MicrobesOnline Operon Predictions for Listeria monocytogenes str. 1/2a F6854

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2279937 2279938 LMOf6854_0616 LMOf6854_0615     TRUE 0.600 44.000 0.545 1.000 N NA
 2279943 2279944 LMOf6854_0610 LMOf6854_0609   hisG TRUE 0.995 -3.000 0.239 0.006 Y NA
 2279944 2279945 LMOf6854_0609 LMOf6854_0608 hisG hisD TRUE 0.995 -3.000 0.254 0.006 Y NA
 2279945 2279946 LMOf6854_0608 LMOf6854_0607 hisD hisB TRUE 0.996 1.000 0.096 0.006 Y NA
 2279946 2279947 LMOf6854_0607 LMOf6854_0606 hisB hisH TRUE 0.996 1.000 0.125 0.006 Y NA
 2279947 2279948 LMOf6854_0606 LMOf6854_0605 hisH hisA TRUE 0.984 -21.000 0.051 0.006 Y NA
 2279948 2279949 LMOf6854_0605 LMOf6854_0604 hisA hisF TRUE 0.987 -10.000 0.013 0.006 Y NA
 2279949 2279950 LMOf6854_0604 LMOf6854_0603 hisF   TRUE 0.996 -3.000 0.430 0.006 Y NA
 2279950 2279951 LMOf6854_0603 LMOf6854_0602     TRUE 0.997 1.000 0.152 0.001 Y NA
 2279951 2279952 LMOf6854_0602 LMOf6854_0601   gdhA FALSE 0.061 493.000 0.000 1.000 Y NA
 2279955 2279956 LMOf6854_0598 LMOf6854_0597     TRUE 0.996 1.000 0.167 0.005 Y NA
 2279956 2279957 LMOf6854_0597 LMOf6854_0596     FALSE 0.348 129.000 0.833 1.000 N NA
 2279957 2279958 LMOf6854_0596 LMOf6854_0595     FALSE 0.276 90.000 0.176 1.000 N NA
 2279960 2279961 LMOf6854_0593 LMOf6854_0592     FALSE 0.500 76.000 0.800 NA   NA
 2279961 2279962 LMOf6854_0592 LMOf6854_0591     TRUE 0.659 44.000 0.889 NA   NA
 2279962 2279963 LMOf6854_0591 LMOf6854_0590     FALSE 0.393 -30.000 0.000 NA   NA
 2279963 2279964 LMOf6854_0590 LMOf6854_0589     FALSE 0.463 18.000 0.000 NA   NA
 2279965 2279966 LMOf6854_0588 LMOf6854_0587     FALSE 0.012 258.000 0.000 1.000 N NA
 2279966 2279967 LMOf6854_0587 LMOf6854_0586     FALSE 0.465 55.000 0.304 NA   NA
 2279967 2279968 LMOf6854_0586 LMOf6854_0585   srlA TRUE 0.700 25.000 0.625 NA   NA
 2279968 2279969 LMOf6854_0585 LMOf6854_0584 srlA srlE TRUE 0.982 21.000 0.500 0.042 Y NA
 2279969 2279970 LMOf6854_0584 LMOf6854_0583 srlE srlB TRUE 0.983 19.000 0.258 0.042 Y NA
 2279970 2279971 LMOf6854_0583 LMOf6854_0582 srlB   FALSE 0.267 111.000 0.258 1.000 N NA
 2279974 2279975 LMOf6854_0579 LMOf6854_0578     TRUE 0.857 -34.000 0.000 0.006   NA
 2279975 2279976 LMOf6854_0578 LMOf6854_0577     FALSE 0.301 106.000 0.360 1.000 N NA
 2279978 2279979 LMOf6854_0575 LMOf6854_0574     TRUE 0.816 19.000 0.569 NA   NA
 2279979 2279980 LMOf6854_0574 LMOf6854_0573     TRUE 0.565 78.000 0.074 0.069   NA
 2279980 2279981 LMOf6854_0573 LMOf6854_0572     FALSE 0.491 60.000 0.244 1.000   NA
 2279981 2279982 LMOf6854_0572 LMOf6854_0571     TRUE 0.914 13.000 0.333 1.000   NA
 2279982 2279983 LMOf6854_0571 LMOf6854_0570     TRUE 0.816 16.000 0.230 NA   NA
 2279983 2279984 LMOf6854_0570 LMOf6854_0569     TRUE 0.879 11.000 0.180 NA   NA
 2279984 2279985 LMOf6854_0569 LMOf6854_0568     TRUE 0.827 -7.000 0.219 NA   NA
 2279989 2279990 LMOf6854_0564 LMOf6854_0563     FALSE 0.266 106.000 0.314 NA   NA
 2279992 2279993 LMOf6854_0561 LMOf6854_0560     FALSE 0.243 132.000 0.268 1.000   NA
 2279993 2279994 LMOf6854_0560 LMOf6854_0559   lmrB TRUE 0.769 -7.000 0.049 NA   NA
 11416797 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 589.000 0.000 NA   NA
 11559160 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 589.000 0.000 NA   NA
 11701552 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 589.000 0.000 NA   NA
 11416798 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 618.000 0.000 NA   NA
 11559161 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 618.000 0.000 NA   NA
 11701553 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 618.000 0.000 NA   NA
 11416799 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 652.000 0.000 NA   NA
 11559162 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 652.000 0.000 NA   NA
 11701554 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 652.000 0.000 NA   NA
 11416800 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 681.000 0.000 NA   NA
 11559163 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 681.000 0.000 NA   NA
 11701555 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 681.000 0.000 NA   NA
 11416801 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 718.000 0.000 NA   NA
 11559164 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 718.000 0.000 NA   NA
 11701556 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 718.000 0.000 NA   NA
 11416802 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 747.000 0.000 NA   NA
 11559165 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 747.000 0.000 NA   NA
 11701557 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 747.000 0.000 NA   NA
 11416803 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 782.000 0.000 NA   NA
 11559166 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 782.000 0.000 NA   NA
 11701558 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 782.000 0.000 NA   NA
 11416804 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 811.000 0.000 NA   NA
 11559167 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 811.000 0.000 NA   NA
 11701559 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 811.000 0.000 NA   NA
 11416805 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 848.000 0.000 NA   NA
 11559168 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 848.000 0.000 NA   NA
 11701560 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 848.000 0.000 NA   NA
 11416806 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 877.000 0.000 NA   NA
 11559169 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 877.000 0.000 NA   NA
 11701561 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 877.000 0.000 NA   NA
 11416807 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 913.000 0.000 NA   NA
 11559170 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 913.000 0.000 NA   NA
 11701562 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 913.000 0.000 NA   NA
 11416808 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 942.000 0.000 NA   NA
 11559171 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 942.000 0.000 NA   NA
 11701563 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 942.000 0.000 NA   NA
 11416809 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 976.000 0.000 NA   NA
 11559172 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 976.000 0.000 NA   NA
 11701564 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 976.000 0.000 NA   NA
 11416810 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1005.000 0.000 NA   NA
 11559173 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1005.000 0.000 NA   NA
 11701565 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1005.000 0.000 NA   NA
 11416811 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1041.000 0.000 NA   NA
 11559174 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1041.000 0.000 NA   NA
 11701566 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1041.000 0.000 NA   NA
 11416812 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1070.000 0.000 NA   NA
 11559175 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1070.000 0.000 NA   NA
 11701567 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1070.000 0.000 NA   NA
 11416813 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1106.000 0.000 NA   NA
 11559176 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1106.000 0.000 NA   NA
 11701568 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1106.000 0.000 NA   NA
 11416814 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1135.000 0.000 NA   NA
 11559177 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1135.000 0.000 NA   NA
 11701569 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1135.000 0.000 NA   NA
 11416815 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1171.000 0.000 NA   NA
 11559178 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1171.000 0.000 NA   NA
 11701570 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1171.000 0.000 NA   NA
 11416816 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1200.000 0.000 NA   NA
 11559179 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1200.000 0.000 NA   NA
 11701571 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1200.000 0.000 NA   NA
 11416817 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1237.000 0.000 NA   NA
 11559180 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1237.000 0.000 NA   NA
 11701572 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1237.000 0.000 NA   NA
 11416818 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11559181 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11701573 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11416819 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1301.000 0.000 NA   NA
 11559182 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1301.000 0.000 NA   NA
 11701574 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1301.000 0.000 NA   NA
 11416820 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1330.000 0.000 NA   NA
 11559183 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1330.000 0.000 NA   NA
 11701575 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1330.000 0.000 NA   NA
 11416821 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1366.000 0.000 NA   NA
 11559184 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1366.000 0.000 NA   NA
 11701576 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1366.000 0.000 NA   NA
 11416822 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1395.000 0.000 NA   NA
 11559185 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1395.000 0.000 NA   NA
 11701577 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1395.000 0.000 NA   NA
 11416823 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1432.000 0.000 NA   NA
 11559186 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1432.000 0.000 NA   NA
 11701578 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1432.000 0.000 NA   NA
 11416824 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11559187 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11701579 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11416825 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1497.000 0.000 NA   NA
 11559188 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1497.000 0.000 NA   NA
 11701580 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1497.000 0.000 NA   NA
 11416826 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1526.000 0.000 NA   NA
 11559189 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1526.000 0.000 NA   NA
 11701581 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1526.000 0.000 NA   NA
 11416827 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1561.000 0.000 NA   NA
 11559190 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1561.000 0.000 NA   NA
 11701582 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1561.000 0.000 NA   NA
 11416828 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1590.000 0.000 NA   NA
 11559191 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1590.000 0.000 NA   NA
 11701583 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1590.000 0.000 NA   NA
 11416829 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1626.000 0.000 NA   NA
 11559192 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1626.000 0.000 NA   NA
 11701584 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1626.000 0.000 NA   NA
 11416830 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1655.000 0.000 NA   NA
 11559193 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1655.000 0.000 NA   NA
 11701585 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1655.000 0.000 NA   NA
 11416831 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1691.000 0.000 NA   NA
 11559194 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1691.000 0.000 NA   NA
 11701586 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1691.000 0.000 NA   NA
 11416832 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1720.000 0.000 NA   NA
 11559195 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1720.000 0.000 NA   NA
 11701587 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1720.000 0.000 NA   NA
 11416833 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1756.000 0.000 NA   NA
 11559196 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1756.000 0.000 NA   NA
 11701588 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1756.000 0.000 NA   NA
 11416834 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1785.000 0.000 NA   NA
 11559197 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1785.000 0.000 NA   NA
 11701589 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1785.000 0.000 NA   NA
 11416835 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1819.000 0.000 NA   NA
 11559198 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1819.000 0.000 NA   NA
 11701590 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1819.000 0.000 NA   NA
 11416836 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1848.000 0.000 NA   NA
 11559199 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1848.000 0.000 NA   NA
 11701591 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1848.000 0.000 NA   NA
 11416837 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1882.000 0.000 NA   NA
 11559200 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1882.000 0.000 NA   NA
 11701592 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1882.000 0.000 NA   NA
 11416838 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1911.000 0.000 NA   NA
 11559201 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1911.000 0.000 NA   NA
 11701593 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1911.000 0.000 NA   NA
 11416839 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1948.000 0.000 NA   NA
 11559202 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1948.000 0.000 NA   NA
 11701594 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1948.000 0.000 NA   NA
 11416840 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1977.000 0.000 NA   NA
 11559203 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1977.000 0.000 NA   NA
 11701595 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 1977.000 0.000 NA   NA
 11416841 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2011.000 0.000 NA   NA
 11559204 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2011.000 0.000 NA   NA
 11701596 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2011.000 0.000 NA   NA
 11416842 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2040.000 0.000 NA   NA
 11559205 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2040.000 0.000 NA   NA
 11701597 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2040.000 0.000 NA   NA
 11416843 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2076.000 0.000 NA   NA
 11559206 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2076.000 0.000 NA   NA
 11701598 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2076.000 0.000 NA   NA
 11416844 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2105.000 0.000 NA   NA
 11559207 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2105.000 0.000 NA   NA
 11701599 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2105.000 0.000 NA   NA
 11416845 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2141.000 0.000 NA   NA
 11559208 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2141.000 0.000 NA   NA
 11701600 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2141.000 0.000 NA   NA
 11416846 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2170.000 0.000 NA   NA
 11559209 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2170.000 0.000 NA   NA
 11701601 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2170.000 0.000 NA   NA
 11416847 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2205.000 0.000 NA   NA
 11559210 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2205.000 0.000 NA   NA
 11701602 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2205.000 0.000 NA   NA
 11416848 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2234.000 0.000 NA   NA
 11559211 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2234.000 0.000 NA   NA
 11701603 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2234.000 0.000 NA   NA
 11416849 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2270.000 0.000 NA   NA
 11559212 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2270.000 0.000 NA   NA
 11701604 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2270.000 0.000 NA   NA
 11416850 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2299.000 0.000 NA   NA
 11559213 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2299.000 0.000 NA   NA
 11701605 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2299.000 0.000 NA   NA
 11416851 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2335.000 0.000 NA   NA
 11559214 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2335.000 0.000 NA   NA
 11701606 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2335.000 0.000 NA   NA
 11416852 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2364.000 0.000 NA   NA
 11559215 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2364.000 0.000 NA   NA
 11701607 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2364.000 0.000 NA   NA
 11416853 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2401.000 0.000 NA   NA
 11559216 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2401.000 0.000 NA   NA
 11701608 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2401.000 0.000 NA   NA
 11416854 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2430.000 0.000 NA   NA
 11559217 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2430.000 0.000 NA   NA
 11701609 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2430.000 0.000 NA   NA
 11416855 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2466.000 0.000 NA   NA
 11559218 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2466.000 0.000 NA   NA
 11701610 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2466.000 0.000 NA   NA
 11416856 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2495.000 0.000 NA   NA
 11559219 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2495.000 0.000 NA   NA
 11701611 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2495.000 0.000 NA   NA
 11416857 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2531.000 0.000 NA   NA
 11559220 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2531.000 0.000 NA   NA
 11701612 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2531.000 0.000 NA   NA
 11416858 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2560.000 0.000 NA   NA
 11559221 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2560.000 0.000 NA   NA
 11701613 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2560.000 0.000 NA   NA
 11416859 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2596.000 0.000 NA   NA
 11559222 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2596.000 0.000 NA   NA
 11701614 2279994   LMOf6854_0559   lmrB FALSE NA 2596.000 0.000 NA   NA
 2279996 2279997 LMOf6854_0557 LMOf6854_0556 cas2   TRUE 0.925 5.000 0.435 NA   NA
 2279997 2279998 LMOf6854_0556 LMOf6854_0555     FALSE 0.365 56.000 0.071 NA   NA
 2279998 2279999 LMOf6854_0555 LMOf6854_0554     FALSE 0.377 68.000 0.250 NA   NA
 2279999 2280000 LMOf6854_0554 LMOf6854_0553     TRUE 0.783 -22.000 0.423 NA   NA
 2280000 2280001 LMOf6854_0553 LMOf6854_0552     TRUE 0.797 -10.000 0.218 NA   NA
 2280001 2280002 LMOf6854_0552 LMOf6854_0551     TRUE 0.825 16.000 0.269 NA   NA
 2280003 2280004 LMOf6854_0550 LMOf6854_0549     FALSE 0.138 121.000 0.078 NA N NA
 2280005 2280006 LMOf6854_0548 LMOf6854_0547     FALSE 0.286 101.000 0.167 1.000   NA
 2280007 2280008 LMOf6854_0546 LMOf6854_0545     TRUE 0.861 7.000 0.058 NA   NA
 2280009 2280010 LMOf6854_0544 LMOf6854_0543     FALSE 0.240 108.000 0.231 NA   NA
 2280010 2280011 LMOf6854_0543 LMOf6854_0542   prs-2 FALSE 0.002 928.000 0.000 NA   NA
 11416860 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 6954.000 0.000 NA   NA
 11559223 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 6954.000 0.000 NA   NA
 11701615 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 6954.000 0.000 NA   NA
 11416861 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 6983.000 0.000 NA   NA
 11559224 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 6983.000 0.000 NA   NA
 11701616 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 6983.000 0.000 NA   NA
 11416862 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7018.000 0.000 NA   NA
 11559225 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7018.000 0.000 NA   NA
 11701617 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7018.000 0.000 NA   NA
 11416863 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7047.000 0.000 NA   NA
 11559226 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7047.000 0.000 NA   NA
 11701618 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7047.000 0.000 NA   NA
 11416864 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7081.000 0.000 NA   NA
 11559227 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7081.000 0.000 NA   NA
 11701619 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7081.000 0.000 NA   NA
 11416865 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7110.000 0.000 NA   NA
 11559228 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7110.000 0.000 NA   NA
 11701620 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7110.000 0.000 NA   NA
 11416866 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7144.000 0.000 NA   NA
 11559229 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7144.000 0.000 NA   NA
 11701621 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7144.000 0.000 NA   NA
 11416867 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7173.000 0.000 NA   NA
 11559230 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7173.000 0.000 NA   NA
 11701622 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7173.000 0.000 NA   NA
 11416868 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7208.000 0.000 NA   NA
 11559231 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7208.000 0.000 NA   NA
 11701623 2280003   LMOf6854_0550     FALSE NA 7208.000 0.000 NA   NA
 2280011 2280012 LMOf6854_0542 LMOf6854_0541 prs-2   FALSE 0.061 140.000 0.000 1.000 N NA
 2280012 2280013 LMOf6854_0541 LMOf6854_0540     TRUE 0.986 15.000 0.000 0.038 Y NA
 2280013 2280014 LMOf6854_0540 LMOf6854_0539     TRUE 0.867 16.000 0.417 1.000 N NA
 2280014 2280015 LMOf6854_0539 LMOf6854_0538   rpe-1 TRUE 0.918 -3.000 0.429 1.000 N NA
 2280015 2280016 LMOf6854_0538 LMOf6854_0537 rpe-1   TRUE 0.902 11.000 0.321 NA   NA
 2280016 2280017 LMOf6854_0537 LMOf6854_0536     TRUE 0.891 17.000 0.900 NA   NA
 2280017 2280018 LMOf6854_0536 LMOf6854_0535     TRUE 0.675 28.000 0.556 1.000 N NA
 2280018 2280019 LMOf6854_0535 LMOf6854_0534     TRUE 0.942 4.000 0.556 1.000 N NA
 2280019 2280020 LMOf6854_0534 LMOf6854_0533     FALSE 0.406 109.000 0.800 1.000 N NA
 2280020 2280021 LMOf6854_0533 LMOf6854_0532     TRUE 0.997 7.000 0.889 0.031 Y NA
 2280021 2280022 LMOf6854_0532 LMOf6854_0531   rpiB-2 TRUE 0.993 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 2280024 2280025 LMOf6854_0529 LMOf6854_0528     FALSE 0.325 75.000 0.196 NA   NA
 2280025 2280026 LMOf6854_0528 LMOf6854_0527     TRUE 0.540 177.000 0.379 1.000 Y NA
 2280027 2280028 LMOf6854_0526 LMOf6854_0525     TRUE 0.532 75.000 0.667 1.000   NA
 2280029 2280030 LMOf6854_0524 LMOf6854_0523 aroD aroE-1 TRUE 0.860 66.000 0.113 1.000 Y NA
 2280030 2280031 LMOf6854_0523 LMOf6854_0522 aroE-1   FALSE 0.249 100.000 0.143 1.000 N NA
 2280033 2280034 LMOf6854_0520 LMOf6854_0519   rpmF-1 FALSE 0.177 92.000 0.011 1.000 N NA
 2280034 2280035 LMOf6854_0519 LMOf6854_0518 rpmF-1   FALSE 0.277 65.000 0.012 1.000 N NA
 2280035 2280036 LMOf6854_0518 LMOf6854_0517     FALSE 0.221 169.000 0.014 0.030   NA
 2280036 2280037 LMOf6854_0517 LMOf6854_0516     FALSE 0.176 158.000 0.600 NA   NA
 2280037 2280038 LMOf6854_0516 LMOf6854_0515     FALSE 0.155 90.000 0.011 NA   NA
 2280038 2280039 LMOf6854_0515 LMOf6854_0514     FALSE 0.066 151.000 0.009 NA   NA
 2280039 2280040 LMOf6854_0514 LMOf6854_0513     FALSE 0.270 110.000 0.344 NA   NA
 2280040 2280041 LMOf6854_0513 LMOf6854_0512     FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 2280041 2280042 LMOf6854_0512 LMOf6854_0511     TRUE 0.562 -7.000 0.000 NA   NA
 2280042 2280043 LMOf6854_0511 LMOf6854_0510     FALSE 0.005 333.000 0.000 NA   NA
 2280043 2280044 LMOf6854_0510 LMOf6854_0509     FALSE 0.006 300.000 0.000 NA   NA
 2280046 2280047 LMOf6854_0507 LMOf6854_0506     FALSE 0.241 28.000 0.000 NA   NA
 2280047 2280048 LMOf6854_0506 LMOf6854_0505     FALSE 0.339 22.000 0.000 NA   NA
 2280048 2280049 LMOf6854_0505 LMOf6854_0504     TRUE 0.539 16.000 0.000 NA   NA
 2280049 2280050 LMOf6854_0504 LMOf6854_0503     FALSE 0.203 37.000 0.000 NA   NA
 2280050 2280051 LMOf6854_0503 LMOf6854_0502     TRUE 0.944 1.000 0.636 NA   NA
 2280051 2280052 LMOf6854_0502 LMOf6854_0501     FALSE 0.002 541.000 0.000 NA   NA
 2280052 2280053 LMOf6854_0501 LMOf6854_0500     FALSE 0.197 76.000 0.000 1.000   NA
 2280053 2280054 LMOf6854_0500 LMOf6854_0499     FALSE 0.175 52.000 0.000 NA   NA
 2280054 2280055 LMOf6854_0499 LMOf6854_0498     FALSE 0.391 20.000 0.000 NA   NA
 2280055 2280056 LMOf6854_0498 LMOf6854_0497     FALSE 0.493 66.000 0.571 NA   NA
 2280056 2280057 LMOf6854_0497 LMOf6854_0496     FALSE 0.052 136.000 0.000 NA   NA
 2280057 2280058 LMOf6854_0496 LMOf6854_0495     FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 2280058 2280059 LMOf6854_0495 LMOf6854_0494     FALSE 0.146 64.000 0.000 NA   NA
 2280059 2280060 LMOf6854_0494 LMOf6854_0493     FALSE 0.012 224.000 0.000 NA   NA
 2280060 2280061 LMOf6854_0493 LMOf6854_0492     FALSE 0.006 309.000 0.000 NA   NA
 2280061 2280062 LMOf6854_0492 LMOf6854_0491     TRUE 0.807 -7.000 0.115 NA   NA
 2280062 2280063 LMOf6854_0491 LMOf6854_0490     TRUE 0.949 1.000 0.731 NA   NA
 2280063 2280064 LMOf6854_0490 LMOf6854_0489     FALSE 0.263 134.000 0.522 1.000 N NA
 2280065 2280066 LMOf6854_0488 LMOf6854_0487     TRUE 0.944 5.000 0.714 NA   NA
 2280066 2280067 LMOf6854_0487 LMOf6854_0486     TRUE 0.928 -3.000 0.642 NA   NA
 2280067 2280068 LMOf6854_0486 LMOf6854_0485     FALSE 0.195 118.000 0.119 NA   NA
 2280068 2280069 LMOf6854_0485 LMOf6854_0484     TRUE 0.695 21.000 0.250 NA   NA
 2280071 2280072 LMOf6854_0971 LMOf6854_0970     TRUE 0.946 0.000 0.713 NA   NA
 2280072 2280073 LMOf6854_0970 LMOf6854_0969   coaA FALSE 0.174 117.000 0.036 1.000 N NA
 2280073 2280074 LMOf6854_0969 LMOf6854_0968 coaA   FALSE 0.181 89.000 0.026 NA   NA
 2280074 2280075 LMOf6854_0968 LMOf6854_0967     TRUE 0.855 19.000 0.841 NA   NA
 2280075 2280076 LMOf6854_0967 LMOf6854_0966     FALSE 0.185 122.000 0.139 NA   NA
 2280076 2280077 LMOf6854_0966 LMOf6854_0965     FALSE 0.012 291.000 0.000 1.000   NA
 2280077 2280078 LMOf6854_0965 LMOf6854_0964   bglH-2 FALSE 0.331 73.000 0.100 1.000 N NA
 2280078 2280079 LMOf6854_0964 LMOf6854_0963 bglH-2   TRUE 0.987 12.000 0.143 1.000 Y NA
 2280079 2280080 LMOf6854_0963 LMOf6854_0962     TRUE 0.994 15.000 0.783 0.035 Y NA
 2280080 2280081 LMOf6854_0962 LMOf6854_0961     TRUE 0.996 5.000 0.522 0.035 Y NA
