MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter lari RM2100

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6887354 6887355 Cla_0001 Cla_0002 dnaA dnaN TRUE 0.744 133.000 0.328 1.000 Y NA
 6887355 6887356 Cla_0002 Cla_0003 dnaN gyrB TRUE 0.968 10.000 0.114 1.000 Y NA
 6887356 6887357 Cla_0003 Cla_0004 gyrB   TRUE 0.691 9.000 0.000 1.000 N NA
 6887357 6887358 Cla_0004 Cla_0005     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6887358 6887359 Cla_0005 Cla_0006     FALSE 0.415 -24.000 0.000 NA   NA
 6887359 6887360 Cla_0006 Cla_0007     FALSE 0.077 172.000 0.000 1.000   NA
 6887360 6887361 Cla_0007 Cla_0008     TRUE 0.988 3.000 0.180 0.052   NA
 6887361 6887362 Cla_0008 Cla_0009     FALSE 0.154 43.000 0.000 1.000   NA
 6887362 6887363 Cla_0009 Cla_0010     TRUE 0.634 10.000 0.000 1.000   NA
 6887365 6887366 Cla_0012 Cla_0013 pyrG recJ TRUE 0.878 -10.000 0.026 1.000 N NA
 6887366 6887367 Cla_0013 Cla_0014 recJ   FALSE 0.077 69.000 0.000 NA   NA
 6887368 6887369 Cla_0015 Cla_0016 prfA rpsT TRUE 0.956 4.000 0.029 1.000 Y NA
 6887369 6887370 Cla_0016 Cla_0017 rpsT   FALSE 0.304 289.000 0.000 0.032 Y NA
 6887370 6887371 Cla_0017 Cla_0018     TRUE 0.957 10.000 0.118 1.000   NA
 6887371 6887372 Cla_0018 Cla_0019   ksgA TRUE 0.812 -34.000 0.028 1.000   NA
 6887373 6887374 Cla_0020 Cla_0021     TRUE 0.944 9.000 0.011 0.034   NA
 6887374 6887375 Cla_0021 Cla_0022     FALSE 0.065 97.000 0.000 NA   NA
 6887377 6887378 Cla_0024 Cla_0025 purB1 nrdA TRUE 0.759 14.000 0.012 1.000 Y NA
 6887378 6887379 Cla_0025 Cla_0026 nrdA   FALSE 0.291 16.000 0.000 NA   NA
 6887379 6887380 Cla_0026 Cla_0027     TRUE 0.947 -3.000 0.043 NA   NA
 6887380 6887381 Cla_0027 Cla_0028   thrS FALSE 0.432 107.000 0.063 1.000 N NA
 6887381 6887382 Cla_0028 Cla_0029 thrS infC TRUE 0.970 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 6887382 6887383 Cla_0029 Cla_0030 infC   FALSE 0.329 34.000 0.004 1.000 N NA
 6887384 6887385 Cla_0031 Cla_0032     FALSE 0.069 79.000 0.000 NA   NA
 6887385 6887386 Cla_0032 Cla_0033     FALSE 0.156 32.000 0.000 NA   NA
 6887387 6887388 Cla_0034 Cla_0035 rpmI rplT TRUE 0.947 98.000 0.928 0.036 Y NA
 6887388 6887389 Cla_0035 Cla_0036 rplT   FALSE 0.426 -52.000 0.000 1.000 N NA
 6887390 6887391 Cla_0037 Cla_0038     TRUE 0.991 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 6887391 6887392 Cla_0038 Cla_0039     TRUE 0.993 -3.000 0.509 1.000 Y NA
 6887394 6887395 Cla_0041 Cla_0042 pyrC1   TRUE 0.866 9.000 0.009 1.000   NA
 6887395 6887396 Cla_0042 Cla_0043   dgkA TRUE 0.961 -15.000 0.273 1.000   NA
 6887396 6887397 Cla_0043 Cla_0044 dgkA   TRUE 0.967 0.000 0.091 1.000   NA
 6887398 6887399 Cla_0045 Cla_0046 xth   FALSE 0.075 70.000 0.000 NA   NA
 6887399 6887400 Cla_0046 Cla_0047     FALSE 0.067 213.000 0.000 NA   NA
 6887400 6887401 Cla_0047 Cla_0048   nrdD FALSE 0.064 132.000 0.000 NA   NA
 6887401 6887402 Cla_0048 Cla_0049 nrdD nrdG TRUE 0.929 -52.000 0.192 1.000 N NA
 6887402 6887403 Cla_0049 Cla_0050 nrdG sodB FALSE 0.093 68.000 0.000 1.000 N NA
 6887403 6887404 Cla_0050 Cla_0051 sodB   FALSE 0.109 60.000 0.000 1.000 N NA
 6887406 6887407 Cla_0053 Cla_0054 coaE dapF TRUE 0.834 11.000 0.016 1.000 N NA
 6887407 6887408 Cla_0054 Cla_0055 dapF   TRUE 0.720 -25.000 0.010 1.000   NA
 6887409 6887410 Cla_0056 Cla_0057     FALSE 0.204 23.000 0.000 NA   NA
 6887411 6887412 Cla_0058 Cla_0059 rpsJ rplC TRUE 0.994 10.000 0.467 0.048 Y NA
 6887412 6887413 Cla_0059 Cla_0060 rplC rplD TRUE 0.995 -3.000 0.361 0.036 Y NA
 6887413 6887414 Cla_0060 Cla_0061 rplD rplW TRUE 0.993 2.000 0.513 1.000 Y NA
 6887414 6887415 Cla_0061 Cla_0062 rplW rplB TRUE 0.996 2.000 0.849 1.000 Y NA
 6887415 6887416 Cla_0062 Cla_0063 rplB rpsS TRUE 0.998 2.000 0.820 0.048 Y NA
 6887416 6887417 Cla_0063 Cla_0064 rpsS rplV TRUE 0.993 12.000 0.769 0.048 Y NA
 6887417 6887418 Cla_0064 Cla_0065 rplV rpsC TRUE 0.997 2.000 0.719 0.048 Y NA
 6887418 6887419 Cla_0065 Cla_0066 rpsC rplP TRUE 0.998 3.000 0.828 0.048 Y NA
 6887419 6887420 Cla_0066 Cla_0067 rplP rpmC TRUE 0.995 -13.000 0.802 0.036 Y NA
 6887420 6887421 Cla_0067 Cla_0068 rpmC rpsQ TRUE 0.997 10.000 0.828 0.036 Y NA
 6887421 6887422 Cla_0068 Cla_0069 rpsQ rplN TRUE 0.998 0.000 0.791 0.048 Y NA
 6887422 6887423 Cla_0069 Cla_0070 rplN rplX TRUE 0.998 0.000 0.810 0.048 Y NA
 6887423 6887424 Cla_0070 Cla_0071 rplX rplE TRUE 0.998 2.000 0.758 0.036 Y NA
 6887424 6887425 Cla_0071 Cla_0072 rplE rpsN TRUE 0.996 2.000 0.496 0.036 Y NA
 6887425 6887426 Cla_0072 Cla_0073 rpsN rpsH TRUE 0.987 13.000 0.473 0.036 Y NA
 6887426 6887427 Cla_0073 Cla_0074 rpsH rplF TRUE 0.942 77.000 0.808 0.036 Y NA
 6887427 6887428 Cla_0074 Cla_0075 rplF rplR TRUE 0.996 11.000 0.815 0.036 Y NA
 6887428 6887429 Cla_0075 Cla_0076 rplR rpsE TRUE 0.994 -16.000 0.814 0.048 Y NA
 6887429 6887430 Cla_0076 Cla_0077 rpsE rplO TRUE 0.990 4.000 0.148 0.048 Y NA
 6887430 6887431 Cla_0077 Cla_0078 rplO secY TRUE 0.994 0.000 0.730 1.000 N NA
 6887431 6887432 Cla_0078 Cla_0079 secY murI FALSE 0.158 41.000 0.000 1.000 N NA
 6887432 6887433 Cla_0079 Cla_0080 murI ansA FALSE 0.077 101.000 0.000 1.000 N NA
 6887433 6887434 Cla_0080 Cla_0081 ansA rbr FALSE 0.080 84.000 0.000 1.000 N NA
 6887434 6887435 Cla_0081 Cla_0082 rbr   FALSE 0.103 55.000 0.000 NA N NA
 6887435 6887436 Cla_0082 Cla_0083   rnhB TRUE 0.901 0.000 0.004 NA Y NA
 6887436 6887437 Cla_0083 Cla_0084 rnhB sdaC FALSE 0.070 380.000 0.000 NA N NA
 6887437 6887438 Cla_0084 Cla_0085 sdaC sdaA TRUE 0.976 12.000 0.400 NA Y NA
 6887438 6887439 Cla_0085 Cla_0086 sdaA map FALSE 0.078 90.000 0.000 1.000 N NA
 6887440 6887441 Cla_0087 Cla_0088     TRUE 0.985 -16.000 0.800 1.000 N NA
 6887441 6887442 Cla_0088 Cla_0089     FALSE 0.116 57.000 0.000 1.000   NA
 6887443 6887444 Cla_0090 Cla_0091 infA rpmJ FALSE 0.501 176.000 0.104 1.000   NA
 6887444 6887445 Cla_0091 Cla_0092 rpmJ rpsM TRUE 0.989 4.000 0.194 0.036   NA
 6887445 6887446 Cla_0092 Cla_0093 rpsM rpsK TRUE 0.997 10.000 0.810 0.036 Y NA
 6887446 6887447 Cla_0093 Cla_0094 rpsK rpsD TRUE 0.958 31.000 0.509 0.048 Y NA
 6887447 6887448 Cla_0094 Cla_0095 rpsD rpoA TRUE 0.959 15.000 0.549 1.000 N NA
 6887448 6887449 Cla_0095 Cla_0096 rpoA rplQ TRUE 0.995 4.000 0.873 1.000 N NA
 6887449 6887450 Cla_0096 Cla_0097 rplQ hisG FALSE 0.159 111.000 0.004 1.000 N NA
 6887450 6887451 Cla_0097 Cla_0098 hisG hisD TRUE 0.988 10.000 0.171 0.010 Y NA
 6887451 6887452 Cla_0098 Cla_0099 hisD hisB TRUE 0.966 -3.000 0.010 0.010 Y NA
 6887452 6887453 Cla_0099 Cla_0100 hisB   FALSE 0.150 34.000 0.000 NA   NA
 6887453 6887454 Cla_0100 Cla_0101   hisH1 FALSE 0.212 22.000 0.000 NA   NA
 6887454 6887455 Cla_0101 Cla_0102 hisH1 hisA TRUE 0.993 7.000 0.210 0.010 Y NA
 6887455 6887456 Cla_0102 Cla_0103 hisA hisF1 TRUE 0.989 -18.000 0.433 0.010 Y NA
 6887456 6887457 Cla_0103 Cla_0104 hisF1 hisIE TRUE 0.990 12.000 0.430 0.010 Y NA
 6887457 6887458 Cla_0104 Cla_0105 hisIE   FALSE 0.076 123.000 0.000 1.000 N NA
 6887458 6887459 Cla_0105 Cla_0106     FALSE 0.067 230.000 0.000 NA   NA
 6887459 6887460 Cla_0106 Cla_0107   flgE1 FALSE 0.064 136.000 0.000 NA   NA
 6887461 6887462 Cla_0108 Cla_0109     FALSE 0.076 129.000 0.000 1.000   NA
 6887463 6887464 Cla_0110 Cla_0111     TRUE 0.929 -13.000 0.107 NA   NA
 6887464 6887465 Cla_0111 Cla_0112   murE TRUE 0.891 -16.000 0.057 NA   NA
 6887465 6887466 Cla_0112 Cla_0113 murE   TRUE 0.857 1.000 0.006 NA   NA
 6887466 6887467 Cla_0113 Cla_0114     TRUE 0.877 -3.000 0.010 NA   NA
 6887467 6887468 Cla_0114 Cla_0115   ispA TRUE 0.977 -3.000 0.167 1.000   NA
 6887468 6887469 Cla_0115 Cla_0116 ispA tkt TRUE 0.987 4.000 0.375 1.000 N NA
 6887469 6887470 Cla_0116 Cla_0117 tkt iamB TRUE 0.947 -10.000 0.132 NA N NA
 6887470 6887471 Cla_0117 Cla_0118 iamB iamA TRUE 0.996 -3.000 0.912 NA Y NA
 6887471 6887472 Cla_0118 Cla_0119 iamA   TRUE 0.996 0.000 0.912 NA Y NA
 6887472 6887473 Cla_0119 Cla_0120     TRUE 0.970 2.000 0.120 NA   NA
 6887473 6887474 Cla_0120 Cla_0121     FALSE 0.460 44.000 0.027 NA   NA
 6887476 6887477 Cla_0123 Cla_0124     TRUE 0.675 66.000 0.250 NA   NA
 6887478 6887479 Cla_0125 Cla_0126   ung FALSE 0.116 50.000 0.000 NA   NA
 6887479 6887480 Cla_0126 Cla_0127 ung   TRUE 0.691 9.000 0.000 1.000 N NA
 6887480 6887481 Cla_0127 Cla_0128     TRUE 0.723 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 6887481 6887482 Cla_0128 Cla_0129     TRUE 0.987 2.000 0.400 NA   NA
 6887482 6887483 Cla_0129 Cla_0130     FALSE 0.087 63.000 0.000 NA   NA
 6887484 6887485 Cla_0131 Cla_0132 mutY   TRUE 0.582 -10.000 0.000 1.000   NA
 6887490 6887491 Cla_0137 Cla_0138 ktrA ktrB TRUE 0.997 -3.000 0.647 0.007 Y NA
 6887491 6887492 Cla_0138 Cla_0139 ktrB   FALSE 0.188 89.000 0.000 0.072   NA
 6887492 6887493 Cla_0139 Cla_0140   aspA TRUE 0.865 20.000 0.195 1.000   NA
 6887493 6887494 Cla_0140 Cla_0141 aspA   FALSE 0.084 392.000 0.000 1.000 N NA
 6887494 6887495 Cla_0141 Cla_0142     FALSE 0.065 175.000 0.000 NA   NA
 6887495 6887496 Cla_0142 Cla_0143     FALSE 0.084 64.000 0.000 NA   NA
 6887496 6887497 Cla_0143 Cla_0144     TRUE 0.848 13.000 0.047 NA   NA
 6887497 6887498 Cla_0144 Cla_0145   moaC TRUE 0.877 -22.000 0.057 NA   NA
 6887499 6887500 Cla_0146 Cla_0147     TRUE 0.695 3.000 0.000 NA   NA
 6887503 6887504 Cla_0150 Cla_0151     TRUE 0.988 -10.000 0.788 NA   NA
 6887504 6887505 Cla_0151 Cla_0152   eno TRUE 0.960 -3.000 0.080 NA   NA
 6887505 6887506 Cla_0152 Cla_0153 eno recA TRUE 0.945 0.000 0.033 1.000 N NA
 6887507 6887508 Cla_0154 Cla_0155   fliQ TRUE 0.697 27.000 0.068 NA   NA
 6887508 6887509 Cla_0155 Cla_0156 fliQ murB TRUE 0.961 -3.000 0.066 1.000 N NA
 6887510 6887511 Cla_0157 Cla_0158   cysQ TRUE 0.946 0.000 0.039 NA   NA
 6887511 6887512 Cla_0158 Cla_0159 cysQ   FALSE 0.134 103.000 0.000 1.000 Y NA
 6887512 6887513 Cla_0159 Cla_0160   bioB TRUE 0.785 -19.000 0.017 1.000 N NA
 6887513 6887514 Cla_0160 Cla_0161 bioB topA TRUE 0.888 0.000 0.009 1.000 N NA
 6887515 6887516 Cla_0162 Cla_0163 maf2 flaA TRUE 0.820 76.000 0.667 NA   NA
 6887516 6887517 Cla_0163 Cla_0164 flaA flaB TRUE 0.959 106.000 1.000 0.004 Y NA
 6887518 6887519 Cla_0165 Cla_0166 maf3 maf4 TRUE 0.980 10.000 0.400 NA   NA
 6887519 6887520 Cla_0166 Cla_0167 maf4 maf5 TRUE 0.980 -7.000 0.400 NA   NA
 6887520 6887521 Cla_0167 Cla_0168 maf5 maf6 FALSE 0.274 17.000 0.000 NA   NA
 6887521 6887522 Cla_0168 Cla_0169 maf6 pseI TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 6887523 6887524 Cla_0170 Cla_0171   fliN TRUE 0.992 -3.000 0.625 NA   NA
 6887524 6887525 Cla_0171 Cla_0172 fliN   TRUE 0.990 -3.000 0.531 NA   NA
 6887526 6887527 Cla_0173 Cla_0174   fdxB TRUE 0.994 0.000 0.806 NA   NA
 6887527 6887528 Cla_0174 Cla_0175 fdxB   TRUE 0.580 115.000 0.200 NA   NA
 6887528 6887529 Cla_0175 Cla_0176   folB FALSE 0.465 78.000 0.067 1.000 N NA
 6887529 6887530 Cla_0176 Cla_0177 folB   TRUE 0.924 -15.000 0.096 1.000   NA
 6887531 6887532 Cla_0178 Cla_0179     FALSE 0.077 93.000 0.000 1.000   NA
 6887532 6887533 Cla_0179 Cla_0180     TRUE 0.902 18.000 0.302 NA   NA
 6887533 6887534 Cla_0180 Cla_0181     TRUE 0.734 25.000 0.087 NA   NA
 6887534 6887535 Cla_0181 Cla_0182     TRUE 0.981 10.000 0.414 NA   NA
 6887535 6887536 Cla_0182 Cla_0183   rplU FALSE 0.153 125.000 0.005 NA   NA
 6887536 6887537 Cla_0183 Cla_0184 rplU rpmA TRUE 0.995 11.000 0.667 0.034 Y NA
 6887537 6887538 Cla_0184 Cla_0185 rpmA obg TRUE 0.689 96.000 0.335 1.000   NA
 6887538 6887539 Cla_0185 Cla_0186 obg fmt FALSE 0.159 143.000 0.004 1.000   NA
 6887539 6887540 Cla_0186 Cla_0187 fmt birA TRUE 0.837 -19.000 0.029 1.000 N NA
 6887540 6887541 Cla_0187 Cla_0188 birA parA TRUE 0.949 -3.000 0.040 1.000 N NA
 6887541 6887542 Cla_0188 Cla_0189 parA parB TRUE 0.995 4.000 0.827 1.000 N NA
 6887542 6887543 Cla_0189 Cla_0190 parB atpF' FALSE 0.436 64.000 0.037 1.000 N NA
 6887543 6887544 Cla_0190 Cla_0191 atpF' atpF TRUE 0.985 10.000 0.110 0.009 Y NA
 6887544 6887545 Cla_0191 Cla_0192 atpF atpH TRUE 0.992 0.000 0.132 0.009 Y NA
 6887545 6887546 Cla_0192 Cla_0193 atpH atpA TRUE 0.998 10.000 0.864 0.009 Y NA
 6887546 6887547 Cla_0193 Cla_0194 atpA atpG TRUE 0.997 10.000 0.846 0.009 Y NA
 6887547 6887548 Cla_0194 Cla_0195 atpG atpD TRUE 0.989 15.000 0.724 0.009 Y NA
 6887548 6887549 Cla_0195 Cla_0196 atpD atpC TRUE 0.998 4.000 0.837 0.009 Y NA
 6887549 6887550 Cla_0196 Cla_0197 atpC exbB1 TRUE 0.949 0.000 0.036 1.000 N NA
