MicrobesOnline Operon Predictions for Rickettsia akari str. Hartford

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3419347 3419348 A1C_00005 A1C_00010     TRUE 0.893 142.000 0.053 NA   NA
 3419348 3419349 A1C_00010 A1C_00015     TRUE 0.991 6.000 0.778 1.000   NA
 3419349 3419350 A1C_00015 A1C_00020     TRUE 0.993 1.000 0.304 1.000 Y NA
 3419350 3419351 A1C_00020 A1C_00025     TRUE 0.977 -3.000 0.088 1.000 N NA
 3419352 3419353 A1C_00030 A1C_00035   fabZ TRUE 0.901 -12.000 0.014 1.000   NA
 3419355 3419356 A1C_00045 A1C_00050   lpxD TRUE 0.777 219.000 0.212 1.000 N NA
 3419358 3419359 A1C_00060 A1C_00065     FALSE 0.016 504.000 0.000 NA   NA
 3419360 3419361 A1C_00080 A1C_00085     TRUE 0.818 -16.000 0.000 NA   NA
 3419361 3419362 A1C_00085 A1C_00090     TRUE 0.678 109.000 0.000 NA   NA
 3419362 3419363 A1C_00090 A1C_00095     TRUE 0.954 0.000 0.027 NA   NA
 3419363 3419364 A1C_00095 A1C_00100     FALSE 0.393 204.000 0.000 NA   NA
 3419364 3419365 A1C_00100 A1C_00105     TRUE 0.981 14.000 0.375 NA   NA
 3419365 3419366 A1C_00105 A1C_00110     FALSE 0.240 231.000 0.000 NA   NA
 3419366 3419367 A1C_00110 A1C_00115     TRUE 0.799 24.000 0.000 NA   NA
 3419368 3419369 A1C_00120 A1C_00125     TRUE 0.772 -73.000 0.000 NA   NA
 3419369 3419370 A1C_00125 A1C_00130     TRUE 0.607 93.000 0.000 NA   NA
 3419370 3419371 A1C_00130 A1C_00135     FALSE 0.447 197.000 0.000 NA   NA
 3419373 3419374 A1C_00145 A1C_00150     FALSE 0.020 450.000 0.000 NA   NA
 3419374 3419375 A1C_00150 A1C_00155     TRUE 0.617 168.000 0.000 NA   NA
 3419375 3419376 A1C_00155 A1C_00160     FALSE 0.017 486.000 0.000 NA   NA
 3419379 3419380 A1C_00175 A1C_00180     TRUE 0.833 -13.000 0.000 NA   NA
 3419380 3419381 A1C_00180 A1C_00185     FALSE 0.010 919.000 0.000 NA   NA
 3419381 3419382 A1C_00185 A1C_00190     TRUE 0.710 143.000 0.000 NA   NA
 3419382 3419383 A1C_00190 A1C_00195     TRUE 0.936 128.000 0.250 NA   NA
 3419383 3419384 A1C_00195 A1C_00200     FALSE 0.475 195.000 0.000 NA   NA
 3419384 3419385 A1C_00200 A1C_00205     FALSE 0.036 349.000 0.000 1.000   NA
 3419385 3419386 A1C_00205 A1C_00220   recF FALSE 0.010 896.000 0.000 1.000   NA
 3419386 3419387 A1C_00220 A1C_00225 recF   FALSE 0.152 246.000 0.000 1.000   NA
 3419387 3419388 A1C_00225 A1C_00230     TRUE 0.885 7.000 0.000 NA   NA
 3419390 3419391 A1C_00240 A1C_00245     TRUE 0.858 159.000 0.043 NA   NA
 3419391 3419392 A1C_00245 A1C_00250     TRUE 0.976 -3.000 0.195 NA   NA
 3419392 3419393 A1C_00250 A1C_00255     TRUE 0.907 195.000 0.628 0.011   NA
 3419393 3419394 A1C_00255 A1C_00260     TRUE 0.972 18.000 0.278 0.012   NA
 3419394 3419395 A1C_00260 A1C_00265     TRUE 0.997 0.000 0.863 0.012 Y NA
 3419396 3419397 A1C_00270 A1C_00275     FALSE 0.051 314.000 0.000 NA   NA
 3419397 3419398 A1C_00275 A1C_t06887     FALSE 0.593 86.000 0.000 NA   NA
 3419398 3419399 A1C_t06887 A1C_00280     FALSE 0.208 235.000 0.000 NA   NA
 3419400 3419401 A1C_00285 A1C_00290     FALSE 0.091 263.000 0.000 NA   NA
 3419401 3419402 A1C_00290 A1C_00295     FALSE 0.025 404.000 0.000 NA   NA
 3419402 3419403 A1C_00295 A1C_00300     TRUE 0.849 63.000 0.023 1.000 N NA
 3419403 3419404 A1C_00300 A1C_00305     TRUE 0.879 -12.000 0.008 NA   NA
 3419405 3419406 A1C_00310 A1C_00315     TRUE 0.939 29.000 0.125 NA   NA
 3419406 3419407 A1C_00315 A1C_00320     TRUE 0.900 -3.000 0.006 1.000   NA
 3419412 3419413 A1C_00340 A1C_00345   rpsR TRUE 0.985 25.000 0.319 0.052 Y NA
 3419413 3419414 A1C_00345 A1C_00350 rpsR rplI TRUE 0.993 12.000 0.499 0.052 Y NA
 3419414 3419415 A1C_00350 A1C_00355 rplI   FALSE 0.283 241.000 0.002 0.084 N NA
 3419415 3419416 A1C_00355 A1C_00360     TRUE 0.929 53.000 0.145 1.000 N NA
 3419416 3419417 A1C_00360 A1C_00365     TRUE 0.626 97.000 0.000 1.000   NA
 3419417 3419418 A1C_00365 A1C_00370   sdhB FALSE 0.013 578.000 0.000 1.000   NA
 3419418 3419419 A1C_00370 A1C_00375 sdhB   FALSE 0.029 380.000 0.000 NA   NA
 3419419 3419420 A1C_00375 A1C_00380     TRUE 0.783 32.000 0.004 NA   NA
 3419420 3419421 A1C_00380 A1C_00385     TRUE 0.649 76.000 0.006 NA   NA
 3419422 3419423 A1C_00390 A1C_00395     TRUE 0.956 -21.000 0.170 NA   NA
 3419424 3419425 A1C_00400 A1C_00405     TRUE 0.832 129.000 0.008 1.000 N NA
 3419425 3419426 A1C_00405 A1C_00410     TRUE 0.944 0.000 0.008 1.000 N NA
 3419426 3419427 A1C_00410 A1C_00415     TRUE 0.880 15.000 0.005 1.000   NA
 3419429 3419430 A1C_00425 A1C_00430     FALSE 0.486 194.000 0.000 NA   NA
 3419432 3419433 A1C_00440 A1C_00445     TRUE 0.969 84.000 0.875 0.052 N NA
 3419433 3419434 A1C_00445 A1C_00450   ndk TRUE 0.871 28.000 0.007 1.000 N NA
 3419434 3419435 A1C_00450 A1C_00455 ndk   TRUE 0.942 4.000 0.007 1.000 N NA
 3419435 3419436 A1C_00455 A1C_00460   gidB TRUE 0.982 -16.000 0.466 1.000 N NA
 3419436 3419437 A1C_00460 A1C_00465 gidB   TRUE 0.987 -3.000 0.339 1.000 N NA
 3419437 3419438 A1C_00465 A1C_00470     TRUE 0.990 -13.000 0.827 1.000 N NA
 3419438 3419439 A1C_00470 A1C_00475     FALSE 0.582 188.000 0.006 0.081   NA
 3419439 3419440 A1C_00475 A1C_00480     TRUE 0.932 3.000 0.013 NA   NA
 3419440 3419441 A1C_00480 A1C_00485     TRUE 0.809 35.000 0.011 NA   NA
 3419441 3419442 A1C_00485 A1C_00490     FALSE 0.027 386.000 0.000 NA   NA
 3419444 3419445 A1C_00500 A1C_00505   argS TRUE 0.962 -13.000 0.062 1.000 N NA
 3419445 3419446 A1C_00505 A1C_00510 argS   TRUE 0.765 147.000 0.008 NA   NA
 3419446 3419447 A1C_00510 A1C_00515     TRUE 0.969 18.000 0.222 NA   NA
 3419447 3419448 A1C_00515 A1C_00520     TRUE 0.738 141.000 0.003 NA   NA
 3419449 3419450 A1C_00525 A1C_00530     FALSE 0.033 354.000 0.000 NA   NA
 3419450 3419451 A1C_00530 A1C_00535     FALSE 0.015 533.000 0.000 NA   NA
 3419452 3419453 A1C_00540 A1C_00545 dcd   TRUE 0.623 209.000 0.015 1.000 N NA
 3419453 3419454 A1C_00545 A1C_00550     FALSE 0.407 225.000 0.005 1.000 N NA
 3419454 3419455 A1C_00550 A1C_00555   queF TRUE 0.958 4.000 0.038 1.000   NA
 3419456 3419457 A1C_00560 A1C_00565     TRUE 0.853 54.000 0.047 NA   NA
 3419457 3419458 A1C_00565 A1C_00570     TRUE 0.813 193.000 0.046 1.000 N NA
 3419459 3419460 A1C_00575 A1C_00580     TRUE 0.981 -13.000 0.556 1.000   NA
 3419462 3419463 A1C_00590 A1C_t06891     TRUE 0.604 92.000 0.000 NA   NA
 3419463 3419464 A1C_t06891 A1C_00595     TRUE 0.857 16.000 0.000 NA   NA
 3419464 3419465 A1C_00595 A1C_00600     FALSE 0.048 317.000 0.000 NA   NA
 3419466 3419467 A1C_00605 A1C_00610     FALSE 0.016 482.000 0.000 0.013   NA
 3419468 3419469 A1C_00615 A1C_00620 cysS rpsB FALSE 0.134 337.000 0.000 1.000 Y NA
 3419469 3419470 A1C_00620 A1C_00625 rpsB tsf TRUE 0.856 244.000 0.748 1.000 Y NA
 3419471 3419472 A1C_00630 A1C_00635     FALSE 0.024 408.000 0.000 NA   NA
 3419472 3419473 A1C_00635 A1C_00640     TRUE 0.911 97.000 0.231 NA   NA
 3419473 3419474 A1C_00640 A1C_00645     TRUE 0.975 -3.000 0.179 NA   NA
 3419474 3419475 A1C_00645 A1C_00650     TRUE 0.889 118.000 0.062 NA   NA
 3419476 3419477 A1C_00655 A1C_00660     TRUE 0.962 5.000 0.049 1.000   NA
 3419477 3419478 A1C_00660 A1C_00665     TRUE 0.963 20.000 0.070 NA N NA
 3419480 3419481 A1C_00675 A1C_00680     TRUE 0.800 -22.000 0.000 NA   NA
 3419482 3419483 A1C_00685 A1C_00690     FALSE 0.037 348.000 0.000 NA   NA
 3419483 3419484 A1C_00690 A1C_00695     TRUE 0.805 -21.000 0.000 NA   NA
 3419484 3419485 A1C_00695 A1C_00700     FALSE 0.515 190.000 0.000 NA   NA
 3419485 3419486 A1C_00700 A1C_00705     TRUE 0.632 90.000 0.004 NA   NA
 3419486 3419487 A1C_00705 A1C_00710     FALSE 0.095 313.000 0.005 1.000 N NA
 3419488 3419489 A1C_00715 A1C_00720   alr FALSE 0.475 195.000 0.000 NA   NA
 3419489 3419490 A1C_00720 A1C_00725 alr   TRUE 0.883 9.000 0.000 NA   NA
 3419490 3419491 A1C_00725 A1C_00730     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3419491 3419492 A1C_00730 A1C_00735     FALSE 0.568 210.000 0.012 NA N NA
 3419492 3419493 A1C_00735 A1C_00740     TRUE 0.799 233.000 0.178 NA Y NA
 3419493 3419494 A1C_00740 A1C_00745     TRUE 0.964 2.000 0.050 NA   NA
 3419494 3419495 A1C_00745 A1C_00750   rpmB TRUE 0.625 79.000 0.003 NA   NA
 3419495 3419496 A1C_00750 A1C_00755 rpmB   TRUE 0.970 -3.000 0.009 0.050 Y NA
 3419496 3419497 A1C_00755 A1C_t06893     FALSE 0.284 221.000 0.000 NA   NA
 3419497 3419498 A1C_t06893 A1C_00760     FALSE 0.038 342.000 0.000 NA   NA
 3419498 3419499 A1C_00760 A1C_00780     FALSE 0.010 888.000 0.000 NA   NA
 3419499 3419500 A1C_00780 A1C_00785     TRUE 0.673 299.000 0.789 NA Y NA
 3419500 3419501 A1C_00785 A1C_00790     TRUE 0.967 175.000 0.421 1.000 Y NA
 3419501 3419502 A1C_00790 A1C_00795     TRUE 0.995 -13.000 1.000 0.006 Y NA
 3419502 3419503 A1C_00795 A1C_00800     TRUE 0.997 7.000 1.000 0.006 Y NA
 3419503 3419504 A1C_00800 A1C_00805     TRUE 0.945 209.000 0.750 0.006 Y NA
 3419504 3419505 A1C_00805 A1C_00810     TRUE 0.978 188.000 0.875 0.006 Y NA
 3419505 3419506 A1C_00810 A1C_00815     TRUE 0.690 118.000 0.000 NA   NA
 3419506 3419507 A1C_00815 A1C_00820     FALSE 0.592 78.000 0.000 NA   NA
 3419507 3419508 A1C_00820 A1C_00825     FALSE 0.104 259.000 0.000 NA   NA
 3419508 3419509 A1C_00825 A1C_00830     TRUE 0.990 2.000 0.148 1.000 Y NA
 3419509 3419510 A1C_00830 A1C_00835   trmD FALSE 0.046 326.000 0.000 1.000   NA
 3419510 3419511 A1C_00835 A1C_00840 trmD   FALSE 0.599 77.000 0.002 0.003   NA