 2280081 2280082 LMOf6854_0961 LMOf6854_0960   gabD FALSE 0.226 143.000 0.533 1.000 N NA
 2280082 2280083 LMOf6854_0960 LMOf6854_0959 gabD   FALSE 0.019 215.000 0.000 1.000 N NA
 2280083 2280084 LMOf6854_0959 LMOf6854_0958     FALSE 0.253 114.000 0.310 NA   NA
 2280084 2280085 LMOf6854_0958 LMOf6854_0957     FALSE 0.101 83.000 0.000 NA   NA
 2280085 2280086 LMOf6854_0957 LMOf6854_0956     TRUE 0.721 3.000 0.000 NA   NA
 2280088 2280089 LMOf6854_0954 LMOf6854_0953   gor FALSE 0.394 29.000 0.006 1.000 N NA
 2280089 2280090 LMOf6854_0953 LMOf6854_0952 gor   FALSE 0.423 36.000 0.010 1.000   NA
 2280090 2280091 LMOf6854_0952 LMOf6854_0951     FALSE 0.057 131.000 0.000 NA   NA
 2280091 2280092 LMOf6854_0951 LMOf6854_0950     FALSE 0.072 115.000 0.000 NA   NA
 2280092 2280093 LMOf6854_0950 LMOf6854_0949     FALSE 0.007 319.000 0.000 1.000 N NA
 2280093 2280094 LMOf6854_0949 LMOf6854_0948   celB FALSE 0.355 81.000 0.286 1.000 N NA
 2280094 2280095 LMOf6854_0948 LMOf6854_0947 celB   FALSE 0.125 146.000 0.123 NA   NA
 2280095 2280096 LMOf6854_0947 LMOf6854_0946     FALSE 0.170 55.000 0.000 NA   NA
 2280096 2280097 LMOf6854_0946 LMOf6854_0945     FALSE 0.003 383.000 0.000 NA   NA
 2280097 2280098 LMOf6854_0945 LMOf6854_0944     TRUE 0.904 0.000 0.215 NA   NA
 2280098 2280099 LMOf6854_0944 LMOf6854_0943     FALSE 0.274 71.000 0.027 1.000 N NA
 2280099 2280100 LMOf6854_0943 LMOf6854_0942     FALSE 0.029 208.000 0.000 1.000   NA
 2280100 2280101 LMOf6854_0942 LMOf6854_0941   sigB TRUE 0.931 1.000 0.243 1.000   NA
 2280101 2280102 LMOf6854_0941 LMOf6854_0940 sigB   TRUE 0.862 -22.000 0.838 1.000 N NA
 2280102 2280103 LMOf6854_0940 LMOf6854_0939     TRUE 0.980 -16.000 0.714 1.000 Y NA
 2280103 2280104 LMOf6854_0939 LMOf6854_0938     TRUE 0.659 150.000 0.440 1.000 Y NA
 2280104 2280105 LMOf6854_0938 LMOf6854_0937   rsbT TRUE 0.982 17.000 0.617 1.000 Y NA
 2280105 2280106 LMOf6854_0937 LMOf6854_0936 rsbT rsbS TRUE 0.987 -3.000 0.320 NA Y NA
 2280106 2280107 LMOf6854_0936 LMOf6854_0935 rsbS rsbR TRUE 0.988 6.000 0.258 NA Y NA
 2280107 2280108 LMOf6854_0935 LMOf6854_0934 rsbR   FALSE 0.212 250.000 0.032 NA Y NA
 2280108 2280109 LMOf6854_0934 LMOf6854_0933     TRUE 0.963 7.000 0.260 0.045 N NA
 2280109 2280110 LMOf6854_0933 LMOf6854_0932   alr FALSE 0.058 206.000 0.108 1.000 N NA
 2280110 2280111 LMOf6854_0932 LMOf6854_0931 alr acpS TRUE 0.723 19.000 0.093 1.000 N NA
 2280111 2280112 LMOf6854_0931 LMOf6854_0930 acpS hemG TRUE 0.864 2.000 0.017 1.000 N NA
 2280112 2280113 LMOf6854_0930 LMOf6854_0929 hemG   FALSE 0.122 149.000 0.170 NA   NA
 2280113 2280114 LMOf6854_0929 LMOf6854_0928     TRUE 0.826 -7.000 0.216 NA   NA
 2280116 2280117 LMOf6854_0926 LMOf6854_0925     FALSE 0.214 118.000 0.333 NA N NA
 2280117 2280118 LMOf6854_0925 LMOf6854_0924     TRUE 0.809 18.000 0.542 NA N NA
 2280118 2280119 LMOf6854_0924 LMOf6854_0923     TRUE 0.938 0.000 0.480 1.000 N NA
 2280119 2280120 LMOf6854_0923 LMOf6854_0922     TRUE 0.966 21.000 0.440 1.000 Y NA
 2280120 2280121 LMOf6854_0922 LMOf6854_0921     TRUE 0.987 20.000 0.786 0.034 Y NA
 2280121 2280122 LMOf6854_0921 LMOf6854_0920     TRUE 0.997 1.000 0.733 0.034 Y NA
 2280122 2280123 LMOf6854_0920 LMOf6854_0919     TRUE 0.958 15.000 0.600 0.034 N NA
 2280123 2280124 LMOf6854_0919 LMOf6854_0918     FALSE 0.020 209.000 0.000 1.000 N NA
 2280126 2280127 LMOf6854_0916 LMOf6854_0915     TRUE 0.539 16.000 0.000 NA   NA
 2280129 2280130 LMOf6854_0913 LMOf6854_0912     FALSE 0.005 455.000 0.004 NA   NA
 2280132 2280133 LMOf6854_0910 LMOf6854_0909     TRUE 0.989 -3.000 0.529 NA Y NA
 2280133 2280134 LMOf6854_0909 LMOf6854_0908     TRUE 0.744 22.000 0.529 NA   NA
 2280134 2280135 LMOf6854_0908 LMOf6854_0907   treC-1 TRUE 0.927 2.000 0.400 NA   NA
 2280135 2280136 LMOf6854_0907 LMOf6854_0906 treC-1   TRUE 0.979 16.000 0.200 1.000 Y NA
 2280136 2280137 LMOf6854_0906 LMOf6854_0905     TRUE 0.990 -13.000 0.711 0.040 Y NA
 2280137 2280138 LMOf6854_0905 LMOf6854_0904     TRUE 0.996 -3.000 0.733 0.040 Y NA
 2280140 2280141 LMOf6854_0902 LMOf6854_0901   murF FALSE 0.442 67.000 0.216 1.000   NA
 2280141 2280142 LMOf6854_0901 LMOf6854_0900 murF   TRUE 0.969 25.000 0.046 0.005 Y NA
 2280142 2280143 LMOf6854_0900 LMOf6854_0899   sugE-2 FALSE 0.095 150.000 0.027 1.000 N NA
 2280143 2280144 LMOf6854_0899 LMOf6854_0898 sugE-2 sugE-1 TRUE 0.997 3.000 0.941 0.082 Y NA
 2280144 2280145 LMOf6854_0898 LMOf6854_0897 sugE-1   TRUE 0.941 11.000 0.706 1.000 N NA
 2280145 2280146 LMOf6854_0897 LMOf6854_0896     FALSE 0.339 80.000 0.297 NA   NA
 2280146 2280147 LMOf6854_0896 LMOf6854_0895     FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 2280149 2280150 LMOf6854_0893 LMOf6854_0892     TRUE 0.984 -7.000 0.414 1.000 Y NA
 2280150 2280151 LMOf6854_0892 LMOf6854_0891     FALSE 0.059 170.000 0.009 1.000 N NA
 2280151 2280152 LMOf6854_0891 LMOf6854_0890     FALSE 0.155 105.000 0.008 1.000 N NA
 2280152 2280153 LMOf6854_0890 LMOf6854_0889     FALSE 0.005 257.000 0.000 NA N NA
 2280155 2280156 LMOf6854_0887 LMOf6854_0886     FALSE 0.005 463.000 0.000 1.000   NA
 2280157 2280158 LMOf6854_0885 LMOf6854_0884   tetA FALSE 0.256 133.000 0.462 1.000 N NA
 2280159 2280160 LMOf6854_0883 LMOf6854_0882     FALSE 0.033 296.000 0.000 0.057 N NA
 2280162 2280163 LMOf6854_0880 LMOf6854_0879     FALSE 0.367 -49.000 0.000 NA   NA
 2280163 2280164 LMOf6854_0879 LMOf6854_0878     FALSE 0.010 241.000 0.000 NA   NA
 2280164 2280165 LMOf6854_0878 LMOf6854_0877     FALSE 0.161 192.000 0.727 1.000   NA
 2280166 2280167 LMOf6854_0876 LMOf6854_0875     FALSE 0.285 114.000 0.222 1.000   NA
 2280168 2280169 LMOf6854_0874 LMOf6854_0873     FALSE 0.048 153.000 0.000 1.000 N NA
 2280169 2280170 LMOf6854_0873 LMOf6854_0872     FALSE 0.041 199.000 0.013 1.000 N NA
 2280170 2280171 LMOf6854_0872 LMOf6854_0871     FALSE 0.403 41.000 0.065 NA   NA
 2280171 2280172 LMOf6854_0871 LMOf6854_0870     FALSE 0.339 78.000 0.265 NA   NA
 2280174 2280175 LMOf6854_0868 LMOf6854_0867     TRUE 0.791 17.000 0.244 NA   NA
 2280175 2280176 LMOf6854_0867 LMOf6854_0866     FALSE 0.235 110.000 0.220 NA   NA
 2280176 2280177 LMOf6854_0866 LMOf6854_0865     TRUE 0.848 15.000 0.265 NA   NA
 2280179 2280180 LMOf6854_0863 LMOf6854_0862     FALSE 0.460 78.000 0.667 NA   NA
 2280180 2280181 LMOf6854_0862 LMOf6854_0861     TRUE 0.709 5.000 0.000 NA   NA
 2280181 2280182 LMOf6854_0861 LMOf6854_0860     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2280182 2280183 LMOf6854_0860 LMOf6854_0859     TRUE 0.955 1.000 0.857 NA   NA
 2280183 2280184 LMOf6854_0859 LMOf6854_0858     FALSE 0.014 216.000 0.000 NA   NA
 2280184 2280185 LMOf6854_0858 LMOf6854_0857   scrK TRUE 0.508 85.000 0.818 1.000   NA
 2280185 2280186 LMOf6854_0857 LMOf6854_0856 scrK   FALSE 0.178 138.000 0.089 1.000   NA
 2280186 2280187 LMOf6854_0856 LMOf6854_0855   cah FALSE 0.383 68.000 0.073 1.000   NA
 2280187 2280188 LMOf6854_0855 LMOf6854_0854 cah   FALSE 0.171 130.000 0.078 1.000 N NA
 2280188 2280189 LMOf6854_0854 LMOf6854_0853     TRUE 0.994 -3.000 0.253 0.040 Y NA
 2280189 2280190 LMOf6854_0853 LMOf6854_0852     TRUE 0.995 -3.000 0.492 0.040 Y NA
 2280190 2280191 LMOf6854_0852 LMOf6854_0851     TRUE 0.997 0.000 0.928 0.040 Y NA
 2280191 2280192 LMOf6854_0851 LMOf6854_0850     TRUE 0.926 10.000 0.326 1.000   NA
 2280195 2280196 LMOf6854_1266 LMOf6854_1265 ung-2   FALSE 0.133 107.000 0.000 1.000   NA
 2280196 2280197 LMOf6854_1265 LMOf6854_1264     TRUE 0.683 16.000 0.000 1.000   NA
 2280197 2280198 LMOf6854_1264 LMOf6854_1263     FALSE 0.257 98.000 0.182 1.000 N NA
 2280198 2280199 LMOf6854_1263 LMOf6854_1262     TRUE 0.900 14.000 0.438 1.000 N NA
 2280199 2280200 LMOf6854_1262 LMOf6854_1261   pheT FALSE 0.067 161.000 0.009 1.000 N NA
 2280200 2280201 LMOf6854_1261 LMOf6854_1260 pheT pheS TRUE 0.997 0.000 0.574 0.001 Y NA
 2280201 2280202 LMOf6854_1260 LMOf6854_1259 pheS   FALSE 0.002 368.000 0.000 NA N NA
 2280204 2280205 LMOf6854_1257 LMOf6854_1256     FALSE 0.467 26.000 0.022 1.000 N NA
 2280205 2280206 LMOf6854_1256 LMOf6854_1255     FALSE 0.259 112.000 0.237 1.000 N NA
 2280206 2280207 LMOf6854_1255 LMOf6854_1254     FALSE 0.356 270.000 0.000 0.003 Y NA
 2280207 2280208 LMOf6854_1254 LMOf6854_1253     FALSE 0.003 421.000 0.000 NA   NA
 2280208 2280209 LMOf6854_1253 LMOf6854_1252     TRUE 0.941 3.000 0.600 NA   NA
 2280209 2280210 LMOf6854_1252 LMOf6854_1251     FALSE 0.137 31.000 0.000 NA N NA
 2280211 2280212 LMOf6854_1250 LMOf6854_1249     TRUE 0.902 14.000 0.545 NA   NA
 2280213 2280214 LMOf6854_1248 LMOf6854_1247   cobQ TRUE 0.880 -36.000 0.021 0.011   NA
 2280214 2280215 LMOf6854_1247 LMOf6854_1246 cobQ   TRUE 0.874 0.000 0.033 1.000 N NA
 2280215 2280216 LMOf6854_1246 LMOf6854_1245   cbiQ TRUE 0.995 13.000 0.152 0.003 Y NA
 2280216 2280217 LMOf6854_1245 LMOf6854_1244 cbiQ   TRUE 0.994 -13.000 0.804 0.002 Y NA
 2280217 2280218 LMOf6854_1244 LMOf6854_1243   cbiM TRUE 0.997 -3.000 0.861 0.011 Y NA
 2280218 2280219 LMOf6854_1243 LMOf6854_1242 cbiM cobI TRUE 0.959 -3.000 0.058 0.011 N NA
 2280219 2280220 LMOf6854_1242 LMOf6854_1241 cobI cbiK TRUE 0.978 -7.000 0.048 1.000 Y NA
 2280220 2280221 LMOf6854_1241 LMOf6854_1240 cbiK   TRUE 0.986 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 2280221 2280222 LMOf6854_1240 LMOf6854_1239   cobK TRUE 0.988 0.000 0.042 1.000 Y NA
 2280222 2280223 LMOf6854_1239 LMOf6854_1238 cobK cobJ TRUE 0.995 -3.000 0.423 0.011 Y NA
 2280223 2280224 LMOf6854_1238 LMOf6854_1237 cobJ cbiG TRUE 0.995 -3.000 0.352 0.011 Y NA
 2280224 2280225 LMOf6854_1237 LMOf6854_1236 cbiG cobM TRUE 0.990 -13.000 0.397 0.011 Y NA
 2280225 2280226 LMOf6854_1236 LMOf6854_1235 cobM cbiT TRUE 0.995 6.000 0.056 0.011 Y NA
 2280226 2280227 LMOf6854_1235 LMOf6854_1234 cbiT cbiE TRUE 0.993 -10.000 0.300 0.001 Y NA
 2280227 2280228 LMOf6854_1234 LMOf6854_1233 cbiE cbiD TRUE 0.994 -3.000 0.126 0.011 Y NA
 2280228 2280229 LMOf6854_1233 LMOf6854_1232 cbiD cobH TRUE 0.991 16.000 0.168 0.011 Y NA
 2280229 2280230 LMOf6854_1232 LMOf6854_1231 cobH   TRUE 0.994 13.000 0.107 0.011 Y NA
 2280230 2280231 LMOf6854_1231 LMOf6854_1230   cobB TRUE 0.994 -3.000 0.124 0.011 Y NA
 2280231 2280232 LMOf6854_1230 LMOf6854_1229 cobB   FALSE 0.005 333.000 0.000 NA   NA
 2280234 2280235 LMOf6854_1227 LMOf6854_1226     FALSE 0.015 210.000 0.000 NA   NA
 2280235 2280236 LMOf6854_1226 LMOf6854_1225     TRUE 0.987 -7.000 0.759 1.000 Y NA
 2280236 2280237 LMOf6854_1225 LMOf6854_1224     TRUE 0.853 16.000 0.552 NA N NA
 2280237 2280238 LMOf6854_1224 LMOf6854_1223     TRUE 0.981 -7.000 0.385 NA Y NA
 2280238 2280239 LMOf6854_1223 LMOf6854_1222     TRUE 0.883 15.000 0.487 NA   NA
 2280239 2280240 LMOf6854_1222 LMOf6854_1221     TRUE 0.931 3.000 0.459 NA   NA
 2280240 2280241 LMOf6854_1221 LMOf6854_1220     TRUE 0.889 13.000 0.452 NA N NA
 2280241 2280242 LMOf6854_1220 LMOf6854_1219     FALSE 0.103 166.000 0.357 NA N NA
 2280242 2280243 LMOf6854_1219 LMOf6854_1218     TRUE 0.915 32.000 0.349 NA Y NA
 2280243 2280244 LMOf6854_1218 LMOf6854_1217     TRUE 0.991 0.000 0.442 NA Y NA
 2280244 2280245 LMOf6854_1217 LMOf6854_1216   eutL TRUE 0.861 15.000 0.468 NA N NA
 2280245 2280246 LMOf6854_1216 LMOf6854_1215 eutL eutC TRUE 0.961 23.000 0.617 1.000 Y NA
 2280246 2280247 LMOf6854_1215 LMOf6854_1214 eutC eutB TRUE 0.987 20.000 0.190 0.001 Y NA
 2280247 2280248 LMOf6854_1214 LMOf6854_1213 eutB eutA TRUE 0.919 42.000 0.636 NA Y NA
 2280248 2280249 LMOf6854_1213 LMOf6854_1212 eutA   FALSE 0.214 89.000 0.163 NA N NA
 2280249 2280250 LMOf6854_1212 LMOf6854_1211     TRUE 0.984 -7.000 0.388 1.000 Y NA
 2280250 2280251 LMOf6854_1211 LMOf6854_1210     FALSE 0.074 131.000 0.000 1.000 N NA
 2280253 2280254 LMOf6854_1208 LMOf6854_1207     TRUE 0.832 -10.000 0.300 1.000 N NA
 2280254 2280255 LMOf6854_1207 LMOf6854_1206     TRUE 0.890 14.000 0.346 1.000 N NA
 2280255 2280256 LMOf6854_1206 LMOf6854_1205   glpF-1 FALSE 0.460 66.000 0.375 1.000 N NA
 2280256 2280257 LMOf6854_1205 LMOf6854_1204 glpF-1 pduQ TRUE 0.635 28.000 0.407 1.000 N NA
 2280257 2280258 LMOf6854_1204 LMOf6854_1203 pduQ pduP TRUE 0.984 16.000 0.000 0.029 Y NA
 2280258 2280259 LMOf6854_1203 LMOf6854_1202 pduP   TRUE 0.809 7.000 0.000 1.000   NA
 2280259 2280260 LMOf6854_1202 LMOf6854_1201   pduN TRUE 0.848 15.000 0.268 NA   NA
 2280260 2280261 LMOf6854_1201 LMOf6854_1200 pduN pduM TRUE 0.779 -22.000 0.407 NA   NA
 2280261 2280262 LMOf6854_1200 LMOf6854_1199 pduM eutJ TRUE 0.911 -3.000 0.440 NA   NA
 2280262 2280263 LMOf6854_1199 LMOf6854_1198 eutJ   TRUE 0.692 21.000 0.364 NA N NA
 2280263 2280264 LMOf6854_1198 LMOf6854_1197     TRUE 0.990 4.000 0.364 NA Y NA
 2280264 2280265 LMOf6854_1197 LMOf6854_1196     TRUE 0.946 25.000 0.645 NA Y NA
 2280265 2280266 LMOf6854_1196 LMOf6854_1195     TRUE 0.897 13.000 0.387 NA   NA
 2280266 2280267 LMOf6854_1195 LMOf6854_1194   pduG TRUE 0.893 -3.000 0.295 NA   NA
 2280267 2280268 LMOf6854_1194 LMOf6854_1193 pduG pduE TRUE 0.555 46.000 0.500 NA   NA
 2280268 2280269 LMOf6854_1193 LMOf6854_1192 pduE pduD TRUE 0.970 17.000 0.759 0.001   NA
 2280269 2280270 LMOf6854_1192 LMOf6854_1191 pduD pduC TRUE 0.866 38.000 0.455 0.001   NA
 2280270 2280271 LMOf6854_1191 LMOf6854_1190 pduC pduB TRUE 0.740 19.000 0.150 1.000 N NA
 2280271 2280272 LMOf6854_1190 LMOf6854_1189 pduB pduA FALSE 0.211 95.000 0.200 NA N NA
 2280274 2280275 LMOf6854_1187 LMOf6854_1186 cobC cobS TRUE 0.869 1.000 0.023 1.000 N NA
 2280275 2280276 LMOf6854_1186 LMOf6854_1185 cobS cobU TRUE 0.989 2.000 0.046 1.000 Y NA
 2280276 2280277 LMOf6854_1185 LMOf6854_1184 cobU   TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2280277 2280278 LMOf6854_1184 LMOf6854_1183     FALSE 0.269 25.000 0.000 NA   NA
 2280278 2280279 LMOf6854_1183 LMOf6854_1182   pduU TRUE 0.992 6.000 0.467 1.000 Y NA
 2280279 2280280 LMOf6854_1182 LMOf6854_1181 pduU   FALSE 0.130 148.000 0.316 NA N NA
 2280280 2280281 LMOf6854_1181 LMOf6854_1180     TRUE 0.986 -3.000 0.289 NA Y NA
 2280281 2280282 LMOf6854_1180 LMOf6854_1179     FALSE 0.221 119.000 0.179 1.000 N NA
 2280283 2280284 LMOf6854_1178 LMOf6854_1177   clpP-1 FALSE 0.167 129.000 0.111 NA   NA
 2280284 2280285 LMOf6854_1177 LMOf6854_1176 clpP-1   FALSE 0.338 67.000 0.111 NA   NA
 2280288 2280289 LMOf6854_1173 LMOf6854_1172     TRUE 0.659 25.000 0.462 NA   NA
 2280291 2280292 LMOf6854_1170 LMOf6854_1169     TRUE 0.997 2.000 0.576 0.010 Y NA
 2280293 2280294 LMOf6854_1168 LMOf6854_1167     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 2280294 2280295 LMOf6854_1167 LMOf6854_1166     TRUE 0.884 -3.000 0.057 1.000   NA
 2280295 2280296 LMOf6854_1166 LMOf6854_1165     TRUE 0.892 -3.000 0.082 1.000   NA
 2280297 2280298 LMOf6854_1164 LMOf6854_1163     TRUE 0.781 -10.000 0.161 NA   NA
 2280298 2280299 LMOf6854_1163 LMOf6854_1162     TRUE 0.529 25.000 0.094 NA   NA
 2280299 2280300 LMOf6854_1162 LMOf6854_1161     FALSE 0.062 124.000 0.000 NA   NA
 2280300 2280301 LMOf6854_1161 LMOf6854_1160     FALSE 0.233 29.000 0.000 NA   NA
 2280301 2280302 LMOf6854_1160 LMOf6854_1159     FALSE 0.157 60.000 0.000 NA   NA
 2280302 2280303 LMOf6854_1159 LMOf6854_1158     FALSE 0.345 81.000 0.333 NA   NA
 2280303 2280304 LMOf6854_1158 LMOf6854_1157     FALSE 0.101 83.000 0.000 NA   NA
 2280304 2280305 LMOf6854_1157 LMOf6854_1156     FALSE 0.203 37.000 0.000 NA   NA
 2280305 2280306 LMOf6854_1156 LMOf6854_1155     TRUE 0.894 12.000 0.300 NA   NA
 2280307 2280308 LMOf6854_1154 LMOf6854_1153     FALSE 0.466 -15.000 0.000 NA   NA
 2280308 2280309 LMOf6854_1153 LMOf6854_1152     FALSE 0.339 22.000 0.000 NA   NA
 2280309 2280310 LMOf6854_1152 LMOf6854_1151     TRUE 0.717 0.000 0.000 NA   NA
 2280311 2280312 LMOf6854_1150 LMOf6854_1149 pXO2-73 guaA FALSE 0.056 133.000 0.000 NA   NA
 2280312 2280313 LMOf6854_1149 LMOf6854_1148 guaA   FALSE 0.092 141.000 0.004 1.000 N NA
 2280313 2280314 LMOf6854_1148 LMOf6854_1147     FALSE 0.434 60.000 0.083 1.000   NA
 2280314 2280315 LMOf6854_1147 LMOf6854_1146   nadE TRUE 0.864 13.000 0.037 1.000   NA
 2280315 2280316 LMOf6854_1146 LMOf6854_1145 nadE   TRUE 0.995 12.000 0.194 0.003 Y NA
 2280316 2280317 LMOf6854_1145 LMOf6854_1144     FALSE 0.009 209.000 0.000 NA N NA
 2280317 2280318 LMOf6854_1144 LMOf6854_1143     TRUE 0.978 15.000 0.111 NA Y NA
 2280318 2280319 LMOf6854_1143 LMOf6854_1142   tagD TRUE 0.943 22.000 0.146 NA Y NA
 2280319 2280320 LMOf6854_1142 LMOf6854_1141 tagD   TRUE 0.997 1.000 0.244 0.002 Y NA
 2280320 2280321 LMOf6854_1141 LMOf6854_1140     FALSE 0.069 187.000 0.069 1.000 N NA
 2280321 2280322 LMOf6854_1140 LMOf6854_1139     TRUE 0.912 -3.000 0.367 1.000 N NA
 2280322 2280323 LMOf6854_1139 LMOf6854_1138     FALSE 0.300 76.000 0.067 1.000 N NA
 2280323 2280324 LMOf6854_1138 LMOf6854_1137   rfbD TRUE 0.739 119.000 0.182 1.000 Y NA
 2280324 2280325 LMOf6854_1137 LMOf6854_1136 rfbD rfbB TRUE 0.996 3.000 0.055 0.002 Y NA
 2280325 2280326 LMOf6854_1136 LMOf6854_1135 rfbB rfbC TRUE 0.990 1.000 0.183 1.000 Y NA
 2280326 2280327 LMOf6854_1135 LMOf6854_1134 rfbC rfbA TRUE 0.966 19.000 0.135 1.000 Y NA
 2280327 2280328 LMOf6854_1134 LMOf6854_1133 rfbA   TRUE 0.718 17.000 0.050 NA   NA
 2280328 2280329 LMOf6854_1133 LMOf6854_1132     FALSE 0.128 132.000 0.040 NA   NA
 2280331 2280332 LMOf6854_1130 LMOf6854_1129     FALSE 0.025 216.000 0.000 1.000   NA
 2280333 2280334 LMOf6854_0017 LMOf6854_0018 qoxB qoxC TRUE 0.993 -12.000 0.957 0.024 Y NA
 2280334 2280335 LMOf6854_0018 LMOf6854_0019 qoxC qoxD TRUE 0.994 2.000 0.959 1.000 Y NA
 2280339 2280340 LMOf6854_0023 LMOf6854_0024     TRUE 0.830 16.000 0.213 1.000 N NA
 2280340 2280341 LMOf6854_0024 LMOf6854_0025     TRUE 0.996 0.000 0.417 0.036 Y NA
 2280341 2280342 LMOf6854_0025 LMOf6854_0026     TRUE 0.981 23.000 0.733 0.036 Y NA
 2280342 2280343 LMOf6854_0026 LMOf6854_0027     TRUE 0.989 -19.000 0.733 0.036 Y NA
 2280343 2280344 LMOf6854_0027 LMOf6854_0028     TRUE 0.668 28.000 0.400 1.000   NA
 2280344 2280345 LMOf6854_0028 LMOf6854_0029     FALSE 0.469 55.000 0.100 1.000   NA
 2280345 2280346 LMOf6854_0029 LMOf6854_0030     FALSE 0.022 205.000 0.000 1.000 N NA
 2280346 2280347 LMOf6854_0030 LMOf6854_0031     FALSE 0.234 82.000 0.125 NA N NA
 2280348 2280349 LMOf6854_0032 LMOf6854_0033     TRUE 0.562 -7.000 0.000 NA   NA
 2280349 2280350 LMOf6854_0033 LMOf6854_0034     TRUE 0.539 16.000 0.000 NA   NA
 2280350 2280351 LMOf6854_0034 LMOf6854_0035     TRUE 0.723 2.000 0.000 NA   NA
 2280351 2280352 LMOf6854_0035 LMOf6854_0036     FALSE 0.479 -13.000 0.000 NA   NA
 2280352 2280353 LMOf6854_0036 LMOf6854_0037     FALSE 0.125 71.000 0.000 NA   NA
 2280354 2280355 LMOf6854_0038 LMOf6854_0039     FALSE 0.103 82.000 0.000 NA   NA
 2280356 2280357 LMOf6854_0040 LMOf6854_0041     TRUE 0.842 17.000 0.286 1.000   NA
 2280358 2280359 LMOf6854_0042 LMOf6854_0043     TRUE 0.936 -3.000 0.529 1.000   NA
 2280359 2280360 LMOf6854_0043 LMOf6854_0044     TRUE 0.945 13.000 0.800 1.000   NA
 2280360 2280361 LMOf6854_0044 LMOf6854_0045     TRUE 0.946 2.000 0.450 1.000   NA
 2280361 2280362 LMOf6854_0045 LMOf6854_0046   argF-1 FALSE 0.020 235.000 0.000 1.000   NA
 2280362 2280363 LMOf6854_0046 LMOf6854_0047 argF-1   TRUE 0.846 64.000 0.028 1.000 Y NA
 2280363 2280364 LMOf6854_0047 LMOf6854_0048     TRUE 0.973 -13.000 0.176 1.000 Y NA
 2280364 2280365 LMOf6854_0048 LMOf6854_0049   arcC TRUE 0.986 13.000 0.182 1.000 Y NA
 2280365 2280366 LMOf6854_0049 LMOf6854_0050 arcC   TRUE 0.796 102.000 0.364 1.000 Y NA
 2280366 2280367 LMOf6854_0050 LMOf6854_0051     TRUE 0.861 17.000 0.533 1.000 N NA
 2280367 2280368 LMOf6854_0051 LMOf6854_0052     FALSE 0.248 105.000 0.250 NA   NA
 2280368 2280369 LMOf6854_0052 LMOf6854_0053   arcA FALSE 0.241 86.000 0.090 NA   NA
 2280369 2280370 LMOf6854_0053 LMOf6854_0054 arcA rpsF FALSE 0.010 279.000 0.000 1.000 N NA
 2280370 2280371 LMOf6854_0054 LMOf6854_0055 rpsF ssb-1 FALSE 0.315 56.000 0.012 1.000 N NA
 2280371 2280372 LMOf6854_0055 LMOf6854_0056 ssb-1 rpsR FALSE 0.350 44.000 0.012 1.000 N NA
 2280372 2280373 LMOf6854_0056 LMOf6854_0057 rpsR   FALSE 0.097 154.000 0.012 1.000   NA
 2280373 2280374 LMOf6854_0057 LMOf6854_0058   agrB FALSE 0.011 296.000 0.000 1.000   NA
 2280374 2280375 LMOf6854_0058 LMOf6854_0059 agrB agrD TRUE 0.778 -16.000 0.300 NA   NA
 2280375 2280376 LMOf6854_0059 LMOf6854_0060 agrD agrC FALSE 0.278 96.000 0.312 NA   NA
 2280376 2280377 LMOf6854_0060 LMOf6854_0061 agrC agrA TRUE 0.980 19.000 0.875 1.000 Y NA
 2280377 2280378 LMOf6854_0061 LMOf6854_0062 agrA   TRUE 0.572 167.000 0.344 1.000 Y NA
 2280378 2280379 LMOf6854_0062 LMOf6854_0063   rplI TRUE 0.854 3.000 0.011 1.000 N NA
 2280379 2280380 LMOf6854_0063 LMOf6854_0064 rplI dnaB TRUE 0.540 25.000 0.064 1.000 N NA
 2280380 2280381 LMOf6854_0064 LMOf6854_0065 dnaB   FALSE 0.400 38.000 0.056 NA   NA
 2280381 2280382 LMOf6854_0065 LMOf6854_0066   purA FALSE 0.274 54.000 0.009 NA   NA
 2280382 2280383 LMOf6854_0066 LMOf6854_0067 purA   FALSE 0.010 317.000 0.000 1.000   NA
 2280383 2280384 LMOf6854_0067 LMOf6854_0068     FALSE 0.140 149.000 0.265 NA   NA
 2280384 2280385 LMOf6854_0068 LMOf6854_0069     TRUE 0.792 -10.000 0.204 NA   NA
 2280385 2280386 LMOf6854_0069 LMOf6854_0070     TRUE 0.780 18.000 0.289 NA   NA
 2280386 2280387 LMOf6854_0070 LMOf6854_0071     TRUE 0.801 22.000 0.833 NA   NA
 2280387 2280388 LMOf6854_0071 LMOf6854_0072     TRUE 0.910 14.000 0.623 NA   NA
 2280388 2280389 LMOf6854_0072 LMOf6854_0073     TRUE 0.646 13.000 0.000 NA   NA
 2280389 2280390 LMOf6854_0073 LMOf6854_0074     TRUE 0.615 14.000 0.000 NA   NA
 2280390 2280391 LMOf6854_0074 LMOf6854_0075     FALSE 0.269 25.000 0.000 NA   NA
 2280391 2280392 LMOf6854_0075 LMOf6854_0076     TRUE 0.717 0.000 0.000 NA   NA
 2280392 2280393 LMOf6854_0076 LMOf6854_0077     TRUE 0.895 17.000 1.000 NA   NA
 2280393 2280394 LMOf6854_0077 LMOf6854_0078     FALSE 0.027 173.000 0.000 NA   NA
 2280394 2280395 LMOf6854_0078 LMOf6854_0079     TRUE 0.721 3.000 0.000 NA   NA
 2280395 2280396 LMOf6854_0079 LMOf6854_0080     FALSE 0.003 446.000 0.000 NA   NA
 2280396 2280397 LMOf6854_0080 LMOf6854_0081     FALSE 0.004 342.000 0.000 NA   NA
 2280397 2280398 LMOf6854_0081 LMOf6854_0082     TRUE 0.927 12.000 0.625 NA   NA
 2280398 2280399 LMOf6854_0082 LMOf6854_0083     TRUE 0.940 -3.000 0.833 NA   NA
 2280399 2280400 LMOf6854_0083 LMOf6854_0084     FALSE 0.003 473.000 0.000 NA   NA
 2280400 2280401 LMOf6854_0084 LMOf6854_0085     FALSE 0.002 563.000 0.000 NA   NA
 2280401 2280402 LMOf6854_0085 LMOf6854_0086     FALSE 0.134 68.000 0.000 NA   NA
 2280402 2280403 LMOf6854_0086 LMOf6854_0087     FALSE 0.010 241.000 0.000 NA   NA
 2280403 2280404 LMOf6854_0087 LMOf6854_0088   ada TRUE 0.906 -3.000 0.312 1.000 N NA
 2280406 2280407 LMOf6854_0090 LMOf6854_0091     FALSE 0.004 342.000 0.000 NA   NA
 2280407 2280408 LMOf6854_0091 LMOf6854_0092     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2280408 2280409 LMOf6854_0092 LMOf6854_0093     FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 2280409 2280410 LMOf6854_0093 LMOf6854_0094     FALSE 0.003 419.000 0.000 NA   NA
 2280411 2280412 LMOf6854_0095 LMOf6854_0096     TRUE 0.515 56.000 0.381 1.000 N NA
 2280413 2280414 LMOf6854_0097 LMOf6854_0098     FALSE 0.021 192.000 0.000 NA   NA
 2280414 2280415 LMOf6854_0098 LMOf6854_0099     TRUE 0.529 78.000 1.000 NA   NA
 2280415 2280416 LMOf6854_0099 LMOf6854_0100     TRUE 0.939 -3.000 0.818 NA   NA
 2280416 2280417 LMOf6854_0100 LMOf6854_0101     FALSE 0.366 57.000 0.079 NA   NA
 2280417 2280418 LMOf6854_0101 LMOf6854_0102     TRUE 0.897 21.000 0.088 0.006   NA
 2280418 2280419 LMOf6854_0102 LMOf6854_0103   atpA-1 TRUE 0.959 -3.000 0.009 0.006   NA
 2280419 2280420 LMOf6854_0103 LMOf6854_0104 atpA-1   TRUE 0.997 -3.000 0.846 0.006 Y NA
 2280420 2280421 LMOf6854_0104 LMOf6854_0105   atpD-1 TRUE 0.995 1.000 0.009 0.006 Y NA
 2280421 2280422 LMOf6854_0105 LMOf6854_0106 atpD-1   TRUE 0.994 13.000 0.143 0.006 Y NA
 2280422 2280423 LMOf6854_0106 LMOf6854_0107     TRUE 0.778 -10.000 0.143 NA   NA
 2280423 2280424 LMOf6854_0107 LMOf6854_0108     FALSE 0.124 176.000 0.500 NA   NA
 2280424 2280425 LMOf6854_0108 LMOf6854_0109   manL FALSE 0.006 300.000 0.000 NA   NA
 2280425 2280426 LMOf6854_0109 LMOf6854_0110 manL   TRUE 0.981 24.000 0.943 0.036 Y NA
 2280426 2280427 LMOf6854_0110 LMOf6854_0111     TRUE 0.984 22.000 0.812 0.036 Y NA
 2280427 2280428 LMOf6854_0111 LMOf6854_0112     FALSE 0.330 112.000 0.583 NA   NA
 2280428 2280429 LMOf6854_0112 LMOf6854_0113     FALSE 0.167 122.000 0.081 NA   NA
 2280431 2280432 LMOf6854_0115 LMOf6854_0116     TRUE 0.961 14.000 0.308 0.028   NA
 2280432 2280433 LMOf6854_0116 LMOf6854_0117     FALSE 0.309 93.000 0.385 NA   NA
 2280433 2280434 LMOf6854_0117 LMOf6854_0118   chiB FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 2280434 2280435 LMOf6854_0118 LMOf6854_0119 chiB   TRUE 0.793 103.000 0.348 1.000 Y NA
 2280436 2280437 LMOf6854_0120 LMOf6854_0121     TRUE 0.995 -7.000 0.941 0.010 Y NA
 2280438 2280439 LMOf6854_0122 LMOf6854_0123     FALSE 0.499 36.000 0.148 1.000 N NA
 2280439 2280440 LMOf6854_0123 LMOf6854_0124     FALSE 0.192 104.000 0.180 NA N NA
 2280441 2280442 LMOf6854_0125 LMOf6854_0126     FALSE 0.013 219.000 0.000 NA   NA
 2280442 2280443 LMOf6854_0126 LMOf6854_0127     TRUE 0.916 6.000 0.364 NA   NA
 2280444 2280445 LMOf6854_0128 LMOf6854_0129 lmaD lmaC TRUE 0.945 12.000 0.917 NA   NA
 2280445 2280446 LMOf6854_0129 LMOf6854_0130 lmaC lmaB FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 2280446 2280447 LMOf6854_0130 LMOf6854_0131 lmaB lmaA TRUE 0.646 13.000 0.000 NA   NA
 2280447 2280448 LMOf6854_0131 LMOf6854_0132 lmaA   FALSE 0.424 48.000 0.134 NA   NA
 2280448 2280449 LMOf6854_0132 LMOf6854_0133     TRUE 0.641 54.000 0.929 NA   NA
 2280449 2280450 LMOf6854_0133 LMOf6854_0134     TRUE 0.853 -13.000 0.625 NA   NA
 2280450 2280451 LMOf6854_0134 LMOf6854_0135     TRUE 0.927 -3.000 0.625 NA   NA
 2280451 2280452 LMOf6854_0135 LMOf6854_0136     TRUE 0.950 10.000 1.000 NA   NA
 2280452 2280453 LMOf6854_0136 LMOf6854_0137     TRUE 0.892 -10.000 0.833 NA   NA
 2280453 2280454 LMOf6854_0137 LMOf6854_0138     TRUE 0.920 15.000 0.900 NA   NA
 2280454 2280455 LMOf6854_0138 LMOf6854_0139     TRUE 0.913 15.000 0.800 NA   NA
 2280455 2280456 LMOf6854_0139 LMOf6854_0140     TRUE 0.934 -3.000 0.727 NA   NA
 2280456 2280457 LMOf6854_0140 LMOf6854_0141     TRUE 0.831 19.000 0.667 NA   NA
 2280457 2280458 LMOf6854_0141 LMOf6854_0142     TRUE 0.822 -31.000 0.750 NA   NA
 2280462 2280463 LMOf6854_0146 LMOf6854_0147     TRUE 0.873 12.000 0.168 NA   NA
 2280464 2280465 LMOf6854_0828 LMOf6854_0827     FALSE 0.039 287.000 0.000 0.043 N NA
 2280465 2280466 LMOf6854_0827 LMOf6854_0826     TRUE 0.996 0.000 0.550 0.035 Y NA
 2280466 2280467 LMOf6854_0826 LMOf6854_0825     TRUE 0.684 174.000 0.234 0.035 Y NA
 2280467 2280468 LMOf6854_0825 LMOf6854_0824     TRUE 0.990 19.000 0.939 0.035 Y NA
 2280471 2280472 LMOf6854_0821 LMOf6854_0820     FALSE 0.003 462.000 0.000 NA   NA
 2280474 2280475 LMOf6854_0818 LMOf6854_0817     TRUE 0.552 40.000 0.423 NA   NA
 2280477 2280478 LMOf6854_0815 LMOf6854_0814     TRUE 0.695 36.000 1.000 NA   NA
 2280480 2280481 LMOf6854_0812 LMOf6854_0811     TRUE 0.990 4.000 0.222 1.000 Y NA
 2280481 2280482 LMOf6854_0811 LMOf6854_0810   ugpE TRUE 0.982 21.000 0.500 0.038 Y NA
 2280482 2280483 LMOf6854_0810 LMOf6854_0809 ugpE   TRUE 0.995 12.000 0.583 0.038 Y NA
 2280483 2280484 LMOf6854_0809 LMOf6854_0808     TRUE 0.825 17.000 0.194 1.000   NA
 2280484 2280485 LMOf6854_0808 LMOf6854_0807     FALSE 0.328 153.000 0.111 0.029   NA
 2280485 2280486 LMOf6854_0807 LMOf6854_0806     TRUE 0.926 6.000 0.265 1.000   NA
 2280486 2280487 LMOf6854_0806 LMOf6854_0805     FALSE 0.316 66.000 0.010 1.000   NA
