MicrobesOnline Operon Predictions for Xanthomonas albilineans

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
10136832	10136833	XALc_0001	XALc_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.753	263.000	0.328	1.000	Y	NA
10136833	10136834	XALc_0002	XALc_0003	dnaN	recF	TRUE	0.728	274.000	0.318	1.000	Y	NA
10136834	10136835	XALc_0003	XALc_0004	recF	gyrB	TRUE	0.974	114.000	0.249	0.005	Y	NA
10136835	10136836	XALc_0004	XALc_0005	gyrB		FALSE	0.433	85.000	0.005	NA		NA
10136836	10136837	XALc_0005	XALc_0006			TRUE	0.689	68.000	0.079	NA		NA
10136837	10136838	XALc_0006	XALc_0007			TRUE	0.451	159.000	0.063	1.000		NA
10136838	10136839	XALc_0007	XALc_0008			FALSE	0.377	151.000	0.095	1.000	N	NA
10136839	10136840	XALc_0008	XALc_0009		exbB	TRUE	0.966	100.000	0.600	0.018	N	NA
10136840	10136841	XALc_0009	XALc_0010	exbB	exbD1	TRUE	0.990	43.000	0.600	0.050	Y	NA
10136841	10136842	XALc_0010	XALc_0011	exbD1	exbD2	TRUE	0.999	4.000	0.857	0.038	Y	NA
10136843	10136844	XALc_0012	XALc_0013		pdxJ	FALSE	0.046	153.000	0.000	1.000	N	NA
10136844	10136845	XALc_0013	XALc_0014	pdxJ		TRUE	0.691	14.000	0.009	NA		NA
10136845	10136846	XALc_0014	XALc_0015			TRUE	0.913	86.000	0.417	NA		NA
10136848	10136849	XALc_0017	XALc_0018		tyrB	FALSE	0.215	156.000	0.000	NA		NA
10136849	10136850	XALc_0018	XALc_0019	tyrB	lldD	FALSE	0.018	252.000	0.000	1.000	N	NA
10136850	10136851	XALc_0019	XALc_0020	lldD		FALSE	0.297	129.000	0.036	1.000	N	NA
10136853	10136854	XALc_0022	XALc_0023			FALSE	0.063	329.000	0.000	NA		NA
10136854	10136855	XALc_0023	XALc_0024		recD	FALSE	0.395	65.000	0.000	NA		NA
10136855	10136856	XALc_0024	XALc_0025	recD	recB	TRUE	1.000	-3.000	0.688	0.001	Y	NA
10136856	10136857	XALc_0025	XALc_0026	recB	recC	TRUE	1.000	-3.000	0.542	0.001	Y	NA
10136858	10136859	XALc_0027	XALc_0028			TRUE	0.997	0.000	0.530	NA	Y	NA
10136859	10136860	XALc_0028	XALc_0029			TRUE	0.936	70.000	0.562	NA		NA
10136860	10136861	XALc_0029	XALc_0030			TRUE	0.953	-3.000	0.024	NA		NA
10136861	10136862	XALc_0030	XALc_0031			TRUE	0.889	-10.000	0.041	NA		NA
10136862	10136863	XALc_0031	XALc_0032			TRUE	0.913	4.000	0.035	NA		NA
10136864	10136865	XALc_0033	XALc_0034			FALSE	0.088	268.000	0.000	NA		NA
10136865	10136866	XALc_0034	XALc_0035		uxaC	FALSE	0.207	159.000	0.000	NA		NA
10136866	10136867	XALc_0035	XALc_0036	uxaC		TRUE	0.840	42.000	0.033	1.000	Y	NA
10136867	10136868	XALc_0036	XALc_0037			TRUE	0.937	100.000	0.286	NA	Y	NA
10136869	10136870	XALc_0038	XALc_0039			TRUE	0.860	81.000	0.136	0.038	N	NA
10136870	10136871	XALc_0039	XALc_0040			TRUE	0.930	28.000	0.455	1.000		NA
10136871	10136872	XALc_0040	XALc_0041			FALSE	0.402	80.000	0.000	NA		NA
10136873	10136874	XALc_0042	XALc_0043	plsB		TRUE	0.946	0.000	0.043	NA		NA
10136875	10136876	XALc_0044	XALc_0045			FALSE	0.097	96.000	0.000	1.000	N	NA
10136876	10136877	XALc_0045	XALc_0046			TRUE	0.923	116.000	0.600	NA		NA
10136878	10136879	XALc_0047	XALc_0048	pyrF		TRUE	0.932	-3.000	0.008	1.000		NA
10136882	10136883	XALc_0051	XALc_0052			TRUE	0.945	72.000	0.625	NA		NA
10136883	10136884	XALc_0052	XALc_0053			TRUE	0.997	-3.000	0.740	NA		NA
10136886	10136887	XALc_0055	XALc_0056			FALSE	0.374	100.000	0.000	NA		NA
10136888	10136889	XALc_0057	XALc_0058			TRUE	0.958	46.000	0.364	1.000	Y	NA
10136889	10136890	XALc_0058	XALc_0059			TRUE	0.999	3.000	0.800	0.009	Y	NA
10136890	10136891	XALc_0059	XALc_0060		rspA	TRUE	0.940	54.000	0.800	1.000	N	NA
10136891	10136892	XALc_0060	XALc_0061	rspA		TRUE	0.998	-3.000	1.000	1.000		NA
10136892	10136893	XALc_0061	XALc_0062			TRUE	0.974	-3.000	0.082	1.000		NA
10136896	10136897	XALc_0065	XALc_0066		rdgC	FALSE	0.175	115.000	0.012	NA	N	NA
10136897	10136898	XALc_0066	XALc_0067	rdgC		TRUE	0.745	76.000	0.121	NA		NA
10136899	10136900	XALc_0068	XALc_0069		hemH	TRUE	0.915	-3.000	0.037	NA	N	NA
10136901	10136902	XALc_0070	XALc_0071		tatA	TRUE	0.517	141.000	0.073	NA		NA
10136902	10136903	XALc_0071	XALc_0072	tatA	tatB	TRUE	0.987	15.000	0.157	0.012	Y	NA
10136903	10136904	XALc_0072	XALc_0073	tatB	tatC	TRUE	0.997	-3.000	0.314	NA	Y	NA
10136905	10136906	XALc_0074	XALc_0075			TRUE	0.676	76.000	0.070	NA		NA
10136909	10136910	XALc_0078	XALc_0079	glyQ	glyS	TRUE	0.987	156.000	0.651	0.001	Y	NA
10136911	10136912	XALc_0080	XALc_0081			FALSE	0.076	289.000	0.000	NA		NA
10136913	10136914	XALc_0082	XALc_0083			TRUE	0.997	-3.000	0.344	1.000	Y	NA
10136916	10136917	XALc_0085	XALc_0086			FALSE	0.063	129.000	0.000	1.000	N	NA
10136917	10136918	XALc_0086	XALc_0087			FALSE	0.023	226.000	0.000	1.000	N	NA
10136918	10136919	XALc_0087	XALc_0088			FALSE	0.396	97.000	0.000	1.000		NA
10136920	10136921	XALc_0089	XALc_0090			FALSE	0.033	543.000	0.000	NA		NA
10136921	10136922	XALc_0090	XALc_0091			FALSE	0.027	613.000	0.000	NA		NA
10136922	10136923	XALc_0091	XALc_0092		acsA	TRUE	0.824	105.000	0.357	1.000	N	NA
10136924	10136925	XALc_0093	XALc_0094		actP	TRUE	0.997	-3.000	0.684	NA		NA
10136925	10136926	XALc_0094	XALc_0095	actP		FALSE	0.318	121.000	0.000	1.000		NA
10136926	10136927	XALc_0095	XALc_0096			FALSE	0.047	421.000	0.000	1.000		NA
10136927	10136928	XALc_0096	XALc_0097			TRUE	0.634	101.000	0.053	1.000		NA
10136928	10136929	XALc_0097	XALc_0098			TRUE	0.868	9.000	0.040	1.000		NA
10136929	10136930	XALc_0098	XALc_0099			FALSE	0.416	79.000	0.000	1.000		NA
10136934	10136935	XALc_0103	XALc_0104	gidB	parA	TRUE	0.840	88.000	0.339	1.000	N	NA
10136935	10136936	XALc_0104	XALc_0105	parA	parB	TRUE	0.994	0.000	0.827	1.000	N	NA
10136936	10136937	XALc_0105	XALc_0106	parB	gla	FALSE	0.104	104.000	0.002	1.000	N	NA
10136937	10136938	XALc_0106	XALc_0107	gla		TRUE	0.933	92.000	0.227	1.000	Y	NA
10136938	10136939	XALc_0107	XALc_0108			TRUE	0.981	2.000	0.273	1.000		NA
10136939	10136940	XALc_0108	XALc_0109		rpmB	FALSE	0.042	458.000	0.000	1.000		NA
10136940	10136941	XALc_0109	XALc_0110	rpmB	rpmG	TRUE	0.993	14.000	0.332	0.019	Y	NA
10136941	10136942	XALc_0110	XALc_0111	rpmG		FALSE	0.050	162.000	0.002	1.000	N	NA
10136942	10136943	XALc_0111	XALc_0112			TRUE	0.851	103.000	0.300	NA		NA
10136943	10136944	XALc_0112	XALc_0113		uvrD	TRUE	0.475	115.000	0.022	NA		NA
10136946	10136947	XALc_0115	XALc_0116			FALSE	0.031	557.000	0.000	NA		NA
10136947	10136948	XALc_0116	XALc_0117			TRUE	0.969	57.000	1.000	NA		NA
10136951	10136952	XALc_0120	XALc_0121	hemF		FALSE	0.285	139.000	0.006	NA		NA
10136952	10136953	XALc_0121	XALc_0122			FALSE	0.113	233.000	0.000	NA		NA
10136954	10136955	XALc_0123	XALc_0124			TRUE	0.989	0.000	0.000	0.049	Y	NA
10136955	10136956	XALc_0124	XALc_0125			FALSE	0.074	118.000	0.000	1.000	N	NA
10136957	10136958	XALc_0126	XALc_0127			TRUE	0.982	-3.000	0.143	NA		NA
10136959	10136960	XALc_0128	XALc_0129			TRUE	0.761	23.000	0.083	NA		NA
10136960	10136961	XALc_0129	XALc_0130			TRUE	0.710	-15.000	0.000	NA		NA
10136961	10136962	XALc_0130	XALc_0131			TRUE	0.963	28.000	0.750	NA		NA
10136962	10136963	XALc_0131	XALc_0132			TRUE	0.953	10.000	0.045	NA	Y	NA
10136963	10136964	XALc_0132	XALc_0133			TRUE	0.990	-3.000	0.297	NA		NA
10136964	10136965	XALc_0133	XALc_0134			TRUE	0.915	-76.000	0.196	NA		NA
10136965	10136966	XALc_0134	XALc_0135			TRUE	0.963	26.000	0.727	NA		NA
10136966	10136967	XALc_0135	XALc_0136			TRUE	0.931	-16.000	0.171	NA		NA
10136967	10136968	XALc_0136	XALc_0137			TRUE	0.828	132.000	0.123	NA	Y	NA
10136969	10136970	XALc_0138	XALc_0139			FALSE	0.154	191.000	0.000	NA		NA
10136970	10136971	XALc_0139	XALc_0140			TRUE	0.942	-3.000	0.070	NA	N	NA
10136971	10136972	XALc_0140	XALc_0141			TRUE	0.961	-3.000	0.037	NA		NA
10136972	10136973	XALc_0141	XALc_0142		fabF	TRUE	0.963	9.000	0.303	NA		NA
10136974	10136975	XALc_0143	XALc_0144			TRUE	0.909	-7.000	0.040	NA		NA
10136975	10136976	XALc_0144	XALc_0145			FALSE	0.184	171.000	0.000	NA		NA
10136979	10136980	XALc_0148	XALc_0149		accC	FALSE	0.404	82.000	0.000	NA		NA
10136980	10136981	XALc_0149	XALc_0150	accC	accD	FALSE	0.272	793.000	0.158	1.000	Y	NA
10136981	10136982	XALc_0150	XALc_0151	accD		TRUE	0.949	57.000	0.316	1.000	Y	NA
10136983	10136984	XALc_0152	XALc_0153			FALSE	0.098	251.000	0.000	NA		NA
10136984	10136985	XALc_0153	XALc_0154			TRUE	0.820	4.000	0.000	NA		NA
10136987	10136988	XALc_0156	XALc_0157			FALSE	0.318	136.000	0.009	NA		NA
10136988	10136989	XALc_0157	XALc_0158			TRUE	0.954	-3.000	0.026	NA		NA
10136989	10136990	XALc_0158	XALc_0159		ohrR	FALSE	0.086	271.000	0.000	NA		NA
10136990	10136991	XALc_0159	XALc_0160	ohrR	ohr	TRUE	0.523	103.000	0.086	1.000	N	NA
10136991	10136992	XALc_0160	XALc_0161	ohr	nrdA	FALSE	0.004	695.000	0.000	1.000	N	NA
10136992	10136993	XALc_0161	XALc_0162	nrdA	nrdB	TRUE	0.959	114.000	0.079	0.001	Y	NA
10136993	10136994	XALc_0162	XALc_0163	nrdB		TRUE	0.773	57.000	0.250	1.000	N	NA
10136994	10136995	XALc_0163	XALc_0164			TRUE	0.925	79.000	0.484	1.000		NA
10136995	10136996	XALc_0164	XALc_0165			FALSE	0.043	446.000	0.000	1.000		NA
10136996	10136997	XALc_0165	XALc_0166			FALSE	0.296	121.000	0.031	1.000	N	NA
10136997	10136998	XALc_0166	XALc_0167			FALSE	0.433	62.000	0.040	1.000	N	NA
10136999	10137000	XALc_0168	XALc_0169		metE	FALSE	0.116	230.000	0.000	NA		NA
10137002	10137003	XALc_0171	XALc_0172			TRUE	0.726	-13.000	0.000	NA		NA
10137003	10137004	XALc_0172	XALc_0173			FALSE	0.379	98.000	0.000	NA		NA
10137004	10137005	XALc_0173	XALc_0174			FALSE	0.317	118.000	0.000	NA		NA
10137005	10137006	XALc_0174	XALc_0175			TRUE	0.801	-7.000	0.000	NA		NA
10137006	10137007	XALc_0175	XALc_0176			TRUE	0.793	5.000	0.000	NA		NA
10137007	10137008	XALc_0176	XALc_0177			FALSE	0.033	539.000	0.000	NA		NA
10137008	10137009	XALc_0177	XALc_0178			FALSE	0.128	215.000	0.000	NA		NA
10137009	10137010	XALc_0178	XALc_0179			TRUE	0.561	17.000	0.000	NA		NA
10137010	10137011	XALc_0179	XALc_0180			FALSE	0.264	135.000	0.000	NA		NA
10137011	10137012	XALc_0180	XALc_0181			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137012	10137013	XALc_0181	XALc_0182			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137013	10137014	XALc_0182	XALc_0183			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137014	10137015	XALc_0183	XALc_0184			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10137015	10137016	XALc_0184	XALc_0185			FALSE	0.395	45.000	0.000	NA		NA
10137016	10137017	XALc_0185	XALc_0186			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137017	10137018	XALc_0186	XALc_0187			FALSE	0.182	173.000	0.000	NA		NA
10137019	10137020	XALc_0188	XALc_0189			FALSE	0.404	82.000	0.000	NA		NA
10137021	10137022	XALc_0190	XALc_0191			FALSE	0.417	35.000	0.000	NA		NA
10137024	10137025	XALc_0193	XALc_0194			FALSE	0.123	223.000	0.000	NA		NA
10137026	10137027	XALc_0195	XALc_0196			TRUE	0.850	2.000	0.000	NA		NA
10137027	10137028	XALc_0196	XALc_0197			FALSE	0.232	147.000	0.000	NA		NA
10137028	10137029	XALc_0197	XALc_0198			FALSE	0.108	237.000	0.000	NA		NA
10137029	10137030	XALc_0198	XALc_0199			FALSE	0.054	357.000	0.000	NA		NA
10137030	10137031	XALc_0199	XALc_0200			FALSE	0.074	296.000	0.000	NA		NA
10137031	10137032	XALc_0200	XALc_0201			FALSE	0.389	51.000	0.000	NA		NA
10137032	10137033	XALc_0201	XALc_0202			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137033	10137034	XALc_0202	XALc_0203			FALSE	0.374	299.000	0.000	0.003		NA
10137034	10137035	XALc_0203	XALc_0204			FALSE	0.103	246.000	0.000	NA		NA
10137035	10137036	XALc_0204	XALc_0205			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137036	10137037	XALc_0205	XALc_0206			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137037	10137038	XALc_0206	XALc_0207			TRUE	0.644	13.000	0.000	NA		NA
10137038	10137039	XALc_0207	XALc_0208			FALSE	0.278	130.000	0.000	NA		NA
10137039	10137040	XALc_0208	XALc_0209			TRUE	0.858	2.000	0.000	1.000		NA
10137040	10137041	XALc_0209	XALc_0210			TRUE	0.985	-3.000	0.182	1.000		NA
10137041	10137042	XALc_0210	XALc_0211			TRUE	0.706	10.000	0.000	NA		NA
10137042	10137043	XALc_0211	XALc_0212			TRUE	0.538	18.000	0.000	NA		NA
10137043	10137044	XALc_0212	XALc_0213			FALSE	0.393	71.000	0.000	NA		NA
10137044	10137045	XALc_0213	XALc_0214			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137045	10137046	XALc_0214	XALc_0215			TRUE	0.640	-42.000	0.000	NA		NA
10137046	10137047	XALc_0215	XALc_0216			FALSE	0.393	56.000	0.000	NA		NA
10137047	10137048	XALc_0216	XALc_0217			TRUE	0.850	2.000	0.000	NA		NA
10137048	10137049	XALc_0217	XALc_0218			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137049	10137050	XALc_0218	XALc_0219			TRUE	0.801	-7.000	0.000	NA		NA
10137050	10137051	XALc_0219	XALc_0220			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137051	10137052	XALc_0220	XALc_0221			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137052	10137053	XALc_0221	XALc_0222			FALSE	0.405	41.000	0.000	NA		NA
10137053	10137054	XALc_0222	XALc_0223			TRUE	0.820	4.000	0.000	NA		NA
10137054	10137055	XALc_0223	XALc_0224			FALSE	0.286	128.000	0.000	NA		NA
10137055	10137056	XALc_0224	XALc_0225			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10137056	10137057	XALc_0225	XALc_0226			TRUE	0.996	0.000	0.857	NA		NA
10137057	10137058	XALc_0226	XALc_0227			TRUE	0.995	-3.000	0.500	NA		NA
10137058	10137059	XALc_0227	XALc_0228			TRUE	0.994	-3.000	0.435	NA		NA
10137059	10137060	XALc_0228	XALc_0229			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10137060	10137061	XALc_0229	XALc_0230			TRUE	0.837	3.000	0.000	NA		NA
10137061	10137062	XALc_0230	XALc_0231			FALSE	0.395	58.000	0.000	NA		NA
10137062	10137063	XALc_0231	XALc_0232			FALSE	0.144	199.000	0.000	NA		NA
10137063	10137064	XALc_0232	XALc_0233			TRUE	0.801	-7.000	0.000	NA		NA
10137064	10137065	XALc_0233	XALc_0234			FALSE	0.215	156.000	0.000	NA		NA
10137065	10137066	XALc_0234	XALc_0235			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137066	10137067	XALc_0235	XALc_0236			FALSE	0.267	134.000	0.000	NA		NA
10137067	10137068	XALc_0236	XALc_0237			FALSE	0.215	156.000	0.000	NA		NA
10137068	10137069	XALc_0237	XALc_0238			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10137069	10137070	XALc_0238	XALc_0239			FALSE	0.445	26.000	0.000	NA		NA
10137070	10137071	XALc_0239	XALc_0240			FALSE	0.437	27.000	0.000	NA		NA
10137071	10137072	XALc_0240	XALc_0241			FALSE	0.060	339.000	0.000	NA		NA
10137074	10137075	XALc_0243	XALc_0244	dusA		FALSE	0.041	444.000	0.000	NA		NA
10137075	10137076	XALc_0244	XALc_0245		phoP	TRUE	0.771	75.000	0.143	NA		NA
10137076	10137077	XALc_0245	XALc_0246	phoP	phoQ	TRUE	0.934	38.000	0.214	1.000	Y	NA
10137077	10137078	XALc_0246	XALc_0247	phoQ		TRUE	0.797	140.000	0.333	NA		NA
10137078	10137079	XALc_0247	XALc_0248			TRUE	0.646	31.000	0.041	NA		NA
10137080	10137081	XALc_0249	XALc_0250			TRUE	0.549	87.000	0.020	NA		NA
10137082	10137083	XALc_0251	XALc_0252	birA		TRUE	0.970	-3.000	0.147	1.000	N	NA
10137083	10137084	XALc_0252	XALc_0253			TRUE	0.745	10.000	0.007	NA		NA
10137084	10137085	XALc_0253	XALc_Yt01		tRNA-tRNA_Thr	FALSE	0.396	75.000	0.000	NA		NA
10137085	10137086	XALc_Yt01	XALc_0255	tRNA-tRNA_Thr		FALSE	0.021	2501.000	0.000	NA		NA
10137086	10137087	XALc_0255	XALc_0256			TRUE	0.837	102.000	0.000	0.001		NA
10137087	10137088	XALc_0256	XALc_0257		trpS	FALSE	0.153	197.000	0.000	1.000		NA
10137088	10137089	XALc_0257	XALc_0258	trpS		FALSE	0.308	160.000	0.017	1.000		NA
10137093	10137094	XALc_0262	XALc_0263			TRUE	0.980	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
10137095	10137096	XALc_0264	XALc_0265			TRUE	0.998	-3.000	0.719	0.047	N	NA
10137096	10137097	XALc_0265	XALc_0266			FALSE	0.232	340.000	0.000	1.000	Y	NA
10137097	10137098	XALc_0266	XALc_0267			TRUE	0.999	-3.000	0.937	1.000	Y	NA
10137098	10137099	XALc_0267	XALc_0268			TRUE	1.000	-3.000	0.937	0.059	Y	NA
10137099	10137100	XALc_0268	XALc_0269			TRUE	0.998	2.000	0.944	1.000	Y	NA
10137100	10137101	XALc_0269	XALc_0270			TRUE	1.000	-3.000	0.976	0.008	Y	NA
10137101	10137102	XALc_0270	XALc_0271			TRUE	1.000	0.000	0.881	0.008	Y	NA
10137104	10137105	XALc_0273	XALc_0274		purC	FALSE	0.067	315.000	0.000	NA		NA
10137106	10137107	XALc_0275	XALc_0276		rpe	TRUE	0.799	10.000	0.015	1.000		NA
10137107	10137108	XALc_0276	XALc_0277	rpe		TRUE	0.941	2.000	0.050	1.000		NA
10137108	10137109	XALc_0277	XALc_0278			FALSE	0.190	169.000	0.000	NA		NA
10137109	10137110	XALc_0278	XALc_0279		trpE	FALSE	0.051	368.000	0.000	NA		NA
10137110	10137111	XALc_0279	XALc_0280	trpE	pabA	TRUE	0.672	839.000	0.230	0.001	Y	NA
10137111	10137112	XALc_0280	XALc_0281	pabA		TRUE	0.498	51.000	0.013	1.000		NA
10137112	10137113	XALc_0281	XALc_0282		trpD	FALSE	0.419	51.000	0.003	1.000		NA
10137113	10137114	XALc_0282	XALc_0283	trpD	trpC	TRUE	0.858	170.000	0.293	1.000	Y	NA
10137114	10137115	XALc_0283	XALc_0284	trpC		TRUE	0.981	-3.000	0.005	NA	Y	NA
10137116	10137117	XALc_0285	XALc_0286			FALSE	0.039	505.000	0.000	1.000		NA
10137119	10137120	XALc_0288	XALc_0289			FALSE	0.156	194.000	0.000	1.000		NA
10137121	10137122	XALc_0290	XALc_0291	rplM	rpsI	TRUE	0.999	4.000	0.601	0.018	Y	NA
10137123	10137124	XALc_Yt02	XALc_Yt03	tRNA-tRNA-Gln	tRNA-tRNA-Met	FALSE	0.403	42.000	0.000	NA		NA
10137125	10137126	XALc_0294	XALc_0295	nudH		FALSE	0.256	80.000	0.015	NA	N	NA
10137126	10137127	XALc_0295	XALc_0296		bfr	TRUE	0.850	102.000	0.070	NA	Y	NA
10137128	10137129	XALc_0297	XALc_0298			TRUE	0.998	4.000	0.556	0.027	Y	NA
10137130	10137131	XALc_0299	XALc_0300			TRUE	0.898	5.000	0.034	NA		NA
10137131	10137132	XALc_0300	XALc_0301			TRUE	0.712	32.000	0.079	NA		NA
10137132	10137133	XALc_0301	XALc_0302			FALSE	0.438	49.000	0.007	NA		NA
10137133	10137134	XALc_0302	XALc_0303			FALSE	0.311	55.000	0.020	1.000	N	NA
10137135	10137136	XALc_0304	XALc_0305			FALSE	0.245	142.000	0.000	NA		NA
10137136	10137137	XALc_0305	XALc_0306		purD	FALSE	0.105	242.000	0.000	NA		NA
10137137	10137138	XALc_0306	XALc_0307	purD	purH	TRUE	0.690	264.000	0.238	1.000	Y	NA
10137138	10137139	XALc_0307	XALc_0308	purH		FALSE	0.084	274.000	0.000	NA		NA
10137139	10137140	XALc_0308	XALc_0309		fis	FALSE	0.056	350.000	0.000	NA		NA
10137140	10137141	XALc_0309	XALc_0310	fis		TRUE	0.546	113.000	0.037	NA		NA
10137141	10137142	XALc_0310	XALc_0311		prmA	FALSE	0.217	271.000	0.058	NA		NA
10137142	10137143	XALc_0311	XALc_0312	prmA	accC	FALSE	0.301	225.000	0.152	1.000	N	NA
10137143	10137144	XALc_0312	XALc_0313	accC	accB	TRUE	0.975	129.000	0.275	0.001	Y	NA
10137144	10137145	XALc_0313	XALc_0314	accB		TRUE	0.774	53.000	0.254	1.000	N	NA
10137145	10137146	XALc_0314	XALc_0315			FALSE	0.161	202.000	0.041	1.000	N	NA
10137146	10137147	XALc_0315	XALc_0316			TRUE	0.988	-3.000	0.032	1.000	Y	NA
10137147	10137148	XALc_0316	XALc_0317			FALSE	0.363	20.000	0.014	1.000	N	NA
10137149	10137150	XALc_0318	XALc_0319	groS	groL	TRUE	0.925	112.000	0.269	1.000	Y	NA
10137150	10137151	XALc_0319	XALc_0320	groL		FALSE	0.029	606.000	0.000	1.000		NA
10137151	10137152	XALc_0320	XALc_0321		aroG	FALSE	0.051	387.000	0.000	1.000		NA
10137152	10137153	XALc_0321	XALc_0322	aroG		FALSE	0.020	242.000	0.000	1.000	N	NA
10137155	10137156	XALc_0324	XALc_0325		glnE	FALSE	0.034	532.000	0.000	NA		NA
10137158	10137159	XALc_0327	XALc_0328			TRUE	0.745	126.000	0.000	0.004		NA
10137161	10137162	XALc_0330	XALc_0331	rutE		TRUE	0.765	85.000	0.132	NA		NA
10137163	10137164	XALc_0332	XALc_0333			FALSE	0.075	295.000	0.000	NA		NA
10137164	10137165	XALc_0333	XALc_0334			FALSE	0.058	357.000	0.000	1.000		NA
10137165	10137166	XALc_0334	XALc_0335			TRUE	0.993	-3.000	0.125	NA	Y	NA
10137166	10137167	XALc_0335	XALc_0336			TRUE	0.899	84.000	0.125	NA	Y	NA
10137168	10137169	XALc_0337	XALc_0338	aceE		FALSE	0.068	314.000	0.000	NA		NA
10137169	10137170	XALc_0338	XALc_0339			FALSE	0.059	341.000	0.000	NA		NA
10137172	10137173	XALc_0341	XALc_0342			FALSE	0.009	365.000	0.000	1.000	N	NA
10137173	10137174	XALc_0342	XALc_0343			TRUE	0.934	11.000	0.300	1.000	N	NA
10137174	10137175	XALc_0343	XALc_0344			TRUE	0.999	-3.000	0.900	0.036	N	NA
10137175	10137176	XALc_0344	XALc_0345			FALSE	0.022	227.000	0.000	1.000	N	NA
10137176	10137177	XALc_0345	XALc_0346			FALSE	0.017	265.000	0.000	1.000	N	NA
10137178	10137179	XALc_0347	XALc_0348	gidA		FALSE	0.027	616.000	0.000	NA		NA
10137181	10137182	XALc_0350	XALc_0351	bioC		FALSE	0.080	146.000	0.006	1.000	N	NA
10137182	10137183	XALc_0351	XALc_0352		bioH	TRUE	0.610	87.000	0.033	1.000		NA
10137183	10137184	XALc_0352	XALc_0353	bioH	bioF	TRUE	0.645	261.000	0.096	0.003		NA
10137184	10137185	XALc_0353	XALc_0354	bioF	bioB	TRUE	0.976	85.000	0.168	0.003	Y	NA
10137188	10137189	XALc_Yt04	XALc_0358	tRNA-tRNA-Arg		FALSE	0.058	344.000	0.000	NA		NA
10137190	10137191	XALc_0359	XALc_0360			TRUE	0.856	13.000	0.074	NA		NA
10137194	10137195	XALc_0363	XALc_0364	speA		FALSE	0.005	569.000	0.000	1.000	N	NA
10137195	10137196	XALc_0364	XALc_0365			TRUE	0.891	-7.000	0.091	1.000	N	NA
10137196	10137197	XALc_0365	XALc_0366			FALSE	0.040	456.000	0.000	NA		NA
10137197	10137198	XALc_0366	XALc_0367			FALSE	0.165	185.000	0.000	NA		NA
10137199	10137200	XALc_0368	XALc_0369			FALSE	0.037	528.000	0.000	1.000		NA
10137200	10137201	XALc_0369	XALc_0370			FALSE	0.267	176.000	0.018	NA		NA
10137201	10137202	XALc_0370	XALc_0371		argS	TRUE	0.612	19.000	0.062	NA	N	NA
10137202	10137203	XALc_0371	XALc_0372	argS	radC	FALSE	0.077	140.000	0.005	1.000	N	NA
10137204	10137205	XALc_0373	XALc_0374	coaBC	dut	TRUE	0.978	-3.000	0.201	1.000	N	NA
10137205	10137206	XALc_0374	XALc_0375	dut		FALSE	0.428	74.000	0.039	1.000	N	NA
10137207	10137208	XALc_0376	XALc_0377		pyrE	TRUE	0.580	26.000	0.018	NA		NA
10137209	10137210	XALc_0378	XALc_0379			TRUE	0.940	-3.000	0.013	NA		NA
10137210	10137211	XALc_0379	XALc_0380			FALSE	0.205	160.000	0.000	NA		NA
10137212	10137213	XALc_0381	XALc_0382			TRUE	0.686	99.000	0.184	NA	N	NA
10137214	10137215	XALc_0383	XALc_Yr01	tyrS	rRNA-rRNA-16S	FALSE	0.027	619.000	0.000	NA		NA
10137215	10137216	XALc_Yr01	XALc_Yt05	rRNA-rRNA-16S	tRNA-tRNA-Ala	FALSE	0.350	107.000	0.000	NA		NA
10137216	10137217	XALc_Yt05	XALc_Yt06	tRNA-tRNA-Ala	tRNA-tRNA_Ile	TRUE	0.606	15.000	0.000	NA		NA
10137217	10137218	XALc_Yt06	XALc_Yr02	tRNA-tRNA_Ile	rRNA-rRNA-23S	FALSE	0.123	223.000	0.000	NA		NA
10137218	10137219	XALc_Yr02	XALc_Yr03	rRNA-rRNA-23S	rRNA-rRNA-5S	FALSE	0.126	218.000	0.000	NA		NA
10137219	10137220	XALc_Yr03	XALc_0389	rRNA-rRNA-5S		FALSE	0.037	489.000	0.000	NA		NA
10137221	10137222	XALc_0390	XALc_0391			FALSE	0.409	39.000	0.000	NA		NA
10137223	10137224	XALc_0392	XALc_0393			TRUE	0.935	106.000	0.408	0.035	N	NA
10137225	10137226	XALc_0394	XALc_0395	serA		TRUE	0.908	5.000	0.043	NA		NA
10137226	10137227	XALc_0395	XALc_0396			TRUE	0.832	17.000	0.096	NA		NA
10137230	10137231	XALc_0399	XALc_0400			TRUE	0.714	21.000	0.042	NA		NA
10137231	10137232	XALc_0400	XALc_0401			TRUE	0.996	32.000	0.741	0.001	Y	NA
10137232	10137233	XALc_0401	XALc_0402			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10137233	10137234	XALc_0402	XALc_0403			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137234	10137235	XALc_0403	XALc_0404			TRUE	0.930	22.000	0.536	1.000	N	NA
10137237	10137238	XALc_0406	XALc_0407			FALSE	0.432	28.000	0.000	NA		NA
10137238	10137239	XALc_0407	XALc_0408			TRUE	0.710	12.000	0.006	1.000		NA
10137239	10137240	XALc_0408	XALc_0409			TRUE	0.997	-3.000	0.321	1.000	Y	NA
10137241	10137242	XALc_0410	XALc_0411			FALSE	0.385	180.000	0.056	1.000		NA
10137244	10137245	XALc_0413	XALc_0414	dnaG		FALSE	0.443	64.000	0.006	1.000		NA
10137245	10137246	XALc_0414	XALc_0415			FALSE	0.407	93.000	0.000	1.000		NA
10137246	10137247	XALc_0415	XALc_0416		rpsU	TRUE	0.770	91.000	0.000	0.027		NA
10137248	10137249	XALc_0417	XALc_0418	gcp	folB	TRUE	0.683	-7.000	0.014	1.000	N	NA
10137249	10137250	XALc_0418	XALc_0419	folB	bglX	FALSE	0.007	448.000	0.000	1.000	N	NA
10137251	10137252	XALc_0420	XALc_0421			FALSE	0.024	220.000	0.000	1.000	N	NA
10137252	10137253	XALc_0421	XALc_0422			TRUE	0.968	-3.000	0.055	NA		NA
10137254	10137255	XALc_0423	XALc_0424	ampD		FALSE	0.235	146.000	0.000	NA		NA
10137255	10137256	XALc_0424	XALc_0425			FALSE	0.116	230.000	0.000	NA		NA
10137256	10137257	XALc_0425	XALc_0426			FALSE	0.190	169.000	0.000	NA		NA
10137257	10137258	XALc_0426	XALc_0427			TRUE	0.695	127.000	0.160	NA		NA
10137259	10137260	XALc_0428	XALc_0429			TRUE	0.564	64.000	0.022	1.000		NA
10137260	10137261	XALc_0429	XALc_0430			TRUE	0.502	100.000	0.018	NA		NA
10137261	10137262	XALc_0430	XALc_0431			TRUE	0.915	95.000	0.455	NA		NA
10137262	10137263	XALc_0431	XALc_0432			TRUE	0.997	0.000	1.000	NA		NA
10137263	10137264	XALc_0432	XALc_0433			TRUE	0.993	6.000	0.857	NA		NA
10137264	10137265	XALc_0433	XALc_0434			TRUE	0.619	163.000	0.192	NA		NA
10137267	10137268	XALc_0436	XALc_0437			FALSE	0.036	529.000	0.000	1.000		NA
10137268	10137269	XALc_0437	XALc_0438			FALSE	0.086	281.000	0.000	1.000		NA
10137269	10137270	XALc_0438	XALc_0440			FALSE	0.156	190.000	0.000	NA		NA
10137271	10137272	XALc_0441	XALc_0442	glpD	glpF	FALSE	0.383	170.000	0.129	1.000	N	NA
10137272	10137273	XALc_0442	XALc_0443	glpF	glpK	FALSE	0.183	94.000	0.008	1.000	N	NA
10137273	10137274	XALc_0443	XALc_0444	glpK		FALSE	0.266	306.000	0.000	1.000	Y	NA
10137274	10137275	XALc_0444	XALc_0445			TRUE	0.989	-9.000	0.600	1.000		NA
10137275	10137276	XALc_0445	XALc_0446			TRUE	0.931	32.000	0.214	0.061		NA
10137276	10137277	XALc_0446	XALc_0447			TRUE	0.974	26.000	0.214	0.061	Y	NA
10137277	10137278	XALc_0447	XALc_0448			FALSE	0.228	252.000	0.000	0.035	N	NA
10137279	10137280	XALc_0449	XALc_0450			TRUE	0.979	4.000	0.300	NA		NA
10137282	10137283	XALc_0452	XALc_0453		glnS	FALSE	0.181	180.000	0.000	1.000		NA
10137284	10137285	XALc_0454	XALc_0455			FALSE	0.230	148.000	0.000	NA		NA
10137285	10137286	XALc_0455	XALc_0456		msrA	TRUE	0.496	62.000	0.013	NA		NA
10137287	10137288	XALc_0457	XALc_0458	tal	oxyR	FALSE	0.015	283.000	0.000	1.000	N	NA
10137288	10137289	XALc_0458	XALc_0459	oxyR	ahpF	FALSE	0.446	88.000	0.041	1.000	N	NA
10137289	10137290	XALc_0459	XALc_0460	ahpF	ahpC	TRUE	0.922	177.000	0.551	1.000	Y	NA
10137291	10137292	XALc_0461	XALc_0462	hemK	pip	FALSE	0.379	128.000	0.012	1.000		NA
10137293	10137294	XALc_0463	XALc_0464			TRUE	0.953	-7.000	0.135	1.000		NA
10137294	10137295	XALc_0464	XALc_0465			TRUE	0.653	102.000	0.068	1.000		NA
10137295	10137296	XALc_0465	XALc_0466			TRUE	0.851	-3.000	0.014	1.000	N	NA
10137297	10137298	XALc_0467	XALc_0468			FALSE	0.247	177.000	0.014	NA		NA
10137299	10137300	XALc_0469	XALc_0470			TRUE	0.987	6.000	0.556	NA		NA
10137300	10137301	XALc_0470	XALc_0471			TRUE	0.970	-3.000	0.065	NA		NA
10137302	10137303	XALc_0472	XALc_0473			TRUE	0.943	131.000	0.321	0.003		NA
