MicrobesOnline Operon Predictions for Mycobacterium bovis AF2122/97

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 538287 538288 Mb0001 Mb0002 dnaA dnaN FALSE 0.066 528.000 0.328 1.000 Y NA
 538288 538289 Mb0002 Mb0003 dnaN recF TRUE 0.930 20.000 0.318 1.000 Y NA
 538289 538290 Mb0003 Mb0004 recF   TRUE 0.939 -3.000 0.099 NA   NA
 538290 538291 Mb0004 Mb0005   gyrB FALSE 0.127 126.000 0.022 NA   NA
 538291 538292 Mb0005 Mb0006 gyrB gyrA TRUE 0.965 35.000 0.306 0.001 Y NA
 538292 538293 Mb0006 Mb0007 gyrA   FALSE 0.183 96.000 0.009 NA   NA
 538293 538294 Mb0007 Mbt01   ileT FALSE 0.149 59.000 0.000 NA   NA
 538294 538295 Mbt01 Mbt02 ileT alaT FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 538298 538299 Mb0010c Mb0011c     FALSE 0.132 156.000 0.181 NA   NA
 538300 538301 Mb0012 Mb0013   trpG FALSE 0.409 37.000 0.098 NA   NA
 538302 538303 Mb0014c Mb0015c pknB pknA TRUE 0.998 -3.000 0.426 0.005 Y NA
 538303 538304 Mb0015c Mb0016c pknA pbpA TRUE 0.983 -3.000 0.574 1.000 N NA
 538304 538305 Mb0016c Mb0017c pbpA rodA TRUE 0.957 -3.000 0.250 1.000 N NA
 538305 538306 Mb0017c Mb0018c rodA ppp TRUE 0.930 -3.000 0.145 1.000 N NA
 538306 538307 Mb0018c Mb0019c ppp   TRUE 0.742 89.000 0.216 NA Y NA
 538307 538308 Mb0019c Mb0020c   TB39.8 FALSE 0.173 124.000 0.069 NA   NA
 538310 538311 Mb0021c Mb0022c   whiB5 FALSE 0.084 142.000 0.000 1.000   NA
 538312 538313 Mb0023 Mb0024     TRUE 0.987 -3.000 0.600 NA   NA
 538313 538314 Mb0024 Mb0025     FALSE 0.226 -258.000 0.000 NA   NA
 538314 538315 Mb0025 Mb0026     FALSE 0.188 38.000 0.000 NA   NA
 538315 538316 Mb0026 Mb0027     TRUE 0.706 115.000 1.000 NA   NA
 538316 538317 Mb0027 Mb0028     TRUE 0.763 38.000 0.600 NA   NA
 538317 538318 Mb0028 Mb0029     TRUE 0.963 8.000 0.800 NA   NA
 538318 538319 Mb0029 Mb0030     FALSE 0.011 238.000 0.000 NA   NA
 538319 538320 Mb0030 Mb0031     TRUE 0.805 70.000 1.000 NA   NA
 538320 538321 Mb0031 Mb0032     FALSE 0.226 29.000 0.000 NA   NA
 538321 538322 Mb0032 Mb0033   bioF2 FALSE 0.002 501.000 0.000 NA   NA
 538322 538323 Mb0033 Mb0034 bioF2 acpA TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 538323 538324 Mb0034 Mb0035 acpA   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538324 538325 Mb0035 Mb0036   fadD34 TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538326 538327 Mb0037c Mb0038c     FALSE 0.427 48.000 0.174 NA   NA
 538329 538330 Mb0040c Mb0041c   mtc28 TRUE 0.781 82.000 0.875 NA   NA
 538332 538333 Mb0043c Mb0044c     FALSE 0.522 159.000 0.000 0.035 Y NA
 538333 538334 Mb0044c Mb0045c     FALSE 0.284 133.000 0.412 NA N NA
 538334 538335 Mb0045c Mb0046c     TRUE 0.725 16.000 0.235 NA   NA
 538335 538336 Mb0046c Mb0047c   ino1 FALSE 0.348 82.000 0.059 1.000   NA
 538336 538337 Mb0047c Mb0048c ino1   TRUE 0.629 61.000 0.608 NA N NA
 538337 538338 Mb0048c Mb0049c     FALSE 0.294 101.000 0.122 NA   NA
 538339 538340 Mb0050 Mb0051   ponA1 FALSE 0.013 419.000 0.200 NA   NA
 538340 538341 Mb0051 Mb0052 ponA1   TRUE 0.958 -3.000 0.204 NA   NA
 538341 538342 Mb0052 Mb0053     FALSE 0.396 32.000 0.061 NA   NA
 538342 538343 Mb0053 Mb0054   rpsF FALSE 0.020 219.000 0.002 NA   NA
 538343 538344 Mb0054 Mb0055 rpsF ssb FALSE 0.140 104.000 0.029 1.000 N NA
 538344 538345 Mb0055 Mb0056 ssb rpsR1 FALSE 0.220 42.000 0.030 1.000 N NA
 538345 538346 Mb0056 Mb0057 rpsR1 rplI TRUE 0.965 33.000 0.499 0.020 Y NA
 538346 538347 Mb0057 Mb0058 rplI   FALSE 0.226 29.000 0.000 NA   NA
 538347 538348 Mb0058 Mb0059   dnaB FALSE 0.348 -21.000 0.000 NA   NA
 538348 538349 Mb0059 Mb0060 dnaB   FALSE 0.025 180.000 0.000 NA   NA
 538349 538350 Mb0060 Mb0061     TRUE 0.770 17.000 0.317 NA   NA
 538350 538351 Mb0061 Mb0062     FALSE 0.264 24.000 0.000 NA   NA
 538351 538352 Mb0062 Mb0063   celA1 FALSE 0.057 136.000 0.000 NA   NA
 538352 538353 Mb0063 Mb0064 celA1   FALSE 0.005 229.000 0.000 1.000 N NA
 538353 538354 Mb0064 Mb0065     FALSE 0.015 258.000 0.000 1.000   NA
 538354 538355 Mb0065 Mb0066     FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 538356 538357 Mb0067c Mb0068c icd2   FALSE 0.037 118.000 0.000 1.000 N NA
 538359 538360 Mb0070c Mb0071c sdaA glyA2 TRUE 0.990 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 538361 538362 Mb0072 Mb0073     FALSE 0.001 431.000 0.000 1.000 N NA
 538362 538363 Mb0073 Mb0074     TRUE 0.996 3.000 1.000 1.000 Y NA
 538363 538364 Mb0074 Mb0075     FALSE 0.269 -63.000 0.000 NA   NA
 538364 538365 Mb0075 Mb0076     FALSE 0.137 80.000 0.000 NA   NA
 538365 538366 Mb0076 Mb0077     FALSE 0.226 13.000 0.000 1.000 N NA
 538367 538368 Mb0078c Mb0079c     FALSE 0.142 64.000 0.000 NA   NA
 538371 538372 Mb0082 Mb0083     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538372 538373 Mb0083 Mb0084     FALSE 0.199 95.000 0.000 1.000   NA
 538373 538374 Mb0084 Mb0085     TRUE 0.750 5.000 0.043 1.000 N NA
 538374 538375 Mb0085 Mb0086     TRUE 0.996 -3.000 0.085 0.007 Y NA
 538375 538376 Mb0086 Mb0087   hycD TRUE 0.994 0.000 0.398 1.000 Y NA
 538376 538377 Mb0087 Mb0088 hycD hycP TRUE 0.980 11.000 0.679 NA Y NA
 538377 538378 Mb0088 Mb0089 hycP hycQ TRUE 0.997 0.000 0.864 NA Y NA
 538378 538379 Mb0089 Mb0090 hycQ hycE TRUE 0.999 -3.000 0.659 0.007 Y NA
 538379 538380 Mb0090 Mb0091 hycE   FALSE 0.197 35.000 0.000 NA   NA
 538380 538381 Mb0091 Mb0092     FALSE 0.037 157.000 0.000 NA   NA
 538381 538382 Mb0092 Mb0093     FALSE 0.069 129.000 0.000 NA   NA
 538382 538383 Mb0093 Mb0094   mtn FALSE 0.003 434.000 0.000 NA   NA
 538383 538384 Mb0094 Mb0095 mtn ctpA FALSE 0.028 132.000 0.000 1.000 N NA
 538385 538386 Mb0096c Mb0097c     FALSE 0.167 47.000 0.000 NA   NA
 538386 538387 Mb0097c Mb0098c     FALSE 0.232 -229.000 0.000 NA   NA
 538388 538389 Mb0099 Mb0100 PPE1   FALSE 0.446 19.000 0.167 NA N NA
 538389 538390 Mb0100 Mb0101     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 538390 538391 Mb0101 Mb0102   fadD10 TRUE 0.954 5.000 0.444 NA   NA
 538391 538392 Mb0102 Mb0103 fadD10   TRUE 0.980 5.000 0.800 1.000   NA
 538392 538393 Mb0103 Mb0104   nrp TRUE 0.945 -18.000 0.364 0.012   NA
 538393 538394 Mb0104 Mb0105 nrp   FALSE 0.027 175.000 0.000 NA   NA
 538399 538400 Mb0111c Mb0112c ctpI   FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 538401 538402 Mb0113 Mb0114 PE_PGRS1   FALSE 0.115 148.000 0.091 NA   NA
 538402 538403 Mb0114 Mb0115     FALSE 0.042 181.000 0.000 1.000   NA
 538403 538404 Mb0115 Mb0116   gca FALSE 0.003 282.000 0.000 1.000 N NA
 538404 538405 Mb0116 Mb0117 gca gmhA FALSE 0.065 74.000 0.000 1.000 N NA
 538405 538406 Mb0117 Mb0118 gmhA   FALSE 0.102 32.000 0.000 1.000 N NA
 538406 538407 Mb0118 Mb0119     FALSE 0.071 151.000 0.000 1.000   NA
 538412 538413 Mb0124c Mb0125c fusA2b fusA2a TRUE 0.984 -3.000 0.009 0.008   NA
 538413 538414 Mb0125c Mb0126c fusA2a   FALSE 0.129 136.000 0.009 1.000   NA
 538415 538416 Mb0127 Mb0128     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538416 538417 Mb0128 Mb0129   PE_PGRS2 FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 538417 538418 Mb0129 Mb0130 PE_PGRS2 pepA FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 538418 538419 Mb0130 Mb0131 pepA treS FALSE 0.103 109.000 0.013 1.000 N NA
 538419 538420 Mb0131 Mb0132 treS   TRUE 0.649 103.000 0.071 NA Y NA
 538420 538421 Mb0132 Mb0133     FALSE 0.346 68.000 0.136 NA   NA
 538424 538425 Mb0136c Mb0137c fadE1 fgd2 FALSE 0.448 42.000 0.286 NA N NA
 538426 538427 Mb0138 Mb0139-1     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 538427 538428 Mb0139-1 Mb0139-2     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 538428 538429 Mb0139-2 Mb0139-3     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 538429 538430 Mb0139-3 Mb0139-4     TRUE 0.739 3.000 0.000 NA   NA
 538434 538435 Mb0143 Mb0144     TRUE 0.978 1.000 0.538 NA   NA
 538435 538436 Mb0144 Mb0145     FALSE 0.259 61.000 0.034 NA   NA
 538440 538441 Mb0149 Mb0150     FALSE 0.568 89.000 0.571 NA N NA
 538441 538442 Mb0150 Mb0151     TRUE 0.903 43.000 0.556 NA Y NA
 538442 538443 Mb0151 Mb0152     FALSE 0.485 95.000 0.444 NA N NA
 538443 538444 Mb0152 Mb0153     TRUE 0.760 75.000 0.875 1.000 N NA
 538444 538445 Mb0153 Mb0154     TRUE 0.956 7.000 0.700 1.000 N NA
 538446 538447 Mb0155c Mb0156c   PE1 FALSE 0.002 591.000 0.000 NA   NA
 538447 538448 Mb0156c Mb0157c PE1 PE2 FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 538448 538449 Mb0157c Mb0158c PE2 ptbB FALSE 0.009 259.000 0.000 NA   NA
 538449 538450 Mb0158c Mb0159c ptbB fadE2 TRUE 0.925 2.000 0.226 1.000 N NA
 538451 538452 Mb0160 Mb0161 pntAa pntAb TRUE 0.997 1.000 0.829 0.001   NA
 538452 538453 Mb0161 Mb0162 pntAb pntB TRUE 0.995 -3.000 0.321 0.001   NA
 538453 538454 Mb0162 Mb0163 pntB   FALSE 0.002 306.000 0.000 1.000 N NA
 538455 538456 Mb0164c Mb0165c PE3 PE4 FALSE 0.125 92.000 0.000 NA   NA
 538459 538460 Mb0168 Mb0169   TB18.5 FALSE 0.249 54.000 0.020 NA   NA
 538461 538462 Mb0170c Mb0171c     FALSE 0.241 -198.000 0.000 NA   NA
 538463 538464 Mb0172 Mb0173 fadD5 yrbE1A FALSE 0.145 204.000 0.000 NA Y NA
 538464 538465 Mb0173 Mb0174 yrbE1A yrbE1B TRUE 0.996 2.000 1.000 NA Y NA
 538465 538466 Mb0174 Mb0175 yrbE1B mce1A TRUE 0.994 5.000 1.000 NA Y NA
 538466 538467 Mb0175 Mb0176 mce1A mce1B TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.008 Y NA
 538467 538468 Mb0176 Mb0177 mce1B mce1C TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.008 Y NA
 538468 538469 Mb0177 Mb0178 mce1C mce1D TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.008 Y NA
 538469 538470 Mb0178 Mb0179 mce1D lprK TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.008 Y NA
 538470 538471 Mb0179 Mb0180 lprK mce1F TRUE 0.996 -6.000 0.800 0.008 Y NA
 538471 538472 Mb0180 Mb0181 mce1F   TRUE 0.598 36.000 0.286 NA   NA
 538472 538473 Mb0181 Mb0182     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 538473 538474 Mb0182 Mb0183     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538474 538475 Mb0183 Mb0184     TRUE 0.914 -33.000 1.000 NA   NA
 538476 538477 Mb0185c MbXXXXc lprO Mb0186c FALSE 0.538 80.000 0.333 NA   NA
 538477 538478 MbXXXXc Mb0187c Mb0186c   FALSE 0.236 27.000 0.000 NA   NA
 538478 538479 Mb0187c Mb0188c   sigG FALSE 0.327 17.000 0.000 NA   NA
 538480 538481 Mb0189 Mb0190     FALSE 0.359 42.000 0.068 NA   NA
 538481 538482 Mb0190 Mb0191     TRUE 0.987 -3.000 0.600 NA   NA
 538482 538483 Mb0191 Mb0192   bglS TRUE 0.601 45.000 0.273 1.000   NA
 538483 538484 Mb0192 Mb0193 bglS   FALSE 0.007 361.000 0.000 1.000   NA
 538484 538485 Mb0193 Mb0194     FALSE 0.080 119.000 0.000 NA   NA
 538487 538488 Mb0196 Mb0197     FALSE 0.193 128.000 0.125 NA   NA
 538488 538489 Mb0197 Mb0198     FALSE 0.570 77.000 0.375 NA   NA
 538491 538492 Mb0200 Mb0201     FALSE 0.001 438.000 0.000 1.000 N NA
 538492 538493 Mb0201 Mb0202     FALSE 0.415 113.000 0.000 0.059   NA
 538493 538494 Mb0202 Mb0203     TRUE 0.971 0.000 0.276 1.000   NA
 538496 538497 Mb0205 Mb0206     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538498 538499 Mb0207c Mb0208c   mmpL11 TRUE 0.992 -3.000 0.750 1.000   NA
 538503 538504 Mb0212c Mb0213c mmpL3   FALSE 0.428 66.000 0.217 NA   NA
 538504 538505 Mb0213c Mb0214c     TRUE 0.858 3.000 0.040 NA   NA
 538506 538507 Mb0215 Mb0216     TRUE 0.985 -3.000 0.529 NA   NA
 538507 538508 Mb0216 Mb0217   pckA FALSE 0.044 184.000 0.026 NA   NA
 538509 538510 Mb0218c Mb0219c nadR   TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 538515 538516 Mb0224 Mb0225     TRUE 0.949 2.000 0.273 NA   NA
 538516 538517 Mb0225 Mb0226   lipC TRUE 0.805 10.000 0.182 NA   NA
 538517 538518 Mb0226 Mb0227 lipC   TRUE 0.842 44.000 1.000 NA   NA
 538519 538520 Mb0228c Mb0229c     FALSE 0.355 99.000 0.104 1.000   NA
 538522 538523 Mb0231c Mb0232c     TRUE 0.857 10.000 0.265 NA   NA
 538525 538526 Mb0234c Mb0235c   php TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538527 538528 Mb0236 Mb0237 fadE4   FALSE 0.210 135.000 0.250 1.000 N NA
 538528 538529 Mb0237 Mb0238   nrdB TRUE 0.972 -3.000 0.357 1.000 N NA
 538530 538531 Mb0239c Mb0240c gabD1   FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 538531 538532 Mb0240c Mb0241c     FALSE 0.364 35.000 0.053 NA   NA
 538532 538533 Mb0241c Mb0242c     TRUE 0.710 47.000 0.526 NA   NA
 538534 538535 Mb0243 Mb0244 lpqI   FALSE 0.328 76.000 0.185 1.000 N NA
 538535 538536 Mb0244 Mb0245     FALSE 0.144 62.000 0.000 NA   NA
 538536 538537 Mb0245 Mb0246     FALSE 0.566 8.000 0.000 NA   NA
 538538 538539 Mb0247c Mb0248c   fabG4 TRUE 0.972 11.000 0.412 1.000 Y NA
 538542 538543 Mb0251 Mb0252     FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 538544 538545 Mb0253c Mb0254c     TRUE 0.999 1.000 0.826 0.004 Y NA
 538545 538546 Mb0254c Mb0255c     TRUE 0.860 31.000 0.860 NA   NA
 538546 538547 Mb0255c Mb0256c     FALSE 0.372 80.000 0.171 NA   NA
 538547 538548 Mb0256c Mb0257c   hsp FALSE 0.121 145.000 0.091 NA   NA
 538549 538550 Mb0258 Mb0259 nirB nirD TRUE 0.891 26.000 0.286 0.001 N NA
 538551 538552 Mb0260c Mb0261c cobU cobQ1 TRUE 0.839 25.000 0.031 1.000 Y NA
 538552 538553 Mb0261c Mb0262c cobQ1 PPE2 FALSE 0.030 19.000 0.000 NA N NA
 538555 538556 Mb0264c Mb0265c     FALSE 0.557 25.000 0.071 1.000   NA
 538556 538557 Mb0265c Mb0266c     TRUE 0.963 -3.000 0.173 1.000   NA
 538557 538558 Mb0266c Mb0267c   narK3 FALSE 0.009 100.000 0.000 NA N NA
 538558 538559 Mb0267c Mb0268c narK3 aac FALSE 0.051 141.000 0.000 NA   NA
 538559 538560 Mb0268c Mb0269c aac   TRUE 0.757 10.000 0.101 NA   NA
 538560 538561 Mb0269c Mb0270c     TRUE 0.955 17.000 0.551 NA Y NA
 538561 538562 Mb0270c Mb0271c     FALSE 0.179 96.000 0.050 1.000 N NA
 538562 538563 Mb0271c Mb0272c   oplA FALSE 0.143 22.000 0.000 1.000 N NA
 538565 538566 Mb0274c Mb0275c     FALSE 0.011 65.000 0.000 NA N NA
 538568 538569 Mb0277c Mb0278c fadE6   FALSE 0.329 114.000 0.182 1.000   NA
 538569 538570 Mb0278c Mb0279c     TRUE 0.980 -3.000 0.333 1.000   NA
 538574 538575 Mb0283c Mb0284c   PE_PGRS3b FALSE 0.006 301.000 0.000 NA   NA
 538575 538576 Mb0284c Mb0285c PE_PGRS3b PE_PGRS3a FALSE 0.247 -177.000 0.000 NA   NA
 538576 538577 Mb0285c Mb0286c PE_PGRS3a PE_PGRS3 FALSE 0.008 264.000 0.000 NA   NA
 11445243 538574   Mb0283c     FALSE NA 406.000 0.000 NA   NA
 11587606 538574   Mb0283c     FALSE NA 406.000 0.000 NA   NA
 11729998 538574   Mb0283c     FALSE NA 406.000 0.000 NA   NA
 11445244 538574   Mb0283c     FALSE NA 427.000 0.000 NA   NA
 11587607 538574   Mb0283c     FALSE NA 427.000 0.000 NA   NA
 11729999 538574   Mb0283c     FALSE NA 427.000 0.000 NA   NA
 11445245 538574   Mb0283c     FALSE NA 454.000 0.000 NA   NA
 11587608 538574   Mb0283c     FALSE NA 454.000 0.000 NA   NA
 11730000 538574   Mb0283c     FALSE NA 454.000 0.000 NA   NA
 11445246 538574   Mb0283c     FALSE NA 475.000 0.000 NA   NA
 11587609 538574   Mb0283c     FALSE NA 475.000 0.000 NA   NA
 11730001 538574   Mb0283c     FALSE NA 475.000 0.000 NA   NA
 11445247 538574   Mb0283c     FALSE NA 529.000 0.000 NA   NA
 11587610 538574   Mb0283c     FALSE NA 529.000 0.000 NA   NA
 11730002 538574   Mb0283c     FALSE NA 529.000 0.000 NA   NA
 11445248 538574   Mb0283c     FALSE NA 550.000 0.000 NA   NA
 11587611 538574   Mb0283c     FALSE NA 550.000 0.000 NA   NA
 11730003 538574   Mb0283c     FALSE NA 550.000 0.000 NA   NA
 11445249 538574   Mb0283c     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11587612 538574   Mb0283c     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11730004 538574   Mb0283c     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11445250 538574   Mb0283c     FALSE NA 604.000 0.000 NA   NA
 11587613 538574   Mb0283c     FALSE NA 604.000 0.000 NA   NA
 11730005 538574   Mb0283c     FALSE NA 604.000 0.000 NA   NA
 11445251 538574   Mb0283c     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11587614 538574   Mb0283c     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11730006 538574   Mb0283c     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11445252 538574   Mb0283c     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11587615 538574   Mb0283c     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11730007 538574   Mb0283c     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11445253 538574   Mb0283c     FALSE NA 676.000 0.000 NA   NA
 11587616 538574   Mb0283c     FALSE NA 676.000 0.000 NA   NA
 11730008 538574   Mb0283c     FALSE NA 676.000 0.000 NA   NA
 11445254 538574   Mb0283c     FALSE NA 697.000 0.000 NA   NA
 11587617 538574   Mb0283c     FALSE NA 697.000 0.000 NA   NA
 11730009 538574   Mb0283c     FALSE NA 697.000 0.000 NA   NA
 11445255 538574   Mb0283c     FALSE NA 733.000 0.000 NA   NA
 11587618 538574   Mb0283c     FALSE NA 733.000 0.000 NA   NA
 11730010 538574   Mb0283c     FALSE NA 733.000 0.000 NA   NA
 11445256 538574   Mb0283c     FALSE NA 754.000 0.000 NA   NA
 11587619 538574   Mb0283c     FALSE NA 754.000 0.000 NA   NA
 11730011 538574   Mb0283c     FALSE NA 754.000 0.000 NA   NA
 11445257 538574   Mb0283c     FALSE NA 781.000 0.000 NA   NA
 11587620 538574   Mb0283c     FALSE NA 781.000 0.000 NA   NA
 11730012 538574   Mb0283c     FALSE NA 781.000 0.000 NA   NA
 11445258 538574   Mb0283c     FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11587621 538574   Mb0283c     FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11730013 538574   Mb0283c     FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11445259 538574   Mb0283c     FALSE NA 829.000 0.000 NA   NA
 11587622 538574   Mb0283c     FALSE NA 829.000 0.000 NA   NA
 11730014 538574   Mb0283c     FALSE NA 829.000 0.000 NA   NA
 11445260 538574   Mb0283c     FALSE NA 850.000 0.000 NA   NA
 11587623 538574   Mb0283c     FALSE NA 850.000 0.000 NA   NA
 11730015 538574   Mb0283c     FALSE NA 850.000 0.000 NA   NA
 11445261 538574   Mb0283c     FALSE NA 874.000 0.000 NA   NA
 11587624 538574   Mb0283c     FALSE NA 874.000 0.000 NA   NA
 11730016 538574   Mb0283c     FALSE NA 874.000 0.000 NA   NA
 11445262 538574   Mb0283c     FALSE NA 895.000 0.000 NA   NA
 11587625 538574   Mb0283c     FALSE NA 895.000 0.000 NA   NA
 11730017 538574   Mb0283c     FALSE NA 895.000 0.000 NA   NA
 11445263 538574   Mb0283c     FALSE NA 928.000 0.000 NA   NA
 11587626 538574   Mb0283c     FALSE NA 928.000 0.000 NA   NA
 11730018 538574   Mb0283c     FALSE NA 928.000 0.000 NA   NA
 11445264 538574   Mb0283c     FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11587627 538574   Mb0283c     FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11730019 538574   Mb0283c     FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11445265 538574   Mb0283c     FALSE NA 1000.000 0.000 NA   NA
 11587628 538574   Mb0283c     FALSE NA 1000.000 0.000 NA   NA
 11730020 538574   Mb0283c     FALSE NA 1000.000 0.000 NA   NA
 11445266 538574   Mb0283c     FALSE NA 1021.000 0.000 NA   NA
 11587629 538574   Mb0283c     FALSE NA 1021.000 0.000 NA   NA
 11730021 538574   Mb0283c     FALSE NA 1021.000 0.000 NA   NA
 11445267 538574   Mb0283c     FALSE NA 1063.000 0.000 NA   NA
 11587630 538574   Mb0283c     FALSE NA 1063.000 0.000 NA   NA
 11730022 538574   Mb0283c     FALSE NA 1063.000 0.000 NA   NA
 11445268 538574   Mb0283c     FALSE NA 1084.000 0.000 NA   NA
 11587631 538574   Mb0283c     FALSE NA 1084.000 0.000 NA   NA
 11730023 538574   Mb0283c     FALSE NA 1084.000 0.000 NA   NA
 11445269 538574   Mb0283c     FALSE NA 1108.000 0.000 NA   NA
 11587632 538574   Mb0283c     FALSE NA 1108.000 0.000 NA   NA
 11730024 538574   Mb0283c     FALSE NA 1108.000 0.000 NA   NA
 11445270 538574   Mb0283c     FALSE NA 1129.000 0.000 NA   NA
 11587633 538574   Mb0283c     FALSE NA 1129.000 0.000 NA   NA
 11730025 538574   Mb0283c     FALSE NA 1129.000 0.000 NA   NA
 11445271 538574   Mb0283c     FALSE NA 1156.000 0.000 NA   NA
 11587634 538574   Mb0283c     FALSE NA 1156.000 0.000 NA   NA
 11730026 538574   Mb0283c     FALSE NA 1156.000 0.000 NA   NA
 11445272 538574   Mb0283c     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
 11587635 538574   Mb0283c     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
 11730027 538574   Mb0283c     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
 11445273 538574   Mb0283c     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11587636 538574   Mb0283c     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11730028 538574   Mb0283c     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11445274 538574   Mb0283c     FALSE NA 1219.000 0.000 NA   NA
 11587637 538574   Mb0283c     FALSE NA 1219.000 0.000 NA   NA
 11730029 538574   Mb0283c     FALSE NA 1219.000 0.000 NA   NA
 11445275 538574   Mb0283c     FALSE NA 1246.000 0.000 NA   NA
 11587638 538574   Mb0283c     FALSE NA 1246.000 0.000 NA   NA
 11730030 538574   Mb0283c     FALSE NA 1246.000 0.000 NA   NA
 11445276 538574   Mb0283c     FALSE NA 1267.000 0.000 NA   NA
 11587639 538574   Mb0283c     FALSE NA 1267.000 0.000 NA   NA
 11730031 538574   Mb0283c     FALSE NA 1267.000 0.000 NA   NA
 11445277 538574   Mb0283c     FALSE NA 1291.000 0.000 NA   NA
 11587640 538574   Mb0283c     FALSE NA 1291.000 0.000 NA   NA
 11730032 538574   Mb0283c     FALSE NA 1291.000 0.000 NA   NA
 538577 538578 Mb0286c Mb0287c PE_PGRS3 PE_PGRS4 FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 538579 538580 Mb0288 Mb0289 PPE3   TRUE 0.802 24.000 0.667 NA N NA
 538580 538581 Mb0289 Mb0290     FALSE 0.013 224.000 0.000 NA   NA
 538581 538582 Mb0290 Mb0291     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538582 538583 Mb0291 Mb0292     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 538583 538584 Mb0292 Mb0293   PE5 TRUE 0.975 -3.000 0.333 NA   NA
 538584 538585 Mb0293 Mb0294 PE5 PPE4 TRUE 0.970 3.000 0.500 NA   NA
 538585 538586 Mb0294 Mb0295 PPE4 esxG FALSE 0.162 49.000 0.000 NA   NA
 538586 538587 Mb0295 Mb0296 esxG esxH FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 538587 538588 Mb0296 Mb0297 esxH   FALSE 0.472 11.000 0.000 NA   NA
 538588 538589 Mb0297 Mb0298     TRUE 0.809 47.000 0.818 NA   NA
 538589 538590 Mb0298 Mb0299     TRUE 0.986 -3.000 0.556 NA   NA
 538590 538591 Mb0299 Mb0300     TRUE 0.986 -3.000 0.556 NA   NA
 538594 538595 Mb0303c Mb0304c     TRUE 0.766 10.000 0.118 NA   NA
 538596 538597 Mb0305 Mb0306 PE_PGRS5   FALSE 0.081 143.000 0.000 1.000   NA
 538597 538598 Mb0306 Mb0307     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538598 538599 Mb0307 Mb0308     FALSE 0.165 48.000 0.000 NA   NA
 538599 538600 Mb0308 Mb0309     TRUE 0.982 -3.000 0.444 NA   NA
 538600 538601 Mb0309 Mb0310     FALSE 0.057 136.000 0.000 NA   NA
 538601 538602 Mb0310 Mb0311     TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 538603 538604 Mb0312c Mb0313c PPE5 PPE6 FALSE 0.324 144.000 0.000 NA Y NA
 538607 538608 Mb0316 Mb0317     FALSE 0.251 102.000 0.067 NA   NA
 538610 538611 Mb0319 Mb0320     FALSE 0.269 155.000 0.333 1.000   NA
 538611 538612 Mb0320 Mb0321     FALSE 0.139 72.000 0.000 NA   NA
 538614 538615 Mb0323 Mb0324     FALSE 0.490 49.000 0.286 1.000 N NA
 538616 538617 Mb0325c Mbt04 glpQ2 glyU FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 538617 538618 Mbt04 Mb0326c glyU   FALSE 0.215 31.000 0.000 NA   NA
 538619 538620 Mb0327 Mb0328 pcp   FALSE 0.139 72.000 0.000 NA   NA
 538620 538621 Mb0328 Mb0329   dcd FALSE 0.295 32.000 0.007 NA   NA
 538621 538622 Mb0329 Mb0330 dcd udgA FALSE 0.048 106.000 0.000 1.000 N NA
 538624 538625 Mb0332 Mb0333     TRUE 0.721 7.000 0.000 1.000   NA
 538628 538629 Mb0336c Mb0337c     FALSE 0.352 27.000 0.000 1.000   NA
 538630 538631 Mb0338 Mb0339     FALSE 0.139 75.000 0.000 NA   NA
 538631 538632 Mb0339 Mb0340     TRUE 0.715 27.000 0.368 NA   NA
 538632 538633 Mb0340 Mb0341   rmlA TRUE 0.623 30.000 0.273 NA   NA
 538636 538637 Mb0344c Mb0345c aspC   FALSE 0.245 31.000 0.023 1.000 N NA
 538637 538638 Mb0345c Mb0346c     FALSE 0.155 109.000 0.057 1.000 N NA
 538639 538640 Mb0347 Mb0348   iniB FALSE 0.121 189.000 0.286 NA   NA
 538640 538641 Mb0348 Mb0349 iniB iniA TRUE 0.768 37.000 0.500 1.000   NA
 538641 538642 Mb0349 Mb0350 iniA iniC TRUE 0.996 -3.000 0.583 0.007   NA
 538646 538647 Mb0355 Mb0356     TRUE 0.739 3.000 0.000 NA   NA
 538647 538648 Mb0356 Mb0357     TRUE 0.739 3.000 0.000 NA   NA
 538648 538649 Mb0357 Mb0358   dnaK FALSE 0.012 227.000 0.000 NA   NA
 538649 538650 Mb0358 Mb0359 dnaK grpE TRUE 0.996 -3.000 0.074 0.005 Y NA
 538650 538651 Mb0359 Mb0360 grpE dnaJ1 TRUE 0.926 36.000 0.068 0.005 Y NA
 538651 538652 Mb0360 Mb0361 dnaJ1 hspR TRUE 0.894 0.000 0.074 1.000 N NA
 538653 538654 Mb0362c Mb0363c PPE8   FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 538654 538655 Mb0363c Mb0364c   purA TRUE 0.925 -3.000 0.052 NA   NA
 538656 538657 Mb0365 Mb0366     TRUE 0.619 11.000 0.020 NA   NA
 538659 538660 Mb0368 Mb0369   mgtE FALSE 0.013 222.000 0.000 NA   NA
 538663 538664 Mb0372c Mb0373c     TRUE 0.721 25.000 0.000 0.047   NA
 538664 538665 Mb0373c Mb0374c     FALSE 0.226 29.000 0.000 NA   NA
 538665 538666 Mb0374c Mb0375c     FALSE 0.136 81.000 0.000 NA   NA
 538666 538667 Mb0375c Mb0376c     TRUE 0.882 6.000 0.208 NA   NA
 538667 538668 Mb0376c Mb0377c     FALSE 0.415 101.000 0.250 NA   NA
 538668 538669 Mb0377c Mb0378c     TRUE 0.957 -3.000 0.200 NA   NA
 538669 538670 Mb0378c Mb0379c     TRUE 0.975 -3.000 0.333 NA   NA
 538670 538671 Mb0379c Mb0380c     TRUE 0.852 19.000 0.750 NA N NA
 538671 538672 Mb0380c Mb0381c     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.071 Y NA
 538672 538673 Mb0381c Mb0382c     TRUE 0.990 15.000 0.909 0.071 Y NA
 538673 538674 Mb0382c Mb0383c     FALSE 0.336 76.000 0.250 NA N NA
 538675 538676 Mb0384 Mb0385     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 538676 538677 Mb0385 Mb0386   secE2 FALSE 0.080 119.000 0.000 NA   NA
 538678 538679 Mb0387c Mb0388c     FALSE 0.250 96.000 0.055 NA   NA