 2280487 2280488 LMOf6854_0805 LMOf6854_0804     FALSE 0.009 328.000 0.000 1.000   NA
 2280488 2280489 LMOf6854_0804 LMOf6854_0803     TRUE 0.907 10.000 0.123 1.000   NA
 2280489 2280490 LMOf6854_0803 LMOf6854_0802     TRUE 0.918 7.000 0.200 1.000   NA
 2280490 2280491 LMOf6854_0802 LMOf6854_0801     TRUE 0.983 0.000 0.526 0.004   NA
 2280491 2280492 LMOf6854_0801 LMOf6854_0800     FALSE 0.195 127.000 0.233 NA   NA
 2280492 2280493 LMOf6854_0800 LMOf6854_0799     TRUE 0.905 -7.000 0.791 NA   NA
 2280493 2280494 LMOf6854_0799 LMOf6854_0798     TRUE 0.853 -28.000 0.850 1.000 N NA
 2280494 2280495 LMOf6854_0798 LMOf6854_0797     FALSE 0.211 115.000 0.175 NA   NA
 2280495 2280496 LMOf6854_0797 LMOf6854_0796     FALSE 0.370 81.000 0.409 NA   NA
 2280496 2280497 LMOf6854_0796 LMOf6854_0795     FALSE 0.205 126.000 0.267 NA   NA
 2280497 2280498 LMOf6854_0795 LMOf6854_0794     FALSE 0.218 96.000 0.100 NA   NA
 2280498 2280499 LMOf6854_0794 LMOf6854_0793     TRUE 0.576 55.000 0.667 NA   NA
 2280499 2280500 LMOf6854_0793 LMOf6854_0792     TRUE 0.770 -7.000 0.051 NA   NA
 2280500 2280501 LMOf6854_0792 LMOf6854_0791     FALSE 0.002 1246.000 0.000 NA   NA
 2280501 2280502 LMOf6854_0791 LMOf6854_0790     FALSE 0.303 95.000 0.385 NA   NA
 2280502 2280503 LMOf6854_0790 LMOf6854_0789     TRUE 0.889 15.000 0.538 NA   NA
 2280503 2280504 LMOf6854_0789 LMOf6854_0788     TRUE 0.935 -3.000 0.750 NA   NA
 2280504 2280505 LMOf6854_0788 LMOf6854_0787     TRUE 0.869 -16.000 0.750 1.000 N NA
 2280507 2280508 LMOf6854_0785 LMOf6854_0784     TRUE 0.941 20.000 0.000 1.000 Y NA
 2280508 2280509 LMOf6854_0784 LMOf6854_0783     FALSE 0.426 24.000 0.000 1.000   NA
 2280509 2280510 LMOf6854_0783 LMOf6854_0782     TRUE 0.771 13.000 0.000 1.000   NA
 2280510 2280511 LMOf6854_0782 LMOf6854_0781     TRUE 0.987 -3.000 0.107 1.000 Y NA
 2280513 2280514 LMOf6854_0779 LMOf6854_0778     FALSE 0.009 330.000 0.000 1.000   NA
 2280514 2280515 LMOf6854_0778 LMOf6854_0777     FALSE 0.002 694.000 0.000 NA   NA
 2280515 2280516 LMOf6854_0777 LMOf6854_0776     FALSE 0.042 145.000 0.000 NA   NA
 2280516 2280517 LMOf6854_0776 LMOf6854_0775     TRUE 0.837 14.000 0.111 NA   NA
 2280517 2280518 LMOf6854_0775 LMOf6854_0774     FALSE 0.226 83.000 0.049 NA   NA
 2280518 2280519 LMOf6854_0774 LMOf6854_0773   glmS FALSE 0.161 112.000 0.014 1.000 N NA
 2280521 2280522 LMOf6854_0771 LMOf6854_0770     TRUE 0.898 13.000 0.391 NA   NA
 2280522 2280523 LMOf6854_0770 LMOf6854_0769     FALSE 0.149 162.000 0.400 1.000 N NA
 2280525 2280526 LMOf6854_0767 LMOf6854_0766     TRUE 0.919 0.000 0.342 NA   NA
 2280526 2280527 LMOf6854_0766 LMOf6854_0765     FALSE 0.200 122.000 0.211 NA   NA
 2280527 2280528 LMOf6854_0765 LMOf6854_0764     TRUE 0.826 14.000 0.083 NA   NA
 2280528 2280529 LMOf6854_0764 LMOf6854_0763   fliI TRUE 0.739 17.000 0.076 NA   NA
 2280529 2280530 LMOf6854_0763 LMOf6854_0762 fliI   TRUE 0.869 -3.000 0.129 NA   NA
 2280530 2280531 LMOf6854_0762 LMOf6854_0761   fliG TRUE 0.830 -13.000 0.471 NA   NA
 2280531 2280532 LMOf6854_0761 LMOf6854_0760 fliG fliF TRUE 0.995 3.000 0.056 0.006 Y NA
 2280532 2280533 LMOf6854_0760 LMOf6854_0759 fliF   TRUE 0.931 68.000 0.076 0.006 Y NA
 2280533 2280534 LMOf6854_0759 LMOf6854_0758   flgC TRUE 0.989 17.000 0.068 0.004 Y NA
 2280534 2280535 LMOf6854_0758 LMOf6854_0757 flgC flgB TRUE 0.997 12.000 0.804 0.004 Y NA
 2280535 2280536 LMOf6854_0757 LMOf6854_0756 flgB   TRUE 0.589 21.000 0.040 NA   NA
 2280536 2280537 LMOf6854_0756 LMOf6854_0755     TRUE 0.685 -28.000 0.127 NA   NA
 2280537 2280538 LMOf6854_0755 LMOf6854_0754   fliD TRUE 0.991 19.000 0.608 0.002 Y NA
 2280538 2280539 LMOf6854_0754 LMOf6854_0753 fliD   TRUE 0.914 39.000 0.292 1.000 Y NA
 2280539 2280540 LMOf6854_0753 LMOf6854_0752     TRUE 0.996 12.000 0.177 0.001 Y NA
 2280540 2280541 LMOf6854_0752 LMOf6854_0751     TRUE 0.812 20.000 0.688 NA   NA
 2280541 2280542 LMOf6854_0751 LMOf6854_0750     TRUE 0.863 10.000 0.076 NA   NA
 2280542 2280543 LMOf6854_0750 LMOf6854_0749     FALSE 0.199 107.000 0.083 NA   NA
 2280543 2280544 LMOf6854_0749 LMOf6854_0748     TRUE 0.790 23.000 0.917 NA   NA
 2280544 2280545 LMOf6854_0748 LMOf6854_0747     TRUE 0.514 24.000 0.052 NA   NA
 2280545 2280546 LMOf6854_0747 LMOf6854_0746   fliM TRUE 0.973 36.000 0.508 0.002 Y NA
 2280546 2280547 LMOf6854_0746 LMOf6854_0745 fliM   TRUE 0.908 21.000 0.079 0.002   NA
 2280547 2280548 LMOf6854_0745 LMOf6854_0744     TRUE 0.966 14.000 0.293 0.006   NA
 2280548 2280549 LMOf6854_0744 LMOf6854_0743   flgD TRUE 0.957 21.000 0.117 1.000 Y NA
 2280549 2280550 LMOf6854_0743 LMOf6854_0742 flgD   TRUE 0.911 2.000 0.064 1.000   NA
 2280550 2280551 LMOf6854_0742 LMOf6854_0741     TRUE 0.539 16.000 0.000 NA   NA
 2280551 2280552 LMOf6854_0741 LMOf6854_0740     FALSE 0.192 43.000 0.000 NA   NA
 2280552 2280553 LMOf6854_0740 LMOf6854_0739   cheA TRUE 0.994 13.000 0.059 0.004 Y NA
 2280553 2280554 LMOf6854_0739 LMOf6854_0738 cheA cheY TRUE 0.983 20.000 0.154 0.010 Y NA
 2280554 2280555 LMOf6854_0738 LMOf6854_0737 cheY   FALSE 0.010 275.000 0.000 1.000 N NA
 2280555 2280556 LMOf6854_0737 LMOf6854_0736   cheV FALSE 0.208 238.000 0.000 1.000 Y NA
 2280556 2280557 LMOf6854_0736 LMOf6854_0735 cheV   TRUE 0.872 13.000 0.117 1.000 N NA
 2280557 2280558 LMOf6854_0735 LMOf6854_0734     TRUE 0.696 23.000 0.450 NA   NA
 2280558 2280559 LMOf6854_0734 LMOf6854_0733   motB TRUE 0.882 10.000 0.175 NA   NA
 2280559 2280560 LMOf6854_0733 LMOf6854_0732 motB motA TRUE 0.958 -82.000 0.257 1.000 Y NA
 2280562 2280563 LMOf6854_0730 LMOf6854_0729   cheR TRUE 0.528 25.000 0.092 NA   NA
 2280563 2280564 LMOf6854_0729 LMOf6854_0728 cheR   TRUE 0.917 29.000 0.084 1.000 Y NA
 2280564 2280565 LMOf6854_0728 LMOf6854_0727     TRUE 0.985 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 2280565 2280566 LMOf6854_0727 LMOf6854_0726   flhA TRUE 0.978 22.000 0.440 0.080 Y NA
 2280566 2280567 LMOf6854_0726 LMOf6854_0725 flhA   TRUE 0.961 47.000 0.207 0.002 Y NA
 2280567 2280568 LMOf6854_0725 LMOf6854_0724   fliR TRUE 0.989 16.000 0.259 0.080 Y NA
 2280568 2280569 LMOf6854_0724 LMOf6854_0723 fliR fliQ TRUE 0.954 30.000 0.181 0.080 Y NA
 2280569 2280570 LMOf6854_0723 LMOf6854_0722 fliQ fliP TRUE 0.995 13.000 0.162 0.002 Y NA
 2280570 2280571 LMOf6854_0722 LMOf6854_0721 fliP   TRUE 0.786 -7.000 0.073 NA   NA
 2280572 2280573 LMOf6854_0720 LMOf6854_0719     TRUE 0.831 19.000 0.667 NA   NA
 2280574 2280575 LMOf6854_0718 LMOf6854_0717     FALSE 0.007 291.000 0.000 NA   NA
 2280575 2280576 LMOf6854_0717 LMOf6854_0716     FALSE 0.002 526.000 0.000 NA   NA
 2280576 2280577 LMOf6854_0716 LMOf6854_0715     FALSE 0.156 126.000 0.073 NA   NA
 2280577 2280578 LMOf6854_0715 LMOf6854_0714     TRUE 0.741 18.000 0.135 NA   NA
 2280578 2280579 LMOf6854_0714 LMOf6854_0713     TRUE 0.872 12.000 0.157 NA   NA
 2280579 2280580 LMOf6854_0713 LMOf6854_0712     FALSE 0.120 133.000 0.032 NA   NA
 2280580 2280581 LMOf6854_0712 LMOf6854_0711     TRUE 0.987 -7.000 0.688 1.000 Y NA
 2280581 2280582 LMOf6854_0711 LMOf6854_0710     FALSE 0.202 114.000 0.024 1.000   NA
 2280582 2280583 LMOf6854_0710 LMOf6854_0709     TRUE 0.831 10.000 0.029 NA   NA
 2280583 2280584 LMOf6854_0709 LMOf6854_0708     TRUE 0.870 -3.000 0.139 NA   NA
 2280587 2280588 LMOf6854_0705 LMOf6854_0704 thiD-2   FALSE 0.438 64.000 0.143 1.000   NA
 2280591 2280592 LMOf6854_0701 LMOf6854_0700     FALSE 0.358 52.000 0.052 NA   NA
 2280594 2280595 LMOf6854_0698 LMOf6854_0697     FALSE 0.406 68.000 0.333 NA   NA
 2280596 2280597 LMOf6854_0696 LMOf6854_0695     TRUE 0.763 -13.000 0.183 NA   NA
 2280598 2280599 LMOf6854_0694 LMOf6854_0693     TRUE 0.515 46.000 0.174 1.000   NA
 2280599 2280600 LMOf6854_0693 LMOf6854_0692     TRUE 0.526 43.000 0.174 1.000   NA
 2280600 2280601 LMOf6854_0692 LMOf6854_0691     TRUE 0.721 24.000 0.545 1.000 N NA
 2280603 2280604 LMOf6854_0689 LMOf6854_0688     FALSE 0.427 90.000 0.571 1.000   NA
 2280607 2280608 LMOf6854_1545 LMOf6854_1544     FALSE 0.376 77.000 0.154 1.000   NA
 2280608 2280609 LMOf6854_1544 LMOf6854_1543   udk TRUE 0.876 -3.000 0.039 1.000   NA
 2280611 2280612 LMOf6854_1541 LMOf6854_1540     FALSE 0.374 51.000 0.065 NA   NA
 2280612 2280613 LMOf6854_1540 LMOf6854_1539   pfs FALSE 0.350 50.000 0.041 NA   NA
 2280615 2280616 LMOf6854_1537 LMOf6854_1536     TRUE 0.938 -3.000 0.555 1.000   NA
 2280616 2280617 LMOf6854_1536 LMOf6854_1535   aroE-2 TRUE 0.790 20.000 0.336 1.000   NA
 2280617 2280618 LMOf6854_1535 LMOf6854_1534 aroE-2   TRUE 0.859 0.000 0.089 NA N NA
 2280618 2280619 LMOf6854_1534 LMOf6854_1533   nadD TRUE 0.700 18.000 0.150 NA N NA
 2280619 2280620 LMOf6854_1533 LMOf6854_1532 nadD   TRUE 0.973 -13.000 0.199 1.000 Y NA
 2280620 2280621 LMOf6854_1532 LMOf6854_1531     TRUE 0.891 5.000 0.149 NA   NA
 2280621 2280622 LMOf6854_1531 LMOf6854_1530     FALSE 0.380 55.000 0.085 NA   NA
 2280622 2280623 LMOf6854_1530 LMOf6854_1529   comEA FALSE 0.333 70.000 0.033 1.000   NA
 2280623 2280624 LMOf6854_1529 LMOf6854_1528 comEA comEB FALSE 0.332 72.000 0.095 1.000 N NA
 2280624 2280625 LMOf6854_1528 LMOf6854_1527 comEB   FALSE 0.501 35.000 0.055 1.000   NA
 2280625 2280626 LMOf6854_1527 LMOf6854_1526     FALSE 0.417 68.000 0.163 1.000   NA
 2280630 2280631 LMOf6854_1522 LMOf6854_1521     FALSE 0.240 89.000 0.063 1.000 N NA
 2280631 2280632 LMOf6854_1521 LMOf6854_1520   hrcA FALSE 0.127 147.000 0.082 1.000 N NA
 2280632 2280633 LMOf6854_1520 LMOf6854_1519 hrcA grpE TRUE 0.525 42.000 0.286 1.000 N NA
 2280635 2280636 LMOf6854_1517 LMOf6854_1516 dnaK dnaJ TRUE 0.830 142.000 0.196 0.003 Y NA
 2280636 2280637 LMOf6854_1516 LMOf6854_1515 dnaJ prmA FALSE 0.345 73.000 0.133 1.000 N NA
 2280637 2280638 LMOf6854_1515 LMOf6854_1514 prmA   TRUE 0.908 1.000 0.227 NA   NA
 2280638 2280639 LMOf6854_1514 LMOf6854_1513   rpsU FALSE 0.060 165.000 0.019 NA   NA
 2280639 2280640 LMOf6854_1513 LMOf6854_1512 rpsU   TRUE 0.967 11.000 0.150 0.024   NA
 2280642 2280643 LMOf6854_1510 LMOf6854_1509     TRUE 0.845 16.000 0.172 1.000   NA
 2280643 2280644 LMOf6854_1509 LMOf6854_1508     TRUE 0.774 17.000 0.182 NA   NA
 2280644 2280645 LMOf6854_1508 LMOf6854_1507   dgkA TRUE 0.703 -22.000 0.123 NA   NA
 2280645 2280646 LMOf6854_1507 LMOf6854_1506 dgkA cdd TRUE 0.561 25.000 0.090 1.000 N NA
 2280646 2280647 LMOf6854_1506 LMOf6854_1505 cdd erA TRUE 0.861 -3.000 0.019 1.000   NA
 2280649 2280650 LMOf6854_1503 LMOf6854_1502 recO glyQ FALSE 0.021 281.000 0.036 1.000 N NA
 2280650 2280651 LMOf6854_1502 LMOf6854_1501 glyQ glyS TRUE 0.995 -7.000 0.651 0.001 Y NA
 2280651 2280652 LMOf6854_1501 LMOf6854_1500 glyS   FALSE 0.344 34.000 0.013 NA   NA
 2280652 2280653 LMOf6854_1500 LMOf6854_1499     FALSE 0.052 181.000 0.029 NA   NA
 2280653 2280654 LMOf6854_1499 LMOf6854_1498   dnaG TRUE 0.600 20.000 0.033 NA   NA
 2280654 2280655 LMOf6854_1498 LMOf6854_1497 dnaG rpoD FALSE 0.275 95.000 0.209 1.000 N NA
 2280655 2280656 LMOf6854_1497 LMOf6854_1496 rpoD   FALSE 0.474 44.000 0.239 NA   NA
 2280656 2280657 LMOf6854_1496 LMOf6854_1495     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2280659 2280660 LMOf6854_1493 LMOf6854_1492   nfo TRUE 0.981 15.000 0.104 1.000 Y NA
 2280660 2280661 LMOf6854_1492 LMOf6854_1491 nfo ppaC TRUE 0.743 16.000 0.019 1.000 N NA
 2280661 2280662 LMOf6854_1491 LMOf6854_1490 ppaC zurA-2 FALSE 0.057 143.000 0.000 1.000 N NA
 2280662 2280663 LMOf6854_1490 LMOf6854_1489 zurA-2 zurM-2 TRUE 0.940 -34.000 0.000 1.000 Y NA
 2280663 2280664 LMOf6854_1489 LMOf6854_1488 zurM-2 zurR TRUE 0.975 -19.000 0.480 1.000 Y NA
 2280664 2280665 LMOf6854_1488 LMOf6854_1487 zurR prsA-1 FALSE 0.160 137.000 0.102 1.000 N NA
 2280666 2280667 LMOf6854_1486 LMOf6854_1485     TRUE 0.835 -9.000 0.338 NA   NA
 2280667 2280668 LMOf6854_1485 LMOf6854_1484   ispG FALSE 0.248 36.000 0.007 NA N NA
 2280668 2280669 LMOf6854_1484 LMOf6854_1483 ispG   FALSE 0.126 113.000 0.008 NA   NA
 2280670 2280671 LMOf6854_1482 LMOf6854_1481 sod   FALSE 0.192 130.000 0.169 1.000 N NA
 2280671 2280672 LMOf6854_1481 LMOf6854_1480   asd FALSE 0.067 198.000 0.136 1.000 N NA
 2280672 2280673 LMOf6854_1480 LMOf6854_1479 asd   TRUE 0.987 12.000 0.091 1.000 Y NA
 2280673 2280674 LMOf6854_1479 LMOf6854_1478   dapA TRUE 0.981 15.000 0.085 1.000 Y NA
 2280674 2280675 LMOf6854_1478 LMOf6854_1477 dapA   TRUE 0.657 20.000 0.014 1.000   NA
 2280675 2280676 LMOf6854_1477 LMOf6854_1476     FALSE 0.315 89.000 0.167 1.000   NA
 2280676 2280677 LMOf6854_1476 LMOf6854_1475     TRUE 0.833 53.000 0.786 0.022   NA
 2280679 2280680 LMOf6854_1473 LMOf6854_1472     FALSE 0.030 165.000 0.000 NA   NA
 2280680 2280681 LMOf6854_1472 LMOf6854_1471   opuCA FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 2280681 2280682 LMOf6854_1471 LMOf6854_1470 opuCA opuCB TRUE 0.997 4.000 0.727 0.004 Y NA
 2280682 2280683 LMOf6854_1470 LMOf6854_1469 opuCB opuCC TRUE 0.986 2.000 0.909 0.004 N NA
 2280683 2280684 LMOf6854_1469 LMOf6854_1468 opuCC opuCD TRUE 0.975 15.000 0.909 0.004 N NA
 2280684 2280685 LMOf6854_1468 LMOf6854_1467 opuCD   TRUE 0.568 113.000 0.636 0.037 N NA
 2280685 2280686 LMOf6854_1467 LMOf6854_1466     FALSE 0.257 139.000 0.700 NA   NA
 2280687 2280688 LMOf6854_1465 LMOf6854_1464 proX   TRUE 0.974 -3.000 0.382 0.004 N NA
 2280689 2280690 LMOf6854_1463 LMOf6854_1462 murB   TRUE 0.755 17.000 0.021 1.000   NA
 2280690 2280691 LMOf6854_1462 LMOf6854_1461     FALSE 0.439 64.000 0.152 1.000   NA
 2280691 2280692 LMOf6854_1461 LMOf6854_1460     TRUE 0.746 19.000 0.068 1.000   NA
 2280692 2280693 LMOf6854_1460 LMOf6854_1459     FALSE 0.252 70.000 0.029 NA   NA
 2280695 2280696 LMOf6854_1457 LMOf6854_1456     FALSE 0.094 186.000 0.140 1.000   NA
 2280697 2280698 LMOf6854_1455 LMOf6854_1454 flaR   FALSE 0.243 41.000 0.000 1.000 N NA
 2280698 2280699 LMOf6854_1454 LMOf6854_1453     FALSE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 2280699 2280700 LMOf6854_1453 LMOf6854_1452     FALSE 0.033 158.000 0.000 NA   NA
 2280702 2280703 LMOf6854_1450 LMOf6854_1449 pflA pfl-1 FALSE 0.332 77.000 0.135 1.000 N NA
 2280703 2280704 LMOf6854_1449 LMOf6854_1448 pfl-1 glpP FALSE 0.004 426.000 0.000 1.000 N NA
 2280704 2280705 LMOf6854_1448 LMOf6854_1447 glpP mutL TRUE 0.709 17.000 0.020 1.000 N NA
 2280705 2280706 LMOf6854_1447 LMOf6854_1446 mutL mutS-2 TRUE 0.982 23.000 0.220 0.001 Y NA
 2280706 2280707 LMOf6854_1446 LMOf6854_1445 mutS-2   FALSE 0.160 110.000 0.031 NA   NA
 2280707 2280708 LMOf6854_1445 LMOf6854_1444     TRUE 0.694 17.000 0.031 NA   NA
 2280708 2280709 LMOf6854_1444 LMOf6854_1443     TRUE 0.888 5.000 0.026 1.000   NA
 2280709 2280710 LMOf6854_1443 LMOf6854_1442     FALSE 0.135 138.000 0.016 1.000   NA
 2280710 2280711 LMOf6854_1442 LMOf6854_1441   recA FALSE 0.018 301.000 0.018 1.000   NA
 2280712 2280713 LMOf6854_2870 LMOf6854_2869   pabB FALSE 0.206 116.000 0.033 1.000   NA
 2280713 2280714 LMOf6854_2869 LMOf6854_2868 pabB   TRUE 0.994 -3.000 0.006 0.001 Y NA
 2280715 2280716 LMOf6854_2867 LMOf6854_2866   serS FALSE 0.008 335.000 0.000 1.000   NA
 2280716 2280717 LMOf6854_2866 LMOf6854_2865 serS   FALSE 0.481 20.000 0.014 NA N NA
 2280719 2280720 LMOf6854_2863 LMOf6854_2862     FALSE 0.122 143.000 0.049 1.000 N NA
 2280720 2280721 LMOf6854_2862 LMOf6854_2861     TRUE 0.658 19.000 0.049 NA   NA
 2280721 2280722 LMOf6854_2861 LMOf6854_2860     FALSE 0.262 117.000 0.375 NA   NA
 2280722 2280723 LMOf6854_2860 LMOf6854_2859     TRUE 0.785 -10.000 0.180 NA   NA
 2280723 2280724 LMOf6854_2859 LMOf6854_2858     TRUE 0.817 -7.000 0.180 NA   NA
 2280724 2280725 LMOf6854_2858 LMOf6854_2857     FALSE 0.196 118.000 0.122 NA   NA
 2280725 2280726 LMOf6854_2857 LMOf6854_2856     FALSE 0.337 68.000 0.122 NA   NA
 2280727 2280728 LMOf6854_2855 LMOf6854_2854 garK-1   TRUE 0.990 -3.000 0.438 1.000 Y NA
 2280728 2280729 LMOf6854_2854 LMOf6854_2853     TRUE 0.993 2.000 0.500 1.000 Y NA
 2280729 2280730 LMOf6854_2853 LMOf6854_2852     TRUE 0.904 61.000 0.529 1.000 Y NA
 2280731 2280732 LMOf6854_2851 LMOf6854_2850     FALSE 0.393 84.000 0.556 NA   NA
 2280732 2280733 LMOf6854_2850 LMOf6854_2849     TRUE 0.916 14.000 0.692 NA   NA
 2280734 2280735 LMOf6854_2848 LMOf6854_2847     TRUE 0.975 0.000 0.524 0.070   NA
 2280735 2280736 LMOf6854_2847 LMOf6854_2846     TRUE 0.527 85.000 0.196 0.052 N NA
 2280737 2280738 LMOf6854_2845 LMOf6854_2844     TRUE 0.926 -3.000 0.520 1.000 N NA
 2280738 2280739 LMOf6854_2844 LMOf6854_2843     FALSE 0.497 58.000 0.440 NA   NA
 2280740 2280741 LMOf6854_2842 LMOf6854_2841     FALSE 0.493 54.000 0.172 1.000   NA
 2280744 2280745 LMOf6854_2838 LMOf6854_2837   cydA FALSE 0.005 382.000 0.000 1.000 N NA
 2280745 2280746 LMOf6854_2837 LMOf6854_2836 cydA cydB TRUE 0.984 -22.000 0.153 0.022 Y NA
 2280746 2280747 LMOf6854_2836 LMOf6854_2835 cydB cydC TRUE 0.990 0.000 0.151 1.000 Y NA
 2280747 2280748 LMOf6854_2835 LMOf6854_2834 cydC cydD TRUE 0.996 0.000 0.168 0.009 Y NA
 2280748 2280749 LMOf6854_2834 LMOf6854_2833 cydD   FALSE 0.141 141.000 0.034 1.000   NA
 2280749 2280750 LMOf6854_2833 LMOf6854_2832     FALSE 0.375 43.000 0.044 NA   NA
 2280750 2280751 LMOf6854_2832 LMOf6854_2831     FALSE 0.216 116.000 0.200 NA   NA
 2280751 2280752 LMOf6854_2831 LMOf6854_2830     TRUE 0.582 58.000 0.750 NA   NA
 2280752 2280753 LMOf6854_2830 LMOf6854_2829     FALSE 0.002 545.000 0.000 NA   NA
 2280755 2280756 LMOf6854_2827 LMOf6854_2826     FALSE 0.255 135.000 0.588 NA   NA
 2280756 2280757 LMOf6854_2826 LMOf6854_2825     TRUE 0.933 -3.000 0.706 NA   NA
 2280757 2280758 LMOf6854_2825 LMOf6854_2824     TRUE 0.856 18.000 0.706 NA   NA
 2280758 2280759 LMOf6854_2824 LMOf6854_2823   dnaX FALSE 0.005 327.000 0.000 NA   NA
 2280759 2280760 LMOf6854_2823 LMOf6854_2822 dnaX   FALSE 0.456 30.000 0.071 NA   NA
 2280760 2280761 LMOf6854_2822 LMOf6854_2821   recR FALSE 0.340 109.000 0.604 NA   NA
 2280761 2280762 LMOf6854_2821 LMOf6854_2820 recR   TRUE 0.798 15.000 0.071 NA   NA
 2280763 2280764 LMOf6854_2819 LMOf6854_2818     FALSE 0.226 121.000 0.094 1.000   NA
 2280764 2280765 LMOf6854_2818 LMOf6854_2817     FALSE 0.117 119.000 0.000 1.000   NA
 2280765 2280766 LMOf6854_2817 LMOf6854_2816     FALSE 0.134 106.000 0.000 1.000   NA
 2280766 2280767 LMOf6854_2816 LMOf6854_2815     TRUE 0.926 4.000 0.211 1.000   NA
 2280767 2280768 LMOf6854_2815 LMOf6854_2814     TRUE 0.984 22.000 0.316 0.002 Y NA
 2280769 2280770 LMOf6854_2813 LMOf6854_2812   tmk FALSE 0.383 53.000 0.045 1.000 N NA
 2280770 2280771 LMOf6854_2812 LMOf6854_2811 tmk   FALSE 0.162 109.000 0.033 NA   NA
 2280775 2280776 LMOf6854_2807 LMOf6854_2806     FALSE 0.003 555.000 0.000 1.000 N NA
 2280776 2280777 LMOf6854_2806 LMOf6854_2805     TRUE 0.939 16.000 0.467 0.075 N NA
 2280777 2280778 LMOf6854_2805 LMOf6854_2804     TRUE 0.996 -3.000 0.727 0.008 Y NA
 2280778 2280779 LMOf6854_2804 LMOf6854_2803     FALSE 0.097 165.000 0.182 NA   NA
 2280779 2280780 LMOf6854_2803 LMOf6854_2802     TRUE 0.902 15.000 0.667 NA   NA
 2280781 2280782 LMOf6854_2801 LMOf6854_2800     TRUE 0.961 37.000 0.429 0.031 Y NA
 2280782 2280783 LMOf6854_2800 LMOf6854_2799     TRUE 0.841 136.000 0.429 0.031 Y NA
 2280784 2280785 LMOf6854_2798 LMOf6854_2797 kdpA kdpB TRUE 0.994 15.000 0.112 0.001 Y NA
 2280785 2280786 LMOf6854_2797 LMOf6854_2796 kdpB kdpC TRUE 0.996 15.000 0.877 0.001 Y NA
 2280786 2280787 LMOf6854_2796 LMOf6854_2795 kdpC kdpD TRUE 0.893 16.000 0.014 0.078 N NA
 2280787 2280788 LMOf6854_2795 LMOf6854_2794 kdpD kdpE TRUE 0.987 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 2280788 2280789 LMOf6854_2794 LMOf6854_2793 kdpE   TRUE 0.508 41.000 0.095 1.000   NA
 2280790 2280791 LMOf6854_2792 LMOf6854_2791     TRUE 0.646 13.000 0.000 NA   NA
 2280791 2280792 LMOf6854_2791 LMOf6854_2790   rpiB-4 FALSE 0.020 195.000 0.000 NA   NA
 2280792 2280793 LMOf6854_2790 LMOf6854_2789 rpiB-4   FALSE 0.494 46.000 0.233 1.000 N NA
 2280794 2280795 LMOf6854_2788 LMOf6854_2787     TRUE 0.540 46.000 0.450 NA   NA
 2280795 2280796 LMOf6854_2787 LMOf6854_2786     TRUE 0.876 -3.000 0.192 NA   NA
 2280796 2280797 LMOf6854_2786 LMOf6854_2785     FALSE 0.326 74.000 0.192 NA   NA
 2280797 2280798 LMOf6854_2785 LMOf6854_2784     FALSE 0.004 369.000 0.000 NA   NA
 2280798 2280799 LMOf6854_2784 LMOf6854_2783     TRUE 0.843 34.000 0.800 0.031 N NA
 2280799 2280800 LMOf6854_2783 LMOf6854_2782     TRUE 0.953 57.000 0.519 0.031 Y NA
 2280800 2280801 LMOf6854_2782 LMOf6854_2781     TRUE 0.943 62.000 0.407 0.034 Y NA
 2280801 2280802 LMOf6854_2781 LMOf6854_2780     TRUE 0.596 37.000 0.455 1.000 N NA
 2280802 2280803 LMOf6854_2780 LMOf6854_2779     TRUE 0.996 2.000 0.241 0.019 Y NA
 2280803 2280804 LMOf6854_2779 LMOf6854_2778   rpiB-3 FALSE 0.099 195.000 0.414 1.000 N NA
 2280804 2280805 LMOf6854_2778 LMOf6854_2777 rpiB-3   TRUE 0.993 9.000 0.786 1.000 Y NA
 2280805 2280806 LMOf6854_2777 LMOf6854_2776   tkt-3 TRUE 0.945 34.000 0.818 1.000 Y NA
 2280806 2280807 LMOf6854_2776 LMOf6854_2775 tkt-3 rpe-3 TRUE 0.986 -3.000 0.061 1.000 Y NA
 2280807 2280808 LMOf6854_2775 LMOf6854_2774 rpe-3   FALSE 0.164 134.000 0.034 1.000   NA
 2280808 2280809 LMOf6854_2774 LMOf6854_2773   dgt2 TRUE 0.866 15.000 0.169 1.000   NA
 2280811 2280812 LMOf6854_2771 LMOf6854_2770 rpsL rpsG TRUE 0.968 31.000 0.224 0.003 Y NA
 2280812 2280813 LMOf6854_2770 LMOf6854_2769 rpsG fusA FALSE 0.307 66.000 0.006 1.000   NA
 2280814 2280815 LMOf6854_2871 LMOf6854_2872     TRUE 0.997 0.000 0.720 0.009 Y NA
 2280816 2280817 LMOf6854_2873 LMOf6854_2874     FALSE 0.184 215.000 0.333 0.029   NA
 2280817 2280818 LMOf6854_2874 LMOf6854_2875   topB FALSE 0.270 100.000 0.096 1.000   NA
 2280818 2280819 LMOf6854_2875 LMOf6854_2876 topB recQ TRUE 0.933 24.000 0.058 1.000 Y NA
 2280819 2280820 LMOf6854_2876 LMOf6854_2877 recQ guaB FALSE 0.097 161.000 0.072 1.000 N NA
 2280820 2280821 LMOf6854_2877 LMOf6854_2878 guaB   FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 2280821 2280822 LMOf6854_2878 LMOf6854_2879     FALSE 0.370 58.000 0.092 NA   NA
 2280823 2280824 LMOf6854_2880 LMOf6854_2881     TRUE 0.932 47.000 0.765 1.000 Y NA
 2280824 2280825 LMOf6854_2881 LMOf6854_2882     TRUE 0.971 33.000 0.789 0.031 Y NA
 2280825 2280826 LMOf6854_2882 LMOf6854_2883     TRUE 0.990 12.000 0.524 1.000 Y NA
 2280826 2280827 LMOf6854_2883 LMOf6854_2884     TRUE 0.979 -7.000 0.095 1.000 Y NA
 2280828 2280829 LMOf6854_2885 LMOf6854_2886     FALSE 0.230 100.000 0.177 NA   NA
 2280829 2280830 LMOf6854_2886 LMOf6854_2887     FALSE 0.331 71.000 0.177 NA   NA
 2280830 2280831 LMOf6854_2887 LMOf6854_2888     TRUE 0.745 27.000 1.000 NA   NA
 2280833 2280834 LMOf6854_2890 LMOf6854_2891 bglA   TRUE 0.983 -7.000 0.368 1.000 Y NA
 2280834 2280835 LMOf6854_2891 LMOf6854_2892     FALSE 0.360 97.000 0.407 1.000   NA
 2280835 2280836 LMOf6854_2892 LMOf6854_2893     FALSE 0.436 -19.000 0.000 NA   NA
 2280836 2280837 LMOf6854_2893 LMOf6854_2894     FALSE 0.008 266.000 0.000 NA   NA
 2280839 2280840 LMOf6854_2896 LMOf6854_2897   ychF FALSE 0.007 291.000 0.000 NA   NA
 2280840 2280841 LMOf6854_2897 LMOf6854_2898 ychF   FALSE 0.077 152.000 0.008 1.000 N NA
 2280841 2280842 LMOf6854_2898 LMOf6854_2899   bglX-2 TRUE 0.991 6.000 0.450 1.000 Y NA
 2280842 2280843 LMOf6854_2899 LMOf6854_2900 bglX-2   TRUE 0.929 35.000 0.450 1.000 Y NA
 2280843 2280844 LMOf6854_2900 LMOf6854_2901     TRUE 0.995 15.000 0.917 0.031 Y NA
 2280844 2280845 LMOf6854_2901 LMOf6854_2902     FALSE 0.312 150.000 0.170 0.031 N NA
 2280845 2280846 LMOf6854_2902 LMOf6854_2903   kaT FALSE 0.020 211.000 0.000 1.000 N NA
 2280846 2280847 LMOf6854_2903 LMOf6854_2904 kaT   FALSE 0.023 148.000 0.000 NA N NA
 2280847 2280848 LMOf6854_2904 LMOf6854_2905   PTBA TRUE 0.584 0.000 0.000 NA N NA
 2280848 2280849 LMOf6854_2905 LMOf6854_2906 PTBA   FALSE 0.133 108.000 0.000 1.000   NA
 2280849 2280850 LMOf6854_2906 LMOf6854_2907     FALSE 0.027 172.000 0.000 NA   NA
 2280850 2280851 LMOf6854_2907 LMOf6854_2908     TRUE 0.859 4.000 0.039 NA   NA
 2280851 2280852 LMOf6854_2908 LMOf6854_2909   soj TRUE 0.916 -7.000 0.827 1.000 N NA
 2280852 2280853 LMOf6854_2909 LMOf6854_2910 soj   FALSE 0.022 224.000 0.000 1.000   NA
 2280853 2280854 LMOf6854_2910 LMOf6854_2911     FALSE 0.135 195.000 0.833 NA   NA
 2280854 2280855 LMOf6854_2911 LMOf6854_2912     TRUE 0.861 12.000 0.098 NA   NA
 2280855 2280856 LMOf6854_2912 LMOf6854_2913     FALSE 0.493 172.000 0.057 1.000 Y NA
 2280856 2280857 LMOf6854_2913 LMOf6854_2914     TRUE 0.975 -16.000 0.380 1.000 Y NA
 2280857 2280858 LMOf6854_2914 LMOf6854_2915     TRUE 0.940 25.000 0.270 1.000 Y NA
 2280858 2280859 LMOf6854_2915 LMOf6854_2916     TRUE 0.934 13.000 0.588 1.000   NA
 2280859 2280860 LMOf6854_2916 LMOf6854_2917   mtlA FALSE 0.383 63.000 0.041 1.000   NA
 2280860 2280861 LMOf6854_2917 LMOf6854_2918 mtlA   FALSE 0.491 34.000 0.041 1.000   NA
 2280861 2280862 LMOf6854_2918 LMOf6854_2919     TRUE 0.922 2.000 0.130 1.000   NA
 2280862 2280863 LMOf6854_2919 LMOf6854_2920   gidB FALSE 0.028 217.000 0.003 1.000 N NA
 2280863 2280864 LMOf6854_2920 LMOf6854_2921 gidB   FALSE 0.063 153.000 0.007 NA   NA
 2280864 2280865 LMOf6854_2921 LMOf6854_2922     TRUE 0.950 5.000 0.833 NA   NA
 2280865 2280866 LMOf6854_2922 LMOf6854_2923     TRUE 0.918 -7.000 1.000 NA   NA
 2280866 2280867 LMOf6854_2923 LMOf6854_2924     TRUE 0.892 5.000 0.167 NA   NA
 2280867 2280868 LMOf6854_2924 LMOf6854_2925     FALSE 0.320 113.000 0.556 NA   NA
 2280868 2280869 LMOf6854_2925 LMOf6854_2926     FALSE 0.080 98.000 0.000 NA   NA
 2280869 2280870 LMOf6854_2926 LMOf6854_2927     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2280870 2280871 LMOf6854_2927 LMOf6854_2928   gidA FALSE 0.057 132.000 0.000 NA   NA
 2280871 2280872 LMOf6854_2928 LMOf6854_2929 gidA trmE TRUE 0.663 25.000 0.266 1.000   NA
 2280874 2280875 LMOf6854_2931 LMOf6854_2932     TRUE 0.589 24.000 0.196 NA   NA
 2280877 2280878 LMOf6854_2934 LMOf6854_2935     FALSE 0.349 88.000 0.258 1.000   NA
 2280878 2280879 LMOf6854_2935 LMOf6854_2936     TRUE 0.914 16.000 0.750 1.000   NA
 2280879 2280880 LMOf6854_2936 LMOf6854_2937     TRUE 0.964 0.000 0.909 1.000   NA
 2280880 2280881 LMOf6854_2937 LMOf6854_2938     FALSE 0.067 211.000 0.182 1.000   NA
 2280883 2280884 LMOf6854_2940 LMOf6854_2941     TRUE 0.843 9.000 0.038 NA   NA
 2280884 2280885 LMOf6854_2941 LMOf6854_2942     FALSE 0.241 89.000 0.109 NA   NA
 2280885 2280886 LMOf6854_2942 LMOf6854_2943   serC TRUE 0.963 -31.000 0.238 1.000 Y NA
 2280886 2280887 LMOf6854_2943 LMOf6854_2944 serC   FALSE 0.005 371.000 0.000 1.000 N NA
 2280887 2280888 LMOf6854_2944 LMOf6854_2945     TRUE 0.904 14.000 0.474 1.000 N NA
 2280888 2280889 LMOf6854_2945 LMOf6854_2946     FALSE 0.352 103.000 0.632 NA   NA
 2280890 2280891 LMOf6854_1835 LMOf6854_1834   purE FALSE 0.016 208.000 0.000 NA   NA
 2280891 2280892 LMOf6854_1834 LMOf6854_1833 purE purK TRUE 0.987 -16.000 0.011 0.001 Y NA
 2280892 2280893 LMOf6854_1833 LMOf6854_1832 purK purB TRUE 0.957 19.000 0.010 1.000 Y NA
 2280893 2280894 LMOf6854_1832 LMOf6854_1831 purB purC TRUE 0.809 81.000 0.072 1.000 Y NA
 2280894 2280895 LMOf6854_1831 LMOf6854_1830 purC purS TRUE 0.990 12.000 0.460 1.000 Y NA
 2280895 2280896 LMOf6854_1830 LMOf6854_1829 purS purQ TRUE 0.998 4.000 0.656 0.001 Y NA
 2280896 2280897 LMOf6854_1829 LMOf6854_1828 purQ purL TRUE 0.994 -7.000 0.346 0.001 Y NA
 2280897 2280898 LMOf6854_1828 LMOf6854_1827 purL purF TRUE 0.973 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 2280898 2280899 LMOf6854_1827 LMOf6854_1826 purF purM TRUE 0.969 19.000 0.248 1.000 Y NA
 2280899 2280900 LMOf6854_1826 LMOf6854_1825 purM purN TRUE 0.996 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 2280900 2280901 LMOf6854_1825 LMOf6854_1824 purN purH TRUE 0.990 6.000 0.225 1.000 Y NA
