 SUB0532     TRUE 0.911 26.000 0.211 NA   NA
 5935781 5935782 SUB0532 SUB0533     TRUE 0.980 27.000 0.842 NA   NA
 5935782 5935783 SUB0533 SUB0534     TRUE 0.483 66.000 0.167 1.000   NA
 5935785 5935786 SUB0536 SUB0537 ccpA   TRUE 0.591 41.000 0.041 1.000 N NA
 5935786 5935787 SUB0537 SUB0538     FALSE 0.245 74.000 0.037 1.000 N NA
 5935787 5935788 SUB0538 SUB0539     TRUE 0.997 2.000 0.413 0.012 Y NA
 5935788 5935789 SUB0539 SUB0540   thrS FALSE 0.055 354.000 0.000 1.000 N NA
 5935790 5935791 SUB0541 SUB0542     TRUE 0.986 9.000 0.625 1.000   NA
 5935792 5935793 SUB0543 SUB0544     TRUE 0.994 10.000 0.316 0.003 Y NA
 5935793 5935794 SUB0544 SUB0545     TRUE 0.951 0.000 0.099 1.000   NA
 5935794 5935795 SUB0545 SUB0546   glpF2 TRUE 0.989 11.000 0.857 0.066   NA
 5935795 5935796 SUB0546 SUB0547 glpF2   FALSE 0.138 109.000 0.000 NA   NA
 5935797 5935798 SUB0548 SUB0549     TRUE 0.998 16.000 0.947 0.013 Y NA
 5935798 5935799 SUB0549 SUB0550     TRUE 0.996 15.000 0.400 0.036 Y NA
 5935799 5935800 SUB0550 SUB0551   glnQ4 TRUE 0.993 14.000 0.185 1.000 Y NA
 10140082 5935801 SUB0552 SUB0553 vicR vicK TRUE 0.999 -7.000 0.597 0.061 Y NA
 5935801 5935802 SUB0553 SUB0554 vicK vicX TRUE 0.901 4.000 0.038 1.000   NA
 5935802 5935803 SUB0554 SUBp04 vicX   FALSE 0.135 159.000 0.002 1.000   NA
 5935803 5935804 SUBp04 SUB0556   smc TRUE 0.952 1.000 0.120 1.000 N NA
 5935804 5935805 SUB0556 SUB0557 smc   TRUE 0.716 22.000 0.000 1.000   NA
 5935805 5935806 SUB0557 SUB0558     TRUE 0.978 2.000 0.375 0.024   NA
 5935806 5935807 SUB0558 SUB0559   ftsY TRUE 0.881 0.000 0.007 0.078   NA
 5935807 5935808 SUB0559 SUB0560 ftsY   TRUE 0.605 30.000 0.000 NA   NA
 5935811 5935812 SUB0563 SUB0564     TRUE 0.996 -3.000 0.841 NA   NA
 5935812 5935813 SUB0564 SUB0565     TRUE 0.565 52.000 0.114 NA   NA
 5935814 5935815 SUB0566 SUB0567   phoP FALSE 0.120 151.000 0.000 NA N NA
 5935815 5935816 SUB0567 SUB0568 phoP phoR TRUE 0.999 -16.000 0.384 1.000 Y NA
 5935816 5935817 SUB0568 SUB0569 phoR   FALSE 0.100 173.000 0.000 1.000   NA
 5935817 5935818 SUB0569 SUB0570     FALSE 0.182 66.000 0.000 1.000   NA
 5935818 5935819 SUB0570 SUB0571     TRUE 0.997 -7.000 0.219 0.005 Y NA
 5935819 5935820 SUB0571 SUB0572   pstB3 TRUE 0.997 2.000 0.428 0.005 Y NA
 5935820 5935821 SUB0572 SUB0573 pstB3   TRUE 0.993 15.000 0.182 NA Y NA
 5935821 5935822 SUB0573 SUB0574     FALSE 0.134 126.000 0.000 NA N NA
 5935822 5935823 SUB0574 SUB0575     TRUE 0.983 -13.000 0.215 NA   NA
 5935823 5935824 SUB0575 SUB0576     TRUE 0.399 58.000 0.051 NA   NA
 5935824 5935825 SUB0576 SUB0577   ptsK TRUE 0.656 187.000 0.017 NA Y NA
 5935825 5935826 SUB0577 SUB0578 ptsK lgt TRUE 0.991 -3.000 0.494 1.000 N NA
 5935826 5935827 SUB0578 SUB0579 lgt   TRUE 0.897 17.000 0.079 NA   NA
 5935827 5935828 SUB0579 SUB0580     TRUE 0.974 0.000 0.206 NA   NA
 5935830 5935831 SUB0582 SUB0583     TRUE 0.783 114.000 0.156 0.003 Y NA
 5935833 5935834 SUB0585 SUB0586     FALSE 0.109 172.000 0.000 NA   NA
 5935835 5935836 SUB0587 SUB0588     FALSE 0.246 58.000 0.000 NA   NA
 5935838 5935839 SUB0591 SUB0592   lysS FALSE 0.155 75.000 0.000 NA   NA
 5935841 5935842 SUB0594 SUB0595     TRUE 0.853 18.000 0.021 NA   NA
 5935842 5935843 SUB0595 SUB0596     TRUE 0.895 4.000 0.016 NA   NA
 5935843 5935844 SUB0596 SUB0597     FALSE 0.188 94.000 0.010 NA   NA
 5935844 5935845 SUB0597 SUBs02     TRUE 0.298 53.000 0.000 NA   NA
 5935845 5935846 SUBs02 SUB0598     FALSE 0.136 93.000 0.000 NA   NA
 5935847 5935848 SUB0599 SUB0600     TRUE 0.991 -16.000 0.375 NA   NA
 5935850 5935851 SUB0602 SUB0603 ppc ftsW FALSE 0.202 104.000 0.028 1.000 N NA
 5935851 5935852 SUB0603 SUB0604 ftsW tufA FALSE 0.079 212.000 0.000 1.000 N NA
 5935852 5935853 SUB0604 SUB0605 tufA tpi FALSE 0.084 261.000 0.003 1.000 N NA
 5935854 5935855 SUB0606 SUB0607 murN murM TRUE 0.998 0.000 0.467 0.008 Y NA
 5935855 5935856 SUB0607 SUB0608 murM   TRUE 0.989 0.000 0.500 1.000   NA
 5935856 5935857 SUB0608 SUB0609     FALSE 0.187 161.000 0.035 1.000   NA
 5935858 5935859 SUB0610 SUB0611     TRUE 0.918 -10.000 0.000 NA   NA
 5935859 5935860 SUB0611 SUB0612     TRUE 0.347 49.000 0.000 NA   NA
 5935860 5935861 SUB0612 SUB0613     TRUE 0.441 43.000 0.000 NA   NA
 5935861 5935862 SUB0613 SUB0614     FALSE 0.270 56.000 0.000 NA   NA
 5935866 5935867 SUB0618 SUB0619     FALSE 0.094 185.000 0.000 1.000   NA
 5935867 5935868 SUB0619 SUB0620     FALSE 0.193 101.000 0.018 1.000 N NA
 5935868 5935869 SUB0620 SUB0621   prfB TRUE 0.398 49.000 0.006 1.000 N NA
 5935869 5935870 SUB0621 SUB0622 prfB ftsE TRUE 0.539 47.000 0.053 1.000 N NA
 5935870 5935871 SUB0622 SUB0623 ftsE ftsX TRUE 0.999 -7.000 0.431 1.000 Y NA
 5935871 5935872 SUB0623 SUB0624 ftsX   FALSE 0.054 529.000 0.000 NA   NA
 5935873 5935874 SUB0625 SUB0626     FALSE 0.183 69.000 0.000 NA   NA
 5935875 5935876 SUB0627 SUB0628   aspC FALSE 0.165 170.000 0.028 1.000 N NA
 5935876 5935877 SUB0628 SUB0629 aspC asnS TRUE 0.865 20.000 0.068 1.000 N NA
 5935877 5935878 SUB0629 SUB0630 asnS   FALSE 0.072 266.000 0.000 NA   NA
 5935878 5935879 SUB0630 SUB0631     TRUE 0.979 -3.000 0.214 NA   NA
 5935879 5935880 SUB0631 SUB0632     TRUE 0.991 -3.000 0.470 NA   NA
 5935880 5935881 SUB0632 SUB0633   pepD TRUE 0.308 63.000 0.015 NA   NA
 5935881 5935882 SUB0633 SUB0634 pepD adcA TRUE 0.464 136.000 0.250 1.000 N NA
 5935883 5935884 SUB0635 SUB0636 rpmE   FALSE 0.202 108.000 0.020 1.000   NA
 5935884 5935885 SUB0636 SUB0637     TRUE 0.886 8.000 0.033 1.000   NA
 5935886 5935887 SUB0638 SUB0639   hisC TRUE 0.983 6.000 0.000 1.000 Y NA
 5935889 5935890 SUB0641 SUB0642     TRUE 0.409 75.000 0.167 1.000 N NA
 5935890 5935891 SUB0642 SUB0643     TRUE 0.965 -16.000 0.094 1.000 N NA
 5935891 5935892 SUB0643 SUB0644   rplS FALSE 0.163 124.000 0.006 1.000 N NA
 5935892 5935893 SUB0644 SUB0646 rplS   FALSE 0.053 437.000 0.000 1.000   NA
 5935893 5935894 SUB0646 SUBt25   tRNA-Arg FALSE 0.230 60.000 0.000 NA   NA
 5935894 5935895 SUBt25 SUB0647 tRNA-Arg   FALSE 0.138 91.000 0.000 NA   NA
 5935895 5935896 SUB0647 SUB0648     TRUE 0.596 86.000 0.385 1.000   NA
 5935896 5935897 SUB0648 SUB0649   gyrB TRUE 0.913 1.000 0.013 1.000   NA
 5935897 5935898 SUB0649 SUB0650 gyrB ezrA FALSE 0.162 152.000 0.011 1.000 N NA
 5935898 5935899 SUB0650 SUB0651 ezrA   FALSE 0.173 109.000 0.009 1.000 N NA
 5935899 5935900 SUB0651 SUB0652     TRUE 0.988 2.000 0.000 NA Y NA
 5935900 5935901 SUB0652 SUB0653     TRUE 0.886 0.000 0.000 NA   NA
 5935903 5935904 SUB0655 SUB0656 eno   FALSE 0.046 730.000 0.000 1.000 N NA
 5935904 5935905 SUB0656 SUB0657     FALSE 0.112 166.000 0.000 NA   NA
 5935905 5935906 SUB0657 SUB0658   lig FALSE 0.189 118.000 0.010 NA   NA
 5935906 5935907 SUB0658 SUB0659 lig   TRUE 0.838 17.000 0.013 1.000 N NA
 5935907 5935908 SUB0659 SUB0660     TRUE 0.961 -7.000 0.088 1.000 N NA
 5935908 5935909 SUB0660 SUB0661   glgB TRUE 0.757 72.000 0.067 0.004 Y NA
 5935909 5935910 SUB0661 SUB0662 glgB glgC TRUE 0.909 64.000 0.317 0.002 Y NA
 5935910 5935911 SUB0662 SUB0663 glgC   TRUE 0.999 -10.000 0.810 0.001 Y NA
 5935911 5935912 SUB0663 SUB0664   glgA TRUE 0.998 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 5935912 5935913 SUB0664 SUB0665 glgA glgP TRUE 0.991 17.000 0.171 1.000 Y NA
 5935913 5935914 SUB0665 SUB0666 glgP atpE FALSE 0.068 254.000 0.000 1.000   NA
 5935914 5935915 SUB0666 SUB0667 atpE atpB TRUE 0.334 105.000 0.189 0.005   NA
 5935915 5935916 SUB0667 SUB0668 atpB atpF TRUE 0.981 16.000 0.032 0.005 Y NA
 5935916 5935917 SUB0668 SUB0669 atpF atpH TRUE 0.996 0.000 0.222 0.005 Y NA
 5935917 5935918 SUB0669 SUB0670 atpH atpA TRUE 0.998 16.000 0.864 0.005 Y NA
 5935918 5935919 SUB0670 SUB0671 atpA atpG TRUE 0.998 19.000 0.846 0.005 Y NA
 5935919 5935920 SUB0671 SUB0672 atpG atpD TRUE 0.941 123.000 0.724 0.005 Y NA
 5935920 5935921 SUB0672 SUB0673 atpD atpC TRUE 0.998 14.000 0.837 0.005 Y NA
 5935921 5935922 SUB0673 SUB0674 atpC   FALSE 0.241 82.000 0.039 NA   NA
 5935922 5935923 SUB0674 SUB0675   murA1 TRUE 0.540 75.000 0.279 NA   NA
 5935923 5935924 SUB0675 SUB0676 murA1 epuA TRUE 0.936 4.000 0.110 NA   NA
 5935924 5935925 SUB0676 SUB0677 epuA endA TRUE 0.885 32.000 0.237 NA   NA
 5935925 5935926 SUB0677 SUB0678 endA pheS FALSE 0.060 303.000 0.000 1.000   NA
 5935926 5935927 SUB0678 SUB0679 pheS   TRUE 0.452 47.000 0.009 1.000   NA
 5935927 5935928 SUB0679 SUB0680   pheT TRUE 0.841 15.000 0.007 1.000   NA
 5935928 5935929 SUB0680 SUB0681 pheT   FALSE 0.125 102.000 0.000 1.000   NA
 5935929 5935930 SUB0681 SUB0682     TRUE 0.583 30.000 0.000 1.000   NA
 5935930 5935931 SUB0682 SUB0683     TRUE 0.978 10.000 0.444 1.000 N NA
 5935933 5935934 SUB0685 SUB0686 addB addA TRUE 0.995 -10.000 0.070 0.043 Y NA
 5935934 5935935 SUB0686 SUB0687 addA   FALSE 0.176 118.000 0.010 1.000 N NA
 5935935 5935936 SUB0687 SUB0688     TRUE 0.885 60.000 0.133 1.000 Y NA
 5935936 5935937 SUB0688 SUB0689   rpsU FALSE 0.205 127.000 0.027 1.000   NA
 5935939 5935940 SUB0691 SUB0692 dnaG rpoD TRUE 0.953 9.000 0.209 1.000 N NA
 5935940 5935941 SUB0692 SUB0693 rpoD   FALSE 0.178 187.000 0.044 NA   NA
 5935941 5935942 SUB0693 SUB0694   rmlD TRUE 0.370 104.000 0.152 NA   NA
 5935942 5935943 SUB0694 SUB0695 rmlD   TRUE 0.857 116.000 0.212 NA Y NA
 5935943 5935944 SUB0695 SUB0696     TRUE 0.998 -10.000 0.289 NA Y NA
 5935944 5935945 SUB0696 SUB0697     TRUE 0.998 -16.000 0.289 NA Y NA
 5935945 5935946 SUB0697 SUB0698     TRUE 0.998 0.000 0.500 1.000 Y NA
 5935946 5935947 SUB0698 SUB0699     TRUE 0.987 14.000 0.056 1.000 Y NA
 5935947 5935948 SUB0699 SUB0700     TRUE 0.995 -3.000 0.056 NA Y NA
 5935948 5935949 SUB0700 SUB0701     TRUE 0.999 -7.000 0.385 NA Y NA
 5935949 5935950 SUB0701 SUB0702     TRUE 0.954 12.000 0.222 NA   NA
 5935950 5935951 SUB0702 SUB0703     TRUE 0.925 4.000 0.075 NA   NA
 5935951 5935952 SUB0703 SUB0704     TRUE 0.966 -13.000 0.086 NA   NA