 6887550 6887551 Cla_0197 Cla_0198 exbB1 exbD1 TRUE 0.998 4.000 0.944 0.042 Y NA
 6887551 6887552 Cla_0198 Cla_0199 exbD1 tonB1 TRUE 0.985 4.000 0.343 NA   NA
 6887552 6887553 Cla_0199 Cla_0200 tonB1   TRUE 0.978 -3.000 0.213 NA   NA
 6887553 6887554 Cla_0200 Cla_0201   pal TRUE 0.840 69.000 0.702 NA N NA
 6887554 6887555 Cla_0201 Cla_0202 pal   TRUE 0.985 12.000 0.794 1.000   NA
 6887555 6887556 Cla_0202 Cla_0203   slyD TRUE 0.964 14.000 0.543 1.000   NA
 6887556 6887557 Cla_0203 Cla_0204 slyD fabD TRUE 0.904 0.000 0.013 1.000 N NA
 6887557 6887558 Cla_0204 Cla_0205 fabD pfs TRUE 0.947 -3.000 0.037 1.000 N NA
 6887558 6887559 Cla_0205 Cla_0206 pfs   TRUE 0.950 -3.000 0.042 1.000 N NA
 6887559 6887560 Cla_0206 Cla_0207     TRUE 0.838 -7.000 0.009 1.000 N NA
 6887560 6887561 Cla_0207 Cla_0208     TRUE 0.869 2.000 0.007 NA   NA
 6887562 6887563 Cla_0209 Cla_0210   dusB FALSE 0.089 62.000 0.000 NA   NA
 6887563 6887564 Cla_0210 Cla_0211 dusB   TRUE 0.912 -3.000 0.021 NA   NA
 6887564 6887565 Cla_0211 Cla_0212     TRUE 0.990 -3.000 0.523 NA   NA
 6887565 6887566 Cla_0212 Cla_0213     TRUE 0.921 9.000 0.029 NA   NA
 6887566 6887567 Cla_0213 Cla_0214   accD TRUE 0.944 3.000 0.035 NA   NA
 6887567 6887568 Cla_0214 Cla_0215 accD   FALSE 0.266 51.000 0.004 1.000 N NA
 6887569 6887570 Cla_0216 Cla_0217 tyrA   FALSE 0.087 73.000 0.000 1.000 N NA
 6887570 6887571 Cla_0217 Cla_0218   lpxC TRUE 0.949 3.000 0.022 1.000 Y NA
 6887571 6887572 Cla_0218 Cla_0219 lpxC   TRUE 0.863 12.000 0.035 NA   NA
 6887572 6887573 Cla_0219 Cla_0220   thrB TRUE 0.927 9.000 0.032 NA   NA
 6887573 6887574 Cla_0220 Cla_0221 thrB   TRUE 0.662 25.000 0.044 NA N NA
 6887574 6887575 Cla_0221 Cla_0222   infB TRUE 0.933 -19.000 0.171 NA N NA
 6887575 6887576 Cla_0222 Cla_0223 infB rbfA TRUE 0.993 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 6887576 6887577 Cla_0223 Cla_0224 rbfA   TRUE 0.889 -10.000 0.033 NA   NA
 6887577 6887578 Cla_0224 Cla_0225     FALSE 0.138 122.000 0.002 NA   NA
 6887581 6887582 Cla_0228 Cla_0229 pspA   TRUE 0.893 -12.000 0.035 1.000 N NA
 6887583 6887584 Cla_0230 Cla_0231 aroQ pepQ TRUE 0.983 -3.000 0.168 1.000 Y NA
 6887584 6887585 Cla_0231 Cla_0232 pepQ folK TRUE 0.945 2.000 0.033 1.000 N NA
 6887585 6887586 Cla_0232 Cla_0233 folK flhF TRUE 0.936 9.000 0.035 1.000 N NA
 6887586 6887587 Cla_0233 Cla_0234 flhF   TRUE 0.981 -7.000 0.382 1.000 N NA
 6887587 6887588 Cla_0234 Cla_0235     TRUE 0.880 16.000 0.159 NA   NA
 6887588 6887589 Cla_0235 Cla_0236   fliA TRUE 0.930 -13.000 0.112 NA   NA
 6887589 6887590 Cla_0236 Cla_0237 fliA fliM TRUE 0.972 1.000 0.118 1.000 N NA
 6887590 6887591 Cla_0237 Cla_0238 fliM fliY TRUE 0.986 -10.000 0.142 0.003 Y NA
 6887591 6887592 Cla_0238 Cla_0239 fliY   TRUE 0.961 -3.000 0.085 NA   NA
 6887592 6887593 Cla_0239 Cla_0240   trmU TRUE 0.704 -37.000 0.012 NA   NA
 6887594 6887595 Cla_0241 Cla_0242   pgpA FALSE 0.079 68.000 0.000 NA   NA
 6887595 6887596 Cla_0242 Cla_0243 pgpA   TRUE 0.959 3.000 0.052 1.000 N NA
 6887596 6887597 Cla_0243 Cla_0244     FALSE 0.467 -22.000 0.000 1.000 N NA
 6887597 6887598 Cla_0244 Cla_0245   ispDF TRUE 0.720 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6887599 6887600 Cla_0246 Cla_0247 mrp dapD TRUE 0.900 11.000 0.036 1.000 N NA
 6887601 6887602 Cla_0248 Cla_0249   pgi FALSE 0.212 129.000 0.011 1.000 N NA
 6887602 6887603 Cla_0249 Cla_0250 pgi galU TRUE 0.904 -6.000 0.023 1.000 N NA
 6887605 6887606 Cla_0252 Cla_0253     FALSE 0.113 51.000 0.000 NA   NA
 6887606 6887607 Cla_0253 Cla_0254     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6887608 6887609 Cla_0255 Cla_0256     TRUE 0.729 2.000 0.000 1.000   NA
 6887610 6887611 Cla_0257 Cla_0258     TRUE 0.880 -7.000 0.019 1.000 N NA
 6887612 6887613 Cla_0259 Cla_0260 prfB uspA FALSE 0.255 21.000 0.000 1.000 N NA
 6887613 6887614 Cla_0260 Cla_0261 uspA   TRUE 0.692 0.000 0.000 NA   NA
 6887619 6887620 Cla_0266 Cla_0267 murD mraY TRUE 0.997 0.000 0.647 0.010 Y NA
 6887621 6887622 Cla_0268 Cla_0269 pgm fabG TRUE 0.668 16.000 0.018 1.000 N NA
 6887623 6887624 Cla_0270 Cla_0271 acpS fliL TRUE 0.956 0.000 0.047 1.000 N NA
 6887624 6887625 Cla_0271 Cla_0272 fliL   FALSE 0.081 66.000 0.000 NA   NA
 6887626 6887627 Cla_0273 Cla_0274 katA   FALSE 0.560 51.000 0.061 NA   NA
 6887627 6887628 Cla_0274 Cla_0275   argH FALSE 0.127 44.000 0.000 NA   NA
 6887630 6887631 Cla_0277 Cla_0278     TRUE 0.980 4.000 0.238 NA N NA
 6887631 6887632 Cla_0278 Cla_0279   metC FALSE 0.381 14.000 0.000 1.000 N NA
 6887632 6887633 Cla_0279 Cla_0280 metC purB2 TRUE 0.725 4.000 0.000 1.000 N NA
 6887633 6887634 Cla_0280 Cla_0281 purB2   TRUE 0.710 7.000 0.000 1.000   NA
 6887634 6887635 Cla_0281 Cla_0282     FALSE 0.077 93.000 0.000 1.000   NA
 6887635 6887636 Cla_0282 Cla_0283   feoB TRUE 0.974 0.000 0.075 1.000 Y NA
 6887638 6887639 Cla_0285 Cla_0286 acpP1 fabF TRUE 0.771 28.000 0.066 1.000 Y NA
 6887639 6887640 Cla_0286 Cla_0287 fabF accA TRUE 0.968 2.000 0.046 1.000 Y NA
 6887640 6887641 Cla_0287 Cla_0289 accA   FALSE 0.074 72.000 0.000 NA   NA
 6887641 6887642 Cla_0289 Cla_0290   kpsM FALSE 0.074 886.000 0.000 NA   NA
 6887642 6887643 Cla_0290 Cla_0291 kpsM kpsT TRUE 0.988 -3.000 0.306 NA Y NA
 6887643 6887644 Cla_0291 Cla_0292 kpsT kpsE TRUE 0.975 -10.000 0.257 NA Y NA
 6887644 6887645 Cla_0292 Cla_0293 kpsE kpsD TRUE 0.984 0.000 0.200 NA Y NA
 6887645 6887646 Cla_0293 Cla_0294 kpsD kpsF TRUE 0.965 9.000 0.056 1.000 Y NA
 6887646 6887647 Cla_0294 Cla_0295 kpsF   TRUE 0.835 0.000 0.000 1.000 Y NA
 6887647 6887648 Cla_0295 Cla_0296     TRUE 0.720 -3.000 0.000 1.000   NA
 6887648 6887649 Cla_0296 Cla_0297     TRUE 0.985 12.000 0.400 0.013   NA
 6887649 6887650 Cla_0297 Cla_0298     FALSE 0.401 -33.000 0.000 NA   NA
 6887650 6887651 Cla_0298 Cla_0299     TRUE 0.692 0.000 0.000 NA   NA
 6887651 6887652 Cla_0299 Cla_0300     FALSE 0.066 201.000 0.000 NA   NA
 6887652 6887653 Cla_0300 Cla_0301     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6887653 6887654 Cla_0301 Cla_0302     TRUE 0.955 -3.000 0.061 NA   NA
 6887654 6887655 Cla_0302 Cla_0303     FALSE 0.433 -19.000 0.000 NA   NA
 6887655 6887656 Cla_0303 Cla_0304     TRUE 0.840 -7.000 0.012 NA   NA
 6887656 6887657 Cla_0304 Cla_0305     TRUE 0.960 -3.000 0.065 1.000   NA
 6887657 6887658 Cla_0305 Cla_0306     TRUE 0.915 -19.000 0.115 NA   NA
 6887658 6887659 Cla_0306 Cla_0307     TRUE 0.962 3.000 0.077 NA   NA
 6887659 6887660 Cla_0307 Cla_0308     TRUE 0.984 -7.000 0.467 NA   NA
 6887660 6887661 Cla_0308 Cla_0309     FALSE 0.491 -13.000 0.000 NA   NA
 6887661 6887662 Cla_0309 Cla_0310     TRUE 0.623 -6.000 0.000 NA   NA
 6887662 6887663 Cla_0310 Cla_0311     FALSE 0.131 43.000 0.000 NA   NA
 6887663 6887664 Cla_0311 Cla_0312     FALSE 0.103 55.000 0.000 NA   NA
 6887664 6887665 Cla_0312 Cla_0313     TRUE 0.807 388.000 0.263 0.012   NA
 6887665 6887666 Cla_0313 Cla_0314     TRUE 0.930 14.000 0.261 1.000 N NA
 6887666 6887667 Cla_0314 Cla_0315     TRUE 0.993 -3.000 0.667 1.000   NA
 6887667 6887668 Cla_0315 Cla_0316     TRUE 0.993 -3.000 0.679 1.000   NA
 6887668 6887669 Cla_0316 Cla_0317   cysC TRUE 0.948 -3.000 0.039 1.000 N NA
 6887669 6887670 Cla_0317 Cla_0318 cysC kpsC TRUE 0.948 -3.000 0.039 1.000 N NA
 6887670 6887671 Cla_0318 Cla_0319 kpsC kpsS TRUE 0.987 -3.000 0.056 0.003 Y NA
 6887673 6887674 Cla_0321 Cla_0322     TRUE 0.966 9.000 0.132 NA   NA
 6887674 6887675 Cla_0322 Cla_0323     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 6887677 6887678 Cla_0325 Cla_0326   miaB TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6887678 6887679 Cla_0326 Cla_0327 miaB   TRUE 0.839 -16.000 0.029 NA   NA
 6887679 6887680 Cla_0327 Cla_0328     TRUE 0.988 6.000 0.462 NA   NA
 6887680 6887681 Cla_0328 Cla_0329     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 6887681 6887682 Cla_0329 Cla_0330     TRUE 0.971 -16.000 0.448 NA   NA
 6887684 6887685 Cla_0332 Cla_0333 lgt frdC FALSE 0.215 78.000 0.010 1.000 N NA
 6887685 6887686 Cla_0333 Cla_0334 frdC frdA TRUE 0.974 -31.000 0.128 0.003 Y NA
 6887686 6887687 Cla_0334 Cla_0335 frdA frdB TRUE 0.989 -7.000 0.153 0.003 Y NA
 6887687 6887688 Cla_0335 Cla_0336 frdB   TRUE 0.800 -22.000 0.022 1.000   NA
 6887688 6887689 Cla_0336 Cla_0337     TRUE 0.994 -10.000 0.750 0.013   NA
 6887690 6887691 Cla_0338 Cla_0339 pnuC   FALSE 0.188 31.000 0.000 1.000 N NA
 6887691 6887692 Cla_0339 Cla_0340     TRUE 0.725 4.000 0.000 1.000   NA
 6887693 6887694 Cla_0341 Cla_0342     TRUE 0.969 -3.000 0.120 NA N NA
 6887696 6887697 Cla_0344 Cla_0345 hsdR rloE FALSE 0.521 11.000 0.000 NA   NA
 6887697 6887698 Cla_0345 Cla_0346 rloE rloG TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 6887698 6887699 Cla_0346 Cla_0347 rloG hsdS TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6887699 6887700 Cla_0347 Cla_0348 hsdS mloC FALSE 0.067 88.000 0.000 NA   NA
 6887700 6887701 Cla_0348 Cla_0349 mloC hsdM FALSE 0.536 -10.000 0.000 NA   NA
 6887702 6887703 Cla_0350 Cla_0351 moeA1 moaE TRUE 0.976 2.000 0.018 0.007 Y NA
 6887703 6887704 Cla_0351 Cla_0352 moaE moaD TRUE 0.991 4.000 0.501 1.000   NA
 6887704 6887705 Cla_0352 Cla_0353 moaD   TRUE 0.758 12.000 0.010 1.000   NA
 6887706 6887707 Cla_0354 Cla_0355 nspC fdhC FALSE 0.191 137.000 0.008 1.000 N NA
 6887707 6887708 Cla_0355 Cla_0356 fdhC   FALSE 0.100 64.000 0.000 1.000   NA
 6887708 6887709 Cla_0356 Cla_0357     TRUE 0.585 177.000 0.200 NA   NA
 6887709 6887710 Cla_0357 Cla_0358   fdhA FALSE 0.274 17.000 0.000 NA   NA
 6887710 6887711 Cla_0358 Cla_0359 fdhA fdhB TRUE 0.991 12.000 0.444 0.003 Y NA
 6887711 6887712 Cla_0359 Cla_0360 fdhB   FALSE 0.122 55.000 0.000 1.000   NA
 6887712 6887713 Cla_0360 Cla_0361     FALSE 0.491 48.000 0.031 1.000   NA
 6887713 6887714 Cla_0361 Cla_0362   selD FALSE 0.560 66.000 0.104 1.000 N NA
 6887714 6887715 Cla_0362 Cla_0363 selD putA FALSE 0.210 141.000 0.011 1.000 N NA
 6887715 6887716 Cla_0363 Cla_0364 putA putP TRUE 0.900 14.000 0.141 1.000 N NA
 6887717 6887718 Cla_0365 Cla_0366     TRUE 0.994 -3.000 0.844 NA   NA
 6887719 6887720 Cla_0367 Cla_0368   purA FALSE 0.169 29.000 0.000 NA   NA
 6887720 6887721 Cla_0368 Cla_0369 purA   TRUE 0.894 -3.000 0.014 NA   NA
 6887721 6887722 Cla_0369 Cla_0370     TRUE 0.974 0.000 0.147 NA   NA
 6887722 6887723 Cla_0370 Cla_0371     TRUE 0.591 62.000 0.120 NA   NA
 6887723 6887724 Cla_0371 Cla_0372   pyrAa TRUE 0.945 -3.000 0.041 NA   NA
 6887724 6887725 Cla_0372 Cla_0373 pyrAa   TRUE 0.880 -3.000 0.011 NA   NA
 6887725 6887726 Cla_0373 Cla_0374   ccoN FALSE 0.064 124.000 0.000 NA   NA
 6887726 6887727 Cla_0374 Cla_0375 ccoN ccoO TRUE 0.983 12.000 0.283 0.003 N NA
 6887727 6887728 Cla_0375 Cla_0376 ccoO ccoQ TRUE 0.997 9.000 0.738 0.003 N NA
 6887728 6887729 Cla_0376 Cla_0377 ccoQ ccoP TRUE 0.993 0.000 0.262 0.003 N NA
 6887729 6887730 Cla_0377 Cla_0378 ccoP   TRUE 0.968 0.000 0.105 NA   NA
 6887730 6887731 Cla_0378 Cla_0379     TRUE 0.760 143.000 0.526 NA   NA
 6887731 6887732 Cla_0379 Cla_0380     TRUE 0.938 -10.000 0.102 NA   NA
 6887732 6887733 Cla_0380 Cla_0381     TRUE 0.965 0.000 0.091 NA   NA
 6887733 6887734 Cla_0381 Cla_0382     TRUE 0.988 -3.000 0.117 0.045 Y NA
 6887734 6887735 Cla_0382 Cla_0383     FALSE 0.087 750.000 0.000 1.000 N NA
 6887735 6887736 Cla_0383 Cla_0384   rplM FALSE 0.076 159.000 0.000 1.000 N NA
 6887736 6887737 Cla_0384 Cla_0385 rplM rpsI TRUE 0.993 3.000 0.231 0.033 Y NA
 6887737 6887738 Cla_0385 Cla_0386 rpsI cadF FALSE 0.301 247.000 0.024 1.000 N NA
 6887738 6887739 Cla_0386 Cla_0387 cadF   TRUE 0.962 4.000 0.068 1.000   NA
 6887739 6887740 Cla_0387 Cla_0388     FALSE 0.418 118.000 0.056 1.000   NA
 6887740 6887741 Cla_0388 Cla_0389     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 6887741 6887742 Cla_0389 Cla_0390   ctsD TRUE 0.942 -28.000 0.250 NA   NA
 6887742 6887743 Cla_0390 Cla_0391 ctsD ctsX FALSE 0.479 -19.000 0.000 1.000   NA
 6887743 6887744 Cla_0391 Cla_0392 ctsX ctsE TRUE 0.636 -7.000 0.000 1.000   NA
 6887744 6887745 Cla_0392 Cla_0393 ctsE ctsF FALSE 0.137 192.000 0.000 1.000 Y NA
 6887746 6887747 Cla_0394 Cla_0395     TRUE 0.878 -15.000 0.035 1.000   NA
 6887747 6887748 Cla_0395 Cla_0396   flgK TRUE 0.966 0.000 0.084 1.000   NA
 6887748 6887749 Cla_0396 Cla_0397 flgK   TRUE 0.993 11.000 0.558 0.005   NA
 6887749 6887750 Cla_0397 Cla_0398     TRUE 0.902 43.000 0.677 NA   NA