 538679 538680 Mb0388c Mb0389c   pyrE FALSE 0.432 18.000 0.012 NA   NA
 538680 538681 Mb0389c Mb0390c pyrE   FALSE 0.197 81.000 0.006 NA   NA
 538681 538682 Mb0390c Mb0391c   clpB FALSE 0.080 141.000 0.009 NA   NA
 538683 538684 Mb0392 Mb0393     FALSE 0.182 104.000 0.000 1.000   NA
 538686 538687 Mb0395 Mb0396 purT   TRUE 0.715 -3.000 0.019 NA N NA
 538687 538688 Mb0396 Mb0397   metZ TRUE 0.871 -3.000 0.092 NA N NA
 538692 538693 Mb0401 Mb0402     TRUE 0.629 6.000 0.000 NA   NA
 538693 538694 Mb0402 Mb0403     FALSE 0.139 74.000 0.000 NA   NA
 538695 538696 Mb0404c Mb0405c   lpqK TRUE 0.887 7.000 0.250 NA   NA
 538696 538697 Mb0405c Mb0406c lpqK fadE7 FALSE 0.313 10.000 0.000 1.000 N NA
 538699 538700 Mb0408c Mb0409c mmpL1b mmpL1a TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.055   NA
 538700 538701 Mb0409c Mb0410c mmpL1a mmpS1 TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538702 538703 Mb0411 Mb0412 fadD30 pks6a TRUE 0.994 -3.000 1.000 1.000   NA
 538703 538704 Mb0412 Mb0413 pks6a pks6b TRUE 0.867 -13.000 0.000 0.011   NA
 538706 538707 Mb0415 Mb0416 fgd1 pta TRUE 0.730 -7.000 0.021 1.000   NA
 538707 538708 Mb0416 Mb0417 pta ackA TRUE 0.838 -7.000 0.185 1.000   NA
 538709 538710 Mb0418c Mb0419c pknG glnH TRUE 0.996 0.000 0.622 1.000 Y NA
 538710 538711 Mb0419c Mb0420c glnH   TRUE 0.990 0.000 0.895 NA   NA
 538714 538715 Mb0423 Mb0424 thiO thiS TRUE 0.985 -3.000 0.625 1.000 N NA
 538715 538716 Mb0424 Mb0425 thiS thiG TRUE 0.948 -7.000 0.104 1.000 Y NA
 538716 538717 Mb0425 Mb0426 thiG lpqL FALSE 0.006 372.000 0.000 1.000   NA
 538717 538718 Mb0426 Mb0427 lpqL lpqM FALSE 0.543 88.000 0.000 0.031   NA
 538719 538720 Mb0428c Mb0429c     FALSE 0.034 161.000 0.000 NA   NA
 538720 538721 Mb0429c Mb0430c   thiD TRUE 0.928 -3.000 0.059 NA   NA
 538721 538722 Mb0430c Mb0431c thiD thiC TRUE 0.931 27.000 0.015 0.006 Y NA
 538722 538723 Mb0431c Mb0432c thiC   FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 538723 538724 Mb0432c Mb0433c   ctpH TRUE 0.686 50.000 0.500 NA   NA
 538724 538725 Mb0433c Mb0434c ctpH   FALSE 0.498 52.000 0.250 NA   NA
 538725 538726 Mb0434c Mb0435c   xthA FALSE 0.031 201.000 0.015 NA   NA
 538726 538727 Mb0435c Mb0436c xthA   TRUE 0.888 3.000 0.088 NA   NA
 538727 538728 Mb0436c Mb0437c   def TRUE 0.980 0.000 0.488 NA   NA
 538729 538730 Mb0438 Mb0439     FALSE 0.501 32.000 0.176 NA   NA
 538730 538731 Mb0439 Mb0440   sodC TRUE 0.747 33.000 0.500 NA   NA
 538731 538732 Mb0440 Mb0441 sodC   TRUE 0.933 2.000 0.128 1.000   NA
 538732 538733 Mb0441 Mb0442     FALSE 0.300 60.000 0.010 1.000   NA
 538734 538735 Mb0443c Mb0444c   pssA TRUE 0.868 -3.000 0.025 1.000 N NA
 538735 538736 Mb0444c Mb0445c pssA psd TRUE 0.996 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 538736 538737 Mb0445c Mb0446c psd moeA2 FALSE 0.161 61.000 0.018 1.000 N NA
 538737 538738 Mb0446c Mb0447c moeA2   TRUE 0.695 19.000 0.188 1.000   NA
 538740 538741 Mb0449c Mb0450c   PPE10 FALSE 0.236 27.000 0.000 NA   NA
 538743 538744 Mb0452c Mb0453c   sigK TRUE 0.804 44.000 0.778 NA   NA
 538744 538745 Mb0453c Mb0454c sigK   FALSE 0.406 49.000 0.065 1.000   NA
 538745 538746 Mb0454c Mb0455c   ufaA1 TRUE 0.818 9.000 0.081 1.000   NA
 538746 538747 Mb0455c Mb0456c ufaA1   TRUE 0.931 -3.000 0.067 NA   NA
 538747 538748 Mb0456c Mb0457c     TRUE 0.752 60.000 0.722 NA   NA
 538748 538749 Mb0457c Mb0458c   mmpL4 FALSE 0.351 40.000 0.007 1.000   NA
 538749 538750 Mb0458c Mb0459c mmpL4 mmpS4 TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 538751 538752 Mb0460 Mb0461   PPE11 FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 538752 538753 Mb0461 Mb0462 PPE11   FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 538754 538755 Mb0463c Mb0464c   echA2 FALSE 0.255 68.000 0.039 NA   NA
 538755 538756 Mb0464c Mb0465c echA2   FALSE 0.013 273.000 0.000 1.000   NA
 538756 538757 Mb0465c Mb0466c     FALSE 0.021 229.000 0.000 1.000   NA
 538758 538759 Mb0467 Mb0468     TRUE 0.890 0.000 0.021 NA   NA
 538759 538760 Mb0468 Mb0469     FALSE 0.271 60.000 0.042 NA   NA
 538760 538761 Mb0469 Mb0470     TRUE 0.856 38.000 1.000 NA   NA
 538761 538762 Mb0470 Mb0471   lpd FALSE 0.228 64.000 0.017 NA   NA
 538762 538763 Mb0471 Mb0472 lpd   TRUE 0.719 8.000 0.028 NA   NA
 538764 538765 Mb0473c Mb0474c     TRUE 0.970 -3.000 0.286 NA   NA
 538766 538767 Mb0475 Mb0476   icl FALSE 0.003 275.000 0.000 1.000 N NA
 538767 538768 Mb0476 Mb0477 icl fadB2 FALSE 0.176 82.000 0.036 1.000 N NA
 538768 538769 Mb0477 Mb0478 fadB2 umaA1 FALSE 0.135 133.000 0.130 1.000 N NA
 538770 538771 Mb0479c Mb0480c pcaA   FALSE 0.081 143.000 0.000 1.000   NA
 538771 538772 Mb0480c Mb0481c     FALSE 0.264 -69.000 0.000 NA   NA
 538772 538773 Mb0481c Mb0482c     FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 538774 538775 Mb0483 Mb0484     FALSE 0.248 87.000 0.047 NA   NA
 538775 538776 Mb0484 Mb0485   hbhA FALSE 0.023 354.000 0.282 NA   NA
 538776 538777 Mb0485 Mb0486 hbhA   FALSE 0.364 112.000 0.270 NA   NA
 538777 538778 Mb0486 Mb0487     TRUE 0.873 5.000 0.143 NA   NA
 538778 538779 Mb0487 Mb0488   deoC TRUE 0.898 0.000 0.030 NA   NA
 538780 538781 Mb0489c Mb0490c     TRUE 0.938 -3.000 0.091 NA   NA
 538781 538782 Mb0490c Mb0491c     FALSE 0.387 33.000 0.061 NA   NA
 538783 538784 Mb0492 Mb0493 murB lprQ FALSE 0.259 62.000 0.036 NA   NA
 538786 538787 Mb0495 Mb0496     FALSE 0.191 48.000 0.082 NA N NA
 538787 538788 Mb0496 Mb0497     TRUE 0.985 -3.000 0.541 NA   NA
 538788 538789 Mb0497 Mb0498     FALSE 0.003 384.000 0.000 NA   NA
 538789 538790 Mb0498 Mb0499   gpm1 FALSE 0.063 157.000 0.000 1.000   NA
 538790 538791 Mb0499 Mb0500 gpm1 senX3 FALSE 0.083 174.000 0.196 1.000 N NA
 538791 538792 Mb0500 Mb0501 senX3 regX3 FALSE 0.136 358.000 0.437 1.000 Y NA
 538793 538794 Mb0502c Mb0503c     TRUE 0.972 -3.000 0.300 NA   NA
 538794 538795 Mb0503c Mb0504c     TRUE 0.957 -3.000 0.200 NA   NA
 538798 538799 Mb0507 Mb0508     TRUE 0.970 -3.000 0.286 NA   NA
 538799 538800 Mb0508 Mb0509     TRUE 0.627 16.000 0.127 NA   NA
 538800 538801 Mb0509 Mb0510     TRUE 0.590 16.000 0.076 NA   NA
 538801 538802 Mb0510 Mb0511   proC TRUE 0.605 25.000 0.143 1.000   NA
 538802 538803 Mb0511 Mb0512 proC   FALSE 0.220 141.000 0.186 1.000   NA
 538803 538804 Mb0512 Mb0513   galE2 FALSE 0.010 307.000 0.000 1.000   NA
 538804 538805 Mb0513 Mb0514 galE2   TRUE 0.962 7.000 0.796 1.000 N NA
 538806 538807 Mb0515c Mb0516c cmaA2   TRUE 0.802 23.000 0.400 1.000   NA
 538807 538808 Mb0516c Mb0517c   serB1 FALSE 0.135 162.000 0.145 1.000   NA
 538809 538810 Mb0518 Mb0519 mmpS2 mmpL2 TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538810 538811 Mb0519 Mb0520 mmpL2   TRUE 0.610 -7.000 0.007 NA   NA
 538811 538812 Mb0520 Mb0521   hemA FALSE 0.242 50.000 0.012 NA   NA
 538812 538813 Mb0521 Mb0523 hemA hemC TRUE 0.987 10.000 0.178 0.002 Y NA
 538813 538814 Mb0523 Mb0524 hemC hemD TRUE 0.936 33.000 0.044 0.002 Y NA
 538814 538815 Mb0524 Mb0525 hemD hemB TRUE 0.952 86.000 0.429 0.002 Y NA
 538815 538816 Mb0525 Mb0526 hemB   TRUE 0.589 13.000 0.039 NA   NA
 538816 538817 Mb0526 Mb0527     TRUE 0.978 -3.000 0.389 NA   NA
 538817 538818 Mb0527 Mb0528     FALSE 0.114 103.000 0.000 NA   NA
 538820 538821 Mb0530 Mb0531     FALSE 0.290 132.000 0.333 1.000 N NA
 538823 538824 Mb0533 Mb0534     FALSE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 538824 538825 Mb0534 Mb0535   gabP FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 538827 538828 Mb0537 Mb0538 hemL   TRUE 0.913 0.000 0.204 NA N NA
 538828 538829 Mb0538 Mb0539     FALSE 0.275 15.000 0.035 NA N NA
 538829 538830 Mb0539 Mb0540   ccdA TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 538830 538831 Mb0540 Mb0541 ccdA   TRUE 0.804 33.000 0.131 NA Y NA
 538831 538832 Mb0541 Mb0542   ccsA TRUE 0.987 -3.000 0.082 NA Y NA
 538832 538833 Mb0542 Mb0543 ccsA   FALSE 0.543 42.000 0.308 1.000 N NA
 538833 538834 Mb0543 Mb0544     FALSE 0.017 205.000 0.000 NA   NA
 538834 538835 Mb0544 Mb0545   PE_PGRS6a FALSE 0.045 147.000 0.000 NA   NA
 538835 538836 Mb0545 Mb0546 PE_PGRS6a PE_PGRS6b FALSE 0.258 -94.000 0.000 NA   NA
 538837 538838 Mb0547c Mb0548c fabH menA FALSE 0.135 82.000 0.011 1.000 N NA
 538839 538840 Mb0549 Mb0550 pnp galE3 TRUE 0.833 -3.000 0.008 1.000 N NA
 538842 538843 Mb0552 Mb0553     FALSE 0.287 57.000 0.048 NA   NA
 538843 538844 Mb0553 Mb0554     TRUE 0.941 -3.000 0.109 NA   NA
 538845 538846 Mb0555c Mb0556c   menE FALSE 0.546 12.000 0.008 NA   NA
 538846 538847 Mb0556c Mb0557c menE   FALSE 0.234 69.000 0.024 NA   NA
 538847 538848 Mb0557c Mb0558c     FALSE 0.147 60.000 0.000 NA   NA
 538848 538849 Mb0558c Mb0559c   pitA TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538849 538850 Mb0559c Mb0560c pitA   FALSE 0.235 120.000 0.167 NA   NA
 538850 538851 Mb0560c Mb0561c     FALSE 0.303 63.000 0.069 NA   NA
 538851 538852 Mb0561c Mb0562c   menB FALSE 0.255 96.000 0.008 1.000   NA
 538852 538853 Mb0562c Mb0563c menB   FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 538853 538854 Mb0563c Mb0564c     FALSE 0.292 -33.000 0.000 NA   NA
 538854 538855 Mb0564c Mb0565c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538855 538856 Mb0565c Mb0566c   fadD8 FALSE 0.021 192.000 0.000 NA   NA
 538857 538858 Mb0567 Mb0568   menC TRUE 0.939 -3.000 0.028 1.000   NA
 538858 538859 Mb0568 Mb0569 menC bpoC TRUE 0.982 -3.000 0.038 0.045   NA
 538859 538860 Mb0569 Mb0570 bpoC menD FALSE 0.368 43.000 0.022 1.000   NA
 538860 538861 Mb0570 Mb0571 menD   TRUE 0.926 -3.000 0.055 NA   NA
 538861 538862 Mb0571 Mb0572   pimB FALSE 0.485 62.000 0.259 NA   NA
 538862 538863 Mb0572 Mb0573 pimB menH FALSE 0.338 17.000 0.013 1.000 N NA
 538864 538865 Mb0574c Mb0575c     FALSE 0.541 34.000 0.222 NA   NA
 538865 538866 Mb0575c Mb0576c     FALSE 0.305 25.000 0.029 1.000 N NA
 538867 538868 Mb0577 Mb0578 grcC1 htpX FALSE 0.161 101.000 0.042 1.000 N NA
 538869 538870 Mb0579c Mb0580c gpdA1   FALSE 0.289 61.000 0.133 1.000 N NA
 538870 538871 Mb0580c Mb0581c     FALSE 0.196 78.000 0.005 NA   NA
 538872 538873 Mbt05 Mb0582 tyrT   FALSE 0.064 132.000 0.000 NA   NA
 538873 538874 Mb0582 Mb0583   cyp135B1 FALSE 0.043 110.000 0.000 1.000 N NA
 538874 538875 Mb0583 Mb0584 cyp135B1   FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 538875 538876 Mb0584 Mb0585   nrdZ TRUE 0.667 26.000 0.286 NA   NA
 538877 538878 Mb0586c Mb0587c     FALSE 0.013 224.000 0.000 NA   NA
 538878 538879 Mb0587c Mb0588c     FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   NA
 538879 538880 Mb0588c Mb0589c     FALSE 0.070 10.000 0.000 NA N NA
 538880 538881 Mb0589c Mb0590c     FALSE 0.001 216.000 0.000 NA N NA
 538882 538883 Mb0591 Mb0592   TB27.3 TRUE 0.632 14.000 0.080 NA   NA
 538887 538888 Mb0596 Mb0597     TRUE 0.954 -3.000 0.182 NA   NA
 538892 538893 Mb0601 Mb0602   yrbE2A TRUE 0.714 -3.000 0.019 NA N NA
 538893 538894 Mb0602 Mb0603 yrbE2A yrbE2B TRUE 0.989 2.000 0.333 NA Y NA
 538894 538895 Mb0603 Mb0604 yrbE2B mce2A TRUE 0.993 6.000 1.000 NA Y NA
 538895 538896 Mb0604 Mb0605 mce2A mce2B TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.007 Y NA
 538896 538897 Mb0605 Mb0606 mce2B mce2C TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.007 Y NA
 538897 538898 Mb0606 Mb0607 mce2C mce2Da TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.007 Y NA
 538898 538899 Mb0607 Mb0608 mce2Da mce2Db FALSE 0.277 -52.000 0.000 NA   NA
 538899 538900 Mb0608 Mb0609 mce2Db lprL TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538900 538901 Mb0609 Mb0610 lprL mce2F FALSE 0.069 647.000 0.500 0.007   NA
 538902 538903 Mb0611c Mb0612c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538903 538904 Mb0612c Mb0613c     FALSE 0.024 183.000 0.000 NA   NA
 538904 538905 Mb0613c Mb0614c     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 538905 538906 Mb0614c Mb0615c     TRUE 0.979 -3.000 0.400 NA   NA
 538906 538907 Mb0615c Mb0616c     FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 538907 538908 Mb0616c Mb0617c     TRUE 0.580 114.000 0.000 0.001   NA
 538908 538909 Mb0617c Mb0618c   tcrA FALSE 0.268 44.000 0.000 1.000   NA
 538910 538911 Mb0619 Mb0620   lpqO FALSE 0.139 72.000 0.000 NA   NA
 538911 538912 Mb0620 Mb0621 lpqO   FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 538912 538913 Mb0621 Mb0622     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 538913 538914 Mb0622 Mb0623     FALSE 0.154 54.000 0.000 NA   NA
 538914 538915 Mb0623 Mb0624     FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 538915 538916 Mb0624 Mb0625     TRUE 0.969 -3.000 0.273 NA   NA
 538916 538917 Mb0625 Mb0626     FALSE 0.273 -57.000 0.000 NA   NA
 538918 538919 Mb0627c Mb0628c     FALSE 0.157 52.000 0.000 NA   NA
 538922 538923 Mb0631 Mb0632     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538925 538926 Mb0634 Mb0635   galT FALSE 0.069 129.000 0.000 NA   NA
 538926 538927 Mb0635 Mb0636 galT galK TRUE 0.994 -3.000 0.370 0.001 N NA
 538927 538928 Mb0636 Mb0637 galK   FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 538928 538929 Mb0637 Mb0638     TRUE 0.867 11.000 0.333 NA   NA
 538929 538930 Mb0638 Mb0639     FALSE 0.125 93.000 0.000 NA   NA
 538930 538931 Mb0639 Mb0640     TRUE 0.949 0.000 0.200 NA   NA
 538933 538934 Mb0642 Mb0643     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538935 538936 Mb0644c Mb0645c   recD FALSE 0.125 93.000 0.000 NA   NA
 538936 538937 Mb0645c Mb0646c recD recBb TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538937 538938 Mb0646c Mb0647c recBb recBa FALSE 0.253 -114.000 0.000 NA   NA
 538938 538939 Mb0647c Mb0648c recBa recC TRUE 0.999 0.000 0.542 0.001 Y NA
 538939 538940 Mb0648c Mb0649c recC echA3 FALSE 0.003 277.000 0.000 1.000 N NA
 538940 538941 Mb0649c Mb0650c echA3   FALSE 0.331 49.000 0.067 NA   NA
 538941 538942 Mb0650c Mb0651c     FALSE 0.060 154.000 0.006 NA   NA
 538943 538944 Mb0652 Mbt06   thrT FALSE 0.067 130.000 0.000 NA   NA
 538944 538945 Mbt06 Mbt07 thrT metT FALSE 0.192 37.000 0.000 NA   NA
 538945 538946 Mbt07 Mb0653 metT rpmG2 FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 538946 538947 Mb0653 Mb0654 rpmG2   FALSE 0.339 51.000 0.079 NA   NA
 538947 538948 Mb0654 Mb0655     TRUE 0.936 -13.000 0.818 NA   NA
 538948 538949 Mb0655 Mb0656     TRUE 0.994 4.000 0.818 NA Y NA
 538949 538950 Mb0656 Mbt08   trpT FALSE 0.019 199.000 0.000 NA   NA
 538950 538951 Mbt08 Mb0657 trpT secE1 FALSE 0.051 141.000 0.000 NA   NA
 538951 538952 Mb0657 Mb0658 secE1 nusG FALSE 0.196 32.000 0.006 1.000 N NA
 538952 538953 Mb0658 Mb0659 nusG rplK TRUE 0.728 52.000 0.681 1.000 N NA
 538953 538954 Mb0659 Mb0660 rplK rplA TRUE 0.968 67.000 0.838 0.023 Y NA
 538955 538956 Mb0661c Mb0662c mmaA4 mmaA3 TRUE 0.935 65.000 0.286 0.004 Y NA
 538956 538957 Mb0662c Mb0663c mmaA3 mmaA2 TRUE 0.891 148.000 0.667 0.004 Y NA
 538957 538958 Mb0663c Mb0664c mmaA2 mmaA1 TRUE 0.777 167.000 0.400 0.004 Y NA
 538958 538959 Mb0664c Mb0665c mmaA1 lipG TRUE 0.667 47.000 0.444 NA   NA
 538959 538960 Mb0665c Mb0666c lipG   TRUE 0.796 12.000 0.243 NA   NA
 538961 538962 Mb0667 Mb0668   fabD2 TRUE 0.993 -3.000 0.857 1.000   NA
 538962 538963 Mb0668 Mb0669 fabD2   TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000   NA
 538963 538964 Mb0669 Mb0670   rplJ FALSE 0.002 331.000 0.000 1.000 N NA
 538964 538965 Mb0670 Mb0671 rplJ rplL TRUE 0.979 37.000 0.884 0.018 Y NA
 538967 538968 Mb0673 Mb0674   mkl FALSE 0.344 12.000 0.038 NA N NA
 538969 538970 Mb0675c Mb0676c     FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 538970 538971 Mb0676c Mb0677c     FALSE 0.139 76.000 0.000 NA   NA
 538971 538972 Mb0677c Mb0678c     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 538972 538973 Mb0678c Mb0679c     FALSE 0.547 -13.000 0.000 1.000   NA
 538973 538974 Mb0679c Mb0680c     FALSE 0.095 110.000 0.000 NA   NA
 538974 538975 Mb0680c Mb0681c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538976 538977 Mb0682 Mb0683 atsD   FALSE 0.209 32.000 0.000 NA   NA
 538977 538978 Mb0683 Mb0684     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538978 538979 Mb0684 Mb0685     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538979 538980 Mb0685 Mb0686   rpoB FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 538980 538981 Mb0686 Mb0687 rpoB rpoC TRUE 0.983 45.000 0.851 0.001 Y NA
 538983 538984 Mb0689 Mb0690 end lpqP FALSE 0.187 32.000 0.004 1.000 N NA
 538984 538985 Mb0690 Mb0691 lpqP fadE8 FALSE 0.244 60.000 0.071 1.000 N NA
 538985 538986 Mb0691 Mb0692 fadE8 echA4 TRUE 0.963 11.000 0.286 1.000 Y NA
 538986 538987 Mb0692 Mb0693 echA4   TRUE 0.917 3.000 0.292 NA N NA
 538987 538988 Mb0693 Mb0694   echA5 TRUE 0.865 -3.000 0.083 NA N NA
 538989 538990 Mb0695c Mb0696c mmpL5 mmpS5 TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538992 538993 Mb0698c Mb0699c     TRUE 0.984 2.000 0.778 NA   NA
 538994 538995 Mb0700 Mb0701   rpsL FALSE 0.004 249.000 0.000 1.000 N NA
 538995 538996 Mb0701 Mb0702 rpsL rpsG TRUE 0.999 0.000 0.620 0.003 Y NA
 538996 538997 Mb0702 Mb0703 rpsG fusA1 TRUE 0.893 81.000 0.579 1.000 Y NA
 538997 538998 Mb0703 Mb0704 fusA1 tuf TRUE 0.626 231.000 0.400 0.001 Y NA
 538998 538999 Mb0704 Mb0705 tuf   FALSE 0.054 138.000 0.000 NA   NA
 538999 539000 Mb0705 Mb0706     FALSE 0.233 153.000 0.333 NA   NA
 539000 539001 Mb0706 Mb0707     TRUE 0.907 14.000 0.214 0.055   NA
 539002 539003 Mb0708c Mb0709c     FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 539003 539004 Mb0709c Mb0710c     TRUE 0.937 -3.000 0.088 NA   NA
 539005 539006 Mb0711 Mb0712   pqqE TRUE 0.983 -3.000 0.484 NA   NA
 539006 539007 Mb0712 Mb0713 pqqE lldD1 TRUE 0.977 3.000 0.548 1.000   NA
 539007 539008 Mb0713 Mb0714 lldD1   FALSE 0.216 190.000 0.464 1.000   NA
 539008 539009 Mb0714 Mb0715     TRUE 0.656 49.000 0.440 NA   NA
 539009 539010 Mb0715 Mb0716     TRUE 0.981 2.000 0.667 NA   NA
 539010 539011 Mb0716 Mb0717     FALSE 0.003 461.000 0.000 NA   NA
 539011 539012 Mb0717 Mb0718     FALSE 0.165 48.000 0.000 NA   NA
 539012 539013 Mb0718 Mb0719     FALSE 0.023 185.000 0.000 NA   NA
 539013 539014 Mb0719 Mb0720   rpsJ FALSE 0.002 637.000 0.000 NA   NA
 539014 539015 Mb0720 Mb0721 rpsJ rplC TRUE 0.980 17.000 0.467 0.022 Y NA
 539015 539016 Mb0721 Mb0722 rplC rplD TRUE 0.997 0.000 0.361 0.017 Y NA
 539016 539017 Mb0722 Mb0723 rplD rplW TRUE 0.998 0.000 0.513 0.017 Y NA
 539017 539018 Mb0723 Mb0724 rplW rplB TRUE 0.904 147.000 0.849 0.014 Y NA
 539018 539019 Mb0724 Mb0725 rplB rpsS TRUE 0.976 41.000 0.820 0.022 Y NA
 539019 539020 Mb0725 Mb0726 rpsS rplV TRUE 0.999 -3.000 0.769 0.022 Y NA
 539020 539021 Mb0726 Mb0727 rplV rpsC TRUE 0.999 0.000 0.719 0.022 Y NA
 539021 539022 Mb0727 Mb0728 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.022 Y NA
 539022 539023 Mb0728 Mb0729 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.017 Y NA
 539023 539024 Mb0729 Mb0730 rpmC rpsQ TRUE 0.999 -3.000 0.828 0.017 Y NA
 539024 539025 Mb0730 Mb0731 rpsQ atsAa FALSE 0.068 169.000 0.005 1.000   NA
 539025 539026 Mb0731 Mb0732 atsAa atsAb TRUE 0.955 7.000 0.000 0.001   NA
 539026 539027 Mb0732 Mb0733 atsAb   FALSE 0.513 48.000 0.250 NA   NA
 539027 539028 Mb0733 Mb0734     FALSE 0.074 301.000 0.600 NA   NA
 539028 539029 Mb0734 Mb0735   rplN FALSE 0.002 486.000 0.000 NA   NA
 539029 539030 Mb0735 Mb0736 rplN rplX TRUE 0.998 1.000 0.810 0.022 Y NA
 539030 539031 Mb0736 Mb0737 rplX rplE TRUE 0.999 0.000 0.758 0.017 Y NA
 539031 539032 Mb0737 Mb0738 rplE rpsN1 TRUE 0.996 5.000 0.496 0.017 Y NA
 539032 539033 Mb0738 Mb0739 rpsN1 rpsH TRUE 0.776 164.000 0.473 0.017 Y NA
 539033 539034 Mb0739 Mb0740 rpsH rplF TRUE 0.985 24.000 0.808 0.017 Y NA
 539034 539035 Mb0740 Mb0741 rplF rplR TRUE 0.998 3.000 0.815 0.017 Y NA
 539035 539036 Mb0741 Mb0742 rplR rpsE TRUE 0.987 20.000 0.814 0.022 Y NA
 539036 539037 Mb0742 Mb0743 rpsE rpmD TRUE 0.998 3.000 0.789 0.022 Y NA
 539037 539038 Mb0743 Mb0744 rpmD rplO TRUE 0.999 0.000 0.653 0.002 Y NA
 539038 539039 Mb0744 Mb0745 rplO sppA FALSE 0.099 33.000 0.000 1.000 N NA
 539040 539041 Mb0746c Mb0747c     TRUE 0.581 93.000 0.000 NA Y NA
 539041 539042 Mb0747c Mb0748c   fucA FALSE 0.001 203.000 0.000 NA N NA
 539042 539043 Mb0748c Mb0749c fucA serA2 TRUE 0.899 -3.000 0.058 1.000 N NA
 539044 539045 Mb0750 Mb0751 xylB   TRUE 0.645 13.000 0.018 1.000   NA
 539047 539048 Mb0753 Mb0754 secY adk TRUE 0.899 -3.000 0.057 1.000 N NA
 539048 539049 Mb0754 Mb0755 adk mapA TRUE 0.972 3.000 0.606 1.000 N NA
 539049 539050 Mb0755 Mb0756 mapA sigL FALSE 0.254 73.000 0.099 1.000 N NA
 539050 539051 Mb0756 Mb0757 sigL   TRUE 0.903 64.000 0.697 NA Y NA
 539051 539052 Mb0757 Mb0758     FALSE 0.067 315.000 0.065 NA Y NA
 539052 539053 Mb0758 Mb0759     FALSE 0.004 358.000 0.000 NA   NA
 539053 539054 Mb0759 Mb0760     FALSE 0.017 205.000 0.000 NA   NA
 539054 539055 Mb0760 Mb0761     FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 539055 539056 Mb0761 Mb0762     FALSE 0.012 231.000 0.000 NA   NA
 539056 539057 Mb0762 Mb0763   PE_PGRS8 FALSE 0.050 142.000 0.000 NA   NA
 539058 539059 Mb0764c Mb0765c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539060 539061 Mb0766 Mb0767   PE_PGRS9 FALSE 0.296 20.000 0.000 NA   NA
 539061 539062 Mb0767 Mb0768 PE_PGRS9 PE_PGRS10 FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 539062 539063 Mb0768 Mb0769 PE_PGRS10   FALSE 0.202 91.000 0.000 1.000   NA
 539063 539064 Mb0769 Mb0770     FALSE 0.264 24.000 0.000 NA   NA
 539067 539068 Mb0773c Mb0774c mmsB fadE9 TRUE 0.935 11.000 0.051 1.000 Y NA
 539068 539069 Mb0774c Mb0775c fadE9 mmsA TRUE 0.824 7.000 0.197 1.000 N NA
 539071 539072 Mb0777c Mb0778c PPE12   FALSE 0.006 302.000 0.000 NA   NA
 539072 539073 Mb0778c Mbt09   thrV FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 539073 539074 Mbt09 Mb0779c thrV   FALSE 0.230 28.000 0.000 NA   NA
 539075 539076 Mb0780 Mb0781 phoP phoR TRUE 0.971 45.000 0.824 0.052 Y NA
 539077 539078 Mb0782c Mb0783c     FALSE 0.221 109.000 0.014 1.000   NA
 539078 539079 Mb0783c Mb0784c   adhB TRUE 0.938 13.000 0.750 1.000   NA
 539079 539080 Mb0784c Mb0785c adhB   FALSE 0.546 99.000 0.400 NA   NA
 539080 539081 Mb0785c Mb0786c     TRUE 0.983 3.000 0.800 NA   NA
 539081 539082 Mb0786c Mb0787c   cyp51 TRUE 0.973 3.000 0.733 NA N NA
 539082 539083 Mb0787c Mb0788c cyp51   TRUE 0.962 0.000 0.212 1.000   NA
 539083 539084 Mb0788c Mb0789c   cyp123 TRUE 0.965 0.000 0.231 1.000   NA
 539084 539085 Mb0789c Mb0790c cyp123   TRUE 0.983 -3.000 0.571 1.000 N NA
 539086 539087 Mb0791 Mb0792 aldA   TRUE 0.830 31.000 0.812 1.000 N NA
 539087 539088 Mb0792 Mb0793     TRUE 0.859 98.000 0.480 1.000 Y NA
 539088 539089 Mb0793 Mb0794     TRUE 0.988 -3.000 0.560 1.000   NA
 539089 539090 Mb0794 Mb0795   purD TRUE 0.635 12.000 0.003 1.000   NA
 539091 539092 Mb0796c Mb0797c ggtA   FALSE 0.410 51.000 0.073 1.000   NA
 539095 539096 Mb0800 Mb0801 purB cyp126 TRUE 0.648 5.000 0.006 1.000 N NA
 539098 539099 Mb0803 Mb0804 purC ptrB TRUE 0.878 -3.000 0.035 1.000 N NA
 539101 539102 Mb0806 Mb0807     TRUE 0.631 16.000 0.048 1.000   NA
 539102 539103 Mb0807 Mb0808     TRUE 0.810 18.000 0.024 0.054   NA
 539105 539106 Mb0810 Mb0811     FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 539106 539107 Mb0811 Mb0812   purQ TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 539108 539109 Mb0813c Mb0814c     FALSE 0.280 22.000 0.000 NA   NA
 539109 539110 Mb0814c Mb0815c     TRUE 0.933 -3.000 0.070 NA   NA
 539110 539111 Mb0815c Mb0816c     TRUE 0.943 -3.000 0.250 NA N NA
 539113 539114 Mb0818c Mb0819c     TRUE 0.840 -12.000 0.000 0.066   NA
 539116 539117 Mb0821c Mb0822c cfp29   TRUE 0.968 -3.000 0.267 NA   NA
 539118 539119 Mb0823 Mb0824 pepC   TRUE 0.615 12.000 0.038 NA   NA
 539121 539122 Mb0826 Mb0827 purL   TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 539122 539123 Mb0827 Mb0828     FALSE 0.127 121.000 0.000 1.000   NA
 539125 539126 Mb0830 Mb0831   purF FALSE 0.232 87.000 0.034 NA   NA
 539126 539127 Mb0831 Mb0832 purF purM TRUE 0.876 31.000 0.248 1.000 Y NA
 539128 539129 Mb0833c Mb0834c     FALSE 0.076 147.000 0.017 NA   NA
 539131 539132 Mb0836c Mb0837c   sseC2 FALSE 0.068 163.000 0.043 NA   NA
 539132 539133 Mb0837c Mb0838c sseC2 cysA2 TRUE 0.981 2.000 0.557 1.000   NA
 539133 539134 Mb0838c Mb0839c cysA2 thiX FALSE 0.011 293.000 0.000 1.000   NA
 539134 539135 Mb0839c Mb0840c thiX   TRUE 0.977 -3.000 0.371 NA   NA
 539136 539137 Mb0841 Mb0842     TRUE 0.966 -3.000 0.196 1.000   NA
 539137 539138 Mb0842 Mb0843   phoT FALSE 0.360 43.000 0.016 1.000   NA
 539139 539140 Mb0844c Mb0845c phoY2   TRUE 0.620 58.000 0.579 NA N NA
 539140 539141 Mb0845c Mb0846c     FALSE 0.008 166.000 0.005 NA N NA
 539141 539142 Mb0846c Mb0847c   desA1 FALSE 0.255 88.000 0.004 1.000   NA
 539142 539143 Mb0847c Mb0848c desA1   FALSE 0.260 162.000 0.375 1.000   NA
 539145 539146 Mb0850c Mb0851c     FALSE 0.071 58.000 0.000 1.000 N NA
 539147 539148 Mb0852 Mb0853     FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 539149 539150 Mb0854c Mbt10   lysT FALSE 0.124 94.000 0.000 NA   NA
 539151 539152 Mbt11 Mbt12 gluT aspT FALSE 0.188 38.000 0.000 NA   NA
 539152 539153 Mbt12 Mbt13 aspT pheU FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 539153 539154 Mbt13 Mb0855 pheU PE_PGRS12 FALSE 0.002 665.000 0.000 NA   NA
 539154 539155 Mb0855 Mb0856 PE_PGRS12 PE_PGRS13 TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539158 539159 Mb0859c Mb0860c     FALSE 0.139 71.000 0.000 NA   NA
 539160 539161 Mb0861 Mb0862 lpqR   FALSE 0.164 87.000 0.033 1.000 N NA
 539163 539164 Mb0864 Mb0865     FALSE 0.007 277.000 0.000 NA   NA
 539164 539165 Mb0865 Mb0866     FALSE 0.518 -16.000 0.000 1.000   NA
 539169 539170 Mb0870 Mb0871 lpqS cysK2 FALSE 0.018 203.000 0.000 NA   NA
 539170 539171 Mb0871 Mb0872 cysK2   TRUE 0.984 0.000 0.500 1.000   NA