 5935952 5935953 SUB0704 SUB0705     FALSE 0.119 140.000 0.000 1.000   NA
 5935953 5935954 SUB0705 SUB0706   pepT FALSE 0.127 87.000 0.000 1.000 N NA
 5935954 5935955 SUB0706 SUB0707 pepT   TRUE 0.838 23.000 0.051 NA   NA
 5935957 5935958 SUB0709 SUB0710   cmk TRUE 0.826 15.000 0.002 1.000   NA
 5935958 5935959 SUB0710 SUB0711 cmk infC FALSE 0.150 163.000 0.010 1.000 N NA
 5935959 5935960 SUB0711 SUB0712 infC rpmI TRUE 0.990 38.000 0.652 1.000 Y NA
 5935960 5935961 SUB0712 SUB0713 rpmI rplT TRUE 0.984 54.000 0.928 0.027 Y NA
 5935963 5935964 SUB0715 SUB0716   aroD TRUE 0.966 -3.000 0.125 NA   NA
 5935964 5935965 SUB0716 SUB0717 aroD aroF TRUE 0.626 95.000 0.004 0.003 Y NA
 5935965 5935966 SUB0717 SUB0718 aroF   FALSE 0.255 64.000 0.005 NA   NA
 5935966 5935967 SUB0718 SUB0719   gor FALSE 0.199 82.000 0.010 NA   NA
 5935969 5935970 SUB0721 SUB0722   thiI TRUE 0.981 2.000 0.349 1.000 N NA
 5935970 5935971 SUB0722 SUB0723 thiI   FALSE 0.203 90.000 0.014 NA N NA
 5935973 5935974 SUB0725 SUB0726 rplU   TRUE 0.994 10.000 0.208 NA Y NA
 5935974 5935975 SUB0726 SUB0727   rpmA TRUE 0.985 28.000 0.203 NA Y NA
 5935975 5935976 SUB0727 SUB0728 rpmA   FALSE 0.123 118.000 0.000 1.000 N NA
 5935976 5935977 SUB0728 SUB0729   lspA TRUE 0.956 0.000 0.119 1.000 N NA
 5935977 5935978 SUB0729 SUB0730 lspA   TRUE 0.937 2.000 0.082 1.000 N NA
 5935978 5935979 SUB0730 SUB0731   pyrR FALSE 0.132 243.000 0.048 1.000 N NA
 5935979 5935980 SUB0731 SUB0732 pyrR pyrP TRUE 0.991 15.000 0.140 1.000 Y NA
 5935980 5935981 SUB0732 SUB0733 pyrP pyrB TRUE 0.944 40.000 0.064 1.000 Y NA
 5935981 5935982 SUB0733 SUB0734 pyrB carA TRUE 0.944 35.000 0.014 1.000 Y NA
 5935982 5935983 SUB0734 SUB0735 carA carB TRUE 0.875 55.000 0.117 0.001 Y NA
 5935983 5935984 SUB0735 SUB0736 carB   FALSE 0.143 193.000 0.017 1.000 N NA
 5935984 5935985 SUB0736 SUB0737     TRUE 0.995 0.000 0.923 1.000 N NA
 5935985 5935986 SUB0737 SUB0738     TRUE 0.999 12.000 0.923 1.000 Y NA
 5935986 5935987 SUB0738 SUB0739     TRUE 0.987 -7.000 0.308 NA   NA
 5935987 5935988 SUB0739 SUB0740     FALSE 0.271 73.000 0.041 NA   NA
 5935988 5935989 SUB0740 SUB0741   rpsP FALSE 0.134 159.000 0.003 1.000 N NA
 5935989 5935990 SUB0741 SUB0742 rpsP   TRUE 0.975 10.000 0.385 1.000   NA
 5935990 5935991 SUB0742 SUB0743   rimM TRUE 0.368 248.000 0.324 1.000   NA
 5935991 5935992 SUB0743 SUB0744 rimM trmD TRUE 0.999 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 5935992 5935993 SUB0744 SUB0745 trmD   TRUE 0.832 12.000 0.007 1.000 N NA
 5935993 5935994 SUB0745 SUB0746     FALSE 0.208 173.000 0.059 NA   NA
 5935994 5935995 SUB0746 SUB0747     TRUE 0.968 16.000 0.333 NA   NA
 5935995 5935996 SUB0747 SUB0748     FALSE 0.110 153.000 0.000 1.000 N NA
 5935996 5935997 SUB0748 SUB0749   fruK TRUE 0.999 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 5935997 5935998 SUB0749 SUB0750 fruK fruA TRUE 0.999 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 5935998 5935999 SUB0750 SUB0751 fruA mur1.1 FALSE 0.201 91.000 0.022 1.000 N NA
 5935999 5936000 SUB0751 SUB0752 mur1.1   TRUE 0.870 126.000 0.333 0.004 Y NA
 5936000 5936001 SUB0752 SUB0753     TRUE 0.724 57.000 0.333 1.000   NA
 5936001 5936002 SUB0753 SUB0754     TRUE 0.306 74.000 0.083 1.000   NA
 5936002 5936003 SUB0754 SUB0755     TRUE 0.963 0.000 0.139 NA   NA
 5936003 5936004 SUB0755 SUB0756   dapB TRUE 0.811 18.000 0.002 NA   NA
 5936004 5936005 SUB0756 SUB0757 dapB cca TRUE 0.932 -3.000 0.015 1.000 N NA
 5936005 5936006 SUB0757 SUB0758 cca   TRUE 0.954 -7.000 0.056 1.000   NA
 5936006 5936007 SUB0758 SUB0759     TRUE 0.856 6.000 0.006 1.000   NA
 5936007 5936008 SUB0759 SUB0760     FALSE 0.200 82.000 0.013 1.000   NA
 5936008 5936009 SUB0760 SUB0761     TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.008 Y NA
 5936009 5936010 SUB0761 SUB0762   gdh FALSE 0.240 123.000 0.059 1.000 N NA
 5936010 5936011 SUB0762 SUB0763 gdh fms FALSE 0.253 80.000 0.056 1.000 N NA
 5936013 5936014 SUB0765 SUB0766 mvaK1 mvaD TRUE 0.998 -18.000 0.281 0.004 Y NA
 5936014 5936015 SUB0766 SUB0767 mvaD mvaK2 TRUE 0.998 -7.000 0.312 0.005 Y NA
 5936015 5936016 SUB0767 SUB0768 mvaK2 fni TRUE 0.958 -3.000 0.097 1.000 N NA
 5936017 5936018 SUB0769 SUB0770 mvaA mvaS TRUE 0.997 -7.000 0.183 1.000 Y NA
 5936019 5936020 SUB0771 SUB0772 thyA dyr TRUE 0.524 80.000 0.295 1.000 N NA
 5936020 5936021 SUB0772 SUB0772A dyr   TRUE 0.800 25.000 0.030 NA   NA
 5936021 5936022 SUB0772A SUB0773   clpX TRUE 0.789 24.000 0.012 NA   NA
 5936022 5936023 SUB0773 SUB0774 clpX engB TRUE 0.878 11.000 0.043 1.000   NA
 5936023 5936024 SUB0774 SUB0775 engB   FALSE 0.153 153.000 0.004 NA   NA
 5936026 5936027 SUB0777 SUB0778 rplJ rplL TRUE 0.972 66.000 0.884 0.027 Y NA
 5936027 5936028 SUB0778 SUB0779 rplL   FALSE 0.072 241.000 0.000 1.000   NA
 5936028 5936029 SUB0779 SUB0780     TRUE 0.975 14.000 0.400 NA   NA
 5936029 5936030 SUB0780 SUB0781     TRUE 0.667 119.000 0.500 NA   NA
 5936030 5936031 SUB0781 SUB0782     FALSE 0.076 244.000 0.000 NA   NA
 5936031 5936032 SUB0782 SUB0783     TRUE 0.993 0.000 0.667 NA   NA
 5936032 5936033 SUB0783 SUB0784     TRUE 0.985 2.000 0.400 NA   NA
 5936033 5936034 SUB0784 SUB0785     TRUE 0.664 134.000 0.500 NA   NA
 5936034 5936035 SUB0785 SUB0786     TRUE 0.934 34.000 0.500 NA   NA
 5936035 5936036 SUB0786 SUB0787     TRUE 0.995 -10.000 0.667 NA   NA
 5936036 5936037 SUB0787 SUB0788     FALSE 0.070 278.000 0.000 NA   NA
 5936037 5936038 SUB0788 SUB0789     TRUE 0.902 -3.000 0.000 NA   NA
 5936038 5936039 SUB0789 SUB0790     FALSE 0.119 158.000 0.000 NA   NA
 5936039 5936040 SUB0790 SUB0790A     TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 5936040 5936041 SUB0790A SUB0792   lacR FALSE 0.104 182.000 0.000 NA   NA
 5936041 5936042 SUB0792 SUB0793 lacR lacA2 TRUE 0.538 215.000 0.000 1.000 Y NA
 5936042 5936043 SUB0793 SUB0794 lacA2 lacB2 TRUE 0.991 33.000 0.667 0.003 Y NA
 5936043 5936044 SUB0794 SUB0795 lacB2 lacC2 TRUE 0.997 11.000 0.500 1.000 Y NA
 5936044 5936045 SUB0795 SUB0796 lacC2 lacD2 TRUE 0.997 3.000 0.500 0.003 Y NA
 5936045 5936046 SUB0796 SUB0797 lacD2 lacT2 FALSE 0.074 236.000 0.000 1.000   NA
 5936046 5936047 SUB0797 SUB0798 lacT2 lacF2 TRUE 0.844 37.000 0.250 1.000   NA
 5936047 5936048 SUB0798 SUB0799 lacF2 lacE2 TRUE 0.994 0.000 0.150 0.020 Y NA
 5936048 5936049 SUB0799 SUB0800 lacE2 lacG2 TRUE 0.777 98.000 0.100 1.000 Y NA
 5936049 5936050 SUB0800 SUB0801 lacG2   TRUE 0.693 25.000 0.000 NA   NA
 5936050 5936051 SUB0801 SUB0802   lacX2 TRUE 0.821 8.000 0.000 NA   NA
 5936051 5936052 SUB0802 SUB0803 lacX2   FALSE 0.092 189.000 0.000 1.000   NA
 5936052 5936053 SUB0803 SUB0804     FALSE 0.091 204.000 0.000 NA   NA
 5936053 5936054 SUB0804 SUB0805     TRUE 0.851 3.000 0.000 NA   NA
 5936056 5936057 SUB0807 SUB0808     FALSE 0.182 66.000 0.000 1.000   NA
 5936059 5936060 SUB0810 SUB0811 hom thrB TRUE 0.991 2.000 0.036 1.000 Y NA
 5936060 5936061 SUB0811 SUB0812 thrB folC1 FALSE 0.171 84.000 0.006 1.000 N NA
 5936061 5936062 SUB0812 SUB0813 folC1 folE TRUE 0.977 25.000 0.057 1.000 Y NA
 5936062 5936063 SUB0813 SUB0814 folE folP TRUE 0.988 12.000 0.073 1.000 Y NA
 5936063 5936064 SUB0814 SUB0815 folP folQ TRUE 0.992 3.000 0.094 1.000 Y NA
 5936064 5936065 SUB0815 SUB0816 folQ folK TRUE 0.996 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 5936065 5936066 SUB0816 SUB0817 folK murB FALSE 0.178 92.000 0.010 1.000 N NA
 5936066 5936067 SUB0817 SUB0818 murB potA TRUE 0.863 17.000 0.041 1.000 N NA
 5936067 5936068 SUB0818 SUB0819 potA potB TRUE 0.999 -16.000 0.928 0.035 Y NA
 5936068 5936069 SUB0819 SUB0820 potB potC TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.035 Y NA
 5936069 5936070 SUB0820 SUB0821 potC potD TRUE 0.997 -7.000 0.253 0.035 Y NA
 5936071 5936072 SUB0822 SUB0823     TRUE 0.988 2.000 0.000 NA Y NA
 5936073 5936074 SUB0824 SUB0825 malP   TRUE 0.996 19.000 0.432 1.000 Y NA
 5936074 5936075 SUB0825 SUB0826     FALSE 0.087 196.000 0.000 1.000   NA
 5936075 5936076 SUB0826 SUB0827     FALSE 0.088 131.000 0.000 0.074   NA
 5936076 5936077 SUB0827 SUB0828     FALSE 0.142 84.000 0.000 NA   NA
 5936077 5936078 SUB0828 SUB0830     FALSE 0.079 240.000 0.000 NA   NA
 5936080 5936081 SUB0834 SUB0835     FALSE 0.250 96.000 0.071 1.000 N NA
 5936081 5936082 SUB0835 SUB0836     TRUE 0.795 28.000 0.071 1.000   NA
 5936082 5936083 SUB0836 SUB0837     FALSE 0.126 130.000 0.000 1.000   NA
 5936083 5936084 SUB0837 SUB0838     TRUE 0.987 32.000 0.333 1.000 Y NA
 5936084 5936085 SUB0838 SUB0839     TRUE 0.997 14.000 0.667 0.020 Y NA
 5936085 5936086 SUB0839 SUB0840     TRUE 0.673 25.000 0.000 1.000   NA
 5936086 5936087 SUB0840 SUB0841     TRUE 0.555 32.000 0.000 1.000   NA
 5936087 5936088 SUB0841 SUB0842     FALSE 0.135 102.000 0.000 NA   NA
 5936088 5936089 SUB0842 SUB0843   radC TRUE 0.594 44.000 0.046 NA   NA
 5936090 5936091 SUB0844 SUB0845   rex TRUE 0.985 18.000 0.714 1.000   NA
 5936091 5936092 SUB0845 SUB0847 rex   TRUE 0.397 164.000 0.214 NA   NA
 5936092 5936093 SUB0847 SUB0848     TRUE 0.792 30.000 0.083 NA   NA
 5936093 5936094 SUB0848 SUB0849     TRUE 0.958 3.000 0.166 NA   NA
 5936094 5936095 SUB0849 SUB0850   prsA2 TRUE 0.996 -10.000 0.089 1.000 Y NA
 5936095 5936096 SUB0850 SUB0851 prsA2   TRUE 0.346 119.000 0.145 1.000   NA
 5936097 5936098 SUB0852 SUB0853   ppnK TRUE 0.996 -25.000 0.725 1.000   NA
 5936098 5936099 SUB0853 SUB0854 ppnK   TRUE 0.969 -3.000 0.150 1.000 N NA
 5936099 5936100 SUB0854 SUB0855   pta TRUE 0.915 4.000 0.067 1.000 N NA
 5936100 5936101 SUB0855 SUB0856 pta   FALSE 0.218 69.000 0.031 0.059   NA
 5936103 5936104 SUB0859 SUB0860     FALSE 0.098 177.000 0.000 1.000   NA
 5936104 5936105 SUB0860 SUB0861     TRUE 0.971 2.000 0.231 1.000 N NA
 5936105 5936106 SUB0861 SUB0862     TRUE 0.943 -3.000 0.046 1.000 N NA
 5936106 5936107 SUB0862 SUB0863     TRUE 0.989 -7.000 0.382 1.000 N NA