 6887750 6887751 Cla_0398 Cla_0399     TRUE 0.807 61.000 0.469 NA   NA
 6887751 6887752 Cla_0399 Cla_0400   flgI TRUE 0.991 0.000 0.569 NA   NA
 6887752 6887753 Cla_0400 Cla_0401 flgI   FALSE 0.439 58.000 0.035 NA N NA
 6887753 6887754 Cla_0401 Cla_0402     TRUE 0.925 -7.000 0.043 NA   NA
 6887754 6887755 Cla_0402 Cla_0403     FALSE 0.456 -16.000 0.000 NA   NA
 6887755 6887756 Cla_0403 Cla_0404     FALSE 0.521 11.000 0.000 NA   NA
 6887757 6887758 Cla_0405 Cla_0406 thiL truD TRUE 0.803 -22.000 0.022 1.000   NA
 6887758 6887759 Cla_0406 Cla_0407 truD   FALSE 0.067 88.000 0.000 NA   NA
 6887759 6887760 Cla_0407 Cla_0408     TRUE 0.965 2.000 0.094 NA   NA
 6887760 6887761 Cla_0408 Cla_0409   fldA TRUE 0.987 1.000 0.391 NA   NA
 6887762 6887763 Cla_0410 Cla_0411     TRUE 0.636 -7.000 0.000 1.000   NA
 6887763 6887764 Cla_0411 Cla_0412     TRUE 0.963 -3.000 0.092 NA   NA
 6887764 6887765 Cla_0412 Cla_0413     TRUE 0.955 -7.000 0.120 NA   NA
 6887765 6887766 Cla_0413 Cla_0414   hydA FALSE 0.076 128.000 0.000 1.000   NA
 6887766 6887767 Cla_0414 Cla_0415 hydA tpiA TRUE 0.718 5.000 0.000 1.000 N NA
 6887767 6887768 Cla_0415 Cla_0416 tpiA pgk TRUE 0.946 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 6887768 6887769 Cla_0416 Cla_0417 pgk gapA TRUE 0.977 2.000 0.020 0.006 Y NA
 6887770 6887771 Cla_0418 Cla_0419     TRUE 0.917 14.000 0.221 NA   NA
 6887771 6887772 Cla_0419 Cla_0420     TRUE 0.591 10.000 0.000 NA   NA
 6887773 6887774 Cla_0421 Cla_0422     FALSE 0.084 64.000 0.000 NA   NA
 6887774 6887775 Cla_0422 Cla_0423     TRUE 0.593 -7.000 0.000 NA   NA
 6887775 6887776 Cla_0423 Cla_0424   fumC FALSE 0.149 44.000 0.000 1.000 N NA
 6887776 6887777 Cla_0424 Cla_0425 fumC glmS FALSE 0.180 129.000 0.007 1.000 N NA
 6887777 6887778 Cla_0425 Cla_0426 glmS   TRUE 0.985 4.000 0.312 1.000   NA
 6887779 6887780 Cla_0427 Cla_0428     TRUE 0.950 9.000 0.053 1.000   NA
 6887780 6887781 Cla_0428 Cla_0429     TRUE 0.956 2.000 0.048 1.000   NA
 6887781 6887782 Cla_0429 Cla_0430   bisC FALSE 0.105 62.000 0.000 1.000   NA
 6887782 6887783 Cla_0430 Cla_0431 bisC   TRUE 0.888 3.000 0.000 0.047   NA
 6887783 6887784 Cla_0431 Cla_0432     TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 6887784 6887785 Cla_0432 Cla_0433     TRUE 0.980 -3.000 0.237 NA   NA
 6887785 6887786 Cla_0433 Cla_0434   porA1 FALSE 0.071 398.000 0.000 NA   NA
 6887788 6887789 Cla_0436 Cla_0437     FALSE 0.113 51.000 0.000 NA   NA
 6887789 6887790 Cla_0437 Cla_0438     FALSE 0.521 11.000 0.000 NA   NA
 6887790 6887791 Cla_0438 Cla_0439     FALSE 0.064 110.000 0.000 NA   NA
 6887791 6887792 Cla_0439 Cla_0440   tuf FALSE 0.077 69.000 0.000 NA   NA
 6887792 6887793 Cla_0440 Cla_0441 tuf rpmG TRUE 0.754 40.000 0.099 1.000 Y NA
 6887793 6887794 Cla_0441 Cla_0442 rpmG   FALSE 0.212 22.000 0.000 NA   NA
 6887794 6887795 Cla_0442 Cla_0443   secE FALSE 0.231 20.000 0.000 NA   NA
 6887795 6887796 Cla_0443 Cla_0444 secE nusG TRUE 0.995 5.000 0.843 1.000   NA
 6887796 6887797 Cla_0444 Cla_0445 nusG rplK TRUE 0.942 24.000 0.681 1.000 N NA
 6887797 6887798 Cla_0445 Cla_0446 rplK rplA TRUE 0.953 64.000 0.838 0.043 Y NA
 6887798 6887799 Cla_0446 Cla_0447 rplA rplJ TRUE 0.835 155.000 0.302 0.043 Y NA
 6887799 6887800 Cla_0447 Cla_0448 rplJ rplL TRUE 0.988 19.000 0.884 0.032 Y NA
 6887800 6887801 Cla_0448 Cla_0449 rplL rpoB TRUE 0.620 97.000 0.223 1.000   NA
 6887801 6887802 Cla_0449 Cla_0450 rpoB rpoC TRUE 0.997 -7.000 0.851 0.002   NA
 6887802 6887803 Cla_0450 Cla_0451 rpoC rpsL FALSE 0.523 127.000 0.122 1.000 N NA
 6887803 6887804 Cla_0451 Cla_0452 rpsL rpsG TRUE 0.938 68.000 0.620 0.007 Y NA
 6887804 6887805 Cla_0452 Cla_0453 rpsG fusA TRUE 0.980 13.000 0.579 1.000 Y NA
 6887806 6887807 Cla_0454 Cla_0455     FALSE 0.537 -13.000 0.000 1.000   NA
 6887807 6887808 Cla_0455 Cla_0456     FALSE 0.516 79.000 0.103 1.000   NA
 6887808 6887809 Cla_0456 Cla_0457     TRUE 0.878 1.000 0.000 0.066 N NA
 6887810 6887811 Cla_0458 Cla_0459   modB FALSE 0.170 36.000 0.000 1.000 N NA
 6887811 6887812 Cla_0459 Cla_0460 modB   FALSE 0.072 591.000 0.000 NA   NA
 6887812 6887813 Cla_0460 Cla_0461     FALSE 0.067 253.000 0.000 NA   NA
 6887813 6887814 Cla_0461 Cla_0462     TRUE 0.591 10.000 0.000 NA   NA
 6887814 6887815 Cla_0462 Cla_0463     FALSE 0.071 430.000 0.000 NA   NA
 6887815 6887816 Cla_0463 Cla_0464     FALSE 0.068 280.000 0.000 NA   NA
 6887816 6887817 Cla_0464 Cla_0465     FALSE 0.073 832.000 0.000 NA   NA
 6887818 6887819 Cla_0466 Cla_0467 tonB2 exbD2 TRUE 0.872 -3.000 0.000 0.087 N NA
 6887819 6887820 Cla_0467 Cla_0468 exbD2 exbB2 TRUE 0.997 -7.000 0.815 0.039 Y NA
 6887822 6887823 Cla_0470 Cla_0471 dnaX rho TRUE 0.891 3.000 0.009 1.000 N NA
 6887824 6887825 Cla_0472 Cla_0473     TRUE 0.995 -3.000 0.713 NA Y NA
 6887827 6887828 Cla_0475 Cla_0476   waaD TRUE 0.966 -3.000 0.093 1.000 N NA
 6887828 6887829 Cla_0476 Cla_0477 waaD waaE TRUE 0.965 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 6887829 6887830 Cla_0477 Cla_0478 waaE gmhA TRUE 0.954 -10.000 0.142 1.000 N NA
 6887831 6887832 Cla_0479 Cla_0480 pyk mqo TRUE 0.882 13.000 0.073 1.000   NA
 6887832 6887833 Cla_0480 Cla_0481 mqo   FALSE 0.181 108.000 0.007 1.000   NA
 6887833 6887834 Cla_0481 Cla_0482     TRUE 0.822 -13.000 0.021 NA   NA
 6887834 6887835 Cla_0482 Cla_0483     TRUE 0.970 2.000 0.118 NA   NA
 6887835 6887836 Cla_0483 Cla_0484     TRUE 0.962 -3.000 0.086 NA   NA
 6887837 6887838 Cla_0485 Cla_0486 gatC   FALSE 0.425 22.000 0.003 1.000   NA
 6887838 6887839 Cla_0486 Cla_0487   fur TRUE 0.871 -10.000 0.023 1.000   NA
 6887839 6887840 Cla_0487 Cla_0488 fur lysS TRUE 0.858 11.000 0.022 1.000 N NA
 6887840 6887841 Cla_0488 Cla_0489 lysS glyA TRUE 0.953 1.000 0.044 1.000 N NA
 6887841 6887842 Cla_0489 Cla_0490 glyA   TRUE 0.982 -3.000 0.271 NA   NA
 6887842 6887843 Cla_0490 Cla_0491     TRUE 0.919 18.000 0.387 NA   NA
 6887843 6887844 Cla_0491 Cla_0492   aroE TRUE 0.909 -3.000 0.020 NA   NA
 6887846 6887847 Cla_0494 Cla_0495 racR racS TRUE 0.992 -3.000 0.448 1.000 Y NA
 6887847 6887848 Cla_0495 Cla_0496 racS recR TRUE 0.899 2.000 0.011 1.000 N NA
 6887849 6887850 Cla_0497 Cla_0498   uvrC TRUE 0.848 -3.000 0.005 NA   NA
 6887850 6887851 Cla_0498 Cla_0499 uvrC   TRUE 0.866 -7.000 0.018 NA   NA
 6887852 6887853 Cla_0500 Cla_0501 nhaD guaA TRUE 0.805 10.000 0.004 1.000 N NA
 6887855 6887856 Cla_0503 Cla_0504   purD FALSE 0.068 262.000 0.000 NA   NA
 6887856 6887857 Cla_0504 Cla_0505 purD   TRUE 0.901 -3.000 0.017 NA   NA
 6887857 6887858 Cla_0505 Cla_0506     TRUE 0.962 -7.000 0.149 NA   NA
 6887858 6887859 Cla_0506 Cla_0507     TRUE 0.978 0.000 0.165 1.000   NA
 6887859 6887860 Cla_0507 Cla_0508   pnp FALSE 0.312 133.000 0.028 1.000   NA
 6887860 6887861 Cla_0508 Cla_0509 pnp   FALSE 0.066 89.000 0.000 NA   NA
 6887861 6887862 Cla_0509 Cla_0510     FALSE 0.274 17.000 0.000 NA   NA
 6887862 6887863 Cla_0510 Cla_0511     FALSE 0.204 23.000 0.000 NA   NA
 6887863 6887864 Cla_0511 Cla_0512     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 6887864 6887865 Cla_0512 Cla_0513     FALSE 0.274 17.000 0.000 NA   NA
 6887865 6887866 Cla_0513 Cla_0514     FALSE 0.204 23.000 0.000 NA   NA
 6887866 6887867 Cla_0514 Cla_0515     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 6887867 6887868 Cla_0515 Cla_0516     TRUE 0.650 9.000 0.000 NA   NA
 6887868 6887869 Cla_0516 Cla_0517     FALSE 0.072 537.000 0.000 NA   NA
 6887869 6887870 Cla_0517 Cla_0518     FALSE 0.067 253.000 0.000 NA   NA
 6887870 6887871 Cla_0518 Cla_0519     TRUE 0.591 10.000 0.000 NA   NA
 6887871 6887872 Cla_0519 Cla_0520     FALSE 0.071 430.000 0.000 NA   NA
 6887872 6887873 Cla_0520 Cla_0521     FALSE 0.068 280.000 0.000 NA   NA
 6887873 6887874 Cla_0521 Cla_0522     FALSE 0.074 955.000 0.000 NA   NA
 6887874 6887875 Cla_0522 Cla_0523     TRUE 0.991 3.000 0.529 NA   NA
 6887877 6887878 Cla_0525 Cla_0526 secA   TRUE 0.691 9.000 0.000 1.000 N NA
 6887878 6887879 Cla_0526 Cla_0527   asd TRUE 0.754 14.000 0.025 1.000 N NA
 6887879 6887880 Cla_0527 Cla_0528 asd   TRUE 0.822 12.000 0.025 NA   NA
 6887880 6887881 Cla_0528 Cla_0529   hemE TRUE 0.723 13.000 0.016 NA   NA
 6887881 6887882 Cla_0529 Cla_0530 hemE   TRUE 0.911 -3.000 0.017 1.000 N NA
 6887882 6887883 Cla_0530 Cla_0531     FALSE 0.077 69.000 0.000 NA   NA
 6887884 6887885 Cla_0532 Cla_0533   serS TRUE 0.895 9.000 0.016 1.000   NA
 6887885 6887886 Cla_0533 Cla_0534 serS trpS TRUE 0.902 12.000 0.010 0.058 Y NA
 6887886 6887887 Cla_0534 Cla_0535 trpS aroK TRUE 0.720 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6887887 6887888 Cla_0535 Cla_0536 aroK   FALSE 0.502 -16.000 0.000 1.000   NA
 6887889 6887890 Cla_0537 Cla_0538     TRUE 0.788 -10.000 0.000 0.085   NA
 6887890 6887891 Cla_0538 Cla_0539   kdsA FALSE 0.292 18.000 0.000 1.000 N NA
 6887891 6887892 Cla_0539 Cla_0540 kdsA ribH TRUE 0.803 13.000 0.027 1.000 N NA
 6887892 6887893 Cla_0540 Cla_0541 ribH nusB TRUE 0.954 2.000 0.045 1.000 N NA
 6887893 6887894 Cla_0541 Cla_0542 nusB pyrF TRUE 0.924 -3.000 0.023 1.000 N NA
 6887895 6887896 Cla_0543 Cla_0544     TRUE 0.977 12.000 0.556 NA N NA
 6887896 6887897 Cla_0544 Cla_0545   purH FALSE 0.528 16.000 0.003 1.000 N NA
 6887897 6887898 Cla_0545 Cla_0546 purH   TRUE 0.720 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6887898 6887899 Cla_0546 Cla_0547   purL TRUE 0.733 3.000 0.000 1.000 N NA
 6887899 6887900 Cla_0547 Cla_0548 purL trmE TRUE 0.680 13.000 0.008 1.000   NA
 6887900 6887901 Cla_0548 Cla_0549 trmE   TRUE 0.951 -3.000 0.049 NA   NA
 6887901 6887902 Cla_0549 Cla_0550   oxaA TRUE 0.894 -16.000 0.061 NA   NA
 6887902 6887903 Cla_0550 Cla_0551 oxaA   TRUE 0.963 -36.000 0.461 NA   NA
 6887903 6887904 Cla_0551 Cla_0552   rnpA TRUE 0.980 -12.000 0.540 NA   NA
 6887904 6887905 Cla_0552 Cla_0553 rnpA rpmH TRUE 0.854 78.000 0.787 1.000   NA
 6887906 6887907 Cla_0554 Cla_0555     TRUE 0.969 0.000 0.102 1.000   NA
 6887907 6887908 Cla_0555 Cla_0556     TRUE 0.984 -3.000 0.323 NA   NA
 6887909 6887910 Cla_0557 Cla_0558     FALSE 0.125 54.000 0.000 1.000   NA
 6887911 6887912 Cla_0559 Cla_0560   astA TRUE 0.706 44.000 0.143 NA   NA
 6887913 6887914 Cla_0561 Cla_0562   pepD FALSE 0.078 198.000 0.000 1.000   NA
 6887915 6887916 Cla_0563 Cla_0564     TRUE 0.650 9.000 0.000 NA   NA
 6887917 6887918 Cla_0565 Cla_0566     TRUE 0.901 3.000 0.015 NA   NA
 6887918 6887919 Cla_0566 Cla_0567   flaC FALSE 0.138 39.000 0.000 NA   NA
 6887919 6887920 Cla_0567 Cla_0568 flaC   TRUE 0.840 21.000 0.172 NA   NA
 6887920 6887921 Cla_0568 Cla_0569     FALSE 0.569 31.000 0.033 NA   NA
 6887921 6887922 Cla_0569 Cla_0570     TRUE 0.961 -3.000 0.068 1.000 N NA
 6887922 6887923 Cla_0570 Cla_0571     FALSE 0.287 56.000 0.009 1.000   NA
 6887924 6887925 Cla_0572 Cla_0573   psd TRUE 0.966 1.000 0.089 1.000   NA
 6887926 6887927 Cla_0574 Cla_0575     TRUE 0.966 3.000 0.083 1.000   NA
 6887927 6887928 Cla_0575 Cla_0576     TRUE 0.582 -10.000 0.000 1.000   NA
 6887928 6887929 Cla_0576 Cla_0577     TRUE 0.979 -6.000 0.318 NA   NA
 6887929 6887930 Cla_0577 Cla_0578     TRUE 0.944 -16.000 0.200 NA   NA
 6887930 6887931 Cla_0578 Cla_0579   hemL TRUE 0.960 -3.000 0.077 NA   NA
 6887931 6887932 Cla_0579 Cla_0580 hemL   TRUE 0.980 -3.000 0.212 1.000   NA
 6887933 6887934 Cla_0581 Cla_0582 folD lepP TRUE 0.970 -3.000 0.117 1.000 N NA
 6887934 6887935 Cla_0582 Cla_0583 lepP aspB FALSE 0.077 165.000 0.000 1.000 N NA
 6887935 6887936 Cla_0583 Cla_0584 aspB tgt FALSE 0.078 91.000 0.000 1.000 N NA
 6887936 6887937 Cla_0584 Cla_0585 tgt   TRUE 0.986 -6.000 0.444 1.000 N NA
 6887939 6887940 Cla_0587 Cla_0588 pycA   TRUE 0.987 -3.000 0.400 NA   NA
 6887940 6887941 Cla_0588 Cla_0589     TRUE 0.904 0.000 0.016 NA   NA
 6887941 6887942 Cla_0589 Cla_0590     TRUE 0.635 19.000 0.022 1.000   NA
 6887942 6887943 Cla_0590 Cla_0591   ftsW FALSE 0.088 71.000 0.000 1.000   NA
 6887943 6887944 Cla_0591 Cla_0592 ftsW cjaC FALSE 0.078 193.000 0.000 1.000 N NA
 6887946 6887947 Cla_0594 Cla_0595     TRUE 0.977 3.000 0.150 1.000   NA
 6887947 6887948 Cla_0595 Cla_0596     FALSE 0.131 43.000 0.000 NA   NA
 6887948 6887949 Cla_0596 Cla_0597     FALSE 0.256 18.000 0.000 NA   NA
 6887950 6887951 Cla_0598 Cla_0599     TRUE 0.965 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 6887952 6887953 Cla_0600 Cla_0601   glyS FALSE 0.077 174.000 0.000 1.000 N NA
 6887953 6887954 Cla_0601 Cla_0602 glyS   TRUE 0.879 -3.000 0.008 1.000 N NA