 539171 539172 Mb0872 Mb0873     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539176 539177 Mb0877 Mb0878   far TRUE 0.926 6.000 0.333 NA   NA
 539177 539178 Mb0878 Mb0879 far   FALSE 0.089 113.000 0.000 NA   NA
 539178 539179 Mb0879 Mb0880     FALSE 0.230 28.000 0.000 NA   NA
 539181 539182 Mb0882 Mb0883 fadA fadB TRUE 0.993 5.000 0.750 1.000 Y NA
 539183 539184 Mb0884c Mb0885c     FALSE 0.200 138.000 0.206 NA   NA
 539185 539186 Mb0886 Mb0888   moaC2 FALSE 0.201 84.000 0.012 NA   NA
 539186 539187 Mb0888 Mb0889 moaC2 mog TRUE 0.996 -3.000 0.016 0.005 Y NA
 539187 539188 Mb0889 Mb0890 mog moaE2 TRUE 0.996 -3.000 0.015 0.005 Y NA
 539189 539190 Mb0891c Mb0892c rpfA moaD2 FALSE 0.005 448.000 0.000 1.000   NA
 539190 539191 Mb0892c Mb0893c moaD2 moaA2 TRUE 0.990 4.000 0.410 1.000 Y NA
 539191 539192 Mb0893c Mb0894c moaA2   TRUE 0.911 -3.000 0.026 NA   NA
 539196 539197 Mb0898c Mb0899c     FALSE 0.119 100.000 0.000 NA   NA
 539197 539198 Mb0899c Mb0900c     TRUE 0.981 -3.000 0.432 NA   NA
 539200 539201 Mb0902c Mb0903c PPE13   FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 539202 539203 Mb0904 Mb0905     TRUE 0.872 -3.000 0.029 1.000 N NA
 539203 539204 Mb0905 Mb0906     TRUE 0.935 -3.000 0.075 NA   NA
 539205 539206 Mb0907c Mb0908c   serC FALSE 0.148 157.000 0.214 NA   NA
 539207 539208 Mb0909 Mb0910   fprB TRUE 0.920 19.000 0.846 1.000   NA
 539211 539212 Mb0913c Mb0914c citA   FALSE 0.205 87.000 0.000 1.000   NA
 539212 539213 Mb0914c Mb0915c     TRUE 0.850 2.000 0.000 1.000   NA
 539216 539217 Mb0918 Mb0919     FALSE 0.138 77.000 0.000 NA   NA
 539217 539218 Mb0919 Mb0920   gltA2 FALSE 0.029 173.000 0.000 NA   NA
 539219 539220 Mb0921c Mb0922c     FALSE 0.480 26.000 0.091 NA   NA
 539221 539222 Mb0923 Mb0924 ompA   TRUE 0.807 13.000 0.286 NA   NA
 539222 539223 Mb0924 Mb0925     TRUE 0.986 0.000 0.667 NA   NA
 539224 539225 Mb0926c Mb0927c prrB prrA TRUE 0.967 11.000 0.333 1.000 Y NA
 539225 539226 Mb0927c Mb0928c prrA accD3 FALSE 0.029 131.000 0.000 1.000 N NA
 539227 539228 Mb0929 Mb0930 echA6   TRUE 0.921 6.000 0.314 NA   NA
 539228 539229 Mb0930 Mb0931     FALSE 0.234 123.000 0.171 NA   NA
 539229 539230 Mb0931 Mb0932   ctpE TRUE 0.923 -3.000 0.119 1.000 N NA
 539230 539231 Mb0932 Mb0933 ctpE   FALSE 0.002 557.000 0.000 NA   NA
 539231 539232 Mb0933 Mb0934     TRUE 0.869 6.000 0.182 NA   NA
 539232 539233 Mb0934 Mb0935     FALSE 0.121 98.000 0.000 NA   NA
 539233 539234 Mb0935 Mb0936     FALSE 0.303 65.000 0.071 NA   NA
 539235 539236 Mb0937c Mb0938c     TRUE 0.951 2.000 0.417 NA N NA
 539236 539237 Mb0938c Mb0939c   PPE14 FALSE 0.010 93.000 0.000 NA N NA
 539237 539238 Mb0939c Mb0940c PPE14 PE7 FALSE 0.366 15.000 0.000 NA   NA
 539239 539240 Mb0941 Mb0942 betP   FALSE 0.007 343.000 0.000 1.000   NA
 539240 539241 Mb0942 Mb0943     TRUE 0.954 -3.000 0.091 1.000   NA
 539242 539243 Mbt14 Mb0944c argT   FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 539244 539245 Mb0945 Mb0946     TRUE 0.977 0.000 0.000 NA Y NA
 539246 539247 Mb0947c Mb0948c   mntH TRUE 0.875 1.000 0.029 NA   NA
 539247 539248 Mb0948c Mb0949c mntH   FALSE 0.295 77.000 0.014 1.000   NA
 539248 539249 Mb0949c Mb0950c     TRUE 0.718 54.000 0.500 1.000   NA
 539250 539251 Mb0951 Mb0952 pstS3 pstC2 TRUE 0.979 13.000 0.200 0.004 Y NA
 539251 539252 Mb0952 Mb0953 pstC2 pstA1 TRUE 0.996 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 539253 539254 Mb0954c Mb0955c pknDb pknDa TRUE 0.911 11.000 0.000 0.004   NA
 539254 539255 Mb0955c Mb0956c pknDa pstS2 TRUE 0.843 22.000 0.667 1.000 N NA
 539256 539257 Mb0957 Mb0958 pstBa pstBb FALSE 0.314 -25.000 0.000 NA   NA
 539257 539258 Mb0958 Mb0959 pstBb pstS1 TRUE 0.941 21.000 0.000 0.004 Y NA
 539258 539259 Mb0959 Mb0960 pstS1 pstC1 TRUE 0.979 60.000 1.000 0.004 Y NA
 539259 539260 Mb0960 Mb0961 pstC1 pstA2 TRUE 0.998 2.000 0.636 0.004 Y NA
 539262 539263 Mb0963 Mb0964     TRUE 0.886 -3.000 0.043 1.000 N NA
 539264 539265 Mb0965c Mb0966c     FALSE 0.369 85.000 0.182 NA   NA
 539268 539269 Mb0969 Mb0970     TRUE 0.866 6.000 0.082 1.000   NA
 539270 539271 Mb0971c Mb0972c pgi   FALSE 0.002 615.000 0.000 NA   NA
 539271 539272 Mb0972c Mb0973c     FALSE 0.084 116.000 0.000 NA   NA
 539275 539276 Mb0976 Mb0977 sucC sucD TRUE 0.989 13.000 0.382 0.001 Y NA
 539278 539279 Mb0979 Mb0980     FALSE 0.506 40.000 0.218 NA   NA
 539279 539280 Mb0980 Mb0981   purN FALSE 0.167 116.000 0.044 NA   NA
 539280 539281 Mb0981 Mb0982 purN purH TRUE 0.992 -3.000 0.225 1.000 Y NA
 539281 539282 Mb0982 Mb0983 purH   FALSE 0.088 107.000 0.002 1.000 N NA
 539282 539283 Mb0983 Mb0984     TRUE 0.948 -7.000 0.645 1.000   NA
 539283 539284 Mb0984 Mb0985     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 539284 539285 Mb0985 Mb0986     FALSE 0.045 146.000 0.000 NA   NA
 539286 539287 Mb0987c Mb0988c lprP   FALSE 0.024 183.000 0.000 NA   NA
 539287 539288 Mb0988c Mb0989c     FALSE 0.120 99.000 0.000 NA   NA
 539288 539289 Mb0989c Mb0990c     FALSE 0.119 100.000 0.000 NA   NA
 539289 539290 Mb0990c Mb0991c     FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 539291 539292 Mb0992 Mb0993     FALSE 0.231 57.000 0.012 NA   NA
 539292 539293 Mb0993 Mb0994   ctpV TRUE 0.675 56.000 0.500 NA   NA
 539293 539294 Mb0994 Mb0995 ctpV   TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 539295 539296 Mb0996c Mb0997c echA7 fadE12 TRUE 0.990 0.000 0.203 1.000 Y NA
 539296 539297 Mb0997c Mb0998c fadE12 accA2 TRUE 0.998 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 539297 539298 Mb0998c Mb0999c accA2 accD2 TRUE 0.998 6.000 0.875 0.003 Y NA
 539298 539299 Mb0999c Mb1000c accD2 fadE13 TRUE 0.918 41.000 0.548 1.000 Y NA
 539299 539300 Mb1000c Mb1001c fadE13   TRUE 0.986 -3.000 0.562 NA   NA
 539302 539303 Mb1003c Mb1004c PE_PGRS17   FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 539306 539307 Mb1007 Mb1008 mprA mprB TRUE 0.999 0.000 0.655 0.008 Y NA
 539307 539308 Mb1008 Mb1009 mprB   TRUE 0.619 44.000 0.424 1.000 N NA
 539308 539309 Mb1009 Mb1010   moaB2 TRUE 0.972 0.000 0.423 1.000 N NA
 539311 539312 Mb1012 Mb1013     TRUE 0.774 -7.000 0.210 1.000 N NA
 539312 539313 Mb1013 Mb1014     TRUE 0.944 1.000 0.000 0.050 N NA
 539313 539314 Mb1014 Mb1015     TRUE 0.721 7.000 0.000 1.000   NA
 539315 539316 Mb1016c Mb1017c grcC2   FALSE 0.146 61.000 0.000 NA   NA
 539316 539317 Mb1017c Mb1018c     FALSE 0.229 73.000 0.022 NA   NA
 539317 539318 Mb1018c Mb1019c     FALSE 0.257 74.000 0.041 NA   NA
 539319 539320 Mb1020 Mb1021 galU moeA1 FALSE 0.337 77.000 0.196 1.000 N NA
 539320 539321 Mb1021 Mb1022 moeA1 rimJ FALSE 0.567 63.000 0.427 1.000 N NA
 539321 539322 Mb1022 Mb1023 rimJ   FALSE 0.122 161.000 0.183 NA   NA
 539322 539323 Mb1023 Mbt15   alaV FALSE 0.158 51.000 0.000 NA   NA
 539323 539324 Mbt15 Mb1024 alaV   FALSE 0.002 710.000 0.000 NA   NA
 539324 539325 Mb1024 Mb1025     FALSE 0.264 24.000 0.000 NA   NA
 539325 539326 Mb1025 Mb1026     FALSE 0.311 18.000 0.000 NA   NA
 539331 539332 Mb1031c Mb1032c   pabB FALSE 0.200 74.000 0.006 NA   NA
 539335 539336 Mb1035 Mb1036 tatD rpfB FALSE 0.026 208.000 0.008 NA   NA
 539336 539337 Mb1036 Mb1037 rpfB ksgA FALSE 0.519 -27.000 0.008 1.000   NA
 539337 539338 Mb1037 Mb1038 ksgA ispE FALSE 0.212 86.000 0.068 1.000 N NA
 539338 539339 Mb1038 Mb1040 ispE   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539339 539340 Mb1040 Mb1041   pks16 FALSE 0.017 204.000 0.000 NA   NA
 539341 539342 Mb1042c Mb1043c pth rplY TRUE 0.986 13.000 0.496 0.025 Y NA
 539342 539343 Mb1043c Mb1044c rplY lpqT FALSE 0.061 134.000 0.000 NA   NA
 539343 539344 Mb1044c Mb1045c lpqT prsA FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 539344 539345 Mb1045c Mb1046c prsA glmU FALSE 0.152 92.000 0.026 1.000 N NA
 539345 539346 Mb1046c Mbt16 glmU glnT FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 539347 539348 Mb1047 Mb1048   mfd TRUE 0.852 59.000 0.013 0.050 Y NA
 539348 539349 Mb1048 Mb1049 mfd   TRUE 0.926 0.000 0.026 1.000   NA
 539349 539350 Mb1049 Mb1050   lpqU FALSE 0.127 88.000 0.000 NA   NA
 539350 539351 Mb1050 Mb1051 lpqU eno FALSE 0.048 97.000 0.012 NA N NA
 539351 539352 Mb1051 Mb1052 eno   TRUE 0.751 5.000 0.043 1.000 N NA
 539352 539353 Mb1052 Mb1053     TRUE 0.727 17.000 0.252 NA   NA
 539353 539354 Mb1053 Mb1054     TRUE 0.813 -9.000 0.243 NA   NA
 539355 539356 Mb1055c Mb1056c kdpE kdpD TRUE 0.995 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 539357 539358 Mb1057 Mb1058 kdpF kdpA TRUE 0.991 0.000 0.152 0.001   NA
 539358 539359 Mb1058 Mb1059 kdpA kdpB TRUE 0.997 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 539359 539360 Mb1059 Mb1060 kdpB kdpC TRUE 0.996 0.000 0.015 0.001 Y NA
 539361 539362 Mb1061c Mb1062c trcS trcR TRUE 0.993 8.000 0.556 0.050 Y NA
 539362 539363 Mb1062c Mb1063c trcR   FALSE 0.002 182.000 0.000 NA N NA
 539363 539364 Mb1063c Mb1064c     FALSE 0.139 68.000 0.000 NA   NA
 539364 539365 Mb1064c Mb1065c     FALSE 0.200 34.000 0.000 NA   NA
 539365 539366 Mb1065c Mb1066c   esxI FALSE 0.093 111.000 0.000 NA   NA
 539366 539367 Mb1066c Mb1067c esxI esxJ FALSE 0.236 27.000 0.000 NA   NA
 539367 539368 Mb1067c Mb1068c esxJ PPE15 FALSE 0.045 146.000 0.000 NA   NA
 539368 539369 Mb1068c Mb1069c PPE15 PE8 TRUE 0.722 77.000 0.667 NA   NA
 539369 539370 Mb1069c Mb1070c PE8   FALSE 0.001 1196.000 0.000 NA   NA
 539370 539371 Mb1070c Mb1071c     FALSE 0.297 -31.000 0.000 NA   NA
 539371 539372 Mb1071c Mb1072c     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 539373 539374 Mb1073 Mb1074     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539378 539379 Mb1078 Mb1079     FALSE 0.257 48.000 0.000 1.000   NA
 539383 539384 Mb1083 Mb1084     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539384 539385 Mb1084 Mbt17   leuX FALSE 0.272 23.000 0.000 NA   NA
 539385 539386 Mbt17 Mb1085 leuX   FALSE 0.035 159.000 0.000 NA   NA
 539386 539387 Mb1085 Mb1086     FALSE 0.002 1004.000 0.000 NA   NA
 539387 539388 Mb1086 Mb1087   fadD14 FALSE 0.267 107.000 0.125 NA   NA
 539388 539389 Mb1087 Mb1088 fadD14   FALSE 0.555 76.000 0.286 1.000   NA
 539389 539390 Mb1088 Mb1089     FALSE 0.532 53.000 0.286 NA   NA
 539390 539391 Mb1089 Mb1090     TRUE 0.647 34.000 0.333 NA   NA
 539391 539392 Mb1090 Mb1091     TRUE 0.933 5.000 0.250 1.000   NA
 539393 539394 Mb1092c Mb1093c   lpqV FALSE 0.217 81.000 0.016 NA   NA
 539395 539396 Mb1094 Mb1095     TRUE 0.981 -3.000 0.429 NA   NA
 539397 539398 Mb1096c Mb1097c PE_PGRS19 PE_PGRS20 FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 539398 539399 Mb1097c Mb1098c PE_PGRS20   FALSE 0.004 362.000 0.000 NA   NA
 539399 539400 Mb1098c Mb1099c   echA8 TRUE 0.967 -3.000 0.259 NA   NA
 539400 539401 Mb1099c Mb1100c echA8 echA9 TRUE 0.977 12.000 0.128 0.007 Y NA
 539402 539403 Mb1101 Mb1102     FALSE 0.084 116.000 0.000 NA   NA
 539404 539405 Mb1103c Mb1104c fadA3   FALSE 0.073 53.000 0.000 1.000 N NA
 539406 539407 Mb1105 Mb1106 lipU cbs FALSE 0.167 57.000 0.017 1.000 N NA
 539407 539408 Mb1106 Mb1107 cbs pra FALSE 0.036 202.000 0.034 NA   NA
 539408 539409 Mb1107 Mb1108 pra metB FALSE 0.340 32.000 0.028 NA   NA
 539410 539411 Mb1109c Mb1110c greA   FALSE 0.110 186.000 0.250 NA   NA
 539412 539413 Mb1111 Mb1112 mca   TRUE 0.939 -3.000 0.099 NA   NA
 539413 539414 Mb1112 Mb1113     FALSE 0.532 -13.000 0.011 NA   NA
 539416 539417 Mb1115 Mb1116   PE_PGRS21 FALSE 0.026 177.000 0.000 NA   NA
 539417 539418 Mb1116 Mb1116A PE_PGRS21   FALSE 0.026 177.000 0.000 NA   NA
 539418 539419 Mb1116A Mb1117   PE9 FALSE 0.040 153.000 0.000 NA   NA
 539419 539420 Mb1117 Mb1118 PE9 PE10 FALSE 0.251 -121.000 0.000 NA   NA
 539420 539421 Mb1118 Mb1119 PE10 celA2a FALSE 0.006 386.000 0.000 1.000   NA
 539421 539422 Mb1119 Mb1120 celA2a celA2b TRUE 0.878 -22.000 0.000 0.001   NA
 539422 539423 Mb1120 Mb1121 celA2b PE_PGRS22 FALSE 0.003 415.000 0.000 NA   NA
 539425 539426 Mb1123 Mb1124 glyA1 desA2 FALSE 0.354 105.000 0.143 1.000   NA
 539426 539427 Mb1124 Mb1125 desA2 phoH2 FALSE 0.048 211.000 0.046 1.000   NA
 539427 539428 Mb1125 Mb1126 phoH2   FALSE 0.242 87.000 0.108 1.000 N NA
 539429 539430 Mb1127c Mb1128c   fum TRUE 0.902 -3.000 0.014 NA   NA
 539430 539431 Mb1128c Mb1129c fum   FALSE 0.338 31.000 0.071 1.000 N NA
 539433 539434 Mb1131c Mb1132c     FALSE 0.011 240.000 0.000 NA   NA
 539434 539435 Mb1132c Mb1133c     TRUE 0.972 0.000 0.286 1.000   NA
 539436 539437 Mb1134 Mb1135     FALSE 0.005 321.000 0.000 NA   NA
 539438 539439 Mb1136c Mb1137c   xseB FALSE 0.507 10.000 0.009 1.000 N NA
 539439 539440 Mb1137c Mb1138c xseB xseA TRUE 0.991 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 539440 539441 Mb1138c Mb1139c xseA   TRUE 0.910 -3.000 0.024 NA   NA
 539444 539445 Mb1142 Mb1143     FALSE 0.127 88.000 0.000 NA   NA
 539445 539446 Mb1143 Mb1144     TRUE 0.989 -3.000 0.689 NA   NA
 539446 539447 Mb1144 Mb1145     FALSE 0.018 203.000 0.000 NA   NA
 539447 539448 Mb1145 Mb1146     FALSE 0.081 118.000 0.000 NA   NA
 539451 539452 Mb1149c Mb1150c     FALSE 0.204 33.000 0.000 NA   NA
 539452 539453 Mb1150c Mb1151c     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.005   NA
 539454 539455 Mb1152 Mb1153 zwf1 gnd2 TRUE 0.868 22.000 0.062 1.000 Y NA
 539457 539458 Mb1155 Mb1156 ephC   TRUE 0.843 5.000 0.070 NA   NA
 539459 539460 Mb1157c Mb1158c   ppdK TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 539460 539461 Mb1158c Mb1159c ppdK   FALSE 0.015 213.000 0.000 NA   NA
 539461 539462 Mb1159c Mb1160c     FALSE 0.116 102.000 0.000 NA   NA
 539463 539464 Mb1161 Mb1162   gltA1 TRUE 0.969 -3.000 0.216 1.000   NA
 539464 539465 Mb1162 Mb1163 gltA1   FALSE 0.431 12.000 0.000 NA   NA
 539469 539470 Mb1167 Mb1168     FALSE 0.250 50.000 0.000 1.000   NA
 539471 539472 Mb1169c Mb1170c     FALSE 0.327 17.000 0.000 NA   NA
 539472 539473 Mb1170c Mb1171c     TRUE 0.964 -3.000 0.176 1.000   NA
 539475 539476 Mb1173c Mb1174c echA11 echA10 TRUE 0.647 143.000 0.000 0.007 Y NA
 539477 539478 Mb1175 Mb1176 mcr   TRUE 0.906 12.000 0.636 1.000 N NA
 539478 539479 Mb1176 Mb1177   mmpL13 FALSE 0.004 515.000 0.000 1.000   NA
 539479 539480 Mb1177 Mb1178 mmpL13   FALSE 0.200 133.000 0.080 1.000   NA
 539482 539483 Mb1180 Mb1181     FALSE 0.297 -31.000 0.000 NA   NA
 539486 539487 Mb1184c Mb1185c omt   TRUE 0.938 -3.000 0.091 NA   NA
 539488 539489 Mb1186 Mb1187     FALSE 0.005 434.000 0.000 1.000   NA
 539490 539491 Mb1188c Mb1189c     TRUE 0.860 8.000 0.222 NA   NA
 539494 539495 Mb1192 Mb1193 mutT2 narG FALSE 0.002 308.000 0.000 1.000 N NA
 539495 539496 Mb1193 Mb1194 narG narH TRUE 0.954 39.000 0.227 0.001 Y NA
 539496 539497 Mb1194 Mb1195 narH narJ TRUE 0.930 57.000 0.182 0.002 Y NA
 539497 539498 Mb1195 Mb1196 narJ narI TRUE 0.994 3.000 0.059 0.002 Y NA
 539498 539499 Mb1196 Mb1197 narI typA FALSE 0.245 22.000 0.002 1.000 N NA
 539499 539500 Mb1197 Mb1198 typA lpqW FALSE 0.144 98.000 0.025 1.000 N NA
 539501 539502 Mb1199c Mb1200c   PPE17b FALSE 0.139 75.000 0.000 NA   NA
 539502 539503 Mb1200c Mb1201c PPE17b PPE17a FALSE 0.281 -46.000 0.000 NA   NA
 539503 539504 Mb1201c Mb1202c PPE17a PE11 FALSE 0.311 18.000 0.000 NA   NA
 539505 539506 Mb1203 Mb1204 mshB   FALSE 0.548 92.000 0.387 NA   NA
 539509 539510 Mb1207c Mb1208c   fadH FALSE 0.018 201.000 0.000 NA   NA
 539510 539511 Mb1208c Mb1209c fadH   TRUE 0.871 -3.000 0.093 NA N NA
 539512 539513 Mb1210 Mb1211 fdxC   FALSE 0.249 33.000 0.029 1.000 N NA
 539515 539516 Mb1213 Mb1214 pks3 papA3 FALSE 0.496 53.000 0.250 NA   NA
 539516 539517 Mb1214 Mb1215 papA3 mmpL10 TRUE 0.807 67.000 1.000 NA   NA
 539518 539519 Mb1216c Mb1217c   fadD21 FALSE 0.031 165.000 0.000 NA   NA
 539519 539520 Mb1217c Mb1218c fadD21   FALSE 0.208 177.000 0.000 NA Y NA
 539521 539522 Mb1219 Mb1220 rocA   TRUE 0.928 0.000 0.181 1.000 N NA
 539522 539523 Mb1220 Mb1221   sigI FALSE 0.063 82.000 0.000 1.000 N NA
 539523 539524 Mb1221 Mb1222 sigI   FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 539524 539525 Mb1222 Mb1223     FALSE 0.139 73.000 0.000 NA   NA
 539525 539526 Mb1223 Mb1224     FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 539526 539527 Mb1224 Mb1225   fadD36 TRUE 0.636 40.000 0.000 0.041   NA
 539529 539530 Mb1227 Mb1228 PE13 PPE18 FALSE 0.167 47.000 0.000 NA   NA
 539530 539531 Mb1228 Mb1229 PPE18 esxK FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 539531 539532 Mb1229 Mb1230 esxK esxL FALSE 0.158 51.000 0.000 NA   NA
 539537 539538 Mb1235c Mb1236c     FALSE 0.324 31.000 0.000 1.000   NA
 539539 539540 Mb1237 Mb1238   fadD6 FALSE 0.572 50.000 0.324 NA   NA
 539540 539541 Mb1238 Mb1239 fadD6 folP2 FALSE 0.317 66.000 0.172 1.000 N NA
 539541 539542 Mb1239 Mb1240 folP2   TRUE 0.945 -3.000 0.136 NA   NA
 539542 539543 Mb1240 Mb1241     FALSE 0.335 39.000 0.045 NA   NA
 539543 539544 Mb1241 Mb1242   tagA TRUE 0.900 -3.000 0.013 NA   NA
 539544 539545 Mb1242 Mb1243 tagA   FALSE 0.175 107.000 0.021 NA   NA
 539548 539549 Mb1246c Mb1247c PE14   FALSE 0.061 134.000 0.000 NA   NA
 539549 539550 Mb1247c Mb1248c     FALSE 0.531 28.000 0.080 1.000   NA
 539550 539551 Mb1248c Mb1249c     TRUE 0.621 9.000 0.111 NA N NA
 539551 539552 Mb1249c Mb1250c     TRUE 0.918 -3.000 0.185 NA N NA
 539552 539553 Mb1250c Mb1251c     TRUE 0.580 -10.000 0.000 1.000   NA
 539553 539554 Mb1251c Mb1252c     FALSE 0.084 142.000 0.000 1.000   NA
 539555 539556 Mb1253 Mb1254 sigE   FALSE 0.152 158.000 0.224 NA   NA
 539556 539557 Mb1254 Mb1255   htrA TRUE 0.697 69.000 0.607 NA   NA
 539557 539558 Mb1255 Mb1256 htrA tatB TRUE 0.928 2.000 0.242 1.000 N NA
 539559 539560 Mb1257c Mb1258c     FALSE 0.194 111.000 0.054 NA   NA
 539560 539561 Mb1258c Mb1259c     TRUE 0.985 -3.000 0.542 NA   NA
 539563 539564 Mb1261c Mb1262c mrp   TRUE 0.579 13.000 0.089 1.000 N NA
 539564 539565 Mb1262c Mb1263c     FALSE 0.207 125.000 0.139 NA   NA
 539565 539566 Mb1263c Mb1264c     TRUE 0.991 -3.000 0.806 NA   NA
 539566 539567 Mb1264c Mb1265c     FALSE 0.144 62.000 0.000 NA   NA
 539568 539569 Mb1266 Mb1267   lpqY TRUE 0.644 21.000 0.211 NA   NA
 539569 539570 Mb1267 Mb1268 lpqY sugA TRUE 0.997 -3.000 0.252 0.023 Y NA
 539570 539571 Mb1268 Mb1269 sugA sugB TRUE 0.997 5.000 0.723 0.023 Y NA
 539571 539572 Mb1269 Mb1270 sugB sugC TRUE 0.991 5.000 0.191 0.023 Y NA
 539574 539575 Mb1272 Mb1273 mdh   FALSE 0.139 76.000 0.000 NA   NA
 539575 539576 Mb1273 Mb1274     TRUE 0.991 -3.000 0.800 NA   NA
 539579 539580 Mb1277c Mb1278c     FALSE 0.152 57.000 0.000 NA   NA
 539580 539581 Mb1278c Mb1279c     TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 539581 539582 Mb1279c Mb1280c   kgd FALSE 0.007 113.000 0.000 NA N NA
 539582 539583 Mb1280c Mb1281c kgd   FALSE 0.081 142.000 0.013 NA   NA
 539585 539586 Mb1283c Mb1284c   lprE FALSE 0.367 56.000 0.133 NA   NA
 539587 539588 Mb1285 Mb1286 deaD   TRUE 0.827 -3.000 0.006 1.000 N NA
 539589 539590 Mb1287c Mb1288c     TRUE 0.946 -3.000 0.143 NA   NA
 539591 539592 Mb1289 Mb1290     TRUE 0.580 2.000 0.016 NA N NA
 539592 539593 Mb1290 Mb1291     TRUE 0.860 -15.000 0.000 0.009   NA
 539594 539595 Mb1292c Mb1293c     TRUE 0.870 5.000 0.136 NA   NA
 539596 539597 Mb1294 Mb1295 amiB2   FALSE 0.065 75.000 0.000 1.000 N NA
 539597 539598 Mb1295 Mb1296     FALSE 0.029 173.000 0.000 NA   NA
 539599 539600 Mb1297c Mb1298c pknH embR FALSE 0.048 341.000 0.000 1.000 Y NA
 539600 539601 Mb1298c Mb1299c embR   FALSE 0.009 311.000 0.000 1.000   NA
 539601 539602 Mb1299c Mb1300c     FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 539602 539603 Mb1300c Mb1301c   lprA TRUE 0.734 61.000 0.667 NA   NA
 539603 539604 Mb1301c Mb1302c lprA   FALSE 0.015 213.000 0.000 NA   NA
 539604 539605 Mb1302c Mb1303c     FALSE 0.101 108.000 0.000 NA   NA
 539605 539606 Mb1303c Mb1304c     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.004 Y NA
 539607 539608 Mb1305 Mb1306 lprB lprC TRUE 0.989 -3.000 0.692 NA   NA
 539610 539611 Mb1308 Mb1309     TRUE 0.993 -3.000 0.312 NA Y NA
 539611 539612 Mb1309 Mb1310     FALSE 0.153 21.000 0.017 NA N NA
 539613 539614 Mb1311c Mb1312c oppA oppD TRUE 0.962 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 539614 539615 Mb1312c Mb1313c oppD oppC TRUE 0.994 -3.000 0.303 1.000 Y NA
 539615 539616 Mb1313c Mb1314c oppC oppB TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.022 Y NA
 539617 539618 Mb1315 Mb1316   cysD FALSE 0.255 94.000 0.136 1.000 N NA
 539618 539619 Mb1316 Mb1317 cysD cysN TRUE 0.994 0.000 0.483 0.001 N NA
 539619 539620 Mb1317 Mb1318 cysN   FALSE 0.170 54.000 0.073 NA N NA
 539620 539621 Mb1318 Mb1319     FALSE 0.150 58.000 0.000 NA   NA
 539621 539622 Mb1319 Mb1320     FALSE 0.162 49.000 0.000 NA   NA
 539625 539626 Mb1323c Mbt18   argV FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 539627 539628 Mb1324 Mb1325 argS lysA TRUE 0.908 -3.000 0.071 1.000 N NA
 539628 539629 Mb1325 Mb1326 lysA thrA TRUE 0.977 4.000 0.071 1.000 Y NA
 539629 539630 Mb1326 Mb1327 thrA thrC TRUE 0.992 -3.000 0.194 1.000 Y NA
 539630 539631 Mb1327 Mb1328 thrC thrB FALSE 0.256 218.000 0.221 1.000 Y NA
 539631 539632 Mb1328 Mb1329 thrB rho FALSE 0.038 257.000 0.000 0.084 N NA
 539632 539633 Mb1329 Mb1330 rho rpmE FALSE 0.088 151.000 0.115 1.000 N NA
 539633 539634 Mb1330 Mb1331 rpmE prfA TRUE 0.728 90.000 0.110 1.000 Y NA
 539634 539635 Mb1331 Mb1332 prfA hemK TRUE 0.989 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 539635 539636 Mb1332 Mb1333 hemK   TRUE 0.960 16.000 0.583 NA Y NA
 539636 539637 Mb1333 Mb1334   rfe FALSE 0.314 84.000 0.248 NA N NA
 539637 539638 Mb1334 Mb1335 rfe   FALSE 0.016 257.000 0.000 1.000   NA
 539638 539639 Mb1335 Mb1336   atpB TRUE 0.730 -7.000 0.021 1.000   NA
 539639 539640 Mb1336 Mb1337 atpB atpE TRUE 0.969 49.000 0.557 0.003 Y NA
 539640 539641 Mb1337 Mb1338 atpE atpF TRUE 0.930 31.000 0.012 0.003 Y NA
 539641 539642 Mb1338 Mb1339 atpF atpH TRUE 0.986 7.000 0.008 0.003 Y NA
 539642 539643 Mb1339 Mb1340 atpH atpA TRUE 0.981 45.000 0.864 0.003 Y NA
 539643 539644 Mb1340 Mb1341 atpA atpG TRUE 0.997 7.000 0.846 0.003 Y NA
 539644 539645 Mb1341 Mb1342 atpG atpD TRUE 0.979 40.000 0.724 0.003 Y NA
 539645 539646 Mb1342 Mb1343 atpD atpC TRUE 0.994 14.000 0.837 0.003 Y NA
 539646 539647 Mb1343 Mb1344 atpC   TRUE 0.754 8.000 0.054 NA   NA
 539648 539649 Mb1345c Mb1346c     TRUE 0.815 -25.000 0.000 0.009   NA
 539649 539650 Mb1346c Mb1347c     FALSE 0.053 166.000 0.000 1.000   NA
 539651 539652 Mb1348 Mbr01 murA rrs FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 539652 539653 Mbr01 Mbr02 rrs rrl FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 539653 539654 Mbr02 Mbr03 rrl rrf FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 539655 539656 Mb1349c Mb1350c ogt alkAb TRUE 0.990 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 539656 539657 Mb1350c Mb1351c alkAb alkAa TRUE 0.946 4.000 0.000 0.062   NA
 539657 539658 Mb1351c Mb1352c alkAa   FALSE 0.217 81.000 0.000 1.000   NA
 539658 539659 Mb1352c Mb1353c     TRUE 0.878 70.000 0.000 0.002 Y NA
 539659 539660 Mb1353c Mb1354c     TRUE 0.968 13.000 0.000 0.002 Y NA
 539661 539662 Mb1355 Mb1356     FALSE 0.552 23.000 0.141 NA   NA
 539664 539665 Mb1358 Mb1359 fadA4   FALSE 0.089 130.000 0.035 1.000 N NA
 539666 539667 Mb1360c Mb1361c PE_PGRS24 glgB FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 539667 539668 Mb1361c Mb1362c glgB glgE TRUE 0.988 8.000 0.159 0.004 Y NA
 539670 539671 Mb1364c Mb1365c dinG   FALSE 0.412 24.000 0.080 1.000 N NA
 539672 539673 Mb1366 Mb1367     TRUE 0.895 -40.000 0.823 NA   NA
 539673 539674 Mb1367 Mb1368     TRUE 0.582 17.000 0.093 NA   NA
 539674 539675 Mb1368 Mb1369     TRUE 0.742 8.000 0.044 NA   NA
 539675 539676 Mb1369 Mb1370     FALSE 0.528 22.000 0.093 NA   NA
 539676 539677 Mb1370 Mb1371   cysM TRUE 0.627 10.000 0.052 1.000 N NA
 539677 539678 Mb1371 Mb1372 cysM   TRUE 0.714 -9.000 0.032 1.000   NA
 539678 539679 Mb1372 Mb1373   murI TRUE 0.936 -3.000 0.024 1.000   NA
 539679 539680 Mb1373 Mb1374 murI   FALSE 0.508 27.000 0.054 1.000   NA
 539680 539681 Mb1374 Mb1375   rphA TRUE 0.616 17.000 0.053 1.000   NA
 539681 539682 Mb1375 Mb1376 rphA   FALSE 0.505 39.000 0.262 1.000 N NA
 539683 539684 Mb1377c Mb1378c   lprD TRUE 0.970 -3.000 0.286 NA   NA
 539685 539686 Mb1379 Mb1380   fadD33 TRUE 0.967 -7.000 0.286 1.000 Y NA
 539686 539687 Mb1380 Mb1381 fadD33 fadE14 TRUE 0.990 0.000 0.200 1.000 Y NA
 539689 539690 Mbt19 Mb1383 leuW   FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 539690 539691 Mb1383 Mb1384     TRUE 0.999 -3.000 0.686 0.004 Y NA
 539691 539692 Mb1384 Mb1385   fabG2 FALSE 0.031 129.000 0.000 1.000 N NA
 539692 539693 Mb1385 Mb1386 fabG2   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539693 539694 Mb1386 Mb1387     FALSE 0.018 203.000 0.000 NA   NA
 539695 539696 Mb1388c Mb1389c     FALSE 0.153 20.000 0.000 1.000 N NA
 539696 539697 Mb1389c Mb1390c   moeY FALSE 0.337 9.000 0.000 1.000 N NA
 539697 539698 Mb1390c Mb1391c moeY   TRUE 0.957 -3.000 0.200 NA   NA
 539698 539699 Mb1391c Mb1392c     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 539700 539701 Mb1393 Mb1394     TRUE 0.626 82.000 0.000 0.005   NA
 539701 539702 Mb1394 Mb1395     FALSE 0.000 423.000 0.000 NA N NA
 539703 539704 Mb1396c Mb1397c PPE19   FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 539704 539705 Mb1397c Mb1398c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539705 539706 Mb1398c Mb1399c     FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 539706 539707 Mb1399c Mb1400c     FALSE 0.401 139.000 0.000 1.000 Y NA
 539710 539711 Mb1403 Mb1404 lprF   FALSE 0.020 196.000 0.000 NA   NA
 539711 539712 Mb1404 Mb1405     FALSE 0.214 -478.000 0.000 NA   NA
 539712 539713 Mb1405 Mb1406     TRUE 0.871 -3.000 0.028 1.000 N NA
 539713 539714 Mb1406 Mb1407     TRUE 0.749 6.000 0.000 1.000   NA
 539714 539715 Mb1407 Mb1408     FALSE 0.222 -334.000 0.000 NA   NA