 5936107 5936108 SUB0863 SUB0864     FALSE 0.123 127.000 0.000 1.000 N NA
 5936108 5936109 SUB0864 SUB0865     FALSE 0.074 228.000 0.000 1.000 N NA
 5936109 5936110 SUB0865 SUBs03     TRUE 0.441 43.000 0.000 NA   NA
 5936110 5936111 SUBs03 SUB0866   xpt FALSE 0.142 85.000 0.000 NA   NA
 5936111 5936112 SUB0866 SUB0867 xpt pbuX TRUE 0.993 0.000 0.046 1.000 Y NA
 5936113 5936114 SUB0868 SUB0869     TRUE 0.491 69.000 0.189 1.000   NA
 5936115 5936116 SUB0870 SUB0871 tdk prfA TRUE 0.873 18.000 0.062 1.000 N NA
 5936116 5936117 SUB0871 SUB0872 prfA   TRUE 0.994 0.000 0.084 1.000 Y NA
 5936117 5936118 SUB0872 SUB0873     TRUE 0.995 -7.000 0.029 NA Y NA
 5936118 5936119 SUB0873 SUB0874   glyA TRUE 0.766 26.000 0.015 NA N NA
 5936119 5936120 SUB0874 SUB0875 glyA   TRUE 0.933 4.000 0.103 NA   NA
 5936120 5936121 SUB0875 SUB0876     TRUE 0.957 1.000 0.128 NA   NA
 5936121 5936122 SUB0876 SUB0877   nox FALSE 0.067 299.000 0.000 NA   NA
 5936122 5936123 SUB0877 SUB0878 nox   TRUE 0.374 58.000 0.047 1.000   NA
 5936125 5936126 SUB0880 SUB0881 gyrA srtA TRUE 0.878 7.000 0.013 NA N NA
 5936126 5936127 SUB0881 SUB0882 srtA   TRUE 0.495 49.000 0.039 NA N NA
 5936127 5936128 SUB0882 SUB0883     FALSE 0.167 181.000 0.024 NA   NA
 5936128 5936129 SUB0883 SUB0884   lmb FALSE 0.103 183.000 0.000 NA   NA
 5936129 5936130 SUB0884 SUB0885 lmb   TRUE 0.989 13.000 0.800 NA   NA
 5936132 5936133 SUB0887 SUB0888     FALSE 0.137 124.000 0.000 NA   NA
 5936134 5936135 SUB0889 SUB0890     FALSE 0.078 214.000 0.000 1.000 N NA
 5936135 5936136 SUB0890 SUB0891   guaA FALSE 0.053 406.000 0.000 1.000 N NA
 5936137 5936138 SUB0892 SUB0893     TRUE 0.356 64.000 0.057 NA   NA
 5936138 5936139 SUB0893 SUB0894     FALSE 0.162 116.000 0.032 0.041   NA
 5936139 5936140 SUB0894 SUB0895   ffh TRUE 0.934 13.000 0.151 1.000   NA
 5936141 5936142 SUB0896 SUB0897     TRUE 0.913 -7.000 0.000 NA   NA
 5936142 5936143 SUB0897 SUB0898     TRUE 0.913 -7.000 0.000 NA   NA
 5936143 5936144 SUB0898 SUB0899     TRUE 0.799 9.000 0.000 1.000 N NA
 5936145 5936146 SUB0900 SUB0901     FALSE 0.137 111.000 0.000 NA   NA
 5936146 5936147 SUB0901 SUB0903     FALSE 0.137 106.000 0.000 NA   NA
 5936149 5936150 SUB0905 SUB0906     TRUE 0.660 113.000 0.000 1.000 Y NA
 5936150 5936151 SUB0906 SUB0907     FALSE 0.106 180.000 0.000 NA   NA
 5936151 5936152 SUB0907 SUB0908     TRUE 0.966 12.000 0.312 NA   NA
 5936152 5936153 SUB0908 SUB0909     FALSE 0.123 136.000 0.000 1.000   NA
 5936153 5936154 SUB0909 SUB0910     TRUE 0.826 6.000 0.000 NA   NA
 5936154 5936155 SUB0910 SUB0911     TRUE 0.997 -9.000 0.900 NA   NA
 5936155 5936156 SUB0911 SUB0913     FALSE 0.058 426.000 0.000 NA   NA
 5936157 5936158 SUB0914 SUB0915     TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 5936158 5936159 SUB0915 SUB0916     TRUE 0.838 4.000 0.000 NA   NA
 5936159 5936160 SUB0916 SUB0917     TRUE 0.999 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 5936160 5936161 SUB0917 SUB0918     TRUE 0.647 44.000 0.094 1.000   NA
 5936161 5936162 SUB0918 SUB0919     TRUE 0.994 2.000 0.855 1.000   NA
 5936164 5936165 SUB0921 SUB0922     FALSE 0.176 139.000 0.008 NA   NA
 5936165 5936166 SUB0922 SUB0923     TRUE 0.984 -7.000 0.250 NA   NA
 5936168 5936169 SUB0925 SUB0926 topA   TRUE 0.865 105.000 0.238 1.000 Y NA
 5936169 5936170 SUB0926 SUB0927   maa TRUE 0.289 58.000 0.005 1.000   NA
 5936170 5936171 SUB0927 SUB0928 maa rnh TRUE 0.636 31.000 0.003 1.000   NA
 5936171 5936172 SUB0928 SUB0929 rnh   TRUE 0.975 -16.000 0.148 1.000   NA
 5936173 5936174 SUB0930 SUB0931     TRUE 0.953 3.000 0.146 NA   NA
 5936174 5936175 SUB0931 SUB0932     TRUE 0.340 84.000 0.135 1.000   NA
 5936176 5936177 SUB0933 SUB0934     TRUE 0.810 10.000 0.000 NA   NA
 5936177 5936178 SUB0934 SUB0935     FALSE 0.071 271.000 0.000 NA   NA
 5936180 5936181 SUB0937 SUB0938   dapA FALSE 0.134 96.000 0.000 NA   NA
 5936181 5936182 SUB0938 SUB0939 dapA asd TRUE 0.908 50.000 0.063 1.000 Y NA
 5936182 5936183 SUB0939 SUB0940 asd   FALSE 0.063 277.000 0.000 1.000 N NA
 5936183 5936184 SUB0940 SUB0941     FALSE 0.137 112.000 0.000 NA   NA
 5936184 5936185 SUB0941 SUB0942   fhs1 FALSE 0.137 126.000 0.000 NA   NA
 5936186 5936187 SUB0943 SUB0944 dpfB coaC TRUE 0.905 -7.000 0.000 1.000   NA
 5936187 5936188 SUB0944 SUB0945 coaC   TRUE 0.305 64.000 0.019 NA   NA
 5936188 5936189 SUB0945 SUB0946   pgmA FALSE 0.276 146.000 0.098 NA   NA
 5936190 5936191 SUB0947 SUB0948     TRUE 0.990 2.000 0.720 0.034   NA
 5936191 5936192 SUB0948 SUB0949     TRUE 0.991 -7.000 0.438 1.000   NA
 5936192 5936193 SUB0949 SUB0950     FALSE 0.215 131.000 0.036 1.000   NA
 5936193 5936194 SUB0950 SUB0951   cdd TRUE 0.514 91.000 0.300 1.000   NA
 5936194 5936195 SUB0951 SUB0952 cdd deoC TRUE 0.995 -10.000 0.051 1.000 Y NA
 5936195 5936196 SUB0952 SUB0953 deoC deoA TRUE 0.989 11.000 0.106 1.000 Y NA
 5936196 5936197 SUB0953 SUB0954 deoA   TRUE 0.942 -3.000 0.044 1.000 N NA
 5936198 5936199 SUB0955 SUB0956 coaA rpsT FALSE 0.247 69.000 0.014 1.000 N NA
 5936200 5936201 SUB0957 SUB0958 ciaH ciaR TRUE 0.999 -7.000 0.606 1.000 Y NA
 5936201 5936202 SUB0958 SUB0959 ciaR pepN FALSE 0.243 122.000 0.061 1.000 N NA
 5936202 5936203 SUB0959 SUB0960 pepN phoU TRUE 0.322 70.000 0.067 NA N NA
 5936203 5936204 SUB0960 SUB0961 phoU pstB1 TRUE 0.995 20.000 0.413 NA Y NA
 5936204 5936205 SUB0961 SUB0962 pstB1 pstB2 TRUE 0.996 13.000 0.542 0.002 Y NA
 5936205 5936206 SUB0962 SUB0963 pstB2   TRUE 0.996 15.000 0.490 0.004 Y NA
 5936206 5936207 SUB0963 SUB0964   pstC TRUE 0.999 -10.000 0.907 0.004 Y NA
 5936207 5936208 SUB0964 SUB0965 pstC pstS TRUE 0.993 11.000 0.206 1.000 Y NA
 5936208 5936209 SUB0965 SUB0966 pstS   FALSE 0.102 165.000 0.000 1.000 N NA
 5936209 5936210 SUB0966 SUB0967     TRUE 0.989 -10.000 0.337 NA   NA
 5936210 5936211 SUB0967 SUB0968   spxA TRUE 0.979 -10.000 0.169 NA   NA
 5936211 5936212 SUB0968 SUB0969 spxA ribC FALSE 0.270 66.000 0.017 1.000 N NA
 5936212 5936213 SUB0969 SUB0970 ribC truB TRUE 0.972 4.000 0.308 1.000 N NA
 5936213 5936214 SUB0970 SUB0971 truB   FALSE 0.203 93.000 0.014 NA   NA
 5936214 5936215 SUB0971 SUB0972     FALSE 0.255 79.000 0.045 NA   NA
 5936215 5936216 SUB0972 SUB0973     TRUE 0.869 18.000 0.045 NA   NA
 5936216 5936217 SUB0973 SUB0974     TRUE 0.312 107.000 0.121 1.000   NA
 5936217 5936218 SUB0974 SUB0975     TRUE 0.996 12.000 0.438 1.000 Y NA
 5936220 5936221 SUB0977 SUB0978 tpx   FALSE 0.122 131.000 0.000 1.000 N NA
 5936221 5936222 SUB0978 SUB0979     TRUE 0.447 150.000 0.238 NA   NA
 5936222 5936223 SUB0979 SUB0980     TRUE 0.984 11.000 0.600 NA   NA
 5936223 5936224 SUB0980 SUB0981     TRUE 0.922 44.000 0.600 NA   NA
 5936224 5936225 SUB0981 SUB0982     TRUE 0.335 68.000 0.060 NA   NA
 5936225 5936226 SUB0982 SUB0983     TRUE 0.933 11.000 0.143 NA   NA
 5936226 5936227 SUB0983 SUB0984     TRUE 0.727 59.000 0.357 NA   NA
 5936227 5936228 SUB0984 SUB0985     FALSE 0.135 64.000 0.000 0.061   NA
 5936228 5936229 SUB0985 SUB0986   pcrA FALSE 0.060 301.000 0.000 1.000   NA
 5936230 5936231 SUB0987 SUB0988     FALSE 0.136 117.000 0.000 NA   NA
 5936231 5936232 SUB0988 SUB0989     FALSE 0.249 70.000 0.060 0.072 N NA
 5936233 5936234 SUB0990 SUB0991     TRUE 0.988 21.000 0.154 1.000 Y NA
 5936234 5936235 SUB0991 SUB0992     TRUE 0.991 10.000 0.130 1.000 Y NA
 5936235 5936236 SUB0992 SUB0993     FALSE 0.192 96.000 0.018 1.000 N NA
 5936236 5936237 SUB0993 SUB0994   mtlD FALSE 0.161 138.000 0.007 1.000 N NA
 5936237 5936238 SUB0994 SUB0995 mtlD mtlF TRUE 0.972 28.000 0.062 1.000 Y NA
 5936238 5936239 SUB0995 SUB0996 mtlF mtlR TRUE 0.934 2.000 0.131 0.019 N NA
 5936239 5936240 SUB0996 SUB0997 mtlR mtlA TRUE 0.925 26.000 0.336 0.019 N NA
 5936240 5936241 SUB0997 SUB0998 mtlA glmS FALSE 0.156 123.000 0.003 1.000 N NA
 5936241 5936242 SUB0998 SUB0999 glmS sipC FALSE 0.150 167.000 0.011 1.000   NA
 5936242 5936243 SUB0999 SUB1000 sipC pyk FALSE 0.258 130.000 0.072 1.000   NA
 5936243 5936244 SUB1000 SUB1001 pyk pfk TRUE 0.885 69.000 0.261 0.006 Y NA
 5936244 5936245 SUB1001 SUB1002 pfk dnaE TRUE 0.300 80.000 0.098 1.000 N NA
 5936246 5936247 SUB1003 SUB1004     TRUE 0.984 2.000 0.412 1.000 N NA
 5936247 5936248 SUB1004 SUB1005     TRUE 0.980 10.000 0.471 NA   NA
 5936250 5936251 SUBs16 SUB1007 ssrA   FALSE 0.122 153.000 0.000 NA   NA
 5936252 5936253 SUBt27 SUB1008 tRNA-Arg   FALSE 0.134 99.000 0.000 NA   NA
 5936253 5936254 SUB1008 SUBt35   tRNA-Gln FALSE 0.137 126.000 0.000 NA   NA
 5936254 5936255 SUBt35 SUBt72 tRNA-Gln tRNA-Tyr TRUE 0.826 6.000 0.000 NA   NA
 5936255 5936256 SUBt72 SUB1009 tRNA-Tyr   FALSE 0.224 61.000 0.000 NA   NA
 5936256 5936257 SUB1009 SUB1010     TRUE 0.405 64.000 0.095 NA   NA
 5936257 5936258 SUB1010 SUB1011   parC FALSE 0.271 119.000 0.086 1.000 N NA
 5936258 5936259 SUB1011 SUB1013 parC   FALSE 0.060 380.000 0.000 NA   NA
 5936259 5936260 SUB1013 SUB1014   parE FALSE 0.057 439.000 0.000 NA   NA
 5936262 5936263 SUB1016 SUB1017 pyrC ung TRUE 0.837 16.000 0.009 1.000 N NA
 5936263 5936264 SUB1017 SUB1018 ung   FALSE 0.200 116.000 0.025 1.000 N NA
 5936264 5936265 SUB1018 SUB1019     TRUE 0.984 21.000 0.125 0.034 Y NA
 5936265 5936266 SUB1019 SUB1020     TRUE 0.391 119.000 0.182 1.000 N NA
 5936266 5936267 SUB1020 SUB1021     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 5936267 5936268 SUB1021 SUB1022     TRUE 0.664 35.000 0.037 NA   NA
 5936268 5936269 SUB1022 SUB1023     FALSE 0.138 91.000 0.000 NA   NA
 5936269 5936270 SUB1023 SUB1024   pyrE FALSE 0.194 82.000 0.012 1.000   NA
 5936270 5936271 SUB1024 SUB1025 pyrE pyrF TRUE 0.983 25.000 0.133 1.000 Y NA
 5936271 5936272 SUB1025 SUB1026 pyrF   FALSE 0.083 227.000 0.000 NA   NA
 5936272 5936273 SUB1026 SUB1027   hasB2 FALSE 0.136 114.000 0.000 NA   NA