 2280901 2280902 LMOf6854_1824 LMOf6854_1823 purH purD TRUE 0.938 25.000 0.238 1.000 Y NA
 2280902 2280903 LMOf6854_1823 LMOf6854_1822 purD   FALSE 0.127 139.000 0.011 1.000   NA
 2280903 2280904 LMOf6854_1822 LMOf6854_1821     TRUE 0.708 18.000 0.068 NA   NA
 2280905 2280906 LMOf6854_1820 LMOf6854_1819     FALSE 0.479 -13.000 0.000 NA   NA
 2280907 2280908 LMOf6854_1818 LMOf6854_1817   pcrA FALSE 0.415 59.000 0.054 1.000   NA
 2280908 2280909 LMOf6854_1817 LMOf6854_1816 pcrA ligA TRUE 0.969 25.000 0.103 0.013 Y NA
 2280909 2280910 LMOf6854_1816 LMOf6854_1815 ligA   TRUE 0.787 -3.000 0.010 NA   NA
 2280910 2280911 LMOf6854_1815 LMOf6854_1814   gatC FALSE 0.113 125.000 0.013 NA   NA
 2280911 2280912 LMOf6854_1814 LMOf6854_1813 gatC gatA TRUE 0.985 24.000 0.643 0.001 Y NA
 2280912 2280913 LMOf6854_1813 LMOf6854_1812 gatA gatB TRUE 0.997 12.000 0.492 0.001 Y NA
 2280913 2280914 LMOf6854_1812 LMOf6854_1811 gatB   FALSE 0.117 141.000 0.034 1.000 N NA
 2280914 2280915 LMOf6854_1811 LMOf6854_1810     FALSE 0.122 148.000 0.132 NA   NA
 2280915 2280916 LMOf6854_1810 LMOf6854_1809     TRUE 0.559 24.000 0.103 NA   NA
 2280916 2280917 LMOf6854_1809 LMOf6854_1808     FALSE 0.005 335.000 0.000 NA   NA
 2280919 2280920 LMOf6854_1806 LMOf6854_1805     FALSE 0.198 128.000 0.250 NA   NA
 2280920 2280921 LMOf6854_1805 LMOf6854_1804     TRUE 0.898 -10.000 0.667 1.000   NA
 2280921 2280922 LMOf6854_1804 LMOf6854_1803     FALSE 0.504 63.000 0.333 1.000   NA
 2280922 2280923 LMOf6854_1803 LMOf6854_1802     FALSE 0.341 71.000 0.104 1.000 N NA
 2280923 2280924 LMOf6854_1802 LMOf6854_1801     TRUE 0.654 -42.000 0.104 NA   NA
 2280924 2280925 LMOf6854_1801 LMOf6854_1800   ade TRUE 0.619 20.000 0.045 NA   NA
 2280925 2280926 LMOf6854_1800 LMOf6854_1799 ade   TRUE 0.596 22.000 0.040 1.000 N NA
 2280926 2280927 LMOf6854_1799 LMOf6854_1798     FALSE 0.004 398.000 0.000 1.000 N NA
 2280927 2280928 LMOf6854_1798 LMOf6854_1797     TRUE 0.988 11.000 0.136 1.000 Y NA
 2280928 2280929 LMOf6854_1797 LMOf6854_1796     TRUE 0.990 2.000 0.131 1.000 Y NA
 2280929 2280930 LMOf6854_1796 LMOf6854_1795     FALSE 0.220 92.000 0.046 1.000 N NA
 2280930 2280931 LMOf6854_1795 LMOf6854_1794     TRUE 0.966 3.000 0.118 0.055   NA
 2280933 2280934 LMOf6854_1792 LMOf6854_1791 gltB gltD TRUE 0.994 15.000 0.222 0.001 Y NA
 2280935 2280936 LMOf6854_1790 LMOf6854_1789     TRUE 0.986 17.000 0.120 0.036 Y NA
 2280936 2280937 LMOf6854_1789 LMOf6854_1788     TRUE 0.951 62.000 0.660 0.036 Y NA
 2280938 2280939 LMOf6854_1787 LMOf6854_1786 bglX-1   TRUE 0.991 3.000 0.293 1.000 Y NA
 2280939 2280940 LMOf6854_1786 LMOf6854_1785     TRUE 0.508 48.000 0.293 1.000 N NA
 2280940 2280941 LMOf6854_1785 LMOf6854_1784     FALSE 0.477 60.000 0.205 1.000   NA
 2280941 2280942 LMOf6854_1784 LMOf6854_1783     FALSE 0.246 121.000 0.182 1.000   NA
 2280942 2280943 LMOf6854_1783 LMOf6854_1782     TRUE 0.808 -7.000 0.071 1.000 N NA
 2280943 2280944 LMOf6854_1782 LMOf6854_1781     TRUE 0.785 -7.000 0.071 NA   NA
 2280944 2280945 LMOf6854_1781 LMOf6854_1780     FALSE 0.383 43.000 0.052 NA   NA
 2280945 2280946 LMOf6854_1780 LMOf6854_1779     TRUE 0.831 134.000 0.052 0.005 Y NA
 2280946 2280947 LMOf6854_1779 LMOf6854_1778     FALSE 0.324 160.000 0.500 0.041 N NA
 2280947 2280948 LMOf6854_1778 LMOf6854_1777     TRUE 0.953 70.000 1.000 0.031 Y NA
 2280948 2280949 LMOf6854_1777 LMOf6854_1776     TRUE 0.829 22.000 0.800 1.000   NA
 2280949 2280950 LMOf6854_1776 LMOf6854_1775     FALSE 0.019 238.000 0.000 1.000   NA
 2280952 2280953 LMOf6854_1773 LMOf6854_1772     FALSE 0.268 81.000 0.096 NA   NA
 2280954 2280955 LMOf6854_1771 LMOf6854_1770     FALSE 0.018 218.000 0.000 1.000 N NA
 2280955 2280956 LMOf6854_1770 LMOf6854_1769     TRUE 0.790 104.000 0.323 1.000 Y NA
 2280959 2280960 LMOf6854_2197 LMOf6854_2198     TRUE 0.991 17.000 0.200 0.002 Y NA
 2280960 2280961 LMOf6854_2198 LMOf6854_2199     TRUE 0.971 18.000 0.160 1.000 Y NA
 2280961 2280962 LMOf6854_2199 LMOf6854_2200     TRUE 0.993 14.000 0.393 0.031 Y NA
 2280962 2280963 LMOf6854_2200 LMOf6854_2201     TRUE 0.995 13.000 0.464 0.031 Y NA
 2280963 2280964 LMOf6854_2201 LMOf6854_2202     TRUE 0.967 12.000 0.429 0.031 N NA
 2280965 2280966 LMOf6854_2203 LMOf6854_2204     TRUE 0.801 -7.000 0.103 NA   NA
 2280966 2280967 LMOf6854_2204 LMOf6854_2205     TRUE 0.657 -55.000 0.162 NA   NA
 2280970 2280971 LMOf6854_2208 LMOf6854_2209     FALSE 0.072 115.000 0.000 NA   NA
 2280971 2280972 LMOf6854_2209 LMOf6854_2210     FALSE 0.264 69.000 0.036 NA   NA
 2280973 2280974 LMOf6854_2211 LMOf6854_2212     FALSE 0.376 56.000 0.086 NA   NA
 2280977 2280978 LMOf6854_2215 LMOf6854_2216     FALSE 0.238 107.000 0.220 NA   NA
 2280978 2280979 LMOf6854_2216 LMOf6854_2217     TRUE 0.933 -3.000 0.484 1.000   NA
 2280979 2280980 LMOf6854_2217 LMOf6854_2218   nrdB TRUE 0.928 -3.000 0.550 1.000 N NA
 2280980 2280981 LMOf6854_2218 LMOf6854_2219 nrdB nrdA TRUE 0.957 56.000 0.101 0.001 Y NA
 2280983 2280984 LMOf6854_2221 LMOf6854_2222     FALSE 0.058 129.000 0.000 NA   NA
 2280984 2280985 LMOf6854_2222 LMOf6854_2223     FALSE 0.283 94.000 0.308 NA   NA
 2280985 2280986 LMOf6854_2223 LMOf6854_2224     TRUE 0.632 23.000 0.244 NA   NA
 2280986 2280987 LMOf6854_2224 LMOf6854_2225     TRUE 0.989 3.000 0.244 NA Y NA
 2280987 2280988 LMOf6854_2225 LMOf6854_2226     TRUE 0.991 2.000 0.480 NA Y NA
 2280988 2280989 LMOf6854_2226 LMOf6854_2227     TRUE 0.866 16.000 0.500 NA   NA
 2280989 2280990 LMOf6854_2227 LMOf6854_2228     TRUE 0.522 75.000 0.625 1.000   NA
 2280990 2280991 LMOf6854_2228 LMOf6854_2229     FALSE 0.427 70.000 0.562 NA N NA
 2280991 2280992 LMOf6854_2229 LMOf6854_2230     FALSE 0.165 253.000 0.000 NA Y NA
 2280992 2280993 LMOf6854_2230 LMOf6854_2231     FALSE 0.262 66.000 0.025 NA   NA
 2280994 2280995 LMOf6854_2232 LMOf6854_2233     FALSE 0.494 26.000 0.068 NA   NA
 2280996 2280997 LMOf6854_2234 LMOf6854_2235     TRUE 0.818 22.000 0.714 1.000   NA
 2280997 2280998 LMOf6854_2235 LMOf6854_2236   pct TRUE 0.938 -3.000 0.700 1.000 N NA
 2280998 2280999 LMOf6854_2236 LMOf6854_2237 pct   FALSE 0.015 230.000 0.000 1.000 N NA
 2280999 2281000 LMOf6854_2237 LMOf6854_2238     TRUE 0.733 106.000 0.033 1.000 Y NA
 2281000 2281001 LMOf6854_2238 LMOf6854_2239     FALSE 0.075 174.000 0.050 1.000 N NA
 2281002 2281003 LMOf6854_2240 LMOf6854_2241     FALSE 0.337 106.000 0.579 NA   NA
 2281004 2281005 LMOf6854_2242 LMOf6854_2243     FALSE 0.271 200.000 0.556 0.014   NA
 2281005 2281006 LMOf6854_2243 LMOf6854_2244     FALSE 0.108 194.000 0.556 NA   NA
 2281006 2281007 LMOf6854_2244 LMOf6854_2245     FALSE 0.373 61.000 0.115 NA   NA
 2281007 2281008 LMOf6854_2245 LMOf6854_2246     TRUE 0.706 22.000 0.373 NA   NA
 2281008 2281009 LMOf6854_2246 LMOf6854_2247     TRUE 0.978 -19.000 0.657 1.000 Y NA
 2281009 2281010 LMOf6854_2247 LMOf6854_2248     TRUE 0.986 -10.000 0.877 1.000 Y NA
 2281010 2281011 LMOf6854_2248 LMOf6854_2249     FALSE 0.291 87.000 0.382 NA N NA
 2281011 2281012 LMOf6854_2249 LMOf6854_2250     TRUE 0.886 15.000 0.515 NA   NA
 2281012 2281013 LMOf6854_2250 LMOf6854_2251     FALSE 0.015 211.000 0.000 NA   NA
 2281013 2281014 LMOf6854_2251 LMOf6854_2252   pepF FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 2281014 2281015 LMOf6854_2252 LMOf6854_2253 pepF   FALSE 0.401 73.000 0.398 NA   NA
 2281015 2281016 LMOf6854_2253 LMOf6854_2254   mecA FALSE 0.074 183.000 0.167 NA   NA
 2281016 2281017 LMOf6854_2254 LMOf6854_2255 mecA   FALSE 0.024 232.000 0.063 NA N NA
 2281017 2281018 LMOf6854_2255 LMOf6854_2256     FALSE 0.007 319.000 0.000 1.000 N NA
 2281018 2281019 LMOf6854_2256 LMOf6854_2257     TRUE 0.996 -3.000 0.238 0.001 Y NA
 2281019 2281020 LMOf6854_2257 LMOf6854_2258     TRUE 0.979 18.000 0.595 1.000 Y NA
 2281020 2281021 LMOf6854_2258 LMOf6854_2259     TRUE 0.995 0.000 0.299 0.036 Y NA
 2281021 2281022 LMOf6854_2259 LMOf6854_2260     FALSE 0.277 279.000 0.000 0.036 Y NA
 2281023 2281024 LMOf6854_2261 LMOf6854_2262   trpS FALSE 0.005 334.000 0.000 NA   NA
 2281025 2281026 LMOf6854_2263 LMOf6854_2264     TRUE 0.843 -16.000 0.545 1.000 N NA
 2281026 2281027 LMOf6854_2264 LMOf6854_2265   fabF FALSE 0.145 119.000 0.014 1.000 N NA
 2281027 2281028 LMOf6854_2265 LMOf6854_2266 fabF fabH TRUE 0.652 203.000 0.076 0.001 Y NA
 2281028 2281029 LMOf6854_2266 LMOf6854_2267 fabH   FALSE 0.172 120.000 0.081 NA   NA
 2281030 2281031 LMOf6854_2131 LMOf6854_2132     TRUE 0.723 2.000 0.000 NA   NA
 2281033 2281034 LMOf6854_2134 LMOf6854_2135     TRUE 0.637 24.000 0.105 1.000   NA
 2281035 2281036 LMOf6854_2136 LMOf6854_2137   rimI TRUE 0.894 -3.000 0.090 1.000   NA
 2281036 2281037 LMOf6854_2137 LMOf6854_2138 rimI   TRUE 0.753 -27.000 0.127 1.000   NA
 2281037 2281038 LMOf6854_2138 LMOf6854_2139     TRUE 0.882 -3.000 0.217 NA   NA
 2281038 2281039 LMOf6854_2139 LMOf6854_2140     FALSE 0.145 105.000 0.015 NA   NA
 2281039 2281040 LMOf6854_2140 LMOf6854_2141     FALSE 0.333 133.000 0.917 NA   NA
 2281040 2281041 LMOf6854_2141 LMOf6854_2142     TRUE 0.572 27.000 0.262 NA   NA
 2281041 2281042 LMOf6854_2142 LMOf6854_2143     TRUE 0.987 -10.000 0.229 0.076 Y NA
 2281042 2281043 LMOf6854_2143 LMOf6854_2144     FALSE 0.192 106.000 0.069 NA   NA
 2281043 2281044 LMOf6854_2144 LMOf6854_2145     TRUE 0.913 -3.000 0.462 NA   NA
 2281044 2281045 LMOf6854_2145 LMOf6854_2146     FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 2281045 2281046 LMOf6854_2146 LMOf6854_2147     FALSE 0.144 95.000 0.000 1.000   NA
 2281046 2281047 LMOf6854_2147 LMOf6854_2148     FALSE 0.004 633.000 0.000 1.000   NA
 2281047 2281048 LMOf6854_2148 LMOf6854_2149     TRUE 0.914 10.000 0.323 1.000 N NA
 2281048 2281049 LMOf6854_2149 LMOf6854_2150     FALSE 0.286 111.000 0.323 1.000 N NA
 2281050 2281051 LMOf6854_2151 LMOf6854_2152 argG argH TRUE 0.991 4.000 0.278 1.000 Y NA
 2281051 2281052 LMOf6854_2152 LMOf6854_2153 argH   FALSE 0.058 168.000 0.004 1.000 N NA
 2281053 2281054 LMOf6854_2154 LMOf6854_2155     TRUE 0.955 4.000 0.909 NA   NA
 2281054 2281055 LMOf6854_2155 LMOf6854_2156     TRUE 0.993 2.000 0.526 1.000 Y NA
 2281055 2281056 LMOf6854_2156 LMOf6854_2157     TRUE 0.978 18.000 0.526 1.000 Y NA
 2281056 2281057 LMOf6854_2157 LMOf6854_2158     TRUE 0.967 28.000 0.400 0.033 Y NA
 2281057 2281058 LMOf6854_2158 LMOf6854_2159     TRUE 0.997 6.000 0.846 0.031 Y NA
 2281058 2281059 LMOf6854_2159 LMOf6854_2160     TRUE 0.967 8.000 0.308 0.031 N NA
 2281059 2281060 LMOf6854_2160 LMOf6854_2161     TRUE 0.668 181.000 0.375 0.067 Y NA
 2281061 2281062 LMOf6854_2162 LMOf6854_2163     TRUE 0.991 2.000 0.488 NA Y NA
 2281063 2281064 LMOf6854_2164 LMOf6854_2165     TRUE 0.717 0.000 0.000 NA   NA
 2281064 2281065 LMOf6854_2165 LMOf6854_2166   pta FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 2281066 2281067 LMOf6854_2167 LMOf6854_2168   feoB TRUE 0.989 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 2281067 2281068 LMOf6854_2168 LMOf6854_2169 feoB   TRUE 0.867 16.000 0.517 NA   NA
 2281070 2281071 LMOf6854_2171 LMOf6854_2172   nagA-2 TRUE 0.990 6.000 0.220 1.000 Y NA
 2281071 2281072 LMOf6854_2172 LMOf6854_2173 nagA-2   TRUE 0.657 42.000 0.615 1.000   NA
 2281073 2281074 LMOf6854_2174 LMOf6854_2175 manA   FALSE 0.341 80.000 0.216 1.000 N NA
 2281075 2281076 LMOf6854_2176 LMOf6854_2177     FALSE 0.292 84.000 0.054 1.000   NA
 2281076 2281077 LMOf6854_2177 LMOf6854_2178     FALSE 0.065 197.000 0.045 1.000   NA
 2281077 2281078 LMOf6854_2178 LMOf6854_2179     TRUE 0.893 -13.000 0.750 1.000   NA
 2281081 2281082 LMOf6854_2182 LMOf6854_2183 glmM   FALSE 0.032 250.000 0.150 NA   NA
 2281082 2281083 LMOf6854_2183 LMOf6854_2184     TRUE 0.918 -3.000 0.502 NA   NA
 2281083 2281084 LMOf6854_2184 LMOf6854_2185     FALSE 0.026 175.000 0.000 NA   NA
 2281084 2281085 LMOf6854_2185 LMOf6854_2186     TRUE 0.539 16.000 0.000 NA   NA
 2281085 2281086 LMOf6854_2186 LMOf6854_2187     TRUE 0.875 1.000 0.057 NA   NA
 2281086 2281087 LMOf6854_2187 LMOf6854_2188     TRUE 0.997 1.000 0.714 0.036 Y NA
 2281087 2281088 LMOf6854_2188 LMOf6854_2189     TRUE 0.848 88.000 0.621 1.000 Y NA
 2281088 2281089 LMOf6854_2189 LMOf6854_2190   nplT FALSE 0.339 213.000 0.065 1.000 Y NA
 2281091 2281092 LMOf6854_2192 LMOf6854_2193     FALSE 0.190 139.000 0.370 NA   NA
 2281092 2281093 LMOf6854_2193 LMOf6854_2194     FALSE 0.002 523.000 0.000 NA   NA
 2281094 2281095 LMOf6854_2426 LMOf6854_2427     FALSE 0.086 93.000 0.000 NA   NA
 2281095 2281096 LMOf6854_2427 LMOf6854_2428   pgi TRUE 0.726 105.000 0.021 1.000 Y NA
 2281096 2281097 LMOf6854_2428 LMOf6854_2429 pgi   FALSE 0.167 102.000 0.014 1.000 N NA
 2281097 2281098 LMOf6854_2429 LMOf6854_2430     FALSE 0.133 148.000 0.110 1.000 N NA
 2281099 2281100 LMOf6854_2431 LMOf6854_2432     FALSE 0.156 139.000 0.110 1.000 N NA
 2281100 2281101 LMOf6854_2432 LMOf6854_2433     TRUE 0.945 0.000 0.591 1.000 N NA
 2281104 2281105 LMOf6854_2436 LMOf6854_2437     TRUE 0.896 0.000 0.160 NA   NA
 2281106 2281107 LMOf6854_2438 LMOf6854_2439     FALSE 0.004 385.000 0.000 1.000 N NA
 2281107 2281108 LMOf6854_2439 LMOf6854_2440     TRUE 0.970 -13.000 0.268 NA Y NA
 2281108 2281109 LMOf6854_2440 LMOf6854_2441     TRUE 0.990 0.000 0.317 NA Y NA
 2281109 2281110 LMOf6854_2441 LMOf6854_2442     TRUE 0.992 -10.000 0.289 0.002 Y NA
 2281110 2281111 LMOf6854_2442 LMOf6854_2443     TRUE 0.993 7.000 0.842 1.000 Y NA
 2281111 2281112 LMOf6854_2443 LMOf6854_2444     TRUE 0.996 -3.000 0.829 0.073 Y NA
 2281112 2281113 LMOf6854_2444 LMOf6854_2445     TRUE 0.973 -16.000 0.293 1.000 Y NA
 2281115 2281116 LMOf6854_2447 LMOf6854_2448     FALSE 0.427 111.000 0.040 0.076   NA
 2281117 2281118 LMOf6854_2449 LMOf6854_2450     FALSE 0.269 84.000 0.148 NA   NA
 2281119 2281120 LMOf6854_2451 LMOf6854_2452     FALSE 0.278 88.000 0.141 1.000 N NA
 2281121 2281122 LMOf6854_2453 LMOf6854_2454     TRUE 0.643 22.000 0.190 NA   NA
 2281123 2281124 LMOf6854_2455 LMOf6854_2456     FALSE 0.081 174.000 0.028 1.000   NA
 2281124 2281125 LMOf6854_2456 LMOf6854_2457     FALSE 0.198 113.000 0.056 1.000 N NA
 2281126 2281127 LMOf6854_2458 LMOf6854_2459     FALSE 0.462 36.000 0.125 NA   NA
 2281127 2281128 LMOf6854_2459 LMOf6854_2460     TRUE 0.681 49.000 0.113 0.054 N NA
 2281128 2281129 LMOf6854_2460 LMOf6854_2461     TRUE 0.736 20.000 0.320 NA   NA
 2281129 2281130 LMOf6854_2461 LMOf6854_2462     TRUE 0.900 -3.000 0.347 NA   NA
 2281131 2281132 LMOf6854_2463 LMOf6854_2464     TRUE 0.956 1.000 0.903 NA   NA
 2281133 2281134 LMOf6854_2465 LMOf6854_2466     FALSE 0.121 142.000 0.079 NA   NA
 2281134 2281135 LMOf6854_2466 LMOf6854_2467     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 2281135 2281136 LMOf6854_2467 LMOf6854_2468     TRUE 0.854 -3.000 0.077 NA   NA
 2281137 2281138 LMOf6854_2469 LMOf6854_2470     TRUE 0.964 -25.000 0.140 1.000 Y NA
 2281138 2281139 LMOf6854_2470 LMOf6854_2471     FALSE 0.002 668.000 0.000 NA   NA
 2281139 2281140 LMOf6854_2471 LMOf6854_2472     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 2281141 2281142 LMOf6854_2473 LMOf6854_2474     TRUE 0.888 23.000 0.152 0.001 N NA
 2281142 2281143 LMOf6854_2474 LMOf6854_2475     TRUE 0.903 -3.000 0.292 1.000 N NA
 2281143 2281144 LMOf6854_2475 LMOf6854_2476     TRUE 0.947 1.000 0.606 1.000 N NA
 2281144 2281145 LMOf6854_2476 LMOf6854_2477     TRUE 0.966 19.000 0.139 1.000 Y NA
 2281145 2281146 LMOf6854_2477 LMOf6854_2478     FALSE 0.005 333.000 0.000 NA   NA
 2281148 2281149 LMOf6854_2480 LMOf6854_2481     TRUE 0.846 65.000 0.181 NA Y NA
 2281149 2281150 LMOf6854_2481 LMOf6854_2482     TRUE 0.991 -3.000 0.642 1.000 Y NA
 2281150 2281151 LMOf6854_2482 LMOf6854_2483     FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 2281151 2281152 LMOf6854_2483 LMOf6854_2484     FALSE 0.298 79.000 0.161 NA   NA
 2281152 2281153 LMOf6854_2484 LMOf6854_2485     TRUE 0.986 -10.000 0.932 1.000 Y NA
 2281153 2281154 LMOf6854_2485 LMOf6854_2486     FALSE 0.272 75.000 0.034 1.000 N NA
 2281155 2281156 LMOf6854_1364 LMOf6854_1365   nusA TRUE 0.683 30.000 0.759 NA   NA
 2281156 2281157 LMOf6854_1365 LMOf6854_1366 nusA   TRUE 0.981 15.000 0.323 NA Y NA
 2281157 2281158 LMOf6854_1366 LMOf6854_1367     TRUE 0.842 -7.000 0.408 NA N NA
 2281158 2281159 LMOf6854_1367 LMOf6854_1368   infB TRUE 0.948 23.000 0.223 1.000 Y NA
 2281159 2281160 LMOf6854_1368 LMOf6854_1369 infB   TRUE 0.862 -3.000 0.102 NA   NA
 2281160 2281161 LMOf6854_1369 LMOf6854_1370   rbfA TRUE 0.761 17.000 0.113 NA   NA
 2281161 2281162 LMOf6854_1370 LMOf6854_1371 rbfA truB TRUE 0.768 98.000 0.111 1.000 Y NA
 2281162 2281163 LMOf6854_1371 LMOf6854_1372 truB ribF FALSE 0.414 70.000 0.308 1.000 N NA
 2281163 2281164 LMOf6854_1372 LMOf6854_1373 ribF rpsO FALSE 0.166 137.000 0.119 1.000 N NA
 2281164 2281165 LMOf6854_1373 LMOf6854_1374 rpsO pnp FALSE 0.307 249.000 0.335 1.000 Y NA
 2281166 2281167 LMOf6854_1375 LMOf6854_1376     FALSE 0.061 161.000 0.014 NA   NA
 2281167 2281168 LMOf6854_1376 LMOf6854_1377     FALSE 0.344 46.000 0.031 NA   NA
 2281169 2281170 LMOf6854_1378 LMOf6854_1379     FALSE 0.292 81.000 0.037 1.000   NA
 2281170 2281171 LMOf6854_1379 LMOf6854_1380     TRUE 0.892 13.000 0.347 NA   NA
 2281171 2281172 LMOf6854_1380 LMOf6854_1381   glcK TRUE 0.667 25.000 0.496 NA   NA
 2281172 2281173 LMOf6854_1381 LMOf6854_1382 glcK   FALSE 0.134 134.000 0.058 NA   NA
 2281174 2281175 LMOf6854_1383 LMOf6854_1384     TRUE 0.881 -3.000 0.214 NA   NA
 2281175 2281176 LMOf6854_1384 LMOf6854_1385   comGE TRUE 0.594 -37.000 0.036 NA   NA
 2281176 2281177 LMOf6854_1385 LMOf6854_1386 comGE   TRUE 0.687 -13.000 0.036 NA   NA
 2281177 2281178 LMOf6854_1386 LMOf6854_1387   comGB FALSE 0.005 334.000 0.000 NA   NA
 2281178 2281179 LMOf6854_1387 LMOf6854_1388 comGB comGA TRUE 0.976 -22.000 0.639 1.000 Y NA
 2281180 2281181 LMOf6854_1389 LMOf6854_1390 gcvT gcvP1 TRUE 0.992 16.000 0.092 0.001 Y NA
 2281181 2281182 LMOf6854_1390 LMOf6854_1391 gcvP1 gcvP2 TRUE 0.996 -3.000 0.316 0.001 Y NA
 2281183 2281184 LMOf6854_1392 LMOf6854_1393     FALSE 0.288 62.000 0.029 NA   NA
 2281184 2281185 LMOf6854_1393 LMOf6854_1394     TRUE 0.859 13.000 0.140 NA   NA
 2281186 2281187 LMOf6854_1395 LMOf6854_1396   efp FALSE 0.247 103.000 0.160 1.000 N NA
 2281187 2281188 LMOf6854_1396 LMOf6854_1397 efp accB FALSE 0.113 159.000 0.120 1.000 N NA
 2281188 2281189 LMOf6854_1397 LMOf6854_1398 accB accC TRUE 0.994 14.000 0.086 0.001 Y NA
 2281189 2281190 LMOf6854_1398 LMOf6854_1399 accC   TRUE 0.922 4.000 0.373 NA   NA
 2281190 2281191 LMOf6854_1399 LMOf6854_1400   nusB FALSE 0.382 31.000 0.023 NA   NA
 2281191 2281192 LMOf6854_1400 LMOf6854_1401 nusB folD FALSE 0.217 96.000 0.056 1.000 N NA
 2281192 2281193 LMOf6854_1401 LMOf6854_1402 folD xseA FALSE 0.442 37.000 0.058 1.000 N NA
 2281193 2281194 LMOf6854_1402 LMOf6854_1403 xseA xseB TRUE 0.993 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 2281194 2281195 LMOf6854_1403 LMOf6854_1404 xseB   TRUE 0.902 3.000 0.100 1.000 N NA
 2281195 2281196 LMOf6854_1404 LMOf6854_1405     FALSE 0.063 199.000 0.108 1.000 N NA
 2281196 2281197 LMOf6854_1405 LMOf6854_1406   dxs FALSE 0.054 182.000 0.015 1.000 N NA
 2281197 2281198 LMOf6854_1406 LMOf6854_1407 dxs   TRUE 0.889 -3.000 0.189 1.000 N NA
 2281198 2281199 LMOf6854_1407 LMOf6854_1408   argR FALSE 0.065 191.000 0.064 1.000 N NA
 2281199 2281200 LMOf6854_1408 LMOf6854_1409 argR recN TRUE 0.578 23.000 0.056 1.000 N NA
 2281200 2281201 LMOf6854_1409 LMOf6854_1410 recN   FALSE 0.127 129.000 0.013 1.000 N NA
 2281201 2281202 LMOf6854_1410 LMOf6854_1411     TRUE 0.738 137.000 0.562 1.000 Y NA
 2281202 2281203 LMOf6854_1411 LMOf6854_1412     TRUE 0.990 15.000 0.078 0.042 Y NA
 2281203 2281204 LMOf6854_1412 LMOf6854_1413     TRUE 0.946 25.000 0.414 1.000 Y NA
 2281204 2281205 LMOf6854_1413 LMOf6854_1414     TRUE 0.995 17.000 0.897 0.001 Y NA
 2281205 2281206 LMOf6854_1414 LMOf6854_1415     TRUE 0.972 31.000 0.882 0.053 Y NA
 2281208 2281209 LMOf6854_1417 LMOf6854_1418   gnd FALSE 0.109 145.000 0.035 1.000 N NA
 2281209 2281210 LMOf6854_1418 LMOf6854_1419 gnd   FALSE 0.054 191.000 0.025 1.000 N NA
 2281210 2281211 LMOf6854_1419 LMOf6854_1420     TRUE 0.853 123.000 0.438 0.075 Y NA
 2281212 2281213 LMOf6854_1421 LMOf6854_1422     TRUE 0.666 37.000 0.833 NA   NA
 2281213 2281214 LMOf6854_1422 LMOf6854_1423     FALSE 0.255 86.000 0.115 NA   NA
 2281215 2281216 LMOf6854_1424 LMOf6854_1425   fni FALSE 0.403 29.000 0.026 NA   NA
 2281218 2281219 LMOf6854_1427 LMOf6854_1428     FALSE 0.088 152.000 0.042 NA   NA
 2281221 2281222 LMOf6854_1430 LMOf6854_1431     FALSE 0.011 434.000 0.048 1.000   NA
 2281223 2281224 LMOf6854_2335 LMOf6854_2336     TRUE 0.626 29.000 0.500 NA   NA
 2281224 2281225 LMOf6854_2336 LMOf6854_2337     TRUE 0.929 6.000 0.500 NA   NA
 2281225 2281226 LMOf6854_2337 LMOf6854_2338     TRUE 0.799 25.000 1.000 1.000   NA
 2281226 2281227 LMOf6854_2338 LMOf6854_2339     FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 2281228 2281229 LMOf6854_2340 LMOf6854_2341     TRUE 0.717 0.000 0.000 NA   NA
 2281229 2281230 LMOf6854_2341 LMOf6854_2342     TRUE 0.646 13.000 0.000 NA   NA
 2281230 2281231 LMOf6854_2342 LMOf6854_2343     FALSE 0.241 28.000 0.000 NA   NA
 2281231 2281232 LMOf6854_2343 LMOf6854_2344     TRUE 0.946 5.000 0.750 NA   NA
 2281232 2281233 LMOf6854_2344 LMOf6854_2345     TRUE 0.946 12.000 1.000 NA   NA
 2281233 2281234 LMOf6854_2345 LMOf6854_2346     TRUE 0.717 0.000 0.000 NA   NA
 2281234 2281235 LMOf6854_2346 LMOf6854_2347     TRUE 0.723 1.000 0.000 NA   NA
 2281235 2281236 LMOf6854_2347 LMOf6854_2348     TRUE 0.951 9.000 1.000 NA   NA
 2281236 2281237 LMOf6854_2348 LMOf6854_2349     TRUE 0.945 2.000 0.667 NA   NA
 2281237 2281238 LMOf6854_2349 LMOf6854_2350     TRUE 0.929 11.000 0.600 NA   NA
 2281238 2281239 LMOf6854_2350 LMOf6854_2351     TRUE 0.938 5.000 0.600 NA   NA
 2281239 2281240 LMOf6854_2351 LMOf6854_2352     FALSE 0.175 52.000 0.000 NA   NA
 2281240 2281241 LMOf6854_2352 LMOf6854_2353     FALSE 0.389 -31.000 0.000 NA   NA
 2281241 2281242 LMOf6854_2353 LMOf6854_2354     TRUE 0.914 3.000 0.286 NA   NA
 2281242 2281243 LMOf6854_2354 LMOf6854_2355     TRUE 0.916 0.000 0.312 NA   NA
 2281243 2281244 LMOf6854_2355 LMOf6854_2356     TRUE 0.908 0.000 0.250 NA   NA
 2281244 2281245 LMOf6854_2356 LMOf6854_2357     TRUE 0.920 0.000 0.357 NA   NA
 2281245 2281246 LMOf6854_2357 LMOf6854_2358     TRUE 0.723 2.000 0.000 NA   NA
 2281246 2281247 LMOf6854_2358 LMOf6854_2359     TRUE 0.717 0.000 0.000 NA   NA
 2281247 2281248 LMOf6854_2359 LMOf6854_2360     FALSE 0.307 23.000 0.000 NA   NA
 2281248 2281249 LMOf6854_2360 LMOf6854_2361     TRUE 0.655 79.000 0.067 0.004   NA
 2281249 2281250 LMOf6854_2361 LMOf6854_2362     TRUE 0.868 6.000 0.067 NA   NA
 2281250 2281251 LMOf6854_2362 LMOf6854_2363     FALSE 0.162 58.000 0.000 NA   NA
 2281251 2281252 LMOf6854_2363 LMOf6854_2364   xtmA TRUE 0.954 -7.000 0.026 0.001   NA
 2281252 2281253 LMOf6854_2364 LMOf6854_2365 xtmA   FALSE 0.195 84.000 0.026 NA   NA
 2281253 2281254 LMOf6854_2365 LMOf6854_2366     FALSE 0.011 237.000 0.000 NA   NA
 2281254 2281255 LMOf6854_2366 LMOf6854_2367     FALSE 0.469 88.000 1.000 NA   NA
 2281255 2281256 LMOf6854_2367 LMOf6854_2368     TRUE 0.783 19.000 0.400 NA   NA
 2281256 2281257 LMOf6854_2368 LMOf6854_2369     TRUE 0.943 4.000 0.667 NA   NA
 2281257 2281258 LMOf6854_2369 LMOf6854_2370     FALSE 0.361 -55.000 0.000 NA   NA
 2281258 2281259 LMOf6854_2370 LMOf6854_2371   ssb FALSE 0.427 19.000 0.000 NA   NA
 2281259 2281260 LMOf6854_2371 LMOf6854_2372 ssb   TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281260 2281261 LMOf6854_2372 LMOf6854_2373     FALSE 0.101 83.000 0.000 NA   NA
 2281261 2281262 LMOf6854_2373 LMOf6854_2374     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281262 2281263 LMOf6854_2374 LMOf6854_2375     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281263 2281264 LMOf6854_2375 LMOf6854_2376     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281264 2281265 LMOf6854_2376 LMOf6854_2377     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281265 2281266 LMOf6854_2377 LMOf6854_2378     TRUE 0.721 3.000 0.000 NA   NA
 2281266 2281267 LMOf6854_2378 LMOf6854_2379     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281267 2281268 LMOf6854_2379 LMOf6854_2380     TRUE 0.977 -3.000 0.000 NA Y NA
 2281268 2281269 LMOf6854_2380 LMOf6854_2381     TRUE 0.931 20.000 0.000 NA Y NA
 2281269 2281270 LMOf6854_2381 LMOf6854_2382     TRUE 0.992 3.000 0.000 0.039 Y NA
 2281270 2281271 LMOf6854_2382 LMOf6854_2383     FALSE 0.011 235.000 0.000 NA   NA
 2281271 2281272 LMOf6854_2383 LMOf6854_2384     FALSE 0.005 321.000 0.000 NA   NA
 2281272 2281273 LMOf6854_2384 LMOf6854_2385     TRUE 0.521 123.000 0.500 0.039   NA
 2281273 2281274 LMOf6854_2385 LMOf6854_2386     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 2281274 2281275 LMOf6854_2386 LMOf6854_2387     FALSE 0.002 513.000 0.000 NA   NA
 2281276 2281277 LMOf6854_2388 LMOf6854_2389     FALSE 0.006 381.000 0.000 1.000   NA
 2281277 2281278 LMOf6854_2389 LMOf6854_2390     TRUE 0.622 21.000 0.069 NA   NA
 2281278 2281279 LMOf6854_2390 LMOf6854_2391     FALSE 0.146 64.000 0.000 NA   NA
 2281279 2281280 LMOf6854_2391 LMOf6854_2392   comK FALSE 0.188 45.000 0.000 NA   NA
 2281281 2281282 LMOf6854_2393 LMOf6854_2394     FALSE 0.227 97.000 0.075 1.000 N NA
 2281282 2281283 LMOf6854_2394 LMOf6854_2395   fruB TRUE 0.994 2.000 0.816 1.000 Y NA
 2281283 2281284 LMOf6854_2395 LMOf6854_2396 fruB   TRUE 0.992 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 2281286 2281287 LMOf6854_2398 LMOf6854_2399     FALSE 0.256 74.000 0.042 NA   NA
 2281287 2281288 LMOf6854_2399 LMOf6854_2400     TRUE 0.826 -3.000 0.085 NA N NA
 2281288 2281289 LMOf6854_2400 LMOf6854_2401   rsuA FALSE 0.174 133.000 0.102 1.000 N NA
 2281289 2281290 LMOf6854_2401 LMOf6854_2402 rsuA   FALSE 0.311 74.000 0.071 1.000 N NA
 2281290 2281291 LMOf6854_2402 LMOf6854_2403     TRUE 0.726 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2281291 2281292 LMOf6854_2403 LMOf6854_2404     TRUE 0.823 -7.000 0.105 1.000 N NA
 2281292 2281293 LMOf6854_2404 LMOf6854_2405     TRUE 0.911 -3.000 0.353 1.000 N NA
 2281293 2281294 LMOf6854_2405 LMOf6854_2406     TRUE 0.990 -3.000 0.405 1.000 Y NA
 2281294 2281295 LMOf6854_2406 LMOf6854_2407     TRUE 0.995 14.000 0.476 0.008 Y NA
 2281295 2281296 LMOf6854_2407 LMOf6854_2408     TRUE 0.980 22.000 0.458 0.035 Y NA
 2281296 2281297 LMOf6854_2408 LMOf6854_2409     TRUE 0.860 17.000 0.391 1.000   NA
 2281297 2281298 LMOf6854_2409 LMOf6854_2410     TRUE 0.837 16.000 0.108 1.000   NA
 2281300 2281301 LMOf6854_2412 LMOf6854_2413     FALSE 0.182 129.000 0.042 1.000   NA
 2281301 2281302 LMOf6854_2413 LMOf6854_2414     TRUE 0.925 4.000 0.208 1.000   NA
 2281303 2281304 LMOf6854_2524 LMOf6854_2525     FALSE 0.392 79.000 0.237 1.000   NA
 2281304 2281305 LMOf6854_2525 LMOf6854_2526     TRUE 0.796 17.000 0.263 NA   NA
 2281311 2281312 LMOf6854_2532 LMOf6854_2533     FALSE 0.429 27.000 0.028 NA   NA
 2281312 2281313 LMOf6854_2533 LMOf6854_2534     TRUE 0.922 8.000 0.470 NA   NA
 2281313 2281314 LMOf6854_2534 LMOf6854_2535     TRUE 0.906 2.000 0.214 NA   NA
 2281314 2281315 LMOf6854_2535 LMOf6854_2536     FALSE 0.216 108.000 0.131 NA   NA
 2281315 2281316 LMOf6854_2536 LMOf6854_2537   mro TRUE 0.952 42.000 0.122 0.026 Y NA
 2281316 2281317 LMOf6854_2537 LMOf6854_2538 mro galE FALSE 0.500 35.000 0.120 1.000 N NA
 2281317 2281318 LMOf6854_2538 LMOf6854_2539 galE trxB FALSE 0.204 119.000 0.100 1.000 N NA
 2281318 2281319 LMOf6854_2539 LMOf6854_2540 trxB   FALSE 0.188 79.000 0.000 1.000   NA
