MicrobesOnline Operon Predictions for Aeropyrum pernix K1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
2754	2755	APE_0001	APE_0002			TRUE	0.745	0.000	0.000	NA		NA
2755	2756	APE_0002	APE_0004			TRUE	0.467	-16.000	0.000	NA		NA
2757	2758	APE_0006.1	APE_0007.1			FALSE	0.022	1069.000	0.000	NA		NA
2759	2760	APE_0009.1	APE_0010.1			FALSE	0.074	155.000	0.000	1.000	N	NA
2761	2762	APE_0011.1	APE_0012	fba		TRUE	0.991	19.000	0.222	1.000	Y	NA
2762	2763	APE_0012	APE_0013.1		ilvD	TRUE	0.482	151.000	0.000	1.000	Y	NA
2765	2766	APE_0017.1	APE_0020.1			TRUE	0.707	18.000	0.000	1.000	N	NA
2766	2767	APE_0020.1	APE_0023.1			FALSE	0.094	72.000	0.000	NA		NA
2767	2768	APE_0023.1	APE_0024.1			FALSE	0.108	112.000	0.000	NA		NA
2768	2769	APE_0024.1	APE_0025.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
2770	2771	APE_0026	APE_0028			TRUE	0.722	-72.000	0.000	0.003		NA
2771	2772	APE_0028	APE_0031.1			TRUE	0.831	12.000	0.000	1.000		NA
2772	2773	APE_0031.1	APE_0033.1		pckA	FALSE	0.108	60.000	0.000	1.000	N	NA
2773	2774	APE_0033.1	APE_0035.1	pckA		FALSE	0.090	127.000	0.000	1.000	N	NA
2774	2775	APE_0035.1	APE_0038.1			TRUE	0.995	15.000	0.125	0.055	Y	NA
2775	2776	APE_0038.1	APE_0040.1			TRUE	0.996	15.000	0.136	0.055	Y	NA
2776	2777	APE_0040.1	APE_0043.1			TRUE	0.997	8.000	0.250	0.055	Y	NA
2777	2778	APE_0043.1	APE_0045		pstS	FALSE	0.061	182.000	0.000	1.000	N	NA
2778	2779	APE_0045	APE_0047.1	pstS	pstC	TRUE	0.997	13.000	0.128	0.004	Y	NA
2779	2780	APE_0047.1	APE_0048	pstC	pstA	TRUE	0.997	-7.000	0.404	0.004	Y	NA
2780	2781	APE_0048	APE_0050	pstA	pstB	TRUE	0.998	0.000	0.333	0.004	Y	NA
2781	2782	APE_0050	APE_0051	pstB		TRUE	0.991	0.000	0.184	NA	Y	NA
2783	2784	APE_0052.1	APE_0053.1			FALSE	0.107	95.000	0.000	NA		NA
2784	2785	APE_0053.1	APE_0054.1			FALSE	0.065	181.000	0.000	NA		NA
2785	2786	APE_0054.1	APE_0055			FALSE	0.098	86.000	0.000	NA		NA
2786	2787	APE_0055	APE_0056.1			FALSE	0.090	69.000	0.000	1.000	N	NA
2788	2791	APE_0057.1	APE_0060.1			TRUE	0.778	13.000	0.000	NA		NA
2791	2792	APE_0060.1	APE_0061.1			FALSE	0.218	115.000	0.012	1.000		NA
2792	2793	APE_0061.1	APE_0063			TRUE	0.550	98.000	0.176	1.000		NA
2793	2794	APE_0063	APE_0065			TRUE	0.970	-3.000	0.286	1.000		NA
2794	2795	APE_0065	APE_0067.1			TRUE	0.994	16.000	0.667	0.055		NA
2795	1786878	APE_0067.1	APE_0067a			FALSE	0.104	94.000	0.000	NA		NA
1786878	2797	APE_0067a	APE_0069.1		dut	FALSE	0.055	207.000	0.000	NA		NA
2798	2799	APE_0070.1	APE_0071.1			FALSE	0.041	263.000	0.000	NA		NA
2800	2801	APE_0072	APE_0073.1			FALSE	0.090	76.000	0.000	1.000	N	NA
2807	2808	APE_0080.1	APE_0082.1			TRUE	0.750	42.000	0.143	NA		NA
2808	2810	APE_0082.1	APE_0084.1			FALSE	0.105	64.000	0.000	NA		NA
2810	2811	APE_0084.1	APE_0085.1			FALSE	0.123	71.000	0.000	1.000		NA
1786880	2812	APE_0085a	APE_0086			FALSE	0.098	85.000	0.000	NA		NA
2814	2815	APE_0088.1	APE_0089.1			FALSE	0.023	711.000	0.000	NA		NA
2815	2816	APE_0089.1	APE_0091			TRUE	0.989	15.000	0.912	NA		NA
2817	2818	APE_0092.1	APE_0093.1			FALSE	0.112	108.000	0.000	NA		NA
2822	2823	APE_0097.1	APE_0099			FALSE	0.105	115.000	0.000	NA		NA
2825	2826	APE_0103.1	APE_0104.1			TRUE	0.729	45.000	0.190	NA		NA
2827	2828	APE_0104a.1	APE_0105	fdxA		FALSE	0.135	54.000	0.000	NA		NA
2829	2830	APE_0106.1	APE_0107		herA	FALSE	0.290	42.000	0.000	NA		NA
2830	2831	APE_0107	APE_0109.1	herA		TRUE	0.871	-16.000	0.153	NA		NA
2831	2832	APE_0109.1	APE_0110			TRUE	0.950	27.000	0.339	NA		NA
2832	2833	APE_0110	APE_0113			TRUE	0.995	7.000	0.331	1.000	Y	NA
2833	2834	APE_0113	APE_0113a		rpl40e	FALSE	0.075	154.000	0.000	1.000	N	NA
2834	1786881	APE_0113a	APE_0115.1	rpl40e	fen	FALSE	0.089	70.000	0.000	1.000	N	NA
2836	1786882	APE_0116.1	APE_0116a			FALSE	0.047	234.000	0.000	NA		NA
2838	2839	APE_0119	APE_0121	radA		FALSE	0.364	-24.000	0.000	NA		NA
2839	2840	APE_0121	APE_0122.1			FALSE	0.135	54.000	0.000	NA		NA
2840	2841	APE_0122.1	APE_0124			TRUE	0.822	4.000	0.000	1.000		NA
2841	2842	APE_0124	APE_0125.1			FALSE	0.091	137.000	0.000	NA		NA
2842	2843	APE_0125.1	APE_0126.1			TRUE	0.778	5.000	0.000	NA		NA
2843	2844	APE_0126.1	APE_0127			TRUE	0.790	8.000	0.000	NA		NA
2844	2845	APE_0127	APE_0129.1			FALSE	0.428	-34.000	0.013	NA		NA
2845	2846	APE_0129.1	APE_0130.1			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
2848	2849	APE_0132.1	APE_0134.1		etfB	FALSE	0.101	121.000	0.000	NA		NA
2849	2850	APE_0134.1	APE_0135	etfB	etfA	TRUE	0.999	20.000	0.900	0.021	Y	NA
2850	2851	APE_0135	APE_0136.1	etfA		FALSE	0.109	96.000	0.000	NA		NA
2851	2852	APE_0136.1	APE_0137		ggt	FALSE	0.098	124.000	0.000	NA		NA
2852	2853	APE_0137	APE_0140.1	ggt		FALSE	0.093	82.000	0.000	1.000	N	NA
2853	2854	APE_0140.1	APE_0141.1			FALSE	0.111	61.000	0.000	NA		NA
2854	2855	APE_0141.1	APE_0142			FALSE	0.048	231.000	0.000	NA		NA
2861	2862	APE_0150.1	APE_0151.1	nth		FALSE	0.262	-36.000	0.000	NA		NA
2862	2863	APE_0151.1	APE_0152.1			FALSE	0.126	56.000	0.000	NA		NA
2863	1786883	APE_0152.1	APE_0152a			TRUE	0.911	24.000	0.079	1.000		NA
2865	2866	APE_0153.1	APE_0154			FALSE	0.091	136.000	0.000	NA		NA
2866	2867	APE_0154	APE_0155.1			FALSE	0.096	77.000	0.000	NA		NA
2867	2868	APE_0155.1	APE_0156.1			TRUE	0.769	14.000	0.000	NA		NA
2868	2869	APE_0156.1	APE_0157			FALSE	0.089	73.000	0.000	1.000	N	NA
2869	2870	APE_0157	APE_0158.1			TRUE	0.601	-7.000	0.000	1.000	N	NA
2870	2871	APE_0158.1	APE_0159			FALSE	0.107	100.000	0.000	1.000	N	NA
2873	2874	APE_0162	APE_0163.1			FALSE	0.053	206.000	0.000	1.000	N	NA
2874	2875	APE_0163.1	APE_0166.1			FALSE	0.057	260.000	0.000	1.000		NA
2875	1786884	APE_0166.1	APE_tRNA01			FALSE	0.110	109.000	0.000	NA		NA
2877	2878	APE_0168.1	APE_0169.1		agt	FALSE	0.135	65.000	0.000	1.000		NA
2878	2879	APE_0169.1	APE_0171.1	agt		FALSE	0.104	97.000	0.000	1.000	N	NA
2879	2880	APE_0171.1	APE_0173.1		pgk	TRUE	0.995	13.000	0.023	0.004	Y	NA
2882	2883	APE_0177	APE_0178.1	moeA	mobB	TRUE	0.977	-10.000	0.000	0.010	Y	NA
2883	2884	APE_0178.1	APE_0179	mobB	mobA	TRUE	0.976	28.000	0.000	0.016	Y	NA
2888	2889	APE_0182.1	APE_0183.1			FALSE	0.266	43.000	0.000	NA		NA
2892	2893	APE_0187	APE_0188.1			TRUE	0.959	8.000	0.105	NA		NA
2893	2894	APE_0188.1	APE_0191.1		hjm	TRUE	0.762	44.000	0.184	1.000		NA
2895	1786885	APE_0193.1	APE_0193a	lys9		FALSE	0.042	262.000	0.000	NA		NA
2900	2901	APE_0199.1	APE_0200			FALSE	0.098	85.000	0.000	NA		NA
2904	1786886	APE_0203.1	APE_tRNA02			FALSE	0.038	281.000	0.000	NA		NA
1786886	2905	APE_tRNA02	APE_0204.1		kptA	FALSE	0.143	53.000	0.000	NA		NA
2906	2907	APE_0207	APE_0208			FALSE	0.098	82.000	0.000	NA		NA
2908	2909	APE_0209.1	APE_0211.1			FALSE	0.203	42.000	0.000	NA	N	NA
2911	2912	APE_0213.1	APE_0214.1			FALSE	0.466	33.000	0.000	NA		NA
2912	2914	APE_0214.1	APE_0216.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
2914	2915	APE_0216.1	APE_0218		rpl2p	FALSE	0.146	99.000	0.000	1.000		NA
2915	2916	APE_0218	APE_0219	rpl2p		TRUE	0.826	13.000	0.000	1.000		NA
2916	2917	APE_0219	APE_0220			TRUE	0.671	21.000	0.000	NA		NA
2917	1786887	APE_0220	APE_0220a			TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
1786887	2919	APE_0220a	APE_0222.1			FALSE	0.115	104.000	0.000	NA		NA
2921	2922	APE_0226.1	APE_0227		rpl3p	FALSE	0.370	282.000	0.359	NA		NA
2922	2923	APE_0227	APE_0228.1	rpl3p	rpl4p	TRUE	0.996	31.000	0.885	0.049	Y	NA
2923	2924	APE_0228.1	APE_0228a.1	rpl4p	rpl23p	TRUE	0.993	-3.000	0.075	0.049	Y	NA
2925	2926	APE_0230.1	APE_0231			FALSE	0.138	115.000	0.000	1.000		NA
2926	2927	APE_0231	APE_0233			TRUE	0.941	0.000	0.000	0.055		NA
2927	2928	APE_0233	APE_0234			TRUE	0.777	37.000	0.000	0.055		NA
2928	2929	APE_0234	APE_0235.1		thiL	FALSE	0.099	64.000	0.000	1.000	N	NA
2929	2930	APE_0235.1	APE_0236.1	thiL	cobA	FALSE	0.455	161.000	0.000	1.000	Y	NA
2930	2931	APE_0236.1	APE_0237.1	cobA		FALSE	0.431	35.000	0.000	NA		NA
2931	2932	APE_0237.1	APE_0238			FALSE	0.040	267.000	0.000	NA		NA
2932	2933	APE_0238	APE_0239			FALSE	0.108	113.000	0.000	NA		NA
2933	2934	APE_0239	APE_0240			FALSE	0.090	139.000	0.000	NA		NA
1786888	2936	APE_0240a	APE_0242.1			FALSE	0.143	53.000	0.000	NA		NA
2937	2938	APE_0243	APE_0244.1		pdxT	FALSE	0.027	474.000	0.000	NA		NA
2938	2939	APE_0244.1	APE_0246.1	pdxT	pdxS	TRUE	0.978	-3.000	0.055	NA	Y	NA
2939	2940	APE_0246.1	APE_0248.1	pdxS		FALSE	0.112	99.000	0.000	NA		NA
2941	2942	APE_0249.1	APE_0252			TRUE	0.988	24.000	0.032	0.025	Y	NA
2942	2943	APE_0252	APE_0254			TRUE	0.592	55.000	0.205	NA		NA
2944	2945	APE_0255.1	APE_0256			FALSE	0.098	87.000	0.000	NA		NA
2945	2946	APE_0256	APE_0256a.1		rpoE2	TRUE	0.988	3.000	0.695	NA		NA
2946	2947	APE_0256a.1	APE_0257	rpoE2	rpoE1	TRUE	0.999	7.000	0.429	0.012	Y	NA
2947	2948	APE_0257	APE_0257a	rpoE1		FALSE	0.125	69.000	0.000	1.000		NA
2948	2949	APE_0257a	APE_0258.1			FALSE	0.150	102.000	0.000	1.000		NA
2949	2950	APE_0258.1	APE_0260.1		pyrD	FALSE	0.097	65.000	0.000	1.000	N	NA
2950	2951	APE_0260.1	APE_0261.1	pyrD	pyrC	TRUE	0.902	-28.000	0.042	1.000	Y	NA
2953	2954	APE_0263.1	APE_0264.1			FALSE	0.026	495.000	0.000	NA		NA
1786889	2957	APE_tRNA03	APE_0267			FALSE	0.044	246.000	0.000	NA		NA
2960	2961	APE_0266b	APE_0270.1		modB	FALSE	0.101	66.000	0.000	NA		NA
2961	2962	APE_0270.1	APE_0272.1	modB	modA	TRUE	0.949	-6.000	0.000	1.000	Y	NA
2963	1786892	APE_0273	APE_0273a			TRUE	0.952	-22.000	1.000	NA		NA
1786892	2964	APE_0273a	APE_0274			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
2964	1786893	APE_0274	APE_0274a			FALSE	0.046	239.000	0.000	NA		NA
1786893	2965	APE_0274a	APE_0275.1			FALSE	0.024	686.000	0.000	NA		NA
2965	1786894	APE_0275.1	APE_0275a			FALSE	0.024	707.000	0.000	NA		NA
1786894	2966	APE_0275a	APE_0275b.1			FALSE	0.040	270.000	0.000	NA		NA
2966	2967	APE_0275b.1	APE_0276.1			FALSE	0.030	404.000	0.000	NA		NA
2967	1786895	APE_0276.1	APE_0276a			TRUE	0.521	-13.000	0.000	NA		NA
1786895	2969	APE_0276a	APE_0278			FALSE	0.032	354.000	0.000	NA		NA
2969	1786896	APE_0278	APE_0278a			FALSE	0.262	-36.000	0.000	NA		NA
1786896	2970	APE_0278a	APE_0279.1			FALSE	0.031	381.000	0.000	NA		NA
2970	2971	APE_0279.1	APE_0279a.1			TRUE	0.616	-7.000	0.000	NA		NA
2978	2979	APE_0287	APE_0288			FALSE	0.130	89.000	0.000	1.000		NA
2980	1786898	APE_0290.1	APE_0290a			FALSE	0.129	123.000	0.000	1.000		NA
1786898	2981	APE_0290a	APE_0291			TRUE	0.723	-58.000	0.000	0.004		NA
2981	1786899	APE_0291	APE_0291a			FALSE	0.071	167.000	0.000	NA		NA
1786899	2983	APE_0291a	APE_0293			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
2985	1786900	APE_0295	APE_0295a			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
1786900	2987	APE_0295a	APE_0297			TRUE	0.521	-13.000	0.000	NA		NA
2987	2989	APE_0297	APE_0299.1			TRUE	0.776	59.000	0.750	NA		NA
2989	2990	APE_0299.1	APE_0300.1			FALSE	0.034	335.000	0.000	NA		NA
2990	2991	APE_0300.1	APE_0301.1			TRUE	0.992	7.000	0.000	0.007	Y	NA
2991	2992	APE_0301.1	APE_0302.1			TRUE	0.960	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
2992	2993	APE_0302.1	APE_0303			TRUE	0.998	14.000	0.535	0.050	Y	NA
2993	2994	APE_0303	APE_0304.1			TRUE	0.986	17.000	0.000	0.050	Y	NA
2995	2997	APE_0306.1	APE_0308.1		eapA	TRUE	0.942	-84.000	0.333	1.000	Y	NA
2997	2998	APE_0308.1	APE_0309.1	eapA		TRUE	0.685	-7.000	0.000	1.000		NA
2998	2999	APE_0309.1	APE_0311		mcl	FALSE	0.129	123.000	0.000	1.000		NA
2999	3000	APE_0311	APE_0313.1	mcl		FALSE	0.112	108.000	0.000	NA		NA
3000	3001	APE_0313.1	APE_0314.1			FALSE	0.105	64.000	0.000	NA		NA
3002	3003	APE_0316.1	APE_0317.1			FALSE	0.044	236.000	0.000	1.000	N	NA
3003	3004	APE_0317.1	APE_0319			FALSE	0.069	218.000	0.000	1.000		NA
3004	3005	APE_0319	APE_0320.1			FALSE	0.110	148.000	0.000	1.000		NA
1786901	3010	APE_tRNA05	APE_0326.1			FALSE	0.098	86.000	0.000	NA		NA
3010	3012	APE_0326.1	APE_0329.1			FALSE	0.033	338.000	0.000	NA		NA
3012	3013	APE_0329.1	APE_0330.1			FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
3016	3017	APE_0334	APE_0336.1			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
3017	3018	APE_0336.1	APE_0337.1			FALSE	0.150	102.000	0.000	1.000		NA
3020	3021	APE_0339.1	APE_0340.1			TRUE	0.787	11.000	0.000	NA		NA
3021	3023	APE_0340.1	APE_0342.1			FALSE	0.064	185.000	0.000	NA		NA
3023	3024	APE_0342.1	APE_0343		rpl15p	FALSE	0.067	116.000	0.000	NA	N	NA
3024	3026	APE_0343	APE_0345.1	rpl15p	rpl30p	TRUE	0.998	14.000	0.471	0.057	Y	NA
3026	3027	APE_0345.1	APE_0346	rpl30p	rps5p	TRUE	0.977	46.000	0.475	0.057	Y	NA
3027	3028	APE_0346	APE_0347	rps5p	rpl18p	TRUE	0.984	29.000	0.072	0.057	Y	NA
3028	3029	APE_0347	APE_0348	rpl18p	rpl19e	TRUE	0.992	21.000	0.079	0.047	Y	NA
3029	3030	APE_0348	APE_0349	rpl19e	rpl32e	TRUE	0.997	21.000	0.529	0.047	Y	NA
3030	3031	APE_0349	APE_0350	rpl32e	rpl6p	TRUE	0.998	0.000	0.465	0.047	Y	NA
3031	3032	APE_0350	APE_0352.1	rpl6p	rps8p	TRUE	0.861	121.000	0.068	0.047	Y	NA
3032	1786902	APE_0352.1	APE_0352a	rps8p	rps14p	TRUE	0.998	17.000	0.473	0.047	Y	NA
1786902	3034	APE_0352a	APE_0354.1	rps14p	rpl5p	TRUE	0.997	21.000	0.496	0.047	Y	NA
3034	3035	APE_0354.1	APE_0356.1	rpl5p	rps4e	TRUE	0.993	-3.000	0.073	0.047	Y	NA
3035	3036	APE_0356.1	APE_0358	rps4e	rpl24p	TRUE	0.981	44.000	0.478	0.057	Y	NA
3036	3037	APE_0358	APE_0359	rpl24p	rpl14p	TRUE	0.997	20.000	0.472	0.057	Y	NA
3037	3038	APE_0359	APE_0360.1	rpl14p	rps17p	TRUE	0.998	13.000	0.506	0.047	Y	NA
3038	3039	APE_0360.1	APE_0362	rps17p	rnp1	TRUE	0.969	-30.000	0.468	1.000	Y	NA
3039	1786903	APE_0362	APE_0362a	rnp1	rpl29p	TRUE	0.936	-19.000	0.046	1.000	Y	NA
1786903	3041	APE_0362a	APE_0363	rpl29p	rps3p	TRUE	0.992	20.000	0.074	0.057	Y	NA
3041	3042	APE_0363	APE_0365	rps3p	rpl22p	TRUE	0.995	5.000	0.074	0.057	Y	NA
3042	3043	APE_0365	APE_0367.1	rpl22p	rps19p	TRUE	0.994	27.000	0.355	0.057	Y	NA
3043	3045	APE_0367.1	APE_0370	rps19p		FALSE	0.274	101.000	0.027	NA		NA
3045	3047	APE_0370	APE_0372.1			TRUE	0.974	-7.000	0.667	NA		NA
3047	3048	APE_0372.1	APE_0373			FALSE	0.080	153.000	0.000	NA		NA
3048	3049	APE_0373	APE_0374		ileS	FALSE	0.150	-60.000	0.000	NA	N	NA
3049	1786904	APE_0374	APE_0374a	ileS		FALSE	0.144	81.000	0.004	NA		NA
3051	3052	APE_0381.1	APE_0382	ilvH		FALSE	0.141	112.000	0.000	1.000		NA
3052	3053	APE_0382	APE_0383.1			FALSE	0.144	109.000	0.000	1.000		NA
3053	3054	APE_0383.1	APE_0384			FALSE	0.088	140.000	0.000	NA		NA
3055	3056	APE_0385.1	APE_0389			FALSE	0.087	181.000	0.000	1.000		NA
3056	3057	APE_0389	APE_0390			TRUE	0.968	7.000	0.000	0.007		NA
3057	3058	APE_0390	APE_0392			TRUE	0.689	24.000	0.000	1.000		NA
3058	3059	APE_0392	APE_0396.1		alkK	FALSE	0.124	55.000	0.000	1.000	N	NA
3059	3060	APE_0396.1	APE_0399.1	alkK		FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
3060	3061	APE_0399.1	APE_0401.1		pyrH	TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