 5936273 5936274 SUB1027 SUB1028 hasB2   TRUE 0.988 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5936274 5936275 SUB1028 SUB1029   mnaA TRUE 0.988 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5936275 5936276 SUB1029 SUB1030 mnaA   TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5936276 5936277 SUB1030 SUB1031     TRUE 0.785 13.000 0.000 1.000   NA
 5936277 5936278 SUB1031 SUB1032     TRUE 0.913 -7.000 0.000 NA   NA
 5936278 5936279 SUB1032 SUB1033     TRUE 0.913 -7.000 0.000 NA   NA
 5936279 5936280 SUB1033 SUB1034     TRUE 0.428 44.000 0.000 NA   NA
 5936280 5936281 SUB1034 SUB1035     TRUE 0.902 -3.000 0.000 NA   NA
 5936281 5936282 SUB1035 SUB1036     TRUE 0.821 8.000 0.000 NA   NA
 5936282 5936283 SUB1036 SUB1037     TRUE 0.988 13.000 0.080 1.000 Y NA
 5936283 5936284 SUB1037 SUB1038     TRUE 0.996 3.000 0.297 NA Y NA
 5936284 5936285 SUB1038 SUB1039     TRUE 0.990 3.000 0.031 NA Y NA
 5936285 5936286 SUB1039 SUB1040   wze TRUE 0.757 51.000 0.300 1.000 N NA
 5936286 5936287 SUB1040 SUB1041 wze   TRUE 0.988 11.000 0.800 1.000 N NA
 5936287 5936288 SUB1041 SUB1042   wzh TRUE 0.998 9.000 0.636 1.000 Y NA
 5936288 5936289 SUB1042 SUB1043 wzh wzg TRUE 0.993 -3.000 0.583 1.000 N NA
 5936291 5936292 SUB1045 SUB1046   deoD TRUE 0.967 -7.000 0.107 NA   NA
 5936292 5936293 SUB1046 SUB1047 deoD punA TRUE 0.530 241.000 0.040 0.001 Y NA
 5936293 5936294 SUB1047 SUB1048 punA   TRUE 0.884 21.000 0.108 1.000 N NA
 5936294 5936295 SUB1048 SUB1049   deoB TRUE 0.910 12.000 0.108 1.000 N NA
 5936295 5936296 SUB1049 SUB1050 deoB rpiA TRUE 0.795 67.000 0.018 1.000 Y NA
 5936298 5936299 SUB1052 SUB1054   pepV FALSE 0.103 184.000 0.000 NA   NA
 5936299 5936300 SUB1054 SUB1055 pepV   TRUE 0.389 122.000 0.179 1.000 N NA
 5936300 5936301 SUB1055 SUB1056   uvrC FALSE 0.156 94.000 0.004 1.000 N NA
 5936301 5936302 SUB1056 SUB1057 uvrC   FALSE 0.190 72.000 0.002 1.000   NA
 5936302 5936303 SUB1057 SUB1058     TRUE 0.325 61.000 0.069 0.057   NA
 5936304 5936305 SUB1059 SUB1060     TRUE 0.988 13.000 0.750 NA   NA
 5936306 5936307 SUB1061 SUB1062     TRUE 0.551 33.000 0.000 NA   NA
 5936307 5936308 SUB1062 SUB1063     FALSE 0.049 239.000 0.000 0.057   NA
 5936308 5936309 SUB1063 SUB1064     FALSE 0.075 251.000 0.000 NA   NA
 5936309 5936310 SUB1064 SUB1066     FALSE 0.090 205.000 0.000 NA   NA
 5936310 5936311 SUB1066 SUB1067     FALSE 0.074 259.000 0.000 NA   NA
 5936311 5936312 SUB1067 SUB1069     FALSE 0.137 127.000 0.000 NA   NA
 5936312 5936313 SUB1069 SUB1070     FALSE 0.168 72.000 0.000 NA   NA
 5936313 5936314 SUB1070 SUB1071     FALSE 0.119 157.000 0.000 NA   NA
 5936314 5936315 SUB1071 SUB1072     FALSE 0.134 95.000 0.000 NA   NA
 5936315 5936316 SUB1072 SUB1073     TRUE 0.720 23.000 0.000 NA   NA
 5936316 5936317 SUB1073 SUB1074     TRUE 0.932 18.000 0.167 NA   NA
 5936317 5936318 SUB1074 SUB1075     TRUE 0.937 3.000 0.095 NA   NA
 5936318 5936319 SUB1075 SUB1076     TRUE 0.912 10.000 0.095 1.000 N NA
 5936319 5936320 SUB1076 SUB1077     FALSE 0.139 169.000 0.051 0.024 N NA
 5936320 5936321 SUB1077 SUB1078     FALSE 0.081 82.000 0.000 0.024   NA
 5936321 5936322 SUB1078 SUB1079     FALSE 0.142 85.000 0.000 NA   NA
 5936322 5936323 SUB1079 SUB1080     FALSE 0.137 123.000 0.000 NA   NA
 5936323 5936324 SUB1080 SUB1081   msrB TRUE 0.936 -7.000 0.010 1.000   NA
 5936324 5936325 SUB1081 SUB1082 msrB lepA FALSE 0.150 103.000 0.002 1.000 N NA
 5936327 5936328 SUB1084 SUB1085 ndk   FALSE 0.067 294.000 0.000 NA   NA
 5936328 5936329 SUB1085 SUB1086     TRUE 0.983 0.000 0.330 NA   NA
 5936329 5936330 SUB1086 SUB1087     TRUE 0.885 13.000 0.055 1.000 N NA
 5936330 5936331 SUB1087 SUB1088   hemN TRUE 0.896 10.000 0.060 1.000 N NA
 5936331 5936332 SUB1088 SUB1089 hemN   FALSE 0.246 58.000 0.000 NA   NA
 5936332 5936333 SUB1089 SUB1090     TRUE 0.310 52.000 0.000 NA   NA
 5936333 5936334 SUB1090 SUB1091     TRUE 0.609 53.000 0.150 NA   NA
 5936334 5936335 SUB1091 SUB1092     TRUE 0.986 4.000 0.502 NA   NA
 5936336 5936337 SUB1093 SUB1094     TRUE 0.994 0.000 0.796 1.000   NA
 5936340 5936341 SUB1098 SUB1099     FALSE 0.089 210.000 0.000 NA   NA
 5936341 5936342 SUB1099 SUB1100   acoL FALSE 0.135 132.000 0.000 NA   NA
 5936342 5936343 SUB1100 SUB1101 acoL pdhC TRUE 0.774 104.000 0.091 1.000 Y NA
 5936343 5936344 SUB1101 SUB1102 pdhC pdhB TRUE 0.714 111.000 0.051 0.057 Y NA
 5936344 5936345 SUB1102 SUB1103 pdhB pdhA TRUE 0.964 64.000 0.769 0.001 Y NA
 5936345 5936346 SUB1103 SUB1104 pdhA   FALSE 0.077 224.000 0.000 1.000   NA
 5936346 5936347 SUB1104 SUB1105     TRUE 0.456 49.000 0.019 1.000   NA
 5936347 5936348 SUB1105 SUB1106     TRUE 0.935 22.000 0.217 NA   NA
 5936348 5936349 SUB1106 SUB1107     TRUE 0.353 93.000 0.143 NA   NA
 5936349 5936350 SUB1107 SUB1108     FALSE 0.151 191.000 0.026 1.000   NA
 5936350 5936351 SUB1108 SUB1109     TRUE 0.996 -3.000 0.895 1.000   NA
 5936351 5936352 SUB1109 SUB1110     TRUE 0.972 16.000 0.368 NA   NA
 5936354 5936355 SUB1112 SUB1113 aldB alsS TRUE 0.964 12.000 0.323 1.000 N NA
 5936355 5936356 SUB1113 SUB1114 alsS   FALSE 0.214 108.000 0.033 1.000   NA
 5936356 5936357 SUB1114 SUB1115     TRUE 0.988 -10.000 0.324 NA   NA
 5936357 5936358 SUB1115 SUB1116   mutX TRUE 0.680 38.000 0.074 NA   NA
 5936359 5936360 SUB1117 SUB1118     TRUE 0.695 61.000 0.333 NA   NA
 5936361 5936362 SUBt68 SUB1119 tRNA-Thr rmlB FALSE 0.149 79.000 0.000 NA   NA
 5936362 5936363 SUB1119 SUB1120 rmlB rmlC TRUE 0.972 47.000 0.350 1.000 Y NA
 5936363 5936364 SUB1120 SUB1121 rmlC rmlA TRUE 0.995 0.000 0.149 1.000 Y NA
 5936364 5936365 SUB1121 SUB1122 rmlA   TRUE 0.411 57.000 0.059 1.000 N NA
 5936365 5936366 SUB1122 SUB1123     TRUE 0.860 11.000 0.018 1.000 N NA
 5936366 5936367 SUB1123 SUB1124     TRUE 0.858 13.000 0.011 NA   NA
 5936367 5936368 SUB1124 SUB1125     TRUE 0.986 -10.000 0.283 NA   NA
 5936368 5936369 SUB1125 SUB1126   nth FALSE 0.245 67.000 0.006 NA   NA
 5936369 5936370 SUB1126 SUB1127 nth   TRUE 0.992 0.000 0.007 NA Y NA
 5936370 5936371 SUB1127 SUB1128   apt TRUE 0.312 57.000 0.005 NA N NA
 5936371 5936372 SUB1128 SUB1129 apt   TRUE 0.313 105.000 0.128 1.000 N NA
 5936372 5936373 SUB1129 SUB1130     TRUE 0.934 -3.000 0.016 1.000   NA
 5936373 5936374 SUB1130 SUB1131   rnz TRUE 0.945 0.000 0.074 1.000   NA
 5936374 5936375 SUB1131 SUB1132 rnz   TRUE 0.845 19.000 0.022 NA   NA
 5936375 5936376 SUB1132 SUB1133     TRUE 0.944 -7.000 0.014 NA   NA
 5936376 5936377 SUB1133 SUB1134   miaA FALSE 0.242 73.000 0.027 1.000   NA
 5936379 5936380 SUB1136 SUB1137     TRUE 0.980 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5936380 5936381 SUB1137 SUB1138     FALSE 0.141 86.000 0.000 NA   NA
 5936383 5936384 SUB1140 SUB1141 glgP malM TRUE 0.990 23.000 0.289 0.029 Y NA
 5936384 5936385 SUB1141 SUB1142 malM   TRUE 0.676 90.000 0.538 1.000 N NA
 5936386 5936387 SUB1143 SUB1144 malX malC TRUE 0.907 269.000 0.690 NA Y NA
 5936387 5936388 SUB1144 SUB1145 malC malD TRUE 0.999 0.000 0.793 0.033 Y NA
 5936389 5936390 SUB1146 SUB1147 dltD dltC TRUE 0.991 -7.000 0.409 NA   NA
 5936390 5936391 SUB1147 SUB1148 dltC dltB TRUE 0.974 16.000 0.387 NA   NA
 5936391 5936392 SUB1148 SUB1149 dltB dltA TRUE 0.990 -3.000 0.435 NA N NA
 5936392 5936393 SUB1149 SUB1150 dltA   TRUE 0.982 13.000 0.549 NA   NA
 5936393 5936394 SUB1150 SUB1151   uvrB FALSE 0.082 231.000 0.000 NA   NA
 5936395 5936396 SUB1152 SUB1153   glnQ1 TRUE 0.998 0.000 0.326 1.000 Y NA
 5936399 5936400 SUB1156 SUB1157     FALSE 0.078 492.000 0.009 NA   NA
 5936400 5936401 SUB1157 SUB1158     TRUE 0.404 52.000 0.011 NA   NA
 5936402 5936403 SUB1159 SUB1160 pepS   TRUE 0.509 47.000 0.035 1.000 N NA
 5936404 5936405 SUB1161 SUB1162     TRUE 0.810 10.000 0.000 NA   NA
 5936409 5936410 SUB1166 SUB1167     TRUE 0.966 -3.000 0.127 NA   NA
 5936410 5936411 SUB1167 SUB1168     FALSE 0.136 130.000 0.000 NA   NA
 5936411 5936412 SUB1168 SUB1169     FALSE 0.085 223.000 0.000 NA   NA
 5936412 5936413 SUB1169 SUB1170     TRUE 0.745 21.000 0.000 NA   NA
 5936413 5936414 SUB1170 SUB1170A     FALSE 0.134 97.000 0.000 NA   NA
 5936414 5936415 SUB1170A SUB1171     TRUE 0.656 27.000 0.000 NA   NA
 5936415 5936416 SUB1171 SUB1173     TRUE 0.823 7.000 0.000 NA   NA
 5936416 5936417 SUB1173 SUB1174     TRUE 0.851 3.000 0.000 NA   NA
 5936417 5936418 SUB1174 SUB1176     FALSE 0.049 512.000 0.000 1.000 N NA
 5936418 5936419 SUB1176 SUB1177     FALSE 0.114 164.000 0.000 NA   NA
 5936419 5936420 SUB1177 SUB1178     FALSE 0.132 138.000 0.000 NA   NA
 5936422 5936423 SUB1180 SUB1181 copZ   TRUE 0.910 96.000 0.500 0.005 Y NA
 5936423 5936424 SUB1181 SUB1182     TRUE 0.602 46.000 0.067 NA   NA
 5936424 5936425 SUB1182 SUB1183     FALSE 0.112 167.000 0.000 NA   NA
 5936425 5936426 SUB1183 SUB1184     TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5936426 5936427 SUB1184 SUB1185     TRUE 0.795 16.000 0.000 NA   NA
 5936427 5936428 SUB1185 SUB1186     FALSE 0.127 143.000 0.000 NA   NA
 5936429 5936430 SUB1187 SUB1188     TRUE 0.993 1.000 0.818 0.039   NA
 5936431 5936432 SUB1189 SUB1190     TRUE 0.351 70.000 0.093 NA N NA
 5936432 5936433 SUB1190 SUB1191   aroK FALSE 0.269 163.000 0.111 NA N NA
 5936433 5936434 SUB1191 SUB1192 aroK aroA TRUE 0.994 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 5936434 5936435 SUB1192 SUB1193 aroA   FALSE 0.132 83.000 0.000 1.000   NA
 5936435 5936436 SUB1193 SUB1194     TRUE 0.856 2.000 0.000 1.000   NA
 5936436 5936437 SUB1194 SUB1195     TRUE 0.931 23.000 0.235 1.000 N NA
 5936437 5936438 SUB1195 SUB1196     TRUE 0.988 -7.000 0.342 1.000 N NA
 5936438 5936439 SUB1196 SUB1197     FALSE 0.118 139.000 0.000 1.000 N NA
 5936439 5936440 SUB1197 SUB1198     TRUE 0.954 25.000 0.000 0.001 Y NA
 5936440 5936441 SUB1198 SUB1199     TRUE 0.836 17.000 0.012 1.000   NA
 5936441 5936442 SUB1199 SUB1200     FALSE 0.074 130.000 0.000 0.019   NA
 5936442 5936443 SUB1200 SUB1201   kduD FALSE 0.138 79.000 0.000 1.000   NA
 5936443 5936444 SUB1201 SUB1202 kduD uxuA TRUE 0.566 130.000 0.364 1.000 N NA
