MicrobesOnline Operon Predictions for Lactobacillus plantarum WCFS1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
329225	329226	lp_0001	lp_0002	dnaA	dnaN	FALSE	0.482	178.000	0.328	1.000	Y	0.233
329226	329227	lp_0002	lp_0004	dnaN		FALSE	0.009	525.000	0.103	1.000		-0.179
329227	329228	lp_0004	lp_0005		recF	TRUE	0.993	1.000	0.209	1.000		0.805
329228	329229	lp_0005	lp_0006	recF	gyrB	TRUE	0.993	-3.000	0.249	0.004	Y	0.546
329229	329230	lp_0006	lp_0007	gyrB	gyrA	TRUE	0.905	165.000	0.306	0.002	Y	0.628
329230	329231	lp_0007	lp_0009	gyrA	rpsF	FALSE	0.014	623.000	0.003	1.000	N	0.190
329231	329232	lp_0009	lp_0010	rpsF	ssb	TRUE	0.979	37.000	0.003	1.000	N	0.908
329232	329233	lp_0010	lp_0011	ssb	rpsR	TRUE	0.970	39.000	0.003	1.000	N	0.738
329233	329234	lp_0011	lp_0012	rpsR		FALSE	0.110	181.000	0.016	1.000	N	0.231
329234	329235	lp_0012	lp_0013		rplI	TRUE	0.990	13.000	0.119	1.000	N	0.738
329235	329236	lp_0013	lp_0014	rplI	dnaC	TRUE	0.989	16.000	0.100	1.000	N	0.704
329236	329237	lp_0014	lp_0015	dnaC		FALSE	0.003	222.000	0.000	1.000	N	-0.250
329237	329238	lp_0015	lp_0016		proB	FALSE	0.084	13.000	0.000	1.000	N	0.158
329238	329239	lp_0016	lp_0017	proB	proA	TRUE	0.942	19.000	0.281	0.002	Y	0.114
329239	329240	lp_0017	lp_0018	proA		FALSE	0.013	461.000	0.000	1.000	Y	0.119
329242	329243	lp_0020	lp_0021	glgB	glgC	TRUE	0.979	-10.000	0.317	0.001	Y	0.324
329243	329244	lp_0021	lp_0022	glgC	glgD	TRUE	0.997	-3.000	0.810	0.001	Y	0.566
329244	329245	lp_0022	lp_0023	glgD	glgA	TRUE	0.996	-7.000	0.395	1.000	Y	0.607
329245	329246	lp_0023	lp_0024	glgA	glgP	TRUE	0.960	20.000	0.171	1.000	Y	0.305
329246	329247	lp_0024	lp_0025	glgP	amy1	TRUE	0.993	18.000	0.186	0.031	Y	0.619
329247	329248	lp_0025	lp_0026	amy1		FALSE	0.001	333.000	0.000	1.000		0.180
329249	329250	lp_0027	lp_0028	pgmB1	map1	TRUE	0.755	18.000	0.038	1.000		0.226
329250	329251	lp_0028	lp_0030	map1		FALSE	0.007	388.000	0.000	1.000		0.250
329252	329253	lp_0031	lp_0032	cspL		TRUE	0.840	83.000	0.000	1.000		0.628
329254	329255	lp_0036	lp_0037	rrp1	hpk1	TRUE	0.996	14.000	0.597	1.000	Y	0.633
329255	329256	lp_0037	lp_0038	hpk1		TRUE	0.996	-19.000	0.575	NA		0.777
329256	329257	lp_0038	lp_0039			TRUE	0.990	12.000	0.890	NA		0.498
329257	329258	lp_0039	lp_0041			FALSE	0.054	358.000	0.176	NA		0.119
329258	329259	lp_0041	lp_0043		htrA	FALSE	0.698	111.000	0.030	1.000		0.478
329259	329260	lp_0043	lp_0045	htrA		FALSE	0.001	555.000	0.000	NA		0.078
329260	329261	lp_0045	lp_0046			FALSE	0.001	483.000	0.000	NA		0.230
329261	329262	lp_0046	lp_0047		aldH	FALSE	0.029	64.000	0.000	1.000	N	0.035
329262	329263	lp_0047	lp_0048	aldH		FALSE	0.003	208.000	0.000	NA	N	0.068
329263	329264	lp_0048	lp_0050		pnb	FALSE	0.002	249.000	0.000	NA	N	-0.310
329264	329265	lp_0050	lp_0052	pnb		FALSE	0.011	116.000	0.000	1.000	N	-0.066
329266	329267	lp_0053	lp_0054			TRUE	0.863	17.000	0.000	NA		0.420
329267	329268	lp_0054	lp_0055			FALSE	0.006	154.000	0.000	NA		-0.106
329269	329270	lp_0056	lp_0057			FALSE	0.016	92.000	0.000	1.000	N	0.088
329272	329273	lp_0059	lp_0060	arsC		FALSE	0.266	320.000	0.000	1.000		0.584
329273	329274	lp_0060	lp_0061			TRUE	0.981	32.000	0.273	1.000		0.571
329274	329275	lp_0061	lp_0062			TRUE	0.965	28.000	0.273	1.000		0.436
329275	329276	lp_0062	lp_0063			FALSE	0.261	169.000	0.000	NA	N	0.412
329280	329281	lp_0068	lp_0069		ptp1	FALSE	0.645	149.000	0.000	NA		0.629
329282	329283	lp_0070	lp_0071			TRUE	0.898	76.000	0.000	NA		0.746
329283	329284	lp_0071	lp_0072			TRUE	0.860	83.000	0.000	NA		0.679
329287	329288	lp_0075	lp_0076		fusA1	FALSE	0.033	262.000	0.000	1.000	N	0.258
329288	329289	lp_0076	lp_0077	fusA1		FALSE	0.092	18.000	0.000	NA		0.206
329289	329290	lp_0077	lp_0078			TRUE	0.832	6.000	0.000	NA		0.401
329290	329291	lp_0078	lp_0080			FALSE	0.331	188.000	0.000	1.000		0.504
329292	329293	lp_0081	lp_0082			FALSE	0.577	46.000	0.000	NA		0.357
329300	329301	lp_0096	lp_0098			FALSE	0.460	258.000	0.000	NA		0.722
329302	329303	lp_0099	lp_0100			FALSE	0.093	21.000	0.000	NA		0.181
329303	329304	lp_0100	lp_0101			TRUE	0.996	2.000	0.682	0.028	Y	0.587
329304	329305	lp_0101	lp_0102		cbiM	TRUE	0.996	-25.000	0.115	0.007	Y	0.851
329305	329306	lp_0102	lp_0103	cbiM		TRUE	0.988	15.000	0.010	1.000	N	0.870
329307	329308	lp_0104	lp_0105			TRUE	0.982	2.000	0.026	NA		0.678
329308	5937118	lp_0105	lp_0106			TRUE	0.942	31.000	0.000	NA		0.583
5937118	5937119	lp_0106	lp_0107			TRUE	0.953	39.000	0.000	NA		0.738
5937119	329309	lp_0107	lp_0108		glpF1	FALSE	0.087	5.000	0.000	NA		0.006
329309	329310	lp_0108	lp_0109	glpF1		FALSE	0.081	25.000	0.017	1.000		-0.107
329312	329313	lp_0113	lp_0114	thiM	thiD	TRUE	0.989	26.000	0.020	0.004	Y	0.725
329313	329314	lp_0114	lp_0115	thiD	thiE	TRUE	0.993	-10.000	0.063	0.004	Y	0.682
329314	329315	lp_0115	lp_0116	thiE		TRUE	0.983	0.000	0.016	1.000	N	0.665
329315	329316	lp_0116	lp_0117			FALSE	0.206	82.000	0.000	1.000		0.285
329316	329317	lp_0117	lp_0118			FALSE	0.070	243.000	0.000	NA		0.351
329319	329320	lp_0120	lp_0121			TRUE	0.933	28.000	0.333	1.000		0.300
329320	329321	lp_0121	lp_0122		hpo	FALSE	0.700	25.000	0.000	NA		0.338
329324	329325	lp_0126	lp_0127			FALSE	0.028	66.000	0.000	NA		-0.086
329326	329327	lp_0128	lp_0129		hsp1	FALSE	0.007	146.000	0.000	NA		0.129
329328	329329	lp_0130	lp_0131			TRUE	0.968	-3.000	0.000	NA		0.617
329330	329331	lp_0132	lp_0133			FALSE	0.659	25.000	0.000	1.000	N	0.282
329331	329332	lp_0133	lp_0134			TRUE	0.807	65.000	0.100	1.000	N	0.353
329332	329333	lp_0134	lp_0135			FALSE	0.008	132.000	0.000	NA		-0.021
329333	329334	lp_0135	lp_0136			TRUE	0.892	2.000	0.000	NA		0.441
329334	329335	lp_0136	lp_0137			FALSE	0.487	77.000	0.000	0.049		0.369
329335	329336	lp_0137	lp_0138			FALSE	0.086	100.000	0.000	NA	N	0.222
329336	329337	lp_0138	lp_0139			FALSE	0.002	305.000	0.000	NA		0.024
329340	329341	lp_0146	lp_0148			FALSE	0.003	233.000	0.000	1.000	N	-0.120
329341	329342	lp_0148	lp_0149			TRUE	0.995	2.000	0.530	1.000		0.749
329342	329343	lp_0149	lp_0150			TRUE	0.992	5.000	0.435	NA		0.644
329343	329344	lp_0150	lp_0151			FALSE	0.020	79.000	0.000	NA		0.207
329345	329346	lp_0152	lp_0154			FALSE	0.007	145.000	0.000	NA		0.166
329346	329347	lp_0154	lp_0155			TRUE	0.975	29.000	0.000	NA		0.846
329347	329348	lp_0155	lp_0156			TRUE	0.980	10.000	0.000	NA		0.926
329348	329349	lp_0156	lp_0158			FALSE	0.002	323.000	0.000	NA		-0.009
329349	329350	lp_0158	lp_0159			FALSE	0.005	169.000	0.000	NA		-0.007
329350	329351	lp_0159	lp_0160			FALSE	0.002	263.000	0.000	1.000	N	-0.050
329351	329352	lp_0160	lp_0161			TRUE	0.992	6.000	0.821	NA	N	0.507
329352	329353	lp_0161	lp_0162			TRUE	0.905	19.000	0.160	NA	N	0.237
329353	329354	lp_0162	lp_0163			FALSE	0.103	168.000	0.000	1.000	N	0.294
329358	329359	lp_0168	lp_0169	dak1B	dak2	TRUE	0.997	14.000	0.316	0.002	Y	0.918
329359	329360	lp_0169	lp_0170	dak2		TRUE	0.994	-3.000	0.169	1.000		0.932
329360	329361	lp_0170	lp_0171		gplF2	TRUE	0.992	15.000	0.143	1.000		0.903
329361	329362	lp_0171	lp_0172	gplF2		FALSE	0.006	151.000	0.000	1.000	N	0.124
329362	329363	lp_0172	lp_0173			TRUE	0.994	24.000	0.074	0.059	Y	0.834
329363	329364	lp_0173	lp_0174		agl1	TRUE	0.992	17.000	0.082	1.000	N	0.903
329364	329365	lp_0174	lp_0175	agl1	malE	FALSE	0.602	256.000	0.000	1.000	Y	0.715
329365	329366	lp_0175	lp_0176	malE	malF	TRUE	0.983	110.000	0.621	1.000	Y	0.918
329366	329367	lp_0176	lp_0177	malF	malG	TRUE	0.998	5.000	0.714	0.051	Y	0.905
329367	329368	lp_0177	lp_0178	malG	malA	TRUE	0.978	28.000	0.000	NA		0.926
329368	329369	lp_0178	lp_0179	malA	amy2	TRUE	0.973	34.000	0.000	NA		0.939
329369	329370	lp_0179	lp_0180	amy2	msmK1	TRUE	0.930	102.000	0.000	1.000	Y	0.941
329370	329371	lp_0180	lp_0181	msmK1	map2	TRUE	0.988	27.000	0.000	1.000	Y	0.931
329374	329375	lp_0184	lp_0185	sacK1	pts1BCA	TRUE	0.820	134.000	0.000	NA	Y	0.657
329376	329377	lp_0187	lp_0188	sacA	sacR	TRUE	0.989	-19.000	0.222	1.000	N	0.550
329377	329378	lp_0188	lp_0189	sacR	agl2	TRUE	0.991	21.000	0.222	1.000	N	0.661
329379	329380	lp_0190	lp_0192		nha1	FALSE	0.034	221.000	0.000	1.000	Y	0.114
329384	329385	lp_0199	lp_0200			FALSE	0.004	188.000	0.000	1.000		0.015
329385	329386	lp_0200	lp_0201			FALSE	0.018	206.000	0.000	0.051	Y	-0.023
329386	329387	lp_0201	lp_0202			FALSE	0.422	153.000	0.000	1.000		0.488
329387	329388	lp_0202	lp_0203		serA1	TRUE	0.975	-3.000	0.000	0.069		0.669
329388	329389	lp_0203	lp_0204	serA1	serC	TRUE	0.996	16.000	0.238	1.000	Y	0.845
329390	329391	lp_0205	lp_0206	pgm1		FALSE	0.011	258.000	0.000	1.000		0.246
329391	329392	lp_0206	lp_0207			FALSE	0.001	501.000	0.000	NA		0.045
329393	5937120	lp_0208	lp_0209			TRUE	0.885	-13.000	0.000	NA		0.419
329395	329396	lp_0211	lp_0213			FALSE	0.048	143.000	0.000	NA		0.258
329396	329397	lp_0213	lp_0214			TRUE	0.993	0.000	0.160	0.094	Y	0.615
329398	329399	lp_0215	lp_0216		ISP2	FALSE	0.003	210.000	0.000	1.000		-0.121
329400	329401	lp_0217	lp_0218			TRUE	0.977	9.000	0.122	1.000		0.553
329401	329402	lp_0218	lp_0219			TRUE	0.981	29.000	0.250	NA		0.550
329403	329404	lp_0220	lp_0221	gpo		TRUE	0.951	51.000	0.000	1.000		0.846
329405	329406	lp_0223	lp_0224	greA1		FALSE	0.673	86.000	0.000	NA		0.485
329406	329407	lp_0224	lp_0225			FALSE	0.084	13.000	0.000	NA		0.210
329410	329411	lp_0230	lp_0231	pts2CB	mtlR	TRUE	0.992	37.000	0.336	0.027	N	0.819
329411	329412	lp_0231	lp_0232	mtlR	pts2A	TRUE	0.991	15.000	0.066	0.027	N	0.838
329412	329413	lp_0232	lp_0233	pts2A	mtlD	TRUE	0.993	2.000	0.031	1.000	Y	0.842
329418	329419	lp_0240	lp_0242		ndk	FALSE	0.542	242.000	0.000	NA		0.828
329420	329421	lp_0243	lp_0244			FALSE	0.019	300.000	0.000	NA		0.277
329421	329422	lp_0244	lp_0245			FALSE	0.002	269.000	0.000	NA		0.128
329422	329423	lp_0245	lp_0247		pts3C	FALSE	0.001	521.000	0.000	1.000	N	0.055
329423	329424	lp_0247	lp_0248	pts3C		TRUE	0.951	10.000	0.000	NA		0.574
329424	329425	lp_0248	lp_0249			TRUE	0.945	-3.000	0.000	NA		0.519
329425	329426	lp_0249	lp_0250			TRUE	0.963	-7.000	0.050	1.000		0.474
329426	329427	lp_0250	lp_0251		selA	TRUE	0.934	70.000	0.750	1.000		0.403
329427	329428	lp_0251	lp_0252	selA		TRUE	0.989	-9.000	0.679	NA		0.464
329428	329429	lp_0252	lp_0253		kdgK	TRUE	0.986	14.000	0.283	NA		0.570
329430	329431	lp_0254	lp_0255	cysE	metC1	TRUE	0.994	5.000	0.076	1.000	Y	0.818
329431	329432	lp_0255	lp_0256	metC1	cysK	TRUE	0.998	12.000	0.690	0.016	Y	0.875
329432	329433	lp_0256	lp_0257	cysK	pepM	FALSE	0.001	613.000	0.000	1.000	N	-0.052
329433	329434	lp_0257	lp_0258	pepM		FALSE	0.513	36.000	0.000	NA		0.306
329435	329436	lp_0259	lp_0260			FALSE	0.071	199.000	0.000	NA		0.328
329436	329437	lp_0260	lp_0261			TRUE	0.966	-7.000	0.065	NA		0.477
329437	329438	lp_0261	lp_0262		treR	FALSE	0.002	316.000	0.000	NA		-0.113
329438	329439	lp_0262	lp_0263	treR	treA	TRUE	0.995	25.000	0.336	1.000	N	0.910
329439	329440	lp_0263	lp_0264	treA	pts4ABC	TRUE	0.991	17.000	0.042	1.000	Y	0.711
329440	329441	lp_0264	lp_0265	pts4ABC	pts5ABC	TRUE	0.836	220.000	0.188	0.027	Y	0.689
329443	329444	lp_0267	lp_0268	tagD1	tagF1	TRUE	0.988	25.000	0.000	0.004	Y	0.835
329444	329445	lp_0268	lp_0269	tagF1	tagF2	TRUE	0.976	41.000	0.000	0.002	Y	0.781
329445	329446	lp_0269	lp_0271	tagF2	vdcB	FALSE	0.377	288.000	0.000	1.000	N	0.622
329446	329447	lp_0271	lp_0272	vdcB		TRUE	0.989	3.000	0.500	NA		0.534
329449	329450	lp_0274	lp_0275		mntH1	FALSE	0.519	171.000	0.000	1.000	N	0.565
329451	329452	lp_0276	lp_0277			FALSE	0.207	56.000	0.000	NA		0.260
329452	329453	lp_0277	lp_0279			FALSE	0.656	41.000	0.000	NA		0.371
329453	329454	lp_0279	lp_0280			FALSE	0.096	301.000	0.000	NA		0.414
329456	329457	lp_0282	lp_0283	hpk2	rrp2	TRUE	0.979	-13.000	0.450	0.094	Y	0.276
329458	329459	lp_0284	lp_0285			FALSE	0.529	81.000	0.000	NA		0.409
329459	329460	lp_0285	lp_0286		pts6C	FALSE	0.037	302.000	0.000	1.000	N	0.284
329464	329465	lp_0291	lp_0292			FALSE	0.264	147.000	0.000	NA		0.400
329465	329466	lp_0292	lp_0293			TRUE	0.932	45.000	0.000	NA		0.675
329468	329469	lp_0295	lp_0296		tag1	FALSE	0.004	180.000	0.000	1.000		-0.177
329469	329470	lp_0296	lp_0297	tag1		FALSE	0.002	241.000	0.000	NA		0.135
329470	329471	lp_0297	lp_0298			FALSE	0.055	323.000	0.000	NA		0.367
329471	329472	lp_0298	lp_0299			TRUE	0.986	12.000	0.667	1.000	Y	0.387
329473	329474	lp_0300	lp_0301			TRUE	0.750	96.000	0.000	NA		0.563
329474	329475	lp_0301	lp_0302			FALSE	0.010	122.000	0.000	NA		-0.097
329475	329476	lp_0302	lp_0304			FALSE	0.259	1051.000	0.000	0.007		0.760
329476	329477	lp_0304	lp_0305		gcsH1	FALSE	0.001	405.000	0.000	1.000		0.196
329477	329478	lp_0305	lp_0306	gcsH1		TRUE	0.869	85.000	0.000	NA		0.716
329478	329479	lp_0306	lp_0307			TRUE	0.994	-3.000	0.238	NA		0.796
329479	329480	lp_0307	lp_0308			TRUE	0.985	0.000	0.033	NA		0.713
329480	329481	lp_0308	lp_0309			FALSE	0.001	420.000	0.000	NA		-0.011
329484	329485	lp_0312	lp_0313		ndh1	FALSE	0.004	189.000	0.000	1.000	N	-0.037
329485	329486	lp_0313	lp_0314	ndh1		FALSE	0.288	132.000	0.000	NA		0.392
329487	329488	lp_0315	lp_0316	potD	potC	TRUE	0.988	-3.000	0.253	0.050	Y	0.460
329488	329489	lp_0316	lp_0317	potC	potB	TRUE	0.997	0.000	0.492	0.050	Y	0.694
329489	329490	lp_0317	lp_0318	potB	potA	TRUE	0.998	12.000	0.928	0.050	Y	0.703
329490	329491	lp_0318	lp_0319	potA		TRUE	0.894	71.000	0.326	1.000	N	0.394
329491	329492	lp_0319	lp_0320			FALSE	0.001	469.000	0.000	NA		-0.188
329493	329494	lp_0321	lp_0322			TRUE	0.830	4.000	0.000	0.012		0.378
329494	329495	lp_0322	lp_0324			FALSE	0.449	94.000	0.000	NA		0.400
329495	329496	lp_0324	lp_0325			FALSE	0.002	261.000	0.000	NA		0.220
329496	329497	lp_0325	lp_0326			TRUE	0.975	0.000	0.000	1.000	N	0.647
329497	329498	lp_0326	lp_0327			TRUE	0.917	13.000	0.000	NA		0.487
329501	329502	lp_0331	lp_0332			FALSE	0.164	170.000	0.000	0.093	N	0.339
329502	329503	lp_0332	lp_0333			FALSE	0.692	13.000	0.000	NA		0.331
329504	329505	lp_0334	lp_0335	pepD2		FALSE	0.028	66.000	0.000	NA		0.118
329505	329506	lp_0335	lp_0336			FALSE	0.009	129.000	0.000	NA		0.159
329506	329507	lp_0336	lp_0337		birA1	FALSE	0.204	38.000	0.017	1.000		0.122
329507	329508	lp_0337	lp_0338	birA1		TRUE	0.800	-3.000	0.034	1.000		0.246
329508	329509	lp_0338	lp_0339			FALSE	0.011	161.000	0.000	1.000		0.233
329511	329512	lp_0343	lp_0344	tagG	tagH	TRUE	0.998	13.000	0.808	1.000	Y	0.768
329512	329513	lp_0344	lp_0346	tagH		FALSE	0.001	379.000	0.000	NA		-0.242
329513	329514	lp_0346	lp_0347			FALSE	0.003	227.000	0.000	NA		-0.230
329514	329515	lp_0347	lp_0348			TRUE	0.760	-3.000	0.027	NA		0.238
329517	329518	lp_0350	lp_0351	hicD1		FALSE	0.399	103.000	0.000	NA		0.395
329520	329521	lp_0354	lp_0355	rpiA2	sufI	FALSE	0.109	150.000	0.000	1.000	N	0.270
329521	329522	lp_0355	lp_0357	sufI		FALSE	0.195	265.000	0.000	NA		0.479
329523	329524	lp_0358	lp_0359			FALSE	0.185	31.000	0.000	NA		0.240
329525	329526	lp_0360	lp_0361			TRUE	0.856	19.000	0.000	NA		0.409
329526	329527	lp_0361	lp_0362		accB3	FALSE	0.675	104.000	0.000	NA		0.531
329529	329530	lp_0364	lp_0365			FALSE	0.001	440.000	0.000	NA		-0.063
329532	329533	lp_0367	lp_0368	choS	choQ	TRUE	0.911	1.000	0.382	1.000	N	0.082
329533	329534	lp_0368	lp_0369	choQ	gshR1	FALSE	0.486	78.000	0.123	1.000	N	0.127
329534	329535	lp_0369	lp_0370	gshR1	glpK1	FALSE	0.001	466.000	0.000	1.000	Y	-0.469
329535	329536	lp_0370	lp_0371	glpK1	glpD	TRUE	0.994	15.000	0.100	0.001	Y	0.729
329536	329537	lp_0371	lp_0372	glpD	glpF3	TRUE	0.995	15.000	0.350	1.000	N	0.853
329537	329538	lp_0372	lp_0373	glpF3		FALSE	0.002	587.000	0.000	1.000		0.236
329538	329539	lp_0373	lp_0374			FALSE	0.093	2.000	0.000	NA		0.174
329539	329540	lp_0374	lp_0375			TRUE	0.913	15.000	0.000	NA		0.477
329540	329541	lp_0375	lp_0376			FALSE	0.038	49.000	0.000	NA		0.227
329541	329542	lp_0376	lp_0377			FALSE	0.013	102.000	0.000	NA		0.070
329542	329543	lp_0377	lp_0379			FALSE	0.002	304.000	0.000	NA		0.080
329543	329544	lp_0379	lp_0381			FALSE	0.034	725.000	0.000	NA		0.382
329544	329545	lp_0381	lp_0382			TRUE	0.753	15.000	0.000	NA		0.355
329545	329546	lp_0382	lp_0383			FALSE	0.181	117.000	0.000	NA		0.318
329546	329547	lp_0383	lp_0384			TRUE	0.839	89.000	0.000	NA		0.659
329547	329548	lp_0384	lp_0385			TRUE	0.960	18.000	0.000	NA		0.595
329548	329549	lp_0385	lp_0387			FALSE	0.021	450.000	0.000	NA		0.317
329549	329550	lp_0387	lp_0388			FALSE	0.001	426.000	0.000	NA		0.161
329550	329551	lp_0388	lp_0391			FALSE	0.001	1271.000	0.000	NA		-0.175
329552	329553	lp_0393	lp_0394	thgA1		TRUE	0.867	4.000	0.000	1.000		0.422
329553	329554	lp_0394	lp_0395			TRUE	0.978	4.000	0.000	1.000		0.791
329554	329555	lp_0395	lp_0396			TRUE	0.926	71.000	0.000	1.000		0.844
329556	329557	lp_0397	lp_0399		brnQ1	FALSE	0.001	526.000	0.000	1.000		-0.087
329557	329558	lp_0399	lp_0400	brnQ1	napA1	FALSE	0.715	45.000	0.000	0.092	N	0.373
329558	329559	lp_0400	lp_0402	napA1		FALSE	0.001	385.000	0.000	NA		-0.040
329560	329561	lp_0403	lp_0404	plnR	plnL	FALSE	0.626	25.000	0.000	NA		0.310
329561	329562	lp_0404	lp_0405	plnL	plnK	FALSE	0.322	-3.000	0.000	NA		0.245
329562	329563	lp_0405	lp_0406	plnK	plnJ	FALSE	0.728	31.000	0.000	NA		0.367
329564	329565	lp_0409	lp_0410	plnM	plnN	TRUE	0.764	128.000	0.000	NA		0.713
329565	329566	lp_0410	lp_0411	plnN	plnO	FALSE	0.740	118.000	0.000	NA		0.625
329566	329567	lp_0411	lp_0412	plnO	plnP	TRUE	0.948	31.000	0.000	NA		0.607
329567	329568	lp_0412	lp_0413	plnP	plnQ	FALSE	0.147	354.000	0.000	NA		0.499
329568	329569	lp_0413	lp_0415	plnQ	plnA	FALSE	0.035	336.000	0.000	NA		0.336
329569	329570	lp_0415	lp_0416	plnA	plnB	FALSE	0.544	191.000	0.000	NA		0.689
329570	329571	lp_0416	lp_0417	plnB	plnC	TRUE	0.996	1.000	0.333	NA	Y	0.751
329571	329572	lp_0417	lp_0418	plnC	plnD	TRUE	0.855	119.000	0.000	0.007	Y	0.639
329573	329574	lp_0419	lp_0421	plnI	plnF	FALSE	0.739	99.000	0.000	NA		0.562
329574	329575	lp_0421	lp_0422	plnF	plnE	TRUE	0.959	25.000	0.000	NA		0.615
329576	329577	lp_0423	lp_0424	plnG	plnH	TRUE	0.868	16.000	0.000	0.065		0.416
329577	329578	lp_0424	lp_0424a	plnH	plnS	FALSE	0.738	90.000	0.000	NA		0.538
329578	329579	lp_0424a	lp_0425	plnS	plnT	TRUE	0.962	-154.000	0.000	NA		0.566
329579	329580	lp_0425	lp_0426	plnT	plnU	TRUE	0.892	67.000	0.000	NA		0.640
329580	329581	lp_0426	lp_0428	plnU	plnV	TRUE	0.805	87.000	0.000	NA		0.596
329581	329582	lp_0428	lp_0429	plnV	plnW	TRUE	0.865	94.000	0.000	NA		0.754
329582	329583	lp_0429	lp_0430	plnW	plnX	FALSE	0.034	176.000	0.000	NA		0.264
329583	329584	lp_0430	lp_0431	plnX	plnY	TRUE	0.896	12.000	0.098	NA		0.325
329586	329587	lp_0433	lp_0434		trpS	FALSE	0.001	440.000	0.000	1.000		0.029
329587	329588	lp_0434	lp_0435	trpS		FALSE	0.001	408.000	0.000	1.000	N	0.129
329588	329589	lp_0435	lp_0436		pts7C	TRUE	0.887	73.000	0.000	1.000	N	0.635
329589	329590	lp_0436	lp_0438	pts7C		FALSE	0.585	185.000	0.000	NA		0.721
329590	329591	lp_0438	lp_0439		pts8C	FALSE	0.368	223.000	0.000	NA		0.573
329591	329592	lp_0439	lp_0440	pts8C	pbg1	TRUE	0.981	18.000	0.000	1.000	Y	0.635
329592	329593	lp_0440	lp_0441	pbg1		TRUE	0.762	121.000	0.000	NA	Y	0.538
329593	329594	lp_0441	lp_0442			FALSE	0.016	150.000	0.000	NA	Y	-0.020
329594	329595	lp_0442	lp_0443			FALSE	0.233	113.000	0.000	1.000	N	0.303
329595	329596	lp_0443	lp_0444			FALSE	0.001	356.000	0.000	NA		-0.019
329596	329597	lp_0444	lp_0445			TRUE	0.949	5.000	0.000	NA		0.559
329597	329598	lp_0445	lp_0446		ppx1	FALSE	0.005	170.000	0.000	NA		-0.352
329598	329599	lp_0446	lp_0447	ppx1	mvaA	FALSE	0.711	46.000	0.059	1.000	N	0.248
329599	329600	lp_0447	lp_0448	mvaA		TRUE	0.966	-7.000	0.065	1.000		0.476
329600	329601	lp_0448	lp_0449			TRUE	0.989	22.000	0.242	1.000		0.620
329601	329602	lp_0449	lp_0450			TRUE	0.972	0.000	0.000	NA		0.677
329602	329603	lp_0450	lp_0452			FALSE	0.001	558.000	0.000	NA		-0.264
329603	329604	lp_0452	lp_0454		metS	FALSE	0.037	322.000	0.000	1.000	N	0.298
329604	329605	lp_0454	lp_0455	metS		FALSE	0.003	232.000	0.000	1.000	N	-0.347
329605	329606	lp_0455	lp_0456			FALSE	0.010	123.000	0.000	NA	N	-0.340
329606	329607	lp_0456	lp_0457			TRUE	0.993	-13.000	0.058	NA	Y	0.698
329607	329608	lp_0457	lp_0458			TRUE	0.989	-3.000	0.093	1.000	N	0.661
329608	329609	lp_0458	lp_0459			FALSE	0.158	105.000	0.035	NA		0.154
329609	329610	lp_0459	lp_0460		ispE	FALSE	0.471	133.000	0.046	NA		0.384
329610	329611	lp_0460	lp_0461	ispE		FALSE	0.002	310.000	0.000	NA		-0.025
329611	329612	lp_0461	lp_0463			FALSE	0.002	268.000	0.000	NA		-0.127
329612	329613	lp_0463	lp_0464			TRUE	0.983	-13.000	0.379	1.000	Y	0.366
329613	329614	lp_0464	lp_0466		purR	FALSE	0.001	356.000	0.017	1.000	N	-0.140
329614	329615	lp_0466	lp_0467	purR	glmU	TRUE	0.955	69.000	0.021	1.000	N	0.799
329615	329616	lp_0467	lp_0469	glmU	bla1	FALSE	0.056	236.000	0.000	1.000	N	0.292
329616	329617	lp_0469	lp_0471	bla1	prs1	FALSE	0.142	366.000	0.000	1.000	N	0.467
329617	329618	lp_0471	lp_0472	prs1		FALSE	0.002	288.000	0.000	NA		-0.028
329618	329619	lp_0472	lp_0473			TRUE	0.782	83.000	0.000	NA		0.557
329620	329621	lp_0475	lp_0476			TRUE	0.987	20.000	0.011	1.000		0.887
329621	329622	lp_0476	lp_0477			TRUE	0.868	15.000	0.082	0.033		0.265
329623	329624	lp_0479	lp_0480		rpoE	TRUE	0.787	45.000	0.122	NA		0.296
329624	329625	lp_0480	lp_0481	rpoE	pyrG	FALSE	0.366	173.000	0.029	1.000	N	0.404
329627	329628	lp_0483	lp_0484		rimK	TRUE	0.802	3.000	0.000	1.000		0.371
329628	329629	lp_0484	lp_0485	rimK		TRUE	0.979	-16.000	0.000	0.033		0.699
329629	329630	lp_0485	lp_0486			TRUE	0.967	0.000	0.000	0.015		0.604
329630	329631	lp_0486	lp_0487		argC1	TRUE	0.975	-3.000	0.000	1.000	N	0.635
329631	329632	lp_0487	lp_0488	argC1		TRUE	0.986	0.000	0.000	0.054	Y	0.695
329632	5937121	lp_0488	lp_0489		tkt1-N	TRUE	0.977	-10.000	0.000	NA		0.704
5937121	329633	lp_0489	lp_0490	tkt1-N		TRUE	0.963	-4.000	0.000	NA		0.582
329633	5937122	lp_0490	lp_0491		tkt1-C	TRUE	0.947	-22.000	0.000	NA		0.513
5937122	329634	lp_0491	lp_0492	tkt1-C		TRUE	0.870	8.000	0.000	NA		0.433
329634	329635	lp_0492	lp_0493			FALSE	0.176	-3.000	0.000	1.000		0.232
329637	329638	lp_0496	lp_0497		deoC	FALSE	0.064	32.000	0.000	NA		0.027
329638	329639	lp_0497	lp_0498	deoC		TRUE	0.938	69.000	0.000	1.000	N	0.828
329639	329640	lp_0498	lp_0499			TRUE	0.995	-3.000	0.464	1.000		0.742