 3419511 3419512 A1C_00840 A1C_00845   rplS TRUE 0.993 16.000 0.567 1.000 Y NA
 3419514 3419515 A1C_00855 A1C_00860 secF   FALSE 0.464 232.000 0.015 1.000 N NA
 3419515 3419516 A1C_00860 A1C_00865     TRUE 0.886 125.000 0.021 1.000 N NA
 3419516 3419517 A1C_00865 A1C_00870   rnc TRUE 0.947 0.000 0.010 1.000 N NA
 3419517 3419518 A1C_00870 A1C_00875 rnc era TRUE 0.963 -7.000 0.098 0.032   NA
 3419518 3419519 A1C_00875 A1C_00880 era ruvC TRUE 0.697 98.000 0.007 1.000   NA
 3419519 3419520 A1C_00880 A1C_00885 ruvC   TRUE 0.935 -3.000 0.006 1.000 N NA
 3419521 3419522 A1C_00890 A1C_00895     FALSE 0.592 176.000 0.000 NA   NA
 3419522 3419523 A1C_00895 A1C_00900     TRUE 0.964 -3.000 0.025 NA N NA
 3419524 3419525 A1C_00905 A1C_00910     TRUE 0.843 18.000 0.000 NA   NA
 3419525 3419526 A1C_00910 A1C_00915     TRUE 0.795 -24.000 0.000 NA   NA
 3419526 3419527 A1C_00915 A1C_00920     TRUE 0.988 5.000 0.084 0.022 Y NA
 3419527 3419528 A1C_00920 A1C_00925     TRUE 0.781 79.000 0.023 NA   NA
 3419528 3419529 A1C_00925 A1C_00930     TRUE 0.763 186.000 0.026 NA   NA
 3419529 3419530 A1C_00930 A1C_00935     TRUE 0.665 161.000 0.000 NA   NA
 3419530 3419531 A1C_00935 A1C_00940     TRUE 0.888 0.000 0.000 NA   NA
 3419531 3419532 A1C_00940 A1C_00945     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3419532 3419533 A1C_00945 A1C_00950     FALSE 0.593 86.000 0.000 NA   NA
 3419533 3419534 A1C_00950 A1C_00955   sdhA TRUE 0.763 35.000 0.004 NA   NA
 3419534 3419535 A1C_00955 A1C_00960 sdhA   FALSE 0.196 258.000 0.006 1.000 N NA
 3419535 3419536 A1C_00960 A1C_00965   rpsL TRUE 0.901 158.000 0.044 1.000 N NA
 3419536 3419537 A1C_00965 A1C_00970 rpsL   TRUE 0.961 27.000 0.029 0.010 Y NA
 3419537 3419538 A1C_00970 A1C_00975     TRUE 0.987 14.000 0.114 1.000 Y NA
 3419538 3419539 A1C_00975 A1C_t06895     TRUE 0.678 109.000 0.000 NA   NA
 3419539 3419540 A1C_t06895 A1C_00980   secE FALSE 0.515 190.000 0.000 NA   NA
 3419540 3419541 A1C_00980 A1C_00985 secE nusG TRUE 0.993 11.000 0.843 1.000 N NA
 3419541 3419542 A1C_00985 A1C_00990 nusG rplK TRUE 0.891 215.000 0.681 1.000 N NA
 3419542 3419543 A1C_00990 A1C_00995 rplK rplA TRUE 0.996 6.000 0.838 0.067 Y NA
 3419543 3419544 A1C_00995 A1C_01000 rplA rplJ TRUE 0.970 102.000 0.302 0.067 Y NA
 3419544 3419545 A1C_01000 A1C_01005 rplJ rplL TRUE 0.976 190.000 0.884 0.049 Y NA
 3419545 3419546 A1C_01005 A1C_01010 rplL rpoB FALSE 0.056 885.000 0.223 1.000   NA
 3419546 3419547 A1C_01010 A1C_01015 rpoB   FALSE 0.430 319.000 0.851 0.003   NA
 3419549 3419550 A1C_01025 A1C_01030     TRUE 0.868 181.000 0.061 1.000 N NA
 3419550 3419551 A1C_01030 A1C_01035     TRUE 0.854 86.000 0.082 NA   NA
 3419551 3419552 A1C_01035 A1C_01040   aspS TRUE 0.634 79.000 0.005 NA   NA
 3419553 3419554 A1C_01045 A1C_01050     TRUE 0.813 22.000 0.000 NA   NA
 3419554 3419555 A1C_01050 A1C_01055     TRUE 0.744 46.000 0.006 NA   NA
 3419555 3419556 A1C_01055 A1C_01060     TRUE 0.883 19.000 0.011 1.000   NA
 3419556 3419557 A1C_01060 A1C_01065     TRUE 0.967 -15.000 0.250 1.000   NA
 3419557 3419558 A1C_01065 A1C_01070   gatB FALSE 0.549 205.000 0.005 1.000 N NA
 3419558 3419559 A1C_01070 A1C_01075 gatB gatA TRUE 0.967 177.000 0.492 0.004 Y NA
 3419559 3419560 A1C_01075 A1C_01080 gatA gatC TRUE 0.995 3.000 0.643 0.004 Y NA
 3419560 3419561 A1C_01080 A1C_01085 gatC frr TRUE 0.685 156.000 0.000 NA   NA
 3419561 3419562 A1C_01085 A1C_01090 frr   FALSE 0.121 255.000 0.000 NA   NA
 3419562 3419563 A1C_01090 A1C_01095   pyrH TRUE 0.883 214.000 0.626 1.000 N NA
 3419563 3419564 A1C_01095 A1C_01100 pyrH   TRUE 0.943 4.000 0.008 1.000 N NA
 3419564 3419565 A1C_01100 A1C_01105     TRUE 0.971 -16.000 0.171 1.000 N NA
 3419566 3419567 A1C_01110 A1C_01115     FALSE 0.008 1375.000 0.000 NA   NA
 3419568 3419569 A1C_01120 A1C_t06897     FALSE 0.145 249.000 0.000 NA   NA
 3419569 3419570 A1C_t06897 A1C_01125     FALSE 0.176 242.000 0.000 NA   NA
 3419570 3419571 A1C_01125 A1C_01130     FALSE 0.325 282.000 0.016 1.000 Y NA
 3419572 3419573 A1C_01135 A1C_01140 nusB   TRUE 0.944 -3.000 0.010 NA N NA
 3419575 3419576 A1C_01150 A1C_01155     TRUE 0.622 60.000 0.000 NA   NA
 3419577 3419578 A1C_01160 A1C_01165     TRUE 0.915 5.000 0.008 NA   NA
 3419583 3419584 A1C_01220 A1C_01225     TRUE 0.919 56.000 0.020 1.000 Y NA
 3419584 3419585 A1C_01225 A1C_01230     FALSE 0.118 283.000 0.000 1.000 N NA
 3419585 3419586 A1C_01230 A1C_01265     FALSE 0.013 3387.000 0.000 1.000 N NA
 3419587 3419588 A1C_01270 A1C_01275     FALSE 0.012 634.000 0.000 NA   NA
 3419588 3419589 A1C_01275 A1C_01280     FALSE 0.026 396.000 0.000 NA   NA
 3419589 3419590 A1C_01280 A1C_01285     TRUE 0.923 24.000 0.017 1.000 N NA
 3419590 3419591 A1C_01285 A1C_01290     TRUE 0.961 3.000 0.017 1.000 N NA
 3419591 3419592 A1C_01290 A1C_01295     TRUE 0.844 110.000 0.013 1.000 N NA
 3419592 3419593 A1C_01295 A1C_01300   kgd TRUE 0.986 138.000 0.667 1.000 Y NA
 3419593 3419594 A1C_01300 A1C_01305 kgd   TRUE 0.817 136.000 0.003 1.000 N NA
 3419594 3419595 A1C_01305 A1C_01310     TRUE 0.727 179.000 0.006 1.000 N NA
 3419595 3419596 A1C_01310 A1C_01315     TRUE 0.854 185.000 0.117 1.000   NA
 3419596 3419597 A1C_01315 A1C_01320     FALSE 0.087 268.000 0.000 NA   NA
 3419597 3419598 A1C_01320 A1C_01325     FALSE 0.294 226.000 0.005 NA   NA
 3419598 3419599 A1C_01325 A1C_01330   dnaK TRUE 0.942 189.000 0.236 0.007 Y NA
 3419600 3419601 A1C_01335 A1C_01340     FALSE 0.041 338.000 0.000 NA   NA
 3419603 3419604 A1C_01350 A1C_01355   holA TRUE 0.971 8.000 0.097 NA   NA
 3419604 3419605 A1C_01355 A1C_01360 holA   FALSE 0.589 200.000 0.007 1.000 N NA
 3419607 3419608 A1C_01370 A1C_01375     TRUE 0.885 156.000 0.022 NA N NA
 3419611 3419612 A1C_01390 A1C_01395     TRUE 0.799 24.000 0.000 NA   NA
 3419612 3419613 A1C_01395 A1C_01400     FALSE 0.016 492.000 0.000 NA   NA
 3419613 3419614 A1C_01400 A1C_01405     TRUE 0.965 33.000 0.500 NA   NA
 3419614 3419615 A1C_01405 A1C_01410     FALSE 0.168 243.000 0.000 NA   NA
 3419616 3419617 A1C_01415 A1C_01420     FALSE 0.597 71.000 0.000 NA   NA
 3419617 3419618 A1C_01420 A1C_01425     FALSE 0.089 265.000 0.000 NA   NA
 3419618 3419619 A1C_01425 A1C_01430     TRUE 0.703 129.000 0.000 NA   NA
 3419619 3419620 A1C_01430 A1C_01435     TRUE 0.678 109.000 0.000 NA   NA
 3419620 3419621 A1C_01435 A1C_01440     TRUE 0.603 64.000 0.000 NA   NA
 3419621 3419622 A1C_01440 A1C_01445     FALSE 0.593 86.000 0.000 NA   NA
 3419622 3419623 A1C_01445 A1C_01450     TRUE 0.684 111.000 0.000 NA   NA
 3419624 3419625 A1C_01455 A1C_01460     TRUE 0.977 10.000 0.200 NA   NA
 3419625 3419626 A1C_01460 A1C_01465     TRUE 0.991 5.000 0.778 NA   NA
 3419626 3419627 A1C_01465 A1C_01470     TRUE 0.963 13.000 0.068 NA   NA
 3419627 3419628 A1C_01470 A1C_01475   hscA TRUE 0.903 62.000 0.091 1.000 N NA
 3419628 3419629 A1C_01475 A1C_01480 hscA hscB TRUE 0.993 -9.000 0.634 1.000 Y NA
 3419632 3419633 A1C_01495 A1C_01525     FALSE 0.013 2443.000 0.000 1.000 N NA
 3419635 3419636 A1C_01545 A1C_01550 def   TRUE 0.810 152.000 0.015 NA   NA
 3419638 3419639 A1C_01560 A1C_01565   fmt TRUE 0.967 12.000 0.008 0.075 Y NA
 3419639 3419640 A1C_01565 A1C_01570 fmt   TRUE 0.688 117.000 0.000 NA   NA
 3419640 3419641 A1C_01570 A1C_01575     FALSE 0.262 225.000 0.000 NA   NA
 3419641 3419642 A1C_01575 A1C_r01     FALSE 0.203 236.000 0.000 NA   NA
 3419642 3419643 A1C_r01 A1C_r06953     FALSE 0.158 245.000 0.000 NA   NA
 3419644 3419645 A1C_01580 A1C_01585     FALSE 0.313 217.000 0.000 1.000   NA
 3419646 3419647 A1C_01590 A1C_01595     TRUE 0.708 43.000 0.000 NA   NA
 3419649 3419650 A1C_01605 A1C_01610     TRUE 0.834 210.000 0.500 NA   NA
 3419650 3419651 A1C_01610 A1C_01615     TRUE 0.946 95.000 0.095 0.049 Y NA
 3419651 3419652 A1C_01615 A1C_01620     FALSE 0.230 247.000 0.000 NA N NA
 3419652 3419653 A1C_01620 A1C_01625     TRUE 0.862 139.000 0.025 NA   NA
 3419653 3419654 A1C_01625 A1C_01630     TRUE 0.693 81.000 0.011 1.000   NA
 3419654 3419655 A1C_01630 A1C_01635     FALSE 0.056 304.000 0.000 NA   NA
 3419655 3419656 A1C_01635 A1C_01640   thrS TRUE 0.738 124.000 0.006 NA   NA
 3419656 3419657 A1C_01640 A1C_01645 thrS   FALSE 0.027 388.000 0.000 NA   NA
 3419658 3419659 A1C_01650 A1C_01655     FALSE 0.025 404.000 0.000 NA   NA
 3419659 3419660 A1C_01655 A1C_01660     FALSE 0.013 614.000 0.000 NA   NA
 3419660 3419661 A1C_01660 A1C_01665     FALSE 0.595 74.000 0.000 NA   NA
 3419662 3419663 A1C_01670 A1C_01675     TRUE 0.976 2.000 0.146 NA   NA
 3419663 3419664 A1C_01675 A1C_01680     TRUE 0.858 63.000 0.073 NA   NA
 3419664 3419665 A1C_01680 A1C_01685     TRUE 0.794 161.000 0.016 NA   NA
 3419665 3419666 A1C_01685 A1C_01690     TRUE 0.861 112.000 0.015 1.000 N NA
 3419666 3419667 A1C_01690 A1C_01695     FALSE 0.586 196.000 0.000 1.000 N NA
 3419667 3419668 A1C_01695 A1C_01700     TRUE 0.682 219.000 0.143 1.000   NA
 3419668 3419669 A1C_01700 A1C_01705     TRUE 0.986 13.000 0.583 NA   NA
 3419669 3419670 A1C_01705 A1C_01710     TRUE 0.909 23.000 0.022 NA   NA
 3419670 3419671 A1C_01710 A1C_01715   rplM TRUE 0.656 94.000 0.006 1.000   NA
 3419671 3419672 A1C_01715 A1C_01720 rplM rpsI TRUE 0.991 7.000 0.231 0.046 Y NA
 3419672 3419673 A1C_01720 A1C_t06899 rpsI   FALSE 0.275 222.000 0.000 NA   NA
 3419673 3419674 A1C_t06899 A1C_01725     FALSE 0.046 327.000 0.000 NA   NA