 5936444 5936445 SUB1202 SUB1203 uxuA uxaC TRUE 0.995 20.000 0.533 0.001 Y NA
 5936445 5936446 SUB1203 SUB1204 uxaC dgoA TRUE 0.997 11.000 0.467 1.000 Y NA
 5936446 5936447 SUB1204 SUB1205 dgoA   TRUE 0.695 122.000 0.583 1.000 N NA
 5936447 5936448 SUB1205 SUB1206   uidA TRUE 0.847 44.000 0.333 1.000 N NA
 5936448 5936449 SUB1206 SUB1207 uidA   TRUE 0.994 12.000 0.238 1.000 Y NA
 5936449 5936450 SUB1207 SUB1208     FALSE 0.159 74.000 0.000 NA   NA
 5936450 5936451 SUB1208 SUB1210   murZ FALSE 0.081 235.000 0.000 NA   NA
 5936451 5936452 SUB1210 SUB1211 murZ metK FALSE 0.152 186.000 0.026 1.000 N NA
 5936452 5936453 SUB1211 SUB1212 metK   FALSE 0.058 322.000 0.000 1.000   NA
 5936455 5936456 SUB1214 SUB1215 dnaH   TRUE 0.931 0.000 0.030 NA N NA
 5936456 5936457 SUB1215 SUB1216     TRUE 0.657 32.000 0.007 NA   NA
 5936457 5936458 SUB1216 SUB1217   udk TRUE 0.876 6.000 0.010 NA   NA
 5936460 5936461 SUB1219 SUB1220   gapN FALSE 0.188 146.000 0.028 1.000 N NA
 5936461 5936462 SUB1220 SUB1222 gapN pstI FALSE 0.188 155.000 0.035 1.000 N NA
 5936462 5936463 SUB1222 SUB1223 pstI ptsH TRUE 0.994 5.000 0.240 0.018 Y NA
 5936464 5936465 SUB1224 SUB1225 nrdH   TRUE 0.976 20.000 0.562 1.000 N NA
 5936465 5936466 SUB1225 SUB1227     TRUE 0.782 569.000 0.500 0.001 Y NA
 5936466 5936467 SUB1227 SUB1228     FALSE 0.137 124.000 0.000 NA   NA
 5936467 5936468 SUB1228 SUB1229     FALSE 0.219 62.000 0.000 NA   NA
 5936469 5936470 SUB1230 SUB1231 alaS prsA1 FALSE 0.062 292.000 0.000 1.000 N NA
 5936470 5936471 SUB1231 SUB1232 prsA1   FALSE 0.198 63.000 0.000 1.000   NA
 5936471 5936472 SUB1232 SUB1233     FALSE 0.186 140.000 0.012 NA   NA
 5936472 5936473 SUB1233 SUB1234     FALSE 0.137 125.000 0.000 NA   NA
 5936473 5936474 SUB1234 SUB1235   pepB TRUE 0.291 52.000 0.000 1.000   NA
 5936474 5936475 SUB1235 SUB1236 pepB   TRUE 0.959 5.000 0.204 NA   NA
 5936475 5936476 SUB1236 SUB1237     FALSE 0.153 76.000 0.000 NA   NA
 5936476 5936477 SUB1237 SUB1238     FALSE 0.138 86.000 0.000 NA N NA
 5936477 5936478 SUB1238 SUB1239   nagB FALSE 0.272 72.000 0.051 1.000 N NA
 5936480 5936481 SUB1241 SUB1242   sodA FALSE 0.112 154.000 0.000 1.000   NA
 5936481 5936482 SUB1242 SUB1243 sodA   FALSE 0.180 97.000 0.012 1.000 N NA
 5936482 5936483 SUB1243 SUB1244   comEC TRUE 0.747 43.000 0.163 1.000   NA
 5936483 5936484 SUB1244 SUB1245 comEC comEA TRUE 0.972 -19.000 0.130 1.000   NA
 5936484 5936485 SUB1245 SUB1246 comEA   TRUE 0.283 63.000 0.014 1.000 N NA
 5936486 5936487 SUB1247 SUB1248     TRUE 0.795 41.000 0.209 1.000   NA
 5936488 5936489 SUB1249 SUB1250     FALSE 0.166 97.000 0.007 1.000 N NA
 5936491 5936492 SUB1252 SUB1253   prfC FALSE 0.086 217.000 0.000 NA   NA
 5936492 5936493 SUB1253 SUB1254 prfC   FALSE 0.169 114.000 0.003 NA   NA
 5936493 5936494 SUB1254 SUB1255   murF FALSE 0.274 93.000 0.078 NA   NA
 5936496 5936497 SUB1257 SUB1258 ddlA recR FALSE 0.171 138.000 0.010 1.000 N NA
 5936497 5936498 SUB1258 SUB1259 recR penA TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 5936498 5936499 SUB1259 SUB1260 penA   TRUE 0.287 54.000 0.000 NA   NA
 5936499 5936500 SUB1260 SUB1261     TRUE 0.298 95.000 0.105 NA   NA
 5936500 5936501 SUB1261 SUB1262     TRUE 0.404 66.000 0.107 NA   NA
 5936501 5936502 SUB1262 SUB1263   gpmA FALSE 0.182 102.000 0.012 1.000   NA
 5936504 5936505 SUB1265 SUB1266     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 5936505 5936506 SUB1266 SUB1267   hlpA FALSE 0.081 205.000 0.000 1.000 N NA
 5936506 5936507 SUB1267 SUB1268 hlpA   TRUE 0.374 99.000 0.156 NA   NA
 5936507 5936508 SUB1268 SUB1269     TRUE 0.996 -22.000 0.828 NA   NA
 5936508 5936509 SUB1269 SUB1270     TRUE 0.980 -7.000 0.203 NA   NA
 5936509 5936510 SUB1270 SUB1271   recN FALSE 0.183 87.000 0.006 NA   NA
 5936510 5936511 SUB1271 SUB1272 recN   TRUE 0.860 17.000 0.037 1.000 N NA
 5936511 5936512 SUB1272 SUB1273     TRUE 0.954 -13.000 0.048 1.000 N NA
 5936512 5936513 SUB1273 SUB1274   fps TRUE 0.954 -7.000 0.058 1.000 N NA
 5936513 5936514 SUB1274 SUB1275 fps xseB TRUE 0.951 0.000 0.100 1.000 N NA
 5936514 5936515 SUB1275 SUB1276 xseB xseA TRUE 0.998 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 5936515 5936516 SUB1276 SUB1277 xseA folD FALSE 0.208 141.000 0.045 1.000 N NA
 5936516 5936517 SUB1277 SUB1278 folD glnQ3 FALSE 0.194 104.000 0.017 1.000 N NA
 5936517 5936518 SUB1278 SUB1279 glnQ3   TRUE 0.999 -3.000 0.640 1.000 Y NA
 5936518 5936519 SUB1279 SUB1280     FALSE 0.234 127.000 0.044 NA   NA
 5936520 5936521 SUB1281 SUB1282 clpE   FALSE 0.259 134.000 0.079 1.000 N NA
 5936521 5936522 SUB1282 SUB1283     TRUE 0.565 52.000 0.114 NA   NA
 5936523 5936524 SUB1284 SUBs04 ileS   TRUE 0.672 26.000 0.000 NA   NA
 5936524 5936525 SUBs04 SUB1285     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 5936525 5936526 SUB1285 SUB1286     TRUE 0.985 10.000 0.579 NA   NA
 5936526 5936527 SUB1286 SUB1287     TRUE 0.983 -3.000 0.287 1.000   NA
 5936527 5936528 SUB1287 SUB1288     TRUE 0.979 4.000 0.370 NA   NA
 5936528 5936529 SUB1288 SUB1289     TRUE 0.949 13.000 0.194 NA   NA
 5936529 5936530 SUB1289 SUB1290   ftsZ TRUE 0.873 16.000 0.030 NA   NA
 5936530 5936531 SUB1290 SUB1291 ftsZ ftsA TRUE 0.984 40.000 0.460 1.000 Y NA
 5936531 5936532 SUB1291 SUB1292 ftsA   TRUE 0.516 186.000 0.389 NA N NA
 5936532 5936533 SUB1292 SUB1293   murG TRUE 0.993 1.000 0.072 NA Y NA
 5936533 5936534 SUB1293 SUB1294 murG murD TRUE 0.994 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 5936534 5936535 SUB1294 SUB1295 murD   FALSE 0.172 138.000 0.006 NA   NA
 5936535 5936536 SUB1295 SUB1296     FALSE 0.205 106.000 0.015 NA   NA
 5936536 5936537 SUB1296 SUB1297     FALSE 0.135 171.000 0.003 NA N NA
 5936537 5936538 SUB1297 SUB1298   glkA TRUE 0.907 9.000 0.064 NA N NA
 5936538 5936539 SUB1298 SUB1299 glkA   TRUE 0.993 -10.000 0.496 NA   NA
 5936541 5936542 SUB1301 SUB1302     TRUE 0.999 -13.000 0.911 0.007 Y NA
 5936542 5936543 SUB1302 SUB1303     TRUE 0.762 81.000 0.045 NA Y NA
 5936543 5936544 SUB1303 SUB1304     TRUE 0.385 54.000 0.012 NA   NA
 5936544 5936545 SUB1304 SUB1305     TRUE 0.938 -3.000 0.016 NA   NA
 5936545 5936546 SUB1305 SUB1306     TRUE 0.990 -31.000 0.347 NA   NA
 5936546 5936547 SUB1306 SUB1307   rbsB FALSE 0.113 163.000 0.000 NA N NA
 5936547 5936548 SUB1307 SUB1308 rbsB rbsC TRUE 0.993 39.000 0.847 NA Y NA
 5936548 5936549 SUB1308 SUB1309 rbsC rbsA TRUE 0.997 2.000 0.358 1.000 Y NA
 5936549 5936550 SUB1309 SUB1310 rbsA rbsD TRUE 0.994 15.000 0.243 1.000 Y NA
 5936550 5936551 SUB1310 SUB1311 rbsD rbsK TRUE 0.997 -25.000 0.183 1.000 Y NA
 5936551 5936552 SUB1311 SUB1312 rbsK   TRUE 0.982 -3.000 0.281 1.000 N NA
 5936552 5936553 SUB1312 SUB1313     FALSE 0.084 201.000 0.000 1.000 N NA
 5936553 5936554 SUB1313 SUB1314   coaD TRUE 0.956 -22.000 0.052 1.000 N NA
 5936554 5936555 SUB1314 SUB1315 coaD   TRUE 0.989 -10.000 0.367 1.000 N NA
 5936555 5936556 SUB1315 SUB1316     FALSE 0.129 89.000 0.000 1.000   NA
 5936556 5936557 SUB1316 SUB1317     TRUE 0.956 -3.000 0.084 1.000   NA
 5936557 5936558 SUB1317 SUB1318     TRUE 0.985 16.000 0.025 1.000 Y NA
 5936558 5936559 SUB1318 SUB1319     TRUE 0.998 0.000 0.444 1.000 Y NA
 5936559 5936560 SUB1319 SUB1320   speE TRUE 0.993 0.000 0.036 1.000 Y NA
 5936560 5936561 SUB1320 SUB1321 speE speA TRUE 0.995 4.000 0.237 1.000 Y NA
 5936561 5936562 SUB1321 SUB1323 speA asnA TRUE 0.420 490.000 0.000 1.000 Y NA
 5936562 5936563 SUB1323 SUB1324 asnA arcC TRUE 0.583 185.000 0.000 1.000 Y NA
 5936563 5936564 SUB1324 SUB1325 arcC   TRUE 0.984 17.000 0.035 1.000 Y NA
 5936564 5936565 SUB1325 SUB1326     TRUE 0.807 33.000 0.140 NA   NA
 5936565 5936566 SUB1326 SUB1327   arcB FALSE 0.230 191.000 0.104 NA   NA
 5936566 5936567 SUB1327 SUB1328 arcB arcA TRUE 0.628 439.000 0.146 1.000 Y NA
 5936567 5936568 SUB1328 SUB1329 arcA   FALSE 0.065 265.000 0.000 1.000 N NA
 5936570 5936571 SUB1331 SUB1332     TRUE 0.705 29.000 0.009 NA   NA
 5936571 5936572 SUB1332 SUB1333     TRUE 0.795 21.000 0.005 NA   NA
 5936572 5936573 SUB1333 SUB1334     TRUE 0.452 217.000 0.375 1.000   NA
 5936577 5936578 SUB1339 SUB1340     FALSE 0.063 321.000 0.000 NA   NA
 5936578 5936579 SUB1340 SUB1342   valS FALSE 0.052 655.000 0.000 NA   NA
 5936579 5936580 SUB1342 SUB1343 valS   TRUE 0.381 47.000 0.000 NA   NA
 5936580 5936581 SUB1343 SUB1344     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 5936581 5936582 SUB1344 SUB1345     TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 5936582 5936583 SUB1345 SUBs05     TRUE 0.800 13.000 0.000 NA   NA
 5936583 5936584 SUBs05 SUB1346     FALSE 0.136 130.000 0.000 NA   NA
 5936584 5936585 SUB1346 SUB1347     TRUE 0.551 33.000 0.000 NA   NA
 5936586 5936587 SUB1349 SUB1350     TRUE 0.907 16.000 0.103 1.000 N NA
 5936588 5936589 SUB1351 SUB1352     TRUE 0.800 13.000 0.000 NA   NA
 5936591 5936592 SUB1353 SUB1354     FALSE 0.072 241.000 0.000 1.000   NA
 5936592 5936593 SUB1354 SUB1355     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 5936594 5936595 SUB1356 SUB1357     TRUE 0.952 -3.000 0.059 NA   NA
 5936596 5936597 SUB1358 SUB1359     FALSE 0.119 158.000 0.000 NA   NA
 5936597 5936598 SUB1359 SUB1360     FALSE 0.138 110.000 0.000 NA   NA
 5936598 5936599 SUB1360 SUB1361   aroD TRUE 0.783 15.000 0.000 1.000 N NA
 5936599 5936600 SUB1361 SUB1362 aroD aroE TRUE 0.522 233.000 0.000 1.000 Y NA
 5936600 5936601 SUB1362 SUB1363 aroE   TRUE 0.762 17.000 0.000 1.000 N NA
 5936601 5936602 SUB1363 SUB1364     FALSE 0.087 80.000 0.000 0.032   NA
 5936602 5936603 SUB1364 SUB1365     TRUE 0.378 46.000 0.000 1.000   NA
 5936603 5936604 SUB1365 SUB1366     FALSE 0.160 73.000 0.000 NA N NA
 5936606 5936607 SUB1368 SUB1369     TRUE 0.911 -22.000 0.000 1.000 N NA
 5936607 5936608 SUB1369 SUB1370     FALSE 0.123 136.000 0.000 1.000   NA