3063	3064	APE_0402.1	APE_0404.1	atpD	aptB	TRUE	0.935	60.000	0.163	0.006	Y	NA
3064	3065	APE_0404.1	APE_0405.1	aptB	atpA	TRUE	0.991	42.000	0.632	0.006	Y	NA
3065	3066	APE_0405.1	APE_0409.1	atpA	atpE	TRUE	0.972	39.000	0.047	0.006	Y	NA
3066	3067	APE_0409.1	APE_0410.1	atpE	atpF	TRUE	0.993	16.000	0.013	0.006	Y	NA
3069	3070	APE_0413	APE_0414.1			TRUE	0.787	11.000	0.000	NA		NA
3070	3071	APE_0414.1	APE_0415			TRUE	0.774	4.000	0.000	NA		NA
3071	3072	APE_0415	APE_0416.1			TRUE	0.774	4.000	0.000	NA		NA
3072	1786906	APE_0416.1	APE_tRNA06			FALSE	0.025	574.000	0.000	NA		NA
1786908	3074	APE_tRNA07	APE_0416b.1			FALSE	0.266	43.000	0.000	NA		NA
3074	3075	APE_0416b.1	APE_0419			FALSE	0.085	146.000	0.000	NA		NA
1786909	1786910	APE_0419a	APE_0420.1			FALSE	0.126	56.000	0.000	NA		NA
1786910	3076	APE_0420.1	APE_0421			FALSE	0.364	-24.000	0.000	NA		NA
3078	1786911	APE_0424.1	APE_0424a			FALSE	0.183	49.000	0.000	NA		NA
1786911	3079	APE_0424a	APE_0426.1			TRUE	0.616	-7.000	0.000	NA		NA
3079	3080	APE_0426.1	APE_0427.1			TRUE	0.776	11.000	0.000	1.000	N	NA
3082	3083	APE_0429.1	APE_0431			FALSE	0.200	47.000	0.000	NA		NA
3083	3085	APE_0431	APE_0433			TRUE	0.586	-9.000	0.000	NA		NA
1786912	3087	APE_0433a	APE_0436.1		aif2a	TRUE	0.994	21.000	0.519	NA	Y	NA
3087	3088	APE_0436.1	APE_0436a	aif2a	rps27e	TRUE	0.942	96.000	0.386	0.061	Y	NA
3088	3089	APE_0436a	APE_0436b.1	rps27e	rpl44e	TRUE	0.998	17.000	0.436	0.046	Y	NA
3089	3090	APE_0436b.1	APE_0437.1	rpl44e		TRUE	0.556	28.000	0.000	NA		NA
3090	3091	APE_0437.1	APE_0438.1		priA	FALSE	0.276	-34.000	0.000	NA		NA
3091	3092	APE_0438.1	APE_0441.1	priA		TRUE	0.992	11.000	0.142	1.000	Y	NA
3092	3093	APE_0441.1	APE_0441a.1			FALSE	0.098	82.000	0.000	NA		NA
3093	3094	APE_0441a.1	APE_0442.1		tfs	FALSE	0.437	-18.000	0.000	NA		NA
3094	1786913	APE_0442.1	APE_0442a	tfs		FALSE	0.244	44.000	0.000	NA		NA
1786913	3096	APE_0442a	APE_0443.1		rpoL	TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3096	3097	APE_0443.1	APE_0444.1	rpoL		TRUE	0.981	13.000	0.358	NA		NA
3097	3098	APE_0444.1	APE_0445			FALSE	0.143	53.000	0.000	NA		NA
3098	3099	APE_0445	APE_0446			TRUE	0.826	-28.000	0.000	1.000	Y	NA
3099	3100	APE_0446	APE_0447.1			TRUE	0.932	25.000	0.000	NA	Y	NA
3100	3101	APE_0447.1	APE_0449		rpl10e	TRUE	0.537	99.000	0.000	NA	Y	NA
3103	3104	APE_0450a	APE_0452.1			FALSE	0.044	251.000	0.000	NA		NA
3104	3105	APE_0452.1	APE_0454			FALSE	0.126	56.000	0.000	NA		NA
3109	3110	APE_0460.1	APE_0461			FALSE	0.047	234.000	0.000	NA		NA
3114	3115	APE_0468.1	APE_0469.1			FALSE	0.103	116.000	0.000	NA		NA
3117	1786915	APE_0471.1	APE_0471a			FALSE	0.032	354.000	0.000	NA		NA
1786915	1786916	APE_0471a	APE_0471b			TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
1786916	3118	APE_0471b	APE_0471c			TRUE	0.788	10.000	0.000	NA		NA
3118	3119	APE_0471c	APE_0472			FALSE	0.308	41.000	0.000	NA		NA
3119	1786917	APE_0472	APE_0472a			FALSE	0.237	-45.000	0.000	NA		NA
1786917	3120	APE_0472a	APE_0472b.1			FALSE	0.328	40.000	0.000	NA		NA
1786919	3121	APE_tRNA08	APE_0473.1			FALSE	0.200	47.000	0.000	NA		NA
3122	3123	APE_0475.1	APE_0476.1			FALSE	0.438	74.000	0.144	NA		NA
1786920	3124	APE_0477.1	APE_0478.1		moaA	FALSE	0.098	80.000	0.000	NA		NA
3127	3128	APE_0481.1	APE_0482			FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
3132	1786922	APE_0487	APE_tRNA10	loxD		FALSE	0.095	75.000	0.000	NA		NA
1786922	1786923	APE_tRNA10	APE_tRNA11			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
3133	3134	APE_0488.1	APE_0489			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3140	3141	APE_0496.1	APE_0498	rnhB		TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
3141	3142	APE_0498	APE_0500.1			FALSE	0.081	152.000	0.000	NA		NA
3142	3143	APE_0500.1	APE_0502			TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
3144	3145	APE_0503.1	APE_0505			FALSE	0.181	56.000	0.004	NA		NA
3145	3146	APE_0505	APE_0506		nfi	FALSE	0.101	92.000	0.000	NA		NA
3146	3147	APE_0506	APE_0507.1	nfi	psmB	FALSE	0.207	108.000	0.015	1.000	N	NA
3148	3150	APE_0508.1	APE_0510.1			FALSE	0.262	90.000	0.025	1.000		NA
3151	3152	APE_0511.1	APE_0513.1	rtcA	nadM	TRUE	0.815	21.000	0.017	1.000	N	NA
3153	3154	APE_0514	APE_0516.1			TRUE	0.923	-24.000	0.060	NA	Y	NA
3154	3155	APE_0516.1	APE_0517			TRUE	0.875	0.000	0.029	NA	N	NA
3157	3158	APE_0521.1	APE_0522.1	psmB		FALSE	0.143	237.000	0.027	1.000		NA
3160	3161	APE_0525a	APE_0525b		rpl37e	TRUE	0.948	30.000	0.439	1.000	N	NA
3161	3162	APE_0525b	APE_0526.1	rpl37e	pepQ	FALSE	0.102	112.000	0.000	1.000	N	NA
3163	3164	APE_0528	APE_0531.1			FALSE	0.119	56.000	0.000	1.000	N	NA
3165	3166	APE_0532.1	APE_0534.1			TRUE	0.931	48.000	0.320	1.000	Y	NA
3166	3167	APE_0534.1	APE_0535			TRUE	0.897	-7.000	0.080	1.000	N	NA
3168	1786924	APE_0536.1	APE_tRNA12			FALSE	0.025	545.000	0.000	NA		NA
3169	3171	APE_0537.1	APE_0537a		rpl13e	TRUE	0.701	8.000	0.000	NA	N	NA
1786925	3174	APE_tRNA13	APE_0542.1			FALSE	0.112	108.000	0.000	NA		NA
3174	1786926	APE_0542.1	APE_0543			FALSE	0.215	46.000	0.000	NA		NA
3177	1786927	APE_0546.1	APE_0546a		rpl21e	TRUE	0.931	46.000	0.255	1.000	Y	NA
1786927	3179	APE_0546a	APE_0549.1	rpl21e	rpoF	TRUE	0.883	43.000	0.479	1.000		NA
3179	3180	APE_0549.1	APE_0550	rpoF		TRUE	0.765	94.000	0.730	1.000		NA
3180	3182	APE_0550	APE_0553		ksgA	TRUE	0.860	-55.000	0.049	1.000	Y	NA
3182	3183	APE_0553	APE_0554.1	ksgA		TRUE	0.972	3.000	0.000	1.000	Y	NA
3183	3184	APE_0554.1	APE_0555.1			TRUE	0.924	-12.000	0.000	1.000	Y	NA
3184	3185	APE_0555.1	APE_0557			TRUE	0.544	-34.000	0.036	1.000	N	NA
3189	1786928	APE_0562.1	APE_0562a		aroQ	TRUE	0.966	-10.000	0.057	1.000	Y	NA
1786928	3191	APE_0562a	APE_0564	aroQ	aroC	TRUE	0.986	-10.000	0.026	0.006	Y	NA
3191	3192	APE_0564	APE_0569	aroC	aroA	TRUE	0.967	-10.000	0.057	1.000	Y	NA
3192	3193	APE_0569	APE_0572	aroA	aroK	TRUE	0.948	-12.000	0.018	1.000	Y	NA
3193	3194	APE_0572	APE_0574.1	aroK	aroE	TRUE	0.989	0.000	0.004	0.043	Y	NA
3194	3196	APE_0574.1	APE_0577	aroE	aroD	TRUE	0.960	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3196	3197	APE_0577	APE_0579	aroD	aroB	TRUE	0.992	7.000	0.000	0.006	Y	NA
3197	3198	APE_0579	APE_0581.1	aroB	aroG	TRUE	0.964	-18.000	0.000	0.006	Y	NA
3198	3199	APE_0581.1	APE_0583	aroG		TRUE	0.684	20.000	0.000	1.000	N	NA
3199	3200	APE_0583	APE_0586.1			TRUE	0.953	40.000	0.000	0.002	Y	NA
3203	3204	APE_0591.1	APE_0593.1			FALSE	0.042	261.000	0.000	NA		NA
3205	3206	APE_0594.1	APE_0594a.1			FALSE	0.337	-25.000	0.000	NA		NA
3206	3207	APE_0594a.1	APE_0595.1			FALSE	0.115	104.000	0.000	NA		NA
1786929	3210	APE_tRNA14	APE_0598			FALSE	0.172	50.000	0.000	NA		NA
3210	1786930	APE_0598	APE_tRNA15			TRUE	0.583	26.000	0.000	NA		NA
1786930	3211	APE_tRNA15	APE_0600			FALSE	0.061	194.000	0.000	NA		NA
3211	3212	APE_0600	APE_0601			FALSE	0.325	-36.000	0.000	1.000		NA
1786931	3214	APE_0601a	APE_0603			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
1786932	3215	APE_0604	APE_0605.1			FALSE	0.117	59.000	0.000	NA		NA
3215	3216	APE_0605.1	APE_0606.1			FALSE	0.390	-22.000	0.000	NA		NA
3216	3217	APE_0606.1	APE_0607			FALSE	0.028	444.000	0.000	NA		NA
3217	3218	APE_0607	APE_0609.1			FALSE	0.060	242.000	0.000	1.000		NA
3218	3223	APE_0609.1	APE_0614.1			FALSE	0.048	304.000	0.000	1.000		NA
3223	3227	APE_0614.1	APE_0618.1			FALSE	0.098	85.000	0.000	NA		NA
3227	3229	APE_0618.1	APE_0620.1			FALSE	0.101	66.000	0.000	NA		NA
3231	3233	APE_0621.1	APE_0623.1			FALSE	0.230	-52.000	0.000	NA		NA
3234	1786934	APE_0624.1	APE_tRNA16	ahcY		FALSE	0.101	66.000	0.000	NA		NA
1786934	3236	APE_tRNA16	APE_0628.1			FALSE	0.036	300.000	0.000	NA		NA
3236	3238	APE_0628.1	APE_0630			FALSE	0.088	140.000	0.000	NA		NA
3246	3248	APE_0644.1	APE_0648.1			TRUE	0.671	21.000	0.000	NA		NA
3250	3251	APE_0650.1	APE_0650a.1	ppsA	secG	FALSE	0.046	167.000	0.000	NA	N	NA
3251	3252	APE_0650a.1	APE_0654.1	secG		FALSE	0.061	194.000	0.000	NA		NA
3252	3254	APE_0654.1	APE_0656.1			TRUE	0.556	28.000	0.000	NA		NA
3254	1786935	APE_0656.1	APE_0656a			TRUE	0.812	39.000	0.132	1.000		NA
3257	3258	APE_0661.1	APE_0662.1		hisS	FALSE	0.415	-19.000	0.000	NA		NA
3259	3260	APE_0663	APE_0665		rpiA	TRUE	0.891	8.000	0.009	1.000		NA
3260	1786936	APE_0665	APE_rnpRNA01	rpiA		FALSE	0.027	483.000	0.000	NA		NA
3262	1786937	APE_0667	APE_tRNA17	priB		FALSE	0.350	39.000	0.000	NA		NA
3266	3267	APE_0673.1	APE_0674.1	atpI	aspC	TRUE	0.733	16.000	0.000	1.000	N	NA
3268	3269	APE_0675.1	APE_0676		panB	FALSE	0.110	147.000	0.000	1.000		NA
3269	3270	APE_0676	APE_0677.1	panB	panE	TRUE	0.966	22.000	0.019	1.000	Y	NA
3270	1786938	APE_0677.1	APE_tRNA18	panE		FALSE	0.111	61.000	0.000	NA		NA
3272	3273	APE_0680.1	APE_0680a.1			FALSE	0.095	69.000	0.000	NA		NA
3274	3275	APE_0681.1	APE_0682.1			TRUE	0.562	-10.000	0.000	NA		NA
3276	3277	APE_0682a.1	APE_0683			TRUE	0.541	29.000	0.000	NA		NA
3277	3278	APE_0683	APE_0685			FALSE	0.349	-24.000	0.000	1.000	N	NA
3278	3279	APE_0685	APE_0686		mtnA	TRUE	0.648	57.000	0.009	1.000	Y	NA
3282	3286	APE_0691	APE_0695.1			TRUE	0.826	5.000	0.000	1.000		NA
3286	3287	APE_0695.1	APE_0697			TRUE	0.522	34.000	0.000	1.000		NA
3289	1786939	APE_0700	APE_tRNA19			FALSE	0.101	91.000	0.000	NA		NA
3292	3293	APE_0703.1	APE_0706.1	top6A	top6B	TRUE	0.998	19.000	0.328	0.002	Y	NA
3294	1786940	APE_0708.1	APE_0708a			TRUE	0.633	23.000	0.000	NA		NA
1786940	3295	APE_0708a	APE_0710.1			TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
3297	3298	APE_0715.1	APE_0716.1	trkH		FALSE	0.101	156.000	0.000	1.000		NA
3299	1786941	APE_0718	APE_0718a			TRUE	0.521	-13.000	0.000	NA		NA
1786941	3301	APE_0718a	APE_0720			TRUE	0.774	4.000	0.000	NA		NA
3301	1786942	APE_0720	APE_0720a			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
1786943	1786944	APE_0722a	APE_0722b			FALSE	0.031	358.000	0.000	NA		NA
1786944	1786945	APE_0722b	APE_0722c			FALSE	0.114	106.000	0.000	NA		NA
1786945	3306	APE_0722c	APE_0725.1			FALSE	0.143	53.000	0.000	NA		NA
3306	3308	APE_0725.1	APE_0727			FALSE	0.101	91.000	0.000	NA		NA
3308	3309	APE_0727	APE_0728			FALSE	0.080	154.000	0.000	NA		NA
3309	1786946	APE_0728	APE_0728a			TRUE	0.643	22.000	0.000	NA		NA
3311	1786948	APE_0730	APE_0730a			TRUE	0.787	11.000	0.000	NA		NA
1786948	3313	APE_0730a	APE_0731			FALSE	0.103	65.000	0.000	NA		NA
3316	3317	APE_0734	APE_0735.1			TRUE	0.616	-7.000	0.000	NA		NA
3317	3318	APE_0735.1	APE_0736			TRUE	0.733	17.000	0.000	NA		NA
3318	3319	APE_0736	APE_0737			TRUE	0.467	-16.000	0.000	NA		NA
3321	3322	APE_0741	APE_0743			FALSE	0.085	146.000	0.000	NA		NA
3324	3325	APE_0745.1	APE_0748.1			FALSE	0.064	67.000	0.000	NA	N	NA
3325	1786950	APE_0748.1	APE_0748a			TRUE	0.978	18.000	0.037	NA	Y	NA
1786950	3327	APE_0748a	APE_0751			TRUE	0.944	-3.000	0.148	1.000	N	NA
3327	3328	APE_0751	APE_0754.1			TRUE	0.976	-3.000	0.387	1.000		NA
3328	3330	APE_0754.1	APE_0756.1			FALSE	0.155	58.000	0.000	1.000		NA
3330	3331	APE_0756.1	APE_0759.1			FALSE	0.404	-13.000	0.000	NA	N	NA
3331	3332	APE_0759.1	APE_0760.1			FALSE	0.026	511.000	0.000	NA		NA
3332	3333	APE_0760.1	APE_0761.1			TRUE	0.803	50.000	0.500	NA		NA
3338	3339	APE_0767.1	APE_0768.1	speE		TRUE	0.507	30.000	0.000	1.000	N	NA
3339	3341	APE_0768.1	APE_0771.1			FALSE	0.114	101.000	0.000	NA		NA
3341	3342	APE_0771.1	APE_0772			FALSE	0.094	73.000	0.000	NA		NA
3342	3343	APE_0772	APE_0773.1			FALSE	0.048	231.000	0.000	NA		NA
3343	3344	APE_0773.1	APE_0774.1			TRUE	0.467	-16.000	0.000	NA		NA
3348	3349	APE_0778	APE_0781.1			FALSE	0.080	146.000	0.000	1.000	N	NA
3349	3350	APE_0781.1	APE_0782.1		trm1	FALSE	0.230	-40.000	0.000	1.000	N	NA
3352	3353	APE_0785.1	APE_0786.1			FALSE	0.107	152.000	0.000	1.000		NA
3353	3354	APE_0786.1	APE_0787.1		tfb	FALSE	0.106	108.000	0.000	1.000	N	NA
3354	3355	APE_0787.1	APE_0788.1	tfb		FALSE	0.102	119.000	0.000	NA		NA
3355	3356	APE_0788.1	APE_0789		rps8e	TRUE	0.510	42.000	0.022	NA		NA
3357	3358	APE_0790	APE_0791.1			FALSE	0.305	116.000	0.051	NA		NA
3359	3360	APE_0792.1	APE_0793.1	aoxA	aoxB	TRUE	0.998	13.000	0.250	0.003	Y	NA
3360	3361	APE_0793.1	APE_0795.1	aoxB	aoxC	TRUE	0.757	15.000	0.000	NA		NA
3361	3362	APE_0795.1	APE_0796.1	aoxC		FALSE	0.043	254.000	0.000	NA		NA
3367	3368	APE_0803.1	APE_0805			FALSE	0.099	64.000	0.000	1.000	N	NA
3369	3370	APE_0807.1	APE_0809.1		thrS	FALSE	0.067	167.000	0.000	1.000	N	NA
3370	3371	APE_0809.1	APE_0812	thrS		FALSE	0.184	53.000	0.000	1.000		NA
3371	3372	APE_0812	APE_0813.1			TRUE	0.769	14.000	0.000	NA		NA
3372	3374	APE_0813.1	APE_0815.1			FALSE	0.030	414.000	0.000	NA		NA
3374	3375	APE_0815.1	APE_0816			TRUE	0.616	-7.000	0.000	NA		NA
1786953	3376	APE_tRNA21	APE_0818.1			FALSE	0.055	207.000	0.000	NA		NA
3376	1786954	APE_0818.1	APE_0818a			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
1786954	3378	APE_0818a	APE_0820.1			FALSE	0.090	139.000	0.000	NA		NA
3378	3379	APE_0820.1	APE_0821			TRUE	0.756	1.000	0.000	NA		NA
3384	1786955	APE_0826a	APE_0826b			FALSE	0.320	-27.000	0.000	NA		NA
1786955	3385	APE_0826b	APE_0827.1			FALSE	0.390	-22.000	0.000	NA		NA
3385	3387	APE_0827.1	APE_0830			TRUE	0.789	9.000	0.000	NA		NA
3387	3389	APE_0830	APE_0832.1			TRUE	0.774	4.000	0.000	NA		NA
3389	3390	APE_0832.1	APE_0833.1			FALSE	0.126	56.000	0.000	NA		NA
3390	3391	APE_0833.1	APE_0836			FALSE	0.090	139.000	0.000	NA		NA
3391	3392	APE_0836	APE_0837			TRUE	0.570	27.000	0.000	NA		NA
3392	3395	APE_0837	APE_0840			TRUE	0.746	16.000	0.000	NA		NA
3395	1786956	APE_0840	APE_0840a			TRUE	0.599	25.000	0.000	NA		NA
1786956	3398	APE_0840a	APE_0843.1			TRUE	0.778	13.000	0.000	NA		NA
3398	3400	APE_0843.1	APE_0847.1			FALSE	0.431	35.000	0.000	NA		NA
3400	3401	APE_0847.1	APE_0848.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3401	3403	APE_0848.1	APE_0850			TRUE	0.505	31.000	0.000	NA		NA
3403	1786957	APE_0850	APE_0850a			TRUE	0.556	28.000	0.000	NA		NA
1786957	3405	APE_0850a	APE_0852.1			FALSE	0.159	51.000	0.000	NA		NA
3405	3408	APE_0852.1	APE_0855.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3408	3409	APE_0855.1	APE_0856			TRUE	0.643	22.000	0.000	NA		NA
3409	3410	APE_0856	APE_0858			FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
3410	1786958	APE_0858	APE_0859			FALSE	0.039	274.000	0.000	NA		NA
1786958	3411	APE_0859	APE_0860			FALSE	0.415	-19.000	0.000	NA		NA
3411	3413	APE_0860	APE_0862.1			FALSE	0.096	77.000	0.000	NA		NA
3413	3414	APE_0862.1	APE_0864.1			FALSE	0.228	45.000	0.000	NA		NA
3414	3415	APE_0864.1	APE_0865.1			FALSE	0.414	36.000	0.000	NA		NA
3415	3417	APE_0865.1	APE_0867.1			FALSE	0.104	94.000	0.000	NA		NA
3417	1786959	APE_0867.1	APE_0867a			TRUE	0.586	-9.000	0.000	NA		NA
1786959	3420	APE_0867a	APE_0867b			FALSE	0.040	267.000	0.000	NA		NA