 3419674 3419675 A1C_01725 A1C_01730     FALSE 0.058 334.000 0.008 NA   NA
 3419675 3419676 A1C_01730 A1C_01735     FALSE 0.021 435.000 0.000 NA   NA
 3419677 3419678 A1C_01740 A1C_01745   pleD TRUE 0.924 24.000 0.017 1.000 N NA
 3419679 3419680 A1C_01750 A1C_01755     TRUE 0.970 10.000 0.047 1.000 N NA
 3419680 3419681 A1C_01755 A1C_01760     FALSE 0.213 241.000 0.005 NA   NA
 3419681 3419682 A1C_01760 A1C_01765     TRUE 0.753 80.000 0.018 NA   NA
 3419682 3419683 A1C_01765 A1C_01770     TRUE 0.972 166.000 0.466 0.006 Y NA
 3419683 3419684 A1C_01770 A1C_01775     TRUE 0.949 9.000 0.013 0.059 N NA
 3419684 3419685 A1C_01775 A1C_01780     FALSE 0.431 198.000 0.000 NA   NA
 3419686 3419687 A1C_01785 A1C_01790     TRUE 0.946 -3.000 0.022 NA   NA
 3419688 3419689 A1C_01795 A1C_01800   murC TRUE 0.818 118.000 0.006 NA N NA
 3419689 3419690 A1C_01800 A1C_01805 murC murB TRUE 0.961 47.000 0.108 0.012 Y NA
 3419690 3419691 A1C_01805 A1C_01810 murB ddl TRUE 0.962 157.000 0.135 0.012 Y NA
 3419691 3419692 A1C_01810 A1C_01815 ddl   FALSE 0.096 590.000 0.372 NA   NA
 3419692 3419693 A1C_01815 A1C_01820     TRUE 0.921 149.000 0.137 NA   NA
 3419694 3419695 A1C_01825 A1C_01830     FALSE 0.227 233.000 0.000 NA   NA
 3419695 3419696 A1C_01830 A1C_01835     FALSE 0.015 520.000 0.000 NA   NA
 3419696 3419697 A1C_01835 A1C_01840     TRUE 0.907 -10.000 0.014 NA   NA
 3419699 3419700 A1C_01850 A1C_01855 lpxC   FALSE 0.158 253.000 0.005 NA   NA
 3419701 3419702 A1C_01860 A1C_01865     TRUE 0.705 176.000 0.000 1.000 N NA
 3419702 3419703 A1C_01865 A1C_01870     TRUE 0.726 198.000 0.022 1.000 N NA
 3419703 3419704 A1C_01870 A1C_01875     TRUE 0.964 149.000 0.412 1.000 N NA
 3419704 3419705 A1C_01875 A1C_01880     TRUE 0.971 14.000 0.063 1.000 N NA
 3419705 3419706 A1C_01880 A1C_01885     TRUE 0.889 42.000 0.018 1.000 N NA
 3419706 3419707 A1C_01885 A1C_01890     TRUE 0.976 108.000 0.456 0.002 Y NA
 3419709 3419710 A1C_01900 A1C_01905     TRUE 0.991 -7.000 1.000 NA   NA
 3419710 3419711 A1C_01905 A1C_01910     TRUE 0.789 -31.000 0.000 NA   NA
 3419711 3419712 A1C_01910 A1C_01915     FALSE 0.023 412.000 0.000 NA   NA
 3419712 3419713 A1C_01915 A1C_01920     TRUE 0.881 81.000 0.062 1.000 N NA
 3419713 3419714 A1C_01920 A1C_01925     TRUE 0.918 158.000 0.069 1.000 N NA
 3419714 3419715 A1C_01925 A1C_01930     TRUE 0.975 35.000 0.184 NA Y NA
 3419715 3419716 A1C_01930 A1C_01935     TRUE 0.939 123.000 0.292 NA   NA
 3419716 3419717 A1C_01935 A1C_01940     TRUE 0.949 77.000 0.700 NA   NA
 3419717 3419718 A1C_01940 A1C_01945     TRUE 0.986 22.000 0.875 NA   NA
 3419718 3419719 A1C_01945 A1C_01950     TRUE 0.980 7.000 0.021 0.003 Y NA
 3419719 3419720 A1C_01950 A1C_01955     TRUE 0.945 202.000 0.630 0.003 Y NA
 3419720 3419721 A1C_01955 A1C_01960     FALSE 0.052 313.000 0.000 NA   NA
 3419721 3419722 A1C_01960 A1C_01965     FALSE 0.046 327.000 0.000 NA   NA
 3419724 3419725 A1C_01975 A1C_t06901     FALSE 0.184 241.000 0.000 NA   NA
 3419725 3419726 A1C_t06901 A1C_01980     FALSE 0.559 185.000 0.000 NA   NA
 3419729 3419730 A1C_01995 A1C_02000     TRUE 0.822 106.000 0.010 1.000 N NA
 3419730 3419731 A1C_02000 A1C_02005     TRUE 0.976 32.000 0.538 1.000 N NA
 3419731 3419732 A1C_02005 A1C_02010     TRUE 0.988 2.000 0.556 NA   NA
 3419732 3419733 A1C_02010 A1C_02015     FALSE 0.014 542.000 0.000 NA   NA
 3419737 3419738 A1C_02035 A1C_02040     TRUE 0.876 179.000 0.065 NA N NA
 3419738 3419739 A1C_02040 A1C_02045     TRUE 0.994 2.000 0.455 NA Y NA
 3419740 3419741 A1C_02050 A1C_02055     TRUE 0.935 51.000 0.316 NA   NA
 3419741 3419742 A1C_02055 A1C_02060     TRUE 0.976 -13.000 0.421 NA   NA
 3419742 3419743 A1C_02060 A1C_02065     TRUE 0.953 145.000 0.421 NA   NA
 3419743 3419744 A1C_02065 A1C_02070     TRUE 0.993 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 3419744 3419745 A1C_02070 A1C_02075     TRUE 0.973 163.000 0.405 1.000 Y NA
 3419745 3419746 A1C_02075 A1C_02080     TRUE 0.973 10.000 0.054 1.000 N NA
 3419746 3419747 A1C_02080 A1C_02105     FALSE 0.008 1782.000 0.000 NA   NA
 3419747 3419748 A1C_02105 A1C_02110     TRUE 0.883 9.000 0.000 NA   NA
 3419748 3419749 A1C_02110 A1C_02115     TRUE 0.992 12.000 1.000 NA   NA
 3419749 3419750 A1C_02115 A1C_02120     FALSE 0.245 230.000 0.000 NA   NA
 3419750 3419751 A1C_02120 A1C_02125     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3419751 3419752 A1C_02125 A1C_02130     FALSE 0.034 353.000 0.000 NA   NA
 3419752 3419753 A1C_02130 A1C_02135     FALSE 0.070 285.000 0.000 NA   NA
 3419753 3419754 A1C_02135 A1C_02140     TRUE 0.878 11.000 0.000 NA   NA
 3419754 3419755 A1C_02140 A1C_02145     TRUE 0.753 32.000 0.000 NA   NA
 3419755 3419756 A1C_02145 A1C_02150     TRUE 0.888 0.000 0.000 NA   NA
 3419758 3419759 A1C_02160 A1C_02165     FALSE 0.600 68.000 0.000 NA   NA
 3419760 3419761 A1C_02180 A1C_02185     TRUE 0.890 2.000 0.000 NA   NA
 3419761 3419762 A1C_02185 A1C_02190     FALSE 0.418 199.000 0.000 NA   NA
 3419763 3419764 A1C_02195 A1C_02200     TRUE 0.987 -16.000 0.875 NA   NA
 3419764 3419765 A1C_02200 A1C_02205     FALSE 0.170 297.000 0.048 NA   NA
 3419769 3419770 A1C_02235 A1C_02250     FALSE 0.011 722.000 0.000 NA   NA
 3419770 3419771 A1C_02250 A1C_02255     TRUE 0.709 141.000 0.000 NA   NA
 3419771 3419772 A1C_02255 A1C_02260   thyX TRUE 0.657 95.000 0.005 NA   NA
 3419772 3419773 A1C_02260 A1C_02265 thyX tolB TRUE 0.853 156.000 0.014 1.000 N NA
 3419777 3419778 A1C_02285 A1C_02290 trmU   TRUE 0.793 78.000 0.014 1.000 N NA
 3419778 3419779 A1C_02290 A1C_02295   hisS TRUE 0.829 153.000 0.008 1.000 N NA
 3419779 3419780 A1C_02295 A1C_02300 hisS   TRUE 0.603 64.000 0.000 NA   NA
 3419780 3419781 A1C_02300 A1C_02305     FALSE 0.593 86.000 0.000 NA   NA
 3419781 3419782 A1C_02305 A1C_02310     FALSE 0.009 1028.000 0.000 1.000   NA
 3419782 3419783 A1C_02310 A1C_02315     TRUE 0.986 0.000 0.059 0.043 Y NA
 3419783 3419784 A1C_02315 A1C_02320     TRUE 0.971 -10.000 0.240 NA   NA
 3419787 3419788 A1C_02335 A1C_02340     TRUE 0.903 84.000 0.273 0.089   NA
 3419788 3419789 A1C_02340 A1C_02345     TRUE 0.834 197.000 0.267 0.011   NA
 3419789 3419790 A1C_02345 A1C_02350     TRUE 0.883 -13.000 0.011 1.000   NA
 3419790 3419791 A1C_02350 A1C_02355     TRUE 0.938 -7.000 0.012 1.000 N NA
 3419791 3419792 A1C_02355 A1C_02360     FALSE 0.262 225.000 0.000 NA   NA
 3419793 3419794 A1C_02365 A1C_02370   hslU TRUE 0.996 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 3419794 3419795 A1C_02370 A1C_02375 hslU lpxB FALSE 0.492 193.000 0.000 1.000   NA
 3419795 3419796 A1C_02375 A1C_02380 lpxB   TRUE 0.861 13.000 0.000 0.002   NA
 3419798 3419799 A1C_02390 A1C_02395   cyaY TRUE 0.780 47.000 0.012 NA   NA
 3419799 3419800 A1C_02395 A1C_02410 cyaY   FALSE 0.017 484.000 0.000 NA   NA
 3419800 3419801 A1C_02410 A1C_02415     TRUE 0.863 15.000 0.000 NA   NA
 3419801 3419802 A1C_02415 A1C_02420     TRUE 0.687 47.000 0.000 NA   NA
 3419802 3419803 A1C_02420 A1C_02425     TRUE 0.699 127.000 0.000 NA   NA
 3419803 3419804 A1C_02425 A1C_02430     FALSE 0.070 285.000 0.000 NA   NA
 3419805 3419806 A1C_02435 A1C_02440 gltX   FALSE 0.217 255.000 0.007 1.000 N NA
 3419806 3419807 A1C_02440 A1C_02445     TRUE 0.696 124.000 0.000 NA   NA
 3419807 3419808 A1C_02445 A1C_02450     FALSE 0.019 462.000 0.000 NA   NA
 3419808 3419809 A1C_02450 A1C_02455     FALSE 0.522 194.000 0.003 NA   NA
 3419809 3419810 A1C_02455 A1C_02460     TRUE 0.887 82.000 0.014 1.000 Y NA
 3419810 3419811 A1C_02460 A1C_02465     FALSE 0.010 779.000 0.000 1.000   NA
 3419812 3419813 A1C_02470 A1C_02475     FALSE 0.314 215.000 0.000 0.066   NA
 3419813 3419814 A1C_02475 A1C_02480     FALSE 0.190 239.000 0.000 1.000   NA
 3419814 3419815 A1C_02480 A1C_02485     TRUE 0.898 177.000 0.271 0.002   NA
 3419815 3419816 A1C_02485 A1C_02490     TRUE 0.968 -7.000 0.148 1.000   NA
 3419816 3419817 A1C_02490 A1C_02495     TRUE 0.764 29.000 0.000 NA   NA
 3419817 3419818 A1C_02495 A1C_02500     TRUE 0.834 19.000 0.000 NA   NA
 3419818 3419819 A1C_02500 A1C_02505     TRUE 0.872 13.000 0.000 NA   NA
 3419819 3419820 A1C_02505 A1C_02510     FALSE 0.012 628.000 0.000 NA   NA
 3419821 3419822 A1C_02525 A1C_02530     FALSE 0.300 270.000 0.129 NA   NA
 3419824 3419825 A1C_02540 A1C_02545     TRUE 0.658 162.000 0.000 NA   NA
 3419825 3419826 A1C_02545 A1C_02550     TRUE 0.650 163.000 0.000 NA   NA
 3419826 3419827 A1C_02550 A1C_02555     TRUE 0.758 31.000 0.000 NA   NA
 3419827 3419828 A1C_02555 A1C_02560   rpsD FALSE 0.018 470.000 0.000 NA   NA
 3419828 3419829 A1C_02560 A1C_02565 rpsD   FALSE 0.176 242.000 0.000 NA   NA
 3419831 3419832 A1C_02575 A1C_02580     TRUE 0.659 52.000 0.000 NA   NA
 3419833 3419834 A1C_02585 A1C_02590     TRUE 0.813 -18.000 0.000 NA   NA
 3419834 3419835 A1C_02590 A1C_02595     FALSE 0.020 448.000 0.000 NA   NA
 3419839 3419840 A1C_02625 A1C_02630     FALSE 0.015 538.000 0.000 NA   NA
 3419841 3419842 A1C_02635 A1C_02640     FALSE 0.017 532.000 0.002 NA   NA
 3419842 3419843 A1C_02640 A1C_02645     TRUE 0.888 -7.000 0.007 NA   NA
 3419843 3419844 A1C_02645 A1C_02650     TRUE 0.979 37.000 0.355 0.010 Y NA
 3419844 3419845 A1C_02650 A1C_02655     FALSE 0.592 79.000 0.000 NA   NA
 3419845 3419846 A1C_02655 A1C_02660     TRUE 0.888 0.000 0.000 NA   NA