10137305	10137306	XALc_0475	XALc_0476			FALSE	0.395	129.000	0.017	NA		NA
10137307	10137308	XALc_0477	XALc_0478			TRUE	0.534	78.000	0.018	NA		NA
10137308	10137309	XALc_0478	XALc_0479		wrbA	TRUE	0.997	-3.000	0.657	NA		NA
10137310	10137311	XALc_0480	XALc_0481			TRUE	0.951	-3.000	0.020	1.000		NA
10137312	10137313	XALc_0482	XALc_0483		moaB	TRUE	0.639	14.000	0.000	1.000		NA
10137313	10137314	XALc_0483	XALc_0484	moaB		FALSE	0.012	311.000	0.000	1.000	N	NA
10137314	10137315	XALc_0484	XALc_0485			FALSE	0.004	839.000	0.000	1.000	N	NA
10137315	10137316	XALc_0485	XALc_0486		prfA	FALSE	0.171	23.000	0.004	1.000	N	NA
10137316	10137317	XALc_0486	XALc_0487	prfA	hemA	TRUE	0.953	-22.000	0.171	0.042	N	NA
10137318	10137319	XALc_0488	XALc_0489		lolB	TRUE	0.955	-3.000	0.024	1.000		NA
10137319	10137320	XALc_0489	XALc_0490	lolB	ispE	TRUE	0.867	-21.000	0.157	1.000	N	NA
10137320	10137321	XALc_0490	XALc_Yt07	ispE	tRNA-tRNA_Gln	TRUE	0.644	13.000	0.000	NA		NA
10137321	10137322	XALc_Yt07	XALc_0492	tRNA-tRNA_Gln	prs	FALSE	0.252	139.000	0.000	NA		NA
10137322	10137323	XALc_0492	XALc_0493	prs		TRUE	0.565	112.000	0.122	1.000	N	NA
10137323	10137324	XALc_0493	XALc_0494		pth	TRUE	0.988	58.000	0.496	0.027	Y	NA
10137324	10137325	XALc_0494	XALc_0495	pth		TRUE	0.921	78.000	0.184	1.000	Y	NA
10137325	10137326	XALc_0495	XALc_Yt08		tRNA-tRNA_Tyr	FALSE	0.190	169.000	0.000	NA		NA
10137326	10137327	XALc_Yt08	XALc_Yt09	tRNA-tRNA_Tyr	tRNA-tRNA_Gly	FALSE	0.419	33.000	0.000	NA		NA
10137327	10137328	XALc_Yt09	XALc_Yt10	tRNA-tRNA_Gly	tRNA-tRNA_Thr	FALSE	0.409	39.000	0.000	NA		NA
10137328	10137329	XALc_Yt10	XALc_0499	tRNA-tRNA_Thr	tuf	FALSE	0.389	48.000	0.000	NA		NA
10137329	10137330	XALc_0499	XALc_Yt11	tuf	tRNA-tRNA_Trp	FALSE	0.197	166.000	0.000	NA		NA
10137330	10137331	XALc_Yt11	XALc_0501	tRNA-tRNA_Trp		FALSE	0.389	51.000	0.000	NA		NA
10137331	10137332	XALc_0501	XALc_0502		nusG	TRUE	0.978	14.000	0.843	1.000	N	NA
10137332	10137333	XALc_0502	XALc_0503	nusG	rplK	TRUE	0.762	203.000	0.681	1.000	N	NA
10137333	10137334	XALc_0503	XALc_0504	rplK	rplA	TRUE	0.999	4.000	0.838	0.024	Y	NA
10137334	10137335	XALc_0504	XALc_0505	rplA	rplJ	TRUE	0.741	488.000	0.302	0.024	Y	NA
10137335	10137336	XALc_0505	XALc_0506	rplJ	rplL	TRUE	0.995	64.000	0.884	0.018	Y	NA
10137336	10137337	XALc_0506	XALc_0507	rplL	rpoB	FALSE	0.402	285.000	0.223	1.000		NA
10137337	10137338	XALc_0507	XALc_0508	rpoB	rpoC	TRUE	0.979	156.000	0.851	0.001		NA
10137338	10137339	XALc_0508	XALc_0509	rpoC	rpsL	FALSE	0.254	226.000	0.122	1.000	N	NA
10137339	10137340	XALc_0509	XALc_0510	rpsL	rpsG	TRUE	0.998	13.000	0.620	0.004	Y	NA
10137340	10137341	XALc_0510	XALc_0511	rpsG	fusA	TRUE	0.953	140.000	0.579	1.000	Y	NA
10137341	10137342	XALc_0511	XALc_0512	fusA	tuf	TRUE	0.991	88.000	0.400	0.001	Y	NA
10137342	10137343	XALc_0512	XALc_0513	tuf	rpsJ	TRUE	0.533	486.000	0.318	1.000	Y	NA
10137343	10137344	XALc_0513	XALc_0514	rpsJ	rplC	TRUE	0.993	12.000	0.307	0.024	Y	NA
10137344	10137345	XALc_0514	XALc_0515	rplC	rplD	TRUE	0.996	13.000	0.486	0.018	Y	NA
10137345	10137346	XALc_0515	XALc_0516	rplD	rplW	TRUE	0.999	-3.000	0.513	0.018	Y	NA
10137346	10137347	XALc_0516	XALc_0517	rplW	rplB	TRUE	0.998	11.000	0.849	0.023	Y	NA
10137347	10137348	XALc_0517	XALc_0518	rplB	rpsS	TRUE	0.999	7.000	0.820	0.024	Y	NA
10137348	10137349	XALc_0518	XALc_0519	rpsS	rplV	TRUE	0.999	7.000	0.769	0.024	Y	NA
10137349	10137350	XALc_0519	XALc_0520	rplV	rpsC	TRUE	0.996	18.000	0.719	0.024	Y	NA
10137350	10137351	XALc_0520	XALc_0521	rpsC	rplP	TRUE	0.999	6.000	0.828	0.024	Y	NA
10137351	10137352	XALc_0521	XALc_0522	rplP	rpmC	TRUE	0.999	0.000	0.802	0.018	Y	NA
10137352	10137353	XALc_0522	XALc_0523	rpmC	rpsQ	TRUE	0.998	12.000	0.828	0.018	Y	NA
10137353	10137354	XALc_0523	XALc_0524	rpsQ	rplN	TRUE	0.997	15.000	0.791	0.024	Y	NA
10137354	10137355	XALc_0524	XALc_0525	rplN	rplX	TRUE	0.997	16.000	0.810	0.024	Y	NA
10137355	10137356	XALc_0525	XALc_0526	rplX	rplE	TRUE	0.998	12.000	0.758	0.018	Y	NA
10137356	10137357	XALc_0526	XALc_0527	rplE	rpsN	TRUE	0.981	66.000	0.309	0.018	Y	NA
10137357	10137358	XALc_0527	XALc_0528	rpsN	rpsH	TRUE	0.879	268.000	0.295	0.018	Y	NA
10137358	10137359	XALc_0528	XALc_0529	rpsH	rplF	TRUE	0.997	17.000	0.808	0.018	Y	NA
10137359	10137360	XALc_0529	XALc_0530	rplF	rplR	TRUE	0.994	96.000	0.815	0.018	Y	NA
10137360	10137361	XALc_0530	XALc_0531	rplR	rpsE	TRUE	0.986	155.000	0.814	0.024	Y	NA
10137361	10137362	XALc_0531	XALc_0532	rpsE	rpmD	TRUE	0.999	-7.000	0.789	0.024	Y	NA
10137362	10137363	XALc_0532	XALc_0533	rpmD	rplO	TRUE	0.999	7.000	0.653	0.003	Y	NA
10137363	10137364	XALc_0533	XALc_0534	rplO	secY	TRUE	0.984	8.000	0.730	1.000	N	NA
10137364	10137365	XALc_0534	XALc_0535	secY	rpsM	FALSE	0.029	340.000	0.011	1.000	N	NA
10137365	10137366	XALc_0535	XALc_0536	rpsM	rpsK	TRUE	0.998	10.000	0.810	0.018	Y	NA
10137366	10137367	XALc_0536	XALc_0537	rpsK	rpsD	TRUE	0.995	15.000	0.509	0.024	Y	NA
10137367	10137368	XALc_0537	XALc_0538	rpsD	rpoA	TRUE	0.900	50.000	0.549	1.000	N	NA
10137368	10137369	XALc_0538	XALc_0539	rpoA	rplQ	TRUE	0.695	293.000	0.873	1.000	N	NA
10137369	10137370	XALc_0539	XALc_0540	rplQ	dsbB	FALSE	0.011	329.000	0.000	1.000	N	NA
10137373	10137374	XALc_0543	XALc_0544		typA	TRUE	0.657	14.000	0.006	NA		NA
10137375	10137376	XALc_0545	XALc_0546		mdh	FALSE	0.023	522.000	0.018	1.000	N	NA
10137376	10137377	XALc_0546	XALc_0547	mdh		FALSE	0.100	67.000	0.000	1.000	N	NA
10137378	10137379	XALc_0548	XALc_0549	gst		TRUE	0.634	128.000	0.111	1.000		NA
10137379	10137380	XALc_0549	XALc_0550			FALSE	0.072	301.000	0.000	NA		NA
10137380	10137381	XALc_0550	XALc_0551			FALSE	0.385	96.000	0.000	NA		NA
10137381	10137382	XALc_0551	XALc_0552			FALSE	0.209	556.000	0.000	0.002		NA
10137382	10137383	XALc_0552	XALc_0553			TRUE	0.990	3.000	0.500	1.000		NA
10137385	10137386	XALc_0555	XALc_0556	fadH		TRUE	0.557	185.000	0.017	1.000	Y	NA
10137387	10137388	XALc_0557	XALc_0558			FALSE	0.091	265.000	0.000	NA		NA
10137388	10137389	XALc_0558	XALc_0559		rluB	TRUE	0.835	46.000	0.227	NA		NA
10137390	10137391	XALc_0560	XALc_0561	kbl	tdh	TRUE	0.724	190.000	0.547	1.000	N	NA
10137392	10137393	XALc_0562	XALc_0563			TRUE	0.587	157.000	0.143	1.000		NA
10137393	10137394	XALc_0563	XALc_0564		folC	FALSE	0.127	115.000	0.006	1.000	N	NA
10137394	10137395	XALc_0564	XALc_0565	folC		TRUE	0.492	70.000	0.013	NA		NA
10137395	10137396	XALc_0565	XALc_0566		cvpA	FALSE	0.433	97.000	0.007	NA		NA
10137396	10137397	XALc_0566	XALc_0567	cvpA	purF	TRUE	0.871	29.000	0.262	1.000		NA
10137397	10137398	XALc_0567	XALc_0568	purF		TRUE	0.524	35.000	0.012	1.000		NA
10137399	10137400	XALc_0569	XALc_0570	lpxH		FALSE	0.226	174.000	0.008	1.000		NA
10137400	10137401	XALc_0570	XALc_0571			TRUE	0.916	-16.000	0.125	1.000		NA
10137401	10137402	XALc_0571	XALc_0572		ppx	FALSE	0.097	200.000	0.018	1.000	N	NA
10137402	10137403	XALc_0572	XALc_0573	ppx	ppk	TRUE	0.872	55.000	0.076	1.000	Y	NA
10137403	10137404	XALc_0573	XALc_0574	ppk	phoR	TRUE	0.717	12.000	0.045	1.000	N	NA
10137404	10137405	XALc_0574	XALc_0575	phoR	phoB	TRUE	0.966	67.000	0.453	1.000	Y	NA
10137405	10137406	XALc_0575	XALc_0576	phoB		TRUE	0.536	84.000	0.016	1.000		NA
10137407	10137408	XALc_0577	XALc_0578			TRUE	0.964	-3.000	0.045	NA		NA
10137408	10137409	XALc_0578	XALc_0579			FALSE	0.307	171.000	0.025	NA		NA
10137411	10137412	XALc_Yt12	XALc_Yt13	tRNA-tRNA_Pro	tRNA-tRNA_Arg	FALSE	0.398	44.000	0.000	NA		NA
10137412	10137413	XALc_Yt13	XALc_Yt14	tRNA-tRNA_Arg	tRNA-tRNA_His	FALSE	0.416	36.000	0.000	NA		NA
10137413	10137414	XALc_Yt14	XALc_Yt15	tRNA-tRNA_His	tRNA-tRNA_Lys	FALSE	0.399	77.000	0.000	NA		NA
10137414	10137415	XALc_Yt15	XALc_Yt16	tRNA-tRNA_Lys	tRNA-tRNA_Leu	FALSE	0.392	93.000	0.000	NA		NA
10137415	10137416	XALc_Yt16	XALc_0586	tRNA-tRNA_Leu	tig	FALSE	0.140	202.000	0.000	NA		NA
10137416	10137417	XALc_0586	XALc_0587	tig	clpP	TRUE	0.923	136.000	0.351	1.000	Y	NA
10137417	10137418	XALc_0587	XALc_0588	clpP	clpX	TRUE	0.929	130.000	0.352	1.000	Y	NA
10137418	10137419	XALc_0588	XALc_0589	clpX	lon	TRUE	0.813	171.000	0.201	1.000	Y	NA
10137419	10137420	XALc_0589	XALc_0590	lon	hupB	FALSE	0.045	226.000	0.008	1.000	N	NA
10137420	10137421	XALc_0590	XALc_Yt17	hupB	tRNA-tRNA_Val	TRUE	0.668	12.000	0.000	NA		NA
10137421	10137422	XALc_Yt17	XALc_Yt18	tRNA-tRNA_Val	tRNA-tRNA_Asp	FALSE	0.432	28.000	0.000	NA		NA
10137422	10137423	XALc_Yt18	XALc_Yt19	tRNA-tRNA_Asp	tRNA-tRNA_Asp	FALSE	0.304	121.000	0.000	NA		NA
10137423	10137424	XALc_Yt19	XALc_0594	tRNA-tRNA_Asp	ppiD	FALSE	0.163	186.000	0.000	NA		NA
10137425	10137426	XALc_0595	XALc_0596	mltD	gloB	TRUE	0.735	12.000	0.008	1.000		NA
10137427	10137428	XALc_0597	XALc_0598		rnhA	TRUE	0.554	18.000	0.000	1.000		NA
10137428	10137429	XALc_0598	XALc_0599	rnhA	dnaQ	TRUE	0.944	29.000	0.248	1.000	Y	NA
10137431	10137432	XALc_Yt20	XALc_0602	tRNA-tRNA_Ser		FALSE	0.312	119.000	0.000	NA		NA
10137434	10137435	XALc_0604	XALc_0605	kdkA		TRUE	0.939	0.000	0.032	1.000		NA
10137435	10137436	XALc_0605	XALc_0606		moaA	TRUE	0.978	-3.000	0.108	1.000		NA
10137436	10137437	XALc_0606	XALc_0607	moaA		TRUE	0.915	4.000	0.037	NA		NA
10137437	10137438	XALc_0607	XALc_0608		moaC	FALSE	0.446	32.000	0.004	NA		NA
10137438	10137439	XALc_0608	XALc_0609	moaC	moaD	TRUE	0.994	-3.000	0.175	1.000	Y	NA
10137439	10137440	XALc_0609	XALc_0610	moaD	moaE	TRUE	0.996	4.000	0.501	1.000	Y	NA
10137442	10137443	XALc_0612	XALc_0613	dnaX		TRUE	0.979	7.000	0.411	NA		NA
10137443	10137444	XALc_0613	XALc_0614		recR	TRUE	0.703	274.000	0.604	NA		NA
10137444	10137445	XALc_0614	XALc_0615	recR		FALSE	0.251	83.000	0.013	1.000	N	NA
10137446	10137447	XALc_0616	XALc_0617			TRUE	0.889	-3.000	0.025	NA	N	NA
10137447	10137448	XALc_0617	XALc_0618			TRUE	0.992	-7.000	0.727	NA		NA
10137448	10137449	XALc_0618	XALc_0619			TRUE	0.991	6.000	0.739	NA		NA
10137452	10137453	XALc_0622	XALc_0623		rpmF	TRUE	0.934	102.000	0.599	NA		NA
10137453	10137454	XALc_0623	XALc_0624	rpmF	fabH	FALSE	0.256	97.000	0.014	1.000	N	NA
10137454	10137455	XALc_0624	XALc_0625	fabH	fabD	TRUE	0.891	226.000	0.182	0.004	Y	NA
10137455	10137456	XALc_0625	XALc_0626	fabD	fabG	TRUE	0.989	91.000	0.432	0.004	Y	NA
10137456	10137457	XALc_0626	XALc_0627	fabG	acpP	TRUE	0.965	155.000	0.321	0.004	Y	NA
10137457	10137458	XALc_0627	XALc_0628	acpP	fabF	TRUE	0.926	132.000	0.346	1.000	Y	NA
10137458	10137459	XALc_0628	XALc_0629	fabF		TRUE	0.567	167.000	0.030	0.017	N	NA
10137459	10137460	XALc_0629	XALc_0630			FALSE	0.436	104.000	0.010	NA		NA
10137460	10137461	XALc_0630	XALc_0631		tmk	TRUE	0.987	-3.000	0.209	NA		NA
10137461	10137462	XALc_0631	XALc_0632	tmk	holB	TRUE	0.979	-3.000	0.211	1.000	N	NA
10137462	10137463	XALc_0632	XALc_0633	holB		TRUE	0.989	-3.000	0.382	NA	N	NA
10137463	10137464	XALc_0633	XALc_Yt22		tRNA-tRNA_Val	FALSE	0.398	76.000	0.000	NA		NA
10137466	10137467	XALc_0636	XALc_0637			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137467	10137468	XALc_0637	XALc_0638		prpB	FALSE	0.385	96.000	0.000	NA		NA
10137468	10137469	XALc_0638	XALc_0639	prpB		FALSE	0.411	38.000	0.000	NA		NA
10137469	10137470	XALc_0639	XALc_0640		prpC	FALSE	0.398	44.000	0.000	NA		NA
10137470	10137471	XALc_0640	XALc_0641	prpC		TRUE	0.876	156.000	0.289	1.000	Y	NA
10137471	10137472	XALc_0641	XALc_0642			TRUE	0.935	121.000	0.733	NA		NA
10137472	10137473	XALc_0642	XALc_0643			FALSE	0.049	384.000	0.000	NA		NA
10137473	10137474	XALc_0643	XALc_0644			TRUE	0.737	69.000	0.214	NA	N	NA
10137474	10137475	XALc_0644	XALc_0645			FALSE	0.394	57.000	0.000	NA		NA
10137475	10137476	XALc_0645	XALc_0646			FALSE	0.186	176.000	0.000	1.000		NA
10137476	10137477	XALc_0646	XALc_0647			TRUE	0.939	20.000	0.400	1.000		NA
10137477	10137478	XALc_0647	XALc_0648			FALSE	0.030	591.000	0.000	1.000		NA
10137478	10137479	XALc_0648	XALc_0649			FALSE	0.065	332.000	0.000	1.000		NA
10137481	10137482	XALc_0651	XALc_0652		cbpA	TRUE	0.826	137.000	0.133	NA	Y	NA
10137483	10137484	XALc_0653	XALc_0654			TRUE	0.673	78.000	0.150	1.000	N	NA
10137485	10137486	XALc_0655	XALc_0656	hflK	hflC	TRUE	1.000	-3.000	0.947	0.010	Y	NA
10137486	10137487	XALc_0656	XALc_0657	hflC	purA	FALSE	0.048	307.000	0.019	1.000	N	NA
10137487	10137488	XALc_0657	XALc_0658	purA		FALSE	0.015	283.000	0.000	1.000	N	NA
10137490	10137491	XALc_0660	XALc_0661	rimK		FALSE	0.004	705.000	0.000	1.000	N	NA
10137491	10137492	XALc_0661	XALc_0662			TRUE	0.595	496.000	0.400	1.000	Y	NA
10137493	10137494	XALc_0663	XALc_0664	coaE	pilD	TRUE	0.821	13.000	0.122	1.000	N	NA
10137494	10137495	XALc_0664	XALc_0665	pilD	pilC	TRUE	0.993	7.000	0.454	1.000	Y	NA
10137496	10137497	XALc_0666	XALc_0667	pilA	pilB	TRUE	0.582	150.000	0.000	1.000	Y	NA
10137498	10137499	XALc_0668	XALc_0669	pilR	pilS	TRUE	0.974	88.000	0.556	1.000	Y	NA
10137500	10137501	XALc_0670	XALc_0671	sucC	sucD	TRUE	0.997	27.000	0.806	0.001	Y	NA
10137501	10137502	XALc_0671	XALc_0672	sucD		FALSE	0.053	359.000	0.000	NA		NA
10137502	10137503	XALc_0672	XALc_0673			TRUE	0.647	-34.000	0.000	NA		NA
10137503	10137504	XALc_0673	XALc_0674			FALSE	0.399	77.000	0.000	NA		NA
10137504	10137505	XALc_0674	XALc_0675			TRUE	0.601	-394.000	0.000	1.000		NA
10137506	10137507	XALc_0676	XALc_0677			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137509	10137510	XALc_0679	XALc_0680			FALSE	0.235	146.000	0.000	NA		NA
10137510	10137511	XALc_0680	XALc_0681			FALSE	0.240	145.000	0.000	NA		NA
10137512	10137513	XALc_0682	XALc_0683			FALSE	0.416	36.000	0.000	NA		NA
10137513	10137514	XALc_0683	XALc_0684			FALSE	0.062	330.000	0.000	NA		NA
10137514	10137515	XALc_0684	XALc_0685			FALSE	0.445	26.000	0.000	NA		NA
10137515	10137516	XALc_0685	XALc_0686			FALSE	0.049	381.000	0.000	NA		NA
10137516	10137517	XALc_0686	XALc_0687			TRUE	0.830	46.000	0.000	0.003		NA
10137517	10137518	XALc_0687	XALc_0688			FALSE	0.155	195.000	0.000	1.000		NA
10137519	10137520	XALc_0689	XALc_0690			TRUE	0.993	-3.000	0.354	NA		NA
10137522	10137523	XALc_0692	XALc_0693			TRUE	0.973	-3.000	0.171	1.000	N	NA
10137523	10137524	XALc_0693	XALc_0694			FALSE	0.160	192.000	0.000	1.000		NA
10137525	10137526	XALc_0695	XALc_0696	rluD		TRUE	0.790	45.000	0.168	NA		NA
10137527	10137528	XALc_0697	XALc_0698	otsA		TRUE	0.990	-3.000	0.057	1.000	Y	NA
10137528	10137529	XALc_0698	XALc_0699			TRUE	0.920	85.000	0.174	1.000	Y	NA
10137529	10137530	XALc_0699	XALc_0700			FALSE	0.021	236.000	0.000	1.000	N	NA
10137531	10137532	XALc_0701	XALc_0702			TRUE	0.981	0.000	0.222	NA		NA
10137532	10137533	XALc_0702	XALc_0703			TRUE	0.819	-6.000	0.000	NA		NA
10137533	10137534	XALc_0703	XALc_0704			TRUE	0.571	-3.000	0.000	NA	N	NA
10137534	10137535	XALc_0704	XALc_0705			FALSE	0.003	1310.000	0.000	NA	N	NA
10137535	10137536	XALc_0705	XALc_0706			TRUE	0.834	182.000	0.810	1.000	N	NA
10137536	10137537	XALc_0706	XALc_0707			TRUE	0.993	16.000	0.839	NA	Y	NA
10137537	10137538	XALc_0707	XALc_0708			TRUE	0.978	13.000	0.820	NA	N	NA
10137538	10137539	XALc_0708	XALc_0709			FALSE	0.053	359.000	0.000	NA		NA
10137539	10137540	XALc_0709	XALc_0710			FALSE	0.335	113.000	0.000	NA		NA
10137540	10137541	XALc_0710	XALc_0711			FALSE	0.388	168.000	0.047	NA		NA
10137541	10137542	XALc_0711	XALc_0712		clpB	FALSE	0.094	260.000	0.000	NA		NA
10137542	10137543	XALc_0712	XALc_0713	clpB		FALSE	0.009	363.000	0.000	1.000	N	NA
10137543	10137544	XALc_0713	XALc_0714			FALSE	0.090	267.000	0.000	NA		NA
10137544	10137545	XALc_0714	XALc_0715			TRUE	0.726	-13.000	0.000	NA		NA
10137545	10137546	XALc_0715	XALc_0716			FALSE	0.407	40.000	0.000	NA		NA
10137546	10137547	XALc_0716	XALc_0717			FALSE	0.429	29.000	0.000	NA		NA
10137548	10137549	XALc_0718	XALc_0719			TRUE	0.980	-3.000	0.222	1.000	N	NA
10137549	10137550	XALc_0719	XALc_0720			TRUE	0.952	-22.000	0.433	NA	N	NA
10137550	10137551	XALc_0720	XALc_0721			TRUE	0.991	-3.000	0.463	NA	N	NA
10137551	10137552	XALc_0721	XALc_0722			TRUE	0.996	-3.000	0.561	1.000		NA
10137552	10137553	XALc_0722	XALc_0723			FALSE	0.430	247.000	0.194	1.000		NA
10137553	10137554	XALc_0723	XALc_0724			TRUE	0.780	23.000	0.194	1.000	N	NA
10137554	10137555	XALc_0724	XALc_0725			FALSE	0.020	242.000	0.000	1.000	N	NA
10137558	10137559	XALc_0728	XALc_0729			FALSE	0.146	203.000	0.000	1.000		NA
10137560	10137561	XALc_0730	XALc_0731	suxB	suxA	TRUE	0.467	48.000	0.052	1.000	N	NA
10137563	10137564	XALc_0733	XALc_0734	suxR		FALSE	0.031	189.000	0.000	1.000	N	NA
10137566	10137567	XALc_0736	XALc_0737		oprO	TRUE	0.512	128.000	0.130	NA	N	NA
10137568	10137569	XALc_0738	XALc_0739	dctA	maeB	TRUE	0.462	276.000	0.058	1.000	Y	NA
10137569	10137570	XALc_0739	XALc_0740	maeB		FALSE	0.230	148.000	0.000	NA		NA
10137572	10137573	XALc_0742	XALc_0743		waaG	TRUE	0.855	12.000	0.058	NA		NA
10137573	10137574	XALc_0743	XALc_0744	waaG	waaL	TRUE	0.949	-19.000	0.050	NA	Y	NA
10137577	10137578	XALc_0747	XALc_0748	tolC		TRUE	0.489	19.000	0.028	1.000	N	NA
10137578	10137579	XALc_0748	XALc_0749			FALSE	0.221	136.000	0.023	1.000	N	NA
10137581	10137582	XALc_0751	XALc_0752	leuB	leuD	TRUE	0.993	-10.000	0.074	0.002	Y	NA
10137582	10137583	XALc_0752	XALc_0753	leuD	leuC	TRUE	0.974	176.000	0.449	0.001	Y	NA
10137583	10137584	XALc_0753	XALc_0754	leuC		TRUE	0.543	37.000	0.015	1.000		NA
10137584	10137585	XALc_0754	XALc_0755		leuA	TRUE	0.792	6.000	0.003	1.000		NA
10137585	10137586	XALc_0755	XALc_0756	leuA	tdcB	TRUE	0.984	-3.000	0.013	1.000	Y	NA
10137586	10137587	XALc_0756	XALc_0757	tdcB		FALSE	0.231	196.000	0.017	1.000		NA
10137587	10137588	XALc_0757	XALc_0758		ilvG	TRUE	0.998	-16.000	0.943	0.001		NA
10137588	10137589	XALc_0758	XALc_0759	ilvG	ilvC	TRUE	0.951	40.000	0.012	0.001	Y	NA
10137590	10137591	XALc_0760	XALc_0761		thiC	FALSE	0.008	426.000	0.000	1.000	N	NA
10137592	10137593	XALc_0762	XALc_0763		ppa	FALSE	0.093	159.000	0.009	1.000	N	NA
10137598	10137599	XALc_0768	XALc_0769	adk		FALSE	0.021	233.000	0.000	1.000	N	NA
10137599	10137600	XALc_0769	XALc_0770			TRUE	0.601	23.000	0.015	1.000		NA
10137600	10137601	XALc_0770	XALc_0771			FALSE	0.079	284.000	0.000	NA		NA
10137601	10137602	XALc_0771	XALc_0772			FALSE	0.022	990.000	0.000	NA		NA
10137604	10137605	XALc_0774	XALc_0775		gloA	FALSE	0.222	152.000	0.000	NA		NA
10137605	10137606	XALc_0775	XALc_0776	gloA	argD	TRUE	0.764	83.000	0.000	1.000	Y	NA
10137607	10137608	XALc_0777	XALc_0778	hemL	thiE	TRUE	0.751	192.000	0.173	1.000	Y	NA
10137610	10137611	XALc_0780	XALc_0781			TRUE	0.563	32.000	0.020	NA		NA
10137611	10137612	XALc_0781	XALc_0782		rpiA	FALSE	0.156	206.000	0.006	NA		NA
10137612	10137613	XALc_0782	XALc_0783	rpiA		TRUE	0.470	51.000	0.011	NA		NA
10137613	10137614	XALc_0783	XALc_0784			TRUE	0.936	-3.000	0.011	NA		NA
10137614	10137615	XALc_0784	XALc_0785			FALSE	0.063	581.000	0.034	NA		NA
10137615	10137616	XALc_0785	XALc_0786			TRUE	0.935	-3.000	0.010	NA		NA
10137616	10137617	XALc_0786	XALc_0787			FALSE	0.393	68.000	0.000	NA		NA
10137618	10137619	XALc_0788	XALc_0789		pepP	TRUE	0.987	0.000	0.329	NA		NA
10137620	10137621	XALc_0790	XALc_0791	pepQ		TRUE	0.476	155.000	0.072	NA		NA
10137621	10137622	XALc_0791	XALc_0792			TRUE	0.997	-3.000	0.667	NA		NA
10137622	10137623	XALc_0792	XALc_0793			TRUE	0.599	17.000	0.006	NA		NA
10137623	10137624	XALc_0793	XALc_0794			TRUE	0.743	96.000	0.218	1.000	N	NA
10137624	10137625	XALc_0794	XALc_0795			TRUE	0.787	86.000	0.262	1.000	N	NA
10137626	10137627	XALc_0796	XALc_0797		gmk	TRUE	0.775	131.000	0.276	NA		NA
10137627	10137628	XALc_0797	XALc_0798	gmk	rpoZ	TRUE	0.852	113.000	0.471	1.000	N	NA
10137628	10137629	XALc_0798	XALc_0799	rpoZ	spoT	TRUE	0.938	102.000	0.291	1.000	Y	NA
10137629	10137630	XALc_0799	XALc_0800	spoT		TRUE	0.682	115.000	0.215	NA	N	NA
10137630	10137631	XALc_0800	XALc_0801		recG	TRUE	0.802	10.000	0.076	NA	N	NA
10137635	10137636	XALc_0805	XALc_0806	mreB	mreC	TRUE	0.797	187.000	0.689	1.000	N	NA
10137636	10137637	XALc_0806	XALc_0807	mreC	mreD	TRUE	1.000	-3.000	0.550	0.003	Y	NA
10137637	10137638	XALc_0807	XALc_0808	mreD	mrdA	TRUE	0.971	2.000	0.013	1.000	Y	NA
10137638	10137639	XALc_0808	XALc_0809	mrdA	mrdB	TRUE	0.840	-3.000	0.013	1.000	N	NA
10137639	10137640	XALc_0809	XALc_0810	mrdB		FALSE	0.008	334.000	0.000	NA	N	NA
10137640	10137641	XALc_0810	XALc_0811		pglA	FALSE	0.420	2.000	0.000	NA	N	NA
10137641	10137642	XALc_0811	XALc_0812	pglA	mltB	FALSE	0.169	436.000	0.000	NA	Y	NA
10137642	10137643	XALc_0812	XALc_0813	mltB		TRUE	0.991	-3.000	0.298	NA		NA
10137643	10137644	XALc_0813	XALc_0814		dacC	TRUE	0.491	154.000	0.080	NA		NA
10137644	10137645	XALc_0814	XALc_0815	dacC		FALSE	0.234	163.000	0.007	NA		NA
10137645	10137646	XALc_0815	XALc_0816		lipB	TRUE	0.956	-12.000	0.219	NA		NA
10137646	10137647	XALc_0816	XALc_0817	lipB	lipA	TRUE	0.991	23.000	0.319	0.001	Y	NA
10137647	10137648	XALc_0817	XALc_0818	lipA	prc	FALSE	0.019	246.000	0.000	1.000	N	NA
10137650	10137651	XALc_0820	XALc_0821			FALSE	0.340	62.000	0.022	1.000	N	NA
10137651	10137652	XALc_0821	XALc_0822			FALSE	0.194	167.000	0.000	NA		NA
10137652	10137653	XALc_0822	XALc_0823			TRUE	0.452	149.000	0.053	NA		NA
10137655	10137656	XALc_0825	XALc_0826		gnd	TRUE	0.511	126.000	0.042	NA		NA
10137656	10137657	XALc_0826	XALc_0827	gnd		FALSE	0.044	431.000	0.000	NA		NA
10137657	10137658	XALc_0827	XALc_0828			FALSE	0.158	189.000	0.000	NA		NA
10137658	10137659	XALc_0828	XALc_0829			FALSE	0.127	217.000	0.000	NA		NA
10137659	10137660	XALc_0829	XALc_0830			TRUE	0.997	-3.000	0.093	0.030	Y	NA
10137660	10137661	XALc_0830	XALc_0831			TRUE	0.991	7.000	0.116	0.025	Y	NA
10137661	10137662	XALc_0831	XALc_0832		folK	FALSE	0.022	524.000	0.017	1.000	N	NA
10137664	10137665	XALc_0834	XALc_0835			TRUE	0.807	-12.000	0.012	NA		NA
10137665	10137666	XALc_0835	XALc_0836			FALSE	0.047	398.000	0.000	NA		NA
10137666	10137667	XALc_0836	XALc_0837		nagQ	FALSE	0.006	406.000	0.000	NA	N	NA
10137667	10137668	XALc_0837	XALc_0838	nagQ	nagP	TRUE	0.595	36.000	0.093	1.000	N	NA
10137668	10137669	XALc_0838	XALc_0839	nagP	nagR	TRUE	0.683	30.000	0.140	1.000	N	NA
10137669	10137670	XALc_0839	XALc_0840	nagR	nagB-II	TRUE	0.707	9.000	0.030	1.000	N	NA
10137670	10137671	XALc_0840	XALc_0841	nagB-II	nagA	TRUE	0.864	0.000	0.030	1.000	N	NA
10137672	10137673	XALc_0842	XALc_0843	cca	slt	FALSE	0.406	89.000	0.034	1.000	N	NA
10137673	10137674	XALc_0843	XALc_0844	slt		FALSE	0.286	128.000	0.000	NA		NA
10137674	10137675	XALc_0844	XALc_0845			TRUE	0.949	5.000	0.132	NA		NA
10137675	10137676	XALc_0845	XALc_0846			TRUE	0.508	27.000	0.008	1.000		NA
10137676	10137677	XALc_0846	XALc_0847			TRUE	0.744	-16.000	0.008	NA		NA
10137677	10137678	XALc_0847	XALc_0848			TRUE	0.749	49.000	0.129	NA		NA
10137680	10137681	XALc_0850	XALc_0851			TRUE	0.724	26.000	0.074	NA		NA
10137681	10137682	XALc_0851	XALc_0852			TRUE	0.983	107.000	0.714	0.006		NA
10137682	10137683	XALc_0852	XALc_0853			TRUE	0.941	86.000	0.571	1.000		NA
10137689	10137690	XALc_0859	XALc_0860	envZ	ompR	TRUE	0.994	-3.000	0.154	1.000	Y	NA
10137691	10137692	XALc_0861	XALc_0862			TRUE	0.870	144.000	0.531	NA		NA
10137692	10137693	XALc_0862	XALc_0863			TRUE	0.888	83.000	0.327	1.000		NA
10137700	10137701	XALc_0870	XALc_0871			TRUE	0.813	32.000	0.013	1.000	Y	NA
10137702	10137703	XALc_0872	XALc_0873	engC		TRUE	0.749	19.000	0.052	NA		NA
10137704	10137705	XALc_0874	XALc_0875			FALSE	0.056	359.000	0.000	1.000		NA
10137705	10137706	XALc_0875	XALc_0876			TRUE	0.793	5.000	0.000	NA		NA
10137706	10137707	XALc_0876	XALc_0877			TRUE	0.646	54.000	0.054	NA		NA
10137708	10137709	XALc_0878	XALc_0879	gcvP		FALSE	0.026	663.000	0.000	NA		NA
10137709	10137710	XALc_0879	XALc_0880			FALSE	0.152	192.000	0.000	NA		NA
10137710	10137711	XALc_0880	XALc_0881			FALSE	0.180	174.000	0.000	NA		NA
10137711	10137712	XALc_0881	XALc_0882			TRUE	0.650	-31.000	0.000	NA		NA
10137713	10137714	XALc_0883	XALc_0884			FALSE	0.264	135.000	0.000	NA		NA
10137715	10137716	XALc_0885	XALc_0886			FALSE	0.179	175.000	0.000	NA		NA
10137717	10137718	XALc_0887	XALc_0888			TRUE	0.452	149.000	0.049	1.000		NA
10137718	10137719	XALc_0888	XALc_0889			TRUE	0.983	-3.000	0.152	1.000		NA
10137720	10137721	XALc_0890	XALc_0891			TRUE	0.996	-16.000	0.833	1.000	Y	NA
10137722	10137723	XALc_0892	XALc_0893		minE	FALSE	0.368	134.000	0.015	NA		NA
10137723	10137724	XALc_0893	XALc_0894	minE	minD	TRUE	0.997	3.000	0.618	NA	Y	NA
10137724	10137725	XALc_0894	XALc_0895	minD	minC	TRUE	0.970	37.000	0.466	1.000	Y	NA
10137725	10137726	XALc_0895	XALc_0896	minC		TRUE	0.891	3.000	0.013	1.000		NA
10137727	10137728	XALc_0897	XALc_0898			TRUE	0.999	0.000	0.900	0.029	Y	NA
10137728	10137729	XALc_0898	XALc_0899			FALSE	0.048	393.000	0.000	NA		NA
10137729	10137730	XALc_0899	XALc_0900			TRUE	0.452	106.000	0.013	NA		NA
10137731	10137732	XALc_0901	XALc_0902			TRUE	0.720	96.000	0.107	NA		NA
10137732	10137733	XALc_0902	XALc_0903			FALSE	0.260	136.000	0.000	NA		NA
10137733	10137734	XALc_0903	XALc_0904			FALSE	0.160	188.000	0.000	NA		NA
10137734	10137735	XALc_0904	XALc_0905			TRUE	0.798	-10.000	0.007	NA		NA
10137737	10137738	XALc_0907	XALc_0908		ate	TRUE	0.786	10.000	0.014	NA		NA
10137740	10137741	XALc_0910	XALc_0911		tesB	TRUE	0.816	11.000	0.026	NA		NA
10137741	10137742	XALc_0911	XALc_0912	tesB		TRUE	0.814	70.000	0.021	1.000	Y	NA
10137744	10137745	XALc_0914	XALc_0915		uvrA	TRUE	0.925	-3.000	0.005	1.000		NA
10137746	10137747	XALc_0916	XALc_0917	rplU	rpmA	TRUE	0.997	13.000	0.667	0.017	Y	NA
10137747	10137748	XALc_0917	XALc_0918	rpmA		TRUE	0.454	330.000	0.335	1.000		NA
10137750	10137751	XALc_0920	XALc_0921	mviN	ribF	FALSE	0.367	268.000	0.169	1.000		NA
10137751	10137752	XALc_0921	XALc_0922	ribF	ileS	TRUE	0.942	7.000	0.254	1.000	N	NA
10137752	10137753	XALc_0922	XALc_0923	ileS	lspA	TRUE	0.671	89.000	0.147	1.000	N	NA
10137753	10137754	XALc_0923	XALc_0924	lspA	ispH	TRUE	0.884	58.000	0.095	1.000	Y	NA
10137754	10137755	XALc_0924	XALc_Yt23	ispH	tRNA-tRNA_Thr	FALSE	0.416	36.000	0.000	NA		NA
10137757	10137758	XALc_0927	XALc_0928			FALSE	0.377	99.000	0.000	NA		NA
10137758	10137759	XALc_0928	XALc_0929		cyoA	FALSE	0.092	262.000	0.000	NA		NA
10137759	10137760	XALc_0929	XALc_0930	cyoA	cyoB	TRUE	0.996	-21.000	0.385	0.009	Y	NA
10137760	10137761	XALc_0930	XALc_0931	cyoB	cyoC	TRUE	0.998	4.000	0.385	0.043	Y	NA
10137761	10137762	XALc_0931	XALc_0932	cyoC	cyoD	TRUE	0.999	0.000	0.917	0.043	Y	NA
10137762	10137763	XALc_0932	XALc_0933	cyoD		FALSE	0.389	252.000	0.167	1.000		NA
10137763	10137764	XALc_0933	XALc_0934			FALSE	0.039	494.000	0.000	1.000		NA
10137764	10137765	XALc_0934	XALc_0935		radA	FALSE	0.104	86.000	0.000	1.000	N	NA
10137765	10137766	XALc_0935	XALc_0936	radA		FALSE	0.274	131.000	0.000	NA		NA
