MicrobesOnline Operon Predictions for Aquifex aeolicus VF5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 24294 24295 aq_001 aq_005 fusA tufA1 TRUE 0.987 17.000 0.400 0.003 Y NA
 24295 24296 aq_005 aq_008 tufA1 rpsJ TRUE 0.979 12.000 0.318 1.000 Y NA
 24296 24297 aq_008 aq_009 rpsJ rplC TRUE 0.993 5.000 0.467 0.048 Y NA
 24297 24298 aq_009 aq_011 rplC rplD TRUE 0.995 -3.000 0.361 0.034 Y NA
 24298 24299 aq_011 aq_012 rplD rplW TRUE 0.995 4.000 0.513 0.034 Y NA
 24299 24300 aq_012 aq_013 rplW rplB TRUE 0.993 12.000 0.849 0.037 Y NA
 24300 24301 aq_013 aq_015 rplB rpsS TRUE 0.973 113.000 0.820 0.048 Y NA
 24301 24302 aq_015 aq_016a rpsS rplV TRUE 0.970 118.000 0.769 0.048 Y NA
 24302 24303 aq_016a aq_017 rplV rpsC TRUE 0.996 3.000 0.719 0.048 Y NA
 24303 24304 aq_017 aq_018 rpsC rplP TRUE 0.978 62.000 0.828 0.048 Y NA
 24304 24305 aq_018 aq_018a rplP rpmC TRUE 0.993 12.000 0.802 0.034 Y NA
 24305 24306 aq_018a aq_020 rpmC rpsQ TRUE 0.997 0.000 0.828 0.034 Y NA
 24306 24307 aq_020 aq_021 rpsQ aroD FALSE 0.316 0.000 0.000 1.000 N NA
 24308 24309 aq_022 aq_023   argD FALSE 0.366 12.000 0.000 NA   NA
 24309 24310 aq_023 aq_024 argD nsd FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24310 24311 aq_024 aq_025 nsd rodA FALSE 0.041 278.000 0.000 1.000 N NA
 24311 24312 aq_025 aq_025a rodA thiS TRUE 0.881 -31.000 0.003 1.000 N NA
 24312 24313 aq_025a aq_026 thiS   TRUE 0.951 -9.000 0.023 1.000 N NA
 24313 24314 aq_026 aq_027     FALSE 0.108 20.000 0.000 1.000 N NA
 24314 24315 aq_027 aq_028     FALSE 0.122 73.000 0.000 1.000   NA
 24316 24317 aq_030 aq_031 moeA1 trnS FALSE 0.147 14.000 0.000 1.000 N NA
 24317 24318 aq_031 aq_032 trnS   FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 24320 24321 aq_036 aq_037     FALSE 0.109 113.000 0.000 1.000   NA
 24321 24322 aq_037 aq_038   hibD FALSE 0.245 16.000 0.000 1.000   NA
 24323 24324 aq_039 aq_040 hisB   FALSE 0.300 15.000 0.000 NA   NA
 24324 24325 aq_040 aq_041     FALSE 0.160 57.000 0.000 NA   NA
 24325 24326 aq_041 aq_042   cyc FALSE 0.085 33.000 0.000 1.000 N NA
 24326 24327 aq_042 aq_044 cyc petB TRUE 0.993 -3.000 0.103 0.003 Y NA
 24327 24328 aq_044 aq_045 petB petA TRUE 0.958 14.000 0.013 0.003 Y NA
 24329 24330 aq_046 aq_049 pyrD phhB FALSE 0.207 8.000 0.000 1.000 N NA
 24330 24331 aq_049 aq_050 phhB   FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24332 24333 aq_052 aq_053 ubiA mraY TRUE 0.694 -3.000 0.000 0.064 N NA
 24333 24334 aq_053 aq_054 mraY   TRUE 0.905 0.000 0.007 NA   NA
 24337 24338 aq_057 aq_058 sfsA   FALSE 0.088 497.000 0.000 NA   NA
 24338 24339 aq_058 aq_059     TRUE 0.773 122.000 0.071 NA   NA
 24341 24342 aq_062 aq_063 speE rpsF FALSE 0.058 75.000 0.000 1.000 N NA
 24342 24343 aq_063 aq_064 rpsF ssb TRUE 0.881 -10.000 0.005 1.000 N NA
 24343 24344 aq_064 aq_064a ssb rpsR TRUE 0.554 19.000 0.004 1.000 N NA
 24344 24345 aq_064a aq_064b rpsR   FALSE 0.067 55.000 0.000 1.000 N NA
 24345 24346 aq_064b aq_064c     TRUE 0.997 1.000 0.750 0.013 Y NA
 24349 24350 aq_067 aq_069 dmsB2 rplQ FALSE 0.045 233.000 0.000 1.000 N NA
 24350 24351 aq_069 aq_070 rplQ rpoA TRUE 0.978 6.000 0.873 1.000 N NA
 24351 24352 aq_070 aq_072 rpoA rpsD TRUE 0.960 13.000 0.549 1.000 N NA
 24352 24353 aq_072 aq_073 rpsD rpsK TRUE 0.996 1.000 0.509 0.048 Y NA
 24353 24354 aq_073 aq_074 rpsK rpsM TRUE 0.990 16.000 0.810 0.034 Y NA
 24354 24355 aq_074 aq_075 rpsM rpmJ TRUE 0.993 -22.000 0.194 0.034   NA
 24355 24356 aq_075 aq_075a rpmJ infA TRUE 0.879 61.000 0.257 1.000   NA
 24356 24357 aq_075a aq_076 infA map TRUE 0.985 3.000 0.160 1.000 Y NA
 24357 24358 aq_076 aq_078 map kad TRUE 0.956 -10.000 0.027 1.000 N NA
 24358 24359 aq_078 aq_079 kad secY TRUE 0.828 5.000 0.008 1.000 N NA
 24360 24361 aq_080 aq_081 rpmB aroC TRUE 0.818 0.000 0.004 1.000 N NA
 24361 24362 aq_081 aq_082 aroC   FALSE 0.304 2.000 0.000 1.000 N NA
 24364 24365 aq_085 aq_086 kdsA modC FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24365 24366 aq_086 aq_087 modC   FALSE 0.124 123.000 0.000 NA   NA
 24366 24367 aq_087 aq_088     TRUE 0.969 15.000 0.800 NA   NA
 24367 24368 aq_088 aq_090     TRUE 0.948 28.000 0.625 NA   NA
 24368 24369 aq_090 aq_091m     TRUE 0.988 -7.000 0.625 1.000 N NA
 24370 24371 aq_094 aq_097 nrdA   FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 24372 24373 aq_098 aq_099 secG hemK TRUE 0.910 -64.000 0.005 1.000 N NA
 24373 24374 aq_099 aq_101 hemK hly3 TRUE 0.939 -9.000 0.010 1.000   NA
 24375 24376 aq_103 aq_104     TRUE 0.469 3.000 0.000 1.000   NA
 24381 24382 aq_109 aq_111 glnB glnA TRUE 0.832 21.000 0.009 1.000 Y NA
 24382 24383 aq_111 aq_112 glnA amtB TRUE 0.481 62.000 0.007 1.000 N NA
 24383 24384 aq_112 aq_113 amtB   TRUE 0.965 14.000 0.600 1.000   NA
 24385 24386 aq_114 aq_116     FALSE 0.100 317.000 0.000 NA   NA
 24386 24387 aq_116 aq_118   pgk TRUE 0.501 1.000 0.000 1.000   NA
 24387 24388 aq_118 aq_119 pgk talC TRUE 0.627 12.000 0.000 1.000 Y NA
 24388 24389 aq_119 aq_121 talC   FALSE 0.091 29.000 0.000 1.000 N NA
 24389 24390 aq_121 aq_122   hisS1 FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24391 24392 aq_123 aq_124a rpsP   TRUE 0.983 -3.000 0.385 1.000   NA
 24392 24393 aq_124a aq_125     TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 24393 24394 aq_125 aq_126     FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 24394 24395 aq_126 aq_127     TRUE 0.955 0.000 0.031 NA   NA
 24397 24398 aq_132 aq_133 ribH nusB TRUE 0.948 -3.000 0.045 1.000 N NA
 24398 24399 aq_133 aq_134 nusB   FALSE 0.098 202.000 0.000 1.000   NA
 24399 24400 aq_134 aq_135   nueM TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24400 24401 aq_135 aq_136 nueM cpx FALSE 0.102 23.000 0.000 1.000 N NA
 24402 24403 aq_138 aq_139 ribD1 ribF TRUE 0.912 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 24403 24404 aq_139 aq_141 ribF pkcI TRUE 0.703 7.000 0.003 1.000 N NA
 24405 24406 aq_142 aq_145   rfaC2 TRUE 0.968 -3.000 0.075 NA   NA
 24406 24407 aq_145 aq_147 rfaC2 cobW TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24407 24408 aq_147 aq_148 cobW deoC TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24408 24409 aq_148 aq_150 deoC gltA FALSE 0.207 8.000 0.000 1.000 N NA
 24409 24410 aq_150 aq_152 gltA tlpA TRUE 0.988 -3.000 0.182 1.000 Y NA
 24410 24411 aq_152 aq_153 tlpA ctaA FALSE 0.213 580.000 0.000 1.000 Y NA
 24411 24412 aq_153 aq_154 ctaA ctaB TRUE 0.985 -3.000 0.112 1.000 Y NA
 24412 24413 aq_154 aq_155 ctaB   TRUE 0.756 2.000 0.000 0.063   NA
 24413 24414 aq_155 aq_156     FALSE 0.117 200.000 0.000 NA   NA
 24414 24415 aq_156 aq_157     TRUE 0.972 2.000 0.111 NA   NA
 24415 24416 aq_157 aq_158   apfA FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24418 24419 aq_162 aq_164 folK ntrC4 FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24421 24422 aq_166 aq_167 proC   TRUE 0.925 -39.000 0.004 NA   NA
 24423 24424 aq_168 aq_169     TRUE 0.974 -45.000 0.007 0.010   NA
 24424 24425 aq_169 aq_170   bioA TRUE 0.469 3.000 0.000 1.000   NA
 24427 24428 aq_172 aq_173 mutY2   TRUE 0.880 -27.000 0.000 NA Y NA
 24428 24429 aq_173 aq_175     FALSE 0.388 -3.000 0.000 NA N NA
 24429 24430 aq_175 aqq_01     TRUE 0.985 -3.000 0.461 NA   NA
 24430 24431 aqq_01 aqq_02   rpmH TRUE 0.859 4.000 0.005 NA   NA
 24431 24432 aqq_02 aq_177 rpmH atpE TRUE 0.608 44.000 0.008 1.000   NA
 24432 24433 aq_177 aq_178 atpE   TRUE 0.818 16.000 0.018 1.000   NA
 24433 24434 aq_178 aq_179   atpB TRUE 0.857 2.000 0.004 1.000   NA
 24436 24437 aq_182 aq_183     FALSE 0.360 10.000 0.000 1.000   NA
 24437 24438 aq_183 aq_183a   rpoZ TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24438 24439 aq_183a aq_184 rpoZ   TRUE 0.991 -16.000 0.471 1.000   NA
 24439 24440 aq_184 aq_185   tagD1 FALSE 0.083 335.000 0.000 1.000   NA
 24440 24441 aq_185 aq_186 tagD1 aldH1 TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24441 24442 aq_186 aq_192 aldH1 hslU FALSE 0.195 11.000 0.000 1.000 N NA
 24442 24443 aq_192 aq_194 hslU   TRUE 0.939 -22.000 0.007 NA   NA
 24444 24445 aq_196 aq_197 trpD1   TRUE 0.506 0.000 0.000 1.000   NA
 24445 24446 aq_197 aq_199     FALSE 0.151 66.000 0.000 NA   NA
 24446 24447 aq_199 aq_200     TRUE 0.979 -3.000 0.190 NA   NA
 24447 24448 aq_200 aq_202     TRUE 0.816 -3.000 0.002 NA   NA
 24448 24449 aq_202 aq_203   atpG2 TRUE 0.831 -16.000 0.002 1.000 N NA
 24451 24452 aq_206 aq_207 nirB cobA FALSE 0.128 16.000 0.000 1.000 N NA
 24452 24453 aq_207 aq_209 cobA trpD2 TRUE 0.850 5.000 0.010 1.000 N NA
 24453 24454 aq_209 aq_211 trpD2 fhp FALSE 0.050 134.000 0.000 1.000 N NA
 24454 24455 aq_211 aq_212 fhp cynS FALSE 0.160 13.000 0.000 1.000 N NA
 24455 24456 aq_212 aq_213 cynS glnBi TRUE 0.778 16.000 0.016 1.000 N NA
 24456 24457 aq_213 aq_215 glnBi nasA TRUE 0.932 -3.000 0.024 1.000 N NA
 24457 24458 aq_215 aq_217 nasA narB TRUE 0.927 -3.000 0.022 1.000 N NA
 24459 24460 aq_218 aq_220 nifA dut FALSE 0.119 17.000 0.000 1.000 N NA
 24460 24461 aq_220 aq_221 dut phpA TRUE 0.955 -7.000 0.031 1.000 N NA
 24461 24462 aq_221 aq_226a phpA rpsO TRUE 0.989 3.000 0.335 1.000 Y NA
 24462 24463 aq_226a aq_227 rpsO aldH2 FALSE 0.065 59.000 0.000 1.000 N NA
 24466 24467 aq_232 aq_234 dhsU soxF TRUE 0.979 10.000 0.182 NA Y NA
 24467 24468 aq_234 aq_235 soxF fccB' TRUE 0.995 -19.000 0.455 NA Y NA
 24470 24471 aq_238 aq_239 sodC2 folE FALSE 0.056 81.000 0.000 1.000 N NA
 24474 24475 aq_243 aq_244   leuB TRUE 0.962 -13.000 0.019 NA   NA
 11403774 24472   aq_240     FALSE NA 5287.000 0.000 NA   NA
 11546137 24472   aq_240     FALSE NA 5287.000 0.000 NA   NA
 11688529 24472   aq_240     FALSE NA 5287.000 0.000 NA   NA
 11403775 24472   aq_240     FALSE NA 5318.000 0.000 NA   NA
 11546138 24472   aq_240     FALSE NA 5318.000 0.000 NA   NA
 11688530 24472   aq_240     FALSE NA 5318.000 0.000 NA   NA
 11403776 24472   aq_240     FALSE NA 5353.000 0.000 NA   NA
 11546139 24472   aq_240     FALSE NA 5353.000 0.000 NA   NA
 11688531 24472   aq_240     FALSE NA 5353.000 0.000 NA   NA
 11403777 24472   aq_240     FALSE NA 5384.000 0.000 NA   NA
 11546140 24472   aq_240     FALSE NA 5384.000 0.000 NA   NA
 11688532 24472   aq_240     FALSE NA 5384.000 0.000 NA   NA
 11403778 24472   aq_240     FALSE NA 5427.000 0.000 NA   NA
 11546141 24472   aq_240     FALSE NA 5427.000 0.000 NA   NA
 11688533 24472   aq_240     FALSE NA 5427.000 0.000 NA   NA
 11403779 24472   aq_240     FALSE NA 5458.000 0.000 NA   NA
 11546142 24472   aq_240     FALSE NA 5458.000 0.000 NA   NA
 11688534 24472   aq_240     FALSE NA 5458.000 0.000 NA   NA
 11403780 24472   aq_240     FALSE NA 5498.000 0.000 NA   NA
 11546143 24472   aq_240     FALSE NA 5498.000 0.000 NA   NA
 11688535 24472   aq_240     FALSE NA 5498.000 0.000 NA   NA
 11403781 24472   aq_240     FALSE NA 5529.000 0.000 NA   NA
 11546144 24472   aq_240     FALSE NA 5529.000 0.000 NA   NA
 11688536 24472   aq_240     FALSE NA 5529.000 0.000 NA   NA
 11403782 24472   aq_240     FALSE NA 5565.000 0.000 NA   NA
 11546145 24472   aq_240     FALSE NA 5565.000 0.000 NA   NA
 11688537 24472   aq_240     FALSE NA 5565.000 0.000 NA   NA
 24477 24478 aq_246 aq_247   gatA TRUE 0.506 0.000 0.000 1.000   NA