 3419846 3419847 A1C_02660 A1C_02665     FALSE 0.575 82.000 0.000 0.023   NA
 3419847 3419848 A1C_02665 A1C_02670     TRUE 0.986 -22.000 0.328 0.007 Y NA
 3419848 3419849 A1C_02670 A1C_02675     TRUE 0.994 3.000 0.507 0.007 Y NA
 3419849 3419850 A1C_02675 A1C_02680     TRUE 0.882 100.000 0.031 NA N NA
 3419850 3419851 A1C_02680 A1C_02685     TRUE 0.965 -3.000 0.066 NA   NA
 3419852 3419853 A1C_02690 A1C_02695     TRUE 0.693 153.000 0.000 NA   NA
 3419853 3419854 A1C_02695 A1C_02700     FALSE 0.043 333.000 0.000 NA   NA
 3419854 3419855 A1C_02700 A1C_t06903     FALSE 0.015 534.000 0.000 NA   NA
 3419855 3419856 A1C_t06903 A1C_02705   xerD TRUE 0.813 22.000 0.000 NA   NA
 3419856 3419857 A1C_02705 A1C_02710 xerD   TRUE 0.667 83.000 0.008 NA   NA
 3419857 3419858 A1C_02710 A1C_02715     TRUE 0.958 112.000 0.571 NA   NA
 3419860 3419861 A1C_02725 A1C_02730 lnt   FALSE 0.008 1673.000 0.000 NA   NA
 3419861 3419862 A1C_02730 A1C_02735     TRUE 0.988 5.000 0.545 NA   NA
 3419862 3419863 A1C_02735 A1C_02740     TRUE 0.949 117.000 0.455 1.000   NA
 3419864 3419865 A1C_02745 A1C_02750     FALSE 0.011 759.000 0.000 NA   NA
 3419866 3419867 A1C_02755 A1C_02760 lysK   TRUE 0.788 61.000 0.021 1.000   NA
 3419867 3419868 A1C_02760 A1C_02765     TRUE 0.898 124.000 0.071 1.000   NA
 3419868 3419869 A1C_02765 A1C_02770     FALSE 0.094 261.000 0.000 1.000   NA
 3419869 3419870 A1C_02770 A1C_02775     FALSE 0.068 285.000 0.000 1.000   NA
 3419871 3419872 A1C_02780 A1C_02785     TRUE 0.858 -7.000 0.000 NA   NA
 3419872 3419873 A1C_02785 A1C_02790     TRUE 0.858 -7.000 0.000 NA   NA
 3419875 3419876 A1C_02800 A1C_02805     TRUE 0.631 97.000 0.000 NA   NA
 3419876 3419877 A1C_02805 A1C_02825     FALSE 0.008 2343.000 0.000 NA   NA
 3419877 3419878 A1C_02825 A1C_02830     FALSE 0.031 1241.000 0.000 1.000 Y NA
 3419878 3419879 A1C_02830 A1C_02835     TRUE 0.770 -66.000 0.000 1.000   NA
 3419882 3419883 A1C_t06905 A1C_t06907     TRUE 0.863 15.000 0.000 NA   NA
 3419885 3419886 A1C_02865 A1C_02870   folE TRUE 0.963 -7.000 0.092 1.000   NA
 3419886 3419887 A1C_02870 A1C_02875 folE   TRUE 0.938 11.000 0.008 0.061 N NA
 3419887 3419888 A1C_02875 A1C_02880     TRUE 0.697 50.000 0.002 NA   NA
 3419888 3419889 A1C_02880 A1C_02885     TRUE 0.888 0.000 0.000 NA   NA
 3419889 3419890 A1C_02885 A1C_02890     FALSE 0.201 237.000 0.000 NA   NA
 3419890 3419891 A1C_02890 A1C_02895   ruvA TRUE 0.908 6.000 0.007 NA   NA
 3419891 3419892 A1C_02895 A1C_02900 ruvA   TRUE 0.833 -13.000 0.000 NA   NA
 3419892 3419893 A1C_02900 A1C_02905     FALSE 0.431 198.000 0.000 NA   NA
 3419893 3419894 A1C_02905 A1C_02910   ruvB TRUE 0.644 63.000 0.004 NA   NA
 3419894 3419895 A1C_02910 A1C_02915 ruvB   TRUE 0.925 -7.000 0.007 1.000 N NA
 3419895 3419896 A1C_02915 A1C_02920     FALSE 0.049 351.000 0.010 0.041   NA
 3419896 3419897 A1C_02920 A1C_02925     TRUE 0.918 192.000 0.625 1.000   NA
 3419898 3419899 A1C_02930 A1C_02935     TRUE 0.916 -22.000 0.029 NA   NA
 3419899 3419900 A1C_02935 A1C_02940     FALSE 0.040 410.000 0.014 NA   NA
 3419900 3419901 A1C_02940 A1C_02945     TRUE 0.924 30.000 0.027 1.000 N NA
 3419901 3419902 A1C_02945 A1C_02950     TRUE 0.988 10.000 0.629 NA   NA
 3419902 3419903 A1C_02950 A1C_02955     TRUE 0.881 109.000 0.057 NA   NA
 3419903 3419904 A1C_02955 A1C_02960     TRUE 0.896 7.000 0.002 NA   NA
 3419905 3419906 A1C_02965 A1C_02970     TRUE 0.847 175.000 0.026 1.000 N NA
 3419906 3419907 A1C_02970 A1C_02975     TRUE 0.980 -7.000 0.042 1.000 Y NA
 3419907 3419908 A1C_02975 A1C_02980   dut TRUE 0.822 156.000 0.008 1.000 N NA
 3419908 3419909 A1C_02980 A1C_02985 dut   TRUE 0.628 196.000 0.006 1.000 N NA
 3419909 3419910 A1C_02985 A1C_02990     TRUE 0.809 80.000 0.041 NA   NA
 3419910 3419911 A1C_02990 A1C_02995     TRUE 0.939 85.000 0.571 NA   NA
 3419914 3419915 A1C_03010 A1C_03015     TRUE 0.709 171.000 0.012 1.000   NA
 3419915 3419916 A1C_03015 A1C_03020     FALSE 0.016 518.000 0.000 NA   NA
 3419916 3419917 A1C_03020 A1C_03025     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3419917 3419918 A1C_03025 A1C_03030     FALSE 0.163 244.000 0.000 NA   NA
 3419919 3419920 A1C_03035 A1C_03040   lspA FALSE 0.275 315.000 0.031 0.027 Y NA
 3419920 3419921 A1C_03040 A1C_03045 lspA   TRUE 0.940 21.000 0.054 NA   NA
 3419921 3419922 A1C_03045 A1C_03050   murD TRUE 0.653 70.000 0.006 NA   NA
 3419922 3419923 A1C_03050 A1C_03055 murD   FALSE 0.555 255.000 0.297 0.002 N NA
 3419923 3419924 A1C_03055 A1C_03060   murG TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 3419924 3419925 A1C_03060 A1C_03065 murG   FALSE 0.405 201.000 0.000 NA   NA
 3419925 3419926 A1C_03065 A1C_03070     FALSE 0.048 317.000 0.000 NA   NA
 3419927 3419928 A1C_03095 A1C_03100     FALSE 0.017 487.000 0.000 NA   NA
 3419928 3419929 A1C_03100 A1C_03105     FALSE 0.033 354.000 0.000 NA   NA
 3419929 3419930 A1C_03105 A1C_03110     FALSE 0.592 79.000 0.000 NA   NA
 3419930 3419931 A1C_03110 A1C_03115     TRUE 0.861 183.000 0.133 NA   NA
 3419931 3419932 A1C_03115 A1C_03120     FALSE 0.018 476.000 0.000 NA   NA
 3419932 3419933 A1C_03120 A1C_03125     TRUE 0.930 145.000 0.182 NA   NA
 3419934 3419935 A1C_03130 A1C_03135 dapF   TRUE 0.972 -10.000 0.109 1.000 N NA
 3419935 3419936 A1C_03135 A1C_03140   pheS TRUE 0.889 101.000 0.007 1.000 Y NA
 3419936 3419937 A1C_03140 A1C_03145 pheS pheT TRUE 0.994 -3.000 0.574 0.002 Y NA
 3419937 3419938 A1C_03145 A1C_03150 pheT   TRUE 0.863 124.000 0.015 1.000 N NA
 3419938 3419939 A1C_03150 A1C_03155     FALSE 0.072 291.000 0.002 NA   NA
 3419939 3419940 A1C_03155 A1C_03160   leuS TRUE 0.880 115.000 0.051 NA   NA
 3419941 3419942 A1C_03165 A1C_03170     TRUE 0.816 133.000 0.015 1.000   NA
 3419942 3419943 A1C_03170 A1C_03175     TRUE 0.945 -3.000 0.011 1.000 N NA
 3419943 3419944 A1C_03175 A1C_03180     TRUE 0.986 -40.000 0.400 1.000 Y NA
 3419944 3419945 A1C_03180 A1C_03185     FALSE 0.370 233.000 0.006 1.000 N NA
 3419945 3419946 A1C_03185 A1C_03190     TRUE 0.984 141.000 0.592 1.000 Y NA
 3419947 3419948 A1C_03195 A1C_03200     TRUE 0.959 118.000 0.087 1.000 Y NA
 3419948 3419949 A1C_03200 A1C_03205   smpB TRUE 0.939 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3419949 3419950 A1C_03205 A1C_03210 smpB   TRUE 0.879 166.000 0.007 1.000 Y NA
 3419951 3419952 A1C_03215 A1C_03220   sucC TRUE 0.966 163.000 0.256 0.002 Y NA
 3419952 3419953 A1C_03220 A1C_03225 sucC   FALSE 0.295 220.000 0.000 NA   NA
 3419953 3419954 A1C_03225 A1C_03230     FALSE 0.063 292.000 0.000 NA   NA
 3419954 3419955 A1C_03230 A1C_03235     TRUE 0.753 89.000 0.018 1.000   NA
 3419955 3419956 A1C_03235 A1C_03240   rbfA FALSE 0.056 302.000 0.000 1.000   NA
 3419956 3419957 A1C_03240 A1C_03245 rbfA   TRUE 0.913 4.000 0.007 NA   NA
 3419958 3419959 A1C_03250 A1C_03255   recR TRUE 0.739 153.000 0.006 NA   NA
 3419959 3419960 A1C_03255 A1C_03260 recR   FALSE 0.336 211.000 0.000 1.000   NA
 3419960 3419961 A1C_03260 A1C_03265     FALSE 0.418 199.000 0.000 NA   NA
 3419962 3419963 A1C_03270 A1C_03275     TRUE 0.658 162.000 0.000 NA   NA
 3419963 3419964 A1C_03275 A1C_03280     TRUE 0.858 -7.000 0.000 NA   NA
 3419964 3419965 A1C_03280 A1C_03285     FALSE 0.250 227.000 0.000 NA   NA
 3419965 3419966 A1C_03285 A1C_03290     FALSE 0.100 260.000 0.000 NA   NA
 3419966 3419967 A1C_03290 A1C_03295   ppnK FALSE 0.592 81.000 0.000 NA   NA
 3419968 3419969 A1C_03300 A1C_03305   gpsA FALSE 0.587 79.000 0.000 1.000   NA
 3419969 3419970 A1C_03305 A1C_03310 gpsA   TRUE 0.847 -7.000 0.000 0.002   NA
 3419970 3419971 A1C_03310 A1C_03315     FALSE 0.114 257.000 0.000 NA   NA
 3419973 3419974 A1C_03325 A1C_03330     TRUE 0.880 59.000 0.096 NA   NA
 3419974 3419975 A1C_03330 A1C_03335     FALSE 0.338 221.000 0.007 NA   NA
 3419975 3419976 A1C_03335 A1C_03340     TRUE 0.687 114.000 0.000 NA   NA
 3419976 3419977 A1C_03340 A1C_03345     TRUE 0.852 17.000 0.000 NA   NA
 3419977 3419978 A1C_03345 A1C_03350     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 3419978 3419979 A1C_03350 A1C_03355     TRUE 0.888 89.000 0.182 NA   NA
 3419979 3419980 A1C_03355 A1C_03360     TRUE 0.740 34.000 0.000 NA   NA
 3419980 3419981 A1C_03360 A1C_03365     FALSE 0.017 487.000 0.000 NA   NA
 3419981 3419982 A1C_03365 A1C_03370     FALSE 0.058 298.000 0.000 1.000   NA
 3419982 3419983 A1C_03370 A1C_03375     TRUE 0.864 116.000 0.040 NA   NA
 3419983 3419984 A1C_03375 A1C_03380     TRUE 0.977 0.000 0.182 NA   NA
 3419984 3419985 A1C_03380 A1C_03385     FALSE 0.513 220.000 0.012 NA N NA
 3419985 3419986 A1C_03385 A1C_03390     TRUE 0.600 91.000 0.000 NA   NA
 3419986 3419987 A1C_03390 A1C_03395     FALSE 0.594 75.000 0.000 NA   NA
 3419987 3419988 A1C_03395 A1C_03400     FALSE 0.527 189.000 0.000 NA   NA
 3419988 3419989 A1C_03400 A1C_03405     TRUE 0.944 55.000 0.500 NA   NA
 3419992 3419993 A1C_03420 A1C_03435     FALSE 0.008 1496.000 0.000 NA   NA
 3419993 3419994 A1C_03435 A1C_t06909     FALSE 0.012 652.000 0.000 NA   NA
 3419995 3419996 A1C_03440 A1C_03445     TRUE 0.621 199.000 0.020 NA   NA
 3419996 3419997 A1C_03445 A1C_03450     TRUE 0.932 0.000 0.013 NA   NA
 3419998 3419999 A1C_03455 A1C_03460     TRUE 0.882 8.000 0.000 1.000   NA
 3419999 3420000 A1C_03460 A1C_03465     TRUE 0.730 35.000 0.000 1.000   NA
 3420000 3420001 A1C_03465 A1C_03470     FALSE 0.012 677.000 0.000 1.000   NA