10137770	10137771	XALc_0940	XALc_0941			FALSE	0.374	100.000	0.000	NA		NA
10137771	10137772	XALc_0941	XALc_0942			TRUE	0.987	12.000	0.400	NA	Y	NA
10137772	10137773	XALc_0942	XALc_0943			TRUE	0.988	-3.000	0.036	1.000	Y	NA
10137773	10137774	XALc_0943	XALc_0944			TRUE	1.000	-3.000	0.865	0.033	Y	NA
10137775	10137776	XALc_0945	XALc_0946		abfA	FALSE	0.021	236.000	0.000	1.000	N	NA
10137779	10137780	XALc_0949	XALc_0950	ffh		FALSE	0.213	167.000	0.003	1.000		NA
10137780	10137781	XALc_0950	XALc_0951			TRUE	0.966	-3.000	0.045	1.000		NA
10137781	10137782	XALc_0951	XALc_0952		rpsP	FALSE	0.128	94.000	0.004	1.000	N	NA
10137782	10137783	XALc_0952	XALc_0953	rpsP	rimM	TRUE	0.984	46.000	0.342	0.017	Y	NA
10137783	10137784	XALc_0953	XALc_0954	rimM	trmD	TRUE	0.981	83.000	0.672	1.000	Y	NA
10137784	10137785	XALc_0954	XALc_0955	trmD	rplS	TRUE	0.955	133.000	0.567	1.000	Y	NA
10137787	10137788	XALc_0957	XALc_0958		hslR	TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137789	10137790	XALc_0959	XALc_0960	katG		FALSE	0.036	506.000	0.000	NA		NA
10137790	10137791	XALc_0960	XALc_0961			TRUE	0.857	1.000	0.000	NA		NA
10137791	10137792	XALc_0961	XALc_0962			FALSE	0.312	119.000	0.000	NA		NA
10137792	10137793	XALc_0962	XALc_0963			FALSE	0.042	440.000	0.000	NA		NA
10137793	10137794	XALc_0963	XALc_0964			TRUE	0.475	23.000	0.000	NA		NA
10137794	10137795	XALc_0964	XALc_0965			TRUE	0.963	183.000	0.333	0.001	Y	NA
10137798	10137799	XALc_0968	XALc_0969		dcd	TRUE	0.481	129.000	0.112	1.000	N	NA
10137800	10137801	XALc_0970	XALc_0971			TRUE	0.557	29.000	0.017	NA		NA
10137801	10137802	XALc_0971	XALc_0972			TRUE	0.603	10.000	0.017	1.000	N	NA
10137806	10137807	XALc_0976	XALc_0977	psd		TRUE	0.967	-3.000	0.051	1.000		NA
10137808	10137809	XALc_0978	XALc_0979			TRUE	0.803	11.000	0.081	1.000	N	NA
10137809	10137810	XALc_0979	XALc_0980			TRUE	0.498	-7.000	0.005	1.000	N	NA
10137810	10137811	XALc_0980	XALc_0981		asd	TRUE	0.715	103.000	0.008	0.007	N	NA
10137811	10137812	XALc_0981	XALc_0982	asd		FALSE	0.063	176.000	0.008	NA	N	NA
10137812	10137813	XALc_0982	XALc_0983		truA	FALSE	0.044	218.000	0.008	NA	N	NA
10137813	10137814	XALc_0983	XALc_0984	truA	trpF	TRUE	0.968	-3.000	0.139	1.000	N	NA
10137816	10137817	XALc_0986	XALc_0987	trpB	trpA	TRUE	0.978	143.000	0.344	0.001	Y	NA
10137817	10137818	XALc_0987	XALc_0988	trpA	accD	TRUE	0.669	126.000	0.232	1.000	N	NA
10137818	10137819	XALc_0988	XALc_0989	accD	glmM	FALSE	0.100	146.000	0.008	1.000	N	NA
10137819	10137820	XALc_0989	XALc_0990	glmM		FALSE	0.340	123.000	0.005	1.000		NA
10137820	10137821	XALc_0990	XALc_0991			FALSE	0.341	157.000	0.023	NA		NA
10137821	10137822	XALc_0991	XALc_0992			TRUE	0.982	-3.000	0.143	NA		NA
10137822	10137823	XALc_0992	XALc_0993			TRUE	0.970	-3.000	0.070	NA		NA
10137823	10137824	XALc_0993	XALc_0994			TRUE	0.993	2.000	0.619	NA		NA
10137826	10137827	XALc_0996	XALc_0997	tpiA	secG	TRUE	0.711	63.000	0.184	1.000	N	NA
10137827	10137828	XALc_0997	XALc_Yt24	secG	tRNA-tRNA_Leu	FALSE	0.389	50.000	0.000	NA		NA
10137828	10137829	XALc_Yt24	XALc_0999	tRNA-tRNA_Leu	nuoA	FALSE	0.340	111.000	0.000	NA		NA
10137829	10137830	XALc_0999	XALc_1000	nuoA	nuoB	TRUE	0.998	-9.000	0.507	0.003	Y	NA
10137830	10137831	XALc_1000	XALc_1001	nuoB	nuoC	TRUE	0.985	100.000	0.328	0.003	Y	NA
10137831	10137832	XALc_1001	XALc_1002	nuoC	nuoD	TRUE	0.999	-3.000	0.483	0.007	Y	NA
10137832	10137833	XALc_1002	XALc_1003	nuoD	nuoE	TRUE	0.967	158.000	0.355	0.007	Y	NA
10137833	10137834	XALc_1003	XALc_1004	nuoE	nuoF	TRUE	0.997	6.000	0.343	0.007	Y	NA
10137834	10137835	XALc_1004	XALc_1005	nuoF	nuoG	TRUE	0.999	-3.000	0.395	0.007	Y	NA
10137835	10137836	XALc_1005	XALc_1006	nuoG	nuoH	TRUE	0.999	-3.000	0.515	0.007	Y	NA
10137836	10137837	XALc_1006	XALc_1007	nuoH	nuoI	TRUE	0.999	4.000	0.500	0.007	Y	NA
10137837	10137838	XALc_1007	XALc_1008	nuoI	nuoJ	TRUE	0.997	10.000	0.442	0.007	Y	NA
10137838	10137839	XALc_1008	XALc_1009	nuoJ	nuoK	TRUE	0.999	-3.000	0.484	0.003	Y	NA
10137839	10137840	XALc_1009	XALc_1010	nuoK	nuoL	TRUE	0.997	8.000	0.451	0.007	Y	NA
10137840	10137841	XALc_1010	XALc_1011	nuoL	nuoM	TRUE	0.985	21.000	0.175	0.002	Y	NA
10137841	10137842	XALc_1011	XALc_1012	nuoM	nuoN	TRUE	0.989	34.000	0.340	0.002	Y	NA
10137842	10137843	XALc_1012	XALc_Yt25	nuoN	tRNA-tRNA_Met	FALSE	0.130	212.000	0.000	NA		NA
10137843	10137844	XALc_Yt25	XALc_1014	tRNA-tRNA_Met		FALSE	0.136	206.000	0.000	NA		NA
10137844	10137845	XALc_1014	XALc_1015		nusA	TRUE	0.997	-3.000	0.759	NA		NA
10137845	10137846	XALc_1015	XALc_1016	nusA	infB	TRUE	0.834	96.000	0.342	1.000	N	NA
10137846	10137847	XALc_1016	XALc_1017	infB	rbfA	TRUE	0.958	123.000	0.530	1.000	Y	NA
10137847	10137848	XALc_1017	XALc_1018	rbfA	truB	TRUE	0.885	158.000	0.318	1.000	Y	NA
10137848	10137849	XALc_1018	XALc_1019	truB	rpsO	TRUE	0.778	194.000	0.211	1.000	Y	NA
10137849	10137850	XALc_1019	XALc_1020	rpsO	pnp	TRUE	0.888	166.000	0.335	1.000	Y	NA
10137851	10137852	XALc_1021	XALc_1022			FALSE	0.183	172.000	0.000	NA		NA
10137854	10137855	XALc_1024	XALc_1025		hcaC	FALSE	0.398	44.000	0.000	NA		NA
10137855	10137856	XALc_1025	XALc_1026	hcaC		TRUE	0.987	-3.000	0.217	NA		NA
10137856	10137857	XALc_1026	XALc_1027		sufS	TRUE	0.593	119.000	0.066	1.000		NA
10137857	10137858	XALc_1027	XALc_1028	sufS	sufD	TRUE	0.926	-3.000	0.041	1.000	N	NA
10137858	10137859	XALc_1028	XALc_1029	sufD	sufC	TRUE	0.998	-3.000	0.482	1.000	Y	NA
10137859	10137860	XALc_1029	XALc_1030	sufC		FALSE	0.390	47.000	0.000	NA		NA
10137860	10137861	XALc_1030	XALc_1031		sufB	TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137861	10137862	XALc_1031	XALc_1032	sufB		TRUE	0.697	17.000	0.078	1.000	N	NA
10137864	10137865	XALc_1034	XALc_1035			FALSE	0.079	284.000	0.000	NA		NA
10137868	10137869	XALc_1038	XALc_1039			FALSE	0.398	145.000	0.029	NA		NA
10137869	10137870	XALc_1039	XALc_1040		murD	TRUE	0.787	-19.000	0.019	NA		NA
10137873	10137874	XALc_1043	XALc_1044			TRUE	0.644	-37.000	0.000	NA		NA
10137875	10137876	XALc_1045	XALc_1046	pntA-1	pntA-2	TRUE	0.995	17.000	0.829	0.002		NA
10137876	10137877	XALc_1046	XALc_1047	pntA-2	pntB	TRUE	0.994	5.000	0.321	0.002		NA
10137877	10137878	XALc_1047	XALc_1048	pntB		TRUE	0.762	88.000	0.000	1.000	Y	NA
10137878	10137879	XALc_1048	XALc_1049			FALSE	0.226	156.000	0.000	1.000		NA
10137880	10137881	XALc_1050	XALc_1051			TRUE	0.587	16.000	0.000	NA		NA
10137881	10137882	XALc_1051	XALc_1052			FALSE	0.024	767.000	0.000	NA		NA
10137882	10137883	XALc_1052	XALc_1053			FALSE	0.032	550.000	0.000	NA		NA
10137885	10137886	XALc_1055	XALc_1056			FALSE	0.412	216.000	0.000	1.000	Y	NA
10137886	10137887	XALc_1056	XALc_1057			TRUE	0.991	81.000	0.500	0.005	Y	NA
10137887	10137888	XALc_1057	XALc_1058			TRUE	0.986	119.000	0.500	0.005	Y	NA
10137889	10137890	XALc_1059	XALc_1060			TRUE	0.595	40.000	0.028	1.000		NA
10137890	10137891	XALc_1060	XALc_1061			TRUE	0.965	-3.000	0.042	1.000		NA
10137891	10137892	XALc_1061	XALc_1062			TRUE	0.640	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10137892	10137893	XALc_1062	XALc_1063			TRUE	0.640	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10137893	10137894	XALc_1063	XALc_1064			FALSE	0.102	77.000	0.000	1.000	N	NA
10137894	10137895	XALc_1064	XALc_1065			FALSE	0.366	102.000	0.000	NA		NA
10137896	10137897	XALc_1066	XALc_Yp01		XALc	FALSE	0.268	137.000	0.000	1.000		NA
10137898	10137899	XALc_1067	XALc_1068			FALSE	0.208	261.000	0.043	NA		NA
10137899	10137900	XALc_1068	XALc_1069			FALSE	0.027	628.000	0.000	NA		NA
10137900	10137901	XALc_1069	XALc_1070			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137901	10137902	XALc_1070	XALc_1071		thrS	FALSE	0.030	586.000	0.000	1.000		NA
10137902	10137903	XALc_1071	XALc_1072	thrS	infC	TRUE	0.879	127.000	0.186	1.000	Y	NA
10137903	10137904	XALc_1072	XALc_1073	infC	rpmI	TRUE	0.822	332.000	0.652	1.000	Y	NA
10137904	10137905	XALc_1073	XALc_Yp02	rpmI	rplT	TRUE	0.999	11.000	0.928	0.017	Y	NA
10137905	10137906	XALc_Yp02	XALc_1074	rplT	pheS	TRUE	0.752	207.000	0.202	1.000	Y	NA
10137906	10137907	XALc_1074	XALc_1075	pheS	pheT	TRUE	0.992	109.000	0.574	0.001	Y	NA
10137907	10137908	XALc_1075	XALc_1076	pheT	ihfA	TRUE	0.788	24.000	0.208	1.000	N	NA
10137908	10137909	XALc_1076	XALc_1077	ihfA		TRUE	0.967	-19.000	0.535	1.000	N	NA
10137909	10137910	XALc_1077	XALc_Yt26		tRNA-tRNA_Pro	FALSE	0.398	76.000	0.000	NA		NA
10137910	10137911	XALc_Yt26	XALc_1079	tRNA-tRNA_Pro		FALSE	0.032	549.000	0.000	NA		NA
10137911	10137912	XALc_1079	XALc_1080			FALSE	0.150	193.000	0.000	NA		NA
10137912	10137913	XALc_1080	XALc_1081			FALSE	0.030	569.000	0.000	NA		NA
10137914	10137915	XALc_1082	XALc_1083	dxs		FALSE	0.088	152.000	0.007	1.000	N	NA
10137915	10137916	XALc_1083	XALc_1084			FALSE	0.064	128.000	0.000	1.000	N	NA
10137916	10137917	XALc_1084	XALc_1085			TRUE	0.574	249.000	0.333	1.000		NA
10137918	10137919	XALc_Yt27	XALc_1087	tRNA-tRNA_Phe		FALSE	0.060	336.000	0.000	NA		NA
10137920	10137921	XALc_1089	XALc_1090		xseA	TRUE	0.801	-7.000	0.000	NA		NA
10137922	10137923	XALc_1091	XALc_1092			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137923	10137924	XALc_1092	XALc_1093		amiC	FALSE	0.124	220.000	0.000	NA		NA
10137924	10137925	XALc_1093	XALc_1094	amiC	mutL	FALSE	0.167	140.000	0.016	1.000	N	NA
10137925	10137926	XALc_1094	XALc_1095	mutL		TRUE	0.894	0.000	0.007	NA		NA
10137926	10137927	XALc_1095	XALc_1096			TRUE	0.977	-100.000	0.625	NA		NA
10137928	10137929	XALc_1097	XALc_1098		phbB	FALSE	0.267	199.000	0.031	NA		NA
10137929	10137930	XALc_1098	XALc_1099	phbB	gluQ	TRUE	0.801	64.000	0.014	0.039		NA
10137932	10137933	XALc_1101	XALc_1102			FALSE	0.040	553.000	0.007	1.000		NA
10137933	10137934	XALc_1102	XALc_1103			TRUE	0.939	-3.000	0.011	1.000		NA
10137935	10137936	XALc_1104	XALc_1105	cspA2		FALSE	0.176	193.000	0.046	NA	N	NA
10137940	10137941	XALc_1109	XALc_1110			TRUE	0.869	7.000	0.100	1.000	N	NA
10137944	10137945	XALc_1113	XALc_1114			TRUE	0.957	-3.000	0.031	NA		NA
10137947	10137948	XALc_1116	XALc_1117			FALSE	0.274	131.000	0.000	NA		NA
10137951	10137952	XALc_1120	XALc_1121			TRUE	0.801	179.000	0.500	NA		NA
10137952	10137953	XALc_1121	XALc_1122			TRUE	0.751	188.000	0.429	NA		NA
10137953	10137954	XALc_1122	XALc_1123			FALSE	0.040	454.000	0.000	NA		NA
10137954	10137955	XALc_1123	XALc_1124			FALSE	0.105	242.000	0.000	NA		NA
10137956	10137957	XALc_1125	XALc_1126	fpr		FALSE	0.250	140.000	0.000	NA		NA
10137957	10137958	XALc_1126	XALc_1127			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137960	10137961	XALc_1129	XALc_1130	pldA		TRUE	0.468	116.000	0.021	NA		NA
10137963	10137964	XALc_1132	XALc_1133			TRUE	0.874	146.000	0.556	1.000		NA
10137967	10137968	XALc_1136	XALc_1137			FALSE	0.417	35.000	0.000	NA		NA
10137968	10137969	XALc_1137	XALc_1138		dnaB	FALSE	0.393	67.000	0.000	NA		NA
10137969	10137970	XALc_1138	XALc_1139	dnaB	phrB	TRUE	0.770	69.000	0.006	1.000	Y	NA
10137970	10137971	XALc_1139	XALc_1140	phrB		FALSE	0.403	87.000	0.000	NA		NA
10137971	10137972	XALc_1140	XALc_1141			FALSE	0.385	96.000	0.000	NA		NA
10137973	10137974	XALc_1142	XALc_1143			FALSE	0.006	532.000	0.000	1.000	N	NA
10137974	10137975	XALc_1143	XALc_1144			FALSE	0.063	129.000	0.000	1.000	N	NA
10137975	10137976	XALc_1144	XALc_1145			FALSE	0.408	-7.000	0.000	1.000	N	NA
10137976	10137977	XALc_1145	XALc_1146			FALSE	0.049	380.000	0.000	NA		NA
10137977	10137978	XALc_1146	XALc_1147		parE	FALSE	0.032	548.000	0.000	NA		NA
10137979	10137980	XALc_1148	XALc_1149		pyrG	FALSE	0.256	137.000	0.000	NA		NA
10137980	10137981	XALc_1149	XALc_1150	pyrG	kdsA	FALSE	0.299	212.000	0.138	1.000	N	NA
10137981	10137982	XALc_1150	XALc_1151	kdsA	eno	FALSE	0.407	159.000	0.125	1.000	N	NA
10137982	10137983	XALc_1151	XALc_1152	eno	ftsB	TRUE	0.963	3.000	0.241	1.000	N	NA
10137983	10137984	XALc_1152	XALc_1153	ftsB	ispD	TRUE	0.962	0.000	0.185	1.000	N	NA
10137984	10137985	XALc_1153	XALc_1154	ispD	ispF	TRUE	0.965	82.000	0.419	1.000	Y	NA
10137985	10137986	XALc_1154	XALc_1155	ispF	truD	TRUE	0.984	-3.000	0.173	1.000		NA
10137988	10137989	XALc_1157	XALc_1158	surE	pcm	TRUE	0.993	-3.000	0.353	1.000		NA
10137989	10137990	XALc_1158	XALc_1159	pcm		TRUE	0.504	20.000	0.000	NA		NA
10137990	10137991	XALc_1159	XALc_1160			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10137992	10137993	XALc_1161	XALc_1162			TRUE	0.630	19.000	0.014	NA		NA
10137994	10137995	XALc_1163	XALc_1164	ftsJ	ftsH	TRUE	0.501	60.000	0.066	NA	N	NA
10137995	10137996	XALc_1164	XALc_1165	ftsH	folP	FALSE	0.396	275.000	0.325	1.000	N	NA
10137996	10137997	XALc_1165	XALc_1166	folP	miaA	TRUE	0.739	0.000	0.009	1.000	N	NA
10137997	10137998	XALc_1166	XALc_1167	miaA	hfq	TRUE	0.904	121.000	0.531	1.000		NA
10137998	10137999	XALc_1167	XALc_1168	hfq	hflX	TRUE	0.801	27.000	0.141	1.000		NA
10137999	10138000	XALc_1168	XALc_1169	hflX		FALSE	0.178	181.000	0.002	NA		NA
10138000	10138001	XALc_1169	XALc_1170		lexA	FALSE	0.042	436.000	0.000	NA		NA
10138001	10138002	XALc_1170	XALc_1171	lexA	recA	FALSE	0.308	193.000	0.005	0.057	N	NA
10138002	10138003	XALc_1171	XALc_1172	recA	recX	TRUE	0.835	114.000	0.296	1.000		NA
10138003	10138004	XALc_1172	XALc_1173	recX	alaS	TRUE	0.669	106.000	0.085	1.000		NA
10138004	10138005	XALc_1173	XALc_1174	alaS	csrA	FALSE	0.209	130.000	0.020	1.000	N	NA
10138005	10138006	XALc_1174	XALc_Yt28	csrA	tRNA-tRNA_Ser	FALSE	0.404	82.000	0.000	NA		NA
10138006	10138007	XALc_Yt28	XALc_1176	tRNA-tRNA_Ser		FALSE	0.023	784.000	0.000	NA		NA
10138008	10138009	XALc_Yt29	XALc_1178	tRNA-tRNA_Arg	thiD	FALSE	0.140	202.000	0.000	NA		NA
10138009	10138010	XALc_1178	XALc_1179	thiD		TRUE	0.482	147.000	0.065	NA		NA
10138010	10138011	XALc_1179	XALc_1180			TRUE	0.663	52.000	0.065	NA		NA
10138011	10138012	XALc_1180	XALc_1181			TRUE	0.955	-3.000	0.027	NA		NA
10138012	10138013	XALc_1181	XALc_1182			TRUE	0.475	83.000	0.050	1.000	N	NA
10138013	10138014	XALc_1182	XALc_1183		gcvR	TRUE	0.592	62.000	0.102	1.000	N	NA
10138015	10138016	XALc_1184	XALc_1185	dapA		TRUE	0.704	18.000	0.028	NA		NA
10138017	10138018	XALc_1186	XALc_1187		dgoK	TRUE	0.890	93.000	0.500	1.000	N	NA
10138018	10138019	XALc_1187	XALc_1188	dgoK		TRUE	0.989	-3.000	0.053	NA	Y	NA
10138019	10138020	XALc_1188	XALc_1189		dgoD	TRUE	0.835	5.000	0.053	NA	N	NA
10138020	10138021	XALc_1189	XALc_1190	dgoD	dgoA	TRUE	0.991	-3.000	0.192	0.056	N	NA
10138022	10138023	XALc_1191	XALc_1192			FALSE	0.268	344.000	0.286	1.000	N	NA
10138023	10138024	XALc_1192	XALc_1193			FALSE	0.160	192.000	0.000	1.000		NA
10138024	10138025	XALc_1193	XALc_1194			FALSE	0.392	99.000	0.000	1.000		NA
10138025	10138026	XALc_1194	XALc_1195		xylB	FALSE	0.312	271.000	0.000	1.000	Y	NA
10138026	10138027	XALc_1195	XALc_1196	xylB	xylA1	TRUE	0.890	37.000	0.091	1.000	Y	NA
10138027	10138028	XALc_1196	XALc_1197	xylA1	glcP	TRUE	0.506	94.000	0.013	1.000		NA
10138030	10138031	XALc_1199	XALc_1200	amiC		TRUE	0.573	52.000	0.026	1.000		NA
10138033	10138034	XALc_1203	XALc_1204	pcnB	folK	TRUE	0.761	93.000	0.234	1.000	N	NA
10138034	10138035	XALc_1204	XALc_1205	folK	panB	TRUE	0.904	32.000	0.117	1.000	Y	NA
10138035	10138036	XALc_1205	XALc_1206	panB	panC	TRUE	0.999	-3.000	0.395	0.001	Y	NA
10138036	10138037	XALc_1206	XALc_1207	panC	panD	TRUE	0.954	96.000	0.342	1.000	Y	NA
10138037	10138038	XALc_1207	XALc_1208	panD	pgi	TRUE	0.821	-3.000	0.011	1.000	N	NA
10138038	10138039	XALc_1208	XALc_1209	pgi		FALSE	0.176	434.000	0.000	1.000	Y	NA
10138039	10138040	XALc_1209	XALc_1210			FALSE	0.379	191.000	0.071	1.000		NA
10138041	10138042	XALc_1211	XALc_1212			TRUE	0.730	103.000	0.000	1.000	Y	NA
10138042	10138043	XALc_1212	XALc_1213			TRUE	0.995	-3.000	0.197	1.000	Y	NA
10138045	10138046	XALc_1215	XALc_1216			FALSE	0.338	112.000	0.000	NA		NA
10138046	10138047	XALc_1216	XALc_1217		murB	TRUE	0.856	-6.000	0.008	NA		NA
10138047	10138048	XALc_1217	XALc_1218	murB		TRUE	0.810	-3.000	0.009	1.000	N	NA
10138048	10138049	XALc_1218	XALc_1219			TRUE	0.715	12.000	0.006	1.000		NA
10138049	10138050	XALc_1219	XALc_1220			TRUE	0.981	-3.000	0.138	NA		NA
10138050	10138051	XALc_1220	XALc_1221			TRUE	0.588	72.000	0.032	NA		NA
10138052	10138053	XALc_1222	XALc_1223			FALSE	0.048	388.000	0.000	NA		NA
10138053	10138054	XALc_1223	XALc_1224			FALSE	0.404	48.000	0.000	1.000		NA
10138054	10138055	XALc_1224	XALc_1225			TRUE	0.978	-3.000	0.000	0.057		NA
10138055	10138056	XALc_1225	XALc_1226			FALSE	0.390	52.000	0.000	NA		NA
10138056	10138057	XALc_1226	XALc_1227			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138057	10138058	XALc_1227	XALc_1228			FALSE	0.394	73.000	0.000	NA		NA
10138058	10138059	XALc_1228	XALc_1229			TRUE	0.997	-3.000	0.667	NA		NA
10138059	10138060	XALc_1229	XALc_1230			TRUE	0.784	-25.000	0.022	NA		NA
10138060	10138061	XALc_1230	XALc_1231			TRUE	0.919	1.000	0.022	NA		NA
10138061	10138062	XALc_1231	XALc_1232			TRUE	0.988	-3.000	0.034	NA	Y	NA
10138065	10138066	XALc_1235	XALc_1236			TRUE	0.987	-3.000	0.211	NA		NA
10138068	10138069	XALc_1238	XALc_1239			TRUE	0.462	24.000	0.000	NA		NA
10138070	10138071	XALc_1240	XALc_1241	thrA	thrB	TRUE	0.983	-3.000	0.009	1.000	Y	NA
10138071	10138072	XALc_1241	XALc_1242	thrB		FALSE	0.071	304.000	0.000	NA		NA
10138073	10138074	XALc_1243	XALc_1244			TRUE	0.462	24.000	0.000	NA		NA
10138075	10138076	XALc_1245	XALc_1246		thrC	FALSE	0.028	592.000	0.000	NA		NA
10138076	10138077	XALc_1246	XALc_1247	thrC		FALSE	0.411	38.000	0.000	NA		NA
10138077	10138078	XALc_1247	XALc_1248			FALSE	0.122	224.000	0.000	NA		NA
10138082	10138083	XALc_1252	XALc_1253		hisG	TRUE	0.531	37.000	0.013	1.000		NA
10138083	10138084	XALc_1253	XALc_1254	hisG	hisD	TRUE	0.998	-3.000	0.171	0.003	Y	NA
10138084	10138085	XALc_1254	XALc_1255	hisD	hisC	TRUE	0.999	-3.000	0.294	0.003	Y	NA
10138085	10138086	XALc_1255	XALc_1256	hisC	hisB	TRUE	0.999	-3.000	0.341	0.003	Y	NA
10138086	10138087	XALc_1256	XALc_1257	hisB	hisH	TRUE	0.970	47.000	0.128	0.003	Y	NA
10138087	10138088	XALc_1257	XALc_1258	hisH	hisA	TRUE	0.999	-3.000	0.210	0.003	Y	NA
10138088	10138089	XALc_1258	XALc_1259	hisA	hisF	TRUE	0.999	-6.000	0.433	0.003	Y	NA
10138089	10138090	XALc_1259	XALc_1260	hisF	hisI	TRUE	0.998	-10.000	0.430	0.003	Y	NA
10138091	10138092	XALc_1261	XALc_1262			TRUE	0.757	88.000	0.220	1.000	N	NA
10138093	10138094	XALc_1263	XALc_1264			FALSE	0.221	148.000	0.033	NA	N	NA
10138094	10138095	XALc_1264	XALc_1265			TRUE	0.998	4.000	0.233	0.001	Y	NA
10138095	10138096	XALc_1265	XALc_1266			TRUE	0.999	-7.000	0.630	0.001	Y	NA
10138096	10138097	XALc_1266	XALc_1267		sspA	TRUE	0.660	171.000	0.370	NA	N	NA
10138097	10138098	XALc_1267	XALc_1268	sspA	sspB	TRUE	0.962	74.000	0.831	NA		NA
10138099	10138100	XALc_1269	XALc_1270		nadC	FALSE	0.278	130.000	0.000	NA		NA
10138100	10138101	XALc_1270	XALc_1271	nadC		TRUE	0.925	-3.000	0.006	NA		NA
10138102	10138103	XALc_1272	XALc_1273	purE	purK	TRUE	0.998	-3.000	0.136	0.001	Y	NA
10138105	10138106	XALc_1275	XALc_1276			TRUE	0.920	0.000	0.016	1.000		NA
10138106	10138107	XALc_1276	XALc_1277			TRUE	0.939	-3.000	0.013	NA		NA
10138107	10138108	XALc_1277	XALc_1278			FALSE	0.047	400.000	0.000	NA		NA
10138108	10138109	XALc_1278	XALc_1279			FALSE	0.313	149.000	0.014	NA		NA
10138111	10138112	XALc_1281	XALc_1282		pilV	TRUE	0.919	26.000	0.139	NA	Y	NA
10138112	10138113	XALc_1282	XALc_1283	pilV	pilW	TRUE	0.999	-3.000	0.667	NA	Y	NA
10138113	10138114	XALc_1283	XALc_1284	pilW	pilX	TRUE	0.998	-3.000	0.615	NA	Y	NA
10138114	10138115	XALc_1284	XALc_1285	pilX	pilY	TRUE	0.956	59.000	0.346	NA	Y	NA
10138115	10138116	XALc_1285	XALc_1286	pilY	pilE	TRUE	0.996	0.000	0.346	NA	Y	NA
10138116	10138117	XALc_1286	XALc_Yt32	pilE	tRNA-tRNA_Asn	FALSE	0.395	74.000	0.000	NA		NA
10138118	10138119	XALc_Yt33	XALc_1289	tRNA-tRNA_Pro	metX	FALSE	0.057	346.000	0.000	NA		NA
10138119	10138120	XALc_1289	XALc_1290	metX		FALSE	0.129	232.000	0.039	1.000	N	NA
10138120	10138121	XALc_1290	XALc_1291		ccmH2	TRUE	0.998	5.000	1.000	NA	Y	NA
10138121	10138122	XALc_1291	XALc_1292	ccmH2	ccmG2	TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA	Y	NA
10138122	10138123	XALc_1292	XALc_1293	ccmG2	ccmF2	TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.004	Y	NA
10138123	10138124	XALc_1293	XALc_1294	ccmF2		TRUE	0.628	190.000	0.016	0.004		NA
10138124	10138125	XALc_1294	XALc_1295		ccmD2	TRUE	0.944	-3.000	0.016	NA		NA
10138125	10138126	XALc_1295	XALc_1296	ccmD2	ccmC2	TRUE	0.944	-3.000	0.015	NA		NA
10138126	10138127	XALc_1296	XALc_1297	ccmC2	ccmB	TRUE	0.947	116.000	0.051	0.002	Y	NA
10138127	10138128	XALc_1297	XALc_1298	ccmB	ccmA	TRUE	0.997	-3.000	0.074	0.004	Y	NA
10138129	10138130	XALc_1299	XALc_1300			TRUE	0.701	102.000	0.099	1.000		NA
10138130	10138131	XALc_1300	XALc_1301			TRUE	0.551	91.000	0.022	NA		NA
10138135	10138136	XALc_1305	XALc_1306		cdh	FALSE	0.051	145.000	0.000	1.000	N	NA
10138136	10138137	XALc_1306	XALc_1307	cdh		FALSE	0.127	217.000	0.000	NA		NA
10138137	10138138	XALc_1307	XALc_1308			TRUE	0.752	7.000	0.000	NA		NA
10138139	10138140	XALc_1309	XALc_1310	rluB		TRUE	0.945	-7.000	0.210	NA	N	NA
10138140	10138141	XALc_1310	XALc_1311			TRUE	0.750	24.000	0.083	NA		NA
10138142	10138143	XALc_1312	XALc_1313			TRUE	0.977	-3.000	0.103	NA		NA
10138143	10138144	XALc_1313	XALc_1314			FALSE	0.066	320.000	0.000	NA		NA
10138144	10138145	XALc_1314	XALc_1315			TRUE	0.983	-3.000	0.156	NA		NA
10138145	10138146	XALc_1315	XALc_1316			TRUE	0.999	-3.000	0.660	0.032	Y	NA
10138146	10138147	XALc_1316	XALc_1317			TRUE	0.998	-3.000	0.160	0.032	Y	NA
10138147	10138148	XALc_1317	XALc_1318			TRUE	0.802	181.000	0.500	1.000		NA
10138149	10138150	XALc_1319	XALc_1320			TRUE	0.940	-3.000	0.012	1.000		NA
10138150	10138151	XALc_1320	XALc_1321			TRUE	0.974	4.000	0.231	1.000		NA
10138151	10138152	XALc_1321	XALc_1322			TRUE	0.774	96.000	0.148	1.000		NA
10138152	10138153	XALc_1322	XALc_1323			FALSE	0.353	118.000	0.041	1.000	N	NA
10138153	10138154	XALc_1323	XALc_1324			TRUE	0.996	85.000	0.833	0.003	Y	NA
10138157	10138158	XALc_1327	XALc_1328			TRUE	0.667	116.000	0.111	NA		NA
10138158	10138159	XALc_1328	XALc_1329			TRUE	0.990	-3.000	0.294	NA		NA
10138160	10138161	XALc_1330	XALc_1331			TRUE	0.553	71.000	0.085	1.000	N	NA
10138161	10138162	XALc_1331	XALc_1332		mvaB	TRUE	0.841	82.000	0.125	0.055	N	NA
10138162	10138163	XALc_1332	XALc_1333	mvaB		TRUE	0.560	166.000	0.054	0.055	N	NA
10138164	10138165	XALc_1334	XALc_1335	feoA	feoB	TRUE	0.989	3.000	0.178	1.000	Y	NA
10138165	10138166	XALc_1335	XALc_1336	feoB		TRUE	0.907	2.000	0.019	NA		NA
10138166	10138167	XALc_1336	XALc_1337		dapB	FALSE	0.199	164.000	0.000	NA		NA
10138167	10138168	XALc_1337	XALc_1338	dapB	carA	TRUE	0.539	166.000	0.000	1.000	Y	NA
10138168	10138169	XALc_1338	XALc_1339	carA	carB	TRUE	0.987	104.000	0.345	0.001	Y	NA
10138169	10138170	XALc_1339	XALc_1340	carB	greA	TRUE	0.981	-3.000	0.241	1.000	N	NA
10138170	10138171	XALc_1340	XALc_1341	greA	rpfE	TRUE	0.706	-55.000	0.011	NA		NA
10138171	10138172	XALc_1341	XALc_1342	rpfE	recJ	TRUE	0.934	-3.000	0.010	NA		NA
10138172	10138173	XALc_1342	XALc_1343	recJ	prfB	FALSE	0.179	165.000	0.028	1.000	N	NA
10138173	10138174	XALc_1343	XALc_1344	prfB	lysS	TRUE	0.962	97.000	0.162	0.038	Y	NA
10138174	10138175	XALc_1344	XALc_1345	lysS	rpfG	FALSE	0.040	208.000	0.005	1.000	N	NA
10138175	10138176	XALc_1345	XALc_1346	rpfG	rpfC	TRUE	0.998	5.000	0.450	0.023	Y	NA
10138177	10138178	XALc_1347	XALc_1348	rpfF	rpfB	TRUE	0.913	136.000	0.108	0.055	Y	NA
10138178	10138179	XALc_1348	XALc_1349	rpfB	acnA	FALSE	0.162	292.000	0.000	0.055	N	NA
10138180	10138181	XALc_1350	XALc_1351			TRUE	0.984	-3.000	0.177	NA		NA
10138181	10138182	XALc_1351	XALc_1352		acnB	TRUE	0.551	51.000	0.023	NA		NA
10138183	10138184	XALc_1353	XALc_1354		cheB	TRUE	0.989	5.000	0.045	0.028	Y	NA
10138184	10138185	XALc_1354	XALc_1355	cheB	cheD	TRUE	0.996	-3.000	0.267	1.000	Y	NA
10138185	10138186	XALc_1355	XALc_1356	cheD	cheR	TRUE	0.990	-3.000	0.056	1.000	Y	NA
10138186	10138187	XALc_1356	XALc_1357	cheR		FALSE	0.204	369.000	0.000	1.000	Y	NA
10138187	10138188	XALc_1357	XALc_1358			TRUE	0.822	99.000	0.222	NA		NA
10138188	10138189	XALc_1358	XALc_1359		cheW	TRUE	0.697	186.000	0.333	NA		NA
10138189	10138190	XALc_1359	XALc_1360	cheW		TRUE	0.676	109.000	0.200	NA	N	NA
10138190	10138191	XALc_1360	XALc_1361			FALSE	0.005	477.000	0.000	NA	N	NA
10138191	10138192	XALc_1361	XALc_1362			FALSE	0.342	575.000	0.000	0.010	Y	NA
10138192	10138193	XALc_1362	XALc_1363			FALSE	0.050	378.000	0.000	NA		NA
10138193	10138194	XALc_1363	XALc_1364			FALSE	0.069	310.000	0.000	NA		NA
10138194	10138195	XALc_1364	XALc_1365			FALSE	0.410	462.000	0.000	0.010	Y	NA
10138199	10138200	XALc_1369	XALc_1370	cheA1	cheY1	TRUE	0.913	31.000	0.135	1.000	Y	NA
10138200	10138201	XALc_1370	XALc_1371	cheY1		TRUE	0.995	-3.000	0.514	NA		NA
10138201	10138202	XALc_1371	XALc_1372			TRUE	0.770	110.000	0.190	NA		NA
10138202	10138203	XALc_1372	XALc_1373			TRUE	0.903	-3.000	0.028	1.000	N	NA
10138203	10138204	XALc_1373	XALc_1374		motB1	TRUE	0.965	0.000	0.199	1.000	N	NA
10138204	10138205	XALc_1374	XALc_1375	motB1	motA1	TRUE	0.984	8.000	0.248	1.000	Y	NA
10138205	10138206	XALc_1375	XALc_1376	motA1	cheA2	FALSE	0.167	223.000	0.009	1.000		NA
10138206	10138207	XALc_1376	XALc_1377	cheA2	cheZ	TRUE	0.980	5.000	0.341	1.000		NA
10138207	10138208	XALc_1377	XALc_1378	cheZ	cheY2	TRUE	0.997	0.000	0.516	1.000	Y	NA
10138208	10138209	XALc_1378	XALc_1379	cheY2	fliA	TRUE	0.943	19.000	0.283	0.054	N	NA
10138209	10138210	XALc_1379	XALc_1380	fliA	fleN	TRUE	0.992	-3.000	0.482	1.000	N	NA
10138210	10138211	XALc_1380	XALc_1381	fleN	flhF	TRUE	0.971	-13.000	0.241	0.095	N	NA
10138211	10138212	XALc_1381	XALc_1382	flhF	flhA	TRUE	0.559	169.000	0.008	1.000	Y	NA
10138212	10138213	XALc_1382	XALc_1383	flhA	flhB	TRUE	0.996	-3.000	0.029	0.013	Y	NA
10138213	10138214	XALc_1383	XALc_1384	flhB	fliR	TRUE	0.682	140.000	0.018	1.000	Y	NA
10138214	10138215	XALc_1384	XALc_1385	fliR	fliQ	TRUE	0.972	14.000	0.215	1.000	Y	NA
10138215	10138216	XALc_1385	XALc_1386	fliQ	fliP	TRUE	0.995	5.000	0.177	0.013	Y	NA
10138216	10138217	XALc_1386	XALc_1387	fliP	fliO	TRUE	0.975	3.000	0.029	1.000	Y	NA
10138217	10138218	XALc_1387	XALc_1388	fliO	fliN	TRUE	0.992	-3.000	0.090	1.000	Y	NA
10138218	10138219	XALc_1388	XALc_1389	fliN	fliM	TRUE	0.997	-3.000	0.026	0.001	Y	NA
10138219	10138220	XALc_1389	XALc_1390	fliM	fliL	TRUE	0.980	16.000	0.029	0.001	Y	NA
10138220	10138221	XALc_1390	XALc_1391	fliL		TRUE	0.570	190.000	0.025	1.000	Y	NA
10138221	10138222	XALc_1391	XALc_1392		fliJ	TRUE	0.997	-3.000	0.317	0.007		NA
10138222	10138223	XALc_1392	XALc_1393	fliJ	fliI	TRUE	0.925	4.000	0.044	1.000		NA