 5936608 5936609 SUB1370 SUB1371     FALSE 0.051 474.000 0.000 1.000   NA
 5936610 5936611 SUB1372 SUB1373     FALSE 0.228 81.000 0.025 NA   NA
 5936611 5936612 SUB1373 SUB1374     TRUE 0.385 59.000 0.051 NA   NA
 5936613 5936614 SUBt37 SUBt45 tRNA-Glu tRNA-Ile TRUE 0.782 17.000 0.000 NA   NA
 5936614 5936615 SUBt45 SUBt69 tRNA-Ile tRNA-Thr TRUE 0.325 51.000 0.000 NA   NA
 5936615 5936616 SUBt69 SUBt50 tRNA-Thr tRNA-Leu TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 5936616 5936617 SUBt50 SUBt53 tRNA-Leu tRNA-Lys TRUE 0.826 6.000 0.000 NA   NA
 5936617 5936618 SUBt53 SUBt32 tRNA-Lys tRNA-Asp FALSE 0.159 74.000 0.000 NA   NA
 5936618 5936619 SUBt32 SUBt75 tRNA-Asp tRNA-Val TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 5936620 5936621 SUBr15 SUBr10 5S_rRNA 23S_rRNA FALSE 0.092 203.000 0.000 NA   NA
 5936624 5936625 SUB1375 SUB1376   comFC TRUE 0.306 76.000 0.080 NA   NA
 5936625 5936626 SUB1376 SUB1377 comFC comFA TRUE 0.971 -10.000 0.130 1.000   NA
 5936627 5936628 SUB1378 SUB1379   cysM FALSE 0.225 109.000 0.033 NA   NA
 5936629 5936630 SUB1380 SUB1381     TRUE 0.944 0.000 0.069 1.000   NA
 5936630 5936631 SUB1381 SUB1382     TRUE 0.912 22.000 0.164 1.000   NA
 5936631 5936632 SUB1382 SUB1383     TRUE 0.999 -7.000 0.853 0.009 Y NA
 5936632 5936633 SUB1383 SUB1384     TRUE 0.994 -3.000 0.679 NA   NA
 5936633 5936634 SUB1384 SUB1385   stk1 FALSE 0.229 118.000 0.039 NA   NA
 5936634 5936635 SUB1385 SUB1386 stk1   TRUE 0.999 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 5936635 5936636 SUB1386 SUB1387     TRUE 0.661 38.000 0.074 1.000 N NA
 5936636 5936637 SUB1387 SUB1388   fmt TRUE 0.998 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 5936637 5936638 SUB1388 SUB1389 fmt priA TRUE 0.297 69.000 0.052 1.000 N NA
 5936638 5936639 SUB1389 SUB1390 priA rpoZ FALSE 0.203 70.000 0.032 0.038 N NA
 5936639 5936640 SUB1390 SUB1391 rpoZ gmk TRUE 0.966 23.000 0.471 1.000 N NA
 5936640 5936641 SUB1391 SUB1392 gmk   FALSE 0.178 116.000 0.010 1.000   NA
 5936641 5936642 SUB1392 SUB1393     FALSE 0.167 123.000 0.006 1.000   NA
 5936643 5936644 SUB1394 SUB1395 atoB2 atoD2 TRUE 0.987 22.000 0.150 1.000 Y NA
 5936644 5936645 SUB1395 SUB1396 atoD2 atoA2 TRUE 0.996 -3.000 0.200 0.001 Y NA
 5936645 5936646 SUB1396 SUB1397 atoA2   TRUE 0.987 16.000 0.111 0.053 Y NA
 5936646 5936647 SUB1397 SUB1398     TRUE 0.637 67.000 0.333 1.000 N NA
 5936647 5936648 SUB1398 SUB1399   luxS FALSE 0.166 107.000 0.006 1.000 N NA
 5936649 5936650 SUB1400 SUB1401     TRUE 0.981 29.000 1.000 NA   NA
 5936650 5936651 SUB1401 SUB1402     FALSE 0.107 176.000 0.000 NA   NA
 5936651 5936652 SUB1402 SUB1403     TRUE 0.896 5.000 0.029 NA   NA
 5936652 5936653 SUB1403 SUBs06     FALSE 0.175 70.000 0.000 NA   NA
 5936653 5936654 SUBs06 SUB1404     TRUE 0.362 48.000 0.000 NA   NA
 5936654 5936655 SUB1404 SUB1405     TRUE 0.704 107.000 0.579 NA   NA
 5936656 5936657 SUB1406 SUB1407 recU pbp1A TRUE 0.988 -13.000 0.319 1.000   NA
 5936658 5936659 SUB1408 SUB1409 pepC nadE FALSE 0.194 92.000 0.017 1.000 N NA
 5936659 5936660 SUB1409 SUB1410 nadE   TRUE 0.997 -16.000 0.194 0.003 Y NA
 5936660 5936661 SUB1410 SUB1411     FALSE 0.208 111.000 0.032 1.000 N NA
 5936661 5936662 SUB1411 SUB1412     FALSE 0.209 119.000 0.033 1.000 N NA
 5936662 5936663 SUB1412 SUB1413     TRUE 0.452 62.000 0.117 NA   NA
 5936663 5936664 SUB1413 SUB1414     TRUE 0.577 100.000 0.364 NA   NA
 5936664 5936665 SUB1414 SUB1415     TRUE 0.997 0.000 0.310 1.000 Y NA
 5936665 5936666 SUB1415 SUB1416     TRUE 0.776 101.000 0.143 0.031 Y NA
 5936666 5936667 SUB1416 SUB1417     FALSE 0.210 135.000 0.036 1.000 N NA
 5936667 5936668 SUB1417 SUB1418   mraY FALSE 0.180 81.000 0.007 1.000 N NA
 5936668 5936669 SUB1418 SUB1419 mraY pbpX TRUE 0.991 2.000 0.038 1.000 Y NA
 5936669 5936670 SUB1419 SUB1420 pbpX ftsL TRUE 0.982 4.000 0.456 1.000 N NA
 5936670 5936671 SUB1420 SUB1421 ftsL mraW TRUE 0.915 5.000 0.077 1.000 N NA
 5936671 5936672 SUB1421 SUB1422 mraW proA FALSE 0.163 83.000 0.003 1.000 N NA
 5936672 5936673 SUB1422 SUB1423 proA proB TRUE 0.995 3.000 0.281 0.002 Y NA
 5936673 5936674 SUB1423 SUB1424 proB   FALSE 0.277 62.000 0.006 NA   NA
 5936674 5936675 SUB1424 SUB1425     TRUE 0.987 -3.000 0.341 NA   NA
 5936675 5936676 SUB1425 SUB1426     TRUE 0.931 15.000 0.136 NA   NA
 5936676 5936677 SUB1426 SUB1427   tkt1 TRUE 0.478 161.000 0.300 NA   NA
 5936677 5936678 SUB1427 SUB1428 tkt1 tal1 TRUE 0.592 180.000 0.000 1.000 Y NA
 5936678 5936679 SUB1428 SUB1429 tal1   FALSE 0.133 136.000 0.000 NA   NA
 5936679 5936680 SUB1429 SUB1430     TRUE 0.990 -3.000 0.462 NA   NA
 5936680 5936681 SUB1430 SUB1431   glpF1 TRUE 0.598 78.000 0.364 1.000   NA
 5936681 5936682 SUB1431 SUB1432 glpF1 glpO TRUE 0.980 13.000 0.500 1.000 N NA
 5936682 5936683 SUB1432 SUB1433 glpO glpK TRUE 0.994 24.000 0.500 0.002 Y NA
 5936683 5936684 SUB1433 SUB1434 glpK   FALSE 0.128 142.000 0.000 NA   NA
 5936684 5936685 SUB1434 SUB1435   glyS TRUE 0.603 38.000 0.020 NA   NA
 5936685 5936686 SUB1435 SUB1436 glyS glyQ TRUE 0.999 0.000 0.651 0.001 Y NA
 5936686 5936687 SUB1436 SUB1438 glyQ   FALSE 0.050 503.000 0.000 1.000   NA
 5936689 5936690 SUB1440 SUB1443     FALSE 0.119 158.000 0.000 NA   NA
 5936694 5936695 SUB1447 SUB1448   lacG1 FALSE 0.124 101.000 0.000 1.000   NA
 5936695 5936696 SUB1448 SUB1450 lacG1 lacE1 TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 5936696 5936697 SUB1450 SUB1451 lacE1 lacF1 TRUE 0.795 16.000 0.000 NA   NA
 5936697 5936698 SUB1451 SUB1452 lacF1 lacT1 TRUE 0.785 11.000 0.000 1.000   NA
 5936698 5936699 SUB1452 SUB1453 lacT1 lacX1 FALSE 0.102 169.000 0.000 1.000   NA
 5936699 5936700 SUB1453 SUB1454 lacX1 lacD1 TRUE 0.981 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5936700 5936701 SUB1454 SUB1455 lacD1 lacC1 TRUE 0.998 6.000 0.833 0.003 Y NA
 5936701 5936702 SUB1455 SUB1456 lacC1 lacB1 TRUE 0.997 9.000 0.400 1.000 Y NA
 5936702 5936703 SUB1456 SUB1457 lacB1 lacA1 TRUE 0.993 18.000 0.333 0.002 Y NA
 5936703 5936704 SUB1457 SUB1458 lacA1   TRUE 0.660 113.000 0.000 1.000 Y NA
 5936704 5936705 SUB1458 SUB1459     TRUE 0.974 16.000 0.000 0.027 Y NA
 5936705 5936706 SUB1459 SUB1460     TRUE 0.998 -7.000 0.429 0.017 Y NA
 5936708 5936709 SUB1462 SUB1463 copZ copA TRUE 0.983 13.000 0.048 0.005 Y NA
 5936709 5936710 SUB1463 SUB1464 copA copY TRUE 0.956 -7.000 0.064 1.000 N NA
 5936710 5936711 SUB1464 SUB1465 copY rbfA FALSE 0.124 106.000 0.000 1.000 N NA
 5936711 5936712 SUB1465 SUB1466 rbfA infB TRUE 0.931 99.000 0.530 1.000 Y NA
 5936712 5936713 SUB1466 SUB1467 infB   TRUE 0.992 20.000 0.223 NA Y NA
 5936713 5936714 SUB1467 SUB1468     TRUE 0.990 -7.000 0.408 NA N NA
 5936714 5936715 SUB1468 SUB1469   nusA TRUE 0.995 16.000 0.323 NA Y NA
 5936715 5936716 SUB1469 SUB1470 nusA   TRUE 0.887 56.000 0.759 NA   NA
 5936716 5936717 SUB1470 SUBt65   tRNA-Ser FALSE 0.113 165.000 0.000 NA   NA
 5936717 5936718 SUBt65 SUB1471 tRNA-Ser   TRUE 0.551 33.000 0.000 NA   NA
 5936718 5936719 SUB1471 SUB1472     TRUE 0.967 0.000 0.154 NA   NA
 5936719 5936720 SUB1472 SUB1473     TRUE 0.440 61.000 0.107 NA N NA
 5936720 5936721 SUB1473 SUB1474     TRUE 0.963 2.000 0.167 NA N NA
 5936722 5936723 SUB1475 SUB1476     TRUE 0.953 -3.000 0.063 NA   NA
 5936724 5936725 SUB1477 SUB1478     TRUE 0.967 9.000 0.283 NA   NA
 5936725 5936726 SUB1478 SUB1479     TRUE 0.950 -7.000 0.033 NA   NA
 5936726 5936727 SUB1479 SUB1480     FALSE 0.184 93.000 0.008 NA   NA
 5936728 5936729 SUB1481 SUB1482   manL FALSE 0.056 373.000 0.000 1.000   NA
 5936729 5936730 SUB1482 SUB1483 manL manM FALSE 0.136 114.000 0.000 NA   NA
 5936730 5936731 SUB1483 SUB1485 manM manN TRUE 0.802 15.000 0.000 NA   NA
 5936731 5936732 SUB1485 SUB1486 manN   TRUE 0.708 112.000 0.583 NA   NA
 5936734 5936735 SUBs07 SUB1489   serS TRUE 0.773 18.000 0.000 NA   NA
 5936736 5936737 SUB1490 SUB1491 accA accD TRUE 0.996 -3.000 0.234 0.002 Y NA
 5936737 5936738 SUB1491 SUB1492 accD accC TRUE 0.990 9.000 0.090 1.000 Y NA
 5936738 5936739 SUB1492 SUB1493 accC fabZ TRUE 0.970 28.000 0.045 1.000 Y NA
 5936739 5936740 SUB1493 SUB1494 fabZ fabE TRUE 0.992 -3.000 0.047 0.007 Y NA
 5936740 5936741 SUB1494 SUB1495 fabE fabF TRUE 0.991 4.000 0.074 1.000 Y NA
 5936741 5936742 SUB1495 SUB1496 fabF fabG TRUE 0.987 16.000 0.056 1.000 Y NA
 5936742 5936743 SUB1496 SUB1497 fabG fabD TRUE 0.998 0.000 0.432 0.007 Y NA
 5936743 5936744 SUB1497 SUB1498 fabD fabK TRUE 0.859 24.000 0.099 1.000   NA
 5936744 5936745 SUB1498 SUB1499 fabK acpP TRUE 0.402 155.000 0.216 1.000   NA
 5936745 5936746 SUB1499 SUB1500 acpP fabH FALSE 0.282 63.000 0.065 0.007   NA
 5936746 5936747 SUB1500 SUB1501 fabH   TRUE 0.943 0.000 0.070 1.000 N NA
 5936747 5936748 SUB1501 SUB1502     TRUE 0.309 76.000 0.098 1.000 N NA
 5936748 5936749 SUB1502 SUB1503   dnaJ FALSE 0.088 193.000 0.000 1.000 N NA
 5936749 5936750 SUB1503 SUB1504 dnaJ dnaK TRUE 0.616 440.000 0.196 0.002 Y NA
 5936750 5936751 SUB1504 SUB1505 dnaK grpE TRUE 0.674 116.000 0.026 0.006 Y NA
 5936751 5936752 SUB1505 SUB1506 grpE hrcA TRUE 0.567 45.000 0.051 1.000 N NA
 5936752 5936753 SUB1506 SUB1507 hrcA   FALSE 0.172 130.000 0.009 1.000 N NA
 5936753 5936754 SUB1507 SUB1508     TRUE 0.973 -3.000 0.174 1.000 N NA
 5936754 5936755 SUB1508 SUB1509     TRUE 0.978 -16.000 0.174 1.000 N NA
 5936755 5936756 SUB1509 SUB1510     FALSE 0.130 139.000 0.000 NA   NA
 5936756 5936757 SUB1510 SUB1511     FALSE 0.136 104.000 0.000 NA   NA
 5936757 5936758 SUB1511 SUB1512     TRUE 0.984 10.000 0.569 NA   NA
 5936760 5936761 SUB1514 SUB1515     TRUE 0.360 58.000 0.036 1.000   NA
 5936761 5936762 SUB1515 SUB1516   gatB FALSE 0.203 69.000 0.002 1.000 N NA
 5936762 5936763 SUB1516 SUB1517 gatB gatA TRUE 0.998 0.000 0.492 0.002 Y NA
 5936763 5936764 SUB1517 SUB1518 gatA gatC TRUE 0.998 0.000 0.643 0.002 Y NA
 5936764 5936765 SUB1518 SUB1519 gatC ppdK FALSE 0.135 157.000 0.002 1.000 N NA