3420	3421	APE_0867b	APE_0870.1			TRUE	0.784	12.000	0.000	NA		NA
3422	3423	APE_0871a.1	APE_0872.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3425	3426	APE_0875.1	APE_0878			FALSE	0.200	47.000	0.000	NA		NA
3426	3427	APE_0878	APE_0879.1			TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
3427	3428	APE_0879.1	APE_0880			TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
1786961	1786962	APE_0880b	APE_0880c			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
1786962	3432	APE_0880c	APE_0883			TRUE	0.745	0.000	0.000	NA		NA
3432	1786963	APE_0883	APE_0883a			TRUE	0.733	17.000	0.000	NA		NA
1786963	1786964	APE_0883a	APE_0883b			TRUE	0.778	13.000	0.000	NA		NA
1786964	1786965	APE_0883b	APE_0883c			TRUE	0.540	-12.000	0.000	NA		NA
1786965	3434	APE_0883c	APE_0885.1			TRUE	0.769	14.000	0.000	NA		NA
3434	1786966	APE_0885.1	APE_0885a			TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
1786967	3436	APE_0885b	APE_0887.1			FALSE	0.030	392.000	0.000	NA		NA
3436	3438	APE_0887.1	APE_0889.1		mpgs	TRUE	0.965	33.000	0.088	0.001		NA
3439	3440	APE_0890	APE_0890a.1			TRUE	0.538	69.000	0.250	NA		NA
3441	3442	APE_0891	APE_0892.1			FALSE	0.122	133.000	0.000	1.000		NA
3442	3444	APE_0892.1	APE_0895.1			FALSE	0.095	128.000	0.000	NA		NA
3446	3447	APE_0898.1	APE_0900.1			FALSE	0.033	342.000	0.000	NA		NA
3449	3450	APE_0903.1	APE_0906			FALSE	0.113	100.000	0.000	NA		NA
3450	3451	APE_0906	APE_0907.1			FALSE	0.066	180.000	0.000	NA		NA
3451	3452	APE_0907.1	APE_0912			FALSE	0.074	155.000	0.000	1.000	N	NA
3452	3453	APE_0912	APE_0914		rpoK	FALSE	0.090	75.000	0.000	1.000	N	NA
3453	3454	APE_0914	APE_0915.1	rpoK		FALSE	0.229	69.000	0.018	1.000		NA
3456	3457	APE_0917	APE_0919	livK	livG	FALSE	0.388	203.000	0.000	1.000	Y	NA
3457	3458	APE_0919	APE_0921	livG	livF	TRUE	0.999	3.000	0.682	0.030	Y	NA
3458	3459	APE_0921	APE_0922	livF	livH	TRUE	0.996	14.000	0.458	1.000	Y	NA
3459	3460	APE_0922	APE_0924.1	livH	livM	TRUE	0.999	13.000	0.792	0.043	Y	NA
3460	1786969	APE_0924.1	APE_tRNA23	livM		FALSE	0.098	84.000	0.000	NA		NA
1786969	3463	APE_tRNA23	APE_0928.1			FALSE	0.102	93.000	0.000	NA		NA
3463	3464	APE_0928.1	APE_0929.1			FALSE	0.113	107.000	0.000	NA		NA
3464	3465	APE_0929.1	APE_0930.1			TRUE	0.988	14.000	0.714	NA		NA
3466	3467	APE_0931	APE_0932.1	dphB		FALSE	0.349	-24.000	0.000	1.000	N	NA
3470	3471	APE_0935	APE_0938.1			FALSE	0.055	145.000	0.000	NA	N	NA
3471	3472	APE_0938.1	APE_0939			TRUE	0.784	12.000	0.000	NA		NA
3472	3473	APE_0939	APE_0940			TRUE	0.521	-13.000	0.000	NA		NA
3473	3474	APE_0940	APE_0941			FALSE	0.308	41.000	0.000	NA		NA
3474	3475	APE_0941	APE_0943			TRUE	0.992	1.000	0.027	0.043	Y	NA
3475	3476	APE_0943	APE_0944.1			TRUE	0.974	-16.000	0.029	0.043	Y	NA
3476	3477	APE_0944.1	APE_0945.1			TRUE	0.760	95.000	0.000	0.043	Y	NA
3477	3478	APE_0945.1	APE_0946		sdhB	FALSE	0.051	208.000	0.000	1.000	N	NA
3478	3479	APE_0946	APE_0947	sdhB	sdhD	TRUE	0.988	22.000	0.008	0.003	Y	NA
3479	3480	APE_0947	APE_0948.1	sdhD	sdhC	TRUE	0.998	14.000	0.157	0.001	Y	NA
3480	3481	APE_0948.1	APE_0950.1	sdhC	sdhA	TRUE	0.810	188.000	0.034	0.003	Y	NA
3481	3482	APE_0950.1	APE_0951.1	sdhA	gcvH	FALSE	0.095	91.000	0.000	1.000	N	NA
3483	3484	APE_0952.1	APE_0954	hxlA		TRUE	0.586	-9.000	0.000	NA		NA
3484	1786970	APE_0954	APE_0954a			TRUE	0.556	28.000	0.000	NA		NA
1786971	3489	APE_0957a	APE_0959		ogt	TRUE	0.568	26.000	0.000	1.000	N	NA
3489	1786972	APE_0959	APE_rRNA01	ogt		FALSE	0.203	-116.000	0.000	NA		NA
1786972	3490	APE_rRNA01	APE_0960			FALSE	0.308	41.000	0.000	NA		NA
3490	1786973	APE_0960	APE_0962			FALSE	0.172	50.000	0.000	NA		NA
1786973	3491	APE_0962	APE_0964.1			FALSE	0.074	161.000	0.000	NA		NA
3495	3497	APE_0969.1	APE_0972.1			FALSE	0.051	221.000	0.000	NA		NA
3497	3498	APE_0972.1	APE_0973.1			FALSE	0.097	68.000	0.000	NA		NA
1786975	3499	APE_0973b	APE_0974.1			FALSE	0.103	155.000	0.000	1.000		NA
3500	3501	APE_0975	APE_0976.1		rpl14e	FALSE	0.034	325.000	0.000	NA		NA
3501	3502	APE_0976.1	APE_0978.1	rpl14e	cmk	FALSE	0.268	51.000	0.020	NA	N	NA
3502	1786976	APE_0978.1	APE_0978a	cmk	rpl34e	TRUE	0.945	-3.000	0.151	1.000	N	NA
1786976	3504	APE_0978a	APE_0979.1	rpl34e		TRUE	0.791	43.000	0.000	1.000	Y	NA
3504	3505	APE_0979.1	APE_0980			FALSE	0.107	95.000	0.000	NA		NA
3505	3506	APE_0980	APE_0981.1		adkA	TRUE	0.505	31.000	0.000	NA		NA
3506	3507	APE_0981.1	APE_0983.1	adkA	secY	TRUE	0.985	3.000	0.192	0.071	N	NA
3508	3509	APE_0985.1	APE_0986.1		ribB	FALSE	0.097	125.000	0.000	NA		NA
3509	3510	APE_0986.1	APE_0988	ribB	ribC	TRUE	0.984	-25.000	0.175	0.004	Y	NA
3510	3512	APE_0988	APE_0989.1	ribC		FALSE	0.093	86.000	0.000	1.000	N	NA
3512	3513	APE_0989.1	APE_0993.1		mtaP	FALSE	0.021	853.000	0.000	1.000	N	NA
3513	3514	APE_0993.1	APE_0994	mtaP		FALSE	0.117	59.000	0.000	NA		NA
3515	1786977	APE_0996.1	APE_0996a			FALSE	0.290	42.000	0.000	NA		NA
1786977	3516	APE_0996a	APE_1000.1			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
3516	3517	APE_1000.1	APE_1001.1			FALSE	0.308	41.000	0.000	NA		NA
3517	3519	APE_1001.1	APE_1003.1			TRUE	0.720	18.000	0.000	NA		NA
3521	3523	APE_1007.1	APE_1007a			FALSE	0.089	54.000	0.000	NA	N	NA
3527	3528	APE_1013.1	APE_1014.1			FALSE	0.075	157.000	0.000	NA		NA
3528	3529	APE_1014.1	APE_1015		leuS	TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
3531	3533	APE_1023.1	APE_1026.1	dapA	helA	FALSE	0.135	53.000	0.000	1.000	N	NA
3533	3534	APE_1026.1	APE_1029	helA	helB	TRUE	0.874	18.000	0.025	NA		NA
3535	3536	APE_1031.1	APE_1035.1			TRUE	0.929	38.000	0.606	NA		NA
3537	3538	APE_1038.1	APE_1040.1	cdd		FALSE	0.095	69.000	0.000	NA		NA
3538	3539	APE_1040.1	APE_1041			FALSE	0.094	73.000	0.000	NA		NA
3540	3541	APE_1042.1	APE_1043.1			TRUE	0.963	18.000	0.222	NA		NA
3545	3546	APE_1047.1	APE_1049.1			FALSE	0.336	39.000	0.000	1.000	N	NA
3546	3549	APE_1049.1	APE_1053.1			TRUE	0.960	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3549	3550	APE_1053.1	APE_1055.1			TRUE	0.919	-13.000	0.000	1.000	Y	NA
3551	3552	APE_1056.1	APE_1059			FALSE	0.062	190.000	0.000	NA		NA
3552	3553	APE_1059	APE_1061.1			FALSE	0.093	67.000	0.000	1.000	N	NA
3553	3554	APE_1061.1	APE_1063			FALSE	0.159	51.000	0.000	NA		NA
3554	3555	APE_1063	APE_1064			FALSE	0.112	108.000	0.000	NA		NA
3556	3557	APE_1065.1	APE_1072.1	sucC	sucD	TRUE	0.998	22.000	0.537	0.001	Y	NA
3558	3560	APE_1073	APE_1078			TRUE	0.790	8.000	0.000	NA		NA
3562	3563	APE_1081.1	APE_1084.1		pfdA	FALSE	0.305	95.000	0.050	1.000	N	NA
3563	1786978	APE_1084.1	APE_1084a	pfdA	rplX	TRUE	0.981	6.000	0.348	1.000	N	NA
1786978	3565	APE_1084a	APE_1085	rplX		TRUE	0.993	-3.000	0.324	1.000	Y	NA
3565	3566	APE_1085	APE_1087.1		rpl31e	TRUE	0.895	93.000	0.474	1.000	Y	NA
3566	1786979	APE_1087.1	APE_1087a	rpl31e	rpl39e	TRUE	0.998	19.000	0.434	0.039	Y	NA
1786979	1786980	APE_1087a	APE_1087b	rpl39e		TRUE	0.621	52.000	0.163	1.000		NA
1786980	3570	APE_1087b	APE_1090		rps19e	TRUE	0.657	77.000	0.399	1.000		NA
3570	3571	APE_1090	APE_1091	rps19e		TRUE	0.986	6.000	0.056	NA	Y	NA
3571	3572	APE_1091	APE_1092.1		rnp4	TRUE	0.849	-100.000	0.070	NA	Y	NA
3572	3573	APE_1092.1	APE_1094.1	rnp4		FALSE	0.323	-25.000	0.000	1.000	N	NA
3576	3577	APE_1102	APE_1104.1		ppnK	TRUE	0.690	-37.000	0.124	NA		NA
3585	3589	APE_1123.1	APE_1127			TRUE	0.745	0.000	0.000	NA		NA
3589	3591	APE_1127	APE_1129		metG	TRUE	0.698	20.000	0.000	NA		NA
3591	3592	APE_1129	APE_1132.1	metG	rps24e	TRUE	0.551	64.000	0.000	1.000	Y	NA
3592	1786981	APE_1132.1	APE_1132a	rps24e	rps27ae	TRUE	0.999	7.000	0.487	0.039	Y	NA
1786981	3594	APE_1132a	APE_1135	rps27ae		TRUE	0.666	58.000	0.364	1.000	N	NA
3594	3595	APE_1135	APE_1136.1			TRUE	0.928	-39.000	0.187	0.001	N	NA
3595	3596	APE_1136.1	APE_1138.1		ntpA	TRUE	0.772	-7.000	0.016	1.000	N	NA
3596	3597	APE_1138.1	APE_1139	ntpA	rps15p	FALSE	0.169	66.000	0.011	1.000	N	NA
3597	3598	APE_1139	APE_1140.1	rps15p	lysC	FALSE	0.050	212.000	0.000	1.000	N	NA
3598	3599	APE_1140.1	APE_1143	lysC	asd	TRUE	0.971	-3.000	0.014	1.000	Y	NA
3599	3600	APE_1143	APE_1144.1	asd	hom	TRUE	0.973	-3.000	0.018	1.000	Y	NA
3600	3601	APE_1144.1	APE_1147.1	hom		TRUE	0.599	25.000	0.000	NA		NA
3601	1786982	APE_1147.1	APE_1147a			FALSE	0.301	-30.000	0.000	NA		NA
1786982	3608	APE_1147a	APE_1154.1		rps3ae	FALSE	0.021	2253.000	0.000	NA		NA
11399867	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6116.000	0.000	NA		NA
11542230	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6116.000	0.000	NA		NA
11684622	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6116.000	0.000	NA		NA
11399868	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6140.000	0.000	NA		NA
11542231	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6140.000	0.000	NA		NA
11684623	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6140.000	0.000	NA		NA
11399869	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6179.000	0.000	NA		NA
11542232	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6179.000	0.000	NA		NA
11684624	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6179.000	0.000	NA		NA
11399870	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6203.000	0.000	NA		NA
11542233	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6203.000	0.000	NA		NA
11684625	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6203.000	0.000	NA		NA
11399871	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6244.000	0.000	NA		NA
11542234	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6244.000	0.000	NA		NA
11684626	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6244.000	0.000	NA		NA
11399872	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6268.000	0.000	NA		NA
11542235	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6268.000	0.000	NA		NA
11684627	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6268.000	0.000	NA		NA
11399873	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6310.000	0.000	NA		NA
11542236	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6310.000	0.000	NA		NA
11684628	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6310.000	0.000	NA		NA
11399874	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6334.000	0.000	NA		NA
11542237	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6334.000	0.000	NA		NA
11684629	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6334.000	0.000	NA		NA
11399875	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6379.000	0.000	NA		NA
11542238	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6379.000	0.000	NA		NA
11684630	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6379.000	0.000	NA		NA
11399876	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6403.000	0.000	NA		NA
11542239	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6403.000	0.000	NA		NA
11684631	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6403.000	0.000	NA		NA
11399877	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6444.000	0.000	NA		NA
11542240	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6444.000	0.000	NA		NA
11684632	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6444.000	0.000	NA		NA
11399878	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6468.000	0.000	NA		NA
11542241	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6468.000	0.000	NA		NA
11684633	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6468.000	0.000	NA		NA
11399879	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6506.000	0.000	NA		NA
11542242	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6506.000	0.000	NA		NA
11684634	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6506.000	0.000	NA		NA
11399880	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6530.000	0.000	NA		NA
11542243	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6530.000	0.000	NA		NA
11684635	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6530.000	0.000	NA		NA
11399881	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6567.000	0.000	NA		NA
11542244	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6567.000	0.000	NA		NA
11684636	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6567.000	0.000	NA		NA
11399882	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6591.000	0.000	NA		NA
11542245	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6591.000	0.000	NA		NA
11684637	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6591.000	0.000	NA		NA
11399883	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6632.000	0.000	NA		NA
11542246	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6632.000	0.000	NA		NA
11684638	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6632.000	0.000	NA		NA
11399884	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6656.000	0.000	NA		NA
11542247	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6656.000	0.000	NA		NA
11684639	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6656.000	0.000	NA		NA
11399885	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6697.000	0.000	NA		NA
11542248	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6697.000	0.000	NA		NA
11684640	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6697.000	0.000	NA		NA
11399886	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6721.000	0.000	NA		NA
11542249	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6721.000	0.000	NA		NA
11684641	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6721.000	0.000	NA		NA
11399887	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6773.000	0.000	NA		NA
11542250	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6773.000	0.000	NA		NA
11684642	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6773.000	0.000	NA		NA
11399888	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6797.000	0.000	NA		NA
11542251	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6797.000	0.000	NA		NA
11684643	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6797.000	0.000	NA		NA
11399889	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6840.000	0.000	NA		NA
11542252	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6840.000	0.000	NA		NA
11684644	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6840.000	0.000	NA		NA
11399890	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6864.000	0.000	NA		NA
11542253	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6864.000	0.000	NA		NA
11684645	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6864.000	0.000	NA		NA
11399891	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6905.000	0.000	NA		NA
11542254	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6905.000	0.000	NA		NA
11684646	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6905.000	0.000	NA		NA