 24478 24479 aq_247 aq_250 gatA   TRUE 0.689 13.000 0.005 1.000 N NA
 24479 24480 aq_250 aq_251     FALSE 0.072 47.000 0.000 1.000 N NA
 24480 24481 aq_251 aq_252     FALSE 0.283 16.000 0.000 NA   NA
 24481 24482 aq_252 aq_253   kdtB TRUE 0.658 -12.000 0.000 NA   NA
 24483 24484 aq_254 aq_255     FALSE 0.193 34.000 0.000 NA   NA
 24485 24486 aq_257 aq_259 ygcA nusA TRUE 0.945 -19.000 0.004 0.035 N NA
 24486 24487 aq_259 aq_260 nusA   TRUE 0.992 -6.000 0.759 NA   NA
 24487 24488 aq_260 aq_262     FALSE 0.082 745.000 0.000 NA   NA
 2209589 24489 aq_t01 aq_263   hemC TRUE 0.701 -45.000 0.000 NA   NA
 24489 24490 aq_263 aq_264 hemC   TRUE 0.782 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 24492 24493 aq_267 aq_268     FALSE 0.127 116.000 0.000 NA   NA
 24495 24496 aq_270 aq_271 lgt   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24498 24499 aq_273 aq_274 aspC4   FALSE 0.180 41.000 0.000 NA   NA
 24500 24501 aq_276 aq_277     TRUE 0.989 -3.000 0.727 NA   NA
 24501 24502 aq_277 aq_278     TRUE 0.979 -3.000 0.200 NA   NA
 24502 24503 aq_278 aq_281   acrR3 FALSE 0.099 25.000 0.000 1.000 N NA
 24505 24506 aq_283 aq_284     TRUE 0.880 -3.000 0.005 NA   NA
 24506 24507 aq_284 aq_286     FALSE 0.212 29.000 0.000 NA   NA
 24507 24508 aq_286 aq_287   smb TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 24508 24509 aq_287 aq_288 smb   FALSE 0.366 8.000 0.000 1.000   NA
 24510 24511 aq_291 aq_293     FALSE 0.349 11.000 0.000 1.000   NA
 24511 24512 aq_293 aq_294     FALSE 0.384 6.000 0.000 1.000   NA
 24512 24513 aq_294 aq_296     TRUE 0.996 -3.000 0.714 0.085 Y NA
 24513 24514 aq_296 aq_297   abcT8 TRUE 0.977 -7.000 0.133 1.000 N NA
 24517 24518 aq_302 aq_303     TRUE 0.980 -3.000 0.206 NA   NA
 24518 24519 aq_303 aq_305   ileS FALSE 0.425 -13.000 0.000 1.000 N NA
 24521 24522 aq_311 aq_313     TRUE 0.666 -13.000 0.000 NA   NA
 24522 24523 aq_313 aq_314     TRUE 0.807 9.000 0.005 NA   NA
 24523 24524 aq_314 aq_316   hksP2 FALSE 0.053 109.000 0.000 1.000 N NA
 24525 24526 aq_319 aq_321 phoB   TRUE 0.821 11.000 0.000 0.031 Y NA
 24527 24528 aq_322 aq_323 dnaA   FALSE 0.329 91.000 0.003 1.000 N NA
 24533 24534 aq_328 aq_331     FALSE 0.179 30.000 0.000 1.000   NA
 24534 2209590 aq_331 aq_t02     FALSE 0.171 48.000 0.000 NA   NA
 2209590 24535 aq_t02 aq_334   dcuP FALSE 0.222 26.000 0.000 NA   NA
 2209591 2209592 aq_t03 aq_t04     FALSE 0.366 12.000 0.000 NA   NA
 24537 24538 aq_337 aq_338 cysQ   FALSE 0.264 4.000 0.000 1.000 N NA
 24539 24540 aq_340 aq_341     FALSE 0.219 906.000 0.000 NA Y NA
 24540 24541 aq_341 aq_342     FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 24542 24543 aq_343 aq_344 arsA2 rfaD FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24545 24546 aq_346 aq_348 pth ctc TRUE 0.988 5.000 0.496 0.051   NA
 24548 24549 aq_351 aq_355 leuS   FALSE 0.333 4.000 0.000 NA N NA
 24549 24550 aq_355 aq_356   leuA1 FALSE 0.193 14.000 0.000 NA N NA
 24551 24552 aq_357a aq_358 flgM dinG FALSE 0.345 64.000 0.000 1.000 Y NA
 24552 24553 aq_358 aq_359 dinG   FALSE 0.321 12.000 0.000 1.000   NA
 24554 24555 aq_360 aq_362 timA   FALSE 0.171 336.000 0.000 0.055 N NA
 24555 24556 aq_362 aq_363     TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 24556 24557 aq_363 aq_364     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24557 24558 aq_364 aq_365   proS TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA Y NA
 11403783 24558   aq_365   proS FALSE NA 2612.000 0.000 NA   NA
 11546146 24558   aq_365   proS FALSE NA 2612.000 0.000 NA   NA
 11688538 24558   aq_365   proS FALSE NA 2612.000 0.000 NA   NA
 11403784 24558   aq_365   proS FALSE NA 2641.000 0.000 NA   NA
 11546147 24558   aq_365   proS FALSE NA 2641.000 0.000 NA   NA
 11688539 24558   aq_365   proS FALSE NA 2641.000 0.000 NA   NA
 11403785 24558   aq_365   proS FALSE NA 2680.000 0.000 NA   NA
 11546148 24558   aq_365   proS FALSE NA 2680.000 0.000 NA   NA
 11688540 24558   aq_365   proS FALSE NA 2680.000 0.000 NA   NA
 11403786 24558   aq_365   proS FALSE NA 2709.000 0.000 NA   NA
 11546149 24558   aq_365   proS FALSE NA 2709.000 0.000 NA   NA
 11688541 24558   aq_365   proS FALSE NA 2709.000 0.000 NA   NA
 11403787 24558   aq_365   proS FALSE NA 2749.000 0.000 NA   NA
 11546150 24558   aq_365   proS FALSE NA 2749.000 0.000 NA   NA
 11688542 24558   aq_365   proS FALSE NA 2749.000 0.000 NA   NA
 11403788 24558   aq_365   proS FALSE NA 2778.000 0.000 NA   NA
 11546151 24558   aq_365   proS FALSE NA 2778.000 0.000 NA   NA
 11688543 24558   aq_365   proS FALSE NA 2778.000 0.000 NA   NA
 11403789 24558   aq_365   proS FALSE NA 2814.000 0.000 NA   NA
 11546152 24558   aq_365   proS FALSE NA 2814.000 0.000 NA   NA
 11688544 24558   aq_365   proS FALSE NA 2814.000 0.000 NA   NA
 24560 24561 aq_369 aq_370     TRUE 0.990 -7.000 0.119 NA Y NA
 24561 24562 aq_370 aq_371     TRUE 0.980 -22.000 0.071 1.000   NA
 24562 24563 aq_371 aq_372     TRUE 0.983 -49.000 0.071 NA   NA
 24563 24564 aq_372 aq_373     TRUE 0.984 -9.000 0.143 NA   NA
 24564 24565 aq_373 aq_374     TRUE 0.991 -19.000 0.103 NA Y NA
 24565 24566 aq_374 aq_376     FALSE 0.140 78.000 0.000 NA   NA
 24566 24567 aq_376 aq_377     TRUE 0.540 2.000 0.000 NA   NA
 24567 24568 aq_377 aq_378     FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 24568 24569 aq_378 aq_380     TRUE 0.977 -3.000 0.034 NA Y NA
 24569 24570 aq_380 aq_381     TRUE 0.562 16.000 0.000 NA Y NA
 24570 24571 aq_381 aq_382     FALSE 0.447 33.000 0.000 NA Y NA
 24571 24572 aq_382 aq_383     TRUE 0.882 -34.000 0.000 NA Y NA
 24572 24573 aq_383 aq_384     FALSE 0.287 242.000 0.000 NA Y NA
 24573 24574 aq_384 aq_385     TRUE 0.993 -10.000 0.256 NA Y NA
 24574 24575 aq_385 aq_386     TRUE 0.987 -3.000 0.136 NA Y NA
 24575 24576 aq_386 aq_387     TRUE 0.976 -19.000 0.041 NA   NA
 24577 24578 aq_388 aq_389     FALSE 0.084 609.000 0.000 NA   NA
 24578 24579 aq_389 aq_390     TRUE 0.961 20.000 0.833 NA   NA
 24579 24580 aq_390 aq_391     TRUE 0.820 127.000 0.132 NA   NA
 24580 24581 aq_391 aq_392     TRUE 0.955 59.000 0.526 NA Y NA
 24581 24582 aq_392 aq_394     FALSE 0.308 148.000 0.000 NA Y NA
 24582 24583 aq_394 aq_395   hdrA TRUE 0.811 58.000 0.062 NA   NA
 24583 24584 aq_395 aq_397 hdrA   TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 24584 24585 aq_397 aq_398   hdrC TRUE 0.969 15.000 0.760 NA   NA
 24585 24586 aq_398 aq_400 hdrC hdrB TRUE 0.994 13.000 0.864 0.003 Y NA
 24586 24587 aq_400 aq_401 hdrB   TRUE 0.814 75.000 0.091 NA   NA
 24587 24588 aq_401 aq_402     TRUE 0.953 28.000 0.786 NA   NA
 24588 24589 aq_402 aq_403     TRUE 0.875 43.000 0.158 1.000   NA
 24589 24590 aq_403 aq_404     FALSE 0.230 17.000 0.000 1.000   NA
 24591 24592 aq_406 aq_407     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24592 24593 aq_407 aq_408     FALSE 0.283 16.000 0.000 NA   NA
 24593 24594 aq_408 aq_409   pyrB TRUE 0.642 -9.000 0.000 NA   NA
 24594 24595 aq_409 aq_410 pyrB carA TRUE 0.963 -3.000 0.014 1.000 Y NA
 11403790 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8184.000 0.000 NA   NA
 11546153 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8184.000 0.000 NA   NA
 11688545 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8184.000 0.000 NA   NA
 11403791 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8213.000 0.000 NA   NA
 11546154 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8213.000 0.000 NA   NA
 11688546 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8213.000 0.000 NA   NA
 11403792 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8249.000 0.000 NA   NA
 11546155 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8249.000 0.000 NA   NA
 11688547 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8249.000 0.000 NA   NA
 11403793 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8278.000 0.000 NA   NA
 11546156 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8278.000 0.000 NA   NA
 11688548 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8278.000 0.000 NA   NA
 11403794 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8314.000 0.000 NA   NA
 11546157 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8314.000 0.000 NA   NA
 11688549 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8314.000 0.000 NA   NA
 11403795 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8343.000 0.000 NA   NA
 11546158 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8343.000 0.000 NA   NA
 11688550 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8343.000 0.000 NA   NA
 11403796 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8381.000 0.000 NA   NA
 11546159 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8381.000 0.000 NA   NA
 11688551 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8381.000 0.000 NA   NA
 11403797 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8410.000 0.000 NA   NA
 11546160 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8410.000 0.000 NA   NA
 11688552 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8410.000 0.000 NA   NA
 11403798 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8447.000 0.000 NA   NA
 11546161 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8447.000 0.000 NA   NA
 11688553 24585   aq_398   hdrC FALSE NA 8447.000 0.000 NA   NA
 24596 24597 aq_411 aq_413 pcnB1 abcT7 TRUE 0.469 3.000 0.000 1.000   NA
 24597 24598 aq_413 aq_414 abcT7   TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24598 24599 aq_414 aq_415   napA1 TRUE 0.979 -28.000 0.062 1.000   NA
 24599 24600 aq_415 aq_416 napA1   FALSE 0.230 17.000 0.000 1.000   NA
 24600 24601 aq_416 aq_417   abcT6 TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24602 24603 aq_418 aq_419 gspG   TRUE 0.506 0.000 0.000 1.000   NA
 24603 24604 aq_419 aq_420     TRUE 0.981 0.000 0.250 NA   NA
 24605 24606 aq_421 aq_422 aspC3 metG' FALSE 0.245 16.000 0.000 1.000   NA
 24606 24607 aq_422 aq_423 metG'   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24608 24609 aq_425 aq_427 thrC2   FALSE 0.219 27.000 0.000 NA   NA
 24609 24610 aq_427 aq_428     FALSE 0.257 18.000 0.000 NA   NA
 24612 24613 aq_430 aq_433   grpE TRUE 0.668 148.000 0.023 NA   NA
 24613 24614 aq_433 aq_434 grpE glpK FALSE 0.108 20.000 0.000 1.000 N NA
 24614 24615 aq_434 aq_436 glpK ribD2 FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24615 2209593 aq_436 aq_t05 ribD2   FALSE 0.227 25.000 0.000 NA   NA
 24617 24618 aq_438 aq_439     TRUE 0.803 239.000 0.022 0.001   NA
 24621 24622 aq_443 aq_445 gua accD TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 24622 24623 aq_445 aq_447 accD mgtC TRUE 0.834 -3.000 0.003 1.000   NA
 24623 24624 aq_447 aq_448 mgtC   FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 24624 24625 aq_448 aq_449     TRUE 0.964 -9.000 0.023 NA   NA
 24625 24626 aq_449 aq_450     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24627 24628 aq_451 aq_453 ilvB   FALSE 0.083 334.000 0.000 1.000   NA
 24628 24629 aq_453 aq_454     TRUE 0.949 -12.000 0.011 1.000   NA
 24629 24630 aq_454 aq_455   sor FALSE 0.203 32.000 0.000 NA   NA