 3420001 3420002 A1C_03470 A1C_03475     TRUE 0.833 -13.000 0.000 NA   NA
 3420003 3420004 A1C_03480 A1C_03485   nrdF TRUE 0.688 248.000 0.161 0.003 Y NA
 3420004 3420005 A1C_03485 A1C_03490 nrdF   TRUE 0.892 153.000 0.065 NA   NA
 3420005 3420006 A1C_03490 A1C_03505     FALSE 0.010 849.000 0.000 NA   NA
 3420006 3420007 A1C_03505 A1C_03515     FALSE 0.012 670.000 0.000 NA   NA
 3420007 3420008 A1C_03515 A1C_03520     TRUE 0.746 33.000 0.000 NA   NA
 3420008 3420009 A1C_03520 A1C_03525     TRUE 0.740 34.000 0.000 NA   NA
 3420010 3420011 A1C_03530 A1C_03535 miaA   FALSE 0.050 403.000 0.007 1.000 N NA
 3420011 3420012 A1C_03535 A1C_03540     TRUE 0.662 178.000 0.009 1.000   NA
 3420012 3420013 A1C_03540 A1C_03545     TRUE 0.960 137.000 0.543 NA   NA
 3420013 3420014 A1C_03545 A1C_03550     TRUE 0.947 26.000 0.144 NA   NA
 3420014 3420015 A1C_03550 A1C_03555     TRUE 0.973 6.000 0.115 NA   NA
 3420015 3420016 A1C_03555 A1C_03560     FALSE 0.241 252.000 0.006 1.000 N NA
 3420016 3420017 A1C_03560 A1C_03565   rpsO TRUE 0.973 161.000 0.335 1.000 Y NA
 3420017 3420018 A1C_03565 A1C_03570 rpsO truB TRUE 0.984 22.000 0.211 1.000 Y NA
 3420019 3420020 A1C_03575 A1C_03580     FALSE 0.085 269.000 0.000 NA   NA
 3420021 3420022 A1C_03585 A1C_03590     TRUE 0.636 56.000 0.000 NA   NA
 3420022 3420023 A1C_03590 A1C_03595     FALSE 0.031 367.000 0.000 1.000   NA
 3420026 3420027 A1C_03610 A1C_03615     FALSE 0.026 420.000 0.004 NA   NA
 3420027 3420028 A1C_03615 A1C_03620     FALSE 0.024 406.000 0.000 NA   NA
 3420029 3420030 A1C_03625 A1C_03630     FALSE 0.019 459.000 0.000 NA   NA
 3420034 3420035 A1C_03650 A1C_03655     TRUE 0.868 33.000 0.020 NA   NA
 3420036 3420037 A1C_03660 A1C_03665     FALSE 0.244 234.000 0.004 NA   NA
 3420037 3420038 A1C_03665 A1C_03670     TRUE 0.841 159.000 0.013 1.000 N NA
 3420038 3420039 A1C_03670 A1C_03690     FALSE 0.009 1285.000 0.000 NA   NA
 3420039 3420040 A1C_03690 A1C_03700     FALSE 0.027 390.000 0.000 NA   NA
 3420042 3420043 A1C_03710 A1C_03715     FALSE 0.009 1055.000 0.000 NA   NA
 3420043 3420044 A1C_03715 A1C_03720     FALSE 0.593 87.000 0.000 NA   NA
 3420044 3420045 A1C_03720 A1C_03725     TRUE 0.883 9.000 0.000 NA   NA
 3420045 3420046 A1C_03725 A1C_03730     TRUE 0.747 215.000 0.240 NA   NA
 3420046 3420047 A1C_03730 A1C_03735     TRUE 0.962 15.000 0.080 NA   NA
 3420047 3420048 A1C_03735 A1C_03740     TRUE 0.987 4.000 0.500 NA   NA
 3420048 3420049 A1C_03740 A1C_03745     TRUE 0.965 -13.000 0.194 NA   NA
 3420049 3420050 A1C_03745 A1C_03750   infC TRUE 0.662 174.000 0.007 NA   NA
 3420050 3420051 A1C_03750 A1C_03755 infC   FALSE 0.142 277.000 0.005 1.000 N NA
 3420051 3420052 A1C_03755 A1C_03760   prfA TRUE 0.773 165.000 0.005 1.000 N NA
 3420052 3420053 A1C_03760 A1C_03765 prfA   TRUE 0.739 175.000 0.005 1.000 N NA
 3420053 3420054 A1C_03765 A1C_03770     FALSE 0.404 225.000 0.005 1.000 N NA
 3420054 3420055 A1C_03770 A1C_03775   rho FALSE 0.042 398.000 0.000 1.000 N NA
 3420055 3420056 A1C_03775 A1C_03790 rho   FALSE 0.017 845.000 0.000 1.000 N NA
 3420056 3420057 A1C_03790 A1C_03795     TRUE 0.647 75.000 0.006 NA   NA
 3420057 3420058 A1C_03795 A1C_03800     FALSE 0.134 253.000 0.000 NA   NA
 3420058 3420059 A1C_03800 A1C_03805     TRUE 0.911 3.000 0.007 NA   NA
 3420059 3420060 A1C_03805 A1C_03810     FALSE 0.462 196.000 0.000 NA   NA
 3420060 3420061 A1C_03810 A1C_03815     FALSE 0.020 451.000 0.000 NA   NA
 3420061 3420062 A1C_03815 A1C_03820     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3420062 3420063 A1C_03820 A1C_03825   hemC TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3420064 3420065 A1C_t06911 A1C_03830     TRUE 0.827 20.000 0.000 NA   NA
 3420065 3420066 A1C_03830 A1C_03835     TRUE 0.725 90.000 0.014 NA   NA
 3420066 3420067 A1C_03835 A1C_03840     TRUE 0.990 -3.000 0.778 NA   NA
 3420067 3420068 A1C_03840 A1C_03845     TRUE 0.959 79.000 0.667 1.000 N NA
 3420069 3420070 A1C_03850 A1C_03865     FALSE 0.013 597.000 0.000 1.000   NA
 3420070 3420071 A1C_03865 A1C_03870     TRUE 0.933 -16.000 0.045 NA   NA
 3420071 3420072 A1C_03870 A1C_03875     TRUE 0.945 -7.000 0.036 NA   NA
 3420074 3420075 A1C_03885 A1C_03890     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3420076 3420077 A1C_03895 A1C_03900     TRUE 0.902 64.000 0.092 NA N NA
 3420078 3420079 A1C_03905 A1C_t06913     TRUE 0.626 59.000 0.000 NA   NA
 3420079 3420080 A1C_t06913 A1C_03910     FALSE 0.029 376.000 0.000 NA   NA
 3420081 3420082 A1C_t06915 A1C_03915     TRUE 0.648 54.000 0.000 NA   NA
 3420082 3420083 A1C_03915 A1C_03920     TRUE 0.964 47.000 0.136 1.000 Y NA
 3420083 3420084 A1C_03920 A1C_03925     FALSE 0.033 359.000 0.000 NA   NA
 3420084 3420085 A1C_03925 A1C_03930     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3420085 3420086 A1C_03930 A1C_03935     TRUE 0.781 26.000 0.000 NA   NA
 3420086 3420087 A1C_03935 A1C_03940     TRUE 0.631 166.000 0.000 NA   NA
 3420087 3420088 A1C_03940 A1C_03945     TRUE 0.886 6.000 0.000 NA   NA
 3420088 3420089 A1C_03945 A1C_03950     TRUE 0.658 162.000 0.000 NA   NA
 3420089 3420090 A1C_03950 A1C_03955     TRUE 0.965 4.000 0.056 NA   NA
 3420090 3420091 A1C_03955 A1C_03960     TRUE 0.947 94.000 0.448 1.000 N NA
 3420091 3420092 A1C_03960 A1C_03965     TRUE 0.955 43.000 0.052 0.002 Y NA
 3420092 3420093 A1C_03965 A1C_03970     TRUE 0.982 -3.000 0.168 NA N NA
 3420093 3420094 A1C_03970 A1C_03975     FALSE 0.014 559.000 0.000 NA   NA
 3420094 3420095 A1C_03975 A1C_03980     FALSE 0.010 841.000 0.000 NA   NA
 3420097 3420098 A1C_03990 A1C_03995     TRUE 0.766 95.000 0.017 NA   NA
 3420098 3420099 A1C_03995 A1C_04000     FALSE 0.023 553.000 0.000 1.000 N NA
 3420100 3420101 A1C_04005 A1C_04010     TRUE 0.666 187.000 0.000 1.000 N NA
 3420102 3420103 A1C_04015 A1C_04020     TRUE 0.687 113.000 0.000 NA   NA
 3420104 3420105 A1C_04025 A1C_04030     TRUE 0.848 51.000 0.034 NA   NA
 3420105 3420106 A1C_04030 A1C_04035     TRUE 0.900 5.000 0.003 NA   NA
 3420106 3420107 A1C_04035 A1C_04040     TRUE 0.769 99.000 0.002 1.000 N NA
 3420107 3420108 A1C_04040 A1C_04045     TRUE 0.903 -3.000 0.007 NA   NA
 3420108 3420109 A1C_04045 A1C_04050   recO TRUE 0.661 75.000 0.008 NA   NA
 3420109 3420110 A1C_04050 A1C_04055 recO   FALSE 0.456 212.000 0.000 1.000 N NA
 3420111 3420112 A1C_04060 A1C_04065   infB FALSE 0.137 252.000 0.000 1.000   NA
 3420112 3420113 A1C_04065 A1C_04070 infB nusA TRUE 0.604 254.000 0.342 1.000 N NA
 3420113 3420114 A1C_04070 A1C_04075 nusA   TRUE 0.952 90.000 0.759 NA   NA
 3420114 3420115 A1C_04075 A1C_04080     FALSE 0.040 340.000 0.000 NA   NA
 3420115 3420116 A1C_04080 A1C_04085     FALSE 0.598 70.000 0.000 NA   NA
 3420116 3420117 A1C_04085 A1C_04090     FALSE 0.021 439.000 0.000 NA   NA
 3420117 3420118 A1C_04090 A1C_04095     TRUE 0.884 164.000 0.008 0.027 Y NA
 3420118 3420119 A1C_04095 A1C_04100     TRUE 0.722 117.000 0.004 NA   NA
 3420119 3420120 A1C_04100 A1C_04105     FALSE 0.011 755.000 0.000 NA   NA
 3420120 3420121 A1C_04105 A1C_04110     TRUE 0.990 2.000 0.667 NA   NA
 3420121 3420122 A1C_04110 A1C_04115     FALSE 0.056 304.000 0.000 NA   NA
 3420123 3420124 A1C_04120 A1C_04125     TRUE 0.933 10.000 0.015 NA   NA
 3420125 3420126 A1C_04130 A1C_04135     TRUE 0.649 168.000 0.004 1.000   NA
 3420126 3420127 A1C_04135 A1C_04140     TRUE 0.855 148.000 0.012 1.000 N NA
 3420127 3420128 A1C_04140 A1C_04145     TRUE 0.640 180.000 0.008 NA   NA
 3420128 3420129 A1C_04145 A1C_04150     TRUE 0.747 219.000 0.286 NA   NA
 3420129 3420130 A1C_04150 A1C_04155     TRUE 0.899 98.000 0.146 NA   NA
 3420130 3420131 A1C_04155 A1C_04160     FALSE 0.011 806.000 0.000 NA   NA
 3420131 3420132 A1C_04160 A1C_04165     TRUE 0.642 55.000 0.000 NA   NA
 3420133 3420134 A1C_04170 A1C_04175     TRUE 0.931 18.000 0.024 NA   NA
 3420134 3420135 A1C_04175 A1C_04180     TRUE 0.907 -3.000 0.008 NA   NA
 3420135 3420136 A1C_04180 A1C_t06917     FALSE 0.026 392.000 0.000 NA   NA
 3420136 3420137 A1C_t06917 A1C_04190     FALSE 0.054 306.000 0.000 NA   NA
 3420139 3420140 A1C_04200 A1C_04205     TRUE 0.664 104.000 0.000 NA   NA
 3420140 3420141 A1C_04205 A1C_04210     TRUE 0.678 48.000 0.000 NA   NA
 3420144 3420145 A1C_04225 A1C_04230     TRUE 0.631 97.000 0.000 NA   NA
 3420145 3420146 A1C_04230 A1C_t06919     FALSE 0.011 693.000 0.000 NA   NA
 3420146 3420147 A1C_t06919 A1C_04235   clpP FALSE 0.110 258.000 0.000 NA   NA
 3420147 3420148 A1C_04235 A1C_04240 clpP rpsA FALSE 0.297 244.000 0.009 1.000 N NA
 3420148 3420149 A1C_04240 A1C_04245 rpsA cmk FALSE 0.481 262.000 0.281 1.000 N NA
 3420151 3420152 A1C_04250 A1C_04255     TRUE 0.693 123.000 0.000 NA   NA
 3420152 3420153 A1C_04255 A1C_04260     FALSE 0.009 1036.000 0.000 NA   NA
 3420153 3420154 A1C_04260 A1C_04265     TRUE 0.640 98.000 0.000 NA   NA
 3420157 3420158 A1C_04280 A1C_04285     TRUE 0.888 0.000 0.000 NA   NA
 3420158 3420159 A1C_04285 A1C_04290     TRUE 0.753 32.000 0.000 NA   NA
 3420159 3420160 A1C_04290 A1C_04295     TRUE 0.618 61.000 0.000 NA   NA
 3420160 3420161 A1C_04295 A1C_04300     TRUE 0.604 92.000 0.000 NA   NA
 3420161 3420162 A1C_04300 A1C_04305     TRUE 0.720 40.000 0.000 NA   NA
 3420162 3420163 A1C_04305 A1C_04310     FALSE 0.015 499.000 0.000 0.013   NA