11399892	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6929.000	0.000	NA		NA
11542255	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6929.000	0.000	NA		NA
11684647	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6929.000	0.000	NA		NA
11399893	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6967.000	0.000	NA		NA
11542256	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6967.000	0.000	NA		NA
11684648	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6967.000	0.000	NA		NA
11399894	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6991.000	0.000	NA		NA
11542257	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6991.000	0.000	NA		NA
11684649	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	6991.000	0.000	NA		NA
11399895	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7032.000	0.000	NA		NA
11542258	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7032.000	0.000	NA		NA
11684650	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7032.000	0.000	NA		NA
11399896	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7056.000	0.000	NA		NA
11542259	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7056.000	0.000	NA		NA
11684651	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7056.000	0.000	NA		NA
11399897	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7100.000	0.000	NA		NA
11542260	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7100.000	0.000	NA		NA
11684652	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7100.000	0.000	NA		NA
11399898	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7124.000	0.000	NA		NA
11542261	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7124.000	0.000	NA		NA
11684653	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7124.000	0.000	NA		NA
11399899	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7163.000	0.000	NA		NA
11542262	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7163.000	0.000	NA		NA
11684654	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7163.000	0.000	NA		NA
11399900	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7187.000	0.000	NA		NA
11542263	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7187.000	0.000	NA		NA
11684655	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7187.000	0.000	NA		NA
11399901	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7236.000	0.000	NA		NA
11542264	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7236.000	0.000	NA		NA
11684656	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7236.000	0.000	NA		NA
11399902	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7260.000	0.000	NA		NA
11542265	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7260.000	0.000	NA		NA
11684657	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7260.000	0.000	NA		NA
11399903	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7302.000	0.000	NA		NA
11542266	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7302.000	0.000	NA		NA
11684658	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7302.000	0.000	NA		NA
11399904	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7326.000	0.000	NA		NA
11542267	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7326.000	0.000	NA		NA
11684659	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7326.000	0.000	NA		NA
11399905	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7369.000	0.000	NA		NA
11542268	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7369.000	0.000	NA		NA
11684660	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7369.000	0.000	NA		NA
11399906	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7393.000	0.000	NA		NA
11542269	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7393.000	0.000	NA		NA
11684661	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7393.000	0.000	NA		NA
11399907	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7435.000	0.000	NA		NA
11542270	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7435.000	0.000	NA		NA
11684662	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7435.000	0.000	NA		NA
11399908	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7459.000	0.000	NA		NA
11542271	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7459.000	0.000	NA		NA
11684663	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7459.000	0.000	NA		NA
11399909	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7501.000	0.000	NA		NA
11542272	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7501.000	0.000	NA		NA
11684664	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7501.000	0.000	NA		NA
11399910	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7525.000	0.000	NA		NA
11542273	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7525.000	0.000	NA		NA
11684665	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7525.000	0.000	NA		NA
11399911	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7569.000	0.000	NA		NA
11542274	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7569.000	0.000	NA		NA
11684666	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7569.000	0.000	NA		NA
11399912	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7593.000	0.000	NA		NA
11542275	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7593.000	0.000	NA		NA
11684667	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7593.000	0.000	NA		NA
11399913	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7640.000	0.000	NA		NA
11542276	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7640.000	0.000	NA		NA
11684668	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7640.000	0.000	NA		NA
11399914	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7664.000	0.000	NA		NA
11542277	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7664.000	0.000	NA		NA
11684669	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7664.000	0.000	NA		NA
11399915	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7710.000	0.000	NA		NA
11542278	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7710.000	0.000	NA		NA
11684670	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7710.000	0.000	NA		NA
11399916	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7734.000	0.000	NA		NA
11542279	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7734.000	0.000	NA		NA
11684671	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7734.000	0.000	NA		NA
11399917	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7775.000	0.000	NA		NA
11542280	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7775.000	0.000	NA		NA
11684672	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7775.000	0.000	NA		NA
11399918	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7799.000	0.000	NA		NA
11542281	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7799.000	0.000	NA		NA
11684673	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7799.000	0.000	NA		NA
11399919	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7842.000	0.000	NA		NA
11542282	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7842.000	0.000	NA		NA
11684674	3596		APE_1138.1		ntpA	FALSE	NA	7842.000	0.000	NA		NA
3608	3609	APE_1154.1	APE_1156.1	rps3ae		FALSE	0.253	60.000	0.024	NA		NA
3609	3610	APE_1156.1	APE_1158.1			TRUE	0.616	-7.000	0.000	NA		NA
3611	3612	APE_1161.1	APE_1164	rnp2		FALSE	0.297	276.000	0.000	1.000	Y	NA
3612	3613	APE_1164	APE_1167.1			TRUE	0.495	77.000	0.000	NA	Y	NA
3613	3614	APE_1167.1	APE_1169.1			FALSE	0.114	60.000	0.000	NA		NA
3614	1786983	APE_1169.1	APE_1169a			FALSE	0.024	681.000	0.000	NA		NA
1786983	3616	APE_1169a	APE_1173.1			TRUE	0.790	8.000	0.000	NA		NA
3621	3622	APE_1178	APE_1179.1	rfbC	rfbD	TRUE	0.986	4.000	0.052	1.000	Y	NA
3622	3623	APE_1179.1	APE_1180	rfbD	rfbB	TRUE	0.998	9.000	0.217	0.001	Y	NA
3623	3624	APE_1180	APE_1181	rfbB	rfbA	TRUE	0.991	13.000	0.130	1.000	Y	NA
3624	3625	APE_1181	APE_1182	rfbA		FALSE	0.032	686.000	0.000	1.000		NA
3625	3626	APE_1182	APE_1183			FALSE	0.030	751.000	0.000	1.000		NA
3626	3627	APE_1183	APE_1184			FALSE	0.024	582.000	0.000	NA		NA
3627	3628	APE_1184	APE_1186.1			FALSE	0.437	-18.000	0.000	NA		NA
3628	3629	APE_1186.1	APE_1187.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3629	3630	APE_1187.1	APE_1188			TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
3630	3631	APE_1188	APE_1189.1			TRUE	0.955	-3.000	0.000	NA	Y	NA
3631	3632	APE_1189.1	APE_1190.1			FALSE	0.328	40.000	0.000	NA		NA
3632	3633	APE_1190.1	APE_1191			FALSE	0.069	171.000	0.000	NA		NA
3633	3634	APE_1191	APE_1192			TRUE	0.778	5.000	0.000	NA		NA
3634	3635	APE_1192	APE_1193.1			FALSE	0.102	93.000	0.000	NA		NA
3635	3636	APE_1193.1	APE_1194.1			FALSE	0.042	261.000	0.000	NA		NA
3636	3637	APE_1194.1	APE_1195.1		cysC	FALSE	0.065	121.000	0.000	NA	N	NA
3638	3639	APE_1196.1	APE_1197.1		sat	TRUE	0.796	-10.000	0.021	1.000		NA
3641	3643	APE_1202.1	APE_1205.1		glmS	FALSE	0.432	175.000	0.000	1.000	Y	NA
3643	3644	APE_1205.1	APE_1208.1	glmS		TRUE	0.866	43.000	0.028	1.000	Y	NA
1786985	3647	APE_1209b	APE_1209c.1			FALSE	0.415	-19.000	0.000	NA		NA
3648	1786986	APE_1209d	APE_1209e			FALSE	0.093	133.000	0.000	NA		NA
1786986	1786987	APE_1209e	APE_1209f			TRUE	0.970	4.000	0.000	0.003		NA
1786987	3650	APE_1209f	APE_1210.1			FALSE	0.043	256.000	0.000	NA		NA
3650	3651	APE_1210.1	APE_1211.1			FALSE	0.104	94.000	0.000	NA		NA
3651	3653	APE_1211.1	APE_1213.1			FALSE	0.025	524.000	0.000	NA		NA
3653	3656	APE_1213.1	APE_1216			FALSE	0.128	86.000	0.000	1.000		NA
3659	3660	APE_1220	APE_1221			FALSE	0.097	68.000	0.000	NA		NA
3660	3662	APE_1221	APE_1223.1			FALSE	0.109	150.000	0.000	1.000		NA
3662	3663	APE_1223.1	APE_1226		metC	TRUE	0.990	-3.000	0.018	0.018	Y	NA
3664	3666	APE_1228.1	APE_1230			TRUE	0.790	8.000	0.000	NA		NA
3666	3667	APE_1230	APE_1231			TRUE	0.976	14.000	0.286	NA		NA
3667	3668	APE_1231	APE_1232		cas3	TRUE	0.973	-3.000	0.389	NA		NA
3668	3670	APE_1232	APE_1234.1	cas3		TRUE	0.910	-22.000	0.389	NA		NA
3670	3671	APE_1234.1	APE_1235			TRUE	0.928	47.000	0.318	NA	Y	NA
3671	3672	APE_1235	APE_1236.1			TRUE	0.964	8.000	0.136	NA		NA
3672	3673	APE_1236.1	APE_1237.1			FALSE	0.070	168.000	0.000	NA		NA
3673	3674	APE_1237.1	APE_1239.1		cas4	FALSE	0.301	-30.000	0.000	NA		NA
3674	1786988	APE_1239.1	APE_1239a	cas4	cas2	TRUE	0.991	2.000	0.175	NA	Y	NA
1786988	3675	APE_1239a	APE_1240.1	cas2	cas1	TRUE	0.990	4.000	0.133	NA	Y	NA
3675	3676	APE_1240.1	APE_1241.1	cas1		TRUE	0.984	-3.000	0.800	NA		NA
3676	1786989	APE_1241.1	APE_1241a			FALSE	0.021	3210.000	0.000	NA		NA
11399920	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5374.000	0.000	NA		NA
11542283	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5374.000	0.000	NA		NA
11684675	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5374.000	0.000	NA		NA
11399921	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5399.000	0.000	NA		NA
11542284	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5399.000	0.000	NA		NA
11684676	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5399.000	0.000	NA		NA
11399922	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5438.000	0.000	NA		NA
11542285	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5438.000	0.000	NA		NA
11684677	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5438.000	0.000	NA		NA
11399923	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5463.000	0.000	NA		NA
11542286	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5463.000	0.000	NA		NA
11684678	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5463.000	0.000	NA		NA
11399924	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5501.000	0.000	NA		NA
11542287	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5501.000	0.000	NA		NA
11684679	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5501.000	0.000	NA		NA
11399925	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5526.000	0.000	NA		NA
11542288	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5526.000	0.000	NA		NA
11684680	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5526.000	0.000	NA		NA
11399926	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5563.000	0.000	NA		NA
11542289	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5563.000	0.000	NA		NA
11684681	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5563.000	0.000	NA		NA
11399927	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5588.000	0.000	NA		NA
11542290	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5588.000	0.000	NA		NA
11684682	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5588.000	0.000	NA		NA
11399928	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5628.000	0.000	NA		NA
11542291	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5628.000	0.000	NA		NA
11684683	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5628.000	0.000	NA		NA
11399929	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5653.000	0.000	NA		NA
11542292	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5653.000	0.000	NA		NA
11684684	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5653.000	0.000	NA		NA
11399930	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5691.000	0.000	NA		NA
11542293	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5691.000	0.000	NA		NA
11684685	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5691.000	0.000	NA		NA
11399931	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5716.000	0.000	NA		NA
11542294	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5716.000	0.000	NA		NA
11684686	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5716.000	0.000	NA		NA
11399932	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5757.000	0.000	NA		NA
11542295	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5757.000	0.000	NA		NA
11684687	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5757.000	0.000	NA		NA
11399933	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5782.000	0.000	NA		NA
11542296	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5782.000	0.000	NA		NA
11684688	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5782.000	0.000	NA		NA
11399934	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5822.000	0.000	NA		NA
11542297	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5822.000	0.000	NA		NA
11684689	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5822.000	0.000	NA		NA
11399935	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5847.000	0.000	NA		NA
11542298	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5847.000	0.000	NA		NA