329640	329641	lp_0499	lp_0500		rbsK1	TRUE	0.986	13.000	0.060	1.000		0.743
329641	329642	lp_0500	lp_0501	rbsK1	serS1	FALSE	0.204	696.000	0.000	1.000	N	0.618
329642	329643	lp_0501	lp_0502	serS1	sdaC	FALSE	0.001	352.000	0.000	1.000	N	0.091
329643	329644	lp_0502	lp_0505	sdaC	sdhB	FALSE	0.272	370.000	0.000	1.000		0.637
329644	329645	lp_0505	lp_0506	sdhB	sdhA	TRUE	0.994	19.000	0.324	0.001		0.710
329645	329646	lp_0506	lp_0507	sdhA		FALSE	0.510	151.000	0.000	NA		0.535
329646	329647	lp_0507	lp_0509			FALSE	0.001	579.000	0.000	NA		-0.015
329647	329648	lp_0509	lp_0510		murA1	FALSE	0.001	543.000	0.000	NA		-0.169
329648	329649	lp_0510	lp_0511	murA1	rho	TRUE	0.934	30.000	0.022	1.000	N	0.450
329649	329650	lp_0511	lp_0512	rho	rpmE	TRUE	0.859	127.000	0.049	1.000	N	0.667
329652	329653	lp_0514	lp_0515	srtA		FALSE	0.476	109.000	0.008	NA		0.385
329653	329654	lp_0515	lp_0516		htpX	TRUE	0.983	12.000	0.222	NA		0.565
329654	329655	lp_0516	lp_0517	htpX		TRUE	0.830	61.000	0.049	NA		0.430
329655	329656	lp_0517	lp_0518		murF	FALSE	0.322	222.000	0.078	NA		0.424
329656	329657	lp_0518	lp_0520	murF	rhe1	FALSE	0.402	255.000	0.021	1.000	N	0.521
329657	329658	lp_0520	lp_0522	rhe1	acpS	FALSE	0.177	1025.000	0.025	1.000	N	0.512
329658	329659	lp_0522	lp_0523	acpS	alr	TRUE	0.833	0.000	0.093	1.000	N	0.165
329659	329660	lp_0523	lp_0524	alr		FALSE	0.008	409.000	0.052	1.000	N	-0.242
329660	329661	lp_0524	lp_0525		kup1	FALSE	0.091	292.000	0.000	1.000	N	0.374
329662	329663	lp_0526	lp_0527	carB	carA	TRUE	0.983	-7.000	0.017	0.002	Y	0.526
329664	329665	lp_0528	lp_0529	argC2	argJ	TRUE	0.991	25.000	0.303	0.004	Y	0.535
329665	329666	lp_0529	lp_0530	argJ	argB	TRUE	0.983	16.000	0.067	0.004	Y	0.518
329666	329667	lp_0530	lp_0531	argB	argD	TRUE	0.991	-3.000	0.322	1.000	Y	0.503
329667	329668	lp_0531	lp_0532	argD	argF	TRUE	0.969	-7.000	0.000	1.000	Y	0.505
329668	329669	lp_0532	lp_0533	argF		FALSE	0.012	109.000	0.000	NA		-0.012
329670	329671	lp_0535	lp_0536			FALSE	0.009	155.000	0.059	NA		-0.162
329671	329672	lp_0536	lp_0537		ldhL1	FALSE	0.003	218.000	0.000	NA		-0.148
329673	329674	lp_0538	lp_0539	pth	mfd	TRUE	0.962	20.000	0.137	1.000	N	0.416
329674	329675	lp_0539	lp_0540	mfd		TRUE	0.764	175.000	0.033	1.000		0.817
329675	329676	lp_0540	lp_0541			TRUE	0.990	-3.000	0.034	1.000		0.860
329676	329677	lp_0541	lp_0542			TRUE	0.842	121.000	0.053	1.000	N	0.595
329677	329678	lp_0542	lp_0543			TRUE	0.891	125.000	0.134	1.000	N	0.651
329678	329679	lp_0543	lp_0545		mesJ	FALSE	0.015	284.000	0.031	1.000	N	0.011
329679	329680	lp_0545	lp_0546	mesJ	hprT	TRUE	0.919	20.000	0.000	0.054	N	0.440
329680	329681	lp_0546	lp_0547	hprT	ftsH	FALSE	0.664	79.000	0.000	1.000	N	0.437
329681	329682	lp_0547	lp_0548	ftsH	hsp33	FALSE	0.419	149.000	0.041	1.000	Y	0.270
329682	329683	lp_0548	lp_0549	hsp33		TRUE	0.985	0.000	0.034	1.000	N	0.657
329683	329684	lp_0549	lp_0550		lysS	FALSE	0.496	104.000	0.032	1.000	Y	0.225
329684	2208811	lp_0550	lp_rRNA01	lysS		FALSE	0.040	598.000	0.000	NA		NA
2208811	401548	lp_rRNA01	lp_tRNA02		tRNA-Ile	FALSE	0.470	85.000	0.000	NA		NA
401548	401549	lp_tRNA02	lp_tRNA03	tRNA-Ile	tRNA-Ala	FALSE	0.698	42.000	0.000	NA		NA
401549	2208812	lp_tRNA03	lp_rRNA02	tRNA-Ala		FALSE	0.201	162.000	0.000	NA		NA
2208812	2208813	lp_rRNA02	lp_rRNA03			FALSE	0.552	71.000	0.000	NA		NA
2208813	401550	lp_rRNA03	lp_tRNA04		tRNA-Asn	TRUE	0.825	5.000	0.000	NA		NA
401550	401551	lp_tRNA04	lp_tRNA05	tRNA-Asn	tRNA-Thr	FALSE	0.671	46.000	0.000	NA		NA
401551	329685	lp_tRNA05	lp_0551	tRNA-Thr	dtpT	FALSE	0.039	642.000	0.000	NA		NA
329685	329686	lp_0551	lp_0552	dtpT		TRUE	0.843	55.000	0.250	1.000		0.303
329686	401552	lp_0552	lp_tRNA06		tRNA-Tyr	FALSE	0.521	76.000	0.000	NA		NA
401552	401553	lp_tRNA06	lp_tRNA07	tRNA-Tyr	tRNA-Gln	TRUE	0.816	10.000	0.000	NA		NA
401553	329687	lp_tRNA07	lp_0554	tRNA-Gln		FALSE	0.072	321.000	0.000	NA		NA
329687	329688	lp_0554	lp_0555			FALSE	0.468	174.000	0.000	NA		0.568
329688	329689	lp_0555	lp_0556			TRUE	0.941	31.000	0.000	NA		0.581
329689	329690	lp_0556	lp_0557			TRUE	0.905	35.000	0.000	NA		0.525
329691	329692	lp_0558	lp_0559			FALSE	0.183	193.000	0.014	1.000	N	0.322
329693	329694	lp_0561	lp_0562	proC	nagA	FALSE	0.642	79.000	0.026	1.000	N	0.351
329694	329695	lp_0562	lp_0563	nagA		TRUE	0.990	15.000	0.125	1.000	N	0.708
329697	329698	lp_0565	lp_0566	nadC1	nadE	TRUE	0.942	0.000	0.194	0.003	Y	0.174
329698	329699	lp_0566	lp_0567	nadE	pacL2	FALSE	0.001	456.000	0.013	1.000	N	-0.111
329699	329700	lp_0567	lp_0568	pacL2		TRUE	0.825	55.000	0.159	NA		0.336
329700	329701	lp_0568	lp_0569		tex	FALSE	0.002	294.000	0.009	NA		-0.104
329701	329702	lp_0569	lp_0570	tex		TRUE	0.991	0.000	0.215	NA		0.706
329702	329703	lp_0570	lp_0571		hom2	TRUE	0.764	66.000	0.000	NA		0.478
329703	329704	lp_0571	lp_0572	hom2	thrB	TRUE	0.975	9.000	0.036	1.000	Y	0.496
329704	401554	lp_0572	lp_tRNA08	thrB	tRNA-Leu	FALSE	0.034	56.000	0.000	NA		-0.122
401554	329705	lp_tRNA08	lp_0574	tRNA-Leu		FALSE	0.101	229.000	0.000	NA		0.379
329705	329706	lp_0574	lp_0575		pts9AB	FALSE	0.002	291.000	0.000	NA		0.067
329706	329707	lp_0575	lp_0576	pts9AB	pts9C	TRUE	0.998	38.000	0.943	0.028	Y	0.976
329707	329708	lp_0576	lp_0577	pts9C	pts9D	TRUE	0.999	18.000	0.812	0.028	Y	0.958
329708	329709	lp_0577	lp_0578	pts9D	npsA	FALSE	0.072	128.000	0.000	1.000	N	0.231
329709	329710	lp_0578	lp_0579	npsA	panD	TRUE	0.966	23.000	0.000	1.000	N	0.603
329710	329711	lp_0579	lp_0580	panD		TRUE	0.791	-3.000	0.000	1.000	Y	0.227
329711	329712	lp_0580	lp_0581		npsB	TRUE	0.933	-7.000	0.000	0.032	N	0.445
329712	329713	lp_0581	lp_0582	npsB	npsC	TRUE	0.940	-3.000	0.000	1.000	N	0.478
329713	329714	lp_0582	lp_0583	npsC		FALSE	0.017	87.000	0.000	NA		-0.040
329714	329715	lp_0583	lp_0584			FALSE	0.010	123.000	0.000	NA		0.130
329715	329716	lp_0584	lp_0585			FALSE	0.023	72.000	0.000	0.089		0.044
329716	329717	lp_0585	lp_0586		pts10A	TRUE	0.893	71.000	0.000	0.035	N	0.616
329717	329718	lp_0586	lp_0587	pts10A	pts10B	TRUE	0.989	-3.000	0.000	0.028	Y	0.772
329718	329719	lp_0587	lp_0588	pts10B	fabH1	FALSE	0.237	164.000	0.000	1.000	N	0.390
329719	329720	lp_0588	lp_0589	fabH1	accB1	TRUE	0.982	11.000	0.000	NA	Y	0.702
329720	329721	lp_0589	lp_0590	accB1	accC1	TRUE	0.986	3.000	0.000	NA	Y	0.752
329721	329722	lp_0590	lp_0591	accC1	accD1	TRUE	0.986	-3.000	0.000	0.003	Y	0.655
329722	329723	lp_0591	lp_0592	accD1	accA1	TRUE	0.997	-7.000	0.234	0.003	Y	0.747
329725	329726	lp_0594	lp_0595	mleP1		FALSE	0.118	433.000	0.000	1.000		0.490
329726	329727	lp_0595	lp_0597		pgm2	FALSE	0.006	150.000	0.000	1.000		0.114
329727	329728	lp_0597	lp_0600	pgm2	zmp2	FALSE	0.001	420.000	0.000	1.000		0.197
329729	329730	lp_0601	lp_0602	pepC1	rpiA1	FALSE	0.472	76.000	0.008	1.000	N	0.268
329730	329731	lp_0602	lp_0603	rpiA1		TRUE	0.978	9.000	0.000	1.000		0.832
329732	329733	lp_0604	lp_0606	dut	radA	FALSE	0.003	889.000	0.028	1.000	N	-0.046
329733	329734	lp_0606	lp_0607	radA		TRUE	0.792	16.000	0.056	NA		0.238
329734	329735	lp_0607	lp_0609		gltX	FALSE	0.154	326.000	0.021	NA		0.423
329735	329736	lp_0609	lp_0610	gltX	cysS	FALSE	0.083	278.000	0.013	1.000	Y	0.163
329736	329737	lp_0610	lp_0611	cysS		TRUE	0.992	2.000	0.129	1.000		0.848
329737	329738	lp_0611	lp_0612		trmH	TRUE	0.993	-10.000	0.150	0.004		0.771
329738	329739	lp_0612	lp_0613	trmH		TRUE	0.989	2.000	0.109	NA		0.739
329739	329740	lp_0613	lp_0614		sigH	FALSE	0.346	507.000	0.021	NA		0.722
329740	329741	lp_0614	lp_0615	sigH	rpmG	TRUE	0.880	62.000	0.049	1.000	N	0.459
329741	329742	lp_0615	lp_0616	rpmG	secE	TRUE	0.913	12.000	0.080	1.000	N	0.337
329742	329743	lp_0616	lp_0617	secE	nusG	TRUE	0.762	105.000	0.843	1.000	N	0.179
329743	329744	lp_0617	lp_0618	nusG		TRUE	0.976	28.000	0.000	NA		0.850
329744	329745	lp_0618	lp_0619		rplK	FALSE	0.151	109.000	0.000	NA		0.298
329745	329746	lp_0619	lp_0620	rplK	rplA	TRUE	0.931	101.000	0.838	0.026	Y	0.377
329746	329747	lp_0620	lp_0621	rplA	rplJ	TRUE	0.908	199.000	0.302	0.026	Y	0.809
329747	329748	lp_0621	lp_0622	rplJ	rplL	TRUE	0.994	62.000	0.884	0.020	Y	0.737
329749	401618	lp_0624	lp_tRNA09		tRNA-Gly	FALSE	0.497	80.000	0.000	NA		NA
401618	329750	lp_tRNA09	lp_0625	tRNA-Gly		TRUE	0.789	30.000	0.000	NA		NA
329750	329751	lp_0625	lp_0627			FALSE	0.045	490.000	0.000	NA		NA
329751	401616	lp_0627	lp_tRNA10		tRNA-Ile	TRUE	0.809	26.000	0.000	NA		NA
401616	329752	lp_tRNA10	lp_0628	tRNA-Ile		TRUE	0.780	31.000	0.000	NA		NA
329752	329753	lp_0628	lp_0629			FALSE	0.070	30.000	0.000	NA		0.013
329753	329754	lp_0629	lp_0630			FALSE	0.023	73.000	0.000	NA		-0.042
329754	329755	lp_0630	lp_0631			TRUE	0.924	12.000	0.000	1.000		0.503
329757	329758	lp_0633	lp_0634			TRUE	0.933	38.000	0.000	NA		0.614
329759	329760	lp_0635	lp_0636			FALSE	0.459	159.000	0.000	NA		0.527
329760	329761	lp_0636	lp_0637			TRUE	0.848	61.000	0.000	NA		0.540
329761	329762	lp_0637	lp_0638			TRUE	0.948	6.000	0.000	NA		0.559
329762	329763	lp_0638	lp_0640			FALSE	0.308	321.000	0.000	NA		0.634
329763	329764	lp_0640	lp_0641			TRUE	0.961	-3.000	0.000	NA		0.574
329764	329765	lp_0641	lp_0642			TRUE	0.983	-76.000	0.500	0.056		0.419
329765	329766	lp_0642	lp_0643			TRUE	0.938	82.000	0.154	NA		0.642
329766	329767	lp_0643	lp_0644			TRUE	0.978	-3.000	0.000	NA		0.739
329767	329768	lp_0644	lp_0645			TRUE	0.849	-3.000	0.000	NA		NA
329768	329769	lp_0645	lp_0646			TRUE	0.946	-3.000	0.000	NA		0.524
329769	329770	lp_0646	lp_0647			TRUE	0.927	-7.000	0.000	NA		0.470
329770	329771	lp_0647	lp_0648			TRUE	0.892	-3.000	0.000	NA		0.432
329771	329772	lp_0648	lp_0649			TRUE	0.961	3.000	0.000	NA		0.600
329772	329773	lp_0649	lp_0650			TRUE	0.955	-3.000	0.000	NA		0.552
329773	329774	lp_0650	lp_0651			TRUE	0.912	0.000	0.000	NA		0.461
329774	329775	lp_0651	lp_0652			TRUE	0.758	14.000	0.000	NA		0.357
329775	329776	lp_0652	lp_0653			FALSE	0.685	-7.000	0.000	NA		0.307
329776	329777	lp_0653	lp_0654			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		0.528
329777	329778	lp_0654	lp_0655			TRUE	0.929	-3.000	0.000	NA		0.483
329778	329779	lp_0655	lp_0656			FALSE	0.040	128.000	0.000	NA		0.247
329779	401555	lp_0656	lp_tRNA11		tRNA-Asn	FALSE	0.319	124.000	0.000	NA		NA
401555	329780	lp_tRNA11	lp_0658	tRNA-Asn		FALSE	0.169	176.000	0.000	NA		NA
329780	329781	lp_0658	lp_0659			FALSE	0.026	68.000	0.000	NA		-0.011
329781	329782	lp_0659	lp_0660			TRUE	0.850	40.000	0.000	NA		0.481
329782	329783	lp_0660	lp_0661			TRUE	0.973	-16.000	0.000	0.002		0.618
329783	329784	lp_0661	lp_0662			TRUE	0.993	-10.000	0.429	NA		0.602
329784	329785	lp_0662	lp_0663			TRUE	0.993	0.000	0.571	NA		0.606
329785	329786	lp_0663	lp_0664			FALSE	0.662	108.000	0.000	NA		0.532
329786	329787	lp_0664	lp_0665			TRUE	0.954	14.000	0.115	NA		0.436
329787	329788	lp_0665	lp_0666			TRUE	0.992	15.000	0.750	NA		0.540
329788	329789	lp_0666	lp_0667			TRUE	0.993	5.000	0.750	NA		0.578
329789	329790	lp_0667	lp_0668			TRUE	0.994	-10.000	0.500	NA		0.619
329790	329791	lp_0668	lp_0669			TRUE	0.985	1.000	0.333	NA		0.520
329791	329792	lp_0669	lp_0670			TRUE	0.992	12.000	0.500	NA		0.635
329792	329793	lp_0670	lp_0671			TRUE	0.988	18.000	0.235	NA		0.596
329793	329794	lp_0671	lp_0672			FALSE	0.691	69.000	0.000	NA		0.444
329794	329795	lp_0672	lp_0673			TRUE	0.940	0.000	0.000	NA		0.514
329795	329796	lp_0673	lp_0674			TRUE	0.934	-6.000	0.000	NA		0.490
329796	329797	lp_0674	lp_0675			FALSE	0.350	0.000	0.000	1.000		0.246
329797	329798	lp_0675	lp_0676			TRUE	0.963	5.000	0.000	1.000	N	0.588
329798	329799	lp_0676	lp_0677			TRUE	0.961	15.000	0.000	NA		0.614
329799	329800	lp_0677	lp_0678			TRUE	0.918	6.000	0.000	NA		0.489
329800	329801	lp_0678	lp_0679			TRUE	0.961	1.000	0.000	NA		0.590
329801	329802	lp_0679	lp_0680			TRUE	0.972	0.000	0.000	NA		0.671
329802	329803	lp_0680	lp_0681			TRUE	0.952	-22.000	0.000	NA		0.529
329803	329804	lp_0681	lp_0682			TRUE	0.877	1.000	0.000	NA		0.424
329804	329805	lp_0682	lp_0683			TRUE	0.802	-13.000	0.000	NA		0.357
5937123	5937124	lp_0686	lp_0687			TRUE	0.941	57.000	0.000	NA		0.809
329807	329808	lp_0688	lp_0689			TRUE	0.962	13.000	0.000	1.000		0.624
329810	329811	lp_0691	lp_0692		nrdF	TRUE	0.903	82.000	0.000	NA		0.833
329811	329812	lp_0692	lp_0693	nrdF	nrdE	TRUE	0.997	28.000	0.500	0.001	Y	0.805
329812	329813	lp_0693	lp_0694	nrdE	nrdH	TRUE	0.913	139.000	0.562	1.000	N	0.574
329814	329815	lp_0695	lp_0696	rsmc		TRUE	0.976	3.000	0.015	1.000	Y	0.513
329815	329816	lp_0696	lp_0698		dnaX	FALSE	0.013	527.000	0.018	1.000	N	0.130
329816	329817	lp_0698	lp_0699	dnaX		TRUE	0.975	22.000	0.100	NA		0.530
329817	329818	lp_0699	lp_0700		recR	TRUE	0.995	16.000	0.604	NA		0.750
329818	329819	lp_0700	lp_0701	recR		TRUE	0.981	15.000	0.071	NA		0.618
329819	329820	lp_0701	lp_0703		tmk	FALSE	0.001	398.000	0.016	NA		-0.219
329820	329821	lp_0703	lp_0704	tmk		TRUE	0.977	-3.000	0.033	NA		0.575
329821	329822	lp_0704	lp_0705		holB	TRUE	0.962	17.000	0.040	NA		0.507
329822	329823	lp_0705	lp_0706	holB		TRUE	0.913	25.000	0.038	NA		0.403
329823	329824	lp_0706	lp_0707			TRUE	0.853	99.000	0.043	NA		0.585
329824	329825	lp_0707	lp_0708		fat	TRUE	0.971	4.000	0.021	1.000		0.576
329825	329826	lp_0708	lp_0709	fat	galE1	FALSE	0.097	139.000	0.000	1.000	N	0.251
329827	329828	lp_0710	lp_0711	phnW	phnX	TRUE	0.906	22.000	0.315	0.064		0.174
329828	329829	lp_0711	lp_0712	phnX	phnE1	TRUE	0.970	25.000	0.012	1.000		0.605
329829	329830	lp_0712	lp_0713	phnE1	phnE2	TRUE	0.997	-3.000	0.800	1.000	Y	0.572
329830	329831	lp_0713	lp_0714	phnE2	phnC	TRUE	0.992	5.000	0.217	0.001	Y	0.566
329831	329832	lp_0714	lp_0715	phnC	phnD	TRUE	0.966	38.000	0.117	0.001	Y	0.456
329833	329834	lp_0717	lp_0718	gpp	rimI1	TRUE	0.906	81.000	0.026	1.000		0.653
329834	329835	lp_0718	lp_0720	rimI1	rimI2	TRUE	0.898	-7.000	0.013	0.001		0.354
329835	329836	lp_0720	lp_0721	rimI2	gcp	FALSE	0.627	5.000	0.030	1.000		0.181
329840	329841	lp_0727	lp_0728	groES	groEL	TRUE	0.989	56.000	0.160	0.007	Y	0.861
329841	329842	lp_0728	lp_0729	groEL		FALSE	0.006	250.000	0.000	1.000	N	0.189
329842	329843	lp_0729	lp_0730		tagO	FALSE	0.267	216.000	0.019	1.000	N	0.407
329843	329844	lp_0730	lp_0733	tagO	pstF	FALSE	0.008	325.000	0.000	1.000	N	0.206
329846	329847	lp_0735	lp_0736	comFA	comFC	TRUE	0.983	-40.000	0.130	1.000		0.541
329847	329848	lp_0736	lp_0737	comFC		FALSE	0.136	134.000	0.080	NA		0.101
329848	329849	lp_0737	lp_0739		secA	FALSE	0.006	387.000	0.041	NA	N	-0.136
329849	329850	lp_0739	lp_0740	secA	prfB-N	FALSE	0.707	106.000	0.000	NA		0.560
329850	329851	lp_0740	lp_0741	prfB-N	prfB-C	TRUE	0.985	-31.000	0.000	NA		0.884
329851	329852	lp_0741	lp_0742	prfB-C		FALSE	0.254	184.000	0.002	1.000		0.410
329852	329853	lp_0742	lp_0743		rrp3	TRUE	0.988	0.000	0.188	1.000		0.603
329853	329854	lp_0743	lp_0744	rrp3	hpk3	TRUE	0.991	-7.000	0.164	1.000	Y	0.548
329854	329855	lp_0744	lp_0746	hpk3	pstE	FALSE	0.107	344.000	0.217	1.000	N	0.183
329855	329856	lp_0746	lp_0747	pstE	pstD	TRUE	0.995	11.000	0.206	1.000	Y	0.744
329856	329857	lp_0747	lp_0748	pstD	pstC	TRUE	0.999	-10.000	0.907	0.003	Y	0.882
329857	329858	lp_0748	lp_0749	pstC	pstB	TRUE	0.980	15.000	0.490	0.003	Y	0.336
329858	329859	lp_0749	lp_0750	pstB	pstA	TRUE	0.990	12.000	0.542	0.001	Y	0.447
329859	329860	lp_0750	lp_0751	pstA	phoU	TRUE	0.974	13.000	0.413	NA	Y	0.313
329860	329861	lp_0751	lp_0752	phoU		FALSE	0.309	100.000	0.027	NA	N	0.211
329861	329862	lp_0752	lp_0753			TRUE	0.906	22.000	0.103	NA		0.323
329862	329863	lp_0753	lp_0754		hprK	FALSE	0.614	146.000	0.215	NA		0.400
329863	329864	lp_0754	lp_0755	hprK	lgt	TRUE	0.994	19.000	0.494	1.000	N	0.623
329864	329865	lp_0755	lp_0756	lgt	gspA	TRUE	0.991	18.000	0.067	1.000	N	0.844
329865	329866	lp_0756	lp_0757	gspA	galU	TRUE	0.857	44.000	0.035	1.000	N	0.400
329868	329869	lp_0760	lp_0761	nox1	trxB1	FALSE	0.003	193.000	0.000	0.029		0.093
329870	329871	lp_0762	lp_0763			TRUE	0.985	1.000	0.083	NA		0.642
329876	329877	lp_0770	lp_0771			FALSE	0.012	106.000	0.000	1.000		0.178
329877	329878	lp_0771	lp_0772		uvrB	FALSE	0.232	149.000	0.002	1.000		0.334
329878	329879	lp_0772	lp_0773	uvrB	uvrA1	TRUE	0.990	35.000	0.154	0.001	Y	0.655
329879	329880	lp_0773	lp_0774	uvrA1	luxS	TRUE	0.848	61.000	0.002	1.000	N	0.466
329880	329881	lp_0774	lp_0775	luxS	argG	FALSE	0.011	338.000	0.000	1.000	N	0.225
329881	329882	lp_0775	lp_0776	argG	argH	TRUE	0.996	0.000	0.278	1.000	Y	0.796
329882	329883	lp_0776	lp_0778	argH		FALSE	0.003	202.000	0.000	NA		0.077
329883	329884	lp_0778	lp_0779			FALSE	0.023	197.000	0.081	NA		-0.108
329884	329885	lp_0779	lp_0780			TRUE	0.992	-3.000	0.214	NA		0.735
329885	329886	lp_0780	lp_0781			TRUE	0.949	13.000	0.470	NA		0.283
329886	329887	lp_0781	lp_0783			FALSE	0.017	425.000	0.000	NA		0.299
329888	329889	lp_0785	lp_0786	serA2	clpP	FALSE	0.005	159.000	0.000	1.000	N	0.179
329889	401615	lp_0786	lp_tRNA12	clpP	tRNA-Arg	FALSE	0.001	816.000	0.000	NA		0.031
329890	329891	lp_0787	lp_0788	rpoN	cggR	FALSE	0.089	217.000	0.050	1.000	Y	-0.095
329891	329892	lp_0788	lp_0789	cggR	gapB	FALSE	0.430	67.000	0.109	1.000	N	0.005
329892	329893	lp_0789	lp_0790	gapB	pgk	TRUE	0.905	121.000	0.013	0.006	Y	0.695
329893	329894	lp_0790	lp_0791	pgk	tpiA	TRUE	0.994	27.000	0.141	1.000	Y	0.817
329894	329895	lp_0791	lp_0792	tpiA	enoA1	TRUE	0.961	82.000	0.018	1.000	Y	0.837
329895	329896	lp_0792	lp_0793	enoA1		FALSE	0.002	291.000	0.000	NA		0.082
329896	329897	lp_0793	lp_0794		eriC	FALSE	0.089	17.000	0.000	NA		0.142
329897	329898	lp_0794	lp_0795	eriC	secG	FALSE	0.525	100.000	0.002	1.000	N	0.367
329898	329899	lp_0795	lp_0796	secG		TRUE	0.889	49.000	0.007	1.000		0.505
329899	329900	lp_0796	lp_0797			TRUE	0.852	9.000	0.015	1.000		0.351
329900	329901	lp_0797	lp_0799		smpB	TRUE	0.966	26.000	0.143	0.022	N	0.444
329901	329902	lp_0799	lp_0800	smpB		FALSE	0.001	460.000	0.000	1.000		-0.299
329902	329903	lp_0800	lp_0802		glnPH1	FALSE	0.001	393.000	0.000	1.000		-0.047
329903	329904	lp_0802	lp_0803	glnPH1	glnQ1	TRUE	0.985	3.000	0.000	1.000	Y	0.710
329905	329906	lp_0804	lp_0805			TRUE	0.991	24.000	0.182	NA		0.798
329907	329908	lp_0806	lp_0807	ung	pta	TRUE	0.951	24.000	0.092	1.000	N	0.416
329908	329909	lp_0807	lp_0809	pta		FALSE	0.011	110.000	0.023	NA		-0.179
329909	329910	lp_0809	lp_0810			TRUE	0.975	6.000	0.033	NA		0.600
329911	329912	lp_0811	lp_0812		exoA	FALSE	0.390	78.000	0.011	0.054	Y	0.045
329913	329914	lp_0813	lp_0814		murB	FALSE	0.072	172.000	0.009	1.000		0.227
329914	329915	lp_0814	lp_0815	murB		TRUE	0.976	34.000	0.014	1.000	N	0.720
329915	329916	lp_0815	lp_0816			FALSE	0.008	139.000	0.000	1.000	N	-0.357
329918	329919	lp_0818	lp_0819			TRUE	0.995	-3.000	0.502	NA		0.709
329919	329920	lp_0819	lp_0820		glmM	TRUE	0.966	32.000	0.150	NA		0.513
329920	329921	lp_0820	lp_0822	glmM	glmS1	FALSE	0.006	538.000	0.030	1.000	N	0.006
329921	329922	lp_0822	lp_0823	glmS1		FALSE	0.384	194.000	0.000	NA	N	0.521
329922	329923	lp_0823	lp_0824			FALSE	0.066	131.000	0.000	NA		0.263
329924	329925	lp_0825	lp_0826		galM1	FALSE	0.118	336.000	0.000	1.000		0.456
329926	329927	lp_0827	lp_0828			FALSE	0.025	246.000	0.000	NA		0.273
329927	329928	lp_0828	lp_0829			FALSE	0.124	1.000	0.000	NA		0.232
329928	5937125	lp_0829	lp_0830			FALSE	0.002	294.000	0.000	NA		0.034
5937125	5937126	lp_0830	lp_0831			TRUE	0.953	13.000	0.000	NA		0.577
329930	401556	lp_0835	lp_tRNA13		tRNA-Asn	FALSE	0.705	98.000	0.000	NA		0.533
401556	329931	lp_tRNA13	lp_0836	tRNA-Asn	nrpR1	FALSE	0.062	225.000	0.000	NA		0.331
329931	329932	lp_0836	lp_0837	nrpR1		FALSE	0.002	269.000	0.000	NA		0.082
329933	329934	lp_0838	lp_0840			FALSE	0.011	116.000	0.000	NA		-0.233
329934	329935	lp_0840	lp_0841		ppx2	FALSE	0.006	149.000	0.000	1.000		-0.105
329935	329936	lp_0841	lp_0842	ppx2	ppk	TRUE	0.990	3.000	0.015	1.000	Y	0.740
329936	329937	lp_0842	lp_0843	ppk	ppx3	TRUE	0.993	1.000	0.093	1.000	Y	0.693
329937	329938	lp_0843	lp_0844	ppx3	licD	FALSE	0.002	325.000	0.000	NA	N	-0.100
329941	329942	lp_0848	lp_0849		pox1	FALSE	0.001	618.000	0.000	1.000		-0.608
329942	329943	lp_0849	lp_0850	pox1	ribC1	TRUE	0.859	141.000	0.000	1.000	Y	0.812
329943	329944	lp_0850	lp_0852	ribC1	pox2	FALSE	0.009	329.000	0.000	1.000	Y	0.037
329946	329947	lp_0854	lp_0856	birA2		FALSE	0.056	422.000	0.000	1.000	N	0.371
329950	329951	lp_0860	lp_0861			FALSE	0.006	151.000	0.000	NA		-0.022
329952	329953	lp_0862	lp_0863		pdx	FALSE	0.139	364.000	0.000	1.000		0.493
329953	329954	lp_0863	lp_0864	pdx		TRUE	0.775	54.000	0.000	1.000	N	0.434
329956	329957	lp_0866	lp_0868	gmk2		FALSE	0.241	111.000	0.003	1.000	N	0.237
329957	329958	lp_0868	lp_0869			FALSE	0.588	133.000	0.071	NA		0.427
329958	329959	lp_0869	lp_0871			TRUE	0.973	4.000	0.667	NA		0.351
329963	329964	lp_0878	lp_0881	glnQ2	glnH1	TRUE	0.984	21.000	0.111	0.061	Y	0.496
329964	329965	lp_0881	lp_0882	glnH1	glnM	TRUE	0.989	0.000	0.080	0.061	Y	0.574
329965	329966	lp_0882	lp_0883	glnM	glnP	TRUE	0.998	17.000	0.947	0.008	Y	0.706
329966	329967	lp_0883	lp_0884	glnP	pts11A	FALSE	0.002	261.000	0.000	1.000	N	-0.304
329967	329968	lp_0884	lp_0885	pts11A	bglG1	TRUE	0.877	26.000	0.250	1.000		0.190
329968	329969	lp_0885	lp_0886	bglG1	pts11BC	TRUE	0.961	28.000	0.375	1.000		0.386
329969	329970	lp_0886	lp_0887	pts11BC		TRUE	0.986	7.000	0.500	1.000		0.505
329971	329972	lp_0888	lp_0889			FALSE	0.002	271.000	0.000	1.000	N	0.110
329973	329974	lp_0891	lp_0892			FALSE	0.195	137.000	0.000	1.000		0.348
329974	329975	lp_0892	lp_0893			TRUE	0.966	-3.000	0.000	1.000	N	0.571
329979	329980	lp_0897	lp_0898		sugE	FALSE	0.007	142.000	0.000	1.000	N	-0.115
329980	329981	lp_0898	lp_0899	sugE		FALSE	0.002	306.000	0.000	NA		0.215
329982	329983	lp_0900	lp_0901	pgm3	pgm4	TRUE	0.932	15.000	0.000	0.004	Y	0.409
329983	329984	lp_0901	lp_0902	pgm4	napA2	TRUE	0.938	71.000	0.000	1.000	N	0.863
329984	329985	lp_0902	lp_0903	napA2		TRUE	0.979	22.000	0.000	1.000		0.807
329986	329987	lp_0904	lp_0905	bglG2	pts12BCA	TRUE	0.986	12.000	0.409	1.000		0.530
329987	329988	lp_0905	lp_0906	pts12BCA	pbg2	TRUE	0.985	15.000	0.182	1.000	Y	0.492
329990	329991	lp_0910	lp_0911		ISP2	FALSE	0.005	169.000	0.000	0.054		-0.436
329991	329992	lp_0911	lp_0912	ISP2		FALSE	0.451	160.000	0.000	1.000		0.523
329992	329993	lp_0912	lp_0913		coaA	FALSE	0.005	169.000	0.000	1.000		0.055