 24631 24632 aq_458 aq_459 bcp   FALSE 0.200 23.000 0.000 1.000   NA
 24632 24633 aq_459 aq_460     TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24633 24634 aq_460 aq_461   gatB FALSE 0.321 12.000 0.000 1.000   NA
 24634 24635 aq_461 aq_465 gatB   FALSE 0.339 13.000 0.000 NA   NA
 24635 24636 aq_465 aq_467     FALSE 0.090 448.000 0.000 NA   NA
 24636 24637 aq_467 aq_468   czcB3 TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24637 24638 aq_468 aq_469 czcB3 acrD3 FALSE 0.138 15.000 0.000 1.000 N NA
 24638 24639 aq_469 aq_473 acrD3   FALSE 0.266 17.000 0.000 NA   NA
 24641 24642 aq_476 aq_477 panD   TRUE 0.850 2.000 0.005 NA N NA
 24643 24644 aq_478 aq_479   glyA TRUE 0.931 -34.000 0.008 1.000 N NA
 24644 24645 aq_479 aq_481 glyA oppB TRUE 0.669 9.000 0.000 1.000 Y NA
 24647 24648 aq_486 aq_488 ahpC1 tpx TRUE 0.623 54.000 0.000 0.004 Y NA
 24648 24649 aq_488 aq_490 tpx fnr FALSE 0.061 69.000 0.000 1.000 N NA
 24649 24650 aq_490 aq_492 fnr   TRUE 0.829 98.000 0.250 1.000 N NA
 24650 24651 aq_492 aq_493     FALSE 0.219 27.000 0.000 NA   NA
 24651 24652 aq_493 aq_494     TRUE 0.703 -52.000 0.000 NA   NA
 24653 24654 aq_495 aq_496   mutY3 TRUE 0.965 -75.000 0.026 1.000 N NA
 24655 24656 aq_497 aq_498 gsdA gnd TRUE 0.994 -37.000 0.286 1.000 Y NA
 24656 24657 aq_498 aq_499 gnd   FALSE 0.316 0.000 0.000 1.000 N NA
 24657 24658 aq_499 aq_500   trxB FALSE 0.056 82.000 0.000 1.000 N NA
 24658 24659 aq_500 aq_501 trxB pmu FALSE 0.049 143.000 0.000 1.000 N NA
 24659 24660 aq_501 aq_503 pmu   TRUE 0.706 -108.000 0.000 NA   NA
 24660 24661 aq_503 aq_504   otnA' FALSE 0.136 84.000 0.000 NA   NA
 24661 24662 aq_504 aq_505 otnA' otnA TRUE 0.458 31.000 0.000 NA Y NA
 24662 24663 aq_505 aq_506 otnA   TRUE 0.936 -58.000 0.000 0.079 Y NA
 24664 24665 aq_507 aq_509     FALSE 0.067 792.000 0.000 1.000   NA
 24665 24666 aq_509 aq_510     TRUE 0.501 1.000 0.000 1.000   NA
 24666 24667 aq_510 aq_511   murB2 FALSE 0.156 39.000 0.000 1.000   NA
 24669 24670 aq_515 aq_516 mtfB mtfC TRUE 0.992 -3.000 0.103 0.016 Y NA
 24670 24671 aq_516 aq_518 mtfC spsK FALSE 0.129 64.000 0.000 1.000   NA
 24671 24672 aq_518 aq_519 spsK rfe TRUE 0.653 -31.000 0.000 1.000   NA
 24672 24673 aq_519 aq_520 rfe murB1 TRUE 0.781 1.000 0.000 1.000 Y NA
 24673 24674 aq_520 aq_521 murB1 ddlA TRUE 0.997 -43.000 0.135 0.007 Y NA
 24674 24675 aq_521 aq_522 ddlA   TRUE 0.801 11.000 0.005 NA   NA
 24675 24676 aq_522 aq_523   ftsA TRUE 0.988 0.000 0.600 NA   NA
 24676 24677 aq_523 aq_525 ftsA ftsZ TRUE 0.846 13.000 0.004 1.000 Y NA
 24677 24678 aq_525 aq_527 ftsZ moaC FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24678 24679 aq_527 aq_528 moaC dedF TRUE 0.945 -12.000 0.003 1.000 Y NA
 24682 24683 aq_532 aq_533     FALSE 0.283 16.000 0.000 NA   NA
 24684 24685 aq_534 aq_538 draG lpxD FALSE 0.054 330.000 0.000 NA N NA
 24685 24686 aq_538 aq_539 lpxD   TRUE 0.491 2.000 0.000 1.000   NA
 24688 24689 aq_542 aq_544 bcpC hpt FALSE 0.304 2.000 0.000 1.000 N NA
 24692 24693 aq_548 aq_549   trpG FALSE 0.054 99.000 0.000 1.000 N NA
 24693 24694 aq_549 aq_551 trpG nuoD1 FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24694 24695 aq_551 aq_552 nuoD1 sms FALSE 0.073 44.000 0.000 1.000 N NA
 24695 24696 aq_552 aq_553 sms frdB1 TRUE 0.657 9.000 0.002 1.000 N NA
 24696 24697 aq_553 aq_554 frdB1   FALSE 0.080 36.000 0.000 1.000 N NA
 24698 24699 aq_555 aq_556   pbpA2 TRUE 0.540 2.000 0.000 NA   NA
 24700 24701 aq_557 aq_558 bioD thiE2 TRUE 0.782 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 24701 24702 aq_558 aq_561 thiE2 recN FALSE 0.078 38.000 0.000 1.000 N NA
 24702 401898 aq_561 aq_t06 recN tRNA-Thr FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 24703 24704 aq_563 aq_565   rfaE FALSE 0.195 11.000 0.000 1.000 N NA
 24704 24705 aq_565 aq_566 rfaE birA FALSE 0.286 3.000 0.000 1.000 N NA
 24708 24709 aq_572 aq_573   nuoF FALSE 0.203 10.000 0.000 1.000 N NA
 24709 24710 aq_573 aq_574 nuoF nuoE TRUE 0.998 -25.000 1.000 0.011 Y NA
 24710 24711 aq_574 aq_575 nuoE   FALSE 0.108 20.000 0.000 1.000 N NA
 24711 24712 aq_575 aq_576   stpK TRUE 0.956 -3.000 0.011 1.000 Y NA
 24715 24716 aq_579 aq_581 def   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24720 24721 aq_589 aq_591 xanB   TRUE 0.682 -19.000 0.000 NA   NA
 24721 2209594 aq_591 aq_t07     TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 2209594 24722 aq_t07 aq_592     FALSE 0.231 24.000 0.000 NA   NA
 24723 24724 aq_594 aq_597 frdA purB FALSE 0.040 296.000 0.000 1.000 N NA
 24724 24725 aq_597 aq_598 purB   FALSE 0.178 42.000 0.000 NA   NA
 24728 24729 aq_601 aq_603     FALSE 0.114 212.000 0.000 NA   NA
 24729 24730 aq_603 aq_604   lpxA FALSE 0.165 34.000 0.000 1.000   NA
 24730 24731 aq_604 aq_607 lpxA glmU TRUE 0.819 14.000 0.003 1.000 Y NA
 24732 24733 aq_608 aq_609 thrC1   FALSE 0.195 11.000 0.000 1.000 N NA
 24733 24734 aq_609 aq_613   deaD FALSE 0.069 676.000 0.000 1.000   NA
 24735 24736 aq_615 aq_616     FALSE 0.193 34.000 0.000 NA   NA
 24736 24737 aq_616 aq_618   pfpI FALSE 0.349 11.000 0.000 1.000   NA
 24737 24738 aq_618 aq_619 pfpI yfeA TRUE 0.945 0.000 0.024 1.000   NA
 24738 24739 aq_619 aq_620 yfeA abcT2 TRUE 0.993 -9.000 0.286 1.000 Y NA
 24739 24740 aq_620 aq_621 abcT2   TRUE 0.929 58.000 0.214 1.000 Y NA
 24742 24743 aq_624 aq_626 mrcA bioF FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24744 24745 aq_627 aq_628     FALSE 0.182 40.000 0.000 NA   NA
 24745 24746 aq_628 aq_629   xcpC FALSE 0.089 455.000 0.000 NA   NA
 24746 24747 aq_629 aq_632 xcpC   FALSE 0.091 254.000 0.000 1.000   NA
 24749 24750 aq_635 aq_638   lysR1 TRUE 0.757 828.000 0.333 1.000 N NA
 24752 24753 aq_642 aq_644     FALSE 0.384 6.000 0.000 1.000   NA
 24754 24755 aq_645 aq_647     TRUE 0.880 363.000 0.684 NA   NA
 24757 24758 aq_651 aq_652   nlpD1 FALSE 0.388 -3.000 0.000 NA N NA
 24758 24759 aq_652 aq_653 nlpD1 fliG FALSE 0.043 257.000 0.000 1.000 N NA
 24759 24760 aq_653 aq_655 fliG frdB2 TRUE 0.824 2.000 0.005 1.000 N NA
 24762 24763 aq_660 aq_662 mbhS1 mbhL1 TRUE 0.991 15.000 0.611 0.004 Y NA
 24763 24764 aq_662 aq_665 mbhL1 hoxZ TRUE 0.994 -7.000 0.111 0.059 Y NA
 24764 24765 aq_665 aq_666 hoxZ hupE FALSE 0.210 13.000 0.000 NA N NA
 24765 24766 aq_666 aq_667 hupE hupD FALSE 0.210 13.000 0.000 NA N NA
 24766 24767 aq_667 aq_668 hupD   TRUE 0.980 -13.000 0.077 NA   NA
 24767 24768 aq_668 aq_669     TRUE 0.979 -6.000 0.103 NA   NA
 24768 24769 aq_669 aq_671   hypB TRUE 0.958 -7.000 0.021 NA   NA
 24769 24770 aq_671 aq_672 hypB hypF TRUE 0.992 -31.000 0.021 0.017 Y NA
 24770 24771 aq_672 aq_673 hypF atpC FALSE 0.195 11.000 0.000 1.000 N NA
 24771 24772 aq_673 aq_674 atpC   TRUE 0.935 -16.000 0.007 1.000   NA
 24773 24774 aq_676 aq_678     FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 24777 24778 aq_684 aq_685   arsC TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24778 24779 aq_685 aq_686 arsC uvrA FALSE 0.177 12.000 0.000 1.000 N NA
 24780 24781 aq_689 aq_691   gidA2 FALSE 0.160 13.000 0.000 1.000 N NA
 24783 24784 aq_693 aq_695   acrD1 FALSE 0.072 111.000 0.000 NA N NA
 24784 24785 aq_695 aq_698 acrD1 acrE TRUE 0.973 5.000 0.449 NA N NA
 24785 24786 aq_698 aq_699 acrE   TRUE 0.991 -3.000 0.422 1.000 Y NA
 24786 24787 aq_699 aq_701     FALSE 0.164 54.000 0.000 NA   NA
 24787 24788 aq_701 aq_702   merR TRUE 0.666 -13.000 0.000 NA   NA
 24788 24789 aq_702 aq_703 merR dnaJ2 TRUE 0.901 6.000 0.028 1.000 N NA
 24789 24790 aq_703 aq_705 dnaJ2 truB FALSE 0.372 71.000 0.004 1.000 N NA
 24791 24792 aq_706 aq_707 trpB1   TRUE 0.535 16.000 0.000 1.000 Y NA
 24792 24793 aq_707 aq_708   hyuA TRUE 0.738 4.000 0.000 1.000 Y NA
 24794 24795 aq_710 aq_711 nucI   TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24795 24796 aq_711 aq_712   frr TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 24796 24797 aq_712 aq_713 frr pyrH FALSE 0.220 6.000 0.000 1.000 N NA
 24797 24798 aq_713 aq_715 pyrH tsf TRUE 0.980 0.000 0.416 1.000 N NA
 24798 24799 aq_715 aq_716 tsf   FALSE 0.078 77.000 0.000 NA N NA
 24800 24801 aq_717 aq_718 glgP mpg TRUE 0.980 -3.000 0.011 0.015 Y NA
 24801 24802 aq_718 aq_720 mpg   TRUE 0.993 -3.000 0.124 0.015 Y NA
 24802 24803 aq_720 aq_721   glgA TRUE 0.782 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 24803 24804 aq_721 aq_722 glgA glgB TRUE 0.867 -25.000 0.000 1.000 Y NA
 24804 24805 aq_722 aq_723 glgB malM TRUE 0.917 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 24805 24806 aq_723 aq_724 malM ctrA1 FALSE 0.177 12.000 0.000 1.000 N NA
 24806 24807 aq_724 aq_727 ctrA1 ldhA TRUE 0.597 6.000 0.000 0.051 N NA
 24807 24808 aq_727 aq_728 ldhA speC FALSE 0.080 36.000 0.000 1.000 N NA
 24808 24809 aq_728 aq_729 speC   TRUE 0.663 -94.000 0.000 1.000   NA
 24809 24810 aq_729 aq_731   ccdA FALSE 0.321 12.000 0.000 1.000   NA
 24810 24811 aq_731 aq_732 ccdA hisH FALSE 0.316 0.000 0.000 1.000 N NA
 24812 24813 aq_734 aq_735 rpsG2 rpsL2 TRUE 0.993 4.000 0.224 0.007 Y NA
 24814 24815 aq_736 aq_737 lpdA   FALSE 0.063 64.000 0.000 1.000 N NA
 24815 24816 aq_737 aq_739   nifS2 TRUE 0.911 21.000 0.267 1.000 N NA
 24816 24817 aq_739 aq_740 nifS2   FALSE 0.366 12.000 0.000 NA   NA
 24819 24820 aq_745 aq_747 pilT pilC1 TRUE 0.989 0.000 0.218 1.000 Y NA
 24821 24822 aq_748 aq_749 ispA truA FALSE 0.147 14.000 0.000 1.000 N NA
 24822 24823 aq_749 aq_750 truA pgi FALSE 0.388 -7.000 0.000 1.000 N NA
 24823 24824 aq_750 aq_752 pgi   FALSE 0.193 34.000 0.000 NA   NA
 24824 24825 aq_752 aq_754     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24825 24826 aq_754 aq_755     TRUE 0.630 -7.000 0.000 NA   NA
 24826 24827 aq_755 aq_756     TRUE 0.981 -3.000 0.235 NA   NA
 24827 24828 aq_756 aq_757     TRUE 0.630 -7.000 0.000 NA   NA
 24828 24829 aq_757 aq_758     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24829 24830 aq_758 aq_759     TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 24831 24832 aq_761 aq_763 gidA1 genX FALSE 0.316 0.000 0.000 1.000 N NA
 24834 24835 aq_765 aq_766     TRUE 0.979 -22.000 0.057 NA   NA
 24835 24836 aq_766 aq_768     TRUE 0.969 7.000 0.286 NA   NA
 24836 24837 aq_768 aq_769   purM TRUE 0.817 3.000 0.005 1.000 N NA
 24837 24838 aq_769 aq_770 purM   FALSE 0.119 157.000 0.000 NA   NA
 24838 24839 aq_770 aq_771     TRUE 0.730 30.000 0.011 NA   NA
 24839 24840 aq_771 aq_773   tly FALSE 0.366 12.000 0.000 NA   NA
 24840 24841 aq_773 aq_775 tly   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24842 24843 aq_777 aq_778 nadB   TRUE 0.644 -22.000 0.000 1.000   NA
 24843 24844 aq_778 aq_780     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24844 24845 aq_780 aq_782   hisD TRUE 0.946 -7.000 0.011 NA   NA
 24845 24846 aq_782 aq_786 hisD acrD4 FALSE 0.049 439.000 0.000 NA N NA
 24847 24848 aq_788 aq_789     FALSE 0.114 18.000 0.000 1.000 N NA
 24848 24849 aq_789 aq_791     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24849 24850 aq_791 aq_792   cycB1 FALSE 0.227 25.000 0.000 NA   NA
 24850 24851 aq_792 aq_792a cycB1 rpmI FALSE 0.133 59.000 0.000 1.000   NA
 24853 24854 aq_796 aq_797   prc TRUE 0.912 -3.000 0.009 NA   NA
 24854 24855 aq_797 aq_801 prc gcp TRUE 0.959 -3.000 0.017 0.024 N NA
