MicrobesOnline Operon Predictions for Agrobacterium vitis S4

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
5477084	5477085	Avi_0001	Avi_0002		maf	TRUE	0.866	32.000	0.135	NA		NA
5477085	5477086	Avi_0002	Avi_0004	maf	aroE	TRUE	0.990	-7.000	0.169	NA	N	NA
5477086	5477087	Avi_0004	Avi_0005	aroE	coaE	TRUE	0.976	-3.000	0.078	1.000	N	NA
5477087	5477088	Avi_0005	Avi_0006	coaE	dnaQ	FALSE	0.394	95.000	0.092	1.000	N	NA
5477089	5477090	Avi_0007	Avi_0008	secB	fxsA	TRUE	0.527	90.000	0.122	NA		NA
5477091	5477092	Avi_0009	Avi_0010		mltA	TRUE	0.995	-3.000	0.324	1.000		NA
5477092	5477093	Avi_0010	Avi_0011	mltA		TRUE	0.926	39.000	0.332	NA		NA
5477093	5477094	Avi_0011	Avi_0012			TRUE	0.989	-3.000	0.183	NA		NA
5477094	5477095	Avi_0012	Avi_0013		gyrB	FALSE	0.133	126.000	0.008	1.000	N	NA
5477097	5477098	Avi_0016	Avi_0017	depA		FALSE	0.327	138.000	0.118	NA		NA
5477098	5477099	Avi_0017	Avi_0018			FALSE	0.288	111.000	0.034	NA		NA
5477099	5477100	Avi_0018	Avi_0019		trpF	TRUE	0.666	42.000	0.017	NA		NA
5477100	5477101	Avi_0019	Avi_0020	trpF	trpB	TRUE	0.999	-3.000	0.375	0.001	Y	NA
5477101	5477102	Avi_0020	Avi_0021	trpB	trpA	TRUE	0.998	2.000	0.344	0.001	Y	NA
5477102	5477103	Avi_0021	Avi_0022	trpA		FALSE	0.419	135.000	0.232	1.000	N	NA
5477103	5477104	Avi_0022	Avi_0024		folC	TRUE	0.922	40.000	0.383	1.000	N	NA
5477104	5477105	Avi_0024	Avi_0025	folC		FALSE	0.012	496.000	0.000	NA		NA
5477105	5477106	Avi_0025	Avi_0027			FALSE	0.050	235.000	0.000	NA		NA
5477107	5477108	Avi_0028	Avi_0030	trxA		FALSE	0.065	200.000	0.000	NA		NA
5477108	5477109	Avi_0030	Avi_0031		hslU	FALSE	0.163	174.000	0.021	NA		NA
5477109	5477110	Avi_0031	Avi_0032	hslU	hslV	TRUE	0.994	38.000	0.752	1.000	Y	NA
5477111	5477112	Avi_0033	Avi_0035	hisB	hisH	TRUE	0.974	28.000	0.049	0.004	Y	NA
5477112	5477113	Avi_0035	Avi_0036	hisH	hisA	TRUE	0.979	25.000	0.070	0.004	Y	NA
5477113	5477114	Avi_0036	Avi_0037	hisA	hisF	TRUE	0.996	14.000	0.433	0.004	Y	NA
5477114	5477115	Avi_0037	Avi_0038	hisF	hisE	TRUE	0.989	13.000	0.105	0.004	Y	NA
5477115	5477116	Avi_0038	Avi_0039	hisE	panK	TRUE	0.928	6.000	0.086	1.000	N	NA
5477116	5477117	Avi_0039	Avi_0040	panK		FALSE	0.326	67.000	0.000	1.000		NA
5477118	5477119	Avi_0041	Avi_0042		pckA	FALSE	0.178	177.000	0.025	1.000		NA
5477120	5477121	Avi_0044	Avi_0045	chvI	chvG	TRUE	0.901	238.000	0.829	1.000	Y	NA
5477121	5477122	Avi_0045	Avi_0046	chvG		TRUE	0.997	-3.000	0.304	0.015		NA
5477122	5477123	Avi_0046	Avi_0047			FALSE	0.112	361.000	0.145	1.000		NA
5477123	5477124	Avi_0047	Avi_0048		ptsH	TRUE	0.996	15.000	0.420	0.001	Y	NA
5477124	5477125	Avi_0048	Avi_0049	ptsH	ahcY	TRUE	0.521	45.000	0.012	1.000	N	NA
5477125	5477126	Avi_0049	Avi_0050	ahcY		FALSE	0.089	212.000	0.018	1.000	N	NA
5477126	5477127	Avi_0050	Avi_0051			TRUE	0.983	-3.000	0.085	NA		NA
5477127	5477128	Avi_0051	Avi_0053			TRUE	0.745	154.000	0.642	NA		NA
5477128	5477129	Avi_0053	Avi_0055		addB	TRUE	0.987	-3.000	0.196	1.000	N	NA
5477129	5477130	Avi_0055	Avi_0056	addB	uvrD	TRUE	1.000	-7.000	0.863	0.067	Y	NA
5477130	5477131	Avi_0056	Avi_0057	uvrD	glcB	FALSE	0.011	348.000	0.000	1.000	N	NA
5477134	5477135	Avi_0063	Avi_0064	actR	actS	TRUE	0.888	159.000	0.560	1.000	Y	NA
5477135	5477136	Avi_0064	Avi_0067	actS	hrpB	TRUE	0.690	37.000	0.042	1.000	N	NA
5477136	5477137	Avi_0067	Avi_0068	hrpB	arcB	FALSE	0.308	83.000	0.021	1.000	N	NA
5477138	5477139	Avi_4501	Avi_4551			FALSE	0.018	392.000	0.000	NA		NA
5477139	5477140	Avi_4551	Avi_4552			FALSE	0.206	85.000	0.000	NA		NA
5477140	5477141	Avi_4552	Avi_4502			FALSE	0.006	985.000	0.000	NA		NA
5477141	5477142	Avi_4502	Avi_4503			FALSE	0.009	600.000	0.000	NA		NA
5477142	5477143	Avi_4503	Avi_4553			FALSE	0.116	118.000	0.000	NA		NA
5477143	5477144	Avi_4553	Avi_0069			FALSE	0.084	153.000	0.000	NA		NA
5477145	5477146	Avi_0070	Avi_0071		dapA	FALSE	0.084	321.000	0.100	1.000	N	NA
5477148	5477149	Avi_0073	Avi_0074		idhA	FALSE	0.053	228.000	0.000	NA		NA
5477150	5477151	Avi_0075	Avi_0076		iolC	FALSE	0.157	128.000	0.021	1.000	N	NA
5477151	5477152	Avi_0076	Avi_0077	iolC	iolD	FALSE	0.254	132.000	0.093	1.000	N	NA
5477152	5477153	Avi_0077	Avi_0078	iolD	iolE	TRUE	0.990	2.000	0.438	1.000	N	NA
5477153	5477154	Avi_0078	Avi_0079	iolE		FALSE	0.360	109.000	0.071	NA		NA
5477154	5477155	Avi_0079	Avi_0080		iolB	TRUE	0.973	-3.000	0.026	NA		NA
5477156	5477157	Avi_0081	Avi_0082			TRUE	0.715	14.000	0.000	NA		NA
5477158	5477159	Avi_0083	Avi_0084	csgA		TRUE	0.463	68.000	0.012	NA		NA
5477159	5477160	Avi_0084	Avi_0085		idnO	TRUE	0.986	0.000	0.240	NA		NA
5477161	5477162	Avi_0086	Avi_0087			TRUE	0.991	-3.000	0.213	NA		NA
5477162	5477163	Avi_0087	Avi_0088			TRUE	0.998	-3.000	0.722	NA		NA
5477164	5477165	Avi_0089	Avi_0090			TRUE	0.997	0.000	0.898	NA	N	NA
5477165	5477166	Avi_0090	Avi_0091			TRUE	0.780	28.000	0.028	NA		NA
5477166	5477167	Avi_0091	Avi_0092		glpR	FALSE	0.211	84.000	0.000	NA		NA
5477167	5477168	Avi_0092	Avi_0094	glpR	glpD	FALSE	0.382	77.000	0.036	1.000	N	NA
5477168	5477169	Avi_0094	Avi_0095	glpD		FALSE	0.125	158.000	0.019	1.000	N	NA
5477169	5477170	Avi_0095	Avi_0096			TRUE	0.999	4.000	0.865	0.010	Y	NA
5477170	5477171	Avi_0096	Avi_0097			TRUE	1.000	-3.000	0.847	NA	Y	NA
5477171	5477172	Avi_0097	Avi_0098			TRUE	0.979	91.000	0.922	NA	Y	NA
5477172	5477173	Avi_0098	Avi_0099			TRUE	0.993	14.000	0.854	NA		NA
5477173	5477174	Avi_0099	Avi_0100			TRUE	0.964	43.000	0.640	NA		NA
5477176	5477177	Avi_0103	Avi_0105	kdsB	pheA	TRUE	0.548	68.000	0.083	1.000	N	NA
5477178	5477179	Avi_0107	Avi_0108			FALSE	0.016	290.000	0.000	1.000	N	NA
5477179	5477180	Avi_0108	Avi_0109			TRUE	0.980	-3.000	0.108	1.000	N	NA
5477181	5477182	Avi_4516	Avi_0110		dnaX	FALSE	0.276	71.000	0.000	NA		NA
5477182	5477183	Avi_0110	Avi_0111	dnaX		TRUE	0.755	100.000	0.411	NA		NA
5477186	5477187	Avi_0114	Avi_0115			TRUE	0.943	17.000	0.205	1.000		NA
5477188	5477189	Avi_0116	Avi_0118	ftsZ1	lepA	TRUE	0.725	34.000	0.000	0.006	N	NA
5477190	5477191	Avi_0120	Avi_0122	rnd		FALSE	0.179	99.000	0.000	1.000		NA
5477191	5477192	Avi_0122	Avi_0125			FALSE	0.044	252.000	0.000	NA		NA
5477193	5477194	Avi_0126	Avi_0127	noeK		FALSE	0.024	198.000	0.000	NA	N	NA
5477194	5477195	Avi_0127	Avi_0128			FALSE	0.125	113.000	0.000	NA		NA
5477199	5477200	Avi_0134	Avi_0136			TRUE	0.613	49.000	0.018	NA		NA
5477200	5477201	Avi_0136	Avi_0137		ampS	FALSE	0.121	198.000	0.006	NA		NA
5477202	5477203	Avi_0138	Avi_0140			FALSE	0.055	223.000	0.000	NA		NA
5477203	5477204	Avi_0140	Avi_0142		cspA	FALSE	0.018	387.000	0.000	NA		NA
5477204	5477205	Avi_0142	Avi_0143	cspA	xseA	FALSE	0.014	310.000	0.000	1.000	N	NA
5477205	5477206	Avi_0143	Avi_0147	xseA		FALSE	0.016	412.000	0.000	NA		NA
5477207	5477208	Avi_0148	Avi_0149	exoA		TRUE	0.985	-3.000	0.114	NA		NA
5477213	5477214	Avi_0154	Avi_0155			FALSE	0.080	165.000	0.000	NA		NA
5477215	5477216	Avi_0156	Avi_0157	recR	mltB	TRUE	0.482	52.000	0.014	1.000	N	NA
5477217	5477218	Avi_0158	Avi_0160			FALSE	0.052	438.000	0.000	0.002		NA
5477220	5477221	Avi_0162	Avi_0163			FALSE	0.211	84.000	0.000	NA		NA
5477222	5477223	Avi_0164	Avi_0166		nusA	TRUE	0.960	59.000	0.759	NA		NA
5477223	5477224	Avi_0166	Avi_0168	nusA		TRUE	0.992	0.000	0.075	NA	Y	NA
5477224	5477225	Avi_0168	Avi_0169		infB	TRUE	0.511	104.000	0.223	NA	N	NA
5477225	5477226	Avi_0169	Avi_0170	infB	rbfA	TRUE	0.880	165.000	0.530	1.000	Y	NA
5477226	5477227	Avi_0170	Avi_0171	rbfA	truB	TRUE	0.995	5.000	0.318	1.000	Y	NA
5477227	5477228	Avi_0171	Avi_0173	truB	rpsO	TRUE	0.667	205.000	0.211	1.000	Y	NA
5477228	5477229	Avi_0173	Avi_0175	rpsO	pnpA	TRUE	0.432	424.000	0.335	1.000	Y	NA
5477229	5477230	Avi_0175	Avi_4510	pnpA	suhB	TRUE	0.961	-17.000	0.000	NA		NA
5477230	5477231	Avi_4510	Avi_0178	suhB	rsmC	FALSE	0.118	117.000	0.000	NA		NA
5477232	5477233	Avi_0179	Avi_0180	fabI	fabB	TRUE	0.987	18.000	0.265	1.000	Y	NA
5477233	5477234	Avi_0180	Avi_0181	fabB	fabA	TRUE	0.987	35.000	0.451	1.000	Y	NA
5477236	5477237	Avi_0184	Avi_0189			FALSE	0.035	283.000	0.000	NA		NA
5477237	5477238	Avi_0189	Avi_0190			FALSE	0.410	49.000	0.000	NA		NA
5477238	5477239	Avi_0190	Avi_4597			FALSE	0.015	440.000	0.000	NA		NA
5477239	5477240	Avi_4597	Avi_0191			FALSE	0.085	152.000	0.000	NA		NA
5477241	5477242	Avi_0193	Avi_0194	cmk	rpsA	TRUE	0.439	151.000	0.281	1.000	N	NA
5477242	5477243	Avi_0194	Avi_0196	rpsA		FALSE	0.093	162.000	0.000	1.000		NA
5477244	5477245	Avi_0197	Avi_0199			FALSE	0.077	274.000	0.014	NA		NA
5477246	5477247	Avi_0200	Avi_0202	infC		FALSE	0.003	1455.000	0.000	1.000	N	NA
5477247	5477248	Avi_0202	Avi_0203			TRUE	1.000	-6.000	0.963	1.000	Y	NA
5477248	5477249	Avi_0203	Avi_0205		rpmI	FALSE	0.026	228.000	0.000	1.000	N	NA
5477249	5477250	Avi_0205	Avi_0206	rpmI	rplT	TRUE	0.997	40.000	0.928	0.011	Y	NA
5477250	5477251	Avi_0206	Avi_0208	rplT	pheS	TRUE	0.720	163.000	0.202	1.000	Y	NA
5477251	5477252	Avi_0208	Avi_0209	pheS	pheT	TRUE	0.732	416.000	0.574	0.001	Y	NA
5477255	5477256	Avi_0211	Avi_0212		ctpI	FALSE	0.020	371.000	0.000	NA		NA
5477256	5477257	Avi_0212	Avi_0213	ctpI	ctpH	TRUE	0.999	11.000	0.941	NA	Y	NA
5477257	5477258	Avi_0213	Avi_0214	ctpH	ctpG	TRUE	0.999	4.000	0.882	NA	Y	NA
5477258	5477259	Avi_0214	Avi_0215	ctpG	ctpF	TRUE	0.990	50.000	0.765	1.000	Y	NA
5477259	5477260	Avi_0215	Avi_0216	ctpF	ctpE	TRUE	0.958	27.000	0.467	NA	N	NA
5477260	5477261	Avi_0216	Avi_0217	ctpE	ctpD	FALSE	0.342	114.000	0.133	NA	N	NA
5477261	5477262	Avi_0217	Avi_0218	ctpD	ctpC	TRUE	0.998	-3.000	0.222	NA	Y	NA
5477262	5477263	Avi_0218	Avi_0221	ctpC	ctpB	TRUE	0.934	111.000	0.611	NA	Y	NA
5477263	5477264	Avi_0221	Avi_0222	ctpB	ctpA	TRUE	0.820	204.000	0.467	NA	Y	NA
5477264	5477265	Avi_0222	Avi_0223	ctpA	ctpA	TRUE	0.746	188.000	0.300	NA	Y	NA
5477266	5477267	Avi_0224	Avi_0226	pilQ		TRUE	0.458	227.000	0.381	NA		NA
5477267	5477268	Avi_0226	Avi_0228			TRUE	1.000	-3.000	0.857	NA	Y	NA
5477268	5477269	Avi_0228	Avi_0229		deoB	FALSE	0.169	149.000	0.055	NA	N	NA
5477269	5477270	Avi_0229	Avi_0230	deoB	add	TRUE	0.977	-3.000	0.086	1.000	N	NA
5477270	5477271	Avi_0230	Avi_0231	add	upp	TRUE	0.780	85.000	0.030	1.000	Y	NA
5477271	5477272	Avi_0231	Avi_0232	upp		FALSE	0.324	96.000	0.014	1.000		NA
5477272	5477273	Avi_0232	Avi_0233		rhtB	FALSE	0.102	140.000	0.000	1.000		NA
5477274	5477275	Avi_0235	Avi_0237		dapB	TRUE	0.687	36.000	0.038	1.000	N	NA
5477275	5477276	Avi_0237	Avi_0238	dapB		FALSE	0.278	86.000	0.017	1.000	N	NA
5477276	5477277	Avi_0238	Avi_0239		glk	FALSE	0.225	105.000	0.027	1.000	N	NA
5477277	5477278	Avi_0239	Avi_0240	glk	mgsA	TRUE	0.910	48.000	0.035	1.000	Y	NA
5477278	5477279	Avi_0240	Avi_0241	mgsA	mepA	FALSE	0.329	86.000	0.035	1.000	N	NA
5477280	5477281	Avi_0244	Avi_0245			FALSE	0.367	173.000	0.197	NA		NA
5477281	5477282	Avi_0245	Avi_0246			TRUE	0.998	0.000	0.882	NA		NA
5477282	5477283	Avi_0246	Avi_0247			TRUE	0.998	-3.000	0.744	NA		NA
5477283	5477284	Avi_0247	Avi_0248			TRUE	0.902	29.000	0.179	1.000		NA
5477284	5477285	Avi_0248	Avi_0249			FALSE	0.216	83.000	0.000	NA		NA
5477285	5477286	Avi_0249	Avi_0250		pncB	FALSE	0.072	181.000	0.000	NA		NA
5477287	5477288	Avi_0252	Avi_4596			FALSE	0.019	377.000	0.000	NA		NA
5477289	5477290	Avi_0253	Avi_0256			FALSE	0.010	576.000	0.000	NA		NA
5477290	5477291	Avi_0256	Avi_0258			TRUE	0.590	242.000	0.586	1.000		NA
5477291	5477292	Avi_0258	Avi_0259			TRUE	0.962	8.000	0.184	NA		NA
5477292	5477293	Avi_0259	Avi_0260			TRUE	0.991	13.000	0.720	NA		NA
5477293	5477294	Avi_0260	Avi_0262		cdd	TRUE	0.957	2.000	0.060	NA		NA
5477294	5477295	Avi_0262	Avi_0263	cdd		TRUE	0.998	-3.000	0.242	1.000	Y	NA
5477295	5477296	Avi_0263	Avi_0264		deoC	TRUE	0.998	-22.000	0.083	1.000	Y	NA
5477296	5477297	Avi_0264	Avi_0265	deoC	deoA	TRUE	0.996	2.000	0.286	1.000	Y	NA
5477299	5477300	Avi_0267	Avi_0269	phnG	phnH	TRUE	0.995	60.000	0.967	0.002	Y	NA
5477300	5477301	Avi_0269	Avi_0270	phnH	phnI	TRUE	1.000	1.000	0.960	0.002	Y	NA
5477301	5477302	Avi_0270	Avi_0273	phnI	phnJ	TRUE	0.952	143.000	0.880	1.000	Y	NA
5477302	5477303	Avi_0273	Avi_0274	phnJ	phnK	TRUE	1.000	-3.000	0.883	1.000	Y	NA
5477303	5477304	Avi_0274	Avi_0275	phnK	phnL	TRUE	0.999	13.000	0.859	0.046	Y	NA
5477304	5477305	Avi_0275	Avi_0277	phnL		TRUE	0.608	76.000	0.104	1.000		NA
5477305	5477306	Avi_0277	Avi_0278		phnC	TRUE	0.491	117.000	0.189	1.000		NA
5477306	5477307	Avi_0278	Avi_0280	phnC	phnD	TRUE	0.938	157.000	0.589	0.002	Y	NA
5477307	5477308	Avi_0280	Avi_0282	phnD	phnE	TRUE	0.981	77.000	0.568	0.001	Y	NA
5477308	5477309	Avi_0282	Avi_0284	phnE	phnE	TRUE	0.998	10.000	0.491	0.001	Y	NA
5477309	5477310	Avi_0284	Avi_0286	phnE		FALSE	0.365	113.000	0.075	1.000		NA
5477310	5477311	Avi_0286	Avi_0287		phnM	TRUE	0.984	0.000	0.205	1.000		NA
5477311	5477312	Avi_0287	Avi_0288	phnM	gmk	TRUE	0.925	60.000	0.173	NA	Y	NA
5477312	5477313	Avi_0288	Avi_0289	gmk	rhtB	FALSE	0.023	205.000	0.000	NA	N	NA
5477315	5477316	Avi_0292	Avi_0293			FALSE	0.009	601.000	0.000	NA		NA
5477316	5477317	Avi_0293	Avi_0295			FALSE	0.028	311.000	0.000	NA		NA
5477317	5477318	Avi_0295	Avi_0296			FALSE	0.095	91.000	0.000	1.000	N	NA
5477318	5477319	Avi_0296	Avi_0297			TRUE	0.960	3.000	0.150	NA	N	NA
5477321	5477322	Avi_0300	Avi_0301		dapE	TRUE	0.622	73.000	0.160	1.000	N	NA
5477322	5477323	Avi_0301	Avi_0303	dapE		FALSE	0.014	461.000	0.000	NA		NA
5477325	5477326	Avi_0305	Avi_0306	pbpC	dnaK	FALSE	0.013	322.000	0.000	1.000	N	NA
5477326	5477327	Avi_0306	Avi_0307	dnaK		TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5477327	5477328	Avi_0307	Avi_0308		dnaJ	TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5477330	5477331	Avi_0311	Avi_0312	recF	moeB	TRUE	0.634	36.000	0.019	1.000	N	NA
5477331	5477332	Avi_0312	Avi_0313	moeB		TRUE	0.862	43.000	0.196	1.000		NA
5477335	5477336	Avi_0316	Avi_0317			FALSE	0.049	112.000	0.000	NA	N	NA
5477336	5477337	Avi_0317	Avi_0319			FALSE	0.015	432.000	0.000	NA		NA
5477337	5477338	Avi_0319	Avi_0320			TRUE	0.987	20.000	0.750	NA		NA
5477342	5477343	Avi_0327	Avi_0328	guaA	pfs	TRUE	0.757	85.000	0.012	1.000	Y	NA
5477343	5477344	Avi_0328	Avi_0329	pfs		TRUE	0.966	-3.000	0.048	NA	N	NA
5477344	5477345	Avi_0329	Avi_0330		tspO	FALSE	0.248	124.000	0.083	NA	N	NA
5477345	5477346	Avi_0330	Avi_0332	tspO		TRUE	0.619	49.000	0.020	NA		NA
5477346	5477347	Avi_0332	Avi_0333			TRUE	0.992	6.000	0.620	NA		NA
5477347	5477348	Avi_0333	Avi_0334			TRUE	0.997	0.000	0.713	NA		NA
5477348	5477349	Avi_0334	Avi_0335			TRUE	0.964	18.000	0.436	NA	N	NA
5477349	5477350	Avi_0335	Avi_0336		sun	FALSE	0.176	118.000	0.029	NA	N	NA
5477350	5477351	Avi_0336	Avi_0337	sun		FALSE	0.065	310.000	0.020	NA		NA
5477351	5477352	Avi_0337	Avi_0339			FALSE	0.037	275.000	0.000	NA		NA
5477352	5477353	Avi_0339	Avi_0340			TRUE	0.923	-27.000	0.000	1.000	N	NA
5477353	5477354	Avi_0340	Avi_0341			TRUE	0.508	12.000	0.000	NA	N	NA
5477356	5477357	Avi_0343	Avi_0345			FALSE	0.212	135.000	0.028	NA		NA
5477359	5477360	Avi_0347	Avi_0348	pyrF		TRUE	0.916	0.000	0.018	NA	N	NA
5477360	5477361	Avi_0348	Avi_0349			TRUE	0.948	14.000	0.256	NA	N	NA
5477361	5477362	Avi_0349	Avi_0351		dnaN	FALSE	0.056	243.000	0.002	1.000	N	NA
5477363	5477364	Avi_0352	Avi_0353			TRUE	0.989	-3.000	0.165	1.000		NA
5477364	5477365	Avi_0353	Avi_0354		ugpA	FALSE	0.091	148.000	0.003	NA	N	NA
5477365	5477366	Avi_0354	Avi_0356	ugpA	ugpA	TRUE	0.979	76.000	0.760	NA	Y	NA
5477366	5477367	Avi_0356	Avi_0357	ugpA	ugpE	TRUE	0.998	11.000	0.840	NA	Y	NA
5477367	5477368	Avi_0357	Avi_0359	ugpE	ugpC	TRUE	0.985	12.000	0.160	NA	Y	NA
5477368	5477369	Avi_0359	Avi_0360	ugpC		FALSE	0.171	152.000	0.016	NA		NA
5477369	5477370	Avi_0360	Avi_0361		gshB	FALSE	0.348	87.000	0.015	NA		NA
5477370	5477371	Avi_0361	Avi_0363	gshB		FALSE	0.029	449.000	0.041	1.000	N	NA
5477372	5477373	Avi_0364	Avi_0365	cysK	rhtB	TRUE	0.692	136.000	0.132	1.000	Y	NA
5477375	5477376	Avi_0367	Avi_0368		dut	TRUE	0.881	9.000	0.008	NA		NA
5477378	5477379	Avi_0370	Avi_0371			TRUE	0.972	30.000	0.037	0.001	Y	NA
5477381	5477382	Avi_0373	Avi_0375			FALSE	0.084	153.000	0.000	NA		NA
5477382	5477383	Avi_0375	Avi_0377			FALSE	0.115	119.000	0.000	NA		NA
5477386	5477387	Avi_0381	Avi_0382	chrA	chrA	TRUE	1.000	-3.000	0.571	0.001	Y	NA
5477388	5477389	Avi_0383	Avi_0384	coaBC	fsrR	FALSE	0.089	95.000	0.000	1.000	N	NA
5477389	5477390	Avi_0384	Avi_0385	fsrR		TRUE	0.988	16.000	0.159	0.019	Y	NA
5477390	5477391	Avi_0385	Avi_0386			TRUE	0.997	3.000	0.341	1.000	Y	NA
5477391	5477392	Avi_0386	Avi_0387		ubiB	TRUE	0.822	7.000	0.000	1.000		NA
5477392	5477393	Avi_0387	Avi_0388	ubiB	ubiE	TRUE	0.817	42.000	0.115	1.000		NA
5477394	5477395	Avi_0389	Avi_0390	mutM	rpsT	FALSE	0.078	226.000	0.016	1.000	N	NA
5477395	5477396	Avi_0390	Avi_0391	rpsT	dnaA	FALSE	0.003	934.000	0.000	1.000	N	NA
5477396	5477397	Avi_0391	Avi_0392	dnaA		FALSE	0.061	209.000	0.000	NA		NA
5477398	5477399	Avi_0393	Avi_0394		hemN	TRUE	0.886	41.000	0.000	1.000	Y	NA
5477399	5477400	Avi_0394	Avi_0395	hemN	rdgB	TRUE	0.962	7.000	0.218	1.000	N	NA
5477400	5477401	Avi_0395	Avi_0396	rdgB		TRUE	0.814	10.000	0.013	NA	N	NA
5477401	5477402	Avi_0396	Avi_0397		rph	TRUE	0.780	14.000	0.019	NA	N	NA
5477403	5477404	Avi_0398	Avi_0399	hrcA	grpE	FALSE	0.389	100.000	0.120	NA	N	NA
5477405	5477406	Avi_0401	Avi_0402	ptsN		TRUE	0.794	73.000	0.353	NA	N	NA
5477406	5477407	Avi_0402	Avi_0404		rpoN	FALSE	0.009	335.000	0.000	NA	N	NA
5477407	5477408	Avi_0404	Avi_0405	rpoN		FALSE	0.025	350.000	0.000	1.000		NA
5477408	5477409	Avi_0405	Avi_0406		yhbN	TRUE	0.983	15.000	0.543	NA		NA
5477409	5477410	Avi_0406	Avi_0408	yhbN		TRUE	0.950	10.000	0.144	NA		NA
5477411	5477412	Avi_0409	Avi_0411	ihfB		FALSE	0.177	234.000	0.085	NA		NA
5477412	5477413	Avi_0411	Avi_0413			FALSE	0.073	304.000	0.027	NA		NA
5477413	5477414	Avi_0413	Avi_0414		trmH	TRUE	0.991	-3.000	0.213	NA		NA
5477414	5477415	Avi_0414	Avi_0415	trmH	lspA	TRUE	0.980	-3.000	0.104	1.000	N	NA
5477415	5477416	Avi_0415	Avi_0417	lspA	barA	FALSE	0.038	430.000	0.062	1.000	N	NA
5477416	5477417	Avi_0417	Avi_0418	barA		FALSE	0.317	154.000	0.130	NA		NA
5477419	5477420	Avi_0422	Avi_0423		mutS	FALSE	0.027	223.000	0.000	1.000	N	NA
5477420	5477421	Avi_0423	Avi_0424	mutS	glnD	FALSE	0.121	169.000	0.021	1.000	N	NA
5477421	5477422	Avi_0424	Avi_0425	glnD	mviN	TRUE	0.965	2.000	0.081	1.000		NA
5477422	5477423	Avi_0425	Avi_0426	mviN		TRUE	0.980	-13.000	0.008	NA		NA
5477423	5477424	Avi_0426	Avi_0427		trpS	FALSE	0.176	107.000	0.016	NA	N	NA
5477424	5477425	Avi_0427	Avi_0429	trpS		FALSE	0.419	90.000	0.042	1.000		NA
5477425	5477426	Avi_0429	Avi_0430			FALSE	0.348	164.000	0.151	1.000		NA
5477426	5477427	Avi_0430	Avi_0432			TRUE	0.827	80.000	0.061	1.000	Y	NA
5477427	5477428	Avi_0432	Avi_0433			FALSE	0.399	173.000	0.209	1.000		NA
5477428	5477429	Avi_0433	Avi_0435		fur	TRUE	0.662	59.000	0.061	1.000		NA
5477429	5477430	Avi_0435	Avi_0436	fur	plsC	TRUE	0.794	32.000	0.091	1.000	N	NA
5477430	5477431	Avi_0436	Avi_0437	plsC	miaB	FALSE	0.290	91.000	0.030	1.000	N	NA
5477431	5477432	Avi_0437	Avi_0438	miaB	phoH	TRUE	0.848	42.000	0.220	1.000	N	NA
5477432	5477433	Avi_0438	Avi_0440	phoH		TRUE	0.954	37.000	0.457	NA		NA
5477433	5477434	Avi_0440	Avi_0441			TRUE	0.956	13.000	0.222	NA		NA
5477434	5477435	Avi_0441	Avi_0442		lnt	FALSE	0.299	230.000	0.213	NA		NA
5477435	5477436	Avi_0442	Avi_0443	lnt		FALSE	0.394	147.000	0.231	1.000	N	NA
5477436	5477437	Avi_0443	Avi_0444		metK	FALSE	0.228	174.000	0.113	1.000	N	NA
5477437	5477438	Avi_0444	Avi_0445	metK	trmB	TRUE	0.955	6.000	0.112	1.000		NA
5477439	5477440	Avi_0446	Avi_0447		hspH	TRUE	0.869	144.000	0.955	NA		NA
5477441	5477442	Avi_0448	Avi_0449	iunH		FALSE	0.216	83.000	0.000	NA		NA
5477442	5477443	Avi_0449	Avi_0450			FALSE	0.122	211.000	0.007	1.000		NA
5477444	5477445	Avi_0452	Avi_4595	mcpC		FALSE	0.019	379.000	0.000	NA		NA
5477445	5477446	Avi_4595	Avi_0453			FALSE	0.083	158.000	0.000	NA		NA
5477447	5477448	Avi_0454	Avi_0455	rnpA		TRUE	0.980	-3.000	0.105	1.000	N	NA
5477448	5477449	Avi_0455	Avi_0456		cgpA	TRUE	0.641	87.000	0.082	0.052		NA
5477450	5477451	Avi_0459	Avi_0461			FALSE	0.339	255.000	0.304	NA		NA
5477451	5477452	Avi_0461	Avi_0463		sigK	TRUE	0.995	-3.000	0.349	NA		NA
5477454	5477455	Avi_0465	Avi_0466	rbsK		FALSE	0.372	87.000	0.024	NA		NA
5477458	5477459	Avi_0473	Avi_0474	dapD	dapE	TRUE	0.857	105.000	0.109	0.002	Y	NA
5477459	5477460	Avi_0474	Avi_0475	dapE		TRUE	0.987	-13.000	0.050	NA		NA
5477460	5477461	Avi_0475	Avi_0476			FALSE	0.096	134.000	0.000	NA		NA
5477461	5477462	Avi_0476	Avi_0477			FALSE	0.040	165.000	0.000	1.000	N	NA
5477463	5477464	Avi_0478	Avi_0479	hslO	argF	FALSE	0.038	406.000	0.052	1.000	N	NA
5477464	5477465	Avi_0479	Avi_0481	argF	argD	TRUE	0.973	16.000	0.058	1.000	Y	NA
5477465	5477466	Avi_0481	Avi_0482	argD		FALSE	0.398	51.000	0.000	NA		NA
5477468	5477469	Avi_0485	Avi_0488	phoB	phoU	FALSE	0.071	361.000	0.128	NA	N	NA
5477469	5477470	Avi_0488	Avi_0489	phoU	pstB	TRUE	0.957	44.000	0.203	NA	Y	NA
5477470	5477471	Avi_0489	Avi_0491	pstB	pstA	TRUE	0.951	99.000	0.402	0.002	Y	NA
5477471	5477472	Avi_0491	Avi_0493	pstA	pstC	TRUE	0.999	-3.000	0.485	0.002	Y	NA
5477472	5477473	Avi_0493	Avi_0495	pstC		TRUE	0.684	128.000	0.107	NA	Y	NA
5477473	5477474	Avi_0495	Avi_0496		phoR	FALSE	0.119	194.000	0.041	NA	N	NA
5477477	5477478	Avi_0500	Avi_4555			FALSE	0.211	84.000	0.000	NA		NA
5477478	5477479	Avi_4555	Avi_0501			FALSE	0.019	386.000	0.000	NA		NA
5477479	5477480	Avi_0501	Avi_0502			TRUE	0.999	-3.000	0.694	NA	Y	NA
5477480	5477481	Avi_0502	Avi_0503			TRUE	1.000	-3.000	0.918	NA	Y	NA
5477481	5477482	Avi_0503	Avi_0504			TRUE	0.925	64.000	0.667	NA	N	NA
5477482	5477483	Avi_0504	Avi_0505		hutC	TRUE	0.788	0.000	0.000	1.000	N	NA
5477483	5477484	Avi_0505	Avi_0506	hutC	hutH	FALSE	0.215	129.000	0.057	1.000	N	NA
5477484	5477485	Avi_0506	Avi_0507	hutH		FALSE	0.052	230.000	0.000	NA		NA
5477486	5477487	Avi_0508	Avi_0509			TRUE	0.994	3.000	0.667	1.000	N	NA
5477487	5477488	Avi_0509	Avi_0510			TRUE	0.999	-3.000	0.714	NA	Y	NA
5477488	5477489	Avi_0510	Avi_0511			TRUE	0.996	11.000	0.571	NA	Y	NA
5477490	5477491	Avi_0512	Avi_0513			FALSE	0.291	34.000	0.000	NA	N	NA
5477491	5477492	Avi_0513	Avi_0514			FALSE	0.092	138.000	0.000	NA		NA
5477492	5477493	Avi_0514	Avi_0516			FALSE	0.019	383.000	0.000	NA		NA
5477493	5477494	Avi_0516	Avi_0517			TRUE	0.570	63.000	0.038	NA		NA
5477494	5477495	Avi_0517	Avi_0518			TRUE	0.486	108.000	0.167	NA		NA
5477495	5477496	Avi_0518	Avi_0519			FALSE	0.009	337.000	0.000	NA	N	NA
5477496	5477497	Avi_0519	Avi_0520		pleD	FALSE	0.184	325.000	0.000	1.000	Y	NA
5477497	5477498	Avi_0520	Avi_0521	pleD		TRUE	0.943	-3.000	0.000	1.000		NA
5477498	5477499	Avi_0521	Avi_0522			TRUE	0.998	0.000	1.000	1.000		NA
5477499	5477500	Avi_0522	Avi_0523			TRUE	0.981	118.000	1.000	0.019	Y	NA
5477500	5477501	Avi_0523	Avi_0524		pyrC	FALSE	0.067	109.000	0.000	1.000	N	NA
5477501	5477502	Avi_0524	Avi_0525	pyrC		FALSE	0.079	213.000	0.011	1.000	N	NA
5477502	5477503	Avi_0525	Avi_0528		pyrE	FALSE	0.019	266.000	0.000	1.000	N	NA
5477503	5477504	Avi_0528	Avi_0530	pyrE	scrK	FALSE	0.277	99.000	0.039	1.000	N	NA
5477505	5477506	Avi_0533	Avi_0534		pgi	TRUE	0.855	3.000	0.000	NA		NA
5477506	5477507	Avi_0534	Avi_0535	pgi	fadD	FALSE	0.108	180.000	0.018	1.000	N	NA
5477510	5477511	Avi_0538	Avi_0539		exsF	FALSE	0.073	180.000	0.000	NA		NA
5477512	5477513	Avi_0540	Avi_0541	truA	fmt	TRUE	0.993	0.000	0.069	1.000	Y	NA
5477513	5477514	Avi_0541	Avi_0542	fmt	def	TRUE	0.765	119.000	0.050	0.017	Y	NA
5477514	5477515	Avi_0542	Avi_0543	def	apaG	FALSE	0.109	74.000	0.000	NA	N	NA
5477515	5477516	Avi_0543	Avi_0544	apaG	metZ	FALSE	0.040	404.000	0.066	NA	N	NA
5477517	5477518	Avi_0545	Avi_4556	dcd		FALSE	0.364	56.000	0.000	NA		NA
5477521	5477522	Avi_0548	Avi_0549			TRUE	0.991	-3.000	0.000	NA	Y	NA
5477522	5477523	Avi_0549	Avi_0550			FALSE	0.032	150.000	0.000	NA	N	NA
5477525	5477526	Avi_0552	Avi_0553	gguC		FALSE	0.102	140.000	0.000	1.000		NA
5477529	5477530	Avi_0556	Avi_0557	attY		FALSE	0.020	375.000	0.000	NA		NA
5477530	5477531	Avi_0557	Avi_0561			FALSE	0.319	63.000	0.000	NA		NA
5477531	5477532	Avi_0561	Avi_0563			FALSE	0.112	638.000	0.000	0.014	Y	NA
5477533	5477534	Avi_0566	Avi_0567			TRUE	0.624	27.000	0.000	1.000		NA
5477534	5477535	Avi_0567	Avi_0570			TRUE	1.000	-3.000	0.571	0.005	Y	NA
5477535	5477536	Avi_0570	Avi_0571			FALSE	0.197	94.000	0.000	1.000		NA
5477536	5477537	Avi_0571	Avi_0572			FALSE	0.011	613.000	0.000	1.000		NA
5477537	5477538	Avi_0572	Avi_0574			FALSE	0.006	1264.000	0.000	NA		NA
5477538	5477539	Avi_0574	Avi_0575			FALSE	0.263	73.000	0.000	NA		NA
5477543	5477544	Avi_0579	Avi_0583			FALSE	0.177	175.000	0.031	NA		NA
5477544	5477545	Avi_0583	Avi_0584			TRUE	0.502	225.000	0.092	NA	Y	NA
5477546	5477547	Avi_0585	Avi_0586		pyrD	TRUE	0.985	-3.000	0.108	NA		NA
5477548	5477549	Avi_0587	Avi_0588	dinF		TRUE	0.678	44.000	0.030	NA		NA
5477549	5477550	Avi_0588	Avi_0589			TRUE	0.944	23.000	0.275	NA		NA
5477551	5477552	Avi_0591	Avi_0592			FALSE	0.421	123.000	0.162	NA		NA
5477552	5477553	Avi_0592	Avi_0593			FALSE	0.155	100.000	0.000	NA		NA
5477553	5477554	Avi_0593	Avi_0596			FALSE	0.014	465.000	0.000	NA		NA
5477555	5477556	Avi_0597	Avi_0598	fadB		TRUE	0.995	16.000	0.562	1.000	Y	NA
5477556	5477557	Avi_0598	Avi_0599		acd	TRUE	0.917	76.000	0.247	1.000	Y	NA
5477558	5477559	Avi_0601	Avi_0602			FALSE	0.021	389.000	0.000	1.000		NA
5477559	5477560	Avi_0602	Avi_0603			TRUE	0.936	27.000	0.274	NA		NA
5477560	5477561	Avi_0603	Avi_0605			FALSE	0.139	106.000	0.000	NA		NA
5477561	5477562	Avi_0605	Avi_0606			FALSE	0.233	156.000	0.057	NA		NA
5477562	5477563	Avi_0606	Avi_0607			TRUE	0.942	7.000	0.086	NA		NA
5477563	5477564	Avi_0607	Avi_0608			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5477564	5477565	Avi_0608	Avi_0609			FALSE	0.112	121.000	0.000	NA		NA
5477567	5477568	Avi_0612	Avi_0614			FALSE	0.155	100.000	0.000	NA		NA
5477568	5477569	Avi_0614	Avi_0615		lhr	FALSE	0.305	71.000	0.000	1.000		NA
5477569	5477570	Avi_0615	Avi_0616	lhr		TRUE	0.963	32.000	0.460	1.000		NA
5477571	5477572	Avi_0617	Avi_0618			TRUE	0.995	2.000	0.633	1.000		NA
5477572	5477573	Avi_0618	Avi_0619		bapA	FALSE	0.038	291.000	0.000	1.000		NA
5477573	5477574	Avi_0619	Avi_0620	bapA		FALSE	0.013	320.000	0.000	1.000	N	NA
5477575	5477576	Avi_0622	Avi_0624	mscL	aspB	FALSE	0.075	223.000	0.012	1.000	N	NA
5477576	5477577	Avi_0624	Avi_0626	aspB	rfbF	FALSE	0.017	645.000	0.000	0.017	N	NA
5477577	5477578	Avi_0626	Avi_0627	rfbF	rfbG	TRUE	1.000	-15.000	0.624	1.000	Y	NA
5477578	5477579	Avi_0627	Avi_0628	rfbG	rfbC	TRUE	0.997	-3.000	0.139	1.000	Y	NA
5477579	5477580	Avi_0628	Avi_0629	rfbC		TRUE	0.997	-3.000	0.457	1.000		NA
5477580	5477581	Avi_0629	Avi_0631			FALSE	0.106	125.000	0.000	NA		NA
5477584	5477585	Avi_4594	Avi_0636			FALSE	0.067	194.000	0.000	NA		NA
5477585	5477586	Avi_0636	Avi_0638			TRUE	0.710	57.000	0.102	NA		NA
5477586	5477587	Avi_0638	Avi_0640		infA	TRUE	0.921	17.000	0.207	NA	N	NA
5477587	5477588	Avi_0640	Avi_0641	infA		TRUE	0.508	122.000	0.293	NA	N	NA
5477588	5477589	Avi_0641	Avi_0642			TRUE	0.993	11.000	0.768	NA		NA
5477589	5477590	Avi_0642	Avi_0643		hisD	TRUE	0.968	4.000	0.157	NA		NA
5477590	5477591	Avi_0643	Avi_0644	hisD		TRUE	0.828	35.000	0.096	NA		NA
5477591	5477592	Avi_0644	Avi_0645		murA	TRUE	0.491	100.000	0.138	NA		NA
5477592	5477593	Avi_0645	Avi_0646	murA		FALSE	0.211	135.000	0.028	NA		NA
5477594	5477595	Avi_4557	Avi_0647			FALSE	0.015	439.000	0.000	NA		NA
5477596	5477597	Avi_0648	Avi_9910			FALSE	0.083	159.000	0.000	NA		NA
5477598	5477599	Avi_0649	Avi_0650			TRUE	0.996	-13.000	0.293	NA		NA
5477601	5477602	Avi_0654	Avi_0656			TRUE	0.682	79.000	0.200	NA		NA
5477602	5477603	Avi_0656	Avi_0658			FALSE	0.031	298.000	0.000	NA		NA
5477603	5477604	Avi_0658	Avi_0659			FALSE	0.008	417.000	0.000	1.000	N	NA
5477604	5477605	Avi_0659	Avi_0660			TRUE	0.964	20.000	0.381	NA		NA
5477605	5477606	Avi_0660	Avi_0662		tag	TRUE	0.917	4.000	0.013	NA		NA
5477607	5477608	Avi_0664	Avi_0666			TRUE	0.846	145.000	0.857	NA		NA
5477608	5477609	Avi_0666	Avi_0667			TRUE	0.987	6.000	0.429	NA		NA
5477612	5477613	Avi_0673	Avi_0674			TRUE	0.457	43.000	0.000	NA		NA
5477613	5477614	Avi_0674	Avi_0676			FALSE	0.017	398.000	0.000	NA		NA
5477615	5477616	Avi_0677	Avi_0679			FALSE	0.013	469.000	0.000	NA		NA
5477616	5477617	Avi_0679	Avi_0680			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5477618	5477619	Avi_0682	Avi_0683	traA	istA	FALSE	0.234	284.000	0.000	1.000	Y	NA
5477619	5477620	Avi_0683	Avi_0684	istA	istB	TRUE	0.998	-10.000	0.182	1.000	Y	NA
5477622	5477623	Avi_0685	Avi_0686			FALSE	0.048	239.000	0.000	NA		NA
5477623	5477624	Avi_0686	Avi_0687			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5477624	5477625	Avi_0687	Avi_0688			TRUE	0.856	46.000	0.000	NA	Y	NA
5477627	5477628	Avi_0691	Avi_0692			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5477628	5477629	Avi_0692	Avi_0693			TRUE	0.974	70.000	0.600	NA	Y	NA
5477629	5477630	Avi_0693	Avi_0695			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5477630	5477631	Avi_0695	Avi_0696		tnpA	FALSE	0.044	253.000	0.000	NA		NA
5477632	5477633	Avi_0697	Avi_9911			TRUE	0.986	-12.000	0.000	0.022		NA
5477633	5477634	Avi_9911	Avi_0698			FALSE	0.008	714.000	0.000	NA		NA
5477636	5477637	Avi_0701	Avi_0702			TRUE	0.998	-3.000	0.689	NA		NA
5477637	5477638	Avi_0702	Avi_0703			FALSE	0.006	1408.000	0.000	NA		NA
5477639	5477640	Avi_0704	Avi_0707	parA		FALSE	0.007	774.000	0.000	NA		NA
5477640	5477641	Avi_0707	Avi_0710			FALSE	0.008	694.000	0.000	NA		NA
5477642	5477643	Avi_0711	Avi_0712			TRUE	0.811	58.000	0.000	NA	Y	NA
5477643	5477644	Avi_0712	Avi_0713			TRUE	0.979	3.000	0.000	NA	Y	NA
5477644	5477645	Avi_0713	Avi_0714			FALSE	0.020	375.000	0.000	NA		NA
5477648	5477649	Avi_0718	Avi_0719	fhuA		FALSE	0.099	131.000	0.000	NA		NA
5477650	5477651	Avi_0720	Avi_0721		flhB	TRUE	0.992	6.000	0.595	NA		NA
5477651	5477652	Avi_0721	Avi_0722	flhB	fliG	TRUE	0.786	272.000	0.571	1.000	Y	NA
5477652	5477653	Avi_0722	Avi_0724	fliG	fliN	TRUE	0.998	30.000	0.875	0.004	Y	NA
5477653	5477654	Avi_0724	Avi_0726	fliN	fliM	TRUE	0.969	64.000	0.485	NA	Y	NA
5477654	5477655	Avi_0726	Avi_0728	fliM	motA	TRUE	1.000	-3.000	0.879	NA	Y	NA
5477656	5477657	Avi_0729	Avi_0731	flgF	fliI	TRUE	0.993	23.000	0.529	1.000	Y	NA
5477657	5477658	Avi_0731	Avi_0732	fliI		TRUE	0.807	68.000	0.275	NA		NA
5477658	5477659	Avi_0732	Avi_0735		flgB	FALSE	0.090	290.000	0.040	NA		NA
5477659	5477660	Avi_0735	Avi_0737	flgB	flgC	TRUE	0.999	4.000	0.804	0.002	Y	NA
5477660	5477661	Avi_0737	Avi_0738	flgC	fliE	TRUE	0.998	-3.000	0.115	0.002	Y	NA
5477661	5477662	Avi_0738	Avi_0740	fliE	flgG	TRUE	0.998	19.000	0.771	0.004	Y	NA
5477662	5477663	Avi_0740	Avi_0741	flgG	flgA	TRUE	0.949	18.000	0.252	NA		NA
5477663	5477664	Avi_0741	Avi_0742	flgA	flgI	TRUE	0.993	-3.000	0.261	NA		NA
5477664	5477665	Avi_0742	Avi_0743	flgI		TRUE	0.997	-3.000	0.531	NA		NA
5477665	5477666	Avi_0743	Avi_0744		flgH	TRUE	0.997	-3.000	0.592	NA		NA
5477666	5477667	Avi_0744	Avi_0745	flgH	fliL	TRUE	0.806	166.000	0.576	0.007		NA
5477667	5477668	Avi_0745	Avi_0747	fliL	fliP	TRUE	0.998	-3.000	0.605	1.000		NA
5477668	5477669	Avi_0747	Avi_0748	fliP	flaA	FALSE	0.261	265.000	0.000	1.000	Y	NA
5477669	5477670	Avi_0748	Avi_0749	flaA	flaA	FALSE	0.365	287.000	0.000	0.002	Y	NA
5477670	5477671	Avi_0749	Avi_0750	flaA	flaA	FALSE	0.231	389.000	0.000	0.002	Y	NA
5477671	5477672	Avi_0750	Avi_0751	flaA	flaA	FALSE	0.211	414.000	0.000	0.002	Y	NA
5477672	5477673	Avi_0751	Avi_0752	flaA	flaB	FALSE	0.216	406.000	0.000	0.002	Y	NA
5477673	5477674	Avi_0752	Avi_0755	flaB		FALSE	0.013	476.000	0.000	NA		NA
5477674	5477675	Avi_0755	Avi_0756		motB	TRUE	0.996	-3.000	0.421	NA		NA
5477675	5477676	Avi_0756	Avi_0759	motB		TRUE	0.995	5.000	0.737	NA		NA
5477676	5477677	Avi_0759	Avi_0760			TRUE	0.995	-3.000	0.379	NA		NA
5477677	5477678	Avi_0760	Avi_0761			TRUE	0.995	-34.000	0.229	NA		NA
5477678	5477679	Avi_0761	Avi_0763			FALSE	0.009	337.000	0.000	NA	N	NA
5477679	5477680	Avi_0763	Avi_0764		flgE	FALSE	0.049	131.000	0.000	1.000	N	NA
5477680	5477681	Avi_0764	Avi_0765	flgE	flgK	TRUE	0.960	25.000	0.000	0.005	Y	NA
5477681	5477682	Avi_0765	Avi_0766	flgK	flgL	TRUE	0.999	4.000	0.667	0.005	Y	NA
5477682	5477683	Avi_0766	Avi_0767	flgL	flaF	TRUE	0.945	35.000	0.057	NA	Y	NA
5477683	5477684	Avi_0767	Avi_0768	flaF	flbT	TRUE	1.000	-3.000	0.829	NA	Y	NA
5477684	5477685	Avi_0768	Avi_0769	flbT	flgD	TRUE	0.999	-9.000	0.528	NA	Y	NA
5477685	5477686	Avi_0769	Avi_0770	flgD	fliQ	TRUE	0.877	152.000	0.509	NA	Y	NA
5477686	5477687	Avi_0770	Avi_0772	fliQ	flhA	TRUE	0.916	124.000	0.349	0.001	Y	NA
5477687	5477688	Avi_0772	Avi_0773	flhA	fliR	TRUE	0.999	-3.000	0.186	0.001	Y	NA
5477688	5477689	Avi_0773	Avi_0774	fliR		TRUE	0.862	64.000	0.350	NA		NA
5477689	5477690	Avi_0774	Avi_0776			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5477690	5477691	Avi_0776	Avi_0777			FALSE	0.075	175.000	0.000	NA		NA
5477691	5477692	Avi_0777	Avi_0778			TRUE	0.993	0.000	0.438	NA		NA
5477692	5477693	Avi_0778	Avi_0780		tagA	FALSE	0.068	348.000	0.043	1.000		NA
5477693	5477694	Avi_0780	Avi_0782	tagA	folD	FALSE	0.020	262.000	0.000	1.000	N	NA
5477696	5477697	Avi_0785	Avi_0786	aglE	aglF	TRUE	0.982	64.000	0.670	NA	Y	NA
5477697	5477698	Avi_0786	Avi_0787	aglF	aglG	TRUE	0.999	2.000	0.693	NA	Y	NA
5477698	5477699	Avi_0787	Avi_0788	aglG	aglA	TRUE	0.943	77.000	0.387	NA	Y	NA
5477699	5477700	Avi_0788	Avi_0789	aglA	aglK	TRUE	0.975	78.000	0.697	1.000	Y	NA
5477700	5477701	Avi_0789	Avi_0790	aglK		TRUE	0.533	139.000	0.303	NA		NA
5477701	5477702	Avi_0790	Avi_0791			FALSE	0.009	609.000	0.000	NA		NA
5477703	5477704	Avi_0792	Avi_0793		mcpA	FALSE	0.021	254.000	0.000	1.000	N	NA
5477704	5477705	Avi_0793	Avi_0796	mcpA	edd	FALSE	0.003	848.000	0.000	1.000	N	NA
5477705	5477706	Avi_0796	Avi_0797	edd	pgl	TRUE	0.736	144.000	0.202	1.000	Y	NA
5477706	5477707	Avi_0797	Avi_0798	pgl	zwf	TRUE	0.997	-7.000	0.028	1.000	Y	NA
5477707	5477708	Avi_0798	Avi_0799	zwf	ordL	FALSE	0.225	146.000	0.088	1.000	N	NA
5477708	5477709	Avi_0799	Avi_0800	ordL	glnA	TRUE	0.980	71.000	0.706	1.000	Y	NA
5477710	5477711	Avi_0801	Avi_0805			FALSE	0.009	658.000	0.000	1.000		NA
5477711	5477712	Avi_0805	Avi_0806		mclA	FALSE	0.020	259.000	0.000	1.000	N	NA
5477712	5477713	Avi_0806	Avi_0808	mclA		FALSE	0.015	466.000	0.000	1.000		NA
5477713	5477714	Avi_0808	Avi_0811			FALSE	0.014	487.000	0.000	1.000		NA
5477714	5477715	Avi_0811	Avi_0812		tetA	FALSE	0.068	272.000	0.000	0.051	N	NA
5477716	5477717	Avi_0814	Avi_0816		aceA	FALSE	0.233	153.000	0.056	NA		NA