11684690	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5847.000	0.000	NA		NA
11399936	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5886.000	0.000	NA		NA
11542299	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5886.000	0.000	NA		NA
11684691	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5886.000	0.000	NA		NA
11399937	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5911.000	0.000	NA		NA
11542300	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5911.000	0.000	NA		NA
11684692	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5911.000	0.000	NA		NA
11399938	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5952.000	0.000	NA		NA
11542301	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5952.000	0.000	NA		NA
11684693	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5952.000	0.000	NA		NA
11399939	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5977.000	0.000	NA		NA
11542302	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5977.000	0.000	NA		NA
11684694	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	5977.000	0.000	NA		NA
11399940	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6015.000	0.000	NA		NA
11542303	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6015.000	0.000	NA		NA
11684695	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6015.000	0.000	NA		NA
11399941	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6040.000	0.000	NA		NA
11542304	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6040.000	0.000	NA		NA
11684696	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6040.000	0.000	NA		NA
11399942	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6077.000	0.000	NA		NA
11542305	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6077.000	0.000	NA		NA
11684697	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6077.000	0.000	NA		NA
11399943	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6102.000	0.000	NA		NA
11542306	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6102.000	0.000	NA		NA
11684698	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6102.000	0.000	NA		NA
11399944	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6141.000	0.000	NA		NA
11542307	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6141.000	0.000	NA		NA
11684699	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6141.000	0.000	NA		NA
11399945	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6166.000	0.000	NA		NA
11542308	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6166.000	0.000	NA		NA
11684700	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6166.000	0.000	NA		NA
11399946	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6203.000	0.000	NA		NA
11542309	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6203.000	0.000	NA		NA
11684701	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6203.000	0.000	NA		NA
11399947	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6228.000	0.000	NA		NA
11542310	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6228.000	0.000	NA		NA
11684702	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6228.000	0.000	NA		NA
11399948	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6270.000	0.000	NA		NA
11542311	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6270.000	0.000	NA		NA
11684703	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6270.000	0.000	NA		NA
11399949	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6295.000	0.000	NA		NA
11542312	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6295.000	0.000	NA		NA
11684704	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6295.000	0.000	NA		NA
11399950	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6333.000	0.000	NA		NA
11542313	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6333.000	0.000	NA		NA
11684705	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6333.000	0.000	NA		NA
11399951	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6358.000	0.000	NA		NA
11542314	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6358.000	0.000	NA		NA
11684706	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6358.000	0.000	NA		NA
11399952	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6396.000	0.000	NA		NA
11542315	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6396.000	0.000	NA		NA
11684707	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6396.000	0.000	NA		NA
11399953	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6421.000	0.000	NA		NA
11542316	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6421.000	0.000	NA		NA
11684708	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6421.000	0.000	NA		NA
11399954	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6468.000	0.000	NA		NA
11542317	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6468.000	0.000	NA		NA
11684709	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6468.000	0.000	NA		NA
11399955	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6493.000	0.000	NA		NA
11542318	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6493.000	0.000	NA		NA
11684710	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6493.000	0.000	NA		NA
11399956	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6532.000	0.000	NA		NA
11542319	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6532.000	0.000	NA		NA
11684711	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6532.000	0.000	NA		NA
11399957	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6557.000	0.000	NA		NA
11542320	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6557.000	0.000	NA		NA
11684712	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6557.000	0.000	NA		NA
11399958	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6597.000	0.000	NA		NA
11542321	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6597.000	0.000	NA		NA
11684713	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6597.000	0.000	NA		NA
11399959	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6622.000	0.000	NA		NA
11542322	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6622.000	0.000	NA		NA
11684714	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6622.000	0.000	NA		NA
11399960	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6662.000	0.000	NA		NA
11542323	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6662.000	0.000	NA		NA
11684715	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6662.000	0.000	NA		NA
11399961	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6687.000	0.000	NA		NA
11542324	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6687.000	0.000	NA		NA
11684716	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6687.000	0.000	NA		NA
11399962	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6729.000	0.000	NA		NA
11542325	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6729.000	0.000	NA		NA
11684717	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6729.000	0.000	NA		NA
11399963	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6754.000	0.000	NA		NA
11542326	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6754.000	0.000	NA		NA
11684718	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6754.000	0.000	NA		NA
11399964	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6798.000	0.000	NA		NA
11542327	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6798.000	0.000	NA		NA
11684719	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6798.000	0.000	NA		NA
11399965	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6823.000	0.000	NA		NA
11542328	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6823.000	0.000	NA		NA
11684720	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6823.000	0.000	NA		NA
11399966	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6865.000	0.000	NA		NA
11542329	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6865.000	0.000	NA		NA
11684721	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6865.000	0.000	NA		NA
11399967	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6890.000	0.000	NA		NA
11542330	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6890.000	0.000	NA		NA
11684722	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6890.000	0.000	NA		NA
11399968	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6929.000	0.000	NA		NA
11542331	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6929.000	0.000	NA		NA
11684723	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6929.000	0.000	NA		NA
11399969	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6954.000	0.000	NA		NA
11542332	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6954.000	0.000	NA		NA
11684724	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	6954.000	0.000	NA		NA
11399970	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7000.000	0.000	NA		NA
11542333	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7000.000	0.000	NA		NA
11684725	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7000.000	0.000	NA		NA
11399971	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7025.000	0.000	NA		NA
11542334	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7025.000	0.000	NA		NA
11684726	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7025.000	0.000	NA		NA
11399972	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7071.000	0.000	NA		NA
11542335	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7071.000	0.000	NA		NA
11684727	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7071.000	0.000	NA		NA
11399973	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7096.000	0.000	NA		NA
11542336	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7096.000	0.000	NA		NA
11684728	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7096.000	0.000	NA		NA
11399974	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7138.000	0.000	NA		NA
11542337	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7138.000	0.000	NA		NA
11684729	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7138.000	0.000	NA		NA
11399975	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7163.000	0.000	NA		NA
11542338	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7163.000	0.000	NA		NA
11684730	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7163.000	0.000	NA		NA
11399976	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7202.000	0.000	NA		NA
11542339	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7202.000	0.000	NA		NA
11684731	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7202.000	0.000	NA		NA
11399977	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7227.000	0.000	NA		NA
11542340	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7227.000	0.000	NA		NA
11684732	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7227.000	0.000	NA		NA
11399978	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7269.000	0.000	NA		NA
11542341	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7269.000	0.000	NA		NA
11684733	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7269.000	0.000	NA		NA
11399979	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7294.000	0.000	NA		NA
11542342	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7294.000	0.000	NA		NA
11684734	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7294.000	0.000	NA		NA
11399980	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7333.000	0.000	NA		NA
11542343	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7333.000	0.000	NA		NA
11684735	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7333.000	0.000	NA		NA
11399981	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7358.000	0.000	NA		NA
11542344	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7358.000	0.000	NA		NA
11684736	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7358.000	0.000	NA		NA
11399982	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7398.000	0.000	NA		NA
11542345	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7398.000	0.000	NA		NA
11684737	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7398.000	0.000	NA		NA
11399983	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7423.000	0.000	NA		NA
11542346	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7423.000	0.000	NA		NA
11684738	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7423.000	0.000	NA		NA
11399984	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7463.000	0.000	NA		NA
11542347	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7463.000	0.000	NA		NA
11684739	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7463.000	0.000	NA		NA
11399985	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7488.000	0.000	NA		NA
11542348	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7488.000	0.000	NA		NA
11684740	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7488.000	0.000	NA		NA
11399986	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7524.000	0.000	NA		NA
11542349	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7524.000	0.000	NA		NA
11684741	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7524.000	0.000	NA		NA
11399987	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7549.000	0.000	NA		NA
11542350	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7549.000	0.000	NA		NA
11684742	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7549.000	0.000	NA		NA
11399988	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7591.000	0.000	NA		NA
11542351	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7591.000	0.000	NA		NA
11684743	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7591.000	0.000	NA		NA
11399989	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7616.000	0.000	NA		NA
11542352	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7616.000	0.000	NA		NA
11684744	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7616.000	0.000	NA		NA
11399990	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7657.000	0.000	NA		NA
11542353	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7657.000	0.000	NA		NA
11684745	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7657.000	0.000	NA		NA
11399991	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7682.000	0.000	NA		NA
11542354	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7682.000	0.000	NA		NA
11684746	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7682.000	0.000	NA		NA
11399992	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7722.000	0.000	NA		NA
11542355	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7722.000	0.000	NA		NA