 6887954 6887955 Cla_0602 Cla_0603     TRUE 0.890 0.000 0.012 NA   NA
 6887957 6887958 Cla_0605 Cla_0606     FALSE 0.274 17.000 0.000 NA   NA
 6887959 6887960 Cla_0607 Cla_0608   rodA FALSE 0.108 53.000 0.000 NA   NA
 6887961 6887962 Cla_0609 Cla_0610 rluD'   TRUE 0.806 -46.000 0.031 NA   NA
 6887962 6887963 Cla_0610 Cla_0611   trmB TRUE 0.957 0.000 0.060 NA   NA
 6887963 6887964 Cla_0611 Cla_0612 trmB ftsE TRUE 0.648 30.000 0.044 1.000   NA
 6887964 6887965 Cla_0612 Cla_0613 ftsE ftsX TRUE 0.852 -13.000 0.024 1.000   NA
 6887965 6887966 Cla_0613 Cla_0614 ftsX   TRUE 0.873 -3.000 0.000 0.084   NA
 6887966 6887967 Cla_0614 Cla_0615   pyrH FALSE 0.119 56.000 0.000 1.000 N NA
 6887967 6887968 Cla_0615 Cla_0616 pyrH rpoZ TRUE 0.933 9.000 0.033 1.000 N NA
 6887968 6887969 Cla_0616 Cla_0617 rpoZ spoT TRUE 0.912 -16.000 0.039 1.000 Y NA
 6887969 6887970 Cla_0617 Cla_0618 spoT tyrS TRUE 0.856 13.000 0.045 1.000 N NA
 6887970 6887971 Cla_0618 Cla_0619 tyrS   TRUE 0.854 -3.000 0.003 1.000   NA
 6887971 6887972 Cla_0619 Cla_0620   amiA TRUE 0.920 -7.000 0.034 1.000   NA
 6887972 6887973 Cla_0620 Cla_0621 amiA   TRUE 0.916 -3.000 0.020 1.000 N NA
 6887973 6887974 Cla_0621 Cla_0622     FALSE 0.064 131.000 0.000 NA   NA
 6887975 6887976 Cla_0623 Cla_0624   pgsA TRUE 0.960 -3.000 0.023 0.063 N NA
 6887976 6887977 Cla_0624 Cla_0625 pgsA   FALSE 0.468 52.000 0.017 1.000 Y NA
 6887977 6887978 Cla_0625 Cla_0626   dapA TRUE 0.982 0.000 0.238 1.000 N NA
 6887978 6887979 Cla_0626 Cla_0627 dapA   TRUE 0.964 -10.000 0.217 1.000   NA
 6887979 6887980 Cla_0627 Cla_0628   pyrD TRUE 0.954 -3.000 0.048 1.000   NA
 6887980 6887981 Cla_0628 Cla_0629 pyrD   FALSE 0.371 52.000 0.017 1.000 N NA
 6887981 6887982 Cla_0629 Cla_0630   cysS TRUE 0.859 -7.000 0.013 1.000 N NA
 6887982 6887983 Cla_0630 Cla_0631 cysS mviN TRUE 0.860 -13.000 0.027 1.000   NA
 6887984 6887985 Cla_0632 Cla_0633   ruvA TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA Y NA
 6887985 6887986 Cla_0633 Cla_0634 ruvA ddlA TRUE 0.621 17.000 0.014 1.000 N NA
 6887986 6887987 Cla_0634 Cla_0635 ddlA   TRUE 0.909 3.000 0.018 NA   NA
 6887987 6887988 Cla_0635 Cla_0636     TRUE 0.955 3.000 0.052 NA   NA
 6887988 6887989 Cla_0636 Cla_0637   murF TRUE 0.957 -7.000 0.129 NA   NA
 6887991 6887992 Cla_0639 Cla_0640 pta ackA TRUE 0.974 9.000 0.103 1.000 Y NA
 6887993 6887994 Cla_0641 Cla_0642     FALSE 0.077 69.000 0.000 NA   NA
 6887994 6887995 Cla_0642 Cla_0643     TRUE 0.725 4.000 0.000 1.000   NA
 6887995 6887996 Cla_0643 Cla_0644     TRUE 0.993 0.000 0.511 1.000 Y NA
 6887996 6887997 Cla_0644 Cla_0645   valS TRUE 0.879 4.000 0.007 1.000 N NA
 6887997 6887998 Cla_0645 Cla_0646 valS   FALSE 0.189 75.000 0.005 1.000   NA
 6887998 6887999 Cla_0646 Cla_0647   ppa FALSE 0.235 23.000 0.000 1.000   NA
 6887999 6888000 Cla_0647 Cla_0648 ppa adk TRUE 0.829 11.000 0.015 1.000 N NA
 6888000 6888001 Cla_0648 Cla_0649 adk aspS TRUE 0.928 -3.000 0.025 1.000 N NA
 6888002 6888003 Cla_0650 Cla_0651   recN TRUE 0.962 0.000 0.066 1.000 N NA
 6888003 6888004 Cla_0651 Cla_0652 recN   TRUE 0.633 62.000 0.141 1.000 N NA
 6888004 6888005 Cla_0652 Cla_0653     TRUE 0.831 -9.000 0.013 NA N NA
 6888005 6888006 Cla_0653 Cla_0654     TRUE 0.899 0.000 0.015 NA   NA
 6888006 6888007 Cla_0654 Cla_0655   rlpA TRUE 0.860 -64.000 0.062 NA   NA
 6888007 6888008 Cla_0655 Cla_0656 rlpA   TRUE 0.907 5.000 0.020 NA   NA
 6888008 6888009 Cla_0656 Cla_0657     TRUE 0.871 -9.000 0.023 NA   NA
 6888009 6888010 Cla_0657 Cla_0658     TRUE 0.752 -18.000 0.013 NA   NA
 6888010 6888011 Cla_0658 Cla_0659     TRUE 0.945 -3.000 0.041 NA   NA
 6888011 6888012 Cla_0659 Cla_0660     TRUE 0.773 -10.000 0.007 NA   NA
 6888012 6888013 Cla_0660 Cla_0661   pbpC TRUE 0.949 2.000 0.043 NA   NA
 6888014 6888015 Cla_0662 Cla_0663 queA tatC TRUE 0.864 -16.000 0.036 NA N NA
 6888015 6888016 Cla_0663 Cla_0664 tatC   TRUE 0.993 3.000 0.535 NA Y NA
 6888017 6888018 Cla_0665 Cla_0666     TRUE 0.948 9.000 0.057 NA   NA
 6888020 6888021 Cla_0668 Cla_0669   lysC TRUE 0.958 0.000 0.051 1.000 N NA
 6888021 6888022 Cla_0669 Cla_0670 lysC   TRUE 0.952 1.000 0.050 NA   NA
 6888022 6888023 Cla_0670 Cla_0671     TRUE 0.953 -3.000 0.053 NA   NA
 6888023 6888024 Cla_0671 Cla_0672   folP TRUE 0.909 -13.000 0.054 1.000   NA
 6888024 6888025 Cla_0672 Cla_0673 folP ligA TRUE 0.878 3.000 0.006 1.000 N NA
 6888025 6888026 Cla_0673 Cla_0674 ligA tlyA TRUE 0.833 -10.000 0.014 1.000 N NA
 6888026 6888027 Cla_0674 Cla_0675 tlyA ribF TRUE 0.815 -34.000 0.029 1.000 N NA
 6888027 6888028 Cla_0675 Cla_0676 ribF   TRUE 0.957 0.000 0.051 1.000   NA
 6888029 6888030 Cla_0677 Cla_0678   pepA TRUE 0.967 -3.000 0.026 0.027 N NA
 6888030 6888031 Cla_0678 Cla_0679 pepA   TRUE 0.981 -3.000 0.250 NA   NA
 6888031 6888032 Cla_0679 Cla_0680   apt TRUE 0.927 3.000 0.026 NA   NA
 6888032 6888033 Cla_0680 Cla_0681 apt   TRUE 0.928 -3.000 0.028 NA   NA
 6888033 6888034 Cla_0681 Cla_0682   rpiB TRUE 0.965 -3.000 0.103 NA   NA
 6888035 6888036 Cla_0683 Cla_0684 cheB cheR TRUE 0.987 10.000 0.538 1.000   NA
 6888038 6888039 Cla_0686 Cla_0687     TRUE 0.974 0.000 0.130 1.000   NA
 6888039 6888040 Cla_0687 Cla_0688   recG TRUE 0.935 -10.000 0.084 1.000   NA
 6888040 6888041 Cla_0688 Cla_0689 recG   TRUE 0.637 -7.000 0.000 1.000 N NA
 6888041 6888042 Cla_0689 Cla_0690     TRUE 0.584 44.000 0.048 1.000 N NA
 6888042 6888043 Cla_0690 Cla_0691     TRUE 0.997 -7.000 0.841 0.013 Y NA
 6888043 6888044 Cla_0691 Cla_0692     TRUE 0.996 2.000 0.773 1.000 Y NA
 6888044 6888045 Cla_0692 Cla_0693   cjaA TRUE 0.872 77.000 0.671 1.000 Y NA
 6888045 6888046 Cla_0693 Cla_0694 cjaA cjaB TRUE 0.978 3.000 0.049 0.037 N NA
 6888046 6888047 Cla_0694 Cla_0695 cjaB   FALSE 0.094 67.000 0.000 1.000   NA
 6888047 6888048 Cla_0695 Cla_0696   aroB TRUE 0.935 8.000 0.031 1.000   NA
 6888048 6888049 Cla_0696 Cla_0697 aroB   TRUE 0.950 -3.000 0.041 1.000 N NA
 6888049 6888050 Cla_0697 Cla_0698     TRUE 0.960 -3.000 0.063 1.000 N NA
 6888050 6888051 Cla_0698 Cla_0699   ftsH1 TRUE 0.930 -10.000 0.067 1.000 N NA
 6888051 6888052 Cla_0699 Cla_0700 ftsH1 mog TRUE 0.915 3.000 0.017 1.000 N NA
 6888053 6888054 Cla_0701 Cla_0702     TRUE 0.818 3.000 0.000 NA Y NA
 6888054 6888055 Cla_0702 Cla_0703   htpG TRUE 0.861 -3.000 0.007 NA N NA
 6888055 6888056 Cla_0703 Cla_0704 htpG   TRUE 0.780 11.000 0.007 1.000 N NA
 6888056 6888057 Cla_0704 Cla_0705   plsC TRUE 0.971 -3.000 0.038 0.083 N NA
 6888057 6888058 Cla_0705 Cla_0706 plsC   TRUE 0.984 -22.000 0.846 NA   NA
 6888058 6888059 Cla_0706 Cla_0707   purQ TRUE 0.928 -6.000 0.038 NA   NA
 6888059 6888060 Cla_0707 Cla_0708 purQ purS TRUE 0.998 -3.000 0.656 0.002 Y NA
 6888060 6888061 Cla_0708 Cla_0709 purS purC TRUE 0.991 9.000 0.460 1.000 Y NA
 6888061 6888062 Cla_0709 Cla_0710 purC   TRUE 0.955 2.000 0.045 1.000 N NA
 6888063 6888064 Cla_0711 Cla_0712 clpB hyaA FALSE 0.076 160.000 0.000 1.000 N NA
 6888064 6888065 Cla_0712 Cla_0713 hyaA hyaB TRUE 0.999 3.000 0.951 0.002 Y NA
 6888065 6888066 Cla_0713 Cla_0714 hyaB hyaC TRUE 0.965 16.000 0.270 0.044 Y NA
 6888066 6888067 Cla_0714 Cla_0715 hyaC hyaD TRUE 0.988 -3.000 0.277 1.000 Y NA
 6888069 6888070 Cla_0717 Cla_0718 gltX1   TRUE 0.967 2.000 0.088 1.000   NA
 6888070 6888071 Cla_0718 Cla_0719     TRUE 0.962 1.000 0.080 NA   NA
 6888073 6888074 Cla_0721 Cla_0722 mobB fbp TRUE 0.635 10.000 0.000 1.000 N NA
 6888074 6888075 Cla_0722 Cla_0723 fbp   TRUE 0.994 0.000 0.778 NA   NA
 6888075 6888076 Cla_0723 Cla_0724   metS TRUE 0.707 15.000 0.024 NA   NA
 6888076 6888077 Cla_0724 Cla_0725 metS   TRUE 0.955 1.000 0.046 1.000   NA
 6888077 6888078 Cla_0725 Cla_0726   peb2 FALSE 0.087 63.000 0.000 NA   NA
 6888079 6888080 Cla_0727 Cla_0728     FALSE 0.084 64.000 0.000 NA   NA
 6888081 6888082 Cla_0729 Cla_0730     TRUE 0.687 1.000 0.000 NA   NA
 6888084 6888085 Cla_0732 Cla_0733     TRUE 0.945 -3.000 0.040 NA   NA
 6888085 6888086 Cla_0733 Cla_0734     FALSE 0.073 719.000 0.000 NA N NA
 6888086 6888087 Cla_0734 Cla_0735   xerD TRUE 0.730 0.000 0.000 1.000 N NA
 6888087 6888088 Cla_0735 Cla_0736 xerD murA FALSE 0.113 58.000 0.000 1.000 N NA
 6888088 6888089 Cla_0736 Cla_0737 murA moeA2 TRUE 0.927 -3.000 0.024 1.000 N NA
 6888093 6888094 Cla_0741 Cla_0742   ubiX TRUE 0.977 -3.000 0.191 NA N NA
 6888094 6888095 Cla_0742 Cla_0743 ubiX coaD TRUE 0.959 4.000 0.032 1.000 Y NA
 6888095 6888096 Cla_0743 Cla_0744 coaD tmk TRUE 0.909 -9.000 0.034 1.000 N NA
 6888096 6888097 Cla_0744 Cla_0745 tmk hisS TRUE 0.878 -7.000 0.018 1.000 N NA
 6888097 6888098 Cla_0745 Cla_0746 hisS speA TRUE 0.919 -3.000 0.021 1.000 N NA
 6888098 6888099 Cla_0746 Cla_0747 speA cysE TRUE 0.969 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 6888099 6888100 Cla_0747 Cla_0748 cysE murG TRUE 0.720 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6888101 6888102 Cla_0749 Cla_0750   rpoN TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 6888102 6888103 Cla_0750 Cla_0751 rpoN   TRUE 0.954 0.000 0.044 1.000   NA
 6888103 6888104 Cla_0751 Cla_0752     TRUE 0.919 -7.000 0.039 NA   NA
 6888104 6888105 Cla_0752 Cla_0753     TRUE 0.882 -3.000 0.011 NA   NA
 6888106 6888107 Cla_0754 Cla_0755 argG rplI TRUE 0.836 10.000 0.009 1.000 N NA
 6888107 6888108 Cla_0755 Cla_0756 rplI hslV TRUE 0.946 0.000 0.034 1.000 N NA
 6888108 6888109 Cla_0756 Cla_0757 hslV hslU TRUE 0.995 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 6888109 6888110 Cla_0757 Cla_0758 hslU era TRUE 0.955 -3.000 0.051 1.000   NA
 6888110 6888111 Cla_0758 Cla_0759 era   TRUE 0.821 -10.000 0.015 NA   NA
 6888111 6888112 Cla_0759 Cla_0760     FALSE 0.391 -37.000 0.000 NA   NA
 6888112 6888113 Cla_0760 Cla_0761   rnpB FALSE 0.173 28.000 0.000 NA   NA
 6888114 6888115 Cla_0762 Cla_0763   fliS TRUE 0.943 -3.000 0.038 NA   NA
 6888115 6888116 Cla_0763 Cla_0764 fliS fliD TRUE 0.976 19.000 0.608 0.005   NA
 6888116 6888117 Cla_0764 Cla_0765 fliD flaG TRUE 0.966 3.000 0.092 NA   NA
 6888117 6888118 Cla_0765 Cla_0766 flaG ubiD FALSE 0.231 122.000 0.018 NA N NA
 6888118 6888119 Cla_0766 Cla_0767 ubiD hemC TRUE 0.917 1.000 0.009 NA Y NA
 6888119 6888120 Cla_0767 Cla_0768 hemC   TRUE 0.843 -9.000 0.013 1.000   NA
 6888120 6888121 Cla_0768 Cla_0769   proS TRUE 0.922 -3.000 0.022 1.000   NA
 6888121 6888122 Cla_0769 Cla_0770 proS hemA TRUE 0.950 -10.000 0.040 0.055 N NA
 6888122 6888123 Cla_0770 Cla_0771 hemA ispB TRUE 0.970 0.000 0.051 1.000 Y NA
 6888123 6888124 Cla_0771 Cla_0772 ispB   FALSE 0.446 51.000 0.030 NA   NA
 6888124 6888125 Cla_0772 Cla_0773     TRUE 0.991 3.000 0.514 NA   NA
 6888125 6888126 Cla_0773 Cla_0774     TRUE 0.973 4.000 0.143 NA   NA
 6888126 6888127 Cla_0774 Cla_0775     TRUE 0.985 -3.000 0.364 NA   NA
 6888127 6888128 Cla_0775 Cla_0776     TRUE 0.938 -3.000 0.034 NA   NA
 6888128 6888129 Cla_0776 Cla_0777   hspR TRUE 0.642 25.000 0.034 1.000 N NA
 6888129 6888130 Cla_0777 Cla_0778 hspR cbpA TRUE 0.976 10.000 0.282 1.000 N NA
 6888131 6888132 Cla_0779 Cla_0780 htrA   TRUE 0.948 13.000 0.294 1.000 N NA
 6888132 6888133 Cla_0780 Cla_0781     TRUE 0.996 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 6888133 6888134 Cla_0781 Cla_0782   rep TRUE 0.707 8.000 0.000 1.000 N NA
 6888134 6888135 Cla_0782 Cla_0783 rep tpx FALSE 0.122 55.000 0.000 1.000 N NA
 6888135 6888136 Cla_0783 Cla_0784 tpx   FALSE 0.160 40.000 0.000 1.000 N NA
 6888136 6888137 Cla_0784 Cla_0785     FALSE 0.553 60.000 0.091 NA   NA
 6888138 6888139 Cla_0786 Cla_0787 msrA hypA TRUE 0.582 -10.000 0.000 1.000   NA
 6888139 6888140 Cla_0787 Cla_0788 hypA hypE TRUE 0.965 0.000 0.080 1.000   NA
 6888140 6888141 Cla_0788 Cla_0789 hypE hypD TRUE 0.825 -37.000 0.019 1.000 Y NA
 6888141 6888142 Cla_0789 Cla_0790 hypD hypC TRUE 0.953 -13.000 0.123 NA Y NA
 6888142 6888143 Cla_0790 Cla_0791 hypC hypB TRUE 0.992 0.000 0.463 NA Y NA
 6888143 6888144 Cla_0791 Cla_0792 hypB hypF TRUE 0.592 64.000 0.064 1.000 Y NA
 6888144 6888145 Cla_0792 Cla_0793 hypF   TRUE 0.772 -19.000 0.018 NA   NA
 6888145 6888146 Cla_0793 Cla_0794     TRUE 0.796 32.000 0.211 NA   NA
 6888146 6888147 Cla_0794 Cla_0795     TRUE 0.892 -24.000 0.085 NA   NA
 6888147 6888148 Cla_0795 Cla_0796     FALSE 0.072 647.000 0.000 NA   NA
 6888148 6888149 Cla_0796 Cla_0797     TRUE 0.691 2.000 0.000 NA   NA
 6888149 6888150 Cla_0797 Cla_0798   pstB FALSE 0.098 57.000 0.000 NA   NA