 24855 2209597 aq_801 aq_t10 gcp   FALSE 0.186 38.000 0.000 NA   NA
 2209597 24856 aq_t10 aq_802   mbhS3 FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 24856 24857 aq_802 aq_804 mbhS3 mbhL3 TRUE 0.998 -10.000 1.000 0.004 Y NA
 24858 24859 aq_805 aq_806   pyrC TRUE 0.809 4.000 0.003 NA   NA
 24859 24860 aq_806 aq_808 pyrC   FALSE 0.316 14.000 0.000 NA   NA
 24860 24861 aq_808 aq_809     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24861 24862 aq_809 aq_811     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24864 24865 aq_813 aq_814 acpS   FALSE 0.388 -3.000 0.000 NA N NA
 24865 24866 aq_814 aq_815   dfp FALSE 0.392 0.000 0.000 NA N NA
 24867 24868 aq_816 aq_818 gsa   TRUE 0.882 4.000 0.008 NA   NA
 24868 24869 aq_818 aq_819   lnt TRUE 0.978 -42.000 0.041 NA   NA
 24870 24871 aq_820 aq_821   murF TRUE 0.956 -10.000 0.014 NA   NA
 24871 2209598 aq_821 aq_r01 murF   FALSE 0.227 25.000 0.000 NA   NA
 2209598 407350 aq_r01 aq_r02   rrl FALSE 0.182 40.000 0.000 NA   NA
 407350 401895 aq_r02 aq_t11 rrl tRNA-Ala FALSE 0.171 48.000 0.000 NA   NA
 401895 401894 aq_t11 aq_t12 tRNA-Ala tRNA-Ile FALSE 0.266 17.000 0.000 NA   NA
 401894 2209599 aq_t12 aq_r03 tRNA-Ile   FALSE 0.131 105.000 0.000 NA   NA
 24873 24874 aq_832 aq_833 surE flgA TRUE 0.491 4.000 0.000 NA   NA
 24874 24875 aq_833 aq_834 flgA flgG2 TRUE 0.985 -70.000 0.021 NA Y NA
 24882 24883 aq_845 aq_847 mreB   TRUE 0.938 -3.000 0.030 1.000 N NA
 24883 24884 aq_847 aq_848     FALSE 0.106 263.000 0.000 NA   NA
 24885 24886 aq_849 aq_850     FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 24886 24887 aq_850 aq_851   corA TRUE 0.642 -9.000 0.000 NA   NA
 24887 24888 aq_851 aq_852 corA pdxA FALSE 0.425 -13.000 0.000 1.000 N NA
 24888 24889 aq_852 aq_853 pdxA   TRUE 0.974 -7.000 0.014 1.000 Y NA
 24889 24890 aq_853 aq_854     TRUE 0.656 11.000 0.000 1.000 Y NA
 24890 24891 aq_854 aq_855     TRUE 0.939 -3.000 0.031 1.000 N NA
 24893 24894 aq_858 aq_862 ahpC2   FALSE 0.036 422.000 0.000 1.000 N NA
 24894 24895 aq_862 aq_863     TRUE 0.987 -7.000 0.288 NA   NA
 24895 24896 aq_863 aq_866   nuoL2 TRUE 0.911 14.000 0.061 NA   NA
 24896 24897 aq_866 aq_867a nuoL2 rpsU FALSE 0.137 55.000 0.000 1.000   NA
 24897 24898 aq_867a aq_869 rpsU nadC FALSE 0.086 286.000 0.000 1.000   NA
 24898 2209600 aq_869 aq_t13 nadC   FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 24899 24900 aq_871 aq_873 thdF rho TRUE 0.762 16.000 0.009 1.000   NA
 24900 24901 aq_873 aq_rpmE rho RpmE TRUE 0.822 51.000 0.115 1.000 N NA
 24901 24902 aq_rpmE aq_876 RpmE prfA TRUE 0.980 4.000 0.110 1.000 Y NA
 24903 24904 aq_877 aq_878 minD2 minC TRUE 0.995 -21.000 0.466 1.000 Y NA
 24906 24907 aq_881 aq_886   topG2 FALSE 0.036 438.000 0.000 1.000 N NA
 24908 24909 aq_888 aq_890     FALSE 0.175 44.000 0.000 NA   NA
 24911 24912 aq_892 aq_893 fabD   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24913 24914 aq_894 aq_895 queA ispB TRUE 0.642 13.000 0.004 1.000 N NA
 24914 401892 aq_895 aq_t14 ispB tRNA-Arg FALSE 0.257 18.000 0.000 NA   NA
 24915 24916 aq_896 aq_898 nifU   TRUE 0.902 2.000 0.012 1.000 N NA
 24916 24917 aq_898 aq_899     TRUE 0.699 -39.000 0.000 NA   NA
 24917 24918 aq_899 aq_900     FALSE 0.124 120.000 0.000 NA   NA
 24918 24919 aq_900 aq_901   aroE FALSE 0.105 267.000 0.000 NA   NA
 24919 24920 aq_901 aq_903 aroE   FALSE 0.388 -7.000 0.000 1.000 N NA
 24920 24921 aq_903 aq_904     TRUE 0.550 1.000 0.000 NA   NA
 24922 24923 aq_905 aq_906 hksP3 phoU TRUE 0.944 -7.000 0.018 NA N NA
 24924 24925 aq_908 aq_909 gmhA   TRUE 0.970 -15.000 0.008 1.000 Y NA
 24926 24927 aq_910 aq_911 dnaC ebs FALSE 0.085 33.000 0.000 1.000 N NA
 24927 24928 aq_911 aq_913 ebs   FALSE 0.409 9.000 0.000 NA   NA
 24929 24930 aq_914 aq_915     FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 24930 24931 aq_915 aq_916   dapB FALSE 0.041 288.000 0.000 1.000 N NA
 24932 24933 aq_917 aq_918     TRUE 0.971 -3.000 0.100 NA   NA
 24935 24936 aq_919a aq_920 fdx1 ftsY FALSE 0.069 51.000 0.000 1.000 N NA
 24936 24937 aq_920 aq_922 ftsY   FALSE 0.165 34.000 0.000 1.000   NA
 24938 24939 aq_923 aq_924 argS rnpH TRUE 0.486 20.000 0.000 1.000 Y NA
 24939 24940 aq_924 aq_926 rnpH   TRUE 0.700 -42.000 0.000 NA   NA
 24940 24941 aq_926 aq_928     FALSE 0.173 46.000 0.000 NA   NA
 24941 24942 aq_928 aq_929   napA2 FALSE 0.321 12.000 0.000 1.000   NA
 24942 24943 aq_929 aq_931 napA2   FALSE 0.093 233.000 0.000 1.000   NA
 2209601 24944 aq_t15 aq_932   dnaQ FALSE 0.209 30.000 0.000 NA   NA
 24944 24945 aq_932 aq_932a dnaQ purS FALSE 0.454 -25.000 0.000 1.000 N NA
 24945 24946 aq_932a aq_933 purS   FALSE 0.102 23.000 0.000 1.000 N NA
 24946 24947 aq_933 aq_935     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24948 24949 aq_936 aq_940 ftsH leuC TRUE 0.890 0.000 0.009 1.000 N NA
 24949 24950 aq_940 aq_943 leuC   FALSE 0.078 1186.000 0.000 NA   NA
 24950 24951 aq_943 aq_944   gcsH3 FALSE 0.145 73.000 0.000 NA   NA
 24951 24952 aq_944 aq_945 gcsH3 glyQ FALSE 0.040 291.000 0.000 1.000 N NA
 24952 24953 aq_945 aq_946 glyQ rnc FALSE 0.450 -22.000 0.000 1.000 N NA
 24953 24954 aq_946 aq_948 rnc hemH FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24954 24955 aq_948 aq_950 hemH   FALSE 0.097 357.000 0.000 NA   NA
 24957 24958 aq_952 aq_953 rplT pheS TRUE 0.988 0.000 0.202 1.000 Y NA
 24958 24959 aq_953 aq_955 pheS lepB FALSE 0.205 9.000 0.000 1.000 N NA
 24959 24960 aq_955 aq_957 lepB   FALSE 0.316 0.000 0.000 1.000 N NA
 24960 24961 aq_957 aq_958   pgsA2 TRUE 0.678 7.000 0.000 1.000 Y NA
 24962 24963 aq_959 aq_960 nadE mbhL2 FALSE 0.349 11.000 0.000 1.000   NA
 24963 24964 aq_960 aq_961 mbhL2 hdrD TRUE 0.996 -3.000 0.667 0.057 Y NA
 24964 24965 aq_961 aq_963 hdrD   TRUE 0.957 13.000 0.273 NA   NA
 24965 24966 aq_963 aq_965   mbhS2 TRUE 0.988 0.000 0.600 NA   NA
 24967 24968 aq_966 aq_967   ostA TRUE 0.956 -12.000 0.025 1.000 N NA
 24971 24972 aq_970 aq_972 argJ   FALSE 0.360 10.000 0.000 1.000   NA
 24973 24974 aq_973 aq_974 secD cphA2 FALSE 0.150 43.000 0.000 1.000   NA
 24974 24975 aq_974 aq_975 cphA2 bioB FALSE 0.321 12.000 0.000 1.000   NA
 24975 24976 aq_975 aq_977 bioB   FALSE 0.117 79.000 0.000 1.000   NA
 24976 24977 aq_977 aq_978     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 24979 24980 aq_980 aq_983 gyrA   FALSE 0.145 73.000 0.000 NA   NA
 24981 24982 aq_985 aq_986     FALSE 0.442 4.000 0.000 1.000   NA
 24982 24983 aq_986 aq_987     TRUE 0.692 -27.000 0.000 NA   NA
 24983 24984 aq_987 aq_988     FALSE 0.339 13.000 0.000 NA   NA
 24984 24985 aq_988 aq_990     TRUE 0.506 0.000 0.000 1.000   NA
 24986 24987 aq_992 aq_993 trpS   TRUE 0.948 0.000 0.026 1.000   NA
 24987 24988 aq_993 aq_994   pncA FALSE 0.158 38.000 0.000 1.000   NA
 24988 24989 aq_994 aq_996 pncA dnaK FALSE 0.296 69.000 0.002 1.000 N NA
 24990 24991 aq_999 aq_1001 fadD motB2 FALSE 0.035 504.000 0.000 1.000 N NA
 24991 24992 aq_1001 aq_1002 motB2 motB1 TRUE 0.989 11.000 0.143 0.004 Y NA
 24992 24993 aq_1002 aq_1003 motB1 motA TRUE 0.979 4.000 0.096 1.000 Y NA
 24994 24995 aq_1005 aq_1006 cutA   FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 24996 24997 aq_1008 aq_1010 dnaE udh FALSE 0.177 12.000 0.000 1.000 N NA
 24998 24999 aq_1012 aq_1013     FALSE 0.366 12.000 0.000 NA   NA
 25001 25002 aq_1017 aq_1018     TRUE 0.642 -9.000 0.000 NA   NA
 25002 25003 aq_1018 aq_1019   hypE FALSE 0.076 423.000 0.000 1.000   NA
 25003 25004 aq_1019 aq_1021 hypE hypA TRUE 0.967 0.000 0.080 1.000   NA
 25004 25005 aq_1021 aq_1022 hypA   TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 25006 25007 aq_1023 aq_1024 acuC1   FALSE 0.425 -13.000 0.000 1.000 N NA
 25007 25008 aq_1024 aq_1026   gyrB TRUE 0.883 -10.000 0.005 1.000 N NA
 25008 25009 aq_1026 aq_1029 gyrB   FALSE 0.283 16.000 0.000 NA   NA
 25009 25010 aq_1029 aq_1030   selD FALSE 0.105 269.000 0.000 NA   NA
 25010 25011 aq_1030 aq_1031 selD selA TRUE 0.836 154.000 0.055 1.000 Y NA
 25013 25014 aq_1035 aq_1036     FALSE 0.120 150.000 0.000 NA   NA
 25014 25015 aq_1036 aq_1037     FALSE 0.133 98.000 0.000 NA   NA
 25016 25017 aq_1038 aq_1039 lysR2 fdoG FALSE 0.046 213.000 0.000 1.000 N NA
 25017 25018 aq_1039 aq_1046 fdoG fdoH TRUE 0.993 15.000 1.000 0.002 Y NA
 25018 25019 aq_1046 aq_1049 fdoH fdoI TRUE 0.997 3.000 0.667 0.002 Y NA
 25019 25020 aq_1049 aq_1050 fdoI sodC1 TRUE 0.813 20.000 0.035 1.000 N NA
 25020 25021 aq_1050 aq_1051 sodC1 fdhE TRUE 0.968 -18.000 0.035 NA N NA
 25021 25022 aq_1051 aq_1052 fdhE gcsH1 TRUE 0.817 99.000 0.174 NA N NA
 25022 401862 aq_1052 aq_t16 gcsH1 tRNA-SeC(p) TRUE 0.518 3.000 0.000 NA   NA
 401862 25023 aq_t16 aq_1053 tRNA-SeC(p) nifS1 FALSE 0.300 15.000 0.000 NA   NA
 25023 25024 aq_1053 aq_1054 nifS1   FALSE 0.077 407.000 0.000 1.000   NA
 25025 2209602 aq_1055 aq_t17 pstB   FALSE 0.168 50.000 0.000 NA   NA
 25028 25029 aq_1058 aq_1059 acrR1   TRUE 0.980 -9.000 0.176 1.000 N NA
 25029 25030 aq_1059 aq_1060     TRUE 0.984 -3.000 0.600 1.000 N NA
 25030 25031 aq_1060 aq_1062   emrB TRUE 0.978 -3.000 0.333 1.000 N NA
 25034 25035 aq_1068 aq_1069 cysS galE FALSE 0.237 5.000 0.000 1.000 N NA
 25036 25037 aq_1070 aq_1071   proA FALSE 0.206 31.000 0.000 NA   NA
 25037 25038 aq_1071 aq_1072 proA   FALSE 0.406 10.000 0.000 NA   NA
 25038 25039 aq_1072 aq_1073   czcD FALSE 0.193 34.000 0.000 NA   NA
 25039 25040 aq_1073 aq_1075 czcD   FALSE 0.300 15.000 0.000 NA   NA
 25040 25041 aq_1075 aq_1076   rhdA1 TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 25041 25042 aq_1076 aq_1078 rhdA1   FALSE 0.098 341.000 0.000 NA   NA
 25042 25043 aq_1078 aq_1079     FALSE 0.112 230.000 0.000 NA   NA
 25043 25044 aq_1079 aq_1080     TRUE 0.948 4.000 0.047 1.000   NA
 25047 25048 aq_1084 aq_1085     FALSE 0.083 645.000 0.000 NA   NA
 25048 25049 aq_1085 aq_1088     FALSE 0.366 12.000 0.000 NA   NA
 25049 25050 aq_1088 aq_1091   hylA FALSE 0.148 45.000 0.000 1.000   NA
 25052 25053 aq_1094 aq_1095 abcT4 abcT3 TRUE 0.782 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 25053 25054 aq_1095 aq_1096 abcT3 mtfA FALSE 0.277 207.000 0.000 1.000 Y NA
 25056 25057 aq_1099 aq_1101 fabH plsX TRUE 0.990 1.000 0.058 0.007 Y NA
 25057 25058 aq_1101 aq_1102 plsX rpmF TRUE 0.980 0.000 0.418 1.000 N NA
 25058 25059 aq_1102 aq_1103 rpmF   TRUE 0.988 0.000 0.599 NA   NA
 25060 25061 aq_1104 aq_1105   purQ FALSE 0.205 9.000 0.000 1.000 N NA
 25061 25062 aq_1105 aq_1106 purQ   TRUE 0.849 -7.000 0.003 1.000 N NA
 25062 25063 aq_1106 aq_1106a   moaD FALSE 0.160 13.000 0.000 1.000 N NA
 25063 25064 aq_1106a aq_1108 moaD gcsH4 FALSE 0.105 21.000 0.000 1.000 N NA
 25064 25065 aq_1108 aq_1109 gcsH4 gcsP2 TRUE 0.933 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 25067 25068 aq_1111 aq_1113     FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 25068 25069 aq_1113 aq_1115   hksP1 TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA   NA
 25069 25070 aq_1115 aq_1117 hksP1 ntrC1 TRUE 0.997 -19.000 0.429 0.027 Y NA
 25070 25071 aq_1117 aq_1119 ntrC1   TRUE 0.920 54.000 0.500 NA   NA
 25071 25072 aq_1119 aq_1120     FALSE 0.104 273.000 0.000 NA   NA
 25072 25073 aq_1120 aq_1121     FALSE 0.180 41.000 0.000 NA   NA