11684747	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7722.000	0.000	NA		NA
11399993	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7747.000	0.000	NA		NA
11542356	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7747.000	0.000	NA		NA
11684748	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7747.000	0.000	NA		NA
11399994	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7785.000	0.000	NA		NA
11542357	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7785.000	0.000	NA		NA
11684749	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7785.000	0.000	NA		NA
11399995	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7810.000	0.000	NA		NA
11542358	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7810.000	0.000	NA		NA
11684750	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7810.000	0.000	NA		NA
11399996	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7848.000	0.000	NA		NA
11542359	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7848.000	0.000	NA		NA
11684751	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7848.000	0.000	NA		NA
11399997	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7873.000	0.000	NA		NA
11542360	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7873.000	0.000	NA		NA
11684752	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7873.000	0.000	NA		NA
11399998	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7914.000	0.000	NA		NA
11542361	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7914.000	0.000	NA		NA
11684753	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7914.000	0.000	NA		NA
11399999	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7939.000	0.000	NA		NA
11542362	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7939.000	0.000	NA		NA
11684754	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7939.000	0.000	NA		NA
11400000	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7979.000	0.000	NA		NA
11542363	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7979.000	0.000	NA		NA
11684755	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	7979.000	0.000	NA		NA
11400001	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	8004.000	0.000	NA		NA
11542364	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	8004.000	0.000	NA		NA
11684756	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	8004.000	0.000	NA		NA
11400002	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	8048.000	0.000	NA		NA
11542365	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	8048.000	0.000	NA		NA
11684757	3670		APE_1234.1			FALSE	NA	8048.000	0.000	NA		NA
1786989	3680	APE_1241a	APE_1244.1			FALSE	0.266	43.000	0.000	NA		NA
3680	3681	APE_1244.1	APE_1245.1			FALSE	0.092	169.000	0.000	1.000		NA
3682	3686	APE_1248	APE_1253			TRUE	0.784	12.000	0.000	NA		NA
3686	3687	APE_1253	APE_1255.1			TRUE	0.913	24.000	0.000	0.022	N	NA
3687	3688	APE_1255.1	APE_1257			TRUE	0.587	-3.000	0.000	NA	N	NA
3688	3689	APE_1257	APE_1258.1			FALSE	0.029	435.000	0.000	NA		NA
3689	3690	APE_1258.1	APE_1260			TRUE	0.599	25.000	0.000	NA		NA
3690	3691	APE_1260	APE_1262		czrB	FALSE	0.140	113.000	0.000	1.000		NA
3691	3693	APE_1262	APE_1265.1	czrB		FALSE	0.174	49.000	0.000	1.000	N	NA
3694	3695	APE_1267.1	APE_1270.1			FALSE	0.146	99.000	0.000	1.000		NA
3695	3696	APE_1270.1	APE_1272.1			TRUE	0.912	-13.000	0.200	NA		NA
3696	3697	APE_1272.1	APE_1273.1			FALSE	0.107	114.000	0.000	NA		NA
3698	1786990	APE_1275	APE_1275a	tnaA		FALSE	0.107	95.000	0.000	NA		NA
1786990	3699	APE_1275a	APE_1275b			FALSE	0.200	-117.000	0.000	NA		NA
3699	1786991	APE_1275b	APE_1275c			FALSE	0.115	104.000	0.000	NA		NA
1786991	3700	APE_1275c	APE_1276			TRUE	0.620	24.000	0.000	NA		NA
3701	3702	APE_1277	APE_1278			FALSE	0.337	-25.000	0.000	NA		NA
3702	3703	APE_1278	APE_1279.1			FALSE	0.414	36.000	0.000	NA		NA
3703	1786992	APE_1279.1	APE_1279a			TRUE	0.746	16.000	0.000	NA		NA
3705	3706	APE_1281	APE_1284.1			FALSE	0.099	83.000	0.000	NA		NA
3706	3707	APE_1284.1	APE_1285.1			FALSE	0.159	51.000	0.000	NA		NA
3709	3710	APE_1288.1	APE_1294.1	narG	narH	TRUE	0.996	40.000	1.000	0.001	Y	NA
3710	3711	APE_1294.1	APE_1297	narH		TRUE	0.989	20.000	0.190	0.003		NA
3711	3712	APE_1297	APE_1298			FALSE	0.049	227.000	0.000	NA		NA
3712	3714	APE_1298	APE_1300.1		narJ	TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3715	3717	APE_1301.1	APE_1303.1			TRUE	0.997	8.000	0.732	NA	Y	NA
3717	3718	APE_1303.1	APE_1304.1			TRUE	0.517	94.000	0.000	NA	Y	NA
3718	3719	APE_1304.1	APE_1305			TRUE	0.987	17.000	0.000	0.032	Y	NA
3719	3720	APE_1305	APE_1307			TRUE	0.777	7.000	0.000	1.000	N	NA
3720	3721	APE_1307	APE_1308			TRUE	0.913	4.000	0.034	1.000	N	NA
3722	3723	APE_1310	APE_1313.1			FALSE	0.111	61.000	0.000	NA		NA
3723	1786993	APE_1313.1	APE_1315			TRUE	0.562	-10.000	0.000	NA		NA
1786993	3726	APE_1315	APE_1317			FALSE	0.337	-25.000	0.000	NA		NA
3726	3727	APE_1317	APE_1319.1			TRUE	0.971	25.000	0.571	NA		NA
3727	3728	APE_1319.1	APE_1322.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3728	3729	APE_1322.1	APE_1322a			TRUE	0.671	21.000	0.000	NA		NA
3731	3732	APE_1324	APE_1326.1			FALSE	0.406	109.000	0.000	0.053		NA
3733	3734	APE_1328.1	APE_1331	hyuA	hyuB	TRUE	0.975	7.000	0.000	1.000	Y	NA
3734	3735	APE_1331	APE_1333	hyuB		FALSE	0.142	62.000	0.000	1.000		NA
3735	3736	APE_1333	APE_1335.1			FALSE	0.129	84.000	0.000	1.000		NA
3738	3739	APE_1337.1	APE_1339.1			TRUE	0.769	14.000	0.000	NA		NA
3739	3740	APE_1339.1	APE_1340.1		rgy	FALSE	0.266	43.000	0.000	NA		NA
3740	3741	APE_1340.1	APE_1343	rgy		TRUE	0.963	4.000	0.125	1.000		NA
3741	3742	APE_1343	APE_1343a.1			FALSE	0.101	121.000	0.000	NA		NA
3742	3743	APE_1343a.1	APE_1345			TRUE	0.746	16.000	0.000	NA		NA
3751	3752	APE_1357	APE_1358.1			FALSE	0.058	202.000	0.000	NA		NA
3752	3753	APE_1358.1	APE_1360.1			FALSE	0.098	80.000	0.000	NA		NA
3757	3758	APE_1364.1	APE_1365.1			FALSE	0.377	41.000	0.000	1.000		NA
3758	3759	APE_1365.1	APE_1366.1		ribH	FALSE	0.351	49.000	0.012	1.000		NA
3763	3764	APE_1372.1	APE_1373			TRUE	0.521	-13.000	0.000	NA		NA
3764	1786997	APE_1373	APE_1373a			FALSE	0.109	62.000	0.000	NA		NA
1786997	3766	APE_1373a	APE_1376.1		rgy	FALSE	0.052	218.000	0.000	NA		NA
3766	3767	APE_1376.1	APE_1380.1	rgy		TRUE	0.601	43.000	0.000	0.080	N	NA
3767	3768	APE_1380.1	APE_1381.1			TRUE	0.933	-19.000	0.500	NA		NA
3768	3769	APE_1381.1	APE_1382			FALSE	0.115	103.000	0.000	NA		NA
1786998	3771	APE_tRNA25	APE_1385		uppS	FALSE	0.095	75.000	0.000	NA		NA
3773	3774	APE_1387.1	APE_1388.1			FALSE	0.390	-22.000	0.000	NA		NA
3775	3777	APE_1390.1	APE_1395.1			TRUE	0.729	145.000	0.000	0.031	Y	NA
3777	3778	APE_1395.1	APE_1396			TRUE	0.998	2.000	0.302	0.031	Y	NA
3778	3779	APE_1396	APE_1399			TRUE	0.995	8.000	0.302	1.000	Y	NA
3779	3780	APE_1399	APE_1402.1			TRUE	0.998	15.000	0.267	0.004	Y	NA
3782	3783	APE_1405.1	APE_1406.1			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
3783	1786999	APE_1406.1	APE_1406a			FALSE	0.070	169.000	0.000	NA		NA
1786999	3784	APE_1406a	APE_1407.1			FALSE	0.150	52.000	0.000	NA		NA
3785	3786	APE_1408	APE_1409.1			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
1787001	3787	APE_1409a	APE_1410.1			FALSE	0.069	173.000	0.000	NA		NA
3787	3788	APE_1410.1	APE_1411.1			TRUE	0.998	14.000	0.267	0.002	Y	NA
3788	3789	APE_1411.1	APE_1415			TRUE	0.996	25.000	0.214	0.002	Y	NA
3789	3790	APE_1415	APE_1417.1			TRUE	0.995	6.000	0.039	0.006	Y	NA
3790	3791	APE_1417.1	APE_1418.1			TRUE	0.997	11.000	0.058	0.002	Y	NA
3791	3792	APE_1418.1	APE_1419.1			TRUE	0.997	-10.000	0.565	0.006	Y	NA
3792	3793	APE_1419.1	APE_1421.1			TRUE	0.996	33.000	0.750	0.006	Y	NA
3793	3794	APE_1421.1	APE_1422			TRUE	0.997	33.000	0.867	0.006	Y	NA
3794	3795	APE_1422	APE_1426			TRUE	0.993	-15.000	0.255	0.006	Y	NA
3795	3796	APE_1426	APE_1428.1			TRUE	0.997	13.000	0.064	0.002	Y	NA
3796	3798	APE_1428.1	APE_1430.1			TRUE	0.986	21.000	0.000	0.006	Y	NA
3798	3799	APE_1430.1	APE_1432		fusA	FALSE	0.082	143.000	0.000	1.000	N	NA
3799	3800	APE_1432	APE_1436.1	fusA		TRUE	0.517	51.000	0.089	1.000	N	NA
3800	3801	APE_1436.1	APE_1437.1			FALSE	0.150	102.000	0.000	1.000		NA
3801	1787002	APE_1437.1	APE_1437a			FALSE	0.209	-85.000	0.000	NA		NA
1787002	3802	APE_1437a	APE_1440		pfdB	FALSE	0.390	-22.000	0.000	NA		NA
3802	1787003	APE_1440	APE_1440a	pfdB		TRUE	0.933	26.000	0.216	NA		NA
1787003	3804	APE_1440a	APE_1441.1		mscS	TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3804	3805	APE_1441.1	APE_1442	mscS		TRUE	0.790	8.000	0.000	NA		NA
3805	3806	APE_1442	APE_1443.1			TRUE	0.784	12.000	0.000	NA		NA
3806	3807	APE_1443.1	APE_1443a		rpl37ae	TRUE	0.840	178.000	0.111	0.039	Y	NA
3807	3808	APE_1443a	APE_1445	rpl37ae		TRUE	0.992	17.000	0.222	1.000	Y	NA
3808	3809	APE_1445	APE_1447			TRUE	0.998	-3.000	0.270	0.001	Y	NA
3809	3810	APE_1447	APE_1448			TRUE	0.999	5.000	0.484	0.013	Y	NA
3810	3811	APE_1448	APE_1449		psmA	FALSE	0.085	139.000	0.000	1.000	N	NA
3811	3812	APE_1449	APE_1450.1	psmA	rnp3	FALSE	0.069	163.000	0.000	1.000	N	NA
3812	3813	APE_1450.1	APE_1451.1	rnp3		TRUE	0.980	11.000	0.017	NA	Y	NA
3813	3814	APE_1451.1	APE_1452		rpl15e	TRUE	0.609	108.000	0.012	NA	Y	NA
3816	3817	APE_1457	APE_1458			FALSE	0.138	115.000	0.000	1.000		NA
3817	1787004	APE_1458	APE_1458a		lysM	FALSE	0.072	156.000	0.000	1.000	N	NA
1787004	3819	APE_1458a	APE_1461.1	lysM	lysZ	TRUE	0.816	-3.000	0.013	1.000	N	NA
3819	3820	APE_1461.1	APE_1462	lysZ	lysY	TRUE	0.995	21.000	0.058	0.001	Y	NA
1787005	3821	APE_1462a	APE_1463	lysW	lysX	TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3821	3822	APE_1463	APE_1464	lysX	lysJ	TRUE	0.605	24.000	0.000	1.000	N	NA
3822	1787006	APE_1464	APE_1467.1	lysJ	lysK	TRUE	0.938	-40.000	0.243	1.000	Y	NA
1787006	3824	APE_1467.1	APE_1470.1	lysK		FALSE	0.039	278.000	0.000	NA		NA
3824	3825	APE_1470.1	APE_1471.1			TRUE	0.789	32.000	0.053	NA		NA
3826	3827	APE_1472	APE_1473.1			TRUE	0.997	-10.000	0.375	0.002	Y	NA
3827	1787007	APE_1473.1	APE_1473a			FALSE	0.159	51.000	0.000	NA		NA
1787007	3829	APE_1473a	APE_1477			FALSE	0.115	102.000	0.000	NA		NA
3830	3831	APE_1478.1	APE_1481.1		nudF	FALSE	0.083	149.000	0.000	NA		NA
3831	3832	APE_1481.1	APE_1483.1	nudF		FALSE	0.390	-22.000	0.000	NA		NA
1787008	3833	APE_tRNA27	APE_1484.1			FALSE	0.059	198.000	0.000	NA		NA
1787009	3834	APE_1484a	APE_1488.1		thrC	FALSE	0.064	183.000	0.000	NA		NA
3834	3836	APE_1488.1	APE_1491.1	thrC	sirC	TRUE	0.745	15.000	0.000	1.000	N	NA
3836	3837	APE_1491.1	APE_1493	sirC	hemD	TRUE	0.869	-22.000	0.000	1.000	Y	NA
3838	3839	APE_1494	APE_1495.1			TRUE	0.761	2.000	0.000	NA		NA
3841	3842	APE_1497.1	APE_1498.1			FALSE	0.075	103.000	0.000	NA	N	NA
3842	3843	APE_1498.1	APE_1501.1			TRUE	0.609	-15.000	0.014	NA	N	NA
3844	3845	APE_1503.1	APE_1505.1			FALSE	0.065	66.000	0.000	NA	N	NA
3845	3846	APE_1505.1	APE_1507.1		guaB	FALSE	0.431	34.000	0.000	1.000	N	NA
3846	3848	APE_1507.1	APE_1509.1	guaB		TRUE	0.671	21.000	0.000	NA		NA
3850	3851	APE_1512	APE_1514.1			TRUE	0.616	-7.000	0.000	NA		NA
3851	3853	APE_1514.1	APE_1516.1			TRUE	0.812	-16.000	0.091	NA	N	NA
3853	3854	APE_1516.1	APE_1517		ino1	TRUE	0.786	151.000	0.000	0.002	Y	NA
1787010	3856	APE_1517a	APE_1520.1			FALSE	0.114	105.000	0.000	NA		NA
3857	3858	APE_1522.1	APE_1524.1	rfcS	rfcL	TRUE	0.998	5.000	0.300	0.003	Y	NA
3859	3860	APE_1525	APE_1526.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
3863	3864	APE_1529.1	APE_1530.1			FALSE	0.172	50.000	0.000	NA		NA
3867	3868	APE_1535.1	APE_1538.1		tpiA	FALSE	0.346	53.000	0.024	1.000		NA
3869	3871	APE_1539.1	APE_1543			FALSE	0.150	52.000	0.000	NA		NA
3873	3874	APE_1546	APE_1547.1			FALSE	0.122	57.000	0.000	NA		NA
3875	3876	APE_1548.1	APE_1550.1			TRUE	0.955	-3.000	0.000	NA	Y	NA
3877	3878	APE_1552	APE_1555.1			TRUE	0.718	-144.000	0.000	0.002		NA
3880	3881	APE_1557.1	APE_1558			FALSE	0.030	794.000	0.000	1.000		NA
3881	1787011	APE_1558	APE_1558a			FALSE	0.067	177.000	0.000	NA		NA
1787011	1787012	APE_1558a	APE_1558b			FALSE	0.200	47.000	0.000	NA		NA
1787013	1787014	APE_1558c	APE_tRNA28			FALSE	0.099	89.000	0.000	NA		NA
3883	3884	APE_1559.1	APE_1559a			FALSE	0.110	109.000	0.000	NA		NA
3884	3885	APE_1559a	APE_1561			FALSE	0.112	99.000	0.000	NA		NA
3886	3887	APE_1563.1	APE_1564.1			TRUE	0.562	-10.000	0.000	NA		NA
3887	3888	APE_1564.1	APE_1567.1			TRUE	0.857	37.000	0.164	1.000		NA
3888	3889	APE_1567.1	APE_1568.1			FALSE	0.094	72.000	0.000	NA		NA
3889	3890	APE_1568.1	APE_1569			FALSE	0.094	130.000	0.000	NA		NA
3890	3891	APE_1569	APE_1570		ubiA	FALSE	0.048	230.000	0.000	NA		NA
3891	3892	APE_1570	APE_1571.1	ubiA	ubiD	TRUE	0.719	53.000	0.027	NA	Y	NA
3892	3893	APE_1571.1	APE_1573	ubiD		FALSE	0.030	404.000	0.000	NA		NA
1787015	1787016	APE_tRNA29	APE_1574a			FALSE	0.228	45.000	0.000	NA		NA
1787016	3895	APE_1574a	APE_1576			TRUE	0.489	32.000	0.000	NA		NA
3895	3896	APE_1576	APE_1578			TRUE	0.999	3.000	0.737	0.004	Y	NA
3896	3897	APE_1578	APE_1581.1			TRUE	0.996	7.000	0.370	1.000	Y	NA
3897	3898	APE_1581.1	APE_1582			TRUE	0.994	37.000	0.814	0.031	Y	NA
3898	3899	APE_1582	APE_1583.1		oppA	FALSE	0.207	289.000	0.000	0.031		NA
3900	3901	APE_1585	APE_1586		cysK	FALSE	0.244	44.000	0.000	NA		NA
1787017	1787018	APE_1586a	APE_1586b			TRUE	0.835	40.000	0.000	0.002		NA
1787018	3902	APE_1586b	APE_1588			FALSE	0.431	35.000	0.000	NA		NA
1787019	1787020	APE_1588a	APE_1588b			TRUE	0.955	21.000	0.000	0.002		NA
1787020	3904	APE_1588b	APE_1591.1			TRUE	0.689	24.000	0.000	1.000		NA
3904	3905	APE_1591.1	APE_1592.1		cysS	FALSE	0.164	50.000	0.000	1.000	N	NA
3905	3906	APE_1592.1	APE_1594	cysS		TRUE	0.478	-15.000	0.000	1.000	N	NA
3906	1787021	APE_1594	APE_tRNA30			FALSE	0.098	67.000	0.000	NA		NA
1787021	1787022	APE_tRNA30	APE_1594a			FALSE	0.097	79.000	0.000	NA		NA
1787022	3907	APE_1594a	APE_1596		mat	FALSE	0.098	80.000	0.000	NA		NA
3908	3909	APE_1599.1	APE_1602.1			TRUE	0.979	14.000	0.337	NA		NA
3912	1787024	APE_1605.1	APE_1605a			TRUE	0.769	14.000	0.000	NA		NA
3913	3914	APE_1609.1	APE_1610.1			FALSE	0.254	-37.000	0.000	NA		NA
3914	3915	APE_1610.1	APE_1611			FALSE	0.101	121.000	0.000	NA		NA
3915	3916	APE_1611	APE_1614			FALSE	0.098	84.000	0.000	NA		NA
3916	3917	APE_1614	APE_1615			FALSE	0.131	55.000	0.000	NA		NA
3917	3918	APE_1615	APE_1616.1		apgM	FALSE	0.190	47.000	0.000	1.000	N	NA
1787025	3919	APE_tRNA31	APE_1617			TRUE	0.698	20.000	0.000	NA		NA
3920	3921	APE_1618.1	APE_1622.1	citB		TRUE	0.600	56.000	0.000	1.000	Y	NA
3921	3922	APE_1622.1	APE_1623			TRUE	0.583	227.000	0.000	0.040	Y	NA
3922	3923	APE_1623	APE_1626			FALSE	0.068	175.000	0.000	NA		NA
3923	3924	APE_1626	APE_1627			FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