 6888150 6888151 Cla_0798 Cla_0799 pstB pstA TRUE 0.996 -3.000 0.402 0.003 Y NA
 6888151 6888152 Cla_0799 Cla_0800 pstA pstC TRUE 0.997 -3.000 0.485 0.003 Y NA
 6888152 6888153 Cla_0800 Cla_0801 pstC pstS TRUE 0.877 15.000 0.079 NA Y NA
 6888154 6888155 Cla_0802 Cla_0803     TRUE 0.982 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 6888155 6888156 Cla_0803 Cla_0804   cft FALSE 0.082 79.000 0.000 1.000 N NA
 6888156 6888157 Cla_0804 Cla_0805 cft   FALSE 0.064 109.000 0.000 NA N NA
 6888157 6888158 Cla_0805 Cla_0806     FALSE 0.065 183.000 0.000 NA   NA
 6888158 6888159 Cla_0806 Cla_0807     TRUE 0.683 48.000 0.136 NA   NA
 6888159 6888160 Cla_0807 Cla_0808     FALSE 0.569 57.000 0.091 NA N NA
 6888160 6888161 Cla_0808 Cla_0809     TRUE 0.993 10.000 0.750 NA Y NA
 6888162 6888163 Cla_0810 Cla_0811   lpxD TRUE 0.893 -7.000 0.026 NA   NA
 6888163 6888164 Cla_0811 Cla_0812 lpxD ilvH TRUE 0.956 -3.000 0.052 1.000 N NA
 6888164 6888165 Cla_0812 Cla_0813 ilvH ilvB TRUE 0.995 -3.000 0.249 0.002 Y NA
 6888165 6888166 Cla_0813 Cla_0814 ilvB oorC FALSE 0.080 84.000 0.000 1.000 N NA
 6888166 6888167 Cla_0814 Cla_0815 oorC oorB TRUE 0.995 -3.000 0.324 0.003 Y NA
 6888167 6888168 Cla_0815 Cla_0816 oorB oorA TRUE 0.998 2.000 0.771 0.003 Y NA
 6888168 6888169 Cla_0816 Cla_0817 oorA oorD TRUE 0.995 9.000 0.316 0.003 Y NA
 6888169 6888170 Cla_0817 Cla_0818 oorD mdh FALSE 0.264 177.000 0.007 1.000 Y NA
 6888170 6888171 Cla_0818 Cla_0819 mdh   FALSE 0.241 19.000 0.000 NA   NA
 6888173 6888174 Cla_0821 Cla_0822 ftsK   FALSE 0.555 104.000 0.145 1.000 N NA
 6888175 6888176 Cla_0823 Cla_0824     FALSE 0.066 196.000 0.000 NA   NA
 6888177 6888178 Cla_0825 Cla_0826     TRUE 0.996 2.000 1.000 NA   NA
 6888178 6888179 Cla_0826 Cla_0827     FALSE 0.291 16.000 0.000 NA   NA
 6888179 6888180 Cla_0827 Cla_0828     TRUE 0.988 -16.000 1.000 NA   NA
 6888180 6888181 Cla_0828 Cla_0829     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6888181 6888182 Cla_0829 Cla_0830     TRUE 0.943 21.000 0.667 NA   NA
 6888182 6888183 Cla_0830 Cla_0831     TRUE 0.695 3.000 0.000 NA   NA
 6888183 6888184 Cla_0831 Cla_0832     FALSE 0.070 349.000 0.000 NA   NA
 6888184 6888185 Cla_0832 Cla_0833     TRUE 0.687 1.000 0.000 NA   NA
 6888186 6888187 Cla_0834 Cla_0835     TRUE 0.993 3.000 0.667 NA   NA
 6888187 6888188 Cla_0835 Cla_0836     TRUE 0.687 1.000 0.000 NA   NA
 6888188 6888189 Cla_0836 Cla_0837     FALSE 0.076 155.000 0.000 1.000   NA
 6888189 6888190 Cla_0837 Cla_0838     FALSE 0.187 25.000 0.000 NA   NA
 6888191 6888192 Cla_0839 Cla_0840     FALSE 0.373 -133.000 0.000 NA   NA
 6888192 6888193 Cla_0840 Cla_0841     FALSE 0.067 230.000 0.000 NA   NA
 6888193 6888194 Cla_0841 Cla_0842     TRUE 0.687 1.000 0.000 NA   NA
 6888194 6888195 Cla_0842 Cla_0843     TRUE 0.983 1.000 0.286 NA   NA
 6888195 6888196 Cla_0843 Cla_0844     TRUE 0.966 -19.000 0.429 NA   NA
 6888196 6888197 Cla_0844 Cla_0845     TRUE 0.990 2.000 0.500 NA   NA
 6888197 6888198 Cla_0845 Cla_0846     TRUE 0.977 10.000 0.333 NA   NA
 6888198 6888199 Cla_0846 Cla_0847     TRUE 0.996 2.000 1.000 NA   NA
 6888199 6888200 Cla_0847 Cla_0848     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 6888200 6888201 Cla_0848 Cla_0849     TRUE 0.990 -13.000 1.000 NA   NA
 6888201 6888202 Cla_0849 Cla_0850     TRUE 0.993 10.000 1.000 NA   NA
 6888202 6888203 Cla_0850 Cla_0851     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 6888203 6888204 Cla_0851 Cla_0852     TRUE 0.991 11.000 1.000 NA   NA
 6888204 6888205 Cla_0852 Cla_0853     TRUE 0.988 12.000 1.000 NA   NA
 6888205 6888206 Cla_0853 Cla_0854     TRUE 0.826 70.000 0.667 NA   NA
 6888206 6888207 Cla_0854 Cla_0855     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 6888207 6888208 Cla_0855 Cla_0856     FALSE 0.197 24.000 0.000 NA   NA
 6888208 6888209 Cla_0856 Cla_0857     TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 6888209 6888210 Cla_0857 Cla_0858     TRUE 0.881 81.000 1.000 NA   NA
 6888210 6888211 Cla_0858 Cla_0859     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 6888211 6888212 Cla_0859 Cla_0860     TRUE 0.903 64.000 1.000 NA   NA
 6888212 6888213 Cla_0860 Cla_0861     TRUE 0.992 1.000 0.667 NA   NA
 6888213 6888214 Cla_0861 Cla_0862     TRUE 0.961 -12.000 0.250 NA   NA
 6888214 6888215 Cla_0862 Cla_0863     FALSE 0.069 79.000 0.000 NA   NA
 6888216 6888217 Cla_0864 Cla_0865     FALSE 0.066 186.000 0.000 NA   NA
 6888217 6888218 Cla_0865 Cla_0866     FALSE 0.382 -52.000 0.000 NA   NA
 6888219 6888220 Cla_0867 Cla_0868     TRUE 0.972 -7.000 0.250 NA   NA
 6888220 6888221 Cla_0868 Cla_0869     FALSE 0.067 244.000 0.000 NA   NA
 6888221 6888222 Cla_0869 Cla_0870     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6888222 6888223 Cla_0870 Cla_0871     FALSE 0.074 1752.000 0.000 NA   NA
 6888226 6888227 Cla_0874 Cla_0875     TRUE 0.979 -3.000 0.222 NA   NA
 6888227 6888228 Cla_0875 Cla_0876     TRUE 0.833 25.000 0.222 NA   NA
 6888228 6888229 Cla_0876 Cla_0877     FALSE 0.072 76.000 0.000 NA   NA
 6888229 6888230 Cla_0877 Cla_0878     FALSE 0.338 14.000 0.000 NA   NA
 6888231 6888232 Cla_0879 Cla_0880     FALSE 0.379 -58.000 0.000 NA   NA
 6888233 6888234 Cla_0881 Cla_0882     FALSE 0.064 146.000 0.000 NA   NA
 6888234 6888235 Cla_0882 Cla_0883     FALSE 0.064 130.000 0.000 NA   NA
 6888236 6888237 Cla_0884 Cla_0885     FALSE 0.491 -13.000 0.000 NA   NA
 6888237 6888238 Cla_0885 Cla_0886     TRUE 0.695 3.000 0.000 NA   NA
 6888238 6888239 Cla_0886 Cla_0887     TRUE 0.591 10.000 0.000 NA   NA
 6888239 6888240 Cla_0887 Cla_0888     FALSE 0.071 412.000 0.000 NA   NA
 6888240 6888241 Cla_0888 Cla_0889     FALSE 0.457 12.000 0.000 NA   NA
 6888241 6888242 Cla_0889 Cla_0890     FALSE 0.173 28.000 0.000 NA   NA
 6888242 6888243 Cla_0890 Cla_0891     TRUE 0.912 10.000 0.034 NA   NA
 6888243 6888244 Cla_0891 Cla_0892   dnaE FALSE 0.079 68.000 0.000 NA   NA
 6888244 6888245 Cla_0892 Cla_0893 dnaE   FALSE 0.067 86.000 0.000 NA   NA
 6888245 6888246 Cla_0893 Cla_0894   thiJ FALSE 0.166 30.000 0.000 NA   NA
 6888246 6888247 Cla_0894 Cla_0895 thiJ   FALSE 0.521 11.000 0.000 NA   NA
 6888247 6888248 Cla_0895 Cla_0896     TRUE 0.776 -31.000 0.020 1.000   NA
 6888248 6888249 Cla_0896 Cla_0897     TRUE 0.923 -3.000 0.025 NA N NA
 6888249 6888250 Cla_0897 Cla_0898     FALSE 0.098 57.000 0.000 NA   NA
 6888250 6888251 Cla_0898 Cla_0899     TRUE 0.944 0.000 0.035 NA   NA
 6888252 6888253 Cla_0900 Cla_0901 nadE lpxK TRUE 0.850 -13.000 0.024 1.000 N NA
 6888253 6888254 Cla_0901 Cla_0902 lpxK thrC TRUE 0.713 -25.000 0.009 1.000 N NA
 6888254 6888255 Cla_0902 Cla_0903 thrC kdsB TRUE 0.910 -3.000 0.017 1.000 N NA
 6888255 6888256 Cla_0903 Cla_0904 kdsB glnH TRUE 0.860 -3.000 0.005 1.000 N NA
 6888258 6888259 Cla_0906 Cla_0907 dsbD   TRUE 0.978 -3.000 0.185 1.000   NA
 6888262 6888263 Cla_0910 Cla_0911     FALSE 0.491 -13.000 0.000 NA   NA
 6888263 6888264 Cla_0911 Cla_0912     TRUE 0.943 -13.000 0.133 1.000   NA
 6888264 6888265 Cla_0912 Cla_0913   fba FALSE 0.334 76.000 0.027 1.000   NA
 6888265 6888266 Cla_0913 Cla_0914 fba peb4 TRUE 0.949 0.000 0.036 1.000 N NA
 6888268 6888269 Cla_0916 Cla_0917 gltS   FALSE 0.076 116.000 0.000 1.000 N NA
 6888269 6888270 Cla_0917 Cla_0918     TRUE 0.977 2.000 0.152 1.000 N NA
 6888270 6888271 Cla_0918 Cla_0919     TRUE 0.990 -3.000 0.258 0.076 N NA
 6888272 6888273 Cla_0920 Cla_0921 rdxA aas FALSE 0.089 70.000 0.000 1.000 N NA
 6888273 6888274 Cla_0921 Cla_0922 aas   FALSE 0.080 265.000 0.000 1.000 N NA
 6888274 6888275 Cla_0922 Cla_0923     TRUE 0.838 -6.000 0.006 1.000   NA
 6888275 6888276 Cla_0923 Cla_0924     TRUE 0.937 -7.000 0.064 NA   NA
 6888276 6888277 Cla_0924 Cla_0925     TRUE 0.940 -24.000 0.228 NA   NA
 6888277 6888278 Cla_0925 Cla_0926     TRUE 0.893 -15.000 0.044 1.000   NA
 6888278 6888279 Cla_0926 Cla_0927     TRUE 0.934 0.000 0.026 1.000   NA
 6888279 6888280 Cla_0927 Cla_0928     TRUE 0.903 -7.000 0.030 NA   NA
 6888281 6888282 Cla_0929 Cla_0930 pitB pdxA FALSE 0.379 47.000 0.014 1.000 N NA
 6888282 6888283 Cla_0930 Cla_0931 pdxA pdxJ TRUE 0.988 -3.000 0.048 0.001 Y NA
 6888284 6888285 Cla_0932 Cla_0933     TRUE 0.759 11.000 0.007 NA   NA
 6888285 6888286 Cla_0933 Cla_0934     TRUE 0.720 -3.000 0.000 1.000   NA
 6888287 6888288 Cla_0935 Cla_0936 dnaK grpE TRUE 0.854 22.000 0.029 0.011 Y NA
 6888288 6888289 Cla_0936 Cla_0937 grpE hrcA TRUE 0.943 -3.000 0.038 NA N NA
 6888289 6888290 Cla_0937 Cla_0938 hrcA   FALSE 0.070 363.000 0.000 NA   NA
 6888290 6888291 Cla_0938 Cla_0939     TRUE 0.983 -3.000 0.294 NA   NA
 6888291 6888292 Cla_0939 Cla_0940     TRUE 0.937 -16.000 0.154 NA   NA
 6888292 6888293 Cla_0940 Cla_0941   flhA TRUE 0.951 10.000 0.106 NA   NA
 6888293 6888294 Cla_0941 Cla_0942 flhA   TRUE 0.932 -7.000 0.053 NA N NA
 6888296 6888297 Cla_0944 Cla_0945     TRUE 0.748 -13.000 0.008 NA N NA
 6888297 6888298 Cla_0945 Cla_0946   dprA TRUE 0.951 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 6888298 6888299 Cla_0946 Cla_0947 dprA   TRUE 0.843 -13.000 0.022 1.000   NA
 6888299 6888300 Cla_0947 Cla_0948   ilvC TRUE 0.905 2.000 0.013 1.000   NA
 6888301 6888302 Cla_0949 Cla_0950 rnr   TRUE 0.812 -7.000 0.005 1.000 N NA
 6888302 6888303 Cla_0950 Cla_0951   rpsF FALSE 0.267 92.000 0.020 1.000 N NA
 6888303 6888304 Cla_0951 Cla_0952 rpsF ssb TRUE 0.944 4.000 0.033 1.000 N NA
 6888304 6888305 Cla_0952 Cla_0953 ssb rpsR TRUE 0.896 11.000 0.034 1.000 N NA
 6888305 6888306 Cla_0953 Cla_0954 rpsR   FALSE 0.110 52.000 0.000 NA N NA
 6888307 6888308 Cla_0955 Cla_0956     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 6888308 6888309 Cla_0956 Cla_0957     FALSE 0.456 -16.000 0.000 NA   NA
 6888309 6888310 Cla_0957 Cla_0958   proC TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6888310 6888311 Cla_0958 Cla_0959 proC   TRUE 0.668 33.000 0.075 NA   NA
 6888312 6888313 Cla_0960 Cla_0961   lon TRUE 0.958 0.000 0.062 NA   NA
 6888314 6888315 Cla_0962 Cla_0963     TRUE 0.982 11.000 0.556 NA   NA
 6888315 6888316 Cla_0963 Cla_0964     FALSE 0.068 83.000 0.000 NA   NA
 6888316 6888317 Cla_0964 Cla_0965   ilvA FALSE 0.149 44.000 0.000 1.000   NA
 6888317 6888318 Cla_0965 Cla_0966 ilvA   TRUE 0.936 3.000 0.030 NA   NA
 6888318 6888319 Cla_0966 Cla_0967     FALSE 0.140 38.000 0.000 NA   NA
 6888319 6888320 Cla_0967 Cla_0968     FALSE 0.457 12.000 0.000 NA   NA
 6888320 6888321 Cla_0968 Cla_0969   trmA FALSE 0.069 79.000 0.000 NA   NA
 6888321 6888322 Cla_0969 Cla_0970 trmA   TRUE 0.955 1.000 0.056 NA N NA
 6888322 6888323 Cla_0970 Cla_0971     TRUE 0.769 17.000 0.047 NA   NA
 6888323 6888324 Cla_0971 Cla_0972     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6888325 6888326 Cla_0973 Cla_0974 ogt   TRUE 0.729 2.000 0.000 1.000   NA
 6888327 6888328 Cla_0975 Cla_0976 truA   TRUE 0.959 1.000 0.059 1.000   NA
 6888328 6888329 Cla_0976 Cla_0977     TRUE 0.949 -3.000 0.039 1.000   NA
 6888329 6888330 Cla_0977 Cla_0978   uppS TRUE 0.910 -3.000 0.017 1.000 N NA
 6888330 6888331 Cla_0978 Cla_0979 uppS   TRUE 0.889 2.000 0.012 NA   NA
 6888331 6888332 Cla_0979 Cla_0980   dfp TRUE 0.899 -6.000 0.024 NA   NA
 6888332 6888333 Cla_0980 Cla_0981 dfp glmU TRUE 0.908 -3.000 0.016 1.000 N NA
 6888334 6888335 Cla_0982 Cla_0983 fliP   TRUE 0.634 10.000 0.000 1.000   NA
 6888335 6888336 Cla_0983 Cla_0984   pabB TRUE 0.690 9.000 0.000 1.000   NA
 6888336 6888337 Cla_0984 Cla_0985 pabB pabA TRUE 0.984 -3.000 0.048 0.018 Y NA
 6888337 6888338 Cla_0985 Cla_0986 pabA cmeD FALSE 0.170 36.000 0.000 1.000 N NA
 6888338 6888339 Cla_0986 Cla_0987 cmeD cmeE TRUE 0.985 -3.000 0.207 1.000 Y NA
 6888339 6888340 Cla_0987 Cla_0988 cmeE cmeF TRUE 0.995 3.000 0.844 NA N NA
 6888341 6888342 Cla_0989 Cla_0990   aroG TRUE 0.876 -6.000 0.014 1.000 N NA
 6888342 6888343 Cla_0990 Cla_0991 aroG   FALSE 0.108 53.000 0.000 NA   NA
 6888343 6888344 Cla_0991 Cla_0992   rplS TRUE 0.844 3.000 0.003 NA   NA
 6888344 6888345 Cla_0992 Cla_0993 rplS trmD TRUE 0.984 12.000 0.567 1.000 Y NA
 6888345 6888346 Cla_0993 Cla_0994 trmD rimM TRUE 0.995 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 6888346 6888347 Cla_0994 Cla_0995 rimM   TRUE 0.833 38.000 0.324 1.000   NA
 6888347 6888348 Cla_0995 Cla_0996   rpsP TRUE 0.988 3.000 0.385 1.000   NA
 6888348 6888349 Cla_0996 Cla_0997 rpsP ffh TRUE 0.726 72.000 0.361 1.000 N NA