5477718	5477719	Avi_0818	Avi_0819		potF	TRUE	0.439	123.000	0.164	1.000		NA
5477719	5477720	Avi_0819	Avi_0820	potF	potG	TRUE	0.936	103.000	0.541	1.000	Y	NA
5477720	5477721	Avi_0820	Avi_0823	potG	potB	TRUE	0.966	74.000	0.545	NA	Y	NA
5477721	5477722	Avi_0823	Avi_0825	potB		TRUE	0.998	10.000	0.758	NA	Y	NA
5477723	5477724	Avi_0826	Avi_0827		pleC	FALSE	0.064	98.000	0.000	NA	N	NA
5477725	5477726	Avi_0828	Avi_4558			FALSE	0.080	166.000	0.000	NA		NA
5477728	5477729	Avi_0830	Avi_0833	ureJ		FALSE	0.007	788.000	0.000	NA		NA
5477730	5477731	Avi_0834	Avi_0835			TRUE	0.529	15.000	0.000	1.000	N	NA
5477732	5477733	Avi_0836	Avi_0838	mmsA	aau3	FALSE	0.007	363.000	0.000	NA	N	NA
5477733	5477734	Avi_0838	Avi_0840	aau3	gntK	FALSE	0.032	150.000	0.000	NA	N	NA
5477735	5477736	Avi_0842	Avi_0844		dadA	FALSE	0.067	109.000	0.000	1.000	N	NA
5477736	5477737	Avi_0844	Avi_0846	dadA		FALSE	0.109	134.000	0.000	1.000		NA
5477739	5477740	Avi_0849	Avi_0850			TRUE	0.919	29.000	0.000	1.000	Y	NA
5477741	5477742	Avi_0851	Avi_0853	mqo	ndh	FALSE	0.054	243.000	0.000	1.000		NA
5477742	5477743	Avi_0853	Avi_0854	ndh		FALSE	0.220	82.000	0.000	NA		NA
5477745	5477746	Avi_0857	Avi_0858			FALSE	0.062	208.000	0.000	NA		NA
5477746	5477747	Avi_0858	Avi_0860			FALSE	0.018	394.000	0.000	NA		NA
5477747	5477748	Avi_0860	Avi_0861			TRUE	0.868	2.000	0.000	NA		NA
5477748	5477749	Avi_0861	Avi_0862			TRUE	0.530	35.000	0.000	NA		NA
5477749	5477750	Avi_0862	Avi_0864			TRUE	0.855	3.000	0.000	NA		NA
5477750	5477751	Avi_0864	Avi_0865			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5477751	5477752	Avi_0865	Avi_0866			TRUE	0.996	4.000	0.750	NA		NA
5477752	5477753	Avi_0866	Avi_0867			TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
5477753	5477754	Avi_0867	Avi_0868			TRUE	0.868	2.000	0.000	NA		NA
5477754	5477755	Avi_0868	Avi_0869			TRUE	0.999	-3.000	0.818	NA		NA
5477755	5477756	Avi_0869	Avi_0871			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5477756	5477757	Avi_0871	Avi_0872			TRUE	0.961	-19.000	0.000	NA		NA
5477757	5477758	Avi_0872	Avi_0873			TRUE	0.994	0.000	0.500	NA		NA
5477758	5477759	Avi_0873	Avi_0874			TRUE	0.986	0.000	0.250	NA		NA
5477759	5477760	Avi_0874	Avi_0876			TRUE	0.809	6.000	0.000	NA		NA
5477761	5477762	Avi_0879	Avi_0880			FALSE	0.240	77.000	0.000	NA		NA
5477763	5477764	Avi_0883	Avi_0886		intD	FALSE	0.008	668.000	0.000	NA		NA
5477766	5477767	Avi_0888	Avi_0889	ppx	ftsJ	TRUE	0.707	85.000	0.316	NA	N	NA
5477767	5477768	Avi_0889	Avi_0890	ftsJ		TRUE	0.880	12.000	0.026	NA		NA
5477769	5477770	Avi_0891	Avi_0893			TRUE	0.692	328.000	0.538	1.000	Y	NA
5477771	5477772	Avi_0895	Avi_0896	mutL		FALSE	0.236	117.000	0.019	NA		NA
5477773	5477774	Avi_0897	Avi_0898	lpxK		TRUE	0.885	11.000	0.015	1.000		NA
5477774	5477775	Avi_0898	Avi_0899		kdtA	TRUE	0.982	-3.000	0.062	1.000		NA
5477775	5477776	Avi_0899	Avi_0900	kdtA		FALSE	0.271	167.000	0.099	NA		NA
5477776	5477777	Avi_0900	Avi_0902			TRUE	0.765	115.000	0.515	NA		NA
5477777	5477778	Avi_0902	Avi_0903			TRUE	0.847	43.000	0.182	NA		NA
5477780	5477781	Avi_0906	Avi_0907			FALSE	0.165	170.000	0.013	1.000		NA
5477781	5477782	Avi_0907	Avi_0910		rluB	TRUE	0.920	7.000	0.079	1.000	N	NA
5477786	5477787	Avi_0915	Avi_0916			FALSE	0.045	250.000	0.000	NA		NA
5477788	5477789	Avi_0918	Avi_0919	avhR	nrt	FALSE	0.139	145.000	0.031	NA	N	NA
5477789	5477790	Avi_0919	Avi_0923	nrt		FALSE	0.003	587.000	0.000	NA	N	NA
5477790	5477791	Avi_0923	Avi_0926		corA	FALSE	0.008	398.000	0.000	1.000	N	NA
5477791	5477792	Avi_0926	Avi_0927	corA		TRUE	0.980	16.000	0.133	1.000	Y	NA
5477792	5477793	Avi_0927	Avi_0928		atpI	FALSE	0.029	309.000	0.000	NA		NA
5477793	5477794	Avi_0928	Avi_0929	atpI	atpB	TRUE	0.687	77.000	0.195	NA		NA
5477794	5477795	Avi_0929	Avi_0930	atpB	atpC	TRUE	0.959	68.000	0.628	0.003		NA
5477795	5477796	Avi_0930	Avi_0931	atpC	atpB	TRUE	0.855	80.000	0.278	0.003		NA
5477796	5477797	Avi_0931	Avi_0934	atpB	atpF	TRUE	0.999	5.000	0.863	0.003	Y	NA
5477798	5477799	Avi_0936	Avi_0937	rnhB		FALSE	0.185	399.000	0.022	1.000	Y	NA
5477801	5477802	Avi_0940	Avi_0941	moaB	ispE	FALSE	0.183	112.000	0.018	1.000	N	NA
5477802	5477803	Avi_0941	Avi_0942	ispE		TRUE	0.776	48.000	0.107	1.000		NA
5477803	5477804	Avi_0942	Avi_0943		ispB	FALSE	0.053	375.000	0.028	1.000		NA
5477805	5477806	Avi_0944	Avi_0945			TRUE	0.846	92.000	0.525	1.000		NA
5477806	5477807	Avi_0945	Avi_0947		sohB	FALSE	0.261	107.000	0.009	1.000		NA
5477807	5477808	Avi_0947	Avi_0948	sohB		FALSE	0.299	100.000	0.019	NA		NA
5477808	5477809	Avi_0948	Avi_0950			FALSE	0.011	537.000	0.000	NA		NA
5477809	5477810	Avi_0950	Avi_0951		glyQ	FALSE	0.049	111.000	0.000	NA	N	NA
5477810	5477811	Avi_0951	Avi_0955	glyQ	aroA	FALSE	0.003	898.000	0.000	1.000	N	NA
5477811	5477812	Avi_0955	Avi_0956	aroA	glyS	FALSE	0.068	108.000	0.000	1.000	N	NA
5477812	5477813	Avi_0956	Avi_0957	glyS		TRUE	0.794	18.000	0.006	NA		NA
5477814	5477815	Avi_0958	Avi_0959	mcpA		FALSE	0.061	210.000	0.000	NA		NA
5477815	5477816	Avi_0959	Avi_0960		purD	FALSE	0.401	76.000	0.010	NA		NA
5477816	5477817	Avi_0960	Avi_0961	purD		FALSE	0.227	54.000	0.000	1.000	N	NA
5477818	5477819	Avi_0962	Avi_0963		cfa	FALSE	0.024	235.000	0.000	1.000	N	NA
5477819	5477820	Avi_0963	Avi_0965	cfa	ubiA	FALSE	0.145	73.000	0.000	1.000	N	NA
5477820	5477821	Avi_0965	Avi_0966	ubiA		FALSE	0.251	75.000	0.000	NA		NA
5477821	5477822	Avi_0966	Avi_0967			TRUE	0.988	-3.000	0.163	NA		NA
5477824	5477825	Avi_0969	Avi_0970		modA	FALSE	0.097	133.000	0.000	NA		NA
5477825	5477826	Avi_0970	Avi_0972	modA	modB	TRUE	0.996	32.000	0.627	0.001	Y	NA
5477826	5477827	Avi_0972	Avi_0973	modB	modC	TRUE	1.000	-3.000	0.537	0.001	Y	NA
5477828	5477829	Avi_0974	Avi_0975	modE		TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5477829	5477830	Avi_0975	Avi_0976			TRUE	0.708	56.000	0.158	NA	N	NA
5477831	5477832	Avi_0978	Avi_0980		mcpC	FALSE	0.052	877.000	0.000	1.000	Y	NA
5477832	5477833	Avi_0980	Avi_0981	mcpC		FALSE	0.006	466.000	0.000	1.000	N	NA
5477833	5477834	Avi_0981	Avi_0982			TRUE	0.997	-3.000	0.455	0.054	N	NA
5477838	5477839	Avi_0986	Avi_0987	mmgC		TRUE	0.995	4.000	0.303	1.000	Y	NA
5477842	5477843	Avi_0991	Avi_0992	rumA		TRUE	0.996	-3.000	0.062	NA	Y	NA
5477843	5477844	Avi_0992	Avi_0993			FALSE	0.364	56.000	0.000	NA		NA
5477845	5477846	Avi_0994	Avi_0996	mcpG		FALSE	0.078	1286.000	0.000	0.016	Y	NA
5477847	5477848	Avi_0997	Avi_0998	dxs	xseB	FALSE	0.051	293.000	0.020	1.000	N	NA
5477848	5477849	Avi_0998	Avi_0999	xseB		TRUE	0.892	3.000	0.019	NA	N	NA
5477851	5477852	Avi_1003	Avi_1004	kka	bioY	FALSE	0.355	57.000	0.000	NA		NA
5477852	5477853	Avi_1004	Avi_1006	bioY		TRUE	0.951	14.000	0.211	NA		NA
5477853	5477854	Avi_1006	Avi_1007			TRUE	1.000	-6.000	0.729	1.000	Y	NA
5477855	5477856	Avi_1009	Avi_1010	speB		FALSE	0.331	61.000	0.000	NA		NA
5477857	5477858	Avi_1011	Avi_1012			FALSE	0.145	103.000	0.000	NA		NA
5477858	5477859	Avi_1012	Avi_1013			FALSE	0.048	239.000	0.000	NA		NA
5477859	5477860	Avi_1013	Avi_1014		ribA	FALSE	0.074	90.000	0.000	NA	N	NA
5477860	5477861	Avi_1014	Avi_1015	ribA	aroC	TRUE	0.829	12.000	0.023	1.000	N	NA
5477861	5477862	Avi_1015	Avi_1017	aroC		FALSE	0.104	143.000	0.002	1.000	N	NA
5477864	5477865	Avi_1020	Avi_1021	gpmB	fabI	TRUE	0.935	47.000	0.397	0.068	N	NA
5477865	5477866	Avi_1021	Avi_1023	fabI	dnaJ	TRUE	0.599	131.000	0.404	1.000	N	NA
5477866	5477867	Avi_1023	Avi_1024	dnaJ		FALSE	0.070	389.000	0.087	NA		NA
5477869	5477870	Avi_1027	Avi_1028			FALSE	0.046	246.000	0.000	NA		NA
5477871	5477872	Avi_1029	Avi_1030	soxR		FALSE	0.035	181.000	0.000	1.000	N	NA
5477872	5477873	Avi_1030	Avi_1032			FALSE	0.041	263.000	0.000	NA		NA
5477874	5477875	Avi_1033	Avi_1034			FALSE	0.080	165.000	0.000	NA		NA
5477875	5477876	Avi_1034	Avi_1035			TRUE	0.929	7.000	0.056	NA		NA
5477876	5477877	Avi_1035	Avi_1036		tldD	TRUE	0.940	0.000	0.007	NA		NA
5477877	5477878	Avi_1036	Avi_1038	tldD	ialB	FALSE	0.372	94.000	0.037	NA		NA
5477879	5477880	Avi_1039	Avi_1041	coxB	ctaD	TRUE	0.998	15.000	0.741	0.002	Y	NA
5477880	5477881	Avi_1041	Avi_1042	ctaD	cyoE	TRUE	0.831	53.000	0.153	0.050	N	NA
5477881	5477882	Avi_1042	Avi_1043	cyoE		TRUE	0.955	0.000	0.033	NA		NA
5477882	5477883	Avi_1043	Avi_1044		coxG	FALSE	0.223	145.000	0.046	NA		NA
5477883	5477884	Avi_1044	Avi_1045	coxG	coxC	TRUE	0.599	191.000	0.536	1.000	N	NA
5477884	5477885	Avi_1045	Avi_1046	coxC		FALSE	0.199	239.000	0.122	NA		NA
5477885	5477886	Avi_1046	Avi_1048			TRUE	0.989	2.000	0.340	NA		NA
5477886	5477887	Avi_1048	Avi_1051			FALSE	0.167	163.000	0.017	NA		NA
5477887	5477888	Avi_1051	Avi_1052		ispH	TRUE	0.930	3.000	0.017	NA		NA
5477889	5477890	Avi_1053	Avi_1054			FALSE	0.214	56.000	0.000	1.000	N	NA
5477890	5477891	Avi_1054	Avi_1055			TRUE	0.913	32.000	0.000	1.000	Y	NA
5477891	5477892	Avi_1055	Avi_1056		aatA	TRUE	0.780	67.000	0.000	1.000	Y	NA
5477892	5477893	Avi_1056	Avi_1057	aatA		FALSE	0.105	126.000	0.000	NA		NA
5477894	5477895	Avi_1059	Avi_1060	thrB		TRUE	0.986	-3.000	0.104	1.000		NA
5477895	5477896	Avi_1060	Avi_1061			TRUE	0.732	27.000	0.003	NA		NA
5477897	5477898	Avi_1062	Avi_1063			TRUE	0.992	16.000	0.400	1.000	Y	NA
5477898	5477899	Avi_1063	Avi_1065			TRUE	0.999	-3.000	0.465	1.000	Y	NA
5477899	5477900	Avi_1065	Avi_1067			FALSE	0.013	320.000	0.000	1.000	N	NA
5477900	5477901	Avi_1067	Avi_1068			TRUE	0.949	71.000	0.357	NA	Y	NA
5477905	5477906	Avi_1072	Avi_1073		rimJ	TRUE	0.992	-3.000	0.293	1.000	N	NA
5477906	5477907	Avi_1073	Avi_1074	rimJ		TRUE	0.818	127.000	0.674	1.000		NA
5477907	5477908	Avi_1074	Avi_1075		thrC	TRUE	0.903	21.000	0.129	1.000		NA
5477909	5477910	Avi_1078	Avi_1079			FALSE	0.418	48.000	0.000	NA		NA
5477912	5477913	Avi_1081	Avi_1083			FALSE	0.330	106.000	0.048	NA		NA
5477913	5477914	Avi_1083	Avi_1084		ccrM	FALSE	0.070	185.000	0.000	NA		NA
5477914	5477915	Avi_1084	Avi_1086	ccrM		FALSE	0.016	295.000	0.000	1.000	N	NA
5477915	5477916	Avi_1086	Avi_1087			FALSE	0.252	80.000	0.000	1.000		NA
5477916	5477917	Avi_1087	Avi_1088			TRUE	0.633	26.000	0.000	1.000		NA
5477918	5477919	Avi_1089	Avi_1090			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5477919	5477920	Avi_1090	Avi_1092		mutY	TRUE	0.921	4.000	0.016	NA		NA
5477921	5477922	Avi_1091	Avi_1093			TRUE	0.474	199.000	0.333	NA		NA
5477922	5477923	Avi_1093	Avi_1095		smc	FALSE	0.044	334.000	0.039	NA	N	NA
5477923	5477924	Avi_1095	Avi_1096	smc		TRUE	0.662	22.000	0.000	1.000		NA
5477924	5477925	Avi_1096	Avi_1098			FALSE	0.191	88.000	0.000	NA		NA
5477925	5477926	Avi_1098	Avi_1099			FALSE	0.037	275.000	0.000	NA		NA
5477927	5477928	Avi_1100	Avi_1101			TRUE	0.661	18.000	0.000	NA		NA
5477929	5477930	Avi_1102	Avi_1104	ppdK		FALSE	0.080	166.000	0.000	NA		NA
5477930	5477931	Avi_1104	Avi_1105			FALSE	0.162	98.000	0.000	NA		NA
5477933	5477934	Avi_1108	Avi_1110		rhtB	TRUE	0.565	61.000	0.030	NA		NA
5477934	5477935	Avi_1110	Avi_1112	rhtB		TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5477936	5477937	Avi_1113	Avi_1114	rspE	prsD	TRUE	0.917	11.000	0.000	0.005		NA
5477937	5477938	Avi_1114	Avi_4592	prsD		FALSE	0.016	423.000	0.000	NA		NA
5477939	5477940	Avi_1115	Avi_1117		mcpA	FALSE	0.012	506.000	0.000	NA		NA
5477940	5477941	Avi_1117	Avi_1118	mcpA	cysH	FALSE	0.007	444.000	0.000	1.000	N	NA
5477941	5477942	Avi_1118	Avi_1120	cysH	cysD	TRUE	0.524	164.000	0.017	1.000	Y	NA
5477942	5477943	Avi_1120	Avi_1122	cysD	cysN	TRUE	0.981	2.000	0.100	0.001	N	NA
5477944	5477945	Avi_1123	Avi_1125		cytR	FALSE	0.023	366.000	0.000	1.000		NA
5477947	5477948	Avi_1127	Avi_1128			FALSE	0.216	123.000	0.017	NA		NA
5477948	5477949	Avi_1128	Avi_1130		pfpI	FALSE	0.088	142.000	0.000	NA		NA
5477950	5477951	Avi_4559	Avi_1133			FALSE	0.014	446.000	0.000	NA		NA
5477952	5477953	Avi_1135	Avi_1136			TRUE	0.958	-9.000	0.000	NA		NA
5477956	5477957	Avi_1140	Avi_1141			FALSE	0.263	73.000	0.000	NA		NA
5477957	5477958	Avi_1141	Avi_1142			TRUE	0.993	-6.000	0.200	NA		NA
5477961	5477962	Avi_1147	Avi_1148	betB		TRUE	0.946	-3.000	0.012	NA	N	NA
5477962	5477963	Avi_1148	Avi_1150		betC	TRUE	0.674	3.000	0.000	NA	N	NA
5477963	5477964	Avi_1150	Avi_1151	betC		TRUE	0.901	24.000	0.138	1.000		NA
5477965	5477966	Avi_1154	Avi_1156		qor	FALSE	0.036	1118.000	0.214	1.000	N	NA
5477966	5477967	Avi_1156	Avi_1157	qor		FALSE	0.041	124.000	0.000	NA	N	NA
5477967	5477968	Avi_1157	Avi_1158			TRUE	0.999	-24.000	0.261	NA	Y	NA
5477968	5477969	Avi_1158	Avi_1159		mcpA	FALSE	0.027	222.000	0.000	1.000	N	NA
5477969	5477970	Avi_1159	Avi_1160	mcpA		FALSE	0.004	536.000	0.000	NA	N	NA
5477970	5477971	Avi_1160	Avi_1161			TRUE	0.995	-13.000	0.000	NA	Y	NA
5477971	5477972	Avi_1161	Avi_1162			FALSE	0.264	129.000	0.000	0.012		NA
5477972	5477973	Avi_1162	Avi_1163			FALSE	0.141	105.000	0.000	NA		NA
5477976	5477977	Avi_1166	Avi_1167			FALSE	0.127	112.000	0.000	NA		NA
5477977	5477978	Avi_1167	Avi_1168			FALSE	0.156	204.000	0.000	0.068		NA
5477978	5477979	Avi_1168	Avi_1170		gst	TRUE	0.647	4.000	0.000	NA	N	NA
5477981	5477982	Avi_1173	Avi_1175	ggt		FALSE	0.021	253.000	0.000	1.000	N	NA
5477983	5477984	Avi_1177	Avi_1178			TRUE	0.630	22.000	0.000	NA		NA
5477985	5477986	Avi_1179	Avi_1180			FALSE	0.091	166.000	0.000	1.000		NA
5477986	5477987	Avi_1180	Avi_1183			FALSE	0.007	783.000	0.000	NA		NA
5477987	5477988	Avi_1183	Avi_1184			FALSE	0.344	59.000	0.000	NA		NA
5477989	5477990	Avi_1186	Avi_1187			FALSE	0.361	152.000	0.167	NA		NA
5477994	5477995	Avi_1193	Avi_1195			FALSE	0.414	171.000	0.000	1.000	Y	NA
5477996	5477997	Avi_1197	Avi_1199			FALSE	0.068	192.000	0.000	NA		NA
5477997	5477998	Avi_1199	Avi_1200			FALSE	0.039	166.000	0.000	1.000	N	NA
5477998	5477999	Avi_1200	Avi_1201			TRUE	0.484	209.000	0.000	0.015	Y	NA
5477999	5478000	Avi_1201	Avi_1202			FALSE	0.060	211.000	0.000	NA		NA
5478001	5478002	Avi_1204	Avi_1205			FALSE	0.012	548.000	0.000	1.000		NA
5478002	5478003	Avi_1205	Avi_1206		pykA	FALSE	0.355	34.000	0.000	1.000	N	NA
5478003	5478004	Avi_1206	Avi_1207	pykA		TRUE	0.900	0.000	0.000	1.000		NA
5478007	5478008	Avi_1210	Avi_1211		xylH	TRUE	0.962	18.000	0.333	NA		NA
5478008	5478009	Avi_1211	Avi_1212	xylH	xylF	FALSE	0.283	452.000	0.208	NA	Y	NA
5478011	5478012	Avi_1215	Avi_1217			FALSE	0.013	486.000	0.000	NA		NA
5478012	5478013	Avi_1217	Avi_1218			FALSE	0.067	194.000	0.000	NA		NA
5478013	5478014	Avi_1218	Avi_1219			TRUE	1.000	-6.000	0.833	NA	Y	NA
5478014	5478015	Avi_1219	Avi_1220			TRUE	0.995	-3.000	0.053	NA	Y	NA
5478015	5478016	Avi_1220	Avi_1221			TRUE	0.588	164.000	0.000	0.002	Y	NA
5478017	5478018	Avi_1222	Avi_1223			FALSE	0.042	154.000	0.000	1.000	N	NA
5478019	5478020	Avi_1224	Avi_1225			TRUE	0.996	-10.000	0.333	NA	N	NA
5478021	5478022	Avi_1227	Avi_1231			FALSE	0.010	588.000	0.000	NA		NA
5478022	5478023	Avi_1231	Avi_1232			TRUE	0.996	-28.000	0.273	NA		NA
5478023	5478024	Avi_1232	Avi_1233			FALSE	0.012	497.000	0.000	NA		NA
5478025	5478026	Avi_1234	Avi_1236			TRUE	0.975	71.000	0.424	0.008	Y	NA
5478026	5478027	Avi_1236	Avi_1238			FALSE	0.086	174.000	0.000	1.000		NA
5478033	5478034	Avi_1245	Avi_1247	sodB		FALSE	0.040	264.000	0.000	NA		NA
5478035	5478036	Avi_1248	Avi_1249			FALSE	0.077	171.000	0.000	NA		NA
5478038	5478039	Avi_1253	Avi_1256			FALSE	0.015	431.000	0.000	NA		NA
5478039	5478040	Avi_1256	Avi_1257			FALSE	0.061	209.000	0.000	NA		NA
5478044	5478045	Avi_1261	Avi_1263			FALSE	0.081	164.000	0.000	NA		NA
5478047	5478048	Avi_1265	Avi_1266		dskA	TRUE	0.931	41.000	0.043	1.000	Y	NA
5478055	5478056	Avi_1277	Avi_1278	ros	mnhG	FALSE	0.008	414.000	0.000	1.000	N	NA
5478056	5478057	Avi_1278	Avi_1279	mnhG	mnhF	TRUE	0.999	0.000	0.614	1.000	Y	NA
5478057	5478058	Avi_1279	Avi_1281	mnhF	mnhE	TRUE	0.998	12.000	0.644	0.049	Y	NA
5478058	5478059	Avi_1281	Avi_1282	mnhE	mnhD	TRUE	1.000	-3.000	0.810	1.000	Y	NA
5478059	5478060	Avi_1282	Avi_1283	mnhD	mnhC	TRUE	0.996	51.000	0.896	0.006	Y	NA
5478060	5478061	Avi_1283	Avi_1284	mnhC	mnhB	TRUE	0.994	0.000	0.500	NA		NA
5478061	5478062	Avi_1284	Avi_1285	mnhB	mnhA	TRUE	0.997	-3.000	0.493	NA		NA
5478063	5478064	Avi_1286	Avi_1287			FALSE	0.030	323.000	0.000	1.000		NA
5478064	5478065	Avi_1287	Avi_1289			TRUE	0.994	-16.000	0.177	NA		NA
5478067	5478068	Avi_1295	Avi_1296			TRUE	0.987	4.000	0.439	1.000	N	NA
5478071	5478072	Avi_1301	Avi_1302			FALSE	0.013	483.000	0.000	NA		NA
5478072	5478073	Avi_1302	Avi_1303			FALSE	0.301	125.000	0.069	NA		NA
5478074	5478075	Avi_1305	Avi_1306			TRUE	0.996	-28.000	0.259	1.000		NA
5478076	5478077	Avi_1307	Avi_1308			TRUE	0.868	2.000	0.000	NA		NA
5478077	5478078	Avi_1308	Avi_1309			TRUE	0.998	-3.000	0.739	NA	N	NA
5478078	5478079	Avi_1309	Avi_1311			TRUE	0.999	2.000	0.826	0.007	Y	NA
5478080	5478081	Avi_1313	Avi_1314			FALSE	0.344	59.000	0.000	NA		NA
5478083	5478084	Avi_1318	Avi_1319			FALSE	0.009	642.000	0.000	NA		NA
5478085	5478086	Avi_1320	Avi_1321			FALSE	0.053	228.000	0.000	NA		NA
5478086	5478087	Avi_1321	Avi_1322			TRUE	0.999	-7.000	0.941	NA		NA
5478087	5478088	Avi_1322	Avi_1323			TRUE	0.948	50.000	0.582	NA		NA
5478091	5478092	Avi_1326	Avi_1327			FALSE	0.165	97.000	0.000	NA		NA
5478092	5478093	Avi_1327	Avi_1328		cueR	FALSE	0.016	416.000	0.000	NA		NA
5478093	5478094	Avi_1328	Avi_1329	cueR		FALSE	0.008	668.000	0.000	NA		NA
5478094	5478095	Avi_1329	Avi_1330			TRUE	0.700	112.000	0.400	NA		NA
5478095	5478096	Avi_1330	Avi_1332			FALSE	0.019	384.000	0.000	NA		NA
5478096	5478097	Avi_1332	Avi_1334			FALSE	0.028	315.000	0.000	NA		NA
5478097	5478098	Avi_1334	Avi_1335			FALSE	0.180	190.000	0.044	NA		NA
5478098	5478099	Avi_1335	Avi_1337			TRUE	0.809	49.000	0.167	NA		NA
5478099	5478100	Avi_1337	Avi_1338			TRUE	0.975	12.000	0.345	NA		NA
5478100	5478101	Avi_1338	Avi_1339			FALSE	0.422	105.000	0.103	NA		NA
5478101	5478102	Avi_1339	Avi_1340			TRUE	0.889	15.000	0.058	NA		NA
5478102	5478103	Avi_1340	Avi_1343			FALSE	0.084	154.000	0.000	NA		NA
5478105	5478106	Avi_1345	Avi_1346			TRUE	0.997	-3.000	0.577	NA		NA
5478106	5478107	Avi_1346	Avi_1347			TRUE	0.933	60.000	0.578	NA		NA
5478107	5478108	Avi_1347	Avi_1349			TRUE	0.994	11.000	0.800	NA		NA
5478108	5478109	Avi_1349	Avi_1350			TRUE	0.992	10.000	0.678	NA		NA
5478109	5478110	Avi_1350	Avi_1351			TRUE	0.996	-3.000	0.390	NA		NA
5478110	5478111	Avi_1351	Avi_1352			TRUE	0.991	-25.000	0.107	NA		NA
5478111	5478112	Avi_1352	Avi_1354			FALSE	0.303	172.000	0.136	NA		NA
5478112	5478113	Avi_1354	Avi_1355			TRUE	0.769	44.000	0.091	NA		NA
5478113	5478114	Avi_1355	Avi_1357			FALSE	0.250	180.000	0.095	NA		NA
5478114	5478115	Avi_1357	Avi_1358		phoP	TRUE	0.469	134.000	0.223	NA		NA
5478115	5478116	Avi_1358	Avi_1359	phoP	popQ	TRUE	0.999	1.000	0.713	1.000	Y	NA
5478116	5478117	Avi_1359	Avi_1361	popQ	lipA	FALSE	0.119	232.000	0.069	NA	N	NA
5478117	5478118	Avi_1361	Avi_1362	lipA	cycH	FALSE	0.183	238.000	0.163	NA	N	NA
5478118	5478119	Avi_1362	Avi_1363	cycH	cycJ	TRUE	0.996	-3.000	0.096	1.000	Y	NA
5478119	5478120	Avi_1363	Avi_1364	cycJ	ccmF	TRUE	0.998	-3.000	0.125	0.002	Y	NA
5478120	5478121	Avi_1364	Avi_1365	ccmF	cycL	TRUE	0.999	-3.000	0.644	NA	Y	NA
5478121	5478122	Avi_1365	Avi_1368	cycL	dop	FALSE	0.182	665.000	0.200	NA	Y	NA
5478122	5478123	Avi_1368	Avi_1370	dop	ragA	TRUE	0.596	90.000	0.222	1.000	N	NA
5478123	5478124	Avi_1370	Avi_1371	ragA	ragB	TRUE	0.998	10.000	0.733	1.000	Y	NA
5478124	5478125	Avi_1371	Avi_1372	ragB	glnE	TRUE	0.880	68.000	0.081	1.000	Y	NA
5478126	5478127	Avi_1373	Avi_1374	pleC	pepN	FALSE	0.057	286.000	0.025	1.000	N	NA
5478127	5478128	Avi_1374	Avi_1377	pepN	mcpA	FALSE	0.056	325.000	0.009	1.000		NA
5478132	5478133	Avi_1384	Avi_1385			TRUE	0.478	59.000	0.034	NA	N	NA
5478133	5478134	Avi_1385	Avi_1387			FALSE	0.050	235.000	0.000	NA		NA
5478134	5478135	Avi_1387	Avi_1388			TRUE	0.704	15.000	0.000	NA		NA
5478135	5478136	Avi_1388	Avi_1389			TRUE	0.978	-3.000	0.100	NA	N	NA
5478136	5478137	Avi_1389	Avi_1391			FALSE	0.034	191.000	0.000	1.000	N	NA
5478138	5478139	Avi_1392	Avi_1393			FALSE	0.006	471.000	0.000	1.000	N	NA
5478139	5478140	Avi_1393	Avi_1395		cfa	FALSE	0.015	298.000	0.000	1.000	N	NA
5478141	5478142	Avi_1396	Avi_1397			FALSE	0.220	82.000	0.000	NA		NA
5478142	5478143	Avi_1397	Avi_1398		mgtE	FALSE	0.023	342.000	0.000	NA		NA
5478143	5478144	Avi_1398	Avi_1399	mgtE		FALSE	0.004	500.000	0.000	NA	N	NA
5478146	5478147	Avi_1402	Avi_1403			TRUE	0.966	3.000	0.115	NA		NA
5478147	5478148	Avi_1403	Avi_1404			TRUE	1.000	-7.000	0.870	NA	Y	NA
5478148	5478149	Avi_1404	Avi_1405			TRUE	0.922	64.000	0.192	NA	Y	NA
5478149	5478150	Avi_1405	Avi_1406		glnA	FALSE	0.197	305.000	0.000	NA	Y	NA
5478152	5478153	Avi_1408	Avi_1409			TRUE	0.938	3.000	0.029	NA		NA
5478153	5478154	Avi_1409	Avi_1410			FALSE	0.071	93.000	0.000	NA	N	NA
5478154	5478155	Avi_1410	Avi_1411			TRUE	0.988	2.000	0.019	NA	Y	NA
5478161	5478162	Avi_1423	Avi_1424	hisC		FALSE	0.208	197.000	0.073	NA		NA
5478162	5478163	Avi_1424	Avi_1425			FALSE	0.405	171.000	0.222	NA		NA
5478165	5478166	Avi_1427	Avi_1428			FALSE	0.288	137.000	0.000	0.000		NA
5478168	5478169	Avi_1430	Avi_1431			TRUE	0.695	43.000	0.082	NA	N	NA
5478170	5478171	Avi_1432	Avi_1434	dapA	smpB	FALSE	0.186	153.000	0.058	1.000	N	NA
5478172	5478173	Avi_1438	Avi_1439	ada	mcpV	FALSE	0.065	111.000	0.000	1.000	N	NA
5478173	5478174	Avi_1439	Avi_1440	mcpV		FALSE	0.008	653.000	0.000	NA		NA
5478175	5478176	Avi_1441	Avi_1443	rpoZ		TRUE	0.593	159.000	0.058	1.000	Y	NA
5478176	5478177	Avi_1443	Avi_1445			FALSE	0.031	302.000	0.000	NA		NA
5478177	5478178	Avi_1445	Avi_1447		lepB	FALSE	0.011	536.000	0.000	NA		NA
5478178	5478179	Avi_1447	Avi_1449	lepB	rnc	TRUE	0.951	-3.000	0.010	1.000	N	NA
5478179	5478180	Avi_1449	Avi_1450	rnc	era	TRUE	0.962	11.000	0.098	0.053		NA
5478183	5478184	Avi_1453	Avi_1456			FALSE	0.011	525.000	0.000	NA		NA
5478184	5478185	Avi_1456	Avi_1457			TRUE	0.977	5.000	0.123	0.028		NA
5478187	5478188	Avi_1460	Avi_1461			TRUE	0.993	-3.000	0.258	NA		NA
5478188	5478189	Avi_1461	Avi_1462		gcvT	TRUE	0.949	2.000	0.039	NA		NA
5478189	5478190	Avi_1462	Avi_1463	gcvT		FALSE	0.159	178.000	0.021	NA		NA
5478190	5478191	Avi_1463	Avi_1464			TRUE	0.976	18.000	0.484	NA		NA
5478191	5478192	Avi_1464	Avi_1465			TRUE	0.784	100.000	0.462	NA		NA
5478192	5478193	Avi_1465	Avi_1466		nudF	TRUE	0.853	55.000	0.259	NA		NA
5478194	5478195	Avi_1467	Avi_1469			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478196	5478197	Avi_1470	Avi_1471	pssA	psd	TRUE	0.992	38.000	0.466	0.002	Y	NA
5478197	5478198	Avi_1471	Avi_1472	psd		FALSE	0.258	122.000	0.075	1.000	N	NA
5478198	5478199	Avi_1472	Avi_1474			TRUE	0.474	179.000	0.290	1.000		NA
5478201	5478202	Avi_1476	Avi_1477			FALSE	0.190	147.000	0.026	NA		NA
5478202	5478203	Avi_1477	Avi_1479		pip	TRUE	0.823	24.000	0.032	1.000		NA
5478203	5478204	Avi_1479	Avi_1480	pip		TRUE	0.987	-7.000	0.052	1.000		NA
5478204	5478205	Avi_1480	Avi_1482			TRUE	0.999	-3.000	0.600	0.001		NA
5478205	5478206	Avi_1482	Avi_1483			TRUE	0.997	-3.000	0.263	0.001		NA
5478206	5478207	Avi_1483	Avi_1484			TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5478207	5478208	Avi_1484	Avi_1485			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478208	5478209	Avi_1485	Avi_1486			FALSE	0.182	91.000	0.000	NA		NA
5478209	5478210	Avi_1486	Avi_1487		cysS	FALSE	0.105	130.000	0.002	NA	N	NA
5478211	5478212	Avi_1489	Avi_1490	peh	rfbC	FALSE	0.391	184.000	0.000	1.000	Y	NA
5478212	5478213	Avi_1490	Avi_1491	rfbC	rffB	TRUE	0.967	55.000	0.337	1.000	Y	NA
5478213	5478214	Avi_1491	Avi_1493	rffB	rfbD	TRUE	0.997	-3.000	0.034	0.003	Y	NA
5478214	5478215	Avi_1493	Avi_1494	rfbD		TRUE	0.828	78.000	0.000	0.004	Y	NA
5478215	5478216	Avi_1494	Avi_1495			FALSE	0.036	281.000	0.000	NA		NA
5478216	5478217	Avi_1495	Avi_1496			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478218	5478219	Avi_1497	Avi_1499		purF	TRUE	0.717	45.000	0.100	1.000	N	NA
5478219	5478220	Avi_1499	Avi_1500	purF	cvpA	FALSE	0.373	121.000	0.101	1.000		NA
5478220	5478221	Avi_1500	Avi_1502	cvpA	ugdH	FALSE	0.078	191.000	0.000	1.000		NA
5478221	5478222	Avi_1502	Avi_1503	ugdH	galE	TRUE	0.765	113.000	0.143	1.000	Y	NA
5478222	5478223	Avi_1503	Avi_1505	galE		TRUE	0.998	-3.000	0.143	0.003	Y	NA
5478223	5478224	Avi_1505	Avi_1507		radA	FALSE	0.046	138.000	0.000	1.000	N	NA
5478224	5478225	Avi_1507	Avi_1508	radA	alr	FALSE	0.051	128.000	0.000	1.000	N	NA
5478227	5478228	Avi_1510	Avi_1512			TRUE	0.999	-3.000	0.308	0.014	Y	NA
5478228	5478229	Avi_1512	Avi_1513			TRUE	0.656	121.000	0.048	1.000	Y	NA
5478229	5478230	Avi_1513	Avi_1515		dnaB	FALSE	0.042	149.000	0.000	1.000	N	NA
5478230	5478231	Avi_1515	Avi_1516	dnaB	rplI	FALSE	0.091	254.000	0.048	1.000	N	NA
5478231	5478232	Avi_1516	Avi_1518	rplI		TRUE	0.600	60.000	0.043	NA		NA
5478232	5478233	Avi_1518	Avi_1519		rpsR	FALSE	0.204	146.000	0.033	NA		NA
5478233	5478234	Avi_1519	Avi_1520	rpsR	rpsF	TRUE	0.995	13.000	0.319	0.010	Y	NA
5478234	5478235	Avi_1520	Avi_1523	rpsF		FALSE	0.010	645.000	0.000	1.000		NA
5478235	5478236	Avi_1523	Avi_1525		rzcA	FALSE	0.088	143.000	0.000	NA		NA
5478236	5478237	Avi_1525	Avi_1526	rzcA		FALSE	0.078	169.000	0.000	NA		NA
5478238	5478239	Avi_1527	Avi_1528	fabD	fabG	TRUE	0.921	132.000	0.432	0.003	Y	NA
5478239	5478240	Avi_1528	Avi_1530	fabG	acpP	TRUE	0.722	296.000	0.321	0.003	Y	NA
5478240	5478241	Avi_1530	Avi_1531	acpP	fabF	TRUE	0.493	244.000	0.106	1.000	Y	NA
5478241	5478242	Avi_1531	Avi_1532	fabF		FALSE	0.116	334.000	0.134	NA		NA
5478242	5478243	Avi_1532	Avi_1534			TRUE	0.663	56.000	0.060	NA		NA
5478243	5478244	Avi_1534	Avi_1535		gmk	TRUE	0.982	4.000	0.276	NA		NA
5478244	5478245	Avi_1535	Avi_1536	gmk		FALSE	0.350	63.000	0.000	1.000		NA
5478246	5478247	Avi_1537	Avi_1538	ksgA	pdxA	TRUE	0.978	0.000	0.197	1.000	N	NA
5478247	5478248	Avi_1538	Avi_1539	pdxA		TRUE	0.928	9.000	0.056	1.000		NA
5478248	5478249	Avi_1539	Avi_1541		ostA	FALSE	0.051	553.000	0.116	1.000		NA
5478249	5478250	Avi_1541	Avi_1542	ostA		TRUE	0.980	0.000	0.153	1.000		NA
5478250	5478251	Avi_1542	Avi_1543			TRUE	0.999	-3.000	0.631	0.048		NA
5478251	5478252	Avi_1543	Avi_1544			FALSE	0.251	112.000	0.012	1.000		NA
5478253	5478254	Avi_1545	Avi_1546	pepA		TRUE	0.941	15.000	0.230	1.000	N	NA
5478255	5478256	Avi_1547	Avi_1549	mcpA		FALSE	0.010	614.000	0.000	1.000		NA
5478257	5478258	Avi_1550	Avi_1552	ligE	ndk	FALSE	0.117	131.000	0.010	NA	N	NA
5478259	5478260	Avi_1553	Avi_1555	moaE		TRUE	0.998	5.000	0.501	0.002	Y	NA
5478260	5478261	Avi_1555	Avi_1556		pgsA	TRUE	0.977	-3.000	0.082	1.000	N	NA
5478261	5478262	Avi_1556	Avi_1558	pgsA	uvrC	TRUE	0.488	113.000	0.227	1.000	N	NA
5478262	5478263	Avi_1558	Avi_1559	uvrC		TRUE	0.954	-3.000	0.014	1.000	N	NA
5478265	5478266	Avi_1562	Avi_1564			TRUE	0.745	33.000	0.024	NA		NA
5478267	5478268	Avi_1565	Avi_1566			TRUE	0.982	-3.000	0.123	1.000	N	NA
5478268	5478269	Avi_1566	Avi_1568			FALSE	0.136	116.000	0.000	1.000		NA
5478269	5478270	Avi_1568	Avi_1569			TRUE	0.961	-6.000	0.000	1.000		NA
5478270	5478271	Avi_1569	Avi_1570			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478271	5478272	Avi_1570	Avi_1572			TRUE	0.990	-3.000	0.192	NA		NA
5478272	5478273	Avi_1572	Avi_1573			TRUE	0.986	-3.000	0.115	NA		NA
5478274	5478275	Avi_1574	Avi_1575	purN	garS	TRUE	0.999	-3.000	0.230	0.002	Y	NA
5478276	5478277	Avi_1577	Avi_1578			TRUE	0.990	1.000	0.362	NA		NA
5478277	5478278	Avi_1578	Avi_1580		ppk	TRUE	0.445	108.000	0.134	NA		NA
5478278	5478279	Avi_1580	Avi_1582	ppk	ppx	TRUE	0.654	177.000	0.149	1.000	Y	NA
5478282	5478283	Avi_1585	Avi_1586			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5478283	5478284	Avi_1586	Avi_1587			TRUE	0.820	56.000	0.000	NA	Y	NA
5478284	5478285	Avi_1587	Avi_1588		rnd	TRUE	0.881	42.000	0.000	1.000	Y	NA
5478285	5478286	Avi_1588	Avi_1589	rnd		FALSE	0.074	236.000	0.017	1.000	N	NA
5478286	5478287	Avi_1589	Avi_1591			FALSE	0.375	88.000	0.071	NA	N	NA
5478288	5478289	Avi_1592	Avi_1593			TRUE	0.896	5.000	0.002	NA		NA
5478293	5478294	Avi_1598	Avi_1600			FALSE	0.013	470.000	0.000	NA		NA
5478295	5478296	Avi_1601	Avi_1602			FALSE	0.111	336.000	0.128	NA		NA
5478296	5478297	Avi_1602	Avi_1603		hemB	FALSE	0.286	123.000	0.055	NA		NA
5478298	5478299	Avi_1604	Avi_1606		mucS	FALSE	0.391	149.000	0.192	NA		NA
5478299	5478300	Avi_1606	Avi_1609	mucS		FALSE	0.014	508.000	0.000	1.000		NA
5478300	5478301	Avi_1609	Avi_1610		glyA	FALSE	0.262	203.000	0.123	1.000		NA
5478301	5478302	Avi_1610	Avi_1612	glyA		TRUE	0.881	10.000	0.052	NA	N	NA
5478302	5478303	Avi_1612	Avi_1613		ribD	TRUE	0.979	3.000	0.277	NA	N	NA
5478303	5478304	Avi_1613	Avi_1614	ribD	ribc	TRUE	0.999	-3.000	0.456	1.000	Y	NA
5478306	5478307	Avi_1618	Avi_1620	ribH	nusB	TRUE	0.981	5.000	0.347	1.000	N	NA
5478307	5478308	Avi_1620	Avi_1621	nusB		TRUE	0.637	27.000	0.011	NA	N	NA
5478308	5478309	Avi_1621	Avi_1622			FALSE	0.008	339.000	0.000	NA	N	NA
5478311	5478312	Avi_1626	Avi_1627			TRUE	0.981	-3.000	0.071	NA		NA
5478312	5478313	Avi_1627	Avi_1628		plsX	FALSE	0.237	135.000	0.044	NA		NA
5478313	5478314	Avi_1628	Avi_1630	plsX	fabH	TRUE	0.994	20.000	0.380	0.003	Y	NA
5478314	5478315	Avi_1630	Avi_1631	fabH	ihfA	TRUE	0.536	98.000	0.207	1.000	N	NA
5478315	5478316	Avi_1631	Avi_1633	ihfA		TRUE	0.649	194.000	0.535	1.000		NA
5478318	5478319	Avi_1635	Avi_1636		exsG	FALSE	0.010	581.000	0.000	NA		NA
5478320	5478321	Avi_1637	Avi_1638		istB	FALSE	0.067	214.000	0.000	1.000		NA
5478321	5478322	Avi_1638	Avi_1639	istB	istA	TRUE	0.998	-10.000	0.182	1.000	Y	NA
5478322	5478323	Avi_1639	Avi_1641	istA		FALSE	0.398	56.000	0.000	1.000		NA
5478323	5478324	Avi_1641	Avi_1642			TRUE	0.956	13.000	0.212	1.000		NA
5478324	5478325	Avi_1642	Avi_1644			FALSE	0.010	575.000	0.000	NA		NA
5478326	5478327	Avi_1645	Avi_1646		vgrG	FALSE	0.020	370.000	0.000	NA		NA
5478327	5478328	Avi_1646	Avi_1647	vgrG		TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5478328	5478329	Avi_1647	Avi_1649			FALSE	0.007	834.000	0.000	NA		NA
5478329	5478330	Avi_1649	Avi_1650			FALSE	0.036	282.000	0.000	NA		NA
5478331	5478332	Avi_1654	Avi_1655	attM		FALSE	0.245	82.000	0.000	1.000		NA
5478333	5478334	Avi_4561	Avi_1658			FALSE	0.012	503.000	0.000	NA		NA
5478335	5478336	Avi_1659	Avi_1661			FALSE	0.127	112.000	0.000	NA		NA
5478336	5478337	Avi_1661	Avi_1662			TRUE	0.822	32.000	0.073	NA		NA
5478337	5478338	Avi_1662	Avi_1663			TRUE	0.995	-3.000	0.357	NA		NA
5478338	5478339	Avi_1663	Avi_1664			TRUE	0.929	101.000	0.500	NA	Y	NA
5478339	5478340	Avi_1664	Avi_1665		gumB	TRUE	0.999	0.000	0.571	1.000	Y	NA
5478342	5478343	Avi_1667	Avi_1668			TRUE	0.611	80.000	0.141	NA		NA
5478345	5478346	Avi_1671	Avi_1673		strB	FALSE	0.350	63.000	0.000	1.000		NA
5478346	5478347	Avi_1673	Avi_1674	strB	argC	TRUE	0.804	17.000	0.037	1.000	N	NA
5478347	5478348	Avi_1674	Avi_1675	argC	speB	TRUE	0.893	70.000	0.124	1.000	Y	NA
5478348	5478349	Avi_1675	Avi_1676	speB		FALSE	0.344	59.000	0.000	NA		NA
5478349	5478350	Avi_1676	Avi_1678			FALSE	0.330	119.000	0.077	NA		NA
5478350	5478351	Avi_1678	Avi_1679			FALSE	0.269	72.000	0.000	NA		NA
5478351	5478352	Avi_1679	Avi_1681		rpsI	FALSE	0.232	116.000	0.008	1.000		NA
5478352	5478353	Avi_1681	Avi_1682	rpsI	rplM	TRUE	0.997	3.000	0.231	0.010	Y	NA
5478354	5478355	Avi_1683	Avi_1684			FALSE	0.006	901.000	0.000	NA		NA
5478357	5478358	Avi_1687	Avi_1690			FALSE	0.220	140.000	0.040	NA		NA
5478361	5478362	Avi_1694	Avi_1695			TRUE	0.690	45.000	0.080	1.000	N	NA
5478363	5478364	Avi_1696	Avi_1698	clpP	clpX	TRUE	0.637	289.000	0.352	1.000	Y	NA
5478364	5478365	Avi_1698	Avi_1700	clpX	lon	FALSE	0.331	405.000	0.201	1.000	Y	NA
5478365	5478366	Avi_1700	Avi_1701	lon	hupA	FALSE	0.053	328.000	0.043	1.000	N	NA
5478366	5478367	Avi_1701	Avi_1702	hupA		FALSE	0.007	376.000	0.000	NA	N	NA
5478369	5478370	Avi_1704	Avi_1705	fadD	fadB	TRUE	0.987	12.000	0.062	0.065	Y	NA
5478371	5478372	Avi_1707	Avi_1708			TRUE	0.469	42.000	0.000	NA		NA
5478372	5478373	Avi_1708	Avi_4591			FALSE	0.010	596.000	0.000	NA		NA
5478374	5478375	Avi_4562	Avi_4563			FALSE	0.319	63.000	0.000	NA		NA
5478375	5478376	Avi_4563	Avi_1712		nuoA	FALSE	0.057	217.000	0.000	NA		NA
5478376	5478377	Avi_1712	Avi_1713	nuoA	nuoB	TRUE	1.000	-9.000	0.396	0.002	Y	NA
5478377	5478378	Avi_1713	Avi_1714	nuoB	nuoC	TRUE	0.992	18.000	0.262	0.002	Y	NA
5478378	5478379	Avi_1714	Avi_1715	nuoC	nouD	TRUE	0.995	20.000	0.483	0.006	Y	NA
5478379	5478380	Avi_1715	Avi_1717	nouD	nuoE	TRUE	0.787	258.000	0.355	0.006	Y	NA
5478380	5478381	Avi_1717	Avi_1718	nuoE	nuoF	TRUE	0.998	4.000	0.343	0.006	Y	NA
5478381	5478382	Avi_1718	Avi_1719	nuoF		TRUE	0.652	45.000	0.024	NA		NA
5478382	5478383	Avi_1719	Avi_1720			FALSE	0.067	283.000	0.006	NA		NA
5478383	5478384	Avi_1720	Avi_1721		nuoH	TRUE	0.997	13.000	0.515	0.006	Y	NA
5478384	5478385	Avi_1721	Avi_1723	nuoH	nuoI	TRUE	0.992	41.000	0.500	0.006	Y	NA
5478385	5478386	Avi_1723	Avi_1724	nuoI	nuoJ	TRUE	0.907	156.000	0.442	0.006	Y	NA
5478386	5478387	Avi_1724	Avi_1726	nuoJ	nuoK	TRUE	0.994	33.000	0.484	0.002	Y	NA
5478387	5478388	Avi_1726	Avi_1727	nuoK	nuoL	TRUE	0.998	8.000	0.451	0.006	Y	NA
5478388	5478389	Avi_1727	Avi_1728	nuoL	nuoM	TRUE	0.999	-27.000	0.251	0.006	Y	NA
5478389	5478390	Avi_1728	Avi_1729	nuoM	nuoN	TRUE	0.995	18.000	0.453	0.006	Y	NA
5478390	5478391	Avi_1729	Avi_1730	nuoN	birA	TRUE	0.994	-3.000	0.372	1.000	N	NA
5478391	5478392	Avi_1730	Avi_1731	birA		TRUE	0.994	-3.000	0.307	1.000		NA
5478392	5478393	Avi_1731	Avi_1733		gloA	FALSE	0.374	122.000	0.105	1.000		NA
5478395	5478396	Avi_1736	Avi_1737			FALSE	0.083	156.000	0.000	NA		NA
5478396	5478397	Avi_1737	Avi_1739		proS	FALSE	0.028	445.000	0.006	NA		NA
5478397	5478398	Avi_1739	Avi_1740	proS		TRUE	0.834	20.000	0.076	1.000	N	NA
5478398	5478399	Avi_1740	Avi_1741		lolD	TRUE	0.983	15.000	0.620	1.000	N	NA
5478399	5478400	Avi_1741	Avi_1742	lolD	dnaE	FALSE	0.014	531.000	0.005	1.000	N	NA
5478401	5478402	Avi_1744	Avi_1745		dinP	FALSE	0.151	249.000	0.063	1.000		NA
5478402	5478403	Avi_1745	Avi_1747	dinP		FALSE	0.272	109.000	0.025	NA		NA
5478403	5478404	Avi_1747	Avi_1748			TRUE	0.987	0.000	0.256	NA		NA
5478405	5478406	Avi_1749	Avi_1750	divK	pleD	TRUE	0.892	185.000	0.461	0.017	Y	NA
5478407	5478408	Avi_1751	Avi_1753	rpmG		FALSE	0.254	94.000	0.028	NA	N	NA
5478408	5478409	Avi_1753	Avi_1754			FALSE	0.043	254.000	0.000	NA		NA
5478409	5478410	Avi_1754	Avi_1755		rnr	FALSE	0.229	147.000	0.050	NA		NA
5478410	5478411	Avi_1755	Avi_1756	rnr	topA	TRUE	0.969	-3.000	0.045	1.000	N	NA
5478411	5478412	Avi_1756	Avi_1759	topA	dprA	FALSE	0.296	493.000	0.238	1.000	Y	NA
5478412	5478413	Avi_1759	Avi_1760	dprA		TRUE	0.941	7.000	0.070	1.000		NA