 25074 25075 aq_1122 aq_1125 acrD2 ctrA3 TRUE 0.988 7.000 0.158 0.052 Y NA
 25075 25076 aq_1125 aq_1127 ctrA3   TRUE 0.540 2.000 0.000 NA   NA
 25076 25077 aq_1127 aq_1129     FALSE 0.431 6.000 0.000 NA   NA
 25077 25078 aq_1129 aq_1130   sufI FALSE 0.316 14.000 0.000 NA   NA
 25078 25079 aq_1130 aq_1132 sufI czcB1 FALSE 0.160 13.000 0.000 1.000 N NA
 25079 25080 aq_1132 aq_1133 czcB1   TRUE 0.990 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 25080 25081 aq_1133 aq_1134   proB FALSE 0.061 69.000 0.000 1.000 N NA
 25082 25083 aq_1137 aq_1138   rpiB FALSE 0.195 11.000 0.000 1.000 N NA
 25083 25084 aq_1138 aq_1139 rpiB ftsW TRUE 0.967 -31.000 0.031 1.000 N NA
 25084 25085 aq_1139 aq_1140 ftsW argG FALSE 0.264 4.000 0.000 1.000 N NA
 25085 25086 aq_1140 aq_1141 argG   FALSE 0.199 33.000 0.000 NA   NA
 25089 25090 aq_1144 aq_1145 pabB dhaT FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25090 25091 aq_1145 aq_1148 dhaT   FALSE 0.129 26.000 0.000 NA N NA
 25091 25092 aq_1148 aq_1151     FALSE 0.051 401.000 0.000 NA N NA
 25092 25093 aq_1151 aq_1152   lysC FALSE 0.070 49.000 0.000 1.000 N NA
 25095 25096 aq_1155 aq_1156 hisS2 hoxX FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25096 25097 aq_1156 aq_1157 hoxX hypD TRUE 0.883 13.000 0.044 1.000 N NA
 25098 25099 aq_1159 aq_1163 topG1   FALSE 0.188 37.000 0.000 NA   NA
 25099 25100 aq_1163 aq_1166     FALSE 0.128 114.000 0.000 NA   NA
 25100 25101 aq_1166 aq_1167   forA2 TRUE 0.949 20.000 0.545 1.000   NA
 25101 25102 aq_1167 aq_1168 forA2 forB2 TRUE 0.974 24.000 0.750 1.000 Y NA
 25102 25103 aq_1168 aq_1169 forB2 forG2 TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 25103 25104 aq_1169 aq_1171a forG2 fdx2 TRUE 0.986 14.000 1.000 NA Y NA
 25104 25105 aq_1171a aq_1172 fdx2 carB1 FALSE 0.051 395.000 0.000 NA N NA
 25105 25106 aq_1172 aq_1173 carB1   FALSE 0.051 116.000 0.000 1.000 N NA
 25106 25107 aq_1173 aq_1174   rlpA2 TRUE 0.550 -51.000 0.000 NA N NA
 25107 25108 aq_1174 aq_1175 rlpA2 purF FALSE 0.124 28.000 0.000 NA N NA
 25108 25109 aq_1175 aq_1176 purF   FALSE 0.150 67.000 0.000 NA   NA
 25111 25112 aq_1178 aq_1180 purE sahH FALSE 0.408 -10.000 0.000 1.000 N NA
 25113 25114 aq_1182 aq_1182a fliF fliE TRUE 0.993 2.000 0.112 0.008 Y NA
 25114 25115 aq_1182a aq_1183 fliE flgC TRUE 0.994 -9.000 0.077 0.005 Y NA
 25115 25116 aq_1183 aq_1184 flgC flgB TRUE 0.963 -3.000 0.013 1.000 Y NA
 25116 25117 aq_1184 aq_1185 flgB   TRUE 0.888 1.000 0.007 1.000   NA
 25117 25118 aq_1185 aq_1186     TRUE 0.704 -64.000 0.000 NA   NA
 25118 25119 aq_1186 aq_1187     FALSE 0.300 15.000 0.000 NA   NA
 25120 25121 aq_1188 aq_1189   pbpA1 TRUE 0.666 -13.000 0.000 NA   NA
 25123 25124 aq_1192a aq_1192 fdx3   TRUE 0.968 13.000 0.500 NA   NA
 25124 25125 aq_1192 aq_1194     TRUE 0.982 0.000 0.333 1.000   NA
 25125 25126 aq_1194 aq_1195   forA1 TRUE 0.969 12.000 0.500 1.000   NA
 25126 25127 aq_1195 aq_1196 forA1 forB1 TRUE 0.995 -10.000 0.500 1.000 Y NA
 25127 25128 aq_1196 aq_1200 forB1 forG1 TRUE 0.996 -3.000 0.333 0.002 Y NA
 2209603 25129 aq_t18 aq_1201     FALSE 0.108 254.000 0.000 NA   NA
 25133 25134 aq_1207 aq_1208 furR1 lysA FALSE 0.367 47.000 0.002 1.000 N NA
 25134 25135 aq_1208 aq_1210 lysA   FALSE 0.237 22.000 0.000 NA   NA
 25136 25137 aq_1211 aq_1212   flhA TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25137 25138 aq_1212 aq_1214 flhA flhF TRUE 0.994 -10.000 0.440 1.000 Y NA
 25138 25139 aq_1214 aq_1217 flhF minD1 TRUE 0.994 -37.000 0.382 0.073 N NA
 25139 25140 aq_1217 aq_1218 minD1 fliA TRUE 0.948 -3.000 0.045 1.000 N NA
 25141 25142 aq_1219 aq_1220     FALSE 0.156 39.000 0.000 1.000   NA
 25143 25144 aq_1221 aq_1222 gltX abcT1 FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25145 2209604 aq_1223 aq_t19     FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 25146 25147 aq_1224 aq_1226     FALSE 0.075 42.000 0.000 1.000 N NA
 25147 25148 aq_1226 aq_1229   mffT2 FALSE 0.077 39.000 0.000 1.000 N NA
 25149 25150 aq_1230 aq_1231   dmsC FALSE 0.081 362.000 0.000 1.000   NA
 25150 25151 aq_1231 aq_1232 dmsC dmsB1 TRUE 0.958 16.000 0.548 1.000   NA
 25151 25152 aq_1232 aq_1234 dmsB1 dmsA TRUE 0.970 13.000 0.042 0.055 Y NA
 25153 25154 aq_1236 aq_1237   cysG FALSE 0.065 162.000 0.000 NA N NA
 25155 25156 aq_1238 aq_1239     FALSE 0.209 30.000 0.000 NA   NA
 25156 25157 aq_1239 aq_1240   adh2 TRUE 0.506 0.000 0.000 1.000   NA
 25157 25158 aq_1240 aq_1241 adh2   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25158 25159 aq_1241 aq_1242   mutS2 TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25159 25160 aq_1242 aq_1244 mutS2   FALSE 0.212 7.000 0.000 1.000 N NA
 25160 25161 aq_1244 aq_1245   ilvC TRUE 0.877 -3.000 0.008 1.000 N NA
 25162 25163 aq_1247 aq_1248     TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 25163 25164 aq_1248 aq_1249   cds TRUE 0.980 -52.000 0.013 1.000 Y NA
 25164 25165 aq_1249 aq_1250 cds   TRUE 0.693 -28.000 0.000 NA   NA
 25168 25169 aq_1255 aq_1256 feoB   TRUE 0.654 10.000 0.000 0.051   NA
 25170 25171 aq_1257 aq_1258 metG   FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25171 25172 aq_1258 aq_1259     TRUE 0.764 77.000 0.044 NA   NA
 25172 25173 aq_1259 aq_1262     TRUE 0.826 66.000 0.095 NA   NA
 25173 25174 aq_1262 aq_1263     TRUE 0.989 -36.000 0.286 1.000   NA
 25174 25175 aq_1263 aq_1264     TRUE 0.977 -3.000 0.143 NA   NA
 25177 25178 aq_1267 aq_1268   hvsT FALSE 0.081 72.000 0.000 NA N NA
 25179 25180 aq_1270 aq_1271   mpp FALSE 0.096 211.000 0.000 1.000   NA
 25181 25182 aq_1272 aq_1273     TRUE 0.947 -12.000 0.010 NA   NA
 25182 25183 aq_1273 aq_1275   cafA TRUE 0.961 -51.000 0.013 1.000   NA
 25186 25187 aq_1279 aq_1281 hemA murA FALSE 0.038 386.000 0.000 1.000 N NA
 25188 25189 aq_1283 aq_1285 hspC pilC2 FALSE 0.087 61.000 0.000 NA N NA
 25189 25190 aq_1285 aq_1286 pilC2   TRUE 0.976 -3.000 0.036 1.000 Y NA
 25190 25191 aq_1286 aq_1287     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25191 25192 aq_1287 aq_1288   gspD TRUE 0.991 -34.000 0.364 NA   NA
 25192 25193 aq_1288 aq_1290 gspD purA FALSE 0.038 386.000 0.000 1.000 N NA
 25193 25194 aq_1290 aq_1292 purA   FALSE 0.440 29.000 0.000 1.000 Y NA
 25195 25196 aq_1293 aq_1295 alaS   FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 25196 25197 aq_1295 aq_1296   clpC FALSE 0.134 97.000 0.000 NA   NA
 25197 25198 aq_1296 aq_1300 clpC omp TRUE 0.731 38.000 0.027 1.000 N NA
 25199 25200 aq_1303a aq_1303 cspC hisA FALSE 0.053 104.000 0.000 1.000 N NA
 25200 25201 aq_1303 aq_1305 hisA pyrDB FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25202 25203 aq_1306 aq_1308 sucC1 tgt FALSE 0.082 34.000 0.000 1.000 N NA
 25205 25206 aq_1310 aq_1312 nuoA2 nuoB TRUE 0.966 13.000 0.022 0.009 Y NA
 25206 25207 aq_1312 aq_1314 nuoB nuoD2 TRUE 0.995 10.000 1.000 0.009 Y NA
 25207 25208 aq_1314 aq_1315 nuoD2 nuoH1 TRUE 0.941 13.000 0.008 0.018 Y NA
 25208 25209 aq_1315 aq_1317 nuoH1 nuoI1 TRUE 0.992 12.000 0.500 0.018 Y NA
 25209 25210 aq_1317 aq_1318 nuoI1 nuoJ1 TRUE 0.997 -12.000 0.442 0.018 Y NA
 25210 25211 aq_1318 aq_1319 nuoJ1 nuoK1 TRUE 0.968 10.000 0.012 0.009 Y NA
 25211 25212 aq_1319 aq_1320 nuoK1 nuoL1 TRUE 0.979 -3.000 0.011 0.018 Y NA
 25212 25213 aq_1320 aq_1321 nuoL1 nuoM1 TRUE 0.981 0.000 0.011 0.005 Y NA
 25213 25214 aq_1321 aq_1322 nuoM1 nuoN1 TRUE 0.996 5.000 1.000 0.005 Y NA
 25214 25215 aq_1322 aq_1323 nuoN1   FALSE 0.203 10.000 0.000 1.000 N NA
 25216 25217 aq_1324 aq_1326   mobB TRUE 0.831 -3.000 0.002 NA   NA
 25220 25221 aq_1329 aq_1330 moeB gltP FALSE 0.312 1.000 0.000 1.000 N NA
 25221 25222 aq_1330 aq_1331 gltP czcB2 TRUE 0.513 12.000 0.000 0.072 N NA
 25222 25223 aq_1331 aq_1332 czcB2   TRUE 0.983 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 25224 25225 aq_1333 aq_1334   pyrG FALSE 0.041 276.000 0.000 1.000 N NA
 25227 25228 aq_1336 aq_1337   clpX TRUE 0.825 -3.000 0.002 NA   NA
 25228 25229 aq_1337 aq_1339 clpX clpP TRUE 0.966 20.000 0.352 1.000 Y NA
 25229 25230 aq_1339 aq_1340 clpP tig TRUE 0.995 -22.000 0.351 1.000 Y NA
 25230 2209606 aq_1340 aq_t21 tig   TRUE 0.705 -77.000 0.000 NA   NA
 2209606 25231 aq_t21 aq_1342   gph FALSE 0.257 18.000 0.000 NA   NA
 25231 25232 aq_1342 aq_1343 gph   TRUE 0.970 -3.000 0.088 NA   NA
 25233 25234 aq_1345 aq_1347     TRUE 0.540 2.000 0.000 NA   NA
 25234 25235 aq_1347 aq_1348     TRUE 0.705 -85.000 0.000 NA   NA
 25235 25236 aq_1348 aq_1349     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25236 25237 aq_1349 aq_1350     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25237 25238 aq_1350 aq_1351   phoH FALSE 0.190 26.000 0.000 1.000   NA
 25238 25239 aq_1351 aq_1354 phoH   TRUE 0.992 -76.000 0.457 NA   NA
 25241 25242 aq_1356 aq_1357   cydA FALSE 0.126 117.000 0.000 NA   NA
 25242 25243 aq_1357 aq_1358 cydA cydB TRUE 0.882 2.000 0.000 0.054 Y NA
 25244 25245 aq_1359 aq_1360   murC TRUE 0.465 -42.000 0.000 1.000 N NA
 25245 25246 aq_1360 aq_1362 murC adh1 FALSE 0.316 0.000 0.000 1.000 N NA
 25246 25247 aq_1362 aq_1363 adh1 accB FALSE 0.147 14.000 0.000 1.000 N NA
 25247 25248 aq_1363 aq_1364 accB efp TRUE 0.966 -3.000 0.120 1.000 N NA
 2209607 25249 aq_t22 aq_1365     FALSE 0.193 34.000 0.000 NA   NA
 25249 401864 aq_1365 aq_t23   tRNA-Ser FALSE 0.257 18.000 0.000 NA   NA
 25250 25251 aq_1366 aq_1367 thiE1 spsI FALSE 0.177 12.000 0.000 1.000 N NA
 25251 25252 aq_1367 aq_1368 spsI tagD2 FALSE 0.138 15.000 0.000 1.000 N NA
 25253 25254 aq_1369 aq_1370   rlpA1 TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA   NA
 25254 25255 aq_1370 aq_1372 rlpA1 argH FALSE 0.252 11.000 0.000 NA N NA
 25255 25256 aq_1372 aq_1373 argH nuoH2 FALSE 0.058 76.000 0.000 1.000 N NA
 25256 25257 aq_1373 aq_1374 nuoH2 nuoH3 TRUE 0.974 -33.000 0.008 0.018   NA
 25257 25258 aq_1374 aq_1375 nuoH3 nuoI2 TRUE 0.988 7.000 0.500 0.018   NA
 25258 25259 aq_1375 aq_1377 nuoI2 nuoJ2 TRUE 0.996 -3.000 0.442 0.018 Y NA
 25259 25260 aq_1377 aq_1378 nuoJ2 nuoK2 TRUE 0.989 -19.000 0.012 0.009 Y NA
 25260 25261 aq_1378 aq_1379 nuoK2 nuoL3 TRUE 0.976 3.000 0.011 0.018 Y NA
 25261 25262 aq_1379 aq_1382 nuoL3 nuoM2 TRUE 0.960 12.000 0.011 0.005 Y NA
 25262 25263 aq_1382 aq_1383 nuoM2 nuoN2 TRUE 0.993 14.000 1.000 0.005 Y NA
 25263 25264 aq_1383 aq_1385 nuoN2 nuoA1 TRUE 0.985 -3.000 0.022 0.018 Y NA
 25264 25265 aq_1385 aq_1386 nuoA1   TRUE 0.653 -31.000 0.000 1.000   NA
 25265 25266 aq_1386 aq_1387   arsR FALSE 0.190 26.000 0.000 1.000   NA
 25266 25267 aq_1387 aq_1388 arsR   FALSE 0.110 243.000 0.000 NA   NA
 25269 25270 aq_1391 aq_1392     FALSE 0.098 205.000 0.000 1.000   NA
 25271 25272 aq_1394 aq_1398 lig leuD FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25273 25274 aq_1400 aq_1401   celY TRUE 0.987 -3.000 0.667 1.000   NA
 25274 25275 aq_1401 aq_1402 celY   TRUE 0.470 -70.000 0.000 1.000 N NA
 25275 25276 aq_1402 aq_1403     TRUE 0.612 -12.000 0.000 1.000   NA
 25276 25277 aq_1403 aq_1404     TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 25278 25279 aq_1405 aq_1407   bcsA TRUE 0.690 -24.000 0.000 NA   NA
 25280 25281 aq_1408 aq_1409     TRUE 0.704 -61.000 0.000 NA   NA