 6888349 6888350 Cla_0997 Cla_0998 ffh   FALSE 0.280 64.000 0.013 1.000 N NA
 6888350 6888351 Cla_0998 Cla_0999   kdtA TRUE 0.929 -19.000 0.133 1.000 N NA
 6888351 6888352 Cla_0999 Cla_1000 kdtA   TRUE 0.970 -3.000 0.122 NA   NA
 6888352 6888353 Cla_1000 Cla_1001     TRUE 0.962 12.000 0.342 NA   NA
 6888353 6888354 Cla_1001 Cla_1002   glyQ TRUE 0.904 -10.000 0.041 NA   NA
 6888354 6888355 Cla_1002 Cla_1003 glyQ   TRUE 0.883 -3.000 0.011 NA   NA
 6888355 6888356 Cla_1003 Cla_1004   purE TRUE 0.868 10.000 0.019 NA   NA
 6888356 6888357 Cla_1004 Cla_1005 purE   TRUE 0.914 -3.000 0.018 1.000 N NA
 6888357 6888358 Cla_1005 Cla_1006     TRUE 0.958 -3.000 0.068 NA   NA
 6888360 6888361 Cla_1008 Cla_1009 cca   TRUE 0.951 -31.000 0.325 NA   NA
 6888361 6888362 Cla_1009 Cla_1010     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6888362 6888363 Cla_1010 Cla_1011     FALSE 0.081 66.000 0.000 NA   NA
 6888363 6888364 Cla_1011 Cla_1012     TRUE 0.695 3.000 0.000 NA   NA
 6888364 6888365 Cla_1012 Cla_1013   napD TRUE 0.695 3.000 0.000 NA   NA
 6888365 6888366 Cla_1013 Cla_1014 napD napL TRUE 0.940 -13.000 0.139 NA   NA
 6888366 6888367 Cla_1014 Cla_1015 napL napB TRUE 0.970 5.000 0.132 NA   NA
 6888367 6888368 Cla_1015 Cla_1016 napB napH TRUE 0.981 -10.000 0.385 NA Y NA
 6888368 6888369 Cla_1016 Cla_1017 napH napG TRUE 0.997 -3.000 0.795 0.039   NA
 6888369 6888370 Cla_1017 Cla_1018 napG napA TRUE 0.991 3.000 0.270 0.039   NA
 6888370 6888371 Cla_1018 Cla_1019 napA flgG1 FALSE 0.077 168.000 0.000 1.000 N NA
 6888371 6888372 Cla_1019 Cla_1020 flgG1 flgG2 TRUE 0.973 18.000 0.377 0.008 Y NA
 6888375 6888376 Cla_1023 Cla_1024 nrfH nrfA TRUE 0.678 17.000 0.000 0.001 N NA
 6888377 6888378 Cla_1025 Cla_1027 thiC dnaQ FALSE 0.190 187.000 0.007 1.000 N NA
 6888378 6888379 Cla_1027 Cla_1028 dnaQ rpe TRUE 0.983 -3.000 0.279 1.000 N NA
 6888380 6888381 Cla_1029 Cla_1030 rpmB   TRUE 0.570 26.000 0.025 1.000 N NA
 6888381 6888382 Cla_1030 Cla_1031     FALSE 0.433 48.000 0.026 NA   NA
 6888382 6888383 Cla_1031 Cla_1032     TRUE 0.663 34.000 0.077 NA   NA
 6888384 6888385 Cla_1033 Cla_1034   groEL FALSE 0.076 121.000 0.000 1.000   NA
 6888385 6888386 Cla_1034 Cla_1035 groEL groES TRUE 0.959 14.000 0.356 1.000 Y NA
 6888388 6888389 Cla_1037 Cla_1038     FALSE 0.069 81.000 0.000 NA N NA
 6888389 6888390 Cla_1038 Cla_1039   mfd TRUE 0.900 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 6888390 6888391 Cla_1039 Cla_1040 mfd   TRUE 0.859 -10.000 0.023 NA N NA
 6888391 6888392 Cla_1040 Cla_1041     TRUE 0.918 -72.000 0.178 NA   NA
 6888392 6888393 Cla_1041 Cla_1042   folC TRUE 0.896 -10.000 0.032 1.000   NA
 6888393 6888394 Cla_1042 Cla_1043 folC   TRUE 0.970 2.000 0.104 1.000   NA
 6888394 6888395 Cla_1043 Cla_1044     TRUE 0.989 2.000 0.455 NA   NA
 6888395 6888396 Cla_1044 Cla_1045   leuS TRUE 0.934 -3.000 0.031 NA   NA
 6888396 6888397 Cla_1045 Cla_1046 leuS   TRUE 0.899 9.000 0.021 NA   NA
 6888397 6888398 Cla_1046 Cla_1047   secF TRUE 0.993 3.000 0.667 NA   NA
 6888398 6888399 Cla_1047 Cla_1048 secF secD TRUE 0.997 0.000 0.436 0.001 Y NA
 6888399 6888400 Cla_1048 Cla_1049 secD   TRUE 0.956 -7.000 0.068 NA Y NA
 6888403 6888404 Cla_1052 Cla_1053   pyrB TRUE 0.809 10.000 0.005 1.000 N NA
 6888404 6888405 Cla_1053 Cla_1054 pyrB pepF TRUE 0.861 5.000 0.005 1.000 N NA
 6888405 6888406 Cla_1054 Cla_1055 pepF   TRUE 0.953 -7.000 0.115 NA   NA
 6888406 6888407 Cla_1055 Cla_1056   uvrD TRUE 0.925 -3.000 0.026 NA   NA
 6888407 6888408 Cla_1056 Cla_1057 uvrD truB TRUE 0.953 -3.000 0.046 1.000 N NA
 6888408 6888409 Cla_1057 Cla_1058 truB csrA TRUE 0.971 -6.000 0.046 0.025 N NA
 6888409 6888410 Cla_1058 Cla_1059 csrA ispE TRUE 0.947 -3.000 0.036 1.000 N NA
 6888410 6888411 Cla_1059 Cla_1060 ispE smpB TRUE 0.934 -3.000 0.028 1.000 N NA
 6888411 6888412 Cla_1060 Cla_1061 smpB trxC TRUE 0.669 13.000 0.009 NA   NA
 6888412 6888413 Cla_1061 Cla_1062 trxC clpS TRUE 0.818 -16.000 0.024 NA   NA
 6888413 6888414 Cla_1062 Cla_1063 clpS clpA TRUE 0.991 -3.000 0.596 NA   NA
 6888414 6888415 Cla_1063 Cla_1064 clpA aat TRUE 0.926 -25.000 0.087 1.000 Y NA
 6888415 6888416 Cla_1064 Cla_1065 aat flgB FALSE 0.180 92.000 0.006 1.000 N NA
 6888416 6888417 Cla_1065 Cla_1066 flgB flgC TRUE 0.992 11.000 0.804 1.000 Y NA
 6888417 6888418 Cla_1066 Cla_1067 flgC fliE TRUE 0.995 4.000 0.271 0.006 Y NA
 6888418 6888419 Cla_1067 Cla_1068 fliE pbpB TRUE 0.756 58.000 0.303 1.000 N NA
 6888420 6888421 Cla_1069 Cla_1070 hemH   TRUE 0.872 0.000 0.005 1.000   NA
 6888421 6888422 Cla_1070 Cla_1071     TRUE 0.970 -3.000 0.117 1.000   NA
 6888423 6888424 Cla_1072 Cla_1073 alaS maf TRUE 0.902 0.000 0.015 NA N NA
 6888424 6888425 Cla_1073 Cla_1074 maf pbpA TRUE 0.923 -3.000 0.026 NA N NA
 6888425 6888426 Cla_1074 Cla_1075 pbpA   FALSE 0.079 86.000 0.000 1.000   NA
 6888426 6888427 Cla_1075 Cla_1076     TRUE 0.997 0.000 0.790 0.039   NA
 6888427 6888428 Cla_1076 Cla_1077     FALSE 0.223 90.000 0.000 0.020   NA
 6888429 6888430 Cla_1078 Cla_1079     FALSE 0.266 196.000 0.000 0.056 Y NA
 6888430 6888431 Cla_1079 Cla_1080     TRUE 0.998 -3.000 0.869 0.056 Y NA
 6888432 6888433 Cla_1081 Cla_1082   ppi TRUE 0.829 10.000 0.010 NA   NA
 6888433 6888434 Cla_1082 Cla_1083 ppi   FALSE 0.119 48.000 0.000 NA   NA
 6888434 6888435 Cla_1083 Cla_1084     FALSE 0.116 50.000 0.000 NA   NA
 6888435 6888436 Cla_1084 Cla_1085     FALSE 0.363 150.000 0.043 NA   NA
 6888436 6888437 Cla_1085 Cla_1086     TRUE 0.961 -3.000 0.083 NA   NA
 6888438 6888439 Cla_1087 Cla_1088 argS   TRUE 0.847 10.000 0.011 1.000 N NA
 6888439 6888440 Cla_1088 Cla_1089   gmk TRUE 0.886 2.000 0.009 1.000 N NA
 6888440 6888441 Cla_1089 Cla_1090 gmk   TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6888441 6888442 Cla_1090 Cla_1091   fliR FALSE 0.093 60.000 0.000 NA   NA
 6888442 6888443 Cla_1091 Cla_1092 fliR   TRUE 0.877 -13.000 0.032 1.000 N NA
 6888443 6888444 Cla_1092 Cla_1093   tsf TRUE 0.919 3.000 0.019 1.000 N NA
 6888444 6888445 Cla_1093 Cla_1094 tsf rpsB TRUE 0.995 0.000 0.748 1.000 Y NA
 6888445 6888446 Cla_1094 Cla_1095 rpsB petC FALSE 0.077 174.000 0.000 1.000 N NA
 6888446 6888447 Cla_1095 Cla_1096 petC petB TRUE 0.991 3.000 0.103 0.002 Y NA
 6888447 6888448 Cla_1096 Cla_1097 petB petA TRUE 0.991 2.000 0.093 0.002 Y NA
 6888448 6888449 Cla_1097 Cla_1098 petA gidA FALSE 0.158 167.000 0.003 1.000 N NA
 6888450 6888451 Cla_1099 Cla_1100 ribE   TRUE 0.690 -36.000 0.011 NA   NA
 6888451 6888452 Cla_1100 Cla_1101     TRUE 0.793 -7.000 0.005 NA   NA
 6888453 6888454 Cla_1102 Cla_1103     TRUE 0.995 -7.000 0.846 1.000 Y NA
 6888455 6888456 Cla_1104 Cla_1105     FALSE 0.079 68.000 0.000 NA   NA
 6888456 6888457 Cla_1105 Cla_1106     FALSE 0.079 68.000 0.000 NA   NA
 6888457 6888458 Cla_1106 Cla_1107     FALSE 0.567 11.000 0.000 1.000   NA
 6888458 6888459 Cla_1107 Cla_1108   porA2 FALSE 0.070 376.000 0.000 NA   NA
 6888459 6888460 Cla_1108 Cla_1109 porA2   FALSE 0.069 290.000 0.000 NA   NA
 6888460 6888461 Cla_1109 Cla_1110   livJ TRUE 0.904 18.000 0.312 NA N NA
 6888461 6888462 Cla_1110 Cla_1111 livJ livK TRUE 0.993 11.000 1.000 NA Y NA
 6888462 6888463 Cla_1111 Cla_1112 livK livH TRUE 0.823 21.000 0.085 NA Y NA
 6888463 6888464 Cla_1112 Cla_1113 livH livM TRUE 0.998 2.000 0.771 0.024 Y NA
 6888464 6888465 Cla_1113 Cla_1114 livM livG TRUE 0.985 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 6888465 6888466 Cla_1114 Cla_1115 livG livF TRUE 0.989 -13.000 0.381 0.018 Y NA
 6888466 6888467 Cla_1115 Cla_1116 livF   TRUE 0.984 4.000 0.280 1.000 N NA
 6888467 6888468 Cla_1116 Cla_1117     FALSE 0.457 12.000 0.000 NA   NA
 6888468 6888469 Cla_1117 Cla_1118   lepA TRUE 0.591 10.000 0.000 NA   NA
 6888472 6888473 Cla_1121 Cla_1122 hemD thiE TRUE 0.960 0.000 0.032 1.000 Y NA
 6888473 6888474 Cla_1122 Cla_1123 thiE thiM TRUE 0.985 -13.000 0.190 0.005 Y NA
 6888474 6888475 Cla_1123 Cla_1124 thiM thiD TRUE 0.985 4.000 0.039 0.005 Y NA
 6888477 6888478 Cla_1126 Cla_1127   gidB TRUE 0.794 -6.000 0.002 NA   NA
 6888478 6888479 Cla_1127 Cla_1128 gidB ribA TRUE 0.909 -3.000 0.017 1.000 N NA
 6888480 6888481 Cla_1129 Cla_1130 hemB   TRUE 0.695 3.000 0.000 NA   NA
 6888481 6888482 Cla_1130 Cla_1131   hemN TRUE 0.973 -13.000 0.419 NA   NA
 6888482 6888483 Cla_1131 Cla_1132 hemN   TRUE 0.995 2.000 0.419 0.018 N NA
 6888484 6888485 Cla_1133 Cla_1134   alr FALSE 0.140 38.000 0.000 NA   NA
 6888485 6888486 Cla_1134 Cla_1135 alr   TRUE 0.937 0.000 0.031 NA   NA
 6888487 6888488 Cla_1136 Cla_1137     TRUE 0.960 0.000 0.069 NA   NA
 6888488 6888489 Cla_1137 Cla_1138     TRUE 0.977 4.000 0.192 NA   NA
 6888490 6888491 Cla_1139 Cla_1140     FALSE 0.087 63.000 0.000 NA   NA
 6888491 6888492 Cla_1140 Cla_1141     TRUE 0.985 -24.000 0.900 NA   NA
 6888492 6888493 Cla_1141 Cla_1142   gyrA FALSE 0.233 61.000 0.008 NA   NA
 6888493 6888494 Cla_1142 Cla_1143 gyrA   FALSE 0.348 37.000 0.007 1.000   NA
 6888494 6888495 Cla_1143 Cla_1144   mapA TRUE 0.974 -3.000 0.152 NA   NA
 6888497 6888498 Cla_1146 Cla_1147   thiH TRUE 0.984 -10.000 0.128 0.005 Y NA
 6888498 6888499 Cla_1147 Cla_1148 thiH thiG TRUE 0.995 2.000 0.277 0.005 Y NA
 6888499 6888500 Cla_1148 Cla_1149 thiG thiF TRUE 0.980 0.000 0.054 0.025   NA
 6888500 6888501 Cla_1149 Cla_1150 thiF thiS TRUE 0.987 0.000 0.346 1.000   NA
 6888501 6888502 Cla_1150 Cla_1151 thiS   FALSE 0.150 34.000 0.000 NA   NA
 6888502 6888503 Cla_1151 Cla_1152   dapE FALSE 0.064 135.000 0.000 NA   NA
 6888503 6888504 Cla_1152 Cla_1153 dapE   TRUE 0.940 4.000 0.018 1.000 Y NA
 6888504 6888505 Cla_1153 Cla_1154     TRUE 0.985 -6.000 0.417 1.000 N NA
 6888505 6888506 Cla_1154 Cla_1155   mutS TRUE 0.926 9.000 0.029 1.000 N NA
 6888506 6888507 Cla_1155 Cla_1156 mutS   TRUE 0.980 0.000 0.217 NA   NA
 6888507 6888508 Cla_1156 Cla_1157   murC TRUE 0.849 -7.000 0.014 NA   NA
 6888508 6888509 Cla_1157 Cla_1158 murC   TRUE 0.840 9.000 0.004 1.000   NA
 6888509 6888510 Cla_1158 Cla_1159   guaB FALSE 0.395 166.000 0.045 1.000   NA
 6888510 6888511 Cla_1159 Cla_1160 guaB gatA TRUE 0.888 11.000 0.032 1.000 N NA
 6888511 6888512 Cla_1160 Cla_1161 gatA ileS FALSE 0.268 100.000 0.008 1.000 Y NA
 6888514 6888515 Cla_1163 Cla_1164     TRUE 0.968 -39.000 0.147 0.002   NA
 6888515 6888516 Cla_1164 Cla_1165     TRUE 0.934 -10.000 0.078 1.000   NA
 6888516 6888517 Cla_1165 Cla_1166     TRUE 0.978 0.000 0.175 1.000 N NA
 6888517 6888518 Cla_1166 Cla_1167     TRUE 0.995 -10.000 0.878 0.073 N NA
 6888518 6888519 Cla_1167 Cla_1168     TRUE 0.984 -10.000 0.625 NA   NA
 6888519 6888520 Cla_1168 Cla_1169   p19 TRUE 0.717 77.000 0.386 NA   NA
 6888520 6888521 Cla_1169 Cla_1170 p19   TRUE 0.985 -3.000 0.238 NA Y NA
 6888521 6888522 Cla_1170 Cla_1171     FALSE 0.086 671.000 0.000 1.000 N NA
 6888522 6888523 Cla_1171 Cla_1172     FALSE 0.457 12.000 0.000 NA   NA
 6888525 6888526 Cla_1174 Cla_1175   mraW TRUE 0.935 4.000 0.031 NA   NA
 6888527 6888528 Cla_1176 Cla_1177     FALSE 0.336 80.000 0.029 1.000   NA
 6888528 6888529 Cla_1177 Cla_1178   ftsA TRUE 0.978 -3.000 0.184 1.000   NA
 6888529 6888530 Cla_1178 Cla_1179 ftsA ftsZ TRUE 0.946 12.000 0.114 1.000 Y NA
 6888530 6888531 Cla_1179 Cla_1180 ftsZ pncB FALSE 0.255 21.000 0.000 1.000 N NA
 6888532 6888533 Cla_1181 Cla_1182 ispG priA FALSE 0.250 57.000 0.006 1.000 N NA
 6888533 6888534 Cla_1182 Cla_1183 priA   TRUE 0.898 -3.000 0.016 NA   NA
 6888534 6888535 Cla_1183 Cla_1184     TRUE 0.984 1.000 0.316 NA   NA
 6888535 6888536 Cla_1184 Cla_1185     TRUE 0.984 -13.000 0.714 NA   NA
 6888538 6888539 Cla_1187 Cla_1188 efp serA FALSE 0.241 61.000 0.007 1.000 N NA
 6888539 6888540 Cla_1188 Cla_1189 serA   TRUE 0.922 -3.000 0.025 NA   NA
 6888540 6888541 Cla_1189 Cla_1190   rpsA TRUE 0.672 121.000 0.343 NA   NA
 6888541 6888542 Cla_1190 Cla_1191 rpsA ispH TRUE 0.824 56.000 0.118 0.001 N NA
 6888542 6888543 Cla_1191 Cla_1192 ispH aroA TRUE 0.895 -10.000 0.032 1.000 N NA
 6888543 6888544 Cla_1192 Cla_1193 aroA pheT TRUE 0.934 -3.000 0.028 1.000 N NA
 6888544 6888545 Cla_1193 Cla_1194 pheT pheS TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 6888547 6888548 Cla_1196 Cla_1197 pckA pycB TRUE 0.882 11.000 0.016 1.000 Y NA
 6888548 6888549 Cla_1197 Cla_1198 pycB   TRUE 0.591 59.000 0.100 1.000   NA
 6888549 6888550 Cla_1198 Cla_1199     TRUE 0.993 10.000 0.444 0.003   NA
 6888550 6888551 Cla_1199 Cla_1200     TRUE 0.881 10.000 0.000 0.003   NA