5478413	5478414	Avi_1760	Avi_1761		pyrC	TRUE	0.905	18.000	0.108	1.000		NA
5478414	5478415	Avi_1761	Avi_1762	pyrC	pyrB	TRUE	0.999	-3.000	0.452	1.000	Y	NA
5478416	5478417	Avi_1763	Avi_1764	acd		FALSE	0.363	61.000	0.000	1.000		NA
5478417	5478418	Avi_1764	Avi_1767			FALSE	0.025	331.000	0.000	NA		NA
5478420	5478421	Avi_1769	Avi_1770		gatC	FALSE	0.190	164.000	0.024	1.000		NA
5478421	5478422	Avi_1770	Avi_1773	gatC	gatA	TRUE	0.986	72.000	0.643	0.002	Y	NA
5478422	5478423	Avi_1773	Avi_1774	gatA		TRUE	0.841	5.000	0.000	1.000		NA
5478423	5478424	Avi_1774	Avi_1775			FALSE	0.386	97.000	0.000	0.011		NA
5478425	5478426	Avi_1776	Avi_1777			TRUE	0.858	16.000	0.027	1.000		NA
5478426	5478427	Avi_1777	Avi_1778			TRUE	0.988	-7.000	0.067	NA		NA
5478428	5478429	Avi_1781	Avi_1782	gatB		TRUE	0.904	7.000	0.014	1.000		NA
5478429	5478430	Avi_1782	Avi_1783			TRUE	0.888	40.000	0.085	0.011		NA
5478430	5478431	Avi_1783	Avi_1784			FALSE	0.373	101.000	0.050	1.000		NA
5478431	5478432	Avi_1784	Avi_1785			TRUE	0.512	132.000	0.260	NA		NA
5478433	5478434	Avi_1786	Avi_1787	aat	accC	TRUE	0.926	10.000	0.114	1.000	N	NA
5478434	5478435	Avi_1787	Avi_1788	accC	accB	TRUE	0.995	5.000	0.153	0.003	Y	NA
5478435	5478436	Avi_1788	Avi_1789	accB	aroQ	TRUE	0.682	26.000	0.014	1.000	N	NA
5478436	5478437	Avi_1789	Avi_1790	aroQ		FALSE	0.292	126.000	0.110	1.000	N	NA
5478438	5478439	Avi_1792	Avi_1793	aspB		FALSE	0.135	124.000	0.007	1.000	N	NA
5478441	5478442	Avi_1795	Avi_1797	amiA	mrcA	TRUE	0.598	326.000	0.396	1.000	Y	NA
5478442	5478443	Avi_1797	Avi_1799	mrcA	prfB	FALSE	0.127	199.000	0.041	1.000	N	NA
5478443	5478444	Avi_1799	Avi_1801	prfB		FALSE	0.049	131.000	0.000	1.000	N	NA
5478445	5478446	Avi_1802	Avi_1804			TRUE	0.766	43.000	0.080	NA		NA
5478448	5478449	Avi_1808	Avi_1810			FALSE	0.008	655.000	0.000	NA		NA
5478450	5478451	Avi_4565	Avi_4566			TRUE	0.590	27.000	0.000	NA		NA
5478451	5478452	Avi_4566	Avi_1812		tuf	FALSE	0.060	211.000	0.000	NA		NA
5478452	5478453	Avi_1812	Avi_1814	tuf		FALSE	0.039	268.000	0.000	NA		NA
5478453	5478454	Avi_1814	Avi_1815			FALSE	0.399	126.000	0.150	NA		NA
5478454	5478455	Avi_1815	Avi_1816			FALSE	0.092	138.000	0.000	NA		NA
5478455	5478456	Avi_1816	Avi_4567			FALSE	0.111	122.000	0.000	NA		NA
5478456	5478457	Avi_4567	Avi_1817		secE	FALSE	0.071	183.000	0.000	NA		NA
5478457	5478458	Avi_1817	Avi_1818	secE		TRUE	0.990	17.000	0.843	1.000	N	NA
5478458	5478459	Avi_1818	Avi_1819		rplK	TRUE	0.746	147.000	0.681	1.000	N	NA
5478459	5478460	Avi_1819	Avi_1820	rplK	rplA	TRUE	0.999	3.000	0.838	0.013	Y	NA
5478460	5478461	Avi_1820	Avi_1822	rplA	rplJ	TRUE	0.611	344.000	0.302	0.013	Y	NA
5478461	5478462	Avi_1822	Avi_1823	rplJ	rplL	TRUE	0.993	69.000	0.884	0.009	Y	NA
5478462	5478463	Avi_1823	Avi_1826	rplL	rpoB	FALSE	0.284	254.000	0.223	1.000		NA
5478463	5478464	Avi_1826	Avi_1827	rpoB	rpoC	TRUE	0.892	185.000	0.851	0.000		NA
5478465	5478466	Avi_1829	Avi_1830			TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5478467	5478468	Avi_1833	Avi_1834	rpsL	rpsG	TRUE	0.980	83.000	0.620	0.002	Y	NA
5478468	5478469	Avi_1834	Avi_1835	rpsG	fusA	TRUE	0.959	35.000	0.114	1.000	Y	NA
5478469	5478470	Avi_1835	Avi_1837	fusA	tuf	TRUE	0.931	72.000	0.102	0.001	Y	NA
5478470	5478471	Avi_1837	Avi_1839	tuf	rpsJ	TRUE	0.552	322.000	0.318	1.000	Y	NA
5478471	5478472	Avi_1839	Avi_1840	rpsJ	rplC	TRUE	0.852	172.000	0.307	0.013	Y	NA
5478472	5478473	Avi_1840	Avi_1841	rplC	rplD	TRUE	0.997	13.000	0.486	0.009	Y	NA
5478473	5478474	Avi_1841	Avi_1842	rplD	rplW	TRUE	0.999	-3.000	0.513	1.000	Y	NA
5478474	5478475	Avi_1842	Avi_1843	rplW	rplB	TRUE	0.998	12.000	0.849	1.000	Y	NA
5478475	5478476	Avi_1843	Avi_1844	rplB	rpsS	TRUE	0.998	16.000	0.820	0.013	Y	NA
5478476	5478477	Avi_1844	Avi_1845	rpsS	rplV	TRUE	0.995	3.000	0.119	0.013	Y	NA
5478477	5478478	Avi_1845	Avi_1846	rplV	rpsC	TRUE	0.975	33.000	0.109	0.013	Y	NA
5478478	5478479	Avi_1846	Avi_1847	rpsC	rplP	TRUE	0.997	38.000	0.828	0.013	Y	NA
5478479	5478480	Avi_1847	Avi_1848	rplP	rpmC	TRUE	0.999	11.000	0.802	0.009	Y	NA
5478480	5478481	Avi_1848	Avi_1849	rpmC	rpsQ	TRUE	0.998	16.000	0.828	0.009	Y	NA
5478481	5478482	Avi_1849	Avi_1850	rpsQ	rplN	TRUE	0.931	234.000	0.791	0.013	Y	NA
5478482	5478483	Avi_1850	Avi_1851	rplN	rplX	TRUE	0.998	16.000	0.810	0.013	Y	NA
5478483	5478484	Avi_1851	Avi_1853	rplX	rplE	TRUE	1.000	-7.000	0.758	0.009	Y	NA
5478484	5478485	Avi_1853	Avi_1854	rplE	rpsN	TRUE	0.988	34.000	0.309	0.009	Y	NA
5478485	5478486	Avi_1854	Avi_1855	rpsN	rpsH	TRUE	0.994	13.000	0.295	0.009	Y	NA
5478486	5478487	Avi_1855	Avi_1856	rpsH	rplF	TRUE	0.996	43.000	0.808	0.009	Y	NA
5478487	5478488	Avi_1856	Avi_1857	rplF	rplR	TRUE	0.999	13.000	0.815	0.009	Y	NA
5478488	5478489	Avi_1857	Avi_1859	rplR	rpsE	TRUE	0.962	146.000	0.814	0.013	Y	NA
5478489	5478490	Avi_1859	Avi_1861	rpsE		TRUE	0.999	12.000	0.789	0.013	Y	NA
5478490	5478491	Avi_1861	Avi_1862		rplO	TRUE	0.998	17.000	0.653	0.002	Y	NA
5478491	5478492	Avi_1862	Avi_1863	rplO	prlA	TRUE	0.451	342.000	0.730	1.000	N	NA
5478492	5478493	Avi_1863	Avi_1864	prlA	adk	TRUE	0.951	-3.000	0.010	1.000	N	NA
5478493	5478494	Avi_1864	Avi_1865	adk	rpsM	FALSE	0.025	230.000	0.000	1.000	N	NA
5478494	5478495	Avi_1865	Avi_1866	rpsM	rpsK	TRUE	0.967	133.000	0.810	0.009	Y	NA
5478495	5478496	Avi_1866	Avi_1867	rpsK	rpoA	TRUE	0.636	100.000	0.308	1.000	N	NA
5478496	5478497	Avi_1867	Avi_1869	rpoA	rplQ	TRUE	0.866	120.000	0.873	1.000	N	NA
5478497	5478498	Avi_1869	Avi_1872	rplQ		FALSE	0.021	213.000	0.000	NA	N	NA
5478501	5478502	Avi_1877	Avi_1878		alaS	TRUE	0.941	18.000	0.222	NA		NA
5478502	5478503	Avi_1878	Avi_1879	alaS	cysK	TRUE	0.943	6.000	0.082	NA		NA
5478503	5478504	Avi_1879	Avi_1880	cysK		FALSE	0.111	145.000	0.008	1.000	N	NA
5478504	5478505	Avi_1880	Avi_1882			FALSE	0.006	511.000	0.000	1.000	N	NA
5478505	5478506	Avi_1882	Avi_1883			FALSE	0.254	141.000	0.054	1.000		NA
5478506	5478507	Avi_1883	Avi_1886		bcp	FALSE	0.373	102.000	0.052	1.000		NA
5478509	5478510	Avi_1888	Avi_1889		avsI	FALSE	0.068	192.000	0.000	NA		NA
5478510	5478511	Avi_1889	Avi_1890	avsI	avsR	FALSE	0.015	301.000	0.000	1.000	N	NA
5478511	5478512	Avi_1890	Avi_1891	avsR	maeB	FALSE	0.011	347.000	0.000	1.000	N	NA
5478513	5478514	Avi_1892	Avi_1893			FALSE	0.069	188.000	0.000	NA		NA
5478514	5478515	Avi_1893	Avi_1894			TRUE	0.997	25.000	0.889	NA	Y	NA
5478515	5478516	Avi_1894	Avi_1895			TRUE	0.999	7.000	0.850	NA	Y	NA
5478516	5478517	Avi_1895	Avi_1896			TRUE	0.857	30.000	0.109	NA		NA
5478518	5478519	Avi_1897	Avi_1898			FALSE	0.051	452.000	0.078	NA		NA
5478519	5478520	Avi_1898	Avi_1901			FALSE	0.085	151.000	0.000	NA		NA
5478520	5478521	Avi_1901	Avi_1902		purQ	FALSE	0.363	87.000	0.020	NA		NA
5478521	5478522	Avi_1902	Avi_1905	purQ	purS	TRUE	0.934	197.000	0.656	0.001	Y	NA
5478522	5478523	Avi_1905	Avi_1906	purS	purC	TRUE	0.993	17.000	0.460	1.000	Y	NA
5478523	5478524	Avi_1906	Avi_1908	purC		FALSE	0.032	296.000	0.000	NA		NA
5478525	5478526	Avi_1909	Avi_1910			FALSE	0.013	482.000	0.000	NA		NA
5478527	5478528	Avi_1911	Avi_1913	gst	icdA	FALSE	0.072	203.000	0.008	NA	N	NA
5478529	5478530	Avi_1915	Avi_1916	lasT	murI	TRUE	0.977	-19.000	0.025	1.000	N	NA
5478532	5478533	Avi_1919	Avi_1920	tlyC		FALSE	0.240	77.000	0.000	NA		NA
5478533	5478534	Avi_1920	Avi_1921			FALSE	0.388	57.000	0.000	1.000		NA
5478536	5478537	Avi_1923	Avi_1925			TRUE	0.996	5.000	0.414	1.000	Y	NA
5478539	5478540	Avi_1927	Avi_1928	rpsD	glsA	FALSE	0.112	156.000	0.011	1.000	N	NA
5478540	5478541	Avi_1928	Avi_1930	glsA		FALSE	0.096	153.000	0.000	1.000		NA
5478541	5478542	Avi_1930	Avi_1931			FALSE	0.165	97.000	0.000	NA		NA
5478542	5478543	Avi_1931	Avi_1933			TRUE	0.468	44.000	0.005	NA	N	NA
5478543	5478544	Avi_1933	Avi_1934			TRUE	0.985	28.000	0.167	0.001	Y	NA
5478545	5478546	Avi_1935	Avi_1936		grlA	FALSE	0.158	258.000	0.147	1.000	N	NA
5478546	5478547	Avi_1936	Avi_1939	grlA		FALSE	0.141	318.000	0.216	NA	N	NA
5478547	5478548	Avi_1939	Avi_1941		purL	TRUE	0.745	39.000	0.093	NA	N	NA
5478549	5478550	Avi_1945	Avi_1947	dnaJ		FALSE	0.011	583.000	0.000	1.000		NA
5478552	5478553	Avi_4568	Avi_1950			FALSE	0.025	330.000	0.000	NA		NA
5478554	5478555	Avi_1951	Avi_1952	intD		FALSE	0.006	1047.000	0.000	NA		NA
5478555	5478556	Avi_1952	Avi_1954			FALSE	0.016	414.000	0.000	NA		NA
5478557	5478558	Avi_1955	Avi_1959			FALSE	0.027	319.000	0.000	NA		NA
5478558	5478559	Avi_1959	Avi_1961			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478559	5478560	Avi_1961	Avi_1963			TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
5478560	5478561	Avi_1963	Avi_1964			TRUE	0.998	-13.000	0.444	NA		NA
5478561	5478562	Avi_1964	Avi_1966			FALSE	0.008	669.000	0.000	NA		NA
5478562	5478563	Avi_1966	Avi_1967			TRUE	0.990	-16.000	0.080	NA		NA
5478563	5478564	Avi_1967	Avi_1968			TRUE	0.912	13.000	0.080	NA		NA
5478564	5478565	Avi_1968	Avi_1969			TRUE	0.987	-25.000	0.048	NA		NA
5478565	5478566	Avi_1969	Avi_1970			TRUE	0.939	36.000	0.357	NA		NA
5478566	5478567	Avi_1970	Avi_1973			FALSE	0.024	339.000	0.000	NA		NA
5478567	5478568	Avi_1973	Avi_1977			FALSE	0.011	531.000	0.000	NA		NA
5478568	5478569	Avi_1977	Avi_1978			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478569	5478570	Avi_1978	Avi_1979			TRUE	0.833	27.000	0.061	NA		NA
5478571	5478572	Avi_1983	Avi_1984	rfbA	rfbD	TRUE	0.828	78.000	0.000	0.004	Y	NA
5478572	5478573	Avi_1984	Avi_1986	rfbD	rfbB	TRUE	0.997	-3.000	0.034	0.003	Y	NA
5478573	5478574	Avi_1986	Avi_1988	rfbB	rfbC	TRUE	0.967	55.000	0.337	1.000	Y	NA
5478574	5478575	Avi_1988	Avi_1989	rfbC		FALSE	0.071	184.000	0.000	NA		NA
5478576	5478577	Avi_1990	Avi_1991			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478577	5478578	Avi_1991	Avi_1992			TRUE	0.995	0.000	0.571	NA		NA
5478578	5478579	Avi_1992	Avi_1994			FALSE	0.034	288.000	0.000	NA		NA
5478579	5478580	Avi_1994	Avi_1995			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478580	5478581	Avi_1995	Avi_1996			TRUE	0.689	16.000	0.000	NA		NA
5478582	5478583	Avi_1998	Avi_2000			TRUE	0.982	4.000	0.286	NA		NA
5478584	5478585	Avi_2001	Avi_2003			FALSE	0.050	236.000	0.000	NA		NA
5478585	5478586	Avi_2003	Avi_2005			FALSE	0.071	184.000	0.000	NA		NA
5478587	5478588	Avi_2007	Avi_2009			TRUE	0.793	8.000	0.000	NA		NA
5478588	5478589	Avi_2009	Avi_2010			FALSE	0.024	335.000	0.000	NA		NA
5478589	5478590	Avi_2010	Avi_2012			FALSE	0.007	772.000	0.000	NA		NA
5478591	5478592	Avi_9912	Avi_9913	pemI	pemK	TRUE	0.997	-3.000	0.167	NA	Y	NA
5478593	5478594	Avi_2013	Avi_2014			TRUE	0.984	4.000	0.305	NA		NA
5478594	5478595	Avi_2014	Avi_2016			TRUE	0.899	10.000	0.028	NA		NA
5478596	5478597	Avi_2018	Avi_2020		dgk	TRUE	0.981	-16.000	0.042	1.000	N	NA
5478597	5478598	Avi_2020	Avi_2021	dgk		TRUE	0.553	32.000	0.000	NA		NA
5478598	5478599	Avi_2021	Avi_2022			FALSE	0.039	271.000	0.000	NA		NA
5478599	5478600	Avi_2022	Avi_2023			FALSE	0.084	155.000	0.000	NA		NA
5478601	5478602	Avi_2024	Avi_2025		def	TRUE	0.916	28.000	0.217	NA		NA
5478602	5478603	Avi_2025	Avi_2026	def	fnrN	TRUE	0.468	19.000	0.000	1.000	N	NA
5478604	5478605	Avi_2028	Avi_2029	hemN	acpP	FALSE	0.251	108.000	0.045	1.000	N	NA
5478605	5478606	Avi_2029	Avi_2030	acpP		TRUE	0.936	83.000	0.394	NA	Y	NA
5478606	5478607	Avi_2030	Avi_2033			TRUE	0.709	291.000	0.490	NA	Y	NA
5478607	5478608	Avi_2033	Avi_2035		fabF	TRUE	0.999	11.000	0.784	0.015	Y	NA
5478608	5478609	Avi_2035	Avi_2036	fabF		TRUE	0.832	77.000	0.453	1.000	N	NA
5478609	5478610	Avi_2036	Avi_2037		msbB	TRUE	0.977	3.000	0.248	1.000	N	NA
5478612	5478613	Avi_2040	Avi_2041	nadE	tolB	TRUE	0.574	8.000	0.000	NA	N	NA
5478613	5478614	Avi_2041	Avi_2042	tolB		FALSE	0.013	279.000	0.000	NA	N	NA
5478616	5478617	Avi_2044	Avi_2045		ada	TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478620	5478621	Avi_2049	Avi_4590			FALSE	0.257	74.000	0.000	NA		NA
5478624	5478625	Avi_2052	Avi_2054	exoI		TRUE	0.995	-3.000	0.050	NA	Y	NA
5478625	5478626	Avi_2054	Avi_2055			TRUE	0.535	66.000	0.081	NA	N	NA
5478627	5478628	Avi_2057	Avi_2058	mmsB	pip	FALSE	0.156	106.000	0.000	1.000		NA
5478628	5478629	Avi_2058	Avi_2059	pip		TRUE	0.662	22.000	0.000	1.000		NA
5478629	5478630	Avi_2059	Avi_2062		usg	FALSE	0.116	280.000	0.061	NA		NA
5478630	5478631	Avi_2062	Avi_2064	usg		TRUE	0.725	192.000	0.273	NA	Y	NA
5478631	5478632	Avi_2064	Avi_2065			TRUE	1.000	-3.000	0.833	0.013	Y	NA
5478632	5478633	Avi_2065	Avi_2066			TRUE	0.883	95.000	0.259	1.000	Y	NA
5478635	5478636	Avi_2069	Avi_2070	mobB	mobA	TRUE	0.999	-13.000	0.056	0.002	Y	NA
5478636	5478637	Avi_2070	Avi_2071	mobA		TRUE	0.842	15.000	0.016	NA		NA
5478637	5478638	Avi_2071	Avi_2072		moaA	FALSE	0.145	103.000	0.000	NA		NA
5478640	5478641	Avi_2075	Avi_2076			FALSE	0.022	247.000	0.000	1.000	N	NA
5478641	5478642	Avi_2076	Avi_2077		fumC	TRUE	0.717	129.000	0.003	0.000	Y	NA
5478647	5478648	Avi_2085	Avi_2087	gor	dhs	FALSE	0.086	296.000	0.079	1.000	N	NA
5478650	5478651	Avi_2092	Avi_2093	ccoN	ccoO	TRUE	0.985	11.000	0.333	0.001	N	NA
5478651	5478652	Avi_2093	Avi_2094	ccoO	fixQ	TRUE	0.992	-25.000	0.188	NA	N	NA
5478652	5478653	Avi_2094	Avi_2096	fixQ	ccoP	TRUE	0.975	3.000	0.232	NA	N	NA
5478655	5478656	Avi_2098	Avi_2099		uvrB	FALSE	0.044	141.000	0.000	1.000	N	NA
5478658	5478659	Avi_2101	Avi_2102			TRUE	0.756	96.000	0.000	0.006	Y	NA
5478659	5478660	Avi_2102	Avi_2104			FALSE	0.155	100.000	0.000	NA		NA
5478660	5478661	Avi_2104	Avi_2106			TRUE	0.573	29.000	0.000	NA		NA
5478661	5478662	Avi_2106	Avi_2107		kdsA	TRUE	0.972	-3.000	0.023	NA		NA
5478662	5478663	Avi_2107	Avi_2109	kdsA	eno	FALSE	0.335	87.000	0.041	1.000	N	NA
5478663	5478664	Avi_2109	Avi_2110	eno		FALSE	0.127	182.000	0.032	1.000	N	NA
5478664	5478665	Avi_2110	Avi_2112		pdhA	FALSE	0.188	202.000	0.104	1.000	N	NA
5478665	5478666	Avi_2112	Avi_2114	pdhA	pdhB	TRUE	0.995	21.000	0.456	0.000	Y	NA
5478666	5478667	Avi_2114	Avi_2115	pdhB		TRUE	0.988	16.000	0.254	1.000	Y	NA
5478667	5478668	Avi_2115	Avi_2117		ada	FALSE	0.026	467.000	0.036	1.000	N	NA
5478668	5478669	Avi_2117	Avi_2119	ada		FALSE	0.332	98.000	0.029	NA		NA
5478669	5478670	Avi_2119	Avi_2120		lpdA	FALSE	0.378	78.000	0.007	NA		NA
5478670	5478671	Avi_2120	Avi_2122	lpdA		TRUE	0.454	71.000	0.007	1.000		NA
5478671	5478672	Avi_2122	Avi_2123		lipA	TRUE	0.691	39.000	0.009	1.000		NA
5478672	5478673	Avi_2123	Avi_2124	lipA		FALSE	0.118	82.000	0.000	1.000	N	NA
5478673	5478674	Avi_2124	Avi_2125			TRUE	0.979	3.000	0.000	NA	Y	NA
5478677	5478678	Avi_2129	Avi_2130		cinA	FALSE	0.107	124.000	0.000	NA		NA
5478678	5478679	Avi_2130	Avi_2131	cinA	ispD	TRUE	0.980	-3.000	0.061	NA		NA
5478680	5478681	Avi_2132	Avi_2134	nifR	ntrB	TRUE	0.978	-3.000	0.094	1.000	N	NA
5478681	5478682	Avi_2134	Avi_2135	ntrB	ntrC	TRUE	0.999	-3.000	0.297	0.094	Y	NA
5478682	5478683	Avi_2135	Avi_2136	ntrC	ntrY	TRUE	0.726	207.000	0.205	0.094	Y	NA
5478683	5478684	Avi_2136	Avi_2137	ntrY	ntrX	TRUE	1.000	-10.000	0.533	0.094	Y	NA
5478684	5478685	Avi_2137	Avi_2139	ntrX	hfq	TRUE	0.473	107.000	0.058	0.094		NA
5478685	5478686	Avi_2139	Avi_2142	hfq	hflx	FALSE	0.314	158.000	0.115	1.000		NA
5478687	5478688	Avi_2143	Avi_2144		mazG	FALSE	0.059	212.000	0.000	NA		NA
5478688	5478689	Avi_2144	Avi_2145	mazG		TRUE	0.794	24.000	0.015	1.000		NA
5478690	5478691	Avi_2146	Avi_2147	cysG		TRUE	0.975	3.000	0.188	NA		NA
5478691	5478692	Avi_2147	Avi_2148		cysI	TRUE	0.898	117.000	0.919	NA		NA
5478692	5478693	Avi_2148	Avi_2149	cysI		TRUE	0.972	12.000	0.309	NA		NA
5478693	5478694	Avi_2149	Avi_2150		mvrA	FALSE	0.106	241.000	0.022	NA		NA
5478694	5478695	Avi_2150	Avi_2152	mvrA	fabG	FALSE	0.042	149.000	0.000	1.000	N	NA
5478695	5478696	Avi_2152	Avi_2153	fabG	rlpA	FALSE	0.021	220.000	0.000	NA	N	NA
5478696	5478697	Avi_2153	Avi_2154	rlpA	dacF	TRUE	0.720	144.000	0.198	NA	Y	NA
5478697	5478698	Avi_2154	Avi_2155	dacF	tmk	FALSE	0.161	222.000	0.099	1.000	N	NA
5478698	5478699	Avi_2155	Avi_2156	tmk	holB	TRUE	0.995	-16.000	0.254	1.000	N	NA
5478701	5478702	Avi_2158	Avi_2159	metS		TRUE	0.522	100.000	0.221	NA	N	NA
5478702	5478703	Avi_2159	Avi_2160			TRUE	0.953	8.000	0.139	NA		NA
5478703	5478704	Avi_2160	Avi_2161		clc	TRUE	0.706	35.000	0.005	1.000		NA
5478708	5478709	Avi_2165	Avi_2166	pcs		FALSE	0.089	170.000	0.000	1.000		NA
5478709	5478710	Avi_2166	Avi_2167			TRUE	0.998	-16.000	0.418	1.000		NA
5478710	5478711	Avi_2167	Avi_2168			TRUE	0.999	-3.000	0.923	0.099		NA
5478711	5478712	Avi_2168	Avi_2169			TRUE	0.889	54.000	0.318	1.000		NA
5478712	5478713	Avi_2169	Avi_2170		glmU	FALSE	0.139	114.000	0.000	1.000		NA
5478713	5478714	Avi_2170	Avi_2171	glmU	glmS	TRUE	0.599	172.000	0.083	1.000	Y	NA
5478714	5478715	Avi_2171	Avi_2172	glmS		FALSE	0.315	117.000	0.059	NA		NA
5478715	5478716	Avi_2172	Avi_2173			FALSE	0.083	158.000	0.000	NA		NA
5478717	5478718	Avi_2174	Avi_2178			FALSE	0.332	102.000	0.080	1.000	N	NA
5478718	5478719	Avi_2178	Avi_2179			TRUE	0.998	-3.000	0.560	0.099	N	NA
5478719	5478720	Avi_2179	Avi_2180			TRUE	0.975	0.000	0.095	0.099	N	NA
5478720	5478721	Avi_2180	Avi_2181			TRUE	0.908	34.000	0.143	0.099		NA
5478723	5478724	Avi_2183	Avi_2184		znuA	TRUE	0.438	85.000	0.045	NA		NA
5478725	5478726	Avi_2185	Avi_2187	znuC	znuB	TRUE	1.000	-10.000	0.755	1.000	Y	NA
5478726	5478727	Avi_2187	Avi_2188	znuB	zur	TRUE	0.988	5.000	0.086	1.000	Y	NA
5478728	5478729	Avi_2190	Avi_2191			FALSE	0.115	119.000	0.000	NA		NA
5478729	5478730	Avi_2191	Avi_2192			FALSE	0.071	183.000	0.000	NA		NA
5478730	5478731	Avi_2192	Avi_2194		dacF	TRUE	0.691	91.000	0.271	NA		NA
5478731	5478732	Avi_2194	Avi_2196	dacF		FALSE	0.206	250.000	0.146	NA		NA
5478732	5478733	Avi_2196	Avi_2198			FALSE	0.034	288.000	0.000	NA		NA
5478733	5478734	Avi_2198	Avi_2200			FALSE	0.008	713.000	0.000	NA		NA
5478734	5478735	Avi_2200	Avi_2201			FALSE	0.056	221.000	0.000	NA		NA
5478736	5478737	Avi_2202	Avi_2203			FALSE	0.103	139.000	0.000	1.000		NA
5478738	5478739	Avi_2204	Avi_2205		hisI	FALSE	0.035	303.000	0.000	1.000		NA
5478739	5478740	Avi_2205	Avi_2207	hisI	folE	FALSE	0.082	99.000	0.000	1.000	N	NA
5478741	5478742	Avi_2208	Avi_2209	nifU		TRUE	0.878	14.000	0.041	NA		NA
5478742	5478743	Avi_2209	Avi_2211		thrS	FALSE	0.149	190.000	0.021	NA		NA
5478745	5478746	Avi_2214	Avi_2215		nadA	FALSE	0.203	170.000	0.037	1.000		NA
5478746	5478747	Avi_2215	Avi_2216	nadA	nadB	TRUE	0.999	-3.000	0.210	0.002	Y	NA
5478747	5478748	Avi_2216	Avi_2217	nadB	nadC	TRUE	0.997	2.000	0.223	0.002	Y	NA
5478750	5478751	Avi_2220	Avi_2221			TRUE	0.978	0.000	0.033	0.041		NA
5478759	5478760	Avi_2230	Avi_2232	tpiA	secG	TRUE	0.500	98.000	0.184	1.000	N	NA
5478760	5478761	Avi_2232	Avi_2233	secG	pyrG	FALSE	0.422	87.000	0.083	1.000	N	NA
5478761	5478762	Avi_2233	Avi_2236	pyrG		FALSE	0.035	183.000	0.000	1.000	N	NA
5478762	5478763	Avi_2236	Avi_2237			TRUE	0.432	24.000	0.000	1.000	N	NA
5478765	5478766	Avi_2241	Avi_2243		fdx	TRUE	0.536	216.000	0.451	NA		NA
5478768	5478769	Avi_2246	Avi_2247	folP	folB	TRUE	0.998	-7.000	0.094	1.000	Y	NA
5478769	5478770	Avi_2247	Avi_2248	folB	folK	TRUE	0.986	11.000	0.142	1.000	Y	NA
5478771	5478772	Avi_2252	Avi_2253	gcvP	gcvH	TRUE	0.997	-3.000	0.130	1.000	Y	NA
5478772	5478773	Avi_2253	Avi_2254	gcvH	gcvT	TRUE	0.991	17.000	0.202	0.002	Y	NA
5478776	5478777	Avi_2259	Avi_2261	crcB	rluC	FALSE	0.231	131.000	0.083	NA	N	NA
5478777	5478778	Avi_2261	Avi_2262	rluC		TRUE	0.996	-3.000	0.389	1.000		NA
5478778	5478779	Avi_2262	Avi_2263			TRUE	0.995	-7.000	0.269	NA		NA
5478780	5478781	Avi_2265	Avi_2266		kgtP	FALSE	0.022	354.000	0.000	NA		NA
5478783	5478784	Avi_2269	Avi_2270	flgE	radC	FALSE	0.056	121.000	0.000	1.000	N	NA
5478784	5478785	Avi_2270	Avi_2271	radC	map	TRUE	0.962	4.000	0.169	1.000	N	NA
5478785	5478786	Avi_2271	Avi_2273	map		FALSE	0.052	126.000	0.000	1.000	N	NA
5478788	5478789	Avi_2275	Avi_2276	sfsA	phbC	TRUE	0.767	25.000	0.013	NA		NA
5478790	5478791	Avi_2277	Avi_2278			FALSE	0.071	281.000	0.009	NA		NA
5478791	5478792	Avi_2278	Avi_2279		hom	TRUE	0.919	70.000	0.202	1.000	Y	NA
5478792	5478793	Avi_2279	Avi_2280	hom	recJ	TRUE	0.552	41.000	0.009	1.000	N	NA
5478794	5478795	Avi_4588	Avi_4587			FALSE	0.075	177.000	0.000	NA		NA
5478795	5478796	Avi_4587	Avi_4586			FALSE	0.063	204.000	0.000	NA		NA
5478796	5478797	Avi_4586	Avi_2282			FALSE	0.145	103.000	0.000	NA		NA
5478797	5478798	Avi_2282	Avi_2283		gloA	FALSE	0.082	162.000	0.000	NA		NA
5478799	5478800	Avi_2286	Avi_2287	cspA		TRUE	0.926	26.000	0.226	NA		NA
5478800	5478801	Avi_2287	Avi_4569			FALSE	0.165	97.000	0.000	NA		NA
5478801	5478802	Avi_4569	Avi_2288			FALSE	0.201	86.000	0.000	NA		NA
5478802	5478803	Avi_2288	Avi_4570			TRUE	0.445	44.000	0.000	NA		NA
5478804	5478805	Avi_2290	Avi_2291	intD		FALSE	0.056	220.000	0.000	NA		NA
5478805	5478806	Avi_2291	Avi_2294		dnaE	FALSE	0.006	1277.000	0.000	NA		NA
5478806	5478807	Avi_2294	Avi_2295	dnaE		TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5478807	5478808	Avi_2295	Avi_2296			TRUE	0.715	14.000	0.000	NA		NA
5478808	5478809	Avi_2296	Avi_2298			FALSE	0.010	575.000	0.000	NA		NA
5478809	5478810	Avi_2298	Avi_2300			FALSE	0.013	481.000	0.000	NA		NA
5478810	5478811	Avi_2300	Avi_2301			FALSE	0.016	417.000	0.000	NA		NA
5478812	5478813	Avi_2303	Avi_2306			FALSE	0.006	1151.000	0.000	NA		NA
5478813	5478814	Avi_2306	Avi_2308			FALSE	0.010	583.000	0.000	NA		NA
5478814	5478815	Avi_2308	Avi_2309			FALSE	0.046	245.000	0.000	NA		NA
5478815	5478816	Avi_2309	Avi_2311			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478816	5478817	Avi_2311	Avi_2312			TRUE	0.985	-3.000	0.105	NA		NA
5478817	5478818	Avi_2312	Avi_2314			FALSE	0.043	276.000	0.000	1.000		NA
5478818	5478819	Avi_2314	Avi_2316			TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5478819	5478820	Avi_2316	Avi_2317			TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5478820	5478821	Avi_2317	Avi_2319			TRUE	0.745	12.000	0.000	NA		NA
5478821	5478822	Avi_2319	Avi_2321			FALSE	0.234	78.000	0.000	NA		NA
5478822	5478823	Avi_2321	Avi_2322			TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5478823	5478824	Avi_2322	Avi_2324			FALSE	0.007	785.000	0.000	NA		NA
5478824	5478825	Avi_2324	Avi_2326			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478825	5478826	Avi_2326	Avi_2327			TRUE	0.989	4.000	0.417	NA		NA
5478826	5478827	Avi_2327	Avi_2328			TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
5478827	5478828	Avi_2328	Avi_2330			TRUE	0.980	13.000	0.444	NA		NA
5478828	5478829	Avi_2330	Avi_2331			TRUE	0.777	10.000	0.000	NA		NA
5478829	5478830	Avi_2331	Avi_2334			FALSE	0.027	321.000	0.000	NA		NA
5478830	5478831	Avi_2334	Avi_2335			TRUE	0.925	27.000	0.231	NA		NA
5478831	5478832	Avi_2335	Avi_2336			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5478832	5478833	Avi_2336	Avi_2337			FALSE	0.216	83.000	0.000	NA		NA
5478833	5478834	Avi_2337	Avi_2340			FALSE	0.007	723.000	0.000	NA		NA
5478834	5478835	Avi_2340	Avi_2342			FALSE	0.040	266.000	0.000	NA		NA
5478835	5478836	Avi_2342	Avi_2343			FALSE	0.182	91.000	0.000	NA		NA
5478836	5478837	Avi_2343	Avi_2344			FALSE	0.216	83.000	0.000	NA		NA
5478837	5478838	Avi_2344	Avi_2347			FALSE	0.052	230.000	0.000	NA		NA
5478838	5478839	Avi_2347	Avi_2350			FALSE	0.032	297.000	0.000	NA		NA
5478839	5478840	Avi_2350	Avi_2351			FALSE	0.023	343.000	0.000	NA		NA
5478840	5478841	Avi_2351	Avi_2353			FALSE	0.048	239.000	0.000	NA		NA
5478841	5478842	Avi_2353	Avi_2354			FALSE	0.364	56.000	0.000	NA		NA
5478842	5478843	Avi_2354	Avi_2356			FALSE	0.071	183.000	0.000	NA		NA
5478844	5478845	Avi_2357	Avi_2360			FALSE	0.006	922.000	0.000	NA		NA
5478845	5478846	Avi_2360	Avi_2361			FALSE	0.007	763.000	0.000	NA		NA
5478846	5478847	Avi_2361	Avi_2362			FALSE	0.051	234.000	0.000	NA		NA
5478847	5478848	Avi_2362	Avi_2363		recG	TRUE	0.599	26.000	0.000	NA		NA
5478849	5478850	Avi_2364	Avi_2366		mfd	TRUE	0.982	-3.000	0.078	NA		NA
5478850	5478851	Avi_2366	Avi_2367	mfd		FALSE	0.300	66.000	0.000	NA		NA
5478852	5478853	Avi_2368	Avi_2369			FALSE	0.178	93.000	0.000	NA		NA
5478853	5478854	Avi_2369	Avi_2370			TRUE	0.585	76.000	0.147	1.000	N	NA
5478856	5478857	Avi_2374	Avi_2375		glnA	FALSE	0.169	142.000	0.012	NA		NA
5478857	5478858	Avi_2375	Avi_2376	glnA	glnB	TRUE	0.918	62.000	0.145	1.000	Y	NA
5478860	5478861	Avi_2379	Avi_2380			TRUE	0.793	8.000	0.000	NA		NA
5478861	5478862	Avi_2380	Avi_2381		uvrA	TRUE	0.766	22.000	0.005	NA		NA
5478867	5478868	Avi_2390	Avi_2391	ccoG	fixH	TRUE	0.996	-3.000	0.506	NA	N	NA
5478868	5478869	Avi_2391	Avi_2393	fixH	fixI	TRUE	0.998	-3.000	0.206	NA	Y	NA
5478869	5478870	Avi_2393	Avi_2394	fixI	ccoS	TRUE	0.999	-3.000	0.713	NA	Y	NA
5478870	5478871	Avi_2394	Avi_2396	ccoS	gnd	FALSE	0.114	132.000	0.009	NA	N	NA
5478871	5478872	Avi_2396	Avi_2397	gnd		FALSE	0.278	75.000	0.000	1.000		NA
5478874	5478875	Avi_2399	Avi_2400			FALSE	0.346	257.000	0.000	0.097	Y	NA
5478875	5478876	Avi_2400	Avi_2402			TRUE	0.999	-22.000	0.111	0.097	Y	NA
5478876	5478877	Avi_2402	Avi_2404			TRUE	0.999	4.000	0.889	0.097	Y	NA
5478877	5478878	Avi_2404	Avi_2405		manA	TRUE	0.735	179.000	0.250	1.000	Y	NA
5478878	5478879	Avi_2405	Avi_2406	manA		TRUE	0.957	64.000	0.357	NA	Y	NA
5478879	5478880	Avi_2406	Avi_2407			TRUE	0.983	28.000	0.722	NA		NA
5478880	5478881	Avi_2407	Avi_2408			FALSE	0.126	325.000	0.029	0.041		NA
5478881	5478882	Avi_2408	Avi_2409			FALSE	0.104	259.000	0.067	1.000	N	NA
5478883	5478884	Avi_2410	Avi_2411			TRUE	0.991	-3.000	0.000	NA	Y	NA
5478884	5478885	Avi_2411	Avi_2412			FALSE	0.065	218.000	0.000	1.000		NA
5478885	5478886	Avi_2412	Avi_2413			TRUE	0.999	-3.000	0.790	0.049		NA
5478888	5478889	Avi_2415	Avi_2416		rhtB	FALSE	0.078	170.000	0.000	NA		NA
5478889	5478890	Avi_2416	Avi_2417	rhtB	purB	FALSE	0.026	227.000	0.000	1.000	N	NA
5478890	5478891	Avi_2417	Avi_2418	purB		FALSE	0.305	89.000	0.003	NA		NA
5478891	5478892	Avi_2418	Avi_2419		rpe	TRUE	0.779	24.000	0.015	NA		NA
5478895	5478896	Avi_2423	Avi_2425			TRUE	0.933	22.000	0.222	NA		NA
5478896	5478897	Avi_2425	Avi_2427			FALSE	0.010	566.000	0.000	NA		NA
5478897	5478898	Avi_2427	Avi_2428			TRUE	0.995	6.000	0.778	NA		NA
5478899	5478900	Avi_2429	Avi_2431		rhlE	TRUE	0.952	2.000	0.087	1.000	N	NA
5478900	5478901	Avi_2431	Avi_2432	rhlE	rhtB	FALSE	0.039	166.000	0.000	1.000	N	NA
5478901	5478902	Avi_2432	Avi_2433	rhtB		FALSE	0.110	133.000	0.000	1.000		NA
5478903	5478904	Avi_2434	Avi_2435	nifS	sufB	FALSE	0.251	145.000	0.109	1.000	N	NA
5478904	5478905	Avi_2435	Avi_2436	sufB	sufC	TRUE	0.728	280.000	0.466	1.000	Y	NA
5478905	5478906	Avi_2436	Avi_2438	sufC	sufD	TRUE	0.992	24.000	0.482	1.000	Y	NA
5478906	5478907	Avi_2438	Avi_2439	sufD		TRUE	0.886	-7.000	0.000	NA	N	NA
5478907	5478908	Avi_2439	Avi_2440			TRUE	0.995	-10.000	0.000	NA	Y	NA
5478908	5478909	Avi_2440	Avi_2441			TRUE	0.945	27.000	0.309	NA		NA
5478909	5478910	Avi_2441	Avi_2442		sufA	FALSE	0.279	141.000	0.083	NA		NA
5478910	5478911	Avi_2442	Avi_2445	sufA	coaD	FALSE	0.006	906.000	0.000	NA		NA
5478911	5478912	Avi_2445	Avi_2446	coaD	ppiB	TRUE	0.700	28.000	0.024	1.000	N	NA
5478912	5478913	Avi_2446	Avi_2448	ppiB	ppiB	TRUE	0.915	137.000	0.420	0.002	Y	NA
5478913	5478914	Avi_2448	Avi_2450	ppiB	queA	FALSE	0.353	80.000	0.031	1.000	N	NA
5478914	5478915	Avi_2450	Avi_2451	queA	tgt	TRUE	0.998	3.000	0.360	0.000	Y	NA
5478917	5478918	Avi_2453	Avi_2454			FALSE	0.151	101.000	0.000	NA		NA
5478919	5478920	Avi_2455	Avi_2456			FALSE	0.106	75.000	0.000	NA	N	NA
5478920	5478921	Avi_2456	Avi_2457			TRUE	1.000	-3.000	0.800	0.001	Y	NA
5478921	5478922	Avi_2457	Avi_2459			TRUE	0.999	0.000	0.600	0.049	Y	NA
5478924	5478925	Avi_2461	Avi_2463		cckA	FALSE	0.035	285.000	0.000	NA		NA
5478928	5478929	Avi_2469	Avi_2470			FALSE	0.268	140.000	0.072	NA		NA
5478929	5478930	Avi_2470	Avi_2471			TRUE	0.999	-3.000	0.791	NA		NA
5478930	5478931	Avi_2471	Avi_2472			FALSE	0.239	153.000	0.059	NA		NA
5478932	5478933	Avi_2473	Avi_2474	speB	aspB	TRUE	0.949	26.000	0.016	1.000	Y	NA
5478935	5478936	Avi_2477	Avi_2478		tig	FALSE	0.073	179.000	0.000	NA		NA
5478936	5478937	Avi_2478	Avi_4585	tig		FALSE	0.019	384.000	0.000	NA		NA
5478937	5478938	Avi_4585	Avi_2479			FALSE	0.096	134.000	0.000	NA		NA
5478938	5478939	Avi_2479	Avi_2480			TRUE	0.997	-3.000	0.589	NA		NA
5478941	5478942	Avi_2483	Avi_2484			TRUE	0.883	2.000	0.000	1.000		NA
5478942	5478943	Avi_2484	Avi_2485		htrA	TRUE	0.970	-3.000	0.051	1.000	N	NA
5478944	5478945	Avi_2487	Avi_2489			FALSE	0.186	90.000	0.000	NA		NA
5478945	5478946	Avi_2489	Avi_2490			FALSE	0.393	52.000	0.000	NA		NA
5478946	5478947	Avi_2490	Avi_2491			FALSE	0.085	150.000	0.000	NA		NA
5478947	5478948	Avi_2491	Avi_2492		cpdB	FALSE	0.336	164.000	0.154	NA		NA
5478949	5478950	Avi_2493	Avi_2495			FALSE	0.090	140.000	0.000	NA		NA
5478951	5478952	Avi_2496	Avi_2497	ilvA		FALSE	0.007	365.000	0.000	NA	N	NA
5478952	5478953	Avi_2497	Avi_2498			TRUE	0.978	74.000	0.719	NA	Y	NA
5478953	5478954	Avi_2498	Avi_2499			TRUE	1.000	-27.000	0.797	1.000	Y	NA
5478954	5478955	Avi_2499	Avi_2500			TRUE	0.975	11.000	0.314	NA		NA
5478955	5478956	Avi_2500	Avi_2501			TRUE	0.995	12.000	0.931	NA		NA
5478956	5478957	Avi_2501	Avi_2502		pccA	TRUE	0.996	4.000	0.835	NA		NA
5478957	5478958	Avi_2502	Avi_2503	pccA		FALSE	0.063	204.000	0.000	NA		NA
5478958	5478959	Avi_2503	Avi_2504			FALSE	0.175	94.000	0.000	NA		NA
5478959	5478960	Avi_2504	Avi_2505			FALSE	0.342	202.000	0.208	NA		NA
5478960	5478961	Avi_2505	Avi_2506		adhC	FALSE	0.191	88.000	0.000	NA		NA
5478961	5478962	Avi_2506	Avi_2507	adhC		TRUE	0.943	-3.000	0.000	1.000		NA
5478962	5478963	Avi_2507	Avi_2508			TRUE	0.899	6.000	0.012	NA		NA
5478963	5478964	Avi_2508	Avi_2509			TRUE	0.968	-3.000	0.012	NA		NA
5478964	5478965	Avi_2509	Avi_2510		fghA	TRUE	0.802	29.000	0.046	NA		NA
5478966	5478967	Avi_2511	Avi_2512	lpxB		TRUE	0.834	44.000	0.173	NA		NA
5478967	5478968	Avi_2512	Avi_2513		lpxA	TRUE	0.992	4.000	0.552	NA		NA
5478968	5478969	Avi_2513	Avi_2514	lpxA	fabZ	TRUE	0.991	-3.000	0.264	1.000	N	NA
5478969	5478970	Avi_2514	Avi_2515	fabZ	lpxD	TRUE	0.989	-3.000	0.212	1.000	N	NA
5478970	5478971	Avi_2515	Avi_2517	lpxD	omp1	TRUE	0.920	49.000	0.063	1.000	Y	NA
5478971	5478972	Avi_2517	Avi_2518	omp1		TRUE	0.676	195.000	0.204	1.000	Y	NA
5478972	5478973	Avi_2518	Avi_2519		cdsA	FALSE	0.293	112.000	0.080	1.000	N	NA
5478973	5478974	Avi_2519	Avi_2520	cdsA	uppS	TRUE	0.996	7.000	0.400	1.000	Y	NA
5478974	5478975	Avi_2520	Avi_2521	uppS	frr	TRUE	0.914	45.000	0.409	1.000	N	NA
5478975	5478976	Avi_2521	Avi_2524	frr	pyrH	TRUE	0.858	88.000	0.626	1.000	N	NA
5478976	5478977	Avi_2524	Avi_2525	pyrH	tsf	TRUE	0.455	218.000	0.416	1.000	N	NA
5478977	5478978	Avi_2525	Avi_2528	tsf	rpsB	TRUE	0.831	293.000	0.748	1.000	Y	NA
5478978	5478979	Avi_2528	Avi_2529	rpsB		FALSE	0.056	311.000	0.009	NA		NA
5478980	5478981	Avi_2531	Avi_2532			TRUE	0.998	-3.000	0.696	NA	N	NA
5478981	5478982	Avi_2532	Avi_2533			TRUE	0.953	18.000	0.280	NA		NA
5478982	5478983	Avi_2533	Avi_2534			TRUE	0.746	56.000	0.131	NA		NA
5478984	5478985	Avi_2535	Avi_2536			TRUE	0.993	-3.000	0.275	NA		NA
5478985	5478986	Avi_2536	Avi_2537		clpA	FALSE	0.089	184.000	0.014	NA	N	NA
5478986	5478987	Avi_2537	Avi_2538	clpA		TRUE	0.992	5.000	0.596	NA		NA
5478987	5478988	Avi_2538	Avi_2539			FALSE	0.017	406.000	0.000	NA		NA
5478988	5478989	Avi_2539	Avi_2541			FALSE	0.068	191.000	0.000	NA		NA
5478989	5478990	Avi_2541	Avi_2542		cysE	TRUE	0.485	216.000	0.386	NA		NA
5478993	5478994	Avi_2547	Avi_2548		nah	FALSE	0.313	552.000	0.745	NA		NA
5478996	5478997	Avi_2551	Avi_2552			TRUE	0.926	133.000	0.548	0.096	Y	NA
5478997	5478998	Avi_2552	Avi_2553			TRUE	0.999	-28.000	0.815	0.013	N	NA
5478998	5478999	Avi_2553	Avi_2554			TRUE	0.835	112.000	0.734	1.000	N	NA
5479000	5479001	Avi_2555	Avi_2557		alaS	FALSE	0.296	67.000	0.000	NA		NA
5479001	5479002	Avi_2557	Avi_2558	alaS	recA	FALSE	0.165	170.000	0.054	1.000	N	NA
5479003	5479004	Avi_2559	Avi_2560			TRUE	0.981	-3.000	0.131	NA	N	NA
5479004	5479005	Avi_2560	Avi_2561		lexA	FALSE	0.006	391.000	0.000	NA	N	NA
5479007	5479008	Avi_2563	Avi_2565	cisY	ppiD	FALSE	0.075	198.000	0.000	1.000		NA
5479008	5479009	Avi_2565	Avi_2566	ppiD	trpD	TRUE	0.796	22.000	0.012	1.000		NA
5479009	5479010	Avi_2566	Avi_2567	trpD	trpC	TRUE	0.998	-3.000	0.293	1.000	Y	NA
5479010	5479011	Avi_2567	Avi_2568	trpC	moaC	TRUE	0.981	-3.000	0.113	1.000	N	NA
5479011	5479012	Avi_2568	Avi_2569	moaC	moeA	TRUE	0.996	0.000	0.093	0.002	Y	NA
5479012	5479013	Avi_2569	Avi_2570	moeA		FALSE	0.087	96.000	0.000	1.000	N	NA
5479015	5479016	Avi_2573	Avi_2574			TRUE	0.812	203.000	0.333	0.096	Y	NA
5479016	5479017	Avi_2574	Avi_2575			TRUE	0.999	-7.000	0.300	1.000	Y	NA
5479019	5479020	Avi_2578	Avi_2579			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479021	5479022	Avi_2581	Avi_2583			FALSE	0.025	333.000	0.000	NA		NA
5479024	5479025	Avi_2585	Avi_2586	cyc		FALSE	0.080	100.000	0.000	1.000	N	NA
5479026	5479027	Avi_2589	Avi_2590			FALSE	0.044	253.000	0.000	NA		NA
5479027	5479028	Avi_2590	Avi_2591			FALSE	0.029	308.000	0.000	NA		NA
5479028	5479029	Avi_2591	Avi_2593			FALSE	0.393	52.000	0.000	NA		NA
5479029	5479030	Avi_2593	Avi_2594			TRUE	0.769	31.000	0.029	NA		NA
5479030	5479031	Avi_2594	Avi_2595		exoN	TRUE	0.970	-3.000	0.012	1.000		NA
5479031	5479032	Avi_2595	Avi_2596	exoN		TRUE	0.809	6.000	0.000	NA		NA
5479033	5479034	Avi_2598	Avi_2599	sipf	nrdE	FALSE	0.112	131.000	0.000	1.000		NA
5479036	5479037	Avi_2601	Avi_2602		gpt	FALSE	0.155	100.000	0.000	NA		NA
5479037	5479038	Avi_2602	Avi_2605	gpt		FALSE	0.062	323.000	0.016	1.000		NA
5479038	5479039	Avi_2605	Avi_2606		cinA	FALSE	0.103	248.000	0.016	1.000		NA
5479039	5479040	Avi_2606	Avi_2608	cinA	mcpA	FALSE	0.022	376.000	0.000	1.000		NA
5479042	5479043	Avi_2609	Avi_2611	cheW		FALSE	0.012	517.000	0.000	NA		NA
5479043	5479044	Avi_2611	Avi_2612		sdaA	TRUE	0.800	46.000	0.140	NA		NA
5479045	5479046	Avi_2613	Avi_2615			FALSE	0.353	129.000	0.118	NA		NA
5479046	5479047	Avi_2615	Avi_2616			TRUE	0.909	12.000	0.059	NA		NA
5479048	5479049	Avi_2617	Avi_2620		mgtE	FALSE	0.248	160.000	0.118	1.000	N	NA
5479049	5479050	Avi_2620	Avi_2621	mgtE	cobD	FALSE	0.056	122.000	0.000	1.000	N	NA
5479050	5479051	Avi_2621	Avi_2622	cobD	cobC	TRUE	0.996	-3.000	0.344	0.009	N	NA
5479051	5479052	Avi_2622	Avi_2623	cobC	cobB	TRUE	0.988	-3.000	0.067	0.009	N	NA
5479052	5479053	Avi_2623	Avi_2624	cobB	cobA	TRUE	0.997	-3.000	0.139	1.000	Y	NA
5479054	5479055	Avi_2627	Avi_2628	cbiD	cobK	TRUE	0.999	-16.000	0.123	0.009	Y	NA
5479056	5479057	Avi_2630	Avi_2631	cheD		FALSE	0.012	496.000	0.000	NA		NA
5479057	5479058	Avi_2631	Avi_2632		iunH	FALSE	0.168	96.000	0.000	NA		NA