 3420165 3420166 A1C_t06923 A1C_04320     FALSE 0.009 1046.000 0.000 NA   NA
 3420167 3420168 A1C_04325 A1C_04330     FALSE 0.128 254.000 0.000 NA   NA
 3420168 3420169 A1C_04330 A1C_04335     FALSE 0.028 381.000 0.000 NA   NA
 3420169 3420170 A1C_04335 A1C_04340     TRUE 0.789 -31.000 0.000 NA   NA
 3420170 3420171 A1C_04340 A1C_04345     TRUE 0.961 106.000 0.667 NA   NA
 3420171 3420172 A1C_04345 A1C_04350     FALSE 0.036 350.000 0.000 NA   NA
 3420172 3420173 A1C_04350 A1C_04355     TRUE 0.955 -19.000 0.057 1.000 N NA
 3420174 3420175 A1C_04360 A1C_04365     TRUE 0.941 -7.000 0.027 NA   NA
 3420176 3420177 A1C_04370 A1C_04375     FALSE 0.104 259.000 0.000 NA   NA
 3420177 3420178 A1C_04375 A1C_04380     TRUE 0.600 91.000 0.000 NA   NA
 3420178 3420179 A1C_04380 A1C_04385     FALSE 0.022 423.000 0.000 NA   NA
 3420179 3420180 A1C_04385 A1C_04390     TRUE 0.958 -10.000 0.091 NA   NA
 3420180 3420181 A1C_04390 A1C_04395     FALSE 0.032 365.000 0.000 NA   NA
 3420181 3420182 A1C_04395 A1C_04400     TRUE 0.897 151.000 0.065 NA   NA
 3420182 3420183 A1C_04400 A1C_04405   mraW FALSE 0.247 284.000 0.089 NA   NA
 3420183 3420184 A1C_04405 A1C_04410 mraW   TRUE 0.989 0.000 0.635 NA   NA
 3420185 3420186 A1C_04415 A1C_04420     FALSE 0.389 222.000 0.000 NA N NA
 3420186 3420187 A1C_04420 A1C_04425     TRUE 0.951 63.000 0.681 NA   NA
 3420188 3420189 A1C_04430 A1C_04435 uvrC   TRUE 0.673 96.000 0.006 NA   NA
 3420189 3420190 A1C_04435 A1C_04440     TRUE 0.884 149.000 0.048 NA   NA
 3420191 3420192 A1C_04455 A1C_04460     TRUE 0.858 -7.000 0.000 NA   NA
 3420193 3420194 A1C_04465 A1C_t06925     FALSE 0.061 295.000 0.000 NA   NA
 3420194 3420195 A1C_t06925 A1C_04470     TRUE 0.746 33.000 0.000 NA   NA
 3420195 3420196 A1C_04470 A1C_04475     FALSE 0.539 188.000 0.000 NA   NA
 3420196 3420197 A1C_04475 A1C_04480     FALSE 0.593 76.000 0.000 NA   NA
 3420197 3420198 A1C_04480 A1C_04485     FALSE 0.018 471.000 0.000 NA   NA
 3420200 3420201 A1C_04495 A1C_04500 acpS rpoZ TRUE 0.947 1.000 0.009 1.000 N NA
 3420201 3420202 A1C_04500 A1C_04505 rpoZ   TRUE 0.765 170.000 0.008 1.000 N NA
 3420202 3420203 A1C_04505 A1C_04510   gyrB FALSE 0.071 340.000 0.004 1.000 N NA
 3420204 3420205 A1C_04515 A1C_t06927     FALSE 0.365 209.000 0.000 NA   NA
 3420205 3420206 A1C_t06927 A1C_04520     FALSE 0.030 375.000 0.000 NA   NA
 3420207 3420208 A1C_04525 A1C_04540     FALSE 0.011 698.000 0.000 NA   NA
 3420211 3420212 A1C_04560 A1C_04565   secD TRUE 0.954 -16.000 0.009 NA Y NA
 3420212 3420213 A1C_04565 A1C_04570 secD   FALSE 0.565 243.000 0.263 1.000   NA
 3420213 3420214 A1C_04570 A1C_04575     TRUE 0.803 102.000 0.018 1.000   NA
 3420214 3420215 A1C_04575 A1C_04580     TRUE 0.858 128.000 0.013 1.000 N NA
 3420215 3420216 A1C_04580 A1C_04585     FALSE 0.265 233.000 0.006 1.000   NA
 3420216 3420217 A1C_04585 A1C_04590     TRUE 0.872 -19.000 0.012 NA   NA
 3420217 3420218 A1C_04590 A1C_04595     TRUE 0.932 74.000 0.500 NA   NA
 3420222 3420223 A1C_04615 A1C_04620     TRUE 0.870 -3.000 0.000 0.003   NA
 3420223 3420224 A1C_04620 A1C_04625     TRUE 0.679 152.000 0.000 0.003   NA
 3420227 3420228 A1C_04660 A1C_04665     TRUE 0.916 80.000 0.037 0.009 Y NA
 3420228 3420229 A1C_04665 A1C_04670   murE TRUE 0.954 142.000 0.051 0.005 Y NA
 3420229 3420230 A1C_04670 A1C_04675 murE   TRUE 0.671 193.000 0.007 1.000 N NA
 3420230 3420231 A1C_04675 A1C_04680     TRUE 0.965 12.000 0.078 NA   NA
 3420232 3420233 A1C_04685 A1C_04690   dnaA TRUE 0.937 1.000 0.002 NA N NA
 3420234 3420235 A1C_04695 A1C_04700     TRUE 0.724 37.000 0.000 NA   NA
 3420235 3420236 A1C_04700 A1C_04705     TRUE 0.884 8.000 0.000 NA   NA
 3420238 3420239 A1C_04715 A1C_04730     FALSE 0.015 1033.000 0.000 0.072 N NA
 3420239 3420240 A1C_04730 A1C_04735     TRUE 0.780 -43.000 0.000 NA   NA
 3420240 3420241 A1C_04735 A1C_04740     TRUE 0.710 142.000 0.000 NA   NA
 3420241 3420242 A1C_04740 A1C_04745     TRUE 0.669 160.000 0.000 NA   NA
 3420242 3420243 A1C_04745 A1C_04750     TRUE 0.862 233.000 0.496 0.056 Y NA
 3420243 3420244 A1C_04750 A1C_04755     FALSE 0.054 372.000 0.002 1.000 N NA
 3420244 3420245 A1C_04755 A1C_04760   rpmI TRUE 0.692 121.000 0.000 NA   NA
 3420246 3420247 A1C_04765 A1C_04770   rplT TRUE 0.994 21.000 0.928 0.034 Y NA
 3420247 3420248 A1C_04770 A1C_04775 rplT rnpA TRUE 0.740 127.000 0.007 0.034   NA
 3420248 3420249 A1C_04775 A1C_04780 rnpA   TRUE 0.984 20.000 0.787 0.002   NA
 3420250 3420251 A1C_04785 A1C_04790     FALSE 0.055 305.000 0.000 NA   NA
 3420251 3420252 A1C_04790 A1C_04795     TRUE 0.951 49.000 0.500 NA   NA
 3420252 3420253 A1C_04795 A1C_04800     TRUE 0.872 13.000 0.000 NA   NA
 3420253 3420254 A1C_04800 A1C_r06955     FALSE 0.008 2403.000 0.000 NA   NA
 3420254 3420255 A1C_r06955 A1C_04815     FALSE 0.017 486.000 0.000 NA   NA
 3420255 3420256 A1C_04815 A1C_04820     FALSE 0.033 430.000 0.011 NA   NA
 3420256 3420257 A1C_04820 A1C_04825   rpsU FALSE 0.061 293.000 0.000 1.000   NA
 3420260 3420261 A1C_04840 A1C_04845 ileS   FALSE 0.593 84.000 0.000 NA   NA
 3420261 3420262 A1C_04845 A1C_04850     FALSE 0.036 349.000 0.000 NA   NA
 3420263 3420264 A1C_04855 A1C_04860     TRUE 0.887 205.000 0.157 0.002 Y NA
 3420265 3420266 A1C_04865 A1C_04870     TRUE 0.612 62.000 0.000 NA   NA
 3420266 3420267 A1C_04870 A1C_04875     TRUE 0.677 158.000 0.000 NA   NA
 3420268 3420269 A1C_04880 A1C_04885     TRUE 0.805 76.000 0.016 0.034 N NA
 3420270 3420271 A1C_04890 A1C_04895   gltX TRUE 0.750 71.000 0.008 0.051 N NA
 3420271 3420272 A1C_04895 A1C_04900 gltX   TRUE 0.915 -3.000 0.010 NA   NA
 3420273 3420274 A1C_04905 A1C_04920     FALSE 0.009 1272.000 0.000 NA   NA
 3420274 3420275 A1C_04920 A1C_04925   groEL FALSE 0.011 719.000 0.000 1.000   NA
 3420275 3420276 A1C_04925 A1C_04930 groEL groES TRUE 0.967 27.000 0.050 0.010 Y NA
 3420276 3420277 A1C_04930 A1C_04945 groES   FALSE 0.008 1397.000 0.000 NA   NA
 3420277 3420278 A1C_04945 A1C_04950   rph FALSE 0.012 660.000 0.000 NA   NA
 3420279 3420280 A1C_04955 A1C_04960     TRUE 0.873 146.000 0.034 NA   NA
 3420280 3420281 A1C_04960 A1C_04965     TRUE 0.946 123.000 0.362 NA   NA
 3420281 3420282 A1C_04965 A1C_04970     FALSE 0.019 466.000 0.000 NA   NA
 3420283 3420284 A1C_t06931 A1C_04975   rpsT TRUE 0.682 110.000 0.000 NA   NA
 3420284 3420285 A1C_04975 A1C_04980 rpsT rplQ TRUE 0.967 12.000 0.008 0.034 Y NA
 3420285 3420286 A1C_04980 A1C_04985 rplQ   TRUE 0.994 7.000 0.873 1.000 N NA
 3420286 3420287 A1C_04985 A1C_04990     TRUE 0.980 19.000 0.308 1.000 N NA
 3420287 3420288 A1C_04990 A1C_04995   rpsM TRUE 0.992 25.000 0.810 0.034 Y NA
 3420288 3420289 A1C_04995 A1C_05000 rpsM adk TRUE 0.837 59.000 0.017 1.000 N NA
 3420289 3420290 A1C_05000 A1C_05005 adk secY TRUE 0.981 16.000 0.241 1.000 N NA
 3420290 3420291 A1C_05005 A1C_05010 secY rplO TRUE 0.993 4.000 0.730 1.000 N NA
 3420291 3420292 A1C_05010 A1C_05015 rplO rpmD TRUE 0.994 14.000 0.653 0.006 Y NA
 3420292 3420293 A1C_05015 A1C_05020 rpmD rpsE TRUE 0.992 24.000 0.789 0.046 Y NA
 3420293 3420294 A1C_05020 A1C_05025 rpsE rplR TRUE 0.994 18.000 0.814 0.046 Y NA
 3420294 3420295 A1C_05025 A1C_05030 rplR rplF TRUE 0.995 16.000 0.815 0.034 Y NA
 3420295 3420296 A1C_05030 A1C_05035 rplF rpsH TRUE 0.996 10.000 0.808 0.034 Y NA
 3420296 3420297 A1C_05035 A1C_05040 rpsH rpsN TRUE 0.987 20.000 0.295 0.034 Y NA
 3420297 3420298 A1C_05040 A1C_05045 rpsN rplE TRUE 0.989 18.000 0.309 0.034 Y NA
 3420298 3420299 A1C_05045 A1C_05050 rplE rplX TRUE 0.996 0.000 0.758 0.034 Y NA
 3420299 3420300 A1C_05050 A1C_05055 rplX rplN TRUE 0.996 1.000 0.810 0.046 Y NA
 3420300 3420301 A1C_05055 A1C_05060 rplN rpsQ TRUE 0.979 75.000 0.791 0.046 Y NA
 3420301 3420302 A1C_05060 A1C_05065 rpsQ rpmC TRUE 0.996 2.000 0.828 0.034 Y NA
 3420302 3420303 A1C_05065 A1C_05070 rpmC rplP TRUE 0.995 -7.000 0.802 0.034 Y NA
 3420303 3420304 A1C_05070 A1C_05075 rplP rpsC TRUE 0.995 15.000 0.828 0.046 Y NA
 3420304 3420305 A1C_05075 A1C_05080 rpsC rplV TRUE 0.989 2.000 0.109 0.046 Y NA
 3420305 3420306 A1C_05080 A1C_05085 rplV rpsS TRUE 0.989 9.000 0.119 0.046 Y NA
 3420306 3420307 A1C_05085 A1C_05090 rpsS rplB TRUE 0.992 25.000 0.820 0.046 Y NA
 3420307 3420308 A1C_05090 A1C_05095 rplB rplW TRUE 0.997 1.000 0.849 1.000 Y NA
 3420308 3420309 A1C_05095 A1C_05100 rplW rplD TRUE 0.994 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3420309 3420310 A1C_05100 A1C_05105 rplD rplC TRUE 0.644 277.000 0.486 0.034 Y NA
 3420310 3420311 A1C_05105 A1C_05110 rplC rpsJ TRUE 0.993 1.000 0.307 0.046 Y NA
 3420311 3420312 A1C_05110 A1C_05115 rpsJ   TRUE 0.967 96.000 0.318 1.000 Y NA
 3420312 3420313 A1C_05115 A1C_t06933     FALSE 0.594 75.000 0.000 NA   NA
 3420313 3420314 A1C_t06933 A1C_t06935     TRUE 0.650 163.000 0.000 NA   NA
 3420315 3420316 A1C_05120 A1C_05125     FALSE 0.307 221.000 0.002 NA   NA
 3420316 3420317 A1C_05125 A1C_05130   fumC TRUE 0.904 -3.000 0.007 NA   NA
 3420317 3420318 A1C_05130 A1C_05135 fumC   TRUE 0.786 98.000 0.007 NA N NA
 3420318 3420319 A1C_05135 A1C_05140     FALSE 0.085 269.000 0.000 NA   NA
 3420319 3420320 A1C_05140 A1C_05145     FALSE 0.569 188.000 0.002 NA   NA
 3420320 3420321 A1C_05145 A1C_05150     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3420321 3420322 A1C_05150 A1C_05165     FALSE 0.010 977.000 0.000 NA   NA
 3420323 3420324 A1C_05170 A1C_05175     TRUE 0.708 63.000 0.011 NA   NA