10138223	10138224	XALc_1393	XALc_1394	fliI	fliH	TRUE	0.991	-3.000	0.085	NA	Y	NA
10138224	10138225	XALc_1394	XALc_1395	fliH	fliG	TRUE	0.997	-3.000	0.320	NA	Y	NA
10138225	10138226	XALc_1395	XALc_1396	fliG	fliF	TRUE	0.992	11.000	0.189	0.007	Y	NA
10138226	10138227	XALc_1396	XALc_1397	fliF	fliE	TRUE	0.999	12.000	0.910	0.007	Y	NA
10138227	10138228	XALc_1397	XALc_1398	fliE		FALSE	0.105	242.000	0.000	NA		NA
10138229	10138230	XALc_1399	XALc_1400			FALSE	0.347	108.000	0.000	NA		NA
10138231	10138232	XALc_1401	XALc_1402			TRUE	0.917	-3.000	0.000	1.000		NA
10138232	10138233	XALc_1402	XALc_1403			FALSE	0.420	25.000	0.027	1.000	N	NA
10138233	10138234	XALc_1403	XALc_1404			TRUE	0.937	-3.000	0.054	1.000	N	NA
10138234	10138235	XALc_1404	XALc_1405			TRUE	0.994	15.000	0.400	0.027	Y	NA
10138235	10138236	XALc_1405	XALc_1406		fabH	TRUE	0.993	3.000	0.308	1.000	Y	NA
10138236	10138237	XALc_1406	XALc_1407	fabH		TRUE	0.972	4.000	0.219	NA		NA
10138237	10138238	XALc_1407	XALc_1408			TRUE	0.963	-3.000	0.041	NA		NA
10138238	10138239	XALc_1408	XALc_1409		fleQ	FALSE	0.042	290.000	0.014	1.000	N	NA
10138239	10138240	XALc_1409	XALc_1410	fleQ		TRUE	0.996	-3.000	0.050	0.054	Y	NA
10138240	10138241	XALc_1410	XALc_1411		rpoN1	TRUE	0.886	15.000	0.050	0.054	N	NA
10138241	10138242	XALc_1411	XALc_1412	rpoN1		TRUE	0.638	271.000	0.000	0.005	Y	NA
10138242	10138243	XALc_1412	XALc_1413			TRUE	0.840	92.000	0.238	NA		NA
10138243	10138244	XALc_1413	XALc_1414			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138244	10138245	XALc_1414	XALc_1415		fliS	TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138245	10138246	XALc_1415	XALc_1416	fliS	fliD	TRUE	0.980	158.000	0.500	0.002	Y	NA
10138246	10138247	XALc_1416	XALc_1417	fliD	fliC	FALSE	0.443	200.000	0.000	1.000	Y	NA
10138247	10138248	XALc_1417	XALc_1418	fliC	flgL	FALSE	0.371	736.000	0.000	0.001	Y	NA
10138248	10138249	XALc_1418	XALc_1419	flgL	flgK	TRUE	0.998	-3.000	0.108	0.001	Y	NA
10138249	10138250	XALc_1419	XALc_1420	flgK	flgJ	TRUE	0.985	12.000	0.034	0.002	Y	NA
10138250	10138251	XALc_1420	XALc_1421	flgJ	flgI	TRUE	0.995	2.000	0.064	0.008	Y	NA
10138251	10138252	XALc_1421	XALc_1422	flgI	flgH	TRUE	0.990	9.000	0.106	0.008	Y	NA
10138252	10138253	XALc_1422	XALc_1423	flgH	flgG	TRUE	0.974	24.000	0.120	0.007	Y	NA
10138253	10138254	XALc_1423	XALc_1424	flgG	flgF	TRUE	0.978	95.000	0.174	0.001	Y	NA
10138254	10138255	XALc_1424	XALc_1425	flgF	flgE	TRUE	0.978	176.000	0.594	0.004	Y	NA
10138255	10138256	XALc_1425	XALc_1426	flgE	flgD	TRUE	0.988	26.000	0.875	1.000	Y	NA
10138256	10138257	XALc_1426	XALc_1427	flgD		TRUE	0.763	42.000	0.000	1.000	Y	NA
10138257	10138258	XALc_1427	XALc_1428		flgB	TRUE	0.989	4.000	0.000	0.004	Y	NA
10138258	10138259	XALc_1428	XALc_1429	flgB		TRUE	0.881	146.000	0.267	1.000	Y	NA
10138260	10138261	XALc_1430	XALc_1431	flgA	flgM	TRUE	0.899	67.000	0.371	NA		NA
10138261	10138262	XALc_1431	XALc_1432	flgM		TRUE	0.993	-3.000	0.052	0.002		NA
10138262	10138263	XALc_1432	XALc_1433			TRUE	0.902	89.000	0.364	1.000		NA
10138264	10138265	XALc_1434	XALc_1435			TRUE	0.995	5.000	0.200	0.028	Y	NA
10138266	10138267	XALc_1436	XALc_1437			FALSE	0.005	580.000	0.000	1.000	N	NA
10138267	10138268	XALc_1437	XALc_1438			TRUE	0.989	17.000	0.667	1.000	Y	NA
10138269	10138270	XALc_1439	XALc_1440			FALSE	0.299	124.000	0.000	NA		NA
10138270	10138271	XALc_1440	XALc_1441			FALSE	0.440	139.000	0.036	NA		NA
10138271	10138272	XALc_1441	XALc_1442		trmU	TRUE	0.984	-3.000	0.180	NA		NA
10138272	10138273	XALc_1442	XALc_1443	trmU		TRUE	0.972	-3.000	0.158	1.000	N	NA
10138274	10138275	XALc_1444	XALc_1445	clpS	clpA	TRUE	0.906	128.000	0.596	NA		NA
10138276	10138277	XALc_1446	XALc_1447	infA	aat	FALSE	0.312	94.000	0.020	1.000	N	NA
10138277	10138278	XALc_1447	XALc_1448	aat		TRUE	0.632	19.000	0.015	NA		NA
10138278	10138279	XALc_1448	XALc_1449		trxB	FALSE	0.428	106.000	0.010	NA		NA
10138280	10138281	XALc_1450	XALc_1451	ftsK		TRUE	0.598	78.000	0.033	NA		NA
10138281	10138282	XALc_1451	XALc_1452		lolA	TRUE	0.479	59.000	0.011	NA		NA
10138284	10138285	XALc_1454	XALc_1455			FALSE	0.020	242.000	0.000	1.000	N	NA
10138286	10138287	XALc_1456	XALc_1457		ccmH1	TRUE	0.980	-3.000	0.000	NA	Y	NA
10138287	10138288	XALc_1457	XALc_1458	ccmH1	ccmG1	TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA	Y	NA
10138288	10138289	XALc_1458	XALc_1459	ccmG1	ccmF1	TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.004	Y	NA
10138289	10138290	XALc_1459	XALc_1460	ccmF1	ccmE	TRUE	0.932	50.000	0.008	0.004	Y	NA
10138290	10138291	XALc_1460	XALc_1461	ccmE	ccmD1	TRUE	0.949	-16.000	0.344	1.000	N	NA
10138291	10138292	XALc_1461	XALc_1462	ccmD1	ccmC1	TRUE	0.993	-3.000	0.501	1.000	N	NA
10138292	10138293	XALc_1462	XALc_1463	ccmC1		TRUE	0.750	11.000	0.008	1.000		NA
10138293	10138294	XALc_1463	XALc_1464			TRUE	0.931	138.000	0.833	NA		NA
10138294	10138295	XALc_1464	XALc_1465		rpoE3	TRUE	0.998	-3.000	0.833	NA		NA
10138295	10138296	XALc_1465	XALc_1466	rpoE3		TRUE	0.950	64.000	0.667	NA		NA
10138296	10138297	XALc_1466	XALc_1467			TRUE	0.660	181.000	0.286	NA		NA
10138297	10138298	XALc_1467	XALc_1468			TRUE	0.982	30.000	0.571	0.008		NA
10138298	10138299	XALc_1468	XALc_1469			TRUE	0.970	66.000	0.500	0.041		NA
10138300	10138301	XALc_1470	XALc_1471			TRUE	0.810	192.000	0.286	0.055		NA
10138303	10138304	XALc_1473	XALc_1474			TRUE	0.979	-3.000	0.000	0.055		NA
10138305	10138306	XALc_1475	XALc_1476			FALSE	0.395	45.000	0.000	NA		NA
10138307	10138308	XALc_1477	XALc_1478	xipD	xapA	FALSE	0.074	296.000	0.000	NA		NA
10138308	10138309	XALc_1478	XALc_1479	xapA	xapB	TRUE	0.650	-31.000	0.000	NA		NA
10138312	10138313	XALc_1482	XALc_1483	xapC		FALSE	0.323	116.000	0.000	NA		NA
10138313	10138314	XALc_1483	XALc_1484		orgB	TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138314	10138315	XALc_1484	XALc_1485	orgB	orgA	TRUE	0.698	-16.000	0.000	NA		NA
10138315	10138316	XALc_1485	XALc_1486	orgA	xsaJ	TRUE	0.989	-3.000	0.238	1.000		NA
10138316	10138317	XALc_1486	XALc_1487	xsaJ	xsaK	TRUE	0.986	7.000	0.571	1.000		NA
10138317	10138318	XALc_1487	XALc_1488	xsaK	xsaL	TRUE	0.936	88.000	0.154	0.004		NA
10138318	10138319	XALc_1488	XALc_1489	xsaL	xsaM	TRUE	0.850	2.000	0.000	NA		NA
10138320	10138321	XALc_1490	XALc_1491	xsaN	xsaO	TRUE	0.640	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10138321	10138322	XALc_1491	XALc_1492	xsaO	xsaP	TRUE	0.991	-13.000	0.360	0.013		NA
10138322	10138323	XALc_1492	XALc_1493	xsaP	xsaQ	TRUE	0.857	196.000	0.320	0.013		NA
10138323	10138324	XALc_1493	XALc_1494	xsaQ	xsaR	TRUE	0.939	12.000	0.222	NA		NA
10138324	10138325	XALc_1494	XALc_1495	xsaR	xsaS	TRUE	0.979	3.000	0.278	NA		NA
10138325	10138326	XALc_1495	XALc_1496	xsaS	xapF	TRUE	0.726	-13.000	0.000	NA		NA
10138326	10138327	XALc_1496	XALc_1497	xapF	xapG	TRUE	0.763	-10.000	0.000	NA		NA
10138327	10138328	XALc_1497	XALc_1498	xapG	xsaV	TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138328	10138329	XALc_1498	XALc_1499	xsaV	xsaW	TRUE	0.999	-3.000	0.625	NA	Y	NA
10138329	10138330	XALc_1499	XALc_1500	xsaW	xsaX	TRUE	0.999	3.000	0.833	0.013	Y	NA
10138330	10138331	XALc_1500	XALc_1501	xsaX	xsaY	TRUE	0.999	0.000	1.000	0.051	Y	NA
10138331	10138332	XALc_1501	XALc_1502	xsaY	xsaZ	TRUE	0.999	-3.000	0.682	1.000	Y	NA
10138332	10138333	XALc_1502	XALc_1503	xsaZ	xicA	FALSE	0.179	181.000	0.000	1.000		NA
10138333	10138334	XALc_1503	XALc_1504	xicA	xipB	FALSE	0.094	268.000	0.000	1.000		NA
10138334	10138335	XALc_1504	XALc_1505	xipB	xipC	TRUE	0.469	234.000	0.000	0.004		NA
10138335	10138336	XALc_1505	XALc_1506	xipC	xapH	FALSE	0.350	107.000	0.000	NA		NA
10138336	10138337	XALc_1506	XALc_1507	xapH	xapI	FALSE	0.104	244.000	0.000	NA		NA
10138337	10138338	XALc_1507	XALc_1508	xapI	xapJ	TRUE	0.993	-3.000	0.360	NA		NA
10138338	10138339	XALc_1508	XALc_1509	xapJ	xapK	FALSE	0.099	250.000	0.000	NA		NA
10138339	10138340	XALc_1509	XALc_1510	xapK	xapL	FALSE	0.418	34.000	0.000	NA		NA
10138340	10138341	XALc_1510	XALc_1511	xapL	xapM	FALSE	0.057	347.000	0.000	NA		NA
10138342	10138343	XALc_1513	XALc_1514	albXVI	albXV	FALSE	0.140	209.000	0.000	1.000		NA
10138343	10138344	XALc_1514	XALc_1515	albXV	albXIV	FALSE	0.418	42.000	0.000	1.000		NA
10138344	10138345	XALc_1515	XALc_1516	albXIV	albXIII	TRUE	0.658	13.000	0.000	1.000		NA
10138345	10138346	XALc_1516	XALc_1517	albXIII	albXII	FALSE	0.429	37.000	0.000	1.000		NA
10138346	10138347	XALc_1517	XALc_1518	albXII	albXI	TRUE	0.770	6.000	0.000	NA		NA
10138348	10138349	XALc_1519	XALc_1520	albXVII	albXVIII	FALSE	0.071	317.000	0.000	1.000		NA
10138349	10138350	XALc_1520	XALc_1521	albXVIII	albXIX	TRUE	0.680	-19.000	0.000	NA		NA
10138350	10138351	XALc_1521	XALc_1522	albXIX	albXX	TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138352	10138353	XALc_1523	XALc_1524	albIX	albVIII	TRUE	0.510	21.000	0.000	1.000		NA
10138353	10138354	XALc_1524	XALc_1525	albVIII	albVII	TRUE	0.746	8.000	0.000	1.000		NA
10138354	10138355	XALc_1525	XALc_1526	albVII	albVI	TRUE	0.598	143.000	0.000	NA	Y	NA
10138355	10138356	XALc_1526	XALc_1528	albVI	albV	FALSE	0.021	196.000	0.000	NA	N	NA
10138357	10138358	XALc_1529	XALc_1530	albI	albII	FALSE	0.099	46.000	0.000	1.000	N	NA
10138358	10138359	XALc_1530	XALc_1531	albII	albIII	TRUE	0.465	0.000	0.000	NA	N	NA
10138359	10138360	XALc_1531	XALc_1532	albIII	albIV	TRUE	0.980	-3.000	0.000	NA	Y	NA
10138360	10138361	XALc_1532	XALc_1533	albIV		FALSE	0.394	66.000	0.000	NA		NA
10138361	10138362	XALc_1533	XALc_1534			FALSE	0.397	90.000	0.000	NA		NA
10138362	10138363	XALc_1534	XALc_1535			FALSE	0.366	102.000	0.000	NA		NA
10138364	10138365	XALc_1536	XALc_1537			TRUE	0.994	-3.000	0.400	NA		NA
10138365	10138366	XALc_1537	XALc_1538			TRUE	0.997	0.000	1.000	NA		NA
10138366	10138367	XALc_1538	XALc_1539			TRUE	0.997	0.000	1.000	NA		NA
10138367	10138368	XALc_1539	XALc_1540			FALSE	0.043	432.000	0.000	NA		NA
10138368	10138369	XALc_1540	XALc_1541			FALSE	0.146	196.000	0.000	NA		NA
10138369	10138370	XALc_1541	XALc_1542			TRUE	0.977	11.000	0.500	NA		NA
10138370	10138371	XALc_1542	XALc_1543			TRUE	0.961	17.000	0.500	NA		NA
10138371	10138372	XALc_1543	XALc_1544			TRUE	0.990	-12.000	0.750	1.000		NA
10138372	10138373	XALc_1544	XALc_1545			FALSE	0.032	556.000	0.000	NA		NA
10138373	10138374	XALc_1545	XALc_1546			FALSE	0.432	28.000	0.000	NA		NA
10138376	10138377	XALc_1548	XALc_1549			FALSE	0.033	543.000	0.000	NA		NA
10138377	10138378	XALc_1549	XALc_1550			FALSE	0.094	260.000	0.000	NA		NA
10138378	10138379	XALc_1550	XALc_1551			TRUE	1.000	-3.000	0.667	0.004	Y	NA
10138379	10138380	XALc_1551	XALc_1552			FALSE	0.067	315.000	0.000	NA		NA
10138380	10138381	XALc_1552	XALc_1553		baeS	FALSE	0.024	762.000	0.000	NA		NA
10138381	10138382	XALc_1553	XALc_1554	baeS		TRUE	0.985	60.000	0.833	1.000	Y	NA
10138383	10138384	XALc_1555	XALc_1556			TRUE	0.913	31.000	0.000	0.031	Y	NA
10138384	10138385	XALc_1556	XALc_1557			TRUE	0.804	24.000	0.000	1.000	Y	NA
10138385	10138386	XALc_1557	XALc_1558			TRUE	0.996	-3.000	0.833	NA	N	NA
10138387	10138388	XALc_Yt34	XALc_Yt35	tRNA-tRNA_Glu	tRNA-tRNA_Ala	FALSE	0.395	45.000	0.000	NA		NA
10138388	10138389	XALc_Yt35	XALc_Yt36	tRNA-tRNA_Ala	tRNA-tRNA_Glu	FALSE	0.355	105.000	0.000	NA		NA
10138389	10138390	XALc_Yt36	XALc_Yt37	tRNA-tRNA_Glu	tRNA-tRNA_Ala	FALSE	0.395	45.000	0.000	NA		NA
10138390	10138391	XALc_Yt37	XALc_1563	tRNA-tRNA_Ala		FALSE	0.107	239.000	0.000	NA		NA
10138391	10138392	XALc_1563	XALc_1564			TRUE	0.462	24.000	0.000	NA		NA
10138392	10138393	XALc_1564	XALc_1565			TRUE	0.970	-18.000	0.400	NA		NA
10138393	10138394	XALc_1565	XALc_1566			FALSE	0.154	191.000	0.000	NA		NA
10138394	10138395	XALc_1566	XALc_1567			FALSE	0.022	855.000	0.000	NA		NA
10138395	10138396	XALc_1567	XALc_1568			TRUE	0.845	72.000	0.250	NA		NA
10138396	10138397	XALc_1568	XALc_1569			TRUE	0.769	214.000	0.250	NA	Y	NA
10138397	10138398	XALc_1569	XALc_1570		traK	FALSE	0.031	557.000	0.000	NA		NA
10138398	10138399	XALc_1570	XALc_1571	traK		FALSE	0.158	189.000	0.000	NA		NA
10138401	10138402	XALc_1573	XALc_1574	repC		TRUE	0.968	-28.000	0.429	NA		NA
10138402	10138403	XALc_1574	XALc_1575			TRUE	0.931	16.000	0.286	NA		NA
10138404	10138405	XALc_1576	XALc_1577			TRUE	0.684	79.000	0.067	1.000		NA
10138406	10138407	XALc_1578	XALc_1579		guaA	FALSE	0.015	307.000	0.002	1.000	N	NA
10138407	10138408	XALc_1579	XALc_1580	guaA	guaB	TRUE	0.901	149.000	0.190	0.001		NA
10138408	10138409	XALc_1580	XALc_1581	guaB	folD	FALSE	0.306	131.000	0.004	1.000		NA
10138411	10138412	XALc_1583	XALc_1584	moeB	moeA	TRUE	0.814	51.000	0.022	1.000	Y	NA
10138412	10138413	XALc_1584	XALc_1585	moeA	mobA	TRUE	0.996	-3.000	0.005	0.002	Y	NA
10138413	10138414	XALc_1585	XALc_1586	mobA	engA	TRUE	0.754	8.000	0.002	1.000		NA
10138414	10138415	XALc_1586	XALc_1587	engA		TRUE	0.886	19.000	0.203	1.000		NA
10138415	10138416	XALc_1587	XALc_1588			TRUE	0.974	12.000	0.492	1.000		NA
10138416	10138417	XALc_1588	XALc_1589			TRUE	0.508	66.000	0.015	NA		NA
10138417	10138418	XALc_1589	XALc_1590			TRUE	0.986	-3.000	0.204	NA		NA
10138418	10138419	XALc_1590	XALc_1591			TRUE	0.908	-13.000	0.086	1.000		NA
10138419	10138420	XALc_1591	XALc_1592		ndk	TRUE	0.904	14.000	0.156	1.000		NA
10138421	10138422	XALc_1593	XALc_1594		fadB	FALSE	0.326	36.000	0.019	1.000	N	NA
10138422	10138423	XALc_1594	XALc_1595	fadB	fadA	TRUE	0.976	58.000	0.588	1.000	Y	NA
10138424	10138425	XALc_1596	XALc_1597	galU		TRUE	0.996	0.000	0.350	1.000	Y	NA
10138425	10138426	XALc_1597	XALc_1598			TRUE	0.897	21.000	0.048	1.000	Y	NA
10138426	10138427	XALc_1598	XALc_1599			TRUE	0.871	1.000	0.038	1.000	N	NA
10138427	10138428	XALc_1599	XALc_1600			TRUE	0.986	7.000	0.576	NA		NA
10138428	10138429	XALc_1600	XALc_1601		ihfB	TRUE	0.822	74.000	0.208	NA		NA
10138429	10138430	XALc_1601	XALc_1602	ihfB	rpsA	TRUE	0.803	79.000	0.292	1.000	N	NA
10138430	10138431	XALc_1602	XALc_1603	rpsA	cmk	FALSE	0.416	236.000	0.281	1.000	N	NA
10138432	10138433	XALc_1604	XALc_1605	rpmJ		FALSE	0.395	125.000	0.014	NA		NA
10138433	10138434	XALc_1605	XALc_1606			FALSE	0.450	191.000	0.123	NA		NA
10138434	10138435	XALc_1606	XALc_1607			TRUE	0.901	80.000	0.364	NA		NA
10138435	10138436	XALc_1607	XALc_1608			FALSE	0.340	145.000	0.016	NA		NA
10138436	10138437	XALc_1608	XALc_1609			FALSE	0.046	405.000	0.000	NA		NA
10138437	10138438	XALc_1609	XALc_1610			TRUE	0.998	9.000	0.688	0.008	Y	NA
10138439	10138440	XALc_1611	XALc_1612		gntY	TRUE	0.781	14.000	0.030	NA		NA
10138441	10138442	XALc_1613	XALc_1614	phhB	tonB	TRUE	0.873	6.000	0.025	1.000		NA
10138442	10138443	XALc_1614	XALc_1615	tonB		FALSE	0.085	272.000	0.000	NA		NA
10138447	10138448	XALc_1619	XALc_1620		virB6-2	FALSE	0.023	784.000	0.000	NA		NA
10138448	10138449	XALc_1620	XALc_1621	virB6-2		FALSE	0.026	630.000	0.000	NA		NA
10138449	10138450	XALc_1621	XALc_1622			FALSE	0.220	153.000	0.000	NA		NA
10138450	10138451	XALc_1622	XALc_1623			TRUE	0.614	-100.000	0.000	NA		NA
10138451	10138452	XALc_1623	XALc_1624			TRUE	0.979	-3.000	0.000	0.054		NA
10138452	10138453	XALc_1624	XALc_1625			FALSE	0.025	684.000	0.000	NA		NA
10138454	10138455	XALc_1626	XALc_1627			FALSE	0.432	28.000	0.000	NA		NA
10138455	10138456	XALc_1627	XALc_1628			FALSE	0.445	26.000	0.000	NA		NA
10138456	10138457	XALc_1628	XALc_1629			FALSE	0.039	472.000	0.000	NA		NA
10138457	10138458	XALc_1629	XALc_1630			TRUE	0.917	-3.000	0.000	1.000		NA
10138458	10138459	XALc_1630	XALc_1631			FALSE	0.054	358.000	0.000	NA		NA
10138459	10138460	XALc_1631	XALc_1632			FALSE	0.374	100.000	0.000	NA		NA
10138460	10138461	XALc_1632	XALc_Yt38		tRNA-tRNA_Leu	FALSE	0.084	274.000	0.000	NA		NA
10138462	10138463	XALc_1634	XALc_1635			TRUE	0.984	32.000	0.333	0.023	Y	NA
10138464	10138465	XALc_1636	XALc_1637	tex		FALSE	0.090	102.000	0.000	1.000	N	NA
10138465	10138466	XALc_1637	XALc_1638		phbC	FALSE	0.005	604.000	0.000	1.000	N	NA
10138466	10138467	XALc_1638	XALc_1639	phbC		TRUE	0.987	-3.000	0.210	NA		NA
10138467	10138468	XALc_1639	XALc_1640		pssA	TRUE	0.543	47.000	0.022	NA		NA
10138470	10138471	XALc_1642	XALc_1643			TRUE	0.610	51.000	0.040	NA		NA
10138471	10138472	XALc_1643	XALc_1644			FALSE	0.436	147.000	0.043	NA		NA
10138473	10138474	XALc_1645	XALc_1646	ppsA	mscS	TRUE	0.699	5.000	0.018	NA	N	NA
10138475	10138476	XALc_1647	XALc_1648	orn		FALSE	0.199	103.000	0.011	1.000	N	NA
10138476	10138477	XALc_1648	XALc_1649		mntR	TRUE	0.863	-3.000	0.016	1.000	N	NA
10138478	10138479	XALc_1650	XALc_1651	mntH	sodA	FALSE	0.209	360.000	0.000	1.000	Y	NA
10138480	10138481	XALc_1652	XALc_1653			TRUE	0.593	29.000	0.024	NA		NA
10138481	10138482	XALc_1653	XALc_1655		ugd	TRUE	0.852	-10.000	0.020	NA		NA
10138482	10138483	XALc_1655	XALc_1656	ugd	fkpA	TRUE	0.924	16.000	0.357	1.000	N	NA
10138483	10138484	XALc_1656	XALc_1657	fkpA		TRUE	0.850	89.000	0.042	1.000	Y	NA
10138485	10138486	XALc_1658	XALc_1659			TRUE	0.992	-3.000	0.500	1.000	N	NA
10138486	10138487	XALc_1659	XALc_1660			TRUE	0.997	-3.000	0.667	NA		NA
10138487	10138488	XALc_1660	XALc_1661			TRUE	0.765	50.000	0.143	NA		NA
10138488	10138489	XALc_1661	XALc_1662			TRUE	0.765	48.000	0.143	NA		NA
10138489	10138490	XALc_1662	XALc_1663			TRUE	0.809	151.000	0.400	NA		NA
10138492	10138493	XALc_1665	XALc_1666	purB		FALSE	0.134	310.000	0.029	NA		NA
10138493	10138494	XALc_1666	XALc_1667			TRUE	0.734	8.000	0.000	NA		NA
10138494	10138495	XALc_1667	XALc_1668		sucA	FALSE	0.173	185.000	0.000	1.000		NA
10138495	10138496	XALc_1668	XALc_1669	sucA	sucB	TRUE	0.979	47.000	0.667	1.000	Y	NA
10138496	10138497	XALc_1669	XALc_1670	sucB	lpd	TRUE	0.906	126.000	0.253	1.000	Y	NA
10138497	10138498	XALc_1670	XALc_1671	lpd		FALSE	0.244	162.000	0.008	NA		NA
10138500	10138501	XALc_1673	XALc_1674		msbA	TRUE	0.938	-3.000	0.012	NA		NA
10138502	10138503	XALc_1675	XALc_1676		dnaJ	FALSE	0.009	387.000	0.000	1.000	N	NA
10138503	10138504	XALc_1676	XALc_1677	dnaJ	dnaK	TRUE	0.959	150.000	0.236	0.003	Y	NA
10138504	10138505	XALc_1677	XALc_1678	dnaK	grpE	TRUE	0.900	150.000	0.049	0.007	Y	NA
10138505	10138506	XALc_1678	XALc_1679	grpE	hrcA	FALSE	0.163	169.000	0.025	1.000	N	NA
10138510	10138511	XALc_1683	XALc_1684			TRUE	0.910	6.000	0.063	NA		NA
10138517	10138518	XALc_1689	XALc_1690			TRUE	0.543	30.000	0.015	NA		NA
10138519	10138520	XALc_1691	XALc_1692	fkpA		TRUE	0.776	14.000	0.028	NA		NA
10138521	10138522	XALc_1693	XALc_1694		gltB	FALSE	0.026	205.000	0.000	1.000	N	NA
10138522	10138523	XALc_1694	XALc_1695	gltB		FALSE	0.151	131.000	0.012	1.000	N	NA
10138523	10138524	XALc_1695	XALc_1696			FALSE	0.079	284.000	0.000	NA		NA
10138524	10138525	XALc_1696	XALc_1697			FALSE	0.296	125.000	0.000	NA		NA
10138525	10138526	XALc_1697	XALc_Yt39		tRNA-tRNA_Ser	FALSE	0.071	305.000	0.000	NA		NA
10138526	10138527	XALc_Yt39	XALc_1699	tRNA-tRNA_Ser		FALSE	0.148	194.000	0.000	NA		NA
10138527	10138528	XALc_1699	XALc_1700		serS	FALSE	0.017	263.000	0.000	1.000	N	NA
10138530	10138531	XALc_1702	XALc_1703	aroA	pheA	TRUE	0.843	87.000	0.035	1.000	Y	NA
10138531	10138532	XALc_1703	XALc_1704	pheA	serC	TRUE	0.898	79.000	0.121	1.000	Y	NA
10138533	10138534	XALc_1705	XALc_1706			TRUE	0.984	77.000	0.790	0.040		NA
10138538	10138539	XALc_1710	XALc_1711			TRUE	0.743	115.000	0.174	NA		NA
10138539	10138540	XALc_1711	XALc_1712			FALSE	0.410	188.000	0.087	NA		NA
10138541	10138542	XALc_1713	XALc_1714		hutC	FALSE	0.057	136.000	0.000	1.000	N	NA
10138542	10138543	XALc_1714	XALc_1715	hutC		TRUE	0.776	-7.000	0.027	1.000	N	NA
10138544	10138545	XALc_1716	XALc_1717	hutI	hutH	TRUE	0.992	-3.000	0.192	0.036	N	NA
10138545	10138546	XALc_1717	XALc_1718	hutH	hutG	TRUE	0.849	83.000	0.039	1.000	Y	NA
10138546	10138547	XALc_1718	XALc_1719	hutG	hutU	TRUE	0.965	-12.000	0.061	1.000	Y	NA
10138547	10138548	XALc_1719	XALc_1720	hutU		FALSE	0.367	120.000	0.008	NA		NA
10138548	10138549	XALc_1720	XALc_1721			FALSE	0.296	125.000	0.000	NA		NA
10138549	10138550	XALc_1721	XALc_1722			TRUE	0.800	0.000	0.015	1.000	N	NA
10138553	10138554	XALc_1725	XALc_1726	gyrA	gcn3	FALSE	0.046	209.000	0.007	1.000	N	NA
10138554	10138555	XALc_1726	XALc_1727	gcn3		TRUE	0.470	58.000	0.009	NA		NA
10138555	10138556	XALc_1727	XALc_1728		lysS	FALSE	0.401	139.000	0.026	NA		NA
10138556	10138557	XALc_1728	XALc_1729	lysS	ligA	TRUE	0.714	-3.000	0.004	1.000	N	NA
10138559	10138560	XALc_1731	XALc_1732		smc	TRUE	0.964	58.000	0.115	0.009	Y	NA
10138560	10138561	XALc_1732	XALc_1733	smc	rplI	FALSE	0.015	278.000	0.000	1.000	N	NA
10138561	10138562	XALc_1733	XALc_1734	rplI	rpsR	TRUE	0.971	166.000	0.499	0.015	Y	NA
10138562	10138563	XALc_1734	XALc_1735	rpsR	rpsF	TRUE	0.994	12.000	0.319	0.015	Y	NA
10138566	10138567	XALc_1738	XALc_1739	asnS		TRUE	0.548	23.000	0.009	NA		NA
10138567	10138568	XALc_1739	XALc_1740			TRUE	0.998	-3.000	0.833	NA		NA
10138568	10138569	XALc_1740	XALc_1741			TRUE	0.912	10.000	0.116	NA		NA
10138570	10138571	XALc_1742	XALc_1743			FALSE	0.064	327.000	0.000	NA		NA
10138571	10138572	XALc_1743	XALc_1744			TRUE	0.816	61.000	0.200	NA		NA
10138572	10138573	XALc_1744	XALc_1745			FALSE	0.388	49.000	0.000	NA		NA
10138573	10138574	XALc_1745	XALc_1746			TRUE	0.801	-7.000	0.000	NA		NA
10138574	10138575	XALc_1746	XALc_1747			TRUE	0.990	-3.000	0.286	NA		NA
10138575	10138576	XALc_1747	XALc_1748			TRUE	0.956	47.000	0.750	NA		NA
10138576	10138577	XALc_1748	XALc_1749			TRUE	0.972	13.000	0.500	NA		NA
10138577	10138578	XALc_1749	XALc_1750			TRUE	0.860	110.000	0.333	NA		NA
10138579	10138580	XALc_1751	XALc_1752			TRUE	0.600	37.000	0.027	1.000		NA
10138580	10138581	XALc_1752	XALc_1753			TRUE	0.564	29.000	0.019	NA		NA
10138581	10138582	XALc_1753	XALc_1754			TRUE	0.684	32.000	0.060	NA		NA
10138582	10138583	XALc_1754	XALc_1755			TRUE	0.581	50.000	0.100	1.000	N	NA
10138583	10138584	XALc_1755	XALc_1756			FALSE	0.187	133.000	0.017	1.000	N	NA
10138584	10138585	XALc_1756	XALc_1757			TRUE	0.959	-3.000	0.034	NA		NA
10138585	10138586	XALc_1757	XALc_1758			TRUE	0.767	44.000	0.139	NA		NA
10138587	10138588	XALc_1759	XALc_1760		ppnK	TRUE	0.514	122.000	0.036	1.000		NA
10138588	10138589	XALc_1760	XALc_1761	ppnK		FALSE	0.054	309.000	0.022	1.000	N	NA
10138590	10138591	XALc_1762	XALc_1763			TRUE	0.983	13.000	1.000	1.000	N	NA
10138593	10138594	XALc_1765	XALc_1766			TRUE	0.864	-3.000	0.017	1.000	N	NA
10138594	10138595	XALc_1766	XALc_1767			TRUE	0.933	111.000	0.009	0.001	Y	NA
10138595	10138596	XALc_1767	XALc_1768			FALSE	0.008	435.000	0.000	1.000	N	NA
10138596	10138597	XALc_1768	XALc_1769			TRUE	0.991	-3.000	0.083	1.000	Y	NA
10138597	10138598	XALc_1769	XALc_1770			TRUE	0.640	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10138598	10138599	XALc_1770	XALc_1771			TRUE	0.995	0.000	0.333	NA	Y	NA
10138599	10138600	XALc_1771	XALc_1772			TRUE	0.934	-93.000	0.375	NA	N	NA
10138600	10138601	XALc_1772	XALc_1775			TRUE	0.998	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
10138601	10138602	XALc_1775	XALc_1776			FALSE	0.140	209.000	0.000	1.000		NA
10138602	10138603	XALc_1776	XALc_1777			TRUE	0.982	0.000	0.241	NA		NA
10138603	10138604	XALc_1777	XALc_1778			TRUE	0.996	-3.000	0.583	NA		NA
10138604	10138605	XALc_1778	XALc_1779			TRUE	0.974	-10.000	0.333	NA		NA
10138606	10138607	XALc_1780	XALc_1781			TRUE	0.954	2.000	0.086	NA		NA
10138608	10138609	XALc_1782	XALc_1783			TRUE	0.703	11.000	0.000	1.000		NA
10138610	10138611	XALc_1784	XALc_1785			TRUE	0.981	6.000	0.152	1.000	Y	NA
10138613	10138614	XALc_1787	XALc_1788			FALSE	0.393	69.000	0.000	NA		NA
10138614	10138615	XALc_1788	XALc_1789			FALSE	0.411	38.000	0.000	NA		NA
10138615	10138616	XALc_1789	XALc_1790			FALSE	0.395	74.000	0.000	NA		NA
10138616	10138617	XALc_1790	XALc_1791		raxB1	FALSE	0.393	71.000	0.000	NA		NA
10138617	10138618	XALc_1791	XALc_1792	raxB1	raxA1	TRUE	0.714	110.000	0.000	1.000	Y	NA
10138621	10138622	XALc_1795	XALc_1796			FALSE	0.396	64.000	0.000	NA		NA
10138623	10138624	XALc_1797	XALc_1798			FALSE	0.432	28.000	0.000	NA		NA
10138624	10138625	XALc_1798	XALc_1799			FALSE	0.445	26.000	0.000	NA		NA
10138625	10138626	XALc_1799	XALc_1800			FALSE	0.039	475.000	0.000	NA		NA
10138626	10138627	XALc_1800	XALc_1801			TRUE	0.917	-3.000	0.000	1.000		NA
10138627	10138628	XALc_1801	XALc_1802			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138628	10138629	XALc_1802	XALc_1803			FALSE	0.366	102.000	0.000	NA		NA
10138629	10138630	XALc_1803	XALc_1804			TRUE	0.969	65.000	1.000	NA		NA
10138630	10138631	XALc_1804	XALc_1805			FALSE	0.024	750.000	0.000	NA		NA
10138633	10138634	XALc_Yt41	XALc_Yt42	tRNA-tRNA_Cys	tRNA-tRNA_Gly	FALSE	0.026	635.000	0.000	NA		NA
10138634	10138635	XALc_Yt42	XALc_1809	tRNA-tRNA_Gly	pgsA	FALSE	0.414	37.000	0.000	NA		NA
10138635	10138636	XALc_1809	XALc_1810	pgsA	uvrC	TRUE	0.920	10.000	0.227	1.000	N	NA
10138636	10138637	XALc_1810	XALc_1811	uvrC		TRUE	0.919	-3.000	0.004	NA		NA
10138637	10138638	XALc_1811	XALc_1812		etp	TRUE	0.926	-3.000	0.006	NA		NA
10138638	10138639	XALc_1812	XALc_1813	etp	kdsB	TRUE	0.934	-3.000	0.050	1.000	N	NA
10138639	10138640	XALc_1813	XALc_1814	kdsB	lpxK	TRUE	0.456	276.000	0.054	1.000	Y	NA
10138640	10138641	XALc_1814	XALc_1815	lpxK		TRUE	0.978	-3.000	0.205	1.000	N	NA
10138641	10138642	XALc_1815	XALc_1816		exbD3	TRUE	0.629	84.000	0.120	1.000	N	NA
10138642	10138643	XALc_1816	XALc_1817	exbD3	exbB	TRUE	0.999	5.000	0.746	0.039	Y	NA
10138643	10138644	XALc_1817	XALc_1818	exbB		TRUE	0.799	-184.000	0.045	1.000		NA
10138644	10138645	XALc_1818	XALc_1819		lolD	FALSE	0.131	258.000	0.010	1.000		NA
10138645	10138646	XALc_1819	XALc_1820	lolD	lolC	TRUE	0.994	-7.000	0.620	0.039	N	NA
10138646	10138647	XALc_1820	XALc_1821	lolC		TRUE	0.597	25.000	0.020	NA		NA
10138647	10138648	XALc_1821	XALc_1822			TRUE	0.741	-49.000	0.016	NA		NA
10138648	10138649	XALc_1822	XALc_1823		sdhB	TRUE	0.660	134.000	0.151	NA		NA
10138649	10138650	XALc_1823	XALc_1824	sdhB	sdhA	TRUE	0.970	234.000	0.604	0.001	Y	NA
10138650	10138651	XALc_1824	XALc_1825	sdhA		TRUE	0.996	30.000	0.705	0.001	Y	NA
10138651	10138652	XALc_1825	XALc_1826			TRUE	0.999	-3.000	0.291	0.001	Y	NA
10138652	10138653	XALc_1826	XALc_1827			TRUE	0.636	61.000	0.047	NA		NA
10138656	10138657	XALc_1830	XALc_1831	zwf	glk1	TRUE	0.990	-3.000	0.055	1.000	Y	NA
10138657	10138658	XALc_1831	XALc_1832	glk1	pgl	TRUE	0.986	-3.000	0.021	1.000	Y	NA
10138658	10138659	XALc_1832	XALc_1833	pgl	edd	TRUE	0.909	111.000	0.202	1.000	Y	NA
10138659	10138660	XALc_1833	XALc_1834	edd	alkH	TRUE	0.790	82.000	0.008	1.000	Y	NA
10138661	10138662	XALc_1835	XALc_1836	virB4	virB3	TRUE	0.806	169.000	0.192	NA	Y	NA
10138662	10138663	XALc_1836	XALc_1837	virB3	virB2	TRUE	0.995	-7.000	1.000	NA		NA
10138663	10138664	XALc_1837	XALc_1838	virB2	virB1	TRUE	0.884	71.000	0.333	NA		NA