 539717 539718 Mb1410 Mb1411     TRUE 0.970 -3.000 0.282 NA   NA
 539719 539720 Mb1412c Mb1413c     FALSE 0.472 11.000 0.000 NA   NA
 539721 539722 Mb1414 Mb1415 pyrR pyrB TRUE 0.993 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 539722 539723 Mb1415 Mb1416 pyrB pyrC TRUE 0.996 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 539723 539724 Mb1416 Mb1417 pyrC   TRUE 0.927 -3.000 0.057 NA   NA
 539724 539725 Mb1417 Mb1418   carA TRUE 0.924 -3.000 0.050 NA   NA
 539725 539726 Mb1418 Mb1419 carA carB TRUE 0.998 0.000 0.345 0.001 Y NA
 539726 539727 Mb1419 Mb1420 carB pyrF TRUE 0.989 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 539727 539728 Mb1420 Mb1421 pyrF PE15 FALSE 0.020 195.000 0.000 NA   NA
 539728 539729 Mb1421 Mb1422 PE15 PPE20 TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 539729 539730 Mb1422 Mb1423 PPE20 mihF FALSE 0.006 306.000 0.000 NA   NA
 539730 539731 Mb1423 Mb1424 mihF gmk FALSE 0.173 135.000 0.054 1.000   NA
 539731 539732 Mb1424 Mb1425 gmk rpoZ TRUE 0.592 66.000 0.471 1.000 N NA
 539732 539733 Mb1425 Mb1426 rpoZ dfp TRUE 0.625 16.000 0.192 1.000 N NA
 539733 539734 Mb1426 Mb1427 dfp metK FALSE 0.559 128.000 0.059 1.000 Y NA
 539735 539736 Mb1428c Mb1429c   cyp132 TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.061 N NA
 539738 539739 Mb1431c Mb1432c PE_PGRS25   FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 539739 539740 Mb1432c Mb1433c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539740 539741 Mb1433c Mb1434c   lipH FALSE 0.212 83.000 0.000 1.000   NA
 539741 539742 Mb1434c Mb1435c lipH lipI TRUE 0.955 25.000 0.250 0.023 Y NA
 539743 539744 Mb1436 Mb1437   priA FALSE 0.264 81.000 0.050 NA   NA
 539748 539749 Mb1441 Mb1442 fmt fmu TRUE 0.994 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 539749 539750 Mb1442 Mb1443 fmu rpe FALSE 0.361 25.000 0.056 1.000 N NA
 539750 539751 Mb1443 Mb1444 rpe ribG TRUE 0.871 -3.000 0.028 1.000 N NA
 539752 539753 Mb1445c Mb1446c   lprG TRUE 0.951 6.000 0.500 NA   NA
 539754 539755 Mb1447 Mb1448 ribC   FALSE 0.015 214.000 0.000 NA   NA
 539755 539756 Mb1448 Mb1449     FALSE 0.440 -10.000 0.000 NA   NA
 539756 539757 Mb1449 Mb1450   ribA2 FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 539757 539758 Mb1450 Mb1451 ribA2 ribH TRUE 0.970 15.000 0.041 0.002 Y NA
 539758 539759 Mb1451 Mb1452 ribH   TRUE 0.901 -3.000 0.014 NA   NA
 539759 539760 Mb1452 Mb1453   lprH FALSE 0.533 25.000 0.143 NA   NA
 539760 539761 Mb1453 Mb1454 lprH   FALSE 0.025 180.000 0.000 NA   NA
 539761 539762 Mb1454 Mb1455   uvrC FALSE 0.142 64.000 0.000 NA   NA
 539762 539763 Mb1455 Mb1456 uvrC   TRUE 0.934 -3.000 0.073 NA   NA
 539763 539764 Mb1456 Mb1457     TRUE 0.967 -3.000 0.259 NA   NA
 539764 539765 Mb1457 Mb1458   whiA TRUE 0.982 -3.000 0.470 NA   NA
 539768 539769 Mb1461c Mb1462c lipO fadD12 TRUE 0.997 0.000 0.857 1.000 Y NA
 539769 539770 Mb1462c Mb1463c fadD12   TRUE 0.990 4.000 0.429 1.000 Y NA
 539771 539772 Mb1464 Mb1465   PE16 FALSE 0.011 240.000 0.000 NA   NA
 539772 539773 Mb1465 Mb1466 PE16   FALSE 0.093 111.000 0.000 NA   NA
 539773 539774 Mb1466 Mb1467     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 539774 539775 Mb1467 Mb1468     FALSE 0.031 164.000 0.000 NA   NA
 539775 539776 Mb1468 Mb1469     TRUE 0.596 7.000 0.000 NA   NA
 539778 539779 Mb1471 Mb1472 gap pgk TRUE 0.994 3.000 0.055 0.003 Y NA
 539779 539780 Mb1472 Mb1473 pgk tpi TRUE 0.989 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 539785 539786 Mb1478c Mb1479c     FALSE 0.002 614.000 0.000 NA   NA
 539786 539787 Mb1479c Mb1480c   devB FALSE 0.504 17.000 0.038 NA   NA
 539787 539788 Mb1480c Mb1481c devB opcA TRUE 0.990 -3.000 0.179 NA Y NA
 539788 539789 Mb1481c Mb1482c opcA zwf2 TRUE 0.739 53.000 0.104 NA Y NA
 539789 539790 Mb1482c Mb1483c zwf2 tal TRUE 0.989 -3.000 0.067 1.000 Y NA
 539790 539791 Mb1483c Mb1484c tal tkt TRUE 0.897 17.000 0.090 1.000 Y NA
 539791 539792 Mb1484c Mb1485c tkt PE_PGRS27 FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 539798 539799 Mb1491c Mb1492c     FALSE 0.488 112.000 0.022 0.047   NA
 539799 539800 Mb1492c Mb1493c     TRUE 0.965 -3.000 0.186 1.000   NA
 539800 539801 Mb1493c Mb1494c     FALSE 0.503 103.000 0.357 NA   NA
 539802 539803 Mb1495 Mb1496     TRUE 0.919 -3.000 0.100 1.000 N NA
 539803 539804 Mb1496 Mb1497     TRUE 0.992 -3.000 0.266 0.001 N NA
 539804 539805 Mb1497 Mb1498     TRUE 0.996 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 539805 539806 Mb1498 Mb1499   csd TRUE 0.870 2.000 0.093 1.000 N NA
 539806 539807 Mb1499 Mb1500 csd   TRUE 0.956 -3.000 0.249 1.000 N NA
 539807 539808 Mb1500 Mb1501     TRUE 0.611 -25.000 0.152 NA   NA
 539809 539810 Mb1502c Mb1503c fadE15 PE_PGRS29 FALSE 0.353 107.000 0.222 NA   NA
 539811 539812 Mb1504 Mb1505 ctpD trxA FALSE 0.190 44.000 0.018 1.000 N NA
 539812 539813 Mb1505 Mb1506 trxA trxB1 TRUE 0.977 16.000 0.222 0.003 Y NA
 539813 539814 Mb1506 Mb1507 trxB1 echA12 TRUE 0.832 22.000 0.636 1.000 N NA
 539814 539815 Mb1507 Mb1508 echA12   FALSE 0.483 36.000 0.090 1.000   NA
 539815 539816 Mb1508 Mb1509     FALSE 0.361 97.000 0.191 NA   NA
 539817 539818 Mb1510c Mb1511c   acn TRUE 0.797 11.000 0.256 1.000 N NA
 539819 539820 Mb1512 Mb1513     FALSE 0.013 226.000 0.000 NA   NA
 539820 539821 Mb1513 Mb1514     TRUE 0.827 11.000 0.250 NA   NA
 539821 539822 Mb1514 Mb1515   moxR1 FALSE 0.149 139.000 0.120 NA   NA
 539822 539823 Mb1515 Mb1516 moxR1   TRUE 0.992 -3.000 0.920 NA   NA
 539823 539824 Mb1516 Mb1517     TRUE 0.945 11.000 0.760 NA   NA
 539826 539827 Mb1519 Mb1520 fabG1 inhA TRUE 0.884 19.000 0.078 1.000 Y NA
 539827 539828 Mb1520 Mb1521 inhA hemZ TRUE 0.704 6.000 0.038 1.000 N NA
 539830 539831 Mb1523 Mb1524     TRUE 0.899 22.000 0.259 NA Y NA
 539831 539832 Mb1524 Mb1525     TRUE 0.706 10.000 0.049 NA   NA
 539832 539833 Mb1525 Mb1526     FALSE 0.200 34.000 0.000 NA   NA
 539833 539834 Mb1526 Mb1527     FALSE 0.042 150.000 0.000 NA   NA
 539836 539837 Mb1529 Mb1530 mutA mutB TRUE 0.996 1.000 0.115 0.001 Y NA
 539837 539838 Mb1530 Mb1531 mutB   FALSE 0.385 14.000 0.000 NA   NA
 539838 539839 Mb1531 Mb1532     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539839 539840 Mb1532 Mb1533     TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 539840 539841 Mb1533 Mb1534   lipL FALSE 0.157 53.000 0.011 1.000 N NA
 539842 539843 Mb1535c Mb1536c     FALSE 0.015 214.000 0.000 NA   NA
 539844 539845 Mb1537 Mb1538     FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 539845 539846 Mb1538 Mb1539     TRUE 0.584 12.000 0.167 NA N NA
 539846 539847 Mb1539 Mb1540     FALSE 0.015 213.000 0.000 NA   NA
 539847 539848 Mb1540 Mb1541     FALSE 0.348 -21.000 0.000 NA   NA
 539849 539850 Mb1542c Mb1543c     FALSE 0.143 137.000 0.027 1.000   NA
 539851 539852 Mb1544 Mb1545     FALSE 0.542 9.000 0.000 NA   NA
 539852 539853 Mb1545 Mb1546     FALSE 0.067 130.000 0.000 NA   NA
 539853 539854 Mb1546 Mb1547     FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 539854 539855 Mb1547 Mb1548   fadD25 FALSE 0.001 234.000 0.000 NA N NA
 539857 539858 Mb1550 Mb1551     FALSE 0.108 30.000 0.000 1.000 N NA
 539858 539859 Mb1551 Mb1552   wbbL2 FALSE 0.167 47.000 0.000 NA   NA
 539860 539861 Mb1553c Mb1554c   pks5 FALSE 0.138 23.000 0.000 1.000 N NA
 539861 539862 Mb1554c Mb1555c pks5 papA4 FALSE 0.002 544.000 0.000 NA   NA
 539863 539864 Mb1556 Mb1557 fadD24 adh FALSE 0.037 117.000 0.000 1.000 N NA
 539864 539865 Mb1557 Mb1558 adh   TRUE 0.972 -3.000 0.300 NA   NA
 539867 539868 Mb1560 Mb1561     TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 539868 539869 Mb1561 Mb1562     FALSE 0.002 565.000 0.000 NA   NA
 539869 539870 Mb1562 Mb1563   ileS FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 539870 539871 Mb1563 Mb1564 ileS dinX FALSE 0.021 197.000 0.014 1.000 N NA
 539873 539874 Mb1566 Mb1567 lspA   TRUE 0.653 -7.000 0.073 1.000 N NA
 539875 539876 Mb1568c Mb1569c lprI glbN FALSE 0.293 55.000 0.050 NA   NA
 539877 539878 Mb1570 Mb1571     TRUE 0.990 5.000 0.750 0.049   NA
 539878 539879 Mb1571 Mb1572     FALSE 0.280 22.000 0.000 NA   NA
 539879 539880 Mb1572 Mb1573     FALSE 0.162 49.000 0.000 NA   NA
 539880 539881 Mb1573 Mb1574   dnaE1 FALSE 0.194 68.000 0.003 NA   NA
 539883 539884 Mb1576 Mb1577 fadD11 plsB1 TRUE 0.954 14.000 0.333 1.000 Y NA
 539884 539885 Mb1577 Mb1578 plsB1 frdA FALSE 0.002 371.000 0.000 1.000 N NA
 539885 539886 Mb1578 Mb1579 frdA frdBC TRUE 0.997 3.000 0.470 0.003 Y NA
 539886 539887 Mb1579 Mb1580 frdBC frdD TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 539887 539888 Mb1580 Mb1581 frdD   FALSE 0.065 68.000 0.000 1.000 N NA
 539888 539889 Mb1581 Mb1582   mmpS6 FALSE 0.350 139.000 0.429 NA   NA
 539889 539890 Mb1582 Mb1583 mmpS6 mmpL6 TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 539890 539891 Mb1583 Mb1584 mmpL6   FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 539891 539892 Mb1584 Mb1585   ilvA FALSE 0.333 35.000 0.033 NA   NA
 539892 539893 Mb1585 Mb1586 ilvA   FALSE 0.016 38.000 0.000 NA N NA
 539893 539894 Mb1586 Mb1587     TRUE 0.629 6.000 0.000 NA   NA
 539895 539896 Mb1588c Mb1589c treZ treYb TRUE 0.963 -7.000 0.263 0.004   NA
 539896 539897 Mb1589c Mb1590c treYb treYa TRUE 0.965 5.000 0.011 0.004   NA
 539897 539898 Mb1590c Mb1591c treYa treX TRUE 0.975 4.000 0.061 0.004   NA
 539898 539899 Mb1591c Mb1592c treX   FALSE 0.301 39.000 0.073 1.000 N NA
 539899 539900 Mb1592c Mb1593c     FALSE 0.441 99.000 0.400 NA N NA
 539900 539901 Mb1593c Mb1594c     FALSE 0.011 240.000 0.000 NA   NA
 539902 539903 Mb1595 Mb1596 bioA bioF1 TRUE 0.997 -3.000 0.033 0.001 Y NA
 539903 539904 Mb1596 Mb1597 bioF1 bioD TRUE 0.998 -3.000 0.214 0.001 Y NA
 539904 539905 Mb1597 Mb1598 bioD   TRUE 0.930 0.000 0.036 1.000   NA
 539907 539908 Mb1599 Mb1600     FALSE 0.017 206.000 0.000 NA   NA
 539908 539909 Mb1600 Mb1601     FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 539910 539911 Mb1602c Mb1603c     FALSE 0.566 8.000 0.000 NA   NA
 539911 539912 Mb1603c Mb1604c     FALSE 0.028 174.000 0.000 NA   NA
 539912 539913 Mb1604c Mb1605c     FALSE 0.136 81.000 0.000 NA   NA
 539913 539914 Mb1605c Mb1606c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539914 539915 Mb1606c Mb1607c     FALSE 0.385 14.000 0.000 NA   NA
 539915 539916 Mb1607c Mb1608c     FALSE 0.020 196.000 0.000 NA   NA
 539916 539917 Mb1608c Mb1609c     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 539917 539918 Mb1609c Mb1610c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539918 539919 Mb1610c Mb1611c     FALSE 0.153 56.000 0.000 NA   NA
 539919 539920 Mb1611c Mb1612c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539920 539921 Mb1612c Mb1613c     FALSE 0.220 -343.000 0.000 NA   NA
 539921 539922 Mb1613c Mb1614c     TRUE 0.673 5.000 0.000 NA   NA
 539923 539924 Mb1615 Mb1616 bioB   TRUE 0.884 1.000 0.041 NA   NA
 539924 539925 Mb1616 Mb1617     TRUE 0.977 -3.000 0.361 NA   NA
 539926 539927 Mb1618c Mb1619c     FALSE 0.050 257.000 0.273 NA   NA
 539928 539929 Mb1620 Mb1621 nadA nadB TRUE 0.997 0.000 0.210 0.003 Y NA
 539929 539930 Mb1621 Mb1622 nadB nadC TRUE 0.997 0.000 0.223 0.003 Y NA
 539930 539931 Mb1622 Mb1623 nadC   FALSE 0.254 49.000 0.000 1.000   NA
 539933 539934 Mb1625 Mb1626 hisD hisC1 TRUE 0.997 -3.000 0.112 0.003 Y NA
 539934 539935 Mb1626 Mb1627 hisC1 hisB TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 539935 539936 Mb1627 Mb1628 hisB hisH TRUE 0.997 -3.000 0.046 0.003 Y NA
 539936 539937 Mb1628 Mb1629 hisH hisA TRUE 0.993 10.000 0.491 0.003 Y NA
 539937 539938 Mb1629 Mb1630 hisA impA TRUE 0.856 8.000 0.266 1.000 N NA
 539938 539939 Mb1630 Mb1631 impA hisF TRUE 0.790 2.000 0.021 1.000 N NA
 539939 539940 Mb1631 Mb1632 hisF hisI TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 539940 539941 Mb1632 Mb1633 hisI chaA FALSE 0.021 181.000 0.002 1.000 N NA
 539943 539944 Mb1635 Mb1636 trpE   TRUE 0.930 -10.000 0.690 NA   NA
 539944 539945 Mb1636 Mb1637   trpC FALSE 0.274 90.000 0.070 NA   NA
 539945 539946 Mb1637 Mb1638 trpC trpB TRUE 0.914 69.000 0.070 0.001 Y NA
 539946 539947 Mb1638 Mb1639 trpB trpA TRUE 0.997 0.000 0.153 0.001 Y NA
 539947 539948 Mb1639 Mb1640 trpA lgt TRUE 0.816 0.000 0.011 1.000 N NA
 539948 539949 Mb1640 Mb1641 lgt   FALSE 0.002 676.000 0.000 NA   NA
 539949 539950 Mb1641 Mb1642     TRUE 0.703 -10.000 0.111 NA   NA
 539950 539951 Mb1642 Mb1643   pykA FALSE 0.301 108.000 0.083 1.000   NA
 539951 539952 Mb1643 Mb1644 pykA tesB1 TRUE 0.895 8.000 0.361 1.000 N NA
 539952 539953 Mb1644 Mb1645 tesB1   FALSE 0.444 58.000 0.214 NA   NA
 539954 539955 Mb1646c Mb1647c cydC cydD TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 539955 539956 Mb1647c Mb1648c cydD cydB TRUE 0.745 87.000 0.151 1.000 Y NA
 539956 539957 Mb1648c Mb1649c cydB cydA TRUE 0.981 30.000 0.925 0.046 Y NA
 539957 539958 Mb1649c Mb1650c cydA   FALSE 0.232 111.000 0.104 NA   NA
 539958 539959 Mb1650c Mb1651c   cya FALSE 0.526 29.000 0.176 NA   NA
 539959 539960 Mb1651c Mbt20 cya leuV FALSE 0.046 145.000 0.000 NA   NA
 539962 539963 Mb1653c Mb1654c     TRUE 0.992 -3.000 0.850 NA   NA
 539964 539965 Mb1655 Mb1656 polA rpsA FALSE 0.029 163.000 0.005 1.000 N NA
 539965 539966 Mb1656 Mb1657 rpsA coaE FALSE 0.280 26.000 0.024 1.000 N NA
 539968 539969 Mb1659 Mb1660 uvrB   TRUE 0.927 -3.000 0.006 1.000   NA
 539974 539975 Mb1665c Mb1666c     FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 539975 539976 Mb1666c Mb1667c   lysX FALSE 0.297 59.000 0.057 NA   NA
 539977 539978 Mb1668 Mb1669 infC rpmI TRUE 0.919 50.000 0.652 1.000 Y NA
 539978 539979 Mb1669 Mb1670 rpmI rplT TRUE 0.973 62.000 0.928 0.015 Y NA
 539979 539980 Mb1670 Mb1671 rplT tsnR TRUE 0.920 33.000 0.057 0.012 Y NA
 539982 539983 Mb1673 Mb1674 PE17   FALSE 0.348 78.000 0.143 NA   NA
 539983 539984 Mb1674 Mb1675     TRUE 0.869 7.000 0.214 NA   NA
 539984 539985 Mb1675 Mb1676   pheS FALSE 0.028 196.000 0.002 NA   NA
 539985 539986 Mb1676 Mb1677 pheS pheT TRUE 0.999 0.000 0.574 0.001 Y NA
 539988 539989 Mb1680 Mb1681 argC argJ TRUE 0.998 -3.000 0.303 0.002 Y NA
 539989 539990 Mb1681 Mb1682 argJ argB TRUE 0.998 -3.000 0.239 0.002 Y NA
 539990 539991 Mb1682 Mb1683 argB argD TRUE 0.990 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 539991 539992 Mb1683 Mb1684 argD argF TRUE 0.990 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 539992 539993 Mb1684 Mb1685 argF argR TRUE 0.915 -3.000 0.088 1.000 N NA
 539993 539994 Mb1685 Mb1686 argR argG TRUE 0.656 9.000 0.054 1.000 N NA
 539994 539995 Mb1686 Mb1687 argG argH TRUE 0.818 80.000 0.278 1.000 Y NA
 539995 539996 Mb1687 Mb1688 argH pks10 FALSE 0.085 109.000 0.003 1.000 N NA
 539996 539997 Mb1688 Mb1689 pks10 pks7 TRUE 0.971 83.000 1.000 0.018 Y NA
 539997 539998 Mb1689 Mb1690 pks7 pks8 TRUE 0.990 20.000 1.000 0.009 Y NA
 539998 539999 Mb1690 Mb1691 pks8 pks17 TRUE 0.993 0.000 0.000 0.009 Y NA
 539999 540000 Mb1691 Mb1692 pks17 pks9 TRUE 0.985 6.000 0.000 0.005 Y NA
 540000 540001 Mb1692 Mb1693 pks9 pks11 TRUE 0.886 147.000 0.750 0.018 Y NA
 540002 540003 Mb1694c Mb1695c cyp139   TRUE 0.585 15.000 0.008 1.000   NA
 540004 540005 Mb1696 Mb1697     FALSE 0.204 33.000 0.000 NA   NA
 540005 540006 Mb1697 Mb1698     FALSE 0.566 8.000 0.000 NA   NA
 540007 540008 Mb1699c Mb1700c     FALSE 0.010 93.000 0.000 NA N NA
 540008 540009 Mb1700c Mb1701c     FALSE 0.021 28.000 0.000 NA N NA
 540009 540010 Mb1701c Mb1702c     FALSE 0.024 325.000 0.000 0.026 N NA
 540011 540012 Mb1703 Mb1704   dsbF TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.003   NA
 540012 540013 Mb1704 Mb1705 dsbF   FALSE 0.117 101.000 0.000 NA   NA
 540013 540014 Mb1705 Mb1706   fadE16 TRUE 0.902 0.000 0.037 NA   NA
 540014 540015 Mb1706 Mb1707 fadE16   TRUE 0.759 9.000 0.222 NA N NA
 540015 540016 Mb1707 Mb1708   moeX TRUE 0.922 -3.000 0.047 NA   NA
 540016 540017 Mb1708 Mb1709 moeX   FALSE 0.034 161.000 0.000 NA   NA
 540017 540018 Mb1709 Mb1710     FALSE 0.014 218.000 0.000 NA   NA
 540018 540019 Mb1710 Mb1710A     TRUE 0.627 -7.000 0.013 NA   NA
 540020 540021 Mb1711c Mb1712c     TRUE 0.972 2.000 0.400 1.000   NA
 540021 540022 Mb1712c Mb1713c     TRUE 0.861 72.000 0.089 0.080 Y NA
 540023 540024 Mb1714 Mb1715   tyrS TRUE 0.578 12.000 0.067 1.000 N NA
 540024 540025 Mb1715 Mb1716 tyrS lprJ FALSE 0.002 617.000 0.000 NA   NA
 540025 540026 Mb1716 Mb1717 lprJ   FALSE 0.185 39.000 0.000 NA   NA
 540026 540027 Mb1717 Mb1718     TRUE 0.987 -3.000 0.500 1.000   NA
 540027 540028 Mb1718 Mb1719     TRUE 0.953 -3.000 0.083 1.000   NA
 540028 540029 Mb1719 Mb1720   tlyA TRUE 0.772 8.000 0.014 1.000   NA
 540029 540030 Mb1720 Mb1721 tlyA ppnK TRUE 0.910 0.000 0.120 1.000 N NA
 540030 540031 Mb1721 Mb1722 ppnK recN FALSE 0.566 14.000 0.094 1.000 N NA
 540031 540032 Mb1722 Mb1723 recN   TRUE 0.577 96.000 0.049 0.080   NA
 540032 540033 Mb1723 Mb1724     TRUE 0.886 22.000 0.798 NA   NA
 540033 540034 Mb1724 Mb1725   pyrG FALSE 0.087 140.000 0.014 NA   NA
 540034 540035 Mb1725 Mb1726 pyrG   TRUE 0.770 -7.000 0.055 1.000   NA
 540035 540036 Mb1726 Mb1727     TRUE 0.949 -3.000 0.063 1.000   NA
 540037 540038 Mb1728c Mb1729c     FALSE 0.002 555.000 0.000 NA   NA
 540038 540039 Mb1729c Mb1730c   cycA FALSE 0.224 65.000 0.000 1.000   NA
 540039 540040 Mb1730c Mb1731c cycA PPE22 FALSE 0.015 41.000 0.000 NA N NA
 540040 540041 Mb1731c Mb1732c PPE22 PPE23 TRUE 0.684 40.000 0.000 NA Y NA
 540041 540042 Mb1732c Mb1733c PPE23   FALSE 0.002 604.000 0.000 NA   NA
 540043 540044 Mb1734 Mb1735     FALSE 0.162 18.000 0.000 1.000 N NA
 540044 540045 Mb1735 Mb1736     TRUE 0.931 -3.000 0.065 NA   NA
 540045 540046 Mb1736 Mb1737     TRUE 0.986 -3.000 0.570 NA   NA
 540046 540047 Mb1737 Mb1738     TRUE 0.935 -3.000 0.224 NA N NA
 540047 540048 Mb1738 Mb1739   cmk TRUE 0.885 -3.000 0.042 1.000 N NA
 540048 540049 Mb1739 Mb1740 cmk engA TRUE 0.986 -3.000 0.060 0.014   NA
 540049 540050 Mb1740 Mb1741 engA   FALSE 0.048 174.000 0.000 1.000   NA
 540050 540051 Mb1741 Mb1742   fadB3a TRUE 0.934 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 540051 540052 Mb1742 Mb1743 fadB3a fadB3b TRUE 0.719 58.000 0.000 0.001   NA
 540052 540053 Mb1743 Mb1744 fadB3b   TRUE 0.894 3.000 0.105 NA   NA
 540053 540054 Mb1744 Mb1745     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 540054 540055 Mb1745 Mb1746     FALSE 0.156 53.000 0.000 NA   NA
 540055 540056 Mb1746 Mb1748     FALSE 0.028 208.000 0.000 1.000   NA
 540056 540057 Mb1748 Mbt21   proT FALSE 0.021 193.000 0.000 NA   NA
 540058 540059 Mb1749c Mb1750c     TRUE 0.951 -3.000 0.167 NA   NA
 540060 540061 Mb1751 Mb1752     TRUE 0.924 -3.000 0.121 1.000 N NA
 540062 540063 Mb1753c Mb1754c     FALSE 0.440 -10.000 0.000 NA   NA
 540064 540065 Mb1755 Mb1756     FALSE 0.204 33.000 0.000 NA   NA
 540066 540067 Mb1757c Mb1758c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540067 540068 Mb1758c Mb1759c     FALSE 0.002 180.000 0.000 NA N NA
 540070 540071 Mb1761c Mb1762c     FALSE 0.142 64.000 0.000 NA   NA
 540071 540072 Mb1762c Mb1763c     FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 540072 540073 Mb1763c Mb1764c     FALSE 0.013 275.000 0.000 1.000   NA
 540073 540074 Mb1764c Mb1765c   narX FALSE 0.005 440.000 0.000 1.000   NA
 540074 540075 Mb1765c Mb1766c narX narK2 TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 540078 540079 Mb1769 Mb1770     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 540079 540080 Mb1770 Mb1771     FALSE 0.136 81.000 0.000 NA   NA
 540080 540081 Mb1771 Mb1772   pknE FALSE 0.124 94.000 0.000 NA   NA
 540082 540083 Mb1773c Mb1774c   idi FALSE 0.139 71.000 0.000 NA   NA
 540084 540085 Mb1775 Mb1776 pknF   FALSE 0.421 62.000 0.000 0.080 N NA
 540085 540086 Mb1776 Mb1777     FALSE 0.004 373.000 0.000 NA   NA
 540087 540088 Mb1778c Mb1779c   fadD1 FALSE 0.131 84.000 0.000 NA   NA
 540089 540090 Mb1780 Mb1781     FALSE 0.072 127.000 0.000 NA   NA
 540091 540092 Mb1782c Mb1783c PPE24   FALSE 0.017 204.000 0.000 NA   NA
 540092 540093 Mb1783c Mb1784c   plcD FALSE 0.023 184.000 0.000 NA   NA
 540093 540094 Mb1784c Mb1785c plcD   FALSE 0.469 129.000 0.000 1.000 Y NA
 540095 540096 Mb1786 Mb1787   mmpL14 FALSE 0.032 201.000 0.000 1.000   NA
 540096 540097 Mb1787 Mb1788 mmpL14 cut1 FALSE 0.009 321.000 0.000 1.000   NA
 540098 540099 Mb1789c Mb1790c wag22b wag22a TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540101 540102 Mb1792c Mb1793c     TRUE 0.991 0.000 1.000 NA   NA
 540102 540103 Mb1793c Mb1794c     FALSE 0.002 1018.000 0.000 NA   NA
 540103 540104 Mb1794c Mb1795c     FALSE 0.003 627.000 0.000 1.000   NA
 540105 540106 Mb1795A Mb1796     FALSE 0.139 68.000 0.000 NA   NA
 540106 540107 Mb1796 Mb1797   PE_PGRS31 FALSE 0.066 181.000 0.087 NA   NA
 540107 540108 Mb1797 Mb1798 PE_PGRS31   FALSE 0.071 156.000 0.025 NA   NA
 540108 540109 Mb1798 Mb1799     TRUE 0.698 8.000 0.016 NA   NA
 540109 540110 Mb1799 Mb1800     TRUE 0.934 -3.000 0.016 1.000   NA
 540110 540111 Mb1800 Mb1801     FALSE 0.022 189.000 0.000 NA   NA
 540113 540114 Mb1803 Mb1804     TRUE 0.924 0.000 0.080 NA   NA
 540117 540118 Mb1807c Mb1808c     FALSE 0.038 156.000 0.000 NA   NA
 540121 540122 Mb1811 Mb1812     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 540124 540125 Mb1814 Mb1815   PPE25 FALSE 0.001 270.000 0.000 NA N NA
 540125 540126 Mb1815 Mb1816 PPE25 PE18 FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 540126 540127 Mb1816 Mb1817 PE18 PPE26 TRUE 0.910 14.000 0.667 NA   NA
 540127 540128 Mb1817 Mb1818 PPE26 PPE27 FALSE 0.025 454.000 0.000 NA Y NA
 540128 540129 Mb1818 Mb1819 PPE27 PE19 FALSE 0.003 427.000 0.000 NA   NA
 540129 540130 Mb1819 Mb1820 PE19 esxM FALSE 0.047 144.000 0.000 NA   NA
 540130 540131 Mb1820 Mb1821 esxM esxN TRUE 0.752 51.000 0.667 NA   NA
 540131 540132 Mb1821 Mb1822 esxN   TRUE 0.582 88.000 0.429 NA   NA
 540132 540133 Mb1822 Mb1823     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 540133 540134 Mb1823 Mb1824     TRUE 0.927 -22.000 1.000 NA   NA
 540134 540135 Mb1824 Mb1825     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 540135 540136 Mb1825 Mb1826     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 540136 540137 Mb1826 Mb1827   lppT FALSE 0.002 627.000 0.000 NA   NA
 540137 540138 Mb1827 Mb1828 lppT PPE28 FALSE 0.114 103.000 0.000 NA   NA
 540138 540139 Mb1828 Mb1829 PPE28 PPE29 FALSE 0.020 581.000 0.000 NA Y NA
 540139 540140 Mb1829 Mb1830 PPE29 PPE30 FALSE 0.491 112.000 0.000 NA Y NA
 540141 540142 Mb1831c Mb1832c PE_PGRS32b PE_PGRS32a FALSE 0.200 34.000 0.000 NA   NA
 540142 540143 Mb1832c Mb1833c PE_PGRS32a   FALSE 0.025 181.000 0.000 NA   NA
 540143 540144 Mb1833c Mb1834c     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 540145 540146 Mb1835 Mb1836 PE20 PPE31 FALSE 0.236 27.000 0.000 NA   NA
 540146 540147 Mb1836 Mb1837 PPE31 PPE32 FALSE 0.044 324.000 0.000 NA Y NA
 540147 540148 Mb1837 Mb1838 PPE32 PPE33a FALSE 0.524 132.000 0.667 NA   NA
 540148 540149 Mb1838 Mb1839 PPE33a PPE33b TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540149 540150 Mb1839 Mb1840 PPE33b   FALSE 0.011 239.000 0.000 NA   NA
 540150 540151 Mb1840 Mb1841   mgtC FALSE 0.066 154.000 0.014 NA   NA
 540152 540153 Mb1842c Mb1843c     FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 540154 540155 Mb1844 Mb1845 erg3   FALSE 0.213 105.000 0.045 NA   NA
 540155 540156 Mb1845 Mb1846     FALSE 0.227 63.000 0.000 1.000   NA
 540156 540157 Mb1846 Mb1847     FALSE 0.002 481.000 0.000 NA   NA
 540157 540158 Mb1847 Mb1848     FALSE 0.139 74.000 0.000 NA   NA
 540159 540160 Mb1849c Mb1850c PE_PGRS33   FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 540161 540162 Mb1851 Mb1852 ilvG secA2 FALSE 0.532 15.000 0.082 1.000 N NA
 540162 540163 Mb1852 Mb1853 secA2 pgsA2 FALSE 0.027 197.000 0.038 1.000 N NA
 540163 540164 Mb1853 Mb1854 pgsA2   TRUE 0.752 -7.000 0.114 NA   NA
 540164 540165 Mb1854 Mb1855     TRUE 0.725 29.000 0.409 NA   NA
 540165 540166 Mb1855 Mb1856     TRUE 0.814 17.000 0.409 NA   NA
 540166 540167 Mb1856 Mb1857   gcvH TRUE 0.693 38.000 0.434 NA   NA
 540167 540168 Mb1857 Mb1858 gcvH cfp17 FALSE 0.031 240.000 0.242 NA N NA
 540168 540169 Mb1858 Mb1859 cfp17   TRUE 0.985 -3.000 0.707 NA N NA
 540169 540170 Mb1859 Mb1860     FALSE 0.217 119.000 0.133 NA   NA
 540170 540171 Mb1860 Mb1861     FALSE 0.014 292.000 0.043 NA   NA
 540171 540172 Mb1861 Mb1862     FALSE 0.265 53.000 0.028 NA   NA
 540172 540173 Mb1862 Mb1863   gcvB FALSE 0.221 49.000 0.002 NA   NA
 540176 540177 Mb1866c Mb1867c     FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 540177 540178 Mb1867c Mb1868c   glcB FALSE 0.192 120.000 0.089 NA   NA
 540178 540179 Mb1868c Mb1869c glcB   FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 540179 540180 Mb1869c Mb1870c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540180 540181 Mb1870c Mb1871c   PE_PGRS34 FALSE 0.149 59.000 0.000 NA   NA
 540181 540182 Mb1871c Mb1872c PE_PGRS34   FALSE 0.032 163.000 0.000 NA   NA
 540182 540183 Mb1872c Mb1873c     TRUE 0.996 0.000 0.815 0.038   NA
 540183 540184 Mb1873c Mb1874c   guaB1 FALSE 0.208 174.000 0.038 0.096   NA
 540184 540185 Mb1874c Mb1875c guaB1 gnd1 FALSE 0.243 -634.000 0.023 1.000 N NA
 540185 540186 Mb1875c Mb1876c gnd1   FALSE 0.147 90.000 0.023 1.000 N NA
 540186 540187 Mb1876c Mb1877c     TRUE 0.917 15.000 0.850 1.000 N NA
 540188 540189 Mb1878 Mb1879   ureA FALSE 0.341 49.000 0.222 NA N NA
 540189 540190 Mb1879 Mb1880 ureA ureB TRUE 0.997 -3.000 0.052 0.001 Y NA
 540190 540191 Mb1880 Mb1881 ureB ureC TRUE 0.999 0.000 0.486 0.001 Y NA
 540191 540192 Mb1881 Mb1882 ureC ureF TRUE 0.983 0.000 0.061 0.002 N NA
 540192 540193 Mb1882 Mb1883 ureF ureG TRUE 0.992 11.000 0.439 0.002 Y NA
 540193 540194 Mb1883 Mb1884 ureG ureD TRUE 0.956 8.000 0.032 0.002   NA
 540195 540196 Mb1885c Mb1886c ndh   TRUE 0.716 141.000 0.500 1.000 Y NA