 6888552 6888553 Cla_1201 Cla_1202 atpE   FALSE 0.161 31.000 0.000 NA   NA
 6888553 6888554 Cla_1202 Cla_1203     FALSE 0.197 24.000 0.000 NA   NA
 6888554 6888555 Cla_1203 Cla_1204     FALSE 0.091 61.000 0.000 NA   NA
 6888556 6888557 Cla_1205 Cla_1206 pyrC2 gpsA TRUE 0.871 -3.000 0.007 1.000 N NA
 6888557 6888558 Cla_1206 Cla_1207 gpsA gatB TRUE 0.896 3.000 0.011 1.000 N NA
 6888558 6888559 Cla_1207 Cla_1208 gatB atpB FALSE 0.156 125.000 0.003 1.000 N NA
 6888559 6888560 Cla_1208 Cla_1209 atpB   FALSE 0.103 63.000 0.000 1.000 N NA
 6888560 6888561 Cla_1209 Cla_1210   radA TRUE 0.607 -9.000 0.000 1.000 N NA
 6888561 6888562 Cla_1210 Cla_1211 radA ftsY TRUE 0.960 0.000 0.015 0.020 N NA
 6888562 6888563 Cla_1211 Cla_1212 ftsY   TRUE 0.896 0.000 0.011 1.000   NA
 6888564 6888565 Cla_1213 Cla_1214     TRUE 0.865 -76.000 0.059 1.000   NA
 6888565 6888566 Cla_1214 Cla_1215     TRUE 0.860 9.000 0.010 NA   NA
 6888566 6888567 Cla_1215 Cla_1216     TRUE 0.851 -3.000 0.005 NA   NA
 6888568 6888569 Cla_1217 Cla_1218 rbn glcD TRUE 0.942 0.000 0.031 1.000   NA
 6888569 6888570 Cla_1218 Cla_1219 glcD   TRUE 0.988 0.000 0.404 NA   NA
 6888571 6888572 Cla_1220 Cla_1221     TRUE 0.953 2.000 0.042 1.000 N NA
 6888572 6888573 Cla_1221 Cla_1222   tpx2 FALSE 0.503 12.000 0.000 1.000 N NA
 6888574 6888575 Cla_1223 Cla_1224 dnaB cysK FALSE 0.432 13.000 0.000 1.000 N NA
 6888575 6888576 Cla_1224 Cla_1225 cysK hup FALSE 0.289 96.000 0.024 1.000 N NA
 6888576 6888577 Cla_1225 Cla_1226 hup waaF FALSE 0.077 93.000 0.000 1.000 N NA
 6888579 6888580 Cla_1228 Cla_1229 ptmA ptmB TRUE 0.974 0.000 0.131 1.000 N NA
 6888580 6888581 Cla_1229 Cla_1230 ptmB ptmF TRUE 0.960 -7.000 0.144 NA   NA
 6888581 6888582 Cla_1230 Cla_1231 ptmF ptmE TRUE 0.963 -3.000 0.088 NA   NA
 6888582 6888583 Cla_1231 Cla_1232 ptmE   TRUE 0.808 11.000 0.014 NA   NA
 6888583 6888584 Cla_1232 Cla_1233     TRUE 0.974 10.000 0.286 NA   NA
 6888584 6888585 Cla_1233 Cla_1234   ptmD TRUE 0.949 -3.000 0.039 1.000 N NA
 6888585 6888586 Cla_1234 Cla_1235 ptmD ptmC TRUE 0.991 -7.000 0.549 1.000 Y NA
 6888586 6888587 Cla_1235 Cla_1236 ptmC   TRUE 0.735 16.000 0.029 1.000 N NA
 6888587 6888588 Cla_1236 Cla_1237     FALSE 0.466 37.000 0.020 1.000 N NA
 6888589 6888590 Cla_1238 Cla_1239     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6888590 6888591 Cla_1239 Cla_1240     FALSE 0.064 148.000 0.000 NA   NA
 6888591 6888592 Cla_1240 Cla_1241     TRUE 0.813 4.000 0.000 NA Y NA
 6888595 6888596 Cla_1244 Cla_1245     TRUE 0.865 4.000 0.007 NA   NA
 6888596 6888597 Cla_1245 Cla_1246   htrB TRUE 0.963 9.000 0.050 1.000 Y NA
 6888597 6888598 Cla_1246 Cla_1247 htrB waaC TRUE 0.986 -3.000 0.231 1.000 Y NA
 6888599 6888600 Cla_1248 Cla_1249 wlaX galE TRUE 0.571 59.000 0.086 1.000 N NA
 6888600 6888601 Cla_1249 Cla_1250 galE pglK TRUE 0.955 -6.000 0.086 1.000 N NA
 6888601 6888602 Cla_1250 Cla_1251 pglK pglH TRUE 0.977 -3.000 0.179 1.000 N NA
 6888602 6888603 Cla_1251 Cla_1252 pglH pglJ TRUE 0.933 2.000 0.000 0.018 Y NA
 6888603 6888604 Cla_1252 Cla_1253 pglJ pglB TRUE 0.987 2.000 0.375 1.000   NA
 6888604 6888605 Cla_1253 Cla_1254 pglB pglA TRUE 0.953 -3.000 0.045 1.000   NA
 6888605 6888606 Cla_1254 Cla_1255 pglA pglC TRUE 0.969 -7.000 0.128 NA Y NA
 6888606 6888607 Cla_1255 Cla_1256 pglC pglD TRUE 0.879 -34.000 0.074 NA   NA
 6888607 6888608 Cla_1256 Cla_1257 pglD pglE TRUE 0.963 0.000 0.070 1.000   NA
 6888608 6888609 Cla_1257 Cla_1258 pglE pglF TRUE 0.981 2.000 0.133 1.000 Y NA
 6888609 6888610 Cla_1258 Cla_1259 pglF cheY FALSE 0.076 113.000 0.000 1.000 N NA
 6888610 6888611 Cla_1259 Cla_1260 cheY prmA TRUE 0.920 13.000 0.146 1.000 N NA
 6888611 6888612 Cla_1260 Cla_1261 prmA ftsH2 TRUE 0.981 0.000 0.217 1.000 N NA
 6888612 6888613 Cla_1261 Cla_1262 ftsH2   TRUE 0.953 0.000 0.043 1.000 N NA
 6888613 6888614 Cla_1262 Cla_1263   pssA TRUE 0.992 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 6888614 6888615 Cla_1263 Cla_1264 pssA   FALSE 0.081 66.000 0.000 NA   NA
 6888615 6888616 Cla_1264 Cla_1265     FALSE 0.119 48.000 0.000 NA   NA
 6888616 6888617 Cla_1265 Cla_1266     FALSE 0.256 18.000 0.000 NA   NA
 6888617 6888618 Cla_1266 Cla_1267     TRUE 0.990 -7.000 0.740 NA   NA
 6888620 6888621 Cla_1269 Cla_1270   prsA FALSE 0.082 65.000 0.000 NA N NA
 6888621 6888622 Cla_1270 Cla_1271 prsA   FALSE 0.064 120.000 0.000 NA   NA
 6888623 6888624 Cla_1272 Cla_1273     FALSE 0.371 -135.000 0.000 NA   NA
 6888624 6888625 Cla_1273 Cla_1274     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 6888626 6888627 Cla_1275 Cla_1276 ruvB amaA TRUE 0.840 -10.000 0.019 NA   NA
 6888630 6888631 Cla_1279 Cla_1280     TRUE 0.982 0.000 0.263 NA   NA
 6888631 6888632 Cla_1280 Cla_1281     TRUE 0.989 10.000 0.684 NA N NA
 6888633 6888634 Cla_1282 Cla_1283 modA   TRUE 0.967 -3.000 0.098 1.000   NA
 6888634 6888635 Cla_1283 Cla_1284   modC TRUE 0.965 -6.000 0.045 0.097   NA
 6888637 6888638 Cla_1286 Cla_1287 selA selB TRUE 0.995 -7.000 0.569 0.001 N NA
 6888638 6888639 Cla_1287 Cla_1288 selB   FALSE 0.454 54.000 0.031 1.000 N NA
 6888639 6888640 Cla_1288 Cla_1289     FALSE 0.491 -13.000 0.000 NA   NA
 6888641 6888642 Cla_1290 Cla_1291 gdhA   TRUE 0.746 13.000 0.020 NA   NA
 6888642 6888643 Cla_1291 Cla_1292   mez FALSE 0.191 247.000 0.010 NA   NA
 6888643 6888644 Cla_1292 Cla_1293 mez gltX2 TRUE 0.924 0.000 0.021 1.000 N NA
 6888646 6888647 Cla_1295 Cla_1296 accC accB TRUE 0.989 2.000 0.071 0.003 Y NA
 6888648 6888649 Cla_1297 Cla_1298 dcd pseB FALSE 0.355 51.000 0.014 1.000   NA
 6888649 6888650 Cla_1298 Cla_1299 pseB   TRUE 0.993 -3.000 0.678 1.000   NA
 6888650 6888651 Cla_1299 Cla_1300     TRUE 0.870 -7.000 0.020 NA   NA
 6888651 6888652 Cla_1300 Cla_1301     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6888652 6888653 Cla_1301 Cla_1302   acpP2 TRUE 0.983 2.000 0.286 NA   NA
 6888653 6888654 Cla_1302 Cla_1303 acpP2   TRUE 0.858 -6.000 0.012 NA   NA
 6888654 6888655 Cla_1303 Cla_1304     TRUE 0.871 -3.000 0.009 NA   NA
 6888655 6888656 Cla_1304 Cla_1305   fabH1 TRUE 0.952 -16.000 0.250 NA N NA
 6888656 6888657 Cla_1305 Cla_1306 fabH1 acpP3 TRUE 0.965 -7.000 0.188 NA   NA
 6888658 6888659 Cla_1307 Cla_1308     TRUE 0.650 9.000 0.000 NA   NA
 6888660 6888661 Cla_1309 Cla_1310     TRUE 0.773 -43.000 0.000 0.002   NA
 6888661 6888662 Cla_1310 Cla_1311     TRUE 0.949 2.000 0.037 1.000 N NA
 6888662 6888663 Cla_1311 Cla_1312     TRUE 0.910 -13.000 0.056 1.000   NA
 6888663 6888664 Cla_1312 Cla_1313   acpP4 TRUE 0.878 15.000 0.138 NA   NA
 6888664 6888665 Cla_1313 Cla_1314 acpP4   TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6888668 6888669 Cla_1317 Cla_1318     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 6888669 6888670 Cla_1318 Cla_1319     TRUE 0.695 3.000 0.000 NA   NA
 6888671 6888672 Cla_1320 Cla_1321 pseF pseG TRUE 0.989 -3.000 0.355 NA Y NA
 6888672 6888673 Cla_1321 Cla_1322 pseG pseH TRUE 0.959 -7.000 0.137 NA N NA
 6888673 6888674 Cla_1322 Cla_1323 pseH   TRUE 0.961 -3.000 0.069 1.000   NA
 6888674 6888675 Cla_1323 Cla_1324     TRUE 0.971 -10.000 0.333 NA   NA
 6888675 6888676 Cla_1324 Cla_1325     TRUE 0.966 -3.000 0.103 NA   NA
 6888677 6888678 Cla_1326 Cla_1327 hisF2 hisH2 TRUE 0.955 10.000 0.011 0.007 Y NA
 6888678 6888679 Cla_1327 Cla_1328 hisH2 pseA TRUE 0.992 -3.000 0.625 NA N NA
 6888681 6888682 Cla_1330 Cla_1331 flhB   FALSE 0.296 69.000 0.000 0.070 Y NA
 6888682 6888683 Cla_1331 Cla_1332   ahpC FALSE 0.077 175.000 0.000 1.000 N NA
 6888684 6888685 Cla_1333 Cla_1334 fdxA ndk FALSE 0.233 143.000 0.015 1.000   NA
 6888685 6888686 Cla_1334 Cla_1335 ndk   TRUE 0.940 0.000 0.033 NA   NA
 6888686 6888687 Cla_1335 Cla_1336   rpmF TRUE 0.751 15.000 0.032 NA   NA
 6888687 6888688 Cla_1336 Cla_1337 rpmF plsX TRUE 0.988 6.000 0.418 1.000 N NA
 6888688 6888689 Cla_1337 Cla_1338 plsX fabH3 TRUE 0.971 -13.000 0.058 0.007 Y NA
 6888690 6888691 Cla_1339 Cla_1340 motB motA TRUE 0.969 10.000 0.119 1.000 Y NA
 6888691 6888692 Cla_1340 Cla_1341 motA polA TRUE 0.662 13.000 0.006 1.000 N NA
 6888693 6888694 Cla_1342 Cla_1343     TRUE 0.964 -3.000 0.097 NA N NA
 6888696 6888697 Cla_1345 Cla_1346 trpB   FALSE 0.081 270.000 0.000 1.000 N NA
 6888699 6888700 Cla_1348 Cla_1349 cstA   TRUE 0.979 -3.000 0.229 NA   NA
 6888701 6888702 Cla_1350 Cla_1351 serC xseA TRUE 0.697 13.000 0.010 1.000 N NA
 6888702 6888703 Cla_1351 Cla_1352 xseA ubiE TRUE 0.907 -3.000 0.016 1.000 N NA
 6888703 6888704 Cla_1352 Cla_1353 ubiE   TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 6888704 6888705 Cla_1353 Cla_1354   perR FALSE 0.457 12.000 0.000 NA   NA
 6888705 6888706 Cla_1354 Cla_1355 perR dxs FALSE 0.254 84.000 0.017 1.000 N NA
 6888706 6888707 Cla_1355 Cla_1356 dxs fliH TRUE 0.952 -3.000 0.052 NA N NA
 6888707 6888708 Cla_1356 Cla_1357 fliH fliG TRUE 0.988 5.000 0.308 NA Y NA
 6888708 6888709 Cla_1357 Cla_1358 fliG fliF TRUE 0.997 0.000 0.477 0.010 Y NA
 6888709 6888710 Cla_1358 Cla_1359 fliF hisC TRUE 0.849 15.000 0.084 1.000 N NA
 6888710 6888711 Cla_1359 Cla_1360 hisC pheA TRUE 0.916 -10.000 0.028 1.000 Y NA
 6888711 6888712 Cla_1360 Cla_1361 pheA   TRUE 0.920 -3.000 0.021 1.000 N NA
 6888712 6888713 Cla_1361 Cla_1362   lysA TRUE 0.909 2.000 0.015 1.000 N NA
 6888713 6888714 Cla_1362 Cla_1363 lysA   TRUE 0.729 14.000 0.021 1.000   NA
 6888714 6888715 Cla_1363 Cla_1364   pth TRUE 0.940 2.000 0.031 1.000   NA
 6888715 6888716 Cla_1364 Cla_1365 pth rplY TRUE 0.996 2.000 0.496 0.041 Y NA
 6888716 6888717 Cla_1365 Cla_1366 rplY tal FALSE 0.396 47.000 0.017 1.000 N NA
 6888717 6888718 Cla_1366 Cla_1367 tal serB TRUE 0.935 -3.000 0.029 1.000 N NA
 6888718 6888719 Cla_1367 Cla_1368 serB cheW TRUE 0.910 0.000 0.015 1.000 N NA
 6888719 6888720 Cla_1368 Cla_1369 cheW cheA TRUE 0.991 5.000 0.137 0.015 Y NA
 6888720 6888721 Cla_1369 Cla_1370 cheA cheV TRUE 0.992 3.000 0.147 0.008 Y NA
 6888721 6888722 Cla_1370 Cla_1371 cheV   TRUE 0.959 0.000 0.065 NA   NA
 6888722 6888723 Cla_1371 Cla_1372   greA TRUE 0.891 4.000 0.012 NA   NA
 6888723 6888724 Cla_1372 Cla_1373 greA lpxB TRUE 0.928 10.000 0.042 1.000 N NA
 6888724 6888725 Cla_1373 Cla_1374 lpxB cdtC FALSE 0.082 79.000 0.000 1.000   NA
 6888725 6888726 Cla_1374 Cla_1375 cdtC cdtB TRUE 0.994 10.000 0.500 0.003   NA
 6888726 6888727 Cla_1375 Cla_1376 cdtB cdtA TRUE 0.957 25.000 0.421 0.003   NA
 6888729 6888730 Cla_1378 Cla_1379   pepE TRUE 0.888 10.000 0.022 1.000 N NA
 6888730 6888731 Cla_1379 Cla_1380 pepE peb3 FALSE 0.073 73.000 0.000 NA   NA
 6888732 6888733 Cla_1381 Cla_1382 surE   TRUE 0.936 -7.000 0.051 1.000   NA
 6888733 6888734 Cla_1382 Cla_1383     FALSE 0.140 48.000 0.000 1.000 N NA
 6888734 6888735 Cla_1383 Cla_1384     FALSE 0.387 13.000 0.000 NA   NA
 6888736 6888737 Cla_1385 Cla_1386 bioC   TRUE 0.957 -3.000 0.065 NA   NA
 6888737 6888738 Cla_1386 Cla_1387   bioF TRUE 0.986 -3.000 0.389 NA   NA
 6888738 6888739 Cla_1387 Cla_1388 bioF   TRUE 0.730 0.000 0.000 1.000   NA
 6888741 6888742 Cla_1390 Cla_1391 bioD   TRUE 0.933 8.000 0.030 1.000 N NA
 6888742 6888743 Cla_1391 Cla_1392     TRUE 0.996 0.000 0.444 0.053 Y NA
 6888745 6888746 Cla_1394 Cla_1395   carB TRUE 0.909 -3.000 0.020 NA   NA
 6888746 6888747 Cla_1395 Cla_1396 carB   FALSE 0.254 82.000 0.016 1.000 N NA
 6888747 6888748 Cla_1396 Cla_1397   mreB TRUE 0.987 -10.000 0.689 1.000 N NA
 6888748 6888749 Cla_1397 Cla_1398 mreB clpX TRUE 0.968 -3.000 0.034 0.095 N NA
 6888749 6888750 Cla_1398 Cla_1399 clpX lpxA TRUE 0.902 -7.000 0.027 1.000 N NA
 6888750 6888751 Cla_1399 Cla_1400 lpxA fabZ TRUE 0.984 0.000 0.264 1.000 N NA
 6888751 6888752 Cla_1400 Cla_1401 fabZ   FALSE 0.377 69.000 0.035 NA   NA
 6888752 6888753 Cla_1401 Cla_1402   bcp TRUE 0.819 -6.000 0.006 NA   NA
 6888753 6888754 Cla_1402 Cla_1403 bcp   TRUE 0.880 -3.000 0.008 1.000   NA
 6888755 6888756 Cla_1404 Cla_1405 ilvE   TRUE 0.897 13.000 0.098 1.000 N NA
 6888756 6888757 Cla_1405 Cla_1406     TRUE 0.790 18.000 0.075 NA   NA
 6888757 6888758 Cla_1406 Cla_1407     TRUE 0.995 0.000 0.867 NA   NA
 6888759 6888760 Cla_1408 Cla_1409 purF dapB TRUE 0.925 1.000 0.022 1.000 N NA
 6888760 6888761 Cla_1409 Cla_1410 dapB   FALSE 0.074 71.000 0.000 NA   NA
 6888761 6888762 Cla_1410 Cla_1411   trxB FALSE 0.082 65.000 0.000 NA   NA
 6888762 6888763 Cla_1411 Cla_1412 trxB trx FALSE 0.444 116.000 0.035 1.000 Y NA
 6888763 6888764 Cla_1412 Cla_1413 trx   FALSE 0.440 52.000 0.027 1.000 N NA