10138664	10138665	XALc_1838	XALc_1839	virB1	virB11	TRUE	0.890	112.000	0.429	NA		NA
10138665	10138666	XALc_1839	XALc_1840	virB11	virB10	TRUE	0.988	19.000	0.714	1.000	Y	NA
10138666	10138667	XALc_1840	XALc_1841	virB10	virB9	TRUE	0.996	9.000	0.800	NA	Y	NA
10138667	10138668	XALc_1841	XALc_1842	virB9	virB8	TRUE	0.997	-3.000	0.400	NA	Y	NA
10138668	10138669	XALc_1842	XALc_1843	virB8		TRUE	0.906	59.000	0.400	NA		NA
10138669	10138670	XALc_1843	XALc_1844			FALSE	0.026	632.000	0.000	NA		NA
10138670	10138671	XALc_1844	XALc_1845			TRUE	0.597	-163.000	0.000	NA		NA
10138671	10138672	XALc_1845	XALc_1846			FALSE	0.397	61.000	0.000	NA		NA
10138672	10138673	XALc_1846	XALc_1847			TRUE	0.519	19.000	0.000	NA		NA
10138673	10138674	XALc_1847	XALc_1848			FALSE	0.278	130.000	0.000	NA		NA
10138674	10138675	XALc_1848	XALc_1849			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138675	10138676	XALc_1849	XALc_1850			TRUE	0.538	18.000	0.000	NA		NA
10138676	10138677	XALc_1850	XALc_1851			FALSE	0.389	51.000	0.000	NA		NA
10138678	10138679	XALc_1852	XALc_1853			FALSE	0.308	120.000	0.000	NA		NA
10138679	10138680	XALc_1853	XALc_1854			TRUE	0.754	145.000	0.071	0.052		NA
10138680	10138681	XALc_1854	XALc_1855			TRUE	0.905	-111.000	0.000	0.010		NA
10138681	10138682	XALc_1855	XALc_1856			FALSE	0.147	613.000	0.000	0.010		NA
10138682	10138683	XALc_1856	XALc_1857			FALSE	0.051	367.000	0.000	NA		NA
10138683	10138684	XALc_1857	XALc_1858			FALSE	0.199	164.000	0.000	NA		NA
10138684	10138685	XALc_1858	XALc_1859			TRUE	0.837	3.000	0.000	NA		NA
10138685	10138686	XALc_1859	XALc_1860			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138686	10138687	XALc_1860	XALc_1861			FALSE	0.225	150.000	0.000	NA		NA
10138687	10138688	XALc_1861	XALc_1862			FALSE	0.023	806.000	0.000	NA		NA
10138688	10138689	XALc_1862	XALc_1863			FALSE	0.445	26.000	0.000	NA		NA
10138689	10138690	XALc_1863	XALc_1864			FALSE	0.432	28.000	0.000	NA		NA
10138691	10138692	XALc_1865	XALc_1866			FALSE	0.396	75.000	0.000	NA		NA
10138692	10138693	XALc_1866	XALc_1867		virB6-1	FALSE	0.398	44.000	0.000	NA		NA
10138695	10138696	XALc_Yt43	XALc_1870	tRNA-tRNA_Val	uvrB	FALSE	0.381	97.000	0.000	NA		NA
10138697	10138698	XALc_1871	XALc_1872			FALSE	0.033	545.000	0.000	NA		NA
10138698	10138699	XALc_1872	XALc_1873			TRUE	0.999	-3.000	0.667	0.052		NA
10138700	10138701	XALc_1874	XALc_1875			TRUE	0.925	25.000	0.100	0.012		NA
10138703	10138704	XALc_1877	XALc_1878			FALSE	0.264	135.000	0.000	NA		NA
10138704	10138705	XALc_1878	XALc_1879			FALSE	0.100	45.000	0.000	1.000	N	NA
10138705	10138706	XALc_1879	XALc_1880			TRUE	0.979	-3.000	0.000	0.052		NA
10138708	10138709	XALc_1882	XALc_1883			FALSE	0.394	98.000	0.000	1.000		NA
10138709	10138710	XALc_1883	XALc_1884			FALSE	0.222	157.000	0.000	1.000		NA
10138710	10138711	XALc_1884	XALc_1885			FALSE	0.023	1441.000	0.000	1.000		NA
10138711	10138712	XALc_1885	XALc_1886		proA	FALSE	0.065	334.000	0.000	1.000		NA
10138712	10138713	XALc_1886	XALc_1887	proA	proB	TRUE	0.853	171.000	0.007	0.001	Y	NA
10138713	10138714	XALc_1887	XALc_1888	proB		TRUE	0.826	17.000	0.091	NA		NA
10138714	10138715	XALc_1888	XALc_1889		argH	FALSE	0.418	58.000	0.004	NA		NA
10138715	10138716	XALc_1889	XALc_1890	argH	argC	TRUE	0.810	49.000	0.020	1.000	Y	NA
10138716	10138717	XALc_1890	XALc_1891	argC		TRUE	0.796	-3.000	0.008	1.000	N	NA
10138717	10138718	XALc_1891	XALc_1892		argB	FALSE	0.321	15.000	0.006	1.000	N	NA
10138718	10138719	XALc_1892	XALc_1893	argB	argE	TRUE	0.785	57.000	0.009	1.000	Y	NA
10138719	10138720	XALc_1893	XALc_1894	argE		TRUE	0.874	7.000	0.032	1.000		NA
10138720	10138721	XALc_1894	XALc_1895		argG	FALSE	0.285	135.000	0.002	1.000		NA
10138721	10138722	XALc_1895	XALc_1896	argG	argF	TRUE	0.775	67.000	0.007	1.000	Y	NA
10138722	10138723	XALc_1896	XALc_1897	argF		FALSE	0.073	300.000	0.000	NA		NA
10138724	10138725	XALc_1898	XALc_1899	cysS		TRUE	0.823	-7.000	0.006	NA		NA
10138725	10138726	XALc_1899	XALc_1900			TRUE	0.960	-3.000	0.034	NA		NA
10138728	10138729	XALc_1902	XALc_1904	raxA3		TRUE	0.917	-3.000	0.000	1.000		NA
10138729	10138730	XALc_1904	XALc_1903			TRUE	0.911	-315.000	0.000	0.004		NA
10138730	10138731	XALc_1903	XALc_1906			FALSE	0.397	61.000	0.000	NA		NA
10138731	10138732	XALc_1906	XALc_1907			FALSE	0.421	32.000	0.000	NA		NA
10138732	10138733	XALc_1907	XALc_1908			FALSE	0.403	42.000	0.000	NA		NA
10138733	10138734	XALc_1908	XALc_1909			FALSE	0.320	117.000	0.000	NA		NA
10138734	10138735	XALc_1909	XALc_1910			FALSE	0.396	75.000	0.000	NA		NA
10138737	10138738	XALc_1912	XALc_1913		pyrC	TRUE	0.902	0.000	0.010	NA		NA
10138738	10138739	XALc_1913	XALc_1914	pyrC		FALSE	0.342	60.000	0.023	1.000	N	NA
10138739	10138740	XALc_1914	XALc_1915			FALSE	0.005	600.000	0.000	1.000	N	NA
10138740	10138741	XALc_1915	XALc_1916			FALSE	0.045	156.000	0.000	1.000	N	NA
10138742	10138743	XALc_1917	XALc_1918		gph	TRUE	0.649	21.000	0.022	NA		NA
10138743	10138744	XALc_1918	XALc_1919	gph	ubiG	TRUE	0.960	-13.000	0.259	1.000		NA
10138744	10138745	XALc_1919	XALc_1920	ubiG		TRUE	0.589	49.000	0.104	1.000	N	NA
10138745	10138746	XALc_1920	XALc_1921		efp	FALSE	0.017	282.000	0.002	1.000	N	NA
10138748	10138749	XALc_1923	XALc_1924			FALSE	0.007	482.000	0.000	1.000	N	NA
10138750	10138751	XALc_1925	XALc_1926	suhB		FALSE	0.006	513.000	0.000	1.000	N	NA
10138752	10138753	XALc_1927	XALc_1928	secF	secD	TRUE	0.969	74.000	0.084	0.001	Y	NA
10138753	10138754	XALc_1928	XALc_1929	secD		TRUE	0.873	57.000	0.083	NA	Y	NA
10138754	10138755	XALc_1929	XALc_1930		tgt	FALSE	0.443	246.000	0.325	NA	N	NA
10138755	10138756	XALc_1930	XALc_1931	tgt	queA	TRUE	0.991	26.000	0.360	0.001	Y	NA
10138756	10138757	XALc_1931	XALc_1932	queA		FALSE	0.124	54.000	0.004	1.000	N	NA
10138759	10138760	XALc_1934	XALc_1935			TRUE	0.519	72.000	0.015	1.000		NA
10138761	10138762	XALc_1937	XALc_1938			TRUE	0.955	10.000	0.267	NA		NA
10138762	10138763	XALc_1938	XALc_1939			TRUE	0.982	4.000	0.333	NA		NA
10138764	10138765	XALc_1940	XALc_1941	ggt		TRUE	0.914	-10.000	0.076	NA		NA
10138765	10138766	XALc_1941	XALc_1942			FALSE	0.186	233.000	0.020	NA		NA
10138766	10138767	XALc_1942	XALc_1943		coaD	TRUE	0.457	41.000	0.007	NA		NA
10138767	10138768	XALc_1943	XALc_1944	coaD		TRUE	0.989	-3.000	0.367	1.000	N	NA
10138770	10138771	XALc_1946	XALc_1947			FALSE	0.035	542.000	0.000	1.000		NA
10138771	10138772	XALc_1947	XALc_1948			FALSE	0.418	42.000	0.000	1.000		NA
10138772	10138773	XALc_1948	XALc_1949			FALSE	0.044	445.000	0.000	1.000		NA
10138773	10138774	XALc_1949	XALc_1950			FALSE	0.243	297.000	0.000	0.098		NA
10138774	10138775	XALc_1950	XALc_1951			TRUE	0.662	81.000	0.053	1.000		NA
10138775	10138776	XALc_1951	XALc_1952			TRUE	0.995	-3.000	0.462	1.000		NA
10138776	10138777	XALc_1952	XALc_1953			FALSE	0.407	54.000	0.000	1.000		NA
10138777	10138778	XALc_1953	XALc_1954			FALSE	0.068	327.000	0.000	1.000		NA
10138778	10138779	XALc_1954	XALc_1955			FALSE	0.226	156.000	0.000	1.000		NA
10138781	10138782	XALc_1957	XALc_1958			TRUE	0.923	112.000	0.071	0.098	Y	NA
10138782	10138783	XALc_1958	XALc_1959			TRUE	0.634	107.000	0.071	NA		NA
10138783	10138784	XALc_1959	XALc_1960			FALSE	0.256	137.000	0.000	NA		NA
10138784	10138785	XALc_1960	XALc_1961			TRUE	0.949	-3.000	0.077	1.000	N	NA
10138785	10138786	XALc_1961	XALc_1962		dapA2	TRUE	0.966	2.000	0.044	0.051	N	NA
10138786	10138787	XALc_1962	XALc_1963	dapA2		TRUE	0.981	-3.000	0.133	1.000		NA
10138787	10138788	XALc_1963	XALc_1964			TRUE	0.996	-7.000	0.600	0.038		NA
10138788	10138789	XALc_1964	XALc_1965			TRUE	0.982	-3.000	0.143	1.000		NA
10138789	10138790	XALc_1965	XALc_1966			TRUE	0.990	-3.000	0.062	1.000	Y	NA
10138792	10138793	XALc_1968	XALc_1969			FALSE	0.371	101.000	0.000	NA		NA
10138793	10138794	XALc_1969	XALc_1970			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138795	10138796	XALc_1971	XALc_1972			FALSE	0.208	61.000	0.009	1.000	N	NA
10138796	10138797	XALc_1972	XALc_1973			FALSE	0.117	235.000	0.000	1.000		NA
10138797	10138798	XALc_1973	XALc_1974			FALSE	0.252	178.000	0.013	1.000		NA
10138798	10138799	XALc_1974	XALc_1975			TRUE	0.957	46.000	0.100	0.022	Y	NA
10138800	10138801	XALc_1976	XALc_1977			FALSE	0.046	431.000	0.000	1.000		NA
10138801	10138802	XALc_1977	XALc_1978			TRUE	0.962	-3.000	0.040	NA		NA
10138802	10138803	XALc_1978	XALc_1979			TRUE	0.956	-3.000	0.029	NA		NA
10138805	10138806	XALc_1981	XALc_1982		sseA	FALSE	0.322	143.000	0.012	NA		NA
10138806	10138807	XALc_1982	XALc_1983	sseA		TRUE	0.883	-3.000	0.021	1.000	N	NA
10138807	10138808	XALc_1983	XALc_1984			FALSE	0.303	115.000	0.028	1.000	N	NA
10138809	10138810	XALc_1985	XALc_1986			TRUE	0.903	14.000	0.160	NA		NA
10138810	10138811	XALc_1986	XALc_1987		nth	TRUE	0.922	-3.000	0.005	NA		NA
10138813	10138814	XALc_1989	XALc_1990	pstS2	pstS1	TRUE	0.703	250.000	0.000	0.002	Y	NA
10138814	10138815	XALc_1990	XALc_1991	pstS1	pstC	TRUE	0.805	233.000	0.033	0.002	Y	NA
10138815	10138816	XALc_1991	XALc_1992	pstC	pstA	TRUE	0.999	2.000	0.537	0.002	Y	NA
10138816	10138817	XALc_1992	XALc_1993	pstA	pstB	TRUE	0.998	8.000	0.526	0.002	Y	NA
10138817	10138818	XALc_1993	XALc_1994	pstB	phoU	TRUE	0.764	125.000	0.034	NA	Y	NA
10138818	10138819	XALc_1994	XALc_1995	phoU		FALSE	0.170	181.000	0.000	NA		NA
10138819	10138820	XALc_1995	XALc_1996			TRUE	0.889	5.000	0.029	NA		NA
10138820	10138821	XALc_1996	XALc_1997			TRUE	0.994	-7.000	0.914	NA		NA
10138821	10138822	XALc_1997	XALc_1998		rnt	TRUE	0.470	75.000	0.009	NA		NA
10138823	10138824	XALc_1999	XALc_2000	rlmB	rnr	TRUE	0.670	189.000	0.147	0.019	N	NA
10138824	10138825	XALc_2000	XALc_Yt44	rnr	tRNA-tRNA_Leu	FALSE	0.264	135.000	0.000	NA		NA
10138826	10138827	XALc_2002	XALc_Yt45		tRNA-tRNA_Leu	FALSE	0.397	90.000	0.000	NA		NA
10138830	10138831	XALc_2006	XALc_2007		emrB	FALSE	0.142	208.000	0.000	1.000		NA
10138831	10138832	XALc_2007	XALc_2008	emrB	emrA	TRUE	0.992	8.000	0.900	1.000		NA
10138832	10138833	XALc_2008	XALc_2009	emrA		TRUE	0.969	11.000	0.278	0.098	N	NA
10138833	10138834	XALc_2009	XALc_2010			TRUE	0.828	48.000	0.333	1.000	N	NA
10138835	10138836	XALc_2011	XALc_2012	pac	parC	FALSE	0.067	329.000	0.000	1.000		NA
10138839	10138840	XALc_2015	XALc_2016	asnB		FALSE	0.297	280.000	0.000	1.000	Y	NA
10138840	10138841	XALc_2016	XALc_2017			TRUE	0.574	174.000	0.292	1.000	N	NA
10138841	10138842	XALc_2017	XALc_2018		dapD	FALSE	0.337	140.000	0.061	1.000	N	NA
10138842	10138843	XALc_2018	XALc_2019	dapD	glnD	FALSE	0.103	168.000	0.012	1.000	N	NA
10138843	10138844	XALc_2019	XALc_2020	glnD	map	TRUE	0.899	6.000	0.128	1.000	N	NA
10138845	10138846	XALc_2021	XALc_2022			FALSE	0.024	757.000	0.000	NA		NA
10138846	10138847	XALc_2022	XALc_2023			TRUE	0.994	-3.000	0.444	NA		NA
10138847	10138848	XALc_2023	XALc_2024			TRUE	0.734	8.000	0.000	NA		NA
10138848	10138849	XALc_2024	XALc_2025			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10138849	10138850	XALc_2025	XALc_2026		rpsB	FALSE	0.011	286.000	0.000	NA	N	NA
10138850	10138851	XALc_2026	XALc_2027	rpsB	tsf	TRUE	0.962	148.000	0.748	1.000	Y	NA
10138851	10138852	XALc_2027	XALc_2028	tsf	pyrH	FALSE	0.260	529.000	0.416	1.000	N	NA
10138852	10138853	XALc_2028	XALc_2029	pyrH	frr	TRUE	0.767	190.000	0.626	1.000	N	NA
10138853	10138854	XALc_2029	XALc_2030	frr	uppS	TRUE	0.914	19.000	0.409	1.000	N	NA
10138854	10138855	XALc_2030	XALc_2031	uppS	cdsA	TRUE	0.998	-3.000	0.400	1.000	Y	NA
10138855	10138856	XALc_2031	XALc_2032	cdsA	dxr	TRUE	0.995	2.000	0.372	1.000	Y	NA
10138856	10138857	XALc_2032	XALc_2033	dxr		TRUE	0.921	27.000	0.568	1.000	N	NA
10138857	10138858	XALc_2033	XALc_2034			TRUE	0.785	83.000	0.007	1.000	Y	NA
10138858	10138859	XALc_2034	XALc_2035		lpxD	FALSE	0.350	247.000	0.000	1.000	Y	NA
10138859	10138860	XALc_2035	XALc_2036	lpxD	fabZ	TRUE	0.877	-3.000	0.019	1.000	N	NA
10138860	10138861	XALc_2036	XALc_2037	fabZ	lpxA	FALSE	0.405	23.000	0.022	1.000	N	NA
10138861	10138862	XALc_2037	XALc_2038	lpxA	lpxB	TRUE	0.943	48.000	0.289	1.000	Y	NA
10138862	10138863	XALc_2038	XALc_2039	lpxB	rnhB	TRUE	0.975	-3.000	0.186	1.000	N	NA
10138863	10138864	XALc_2039	XALc_2040	rnhB	dnaE	TRUE	0.742	169.000	0.104	1.000	Y	NA
10138864	10138865	XALc_2040	XALc_2041	dnaE	accA	FALSE	0.414	155.000	0.122	1.000	N	NA
10138867	10138868	XALc_2043	XALc_2044		phaZ	TRUE	0.626	31.000	0.034	NA		NA
10138868	10138869	XALc_2044	XALc_2045	phaZ		FALSE	0.056	118.000	0.000	NA	N	NA
10138869	10138870	XALc_2045	XALc_2046			FALSE	0.037	496.000	0.000	NA		NA
10138872	10138873	XALc_2048	XALc_2049	kdgT		FALSE	0.407	54.000	0.000	1.000		NA
10138874	10138875	XALc_2050	XALc_2051		rluF	TRUE	0.574	27.000	0.074	1.000	N	NA
10138875	10138876	XALc_2051	XALc_2052	rluF	deaD	TRUE	0.755	93.000	0.000	1.000	Y	NA
10138878	10138879	XALc_2054	XALc_2055			TRUE	0.778	37.000	0.138	NA		NA
10138879	10138880	XALc_2055	XALc_2056			FALSE	0.389	48.000	0.000	NA		NA
10138881	10138882	XALc_2057	XALc_2058	ogt	clcA	FALSE	0.025	210.000	0.000	1.000	N	NA
10138883	10138884	XALc_2059	XALc_2060			TRUE	0.960	113.000	1.000	NA		NA
10138884	10138885	XALc_2060	XALc_2061		zur	FALSE	0.346	109.000	0.000	NA		NA
10138885	10138886	XALc_2061	XALc_2062	zur	gltX	FALSE	0.378	17.000	0.012	1.000	N	NA
10138887	10138888	XALc_2063	XALc_2064			FALSE	0.252	139.000	0.000	NA		NA
10138888	10138889	XALc_2064	XALc_2065			FALSE	0.096	256.000	0.000	NA		NA
10138889	10138890	XALc_2065	XALc_2066		mfd	FALSE	0.281	136.000	0.002	1.000		NA
10138892	10138893	XALc_2068	XALc_2069	nfi		FALSE	0.109	236.000	0.000	NA		NA
10138895	10138896	XALc_2071	XALc_2072	cstA		TRUE	0.974	0.000	0.156	NA		NA
10138896	10138897	XALc_2072	XALc_2073			FALSE	0.103	246.000	0.000	NA		NA
10138897	10138898	XALc_2073	XALc_2074			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138898	10138899	XALc_2074	XALc_2075			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138899	10138900	XALc_2075	XALc_2076			FALSE	0.132	209.000	0.000	NA		NA
10138900	10138901	XALc_2076	XALc_2077		mutY	FALSE	0.065	146.000	0.004	1.000	N	NA
10138901	10138902	XALc_2077	XALc_2078	mutY		TRUE	0.658	54.000	0.150	NA	N	NA
10138903	10138904	XALc_2079	XALc_2080			FALSE	0.396	64.000	0.000	NA		NA
10138907	10138908	XALc_Yt46	XALc_2084	tRNA-tRNA_Ala		FALSE	0.049	383.000	0.000	NA		NA
10138908	10138909	XALc_2084	XALc_2085			FALSE	0.181	186.000	0.005	NA		NA
10138909	10138910	XALc_2085	XALc_2086		corC	TRUE	0.494	113.000	0.024	NA		NA
10138910	10138911	XALc_2086	XALc_2087	corC		TRUE	0.956	-3.000	0.029	NA		NA
10138911	10138912	XALc_2087	XALc_2088		corA	TRUE	0.729	38.000	0.095	NA		NA
10138913	10138914	XALc_2089	XALc_2090		potI	FALSE	0.269	141.000	0.038	1.000	N	NA
10138914	10138915	XALc_2090	XALc_2091	potI	potH	TRUE	0.997	-3.000	0.094	0.029	Y	NA
10138915	10138916	XALc_2091	XALc_2092	potH	potG	TRUE	0.997	-3.000	0.385	1.000	Y	NA
10138916	10138917	XALc_2092	XALc_2093	potG	potF	FALSE	0.204	369.000	0.000	1.000	Y	NA
10138917	10138918	XALc_2093	XALc_2094	potF		FALSE	0.301	276.000	0.000	1.000	Y	NA
10138918	10138919	XALc_2094	XALc_2095			TRUE	0.943	5.000	0.111	1.000		NA
10138920	10138921	XALc_2096	XALc_2097			TRUE	0.982	95.000	0.750	1.000	Y	NA
10138921	10138922	XALc_2097	XALc_2098			FALSE	0.404	307.000	0.375	1.000	N	NA
10138923	10138924	XALc_2099	XALc_2100			FALSE	0.100	92.000	0.000	1.000	N	NA
10138924	10138925	XALc_2100	XALc_2101			TRUE	0.994	-3.000	0.000	0.021	Y	NA
10138925	10138926	XALc_2101	XALc_2102			FALSE	0.077	287.000	0.000	NA		NA
10138926	10138927	XALc_2102	XALc_2103			TRUE	0.932	-10.000	0.114	NA		NA
10138927	10138928	XALc_2103	XALc_2104		FdhD	TRUE	0.998	-3.000	0.086	0.001	Y	NA
10138928	10138929	XALc_2104	XALc_2105	FdhD		FALSE	0.189	403.000	0.000	1.000	Y	NA
10138929	10138930	XALc_2105	XALc_2106			FALSE	0.111	242.000	0.000	1.000		NA
10138932	10138933	XALc_2108	XALc_2109		RhsA	FALSE	0.036	512.000	0.000	NA		NA
10138933	10138934	XALc_2109	XALc_2110	RhsA		FALSE	0.388	49.000	0.000	NA		NA
10138934	10138935	XALc_2110	XALc_2111			FALSE	0.187	170.000	0.000	NA		NA
10138935	10138936	XALc_2111	XALc_2112		RhsA	TRUE	0.850	2.000	0.000	NA		NA
10138936	10138937	XALc_2112	XALc_2113	RhsA		TRUE	0.726	-13.000	0.000	NA		NA
10138937	10138938	XALc_2113	XALc_2114			TRUE	0.620	-88.000	0.000	NA		NA
10138940	10138941	XALc_2116	XALc_2117			FALSE	0.034	531.000	0.000	NA		NA
10138941	10138942	XALc_2117	XALc_2118			FALSE	0.115	231.000	0.000	NA		NA
10138943	10138944	XALc_2119	XALc_2120			FALSE	0.259	141.000	0.000	1.000		NA
10138944	10138945	XALc_2120	XALc_2121			FALSE	0.430	72.000	0.006	NA		NA
10138945	10138946	XALc_2121	XALc_2122			TRUE	0.996	-3.000	0.642	NA		NA
10138947	10138948	XALc_2123	XALc_2124	hda		TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138948	10138949	XALc_2124	XALc_2125			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10138950	10138951	XALc_2126	XALc_2127	PurM		TRUE	0.722	-16.000	0.005	NA		NA
10138951	10138952	XALc_2127	XALc_2128		PurU	TRUE	0.498	56.000	0.014	NA		NA
10138952	10138953	XALc_2128	XALc_2129	PurU		TRUE	0.874	5.000	0.020	NA		NA
10138953	10138954	XALc_2129	XALc_2130			TRUE	0.996	3.000	1.000	NA		NA
10138954	10138955	XALc_2130	XALc_2131			FALSE	0.026	654.000	0.000	NA		NA
10138956	10138957	XALc_2132	XALc_2133		murA	TRUE	0.940	-3.000	0.013	NA		NA
10138957	10138958	XALc_2133	XALc_2134	murA		TRUE	0.621	50.000	0.129	NA	N	NA
10138959	10138960	XALc_2135	XALc_2136		kdsC	TRUE	0.942	91.000	0.598	1.000		NA
10138960	10138961	XALc_2136	XALc_2137	kdsC		TRUE	0.996	-3.000	0.617	NA		NA
10138961	10138962	XALc_2137	XALc_2138			TRUE	0.971	-22.000	0.459	NA		NA
10138962	10138963	XALc_2138	XALc_2139			TRUE	0.993	0.000	0.543	NA		NA
10138963	10138964	XALc_2139	XALc_2140		rpoN2	TRUE	0.799	41.000	0.163	1.000		NA
10138964	10138965	XALc_2140	XALc_2141	rpoN2		FALSE	0.449	47.000	0.050	NA	N	NA
10138965	10138966	XALc_2141	XALc_2142			FALSE	0.031	414.000	0.021	NA	N	NA
10138966	10138967	XALc_2142	XALc_2143			TRUE	0.985	-3.000	0.194	NA		NA
10138967	10138968	XALc_2143	XALc_2144			FALSE	0.380	257.000	0.171	NA		NA
10138968	10138969	XALc_2144	XALc_2145			TRUE	0.997	-7.000	0.261	0.001	Y	NA
10138969	10138970	XALc_2145	XALc_2146			TRUE	0.982	59.000	0.205	0.001	Y	NA
10138970	10138971	XALc_2146	XALc_2147			FALSE	0.196	184.000	0.042	1.000	N	NA
10138971	10138972	XALc_2147	XALc_2148			FALSE	0.396	97.000	0.000	1.000		NA
10138972	10138973	XALc_2148	XALc_2149			FALSE	0.105	250.000	0.000	1.000		NA
10138974	10138975	XALc_2150	XALc_2151			FALSE	0.013	301.000	0.000	1.000	N	NA
10138975	10138976	XALc_2151	XALc_2152			FALSE	0.320	629.000	0.000	0.009	Y	NA
10138976	10138977	XALc_2152	XALc_2153			FALSE	0.429	439.000	0.000	0.009	Y	NA
10138977	10138978	XALc_2153	XALc_2154			FALSE	0.024	834.000	0.000	1.000		NA
10138978	10138979	XALc_2154	XALc_2155		PyrB	FALSE	0.419	86.000	0.000	1.000		NA
10138979	10138980	XALc_2155	XALc_2156	PyrB		FALSE	0.451	19.000	0.022	1.000	N	NA
10138980	10138981	XALc_2156	XALc_2157			TRUE	0.955	-7.000	0.263	NA	N	NA
10138983	10138984	XALc_2159	XALc_2160	pilU	pilT	TRUE	0.981	125.000	0.436	0.016	Y	NA
10138985	10138986	XALc_2161	XALc_2162			FALSE	0.077	287.000	0.000	NA		NA
10138986	10138987	XALc_2162	XALc_2163		proC	FALSE	0.225	150.000	0.000	NA		NA
10138989	10138990	XALc_2165	XALc_2166	AroK	AroB	TRUE	0.995	-3.000	0.208	1.000	Y	NA
10138991	10138992	XALc_2167	XALc_2168			TRUE	0.465	0.000	0.000	NA	N	NA
10138992	10138993	XALc_2168	XALc_2169			TRUE	0.997	-3.000	1.000	NA	N	NA
10138994	10138995	XALc_2170	XALc_2171			TRUE	0.702	12.000	0.006	NA		NA
10138995	10138996	XALc_2171	XALc_2172			FALSE	0.102	89.000	0.000	1.000	N	NA
10138996	10138997	XALc_2172	XALc_2173			FALSE	0.370	301.000	0.000	0.003		NA
10138999	10139000	XALc_2175	XALc_2176			TRUE	0.988	-3.000	0.222	NA		NA
10139000	10139001	XALc_2176	XALc_2177			TRUE	0.873	12.000	0.080	NA		NA
10139003	10139004	XALc_2179	XALc_2180			FALSE	0.037	173.000	0.000	1.000	N	NA
10139004	10139005	XALc_2180	XALc_2181			FALSE	0.362	108.000	0.000	1.000		NA
10139005	10139006	XALc_2181	XALc_2182			FALSE	0.289	127.000	0.000	NA		NA
10139006	10139007	XALc_2182	XALc_2183			FALSE	0.081	280.000	0.000	NA		NA
10139008	10139009	XALc_2184	XALc_2185		metC	TRUE	0.989	-3.000	0.039	1.000	Y	NA
10139009	10139010	XALc_2185	XALc_2186	metC		TRUE	0.992	-3.000	0.087	1.000	Y	NA
10139011	10139012	XALc_2187	XALc_2188		prfC	FALSE	0.448	74.000	0.006	1.000		NA
10139012	10139013	XALc_2188	XALc_2189	prfC		FALSE	0.123	258.000	0.008	1.000		NA
10139014	10139015	XALc_2190	XALc_2191		wcaA	TRUE	0.893	-40.000	0.128	NA		NA
10139015	10139016	XALc_2191	XALc_2192	wcaA		FALSE	0.142	248.000	0.013	NA		NA
10139017	10139018	XALc_2193	XALc_2194	hsp33		FALSE	0.402	115.000	0.010	NA		NA
10139018	10139019	XALc_2194	XALc_2195			FALSE	0.116	230.000	0.000	NA		NA
10139023	10139024	XALc_2199	XALc_2200	betA		FALSE	0.010	357.000	0.000	1.000	N	NA
10139025	10139026	XALc_2201	XALc_2202			FALSE	0.091	265.000	0.000	NA		NA
10139028	10139029	XALc_2204	XALc_2205	gcvH	gcvT	TRUE	0.986	101.000	0.317	0.001	Y	NA
10139029	10139030	XALc_2205	XALc_2206	gcvT		FALSE	0.029	268.000	0.008	NA	N	NA
10139030	10139031	XALc_2206	XALc_2207		hflC	TRUE	0.992	4.000	0.313	NA	Y	NA
10139031	10139032	XALc_2207	XALc_2209	hflC	mazG	FALSE	0.047	428.000	0.000	1.000		NA
10139032	10139033	XALc_2209	XALc_2210	mazG	cysQ	FALSE	0.365	120.000	0.007	1.000		NA
10139033	10139034	XALc_2210	XALc_2211	cysQ		TRUE	0.989	-3.000	0.373	1.000	N	NA
10139035	10139036	XALc_2212	XALc_2213			TRUE	0.898	-9.000	0.041	NA		NA
10139036	10139037	XALc_2213	XALc_2214			FALSE	0.043	433.000	0.000	NA		NA
10139039	10139040	XALc_2216	XALc_2217			TRUE	0.909	99.000	0.600	1.000	N	NA
10139040	10139041	XALc_2217	XALc_2218			TRUE	0.996	-3.000	0.214	0.008		NA
10139041	10139042	XALc_2218	XALc_2219			TRUE	0.954	54.000	0.286	0.008		NA
10139042	10139043	XALc_2219	XALc_2220			TRUE	0.994	17.000	0.417	0.008	Y	NA
10139043	10139044	XALc_2220	XALc_2221			TRUE	0.990	30.000	0.500	0.018	Y	NA
10139044	10139045	XALc_2221	XALc_2222			TRUE	0.912	50.000	0.429	1.000		NA
10139045	10139046	XALc_2222	XALc_2223			TRUE	0.977	46.000	0.600	0.029		NA
10139046	10139047	XALc_2223	XALc_2224			TRUE	0.947	58.000	0.300	1.000	Y	NA
10139047	10139048	XALc_2224	XALc_2225			FALSE	0.006	402.000	0.000	NA	N	NA
10139051	10139052	XALc_2228	XALc_2229	cutC		TRUE	0.921	-3.000	0.038	1.000	N	NA
10139053	10139054	XALc_2230	XALc_2231	mutS	cobW	FALSE	0.042	462.000	0.000	1.000		NA
10139054	10139055	XALc_2231	XALc_2232	cobW		TRUE	0.966	-3.000	0.051	NA		NA
10139055	10139056	XALc_2232	XALc_2233			FALSE	0.225	150.000	0.000	NA		NA
10139056	10139057	XALc_2233	XALc_2234			TRUE	0.981	-13.000	0.500	NA		NA
10139058	10139059	XALc_2235	XALc_2236			FALSE	0.256	137.000	0.000	NA		NA
10139059	10139060	XALc_2236	XALc_2237			TRUE	0.931	44.000	0.167	0.009		NA
10139060	10139061	XALc_2237	XALc_2238		pilL	TRUE	0.968	-13.000	0.054	0.011		NA
10139061	10139062	XALc_2238	XALc_2239	pilL	pilJ	TRUE	0.988	112.000	0.554	0.011	Y	NA
10139062	10139063	XALc_2239	XALc_2240	pilJ	pilI	TRUE	0.995	41.000	0.795	0.009	Y	NA
10139063	10139064	XALc_2240	XALc_2241	pilI	pilH	TRUE	0.964	2.000	0.000	1.000	Y	NA
10139064	10139065	XALc_2241	XALc_2242	pilH	pilG	TRUE	0.951	17.000	0.000	0.021	Y	NA
10139066	10139067	XALc_2243	XALc_2244	RimK	TonB	TRUE	0.954	-3.000	0.089	1.000	N	NA
10139067	10139068	XALc_2244	XALc_2245	TonB		FALSE	0.130	323.000	0.000	0.095	N	NA
10139069	10139070	XALc_2246	XALc_2247		DinG	FALSE	0.204	225.000	0.082	1.000	N	NA
10139070	10139071	XALc_2247	XALc_2248	DinG		FALSE	0.081	287.000	0.000	1.000		NA
10139071	10139072	XALc_2248	XALc_2249			TRUE	0.710	17.000	0.021	1.000		NA
10139074	10139075	XALc_2251	XALc_2252		SpoT	TRUE	0.568	126.000	0.065	1.000		NA
10139076	10139077	XALc_2253	XALc_2254			TRUE	0.668	12.000	0.000	NA		NA
10139079	10139080	XALc_2256	XALc_2257		RecQ	FALSE	0.117	114.000	0.005	1.000	N	NA
10139080	10139081	XALc_2257	XALc_2258	RecQ		FALSE	0.220	183.000	0.011	NA		NA
10139082	10139083	XALc_Yt47	XALc_2260	tRNA-tRNA_Gly		FALSE	0.095	257.000	0.000	NA		NA
10139084	10139085	XALc_2261	XALc_2262	ThiS	ThiG	TRUE	0.773	65.000	0.006	1.000	Y	NA
10139085	10139086	XALc_2262	XALc_2263	ThiG		TRUE	0.872	11.000	0.060	1.000		NA
10139086	10139087	XALc_2263	XALc_2264			TRUE	0.464	103.000	0.012	1.000		NA
10139089	10139090	XALc_2266	XALc_2267			TRUE	0.935	114.000	0.667	NA		NA
10139090	10139091	XALc_2267	XALc_2268			FALSE	0.169	110.000	0.008	1.000	N	NA
10139091	10139092	XALc_2268	XALc_2269			FALSE	0.033	184.000	0.000	1.000	N	NA
10139092	10139093	XALc_2269	XALc_2270			FALSE	0.321	120.000	0.000	1.000		NA
10139093	10139094	XALc_2270	XALc_2271			TRUE	0.927	75.000	0.500	NA		NA
10139094	10139095	XALc_2271	XALc_2272			TRUE	0.589	-324.000	0.000	NA		NA
10139096	10139097	XALc_2273	XALc_2274			TRUE	0.925	25.000	0.100	0.011		NA
10139097	10139098	XALc_2274	XALc_2275			FALSE	0.426	30.000	0.000	NA		NA
10139100	10139101	XALc_2277	XALc_2278			FALSE	0.414	37.000	0.000	NA		NA
10139103	10139104	XALc_2280	XALc_2281			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10139104	10139105	XALc_2281	XALc_2282			TRUE	0.583	-2506.000	0.000	NA		NA
10139105	10139106	XALc_2282	XALc_2283			FALSE	0.194	167.000	0.000	NA		NA
10139106	10139107	XALc_2283	XALc_2284			FALSE	0.024	772.000	0.000	NA		NA
10139107	10139108	XALc_2284	XALc_2285			TRUE	0.698	-16.000	0.000	NA		NA
10139110	10139111	XALc_2287	XALc_2288			TRUE	0.734	8.000	0.000	NA		NA
10139113	10139114	XALc_2290	XALc_2291			TRUE	0.906	22.000	0.300	NA		NA
10139114	10139115	XALc_2291	XALc_2292			FALSE	0.005	519.000	0.000	NA	N	NA
10139116	10139117	XALc_2293	XALc_2294			TRUE	0.976	-3.000	0.195	1.000	N	NA
10139117	10139118	XALc_2294	XALc_2295			FALSE	0.036	509.000	0.000	NA		NA
10139119	10139120	XALc_2296	XALc_2297	CysN		TRUE	0.993	0.000	0.203	0.001	N	NA
10139124	10139125	XALc_2301	XALc_2302			FALSE	0.026	630.000	0.000	NA		NA
10139125	10139126	XALc_2302	XALc_2303			FALSE	0.031	565.000	0.000	NA		NA
10139126	10139127	XALc_2303	XALc_2304			FALSE	0.173	215.000	0.009	1.000		NA
10139127	10139128	XALc_2304	XALc_2305			TRUE	0.922	-3.000	0.004	1.000		NA
10139128	10139129	XALc_2305	XALc_2306			TRUE	0.566	359.000	0.015	0.005	Y	NA
10139130	10139131	XALc_2307	XALc_2308			FALSE	0.113	233.000	0.000	NA		NA
10139131	10139132	XALc_2308	XALc_2309		ArsR	FALSE	0.115	20.000	0.000	NA	N	NA
10139132	10139133	XALc_2309	XALc_2310	ArsR		TRUE	0.917	-3.000	0.000	1.000		NA
10139133	10139134	XALc_2310	XALc_2311		modA	FALSE	0.372	135.000	0.014	1.000		NA
10139134	10139135	XALc_2311	XALc_2312	modA	modB	TRUE	0.999	9.000	0.627	0.001	Y	NA