 540196 540197 Mb1886c Mb1887c     TRUE 0.716 39.000 0.571 1.000 N NA
 540198 540199 Mb1888 Mb1889 modA modB TRUE 0.998 3.000 0.578 0.001 Y NA
 540199 540200 Mb1889 Mb1890 modB modC TRUE 0.955 7.000 0.018 1.000 Y NA
 540200 540201 Mb1890 Mb1891 modC apa FALSE 0.377 53.000 0.052 1.000   NA
 540201 540202 Mb1891 Mb1892 apa   FALSE 0.017 452.000 0.238 1.000   NA
 540202 540203 Mb1892 Mb1893   adhA FALSE 0.460 75.000 0.189 1.000   NA
 540204 540205 Mb1894c Mb1895c     FALSE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 540205 540206 Mb1895c Mb1896c     TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 540207 540208 Mb1897 Mb1898     FALSE 0.016 288.000 0.143 1.000 N NA
 540208 540209 Mb1898 Mb1899     FALSE 0.324 99.000 0.214 1.000 N NA
 540210 540211 Mb1900c Mb1901c     FALSE 0.222 67.000 0.000 1.000   NA
 540211 540212 Mb1901c Mb1902c     FALSE 0.141 65.000 0.000 NA   NA
 540212 540213 Mb1902c Mb1903c   lldD2 FALSE 0.272 23.000 0.000 NA   NA
 540214 540215 Mb1904 Mb1905     FALSE 0.139 73.000 0.000 NA   NA
 540215 540216 Mb1905 Mb1906     TRUE 0.782 11.000 0.188 NA   NA
 540216 540217 Mb1906 Mb1907   bfrA FALSE 0.004 516.000 0.000 1.000   NA
 540217 540218 Mb1907 Mb1908 bfrA   FALSE 0.395 85.000 0.135 1.000   NA
 540218 540219 Mb1908 Mb1909     TRUE 0.672 -685.000 0.000 0.045   NA
 540219 540220 Mb1909 Mb1910   glnA3 FALSE 0.242 55.000 0.000 1.000   NA
 540220 540221 Mb1910 Mb1911 glnA3   TRUE 0.966 3.000 0.364 1.000   NA
 540222 540223 Mb1912c Mb1913c cyp140 lppE FALSE 0.525 50.000 0.273 NA   NA
 540223 540224 Mb1913c Mb1914c lppE   FALSE 0.364 41.000 0.070 NA   NA
 540224 540225 Mb1914c Mb1915c     FALSE 0.463 28.000 0.093 NA   NA
 540225 540226 Mb1915c Mb1916c   rpfC TRUE 0.652 39.000 0.375 NA   NA
 540226 540227 Mb1916c Mb1917c rpfC   TRUE 0.670 12.000 0.018 1.000   NA
 540227 540228 Mb1917c Mb1918c   fbpB FALSE 0.447 18.000 0.018 NA   NA
 540230 540231 Mb1920c Mb1921c     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 540231 540232 Mb1921c Mb1922c     FALSE 0.173 44.000 0.000 NA   NA
 540232 540233 Mb1922c Mb1923c     FALSE 0.149 59.000 0.000 NA   NA
 540234 540235 Mb1924 Mb1925     TRUE 0.780 17.000 0.333 NA   NA
 540235 540236 Mb1925 Mb1926     TRUE 0.898 10.000 0.375 NA   NA
 540238 540239 Mb1928 Mb1929     TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.018   NA
 540240 540241 Mb1931c Mb1932c     FALSE 0.328 5.000 0.004 NA N NA
 540243 540244 Mb1934c Mb1935c lppD lipJ TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 540247 540248 Mb1938 Mb1939     FALSE 0.023 186.000 0.000 NA   NA
 540249 540250 Mb1940c Mb1941c aao   FALSE 0.486 30.000 0.143 NA   NA
 540250 540251 Mb1941c Mb1942c     FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 540251 540252 Mb1942c Mb1943c   katG TRUE 0.596 7.000 0.000 NA   NA
 540252 540253 Mb1943c Mb1944c katG furA TRUE 0.794 38.000 0.057 1.000 Y NA
 540253 540254 Mb1944c Mb1945c furA   FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 540254 540255 Mb1945c Mb1946c   lppC FALSE 0.133 83.000 0.000 NA   NA
 540255 540256 Mb1946c Mb1947c lppC fadB5 FALSE 0.119 100.000 0.000 NA   NA
 540260 540261 Mb1951c Mb1952c PPE34 PPE35b FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 540261 540262 Mb1952c Mb1953c PPE35b PPE35a FALSE 0.133 83.000 0.000 NA   NA
 540262 540263 Mb1953c Mb1954c PPE35a   FALSE 0.003 449.000 0.000 NA   NA
 540266 540267 Mb1957 Mb1958   lipD TRUE 0.988 -9.000 0.333 0.004 Y NA
 540272 540273 Mb1963c Mb1964c     FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 540273 540274 Mb1964c Mb1965c     FALSE 0.431 12.000 0.000 NA   NA
 540274 540275 Mb1965c Mb1966c     FALSE 0.311 18.000 0.000 NA   NA
 540277 540278 Mb1968c Mb1969c fadE18 fadE17 TRUE 0.998 2.000 0.800 0.011 Y NA
 540278 540279 Mb1969c Mb1970c fadE17 echA13 TRUE 0.969 15.000 0.600 1.000 Y NA
 540280 540281 Mb1971 Mb1972     TRUE 0.991 3.000 0.500 NA Y NA
 540281 540282 Mb1972 Mb1973   ephB TRUE 0.958 12.000 1.000 1.000   NA
 540282 540283 Mb1973 Mb1974 ephB   TRUE 0.980 -3.000 0.333 1.000   NA
 540283 540284 Mb1974 Mb1975   ribA1 FALSE 0.479 -223.000 0.036 1.000   NA
 540284 540285 Mb1975 Mb1976 ribA1   TRUE 0.879 -3.000 0.036 1.000 N NA
 540286 540287 Mb1977c Mb1978c     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 540287 540288 Mb1978c Mb1979c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540292 540293 Mb1983c Mb1984c     FALSE 0.472 11.000 0.000 NA   NA
 540293 540294 Mb1984c Mb1985c     FALSE 0.289 21.000 0.000 NA   NA
 540294 540295 Mb1985c Mb1986c     TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540296 540297 Mb1987 Mb1988     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540299 540300 Mb1990 Mb1991     FALSE 0.177 42.000 0.000 NA   NA
 540300 540301 Mb1991 Mb1992     TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 540302 540303 Mb1993c Mb1994c     FALSE 0.162 49.000 0.000 NA   NA
 540303 540304 Mb1994c Mb1995c     TRUE 0.978 -3.000 0.385 NA   NA
 540306 540307 Mb1997c Mb1998c     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 540308 540309 Mb1999 Mb2000 yrbE3A   FALSE 0.130 85.000 0.000 NA   NA
 540310 540311 Mb2001c Mb2002c   mpt64 FALSE 0.026 179.000 0.000 NA   NA
 540311 540312 Mb2002c Mb2003c mpt64 nrdF1 FALSE 0.021 191.000 0.000 NA   NA
 540312 540313 Mb2003c Mb2004c nrdF1   FALSE 0.013 225.000 0.000 NA   NA
 540315 540316 Mb2006c Mb2007c cfp21   FALSE 0.005 430.000 0.000 1.000   NA
 540317 540318 Mb2008 Mb2009     FALSE 0.005 416.000 0.000 1.000   NA
 540318 540319 Mb2009 Mb2010     FALSE 0.022 226.000 0.000 1.000   NA
 540320 540321 Mb2011c Mb2012c     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 540321 540322 Mb2012c Mb2013c     FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 540322 540323 Mb2013c Mb2014c     FALSE 0.127 89.000 0.000 NA   NA
 540323 540324 Mb2014c Mb2015c   ctpG FALSE 0.002 342.000 0.000 1.000 N NA
 540324 540325 Mb2015c Mb2016c ctpG   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540325 540326 Mb2016c Mb2017c     FALSE 0.156 53.000 0.000 NA   NA
 540327 540328 Mb2018 Mb2019     FALSE 0.123 96.000 0.000 NA   NA
 540328 540329 Mb2019 Mb2020   ctpF FALSE 0.008 202.000 0.000 1.000 N NA
 540330 540331 Mb2021c Mb2022c     FALSE 0.057 95.000 0.000 1.000 N NA
 540332 540333 Mb2023 Mb2024     TRUE 0.766 10.000 0.118 NA   NA
 540333 540334 Mb2024 Mb2025   fabG3 TRUE 0.657 76.000 0.000 1.000 Y NA
 540335 540336 Mb2026c Mb2027c     FALSE 0.237 58.000 0.000 1.000   NA
 540336 540337 Mb2027c Mb2028c     FALSE 0.406 22.000 0.000 1.000   NA
 540339 540340 Mb2030c Mb2031c fdxA   FALSE 0.038 189.000 0.000 1.000   NA
 540341 540342 Mb2032 Mb2033     TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540344 540345 Mb2035 Mb2036     FALSE 0.002 704.000 0.000 NA   NA
 540345 540346 Mb2036 Mb2037     TRUE 0.795 -46.000 0.000 0.008   NA
 540348 540349 Mb2039 Mb2040     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540349 540350 Mb2040 Mb2041     FALSE 0.010 242.000 0.000 NA   NA
 540350 540351 Mb2041 Mb2042     TRUE 0.833 -10.000 0.294 NA   NA
 540352 540353 Mb2043c Mb2044c     FALSE 0.130 85.000 0.000 NA   NA
 540353 540354 Mb2044c Mb2045c     TRUE 0.907 9.000 0.375 NA   NA
 540354 540355 Mb2045c Mb2046c     FALSE 0.255 25.000 0.000 NA   NA
 540355 540356 Mb2046c Mb2047c     FALSE 0.035 160.000 0.000 NA   NA
 540356 540357 Mb2047c Mb2048c     FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 540357 540358 Mb2048c Mb2049c     FALSE 0.023 184.000 0.000 NA   NA
 540358 540359 Mb2049c Mb2050c     FALSE 0.004 508.000 0.000 1.000   NA
 540359 540360 Mb2050c Mb2051c     FALSE 0.039 115.000 0.000 1.000 N NA
 540360 540361 Mb2051c Mb2052c     TRUE 0.726 40.000 0.000 1.000 Y NA
 540361 540362 Mb2052c Mb2053c     TRUE 0.670 61.000 0.000 1.000 Y NA
 540362 540363 Mb2053c Mb2054c   pfkB FALSE 0.272 -3.000 0.000 NA N NA
 540363 540364 Mb2054c Mb2055c pfkB   FALSE 0.525 17.000 0.050 NA   NA
 540364 540365 Mb2055c Mb2056c     TRUE 0.871 -15.000 0.000 0.006   NA
 540365 540366 Mb2056c Mb2057c   hspX TRUE 0.832 12.000 0.300 NA   NA
 540369 540370 Mb2060 Mb2061     TRUE 0.957 -3.000 0.200 NA   NA
 540370 540371 Mb2061 Mb2062     TRUE 0.948 -3.000 0.150 NA   NA
 540372 540373 Mb2063c Mb2064c     TRUE 0.975 2.000 0.444 1.000   NA
 540373 540374 Mb2064c Mb2065c     TRUE 0.994 3.000 0.211 0.020 Y NA
 540374 540375 Mb2065c Mb2066c     TRUE 0.975 -13.000 0.211 0.020 Y NA
 540375 540376 Mb2066c Mb2067c     TRUE 0.997 -3.000 0.235 0.020 Y NA
 540376 540377 Mb2067c Mb2068c     TRUE 0.758 38.000 0.118 0.027   NA
 540377 540378 Mb2068c Mb2069c   pncA TRUE 0.913 0.000 0.005 1.000   NA
 540378 540379 Mb2069c Mb2070c pncA   FALSE 0.180 41.000 0.000 NA   NA
 540379 540380 Mb2070c Mb2071c   lipT FALSE 0.129 86.000 0.000 NA   NA
 540382 540383 Mb2073c Mb2074c   pks12 TRUE 0.978 5.000 1.000 1.000 N NA
 540383 540384 Mb2074c Mb2075c pks12   FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 540386 540387 Mb2077c Mb2078c ppm1   FALSE 0.376 158.000 0.041 0.003   NA
 540387 540388 Mb2078c Mb2079c     TRUE 0.861 5.000 0.037 1.000   NA
 540390 540391 Mb2081c Mb2082c rpsR2 rpsN2 TRUE 0.993 1.000 0.024 0.015 Y NA
 540391 540392 Mb2082c Mb2083c rpsN2 rpmG1 TRUE 0.993 2.000 0.052 0.015 Y NA
 540392 540393 Mb2083c Mb2084c rpmG1 rpmB2 TRUE 0.997 0.000 0.332 0.015 Y NA
 540394 540395 Mb2085 Mb2086     FALSE 0.327 -430.000 0.000 1.000   NA
 540396 540397 Mb2087c Mb2088c   cobN FALSE 0.323 84.000 0.045 1.000   NA
 540398 540399 Mb2089 Mb2090   cobG FALSE 0.006 387.000 0.000 1.000   NA
 540399 540400 Mb2090 Mb2091 cobG cobH TRUE 0.823 10.000 0.255 1.000 N NA
 540400 540401 Mb2091 Mb2092 cobH cobI TRUE 0.996 -3.000 0.096 0.008 Y NA
 540402 540403 Mb2093c Mb2094c   blaC FALSE 0.482 16.000 0.000 1.000   NA
 540405 540406 Mb2096c Mb2097c cobK cobM TRUE 0.921 37.000 0.076 0.008 Y NA
 540406 540407 Mb2097c Mb2098c cobM cobLb TRUE 0.996 -3.000 0.065 0.008 Y NA
 540407 540408 Mb2098c Mb2099c cobLb cobLa TRUE 0.843 -58.000 0.000 0.001   NA
 540408 540409 Mb2099c Mb2100c cobLa   FALSE 0.220 75.000 0.000 1.000   NA
 540409 540410 Mb2100c Mb2101c     FALSE 0.036 158.000 0.000 NA   NA
 540410 540411 Mb2101c Mb2102c     FALSE 0.197 35.000 0.000 NA   NA
 540411 540412 Mb2102c Mb2103c     TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540413 540414 Mb2104 Mb2105     TRUE 0.872 -18.000 0.500 NA   NA
 540414 540415 Mb2105 Mb2106   lppJ FALSE 0.360 -19.000 0.000 NA   NA
 540417 540418 Mb2108 Mb2109     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540418 540419 Mb2109 Mb2110     FALSE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 540419 540420 Mb2110 Mb2111     FALSE 0.245 -180.000 0.000 NA   NA
 540420 540421 Mb2111 Mb2112     FALSE 0.133 83.000 0.000 NA   NA
 540421 540422 Mb2112 Mb2113     FALSE 0.348 -21.000 0.000 NA   NA
 540422 540423 Mb2113 Mb2114     FALSE 0.138 78.000 0.000 NA   NA
 540423 540424 Mb2114 Mb2115   pknJ FALSE 0.022 187.000 0.000 NA   NA
 540427 540428 Mb2118c Mb2119c   helY FALSE 0.391 42.000 0.105 NA   NA
 540428 540429 Mb2119c Mb2120c helY tatC FALSE 0.261 49.000 0.166 NA N NA
 540429 540430 Mb2120c Mb2121c tatC tatA TRUE 0.860 17.000 0.031 NA Y NA
 540430 540431 Mb2121c Mb2122c tatA   FALSE 0.181 68.000 0.110 NA N NA
 540431 540432 Mb2122c Mb2123c     TRUE 0.997 -3.000 0.767 NA Y NA
 540432 540433 Mb2123c Mb2124c     TRUE 0.827 9.000 0.188 NA   NA
 540433 540434 Mb2124c Mb2125c   PE_PGRS36 FALSE 0.157 52.000 0.000 NA   NA
 540435 540436 Mb2126 Mb2127   helZ FALSE 0.032 199.000 0.000 1.000   NA
 540436 540437 Mb2127 Mb2128 helZ   FALSE 0.391 110.000 0.222 1.000   NA
 540438 540439 Mb2129c Mb2130c     TRUE 0.960 7.000 0.667 NA   NA
 540440 540441 Mb2131 Mb2132 PE22 PPE36 TRUE 0.822 56.000 1.000 NA   NA
 540442 540443 Mb2133c Mb2134c prcA prcB TRUE 0.999 -3.000 0.797 0.001 Y NA
 540443 540444 Mb2134c Mb2135c prcB   TRUE 0.985 -3.000 0.512 NA   NA
 540444 540445 Mb2135c Mb2136c     TRUE 0.628 113.000 0.706 NA   NA
 540446 540447 Mb2137 Mb2138     TRUE 0.790 11.000 0.200 NA   NA
 540449 540450 Mb2140 Mb2141 lppK   TRUE 0.722 8.000 0.030 NA   NA
 540453 540454 Mb2144c Mb2145c   hisG FALSE 0.278 79.000 0.006 1.000   NA
 540454 540455 Mb2145c Mb2146c hisG hisE TRUE 0.994 3.000 0.081 0.003 Y NA
 540460 540461 Mb2151 Mb2152 ansP1   TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 540462 540463 Mb2153c Mb2154c   cysS2 FALSE 0.563 26.000 0.096 1.000   NA
 540463 540464 Mb2154c Mb2155c cysS2 cysQ FALSE 0.259 58.000 0.082 1.000 N NA
 540466 540467 Mb2157c Mb2158c     TRUE 0.948 11.000 0.810 NA   NA
 540467 540468 Mb2158c Mb2159c     TRUE 0.703 64.000 0.608 NA   NA
 540468 540469 Mb2159c Mb2160c     TRUE 0.852 -3.000 0.071 NA N NA
 540469 540470 Mb2160c Mb2161c     FALSE 0.242 64.000 0.026 NA   NA
 540471 540472 Mb2162 Mb2163 lppL pyrD FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 540473 540474 Mb2164c Mb2165c TB18.6   FALSE 0.487 48.000 0.224 NA   NA
 540478 540479 Mb2168c Mb2169c   wag31 FALSE 0.325 95.000 0.149 NA   NA
 540479 540480 Mb2169c Mb2170c wag31   FALSE 0.025 268.000 0.114 NA   NA
 540480 540481 Mb2170c Mb2171c     FALSE 0.110 162.000 0.165 NA   NA
 540481 540482 Mb2171c Mb2172c     TRUE 0.986 -3.000 0.581 NA   NA
 540482 540483 Mb2172c Mb2173c   yfiH TRUE 0.808 6.000 0.061 NA   NA
 540483 540484 Mb2173c Mb2174c yfiH ftsZ TRUE 0.712 11.000 0.082 NA   NA
 540484 540485 Mb2174c Mb2175c ftsZ ftsQ FALSE 0.050 173.000 0.067 1.000 N NA
 540485 540486 Mb2175c Mb2176c ftsQ murC TRUE 0.990 -3.000 0.134 1.000 Y NA
 540486 540487 Mb2176c Mb2177c murC murG TRUE 0.993 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 540487 540488 Mb2177c Mb2178c murG ftsW TRUE 0.936 -3.000 0.167 1.000 N NA
 540488 540489 Mb2178c Mb2179c ftsW murD TRUE 0.901 12.000 0.081 0.004 N NA
 540489 540490 Mb2179c Mb2180c murD murX TRUE 0.998 2.000 0.647 0.004 Y NA
 540490 540491 Mb2180c Mb2181c murX murF TRUE 0.997 -3.000 0.071 0.004 Y NA
 540491 540492 Mb2181c Mb2182c murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.367 0.001 Y NA
 540492 540493 Mb2182c Mb2183c murE   FALSE 0.272 23.000 0.000 NA   NA
 540493 540494 Mb2183c Mb2184c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540494 540495 Mb2184c Mb2185c     FALSE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 540495 540496 Mb2185c Mb2186c   PE_PGRS38 FALSE 0.114 103.000 0.000 NA   NA
 540496 540497 Mb2186c Mb2187c PE_PGRS38 pbpB FALSE 0.016 210.000 0.000 NA   NA
 540497 540498 Mb2187c Mb2188c pbpB   TRUE 0.947 -3.000 0.144 NA   NA
 540498 540499 Mb2188c Mb2189c   mraW TRUE 0.912 -3.000 0.028 NA   NA
 540499 540500 Mb2189c Mb2190c mraW   FALSE 0.356 158.000 0.635 NA   NA
 540500 540501 Mb2190c Mb2191c     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 540502 540503 Mb2192 Mb2193   lppM FALSE 0.428 96.000 0.250 NA   NA
 540505 540506 Mb2195 Mb2196 idsA2   TRUE 0.940 4.000 0.298 NA   NA
 540509 540510 Mb2199c Mb2200c   aroG FALSE 0.006 385.000 0.000 1.000   NA
 540510 540511 Mb2200c Mb2201c aroG   FALSE 0.543 91.000 0.301 1.000   NA
 540511 540512 Mb2201c Mb2202c     TRUE 0.773 10.000 0.132 NA   NA
 540514 540515 Mb2204c Mb2205c     TRUE 0.577 86.000 0.417 NA   NA
 540515 540516 Mb2205c Mb2206c     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 540516 540517 Mb2206c Mb2207c   TB16.3 FALSE 0.250 120.000 0.184 NA   NA
 540517 540518 Mb2207c Mb2208c TB16.3   FALSE 0.305 105.000 0.164 NA   NA
 540519 540520 Mb2209 Mb2210   fadD15 TRUE 0.811 -237.000 0.000 0.001   NA
 540521 540522 Mb2211c Mb2212c     FALSE 0.436 97.000 0.258 NA   NA
 540522 540523 Mb2212c Mb2213c     TRUE 0.599 95.000 0.471 NA   NA
 540526 540527 Mb2216 Mb2217 ctaE qcrC TRUE 0.898 41.000 0.088 0.055 Y NA
 540527 540528 Mb2217 Mb2218 qcrC qcrA TRUE 0.998 -3.000 0.421 0.055 Y NA
 540528 540529 Mb2218 Mb2219 qcrA qcrB TRUE 0.999 -3.000 0.660 0.043 Y NA
 540530 540531 Mb2220c Mb2221c   mmpS3 TRUE 0.990 0.000 0.900 NA   NA
 540531 540532 Mb2221c Mb2222c mmpS3   FALSE 0.062 186.000 0.092 NA   NA
 540532 540533 Mb2222c Mb2223c   ctaC TRUE 0.909 8.000 0.342 NA   NA
 540537 540538 Mb2227c Mb2228c     FALSE 0.191 100.000 0.016 NA   NA
 540539 540540 Mb2229 Mb2230   cobT FALSE 0.317 79.000 0.095 NA   NA
 540540 540541 Mb2230 Mb2231 cobT cobS TRUE 0.996 -3.000 0.039 0.008 Y NA
 540541 540542 Mb2231 Mb2232 cobS   FALSE 0.052 158.000 0.003 NA   NA
 540543 540544 Mb2233c Mb2234c ilvE gcvT TRUE 0.706 72.000 0.025 1.000 Y NA
 540545 540546 Mb2235 Mb2236   pepB FALSE 0.521 12.000 0.041 1.000 N NA
 540548 540549 Mb2238 Mb2239 sucB   TRUE 0.976 0.000 0.333 1.000   NA
 540549 540550 Mb2239 Mb2240   lipB TRUE 0.649 53.000 0.019 0.036   NA
 540550 540551 Mb2240 Mb2241 lipB lipA TRUE 0.998 -3.000 0.319 0.001 Y NA
 540551 540552 Mb2241 Mb2242 lipA   FALSE 0.431 27.000 0.059 NA   NA
 540555 540556 Mb2245c Mb2246c glnE glnA2 FALSE 0.226 49.000 0.046 1.000 N NA
 540556 540557 Mb2246c Mb2247c glnA2   FALSE 0.234 95.000 0.042 NA   NA
 540557 540558 Mb2247c Mb2248c     TRUE 0.717 62.000 0.636 NA   NA
 540559 540560 Mb2249 Mb2250 panB   FALSE 0.017 245.000 0.000 1.000   NA
 540562 540563 Mb2251 Mb2252     FALSE 0.566 8.000 0.000 NA   NA
 540564 540565 Mb2253c Mb2254c     TRUE 0.980 -3.000 0.422 NA   NA
 540565 540566 Mb2254c Mb2255c     TRUE 0.982 -3.000 0.468 NA   NA
 540566 540567 Mb2255c Mb2256c   cobC TRUE 0.943 -3.000 0.121 NA   NA
 540568 540569 Mb2257 Mb2258   ptpA TRUE 0.743 -7.000 0.029 1.000   NA
 540569 540570 Mb2258 Mb2259 ptpA   TRUE 0.883 0.000 0.013 NA   NA
 540573 540574 Mbt23 Mb2262c valV ahpE FALSE 0.169 46.000 0.000 NA   NA
 540574 540575 Mb2262c Mb2263c ahpE   TRUE 0.983 0.000 0.575 NA   NA
 540575 540576 Mb2263c Mb2264c     FALSE 0.413 38.000 0.113 NA   NA
 540577 540578 Mb2265 Mb2266 aceE   FALSE 0.247 60.000 0.169 NA N NA
 540578 540579 Mb2266 Mb2267   fabD FALSE 0.068 239.000 0.441 NA N NA
 540579 540580 Mb2267 Mb2268 fabD acpM TRUE 0.755 76.000 0.127 1.000 Y NA
 540580 540581 Mb2268 Mb2269 acpM kasA TRUE 0.990 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 540581 540582 Mb2269 Mb2270 kasA kasB TRUE 0.962 31.000 0.400 0.016 Y NA
 540582 540583 Mb2270 Mb2271 kasB accD6 TRUE 0.869 31.000 0.222 1.000 Y NA
 540583 540584 Mb2271 Mb2272 accD6   FALSE 0.316 108.000 0.111 1.000   NA
 540585 540586 Mb2273c Mb2274c glpD1   TRUE 0.948 -6.000 0.727 1.000 N NA
 540587 540588 Mb2275 Mb2276     TRUE 0.947 -3.000 0.204 1.000 N NA
 540588 540589 Mb2276 Mb2277     FALSE 0.263 66.000 0.043 NA   NA
 540590 540591 Mb2278c Mb2279c     TRUE 0.673 5.000 0.000 NA   NA
 540591 540592 Mb2279c Mb2280c     FALSE 0.030 167.000 0.000 NA   NA
 540592 540593 Mb2280c Mb2281c     FALSE 0.233 130.000 0.200 NA   NA
 540593 540594 Mb2281c Mb2282c     TRUE 0.626 14.000 0.163 1.000 N NA
 540595 540596 Mb2283 Mb2284 adhE2   TRUE 0.985 0.000 0.538 1.000   NA
 540600 540601 Mb2288 Mb2289   cyp124 FALSE 0.027 175.000 0.000 NA   NA
 540602 540603 Mb2290c Mb2291c   cyp128 TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 540603 540604 Mb2291c Mb2292c cyp128   FALSE 0.404 13.000 0.000 NA   NA
 540605 540606 Mb2293 Mb2294 lppN   FALSE 0.104 107.000 0.000 NA   NA
 540606 540607 Mb2294 Mb2295     FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 540607 540608 Mb2295 Mb2296     TRUE 0.956 -3.000 0.190 NA   NA
 540610 540611 Mb2298 Mb2299   cyp121 TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540613 540614 Mb2301 Mb2302   pitB FALSE 0.005 234.000 0.000 1.000 N NA
 540616 540617 Mb2304 Mb2305   lipM FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 540617 540618 Mb2305 Mb2306 lipM   FALSE 0.204 33.000 0.000 NA   NA
 540619 540620 Mb2307c Mb2308c     FALSE 0.230 28.000 0.000 NA   NA
 540621 540622 Mb2309 Mb2310 yjcE   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540622 540623 Mb2310 Mb2311   cdh FALSE 0.300 -30.000 0.000 NA   NA
 540623 540624 Mb2311 Mb2312 cdh lppOa FALSE 0.050 142.000 0.000 NA   NA
 540624 540625 Mb2312 Mb2313 lppOa lppOb FALSE 0.543 -6.000 0.000 NA   NA
 540625 540626 Mb2313 Mb2314 lppOb sseB FALSE 0.050 142.000 0.000 NA   NA
 540628 540629 Mb2316 Mb2317     FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 540629 540630 Mb2317 Mb2318     FALSE 0.124 94.000 0.000 NA   NA
 540630 540631 Mb2318 Mb2319     FALSE 0.209 32.000 0.000 NA   NA
 540631 540632 Mb2319 Mb2320     FALSE 0.021 192.000 0.000 NA   NA
 540633 540634 Mb2321c Mb2322c htpG   FALSE 0.220 74.000 0.000 1.000   NA
 540635 540636 Mb2323 Mb2324 cut2   FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 540637 540638 Mb2325c Mb2326c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540639 540640 Mb2327 Mb2328     FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 540640 540641 Mb2328 Mb2329     FALSE 0.237 -213.000 0.000 NA   NA
 540642 540643 Mb2330c Mb2331c     FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 540643 540644 Mb2331c Mb2332c     FALSE 0.130 85.000 0.000 NA   NA
 540644 540645 Mb2332c Mb2333c     FALSE 0.125 93.000 0.000 NA   NA
 540647 540648 Mbt24 Mb2335c metV   TRUE 0.629 6.000 0.000 NA   NA
 540649 540650 Mb2336 Mb2337     FALSE 0.114 103.000 0.000 NA   NA
 540650 540651 Mb2337 Mb2338     FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 540651 540652 Mb2338 Mb2339     FALSE 0.138 78.000 0.000 NA   NA
 540653 540654 Mb2340c Mb2341c     TRUE 0.737 11.000 0.121 NA   NA
 540654 540655 Mb2341c Mb2342c     TRUE 0.992 -3.000 0.914 NA   NA
 540656 540657 Mb2343 Mb2344 uspA uspB TRUE 0.992 -13.000 0.818 0.019 Y NA
 540657 540658 Mb2344 Mb2345 uspB uspC TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.019 Y NA
 540659 540660 Mb2346c Mb2347c   rocE TRUE 0.978 -3.000 0.444 1.000 N NA
 540660 540661 Mb2347c Mb2348c rocE rocD2 TRUE 0.903 1.000 0.015 1.000   NA
 540661 540662 Mb2348c Mb2349c rocD2 rocD1 TRUE 0.982 0.000 0.000 0.003   NA
 540662 540663 Mb2349c Mb2350c rocD1   TRUE 0.942 -3.000 0.038 1.000   NA
 540665 540666 Mb2352c Mb2353c     TRUE 0.972 -3.000 0.240 1.000   NA
 540667 540668 Mb2354 Mb2355   PE23 FALSE 0.016 252.000 0.000 1.000   NA
 540669 540670 Mb2356c Mb2357c narK1 lppP FALSE 0.011 234.000 0.000 NA   NA
 540671 540672 Mb2358 Mb2359     FALSE 0.152 57.000 0.000 NA   NA
 540672 540673 Mb2359 Mb2360   mez FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 540675 540676 Mb2362 Mb2363 cysK1 cysE TRUE 0.994 4.000 0.133 0.001 Y NA
 540676 540677 Mb2363 Mb2364 cysE   FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 540678 540679 Mb2365c Mb2366c   moeW FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 540680 540681 Mb2367 Mb2368 mmpL9a mmpL9b TRUE 0.841 13.000 0.000 0.042   NA
 540682 540683 Mb2369c Mbt25 PE_PGRS39 asnT FALSE 0.002 499.000 0.000 NA   NA
 540684 540685 Mb2370 Mb2371 lppQ   FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 540686 540687 Mb2372c Mb2373c dnaG dgt TRUE 0.740 5.000 0.037 1.000 N NA
 540689 540690 Mb2375c Mb2376c esxO PPE71 FALSE 0.380 -16.000 0.000 NA   NA
 540690 540691 Mb2376c Mb2377c PPE71 PPE40 FALSE 0.016 738.000 0.000 NA Y NA
 540691 540692 Mb2377c Mb2378c PPE40 glyS FALSE 0.004 138.000 0.000 NA N NA
 540693 540694 Mb2379 Mb2380   furB TRUE 0.972 -3.000 0.021 0.042 N NA
 540695 540696 Mb2381c Mb2382c     TRUE 0.887 0.000 0.017 NA   NA
 540696 540697 Mb2382c Mb2383c     TRUE 0.657 -7.000 0.076 1.000 N NA
 540699 540700 Mb2385c Mb2386c era   FALSE 0.228 74.000 0.021 NA   NA
 540700 540701 Mb2386c Mb2387c     FALSE 0.454 -28.000 0.025 NA   NA
 540701 540702 Mb2387c Mb2388c     TRUE 0.962 -3.000 0.222 NA   NA
 540702 540703 Mb2388c Mb2389c   phoH1 TRUE 0.962 4.000 0.457 NA   NA
 540703 540704 Mb2389c Mb2390c phoH1   FALSE 0.303 -28.000 0.000 NA   NA
 540704 540705 Mb2390c Mb2391c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540707 540708 Mb2393c Mb2394c   dnaJ2 TRUE 0.626 14.000 0.073 NA   NA
 540708 540709 Mb2394c Mb2395c dnaJ2 hrcA FALSE 0.221 75.000 0.064 1.000 N NA
 540711 540712 Mb2397c Mb2398c cfp2 mbtH FALSE 0.119 100.000 0.000 NA   NA
 540712 540713 Mb2398c Mb2399c mbtH mbtG FALSE 0.332 -22.000 0.000 NA   NA
 540713 540714 Mb2399c Mb2400c mbtG mbtF TRUE 0.995 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 540714 540715 Mb2400c Mb2401c mbtF mbtE TRUE 0.988 -18.000 0.462 0.002 Y NA
 540715 540716 Mb2401c Mb2402c mbtE mbtD TRUE 0.676 140.000 0.000 0.005 Y NA
 540716 540717 Mb2402c Mb2403c mbtD mbtC TRUE 0.976 0.000 0.000 0.016   NA
 540717 540718 Mb2403c Mb2404c mbtC mbtB TRUE 0.877 -10.000 0.000 0.016   NA
 540719 540720 Mb2405 Mb2406 mbtA mbtJ FALSE 0.511 96.000 0.095 0.090 N NA
 540723 540724 Mb2409c Mb2410c hemN rpfD FALSE 0.173 106.000 0.000 1.000   NA
 540724 540725 Mb2410c Mb2411c rpfD   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540726 540727 Mb2412 Mb2413 nirA cysH TRUE 0.884 -3.000 0.041 1.000 N NA
 540727 540728 Mb2413 Mb2414 cysH   TRUE 0.929 -3.000 0.010 1.000   NA
 540728 540729 Mb2414 Mb2415   ggtB FALSE 0.462 37.000 0.069 1.000   NA
 540729 540730 Mb2415 Mb2416 ggtB   FALSE 0.122 131.000 0.029 NA   NA
 540730 540731 Mb2416 Mb2417     FALSE 0.552 14.000 0.029 NA   NA
 540731 540732 Mb2417 Mb2418   PE_PGRS41 FALSE 0.002 724.000 0.000 NA   NA
 540733 540734 Mb2419c Mb2420c cysA1 cysW TRUE 0.897 17.000 0.087 1.000 Y NA
 540734 540735 Mb2420c Mb2421c cysW cysT TRUE 0.990 -3.000 0.177 0.001 N NA
 540735 540736 Mb2421c Mb2422c cysT subI TRUE 0.988 -3.000 0.188 0.003 N NA
 540740 540741 Mb2426c Mb2427c lppR lepA TRUE 0.888 -3.000 0.004 NA   NA
 540744 540745 Mb2430 Mb2431   PE24 FALSE 0.002 593.000 0.000 NA   NA
 540746 540747 Mb2432c Mb2433c     TRUE 0.926 0.000 0.089 NA   NA
 540747 540748 Mb2433c Mb2434c     TRUE 0.907 0.000 0.044 NA   NA
 540750 540751 Mb2436c Mb2437c     TRUE 0.880 5.000 0.163 NA   NA
 540751 540752 Mb2437c Mb2438c     TRUE 0.647 15.000 0.130 NA   NA
 540752 540753 Mb2438c Mb2439c     FALSE 0.008 340.000 0.000 1.000   NA
 540753 540754 Mb2439c Mb2440c     FALSE 0.076 122.000 0.000 NA   NA