329993	329994	lp_0913	lp_0914	coaA	guaA	FALSE	0.558	94.000	0.006	0.051	N	0.354
329995	329996	lp_0915	lp_0917			FALSE	0.003	234.000	0.000	1.000		-0.030
329997	329998	lp_0918	lp_0919			FALSE	0.002	302.000	0.000	NA		0.202
329998	329999	lp_0919	lp_0921			FALSE	0.003	220.000	0.000	NA		-0.121
330001	330002	lp_0923	lp_0924			FALSE	0.001	485.000	0.000	NA		0.214
330002	330003	lp_0924	lp_0925			TRUE	0.930	-10.000	0.351	NA		0.194
330003	330004	lp_0925	lp_0926			FALSE	0.002	242.000	0.000	1.000		0.102
330004	330005	lp_0926	lp_0927			TRUE	0.973	12.000	0.000	NA		0.739
330005	330006	lp_0927	lp_0928			TRUE	0.980	13.000	0.000	NA		0.893
330006	330007	lp_0928	lp_0929		asp1	TRUE	0.981	15.000	0.000	NA		0.940
330007	330008	lp_0929	lp_0930	asp1	asp2	TRUE	0.997	22.000	0.667	NA		0.893
330008	330009	lp_0930	lp_0931	asp2	hpaG	FALSE	0.038	174.000	0.000	NA		0.267
330009	330010	lp_0931	lp_0932	hpaG		FALSE	0.690	122.000	0.000	NA		0.584
330010	330011	lp_0932	lp_0934			FALSE	0.002	316.000	0.000	NA		0.195
330011	330012	lp_0934	lp_0935			FALSE	0.731	107.000	0.000	NA		0.583
330012	330013	lp_0935	lp_0937		pepN	FALSE	0.004	182.000	0.000	NA		0.164
330013	330014	lp_0937	lp_0938	pepN	hsdR	FALSE	0.003	228.000	0.000	1.000	N	0.143
330014	330015	lp_0938	lp_0939	hsdR	hsdM	TRUE	0.991	14.000	0.083	0.054	Y	0.635
330015	330016	lp_0939	lp_0940	hsdM	hsdS1	TRUE	0.990	-3.000	0.022	0.054	Y	0.635
330016	330017	lp_0940	lp_0941	hsdS1		FALSE	0.465	152.000	0.125	0.054	N	0.325
330018	330019	lp_0945	lp_0946			FALSE	0.355	124.000	0.000	NA		0.410
330020	330021	lp_0947	lp_0948			FALSE	0.016	89.000	0.000	NA		0.196
330021	330022	lp_0948	lp_0949			FALSE	0.475	69.000	0.000	1.000		0.357
330022	330023	lp_0949	lp_0950			TRUE	0.861	100.000	0.000	0.025	Y	0.582
330026	330027	lp_0954	lp_0955			FALSE	0.289	109.000	0.058	1.000		0.212
330027	330028	lp_0955	lp_0956		asnS1	FALSE	0.004	171.000	0.000	1.000	N	0.118
330028	330029	lp_0956	lp_0957	asnS1	asnA	TRUE	0.932	77.000	0.021	0.051	N	0.682
330029	330030	lp_0957	lp_0959	asnA	pepD3	FALSE	0.086	453.000	0.000	1.000	Y	0.360
330030	330031	lp_0959	lp_0960	pepD3		FALSE	0.545	36.000	0.000	1.000		0.312
330032	330033	lp_0961	lp_0962		recQ1	FALSE	0.002	258.000	0.000	1.000		-0.083
330033	330034	lp_0962	lp_0963	recQ1	rluE	FALSE	0.043	43.000	0.000	1.000	N	-0.066
330036	330037	lp_0966	lp_0967			FALSE	0.001	420.000	0.000	NA		0.102
330037	330038	lp_0967	lp_0968			FALSE	0.110	-36.000	0.000	NA		0.123
330038	330039	lp_0968	lp_0969			TRUE	0.994	-3.000	0.957	NA		0.551
330039	330040	lp_0969	lp_0970			FALSE	0.102	-3.000	0.000	NA		0.097
330040	330041	lp_0970	lp_0971			FALSE	0.282	132.000	0.000	1.000		0.385
330042	330043	lp_0972	lp_0973			FALSE	0.007	144.000	0.000	NA		-0.079
330043	330044	lp_0973	lp_0975		xylP2	TRUE	0.905	-13.000	0.033	1.000	N	0.321
330044	330045	lp_0975	lp_0977	xylP2	murE1	FALSE	0.001	329.000	0.000	1.000	N	-0.363
330045	330046	lp_0977	lp_0979	murE1	thrA1	TRUE	0.930	24.000	0.000	1.000	N	0.485
330046	330047	lp_0979	lp_0980	thrA1	asnB1	FALSE	0.548	5.000	0.000	1.000	Y	0.115
330047	330048	lp_0980	lp_0981	asnB1		FALSE	0.001	471.000	0.000	NA		0.210
330048	330049	lp_0981	lp_0982			TRUE	0.972	-3.000	0.338	NA		0.394
330050	330051	lp_0984	lp_0988			FALSE	0.031	985.000	0.000	NA		0.377
330052	330053	lp_0989	lp_0990			FALSE	0.104	330.000	0.000	NA		0.439
330053	330054	lp_0990	lp_0991			TRUE	0.997	0.000	0.600	NA		0.887
330056	330057	lp_0994	lp_0995			FALSE	0.011	115.000	0.000	NA		0.035
330058	330059	lp_0996	lp_0997		cspC	FALSE	0.041	252.000	0.000	0.091	Y	0.130
330059	330060	lp_0997	lp_0998	cspC		FALSE	0.005	169.000	0.000	NA		0.011
330060	330061	lp_0998	lp_0999			TRUE	0.945	34.000	0.067	NA		0.494
330065	330066	lp_1003	lp_1004			FALSE	0.082	12.000	0.000	NA	N	0.013
330066	330067	lp_1004	lp_1005		als	FALSE	0.139	186.000	0.000	NA	N	0.355
330067	330068	lp_1005	lp_1008	als	lysP	FALSE	0.057	384.000	0.000	1.000	Y	0.270
330068	330069	lp_1008	lp_1010	lysP	dacB	FALSE	0.082	346.000	0.000	1.000	N	0.394
330069	330070	lp_1010	lp_1011	dacB	dgk1	FALSE	0.378	396.000	0.043	1.000	N	0.599
330070	330071	lp_1011	lp_1012	dgk1	serS2	FALSE	0.002	283.000	0.000	1.000	N	-0.001
330071	401557	lp_1012	lp_tRNA14	serS2	tRNA-Leu	FALSE	0.054	417.000	0.000	NA		0.395
401557	401558	lp_tRNA14	lp_tRNA15	tRNA-Leu	tRNA-Thr	TRUE	0.829	4.000	0.000	NA		NA
401558	401559	lp_tRNA15	lp_tRNA16	tRNA-Thr	tRNA-Gly	TRUE	0.815	25.000	0.000	NA		NA
401559	401560	lp_tRNA16	lp_tRNA17	tRNA-Gly	tRNA-Leu	TRUE	0.817	9.000	0.000	NA		NA
401560	401561	lp_tRNA17	lp_tRNA18	tRNA-Leu	tRNA-Arg	TRUE	0.816	11.000	0.000	NA		NA
401561	401562	lp_tRNA18	lp_tRNA19	tRNA-Arg	tRNA-Pro	TRUE	0.818	8.000	0.000	NA		NA
401562	401563	lp_tRNA19	lp_tRNA20	tRNA-Pro	tRNA-Pro	FALSE	0.655	51.000	0.000	NA		NA
401563	330072	lp_tRNA20	lp_1018	tRNA-Pro	ctsR	FALSE	0.045	489.000	0.000	NA		NA
330072	330073	lp_1018	lp_1019	ctsR	clpC	TRUE	0.985	19.000	0.188	NA	N	0.539
330073	330074	lp_1019	lp_1020	clpC		FALSE	0.155	169.000	0.000	1.000	N	0.340
330074	330075	lp_1020	lp_1021		rpoB	FALSE	0.002	247.000	0.000	1.000	Y	-0.440
330075	330076	lp_1021	lp_1022	rpoB	rpoC	TRUE	0.999	18.000	0.851	0.002	Y	0.849
330078	330079	lp_1025	lp_1026	rpsL	rpsG	TRUE	0.996	17.000	0.224	0.003	Y	0.784
330079	330080	lp_1026	lp_1027	rpsG	fusA2	TRUE	0.969	142.000	0.579	1.000	Y	0.822
330080	330081	lp_1027	lp_1032	fusA2	rpsJ	FALSE	0.408	951.000	0.014	1.000	Y	0.696
330081	330082	lp_1032	lp_1033	rpsJ	rplC	TRUE	0.996	38.000	0.467	0.025	Y	0.943
330082	330083	lp_1033	lp_1034	rplC	rplD	TRUE	0.998	19.000	0.544	0.019	Y	0.963
330083	330084	lp_1034	lp_1035	rplD	rplW	TRUE	0.997	0.000	0.307	0.019	Y	0.971
330084	330085	lp_1035	lp_1036	rplW	rplB	TRUE	0.998	24.000	0.849	0.022	Y	0.937
330085	330086	lp_1036	lp_1038	rplB	rpsS	TRUE	0.997	43.000	0.820	0.025	Y	0.915
330086	330087	lp_1038	lp_1039	rpsS	rplV	TRUE	0.998	21.000	0.769	0.025	Y	0.919
330087	330088	lp_1039	lp_1040	rplV	rpsC	TRUE	0.998	13.000	0.719	0.025	Y	0.803
330088	330089	lp_1040	lp_1041	rpsC	rplP	TRUE	0.999	3.000	0.828	0.025	Y	0.957
330089	330090	lp_1041	lp_1043	rplP	rpmC	TRUE	0.999	-10.000	0.802	0.019	Y	0.880
330090	330091	lp_1043	lp_1044	rpmC	rpsQ	TRUE	0.998	23.000	0.828	0.019	Y	0.933
330091	330092	lp_1044	lp_1045	rpsQ	rplN	TRUE	0.997	43.000	0.791	0.025	Y	0.930
330092	330093	lp_1045	lp_1046	rplN	rplX	TRUE	0.998	34.000	0.810	0.025	Y	0.964
330093	330094	lp_1046	lp_1047	rplX	rplE	TRUE	0.998	29.000	0.758	0.019	Y	0.964
330094	330095	lp_1047	lp_1048	rplE	rpsN	TRUE	0.998	21.000	0.496	0.019	Y	0.952
330095	330096	lp_1048	lp_1050	rpsN	rpsH	TRUE	0.996	34.000	0.473	0.019	Y	0.863
330096	330097	lp_1050	lp_1051	rpsH	rplF	TRUE	0.998	30.000	0.808	0.019	Y	0.953
330097	330098	lp_1051	lp_1052	rplF	rplR	TRUE	0.998	35.000	0.815	0.019	Y	0.952
330098	330099	lp_1052	lp_1053	rplR	rpsE	TRUE	0.999	21.000	0.814	0.025	Y	0.921
330099	330100	lp_1053	lp_1054	rpsE	rpmD	TRUE	0.998	15.000	0.789	0.025	Y	0.937
330100	330101	lp_1054	lp_1055	rpmD	rplO	TRUE	0.996	32.000	0.653	0.003	Y	0.641
330101	330102	lp_1055	lp_1056	rplO	secY	TRUE	0.997	2.000	0.730	1.000	N	0.915
330102	330103	lp_1056	lp_1058	secY	adk	TRUE	0.983	64.000	0.241	1.000	N	0.870
330103	330104	lp_1058	lp_1059	adk	infA	TRUE	0.755	175.000	0.059	1.000	N	0.681
330104	330105	lp_1059	lp_1059a	infA	rpmJ	TRUE	0.990	37.000	0.067	1.000	Y	0.914
330105	330106	lp_1059a	lp_1060	rpmJ	rpsM	TRUE	0.994	28.000	0.086	0.019	Y	0.849
330106	330107	lp_1060	lp_1061	rpsM	rpsK	TRUE	0.998	25.000	0.810	0.019	Y	0.922
330107	330108	lp_1061	lp_1062	rpsK	rpoA	TRUE	0.974	87.000	0.308	1.000	N	0.880
330108	330109	lp_1062	lp_1063	rpoA	rplQ	TRUE	0.998	22.000	0.873	1.000	N	0.838
330110	330111	lp_1064	lp_1066	ISP1	hepB1	FALSE	0.062	308.000	0.000	1.000	N	0.340
330111	330112	lp_1066	lp_1067	hepB1		TRUE	0.990	6.000	0.118	NA		0.818
330112	330113	lp_1067	lp_1068			TRUE	0.988	4.000	0.026	NA		0.890
330113	330114	lp_1068	lp_1069		ndh2	FALSE	0.604	95.000	0.052	NA		0.370
330115	330116	lp_1070	lp_1072		apbE1	FALSE	0.001	340.000	0.000	1.000		0.199
330116	330117	lp_1072	lp_1073	apbE1		TRUE	0.799	83.000	0.000	1.000	N	0.545
330117	330118	lp_1073	lp_1074			TRUE	0.998	-24.000	0.713	0.025	Y	0.715
330118	330119	lp_1074	lp_1075			TRUE	0.993	-10.000	0.136	1.000	Y	0.602
330119	330120	lp_1075	lp_1076		truA	TRUE	0.968	65.000	0.085	1.000	N	0.767
330120	330121	lp_1076	lp_1077	truA	rplM	TRUE	0.808	109.000	0.052	1.000	Y	0.450
330121	330122	lp_1077	lp_1078	rplM	rpsI	TRUE	0.998	14.000	0.601	0.019	Y	0.920
330123	330124	lp_1079	lp_1081			FALSE	0.001	417.000	0.000	NA		-0.234
330125	330126	lp_1082	lp_1083		tkt2	FALSE	0.048	878.000	0.000	0.062	N	0.380
330126	330127	lp_1083	lp_1084	tkt2	aroD1	TRUE	0.980	20.000	0.000	1.000	N	0.747
330127	330128	lp_1084	lp_1085	aroD1	aroA	TRUE	0.989	41.000	0.121	1.000	Y	0.792
330128	330129	lp_1085	lp_1086	aroA	aroB	TRUE	0.988	4.000	0.007	0.003	Y	0.674
330130	330131	lp_1087	lp_1088			FALSE	0.013	104.000	0.000	NA		0.160
330131	330132	lp_1088	lp_1089		ttdB	FALSE	0.185	64.000	0.000	NA		0.261
330132	330133	lp_1089	lp_1090	ttdB	ttdA	TRUE	0.987	-3.000	0.667	1.000	Y	0.352
330133	330134	lp_1090	lp_1092	ttdA		FALSE	0.047	266.000	0.000	1.000	N	0.289
330135	330136	lp_1093	lp_1095	citG	mtsC	FALSE	0.002	313.000	0.000	1.000	N	-0.200
330136	330137	lp_1095	lp_1096	mtsC	mtsB	TRUE	0.995	-3.000	0.152	1.000	Y	0.763
330137	330138	lp_1096	lp_1097	mtsB	mtsA	TRUE	0.995	-3.000	0.135	1.000	Y	0.768
330140	330141	lp_1101	lp_1102	ldhL2		TRUE	0.978	32.000	0.000	1.000	N	0.917
330143	330144	lp_1105	lp_1106	mae	citC	TRUE	0.994	18.000	0.038	1.000	Y	0.955
330144	330145	lp_1106	lp_1107	citC	citD	TRUE	0.997	-10.000	0.231	1.000	Y	0.948
330145	330146	lp_1107	lp_1108	citD	citE	TRUE	0.996	0.000	0.284	0.001	N	0.969
330146	330147	lp_1108	lp_1109	citE	citF	TRUE	0.995	-10.000	0.119	0.001	N	0.941
330147	330148	lp_1109	lp_1110	citF		FALSE	0.376	200.000	0.000	NA		0.552
330150	330151	lp_1112	lp_1113	fum		TRUE	0.838	173.000	0.017	1.000	Y	0.808
330151	330152	lp_1113	lp_1114		citX	FALSE	0.206	156.000	0.000	1.000	N	0.356
330152	330153	lp_1114	lp_1115	citX	mleR2	TRUE	0.977	-3.000	0.000	1.000	N	0.666
330155	330156	lp_1118	lp_1119	mleS	mleP2	TRUE	0.975	42.000	0.302	1.000		0.573
330156	330157	lp_1119	lp_1120	mleP2		FALSE	0.019	502.000	0.000	0.084		0.303
330157	330158	lp_1120	lp_1121			FALSE	0.079	118.000	0.000	NA		0.263
330160	330161	lp_1125	lp_1126	cydA	cydB	TRUE	0.999	-7.000	0.950	0.028	Y	0.831
330161	330162	lp_1126	lp_1128	cydB	cydC	TRUE	0.908	129.000	0.061	1.000	Y	0.690
330162	330163	lp_1128	lp_1129	cydC	cydD	TRUE	0.986	0.000	0.168	0.008	Y	0.466
330164	330165	lp_1132	lp_1134		hepB2	FALSE	0.028	229.000	0.000	NA		0.276
330168	330169	lp_1138	lp_1139	acm1	xpt	TRUE	0.944	51.000	0.023	1.000	N	0.592
330169	330170	lp_1139	lp_1140	xpt		TRUE	0.982	23.000	0.009	NA		0.754
330170	330171	lp_1140	lp_1141		purK2	TRUE	0.814	113.000	0.000	NA		0.737
330171	330172	lp_1141	lp_1144	purK2	pcrA	FALSE	0.359	441.000	0.012	1.000	N	0.660
330172	330173	lp_1144	lp_1145	pcrA	ligA	TRUE	0.995	17.000	0.103	0.014	Y	0.808
330173	330174	lp_1145	lp_1146	ligA		TRUE	0.988	-3.000	0.030	1.000		0.805
330174	330175	lp_1146	lp_1147		gatC	TRUE	0.974	41.000	0.017	1.000		0.855
330175	330176	lp_1147	lp_1148	gatC	gatA	TRUE	0.998	0.000	0.643	0.001	Y	0.832
330176	330177	lp_1148	lp_1149	gatA	gatB	TRUE	0.998	0.000	0.492	0.001	Y	0.879
330177	330178	lp_1149	lp_1150	gatB		TRUE	0.896	105.000	0.034	1.000	N	0.702
330178	330179	lp_1150	lp_1151			FALSE	0.293	334.000	0.299	1.000	N	0.377
330179	330180	lp_1151	lp_1153			FALSE	0.001	454.000	0.000	1.000	N	-0.009
330180	330181	lp_1153	lp_1154			FALSE	0.002	267.000	0.000	1.000	N	0.118
330181	330182	lp_1154	lp_1155		pts13C	FALSE	0.016	241.000	0.000	1.000	N	0.214
330182	330183	lp_1155	lp_1156	pts13C		TRUE	0.943	-7.000	0.231	NA		0.305
330183	330184	lp_1156	lp_1157			FALSE	0.009	125.000	0.000	NA		0.173
330184	330185	lp_1157	lp_1158		lys	TRUE	0.968	25.000	0.087	1.000	N	0.486
330187	330188	lp_1160	lp_1161	cspP		FALSE	0.004	187.000	0.000	1.000		0.033
330188	330189	lp_1161	lp_1162		rhe2	TRUE	0.908	13.000	0.200	1.000		0.270
330189	401564	lp_1162	lp_tRNA21	rhe2	tRNA-Arg	FALSE	0.039	48.000	0.000	NA		0.085
330191	330192	lp_1164	lp_1165	pts14C		TRUE	0.964	-7.000	1.000	NA		0.150
330192	330193	lp_1165	lp_1166			FALSE	0.001	550.000	0.000	NA		-0.160
330193	330194	lp_1166	lp_1168			FALSE	0.001	434.000	0.000	NA		0.094
330196	330197	lp_1171	lp_1173	pbpX1		FALSE	0.022	189.000	0.000	1.000	N	0.213
330197	330198	lp_1173	lp_1174			FALSE	0.001	386.000	0.000	1.000		-0.119
330198	330199	lp_1174	lp_1175		glpF4	FALSE	0.070	200.000	0.000	1.000		0.324
330199	330200	lp_1175	lp_1176	glpF4	glf1	FALSE	0.586	154.000	0.000	1.000	N	0.562
330200	330201	lp_1176	lp_1177	glf1	cps1A	TRUE	0.966	4.000	0.008	NA		0.568
330201	330202	lp_1177	lp_1178	cps1A	cps1B	TRUE	0.976	5.000	0.000	NA		0.760
330202	330203	lp_1178	lp_1179	cps1B	cps1C	TRUE	0.977	27.000	0.000	1.000		0.862
330203	330204	lp_1179	lp_1180	cps1C	cps1D	TRUE	0.979	12.000	0.000	NA		0.853
330204	330205	lp_1180	lp_1181	cps1D	cps1E	TRUE	0.981	-7.000	0.000	NA		0.777
330205	330206	lp_1181	lp_1182	cps1E	cps1F	TRUE	0.980	14.000	0.000	1.000		0.854
330206	330207	lp_1182	lp_1183	cps1F	cps1G	TRUE	0.988	8.000	0.000	1.000	Y	0.846
330207	330208	lp_1183	lp_1184	cps1G	cps1H	TRUE	0.981	1.000	0.000	NA		0.833
330208	330209	lp_1184	lp_1185	cps1H	cps1I	TRUE	0.979	11.000	0.000	NA		0.862
330209	330210	lp_1185	lp_1186	cps1I	rfbA	TRUE	0.980	6.000	0.000	NA		0.893
330210	330211	lp_1186	lp_1187	rfbA		TRUE	0.974	23.000	0.000	1.000		0.737
330211	330212	lp_1187	lp_1188		rfbC	TRUE	0.932	60.000	0.000	1.000		0.759
330212	330213	lp_1188	lp_1189	rfbC	rfbB	TRUE	0.966	44.000	0.000	1.000	Y	0.713
330213	330214	lp_1189	lp_1190	rfbB	rfbD	TRUE	0.879	70.000	0.000	0.003	Y	0.501
330215	330216	lp_1191	lp_1192			TRUE	0.951	-78.000	0.000	1.000		0.525
330216	330217	lp_1192	lp_1193			FALSE	0.528	43.000	0.000	NA		0.333
330217	330218	lp_1193	lp_1194			TRUE	0.888	-3.000	0.000	NA		0.428
330218	330219	lp_1194	lp_1195			FALSE	0.663	99.000	0.000	1.000		0.505
330219	330220	lp_1195	lp_1196			FALSE	0.295	63.000	0.000	0.053		0.269
330221	330222	lp_1197	lp_1198	cps2A	cps2B	TRUE	0.995	12.000	0.615	1.000	N	0.659
330222	330223	lp_1198	lp_1199	cps2B	cps2C	TRUE	0.988	-13.000	0.080	1.000	N	0.618
330223	330224	lp_1199	lp_1200	cps2C	galE2	TRUE	0.981	18.000	0.000	1.000	Y	0.626
330224	330225	lp_1200	lp_1201	galE2	cps2E	TRUE	0.980	-19.000	0.015	NA	Y	0.509
330225	330226	lp_1201	lp_1202	cps2E	cps2F	TRUE	0.932	1.000	0.047	NA	Y	0.303
330226	330227	lp_1202	lp_1203	cps2F	cps2G	TRUE	0.860	1.000	0.000	NA		0.411
330227	330228	lp_1203	lp_1204	cps2G	cps2H	TRUE	0.876	38.000	0.000	NA		0.501
330228	330229	lp_1204	lp_1205	cps2H	cps2I	TRUE	0.975	7.000	0.000	NA		0.761
330229	330230	lp_1205	lp_1206	cps2I	cps2J	FALSE	0.719	140.000	0.000	1.000		0.687
330230	330231	lp_1206	lp_1207	cps2J		TRUE	0.777	125.000	0.000	NA		0.721
330233	330234	lp_1210	lp_1211			TRUE	0.742	37.000	0.000	NA		0.395
330235	330236	lp_1212	lp_1213			FALSE	0.061	235.000	0.167	NA		-0.039
330236	330237	lp_1213	lp_1214			FALSE	0.696	30.000	0.000	NA		0.349
330238	330239	lp_1215	lp_1216	cps3A	cps3B	FALSE	0.108	83.000	0.000	NA		0.256
330239	330240	lp_1216	lp_1219	cps3B	glf2	FALSE	0.002	513.000	0.028	NA		0.064
330240	330241	lp_1219	lp_1220	glf2	cps3D	TRUE	0.958	16.000	0.000	NA		0.596
330241	330242	lp_1220	lp_1221	cps3D	cps3E	TRUE	0.971	-3.000	0.000	NA		0.639
330242	330243	lp_1221	lp_1222	cps3E	cps3F	TRUE	0.979	-13.000	0.000	NA		0.729
330243	330244	lp_1222	lp_1224	cps3F	cps3G	FALSE	0.011	112.000	0.000	NA		0.196
330244	330245	lp_1224	lp_1225	cps3G	cps3H	FALSE	0.102	-3.000	0.000	NA		0.168
330245	330246	lp_1225	lp_1226	cps3H	cps3I	TRUE	0.976	-16.000	0.000	NA		0.687
330246	330247	lp_1226	lp_1227	cps3I	cps3J	TRUE	0.772	136.000	0.000	NA		0.763
330249	330250	lp_1229	lp_1230			TRUE	0.889	12.000	0.000	1.000		0.448
330251	330252	lp_1231	lp_1233			FALSE	0.001	438.000	0.000	NA		0.190
330254	330255	lp_1235	lp_1236			TRUE	0.884	30.000	0.000	NA		0.466
330255	330256	lp_1236	lp_1237			FALSE	0.176	115.000	0.000	NA		0.312
330256	330257	lp_1237	lp_1238			FALSE	0.617	36.000	0.000	NA		0.340
330258	330259	lp_1239	lp_1240			FALSE	0.076	27.000	0.000	NA		-0.146
330259	330260	lp_1240	lp_1241			FALSE	0.026	98.000	0.025	NA		0.068
330262	330263	lp_1243	lp_1244			FALSE	0.653	103.000	0.000	NA		0.512
330265	330266	lp_1247	lp_1248		tagD2	FALSE	0.633	53.000	0.057	NA		0.254
330267	330268	lp_1249	lp_1250	gntP	gntK	TRUE	0.982	12.000	0.000	1.000	Y	0.687
330268	330269	lp_1250	lp_1251	gntK	gnd1	TRUE	0.975	16.000	0.000	1.000	Y	0.576
330269	330270	lp_1251	lp_1253	gnd1	gshR2	FALSE	0.121	171.000	0.000	1.000	N	0.315
330271	330272	lp_1255	lp_1256	prfC		FALSE	0.001	643.000	0.000	NA		-0.301
330274	330275	lp_1258	lp_1259			FALSE	0.221	229.000	0.000	1.000		0.470
330275	330276	lp_1259	lp_1260			TRUE	0.994	0.000	0.903	NA		0.558
330276	330277	lp_1260	lp_1261		oppA	FALSE	0.001	547.000	0.000	NA		0.187
330277	330278	lp_1261	lp_1262	oppA	oppB	TRUE	0.881	158.000	0.031	0.045	Y	0.795
330278	330279	lp_1262	lp_1263	oppB	oppC	TRUE	0.997	4.000	0.299	0.045	Y	0.864
330279	330280	lp_1263	lp_1264	oppC	oppD	TRUE	0.998	16.000	0.595	1.000	Y	0.861
330280	330281	lp_1264	lp_1265	oppD	oppF	TRUE	0.998	7.000	0.619	0.001	Y	0.775
330281	330282	lp_1265	lp_1267	oppF		FALSE	0.001	539.000	0.000	1.000	N	-0.064
330282	330283	lp_1267	lp_1268			FALSE	0.098	185.000	0.000	1.000		0.343
330285	330286	lp_1273	lp_1274	hpr	ptsI	TRUE	0.996	0.000	0.240	0.024	Y	0.728
330286	330287	lp_1274	lp_1275	ptsI		FALSE	0.001	538.000	0.016	1.000	N	-0.065
330287	330288	lp_1275	lp_1276			TRUE	0.972	77.000	0.413	0.017	Y	0.551
330288	330289	lp_1276	lp_1277			TRUE	0.973	67.000	0.336	NA		0.677
330289	330290	lp_1277	lp_1278		dacA2	FALSE	0.478	64.000	0.000	NA		0.350
330292	330293	lp_1281	lp_1283			TRUE	0.794	156.000	0.103	NA		0.644
2208820	401565	lp_rRNA04	lp_tRNA22		tRNA-Ile	FALSE	0.470	85.000	0.000	NA		NA
401565	401566	lp_tRNA22	lp_tRNA23	tRNA-Ile	tRNA-Ala	FALSE	0.698	42.000	0.000	NA		NA
401566	2208821	lp_tRNA23	lp_rRNA05	tRNA-Ala		FALSE	0.201	162.000	0.000	NA		NA
2208821	2208822	lp_rRNA05	lp_rRNA06			FALSE	0.552	71.000	0.000	NA		NA
2208822	401567	lp_rRNA06	lp_tRNA24		tRNA-Asn	TRUE	0.825	5.000	0.000	NA		NA
401567	401568	lp_tRNA24	lp_tRNA25	tRNA-Asn	tRNA-Ser	TRUE	0.837	19.000	0.000	NA		NA
401568	401569	lp_tRNA25	lp_tRNA26	tRNA-Ser	tRNA-Glu	TRUE	0.830	22.000	0.000	NA		NA
401569	401570	lp_tRNA26	lp_tRNA27	tRNA-Glu	tRNA-Val	TRUE	0.825	5.000	0.000	NA		NA
401570	401571	lp_tRNA27	lp_tRNA28	tRNA-Val	tRNA-Phe	FALSE	0.635	56.000	0.000	NA		NA
401571	401572	lp_tRNA28	lp_tRNA29	tRNA-Phe	tRNA-Tyr	TRUE	0.821	6.000	0.000	NA		NA
401572	401573	lp_tRNA29	lp_tRNA30	tRNA-Tyr	tRNA-Trp	TRUE	0.817	9.000	0.000	NA		NA
401573	401574	lp_tRNA30	lp_tRNA31	tRNA-Trp	tRNA-His	TRUE	0.821	6.000	0.000	NA		NA
401574	401575	lp_tRNA31	lp_tRNA32	tRNA-His	tRNA-Gln	TRUE	0.818	8.000	0.000	NA		NA
401575	401576	lp_tRNA32	lp_tRNA33	tRNA-Gln	tRNA-Cys	TRUE	0.825	23.000	0.000	NA		NA
401576	401577	lp_tRNA33	lp_tRNA34	tRNA-Cys	tRNA-Leu	FALSE	0.635	56.000	0.000	NA		NA
330295	330296	lp_1288	lp_1289			FALSE	0.070	409.000	0.000	1.000	N	NA
330296	330297	lp_1289	lp_1290			TRUE	0.993	3.000	0.182	1.000		0.894
330299	330300	lp_1292	lp_1293			FALSE	0.011	115.000	0.000	1.000		0.224
330300	330301	lp_1293	lp_1295		mntH3	FALSE	0.001	839.000	0.000	1.000		-0.055
330301	330302	lp_1295	lp_1296	mntH3	hemH	TRUE	0.985	-28.000	0.007	1.000	N	0.686
330302	330303	lp_1296	lp_1297	hemH		FALSE	0.001	332.000	0.000	1.000	N	-0.061
330304	330305	lp_1298	lp_1299		tagE1	FALSE	0.032	421.000	0.000	1.000	N	0.310
330307	330308	lp_1301	lp_1302	metK		FALSE	0.087	137.000	0.069	1.000	N	-0.151
330308	330309	lp_1302	lp_1303a		sdr	FALSE	0.041	440.000	0.000	NA		0.373
330309	330310	lp_1303a	lp_1310	sdr		FALSE	0.009	127.000	0.000	NA		-0.235
330310	330311	lp_1310	lp_1311		tagE2	TRUE	0.912	27.000	0.000	1.000		0.495
330311	330312	lp_1311	lp_1312	tagE2	tagE3	TRUE	0.995	11.000	0.500	0.017		0.730
330312	330313	lp_1312	lp_1313	tagE3		FALSE	0.070	30.000	0.000	NA		0.214
330314	330315	lp_1314	lp_1315			TRUE	0.983	4.000	0.015	NA		0.752
330316	330317	lp_1316	lp_1317	leuS		FALSE	0.094	596.000	0.006	1.000		0.440
330317	330318	lp_1317	lp_1319		rsuA	TRUE	0.989	8.000	0.128	1.000		0.760
330320	330321	lp_1321	lp_1322	pepV		TRUE	0.988	27.000	0.154	1.000	N	0.668
330321	330322	lp_1322	lp_1324			FALSE	0.022	336.000	0.000	1.000	N	0.261
330322	330323	lp_1324	lp_1325			TRUE	0.983	50.000	0.391	0.044	Y	0.541
330323	330324	lp_1325	lp_1326			TRUE	0.990	12.000	0.848	0.044	Y	0.407
330324	330325	lp_1326	lp_1327			TRUE	0.985	-3.000	0.708	0.044	Y	0.302
330325	330326	lp_1327	lp_1328		glpQ1	FALSE	0.438	21.000	0.042	1.000	N	-0.064
330327	330328	lp_1329	lp_1330	dgk2	mscL	TRUE	0.825	105.000	0.007	1.000	N	0.584
330328	330329	lp_1330	lp_1332	mscL		FALSE	0.001	504.000	0.000	NA		-0.164
330329	330330	lp_1332	lp_1333			FALSE	0.009	398.000	0.000	NA		0.262
330330	330331	lp_1333	lp_1334			FALSE	0.093	21.000	0.000	NA		0.206
330331	330332	lp_1334	lp_1335			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		0.556
330332	330333	lp_1335	lp_1336			FALSE	0.660	151.000	0.000	0.024	N	0.598
330333	330334	lp_1336	lp_1339		mrsA1	FALSE	0.006	563.000	0.000	1.000	N	0.222
330335	330336	lp_1341	lp_1342			TRUE	0.923	-3.000	0.000	NA		0.469
330336	330337	lp_1342	lp_1343			FALSE	0.404	16.000	0.000	NA		0.258
330339	330340	lp_1346	lp_1347	asd1		FALSE	0.609	190.000	0.000	NA		0.779
330340	330341	lp_1347	lp_1348			TRUE	0.979	2.000	0.062	NA		0.585
330341	330342	lp_1348	lp_1350		nox6	FALSE	0.659	156.000	0.000	NA		0.688
330342	330343	lp_1350	lp_1351	nox6		TRUE	0.922	26.000	0.000	NA		0.507
330345	330346	lp_1353	lp_1354			FALSE	0.009	130.000	0.000	NA		0.163
330346	330347	lp_1354	lp_1354a		pltA	FALSE	0.007	140.000	0.000	NA		0.031
330347	330348	lp_1354a	lp_1355	pltA	pltK	TRUE	0.899	-27.000	0.000	NA		0.431
330348	330349	lp_1355	lp_1356	pltK	pltR	TRUE	0.966	6.000	0.400	NA		0.380
330349	330350	lp_1356	lp_1357	pltR		FALSE	0.040	168.000	0.000	NA		0.264
330350	330351	lp_1357	lp_1358			FALSE	0.326	160.000	0.000	NA		0.452