 2281319 2281320 LMOf6854_2540 LMOf6854_2541     FALSE 0.162 86.000 0.000 1.000   NA
 2281320 2281321 LMOf6854_2541 LMOf6854_2542     TRUE 0.870 4.000 0.003 1.000   NA
 2281321 2281322 LMOf6854_2542 LMOf6854_2543   lgt TRUE 0.521 44.000 0.169 1.000   NA
 2281322 2281323 LMOf6854_2543 LMOf6854_2544 lgt hprK FALSE 0.388 86.000 0.494 1.000 N NA
 2281323 2281324 LMOf6854_2544 LMOf6854_2545 hprK   FALSE 0.077 187.000 0.215 NA   NA
 2281324 2281325 LMOf6854_2545 LMOf6854_2546     TRUE 0.895 9.000 0.241 NA   NA
 2281325 2281326 LMOf6854_2546 LMOf6854_2547     TRUE 0.635 24.000 0.316 NA   NA
 2281326 2281327 LMOf6854_2547 LMOf6854_2548     TRUE 0.506 68.000 0.667 NA   NA
 2281327 2281328 LMOf6854_2548 LMOf6854_2549   uvrA FALSE 0.016 209.000 0.000 NA   NA
 2281328 2281329 LMOf6854_2549 LMOf6854_2550 uvrA uvrB TRUE 0.996 8.000 0.154 0.001 Y NA
 2281331 2281332 LMOf6854_2552 LMOf6854_2553     TRUE 0.640 21.000 0.093 NA   NA
 2281332 2281333 LMOf6854_2553 LMOf6854_2554     TRUE 0.581 22.000 0.059 NA   NA
 2281333 2281334 LMOf6854_2554 LMOf6854_2555     FALSE 0.129 160.000 0.333 NA   NA
 2281334 2281335 LMOf6854_2555 LMOf6854_2556     FALSE 0.014 268.000 0.027 NA N NA
 2281335 2281336 LMOf6854_2556 LMOf6854_2557     TRUE 0.984 13.000 0.182 NA Y NA
 2281336 2281337 LMOf6854_2557 LMOf6854_2558     TRUE 0.993 15.000 0.086 0.001 Y NA
 2281337 2281338 LMOf6854_2558 LMOf6854_2559     TRUE 0.977 28.000 0.490 0.002 Y NA
 2281338 2281339 LMOf6854_2559 LMOf6854_2560     TRUE 0.997 -3.000 0.907 0.002 Y NA
 2281339 2281340 LMOf6854_2560 LMOf6854_2561     TRUE 0.853 67.000 0.093 1.000 Y NA
 2281340 2281341 LMOf6854_2561 LMOf6854_2562     FALSE 0.012 256.000 0.000 1.000 N NA
 2281341 2281342 LMOf6854_2562 LMOf6854_2563   phoP TRUE 0.996 0.000 0.384 0.009 Y NA
 2281342 2281343 LMOf6854_2563 LMOf6854_2564 phoP   FALSE 0.197 138.000 0.188 1.000   NA
 2281343 2281344 LMOf6854_2564 LMOf6854_2565   cls-2 TRUE 0.574 28.000 0.094 1.000   NA
 2281344 2281345 LMOf6854_2565 LMOf6854_2566 cls-2   FALSE 0.334 123.000 0.692 1.000 N NA
 2281345 2281346 LMOf6854_2566 LMOf6854_2567     FALSE 0.237 120.000 0.333 NA   NA
 2281346 2281347 LMOf6854_2567 LMOf6854_2568   ftsX FALSE 0.221 76.000 0.021 NA   NA
 2281347 2281348 LMOf6854_2568 LMOf6854_2569 ftsX ftsE TRUE 0.981 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 2281348 2281349 LMOf6854_2569 LMOf6854_2570 ftsE   FALSE 0.003 504.000 0.000 NA   NA
 2281349 2281350 LMOf6854_2570 LMOf6854_2571   prfB TRUE 0.837 6.000 0.024 NA   NA
 2281350 2281351 LMOf6854_2571 LMOf6854_2572 prfB secA FALSE 0.080 170.000 0.052 1.000 N NA
 2281351 2281352 LMOf6854_2572 LMOf6854_2573 secA yfiA FALSE 0.022 231.000 0.041 NA N NA
 2281352 2281353 LMOf6854_2573 LMOf6854_2574 yfiA   FALSE 0.055 195.000 0.080 NA   NA
 2281353 2281354 LMOf6854_2574 LMOf6854_2575     TRUE 0.853 -7.000 0.130 1.000   NA
 2281354 2281355 LMOf6854_2575 LMOf6854_2576     FALSE 0.067 196.000 0.214 NA   NA
 2281355 2281356 LMOf6854_2576 LMOf6854_2577   degU TRUE 0.681 21.000 0.210 NA   NA
 2281358 2281359 LMOf6854_1128 LMOf6854_1127     FALSE 0.071 177.000 0.087 NA   NA
 2281359 2281360 LMOf6854_1127 LMOf6854_1126     TRUE 0.992 12.000 0.808 1.000 Y NA
 2281360 2281361 LMOf6854_1126 LMOf6854_1125     FALSE 0.009 291.000 0.000 1.000 N NA
 2281361 2281362 LMOf6854_1125 LMOf6854_1124   pyc FALSE 0.093 152.000 0.028 1.000 N NA
 2281362 2281363 LMOf6854_1124 LMOf6854_1123 pyc   FALSE 0.023 278.000 0.046 1.000 N NA
 2281363 2281364 LMOf6854_1123 LMOf6854_1122     FALSE 0.096 177.000 0.300 NA   NA
 2281364 2281365 LMOf6854_1122 LMOf6854_1121     FALSE 0.004 366.000 0.000 NA   NA
 2281365 2281366 LMOf6854_1121 LMOf6854_1120   typA FALSE 0.049 172.000 0.010 NA   NA
 2281366 2281367 LMOf6854_1120 LMOf6854_1119 typA   FALSE 0.052 192.000 0.024 1.000 N NA
 2281368 2281369 LMOf6854_1118 LMOf6854_1117     FALSE 0.017 201.000 0.000 NA   NA
 2281369 2281370 LMOf6854_1117 LMOf6854_1116     FALSE 0.358 -58.000 0.000 NA   NA
 2281371 2281372 LMOf6854_1115 LMOf6854_1114     TRUE 0.992 13.000 1.000 1.000 Y NA
 2281372 2281373 LMOf6854_1114 LMOf6854_1113     FALSE 0.500 87.000 0.143 0.073 N NA
 2281373 2281374 LMOf6854_1113 LMOf6854_1112   drrA TRUE 0.980 -7.000 0.143 1.000 Y NA
 2281374 2281375 LMOf6854_1112 LMOf6854_1111 drrA   FALSE 0.025 142.000 0.000 NA N NA
 2281375 2281376 LMOf6854_1111 LMOf6854_1110     TRUE 0.632 22.000 0.145 NA   NA
 2281376 2281377 LMOf6854_1110 LMOf6854_1109     TRUE 0.847 0.000 0.024 NA   NA
 2281377 2281378 LMOf6854_1109 LMOf6854_1108     FALSE 0.058 129.000 0.000 NA   NA
 2281378 2281379 LMOf6854_1108 LMOf6854_1107     FALSE 0.296 59.000 0.026 NA   NA
 2281379 2281380 LMOf6854_1107 LMOf6854_1106     TRUE 0.994 5.000 0.948 1.000 Y NA
 2281380 2281381 LMOf6854_1106 LMOf6854_1105   pdhB TRUE 0.908 111.000 0.883 0.052 Y NA
 2281381 2281382 LMOf6854_1105 LMOf6854_1104 pdhB pdhA TRUE 0.997 3.000 0.484 0.001 Y NA
 2281382 2281383 LMOf6854_1104 LMOf6854_1103 pdhA   FALSE 0.002 643.000 0.000 NA   NA
 2281386 2281387 LMOf6854_1100 LMOf6854_1099 moeB moaB TRUE 0.986 12.000 0.044 1.000 Y NA
 2281388 2281389 LMOf6854_1098 LMOf6854_1097 moaA moaC TRUE 0.966 29.000 0.071 0.003 Y NA
 2281391 2281392 LMOf6854_1095 LMOf6854_1094 moaD moaE TRUE 0.991 -16.000 0.501 0.003 Y NA
 2281392 2281393 LMOf6854_1094 LMOf6854_1093 moaE mobB TRUE 0.994 -3.000 0.012 0.003 Y NA
 2281393 2281394 LMOf6854_1093 LMOf6854_1092 mobB moeA TRUE 0.980 -21.000 0.000 0.003 Y NA
 2281394 2281395 LMOf6854_1092 LMOf6854_1091 moeA modA FALSE 0.108 95.000 0.000 1.000 N NA
 2281396 2281397 LMOf6854_1090 LMOf6854_1089 modB modC TRUE 0.918 3.000 0.103 1.000   NA
 2281397 2281398 LMOf6854_1089 LMOf6854_1088 modC mobA TRUE 0.626 -19.000 0.024 NA   NA
 2281398 2281399 LMOf6854_1088 LMOf6854_1087 mobA   TRUE 0.566 -43.000 0.026 NA   NA
 2281399 2281400 LMOf6854_1087 LMOf6854_1086     TRUE 0.847 1.000 0.021 NA   NA
 2281401 2281402 LMOf6854_1085 LMOf6854_1084     TRUE 0.686 20.000 0.167 NA   NA
 2281402 2281403 LMOf6854_1084 LMOf6854_1083   glpK-1 TRUE 0.877 -3.000 0.100 1.000 N NA
 2281403 2281404 LMOf6854_1083 LMOf6854_1082 glpK-1   TRUE 0.931 -3.000 0.596 1.000 N NA
 2281404 2281405 LMOf6854_1082 LMOf6854_1081     TRUE 0.996 -7.000 0.860 0.002 Y NA
 2281405 2281406 LMOf6854_1081 LMOf6854_1080     TRUE 0.980 16.000 0.245 1.000 Y NA
 2281409 2281410 LMOf6854_1077 LMOf6854_1076     TRUE 0.933 7.000 0.576 NA   NA
 2281410 2281411 LMOf6854_1076 LMOf6854_1075     FALSE 0.193 109.000 0.076 NA   NA
 2281415 2281416 LMOf6854_0185 LMOf6854_0186   metG FALSE 0.266 69.000 0.016 1.000 N NA
 2281416 2281417 LMOf6854_0186 LMOf6854_0187 metG   FALSE 0.069 165.000 0.014 1.000 N NA
 2281417 2281418 LMOf6854_0187 LMOf6854_0188     TRUE 0.916 36.000 0.257 1.000 Y NA
 2281418 2281419 LMOf6854_0188 LMOf6854_0189     TRUE 0.997 0.000 0.778 0.034 Y NA
 2281419 2281420 LMOf6854_0189 LMOf6854_0190     TRUE 0.962 28.000 0.211 0.034 Y NA
 2281420 2281421 LMOf6854_0190 LMOf6854_0191     TRUE 0.823 83.000 0.237 1.000 Y NA
 2281421 2281422 LMOf6854_0191 LMOf6854_0192     TRUE 0.997 3.000 0.444 0.009 Y NA
 2281422 2281423 LMOf6854_0192 LMOf6854_0193   malL-1 TRUE 0.996 4.000 0.237 0.026 Y NA
 2281423 2281424 LMOf6854_0193 LMOf6854_0194 malL-1   FALSE 0.170 73.000 0.015 NA N NA
 2281424 2281425 LMOf6854_0194 LMOf6854_0195     FALSE 0.011 292.000 0.007 NA   NA
 2281425 2281426 LMOf6854_0195 LMOf6854_0196     FALSE 0.278 102.000 0.121 1.000   NA
 2281426 2281427 LMOf6854_0196 LMOf6854_0197   ksgA TRUE 0.818 -7.000 0.093 1.000 N NA
 2281427 2281428 LMOf6854_0197 LMOf6854_0198 ksgA   FALSE 0.143 120.000 0.035 NA   NA
 2281428 2281429 LMOf6854_0198 LMOf6854_0199   ispE FALSE 0.114 139.000 0.046 NA   NA
 2281429 2281430 LMOf6854_0199 LMOf6854_0200 ispE   TRUE 0.590 22.000 0.009 1.000   NA
 2281430 2281431 LMOf6854_0200 LMOf6854_0201   purR FALSE 0.100 164.000 0.041 1.000   NA
 2281431 2281432 LMOf6854_0201 LMOf6854_0202 purR   FALSE 0.066 175.000 0.058 NA   NA
 2281432 2281433 LMOf6854_0202 LMOf6854_0203     TRUE 0.608 49.000 0.727 NA   NA
 2281433 2281434 LMOf6854_0203 LMOf6854_0204     TRUE 0.934 -3.000 0.636 1.000 N NA
 2281434 2281435 LMOf6854_0204 LMOf6854_0205   spoVG-1 FALSE 0.047 685.000 0.000 1.000 Y NA
 2281435 2281436 LMOf6854_0205 LMOf6854_0206 spoVG-1 spoVG-2 TRUE 0.896 120.000 0.250 0.001 Y NA
 2281436 2281437 LMOf6854_0206 LMOf6854_0207 spoVG-2   FALSE 0.091 387.000 0.014 1.000 Y NA
 2281437 2281438 LMOf6854_0207 LMOf6854_0208   prs-1 FALSE 0.413 51.000 0.069 1.000 N NA
 2281439 2281440 LMOf6854_0209 LMOf6854_0210 prfA plcA FALSE 0.015 271.000 0.000 1.000   NA
 2281441 2281442 LMOf6854_0211 LMOf6854_0212 hly mpl FALSE 0.009 331.000 0.000 1.000   NA
 2281442 2281443 LMOf6854_0212 LMOf6854_0213 mpl actA FALSE 0.045 217.000 0.174 NA   NA
 2281443 2281444 LMOf6854_0213 LMOf6854_0214 actA plcB FALSE 0.364 64.000 0.150 NA   NA
 2281444 2281445 LMOf6854_0214 LMOf6854_0215 plcB   FALSE 0.348 72.000 0.225 NA   NA
 2281445 2281446 LMOf6854_0215 LMOf6854_0216     FALSE 0.301 135.000 0.818 NA   NA
 2281447 2281448 LMOf6854_0217 LMOf6854_0218     FALSE 0.140 66.000 0.000 NA   NA
 2281448 2281449 LMOf6854_0218 LMOf6854_0219   ldh-1 FALSE 0.116 77.000 0.000 NA   NA
 2281450 2281451 LMOf6854_0220 LMOf6854_0221     FALSE 0.223 90.000 0.013 1.000   NA
 2281451 2281452 LMOf6854_0221 LMOf6854_0222   pth FALSE 0.193 107.000 0.011 1.000   NA
 2281452 2281453 LMOf6854_0222 LMOf6854_0223 pth mfd FALSE 0.228 115.000 0.137 1.000 N NA
 2281453 2281454 LMOf6854_0223 LMOf6854_0224 mfd   FALSE 0.435 46.000 0.033 1.000   NA
 2281454 2281455 LMOf6854_0224 LMOf6854_0225     TRUE 0.579 24.000 0.034 1.000   NA
 2281455 2281456 LMOf6854_0225 LMOf6854_0226     FALSE 0.035 229.000 0.053 1.000 N NA
 2281457 2281458 LMOf6854_0972 LMOf6854_0973     FALSE 0.481 53.000 0.110 1.000   NA
 2281460 2281461 LMOf6854_0975 LMOf6854_0976     FALSE 0.123 109.000 0.027 NA N NA
 2281461 2281462 LMOf6854_0976 LMOf6854_0977     FALSE 0.192 116.000 0.100 NA   NA
 2281462 2281463 LMOf6854_0977 LMOf6854_0978     TRUE 0.642 24.000 0.113 1.000   NA
 2281464 2281465 LMOf6854_0979 LMOf6854_0980     FALSE 0.153 125.000 0.066 NA   NA
 2281466 2281467 LMOf6854_0981 LMOf6854_0982     TRUE 0.662 21.000 0.077 1.000 N NA
 2281467 2281468 LMOf6854_0982 LMOf6854_0983     TRUE 0.837 13.000 0.036 1.000 N NA
 2281469 2281470 LMOf6854_0984 LMOf6854_0985     FALSE 0.172 88.000 0.018 NA   NA
 2281470 2281471 LMOf6854_0985 LMOf6854_0986     TRUE 0.788 13.000 0.016 NA   NA
 2281471 2281472 LMOf6854_0986 LMOf6854_0987     FALSE 0.330 96.000 0.500 NA   NA
 2281472 2281473 LMOf6854_0987 LMOf6854_0988     TRUE 0.920 12.000 0.318 1.000   NA
 2281474 2281475 LMOf6854_0989 LMOf6854_0990     FALSE 0.011 233.000 0.000 NA   NA
 2281475 2281476 LMOf6854_0990 LMOf6854_0991     FALSE 0.483 31.000 0.118 NA   NA
 2281476 2281477 LMOf6854_0991 LMOf6854_0992     TRUE 0.629 -58.000 0.091 NA   NA
 2281477 2281478 LMOf6854_0992 LMOf6854_0993     TRUE 0.921 10.000 0.481 NA   NA
 2281479 2281480 LMOf6854_0994 LMOf6854_0995     TRUE 0.886 -3.000 0.162 1.000 N NA
 2281482 2281483 LMOf6854_0997 LMOf6854_0998     FALSE 0.368 21.000 0.000 NA   NA
 2281484 2281485 LMOf6854_0999 LMOf6854_1000     FALSE 0.399 94.000 0.733 NA   NA
 2281485 2281486 LMOf6854_1000 LMOf6854_1001     FALSE 0.037 234.000 0.167 NA   NA
 2281486 2281487 LMOf6854_1001 LMOf6854_1002     TRUE 0.825 16.000 0.270 NA   NA
 2281487 2281488 LMOf6854_1002 LMOf6854_1003   nagA-1 FALSE 0.050 189.000 0.083 NA N NA
 2281488 2281489 LMOf6854_1003 LMOf6854_1004 nagA-1 nagB TRUE 0.992 16.000 0.194 0.002 Y NA
 2281489 2281490 LMOf6854_1004 LMOf6854_1005 nagB   TRUE 0.796 16.000 0.075 1.000 N NA
 2281490 2281491 LMOf6854_1005 LMOf6854_1006     FALSE 0.236 120.000 0.245 1.000 N NA
 2281491 2281492 LMOf6854_1006 LMOf6854_1007     FALSE 0.234 113.000 0.149 1.000 N NA
 2281492 2281493 LMOf6854_1007 LMOf6854_1008     TRUE 0.994 14.000 0.156 0.002 Y NA
 2281493 2281494 LMOf6854_1008 LMOf6854_1009     FALSE 0.188 84.000 0.020 NA   NA
 2281494 2281495 LMOf6854_1009 LMOf6854_1010     TRUE 0.624 23.000 0.222 NA   NA
 2281496 2281497 LMOf6854_1011 LMOf6854_1012     FALSE 0.040 238.000 0.071 1.000   NA
 2281497 2281498 LMOf6854_1012 LMOf6854_1013     TRUE 0.807 17.000 0.096 1.000   NA
 2281499 2281500 LMOf6854_1014 LMOf6854_1015   ppnK FALSE 0.469 89.000 0.725 1.000   NA
 2281500 2281501 LMOf6854_1015 LMOf6854_1016 ppnK   TRUE 0.816 19.000 0.480 1.000 N NA
 2281501 2281502 LMOf6854_1016 LMOf6854_1017   fabI FALSE 0.329 78.000 0.141 1.000 N NA
 2281505 2281506 LMOf6854_1020 LMOf6854_1021 dltC dltB TRUE 0.623 26.000 0.387 NA   NA
 2281506 2281507 LMOf6854_1021 LMOf6854_1022 dltB dltA TRUE 0.895 -3.000 0.435 NA N NA
 2281507 2281508 LMOf6854_1022 LMOf6854_1023 dltA   TRUE 0.749 22.000 0.549 NA   NA
 2281510 2281511 LMOf6854_1025 LMOf6854_1026     TRUE 0.745 18.000 0.159 NA   NA
 2281512 2281513 LMOf6854_1027 LMOf6854_1028 ilvE   FALSE 0.061 198.000 0.086 1.000 N NA
 2281515 2281516 LMOf6854_0686 LMOf6854_0685     FALSE 0.216 33.000 0.000 NA   NA
 2281516 2281517 LMOf6854_0685 LMOf6854_0684     FALSE 0.403 -27.000 0.000 NA   NA
 2281517 2281518 LMOf6854_0684 LMOf6854_0683   cadA FALSE 0.082 96.000 0.000 NA   NA
 2281518 2281519 LMOf6854_0683 LMOf6854_0682 cadA   FALSE 0.015 266.000 0.000 1.000   NA
 2281519 2281520 LMOf6854_0682 LMOf6854_0681     FALSE 0.297 64.000 0.041 NA   NA
 2281520 2281521 LMOf6854_0681 LMOf6854_0680     FALSE 0.006 312.000 0.000 NA   NA
 2281521 2281522 LMOf6854_0680 LMOf6854_0679     FALSE 0.080 98.000 0.000 NA   NA
 2281522 2281523 LMOf6854_0679 LMOf6854_0678     TRUE 0.877 0.000 0.068 NA   NA
 2281523 2281524 LMOf6854_0678 LMOf6854_0677     FALSE 0.003 1286.000 0.000 1.000   NA
 2281524 2281525 LMOf6854_0677 LMOf6854_0676     TRUE 0.844 14.000 0.161 NA   NA
 2281525 2281526 LMOf6854_0676 LMOf6854_0675     FALSE 0.264 105.000 0.306 NA   NA
 2281526 2281527 LMOf6854_0675 LMOf6854_0674     FALSE 0.366 90.000 0.350 1.000   NA
 2281527 2281528 LMOf6854_0674 LMOf6854_0673     TRUE 0.935 27.000 0.280 1.000 Y NA
 2281528 2281529 LMOf6854_0673 LMOf6854_0672     TRUE 0.992 15.000 0.320 0.029 Y NA
 2281529 2281530 LMOf6854_0672 LMOf6854_0671     TRUE 0.997 1.000 0.900 0.029 Y NA
 2281530 2281531 LMOf6854_0671 LMOf6854_0670     TRUE 0.978 2.000 0.538 0.029 N NA
 2281531 2281532 LMOf6854_0670 LMOf6854_0669     FALSE 0.005 359.000 0.000 1.000 N NA
 2281532 2281533 LMOf6854_0669 LMOf6854_0668     FALSE 0.308 62.000 0.042 NA   NA
 2281533 2281534 LMOf6854_0668 LMOf6854_0667     FALSE 0.380 96.000 0.700 NA   NA
 2281535 2281536 LMOf6854_0666 LMOf6854_0665     FALSE 0.304 86.000 0.294 NA   NA
 2281536 2281537 LMOf6854_0665 LMOf6854_0664     TRUE 0.631 31.000 0.353 1.000   NA
 2281538 2281539 LMOf6854_0663 LMOf6854_0662     TRUE 0.911 16.000 1.000 NA   NA
 2281539 2281540 LMOf6854_0662 LMOf6854_0661     FALSE 0.350 86.000 0.440 NA   NA
 2281540 2281541 LMOf6854_0661 LMOf6854_0660     FALSE 0.242 97.000 0.204 NA   NA
 2281541 2281542 LMOf6854_0660 LMOf6854_0659     FALSE 0.413 56.000 0.185 NA   NA
 2281543 2281544 LMOf6854_0658 LMOf6854_0657     FALSE 0.370 80.000 0.389 NA   NA
 2281547 2281548 LMOf6854_0654 LMOf6854_0653     FALSE 0.276 96.000 0.222 1.000 N NA
 2281548 2281549 LMOf6854_0653 LMOf6854_0652     TRUE 0.899 -3.000 0.250 1.000 N NA
 2281550 2281551 LMOf6854_0651 LMOf6854_0650     FALSE 0.057 161.000 0.000 1.000   NA
 2281552 2281553 LMOf6854_0649 LMOf6854_0648     FALSE 0.228 116.000 0.159 1.000 N NA
 2281553 2281554 LMOf6854_0648 LMOf6854_0647     TRUE 0.997 -3.000 0.784 0.009 Y NA
 2281555 2281556 LMOf6854_1072 LMOf6854_1071     TRUE 0.781 19.000 0.194 1.000   NA
 2281556 2281557 LMOf6854_1071 LMOf6854_1070     TRUE 0.997 -3.000 0.853 0.009 Y NA
 2281557 2281558 LMOf6854_1070 LMOf6854_1069     TRUE 0.931 -3.000 0.679 NA   NA
 2281558 2281559 LMOf6854_1069 LMOf6854_1068     FALSE 0.098 144.000 0.038 NA   NA
 2281559 2281560 LMOf6854_1068 LMOf6854_1067     FALSE 0.245 81.000 0.006 1.000   NA
 2281560 2281561 LMOf6854_1067 LMOf6854_1066     FALSE 0.185 113.000 0.038 1.000 N NA
 2281561 2281562 LMOf6854_1066 LMOf6854_1065     FALSE 0.238 115.000 0.192 1.000 N NA
 2281562 2281563 LMOf6854_1065 LMOf6854_1064     TRUE 0.752 167.000 0.179 0.003 Y NA
 2281563 2281564 LMOf6854_1064 LMOf6854_1063     TRUE 0.991 -7.000 0.042 0.003 Y NA
 2281566 2281567 LMOf6854_1061 LMOf6854_1060     TRUE 0.511 64.000 0.372 1.000   NA
 2281567 2281568 LMOf6854_1060 LMOf6854_1059     FALSE 0.453 48.000 0.121 1.000 N NA
 2281568 2281569 LMOf6854_1059 LMOf6854_1058     TRUE 0.988 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 2281569 2281570 LMOf6854_1058 LMOf6854_1057     FALSE 0.035 201.000 0.017 NA   NA
 2281570 2281571 LMOf6854_1057 LMOf6854_1056     FALSE 0.043 144.000 0.000 NA   NA
 2281573 2281574 LMOf6854_1054 LMOf6854_1053     TRUE 0.831 13.000 0.058 NA   NA
 2281574 2281575 LMOf6854_1053 LMOf6854_1052   ptsI FALSE 0.208 113.000 0.121 NA   NA
 2281575 2281576 LMOf6854_1052 LMOf6854_1051 ptsI ptsH TRUE 0.995 0.000 0.140 0.029 Y NA
 2281577 2281578 LMOf6854_1050 LMOf6854_1049     TRUE 0.703 20.000 0.214 NA   NA
 2281580 2281581 LMOf6854_1047 LMOf6854_1046     FALSE 0.094 163.000 0.115 NA   NA
 2281583 2281584 LMOf6854_1044 LMOf6854_1043     TRUE 0.555 30.000 0.303 NA   NA
 2281585 2281586 LMOf6854_1042 LMOf6854_1041     TRUE 0.959 -37.000 0.151 1.000 Y NA
 2281586 2281587 LMOf6854_1041 LMOf6854_1040     TRUE 0.877 103.000 0.381 0.069 Y NA
 2281587 2281588 LMOf6854_1040 LMOf6854_1039     FALSE 0.010 282.000 0.000 1.000 N NA
 2281588 2281589 LMOf6854_1039 LMOf6854_1038     TRUE 0.598 52.000 0.625 1.000 N NA
 2281589 2281590 LMOf6854_1038 LMOf6854_1037   prfC FALSE 0.136 125.000 0.017 1.000 N NA
 2281590 2281591 LMOf6854_1037 LMOf6854_1036 prfC   FALSE 0.255 82.000 0.014 1.000   NA
 2281591 2281592 LMOf6854_1036 LMOf6854_1035     TRUE 0.962 -7.000 0.849 0.099   NA
 2281592 2281593 LMOf6854_1035 LMOf6854_1034     TRUE 0.876 -3.000 0.189 NA   NA
 2281593 2281594 LMOf6854_1034 LMOf6854_1033     TRUE 0.884 -3.000 0.235 NA   NA
 2281594 2281595 LMOf6854_1033 LMOf6854_1032   bsaA FALSE 0.148 134.000 0.216 NA N NA
 2281595 2281596 LMOf6854_1032 LMOf6854_1031 bsaA   TRUE 0.869 13.000 0.106 1.000 N NA
 2281599 2281600 LMOf6854_0320 LMOf6854_0319     FALSE 0.372 -43.000 0.000 NA   NA
 2281600 2281601 LMOf6854_0319 LMOf6854_0318     FALSE 0.017 206.000 0.000 NA   NA
 2281601 2281602 LMOf6854_0318 LMOf6854_0317     TRUE 0.513 36.000 0.273 NA   NA
 2281603 2281604 LMOf6854_0316 LMOf6854_0315     TRUE 0.987 -7.000 0.714 1.000 Y NA
 2281604 2281605 LMOf6854_0315 LMOf6854_0314     TRUE 0.984 17.000 0.786 1.000 Y NA
 2281605 2281606 LMOf6854_0314 LMOf6854_0313     TRUE 0.996 5.000 0.565 0.029 Y NA
 2281606 2281607 LMOf6854_0313 LMOf6854_0312     TRUE 0.552 99.000 0.348 0.029 N NA
 2281608 2281609 LMOf6854_0311 LMOf6854_0310     FALSE 0.015 211.000 0.000 NA   NA
 2281611 2281612 LMOf6854_0308 LMOf6854_0307     FALSE 0.002 675.000 0.000 NA   NA
 2281612 2281613 LMOf6854_0307 LMOf6854_0306     TRUE 0.697 -25.000 0.030 1.000   NA
 2281613 2281614 LMOf6854_0306 LMOf6854_0305     FALSE 0.195 120.000 0.176 NA   NA
 2281614 2281615 LMOf6854_0305 LMOf6854_0304     TRUE 0.955 3.000 0.890 NA   NA
 2281615 2281616 LMOf6854_0304 LMOf6854_0303     TRUE 0.924 -3.000 0.575 NA   NA
 2281616 2281617 LMOf6854_0303 LMOf6854_0302     TRUE 0.694 185.000 0.597 0.063 Y NA
 2281617 2281618 LMOf6854_0302 LMOf6854_0301     FALSE 0.019 213.000 0.000 1.000 N NA
 2281619 2281620 LMOf6854_0300 LMOf6854_0299     TRUE 0.987 15.000 0.880 NA Y NA
 2281620 2281621 LMOf6854_0299 LMOf6854_0298     TRUE 0.992 -3.000 0.846 1.000 Y NA
 2281621 2281622 LMOf6854_0298 LMOf6854_0297     FALSE 0.311 90.000 0.169 1.000   NA
 2281622 2281623 LMOf6854_0297 LMOf6854_0296     FALSE 0.099 162.000 0.169 NA   NA
 2281624 2281625 LMOf6854_0295 LMOf6854_0294 nrdG nrdD TRUE 0.848 -7.000 0.240 1.000 N NA
 2281628 2281629 LMOf6854_0291 LMOf6854_0290     TRUE 0.941 17.000 0.308 0.019   NA
 2281629 2281630 LMOf6854_0290 LMOf6854_0289     FALSE 0.009 259.000 0.000 NA   NA
 2281632 2281633 LMOf6854_0287 LMOf6854_0286     FALSE 0.426 120.000 0.917 1.000   NA
 2281633 2281634 LMOf6854_0286 LMOf6854_0285     TRUE 0.913 1.000 0.265 NA   NA
 2281634 2281635 LMOf6854_0285 LMOf6854_0284     FALSE 0.176 135.000 0.235 NA   NA
 2281637 2281638 LMOf6854_0321 LMOf6854_0322     FALSE 0.023 223.000 0.000 1.000   NA
 2281640 2281641 LMOf6854_0324 LMOf6854_0325 thiM thiD-1 TRUE 0.994 -3.000 0.044 0.004 Y NA
 2281641 2281642 LMOf6854_0325 LMOf6854_0326 thiD-1 thiE TRUE 0.995 -3.000 0.142 0.004 Y NA
 2281643 2281644 LMOf6854_0327 LMOf6854_0328 bglH-1   FALSE 0.025 216.000 0.000 1.000   NA
 2281645 2281646 LMOf6854_0329 LMOf6854_0330     FALSE 0.202 109.000 0.094 NA   NA
 2281648 2281649 LMOf6854_0332 LMOf6854_0333     FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 2281649 2281650 LMOf6854_0333 LMOf6854_0334     FALSE 0.431 163.000 0.778 0.017   NA
 2281652 2281653 LMOf6854_0336 LMOf6854_0337     FALSE 0.280 138.000 0.800 NA   NA
 2281653 2281654 LMOf6854_0337 LMOf6854_0338     FALSE 0.164 57.000 0.000 NA   NA
 2281654 2281655 LMOf6854_0338 LMOf6854_0339     FALSE 0.006 384.000 0.000 1.000   NA
 2281655 2281656 LMOf6854_0339 LMOf6854_0340     FALSE 0.002 556.000 0.000 NA   NA
 2281656 2281657 LMOf6854_0340 LMOf6854_0341     FALSE 0.004 375.000 0.000 NA   NA
 2281657 2281658 LMOf6854_0341 LMOf6854_0342     TRUE 0.678 11.000 0.000 NA   NA
 2281658 2281659 LMOf6854_0342 LMOf6854_0343     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281659 2281660 LMOf6854_0343 LMOf6854_0344     TRUE 0.505 -19.000 0.000 1.000 N NA
 2281660 2281661 LMOf6854_0344 LMOf6854_0345     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281661 2281662 LMOf6854_0345 LMOf6854_0346     TRUE 0.562 -7.000 0.000 NA   NA
 2281662 2281663 LMOf6854_0346 LMOf6854_0347     FALSE 0.389 -31.000 0.000 NA   NA
 2281663 2281664 LMOf6854_0347 LMOf6854_0348   tkt FALSE 0.425 -21.000 0.000 NA   NA
 2281664 2281665 LMOf6854_0348 LMOf6854_0349 tkt   TRUE 0.934 -3.000 0.000 0.026 N NA
 2281665 2281666 LMOf6854_0349 LMOf6854_0350     FALSE 0.368 -46.000 0.000 NA   NA
 2281666 2281667 LMOf6854_0350 LMOf6854_0351     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281667 2281668 LMOf6854_0351 LMOf6854_0352     FALSE 0.003 612.000 0.000 1.000 N NA
 2281668 2281669 LMOf6854_0352 LMOf6854_0353     TRUE 0.803 9.000 0.000 1.000   NA
 2281669 2281670 LMOf6854_0353 LMOf6854_0354     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281670 2281671 LMOf6854_0354 LMOf6854_0355   celB TRUE 0.721 3.000 0.000 NA   NA
 2281671 2281672 LMOf6854_0355 LMOf6854_0356 celB celA TRUE 0.987 15.000 0.000 0.028 Y NA
 2281672 2281673 LMOf6854_0356 LMOf6854_0357 celA   TRUE 0.992 9.000 0.000 0.028 Y NA
 2281673 2281674 LMOf6854_0357 LMOf6854_0358     FALSE 0.070 134.000 0.000 1.000 N NA
 2281678 2281679 LMOf6854_0480 LMOf6854_0479     FALSE 0.207 137.000 0.407 NA   NA
 2281683 2281684 LMOf6854_0475 LMOf6854_0474     FALSE 0.050 137.000 0.000 NA   NA
 2281686 2281687 LMOf6854_0472 LMOf6854_0471     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 2281687 2281688 LMOf6854_0471 LMOf6854_0470   inlA FALSE 0.020 195.000 0.000 NA   NA
 2281688 2281689 LMOf6854_0470 LMOf6854_0469 inlA   TRUE 0.651 85.000 0.375 0.017   NA
 2281689 2281690 LMOf6854_0469 LMOf6854_0468     FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 2281690 2281691 LMOf6854_0468 LMOf6854_0467     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 2281691 2281692 LMOf6854_0467 LMOf6854_0466     TRUE 0.886 14.000 0.200 1.000   NA
 2281694 2281695 LMOf6854_0464 LMOf6854_0463     TRUE 0.985 16.000 0.600 1.000 Y NA
 2281695 2281696 LMOf6854_0463 LMOf6854_0462     TRUE 0.996 13.000 0.714 0.028 Y NA
 2281696 2281697 LMOf6854_0462 LMOf6854_0461     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.028 Y NA
 2281697 2281698 LMOf6854_0461 LMOf6854_0460     TRUE 0.970 0.000 0.222 0.028 N NA
 2281699 2281700 LMOf6854_0459 LMOf6854_0458     FALSE 0.085 180.000 0.150 1.000 N NA
 2281700 2281701 LMOf6854_0458 LMOf6854_0457     TRUE 0.903 3.000 0.200 NA   NA
 2281701 2281702 LMOf6854_0457 LMOf6854_0456     TRUE 0.906 -3.000 0.389 NA   NA
 2281704 2281705 LMOf6854_0454 LMOf6854_0453     FALSE 0.352 80.000 0.333 NA   NA
 2281706 2281707 LMOf6854_0452 LMOf6854_0451     TRUE 0.902 2.000 0.040 1.000   NA
 2281707 2281708 LMOf6854_0451 LMOf6854_0450     FALSE 0.297 127.000 0.571 1.000 N NA
 2281709 2281710 LMOf6854_1946 LMOf6854_1947     FALSE 0.002 581.000 0.000 NA   NA
 2281710 2281711 LMOf6854_1947 LMOf6854_1948     FALSE 0.266 132.000 0.579 NA   NA
 2281711 2281712 LMOf6854_1948 LMOf6854_1949     TRUE 0.872 -3.000 0.165 NA   NA
 2281713 2281714 LMOf6854_1950 LMOf6854_1951 recU   TRUE 0.520 32.000 0.062 1.000   NA
 2281715 2281716 LMOf6854_1952 LMOf6854_1953   nth TRUE 0.752 -7.000 0.034 NA   NA
 2281716 2281717 LMOf6854_1953 LMOf6854_1954 nth dnaD TRUE 0.984 11.000 0.075 NA Y NA
 2281717 2281718 LMOf6854_1954 LMOf6854_1955 dnaD asnS FALSE 0.113 149.000 0.234 NA N NA
 2281718 2281719 LMOf6854_1955 LMOf6854_1956 asnS   TRUE 0.848 14.000 0.094 1.000 N NA
 2281719 2281720 LMOf6854_1956 LMOf6854_1957     TRUE 0.729 23.000 0.367 1.000   NA
 2281720 2281721 LMOf6854_1957 LMOf6854_1958     TRUE 0.561 45.000 0.296 1.000   NA
 2281721 2281722 LMOf6854_1958 LMOf6854_1959   panD FALSE 0.212 97.000 0.053 1.000 N NA
 2281722 2281723 LMOf6854_1959 LMOf6854_1960 panD panC TRUE 0.991 5.000 0.342 1.000 Y NA
 2281723 2281724 LMOf6854_1960 LMOf6854_1961 panC panB TRUE 0.997 4.000 0.395 0.001 Y NA
 2281724 2281725 LMOf6854_1961 LMOf6854_1962 panB   FALSE 0.080 167.000 0.012 1.000   NA
 2281725 2281726 LMOf6854_1962 LMOf6854_1963   birA FALSE 0.128 148.000 0.039 1.000   NA
 2281726 2281727 LMOf6854_1963 LMOf6854_1964 birA   TRUE 0.799 -10.000 0.134 1.000 N NA
 2281727 2281728 LMOf6854_1964 LMOf6854_1965   mgsA TRUE 0.787 15.000 0.029 1.000 N NA
 2281728 2281729 LMOf6854_1965 LMOf6854_1966 mgsA dapB TRUE 0.911 16.000 0.044 0.039 N NA
 2281729 2281730 LMOf6854_1966 LMOf6854_1967 dapB   TRUE 0.835 -3.000 0.044 NA   NA
 2281733 2281734 LMOf6854_1970 LMOf6854_1971     TRUE 0.938 95.000 0.667 0.001 Y NA
 2281734 2281735 LMOf6854_1971 LMOf6854_1972     TRUE 0.911 -3.000 0.225 1.000   NA
 2281735 2281736 LMOf6854_1972 LMOf6854_1973     FALSE 0.427 19.000 0.000 NA   NA
 2281736 2281737 LMOf6854_1973 LMOf6854_1974   sfcA FALSE 0.044 110.000 0.000 NA N NA
 2281737 2281738 LMOf6854_1974 LMOf6854_1975 sfcA   TRUE 0.915 3.000 0.209 1.000 N NA
 2281738 2281739 LMOf6854_1975 LMOf6854_1976   pfl-2 FALSE 0.014 235.000 0.000 1.000 N NA
 2281740 2281741 LMOf6854_1977 LMOf6854_1978     FALSE 0.201 114.000 0.023 1.000   NA
 2281742 2281743 LMOf6854_0282 LMOf6854_0281     FALSE 0.409 84.000 0.529 1.000 N NA
 2281743 2281744 LMOf6854_0281 LMOf6854_0280     TRUE 0.507 71.000 0.647 1.000 N NA
 2281744 2281745 LMOf6854_0280 LMOf6854_0279     TRUE 0.936 7.000 0.545 1.000 N NA
 2281745 2281746 LMOf6854_0279 LMOf6854_0278     FALSE 0.180 147.000 0.364 1.000 N NA
 2281746 2281747 LMOf6854_0278 LMOf6854_0277   inlE FALSE 0.269 136.000 0.455 1.000   NA
 2281747 2281748 LMOf6854_0277 LMOf6854_0276 inlE inlD FALSE 0.121 209.000 0.000 0.013   NA
 2281748 2281749 LMOf6854_0276 LMOf6854_0275 inlD inlC2 FALSE 0.220 208.000 0.333 0.013   NA
 2281749 2281750 LMOf6854_0275 LMOf6854_0274 inlC2   FALSE 0.007 370.000 0.000 1.000   NA
 2281750 2281751 LMOf6854_0274 LMOf6854_0273     TRUE 0.523 66.000 0.458 1.000   NA
 2281751 2281752 LMOf6854_0273 LMOf6854_0272   rpoC FALSE 0.196 101.000 0.010 1.000   NA
 2281752 2281753 LMOf6854_0272 LMOf6854_0271 rpoC rpoB TRUE 0.831 171.000 0.851 0.002 Y NA