 3420326 3420327 A1C_05185 A1C_05190     FALSE 0.041 676.000 0.000 1.000 Y NA
 3420328 3420329 A1C_05195 A1C_t06937 ksgA   TRUE 0.709 147.000 0.000 NA   NA
 3420330 3420331 A1C_05200 A1C_05205     TRUE 0.747 135.000 0.006 1.000   NA
 3420331 3420332 A1C_05205 A1C_05210     TRUE 0.840 168.000 0.051 1.000   NA
 3420333 3420334 A1C_05215 A1C_05220   xseA TRUE 0.730 129.000 0.002 NA   NA
 3420334 3420335 A1C_05220 A1C_05225 xseA   TRUE 0.730 79.000 0.004 1.000 N NA
 3420335 3420336 A1C_05225 A1C_05230     TRUE 0.975 -3.000 0.069 1.000 N NA
 3420336 3420337 A1C_05230 A1C_05235     TRUE 0.788 198.000 0.138 NA   NA
 3420337 3420338 A1C_05235 A1C_05240   engA TRUE 0.907 3.000 0.005 NA   NA
 3420339 3420340 A1C_05245 A1C_05250     FALSE 0.029 378.000 0.000 NA   NA
 3420342 3420343 A1C_05260 A1C_05265   ubiE TRUE 0.971 -3.000 0.115 1.000   NA
 3420343 3420344 A1C_05265 A1C_05270 ubiE   FALSE 0.486 194.000 0.000 NA   NA
 3420344 3420345 A1C_05270 A1C_05275     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3420346 3420347 A1C_05290 A1C_05295     FALSE 0.037 587.000 0.032 NA   NA
 3420347 3420348 A1C_05295 A1C_05300     FALSE 0.019 469.000 0.000 NA   NA
 3420349 3420350 A1C_05305 A1C_05320     FALSE 0.010 907.000 0.000 NA   NA
 3420350 3420351 A1C_05320 A1C_05325     FALSE 0.082 275.000 0.000 NA   NA
 3420351 3420352 A1C_05325 A1C_05330     FALSE 0.389 284.000 0.221 NA N NA
 3420352 3420353 A1C_05330 A1C_05335   tdk TRUE 0.938 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3420356 3420357 A1C_05365 A1C_05400 valS   FALSE 0.008 2272.000 0.000 NA   NA
 3420358 3420359 A1C_05405 A1C_05410     FALSE 0.506 192.000 0.000 NA   NA
 3420359 3420360 A1C_05410 A1C_05415     TRUE 0.792 -28.000 0.000 NA   NA
 3420360 3420361 A1C_05415 A1C_05420     FALSE 0.037 348.000 0.000 NA   NA
 3420362 3420363 A1C_05435 A1C_05440     TRUE 0.889 1.000 0.000 NA   NA
 3420364 3420365 A1C_05445 A1C_05450 clpX   TRUE 0.748 67.000 0.006 1.000 N NA
 3420365 3420366 A1C_05450 A1C_05455     TRUE 0.743 134.000 0.005 1.000   NA
 3420366 3420367 A1C_05455 A1C_05460     TRUE 0.793 -25.000 0.000 NA   NA
 3420367 3420368 A1C_05460 A1C_05465     TRUE 0.690 118.000 0.000 NA   NA
 3420368 3420369 A1C_05465 A1C_05470     TRUE 0.807 23.000 0.000 NA   NA
 3420370 3420371 A1C_t06939 A1C_05475     TRUE 0.708 137.000 0.000 NA   NA
 3420371 3420372 A1C_05475 A1C_05480     FALSE 0.044 329.000 0.000 NA   NA
 3420372 3420373 A1C_05480 A1C_05485     FALSE 0.014 544.000 0.000 NA   NA
 3420373 3420374 A1C_05485 A1C_05490     TRUE 0.871 109.000 0.020 0.033 N NA
 3420374 3420375 A1C_05490 A1C_05495     TRUE 0.989 -7.000 0.620 1.000 N NA
 3420375 3420376 A1C_05495 A1C_05500     TRUE 0.710 57.000 0.009 NA   NA
 3420376 3420377 A1C_05500 A1C_05505     FALSE 0.011 767.000 0.000 NA   NA
 3420377 3420378 A1C_05505 A1C_05510     FALSE 0.295 220.000 0.000 NA   NA
 3420378 3420379 A1C_05510 A1C_05515     FALSE 0.172 314.000 0.028 NA N NA
 3420380 3420381 A1C_05530 A1C_05535     FALSE 0.010 843.000 0.000 NA   NA
 3420381 3420382 A1C_05535 A1C_05540     FALSE 0.044 329.000 0.000 1.000   NA
 3420382 3420383 A1C_05540 A1C_05545     FALSE 0.022 422.000 0.000 1.000   NA
 3420383 3420384 A1C_05545 A1C_05550     TRUE 0.693 53.000 0.005 1.000   NA
 3420384 3420385 A1C_05550 A1C_05555     TRUE 0.980 -13.000 0.535 1.000   NA
 3420385 3420386 A1C_05555 A1C_05560     TRUE 0.655 83.000 0.008 1.000   NA
 3420388 3420389 A1C_05570 A1C_05575   lpxK TRUE 0.967 -37.000 0.044 1.000 Y NA
 3420389 3420390 A1C_05575 A1C_05580 lpxK   TRUE 0.603 223.000 0.006 1.000 Y NA
 3420390 3420391 A1C_05580 A1C_05585     TRUE 0.878 -51.000 0.017 1.000   NA
 3420391 3420392 A1C_05585 A1C_05590   ligA FALSE 0.190 239.000 0.000 1.000   NA
 3420392 3420393 A1C_05590 A1C_05595 ligA   FALSE 0.129 252.000 0.000 0.002   NA
 3420393 3420394 A1C_05595 A1C_05600     TRUE 0.833 -13.000 0.000 NA   NA
 3420394 3420395 A1C_05600 A1C_05605     TRUE 0.889 1.000 0.000 NA   NA
 3420395 3420396 A1C_05605 A1C_05610   tgt TRUE 0.702 49.000 0.003 NA   NA
 3420396 3420397 A1C_05610 A1C_05615 tgt   FALSE 0.215 234.000 0.000 NA   NA
 3420399 3420400 A1C_05625 A1C_05630   trmE FALSE 0.039 341.000 0.000 NA   NA
 3420401 3420402 A1C_05635 A1C_05640     FALSE 0.027 381.000 0.000 1.000   NA
 3420402 3420403 A1C_05640 A1C_05645     TRUE 0.917 3.000 0.008 NA   NA
 3420403 3420404 A1C_05645 A1C_05650     TRUE 0.828 -22.000 0.005 NA   NA
 3420404 3420405 A1C_05650 A1C_05655     FALSE 0.096 261.000 0.000 NA   NA
 3420405 3420406 A1C_05655 A1C_05660     TRUE 0.923 102.000 0.250 NA   NA
 3420406 3420407 A1C_05660 A1C_05665     TRUE 0.987 -19.000 1.000 NA   NA
 3420408 3420409 A1C_05670 A1C_05675     TRUE 0.868 47.000 0.043 NA   NA
 3420409 3420410 A1C_05675 A1C_05680     TRUE 0.818 91.000 0.043 NA   NA
 3420410 3420411 A1C_05680 A1C_05685     FALSE 0.022 412.000 0.000 1.000   NA
 3420411 3420412 A1C_05685 A1C_05690   rpmA FALSE 0.260 242.000 0.000 1.000 N NA
 3420412 3420413 A1C_05690 A1C_05695 rpmA rplU TRUE 0.991 25.000 0.667 0.033 Y NA
 3420413 3420414 A1C_05695 A1C_05700 rplU   FALSE 0.467 217.000 0.004 1.000 N NA
 3420417 3420418 A1C_05715 A1C_05720     FALSE 0.041 338.000 0.000 NA   NA
 3420418 3420419 A1C_05720 A1C_05725     FALSE 0.020 455.000 0.000 NA   NA
 3420420 3420421 A1C_05730 A1C_05735     FALSE 0.587 80.000 0.000 1.000   NA
 3420422 3420423 A1C_05740 A1C_05745     TRUE 0.956 112.000 0.538 NA   NA
 3420423 3420424 A1C_05745 A1C_05750     TRUE 0.612 62.000 0.000 NA   NA
 3420424 3420425 A1C_05750 A1C_05755     TRUE 0.886 6.000 0.000 NA   NA
 3420425 3420426 A1C_05755 A1C_05760     TRUE 0.701 128.000 0.000 NA   NA
 3420426 3420427 A1C_05760 A1C_05765     FALSE 0.104 259.000 0.000 NA   NA
 3420427 3420428 A1C_05765 A1C_05770   glyA TRUE 0.863 15.000 0.000 NA   NA
 3420428 3420429 A1C_05770 A1C_05775 glyA   TRUE 0.931 -7.000 0.009 1.000 N NA
 3420429 3420430 A1C_05775 A1C_05780     FALSE 0.190 240.000 0.000 NA   NA
 3420430 3420431 A1C_05780 A1C_05785     TRUE 0.971 -13.000 0.292 NA   NA
 3420431 3420432 A1C_05785 A1C_05790     TRUE 0.794 27.000 0.002 NA   NA
 3420432 3420433 A1C_05790 A1C_05795     TRUE 0.971 17.000 0.222 NA   NA
 3420434 3420435 A1C_05800 A1C_05805     FALSE 0.070 285.000 0.000 NA   NA
 3420435 3420436 A1C_05805 A1C_05810     FALSE 0.008 1282.000 0.000 1.000   NA
 3420437 3420438 A1C_05815 A1C_05820     TRUE 0.962 149.000 0.085 NA Y NA
 3420440 3420441 A1C_05830 A1C_05835     FALSE 0.012 692.000 0.000 NA   NA
 3420442 3420443 A1C_t06941 A1C_05840     FALSE 0.016 492.000 0.000 NA   NA
 3420443 3420444 A1C_05840 A1C_05845     FALSE 0.013 597.000 0.000 NA   NA
 3420444 3420445 A1C_05845 A1C_05850     FALSE 0.013 2082.000 0.000 1.000 N NA
 3420445 3420446 A1C_05850 A1C_05855     TRUE 0.826 52.000 0.023 NA   NA
 3420446 3420447 A1C_05855 A1C_05860     FALSE 0.168 255.000 0.010 NA   NA
 3420447 3420448 A1C_05860 A1C_05865   coaE FALSE 0.523 246.000 0.092 1.000 N NA
 3420448 3420449 A1C_05865 A1C_05870 coaE   TRUE 0.892 -6.000 0.006 NA   NA
 3420450 3420451 A1C_05875 A1C_05880   rnhA TRUE 0.924 10.000 0.012 NA   NA
 3420451 3420452 A1C_05880 A1C_05885 rnhA   TRUE 0.930 -12.000 0.012 1.000 N NA
 3420452 3420453 A1C_05885 A1C_05890     TRUE 0.893 69.000 0.199 NA   NA
 3420453 3420454 A1C_05890 A1C_05895     FALSE 0.035 351.000 0.000 NA   NA
 3420454 3420455 A1C_05895 A1C_05900     TRUE 0.703 129.000 0.000 NA   NA
 3420456 3420457 A1C_05905 A1C_05910     TRUE 0.880 10.000 0.000 NA   NA
 3420457 3420458 A1C_05910 A1C_05915     FALSE 0.008 1591.000 0.000 NA   NA
 3420458 3420459 A1C_05915 A1C_05920     TRUE 0.853 118.000 0.026 NA   NA
 3420459 3420460 A1C_05920 A1C_05925     FALSE 0.021 447.000 0.000 NA   NA
 3420461 3420462 A1C_05930 A1C_05935 recA fabG TRUE 0.928 -7.000 0.008 1.000 N NA
 3420462 3420463 A1C_05935 A1C_05940 fabG acpP TRUE 0.967 166.000 0.321 0.005 Y NA
 3420463 3420464 A1C_05940 A1C_05945 acpP   TRUE 0.968 36.000 0.106 1.000 Y NA
 3420464 3420465 A1C_05945 A1C_05960     FALSE 0.008 1448.000 0.000 NA   NA
 3420465 3420466 A1C_05960 A1C_05965     TRUE 0.761 30.000 0.000 NA   NA
 3420467 3420468 A1C_05970 A1C_05975     TRUE 0.983 -7.000 0.500 NA   NA
 3420468 3420469 A1C_05975 A1C_05980     TRUE 0.863 189.000 0.200 NA   NA
 3420469 3420470 A1C_05980 A1C_05985   gmk FALSE 0.077 282.000 0.000 NA   NA
 3420470 3420471 A1C_05985 A1C_05990 gmk   TRUE 0.754 129.000 0.008 1.000   NA
 3420471 3420472 A1C_05990 A1C_05995     FALSE 0.013 573.000 0.000 1.000   NA
 3420472 3420473 A1C_05995 A1C_06000     TRUE 0.993 3.000 0.689 1.000 N NA
 3420473 3420474 A1C_06000 A1C_06005     FALSE 0.386 210.000 0.005 1.000   NA
 3420474 3420475 A1C_06005 A1C_t06943     TRUE 0.716 42.000 0.000 NA   NA
 3420475 3420476 A1C_t06943 A1C_06010     FALSE 0.067 286.000 0.000 NA   NA
 3420476 3420477 A1C_06010 A1C_06015     FALSE 0.068 335.000 0.000 1.000 N NA
 3420477 3420478 A1C_06015 A1C_06020   rpmF TRUE 0.954 8.000 0.014 1.000 N NA
 3420479 3420480 A1C_06025 A1C_06030     TRUE 0.769 166.000 0.005 1.000 N NA
 3420480 3420481 A1C_06030 A1C_06035     TRUE 0.611 197.000 0.005 1.000 N NA
 3420481 3420482 A1C_06035 A1C_06040     FALSE 0.021 614.000 0.000 1.000 N NA
 3420482 3420483 A1C_06040 A1C_06045     FALSE 0.018 481.000 0.000 NA   NA