330352	330353	lp_1359	lp_1360			FALSE	0.001	693.000	0.000	NA		-0.246
330353	330354	lp_1360	lp_1362			FALSE	0.717	114.000	0.000	NA		0.585
330355	330356	lp_1363	lp_1364		uvrA2	TRUE	0.922	62.000	0.000	NA		0.721
401614	401613	lp_tRNA35	lp_tRNA36	tRNA-His	tRNA-Leu	FALSE	0.056	389.000	0.000	NA		NA
401613	330358	lp_tRNA36	lp_1369	tRNA-Leu		FALSE	0.105	249.000	0.000	NA		NA
330358	330359	lp_1369	lp_1371			FALSE	0.005	165.000	0.000	NA		0.026
330361	330362	lp_1373	lp_1374		metH	FALSE	0.074	28.000	0.000	NA		-0.561
330362	330363	lp_1374	lp_1375	metH	metE	TRUE	0.989	14.000	0.030	1.000	Y	0.684
330364	330365	lp_1377	lp_1378		cysD	FALSE	0.109	-22.000	0.000	NA		0.200
330365	330366	lp_1378	lp_1379	cysD	cysC	TRUE	0.963	3.000	0.000	0.001	Y	0.488
330366	330367	lp_1379	lp_1380	cysC		TRUE	0.893	-31.000	0.000	1.000		0.423
330367	330368	lp_1380	lp_1381		astA	FALSE	0.096	221.000	0.000	1.000		0.367
330368	330369	lp_1381	lp_1385	astA		FALSE	0.131	506.000	0.000	1.000		0.529
330369	330370	lp_1385	lp_1386			FALSE	0.002	276.000	0.000	1.000		-0.052
330370	330371	lp_1386	lp_1388			FALSE	0.200	127.000	0.000	NA		0.341
330371	401578	lp_1388	lp_tRNA37		tRNA-Gly	FALSE	0.602	63.000	0.000	NA		NA
401578	401579	lp_tRNA37	lp_tRNA38	tRNA-Gly	tRNA-Asp	FALSE	0.629	57.000	0.000	NA		NA
401579	330372	lp_tRNA38	lp_1390	tRNA-Asp		FALSE	0.327	122.000	0.000	NA		NA
330372	330373	lp_1390	lp_1391		argS	FALSE	0.002	272.000	0.000	1.000		-0.150
330375	330376	lp_1393	lp_1394			FALSE	0.001	684.000	0.000	NA		0.064
330376	330377	lp_1394	lp_1395			TRUE	0.982	19.000	0.000	NA		0.866
330377	330378	lp_1395	lp_1396			FALSE	0.078	135.000	0.000	NA		0.271
330380	330381	lp_1398	lp_1399	pts15A	pts15B	TRUE	0.996	-3.000	0.500	0.023	Y	0.617
330381	330382	lp_1399	lp_1400	pts15B	pts15C	TRUE	0.982	34.000	1.000	0.023	Y	0.325
330382	330383	lp_1400	lp_1401	pts15C	pbg3	TRUE	0.979	3.000	0.000	1.000	Y	0.615
330384	330385	lp_1402	lp_1403			TRUE	0.898	0.000	0.000	NA		0.442
330385	330386	lp_1403	lp_1406		dltC2	FALSE	0.163	270.000	0.000	NA		0.459
330386	330387	lp_1406	lp_1407	dltC2		FALSE	0.013	103.000	0.000	1.000		-0.026
330388	330389	lp_1409	lp_1410		arcT	FALSE	0.028	66.000	0.000	1.000		0.019
330389	330390	lp_1410	lp_1411	arcT	argR1	FALSE	0.059	178.000	0.015	1.000	N	0.147
330390	330391	lp_1411	lp_1412	argR1		TRUE	0.884	78.000	0.000	NA		0.711
330391	330392	lp_1412	lp_1413		pbp2A	FALSE	0.127	294.000	0.000	NA		0.441
330392	330393	lp_1413	lp_1415	pbp2A		FALSE	0.502	91.000	0.168	NA		0.197
330393	330394	lp_1415	lp_1416			FALSE	0.201	70.000	0.093	NA		-0.104
330394	330395	lp_1416	lp_1417			TRUE	0.942	-13.000	0.330	1.000	Y	0.031
330395	330396	lp_1417	lp_1418			TRUE	0.955	11.000	0.291	1.000		0.373
330396	330397	lp_1418	lp_1419			FALSE	0.002	317.000	0.000	NA		-0.045
330398	330399	lp_1420	lp_1422	nsr		FALSE	0.004	186.000	0.000	1.000		-0.038
330400	330401	lp_1424	lp_1425			TRUE	0.985	3.000	0.312	NA		0.533
330401	330402	lp_1425	lp_1426			FALSE	0.176	88.000	0.000	NA		0.283
330404	330405	lp_1428	lp_1430			FALSE	0.001	627.000	0.000	NA		-0.012
330405	330406	lp_1430	lp_1431			TRUE	0.972	-3.000	0.031	NA		0.544
330406	330407	lp_1431	lp_1433			FALSE	0.585	120.000	0.000	NA		0.507
5937129	330409	lp_1436	lp_1437	ribB	ribA	TRUE	0.975	2.000	0.000	NA		0.719
330409	330410	lp_1437	lp_1438	ribA	ribH	TRUE	0.993	-3.000	0.010	0.002	Y	0.826
330411	330412	lp_1439	lp_1440			FALSE	0.004	177.000	0.000	NA		0.108
330416	330417	lp_1446	lp_1447			TRUE	0.968	6.000	0.000	NA		0.675
330417	330418	lp_1447	lp_1448			TRUE	0.840	60.000	0.000	NA		0.529
330418	330419	lp_1448	lp_1449			TRUE	0.955	10.000	0.000	NA		0.592
330419	330420	lp_1449	lp_1450			TRUE	0.962	19.000	0.000	NA		0.601
330420	330421	lp_1450	lp_1452		prtM1	FALSE	0.001	474.000	0.000	NA		-0.300
330421	330422	lp_1452	lp_1453	prtM1		FALSE	0.138	233.000	0.000	NA		0.419
330422	330423	lp_1453	lp_1454			TRUE	0.980	11.000	0.011	NA		0.721
330424	330425	lp_1455	lp_1456	ecsA	ecsB	TRUE	0.962	-7.000	0.135	NA	N	0.400
330425	330426	lp_1456	lp_1457	ecsB		FALSE	0.609	119.000	0.049	NA	N	0.406
330426	330427	lp_1457	lp_1458			TRUE	0.858	86.000	0.154	NA		0.479
330429	330430	lp_1460	lp_1461		ftsK1	TRUE	0.975	27.000	0.143	1.000		0.540
330430	330431	lp_1461	lp_1462	ftsK1	murC	TRUE	0.945	63.000	0.017	0.004	N	0.639
330432	330433	lp_1463	lp_1466	ISP1	feoB	FALSE	0.053	586.000	0.000	1.000	N	NA
330433	330434	lp_1466	lp_1467	feoB		TRUE	0.967	2.000	0.052	1.000		0.515
330435	330436	lp_1468	lp_1469			TRUE	0.993	13.000	0.139	1.000	Y	0.710
330436	330437	lp_1469	lp_1470		csd1	TRUE	0.997	-16.000	0.606	1.000	N	0.759
330437	330438	lp_1470	lp_1471	csd1	nifU	TRUE	0.996	-13.000	0.292	1.000	N	0.888
330438	330439	lp_1471	lp_1472	nifU		TRUE	0.995	-3.000	0.152	0.001	N	0.868
330439	330440	lp_1472	lp_1473		fecB	TRUE	0.980	17.000	0.003	1.000	N	0.663
330441	330442	lp_1475	lp_1476	fecE	fecD	TRUE	0.994	-3.000	0.400	1.000	Y	0.548
330442	330443	lp_1476	lp_1477	fecD		TRUE	0.960	4.000	0.000	1.000	N	0.565
330444	330445	lp_1478	lp_1479	moaE	moaD	TRUE	0.983	3.000	0.501	1.000	Y	0.362
330445	330446	lp_1479	lp_1480	moaD	moaA	TRUE	0.933	44.000	0.006	1.000	Y	0.483
330446	330447	lp_1480	lp_1481	moaA	narK	TRUE	0.976	5.000	0.011	1.000	N	0.603
330447	330448	lp_1481	lp_1482	narK		FALSE	0.013	104.000	0.029	NA		-0.080
330448	330449	lp_1482	lp_1483			TRUE	0.936	30.000	0.000	NA		0.557
330450	330451	lp_1484	lp_1485			TRUE	0.982	15.000	0.500	NA		0.459
330451	330452	lp_1485	lp_1486			TRUE	0.993	10.000	1.000	NA		0.549
330452	330453	lp_1486	lp_1487		rrp4	FALSE	0.317	318.000	0.750	NA		0.281
330453	330454	lp_1487	lp_1488	rrp4	hpk4	TRUE	0.996	33.000	0.400	0.008	Y	0.860
330454	330455	lp_1488	lp_1489	hpk4		TRUE	0.993	24.000	0.200	NA		0.908
330455	330456	lp_1489	lp_1490			TRUE	0.784	93.000	0.250	NA		0.382
330456	330457	lp_1490	lp_1491		mobA	TRUE	0.870	-10.000	0.009	NA		0.344
330457	330458	lp_1491	lp_1492	mobA	moaC	TRUE	0.963	17.000	0.020	NA	Y	0.442
330458	330459	lp_1492	lp_1493	moaC	mobB	TRUE	0.890	-7.000	0.000	0.003	Y	0.300
330459	330460	lp_1493	lp_1494	mobB	moeA	TRUE	0.959	-21.000	0.075	0.003	Y	0.318
330460	330461	lp_1494	lp_1495	moeA	moaB	TRUE	0.990	15.000	0.012	0.003	Y	0.713
330461	330462	lp_1495	lp_1496	moaB	moeB	TRUE	0.966	-3.000	0.044	1.000	Y	0.411
330463	330464	lp_1497	lp_1498	narG	narH	TRUE	0.998	-10.000	0.429	0.001	Y	0.868
330464	330465	lp_1498	lp_1499	narH	narJ	TRUE	0.997	-7.000	0.933	0.002	Y	0.554
330465	330466	lp_1499	lp_1500	narJ	narI	TRUE	0.991	-3.000	0.206	0.002	Y	0.530
330466	330467	lp_1500	lp_1502	narI		FALSE	0.256	213.000	0.000	NA		0.485
330467	330468	lp_1502	lp_1503			TRUE	0.993	-3.000	0.714	NA		0.554
330468	330469	lp_1503	lp_1505			FALSE	0.003	192.000	0.000	NA		-0.094
330469	330470	lp_1505	lp_1506			TRUE	0.996	18.000	1.000	NA		0.675
330470	330471	lp_1506	lp_1507			FALSE	0.052	256.000	0.000	NA		0.330
330471	330472	lp_1507	lp_1508		polA	FALSE	0.049	263.000	0.000	NA		0.329
330472	330473	lp_1508	lp_1509	polA	fpg	TRUE	0.984	12.000	0.101	1.000	Y	0.527
330473	330474	lp_1509	lp_1510	fpg	coaE	TRUE	0.989	1.000	0.066	1.000	N	0.736
330474	330475	lp_1510	lp_1511	coaE		TRUE	0.926	42.000	0.024	NA	N	0.505
330475	330476	lp_1511	lp_1512		dnaB	TRUE	0.990	22.000	0.109	NA	N	0.709
330476	330477	lp_1512	lp_1513	dnaB	dnaI	TRUE	0.997	4.000	0.817	NA	Y	0.662
330477	330478	lp_1513	lp_1514	dnaI	thrS	FALSE	0.179	333.000	0.000	NA	N	0.496
330478	330479	lp_1514	lp_1515	thrS	infC	FALSE	0.147	222.000	0.000	1.000	Y	0.306
330479	330480	lp_1515	lp_1516	infC	rpmI	TRUE	0.998	22.000	0.652	1.000	Y	0.879
330480	330481	lp_1516	lp_1517	rpmI	rplT	TRUE	0.997	37.000	0.928	0.018	Y	0.849
330481	330482	lp_1517	lp_1518	rplT		FALSE	0.002	244.000	0.000	NA		0.082
330483	330484	lp_1519	lp_1521	cshA1		FALSE	0.001	410.000	0.000	1.000	N	0.068
330485	330486	lp_1522	lp_1523		racD	FALSE	0.005	376.000	0.000	NA	N	0.204
330487	330488	lp_1524	lp_1525	ica1		TRUE	0.835	13.000	0.000	NA		0.404
330489	330490	lp_1527	lp_1528			TRUE	0.967	-3.000	0.555	1.000		0.306
330490	330491	lp_1528	lp_1529			TRUE	0.888	71.000	0.068	NA		0.520
330491	330492	lp_1529	lp_1530		nadD	TRUE	0.976	13.000	0.150	NA	N	0.501
330492	330493	lp_1530	lp_1531	nadD		TRUE	0.996	-16.000	0.199	1.000	Y	0.731
330493	330494	lp_1531	lp_1532			TRUE	0.983	18.000	0.149	NA		0.569
330494	330495	lp_1532	lp_1533			TRUE	0.964	-3.000	0.085	NA		0.462
330495	330496	lp_1533	lp_1534			TRUE	0.990	15.000	0.094	NA		0.829
330496	330497	lp_1534	lp_1535			TRUE	0.762	125.000	0.070	NA		0.532
330497	330498	lp_1535	lp_1535a		rpmF	TRUE	0.897	60.000	0.599	NA		0.306
330502	330503	lp_1541	lp_1543	gnd2	cshA2	FALSE	0.005	169.000	0.000	1.000	N	0.034
330503	330504	lp_1543	lp_1544	cshA2	rrp5	FALSE	0.005	163.000	0.000	0.050	N	0.128
330504	330505	lp_1544	lp_1545	rrp5	hpk5	TRUE	0.997	0.000	0.438	0.080	Y	0.683
330505	330506	lp_1545	lp_1546	hpk5		FALSE	0.001	371.000	0.000	1.000	N	0.042
330507	330508	lp_1548	lp_1549	sbcC	sbcD	TRUE	0.994	3.000	0.669	1.000	Y	0.502
330510	330511	lp_1553	lp_1554			TRUE	0.847	64.000	0.000	1.000	N	0.521
330512	330513	lp_1555	lp_1556			FALSE	0.046	101.000	0.005	NA		0.147
330513	330514	lp_1556	lp_1557			TRUE	0.954	62.000	0.009	NA		0.820
330514	330515	lp_1557	lp_1558		pheS	FALSE	0.001	328.000	0.000	NA	N	0.097
330515	330516	lp_1558	lp_1559	pheS	pheT	TRUE	0.995	9.000	0.574	0.001	Y	0.565
330516	330517	lp_1559	lp_1561	pheT		FALSE	0.156	147.000	0.007	NA		0.264
330517	330518	lp_1561	lp_1562		udk	TRUE	0.988	19.000	0.017	NA		0.868
330518	330519	lp_1562	lp_1563	udk	greA2	TRUE	0.923	111.000	0.095	1.000	N	0.751
330520	330521	lp_1564	lp_1565			TRUE	0.985	1.000	0.714	NA		0.436
330524	330525	lp_1568	lp_1570	pbp2B1	fthC	FALSE	0.235	423.000	0.000	1.000	N	0.587
330525	330526	lp_1570	lp_1571	fthC		TRUE	0.991	-13.000	0.037	1.000		0.891
330526	330527	lp_1571	lp_1572			TRUE	0.992	19.000	0.347	NA		0.635
330527	330528	lp_1572	lp_1573		glk	TRUE	0.984	18.000	0.496	NA		0.474
330528	330529	lp_1573	lp_1574	glk		FALSE	0.002	286.000	0.000	1.000	N	0.097
330529	330530	lp_1574	lp_1576			FALSE	0.003	228.000	0.000	NA	N	0.129
330532	330533	lp_1578	lp_1579	glpQ2	miaA	FALSE	0.464	5.000	0.018	1.000	N	0.086
330533	330534	lp_1579	lp_1580	miaA	glnR	FALSE	0.053	112.000	0.004	1.000	N	0.096
330534	330535	lp_1580	lp_1581	glnR	glnA	TRUE	0.940	44.000	0.090	1.000	N	0.499
330535	330536	lp_1581	lp_1583	glnA		TRUE	0.785	135.000	0.118	NA		0.548
330536	330537	lp_1583	lp_1584			TRUE	0.995	-10.000	0.786	NA		0.603
330537	330538	lp_1584	lp_1585			TRUE	0.850	17.000	0.176	NA		0.179
330539	330540	lp_1586	lp_1587			TRUE	0.897	58.000	0.000	NA		0.613
330540	401612	lp_1587	lp_tRNA39		tRNA-Arg	FALSE	0.051	431.000	0.000	NA		NA
330541	330542	lp_1590	lp_1591			FALSE	0.001	379.000	0.000	NA		0.125
330542	330543	lp_1591	lp_1592		rplU	FALSE	0.089	158.000	0.005	1.000	N	0.188
330543	330544	lp_1592	lp_1593	rplU		TRUE	0.976	22.000	0.208	NA	Y	0.399
330544	330545	lp_1593	lp_1594		rpmA	TRUE	0.993	25.000	0.203	NA	Y	0.685
330545	330546	lp_1594	lp_1595	rpmA	pepP	FALSE	0.541	195.000	0.013	1.000	N	0.560
330546	330547	lp_1595	lp_1596	pepP	efp	TRUE	0.917	71.000	0.160	1.000	N	0.495
330547	330548	lp_1596	lp_1597	efp	asp3	TRUE	0.910	50.000	0.031	NA		0.518
330548	330549	lp_1597	lp_1598	asp3	nusB	TRUE	0.993	-3.000	0.265	NA		0.741
330549	330550	lp_1598	lp_1599	nusB	folD	FALSE	0.488	138.000	0.082	1.000	N	0.343
330550	330551	lp_1599	lp_1600	folD	xseA	TRUE	0.981	-7.000	0.045	1.000	N	0.566
330551	330552	lp_1600	lp_1601	xseA	xseB	TRUE	0.977	0.000	0.412	0.001	Y	0.294
330552	330553	lp_1601	lp_1602	xseB	ispA	TRUE	0.989	-7.000	0.100	1.000	N	0.636
330553	330554	lp_1602	lp_1603	ispA		TRUE	0.989	15.000	0.058	1.000	N	0.800
330554	330555	lp_1603	lp_1604		argR2	TRUE	0.893	84.000	0.048	1.000	N	0.568
330555	330556	lp_1604	lp_1605	argR2	recN	TRUE	0.741	103.000	0.037	1.000	N	0.456
330556	330557	lp_1605	lp_1607	recN	opuA	FALSE	0.019	366.000	0.000	1.000	N	0.256
330557	330558	lp_1607	lp_1608	opuA	opuB	TRUE	0.998	-3.000	0.450	0.079	Y	0.810
330558	330559	lp_1608	lp_1609	opuB	opuC	TRUE	0.997	13.000	0.650	0.043	N	0.860
330559	330560	lp_1609	lp_1610	opuC	opuD	TRUE	0.997	0.000	0.619	0.043	N	0.845
330562	330563	lp_1612	lp_1613	gmk1	rpoZ	TRUE	0.963	-3.000	0.471	1.000	N	0.265
330563	330564	lp_1613	lp_1614	rpoZ	dfp	FALSE	0.285	164.000	0.192	1.000	N	0.180
330564	330565	lp_1614	lp_1615	dfp	priA	TRUE	0.974	23.000	0.099	1.000	N	0.507
330565	330566	lp_1615	lp_1616	priA	fmt	TRUE	0.989	24.000	0.052	1.000	N	0.825
330566	330567	lp_1616	lp_1617	fmt	sunL	TRUE	0.996	-3.000	0.305	1.000	Y	0.736
330567	330568	lp_1617	lp_1618	sunL	pppL	TRUE	0.992	18.000	0.074	1.000	N	0.852
330568	330569	lp_1618	lp_1619	pppL	pkn1	TRUE	0.998	-3.000	0.704	1.000	Y	0.716
330569	330570	lp_1619	lp_1620	pkn1		FALSE	0.609	85.000	0.196	1.000		0.239
330570	330571	lp_1620	lp_1621		rpe	TRUE	0.993	10.000	0.213	1.000		0.855
330571	330572	lp_1621	lp_1622	rpe		TRUE	0.992	0.000	0.166	1.000	N	0.732
330574	330575	lp_1625	lp_1626			TRUE	0.993	37.000	0.567	NA		0.850
330575	330576	lp_1626	lp_1627		recG	FALSE	0.679	143.000	0.074	1.000		0.502
330576	330577	lp_1627	lp_1628	recG	plsX	TRUE	0.926	42.000	0.033	1.000	N	0.497
330577	330578	lp_1628	lp_1629	plsX	acpA1	TRUE	0.963	39.000	0.029	0.005	Y	0.520
330578	330579	lp_1629	lp_1631	acpA1	rnc	FALSE	0.054	416.000	0.009	1.000	N	0.300
330579	330580	lp_1631	lp_1632	rnc	smc	TRUE	0.982	31.000	0.120	1.000	N	0.625
330580	330581	lp_1632	lp_1633	smc	ftsY	TRUE	0.944	10.000	0.165	0.013	N	0.344
330581	330582	lp_1633	lp_1634	ftsY		FALSE	0.201	178.000	0.081	1.000		0.267
330582	330583	lp_1634	lp_1635		ffh	TRUE	0.987	23.000	0.151	1.000		0.643
330583	330584	lp_1635	lp_1636	ffh	rpsP	TRUE	0.895	97.000	0.361	1.000	N	0.463
330584	330585	lp_1636	lp_1637	rpsP		TRUE	0.995	18.000	0.385	1.000		0.771
330585	330586	lp_1637	lp_1638		rimM	FALSE	0.295	161.000	0.324	1.000		0.136
330586	330587	lp_1638	lp_1639	rimM	trmD	TRUE	0.998	0.000	0.672	1.000	Y	0.845
330587	330588	lp_1639	lp_1640	trmD	rplS	TRUE	0.869	158.000	0.567	1.000	Y	0.476
330588	330589	lp_1640	lp_1642	rplS		FALSE	0.001	436.000	0.000	NA		0.128
330589	330590	lp_1642	lp_1643			FALSE	0.001	629.000	0.000	NA		-0.034
330590	330591	lp_1643	lp_1645			FALSE	0.604	22.000	0.000	1.000		0.297
330591	330592	lp_1645	lp_1648			FALSE	0.001	497.000	0.000	1.000		-0.146
330592	330593	lp_1648	lp_1649			TRUE	0.984	-10.000	0.341	NA		0.468
330593	330594	lp_1649	lp_1652		trpE	FALSE	0.001	473.000	0.000	NA		0.140
330594	330595	lp_1652	lp_1653	trpE	trpG	TRUE	0.995	-16.000	0.152	0.001	Y	0.644
330595	330596	lp_1653	lp_1654	trpG	trpD	TRUE	0.985	25.000	0.053	1.000	Y	0.571
330596	330597	lp_1654	lp_1655	trpD	trpC	TRUE	0.985	-3.000	0.022	1.000	Y	0.561
330597	330598	lp_1655	lp_1656	trpC	trpF	TRUE	0.991	-3.000	0.020	0.002	Y	0.665
330598	330599	lp_1656	lp_1657	trpF	trpA	TRUE	0.994	2.000	0.375	0.002	Y	0.543
330599	330600	lp_1657	lp_1658	trpA	trpB	TRUE	0.982	-10.000	0.002	0.001	Y	0.528
330600	330601	lp_1658	lp_1659	trpB		FALSE	0.005	161.000	0.000	1.000	N	-0.232
330601	330602	lp_1659	lp_1660			TRUE	0.905	1.000	0.000	1.000	N	0.431
330602	330603	lp_1660	lp_1662			FALSE	0.003	215.000	0.000	NA		0.009
330603	330604	lp_1662	lp_1663			FALSE	0.040	280.000	0.000	NA		0.320
330604	330605	lp_1663	lp_1664			TRUE	0.953	13.000	0.000	NA		0.577
330605	330606	lp_1664	lp_1665		adh1	FALSE	0.002	289.000	0.000	1.000		0.186
330606	330607	lp_1665	lp_1667	adh1		FALSE	0.002	307.000	0.000	NA		-0.055
330607	330608	lp_1667	lp_1668			FALSE	0.040	289.000	0.000	NA		0.323
330608	330609	lp_1668	lp_1669			TRUE	0.931	15.000	0.000	1.000		0.508
330609	330610	lp_1669	lp_1670		fabZ1	FALSE	0.125	462.000	0.000	1.000	N	0.482
330610	330611	lp_1670	lp_1671	fabZ1	fabH2	TRUE	0.970	75.000	0.007	0.005	Y	0.958
330611	330612	lp_1671	lp_1672	fabH2	acpA2	TRUE	0.982	57.000	0.019	0.005	Y	0.944
330612	330613	lp_1672	lp_1673	acpA2	fabD	TRUE	0.992	4.000	0.005	1.000	Y	0.951
330613	330614	lp_1673	lp_1674	fabD	fabG1	TRUE	0.998	-13.000	0.432	0.057	Y	0.965
330614	330615	lp_1674	lp_1675	fabG1	fabF	TRUE	0.995	19.000	0.056	1.000	Y	0.972
330615	330616	lp_1675	lp_1676	fabF	accB2	TRUE	0.995	-3.000	0.074	1.000	Y	0.964
330616	330617	lp_1676	lp_1677	accB2	fabZ2	TRUE	0.991	0.000	0.000	NA	Y	0.951
330617	330618	lp_1677	lp_1678	fabZ2	accC2	TRUE	0.991	15.000	0.031	NA	Y	0.783
330618	330619	lp_1678	lp_1679	accC2	accD2	TRUE	0.995	-34.000	0.090	1.000	Y	0.822
330619	330620	lp_1679	lp_1680	accD2	accA2	TRUE	0.997	-7.000	0.234	0.002	Y	0.974
330620	330621	lp_1680	lp_1681	accA2	fabI	TRUE	0.993	21.000	0.015	1.000	Y	0.969
330621	330622	lp_1681	lp_1682	fabI		TRUE	0.986	0.000	0.000	1.000	N	0.978
330624	330625	lp_1685	lp_1686			FALSE	0.655	207.000	0.000	NA	N	0.888
330625	330626	lp_1686	lp_1687			FALSE	0.494	265.000	0.000	NA		0.802
330628	330629	lp_1689	lp_1690			FALSE	0.005	158.000	0.000	1.000		-0.013
330631	330632	lp_1693	lp_1693a			FALSE	0.110	-76.000	0.000	NA		0.147
330633	330634	lp_1694	lp_1695			FALSE	0.009	129.000	0.000	NA		0.209
330635	330636	lp_1696	lp_1697	cfa1		FALSE	0.002	248.000	0.000	1.000		-0.081
330639	330640	lp_1700	lp_1701	tspO		TRUE	0.959	28.000	0.000	1.000	Y	0.521
330640	330641	lp_1701	lp_1702			FALSE	0.433	158.000	0.000	1.000		0.505
330641	330642	lp_1702	lp_1703			FALSE	0.174	147.000	0.000	1.000		0.348
330643	330644	lp_1704	lp_1705			TRUE	0.929	72.000	0.000	NA		0.933
330644	330645	lp_1705	lp_1706			TRUE	0.978	16.000	0.000	NA		0.817
330646	330647	lp_1708	lp_1709			FALSE	0.020	78.000	0.000	NA		0.180
330647	330648	lp_1709	lp_1711		pepD4	FALSE	0.004	184.000	0.000	NA		0.217
330649	330650	lp_1712	lp_1713	xylH	lysA	TRUE	0.935	73.000	0.002	1.000		0.807
330650	330651	lp_1713	lp_1715	lysA		FALSE	0.254	406.000	0.000	1.000	N	0.600
330651	330652	lp_1715	lp_1716			FALSE	0.139	99.000	0.000	1.000		0.273
330652	330653	lp_1716	lp_1717			FALSE	0.015	93.000	0.000	NA		0.160
330653	330654	lp_1717	lp_1718			FALSE	0.007	140.000	0.000	NA		0.201
330654	330655	lp_1718	lp_1721			FALSE	0.001	438.000	0.000	NA		-0.288
330655	330656	lp_1721	lp_1722			TRUE	0.973	17.000	0.462	1.000	Y	0.279
330658	330659	lp_1724	lp_1726			FALSE	0.318	169.000	0.000	NA		0.464
330659	330660	lp_1726	lp_1729			FALSE	0.033	495.000	0.000	NA		0.365
330660	330661	lp_1729	lp_1730		map3	TRUE	0.989	14.000	0.000	NA	Y	0.875
330661	330662	lp_1730	lp_1731	map3	galM2	TRUE	0.989	25.000	0.000	0.009	Y	0.891
330663	330664	lp_1732	lp_1733	idi1	mvaK2	TRUE	0.902	72.000	0.097	0.003	N	0.487
330664	330665	lp_1733	lp_1734	mvaK2	mvaD	TRUE	0.991	51.000	0.312	0.003	Y	0.756
330665	330666	lp_1734	lp_1735	mvaD	mvaK1	TRUE	0.995	26.000	0.281	0.003	Y	0.677
330667	330668	lp_1736	lp_1737		dinG	FALSE	0.001	329.000	0.000	NA		0.116
330668	330669	lp_1737	lp_1738	dinG		TRUE	0.918	66.000	0.296	NA		0.447
330669	330670	lp_1738	lp_1739		aspB	TRUE	0.992	17.000	0.205	NA		0.786
330670	330671	lp_1739	lp_1740	aspB	asnS2	TRUE	0.989	18.000	0.068	1.000	N	0.717
330671	330672	lp_1740	lp_1741	asnS2	dnaD	TRUE	0.971	78.000	0.234	NA	N	0.792
330672	330673	lp_1741	lp_1742	dnaD		FALSE	0.034	56.000	0.000	NA		0.083
330673	330674	lp_1742	lp_1744			FALSE	0.001	374.000	0.000	NA		-0.134
330674	330675	lp_1744	lp_1745			TRUE	0.991	0.000	0.938	1.000	Y	0.393
330675	330676	lp_1745	lp_1746			TRUE	0.895	19.000	0.042	NA	Y	0.224
330676	330677	lp_1746	lp_1747			FALSE	0.235	91.000	0.000	NA	N	0.271
330678	330679	lp_1748	lp_1749			TRUE	0.938	-3.000	0.000	0.042	N	0.463
330679	330680	lp_1749	lp_1750			TRUE	0.857	13.000	0.000	0.042	N	0.381
330680	330681	lp_1750	lp_1751		pbp1A	FALSE	0.004	185.000	0.000	1.000	N	-0.180
330681	330682	lp_1751	lp_1752	pbp1A	recU	TRUE	0.955	12.000	0.319	1.000		0.366
330683	330684	lp_1753	lp_1754			TRUE	0.958	75.000	0.579	NA		0.540
330684	330685	lp_1754	lp_1756			FALSE	0.175	560.000	0.000	1.000		0.596
330685	330686	lp_1756	lp_1757			FALSE	0.693	38.000	0.000	1.000	N	0.346
330686	330687	lp_1757	lp_1759			FALSE	0.002	263.000	0.000	1.000	N	0.108
330689	330690	lp_1762	lp_1763			FALSE	0.559	169.000	0.000	NA		0.622
330690	330691	lp_1763	lp_1764			FALSE	0.037	154.000	0.000	NA	N	0.219
330691	330692	lp_1764	lp_1765			TRUE	0.979	-13.000	0.000	NA		0.733
330692	330693	lp_1765	lp_1766			FALSE	0.285	145.000	0.000	NA		0.408
330693	330694	lp_1766	lp_1767			FALSE	0.007	148.000	0.000	NA		0.205
330694	330695	lp_1767	lp_1768			FALSE	0.374	82.000	0.000	NA	N	0.319
330695	330696	lp_1768	lp_1770			FALSE	0.007	145.000	0.000	NA		0.073
330696	330697	lp_1770	lp_1771			TRUE	0.982	0.000	0.000	NA		0.868
330699	330700	lp_1774	lp_1776			FALSE	0.005	158.000	0.000	1.000		-0.020
330702	330703	lp_1778	lp_1779	esbA	fhs	TRUE	0.857	94.000	0.333	NA		0.436
330703	330704	lp_1779	lp_1780	fhs	lspA	FALSE	0.006	333.000	0.030	1.000	N	-0.055
330704	330705	lp_1780	lp_1781	lspA	rluD1	TRUE	0.974	20.000	0.082	1.000	N	0.501
330705	330706	lp_1781	lp_1782	rluD1	pyrR2	FALSE	0.326	159.000	0.048	1.000	N	0.327
330706	330707	lp_1782	lp_1783	pyrR2	pyrAA2	TRUE	0.987	35.000	0.007	1.000	Y	0.870
330707	5937130	lp_1783	lp_1784	pyrAA2	pyrAB2	TRUE	0.984	-3.000	0.000	NA		0.928
5937130	330708	lp_1784	lp_1785	pyrAB2	pgm5	FALSE	0.358	179.000	0.000	NA		0.510
330709	330710	lp_1786	lp_1787		cat	FALSE	0.001	566.000	0.000	NA		-0.006
330710	330711	lp_1787	lp_1788	cat		TRUE	0.988	1.000	0.037	1.000		0.794
330711	330712	lp_1788	lp_1789			TRUE	0.980	4.000	0.074	NA		0.597
330713	330714	lp_1790	lp_1791			FALSE	0.047	394.000	0.000	1.000	N	0.345
330714	330715	lp_1791	lp_1792			FALSE	0.322	13.000	0.000	NA		0.248
330717	330718	lp_1795	lp_1796			TRUE	0.953	85.000	0.176	NA		0.751
330718	330719	lp_1796	lp_1797			TRUE	0.810	2.000	0.000	NA		0.377
330719	330720	lp_1797	lp_1798			FALSE	0.503	115.000	0.000	NA		0.454
330720	330721	lp_1798	lp_1799			FALSE	0.592	116.000	0.000	NA		0.504
330721	330722	lp_1799	lp_1800			FALSE	0.601	92.000	0.000	NA		0.456
330722	330723	lp_1800	lp_1801			TRUE	0.809	82.000	0.000	NA		0.580
330725	330726	lp_1805	lp_1806			FALSE	0.594	7.000	0.000	NA		0.301
330726	330727	lp_1806	lp_1807			FALSE	0.003	220.000	0.000	NA		0.194
330729	330730	lp_1811	lp_1812			FALSE	0.012	193.000	0.000	NA		0.241
330731	330732	lp_1813	lp_1814			FALSE	0.484	115.000	0.000	NA		0.446
330732	330733	lp_1814	lp_1815			FALSE	0.076	27.000	0.000	NA		0.183