 2281753 2281754 LMOf6854_0271 LMOf6854_0270 rpoB   FALSE 0.010 246.000 0.000 NA   NA
 2281754 2281755 LMOf6854_0270 LMOf6854_0269   gtfA TRUE 0.573 66.000 0.889 NA   NA
 2281755 2281756 LMOf6854_0269 LMOf6854_0268 gtfA malL-2 TRUE 0.997 1.000 0.778 0.009 Y NA
 2281756 2281757 LMOf6854_0268 LMOf6854_0267 malL-2   TRUE 0.984 15.000 0.310 1.000 Y NA
 2281757 2281758 LMOf6854_0267 LMOf6854_0266     TRUE 0.997 2.000 0.793 0.033 Y NA
 2281758 2281759 LMOf6854_0266 LMOf6854_0265     TRUE 0.990 18.000 0.690 0.033 Y NA
 2281759 2281760 LMOf6854_0265 LMOf6854_0264     FALSE 0.195 138.000 0.296 1.000 N NA
 2281760 2281761 LMOf6854_0264 LMOf6854_0263     FALSE 0.202 145.000 0.538 NA   NA
 2281761 2281762 LMOf6854_0263 LMOf6854_0262     FALSE 0.003 398.000 0.000 NA   NA
 2281762 2281763 LMOf6854_0262 LMOf6854_0261     FALSE 0.139 112.000 0.014 NA   NA
 2281763 2281764 LMOf6854_0261 LMOf6854_0260     TRUE 0.694 25.000 0.600 NA   NA
 2281764 2281765 LMOf6854_0260 LMOf6854_0259     FALSE 0.311 117.000 0.571 NA   NA
 2281765 2281766 LMOf6854_0259 LMOf6854_0258     TRUE 0.984 -7.000 0.667 NA Y NA
 2281766 2281767 LMOf6854_0258 LMOf6854_0257   rplL FALSE 0.068 158.000 0.004 1.000 N NA
 2281767 2281768 LMOf6854_0257 LMOf6854_0256 rplL rplJ TRUE 0.948 79.000 0.884 0.014 Y NA
 2281769 2281770 LMOf6854_1871 LMOf6854_1872 recG sdhA TRUE 0.721 -52.000 0.265 1.000 N NA
 2281770 2281771 LMOf6854_1872 LMOf6854_1873 sdhA sdhB TRUE 0.861 136.000 0.147 0.001 Y NA
 2281771 2281772 LMOf6854_1873 LMOf6854_1874 sdhB   FALSE 0.487 31.000 0.029 1.000   NA
 2281772 2281773 LMOf6854_1874 LMOf6854_1875     TRUE 0.892 15.000 0.567 NA   NA
 2281775 2281776 LMOf6854_1877 LMOf6854_1878   rpe-2 FALSE 0.398 64.000 0.166 1.000 N NA
 2281776 2281777 LMOf6854_1878 LMOf6854_1879 rpe-2   TRUE 0.928 3.000 0.213 1.000   NA
 2281777 2281778 LMOf6854_1879 LMOf6854_1880     TRUE 0.782 19.000 0.196 1.000   NA
 2281778 2281779 LMOf6854_1880 LMOf6854_1881     TRUE 0.992 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 2281779 2281780 LMOf6854_1881 LMOf6854_1882   sun TRUE 0.595 23.000 0.074 1.000 N NA
 2281780 2281781 LMOf6854_1882 LMOf6854_1883 sun fmt TRUE 0.991 1.000 0.305 1.000 Y NA
 2281781 2281782 LMOf6854_1883 LMOf6854_1884 fmt priA TRUE 0.829 14.000 0.052 1.000 N NA
 2281782 2281783 LMOf6854_1884 LMOf6854_1885 priA coaBC TRUE 0.896 5.000 0.099 1.000 N NA
 2281783 2281784 LMOf6854_1885 LMOf6854_1886 coaBC rpoZ FALSE 0.127 155.000 0.192 1.000 N NA
 2281784 2281785 LMOf6854_1886 LMOf6854_1887 rpoZ   TRUE 0.922 -3.000 0.471 1.000 N NA
 2281785 2281786 LMOf6854_1887 LMOf6854_1888     TRUE 0.751 19.000 0.276 NA   NA
 2281787 2281788 LMOf6854_1889 LMOf6854_1890     FALSE 0.179 88.000 0.023 NA   NA
 2281789 2281790 LMOf6854_1891 LMOf6854_1892 pyrE pyrF TRUE 0.987 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 2281790 2281791 LMOf6854_1892 LMOf6854_1893 pyrF pyrD TRUE 0.996 -3.000 0.154 0.001 Y NA
 2281791 2281792 LMOf6854_1893 LMOf6854_1894 pyrD pyrDII TRUE 0.931 -3.000 0.592 1.000 N NA
 2281792 2281793 LMOf6854_1894 LMOf6854_1895 pyrDII carB FALSE 0.488 38.000 0.147 1.000 N NA
 2281793 2281794 LMOf6854_1895 LMOf6854_1896 carB carA TRUE 0.993 -7.000 0.117 0.001 Y NA
 2281794 2281795 LMOf6854_1896 LMOf6854_1897 carA pyrC TRUE 0.987 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 2281795 2281796 LMOf6854_1897 LMOf6854_1898 pyrC pyrB TRUE 0.979 -12.000 0.452 1.000 Y NA
 2281796 2281797 LMOf6854_1898 LMOf6854_1899 pyrB uraA TRUE 0.794 84.000 0.064 1.000 Y NA
 2281797 2281798 LMOf6854_1899 LMOf6854_1900 uraA   TRUE 0.704 129.000 0.140 1.000 Y NA
 2281800 2281801 LMOf6854_0448 LMOf6854_0447     FALSE 0.018 200.000 0.000 NA   NA
 2281802 2281803 LMOf6854_0446 LMOf6854_0445     TRUE 0.890 13.000 0.333 NA   NA
 2281803 2281804 LMOf6854_0445 LMOf6854_0444     FALSE 0.410 68.000 0.120 1.000   NA
 2281804 2281805 LMOf6854_0444 LMOf6854_0443     TRUE 0.811 16.000 0.110 1.000 N NA
 2281805 2281806 LMOf6854_0443 LMOf6854_0442     FALSE 0.326 109.000 0.550 NA   NA
 2281806 2281807 LMOf6854_0442 LMOf6854_0441     TRUE 0.941 -3.000 0.846 NA   NA
 2281807 2281808 LMOf6854_0441 LMOf6854_0440     FALSE 0.207 126.000 0.276 NA   NA
 2281808 2281809 LMOf6854_0440 LMOf6854_0439     TRUE 0.529 34.000 0.207 1.000 N NA
 2281809 2281810 LMOf6854_0439 LMOf6854_0438     TRUE 0.981 16.000 0.300 1.000 Y NA
 2281810 2281811 LMOf6854_0438 LMOf6854_0437     TRUE 0.997 4.000 0.800 0.028 Y NA
 2281811 2281812 LMOf6854_0437 LMOf6854_0436     TRUE 0.996 -3.000 0.600 0.028 Y NA
 2281812 2281813 LMOf6854_0436 LMOf6854_0435     FALSE 0.451 38.000 0.125 NA   NA
 2281813 2281814 LMOf6854_0435 LMOf6854_0434     TRUE 0.512 -10.000 0.000 NA   NA
 2281816 2281817 LMOf6854_0432 LMOf6854_0431     FALSE 0.458 56.000 0.300 NA   NA
 2281817 2281818 LMOf6854_0431 LMOf6854_0430     FALSE 0.198 144.000 0.500 NA   NA
 2281818 2281819 LMOf6854_0430 LMOf6854_0429     FALSE 0.422 35.000 0.062 NA   NA
 2281819 2281820 LMOf6854_0429 LMOf6854_0428     TRUE 0.857 -3.000 0.086 NA   NA
 2281820 2281821 LMOf6854_0428 LMOf6854_0427   ung-1 FALSE 0.213 159.000 0.846 NA   NA
 2281823 2281824 LMOf6854_0425 LMOf6854_0424     FALSE 0.276 94.000 0.286 NA   NA
 2281824 2281825 LMOf6854_0424 LMOf6854_0423     FALSE 0.145 134.000 0.081 NA   NA
 2281825 2281826 LMOf6854_0423 LMOf6854_0422     TRUE 0.874 10.000 0.064 1.000 N NA
 2281826 2281827 LMOf6854_0422 LMOf6854_0421     TRUE 0.974 17.000 0.109 1.000 Y NA
 2281827 2281828 LMOf6854_0421 LMOf6854_0420   mmsA TRUE 0.857 13.000 0.071 1.000 N NA
 2281830 2281831 LMOf6854_0418 LMOf6854_0417     FALSE 0.011 237.000 0.000 NA   NA
 2281831 2281832 LMOf6854_0417 LMOf6854_0416     FALSE 0.004 368.000 0.000 NA   NA
 2281832 2281833 LMOf6854_0416 LMOf6854_0415     FALSE 0.003 507.000 0.000 NA   NA
 2281833 2281834 LMOf6854_0415 LMOf6854_0414     FALSE 0.013 219.000 0.000 NA   NA
 2281836 2281837 LMOf6854_0412 LMOf6854_0411     FALSE 0.260 87.000 0.167 NA   NA
 2281837 2281838 LMOf6854_0411 LMOf6854_0410     FALSE 0.463 18.000 0.000 NA   NA
 2281839 2281840 LMOf6854_2021 LMOf6854_2022     TRUE 0.839 -10.000 0.333 1.000 N NA
 2281841 2281842 LMOf6854_2023 LMOf6854_2024     TRUE 0.925 0.000 0.400 NA   NA
 2281842 2281843 LMOf6854_2024 LMOf6854_2025     FALSE 0.321 84.000 0.314 NA   NA
 2281843 2281844 LMOf6854_2025 LMOf6854_2026     FALSE 0.003 601.000 0.000 1.000 N NA
 2281845 2281846 LMOf6854_2027 LMOf6854_2028     TRUE 0.771 -22.000 0.373 NA   NA
 2281847 2281848 LMOf6854_2029 LMOf6854_2030     TRUE 0.771 13.000 0.000 1.000   NA
 2281848 2281849 LMOf6854_2030 LMOf6854_2031     FALSE 0.369 28.000 0.000 1.000   NA
 2281849 2281850 LMOf6854_2031 LMOf6854_2032     TRUE 0.641 24.000 0.111 1.000   NA
 2281850 2281851 LMOf6854_2032 LMOf6854_2033     TRUE 0.929 16.000 0.048 0.030   NA
 2281851 2281852 LMOf6854_2033 LMOf6854_2034     TRUE 0.995 0.000 0.048 0.028 Y NA
 2281852 2281853 LMOf6854_2034 LMOf6854_2035     TRUE 0.532 18.000 0.000 1.000 N NA
 2281853 2281854 LMOf6854_2035 LMOf6854_2036     FALSE 0.029 186.000 0.000 1.000 N NA
 2281854 2281855 LMOf6854_2036 LMOf6854_2037     FALSE 0.226 109.000 0.040 1.000   NA
 2281855 2281856 LMOf6854_2037 LMOf6854_2038     TRUE 0.907 5.000 0.074 1.000   NA
 2281857 2281858 LMOf6854_2039 LMOf6854_2040 zwf   FALSE 0.190 119.000 0.116 NA   NA
 2281859 2281860 LMOf6854_2041 LMOf6854_2042     TRUE 0.743 -27.000 0.312 NA   NA
 2281861 2281862 LMOf6854_2043 LMOf6854_2044 ilvD ilvB TRUE 0.989 18.000 0.089 0.001 Y NA
 2281862 2281863 LMOf6854_2044 LMOf6854_2045 ilvB ilvN TRUE 0.997 1.000 0.249 0.001 Y NA
 2281863 2281864 LMOf6854_2045 LMOf6854_2046 ilvN ilvC TRUE 0.908 99.000 0.130 0.001 Y NA
 2281864 2281865 LMOf6854_2046 LMOf6854_2047 ilvC leuA TRUE 0.563 158.000 0.103 1.000 Y NA
 2281865 2281866 LMOf6854_2047 LMOf6854_2048 leuA leuB TRUE 0.996 2.000 0.041 0.001 Y NA
 2281866 2281867 LMOf6854_2048 LMOf6854_2049 leuB leuC TRUE 0.996 2.000 0.080 0.001 Y NA
 2281867 2281868 LMOf6854_2049 LMOf6854_2050 leuC leuD TRUE 0.993 -13.000 0.477 0.001 Y NA
 2281868 2281869 LMOf6854_2050 LMOf6854_2051 leuD ilvA TRUE 0.965 19.000 0.100 1.000 Y NA
 2281869 2281870 LMOf6854_2051 LMOf6854_2052 ilvA budA FALSE 0.061 193.000 0.056 1.000 N NA
 2281872 2281873 LMOf6854_2084 LMOf6854_2083     TRUE 0.926 5.000 0.243 1.000   NA
 2281873 2281874 LMOf6854_2083 LMOf6854_2082   divIVA FALSE 0.265 94.000 0.064 1.000   NA
 2281874 2281875 LMOf6854_2082 LMOf6854_2081 divIVA ileS FALSE 0.017 283.000 0.012 1.000 N NA
 2281875 2281876 LMOf6854_2081 LMOf6854_2080 ileS dapF FALSE 0.153 112.000 0.010 1.000 N NA
 2281876 2281877 LMOf6854_2080 LMOf6854_2079 dapF   TRUE 0.784 14.000 0.011 1.000 N NA
 2281877 2281878 LMOf6854_2079 LMOf6854_2078     FALSE 0.009 289.000 0.000 1.000 N NA
 2281880 2281881 LMOf6854_2076 LMOf6854_2075     TRUE 0.822 4.000 0.000 1.000   NA
 2281881 2281882 LMOf6854_2075 LMOf6854_2074     TRUE 0.526 61.000 0.579 NA   NA
 2281882 2281883 LMOf6854_2074 LMOf6854_2073     TRUE 0.579 57.000 0.714 NA   NA
 2281883 2281884 LMOf6854_2073 LMOf6854_2072     TRUE 0.996 0.000 0.226 0.009 Y NA
 2281884 2281885 LMOf6854_2072 LMOf6854_2071     FALSE 0.254 104.000 0.194 1.000 N NA
 2281885 2281886 LMOf6854_2071 LMOf6854_2070     TRUE 0.941 70.000 0.615 0.033 Y NA
 2281886 2281887 LMOf6854_2070 LMOf6854_2069     TRUE 0.987 21.000 1.000 0.033 Y NA
 2281887 2281888 LMOf6854_2069 LMOf6854_2068   alsS FALSE 0.067 196.000 0.111 1.000 N NA
 2281888 2281889 LMOf6854_2068 LMOf6854_2067 alsS   FALSE 0.214 118.000 0.111 1.000 N NA
 2281889 2281890 LMOf6854_2067 LMOf6854_2066     TRUE 0.657 -25.000 0.066 NA   NA
 2281890 2281891 LMOf6854_2066 LMOf6854_2065     FALSE 0.463 42.000 0.200 NA   NA
 2281891 2281892 LMOf6854_2065 LMOf6854_2064     TRUE 0.996 2.000 0.500 0.041 Y NA
 2281892 2281893 LMOf6854_2064 LMOf6854_2063     TRUE 0.741 20.000 0.257 1.000 N NA
 2281893 2281894 LMOf6854_2063 LMOf6854_2062     TRUE 0.982 23.000 0.800 0.030 Y NA
 2281894 2281895 LMOf6854_2062 LMOf6854_2061     TRUE 0.987 -19.000 0.448 0.030 Y NA
 2281895 2281896 LMOf6854_2061 LMOf6854_2060     TRUE 0.815 22.000 0.692 1.000   NA
 2281896 2281897 LMOf6854_2060 LMOf6854_2059     TRUE 0.778 59.000 0.300 0.005   NA
 2281897 2281898 LMOf6854_2059 LMOf6854_2058     TRUE 0.829 17.000 0.333 1.000 N NA
 2281898 2281899 LMOf6854_2058 LMOf6854_2057   deoR FALSE 0.303 96.000 0.200 1.000   NA
 2281900 2281901 LMOf6854_0372 LMOf6854_0373     TRUE 0.943 4.000 0.667 NA   NA
 2281901 2281902 LMOf6854_0373 LMOf6854_0374     FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 2281902 2281903 LMOf6854_0374 LMOf6854_0375     TRUE 0.764 13.000 0.006 NA   NA
 2281904 2281905 LMOf6854_0376 LMOf6854_0377   tkt-1 FALSE 0.356 66.000 0.167 NA   NA
 2281905 2281906 LMOf6854_0377 LMOf6854_0378 tkt-1   TRUE 0.994 2.000 0.750 1.000 Y NA
 2281908 2281909 LMOf6854_0380 LMOf6854_0381   rpiB-1 TRUE 0.605 25.000 0.212 1.000 N NA
 2281909 2281910 LMOf6854_0381 LMOf6854_0382 rpiB-1 tpiA-1 TRUE 0.989 7.000 0.208 1.000 Y NA
 2281910 2281911 LMOf6854_0382 LMOf6854_0383 tpiA-1   TRUE 0.990 4.000 0.147 1.000 Y NA
 2281911 2281912 LMOf6854_0383 LMOf6854_0384     TRUE 0.982 22.000 0.162 0.002 Y NA
 2281912 2281913 LMOf6854_0384 LMOf6854_0385     TRUE 0.772 22.000 0.667 NA   NA
 2281913 2281914 LMOf6854_0385 LMOf6854_0386     TRUE 0.906 16.000 0.889 NA   NA
 2281914 2281915 LMOf6854_0386 LMOf6854_0387     FALSE 0.415 85.000 0.667 NA   NA
 2281916 2281917 LMOf6854_0388 LMOf6854_0389     FALSE 0.434 66.000 0.182 1.000   NA
 2281919 2281920 LMOf6854_0391 LMOf6854_0392     FALSE 0.263 174.000 0.095 0.020   NA
 2281920 2281921 LMOf6854_0392 LMOf6854_0393     FALSE 0.094 199.000 0.308 1.000   NA
 2281921 2281922 LMOf6854_0393 LMOf6854_0394     TRUE 0.995 14.000 0.692 0.028 Y NA
 2281922 2281923 LMOf6854_0394 LMOf6854_0395     TRUE 0.994 0.000 0.846 1.000 Y NA
 2281923 2281924 LMOf6854_0395 LMOf6854_0396     TRUE 0.909 57.000 0.500 1.000 Y NA
 2281925 2281926 LMOf6854_0397 LMOf6854_0398 tatC   TRUE 0.988 -3.000 0.393 NA Y NA
 2281926 2281927 LMOf6854_0398 LMOf6854_0399     FALSE 0.223 96.000 0.066 1.000 N NA
 2281928 2281929 LMOf6854_0400 LMOf6854_0401     FALSE 0.090 131.000 0.024 NA N NA
 2281929 2281930 LMOf6854_0401 LMOf6854_0402     TRUE 0.983 -3.000 0.040 NA Y NA
 2281930 2281931 LMOf6854_0402 LMOf6854_0403     TRUE 0.979 18.000 0.812 NA Y NA
 2281931 2281932 LMOf6854_0403 LMOf6854_0404     FALSE 0.239 73.000 0.072 NA N NA
 2281932 2281933 LMOf6854_0404 LMOf6854_0405     FALSE 0.208 96.000 0.013 1.000   NA
 2281933 2281934 LMOf6854_0405 LMOf6854_0406   phnA FALSE 0.428 37.000 0.013 1.000   NA
 2281936 2281937 LMOf6854_0408 LMOf6854_0409     TRUE 0.988 -7.000 0.857 1.000 Y NA
 2281938 2281939 LMOf6854_1592 LMOf6854_1593   minD FALSE 0.367 52.000 0.060 NA   NA
 2281939 2281940 LMOf6854_1593 LMOf6854_1594 minD minC TRUE 0.992 3.000 0.368 1.000 Y NA
 2281940 2281941 LMOf6854_1594 LMOf6854_1595 minC mreD FALSE 0.083 178.000 0.106 1.000 N NA
 2281941 2281942 LMOf6854_1595 LMOf6854_1596 mreD mreC TRUE 0.997 3.000 0.550 0.003 Y NA
 2281942 2281943 LMOf6854_1596 LMOf6854_1597 mreC mreB FALSE 0.440 86.000 0.689 1.000 N NA
 2281943 2281944 LMOf6854_1597 LMOf6854_1598 mreB   FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 2281944 2281945 LMOf6854_1598 LMOf6854_1599   radC FALSE 0.375 90.000 0.600 NA   NA
 2281945 2281946 LMOf6854_1599 LMOf6854_1600 radC   TRUE 0.833 12.000 0.019 1.000 N NA
 2281946 2281947 LMOf6854_1600 LMOf6854_1601     FALSE 0.181 80.000 0.008 NA   NA
 2281947 2281948 LMOf6854_1601 LMOf6854_1602   folC TRUE 0.527 25.000 0.091 NA   NA
 2281948 2281949 LMOf6854_1602 LMOf6854_1603 folC valS TRUE 0.580 62.000 0.041 0.096 N NA
 2281949 2281950 LMOf6854_1603 LMOf6854_1604 valS hemL FALSE 0.007 323.000 0.000 1.000 N NA
 2281950 2281951 LMOf6854_1604 LMOf6854_1605 hemL hemB TRUE 0.995 13.000 0.126 0.002 Y NA
 2281951 2281952 LMOf6854_1605 LMOf6854_1606 hemB hemD TRUE 0.995 -3.000 0.042 0.002 Y NA
 2281952 2281953 LMOf6854_1606 LMOf6854_1607 hemD hemC TRUE 0.994 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 2281953 2281954 LMOf6854_1607 LMOf6854_1608 hemC hemA TRUE 0.995 4.000 0.016 0.002 Y NA
 2281954 2281955 LMOf6854_1608 LMOf6854_1609 hemA   FALSE 0.165 128.000 0.020 1.000   NA
 2281955 2281956 LMOf6854_1609 LMOf6854_1610   thrS FALSE 0.190 108.000 0.010 1.000   NA
 2281956 2281957 LMOf6854_1610 LMOf6854_1611 thrS dnaI FALSE 0.021 350.000 0.000 0.096 N NA
 2281957 2281958 LMOf6854_1611 LMOf6854_1612 dnaI   TRUE 0.991 10.000 0.817 NA Y NA
 2281958 2281959 LMOf6854_1612 LMOf6854_1613     TRUE 0.599 21.000 0.109 NA N NA
 2281959 2281960 LMOf6854_1613 LMOf6854_1614   coaE FALSE 0.174 78.000 0.024 NA N NA
 2281960 2281961 LMOf6854_1614 LMOf6854_1615 coaE mutM TRUE 0.661 -40.000 0.066 1.000 N NA
 2281961 2281962 LMOf6854_1615 LMOf6854_1616 mutM polA TRUE 0.937 24.000 0.101 1.000 Y NA
 2281962 2281963 LMOf6854_1616 LMOf6854_1617 polA icd FALSE 0.062 166.000 0.008 1.000 N NA
 2281963 2281964 LMOf6854_1617 LMOf6854_1618 icd   TRUE 0.961 20.000 0.140 1.000 Y NA
 2281964 2281965 LMOf6854_1618 LMOf6854_1619     FALSE 0.389 36.000 0.039 NA   NA
 2281965 2281966 LMOf6854_1619 LMOf6854_1620     FALSE 0.082 157.000 0.043 NA   NA
 2281966 2281967 LMOf6854_1620 LMOf6854_1621   pyk FALSE 0.120 118.000 0.000 1.000   NA
 2281969 2281970 LMOf6854_1738 LMOf6854_1737   metE FALSE 0.009 290.000 0.000 1.000 N NA
 2281970 2281971 LMOf6854_1737 LMOf6854_1736 metE   TRUE 0.941 22.000 0.017 1.000 Y NA
 2281971 2281972 LMOf6854_1736 LMOf6854_1735     TRUE 0.995 -7.000 0.600 0.001 Y NA
 2281972 2281973 LMOf6854_1735 LMOf6854_1734     TRUE 0.987 -3.000 0.162 1.000 Y NA
 2281975 2281976 LMOf6854_1732 LMOf6854_1731   menD TRUE 0.987 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 2281976 2281977 LMOf6854_1731 LMOf6854_1730 menD   TRUE 0.940 2.000 0.355 1.000   NA
 2281977 2281978 LMOf6854_1730 LMOf6854_1729   menB TRUE 0.916 -3.000 0.280 1.000   NA
 2281978 2281979 LMOf6854_1729 LMOf6854_1728 menB menE TRUE 0.904 22.000 0.193 0.001 N NA
 2281980 2281981 LMOf6854_1727 LMOf6854_1726     FALSE 0.082 141.000 0.000 1.000   NA
 2281982 2281983 LMOf6854_1725 LMOf6854_1724     FALSE 0.435 57.000 0.250 NA   NA
 2281983 2281984 LMOf6854_1724 LMOf6854_1723     FALSE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 2281984 2281985 LMOf6854_1723 LMOf6854_1722     FALSE 0.136 102.000 0.000 1.000   NA
 2281988 2281989 LMOf6854_2660 LMOf6854_2659     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2281989 2281990 LMOf6854_2659 LMOf6854_2658     TRUE 0.646 13.000 0.000 NA   NA
 2281990 2281991 LMOf6854_2658 LMOf6854_2657     FALSE 0.106 81.000 0.000 NA   NA
 2281991 2281992 LMOf6854_2657 LMOf6854_2656     TRUE 0.850 0.000 0.027 NA   NA
 2281992 2281993 LMOf6854_2656 LMOf6854_2655     TRUE 0.892 0.000 0.027 1.000   NA
 2281993 2281994 LMOf6854_2655 LMOf6854_2654     FALSE 0.003 402.000 0.000 NA   NA
 2281995 2281996 LMOf6854_2653 LMOf6854_2652     TRUE 0.709 5.000 0.000 NA   NA
 2281997 2281998 LMOf6854_2651 LMOf6854_2650   lmrB-2 FALSE 0.350 101.000 0.524 1.000 N NA
 2282000 2282001 LMOf6854_2648 LMOf6854_2647     TRUE 0.896 0.000 0.167 NA   NA
 2282001 2282002 LMOf6854_2647 LMOf6854_2646   fdhD TRUE 0.604 62.000 0.923 NA   NA
 2282002 2282003 LMOf6854_2646 LMOf6854_2645 fdhD   TRUE 0.506 47.000 0.278 1.000 N NA
 2282003 2282004 LMOf6854_2645 LMOf6854_2644     TRUE 0.992 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 2282004 2282005 LMOf6854_2644 LMOf6854_2643     TRUE 0.604 79.000 0.367 0.069 N NA
 2282005 2282006 LMOf6854_2643 LMOf6854_2642     TRUE 0.994 0.000 0.852 1.000 Y NA
 2282006 2282007 LMOf6854_2642 LMOf6854_2641     FALSE 0.327 69.000 0.111 NA   NA
 2282008 2282009 LMOf6854_2640 LMOf6854_2639     TRUE 0.947 11.000 0.917 NA   NA
 2282010 2282011 LMOf6854_2638 LMOf6854_2637     FALSE 0.024 221.000 0.000 1.000   NA
 2282014 2282015 LMOf6854_1624 LMOf6854_1625 accA accD TRUE 0.992 -10.000 0.234 0.001 Y NA
 2282015 2282016 LMOf6854_1625 LMOf6854_1626 accD dnaE FALSE 0.091 218.000 0.003 0.036 N NA
 2282016 2282017 LMOf6854_1626 LMOf6854_1627 dnaE   FALSE 0.239 122.000 0.159 1.000   NA
 2282017 2282018 LMOf6854_1627 LMOf6854_1628     TRUE 0.671 21.000 0.038 1.000   NA
 2282018 2282019 LMOf6854_1628 LMOf6854_1629     FALSE 0.485 26.000 0.006 1.000   NA
 2282023 2282024 LMOf6854_1633 LMOf6854_1634 ackA   TRUE 0.914 0.000 0.217 1.000 N NA
 2282024 2282025 LMOf6854_1634 LMOf6854_1635     FALSE 0.041 224.000 0.089 1.000 N NA
 2282025 2282026 LMOf6854_1635 LMOf6854_1636     FALSE 0.305 62.000 0.040 NA   NA
 2282026 2282027 LMOf6854_1636 LMOf6854_1637     TRUE 0.658 20.000 0.087 NA   NA
 2282029 2282030 LMOf6854_1639 LMOf6854_1640 argF-2 argD TRUE 0.985 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 2282030 2282031 LMOf6854_1640 LMOf6854_1641 argD argB TRUE 0.989 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 2282031 2282032 LMOf6854_1641 LMOf6854_1642 argB argJ TRUE 0.994 13.000 0.067 0.002 Y NA
 2282032 2282033 LMOf6854_1642 LMOf6854_1643 argJ argC TRUE 0.993 16.000 0.303 0.002 Y NA
 2282033 2282034 LMOf6854_1643 LMOf6854_1644 argC thiI FALSE 0.175 173.000 0.013 0.038 N NA
 2282034 2282035 LMOf6854_1644 LMOf6854_1645 thiI   TRUE 0.930 2.000 0.349 1.000 N NA
 2282035 2282036 LMOf6854_1645 LMOf6854_1646   ezrA FALSE 0.207 127.000 0.201 1.000 N NA
 2282037 2282038 LMOf6854_1647 LMOf6854_1648   rpsD FALSE 0.018 212.000 0.005 NA N NA
 2282039 2282040 LMOf6854_2513 LMOf6854_2512 est-2   FALSE 0.396 64.000 0.060 1.000   NA
 2282040 2282041 LMOf6854_2512 LMOf6854_2511   smpB TRUE 0.936 16.000 0.143 0.018 N NA
 2282045 2282046 LMOf6854_2507 LMOf6854_2506     TRUE 0.865 15.000 0.159 1.000   NA
 2282046 2282047 LMOf6854_2506 LMOf6854_2505     FALSE 0.002 1545.000 0.000 NA   NA
 2282047 2282048 LMOf6854_2505 LMOf6854_2504     FALSE 0.438 45.000 0.153 NA   NA
 2282048 2282049 LMOf6854_2504 LMOf6854_2503     FALSE 0.392 55.000 0.103 NA   NA
 2282056 2282057 LMOf6854_2496 LMOf6854_2495 estA   FALSE 0.224 133.000 0.407 NA   NA
 2282058 2282059 LMOf6854_2494 LMOf6854_2493     TRUE 0.994 0.000 0.889 1.000 Y NA
 2282059 2282060 LMOf6854_2493 LMOf6854_2492     TRUE 0.990 -3.000 0.520 1.000 Y NA
 2282060 2282061 LMOf6854_2492 LMOf6854_2491     FALSE 0.214 142.000 0.455 1.000 N NA
 2282061 2282062 LMOf6854_2491 LMOf6854_2490     TRUE 0.913 76.000 0.008 0.003 Y NA
 2282062 2282063 LMOf6854_2490 LMOf6854_2489     FALSE 0.072 156.000 0.008 1.000 N NA
 2282063 2282064 LMOf6854_2489 LMOf6854_2488   gcvH FALSE 0.408 41.000 0.038 1.000 N NA
 2282064 2282065 LMOf6854_2488 LMOf6854_2487 gcvH   FALSE 0.273 85.000 0.038 1.000   NA
 2282066 2282067 LMOf6854_2315 LMOf6854_2314     TRUE 0.980 14.000 0.100 NA Y NA
 2282068 2282069 LMOf6854_2313 LMOf6854_2312     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282069 2282070 LMOf6854_2312 LMOf6854_2311     TRUE 0.592 2.000 0.000 NA N NA
 2282071 2282072 LMOf6854_2310 LMOf6854_2309     TRUE 0.646 22.000 0.100 1.000 N NA
 2282073 2282074 LMOf6854_2308 LMOf6854_2307 ogt   FALSE 0.264 92.000 0.135 1.000 N NA
 2282074 2282075 LMOf6854_2307 LMOf6854_2306     TRUE 0.747 -19.000 0.149 1.000 N NA
 2282075 2282076 LMOf6854_2306 LMOf6854_2305     TRUE 0.940 -3.000 0.833 NA   NA
 2282077 2282078 LMOf6854_2304 LMOf6854_2303     FALSE 0.315 160.000 0.250 0.032   NA
 2282078 2282079 LMOf6854_2303 LMOf6854_2302     TRUE 0.679 33.000 0.571 1.000   NA
 2282081 2282082 LMOf6854_2300 LMOf6854_2299     FALSE 0.353 69.000 0.320 NA N NA
 2282084 2282085 LMOf6854_2297 LMOf6854_2296     FALSE 0.017 256.000 0.000 1.000   NA
 2282085 2282086 LMOf6854_2296 LMOf6854_2295     TRUE 0.569 65.000 0.750 1.000 N NA
 2282087 2282088 LMOf6854_2294 LMOf6854_2293     FALSE 0.225 99.000 0.141 NA   NA
 2282088 2282089 LMOf6854_2293 LMOf6854_2292     TRUE 0.892 0.000 0.118 NA   NA
 2282089 2282090 LMOf6854_2292 LMOf6854_2291     TRUE 0.891 -3.000 0.275 NA   NA
 2282090 2282091 LMOf6854_2291 LMOf6854_2290   fumC FALSE 0.232 70.000 0.017 NA   NA
 2282091 2282092 LMOf6854_2290 LMOf6854_2289 fumC   FALSE 0.144 104.000 0.014 NA   NA
 2282092 2282093 LMOf6854_2289 LMOf6854_2288     FALSE 0.334 82.000 0.321 NA   NA
 2282093 2282094 LMOf6854_2288 LMOf6854_2287     FALSE 0.123 143.000 0.093 NA   NA
 2282095 2282096 LMOf6854_0639 LMOf6854_0638     FALSE 0.302 76.000 0.117 NA   NA
 2282098 2282099 LMOf6854_0636 LMOf6854_0635     TRUE 0.969 17.000 0.027 1.000 Y NA
 2282100 2282101 LMOf6854_0634 LMOf6854_0633     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 2282101 2282102 LMOf6854_0633 LMOf6854_0632     FALSE 0.182 128.000 0.194 NA   NA
 2282102 2282103 LMOf6854_0632 LMOf6854_0631     TRUE 0.908 -3.000 0.210 1.000   NA
 2282103 2282104 LMOf6854_0631 LMOf6854_0630     TRUE 0.945 0.000 0.688 NA   NA
 2282104 2282105 LMOf6854_0630 LMOf6854_0629   phrB FALSE 0.094 138.000 0.015 NA   NA
 2282105 2282106 LMOf6854_0629 LMOf6854_0628 phrB   FALSE 0.129 117.000 0.014 NA   NA
 2282106 2282107 LMOf6854_0628 LMOf6854_0627     TRUE 0.575 51.000 0.615 NA   NA
 2282107 2282108 LMOf6854_0627 LMOf6854_0626     FALSE 0.471 69.000 0.556 NA   NA
 2282108 2282109 LMOf6854_0626 LMOf6854_0625     FALSE 0.009 259.000 0.000 NA   NA
 2282109 2282110 LMOf6854_0625 LMOf6854_0624     FALSE 0.232 116.000 0.256 NA   NA
 2282111 2282112 LMOf6854_0623 LMOf6854_0622 iap   FALSE 0.250 88.000 0.125 NA   NA
 2282113 2282114 LMOf6854_0621 LMOf6854_0620     TRUE 0.840 16.000 0.345 NA   NA
 2282115 2282116 LMOf6854_0619 LMOf6854_0618     TRUE 0.890 14.000 0.433 NA   NA
 2282118 2282119 LMOf6854_1911 LMOf6854_1912     FALSE 0.127 154.000 0.175 1.000 N NA
 2282119 2282120 LMOf6854_1912 LMOf6854_1913     TRUE 0.993 13.000 0.000 0.001 Y NA
 2282120 2282121 LMOf6854_1913 LMOf6854_1914     TRUE 0.582 15.000 0.000 NA   NA
 2282121 2282122 LMOf6854_1914 LMOf6854_1915     FALSE 0.259 123.000 0.458 NA   NA
 2282122 2282123 LMOf6854_1915 LMOf6854_1916     FALSE 0.492 -12.000 0.000 NA   NA
 2282123 2282124 LMOf6854_1916 LMOf6854_1917   deoD FALSE 0.162 58.000 0.000 NA   NA
 2282124 2282125 LMOf6854_1917 LMOf6854_1918 deoD   FALSE 0.011 308.000 0.000 1.000   NA
 2282125 2282126 LMOf6854_1918 LMOf6854_1919     FALSE 0.326 83.000 0.098 1.000   NA
 2282126 2282127 LMOf6854_1919 LMOf6854_1920   msrA TRUE 0.996 7.000 0.262 0.001 Y NA
 2282127 2282128 LMOf6854_1920 LMOf6854_1921 msrA   FALSE 0.472 36.000 0.172 NA   NA
 2282128 2282129 LMOf6854_1921 LMOf6854_1922     TRUE 0.901 16.000 0.828 NA   NA
 2282129 2282130 LMOf6854_1922 LMOf6854_1923     TRUE 0.824 15.000 0.153 NA   NA
 2282131 2282132 LMOf6854_1924 LMOf6854_1925 hlY-III   FALSE 0.209 122.000 0.064 1.000   NA
 2282132 2282133 LMOf6854_1925 LMOf6854_1926     TRUE 0.864 13.000 0.179 NA   NA
 2282133 2282134 LMOf6854_1926 LMOf6854_1927   ppdK TRUE 0.673 19.000 0.065 NA   NA
 2282135 2282136 LMOf6854_1928 LMOf6854_1929     TRUE 0.916 4.000 0.102 1.000   NA
 2282136 2282137 LMOf6854_1929 LMOf6854_1930     FALSE 0.286 94.000 0.102 1.000   NA
 2282137 2282138 LMOf6854_1930 LMOf6854_1931     FALSE 0.169 140.000 0.083 1.000   NA
 2282138 2282139 LMOf6854_1931 LMOf6854_1932     FALSE 0.383 69.000 0.082 1.000   NA
 2282139 2282140 LMOf6854_1932 LMOf6854_1933   folA FALSE 0.223 98.000 0.027 1.000   NA
 2282140 2282141 LMOf6854_1933 LMOf6854_1934 folA thyA TRUE 0.846 16.000 0.295 1.000 N NA
 2282141 2282142 LMOf6854_1934 LMOf6854_1935 thyA   TRUE 0.863 13.000 0.036 1.000   NA
 2282142 2282143 LMOf6854_1935 LMOf6854_1936   fhs FALSE 0.368 120.000 0.022 0.094   NA
 2282143 2282144 LMOf6854_1936 LMOf6854_1937 fhs   FALSE 0.127 157.000 0.083 1.000   NA
 2282145 2282146 LMOf6854_1338 LMOf6854_1339     TRUE 0.834 -7.000 0.065 1.000   NA
 2282146 2282147 LMOf6854_1339 LMOf6854_1340   glnR FALSE 0.049 204.000 0.046 1.000 N NA
 2282147 2282148 LMOf6854_1340 LMOf6854_1341 glnR glnA FALSE 0.365 71.000 0.192 1.000 N NA
 2282148 2282149 LMOf6854_1341 LMOf6854_1342 glnA arsB FALSE 0.158 144.000 0.212 1.000 N NA
 2282150 2282151 LMOf6854_1343 LMOf6854_1344   lexA FALSE 0.464 30.000 0.043 1.000 N NA
 2282152 2282153 LMOf6854_1345 LMOf6854_1346     FALSE 0.338 92.000 0.480 NA   NA
 2282153 2282154 LMOf6854_1346 LMOf6854_1347   tkt-2 FALSE 0.179 147.000 0.440 NA   NA
 2282154 2282155 LMOf6854_1347 LMOf6854_1348 tkt-2   FALSE 0.024 221.000 0.000 1.000   NA
 2282156 2282157 LMOf6854_1349 LMOf6854_1350     TRUE 0.622 19.000 0.026 NA   NA
 2282157 2282158 LMOf6854_1350 LMOf6854_1351     TRUE 0.639 22.000 0.087 1.000 N NA
 2282158 2282159 LMOf6854_1351 LMOf6854_1352     TRUE 0.949 10.000 0.692 1.000   NA
 2282159 2282160 LMOf6854_1352 LMOf6854_1353     TRUE 0.825 -10.000 0.123 1.000   NA
 2282160 2282161 LMOf6854_1353 LMOf6854_1354     TRUE 0.736 -16.000 0.137 NA   NA
 2282162 2282163 LMOf6854_1355 LMOf6854_1356 pyrH frr TRUE 0.947 0.000 0.626 1.000 N NA
 2282163 2282164 LMOf6854_1356 LMOf6854_1357 frr uppS FALSE 0.062 230.000 0.409 1.000 N NA
 2282164 2282165 LMOf6854_1357 LMOf6854_1358 uppS cdsA TRUE 0.984 14.000 0.113 1.000 Y NA
 2282165 2282166 LMOf6854_1358 LMOf6854_1359 cdsA dxr TRUE 0.980 15.000 0.071 1.000 Y NA
 2282166 2282167 LMOf6854_1359 LMOf6854_1360 dxr   TRUE 0.913 14.000 0.568 1.000 N NA
 2282167 2282168 LMOf6854_1360 LMOf6854_1361   proS FALSE 0.463 40.000 0.095 1.000 N NA
 2282169 2282170 LMOf6854_2585 LMOf6854_2586 ssb-2 fabZ FALSE 0.012 252.000 0.000 1.000 N NA
 2282170 2282171 LMOf6854_2586 LMOf6854_2587 fabZ   TRUE 0.590 22.000 0.037 1.000 N NA
 2282171 2282172 LMOf6854_2587 LMOf6854_2588   murA-1 FALSE 0.107 163.000 0.126 1.000 N NA
 2282172 2282173 LMOf6854_2588 LMOf6854_2589 murA-1   FALSE 0.088 182.000 0.279 NA   NA
 2282173 2282174 LMOf6854_2589 LMOf6854_2590   atpC FALSE 0.138 124.000 0.039 NA   NA