 5936765 5936766 SUB1519 SUB1520 ppdK   TRUE 0.898 12.000 0.065 NA   NA
 5936766 5936767 SUB1520 SUB1521     TRUE 0.911 13.000 0.089 NA   NA
 5936769 5936770 SUB1523 SUB1524     TRUE 0.954 -7.000 0.047 NA   NA
 5936770 5936771 SUB1524 SUB1525     TRUE 0.940 11.000 0.163 NA   NA
 5936773 5936774 SUB1527 SUB1528   codY FALSE 0.250 144.000 0.083 1.000 N NA
 5936774 5936775 SUB1528 SUB1529 codY   FALSE 0.135 196.000 0.015 1.000 N NA
 5936779 5936780 SUB1533 SUB1534   recG FALSE 0.174 106.000 0.008 1.000   NA
 5936780 5936781 SUB1534 SUB1535 recG alr TRUE 0.377 63.000 0.078 1.000 N NA
 5936781 5936782 SUB1535 SUB1536 alr acpS TRUE 0.957 -3.000 0.093 1.000 N NA
 5936782 5936783 SUB1536 SUB1537 acpS secA FALSE 0.171 114.000 0.008 1.000 N NA
 5936783 5936784 SUB1537 SUB1538 secA pmi FALSE 0.115 143.000 0.000 1.000 N NA
 5936784 5936785 SUB1538 SUB1539 pmi   TRUE 0.957 25.000 0.000 0.027 Y NA
 5936785 5936786 SUB1539 SUB1540     TRUE 0.832 63.000 0.048 1.000 Y NA
 5936786 5936787 SUB1540 SUB1541     FALSE 0.125 91.000 0.000 1.000 N NA
 5936787 5936788 SUB1541 SUB1542   scrK1 TRUE 0.662 107.000 0.000 1.000 Y NA
 5936788 5936789 SUB1542 SUB1543 scrK1 scrA TRUE 0.860 137.000 0.235 1.000 Y NA
 5936790 5936791 SUB1544 SUB1545 scrB scrR TRUE 0.985 6.000 0.571 1.000 N NA
 5936792 5936793 SUB1546 SUB1547 nusB   TRUE 0.985 -7.000 0.265 NA   NA
 5936793 5936794 SUB1547 SUB1548   efp TRUE 0.586 43.000 0.031 NA   NA
 5936794 5936795 SUB1548 SUB1549 efp   FALSE 0.159 116.000 0.005 1.000 N NA
 5936795 5936796 SUB1549 SUB1550     TRUE 0.578 38.000 0.018 1.000 N NA
 5936796 5936797 SUB1550 SUB1551   uvrA FALSE 0.100 238.000 0.008 1.000 N NA
 5936798 5936799 SUB1552 SUB1553     FALSE 0.150 285.000 0.072 NA   NA
 5936800 5936801 SUB1555 SUB1556 rpsR ssb TRUE 0.362 54.000 0.012 1.000 N NA
 5936801 5936802 SUB1556 SUB1557 ssb rpsF TRUE 0.802 21.000 0.012 1.000 N NA
 5936804 5936805 SUB1559 SUB1560   mutS2 FALSE 0.162 112.000 0.005 1.000 N NA
 5936805 5936806 SUB1560 SUB1561 mutS2   TRUE 0.328 69.000 0.070 1.000   NA
 5936806 5936807 SUB1561 SUB1562     TRUE 0.906 3.000 0.019 NA   NA
 5936808 5936809 SUB1563 SUB1564   spi TRUE 0.903 15.000 0.080 1.000   NA
 5936809 5936810 SUB1564 SUB1565 spi   TRUE 0.483 56.000 0.099 1.000   NA
 5936810 5936811 SUB1565 SUB1566     FALSE 0.255 81.000 0.050 NA   NA
 5936813 5936814 SUB1568 SUB1569 pfl   TRUE 0.555 57.000 0.154 1.000   NA
 5936815 5936816 SUB1570 SUB1571     TRUE 0.988 -15.000 0.326 NA   NA
 5936819 5936820 SUB1574 SUB1575 pepXP   TRUE 0.719 33.000 0.054 NA   NA
 5936822 5936823 SUB1577 SUB1578     FALSE 0.073 261.000 0.000 NA   NA
 5936824 5936825 SUB1579 SUB1580     TRUE 0.720 23.000 0.000 NA   NA
 5936825 5936826 SUB1580 SUB1581     TRUE 0.996 -3.000 0.889 NA   NA
 5936827 5936828 SUB1582 SUB1583     FALSE 0.131 85.000 0.000 1.000   NA
 5936829 5936830 SUB1584 SUB1585   citX TRUE 0.948 2.000 0.123 1.000 N NA
 5936830 5936831 SUB1585 SUB1586 citX citF TRUE 0.970 -7.000 0.138 1.000 N NA
 5936831 5936832 SUB1586 SUB1587 citF citE TRUE 0.851 3.000 0.000 NA   NA
 5936832 5936833 SUB1587 SUB1589 citE citD TRUE 0.918 -12.000 0.000 NA   NA
 5936833 5936834 SUB1589 SUB1590 citD   TRUE 0.637 54.000 0.192 1.000   NA
 5936834 5936835 SUB1590 SUB1591   gcdB TRUE 0.864 31.000 0.273 0.002   NA
 5936835 5936836 SUB1591 SUB1592 gcdB   TRUE 0.588 48.000 0.103 1.000 N NA
 5936836 5936837 SUB1592 SUB1593     TRUE 0.860 23.000 0.077 NA   NA
 5936840 5936841 SUB1597 SUB1598     FALSE 0.144 82.000 0.000 NA   NA
 5936842 5936843 SUB1599 SUB1600     FALSE 0.136 114.000 0.000 NA   NA
 5936843 5936844 SUB1600 SUB1601   kgdA FALSE 0.135 134.000 0.000 NA   NA
 5936844 5936845 SUB1601 SUB1602 kgdA   TRUE 0.995 -13.000 0.048 1.000 Y NA
 5936845 5936846 SUB1602 SUB1603     TRUE 0.999 -3.000 0.571 NA Y NA
 5936846 5936847 SUB1603 SUB1604   idnO FALSE 0.197 65.000 0.000 NA N NA
 5936847 5936848 SUB1604 SUB1605 idnO kdgT TRUE 0.787 14.000 0.000 1.000   NA
 5936848 5936849 SUB1605 SUB1606 kdgT kduI TRUE 0.305 51.000 0.000 1.000   NA
 5936849 5936850 SUB1606 SUB1607 kduI   FALSE 0.086 195.000 0.000 1.000 N NA
 5936850 5936851 SUB1607 SUB1607A     FALSE 0.113 165.000 0.000 NA   NA
 5936852 5936853 SUB1608 SUB1609     TRUE 0.909 -4.000 0.000 NA   NA
 5936853 5936854 SUB1609 SUB1610     FALSE 0.196 66.000 0.000 NA   NA
 5936854 5936855 SUB1610 SUB1611     FALSE 0.184 78.000 0.002 NA   NA
 5936856 5936857 SUB1612 SUB1613     TRUE 0.532 49.000 0.057 NA   NA
 5936858 5936859 SUB1614 SUB1615   rpsN FALSE 0.132 170.000 0.005 1.000   NA
 5936860 5936861 SUB1616 SUB1617     TRUE 0.949 -10.000 0.030 1.000   NA
 5936861 5936862 SUB1617 SUB1618     TRUE 0.955 8.000 0.209 1.000   NA
 5936863 5936864 SUB1619 SUB1620     TRUE 0.990 2.000 0.576 NA   NA
 5936865 5936866 SUB1621 SUB1622 dppF dppD TRUE 0.998 0.000 0.619 0.001 Y NA
 5936866 5936867 SUB1622 SUB1623 dppD dppC TRUE 0.961 12.000 0.286 1.000   NA
 5936867 5936868 SUB1623 SUB1624 dppC dppB TRUE 0.908 10.000 0.134 0.030   NA
 5936868 5936869 SUB1624 SUB1625 dppB dppA TRUE 0.711 75.000 0.021 0.030 Y NA
 5936869 5936870 SUB1625 SUB1626 dppA glnA TRUE 0.533 223.000 0.000 1.000 Y NA
 5936870 5936871 SUB1626 SUB1627 glnA glnR TRUE 0.760 43.000 0.179 1.000 N NA
 5936871 5936872 SUB1627 SUB1628 glnR   TRUE 0.382 88.000 0.154 NA   NA
 5936872 5936873 SUB1628 SUB1629   pgk FALSE 0.065 593.000 0.002 NA   NA
 5936873 5936874 SUB1629 SUB1630 pgk plr TRUE 0.573 150.000 0.000 0.005 Y NA
 5936874 5936875 SUB1630 SUB1631 plr fus FALSE 0.058 311.000 0.000 1.000 N NA
 5936875 5936876 SUB1631 SUB1632 fus rpsG TRUE 0.930 154.000 0.579 1.000 Y NA
 5936876 5936877 SUB1632 SUB1633 rpsG rpsL TRUE 0.989 21.000 0.224 0.004 Y NA
 5936877 5936878 SUB1633 SUB1635 rpsL   FALSE 0.146 188.000 0.012 NA N NA
 5936878 5936879 SUB1635 SUB1636   purR TRUE 0.771 26.000 0.017 NA N NA
 5936879 5936880 SUB1636 SUB1637 purR   FALSE 0.231 135.000 0.052 1.000   NA
 5936880 5936881 SUB1637 SUB1638     TRUE 0.952 -10.000 0.030 NA   NA
 5936881 5936882 SUB1638 SUB1639   thiN TRUE 0.921 2.000 0.030 NA   NA
 5936882 5936883 SUB1639 SUB1640 thiN rpe TRUE 0.975 -7.000 0.166 1.000 N NA
 5936883 5936884 SUB1640 SUB1641 rpe engC TRUE 0.955 9.000 0.213 1.000   NA
 5936885 5936886 SUB1642 SUB1643     TRUE 0.988 2.000 0.500 NA   NA
 5936888 5936889 SUB1645 SUB1646     TRUE 0.920 -15.000 0.000 NA   NA
 5936890 5936891 SUB1647 SUB1648     TRUE 0.996 -31.000 0.058 NA Y NA
 5936891 5936892 SUB1648 SUB1649     FALSE 0.164 73.000 0.000 NA   NA
 5936894 5936895 SUB1651 SUB1652     TRUE 0.961 -3.000 0.105 NA N NA
 5936895 5936896 SUB1652 SUB1653   nanH TRUE 0.903 18.000 0.108 NA N NA
 5936896 5936897 SUB1653 SUB1654 nanH   TRUE 0.848 3.000 0.000 NA N NA
 5936897 5936898 SUB1654 SUB1655     TRUE 0.973 22.000 0.000 NA Y NA
 5936898 5936899 SUB1655 SUB1656     TRUE 0.971 47.000 0.400 0.030 Y NA
 5936899 5936900 SUB1656 SUB1657     TRUE 0.999 9.000 1.000 0.030 Y NA
 5936900 5936901 SUB1657 SUB1658     TRUE 0.979 16.000 0.000 1.000 Y NA
 5936901 5936902 SUB1658 SUB1659A   rpmH FALSE 0.082 206.000 0.000 1.000   NA
 5936902 5936903 SUB1659A SUB1660 rpmH   FALSE 0.051 886.000 0.000 NA   NA
 5936903 5936904 SUB1660 SUB1661     FALSE 0.059 401.000 0.000 NA   NA
 5936904 5936905 SUB1661 SUB1662     TRUE 0.924 11.000 0.125 NA   NA
 5936905 5936906 SUB1662 SUB1663     FALSE 0.137 106.000 0.000 NA   NA
 5936906 5936907 SUB1663 SUB1664   sagG TRUE 0.996 -3.000 0.849 NA   NA
 5936907 5936908 SUB1664 SUB1665 sagG   FALSE 0.049 593.000 0.000 1.000   NA
 5936908 5936909 SUB1665 SUB1666     TRUE 0.912 13.000 0.106 1.000   NA
 5936909 5936910 SUB1666 SUB1667   rnpA TRUE 0.956 -16.000 0.052 1.000 N NA
 5936910 5936911 SUB1667 SUB1668 rnpA argH FALSE 0.166 88.000 0.005 1.000 N NA
 5936911 5936912 SUB1668 SUB1669 argH argG TRUE 0.998 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 5936912 5936913 SUB1669 SUB1670 argG fasA FALSE 0.050 469.000 0.000 1.000 N NA
 5936913 5936914 SUB1670 SUB1671 fasA   TRUE 0.998 2.000 0.571 NA Y NA
 5936914 5936915 SUB1671 SUB1672     TRUE 0.902 -3.000 0.000 NA   NA
 5936915 5936916 SUB1672 SUB1674     FALSE 0.159 74.000 0.000 NA   NA
 5936916 5936917 SUB1674 SUB1675     TRUE 0.920 -16.000 0.000 NA   NA
 5936917 5936918 SUB1675 SUB1676     FALSE 0.136 114.000 0.000 NA   NA
 5936918 5936919 SUB1676 SUB1677     TRUE 0.886 0.000 0.000 NA   NA
 5936919 5936920 SUB1677 SUB1679   gltX FALSE 0.137 128.000 0.000 NA   NA
 5936920 5936921 SUB1679 SUB1680 gltX   FALSE 0.141 184.000 0.008 NA   NA
 5936921 5936922 SUB1680 SUB1681     TRUE 0.401 195.000 0.278 NA   NA
 5936922 5936923 SUB1681 SUB1682   sms FALSE 0.149 160.000 0.009 1.000 N NA
 5936923 5936924 SUB1682 SUB1683 sms   TRUE 0.478 48.000 0.028 1.000 N NA
 5936924 5936925 SUB1683 SUB1684     FALSE 0.136 115.000 0.000 NA   NA
 5936926 5936927 SUB1685 SUB1686     TRUE 0.980 19.000 0.588 NA   NA
 5936927 5936928 SUB1686 SUB1687     FALSE 0.071 277.000 0.000 NA   NA
 5936929 5936930 SUB1688 SUB1689     TRUE 0.999 0.000 0.720 0.007 Y NA
 5936930 5936931 SUB1689 SUB1690     TRUE 0.959 -7.000 0.080 1.000 N NA
 5936932 5936933 SUB1691 SUB1692 gpsA hasC TRUE 0.660 30.000 0.007 1.000 N NA
 5936934 5936935 SUB1693 SUB1694     TRUE 0.941 -3.000 0.037 1.000   NA
 5936937 5936938 SUB1696 SUB1697 hasB1 hasA TRUE 0.976 25.000 0.048 1.000 Y NA
 5936938 5936939 SUB1697 SUB1698 hasA   FALSE 0.096 182.000 0.000 1.000   NA
 5936939 5936940 SUB1698 SUB1699     TRUE 0.684 65.000 0.372 1.000   NA
 5936940 5936941 SUB1699 SUB1700   srlB FALSE 0.112 148.000 0.000 1.000 N NA
 5936941 5936942 SUB1700 SUB1701 srlB srlE TRUE 0.985 41.000 0.600 0.018 Y NA
 5936942 5936943 SUB1701 SUB1702 srlE srlA TRUE 0.984 19.000 0.116 0.018 Y NA
 5936943 5936944 SUB1702 SUB1703 srlA gutM TRUE 0.958 13.000 0.239 NA N NA
 5936944 5936945 SUB1703 SUB1704 gutM   TRUE 0.994 0.000 0.070 NA Y NA
 5936945 5936946 SUB1704 SUB1705   sorD TRUE 0.954 23.000 0.357 1.000 N NA