330734	330735	lp_1816	lp_1817			TRUE	0.989	2.000	0.367	1.000	N	0.533
330735	330736	lp_1817	lp_1818		tagB1	FALSE	0.108	-12.000	0.000	1.000	N	0.033
330736	330737	lp_1818	lp_1819	tagB1	tagB2	FALSE	0.245	1.000	0.000	0.002	Y	-0.191
330737	330738	lp_1819	lp_1820	tagB2		FALSE	0.014	99.000	0.000	1.000		0.139
330738	330739	lp_1820	lp_1821			FALSE	0.107	157.000	0.000	1.000		0.317
330739	330740	lp_1821	lp_1822		gshR3	TRUE	0.770	66.000	0.400	1.000	N	0.128
330742	330743	lp_1824	lp_1825			TRUE	0.873	12.000	0.000	NA		0.436
330743	330744	lp_1825	lp_1833			FALSE	0.003	2226.000	0.000	NA		0.242
330744	330745	lp_1833	lp_1834			FALSE	0.316	213.000	0.000	NA		0.526
330746	330747	lp_1835	lp_1836	msrA2	msrA3	TRUE	0.992	28.000	0.048	0.002	Y	0.810
330747	330748	lp_1836	lp_1837	msrA3		FALSE	0.093	128.000	0.000	1.000	N	0.242
330748	330749	lp_1837	lp_1838			TRUE	0.801	23.000	0.028	1.000	N	0.243
330749	330750	lp_1838	lp_1839		parC	FALSE	0.219	184.000	0.053	1.000	N	0.287
330750	330751	lp_1839	lp_1840	parC	parE	TRUE	0.987	14.000	0.552	0.002	Y	0.398
330753	330754	lp_1843	lp_1845		hslU	TRUE	0.927	27.000	0.020	1.000	N	0.431
330754	330755	lp_1845	lp_1846	hslU	hslV	TRUE	0.997	18.000	0.752	1.000	Y	0.637
330755	330756	lp_1846	lp_1847	hslV	codV	TRUE	0.991	-16.000	0.113	1.000	N	0.667
330756	330757	lp_1847	lp_1848	codV	gidC	FALSE	0.526	80.000	0.105	1.000	N	0.188
330757	330758	lp_1848	lp_1850	gidC	topA	FALSE	0.684	279.000	0.137	1.000	N	0.729
330758	330759	lp_1850	lp_1852	topA	dprA	TRUE	0.965	89.000	0.238	1.000	Y	0.637
330759	330760	lp_1852	lp_1853	dprA	rnhB	TRUE	0.923	79.000	0.037	1.000	Y	0.552
330760	330761	lp_1853	lp_1854	rnhB		TRUE	0.993	-7.000	0.148	1.000		0.804
330761	330762	lp_1854	lp_1855			FALSE	0.004	171.000	0.000	NA		0.018
330762	330763	lp_1855	lp_1856			FALSE	0.044	163.000	0.000	NA		0.266
330765	330766	lp_1858	lp_1859	mrr		FALSE	0.004	187.000	0.000	1.000		0.010
330766	330767	lp_1859	lp_1860			TRUE	0.991	-3.000	0.258	NA		0.631
330767	330768	lp_1860	lp_1863			FALSE	0.002	285.000	0.000	NA		-0.024
330768	330769	lp_1863	lp_1864		ctpA	FALSE	0.039	367.000	0.000	1.000		0.351
330769	330770	lp_1864	lp_1865	ctpA		FALSE	0.692	30.000	0.080	NA		0.170
330770	330771	lp_1865	lp_1866			TRUE	0.876	12.000	0.136	NA		0.263
330771	330772	lp_1866	lp_1867			TRUE	0.992	13.000	0.828	1.000		0.534
330772	330773	lp_1867	lp_1868			TRUE	0.862	150.000	0.136	NA		0.747
330773	330774	lp_1868	lp_1869		dfrA	TRUE	0.828	107.000	0.012	NA		0.625
330774	330775	lp_1869	lp_1870	dfrA	thyA	TRUE	0.988	10.000	0.295	1.000	N	0.563
330775	330776	lp_1870	lp_1871	thyA		TRUE	0.941	13.000	0.036	1.000		0.448
330776	330777	lp_1871	lp_1872			FALSE	0.004	186.000	0.011	NA		0.028
330777	330778	lp_1872	lp_1873		papL	TRUE	0.763	57.000	0.014	NA		0.402
330778	330779	lp_1873	lp_1874	papL	dapB	TRUE	0.989	-3.000	0.015	1.000	N	0.824
330779	330780	lp_1874	lp_1876	dapB		FALSE	0.050	286.000	0.000	1.000		0.339
330780	330781	lp_1876	lp_1877			FALSE	0.196	111.000	0.000	1.000		0.317
330781	330782	lp_1877	lp_1879		hbsU	FALSE	0.051	212.000	0.146	1.000		-0.155
330782	330783	lp_1879	lp_1880	hbsU		TRUE	0.839	46.000	0.000	NA		0.497
330783	330784	lp_1880	lp_1881			FALSE	0.014	98.000	0.000	NA		0.099
330784	330785	lp_1881	lp_1882		rpsA	FALSE	0.645	135.000	0.032	1.000		0.495
330785	330786	lp_1882	lp_1883	rpsA	cmk	TRUE	0.897	90.000	0.047	1.000	N	0.603
330786	330787	lp_1883	lp_1884	cmk		TRUE	0.975	35.000	0.005	1.000		0.817
330787	330788	lp_1884	lp_1885		recQ2	TRUE	0.886	62.000	0.063	1.000		0.481
330788	330789	lp_1885	lp_1886	recQ2		TRUE	0.994	-13.000	0.222	NA		0.776
330789	330790	lp_1886	lp_1887			FALSE	0.189	336.000	0.033	NA		0.449
330790	330791	lp_1887	lp_1888		rluB	FALSE	0.002	300.000	0.000	NA		-0.025
330791	330792	lp_1888	lp_1889	rluB		TRUE	0.989	0.000	0.224	NA	N	0.586
330792	330793	lp_1889	lp_1890			TRUE	0.996	-13.000	0.570	NA		0.744
330793	330794	lp_1890	lp_1891			TRUE	0.983	-4.000	0.013	NA		0.688
330794	330795	lp_1891	lp_1892			TRUE	0.944	39.000	0.013	NA		0.580
330795	330796	lp_1892	lp_1893			TRUE	0.960	8.000	0.024	1.000		0.529
330796	330797	lp_1893	lp_1894			TRUE	0.933	56.000	0.019	NA		0.612
330797	330798	lp_1894	lp_1897		pyk	FALSE	0.001	973.000	0.027	NA		-0.114
330798	330799	lp_1897	lp_1898	pyk	pfk	TRUE	0.973	86.000	0.261	0.006	Y	0.666
330799	330800	lp_1898	lp_1899	pfk	dnaE	FALSE	0.364	114.000	0.098	1.000	N	0.180
330802	330803	lp_1901	lp_1903		clpB	FALSE	0.022	357.000	0.000	NA		0.304
330803	330804	lp_1903	lp_1904	clpB	pepT	FALSE	0.608	117.000	0.003	1.000	N	0.442
330804	330805	lp_1904	lp_1905	pepT		TRUE	0.965	39.000	0.051	NA		0.639
330805	330806	lp_1905	lp_1906			TRUE	0.992	-13.000	0.283	NA		0.628
330808	330809	lp_1909	lp_1910	drrB	drrA	TRUE	0.988	15.000	0.920	1.000	N	0.422
330811	330812	lp_1912	lp_1913	pps		FALSE	0.048	430.000	0.000	NA	N	0.359
330812	330813	lp_1913	lp_1914			TRUE	0.933	-7.000	0.154	NA	N	0.281
330815	330816	lp_1916	lp_1918			FALSE	0.022	331.000	0.000	NA		0.299
330816	330817	lp_1918	lp_1919		mntA	FALSE	0.011	111.000	0.000	1.000		0.099
330817	330818	lp_1919	lp_1920	mntA	enoA2	TRUE	0.895	68.000	0.006	1.000	N	0.552
330818	330819	lp_1920	lp_1921	enoA2		FALSE	0.037	174.000	0.000	1.000	Y	0.078
330821	330822	lp_1923	lp_1925	dapE1	nox3	FALSE	0.010	121.000	0.000	1.000		0.142
330823	330824	lp_1926	lp_1927		mutT	TRUE	0.931	16.000	0.000	1.000	N	0.482
330825	330826	lp_1928	lp_1929	nrpR2		FALSE	0.323	166.000	0.000	NA		0.463
330826	330827	lp_1929	lp_1930			FALSE	0.040	230.000	0.000	NA		0.301
330827	330828	lp_1930	lp_1931			FALSE	0.040	436.000	0.000	1.000		0.367
330828	330829	lp_1931	lp_1932		gph2	FALSE	0.112	160.000	0.000	1.000		0.327
330829	330830	lp_1932	lp_1933	gph2	thgA2	TRUE	0.887	-7.000	0.000	1.000		0.421
330830	330831	lp_1933	lp_1934	thgA2		FALSE	0.580	71.000	0.000	1.000		0.403
330831	330832	lp_1934	lp_1935			FALSE	0.017	332.000	0.000	NA		0.280
330832	330833	lp_1935	lp_1936			FALSE	0.697	139.000	0.000	NA		0.647
330833	330834	lp_1936	lp_1937			TRUE	0.781	3.000	0.000	NA		0.364
330835	330836	lp_1938	lp_1939			FALSE	0.005	164.000	0.000	1.000	N	-0.036
330837	330838	lp_1941	lp_1942	nox4	rrp6	FALSE	0.323	155.000	0.000	1.000		0.441
330838	330839	lp_1942	lp_1943	rrp6	hpk6	TRUE	0.975	10.000	0.857	0.007	Y	0.177
330839	330840	lp_1943	lp_1944	hpk6		TRUE	0.951	-16.000	0.167	NA		0.364
330840	330841	lp_1944	lp_1945			TRUE	0.982	-3.000	0.080	NA		0.579
330841	330842	lp_1945	lp_1946			FALSE	0.003	204.000	0.000	NA		0.205
330843	330844	lp_1947	lp_1948			FALSE	0.734	29.000	0.000	1.000		0.361
330844	330845	lp_1948	lp_1949			TRUE	0.969	-3.000	0.333	NA		0.381
330847	330848	lp_1954	lp_1955			TRUE	0.983	14.000	0.368	NA		0.500
330849	330850	lp_1956	lp_1957			FALSE	0.102	-3.000	0.000	NA		0.214
330850	330851	lp_1957	lp_1958			FALSE	0.093	2.000	0.000	NA		-0.101
330851	330852	lp_1958	lp_1959			TRUE	0.851	-16.000	0.027	1.000	N	0.256
330854	330855	lp_1961	lp_1962		rpoD	FALSE	0.006	149.000	0.000	NA		-0.118
330855	330856	lp_1962	lp_1963	rpoD	dnaG	TRUE	0.960	82.000	0.209	1.000	N	0.708
330856	330857	lp_1963	lp_1964	dnaG	glyS	FALSE	0.101	257.000	0.017	1.000	N	0.278
330857	330858	lp_1964	lp_1965	glyS	glyQ	TRUE	0.998	0.000	0.651	0.001	Y	0.764
330858	330859	lp_1965	lp_1966	glyQ	recO	FALSE	0.106	323.000	0.036	1.000	N	0.311
330859	330860	lp_1966	lp_1967	recO		TRUE	0.938	31.000	0.108	1.000		0.433
330860	330861	lp_1967	lp_1968		dgk	TRUE	0.967	41.000	0.063	1.000		0.655
330861	330862	lp_1968	lp_1969	dgk		TRUE	0.990	-16.000	0.035	NA		0.825
330862	330863	lp_1969	lp_1970		phoH	TRUE	0.992	10.000	0.457	NA		0.637
330863	330864	lp_1970	lp_1972	phoH		FALSE	0.001	333.000	0.027	1.000		-0.090
330864	330865	lp_1972	lp_1973		rpsU	TRUE	0.983	42.000	0.150	0.026		0.800
330867	330868	lp_1975	lp_1976		nfo	FALSE	0.033	58.000	0.000	1.000	N	0.053
330868	330869	lp_1976	lp_1977	nfo	tagB3	TRUE	0.835	113.000	0.000	1.000	N	0.728
330869	330870	lp_1977	lp_1978	tagB3		FALSE	0.001	373.000	0.000	NA		0.194
330870	330871	lp_1978	lp_1979		msrA4	FALSE	0.025	203.000	0.062	NA		0.017
330871	330872	lp_1979	lp_1980	msrA4	aspS	FALSE	0.019	81.000	0.000	1.000	N	-0.113
330872	330873	lp_1980	lp_1981	aspS	hisS	TRUE	0.991	42.000	0.161	0.045	Y	0.867
330874	330875	lp_1982	lp_1983	lytH		FALSE	0.034	269.000	0.038	1.000	N	0.091
330876	330877	lp_1985	lp_1986			TRUE	0.845	73.000	0.009	1.000		0.529
330877	330878	lp_1986	lp_1987		relA	TRUE	0.987	10.000	0.177	1.000	N	0.602
330878	330879	lp_1987	lp_1988	relA		FALSE	0.621	81.000	0.016	NA		0.383
330879	330880	lp_1988	lp_1989			TRUE	0.912	71.000	0.006	NA		0.646
330880	330881	lp_1989	lp_1990			TRUE	0.991	13.000	0.227	NA		0.740
330881	330882	lp_1990	lp_1991			FALSE	0.473	109.000	0.000	1.000	N	0.411
330882	330883	lp_1991	lp_1992			FALSE	0.705	67.000	0.000	NA		0.446
330884	330885	lp_1994	lp_1995			FALSE	0.004	309.000	0.000	NA		0.237
330885	330886	lp_1995	lp_1997			FALSE	0.206	294.000	0.000	NA		0.513
330886	330887	lp_1997	lp_2000			FALSE	0.001	988.000	0.000	NA		0.174
330889	330890	lp_2002	lp_2003			TRUE	0.988	-22.000	0.061	NA		0.708
330890	330891	lp_2003	lp_2004			TRUE	0.973	30.000	0.000	NA		0.828
330892	330893	lp_2005	lp_2006		ISP2	FALSE	0.010	122.000	0.000	NA		0.136
330893	330894	lp_2006	lp_2007	ISP2		FALSE	0.300	141.000	0.000	0.008		NA
330894	330895	lp_2007	lp_2009			TRUE	0.849	-3.000	0.000	NA		NA
330896	330897	lp_2010	lp_2011			TRUE	0.941	4.000	0.000	0.022		0.517
330897	330898	lp_2011	lp_2013			FALSE	0.255	261.000	0.000	NA		0.524
330898	330899	lp_2013	lp_2014			FALSE	0.352	178.000	0.000	NA		0.505
330900	330901	lp_2015	lp_2016	lepA1	dltD	FALSE	0.344	164.000	0.002	NA	Y	0.330
330901	330902	lp_2016	lp_2017	dltD	dltC1	TRUE	0.995	-3.000	0.409	NA		0.778
330902	330903	lp_2017	lp_2018	dltC1	dltB	TRUE	0.995	24.000	0.387	NA		0.871
330903	330904	lp_2018	lp_2019	dltB	dltA	TRUE	0.997	-3.000	0.435	NA	N	0.938
330904	330905	lp_2019	lp_2020	dltA	dltX	TRUE	0.990	43.000	0.549	NA		0.777
330905	330906	lp_2020	lp_2021	dltX	pbpX2	TRUE	0.971	32.000	0.000	NA		0.835
330907	330908	lp_2022	lp_2023			FALSE	0.664	-3.000	0.000	NA		0.305
330909	330910	lp_2026	lp_2027	dnaJ	dnaK	TRUE	0.923	102.000	0.196	0.003	Y	0.509
330910	330911	lp_2027	lp_2028	dnaK	grpE	TRUE	0.985	44.000	0.026	0.006	Y	0.879
330911	330912	lp_2028	lp_2029	grpE	hrcA	TRUE	0.992	21.000	0.051	1.000	N	0.928
330912	330913	lp_2029	lp_2030	hrcA	aldB	FALSE	0.001	390.000	0.000	1.000	N	0.180
330913	330914	lp_2030	lp_2031	aldB	ribC2	TRUE	0.962	1.000	0.000	1.000	N	0.566
330914	330915	lp_2031	lp_2032	ribC2	truB	TRUE	0.993	13.000	0.308	1.000	N	0.707
330915	330916	lp_2032	lp_2033	truB	aroI	FALSE	0.008	485.000	0.000	1.000	N	0.230
330916	330917	lp_2033	lp_2034	aroI	tyrA	TRUE	0.989	3.000	0.000	1.000	Y	0.868
330917	330918	lp_2034	lp_2035	tyrA	aroE	TRUE	0.994	3.000	0.069	1.000	Y	0.853
330918	330919	lp_2035	lp_2036	aroE		TRUE	0.985	14.000	0.003	NA		0.897
330919	330920	lp_2036	lp_2037		aroF	TRUE	0.983	9.000	0.003	NA		0.839
330920	330921	lp_2037	lp_2038	aroF		TRUE	0.987	-7.000	0.000	0.002	N	0.845
330921	330922	lp_2038	lp_2039		rbfA	FALSE	0.002	649.000	0.000	1.000	N	0.188
330922	330923	lp_2039	lp_2040	rbfA	infB	TRUE	0.991	23.000	0.530	1.000	Y	0.475
330923	330924	lp_2040	lp_2041	infB		TRUE	0.993	15.000	0.223	NA	Y	0.625
330924	330925	lp_2041	lp_2042			TRUE	0.996	-10.000	0.408	NA	N	0.815
330925	330926	lp_2042	lp_2043		nusA	TRUE	0.992	45.000	0.323	NA	Y	0.812
330926	330927	lp_2043	lp_2044	nusA		TRUE	0.997	21.000	0.759	NA		0.828
330927	330928	lp_2044	lp_2045		polC	FALSE	0.441	296.000	0.059	NA		0.585
330928	330929	lp_2045	lp_2048	polC	proS	FALSE	0.451	494.000	0.070	0.045	N	0.701
330929	330930	lp_2048	lp_2049	proS		TRUE	0.981	40.000	0.095	1.000	N	0.745
330930	330931	lp_2049	lp_2050		cdsA	TRUE	0.981	38.000	0.040	1.000	N	0.822
330931	330932	lp_2050	lp_2051	cdsA	uppS	TRUE	0.994	16.000	0.113	1.000	Y	0.800
330932	330933	lp_2051	lp_2052	uppS	frr	FALSE	0.642	120.000	0.409	1.000	N	0.235
330933	330934	lp_2052	lp_2053	frr	pyrH	TRUE	0.994	2.000	0.626	1.000	N	0.600
330934	330935	lp_2053	lp_2054	pyrH	tsf	TRUE	0.786	201.000	0.416	1.000	N	0.567
330935	330936	lp_2054	lp_2055	tsf	rpsB	TRUE	0.985	103.000	0.748	1.000	Y	0.833
330938	330939	lp_2057	lp_2058	ldhD		FALSE	0.732	85.000	0.044	1.000	N	0.408
330939	330940	lp_2058	lp_2059			TRUE	0.979	-16.000	0.209	1.000		0.468
330942	330943	lp_2061	lp_2062			FALSE	0.704	98.000	0.145	NA		0.379
330946	330947	lp_2067	lp_2068	mvaS		TRUE	0.746	36.000	0.000	NA		0.394
330948	330949	lp_2069	lp_2071			FALSE	0.001	447.000	0.000	NA		-0.186
330950	330951	lp_2074	lp_2075			FALSE	0.103	152.000	0.000	NA		0.310
330951	330952	lp_2075	lp_2076			TRUE	0.995	-19.000	0.375	NA	N	0.701
330952	330953	lp_2076	lp_2077			TRUE	0.983	19.000	0.000	1.000	Y	0.655
330953	330954	lp_2077	lp_2078		rodA1	FALSE	0.064	479.000	0.000	1.000	N	0.402
330955	330956	lp_2081	lp_2082			FALSE	0.013	103.000	0.000	NA		0.028
330960	330961	lp_2086	lp_2087	apt	recJ	TRUE	0.989	19.000	0.128	1.000	N	0.638
330961	330962	lp_2087	lp_2088	recJ		TRUE	0.965	22.000	0.026	1.000		0.536
330962	330963	lp_2088	lp_2089			TRUE	0.909	13.000	0.048	1.000		0.382
330963	330964	lp_2089	lp_2090			TRUE	0.897	10.000	0.074	1.000		0.344
330967	330968	lp_2095	lp_2096	fruR	fruK	TRUE	0.998	-3.000	0.721	1.000	Y	0.911
330968	330969	lp_2096	lp_2097	fruK	pts16ABC	TRUE	0.998	22.000	0.816	1.000	Y	0.813
330969	330970	lp_2097	lp_2098	pts16ABC		FALSE	0.207	140.000	0.000	1.000		0.359
330971	330972	lp_2099	lp_2100	cps4J	cps4I	FALSE	0.493	80.000	0.000	NA		0.393
330972	330973	lp_2100	lp_2101	cps4I	cps4H	TRUE	0.810	-15.000	0.000	NA		0.362
330973	330974	lp_2101	lp_2102	cps4H	cps4G	TRUE	0.945	-3.000	0.000	NA		0.521
330974	330975	lp_2102	lp_2103	cps4G	cps4F	TRUE	0.962	10.000	0.000	0.016	Y	0.504
330975	330976	lp_2103	lp_2104	cps4F	cps4E	TRUE	0.990	0.000	0.047	NA	Y	0.656
330976	330977	lp_2104	lp_2105	cps4E	galE3	TRUE	0.941	-19.000	0.015	NA	Y	0.340
330977	330978	lp_2105	lp_2106	galE3	cps4C	FALSE	0.528	16.000	0.000	1.000	Y	0.102
330978	330979	lp_2106	lp_2107	cps4C	cps4B	TRUE	0.913	-19.000	0.080	1.000	N	0.281
330979	330980	lp_2107	lp_2108	cps4B	cps4A	TRUE	0.958	18.000	0.615	1.000	N	0.226
330980	330981	lp_2108	lp_2109	cps4A	uvrC	FALSE	0.001	423.000	0.000	1.000	N	-0.161
330981	330982	lp_2109	lp_2110	uvrC	glnQ3	FALSE	0.004	183.000	0.004	1.000	N	-0.255
330982	330983	lp_2110	lp_2111	glnQ3	glnPH2	TRUE	0.996	-7.000	0.410	1.000	Y	0.590
330985	330986	lp_2113	lp_2114			FALSE	0.002	247.000	0.000	NA		0.190
330986	330987	lp_2114	lp_2115			TRUE	0.936	2.000	0.011	NA		0.453
330987	330988	lp_2115	lp_2116		clpX	FALSE	0.239	159.000	0.043	1.000		0.302
330988	330989	lp_2116	lp_2118	clpX	tig	FALSE	0.066	295.000	0.033	0.001	Y	-0.015
330989	330990	lp_2118	lp_2119	tig	tuf	FALSE	0.003	204.000	0.011	1.000	N	-0.134
330990	330991	lp_2119	lp_2121	tuf		FALSE	0.003	215.000	0.006	NA		-0.236
330991	330992	lp_2121	lp_2122			TRUE	0.745	63.000	0.182	NA		0.263
330992	330993	lp_2122	lp_2123		dapA1	TRUE	0.838	20.000	0.035	1.000		0.287
330993	330994	lp_2123	lp_2124	dapA1		FALSE	0.010	118.000	0.000	1.000	N	-0.080
330994	330995	lp_2124	lp_2125		rpsO	FALSE	0.008	137.000	0.000	1.000	N	0.133
330997	330998	lp_2128	lp_2129	holA	comEC	TRUE	0.902	-49.000	0.163	1.000		0.233
330998	330999	lp_2129	lp_2130	comEC	comEB	FALSE	0.401	1.000	0.055	1.000		0.006
330999	331000	lp_2130	lp_2131	comEB	comEA	TRUE	0.957	52.000	0.095	0.047	N	0.565
331000	331001	lp_2131	lp_2132	comEA	lon	FALSE	0.253	103.000	0.035	1.000	N	0.162
331001	331002	lp_2132	lp_2133	lon	kdtB	TRUE	0.990	-7.000	0.052	1.000	N	0.720
331002	331003	lp_2133	lp_2134	kdtB		TRUE	0.992	4.000	0.367	1.000	N	0.616
331003	331004	lp_2134	lp_2135			TRUE	0.971	16.000	0.048	NA		0.554
331004	331005	lp_2135	lp_2136		pycA	FALSE	0.366	161.000	0.014	NA		0.423
331005	331006	lp_2136	lp_2137	pycA	ftsW	FALSE	0.686	28.000	0.035	1.000	N	0.168
331006	331007	lp_2137	lp_2141	ftsW		FALSE	0.001	463.000	0.000	NA		0.083
331007	331008	lp_2141	lp_2142		ica2	TRUE	0.790	102.000	0.000	NA		0.626
331008	331009	lp_2142	lp_2143	ica2		TRUE	0.994	-3.000	0.400	NA		0.699
331009	331010	lp_2143	lp_2145			FALSE	0.480	932.000	0.400	NA		0.620
331010	331011	lp_2145	lp_2146		typA	FALSE	0.002	268.000	0.000	1.000		0.131
331011	331012	lp_2146	lp_2147	typA	suhB	FALSE	0.375	190.000	0.024	1.000	N	0.439
331012	331013	lp_2147	lp_2149	suhB		TRUE	0.993	11.000	0.337	NA		0.748
331013	5937132	lp_2149	lp_2150			TRUE	0.957	-13.000	0.000	NA		0.549
5937132	331014	lp_2150	lp_2151		pdhD	FALSE	0.086	273.000	0.000	NA		0.387
331014	331015	lp_2151	lp_2152	pdhD	pdhC	TRUE	0.998	8.000	0.948	1.000	Y	0.927
331015	331016	lp_2152	lp_2153	pdhC	pdhB	TRUE	0.996	58.000	0.883	0.055	Y	0.907
331016	331017	lp_2153	lp_2154	pdhB	pdhA	TRUE	0.998	2.000	0.484	0.001	Y	0.923
331020	331021	lp_2157	lp_2158			TRUE	0.939	-3.000	0.576	NA		0.147
331021	331022	lp_2158	lp_2159			TRUE	0.955	63.000	0.045	1.000		0.740
331023	331024	lp_2160	lp_2162			FALSE	0.004	174.000	0.000	NA		0.219
331026	331027	lp_2166	lp_2168	prs2	recD	FALSE	0.686	155.000	0.066	1.000	N	0.521
331027	331028	lp_2168	lp_2169	recD		TRUE	0.994	16.000	0.281	1.000		0.849
331028	331029	lp_2169	lp_2170		pgm6	TRUE	0.989	21.000	0.183	1.000		0.664
331029	331030	lp_2170	lp_2173	pgm6		FALSE	0.001	524.000	0.000	NA		-0.053
331030	331031	lp_2173	lp_2174			TRUE	0.930	7.000	0.000	NA		0.514
331031	331032	lp_2174	lp_2175			TRUE	0.788	44.000	0.000	NA		0.446
331032	331033	lp_2175	lp_2176		ktrA	FALSE	0.002	282.000	0.000	1.000		-0.169
331033	331034	lp_2176	lp_2177	ktrA	ntpJ	TRUE	0.889	10.000	0.176	0.003	Y	-0.034
331034	331035	lp_2177	lp_2178	ntpJ	trmU	FALSE	0.004	190.000	0.000	1.000	N	-0.165
331035	331036	lp_2178	lp_2179	trmU		FALSE	0.736	117.000	0.021	NA		0.533
331036	331037	lp_2179	lp_2180		csd2	TRUE	0.992	3.000	0.166	NA		0.834
331037	331038	lp_2180	lp_2181	csd2	mtn	TRUE	0.936	59.000	0.029	1.000	N	0.584
331038	331039	lp_2181	lp_2182	mtn		TRUE	0.987	21.000	0.016	NA		0.835
331039	331040	lp_2182	lp_2183			TRUE	0.987	0.000	0.010	NA		0.838
331040	331041	lp_2183	lp_2185		dapF	FALSE	0.110	195.000	0.002	1.000	N	0.265
331041	331042	lp_2185	lp_2187	dapF	ileS	FALSE	0.003	334.000	0.010	1.000	N	0.031
331042	331043	lp_2187	lp_2189	ileS	divIVA	FALSE	0.479	315.000	0.012	NA	N	0.687
331043	331044	lp_2189	lp_2190	divIVA		TRUE	0.983	18.000	0.579	NA		0.439
331044	331045	lp_2190	lp_2191			TRUE	0.986	24.000	0.287	1.000		0.566
331045	331046	lp_2191	lp_2192			TRUE	0.995	13.000	0.370	NA		0.847
331046	331047	lp_2192	lp_2193		ftsZ	TRUE	0.987	24.000	0.020	NA		0.884
331047	331048	lp_2193	lp_2194	ftsZ	ftsA	TRUE	0.996	30.000	0.460	1.000	Y	0.803
331048	331049	lp_2194	lp_2195	ftsA	ftsQ	TRUE	0.955	117.000	0.389	NA	N	0.755
331049	331050	lp_2195	lp_2196	ftsQ	murG	TRUE	0.994	22.000	0.072	NA	Y	0.802
331050	331051	lp_2196	lp_2197	murG	murD	TRUE	0.993	0.000	0.060	1.000	Y	0.732
331051	331052	lp_2197	lp_2199	murD	mraY	FALSE	0.580	292.000	0.647	0.004	Y	0.368
331052	331053	lp_2199	lp_2200	mraY	pbp2B2	TRUE	0.985	29.000	0.038	1.000	Y	0.630
331053	331054	lp_2200	lp_2201	pbp2B2	ftsL	TRUE	0.993	-3.000	0.167	1.000	N	0.733
331054	331055	lp_2201	lp_2202	ftsL	mraW	TRUE	0.987	22.000	0.009	1.000	N	0.805
331055	331056	lp_2202	lp_2203	mraW	mraZ	TRUE	0.994	34.000	0.635	NA		0.798
331056	331057	lp_2203	lp_2205	mraZ		FALSE	0.262	170.000	0.008	NA		0.386
331059	331060	lp_2210	lp_2211	ftsK2	cspR	FALSE	0.016	92.000	0.009	1.000	N	-0.011
331061	331062	lp_2212	lp_2213		brnQ2	FALSE	0.015	335.000	0.000	1.000		0.271
331065	331066	lp_2217	lp_2218		pts17A	TRUE	0.983	15.000	0.324	NA		0.517
331067	331068	lp_2219	lp_2220		cutC	TRUE	0.980	16.000	0.000	1.000	N	0.764
331069	331070	lp_2221	lp_2222	rluD2	ppnK	TRUE	0.981	-3.000	0.080	1.000	N	0.539
331070	331071	lp_2222	lp_2223	ppnK		TRUE	0.997	-3.000	0.725	1.000		0.848
331073	331074	lp_2225	lp_2226	pepF1	coiA	TRUE	0.814	78.000	0.204	NA		0.392
331074	331075	lp_2226	lp_2227	coiA	mecA	FALSE	0.279	185.000	0.178	NA		0.281
331075	331076	lp_2227	lp_2228	mecA	nrpR3	FALSE	0.432	136.000	0.000	NA	N	0.436
331076	331077	lp_2228	lp_2229	nrpR3		FALSE	0.002	287.000	0.000	1.000		-0.028
401611	401610	lp_tRNA41	lp_tRNA42	tRNA-Asp	tRNA-Met	TRUE	0.832	3.000	0.000	NA		NA
401610	401609	lp_tRNA42	lp_tRNA43	tRNA-Met	tRNA-Glu	TRUE	0.816	10.000	0.000	NA		NA
401609	401608	lp_tRNA43	lp_tRNA44	tRNA-Glu	tRNA-Ser	TRUE	0.837	20.000	0.000	NA		NA
401608	401607	lp_tRNA44	lp_tRNA45	tRNA-Ser	tRNA-Ile	TRUE	0.825	5.000	0.000	NA		NA
401607	401606	lp_tRNA45	lp_tRNA46	tRNA-Ile	tRNA-Gly	TRUE	0.819	7.000	0.000	NA		NA
401606	401605	lp_tRNA46	lp_tRNA47	tRNA-Gly	tRNA-Phe	TRUE	0.821	13.000	0.000	NA		NA
401605	401604	lp_tRNA47	lp_tRNA48	tRNA-Phe	tRNA-Asp	TRUE	0.789	30.000	0.000	NA		NA
401604	401603	lp_tRNA48	lp_tRNA49	tRNA-Asp	tRNA-Met	TRUE	0.829	4.000	0.000	NA		NA
401603	401602	lp_tRNA49	lp_tRNA50	tRNA-Met	tRNA-Ser	TRUE	0.819	7.000	0.000	NA		NA
401602	401601	lp_tRNA50	lp_tRNA51	tRNA-Ser	tRNA-Met	FALSE	0.711	40.000	0.000	NA		NA
401601	401600	lp_tRNA51	lp_tRNA52	tRNA-Met	tRNA-Met	TRUE	0.826	16.000	0.000	NA		NA
401600	401599	lp_tRNA52	lp_tRNA53	tRNA-Met	tRNA-Pro	TRUE	0.772	32.000	0.000	NA		NA
401599	401598	lp_tRNA53	lp_tRNA54	tRNA-Pro	tRNA-Arg	TRUE	0.821	6.000	0.000	NA		NA
401598	401597	lp_tRNA54	lp_tRNA55	tRNA-Arg	tRNA-Leu	TRUE	0.816	11.000	0.000	NA		NA
401597	401596	lp_tRNA55	lp_tRNA56	tRNA-Leu	tRNA-Gly	TRUE	0.826	16.000	0.000	NA		NA
401596	401595	lp_tRNA56	lp_tRNA57	tRNA-Gly	tRNA-Thr	TRUE	0.830	17.000	0.000	NA		NA
401595	401594	lp_tRNA57	lp_tRNA58	tRNA-Thr	tRNA-Lys	FALSE	0.430	95.000	0.000	NA		NA
401594	401593	lp_tRNA58	lp_tRNA59	tRNA-Lys	tRNA-Val	TRUE	0.835	2.000	0.000	NA		NA
401593	3829844	lp_tRNA59	lp_rRNA16	tRNA-Val		TRUE	0.825	5.000	0.000	NA		NA
3829844	401592	lp_rRNA16	lp_tRNA60		tRNA-Lys	FALSE	0.640	55.000	0.000	NA		NA
401592	401591	lp_tRNA60	lp_tRNA61	tRNA-Lys	tRNA-Val	TRUE	0.835	2.000	0.000	NA		NA
401591	2208827	lp_tRNA61	lp_rRNA07	tRNA-Val		TRUE	0.825	5.000	0.000	NA		NA
2208827	2208828	lp_rRNA07	lp_rRNA08			FALSE	0.552	71.000	0.000	NA		NA
2208828	2208829	lp_rRNA08	lp_rRNA09			FALSE	0.133	206.000	0.000	NA		NA
2208829	331079	lp_rRNA09	lp_2231a			FALSE	0.045	497.000	0.000	NA		NA
331079	331080	lp_2231a	lp_2231b			TRUE	0.970	0.000	0.041	NA		0.535