 6888764 6888765 Cla_1413 Cla_1414   hom TRUE 0.927 1.000 0.023 1.000 N NA
 6888765 6888766 Cla_1414 Cla_1415 hom aspC TRUE 0.986 2.000 0.202 1.000 Y NA
 6888766 6888767 Cla_1415 Cla_1416 aspC   TRUE 0.889 13.000 0.098 NA   NA
 6888767 6888768 Cla_1416 Cla_1417     TRUE 0.993 -6.000 0.882 NA   NA
 6888768 6888769 Cla_1417 Cla_1418     TRUE 0.909 -7.000 0.033 NA   NA
 6888769 6888770 Cla_1418 Cla_1419     TRUE 0.679 20.000 0.031 1.000   NA
 6888770 6888771 Cla_1419 Cla_1420   rpmE TRUE 0.941 0.000 0.031 1.000   NA
 6888771 6888772 Cla_1420 Cla_1421 rpmE   FALSE 0.283 78.000 0.023 NA   NA
 6888772 6888773 Cla_1421 Cla_1422     TRUE 0.960 0.000 0.070 NA   NA
 6888773 6888774 Cla_1422 Cla_1423     TRUE 0.978 0.000 0.200 NA   NA
 6888774 6888775 Cla_1423 Cla_1424     TRUE 0.871 0.000 0.008 NA   NA
 6888775 6888776 Cla_1424 Cla_1425     TRUE 0.972 -3.000 0.139 NA N NA
 6888776 6888777 Cla_1425 Cla_1426   moaA TRUE 0.931 0.000 0.028 NA N NA
 6888777 6888778 Cla_1426 Cla_1427 moaA   TRUE 0.923 10.000 0.042 NA   NA
 6888778 6888779 Cla_1427 Cla_1428     TRUE 0.984 -7.000 0.476 NA   NA
 6888779 6888780 Cla_1428 Cla_1429   ubiA TRUE 0.943 -9.000 0.100 NA   NA
 6888782 6888783 Cla_1431 Cla_1432 pflA nuoN FALSE 0.545 25.000 0.020 1.000   NA
 6888783 6888784 Cla_1432 Cla_1433 nuoN nuoM TRUE 0.982 0.000 0.024 0.002 Y NA
 6888784 6888785 Cla_1433 Cla_1434 nuoM nuoL TRUE 0.989 2.000 0.056 0.002 Y NA
 6888785 6888786 Cla_1434 Cla_1435 nuoL nuoK TRUE 0.972 -12.000 0.056 0.010 Y NA
 6888786 6888787 Cla_1435 Cla_1436 nuoK nuoJ TRUE 0.988 -3.000 0.064 0.005 Y NA
 6888787 6888788 Cla_1436 Cla_1437 nuoJ nuoI TRUE 0.994 -7.000 0.442 0.010 Y NA
 6888788 6888789 Cla_1437 Cla_1438 nuoI nuoH TRUE 0.996 9.000 0.500 0.010 Y NA
 6888789 6888790 Cla_1438 Cla_1439 nuoH nuoG TRUE 0.987 -3.000 0.065 0.010 Y NA
 6888790 6888791 Cla_1439 Cla_1440 nuoG   TRUE 0.995 -3.000 0.444 0.010   NA
 6888791 6888792 Cla_1440 Cla_1441     TRUE 0.995 -3.000 0.464 0.010   NA
 6888792 6888793 Cla_1441 Cla_1442   nuoD TRUE 0.996 -3.000 0.650 0.010   NA
 6888793 6888794 Cla_1442 Cla_1443 nuoD nuoC TRUE 0.997 2.000 0.650 0.010 Y NA
 6888794 6888795 Cla_1443 Cla_1444 nuoC nuoB TRUE 0.998 -3.000 0.703 0.005 Y NA
 6888795 6888796 Cla_1444 Cla_1445 nuoB nuoA TRUE 0.992 -21.000 0.571 0.005 Y NA
 6888796 6888797 Cla_1445 Cla_1446 nuoA dppF FALSE 0.076 121.000 0.000 1.000 N NA
 6888797 6888798 Cla_1446 Cla_1447 dppF dppD TRUE 0.973 -16.000 0.111 0.017 Y NA
 6888798 6888799 Cla_1447 Cla_1448 dppD dppC TRUE 0.988 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 6888799 6888800 Cla_1448 Cla_1449 dppC dppB TRUE 0.996 -7.000 0.647 0.023 Y NA
 6888800 6888801 Cla_1449 Cla_1450 dppB dppA TRUE 0.996 0.000 0.412 0.023 Y NA
 6888801 6888802 Cla_1450 Cla_1451 dppA   FALSE 0.376 43.000 0.000 0.023 N NA
 6888802 6888803 Cla_1451 Cla_1452     FALSE 0.079 199.000 0.000 1.000   NA
 6888803 6888804 Cla_1452 Cla_1453     TRUE 0.988 -7.000 0.209 0.002   NA
 6888804 6888805 Cla_1453 Cla_1454     TRUE 0.994 -3.000 0.657 NA Y NA
 6888805 6888806 Cla_1454 Cla_1455   lctP TRUE 0.957 10.000 0.075 NA Y NA
 6888806 6888807 Cla_1455 Cla_1456 lctP   FALSE 0.068 277.000 0.000 NA   NA
 6888807 6888808 Cla_1456 Cla_1457     TRUE 0.985 0.000 0.333 NA   NA
 6888809 6888810 Cla_1458 Cla_1459 torC torA TRUE 0.991 2.000 0.148 0.036 Y NA
 6888811 6888812 Cla_1460 Cla_1461     FALSE 0.073 678.000 0.000 NA   NA
 6888812 6888813 Cla_1461 Cla_1462     FALSE 0.068 280.000 0.000 NA   NA
 6888813 6888814 Cla_1462 Cla_1463     FALSE 0.071 430.000 0.000 NA   NA
 6888814 6888815 Cla_1463 Cla_1464     TRUE 0.591 10.000 0.000 NA   NA
 6888815 6888816 Cla_1464 Cla_1465     FALSE 0.067 253.000 0.000 NA   NA
 6888816 6888817 Cla_1465 Cla_1466     FALSE 0.074 1162.000 0.000 NA   NA
 6888817 6888818 Cla_1466 Cla_1467     TRUE 0.650 9.000 0.000 NA   NA
 6888818 6888819 Cla_1467 Cla_1468     FALSE 0.169 29.000 0.000 NA   NA
 6888819 6888820 Cla_1468 Cla_1469     TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 6888820 6888821 Cla_1469 Cla_1470     FALSE 0.274 17.000 0.000 NA   NA
 6888821 6888822 Cla_1470 Cla_1471     FALSE 0.067 86.000 0.000 NA   NA
 6888822 6888823 Cla_1471 Cla_1472   purN FALSE 0.350 42.000 0.009 1.000 N NA
 6888823 6888824 Cla_1472 Cla_1473 purN   TRUE 0.835 -9.000 0.014 NA N NA
 6888824 6888825 Cla_1473 Cla_1474   rmuC TRUE 0.665 -16.000 0.003 NA   NA
 6888825 6888826 Cla_1474 Cla_1475 rmuC   TRUE 0.695 3.000 0.000 NA   NA
 6888826 6888827 Cla_1475 Cla_1476     TRUE 0.844 9.000 0.007 NA   NA
 6888827 6888828 Cla_1476 Cla_1477   def TRUE 0.957 -3.000 0.054 1.000 N NA
 6888828 6888829 Cla_1477 Cla_1478 def   TRUE 0.963 -3.000 0.076 1.000 N NA
 6888829 6888830 Cla_1478 Cla_1479   clpP TRUE 0.610 15.000 0.009 1.000 N NA
 6888830 6888831 Cla_1479 Cla_1480 clpP tig TRUE 0.990 0.000 0.351 1.000 Y NA
 6888832 6888833 Cla_1481 Cla_1482 folE fliI TRUE 0.993 0.000 0.378 0.046 N NA
 6888833 6888834 Cla_1482 Cla_1483 fliI   FALSE 0.106 54.000 0.000 NA   NA
 6888834 6888835 Cla_1483 Cla_1484     FALSE 0.101 56.000 0.000 NA   NA
 6888835 6888836 Cla_1484 Cla_1485     FALSE 0.069 79.000 0.000 NA   NA
 6888836 6888837 Cla_1485 Cla_1486   iscS FALSE 0.330 123.000 0.034 NA   NA
 6888837 6888838 Cla_1486 Cla_1487 iscS iscU TRUE 0.804 11.000 0.011 1.000 N NA
 6888838 6888839 Cla_1487 Cla_1488 iscU nhaA1 FALSE 0.081 81.000 0.000 1.000 N NA
 6888839 6888840 Cla_1488 Cla_1489 nhaA1 nhaA2 TRUE 0.997 -3.000 0.571 0.003 Y NA
 6888840 6888841 Cla_1489 Cla_1490 nhaA2   FALSE 0.098 57.000 0.000 NA   NA
 6888842 6888843 Cla_1491 Cla_1492     FALSE 0.150 34.000 0.000 NA   NA
 6888843 6888844 Cla_1492 Cla_1493   aroC FALSE 0.103 55.000 0.000 NA   NA
 6888844 6888845 Cla_1493 Cla_1494 aroC rnc TRUE 0.937 -3.000 0.030 1.000 N NA
 6888845 6888846 Cla_1494 Cla_1495 rnc rnhA TRUE 0.915 -7.000 0.032 1.000 N NA
 6888846 6888847 Cla_1495 Cla_1496 rnhA   TRUE 0.878 -3.000 0.008 1.000 N NA
 6888848 6888849 Cla_1497 Cla_1498 dnaG   FALSE 0.417 66.000 0.035 1.000 N NA
 6888850 6888851 Cla_1499 Cla_1500   pbpC2 FALSE 0.077 176.000 0.000 1.000 N NA
 6888851 6888852 Cla_1500 Cla_1501 pbpC2   TRUE 0.988 -3.000 0.417 1.000   NA
 6888853 6888854 Cla_1502 Cla_1503     FALSE 0.156 32.000 0.000 NA   NA
 6888855 6888856 Cla_1504 Cla_1505   cynT TRUE 0.969 -3.000 0.105 1.000 N NA
 6888857 6888858 Cla_1506 Cla_1507   secG FALSE 0.171 100.000 0.007 NA   NA
 6888858 6888859 Cla_1507 Cla_1508 secG frr TRUE 0.840 11.000 0.017 1.000 N NA
 6888859 6888860 Cla_1508 Cla_1509 frr pyrE TRUE 0.934 3.000 0.026 1.000 N NA
 6888860 6888861 Cla_1509 Cla_1510 pyrE   TRUE 0.961 0.000 0.071 NA   NA
 6888861 6888862 Cla_1510 Cla_1511   nrdB TRUE 0.962 -3.000 0.086 NA   NA
 6888862 6888863 Cla_1511 Cla_1512 nrdB   FALSE 0.082 302.000 0.000 1.000 N NA
 6888863 6888864 Cla_1512 Cla_1513   pimT FALSE 0.139 88.000 0.000 1.000 Y NA
 6888864 6888865 Cla_1513 Cla_1514 pimT   FALSE 0.078 91.000 0.000 1.000 N NA
 6888866 6888867 Cla_1515 Cla_1516   typA TRUE 0.859 0.000 0.006 NA   NA
 6888868 6888869 Cla_1517 Cla_1518     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 6888869 6888870 Cla_1518 Cla_1519   flgD TRUE 0.708 51.000 0.184 NA   NA
 6888870 6888871 Cla_1519 Cla_1520 flgD flgE2 TRUE 0.989 5.000 0.341 NA Y NA
 6888872 6888873 Cla_1521 Cla_1522     FALSE 0.183 153.000 0.010 NA   NA
 6888873 6888874 Cla_1522 Cla_1523   fic FALSE 0.065 166.000 0.000 NA   NA
 6888874 6888875 Cla_1523 Cla_1524 fic   FALSE 0.103 63.000 0.000 1.000 N NA
 6888875 6888876 Cla_1524 Cla_1525     TRUE 0.996 3.000 0.529 0.022 N NA
 6888876 6888877 Cla_1525 Cla_1526     TRUE 0.982 18.000 0.618 0.022 Y NA
 6888880 6888881 Cla_1529 Cla_1530     FALSE 0.179 26.000 0.000 NA   NA
 6888881 6888882 Cla_1530 Cla_1531     FALSE 0.077 69.000 0.000 NA   NA
 6888883 6888884 Cla_1532 Cla_1533 ctsG gcp TRUE 0.862 -3.000 0.005 1.000   NA
 6888884 6888885 Cla_1533 Cla_1534 gcp   TRUE 0.866 -3.000 0.008 NA   NA
 6888885 6888886 Cla_1534 Cla_1535   dxr TRUE 0.856 -3.000 0.006 NA   NA
 6888886 6888887 Cla_1535 Cla_1536 dxr cdsA TRUE 0.990 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 6888887 6888888 Cla_1536 Cla_1537 cdsA   TRUE 0.705 12.000 0.007 NA   NA
 6888888 6888889 Cla_1537 Cla_1538     TRUE 0.931 3.000 0.028 NA   NA
 6888893 6888894 Cla_1542 Cla_1543     FALSE 0.143 37.000 0.000 NA   NA
 6888894 6888895 Cla_1543 Cla_1544     FALSE 0.231 20.000 0.000 NA   NA
 6888895 6888896 Cla_1544 Cla_1545     FALSE 0.338 14.000 0.000 NA   NA
 6888897 6888898 Cla_1546 Cla_1547     FALSE 0.309 131.000 0.000 0.010 Y NA
 6888899 6888900 Cla_1548 Cla_1549     FALSE 0.087 63.000 0.000 NA   NA
 6888900 6888901 Cla_1549 Cla_1550     TRUE 0.950 9.000 0.065 NA   NA
 6888901 6888902 Cla_1550 Cla_1551     TRUE 0.887 -3.000 0.012 NA   NA
 6888902 6888903 Cla_1551 Cla_1552     TRUE 0.851 -10.000 0.021 NA   NA
 6888903 6888904 Cla_1552 Cla_1553     TRUE 0.972 0.000 0.118 1.000 N NA
 6888904 6888905 Cla_1553 Cla_1554     TRUE 0.990 10.000 0.763 NA   NA
 6888905 6888906 Cla_1554 Cla_1555     FALSE 0.073 73.000 0.000 NA   NA
 6888906 6888907 Cla_1555 Cla_1556   rpsU FALSE 0.145 45.000 0.000 1.000 N NA
 6888908 6888909 Cla_1557 Cla_1558   cmeR TRUE 0.995 -3.000 0.818 1.000   NA
 6888909 6888910 Cla_1558 Cla_1559 cmeR cmeA FALSE 0.570 83.000 0.145 1.000   NA
 6888910 6888911 Cla_1559 Cla_1560 cmeA cmeB TRUE 0.996 0.000 0.945 1.000 N NA
 6888911 6888912 Cla_1560 Cla_1561 cmeB cmeC TRUE 0.987 -7.000 0.241 0.022 N NA
 6888914 6888915 Cla_1563 Cla_1564     FALSE 0.113 58.000 0.000 1.000   NA
 6888916 6888917 Cla_1565 Cla_1566   lspA TRUE 0.782 -19.000 0.020 NA   NA
 6888917 6888918 Cla_1566 Cla_1567 lspA   TRUE 0.929 -7.000 0.042 1.000 N NA
 6888919 6888920 Cla_1568 Cla_1569     TRUE 0.847 -3.000 0.005 NA   NA
 6888920 6888921 Cla_1569 Cla_1570     FALSE 0.119 48.000 0.000 NA   NA
 6887314 6887315 Cla_a002 Cla_a003     FALSE 0.291 188.000 0.000 0.034 Y NA
 6887315 6887316 Cla_a003 Cla_a004     FALSE 0.076 122.000 0.000 1.000   NA
 6887316 6887317 Cla_a004 Cla_a005     TRUE 0.718 5.000 0.000 1.000   NA
 6887317 6887318 Cla_a005 Cla_a006     FALSE 0.068 268.000 0.000 NA   NA
 6887318 6887319 Cla_a006 Cla_a007     FALSE 0.072 469.000 0.000 NA   NA
 6887320 6887321 Cla_a008 Cla_a009     TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 6887321 6887322 Cla_a009 Cla_a010     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6887322 6887323 Cla_a010 Cla_a011     TRUE 0.946 14.000 0.400 NA   NA
 6887323 6887324 Cla_a011 Cla_a012     TRUE 0.727 499.000 0.400 NA   NA
 6887324 6887325 Cla_a012 Cla_a013     TRUE 0.681 -3.000 0.000 NA   NA
 6887325 6887326 Cla_a013 Cla_a014     FALSE 0.069 290.000 0.000 NA   NA
 6887326 6887327 Cla_a014 Cla_a015     TRUE 0.976 -10.000 0.400 NA   NA
 6887327 6887328 Cla_a015 Cla_a016     TRUE 0.600 291.000 0.200 NA   NA
 6887328 6887329 Cla_a016 Cla_a017     TRUE 0.994 -3.000 0.600 NA Y NA
 6887329 6887330 Cla_a017 Cla_a018     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA Y NA
 6887330 6887331 Cla_a018 Cla_a019     TRUE 0.988 0.000 0.250 1.000 Y NA
 6887331 6887332 Cla_a019 Cla_a020     FALSE 0.536 -10.000 0.000 NA   NA
 6887332 6887333 Cla_a020 Cla_a021     FALSE 0.536 -10.000 0.000 NA   NA
 6887333 6887334 Cla_a021 Cla_a022     TRUE 0.942 -16.000 0.190 NA   NA
 6887334 6887335 Cla_a022 Cla_a023     FALSE 0.064 121.000 0.000 NA   NA
 6887335 6887336 Cla_a023 Cla_a024     TRUE 0.593 -7.000 0.000 NA   NA
 6887336 6887337 Cla_a024 Cla_a025     TRUE 0.830 84.000 0.750 NA   NA
 6887337 6887338 Cla_a025 Cla_a026     TRUE 0.635 54.000 0.120 NA   NA
 6887338 6887339 Cla_a026 Cla_a027     TRUE 0.588 13.000 0.000 1.000 Y NA
 6887339 6887340 Cla_a027 Cla_a028     TRUE 0.692 0.000 0.000 NA   NA
 6887341 6887342 Cla_a029 Cla_a030     FALSE 0.071 77.000 0.000 NA   NA
 6887343 6887344 Cla_a031 Cla_a032     FALSE 0.064 155.000 0.000 NA   NA
 6887344 6887345 Cla_a032 Cla_a033     FALSE 0.066 89.000 0.000 NA   NA
 6887346 6887347 Cla_a034 Cla_a035     TRUE 0.674 89.000 0.333 NA   NA
 6887347 6887348 Cla_a035 Cla_a036     FALSE 0.094 59.000 0.000 NA   NA
 6887348 6887349 Cla_a036 Cla_a037     TRUE 0.977 -3.000 0.200 NA   NA
 6887351 6887352 Cla_a039 Cla_a040     TRUE 0.902 19.000 0.333 NA   NA
 6887352 6887353 Cla_a040 Cla_a041     TRUE 0.889 72.000 1.000 NA   NA
 6887312 6887313 Cla_a042 Cla_a001     TRUE 0.692 0.000 0.000 NA   NA