3924	3925	APE_1627	APE_1629			FALSE	0.111	146.000	0.000	1.000		NA
3926	3927	APE_1629a.1	APE_1630.1			FALSE	0.054	203.000	0.000	1.000	N	NA
3927	3928	APE_1630.1	APE_1632			TRUE	0.958	144.000	0.674	0.030	Y	NA
3928	3929	APE_1632	APE_1633			TRUE	0.999	8.000	0.897	0.030	Y	NA
3929	3930	APE_1633	APE_1635.1			TRUE	0.998	7.000	0.368	0.030	Y	NA
3932	1787026	APE_1639	APE_1644.1	glyS		FALSE	0.287	74.000	0.036	1.000		NA
1787026	3933	APE_1644.1	APE_1645.1			FALSE	0.094	71.000	0.000	NA		NA
3933	3934	APE_1645.1	APE_1646.1		endA	FALSE	0.350	39.000	0.000	NA		NA
3935	3936	APE_1647	APE_1648.1			FALSE	0.301	-30.000	0.000	NA		NA
3936	3937	APE_1648.1	APE_1649.1			TRUE	0.733	17.000	0.000	NA		NA
3938	3939	APE_1652	APE_1655			TRUE	0.976	-10.000	0.189	0.014		NA
3939	3940	APE_1655	APE_1657.1			FALSE	0.129	84.000	0.000	1.000		NA
3940	3941	APE_1657.1	APE_1659			TRUE	0.756	3.000	0.000	1.000	N	NA
3944	3945	APE_1662.1	APE_1663.1	pyrI	pyrB	TRUE	0.998	6.000	0.197	0.001	Y	NA
3945	3946	APE_1663.1	APE_1666	pyrB		FALSE	0.398	40.000	0.000	1.000		NA
3946	3947	APE_1666	APE_1668			TRUE	0.892	7.000	0.010	1.000		NA
3947	3948	APE_1668	APE_1669.1		pdhD	FALSE	0.093	84.000	0.000	1.000	N	NA
3948	3949	APE_1669.1	APE_1671	pdhD	pdhC	TRUE	0.912	94.000	0.538	1.000	Y	NA
3949	3950	APE_1671	APE_1674	pdhC	pdhB	TRUE	0.997	16.000	0.235	0.050	Y	NA
3950	3951	APE_1674	APE_1677.1	pdhB	pdhA	TRUE	0.998	15.000	0.235	0.001	Y	NA
3954	3955	APE_1683.1	APE_1686.1			TRUE	0.505	-13.000	0.000	1.000	N	NA
3955	3956	APE_1686.1	APE_1687			TRUE	0.967	-22.000	0.000	0.001	Y	NA
3958	3959	APE_1689	APE_1690.1			FALSE	0.276	-34.000	0.000	NA		NA
3959	3960	APE_1690.1	APE_1691			TRUE	0.599	25.000	0.000	NA		NA
3961	3962	APE_1692.1	APE_1693.1			FALSE	0.244	44.000	0.000	NA		NA
3962	3963	APE_1693.1	APE_1694.1			FALSE	0.103	65.000	0.000	NA		NA
3963	3964	APE_1694.1	APE_1695.1		gcvT	FALSE	0.071	213.000	0.000	1.000		NA
3964	3965	APE_1695.1	APE_1697	gcvT		TRUE	0.733	17.000	0.000	NA		NA
3966	3967	APE_1698.1	APE_1699			TRUE	0.523	30.000	0.000	NA		NA
3967	3968	APE_1699	APE_1701.1			TRUE	0.494	-15.000	0.000	NA		NA
3969	3970	APE_1702	APE_1703	sufC	sufB	TRUE	0.884	69.000	0.466	1.000	Y	NA
3970	3971	APE_1703	APE_1706	sufB	sufD	TRUE	0.978	48.000	0.266	0.001	Y	NA
3975	3976	APE_1711	APE_1713		gltA	FALSE	0.132	121.000	0.000	1.000		NA
3978	3979	APE_1716	APE_1717.1		gatA	TRUE	0.999	-3.000	0.643	0.002	Y	NA
3979	3980	APE_1717.1	APE_1718	gatA	gatB	TRUE	0.998	-3.000	0.492	0.002	Y	NA
3980	3981	APE_1718	APE_1719.1	gatB		FALSE	0.139	114.000	0.000	1.000		NA
3981	3982	APE_1719.1	APE_1720			FALSE	0.228	239.000	0.000	0.040		NA
3982	3983	APE_1720	APE_1721			FALSE	0.109	111.000	0.000	NA		NA
3983	3984	APE_1721	APE_1722			FALSE	0.097	68.000	0.000	NA		NA
3984	1787027	APE_1722	APE_1722a			FALSE	0.097	79.000	0.000	NA		NA
3986	3987	APE_1724.1	APE_1725	soxL	soxC	TRUE	0.980	22.000	0.000	0.039	Y	NA
3987	3988	APE_1725	APE_1727.1	soxC		FALSE	0.099	122.000	0.000	NA		NA
3988	3989	APE_1727.1	APE_1728			FALSE	0.200	47.000	0.000	NA		NA
3989	3990	APE_1728	APE_1730.1			TRUE	0.999	10.000	0.700	0.030	Y	NA
3990	3991	APE_1730.1	APE_1732			TRUE	0.996	7.000	0.842	0.030	N	NA
3992	3993	APE_1734.1	APE_1735			TRUE	0.778	20.000	0.004	NA		NA
3994	3995	APE_1737.1	APE_1739.1	rps13p	rps4p	TRUE	0.998	21.000	0.512	0.034	Y	NA
3995	3996	APE_1739.1	APE_1742.1	rps4p	rps11p	TRUE	0.994	17.000	0.073	0.034	Y	NA
3996	3997	APE_1742.1	APE_1744.1	rps11p	rpoD	FALSE	0.312	80.000	0.058	1.000	N	NA
3997	3999	APE_1744.1	APE_1746	rpoD	rpl18e	TRUE	0.870	-3.000	0.031	1.000	N	NA
3999	4000	APE_1746	APE_1747	rpl18e	rpl13p	TRUE	0.987	33.000	0.075	0.003	Y	NA
4000	4001	APE_1747	APE_1749	rpl13p	rps9p	TRUE	0.998	-3.000	0.515	0.034	Y	NA
4001	4002	APE_1749	APE_1749a	rps9p	rpoN	TRUE	0.988	8.000	0.536	1.000	N	NA
4002	4003	APE_1749a	APE_1750	rpoN	rps2p	TRUE	0.885	9.000	0.015	1.000	N	NA
4004	4005	APE_1751	APE_1753.1			TRUE	0.755	-16.000	0.042	NA		NA
4005	4006	APE_1753.1	APE_1754.1			TRUE	0.778	9.000	0.000	1.000	N	NA
4006	4007	APE_1754.1	APE_1756		argS	FALSE	0.049	217.000	0.000	1.000	N	NA
4009	4011	APE_1761.1	APE_1763			FALSE	0.076	156.000	0.000	NA		NA
4011	4012	APE_1763	APE_1764.1		fgs	TRUE	0.944	1.000	0.079	NA		NA
4012	4013	APE_1764.1	APE_1765.1	fgs	fni	TRUE	0.690	73.000	0.071	0.002	N	NA
4013	4014	APE_1765.1	APE_1768.1	fni		TRUE	0.941	-3.000	0.105	1.000		NA
4014	4015	APE_1768.1	APE_1769.1			TRUE	0.830	-7.000	0.031	NA		NA
4015	4016	APE_1769.1	APE_1771			TRUE	0.867	5.000	0.010	NA		NA
4016	4017	APE_1771	APE_1773.1			FALSE	0.142	62.000	0.000	1.000		NA
4017	4018	APE_1773.1	APE_1775.1			FALSE	0.105	61.000	0.000	1.000	N	NA
4018	1787028	APE_1775.1	APE_1777			FALSE	0.025	538.000	0.000	NA		NA
4020	4021	APE_1779.1	APE_1782.1		npdA	FALSE	0.095	74.000	0.000	NA		NA
4022	4024	APE_1783.1	APE_1785.1			FALSE	0.051	223.000	0.000	NA		NA
4024	4025	APE_1785.1	APE_1786.1		gapN	FALSE	0.032	355.000	0.000	NA		NA
4027	4028	APE_1790.1	APE_1791.1		cca	TRUE	0.871	0.000	0.027	NA	N	NA
4028	4029	APE_1791.1	APE_1792	cca	ligT	TRUE	0.983	21.000	0.096	1.000	Y	NA
4032	4033	APE_1797	APE_1798.1		fbpA	TRUE	0.884	0.000	0.024	NA		NA
4033	4034	APE_1798.1	APE_1799.1	fbpA		TRUE	0.680	4.000	0.000	NA	N	NA
4034	1787029	APE_1799.1	APE_1799a			FALSE	0.054	208.000	0.000	NA		NA
4036	4038	APE_1800.1	APE_1804	pelA		FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
4038	4039	APE_1804	APE_1805.1		valS	FALSE	0.098	81.000	0.000	NA		NA
4040	1787030	APE_1807	APE_tRNA32			TRUE	0.504	-14.000	0.000	NA		NA
4043	4044	APE_1813.1	APE_1814.1			TRUE	0.757	15.000	0.000	NA		NA
4045	4046	APE_1816.1	APE_1817.1	fumC		TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
4046	4047	APE_1817.1	APE_1818		rpl7ae	FALSE	0.109	96.000	0.000	NA		NA
4047	4048	APE_1818	APE_1819	rpl7ae	truD	FALSE	0.142	162.000	0.006	1.000		NA
4049	4050	APE_1820	APE_1823		albA	FALSE	0.037	269.000	0.000	1.000	N	NA
4052	4054	APE_1825.1	APE_1827.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
4054	4055	APE_1827.1	APE_1828.1			TRUE	0.966	-3.000	0.286	NA		NA
4055	4056	APE_1828.1	APE_1829			TRUE	0.972	15.000	0.250	NA		NA
4057	4058	APE_1831.1	APE_1832	gyaR		FALSE	0.093	87.000	0.000	1.000	N	NA
4058	4059	APE_1832	APE_1832a.1		albA	FALSE	0.089	70.000	0.000	1.000	N	NA
4059	4060	APE_1832a.1	APE_1834.1	albA	prs	FALSE	0.107	100.000	0.000	1.000	N	NA
4060	4061	APE_1834.1	APE_1835	prs		TRUE	0.733	0.000	0.000	1.000	N	NA
4061	4062	APE_1835	APE_1836.1		rnz	TRUE	0.685	-7.000	0.000	1.000		NA
1787031	4063	APE_tRNA33	APE_1838.1			FALSE	0.107	63.000	0.000	NA		NA
1787032	4066	APE_tRNA34	APE_1842		rps10p	FALSE	0.055	207.000	0.000	NA		NA
4066	4067	APE_1842	APE_1844	rps10p	tuf	TRUE	0.496	333.000	0.083	1.000	Y	NA
4067	4068	APE_1844	APE_1846.1	tuf	rps7p	TRUE	0.735	74.000	0.077	1.000	Y	NA
4071	4072	APE_1849	APE_1850	rps12p		FALSE	0.308	90.000	0.057	1.000	N	NA
4072	4073	APE_1850	APE_1851.1		rpl30e	TRUE	0.935	2.000	0.068	1.000	N	NA
4073	4074	APE_1851.1	APE_1852.1	rpl30e	rpoA2	TRUE	0.698	36.000	0.026	1.000		NA
4074	4075	APE_1852.1	APE_1853.1	rpoA2	rpoA1	TRUE	0.984	15.000	0.065	0.006		NA
4075	4076	APE_1853.1	APE_1856	rpoA1	rpoB	TRUE	0.981	43.000	0.237	0.006	Y	NA
4076	4077	APE_1856	APE_1856a	rpoB	rpoH	TRUE	0.998	2.000	0.250	0.006	Y	NA
1787033	4078	APE_tRNA35	APE_1861.1			FALSE	0.033	339.000	0.000	NA		NA
4079	4080	APE_1862.1	APE_1864.1	tbp		FALSE	0.078	155.000	0.000	NA		NA
4080	1787034	APE_1864.1	APE_tRNA36			FALSE	0.159	51.000	0.000	NA		NA
4082	4083	APE_1866.1	APE_1867.1		mscS	FALSE	0.059	201.000	0.000	NA		NA
4083	4084	APE_1867.1	APE_1868.1	mscS		TRUE	0.917	15.000	0.042	NA		NA
4084	4085	APE_1868.1	APE_1869		hmgA	FALSE	0.098	67.000	0.000	NA		NA
4085	4086	APE_1869	APE_1871.1	hmgA		TRUE	0.744	-28.000	0.116	NA		NA
4086	4087	APE_1871.1	APE_1872.1			TRUE	0.989	13.000	0.756	NA		NA
4087	4088	APE_1872.1	APE_1873.1			TRUE	0.976	41.000	0.565	1.000	Y	NA
4089	4090	APE_1874.1	APE_1876			FALSE	0.088	141.000	0.000	NA		NA
4092	4093	APE_1878	APE_1880.1	ctaB		TRUE	0.583	26.000	0.000	NA		NA
4098	4099	APE_1885	APE_1886.1			FALSE	0.453	-25.000	0.005	NA		NA
4099	4100	APE_1886.1	APE_1887.1			FALSE	0.135	54.000	0.000	NA		NA
4100	4101	APE_1887.1	APE_1889			TRUE	0.733	0.000	0.000	1.000	N	NA
4101	1787037	APE_1889	APE_1889a			FALSE	0.096	78.000	0.000	NA		NA
4102	4103	APE_1891.1	APE_1892			TRUE	0.995	7.000	0.286	1.000	Y	NA
4103	4104	APE_1892	APE_1893.1			TRUE	0.946	104.000	0.286	0.030	Y	NA
4106	4107	APE_1895.1	APE_1896.1			TRUE	0.990	17.000	0.156	1.000	Y	NA
4107	4108	APE_1896.1	APE_1898			TRUE	0.996	15.000	0.156	0.075	Y	NA
4108	4109	APE_1898	APE_1899			TRUE	0.790	8.000	0.000	NA		NA
4109	4110	APE_1899	APE_1901			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
4110	1787038	APE_1901	APE_1902.1			FALSE	0.437	-18.000	0.000	NA		NA
1787038	4113	APE_1902.1	APE_1905			FALSE	0.090	139.000	0.000	NA		NA
4113	4114	APE_1905	APE_1907			TRUE	0.987	22.000	0.000	0.002	Y	NA
4114	4115	APE_1907	APE_1908.1			FALSE	0.050	226.000	0.000	NA		NA
4115	4116	APE_1908.1	APE_1909.1			FALSE	0.135	54.000	0.000	NA		NA
4116	4117	APE_1909.1	APE_1911.1			TRUE	0.784	12.000	0.000	NA		NA
4117	4118	APE_1911.1	APE_1914.1			FALSE	0.164	50.000	0.000	1.000	N	NA
4118	4120	APE_1914.1	APE_1917			FALSE	0.354	38.000	0.000	1.000	N	NA
4120	1787039	APE_1917	APE_rRNA03			FALSE	0.035	320.000	0.000	NA		NA
1787039	1787040	APE_rRNA03	APE_1921			FALSE	0.192	-1488.000	0.000	NA		NA
1787040	1787041	APE_1921	APE_rRNA05			FALSE	0.021	2731.000	0.000	NA		NA
1787041	4121	APE_rRNA05	APE_1929.1			FALSE	0.195	-1239.000	0.000	NA		NA
4125	4126	APE_1932.1	APE_1934.1			TRUE	0.922	-3.000	0.105	NA	N	NA
4127	4128	APE_1937.1	APE_1939.1			TRUE	0.582	71.000	0.320	NA		NA
4129	4130	APE_1940.1	APE_1941	hxlB		TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
4130	4132	APE_1941	APE_1943.1			TRUE	0.711	19.000	0.000	NA		NA
4132	4135	APE_1943.1	APE_1946.1			FALSE	0.115	102.000	0.000	NA		NA
4135	4136	APE_1946.1	APE_1947			FALSE	0.075	158.000	0.000	NA		NA
4136	4137	APE_1947	APE_1948			FALSE	0.057	203.000	0.000	NA		NA
4138	4139	APE_1949.1	APE_1950.1			FALSE	0.211	124.000	0.019	NA		NA
4147	4148	APE_1958.1	APE_1959.1	nadE	dfp	TRUE	0.530	80.000	0.000	1.000	Y	NA
4148	4149	APE_1959.1	APE_1961	dfp		TRUE	0.642	27.000	0.000	1.000		NA
4150	4151	APE_1962.1	APE_1963.1	glyA		FALSE	0.032	335.000	0.000	1.000	N	NA
4151	4152	APE_1963.1	APE_1964.1			TRUE	0.852	35.000	0.154	1.000	N	NA
4153	4154	APE_1965.1	APE_1966			FALSE	0.066	179.000	0.000	NA		NA
4154	4155	APE_1966	APE_1967.1			FALSE	0.097	126.000	0.000	NA		NA
4155	4156	APE_1967.1	APE_1968			FALSE	0.115	141.000	0.000	1.000		NA
4156	4157	APE_1968	APE_1971.1			TRUE	0.489	32.000	0.000	NA		NA
4158	4159	APE_1973.1	APE_1975.1			FALSE	0.097	79.000	0.000	NA		NA
4159	4160	APE_1975.1	APE_1976.1		serS	FALSE	0.038	198.000	0.000	NA	N	NA
4161	4162	APE_1977.1	APE_1979.1			FALSE	0.442	38.000	0.000	1.000		NA
4162	1787043	APE_1979.1	APE_1979a			FALSE	0.350	39.000	0.000	NA		NA
1787043	4163	APE_1979a	APE_1980.1			FALSE	0.276	-34.000	0.000	NA		NA
4166	1787044	APE_1984.1	APE_1984a			FALSE	0.115	102.000	0.000	NA		NA
4173	4174	APE_1996.1	APE_1998			FALSE	0.028	444.000	0.000	NA		NA
4174	4175	APE_1998	APE_1999			TRUE	0.756	1.000	0.000	NA		NA
4175	4177	APE_1999	APE_2001.1			TRUE	0.467	-16.000	0.000	NA		NA
4177	4178	APE_2001.1	APE_2002			TRUE	0.995	6.000	0.378	NA	Y	NA
4178	4179	APE_2002	APE_2004.1			TRUE	0.750	-25.000	0.105	1.000	N	NA
4179	4180	APE_2004.1	APE_2006.1			TRUE	0.852	-16.000	0.124	NA		NA
4180	4181	APE_2006.1	APE_2007		hflX	TRUE	0.679	47.000	0.170	NA		NA
4181	4182	APE_2007	APE_2011.1	hflX		TRUE	0.934	-10.000	0.208	1.000		NA
4186	4187	APE_2018.1	APE_2020			TRUE	0.968	18.000	0.267	NA		NA
4188	1787045	APE_2021.1	APE_2021a			FALSE	0.097	79.000	0.000	NA		NA
1787045	4189	APE_2021a	APE_2022			FALSE	0.075	159.000	0.000	NA		NA
4189	1787046	APE_2022	APE_2022a			FALSE	0.111	98.000	0.000	NA		NA
1787047	4190	APE_tRNA38	APE_2023		csd	FALSE	0.117	59.000	0.000	NA		NA
1787048	4194	APE_tRNA39	APE_2029.1			FALSE	0.022	1682.000	0.000	NA		NA
4194	4195	APE_2029.1	APE_2032.1			TRUE	0.931	16.000	0.053	1.000		NA
4195	4196	APE_2032.1	APE_2034.1		cobY	TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
4196	4197	APE_2034.1	APE_2035.1	cobY	cobD	FALSE	0.201	-33.000	0.000	NA	N	NA
4197	4198	APE_2035.1	APE_2037.1	cobD	cobS	TRUE	0.576	-18.000	0.010	1.000	N	NA
4198	4200	APE_2037.1	APE_2039.1	cobS	cbiB	TRUE	0.991	-7.000	0.046	0.003	Y	NA
4200	4201	APE_2039.1	APE_2041.1	cbiB		TRUE	0.756	-3.000	0.000	1.000		NA
4201	4202	APE_2041.1	APE_2042.1			TRUE	0.774	4.000	0.000	NA		NA
4203	4204	APE_2044.1	APE_2048	hypE	metE	FALSE	0.400	-19.000	0.000	1.000	N	NA
4204	4205	APE_2048	APE_2050.1	metE		TRUE	0.995	3.000	0.006	0.001	Y	NA
4207	4208	APE_2052.1	APE_2054.1			TRUE	0.789	9.000	0.000	NA		NA
4209	4210	APE_2055.1	APE_2056.1			FALSE	0.055	263.000	0.000	1.000		NA
4213	1787050	APE_2060.1	APE_tRNA40			FALSE	0.035	320.000	0.000	NA		NA
4214	4215	APE_2062.1	APE_2064.1		thyX	FALSE	0.208	104.000	0.005	1.000		NA
4216	4217	APE_2065.1	APE_2066.1			FALSE	0.094	71.000	0.000	NA		NA
4218	4219	APE_2067.1	APE_2068	thrB	metB	TRUE	0.975	7.000	0.000	1.000	Y	NA
4219	4220	APE_2068	APE_2069.1	metB		FALSE	0.103	116.000	0.000	NA		NA
4221	4222	APE_2070	APE_2071.1			TRUE	0.761	2.000	0.000	NA		NA
4222	4223	APE_2071.1	APE_2071a		rps17e	FALSE	0.038	440.000	0.000	1.000		NA
4224	4225	APE_2072.1	APE_2074.1		tyrS	FALSE	0.214	194.000	0.000	0.069	N	NA
4228	4229	APE_2077.1	APE_2078			FALSE	0.437	-18.000	0.000	NA		NA
4229	4230	APE_2078	APE_2080.1		nudF	TRUE	0.657	21.000	0.000	1.000	N	NA
4230	4231	APE_2080.1	APE_2081.1	nudF		FALSE	0.090	75.000	0.000	1.000	N	NA
4234	1787051	APE_2086	APE_2086a			TRUE	0.952	-7.000	0.286	NA		NA
4235	4236	APE_2087.1	APE_2089			TRUE	0.902	30.000	0.167	NA		NA
4237	4238	APE_2090	APE_2091.1	tmk		TRUE	0.473	32.000	0.000	1.000	N	NA
4240	4242	APE_2094.1	APE_2096.1			FALSE	0.090	69.000	0.000	1.000	N	NA
4242	4243	APE_2096.1	APE_2098.1			TRUE	0.781	122.000	0.129	1.000	Y	NA
4243	4244	APE_2098.1	APE_2102			FALSE	0.097	68.000	0.000	NA		NA
4244	4245	APE_2102	APE_2104.1			FALSE	0.131	55.000	0.000	NA		NA
4246	4247	APE_2105.1	APE_2106.1	udp		TRUE	0.671	-15.000	0.015	1.000	N	NA
4248	4249	APE_2108	APE_2109			FALSE	0.089	72.000	0.000	1.000	N	NA
4250	4251	APE_2110	APE_2112.1			FALSE	0.466	33.000	0.000	NA		NA
4257	4258	APE_2118.1	APE_2119.1			FALSE	0.035	323.000	0.000	NA		NA
4258	4260	APE_2119.1	APE_2121.1		gcvPB	FALSE	0.023	727.000	0.000	NA		NA
4260	4261	APE_2121.1	APE_2124.1	gcvPB	gcvPA	TRUE	0.999	6.000	0.316	0.001	Y	NA
4262	4263	APE_2125.1	APE_2126.1	bcp		FALSE	0.027	432.000	0.000	1.000	N	NA
4263	4264	APE_2126.1	APE_2128			TRUE	0.997	-10.000	0.500	0.002	Y	NA