331080	331081	lp_2231b	lp_2231c		ppiB	FALSE	0.211	130.000	0.110	1.000	N	0.046
331083	331084	lp_2234	lp_2235			TRUE	0.995	-16.000	0.330	NA		0.777
331084	331085	lp_2235	lp_2236			TRUE	0.994	22.000	0.320	NA		0.846
331085	331086	lp_2236	lp_2237			TRUE	0.993	19.000	0.347	NA		0.673
331086	331087	lp_2237	lp_2238			TRUE	0.972	45.000	0.069	1.000		0.752
331089	331090	lp_2240	lp_2242		ack3	FALSE	0.204	320.000	0.000	1.000	N	0.502
331090	331091	lp_2242	lp_2243	ack3		TRUE	0.985	12.000	0.052	1.000	N	0.684
331091	331092	lp_2243	lp_2244			FALSE	0.003	212.000	0.000	NA		-0.362
331092	331093	lp_2244	lp_2246			FALSE	0.479	75.000	0.000	NA		0.375
331093	331094	lp_2246	lp_2247		comGC	TRUE	0.970	-10.000	0.320	NA		0.386
331094	331095	lp_2247	lp_2248	comGC	comGB	TRUE	0.969	-3.000	0.861	NA	Y	-0.013
331095	331096	lp_2248	lp_2249	comGB	comGA	TRUE	0.938	-64.000	0.639	1.000		0.078
331096	331097	lp_2249	lp_2251	comGA	rbsK2	FALSE	0.003	200.000	0.015	1.000		-0.217
331097	331098	lp_2251	lp_2253	rbsK2		FALSE	0.673	137.000	0.002	NA		0.556
331098	331099	lp_2253	lp_2254			FALSE	0.011	218.000	0.000	NA		0.243
331099	331100	lp_2254	lp_2255			TRUE	0.960	-7.000	0.000	NA		0.565
331100	331101	lp_2255	lp_2256		ccpA	FALSE	0.010	123.000	0.000	NA	N	-0.013
331103	331104	lp_2259	lp_2260			TRUE	0.836	70.000	0.000	NA		0.560
331104	331105	lp_2260	lp_2261			TRUE	0.976	3.000	0.000	NA		0.744
331107	331108	lp_2263	lp_2264		dapD	TRUE	0.993	18.000	0.372	1.000		0.707
331108	331109	lp_2264	lp_2265	dapD		TRUE	0.977	19.000	0.000	NA		0.751
331109	331110	lp_2265	lp_2266			TRUE	0.892	88.000	0.000	NA		0.830
331110	331111	lp_2266	lp_2267		xtp1	TRUE	0.987	-3.000	0.085	1.000		0.646
331111	331112	lp_2267	lp_2268	xtp1	murI	TRUE	0.989	-7.000	0.034	1.000	N	0.738
331114	331115	lp_2270	lp_2271	trxA2	mutS	FALSE	0.013	156.000	0.005	1.000	N	0.053
331115	331116	lp_2271	lp_2272	mutS		TRUE	0.784	60.000	0.005	NA		0.433
331116	331117	lp_2272	lp_2273			FALSE	0.294	105.000	0.007	NA		0.289
331117	331118	lp_2273	lp_2274			TRUE	0.995	13.000	0.651	NA		0.733
331118	331119	lp_2274	lp_2275			TRUE	0.996	-3.000	0.537	NA		0.781
331119	331120	lp_2275	lp_2276			FALSE	0.061	34.000	0.000	NA		0.089
331120	331121	lp_2276	lp_2277		alaS	FALSE	0.084	7.000	0.000	NA		0.203
331121	331122	lp_2277	lp_2278	alaS	rhe3	FALSE	0.204	328.000	0.000	0.014	Y	0.431
331122	331123	lp_2278	lp_2279	rhe3		TRUE	0.987	3.000	0.182	0.014		0.592
331123	331124	lp_2279	lp_2280		dinP	FALSE	0.555	93.000	0.054	1.000		0.332
331124	331125	lp_2280	lp_2281	dinP		FALSE	0.006	152.000	0.002	NA	N	-0.314
331125	331126	lp_2281	lp_2282		tgt	TRUE	0.951	78.000	0.325	NA	N	0.562
331126	331127	lp_2282	lp_2285	tgt	queA	TRUE	0.842	310.000	0.360	0.001	Y	0.767
331127	331128	lp_2285	lp_2286	queA	ruvB	TRUE	0.974	18.000	0.069	1.000	N	0.515
331128	331129	lp_2286	lp_2287	ruvB	ruvA	TRUE	0.997	18.000	0.549	0.002	Y	0.646
331131	331132	lp_2290	lp_2292			FALSE	0.409	154.000	0.000	NA		0.484
331132	331133	lp_2292	lp_2297		hexB	FALSE	0.001	1039.000	0.000	NA		0.213
331133	331134	lp_2297	lp_2298	hexB	hexA	TRUE	0.899	171.000	0.220	0.001	Y	0.699
331134	331135	lp_2298	lp_2299	hexA		TRUE	0.849	28.000	0.005	1.000		0.375
331135	331136	lp_2299	lp_2300			TRUE	0.863	125.000	0.245	1.000		0.556
331136	331137	lp_2300	lp_2301		recA	FALSE	0.072	231.000	0.018	1.000		0.254
331137	331138	lp_2301	lp_2302	recA	cinA	TRUE	0.881	92.000	0.083	1.000		0.569
331138	331139	lp_2302	lp_2303	cinA	pgsA	FALSE	0.036	268.000	0.151	1.000		-0.279
331139	331140	lp_2303	lp_2304	pgsA		TRUE	0.988	23.000	0.077	1.000		0.767
331140	331141	lp_2304	lp_2305			TRUE	0.922	89.000	0.156	1.000		0.613
331141	331142	lp_2305	lp_2306			TRUE	0.998	-3.000	0.872	0.004		0.808
331144	331145	lp_2312	lp_2313	glnH2	glnQ4	TRUE	0.992	12.000	0.131	1.000	Y	0.667
331145	331146	lp_2313	lp_2314	glnQ4	glnP2	TRUE	0.993	13.000	0.136	1.000	Y	0.731
331146	331147	lp_2314	lp_2315	glnP2	minD	FALSE	0.063	480.000	0.000	1.000	N	0.401
331147	331148	lp_2315	lp_2316	minD	minC	TRUE	0.997	0.000	0.368	1.000	Y	0.894
331148	331149	lp_2316	lp_2317	minC	mreD	TRUE	0.992	22.000	0.106	1.000		0.902
331149	331150	lp_2317	lp_2318	mreD	mreC	TRUE	0.996	13.000	0.550	0.002		0.822
331150	331151	lp_2318	lp_2319	mreC	mreB1	TRUE	0.957	71.000	0.024	1.000	N	0.845
331151	331152	lp_2319	lp_2320	mreB1		FALSE	0.449	227.000	0.130	1.000		0.472
331152	331153	lp_2320	lp_2321		folC1	FALSE	0.740	172.000	0.074	1.000		0.666
331153	331154	lp_2321	lp_2322	folC1	valS	FALSE	0.578	174.000	0.007	0.097	N	0.548
331154	331155	lp_2322	lp_2323	valS	tpx	FALSE	0.028	324.000	0.000	1.000	N	0.269
331155	331156	lp_2323	lp_2324	tpx	gshA	FALSE	0.002	240.000	0.000	1.000	N	0.006
331156	331157	lp_2324	lp_2325	gshA	thiI	FALSE	0.003	205.000	0.000	1.000	Y	-0.405
331157	331158	lp_2325	lp_2326	thiI	csd3	TRUE	0.993	18.000	0.349	1.000	N	0.664
331158	331159	lp_2326	lp_2328	csd3	ezrA	FALSE	0.425	312.000	0.201	1.000	N	0.477
331160	331161	lp_2330	lp_2331		rpsD	FALSE	0.508	202.000	0.005	NA	N	0.561
331164	331165	lp_2334	lp_2335			TRUE	0.982	0.000	0.000	NA		0.858
331165	331166	lp_2335	lp_2336			FALSE	0.005	167.000	0.000	1.000	N	-0.705
331167	331168	lp_2337	lp_2339	cshA3		FALSE	0.001	631.000	0.000	NA		0.182
331168	331169	lp_2339	lp_2340			FALSE	0.251	67.000	0.083	NA		-0.001
331170	331171	lp_2341	lp_2342	bla2		FALSE	0.010	117.000	0.000	1.000	N	-0.052
331171	331172	lp_2342	lp_2344		glpQ3	FALSE	0.006	450.000	0.000	1.000	N	0.207
331172	331173	lp_2344	lp_2345	glpQ3	ddl	FALSE	0.656	76.000	0.000	1.000	N	0.424
331173	331174	lp_2345	lp_2346	ddl		FALSE	0.458	102.000	0.000	1.000	N	0.389
331174	331175	lp_2346	lp_2347			TRUE	0.974	22.000	0.000	NA		0.731
331175	331176	lp_2347	lp_2349		hicD3	FALSE	0.315	199.000	0.000	NA		0.508
331176	331177	lp_2349	lp_2350	hicD3		FALSE	0.166	243.000	0.000	NA	N	0.421
331177	331178	lp_2350	lp_2351			TRUE	0.995	26.000	0.181	NA	Y	0.841
331178	331179	lp_2351	lp_2352			TRUE	0.998	-7.000	0.642	1.000	Y	0.841
331179	331180	lp_2352	lp_2353		gcsH2	FALSE	0.292	368.000	0.000	1.000	N	0.622
331180	331181	lp_2353	lp_2354	gcsH2	rodA2	TRUE	0.991	31.000	0.222	1.000	N	0.780
331181	331182	lp_2354	lp_2357	rodA2		FALSE	0.183	148.000	0.243	NA		-0.216
331182	331183	lp_2357	lp_2358		hlyA	FALSE	0.109	-16.000	0.018	NA		-0.186
331183	331184	lp_2358	lp_2359	hlyA	mreB2	TRUE	0.984	7.000	0.013	NA		0.830
331184	331185	lp_2359	lp_2360	mreB2		TRUE	0.812	124.000	0.000	1.000	N	0.732
331185	331186	lp_2360	lp_2361		murA2	TRUE	0.865	108.000	0.000	1.000	N	0.800
331186	331187	lp_2361	lp_2363	murA2	atpC	FALSE	0.022	974.000	0.000	1.000	N	0.310
331187	331188	lp_2363	lp_2364	atpC	atpD	TRUE	0.998	12.000	0.837	0.003	Y	0.764
331188	331189	lp_2364	lp_2365	atpD	atpG	TRUE	0.998	25.000	0.724	0.003	Y	0.804
331189	331190	lp_2365	lp_2366	atpG	atpA	TRUE	0.998	30.000	0.846	0.003	Y	0.917
331190	331191	lp_2366	lp_2367	atpA	atpH	TRUE	0.998	23.000	0.864	0.003	Y	0.859
331191	331192	lp_2367	lp_2368	atpH	atpF	TRUE	0.997	-10.000	0.222	0.003	Y	0.870
331192	331193	lp_2368	lp_2369	atpF	atpE	TRUE	0.989	54.000	0.402	0.003		0.911
331193	331194	lp_2369	lp_2370	atpE	atpB	TRUE	0.988	38.000	0.189	0.003		0.837
331194	331195	lp_2370	lp_2371	atpB	pyrP	FALSE	0.002	278.000	0.000	1.000	N	0.106
331195	331196	lp_2371	lp_2374	pyrP	upp	FALSE	0.058	1153.000	0.101	1.000	Y	0.130
331196	331197	lp_2374	lp_2375	upp	glyA	TRUE	0.950	80.000	0.021	1.000	N	0.905
331197	331198	lp_2375	lp_2376	glyA		TRUE	0.925	59.000	0.088	NA	N	0.504
331198	331199	lp_2376	lp_2377		hemK	TRUE	0.779	291.000	0.204	NA	Y	0.726
331199	331200	lp_2377	lp_2378	hemK	prfA	TRUE	0.993	-7.000	0.084	1.000	Y	0.690
331200	331201	lp_2378	lp_2379	prfA	tdk	TRUE	0.988	14.000	0.062	1.000	N	0.747
331202	331203	lp_2380	lp_2382	murC	cobQ	TRUE	0.996	3.000	0.796	1.000		0.717
331204	331205	lp_2384	lp_2385	pmi		FALSE	0.525	77.000	0.140	1.000	N	0.133
331205	331206	lp_2385	lp_2388			FALSE	0.487	171.000	0.000	NA		0.573
331206	331207	lp_2388	lp_2390		bcaT	FALSE	0.002	252.000	0.000	NA		0.075
331209	331210	lp_2393	lp_2394			TRUE	0.981	15.000	0.000	NA		0.894
331210	331211	lp_2394	lp_2395			TRUE	0.998	0.000	0.467	0.007	Y	0.845
331211	331212	lp_2395	lp_2396			FALSE	0.010	228.000	0.000	NA		0.243
331214	331215	lp_2399	lp_2400			TRUE	0.977	-13.000	0.000	NA		0.705
331215	331216	lp_2400	lp_2401			TRUE	0.969	1.000	0.000	NA		0.640
331216	331217	lp_2401	lp_2402			TRUE	0.938	12.000	0.000	NA		0.535
331217	331218	lp_2402	lp_2403			FALSE	0.082	12.000	0.000	NA		0.199
331218	331219	lp_2403	lp_2404			TRUE	0.961	-3.000	0.000	NA		0.576
331219	331220	lp_2404	lp_2405			TRUE	0.910	22.000	0.000	1.000		0.465
331220	331221	lp_2405	lp_2406			TRUE	0.954	-10.000	0.000	NA		0.539
331221	331222	lp_2406	lp_2407			TRUE	0.980	-3.000	0.000	NA		0.781
331222	331223	lp_2407	lp_2408			TRUE	0.996	-3.000	1.000	NA		0.633
331223	331224	lp_2408	lp_2409			TRUE	0.990	10.000	0.600	NA		0.546
331224	331225	lp_2409	lp_2410			TRUE	0.931	0.000	0.000	NA		0.496
331225	331226	lp_2410	lp_2411			TRUE	0.948	45.000	0.000	NA		0.773
331226	331227	lp_2411	lp_2412			TRUE	0.988	34.000	0.235	NA		0.742
331227	331228	lp_2412	lp_2413			TRUE	0.989	12.000	0.500	NA		0.554
331228	331229	lp_2413	lp_2414			TRUE	0.992	2.000	0.333	NA		0.648
331229	331230	lp_2414	lp_2415			TRUE	0.992	-10.000	0.500	NA		0.551
331230	331231	lp_2415	lp_2416			TRUE	0.979	-10.000	0.750	NA		0.345
331231	331232	lp_2416	lp_2417			TRUE	0.970	15.000	0.750	NA		0.313
331232	331233	lp_2417	lp_2418			TRUE	0.975	17.000	0.000	NA		0.744
331233	331234	lp_2418	lp_2419			TRUE	0.771	107.000	0.000	NA		0.628
331234	331235	lp_2419	lp_2420			TRUE	0.995	3.000	0.571	NA		0.711
331235	331236	lp_2420	lp_2421			TRUE	0.982	-10.000	0.000	NA		0.804
331236	331237	lp_2421	lp_2422			TRUE	0.973	-61.000	0.000	0.002		0.611
331237	331238	lp_2422	lp_2423			FALSE	0.121	205.000	0.000	0.002		0.364
331238	331239	lp_2423	lp_2424			FALSE	0.526	198.000	0.000	NA		0.684
331239	331240	lp_2424	lp_2425			TRUE	0.881	-31.000	0.000	NA		0.413
331240	401590	lp_2425	lp_tRNA62		tRNA-Trp	FALSE	0.001	880.000	0.000	NA		0.017
401590	401589	lp_tRNA62	lp_tRNA63	tRNA-Trp	tRNA-Asn	FALSE	0.562	70.000	0.000	NA		NA
401589	331241	lp_tRNA63	lp_2426	tRNA-Asn		FALSE	0.327	122.000	0.000	NA		NA
331241	331242	lp_2426	lp_2427			TRUE	0.860	79.000	0.000	NA		0.647
331242	331243	lp_2427	lp_2428			TRUE	0.963	31.000	0.000	NA		0.710
331243	331244	lp_2428	lp_2429			TRUE	0.970	34.000	0.000	NA		0.848
331244	331245	lp_2429	lp_2430			TRUE	0.979	15.000	0.000	NA		0.837
331245	331246	lp_2430	lp_2431			TRUE	0.837	73.000	0.000	NA		0.580
331246	331247	lp_2431	lp_2432			FALSE	0.734	149.000	0.000	NA		0.765
331247	331248	lp_2432	lp_2433			TRUE	0.980	-7.000	0.000	NA		0.758
331248	331249	lp_2433	lp_2434			TRUE	0.952	-3.000	0.000	NA		0.543
331249	331250	lp_2434	lp_2435			TRUE	0.849	-3.000	0.000	NA		NA
331250	331251	lp_2435	lp_2436			TRUE	0.849	-3.000	0.000	NA		NA
331251	331252	lp_2436	lp_2437			TRUE	0.965	-3.000	0.000	NA		0.599
331252	331253	lp_2437	lp_2439			TRUE	0.790	98.000	0.000	NA		0.613
331253	331254	lp_2439	lp_2440			TRUE	0.992	3.000	0.150	NA		0.845
331254	331255	lp_2440	lp_2441			TRUE	0.980	7.000	0.000	NA		0.881
331257	331258	lp_2444	lp_2445			TRUE	0.928	68.000	0.000	NA		0.819
331258	331259	lp_2445	lp_2446			TRUE	0.960	42.000	0.000	NA		0.857
331259	331260	lp_2446	lp_2447			TRUE	0.983	-3.000	0.000	NA		0.848
331261	331262	lp_2448	lp_2449			TRUE	0.954	42.000	0.000	1.000		0.778
331262	331263	lp_2449	lp_2450			TRUE	0.978	27.000	0.000	NA		0.891
331263	331264	lp_2450	lp_2451			TRUE	0.788	126.000	0.000	NA		0.750
331264	401581	lp_2451	lp_tRNA64		tRNA-Ile	FALSE	0.649	53.000	0.000	NA		NA
401581	331265	lp_tRNA64	lp_2452	tRNA-Ile		TRUE	0.809	26.000	0.000	NA		NA
331265	401583	lp_2452	lp_tRNA65		tRNA-Met	FALSE	0.054	411.000	0.000	NA		NA
401583	401584	lp_tRNA65	lp_tRNA66	tRNA-Met	tRNA-Gly	TRUE	0.821	6.000	0.000	NA		NA
401584	331266	lp_tRNA66	lp_2453	tRNA-Gly		FALSE	0.667	48.000	0.000	NA		NA
331266	331267	lp_2453	lp_2454			TRUE	0.931	54.000	0.000	0.045		0.691
331267	331268	lp_2454	lp_2455			FALSE	0.112	87.000	0.000	0.045	Y	0.006
401588	331270	lp_tRNA67	lp_2457	tRNA-Glu		FALSE	0.606	50.000	0.000	NA		0.371
331271	331272	lp_2460	lp_2461			FALSE	0.018	83.000	0.000	NA		-0.084
331272	331273	lp_2461	lp_2462			FALSE	0.315	142.000	0.000	NA		0.419
331273	331274	lp_2462	lp_2463			FALSE	0.049	95.000	0.000	NA		0.241
331274	331275	lp_2463	lp_2464			TRUE	0.961	22.000	0.750	NA		0.248
331275	331276	lp_2464	lp_2466			TRUE	0.759	155.000	0.500	NA		0.446
331276	331277	lp_2466	lp_2467			TRUE	0.984	-3.000	0.750	NA		0.404
331277	331278	lp_2467	lp_2469			FALSE	0.022	783.000	0.000	NA		0.343
331278	331279	lp_2469	lp_2470			TRUE	0.809	-7.000	0.000	NA		0.364
331279	331280	lp_2470	lp_2471			TRUE	0.758	-13.000	0.000	NA		0.336
331280	331281	lp_2471	lp_2472			TRUE	0.942	22.000	0.000	NA		0.533
331281	331282	lp_2472	lp_2473			FALSE	0.163	146.000	0.000	NA		0.342
331282	331283	lp_2473	lp_2474			TRUE	0.952	0.000	0.000	NA		0.551
331283	331284	lp_2474	lp_2475			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		0.349
331284	331285	lp_2475	lp_2476			FALSE	0.010	121.000	0.000	NA		-0.018
331285	331286	lp_2476	lp_2477			FALSE	0.474	43.000	0.000	NA		0.315
331287	331288	lp_2479	lp_2480			TRUE	0.950	53.000	0.000	1.000	N	0.777
331288	331289	lp_2480	lp_2482			FALSE	0.111	491.000	0.000	NA		0.501
331289	331290	lp_2482	lp_2483			FALSE	0.410	25.000	0.000	NA		0.262
331291	331292	lp_2484	lp_2485			FALSE	0.425	55.000	0.000	NA		0.317
331292	331293	lp_2485	lp_2486			FALSE	0.237	100.000	0.000	NA		0.323
331293	331294	lp_2486	lp_2488			FALSE	0.004	175.000	0.000	NA		-0.042
331296	331297	lp_2497	lp_2498		tagE4	TRUE	0.928	-28.000	0.000	1.000		0.467
331297	331298	lp_2498	lp_2499	tagE4		TRUE	0.911	18.000	0.000	1.000		0.464
331298	331299	lp_2499	lp_2502		pgi	FALSE	0.001	1021.000	0.000	1.000	N	-0.277
331299	331300	lp_2502	lp_2503	pgi		FALSE	0.443	221.000	0.005	1.000	Y	0.467
331300	331301	lp_2503	lp_2504			FALSE	0.002	235.000	0.000	NA		0.123
331301	331302	lp_2504	lp_2505		hpk7	FALSE	0.002	296.000	0.000	NA		-0.010
331302	331303	lp_2505	lp_2506	hpk7	rrp7	TRUE	0.982	-3.000	0.586	1.000	Y	0.302
331303	331304	lp_2506	lp_2507	rrp7		FALSE	0.001	373.000	0.000	NA		0.109
331304	331305	lp_2507	lp_2508			TRUE	0.937	10.000	0.033	NA		0.449
331307	331308	lp_2510	lp_2512			FALSE	0.002	305.000	0.000	NA		-0.178
331308	331309	lp_2512	lp_2513			FALSE	0.245	76.000	0.000	NA		0.297
331309	331310	lp_2513	lp_2514			FALSE	0.565	214.000	0.000	NA		0.786
331310	331311	lp_2514	lp_2515			FALSE	0.462	106.000	0.044	1.000	N	0.291
331311	331312	lp_2515	lp_2516			FALSE	0.545	59.000	0.000	NA		0.365
331312	331313	lp_2516	lp_2519			FALSE	0.003	562.000	0.000	NA		0.239
331313	331314	lp_2519	lp_2520			TRUE	0.841	67.000	0.000	NA		0.554
331316	331317	lp_2522	lp_2523			FALSE	0.719	26.000	0.000	NA		0.348
331319	331320	lp_2525	lp_2526			FALSE	0.424	85.000	0.000	1.000		0.373
331322	331323	lp_2529	lp_2531		pts18CBA	FALSE	0.003	197.000	0.000	NA		0.037
331323	331324	lp_2531	lp_2532	pts18CBA	panE1	FALSE	0.004	190.000	0.000	1.000	N	-0.113
331324	331325	lp_2532	lp_2534	panE1		FALSE	0.001	606.000	0.000	NA		-0.053
331325	331326	lp_2534	lp_2535		hom1	FALSE	0.006	151.000	0.000	NA		-0.050
331326	331327	lp_2535	lp_2536	hom1	metY	TRUE	0.947	51.000	0.000	1.000	Y	0.611
331327	331328	lp_2536	lp_2537	metY	metA	TRUE	0.985	3.000	0.000	1.000	Y	0.705
331328	331329	lp_2537	lp_2540	metA		FALSE	0.001	1050.000	0.000	NA		0.168
331330	331331	lp_2541	lp_2542			TRUE	0.831	-3.000	0.184	NA		0.100
331331	331332	lp_2542	lp_2543			TRUE	0.995	-13.000	0.895	1.000		0.547
331332	331333	lp_2543	lp_2544		npr2	FALSE	0.002	275.000	0.000	1.000		0.084
331334	331335	lp_2548	lp_2549	hibD		TRUE	0.930	-3.000	0.014	1.000	N	0.401
331335	331336	lp_2549	lp_2550		maa1	FALSE	0.156	176.000	0.000	1.000		0.382
331336	331337	lp_2550	lp_2551	maa1	hisC	FALSE	0.097	186.000	0.000	1.000		0.343
331337	331338	lp_2551	lp_2552	hisC	hisE	TRUE	0.797	12.000	0.000	0.004	Y	0.238
331338	331339	lp_2552	lp_2553	hisE	hisI	TRUE	0.743	141.000	0.152	0.004	Y	0.399
331339	331340	lp_2553	lp_2554	hisI	hisF	TRUE	0.996	-3.000	0.430	0.004	Y	0.604
331340	331341	lp_2554	lp_2556	hisF	hisA	TRUE	0.996	-6.000	0.433	0.004	Y	0.598
331341	331342	lp_2556	lp_2557	hisA	hisH	TRUE	0.988	-25.000	0.124	0.004	Y	0.503
331342	331343	lp_2557	lp_2558	hisH	hisB	TRUE	0.994	1.000	0.125	0.004	Y	0.722
331343	331344	lp_2558	lp_2559	hisB	hisD	TRUE	0.980	67.000	0.096	0.004	Y	0.773
331344	331345	lp_2559	lp_2560	hisD	hisG	TRUE	0.994	0.000	0.254	0.004	Y	0.584
331345	331346	lp_2560	lp_2561	hisG	hisX	TRUE	0.996	-7.000	0.239	0.004	Y	0.660
331346	331347	lp_2561	lp_2563	hisX	hisK	FALSE	0.035	466.000	0.026	0.004	Y	0.002
331348	331349	lp_2564	lp_2565			FALSE	0.018	84.000	0.000	NA	N	0.158
331349	331350	lp_2565	lp_2566			FALSE	0.086	15.000	0.000	NA		0.184
331351	331352	lp_2567	lp_2568			FALSE	0.321	49.000	0.000	1.000		0.278
331352	331353	lp_2568	lp_2569			TRUE	0.894	39.000	0.000	NA		0.533
331353	331354	lp_2569	lp_2570		asd2	FALSE	0.002	318.000	0.000	NA		-0.093
331356	331357	lp_2573	lp_2574			TRUE	0.819	0.000	0.000	NA		0.378
331359	331360	lp_2578	lp_2579			FALSE	0.001	362.000	0.000	1.000		0.136
331361	331362	lp_2580	lp_2582		glpQ4	FALSE	0.001	382.000	0.000	1.000	N	0.018
331363	331364	lp_2584	lp_2585		trxB2	FALSE	0.001	392.000	0.000	NA		-0.290
331365	331366	lp_2586	lp_2588			FALSE	0.072	273.000	0.000	NA		0.370
331367	331368	lp_2589	lp_2590			TRUE	0.980	20.000	0.000	NA		0.822
331369	331370	lp_2591	lp_2593		rnh	FALSE	0.054	148.000	0.000	1.000	N	0.230
331371	331372	lp_2594	lp_2595			TRUE	0.972	4.000	0.000	NA	Y	0.556
331372	331373	lp_2595	lp_2596		pflA1	FALSE	0.043	336.000	0.000	NA	N	0.322
331374	331375	lp_2597	lp_2598		pflB1	FALSE	0.575	223.000	0.000	1.000	N	0.761
331375	331376	lp_2598	lp_2599	pflB1		FALSE	0.003	633.000	0.000	1.000	N	0.199
331376	331377	lp_2599	lp_2600		tal1	FALSE	0.007	142.000	0.000	1.000	N	0.021
331378	331379	lp_2601	lp_2602		ccpB	TRUE	0.973	16.000	0.000	1.000		0.718
331381	331382	lp_2604	lp_2606			FALSE	0.305	223.000	0.000	0.036		0.515
331383	331384	lp_2608	lp_2610		dxs	FALSE	0.010	270.000	0.000	1.000	N	0.206
331384	331385	lp_2610	lp_2612	dxs		FALSE	0.001	437.000	0.000	0.051	N	0.049
331386	331387	lp_2613	lp_2614			TRUE	0.995	-10.000	0.333	NA		0.775
331387	331388	lp_2614	lp_2615			TRUE	0.997	-19.000	0.478	1.000	N	0.866
331390	331391	lp_2617	lp_2620	ISP1		FALSE	0.049	860.000	0.000	1.000	N	NA
331392	331393	lp_2621	lp_2622	pepF2		TRUE	0.957	18.000	0.009	1.000		0.515
331393	331394	lp_2622	lp_2623			TRUE	0.991	10.000	0.364	NA		0.659
331395	331396	lp_2624	lp_2625			TRUE	0.941	-18.000	0.000	NA		0.500
331396	331397	lp_2625	lp_2629		pox3	FALSE	0.001	726.000	0.000	NA		0.206
331399	331400	lp_2631	lp_2633		trxH	FALSE	0.003	191.000	0.000	1.000		-0.018
331400	331401	lp_2633	lp_2634	trxH	metB	FALSE	0.023	72.000	0.000	1.000	N	-0.063
331401	331402	lp_2634	lp_2635	metB		FALSE	0.001	448.000	0.000	NA		-0.225
331402	331403	lp_2635	lp_2636			FALSE	0.281	267.000	0.000	NA		0.551
331405	331406	lp_2641	lp_2642			TRUE	0.979	34.000	0.105	NA		0.666
331406	331407	lp_2642	lp_2643		lplA1	TRUE	0.993	-10.000	0.182	NA		0.737
331407	331408	lp_2643	lp_2645	lplA1	acm2	FALSE	0.002	502.000	0.000	1.000	N	0.183
331408	331409	lp_2645	lp_2647	acm2	pts19A	FALSE	0.001	480.000	0.000	1.000	N	-0.043
331409	331410	lp_2647	lp_2648	pts19A	pts19D	TRUE	0.991	2.000	0.080	0.022	Y	0.627
331410	331411	lp_2648	lp_2649	pts19D	pts19C	TRUE	0.996	-10.000	0.222	0.022	Y	0.709
331411	331412	lp_2649	lp_2650	pts19C	pts19B	TRUE	0.992	1.000	0.333	0.022	Y	0.525
331412	331413	lp_2650	lp_2651	pts19B		TRUE	0.894	31.000	0.000	1.000	N	0.459
331414	331415	lp_2652	lp_2653		rluA	TRUE	0.899	86.000	0.033	1.000	N	0.609
331415	331416	lp_2653	lp_2654	rluA		TRUE	0.883	78.000	0.000	1.000		0.706
331417	331418	lp_2658	lp_2659		xpk1	FALSE	0.012	407.000	0.000	1.000	N	0.239
331418	331419	lp_2659	lp_2660	xpk1	est1	FALSE	0.471	230.000	0.000	NA		0.692
331419	331420	lp_2660	lp_2661	est1		TRUE	0.969	15.000	0.000	NA		0.674
331421	331422	lp_2662	lp_2663			TRUE	0.958	5.000	0.010	1.000		0.529
331423	331424	lp_2664	lp_2665		rrp8	TRUE	0.979	10.000	0.000	1.000		0.877
331424	331425	lp_2665	lp_2666	rrp8		FALSE	0.291	177.000	0.000	NA		0.466
331427	331428	lp_2668	lp_2669	hsp2		TRUE	0.976	29.000	0.000	NA		0.871
331429	331430	lp_2671	lp_2673		nrdI	FALSE	0.586	308.000	0.235	NA		0.609
331431	331432	lp_2674	lp_2675			FALSE	0.025	164.000	0.000	0.070	N	0.190
331433	331434	lp_2676	lp_2677			FALSE	0.141	86.000	0.000	1.000	N	0.233
331434	331435	lp_2677	lp_2680			FALSE	0.001	408.000	0.000	NA		0.210
331435	331436	lp_2680	lp_2681		gpd	TRUE	0.759	118.000	0.000	NA		0.650
331438	331439	lp_2684	lp_2685	araT2	dapA2	FALSE	0.738	5.000	0.000	1.000	Y	0.209
331444	331445	lp_2693	lp_2694	rexA	rexB	TRUE	0.997	-7.000	0.276	1.000	Y	0.752
331445	331446	lp_2694	lp_2696	rexB		FALSE	0.095	395.000	0.000	NA		0.448
331446	331447	lp_2696	lp_2697		pyrE	TRUE	0.980	16.000	0.000	NA		0.846
331447	331448	lp_2697	lp_2698	pyrE	pyrF	TRUE	0.996	2.000	0.133	1.000	Y	0.970
331448	331449	lp_2698	lp_2699	pyrF	pyrD	TRUE	0.997	-3.000	0.154	0.001	Y	0.934
331449	331450	lp_2699	lp_2700	pyrD	pyrAB	TRUE	0.982	43.000	0.018	0.042	Y	0.786
331450	331451	lp_2700	lp_2701	pyrAB	pyrAA	TRUE	0.996	-7.000	0.117	0.002	Y	0.765
331451	331452	lp_2701	lp_2702	pyrAA	pyrC	TRUE	0.996	-3.000	0.155	1.000	Y	0.931
331452	331453	lp_2702	lp_2703	pyrC	pyrB	TRUE	0.998	4.000	0.452	1.000	Y	0.926
331453	331454	lp_2703	lp_2704	pyrB	pyrR1	TRUE	0.952	147.000	0.247	1.000	Y	0.878
331455	331456	lp_2708	lp_2710	pucR	pucK	FALSE	0.002	260.000	0.000	1.000	N	0.121
331456	331457	lp_2710	lp_2712	pucK		FALSE	0.053	345.000	0.000	0.038		0.361
331459	331460	lp_2714	lp_2715			TRUE	0.994	-7.000	0.333	NA		0.716
331460	331461	lp_2715	lp_2716		ica3	TRUE	0.969	13.000	0.667	NA		0.335
331462	331463	lp_2718	lp_2719		purD	FALSE	0.551	179.000	0.000	NA		0.661
331463	331464	lp_2719	lp_2720	purD	purH	TRUE	0.996	20.000	0.238	1.000	Y	0.784
331464	331465	lp_2720	lp_2721	purH	purN	TRUE	0.997	2.000	0.225	1.000	Y	0.950