 540754 540755 Mb2440c Mb2441c     TRUE 0.630 81.000 0.484 NA   NA
 540755 540756 Mb2441c Mb2442c     TRUE 0.838 -10.000 0.245 1.000   NA
 540756 540757 Mb2442c Mb2443c     TRUE 0.921 -3.000 0.045 NA   NA
 540757 540758 Mb2443c Mb2444c   nadD TRUE 0.961 -3.000 0.221 NA   NA
 540759 540760 Mb2445 Mb2446     FALSE 0.010 242.000 0.000 NA   NA
 540761 540762 Mb2447c Mb2448c     TRUE 0.861 14.000 0.000 0.008   NA
 540762 540763 Mb2448c Mb2449c     FALSE 0.127 89.000 0.000 NA   NA
 540763 540764 Mb2449c Mb2450c     TRUE 0.990 0.000 0.862 NA   NA
 540764 540765 Mb2450c Mb2451c   proA FALSE 0.456 27.000 0.019 1.000   NA
 540765 540766 Mb2451c Mb2452c proA   FALSE 0.133 83.000 0.000 NA   NA
 540766 540767 Mb2452c Mb2453c     TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540768 540769 Mb2454 Mb2455 ahpC ahpD FALSE 0.562 26.000 0.095 1.000   NA
 540770 540771 Mb2456c Mb2457c PPE41 PE25 FALSE 0.167 47.000 0.000 NA   NA
 540771 540772 Mb2457c Mb2458c PE25   FALSE 0.029 171.000 0.000 NA   NA
 540772 540773 Mb2458c Mb2459c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540773 540774 Mb2459c Mb2460c     FALSE 0.360 -19.000 0.000 NA   NA
 540774 540775 Mb2460c Mb2461c     TRUE 0.994 -3.000 0.667 0.042 N NA
 540776 540777 Mb2462 Mb2463 rbsK   FALSE 0.005 232.000 0.000 1.000 N NA
 540780 540781 Mb2466c Mb2467c proB obg TRUE 0.962 0.000 0.206 1.000   NA
 540781 540782 Mb2467c Mb2468c obg rpmA TRUE 0.582 86.000 0.335 1.000   NA
 540782 540783 Mb2468c Mb2469c rpmA rplU TRUE 0.989 15.000 0.667 0.014 Y NA
 540785 540786 Mb2471c Mb2472c rne ndkA FALSE 0.002 330.000 0.000 1.000 N NA
 540786 540787 Mb2472c Mb2473c ndkA   FALSE 0.268 43.000 0.014 NA   NA
 540787 540788 Mb2473c Mb2474c   folC TRUE 0.955 -3.000 0.188 NA   NA
 540788 540789 Mb2474c Mb2475c folC valS TRUE 0.982 -3.000 0.208 0.072 N NA
 540789 540790 Mb2475c Mb2476c valS   FALSE 0.238 88.000 0.041 NA   NA
 540790 540791 Mb2476c Mb2477c   rpfE FALSE 0.514 90.000 0.333 NA   NA
 540793 540794 Mb2479c Mb2480c   mobA FALSE 0.264 24.000 0.000 NA   NA
 540794 540795 Mb2480c Mb2481c mobA   TRUE 0.838 2.000 0.053 1.000 N NA
 540795 540796 Mb2481c Mb2482c     TRUE 0.999 -3.000 0.832 0.001 Y NA
 540796 540797 Mb2482c Mb2483c     FALSE 0.005 232.000 0.000 1.000 N NA
 540797 540798 Mb2483c Mb2484c   clpX FALSE 0.306 16.000 0.002 1.000 N NA
 540799 540800 Mb2485 Mb2486 mmuM   FALSE 0.013 167.000 0.000 1.000 N NA
 540801 540802 Mb2487c Mb2488c clpP2 clpP1 TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.001 Y NA
 540802 540803 Mb2488c Mb2489c clpP1 tig FALSE 0.568 117.000 0.018 1.000 Y NA
 540803 540804 Mb2489c Mbt26 tig proU FALSE 0.182 40.000 0.000 NA   NA
 540805 540806 Mbt27 Mb2490 glyV lipP FALSE 0.173 44.000 0.000 NA   NA
 540807 540808 Mb2491c Mb2492c     TRUE 0.924 6.000 0.398 1.000 N NA
 540808 540809 Mb2492c Mb2493c     FALSE 0.401 102.000 0.182 1.000   NA
 540811 540812 Mb2495c Mb2496c     FALSE 0.014 220.000 0.000 NA   NA
 540813 540814 Mb2497 Mb2498 glbO aglA TRUE 0.937 0.000 0.055 1.000   NA
 540814 540815 Mb2498 Mb2499 aglA   FALSE 0.139 68.000 0.000 NA   NA
 540815 540816 Mb2499 Mb2500     TRUE 0.739 3.000 0.000 NA   NA
 540817 540818 Mb2501c Mb2502c     TRUE 0.814 6.000 0.068 NA   NA
 540818 540819 Mb2502c Mb2503c   gdh TRUE 0.948 -3.000 0.153 NA   NA
 540819 540820 Mb2503c Mb2504c gdh   FALSE 0.253 104.000 0.018 1.000   NA
 540820 540821 Mb2504c Mb2505c     FALSE 0.343 81.000 0.053 1.000   NA
 540821 540822 Mb2505c Mb2506c     FALSE 0.002 609.000 0.000 NA   NA
 540822 540823 Mb2506c Mb2507c   plsB2 FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 540823 540824 Mb2507c Mb2508c plsB2 plsC TRUE 0.994 -3.000 0.044 0.089 Y NA
 540824 540825 Mb2508c Mb2509c plsC   TRUE 0.921 -3.000 0.044 NA   NA
 540825 540826 Mb2509c Mb2510c   lipQ FALSE 0.062 229.000 0.250 NA   NA
 540827 540828 Mbt28 Mb2511 argW echA14 FALSE 0.117 101.000 0.000 NA   NA
 540829 540830 Mb2512c Mb2513c PE_PGRS42d PE_PGRS42b FALSE 0.224 -321.000 0.000 NA   NA
 540830 540831 Mb2513c Mb2514c PE_PGRS42b PE_PGRS42a FALSE 0.239 -211.000 0.000 NA   NA
 540831 540832 Mb2514c Mb2515c PE_PGRS42a   FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 540832 540833 Mb2515c Mb2516c     FALSE 0.288 -34.000 0.000 NA   NA
 540833 540834 Mb2516c Mb2517c   PE_PGRS43b FALSE 0.098 109.000 0.000 NA   NA
 540834 540835 Mb2517c Mb2518c PE_PGRS43b PE_PGRS43a TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540836 540837 Mb2519 Mb2520     FALSE 0.440 -10.000 0.000 NA   NA
 540837 540838 Mb2520 Mb2521     FALSE 0.156 53.000 0.000 NA   NA
 540838 540839 Mb2521 Mb2522     TRUE 0.629 6.000 0.000 NA   NA
 540840 540841 Mb2523c Mb2524c pdhC pdhB TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.088 Y NA
 540841 540842 Mb2524c Mb2525c pdhB pdhA TRUE 0.997 11.000 1.000 0.001 Y NA
 540842 540843 Mb2525c Mb2526c pdhA citE FALSE 0.017 259.000 0.083 1.000 N NA
 540843 540844 Mb2526c Mb2527c citE   TRUE 0.968 -3.000 0.326 1.000 N NA
 540844 540845 Mb2527c Mb2528c   fadE19 TRUE 0.990 -3.000 0.117 1.000 Y NA
 540845 540846 Mb2528c Mb2529c fadE19 accA1 TRUE 0.978 5.000 0.190 1.000 Y NA
 540846 540847 Mb2529c Mb2530c accA1 accD1 TRUE 0.975 5.000 0.136 1.000 Y NA
 540847 540848 Mb2530c Mb2531c accD1 scoB TRUE 0.986 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 540848 540849 Mb2531c Mb2532c scoB scoA TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.001 Y NA
 540849 540850 Mb2532c Mb2533c scoA fadD35 TRUE 0.843 83.000 0.054 0.088 Y NA
 540851 540852 Mb2534 Mb2535     FALSE 0.368 79.000 0.167 NA   NA
 540856 540857 Mb2539 Mbt29 orn hisT FALSE 0.160 50.000 0.000 NA   NA
 540859 540860 Mb2541 Mb2542     FALSE 0.014 221.000 0.000 NA   NA
 540861 540862 Mb2543c Mb2544c     TRUE 0.968 6.000 0.726 NA   NA
 540862 540863 Mb2544c Mb2545c     FALSE 0.132 119.000 0.000 1.000   NA
 540863 540864 Mb2545c Mb2546c     TRUE 0.966 -3.000 0.250 NA   NA
 540864 540865 Mb2546c Mb2547c   lppS FALSE 0.004 348.000 0.000 NA   NA
 540866 540867 Mbt30 Mb2548 lysU PE26 FALSE 0.014 219.000 0.000 NA   NA
 540870 540871 Mb2551c Mb2552c   acpS TRUE 0.879 -3.000 0.036 1.000 N NA
 540871 540872 Mb2552c Mb2553c acpS fas TRUE 0.574 193.000 0.138 0.003 Y NA
 540872 540873 Mb2553c Mb2554c fas   FALSE 0.002 520.000 0.000 NA   NA
 540874 540875 Mb2555 Mb2556     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540878 540879 Mb2559c Mb2559Ac     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540879 540880 Mb2559Ac Mb2560c     FALSE 0.324 31.000 0.000 1.000   NA
 540880 540881 Mb2560c Mb2561c     FALSE 0.349 72.000 0.143 NA   NA
 540881 540882 Mb2561c Mb2562c   nusB TRUE 0.869 0.000 0.004 NA   NA
 540882 540883 Mb2562c Mb2563c nusB efp TRUE 0.846 3.000 0.078 1.000 N NA
 540883 540884 Mb2563c Mb2564c efp pepQ TRUE 0.738 10.000 0.160 1.000 N NA
 540886 540887 Mb2566c Mb2567c aroD aroB TRUE 0.997 -3.000 0.052 0.002 Y NA
 540887 540888 Mb2567c Mb2568c aroB aroK TRUE 0.991 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 540888 540889 Mb2568c Mb2569c aroK aroF TRUE 0.975 4.000 0.041 1.000 Y NA
 540890 540891 Mb2570 Mb2571     FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 540891 540892 Mb2571 Mb2572   lppA FALSE 0.072 127.000 0.000 NA   NA
 540892 540893 Mb2572 Mb2573 lppA lprR TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540893 540894 Mb2573 Mb2574 lprR lppB TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540894 540895 Mb2574 Mb2575 lppB   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540895 540896 Mb2575 Mb2576     FALSE 0.125 93.000 0.000 NA   NA
 540896 540897 Mb2576 Mb2577     FALSE 0.185 39.000 0.000 NA   NA
 540897 540898 Mb2577 Mb2578     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540899 540900 Mb2579c Mb2580c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540900 540901 Mb2580c Mb2581c     FALSE 0.006 411.000 0.000 1.000   NA
 540901 540902 Mb2581c Mb2582c   aroE TRUE 0.675 12.000 0.022 1.000   NA
 540902 540903 Mb2582c Mb2583c aroE   TRUE 0.889 -22.000 0.667 NA   NA
 540903 540904 Mb2583c Mb2584c     TRUE 0.678 -7.000 0.039 NA   NA
 540904 540905 Mb2584c Mb2585c   alaS TRUE 0.884 1.000 0.103 1.000 N NA
 540905 540906 Mb2585c Mb2586c alaS   FALSE 0.192 91.000 0.011 NA   NA
 540907 540908 Mb2587 Mb2588     FALSE 0.130 85.000 0.000 NA   NA
 540910 540911 Mb2590 Mb2591     FALSE 0.004 357.000 0.000 NA   NA
 540911 540912 Mb2591 Mb2592     FALSE 0.081 143.000 0.000 1.000   NA
 540912 540913 Mb2592 Mb2593   glnQ FALSE 0.549 3.000 0.000 1.000 N NA
 540913 540914 Mb2593 Mb2594 glnQ   FALSE 0.013 277.000 0.000 1.000   NA
 540914 540915 Mb2594 Mb2595     FALSE 0.472 11.000 0.000 NA   NA
 540915 540916 Mb2595 Mb2596     FALSE 0.357 26.000 0.014 NA   NA
 540916 540917 Mb2596 Mb2597     TRUE 0.986 0.000 0.667 NA   NA
 540918 540919 Mb2598c Mb2599c     TRUE 0.690 -7.000 0.046 NA   NA
 540921 540922 Mb2601c Mb2602c   aspS TRUE 0.596 7.000 0.000 NA   NA
 540923 540924 Mb2603 Mb2604     FALSE 0.521 23.000 0.098 NA   NA
 540924 540925 Mb2604 Mb2605     FALSE 0.343 30.000 0.021 NA   NA
 540927 540928 Mb2607 Mb2608     FALSE 0.200 34.000 0.000 NA   NA
 540931 540932 Mb2611c Mb2612c hisS   TRUE 0.946 -3.000 0.051 1.000   NA
 540934 540935 Mb2614c Mb2615c relA apt FALSE 0.300 31.000 0.051 1.000 N NA
 540935 540936 Mb2615c Mb2616c apt   FALSE 0.131 104.000 0.023 1.000 N NA
 540936 540937 Mb2616c Mb2617c   secF TRUE 0.771 6.000 0.083 1.000 N NA
 540937 540938 Mb2617c Mb2618c secF secD TRUE 0.997 4.000 0.336 0.001 Y NA
 540938 540939 Mb2618c Mb2619c secD yajC TRUE 0.596 110.000 0.062 NA Y NA
 540940 540941 Mb2620 Mb2621 gabT fadD9 FALSE 0.223 162.000 0.444 1.000 N NA
 540941 540942 Mb2621 Mb2622 fadD9 PE_PGRS44 FALSE 0.028 174.000 0.000 NA   NA
 540943 540944 Mb2623c Mb2624c ruvB ruvA TRUE 0.999 -3.000 0.549 0.002 Y NA
 540944 540945 Mb2624c Mb2625c ruvA ruvC TRUE 0.998 -3.000 0.451 0.008 Y NA
 540946 540947 Mb2626 Mb2627     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540947 540948 Mb2627 Mb2628     FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 540948 540949 Mb2628 Mb2629     TRUE 0.901 11.000 0.455 NA   NA
 540949 540950 Mb2629 Mb2630     TRUE 0.964 -3.000 0.242 NA   NA
 540950 540951 Mb2630 Mb2631     TRUE 0.609 82.000 0.444 NA   NA
 540951 540952 Mb2631 Mb2632   speE TRUE 0.931 -3.000 0.065 NA   NA
 540952 540953 Mb2632 Mb2633 speE   FALSE 0.152 111.000 0.000 1.000   NA
 540953 540954 Mb2633 Mb2634     FALSE 0.408 -13.000 0.000 NA   NA
 540955 540956 Mb2635c Mb2636c     FALSE 0.136 133.000 0.055 NA   NA
 540956 540957 Mb2636c Mb2637c   tesB2 FALSE 0.427 8.000 0.027 NA N NA
 540957 540958 Mb2637c Mb2638c tesB2   FALSE 0.238 29.000 0.014 1.000 N NA
 540959 540960 Mb2639 Mb2640 pdxH PPE42 FALSE 0.002 174.000 0.000 NA N NA
 540961 540962 Mb2641c Mb2642c   pimA TRUE 0.812 0.000 0.010 1.000 N NA
 540962 540963 Mb2642c Mb2643c pimA   TRUE 0.986 11.000 0.831 1.000 Y NA
 540963 540964 Mb2643c Mb2644c   pgsA1 TRUE 0.988 -3.000 0.737 1.000 N NA
 540964 540965 Mb2644c Mb2645c pgsA1   TRUE 0.928 -3.000 0.140 1.000 N NA
 540965 540966 Mb2645c Mb2646c   thrS TRUE 0.773 -7.000 0.208 1.000 N NA
 540972 540973 Mb2652c Mb2653c     TRUE 0.657 13.000 0.090 NA   NA
 540973 540974 Mb2653c Mb2654c     TRUE 0.944 -3.000 0.129 NA   NA
 540975 540976 Mb2655 Mb2656   TB31.7 FALSE 0.133 136.000 0.013 1.000   NA
 540977 540978 Mb2657c Mb2658c     FALSE 0.503 15.000 0.000 1.000   NA
 540978 540979 Mb2658c Mb2659c     FALSE 0.235 59.000 0.000 1.000   NA
 540979 540980 Mb2659c Mb2660c     FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 540981 540982 Mb2661 Mb2662     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 540982 540983 Mb2662 Mb2663     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 540983 540984 Mb2663 Mb2664     FALSE 0.251 139.000 0.279 NA   NA
 540985 540986 Mb2665c Mb2666c     FALSE 0.046 145.000 0.000 NA   NA
 540986 540987 Mb2666c Mb2667c   PE_PGRS46 FALSE 0.007 285.000 0.000 NA   NA
 540988 540989 Mb2668 Mb2669     TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540989 540990 Mb2669 Mb2670   dedA FALSE 0.020 196.000 0.000 NA   NA
 540990 540991 Mb2670 Mb2671 dedA   FALSE 0.032 163.000 0.000 NA   NA
 540992 540993 Mb2672c Mb2673c     FALSE 0.129 120.000 0.000 1.000   NA
 540994 540995 Mb2674 Mb2675 cadI   FALSE 0.346 136.000 0.400 NA   NA
 540995 540996 Mb2675 Mb2676   arsC TRUE 0.984 -3.000 0.600 1.000 N NA
 540997 540998 Mb2677c Mbt31   valT FALSE 0.002 647.000 0.000 NA   NA
 540999 541000 Mbt32 Mbt33 glyT cysU FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 541000 541001 Mbt33 Mbt34 cysU valU FALSE 0.327 17.000 0.000 NA   NA
 541002 541003 Mb2678c Mb2679c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541004 541005 Mb2680 Mb2681     FALSE 0.120 99.000 0.000 NA   NA
 541005 541006 Mb2681 Mb2682     FALSE 0.472 11.000 0.000 NA   NA
 541008 541009 Mb2684 Mb2685     FALSE 0.126 91.000 0.000 NA   NA
 541009 541010 Mb2685 Mb2686   clpX' FALSE 0.406 22.000 0.000 1.000   NA
 541010 541011 Mb2686 Mb2687 clpX'   FALSE 0.353 79.000 0.150 NA   NA
 541011 541012 Mb2687 Mb2688     FALSE 0.401 29.000 0.051 NA   NA
 541014 541015 Mb2690 Mb2691 ribD   FALSE 0.490 67.000 0.275 NA   NA
 541015 541016 Mb2691 Mb2692     TRUE 0.789 23.000 0.444 NA   NA
 541016 541017 Mb2692 Mb2693     FALSE 0.123 169.000 0.217 NA   NA
 541018 541019 Mb2694c Mb2695c     TRUE 0.901 -3.000 0.014 NA   NA
 541019 541020 Mb2695c Mb2696c   hemY TRUE 0.856 6.000 0.158 NA   NA
 541020 541021 Mb2696c Mb2697c hemY hemE TRUE 0.997 -3.000 0.049 0.001 Y NA
 541022 541023 Mb2698 Mb2699 echA15   FALSE 0.018 262.000 0.038 NA   NA
 541023 541024 Mb2699 Mb2700     TRUE 0.908 2.000 0.115 NA   NA
 541026 541027 Mb2702 Mb2703   arsA TRUE 0.783 5.000 0.000 1.000   NA
 541027 541028 Mb2703 Mb2704 arsA arsB1 TRUE 0.885 80.000 0.000 0.001 Y NA
 541029 541030 Mb2705c Mb2706c     TRUE 0.953 -3.000 0.176 NA   NA
 541030 541031 Mb2706c Mb2707c     TRUE 0.962 -3.000 0.222 NA   NA
 541031 541032 Mb2707c Mb2708c     FALSE 0.005 195.000 0.004 NA N NA
 541032 541033 Mb2708c Mb2709c     FALSE 0.045 156.000 0.082 NA N NA
 541034 541035 Mb2710 Mb2711 ceoB ceoC TRUE 0.997 -3.000 0.162 0.002 Y NA
 541036 541037 Mb2712c Mb2713c     FALSE 0.481 31.000 0.145 NA   NA
 541039 541040 Mb2715c Mb2716c   dut FALSE 0.305 75.000 0.078 NA   NA
 541045 541046 Mb2721 Mb2722 ppgK sigA FALSE 0.313 180.000 0.075 1.000 Y NA
 541046 541047 Mb2722 Mb2723 sigA   FALSE 0.113 37.000 0.024 NA N NA
 541048 541049 Mb2724c Mb2725c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541052 541053 Mb2728 Mb2729   sigB FALSE 0.154 176.000 0.303 NA   NA
 541053 541054 Mb2729 Mb2730 sigB ideR TRUE 0.749 133.000 0.134 0.040 Y NA
 541056 541057 Mb2732 Mb2733 sthA   FALSE 0.025 218.000 0.000 1.000   NA
 541057 541058 Mb2733 Mb2734     TRUE 0.723 59.000 0.538 1.000   NA
 541058 541059 Mb2734 Mb2735     TRUE 0.800 49.000 0.280 0.034   NA
 541060 541061 Mb2736c Mb2737c     FALSE 0.221 52.000 0.005 NA   NA
 541061 541062 Mb2737c Mb2738c     FALSE 0.053 163.000 0.012 NA   NA
 541065 541066 Mb2741 Mb2742     FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 541067 541068 Mb2743c Mb2744c fadE20 hflX FALSE 0.122 136.000 0.003 1.000   NA
 541068 541069 Mb2744c Mb2745c hflX dapF TRUE 0.576 17.000 0.025 1.000   NA
 541069 541070 Mb2745c Mb2746c dapF miaA FALSE 0.373 25.000 0.062 1.000 N NA
 541070 541071 Mb2746c Mb2747c miaA   TRUE 0.920 -3.000 0.043 NA   NA
 541071 541072 Mb2747c Mb2748c     FALSE 0.098 109.000 0.000 NA   NA
 541073 541074 Mb2749 Mb2750     FALSE 0.566 8.000 0.000 NA   NA
 541075 541076 Mb2751c Mb2752c     TRUE 0.909 -3.000 0.024 NA   NA
 541078 541079 Mb2754c Mb2755c   recX FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 541079 541080 Mb2755c Mb2756c recX recA TRUE 0.764 -34.000 0.296 1.000   NA
 541082 541083 Mb2758c Mb2759c     TRUE 0.754 11.000 0.152 NA   NA
 541084 541085 Mb2760 Mb2761   PE_PGRS47 FALSE 0.016 210.000 0.000 NA   NA
 541086 541087 Mb2762c Mb2763c     FALSE 0.289 21.000 0.000 NA   NA
 541087 541088 Mb2763c Mb2764c     FALSE 0.370 72.000 0.167 NA   NA
 541088 541089 Mb2764c Mb2765c   35kd_ag TRUE 0.745 19.000 0.306 NA   NA
 541089 541090 Mb2765c Mb2766c 35kd_ag   FALSE 0.287 130.000 0.260 NA   NA
 541090 541091 Mb2766c Mb2767c   pgsA3 FALSE 0.278 71.000 0.006 1.000   NA
 541094 541095 Mb2770 Mb2771     TRUE 0.990 -3.000 0.250 0.042   NA
 541095 541096 Mb2771 Mb2772     TRUE 0.991 4.000 0.600 NA Y NA
 541097 541098 Mb2773c Mb2774c   dapA TRUE 0.808 31.000 0.550 1.000   NA
 541098 541099 Mb2774c Mb2775c dapA   FALSE 0.183 69.000 0.037 1.000 N NA
 541099 541100 Mb2775c Mb2776c   hsdS' FALSE 0.018 244.000 0.000 1.000   NA
 541100 541101 Mb2776c Mb2777c hsdS' hsdM TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.048   NA
 541101 541102 Mb2777c Mb2778c hsdM   FALSE 0.128 87.000 0.000 NA   NA
 541102 541103 Mb2778c Mb2779c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541103 541104 Mb2779c Mb2780c     FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 541104 541105 Mb2780c Mb2781c     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 541105 541106 Mb2781c Mb2782c   hsdS FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 541106 541107 Mb2782c Mb2783c hsdS   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541107 541108 Mb2783c Mb2784c     FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 541108 541109 Mb2784c Mb2785c   dfrA FALSE 0.139 74.000 0.000 NA   NA
 541109 541110 Mb2785c Mb2786c dfrA thyA FALSE 0.454 71.000 0.295 1.000 N NA
 541112 541113 Mb2788c Mb2789c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541113 541114 Mb2789c Mb2790c   PPE43 FALSE 0.028 174.000 0.000 NA   NA
 541114 541115 Mb2790c Mb2791c PPE43 PE27 TRUE 0.803 80.000 1.000 NA   NA
 541115 541116 Mb2791c Mb2792c PE27 PPE44 FALSE 0.005 324.000 0.000 NA   NA
 541116 541117 Mb2792c Mb2793c PPE44   FALSE 0.075 124.000 0.000 NA   NA
 541117 541118 Mb2793c Mb2794c     FALSE 0.129 86.000 0.000 NA   NA
 541118 541119 Mb2794c Mb2795c   dapB TRUE 0.683 12.000 0.027 1.000   NA
 541119 541120 Mb2795c Mb2796c dapB   FALSE 0.472 11.000 0.000 NA   NA
 541122 541123 Mb2798c Mb2799c     FALSE 0.024 182.000 0.000 NA   NA
 541123 541124 Mb2799c Mb2800c     FALSE 0.262 158.000 0.429 NA   NA
 541124 541125 Mb2800c Mb2801c     FALSE 0.415 32.000 0.074 NA   NA
 541126 541127 Mb2802 Mb2803 alda aldb TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.001   NA
 541128 541129 Mb2804c Mb2805c   pepR FALSE 0.299 61.000 0.010 1.000   NA
 541129 541130 Mb2805c Mb2806c pepR gpsI TRUE 0.710 -22.000 0.171 1.000   NA
 541130 541131 Mb2806c Mb2807c gpsI lppU FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 541131 541132 Mb2807c Mb2808c lppU rpsO FALSE 0.505 13.000 0.004 NA   NA
 541132 541133 Mb2808c Mb2809c rpsO ribF FALSE 0.080 157.000 0.119 1.000 N NA
 541134 541135 Mb2810 Mb2811   sirR FALSE 0.060 85.000 0.000 1.000 N NA
 541136 541137 Mb2812c Mb2813c fadE21 ltp1 TRUE 0.820 26.000 0.011 1.000 Y NA
 541137 541138 Mb2813c Mb2814c ltp1   FALSE 0.018 33.000 0.000 NA N NA
 541138 541139 Mb2814c Mb2815c     TRUE 0.977 0.000 0.000 NA Y NA
 541139 541140 Mb2815c Mb2816c   truB FALSE 0.008 202.000 0.000 1.000 N NA
 541140 541141 Mb2816c Mb2817c truB   TRUE 0.877 -3.000 0.034 1.000 N NA
 541141 541142 Mb2817c Mb2818c     TRUE 0.968 -3.000 0.203 1.000   NA
 541142 541143 Mb2818c Mb2819c   lppV FALSE 0.128 145.000 0.111 NA   NA
 541143 541144 Mb2819c Mb2820c lppV   TRUE 0.873 0.000 0.006 NA   NA
 541144 541145 Mb2820c Mb2821c     TRUE 0.791 4.000 0.006 NA   NA
 541146 541147 Mb2822 Mb2823     TRUE 0.782 19.000 0.375 NA   NA
 541148 541149 Mb2824c Mb2825c     FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 541152 541153 Mb2828 Mb2829     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541153 541154 Mb2829 Mb2830     FALSE 0.019 199.000 0.000 NA   NA
 541154 541155 Mb2830 Mb2831     FALSE 0.011 234.000 0.000 NA   NA
 541155 541156 Mb2831 Mb2832     FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 541158 541159 Mb2834 Mb2835     TRUE 0.690 71.000 0.600 NA   NA
 541159 541160 Mb2835 Mb2836     TRUE 0.802 -70.000 0.000 0.004   NA
 541160 541161 Mb2836 Mb2837     TRUE 0.958 -3.000 0.125 1.000   NA
 541162 541163 Mb2838c Mb2839c     TRUE 0.746 99.000 0.308 0.046   NA
 541163 541164 Mb2839c Mb2840c     FALSE 0.003 1880.000 0.000 1.000   NA
 11445368 541165   Mb2841c     FALSE NA 465.000 0.000 NA   NA
 11587731 541165   Mb2841c     FALSE NA 465.000 0.000 NA   NA
 11730123 541165   Mb2841c     FALSE NA 465.000 0.000 NA   NA
 11445369 541165   Mb2841c     FALSE NA 427.000 0.000 NA   NA
 11587732 541165   Mb2841c     FALSE NA 427.000 0.000 NA   NA
 11730124 541165   Mb2841c     FALSE NA 427.000 0.000 NA   NA
 11445370 541165   Mb2841c     FALSE NA 391.000 0.000 NA   NA
 11587733 541165   Mb2841c     FALSE NA 391.000 0.000 NA   NA
 11730125 541165   Mb2841c     FALSE NA 391.000 0.000 NA   NA
 541164 541165 Mb2840c Mb2841c     TRUE 0.988 1.000 0.280 NA Y NA
 541165 541166 Mb2841c Mb2842c     FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 541166 541167 Mb2842c Mb2843c     FALSE 0.245 96.000 0.052 NA   NA
 541167 541168 Mb2843c Mb2844c     TRUE 0.996 -3.000 0.597 NA Y NA
 541168 541169 Mb2844c Mb2845c     TRUE 0.960 -19.000 0.547 NA Y NA
 541169 541170 Mb2845c Mb2846c     TRUE 0.915 10.000 0.453 NA   NA
 541170 541171 Mb2846c Mb2847c     TRUE 0.976 -3.000 0.347 NA   NA
 541171 541172 Mb2847c Mb2848c     TRUE 0.940 -3.000 0.102 NA   NA
 541172 541173 Mb2848c Mb2849c     FALSE 0.026 178.000 0.000 NA   NA
 541173 541174 Mb2849c Mb2850c     FALSE 0.030 170.000 0.000 NA   NA
 541174 541175 Mb2850c Mb2851c     TRUE 0.739 3.000 0.000 NA   NA
 541175 541176 Mb2851c Mb2852c     FALSE 0.006 305.000 0.000 NA   NA
 541176 541177 Mb2852c Mb2853c     FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 541177 541178 Mb2853c Mb2854c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541180 541181 Mb2856c Mb2857c ugpC ugpB TRUE 0.990 -7.000 0.467 0.017 Y NA
 541181 541182 Mb2857c Mb2858c ugpB ugpE TRUE 0.997 3.000 0.467 0.017 Y NA
 541182 541183 Mb2858c Mb2859c ugpE ugpAb TRUE 0.998 -3.000 0.389 0.017 Y NA
 541183 541184 Mb2859c Mb2860c ugpAb ugpAa TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 541184 541185 Mb2860c Mb2861c ugpAa dinF FALSE 0.205 87.000 0.000 1.000   NA
 541185 541186 Mb2861c Mb2862c dinF   TRUE 0.831 7.000 0.054 1.000   NA
 541186 541187 Mb2862c Mb2863c   rbfA TRUE 0.694 -25.000 0.173 1.000   NA
 541187 541188 Mb2863c Mb2864c rbfA infB TRUE 0.995 0.000 0.530 1.000 Y NA
 541188 541189 Mb2864c Mb2865c infB   FALSE 0.222 86.000 0.171 NA N NA
 541189 541190 Mb2865c Mb2866c   nusA TRUE 0.675 127.000 0.323 NA Y NA
 541190 541191 Mb2866c Mb2867c nusA   TRUE 0.990 -3.000 0.759 NA   NA
 541192 541193 Mb2868 Mb2869     TRUE 0.946 -3.000 0.139 NA   NA
 541194 541195 Mb2870c Mb2871c proS efpA FALSE 0.253 89.000 0.004 1.000   NA
 541195 541196 Mb2871c Mb2872c efpA cysG TRUE 0.853 23.000 0.156 0.017   NA
 541196 541197 Mb2872c Mb2873c cysG cobB FALSE 0.209 223.000 0.145 1.000 Y NA
 541197 541198 Mb2873c Mb2874c cobB cobO TRUE 0.996 0.000 0.114 0.007 Y NA
 541198 541199 Mb2874c Mb2875c cobO   TRUE 0.937 21.000 0.057 0.064 Y NA
 541199 541200 Mb2875c Mb2876c     TRUE 0.978 -3.000 0.314 1.000   NA
 541200 541201 Mb2876c Mb2877c   mqo FALSE 0.423 59.000 0.119 1.000   NA
 541202 541203 Mb2878 Mb2879 PE_PGRS48   FALSE 0.192 37.000 0.000 NA   NA
 541203 541204 Mb2879 Mb2880   mtr TRUE 0.768 13.000 0.341 NA N NA
 541204 541205 Mb2880 Mb2881 mtr nicT FALSE 0.149 100.000 0.030 1.000 N NA
 541206 541207 Mb2882c Mb2883c   aldC TRUE 0.995 -3.000 0.839 0.079 N NA
 541207 541208 Mb2883c Mb2884c aldC   TRUE 0.984 -3.000 0.419 1.000   NA
 541208 541209 Mb2884c Mb2885c   glnA4 TRUE 0.723 -19.000 0.157 1.000   NA
 541209 541210 Mb2885c Mb2886c glnA4 mapB FALSE 0.015 160.000 0.000 1.000 N NA
 541210 541211 Mb2886c Mb2887c mapB   FALSE 0.318 42.000 0.042 NA   NA
 541214 541215 Mb2890 Mb2891     TRUE 0.960 4.000 0.000 NA Y NA
 541216 541217 Mb2892c Mb2893c   gcpE FALSE 0.325 56.000 0.018 1.000   NA
 541217 541218 Mb2893c Mb2894c gcpE   FALSE 0.477 17.000 0.072 1.000 N NA
 541218 541219 Mb2894c Mb2895c   dxr TRUE 0.725 8.000 0.088 1.000 N NA
 541220 541221 Mb2896 Mb2897     FALSE 0.408 -13.000 0.000 NA   NA
 541221 541222 Mb2897 Mb2898   mpb83 FALSE 0.137 80.000 0.000 NA   NA
 541222 541223 Mb2898 Mb2899 mpb83 dipZ FALSE 0.003 280.000 0.000 1.000 N NA
 541223 541224 Mb2899 Mb2900 dipZ mpb70 FALSE 0.057 96.000 0.000 1.000 N NA
 541224 541225 Mb2900 Mb2901 mpb70   FALSE 0.157 52.000 0.000 NA   NA
 541226 541227 Mb2902c Mb2903c   mpb53 TRUE 0.995 5.000 1.000 1.000 Y NA
 541227 541228 Mb2903c Mb2904c mpb53   FALSE 0.051 186.000 0.003 1.000   NA
 541228 541229 Mb2904c Mb2905c   cdsA FALSE 0.525 23.000 0.033 1.000   NA
 541229 541230 Mb2905c Mb2906c cdsA frr FALSE 0.418 23.000 0.076 1.000 N NA
 541230 541231 Mb2906c Mb2907c frr pyrH FALSE 0.271 172.000 0.626 1.000 N NA
 541233 541234 Mb2909c Mb2910c     TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 541236 541237 Mb2912c Mb2913c amiC tsf TRUE 0.953 7.000 0.006 1.000 Y NA
 541237 541238 Mb2913c Mb2914c tsf rpsB TRUE 0.981 12.000 0.748 1.000 Y NA
 541242 541243 Mb2918c Mb2919c xerC viuB FALSE 0.041 91.000 0.008 NA N NA
 541243 541244 Mb2919c Mb2920c viuB   FALSE 0.068 33.000 0.007 NA N NA
 541244 541245 Mb2920c Mb2921c     TRUE 0.895 -3.000 0.053 1.000 N NA
 541245 541246 Mb2921c Mb2922c     TRUE 0.873 0.000 0.050 1.000 N NA
 541246 541247 Mb2922c Mb2923c   fdhD FALSE 0.008 248.000 0.003 1.000 N NA
 541247 541248 Mb2923c Mb2924c fdhD fdhF TRUE 0.998 0.000 0.261 0.001 Y NA
 541248 541249 Mb2924c Mb2925c fdhF   FALSE 0.150 58.000 0.000 NA   NA
 541249 541250 Mb2925c Mb2926c   rnhB FALSE 0.317 54.000 0.067 NA   NA
 541250 541251 Mb2926c Mb2927c rnhB lepB FALSE 0.430 14.000 0.024 1.000 N NA