5479058	5479059	Avi_2632	Avi_2635	iunH	cobM	FALSE	0.076	89.000	0.000	NA	N	NA
5479059	5479060	Avi_2635	Avi_2636	cobM	cobJ	TRUE	0.993	2.000	0.027	0.009	Y	NA
5479060	5479061	Avi_2636	Avi_2637	cobJ	cobI	TRUE	0.996	0.000	0.097	0.009	Y	NA
5479061	5479062	Avi_2637	Avi_2638	cobI	cobL	TRUE	0.996	-3.000	0.005	0.009	Y	NA
5479062	5479063	Avi_2638	Avi_2639	cobL	cobH	TRUE	0.997	-7.000	0.000	0.009	Y	NA
5479063	5479064	Avi_2639	Avi_2641	cobH		FALSE	0.360	153.000	0.032	0.009		NA
5479065	5479066	Avi_2642	Avi_2643			FALSE	0.335	65.000	0.000	1.000		NA
5479066	5479067	Avi_2643	Avi_2644			TRUE	0.976	-3.000	0.038	NA		NA
5479068	5479069	Avi_2646	Avi_2647	cobO	cobN	TRUE	0.996	-3.000	0.054	1.000	Y	NA
5479069	5479070	Avi_2647	Avi_2648	cobN	cobW	TRUE	0.982	4.000	0.274	1.000		NA
5479070	5479071	Avi_2648	Avi_2650	cobW	cobU	TRUE	0.952	4.000	0.063	1.000		NA
5479071	5479072	Avi_2650	Avi_2651	cobU		TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5479072	5479073	Avi_2651	Avi_2652			FALSE	0.010	570.000	0.000	NA		NA
5479074	5479075	Avi_2653	Avi_2654		gidA	FALSE	0.181	154.000	0.023	NA		NA
5479076	5479077	Avi_2655	Avi_2656		crtB	TRUE	0.607	64.000	0.059	NA		NA
5479077	5479078	Avi_2656	Avi_2657	crtB		TRUE	0.776	56.000	0.165	NA		NA
5479078	5479079	Avi_2657	Avi_2658		secD	TRUE	0.947	4.000	0.060	NA		NA
5479079	5479080	Avi_2658	Avi_2659	secD	yajC	TRUE	0.542	210.000	0.099	NA	Y	NA
5479082	5479083	Avi_2662	Avi_2663		pcm	FALSE	0.124	252.000	0.089	1.000	N	NA
5479083	5479084	Avi_2663	Avi_2664	pcm	surE	TRUE	0.988	-3.000	0.147	1.000		NA
5479084	5479085	Avi_2664	Avi_2665	surE	serS	FALSE	0.274	135.000	0.058	1.000		NA
5479085	5479086	Avi_2665	Avi_2666	serS	tatC	TRUE	0.682	42.000	0.065	NA	N	NA
5479086	5479087	Avi_2666	Avi_2667	tatC	tatB	TRUE	0.999	-3.000	0.535	NA	Y	NA
5479087	5479088	Avi_2667	Avi_2668	tatB	tatA	TRUE	0.946	95.000	0.353	0.005	Y	NA
5479088	5479089	Avi_2668	Avi_2670	tatA		FALSE	0.141	195.000	0.060	NA	N	NA
5479089	5479090	Avi_2670	Avi_2671			TRUE	0.991	6.000	0.570	NA		NA
5479090	5479091	Avi_2671	Avi_2673			TRUE	0.693	60.000	0.103	NA		NA
5479091	5479092	Avi_2673	Avi_2674			FALSE	0.223	165.000	0.056	NA		NA
5479092	5479093	Avi_2674	Avi_2675		argS	TRUE	0.783	27.000	0.027	NA		NA
5479093	5479094	Avi_2675	Avi_2676	argS	dgt	TRUE	0.546	63.000	0.062	1.000	N	NA
5479095	5479096	Avi_2678	Avi_2680			FALSE	0.407	87.000	0.038	NA		NA
5479097	5479098	Avi_2681	Avi_2682	exoR	fadL	FALSE	0.008	707.000	0.000	NA		NA
5479098	5479099	Avi_2682	Avi_2683	fadL	valS	FALSE	0.003	667.000	0.000	NA	N	NA
5479099	5479100	Avi_2683	Avi_2684	valS		FALSE	0.144	214.000	0.033	NA		NA
5479100	5479101	Avi_2684	Avi_2686			FALSE	0.070	306.000	0.024	NA		NA
5479101	5479102	Avi_2686	Avi_2687		pcm	FALSE	0.020	611.000	0.047	1.000	N	NA
5479103	5479104	Avi_2689	Avi_2691			FALSE	0.008	656.000	0.000	NA		NA
5479105	5479106	Avi_2693	Avi_2694	accG	accF	TRUE	0.990	-7.000	0.150	1.000	N	NA
5479106	5479107	Avi_2694	Avi_2696	accF	accE	TRUE	0.918	17.000	0.190	1.000	N	NA
5479107	5479108	Avi_2696	Avi_2697	accE	accD	TRUE	0.995	2.000	0.143	0.095	Y	NA
5479108	5479109	Avi_2697	Avi_2698	accD	accC	TRUE	0.999	-3.000	0.667	1.000	Y	NA
5479109	5479110	Avi_2698	Avi_2699	accC	accB	TRUE	0.997	-3.000	0.040	0.006	Y	NA
5479110	5479111	Avi_2699	Avi_2700	accB	accA	TRUE	0.856	68.000	0.040	1.000	Y	NA
5479111	5479112	Avi_2700	Avi_2701	accA	accR	FALSE	0.247	49.000	0.000	1.000	N	NA
5479112	5479113	Avi_2701	Avi_2704	accR		FALSE	0.093	713.000	0.000	0.066	Y	NA
5479114	5479115	Avi_2705	Avi_2706			TRUE	0.829	69.000	0.000	0.095	Y	NA
5479115	5479116	Avi_2706	Avi_2707		attA2	TRUE	0.764	84.000	0.000	0.095	Y	NA
5479116	5479117	Avi_2707	Avi_2708	attA2		TRUE	0.977	10.000	0.000	0.095	Y	NA
5479117	5479118	Avi_2708	Avi_2709		noxB	TRUE	0.978	4.000	0.000	1.000	Y	NA
5479118	5479119	Avi_2709	Avi_2710	noxB		TRUE	0.962	-7.000	0.000	1.000		NA
5479119	5479120	Avi_2710	Avi_2712		noxA	TRUE	0.944	3.000	0.000	0.048		NA
5479124	5479125	Avi_2715	Avi_2717			FALSE	0.073	180.000	0.000	NA		NA
5479126	5479127	Avi_2719	Avi_4584			FALSE	0.011	526.000	0.000	NA		NA
5479129	5479130	Avi_2722	Avi_2723			TRUE	0.998	-3.000	0.303	1.000	Y	NA
5479130	5479131	Avi_2723	Avi_2724			FALSE	0.127	121.000	0.000	1.000		NA
5479131	5479132	Avi_2724	Avi_2726		rrpX	FALSE	0.073	202.000	0.000	1.000		NA
5479132	5479133	Avi_2726	Avi_2727	rrpX		FALSE	0.048	257.000	0.000	1.000		NA
5479133	5479134	Avi_2727	Avi_2728			FALSE	0.147	110.000	0.000	1.000		NA
5479136	5479137	Avi_2730	Avi_2731	kefA		FALSE	0.006	424.000	0.000	NA	N	NA
5479137	5479138	Avi_2731	Avi_2732			TRUE	0.906	8.000	0.027	NA		NA
5479139	5479140	Avi_2734	Avi_2735	hmuT	hmuU	TRUE	1.000	-3.000	0.852	1.000	Y	NA
5479140	5479141	Avi_2735	Avi_2736	hmuU	hmuV	TRUE	0.969	30.000	0.158	1.000	Y	NA
5479143	5479144	Avi_2738	Avi_2739			FALSE	0.357	62.000	0.000	1.000		NA
5479144	5479145	Avi_2739	Avi_2740			FALSE	0.011	526.000	0.000	NA		NA
5479145	5479146	Avi_2740	Avi_2741			FALSE	0.009	619.000	0.000	NA		NA
5479146	5479147	Avi_2741	Avi_2742			TRUE	0.998	-3.000	0.103	0.056	Y	NA
5479147	5479148	Avi_2742	Avi_2743			TRUE	0.594	61.000	0.043	NA		NA
5479148	5479149	Avi_2743	Avi_2744			TRUE	0.997	-7.000	0.338	NA		NA
5479149	5479150	Avi_2744	Avi_2745			TRUE	0.996	-3.000	0.423	NA		NA
5479150	5479151	Avi_2745	Avi_2746			TRUE	0.998	-3.000	0.609	NA		NA
5479151	5479152	Avi_2746	Avi_2747			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479152	5479153	Avi_2747	Avi_2748			TRUE	0.962	-27.000	0.000	NA		NA
5479155	5479156	Avi_2751	Avi_2753	tnp	tnp	TRUE	0.998	-3.000	0.136	0.056	Y	NA
5479157	5479158	Avi_2755	Avi_2756			FALSE	0.074	178.000	0.000	NA		NA
5479159	5479160	Avi_2757	Avi_2758		vgrG	FALSE	0.010	580.000	0.000	NA		NA
5479160	5479161	Avi_2758	Avi_2759	vgrG		TRUE	0.809	6.000	0.000	NA		NA
5479161	5479162	Avi_2759	Avi_2760			TRUE	0.957	-7.000	0.000	NA		NA
5479162	5479163	Avi_2760	Avi_2761			FALSE	0.009	606.000	0.000	NA		NA
5479163	5479164	Avi_2761	Avi_2762			TRUE	0.523	36.000	0.000	NA		NA
5479165	5479166	Avi_2763	Avi_2764			FALSE	0.057	219.000	0.000	NA		NA
5479166	5479167	Avi_2764	Avi_2765			TRUE	0.998	-13.000	0.444	NA		NA
5479168	5479169	Avi_2767	Avi_2770			FALSE	0.022	347.000	0.000	NA		NA
5479169	5479170	Avi_2770	Avi_2771		intD	FALSE	0.011	545.000	0.000	NA		NA
5479171	5479172	Avi_4583	Avi_2772			FALSE	0.091	139.000	0.000	NA		NA
5479172	5479173	Avi_2772	Avi_2774			TRUE	0.866	75.000	0.444	1.000		NA
5479173	5479174	Avi_2774	Avi_2775		mcpA	FALSE	0.048	257.000	0.000	1.000		NA
5479176	5479177	Avi_2778	Avi_2780	ilvC		TRUE	0.458	58.000	0.019	1.000	N	NA
5479177	5479178	Avi_2780	Avi_2782			FALSE	0.015	299.000	0.000	1.000	N	NA
5479178	5479179	Avi_2782	Avi_2784			FALSE	0.007	815.000	0.000	NA		NA
5479179	5479180	Avi_2784	Avi_2786			FALSE	0.007	743.000	0.000	NA		NA
5479181	5479182	Avi_2787	Avi_2789			FALSE	0.153	71.000	0.000	1.000	N	NA
5479182	5479183	Avi_2789	Avi_2790			TRUE	0.628	157.000	0.522	NA	N	NA
5479184	5479185	Avi_2791	Avi_2792	mcpA		FALSE	0.007	365.000	0.000	NA	N	NA
5479189	5479190	Avi_2796	Avi_2797		rhtB	TRUE	0.609	49.000	0.016	NA		NA
5479192	5479193	Avi_2799	Avi_2801		ilvN	FALSE	0.064	202.000	0.000	NA		NA
5479193	5479194	Avi_2801	Avi_2802	ilvN	ilvI	TRUE	0.986	22.000	0.146	0.001	Y	NA
5479195	5479196	Avi_2804	Avi_2805			TRUE	0.857	4.000	0.000	1.000		NA
5479198	5479199	Avi_2809	Avi_2810	serB		TRUE	0.833	10.000	0.014	1.000	N	NA
5479200	5479201	Avi_2812	Avi_2816	htrA	hflC	TRUE	0.571	265.000	0.084	0.005	Y	NA
5479201	5479202	Avi_2816	Avi_2818	hflC	hflK	TRUE	1.000	2.000	0.947	0.005	Y	NA
5479202	5479203	Avi_2818	Avi_2819	hflK	folA	FALSE	0.121	210.000	0.044	1.000	N	NA
5479203	5479204	Avi_2819	Avi_2820	folA		FALSE	0.123	114.000	0.000	NA		NA
5479204	5479205	Avi_2820	Avi_2822		thyA	FALSE	0.050	236.000	0.000	NA		NA
5479206	5479207	Avi_4507	Avi_2824			FALSE	0.035	283.000	0.000	NA		NA
5479207	5479208	Avi_2824	Avi_2825			TRUE	0.761	27.000	0.016	NA		NA
5479208	5479209	Avi_2825	Avi_2826			FALSE	0.327	108.000	0.050	NA		NA
5479209	5479210	Avi_2826	Avi_2827			FALSE	0.025	333.000	0.000	NA		NA
5479211	5479212	Avi_2828	Avi_2829			TRUE	0.577	76.000	0.156	NA	N	NA
5479212	5479213	Avi_2829	Avi_2830		pstB	FALSE	0.056	121.000	0.000	1.000	N	NA
5479213	5479214	Avi_2830	Avi_2831	pstB	pstA	TRUE	0.999	1.000	0.526	0.002	Y	NA
5479214	5479215	Avi_2831	Avi_2832	pstA	pstC	TRUE	0.998	10.000	0.537	0.002	Y	NA
5479215	5479216	Avi_2832	Avi_2833	pstC		TRUE	0.834	100.000	0.046	0.002	Y	NA
5479217	5479218	Avi_2836	Avi_2837	pcrA		FALSE	0.300	66.000	0.000	NA		NA
5479218	5479219	Avi_2837	Avi_2838			FALSE	0.092	138.000	0.000	NA		NA
5479219	5479220	Avi_2838	Avi_2839			TRUE	0.998	-3.000	0.613	NA		NA
5479222	5479223	Avi_2845	Avi_2846	pncA	panC	FALSE	0.268	45.000	0.000	1.000	N	NA
5479223	5479224	Avi_2846	Avi_2847	panC	panB	TRUE	0.999	-3.000	0.395	0.000	Y	NA
5479225	5479226	Avi_2848	Avi_2849		nadB	TRUE	0.771	12.000	0.000	1.000		NA
5479226	5479227	Avi_2849	Avi_2851	nadB		FALSE	0.057	218.000	0.000	NA		NA
5479228	5479229	Avi_2852	Avi_2853			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
5479230	5479231	Avi_2855	Avi_2857		prmA	FALSE	0.013	754.000	0.027	1.000	N	NA
5479231	5479232	Avi_2857	Avi_2858	prmA		FALSE	0.256	120.000	0.025	1.000		NA
5479233	5479234	Avi_2860	Avi_2861	mcpG	cheW	TRUE	0.999	4.000	0.636	0.014	Y	NA
5479234	5479235	Avi_2861	Avi_2863	cheW		FALSE	0.028	312.000	0.000	NA		NA
5479236	5479237	Avi_2864	Avi_2865			FALSE	0.419	84.000	0.033	NA		NA
5479240	5479241	Avi_2870	Avi_2871		deaD	FALSE	0.404	177.000	0.000	1.000	Y	NA
5479241	5479242	Avi_2871	Avi_2873	deaD		FALSE	0.018	273.000	0.000	1.000	N	NA
5479242	5479243	Avi_2873	Avi_2874			FALSE	0.043	145.000	0.000	1.000	N	NA
5479244	5479245	Avi_2875	Avi_2876			FALSE	0.045	249.000	0.000	NA		NA
5479245	5479246	Avi_2876	Avi_2877			FALSE	0.326	62.000	0.000	NA		NA
5479246	5479247	Avi_2877	Avi_2878		cls	TRUE	0.831	39.000	0.121	NA		NA
5479247	5479248	Avi_2878	Avi_2879	cls	recN	FALSE	0.042	151.000	0.000	1.000	N	NA
5479248	5479249	Avi_2879	Avi_2880	recN		TRUE	0.789	47.000	0.117	1.000		NA
5479249	5479250	Avi_2880	Avi_2881		lpxC	FALSE	0.070	379.000	0.064	1.000		NA
5479250	5479251	Avi_2881	Avi_2882	lpxC	ftsZ2	FALSE	0.046	510.000	0.134	1.000	N	NA
5479251	5479252	Avi_2882	Avi_2884	ftsZ2	ftsA	TRUE	0.917	58.000	0.114	1.000	Y	NA
5479252	5479253	Avi_2884	Avi_2885	ftsA	ftsQ	TRUE	0.982	-3.000	0.137	NA	N	NA
5479253	5479254	Avi_2885	Avi_2887	ftsQ	ddl	TRUE	0.999	-3.000	0.372	NA	Y	NA
5479256	5479257	Avi_2889	Avi_2890	murB	murC	TRUE	0.998	-3.000	0.108	0.003	Y	NA
5479257	5479258	Avi_2890	Avi_2891	murC	murG	TRUE	0.998	-3.000	0.283	1.000	Y	NA
5479258	5479259	Avi_2891	Avi_2892	murG	ftsW	TRUE	0.980	19.000	0.647	1.000	N	NA
5479259	5479260	Avi_2892	Avi_2893	ftsW	murD	TRUE	0.991	2.000	0.297	0.002	N	NA
5479260	5479261	Avi_2893	Avi_2894	murD	mraY	TRUE	0.999	8.000	0.647	0.003	Y	NA
5479261	5479262	Avi_2894	Avi_2895	mraY	murF	TRUE	0.980	53.000	0.309	0.003	Y	NA
5479262	5479263	Avi_2895	Avi_2896	murF	murE	TRUE	1.000	-3.000	0.569	0.001	Y	NA
5479263	5479264	Avi_2896	Avi_2897	murE		TRUE	0.842	65.000	0.014	1.000	Y	NA
5479264	5479265	Avi_2897	Avi_2898			TRUE	0.982	-3.000	0.076	NA		NA
5479265	5479266	Avi_2898	Avi_2900		mraW	TRUE	0.955	4.000	0.089	NA		NA
5479266	5479267	Avi_2900	Avi_2899	mraW		TRUE	0.809	117.000	0.635	NA		NA
5479267	5479268	Avi_2899	Avi_4508			FALSE	0.015	435.000	0.000	NA		NA
5479268	5479269	Avi_4508	Avi_2901			FALSE	0.398	51.000	0.000	NA		NA
5479269	5479270	Avi_2901	Avi_2904		slt	FALSE	0.228	163.000	0.057	NA		NA
5479270	5479271	Avi_2904	Avi_2906	slt		FALSE	0.076	296.000	0.026	NA		NA
5479271	5479272	Avi_2906	Avi_2908		djlA	TRUE	0.979	-3.000	0.098	1.000	N	NA
5479273	5479274	Avi_2909	Avi_2910	pfp		FALSE	0.017	240.000	0.000	NA	N	NA
5479274	5479275	Avi_2910	Avi_2912			FALSE	0.015	255.000	0.000	NA	N	NA
5479277	5479278	Avi_2914	Avi_2916			TRUE	0.832	63.000	0.347	NA	N	NA
5479278	5479279	Avi_2916	Avi_2919		lyc	FALSE	0.126	222.000	0.058	1.000	N	NA
5479279	5479280	Avi_2919	Avi_2920	lyc	mltB	TRUE	0.818	117.000	0.235	1.000	Y	NA
5479280	5479281	Avi_2920	Avi_2922	mltB		FALSE	0.108	202.000	0.000	0.060	N	NA
5479281	5479282	Avi_2922	Avi_2923			TRUE	0.990	6.000	0.596	1.000	N	NA
5479283	5479284	Avi_2925	Avi_2926	metF		TRUE	0.973	0.000	0.160	1.000	N	NA
5479284	5479285	Avi_2926	Avi_2927		mcpC	FALSE	0.031	203.000	0.000	1.000	N	NA
5479285	5479286	Avi_2927	Avi_2928	mcpC	mcpC	FALSE	0.309	305.000	0.000	0.014	Y	NA
5479286	5479287	Avi_2928	Avi_2929	mcpC	chvD	FALSE	0.114	130.000	0.000	1.000		NA
5479287	5479288	Avi_2929	Avi_2930	chvD		FALSE	0.188	147.000	0.016	1.000		NA
5479289	5479290	Avi_2931	Avi_2932			TRUE	0.887	20.000	0.100	NA		NA
5479290	5479291	Avi_2932	Avi_2933		iivG	TRUE	0.561	31.000	0.000	NA		NA
5479294	5479295	Avi_2936	Avi_2938			TRUE	0.693	76.000	0.194	NA		NA
5479295	5479296	Avi_2938	Avi_2941			TRUE	0.589	104.000	0.231	NA		NA
5479298	5479299	Avi_2944	Avi_2945			FALSE	0.128	177.000	0.029	1.000	N	NA
5479299	5479300	Avi_2945	Avi_2946			FALSE	0.013	317.000	0.000	1.000	N	NA
5479301	5479302	Avi_2948	Avi_2949			TRUE	0.800	88.000	0.301	0.094		NA
5479302	5479303	Avi_2949	Avi_2950			TRUE	0.999	-3.000	0.774	0.094		NA
5479303	5479304	Avi_2950	Avi_2951			TRUE	0.999	-3.000	0.461	1.000	Y	NA
5479304	5479305	Avi_2951	Avi_2952			FALSE	0.045	140.000	0.000	1.000	N	NA
5479305	5479306	Avi_2952	Avi_2954			FALSE	0.095	155.000	0.000	1.000		NA
5479308	5479309	Avi_2957	Avi_2958			FALSE	0.289	315.000	0.000	0.024	Y	NA
5479309	5479310	Avi_2958	Avi_2960		nodX	FALSE	0.011	341.000	0.000	1.000	N	NA
5479311	5479312	Avi_2961	Avi_2962			FALSE	0.103	87.000	0.000	1.000	N	NA
5479314	5479315	Avi_2964	Avi_2966		metH	FALSE	0.226	80.000	0.000	NA		NA
5479316	5479317	Avi_2967	Avi_2969			FALSE	0.111	122.000	0.000	NA		NA
5479318	5479319	Avi_2970	Avi_2972		yci	FALSE	0.037	275.000	0.000	NA		NA
5479319	5479320	Avi_2972	Avi_2975	yci	copC	FALSE	0.079	186.000	0.000	1.000		NA
5479320	5479321	Avi_2975	Avi_2977	copC		FALSE	0.120	81.000	0.000	1.000	N	NA
5479322	5479323	Avi_2978	Avi_2979		omp	FALSE	0.031	298.000	0.000	NA		NA
5479328	5479329	Avi_2983	Avi_2984			TRUE	0.786	9.000	0.000	NA		NA
5479329	5479330	Avi_2984	Avi_2985			TRUE	0.996	-3.000	0.462	NA		NA
5479330	5479331	Avi_2985	Avi_2988			FALSE	0.008	684.000	0.000	NA		NA
5479331	5479332	Avi_2988	Avi_2989			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479332	5479333	Avi_2989	Avi_2990			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479335	5479336	Avi_2995	Avi_2996			FALSE	0.078	170.000	0.000	NA		NA
5479336	5479337	Avi_2996	Avi_2997			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479337	5479338	Avi_2997	Avi_2998			TRUE	0.954	2.000	0.050	NA		NA
5479338	5479339	Avi_2998	Avi_3000			TRUE	0.745	12.000	0.000	NA		NA
5479339	5479340	Avi_3000	Avi_3001			TRUE	0.557	108.000	0.222	NA		NA
5479340	5479341	Avi_3001	Avi_3002			TRUE	0.960	13.000	0.241	NA		NA
5479341	5479342	Avi_3002	Avi_3003			TRUE	0.993	-3.000	0.276	NA		NA
5479342	5479343	Avi_3003	Avi_3005			FALSE	0.013	477.000	0.000	NA		NA
5479343	5479344	Avi_3005	Avi_3006			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479344	5479345	Avi_3006	Avi_3008			TRUE	0.982	0.000	0.190	NA		NA
5479345	5479346	Avi_3008	Avi_3009			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479346	5479347	Avi_3009	Avi_3010			TRUE	0.989	3.000	0.375	NA		NA
5479347	5479348	Avi_3010	Avi_3011		clpB	TRUE	0.994	-19.000	0.194	NA		NA
5479348	5479349	Avi_3011	Avi_3012	clpB		TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479351	5479352	Avi_3017	Avi_3018			FALSE	0.147	102.000	0.000	NA		NA
5479353	5479354	Avi_3019	Avi_3023			TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5479355	5479356	Avi_3025	Avi_3027			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479356	5479357	Avi_3027	Avi_3030			FALSE	0.006	957.000	0.000	NA		NA
5479357	5479358	Avi_3030	Avi_3033			FALSE	0.008	845.000	0.000	1.000		NA
5479358	5479359	Avi_3033	Avi_3035			TRUE	0.941	38.000	0.222	0.009		NA
5479359	5479360	Avi_3035	Avi_3037			FALSE	0.065	200.000	0.000	NA		NA
5479360	5479361	Avi_3037	Avi_3038			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479361	5479362	Avi_3038	Avi_3040			FALSE	0.041	259.000	0.000	NA		NA
5479362	5479363	Avi_3040	Avi_3041			FALSE	0.062	207.000	0.000	NA		NA
5479364	5479365	Avi_9915	Avi_3042			FALSE	0.008	656.000	0.000	NA		NA
5479365	5479366	Avi_3042	Avi_3043			TRUE	0.987	-3.000	0.143	NA		NA
5479366	5479367	Avi_3043	Avi_3044		istA	FALSE	0.029	309.000	0.000	NA		NA
5479367	5479368	Avi_3044	Avi_3045	istA	istB	TRUE	0.998	-10.000	0.182	1.000	Y	NA
5479369	5479370	Avi_3046	Avi_3047			FALSE	0.084	153.000	0.000	NA		NA
5479370	5479371	Avi_3047	Avi_3048			TRUE	0.982	0.000	0.190	NA		NA
5479371	5479372	Avi_3048	Avi_3049			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479372	5479373	Avi_3049	Avi_3052			FALSE	0.031	301.000	0.000	NA		NA
5479373	5479374	Avi_3052	Avi_3053			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479374	5479375	Avi_3053	Avi_3055			FALSE	0.066	195.000	0.000	NA		NA
5479375	5479376	Avi_3055	Avi_3056		pntB	TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
5479376	5479377	Avi_3056	Avi_3058	pntB		FALSE	0.076	173.000	0.000	NA		NA
5479377	5479378	Avi_3058	Avi_3060			FALSE	0.016	420.000	0.000	NA		NA
5479378	5479379	Avi_3060	Avi_3062			FALSE	0.046	245.000	0.000	NA		NA
5479381	5479382	Avi_3067	Avi_3068			TRUE	0.772	38.000	0.000	0.009		NA
5479382	5479383	Avi_3068	Avi_3069			TRUE	0.991	-3.000	0.222	NA		NA
5479383	5479384	Avi_3069	Avi_3070			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479384	5479385	Avi_3070	Avi_3073			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5479385	5479386	Avi_3073	Avi_3074			FALSE	0.014	451.000	0.000	NA		NA
5479386	5479387	Avi_3074	Avi_3075			TRUE	0.561	31.000	0.000	NA		NA
5479388	5479389	Avi_3076	Avi_3077			FALSE	0.112	121.000	0.000	NA		NA
5479390	5479391	Avi_3078	Avi_3079			FALSE	0.020	374.000	0.000	NA		NA
5479391	5479392	Avi_3079	Avi_3084			FALSE	0.006	1276.000	0.000	NA		NA
5479392	5479393	Avi_3084	Avi_3085			FALSE	0.388	53.000	0.000	NA		NA
5479393	5479394	Avi_3085	Avi_3086		cspA	FALSE	0.035	181.000	0.000	1.000	N	NA
5479394	5479395	Avi_3086	Avi_3088	cspA	glf	FALSE	0.010	351.000	0.000	1.000	N	NA
5479396	5479397	Avi_3090	Avi_3091	ina		FALSE	0.030	306.000	0.000	NA		NA
5479398	5479399	Avi_3092	Avi_3093			FALSE	0.022	349.000	0.000	NA		NA
5479399	5479400	Avi_3093	Avi_3095			FALSE	0.047	242.000	0.000	NA		NA
5479400	5479401	Avi_3095	Avi_3097			FALSE	0.165	97.000	0.000	NA		NA
5479401	5479402	Avi_3097	Avi_3098			TRUE	0.952	0.000	0.019	1.000		NA
5479402	5479403	Avi_3098	Avi_3099		oriC	FALSE	0.129	120.000	0.000	1.000		NA
5479406	5479407	Avi_3102	Avi_3103	celE		FALSE	0.410	49.000	0.000	NA		NA
5479408	5479409	Avi_3104	Avi_3106	rpoD	dnaG	FALSE	0.066	687.000	0.299	1.000	N	NA
5479410	5479411	Avi_3107	Avi_3108	mnhA	bioB	TRUE	0.967	-3.000	0.009	NA		NA
5479414	5479415	Avi_3112	Avi_3113			FALSE	0.020	260.000	0.000	1.000	N	NA
5479417	5479418	Avi_3115	Avi_3116			FALSE	0.081	163.000	0.000	NA		NA
5479418	5479419	Avi_3116	Avi_3120			FALSE	0.010	553.000	0.000	NA		NA
5479420	5479421	Avi_3122	Avi_3124	carB		FALSE	0.086	148.000	0.000	NA		NA
5479421	5479422	Avi_3124	Avi_3127		greA	FALSE	0.014	448.000	0.000	NA		NA
5479422	5479423	Avi_3127	Avi_3128	greA	lpcC	FALSE	0.359	81.000	0.036	1.000	N	NA
5479423	5479424	Avi_3128	Avi_3129	lpcC		TRUE	0.977	11.000	0.027	1.000	Y	NA
5479424	5479425	Avi_3129	Avi_3131			TRUE	0.960	-13.000	0.000	NA		NA
5479425	5479426	Avi_3131	Avi_3134			FALSE	0.030	303.000	0.000	NA		NA
5479426	5479427	Avi_3134	Avi_3135			FALSE	0.052	231.000	0.000	NA		NA
5479427	5479428	Avi_3135	Avi_3137			FALSE	0.066	195.000	0.000	NA		NA
5479430	5479431	Avi_3139	Avi_3141	trxB		TRUE	0.910	8.000	0.065	1.000	N	NA
5479431	5479432	Avi_3141	Avi_4512		suhB	FALSE	0.054	224.000	0.000	NA		NA
5479432	5479433	Avi_4512	Avi_4511	suhB	suhB	FALSE	0.114	120.000	0.000	NA		NA
5479433	5479434	Avi_4511	Avi_3142	suhB		FALSE	0.143	104.000	0.000	NA		NA
5479434	5479435	Avi_3142	Avi_3143			TRUE	0.637	46.000	0.054	1.000	N	NA
5479439	5479440	Avi_3147	Avi_3149	chaA		FALSE	0.065	199.000	0.000	NA		NA
5479442	5479443	Avi_3152	Avi_3154			FALSE	0.079	168.000	0.000	NA		NA
5479443	5479444	Avi_3154	Avi_3156		cspA	FALSE	0.014	460.000	0.000	NA		NA
5479446	5479447	Avi_3163	Avi_3164	petP	petR	TRUE	0.997	6.000	0.392	0.088	Y	NA
5479447	5479448	Avi_3164	Avi_3166	petR	envZ	TRUE	0.878	186.000	0.592	1.000	Y	NA
5479449	5479450	Avi_3167	Avi_3168	csaA	proC	TRUE	0.989	-3.000	0.163	1.000		NA
5479450	5479451	Avi_3168	Avi_3169	proC		TRUE	0.986	3.000	0.308	NA		NA
5479451	5479452	Avi_3169	Avi_3170			FALSE	0.047	485.000	0.080	NA		NA
5479453	5479454	Avi_3171	Avi_3172	lgt		TRUE	0.989	-3.000	0.170	NA		NA
5479454	5479455	Avi_3172	Avi_3173			FALSE	0.287	162.000	0.107	NA		NA
5479455	5479456	Avi_3173	Avi_3174		pepQ	TRUE	0.972	-3.000	0.023	NA		NA
5479456	5479457	Avi_3174	Avi_3175	pepQ		TRUE	0.673	141.000	0.485	NA		NA
5479457	5479458	Avi_3175	Avi_3177		prsA	FALSE	0.044	1069.000	0.209	NA		NA
5479458	5479459	Avi_3177	Avi_3178	prsA		FALSE	0.020	371.000	0.000	NA		NA
5479460	5479461	Avi_3179	Avi_3181		aldA	FALSE	0.074	283.000	0.014	NA		NA
5479461	5479462	Avi_3181	Avi_3183	aldA	acoR	FALSE	0.279	186.000	0.119	1.000		NA
5479463	5479464	Avi_3185	Avi_3187	rplY		FALSE	0.022	395.000	0.006	1.000	N	NA
5479464	5479465	Avi_3187	Avi_3188			TRUE	0.508	123.000	0.000	1.000	Y	NA
5479465	5479466	Avi_3188	Avi_3190		pth	FALSE	0.127	78.000	0.000	1.000	N	NA
5479466	5479467	Avi_3190	Avi_3191	pth		TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5479467	5479468	Avi_3191	Avi_3192			TRUE	0.704	15.000	0.000	NA		NA
5479470	5479471	Avi_3194	Avi_3195			FALSE	0.084	155.000	0.000	NA		NA
5479471	5479472	Avi_3195	Avi_3196			FALSE	0.410	49.000	0.000	NA		NA
5479472	5479473	Avi_3196	Avi_3197			TRUE	0.999	-3.000	0.433	0.039	Y	NA
5479473	5479474	Avi_3197	Avi_3198			TRUE	0.919	-13.000	0.000	1.000	N	NA
5479475	5479476	Avi_3200	Avi_3201		apt	TRUE	0.588	32.000	0.000	1.000		NA
5479476	5479477	Avi_3201	Avi_3203	apt	fbcC	FALSE	0.057	267.000	0.015	1.000	N	NA
5479477	5479478	Avi_3203	Avi_3204	fbcC	fbcB	TRUE	0.996	26.000	0.630	0.001	Y	NA
5479478	5479479	Avi_3204	Avi_3205	fbcB	petA	TRUE	0.985	14.000	0.029	0.001	Y	NA
5479484	5479485	Avi_3216	Avi_3218			FALSE	0.048	240.000	0.000	NA		NA
5479486	5479487	Avi_3219	Avi_3220	flaA		FALSE	0.070	187.000	0.000	NA		NA
5479488	5479489	Avi_3221	Avi_3224	hemF		FALSE	0.147	179.000	0.014	NA		NA
5479490	5479491	Avi_3226	Avi_3227	papS		TRUE	0.985	-3.000	0.163	1.000	N	NA
5479491	5479492	Avi_3227	Avi_3228			TRUE	0.995	-3.000	0.346	NA		NA
5479493	5479494	Avi_3229	Avi_3231	moxR		TRUE	0.988	16.000	0.697	NA		NA
5479494	5479495	Avi_3231	Avi_3232			TRUE	0.998	0.000	0.816	NA		NA
5479495	5479496	Avi_3232	Avi_3233			TRUE	0.997	2.000	0.876	NA		NA
5479496	5479497	Avi_3233	Avi_3234			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5479497	5479498	Avi_3234	Avi_3235			TRUE	0.786	9.000	0.000	NA		NA
5479498	5479499	Avi_3235	Avi_3236			TRUE	0.800	32.000	0.000	0.010		NA
5479499	5479500	Avi_3236	Avi_3238			TRUE	0.515	41.000	0.000	1.000		NA
5479504	5479505	Avi_3243	Avi_3244		clpP	FALSE	0.058	233.000	0.000	1.000		NA
5479505	5479506	Avi_3244	Avi_3247	clpP		FALSE	0.163	174.000	0.055	1.000	N	NA
5479506	5479507	Avi_3247	Avi_3249		leuA	FALSE	0.010	349.000	0.000	1.000	N	NA
5479508	5479509	Avi_9916	Avi_3250			FALSE	0.132	109.000	0.000	NA		NA
5479510	5479511	Avi_3251	Avi_3252			FALSE	0.122	115.000	0.000	NA		NA
5479511	5479512	Avi_3252	Avi_3254		vgrG	FALSE	0.062	206.000	0.000	NA		NA
5479512	5479513	Avi_3254	Avi_3255	vgrG		TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5479513	5479514	Avi_3255	Avi_3256			TRUE	0.800	7.000	0.000	NA		NA
5479514	5479515	Avi_3256	Avi_3257			FALSE	0.106	125.000	0.000	NA		NA
5479515	5479516	Avi_3257	Avi_3258			FALSE	0.084	154.000	0.000	NA		NA
5479516	5479517	Avi_3258	Avi_3259		trpEG	FALSE	0.055	222.000	0.000	NA		NA
5479517	5479518	Avi_3259	Avi_3260	trpEG		TRUE	0.965	-3.000	0.036	1.000	N	NA
5479518	5479519	Avi_3260	Avi_3261			FALSE	0.032	200.000	0.000	1.000	N	NA
5479519	5479520	Avi_3261	Avi_3262			TRUE	0.975	-3.000	0.025	1.000		NA
5479520	5479521	Avi_3262	Avi_3264			FALSE	0.104	127.000	0.000	NA		NA
5479522	5479523	Avi_3266	Avi_3268		ureJ	FALSE	0.178	157.000	0.022	NA		NA
5479524	5479525	Avi_3269	Avi_3270			FALSE	0.087	145.000	0.000	NA		NA
5479526	5479527	Avi_3271	Avi_3272			FALSE	0.026	224.000	0.000	1.000	N	NA
5479528	5479529	Avi_3273	Avi_3275	avxR		TRUE	0.915	40.000	0.300	NA		NA
5479530	5479531	Avi_3276	Avi_3277		tdk	FALSE	0.068	192.000	0.000	NA		NA
5479532	5479533	Avi_3281	Avi_3282			TRUE	0.939	107.000	0.469	0.092	Y	NA
5479533	5479534	Avi_3282	Avi_3283			TRUE	1.000	-3.000	0.844	1.000	Y	NA
5479534	5479535	Avi_3283	Avi_3284			FALSE	0.146	192.000	0.054	1.000	N	NA
5479535	5479536	Avi_3284	Avi_3285		nolR	FALSE	0.192	138.000	0.054	1.000	N	NA
5479536	5479537	Avi_3285	Avi_3287	nolR	bioA	FALSE	0.003	861.000	0.000	1.000	N	NA
5479538	5479539	Avi_3288	Avi_3289	tnp		TRUE	0.963	-28.000	0.000	NA		NA
5479540	5479541	Avi_3290	Avi_3294		braC	FALSE	0.007	794.000	0.000	NA		NA
5479541	5479542	Avi_3294	Avi_3295	braC		FALSE	0.017	284.000	0.000	1.000	N	NA
5479542	5479543	Avi_3295	Avi_3296			TRUE	0.834	-3.000	0.000	NA	N	NA
5479543	5479544	Avi_3296	Avi_3297		ade	FALSE	0.387	20.000	0.000	NA	N	NA
5479544	5479545	Avi_3297	Avi_3298	ade		FALSE	0.175	55.000	0.000	NA	N	NA
5479545	5479546	Avi_3298	Avi_3299			TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5479549	5479550	Avi_3302	Avi_3303	engA		FALSE	0.200	153.000	0.026	1.000		NA
5479550	5479551	Avi_3303	Avi_3305			FALSE	0.171	265.000	0.123	NA		NA
5479553	5479554	Avi_3309	Avi_3310			FALSE	0.241	170.000	0.136	NA	N	NA
5479556	5479557	Avi_3313	Avi_3314	map		TRUE	0.762	40.000	0.112	NA	N	NA
5479557	5479558	Avi_3314	Avi_3316		glpK	FALSE	0.189	311.000	0.000	NA	Y	NA
5479559	5479560	Avi_3319	Avi_3320	bdhA	xdhA	TRUE	0.849	31.000	0.149	1.000	N	NA
5479560	5479561	Avi_3320	Avi_3321	xdhA	xdhB	TRUE	0.680	253.000	0.164	0.000	Y	NA
5479561	5479562	Avi_3321	Avi_3322	xdhB	xdhC	TRUE	0.834	-3.000	0.000	NA	N	NA
5479562	5479563	Avi_3322	Avi_3323	xdhC		FALSE	0.134	65.000	0.000	NA	N	NA
5479563	5479564	Avi_3323	Avi_3324			FALSE	0.011	346.000	0.000	1.000	N	NA
5479564	5479565	Avi_3324	Avi_3325			FALSE	0.120	125.000	0.000	1.000		NA
5479565	5479566	Avi_3325	Avi_3326		guaD	TRUE	0.957	0.000	0.029	1.000		NA
5479566	5479567	Avi_3326	Avi_3327	guaD		FALSE	0.018	237.000	0.000	NA	N	NA
5479567	5479568	Avi_3327	Avi_3328			TRUE	0.905	94.000	0.333	NA	Y	NA
5479568	5479569	Avi_3328	Avi_3330			TRUE	0.998	14.000	0.914	1.000	Y	NA
5479571	5479572	Avi_3332	Avi_3334	lrp		FALSE	0.139	106.000	0.000	NA		NA
5479572	5479573	Avi_3334	Avi_3335			TRUE	0.995	-3.000	0.351	NA		NA
5479574	5479575	Avi_3336	Avi_3337	tctE	tctD	TRUE	0.969	16.000	0.037	1.000	Y	NA
5479575	5479576	Avi_3337	Avi_3339	tctD		FALSE	0.174	100.000	0.000	1.000		NA
5479576	5479577	Avi_3339	Avi_3340		pucM	TRUE	0.966	4.000	0.133	1.000		NA
5479577	5479578	Avi_3340	Avi_3341	pucM	allA	TRUE	0.998	-3.000	0.571	1.000		NA
5479578	5479579	Avi_3341	Avi_3342	allA		FALSE	0.034	188.000	0.000	1.000	N	NA
5479579	5479580	Avi_3342	Avi_3343			FALSE	0.093	137.000	0.000	NA		NA
5479580	5479581	Avi_3343	Avi_3344		glnA	FALSE	0.007	820.000	0.000	NA		NA
5479585	5479586	Avi_3350	Avi_3352			FALSE	0.071	184.000	0.000	NA		NA
5479588	5479589	Avi_3355	Avi_3356			TRUE	0.473	82.000	0.052	NA		NA
5479589	5479590	Avi_3356	Avi_3358			FALSE	0.062	402.000	0.078	NA		NA
5479593	5479594	Avi_3361	Avi_3362		rhlE	FALSE	0.029	309.000	0.000	NA		NA
5479595	5479596	Avi_3364	Avi_3366			FALSE	0.093	163.000	0.000	1.000		NA
5479596	5479597	Avi_3366	Avi_3369			FALSE	0.005	473.000	0.000	NA	N	NA
5479598	5479599	Avi_3370	Avi_3371			TRUE	0.641	20.000	0.000	NA		NA
5479599	5479600	Avi_3371	Avi_3374		dinP	FALSE	0.008	667.000	0.000	NA		NA
5479601	5479602	Avi_3375	Avi_3376			FALSE	0.234	172.000	0.070	NA		NA
5479603	5479604	Avi_3377	Avi_3378			TRUE	0.961	41.000	0.650	1.000	N	NA
5479605	5479606	Avi_3380	Avi_3381			TRUE	0.746	137.000	0.600	NA		NA
5479606	5479607	Avi_3381	Avi_3382			FALSE	0.245	76.000	0.000	NA		NA
5479607	5479608	Avi_3382	Avi_3383			FALSE	0.311	64.000	0.000	NA		NA
5479608	5479609	Avi_3383	Avi_3385			TRUE	0.988	12.000	0.600	NA		NA
5479609	5479610	Avi_3385	Avi_3386			TRUE	0.987	5.000	0.400	NA		NA
5479610	5479611	Avi_3386	Avi_3387			TRUE	0.996	-3.000	0.400	NA		NA
5479611	5479612	Avi_3387	Avi_3388			TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5479612	5479613	Avi_3388	Avi_3389			FALSE	0.103	128.000	0.000	NA		NA
5479613	5479614	Avi_3389	Avi_4515			FALSE	0.008	661.000	0.000	NA		NA
5479614	5479615	Avi_4515	Avi_3390			TRUE	0.608	25.000	0.000	NA		NA
5479615	5479616	Avi_3390	Avi_3391			TRUE	0.868	2.000	0.000	NA		NA
5479616	5479617	Avi_3391	Avi_3392		vgrG	TRUE	0.704	15.000	0.000	NA		NA
5479619	5479620	Avi_3398	Avi_3401			FALSE	0.075	176.000	0.000	NA		NA
5479620	5479621	Avi_3401	Avi_3402		istB	FALSE	0.014	451.000	0.000	NA		NA
5479621	5479622	Avi_3402	Avi_3403	istB	istA	TRUE	0.998	-10.000	0.182	1.000	Y	NA
5479622	5479623	Avi_3403	Avi_9917	istA		FALSE	0.364	56.000	0.000	NA		NA
5479624	5479625	Avi_3404	Avi_3406			FALSE	0.009	615.000	0.000	NA		NA
5479626	5479627	Avi_3407	Avi_3408			TRUE	0.856	46.000	0.000	NA	Y	NA
5479627	5479628	Avi_3408	Avi_3409			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479629	5479630	Avi_3410	Avi_3411			FALSE	0.012	555.000	0.000	1.000		NA
5479630	5479631	Avi_3411	Avi_3412			TRUE	0.581	12.000	0.000	1.000	N	NA
5479631	5479632	Avi_3412	Avi_3414			TRUE	0.994	8.000	0.714	1.000		NA
5479633	5479634	Avi_3415	Avi_3416			FALSE	0.240	77.000	0.000	NA		NA
5479634	5479635	Avi_3416	Avi_3418			TRUE	0.994	-3.000	0.300	NA		NA
5479635	5479636	Avi_3418	Avi_3419			FALSE	0.009	628.000	0.000	NA		NA
5479636	5479637	Avi_3419	Avi_3420			FALSE	0.011	542.000	0.000	NA		NA
5479637	5479638	Avi_3420	Avi_3421			TRUE	0.998	-13.000	0.444	NA		NA
5479640	5479641	Avi_3428	Avi_4582			FALSE	0.088	142.000	0.000	NA		NA
5479643	5479644	Avi_3431	Avi_3432		qor	FALSE	0.182	91.000	0.000	NA		NA
5479646	5479647	Avi_3435	Avi_3436			TRUE	0.972	15.000	0.365	NA		NA
5479647	5479648	Avi_3436	Avi_3437			TRUE	0.999	-18.000	0.805	NA		NA
5479650	5479651	Avi_3440	Avi_3442			FALSE	0.042	256.000	0.000	NA		NA
5479652	5479653	Avi_3443	Avi_3444			FALSE	0.018	395.000	0.000	NA		NA
5479653	5479654	Avi_3444	Avi_3445			TRUE	0.920	5.000	0.026	NA		NA
5479656	5479657	Avi_3448	Avi_3449			TRUE	0.947	18.000	0.301	1.000	N	NA
5479657	5479658	Avi_3449	Avi_3451			FALSE	0.003	961.000	0.000	1.000	N	NA
5479658	5479659	Avi_3451	Avi_3452			FALSE	0.106	125.000	0.000	NA		NA
5479661	5479662	Avi_3455	Avi_3456	amaB		FALSE	0.315	69.000	0.000	1.000		NA
5479662	5479663	Avi_3456	Avi_3457		dht	FALSE	0.064	220.000	0.000	1.000		NA
5479663	5479664	Avi_3457	Avi_3458	dht		FALSE	0.046	541.000	0.149	1.000	N	NA
5479664	5479665	Avi_3458	Avi_3459			TRUE	1.000	-10.000	0.661	1.000	Y	NA
5479665	5479666	Avi_3459	Avi_3460			TRUE	1.000	-3.000	0.855	0.091	Y	NA
5479666	5479667	Avi_3460	Avi_3461			TRUE	0.990	33.000	0.539	NA	Y	NA
5479667	5479668	Avi_3461	Avi_3463			FALSE	0.003	648.000	0.000	NA	N	NA
5479668	5479669	Avi_3463	Avi_3464			TRUE	0.907	13.000	0.130	NA	N	NA
5479669	5479670	Avi_3464	Avi_3466			FALSE	0.008	351.000	0.000	NA	N	NA
5479671	5479672	Avi_3467	Avi_3468		ureG	TRUE	0.937	2.000	0.010	1.000		NA
5479672	5479673	Avi_3468	Avi_3469	ureG	ureF	TRUE	0.976	55.000	0.283	0.002	Y	NA
5479673	5479674	Avi_3469	Avi_3470	ureF	ureE	TRUE	0.997	7.000	0.330	0.002	Y	NA
5479674	5479675	Avi_3470	Avi_3471	ureE		FALSE	0.076	102.000	0.000	1.000	N	NA
5479675	5479676	Avi_3471	Avi_3473			FALSE	0.007	429.000	0.000	1.000	N	NA
5479678	5479679	Avi_3476	Avi_3477		ureC	FALSE	0.104	127.000	0.000	NA		NA
5479679	5479680	Avi_3477	Avi_3478	ureC		TRUE	0.938	3.000	0.029	NA		NA
5479680	5479681	Avi_3478	Avi_3481			TRUE	0.917	16.000	0.125	NA		NA
5479681	5479682	Avi_3481	Avi_3482		ureB	TRUE	0.978	-3.000	0.048	NA		NA
5479682	5479683	Avi_3482	Avi_3484	ureB		FALSE	0.380	95.000	0.043	NA		NA
5479683	5479684	Avi_3484	Avi_3485		ureA	TRUE	0.935	5.000	0.049	NA		NA
5479684	5479685	Avi_3485	Avi_3486	ureA	ureD	TRUE	0.987	24.000	0.664	0.002	N	NA
5479685	5479686	Avi_3486	Avi_3487	ureD		TRUE	0.686	5.000	0.000	1.000	N	NA
5479686	5479687	Avi_3487	Avi_3488			FALSE	0.425	151.000	0.000	NA	Y	NA
5479687	5479688	Avi_3488	Avi_3489			FALSE	0.024	202.000	0.000	NA	N	NA
5479688	5479689	Avi_3489	Avi_3490			TRUE	0.995	12.000	0.731	0.037		NA
5479689	5479690	Avi_3490	Avi_3491			TRUE	0.997	4.000	0.823	1.000		NA
5479690	5479691	Avi_3491	Avi_3492			TRUE	1.000	-3.000	0.758	0.090	Y	NA
5479691	5479692	Avi_3492	Avi_3494			TRUE	0.963	87.000	0.654	NA	Y	NA
5479693	5479694	Avi_3495	Avi_3496			TRUE	0.995	-22.000	0.294	NA	N	NA
5479696	5479697	Avi_3498	Avi_3499			FALSE	0.397	271.000	0.310	0.016	N	NA
5479697	5479698	Avi_3499	Avi_3501			FALSE	0.008	698.000	0.000	NA		NA
5479699	5479700	Avi_3502	Avi_3503		pemK	FALSE	0.008	671.000	0.000	NA		NA
5479700	5479701	Avi_3503	Avi_3504	pemK	pemI	TRUE	0.995	20.000	0.667	NA	Y	NA
5479701	5479702	Avi_3504	Avi_3505	pemI		FALSE	0.175	94.000	0.000	NA		NA
5479702	5479703	Avi_3505	Avi_3506		minE	FALSE	0.006	958.000	0.000	NA		NA
5479703	5479704	Avi_3506	Avi_3507	minE	minD	TRUE	0.999	-3.000	0.618	NA	Y	NA
5479704	5479705	Avi_3507	Avi_3508	minD	minC	TRUE	0.883	133.000	0.466	1.000	Y	NA
5479705	5479706	Avi_3508	Avi_3510	minC		FALSE	0.026	229.000	0.000	1.000	N	NA
5479706	5479707	Avi_3510	Avi_3511			FALSE	0.279	134.000	0.069	NA		NA
5479707	5479708	Avi_3511	Avi_3512			TRUE	0.925	55.000	0.475	NA		NA
5479708	5479709	Avi_3512	Avi_3513			TRUE	1.000	-3.000	0.881	0.037	Y	NA
5479709	5479710	Avi_3513	Avi_3514			TRUE	0.999	-3.000	0.386	1.000	Y	NA
5479710	5479711	Avi_3514	Avi_3515		livH	TRUE	0.997	5.000	0.406	0.090	Y	NA
5479711	5479712	Avi_3515	Avi_3517	livH		FALSE	0.020	263.000	0.000	1.000	N	NA
5479713	5479714	Avi_3518	Avi_3519			FALSE	0.006	479.000	0.000	1.000	N	NA
5479714	5479715	Avi_3519	Avi_3520		pssB	TRUE	0.745	74.000	0.000	1.000	Y	NA
5479715	5479716	Avi_3520	Avi_3522	pssB		FALSE	0.042	257.000	0.000	NA		NA
5479716	5479717	Avi_3522	Avi_3523			FALSE	0.034	289.000	0.000	NA		NA
5479717	5479718	Avi_3523	Avi_3524			FALSE	0.011	552.000	0.000	NA		NA