 25282 25283 aq_1410 aq_1412 trpB2   FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 25285 25286 aq_1418 aq_1419 furR2   FALSE 0.212 7.000 0.000 1.000 N NA
 25286 25287 aq_1419 aq_1420     TRUE 0.553 -76.000 0.000 NA N NA
 25292 25293 aq_1426 aq_1427   lpxB TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25293 25294 aq_1427 aq_1428 lpxB   FALSE 0.406 10.000 0.000 NA   NA
 25296 25297 aq_1432 aq_1433 ppdD1 fimZ FALSE 0.361 70.000 0.000 NA Y NA
 25297 25298 aq_1433 aq_1434 fimZ ppdD2 TRUE 0.871 -16.000 0.000 NA Y NA
 25298 25299 aq_1434 aq_1435 ppdD2 ppdD3 TRUE 0.705 -93.000 0.000 NA   NA
 25299 25300 aq_1435 aq_1436 ppdD3   TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 25300 25301 aq_1436 aq_1439     FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 25301 25302 aq_1439 aq_1441   oppA FALSE 0.419 7.000 0.000 NA   NA
 25302 25303 aq_1441 aq_1442 oppA   FALSE 0.038 386.000 0.000 1.000 N NA
 25304 25305 aq_1444 aq_1445   ctrA2 FALSE 0.189 36.000 0.000 NA   NA
 25305 25306 aq_1445 aq_1446 ctrA2   FALSE 0.136 57.000 0.000 1.000   NA
 25306 25307 aq_1446 aq_1447     FALSE 0.321 12.000 0.000 1.000   NA
 25307 25308 aq_1447 aq_1449   mutT FALSE 0.237 5.000 0.000 1.000 N NA
 25309 25310 aq_1450 aq_1452 htrA rpoS TRUE 0.945 11.000 0.152 1.000 N NA
 25310 25311 aq_1452 aq_1453 rpoS   TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 25311 25312 aq_1453 aq_1455     FALSE 0.097 349.000 0.000 NA   NA
 25316 25317 aq_1462 aq_1464     TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 25317 25318 aq_1464 aq_1465     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25319 25320 aq_1466 aq_1467     TRUE 0.941 -22.000 0.007 NA   NA
 25320 25321 aq_1467 aq_1468   folP TRUE 0.985 -13.000 0.133 NA   NA
 25322 25323 aq_1470 aq_1472 accC2 dnaB FALSE 0.037 406.000 0.000 1.000 N NA
 25323 2209608 aq_1472 aq_t24 dnaB   FALSE 0.203 32.000 0.000 NA   NA
 2209608 25324 aq_t24 aq_1473     FALSE 0.222 26.000 0.000 NA   NA
 25324 25325 aq_1473 aq_1474   gspE TRUE 0.859 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 25325 25326 aq_1474 aq_1476 gspE   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25326 25327 aq_1476 aq_1477     TRUE 0.682 -19.000 0.000 NA   NA
 25328 25329 aq_1478 aq_1480 recR   FALSE 0.043 259.000 0.000 1.000 N NA
 25329 25330 aq_1480 aq_1481     FALSE 0.413 8.000 0.000 NA   NA
 25330 25331 aq_1481 aq_1482     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25331 25332 aq_1482 aq_1483     TRUE 0.963 -7.000 0.029 1.000   NA
 25332 25333 aq_1483 aq_1484     TRUE 0.627 -15.000 0.000 1.000   NA
 25333 25334 aq_1484 aq_1484a   himA TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 25334 25335 aq_1484a aq_1485 himA rpsA TRUE 0.462 32.000 0.003 1.000 N NA
 25335 25336 aq_1485 aq_1489 rpsA trmD TRUE 0.742 67.000 0.002 0.029 Y NA
 25336 25337 aq_1489 aq_1490 trmD rpoD FALSE 0.408 -10.000 0.000 1.000 N NA
 25337 25338 aq_1490 aq_1493 rpoD dnaG TRUE 0.522 39.000 0.006 1.000 N NA
 25340 25341 aq_1495 aq_1496 ogt xylR FALSE 0.089 58.000 0.000 NA N NA
 25341 25342 aq_1496 aq_1498 xylR   FALSE 0.388 -3.000 0.000 NA N NA
 25343 25344 aq_1499 aq_1501 sodA   FALSE 0.431 6.000 0.000 NA   NA
 25345 25346 aq_1502 aq_1503     TRUE 0.675 -16.000 0.000 NA   NA
 25346 25347 aq_1503 aq_1504   trk1 TRUE 0.997 -3.000 0.647 0.007 Y NA
 25347 25348 aq_1504 aq_1505 trk1 nrdF FALSE 0.377 -6.000 0.000 1.000 N NA
 25348 25349 aq_1505 aq_1507 nrdF omt FALSE 0.110 106.000 0.000 1.000   NA
 25349 25350 aq_1507 aq_1508 omt   TRUE 0.682 -19.000 0.000 NA   NA
 25350 25351 aq_1508 aq_1509   oppC TRUE 0.682 -19.000 0.000 NA   NA
 25351 25352 aq_1509 aq_1510 oppC   FALSE 0.316 0.000 0.000 1.000 N NA
 25353 25354 aq_1512 aq_1515 icd   TRUE 0.643 26.000 0.009 1.000 N NA
 25354 25355 aq_1515 aq_1516     TRUE 0.553 59.000 0.006 NA   NA
 25355 25356 aq_1516 aq_1517   pycB TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 25356 25357 aq_1517 aq_1520 pycB pycA TRUE 0.912 24.000 0.038 0.001 N NA
 25357 25358 aq_1520 aq_1525 pycA   FALSE 0.180 41.000 0.000 NA   NA
 25358 25359 aq_1525 aq_1526     FALSE 0.167 51.000 0.000 NA   NA
 25359 25360 aq_1526 aq_1527     TRUE 0.898 71.000 0.372 NA   NA
 25360 25361 aq_1527 aq_1528     TRUE 0.959 -28.000 0.011 NA   NA
 25361 25362 aq_1528 aq_1530     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25362 3829861 aq_1530 aq_1531   abcT10 TRUE 0.981 -3.000 0.061 NA Y NA
 3829861 25364 aq_1531 aq_1533 abcT10   TRUE 0.993 -12.000 0.222 NA Y NA
 25364 25365 aq_1533 aq_1534     TRUE 0.981 -6.000 0.125 NA   NA
 25366 25367 aq_1535 aq_1536 pepQ aroA TRUE 0.941 2.000 0.007 1.000 Y NA
 25367 25368 aq_1536 aq_1539 aroA fliN FALSE 0.078 38.000 0.000 1.000 N NA
 25368 25369 aq_1539 aq_1540 fliN gcpE TRUE 0.856 -16.000 0.002 1.000 N NA
 25370 25371 aq_1542 aq_1543   rfaC1 FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25371 25372 aq_1543 aq_1545 rfaC1   TRUE 0.770 31.000 0.019 NA   NA
 25373 25374 aq_1546 aq_1547 kpsF ppa FALSE 0.312 1.000 0.000 1.000 N NA
 25374 25375 aq_1547 aq_1548 ppa trpA FALSE 0.046 207.000 0.000 1.000 N NA
 25375 25376 aq_1548 aq_1549 trpA   TRUE 0.922 -12.000 0.009 1.000 N NA
 25376 25377 aq_1549 aq_1550   cycB2 FALSE 0.077 39.000 0.000 1.000 N NA
 25377 25378 aq_1550 aq_1552 cycB2 fabI FALSE 0.070 49.000 0.000 1.000 N NA
 25378 25379 aq_1552 aq_1554 fabI   TRUE 0.992 -31.000 0.185 0.045 N NA
 25380 25381 aq_1556 aq_1558 cysM   FALSE 0.184 28.000 0.000 1.000   NA
 25381 25382 aq_1558 aq_1560   mglA1 TRUE 0.638 -19.000 0.000 1.000   NA
 25382 25383 aq_1560 aq_1562 mglA1   TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 25383 3829862 aq_1562 aq_1563   abcT13 TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 3829862 25385 aq_1563 aq_1565 abcT13 gltB FALSE 0.088 31.000 0.000 1.000 N NA
 25385 25386 aq_1565 aq_1569 gltB   TRUE 0.651 -30.000 0.000 1.000   NA
 25386 25387 aq_1569 aq_1570     TRUE 0.706 -111.000 0.000 NA   NA
 25387 25388 aq_1570 aq_1571     FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 25390 25391 aq_1575 aq_1578   mutL FALSE 0.199 33.000 0.000 NA   NA
 25391 25392 aq_1578 aq_1579 mutL iagB FALSE 0.221 18.000 0.000 1.000   NA
 25392 25393 aq_1579 aq_1580 iagB pyrF TRUE 0.469 3.000 0.000 1.000   NA
 25393 25394 aq_1580 aq_1581 pyrF   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25394 25395 aq_1581 aq_1582   gidB TRUE 0.682 -19.000 0.000 NA   NA
 25395 25396 aq_1582 aq_1583 gidB   TRUE 0.671 -15.000 0.000 NA   NA
 25396 25397 aq_1583 aq_1585     TRUE 0.978 -3.000 0.176 NA   NA
 25397 25398 aq_1585 aq_1586   atpF1 FALSE 0.082 34.000 0.000 1.000 N NA
 25398 25399 aq_1586 aq_1587 atpF1 atpF2 TRUE 0.997 0.000 0.569 0.007 Y NA
 25399 25400 aq_1587 aq_1588 atpF2 atpH TRUE 0.995 -7.000 0.132 0.007 Y NA
 25400 25401 aq_1588 aq_1590 atpH ndk TRUE 0.760 1.000 0.002 1.000 N NA
 25401 25402 aq_1590 aq_1591 ndk shyS TRUE 0.813 -3.000 0.002 1.000   NA
 25402 25403 aq_1591 aq_1593 shyS   FALSE 0.331 114.000 0.000 0.016   NA
 25404 25405 aq_1595 aq_1596 fliI   TRUE 0.704 -73.000 0.000 NA   NA
 25407 25408 aq_1599 aq_1601   pilD FALSE 0.124 28.000 0.000 NA N NA
 25408 25409 aq_1601 aq_1602 pilD secF TRUE 0.937 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 25409 25410 aq_1602 aq_1603 secF   TRUE 0.962 -3.000 0.080 NA N NA
 25410 25411 aq_1603 aq_1606   pabC FALSE 0.044 687.000 0.000 NA N NA
 25411 25412 aq_1606 aq_1607 pabC dcd TRUE 0.943 -7.000 0.020 1.000 N NA
 25412 25413 aq_1607 aq_1609 dcd modA FALSE 0.040 327.000 0.000 1.000 N NA
 25413 25414 aq_1609 aq_1610 modA radC FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25414 25415 aq_1610 aq_1612 radC   TRUE 0.535 -24.000 0.000 NA N NA
 25415 25416 aq_1612 aq_1613   hisG TRUE 0.539 -28.000 0.000 NA N NA
 25416 25417 aq_1613 aq_1614 hisG oadA TRUE 0.796 -3.000 0.003 1.000 N NA
 25418 25419 aq_1618 aq_1620   sucC2 FALSE 0.209 30.000 0.000 NA   NA
 25419 25420 aq_1620 aq_1622 sucC2 sucD2 TRUE 0.974 12.000 0.025 0.003 Y NA
 25420 25421 aq_1622 aq_1625 sucD2   FALSE 0.071 592.000 0.000 1.000   NA
 25421 25422 aq_1625 aq_1627     FALSE 0.409 9.000 0.000 NA   NA
 25422 25423 aq_1627 aq_1628   pol FALSE 0.339 13.000 0.000 NA   NA
 25424 25425 aq_1629 aq_1630 nfo   TRUE 0.902 0.000 0.008 1.000   NA
 25425 25426 aq_1630 aq_1631     FALSE 0.146 72.000 0.000 NA   NA
 25426 25427 aq_1631 aq_1632     FALSE 0.165 53.000 0.000 NA   NA
 25429 2209609 aq_1636 aq_t25 prs   FALSE 0.300 15.000 0.000 NA   NA
 2209609 25430 aq_t25 aq_1638   lplA FALSE 0.178 42.000 0.000 NA   NA
 408223 25434 aq_s01 aq_1641a ssrA rplU FALSE 0.156 60.000 0.000 NA   NA
 25434 25435 aq_1641a aq_1642 rplU rplO TRUE 0.797 12.000 0.000 0.037 Y NA
 25435 25436 aq_1642 aq_1644 rplO rpmD TRUE 0.993 13.000 0.653 0.004 Y NA
 25436 25437 aq_1644 aq_1645 rpmD rpsE TRUE 0.998 -13.000 0.789 0.037 Y NA
 25437 25438 aq_1645 aq_1648 rpsE rplR TRUE 0.993 12.000 0.814 0.037 Y NA
 25438 25439 aq_1648 aq_1649 rplR rplF TRUE 0.992 13.000 0.815 0.026 Y NA
 25439 25440 aq_1649 aq_1651 rplF rpsH TRUE 0.992 13.000 0.808 0.026 Y NA
 25440 25441 aq_1651 aq_1651a rpsH rpsN TRUE 0.977 41.000 0.473 0.026 Y NA
 25441 25442 aq_1651a aq_1652 rpsN rplE TRUE 0.979 34.000 0.496 0.026 Y NA
 25442 25443 aq_1652 aq_1653 rplE rplX TRUE 0.997 2.000 0.758 0.026 Y NA
 25443 25444 aq_1653 aq_1654 rplX rplN TRUE 0.997 0.000 0.810 0.037 Y NA
 25445 25446 aq_1655 aq_1656     TRUE 0.621 -13.000 0.000 1.000   NA
 25447 25448 aq_1657 aq_1658 gcsH2 fucA1 TRUE 0.950 -16.000 0.018 1.000 N NA
 25448 25449 aq_1658 aq_1659 fucA1 bioW FALSE 0.070 49.000 0.000 1.000 N NA
 25452 25453 aq_1662 aq_1663 flgK flgL TRUE 0.989 10.000 0.113 0.001 Y NA
 25454 25455 aq_1664 aq_1665 accC1 mdh2 FALSE 0.160 13.000 0.000 1.000 N NA
 25455 25456 aq_1665 aq_1666 mdh2   TRUE 0.660 -49.000 0.000 1.000   NA
 25456 25457 aq_1666 aq_1667   thrS FALSE 0.091 253.000 0.000 1.000   NA
 25458 25459 aq_1668 aq_1669     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25459 25460 aq_1669 aq_1670     TRUE 0.987 0.000 0.833 NA N NA
 25460 25461 aq_1670 aq_1671   hslV FALSE 0.203 10.000 0.000 1.000 N NA
 401884 25462 aq_t26 aq_1672 tRNA-Pro clpB FALSE 0.182 40.000 0.000 NA   NA
 25463 25464 aq_1677 aq_1679 aspS fumX TRUE 0.669 5.000 0.002 1.000 N NA
 25464 25465 aq_1679 aq_1680 fumX   TRUE 0.630 -7.000 0.000 NA   NA
 25466 25467 aq_1681 aq_1682 amiB   TRUE 0.980 -28.000 0.061 NA   NA
 25467 25468 aq_1682 aq_1684   alg FALSE 0.168 50.000 0.000 NA   NA
 25468 25469 aq_1684 aq_1687 alg   FALSE 0.392 0.000 0.000 NA N NA
 25469 25470 aq_1687 aq_1689     TRUE 0.630 -7.000 0.000 NA   NA
 25471 25472 aq_1691 aq_1693   dplF TRUE 0.637 69.000 0.011 NA   NA
 25473 25474 aq_1694 aq_1695     TRUE 0.472 32.000 0.000 0.009   NA
 2209610 401866 aq_r04 aq_t27   tRNA-Ile FALSE 0.131 105.000 0.000 NA   NA
 401866 401867 aq_t27 aq_t28 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.266 17.000 0.000 NA   NA
 401867 407351 aq_t28 aq_r05 tRNA-Ala rrl FALSE 0.171 48.000 0.000 NA   NA
 407351 2209611 aq_r05 aq_r06 rrl   FALSE 0.182 40.000 0.000 NA   NA
 2209611 2209612 aq_r06 aq_t29     FALSE 0.227 25.000 0.000 NA   NA