 5936946 5936947 SUB1705 SUB1706 sorD pgi FALSE 0.109 199.000 0.005 1.000 N NA
 5936947 5936948 SUB1706 SUBs08 pgi   FALSE 0.125 148.000 0.000 NA   NA
 5936948 5936949 SUBs08 SUB1707     TRUE 0.529 34.000 0.000 NA   NA
 5936949 5936950 SUB1707 SUB1708     TRUE 0.882 0.000 0.013 0.020   NA
 5936950 5936951 SUB1708 SUB1709     FALSE 0.228 89.000 0.033 NA   NA
 5936951 5936952 SUB1709 SUB1710     TRUE 0.915 3.000 0.039 NA   NA
 5936952 5936953 SUB1710 SUB1711   tgt FALSE 0.158 95.000 0.004 1.000   NA
 5936955 5936956 SUB1714 SUB1715     TRUE 0.523 44.000 0.010 NA   NA
 5936956 5936957 SUB1715 SUB1716   polA FALSE 0.118 203.000 0.005 NA   NA
 5936957 5936958 SUB1716 SUB1717 polA   FALSE 0.156 106.000 0.003 1.000 N NA
 5936958 5936959 SUB1717 SUB1718     TRUE 0.990 17.000 0.177 0.064 Y NA
 5936959 5936960 SUB1718 SUB1719     FALSE 0.061 293.000 0.000 1.000 N NA
 5936960 5936961 SUB1719 SUB1720     FALSE 0.275 113.000 0.077 NA   NA
 5936961 5936962 SUB1720 SUB1721     TRUE 0.392 181.000 0.231 NA   NA
 5936962 5936963 SUB1721 SUB1722     TRUE 0.345 179.000 0.200 1.000 N NA
 5936963 5936964 SUB1722 SUB1723     TRUE 0.999 0.000 0.700 1.000 Y NA
 5936964 5936965 SUB1723 SUB1724     TRUE 0.998 5.000 0.536 1.000 Y NA
 5936965 5936966 SUB1724 SUB1725     TRUE 0.948 57.000 0.328 1.000 Y NA
 5936966 5936967 SUB1725 SUB1726     TRUE 0.851 92.000 0.279 0.017 Y NA
 5936967 5936968 SUB1726 SUB1727     TRUE 0.583 78.000 0.431 0.018   NA
 5936968 5936969 SUB1727 SUB1728     FALSE 0.113 153.000 0.000 1.000   NA
 5936969 5936970 SUB1728 SUB1729   leuS FALSE 0.155 71.000 0.000 1.000 N NA
 5936970 5936971 SUB1729 SUB1730 leuS   FALSE 0.123 136.000 0.000 1.000   NA
 5936971 5936972 SUB1730 SUB1731   nusG FALSE 0.081 212.000 0.000 1.000   NA
 5936972 5936973 SUB1731 SUB1732 nusG   TRUE 0.778 146.000 0.843 1.000 N NA
 5936973 5936974 SUB1732 SUB1732A     TRUE 0.899 12.000 0.080 1.000 N NA
 5936974 5936975 SUB1732A SUB1733   pbp2A TRUE 0.571 50.000 0.111 1.000 N NA
 5936975 5936976 SUB1733 SUB1734 pbp2A   TRUE 0.728 33.000 0.062 NA N NA
 5936977 5936978 SUB1735 SUB1736     TRUE 0.960 -13.000 0.056 NA   NA
 5936981 5936982 SUB1739 SUB1741   groEL FALSE 0.116 163.000 0.000 NA   NA
 5936982 5936983 SUB1741 SUB1742 groEL groES TRUE 0.952 46.000 0.160 1.000 Y NA
 5936983 5936984 SUB1742 SUB1743 groES clpC TRUE 0.720 142.000 0.036 1.000 Y NA
 5936984 5936985 SUB1743 SUB1744 clpC ctsR TRUE 0.972 0.000 0.188 NA N NA
 5936985 5936986 SUB1744 SUB1745 ctsR csp TRUE 0.612 214.000 0.013 NA Y NA
 5936987 5936988 SUB1746 SUB1747     TRUE 0.944 2.000 0.091 NA   NA
 5936988 5936989 SUB1747 SUB1748     FALSE 0.134 126.000 0.000 NA N NA
 5936989 5936990 SUB1748 SUB1749     TRUE 0.984 10.000 0.571 NA   NA
 5936990 5936991 SUB1749 SUB1750     TRUE 0.919 -13.000 0.000 NA   NA
 5936991 5936992 SUB1750 SUB1751     TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 5936994 5936995 SUB1752 SUB1753 ahpC ndh TRUE 0.987 39.000 0.551 1.000 Y NA
 5936995 5936996 SUB1753 SUB1754 ndh rpsB FALSE 0.075 225.000 0.000 1.000 N NA
 5936996 5936997 SUB1754 SUB1755 rpsB tsf TRUE 0.952 139.000 0.748 1.000 Y NA
 5936998 5936999 SUB1756 SUB1757 pepO   FALSE 0.123 129.000 0.000 1.000 N NA
 5936999 5937000 SUB1757 SUB1758     TRUE 0.999 -3.000 0.742 0.002 Y NA
 5937000 5937001 SUB1758 SUB1759     TRUE 0.977 3.000 0.333 1.000   NA
 5937001 5937002 SUB1759 SUB1760     TRUE 0.927 13.000 0.182 0.026   NA
 5937002 5937003 SUB1760 SUB1761     TRUE 0.928 5.000 0.156 0.017 N NA
 5937003 5937004 SUB1761 SUB1762   treA FALSE 0.073 233.000 0.000 1.000 N NA
 5937004 5937005 SUB1762 SUB1763 treA   TRUE 0.963 68.000 0.650 1.000 Y NA
 5937008 5937009 SUB1766 SUB1767     TRUE 0.369 53.000 0.007 NA   NA
 5937010 5937011 SUB1768 SUB1769 nrdG   TRUE 0.948 5.000 0.159 1.000   NA
 5937011 5937012 SUB1769 SUB1770     TRUE 0.954 -31.000 0.041 1.000   NA
 5937012 5937013 SUB1770 SUB1771     TRUE 0.796 26.000 0.041 NA   NA
 5937013 5937014 SUB1771 SUB1772   nrdD FALSE 0.260 106.000 0.062 NA   NA
 5937014 5937015 SUB1772 SUB1773 nrdD   FALSE 0.250 101.000 0.057 NA   NA
 5937015 5937016 SUB1773 SUB1774     FALSE 0.120 156.000 0.000 NA   NA
 5937016 5937017 SUB1774 SUB1775     TRUE 0.986 11.000 0.651 NA   NA
 5937017 5937018 SUB1775 SUB1776     TRUE 0.992 -3.000 0.537 NA   NA
 5937018 5937019 SUB1776 SUB1777     FALSE 0.221 116.000 0.032 NA   NA
 5937019 5937020 SUB1777 SUB1778   recA FALSE 0.075 316.000 0.004 1.000 N NA
 5937020 5937021 SUB1778 SUB1779 recA cinA TRUE 0.282 82.000 0.083 1.000   NA
 5937021 5937022 SUB1779 SUB1780 cinA tag FALSE 0.183 91.000 0.011 1.000   NA
 5937022 5937023 SUB1780 SUB1781 tag ruvA TRUE 0.987 5.000 0.012 1.000 Y NA
 5937023 5937024 SUB1781 SUB1782 ruvA lmrP TRUE 0.898 2.000 0.005 NA   NA
 5937024 5937025 SUB1782 SUB1783 lmrP mutL TRUE 0.854 10.000 0.006 NA   NA
 5937026 5937027 SUB1784 SUB1785     FALSE 0.083 227.000 0.000 NA   NA
 5937028 5937029 SUB1786 SUB1787 mutS   TRUE 0.953 -13.000 0.031 NA   NA
 5937029 5937030 SUB1787 SUB1788   argR TRUE 0.950 -3.000 0.054 NA   NA
 5937032 5937033 SUB1790 SUB1791     TRUE 0.918 47.000 0.667 NA   NA
 5937033 5937034 SUB1791 SUB1792     TRUE 0.940 15.000 0.156 NA   NA
 5937034 5937035 SUB1792 SUB1793   aspS TRUE 0.945 -7.000 0.016 NA   NA
 5937035 5937036 SUB1793 SUB1794 aspS hisS TRUE 0.702 223.000 0.161 0.045 Y NA
 5937037 5937038 SUB1795 SUB1796 rpmF rpmG TRUE 0.980 16.000 0.012 0.030 Y NA
 5937038 5937039 SUB1796 SUB1797 rpmG   FALSE 0.061 299.000 0.000 1.000   NA
 5937042 5937043 SUB1800 SUB1801     FALSE 0.134 122.000 0.000 NA N NA
 5937043 5937044 SUB1801 SUB1802     TRUE 0.951 27.000 0.000 0.050 Y NA
 5937044 5937045 SUB1802 SUB1803     TRUE 0.875 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5937045 5937046 SUB1803 SUB1804   thlA TRUE 0.967 24.000 0.000 1.000 Y NA
 5937046 5937047 SUB1804 SUB1805 thlA   TRUE 0.680 80.000 0.000 1.000 Y NA
 5937047 5937048 SUB1805 SUB1806   hbd TRUE 0.910 41.000 0.000 1.000 Y NA
 5937048 5937049 SUB1806 SUB1807 hbd   FALSE 0.124 150.000 0.000 NA   NA
 5937049 5937050 SUB1807 SUB1808     FALSE 0.137 106.000 0.000 NA   NA
 5937050 5937051 SUB1808 SUB1809     TRUE 0.336 83.000 0.124 NA   NA
 5937051 5937052 SUB1809 SUB1810     FALSE 0.129 89.000 0.000 1.000   NA
 5937053 5937054 SUB1811 SUB1812     TRUE 0.987 -13.000 0.300 NA   NA
 5937054 5937055 SUB1812 SUB1813     TRUE 0.987 -3.000 0.350 NA   NA
 5937056 5937057 SUB1814 SUB1815     TRUE 0.872 9.000 0.012 NA   NA
 5937059 5937060 SUB1817 SUB1818     FALSE 0.065 309.000 0.000 NA   NA
 5937060 5937061 SUB1818 SUB1819     FALSE 0.127 143.000 0.000 NA   NA
 5937061 5937062 SUB1819 SUB1820     FALSE 0.137 126.000 0.000 NA   NA
 5937062 5937063 SUB1820 SUB1821     FALSE 0.138 108.000 0.000 NA   NA
 5937063 5937064 SUB1821 SUB1822     FALSE 0.113 165.000 0.000 NA   NA
 5937064 5937065 SUB1822 SUB1823     FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 5937065 5937066 SUB1823 SUB1824     FALSE 0.152 77.000 0.000 NA   NA
 5937066 5937067 SUB1824 SUB1825     FALSE 0.055 510.000 0.000 NA   NA
 5937067 5937068 SUB1825 SUB1826     FALSE 0.077 243.000 0.000 NA   NA
 5937068 5937069 SUB1826 SUB1827     FALSE 0.127 143.000 0.000 NA   NA
 5937069 5937070 SUB1827 SUB1828     TRUE 0.916 -9.000 0.000 NA   NA
 5937070 5937071 SUB1828 SUB1829     FALSE 0.159 74.000 0.000 NA   NA
 5937071 5937072 SUB1829 SUB1830     TRUE 0.639 28.000 0.000 NA   NA
 5937072 5937073 SUB1830 SUB1831     TRUE 0.362 48.000 0.000 NA   NA
 5937073 5937074 SUB1831 SUB1832     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 5937074 5937075 SUB1832 SUB1832A     TRUE 0.800 11.000 0.000 NA   NA
 5937075 5937076 SUB1832A SUB1834     TRUE 0.920 -18.000 0.000 NA   NA
 5937076 5937077 SUB1834 SUB1835     TRUE 0.913 -7.000 0.000 NA   NA
 5937077 5937078 SUB1835 SUB1836     FALSE 0.068 293.000 0.000 NA   NA
 5937078 5937079 SUB1836 SUB1837     TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 5937079 5937080 SUB1837 SUB1838     TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 5937081 5937082 SUB1839 SUB1840     FALSE 0.127 112.000 0.000 1.000   NA
 5937083 5937084 SUB1841 SUB1842 rpsD veg FALSE 0.063 321.000 0.000 NA   NA
 5937084 5937085 SUB1842 SUB1843 veg dnaC TRUE 0.874 12.000 0.030 NA   NA
 5937085 5937086 SUB1843 SUB1844 dnaC rplI TRUE 0.725 35.000 0.100 1.000 N NA
 5937086 5937087 SUB1844 SUB1845 rplI   TRUE 0.956 0.000 0.119 1.000 N NA
 5937087 5937088 SUB1845 SUB1846   gidA FALSE 0.183 88.000 0.011 1.000 N NA
 5937088 5937089 SUB1846 SUB1847 gidA   FALSE 0.041 355.000 0.002 0.006 N NA
 5937090 5937091 SUB1848 SUB1849 sdhB sdhA TRUE 0.991 12.000 0.221 0.001 Y NA
 5937091 5937092 SUB1849 SUB1850 sdhA   TRUE 0.889 6.000 0.033 1.000   NA
 5937093 5937094 SUB1851 SUB1852     FALSE 0.117 145.000 0.000 1.000   NA
 5937094 5937095 SUB1852 SUB1853     TRUE 0.996 -7.000 0.136 1.000 Y NA
 5937095 5937096 SUB1853 SUB1854     TRUE 0.999 -24.000 0.713 0.025 Y NA
 5937096 5937097 SUB1854 SUB1855   pgsA TRUE 0.895 3.000 0.015 1.000 N NA
 5937097 5937098 SUB1855 SUB1856 pgsA   TRUE 0.906 10.000 0.077 1.000   NA
 5937098 5937099 SUB1856 SUB1857     TRUE 0.636 51.000 0.156 1.000   NA
 5937099 5937100 SUB1857 SUB1858     TRUE 0.995 -3.000 0.872 0.004   NA
 5937101 5937102 SUB1859 SUB1860   recF TRUE 0.964 3.000 0.209 1.000   NA
 5937103 5937104 SUB1861 SUB1862   guaB FALSE 0.090 188.000 0.000 1.000 N NA
 5937104 5937105 SUB1862 SUB1863 guaB trsA FALSE 0.086 242.000 0.002 1.000 N NA
 5937106 5937107 SUB1864 SUB1865     FALSE 0.235 79.000 0.027 NA   NA
 5937107 5937108 SUB1865 SUB1866     TRUE 0.370 59.000 0.040 NA   NA
 5937109 5937110 SUBt30 SUBt38 tRNA-Asn tRNA-Glu TRUE 0.486 37.000 0.000 NA   NA
 5937113 5937114 SUB1868 SUB1869 htrA   FALSE 0.208 78.000 0.015 1.000 N NA
 5937114 5935209 SUB1869 SUB0001   dnaA FALSE 0.091 235.000 0.002 1.000 N NA