5479721	5479722	Avi_3528	Avi_3529	petR		FALSE	0.104	287.000	0.055	NA		NA
5479723	5479724	Avi_3530	Avi_3531			FALSE	0.242	164.000	0.068	NA		NA
5479724	5479725	Avi_3531	Avi_3532			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479726	5479727	Avi_3534	Avi_3535			TRUE	0.905	13.000	0.064	NA		NA
5479728	5479729	Avi_3536	Avi_3537	rluD		FALSE	0.336	37.000	0.000	1.000	N	NA
5479729	5479730	Avi_3537	Avi_3538		rpoH	FALSE	0.044	143.000	0.000	1.000	N	NA
5479730	5479731	Avi_3538	Avi_3539	rpoH		FALSE	0.041	259.000	0.000	NA		NA
5479734	5479735	Avi_3542	Avi_3544		purA	TRUE	0.489	60.000	0.002	NA		NA
5479740	5479741	Avi_3549	Avi_3551			TRUE	0.896	201.000	0.702	NA	Y	NA
5479741	5479742	Avi_3551	Avi_3552			TRUE	1.000	-3.000	0.769	1.000	Y	NA
5479742	5479743	Avi_3552	Avi_3553			TRUE	0.993	-3.000	0.333	1.000	N	NA
5479743	5479744	Avi_3553	Avi_3554			TRUE	0.963	4.000	0.174	1.000	N	NA
5479744	5479745	Avi_3554	Avi_3555			TRUE	0.441	225.000	0.217	0.038		NA
5479746	5479747	Avi_3556	Avi_3557			FALSE	0.155	100.000	0.000	NA		NA
5479747	5479748	Avi_3557	Avi_3558			FALSE	0.046	247.000	0.000	NA		NA
5479748	5479749	Avi_3558	Avi_3559			TRUE	0.834	-3.000	0.000	NA	N	NA
5479749	5479750	Avi_3559	Avi_3560		ung	FALSE	0.029	211.000	0.000	1.000	N	NA
5479750	5479751	Avi_3560	Avi_3561	ung		FALSE	0.415	26.000	0.000	1.000	N	NA
5479753	5479754	Avi_3564	Avi_3565			TRUE	0.607	69.000	0.080	NA		NA
5479754	5479755	Avi_3565	Avi_3566			TRUE	0.952	31.000	0.389	NA		NA
5479756	5479757	Avi_3567	Avi_3568			TRUE	0.660	296.000	0.306	0.090	Y	NA
5479757	5479758	Avi_3568	Avi_3569			TRUE	0.999	4.000	0.918	0.090	Y	NA
5479758	5479759	Avi_3569	Avi_3570			TRUE	0.995	13.000	0.373	0.090	Y	NA
5479759	5479760	Avi_3570	Avi_3571			TRUE	0.993	-3.000	0.309	1.000	N	NA
5479760	5479761	Avi_3571	Avi_3572		mtlK	FALSE	0.256	307.000	0.235	0.058	N	NA
5479761	5479762	Avi_3572	Avi_3573	mtlK		TRUE	0.983	12.000	0.308	0.058		NA
5479762	5479763	Avi_3573	Avi_3574			TRUE	0.976	26.000	0.562	1.000		NA
5479763	5479764	Avi_3574	Avi_3576		trmU	FALSE	0.029	212.000	0.000	1.000	N	NA
5479764	5479765	Avi_3576	Avi_4573	trmU		FALSE	0.083	159.000	0.000	NA		NA
5479765	5479766	Avi_4573	Avi_3577		fhuA	FALSE	0.032	296.000	0.000	NA		NA
5479767	5479768	Avi_3578	Avi_3579		fhuB	FALSE	0.291	73.000	0.000	1.000		NA
5479768	5479769	Avi_3579	Avi_3580	fhuB	fhuD	TRUE	0.998	-3.000	0.304	1.000	Y	NA
5479769	5479770	Avi_3580	Avi_3581	fhuD	fhuC	TRUE	0.896	56.000	0.047	1.000	Y	NA
5479771	5479772	Avi_3583	Avi_3585			FALSE	0.018	279.000	0.000	1.000	N	NA
5479775	5479776	Avi_3590	Avi_3592			FALSE	0.017	442.000	0.000	1.000		NA
5479776	5479777	Avi_3592	Avi_3593			TRUE	0.998	-10.000	0.041	0.045	Y	NA
5479777	5479778	Avi_3593	Avi_3595		serA	FALSE	0.030	208.000	0.000	1.000	N	NA
5479778	5479779	Avi_3595	Avi_3596	serA	serC	TRUE	0.854	85.000	0.140	1.000	Y	NA
5479781	5479782	Avi_3600	Avi_3602			FALSE	0.016	248.000	0.000	NA	N	NA
5479782	5479783	Avi_3602	Avi_3603			FALSE	0.034	138.000	0.000	NA	N	NA
5479784	5479785	Avi_3604	Avi_3605	ruvC	ruvA	TRUE	0.994	26.000	0.451	0.008	Y	NA
5479785	5479786	Avi_3605	Avi_3606	ruvA		FALSE	0.175	55.000	0.000	NA	N	NA
5479786	5479787	Avi_3606	Avi_3609		ruvB	FALSE	0.008	346.000	0.000	NA	N	NA
5479787	5479788	Avi_3609	Avi_3610	ruvB		TRUE	0.972	-3.000	0.016	1.000		NA
5479788	5479789	Avi_3610	Avi_3611		mutT	TRUE	0.986	11.000	0.333	0.013		NA
5479789	5479790	Avi_3611	Avi_3612	mutT	mutT	TRUE	0.995	-3.000	0.000	0.013	Y	NA
5479790	5479791	Avi_3612	Avi_3614	mutT		TRUE	0.959	-10.000	0.000	NA		NA
5479791	5479792	Avi_3614	Avi_3616		ybgC	TRUE	0.745	12.000	0.000	NA		NA
5479792	5479793	Avi_3616	Avi_3618	ybgC	tolQ	FALSE	0.291	452.000	0.593	1.000		NA
5479793	5479794	Avi_3618	Avi_3619	tolQ	tolR	TRUE	0.954	50.000	0.220	1.000	Y	NA
5479794	5479795	Avi_3619	Avi_3620	tolR	tolA	TRUE	0.924	10.000	0.061	NA		NA
5479795	5479796	Avi_3620	Avi_3621	tolA	tolB	TRUE	0.615	53.000	0.027	NA		NA
5479796	5479797	Avi_3621	Avi_3622	tolB	pal	TRUE	0.556	232.000	0.592	1.000	N	NA
5479797	5479798	Avi_3622	Avi_3624	pal	ygbF	FALSE	0.313	217.000	0.199	1.000		NA
5479798	5479799	Avi_3624	Avi_3626	ygbF		TRUE	0.971	0.000	0.085	1.000		NA
5479799	5479800	Avi_3626	Avi_3627		ftsH	TRUE	0.963	7.000	0.145	0.095	N	NA
5479800	5479801	Avi_3627	Avi_3629	ftsH	glmM	FALSE	0.054	269.000	0.012	1.000	N	NA
5479804	5479805	Avi_3633	Avi_3634			FALSE	0.091	139.000	0.000	NA		NA
5479805	5479806	Avi_3634	Avi_3635			FALSE	0.007	828.000	0.000	NA		NA
5479806	5479807	Avi_3635	Avi_3636			FALSE	0.046	247.000	0.000	NA		NA
5479807	5479808	Avi_3636	Avi_3637		gapA	FALSE	0.007	730.000	0.000	NA		NA
5479808	5479809	Avi_3637	Avi_3638	gapA	tktA	TRUE	0.515	199.000	0.049	1.000	Y	NA
5479810	5479811	Avi_3640	Avi_3642			TRUE	0.795	37.000	0.068	NA		NA
5479811	5479812	Avi_3642	Avi_4514			FALSE	0.305	65.000	0.000	NA		NA
5479812	5479813	Avi_4514	Avi_3644			FALSE	0.107	124.000	0.000	NA		NA
5479815	5479816	Avi_3649	Avi_3650			TRUE	0.905	14.000	0.077	NA		NA
5479816	5479817	Avi_3650	Avi_3651		pgk	FALSE	0.114	120.000	0.000	NA		NA
5479817	5479818	Avi_3651	Avi_3652	pgk		TRUE	0.655	185.000	0.032	0.003	Y	NA
5479818	5479819	Avi_3652	Avi_3653			FALSE	0.082	161.000	0.000	NA		NA
5479819	5479820	Avi_3653	Avi_3655			TRUE	0.567	30.000	0.000	NA		NA
5479820	5479821	Avi_3655	Avi_3656			FALSE	0.062	205.000	0.000	NA		NA
5479823	5479824	Avi_3661	Avi_3662			TRUE	0.980	4.000	0.250	NA		NA
5479824	5479825	Avi_3662	Avi_3663			FALSE	0.083	409.000	0.141	NA		NA
5479828	5479829	Avi_3668	Avi_3670		motB	FALSE	0.054	343.000	0.016	1.000		NA
5479829	5479830	Avi_3670	Avi_3671	motB		TRUE	0.989	4.000	0.432	NA		NA
5479830	5479831	Avi_3671	Avi_3672		suhB	FALSE	0.141	185.000	0.014	NA		NA
5479831	5479832	Avi_3672	Avi_3674	suhB	enhC	FALSE	0.206	144.000	0.026	1.000		NA
5479832	5479833	Avi_3674	Avi_3675	enhC	thiE	TRUE	0.990	-3.000	0.181	1.000		NA
5479834	5479835	Avi_3677	Avi_3678			FALSE	0.215	183.000	0.056	1.000		NA
5479837	5479838	Avi_3681	Avi_3683		purE	TRUE	0.861	17.000	0.044	NA		NA
5479838	5479839	Avi_3683	Avi_3684	purE	purK	TRUE	0.987	28.000	0.201	0.000	Y	NA
5479839	5479840	Avi_3684	Avi_3686	purK	rpmJ	FALSE	0.223	163.000	0.045	1.000		NA
5479840	5479841	Avi_3686	Avi_3687	rpmJ		FALSE	0.348	109.000	0.055	1.000		NA
5479841	5479842	Avi_3687	Avi_3689			FALSE	0.198	262.000	0.143	1.000		NA
5479843	5479844	Avi_3690	Avi_3691	pykA		TRUE	0.997	-3.000	0.487	NA		NA
5479845	5479846	Avi_3692	Avi_3693			TRUE	0.993	-3.000	0.254	NA		NA
5479846	5479847	Avi_3693	Avi_3695			FALSE	0.143	228.000	0.045	NA		NA
5479848	5479849	Avi_3697	Avi_3698			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479849	5479850	Avi_3698	Avi_3699			FALSE	0.014	450.000	0.000	NA		NA
5479851	5479852	Avi_3702	Avi_3703	pepF	pabB	TRUE	0.960	20.000	0.027	1.000	Y	NA
5479852	5479853	Avi_3703	Avi_3704	pabB		TRUE	0.999	-15.000	0.219	1.000	Y	NA
5479853	5479854	Avi_3704	Avi_3705			FALSE	0.051	234.000	0.000	NA		NA
5479854	5479855	Avi_3705	Avi_3707			FALSE	0.036	281.000	0.000	NA		NA
5479855	5479856	Avi_3707	Avi_3710			FALSE	0.271	338.000	0.385	NA		NA
5479856	5479857	Avi_3710	Avi_3711			FALSE	0.137	184.000	0.011	NA		NA
5479857	5479858	Avi_3711	Avi_3712		hemH	FALSE	0.193	149.000	0.061	1.000	N	NA
5479861	5479862	Avi_3715	Avi_3716		exsD	FALSE	0.189	89.000	0.000	NA		NA
5479862	5479863	Avi_3716	Avi_3717	exsD	exsC	TRUE	0.993	-21.000	0.195	1.000	N	NA
5479863	5479864	Avi_3717	Avi_3719	exsC	exsB	TRUE	0.938	5.000	0.055	NA		NA
5479865	5479866	Avi_3720	Avi_3721			TRUE	0.994	7.000	0.313	NA	Y	NA
5479870	5479871	Avi_3727	Avi_3728	mltB		TRUE	0.915	46.000	0.346	1.000		NA
5479872	5479873	Avi_3729	Avi_3730		gltD	FALSE	0.010	356.000	0.000	1.000	N	NA
5479873	5479874	Avi_3730	Avi_3732	gltD		FALSE	0.069	189.000	0.000	NA		NA
5479874	5479875	Avi_3732	Avi_3733			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479875	5479876	Avi_3733	Avi_3734		gltB	TRUE	0.608	25.000	0.000	NA		NA
5479879	5479880	Avi_3740	Avi_3741	pldB		FALSE	0.057	217.000	0.000	NA		NA
5479884	5479885	Avi_3746	Avi_4574			FALSE	0.040	265.000	0.000	NA		NA
5479885	5479886	Avi_4574	Avi_3749			FALSE	0.063	204.000	0.000	NA		NA
5479886	5479887	Avi_3749	Avi_3751			FALSE	0.242	272.000	0.000	NA	Y	NA
5479887	5479888	Avi_3751	Avi_3752			FALSE	0.035	284.000	0.000	NA		NA
5479888	5479889	Avi_3752	Avi_3754			TRUE	0.643	237.000	0.667	NA		NA
5479889	5479890	Avi_3754	Avi_3755			TRUE	0.990	15.000	0.734	NA		NA
5479890	5479891	Avi_3755	Avi_3756			FALSE	0.151	179.000	0.058	NA	N	NA
5479891	5479892	Avi_3756	Avi_3757			FALSE	0.178	93.000	0.000	NA		NA
5479892	5479893	Avi_3757	Avi_3758		glgP	FALSE	0.027	317.000	0.000	NA		NA
5479893	5479894	Avi_3758	Avi_3760	glgP	glgB	TRUE	0.995	0.000	0.189	1.000	Y	NA
5479894	5479895	Avi_3760	Avi_3761	glgB	glgC	TRUE	0.948	75.000	0.205	0.001	Y	NA
5479895	5479896	Avi_3761	Avi_3762	glgC	glgA	TRUE	0.989	6.000	0.134	1.000	Y	NA
5479896	5479897	Avi_3762	Avi_3763	glgA	pgm	TRUE	0.981	8.000	0.032	1.000	Y	NA
5479897	5479898	Avi_3763	Avi_3764	pgm	glgX	TRUE	0.971	15.000	0.034	1.000	Y	NA
5479898	5479899	Avi_3764	Avi_3765	glgX	nodN	FALSE	0.054	304.000	0.029	1.000	N	NA
5479899	5479900	Avi_3765	Avi_3766	nodN		TRUE	0.957	2.000	0.059	NA		NA
5479901	5479902	Avi_3768	Avi_3769			TRUE	0.992	10.000	0.283	NA	Y	NA
5479904	5479905	Avi_3772	Avi_3775		rpsU	FALSE	0.012	540.000	0.000	1.000		NA
5479906	5479907	Avi_3774	Avi_3776	soxB	soxD	TRUE	0.992	17.000	0.233	0.001	Y	NA
5479907	5479908	Avi_3776	Avi_3777	soxD	soxA	TRUE	0.999	-3.000	0.867	0.001		NA
5479908	5479909	Avi_3777	Avi_3778	soxA	soxG	TRUE	0.999	-7.000	0.407	0.002		NA
5479912	5479913	Avi_3781	Avi_3782			TRUE	0.995	-13.000	0.231	NA		NA
5479914	5479915	Avi_3784	Avi_3785			TRUE	0.999	-10.000	0.407	NA	Y	NA
5479915	5479916	Avi_3785	Avi_3786			FALSE	0.021	359.000	0.000	NA		NA
5479916	5479917	Avi_3786	Avi_3787			FALSE	0.116	118.000	0.000	NA		NA
5479917	5479918	Avi_3787	Avi_3788			TRUE	0.752	41.000	0.056	NA		NA
5479921	5479922	Avi_3791	Avi_3792		pckR	TRUE	0.962	13.000	0.308	1.000	N	NA
5479922	5479923	Avi_3792	Avi_3793	pckR		TRUE	0.924	108.000	0.368	0.045	Y	NA
5479924	5479925	Avi_3794	Avi_3796			TRUE	0.948	49.000	0.565	NA		NA
5479925	5479926	Avi_3796	Avi_3798			TRUE	0.831	56.000	0.231	NA		NA
5479926	5479927	Avi_3798	Avi_3799			FALSE	0.045	250.000	0.000	NA		NA
5479929	5479930	Avi_3801	Avi_3802			TRUE	0.962	26.000	0.467	1.000	N	NA
5479931	5479932	Avi_3804	Avi_3806		speF	TRUE	0.747	80.000	0.257	1.000		NA
5479933	5479934	Avi_3808	Avi_3809	ptxR		TRUE	0.719	208.000	0.706	NA		NA
5479934	5479935	Avi_3809	Avi_3811			TRUE	0.994	-6.000	0.226	NA		NA
5479936	5479937	Avi_3812	Avi_3813			TRUE	0.980	-3.000	0.058	NA		NA
5479937	5479938	Avi_3813	Avi_3814			FALSE	0.101	292.000	0.055	NA		NA
5479938	5479939	Avi_3814	Avi_3816			FALSE	0.343	101.000	0.042	NA		NA
5479940	5479941	Avi_3819	Avi_3820			TRUE	0.985	-22.000	0.032	NA		NA
5479941	5479942	Avi_3820	Avi_3821			TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5479942	5479943	Avi_3821	Avi_3822			FALSE	0.165	97.000	0.000	NA		NA
5479943	5479944	Avi_3822	Avi_3823			FALSE	0.240	77.000	0.000	NA		NA
5479945	5479946	Avi_3825	Avi_3826			FALSE	0.123	114.000	0.000	NA		NA
5479946	5479947	Avi_3826	Avi_3827		bgl	TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5479949	5479950	Avi_3830	Avi_3831			TRUE	0.975	19.000	0.481	NA		NA
5479950	5479951	Avi_3831	Avi_3832		xylA	TRUE	0.675	99.000	0.007	NA	Y	NA
5479951	5479952	Avi_3832	Avi_3833	xylA	xylB	TRUE	0.951	38.000	0.094	1.000	Y	NA
5479952	5479953	Avi_3833	Avi_3834	xylB		TRUE	0.985	24.000	0.300	1.000	Y	NA
5479953	5479954	Avi_3834	Avi_3836		emrB	TRUE	0.430	241.000	0.048	1.000	Y	NA
5479954	5479955	Avi_3836	Avi_3837	emrB	emrA	TRUE	0.961	37.000	0.586	1.000	N	NA
5479956	5479957	Avi_3838	Avi_3839			FALSE	0.160	139.000	0.033	1.000	N	NA
5479957	5479958	Avi_3839	Avi_3841			FALSE	0.162	137.000	0.000	0.041	N	NA
5479960	5479961	Avi_3844	Avi_3845		ada	TRUE	0.603	82.000	0.142	NA		NA
5479961	5479962	Avi_3845	Avi_3846	ada		FALSE	0.105	126.000	0.000	NA		NA
5479962	5479963	Avi_3846	Avi_3848			FALSE	0.061	209.000	0.000	NA		NA
5479967	5479968	Avi_3854	Avi_3855			FALSE	0.111	122.000	0.000	NA		NA
5479969	5479970	Avi_3856	Avi_3858	lysS	gltX	TRUE	0.741	104.000	0.014	0.094	Y	NA
5479970	5479971	Avi_3858	Avi_3860	gltX		FALSE	0.009	387.000	0.000	1.000	N	NA
5479971	5479972	Avi_3860	Avi_3861			FALSE	0.076	195.000	0.000	1.000		NA
5479972	5479973	Avi_3861	Avi_3862			TRUE	0.943	-3.000	0.000	1.000		NA
5479973	5479974	Avi_3862	Avi_3863			TRUE	1.000	-28.000	1.000	0.041	Y	NA
5479976	5479977	Avi_3865	Avi_3866			TRUE	0.979	-3.000	0.000	0.010		NA
5479977	5479978	Avi_3866	Avi_3867			FALSE	0.072	182.000	0.000	NA		NA
5479978	5479979	Avi_3867	Avi_3869			FALSE	0.091	139.000	0.000	NA		NA
5479979	5479980	Avi_3869	Avi_3870			FALSE	0.081	164.000	0.000	NA		NA
5479980	5479981	Avi_3870	Avi_3871			FALSE	0.129	111.000	0.000	NA		NA
5479981	5479982	Avi_3871	Avi_3872			TRUE	0.766	80.000	0.286	1.000		NA
5479983	5479984	Avi_3874	Avi_3875			FALSE	0.215	349.000	0.000	0.088	Y	NA
5479984	5479985	Avi_3875	Avi_3876			TRUE	0.705	127.000	0.042	0.088	Y	NA
5479985	5479986	Avi_3876	Avi_3878			TRUE	1.000	-7.000	0.725	0.088	Y	NA
5479987	5479988	Avi_3879	Avi_3880			TRUE	0.536	75.000	0.000	0.005		NA
5479988	5479989	Avi_3880	Avi_3881			TRUE	0.952	12.000	0.179	1.000		NA
5479990	5479991	Avi_3882	Avi_3883		phnM	FALSE	0.048	113.000	0.000	NA	N	NA
5479992	5479993	Avi_3884	Avi_3885	dfpD		TRUE	1.000	-3.000	0.875	0.036	Y	NA
5479993	5479994	Avi_3885	Avi_3886			TRUE	0.999	-3.000	0.714	1.000	Y	NA
5479994	5479995	Avi_3886	Avi_3887			TRUE	0.997	18.000	0.667	0.088	Y	NA
5479995	5479996	Avi_3887	Avi_3888			TRUE	0.997	16.000	0.667	0.088	Y	NA
5479996	5479997	Avi_3888	Avi_3889			TRUE	0.992	49.000	0.833	1.000	Y	NA
5479997	5479998	Avi_3889	Avi_3890		kdgK	FALSE	0.023	245.000	0.000	1.000	N	NA
5479998	5479999	Avi_3890	Avi_3891	kdgK		TRUE	0.512	16.000	0.000	1.000	N	NA
5480000	5480001	Avi_3892	Avi_3893		kdgF	FALSE	0.129	388.000	0.000	NA	Y	NA
5480001	5480002	Avi_3893	Avi_3894	kdgF		TRUE	0.965	20.000	0.059	NA	Y	NA
5480002	5480003	Avi_3894	Avi_3895		kduD	TRUE	0.997	-3.000	0.529	1.000	N	NA
5480003	5480004	Avi_3895	Avi_3896	kduD	uxuB	TRUE	0.997	-22.000	0.318	0.057	N	NA
5480004	5480005	Avi_3896	Avi_3897	uxuB	uxuA	TRUE	0.997	-3.000	0.182	1.000	Y	NA
5480005	5480006	Avi_3897	Avi_3898	uxuA	uxaA	TRUE	0.998	-7.000	0.111	1.000	Y	NA
5480007	5480008	Avi_3899	Avi_3900	pntB	pntA	TRUE	0.998	17.000	0.745	0.001	Y	NA
5480008	5480009	Avi_3900	Avi_3902	pntA	gbpR	FALSE	0.015	299.000	0.000	1.000	N	NA
5480010	5480011	Avi_3903	Avi_3905	chvE	gguA	TRUE	0.874	147.000	0.500	NA	Y	NA
5480011	5480012	Avi_3905	Avi_3906	gguA	gguB	TRUE	0.999	0.000	0.680	1.000	Y	NA
5480012	5480013	Avi_3906	Avi_3907	gguB	gguC	TRUE	0.473	178.000	0.286	1.000		NA
5480013	5480014	Avi_3907	Avi_3909	gguC	ilvD	TRUE	0.444	131.000	0.082	0.057		NA
5480014	5480015	Avi_3909	Avi_3910	ilvD		TRUE	0.710	74.000	0.186	1.000		NA
5480015	5480016	Avi_3910	Avi_3912			FALSE	0.224	170.000	0.051	1.000		NA
5480016	5480017	Avi_3912	Avi_3914		dgoK	FALSE	0.074	103.000	0.000	1.000	N	NA
5480017	5480018	Avi_3914	Avi_3915	dgoK		TRUE	0.985	16.000	0.205	1.000	Y	NA
5480018	5480019	Avi_3915	Avi_3917			FALSE	0.098	132.000	0.000	NA		NA
5480021	5480022	Avi_3919	Avi_3920			TRUE	0.990	-3.000	0.250	NA	N	NA
5480022	5480023	Avi_3920	Avi_3921			FALSE	0.044	253.000	0.000	NA		NA
5480023	5480024	Avi_3921	Avi_3922		pbpC	TRUE	0.997	-3.000	0.473	1.000		NA
5480024	5480025	Avi_3922	Avi_3923	pbpC	mclA	FALSE	0.014	312.000	0.000	1.000	N	NA
5480025	5480026	Avi_3923	Avi_3924	mclA	lspL	FALSE	0.041	160.000	0.000	1.000	N	NA
5480027	5480028	Avi_3925	Avi_3926	redA	redB	TRUE	0.648	113.000	0.318	1.000		NA
5480028	5480029	Avi_3926	Avi_3927	redB		TRUE	0.993	5.000	0.614	1.000		NA
5480029	5480030	Avi_3927	Avi_3928			TRUE	0.500	106.000	0.158	1.000		NA
5480030	5480031	Avi_3928	Avi_3929			TRUE	0.999	-3.000	0.929	0.088		NA
5480031	5480032	Avi_3929	Avi_3931			TRUE	1.000	-3.000	0.821	0.088	Y	NA
5480032	5480033	Avi_3931	Avi_3932			TRUE	0.978	39.000	0.741	1.000		NA
5480035	5480036	Avi_3934	Avi_3935			TRUE	0.991	-7.000	0.111	1.000		NA
5480037	5480038	Avi_3939	Avi_3940			TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5480039	5480040	Avi_3942	Avi_3943			TRUE	0.677	40.000	0.047	1.000	N	NA
5480041	5480042	Avi_3945	Avi_3946		sbcC	TRUE	0.999	-3.000	0.669	NA	Y	NA
5480043	5480044	Avi_3947	Avi_4581			FALSE	0.011	544.000	0.000	NA		NA
5480044	5480045	Avi_4581	Avi_4506			FALSE	0.116	118.000	0.000	NA		NA
5480045	5480046	Avi_4506	Avi_4505			FALSE	0.009	600.000	0.000	NA		NA
5480046	5480047	Avi_4505	Avi_4580			FALSE	0.006	985.000	0.000	NA		NA
5480047	5480048	Avi_4580	Avi_4579			FALSE	0.206	85.000	0.000	NA		NA
5480048	5480049	Avi_4579	Avi_4504			FALSE	0.018	392.000	0.000	NA		NA
5480051	5480052	Avi_3951	Avi_3953	clpB		FALSE	0.048	331.000	0.006	NA		NA
5480052	5480053	Avi_3953	Avi_3954		hemK	FALSE	0.035	427.000	0.021	NA		NA
5480053	5480054	Avi_3954	Avi_3955	hemK	prfA	TRUE	0.999	-3.000	0.229	0.026	Y	NA
5480054	5480055	Avi_3955	Avi_3956	prfA	ptsI	TRUE	0.854	28.000	0.034	0.026	N	NA
5480055	5480056	Avi_3956	Avi_3957	ptsI	lysC	FALSE	0.406	86.000	0.069	1.000	N	NA
5480057	5480058	Avi_3961	Avi_3963	lpiA	acvB	TRUE	0.989	-3.000	0.176	NA		NA
5480061	5480062	Avi_3966	Avi_3967			TRUE	0.940	3.000	0.031	NA		NA
5480062	5480063	Avi_3967	Avi_3968			TRUE	0.984	-3.000	0.097	NA		NA
5480063	5480064	Avi_3968	Avi_3969		grxC	TRUE	0.912	10.000	0.035	1.000		NA
5480064	5480065	Avi_3969	Avi_3970	grxC	comF	TRUE	0.639	52.000	0.027	1.000		NA
5480067	5480068	Avi_3972	Avi_3974	pilA		FALSE	0.356	133.000	0.133	NA		NA
5480068	5480069	Avi_3974	Avi_3976			FALSE	0.027	509.000	0.019	NA		NA
5480069	5480070	Avi_3976	Avi_3977			TRUE	0.984	-3.000	0.082	1.000		NA
5480070	5480071	Avi_3977	Avi_3979		argJ	TRUE	0.953	0.000	0.020	1.000		NA
5480071	5480072	Avi_3979	Avi_3981	argJ	ppiD	FALSE	0.387	89.000	0.070	1.000	N	NA
5480073	5480074	Avi_3982	Avi_3983	secA		FALSE	0.182	149.000	0.014	1.000		NA
5480074	5480075	Avi_3983	Avi_3984			TRUE	0.963	21.000	0.378	NA		NA
5480078	5480079	Avi_3989	Avi_3990		kka	FALSE	0.010	597.000	0.000	NA		NA
5480079	5480080	Avi_3990	Avi_3992	kka		FALSE	0.008	715.000	0.000	NA		NA
5480080	5480081	Avi_3992	Avi_3993			FALSE	0.012	514.000	0.000	NA		NA
5480082	5480083	Avi_3994	Avi_3996			FALSE	0.091	732.000	0.000	0.061	Y	NA
5480085	5480086	Avi_3998	Avi_4000			TRUE	0.961	24.000	0.385	NA		NA
5480087	5480088	Avi_4001	Avi_4002		alkA	FALSE	0.300	99.000	0.050	1.000	N	NA
5480091	5480092	Avi_4006	Avi_4007			TRUE	0.901	37.000	0.231	NA		NA
5480092	5480093	Avi_4007	Avi_4008			FALSE	0.099	131.000	0.000	NA		NA
5480093	5480094	Avi_4008	Avi_4010		etfB	FALSE	0.020	401.000	0.000	1.000		NA
5480094	5480095	Avi_4010	Avi_4012	etfB	etfA	TRUE	0.988	25.000	0.226	0.008	Y	NA
5480099	5480100	Avi_4017	Avi_4018	argH		FALSE	0.295	95.000	0.008	NA		NA
5480100	5480101	Avi_4018	Avi_4020		lysA	TRUE	0.872	11.000	0.013	NA		NA
5480101	5480102	Avi_4020	Avi_4021	lysA		FALSE	0.234	165.000	0.062	NA		NA
5480103	5480104	Avi_4023	Avi_4024		hpt	FALSE	0.045	333.000	0.031	1.000	N	NA
5480104	5480105	Avi_4024	Avi_4026	hpt		TRUE	0.486	69.000	0.021	NA		NA
5480106	5480107	Avi_4027	Avi_4028	ftsE	ftsX	TRUE	0.735	119.000	0.139	NA	Y	NA
5480107	5480108	Avi_4028	Avi_4029	ftsX		TRUE	0.931	44.000	0.417	NA		NA
5480108	5480109	Avi_4029	Avi_4030		plsC	TRUE	0.996	-28.000	0.250	NA		NA
5480112	5480113	Avi_4033	Avi_4034	tyrC	hisC	TRUE	0.995	0.000	0.198	1.000	Y	NA
5480113	5480114	Avi_4034	Avi_4035	hisC		TRUE	0.499	84.000	0.061	1.000		NA
5480115	5480116	Avi_4036	Avi_4037	gloB		TRUE	0.967	0.000	0.071	NA		NA
5480116	5480117	Avi_4037	Avi_4038			FALSE	0.141	105.000	0.000	NA		NA
5480118	5480119	Avi_4039	Avi_4040			TRUE	0.849	26.000	0.076	NA		NA
5480120	5480121	Avi_4041	Avi_4043	rpmB		FALSE	0.161	181.000	0.025	NA		NA
5480122	5480123	Avi_4044	Avi_4045		cobT	TRUE	0.993	-3.000	0.260	NA		NA
5480123	5480124	Avi_4045	Avi_4046	cobT	cobS	TRUE	0.986	18.000	0.433	0.001		NA
5480124	5480125	Avi_4046	Avi_4048	cobS	dnaJ	TRUE	0.466	90.000	0.065	1.000		NA
5480127	5480128	Avi_4051	Avi_4053	aroB	aroK	TRUE	0.997	-3.000	0.147	1.000	Y	NA
5480129	5480130	Avi_4054	Avi_4056		xerD	TRUE	0.714	43.000	0.043	NA		NA
5480130	5480131	Avi_4056	Avi_4057	xerD	accA	FALSE	0.142	205.000	0.058	1.000	N	NA
5480131	5480132	Avi_4057	Avi_4058	accA		FALSE	0.046	353.000	0.015	NA		NA
5480132	5480133	Avi_4058	Avi_4059			TRUE	0.989	-24.000	0.060	NA		NA
5480134	5480135	Avi_4060	Avi_4061		dac	TRUE	0.669	136.000	0.458	NA		NA
5480136	5480137	Avi_4062	Avi_4575			FALSE	0.344	59.000	0.000	NA		NA
5480137	5480138	Avi_4575	Avi_4064			FALSE	0.044	251.000	0.000	NA		NA
5480139	5480140	Avi_4065	Avi_4066	agrR	luxR	TRUE	0.950	136.000	0.667	0.022	Y	NA
5480140	5480141	Avi_4066	Avi_4068	luxR	fliF	FALSE	0.024	239.000	0.000	1.000	N	NA
5480141	5480142	Avi_4068	Avi_4070	fliF		FALSE	0.200	261.000	0.158	NA		NA
5480142	5480143	Avi_4070	Avi_4071		cheD	FALSE	0.177	309.000	0.200	NA		NA
5480143	5480144	Avi_4071	Avi_4072	cheD	cheY	TRUE	0.998	-3.000	0.320	1.000	Y	NA
5480144	5480145	Avi_4072	Avi_4073	cheY	cheB	TRUE	0.998	0.000	0.258	0.015	Y	NA
5480145	5480146	Avi_4073	Avi_4074	cheB	cheR	TRUE	0.999	-3.000	0.439	1.000	Y	NA
5480146	5480147	Avi_4074	Avi_4076	cheR	cheW	TRUE	0.995	-3.000	0.047	1.000	Y	NA
5480147	5480148	Avi_4076	Avi_4077	cheW	cheA	TRUE	0.991	5.000	0.044	0.013	Y	NA
5480148	5480149	Avi_4077	Avi_4079	cheA	cheY	TRUE	0.834	280.000	0.711	1.000	Y	NA
5480149	5480150	Avi_4079	Avi_4080	cheY		TRUE	0.997	-3.000	0.200	NA	Y	NA
5480150	5480151	Avi_4080	Avi_4081			TRUE	0.867	101.000	0.278	NA	Y	NA
5480153	5480154	Avi_4084	Avi_4085		hemA	FALSE	0.127	78.000	0.000	1.000	N	NA
5480155	5480156	Avi_4087	Avi_4088			FALSE	0.078	268.000	0.010	NA		NA
5480156	5480157	Avi_4088	Avi_4089			TRUE	0.861	44.000	0.212	NA		NA
5480157	5480158	Avi_4089	Avi_4091		mcpA	FALSE	0.009	620.000	0.000	NA		NA
5480158	5480159	Avi_4091	Avi_4092	mcpA	cheW	TRUE	0.670	114.000	0.000	0.014	Y	NA
5480160	5480161	Avi_4093	Avi_4095		fdsD	FALSE	0.111	281.000	0.057	NA		NA
5480161	5480162	Avi_4095	Avi_4096	fdsD	fdhD	TRUE	0.999	-10.000	0.458	0.001		NA
5480162	5480163	Avi_4096	Avi_4097	fdhD	fdhA	TRUE	0.918	44.000	0.180	0.001		NA
5480163	5480164	Avi_4097	Avi_4098	fdhA	nuoF	TRUE	0.989	6.000	0.466	1.000		NA
5480164	5480165	Avi_4098	Avi_4099	nuoF	nuoE	TRUE	0.999	9.000	0.870	0.006	Y	NA
5480165	5480166	Avi_4099	Avi_4101	nuoE		TRUE	0.606	93.000	0.243	1.000	N	NA
5480166	5480167	Avi_4101	Avi_4102			TRUE	0.915	78.000	0.146	0.061	Y	NA
5480167	5480168	Avi_4102	Avi_4103		mdh	FALSE	0.038	173.000	0.000	1.000	N	NA
5480168	5480169	Avi_4103	Avi_4104	mdh	atpC	FALSE	0.055	823.000	0.000	1.000	Y	NA
5480169	5480170	Avi_4104	Avi_4106	atpC	atpD	TRUE	0.992	69.000	0.837	0.002	Y	NA
5480170	5480171	Avi_4106	Avi_4107	atpD	atpG	TRUE	0.997	25.000	0.724	0.002	Y	NA
5480171	5480172	Avi_4107	Avi_4108	atpG	atpA	TRUE	0.998	31.000	0.846	0.002	Y	NA
5480172	5480173	Avi_4108	Avi_4110	atpA	atpH	TRUE	1.000	0.000	0.864	0.002	Y	NA
5480173	5480174	Avi_4110	Avi_4111	atpH		FALSE	0.044	252.000	0.000	NA		NA
5480174	5480175	Avi_4111	Avi_4112		priA	FALSE	0.135	193.000	0.014	NA		NA
5480175	5480176	Avi_4112	Avi_4113	priA		FALSE	0.080	100.000	0.000	1.000	N	NA
5480177	5480178	Avi_4114	Avi_4115	xerC		FALSE	0.352	95.000	0.030	NA		NA
5480179	5480180	Avi_4116	Avi_4118	lpdA	rhtB	FALSE	0.189	110.000	0.018	1.000	N	NA
5480180	5480181	Avi_4118	Avi_4119	rhtB		TRUE	0.828	34.000	0.091	NA		NA
5480181	5480182	Avi_4119	Avi_4121		sucB	FALSE	0.252	108.000	0.014	NA		NA
5480182	5480183	Avi_4121	Avi_4122	sucB	sucA	TRUE	0.984	58.000	0.667	1.000	Y	NA
5480183	5480184	Avi_4122	Avi_4124	sucA	sucD	TRUE	0.607	173.000	0.092	1.000	Y	NA
5480184	5480185	Avi_4124	Avi_4126	sucD		TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5480185	5480186	Avi_4126	Avi_4127		sucC	TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5480186	5480187	Avi_4127	Avi_4129	sucC	mdh	TRUE	0.710	124.000	0.113	1.000	Y	NA
5480187	5480188	Avi_4129	Avi_4130	mdh		FALSE	0.173	180.000	0.032	NA		NA
5480188	5480189	Avi_4130	Avi_4132			TRUE	0.855	84.000	0.500	NA		NA
5480189	5480190	Avi_4132	Avi_4134		sdhB	FALSE	0.021	391.000	0.000	1.000		NA
5480190	5480191	Avi_4134	Avi_4135	sdhB	sdhA	TRUE	0.997	16.000	0.604	0.001	Y	NA
5480191	5480192	Avi_4135	Avi_4136	sdhA	sdhD	TRUE	0.999	7.000	0.705	0.001	Y	NA
5480192	5480193	Avi_4136	Avi_4137	sdhD	sdhC	TRUE	0.995	13.000	0.291	0.000	Y	NA
5480195	5480196	Avi_4139	Avi_4141			TRUE	0.974	-3.000	0.031	NA		NA
5480196	5480197	Avi_4141	Avi_4142			TRUE	0.954	6.000	0.122	NA		NA
5480197	5480198	Avi_4142	Avi_4143		gpsA	TRUE	0.973	19.000	0.456	NA		NA
5480198	5480199	Avi_4143	Avi_4144	gpsA	gcp	TRUE	0.975	-3.000	0.070	1.000	N	NA
5480200	5480201	Avi_4145	Avi_4146	hemC		TRUE	0.993	5.000	0.056	0.001	Y	NA
5480201	5480202	Avi_4146	Avi_4147			TRUE	0.672	95.000	0.263	NA		NA
5480202	5480203	Avi_4147	Avi_4148			TRUE	0.986	6.000	0.408	NA		NA
5480203	5480204	Avi_4148	Avi_4149			TRUE	0.941	10.000	0.108	NA		NA
5480204	5480205	Avi_4149	Avi_4150		guaA	TRUE	0.998	-7.000	0.452	NA		NA
5480207	5480208	Avi_4152	Avi_4153			TRUE	0.991	-3.000	0.220	NA		NA
5480209	5480210	Avi_4154	Avi_4155	ppa		FALSE	0.256	135.000	0.048	1.000		NA
5480210	5480211	Avi_4155	Avi_4156		typA	FALSE	0.089	248.000	0.002	1.000		NA
5480211	5480212	Avi_4156	Avi_4157	typA		FALSE	0.114	124.000	0.003	NA	N	NA
5480212	5480213	Avi_4157	Avi_4158		dcp	FALSE	0.038	130.000	0.000	NA	N	NA
5480216	5480217	Avi_4162	Avi_4163			FALSE	0.092	138.000	0.000	NA		NA
5480217	5480218	Avi_4163	Avi_4164		rhtB	FALSE	0.220	82.000	0.000	NA		NA
5480219	5480220	Avi_4167	Avi_4168			TRUE	0.704	15.000	0.000	NA		NA
5480220	5480221	Avi_4168	Avi_4170			FALSE	0.086	245.000	0.006	NA		NA
5480221	5480222	Avi_4170	Avi_4172			FALSE	0.036	282.000	0.000	NA		NA
5480222	5480223	Avi_4172	Avi_4174			TRUE	0.634	68.000	0.094	NA		NA
5480223	5480224	Avi_4174	Avi_4176			FALSE	0.146	116.000	0.005	1.000	N	NA
5480224	5480225	Avi_4176	Avi_4178			TRUE	0.543	67.000	0.077	1.000	N	NA
5480226	5480227	Avi_4180	Avi_4181			TRUE	0.999	-3.000	0.626	NA	Y	NA
5480227	5480228	Avi_4181	Avi_4182			FALSE	0.246	189.000	0.101	NA		NA
5480228	5480229	Avi_4182	Avi_4184			TRUE	0.773	55.000	0.149	NA		NA
5480230	5480231	Avi_4185	Avi_4186			FALSE	0.025	331.000	0.000	NA		NA
5480231	5480232	Avi_4186	Avi_4187		acnA	FALSE	0.046	405.000	0.038	NA		NA
5480233	5480234	Avi_4188	Avi_4189	ccmA	ccmB	TRUE	1.000	-3.000	0.503	0.001	Y	NA
5480234	5480235	Avi_4189	Avi_4191	ccmB	ccmC	TRUE	0.983	69.000	0.501	0.001	Y	NA
5480235	5480236	Avi_4191	Avi_4192	ccmC		TRUE	0.997	-3.000	0.501	1.000		NA
5480236	5480237	Avi_4192	Avi_4193		ccmG	TRUE	0.981	0.000	0.172	1.000		NA
5480238	5480239	Avi_4194	Avi_4195		ispZ	TRUE	0.976	-3.000	0.037	NA		NA
5480239	5480240	Avi_4195	Avi_4196	ispZ	fstY	TRUE	0.439	74.000	0.050	1.000	N	NA
5480240	5480241	Avi_4196	Avi_4197	fstY		TRUE	0.777	23.000	0.042	1.000	N	NA
5480241	5480242	Avi_4197	Avi_4198		dapF	TRUE	0.980	-3.000	0.109	1.000	N	NA
5480242	5480243	Avi_4198	Avi_4200	dapF		FALSE	0.417	72.000	0.006	NA		NA
5480243	5480244	Avi_4200	Avi_4202			FALSE	0.331	61.000	0.000	NA		NA
5480245	5480246	Avi_4203	Avi_4204	ffh	tyrA	TRUE	0.817	13.000	0.023	1.000	N	NA
5480246	5480247	Avi_4204	Avi_4205	tyrA	rpsP	TRUE	0.500	65.000	0.050	1.000	N	NA
5480247	5480248	Avi_4205	Avi_4207	rpsP	rimM	TRUE	0.990	32.000	0.342	0.008	Y	NA
5480248	5480249	Avi_4207	Avi_4208	rimM	trmD	TRUE	1.000	-28.000	0.672	1.000	Y	NA
5480251	5480252	Avi_4210	Avi_4212	rplS		FALSE	0.054	224.000	0.000	NA		NA
5480252	5480253	Avi_4212	Avi_4213			FALSE	0.049	238.000	0.000	NA		NA
5480253	5480254	Avi_4213	Avi_4214			FALSE	0.305	65.000	0.000	NA		NA
5480254	5480255	Avi_4214	Avi_4216			TRUE	0.998	-3.000	0.613	1.000		NA
5480255	5480256	Avi_4216	Avi_4217			FALSE	0.072	105.000	0.000	1.000	N	NA
5480256	5480257	Avi_4217	Avi_4218			TRUE	0.996	18.000	0.609	0.097	Y	NA
5480257	5480258	Avi_4218	Avi_4222			FALSE	0.003	1140.000	0.000	1.000	N	NA
5480258	5480259	Avi_4222	Avi_4223		leuC	FALSE	0.014	309.000	0.000	1.000	N	NA
5480260	5480261	Avi_4225	Avi_4226	yafB		FALSE	0.218	155.000	0.047	NA		NA
5480262	5480263	Avi_4227	Avi_4229	mtrA		TRUE	0.973	38.000	0.261	NA	Y	NA
5480264	5480265	Avi_4231	Avi_4232		xth	TRUE	0.607	29.000	0.000	1.000		NA
5480265	5480266	Avi_4232	Avi_4235	xth		FALSE	0.219	135.000	0.068	1.000	N	NA
5480266	5480267	Avi_4235	Avi_4236			FALSE	0.198	121.000	0.035	1.000	N	NA
5480267	5480268	Avi_4236	Avi_4237		amt	FALSE	0.016	291.000	0.000	1.000	N	NA
5480268	5480269	Avi_4237	Avi_4239	amt	glnK	TRUE	0.882	29.000	0.197	1.000	N	NA
5480269	5480270	Avi_4239	Avi_4240	glnK	tesB	FALSE	0.028	219.000	0.000	1.000	N	NA
5480272	5480273	Avi_4243	Avi_4244		lonD	TRUE	0.868	34.000	0.148	NA		NA
5480273	5480274	Avi_4244	Avi_4245	lonD	trx	FALSE	0.408	178.000	0.222	1.000		NA
5480274	5480275	Avi_4245	Avi_4247	trx		FALSE	0.414	179.000	0.245	NA		NA
5480277	5480278	Avi_4248	Avi_4249		galM	TRUE	0.585	101.000	0.000	NA	Y	NA
5480278	5480279	Avi_4249	Avi_4250	galM		FALSE	0.104	127.000	0.000	NA		NA
5480279	5480280	Avi_4250	Avi_4251			TRUE	0.892	7.000	0.010	NA		NA
5480280	5480281	Avi_4251	Avi_4253		metA	TRUE	0.968	-3.000	0.005	1.000		NA
5480281	5480282	Avi_4253	Avi_4254	metA		FALSE	0.070	208.000	0.000	1.000		NA
5480283	5480284	Avi_4257	Avi_4259		rpsU	TRUE	0.986	36.000	0.889	NA		NA
5480284	5480285	Avi_4259	Avi_4260	rpsU		FALSE	0.083	180.000	0.000	1.000		NA
5480285	5480286	Avi_4260	Avi_4261			TRUE	0.960	4.000	0.030	0.092		NA
5480287	5480288	Avi_4263	Avi_4264		exsE	FALSE	0.016	423.000	0.000	NA		NA
5480288	5480289	Avi_4264	Avi_4265	exsE		FALSE	0.051	234.000	0.000	NA		NA
5480290	5480291	Avi_4266	Avi_4267	thiB	thiP	TRUE	0.994	9.000	0.697	0.097	N	NA
5480291	5480292	Avi_4267	Avi_4268	thiP	thiQ	TRUE	0.998	-3.000	0.522	0.012	N	NA
5480292	5480293	Avi_4268	Avi_4269	thiQ		FALSE	0.048	361.000	0.013	1.000		NA
5480296	5480297	Avi_4273	Avi_4276	bfr		FALSE	0.033	447.000	0.020	NA		NA
5480297	5480298	Avi_4276	Avi_4277			FALSE	0.180	92.000	0.000	NA		NA
5480298	5480299	Avi_4277	Avi_4278			TRUE	0.507	164.000	0.307	NA		NA
5480299	5480300	Avi_4278	Avi_4279		nadD	TRUE	0.660	87.000	0.221	NA		NA
5480300	5480301	Avi_4279	Avi_4280	nadD	proA	TRUE	0.992	-25.000	0.170	1.000	N	NA
5480301	5480302	Avi_4280	Avi_4281	proA	proB	TRUE	0.999	-7.000	0.065	0.001	Y	NA
5480302	5480303	Avi_4281	Avi_4282	proB	cgtA	TRUE	0.984	-3.000	0.087	1.000		NA
5480305	5480306	Avi_4284	Avi_4286			TRUE	0.998	0.000	0.222	0.010	Y	NA
5480306	5480307	Avi_4286	Avi_4287		rpmA	TRUE	0.617	128.000	0.035	1.000	Y	NA
5480307	5480308	Avi_4287	Avi_4288	rpmA	rplU	TRUE	0.995	39.000	0.667	0.008	Y	NA
5480312	5480313	Avi_4292	Avi_4294	purH		FALSE	0.190	210.000	0.068	NA		NA
5480313	5480314	Avi_4294	Avi_4295		sun	FALSE	0.162	236.000	0.071	NA		NA
5480314	5480315	Avi_4295	Avi_4296	sun	htpx	TRUE	0.984	-9.000	0.075	1.000	N	NA
5480316	5480317	Avi_4297	Avi_4298			FALSE	0.066	195.000	0.000	NA		NA
5480317	5480318	Avi_4298	Avi_4299			FALSE	0.035	284.000	0.000	NA		NA
5480318	5480319	Avi_4299	Avi_4300			TRUE	0.997	-10.000	0.408	NA	N	NA
5480319	5480320	Avi_4300	Avi_4301			FALSE	0.393	178.000	0.210	1.000		NA
5480320	5480321	Avi_4301	Avi_4302		ialA	TRUE	0.827	40.000	0.109	1.000		NA
5480323	5480324	Avi_4304	Avi_4305			TRUE	0.997	-3.000	0.478	NA		NA
5480324	5480325	Avi_4305	Avi_4307			TRUE	0.960	34.000	0.474	NA		NA
5480325	5480326	Avi_4307	Avi_4308			FALSE	0.019	386.000	0.000	NA		NA
5480327	5480328	Avi_4309	Avi_4310	cheB	cheR	TRUE	0.998	8.000	0.672	1.000	Y	NA
5480328	5480329	Avi_4310	Avi_4311	cheR	cheW	TRUE	0.998	-3.000	0.310	1.000	Y	NA
5480329	5480330	Avi_4311	Avi_4312	cheW		TRUE	0.990	2.000	0.000	0.013	Y	NA
5480330	5480331	Avi_4312	Avi_4313			TRUE	0.786	86.000	0.000	0.013	Y	NA
5480331	5480332	Avi_4313	Avi_4314			TRUE	0.572	154.000	0.000	0.013	Y	NA
5480332	5480333	Avi_4314	Avi_4315		cheW	TRUE	0.982	9.000	0.000	0.013	Y	NA
5480333	5480334	Avi_4315	Avi_4316	cheW	cheA	TRUE	1.000	-3.000	0.808	0.013	Y	NA
5480334	5480335	Avi_4316	Avi_4317	cheA	cheY	TRUE	0.999	-3.000	0.615	1.000	Y	NA
5480335	5480336	Avi_4317	Avi_4318	cheY		TRUE	0.986	5.000	0.381	NA		NA
5480336	5480337	Avi_4318	Avi_4319			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5480337	5480338	Avi_4319	Avi_4321			FALSE	0.015	430.000	0.000	NA		NA
5480338	5480339	Avi_4321	Avi_4322			FALSE	0.120	116.000	0.000	NA		NA
5480340	5480341	Avi_4324	Avi_4326	putR		FALSE	0.096	134.000	0.000	NA		NA
5480341	5480342	Avi_4326	Avi_4327			FALSE	0.087	146.000	0.000	NA		NA
5480343	5480344	Avi_4328	Avi_4329			TRUE	0.972	12.000	0.300	1.000		NA
5480344	5480345	Avi_4329	Avi_4330			TRUE	0.882	115.000	0.714	0.013	N	NA
5480346	5480347	Avi_4331	Avi_4332		ispG	FALSE	0.223	88.000	0.011	NA	N	NA
5480347	5480348	Avi_4332	Avi_4333	ispG	ompA	FALSE	0.161	107.000	0.002	1.000	N	NA
5480349	5480350	Avi_4336	Avi_4337	rhtB	ispA	FALSE	0.270	89.000	0.020	1.000	N	NA
5480351	5480352	Avi_4339	Avi_4340	mtgA		TRUE	0.455	74.000	0.016	1.000		NA
5480352	5480353	Avi_4340	Avi_4342		rpmF	FALSE	0.086	199.000	0.009	1.000	N	NA
5480355	5480356	Avi_4344	Avi_4345	phbA	phbB	TRUE	0.508	347.000	0.319	1.000	Y	NA
5480358	5480359	Avi_4347	Avi_4348	mgpS		TRUE	0.984	4.000	0.013	1.000	Y	NA
5480359	5480360	Avi_4348	Avi_4350		fdxA	FALSE	0.051	342.000	0.050	1.000	N	NA
5480360	5480361	Avi_4350	Avi_4352	fdxA		FALSE	0.004	632.000	0.000	1.000	N	NA
5480362	5480363	Avi_4353	Avi_4355			FALSE	0.082	161.000	0.000	NA		NA
5480363	5480364	Avi_4355	Avi_4356		citE	TRUE	0.989	-3.000	0.179	NA		NA
5480365	5480366	Avi_4357	Avi_4358		leuD	FALSE	0.102	129.000	0.000	NA		NA
5480366	5480367	Avi_4358	Avi_4359	leuD	leuB	FALSE	0.339	306.000	0.000	0.001	Y	NA
5480367	5480368	Avi_4359	Avi_4360	leuB		FALSE	0.192	135.000	0.011	1.000		NA
5480370	5480371	Avi_4363	Avi_4364	asd		TRUE	0.947	-3.000	0.012	NA	N	NA
5480371	5480372	Avi_4364	Avi_4365			FALSE	0.065	200.000	0.000	NA		NA
5480373	5480374	Avi_4366	Avi_4367	cah	pdxK	TRUE	0.532	72.000	0.089	1.000	N	NA
5480375	5480376	Avi_4368	Avi_4369	gdh		FALSE	0.150	157.000	0.006	NA		NA
5480380	5480381	Avi_4374	Avi_4375	aviR	pycA	FALSE	0.344	107.000	0.100	1.000	N	NA
5480382	5480383	Avi_4376	Avi_4377		acs	FALSE	0.026	324.000	0.000	NA		NA
5480386	5480387	Avi_4381	Avi_4382	leuS		TRUE	0.990	-10.000	0.090	NA		NA
5480387	5480388	Avi_4382	Avi_4384		holA	FALSE	0.144	274.000	0.097	NA		NA
5480389	5480390	Avi_4385	Avi_4386	parB	parA	TRUE	0.878	105.000	0.827	1.000	N	NA