331465	331466	lp_2721	lp_2722	purN	purM	TRUE	0.997	-7.000	0.238	0.002	Y	0.961
331466	331467	lp_2722	lp_2723	purM	purF	TRUE	0.997	-3.000	0.248	1.000	Y	0.946
331467	331468	lp_2723	lp_2724	purF	purL	TRUE	0.997	-15.000	0.223	1.000	Y	0.975
331468	331469	lp_2724	lp_2725	purL	purQ	TRUE	0.998	-7.000	0.346	0.001	Y	0.952
331469	331470	lp_2725	lp_2726	purQ	purS	TRUE	0.998	0.000	0.656	0.001	Y	0.929
331470	331471	lp_2726	lp_2727	purS	purC	TRUE	0.998	2.000	0.460	1.000	Y	0.945
331471	331472	lp_2727	lp_2728	purC	purK1	TRUE	0.993	3.000	0.013	0.093	Y	0.955
331472	331473	lp_2728	lp_2729	purK1	purE	TRUE	0.995	-16.000	0.024	0.001	Y	0.941
331473	331474	lp_2729	lp_2732	purE		FALSE	0.001	568.000	0.000	NA		-0.440
331474	331475	lp_2732	lp_2733			TRUE	0.991	15.000	0.143	NA		0.815
331475	331476	lp_2733	lp_2734		lplA2	FALSE	0.154	231.000	0.000	NA		0.429
331476	331477	lp_2734	lp_2735	lplA2	ptp3	TRUE	0.939	12.000	0.000	1.000	N	0.508
331478	331479	lp_2736	lp_2737	cah		TRUE	0.967	23.000	0.000	NA		0.659
331481	331482	lp_2739	lp_2740			TRUE	0.992	31.000	0.583	1.000		0.684
331482	331483	lp_2740	lp_2741			TRUE	0.781	23.000	0.000	NA		0.367
331483	331484	lp_2741	lp_2742			TRUE	0.971	28.000	0.000	NA		0.753
331484	331485	lp_2742	lp_2743			TRUE	0.998	-3.000	0.833	1.000	N	0.788
331485	331486	lp_2743	lp_2744			TRUE	0.987	-10.000	0.111	NA		0.621
331491	331492	lp_2751	lp_2753			FALSE	0.078	328.000	0.000	NA		0.407
331492	331493	lp_2753	lp_2754			FALSE	0.460	205.000	0.000	NA		0.622
331496	331497	lp_2758	lp_2759	thrC		TRUE	0.966	15.000	0.000	1.000		0.639
331497	331498	lp_2759	lp_2760			TRUE	0.859	72.000	0.000	NA		0.611
331499	331500	lp_2761	lp_2762			FALSE	0.138	15.000	0.000	1.000		0.231
331500	331501	lp_2762	lp_2763			FALSE	0.729	16.000	0.000	1.000		0.340
331501	331502	lp_2763	lp_2764			TRUE	0.978	16.000	0.000	1.000	N	0.734
331502	331503	lp_2764	lp_2765			TRUE	0.985	0.000	0.710	NA		0.432
331504	331505	lp_2766	lp_2767			TRUE	0.979	28.000	0.167	1.000		0.563
331505	331506	lp_2767	lp_2768			FALSE	0.001	890.000	0.000	NA		0.037
331509	331510	lp_2772	lp_2773			TRUE	0.982	5.000	0.024	1.000	N	0.666
331510	331511	lp_2773	lp_2774			TRUE	0.997	17.000	0.713	0.093	Y	0.707
331511	331512	lp_2774	lp_2776		dsdA	FALSE	0.003	220.000	0.000	1.000	N	0.163
331512	331513	lp_2776	lp_2777	dsdA	pbg4	FALSE	0.001	510.000	0.000	1.000	N	0.174
331513	331514	lp_2777	lp_2778	pbg4	pbg5	TRUE	0.997	18.000	0.286	0.003	Y	0.923
331514	331515	lp_2778	lp_2780	pbg5	pts20A	TRUE	0.931	194.000	0.429	1.000	Y	0.888
331515	331516	lp_2780	lp_2781	pts20A	pts20B	TRUE	0.984	101.000	0.429	0.020	Y	0.951
331517	331518	lp_2782	lp_2783			FALSE	0.015	93.000	0.000	NA	N	0.163
331518	331519	lp_2783	lp_2785		pgm7	FALSE	0.064	303.000	0.000	NA	N	0.344
331520	331521	lp_2786	lp_2787			FALSE	0.004	188.000	0.000	NA		0.120
331522	331523	lp_2788	lp_2789	panE2		TRUE	0.883	73.000	0.000	1.000	N	0.625
331524	331525	lp_2790	lp_2792	serA3		FALSE	0.002	276.000	0.000	1.000		0.012
331525	331526	lp_2792	lp_2793			FALSE	0.001	334.000	0.000	NA		-0.333
331528	331529	lp_2795	lp_2796			FALSE	0.648	23.000	0.000	0.007		0.292
331529	331530	lp_2796	lp_2797			FALSE	0.001	468.000	0.000	NA		-0.197
331530	331531	lp_2797	lp_2798		aroC1	TRUE	0.942	-3.000	0.000	NA		0.510
331532	331533	lp_2799	lp_2800			FALSE	0.110	-31.000	0.000	1.000	N	0.146
331534	331535	lp_2802	lp_2803			TRUE	0.893	19.000	0.286	0.036		0.137
401587	2208830	lp_tRNA69	lp_rRNA10	tRNA-Thr		FALSE	0.395	103.000	0.000	NA		NA
2208830	2208831	lp_rRNA10	lp_rRNA11			FALSE	0.552	71.000	0.000	NA		NA
2208831	2208832	lp_rRNA11	lp_rRNA12			FALSE	0.133	206.000	0.000	NA		NA
2208832	331537	lp_rRNA12	lp_2806			FALSE	0.040	590.000	0.000	NA		NA
331537	331538	lp_2806	lp_2807		tyrS	FALSE	0.008	135.000	0.000	NA		0.230
331538	331539	lp_2807	lp_2809	tyrS		FALSE	0.001	425.000	0.000	NA		0.224
331539	331540	lp_2809	lp_2810			TRUE	0.777	146.000	0.000	NA		0.846
331540	331541	lp_2810	lp_2812			FALSE	0.001	474.000	0.000	NA		-0.038
331542	331543	lp_2813	lp_2814			TRUE	0.834	127.000	0.000	NA		0.951
331544	331545	lp_2816	lp_2817			TRUE	0.846	96.000	0.125	NA		0.507
331545	331546	lp_2817	lp_2818			FALSE	0.003	196.000	0.000	1.000	N	0.075
331546	331547	lp_2818	lp_2820			FALSE	0.001	384.000	0.000	NA		-0.085
331548	331549	lp_2822	lp_2823			TRUE	0.973	15.000	0.000	1.000	N	0.669
331550	331551	lp_2824	lp_2825			TRUE	0.954	-3.000	0.262	NA		0.339
331554	331555	lp_2828	lp_2829		mleP3	TRUE	0.816	69.000	0.000	NA		0.534
331556	331557	lp_2830	lp_2833	ansB		FALSE	0.003	1058.000	0.000	1.000	N	0.197
331557	331558	lp_2833	lp_2835			FALSE	0.448	119.000	0.000	1.000		0.438
331559	331560	lp_2836	lp_2839			TRUE	0.759	-3.000	0.000	NA		0.341
331561	331562	lp_2840	lp_2841			FALSE	0.058	84.000	0.000	NA		0.241
331564	331565	lp_2843	lp_2844	tagE5	tagE6	TRUE	0.989	-3.000	0.000	0.014	Y	0.751
331566	331567	lp_2845	lp_2847			FALSE	0.095	468.000	0.000	0.005		0.455
331567	331568	lp_2847	lp_2848		ogt	FALSE	0.054	182.000	0.000	1.000		0.294
331568	331569	lp_2848	lp_2849	ogt		FALSE	0.174	923.000	0.000	1.000		0.619
331569	331570	lp_2849	lp_2850			TRUE	0.989	-7.000	0.029	NA		0.805
331571	331572	lp_2851	lp_2852			TRUE	0.897	14.000	0.000	1.000		0.451
331572	331573	lp_2852	lp_2853			TRUE	0.936	34.000	0.375	1.000		0.332
331575	331576	lp_2855	lp_2856	dapE2		FALSE	0.188	90.000	0.000	1.000	N	0.251
331576	5937133	lp_2856	lp_2857			FALSE	0.105	-6.000	0.000	NA		0.138
5937133	5937134	lp_2857	lp_2858			TRUE	0.958	-13.000	0.000	NA		0.553
5937134	331577	lp_2858	lp_2860		nth1	FALSE	0.031	503.000	0.000	NA		0.359
331577	331578	lp_2860	lp_2861	nth1	thgA3	FALSE	0.570	139.000	0.000	1.000		0.538
331579	331580	lp_2862	lp_2863	sip1	sip2	TRUE	0.906	89.000	0.000	0.001	Y	0.636
331581	331582	lp_2864	lp_2865			TRUE	0.879	-28.000	0.000	NA		0.411
331582	331583	lp_2865	lp_2866			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		0.536
331583	331584	lp_2866	lp_2867			TRUE	0.792	35.000	0.000	NA		0.417
331584	331585	lp_2867	lp_2868		pgm8	FALSE	0.516	95.000	0.000	NA		0.428
331585	331586	lp_2868	lp_2870	pgm8		FALSE	0.013	557.000	0.000	NA		0.299
331586	331587	lp_2870	lp_2871			TRUE	0.986	21.000	0.125	NA		0.629
331587	331588	lp_2871	lp_2872			FALSE	0.074	172.000	0.125	1.000		-0.036
331588	331589	lp_2872	lp_2873		adh2	TRUE	0.914	10.000	0.000	1.000		0.485
331589	331590	lp_2873	lp_2874	adh2		TRUE	0.933	21.000	0.051	1.000	N	0.384
331590	331591	lp_2874	lp_2876			FALSE	0.001	441.000	0.000	NA		0.172
331591	331592	lp_2876	lp_2877			FALSE	0.002	256.000	0.000	NA		0.133
331592	331593	lp_2877	lp_2878		maa2	FALSE	0.023	72.000	0.000	1.000		-0.086
331595	331596	lp_2880	lp_2882		chpA	FALSE	0.167	454.000	0.000	NA		0.559
331596	331597	lp_2882	lp_2883	chpA		FALSE	0.368	0.000	0.000	NA		0.249
331597	331598	lp_2883	lp_2885			FALSE	0.001	734.000	0.000	NA		-0.275
331598	331599	lp_2885	lp_2887			FALSE	0.001	827.000	0.000	NA		0.226
331599	331600	lp_2887	lp_2888		patB	FALSE	0.006	149.000	0.000	1.000		0.109
331600	331601	lp_2888	lp_2889	patB		TRUE	0.912	-10.000	0.386	NA		0.109
331601	331602	lp_2889	lp_2890			FALSE	0.495	103.000	0.000	NA		0.434
331602	331603	lp_2890	lp_2893			FALSE	0.001	638.000	0.000	1.000	N	0.007
331603	331604	lp_2893	lp_2894			TRUE	0.993	0.000	0.911	0.006	Y	0.430
5937135	5937136	lp_2896	lp_2897			TRUE	0.971	31.000	0.000	NA		0.813
331607	331608	lp_2901	lp_2902			TRUE	0.992	25.000	0.500	NA		0.639
331608	331609	lp_2902	lp_2903			TRUE	0.903	6.000	0.000	0.060	Y	0.364
331609	331610	lp_2903	lp_2906		endA	FALSE	0.001	498.000	0.000	1.000		-0.039
331610	331611	lp_2906	lp_2907	endA		FALSE	0.021	77.000	0.000	1.000		0.080
331611	331612	lp_2907	lp_2909			FALSE	0.026	263.000	0.000	0.050	Y	0.077
331612	331613	lp_2909	lp_2911			FALSE	0.016	601.000	0.000	1.000		0.307
331613	331614	lp_2911	lp_2912			FALSE	0.078	93.000	0.000	1.000		0.247
331614	331615	lp_2912	lp_2913			FALSE	0.002	314.000	0.000	1.000		-0.279
331615	331616	lp_2913	lp_2914			FALSE	0.718	87.000	0.000	NA		0.516
331619	331620	lp_2918	lp_2919	ropB	pepR2	FALSE	0.016	435.000	0.000	1.000		0.296
331620	331621	lp_2919	lp_2920	pepR2		FALSE	0.480	146.000	0.000	1.000		0.501
331622	331623	lp_2921	lp_2922		npp	FALSE	0.690	62.000	0.068	1.000		0.303
331623	331624	lp_2922	lp_2923	npp		FALSE	0.009	127.000	0.000	0.021		0.053
331626	331627	lp_2925	lp_2926			FALSE	0.015	417.000	0.000	1.000		0.286
331627	331628	lp_2926	lp_2927		pts21A	FALSE	0.044	513.000	0.000	1.000		0.394
331628	331629	lp_2927	lp_2929	pts21A		FALSE	0.001	445.000	0.000	1.000	N	0.004
331629	331630	lp_2929	lp_2930			TRUE	0.974	16.000	0.000	NA	Y	0.572
331630	331631	lp_2930	lp_2931		nrdG	FALSE	0.003	212.000	0.000	NA	N	-0.166
331631	331632	lp_2931	lp_2932	nrdG	nrdD	TRUE	0.996	-34.000	0.240	1.000	N	0.832
331633	331634	lp_2934	lp_2935		def2	FALSE	0.211	143.000	0.000	NA		0.367
331634	331635	lp_2935	lp_2936	def2	apbE2	TRUE	0.961	40.000	0.000	1.000	N	0.765
331636	331637	lp_2937	lp_2939			FALSE	0.053	176.000	0.000	NA		0.289
331637	331638	lp_2939	lp_2940			FALSE	0.002	313.000	0.000	NA		-0.085
331640	331641	lp_2943	lp_2945		ubiD	FALSE	0.008	137.000	0.000	NA	N	-0.036
331642	331643	lp_2946	lp_2948			FALSE	0.028	348.000	0.000	NA		0.319
331643	331644	lp_2948	lp_2949			TRUE	0.946	19.000	0.000	NA		0.537
331645	331646	lp_2952	lp_2953			FALSE	0.032	152.000	0.000	NA		0.249
331646	331647	lp_2953	lp_2954			FALSE	0.005	165.000	0.000	NA		-0.029
331647	331648	lp_2954	lp_2956			FALSE	0.004	179.000	0.000	NA		-0.258
331648	331649	lp_2956	lp_2958		wapA	FALSE	0.002	324.000	0.000	NA		0.113
331649	331650	lp_2958	lp_2959	wapA		FALSE	0.008	136.000	0.000	1.000		0.053
331653	331654	lp_2964	lp_2965			FALSE	0.663	103.000	0.000	NA		0.518
331654	331655	lp_2965	lp_2966		lmrA	FALSE	0.026	193.000	0.000	NA	N	0.229
331655	331656	lp_2966	lp_2967	lmrA		FALSE	0.735	29.000	0.000	1.000	N	0.331
331656	331657	lp_2967	lp_2968			FALSE	0.021	152.000	0.000	1.000	N	0.197
331659	331660	lp_2972	lp_2973			TRUE	0.958	-103.000	0.500	1.000		0.248
331660	331661	lp_2973	lp_2974			TRUE	0.987	18.000	0.500	1.000		0.500
331661	331662	lp_2974	lp_2975			FALSE	0.025	442.000	0.000	NA		0.330
331662	331663	lp_2975	lp_2976			TRUE	0.981	-3.000	0.000	NA		0.787
331663	331664	lp_2976	lp_2977			TRUE	0.901	82.000	0.000	NA		0.822
331664	331665	lp_2977	lp_2978			TRUE	0.913	74.000	0.000	NA		0.808
331665	5937138	lp_2978	lp_2979			FALSE	0.016	641.000	0.000	NA		0.312
5937138	5937139	lp_2979	lp_2980			TRUE	0.970	8.000	0.000	NA		0.707
5937139	331666	lp_2980	lp_2981		livE	TRUE	0.960	3.000	0.000	NA		0.593
331666	331667	lp_2981	lp_2982	livE	livD	TRUE	0.995	1.000	0.107	0.020	Y	0.763
331667	331668	lp_2982	lp_2983	livD	livC	TRUE	0.992	-7.000	0.067	1.000	Y	0.636
331668	331669	lp_2983	lp_2984	livC	livB	TRUE	0.989	17.000	0.363	0.037	Y	0.463
331669	331670	lp_2984	lp_2985	livB	livA	TRUE	0.956	31.000	0.150	NA	Y	0.371
331670	331671	lp_2985	lp_2987	livA		FALSE	0.002	569.000	0.000	NA		0.235
331671	331672	lp_2987	lp_2988		zmp3	FALSE	0.015	95.000	0.000	NA		-0.045
331672	331673	lp_2988	lp_2989	zmp3	gtcA3	FALSE	0.003	233.000	0.000	1.000		0.137
331673	331674	lp_2989	lp_2991	gtcA3		FALSE	0.001	405.000	0.000	1.000		0.135
331675	331676	lp_2992	lp_2993	mntH2		TRUE	0.997	0.000	0.667	1.000	N	0.807
331676	331677	lp_2993	lp_2994			TRUE	0.793	123.000	0.000	NA		0.742
331678	5937140	lp_2995	lp_2996			TRUE	0.904	16.000	0.000	NA		0.463
5937140	5937141	lp_2996	lp_2997			FALSE	0.673	45.000	0.000	NA		0.393
5937141	331679	lp_2997	lp_2998			FALSE	0.102	-3.000	0.000	NA		0.056
331679	331680	lp_2998	lp_3000			FALSE	0.001	983.000	0.000	NA	N	0.087
331680	331681	lp_3000	lp_3001			FALSE	0.001	376.000	0.000	1.000		0.136
331681	331682	lp_3001	lp_3002			FALSE	0.003	213.000	0.000	NA		0.053
331682	331683	lp_3002	lp_3003			FALSE	0.058	35.000	0.000	NA		-0.057
331684	331685	lp_3004	lp_3006			FALSE	0.008	131.000	0.000	NA		-0.228
331686	331687	lp_3008	lp_3009	pts23A	pts23B	FALSE	0.029	454.000	0.000	0.020	Y	0.184
331687	331688	lp_3009	lp_3010	pts23B	pts23C	TRUE	0.996	24.000	0.400	0.020	Y	0.705
331688	331689	lp_3010	lp_3011	pts23C	pbg6	TRUE	0.992	0.000	0.294	1.000	Y	0.550
331689	331690	lp_3011	lp_3012	pbg6		FALSE	0.028	197.000	0.000	1.000	Y	0.071
331691	331692	lp_3013	lp_3014			FALSE	0.058	384.000	0.000	1.000		0.393
331692	331693	lp_3014	lp_3015			FALSE	0.001	441.000	0.000	0.002		0.139
331697	331698	lp_3019	lp_3020		tag2	FALSE	0.384	127.000	0.000	NA		0.425
331698	331699	lp_3020	lp_3021	tag2		FALSE	0.026	199.000	0.000	1.000	N	0.226
331700	331701	lp_3022	lp_3023		umuC	TRUE	0.997	0.000	0.740	NA		0.825
331701	331702	lp_3023	lp_3024	umuC		FALSE	0.085	338.000	0.000	1.000	N	0.397
331703	331704	lp_3025	lp_3026			TRUE	0.813	17.000	0.000	NA		0.382
331704	331705	lp_3026	lp_3027			FALSE	0.196	48.000	0.000	NA		0.253
331705	331706	lp_3027	lp_3028			TRUE	0.968	-178.000	0.000	NA		0.598
331706	331707	lp_3028	lp_3029			FALSE	0.089	17.000	0.000	NA		0.140
331707	331708	lp_3029	lp_3030			TRUE	0.933	13.000	0.000	NA		0.519
331708	331709	lp_3030	lp_3031			FALSE	0.367	26.000	0.000	NA		0.257
331709	331710	lp_3031	lp_3032			TRUE	0.976	14.000	0.038	NA		0.607
331710	331711	lp_3032	lp_3033			TRUE	0.805	17.000	0.075	NA		0.223
331711	331712	lp_3033	lp_3034			FALSE	0.388	17.000	0.000	1.000		0.252
331712	331713	lp_3034	lp_3036		ISP1	FALSE	0.129	213.000	0.000	1.000		NA
331714	331715	lp_3038	lp_3040			TRUE	0.865	22.000	0.000	NA		0.421
331715	331716	lp_3040	lp_3042			TRUE	0.990	-7.000	0.720	0.006	Y	0.376
331717	331718	lp_3043	lp_3044	zmp4	amd	FALSE	0.014	403.000	0.000	0.005		0.258
331719	331720	lp_3045	lp_3047			FALSE	0.020	254.000	0.000	NA		0.265
331720	331721	lp_3047	lp_3048			FALSE	0.520	103.000	0.100	NA		0.300
331721	331722	lp_3048	lp_3049			FALSE	0.009	127.000	0.000	1.000		0.119
331723	331724	lp_3050	lp_3051		dhaT	FALSE	0.002	296.000	0.000	NA		0.184
331725	331726	lp_3054	lp_3055		copA	FALSE	0.049	363.000	0.000	1.000	N	0.341
331726	5937142	lp_3055	lp_3057	copA		TRUE	0.979	0.000	0.000	NA		0.769
5937142	5937143	lp_3057	lp_3058			TRUE	0.971	16.000	0.000	NA		0.695
5937143	331727	lp_3058	lp_3059			FALSE	0.001	407.000	0.000	NA		0.028
331727	331728	lp_3059	lp_3060			TRUE	0.748	134.000	0.000	1.000	N	0.648
331728	331729	lp_3060	lp_3062			FALSE	0.001	331.000	0.000	NA		0.094
331729	331730	lp_3062	lp_3063		hpk9	FALSE	0.672	4.000	0.000	NA		0.318
331730	331731	lp_3063	lp_3064	hpk9		FALSE	0.002	270.000	0.000	NA		0.056
331731	331732	lp_3064	lp_3065			FALSE	0.704	-7.000	0.000	NA		0.314
331732	331733	lp_3065	lp_3066			TRUE	0.828	28.000	0.000	NA		0.413
331733	331734	lp_3066	lp_3066a			FALSE	0.629	57.000	0.000	NA		NA
331734	331735	lp_3066a	lp_3067			TRUE	0.821	13.000	0.000	NA		NA
331735	331736	lp_3067	lp_3069			FALSE	0.021	725.000	0.000	NA		0.339
331736	331737	lp_3069	lp_3070			TRUE	0.976	25.000	0.000	NA		0.805
331737	331738	lp_3070	lp_3071			FALSE	0.681	96.000	0.000	NA		0.512
331738	331739	lp_3071	lp_3072			FALSE	0.373	181.000	0.000	NA		0.523
331739	331740	lp_3072	lp_3073			TRUE	0.872	73.000	0.000	NA		0.641
331740	331741	lp_3073	lp_3074			TRUE	0.974	-3.000	0.000	NA		0.677
331741	331742	lp_3074	lp_3075			FALSE	0.448	177.000	0.000	NA		0.564
331742	331743	lp_3075	lp_3077			FALSE	0.001	523.000	0.000	NA		-0.087
331743	331744	lp_3077	lp_3078			FALSE	0.664	136.000	0.000	NA		0.602
331745	331746	lp_3079	lp_3080			FALSE	0.102	-3.000	0.000	NA		0.177
331748	331749	lp_3082	lp_3084			FALSE	0.001	531.000	0.000	NA		-0.168
331750	331751	lp_3085	lp_3087	asnB2	rrp10	FALSE	0.016	495.000	0.000	1.000	N	0.263
331751	331752	lp_3087	lp_3088	rrp10	hpk10	TRUE	0.995	5.000	0.875	1.000	Y	0.524
331752	331753	lp_3088	lp_3090	hpk10		FALSE	0.030	355.000	0.000	1.000	N	0.288
331754	331755	lp_3091	lp_3092		gabD	FALSE	0.047	40.000	0.000	1.000	N	0.125
331762	331763	lp_3099	lp_3100			FALSE	0.044	220.000	0.000	NA		0.302
331763	331764	lp_3100	lp_3101			FALSE	0.456	117.000	0.000	1.000		0.438
331767	331768	lp_3104	lp_3105	fhuC	fhuB	TRUE	0.998	-3.000	0.600	1.000	Y	0.750
331768	331769	lp_3105	lp_3106	fhuB	fhuG	TRUE	0.991	-3.000	0.095	0.036	Y	0.587
331769	331770	lp_3106	lp_3107	fhuG		FALSE	0.074	244.000	0.000	1.000		0.355
331771	331772	lp_3108	lp_3110			FALSE	0.107	294.000	0.000	1.000		0.421
331772	2208844	lp_3110	lp_3111			TRUE	0.870	17.000	0.000	NA		0.424
331773	331774	lp_3112	lp_3113			TRUE	0.875	11.000	0.000	1.000		0.437
331775	331776	lp_3114	lp_3115			FALSE	0.008	469.000	0.000	NA		0.263
331776	331777	lp_3115	lp_3116			FALSE	0.022	74.000	0.000	NA		0.199
331777	331778	lp_3116	lp_3117			FALSE	0.690	53.000	0.000	NA		0.412
331779	331780	lp_3119	lp_3120		lepA2	TRUE	0.968	-3.000	0.000	1.000	N	0.578
331781	331782	lp_3122	lp_3123			FALSE	0.038	302.000	0.000	1.000	N	0.287
331782	331783	lp_3123	lp_3124			FALSE	0.577	155.000	0.000	1.000	N	0.559
331784	331785	lp_3125	lp_3127			FALSE	0.044	456.000	0.000	1.000		0.383
331785	331786	lp_3127	lp_3128			FALSE	0.003	207.000	0.000	1.000		0.052
331787	331788	lp_3129	lp_3130			FALSE	0.043	283.000	0.000	NA		0.328
331788	331789	lp_3130	lp_3131		bglG3	FALSE	0.137	275.000	0.000	NA		0.440
331789	331790	lp_3131	lp_3132	bglG3	pbg7	TRUE	0.988	19.000	0.833	1.000		0.444
331790	331791	lp_3132	lp_3133	pbg7	pts24BCA	TRUE	0.986	4.000	0.750	1.000	Y	0.359
331793	331794	lp_3135	lp_3136	tkt3		TRUE	0.923	50.000	0.000	1.000		0.653
331794	331795	lp_3136	lp_3137		pts25B	TRUE	0.860	16.000	0.182	0.026		0.167
331795	331796	lp_3137	lp_3138	pts25B		TRUE	0.966	-3.000	0.052	0.019	N	0.450
2208845	2208846	lp_3143	lp_3144			FALSE	0.002	251.000	0.000	NA		0.206
2208846	2208847	lp_3144	lp_3145			FALSE	0.271	1.000	0.000	NA		0.242
331800	2208848	lp_3150	lp_3151		acm3-N	FALSE	0.180	471.000	0.000	NA		0.580
2208848	2208849	lp_3151	lp_3153	acm3-N	acm3-M	TRUE	0.837	76.000	0.000	NA		0.590
2208849	2208850	lp_3153	lp_3154	acm3-M	acm3-C	TRUE	0.944	37.000	0.000	NA		0.641
2208850	331801	lp_3154	lp_3155	acm3-C		TRUE	0.876	20.000	0.000	NA		0.424
2208851	2208852	lp_3156	lp_3157			TRUE	0.814	-4.000	0.000	NA		0.367
2208852	331802	lp_3157	lp_3158			FALSE	0.662	12.000	0.000	NA		0.322
331802	331803	lp_3158	lp_3159		baiE	TRUE	0.943	1.000	0.000	NA		0.527
331803	331804	lp_3159	lp_3160	baiE		FALSE	0.083	125.000	0.049	NA		0.085
331804	331805	lp_3160	lp_3161			TRUE	0.960	9.000	0.000	NA		0.620
331805	331806	lp_3161	lp_3164			FALSE	0.002	310.000	0.000	NA		0.144
331806	331807	lp_3164	lp_3165			FALSE	0.001	582.000	0.000	NA		0.163
331807	331808	lp_3165	lp_3168			FALSE	0.006	415.000	0.000	NA		0.248
331808	331809	lp_3168	lp_3169			FALSE	0.001	901.000	0.000	NA		0.125
331809	331810	lp_3169	lp_3170		pmg9	FALSE	0.362	139.000	0.000	NA		0.434
331810	331811	lp_3170	lp_3171	pmg9		FALSE	0.021	76.000	0.000	NA		0.151
331811	331812	lp_3171	lp_3172		xylR	TRUE	0.771	148.000	0.054	NA		0.620
331812	331813	lp_3172	lp_3173	xylR		FALSE	0.001	372.000	0.000	NA		0.151
331815	331816	lp_3175	lp_3176		pkn2	FALSE	0.017	333.000	0.000	NA		0.280
331817	331818	lp_3177	lp_3178			TRUE	0.967	9.000	0.000	NA		0.670
331818	331819	lp_3178	lp_3179			FALSE	0.036	52.000	0.000	NA		0.184
331820	331821	lp_3180	lp_3183			FALSE	0.017	544.000	0.000	NA		0.314
331821	331822	lp_3183	lp_3184			FALSE	0.679	60.000	0.000	NA		0.421
331822	331823	lp_3184	lp_3185			TRUE	0.912	21.000	0.225	NA		0.248
331823	331824	lp_3185	lp_3187		bar	FALSE	0.619	138.000	0.026	NA	N	0.466
331824	331825	lp_3187	lp_3189	bar	dacA1	FALSE	0.046	586.000	0.000	1.000	Y	0.295
331825	331826	lp_3189	lp_3190	dacA1	hpk11	TRUE	0.870	70.000	0.089	1.000	N	0.444
331826	331827	lp_3190	lp_3191	hpk11	rrp11	TRUE	0.997	17.000	0.932	1.000	Y	0.593
331827	331828	lp_3191	lp_3192	rrp11		FALSE	0.016	91.000	0.000	NA		0.107
331828	331829	lp_3192	lp_3193		prtM2	FALSE	0.004	176.000	0.000	NA		-0.034
331829	2208853	lp_3193	lp_3194	prtM2	guaB	FALSE	0.002	269.000	0.000	NA		0.152
2208853	331830	lp_3194	lp_3195	guaB		FALSE	0.227	286.000	0.000	NA		0.524
331830	331831	lp_3195	lp_3196			TRUE	0.975	22.000	0.022	NA		0.603
331831	331832	lp_3196	lp_3197			TRUE	0.980	31.000	0.064	NA		0.703
331832	331833	lp_3197	lp_3198		parB1	TRUE	0.972	25.000	0.039	NA		0.578
331833	331834	lp_3198	lp_3199	parB1	parA	TRUE	0.998	-10.000	0.827	1.000	N	0.962
331834	331835	lp_3199	lp_3200	parA	parB2	TRUE	0.992	3.000	0.069	1.000	N	0.873
331835	331836	lp_3200	lp_3201	parB2	gidB	FALSE	0.656	18.000	0.089	1.000	N	-0.069
331836	331837	lp_3201	lp_3204	gidB	nupC	FALSE	0.001	341.000	0.000	1.000	N	0.096
331840	331841	lp_3207	lp_3209			FALSE	0.239	368.000	0.000	1.000	Y	0.496
331841	331842	lp_3209	lp_3210			TRUE	0.992	69.000	0.594	0.036	Y	0.802
331842	331843	lp_3210	lp_3211			TRUE	0.990	12.000	0.069	1.000	Y	0.654
331843	331844	lp_3211	lp_3214			FALSE	0.409	472.000	0.032	1.000	Y	0.592
331846	331847	lp_3216	lp_3217			TRUE	0.996	-3.000	0.692	NA		0.678
331847	331848	lp_3217	lp_3218			TRUE	0.919	-16.000	0.273	NA		0.207
331849	331850	lp_3219	lp_3220	pts24BCA	agl4	TRUE	0.993	-7.000	0.125	1.000	Y	0.625
331850	331851	lp_3220	lp_3221	agl4		TRUE	0.878	54.000	0.150	1.000	N	0.375
331851	331852	lp_3221	lp_3222			TRUE	0.923	-3.000	0.000	NA		0.469
331852	331853	lp_3222	lp_3223			FALSE	0.031	60.000	0.000	NA		-0.122
331853	331854	lp_3223	lp_3224			FALSE	0.498	76.000	0.000	NA		0.384
331854	331855	lp_3224	lp_3225			TRUE	0.986	-3.000	0.127	NA		0.611
331856	331857	lp_3226	lp_3227			TRUE	0.947	39.000	0.000	NA		0.697
331858	331859	lp_3228	lp_3229		pts27BCA	TRUE	0.970	22.000	0.000	1.000		0.666
331859	331860	lp_3229	lp_3232	pts27BCA		FALSE	0.723	268.000	0.182	NA		0.789
331860	331861	lp_3232	lp_3233			TRUE	0.929	1.000	0.286	NA		0.258
331862	331863	lp_3234	lp_3236			FALSE	0.175	354.000	0.000	1.000	N	0.500
331864	331865	lp_3237	lp_3238			FALSE	0.213	72.000	0.000	1.000		0.273
331865	331866	lp_3238	lp_3239			FALSE	0.372	94.000	0.000	1.000		0.367
331866	331867	lp_3239	lp_3240		pts28ABC	FALSE	0.007	217.000	0.000	1.000	Y	-0.039
331867	331868	lp_3240	lp_3241	pts28ABC	nth2	FALSE	0.003	210.000	0.000	1.000	N	0.003
331868	331869	lp_3241	lp_3243	nth2		FALSE	0.259	116.000	0.010	NA		0.279
331869	331870	lp_3243	lp_3244			TRUE	0.937	35.000	0.000	NA		0.598
331874	331875	lp_3248	lp_3250			FALSE	0.003	195.000	0.000	NA		0.162