 2282174 2282175 LMOf6854_2590 LMOf6854_2591 atpC atpD-2 TRUE 0.988 22.000 0.837 0.005 Y NA
 2282175 2282176 LMOf6854_2591 LMOf6854_2592 atpD-2 atpG TRUE 0.964 61.000 0.724 0.005 Y NA
 2282176 2282177 LMOf6854_2592 LMOf6854_2593 atpG atpA-2 TRUE 0.975 38.000 0.846 0.005 Y NA
 2282177 2282178 LMOf6854_2593 LMOf6854_2594 atpA-2 atpH TRUE 0.982 27.000 0.864 0.005 Y NA
 2282178 2282179 LMOf6854_2594 LMOf6854_2595 atpH atpF TRUE 0.995 -3.000 0.222 0.005 Y NA
 2282179 2282180 LMOf6854_2595 LMOf6854_2596 atpF atpE TRUE 0.674 88.000 0.402 0.005   NA
 2282180 2282181 LMOf6854_2596 LMOf6854_2597 atpE atpB TRUE 0.696 72.000 0.189 0.006   NA
 2282181 2282182 LMOf6854_2597 LMOf6854_2598 atpB   FALSE 0.003 1237.000 0.000 1.000 N NA
 2282182 2282183 LMOf6854_2598 LMOf6854_2599   upp FALSE 0.143 118.000 0.011 1.000 N NA
 2282183 2282184 LMOf6854_2599 LMOf6854_2600 upp glyA FALSE 0.139 137.000 0.051 1.000 N NA
 2282184 2282185 LMOf6854_2600 LMOf6854_2601 glyA   FALSE 0.134 136.000 0.037 1.000 N NA
 2282185 2282186 LMOf6854_2601 LMOf6854_2602     TRUE 0.848 -3.000 0.176 NA N NA
 2282186 2282187 LMOf6854_2602 LMOf6854_2603     FALSE 0.166 301.000 0.204 NA Y NA
 2282187 2282188 LMOf6854_2603 LMOf6854_2604   prf1 TRUE 0.729 118.000 0.084 1.000 Y NA
 2282188 2282189 LMOf6854_2604 LMOf6854_2605 prf1   TRUE 0.584 23.000 0.062 1.000 N NA
 2282189 2282190 LMOf6854_2605 LMOf6854_2606   thrB FALSE 0.364 112.000 0.019 0.094 N NA
 2282190 2282191 LMOf6854_2606 LMOf6854_2607 thrB thrC TRUE 0.990 0.000 0.221 1.000 Y NA
 2282191 2282192 LMOf6854_2607 LMOf6854_2608 thrC hom TRUE 0.988 3.000 0.034 1.000 Y NA
 2282193 2282194 LMOf6854_0182 LMOf6854_0181     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282194 2282195 LMOf6854_0181 LMOf6854_0180     FALSE 0.079 101.000 0.000 NA   NA
 2282195 2282196 LMOf6854_0180 LMOf6854_0179     FALSE 0.010 240.000 0.000 NA   NA
 2282196 2282197 LMOf6854_0179 LMOf6854_0178     FALSE 0.452 68.000 0.474 NA   NA
 2282199 2282200 LMOf6854_0176 LMOf6854_0175     TRUE 0.877 -3.000 0.041 1.000   NA
 2282200 2282201 LMOf6854_0175 LMOf6854_0174     TRUE 0.805 -16.000 0.209 1.000   NA
 2282201 2282202 LMOf6854_0174 LMOf6854_0173     FALSE 0.401 59.000 0.193 NA   NA
 2282202 2282203 LMOf6854_0173 LMOf6854_0172     TRUE 0.880 11.000 0.183 NA   NA
 2282203 2282204 LMOf6854_0172 LMOf6854_0171   holB TRUE 0.917 6.000 0.372 NA   NA
 2282206 2282207 LMOf6854_0169 LMOf6854_0168     FALSE 0.395 193.000 0.818 0.002   NA
 2282207 2282208 LMOf6854_0168 LMOf6854_0167     FALSE 0.013 284.000 0.000 1.000   NA
 2282208 2282209 LMOf6854_0167 LMOf6854_0166     TRUE 0.684 46.000 0.066 0.094   NA
 2282211 2282212 LMOf6854_0164 LMOf6854_0163 zurM-1 zurA-1 TRUE 0.983 -51.000 0.673 0.094 Y NA
 2282212 2282213 LMOf6854_0163 LMOf6854_0162 zurA-1   TRUE 0.987 13.000 0.212 1.000 Y NA
 2282214 2282215 LMOf6854_1695 LMOf6854_1696   tag TRUE 0.755 -3.000 0.019 NA N NA
 2282215 2282216 LMOf6854_1696 LMOf6854_1697 tag acnA FALSE 0.006 347.000 0.000 1.000 N NA
 2282216 2282217 LMOf6854_1697 LMOf6854_1698 acnA   FALSE 0.043 155.000 0.004 NA N NA
 2282217 2282218 LMOf6854_1698 LMOf6854_1699     FALSE 0.269 25.000 0.000 NA   NA
 2282218 2282219 LMOf6854_1699 LMOf6854_1700     FALSE 0.019 197.000 0.000 NA   NA
 2282219 2282220 LMOf6854_1700 LMOf6854_1701     FALSE 0.436 -19.000 0.000 NA   NA
 2282220 2282221 LMOf6854_1701 LMOf6854_1702     TRUE 0.861 84.000 0.023 0.094 Y NA
 2282221 2282222 LMOf6854_1702 LMOf6854_1703     TRUE 0.997 -3.000 0.669 0.003 Y NA
 2282224 2282225 LMOf6854_1705 LMOf6854_1706     FALSE 0.143 174.000 0.600 NA   NA
 2282225 2282226 LMOf6854_1706 LMOf6854_1707     FALSE 0.218 81.000 0.083 NA N NA
 2282226 2282227 LMOf6854_1707 LMOf6854_1708     TRUE 0.992 -16.000 0.911 0.008 Y NA
 2282227 2282228 LMOf6854_1708 LMOf6854_1709     FALSE 0.003 403.000 0.000 NA   NA
 2282228 2282229 LMOf6854_1709 LMOf6854_1710     TRUE 0.662 30.000 0.667 NA   NA
 2282229 2282230 LMOf6854_1710 LMOf6854_1711     FALSE 0.002 533.000 0.000 NA   NA
 2282230 2282231 LMOf6854_1711 LMOf6854_1712   tsf FALSE 0.008 265.000 0.000 NA   NA
 2282232 2282233 LMOf6854_1581 LMOf6854_1580 ldh ruvA FALSE 0.157 124.000 0.010 1.000   NA
 2282233 2282234 LMOf6854_1580 LMOf6854_1579 ruvA ruvB TRUE 0.994 16.000 0.549 0.001 Y NA
 2282234 2282235 LMOf6854_1579 LMOf6854_1578 ruvB queA TRUE 0.891 4.000 0.069 1.000 N NA
 2282235 2282236 LMOf6854_1578 LMOf6854_1577 queA tgt TRUE 0.932 87.000 0.360 0.001 Y NA
 2282236 2282237 LMOf6854_1577 LMOf6854_1576 tgt yajC TRUE 0.572 34.000 0.325 1.000 N NA
 2282237 2282238 LMOf6854_1576 LMOf6854_1575 yajC   FALSE 0.082 143.000 0.013 NA   NA
 2282238 2282239 LMOf6854_1575 LMOf6854_1574   secDF FALSE 0.232 101.000 0.185 NA   NA
 2282239 2282240 LMOf6854_1574 LMOf6854_1573 secDF   FALSE 0.187 96.000 0.048 NA   NA
 2282240 2282241 LMOf6854_1573 LMOf6854_1572   recJ TRUE 0.531 22.000 0.026 NA   NA
 2282241 2282242 LMOf6854_1572 LMOf6854_1571 recJ apt TRUE 0.798 -10.000 0.128 1.000 N NA
 2282242 2282243 LMOf6854_1571 LMOf6854_1570 apt relA FALSE 0.052 206.000 0.068 1.000 N NA
 2282243 2282244 LMOf6854_1570 LMOf6854_1569 relA dtd TRUE 0.821 16.000 0.177 1.000 N NA
 2282246 2282247 LMOf6854_1567 LMOf6854_1566 hisS aspS TRUE 0.995 3.000 0.161 0.037 Y NA
 2282248 2282249 LMOf6854_1565 LMOf6854_1564     FALSE 0.164 150.000 0.407 NA   NA
 2282249 2282250 LMOf6854_1564 LMOf6854_1563     TRUE 0.877 14.000 0.259 1.000 N NA
 2282250 2282251 LMOf6854_1563 LMOf6854_1562     FALSE 0.010 245.000 0.000 NA   NA
 2282253 2282254 LMOf6854_1282 LMOf6854_1283     FALSE 0.196 137.000 0.364 NA   NA
 2282257 2282258 LMOf6854_1286 LMOf6854_1287 dbpA   TRUE 0.524 25.000 0.086 NA   NA
 2282258 2282259 LMOf6854_1287 LMOf6854_1288     FALSE 0.085 168.000 0.106 NA   NA
 2282260 2282261 LMOf6854_1289 LMOf6854_1290     TRUE 0.885 -3.000 0.239 NA   NA
 2282263 2282264 LMOf6854_1292 LMOf6854_1293     TRUE 0.519 67.000 0.692 NA   NA
 2282264 2282265 LMOf6854_1293 LMOf6854_1294     FALSE 0.096 199.000 0.538 NA   NA
 2282265 2282266 LMOf6854_1294 LMOf6854_1295     TRUE 0.709 25.000 0.667 NA   NA
 2282268 2282269 LMOf6854_1297 LMOf6854_1298 treC-2 treB TRUE 0.977 19.000 0.650 1.000 Y NA
 2282273 2282274 LMOf6854_1302 LMOf6854_1303 proA proB TRUE 0.990 -16.000 0.281 0.002 Y NA
 2282274 2282275 LMOf6854_1303 LMOf6854_1304 proB   FALSE 0.099 136.000 0.015 NA   NA
 2282275 2282276 LMOf6854_1304 LMOf6854_1305     FALSE 0.335 81.000 0.306 NA   NA
 2282277 2282278 LMOf6854_1652 LMOf6854_1653 ccpA   FALSE 0.026 234.000 0.017 1.000 N NA
 2282278 2282279 LMOf6854_1653 LMOf6854_1654     FALSE 0.013 221.000 0.000 NA   NA
 2282279 2282280 LMOf6854_1654 LMOf6854_1655     TRUE 0.638 22.000 0.175 NA   NA
 2282282 2282283 LMOf6854_1657 LMOf6854_1658   murC FALSE 0.089 145.000 0.010 1.000 N NA
 2282283 2282284 LMOf6854_1658 LMOf6854_1659 murC   FALSE 0.069 295.000 0.017 0.004 N NA
 2282284 2282285 LMOf6854_1659 LMOf6854_1660     FALSE 0.025 310.000 0.143 1.000   NA
 2282285 2282286 LMOf6854_1660 LMOf6854_1661     TRUE 0.929 6.000 0.511 NA   NA
 2282286 2282287 LMOf6854_1661 LMOf6854_1662     TRUE 0.594 35.000 0.500 NA   NA
 2282287 2282288 LMOf6854_1662 LMOf6854_1663     FALSE 0.212 112.000 0.140 NA   NA
 2282288 2282289 LMOf6854_1663 LMOf6854_1664     TRUE 0.723 -25.000 0.224 NA   NA
 2282291 2282292 LMOf6854_1666 LMOf6854_1667     FALSE 0.191 110.000 0.074 NA   NA
 2282292 2282293 LMOf6854_1667 LMOf6854_1668   trmB FALSE 0.450 61.000 0.117 1.000   NA
 2282293 2282294 LMOf6854_1668 LMOf6854_1669 trmB   TRUE 0.913 7.000 0.154 1.000   NA
 2282294 2282295 LMOf6854_1669 LMOf6854_1670     FALSE 0.020 209.000 0.000 1.000 N NA
 2282295 2282296 LMOf6854_1670 LMOf6854_1671     TRUE 0.924 3.000 0.297 1.000 N NA
 2282296 2282297 LMOf6854_1671 LMOf6854_1672   dat FALSE 0.016 226.000 0.000 1.000 N NA
 2282298 2282299 LMOf6854_1998 LMOf6854_1999   cmk FALSE 0.091 173.000 0.047 1.000   NA
 2282299 2282300 LMOf6854_1999 LMOf6854_2000 cmk ansA TRUE 0.747 16.000 0.021 1.000 N NA
 2282300 2282301 LMOf6854_2000 LMOf6854_2001 ansA   FALSE 0.273 81.000 0.021 1.000   NA
 2282301 2282302 LMOf6854_2001 LMOf6854_2002     FALSE 0.010 320.000 0.000 1.000   NA
 2282302 2282303 LMOf6854_2002 LMOf6854_2003     TRUE 0.870 -3.000 0.143 NA   NA
 2282305 2282306 LMOf6854_2005 LMOf6854_2006     FALSE 0.003 441.000 0.000 NA   NA
 2282306 2282307 LMOf6854_2006 LMOf6854_2007   resE TRUE 0.761 16.000 0.157 NA N NA
 2282307 2282308 LMOf6854_2007 LMOf6854_2008 resE resD TRUE 0.815 101.000 0.511 1.000 Y NA
 2282308 2282309 LMOf6854_2008 LMOf6854_2009 resD rluB FALSE 0.065 183.000 0.046 1.000 N NA
 2282309 2282310 LMOf6854_2009 LMOf6854_2010 rluB scpB TRUE 0.889 3.000 0.224 NA N NA
 2282310 2282311 LMOf6854_2010 LMOf6854_2011 scpB scpA TRUE 0.923 -3.000 0.570 NA   NA
 2282311 2282312 LMOf6854_2011 LMOf6854_2012 scpA lysA TRUE 0.774 16.000 0.013 1.000   NA
 2282312 2282313 LMOf6854_2012 LMOf6854_2013 lysA   FALSE 0.039 205.000 0.014 1.000 N NA
 2282313 2282314 LMOf6854_2013 LMOf6854_2014   deoB TRUE 0.837 19.000 0.609 1.000 N NA
 2282314 2282315 LMOf6854_2014 LMOf6854_2015 deoB xerD FALSE 0.438 29.000 0.024 1.000 N NA
 2282315 2282316 LMOf6854_2015 LMOf6854_2016 xerD   FALSE 0.092 153.000 0.029 1.000 N NA
 2282318 2282319 LMOf6854_2619 LMOf6854_2620 pyrG rpoE FALSE 0.010 368.000 0.029 1.000 N NA
 2282319 2282320 LMOf6854_2620 LMOf6854_2621 rpoE argS FALSE 0.009 366.000 0.010 1.000 N NA
 2282320 2282321 LMOf6854_2621 LMOf6854_2622 argS   TRUE 0.854 -3.000 0.079 NA   NA
 2282321 2282322 LMOf6854_2622 LMOf6854_2623     FALSE 0.222 78.000 0.026 NA   NA
 2282324 2282325 LMOf6854_2625 LMOf6854_2626     TRUE 0.947 15.000 0.082 0.024   NA
 2282325 2282326 LMOf6854_2626 LMOf6854_2627     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 2282326 2282327 LMOf6854_2627 LMOf6854_2628     TRUE 0.817 22.000 1.000 NA   NA
 2282327 2282328 LMOf6854_2628 LMOf6854_2629     FALSE 0.138 155.000 0.333 NA   NA
 2282328 2282329 LMOf6854_2629 LMOf6854_2630     TRUE 0.591 -6.000 0.000 NA   NA
 2282329 2282330 LMOf6854_2630 LMOf6854_2631     FALSE 0.323 71.000 0.133 NA   NA
 2282330 2282331 LMOf6854_2631 LMOf6854_2632     FALSE 0.454 24.000 0.018 NA   NA
 2282331 2282332 LMOf6854_2632 LMOf6854_2633     TRUE 0.865 1.000 0.018 1.000 N NA
 2282332 2282333 LMOf6854_2633 LMOf6854_2634     TRUE 0.910 3.000 0.175 1.000 N NA
 2282333 2282334 LMOf6854_2634 LMOf6854_2635     FALSE 0.438 46.000 0.175 NA   NA
 2282334 2282335 LMOf6854_2635 LMOf6854_2636     FALSE 0.398 49.000 0.090 NA   NA
 2282336 2282337 LMOf6854_2752 LMOf6854_2753     FALSE 0.067 194.000 0.190 NA   NA
 2282337 2282338 LMOf6854_2753 LMOf6854_2754     FALSE 0.447 33.000 0.078 NA   NA
 2282338 2282339 LMOf6854_2754 LMOf6854_2755     TRUE 0.910 22.000 0.118 0.001   NA
 2282339 2282340 LMOf6854_2755 LMOf6854_2756     FALSE 0.329 90.000 0.222 1.000   NA
 2282341 2282342 LMOf6854_2757 LMOf6854_2758     FALSE 0.501 28.000 0.103 NA   NA
 2282342 2282343 LMOf6854_2758 LMOf6854_2759     FALSE 0.295 79.000 0.136 NA   NA
 2282343 2282344 LMOf6854_2759 LMOf6854_2760     TRUE 0.912 1.000 0.264 NA   NA
 2282344 2282345 LMOf6854_2760 LMOf6854_2761     TRUE 0.701 -40.000 0.245 NA   NA
 2282345 2282346 LMOf6854_2761 LMOf6854_2762     TRUE 0.950 13.000 0.895 1.000   NA
 2282346 2282347 LMOf6854_2762 LMOf6854_2763     TRUE 0.506 70.000 0.484 1.000   NA
 2282347 2282348 LMOf6854_2763 LMOf6854_2764     TRUE 0.868 27.000 0.595 0.029   NA
 2282348 2282349 LMOf6854_2764 LMOf6854_2765     TRUE 0.996 3.000 0.405 0.027 Y NA
 2282349 2282350 LMOf6854_2765 LMOf6854_2766     FALSE 0.255 193.000 0.471 0.027 N NA
 2282350 2282351 LMOf6854_2766 LMOf6854_2767   tuf FALSE 0.050 179.000 0.006 1.000 N NA
 2282351 2282352 LMOf6854_2767 LMOf6854_2768 tuf fus TRUE 0.913 109.000 0.400 0.002 Y NA
 2282353 2282354 LMOf6854_2705 LMOf6854_2706     FALSE 0.463 18.000 0.000 NA   NA
 2282356 2282357 LMOf6854_2708 LMOf6854_2709 morA   TRUE 0.728 22.000 0.250 1.000   NA
 2282357 2282358 LMOf6854_2709 LMOf6854_2710     FALSE 0.257 122.000 0.438 NA   NA
 2282358 2282359 LMOf6854_2710 LMOf6854_2711     FALSE 0.002 1943.000 0.000 NA   NA
 11426766 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4143.000 0.000 NA   NA
 11569129 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4143.000 0.000 NA   NA
 11711521 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4143.000 0.000 NA   NA
 11426767 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4177.000 0.000 NA   NA
 11569130 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4177.000 0.000 NA   NA
 11711522 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4177.000 0.000 NA   NA
 11426768 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4206.000 0.000 NA   NA
 11569131 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4206.000 0.000 NA   NA
 11711523 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4206.000 0.000 NA   NA
 11426769 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4242.000 0.000 NA   NA
 11569132 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4242.000 0.000 NA   NA
 11711524 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4242.000 0.000 NA   NA
 11426770 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4272.000 0.000 NA   NA
 11569133 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4272.000 0.000 NA   NA
 11711525 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4272.000 0.000 NA   NA
 11426771 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4308.000 0.000 NA   NA
 11569134 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4308.000 0.000 NA   NA
 11711526 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4308.000 0.000 NA   NA
 11426772 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4338.000 0.000 NA   NA
 11569135 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4338.000 0.000 NA   NA
 11711527 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4338.000 0.000 NA   NA
 11426773 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4374.000 0.000 NA   NA
 11569136 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4374.000 0.000 NA   NA
 11711528 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4374.000 0.000 NA   NA
 11426774 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4404.000 0.000 NA   NA
 11569137 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4404.000 0.000 NA   NA
 11711529 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4404.000 0.000 NA   NA
 11426775 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11569138 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11711530 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11426776 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4470.000 0.000 NA   NA
 11569139 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4470.000 0.000 NA   NA
 11711531 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4470.000 0.000 NA   NA
 11426777 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4506.000 0.000 NA   NA
 11569140 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4506.000 0.000 NA   NA
 11711532 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4506.000 0.000 NA   NA
 11426778 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4536.000 0.000 NA   NA
 11569141 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4536.000 0.000 NA   NA
 11711533 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4536.000 0.000 NA   NA
 11426779 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4572.000 0.000 NA   NA
 11569142 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4572.000 0.000 NA   NA
 11711534 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4572.000 0.000 NA   NA
 11426780 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4602.000 0.000 NA   NA
 11569143 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4602.000 0.000 NA   NA
 11711535 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4602.000 0.000 NA   NA
 11426781 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4638.000 0.000 NA   NA
 11569144 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4638.000 0.000 NA   NA
 11711536 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4638.000 0.000 NA   NA
 11426782 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4668.000 0.000 NA   NA
 11569145 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4668.000 0.000 NA   NA
 11711537 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4668.000 0.000 NA   NA
 11426783 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4704.000 0.000 NA   NA
 11569146 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4704.000 0.000 NA   NA
 11711538 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4704.000 0.000 NA   NA
 11426784 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4734.000 0.000 NA   NA
 11569147 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4734.000 0.000 NA   NA
 11711539 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4734.000 0.000 NA   NA
 11426785 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4770.000 0.000 NA   NA
 11569148 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4770.000 0.000 NA   NA
 11711540 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4770.000 0.000 NA   NA
 11426786 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4800.000 0.000 NA   NA
 11569149 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4800.000 0.000 NA   NA
 11711541 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4800.000 0.000 NA   NA
 11426787 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4836.000 0.000 NA   NA
 11569150 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4836.000 0.000 NA   NA
 11711542 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4836.000 0.000 NA   NA
 11426788 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4866.000 0.000 NA   NA
 11569151 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4866.000 0.000 NA   NA
 11711543 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4866.000 0.000 NA   NA
 11426789 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4902.000 0.000 NA   NA
 11569152 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4902.000 0.000 NA   NA
 11711544 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4902.000 0.000 NA   NA
 11426790 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4932.000 0.000 NA   NA
 11569153 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4932.000 0.000 NA   NA
 11711545 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4932.000 0.000 NA   NA
 11426791 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4968.000 0.000 NA   NA
 11569154 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4968.000 0.000 NA   NA
 11711546 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4968.000 0.000 NA   NA
 11426792 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4998.000 0.000 NA   NA
 11569155 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4998.000 0.000 NA   NA
 11711547 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 4998.000 0.000 NA   NA
 11426793 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5034.000 0.000 NA   NA
 11569156 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5034.000 0.000 NA   NA
 11711548 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5034.000 0.000 NA   NA
 11426794 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5064.000 0.000 NA   NA
 11569157 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5064.000 0.000 NA   NA
 11711549 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5064.000 0.000 NA   NA
 11426795 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5100.000 0.000 NA   NA
 11569158 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5100.000 0.000 NA   NA
 11711550 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5100.000 0.000 NA   NA
 11426796 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5130.000 0.000 NA   NA
 11569159 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5130.000 0.000 NA   NA
 11711551 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5130.000 0.000 NA   NA
 11426797 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5166.000 0.000 NA   NA
 11569160 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5166.000 0.000 NA   NA
 11711552 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5166.000 0.000 NA   NA
 11426798 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5196.000 0.000 NA   NA
 11569161 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5196.000 0.000 NA   NA
 11711553 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5196.000 0.000 NA   NA
 11426799 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5232.000 0.000 NA   NA
 11569162 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5232.000 0.000 NA   NA
 11711554 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5232.000 0.000 NA   NA
 11426800 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5262.000 0.000 NA   NA
 11569163 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5262.000 0.000 NA   NA
 11711555 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5262.000 0.000 NA   NA
 11426801 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5298.000 0.000 NA   NA
 11569164 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5298.000 0.000 NA   NA
 11711556 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5298.000 0.000 NA   NA
 11426802 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5328.000 0.000 NA   NA
 11569165 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5328.000 0.000 NA   NA
 11711557 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5328.000 0.000 NA   NA
 11426803 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5364.000 0.000 NA   NA
 11569166 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5364.000 0.000 NA   NA
 11711558 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5364.000 0.000 NA   NA
 11426804 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11569167 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11711559 2282354   LMOf6854_2706     FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 2282359 2282360 LMOf6854_2711 LMOf6854_2712   cas2 TRUE 0.805 -10.000 0.253 NA   NA
 2282360 2282361 LMOf6854_2712 LMOf6854_2713 cas2 cas1 TRUE 0.942 -3.000 0.876 NA   NA
 2282361 2282362 LMOf6854_2713 LMOf6854_2714 cas1   TRUE 0.938 1.000 0.546 NA   NA
 2282362 2282363 LMOf6854_2714 LMOf6854_2715     FALSE 0.002 510.000 0.000 NA   NA
 2282363 2282364 LMOf6854_2715 LMOf6854_2716   rpsI FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 2282364 2282365 LMOf6854_2716 LMOf6854_2717 rpsI rplM TRUE 0.918 22.000 0.601 0.013   NA
 2282367 2282368 LMOf6854_2333 LMOf6854_2332 yhzC addB FALSE 0.104 150.000 0.076 NA   NA
 2282368 2282369 LMOf6854_2332 LMOf6854_2331 addB addA TRUE 0.997 2.000 0.408 0.002 Y NA
 2282369 2282370 LMOf6854_2331 LMOf6854_2330 addA   TRUE 0.897 1.000 0.075 1.000 N NA
 2282370 2282371 LMOf6854_2330 LMOf6854_2329     TRUE 0.666 21.000 0.169 NA   NA
 2282371 2282372 LMOf6854_2329 LMOf6854_2328     FALSE 0.305 84.000 0.263 NA   NA
 2282374 2282375 LMOf6854_2326 LMOf6854_2325     FALSE 0.482 65.000 0.303 1.000   NA
 2282375 2282376 LMOf6854_2325 LMOf6854_2324     FALSE 0.379 80.000 0.214 1.000   NA
 2282378 2282379 LMOf6854_2322 LMOf6854_2321     FALSE 0.003 505.000 0.000 NA   NA
 2282380 2282381 LMOf6854_2320 LMOf6854_2319     FALSE 0.396 110.000 0.846 NA   NA
 2282382 2282383 LMOf6854_2718 LMOf6854_2719 truA   TRUE 0.897 6.000 0.049 1.000   NA
 2282383 2282384 LMOf6854_2719 LMOf6854_2720     TRUE 0.989 3.000 0.044 1.000 Y NA
 2282384 2282385 LMOf6854_2720 LMOf6854_2721     TRUE 0.989 -24.000 0.713 0.020 Y NA
 2282386 2282387 LMOf6854_2722 LMOf6854_2723     FALSE 0.271 119.000 0.238 1.000   NA
 2282388 2282389 LMOf6854_2724 LMOf6854_2725   rplQ FALSE 0.016 208.000 0.000 NA   NA
 2282389 2282390 LMOf6854_2725 LMOf6854_2726 rplQ rpoA TRUE 0.897 17.000 0.873 1.000 N NA
 2282390 2282391 LMOf6854_2726 LMOf6854_2727 rpoA rpsK FALSE 0.283 110.000 0.308 1.000 N NA
 2282391 2282392 LMOf6854_2727 LMOf6854_2728 rpsK rpsM TRUE 0.984 23.000 0.810 0.013 Y NA
 2282392 2282393 LMOf6854_2728 LMOf6854_2729 rpsM rpmJ TRUE 0.918 19.000 0.194 0.013   NA
 2282393 2282394 LMOf6854_2729 LMOf6854_2730 rpmJ infA FALSE 0.309 104.000 0.257 1.000   NA
 2282394 2282395 LMOf6854_2730 LMOf6854_2731 infA   FALSE 0.010 387.000 0.059 1.000 N NA
 2282395 2282396 LMOf6854_2731 LMOf6854_2732   secY FALSE 0.448 60.000 0.241 1.000 N NA
 2282396 2282397 LMOf6854_2732 LMOf6854_2733 secY rplO TRUE 0.952 0.000 0.730 1.000 N NA
 2282397 2282398 LMOf6854_2733 LMOf6854_2734 rplO rpmD TRUE 0.971 56.000 0.653 0.001 Y NA
 2282398 2282399 LMOf6854_2734 LMOf6854_2735 rpmD rpsE TRUE 0.992 17.000 0.789 0.016 Y NA
 2282399 2282400 LMOf6854_2735 LMOf6854_2736 rpsE rplR TRUE 0.986 22.000 0.814 0.016 Y NA
 2282400 2282401 LMOf6854_2736 LMOf6854_2737 rplR rplF TRUE 0.990 19.000 0.815 0.013 Y NA
 2282401 2282402 LMOf6854_2737 LMOf6854_2738 rplF rpsH TRUE 0.976 31.000 0.808 0.013 Y NA
 2282402 2282403 LMOf6854_2738 LMOf6854_2739 rpsH rpsN-2 TRUE 0.970 31.000 0.473 0.013 Y NA
 2282403 2282404 LMOf6854_2739 LMOf6854_2740 rpsN-2 rplE TRUE 0.970 31.000 0.496 0.013 Y NA
 2282404 2282405 LMOf6854_2740 LMOf6854_2741 rplE rplX TRUE 0.964 27.000 0.057 0.013 Y NA
 2282405 2282406 LMOf6854_2741 LMOf6854_2742 rplX rplN TRUE 0.952 38.000 0.071 0.016 Y NA
 2282406 2282407 LMOf6854_2742 LMOf6854_2743 rplN rpsQ TRUE 0.943 80.000 0.791 0.016 Y NA
 2282407 2282408 LMOf6854_2743 LMOf6854_2744 rpsQ rpmC TRUE 0.978 28.000 0.828 0.013 Y NA
 2282408 2282409 LMOf6854_2744 LMOf6854_2745 rpmC rplP TRUE 0.991 -19.000 0.802 0.013 Y NA
 2282409 2282410 LMOf6854_2745 LMOf6854_2746 rplP rpsC TRUE 0.997 3.000 0.828 0.016 Y NA
 2282412 2282413 LMOf6854_1560 LMOf6854_1559     FALSE 0.005 380.000 0.000 1.000 N NA
 2282413 2282414 LMOf6854_1559 LMOf6854_1558   trmU TRUE 0.710 19.000 0.072 1.000 N NA
 2282414 2282415 LMOf6854_1558 LMOf6854_1557 trmU   FALSE 0.112 118.000 0.003 NA   NA
 2282415 2282416 LMOf6854_1557 LMOf6854_1556     TRUE 0.832 11.000 0.035 NA   NA
 2282416 2282417 LMOf6854_1556 LMOf6854_1555     TRUE 0.554 28.000 0.174 1.000 N NA
 2282418 2282419 LMOf6854_1554 LMOf6854_1553     TRUE 0.992 6.000 0.586 1.000 Y NA
 2282420 2282421 LMOf6854_1552 LMOf6854_1551     TRUE 0.992 9.000 0.565 1.000 Y NA
 2282421 2282422 LMOf6854_1551 LMOf6854_1550   alaS FALSE 0.029 307.000 0.000 0.089 N NA
 2282422 2282423 LMOf6854_1550 LMOf6854_1549 alaS   FALSE 0.234 92.000 0.110 NA   NA
 2282423 2282424 LMOf6854_1549 LMOf6854_1548     TRUE 0.920 -3.000 0.537 NA   NA
 2282425 2282426 LMOf6854_0360 LMOf6854_0361     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282426 2282427 LMOf6854_0361 LMOf6854_0362     FALSE 0.078 106.000 0.000 NA   NA
 2282427 2282428 LMOf6854_0362 LMOf6854_0363     TRUE 0.822 4.000 0.000 1.000   NA
 2282431 2282432 LMOf6854_0366 LMOf6854_0367     FALSE 0.003 429.000 0.000 NA   NA
 2282432 2282433 LMOf6854_0367 LMOf6854_0368     FALSE 0.426 24.000 0.000 1.000   NA
 2282433 2282434 LMOf6854_0368 LMOf6854_0369     FALSE 0.012 224.000 0.000 NA   NA
 2282434 2282435 LMOf6854_0369 LMOf6854_0370     FALSE 0.016 209.000 0.000 NA   NA
 2282435 2282436 LMOf6854_0370 LMOf6854_0371     TRUE 0.944 1.000 0.636 NA   NA
 2282438 2282439 LMOf6854_2973 LMOf6854_2972   rpmH FALSE 0.052 168.000 0.011 NA   NA
 2282439 2282440 LMOf6854_2972 LMOf6854_2971 rpmH rnpA TRUE 0.763 90.000 0.787 0.001   NA
 2282440 2282441 LMOf6854_2971 LMOf6854_2970 rnpA   FALSE 0.425 41.000 0.052 1.000 N NA
 2282441 2282442 LMOf6854_2970 LMOf6854_2969     TRUE 0.898 -3.000 0.106 1.000   NA