 25475 25476 aqq_03 aq_1705   galF TRUE 0.782 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 25476 25477 aq_1705 aq_1706 galF   TRUE 0.621 -13.000 0.000 1.000   NA
 25477 25478 aq_1706 aq_1707   ribC TRUE 0.573 -6.000 0.000 1.000   NA
 25478 25479 aq_1707 aq_1708 ribC pfkA FALSE 0.304 2.000 0.000 1.000 N NA
 25479 25480 aq_1708 aq_1710 pfkA metE FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25482 25483 aq_1713 aq_1714 flgI flgH TRUE 0.998 -39.000 0.750 0.010 Y NA
 25484 25485 aq_1716 aq_1717a fabG acpP TRUE 0.989 13.000 0.321 0.006 Y NA
 25485 25486 aq_1717a aq_1717 acpP fabF TRUE 0.981 -3.000 0.066 1.000 Y NA
 25486 25487 aq_1717 aq_1718 fabF maf FALSE 0.388 -3.000 0.000 NA N NA
 25488 25489 aq_1719 aq_1720   ffh FALSE 0.087 32.000 0.000 1.000 N NA
 25489 25490 aq_1720 aq_1723 ffh   FALSE 0.153 41.000 0.000 1.000   NA
 25491 25492 aq_1724 aq_1725 degT lepA TRUE 0.495 19.000 0.000 1.000 Y NA
 25494 25495 aq_1730 aq_1731 pheT   FALSE 0.253 196.000 0.002 1.000 N NA
 25495 25496 aq_1731 aq_1732     TRUE 0.988 -13.000 0.059 0.031   NA
 25496 25497 aq_1732 aq_1735   dnaJ1 FALSE 0.116 81.000 0.000 1.000   NA
 25499 25500 aq_1739 aq_1740 lytB   TRUE 0.940 -27.000 0.011 1.000 N NA
 25501 25502 aq_1741 aq_1742   lgtF FALSE 0.087 542.000 0.000 NA   NA
 11403799 25496   aq_1732     FALSE NA 4481.000 0.000 NA   NA
 11546162 25496   aq_1732     FALSE NA 4481.000 0.000 NA   NA
 11688554 25496   aq_1732     FALSE NA 4481.000 0.000 NA   NA
 11403800 25496   aq_1732     FALSE NA 4511.000 0.000 NA   NA
 11546163 25496   aq_1732     FALSE NA 4511.000 0.000 NA   NA
 11688555 25496   aq_1732     FALSE NA 4511.000 0.000 NA   NA
 11403801 25496   aq_1732     FALSE NA 4548.000 0.000 NA   NA
 11546164 25496   aq_1732     FALSE NA 4548.000 0.000 NA   NA
 11688556 25496   aq_1732     FALSE NA 4548.000 0.000 NA   NA
 11403802 25496   aq_1732     FALSE NA 4578.000 0.000 NA   NA
 11546165 25496   aq_1732     FALSE NA 4578.000 0.000 NA   NA
 11688557 25496   aq_1732     FALSE NA 4578.000 0.000 NA   NA
 11403803 25496   aq_1732     FALSE NA 4615.000 0.000 NA   NA
 11546166 25496   aq_1732     FALSE NA 4615.000 0.000 NA   NA
 11688558 25496   aq_1732     FALSE NA 4615.000 0.000 NA   NA
 11403804 25496   aq_1732     FALSE NA 4645.000 0.000 NA   NA
 11546167 25496   aq_1732     FALSE NA 4645.000 0.000 NA   NA
 11688559 25496   aq_1732     FALSE NA 4645.000 0.000 NA   NA
 11403805 25496   aq_1732     FALSE NA 4685.000 0.000 NA   NA
 11546168 25496   aq_1732     FALSE NA 4685.000 0.000 NA   NA
 11688560 25496   aq_1732     FALSE NA 4685.000 0.000 NA   NA
 25504 25505 aq_1744 aq_1747 gpmA murE FALSE 0.045 221.000 0.000 1.000 N NA
 25505 2209613 aq_1747 aq_t30 murE   TRUE 0.690 -24.000 0.000 NA   NA
 2209613 25506 aq_t30 aq_1751   tyrS FALSE 0.078 1159.000 0.000 NA   NA
 25508 25509 aq_1753 aq_1754 nlpD2   TRUE 0.977 -22.000 0.043 NA   NA
 25510 25511 aq_1755 aq_1757 tyrA exbB FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25512 25513 aq_1758 aq_1760     FALSE 0.366 12.000 0.000 NA   NA
 25513 25514 aq_1760 aq_1761     FALSE 0.199 33.000 0.000 NA   NA
 2209614 2209615 aq_t31 aq_t32     FALSE 0.212 29.000 0.000 NA   NA
 25516 2209616 aq_1765 aq_t33 tktA   FALSE 0.233 23.000 0.000 NA   NA
 2209616 25517 aq_t33 aq_1767   rpsT TRUE 0.694 -29.000 0.000 NA   NA
 25517 25518 aq_1767 aq_1768 rpsT   TRUE 0.822 10.000 0.002 0.027 N NA
 25519 25520 aq_1769 aq_1770 dld1 leuS' TRUE 0.604 -10.000 0.000 1.000   NA
 25521 25522 aq_1771 aq_1772   envA TRUE 0.806 8.000 0.008 1.000 N NA
 25525 25526 aq_1774 aq_1776 glnE   FALSE 0.092 411.000 0.000 NA   NA
 25526 25527 aq_1776 aq_1777   infC FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 25527 25528 aq_1777 aq_1780 infC fumB FALSE 0.034 506.000 0.000 1.000 N NA
 25528 25529 aq_1780 aq_1782 fumB mdh1 TRUE 0.974 -22.000 0.010 1.000 Y NA
 25529 25530 aq_1782 aq_1784 mdh1 aco TRUE 0.961 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 25530 25531 aq_1784 aq_1787 aco trpC FALSE 0.069 53.000 0.000 1.000 N NA
 25531 25532 aq_1787 aq_1789 trpC mviB TRUE 0.659 -46.000 0.000 1.000   NA
 25532 25533 aq_1789 aq_1790 mviB   FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 25533 25534 aq_1790 aq_1791     FALSE 0.339 13.000 0.000 NA   NA
 25534 25535 aq_1791 aq_1792   ntrC2 FALSE 0.180 41.000 0.000 NA   NA
 25535 25536 aq_1792 aq_1793 ntrC2   FALSE 0.115 210.000 0.000 NA   NA
 25537 25538 aq_1794 aq_1795     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25538 25539 aq_1795 aq_1796     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25540 25541 aq_1797 aq_1798   cphA1 FALSE 0.171 48.000 0.000 NA   NA
 25541 25542 aq_1798 aq_1799 cphA1 rhdA2 FALSE 0.203 22.000 0.000 1.000   NA
 25542 25543 aq_1799 aq_1800 rhdA2   TRUE 0.540 2.000 0.000 NA   NA
 25543 25544 aq_1800 aq_1802     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA   NA
 25544 25545 aq_1802 aq_1803   soxB TRUE 0.981 -3.000 0.250 NA   NA
 25545 25546 aq_1803 aq_1806 soxB   TRUE 0.880 46.000 0.188 1.000   NA
 25546 25547 aq_1806 aq_1807     TRUE 0.980 13.000 0.333 0.010   NA
 25547 25548 aq_1807 aq_1809     TRUE 0.957 14.000 0.333 NA   NA
 25548 25549 aq_1809 aq_1810     TRUE 0.958 22.000 0.778 NA   NA
 25549 25550 aq_1810 aq_1811   trxA2 TRUE 0.990 -6.000 0.500 NA   NA
 25551 25552 aq_1812 aq_1814 thrA   FALSE 0.237 5.000 0.000 1.000 N NA
 25552 25553 aq_1814 aq_1815     FALSE 0.372 7.000 0.000 1.000   NA
 25555 25556 aq_1818 aq_1820 purU nfeD FALSE 0.195 11.000 0.000 1.000 N NA
 25556 25557 aq_1820 aq_1822 nfeD   FALSE 0.237 22.000 0.000 NA   NA
 25557 25558 aq_1822 aq_1823   mglA2 TRUE 0.986 2.000 0.500 NA   NA
 25558 25559 aq_1823 aq_1824 mglA2   TRUE 0.907 118.000 0.667 NA   NA
 25559 25560 aq_1824 aq_1825     TRUE 0.682 -19.000 0.000 NA   NA
 25560 25561 aq_1825 aq_1827   alr FALSE 0.044 253.000 0.000 1.000 N NA
 25562 25563 aqq_04 aq_1829     FALSE 0.121 144.000 0.000 NA   NA
 25563 25564 aq_1829 aq_1832   rpsG1 FALSE 0.076 433.000 0.000 1.000   NA
 25564 25565 aq_1832 aq_1834 rpsG1 rpsL1 TRUE 0.993 4.000 0.224 0.006 Y NA
 25566 25567 aq_1836 aq_1837 purL lsp TRUE 0.937 -39.000 0.009 1.000 N NA
 25569 25570 aq_1839 aq_1840a exbD   FALSE 0.128 16.000 0.000 1.000 N NA
 25570 25571 aq_1840a aq_1840   prfB FALSE 0.397 34.000 0.002 1.000 N NA
 25572 25573 aq_1842 aq_1843     FALSE 0.237 22.000 0.000 NA   NA
 25573 25574 aq_1843 aq_1844     FALSE 0.106 116.000 0.000 1.000   NA
 25574 25575 aq_1844 aq_1845     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 25575 25576 aq_1845 aq_1847     TRUE 0.987 4.000 1.000 NA   NA
 25576 25577 aq_1847 aq_1849     TRUE 0.968 13.000 0.500 NA   NA
 25577 25578 aq_1849 aq_1850     FALSE 0.189 36.000 0.000 NA   NA
 25578 25579 aq_1850 aq_1851   ilvH TRUE 0.630 -7.000 0.000 NA   NA
 25580 25581 aq_1852 aq_1853     FALSE 0.072 561.000 0.000 1.000   NA
 25583 25584 aq_1855 aq_1856 dnaX uvrB FALSE 0.437 286.000 0.000 0.037 Y NA
 25586 25587 aq_1858 aq_1859   flgE TRUE 0.982 4.000 0.105 NA Y NA
 25587 25588 aq_1859 aq_1860 flgE fliL TRUE 0.903 52.000 0.014 0.010 Y NA
 25588 25589 aq_1860 aq_1861 fliL   FALSE 0.057 77.000 0.000 1.000 N NA
 25591 25592 aq_1863 aq_1866 kch asd FALSE 0.032 756.000 0.000 1.000 N NA
 25592 25593 aq_1866 aq_1869 asd   FALSE 0.316 14.000 0.000 NA   NA
 25593 25594 aq_1869 aq_1870   secA TRUE 0.502 57.000 0.004 NA   NA
 25594 25595 aq_1870 aq_1871 secA pmbA FALSE 0.283 16.000 0.000 NA   NA
 25595 25596 aq_1871 aq_1873 pmbA   FALSE 0.083 617.000 0.000 NA   NA
 25596 25597 aq_1873 aq_1875     FALSE 0.339 13.000 0.000 NA   NA
 25597 25598 aq_1875 aq_1877   rplM FALSE 0.072 46.000 0.000 1.000 N NA
 25598 25599 aq_1877 aq_1878 rplM rpsI TRUE 0.989 -3.000 0.051 0.025 Y NA
 25599 25600 aq_1878 aq_1879 rpsI argC TRUE 0.963 -15.000 0.031 1.000 N NA
 25600 25601 aq_1879 aq_1882 argC dnaN FALSE 0.099 25.000 0.000 1.000 N NA
 25601 25602 aq_1882 aq_1884 dnaN   FALSE 0.113 227.000 0.000 NA   NA
 25602 25603 aq_1884 aq_1886   sbcD TRUE 0.952 -22.000 0.010 NA   NA
 25603 25604 aq_1886 aq_1887 sbcD mesJ FALSE 0.408 -10.000 0.000 1.000 N NA
 25607 25608 aq_1890 aq_1891 tsnR   FALSE 0.360 10.000 0.000 1.000   NA
 25608 25609 aq_1891 aq_1893   ilvE TRUE 0.968 -10.000 0.032 1.000   NA
 25610 25611 aq_1894 aq_1896     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25612 25613 aq_1898 aq_1899 folD dmt TRUE 0.519 -16.000 0.000 NA N NA
 25614 25615 aqq_05 aqq_06     FALSE 0.339 13.000 0.000 NA   NA
 25615 25616 aqq_06 aq_1903   gcsP1 FALSE 0.316 14.000 0.000 NA   NA
 25616 25617 aq_1903 aq_1905 gcsP1 serA FALSE 0.445 28.000 0.000 1.000 Y NA
 25617 25618 aq_1905 aq_1907 serA umpS FALSE 0.111 19.000 0.000 1.000 N NA
 25620 25621 aq_1909 aq_1910     TRUE 0.601 83.000 0.011 NA   NA
 25621 25622 aq_1910 aq_1912     FALSE 0.440 376.000 0.007 NA   NA
 25622 25623 aq_1912 aq_1916   trxA1 FALSE 0.098 345.000 0.000 NA   NA
 25623 25624 aq_1916 aq_1917 trxA1   TRUE 0.993 -87.000 0.500 NA   NA
 25624 25625 aq_1917 aq_1919   era2 TRUE 0.831 -3.000 0.002 NA   NA
 25626 25627 aq_1920 aq_1922 fliP   FALSE 0.045 232.000 0.000 1.000 N NA
 25629 25630 aq_1924 aq_1925   hyuB FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 401870 401871 aq_t34 aq_t35 tRNA-Thr tRNA-Tyr FALSE 0.233 23.000 0.000 NA   NA
 401871 2209617 aq_t35 aq_t36 tRNA-Tyr   FALSE 0.406 10.000 0.000 NA   NA
 2209617 2209618 aq_t36 aq_t37     FALSE 0.199 33.000 0.000 NA   NA
 2209618 25631 aq_t37 aq_1928   tufA2 FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 25631 25632 aq_1928 aq_1930a tufA2 rpmG TRUE 0.969 11.000 0.099 1.000 Y NA
 25632 2209619 aq_1930a aq_t38 rpmG   FALSE 0.316 14.000 0.000 NA   NA
 2209619 25633 aq_t38 aq_1930b   secE FALSE 0.199 33.000 0.000 NA   NA
 25633 25634 aq_1930b aq_1931 secE nusG TRUE 0.986 -3.000 0.843 1.000 N NA
 25634 25635 aq_1931 aq_1933 nusG rplK TRUE 0.957 15.000 0.681 1.000 N NA
 25635 25636 aq_1933 aq_1935 rplK rplA TRUE 0.995 5.000 0.838 0.035 Y NA
 25636 25637 aq_1935 aq_1936 rplA rplJ TRUE 0.985 15.000 0.302 0.035 Y NA
 25637 25638 aq_1936 aq_1937 rplJ rplL TRUE 0.997 3.000 0.884 0.025 Y NA
 25638 25639 aq_1937 aq_1939 rplL rpoB TRUE 0.828 213.000 0.223 1.000   NA
 25639 25640 aq_1939 aq_1945 rpoB rpoC TRUE 0.995 -3.000 0.851 0.002   NA
 25644 25645 aq_1954 aq_1955 rplS rnhB TRUE 0.968 -7.000 0.066 1.000 N NA
 25646 2209620 aq_1956 aq_t39     FALSE 0.127 115.000 0.000 NA   NA
 2209620 25647 aq_t39 aq_1958     FALSE 0.165 53.000 0.000 NA   NA
 25648 25649 aq_1959 aq_1960   thiD TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25650 25651 aq_1961 aq_1962 fliR fliQ TRUE 0.995 -12.000 0.078 0.003 Y NA
 25651 25652 aq_1962 aq_1963 fliQ purH FALSE 0.033 596.000 0.000 1.000 N NA
 25652 25653 aq_1963 aq_1964 purH   FALSE 0.160 13.000 0.000 1.000 N NA
 25653 25654 aq_1964 aq_1965     TRUE 0.893 0.000 0.006 NA   NA
 25654 25655 aq_1965 aq_1966     TRUE 0.675 -16.000 0.000 NA   NA
 25656 25657 aq_1967 aq_1968 polA hisIE FALSE 0.195 11.000 0.000 1.000 N NA
 25657 25658 aq_1968 aq_1969 hisIE aspC1 FALSE 0.259 261.000 0.000 1.000 Y NA
 25659 25660 aq_1971 aq_1973 tapB panB TRUE 0.870 -7.000 0.004 1.000 N NA
 25660 25661 aq_1973 aq_1974 panB   TRUE 0.491 4.000 0.000 NA   NA