331875	331876	lp_3250	lp_3251			FALSE	0.081	25.000	0.000	NA		0.089
331878	331879	lp_3254	lp_3255	lrgA	lrgB	TRUE	0.990	20.000	0.869	1.000		0.477
331879	331880	lp_3255	lp_3256	lrgB		FALSE	0.004	175.000	0.000	NA		0.175
331881	331882	lp_3259	lp_3262		crtN	FALSE	0.001	607.000	0.000	NA		0.046
331882	331883	lp_3262	lp_3263	crtN	crtM	TRUE	0.997	-19.000	0.800	1.000	N	0.680
331883	331884	lp_3263	lp_3265	crtM		FALSE	0.082	362.000	0.000	1.000		0.423
331886	331887	lp_3267	lp_3268	gshR4		FALSE	0.022	180.000	0.000	NA		0.252
331889	331890	lp_3270	lp_3271	purA	guaC	TRUE	0.976	43.000	0.011	1.000	N	0.915
331890	331891	lp_3271	lp_3272	guaC	ptp2	FALSE	0.516	155.000	0.000	1.000	N	0.520
331892	331893	lp_3273	lp_3275	cls		FALSE	0.001	591.000	0.000	NA		0.206
331894	331895	lp_3278	lp_3279		kup2	FALSE	0.002	262.000	0.000	0.066	N	0.058
331896	331897	lp_3280	lp_3281			FALSE	0.001	329.000	0.000	NA		0.177
331899	331900	lp_3284	lp_3285	qacC	qacH	TRUE	0.804	15.000	0.000	0.066	Y	0.243
331900	331901	lp_3285	lp_3286	qacH	hly	FALSE	0.001	352.000	0.000	0.066		0.170
331901	331902	lp_3286	lp_3287	hly		FALSE	0.002	258.000	0.000	1.000		-0.007
331904	331905	lp_3290	lp_3291			FALSE	0.020	78.000	0.000	NA		0.132
331907	331908	lp_3293	lp_3294	tag3	folP	FALSE	0.110	-34.000	0.000	1.000	N	0.149
331908	331909	lp_3294	lp_3295	folP	xtp2	FALSE	0.519	382.000	0.005	1.000	N	0.943
331909	331910	lp_3295	lp_3296	xtp2	folC2	TRUE	0.990	-3.000	0.005	1.000	N	0.980
331910	331911	lp_3296	lp_3297	folC2	folE	TRUE	0.997	9.000	0.462	1.000	Y	0.949
331911	331912	lp_3297	lp_3298	folE	folK	TRUE	0.994	-7.000	0.012	1.000	Y	0.968
331912	331913	lp_3298	lp_3299	folK	folB	TRUE	0.997	-10.000	0.142	1.000	Y	0.983
331913	331914	lp_3299	lp_3301	folB		FALSE	0.003	225.000	0.000	1.000		0.022
331916	331917	lp_3303	lp_3305			FALSE	0.008	359.000	0.000	NA		0.253
2208854	2208855	lp_rRNA13	lp_rRNA14			FALSE	0.552	71.000	0.000	NA		NA
2208855	2208856	lp_rRNA14	lp_rRNA15			FALSE	0.133	206.000	0.000	NA		NA
331921	331922	lp_3313	lp_3314	pflB2	pflA2	TRUE	0.984	37.000	0.082	1.000	N	0.804
331924	331925	lp_3318	lp_3319			FALSE	0.179	170.000	0.000	1.000		0.387
331928	331929	lp_3323	lp_3324			FALSE	0.001	983.000	0.000	1.000		0.144
331932	331933	lp_3331	lp_3332	ISP2-N	ISP2-C	FALSE	0.671	46.000	0.000	NA		NA
331933	331934	lp_3332	lp_3333	ISP2-C		TRUE	0.835	21.000	0.000	NA		NA
331936	331937	lp_3337	lp_3338		nha2	FALSE	0.578	39.000	0.000	NA		0.339
331937	331938	lp_3338	lp_3339	nha2		FALSE	0.001	437.000	0.000	0.066	N	0.060
331938	331939	lp_3339	lp_3341			FALSE	0.002	288.000	0.000	1.000		0.169
331941	331942	lp_3343	lp_3344			TRUE	0.961	5.000	0.238	1.000	N	0.379
331942	331943	lp_3344	lp_3345		nrpR4	FALSE	0.004	171.000	0.000	1.000	N	-0.275
331943	331944	lp_3345	lp_3346	nrpR4		FALSE	0.262	208.000	0.000	NA		0.484
331944	331945	lp_3346	lp_3348			FALSE	0.055	270.000	0.000	NA		0.343
331945	331946	lp_3348	lp_3349		mutY	FALSE	0.633	90.000	0.002	NA		0.430
331946	331947	lp_3349	lp_3350	mutY		FALSE	0.057	68.000	0.000	NA		0.236
331947	331948	lp_3350	lp_3351			TRUE	0.949	35.000	0.000	NA		0.654
331948	331949	lp_3351	lp_3352		hsp3	FALSE	0.239	233.000	0.000	NA		0.495
331949	331950	lp_3352	lp_3353	hsp3		TRUE	0.869	96.000	0.000	NA		0.786
331951	331952	lp_3355	lp_3356			FALSE	0.002	327.000	0.000	1.000		0.016
331953	331954	lp_3358	lp_3359			FALSE	0.001	386.000	0.000	NA		0.116
331954	331955	lp_3359	lp_3360			TRUE	0.996	26.000	0.650	NA		0.822
331955	331956	lp_3360	lp_3362		bsh3	FALSE	0.002	279.000	0.000	NA		0.198
331956	331957	lp_3362	lp_3363	bsh3	copB	TRUE	0.808	97.000	0.000	1.000	N	0.595
331957	331958	lp_3363	lp_3365	copB	copR	FALSE	0.649	320.000	0.667	1.000	N	0.518
331958	331959	lp_3365	lp_3366	copR		FALSE	0.195	198.000	0.000	NA		0.432
331960	2208858	lp_3367	lp_3368		lmrB-N	FALSE	0.085	321.000	0.000	NA		0.411
2208858	2208859	lp_3368	lp_3369	lmrB-N	lmrB-C	TRUE	0.773	10.000	0.000	NA		0.368
331961	331962	lp_3373	lp_3374			FALSE	0.038	49.000	0.000	NA		-0.128
331962	331963	lp_3374	lp_3375			FALSE	0.048	446.000	0.000	NA		0.392
331963	331964	lp_3375	lp_3377			FALSE	0.001	941.000	0.000	NA		0.230
331964	331965	lp_3377	lp_3378			FALSE	0.012	106.000	0.000	NA		-0.129
331965	331966	lp_3378	lp_3379			TRUE	0.911	2.000	0.000	NA		0.465
331966	331967	lp_3379	lp_3380			TRUE	0.753	56.000	0.000	NA		0.447
331967	331968	lp_3380	lp_3381			TRUE	0.861	27.000	0.000	NA		0.434
331968	331969	lp_3381	lp_3382			FALSE	0.189	509.000	0.000	NA		0.609
331969	331970	lp_3382	lp_3383			TRUE	0.921	15.000	0.000	NA		0.495
331970	331971	lp_3383	lp_3384			TRUE	0.955	13.000	0.000	NA		0.587
331971	331972	lp_3384	lp_3385			TRUE	0.974	-7.000	0.000	NA		0.666
331972	331973	lp_3385	lp_3387			FALSE	0.086	312.000	0.000	NA		0.409
331973	331974	lp_3387	lp_3388			FALSE	0.008	139.000	0.000	NA		-0.002
331975	331976	lp_3389	lp_3390			TRUE	0.962	32.000	0.000	1.000		0.714
331976	331977	lp_3390	lp_3391			FALSE	0.689	13.000	0.000	NA		0.330
331977	331978	lp_3391	lp_3392			FALSE	0.063	33.000	0.000	NA		0.199
331979	331980	lp_3393	lp_3394			TRUE	0.799	125.000	0.000	NA		0.771
331980	331981	lp_3394	lp_3396			FALSE	0.001	809.000	0.000	NA		0.122
2208860	2208861	lp_3399	lp_3400	cpd-N	cpd-C	FALSE	0.109	-25.000	0.000	NA		0.121
331984	331985	lp_3402	lp_3403			FALSE	0.002	263.000	0.000	1.000		-0.068
331986	331987	lp_3404	lp_3405			TRUE	0.932	13.000	0.000	NA		0.516
331987	331988	lp_3405	lp_3406			FALSE	0.001	445.000	0.000	NA		-0.191
331989	331990	lp_3407	lp_3408	bacA		FALSE	0.007	148.000	0.000	NA		0.191
331990	331991	lp_3408	lp_3409			TRUE	0.847	2.000	0.000	NA		0.402
331991	331992	lp_3409	lp_3410			TRUE	0.973	-10.000	0.000	NA		0.639
331994	331995	lp_3412	lp_3413			TRUE	0.916	42.000	0.000	NA		0.591
331995	331996	lp_3413	lp_3414			TRUE	0.850	62.000	0.000	NA		0.549
331998	331999	lp_3416	lp_3417			FALSE	0.005	161.000	0.000	0.057		-0.190
332000	332001	lp_3418	lp_3420	pck	gadB	FALSE	0.001	466.000	0.000	1.000	N	-0.159
332002	332003	lp_3421	lp_3422			FALSE	0.002	281.000	0.000	NA		-0.104
332004	401586	lp_3423	lp_tRNA70		tRNA-Ala	FALSE	0.644	54.000	0.000	NA		NA
332005	332006	lp_3425	lp_3426			FALSE	0.520	22.000	0.000	NA		0.275
332006	332007	lp_3426	lp_3427			FALSE	0.311	14.000	0.000	NA		0.247
332007	10140083	lp_3427	lp_3427a			FALSE	0.110	-129.000	0.000	NA		0.156
332008	332009	lp_3429	lp_3430			FALSE	0.005	161.000	0.000	NA		0.014
332009	332010	lp_3430	lp_3431		ubiE	FALSE	0.006	268.000	0.000	NA	N	0.196
332010	332011	lp_3431	lp_3432	ubiE		TRUE	0.935	1.000	0.000	NA		0.507
332015	332016	lp_3437	lp_3438	trxA3		TRUE	0.986	24.000	0.048	NA		0.764
332017	332018	lp_3441	lp_3442			TRUE	0.995	13.000	0.130	1.000	Y	0.952
332019	332020	lp_3444	lp_3445		pepO	FALSE	0.036	309.000	0.000	1.000	N	0.284
332020	332021	lp_3445	lp_3448	pepO		FALSE	0.020	1089.000	0.000	NA		0.339
332022	332023	lp_3449	lp_3450	nox5		FALSE	0.002	317.000	0.000	NA		0.066
332023	332024	lp_3450	lp_3451			TRUE	0.970	22.000	0.000	NA		0.676
332024	332025	lp_3451	lp_3452			TRUE	0.791	98.000	0.000	NA		0.615
332025	332026	lp_3452	lp_3453			TRUE	0.942	38.000	0.000	NA		0.645
332026	332027	lp_3453	lp_3454			TRUE	0.961	-3.000	0.000	NA		0.578
332029	332030	lp_3459	lp_3460			TRUE	0.948	2.000	0.143	NA		0.394
332030	332031	lp_3460	lp_3461			TRUE	0.884	18.000	0.107	NA		0.278
332035	332036	lp_3468	lp_3469	lacS1	lacA	TRUE	0.993	19.000	0.071	1.000	Y	0.746
332038	332039	lp_3471	lp_3472	ram1		TRUE	0.883	77.000	0.000	1.000		0.700
332039	332040	lp_3472	lp_3473		ram2	TRUE	0.942	15.000	0.000	1.000		0.536
332040	332041	lp_3473	lp_3474	ram2		TRUE	0.968	21.000	0.000	1.000		0.636
332043	332044	lp_3477	lp_3478	fic		TRUE	0.918	-3.000	0.000	1.000		0.461
332044	332045	lp_3478	lp_3479		galR1	FALSE	0.603	98.000	0.000	1.000		0.467
332045	332046	lp_3479	lp_3480	galR1	galT	FALSE	0.682	138.000	0.000	1.000	N	0.587
332046	332047	lp_3480	lp_3481	galT	galE4	TRUE	0.987	0.000	0.071	0.002	N	0.625
332047	332048	lp_3481	lp_3482	galE4	galK	TRUE	0.954	65.000	0.009	0.002	N	0.737
332049	332050	lp_3483	lp_3484	lacL	lacM	TRUE	0.996	-16.000	0.435	0.001		0.796
332051	332052	lp_3485	lp_3486	melA	lacS2	TRUE	0.899	97.000	0.000	1.000	Y	0.686
332052	332053	lp_3486	lp_3487	lacS2	galM3	FALSE	0.473	328.000	0.000	1.000	Y	0.681
332053	332054	lp_3487	lp_3488	galM3	galR2	FALSE	0.489	123.000	0.500	1.000	N	-0.056
332054	332055	lp_3488	lp_3489	galR2		FALSE	0.002	327.000	0.000	1.000	N	-0.054
332057	332058	lp_3491	lp_3492		apbE3	TRUE	0.871	-7.000	0.000	1.000	N	0.378
332058	332059	lp_3492	lp_3493	apbE3	aroC2	TRUE	0.764	34.000	0.000	1.000	N	0.366
332059	332060	lp_3493	lp_3494	aroC2	aroD2	TRUE	0.970	24.000	0.113	1.000	Y	0.416
332062	332063	lp_3496	lp_3497	ISP2		FALSE	0.006	157.000	0.000	1.000		0.085
332063	332064	lp_3497	lp_3498		aroD3	TRUE	0.984	2.000	0.571	1.000		0.451
332064	332065	lp_3498	lp_3499	aroD3	aroD4	TRUE	0.937	18.000	0.000	0.001	Y	0.410
332065	332066	lp_3499	lp_3500	aroD4		FALSE	0.729	88.000	0.071	1.000	N	0.391
332066	332067	lp_3500	lp_3501			TRUE	0.984	28.000	0.160	NA	N	0.591
332068	332069	lp_3502	lp_3503			FALSE	0.002	298.000	0.000	1.000		0.167
332070	332071	lp_3504	lp_3505		est2	FALSE	0.106	-7.000	0.000	NA		0.222
332071	332072	lp_3505	lp_3506	est2		FALSE	0.081	30.000	0.000	NA		0.231
332073	332074	lp_3507	lp_3508	pts29C		FALSE	0.173	157.000	0.000	1.000		0.366
332074	332075	lp_3508	lp_3509			TRUE	0.883	-3.000	0.000	NA		0.423
332075	332076	lp_3509	lp_3510			TRUE	0.993	-3.000	0.500	NA		0.602
332077	332078	lp_3512	lp_3513	pbg8	pts30BCA	TRUE	0.913	-7.000	0.222	1.000	Y	-0.078
332078	332079	lp_3513	lp_3514	pts30BCA	bglG4	FALSE	0.498	125.000	0.333	1.000		0.198
332079	332080	lp_3514	lp_3516	bglG4		FALSE	0.072	247.000	0.000	1.000		0.353
332080	332081	lp_3516	lp_3517		metC2	FALSE	0.089	4.000	0.000	1.000		0.110
332081	332082	lp_3517	lp_3518	metC2	pts31BC	FALSE	0.627	92.000	0.125	1.000	N	0.282
332082	332083	lp_3518	lp_3519	pts31BC	pts31A	TRUE	0.996	19.000	1.000	0.019	Y	0.498
332083	332084	lp_3519	lp_3520	pts31A	pts32A	FALSE	0.057	376.000	0.000	0.019	Y	0.250
332084	332085	lp_3520	lp_3521	pts32A		FALSE	0.717	13.000	0.000	1.000	N	0.304
332085	332086	lp_3521	lp_3522		pts32BC	TRUE	0.748	38.000	0.250	1.000	N	-0.046
332086	332087	lp_3522	lp_3523	pts32BC		TRUE	0.992	15.000	0.250	1.000		0.758
332087	332088	lp_3523	lp_3524			TRUE	0.982	-3.000	0.234	1.000		0.504
332088	332089	lp_3524	lp_3525		pbg9	FALSE	0.387	185.000	0.000	1.000		0.534
332089	332090	lp_3525	lp_3526	pbg9	pbg10	TRUE	0.924	89.000	0.000	0.003	Y	0.714
332090	332091	lp_3526	lp_3527	pbg10	pts33BCA	TRUE	0.988	20.000	0.000	1.000	Y	0.774
332091	332092	lp_3527	lp_3529	pts33BCA	bglG5	TRUE	0.883	171.000	0.333	1.000		0.783
332092	332093	lp_3529	lp_3530	bglG5	map4	FALSE	0.509	219.000	0.000	1.000		0.707
332093	332094	lp_3530	lp_3531	map4		FALSE	0.002	248.000	0.000	1.000	N	0.145
332095	332096	lp_3533	lp_3534		agl5	TRUE	0.825	31.000	0.000	NA	Y	0.316
332097	332098	lp_3536	lp_3537	bsh1		FALSE	0.084	208.000	0.000	1.000		0.346
332098	332099	lp_3537	lp_3538		tkt4	TRUE	0.917	73.000	0.000	0.047		0.782
332099	332100	lp_3538	lp_3539	tkt4	tal2	TRUE	0.997	30.000	0.667	1.000	Y	0.785
332100	332101	lp_3539	lp_3540	tal2		TRUE	0.927	67.000	0.000	1.000		0.795
332101	332102	lp_3540	lp_3541		pts34B	TRUE	0.990	24.000	0.091	0.025		0.837
332102	332103	lp_3541	lp_3542	pts34B		TRUE	0.981	13.000	0.052	0.019	Y	0.513
332105	332106	lp_3544	lp_3545	gph3	gutB	TRUE	0.837	106.000	0.000	1.000		0.754
332106	332107	lp_3545	lp_3546	gutB	pts35C	TRUE	0.928	81.000	0.000	1.000	N	0.947
332107	332108	lp_3546	lp_3547	pts35C	pts35B	TRUE	0.959	35.000	0.000	0.020	Y	0.552
332108	332109	lp_3547	lp_3548	pts35B	pts35A	TRUE	0.946	35.000	0.111	0.019	Y	0.370
332110	332111	lp_3549	lp_3551		xpk2	TRUE	0.935	148.000	0.286	1.000	Y	0.704
332112	332113	lp_3552	lp_3553		maa3	FALSE	0.492	82.000	0.000	NA		0.396
332113	332114	lp_3553	lp_3554	maa3	araA	TRUE	0.864	81.000	0.029	1.000		0.557
332114	332115	lp_3554	lp_3555	araA	araD	TRUE	0.981	52.000	0.063	1.000	Y	0.759
332115	332116	lp_3555	lp_3556	araD	araB	TRUE	0.994	18.000	0.160	1.000	Y	0.721
332116	332117	lp_3556	lp_3557	araB	araT	TRUE	0.994	17.000	0.136	1.000	Y	0.777
332117	332118	lp_3557	lp_3558	araT	araR	FALSE	0.002	295.000	0.000	1.000	N	-0.004
332120	332121	lp_3560	lp_3561			TRUE	0.946	10.000	0.000	NA		0.561
332121	332122	lp_3561	lp_3562			TRUE	0.903	13.000	0.000	0.003	Y	0.357
332122	332123	lp_3562	lp_3563			FALSE	0.032	178.000	0.000	1.000	N	0.229
332123	332124	lp_3563	lp_3565		napA4	TRUE	0.805	-3.000	0.000	1.000	N	0.332
332124	332125	lp_3565	lp_3566	napA4		TRUE	0.970	15.000	0.000	NA		0.690
332125	332126	lp_3566	lp_3567			FALSE	0.526	206.000	0.000	NA		0.706
332128	332129	lp_3569	lp_3570			TRUE	0.991	-67.000	0.000	NA	Y	0.848
332133	332134	lp_3574	lp_3575			TRUE	0.804	37.000	0.000	NA		0.431
332134	332135	lp_3575	lp_3577			FALSE	0.113	346.000	0.000	NA		0.455
332137	332138	lp_3579	lp_3580	nrpR5	agrA	FALSE	0.414	356.000	0.000	1.000	N	0.796
332138	332139	lp_3580	lp_3581	agrA	agrC	TRUE	0.998	-7.000	0.875	1.000		0.934
332139	332140	lp_3581	lp_3581a	agrC	agrD	TRUE	0.980	15.000	0.000	NA		0.858
332140	332141	lp_3581a	lp_3582	agrD	agrB	TRUE	0.932	-19.000	0.000	NA		0.478
332141	332142	lp_3582	lp_3583	agrB	clpL	FALSE	0.413	368.000	0.000	1.000	Y	0.650
332142	332143	lp_3583	lp_3586	clpL	lox	FALSE	0.164	1261.000	0.000	1.000	N	0.578
332143	332144	lp_3586	lp_3587	lox	pox4	TRUE	0.972	27.000	0.000	1.000	N	0.707
332144	332145	lp_3587	lp_3588	pox4		TRUE	0.826	82.000	0.000	NA	N	0.570
332145	332146	lp_3588	lp_3589		pox5	FALSE	0.004	173.000	0.000	NA	N	0.115
332146	332147	lp_3589	lp_3590	pox5		FALSE	0.002	318.000	0.000	NA		0.209
332147	332148	lp_3590	lp_3591			FALSE	0.218	88.000	0.000	NA		0.302
332148	332149	lp_3591	lp_3592		rhaD	FALSE	0.164	25.000	0.000	NA		0.236
332149	332150	lp_3592	lp_3593	rhaD	rhaA	TRUE	0.987	49.000	0.247	1.000	Y	0.677
332150	332151	lp_3593	lp_3594	rhaA		TRUE	0.977	37.000	0.056	NA		0.753
332151	332152	lp_3594	lp_3595		rhaB	TRUE	0.986	1.000	0.049	NA		0.727
332152	332153	lp_3595	lp_3596	rhaB		TRUE	0.993	0.000	0.158	1.000	Y	0.634
332156	332157	lp_3599	lp_3600	pts36A	pts36B	TRUE	0.998	21.000	0.846	0.018	Y	0.804
332157	332158	lp_3600	lp_3601	pts36B	pts36C	TRUE	0.966	37.000	0.120	0.020	Y	0.449
332158	332159	lp_3601	lp_3602	pts36C		TRUE	0.981	6.000	0.750	NA		0.410
332159	332160	lp_3602	lp_3603			TRUE	0.997	-3.000	0.750	NA		0.742
332161	332162	lp_3604	lp_3605		iolG1	TRUE	0.956	40.000	0.000	1.000		0.773
332162	332163	lp_3605	lp_3606	iolG1	iolG2	TRUE	0.984	36.000	0.054	0.001		0.882
332163	332164	lp_3606	lp_3607	iolG2	iolE	TRUE	0.967	72.000	0.107	1.000		0.916
332164	332165	lp_3607	lp_3608	iolE	iolG3	TRUE	0.980	23.000	0.000	1.000		0.854
332166	332167	lp_3611	lp_3612		iolG4	TRUE	0.932	48.000	0.000	1.000		0.682
332167	332168	lp_3612	lp_3613	iolG4		TRUE	0.982	21.000	0.000	NA		0.870
332168	332169	lp_3613	lp_3614			TRUE	0.951	19.000	0.000	NA		0.554
332169	332170	lp_3614	lp_3615			FALSE	0.084	331.000	0.000	NA	N	0.392
332171	332172	lp_3617	lp_3618	tal3	pts37A	TRUE	0.962	26.000	0.000	1.000	Y	0.523
332172	332173	lp_3618	lp_3619	pts37A	pts37BC	TRUE	0.964	19.000	0.000	0.020	Y	0.489
332173	332174	lp_3619	lp_3620	pts37BC	pts37C	TRUE	0.966	14.000	0.116	0.020	Y	0.379
332174	332175	lp_3620	lp_3621	pts37C	srlM1	TRUE	0.989	-3.000	0.116	NA	N	0.629
332175	332176	lp_3621	lp_3622	srlM1	srlR1	TRUE	0.985	1.000	0.000	NA	Y	0.701
332176	332177	lp_3622	lp_3623	srlR1	srlD1	TRUE	0.937	15.000	0.000	1.000	N	0.500
332177	332178	lp_3623	lp_3625	srlD1		FALSE	0.001	355.000	0.000	1.000	N	-0.146
332178	332179	lp_3625	lp_3626			FALSE	0.583	85.000	0.333	NA	N	0.032
332179	332180	lp_3626	lp_3627		agl6	TRUE	0.996	19.000	0.667	NA	Y	0.563
332180	332181	lp_3627	lp_3629	agl6	bgl	FALSE	0.078	159.000	0.000	0.011	Y	0.100
332181	332182	lp_3629	lp_3630	bgl		TRUE	0.994	6.000	0.182	NA	Y	0.712
332182	332183	lp_3630	lp_3631			TRUE	0.968	0.000	0.000	NA	Y	0.516
332183	332184	lp_3631	lp_3632			TRUE	0.977	7.000	0.194	1.000		0.510
332185	332186	lp_3633	lp_3634			TRUE	0.863	6.000	0.000	1.000	N	0.399
332187	332188	lp_3635	lp_3637	msmK2	sacK2	FALSE	0.359	251.000	0.000	1.000	Y	0.491
332188	332189	lp_3637	lp_3638	sacK2	rrp12	FALSE	0.453	96.000	0.000	1.000	N	0.375
332189	332190	lp_3638	lp_3639	rrp12	hpk12	TRUE	0.944	0.000	0.000	0.006	Y	0.420
332190	332191	lp_3639	lp_3640	hpk12		TRUE	0.988	1.000	0.667	NA		0.475
332191	332192	lp_3640	lp_3641		dexB	TRUE	0.964	25.000	0.000	NA		0.650
332192	332193	lp_3641	lp_3642	dexB		TRUE	0.811	103.000	0.000	1.000	Y	0.539
332193	332194	lp_3642	lp_3643			TRUE	0.974	90.000	0.250	0.035	Y	0.717
332194	332195	lp_3643	lp_3644			TRUE	0.998	13.000	0.917	0.035	Y	0.777
332195	332196	lp_3644	lp_3645			FALSE	0.473	336.000	0.000	1.000	Y	0.705
332196	332197	lp_3645	lp_3646			FALSE	0.648	171.000	0.000	1.000	N	0.701
332198	332199	lp_3647	lp_3648			TRUE	0.997	-19.000	0.941	0.006	Y	0.541
332199	332200	lp_3648	lp_3649			FALSE	0.026	230.000	0.000	1.000	N	0.237
332200	332201	lp_3649	lp_3650			FALSE	0.740	32.000	0.000	0.056	N	0.334
332202	332203	lp_3652	lp_3653	pts38A	pts38BC	TRUE	0.950	28.000	0.000	0.020	Y	0.477
332203	332204	lp_3653	lp_3654	pts38BC	pts38C	TRUE	0.830	24.000	0.000	0.020	Y	0.263
332204	332205	lp_3654	lp_3655	pts38C	srlM2	TRUE	0.744	5.000	0.000	NA	N	0.317
332205	332206	lp_3655	lp_3656	srlM2	srlR2	TRUE	0.978	0.000	0.000	NA	Y	0.587
332206	332207	lp_3656	lp_3657	srlR2	srlD2	TRUE	0.996	34.000	1.000	1.000	N	0.757
332207	332208	lp_3657	lp_3658	srlD2	rbsU	FALSE	0.117	305.000	0.000	1.000	N	0.413
332208	332209	lp_3658	lp_3659	rbsU	rbsD	TRUE	0.993	30.000	0.045	0.002	Y	0.957
332209	332210	lp_3659	lp_3660	rbsD	rbsK3	TRUE	0.991	3.000	0.020	1.000	Y	0.775
332210	332211	lp_3660	lp_3661	rbsK3	rbsR	FALSE	0.344	104.000	0.222	1.000	N	-0.215
332211	332212	lp_3661	lp_3662	rbsR	adhE	FALSE	0.002	260.000	0.000	1.000	N	0.119
332212	332213	lp_3662	lp_3663	adhE		FALSE	0.002	289.000	0.000	1.000	N	-0.082
332213	332214	lp_3663	lp_3664		padR	FALSE	0.045	191.000	0.000	NA	N	0.251
332216	332217	lp_3666	lp_3668			FALSE	0.001	772.000	0.000	0.047		0.046
332219	332220	lp_3672	lp_3673		pepC2	TRUE	0.971	13.000	0.000	1.000		0.705
332220	332221	lp_3673	lp_3675	pepC2	sip3	FALSE	0.003	229.000	0.000	0.023	N	-0.164
332221	332222	lp_3675	lp_3676	sip3		FALSE	0.003	209.000	0.000	NA		-0.053
332222	332223	lp_3676	lp_3677			TRUE	0.982	20.000	0.000	NA		0.869
332223	332224	lp_3677	lp_3678			TRUE	0.980	20.000	0.000	NA		0.818
332224	332225	lp_3678	lp_3679			TRUE	0.769	147.000	0.000	NA		0.834
332225	332226	lp_3679	lp_3681		gidA	FALSE	0.002	256.000	0.000	NA		0.182
332226	332227	lp_3681	lp_3682	gidA	thdF	TRUE	0.994	19.000	0.266	1.000		0.777
332227	332228	lp_3682	lp_3683	thdF		FALSE	0.034	232.000	0.116	1.000		-0.104
332228	332229	lp_3683	lp_3684			FALSE	0.001	486.000	0.000	1.000		0.006
332229	332230	lp_3684	lp_3686			TRUE	0.867	133.000	0.500	1.000	N	0.479
332230	332231	lp_3686	lp_3687			FALSE	0.001	715.000	0.000	1.000	N	-0.615
332231	332232	lp_3687	lp_3688		rnpA	TRUE	0.990	16.000	0.052	1.000	N	0.838
332233	329225	lp_3688a	lp_0001	rpmH	dnaA	FALSE	0.001	501.000	0.000	NA		-0.073
2208758	2208756	pWCFS101_03	pWCFS101_01	orf3	repA	FALSE	0.091	271.000	0.000	NA		NA
2208761	2208762	pWCFS102_03	pWCFS102_04	orf2	orf3	FALSE	0.083	293.000	0.000	NA		NA
2208759	2208760	pWCFS102_01	pWCFS102_02	repA	repB	FALSE	0.585	67.000	0.000	1.000		NA
2208764	2208765	pWCFS103_02	pWCFS103_03	repA	orf3	FALSE	0.075	315.000	0.000	NA		NA
2208766	2208767	pWCFS103_04	pWCFS103_05	repB	orf5	TRUE	0.835	2.000	0.000	NA		NA
2208767	2208768	pWCFS103_05	pWCFS103_06	orf5	orf6	FALSE	0.297	131.000	0.000	NA		NA
2208772	2208773	pWCFS103_10	pWCFS103_11	arsR	arsD1	TRUE	0.973	-13.000	0.333	1.000		NA
2208773	2208774	pWCFS103_11	pWCFS103_12	arsD1	arsA	TRUE	0.765	84.000	0.140	1.000		NA
2208774	2208775	pWCFS103_12	pWCFS103_13	arsA	arsB	TRUE	0.794	59.000	0.000	1.000	Y	NA
2208775	2208776	pWCFS103_13	pWCFS103_14	arsB	orf14	TRUE	0.830	17.000	0.000	NA		NA
2208776	2208777	pWCFS103_14	pWCFS103_15	orf14	arsD2	TRUE	0.825	23.000	0.000	NA		NA
2208777	2208778	pWCFS103_15	pWCFS103_16	arsD2	nox	TRUE	0.824	24.000	0.000	1.000		NA
2208778	2208779	pWCFS103_16	pWCFS103_17	nox	cadC	FALSE	0.081	350.000	0.000	1.000	N	NA
2208779	2208780	pWCFS103_17	pWCFS103_18	cadC	cadD	TRUE	0.868	2.000	0.000	NA	N	NA
2208781	2208782	pWCFS103_19	pWCFS103_20	orf19	orf20	FALSE	0.362	111.000	0.000	NA		NA
2208782	2208783	pWCFS103_20	pWCFS103_21	orf20	orf21	TRUE	0.829	4.000	0.000	NA		NA
2208783	2208784	pWCFS103_21	pWCFS103_22	orf21	traI	FALSE	0.631	123.000	0.143	NA		NA
2208784	2208785	pWCFS103_22	pWCFS103_23	traI	orf23	TRUE	0.942	7.000	0.143	NA		NA
2208785	2208786	pWCFS103_23	pWCFS103_24	orf23	traL	TRUE	0.984	15.000	1.000	NA		NA
2208786	2208787	pWCFS103_24	pWCFS103_25	traL	orf25	TRUE	0.983	6.000	1.000	NA		NA
2208787	2208788	pWCFS103_25	pWCFS103_26	orf25	traK	TRUE	0.955	15.000	0.222	NA		NA
2208788	2208789	pWCFS103_26	pWCFS103_27	traK	traJ	TRUE	0.968	2.000	0.333	NA		NA
2208789	2208790	pWCFS103_27	pWCFS103_28	traJ	orf28	TRUE	0.975	1.000	0.500	NA		NA
2208790	2208791	pWCFS103_28	pWCFS103_29	orf28	orf29	TRUE	0.979	-13.000	0.500	NA		NA
2208791	2208792	pWCFS103_29	pWCFS103_30	orf29	orf30	TRUE	0.969	15.000	0.400	NA		NA
2208792	2208793	pWCFS103_30	pWCFS103_31	orf30	traF	TRUE	0.972	1.000	0.400	NA		NA
2208793	2208794	pWCFS103_31	pWCFS103_32	traF	traE	TRUE	0.980	-7.000	0.571	NA		NA
2208794	2208795	pWCFS103_32	pWCFS103_33	traE	traD	TRUE	0.975	12.000	0.625	NA		NA
2208795	2208796	pWCFS103_33	pWCFS103_34	traD	traC	TRUE	0.975	-31.000	0.375	NA		NA
2208796	2208797	pWCFS103_34	pWCFS103_35	traC	traB	TRUE	0.982	21.000	0.800	NA		NA
2208797	2208798	pWCFS103_35	pWCFS103_36	traB	orf36	TRUE	0.981	2.000	0.750	NA		NA
2208798	2208799	pWCFS103_36	pWCFS103_37	orf36	orf37	TRUE	0.960	39.000	0.667	NA		NA
2208799	2208800	pWCFS103_37	pWCFS103_38	orf37	traA	FALSE	0.649	53.000	0.000	NA		NA
2208801	2208802	pWCFS103_39	pWCFS103_40	orf39	orf40	TRUE	0.976	23.000	0.600	NA		NA
2208803	2208804	pWCFS103_41	pWCFS103_42	orf41	tnpR2	FALSE	0.129	210.000	0.000	NA		NA
2208763	2208764	pWCFS103_01	pWCFS103_02	orf1	repA	FALSE	0.104	251.000	0.000	NA		NA