 541251 541252 Mb2927c Mb2928c lepB rplS FALSE 0.167 58.000 0.018 1.000 N NA
 541254 541255 Mb2930c Mb2931c trmD rimM TRUE 0.994 4.000 0.672 1.000 Y NA
 541255 541256 Mb2931c Mb2932c rimM   TRUE 0.846 14.000 0.324 1.000   NA
 541256 541257 Mb2932c Mb2933c   rpsP TRUE 0.931 8.000 0.385 1.000   NA
 541257 541258 Mb2933c Mb2934c rpsP   FALSE 0.034 184.000 0.002 NA   NA
 541260 541261 Mb2936c Mb2937c     TRUE 0.960 2.000 0.278 1.000   NA
 541261 541262 Mb2937c Mb2938c   pknI FALSE 0.065 69.000 0.000 1.000 N NA
 541262 541263 Mb2938c Mb2939c pknI   FALSE 0.082 44.000 0.000 1.000 N NA
 541263 541264 Mb2939c Mb2940c   ffh FALSE 0.270 28.000 0.025 1.000 N NA
 541266 541267 Mb2942c Mb2943c glnD glnB FALSE 0.225 58.000 0.055 1.000 N NA
 541267 541268 Mb2943c Mb2944c glnB amt TRUE 0.979 -3.000 0.467 1.000 N NA
 541268 541269 Mb2944c Mb2945c amt ftsY FALSE 0.015 477.000 0.004 0.037 N NA
 541269 541270 Mb2945c Mb2946c ftsY smc TRUE 0.691 50.000 0.165 0.011 N NA
 541270 541271 Mb2946c Mb2947c smc acyP FALSE 0.468 12.000 0.021 1.000 N NA
 541271 541272 Mb2947c Mb2948c acyP   FALSE 0.467 -13.000 0.028 1.000 N NA
 541272 541273 Mb2948c Mb2949c   fpg FALSE 0.115 102.000 0.010 1.000 N NA
 541273 541274 Mb2949c Mb2950c fpg rnc FALSE 0.010 304.000 0.068 1.000 N NA
 541274 541275 Mb2950c Mb2951c rnc   TRUE 0.911 -3.000 0.026 NA   NA
 541275 541276 Mb2951c Mb2952c     FALSE 0.272 51.000 0.029 NA   NA
 541277 541278 Mb2953 Mb2954 tesA   FALSE 0.408 -13.000 0.000 NA   NA
 541278 541279 Mb2954 Mb2955   fadD26 FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 541279 541280 Mb2955 Mb2956 fadD26 ppsA TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 541280 541281 Mb2956 Mb2957 ppsA ppsB TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.007 Y NA
 541281 541282 Mb2957 Mb2958 ppsB ppsC TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.007 Y NA
 541282 541283 Mb2958 Mb2959 ppsC ppsD TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.004 Y NA
 541283 541284 Mb2959 Mb2960 ppsD ppsE TRUE 0.994 6.000 0.417 0.007 Y NA
 541284 541285 Mb2960 Mb2961 ppsE drrA TRUE 0.896 11.000 0.500 1.000 N NA
 541285 541286 Mb2961 Mb2962 drrA drrB TRUE 0.992 -3.000 0.750 1.000   NA
 541286 541287 Mb2962 Mb2963 drrB drrC TRUE 0.998 -3.000 0.857 0.001   NA
 541287 541288 Mb2963 Mb2964 drrC papA5 TRUE 0.616 47.000 0.364 NA   NA
 541290 541291 Mb2966 Mb2967 fadD28 mmpL7 TRUE 0.943 -7.000 0.600 1.000   NA
 541291 541292 Mb2967 Mb2968 mmpL7   FALSE 0.003 632.000 0.000 1.000   NA
 541292 541293 Mb2968 Mb2969     TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000   NA
 541294 541295 Mb2970c Mb2971c lppX pks1 FALSE 0.068 292.000 0.500 NA   NA
 541295 541296 Mb2971c Mb2972c pks1 fadD22 TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 541296 541297 Mb2972c Mb2973c fadD22   FALSE 0.138 17.000 0.010 NA N NA
 541297 541298 Mb2973c Mb2974c   fadD29 FALSE 0.097 26.000 0.010 NA N NA
 541298 541299 Mb2974c Mb2975c fadD29   FALSE 0.000 759.000 0.000 NA N NA
 541300 541301 Mb2976 Mb2977     FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 541302 541303 Mb2978c Mb2979c     FALSE 0.022 189.000 0.000 NA   NA
 541304 541305 Mb2980 Mb2981     FALSE 0.299 71.000 0.071 NA   NA
 541306 541307 Mb2982c Mb2983c     FALSE 0.009 101.000 0.000 NA N NA
 541307 541308 Mb2983c Mb2984c     FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 541311 541312 Mb2987 Mb2988   purU FALSE 0.214 73.000 0.012 NA   NA
 541313 541314 Mb2989c Mb2990c kdtB   FALSE 0.496 86.000 0.367 1.000 N NA
 541314 541315 Mb2990c Mb2991c   pca FALSE 0.021 196.000 0.014 1.000 N NA
 541315 541316 Mb2991c Mb2992c pca   FALSE 0.386 25.000 0.021 NA   NA
 541316 541317 Mb2992c Mb2993c     TRUE 0.904 6.000 0.257 NA   NA
 541317 541318 Mb2993c Mb2994c   lipN FALSE 0.460 97.000 0.421 NA N NA
 541319 541320 Mb2995 Mb2996     TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.038   NA
 541321 541322 Mb2997c Mb2998c   recG TRUE 0.905 -3.000 0.018 NA   NA
 541322 541323 Mb2998c Mb2999c recG   TRUE 0.897 3.000 0.040 1.000   NA
 541323 541324 Mb2999c Mb3000c   ung FALSE 0.007 459.000 0.029 1.000   NA
 541324 541325 Mb3000c Mb3001c ung thiL FALSE 0.246 33.000 0.028 1.000 N NA
 541325 541326 Mb3001c Mb3002c thiL   FALSE 0.272 -3.000 0.000 NA N NA
 541326 541327 Mb3002c Mb3003c     TRUE 0.977 0.000 0.000 NA Y NA
 541329 541330 Mb3005c Mb3006c ddlA gpdA2 FALSE 0.245 78.000 0.088 1.000 N NA
 541331 541332 Mb3007 Mb3008   ppk FALSE 0.216 92.000 0.026 NA   NA
 541332 541333 Mb3008 Mb3009 ppk mutT1 FALSE 0.201 83.000 0.056 1.000 N NA
 541334 541335 Mb3010c Mb3011c hupB leuD FALSE 0.027 213.000 0.066 1.000 N NA
 541335 541336 Mb3011c Mb3012c leuD leuC TRUE 0.983 25.000 0.477 0.000 Y NA
 541340 541341 Mbt35 Mbt36 gluU glnU FALSE 0.182 40.000 0.000 NA   NA
 541341 541342 Mbt36 Mb3016c glnU gltS FALSE 0.139 75.000 0.000 NA   NA
 541342 541343 Mb3016c Mb3017c gltS   TRUE 0.907 -3.000 0.070 1.000 N NA
 541345 541346 Mb3019c Mb3020c leuB serA1 TRUE 0.900 15.000 0.039 1.000 Y NA
 541347 541348 Mb3021 Mb3022     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 541350 541351 Mb3024 Mb3025 lppY   FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 541352 541353 Mb3026c Mb3027c ilvC ilvN TRUE 0.939 38.000 0.071 0.001 Y NA
 541353 541354 Mb3027c Mb3028c ilvN ilvB1 TRUE 0.998 0.000 0.380 0.001 Y NA
 541360 541361 Mb3034c Mb3035c gatB pfkA FALSE 0.220 30.000 0.011 1.000 N NA
 541361 541362 Mb3035c Mb3036c pfkA gatA FALSE 0.116 96.000 0.007 1.000 N NA
 541362 541363 Mb3036c Mb3037c gatA gatC TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.001 Y NA
 541365 541366 Mb3039c Mb3040c ligA   FALSE 0.207 31.000 0.009 1.000 N NA
 541368 541369 Mb3042c Mb3043c esxQ PPE46 FALSE 0.128 87.000 0.000 NA   NA
 541369 541370 Mb3043c Mb3044c PPE46 PE27A FALSE 0.289 21.000 0.000 NA   NA
 541370 541371 Mb3044c Mb3045c PE27A esxR FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 541371 541372 Mb3045c Mb3046c esxR esxS FALSE 0.197 35.000 0.000 NA   NA
 541372 541373 Mb3046c Mb3047c esxS PPE47 FALSE 0.167 47.000 0.000 NA   NA
 541373 541374 Mb3047c Mb3048c PPE47 PE29 TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541374 541375 Mb3048c Mb3049c PE29   FALSE 0.003 382.000 0.000 NA   NA
 541375 541376 Mb3049c Mb3050c   trmU FALSE 0.014 163.000 0.000 1.000 N NA
 541376 541377 Mb3050c Mb3051c trmU iscS TRUE 0.917 -3.000 0.094 1.000 N NA
 541377 541378 Mb3051c Mb3052c iscS   FALSE 0.472 97.000 0.045 0.078 N NA
 541378 541379 Mb3052c Mb3053c     TRUE 0.971 -3.000 0.286 NA   NA
 541379 541380 Mb3053c Mb3054c   fixB FALSE 0.021 261.000 0.062 NA   NA
 541380 541381 Mb3054c Mb3055c fixB fixA TRUE 0.980 39.000 0.877 0.008 Y NA
 541382 541383 Mb3056 Mb3057     TRUE 0.935 -3.000 0.019 1.000   NA
 541383 541384 Mb3057 Mb3058     FALSE 0.502 32.000 0.082 1.000   NA
 541384 541385 Mb3058 Mb3059     FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 541388 541389 Mb3062c Mb3063c TB22.2   FALSE 0.248 73.000 0.034 NA   NA
 541389 541390 Mb3063c Mb3064c     FALSE 0.159 135.000 0.112 NA   NA
 541390 541391 Mb3064c Mb3065c   echA17 TRUE 0.945 11.000 0.292 0.078   NA
 541391 541392 Mb3065c Mb3066c echA17   TRUE 0.787 9.000 0.043 1.000   NA
 541392 541393 Mb3066c Mb3067c     TRUE 0.936 -3.000 0.024 1.000   NA
 541393 541394 Mb3067c Mb3068c   serB2 FALSE 0.378 15.000 0.014 1.000 N NA
 541394 541395 Mb3068c Mb3069c serB2 ctaD FALSE 0.178 38.000 0.007 1.000 N NA
 541396 541397 Mb3070 Mb3071 fecB adhC FALSE 0.367 70.000 0.068 1.000   NA
 541398 541399 Mb3072c Mb3073c     FALSE 0.004 334.000 0.000 NA   NA
 541399 541400 Mb3073c Mb3074c   nrdF2 FALSE 0.121 98.000 0.000 NA   NA
 541400 541401 Mb3074c Mb3075c nrdF2   FALSE 0.112 131.000 0.067 1.000 N NA
 541401 541402 Mb3075c Mb3076c     FALSE 0.320 134.000 0.400 1.000 N NA
 541402 541403 Mb3076c Mb3077c   nrdE FALSE 0.139 128.000 0.100 1.000 N NA
 541403 541404 Mb3077c Mb3078c nrdE nrdI TRUE 0.807 66.000 0.300 NA Y NA
 541404 541405 Mb3078c Mb3079c nrdI nrdH TRUE 0.657 35.000 0.500 NA N NA
 541405 541406 Mb3079c Mb3080c nrdH   FALSE 0.003 463.000 0.000 NA   NA
 541407 541408 Mb3081 Mb3082   dinP TRUE 0.785 10.000 0.060 1.000   NA
 541409 541410 Mb3083c Mb3084c     TRUE 0.587 64.000 0.316 1.000   NA
 541412 541413 Mb3086c Mb3087c   fadE22b FALSE 0.077 49.000 0.000 1.000 N NA
 541413 541414 Mb3087c Mb3088c fadE22b fadE22a TRUE 0.802 20.000 0.000 0.009   NA
 541415 541416 Mb3089 Mb3090 ligB cstA FALSE 0.085 136.000 0.049 1.000 N NA
 541418 541419 Mb3092 Mb3093 mmr   TRUE 0.960 -3.000 0.143 1.000   NA
 541419 541420 Mb3093 Mb3094     FALSE 0.089 113.000 0.000 NA   NA
 541421 541422 Mbt37 Mb3095c alaU pgmA FALSE 0.140 67.000 0.000 NA   NA
 541423 541424 Mb3096 Mb3097     TRUE 0.997 -3.000 0.290 0.036 Y NA
 541424 541425 Mb3097 Mb3098     TRUE 0.963 -3.000 0.226 NA   NA
 541426 541427 Mb3099c Mb3100c     TRUE 0.596 7.000 0.000 NA   NA
 541430 541431 Mb3103 Mb3104     TRUE 0.879 -7.000 0.333 NA   NA
 541431 541432 Mb3104 Mb3105   hab TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 541433 541434 Mb3106c Mb3107c   pknK FALSE 0.149 59.000 0.000 NA   NA
 541437 541438 Mb3110 Mb3111   lipR TRUE 0.767 6.000 0.077 1.000 N NA
 541438 541439 Mb3111 Mb3112 lipR   TRUE 0.983 -3.000 0.077 0.078   NA
 541439 541440 Mb3112 Mb3113   adhD TRUE 0.684 31.000 0.000 0.038   NA
 541440 541441 Mb3113 Mb3114 adhD   FALSE 0.188 38.000 0.000 NA   NA
 541441 541442 Mb3114 Mb3115     TRUE 0.970 -3.000 0.286 NA   NA
 541442 541443 Mb3115 Mb3116   fadD13 TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 541443 541444 Mb3116 Mb3117 fadD13   FALSE 0.000 939.000 0.000 NA N NA
 541444 541445 Mb3117 Mb3118     FALSE 0.311 18.000 0.000 NA   NA
 541446 541447 Mb3119c Mb3120c     FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 541447 541448 Mb3120c Mb3121c     TRUE 0.937 -3.000 0.231 NA N NA
 541449 541450 Mb3122 Mb3123     FALSE 0.121 98.000 0.000 NA   NA
 541451 541452 Mb3124c Mb3125c PE_PGRS63   FALSE 0.080 119.000 0.000 NA   NA
 541452 541453 Mb3125c Mbs02   ssr FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 541453 541454 Mbs02 Mb3126c ssr   FALSE 0.543 -6.000 0.000 NA   NA
 541454 541455 Mb3126c Mb3127c   smpB FALSE 0.192 37.000 0.000 NA   NA
 541455 541456 Mb3127c Mb3128c smpB ftsX TRUE 0.799 3.000 0.038 1.000 N NA
 541456 541457 Mb3128c Mb3129c ftsX ftsE TRUE 0.993 1.000 0.431 1.000 Y NA
 541457 541458 Mb3129c Mb3130c ftsE   TRUE 0.644 44.000 0.010 0.063   NA
 541458 541459 Mb3130c Mb3131c     TRUE 0.928 2.000 0.096 1.000   NA
 541459 541460 Mb3131c Mb3132c   prfB FALSE 0.449 -10.000 0.013 1.000 N NA
 541463 541464 Mb3135 Mb3136   moaA1 FALSE 0.043 149.000 0.000 NA   NA
 541464 541465 Mb3136 Mb3137 moaA1 moaB1 TRUE 0.691 51.000 0.000 1.000 Y NA
 541465 541466 Mb3137 Mb3138 moaB1 moaC1 TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 541466 541467 Mb3138 Mb3139 moaC1 moaD1 TRUE 0.969 17.000 0.175 0.004 Y NA
 541467 541468 Mb3139 Mb3140 moaD1   FALSE 0.126 122.000 0.000 1.000   NA
 541468 541469 Mb3140 Mb3141     FALSE 0.460 17.000 0.000 1.000   NA
 541469 541470 Mb3141 Mb3142     FALSE 0.015 162.000 0.000 1.000 N NA
 541470 541471 Mb3142 Mb3143   moeB2 FALSE 0.064 78.000 0.000 1.000 N NA
 541471 541472 Mb3143 Mb3144 moeB2 cysA3 FALSE 0.111 29.000 0.000 1.000 N NA
 541472 541473 Mb3144 Mb3145 cysA3   FALSE 0.003 378.000 0.000 NA   NA
 541473 541474 Mb3145 Mb3146     FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 541474 541475 Mb3146 Mb3147     FALSE 0.003 443.000 0.000 NA   NA
 541476 541477 Mb3148c Mb3149c PPE49   FALSE 0.037 157.000 0.000 NA   NA
 541479 541480 Mb3151c Mb3152c     FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 541484 541485 Mb3156c Mb3157c devS devR TRUE 0.996 -3.000 0.091 0.006 Y NA
 541485 541486 Mb3157c Mb3158c devR   TRUE 0.966 28.000 1.000 1.000 Y NA
 541487 541488 Mb3159 Mb3160 PPE50 PPE51 FALSE 0.017 652.000 0.000 NA Y NA
 541488 541489 Mb3160 Mb3161 PPE51   FALSE 0.000 457.000 0.000 NA N NA
 541489 541490 Mb3161 Mb3162   pflA FALSE 0.153 20.000 0.000 1.000 N NA
 541490 541491 Mb3162 Mb3163 pflA fadE24 FALSE 0.064 80.000 0.000 1.000 N NA
 541491 541492 Mb3163 Mb3164 fadE24 fadE23 TRUE 0.983 21.000 0.604 0.009 Y NA
 541492 541493 Mb3164 Mb3165 fadE23 fadB4 FALSE 0.184 100.000 0.057 1.000 N NA
 541497 541498 Mb3169 Mb3170 nuoA nuoB TRUE 0.994 9.000 0.498 0.002 Y NA
 541498 541499 Mb3170 Mb3171 nuoB nuoC TRUE 0.999 -3.000 0.691 0.002 Y NA
 541499 541500 Mb3171 Mb3172 nuoC nuoD TRUE 0.997 0.000 0.299 0.004 Y NA
 541500 541501 Mb3172 Mb3173 nuoD nuoE TRUE 0.997 -3.000 0.161 0.004 Y NA
 541501 541502 Mb3173 Mb3174 nuoE nuoF TRUE 0.997 -3.000 0.163 0.004 Y NA
 541502 541503 Mb3174 Mb3175 nuoF nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.753 0.004 Y NA
 541503 541504 Mb3175 Mb3176 nuoG nuoH TRUE 0.850 116.000 0.151 0.004 Y NA
 541504 541505 Mb3176 Mb3177 nuoH nuoI TRUE 0.986 -7.000 0.221 0.004 Y NA
 541505 541506 Mb3177 Mb3178 nuoI nuoJ TRUE 0.997 -3.000 0.210 0.004 Y NA
 541506 541507 Mb3178 Mb3179 nuoJ nuoK TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.002 Y NA
 541507 541508 Mb3179 Mb3180 nuoK nuoL TRUE 0.995 11.000 0.790 0.004 Y NA
 541508 541509 Mb3180 Mb3181 nuoL nuoM TRUE 0.999 -3.000 0.373 0.001 Y NA
 541509 541510 Mb3181 Mb3182 nuoM nuoN TRUE 0.998 -3.000 0.257 0.001 Y NA
 541511 541512 Mb3183c Mb3184c PPE53 PPE70 FALSE 0.089 248.000 0.000 NA Y NA
 541512 541513 Mb3184c Mb3185c PPE70   FALSE 0.002 175.000 0.000 NA N NA
 541513 541514 Mb3185c Mb3186c     FALSE 0.277 11.000 0.000 1.000 N NA
 541514 541515 Mb3186c Mb3187c     FALSE 0.260 -84.000 0.000 NA   NA
 541515 541516 Mb3187c Mb3188c     TRUE 0.960 -3.000 0.212 NA   NA
 541516 541517 Mb3188c Mb3189c   moxR3 TRUE 0.838 30.000 0.744 NA   NA
 541517 541518 Mb3189c Mb3190c moxR3   TRUE 0.865 8.000 0.231 NA   NA
 541518 541519 Mb3190c Mb3191c     TRUE 0.976 -3.000 0.345 NA   NA
 541519 541520 Mb3191c Mb3192c     FALSE 0.137 80.000 0.000 NA   NA
 541521 541522 Mb3193 Mb3194     TRUE 0.978 0.000 0.444 NA   NA
 541522 541523 Mb3194 Mb3195   aofH FALSE 0.048 143.000 0.000 NA   NA
 541524 541525 Mb3196c Mb3197c hpx   FALSE 0.055 137.000 0.000 NA   NA
 541525 541526 Mb3197c Mb3198c     FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 541527 541528 Mb3199 Mb3200     FALSE 0.503 15.000 0.000 1.000   NA
 541529 541530 Mb3201c Mb3202c mesTb mesTa FALSE 0.431 12.000 0.000 NA   NA
 541531 541532 Mb3203 Mb3204     FALSE 0.066 131.000 0.000 NA   NA
 541532 541533 Mb3204 Mb3205     FALSE 0.002 821.000 0.000 NA   NA
 541534 541535 Mb3206c Mb3207c     TRUE 0.946 3.000 0.286 NA   NA
 541536 541537 Mb3208 Mb3209     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541537 541538 Mb3209 Mb3210     FALSE 0.004 538.000 0.000 1.000   NA
 541538 541539 Mb3210 Mb3211     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541540 541541 Mb3212c Mb3213c     FALSE 0.002 624.000 0.000 NA   NA
 541541 541542 Mb3213c Mbt38   metU FALSE 0.002 1026.000 0.000 NA   NA
 541544 541545 Mb3215c Mb3216c     FALSE 0.341 92.000 0.069 1.000   NA
 541546 541547 Mb3217 Mb3218     TRUE 0.819 6.000 0.072 NA   NA
 541550 541551 Mb3221c Mb3222c whiB7 uvrD2 FALSE 0.005 430.000 0.000 1.000   NA
 541553 541554 Mb3224c Mb3225c nudC   FALSE 0.211 59.000 0.048 1.000 N NA
 541554 541555 Mb3225c Mb3226c     FALSE 0.270 62.000 0.110 1.000 N NA
 541555 541556 Mb3226c Mb3227c     TRUE 0.999 -3.000 0.493 0.002 Y NA
 541557 541558 Mb3228 Mb3229 lipV   TRUE 0.974 3.000 0.111 0.030   NA
 541559 541560 Mb3230c Mb3231c   moeB1 TRUE 0.643 27.000 0.273 NA   NA
 541560 541561 Mb3231c Mb3232c moeB1   FALSE 0.479 91.000 0.236 1.000   NA
 541566 541567 Mb3237 Mb3238 rhlE   TRUE 0.664 13.000 0.096 NA   NA
 541569 541570 Mb3240 Mb3241 gpm2 entC TRUE 0.936 -3.000 0.167 1.000 N NA
 541570 541571 Mb3241 Mb3242 entC   FALSE 0.182 148.000 0.170 1.000   NA
 541573 541574 Mb3244 Mb3245   whiB1 FALSE 0.012 280.000 0.000 1.000   NA
 541575 541576 Mb3246c Mb3247c   TB7.3 TRUE 0.588 17.000 0.102 NA   NA
 541576 541577 Mb3247c Mb3248c TB7.3   FALSE 0.015 285.000 0.046 NA   NA
 541577 541578 Mb3248c Mb3249c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541578 541579 Mb3249c Mb3250c   sigH TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541580 541581 Mb3251 Mb3252     FALSE 0.266 -64.000 0.000 NA   NA
 541581 541582 Mb3252 Mb3253     FALSE 0.332 -22.000 0.000 NA   NA
 541583 541584 Mb3254c Mb3255c     FALSE 0.075 124.000 0.000 NA   NA
 541585 541586 Mb3256 Mb3257 aroA   TRUE 0.949 -3.000 0.063 1.000   NA
 541587 541588 Mb3258c Mb3259c     TRUE 0.646 78.000 0.583 1.000 N NA
 541588 541589 Mb3259c Mb3260c     FALSE 0.316 110.000 0.208 NA   NA
 541589 541590 Mb3260c Mb3261c   pvdS TRUE 0.913 -3.000 0.029 NA   NA
 541590 541591 Mb3261c Mb3262c pvdS   FALSE 0.399 24.000 0.022 NA   NA
 541593 541594 Mb3264c Mb3265c     TRUE 0.994 5.000 0.889 1.000 Y NA
 541594 541595 Mb3265c Mb3266c     FALSE 0.211 61.000 0.136 NA N NA
 541595 541596 Mb3266c Mb3267c     FALSE 0.180 59.000 0.091 NA N NA
 541596 541597 Mb3267c Mb3268c   secA1 FALSE 0.156 79.000 0.020 1.000 N NA
 541597 541598 Mb3268c Mb3269c secA1   FALSE 0.170 79.000 0.094 NA N NA
 541598 541599 Mb3269c Mb3270c     FALSE 0.013 316.000 0.072 NA   NA
 541599 541600 Mb3270c Mb3271c     FALSE 0.300 38.000 0.022 NA   NA
 541600 541601 Mb3271c Mb3272c   lpqB FALSE 0.285 68.000 0.061 NA   NA
 541601 541602 Mb3272c Mb3273c lpqB mtrB TRUE 0.976 0.000 0.418 NA   NA
 541602 541603 Mb3273c Mb3274c mtrB mtrA TRUE 0.933 50.000 0.772 1.000 Y NA
 541603 541604 Mb3274c Mb3275c mtrA tmk FALSE 0.159 70.000 0.021 1.000 N NA
 541604 541605 Mb3275c Mb3276c tmk sahH FALSE 0.132 97.000 0.016 1.000 N NA
 541605 541606 Mb3276c Mb3277c sahH   FALSE 0.112 105.000 0.012 1.000 N NA
 541606 541607 Mb3277c Mb3278c   rubB TRUE 0.984 -3.000 0.600 1.000 N NA
 541607 541608 Mb3278c Mb3279c rubB rubA TRUE 0.997 5.000 0.750 0.007 Y NA
 541608 541609 Mb3279c Mb3280c rubA alkB TRUE 0.990 0.000 0.778 1.000   NA
 541609 541610 Mb3280c Mb3281c alkB   TRUE 0.719 109.000 0.778 1.000   NA
 541612 541613 Mb3283c Mb3284c manA   TRUE 0.844 8.000 0.198 NA   NA
 541613 541614 Mb3284c Mb3285c   manB TRUE 0.946 -3.000 0.138 NA   NA
 541614 541615 Mb3285c Mb3286c manB   TRUE 0.574 102.000 0.460 NA   NA
 541618 541619 Mb3289 Mb3290 fbiA fbiB TRUE 0.977 -3.000 0.371 NA   NA
 541619 541620 Mb3290 Mb3291 fbiB   FALSE 0.016 296.000 0.018 1.000   NA
 541621 541622 Mb3292c Mb3293c manC wbbL1 TRUE 0.917 2.000 0.151 NA   NA
 541622 541623 Mb3293c Mb3294c wbbL1 rmlD TRUE 0.875 11.000 0.354 NA   NA
 541624 541625 Mb3295 Mb3296     TRUE 0.733 39.000 0.517 NA   NA
 541625 541626 Mb3296 Mb3297     FALSE 0.190 125.000 0.103 NA   NA
 541626 541627 Mb3297 Mb3298   ctpC TRUE 0.911 11.000 0.500 NA   NA
 541629 541630 Mb3300 Mb3301     FALSE 0.469 5.000 0.000 1.000 N NA
 541631 541632 Mb3302c Mb3303c fadE25 purE FALSE 0.249 25.000 0.009 1.000 N NA
 541632 541633 Mb3303c Mb3304c purE purK TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.000 Y NA
 541635 541636 Mb3306c Mb3307c   birA FALSE 0.274 43.000 0.016 NA   NA
 541637 541638 Mb3308 Mb3309 accD5   TRUE 0.906 -19.000 0.692 NA   NA
 541638 541639 Mb3309 Mb3310     TRUE 0.902 -3.000 0.015 NA   NA
 541639 541640 Mb3310 Mb3311   sseA FALSE 0.071 41.000 0.011 NA N NA
 541640 541641 Mb3311 Mb3312 sseA   TRUE 0.976 -3.000 0.351 NA   NA
 541641 541642 Mb3312 Mb3313   accA3 FALSE 0.199 108.000 0.045 NA   NA
 541643 541644 Mb3314c Mb3315c sigF rsbW TRUE 0.982 -3.000 0.636 NA N NA
 541644 541645 Mb3315c Mb3316c rsbW usfY FALSE 0.019 198.000 0.000 NA   NA
 541645 541646 Mb3316c Mb3317c usfY   TRUE 0.642 35.000 0.333 NA   NA
 541646 541647 Mb3317c Mb3318c   lat FALSE 0.410 34.000 0.083 NA   NA
 541647 541648 Mb3318c Mb3319c lat   FALSE 0.416 51.000 0.224 1.000 N NA
 541649 541650 Mb3320 Mb3321   pcd FALSE 0.477 27.000 0.103 NA   NA
 541652 541653 Mb3323 Mb3324   lhr FALSE 0.390 44.000 0.040 1.000   NA
 541653 541654 Mb3324 Mb3325 lhr nei TRUE 0.959 4.000 0.352 1.000   NA
 541655 541656 Mb3326c Mb3327c lpqC atsB FALSE 0.117 27.000 0.000 1.000 N NA
 541656 541657 Mb3327c Mb3328c atsB   FALSE 0.312 20.000 0.015 1.000 N NA
 541657 541658 Mb3328c Mb3329c   phoY1 FALSE 0.051 12.000 0.000 NA N NA
 541658 541659 Mb3329c Mb3330c phoY1 glpD2 FALSE 0.008 108.000 0.000 NA N NA
 541659 541660 Mb3330c Mb3331c glpD2 lpdA TRUE 0.863 81.000 0.071 0.046 Y NA
 541662 541663 Mb3333c Mb3334c amiA1 amiB1 TRUE 0.991 -3.000 0.132 0.003   NA
 541664 541665 Mb3335 Mb3336 deoD pmmB TRUE 0.905 4.000 0.235 1.000 N NA
 541667 541668 Mb3338 Mb3339     FALSE 0.512 24.000 0.100 NA   NA
 541669 541670 Mb3340c Mb3341c     FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   NA
 541670 541671 Mb3341c Mb3342c   add FALSE 0.139 71.000 0.000 NA   NA
 541671 541672 Mb3342c Mb3343c add deoA TRUE 0.987 0.000 0.062 1.000 Y NA
 541672 541673 Mb3343c Mb3344c deoA cdd TRUE 0.992 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 541674 541675 Mb3345 Mb3346 sdhC sdhD TRUE 0.998 -3.000 0.157 0.000 Y NA
 541675 541676 Mb3346 Mb3347 sdhD sdhA TRUE 0.940 129.000 0.705 0.002 Y NA
 541676 541677 Mb3347 Mb3348 sdhA sdhB TRUE 0.999 0.000 0.604 0.002 Y NA
 541678 541679 Mb3349c Mb3350c     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 541679 541680 Mb3350c Mb3351c     FALSE 0.076 122.000 0.000 NA   NA
 541680 541681 Mb3351c Mb3352c   moaX TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541681 541682 Mb3352c Mb3353c moaX moaC TRUE 0.994 1.000 0.025 0.004 Y NA
 541682 541683 Mb3353c Mb3354c moaC moaB3 TRUE 0.849 -24.000 0.000 1.000 Y NA
 541683 541684 Mb3354c Mb3355c moaB3 moaA3 TRUE 0.623 97.000 0.000 1.000 Y NA
 541685 541686 Mb3356 Mb3357     FALSE 0.332 -22.000 0.000 NA   NA
 541686 541687 Mb3357 Mb3358   embR2 FALSE 0.249 -124.000 0.000 NA   NA
 541691 541692 Mb3362 Mb3363   dacB1 FALSE 0.238 69.000 0.077 1.000 N NA
 541692 541693 Mb3363 Mb3364 dacB1 sugI FALSE 0.211 96.000 0.074 1.000 N NA
 541693 541694 Mb3364 Mb3365 sugI nagA TRUE 0.989 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 541697 541698 Mb3368c Mb3369c   trpS FALSE 0.562 21.000 0.045 1.000   NA
 541701 541702 Mb3372 Mb3373 metC metA TRUE 0.974 12.000 0.542 1.000 Y NA
 541702 541703 Mb3373 Mb3374 metA   TRUE 0.927 -3.000 0.136 1.000 N NA
 541704 541705 Mb3375c Mb3376c PPE54 PE_PGRS50b FALSE 0.162 49.000 0.000 NA   NA
 541705 541706 Mb3376c Mb3377c PE_PGRS50b PE_PGRS50a TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541706 541707 Mb3377c Mb3378c PE_PGRS50a   FALSE 0.003 424.000 0.000 NA   NA
 541707 541708 Mb3378c Mb3379c   PPE55b FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 541708 541709 Mb3379c Mb3380c PPE55b PPE55a TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541711 541712 Mb3382c Mb3383c   PPE56d FALSE 0.002 914.000 0.000 NA   NA
 541712 541713 Mb3383c Mb3384c PPE56d PPE56b FALSE 0.543 -6.000 0.000 NA   NA
 541713 541714 Mb3384c Mb3385c PPE56b PPE56a FALSE 0.150 58.000 0.000 NA   NA
 541714 541715 Mb3385c Mb3386c PPE56a   FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 541715 541716 Mb3386c Mb3387c     FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 541716 541717 Mb3387c Mb3388c     FALSE 0.048 143.000 0.000 NA   NA
 541719 541720 Mb3390c Mb3391c   folD TRUE 0.982 -3.000 0.453 NA   NA
 541721 541722 Mb3392 Mb3393     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541722 541723 Mb3393 Mb3394     FALSE 0.177 42.000 0.000 NA   NA
 541723 541724 Mb3394 Mb3395     FALSE 0.083 117.000 0.000 NA   NA
 541725 541726 Mb3396c Mb3397c     TRUE 0.931 7.000 0.412 NA   NA
 541726 541727 Mb3397c Mb3398c     TRUE 0.873 -19.000 0.529 NA   NA
 541727 541728 Mb3398c Mb3399c     TRUE 0.913 -22.000 0.818 NA   NA
 541728 541729 Mb3399c Mb3400c     TRUE 0.988 -3.000 0.636 NA   NA
 541730 541731 Mb3401 Mb3402 spoU PE_PGRS51 FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 541735 541736 Mb3406 Mb3407   otsB2 FALSE 0.275 42.000 0.016 NA   NA
 541736 541737 Mb3407 Mb3408 otsB2 echA18 FALSE 0.005 237.000 0.000 1.000 N NA
 541737 541738 Mb3408 Mb3409 echA18 amiD FALSE 0.469 5.000 0.000 1.000 N NA
 541738 541739 Mb3409 Mb3410 amiD   FALSE 0.165 108.000 0.000 1.000   NA
 541740 541741 Mb3411c Mb3412c     TRUE 0.673 5.000 0.000 NA   NA
 541741 541742 Mb3412c Mb3413c   dxs2 TRUE 0.892 9.000 0.000 0.076   NA
 541742 541743 Mb3413c Mb3414c dxs2 lytB1 TRUE 0.903 30.000 0.333 1.000 Y NA
 541743 541744 Mb3414c Mb3415c lytB1 idsB TRUE 0.655 0.000 0.000 1.000 N NA
 541744 541745 Mb3415c Mb3416c idsB   FALSE 0.002 754.000 0.000 NA   NA
 541745 541746 Mb3416c Mb3417c     TRUE 0.981 0.000 0.500 NA   NA
 541747 541748 Mb3418 Mb3419     TRUE 0.884 -10.000 0.000 NA Y NA
 541748 541749 Mb3419 Mb3420   PE_PGRS52 FALSE 0.021 190.000 0.000 NA   NA
 541751 541752 Mb3422 Mb3423 lpqD acrA1 FALSE 0.189 46.000 0.077 NA N NA
 541755 541756 Mb3426c Mb3427c     TRUE 0.988 -3.000 0.636 NA   NA
 541758 541759 Mb3429c Mb3430c guaA phyA FALSE 0.245 12.000 0.000 1.000 N NA
 541759 541760 Mb3430c Mb3431c phyA idsA1 FALSE 0.111 29.000 0.000 1.000 N NA
 541761 541762 Mb3432 Mb3433     FALSE 0.142 64.000 0.000 NA   NA
 541762 541763 Mb3433 Mb3434     TRUE 0.925 15.000 0.286 0.030   NA
 541764 541765 Mb3436c Mb3437c     FALSE 0.004 371.000 0.000 NA   NA
 541765 541766 Mb3437c Mb3438c     FALSE 0.327 17.000 0.000 NA   NA
 541766 541767 Mb3438c Mb3439c     FALSE 0.135 118.000 0.000 1.000   NA
 541768 541769 Mb3440 Mb3441     FALSE 0.017 35.000 0.000 NA N NA
 541769 541770 Mb3441 Mb3442     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 541771 541772 Mb3443c Mb3444c choD guaB3 FALSE 0.233 56.000 0.057 1.000 N NA
 541772 541773 Mb3444c Mb3445c guaB3 guaB2 TRUE 0.964 20.000 0.056 0.001 Y NA
 541775 541776 Mb3447c Mb3448c   sigD TRUE 0.935 -7.000 0.615 NA   NA
 541776 541777 Mb3448c Mb3449c sigD   TRUE 0.903 18.000 0.706 1.000   NA