4264	4265	APE_2128	APE_2129.1			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
4267	4268	APE_2133	APE_2136.1			FALSE	0.210	155.000	0.033	NA		NA
4269	4270	APE_2138	APE_2139.1			FALSE	0.094	70.000	0.000	NA		NA
4270	1787052	APE_2139.1	APE_2139a			FALSE	0.113	107.000	0.000	NA		NA
1787052	4272	APE_2139a	APE_2142.1		glnA	FALSE	0.094	90.000	0.000	1.000	N	NA
4273	4274	APE_2144.1	APE_2146.1			FALSE	0.027	475.000	0.000	NA		NA
4277	4278	APE_2151.1	APE_2153.1			TRUE	0.989	5.000	0.077	1.000	Y	NA
1787054	4282	APE_2154b	APE_2155.1			TRUE	0.586	-9.000	0.000	NA		NA
4285	4286	APE_2158.1	APE_2161			FALSE	0.060	244.000	0.000	1.000		NA
1787055	4287	APE_2161a	APE_2162.1		cstA	TRUE	0.778	13.000	0.000	NA		NA
4287	4288	APE_2162.1	APE_2163	cstA		TRUE	0.503	50.000	0.057	1.000		NA
4288	4289	APE_2163	APE_2164.1			TRUE	0.705	43.000	0.085	1.000		NA
4289	4290	APE_2164.1	APE_2165			TRUE	0.943	-9.000	0.000	0.001		NA
4291	4292	APE_2166	APE_2170	alaS	rpl12p	TRUE	0.589	229.000	0.084	1.000	Y	NA
4292	4293	APE_2170	APE_2171.1	rpl12p	rplP0	TRUE	0.944	54.000	0.758	1.000	Y	NA
4293	4295	APE_2171.1	APE_2173.1	rplP0	rpl1p	TRUE	0.989	14.000	0.076	1.000	Y	NA
4295	4296	APE_2173.1	APE_2174	rpl1p	rpl11p	TRUE	0.760	46.000	0.019	0.025		NA
4296	4297	APE_2174	APE_2176.1	rpl11p		TRUE	0.570	83.000	0.242	1.000		NA
4297	1787056	APE_2176.1	APE_2176a		secE	TRUE	0.986	7.000	0.506	1.000	N	NA
1787056	4299	APE_2176a	APE_2177.1	secE		TRUE	0.620	24.000	0.000	NA		NA
4299	4300	APE_2177.1	APE_2178.1			FALSE	0.113	107.000	0.000	NA		NA
4302	1787057	APE_2180.1	APE_2180a			FALSE	0.056	204.000	0.000	NA		NA
4305	4306	APE_2185.1	APE_2187.1			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
4307	4308	APE_2188.1	APE_2190			FALSE	0.073	162.000	0.000	NA		NA
1787058	1787059	APE_tRNA41	APE_tRNA42			FALSE	0.244	44.000	0.000	NA		NA
1787059	4310	APE_tRNA42	APE_2192.1		aspS	FALSE	0.150	52.000	0.000	NA		NA
4310	4311	APE_2192.1	APE_2195	aspS		FALSE	0.210	101.000	0.013	NA		NA
4311	4312	APE_2195	APE_2196			TRUE	0.880	29.000	0.110	NA		NA
4312	4313	APE_2196	APE_2199.1			TRUE	0.996	15.000	0.720	NA	Y	NA
4314	4315	APE_2199a	APE_2200	rps30e	gatD	TRUE	0.545	262.000	0.080	1.000	Y	NA
4315	4316	APE_2200	APE_2202	gatD	gatE	TRUE	0.998	3.000	0.301	0.002	Y	NA
4317	4318	APE_2206.1	APE_2207.1			TRUE	0.969	3.000	0.000	0.003		NA
4318	4319	APE_2207.1	APE_2208.1			TRUE	0.947	50.000	0.526	1.000	Y	NA
4319	4320	APE_2208.1	APE_2211.1			FALSE	0.086	136.000	0.000	1.000	N	NA
4321	4322	APE_2212.1	APE_2213			FALSE	0.045	169.000	0.000	NA	N	NA
4322	4324	APE_2213	APE_2216.1			TRUE	0.997	3.000	0.188	0.035	Y	NA
4324	4325	APE_2216.1	APE_2219			TRUE	0.993	0.000	0.000	0.001	Y	NA
4325	4326	APE_2219	APE_2220.1			FALSE	0.125	127.000	0.000	1.000		NA
4326	4327	APE_2220.1	APE_2221.1			TRUE	0.990	8.000	0.750	NA		NA
4330	4332	APE_2225.1	APE_2227			FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
4333	4337	APE_2229.1	APE_2235			FALSE	0.363	202.000	0.000	NA	Y	NA
4337	4338	APE_2235	APE_2236			FALSE	0.094	130.000	0.000	NA		NA
4338	4339	APE_2236	APE_2238.1			FALSE	0.093	133.000	0.000	NA		NA
4339	4340	APE_2238.1	APE_2239.1		adh	FALSE	0.022	886.000	0.000	NA		NA
4341	4342	APE_2240	APE_2242.1			FALSE	0.137	64.000	0.000	1.000		NA
1787060	1787061	APE_2242a	APE_2242b			FALSE	0.111	61.000	0.000	NA		NA
1787061	1787062	APE_2242b	APE_tRNA43			FALSE	0.026	523.000	0.000	NA		NA
4346	4347	APE_2247	APE_2248.1		aspC	FALSE	0.431	34.000	0.000	1.000	N	NA
4350	4351	APE_2252.1	APE_2253.1			TRUE	0.999	0.000	0.775	0.027	Y	NA
4351	4352	APE_2253.1	APE_2254.1			TRUE	0.999	16.000	0.625	0.027	Y	NA
4352	4353	APE_2254.1	APE_2256.1			FALSE	0.027	473.000	0.000	NA		NA
4354	4355	APE_2257	APE_2258	dppA	dppB	TRUE	0.926	127.000	0.222	0.027	Y	NA
4355	4356	APE_2258	APE_2260	dppB	dppC	TRUE	0.997	21.000	0.435	0.027	Y	NA
4356	4357	APE_2260	APE_2261.1	dppC	dppD	TRUE	0.991	20.000	0.228	1.000	Y	NA
4357	4358	APE_2261.1	APE_2263.1	dppD	dppF	TRUE	0.999	19.000	0.875	0.004	Y	NA
4358	4359	APE_2263.1	APE_2265.1	dppF		FALSE	0.286	45.000	0.000	1.000		NA
4359	1787063	APE_2265.1	APE_2265a			FALSE	0.062	190.000	0.000	NA		NA
1787063	4360	APE_2265a	APE_2267.1			FALSE	0.098	124.000	0.000	NA		NA
4360	4361	APE_2267.1	APE_2269.1			TRUE	0.756	-3.000	0.000	1.000		NA
4362	4363	APE_2271.1	APE_2272.1			FALSE	0.092	135.000	0.000	NA		NA
4364	4365	APE_2273.1	APE_2274			TRUE	0.992	19.000	0.286	1.000	Y	NA
4365	4366	APE_2274	APE_2275			FALSE	0.092	134.000	0.000	NA		NA
4366	4368	APE_2275	APE_2277.1			FALSE	0.064	185.000	0.000	NA		NA
4368	4369	APE_2277.1	APE_2278			FALSE	0.049	298.000	0.000	1.000		NA
4370	4371	APE_2279.1	APE_2281.1			FALSE	0.115	141.000	0.000	1.000		NA
4371	4372	APE_2281.1	APE_2283.1			FALSE	0.149	60.000	0.000	1.000		NA
1787064	4374	APE_2284a	APE_2286		thrC	FALSE	0.135	116.000	0.000	1.000		NA
4377	4378	APE_2290.1	APE_2291			FALSE	0.059	189.000	0.000	1.000	N	NA
4378	1787066	APE_2291	APE_2292.1			FALSE	0.095	165.000	0.000	1.000		NA
1787066	4380	APE_2292.1	APE_2295.1			FALSE	0.050	292.000	0.000	1.000		NA
4380	4381	APE_2295.1	APE_2296		hemA	FALSE	0.119	56.000	0.000	1.000	N	NA
4381	4382	APE_2296	APE_2298.1	hemA	hemC	TRUE	0.992	0.000	0.000	0.002	Y	NA
4382	4383	APE_2298.1	APE_2299.1	hemC	hemL	TRUE	0.994	-3.000	0.041	0.002	Y	NA
4383	4384	APE_2299.1	APE_2300.1	hemL	hemB	TRUE	0.959	45.000	0.054	0.002	Y	NA
4385	4386	APE_2302.1	APE_2305	pheS	pheT	TRUE	0.994	2.000	0.007	0.001	Y	NA
4386	4387	APE_2305	APE_2308	pheT		TRUE	0.513	-18.000	0.000	1.000		NA
4387	4388	APE_2308	APE_2310.1			FALSE	0.094	131.000	0.000	NA		NA
4388	4389	APE_2310.1	APE_2311.1			TRUE	0.494	-15.000	0.000	NA		NA
1787067	4391	APE_2311a	APE_2314			FALSE	0.045	244.000	0.000	NA		NA
4391	4392	APE_2314	APE_2315			TRUE	0.782	6.000	0.000	NA		NA
4392	1787068	APE_2315	APE_2315a			TRUE	0.523	30.000	0.000	NA		NA
1787068	4393	APE_2315a	APE_2316		trpB	FALSE	0.112	108.000	0.000	NA		NA
4393	4394	APE_2316	APE_2317.1	trpB	gltX	FALSE	0.187	70.000	0.010	1.000		NA
4396	4397	APE_2322.1	APE_2323			TRUE	0.541	29.000	0.000	NA		NA
4398	1787069	APE_2324.1	APE_tRNA45	rpl35ae		FALSE	0.101	66.000	0.000	NA		NA
4399	4400	APE_2325	APE_2326.1		atpP	FALSE	0.147	107.000	0.000	1.000		NA
4400	4402	APE_2326.1	APE_2328	atpP	proS	FALSE	0.230	80.000	0.018	1.000		NA
4402	1787070	APE_2328	APE_2328a	proS	rps26e	TRUE	0.671	66.000	0.031	1.000	Y	NA
1787070	4403	APE_2328a	APE_2330	rps26e		FALSE	0.114	106.000	0.000	NA		NA
4403	4406	APE_2330	APE_2333.1			FALSE	0.248	-39.000	0.000	NA		NA
1787071	4407	APE_2333a	APE_2334.1			FALSE	0.111	61.000	0.000	NA		NA
4409	4410	APE_2336.1	APE_2336a			FALSE	0.227	67.000	0.025	NA		NA
4412	4413	APE_2340.1	APE_2341		lipB	FALSE	0.036	311.000	0.000	NA		NA
4413	4414	APE_2341	APE_2342.1	lipB	lipB	TRUE	0.993	12.000	0.000	0.002	Y	NA
4414	4415	APE_2342.1	APE_2344.1	lipB	lipA	TRUE	0.850	-31.000	0.010	1.000	Y	NA
4415	4416	APE_2344.1	APE_2347.1	lipA		FALSE	0.337	-25.000	0.000	NA		NA
4417	4418	APE_2348	APE_2349.1	pyrF	pyrE	TRUE	0.888	42.000	0.038	1.000	Y	NA
4418	4419	APE_2349.1	APE_2350.1	pyrE		FALSE	0.047	226.000	0.000	1.000	N	NA
4423	4424	APE_2357.1	APE_2359.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
4424	1787072	APE_2359.1	APE_2360.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
4425	4426	APE_2361.1	APE_2362.1			TRUE	0.523	30.000	0.000	NA		NA
4426	4427	APE_2362.1	APE_2365.1			FALSE	0.109	62.000	0.000	NA		NA
4427	4428	APE_2365.1	APE_2366.1		aif2g	FALSE	0.287	-33.000	0.000	NA		NA
4428	4429	APE_2366.1	APE_2371.1	aif2g	rps6e	TRUE	0.824	76.000	0.222	1.000	Y	NA
4432	4433	APE_2377	APE_2379	ndk		FALSE	0.093	82.000	0.000	1.000	N	NA
4433	4434	APE_2379	APE_2379a		rpl24e	FALSE	0.113	58.000	0.000	1.000	N	NA
4436	1787073	APE_2380.1	APE_2381.1	atoE		TRUE	0.869	-24.000	0.000	0.001		NA
4437	4438	APE_2382.1	APE_2384			TRUE	0.998	27.000	0.933	0.002	Y	NA
4438	4439	APE_2384	APE_2389			TRUE	0.989	15.000	0.867	NA		NA
4439	4440	APE_2389	APE_2390.1			TRUE	0.990	14.000	0.933	NA		NA
4440	4442	APE_2390.1	APE_2392.1			FALSE	0.051	223.000	0.000	NA		NA
4442	4443	APE_2392.1	APE_2397			FALSE	0.218	-64.000	0.000	NA		NA
4444	4445	APE_2400.1	APE_2403.1	thiDN		FALSE	0.098	82.000	0.000	NA		NA
4445	4447	APE_2403.1	APE_2406.1			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
4447	4448	APE_2406.1	APE_2408.1			TRUE	0.937	-3.000	0.000	0.018	N	NA
4448	4449	APE_2408.1	APE_2409			TRUE	0.695	-3.000	0.000	NA		NA
4449	4451	APE_2409	APE_2411.1			FALSE	0.234	-49.000	0.000	NA		NA
1787074	4454	APE_tRNA46	APE_2414.1			FALSE	0.105	115.000	0.000	NA		NA
4455	4456	APE_2417.1	APE_2418.1		etfB	FALSE	0.093	132.000	0.000	NA		NA
4456	4457	APE_2418.1	APE_2419	etfB	etfA	TRUE	0.996	7.000	0.071	0.010	Y	NA
4457	4458	APE_2419	APE_2421	etfA		TRUE	0.983	21.000	0.000	0.034	Y	NA
4458	4459	APE_2421	APE_2423			FALSE	0.091	78.000	0.000	1.000	N	NA
4462	4464	APE_2426.1	APE_2430.1	napA		FALSE	0.026	441.000	0.000	1.000	N	NA
1787075	4466	APE_2431.1	APE_2433.1			TRUE	0.467	-16.000	0.000	NA		NA
4469	4470	APE_2437.1	APE_2438	deoC		TRUE	0.707	18.000	0.000	1.000	N	NA
4470	4471	APE_2438	APE_2439		mvk	FALSE	0.451	-16.000	0.000	1.000	N	NA
4471	4472	APE_2439	APE_2441.1	mvk		FALSE	0.217	45.000	0.000	1.000	N	NA
4472	4473	APE_2441.1	APE_2443.1		tfb	FALSE	0.098	94.000	0.000	1.000	N	NA
4477	4478	APE_2447	APE_2448			FALSE	0.039	415.000	0.000	1.000		NA
4478	4479	APE_2448	APE_2450.1		pepA	TRUE	0.822	4.000	0.000	1.000		NA
1787077	1787078	APE_2454.1	APE_2455.1			TRUE	0.616	-7.000	0.000	NA		NA
1787078	4481	APE_2455.1	APE_2456.1		trkA	FALSE	0.093	81.000	0.000	1.000	N	NA
4483	1787079	APE_2458	APE_2458a	eno		FALSE	0.099	83.000	0.000	NA		NA
1787079	4484	APE_2458a	APE_2460.1			FALSE	0.095	74.000	0.000	NA		NA
4484	4485	APE_2460.1	APE_2461.1		trpS	FALSE	0.089	70.000	0.000	1.000	N	NA
4485	4487	APE_2461.1	APE_2462.1	trpS		FALSE	0.023	727.000	0.000	NA		NA
4487	4488	APE_2462.1	APE_2463.1			FALSE	0.080	153.000	0.000	NA		NA
4490	4491	APE_2465.1	APE_2466			FALSE	0.067	116.000	0.000	NA	N	NA
4493	4494	APE_2468.1	APE_2470		rps25e	FALSE	0.105	51.000	0.000	NA	N	NA
4494	4495	APE_2470	APE_2472.1	rps25e		FALSE	0.107	63.000	0.000	NA		NA
4496	1787080	APE_2473.1	APE_2473a			FALSE	0.063	187.000	0.000	NA		NA
1787080	4497	APE_2473a	APE_2474.1			FALSE	0.414	36.000	0.000	NA		NA
4497	4498	APE_2474.1	APE_2480.1			FALSE	0.196	294.000	0.122	1.000	N	NA
4498	1787081	APE_2480.1	APE_2480a			TRUE	0.996	14.000	0.511	NA	Y	NA
1787081	4500	APE_2480a	APE_2481.1			FALSE	0.233	40.000	0.000	NA	N	NA
4501	4502	APE_2484.1	APE_2485.1	sixA		TRUE	0.789	9.000	0.000	NA		NA
4502	4503	APE_2485.1	APE_2486.1			FALSE	0.369	38.000	0.000	NA		NA
4503	4504	APE_2486.1	APE_2489.1			FALSE	0.093	84.000	0.000	1.000	N	NA
4504	4505	APE_2489.1	APE_2490.1			FALSE	0.103	110.000	0.000	1.000	N	NA
4506	4507	APE_2491.1	APE_2493.1			FALSE	0.101	156.000	0.000	1.000		NA
4507	4508	APE_2493.1	APE_2495.1			FALSE	0.388	127.000	0.000	0.028	N	NA
4509	4510	APE_2496.1	APE_2497	trxA	snatA	TRUE	0.504	24.000	0.000	NA	N	NA
4510	4511	APE_2497	APE_2499.1	snatA		FALSE	0.095	69.000	0.000	NA		NA
4511	4512	APE_2499.1	APE_2500.1			FALSE	0.115	103.000	0.000	NA		NA
4512	4514	APE_2500.1	APE_2502.1			TRUE	0.596	-13.000	0.000	1.000		NA
4514	4515	APE_2502.1	APE_2503.1		fabG	FALSE	0.435	101.000	0.000	0.044		NA
4518	4519	APE_2507.1	APE_2509			TRUE	0.988	17.000	0.114	1.000	Y	NA
4520	4521	APE_2512	APE_2514			TRUE	0.983	26.000	0.000	0.002	Y	NA
4521	4522	APE_2514	APE_2516			TRUE	0.981	-3.000	0.000	0.066	Y	NA
4522	4523	APE_2516	APE_2517.1			FALSE	0.074	155.000	0.000	1.000	N	NA
4526	4527	APE_2521.1	APE_2522.1	livK	livH	TRUE	0.923	97.000	0.679	1.000	Y	NA
4527	4528	APE_2522.1	APE_2523.1	livH	livM	TRUE	0.775	66.000	0.000	0.026	Y	NA
4528	4529	APE_2523.1	APE_2524.1	livM	livG	TRUE	0.960	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
4529	4530	APE_2524.1	APE_2526	livG	livF	TRUE	0.998	0.000	0.273	0.018	Y	NA
4530	4531	APE_2526	APE_2528.1	livF	hyuA	TRUE	0.974	12.000	0.000	1.000	Y	NA
4531	4533	APE_2528.1	APE_2530.1	hyuA	hyuB	TRUE	0.996	3.000	0.400	1.000	Y	NA
4534	4535	APE_2533.1	APE_2535.1			FALSE	0.094	71.000	0.000	NA		NA
4541	4542	APE_2540.1	APE_2541			TRUE	0.523	30.000	0.000	NA		NA
4543	4544	APE_2542.1	APE_2545.1			TRUE	0.961	32.000	0.750	NA		NA
4544	4545	APE_2545.1	APE_2546		trpC	FALSE	0.067	178.000	0.000	NA		NA
4545	4546	APE_2546	APE_2547	trpC	trpF	TRUE	0.998	-3.000	0.264	0.001	Y	NA
4546	4547	APE_2547	APE_2548	trpF	trpB	TRUE	0.706	-6.000	0.000	1.000		NA
4547	4548	APE_2548	APE_2550	trpB	trpA	TRUE	0.981	6.000	0.007	0.001		NA
4549	4550	APE_2551	APE_2553.1	trpD	trpE	TRUE	0.978	4.000	0.005	1.000	Y	NA
4550	4551	APE_2553.1	APE_2555	trpE	trpG	TRUE	0.995	-7.000	0.122	0.001	Y	NA
4552	4554	APE_2556.1	APE_2563			TRUE	0.999	0.000	0.833	0.001	Y	NA
4554	4555	APE_2563	APE_2565.1			FALSE	0.030	355.000	0.000	1.000	N	NA
4555	4556	APE_2565.1	APE_2567			FALSE	0.135	54.000	0.000	NA		NA
4556	4557	APE_2567	APE_2568.1			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
4557	4558	APE_2568.1	APE_2570.1		nikR	FALSE	0.027	417.000	0.000	1.000	N	NA
4560	4561	APE_2574	APE_2575		aspC	FALSE	0.107	114.000	0.000	NA		NA
4563	4564	APE_2578	APE_2579.1			TRUE	0.931	2.000	0.000	0.066	N	NA
4565	4566	APE_2580	APE_2581			FALSE	0.064	185.000	0.000	NA		NA
4569	4570	APE_2586.1	APE_2587.1			TRUE	0.984	8.000	0.058	0.026		NA
4570	4571	APE_2587.1	APE_2588			TRUE	0.888	-7.000	0.058	1.000		NA
4571	4572	APE_2588	APE_2592.1			TRUE	0.707	146.000	0.667	1.000		NA
4572	1787082	APE_2592.1	APE_2592a			FALSE	0.079	197.000	0.000	1.000		NA
1787082	4574	APE_2592a	APE_2595.1			FALSE	0.158	57.000	0.000	1.000		NA
4574	4576	APE_2595.1	APE_2598			FALSE	0.070	214.000	0.000	1.000		NA
4576	1787083	APE_2598	APE_2598a			FALSE	0.054	208.000	0.000	NA		NA
4578	4579	APE_2602	APE_2604		acsA	FALSE	0.109	96.000	0.000	NA		NA
4579	1787084	APE_2604	APE_2604a.1	acsA	acsA	TRUE	0.973	1.000	0.000	0.001		NA
4580	4581	APE_2605.1	APE_2607			TRUE	0.733	17.000	0.000	NA		NA
4581	4584	APE_2607	APE_2610			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
4584	4585	APE_2610	APE_2612.1			TRUE	0.809	15.000	0.000	1.000		NA
4588	1787086	APE_2616	APE_2616a			TRUE	0.556	28.000	0.000	NA		NA
1787086	4589	APE_2616a	APE_2617.1			FALSE	0.049	228.000	0.000	NA		NA
4589	1787087	APE_2617.1	APE_2617a			FALSE	0.446	-25.000	0.004	NA		NA
1787087	1787088	APE_2617a	APE_2617b			FALSE	0.031	368.000	0.000	NA		NA
1787088	1787089	APE_2617b	APE_2617c			FALSE	0.072	165.000	0.000	NA		NA
1787089	4592	APE_2617c	APE_2617d			FALSE	0.036	300.000	0.000	NA		NA
4592	4593	APE_2617d	APE_2617e.1			FALSE	0.308	41.000	0.000	NA		NA
4593	2754	APE_2617e.1	APE_0001			FALSE	0.026	488.000	0.000	NA		NA