5480390	5480391	Avi_4386	Avi_4387	parA	gidB	TRUE	0.953	19.000	0.339	1.000	N	NA
5480391	5480392	Avi_4387	Avi_4389	gidB	gidA	TRUE	0.987	5.000	0.466	1.000	N	NA
5480392	5480393	Avi_4389	Avi_4390	gidA	trmE	TRUE	0.922	35.000	0.266	1.000		NA
5480393	5480394	Avi_4390	Avi_4391	trmE	rho	FALSE	0.239	149.000	0.050	1.000		NA
5480394	5480395	Avi_4391	Avi_4392	rho		FALSE	0.147	196.000	0.024	NA		NA
5480395	5480396	Avi_4392	Avi_4393		hemE	TRUE	0.951	2.000	0.044	NA		NA
5480397	5480398	Avi_5000	Avi_5001	repA	repB	TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	N	NA
5480398	5480399	Avi_5001	Avi_5002	repB	repC	FALSE	0.006	951.000	0.000	NA		NA
5480399	5480400	Avi_5002	Avi_5003	repC		FALSE	0.035	283.000	0.000	NA		NA
5480404	5480405	Avi_5007	Avi_5009		exoD	FALSE	0.146	363.000	0.222	NA		NA
5480407	5480408	Avi_5012	Avi_5014	nocP1		TRUE	0.968	45.000	0.286	1.000	Y	NA
5480408	5480409	Avi_5014	Avi_5015			TRUE	0.997	17.000	0.714	0.097	Y	NA
5480409	5480410	Avi_5015	Avi_5016			TRUE	0.999	9.000	0.833	0.011	Y	NA
5480410	5480411	Avi_5016	Avi_5017			TRUE	0.974	18.000	0.100	1.000	Y	NA
5480412	5480413	Avi_5018	Avi_5019			TRUE	0.993	46.000	0.833	1.000	Y	NA
5480413	5480414	Avi_5019	Avi_5021			TRUE	0.997	23.000	0.909	1.000	Y	NA
5480414	5480415	Avi_5021	Avi_5022			FALSE	0.077	192.000	0.000	1.000		NA
5480415	5480416	Avi_5022	Avi_5023			FALSE	0.094	135.000	0.000	NA		NA
5480416	5480417	Avi_5023	Avi_5024		glgA	TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5480417	5480418	Avi_5024	Avi_5025	glgA		FALSE	0.269	72.000	0.000	NA		NA
5480422	5480423	Avi_5030	Avi_5031			TRUE	0.967	11.000	0.300	1.000	N	NA
5480424	5480425	Avi_5032	Avi_5034	idnO	gntK	TRUE	0.984	2.000	0.308	1.000	N	NA
5480425	5480426	Avi_5034	Avi_5035	gntK	garR	TRUE	0.974	3.000	0.222	1.000	N	NA
5480426	5480427	Avi_5035	Avi_5036	garR		TRUE	0.985	0.000	0.222	NA		NA
5480427	5480428	Avi_5036	Avi_5038			FALSE	0.365	127.000	0.125	NA		NA
5480429	5480430	Avi_5039	Avi_5041			TRUE	0.993	39.000	0.741	NA	Y	NA
5480430	5480431	Avi_5041	Avi_5042			TRUE	0.997	17.000	0.852	1.000	Y	NA
5480432	5480433	Avi_5044	Avi_5045			FALSE	0.007	782.000	0.000	NA		NA
5480433	5480434	Avi_5045	Avi_5046			FALSE	0.100	130.000	0.000	NA		NA
5480434	5480435	Avi_5046	Avi_5049			TRUE	0.977	84.000	0.804	NA	Y	NA
5480435	5480436	Avi_5049	Avi_5050			TRUE	0.999	-3.000	0.506	1.000	Y	NA
5480436	5480437	Avi_5050	Avi_5051			TRUE	1.000	-3.000	0.865	0.086	Y	NA
5480437	5480438	Avi_5051	Avi_5052			TRUE	0.969	-3.000	0.045	1.000	N	NA
5480439	5480440	Avi_5053	Avi_5054	vdh	vdh	TRUE	0.941	80.000	0.250	0.036	Y	NA
5480442	5480443	Avi_5056	Avi_5057		ilvD	TRUE	0.958	18.000	0.385	NA	N	NA
5480443	5480444	Avi_5057	Avi_5058	ilvD		TRUE	0.740	44.000	0.111	1.000	N	NA
5480444	5480445	Avi_5058	Avi_5059		ssuB	TRUE	0.997	5.000	0.500	1.000	Y	NA
5480445	5480446	Avi_5059	Avi_5060	ssuB		TRUE	0.923	192.000	0.800	1.000	Y	NA
5480447	5480448	Avi_5061	Avi_5062			FALSE	0.008	421.000	0.000	1.000	N	NA
5480448	5480449	Avi_5062	Avi_5063			FALSE	0.136	171.000	0.000	0.043	N	NA
5480449	5480450	Avi_5063	Avi_5064			FALSE	0.120	116.000	0.000	NA		NA
5480450	5480451	Avi_5064	Avi_5066		cfa	FALSE	0.008	687.000	0.000	NA		NA
5480451	5480452	Avi_5066	Avi_5067	cfa		FALSE	0.089	95.000	0.000	1.000	N	NA
5480452	5480453	Avi_5067	Avi_5068		uspA	TRUE	0.950	12.000	0.222	1.000	N	NA
5480453	5480454	Avi_5068	Avi_5070	uspA		FALSE	0.053	107.000	0.000	NA	N	NA
5480455	5480456	Avi_5072	Avi_5073			FALSE	0.008	402.000	0.000	1.000	N	NA
5480457	5480458	Avi_5074	Avi_5075			TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5480458	5480459	Avi_5075	Avi_5076			FALSE	0.026	327.000	0.000	NA		NA
5480459	5480460	Avi_5076	Avi_5077			TRUE	0.608	25.000	0.000	NA		NA
5480460	5480461	Avi_5077	Avi_5079			TRUE	0.457	43.000	0.000	NA		NA
5480461	5480462	Avi_5079	Avi_5080			FALSE	0.007	818.000	0.000	NA		NA
5480462	5480463	Avi_5080	Avi_5081			FALSE	0.052	247.000	0.000	1.000		NA
5480463	5480464	Avi_5081	Avi_5082			TRUE	0.996	11.000	1.000	1.000		NA
5480464	5480465	Avi_5082	Avi_5084			FALSE	0.006	479.000	0.000	1.000	N	NA
5480467	5480468	Avi_5086	Avi_5087		bgl	TRUE	0.756	2.000	0.000	1.000	N	NA
5480468	5480469	Avi_5087	Avi_5088	bgl		FALSE	0.423	25.000	0.000	1.000	N	NA
5480469	5480470	Avi_5088	Avi_5089			TRUE	0.999	0.000	0.625	0.086	Y	NA
5480470	5480471	Avi_5089	Avi_5090			TRUE	0.987	3.000	0.312	1.000		NA
5480471	5480472	Avi_5090	Avi_5091			TRUE	0.863	40.000	0.182	NA		NA
5480474	5480475	Avi_5094	Avi_5096	selA		FALSE	0.007	425.000	0.000	1.000	N	NA
5480475	5480476	Avi_5096	Avi_5097			FALSE	0.014	267.000	0.000	NA	N	NA
5480476	5480477	Avi_5097	Avi_5101			TRUE	0.867	96.000	0.241	NA	Y	NA
5480477	5480478	Avi_5101	Avi_5102			FALSE	0.029	308.000	0.000	NA		NA
5480478	5480479	Avi_5102	Avi_5103			FALSE	0.035	285.000	0.000	NA		NA
5480479	5480480	Avi_5103	Avi_5106			TRUE	1.000	-3.000	0.705	0.043	Y	NA
5480480	5480481	Avi_5106	Avi_5107			TRUE	1.000	4.000	0.917	0.001	Y	NA
5480481	5480482	Avi_5107	Avi_5108			FALSE	0.013	322.000	0.000	1.000	N	NA
5480482	5480483	Avi_5108	Avi_5109			FALSE	0.222	101.000	0.000	0.082	N	NA
5480484	5480485	Avi_5111	Avi_5112			FALSE	0.094	135.000	0.000	NA		NA
5480485	5480486	Avi_5112	Avi_5113		fabG	FALSE	0.357	62.000	0.000	1.000		NA
5480488	5480489	Avi_5115	Avi_5116	melA		TRUE	0.969	26.000	0.464	1.000		NA
5480489	5480490	Avi_5116	Avi_5117			TRUE	0.994	13.000	0.857	1.000		NA
5480490	5480491	Avi_5117	Avi_5118			TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.086		NA
5480491	5480492	Avi_5118	Avi_5120		agpA	TRUE	0.989	74.000	0.867	0.086	Y	NA
5480492	5480493	Avi_5120	Avi_5121	agpA	melA	TRUE	0.609	115.000	0.348	1.000	N	NA
5480495	5480496	Avi_5123	Avi_5124			TRUE	0.783	70.000	0.250	NA		NA
5480497	5480498	Avi_5125	Avi_5126	phoP	phoQ	TRUE	0.998	-3.000	0.217	1.000	Y	NA
5480498	5480499	Avi_5126	Avi_5127	phoQ		FALSE	0.129	120.000	0.000	1.000		NA
5480500	5480501	Avi_5128	Avi_5129			FALSE	0.227	54.000	0.000	1.000	N	NA
5480501	5480502	Avi_5129	Avi_5130			FALSE	0.130	243.000	0.000	0.023		NA
5480502	5480503	Avi_5130	Avi_5131			TRUE	0.993	3.000	0.500	1.000		NA
5480503	5480504	Avi_5131	Avi_5133		rbsB	TRUE	0.883	70.000	0.533	NA	N	NA
5480504	5480505	Avi_5133	Avi_5134	rbsB	rbsC	TRUE	0.940	99.000	0.550	NA	Y	NA
5480505	5480506	Avi_5134	Avi_5135	rbsC	rbsA	TRUE	1.000	-7.000	0.600	1.000	Y	NA
5480507	5480508	Avi_5136	Avi_5137			FALSE	0.033	195.000	0.000	1.000	N	NA
5480508	5480509	Avi_5137	Avi_5138		malF	TRUE	0.808	96.000	0.042	0.086	Y	NA
5480509	5480510	Avi_5138	Avi_5139	malF	aglG	TRUE	0.997	-3.000	0.042	0.086	Y	NA
5480510	5480511	Avi_5139	Avi_5140	aglG		TRUE	0.859	61.000	0.000	0.086	Y	NA
5480511	5480512	Avi_5140	Avi_5141			TRUE	0.944	39.000	0.400	1.000		NA
5480512	5480513	Avi_5141	Avi_5142			FALSE	0.272	76.000	0.000	1.000		NA
5480513	5480514	Avi_5142	Avi_5143			FALSE	0.370	60.000	0.000	1.000		NA
5480514	5480515	Avi_5143	Avi_5146			FALSE	0.003	858.000	0.000	1.000	N	NA
5480515	5480516	Avi_5146	Avi_5147			TRUE	1.000	-3.000	0.900	1.000	Y	NA
5480516	5480517	Avi_5147	Avi_5148			TRUE	0.999	4.000	0.818	0.086	Y	NA
5480517	5480518	Avi_5148	Avi_5149			TRUE	0.935	102.000	0.556	NA	Y	NA
5480518	5480519	Avi_5149	Avi_5150			TRUE	0.819	192.000	0.444	NA	Y	NA
5480521	5480522	Avi_5152	Avi_5154			FALSE	0.282	243.000	0.000	NA	Y	NA
5480522	5480523	Avi_5154	Avi_5155		acd	FALSE	0.284	35.000	0.000	NA	N	NA
5480523	5480524	Avi_5155	Avi_5156	acd	acd	TRUE	0.985	22.000	0.138	0.004	Y	NA
5480524	5480525	Avi_5156	Avi_5157	acd		FALSE	0.148	72.000	0.000	1.000	N	NA
5480526	5480527	Avi_5158	Avi_5159			TRUE	0.881	34.000	0.177	NA		NA
5480527	5480528	Avi_5159	Avi_5160		rbsC	TRUE	0.984	32.000	0.355	NA	Y	NA
5480528	5480529	Avi_5160	Avi_5161	rbsC	rbsA	TRUE	0.999	0.000	0.952	1.000	Y	NA
5480532	5480533	Avi_5165	Avi_5167	rbsB	rbsA	TRUE	0.957	73.000	0.444	NA	Y	NA
5480533	5480534	Avi_5167	Avi_5168	rbsA	rbsC	TRUE	1.000	-10.000	0.778	1.000	Y	NA
5480534	5480535	Avi_5168	Avi_5169	rbsC		TRUE	0.995	8.000	0.286	0.086	Y	NA
5480535	5480536	Avi_5169	Avi_5170			FALSE	0.069	241.000	0.000	0.086	N	NA
5480536	5480537	Avi_5170	Avi_5171			TRUE	0.813	162.000	0.250	0.086	Y	NA
5480537	5480538	Avi_5171	Avi_5172			TRUE	1.000	-3.000	0.800	0.011	Y	NA
5480538	5480539	Avi_5172	Avi_5173			TRUE	0.998	13.000	0.789	1.000	Y	NA
5480539	5480540	Avi_5173	Avi_5175			TRUE	0.975	9.000	0.273	1.000		NA
5480540	5480541	Avi_5175	Avi_5176			TRUE	0.936	33.000	0.318	NA		NA
5480542	5480543	Avi_5177	Avi_5178			TRUE	0.788	0.000	0.000	1.000	N	NA
5480543	5480544	Avi_5178	Avi_5179		ssuD	FALSE	0.260	153.000	0.125	1.000	N	NA
5480544	5480545	Avi_5179	Avi_5180	ssuD		FALSE	0.406	167.000	0.000	NA	Y	NA
5480545	5480546	Avi_5180	Avi_5181		moaD	TRUE	0.995	-3.000	0.333	NA		NA
5480546	5480547	Avi_5181	Avi_5182	moaD	dppC	TRUE	0.999	-21.000	0.667	1.000		NA
5480547	5480548	Avi_5182	Avi_5183	dppC		TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.086	Y	NA
5480548	5480549	Avi_5183	Avi_5184			TRUE	0.997	25.000	0.800	0.086	Y	NA
5480550	5480551	Avi_5186	Avi_5187		invB	TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5480551	5480552	Avi_5187	Avi_5188	invB		FALSE	0.050	235.000	0.000	NA		NA
5480553	5480554	Avi_5189	Avi_5190		katA	FALSE	0.006	469.000	0.000	1.000	N	NA
5480554	5480555	Avi_5190	Avi_5192	katA		FALSE	0.002	851.000	0.000	NA	N	NA
5480555	5480556	Avi_5192	Avi_5193		dapA	TRUE	0.586	89.000	0.222	NA	N	NA
5480556	5480557	Avi_5193	Avi_5194	dapA		TRUE	0.784	81.000	0.389	1.000	N	NA
5480558	5480559	Avi_5195	Avi_5196			FALSE	0.003	627.000	0.000	NA	N	NA
5480559	5480560	Avi_5196	Avi_5198			TRUE	0.964	75.000	0.526	NA	Y	NA
5480560	5480561	Avi_5198	Avi_5199			TRUE	0.677	123.000	0.421	NA		NA
5480561	5480562	Avi_5199	Avi_5200			TRUE	0.981	16.000	0.500	1.000		NA
5480562	5480563	Avi_5200	Avi_5203			TRUE	0.427	46.000	0.000	NA		NA
5480563	5480564	Avi_5203	Avi_5205			FALSE	0.383	54.000	0.000	NA		NA
5480564	5480565	Avi_5205	Avi_5206			TRUE	0.955	58.000	0.158	0.012	Y	NA
5480565	5480566	Avi_5206	Avi_5208			TRUE	0.858	44.000	0.263	NA	N	NA
5480567	5480568	Avi_5209	Avi_5210	envZ	petR	TRUE	1.000	-7.000	1.000	1.000	Y	NA
5480569	5480570	Avi_5211	Avi_5212			TRUE	0.999	-3.000	0.900	NA	N	NA
5480570	5480571	Avi_5212	Avi_5213			FALSE	0.083	156.000	0.000	NA		NA
5480573	5480574	Avi_5216	Avi_5217			FALSE	0.114	120.000	0.000	NA		NA
5480575	5480576	Avi_5218	Avi_5219			FALSE	0.201	86.000	0.000	NA		NA
5480576	5480577	Avi_5219	Avi_5221			FALSE	0.024	334.000	0.000	NA		NA
5480577	5480578	Avi_5221	Avi_5222			FALSE	0.012	490.000	0.000	NA		NA
5480579	5480580	Avi_5223	Avi_5224			TRUE	0.994	0.000	0.571	NA	N	NA
5480581	5480582	Avi_5225	Avi_5226	fadL		FALSE	0.004	536.000	0.000	NA	N	NA
5480582	5480583	Avi_5226	Avi_5227			TRUE	0.647	4.000	0.000	NA	N	NA
5480584	5480585	Avi_5228	Avi_5229			FALSE	0.049	131.000	0.000	1.000	N	NA
5480585	5480586	Avi_5229	Avi_5230			TRUE	0.997	-7.000	0.077	1.000	Y	NA
5480586	5480587	Avi_5230	Avi_5231		atrB	TRUE	0.960	2.000	0.115	1.000	N	NA
5480587	5480588	Avi_5231	Avi_5232	atrB		TRUE	0.815	8.000	0.000	1.000		NA
5480588	5480589	Avi_5232	Avi_5234			FALSE	0.068	212.000	0.000	1.000		NA
5480589	5480590	Avi_5234	Avi_5235			TRUE	0.607	29.000	0.000	1.000		NA
5480590	5480591	Avi_5235	Avi_5237			FALSE	0.196	87.000	0.000	NA		NA
5480592	5480593	Avi_5238	Avi_5240			TRUE	0.944	4.000	0.054	NA		NA
5480593	5480594	Avi_5240	Avi_5241			TRUE	0.616	77.000	0.130	NA		NA
5480594	5480595	Avi_5241	Avi_5242			TRUE	0.989	-3.000	0.174	NA		NA
5480595	5480596	Avi_5242	Avi_5243		sigW	TRUE	0.987	-7.000	0.062	NA		NA
5480596	5480597	Avi_5243	Avi_5247	sigW	phnA	FALSE	0.015	298.000	0.000	1.000	N	NA
5480600	5480601	Avi_5250	Avi_5252			TRUE	0.983	70.000	0.625	0.085	Y	NA
5480601	5480602	Avi_5252	Avi_5253			TRUE	0.999	0.000	0.775	0.085	Y	NA
5480602	5480603	Avi_5253	Avi_5254			TRUE	0.999	6.000	0.789	0.085	Y	NA
5480603	5480604	Avi_5254	Avi_5255		ugpQ	TRUE	0.885	13.000	0.079	1.000	N	NA
5480604	5480605	Avi_5255	Avi_5256	ugpQ		FALSE	0.159	105.000	0.000	1.000		NA
5480606	5480607	Avi_5257	Avi_5258			FALSE	0.063	203.000	0.000	NA		NA
5480607	5480608	Avi_5258	Avi_5259			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5480609	5480610	Avi_5260	Avi_5261			FALSE	0.016	417.000	0.000	NA		NA
5480610	5480611	Avi_5261	Avi_5262			TRUE	0.964	41.000	0.600	NA		NA
5480612	5480613	Avi_5263	Avi_5264	phaG	phaF	TRUE	1.000	-3.000	0.937	1.000	Y	NA
5480613	5480614	Avi_5264	Avi_5265	phaF	phaE	TRUE	1.000	-3.000	0.937	0.040	Y	NA
5480614	5480615	Avi_5265	Avi_5266	phaE	phaD	TRUE	0.999	0.000	0.944	1.000	Y	NA
5480615	5480616	Avi_5266	Avi_5268	phaD	phaC	TRUE	1.000	-3.000	0.976	0.005	Y	NA
5480616	5480617	Avi_5268	Avi_5269	phaC	phaA	TRUE	0.996	0.000	0.095	0.005	Y	NA
5480618	5480619	Avi_5270	Avi_5271		gatA	TRUE	0.965	8.000	0.188	1.000		NA
5480619	5480620	Avi_5271	Avi_5272	gatA		TRUE	0.991	-3.000	0.208	1.000		NA
5480620	5480621	Avi_5272	Avi_5273			TRUE	0.999	-10.000	0.864	1.000		NA
5480621	5480622	Avi_5273	Avi_5274			TRUE	0.999	-3.000	0.976	0.085		NA
5480622	5480623	Avi_5274	Avi_5276			FALSE	0.304	194.000	0.151	1.000		NA
5480624	5480625	Avi_5277	Avi_5278			TRUE	0.992	-3.000	0.250	NA		NA
5480625	5480626	Avi_5278	Avi_5280			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5480626	5480627	Avi_5280	Avi_5281			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5480627	5480628	Avi_5281	Avi_5282			TRUE	0.986	-7.000	0.111	NA	N	NA
5480628	5480629	Avi_5282	Avi_5283		potB	TRUE	1.000	-3.000	0.750	0.085	Y	NA
5480629	5480630	Avi_5283	Avi_5284	potB	potG	TRUE	0.998	-3.000	0.120	0.085	Y	NA
5480630	5480631	Avi_5284	Avi_5285	potG	potF	TRUE	0.994	4.000	0.160	0.085	Y	NA
5480631	5480632	Avi_5285	Avi_5286	potF		FALSE	0.063	113.000	0.000	1.000	N	NA
5480632	5480633	Avi_5286	Avi_5287			TRUE	0.546	161.000	0.000	0.059	Y	NA
5480634	5480635	Avi_5288	Avi_5289	gatA		FALSE	0.304	41.000	0.000	1.000	N	NA
5480635	5480636	Avi_5289	Avi_5290			TRUE	0.979	56.000	0.400	0.085	Y	NA
5480636	5480637	Avi_5290	Avi_5291		dppC	TRUE	0.997	-3.000	0.036	0.085	Y	NA
5480637	5480638	Avi_5291	Avi_5292	dppC	moaD	TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5480638	5480639	Avi_5292	Avi_5293	moaD	moaD	TRUE	0.995	-3.000	0.000	0.008	Y	NA
5480639	5480640	Avi_5293	Avi_5294	moaD		TRUE	0.447	87.000	0.000	0.008		NA
5480640	5480641	Avi_5294	Avi_5296			FALSE	0.021	386.000	0.000	1.000		NA
5480641	5480642	Avi_5296	Avi_5297			FALSE	0.127	78.000	0.000	1.000	N	NA
5480642	5480643	Avi_5297	Avi_5299			TRUE	0.702	204.000	0.250	1.000	Y	NA
5480643	5480644	Avi_5299	Avi_5300			TRUE	0.943	176.000	0.750	0.085	Y	NA
5480644	5480645	Avi_5300	Avi_5301			TRUE	0.996	33.000	0.800	0.085	Y	NA
5480645	5480646	Avi_5301	Avi_5303		xylR	FALSE	0.039	166.000	0.000	1.000	N	NA
5480646	5480647	Avi_5303	Avi_5304	xylR		TRUE	0.989	-3.000	0.167	1.000		NA
5480647	5480648	Avi_5304	Avi_5305			TRUE	0.919	37.000	0.286	NA		NA
5480648	5480649	Avi_5305	Avi_5307		rbsC	TRUE	0.960	53.000	0.286	NA	Y	NA
5480649	5480650	Avi_5307	Avi_5308	rbsC		TRUE	0.989	-3.000	0.222	1.000	N	NA
5480652	5480653	Avi_5310	Avi_5311			FALSE	0.121	247.000	0.000	0.043		NA
5480653	5480654	Avi_5311	Avi_5313			TRUE	0.908	73.000	0.667	NA	N	NA
5480654	5480655	Avi_5313	Avi_5314			TRUE	0.975	27.000	0.667	NA	N	NA
5480655	5480656	Avi_5314	Avi_5315			TRUE	0.972	63.000	1.000	NA		NA
5480656	5480657	Avi_5315	Avi_5317		attY	TRUE	0.556	73.000	0.062	NA		NA
5480657	5480658	Avi_5317	Avi_5318	attY		TRUE	0.729	13.000	0.000	NA		NA
5480658	5480659	Avi_5318	Avi_5319			FALSE	0.058	216.000	0.000	NA		NA
5480659	5480660	Avi_5319	Avi_5320			TRUE	0.949	16.000	0.000	1.000	Y	NA
5480660	5480661	Avi_5320	Avi_5321			FALSE	0.138	176.000	0.000	0.023	N	NA
5480662	5480663	Avi_5322	Avi_5324			TRUE	0.827	36.000	0.163	NA	N	NA
5480663	5480664	Avi_5324	Avi_5325			FALSE	0.114	120.000	0.000	NA		NA
5480664	5480665	Avi_5325	Avi_5326		catE	FALSE	0.011	522.000	0.000	NA		NA
5480665	5480666	Avi_5326	Avi_5327	catE		TRUE	0.428	163.000	0.000	1.000	Y	NA
5480667	5480668	Avi_5328	Avi_5329			TRUE	0.998	-3.000	0.190	0.085	Y	NA
5480668	5480669	Avi_5329	Avi_5330			TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.085	Y	NA
5480669	5480670	Avi_5330	Avi_5331			TRUE	0.996	44.000	1.000	0.085	Y	NA
5480670	5480671	Avi_5331	Avi_5332			FALSE	0.145	103.000	0.000	NA		NA
5480672	5480673	Avi_5334	Avi_5336	vdh		FALSE	0.038	171.000	0.000	1.000	N	NA
5480673	5480674	Avi_5336	Avi_5337			TRUE	0.996	15.000	0.667	1.000	Y	NA
5480675	5480676	Avi_5338	Avi_5339		rbsB	FALSE	0.049	112.000	0.000	NA	N	NA
5480676	5480677	Avi_5339	Avi_5341	rbsB	rbsC	FALSE	0.420	122.000	0.158	NA		NA
5480677	5480678	Avi_5341	Avi_5342	rbsC		TRUE	0.996	-10.000	0.263	1.000		NA
5480678	5480679	Avi_5342	Avi_5343		cbr	TRUE	0.515	41.000	0.000	1.000		NA
5480680	5480681	Avi_5344	Avi_5346	dapE	mdeA	TRUE	0.877	43.000	0.000	1.000	Y	NA
5480681	5480682	Avi_5346	Avi_5347	mdeA		TRUE	0.996	-3.000	0.478	1.000	N	NA
5480683	5480684	Avi_5349	Avi_5350	dppA	dppB	FALSE	0.388	331.000	0.072	0.085	Y	NA
5480684	5480685	Avi_5350	Avi_5351	dppB	dppC	TRUE	0.986	9.000	0.031	0.085	Y	NA
5480685	5480686	Avi_5351	Avi_5352	dppC		TRUE	0.995	-28.000	0.000	1.000	Y	NA
5480686	5480687	Avi_5352	Avi_5354			TRUE	0.996	-3.000	0.000	0.005	Y	NA
5480687	5480688	Avi_5354	Avi_5355			TRUE	0.936	21.000	0.000	1.000	Y	NA
5480688	5480689	Avi_5355	Avi_5356			FALSE	0.060	117.000	0.000	1.000	N	NA
5480689	5480690	Avi_5356	Avi_5357		dppA	TRUE	0.749	52.000	0.160	1.000	N	NA
5480690	5480691	Avi_5357	Avi_5358	dppA	dppB	TRUE	0.866	101.000	0.176	0.085	Y	NA
5480691	5480692	Avi_5358	Avi_5359	dppB	dppC	TRUE	1.000	-3.000	0.762	0.085	Y	NA
5480692	5480693	Avi_5359	Avi_5360	dppC	ggt	TRUE	0.932	48.000	0.095	1.000	Y	NA
5480693	5480694	Avi_5360	Avi_5362	ggt	moaD	TRUE	0.896	45.000	0.286	1.000		NA
5480695	5480696	Avi_5363	Avi_5364	gsp		TRUE	0.979	2.000	0.195	NA		NA
5480696	5480697	Avi_5364	Avi_5365			TRUE	0.985	11.000	0.470	NA		NA
5480697	5480698	Avi_5365	Avi_5366			TRUE	0.954	28.000	0.379	NA		NA
5480699	5480700	Avi_5367	Avi_5368			TRUE	0.999	-27.000	0.911	NA		NA
5480701	5480702	Avi_5370	Avi_5371		fadD	FALSE	0.218	129.000	0.058	1.000	N	NA
5480702	5480703	Avi_5371	Avi_5372	fadD		TRUE	0.516	97.000	0.130	1.000		NA
5480704	5480705	Avi_5373	Avi_5374			TRUE	0.809	78.000	0.000	0.043	Y	NA
5480705	5480706	Avi_5374	Avi_5375			FALSE	0.190	175.000	0.080	1.000	N	NA
5480706	5480707	Avi_5375	Avi_5376			TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.085	Y	NA
5480707	5480708	Avi_5376	Avi_5377			TRUE	0.986	3.000	0.300	1.000		NA
5480708	5480709	Avi_5377	Avi_5378			TRUE	0.959	26.000	0.375	1.000		NA
5480709	5480710	Avi_5378	Avi_5379			TRUE	0.999	-3.000	0.800	NA		NA
5480710	5480711	Avi_5379	Avi_5380			TRUE	0.554	102.000	0.200	NA		NA
5480711	5480712	Avi_5380	Avi_5381			TRUE	0.480	41.000	0.000	NA		NA
5480713	5480714	Avi_5382	Avi_5383			TRUE	0.998	-3.000	0.083	0.015	Y	NA
5480714	5480715	Avi_5383	Avi_5384		narL	TRUE	0.997	0.000	0.167	0.015	Y	NA
5480715	5480716	Avi_5384	Avi_5386	narL		TRUE	0.996	7.000	0.261	0.018	Y	NA
5480718	5480719	Avi_5388	Avi_5390			FALSE	0.007	432.000	0.000	1.000	N	NA
5480719	5480720	Avi_5390	Avi_5391		cysW	TRUE	0.996	15.000	0.587	1.000	Y	NA
5480720	5480721	Avi_5391	Avi_5392	cysW	cysT	TRUE	1.000	-13.000	0.935	0.000	N	NA
5480721	5480722	Avi_5392	Avi_5393	cysT		TRUE	0.786	28.000	0.000	0.001	N	NA
5480722	5480723	Avi_5393	Avi_5394		thuR	FALSE	0.033	194.000	0.000	1.000	N	NA
5480724	5480725	Avi_5395	Avi_5396			TRUE	0.990	7.000	0.520	NA		NA
5480725	5480726	Avi_5396	Avi_5398			TRUE	0.935	97.000	0.500	NA	Y	NA
5480726	5480727	Avi_5398	Avi_5399		thuF	TRUE	0.948	138.000	0.700	0.085	Y	NA
5480727	5480728	Avi_5399	Avi_5400	thuF		TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.085	Y	NA
5480728	5480729	Avi_5400	Avi_5401			TRUE	1.000	-3.000	0.818	0.085	Y	NA
5480729	5480730	Avi_5401	Avi_5403			FALSE	0.005	450.000	0.000	NA	N	NA
5480730	5480731	Avi_5403	Avi_5404			TRUE	0.997	6.000	0.538	NA	Y	NA
5480731	5480732	Avi_5404	Avi_5406			TRUE	0.953	56.000	0.250	1.000	Y	NA
5480732	5480733	Avi_5406	Avi_5408			FALSE	0.328	118.000	0.071	NA		NA
5480733	5480734	Avi_5408	Avi_5409			TRUE	0.540	87.000	0.118	NA		NA
5480734	5480735	Avi_5409	Avi_5410			TRUE	0.829	72.000	0.400	1.000	N	NA
5480738	5480739	Avi_5413	Avi_5414			FALSE	0.032	197.000	0.000	1.000	N	NA
5480739	5480740	Avi_5414	Avi_5416			TRUE	0.886	-7.000	0.000	NA	N	NA
5480740	5480741	Avi_5416	Avi_5417			TRUE	0.945	24.000	0.286	NA		NA
5480741	5480742	Avi_5417	Avi_5418			TRUE	0.995	12.000	0.750	0.085		NA
5480742	5480743	Avi_5418	Avi_5419			TRUE	0.998	-7.000	0.500	1.000		NA
5480743	5480744	Avi_5419	Avi_5420			TRUE	0.835	74.000	0.353	1.000		NA
5480745	5480746	Avi_5422	Avi_5423			TRUE	0.993	0.000	0.500	NA	N	NA
5480746	5480747	Avi_5423	Avi_5424		ade	TRUE	0.521	55.000	0.038	NA	N	NA
5480747	5480748	Avi_5424	Avi_5425	ade		TRUE	0.788	0.000	0.000	1.000	N	NA
5480748	5480749	Avi_5425	Avi_5426			TRUE	0.675	94.000	0.250	1.000		NA
5480749	5480750	Avi_5426	Avi_5427			TRUE	0.999	-3.000	0.571	0.001		NA
5480750	5480751	Avi_5427	Avi_5429		betA	TRUE	0.715	14.000	0.000	NA		NA
5480751	5480752	Avi_5429	Avi_5431	betA		TRUE	0.491	40.000	0.000	NA		NA
5480752	5480753	Avi_5431	Avi_5432			TRUE	0.994	-3.000	0.375	NA	N	NA
5480753	5480754	Avi_5432	Avi_5433			TRUE	0.980	0.000	0.222	NA	N	NA
5480754	5480755	Avi_5433	Avi_5434		xdhA	TRUE	0.999	-3.000	0.222	0.043	Y	NA
5480755	5480756	Avi_5434	Avi_5435	xdhA	dhaS	TRUE	0.982	2.000	0.000	1.000	Y	NA
5480756	5480757	Avi_5435	Avi_5436	dhaS	pcaI	FALSE	0.138	162.000	0.000	0.054	N	NA
5480757	5480758	Avi_5436	Avi_5437	pcaI	pcaJ	TRUE	0.992	0.000	0.000	0.001	Y	NA
5480758	5480759	Avi_5437	Avi_5438	pcaJ		FALSE	0.026	224.000	0.000	1.000	N	NA
5480759	5480760	Avi_5438	Avi_5439		lldA	TRUE	0.983	-3.000	0.136	1.000	N	NA
5480760	5480761	Avi_5439	Avi_5440	lldA		FALSE	0.023	346.000	0.000	NA		NA
5480761	5480762	Avi_5440	Avi_5441			TRUE	0.791	49.000	0.143	NA		NA
5480762	5480763	Avi_5441	Avi_5443			FALSE	0.291	193.000	0.200	1.000	N	NA
5480763	5480764	Avi_5443	Avi_5444		livJ	FALSE	0.004	625.000	0.000	1.000	N	NA
5480764	5480765	Avi_5444	Avi_5445	livJ	livH	FALSE	0.412	172.000	0.000	1.000	Y	NA
5480765	5480766	Avi_5445	Avi_5446	livH		TRUE	0.978	10.000	0.000	0.085	Y	NA
5480766	5480767	Avi_5446	Avi_5447			TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5480767	5480768	Avi_5447	Avi_5448		livF	TRUE	0.995	-3.000	0.000	0.035	Y	NA
5480771	5480772	Avi_5453	Avi_5454	aroQ	aroE	TRUE	0.995	-3.000	0.034	1.000	Y	NA
5480772	5480773	Avi_5454	Avi_5456	aroE		TRUE	0.982	72.000	0.750	1.000	Y	NA
5480773	5480774	Avi_5456	Avi_5457			TRUE	0.955	14.000	0.000	1.000	Y	NA
5480774	5480775	Avi_5457	Avi_5458			TRUE	0.878	131.000	0.333	0.085	Y	NA
5480775	5480776	Avi_5458	Avi_5459			TRUE	0.999	11.000	0.714	0.011	Y	NA
5480776	5480777	Avi_5459	Avi_5460			FALSE	0.013	628.000	0.000	0.085	N	NA
5480777	5480778	Avi_5460	Avi_5461		treZ	FALSE	0.005	590.000	0.000	1.000	N	NA
5480779	5480780	Avi_5462	Avi_5463	treY		FALSE	0.061	116.000	0.000	1.000	N	NA
5480780	5480781	Avi_5463	Avi_5465			TRUE	0.501	39.000	0.000	NA		NA
5480781	5480782	Avi_5465	Avi_5466			FALSE	0.021	362.000	0.000	NA		NA
5480783	5480784	Avi_5467	Avi_5468			TRUE	0.997	6.000	0.472	1.000	Y	NA
5480784	5480785	Avi_5468	Avi_5469			TRUE	0.947	41.000	0.028	0.085	Y	NA
5480786	5480787	Avi_5471	Avi_5472	ssuA	ssuD	TRUE	0.770	26.000	0.049	1.000	N	NA
5480787	5480788	Avi_5472	Avi_5475	ssuD		FALSE	0.014	270.000	0.000	NA	N	NA
5480789	5480790	Avi_5477	Avi_5479			FALSE	0.057	365.000	0.000	0.043		NA
5480790	5480791	Avi_5479	Avi_5481			FALSE	0.018	274.000	0.000	1.000	N	NA
5480792	5480793	Avi_5482	Avi_5483		mexE	TRUE	0.567	59.000	0.059	1.000	N	NA
5480793	5480794	Avi_5483	Avi_5484	mexE	mexF	TRUE	0.475	181.000	0.361	1.000	N	NA
5480796	5480797	Avi_5486	Avi_5487			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5480797	5480798	Avi_5487	Avi_5488			TRUE	0.545	33.000	0.000	NA		NA
5480798	5480799	Avi_5488	Avi_5489			TRUE	0.988	18.000	0.737	NA		NA
5480799	5480800	Avi_5489	Avi_5490			TRUE	0.990	4.000	0.529	NA	N	NA
5480800	5480801	Avi_5490	Avi_5491			TRUE	0.626	144.000	0.429	NA		NA
5480801	5480802	Avi_5491	Avi_5492			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5480802	5480803	Avi_5492	Avi_5493			TRUE	0.491	40.000	0.000	NA		NA
5480803	5480804	Avi_5493	Avi_5494			TRUE	0.995	0.000	0.609	1.000	N	NA
5480804	5480805	Avi_5494	Avi_5495			TRUE	0.976	-3.000	0.040	NA		NA
5480806	5480807	Avi_5496	Avi_5498			FALSE	0.235	52.000	0.000	1.000	N	NA
5480808	5480809	Avi_5501	Avi_5502		nwsB	TRUE	1.000	-3.000	0.800	1.000	Y	NA
5480810	5480811	Avi_5503	Avi_5504		ugpC	TRUE	0.991	-3.000	0.000	NA	Y	NA
5480811	5480812	Avi_5504	Avi_5505	ugpC	ugpE	TRUE	0.994	41.000	0.700	0.085	Y	NA
5480812	5480813	Avi_5505	Avi_5506	ugpE	ugpA	TRUE	0.999	8.000	0.900	0.085	Y	NA
5480813	5480814	Avi_5506	Avi_5507	ugpA	ugpB	TRUE	0.989	77.000	0.900	0.085	Y	NA
5480814	5480815	Avi_5507	Avi_5508	ugpB		FALSE	0.103	186.000	0.000	0.085	N	NA
5480815	5480816	Avi_5508	Avi_5510			TRUE	0.997	4.000	0.864	0.085	N	NA
5480816	5480817	Avi_5510	Avi_5511		ugpC	TRUE	0.999	-3.000	0.594	0.085	Y	NA
5480817	5480818	Avi_5511	Avi_5512	ugpC		TRUE	0.721	139.000	0.562	NA		NA
5480818	5480819	Avi_5512	Avi_5513			FALSE	0.069	189.000	0.000	NA		NA
5480819	5480820	Avi_5513	Avi_5514			TRUE	0.848	17.000	0.025	1.000		NA
5480821	5480822	Avi_5515	Avi_5516			TRUE	0.600	124.000	0.000	0.085	Y	NA
5480822	5480823	Avi_5516	Avi_5517			TRUE	0.991	10.000	0.500	0.085		NA
5480823	5480824	Avi_5517	Avi_5518			TRUE	0.943	-3.000	0.000	1.000		NA
5480824	5480825	Avi_5518	Avi_5520			TRUE	0.996	-3.000	0.000	0.005	Y	NA
5480825	5480826	Avi_5520	Avi_5521		phoP	FALSE	0.041	158.000	0.000	1.000	N	NA
5480826	5480827	Avi_5521	Avi_5522	phoP		TRUE	0.998	4.000	0.500	1.000	Y	NA
5480827	5480828	Avi_5522	Avi_5523			FALSE	0.119	179.000	0.025	1.000	N	NA
5480828	5480829	Avi_5523	Avi_5524			TRUE	0.983	14.000	0.152	1.000	Y	NA
5480829	5480830	Avi_5524	Avi_5525			TRUE	0.643	59.000	0.052	1.000		NA
5480830	5480831	Avi_5525	Avi_5526			TRUE	0.984	-3.000	0.086	1.000		NA
5480831	5480832	Avi_5526	Avi_5527			TRUE	0.943	-3.000	0.000	1.000		NA
5480832	5480833	Avi_5527	Avi_5529			TRUE	0.982	-3.000	0.069	1.000		NA
5480833	5480834	Avi_5529	Avi_5530			TRUE	0.730	62.000	0.147	NA		NA
5480834	5480835	Avi_5530	Avi_5531			TRUE	0.986	-3.000	0.118	NA		NA
5480836	5480837	Avi_5533	Avi_5534		celB	FALSE	0.059	212.000	0.000	NA		NA
5480837	5480838	Avi_5534	Avi_5535	celB	celA	TRUE	0.781	75.000	0.286	NA		NA
5480838	5480839	Avi_5535	Avi_5536	celA		TRUE	0.822	102.000	0.571	NA		NA
5480842	5480843	Avi_5540	Avi_5541			TRUE	0.830	24.000	0.000	0.018		NA
5480845	5480846	Avi_5545	Avi_5547	cvgS	galE	FALSE	0.103	87.000	0.000	1.000	N	NA
5480847	5480848	Avi_5548	Avi_5549			TRUE	0.899	41.000	0.133	0.035		NA
5480848	5480849	Avi_5549	Avi_5550			TRUE	0.624	27.000	0.000	1.000		NA
5480849	5480850	Avi_5550	Avi_5552		glnH	TRUE	0.876	80.000	0.077	0.095	Y	NA
5480851	5480852	Avi_5553	Avi_5554		mcpA	FALSE	0.018	278.000	0.000	1.000	N	NA
5480852	5480853	Avi_5554	Avi_5555	mcpA	cheW	TRUE	0.991	0.000	0.000	0.012	Y	NA
5480853	5480854	Avi_5555	Avi_5556	cheW		FALSE	0.018	279.000	0.000	1.000	N	NA
5480854	5480855	Avi_5556	Avi_5557			TRUE	0.997	-3.000	0.630	NA	N	NA
5480855	5480856	Avi_5557	Avi_5558			TRUE	1.000	-3.000	0.963	NA	Y	NA
5480856	5480857	Avi_5558	Avi_5559			FALSE	0.033	141.000	0.000	NA	N	NA
5480857	5480858	Avi_5559	Avi_5560		gcvT	FALSE	0.347	124.000	0.150	1.000	N	NA
5480861	5480862	Avi_5563	Avi_5564	glgB	aglA	TRUE	0.998	-3.000	0.115	0.005	Y	NA
5480862	5480863	Avi_5564	Avi_5565	aglA		TRUE	0.998	12.000	0.544	0.005	Y	NA
5480864	5480865	Avi_5566	Avi_5567		cspA	FALSE	0.006	466.000	0.000	1.000	N	NA
5480866	5480867	Avi_5568	Avi_5569			TRUE	0.961	-16.000	0.000	NA		NA
5480867	5480868	Avi_5569	Avi_5570		thuB	FALSE	0.100	130.000	0.000	NA		NA
5480868	5480869	Avi_5570	Avi_5571	thuB	thuA	TRUE	0.989	-3.000	0.182	NA		NA
5480870	5480871	Avi_5575	Avi_5576		dapA	FALSE	0.392	144.000	0.227	1.000	N	NA
5480872	5480873	Avi_5578	Avi_5579			FALSE	0.330	66.000	0.000	1.000		NA
5480874	5480875	Avi_5580	Avi_5581	togB	togM	TRUE	0.996	26.000	0.643	0.084	Y	NA
5480875	5480876	Avi_5581	Avi_5582	togM	togN	TRUE	1.000	-7.000	0.714	0.084	Y	NA
5480876	5480877	Avi_5582	Avi_5583	togN		TRUE	0.907	29.000	0.190	1.000		NA
5480877	5480878	Avi_5583	Avi_5584			TRUE	0.985	-7.000	0.000	0.035		NA
5480878	5480879	Avi_5584	Avi_5585		togA	TRUE	0.900	0.000	0.000	1.000		NA
5480879	5480880	Avi_5585	Avi_5586	togA		FALSE	0.099	89.000	0.000	1.000	N	NA
5480882	5480883	Avi_5588	Avi_5589			FALSE	0.017	287.000	0.000	1.000	N	NA
5480883	5480884	Avi_5589	Avi_5592			FALSE	0.260	314.000	0.000	0.090	Y	NA
5480884	5480885	Avi_5592	Avi_5593		exsG	TRUE	0.994	-3.000	0.000	0.090	Y	NA
5480886	5480887	Avi_5594	Avi_5595			FALSE	0.052	108.000	0.000	NA	N	NA
5480888	5480889	Avi_5596	Avi_5597		ecfR	FALSE	0.081	183.000	0.000	1.000		NA
5480889	5480890	Avi_5597	Avi_5598	ecfR		TRUE	0.469	202.000	0.000	0.080	Y	NA
5480890	5480891	Avi_5598	Avi_5599			FALSE	0.006	508.000	0.000	1.000	N	NA
5480891	5480892	Avi_5599	Avi_5600			FALSE	0.041	123.000	0.000	NA	N	NA
5480892	5480893	Avi_5600	Avi_5601			FALSE	0.007	787.000	0.000	NA		NA
5480893	5480894	Avi_5601	Avi_5602			TRUE	0.976	10.000	0.300	1.000		NA
5480894	5480895	Avi_5602	Avi_5603			FALSE	0.090	167.000	0.000	1.000		NA
5480895	5480896	Avi_5603	Avi_5604		cyaA	FALSE	0.098	147.000	0.000	1.000		NA
5480896	5480897	Avi_5604	Avi_5605	cyaA	cyaA	TRUE	0.524	193.000	0.000	0.007	Y	NA
5480897	5480898	Avi_5605	Avi_5606	cyaA		FALSE	0.035	181.000	0.000	1.000	N	NA
5480898	5480899	Avi_5606	Avi_5607			TRUE	0.852	36.000	0.186	1.000	N	NA
5480899	5480900	Avi_5607	Avi_5608		suhB	FALSE	0.041	159.000	0.000	1.000	N	NA
5480901	5480902	Avi_5609	Avi_5610			TRUE	0.919	-13.000	0.000	1.000	N	NA
5480902	5480903	Avi_5610	Avi_5611			TRUE	0.831	44.000	0.120	0.084	N	NA
5480903	5480904	Avi_5611	Avi_5612			TRUE	0.998	11.000	0.560	0.084	Y	NA
5480904	5480905	Avi_5612	Avi_5613			TRUE	0.996	0.000	0.143	0.084	Y	NA
5480908	5480909	Avi_5617	Avi_5618			FALSE	0.021	364.000	0.000	NA		NA
5480909	5480910	Avi_5618	Avi_5619			FALSE	0.402	50.000	0.000	NA		NA
5480910	5480911	Avi_5619	Avi_5621			FALSE	0.336	106.000	0.000	0.013		NA
5480911	5480912	Avi_5621	Avi_5624			TRUE	0.765	38.000	0.000	0.013		NA
5480912	5480913	Avi_5624	Avi_5625			TRUE	0.996	-3.000	0.000	0.003	Y	NA
5480913	5480914	Avi_5625	Avi_5626			TRUE	0.974	16.000	0.400	1.000		NA
5480914	5480915	Avi_5626	Avi_5627			TRUE	0.964	39.000	0.400	0.042		NA
5480915	5480916	Avi_5627	Avi_5628			TRUE	0.828	78.000	0.000	0.004	Y	NA
5480917	5480918	Avi_5629	Avi_5630			TRUE	0.480	18.000	0.000	1.000	N	NA
5480918	5480919	Avi_5630	Avi_5631			TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.005	Y	NA
5480919	5480920	Avi_5631	Avi_5632			TRUE	0.998	3.000	0.636	1.000	Y	NA
5480920	5480921	Avi_5632	Avi_5633		dppC	TRUE	0.999	12.000	1.000	0.084	Y	NA
5480921	5480922	Avi_5633	Avi_5634	dppC		TRUE	0.967	78.000	0.455	0.084	Y	NA
5480922	5480923	Avi_5634	Avi_5637			TRUE	0.749	56.000	0.120	1.000		NA
5480923	5480924	Avi_5637	Avi_5638			TRUE	0.553	32.000	0.000	NA		NA
5480924	5480925	Avi_5638	Avi_5639			TRUE	0.999	-3.000	0.938	NA	N	NA
5480926	5480927	Avi_5640	Avi_5641			FALSE	0.383	144.000	0.222	1.000	N	NA
5480927	5480928	Avi_5641	Avi_5642			TRUE	0.731	119.000	0.038	0.084	Y	NA
5480928	5480929	Avi_5642	Avi_5643			TRUE	1.000	-3.000	0.829	0.084	Y	NA
5480929	5480930	Avi_5643	Avi_5644			TRUE	0.998	-3.000	0.317	1.000	Y	NA
5480930	5480931	Avi_5644	Avi_5646			TRUE	0.992	0.000	0.000	0.005	Y	NA
5480931	5480932	Avi_5646	Avi_5648		gatA	FALSE	0.406	27.000	0.000	1.000	N	NA
5480933	5480934	Avi_5649	Avi_5650			TRUE	0.980	4.000	0.250	NA		NA
5480934	5480935	Avi_5650	Avi_5651			TRUE	0.993	-7.000	0.167	NA		NA
5480935	5480936	Avi_5651	Avi_5652			TRUE	0.996	-3.000	0.429	1.000		NA
5480936	5480937	Avi_5652	Avi_5653			TRUE	0.980	-3.000	0.054	1.000		NA
5480937	5480938	Avi_5653	Avi_5654			TRUE	0.980	-3.000	0.053	1.000		NA
5480938	5480939	Avi_5654	Avi_5655			TRUE	0.963	9.000	0.184	1.000		NA
5480939	5480940	Avi_5655	Avi_5656			TRUE	0.937	17.000	0.189	1.000		NA
5480940	5480941	Avi_5656	Avi_5657			TRUE	0.999	0.000	0.966	0.084		NA
5480941	5480942	Avi_5657	Avi_5659			TRUE	0.997	5.000	0.929	1.000		NA
5480944	5480945	Avi_5661	Avi_5662			TRUE	0.999	-3.000	0.900	1.000		NA
5480945	5480946	Avi_5662	Avi_5663			TRUE	1.000	-3.000	0.900	0.084	Y	NA
5480946	5480947	Avi_5663	Avi_5666			TRUE	0.879	181.000	0.450	0.084	Y	NA
5480947	5480948	Avi_5666	Avi_5667		hadL	TRUE	0.810	83.000	0.375	1.000		NA
5480948	5480949	Avi_5667	Avi_5668	hadL	bioA	FALSE	0.362	246.000	0.300	1.000		NA
5480949	5480950	Avi_5668	Avi_5669	bioA		TRUE	0.681	19.000	0.000	1.000		NA
5480951	5480952	Avi_5670	Avi_5671	dehII	ordL	TRUE	0.969	4.000	0.150	1.000		NA
5480952	5480953	Avi_5671	Avi_5672	ordL		FALSE	0.070	186.000	0.000	NA		NA
5480954	5480955	Avi_5673	Avi_5674			TRUE	0.825	58.000	0.235	NA		NA
5480955	5480956	Avi_5674	Avi_5675		argE	TRUE	0.921	16.000	0.136	NA		NA
5480956	5480957	Avi_5675	Avi_5677	argE		FALSE	0.033	195.000	0.000	1.000	N	NA
5480958	5480959	Avi_5678	Avi_5679			TRUE	0.712	4.000	0.000	1.000	N	NA
5480959	5480960	Avi_5679	Avi_5680			FALSE	0.021	254.000	0.000	1.000	N	NA
5480960	5480961	Avi_5680	Avi_5681			FALSE	0.390	80.000	0.015	NA		NA
5480961	5480962	Avi_5681	Avi_5682			FALSE	0.350	58.000	0.000	NA		NA
5480962	5480963	Avi_5682	Avi_5683		accC	TRUE	0.933	3.000	0.021	NA		NA
5480964	5480965	Avi_5684	Avi_5686			TRUE	0.868	2.000	0.000	NA		NA
5480966	5480967	Avi_5687	Avi_5688	mutA		FALSE	0.072	105.000	0.000	1.000	N	NA
5480967	5480968	Avi_5688	Avi_5689			TRUE	0.941	6.000	0.074	NA		NA
5480968	5480969	Avi_5689	Avi_5690			FALSE	0.059	212.000	0.000	NA		NA
5480970	5480971	Avi_5691	Avi_5692			TRUE	0.979	45.000	0.429	1.000	Y	NA
5480971	5480972	Avi_5692	Avi_5693			FALSE	0.342	215.000	0.000	1.000	Y	NA
5480972	5480973	Avi_5693	Avi_5694			FALSE	0.074	200.000	0.000	1.000		NA
5480973	5480974	Avi_5694	Avi_5696			FALSE	0.094	135.000	0.000	NA		NA
5480974	5480975	Avi_5696	Avi_5697			FALSE	0.134	108.000	0.000	NA		NA
5480975	5480976	Avi_5697	Avi_5698			TRUE	0.800	10.000	0.000	1.000		NA
5480976	5480977	Avi_5698	Avi_5699			TRUE	0.973	-3.000	0.000	0.084		NA
5480977	5480978	Avi_5699	Avi_5700			TRUE	0.432	219.000	0.000	0.084	Y	NA
5480978	5480979	Avi_5700	Avi_5701			TRUE	0.550	112.000	0.000	1.000	Y	NA