10139135	10139136	XALc_2312	XALc_2313	modB	modC	TRUE	0.663	29.000	0.041	1.000		NA
10139136	10139137	XALc_2313	XALc_2314	modC		FALSE	0.223	151.000	0.000	NA		NA
10139138	10139139	XALc_2315	XALc_2316		blaR1	TRUE	0.998	-3.000	1.000	NA		NA
10139139	10139140	XALc_2316	XALc_2317	blaR1	bla1	TRUE	0.997	-10.000	0.833	1.000	Y	NA
10139141	10139142	XALc_2318	XALc_2319			FALSE	0.251	239.000	0.053	NA		NA
10139142	10139143	XALc_2319	XALc_2320			TRUE	0.646	144.000	0.167	NA		NA
10139144	10139145	XALc_2321	XALc_2323			FALSE	0.004	777.000	0.000	1.000	N	NA
10139145	10139146	XALc_2323	XALc_2324			TRUE	0.916	45.000	0.182	0.049		NA
10139146	10139147	XALc_2324	XALc_2325			TRUE	0.601	-159.000	0.000	NA		NA
10139147	10139148	XALc_2325	XALc_2326			FALSE	0.404	86.000	0.000	NA		NA
10139148	10139149	XALc_2326	XALc_2327			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139149	10139150	XALc_2327	XALc_2328			FALSE	0.184	171.000	0.000	NA		NA
10139150	10139151	XALc_2328	XALc_2329			FALSE	0.101	247.000	0.000	NA		NA
10139151	10139152	XALc_2329	XALc_2330			TRUE	0.793	5.000	0.000	NA		NA
10139152	10139153	XALc_2330	XALc_2331			FALSE	0.357	104.000	0.000	NA		NA
10139153	10139154	XALc_2331	XALc_2332			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139155	10139156	XALc_2333	XALc_2334			TRUE	0.896	11.000	0.098	NA		NA
10139156	10139157	XALc_2334	XALc_2335			TRUE	0.997	-3.000	0.679	NA		NA
10139157	10139158	XALc_2335	XALc_2336			TRUE	0.990	-10.000	0.717	NA		NA
10139160	10139161	XALc_2338	XALc_2339			FALSE	0.031	562.000	0.000	NA		NA
10139162	10139163	XALc_2340	XALc_2341			TRUE	0.608	-111.000	0.000	NA		NA
10139165	10139166	XALc_2343	XALc_2344			TRUE	0.995	-3.000	0.500	NA		NA
10139166	10139167	XALc_2344	XALc_2345			TRUE	0.963	-3.000	0.041	NA		NA
10139167	10139168	XALc_2345	XALc_2346			TRUE	0.951	0.000	0.055	NA		NA
10139168	10139169	XALc_2346	XALc_2347			TRUE	0.991	-3.000	0.308	NA		NA
10139169	10139170	XALc_2347	XALc_2348			TRUE	0.656	69.000	0.060	NA		NA
10139170	10139171	XALc_2348	XALc_2349		pilQ	FALSE	0.361	142.000	0.017	1.000		NA
10139171	10139172	XALc_2349	XALc_2350	pilQ	PilP	TRUE	0.999	-3.000	0.668	NA	Y	NA
10139172	10139173	XALc_2350	XALc_2351	PilP	pilO	TRUE	0.999	-3.000	0.680	NA	Y	NA
10139173	10139174	XALc_2351	XALc_2352	pilO	pilN	TRUE	0.999	-3.000	0.770	NA	Y	NA
10139174	10139175	XALc_2352	XALc_2353	pilN	pilM	TRUE	0.998	0.000	0.616	NA	Y	NA
10139176	10139177	XALc_2354	XALc_2355			FALSE	0.353	183.000	0.050	NA		NA
10139178	10139179	XALc_2356	XALc_2357	GltA	RpmE	FALSE	0.019	290.000	0.004	1.000	N	NA
10139179	10139180	XALc_2357	XALc_2358	RpmE		FALSE	0.044	430.000	0.000	NA		NA
10139181	10139182	XALc_2359	XALc_2360		VirB6	FALSE	0.121	225.000	0.000	NA		NA
10139182	10139183	XALc_2360	XALc_2361	VirB6		FALSE	0.082	278.000	0.000	NA		NA
10139184	10139185	XALc_2362	XALc_2363			TRUE	0.605	-147.000	0.000	NA		NA
10139186	10139187	XALc_2364	XALc_2365			TRUE	0.629	-60.000	0.000	NA		NA
10139187	10139188	XALc_2365	XALc_2366			FALSE	0.357	110.000	0.000	1.000		NA
10139188	10139189	XALc_2366	XALc_2367			TRUE	0.993	0.000	0.021	0.013	Y	NA
10139189	10139190	XALc_2367	XALc_2368			FALSE	0.369	26.000	0.021	1.000	N	NA
10139190	10139191	XALc_2368	XALc_2369			TRUE	0.958	18.000	0.500	1.000		NA
10139191	10139192	XALc_2369	XALc_2370		RhtB	TRUE	0.747	37.000	0.103	1.000		NA
10139192	10139193	XALc_2370	XALc_2371	RhtB	MetA	TRUE	0.781	68.000	0.008	1.000	Y	NA
10139193	10139194	XALc_2371	XALc_2372	MetA		TRUE	0.787	79.000	0.008	1.000	Y	NA
10139194	10139195	XALc_2372	XALc_2373			FALSE	0.420	85.000	0.000	1.000		NA
10139195	10139196	XALc_2373	XALc_2374			TRUE	0.979	-3.000	0.000	0.049		NA
10139197	10139198	XALc_2375	XALc_2376			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139198	10139199	XALc_2376	XALc_2377			FALSE	0.134	208.000	0.000	NA		NA
10139199	10139200	XALc_2377	XALc_2378			FALSE	0.389	48.000	0.000	NA		NA
10139200	10139201	XALc_2378	XALc_2379			FALSE	0.012	268.000	0.000	NA	N	NA
10139201	10139202	XALc_2379	XALc_2380			FALSE	0.372	104.000	0.000	1.000		NA
10139202	10139203	XALc_2380	XALc_2381			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139203	10139204	XALc_2381	XALc_2382			FALSE	0.086	271.000	0.000	NA		NA
10139204	10139205	XALc_2382	XALc_2383			TRUE	0.986	-3.000	0.200	NA		NA
10139205	10139206	XALc_2383	XALc_2384			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10139206	10139207	XALc_2384	XALc_2385			TRUE	0.989	-3.000	0.250	NA		NA
10139207	10139208	XALc_2385	XALc_2386			TRUE	0.994	-3.000	0.417	NA		NA
10139209	10139210	XALc_2387	XALc_2388			FALSE	0.332	114.000	0.000	NA		NA
10139210	10139211	XALc_2388	XALc_2389			FALSE	0.409	39.000	0.000	NA		NA
10139211	10139212	XALc_2389	XALc_2390			TRUE	0.983	-3.000	0.156	NA		NA
10139212	10139213	XALc_2390	XALc_2391			FALSE	0.309	145.000	0.011	NA		NA
10139213	10139214	XALc_2391	XALc_2392			TRUE	0.827	5.000	0.007	NA		NA
10139214	10139215	XALc_2392	XALc_2393			TRUE	0.991	-7.000	0.667	NA		NA
10139215	10139216	XALc_2393	XALc_2394			FALSE	0.190	169.000	0.000	NA		NA
10139217	10139218	XALc_2395	XALc_2396			FALSE	0.207	159.000	0.000	NA		NA
10139219	10139220	XALc_2397	XALc_2398			FALSE	0.097	253.000	0.000	NA		NA
10139220	10139221	XALc_2398	XALc_2399			TRUE	0.726	-13.000	0.000	NA		NA
10139221	10139222	XALc_2399	XALc_2400			FALSE	0.399	89.000	0.000	NA		NA
10139222	10139223	XALc_2400	XALc_2401			FALSE	0.292	126.000	0.000	NA		NA
10139224	10139225	XALc_2402	XALc_2403			TRUE	0.635	-52.000	0.000	NA		NA
10139225	10139226	XALc_2403	XALc_2404			FALSE	0.432	28.000	0.000	NA		NA
10139227	10139228	XALc_2405	XALc_2406			FALSE	0.039	465.000	0.000	NA		NA
10139229	10139230	XALc_2407	XALc_2408			FALSE	0.215	156.000	0.000	NA		NA
10139230	10139231	XALc_2408	XALc_2409		RhsA	TRUE	0.587	16.000	0.000	NA		NA
10139231	10139232	XALc_2409	XALc_2410	RhsA		TRUE	0.981	-13.000	0.500	NA		NA
10139235	10139236	XALc_2413	XALc_2414			TRUE	0.625	-61.000	0.000	NA		NA
10139239	10139240	XALc_2417	XALc_Yt48		tRNA-tRNA_Lys	FALSE	0.027	611.000	0.000	NA		NA
10139240	10139241	XALc_Yt48	XALc_2419	tRNA-tRNA_Lys	exsB	FALSE	0.395	65.000	0.000	NA		NA
10139241	10139242	XALc_2419	XALc_2420	exsB	NrdG	TRUE	0.832	107.000	0.270	1.000		NA
10139242	10139243	XALc_2420	XALc_2421	NrdG		TRUE	0.661	50.000	0.059	1.000		NA
10139243	10139244	XALc_2421	XALc_2422		pal	TRUE	0.857	49.000	0.278	1.000		NA
10139244	10139245	XALc_2422	XALc_2423	pal	tolB	TRUE	0.911	69.000	0.592	1.000	N	NA
10139245	10139246	XALc_2423	XALc_2424	tolB	tolA	TRUE	0.606	180.000	0.215	NA		NA
10139246	10139247	XALc_2424	XALc_2425	tolA	tolR	TRUE	0.982	-10.000	0.460	NA		NA
10139247	10139248	XALc_2425	XALc_2426	tolR	tolQ	TRUE	0.990	38.000	0.556	0.036	Y	NA
10139248	10139249	XALc_2426	XALc_2427	tolQ	FcbC	TRUE	0.996	-3.000	0.593	1.000		NA
10139249	10139250	XALc_2427	XALc_2428	FcbC	RuvB	TRUE	0.703	62.000	0.082	1.000		NA
10139250	10139251	XALc_2428	XALc_2429	RuvB		FALSE	0.069	152.000	0.005	1.000	N	NA
10139251	10139252	XALc_2429	XALc_2430		RuvA	FALSE	0.169	61.000	0.007	1.000	N	NA
10139252	10139253	XALc_2430	XALc_2431	RuvA	RuvC	TRUE	0.970	164.000	0.451	0.009	Y	NA
10139253	10139254	XALc_2431	XALc_2432	RuvC		TRUE	0.856	57.000	0.277	NA		NA
10139254	10139255	XALc_2432	XALc_2433			FALSE	0.438	80.000	0.006	NA		NA
10139255	10139256	XALc_2433	XALc_2434			TRUE	0.467	158.000	0.075	NA		NA
10139256	10139257	XALc_2434	XALc_2435		AspRS	FALSE	0.060	348.000	0.000	1.000		NA
10139257	10139258	XALc_2435	XALc_2436	AspRS		FALSE	0.264	187.000	0.020	1.000		NA
10139258	10139259	XALc_2436	XALc_2437			FALSE	0.411	91.000	0.000	1.000		NA
10139265	10139266	XALc_2443	XALc_2444			TRUE	0.652	41.000	0.046	1.000		NA
10139266	10139267	XALc_2444	XALc_2445			FALSE	0.418	34.000	0.000	NA		NA
10139267	10139268	XALc_2445	XALc_2446		SlpA	TRUE	0.577	136.000	0.098	NA		NA
10139269	10139270	XALc_2447	XALc_2448			TRUE	0.982	117.000	1.000	NA	Y	NA
10139271	10139272	XALc_2449	XALc_2450			FALSE	0.332	114.000	0.000	NA		NA
10139272	10139273	XALc_2450	XALc_2451		GltT	TRUE	0.941	-3.000	0.012	1.000		NA
10139274	10139275	XALc_2452	XALc_2453		XseB	FALSE	0.169	32.000	0.006	1.000	N	NA
10139275	10139276	XALc_2453	XALc_2454	XseB	IspA	TRUE	0.920	-10.000	0.177	1.000	N	NA
10139277	10139278	XALc_2455	XALc_2456		pmbA	FALSE	0.407	107.000	0.008	NA		NA
10139280	10139281	XALc_2458	XALc_2459	tldD		TRUE	0.640	56.000	0.050	NA		NA
10139281	10139282	XALc_2459	XALc_2460		CafA	TRUE	0.790	131.000	0.296	NA		NA
10139282	10139283	XALc_2460	XALc_2461	CafA		TRUE	0.985	0.000	0.417	NA	N	NA
10139287	10139288	XALc_2465	XALc_2466			TRUE	0.953	25.000	0.436	0.091	N	NA
10139288	10139289	XALc_2466	XALc_2467			FALSE	0.389	51.000	0.000	NA		NA
10139289	10139290	XALc_2467	XALc_2468			FALSE	0.389	51.000	0.000	NA		NA
10139290	10139291	XALc_2468	XALc_2469			FALSE	0.100	68.000	0.000	1.000	N	NA
10139291	10139292	XALc_2469	XALc_2470			TRUE	0.811	-7.000	0.000	1.000		NA
10139292	10139293	XALc_2470	XALc_2471			TRUE	0.534	232.000	0.000	0.001		NA
10139293	10139294	XALc_2471	XALc_2472			FALSE	0.028	597.000	0.000	NA		NA
10139294	10139295	XALc_2472	XALc_2473			FALSE	0.025	702.000	0.000	NA		NA
10139295	10139296	XALc_2473	XALc_2474			FALSE	0.036	505.000	0.000	NA		NA
10139296	10139297	XALc_2474	XALc_2475			TRUE	0.475	23.000	0.000	NA		NA
10139297	10139298	XALc_2475	XALc_2476			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139298	10139299	XALc_2476	XALc_2477		nadD	TRUE	0.626	56.000	0.044	NA		NA
10139299	10139300	XALc_2477	XALc_2478	nadD	holA	FALSE	0.121	117.000	0.006	1.000	N	NA
10139300	10139301	XALc_2478	XALc_2479	holA		TRUE	0.682	105.000	0.199	NA	N	NA
10139301	10139302	XALc_2479	XALc_2480			TRUE	0.563	135.000	0.182	NA	N	NA
10139302	10139303	XALc_2480	XALc_2481			FALSE	0.255	146.000	0.005	NA		NA
10139304	10139305	XALc_2482	XALc_2483			FALSE	0.090	267.000	0.000	NA		NA
10139305	10139306	XALc_2483	XALc_2484			TRUE	0.909	2.000	0.020	NA		NA
10139306	10139307	XALc_2484	XALc_2485			TRUE	0.596	86.000	0.032	NA		NA
10139309	10139310	XALc_2487	XALc_2488		metS	FALSE	0.188	227.000	0.019	NA		NA
10139310	10139311	XALc_2488	XALc_2489	metS		TRUE	0.491	79.000	0.055	1.000	N	NA
10139311	10139312	XALc_2489	XALc_2490		rnfB	FALSE	0.070	225.000	0.014	1.000	N	NA
10139312	10139313	XALc_2490	XALc_2491	rnfB		FALSE	0.402	80.000	0.000	NA		NA
10139313	10139314	XALc_2491	XALc_2492			TRUE	0.863	89.000	0.286	NA		NA
10139314	10139315	XALc_2492	XALc_2493		rpoE2	TRUE	0.637	59.000	0.048	NA		NA
10139315	10139316	XALc_2493	XALc_2494	rpoE2		TRUE	0.993	-3.000	0.349	NA		NA
10139316	10139317	XALc_2494	XALc_2495			FALSE	0.041	441.000	0.000	NA		NA
10139317	10139318	XALc_2495	XALc_2496			TRUE	0.966	-3.000	0.047	1.000		NA
10139318	10139319	XALc_2496	XALc_2497			TRUE	0.997	-3.000	0.722	NA		NA
10139319	10139320	XALc_2497	XALc_2498		cfa	TRUE	0.967	-3.000	0.053	NA		NA
10139320	10139321	XALc_2498	XALc_2499	cfa		TRUE	0.974	-3.000	0.087	NA		NA
10139321	10139322	XALc_2499	XALc_2500			TRUE	0.978	-3.000	0.113	NA		NA
10139322	10139323	XALc_2500	XALc_2501			TRUE	0.913	23.000	0.324	1.000		NA
10139326	10139327	XALc_2504	XALc_2505			TRUE	0.516	133.000	0.056	NA		NA
10139327	10139328	XALc_2505	XALc_2506			FALSE	0.197	166.000	0.000	NA		NA
10139329	10139330	XALc_2507	XALc_2508	nemA		FALSE	0.190	174.000	0.000	1.000		NA
10139330	10139331	XALc_2508	XALc_2509			FALSE	0.053	359.000	0.000	NA		NA
10139331	10139332	XALc_2509	XALc_2510			TRUE	0.794	17.000	0.062	NA		NA
10139332	10139333	XALc_2510	XALc_2511			FALSE	0.394	73.000	0.000	NA		NA
10139336	10139337	XALc_2514	XALc_2515			TRUE	0.601	-159.000	0.000	NA		NA
10139339	10139340	XALc_2517	XALc_2518			TRUE	0.986	0.000	0.312	NA		NA
10139340	10139341	XALc_2518	XALc_2519			FALSE	0.394	73.000	0.000	NA		NA
10139344	10139345	XALc_2522	XALc_2523	cysK		FALSE	0.126	581.000	0.000	1.000	Y	NA
10139347	10139348	XALc_2525	XALc_2526	atoB		FALSE	0.301	123.000	0.000	NA		NA
10139348	10139349	XALc_2526	XALc_2527			FALSE	0.050	373.000	0.000	NA		NA
10139349	10139350	XALc_2527	XALc_2528			FALSE	0.317	118.000	0.000	NA		NA
10139350	10139351	XALc_2528	XALc_2529			FALSE	0.063	109.000	0.000	NA	N	NA
10139351	10139352	XALc_2529	XALc_2530			TRUE	0.997	-3.000	0.750	NA		NA
10139352	10139353	XALc_2530	XALc_2531			FALSE	0.024	745.000	0.000	NA		NA
10139354	10139355	XALc_2532	XALc_2533			TRUE	0.963	72.000	0.067	0.002	Y	NA
10139355	10139356	XALc_2533	XALc_2534		nagZ	TRUE	0.876	0.000	0.034	1.000	N	NA
10139356	10139357	XALc_2534	XALc_2535	nagZ		FALSE	0.163	90.000	0.006	1.000	N	NA
10139357	10139358	XALc_2535	XALc_2536			TRUE	0.546	96.000	0.021	1.000		NA
10139358	10139359	XALc_2536	XALc_2537		rumA	FALSE	0.309	138.000	0.007	1.000		NA
10139361	10139362	XALc_2539	XALc_2540	recO	era	FALSE	0.163	233.000	0.012	1.000		NA
10139362	10139363	XALc_2540	XALc_2541	era	rnc	TRUE	0.986	-3.000	0.017	0.028		NA
10139363	10139364	XALc_2541	XALc_2542	rnc		TRUE	0.799	-13.000	0.013	NA		NA
10139364	10139365	XALc_2542	XALc_2543		lepB	TRUE	0.734	21.000	0.053	NA		NA
10139365	10139366	XALc_2543	XALc_2544	lepB	lepA	TRUE	0.623	122.000	0.187	1.000	N	NA
10139366	10139367	XALc_2544	XALc_2545	lepA		FALSE	0.077	157.000	0.007	1.000	N	NA
10139367	10139368	XALc_2545	XALc_2546			FALSE	0.366	102.000	0.035	NA	N	NA
10139368	10139369	XALc_2546	XALc_2547		rpoE1	TRUE	0.995	-3.000	0.705	NA	N	NA
10139371	10139372	XALc_2549	XALc_2550			FALSE	0.299	124.000	0.000	NA		NA
10139373	10139374	XALc_2551	XALc_2552			FALSE	0.032	551.000	0.000	NA		NA
10139374	10139375	XALc_2552	XALc_2553			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139375	10139376	XALc_2553	XALc_2554			FALSE	0.024	769.000	0.000	NA		NA
10139376	10139377	XALc_2554	XALc_2555		raxA2	TRUE	0.989	-3.000	0.250	NA		NA
10139377	10139378	XALc_2555	XALc_2556	raxA2		FALSE	0.132	209.000	0.000	NA		NA
10139378	10139379	XALc_2556	XALc_2557			FALSE	0.392	54.000	0.000	NA		NA
10139379	10139380	XALc_2557	XALc_2558			FALSE	0.092	262.000	0.000	NA		NA
10139380	10139381	XALc_2558	XALc_2559			FALSE	0.072	301.000	0.000	NA		NA
10139381	10139382	XALc_2559	XALc_2560			TRUE	0.869	16.000	0.000	0.044		NA
10139382	10139383	XALc_2560	XALc_2561			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139383	10139384	XALc_2561	XALc_2562			FALSE	0.327	115.000	0.000	NA		NA
10139384	10139385	XALc_2562	XALc_2563		raxB2	FALSE	0.056	351.000	0.000	NA		NA
10139386	10139387	XALc_2564	XALc_2565			TRUE	0.878	6.000	0.031	NA		NA
10139387	10139388	XALc_2565	XALc_2566			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139388	10139389	XALc_2566	XALc_2567			FALSE	0.418	34.000	0.000	NA		NA
10139389	10139390	XALc_2567	XALc_2568		pepN	FALSE	0.115	231.000	0.000	NA		NA
10139390	10139391	XALc_2568	XALc_2569	pepN	tzs	FALSE	0.100	65.000	0.000	1.000	N	NA
10139391	10139392	XALc_2569	XALc_2570	tzs		TRUE	0.996	-3.000	0.600	NA		NA
10139392	10139393	XALc_2570	XALc_2571		ubiE	FALSE	0.045	415.000	0.000	NA		NA
10139395	10139396	XALc_2573	XALc_2574	hslU	hslV	TRUE	0.949	176.000	0.752	1.000	Y	NA
10139396	10139397	XALc_2574	XALc_2575	hslV	xerC	FALSE	0.042	341.000	0.020	1.000	N	NA
10139397	10139398	XALc_2575	XALc_2576	xerC		TRUE	0.955	81.000	0.714	NA		NA
10139398	10139399	XALc_2576	XALc_2577		dapF	TRUE	0.984	-3.000	0.175	NA		NA
10139399	10139400	XALc_2577	XALc_2578	dapF	ptrB	FALSE	0.177	432.000	0.000	1.000	Y	NA
10139402	10139403	XALc_2580	XALc_2581			TRUE	0.592	68.000	0.034	NA		NA
10139404	10139405	XALc_2582	XALc_2583	blc1		FALSE	0.072	99.000	0.000	NA	N	NA
10139408	10139409	XALc_2586	XALc_2587	hemC		FALSE	0.394	59.000	0.032	1.000	N	NA
10139409	10139410	XALc_2587	XALc_2588			FALSE	0.372	104.000	0.000	1.000		NA
10139410	10139411	XALc_2588	XALc_2589		opgH	FALSE	0.409	39.000	0.000	NA		NA
10139411	10139412	XALc_2589	XALc_2590	opgH		FALSE	0.008	340.000	0.000	NA	N	NA
10139413	10139414	XALc_2591	XALc_2592	glgA	glgB	TRUE	0.745	98.000	0.000	1.000	Y	NA
10139414	10139415	XALc_2592	XALc_2593	glgB		TRUE	0.909	161.000	0.093	0.007	Y	NA
10139415	10139416	XALc_2593	XALc_2594		glgY	TRUE	0.998	-3.000	0.141	0.007	Y	NA
10139416	10139417	XALc_2594	XALc_2595	glgY		TRUE	0.768	15.000	0.031	NA		NA
10139417	10139418	XALc_2595	XALc_2596		glgX	TRUE	0.955	13.000	0.333	NA		NA
10139419	10139420	XALc_2597	XALc_2598			FALSE	0.447	187.000	0.111	NA		NA
10139420	10139421	XALc_2598	XALc_2599			TRUE	0.997	-15.000	0.556	0.081	Y	NA
10139421	10139422	XALc_2599	XALc_2600			FALSE	0.010	356.000	0.000	1.000	N	NA
10139422	10139423	XALc_2600	XALc_2601			TRUE	0.972	12.000	0.615	1.000	N	NA
10139425	10139426	XALc_2603	XALc_2604			FALSE	0.343	110.000	0.000	NA		NA
10139426	10139427	XALc_2604	XALc_2605			FALSE	0.022	901.000	0.000	NA		NA
10139427	10139428	XALc_2605	XALc_2606			TRUE	0.966	14.000	0.182	0.047		NA
10139428	10139429	XALc_2606	XALc_2607			FALSE	0.388	49.000	0.000	NA		NA
10139431	10139432	XALc_2609	XALc_2610			FALSE	0.050	376.000	0.000	NA		NA
10139432	10139433	XALc_2610	XALc_2611			FALSE	0.299	124.000	0.000	NA		NA
10139433	10139434	XALc_2611	XALc_2612			TRUE	0.793	5.000	0.000	NA		NA
10139434	10139435	XALc_2612	XALc_2613			FALSE	0.357	104.000	0.000	NA		NA
10139435	10139436	XALc_2613	XALc_2614			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139436	10139437	XALc_2614	XALc_2615			FALSE	0.061	334.000	0.000	NA		NA
10139437	10139438	XALc_2615	XALc_2616			TRUE	0.986	-3.000	0.200	NA		NA
10139438	10139439	XALc_2616	XALc_2617			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10139439	10139440	XALc_2617	XALc_2618			TRUE	0.983	-3.000	0.167	NA		NA
10139440	10139441	XALc_2618	XALc_2619			TRUE	0.994	-3.000	0.417	NA		NA
10139442	10139443	XALc_2620	XALc_2621			FALSE	0.029	584.000	0.000	NA		NA
10139443	10139444	XALc_2621	XALc_Yp03		XALc	FALSE	0.397	61.000	0.000	NA		NA
10139444	10139445	XALc_Yp03	XALc_2622	XALc		TRUE	0.751	45.000	0.000	0.047		NA
10139445	10139446	XALc_2622	XALc_2623			TRUE	0.804	5.000	0.000	1.000		NA
10139446	10139447	XALc_2623	XALc_2624			TRUE	0.827	5.000	0.007	NA		NA
10139447	10139448	XALc_2624	XALc_2625			TRUE	0.991	-7.000	0.667	NA		NA
10139448	10139449	XALc_2625	XALc_2626			FALSE	0.131	211.000	0.000	NA		NA
10139450	10139451	XALc_2627	XALc_2628			FALSE	0.207	159.000	0.000	NA		NA
10139452	10139453	XALc_2629	XALc_2630			FALSE	0.042	458.000	0.038	NA	N	NA
11515929	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6014.000	0.000	NA		NA
11658292	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6014.000	0.000	NA		NA
11800684	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6014.000	0.000	NA		NA
11515930	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6037.000	0.000	NA		NA
11658293	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6037.000	0.000	NA		NA
11800685	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6037.000	0.000	NA		NA
11515931	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6074.000	0.000	NA		NA
11658294	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6074.000	0.000	NA		NA
11800686	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6074.000	0.000	NA		NA
11515932	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6097.000	0.000	NA		NA
11658295	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6097.000	0.000	NA		NA
11800687	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6097.000	0.000	NA		NA
11515933	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6134.000	0.000	NA		NA
11658296	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6134.000	0.000	NA		NA
11800688	10139442		XALc_2620			FALSE	NA	6134.000	0.000	NA		NA
10139454	10139455	XALc_2631	XALc_2632			TRUE	0.980	-3.000	0.000	0.046		NA
10139456	10139457	XALc_2633	XALc_2634			FALSE	0.022	887.000	0.000	NA		NA
10139457	10139458	XALc_2634	XALc_2635			TRUE	0.971	-3.000	0.070	NA		NA
10139458	10139459	XALc_2635	XALc_2636			FALSE	0.366	102.000	0.000	NA		NA
10139460	10139461	XALc_2637	XALc_2638			FALSE	0.026	655.000	0.000	NA		NA
10139461	10139462	XALc_2638	XALc_2639			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139462	10139463	XALc_2639	XALc_2640		traH	TRUE	0.820	4.000	0.000	NA		NA
10139463	10139464	XALc_2640	XALc_2641	traH		TRUE	0.978	2.000	0.227	NA		NA
10139464	10139465	XALc_2641	XALc_2642			TRUE	0.996	-3.000	0.571	NA		NA
10139465	10139466	XALc_2642	XALc_2643			TRUE	0.952	14.000	0.333	NA		NA
10139466	10139467	XALc_2643	XALc_2644			FALSE	0.056	352.000	0.000	NA		NA
10139467	10139468	XALc_2644	XALc_2645			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139468	10139469	XALc_2645	XALc_2646			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139469	10139470	XALc_2646	XALc_2647			FALSE	0.107	239.000	0.000	NA		NA
10139470	10139471	XALc_2647	XALc_Yt49		tRNA-RNA_Met	FALSE	0.396	75.000	0.000	NA		NA
10139471	10139472	XALc_Yt49	XALc_2649	tRNA-RNA_Met	glgB	FALSE	0.044	427.000	0.000	NA		NA
10139473	10139474	XALc_2650	XALc_2651			TRUE	0.755	93.000	0.000	1.000	Y	NA
10139475	10139476	XALc_2652	XALc_2653			TRUE	0.801	-7.000	0.000	NA		NA
10139476	10139477	XALc_2653	XALc_2654		xpsD	TRUE	0.758	22.000	0.074	NA		NA
10139477	10139478	XALc_2654	XALc_2655	xpsD	xpsN	TRUE	0.960	12.000	0.333	NA		NA
10139478	10139479	XALc_2655	XALc_2656	xpsN	xpsM	TRUE	0.990	-10.000	0.700	NA		NA
10139479	10139480	XALc_2656	XALc_2657	xpsM	xpsL	TRUE	0.966	-19.000	0.364	NA		NA
10139480	10139481	XALc_2657	XALc_2658	xpsL	xpsK	TRUE	0.997	-3.000	0.385	NA	Y	NA
10139481	10139482	XALc_2658	XALc_2659	xpsK	xpsJ	TRUE	0.991	-3.000	0.308	NA		NA
10139482	10139483	XALc_2659	XALc_2660	xpsJ	xpsI	TRUE	0.997	-3.000	0.750	NA		NA
10139483	10139484	XALc_2660	XALc_2661	xpsI	xpsH	TRUE	0.980	-3.000	0.130	NA		NA
10139484	10139485	XALc_2661	XALc_2662	xpsH	xpsG	TRUE	0.987	64.000	0.348	0.003	Y	NA
10139485	10139486	XALc_2662	XALc_2663	xpsG	xpsF	TRUE	0.796	301.000	0.125	0.003	Y	NA
10139486	10139487	XALc_2663	XALc_2664	xpsF	xpsE	TRUE	0.973	125.000	0.255	0.003	Y	NA
10139487	10139488	XALc_2664	XALc_2665	xpsE		FALSE	0.021	236.000	0.000	1.000	N	NA
10139488	10139489	XALc_2665	XALc_2666		xadA	FALSE	0.220	158.000	0.000	1.000		NA
10139489	10139490	XALc_2666	XALc_2667	xadA	purL	FALSE	0.027	698.000	0.000	1.000		NA
10139490	10139491	XALc_2667	XALc_2668	purL	dsbC	FALSE	0.070	196.000	0.011	1.000	N	NA
10139491	10139492	XALc_2668	XALc_2669	dsbC	xerD	FALSE	0.120	102.000	0.004	1.000	N	NA
10139494	10139495	XALc_2671	XALc_2672			TRUE	0.999	-3.000	0.631	0.043		NA
10139496	10139497	XALc_2673	XALc_2674	pepA	holC	TRUE	0.848	117.000	0.494	1.000	N	NA
10139497	10139498	XALc_2674	XALc_2675	holC	valS	TRUE	0.522	106.000	0.089	1.000	N	NA
10139499	10139500	XALc_2676	XALc_2677			TRUE	0.922	-3.000	0.004	1.000		NA
10139500	10139501	XALc_2677	XALc_2678		pssA	TRUE	0.922	-3.000	0.004	1.000		NA
10139502	10139503	XALc_2679	XALc_2680		proS	FALSE	0.386	100.000	0.002	NA		NA
10139503	10139504	XALc_2680	XALc_2681	proS		FALSE	0.088	286.000	0.004	1.000		NA
10139506	10139507	XALc_2683	XALc_2684			TRUE	0.967	74.000	0.472	NA	Y	NA
10139507	10139508	XALc_2684	XALc_2685			TRUE	0.991	4.000	0.275	NA	Y	NA
10139508	10139509	XALc_2685	XALc_2686			TRUE	0.986	-3.000	0.201	NA		NA
10139511	10139512	XALc_2688	XALc_2689			FALSE	0.449	9.000	0.008	NA	N	NA
10139513	10139514	XALc_2690	XALc_2691	lpsJ	lpsI	TRUE	0.996	2.000	0.070	0.001	Y	NA
10139515	10139516	XALc_2692	XALc_2693	xanA	xanB	TRUE	0.891	56.000	0.500	1.000	N	NA
10139517	10139518	XALc_2694	XALc_2695	rmlD	rmlC	TRUE	0.990	-3.000	0.063	1.000	Y	NA
10139518	10139519	XALc_2695	XALc_2696	rmlC	rmlA	TRUE	0.994	-3.000	0.163	1.000	Y	NA
10139519	10139520	XALc_2696	XALc_2697	rmlA	rmlB	TRUE	0.973	62.000	0.143	0.003	Y	NA
10139521	10139522	XALc_2698	XALc_2699	etfB	etfA	TRUE	0.998	0.000	0.316	0.010	Y	NA
10139522	10139523	XALc_2699	XALc_2700	etfA		FALSE	0.177	176.000	0.000	NA		NA
10139523	10139524	XALc_2700	XALc_2701			TRUE	0.763	-10.000	0.000	NA		NA
10139524	10139525	XALc_2701	XALc_2702			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139525	10139526	XALc_2702	XALc_2703			TRUE	0.980	-3.000	0.125	1.000		NA
10139526	10139527	XALc_2703	XALc_2704			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139528	10139529	XALc_2705	XALc_2706		gmd	TRUE	0.819	22.000	0.000	1.000	Y	NA
10139529	10139530	XALc_2706	XALc_2707	gmd	rmd	TRUE	0.996	-3.000	0.000	0.002	Y	NA
10139530	10139531	XALc_2707	XALc_2708	rmd		TRUE	0.811	-7.000	0.000	1.000		NA
10139531	10139532	XALc_2708	XALc_2709			FALSE	0.421	201.000	0.116	1.000		NA
10139532	10139533	XALc_2709	XALc_2710		wzm	TRUE	0.996	-3.000	0.450	0.079	N	NA
10139533	10139534	XALc_2710	XALc_2711	wzm		TRUE	0.913	18.000	0.050	1.000	Y	NA
10139534	10139535	XALc_2711	XALc_2712			FALSE	0.245	26.000	0.009	1.000	N	NA
10139535	10139536	XALc_2712	XALc_2713			TRUE	0.967	84.000	0.133	0.012	Y	NA
10139536	10139537	XALc_2713	XALc_2714			FALSE	0.418	180.000	0.081	NA		NA
10139537	10139538	XALc_2714	XALc_2715			FALSE	0.203	161.000	0.000	NA		NA
10139538	10139539	XALc_2715	XALc_2716			TRUE	0.998	-3.000	0.857	NA		NA
10139541	10139542	XALc_2718	XALc_2719	uptB	uptA	TRUE	0.879	98.000	0.495	1.000	N	NA
10139543	10139544	XALc_2720	XALc_2721	rhlE	ptpS	FALSE	0.236	150.000	0.035	1.000	N	NA
10139544	10139545	XALc_2721	XALc_2722	ptpS		FALSE	0.257	198.000	0.028	NA		NA
10139547	10139548	XALc_2724	XALc_2725			TRUE	0.749	11.000	0.009	NA		NA
10139548	10139549	XALc_2725	XALc_2726			FALSE	0.055	356.000	0.000	NA		NA
10139550	10139551	XALc_2727	XALc_2728		dinB	TRUE	0.460	112.000	0.015	1.000		NA
10139551	10139552	XALc_2728	XALc_2729	dinB	opdA	FALSE	0.015	283.000	0.000	1.000	N	NA
10139552	10139553	XALc_2729	XALc_2730	opdA	cysK	TRUE	0.829	63.000	0.028	1.000	Y	NA
10139553	10139554	XALc_2730	XALc_2731	cysK		FALSE	0.256	174.000	0.014	NA		NA
10139554	10139555	XALc_2731	XALc_2732			FALSE	0.035	526.000	0.000	NA		NA
10139556	10139557	XALc_2733	XALc_2734			FALSE	0.239	256.000	0.148	NA	N	NA
10139557	10139558	XALc_2734	XALc_2735			TRUE	0.988	32.000	0.963	NA	Y	NA
10139558	10139559	XALc_2735	XALc_2736			FALSE	0.035	521.000	0.000	NA		NA
10139560	10139561	XALc_2737	XALc_2738	hmgA		FALSE	0.446	119.000	0.077	1.000	N	NA
10139563	10139564	XALc_2740	XALc_2741			TRUE	0.561	17.000	0.000	NA		NA
10139564	10139565	XALc_2741	XALc_2742			FALSE	0.249	322.000	0.000	1.000	Y	NA
10139565	10139566	XALc_2742	XALc_2743			FALSE	0.127	217.000	0.000	NA		NA
10139567	10139568	XALc_2744	XALc_2745			FALSE	0.074	118.000	0.000	1.000	N	NA
10139570	10139571	XALc_2747	XALc_2748		mtfA	TRUE	0.664	23.000	0.032	NA		NA
10139573	10139574	XALc_2750	XALc_2751			TRUE	0.720	82.000	0.094	NA		NA
10139574	10139575	XALc_2751	XALc_2752			FALSE	0.389	48.000	0.000	NA		NA