 541779 541780 Mb3451c Mb3452c groEL1 groES TRUE 0.959 95.000 0.592 0.003 Y NA
 541780 541781 Mb3452c Mb3453c groES gcp FALSE 0.102 267.000 0.004 1.000 Y NA
 541781 541782 Mb3453c Mb3454c gcp rimI TRUE 0.947 -3.000 0.056 1.000   NA
 541782 541783 Mb3454c Mb3455c rimI   TRUE 0.949 -3.000 0.062 1.000   NA
 541783 541784 Mb3455c Mb3456c     TRUE 0.960 -3.000 0.217 NA   NA
 541784 541785 Mb3456c Mb3457c   alr TRUE 0.912 -3.000 0.028 NA   NA
 541785 541786 Mb3457c Mb3458c alr   FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 541788 541789 Mb3460c Mb3461c     FALSE 0.065 489.000 0.000 0.042 Y NA
 541789 541790 Mb3461c Mb3462c   gadB FALSE 0.005 233.000 0.000 1.000 N NA
 541790 541791 Mb3462c Mb3463c gadB   FALSE 0.069 38.000 0.009 NA N NA
 541791 541792 Mb3463c Mb3464c     TRUE 0.829 2.000 0.004 NA   NA
 541792 541793 Mb3464c Mb3465c     TRUE 0.854 11.000 0.300 NA   NA
 541793 541794 Mb3465c Mb3466c   glmS FALSE 0.020 222.000 0.005 NA   NA
 541795 541796 Mb3467 Mb3468     TRUE 0.754 10.000 0.095 NA   NA
 541797 541798 Mb3469c Mb3470c     TRUE 0.985 3.000 0.875 NA   NA
 541798 541799 Mb3470c Mb3471c   mrsA FALSE 0.241 48.000 0.009 NA   NA
 541799 541800 Mb3471c Mb3472c mrsA rpsI FALSE 0.126 125.000 0.068 1.000 N NA
 541800 541801 Mb3472c Mb3473c rpsI rplM TRUE 0.999 -3.000 0.601 0.012 Y NA
 541801 541802 Mb3473c Mb3474c rplM esxT FALSE 0.012 233.000 0.000 NA   NA
 541802 541803 Mb3474c Mb3475c esxT esxU TRUE 0.622 21.000 0.190 NA   NA
 541803 541804 Mb3475c Mb3476c esxU   TRUE 0.871 -7.000 0.310 NA   NA
 541804 541805 Mb3476c Mb3477c     TRUE 0.975 -3.000 0.333 NA   NA
 541806 541807 Mb3478 Mb3479     TRUE 0.990 -3.000 0.727 NA   NA
 541809 541810 Mb3481 Mb3482 cut3 cut4 TRUE 0.862 47.000 0.500 0.075   NA
 541810 541811 Mb3482 Mb3483 cut4   FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 541812 541813 Mb3484c Mb3485c truA rplQ TRUE 0.875 -55.000 0.102 1.000 Y NA
 541813 541814 Mb3485c Mb3486c rplQ rpoA TRUE 0.838 32.000 0.873 1.000 N NA
 541814 541815 Mb3486c Mb3487c rpoA rpsD FALSE 0.328 148.000 0.549 1.000 N NA
 541815 541816 Mb3487c Mb3488c rpsD rpsK TRUE 0.993 9.000 0.509 0.015 Y NA
 541816 541817 Mb3488c Mb3489c rpsK rpsM TRUE 0.998 4.000 0.810 0.012 Y NA
 541817 541818 Mb3489c Mb3490c rpsM rpmJ FALSE 0.416 216.000 0.086 0.012 Y NA
 541818 541819 Mb3490c Mb3491c rpmJ infA TRUE 0.814 33.000 0.067 1.000 Y NA
 541820 541821 Mb3492 Mb3493   rmlB1 FALSE 0.011 73.000 0.000 NA N NA
 541821 541822 Mb3493 Mb3494 rmlB1 rmlC TRUE 0.988 2.000 0.250 1.000 Y NA
 541822 541823 Mb3494 Mb3495 rmlC   FALSE 0.133 83.000 0.000 NA   NA
 541823 541824 Mb3495 Mb3496     FALSE 0.232 -229.000 0.000 NA   NA
 541825 541826 Mb3497c Mb3498c rmlB2 mhpE FALSE 0.512 4.000 0.000 1.000 N NA
 541826 541827 Mb3498c Mb3499c mhpE ilvB2 TRUE 0.670 61.000 0.000 1.000 Y NA
 541827 541828 Mb3499c Mb3500c ilvB2   FALSE 0.422 6.000 0.000 1.000 N NA
 541830 541831 Mb3502c Mb3503c bpoA kgtP FALSE 0.003 280.000 0.000 1.000 N NA
 541832 541833 Mb3504 Mb3505 PE31 PPE60 TRUE 0.859 37.000 1.000 NA   NA
 541833 541834 Mb3505 Mb3507 PPE60   FALSE 0.015 213.000 0.000 NA   NA
 541834 541835 Mb3507 Mb3508     TRUE 0.673 5.000 0.000 NA   NA
 541836 541837 Mb3509c Mb3510c     FALSE 0.385 14.000 0.000 NA   NA
 541837 541838 Mb3510c Mb3511c     FALSE 0.126 91.000 0.000 NA   NA
 541838 541839 Mb3511c Mb3512c     FALSE 0.050 142.000 0.000 NA   NA
 541839 541840 Mb3512c Mb3513c     TRUE 0.842 44.000 1.000 NA   NA
 541845 541846 Mb3518 Mb3519     FALSE 0.250 82.000 0.041 NA   NA
 541846 541847 Mb3519 Mb3520   otsA TRUE 0.989 0.000 0.800 NA   NA
 541847 541848 Mb3520 Mb3521 otsA   FALSE 0.151 152.000 0.200 NA   NA
 541849 541850 Mb3522c Mb3523c     TRUE 0.989 0.000 0.800 NA   NA
 541850 541851 Mb3523c Mb3524c   mce4F TRUE 0.986 0.000 0.667 NA   NA
 541851 541852 Mb3524c Mb3525c mce4F lprN TRUE 0.994 11.000 0.667 0.005 Y NA
 541852 541853 Mb3525c Mb3526c lprN mce4D TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.005 Y NA
 541853 541854 Mb3526c Mb3527c mce4D mce4C TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.005 Y NA
 541854 541855 Mb3527c Mb3528c mce4C mce4B TRUE 0.993 -10.000 0.667 0.005 Y NA
 541855 541856 Mb3528c Mb3529c mce4B mce4A TRUE 0.999 0.000 0.667 0.005 Y NA
 541856 541857 Mb3529c Mb3530c mce4A yrbE4B TRUE 0.971 20.000 1.000 NA Y NA
 541857 541858 Mb3530c Mb3531c yrbE4B yrbE4A TRUE 0.952 35.000 1.000 NA Y NA
 541858 541859 Mb3531c Mb3532c yrbE4A   FALSE 0.111 226.000 0.000 NA Y NA
 541859 541860 Mb3532c Mb3533c   fdxD TRUE 0.731 25.000 0.429 1.000 N NA
 541861 541862 Mb3534 Mb3535 fadE26 fadE27 TRUE 0.987 25.000 0.882 0.009 Y NA
 541862 541863 Mb3535 Mb3536 fadE27 fadD17 TRUE 0.905 71.000 0.647 1.000 Y NA
 541863 541864 Mb3536 Mb3537 fadD17 PE_PGRS53 FALSE 0.029 171.000 0.000 NA   NA
 541864 541865 Mb3537 Mb3538 PE_PGRS53 PE_PGRS54 FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 541866 541867 Mb3539c Mb3540c ilvX   TRUE 0.962 -3.000 0.167 1.000   NA
 541872 541873 Mb3545 Mb3546 echA19   FALSE 0.358 96.000 0.097 1.000   NA
 541874 541875 Mb3547c Mb3548c cyp142b cyp142a TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.008   NA
 541878 541879 Mb3551 Mb3552     TRUE 0.925 16.000 0.880 NA   NA
 541879 541880 Mb3552 Mb3553     TRUE 0.992 17.000 0.880 0.002 Y NA
 541880 541881 Mb3553 Mb3554     FALSE 0.275 42.000 0.000 1.000   NA
 541883 541884 Mb3556 Mb3557     TRUE 0.968 6.000 0.727 NA   NA
 541885 541886 Mb3558c Mb3559c     FALSE 0.002 692.000 0.000 NA   NA
 541886 541887 Mb3559c Mb3560c     TRUE 0.987 0.000 0.625 1.000   NA
 541887 541888 Mb3560c Mb3561c     TRUE 0.969 -3.000 0.273 NA   NA
 541890 541891 Mb3563c Mb3564c PPE62   FALSE 0.010 99.000 0.000 NA N NA
 541891 541892 Mb3564c Mb3565c     TRUE 0.969 -3.000 0.333 1.000 N NA
 541892 541893 Mb3565c Mb3566c     TRUE 0.957 11.000 0.231 1.000 Y NA
 541894 541895 Mb3567 Mb3568     TRUE 0.990 2.000 0.625 0.036 N NA
 541895 541896 Mb3568 Mb3569   PPE63 FALSE 0.004 137.000 0.000 NA N NA
 541897 541898 Mb3570c Mb3571c ltp2   TRUE 0.981 0.000 0.500 NA   NA
 541898 541899 Mb3571c Mb3572c     TRUE 0.992 -3.000 0.889 NA   NA
 541899 541900 Mb3572c Mb3573c   fadE29 TRUE 0.988 -3.000 0.652 NA   NA
 541900 541901 Mb3573c Mb3574c fadE29 fadE28 TRUE 0.991 -15.000 0.696 0.009 Y NA
 541901 541902 Mb3574c Mb3575c fadE28 cyp125 TRUE 0.988 0.000 0.381 0.045 N NA
 541903 541904 Mb3576 Mb3577 fadA5   FALSE 0.090 112.000 0.000 NA   NA
 541905 541906 Mb3578c Mb3579c     TRUE 0.976 23.000 0.515 0.036 Y NA
 541907 541908 Mb3580 Mb3581 echA20   TRUE 0.998 0.000 0.647 0.075 Y NA
 541908 541909 Mb3581 Mb3582     TRUE 0.997 -3.000 0.912 NA Y NA
 541909 541910 Mb3582 Mb3583     TRUE 0.643 98.000 0.561 NA   NA
 541910 541911 Mb3583 Mb3584   fdxB TRUE 0.982 -3.000 0.037 0.045   NA
 541912 541913 Mb3585c Mb3586c   fadA6 FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 541913 541914 Mb3586c Mb3587c fadA6   FALSE 0.503 65.000 0.423 NA N NA
 541916 541917 Mb3589c Mb3590c   fadE30 TRUE 0.997 -3.000 0.629 1.000 Y NA
 541918 541919 Mb3591 Mb3592 fadD3 fadE31 TRUE 0.989 1.000 0.242 1.000 Y NA
 541919 541920 Mb3592 Mb3593 fadE31 fadE32 TRUE 0.997 -3.000 0.879 0.009   NA
 541920 541921 Mb3593 Mb3594 fadE32 fadE33 TRUE 0.995 -3.000 0.484 0.009   NA
 541921 541922 Mb3594 Mb3595 fadE33 aspB TRUE 0.865 -3.000 0.024 1.000 N NA
 541923 541924 Mb3596c Mb3597c nat   FALSE 0.390 -15.000 0.000 NA   NA
 541924 541925 Mb3597c Mb3598c     FALSE 0.007 286.000 0.000 NA   NA
 541925 541926 Mb3598c Mb3599c   bphC TRUE 0.894 15.000 0.520 1.000   NA
 541926 541927 Mb3599c Mb3600c bphC bphD TRUE 0.997 -3.000 0.733 0.007   NA
 541927 541928 Mb3600c Mb3601c bphD   TRUE 0.926 15.000 0.733 1.000   NA
 541929 541930 Mb3602 Mb3603 hmp   TRUE 0.890 18.000 0.727 NA   NA
 541934 541935 Mb3607 Mb3608 lppH   FALSE 0.021 191.000 0.000 NA   NA
 541935 541936 Mb3608 Mb3609   arsB2 TRUE 0.631 14.000 0.078 NA   NA
 541937 541938 Mb3610c Mb3611c   cysS1 TRUE 0.985 1.000 0.088 1.000 Y NA
 541938 541939 Mb3611c Mb3612c cysS1 ispF FALSE 0.185 65.000 0.037 1.000 N NA
 541939 541940 Mb3612c Mb3613c ispF ispD TRUE 0.995 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 541940 541941 Mb3613c Mb3614c ispD   FALSE 0.470 17.000 0.068 1.000 N NA
 541942 541943 Mb3615 Mb3616 lpqE radA FALSE 0.298 66.000 0.014 1.000   NA
 541943 541944 Mb3616 Mb3617 radA   TRUE 0.867 5.000 0.126 NA   NA
 541945 541946 Mb3618c Mb3619c     FALSE 0.444 109.000 0.333 NA   NA
 541948 541949 Mb3621c Mb3622c PE_PGRS58   FALSE 0.093 111.000 0.000 NA   NA
 541950 541951 Mb3623 Mb3624 TB11.2 lpqF TRUE 0.637 -22.000 0.160 NA   NA
 541951 541952 Mb3624 Mb3625 lpqF   FALSE 0.045 147.000 0.000 NA   NA
 541953 541954 Mb3626c Mb3627c PE_PGRS59 clpC FALSE 0.101 108.000 0.000 NA   NA
 541954 541955 Mb3627c Mb3628c clpC lsr2 FALSE 0.007 277.000 0.000 NA   NA
 541955 541956 Mb3628c Mb3629c lsr2 lysS FALSE 0.395 104.000 0.247 NA   NA
 541956 541957 Mb3629c Mb3630c lysS   FALSE 0.126 101.000 0.015 1.000 N NA
 541957 541958 Mb3630c Mb3631c   panD TRUE 0.787 3.000 0.030 1.000 N NA
 541958 541959 Mb3631c Mb3632c panD panC TRUE 0.993 0.000 0.342 1.000 Y NA
 541959 541960 Mb3632c Mb3633c panC   TRUE 0.950 -3.000 0.067 1.000   NA
 541960 541961 Mb3633c Mb3634c     FALSE 0.053 185.000 0.054 NA   NA
 541961 541962 Mb3634c Mb3635c     FALSE 0.076 209.000 0.237 NA   NA
 541962 541963 Mb3635c Mb3636c   folK TRUE 0.924 0.000 0.081 NA   NA
 541963 541964 Mb3636c Mb3637c folK folB TRUE 0.989 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 541964 541965 Mb3637c Mb3638c folB folP1 TRUE 0.978 -7.000 0.471 1.000 Y NA
 541965 541966 Mb3638c Mb3639c folP1 folE TRUE 0.997 -3.000 0.609 1.000 Y NA
 541966 541967 Mb3639c Mb3640c folE ftsH TRUE 0.650 16.000 0.212 1.000 N NA
 541969 541970 Mb3642c Mb3643c     FALSE 0.200 34.000 0.000 NA   NA
 541970 541971 Mb3643c Mb3644c     FALSE 0.119 100.000 0.000 NA   NA
 541971 541972 Mb3644c Mb3645c     TRUE 0.702 116.000 1.000 NA   NA
 541972 541973 Mb3645c Mb3646c     TRUE 0.805 74.000 1.000 NA   NA
 541975 541976 Mb3648c Mb3649c hpt mesJ TRUE 0.981 -3.000 0.137 0.025 N NA
 541976 541977 Mb3649c Mb3650c mesJ   FALSE 0.550 -21.000 0.050 NA   NA
 541977 541978 Mb3650c Mb3651c     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 541981 541982 Mb3654 Mb3655     FALSE 0.173 44.000 0.000 NA   NA
 541982 541983 Mb3655 Mb3656     TRUE 0.936 -3.000 0.081 NA   NA
 541983 541984 Mb3656 Mb3657     FALSE 0.016 211.000 0.000 NA   NA
 541986 541987 Mb3659 Mb3660     FALSE 0.004 343.000 0.000 NA   NA
 541987 541988 Mb3660 Mb3661     FALSE 0.003 385.000 0.000 NA   NA
 541988 541989 Mb3661 Mb3662     TRUE 0.977 0.000 0.000 NA Y NA
 541990 541991 Mb3663c Mb3664c     FALSE 0.139 70.000 0.000 NA   NA
 541991 541992 Mb3664c Mb3665c   fic FALSE 0.012 176.000 0.000 1.000 N NA
 541992 541993 Mb3665c Mb3666c fic   TRUE 0.827 11.000 0.250 NA   NA
 541995 541996 Mbt39 Mb3668c thrU   FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 541998 541999 Mb3670c Mb3671c topA   FALSE 0.006 353.000 0.008 NA   NA
 541999 542000 Mb3671c Mb3672c   cspA FALSE 0.443 140.000 0.611 NA   NA
 542001 542002 Mb3673 Mb3674   PE33 FALSE 0.055 137.000 0.000 NA   NA
 542002 542003 Mb3674 Mb3675 PE33   FALSE 0.005 324.000 0.000 NA   NA
 542003 542004 Mb3675 Mb3676   PE_PGRS60 FALSE 0.002 754.000 0.000 NA   NA
 542004 542005 Mb3676 Mb3677 PE_PGRS60 PE_PGRS61 FALSE 0.543 -6.000 0.000 NA   NA
 542006 542007 Mb3678c Mb3679c     FALSE 0.313 86.000 0.118 NA   NA
 542007 542008 Mb3679c Mb3680c     FALSE 0.264 24.000 0.000 NA   NA
 542008 542009 Mb3680c Mb3681c     TRUE 0.744 10.000 0.080 NA   NA
 542009 542010 Mb3681c Mb3682c     TRUE 0.931 24.000 0.323 0.001   NA
 542010 542011 Mb3682c Mb3683c     TRUE 0.997 -3.000 0.659 1.000 Y NA
 542011 542012 Mb3683c Mb3684c     TRUE 0.644 102.000 0.776 NA N NA
 542014 542015 Mb3686c Mb3687c   dppD TRUE 0.955 -3.000 0.104 1.000   NA
 542015 542016 Mb3687c Mb3688c dppD dppC TRUE 0.991 -3.000 0.725 1.000   NA
 542016 542017 Mb3688c Mb3689c dppC dppB TRUE 0.971 56.000 0.811 0.016 Y NA
 542017 542018 Mb3689c Mb3690c dppB dppA TRUE 0.994 2.000 0.147 0.016 Y NA
 542021 542022 Mb3693 Mb3694   ephE TRUE 0.975 1.000 0.494 NA   NA
 542023 542024 Mb3695c Mb3696c     TRUE 0.944 6.000 0.367 1.000   NA
 542024 542025 Mb3696c Mb3697c     FALSE 0.270 132.000 0.304 1.000 N NA
 542025 542026 Mb3697c Mb3698c   nth TRUE 0.840 0.000 0.022 1.000 N NA
 542027 542028 Mb3699 Mb3700     FALSE 0.295 99.000 0.116 NA   NA
 542029 542030 Mb3701c Mb3702c     TRUE 0.758 7.000 0.039 NA   NA
 542030 542031 Mb3702c Mb3703c     TRUE 0.605 16.000 0.094 NA   NA
 542032 542033 Mb3704 Mb3705     TRUE 0.999 -3.000 0.709 0.001 Y NA
 542035 542036 Mb3707 Mb3708 ponA2   FALSE 0.373 69.000 0.072 1.000   NA
 542036 542037 Mb3708 Mb3709     FALSE 0.362 63.000 0.057 1.000   NA
 542037 542038 Mb3709 Mbt40   proY FALSE 0.144 62.000 0.000 NA   NA
 542039 542040 Mb3710c Mb3711c cyp137   FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 542040 542041 Mb3711c Mb3712c     FALSE 0.011 240.000 0.000 NA   NA
 542041 542042 Mb3712c Mb3713c     FALSE 0.005 325.000 0.000 NA   NA
 542043 542044 Mb3714 Mb3715     TRUE 0.820 27.000 0.628 NA   NA
 542044 542045 Mb3715 Mb3716     TRUE 0.633 126.000 0.841 NA   NA
 542045 542046 Mb3716 Mb3717   moxR2 TRUE 0.972 -3.000 0.302 NA   NA
 542046 542047 Mb3717 Mb3718 moxR2   FALSE 0.498 134.000 0.648 NA   NA
 542050 542051 Mb3721c Mb3722c glpKb glpKa FALSE 0.243 -181.000 0.000 NA   NA
 542051 542052 Mb3722c Mb3723c glpKa   FALSE 0.160 50.000 0.000 NA   NA
 542053 542054 Mb3724 Mb3725     TRUE 0.622 22.000 0.200 NA   NA
 542055 542056 Mb3726c Mb3727c     FALSE 0.426 31.000 0.077 NA   NA
 542056 542057 Mb3727c Mb3728c     TRUE 0.973 -3.000 0.316 NA   NA
 542057 542058 Mb3728c Mb3729c     TRUE 0.984 0.000 0.597 NA   NA
 542058 542059 Mb3729c Mb3730c   gshA TRUE 0.976 -3.000 0.337 NA   NA
 542059 542060 Mb3730c Mb3731c gshA   FALSE 0.146 132.000 0.063 NA   NA
 542060 542061 Mb3731c Mb3732c     FALSE 0.259 129.000 0.222 NA   NA
 542061 542062 Mb3732c Mb3733c     TRUE 0.622 111.000 0.667 NA   NA
 542062 542063 Mb3733c Mb3734c     FALSE 0.290 119.000 0.222 NA   NA
 542063 542064 Mb3734c Mb3735c   asd FALSE 0.085 140.000 0.012 NA   NA
 542064 542065 Mb3735c Mb3736c asd ask TRUE 0.985 1.000 0.119 1.000 Y NA
 542068 542069 Mb3739 Mb3740   cobQ2 TRUE 0.980 5.000 0.796 1.000   NA
 542070 542071 Mb3741c Mb3742c   recR FALSE 0.273 68.000 0.003 1.000   NA
 542071 542072 Mb3742c Mb3743c recR   TRUE 0.915 12.000 0.604 NA   NA
 542075 542076 Mb3746 Mb3747     TRUE 0.850 18.000 0.633 1.000 N NA
 542077 542078 Mb3748c Mb3749c dnaZX   FALSE 0.199 90.000 0.061 1.000 N NA
 542079 542080 Mbt41 Mb3750 serV   FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 542080 542081 Mb3750 Mb3751   cut5 FALSE 0.030 167.000 0.000 NA   NA
 542081 542082 Mb3751 Mb3752 cut5   FALSE 0.264 45.000 0.000 1.000   NA
 542082 542083 Mb3752 Mb3753     FALSE 0.007 207.000 0.000 1.000 N NA
 542083 542084 Mb3753 Mb3754     FALSE 0.033 341.000 0.000 0.036   NA
 542084 542085 Mb3754 Mb3755     FALSE 0.241 110.000 0.036 1.000   NA
 542085 542086 Mb3755 Mb3756     FALSE 0.026 215.000 0.000 1.000   NA
 542088 542089 Mb3758 Mb3759 ligC   FALSE 0.119 100.000 0.000 NA   NA
 542090 542091 Mb3760c Mb3761c     FALSE 0.554 14.000 0.029 NA   NA
 542092 542093 Mb3762 Mb3763     FALSE 0.152 57.000 0.000 NA   NA
 542093 542094 Mb3763 Mb3764     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 542095 542096 Mb3765c Mb3766c PPE66   FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 542096 542097 Mb3766c Mb3767c     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 542097 542098 Mb3767c Mb3768c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 542098 542099 Mb3768c Mb3769c   ctpJ FALSE 0.077 146.000 0.000 1.000   NA
 542101 542102 Mb3771c Mb3772c   PE34 FALSE 0.212 73.000 0.012 NA   NA
 542103 542104 Mb3773 Mb3774     FALSE 0.067 130.000 0.000 NA   NA
 542105 542106 Mb3775c Mb3776c     FALSE 0.222 68.000 0.000 1.000   NA
 542108 542109 Mbt42 Mb3778c serX   FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 542109 542110 Mb3778c Mb3779c     FALSE 0.553 16.000 0.053 NA   NA
 542112 542113 Mb3781c Mb3782c   proZ TRUE 0.846 6.000 0.136 NA   NA
 542113 542114 Mb3782c Mb3783c proZ proW TRUE 0.999 -3.000 0.918 0.016 Y NA
 542114 542115 Mb3783c Mb3784c proW proV TRUE 0.979 -12.000 0.694 1.000 Y NA
 542115 542116 Mb3784c Mb3785c proV proX TRUE 0.703 9.000 0.085 1.000 N NA
 542118 542119 Mb3787c Mb3788c fadE36   FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 542121 542122 Mb3790c Mb3791c     TRUE 0.961 71.000 0.742 0.034 Y NA
 542125 542126 Mb3794 Mb3795     FALSE 0.023 186.000 0.000 NA   NA
 542127 542128 Mb3796c Mb3797c     FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 542128 542129 Mb3797c Mb3798c     FALSE 0.366 15.000 0.000 NA   NA
 542129 542130 Mb3798c Mb3799c     FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 542130 542131 Mb3799c Mbt43   argU FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 542131 542132 Mbt43 Mbt44 argU serT FALSE 0.215 31.000 0.000 NA   NA
 542134 542135 Mb3801c Mb3802c     TRUE 0.673 5.000 0.000 NA   NA
 542136 542137 Mb3803 Mb3804 echA21 lipE TRUE 0.658 12.000 0.148 1.000 N NA
 542137 542138 Mb3804 Mb3805 lipE   FALSE 0.063 157.000 0.000 1.000   NA
 542142 542143 Mb3808 Mb3809     TRUE 0.875 4.000 0.093 NA   NA
 542143 542144 Mb3809 Mb3810   rfbE TRUE 0.888 4.000 0.136 NA   NA
 542144 542145 Mb3810 Mb3811 rfbE   TRUE 0.972 -3.000 0.303 NA   NA
 542145 542146 Mb3811 Mb3812   rfbD TRUE 0.961 -3.000 0.220 NA   NA
 542146 542147 Mb3812 Mb3813 rfbD rfbB FALSE 0.279 156.000 0.000 NA Y NA
 542147 542148 Mb3813 Mb3814 rfbB   FALSE 0.131 84.000 0.000 NA   NA
 542149 542150 Mb3815c Mb3816c     FALSE 0.046 13.000 0.000 NA N NA
 542151 542152 Mb3817 Mb3818     FALSE 0.472 109.000 0.300 1.000   NA
 542152 542153 Mb3818 Mb3819     FALSE 0.397 40.000 0.033 1.000   NA
 542153 542154 Mb3819 Mb3820     TRUE 0.959 1.000 0.242 1.000   NA
 542154 542155 Mb3820 Mb3821     TRUE 0.973 3.000 0.543 NA   NA
 542155 542156 Mb3821 Mb3822   embC TRUE 0.972 0.000 0.360 NA   NA
 542156 542157 Mb3822 Mb3823 embC embA TRUE 0.881 86.000 0.455 0.001   NA
 542157 542158 Mb3823 Mb3824 embA embB TRUE 0.996 -3.000 0.400 0.001   NA
 542158 542159 Mb3824 Mb3825 embB   FALSE 0.453 68.000 0.182 1.000   NA
 542159 542160 Mb3825 Mb3826   fadE35 FALSE 0.218 80.000 0.000 1.000   NA
 542160 542161 Mb3826 Mb3827 fadE35   FALSE 0.119 127.000 0.000 1.000   NA
 542161 542162 Mb3827 Mb3828     TRUE 0.828 -25.000 0.000 0.006   NA
 542163 542164 Mb3829c Mb3830c accD4 pks13 TRUE 0.989 -3.000 0.800 1.000 N NA
 542164 542165 Mb3830c Mb3831c pks13 fadD32 TRUE 0.986 7.000 0.520 1.000 Y NA
 542165 542166 Mb3831c Mb3832c fadD32   FALSE 0.069 289.000 0.091 0.073   NA
 542166 542167 Mb3832c Mb3833c   fbpD FALSE 0.078 198.000 0.136 1.000   NA
 542167 542168 Mb3833c Mb3834c fbpD fbpA FALSE 0.109 180.000 0.222 NA   NA
 542168 542169 Mb3834c Mb3835c fbpA   FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 542169 542170 Mb3835c Mb3836c     FALSE 0.289 89.000 0.086 NA   NA
 542170 542171 Mb3836c Mb3837c     TRUE 0.866 7.000 0.136 1.000   NA
 542171 542172 Mb3837c Mb3838c     TRUE 0.771 29.000 0.500 NA   NA
 542172 542173 Mb3838c Mb3839c   glf TRUE 0.940 -3.000 0.105 NA   NA
 542174 542175 Mb3840 Mb3841 pirG   FALSE 0.089 205.000 0.269 NA   NA
 542175 542176 Mb3841 Mb3842   PE_PGRS62 FALSE 0.039 154.000 0.000 NA   NA
 542177 542178 Mb3843c Mb3844c     TRUE 0.880 15.000 0.154 0.073   NA
 542178 542179 Mb3844c Mb3845c     TRUE 0.989 18.000 0.750 0.004 Y NA
 542179 542180 Mb3845c Mb3846c     TRUE 0.995 4.000 0.267 0.004 Y NA
 542181 542182 Mb3847 Mb3848     FALSE 0.346 47.000 0.071 NA   NA
 542182 542183 Mb3848 Mb3849     TRUE 0.973 -3.000 0.250 1.000   NA
 542185 542186 Mb3851 Mb3852     FALSE 0.197 35.000 0.000 NA   NA
 542187 542188 Mb3853c Mb3854c mmpL8 papA1 FALSE 0.095 110.000 0.000 NA   NA
 542188 542189 Mb3854c Mb3855c papA1 pks2 FALSE 0.158 51.000 0.000 NA   NA
 542191 542192 Mb3857c Mb3858c     TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 542192 542193 Mb3858c Mb3859c     TRUE 0.604 1.000 0.000 1.000 N NA
 542193 542194 Mb3859c Mb3860c     TRUE 0.813 48.000 1.000 1.000 N NA
 542199 542200 Mb3865 Mb3866     TRUE 0.946 5.000 0.387 NA   NA
 542201 542202 Mb3867c Mb3868c   pheA TRUE 0.861 -3.000 0.079 NA N NA
 542203 542204 Mb3869 Mb3870     FALSE 0.422 26.000 0.048 NA   NA
 542204 542205 Mb3870 Mb3871   bfrB FALSE 0.040 198.000 0.042 NA   NA
 542206 542207 Mb3872c Mb3873c glpQ1   TRUE 0.826 6.000 0.087 NA   NA
 542208 542209 Mb3874 Mb3875     FALSE 0.366 15.000 0.000 NA   NA
 542209 542210 Mb3875 Mb3876   sodA FALSE 0.001 1064.000 0.000 NA   NA
 542210 542211 Mb3876 Mb3877 sodA   FALSE 0.016 211.000 0.000 NA   NA
 542211 542212 Mb3877 Mb3878     FALSE 0.015 255.000 0.008 NA   NA
 542212 542213 Mb3878 Mb3879     FALSE 0.015 265.000 0.000 1.000   NA
 542213 542214 Mb3879 Mb3880     FALSE 0.232 118.000 0.148 NA   NA
 542214 542215 Mb3880 Mb3881     FALSE 0.431 12.000 0.000 NA   NA
 542215 542216 Mb3881 Mb3882   hns FALSE 0.104 107.000 0.000 NA   NA
 542216 542217 Mb3882 Mb3883 hns menG FALSE 0.537 17.000 0.056 NA   NA
 542220 542221 Mb3886c Mb3887c     FALSE 0.542 9.000 0.000 NA   NA
 542221 542222 Mb3887c Mb3888c   gltD FALSE 0.003 425.000 0.000 NA   NA
 542222 542223 Mb3888c Mb3889c gltD gltB TRUE 0.985 -7.000 0.043 0.000 Y NA
 542224 542225 Mb3890 Mb3891     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 542227 542228 Mb3893 Mb3894     FALSE 0.010 243.000 0.000 NA   NA
 542228 542229 Mb3894 Mb3895     TRUE 0.789 88.000 1.000 NA   NA
 542229 542230 Mb3895 Mb3896     TRUE 0.923 3.000 0.200 NA   NA
 542230 542231 Mb3896 Mb3897     FALSE 0.489 39.000 0.200 NA   NA
 542231 542232 Mb3897 Mb3898     TRUE 0.920 -7.000 0.500 NA   NA
 542232 542233 Mb3898 Mb3899     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 542233 542234 Mb3899 Mb3900     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 542234 542235 Mb3900 Mb3901     TRUE 0.925 103.000 1.000 0.003   NA
 542235 542236 Mb3901 Mb3902   PE35 FALSE 0.237 143.000 0.286 NA   NA
 542236 542237 Mb3902 Mb3903 PE35 PPE68 TRUE 0.802 34.000 0.667 NA   NA
 542237 542238 Mb3903 Mb3904 PPE68 esxB FALSE 0.432 93.000 0.250 NA   NA
 542238 542239 Mb3904 Mb3905 esxB esxA TRUE 0.653 33.000 0.333 NA   NA
 542239 542240 Mb3905 Mb3906 esxA   FALSE 0.338 114.000 0.250 NA   NA
 542240 542241 Mb3906 Mb3907     TRUE 0.981 -3.000 0.429 NA   NA
 542241 542242 Mb3907 Mb3908     FALSE 0.364 151.000 0.571 NA   NA
 542243 542244 Mb3909c Mb3910c     FALSE 0.003 417.000 0.000 NA   NA
 542244 542245 Mb3910c Mb3911c     TRUE 0.886 -3.000 0.002 NA   NA
 542245 542246 Mb3911c Mb3912c     FALSE 0.417 107.000 0.286 NA   NA
 542246 542247 Mb3912c Mb3913c     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 542247 542248 Mb3913c Mb3914c     FALSE 0.140 222.000 0.000 1.000 Y NA
 542248 542249 Mb3914c Mb3915c     TRUE 0.650 70.000 0.500 NA   NA
 542249 542250 Mb3915c Mb3916c     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 542250 542251 Mb3916c Mb3917c     TRUE 0.942 -15.000 1.000 NA   NA
 542251 542252 Mb3917c Mb3918c     FALSE 0.372 -18.000 0.000 NA   NA
 542252 542253 Mb3918c Mb3919c   esxC TRUE 0.971 8.000 1.000 NA   NA
 542253 542254 Mb3919c Mb3920c esxC esxD TRUE 0.680 36.000 0.400 NA   NA
 542254 542255 Mb3920c Mb3921c esxD PPE69 FALSE 0.093 111.000 0.000 NA   NA
 542255 542256 Mb3921c Mb3922c PPE69 PE36 TRUE 0.804 79.000 1.000 NA   NA
 542256 542257 Mb3922c Mb3923c PE36   FALSE 0.008 267.000 0.000 NA   NA
 542257 542258 Mb3923c Mb3924c     TRUE 0.962 5.000 0.000 0.003   NA
 542258 542259 Mb3924c Mb3925c     TRUE 0.976 1.000 0.500 NA   NA
 542259 542260 Mb3925c Mb3926c     TRUE 0.648 44.000 0.400 NA   NA
 542260 542261 Mb3926c Mb3927c     FALSE 0.042 150.000 0.000 NA   NA
 542261 542262 Mb3927c Mb3928c     FALSE 0.469 162.000 1.000 NA   NA
 542262 542263 Mb3928c Mb3929c     FALSE 0.218 -393.000 0.000 NA   NA
 542263 542264 Mb3929c Mb3930c     FALSE 0.543 -6.000 0.000 NA   NA
 542264 542265 Mb3930c Mb3931c     FALSE 0.152 57.000 0.000 NA   NA
 542265 542266 Mb3931c Mb3932c     FALSE 0.002 551.000 0.000 NA   NA
 542266 542267 Mb3932c Mb3933c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 542267 542268 Mb3933c Mb3934c   esxE TRUE 0.952 5.000 0.429 NA   NA
 542268 542269 Mb3934c Mb3935c esxE esxF FALSE 0.299 149.000 0.429 NA   NA
 542269 542270 Mb3935c Mb3936c esxF   FALSE 0.140 66.000 0.000 NA   NA
 542270 542271 Mb3936c Mb3937c   pcnA FALSE 0.483 25.000 0.078 NA   NA
 542272 542273 Mb3938 Mb3939     TRUE 0.976 -3.000 0.351 NA   NA
 542273 542274 Mb3939 Mb3940     TRUE 0.980 -3.000 0.411 NA   NA
 542274 542275 Mb3940 Mb3941   sigMa TRUE 0.674 35.000 0.306 1.000   NA
 542275 542276 Mb3941 Mb3942 sigMa sigMb FALSE 0.256 -111.000 0.000 NA   NA
 542276 542277 Mb3942 Mb3943 sigMb   FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 542277 542278 Mb3943 Mb3944   trxB2 FALSE 0.199 94.000 0.015 NA   NA
 542278 542279 Mb3944 Mb3945 trxB2 trxC TRUE 0.988 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 542279 542280 Mb3945 Mb3946 trxC   FALSE 0.294 110.000 0.237 1.000 N NA
 542281 542282 Mb3947c Mb3948c   parB FALSE 0.011 290.000 0.013 NA   NA
 542282 542283 Mb3948c Mb3949c parB parA TRUE 0.990 -3.000 0.827 1.000 N NA
 542283 542284 Mb3949c Mb3950c parA gid TRUE 0.971 -3.000 0.339 1.000 N NA
 542284 542285 Mb3950c Mb3951c gid   FALSE 0.199 132.000 0.070 1.000   NA
 542285 542286 Mb3951c Mb3952c     FALSE 0.309 72.000 0.024 1.000   NA
 542286 542287 Mb3952c Mb3953c     FALSE 0.499 -16.000 0.010 NA   NA
 542287 542288 Mb3953c Mb3954c   rnpA TRUE 0.985 -3.000 0.540 NA   NA
 542288 542289 Mb3954c Mb3955c rnpA rpmH TRUE 0.894 24.000 0.787 1.000   NA