 2282442 2282443 LMOf6854_2969 LMOf6854_2968     FALSE 0.196 85.000 0.029 NA   NA
 2282445 2282446 LMOf6854_2966 LMOf6854_2965   rhaB TRUE 0.966 19.000 0.158 1.000 Y NA
 2282446 2282447 LMOf6854_2965 LMOf6854_2964 rhaB rhaA TRUE 0.988 13.000 0.387 1.000 Y NA
 2282447 2282448 LMOf6854_2964 LMOf6854_2963 rhaA rhaD TRUE 0.987 13.000 0.247 1.000 Y NA
 2282448 2282449 LMOf6854_2963 LMOf6854_2962 rhaD   TRUE 0.890 13.000 0.112 1.000   NA
 2282451 2282452 LMOf6854_2960 LMOf6854_2959     FALSE 0.052 136.000 0.000 NA   NA
 2282454 2282455 LMOf6854_1337 LMOf6854_1336 hfq miaA FALSE 0.242 123.000 0.192 1.000   NA
 2282455 2282456 LMOf6854_1336 LMOf6854_1335 miaA glpD FALSE 0.127 126.000 0.011 1.000 N NA
 2282456 2282457 LMOf6854_1335 LMOf6854_1334 glpD   FALSE 0.223 233.000 0.000 1.000 Y NA
 2282459 2282460 LMOf6854_1332 LMOf6854_1331     FALSE 0.041 332.000 0.000 0.012   NA
 2282460 2282461 LMOf6854_1331 LMOf6854_1330   luxS FALSE 0.009 330.000 0.000 1.000   NA
 2282461 2282462 LMOf6854_1330 LMOf6854_1329 luxS parC FALSE 0.227 83.000 0.026 1.000 N NA
 2282462 2282463 LMOf6854_1329 LMOf6854_1328 parC parE TRUE 0.997 -3.000 0.552 0.001 Y NA
 2282463 2282464 LMOf6854_1328 LMOf6854_1327 parE   FALSE 0.052 181.000 0.030 NA   NA
 2282465 2282466 LMOf6854_0238 LMOf6854_0237 lysS   TRUE 0.717 115.000 0.032 1.000 Y NA
 2282466 2282467 LMOf6854_0237 LMOf6854_0236   folK FALSE 0.253 77.000 0.025 1.000 N NA
 2282467 2282468 LMOf6854_0236 LMOf6854_0235 folK folB TRUE 0.980 -7.000 0.142 1.000 Y NA
 2282468 2282469 LMOf6854_0235 LMOf6854_0234 folB folP TRUE 0.984 14.000 0.176 1.000 Y NA
 2282469 2282470 LMOf6854_0234 LMOf6854_0233 folP   FALSE 0.093 154.000 0.064 NA   NA
 2282470 2282471 LMOf6854_0233 LMOf6854_0232   cysK FALSE 0.002 599.000 0.000 NA   NA
 2282471 2282472 LMOf6854_0232 LMOf6854_0231 cysK   FALSE 0.189 116.000 0.053 1.000 N NA
 2282472 2282473 LMOf6854_0231 LMOf6854_0230     TRUE 0.787 16.000 0.060 1.000 N NA
 2282473 2282474 LMOf6854_0230 LMOf6854_0229   ftsH FALSE 0.170 116.000 0.029 1.000 N NA
 2282474 2282475 LMOf6854_0229 LMOf6854_0228 ftsH   FALSE 0.034 346.000 0.051 0.088 N NA
 2282475 2282476 LMOf6854_0228 LMOf6854_0227     FALSE 0.184 107.000 0.031 1.000 N NA
 2282478 2282479 LMOf6854_2112 LMOf6854_2111 drrC   FALSE 0.103 82.000 0.000 NA   NA
 2282480 2282481 LMOf6854_2110 LMOf6854_2109   panE FALSE 0.003 414.000 0.000 NA   NA
 2282481 2282482 LMOf6854_2109 LMOf6854_2108 panE   TRUE 0.815 -10.000 0.091 1.000   NA
 2282484 2282485 LMOf6854_2106 LMOf6854_2105   mraZ FALSE 0.015 211.000 0.000 NA   NA
 2282485 2282486 LMOf6854_2105 LMOf6854_2104 mraZ mraW TRUE 0.921 13.000 0.635 NA   NA
 2282486 2282487 LMOf6854_2104 LMOf6854_2103 mraW   TRUE 0.766 17.000 0.077 1.000 N NA
 2282487 2282488 LMOf6854_2103 LMOf6854_2102     TRUE 0.907 -3.000 0.316 1.000 N NA
 2282488 2282489 LMOf6854_2102 LMOf6854_2101   murE TRUE 0.508 175.000 0.190 1.000 Y NA
 2282490 2282491 LMOf6854_0014 LMOf6854_0013 qoxA   FALSE 0.006 345.000 0.000 1.000 N NA
 2282491 2282492 LMOf6854_0013 LMOf6854_0012   mvaD TRUE 0.991 -10.000 0.312 0.004 Y NA
 2282492 2282493 LMOf6854_0012 LMOf6854_0011 mvaD   TRUE 0.985 -43.000 0.281 0.004 Y NA
 2282493 2282494 LMOf6854_0011 LMOf6854_0010     TRUE 0.543 22.000 0.032 NA   NA
 2282494 2282495 LMOf6854_0010 LMOf6854_0009   speG TRUE 0.869 4.000 0.055 NA   NA
 2282495 2282496 LMOf6854_0009 LMOf6854_0008 speG cls-1 TRUE 0.915 16.000 0.075 0.045 N NA
 2282496 2282497 LMOf6854_0008 LMOf6854_0007 cls-1 gyrA FALSE 0.111 135.000 0.010 1.000 N NA
 2282497 2282498 LMOf6854_0007 LMOf6854_0006 gyrA gyrB TRUE 0.921 95.000 0.306 0.001 Y NA
 2282498 2282499 LMOf6854_0006 LMOf6854_0005 gyrB recF TRUE 0.958 49.000 0.249 0.004 Y NA
 2282499 2282500 LMOf6854_0005 LMOf6854_0004 recF   TRUE 0.925 4.000 0.209 1.000   NA
 2282500 2282501 LMOf6854_0004 LMOf6854_0003     FALSE 0.202 114.000 0.024 1.000   NA
 2282501 2282502 LMOf6854_0003 LMOf6854_0002   dnaN FALSE 0.140 118.000 0.009 1.000 N NA
 2282503 2282504 LMOf6854_2661 LMOf6854_2662     TRUE 0.709 5.000 0.000 NA   NA
 2282504 2282505 LMOf6854_2662 LMOf6854_2663     FALSE 0.216 33.000 0.000 NA   NA
 2282505 2282506 LMOf6854_2663 LMOf6854_2664     FALSE 0.179 49.000 0.000 NA   NA
 2282506 2282507 LMOf6854_2664 LMOf6854_2665     TRUE 0.512 -10.000 0.000 NA   NA
 2282507 2282508 LMOf6854_2665 LMOf6854_2666     FALSE 0.397 -28.000 0.000 NA   NA
 2282508 2282509 LMOf6854_2666 LMOf6854_2667     TRUE 0.917 -3.000 0.500 NA   NA
 2282509 2282510 LMOf6854_2667 LMOf6854_2668     FALSE 0.004 355.000 0.000 NA   NA
 2282510 2282511 LMOf6854_2668 LMOf6854_2669     TRUE 0.953 1.000 0.833 NA   NA
 2282511 2282512 LMOf6854_2669 LMOf6854_2670     TRUE 0.886 14.000 0.400 NA   NA
 2282512 2282513 LMOf6854_2670 LMOf6854_2671     TRUE 0.683 23.000 0.400 NA   NA
 2282513 2282514 LMOf6854_2671 LMOf6854_2672     FALSE 0.082 96.000 0.000 NA   NA
 2282514 2282515 LMOf6854_2672 LMOf6854_2673     TRUE 0.709 5.000 0.000 NA   NA
 2282515 2282516 LMOf6854_2673 LMOf6854_2674     TRUE 0.879 15.000 0.455 NA   NA
 2282516 2282517 LMOf6854_2674 LMOf6854_2675     TRUE 0.762 -70.000 0.545 NA   NA
 2282517 2282518 LMOf6854_2675 LMOf6854_2676     TRUE 0.658 40.000 0.833 NA   NA
 2282518 2282519 LMOf6854_2676 LMOf6854_2677     FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 2282519 2282520 LMOf6854_2677 LMOf6854_2678     FALSE 0.251 27.000 0.000 NA   NA
 2282520 2282521 LMOf6854_2678 LMOf6854_2679     FALSE 0.029 166.000 0.000 NA   NA
 2282521 2282522 LMOf6854_2679 LMOf6854_2680     FALSE 0.004 353.000 0.000 NA   NA
 2282524 2282525 LMOf6854_0830 LMOf6854_0831     FALSE 0.105 193.000 0.421 1.000 N NA
 2282525 2282526 LMOf6854_0831 LMOf6854_0832     FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 2282526 2282527 LMOf6854_0832 LMOf6854_0833     FALSE 0.079 178.000 0.171 NA   NA
 2282528 2282529 LMOf6854_0834 LMOf6854_0835     TRUE 0.507 27.000 0.018 1.000   NA
 2282530 2282531 LMOf6854_0836 LMOf6854_0837     FALSE 0.297 106.000 0.429 NA   NA
 2282532 2282533 LMOf6854_0838 LMOf6854_0839     FALSE 0.174 115.000 0.059 NA   NA
 2282533 2282534 LMOf6854_0839 LMOf6854_0840     FALSE 0.262 84.000 0.026 1.000   NA
 2282535 2282536 LMOf6854_2415 LMOf6854_2416     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 2282536 2282537 LMOf6854_2416 LMOf6854_2417     FALSE 0.481 60.000 0.417 NA   NA
 2282537 2282538 LMOf6854_2417 LMOf6854_2418     FALSE 0.147 190.000 0.833 NA   NA
 2282538 2282539 LMOf6854_2418 LMOf6854_2419     TRUE 0.907 17.000 0.846 1.000   NA
 2282539 2282540 LMOf6854_2419 LMOf6854_2420     TRUE 0.683 44.000 0.769 1.000   NA
 2282540 2282541 LMOf6854_2420 LMOf6854_2421     FALSE 0.306 120.000 0.615 NA   NA
 2282541 2282542 LMOf6854_2421 LMOf6854_2422     TRUE 0.522 33.000 0.257 NA   NA
 2282543 2282544 LMOf6854_2423 LMOf6854_2424   gadB TRUE 0.991 13.000 0.700 1.000 Y NA
 2282548 2282549 LMOf6854_2270 LMOf6854_2271 gpm   FALSE 0.182 91.000 0.013 1.000 N NA
 2282549 2282550 LMOf6854_2271 LMOf6854_2272     FALSE 0.072 149.000 0.011 NA   NA
 2282550 2282551 LMOf6854_2272 LMOf6854_2273     FALSE 0.266 112.000 0.344 NA   NA
 2282551 2282552 LMOf6854_2273 LMOf6854_2274     TRUE 0.684 64.000 0.256 0.045   NA
 2282552 2282553 LMOf6854_2274 LMOf6854_2275     FALSE 0.266 121.000 0.256 1.000   NA
 2282553 2282554 LMOf6854_2275 LMOf6854_2276   hemH FALSE 0.099 157.000 0.020 1.000   NA
 2282554 2282555 LMOf6854_2276 LMOf6854_2277 hemH hemE TRUE 0.987 -3.000 0.131 1.000 Y NA
 2282557 2282558 LMOf6854_2279 LMOf6854_2280     TRUE 0.641 -16.000 0.062 NA N NA
 2282559 2282560 LMOf6854_2281 LMOf6854_2282     FALSE 0.496 30.000 0.137 NA   NA
 2282561 2282562 LMOf6854_2947 LMOf6854_2948 trx-2   FALSE 0.110 123.000 0.000 1.000   NA
 2282562 2282563 LMOf6854_2948 LMOf6854_2949   garK-2 TRUE 0.911 -3.000 0.231 1.000   NA
 2282563 2282564 LMOf6854_2949 LMOf6854_2950 garK-2   TRUE 0.989 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 2282564 2282565 LMOf6854_2950 LMOf6854_2951     TRUE 0.917 -3.000 0.292 1.000   NA
 2282565 2282566 LMOf6854_2951 LMOf6854_2952   ycjR FALSE 0.465 58.000 0.347 NA   NA
 2282566 2282567 LMOf6854_2952 LMOf6854_2953 ycjR   TRUE 0.857 13.000 0.261 NA N NA
 2282567 2282568 LMOf6854_2953 LMOf6854_2954     TRUE 0.754 19.000 0.205 1.000 N NA
 2282568 2282569 LMOf6854_2954 LMOf6854_2955     TRUE 0.991 -13.000 0.805 0.030 Y NA
 2282569 2282570 LMOf6854_2955 LMOf6854_2956     TRUE 0.938 75.000 0.620 0.030 Y NA
 2282570 2282571 LMOf6854_2956 LMOf6854_2957     TRUE 0.989 -3.000 0.360 1.000 Y NA
 2282572 2282573 LMOf6854_1269 LMOf6854_1270     FALSE 0.269 93.000 0.066 1.000   NA
 2282573 2282574 LMOf6854_1270 LMOf6854_1271   mutS-1 TRUE 0.944 23.000 0.114 1.000 Y NA
 2282574 2282575 LMOf6854_1271 LMOf6854_1272 mutS-1 trx-1 FALSE 0.244 81.000 0.031 1.000 N NA
 2282575 2282576 LMOf6854_1272 LMOf6854_1273 trx-1 uvrC FALSE 0.117 76.000 0.000 NA   NA
 2282576 2282577 LMOf6854_1273 LMOf6854_1275 uvrC   FALSE 0.022 189.000 0.000 NA   NA
 2282579 2282580 LMOf6854_1277 LMOf6854_1278 murI rph TRUE 0.846 13.000 0.048 1.000 N NA
 2282580 2282581 LMOf6854_1278 LMOf6854_1279 rph   TRUE 0.919 4.000 0.262 1.000 N NA
 2282581 2282582 LMOf6854_1279 LMOf6854_1280     FALSE 0.431 37.000 0.085 NA   NA
 2282583 2282584 LMOf6854_1859 LMOf6854_1860   ffh FALSE 0.073 144.000 0.006 NA   NA
 2282584 2282585 LMOf6854_1860 LMOf6854_1861 ffh   TRUE 0.894 13.000 0.151 1.000   NA
 2282585 2282586 LMOf6854_1861 LMOf6854_1862   ftsY FALSE 0.247 113.000 0.081 1.000   NA
 2282586 2282587 LMOf6854_1862 LMOf6854_1863 ftsY smC TRUE 0.951 15.000 0.165 0.008 N NA
 2282587 2282588 LMOf6854_1863 LMOf6854_1864 smC   TRUE 0.624 23.000 0.120 1.000 N NA
 2282588 2282589 LMOf6854_1864 LMOf6854_1865   acpP FALSE 0.062 194.000 0.068 1.000 N NA
 2282589 2282590 LMOf6854_1865 LMOf6854_1866 acpP fabG TRUE 0.890 107.000 0.100 0.003 Y NA
 2282592 2282593 LMOf6854_1868 LMOf6854_1869 fabD plsX TRUE 0.992 -7.000 0.106 0.003 Y NA
 2282593 2282594 LMOf6854_1869 LMOf6854_1870 plsX   TRUE 0.513 21.000 0.035 NA N NA
 2282596 2282597 LMOf6854_1749 LMOf6854_1748     TRUE 0.840 2.000 0.015 NA   NA
 2282597 2282598 LMOf6854_1748 LMOf6854_1747     TRUE 0.834 3.000 0.013 NA   NA
 2282600 2282601 LMOf6854_1745 LMOf6854_1744 mutY   TRUE 0.849 4.000 0.010 1.000 N NA
 2282601 2282602 LMOf6854_1744 LMOf6854_1743     FALSE 0.080 155.000 0.088 NA N NA
 2282603 2282604 LMOf6854_1742 LMOf6854_1741   gsaB FALSE 0.207 107.000 0.102 NA   NA
 2282606 2282607 LMOf6854_1306 LMOf6854_1307   tig FALSE 0.134 115.000 0.014 NA   NA
 2282607 2282608 LMOf6854_1307 LMOf6854_1308 tig   FALSE 0.154 87.000 0.006 NA   NA
 2282608 2282609 LMOf6854_1308 LMOf6854_1309   clpX TRUE 0.803 7.000 0.007 NA   NA
 2282609 2282610 LMOf6854_1309 LMOf6854_1310 clpX   FALSE 0.136 119.000 0.009 1.000 N NA
 2282610 2282611 LMOf6854_1310 LMOf6854_1311     TRUE 0.977 35.000 0.643 0.001 Y NA
 2282611 2282612 LMOf6854_1311 LMOf6854_1312     TRUE 0.938 102.000 0.769 0.001 Y NA
 2282612 2282613 LMOf6854_1312 LMOf6854_1313     TRUE 0.950 10.000 0.023 0.060   NA
 2282613 2282614 LMOf6854_1313 LMOf6854_1314   rnhB TRUE 0.902 -3.000 0.148 1.000   NA
 2282614 2282615 LMOf6854_1314 LMOf6854_1315 rnhB   TRUE 0.655 134.000 0.037 1.000 Y NA
 2282615 2282616 LMOf6854_1315 LMOf6854_1316   topA FALSE 0.250 271.000 0.238 1.000 Y NA
 2282617 2282618 LMOf6854_0240 LMOf6854_0241 ctsR   TRUE 0.925 13.000 0.681 NA   NA
 2282618 2282619 LMOf6854_0241 LMOf6854_0242     TRUE 0.953 -3.000 0.848 1.000   NA
 2282619 2282620 LMOf6854_0242 LMOf6854_0243     TRUE 0.630 29.000 0.425 1.000 N NA
 2282620 2282621 LMOf6854_0243 LMOf6854_0244   radA TRUE 0.731 146.000 0.062 0.087 Y NA
 2282621 2282622 LMOf6854_0244 LMOf6854_0245 radA   FALSE 0.132 134.000 0.056 NA   NA
 2282622 2282623 LMOf6854_0245 LMOf6854_0246   ispD TRUE 0.672 20.000 0.108 NA   NA
 2282623 2282624 LMOf6854_0246 LMOf6854_0247 ispD ispF TRUE 0.984 -7.000 0.419 1.000 Y NA
 2282624 2282625 LMOf6854_0247 LMOf6854_0248 ispF gltX TRUE 0.751 19.000 0.076 1.000   NA
 2282626 2282627 LMOf6854_1979 LMOf6854_1980     FALSE 0.267 88.000 0.200 NA   NA
 2282627 2282628 LMOf6854_1980 LMOf6854_1981     FALSE 0.457 35.000 0.104 NA   NA
 2282628 2282629 LMOf6854_1981 LMOf6854_1982   aroA FALSE 0.115 130.000 0.005 1.000 N NA
 2282629 2282630 LMOf6854_1982 LMOf6854_1983 aroA tyrA TRUE 0.983 14.000 0.069 1.000 Y NA
 2282630 2282631 LMOf6854_1983 LMOf6854_1984 tyrA hisC TRUE 0.950 22.000 0.098 1.000 Y NA
 2282631 2282632 LMOf6854_1984 LMOf6854_1985 hisC aroH TRUE 0.989 0.000 0.078 1.000 Y NA
 2282632 2282633 LMOf6854_1985 LMOf6854_1986 aroH aroB TRUE 0.985 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 2282633 2282634 LMOf6854_1986 LMOf6854_1987 aroB aroC TRUE 0.997 3.000 0.110 0.001 Y NA
 2282634 2282635 LMOf6854_1987 LMOf6854_1988 aroC ndk FALSE 0.035 204.000 0.002 1.000 N NA
 2282635 2282636 LMOf6854_1988 LMOf6854_1989 ndk   TRUE 0.736 19.000 0.054 1.000   NA
 2282637 2282638 LMOf6854_1432 LMOf6854_1433     TRUE 0.894 -7.000 0.438 1.000   NA
 2282638 2282639 LMOf6854_1433 LMOf6854_1434     TRUE 0.977 -3.000 0.720 0.030   NA
 2282639 2282640 LMOf6854_1434 LMOf6854_1435     FALSE 0.011 459.000 0.077 1.000   NA
 2282640 2282641 LMOf6854_1435 LMOf6854_1436     TRUE 0.960 -19.000 0.872 0.003   NA
 2282641 2282642 LMOf6854_1436 LMOf6854_1437     FALSE 0.374 92.000 0.397 1.000   NA
 2282642 2282643 LMOf6854_1437 LMOf6854_1438     TRUE 0.517 51.000 0.213 1.000   NA
 2282643 2282644 LMOf6854_1438 LMOf6854_1439   pgsA FALSE 0.283 90.000 0.077 1.000   NA
 2282644 2282645 LMOf6854_1439 LMOf6854_1440 pgsA   FALSE 0.409 69.000 0.151 1.000   NA
 2282646 2282647 LMOf6854_2523 LMOf6854_2522     FALSE 0.316 78.000 0.103 1.000 N NA
 2282647 2282648 LMOf6854_2522 LMOf6854_2521     FALSE 0.089 442.000 0.050 1.000 Y NA
 2282648 2282649 LMOf6854_2521 LMOf6854_2520   gap FALSE 0.270 32.000 0.000 1.000 N NA
 2282649 2282650 LMOf6854_2520 LMOf6854_2519 gap pgk TRUE 0.786 135.000 0.000 0.004 Y NA
 2282650 2282651 LMOf6854_2519 LMOf6854_2518 pgk tpiA-2 TRUE 0.897 46.000 0.141 1.000 Y NA
 2282651 2282652 LMOf6854_2518 LMOf6854_2517 tpiA-2 gpmA TRUE 0.990 2.000 0.138 1.000 Y NA
 2282652 2282653 LMOf6854_2517 LMOf6854_2516 gpmA eno FALSE 0.199 136.000 0.136 1.000   NA
 2282654 2282655 LMOf6854_1680 LMOf6854_1681     FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 2282655 2282656 LMOf6854_1681 LMOf6854_1682   trpA FALSE 0.238 71.000 0.024 NA   NA
 2282656 2282657 LMOf6854_1682 LMOf6854_1683 trpA trpB TRUE 0.994 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 2282657 2282658 LMOf6854_1683 LMOf6854_1684 trpB trpF TRUE 0.997 3.000 0.375 0.001 Y NA
 2282658 2282659 LMOf6854_1684 LMOf6854_1685 trpF   TRUE 0.996 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 2282659 2282660 LMOf6854_1685 LMOf6854_1686   trpD TRUE 0.988 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 2282660 2282661 LMOf6854_1686 LMOf6854_1687 trpD trpG TRUE 0.953 -28.000 0.018 1.000 Y NA
 2282661 2282662 LMOf6854_1687 LMOf6854_1688 trpG trpE TRUE 0.996 -3.000 0.321 0.001 Y NA
 2282664 2282665 LMOf6854_2120 LMOf6854_2121     FALSE 0.276 147.000 0.028 0.062   NA
 2282666 2282667 LMOf6854_2122 LMOf6854_2123     TRUE 0.728 19.000 0.200 NA   NA
 2282667 2282668 LMOf6854_2123 LMOf6854_2124     TRUE 0.919 13.000 0.600 NA   NA
 2282669 2282670 LMOf6854_2125 LMOf6854_2126   mscL FALSE 0.273 62.000 0.020 NA   NA
 2282671 2282672 LMOf6854_2127 LMOf6854_2128     TRUE 0.662 45.000 0.917 NA   NA
 2282672 2282673 LMOf6854_2128 LMOf6854_2129   cbH FALSE 0.479 -13.000 0.000 NA   NA
 2282673 2282674 LMOf6854_2129 LMOf6854_2130 cbH groEL FALSE 0.012 258.000 0.000 1.000 N NA
 2282675 2282676 LMOf6854_2697 LMOf6854_2696     FALSE 0.011 233.000 0.000 NA   NA
 2282676 2282677 LMOf6854_2696 LMOf6854_2695     TRUE 0.935 -7.000 0.000 0.002   NA
 2282677 2282678 LMOf6854_2695 LMOf6854_2694     TRUE 0.896 38.000 0.222 NA Y NA
 2282678 2282679 LMOf6854_2694 LMOf6854_2693     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 2282679 2282680 LMOf6854_2693 LMOf6854_2692     FALSE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 2282680 2282681 LMOf6854_2692 LMOf6854_2691     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282681 2282682 LMOf6854_2691 LMOf6854_2690     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282682 2282683 LMOf6854_2690 LMOf6854_2689     FALSE 0.024 178.000 0.000 NA   NA
 2282683 2282684 LMOf6854_2689 LMOf6854_2688     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282684 2282685 LMOf6854_2688 LMOf6854_2687     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282685 2282686 LMOf6854_2687 LMOf6854_2686     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282686 2282687 LMOf6854_2686 LMOf6854_2685     TRUE 0.717 0.000 0.000 NA   NA
 2282687 2282688 LMOf6854_2685 LMOf6854_2684     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282688 2282689 LMOf6854_2684 LMOf6854_2683     TRUE 0.883 -3.000 0.222 NA   NA
 2282689 2282690 LMOf6854_2683 LMOf6854_2682   ssb TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282690 2282691 LMOf6854_2682 LMOf6854_2681 ssb   FALSE 0.427 19.000 0.000 NA   NA
 2282692 2282693 LMOf6854_1713 LMOf6854_1714 tsf rpsB FALSE 0.308 140.000 0.748 1.000   NA
 2282693 2282694 LMOf6854_1714 LMOf6854_1715 rpsB   FALSE 0.003 488.000 0.000 NA   NA
 2282694 2282695 LMOf6854_1715 LMOf6854_1716   leuS FALSE 0.046 141.000 0.000 NA   NA
 2282696 2282697 LMOf6854_1717 LMOf6854_1718     TRUE 0.928 -3.000 0.408 1.000   NA
 2282700 2282701 LMOf6854_0848 LMOf6854_0847     FALSE 0.219 128.000 0.113 1.000   NA
 2282701 2282702 LMOf6854_0847 LMOf6854_0846     FALSE 0.114 151.000 0.028 1.000   NA
 2282702 2282703 LMOf6854_0846 LMOf6854_0845     FALSE 0.090 152.000 0.048 NA   NA
 2282705 2282706 LMOf6854_1844 LMOf6854_1843 infC rpmI TRUE 0.967 22.000 0.652 1.000 Y NA
 2282706 2282707 LMOf6854_1843 LMOf6854_1842 rpmI rplT TRUE 0.974 40.000 0.928 0.013 Y NA
 2282709 2282710 LMOf6854_1840 LMOf6854_1839   pepT FALSE 0.410 58.000 0.200 NA   NA
 2282711 2282712 LMOf6854_1838 LMOf6854_1837     FALSE 0.453 62.000 0.367 NA   NA
 2282714 2282715 LMOf6854_0154 LMOf6854_0155     TRUE 0.930 12.000 0.667 NA   NA
 2282715 2282716 LMOf6854_0155 LMOf6854_0156     TRUE 0.912 0.000 0.286 NA   NA
 2282716 2282717 LMOf6854_0156 LMOf6854_0157     FALSE 0.077 108.000 0.000 NA   NA
 2282717 2282718 LMOf6854_0157 LMOf6854_0158     TRUE 0.615 14.000 0.000 NA   NA
 2282718 2282719 LMOf6854_0158 LMOf6854_0159     FALSE 0.003 383.000 0.000 NA   NA
 2282719 2282720 LMOf6854_0159 LMOf6854_0160     FALSE 0.002 550.000 0.000 NA   NA
 2282722 2282723 LMOf6854_1317 LMOf6854_1318 topA gid FALSE 0.399 63.000 0.137 1.000 N NA
 2282723 2282724 LMOf6854_1318 LMOf6854_1319 gid xerC FALSE 0.026 283.000 0.105 1.000 N NA
 2282724 2282725 LMOf6854_1319 LMOf6854_1320 xerC hslV TRUE 0.684 21.000 0.113 1.000 N NA
 2282725 2282726 LMOf6854_1320 LMOf6854_1321 hslV hslU TRUE 0.993 5.000 0.752 1.000 Y NA
 2282726 2282727 LMOf6854_1321 LMOf6854_1322 hslU   TRUE 0.726 21.000 0.131 1.000   NA
 2282728 2282729 LMOf6854_2579 LMOf6854_2580     FALSE 0.130 176.000 0.688 NA N NA
 2282730 2282731 LMOf6854_2581 LMOf6854_2582     TRUE 0.990 8.000 0.273 1.000 Y NA
 2282731 2282732 LMOf6854_2582 LMOf6854_2583     TRUE 0.988 1.000 0.015 1.000 Y NA
 2282732 2282733 LMOf6854_2583 LMOf6854_2584     TRUE 0.681 126.000 0.038 1.000 Y NA
 2282734 2282735 LMOf6854_1858 LMOf6854_1857     FALSE 0.003 482.000 0.000 NA   NA
 2282735 2282736 LMOf6854_1857 LMOf6854_1856     FALSE 0.446 72.000 0.316 1.000   NA
 2282738 2282739 LMOf6854_2699 LMOf6854_2700     TRUE 0.865 16.000 0.286 1.000   NA
 2282739 2282740 LMOf6854_2700 LMOf6854_2701     TRUE 0.851 15.000 0.286 NA   NA
 2282740 2282741 LMOf6854_2701 LMOf6854_2702     TRUE 0.510 59.000 0.500 NA   NA
 2282741 2282742 LMOf6854_2702 LMOf6854_2703     FALSE 0.149 63.000 0.000 NA   NA
 2282744 2282745 LMOf6854_2613 LMOf6854_2614 murA-2   FALSE 0.165 121.000 0.072 NA   NA
 2282745 2282746 LMOf6854_2614 LMOf6854_2615     TRUE 0.911 7.000 0.336 NA   NA
 2282746 2282747 LMOf6854_2615 LMOf6854_2616     TRUE 0.996 8.000 0.413 0.007 Y NA
 2282747 2282748 LMOf6854_2616 LMOf6854_2617     FALSE 0.007 321.000 0.000 1.000 N NA
 2282750 2282751 LMOf6854_2284 LMOf6854_2285     FALSE 0.489 45.000 0.291 NA   NA
 2282751 2282752 LMOf6854_2285 LMOf6854_2286     TRUE 0.667 -3.000 0.000 NA   NA
 2282753 2282754 LMOf6854_1997 LMOf6854_1996   gpsA TRUE 0.636 23.000 0.068 1.000   NA
 2282754 2282755 LMOf6854_1996 LMOf6854_1995 gpsA   FALSE 0.199 103.000 0.042 1.000 N NA
 2282755 2282756 LMOf6854_1995 LMOf6854_1994   hup FALSE 0.004 413.000 0.000 1.000 N NA
 2282756 2282757 LMOf6854_1994 LMOf6854_1993 hup folE FALSE 0.040 235.000 0.154 1.000 N NA
 2282758 2282759 LMOf6854_0148 LMOf6854_0149     TRUE 0.911 102.000 0.688 0.029 Y NA
 2282759 2282760 LMOf6854_0149 LMOf6854_0150     TRUE 0.996 11.000 0.786 0.029 Y NA
 2282760 2282761 LMOf6854_0150 LMOf6854_0151     FALSE 0.064 199.000 0.214 NA   NA
 2282761 2282762 LMOf6854_0151 LMOf6854_0152     TRUE 0.953 1.000 0.833 NA   NA
 2282762 2282763 LMOf6854_0152 LMOf6854_0153     FALSE 0.353 -87.000 0.000 NA   NA
 2282766 2282767 LMOf6854_1693 LMOf6854_1692     TRUE 0.924 -3.000 0.579 NA   NA
 2282767 2282768 LMOf6854_1692 LMOf6854_1691     FALSE 0.411 84.000 0.625 NA   NA
 2282768 2282769 LMOf6854_1691 LMOf6854_1690   adhE FALSE 0.326 123.000 0.750 NA   NA
 2282770 2282771 LMOf6854_1855 LMOf6854_1854     FALSE 0.182 110.000 0.005 1.000   NA
 2282771 2282772 LMOf6854_1854 LMOf6854_1853     FALSE 0.430 28.000 0.035 NA   NA
 2282772 2282773 LMOf6854_1853 LMOf6854_1852   rimM TRUE 0.649 19.000 0.041 NA   NA
 2282773 2282774 LMOf6854_1852 LMOf6854_1851 rimM trmD TRUE 0.993 0.000 0.672 1.000 Y NA
 2282774 2282775 LMOf6854_1851 LMOf6854_1850 trmD   TRUE 0.551 20.000 0.012 NA   NA
 2282776 2282777 LMOf6854_1849 LMOf6854_1848     TRUE 0.705 21.000 0.080 1.000   NA
 2282777 2282778 LMOf6854_1848 LMOf6854_1847     TRUE 0.888 0.000 0.102 NA   NA
 2282779 2282780 LMOf6854_1762 LMOf6854_1763     FALSE 0.335 65.000 0.090 NA   NA
 2282784 2282785 LMOf6854_1767 LMOf6854_1768   map FALSE 0.162 139.000 0.156 1.000 N NA
 2282786 2282787 LMOf6854_0640 LMOf6854_0641     TRUE 0.562 -7.000 0.000 NA   NA
 2282787 2282788 LMOf6854_0641 LMOf6854_0642     FALSE 0.215 106.000 0.115 NA   NA
 2282789 2282790 LMOf6854_0643 LMOf6854_0644     FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 2282791 2282792 LMOf6854_2090 LMOf6854_2091     FALSE 0.263 125.000 0.287 1.000   NA
 2282792 2282793 LMOf6854_2091 LMOf6854_2092     TRUE 0.674 23.000 0.370 NA   NA
 2282793 2282794 LMOf6854_2092 LMOf6854_2093     TRUE 0.899 4.000 0.194 NA   NA
 2282794 2282795 LMOf6854_2093 LMOf6854_2094   ftsZ FALSE 0.142 119.000 0.030 NA   NA
 2282797 2282798 LMOf6854_1908 LMOf6854_1909     TRUE 0.987 -3.000 0.173 1.000 Y NA
 2282798 2282799 LMOf6854_1909 LMOf6854_1910     TRUE 0.994 7.000 0.174 0.085 Y NA
 2282801 2282802 LMOf6854_1752 LMOf6854_1753     FALSE 0.476 27.000 0.059 NA   NA
 2282803 2282804 LMOf6854_1945 LMOf6854_1944     TRUE 0.709 5.000 0.000 NA   NA
 2282804 2282805 LMOf6854_1944 LMOf6854_1943   xpt FALSE 0.026 228.000 0.009 1.000 N NA
 2282805 2282806 LMOf6854_1943 LMOf6854_1942 xpt pbuX TRUE 0.987 7.000 0.051 1.000 Y NA
 2282808 2282809 LMOf6854_0250 LMOf6854_0251 cysE cysS TRUE 0.887 7.000 0.035 1.000   NA
 2282809 2282810 LMOf6854_0251 LMOf6854_0252 cysS   TRUE 0.919 4.000 0.129 1.000   NA
 2282810 2282811 LMOf6854_0252 LMOf6854_0253     TRUE 0.978 0.000 0.150 0.003   NA
 2282811 2282812 LMOf6854_0253 LMOf6854_0254     TRUE 0.892 3.000 0.109 NA   NA
 2282812 2282813 LMOf6854_0254 LMOf6854_0255   sigH FALSE 0.182 81.000 0.010 NA   NA
 2282814 2282815 LMOf6854_2095 LMOf6854_2096 ftsA   FALSE 0.015 367.000 0.389 NA N NA
 2282815 2282816 LMOf6854_2096 LMOf6854_2097   murG TRUE 0.930 23.000 0.072 NA Y NA
 2282816 2282817 LMOf6854_2097 LMOf6854_2098 murG   TRUE 0.885 -3.000 0.060 1.000   NA
 2282818 2282819 LMOf6854_2119 LMOf6854_2118 ctaB   FALSE 0.076 159.000 0.037 NA   NA
 2282819 2282820 LMOf6854_2118 LMOf6854_2117     FALSE 0.483 48.000 0.301 NA   NA
 2282820 2282821 LMOf6854_2117 LMOf6854_2116     TRUE 0.612 31.000 0.500 NA   NA
 2282821 2282822 LMOf6854_2116 LMOf6854_2115     FALSE 0.185 97.000 0.048 NA   NA
 2282822 2282823 LMOf6854_2115 LMOf6854_2114   coaD TRUE 0.940 3.000 0.367 1.000   NA
 2282826 2282827 LMOf6854_1756 LMOf6854_1757     FALSE 0.445 -18.000 0.000 NA   NA
 2282827 2282828 LMOf6854_1757 LMOf6854_1758     FALSE 0.241 28.000 0.000 NA   NA
 2282829 2282830 LMOf6854_1759 LMOf6854_1760     TRUE 0.648 29.000 0.579 NA   NA
 2282831 2282832 LMOf6854_2609 LMOf6854_2610 gtcA   TRUE 0.869 -3.000 0.129 NA   NA
 2282832 2282833 LMOf6854_2610 LMOf6854_2611   rho FALSE 0.130 81.000 0.007 NA N NA
 2282833 2282834 LMOf6854_2611 LMOf6854_2612 rho   FALSE 0.212 103.000 0.022 1.000   NA
 2282835 2282836 LMOf6854_2747 LMOf6854_2748 rpsJ   FALSE 0.005 361.000 0.000 1.000 N NA
 2282836 2282837 LMOf6854_2748 LMOf6854_2749     TRUE 0.708 20.000 0.224 NA   NA
 2282837 2282838 LMOf6854_2749 LMOf6854_2750     TRUE 0.512 -10.000 0.000 NA   NA
 2282838 2282839 LMOf6854_2750 LMOf6854_2751     FALSE 0.455 82.000 0.526 1.000   NA
 2282842 2282843 LMOf6854_1586 LMOf6854_1585   pheA FALSE 0.315 67.000 0.012 1.000   NA
 2282844 2282845 LMOf6854_1679 LMOf6854_1678     TRUE 0.746 111.000 0.900 0.001   NA
 2282845 2282846 LMOf6854_1678 LMOf6854_1677     TRUE 0.978 10.000 0.833 0.061   NA
 2282847 2282848 LMOf6854_2087 LMOf6854_2086 nadA nadC TRUE 0.974 -3.000 0.198 0.002   NA
 2282848 2282849 LMOf6854_2086 LMOf6854_2085 nadC nadB TRUE 0.996 -3.000 0.223 0.002 Y NA
 2282850 2282851 LMOf6854_0016 LMOf6854_0015   qoxA TRUE 0.990 19.000 0.489 0.003 Y NA
 2282853 2282854 LMOf6854_1904 LMOf6854_1905   lspA TRUE 0.851 0.000 0.011 1.000 N NA
 2282854 2282855 LMOf6854_1905 LMOf6854_1906 lspA   TRUE 0.547 82.000 0.087 0.061   NA
 2282857 2282858 LMOf6854_1325 LMOf6854_1324     TRUE 0.891 3.000 0.105 NA   NA
 2282858 2282859 LMOf6854_1324 LMOf6854_1323     TRUE 0.612 22.000 0.096 NA   NA
 2282860 2282861 LMOf6854_2316 LMOf6854_2317     TRUE 0.986 -7.000 0.640 1.000 Y NA
 2282861 2282862 LMOf6854_2317 LMOf6854_2318   aspB TRUE 0.835 73.000 0.088 1.000 Y NA
 2282863 2282864 LMOf6854_1584 LMOf6854_1583 pheA   FALSE 0.198 111.000 0.016 1.000   NA
 2282864 2282865 LMOf6854_1583 LMOf6854_1582   ldh-2 FALSE 0.299 70.000 0.012 1.000   NA
 2282866 2282867 LMOf6854_2056 LMOf6854_2055   deoC FALSE 0.420 62.000 0.077 1.000   NA
 2282867 2282868 LMOf6854_2055 LMOf6854_2054 deoC   FALSE 0.259 80.000 0.038 1.000 N NA
 2282869 2282870 LMOf6854_2099 LMOf6854_2100 murD mraY TRUE 0.871 141.000 0.647 0.004 Y NA
 2282872 2282873 LMOf6854_1938 LMOf6854_1939   rpsN-1 FALSE 0.286 78.000 0.020 1.000   NA
 2282873 2282874 LMOf6854_1939 LMOf6854_1940 rpsN-1   FALSE 0.141 124.000 0.020 1.000 N NA
 2282875 2282876 LMOf6854_2017 LMOf6854_2018     TRUE 0.973 0.000 0.214 0.029   NA
 2282877 2282878 LMOf6854_1990 LMOf6854_1991 hepB menG TRUE 0.935 11.000 0.476 1.000   NA
 2282878 2282879 LMOf6854_1991 LMOf6854_1992 menG   TRUE 0.754 23.000 0.708 NA   NA
 2282880 2282881 LMOf6854_1591 LMOf6854_1590   rplU FALSE 0.473 157.000 0.011 NA Y NA
 2282888 2282889 LMOf6854_2020 LMOf6854_2019   sirB FALSE 0.437 102.000 0.750 1.000   NA
 2282890 2282891 LMOf6854_1674 LMOf6854_1675     FALSE 0.407 75.000 0.224 1.000   NA
 2282893 2282894 LMOf6854_2514 LMOf6854_2515     FALSE 0.195 133.000 0.286 NA   NA
 2282895 2282896 LMOf6854_0645 LMOf6854_0646     TRUE 0.936 8.000 0.419 1.000   NA
 2282901 2282902 LMOf6854_1650 LMOf6854_1649     FALSE 0.007 290.000 0.000 NA   NA