 3420484 3420485 A1C_06050 A1C_06055 dnaE   TRUE 0.829 149.000 0.007 1.000 N NA
 3420486 3420487 A1C_06060 A1C_06065     TRUE 0.967 10.000 0.079 NA   NA
 3420487 3420488 A1C_06065 A1C_06070     TRUE 0.808 67.000 0.033 NA   NA
 3420488 3420489 A1C_06070 A1C_06075     TRUE 0.955 -22.000 0.065 NA N NA
 3420489 3420490 A1C_06075 A1C_06080     FALSE 0.151 260.000 0.000 0.096 N NA
 3420490 3420491 A1C_06080 A1C_06085     FALSE 0.509 256.000 0.375 NA   NA
 3420491 3420492 A1C_06085 A1C_06090     TRUE 0.964 5.000 0.051 NA   NA
 3420492 3420493 A1C_06090 A1C_06095     TRUE 0.870 43.000 0.037 0.066   NA
 3420493 3420494 A1C_06095 A1C_06100     TRUE 0.964 166.000 0.857 1.000   NA
 3420494 3420495 A1C_06100 A1C_06105     TRUE 0.731 166.000 0.012 1.000   NA
 3420495 3420496 A1C_06105 A1C_06110     TRUE 0.992 -7.000 0.484 0.006 Y NA
 3420496 3420497 A1C_06110 A1C_06115     TRUE 0.994 2.000 0.451 0.018 Y NA
 3420497 3420498 A1C_06115 A1C_06120     TRUE 0.973 151.000 0.251 0.006 Y NA
 3420498 3420499 A1C_06120 A1C_06125     TRUE 0.889 1.000 0.000 NA   NA
 3420499 3420500 A1C_06125 A1C_06130     FALSE 0.145 249.000 0.000 NA   NA
 3420503 3420504 A1C_06145 A1C_06150     TRUE 0.982 148.000 0.515 0.018 Y NA
 3420504 3420505 A1C_06150 A1C_06155     TRUE 0.950 2.000 0.021 NA   NA
 3420505 3420506 A1C_06155 A1C_06160     TRUE 0.863 15.000 0.000 NA   NA
 3420506 3420507 A1C_06160 A1C_06165     TRUE 0.947 72.000 0.667 NA   NA
 3420507 3420508 A1C_06165 A1C_06180     FALSE 0.025 401.000 0.000 NA   NA
 3420508 3420509 A1C_06180 A1C_06185   atpC TRUE 0.777 196.000 0.005 1.000 Y NA
 3420509 3420510 A1C_06185 A1C_06190 atpC   TRUE 0.975 189.000 0.837 0.006 Y NA
 3420510 3420511 A1C_06190 A1C_06195     TRUE 0.977 83.000 0.724 0.006 Y NA
 3420511 3420512 A1C_06195 A1C_06200     TRUE 0.981 90.000 0.846 0.006 Y NA
 3420512 3420513 A1C_06200 A1C_06205     TRUE 0.989 131.000 0.864 0.006 Y NA
 3420513 3420514 A1C_06205 A1C_06210     TRUE 0.969 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 3420514 3420515 A1C_06210 A1C_06215     TRUE 0.842 104.000 0.014 1.000 N NA
 3420515 3420516 A1C_06215 A1C_06220     FALSE 0.058 299.000 0.000 NA   NA
 3420518 3420519 A1C_06240 A1C_06245     TRUE 0.939 4.000 0.005 1.000 N NA
 3420519 3420520 A1C_06245 A1C_06250     TRUE 0.667 105.000 0.000 NA   NA
 3420520 3420521 A1C_06250 A1C_06255     FALSE 0.065 289.000 0.000 NA   NA
 3420521 3420522 A1C_06255 A1C_06270     FALSE 0.009 1073.000 0.000 NA   NA
 3420522 3420523 A1C_06270 A1C_06275     TRUE 0.933 -7.000 0.021 NA   NA
 3420523 3420524 A1C_06275 A1C_06280     TRUE 0.906 -3.000 0.008 NA   NA
 3420525 3420526 A1C_06285 A1C_06290     FALSE 0.552 186.000 0.000 NA   NA
 3420526 3420527 A1C_06290 A1C_06295     TRUE 0.688 116.000 0.000 NA   NA
 3420527 3420528 A1C_06295 A1C_t06945     FALSE 0.011 758.000 0.000 NA   NA
 3420528 3420529 A1C_t06945 A1C_06300   infA TRUE 0.852 17.000 0.000 NA   NA
 3420529 3420530 A1C_06300 A1C_06305 infA   TRUE 0.982 12.000 0.207 NA N NA
 3420531 3420532 A1C_06310 A1C_06315   xerC TRUE 0.884 99.000 0.040 1.000 N NA
 3420534 3420535 A1C_06325 A1C_06330     TRUE 0.827 93.000 0.047 1.000   NA
 3420535 3420536 A1C_06330 A1C_06335     TRUE 0.766 82.000 0.009 NA N NA
 3420536 3420537 A1C_06335 A1C_06340     TRUE 0.633 206.000 0.015 NA N NA
 3420537 3420538 A1C_06340 A1C_06355     FALSE 0.009 1106.000 0.000 NA   NA
 3420538 3420539 A1C_06355 A1C_06360     TRUE 0.618 61.000 0.000 NA   NA
 3420539 3420540 A1C_06360 A1C_06365     TRUE 0.661 103.000 0.000 NA   NA
 3420540 3420541 A1C_06365 A1C_06370     FALSE 0.110 258.000 0.000 NA   NA
 3420541 3420542 A1C_06370 A1C_06375     TRUE 0.787 -33.000 0.000 NA   NA
 3420542 3420543 A1C_06375 A1C_06380     TRUE 0.697 152.000 0.000 NA   NA
 3420543 3420544 A1C_06380 A1C_06385     TRUE 0.631 166.000 0.000 NA   NA
 3420544 3420545 A1C_06385 A1C_06390     FALSE 0.053 309.000 0.000 NA   NA
 3420546 3420547 A1C_06395 A1C_06410     FALSE 0.015 1103.000 0.000 1.000 N NA
 3420547 3420548 A1C_06410 A1C_06415     TRUE 0.947 -3.000 0.023 NA   NA
 3420549 3420550 A1C_06420 A1C_06425     FALSE 0.474 235.000 0.000 0.004 Y NA
 3420550 3420551 A1C_06425 A1C_06430     TRUE 0.970 149.000 0.545 1.000 N NA
 3420551 3420552 A1C_06430 A1C_06435     TRUE 0.961 5.000 0.018 1.000 N NA
 3420552 3420553 A1C_06435 A1C_06440     FALSE 0.571 209.000 0.010 1.000 N NA
 3420553 3420554 A1C_06440 A1C_06445     TRUE 0.939 -19.000 0.023 1.000 N NA
 3420555 3420556 A1C_06450 A1C_06455     TRUE 0.901 155.000 0.085 NA   NA
 3420556 3420557 A1C_06455 A1C_06460     FALSE 0.040 436.000 0.016 NA   NA
 3420559 3420560 A1C_06470 A1C_06475     FALSE 0.377 206.000 0.000 NA   NA
 3420560 3420561 A1C_06475 A1C_06480     FALSE 0.176 242.000 0.000 NA   NA
 3420561 3420562 A1C_06480 A1C_06485     FALSE 0.245 230.000 0.000 NA   NA
 3420563 3420564 A1C_06490 A1C_06495     FALSE 0.405 201.000 0.000 NA   NA
 3420564 3420565 A1C_06495 A1C_06500     FALSE 0.015 530.000 0.000 NA   NA
 3420565 3420566 A1C_06500 A1C_06505     TRUE 0.700 44.000 0.000 NA   NA
 3420566 3420567 A1C_06505 A1C_t06947     FALSE 0.012 690.000 0.000 NA   NA
 3420568 3420569 A1C_06510 A1C_06515     TRUE 0.686 169.000 0.008 NA   NA
 3420569 3420570 A1C_06515 A1C_06520     TRUE 0.732 185.000 0.008 1.000 N NA
 3420570 3420571 A1C_06520 A1C_06525     FALSE 0.096 261.000 0.000 NA   NA
 3420571 3420572 A1C_06525 A1C_06530   tig FALSE 0.019 485.000 0.002 NA   NA
 3420573 3420574 A1C_06535 A1C_06540 obgE gltA FALSE 0.332 218.000 0.002 1.000   NA
 3420574 3420575 A1C_06540 A1C_06545 gltA   FALSE 0.032 367.000 0.000 NA   NA
 3420575 3420576 A1C_06545 A1C_06550     FALSE 0.447 197.000 0.000 NA   NA
 3420577 3420578 A1C_06555 A1C_06560     FALSE 0.010 1013.000 0.000 NA   NA
 3420578 3420579 A1C_06560 A1C_06565     TRUE 0.617 95.000 0.000 NA   NA
 3420579 3420580 A1C_06565 A1C_06570     TRUE 0.851 -15.000 0.006 1.000   NA
 3420581 3420582 A1C_06575 A1C_06580   glyS TRUE 0.882 79.000 0.013 NA Y NA
 3420582 3420583 A1C_06580 A1C_06585 glyS glyQ TRUE 0.994 -7.000 0.651 0.002 Y NA
 3420583 3420584 A1C_06585 A1C_06590 glyQ   TRUE 0.753 32.000 0.000 NA   NA
 3420584 3420585 A1C_06590 A1C_06595     FALSE 0.067 286.000 0.000 NA   NA
 3420585 3420586 A1C_06595 A1C_06600     TRUE 0.930 9.000 0.014 NA   NA
 3420586 3420587 A1C_06600 A1C_06605     TRUE 0.764 -51.000 0.000 0.020   NA
 3420587 3420588 A1C_06605 A1C_06610     FALSE 0.031 368.000 0.000 NA   NA
 3420588 3420589 A1C_06610 A1C_06615     TRUE 0.992 10.000 1.000 NA   NA
 3420589 3420590 A1C_06615 A1C_06620     TRUE 0.603 254.000 0.556 NA   NA
 3420592 3420593 A1C_06630 A1C_06635     FALSE 0.398 202.000 0.000 NA   NA
 3420593 3420594 A1C_06635 A1C_06640   truA FALSE 0.198 238.000 0.000 NA   NA
 3420594 3420595 A1C_06640 A1C_06645 truA   TRUE 0.785 -34.000 0.000 NA   NA
 3420595 3420596 A1C_06645 A1C_06650     TRUE 0.708 43.000 0.000 NA   NA
 3420596 3420597 A1C_06650 A1C_06655     FALSE 0.585 177.000 0.000 NA   NA
 3420597 3420598 A1C_06655 A1C_06660     TRUE 0.705 149.000 0.000 NA   NA
 3420598 3420599 A1C_06660 A1C_06665     FALSE 0.534 209.000 0.006 1.000 N NA
 3420599 3420600 A1C_06665 A1C_06670   dnaG TRUE 0.957 44.000 0.299 1.000 N NA
 3420600 3420601 A1C_06670 A1C_06675 dnaG   TRUE 0.943 5.000 0.008 1.000 N NA
 3420603 3420604 A1C_06685 A1C_06690     TRUE 0.955 77.000 0.829 0.002   NA
 3420605 3420606 A1C_06695 A1C_06700     FALSE 0.049 371.000 0.000 1.000 N NA
 3420606 3420607 A1C_06700 A1C_06705     TRUE 0.983 12.000 0.411 NA   NA
 3420608 3420609 A1C_06710 A1C_06715     FALSE 0.397 234.000 0.022 1.000   NA
 3420609 3420610 A1C_06715 A1C_06720     FALSE 0.013 591.000 0.000 1.000   NA
 3420610 3420611 A1C_06720 A1C_06725     TRUE 0.946 4.000 0.019 1.000   NA
 3420612 3420613 A1C_06730 A1C_06735     TRUE 0.671 74.000 0.009 1.000   NA
 3420616 3420617 A1C_06750 A1C_06755     TRUE 0.798 28.000 0.005 1.000   NA
 3420617 3420618 A1C_06755 A1C_06760     TRUE 0.696 124.000 0.000 NA   NA
 3420618 3420619 A1C_06760 A1C_06765     TRUE 0.690 118.000 0.000 NA   NA
 3420620 3420621 A1C_06770 A1C_06775     FALSE 0.021 410.000 0.000 0.002   NA
 3420622 3420623 A1C_06780 A1C_06785   lipB TRUE 0.905 -3.000 0.007 NA   NA
 3420623 3420624 A1C_06785 A1C_06790 lipB   TRUE 0.911 18.000 0.004 1.000 N NA
 3420624 3420625 A1C_06790 A1C_t06951     FALSE 0.385 205.000 0.000 NA   NA
 3420625 3420626 A1C_t06951 A1C_06795   rpsP FALSE 0.349 210.000 0.000 NA   NA
 3420626 3420627 A1C_06795 A1C_06800 rpsP rpmG TRUE 0.965 14.000 0.008 0.030 Y NA
 3420627 3420628 A1C_06800 A1C_06805 rpmG mutL TRUE 0.722 178.000 0.004 1.000 N NA
 3420628 3420629 A1C_06805 A1C_06810 mutL   TRUE 0.894 -3.000 0.004 NA   NA
 3420629 3420630 A1C_06810 A1C_06815     FALSE 0.592 77.000 0.000 NA   NA
 3420631 3420632 A1C_06835 A1C_06840     TRUE 0.954 120.000 0.500 NA   NA
 3420632 3420633 A1C_06840 A1C_06845     TRUE 0.636 56.000 0.000 NA   NA
 3420633 3420634 A1C_06845 A1C_06850     TRUE 0.879 -3.000 0.000 NA   NA
 3420634 3420635 A1C_06850 A1C_06855     FALSE 0.009 1301.000 0.000 NA   NA
 3420635 3420636 A1C_06855 A1C_06860     TRUE 0.925 -16.000 0.014 1.000 N NA
 3420637 3420638 A1C_06865 A1C_06870     FALSE 0.009 1019.000 0.000 NA   NA
 3420638 3420639 A1C_06870 A1C_06875   hemH TRUE 0.955 12.000 0.043 NA   NA
 3420639 3420640 A1C_06875 A1C_06880 hemH hemE TRUE 0.986 -7.000 0.131 1.000 Y NA