10139576	10139577	XALc_2753	XALc_2754			TRUE	0.999	-3.000	0.474	0.001	Y	NA
10139578	10139579	XALc_2755	XALc_2756			TRUE	0.743	-12.000	0.000	NA		NA
10139579	10139580	XALc_2756	XALc_2757			TRUE	0.538	18.000	0.000	NA		NA
10139580	10139581	XALc_2757	XALc_2758			FALSE	0.173	179.000	0.000	NA		NA
10139581	10139582	XALc_2758	XALc_2759			TRUE	0.818	7.000	0.013	NA		NA
10139582	10139583	XALc_2759	XALc_2760			TRUE	0.553	25.000	0.013	NA		NA
10139583	10139584	XALc_2760	XALc_2761		ostA	TRUE	0.811	110.000	0.357	NA	N	NA
10139584	10139585	XALc_2761	XALc_2762	ostA	surA	TRUE	0.877	-3.000	0.020	1.000	N	NA
10139585	10139586	XALc_2762	XALc_2763	surA	pdxA	TRUE	0.985	4.000	0.561	1.000	N	NA
10139586	10139587	XALc_2763	XALc_2764	pdxA	ksgA	FALSE	0.360	221.000	0.197	1.000	N	NA
10139587	10139588	XALc_2764	XALc_2765	ksgA	apaG	TRUE	0.522	94.000	0.078	NA	N	NA
10139588	10139589	XALc_2765	XALc_2766	apaG	apaH	TRUE	0.952	11.000	0.267	NA		NA
10139590	10139591	XALc_2767	XALc_2768		thyA	FALSE	0.152	335.000	0.134	1.000	N	NA
10139591	10139592	XALc_2768	XALc_2769	thyA	lgt	TRUE	0.972	-3.000	0.164	1.000	N	NA
10139592	10139593	XALc_2769	XALc_2770	lgt		FALSE	0.042	182.000	0.003	1.000	N	NA
10139593	10139594	XALc_2770	XALc_2771		dgkA	FALSE	0.428	40.000	0.037	1.000	N	NA
10139594	10139595	XALc_2771	XALc_2772	dgkA		FALSE	0.212	236.000	0.000	0.087	N	NA
10139595	10139596	XALc_2772	XALc_2773			TRUE	0.969	49.000	0.500	1.000	Y	NA
10139596	10139597	XALc_2773	XALc_2774		tesA	FALSE	0.270	96.000	0.016	1.000	N	NA
10139598	10139599	XALc_2775	XALc_2776			TRUE	0.993	-3.000	0.535	1.000	N	NA
10139600	10139601	XALc_2777	XALc_2778			TRUE	0.590	102.000	0.041	NA		NA
10139601	10139602	XALc_2778	XALc_2779			TRUE	0.462	142.000	0.046	NA		NA
10139602	10139603	XALc_2779	XALc_2780			FALSE	0.268	188.000	0.023	NA		NA
10139604	10139605	XALc_2781	XALc_2782		rbsK	FALSE	0.362	58.000	0.027	1.000	N	NA
10139605	10139606	XALc_2782	XALc_2783	rbsK		FALSE	0.205	160.000	0.000	NA		NA
10139606	10139607	XALc_2783	XALc_2784			FALSE	0.147	195.000	0.000	NA		NA
10139607	10139608	XALc_2784	XALc_2785		dusB	FALSE	0.420	92.000	0.002	1.000		NA
10139611	10139612	XALc_2788	XALc_2789		ppc	FALSE	0.145	204.000	0.000	1.000		NA
10139614	10139615	XALc_2791	XALc_2792			TRUE	0.833	35.000	0.200	1.000		NA
10139615	10139616	XALc_2792	XALc_2793			FALSE	0.033	540.000	0.000	NA		NA
10139616	10139617	XALc_2793	XALc_2794			FALSE	0.117	228.000	0.000	NA		NA
10139617	10139618	XALc_2794	XALc_2795			FALSE	0.264	135.000	0.000	NA		NA
10139618	10139619	XALc_2795	XALc_2796			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
10139619	10139620	XALc_2796	XALc_2797			FALSE	0.065	321.000	0.000	NA		NA
10139620	10139621	XALc_2797	XALc_2798			FALSE	0.073	299.000	0.000	NA		NA
10139621	10139622	XALc_2798	XALc_2799			FALSE	0.023	783.000	0.000	NA		NA
10139622	10139623	XALc_2799	XALc_2800			TRUE	0.561	17.000	0.000	NA		NA
10139623	10139624	XALc_2800	XALc_2801			FALSE	0.197	166.000	0.000	NA		NA
10139626	10139627	XALc_2803	XALc_2804			FALSE	0.301	158.000	0.016	NA		NA
10139627	10139628	XALc_2804	XALc_2805		secA	FALSE	0.141	201.000	0.000	NA		NA
10139628	10139629	XALc_2805	XALc_2806	secA		TRUE	0.520	163.000	0.111	1.000		NA
10139631	10139632	XALc_2808	XALc_2809	lpxC	ftsZ	FALSE	0.231	253.000	0.134	1.000	N	NA
10139632	10139633	XALc_2809	XALc_2810	ftsZ	ftsA	TRUE	0.874	208.000	0.460	1.000	Y	NA
10139633	10139634	XALc_2810	XALc_2811	ftsA	ftsQ	TRUE	0.989	-3.000	0.389	NA	N	NA
10139634	10139635	XALc_2811	XALc_2812	ftsQ	ddl	TRUE	0.997	-3.000	0.372	NA	Y	NA
10139635	10139636	XALc_2812	XALc_2813	ddl	murC	TRUE	0.998	-3.000	0.153	0.004	Y	NA
10139636	10139637	XALc_2813	XALc_2814	murC	murG	TRUE	0.996	-3.000	0.283	1.000	Y	NA
10139637	10139638	XALc_2814	XALc_2815	murG	ftsW	TRUE	0.995	-3.000	0.647	1.000	N	NA
10139638	10139639	XALc_2815	XALc_2816	ftsW	mraY	TRUE	0.975	0.000	0.018	0.004	N	NA
10139639	10139640	XALc_2816	XALc_2817	mraY	murF	TRUE	0.997	-10.000	0.309	0.004	Y	NA
10139640	10139641	XALc_2817	XALc_2818	murF	murE	TRUE	1.000	-3.000	0.569	0.002	Y	NA
10139641	10139642	XALc_2818	XALc_2819	murE	ftsI	TRUE	0.984	-3.000	0.012	1.000	Y	NA
10139642	10139643	XALc_2819	XALc_2820	ftsI	ftsL	TRUE	0.894	-3.000	0.024	1.000	N	NA
10139643	10139644	XALc_2820	XALc_2821	ftsL	MraW	TRUE	0.980	-3.000	0.227	1.000	N	NA
10139644	10139645	XALc_2821	XALc_2822	MraW	MraZ	TRUE	0.977	15.000	0.635	NA		NA
10139648	10139649	XALc_2825	XALc_2826			TRUE	0.950	-10.000	0.172	NA		NA
10139649	10139650	XALc_2826	XALc_2827		GlcD	FALSE	0.029	229.000	0.004	1.000	N	NA
10139651	10139652	XALc_2828	XALc_2829		KdpD	TRUE	0.992	-10.000	0.379	1.000	Y	NA
10139652	10139653	XALc_2829	XALc_2830	KdpD	kdpC	TRUE	0.704	61.000	0.026	0.087	N	NA
10139653	10139654	XALc_2830	XALc_2831	kdpC	KdpB	TRUE	0.997	41.000	0.877	0.001	Y	NA
10139654	10139655	XALc_2831	XALc_2832	KdpB	KdpA	TRUE	0.978	38.000	0.145	0.001	Y	NA
10139655	10139656	XALc_2832	XALc_2833	KdpA		TRUE	0.803	17.000	0.071	NA		NA
10139656	10139657	XALc_2833	XALc_2834			FALSE	0.051	367.000	0.000	NA		NA
10139657	10139658	XALc_2834	XALc_2835			FALSE	0.046	412.000	0.000	NA		NA
10139658	10139659	XALc_2835	XALc_2836		NusB	TRUE	0.751	95.000	0.225	1.000	N	NA
10139659	10139660	XALc_2836	XALc_2837	NusB	RibH	TRUE	0.824	-3.000	0.011	1.000	N	NA
10139660	10139661	XALc_2837	XALc_2838	RibH	RibB	TRUE	0.989	102.000	0.417	0.002	Y	NA
10139661	10139662	XALc_2838	XALc_2839	RibB	RibC	TRUE	0.794	83.000	0.010	1.000	Y	NA
10139662	10139663	XALc_2839	XALc_2840	RibC	ribD	TRUE	0.723	352.000	0.456	1.000	Y	NA
10139663	10139664	XALc_2840	XALc_2841	ribD		TRUE	0.924	-3.000	0.005	1.000		NA
10139664	10139665	XALc_2841	XALc_2842			TRUE	0.775	7.000	0.005	NA		NA
10139665	10139666	XALc_2842	XALc_2843		glyA	FALSE	0.057	145.000	0.004	NA	N	NA
10139666	10139667	XALc_2843	XALc_2844	glyA		FALSE	0.312	119.000	0.000	NA		NA
10139669	10139670	XALc_2846	XALc_2847	rpoD		FALSE	0.079	153.000	0.006	1.000	N	NA
10139674	10139675	XALc_2851	XALc_2852			TRUE	0.982	0.000	0.040	NA	Y	NA
10139675	10139676	XALc_2852	XALc_2853			TRUE	0.829	80.000	0.029	NA	Y	NA
10139676	10139677	XALc_2853	XALc_2854			FALSE	0.394	66.000	0.000	NA		NA
10139677	10139678	XALc_2854	XALc_2855			FALSE	0.410	74.000	0.000	1.000		NA
10139678	10139679	XALc_2855	XALc_2856		sun	FALSE	0.234	26.000	0.008	1.000	N	NA
10139679	10139680	XALc_2856	XALc_2857	sun	Fmt	TRUE	0.960	24.000	0.305	1.000	Y	NA
10139680	10139681	XALc_2857	XALc_2858	Fmt		TRUE	0.951	105.000	0.105	0.020	Y	NA
10139682	10139683	XALc_2859	XALc_2860		DprA	TRUE	0.643	82.000	0.043	1.000		NA
10139683	10139684	XALc_2860	XALc_2861	DprA		TRUE	0.749	44.000	0.124	NA		NA
10139684	10139685	XALc_2861	XALc_2862			TRUE	0.659	23.000	0.030	NA		NA
10139685	10139686	XALc_2862	XALc_2863			TRUE	0.729	38.000	0.095	NA		NA
10139686	10139687	XALc_2863	XALc_2864		TopA	FALSE	0.106	248.000	0.003	NA		NA
10139687	10139688	XALc_2864	XALc_2865	TopA		FALSE	0.123	137.000	0.011	NA	N	NA
10139688	10139689	XALc_2865	XALc_2866			TRUE	0.460	119.000	0.022	NA		NA
10139689	10139690	XALc_2866	XALc_2867			TRUE	0.992	-15.000	1.000	NA		NA
10139693	10139694	XALc_2870	XALc_2871	SppA	NorM	FALSE	0.255	77.000	0.013	1.000	N	NA
10139694	10139695	XALc_2871	XALc_2872	NorM		FALSE	0.201	163.000	0.000	NA		NA
10139697	10139698	XALc_2874	XALc_2875		rpoH	FALSE	0.068	311.000	0.000	NA		NA
10139698	10139699	XALc_2875	XALc_2876	rpoH	Ung	FALSE	0.038	213.000	0.005	1.000	N	NA
10139699	10139700	XALc_2876	XALc_2877	Ung		FALSE	0.337	44.000	0.022	1.000	N	NA
10139700	10139701	XALc_2877	XALc_2878		FtsX	TRUE	0.910	8.000	0.182	1.000	N	NA
10139701	10139702	XALc_2878	XALc_2879	FtsX	FtsE	TRUE	0.983	-3.000	0.010	1.000	Y	NA
10139702	10139703	XALc_2879	XALc_2880	FtsE		TRUE	0.629	76.000	0.007	0.078	N	NA
10139704	10139705	XALc_2881	XALc_2882		Rho	FALSE	0.048	707.000	0.087	1.000	N	NA
10139707	10139708	XALc_2884	XALc_2885			FALSE	0.170	181.000	0.000	NA		NA
10139708	10139709	XALc_2885	XALc_2886			FALSE	0.396	64.000	0.000	NA		NA
10139709	10139710	XALc_2886	XALc_2887			FALSE	0.162	187.000	0.000	NA		NA
10139710	10139711	XALc_2887	XALc_2888			TRUE	0.998	-3.000	0.891	NA		NA
10139711	10139712	XALc_2888	XALc_2889			TRUE	0.998	-3.000	0.948	NA		NA
10139712	10139713	XALc_2889	XALc_2890			TRUE	0.988	19.000	0.711	NA	Y	NA
10139713	10139714	XALc_2890	XALc_2891			TRUE	0.998	3.000	0.773	NA	Y	NA
10139714	10139715	XALc_2891	XALc_2892			TRUE	0.993	16.000	0.882	NA	Y	NA
11515934	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2183.000	0.000	NA		NA
11658297	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2183.000	0.000	NA		NA
11800689	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2183.000	0.000	NA		NA
11515935	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2214.000	0.000	NA		NA
11658298	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2214.000	0.000	NA		NA
11800690	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2214.000	0.000	NA		NA
11515936	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2247.000	0.000	NA		NA
11658299	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2247.000	0.000	NA		NA
11800691	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2247.000	0.000	NA		NA
11515937	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2278.000	0.000	NA		NA
11658300	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2278.000	0.000	NA		NA
11800692	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2278.000	0.000	NA		NA
11515938	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2312.000	0.000	NA		NA
11658301	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2312.000	0.000	NA		NA
11800693	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2312.000	0.000	NA		NA
11515939	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2343.000	0.000	NA		NA
11658302	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2343.000	0.000	NA		NA
11800694	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2343.000	0.000	NA		NA
11515940	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2376.000	0.000	NA		NA
11658303	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2376.000	0.000	NA		NA
11800695	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2376.000	0.000	NA		NA
11515941	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2407.000	0.000	NA		NA
11658304	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2407.000	0.000	NA		NA
11800696	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2407.000	0.000	NA		NA
11515942	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2442.000	0.000	NA		NA
11658305	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2442.000	0.000	NA		NA
11800697	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2442.000	0.000	NA		NA
11515943	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2473.000	0.000	NA		NA
11658306	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2473.000	0.000	NA		NA
11800698	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2473.000	0.000	NA		NA
11515944	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2508.000	0.000	NA		NA
11658307	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2508.000	0.000	NA		NA
11800699	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2508.000	0.000	NA		NA
11515945	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2539.000	0.000	NA		NA
11658308	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2539.000	0.000	NA		NA
11800700	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2539.000	0.000	NA		NA
11515946	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2574.000	0.000	NA		NA
11658309	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2574.000	0.000	NA		NA
11800701	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2574.000	0.000	NA		NA
11515947	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2605.000	0.000	NA		NA
11658310	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2605.000	0.000	NA		NA
11800702	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2605.000	0.000	NA		NA
11515948	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2641.000	0.000	NA		NA
11658311	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2641.000	0.000	NA		NA
11800703	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2641.000	0.000	NA		NA
11515949	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2672.000	0.000	NA		NA
11658312	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2672.000	0.000	NA		NA
11800704	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2672.000	0.000	NA		NA
11515950	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2709.000	0.000	NA		NA
11658313	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2709.000	0.000	NA		NA
11800705	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2709.000	0.000	NA		NA
11515951	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2740.000	0.000	NA		NA
11658314	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2740.000	0.000	NA		NA
11800706	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2740.000	0.000	NA		NA
11515952	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2776.000	0.000	NA		NA
11658315	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2776.000	0.000	NA		NA
11800707	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2776.000	0.000	NA		NA
11515953	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2807.000	0.000	NA		NA
11658316	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2807.000	0.000	NA		NA
11800708	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2807.000	0.000	NA		NA
11515954	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2842.000	0.000	NA		NA
11658317	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2842.000	0.000	NA		NA
11800709	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2842.000	0.000	NA		NA
11515955	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2873.000	0.000	NA		NA
11658318	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2873.000	0.000	NA		NA
11800710	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2873.000	0.000	NA		NA
11515956	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2907.000	0.000	NA		NA
11658319	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2907.000	0.000	NA		NA
11800711	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2907.000	0.000	NA		NA
11515957	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2938.000	0.000	NA		NA
11658320	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2938.000	0.000	NA		NA
11800712	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2938.000	0.000	NA		NA
11515958	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2973.000	0.000	NA		NA
11658321	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2973.000	0.000	NA		NA
11800713	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	2973.000	0.000	NA		NA
11515959	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3004.000	0.000	NA		NA
11658322	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3004.000	0.000	NA		NA
11800714	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3004.000	0.000	NA		NA
11515960	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3039.000	0.000	NA		NA
11658323	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3039.000	0.000	NA		NA
11800715	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3039.000	0.000	NA		NA
11515961	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3070.000	0.000	NA		NA
11658324	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3070.000	0.000	NA		NA
11800716	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3070.000	0.000	NA		NA
11515962	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3105.000	0.000	NA		NA
11658325	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3105.000	0.000	NA		NA
11800717	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3105.000	0.000	NA		NA
11515963	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3136.000	0.000	NA		NA
11658326	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3136.000	0.000	NA		NA
11800718	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3136.000	0.000	NA		NA
11515964	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3171.000	0.000	NA		NA
11658327	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3171.000	0.000	NA		NA
11800719	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3171.000	0.000	NA		NA
11515965	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3202.000	0.000	NA		NA
11658328	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3202.000	0.000	NA		NA
11800720	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3202.000	0.000	NA		NA
11515966	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3236.000	0.000	NA		NA
11658329	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3236.000	0.000	NA		NA
11800721	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3236.000	0.000	NA		NA
11515967	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3267.000	0.000	NA		NA
11658330	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3267.000	0.000	NA		NA
11800722	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3267.000	0.000	NA		NA
11515968	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3304.000	0.000	NA		NA
11658331	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3304.000	0.000	NA		NA
11800723	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3304.000	0.000	NA		NA
11515969	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3335.000	0.000	NA		NA
11658332	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3335.000	0.000	NA		NA
11800724	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3335.000	0.000	NA		NA
11515970	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3370.000	0.000	NA		NA
11658333	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3370.000	0.000	NA		NA
11800725	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3370.000	0.000	NA		NA
11515971	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3401.000	0.000	NA		NA
11658334	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3401.000	0.000	NA		NA
11800726	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3401.000	0.000	NA		NA
11515972	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3435.000	0.000	NA		NA
11658335	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3435.000	0.000	NA		NA
11800727	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3435.000	0.000	NA		NA
11515973	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3466.000	0.000	NA		NA
11658336	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3466.000	0.000	NA		NA
11800728	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3466.000	0.000	NA		NA
11515974	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3500.000	0.000	NA		NA
11658337	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3500.000	0.000	NA		NA
11800729	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3500.000	0.000	NA		NA
11515975	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3531.000	0.000	NA		NA
11658338	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3531.000	0.000	NA		NA
11800730	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3531.000	0.000	NA		NA
11515976	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3569.000	0.000	NA		NA
11658339	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3569.000	0.000	NA		NA
11800731	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3569.000	0.000	NA		NA
11515977	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3600.000	0.000	NA		NA
11658340	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3600.000	0.000	NA		NA
11800732	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3600.000	0.000	NA		NA
11515978	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3636.000	0.000	NA		NA
11658341	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3636.000	0.000	NA		NA
11800733	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3636.000	0.000	NA		NA
11515979	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3667.000	0.000	NA		NA
11658342	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3667.000	0.000	NA		NA
11800734	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3667.000	0.000	NA		NA
11515980	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3703.000	0.000	NA		NA
11658343	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3703.000	0.000	NA		NA
11800735	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3703.000	0.000	NA		NA
11515981	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3734.000	0.000	NA		NA
11658344	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3734.000	0.000	NA		NA
11800736	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3734.000	0.000	NA		NA
11515982	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3769.000	0.000	NA		NA
11658345	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3769.000	0.000	NA		NA
11800737	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3769.000	0.000	NA		NA
11515983	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3800.000	0.000	NA		NA
11658346	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3800.000	0.000	NA		NA
11800738	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3800.000	0.000	NA		NA
11515984	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3835.000	0.000	NA		NA
11658347	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3835.000	0.000	NA		NA
11800739	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3835.000	0.000	NA		NA
11515985	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3866.000	0.000	NA		NA
11658348	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3866.000	0.000	NA		NA
11800740	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3866.000	0.000	NA		NA
11515986	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3900.000	0.000	NA		NA
11658349	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3900.000	0.000	NA		NA
11800741	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3900.000	0.000	NA		NA
11515987	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3931.000	0.000	NA		NA
11658350	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3931.000	0.000	NA		NA
11800742	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3931.000	0.000	NA		NA
11515988	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3965.000	0.000	NA		NA
11658351	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3965.000	0.000	NA		NA
11800743	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3965.000	0.000	NA		NA
11515989	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3996.000	0.000	NA		NA
11658352	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3996.000	0.000	NA		NA
11800744	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	3996.000	0.000	NA		NA
11515990	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4032.000	0.000	NA		NA
11658353	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4032.000	0.000	NA		NA
11800745	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4032.000	0.000	NA		NA
11515991	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4063.000	0.000	NA		NA
11658354	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4063.000	0.000	NA		NA
11800746	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4063.000	0.000	NA		NA
11515992	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4101.000	0.000	NA		NA
11658355	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4101.000	0.000	NA		NA
11800747	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4101.000	0.000	NA		NA
11515993	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4132.000	0.000	NA		NA
11658356	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4132.000	0.000	NA		NA
11800748	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4132.000	0.000	NA		NA
11515994	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4169.000	0.000	NA		NA
11658357	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4169.000	0.000	NA		NA
11800749	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4169.000	0.000	NA		NA
11515995	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4200.000	0.000	NA		NA
11658358	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4200.000	0.000	NA		NA
11800750	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4200.000	0.000	NA		NA
11515996	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4237.000	0.000	NA		NA
11658359	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4237.000	0.000	NA		NA
11800751	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4237.000	0.000	NA		NA
11515997	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4268.000	0.000	NA		NA
11658360	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4268.000	0.000	NA		NA
11800752	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4268.000	0.000	NA		NA
11515998	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4305.000	0.000	NA		NA
11658361	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4305.000	0.000	NA		NA
11800753	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4305.000	0.000	NA		NA
11515999	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4336.000	0.000	NA		NA
11658362	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4336.000	0.000	NA		NA
11800754	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4336.000	0.000	NA		NA
11516000	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4370.000	0.000	NA		NA
11658363	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4370.000	0.000	NA		NA
11800755	10139712		XALc_2889			FALSE	NA	4370.000	0.000	NA		NA
10139717	10139718	XALc_2894	XALc_2895			TRUE	0.851	119.000	0.500	1.000	N	NA
10139718	10139719	XALc_2895	XALc_2896			TRUE	0.865	31.000	0.250	1.000		NA
10139719	10139720	XALc_2896	XALc_2897			TRUE	0.994	16.000	1.000	0.081		NA
10139720	10139721	XALc_2897	XALc_2898			TRUE	0.724	48.000	0.000	0.081		NA
10139721	10139722	XALc_2898	XALc_2899			TRUE	0.919	8.000	0.000	0.081		NA
10139722	10139723	XALc_2899	XALc_2900			FALSE	0.093	100.000	0.000	1.000	N	NA
10139723	10139724	XALc_2900	XALc_2901			TRUE	1.000	-3.000	0.957	0.073	Y	NA
10139727	10139728	XALc_2904	XALc_2905		atpC	FALSE	0.012	319.000	0.000	1.000	N	NA
10139728	10139729	XALc_2905	XALc_2906	atpC	atpD	TRUE	0.988	171.000	0.837	0.003	Y	NA
10139729	10139730	XALc_2906	XALc_2907	atpD	atpG	TRUE	0.992	119.000	0.724	0.003	Y	NA
10139730	10139731	XALc_2907	XALc_2908	atpG	atpA	TRUE	0.991	147.000	0.846	0.003	Y	NA