 25662 25663 aq_1975 aq_1977   masA TRUE 0.985 -7.000 0.231 1.000   NA
 25663 25664 aq_1977 aq_1978 masA   TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 25664 25665 aq_1978 aq_1979   fucA2 TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 25667 25668 aq_1982 aq_1983   imp2 FALSE 0.349 11.000 0.000 1.000   NA
 25668 25669 aq_1983 aq_1985 imp2   FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25670 25671 aq_1986 aq_1987     TRUE 0.960 0.000 0.041 NA   NA
 25671 25672 aq_1987 aq_1988   tolQ TRUE 0.984 5.000 0.051 0.019 Y NA
 25672 25673 aq_1988 aq_1989 tolQ   FALSE 0.442 4.000 0.000 1.000   NA
 25673 25674 aq_1989 aq_1990   pgmA TRUE 0.648 -25.000 0.000 1.000   NA
 25674 25675 aq_1990 aq_1991 pgmA htpX TRUE 0.783 9.000 0.007 1.000 N NA
 25675 25676 aq_1991 aq_1993 htpX   FALSE 0.266 17.000 0.000 NA   NA
 25676 25677 aq_1993 aq_1994   era1 TRUE 0.675 -16.000 0.000 NA   NA
 25677 25678 aq_1994 aq_1996 era1   FALSE 0.153 63.000 0.000 NA   NA
 25679 25680 aq_1997 aq_1998   fliC FALSE 0.057 79.000 0.000 1.000 N NA
 25680 25681 aq_1998 aq_2000 fliC   TRUE 0.879 43.000 0.032 NA Y NA
 25681 25682 aq_2000 aq_2001   fliD TRUE 0.989 3.000 0.298 NA Y NA
 25682 25683 aq_2001 aq_2002 fliD fliS TRUE 0.991 -3.000 0.056 0.002 Y NA
 25684 25685 aq_2004 aq_2005     FALSE 0.366 12.000 0.000 NA   NA
 25685 25686 aq_2005 aq_2007   rpsB FALSE 0.069 622.000 0.000 1.000   NA
 25686 25687 aq_2007 aq_2009 rpsB   FALSE 0.313 92.000 0.003 1.000 N NA
 25687 25688 aq_2009 aq_2011     TRUE 0.495 17.000 0.000 0.053   NA
 25689 25690 aq_2013 aq_2014   flhB FALSE 0.394 11.000 0.000 NA   NA
 25692 25693 aq_2016 aq_2018 pstS pstC TRUE 0.995 -13.000 0.086 0.002 Y NA
 25693 25694 aq_2018 aq_2019 pstC pstA TRUE 0.998 -21.000 0.537 0.002 Y NA
 25694 25695 aq_2019 aq_2020 pstA   TRUE 0.664 -232.000 0.000 1.000   NA
 25695 25696 aq_2020 aq_2021   tldD FALSE 0.177 43.000 0.000 NA   NA
 25696 25697 aq_2021 aq_2023 tldD guaB FALSE 0.086 544.000 0.000 NA   NA
 25699 25700 aq_2028 aq_2030   napA3 TRUE 0.993 2.000 0.688 1.000 Y NA
 25702 25703 aq_2032 aq_2035 infB   TRUE 0.913 -36.000 0.006 1.000 N NA
 25703 25704 aq_2035 aq_2036     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25705 25706 aq_2038 aq_2041 atpD atpG1 TRUE 0.992 14.000 0.724 0.006 Y NA
 25707 25708 aq_2042 aq_2043 rplI hemX2 TRUE 0.681 10.000 0.003 1.000 N NA
 25709 25710 aq_2044 aq_2045   folC TRUE 0.780 5.000 0.004 NA N NA
 25711 25712 aq_2046 aq_2049 vacB   TRUE 0.535 16.000 0.000 1.000 Y NA
 25712 25713 aq_2049 aq_2051   flgG1 TRUE 0.961 0.000 0.091 1.000 N NA
 25714 25715 aq_2053 aq_2054 recG   TRUE 0.540 2.000 0.000 NA   NA
 25715 25716 aq_2054 aq_2056     FALSE 0.409 9.000 0.000 NA   NA
 25716 25717 aq_2056 aq_2057   helX FALSE 0.373 27.000 0.000 0.035 N NA
 25719 25720 aq_2059 aq_2060     TRUE 0.631 -16.000 0.000 1.000   NA
 25720 2209621 aq_2060 aq_t40     FALSE 0.188 37.000 0.000 NA   NA
 2209621 2209622 aq_t40 aq_t41     FALSE 0.227 25.000 0.000 NA   NA
 2209622 25721 aq_t41 aq_2063     FALSE 0.141 77.000 0.000 NA   NA
 25721 25722 aq_2063 aq_2064   gltD TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25723 25724 aq_2066 aq_2067     TRUE 0.706 -123.000 0.000 NA   NA
 25724 25725 aq_2067 aq_2068   argB FALSE 0.143 74.000 0.000 NA   NA
 25725 25726 aq_2068 aq_2069 argB obg FALSE 0.296 13.000 0.000 1.000   NA
 25726 25727 aq_2069 aq_2071 obg   FALSE 0.190 26.000 0.000 1.000   NA
 25727 25728 aq_2071 aq_2073     TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 25728 25729 aq_2073 aq_2075   murD FALSE 0.313 -3.000 0.000 1.000 N NA
 25731 25732 aq_2077 aq_2080 snf sppA TRUE 0.621 -13.000 0.000 1.000   NA
 25732 25733 aq_2080 aq_2082 sppA   FALSE 0.273 278.000 0.000 NA Y NA
 25734 25735 aq_2084 aq_2085 hisC   FALSE 0.106 265.000 0.000 NA   NA
 25735 25736 aq_2085 aq_2086     TRUE 0.983 -19.000 0.100 NA   NA
 25736 25737 aq_2086 aq_2087     TRUE 0.502 -3.000 0.000 1.000   NA
 25738 25739 aq_2088 aq_2090   leuA2 FALSE 0.164 54.000 0.000 NA   NA
 25739 25740 aq_2090 aq_2093 leuA2 dsbC FALSE 0.042 266.000 0.000 1.000 N NA
 25741 25742 aq_2094 aq_2095 aspC2 dksA TRUE 0.948 -7.000 0.022 1.000 N NA
 25742 25743 aq_2095 aq_2096 dksA floX FALSE 0.216 19.000 0.000 1.000   NA
 25743 25744 aq_2096 aq_2098 floX   TRUE 0.508 17.000 0.000 0.047   NA
 25744 25745 aq_2098 aq_2099   pepA FALSE 0.388 -7.000 0.000 1.000 N NA
 25746 25747 aq_2101 aq_2102 carB2 prmA TRUE 0.794 -13.000 0.000 0.052 N NA
 25748 25749 aq_2103 aq_2104 acs' acs TRUE 0.907 -55.000 0.000 0.001   NA
 25750 25751 aq_2106 aq_2107 ssf   TRUE 0.947 -3.000 0.026 1.000   NA
 25751 25752 aq_2107 aq_2108     TRUE 0.949 -3.000 0.050 1.000 N NA
 25752 25753 aq_2108 aq_2109   hemB FALSE 0.195 11.000 0.000 1.000 N NA
 25753 25754 aq_2109 aq_2110 hemB acuC2 FALSE 0.388 -3.000 0.000 NA N NA
 25754 25755 aq_2110 aq_2113 acuC2   FALSE 0.055 292.000 0.000 NA N NA
 25756 25757 aq_2114 aq_2115 eif rfaG FALSE 0.177 12.000 0.000 1.000 N NA
 25757 25758 aq_2115 aq_2117 rfaG purC FALSE 0.037 403.000 0.000 1.000 N NA
 25758 25759 aq_2117 aq_2118 purC   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25759 25760 aq_2118 aq_2119   thiL TRUE 0.700 -40.000 0.000 NA   NA
 25760 25761 aq_2119 aq_2120 thiL hlyC TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 25761 3829863 aq_2120 aq_2122 hlyC abcT11 TRUE 0.977 -31.000 0.037 NA   NA
 3829863 25763 aq_2122 aq_2124 abcT11 hemN TRUE 0.953 2.000 0.065 1.000 N NA
 25764 25765 aq_2126 aq_2128 uvrC   TRUE 0.658 -12.000 0.000 NA   NA
 25766 25767 aq_2129 aq_2131 sbf fmt FALSE 0.074 469.000 0.000 1.000   NA
 25767 25768 aq_2131 aq_2132 fmt panC TRUE 0.750 -3.000 0.002 1.000 N NA
 25769 25770 aq_2134 aq_2135     TRUE 0.650 -10.000 0.000 NA   NA
 25770 3829864 aq_2135 aq_2137   abcT12 TRUE 0.978 -7.000 0.100 1.000   NA
 3829864 25772 aq_2137 aq_2138 abcT12   FALSE 0.360 10.000 0.000 1.000   NA
 25772 25773 aq_2138 aq_2139     TRUE 0.987 -40.000 0.163 1.000   NA
 25775 25776 aq_2141 aq_2142 glyS ppsA TRUE 0.916 2.000 0.006 0.097 N NA
 25776 25777 aq_2142 aq_2144 ppsA   TRUE 0.987 -3.000 0.571 NA   NA
 25777 25778 aq_2144 aq_2145     TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 25778 25779 aq_2145 aq_2146     FALSE 0.245 20.000 0.000 NA   NA
 25780 2209623 aq_2147 aq_t42 pal   FALSE 0.145 73.000 0.000 NA   NA
 2209623 2209624 aq_t42 aq_t43     FALSE 0.266 17.000 0.000 NA   NA
 25781 25782 aqq_07 aq_2150 gatC recA TRUE 0.751 11.000 0.006 1.000 N NA
 25782 25783 aq_2150 aq_2151 recA pilU TRUE 0.981 -46.000 0.021 0.021 N NA
 25783 25784 aq_2151 aq_2153 pilU cmk TRUE 0.896 -3.000 0.004 0.097 N NA
 25784 25785 aq_2153 aq_2154 cmk pgsA1 TRUE 0.866 -31.000 0.002 1.000 N NA
 25785 25786 aq_2154 aq_2155 pgsA1 recJ TRUE 0.779 -3.000 0.002 1.000 N NA
 25786 25787 aq_2155 aq_2157 recJ   TRUE 0.552 44.000 0.005 NA   NA
 25789 25790 aq_2159 aq_2160   abcT9 TRUE 0.946 -13.000 0.015 1.000 N NA
 25790 25791 aq_2160 aq_2163 abcT9 uraP FALSE 0.195 11.000 0.000 1.000 N NA
 25792 25793 aq_2164 aq_2165     FALSE 0.419 7.000 0.000 NA   NA
 25793 25794 aq_2165 aq_2166   scbA TRUE 0.995 -7.000 0.604 1.000 Y NA
 25794 25795 aq_2166 aq_2168 scbA   TRUE 0.976 13.000 0.887 NA   NA
 25796 25797 aq_2170 aq_2171     TRUE 0.631 -16.000 0.000 1.000   NA
 25797 25798 aq_2171 aq_2172     TRUE 0.630 -7.000 0.000 NA   NA
 25798 25799 aq_2172 aq_2173     TRUE 0.968 -31.000 0.020 NA   NA
 25799 25800 aq_2173 aq_2174   ihfB TRUE 0.914 -3.000 0.009 NA   NA
 25801 25802 aq_2175 aq_2177   aroK TRUE 0.941 -3.000 0.020 NA   NA
 25804 25805 aq_2179 aq_2181 acrR2 moaE FALSE 0.072 46.000 0.000 1.000 N NA
 25805 25806 aq_2181 aq_2183 moaE moaA TRUE 0.984 -22.000 0.006 0.005 Y NA
 25807 25808 aq_2185 aq_2186   sqr TRUE 0.859 84.000 0.333 NA N NA
 25809 25810 aq_2188 aq_2189 coxC   TRUE 0.994 2.000 1.000 0.047   NA
 25810 25811 aq_2189 aq_2190   coxB TRUE 0.993 3.000 1.000 0.047   NA
 25811 25812 aq_2190 aq_2191 coxB coxA1 TRUE 0.969 162.000 0.500 0.003 Y NA
 25812 25813 aq_2191 aq_2191a coxA1 coxB2 FALSE 0.269 551.000 0.000 0.003   NA
 25813 25814 aq_2191a aq_2192 coxB2 coxA2 TRUE 0.984 6.000 0.200 0.003   NA
 25814 25815 aq_2192 aq_2194 coxA2   TRUE 0.993 -3.000 0.571 0.047   NA
 25816 25817 aq_2195 aq_2196 bacA   TRUE 0.491 4.000 0.000 NA   NA
 25817 25818 aq_2196 aq_2197     TRUE 0.554 0.000 0.000 NA   NA
 25819 25820 aq_2199 aq_2200 mopB mopA TRUE 0.996 -48.000 0.125 0.008 Y NA
 25821 25822 aq_2203 aq_2204   ymxG TRUE 0.491 2.000 0.000 1.000   NA
 11481943 45092   aq_aa03     FALSE NA 674.000 0.000 NA   NA
 11624306 45092   aq_aa03     FALSE NA 674.000 0.000 NA   NA
 11766698 45092   aq_aa03     FALSE NA 674.000 0.000 NA   NA
 11481944 45092   aq_aa03     FALSE NA 639.000 0.000 NA   NA
 11624307 45092   aq_aa03     FALSE NA 639.000 0.000 NA   NA
 11766699 45092   aq_aa03     FALSE NA 639.000 0.000 NA   NA
 11481945 45092   aq_aa03     FALSE NA 609.000 0.000 NA   NA
 11624308 45092   aq_aa03     FALSE NA 609.000 0.000 NA   NA
 11766700 45092   aq_aa03     FALSE NA 609.000 0.000 NA   NA
 11481946 45092   aq_aa03     FALSE NA 572.000 0.000 NA   NA
 11624309 45092   aq_aa03     FALSE NA 572.000 0.000 NA   NA
 11766701 45092   aq_aa03     FALSE NA 572.000 0.000 NA   NA
 11481947 45092   aq_aa03     FALSE NA 542.000 0.000 NA   NA
 11624310 45092   aq_aa03     FALSE NA 542.000 0.000 NA   NA
 11766702 45092   aq_aa03     FALSE NA 542.000 0.000 NA   NA
 11481948 45092   aq_aa03     FALSE NA 506.000 0.000 NA   NA
 11624311 45092   aq_aa03     FALSE NA 506.000 0.000 NA   NA
 11766703 45092   aq_aa03     FALSE NA 506.000 0.000 NA   NA
 11481949 45092   aq_aa03     FALSE NA 476.000 0.000 NA   NA
 11624312 45092   aq_aa03     FALSE NA 476.000 0.000 NA   NA
 11766704 45092   aq_aa03     FALSE NA 476.000 0.000 NA   NA
 45092 45093 aq_aa03 aq_aa04     FALSE 0.122 137.000 0.000 NA   NA
 45093 45094 aq_aa04 aq_aa05     TRUE 0.920 19.000 0.143 NA   NA
 45094 45095 aq_aa05 aq_aa07     FALSE 0.079 937.000 0.000 NA   NA
 45095 45096 aq_aa07 aq_aa09     FALSE 0.080 813.000 0.000 NA   NA
 45096 45097 aq_aa09 aq_aa10     FALSE 0.085 571.000 0.000 NA   NA
 45097 45098 aq_aa10 aq_aa11     FALSE 0.081 806.000 0.000 NA   NA
 45099 45100 aq_aa13 aq_aa15     FALSE 0.107 260.000 0.000 NA   NA
 45102 45103 aq_aa18 aq_aa19     FALSE 0.077 2004.000 0.000 NA   NA
 45103 45104 aq_aa19 aq_aa20     FALSE 0.087 517.000 0.000 NA   NA
 45105 45106 aq_aa21 aq_aa22     FALSE 0.143 74.000 0.000 NA   NA
 45106 45107 aq_aa22 aq_aa23     FALSE 0.162 55.000 0.000 NA   NA
 45108 45109 aq_aa24 aq_aa25     FALSE 0.077 1665.000 0.000 NA   NA
 45109 45110 aq_aa25 aq_aa26     FALSE 0.077 1914.000 0.000 NA   NA
 45110 45111 aq_aa26 aq_aa27     TRUE 0.702 -46.000 0.000 NA   NA
 45111 45112 aq_aa27 aq_aa28     FALSE 0.118 180.000 0.000 NA   NA
 45112 45113 aq_aa28 aq_aa29     FALSE 0.122 139.000 0.000 NA   NA
 45113 45114 aq_aa29 aq_aa31     FALSE 0.188 37.000 0.000 NA   NA
 45114 45115 aq_aa31 aq_aa32     FALSE 0.090 451.000 0.000 NA   NA
 45118 45119 aq_aa37 aq_aa38     FALSE 0.110 242.000 0.000 NA   NA
 45120 45121 aq_aa39 aq_aa40     FALSE 0.079 1139.000 0.000 NA   NA
 45121 45091 aq_aa40 aq_aa01     FALSE 0.078 1510.000 0.000 NA   NA