5480980	5480981	Avi_5703	Avi_5704		dapE	FALSE	0.115	83.000	0.000	1.000	N	NA
5480981	5480982	Avi_5704	Avi_5706	dapE	celI	FALSE	0.060	117.000	0.000	1.000	N	NA
5480982	5480983	Avi_5706	Avi_5707	celI		FALSE	0.235	210.000	0.167	1.000	N	NA
5480983	5480984	Avi_5707	Avi_5708			TRUE	0.953	48.000	0.200	1.000	Y	NA
5480984	5480985	Avi_5708	Avi_5709			TRUE	1.000	-7.000	0.500	0.084	Y	NA
5480985	5480986	Avi_5709	Avi_5710			TRUE	0.999	-3.000	0.312	0.084	Y	NA
5480986	5480987	Avi_5710	Avi_5711			TRUE	0.988	43.000	0.455	0.084	Y	NA
5480991	5480992	Avi_5718	Avi_5719	ordL		TRUE	0.816	60.000	0.172	0.035	N	NA
5480993	5480994	Avi_5720	Avi_5722			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5480996	5480997	Avi_5724	Avi_5725			FALSE	0.026	224.000	0.000	1.000	N	NA
5480997	5480998	Avi_5725	Avi_5726		lysA	FALSE	0.005	533.000	0.000	1.000	N	NA
5480998	5480999	Avi_5726	Avi_5727	lysA	mdeA	TRUE	0.453	191.000	0.002	1.000	Y	NA
5480999	5481000	Avi_5727	Avi_5728	mdeA		TRUE	0.997	-3.000	0.583	1.000	N	NA
5481000	5481001	Avi_5728	Avi_5729			TRUE	0.989	0.000	0.364	NA	N	NA
5481002	5481003	Avi_5730	Avi_5731			TRUE	0.940	56.000	0.200	NA	Y	NA
5481003	5481004	Avi_5731	Avi_5732		pfrI	FALSE	0.007	376.000	0.000	NA	N	NA
5481004	5481005	Avi_5732	Avi_5733	pfrI		FALSE	0.370	146.000	0.158	1.000		NA
5481006	5481007	Avi_5734	Avi_5735			FALSE	0.118	117.000	0.000	NA		NA
5481008	5481009	Avi_5736	Avi_5738			TRUE	0.946	114.000	0.560	0.084	Y	NA
5481009	5481010	Avi_5738	Avi_5739			TRUE	1.000	-3.000	0.762	0.084	Y	NA
5481010	5481011	Avi_5739	Avi_5740			TRUE	0.998	-3.000	0.211	1.000	Y	NA
5481011	5481012	Avi_5740	Avi_5741			TRUE	0.999	-7.000	0.250	1.000	Y	NA
5481012	5481013	Avi_5741	Avi_5742			TRUE	0.996	0.000	0.222	1.000	Y	NA
5481014	5481015	Avi_5743	Avi_5744		soxA	TRUE	0.998	-7.000	0.370	0.002		NA
5481015	5481016	Avi_5744	Avi_5745	soxA	soxD	TRUE	0.999	-3.000	0.923	0.001		NA
5481016	5481017	Avi_5745	Avi_5746	soxD	soxB	TRUE	0.999	12.000	0.846	0.001	Y	NA
5481018	5481019	Avi_5747	Avi_5748	glxA		TRUE	0.903	41.000	0.140	0.021		NA
5481019	5481020	Avi_5748	Avi_5749		purF	TRUE	0.645	90.000	0.206	1.000		NA
5481020	5481021	Avi_5749	Avi_5750	purF	fwdC	TRUE	0.998	11.000	0.786	1.000	Y	NA
5481021	5481022	Avi_5750	Avi_5751	fwdC	gltB	TRUE	0.982	85.000	0.901	1.000	Y	NA
5481022	5481023	Avi_5751	Avi_5752	gltB	glnA	TRUE	0.955	82.000	0.493	1.000	Y	NA
5481024	5481025	Avi_5753	Avi_5754	tphA	lldA	FALSE	0.077	101.000	0.000	1.000	N	NA
5481025	5481026	Avi_5754	Avi_5755	lldA		FALSE	0.043	144.000	0.000	1.000	N	NA
5481027	5481028	Avi_5757	Avi_5758			TRUE	0.974	13.000	0.357	NA		NA
5481028	5481029	Avi_5758	Avi_5759			TRUE	0.731	75.000	0.211	1.000		NA
5481029	5481030	Avi_5759	Avi_5760			TRUE	0.893	24.000	0.184	1.000	N	NA
5481030	5481031	Avi_5760	Avi_5762			TRUE	0.993	42.000	0.667	0.084	Y	NA
5481031	5481032	Avi_5762	Avi_5763			TRUE	0.999	2.000	0.750	0.084	Y	NA
5481033	5481034	Avi_5764	Avi_5766	purR		FALSE	0.225	86.000	0.000	1.000		NA
5481034	5481035	Avi_5766	Avi_5768		adhP	FALSE	0.094	158.000	0.000	1.000		NA
5481035	5481036	Avi_5768	Avi_5769	adhP	dlhH	FALSE	0.195	142.000	0.018	1.000		NA
5481036	5481037	Avi_5769	Avi_5770	dlhH	guaB	FALSE	0.060	117.000	0.000	1.000	N	NA
5481037	5481038	Avi_5770	Avi_5771	guaB	oxyR	FALSE	0.400	57.000	0.002	1.000	N	NA
5481042	5481043	Avi_5777	Avi_5779			FALSE	0.124	273.000	0.066	NA		NA
5481043	5481044	Avi_5779	Avi_5780			FALSE	0.244	179.000	0.087	NA		NA
5481044	5481045	Avi_5780	Avi_5782		pit	TRUE	0.805	20.000	0.019	NA		NA
5481045	5481046	Avi_5782	Avi_5783	pit		FALSE	0.082	348.000	0.069	1.000		NA
5481047	5481048	Avi_5784	Avi_5786		glcD	FALSE	0.085	151.000	0.000	NA		NA
5481048	5481049	Avi_5786	Avi_5788	glcD	glcE	TRUE	0.999	-3.000	0.266	0.011	Y	NA
5481049	5481050	Avi_5788	Avi_5789	glcE	glcF	TRUE	0.981	39.000	0.227	0.035	Y	NA
5481050	5481051	Avi_5789	Avi_5790	glcF		FALSE	0.191	140.000	0.022	NA		NA
5481054	5481055	Avi_5794	Avi_5795	hisG	hisS	TRUE	0.996	0.000	0.239	1.000	Y	NA
5481055	5481056	Avi_5795	Avi_5796	hisS		FALSE	0.026	327.000	0.000	NA		NA
5481056	5481057	Avi_5796	Avi_5797			FALSE	0.024	338.000	0.000	NA		NA
5481060	5481061	Avi_5802	Avi_5803			TRUE	0.509	38.000	0.000	NA		NA
5481061	5481062	Avi_5803	Avi_5806			FALSE	0.012	502.000	0.000	NA		NA
5481062	5481063	Avi_5806	Avi_5807			FALSE	0.276	71.000	0.000	NA		NA
5481065	5481066	Avi_5810	Avi_5811			FALSE	0.363	155.000	0.172	NA		NA
5481067	5481068	Avi_5812	Avi_5813			FALSE	0.044	142.000	0.000	1.000	N	NA
5481068	5481069	Avi_5813	Avi_5814			FALSE	0.342	64.000	0.000	1.000		NA
5481071	5481072	Avi_5816	Avi_5817			TRUE	0.428	84.000	0.037	NA		NA
5481072	5481073	Avi_5817	Avi_5819		ileS	FALSE	0.054	337.000	0.019	NA		NA
5481073	5481074	Avi_5819	Avi_5820	ileS		FALSE	0.006	485.000	0.000	1.000	N	NA
5481074	5481075	Avi_5820	Avi_5821			TRUE	0.999	-10.000	0.947	NA		NA
5481075	5481076	Avi_5821	Avi_5822			FALSE	0.097	133.000	0.000	NA		NA
5481076	5481077	Avi_5822	Avi_5823		dapA	FALSE	0.088	144.000	0.000	NA		NA
5481077	5481078	Avi_5823	Avi_5824	dapA		TRUE	0.624	23.000	0.000	NA		NA
5481078	5481079	Avi_5824	Avi_5826		ribF	FALSE	0.021	361.000	0.000	NA		NA
5481079	5481080	Avi_5826	Avi_5827	ribF		TRUE	0.857	13.000	0.049	1.000	N	NA
5481080	5481081	Avi_5827	Avi_5828			FALSE	0.218	107.000	0.027	1.000	N	NA
5481082	5481083	Avi_5829	Avi_5830	groES	groEL	TRUE	0.913	68.000	0.087	0.089	Y	NA
5481083	5481084	Avi_5830	Avi_5832	groEL		FALSE	0.010	587.000	0.000	NA		NA
5481084	5481085	Avi_5832	Avi_5833		hyuB	FALSE	0.031	301.000	0.000	NA		NA
5481085	5481086	Avi_5833	Avi_5834	hyuB	hyuA	TRUE	0.998	-3.000	0.091	0.002	Y	NA
5481086	5481087	Avi_5834	Avi_5835	hyuA	potG	TRUE	0.991	2.000	0.061	1.000	Y	NA
5481087	5481088	Avi_5835	Avi_5836	potG		TRUE	0.986	67.000	0.667	0.084	Y	NA
5481088	5481089	Avi_5836	Avi_5839			TRUE	0.778	299.000	0.500	0.084	Y	NA
5481089	5481090	Avi_5839	Avi_5840		potI	TRUE	1.000	-3.000	0.750	0.084	Y	NA
5481092	5481093	Avi_5843	Avi_5844	nspC		TRUE	0.984	39.000	0.444	NA	Y	NA
5481094	5481095	Avi_5845	Avi_5847			TRUE	0.911	21.000	0.203	1.000	N	NA
5481095	5481096	Avi_5847	Avi_5849			TRUE	0.938	8.000	0.082	NA		NA
5481096	5481097	Avi_5849	Avi_5851			FALSE	0.387	115.000	0.108	NA		NA
5481097	5481098	Avi_5851	Avi_5852			TRUE	0.890	35.000	0.189	1.000		NA
5481102	5481103	Avi_5857	Avi_5858			FALSE	0.038	273.000	0.000	NA		NA
5481104	5481105	Avi_5861	Avi_5862		attK2	FALSE	0.089	95.000	0.000	1.000	N	NA
5481107	5481108	Avi_5865	Avi_5866			TRUE	0.941	13.000	0.145	1.000		NA
5481108	5481109	Avi_5866	Avi_5868		accC	TRUE	0.981	-3.000	0.000	0.002		NA
5481109	5481110	Avi_5868	Avi_5869	accC		TRUE	0.950	0.000	0.057	1.000	N	NA
5481110	5481111	Avi_5869	Avi_5870			TRUE	1.000	-10.000	0.886	NA	Y	NA
5481113	5481114	Avi_5873	Avi_5874			TRUE	1.000	-7.000	1.000	0.084	Y	NA
5481114	5481115	Avi_5874	Avi_5876			TRUE	1.000	2.000	1.000	0.084	Y	NA
5481115	5481116	Avi_5876	Avi_5877			TRUE	0.995	-3.000	0.400	1.000	N	NA
5481116	5481117	Avi_5877	Avi_5878			TRUE	0.996	20.000	0.500	0.001	Y	NA
5481117	5481118	Avi_5878	Avi_5880			TRUE	0.999	-13.000	0.857	NA	N	NA
5481118	5481119	Avi_5880	Avi_5881			TRUE	0.893	210.000	0.714	NA	Y	NA
5481119	5481120	Avi_5881	Avi_5882			TRUE	0.827	48.000	0.172	1.000		NA
5481120	5481121	Avi_5882	Avi_5883			TRUE	0.934	55.000	0.517	NA		NA
5481121	5481122	Avi_5883	Avi_5884			TRUE	0.999	-7.000	0.788	NA		NA
5481122	5481123	Avi_5884	Avi_5885			TRUE	0.799	74.000	0.303	NA		NA
5481123	5481124	Avi_5885	Avi_5886		gatA	TRUE	0.824	23.000	0.087	NA	N	NA
5481126	5481127	Avi_5888	Avi_5890			FALSE	0.028	218.000	0.000	1.000	N	NA
5481128	5481129	Avi_5891	Avi_5892	cysG	nasA	TRUE	0.978	-28.000	0.026	1.000	N	NA
5481129	5481130	Avi_5892	Avi_5893	nasA	nirD	TRUE	0.974	6.000	0.294	1.000	N	NA
5481130	5481131	Avi_5893	Avi_5894	nirD	nirB	TRUE	0.994	5.000	0.539	0.000	N	NA
5481131	5481132	Avi_5894	Avi_5895	nirB	nrtC	TRUE	0.922	6.000	0.074	1.000	N	NA
5481132	5481133	Avi_5895	Avi_5896	nrtC	nrtB	TRUE	0.997	9.000	0.323	0.000	Y	NA
5481133	5481134	Avi_5896	Avi_5897	nrtB	nrtA	TRUE	0.997	24.000	0.915	NA	Y	NA
5481134	5481135	Avi_5897	Avi_5899	nrtA	nrtC	FALSE	0.118	410.000	0.000	NA	Y	NA
5481135	5481136	Avi_5899	Avi_5900	nrtC	nasT	TRUE	0.977	13.000	0.466	NA	N	NA
5481141	5481142	Avi_5908	Avi_5909	gcdH	caiB	TRUE	0.913	11.000	0.098	1.000	N	NA
5481142	5481143	Avi_5909	Avi_5910	caiB		FALSE	0.137	107.000	0.000	NA		NA
5481143	5481144	Avi_5910	Avi_5913			FALSE	0.059	212.000	0.000	NA		NA
5481144	5481145	Avi_5913	Avi_5914		dat	TRUE	0.956	28.000	0.061	NA	Y	NA
5481147	5481148	Avi_5916	Avi_5917		thiC	FALSE	0.016	292.000	0.000	1.000	N	NA
5481148	5481149	Avi_5917	Avi_5918	thiC	thiO	TRUE	0.915	2.000	0.022	1.000	N	NA
5481149	5481150	Avi_5918	Avi_5919	thiO	thiS	TRUE	0.987	-3.000	0.192	1.000	N	NA
5481150	5481151	Avi_5919	Avi_5920	thiS	thiG	TRUE	0.992	2.000	0.095	1.000	Y	NA
5481151	5481152	Avi_5920	Avi_5922	thiG		TRUE	0.998	-3.000	0.118	0.003	Y	NA
5481152	5481153	Avi_5922	Avi_6501			FALSE	0.011	552.000	0.000	NA		NA
5481153	5481154	Avi_6501	Avi_6551			FALSE	0.018	392.000	0.000	NA		NA
5481154	5481155	Avi_6551	Avi_6552			FALSE	0.206	85.000	0.000	NA		NA
5481155	5481156	Avi_6552	Avi_6502			FALSE	0.006	985.000	0.000	NA		NA
5481156	5481157	Avi_6502	Avi_6503			FALSE	0.009	600.000	0.000	NA		NA
5481157	5481158	Avi_6503	Avi_6553			FALSE	0.116	118.000	0.000	NA		NA
5481158	5481159	Avi_6553	Avi_5923			FALSE	0.037	277.000	0.000	NA		NA
5481160	5481161	Avi_5924	Avi_5925	exoP	exoO	FALSE	0.068	641.000	0.000	1.000	Y	NA
5481161	5481162	Avi_5925	Avi_5926	exoO	exoM	TRUE	0.998	-3.000	0.280	NA	Y	NA
5481162	5481163	Avi_5926	Avi_5927	exoM	exoA	TRUE	0.997	-3.000	0.143	NA	Y	NA
5481163	5481164	Avi_5927	Avi_5928	exoA	exoL	TRUE	0.992	-10.000	0.143	NA		NA
5481164	5481165	Avi_5928	Avi_5929	exoL	exoK	FALSE	0.217	230.000	0.129	NA		NA
5481165	5481166	Avi_5929	Avi_5930	exoK	exoH	TRUE	0.985	2.000	0.250	1.000		NA
5481166	5481167	Avi_5930	Avi_5931	exoH	exoT	FALSE	0.016	447.000	0.000	1.000		NA
5481168	5481169	Avi_5932	Avi_5933	exoW	exoV	TRUE	0.602	74.000	0.100	NA		NA
5481170	5481171	Avi_5934	Avi_5935	exoU	exoX	FALSE	0.038	273.000	0.000	NA		NA
5481172	5481173	Avi_5936	Avi_5937	exoY	exoF	TRUE	0.853	97.000	0.611	NA		NA
5481173	5481174	Avi_5937	Avi_5938	exoF	exoQ	TRUE	0.985	7.000	0.400	NA		NA
5481174	5481175	Avi_5938	Avi_5941	exoQ		FALSE	0.011	525.000	0.000	NA		NA
5481175	5481176	Avi_5941	Avi_5942			TRUE	0.553	32.000	0.000	NA		NA
5481177	5481178	Avi_5943	Avi_5945			TRUE	0.574	135.000	0.333	NA		NA
5481179	5481180	Avi_5946	Avi_5948		pssN	FALSE	0.028	216.000	0.000	1.000	N	NA
5481182	5481183	Avi_5950	Avi_5952			FALSE	0.030	303.000	0.000	NA		NA
5481183	5481184	Avi_5952	Avi_5953		vdh	TRUE	0.885	23.000	0.111	NA		NA
5481185	5481186	Avi_5954	Avi_5955			FALSE	0.141	105.000	0.000	NA		NA
5481186	5481187	Avi_5955	Avi_5956		hutU	TRUE	0.961	2.000	0.077	NA		NA
5481187	5481188	Avi_5956	Avi_5957	hutU	hutG	TRUE	0.991	3.000	0.081	1.000	Y	NA
5481188	5481189	Avi_5957	Avi_5958	hutG	hutH	TRUE	0.992	1.000	0.064	1.000	Y	NA
5481189	5481190	Avi_5958	Avi_5959	hutH	hutI	TRUE	0.955	16.000	0.192	0.024	N	NA
5481192	5481193	Avi_5962	Avi_5963			FALSE	0.380	21.000	0.000	NA	N	NA
5481193	5481194	Avi_5963	Avi_5964			TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5481194	5481195	Avi_5964	Avi_5965			TRUE	0.998	-3.000	0.312	1.000	Y	NA
5481195	5481196	Avi_5965	Avi_5966			TRUE	1.000	-3.000	0.812	0.011	Y	NA
5481196	5481197	Avi_5966	Avi_5967			TRUE	0.903	287.000	0.846	0.083	Y	NA
5481197	5481198	Avi_5967	Avi_5968		frcK	FALSE	0.030	210.000	0.000	1.000	N	NA
5481198	5481199	Avi_5968	Avi_5969	frcK	frcA	TRUE	0.984	-3.000	0.020	0.088		NA
5481199	5481200	Avi_5969	Avi_5970	frcA	frcC	TRUE	0.999	-24.000	0.797	1.000		NA
5481200	5481201	Avi_5970	Avi_5971	frcC	frcB	TRUE	0.895	196.000	0.676	NA	Y	NA
5481202	5481203	Avi_5972	Avi_5973	frcR		TRUE	0.995	1.000	0.188	1.000	Y	NA
5481204	5481205	Avi_5975	Avi_5976			FALSE	0.295	42.000	0.000	1.000	N	NA
5481206	5481207	Avi_5977	Avi_5979	rocF	ocd	TRUE	0.995	0.000	0.174	1.000	Y	NA
5481207	5481208	Avi_5979	Avi_5980	ocd		FALSE	0.219	87.000	0.000	1.000		NA
5481208	5481209	Avi_5980	Avi_5981		yteR	FALSE	0.110	133.000	0.000	1.000		NA
5481210	5481211	Avi_5982	Avi_5983	tonB	exbD	TRUE	0.986	-3.000	0.179	1.000	N	NA
5481211	5481212	Avi_5983	Avi_5985	exbD	exbB	TRUE	0.999	5.000	0.810	0.093	Y	NA
5481217	5481218	Avi_5993	Avi_5995			TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5481219	5481220	Avi_5998	Avi_5999			FALSE	0.043	255.000	0.000	NA		NA
5481220	5481221	Avi_5999	Avi_6000			FALSE	0.187	178.000	0.091	NA	N	NA
5481223	5481224	Avi_6002	Avi_6003			FALSE	0.129	111.000	0.000	NA		NA
5481224	5481225	Avi_6003	Avi_6004			TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5481227	5481228	Avi_6007	Avi_6008			TRUE	0.998	-3.000	0.751	1.000	N	NA
5481230	5481231	Avi_6010	Avi_6011		purU	FALSE	0.018	279.000	0.000	1.000	N	NA
5481233	5481234	Avi_6013	Avi_6014	rfe		FALSE	0.186	90.000	0.000	NA		NA
5481235	5481236	Avi_6015	Avi_6016			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481236	5481237	Avi_6016	Avi_6017			TRUE	0.756	55.000	0.133	NA		NA
5481237	5481238	Avi_6017	Avi_6018			FALSE	0.083	159.000	0.000	NA		NA
5481239	5481240	Avi_6019	Avi_6020			TRUE	0.870	55.000	0.300	NA		NA
5481240	5481241	Avi_6020	Avi_6021			TRUE	0.922	3.000	0.008	NA		NA
5481241	5481242	Avi_6021	Avi_6022		acd	TRUE	0.860	5.000	0.016	NA	N	NA
5481242	5481243	Avi_6022	Avi_6023	acd		TRUE	0.993	0.000	0.440	1.000		NA
5481243	5481244	Avi_6023	Avi_6024		kamA	FALSE	0.051	233.000	0.000	NA		NA
5481244	5481245	Avi_6024	Avi_6025	kamA	poxA	TRUE	0.985	-3.000	0.174	NA	N	NA
5481247	5481248	Avi_6027	Avi_6028	nodT	acrB	FALSE	0.192	111.000	0.000	0.083	N	NA
5481248	5481249	Avi_6028	Avi_6029	acrB	acrA	TRUE	0.974	45.000	0.857	1.000	N	NA
5481249	5481250	Avi_6029	Avi_6030	acrA	ameR	TRUE	0.704	173.000	0.667	1.000	N	NA
5481250	5481251	Avi_6030	Avi_6031	ameR	purC	TRUE	0.852	6.000	0.010	1.000	N	NA
5481251	5481252	Avi_6031	Avi_6032	purC		FALSE	0.028	216.000	0.000	1.000	N	NA
5481253	5481254	Avi_6504	Avi_6554			FALSE	0.018	392.000	0.000	NA		NA
5481254	5481255	Avi_6554	Avi_6555			FALSE	0.206	85.000	0.000	NA		NA
5481255	5481256	Avi_6555	Avi_6505			FALSE	0.006	985.000	0.000	NA		NA
5481256	5481257	Avi_6505	Avi_6506			FALSE	0.009	600.000	0.000	NA		NA
5481257	5481258	Avi_6506	Avi_6556			FALSE	0.116	118.000	0.000	NA		NA
5481259	5481260	Avi_6034	Avi_6035			FALSE	0.216	83.000	0.000	NA		NA
5481260	5481261	Avi_6035	Avi_6036			FALSE	0.383	54.000	0.000	NA		NA
5481261	5481262	Avi_6036	Avi_6037			FALSE	0.338	60.000	0.000	NA		NA
5481264	5481265	Avi_6039	Avi_6040	impN	impM	TRUE	0.998	-13.000	0.500	1.000		NA
5481265	5481266	Avi_6040	Avi_6041	impM	impL	TRUE	0.696	101.000	0.333	NA		NA
5481266	5481267	Avi_6041	Avi_6042	impL	impK	TRUE	0.996	-3.000	0.400	NA		NA
5481267	5481268	Avi_6042	Avi_6043	impK	impJ	TRUE	0.995	-3.000	0.385	NA		NA
5481268	5481269	Avi_6043	Avi_6044	impJ	impI	TRUE	0.995	-10.000	0.231	NA		NA
5481269	5481270	Avi_6044	Avi_6045	impI	impH	TRUE	0.989	-3.000	0.176	NA		NA
5481270	5481271	Avi_6045	Avi_6046	impH	impG	TRUE	0.976	9.000	0.300	NA		NA
5481271	5481272	Avi_6046	Avi_6047	impG	impF	TRUE	0.996	-7.000	0.300	NA		NA
5481272	5481273	Avi_6047	Avi_6048	impF	impE	TRUE	0.995	-7.000	0.250	NA		NA
5481273	5481274	Avi_6048	Avi_6049	impE	impD	TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
5481274	5481275	Avi_6049	Avi_6050	impD	impC	TRUE	0.636	103.000	0.278	NA		NA
5481275	5481276	Avi_6050	Avi_6051	impC	impB	TRUE	0.757	73.000	0.235	NA		NA
5481276	5481277	Avi_6051	Avi_6052	impB	impA	TRUE	0.721	76.000	0.221	NA		NA
5481278	5481279	Avi_6053	Avi_6054	clpB		TRUE	0.732	63.000	0.158	NA		NA
5481279	5481280	Avi_6054	Avi_6056			FALSE	0.045	250.000	0.000	NA		NA
5481280	5481281	Avi_6056	Avi_6059		secD	FALSE	0.007	864.000	0.000	NA		NA
5481282	5481283	Avi_6060	Avi_6061		acd	FALSE	0.079	168.000	0.000	NA		NA
5481283	5481284	Avi_6061	Avi_6062	acd		FALSE	0.080	302.000	0.071	1.000	N	NA
5481285	5481286	Avi_6064	Avi_6065		arsB	TRUE	0.686	5.000	0.000	1.000	N	NA
5481286	5481287	Avi_6065	Avi_6066	arsB	arsC	TRUE	0.996	-3.000	0.105	1.000	Y	NA
5481287	5481288	Avi_6066	Avi_6068	arsC	arsH	TRUE	0.967	2.000	0.105	NA		NA
5481288	5481289	Avi_6068	Avi_6069	arsH		TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481290	5481291	Avi_6070	Avi_6071	kdpE	kdpD	TRUE	0.999	-3.000	0.695	1.000	Y	NA
5481291	5481292	Avi_6071	Avi_6072	kdpD	kdpC	TRUE	0.923	10.000	0.106	1.000	N	NA
5481292	5481293	Avi_6072	Avi_6073	kdpC	kdpB	TRUE	1.000	3.000	0.877	0.001	Y	NA
5481293	5481294	Avi_6073	Avi_6074	kdpB	kdpA	TRUE	0.990	19.000	0.201	0.001	Y	NA
5481294	5481295	Avi_6074	Avi_6076	kdpA		FALSE	0.012	487.000	0.000	NA		NA
5481296	5481297	Avi_6077	Avi_6078	recQ		TRUE	0.512	16.000	0.000	1.000	N	NA
5481298	5481299	Avi_6079	Avi_6080	dadA	alr	TRUE	0.858	18.000	0.089	1.000	N	NA
5481300	5481301	Avi_6081	Avi_6082			TRUE	0.705	102.000	0.000	0.042	Y	NA
5481301	5481302	Avi_6082	Avi_6083			FALSE	0.147	102.000	0.000	NA		NA
5481302	5481303	Avi_6083	Avi_6084			TRUE	0.985	15.000	0.582	NA		NA
5481303	5481304	Avi_6084	Avi_6086			TRUE	0.926	32.000	0.273	NA		NA
5481304	5481305	Avi_6086	Avi_6087			TRUE	0.990	4.000	0.452	NA		NA
5481305	5481306	Avi_6087	Avi_6088		dhaS	TRUE	0.997	5.000	0.548	NA	Y	NA
5481306	5481307	Avi_6088	Avi_6089	dhaS		FALSE	0.118	82.000	0.000	1.000	N	NA
5481307	5481308	Avi_6089	Avi_6090			TRUE	0.935	88.000	0.304	0.082	Y	NA
5481308	5481309	Avi_6090	Avi_6091			TRUE	0.999	2.000	0.852	0.082	Y	NA
5481309	5481310	Avi_6091	Avi_6092			TRUE	1.000	-3.000	0.815	0.082	Y	NA
5481310	5481311	Avi_6092	Avi_6093		attK	FALSE	0.041	160.000	0.000	1.000	N	NA
5481312	5481313	Avi_6094	Avi_6095			TRUE	0.667	21.000	0.000	1.000		NA
5481313	5481314	Avi_6095	Avi_6096		fdh	TRUE	0.459	20.000	0.000	1.000	N	NA
5481314	5481315	Avi_6096	Avi_6097	fdh		TRUE	0.705	17.000	0.000	1.000		NA
5481315	5481316	Avi_6097	Avi_6098		rbsC	TRUE	0.930	4.000	0.000	0.082		NA
5481316	5481317	Avi_6098	Avi_6099	rbsC	rbsA	TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5481317	5481318	Avi_6099	Avi_6100	rbsA		TRUE	0.746	72.000	0.000	NA	Y	NA
5481318	5481319	Avi_6100	Avi_6101			FALSE	0.229	43.000	0.000	NA	N	NA
5481320	5481321	Avi_6102	Avi_6103		garD	TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5481321	5481322	Avi_6103	Avi_6104	garD		FALSE	0.065	111.000	0.000	1.000	N	NA
5481322	5481323	Avi_6104	Avi_6105			FALSE	0.348	35.000	0.000	1.000	N	NA
5481323	5481324	Avi_6105	Avi_6106			TRUE	0.698	31.000	0.000	0.053	N	NA
5481325	5481326	Avi_6107	Avi_6108	tctE	tctD	TRUE	0.999	-3.000	0.688	1.000	Y	NA
5481327	5481328	Avi_6109	Avi_6110			FALSE	0.050	253.000	0.000	1.000		NA
5481328	5481329	Avi_6110	Avi_6111			TRUE	0.999	-3.000	0.938	NA		NA
5481329	5481330	Avi_6111	Avi_6112			TRUE	0.988	23.000	0.812	NA		NA
5481330	5481331	Avi_6112	Avi_6114			FALSE	0.266	292.000	0.286	NA		NA
5481332	5481333	Avi_6115	Avi_6117		pcaF	FALSE	0.020	397.000	0.000	1.000		NA
5481333	5481334	Avi_6117	Avi_6118	pcaF	pcaJ	TRUE	0.996	10.000	0.517	1.000	Y	NA
5481334	5481335	Avi_6118	Avi_6120	pcaJ	pcaI	TRUE	1.000	-3.000	0.857	0.000	Y	NA
5481340	5481341	Avi_6126	Avi_6127	pcaD	pcaC	TRUE	0.920	43.000	0.333	1.000		NA
5481341	5481342	Avi_6127	Avi_6128	pcaC	pcaH	TRUE	0.640	46.000	0.015	1.000		NA
5481342	5481343	Avi_6128	Avi_6129	pcaH	pcaG	TRUE	0.999	2.000	0.782	0.000	Y	NA
5481343	5481344	Avi_6129	Avi_6130	pcaG	pcaB	TRUE	0.973	9.000	0.314	1.000	N	NA
5481347	5481348	Avi_6134	Avi_6135			TRUE	0.994	-3.000	0.275	0.082	N	NA
5481348	5481349	Avi_6135	Avi_6136			TRUE	0.920	251.000	0.824	0.082	Y	NA
5481349	5481350	Avi_6136	Avi_6137			FALSE	0.009	332.000	0.000	NA	N	NA
5481350	5481351	Avi_6137	Avi_6139			FALSE	0.082	162.000	0.000	NA		NA
5481352	5481353	Avi_6140	Avi_6143		exsA	FALSE	0.007	761.000	0.000	NA		NA
5481354	5481355	Avi_6144	Avi_6145			TRUE	0.985	0.000	0.000	1.000	Y	NA
5481356	5481357	Avi_6146	Avi_6557			FALSE	0.090	140.000	0.000	NA		NA
5481357	5481358	Avi_6557	Avi_6560			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5481359	5481360	Avi_6147	Avi_6148			TRUE	0.729	13.000	0.000	NA		NA
5481360	5481361	Avi_6148	Avi_6150			FALSE	0.006	1040.000	0.000	NA		NA
5481361	5481362	Avi_6150	Avi_6151			FALSE	0.028	316.000	0.000	NA		NA
5481362	5481363	Avi_6151	Avi_6152			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481363	5481364	Avi_6152	Avi_6153			TRUE	0.961	-18.000	0.000	NA		NA
5481364	5481365	Avi_6153	Avi_6154		dnaN	TRUE	0.957	-7.000	0.000	NA		NA
5481365	5481366	Avi_6154	Avi_6155	dnaN		FALSE	0.065	201.000	0.000	NA		NA
5481366	5481367	Avi_6155	Avi_6157			FALSE	0.085	151.000	0.000	NA		NA
5481367	5481368	Avi_6157	Avi_6158			FALSE	0.079	167.000	0.000	NA		NA
5481368	5481369	Avi_6158	Avi_6161			FALSE	0.015	432.000	0.000	NA		NA
5481369	5481370	Avi_6161	Avi_6162			FALSE	0.305	65.000	0.000	NA		NA
5481371	5481372	Avi_6163	Avi_6164			TRUE	0.800	7.000	0.000	NA		NA
5481374	5481375	Avi_6166	Avi_6167			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481375	5481376	Avi_6167	Avi_6168			FALSE	0.286	69.000	0.000	NA		NA
5481376	5481377	Avi_6168	Avi_6173			FALSE	0.007	866.000	0.000	NA		NA
5481377	5481378	Avi_6173	Avi_6175			FALSE	0.054	226.000	0.000	NA		NA
5481378	5481379	Avi_6175	Avi_6177			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481379	5481380	Avi_6177	Avi_6178			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481380	5481381	Avi_6178	Avi_6179			FALSE	0.007	825.000	0.000	NA		NA
5481381	5481382	Avi_6179	Avi_6181			FALSE	0.093	137.000	0.000	NA		NA
5481382	5481383	Avi_6181	Avi_6182			TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5481383	5481384	Avi_6182	Avi_6184			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5481384	5481385	Avi_6184	Avi_6185			TRUE	0.999	-22.000	0.667	NA		NA
5481385	5481386	Avi_6185	Avi_6186			TRUE	0.971	10.000	0.261	NA		NA
5481386	5481387	Avi_6186	Avi_6187			TRUE	0.720	53.000	0.087	NA		NA
5481387	5481388	Avi_6187	Avi_6188			FALSE	0.319	63.000	0.000	NA		NA
5481388	5481389	Avi_6188	Avi_6189			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5481389	5481390	Avi_6189	Avi_6190			TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5481390	5481391	Avi_6190	Avi_6192			TRUE	0.952	4.000	0.077	NA		NA
5481391	5481392	Avi_6192	Avi_6193			TRUE	0.661	18.000	0.000	NA		NA
5481392	5481393	Avi_6193	Avi_6194			TRUE	0.793	8.000	0.000	NA		NA
5481393	5481394	Avi_6194	Avi_6195			FALSE	0.319	63.000	0.000	NA		NA
5481394	5481395	Avi_6195	Avi_6196			FALSE	0.129	111.000	0.000	NA		NA
5481395	5481396	Avi_6196	Avi_6197			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5481396	5481397	Avi_6197	Avi_6198			TRUE	0.995	3.000	0.667	NA		NA
5481399	5481400	Avi_6201	Avi_6202		dsd	FALSE	0.088	144.000	0.000	NA		NA
5481400	5481401	Avi_6202	Avi_6204	dsd		FALSE	0.039	269.000	0.000	NA		NA
5481401	5481402	Avi_6204	Avi_6207		emrA	FALSE	0.010	598.000	0.000	NA		NA
5481402	5481403	Avi_6207	Avi_6209	emrA		FALSE	0.042	257.000	0.000	NA		NA
5481403	5481404	Avi_6209	Avi_6210			TRUE	0.868	2.000	0.000	NA		NA
5481404	5481405	Avi_6210	Avi_6211			TRUE	0.809	6.000	0.000	NA		NA
5481406	5481407	Avi_6212	Avi_6213	surf	cyoD	TRUE	0.961	65.000	0.849	NA		NA
5481407	5481408	Avi_6213	Avi_6214	cyoD	cyoC	TRUE	1.000	-3.000	0.906	0.041	Y	NA
5481408	5481409	Avi_6214	Avi_6215	cyoC	cyoB	TRUE	0.999	5.000	0.847	0.041	Y	NA
5481409	5481410	Avi_6215	Avi_6217	cyoB	cyoA	TRUE	0.997	41.000	0.915	0.006	Y	NA
5481411	5481412	Avi_6218	Avi_6219			TRUE	0.999	-16.000	0.475	NA	Y	NA
5481412	5481413	Avi_6219	Avi_6220			TRUE	0.731	96.000	0.343	NA		NA
5481415	5481416	Avi_6222	Avi_6224	nnrU	exsH	FALSE	0.074	178.000	0.000	NA		NA
5481416	5481417	Avi_6224	Avi_6558	exsH	suhB	TRUE	0.960	-13.000	0.000	NA		NA
5481419	5481420	Avi_6227	Avi_6228	dctB	dctD	TRUE	0.999	-3.000	0.615	0.087	Y	NA
5481423	5481424	Avi_6233	Avi_6234		nagA	TRUE	0.995	-3.000	0.056	NA	Y	NA
5481424	5481425	Avi_6234	Avi_6235	nagA	glmS	TRUE	0.994	-3.000	0.369	1.000	N	NA
5481425	5481426	Avi_6235	Avi_6236	glmS		TRUE	0.968	29.000	0.577	1.000	N	NA
5481427	5481428	Avi_6237	Avi_6238		malF	TRUE	0.976	10.000	0.300	1.000		NA
5481428	5481429	Avi_6238	Avi_6239	malF	malG	TRUE	0.999	-3.000	0.433	0.081	Y	NA
5481429	5481430	Avi_6239	Avi_6240	malG	malE	TRUE	0.976	57.000	0.357	0.081	Y	NA
5481430	5481431	Avi_6240	Avi_6242	malE	malK	TRUE	0.932	104.000	0.400	0.081	Y	NA
5481432	5481433	Avi_6243	Avi_6244			TRUE	0.980	2.000	0.205	NA		NA
5481433	5481434	Avi_6244	Avi_6246			FALSE	0.343	217.000	0.231	NA		NA
5481435	5481436	Avi_6248	Avi_6249			FALSE	0.387	20.000	0.000	NA	N	NA
5481436	5481437	Avi_6249	Avi_6250			TRUE	0.989	2.000	0.417	1.000	N	NA
5481437	5481438	Avi_6250	Avi_6251			TRUE	0.893	35.000	0.250	1.000	N	NA
5481438	5481439	Avi_6251	Avi_6252			TRUE	0.931	12.000	0.109	NA		NA
5481439	5481440	Avi_6252	Avi_6253			FALSE	0.351	109.000	0.065	NA		NA
5481440	5481441	Avi_6253	Avi_6254		cutC	TRUE	0.608	25.000	0.000	NA		NA
5481442	5481443	Avi_6255	Avi_6256			FALSE	0.031	160.000	0.000	NA	N	NA
5481445	5481446	Avi_6258	Avi_6259			TRUE	0.997	-3.000	0.143	1.000	Y	NA
5481448	5481449	Avi_6559	Avi_6262	suhB		FALSE	0.097	133.000	0.000	NA		NA
5481449	5481450	Avi_6262	Avi_6263		rhaI	TRUE	0.509	38.000	0.000	NA		NA
5481450	5481451	Avi_6263	Avi_6264	rhaI	rhaD	TRUE	0.849	39.000	0.147	NA		NA
5481452	5481453	Avi_6265	Avi_6266		rhaS	TRUE	0.965	56.000	0.357	NA	Y	NA
5481453	5481454	Avi_6266	Avi_6267	rhaS		TRUE	0.909	107.000	0.446	NA	Y	NA
5481454	5481455	Avi_6267	Avi_6268			TRUE	0.998	10.000	0.794	1.000	Y	NA
5481455	5481456	Avi_6268	Avi_6269			TRUE	0.999	-3.000	0.515	0.081	Y	NA
5481456	5481457	Avi_6269	Avi_6270		rhaU	TRUE	0.973	3.000	0.168	NA		NA
5481457	5481458	Avi_6270	Avi_6271	rhaU		TRUE	0.988	-3.000	0.147	NA		NA
5481458	5481459	Avi_6271	Avi_6272			FALSE	0.054	124.000	0.000	1.000	N	NA
5481459	5481460	Avi_6272	Avi_6273			FALSE	0.016	293.000	0.000	1.000	N	NA
5481461	5481462	Avi_6274	Avi_6275			TRUE	0.994	25.000	0.613	1.000	Y	NA
5481462	5481463	Avi_6275	Avi_6277			TRUE	0.999	4.000	0.571	0.081	Y	NA
5481463	5481464	Avi_6277	Avi_6278			TRUE	0.842	79.000	0.094	NA	Y	NA
5481464	5481465	Avi_6278	Avi_6279			TRUE	0.995	28.000	0.737	NA	Y	NA
5481466	5481467	Avi_6280	Avi_6281			FALSE	0.048	239.000	0.000	NA		NA
5481467	5481468	Avi_6281	Avi_6283			FALSE	0.019	385.000	0.000	NA		NA
5481468	5481469	Avi_6283	Avi_6284		attE	FALSE	0.172	65.000	0.000	1.000	N	NA
5481469	5481470	Avi_6284	Avi_6285	attE	attG	TRUE	0.996	0.000	0.680	NA	N	NA
5481470	5481471	Avi_6285	Avi_6286	attG		TRUE	0.999	-10.000	0.627	NA		NA
5481471	5481472	Avi_6286	Avi_6287			FALSE	0.093	160.000	0.000	1.000		NA
5481472	5481473	Avi_6287	Avi_6288			TRUE	1.000	-3.000	0.859	0.000	Y	NA
5481473	5480397	Avi_6288	Avi_5000		repA	FALSE	0.017	287.000	0.000	1.000	N	NA
5476262	5476263	Avi_9001	Avi_9002	repA	repB	TRUE	0.888	83.000	0.667	1.000	N	NA
5476263	5476264	Avi_9002	Avi_9003	repB	repC	FALSE	0.069	188.000	0.000	NA		NA
5476268	5476269	Avi_9009	Avi_9010			FALSE	0.041	262.000	0.000	NA		NA
5476270	5476271	Avi_9011	Avi_9013			TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5476273	5476274	Avi_9017	Avi_9018	orfB		TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476274	5476275	Avi_9018	Avi_9019			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476275	5476276	Avi_9019	Avi_9020			TRUE	0.648	52.000	0.000	0.048		NA
5476277	5476278	Avi_9021	Avi_9024			FALSE	0.230	79.000	0.000	NA		NA
5476279	5476280	Avi_9026	Avi_9028			FALSE	0.132	109.000	0.000	NA		NA
5476280	5476281	Avi_9028	Avi_9030			FALSE	0.059	232.000	0.000	1.000		NA
5476281	5476282	Avi_9030	Avi_9031			FALSE	0.085	150.000	0.000	NA		NA
5476282	5476283	Avi_9031	Avi_9035			FALSE	0.300	66.000	0.000	NA		NA
5476283	5476284	Avi_9035	Avi_9036			FALSE	0.276	71.000	0.000	NA		NA
5476285	5476286	Avi_9037	Avi_9038			TRUE	0.962	-7.000	0.000	1.000		NA
5476287	5476288	Avi_9039	Avi_9041		cvgS	FALSE	0.423	25.000	0.000	1.000	N	NA
5476288	5476289	Avi_9041	Avi_9042	cvgS		FALSE	0.010	371.000	0.000	1.000	N	NA
5476289	5476290	Avi_9042	Avi_9043			FALSE	0.098	147.000	0.000	1.000		NA
5476290	5476291	Avi_9043	Avi_9044			FALSE	0.311	64.000	0.000	NA		NA
5476291	5476292	Avi_9044	Avi_9047			TRUE	0.661	18.000	0.000	NA		NA
5476293	5476294	Avi_9049	Avi_9050			FALSE	0.292	214.000	0.185	NA		NA
5476294	5476295	Avi_9050	Avi_9052			FALSE	0.068	192.000	0.000	NA		NA
5476295	5476296	Avi_9052	Avi_9053			FALSE	0.017	246.000	0.000	NA	N	NA
5476297	5476298	Avi_9054	Avi_9055			TRUE	0.990	-7.000	0.098	NA		NA
5476301	5476302	Avi_9059	Avi_9061			TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5476302	5476303	Avi_9061	Avi_9064			FALSE	0.023	343.000	0.000	NA		NA
5476305	5476306	Avi_9066	Avi_9067			FALSE	0.276	71.000	0.000	NA		NA
5476307	5476308	Avi_9068	Avi_9071			FALSE	0.023	656.000	0.000	0.047		NA
5476308	5476309	Avi_9071	Avi_9072			FALSE	0.276	71.000	0.000	NA		NA
5476312	5476313	Avi_9075	Avi_9076		mcpC	FALSE	0.176	64.000	0.000	1.000	N	NA
5476313	5476314	Avi_9076	Avi_9077	mcpC	mcpA	FALSE	0.110	443.000	0.000	1.000	Y	NA
5476314	5476315	Avi_9077	Avi_9079	mcpA		FALSE	0.321	68.000	0.000	1.000		NA
5476315	5476316	Avi_9079	Avi_9080			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476317	5476318	Avi_9083	Avi_9084		agpT	TRUE	0.740	23.000	0.000	0.077	N	NA
5476321	5476322	Avi_9092	Avi_9093			FALSE	0.355	57.000	0.000	NA		NA
5476323	5476324	Avi_9094	Avi_9096			TRUE	0.427	46.000	0.000	NA		NA
5476324	5476325	Avi_9096	Avi_9097			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476325	5476326	Avi_9097	Avi_9098			FALSE	0.025	348.000	0.000	1.000		NA
5476326	5476327	Avi_9098	Avi_9099		cheB	TRUE	0.972	0.000	0.088	1.000		NA
5476327	5476328	Avi_9099	Avi_9100	cheB	cheR	TRUE	0.996	-3.000	0.416	1.000		NA
5476328	5476329	Avi_9100	Avi_9103	cheR		TRUE	0.995	-3.000	0.026	1.000	Y	NA
5476330	5476331	Avi_9104	Avi_9105			TRUE	0.675	17.000	0.000	NA		NA
5476331	5476332	Avi_9105	Avi_9106			TRUE	0.545	33.000	0.000	NA		NA
5476332	5476333	Avi_9106	Avi_9108			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476334	5476335	Avi_9109	Avi_9110			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476337	5476338	Avi_9112	Avi_9114			FALSE	0.055	222.000	0.000	NA		NA
5476338	5476339	Avi_9114	Avi_9115			TRUE	0.950	15.000	0.000	NA	Y	NA
5476340	5476341	Avi_9116	Avi_9117	moeB		FALSE	0.118	117.000	0.000	NA		NA
5476342	5476343	Avi_9118	Avi_9119	pykA		TRUE	0.971	7.000	0.000	1.000	Y	NA
5476343	5476344	Avi_9119	Avi_9120			TRUE	0.836	30.000	0.130	1.000	N	NA
5476344	5476345	Avi_9120	Avi_9121			TRUE	0.869	22.000	0.130	1.000	N	NA
5476347	5476348	Avi_9123	Avi_9124	gntK	idnO	FALSE	0.043	148.000	0.000	1.000	N	NA
5476348	5476349	Avi_9124	Avi_9125	idnO		TRUE	0.736	3.000	0.000	1.000	N	NA
5476349	5476350	Avi_9125	Avi_9126		rbsC	TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5476350	5476351	Avi_9126	Avi_9127	rbsC		TRUE	0.474	129.000	0.000	NA	Y	NA
5476352	5476353	Avi_9128	Avi_9129	hyuA	hyuB	TRUE	0.973	66.000	0.333	0.002	Y	NA
5476353	5476354	Avi_9129	Avi_9130	hyuB		TRUE	0.512	16.000	0.000	1.000	N	NA
5476354	5476355	Avi_9130	Avi_9131			FALSE	0.295	42.000	0.000	1.000	N	NA
5476356	5476357	Avi_9132	Avi_9134		tnp	FALSE	0.038	272.000	0.000	NA		NA
5476357	5476358	Avi_9134	Avi_9135	tnp		TRUE	0.936	37.000	0.000	0.047	Y	NA
5476359	5476360	Avi_9137	Avi_9138	vdh		FALSE	0.216	83.000	0.000	NA		NA
5476361	5476362	Avi_9140	Avi_9142		dppD	TRUE	0.990	-3.000	0.097	0.005	N	NA
5476362	5476363	Avi_9142	Avi_9143	dppD	dppB	FALSE	0.302	168.000	0.097	0.100	N	NA
5476363	5476364	Avi_9143	Avi_9144	dppB		TRUE	0.964	107.000	0.667	0.080	Y	NA
5476364	5476365	Avi_9144	Avi_9145			FALSE	0.009	380.000	0.000	1.000	N	NA
5476366	5476367	Avi_9146	Avi_9147			FALSE	0.029	171.000	0.000	NA	N	NA
5476367	5476368	Avi_9147	Avi_9148		hyuA	FALSE	0.055	105.000	0.000	NA	N	NA
5476368	5476369	Avi_9148	Avi_9149	hyuA	hyuB	TRUE	1.000	-7.000	1.000	0.002	Y	NA
5476369	5476370	Avi_9149	Avi_9150	hyuB		FALSE	0.305	71.000	0.000	1.000		NA
5476370	5476371	Avi_9150	Avi_9151		ilvA	TRUE	0.536	39.000	0.000	1.000		NA
5476371	5476372	Avi_9151	Avi_9152	ilvA		TRUE	0.942	36.000	0.000	0.011	Y	NA
5476372	5476373	Avi_9152	Avi_9153			FALSE	0.086	147.000	0.000	NA		NA
5476373	5476374	Avi_9153	Avi_9154			TRUE	0.965	-3.000	0.004	NA		NA
5476374	5476375	Avi_9154	Avi_9155		dnaE	FALSE	0.035	285.000	0.000	NA		NA
5476375	5476376	Avi_9155	Avi_9156	dnaE		FALSE	0.016	411.000	0.000	NA		NA
5476376	5476377	Avi_9156	Avi_9158			TRUE	0.451	211.000	0.333	NA		NA
5476377	5476378	Avi_9158	Avi_9160			FALSE	0.062	206.000	0.000	NA		NA
5476378	5476379	Avi_9160	Avi_9161			TRUE	0.704	15.000	0.000	NA		NA
5476379	5476380	Avi_9161	Avi_9162			FALSE	0.151	101.000	0.000	NA		NA
5476382	5476383	Avi_9165	Avi_9166	parB		FALSE	0.151	101.000	0.000	NA		NA
5476383	5476384	Avi_9166	Avi_9167			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476384	5476385	Avi_9167	Avi_9168			TRUE	0.993	-3.000	0.286	NA		NA
5476385	5476386	Avi_9168	Avi_9171			FALSE	0.011	541.000	0.000	NA		NA
5476386	5476387	Avi_9171	Avi_9173		ardC	FALSE	0.030	306.000	0.000	NA		NA
5476387	5476388	Avi_9173	Avi_9174	ardC		TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
5476388	5476389	Avi_9174	Avi_9175			FALSE	0.009	600.000	0.000	NA		NA
5476389	5476390	Avi_9175	Avi_9177			FALSE	0.027	321.000	0.000	NA		NA
5476391	5476392	Avi_9178	Avi_9182			FALSE	0.092	138.000	0.000	NA		NA
5476392	5476393	Avi_9182	Avi_9184			FALSE	0.049	238.000	0.000	NA		NA
5476393	5476394	Avi_9184	Avi_9185			TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
5476394	5476395	Avi_9185	Avi_9186		traG	TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
5476395	5476396	Avi_9186	Avi_9187	traG	traD	TRUE	0.999	-13.000	1.000	1.000		NA
5476396	5476397	Avi_9187	Avi_9188	traD	traC	TRUE	0.999	-25.000	1.000	NA		NA
5476398	5476399	Avi_9189	Avi_9191	traA	traF	TRUE	0.997	-3.000	0.667	NA	N	NA
5476399	5476400	Avi_9191	Avi_9192	traF	traB	TRUE	0.986	17.000	0.667	NA		NA
5476400	5476401	Avi_9192	Avi_9193	traB	traH	TRUE	0.993	18.000	1.000	NA		NA
5476401	5476402	Avi_9193	Avi_9194	traH	traM	FALSE	0.028	314.000	0.000	NA		NA
5476403	5476404	Avi_9195	Avi_9196	traR		FALSE	0.021	387.000	0.000	1.000		NA
5476404	5476405	Avi_9196	Avi_9197			FALSE	0.278	75.000	0.000	1.000		NA
5476405	5476406	Avi_9197	Avi_9198			TRUE	1.000	3.000	1.000	0.080	Y	NA
5476406	5476407	Avi_9198	Avi_9199			TRUE	0.998	-3.000	0.133	0.080	Y	NA
5476407	5476408	Avi_9199	Avi_9200			TRUE	0.993	71.000	1.000	0.080	Y	NA