10139731	10139732	XALc_2908	XALc_2909	atpA	atpH	TRUE	0.991	148.000	0.864	0.003	Y	NA
10139732	10139733	XALc_2909	XALc_2910	atpH	atpF	TRUE	0.998	2.000	0.242	0.003	Y	NA
10139733	10139734	XALc_2910	XALc_2911	atpF	atpE	TRUE	0.980	115.000	0.666	0.003		NA
10139734	10139735	XALc_2911	XALc_2912	atpE	atpB	TRUE	0.982	83.000	0.557	0.003		NA
10139735	10139736	XALc_2912	XALc_2913	atpB		TRUE	0.547	27.000	0.014	NA		NA
10139736	10139737	XALc_2913	XALc_2914		lpdA	FALSE	0.031	560.000	0.000	NA		NA
10139737	10139738	XALc_2914	XALc_2915	lpdA	aceF	TRUE	0.942	134.000	0.463	1.000	Y	NA
10139742	10139743	XALc_2919	XALc_2920	metQ	metI	TRUE	0.856	170.000	0.294	NA	Y	NA
10139743	10139744	XALc_2920	XALc_2921	metI	metN	TRUE	0.997	-3.000	0.312	1.000	Y	NA
10139744	10139745	XALc_2921	XALc_2922	metN		FALSE	0.375	103.000	0.000	1.000		NA
10139745	10139746	XALc_2922	XALc_2923			FALSE	0.393	72.000	0.000	NA		NA
10139748	10139749	XALc_2925	XALc_2926	rsuA	rsmC	TRUE	0.992	-3.000	0.088	1.000	Y	NA
10139751	10139752	XALc_2928	XALc_2929			FALSE	0.012	323.000	0.000	1.000	N	NA
10139752	10139753	XALc_2929	XALc_2930			FALSE	0.049	386.000	0.000	NA		NA
10139754	10139755	XALc_2931	XALc_2932			TRUE	0.980	-3.000	0.000	0.042		NA
10139755	10139756	XALc_2932	XALc_2933			FALSE	0.381	97.000	0.000	NA		NA
10139757	10139758	XALc_2934	XALc_2935	alr	dadA	TRUE	0.814	-21.000	0.099	1.000	N	NA
10139758	10139759	XALc_2935	XALc_2936	dadA		FALSE	0.083	284.000	0.000	1.000		NA
10139759	10139760	XALc_2936	XALc_2937			FALSE	0.437	32.000	0.000	1.000		NA
10139760	10139761	XALc_2937	XALc_2938			FALSE	0.184	171.000	0.000	NA		NA
10139761	10139762	XALc_2938	XALc_2939			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139763	10139764	XALc_2940	XALc_2941	msrB		FALSE	0.289	145.000	0.008	NA		NA
10139764	10139765	XALc_2941	XALc_2942		motA2	TRUE	0.453	146.000	0.049	NA		NA
10139765	10139766	XALc_2942	XALc_2943	motA2	motB2	TRUE	0.994	8.000	0.571	1.000	Y	NA
10139766	10139767	XALc_2943	XALc_2944	motB2		TRUE	0.979	12.000	0.571	NA		NA
10139767	10139768	XALc_2944	XALc_2945			TRUE	0.912	10.000	0.118	NA		NA
10139768	10139769	XALc_2945	XALc_2946			FALSE	0.067	315.000	0.000	NA		NA
10139771	10139772	XALc_2948	XALc_2949			FALSE	0.028	599.000	0.000	NA		NA
10139773	10139774	XALc_2950	XALc_2951			TRUE	0.629	-60.000	0.000	NA		NA
10139774	10139775	XALc_2951	XALc_2952			FALSE	0.245	142.000	0.000	NA		NA
10139778	10139779	XALc_2955	XALc_2956			TRUE	0.563	108.000	0.036	1.000		NA
10139779	10139780	XALc_2956	XALc_2957			TRUE	0.613	192.000	0.034	0.020		NA
10139780	10139781	XALc_2957	XALc_2958			FALSE	0.421	28.000	0.034	NA	N	NA
10139781	10139782	XALc_2958	XALc_2959			FALSE	0.007	362.000	0.000	NA	N	NA
10139784	10139785	XALc_2961	XALc_2962			FALSE	0.066	320.000	0.000	NA		NA
10139786	10139787	XALc_2963	XALc_2964			TRUE	0.981	-19.000	0.600	NA		NA
10139787	10139788	XALc_2964	XALc_2965			TRUE	0.952	11.000	0.000	0.001		NA
10139789	10139790	XALc_2966	XALc_2967			FALSE	0.005	573.000	0.000	1.000	N	NA
10139790	10139791	XALc_2967	XALc_2968			FALSE	0.030	570.000	0.000	NA		NA
10139791	10139792	XALc_2968	XALc_2969			FALSE	0.404	86.000	0.000	NA		NA
10139792	10139793	XALc_2969	XALc_2970			FALSE	0.190	174.000	0.000	1.000		NA
10139793	10139794	XALc_2970	XALc_2971			FALSE	0.174	178.000	0.000	NA		NA
10139794	10139795	XALc_2971	XALc_2972		treA	FALSE	0.152	192.000	0.000	NA		NA
10139795	10139796	XALc_2972	XALc_2973	treA	pheC	FALSE	0.010	349.000	0.000	1.000	N	NA
10139797	10139798	XALc_2974	XALc_2975	corA		TRUE	0.512	85.000	0.062	1.000	N	NA
10139798	10139799	XALc_2975	XALc_2976			FALSE	0.142	208.000	0.000	1.000		NA
10139800	10139801	XALc_2977	XALc_2978			FALSE	0.046	411.000	0.000	NA		NA
10139802	10139803	XALc_2979	XALc_2980			TRUE	0.587	16.000	0.000	NA		NA
10139803	10139804	XALc_2980	XALc_2981			FALSE	0.040	459.000	0.000	NA		NA
10139806	10139807	XALc_2983	XALc_2984			FALSE	0.142	200.000	0.000	NA		NA
10139807	10139808	XALc_2984	XALc_2985		ilvD	FALSE	0.046	406.000	0.000	NA		NA
10139808	10139809	XALc_2985	XALc_2986	ilvD		FALSE	0.025	714.000	0.000	NA		NA
10139811	10139812	XALc_2988	XALc_2989			FALSE	0.397	90.000	0.000	NA		NA
10139812	10139813	XALc_2989	XALc_2990			FALSE	0.086	271.000	0.000	NA		NA
10139813	10139814	XALc_2990	XALc_2991		catB	FALSE	0.395	74.000	0.000	NA		NA
10139814	10139815	XALc_2991	XALc_2992	catB	dinG	FALSE	0.010	344.000	0.000	1.000	N	NA
10139815	10139816	XALc_2992	XALc_2993	dinG	aroE	FALSE	0.134	23.000	0.000	1.000	N	NA
10139820	10139821	XALc_2997	XALc_2998	hemB		FALSE	0.170	200.000	0.007	NA		NA
10139823	10139824	XALc_3000	XALc_3001		gst	FALSE	0.309	71.000	0.020	1.000	N	NA
10139825	10139826	XALc_3002	XALc_3003			FALSE	0.162	187.000	0.000	NA		NA
10139827	10139828	XALc_3004	XALc_3005	natB	natA	TRUE	0.996	-3.000	0.271	NA	Y	NA
10139828	10139829	XALc_3005	XALc_3006	natA		TRUE	0.876	32.000	0.292	NA		NA
10139829	10139830	XALc_3006	XALc_3007			FALSE	0.396	59.000	0.000	NA		NA
10139831	10139832	XALc_3008	XALc_3009			TRUE	0.983	17.000	0.688	0.072	N	NA
10139832	10139833	XALc_3009	XALc_3010		panE	FALSE	0.357	20.000	0.014	1.000	N	NA
10139835	10139836	XALc_3012	XALc_3013	hrpB		FALSE	0.245	177.000	0.012	1.000		NA
10139837	10139838	XALc_3014	XALc_3015			TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		NA
10139838	10139839	XALc_3015	XALc_3016			FALSE	0.058	345.000	0.000	NA		NA
10139839	10139840	XALc_3016	XALc_3017		rluE	FALSE	0.421	32.000	0.000	NA		NA
10139840	10139841	XALc_3017	XALc_3018	rluE		TRUE	0.462	88.000	0.008	NA		NA
10139842	10139843	XALc_3019	XALc_3020			TRUE	0.989	-3.000	0.028	0.020		NA
10139843	10139844	XALc_3020	XALc_3021			FALSE	0.031	579.000	0.000	1.000		NA
10139845	10139846	XALc_3022	XALc_3023			TRUE	0.994	-9.000	1.000	NA		NA
10139846	10139847	XALc_3023	XALc_3024			TRUE	0.997	-3.000	0.750	NA		NA
10139847	10139848	XALc_3024	XALc_3025			TRUE	0.984	0.000	0.375	1.000	N	NA
10139848	10139849	XALc_3025	XALc_3026		pcaC	FALSE	0.040	481.000	0.000	1.000		NA
10139849	10139850	XALc_3026	XALc_3027	pcaC	pcaD	TRUE	0.945	43.000	0.600	1.000		NA
10139850	10139851	XALc_3027	XALc_3028	pcaD	pcaB	FALSE	0.210	202.000	0.014	1.000		NA
10139851	10139852	XALc_3028	XALc_3029	pcaB	pcaG	TRUE	0.815	57.000	0.314	1.000	N	NA
10139852	10139853	XALc_3029	XALc_3030	pcaG	pcaH	TRUE	0.999	6.000	0.782	0.001	Y	NA
10139853	10139854	XALc_3030	XALc_3031	pcaH	pcaF	TRUE	0.879	75.000	0.066	0.001	N	NA
10139854	10139855	XALc_3031	XALc_3032	pcaF	pcaJ	TRUE	0.991	-3.000	0.086	1.000	Y	NA
10139855	10139856	XALc_3032	XALc_3033	pcaJ	pcaI	TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.001	Y	NA
10139857	10139858	XALc_3034	XALc_3035	vanA		TRUE	0.821	26.000	0.277	1.000	N	NA
10139858	10139859	XALc_3035	XALc_3036		vanB	TRUE	0.875	55.000	0.450	1.000	N	NA
10139860	10139861	XALc_3037	XALc_3038		pobA	FALSE	0.045	419.000	0.000	NA		NA
10139863	10139864	XALc_3040	XALc_3041			TRUE	0.521	169.000	0.000	NA	Y	NA
10139864	10139865	XALc_3041	XALc_3042			TRUE	0.760	185.000	0.600	NA	N	NA
10139865	10139866	XALc_3042	XALc_3043			FALSE	0.056	118.000	0.000	NA	N	NA
10139866	10139867	XALc_3043	XALc_3044			FALSE	0.007	372.000	0.000	NA	N	NA
10139867	10139868	XALc_3044	XALc_3045			TRUE	0.900	77.000	0.000	0.041	Y	NA
10139871	10139872	XALc_3048	XALc_3049			TRUE	0.997	-3.000	0.707	NA		NA
10139872	10139873	XALc_3049	XALc_3050			FALSE	0.445	489.000	0.528	NA		NA
10139873	10139874	XALc_3050	XALc_3051			TRUE	0.998	-3.000	0.895	NA		NA
10139874	10139875	XALc_3051	XALc_3052			TRUE	0.965	27.000	0.787	NA		NA
10139875	10139876	XALc_3052	XALc_3053			TRUE	0.977	10.000	0.468	NA		NA
11516001	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1782.000	0.000	NA		NA
11658364	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1782.000	0.000	NA		NA
11800756	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1782.000	0.000	NA		NA
11516002	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1810.000	0.000	NA		NA
11658365	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1810.000	0.000	NA		NA
11800757	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1810.000	0.000	NA		NA
11516003	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1842.000	0.000	NA		NA
11658366	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1842.000	0.000	NA		NA
11800758	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1842.000	0.000	NA		NA
11516004	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1870.000	0.000	NA		NA
11658367	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1870.000	0.000	NA		NA
11800759	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1870.000	0.000	NA		NA
11516005	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1902.000	0.000	NA		NA
11658368	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1902.000	0.000	NA		NA
11800760	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1902.000	0.000	NA		NA
11516006	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1930.000	0.000	NA		NA
11658369	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1930.000	0.000	NA		NA
11800761	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1930.000	0.000	NA		NA
11516007	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1962.000	0.000	NA		NA
11658370	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1962.000	0.000	NA		NA
11800762	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1962.000	0.000	NA		NA
11516008	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1990.000	0.000	NA		NA
11658371	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1990.000	0.000	NA		NA
11800763	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	1990.000	0.000	NA		NA
11516009	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2022.000	0.000	NA		NA
11658372	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2022.000	0.000	NA		NA
11800764	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2022.000	0.000	NA		NA
11516010	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2050.000	0.000	NA		NA
11658373	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2050.000	0.000	NA		NA
11800765	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2050.000	0.000	NA		NA
11516011	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2082.000	0.000	NA		NA
11658374	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2082.000	0.000	NA		NA
11800766	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2082.000	0.000	NA		NA
11516012	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2110.000	0.000	NA		NA
11658375	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2110.000	0.000	NA		NA
11800767	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2110.000	0.000	NA		NA
11516013	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2142.000	0.000	NA		NA
11658376	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2142.000	0.000	NA		NA
11800768	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2142.000	0.000	NA		NA
11516014	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2170.000	0.000	NA		NA
11658377	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2170.000	0.000	NA		NA
11800769	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2170.000	0.000	NA		NA
11516015	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2202.000	0.000	NA		NA
11658378	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2202.000	0.000	NA		NA
11800770	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2202.000	0.000	NA		NA
11516016	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2230.000	0.000	NA		NA
11658379	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2230.000	0.000	NA		NA
11800771	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2230.000	0.000	NA		NA
11516017	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2262.000	0.000	NA		NA
11658380	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2262.000	0.000	NA		NA
11800772	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2262.000	0.000	NA		NA
11516018	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2290.000	0.000	NA		NA
11658381	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2290.000	0.000	NA		NA
11800773	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2290.000	0.000	NA		NA
11516019	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2322.000	0.000	NA		NA
11658382	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2322.000	0.000	NA		NA
11800774	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2322.000	0.000	NA		NA
11516020	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2350.000	0.000	NA		NA
11658383	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2350.000	0.000	NA		NA
11800775	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2350.000	0.000	NA		NA
11516021	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2382.000	0.000	NA		NA
11658384	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2382.000	0.000	NA		NA
11800776	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2382.000	0.000	NA		NA
11516022	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2410.000	0.000	NA		NA
11658385	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2410.000	0.000	NA		NA
11800777	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2410.000	0.000	NA		NA
11516023	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2442.000	0.000	NA		NA
11658386	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2442.000	0.000	NA		NA
11800778	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2442.000	0.000	NA		NA
11516024	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2470.000	0.000	NA		NA
11658387	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2470.000	0.000	NA		NA
11800779	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2470.000	0.000	NA		NA
11516025	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2502.000	0.000	NA		NA
11658388	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2502.000	0.000	NA		NA
11800780	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2502.000	0.000	NA		NA
11516026	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2530.000	0.000	NA		NA
11658389	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2530.000	0.000	NA		NA
11800781	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2530.000	0.000	NA		NA
11516027	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2562.000	0.000	NA		NA
11658390	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2562.000	0.000	NA		NA
11800782	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2562.000	0.000	NA		NA
11516028	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2590.000	0.000	NA		NA
11658391	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2590.000	0.000	NA		NA
11800783	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2590.000	0.000	NA		NA
11516029	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2622.000	0.000	NA		NA
11658392	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2622.000	0.000	NA		NA
11800784	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2622.000	0.000	NA		NA
11516030	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2650.000	0.000	NA		NA
11658393	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2650.000	0.000	NA		NA
11800785	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2650.000	0.000	NA		NA
11516031	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2682.000	0.000	NA		NA
11658394	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2682.000	0.000	NA		NA
11800786	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2682.000	0.000	NA		NA
11516032	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2710.000	0.000	NA		NA
11658395	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2710.000	0.000	NA		NA
11800787	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2710.000	0.000	NA		NA
11516033	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2742.000	0.000	NA		NA
11658396	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2742.000	0.000	NA		NA
11800788	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2742.000	0.000	NA		NA
11516034	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2770.000	0.000	NA		NA
11658397	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2770.000	0.000	NA		NA
11800789	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2770.000	0.000	NA		NA
11516035	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2802.000	0.000	NA		NA
11658398	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2802.000	0.000	NA		NA
11800790	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2802.000	0.000	NA		NA
11516036	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2830.000	0.000	NA		NA
11658399	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2830.000	0.000	NA		NA
11800791	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2830.000	0.000	NA		NA
11516037	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2862.000	0.000	NA		NA
11658400	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2862.000	0.000	NA		NA
11800792	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2862.000	0.000	NA		NA
11516038	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2890.000	0.000	NA		NA
11658401	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2890.000	0.000	NA		NA
11800793	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2890.000	0.000	NA		NA
11516039	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2922.000	0.000	NA		NA
11658402	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2922.000	0.000	NA		NA
11800794	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2922.000	0.000	NA		NA
11516040	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2950.000	0.000	NA		NA
11658403	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2950.000	0.000	NA		NA
11800795	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2950.000	0.000	NA		NA
11516041	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2982.000	0.000	NA		NA
11658404	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2982.000	0.000	NA		NA
11800796	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	2982.000	0.000	NA		NA
11516042	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3010.000	0.000	NA		NA
11658405	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3010.000	0.000	NA		NA
11800797	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3010.000	0.000	NA		NA
11516043	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3042.000	0.000	NA		NA
11658406	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3042.000	0.000	NA		NA
11800798	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3042.000	0.000	NA		NA
11516044	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3070.000	0.000	NA		NA
11658407	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3070.000	0.000	NA		NA
11800799	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3070.000	0.000	NA		NA
11516045	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3102.000	0.000	NA		NA
11658408	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3102.000	0.000	NA		NA
11800800	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3102.000	0.000	NA		NA
11516046	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3130.000	0.000	NA		NA
11658409	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3130.000	0.000	NA		NA
11800801	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3130.000	0.000	NA		NA
11516047	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3162.000	0.000	NA		NA
11658410	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3162.000	0.000	NA		NA
11800802	10139874		XALc_3051			FALSE	NA	3162.000	0.000	NA		NA
10139877	10139878	XALc_3054	XALc_3055			TRUE	0.793	5.000	0.000	NA		NA
10139878	10139879	XALc_3055	XALc_3056			FALSE	0.167	183.000	0.000	NA		NA
10139879	10139880	XALc_3056	XALc_3057			FALSE	0.445	26.000	0.000	NA		NA
10139880	10139881	XALc_3057	XALc_3058			FALSE	0.062	330.000	0.000	NA		NA
10139881	10139882	XALc_3058	XALc_3059			FALSE	0.286	128.000	0.000	NA		NA
10139882	10139883	XALc_3059	XALc_3060			FALSE	0.445	26.000	0.000	NA		NA
10139883	10139884	XALc_3060	XALc_3061		dcp	FALSE	0.022	945.000	0.000	NA		NA
10139884	10139885	XALc_3061	XALc_3062	dcp		FALSE	0.010	355.000	0.000	1.000	N	NA
10139885	10139886	XALc_3062	XALc_3063			TRUE	0.880	4.000	0.014	1.000		NA
10139888	10139889	XALc_3065	XALc_3066	truC	ubiB	FALSE	0.218	169.000	0.005	1.000		NA
10139889	10139890	XALc_3066	XALc_3067	ubiB		TRUE	0.994	-3.000	0.432	1.000		NA
10139890	10139891	XALc_3067	XALc_3068			FALSE	0.409	66.000	0.000	1.000		NA
10139891	10139892	XALc_3068	XALc_3069			TRUE	0.548	241.000	0.418	1.000	N	NA
10139894	10139895	XALc_3071	XALc_3072			FALSE	0.085	272.000	0.000	NA		NA
10139895	10139896	XALc_3072	XALc_3073		fabH	FALSE	0.300	584.000	0.377	1.000		NA
10139896	10139897	XALc_3073	XALc_3074	fabH		TRUE	0.661	102.000	0.078	NA		NA
10139898	10139899	XALc_3075	XALc_3076			FALSE	0.411	38.000	0.000	NA		NA
10139899	10139900	XALc_3076	XALc_3077			FALSE	0.145	205.000	0.000	1.000		NA
10139901	10139902	XALc_3078	XALc_3079	gpsA	secB	FALSE	0.387	19.000	0.015	1.000	N	NA
10139902	10139903	XALc_3079	XALc_3080	secB		TRUE	0.676	89.000	0.158	NA	N	NA
10139903	10139904	XALc_3080	XALc_3081			TRUE	0.528	54.000	0.019	NA		NA
10139904	10139905	XALc_3081	XALc_3082			TRUE	0.598	46.000	0.035	NA		NA
10139906	10139907	XALc_3083	XALc_3084			TRUE	0.972	106.000	0.600	1.000	Y	NA
10139907	10139908	XALc_3084	XALc_3085			TRUE	0.999	-3.000	0.765	1.000	Y	NA
10139911	10139912	XALc_3088	XALc_3089	sodC	ntrC	FALSE	0.034	247.000	0.007	1.000	N	NA
10139912	10139913	XALc_3089	XALc_3090	ntrC	ntrB	TRUE	0.997	11.000	0.587	0.068	Y	NA
10139913	10139914	XALc_3090	XALc_3091	ntrB	amtB	FALSE	0.140	312.000	0.000	0.076	N	NA
10139914	10139915	XALc_3091	XALc_3092	amtB	glnB1	TRUE	0.542	23.000	0.048	1.000	N	NA
10139915	10139916	XALc_3092	XALc_3093	glnB1	glnA	FALSE	0.241	330.000	0.000	1.000	Y	NA
10139918	10139919	XALc_3095	XALc_3096			TRUE	0.775	21.000	0.083	NA		NA
10139919	10139920	XALc_3096	XALc_3097			TRUE	0.621	69.000	0.042	NA		NA
10139920	10139921	XALc_3097	XALc_3098			TRUE	0.553	68.000	0.023	NA		NA
10139921	10139922	XALc_3098	XALc_3099			FALSE	0.303	101.000	0.023	NA	N	NA
10139922	10139923	XALc_3099	XALc_3100			TRUE	0.554	103.000	0.107	NA	N	NA
10139923	10139924	XALc_3100	XALc_Yp04		XALc	TRUE	0.980	-3.000	0.128	NA		NA
10139924	10139925	XALc_Yp04	XALc_1	XALc		TRUE	0.704	42.000	0.083	NA		NA
10139925	10139926	XALc_1	XALc_2			TRUE	0.888	4.000	0.079	NA	N	NA
10139926	10139927	XALc_2	XALc_3			FALSE	0.070	319.000	0.000	1.000		NA
10139927	10139928	XALc_3	XALc_4			FALSE	0.364	107.000	0.000	1.000		NA
10139930	10139931	XALc_Yp05	XALc_5	XALc		FALSE	0.411	38.000	0.000	NA		NA
10139931	10139932	XALc_5	XALc_6			FALSE	0.343	110.000	0.000	NA		NA
10139932	10139933	XALc_6	XALc_3103			FALSE	0.390	52.000	0.000	NA		NA
10139935	10139936	XALc_3105	XALc_3106			FALSE	0.399	89.000	0.000	NA		NA
10139937	10139938	XALc_3107	XALc_3108			TRUE	0.996	-3.000	0.185	0.012		NA
10139938	10139939	XALc_3108	XALc_3109			FALSE	0.047	395.000	0.000	NA		NA
10139939	10139940	XALc_3109	XALc_3110		gltB	FALSE	0.206	190.000	0.011	NA		NA
10139940	10139941	XALc_3110	XALc_3111	gltB	gltD	TRUE	0.957	53.000	0.032	0.001	Y	NA
10139941	10139942	XALc_3111	XALc_3112	gltD		FALSE	0.023	191.000	0.000	NA	N	NA
10139943	10139944	XALc_Yr04	XALc_Yr05	rRNA-rRNA-5S	rRNA-rRNA-23S	FALSE	0.126	218.000	0.000	NA		NA
10139944	10139945	XALc_Yr05	XALc_Yt50	rRNA-rRNA-23S	tRNA-tRNA_Ile	FALSE	0.123	223.000	0.000	NA		NA
10139945	10139946	XALc_Yt50	XALc_Yt51	tRNA-tRNA_Ile	tRNA-tRNA_Ala	TRUE	0.606	15.000	0.000	NA		NA
10139946	10139947	XALc_Yt51	XALc_Yr06	tRNA-tRNA_Ala	rRNA-rRNA-16S	FALSE	0.385	96.000	0.000	NA		NA
10139949	10139950	XALc_3119	XALc_3120			TRUE	0.957	-3.000	0.103	NA	N	NA
10139950	10139951	XALc_3120	XALc_3121			FALSE	0.018	219.000	0.000	NA	N	NA
10139951	10139952	XALc_3121	XALc_3122			TRUE	0.500	-21.000	0.013	1.000	N	NA
10139952	10139953	XALc_3122	XALc_3123			FALSE	0.404	85.000	0.000	NA		NA
10139955	10139956	XALc_3125	XALc_3126			TRUE	0.850	65.000	0.257	NA		NA
10139956	10139957	XALc_3126	XALc_3127			TRUE	0.938	82.000	0.561	NA		NA
10139957	10139958	XALc_3127	XALc_3128			TRUE	0.966	-13.000	0.311	NA		NA
10139958	10139959	XALc_3128	XALc_3129		folE	TRUE	0.673	78.000	0.066	NA		NA
10139959	10139960	XALc_3129	XALc_3130	folE	kgtP	FALSE	0.071	120.000	0.000	1.000	N	NA
10139961	10139962	XALc_3131	XALc_3132			FALSE	0.166	184.000	0.000	NA		NA
10139962	10139963	XALc_3132	XALc_3133			FALSE	0.025	709.000	0.000	NA		NA
10139963	10139964	XALc_3133	XALc_3134			FALSE	0.023	834.000	0.000	NA		NA
10139964	10139965	XALc_3134	XALc_3135			FALSE	0.149	201.000	0.000	1.000		NA
10139965	10139966	XALc_3135	XALc_3136			TRUE	0.996	-3.000	0.575	NA		NA
10139969	10139970	XALc_3139	XALc_3140			TRUE	0.960	25.000	0.667	NA		NA
10139970	10139971	XALc_3140	XALc_3141			TRUE	0.837	3.000	0.000	NA		NA
10139971	10139972	XALc_3141	XALc_3142			FALSE	0.150	193.000	0.000	NA		NA
10139974	10139975	XALc_3144	XALc_3145			FALSE	0.393	55.000	0.000	NA		NA
10139976	10139977	XALc_3146	XALc_3147			FALSE	0.032	568.000	0.000	1.000		NA
10139977	10139978	XALc_3147	XALc_3148			TRUE	0.904	38.000	0.364	NA		NA
10139978	10139979	XALc_3148	XALc_3149			TRUE	0.996	-3.000	0.647	NA		NA
10139979	10139980	XALc_3149	XALc_3150			TRUE	0.946	52.000	0.647	NA		NA
10139981	10139982	XALc_3151	XALc_3152			FALSE	0.103	87.000	0.000	1.000	N	NA
10139982	10139983	XALc_3152	XALc_3153			TRUE	0.999	-3.000	0.800	1.000	Y	NA
10139983	10139984	XALc_3153	XALc_3154			TRUE	0.810	46.000	0.029	0.075		NA
10139984	10139985	XALc_3154	XALc_3155			TRUE	0.613	131.000	0.000	0.075		NA
10139985	10139986	XALc_3155	XALc_3156			TRUE	0.985	-3.000	0.296	1.000	N	NA
10139986	10139987	XALc_3156	XALc_3157			TRUE	0.982	-7.000	0.519	1.000	N	NA
10139987	10139988	XALc_3157	XALc_3158			TRUE	0.762	92.000	0.136	NA		NA
10139988	10139989	XALc_3158	XALc_3159			FALSE	0.039	474.000	0.000	NA		NA
10139990	10139991	XALc_3160	XALc_3161	mutM	opgD	FALSE	0.027	229.000	0.003	1.000	N	NA
10139992	10139993	XALc_3162	XALc_3163		tdk	FALSE	0.381	108.000	0.004	1.000		NA
10139999	10140000	XALc_3169	XALc_3170			FALSE	0.240	145.000	0.000	NA		NA
10140000	10140001	XALc_3170	XALc_3171		oxaA	TRUE	0.888	132.000	0.221	0.037		NA
10140001	10140002	XALc_3171	XALc_3172	oxaA	rnpA	TRUE	0.710	19.000	0.105	1.000	N	NA
10140002	10140003	XALc_3172	XALc_3173	rnpA	rpmH	TRUE	0.962	39.000	0.787	1.000		NA