5476409	5476410	Avi_9201	Avi_9202			FALSE	0.007	762.000	0.000	NA		NA
5476411	5476412	Avi_9206	Avi_9208	fabG		TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5476413	5476414	Avi_9209	Avi_9211		tnp	FALSE	0.061	210.000	0.000	NA		NA
5476414	5476415	Avi_9211	Avi_9214	tnp		FALSE	0.119	269.000	0.000	0.008		NA
5476415	5476416	Avi_9214	Avi_9215			TRUE	0.800	7.000	0.000	NA		NA
5476416	5476417	Avi_9215	Avi_9216			FALSE	0.010	562.000	0.000	NA		NA
5476417	5476418	Avi_9216	Avi_9217			TRUE	0.992	3.000	0.375	0.099		NA
5476418	5476419	Avi_9217	Avi_9218			TRUE	0.953	3.000	0.000	0.005		NA
5476419	5476420	Avi_9218	Avi_9219		pntA	FALSE	0.071	621.000	0.000	1.000	Y	NA
5476420	5476421	Avi_9219	Avi_9220	pntA		TRUE	0.999	-3.000	0.829	0.001		NA
5476421	5476422	Avi_9220	Avi_9221		pntB	TRUE	0.992	4.000	0.321	0.001		NA
5476422	5476423	Avi_9221	Avi_9222	pntB	attK	TRUE	0.881	42.000	0.000	1.000	Y	NA
5476423	5476424	Avi_9222	Avi_9223	attK	adhP	TRUE	0.973	-3.000	0.018	1.000		NA
5476425	5476426	Avi_9225	Avi_9227			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476431	5476432	Avi_9233	Avi_9234		petR	FALSE	0.036	282.000	0.000	NA		NA
5476433	5476434	Avi_9236	Avi_9237			FALSE	0.056	220.000	0.000	NA		NA
5476434	5476435	Avi_9237	Avi_9239			TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5476435	5476436	Avi_9239	Avi_9240			TRUE	0.997	0.000	0.143	0.011	Y	NA
5476436	5476437	Avi_9240	Avi_9241			TRUE	0.996	35.000	0.750	0.080	Y	NA
5476440	5476441	Avi_9247	Avi_9248	etfB	etfA	TRUE	0.983	24.000	0.125	0.008	Y	NA
5476441	5476442	Avi_9248	Avi_9249	etfA	proC	TRUE	0.879	8.000	0.000	0.040	N	NA
5476445	5476446	Avi_9253	Avi_9254			FALSE	0.008	677.000	0.000	NA		NA
5476446	5476447	Avi_9254	Avi_9257		trbI	FALSE	0.012	513.000	0.000	NA		NA
5476447	5476448	Avi_9257	Avi_9258	trbI	trbH	TRUE	0.995	12.000	1.000	NA		NA
5476448	5476449	Avi_9258	Avi_9259	trbH	trbG	TRUE	0.998	0.000	1.000	NA		NA
5476449	5476450	Avi_9259	Avi_9260	trbG	trbF	TRUE	1.000	-18.000	1.000	NA	Y	NA
5476450	5476451	Avi_9260	Avi_9261	trbF	trbL	TRUE	0.998	15.000	1.000	NA	Y	NA
5476451	5476452	Avi_9261	Avi_9262	trbL	trbK	TRUE	0.999	-6.000	1.000	NA		NA
5476452	5476453	Avi_9262	Avi_9263	trbK	trbJ	TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
5476453	5476454	Avi_9263	Avi_9265	trbJ	trbE	TRUE	1.000	-28.000	1.000	NA	Y	NA
5476454	5476455	Avi_9265	Avi_9267	trbE	trbD	TRUE	0.962	11.000	0.000	NA	Y	NA
5476455	5476456	Avi_9267	Avi_9268	trbD	trbC	TRUE	0.994	-7.000	0.000	NA	Y	NA
5476456	5476457	Avi_9268	Avi_9269	trbC	trbB	TRUE	1.000	-10.000	1.000	NA	Y	NA
5476457	5476458	Avi_9269	Avi_9270	trbB	traI	TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	N	NA
5476459	5476460	Avi_9800	Avi_9801	repA	repB	TRUE	0.914	46.000	0.429	1.000	N	NA
5476460	5476461	Avi_9801	Avi_9802	repB	repC	FALSE	0.084	155.000	0.000	NA		NA
5476462	5476463	Avi_9804	Avi_9805			FALSE	0.010	614.000	0.000	1.000		NA
5476463	5476464	Avi_9805	Avi_9806		parA	TRUE	0.997	5.000	1.000	1.000		NA
5476465	5476466	Avi_9807	Avi_9808		traA	TRUE	0.868	2.000	0.000	NA		NA
5476467	5476468	Avi_9810	Avi_9811	avhD4	avhB11	TRUE	0.998	-3.000	0.214	1.000	Y	NA
5476468	5476469	Avi_9811	Avi_9812	avhB11	avhB10	TRUE	0.999	-19.000	0.214	1.000	Y	NA
5476469	5476470	Avi_9812	Avi_9813	avhB10	avhB9	TRUE	0.996	0.000	0.250	NA	Y	NA
5476470	5476471	Avi_9813	Avi_9815	avhB9	avhB8	TRUE	0.998	-3.000	0.250	NA	Y	NA
5476471	5476472	Avi_9815	Avi_9816	avhB8	avhB6	TRUE	0.995	36.000	0.900	NA	Y	NA
5476472	5476473	Avi_9816	Avi_9817	avhB6		TRUE	0.956	13.000	0.222	NA		NA
5476473	5476474	Avi_9817	Avi_9818			TRUE	0.994	-7.000	0.222	NA		NA
5476474	5476475	Avi_9818	Avi_9819		avhB1b	TRUE	0.980	13.000	0.444	NA		NA
5476475	5476476	Avi_9819	Avi_9821	avhB1b	avhB4	TRUE	0.996	-3.000	0.444	NA		NA
5476476	5476477	Avi_9821	Avi_9822	avhB4	avhB2	FALSE	0.199	304.000	0.000	NA	Y	NA
5476477	5476478	Avi_9822	Avi_9824	avhB2	avhB1a	TRUE	0.729	13.000	0.000	NA		NA
5476479	5476480	Avi_9825	Avi_9826			TRUE	0.998	-3.000	0.444	0.008		NA
5476480	5476481	Avi_9826	Avi_9827			TRUE	0.999	-3.000	0.444	0.008	Y	NA
5476481	5476482	Avi_9827	Avi_9829			TRUE	0.997	1.000	0.750	NA		NA
5476482	5476483	Avi_9829	Avi_9830			TRUE	0.983	5.000	0.333	NA		NA
5476483	5476484	Avi_9830	Avi_9831			TRUE	0.976	11.000	0.333	NA		NA
5476488	5476489	Avi_9835	Avi_9836	tnp		TRUE	0.992	13.000	0.333	1.000	Y	NA
5476489	5476490	Avi_9836	Avi_9837			FALSE	0.056	238.000	0.000	1.000		NA
5476490	5476491	Avi_9837	Avi_9838		tnp	TRUE	0.976	-3.000	0.000	0.047		NA
5476492	5476493	Avi_9841	Avi_9842			FALSE	0.201	86.000	0.000	NA		NA
5476493	5476494	Avi_9842	Avi_9844		copC	TRUE	0.624	23.000	0.000	NA		NA
5476494	5476495	Avi_9844	Avi_9845	copC		FALSE	0.090	140.000	0.000	NA		NA
5476496	5476497	Avi_9846	Avi_9847			TRUE	0.999	-13.000	0.316	1.000	Y	NA
5476498	5476499	Avi_9848	Avi_9849		copC	TRUE	0.624	23.000	0.000	NA		NA
5476499	5476500	Avi_9849	Avi_9850	copC	copA	TRUE	0.742	33.000	0.000	0.003	N	NA
5476500	5476501	Avi_9850	Avi_9851	copA	copB	TRUE	0.979	14.000	0.500	1.000	N	NA
5476501	5476502	Avi_9851	Avi_9852	copB		TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476502	5476503	Avi_9852	Avi_9853			FALSE	0.418	48.000	0.000	NA		NA
5476504	5476505	Avi_9854	Avi_9856			TRUE	0.931	43.000	0.400	NA		NA
5476505	5476506	Avi_9856	Avi_9857			TRUE	0.994	10.000	0.800	NA		NA
5476507	5476508	Avi_9859	Avi_9861			FALSE	0.085	151.000	0.000	NA		NA
5476510	5476511	Avi_9863	Avi_9864	cueR		TRUE	0.969	16.000	0.250	0.003	N	NA
5476511	5476512	Avi_9864	Avi_9865			TRUE	0.437	153.000	0.000	1.000	Y	NA
5476513	5476514	Avi_9866	Avi_9867			FALSE	0.109	123.000	0.000	NA		NA
5476514	5476515	Avi_9867	Avi_9868			TRUE	0.996	-3.000	0.444	NA		NA
5476515	5476516	Avi_9868	Avi_9869			TRUE	0.995	-3.000	0.444	1.000	N	NA
5476516	5476517	Avi_9869	Avi_9870			TRUE	0.704	15.000	0.000	NA		NA
5476518	5476519	Avi_9871	Avi_9872			FALSE	0.093	160.000	0.000	1.000		NA
5476519	5476520	Avi_9872	Avi_9873			FALSE	0.021	363.000	0.000	NA		NA
5476521	5476522	Avi_9874	Avi_9875			FALSE	0.083	159.000	0.000	NA		NA
5476524	5476525	Avi_9879	Avi_9881			FALSE	0.006	882.000	0.000	NA		NA
5476525	5476526	Avi_9881	Avi_9882			TRUE	0.994	0.000	0.500	NA		NA
5476528	5476529	Avi_9887	Avi_9888			TRUE	0.999	-10.000	0.667	NA		NA
5476532	5476533	Avi_9897	Avi_9898		tnp	FALSE	0.045	248.000	0.000	NA		NA
5476533	5476534	Avi_9898	Avi_9899	tnp		TRUE	0.976	-3.000	0.000	0.047		NA
5476535	5476536	Avi_9901	Avi_9903	repC	exoI	TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476536	5476537	Avi_9903	Avi_9904	exoI		FALSE	0.017	402.000	0.000	NA		NA
5476537	5476538	Avi_9904	Avi_9906			FALSE	0.112	121.000	0.000	NA		NA
5476538	5476539	Avi_9906	Avi_9907			TRUE	0.863	70.000	0.400	NA		NA
5476539	5476540	Avi_9907	Avi_9909		ardC	FALSE	0.019	229.000	0.000	NA	N	NA
5476540	5476459	Avi_9909	Avi_9800	ardC	repA	FALSE	0.023	206.000	0.000	NA	N	NA
5476541	5476542	Avi_7000	Avi_7001	repA	repB	TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	N	NA
5476542	5476543	Avi_7001	Avi_7002	repB	repC	TRUE	0.688	164.000	0.545	NA		NA
5476548	5476549	Avi_7012	Avi_7013			FALSE	0.030	306.000	0.000	NA		NA
5476549	5476550	Avi_7013	Avi_7014		mdh	FALSE	0.033	291.000	0.000	NA		NA
5476551	5476552	Avi_7015	Avi_7016		hyuA	TRUE	0.767	118.000	0.167	1.000	Y	NA
5476552	5476553	Avi_7016	Avi_7017	hyuA	hyuB	TRUE	0.997	3.000	0.250	0.002	Y	NA
5476553	5476554	Avi_7017	Avi_7018	hyuB	dppC	TRUE	0.995	-3.000	0.022	1.000	Y	NA
5476554	5476555	Avi_7018	Avi_7019	dppC	dppB	TRUE	0.991	3.000	0.022	0.079	Y	NA
5476555	5476556	Avi_7019	Avi_7020	dppB		TRUE	0.988	3.000	0.036	1.000	Y	NA
5476556	5476557	Avi_7020	Avi_7021			TRUE	0.999	-3.000	0.436	0.005	Y	NA
5476557	5476558	Avi_7021	Avi_7022			TRUE	0.827	55.000	0.000	NA	Y	NA
5476559	5476560	Avi_7024	Avi_7025			FALSE	0.085	152.000	0.000	NA		NA
5476560	5476561	Avi_7025	Avi_7026			FALSE	0.084	153.000	0.000	NA		NA
5476561	5476562	Avi_7026	Avi_7027			TRUE	0.998	-3.000	0.123	0.005	Y	NA
5476562	5476563	Avi_7027	Avi_7028			TRUE	0.998	2.000	0.554	1.000	Y	NA
5476563	5476564	Avi_7028	Avi_7029			TRUE	0.999	5.000	0.870	0.079	Y	NA
5476564	5476565	Avi_7029	Avi_7030			TRUE	0.923	54.000	0.021	0.079	Y	NA
5476566	5476567	Avi_7032	Avi_7033			FALSE	0.071	183.000	0.000	NA		NA
5476569	5476570	Avi_7035	Avi_7036	parB		FALSE	0.220	82.000	0.000	NA		NA
5476570	5476571	Avi_7036	Avi_7038			FALSE	0.015	425.000	0.000	NA		NA
5476574	5476575	Avi_7041	Avi_7042		hupT	FALSE	0.039	270.000	0.000	NA		NA
5476576	5476577	Avi_7043	Avi_7044			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476577	5476578	Avi_7044	Avi_7045			TRUE	0.856	46.000	0.000	NA	Y	NA
5476579	5476580	Avi_7046	Avi_7047			FALSE	0.091	139.000	0.000	NA		NA
5476580	5476581	Avi_7047	Avi_7050			FALSE	0.039	269.000	0.000	NA		NA
5476581	5476582	Avi_7050	Avi_7051			FALSE	0.172	95.000	0.000	NA		NA
5476582	5476583	Avi_7051	Avi_7052			TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5476583	5476584	Avi_7052	Avi_7053			TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5476584	5476585	Avi_7053	Avi_7054			TRUE	0.786	9.000	0.000	NA		NA
5476585	5476586	Avi_7054	Avi_7055			TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
5476586	5476587	Avi_7055	Avi_7056		vgrG	TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5476587	5476588	Avi_7056	Avi_7057	vgrG		FALSE	0.019	382.000	0.000	NA		NA
5476588	5476589	Avi_7057	Avi_7058			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476589	5476590	Avi_7058	Avi_7061		traG	FALSE	0.013	476.000	0.000	NA		NA
5476590	5476591	Avi_7061	Avi_7062	traG	traD	TRUE	0.965	-13.000	0.000	1.000		NA
5476591	5476592	Avi_7062	Avi_7063	traD	traC	TRUE	0.962	-25.000	0.000	NA		NA
5476593	5476594	Avi_7064	Avi_7065	traA	traF	TRUE	0.982	18.000	0.667	NA	N	NA
5476594	5476595	Avi_7065	Avi_7066	traF	traB	TRUE	0.930	71.000	0.667	NA		NA
5476595	5476596	Avi_7066	Avi_7067	traB	traH	TRUE	0.995	12.000	1.000	NA		NA
5476596	5476597	Avi_7067	Avi_7070	traH		FALSE	0.007	765.000	0.000	NA		NA
5476597	5476598	Avi_7070	Avi_7072			FALSE	0.163	103.000	0.000	1.000		NA
5476598	5476599	Avi_7072	Avi_7073			FALSE	0.010	634.000	0.000	1.000		NA
5476600	5476601	Avi_7074	Avi_7075			FALSE	0.009	328.000	0.000	NA	N	NA
5476601	5476602	Avi_7075	Avi_7076			FALSE	0.191	50.000	0.000	NA	N	NA
5476602	5476603	Avi_7076	Avi_7077		menG	FALSE	0.005	447.000	0.000	NA	N	NA
5476603	5476604	Avi_7077	Avi_7079	menG	serA	TRUE	0.961	31.000	0.111	NA	Y	NA
5476605	5476606	Avi_7080	Avi_7081			TRUE	0.427	52.000	0.000	1.000		NA
5476606	5476607	Avi_7081	Avi_7082			TRUE	0.983	-3.000	0.091	NA		NA
5476607	5476608	Avi_7082	Avi_7083			TRUE	0.952	32.000	0.400	NA		NA
5476608	5476609	Avi_7083	Avi_7084			FALSE	0.182	91.000	0.000	NA		NA
5476610	5476611	Avi_7085	Avi_7086		ameR	FALSE	0.370	32.000	0.000	1.000	N	NA
5476612	5476613	Avi_7087	Avi_7088		rbsA	TRUE	1.000	-7.000	0.667	NA	Y	NA
5476613	5476614	Avi_7088	Avi_7089	rbsA		TRUE	0.997	-22.000	0.000	0.032	Y	NA
5476614	5476615	Avi_7089	Avi_7090			TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5476615	5476616	Avi_7090	Avi_7091			TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.079	Y	NA
5476616	5476617	Avi_7091	Avi_7092			TRUE	0.993	-3.000	0.333	1.000	N	NA
5476617	5476618	Avi_7092	Avi_7093			FALSE	0.073	91.000	0.000	NA	N	NA
5476618	5476619	Avi_7093	Avi_7095			TRUE	0.904	84.000	0.261	NA	Y	NA
5476619	5476620	Avi_7095	Avi_7096			TRUE	0.526	40.000	0.000	1.000		NA
5476621	5476622	Avi_7098	Avi_7100	rhtB		TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5476622	5476623	Avi_7100	Avi_7101			TRUE	0.661	18.000	0.000	NA		NA
5476623	5476624	Avi_7101	Avi_7103			FALSE	0.059	212.000	0.000	NA		NA
5476624	5476625	Avi_7103	Avi_7104			TRUE	0.469	42.000	0.000	NA		NA
5476626	5476627	Avi_7106	Avi_7108			TRUE	0.562	75.000	0.000	0.001		NA
5476627	5476628	Avi_7108	Avi_7109			TRUE	0.998	-3.000	0.667	1.000		NA
5476628	5476629	Avi_7109	Avi_7110			TRUE	0.997	0.000	0.679	1.000		NA
5476629	5476630	Avi_7110	Avi_7111		rhtB	TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5476630	5476631	Avi_7111	Avi_7112	rhtB		FALSE	0.359	69.000	0.000	0.098	N	NA
5476632	5476633	Avi_7114	Avi_7117			FALSE	0.352	99.000	0.000	0.046		NA
5476633	5476634	Avi_7117	Avi_7120			FALSE	0.263	73.000	0.000	NA		NA
5476634	5476635	Avi_7120	Avi_7121			FALSE	0.077	171.000	0.000	NA		NA
5476635	5476636	Avi_7121	Avi_7122			FALSE	0.120	116.000	0.000	NA		NA
5476636	5476637	Avi_7122	Avi_7123			TRUE	0.545	33.000	0.000	NA		NA
5476637	5476638	Avi_7123	Avi_7125			FALSE	0.109	134.000	0.000	1.000		NA
5476641	5476642	Avi_7128	Avi_7129			FALSE	0.220	82.000	0.000	NA		NA
5476642	5476643	Avi_7129	Avi_7130			TRUE	0.997	29.000	1.000	NA	Y	NA
5476643	5476644	Avi_7130	Avi_7131			TRUE	0.985	4.000	0.000	0.079	Y	NA
5476644	5476645	Avi_7131	Avi_7132			TRUE	0.947	28.000	0.000	0.079	Y	NA
5476646	5476647	Avi_7134	Avi_7135			FALSE	0.234	78.000	0.000	NA		NA
5476647	5476648	Avi_7135	Avi_7136			TRUE	0.998	-3.000	0.607	NA		NA
5476649	5476650	Avi_7140	Avi_7142			FALSE	0.102	129.000	0.000	NA		NA
5476654	5476655	Avi_7149	Avi_7150	virH2		TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5476655	5476656	Avi_7150	Avi_7151			TRUE	0.480	41.000	0.000	NA		NA
5476656	5476657	Avi_7151	Avi_7152			TRUE	0.630	22.000	0.000	NA		NA
5476658	5476659	Avi_7153	Avi_7154			FALSE	0.010	320.000	0.000	NA	N	NA
5476660	5476661	Avi_7155	Avi_7156			FALSE	0.040	126.000	0.000	NA	N	NA
5476661	5476662	Avi_7156	Avi_7157			TRUE	1.000	-3.000	0.917	1.000	Y	NA
5476662	5476663	Avi_7157	Avi_7158			TRUE	0.999	4.000	0.846	0.079	Y	NA
5476663	5476664	Avi_7158	Avi_7159			TRUE	0.940	18.000	0.000	NA	Y	NA
5476664	5476665	Avi_7159	Avi_7160			TRUE	0.981	63.000	0.667	NA	Y	NA
5476665	5476666	Avi_7160	Avi_7161			TRUE	0.835	152.000	0.400	NA	Y	NA
5476666	5476667	Avi_7161	Avi_7162			FALSE	0.313	40.000	0.000	1.000	N	NA
5476667	5476668	Avi_7162	Avi_7163		tauA	FALSE	0.041	155.000	0.000	1.000	N	NA
5476668	5476669	Avi_7163	Avi_7165	tauA		TRUE	0.945	68.000	0.302	1.000	Y	NA
5476669	5476670	Avi_7165	Avi_7166			TRUE	0.985	63.000	0.728	1.000	Y	NA
5476671	5476672	Avi_7167	Avi_7168	ssuD		FALSE	0.201	86.000	0.000	NA		NA
5476672	5476673	Avi_7168	Avi_7169			TRUE	0.704	15.000	0.000	NA		NA
5476673	5476674	Avi_7169	Avi_7170			TRUE	0.981	13.000	0.455	NA		NA
5476674	5476675	Avi_7170	Avi_7171			TRUE	0.946	33.000	0.375	NA		NA
5476675	5476676	Avi_7171	Avi_7172			TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
5476676	5476677	Avi_7172	Avi_7173		dppC	TRUE	0.999	-3.000	0.955	1.000		NA
5476677	5476678	Avi_7173	Avi_7174	dppC	dppB	TRUE	1.000	-3.000	0.864	0.078	Y	NA
5476678	5476679	Avi_7174	Avi_7175	dppB		TRUE	0.991	63.000	0.792	0.078	Y	NA
5476679	5476680	Avi_7175	Avi_7179		acd	FALSE	0.004	699.000	0.000	1.000	N	NA
5476680	5476681	Avi_7179	Avi_7180	acd		TRUE	0.995	-3.000	0.429	NA	N	NA
5476681	5476682	Avi_7180	Avi_7181			TRUE	0.691	67.000	0.200	NA	N	NA
5476683	5476684	Avi_7182	Avi_7183			TRUE	0.999	-3.000	0.400	0.078	Y	NA
5476684	5476685	Avi_7183	Avi_7185			TRUE	0.999	-3.000	0.444	1.000	Y	NA
5476685	5476686	Avi_7185	Avi_7187			TRUE	1.000	-22.000	1.000	0.005	Y	NA
5476686	5476687	Avi_7187	Avi_7188			TRUE	0.875	16.000	0.094	1.000	N	NA
5476687	5476688	Avi_7188	Avi_7189		acd	TRUE	0.561	61.000	0.062	1.000	N	NA
5476689	5476690	Avi_7190	Avi_7191			FALSE	0.145	111.000	0.000	1.000		NA
5476690	5476691	Avi_7191	Avi_7192			TRUE	0.978	-3.000	0.041	1.000		NA
5476691	5476692	Avi_7192	Avi_7193			TRUE	0.998	5.000	0.452	0.078	Y	NA
5476692	5476693	Avi_7193	Avi_7194			TRUE	0.903	107.000	0.290	0.078	Y	NA
5476693	5476694	Avi_7194	Avi_7195			FALSE	0.021	216.000	0.000	NA	N	NA
5476694	5476695	Avi_7195	Avi_7196			FALSE	0.229	43.000	0.000	NA	N	NA
5476695	5476696	Avi_7196	Avi_7197			TRUE	0.997	3.000	0.294	0.078	Y	NA
5476696	5476697	Avi_7197	Avi_7198			TRUE	0.954	24.000	0.000	0.078	Y	NA
5476697	5476698	Avi_7198	Avi_7199		ssuB	TRUE	0.970	67.000	0.500	1.000	Y	NA
5476698	5476699	Avi_7199	Avi_7200	ssuB		FALSE	0.040	126.000	0.000	NA	N	NA
5476699	5476700	Avi_7200	Avi_7201			TRUE	0.624	23.000	0.000	NA		NA
5476700	5476701	Avi_7201	Avi_7202		dppC	TRUE	0.998	-3.000	0.571	1.000		NA
5476701	5476702	Avi_7202	Avi_7203	dppC		TRUE	0.999	-3.000	0.571	0.078	Y	NA
5476702	5476703	Avi_7203	Avi_7204			FALSE	0.410	49.000	0.000	NA		NA
5476703	5476704	Avi_7204	Avi_7206			TRUE	0.545	33.000	0.000	NA		NA
5476705	5476706	Avi_7207	Avi_7208			TRUE	0.877	57.000	0.333	NA		NA
5476706	5476707	Avi_7208	Avi_7209			TRUE	0.516	37.000	0.000	NA		NA
5476707	5476708	Avi_7209	Avi_7210			TRUE	0.650	19.000	0.000	NA		NA
5476709	5476710	Avi_7212	Avi_7213			TRUE	0.661	18.000	0.000	NA		NA
5476710	5476711	Avi_7213	Avi_7214			FALSE	0.383	54.000	0.000	NA		NA
5476711	5476712	Avi_7214	Avi_7215			TRUE	0.763	43.000	0.065	1.000		NA
5476712	5476713	Avi_7215	Avi_7216			TRUE	0.472	86.000	0.065	NA		NA
5476714	5476715	Avi_7220	Avi_7221			TRUE	0.997	26.000	0.795	0.078	Y	NA
5476715	5476716	Avi_7221	Avi_7222			TRUE	0.997	0.000	0.318	1.000	Y	NA
5476716	5476717	Avi_7222	Avi_7224		nocT	FALSE	0.066	110.000	0.000	1.000	N	NA
5476717	5476718	Avi_7224	Avi_7225	nocT		TRUE	0.943	124.000	0.594	0.078	Y	NA
5476718	5476719	Avi_7225	Avi_7227		nocP	TRUE	0.999	-3.000	0.481	1.000	Y	NA
5476719	5476720	Avi_7227	Avi_7228	nocP		FALSE	0.008	340.000	0.000	NA	N	NA
5476720	5476721	Avi_7228	Avi_7230			TRUE	0.963	78.000	0.560	NA	Y	NA
5476721	5476722	Avi_7230	Avi_7231			TRUE	0.998	5.000	0.565	1.000	Y	NA
5476722	5476723	Avi_7231	Avi_7233			FALSE	0.416	160.000	0.000	NA	Y	NA
5476723	5476724	Avi_7233	Avi_7234			TRUE	1.000	-9.000	0.667	NA	Y	NA
5476724	5476725	Avi_7234	Avi_7235			TRUE	0.998	-19.000	0.139	1.000	Y	NA
5476725	5476726	Avi_7235	Avi_7237			FALSE	0.006	1040.000	0.000	NA		NA
5476726	5476727	Avi_7237	Avi_7238			FALSE	0.046	246.000	0.000	NA		NA
5476727	5476728	Avi_7238	Avi_7239		nocT	TRUE	0.528	92.000	0.182	1.000	N	NA
5476728	5476729	Avi_7239	Avi_7240	nocT	nocQ	TRUE	0.995	17.000	0.455	0.088	Y	NA
5476729	5476730	Avi_7240	Avi_7241	nocQ	nocM	TRUE	0.999	-3.000	0.400	0.010	Y	NA
5476730	5476731	Avi_7241	Avi_7242	nocM	ggt	TRUE	0.881	42.000	0.000	1.000	Y	NA
5476732	5476733	Avi_7245	Avi_7246			FALSE	0.050	235.000	0.000	NA		NA
5476733	5476734	Avi_7246	Avi_7247			FALSE	0.023	340.000	0.000	NA		NA
5476734	5476735	Avi_7247	Avi_7250			TRUE	0.457	43.000	0.000	NA		NA
5476735	5476736	Avi_7250	Avi_7251			FALSE	0.179	54.000	0.000	NA	N	NA
5476736	5476737	Avi_7251	Avi_7252			TRUE	0.971	20.000	0.100	NA	Y	NA
5476737	5476738	Avi_7252	Avi_7253			TRUE	0.998	-3.000	0.200	0.078	Y	NA
5476738	5476739	Avi_7253	Avi_7254			TRUE	0.992	11.000	0.200	0.097	Y	NA
5476739	5476740	Avi_7254	Avi_7255			TRUE	0.968	92.000	0.727	1.000	Y	NA
5476740	5476741	Avi_7255	Avi_7256			TRUE	0.970	79.000	0.636	1.000	Y	NA
5476741	5476742	Avi_7256	Avi_7257		dhaL	TRUE	0.996	-3.000	0.345	0.033	N	NA
5476742	5476743	Avi_7257	Avi_7258	dhaL	dapA	TRUE	0.999	-7.000	0.690	0.050	N	NA
5476743	5476744	Avi_7258	Avi_7259	dapA		TRUE	0.977	-3.000	0.083	1.000	N	NA
5476748	5476749	Avi_7265	Avi_7266			TRUE	0.986	16.000	0.647	NA		NA
5476749	5476750	Avi_7266	Avi_7267		amaB	TRUE	0.998	-3.000	0.714	NA		NA
5476750	5476751	Avi_7267	Avi_7268	amaB		TRUE	0.887	53.000	0.385	1.000	N	NA
5476751	5476752	Avi_7268	Avi_7269		moaD	TRUE	0.921	56.000	0.455	1.000		NA
5476752	5476753	Avi_7269	Avi_7270	moaD	dppC	TRUE	0.996	0.000	0.636	1.000		NA
5476753	5476754	Avi_7270	Avi_7271	dppC		TRUE	0.998	-3.000	0.163	0.078	Y	NA
5476754	5476755	Avi_7271	Avi_7272			TRUE	0.908	83.000	0.163	0.078	Y	NA
5476756	5476757	Avi_7273	Avi_7274			FALSE	0.090	168.000	0.000	1.000		NA
5476759	5476760	Avi_7276	Avi_7277			TRUE	0.855	3.000	0.000	NA		NA
5476762	5476763	Avi_7279	Avi_7280			TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5476763	5476764	Avi_7280	Avi_7281			FALSE	0.015	435.000	0.000	NA		NA
5476764	5476765	Avi_7281	Avi_7282			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476765	5476766	Avi_7282	Avi_7283			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA	N	NA
5476767	5476768	Avi_7284	Avi_7286	fecR		FALSE	0.245	330.000	0.400	NA	N	NA
5476768	5476769	Avi_7286	Avi_7287		fecE	FALSE	0.016	294.000	0.000	1.000	N	NA
5476769	5476770	Avi_7287	Avi_7289	fecE	fecD	TRUE	0.997	-10.000	0.039	1.000	Y	NA
5476770	5476771	Avi_7289	Avi_7290	fecD	fecC	TRUE	0.997	-3.000	0.039	0.078	Y	NA
5476771	5476772	Avi_7290	Avi_7292	fecC	fecB	TRUE	1.000	-3.000	0.750	1.000	Y	NA
5476772	5476773	Avi_7292	Avi_7293	fecB		TRUE	0.976	59.000	0.500	1.000	Y	NA
5476773	5476774	Avi_7293	Avi_7294			FALSE	0.165	97.000	0.000	NA		NA
5476774	5476775	Avi_7294	Avi_7295		grsT	FALSE	0.355	57.000	0.000	NA		NA
5476775	5476776	Avi_7295	Avi_7296	grsT	mcyB	TRUE	0.943	-3.000	0.000	1.000		NA
5476776	5476777	Avi_7296	Avi_7298	mcyB		FALSE	0.302	125.000	0.000	0.002		NA
5476777	5476778	Avi_7298	Avi_7299			TRUE	0.996	-3.000	0.000	0.002	Y	NA
5476778	5476779	Avi_7299	Avi_7300			TRUE	0.876	34.000	0.167	NA		NA
5476779	5476780	Avi_7300	Avi_7301			TRUE	0.999	-3.000	0.875	NA		NA
5476780	5476781	Avi_7301	Avi_7303		mcyE	FALSE	0.297	237.000	0.222	NA		NA
5476781	5476782	Avi_7303	Avi_7304	mcyE		TRUE	0.991	-3.000	0.250	1.000	N	NA
5476782	5476783	Avi_7304	Avi_7306			TRUE	0.998	-19.000	0.083	1.000	Y	NA
5476784	5476785	Avi_7308	Avi_7309			TRUE	0.899	164.000	0.400	0.002	Y	NA
5476785	5476786	Avi_7309	Avi_7310			TRUE	0.787	45.000	0.182	NA	N	NA
5476786	5476787	Avi_7310	Avi_7311			TRUE	0.953	6.000	0.182	NA	N	NA
5476787	5476788	Avi_7311	Avi_7312			TRUE	0.889	4.000	0.017	1.000	N	NA
5476788	5476789	Avi_7312	Avi_7313			FALSE	0.244	88.000	0.017	NA	N	NA
5476790	5476791	Avi_7315	Avi_7317			FALSE	0.080	165.000	0.000	NA		NA
5476792	5476793	Avi_7319	Avi_7320			FALSE	0.011	535.000	0.000	NA		NA
5476794	5476795	Avi_7322	Avi_7323	asg		TRUE	0.895	37.000	0.000	NA	Y	NA
5476795	5476796	Avi_7323	Avi_7325		dppC	TRUE	0.667	86.000	0.000	NA	Y	NA
5476796	5476797	Avi_7325	Avi_7327	dppC	dppB	TRUE	0.999	8.000	0.689	0.078	Y	NA
5476797	5476798	Avi_7327	Avi_7328	dppB	dppA	TRUE	0.961	136.000	0.803	0.078	Y	NA
5476798	5476799	Avi_7328	Avi_7329	dppA		TRUE	0.480	44.000	0.000	1.000		NA
5476799	5476800	Avi_7329	Avi_7330			TRUE	0.544	38.000	0.000	1.000		NA
5476802	5476803	Avi_7333	Avi_7334	xylR		TRUE	0.711	80.000	0.000	1.000	Y	NA
5476803	5476804	Avi_7334	Avi_7335			TRUE	0.907	34.000	0.000	1.000	Y	NA
5476804	5476805	Avi_7335	Avi_7336			TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.078	Y	NA
5476805	5476806	Avi_7336	Avi_7337			TRUE	0.872	152.000	0.500	NA	Y	NA
5476808	5476809	Avi_7339	Avi_7340	attR		TRUE	0.809	6.000	0.000	NA		NA
5476809	5476810	Avi_7340	Avi_7341			TRUE	0.906	75.000	0.600	NA		NA
5476810	5476811	Avi_7341	Avi_7342			TRUE	0.937	50.000	0.500	NA		NA
5476811	5476812	Avi_7342	Avi_7343			TRUE	0.988	13.000	0.625	NA		NA
5476812	5476813	Avi_7343	Avi_7344			TRUE	0.991	15.000	0.750	1.000		NA
5476813	5476814	Avi_7344	Avi_7346			TRUE	0.995	5.000	0.700	1.000		NA
5476814	5476815	Avi_7346	Avi_7347			TRUE	0.999	4.000	0.625	0.078	Y	NA
5476816	5476817	Avi_7349	Avi_7350			TRUE	0.963	12.000	0.238	NA		NA
5476818	5476819	Avi_7351	Avi_7352		ych	TRUE	0.650	19.000	0.000	NA		NA
5476819	5476820	Avi_7352	Avi_7353	ych		FALSE	0.132	109.000	0.000	NA		NA
5476821	5476822	Avi_7355	Avi_7356			FALSE	0.196	388.000	0.000	0.078	Y	NA
5476822	5476823	Avi_7356	Avi_7357			TRUE	0.830	145.000	0.250	0.078	Y	NA
5476823	5476824	Avi_7357	Avi_7358			TRUE	0.996	11.000	0.425	0.078	Y	NA
5476824	5476825	Avi_7358	Avi_7360			TRUE	0.881	42.000	0.000	1.000	Y	NA
5476825	5476826	Avi_7360	Avi_7361		rbsK	TRUE	0.986	11.000	0.134	1.000	Y	NA
5476826	5476827	Avi_7361	Avi_7362	rbsK		FALSE	0.073	104.000	0.000	1.000	N	NA
5476827	5476828	Avi_7362	Avi_7364			FALSE	0.023	206.000	0.000	NA	N	NA
5476828	5476829	Avi_7364	Avi_7365		rbsA	TRUE	0.918	65.000	0.185	NA	Y	NA
5476829	5476830	Avi_7365	Avi_7366	rbsA	rbsC	TRUE	0.948	20.000	0.259	1.000		NA
5476830	5476831	Avi_7366	Avi_7367	rbsC		TRUE	0.993	-3.000	0.250	1.000		NA
5476831	5476832	Avi_7367	Avi_7369			TRUE	0.986	-3.000	0.182	1.000	N	NA
5476834	5476835	Avi_7371	Avi_7373			FALSE	0.019	407.000	0.000	1.000		NA
5476836	5476837	Avi_7374	Avi_7375		rdh	TRUE	0.871	57.000	0.306	1.000		NA
5476837	5476838	Avi_7375	Avi_7376	rdh	xylH	TRUE	0.959	26.000	0.375	1.000		NA
5476838	5476839	Avi_7376	Avi_7377	xylH	xylG	TRUE	0.997	-3.000	0.565	1.000		NA
5476839	5476840	Avi_7377	Avi_7378	xylG	xylF	TRUE	0.906	72.000	0.565	NA		NA
5476841	5476842	Avi_7379	Avi_7380			FALSE	0.012	513.000	0.000	NA		NA
5476843	5476844	Avi_7381	Avi_7382			TRUE	0.637	61.000	0.125	NA	N	NA
5476845	5476846	Avi_7384	Avi_7386	nrdH	nrdI	TRUE	0.978	11.000	0.440	NA	N	NA
5476846	5476847	Avi_7386	Avi_7387	nrdI		TRUE	0.929	42.000	0.054	NA	Y	NA
5476847	5476848	Avi_7387	Avi_7388		nrdF	TRUE	0.986	15.000	0.048	0.000	Y	NA
5476850	5476851	Avi_7390	Avi_7392		gatA	FALSE	0.004	689.000	0.000	1.000	N	NA
5476851	5476852	Avi_7392	Avi_7393	gatA		FALSE	0.355	34.000	0.000	1.000	N	NA
5476852	5476853	Avi_7393	Avi_7394			TRUE	0.992	71.000	1.000	0.087	Y	NA
5476853	5476854	Avi_7394	Avi_7395			TRUE	1.000	2.000	1.000	0.010	Y	NA
5476854	5476855	Avi_7395	Avi_7396			FALSE	0.085	97.000	0.000	1.000	N	NA
5476856	5476857	Avi_7397	Avi_7398			TRUE	0.969	9.000	0.000	1.000	Y	NA
5476858	5476859	Avi_7399	Avi_7400			TRUE	0.834	-3.000	0.000	NA	N	NA
5476859	5476860	Avi_7400	Avi_7402			FALSE	0.006	421.000	0.000	NA	N	NA
5476860	5476861	Avi_7402	Avi_7403			FALSE	0.278	75.000	0.000	1.000		NA
5476861	5476862	Avi_7403	Avi_7405			FALSE	0.025	632.000	0.000	0.039		NA
5476862	5476863	Avi_7405	Avi_7406			TRUE	0.660	51.000	0.000	0.039		NA
5476863	5476864	Avi_7406	Avi_7407			FALSE	0.073	202.000	0.000	1.000		NA
5476866	5476867	Avi_7410	Avi_7411			FALSE	0.423	17.000	0.000	NA	N	NA
5476867	5476868	Avi_7411	Avi_7413			FALSE	0.104	464.000	0.000	1.000	Y	NA
5476868	5476869	Avi_7413	Avi_7414			FALSE	0.123	114.000	0.000	NA		NA
5476871	5476872	Avi_7417	Avi_7418			FALSE	0.134	108.000	0.000	NA		NA
5476872	5476873	Avi_7418	Avi_7419			TRUE	0.868	2.000	0.000	NA		NA
5476873	5476874	Avi_7419	Avi_7421			TRUE	0.680	86.000	0.000	1.000	Y	NA
5476874	5476875	Avi_7421	Avi_7422			TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5476875	5476876	Avi_7422	Avi_7423		hpcE	FALSE	0.338	60.000	0.000	NA		NA
5476877	5476878	Avi_7425	Avi_7426			TRUE	0.966	-16.000	0.000	1.000		NA
5476879	5476880	Avi_7427	Avi_7428			FALSE	0.168	96.000	0.000	NA		NA
5476880	5476881	Avi_7428	Avi_7430			FALSE	0.032	145.000	0.000	NA	N	NA
5476881	5476882	Avi_7430	Avi_7431			FALSE	0.041	156.000	0.000	1.000	N	NA
5476882	5476883	Avi_7431	Avi_7432			TRUE	0.650	19.000	0.000	NA		NA
5476884	5476885	Avi_7433	Avi_7434			TRUE	0.999	11.000	0.857	0.078	Y	NA
5476885	5476886	Avi_7434	Avi_7436			TRUE	1.000	-13.000	0.667	1.000	Y	NA
5476886	5476887	Avi_7436	Avi_7437			TRUE	1.000	-3.000	0.667	0.032	Y	NA
5476887	5476888	Avi_7437	Avi_7438			TRUE	0.989	59.000	0.833	NA	Y	NA
5476888	5476889	Avi_7438	Avi_7439			FALSE	0.020	222.000	0.000	NA	N	NA
5476889	5476890	Avi_7439	Avi_7440		macA	TRUE	0.919	29.000	0.000	1.000	Y	NA
5476892	5476893	Avi_7442	Avi_7443			TRUE	0.715	14.000	0.000	NA		NA
5476893	5476894	Avi_7443	Avi_7446			FALSE	0.003	925.000	0.000	1.000	N	NA
5476895	5476896	Avi_7450	Avi_7451		potB	TRUE	0.986	4.000	0.000	0.078	Y	NA
5476896	5476897	Avi_7451	Avi_7452	potB		TRUE	0.999	3.000	0.560	0.078	Y	NA
5476897	5476898	Avi_7452	Avi_7453		afuC	TRUE	0.926	40.000	0.000	0.078	Y	NA
5476899	5476900	Avi_7454	Avi_7455			TRUE	0.853	47.000	0.000	NA	Y	NA
5476902	5476903	Avi_7458	Avi_7459			TRUE	0.924	6.000	0.079	1.000	N	NA
5476903	5476904	Avi_7459	Avi_7461			FALSE	0.083	156.000	0.000	NA		NA
5476904	5476905	Avi_7461	Avi_7463		tnp	FALSE	0.011	527.000	0.000	NA		NA
5476905	5476906	Avi_7463	Avi_7466	tnp		FALSE	0.245	76.000	0.000	NA		NA
5476906	5476907	Avi_7466	Avi_7467			TRUE	0.998	-3.000	0.748	1.000		NA
5476908	5476909	Avi_7468	Avi_7470			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476909	5476910	Avi_7470	Avi_7471			TRUE	0.960	-13.000	0.000	NA		NA
5476910	5476911	Avi_7471	Avi_7472			FALSE	0.041	260.000	0.000	NA		NA
5476911	5476912	Avi_7472	Avi_7473			TRUE	0.852	35.000	0.194	NA	N	NA
5476912	5476913	Avi_7473	Avi_7475			TRUE	0.994	-3.000	0.323	NA		NA
5476913	5476914	Avi_7475	Avi_7476			TRUE	0.998	-3.000	0.632	1.000		NA
5476914	5476915	Avi_7476	Avi_7477			TRUE	0.992	4.000	0.526	1.000		NA
5476915	5476916	Avi_7477	Avi_7478			TRUE	0.982	31.000	0.733	NA		NA
5476918	5476919	Avi_7481	Avi_7482		amaB	TRUE	0.933	6.000	0.047	1.000		NA
5476920	5476921	Avi_7483	Avi_7484			TRUE	0.834	-3.000	0.000	NA	N	NA
5476921	5476922	Avi_7484	Avi_7487		nodT	TRUE	0.985	63.000	0.625	0.096	Y	NA
5476923	5476924	Avi_7488	Avi_7490	chvI		TRUE	0.985	0.000	0.000	1.000	Y	NA
5476925	5476926	Avi_7492	Avi_7493			TRUE	0.822	5.000	0.000	NA		NA
5476926	5476927	Avi_7493	Avi_7497		gstR	FALSE	0.010	579.000	0.000	NA		NA
5476927	5476928	Avi_7497	Avi_7498	gstR		FALSE	0.114	130.000	0.000	1.000		NA
5476928	5476929	Avi_7498	Avi_7500			FALSE	0.019	414.000	0.000	1.000		NA
5476929	5476930	Avi_7500	Avi_7502		pecM	FALSE	0.025	356.000	0.000	1.000		NA
5476930	5476931	Avi_7502	Avi_7504	pecM	orfB	FALSE	0.009	711.000	0.000	1.000		NA
5476931	5476932	Avi_7504	Avi_7505	orfB		TRUE	0.573	29.000	0.000	NA		NA
5476932	5476933	Avi_7505	Avi_7506		nocM	TRUE	0.982	24.000	0.667	NA		NA
5476933	5476934	Avi_7506	Avi_7507	nocM	nocQ	TRUE	0.997	2.000	0.250	0.010	Y	NA
5476934	5476935	Avi_7507	Avi_7508	nocQ		TRUE	0.962	61.000	0.250	0.077	Y	NA
5476935	5476936	Avi_7508	Avi_7509		nocP	TRUE	0.992	39.000	0.667	1.000	Y	NA
5476936	5476937	Avi_7509	Avi_7510	nocP	bioA	TRUE	0.982	19.000	0.667	1.000	N	NA
5476938	5476939	Avi_7513	Avi_7514			FALSE	0.015	425.000	0.000	NA		NA
5476939	5476940	Avi_7514	Avi_7515			FALSE	0.009	611.000	0.000	NA		NA
5476940	5476941	Avi_7515	Avi_7516			FALSE	0.216	95.000	0.008	1.000	N	NA
5476941	5476942	Avi_7516	Avi_7517		dppB	TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.077	Y	NA
5476942	5476943	Avi_7517	Avi_7518	dppB	dppC	TRUE	0.991	8.000	0.111	0.077	Y	NA
5476943	5476944	Avi_7518	Avi_7520	dppC		TRUE	0.985	0.000	0.000	1.000	Y	NA
5476944	5476945	Avi_7520	Avi_7522		moaD	TRUE	0.998	-3.000	0.083	0.004	Y	NA
5476945	5476946	Avi_7522	Avi_7524	moaD		TRUE	0.721	78.000	0.000	1.000	Y	NA
5476948	5476949	Avi_7527	Avi_7528			TRUE	0.995	-3.000	0.031	NA	Y	NA
5476949	5476950	Avi_7528	Avi_7529		dppA	FALSE	0.248	109.000	0.047	1.000	N	NA
5476950	5476951	Avi_7529	Avi_7530	dppA		FALSE	0.362	66.000	0.008	1.000	N	NA
5476951	5476952	Avi_7530	Avi_7531		dppB	TRUE	0.972	-28.000	0.008	1.000	N	NA
5476952	5476953	Avi_7531	Avi_7532	dppB	dppC	TRUE	0.999	-3.000	0.429	0.077	Y	NA
5476953	5476954	Avi_7532	Avi_7533	dppC		TRUE	0.995	2.000	0.200	1.000	Y	NA
5476954	5476955	Avi_7533	Avi_7536			TRUE	0.999	-7.000	0.200	0.004	Y	NA
5476955	5476956	Avi_7536	Avi_7537			TRUE	0.885	11.000	0.022	NA		NA
5476956	5476957	Avi_7537	Avi_7538			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5476957	5476958	Avi_7538	Avi_7539		amaB	TRUE	0.961	5.000	0.191	1.000	N	NA
5476958	5476959	Avi_7539	Avi_7540	amaB	hutH	TRUE	0.561	109.000	0.000	1.000	Y	NA
5476959	5476960	Avi_7540	Avi_7541	hutH		FALSE	0.159	99.000	0.000	NA		NA
5476961	5476962	Avi_7543	Avi_7544			TRUE	0.972	3.000	0.160	NA		NA
5476962	5476963	Avi_7544	Avi_7546		aceF	TRUE	0.982	-3.000	0.080	NA		NA
5476963	5476964	Avi_7546	Avi_7548	aceF		TRUE	0.992	23.000	1.000	NA		NA
5476964	5476965	Avi_7548	Avi_7549			TRUE	0.944	8.000	0.100	NA		NA
5476965	5476966	Avi_7549	Avi_7550		purA	FALSE	0.036	300.000	0.000	1.000		NA
5476966	5476967	Avi_7550	Avi_7551	purA		TRUE	0.971	-3.000	0.019	NA		NA
5476967	5476968	Avi_7551	Avi_7552			TRUE	0.993	-7.000	0.190	NA		NA
5476971	5476972	Avi_7557	Avi_7558	vgrG		FALSE	0.080	165.000	0.000	NA		NA
5476972	5476973	Avi_7558	Avi_7559			TRUE	0.959	-10.000	0.000	NA		NA
5476973	5476974	Avi_7559	Avi_7560			TRUE	0.729	13.000	0.000	NA		NA
5476974	5476975	Avi_7560	Avi_7561			FALSE	0.245	76.000	0.000	NA		NA
5476976	5476977	Avi_7563	Avi_7564			TRUE	0.997	-3.000	0.511	NA		NA
5476978	5476979	Avi_7565	Avi_7566		tnp	FALSE	0.024	339.000	0.000	NA		NA
5476980	5476981	Avi_7569	Avi_7570			TRUE	0.983	12.000	0.100	1.000	Y	NA
5476981	5476982	Avi_7570	Avi_7571			TRUE	0.996	-3.000	0.052	1.000	Y	NA
5476982	5476983	Avi_7571	Avi_7572			TRUE	0.962	19.000	0.031	1.000	Y	NA
5476983	5476984	Avi_7572	Avi_7573			FALSE	0.034	190.000	0.000	1.000	N	NA
5476985	5476986	Avi_7575	Avi_7576			TRUE	0.933	80.000	0.791	NA		NA
5476986	5476987	Avi_7576	Avi_7577			TRUE	0.923	74.000	0.660	1.000		NA
5476987	5476988	Avi_7577	Avi_7578			TRUE	0.999	-3.000	0.623	0.050		NA
5476988	5476989	Avi_7578	Avi_7579			TRUE	0.998	3.000	0.944	1.000		NA
5476989	5476990	Avi_7579	Avi_7580			TRUE	0.908	21.000	0.139	1.000		NA
5476990	5476991	Avi_7580	Avi_7582			TRUE	0.971	2.000	0.128	NA		NA
5476991	5476992	Avi_7582	Avi_7583			TRUE	0.986	12.000	0.520	NA		NA
5476992	5476993	Avi_7583	Avi_7584			TRUE	0.813	61.000	0.240	NA		NA
5476993	5476994	Avi_7584	Avi_7585			FALSE	0.028	315.000	0.000	NA		NA
5476994	5476995	Avi_7585	Avi_7586		fdhF	TRUE	0.595	31.000	0.000	1.000		NA
5476996	5476997	Avi_7587	Avi_7588			TRUE	0.822	11.000	0.014	1.000	N	NA
5476997	5476998	Avi_7588	Avi_7589			TRUE	0.800	10.000	0.000	1.000		NA
5476998	5476999	Avi_7589	Avi_7590			FALSE	0.185	97.000	0.000	1.000		NA
5476999	5477000	Avi_7590	Avi_7591			TRUE	0.995	-3.000	0.000	0.077	Y	NA
5477000	5477001	Avi_7591	Avi_7592			TRUE	0.990	0.000	0.000	0.077	Y	NA
5477001	5477002	Avi_7592	Avi_7593			TRUE	0.977	-16.000	0.000	0.077	N	NA
5477003	5477004	Avi_7595	Avi_7597		prxC	FALSE	0.063	222.000	0.000	1.000		NA
5477005	5477006	Avi_7599	Avi_7600		pepQ	TRUE	0.987	2.000	0.294	1.000		NA
5477006	5477007	Avi_7600	Avi_7601	pepQ		TRUE	0.982	29.000	0.294	1.000	Y	NA
5477007	5477008	Avi_7601	Avi_7602			TRUE	1.000	-7.000	0.833	0.077	Y	NA
5477008	5477009	Avi_7602	Avi_7603			TRUE	0.999	10.000	0.714	0.077	Y	NA
5477009	5477010	Avi_7603	Avi_7604			TRUE	0.994	21.000	0.467	0.077	Y	NA
5477011	5477012	Avi_7606	Avi_7608			TRUE	0.999	4.000	0.714	0.077	Y	NA
5477012	5477013	Avi_7608	Avi_7610			TRUE	0.928	79.000	0.833	NA	N	NA
5477013	5477014	Avi_7610	Avi_7611			FALSE	0.106	283.000	0.108	NA	N	NA
5477016	5477017	Avi_7613	Avi_7614	nikA	nikB	TRUE	0.999	4.000	0.833	0.086	Y	NA
5477017	5477018	Avi_7614	Avi_7616	nikB	nikC	TRUE	1.000	-3.000	0.629	0.001	Y	NA
5477018	5477019	Avi_7616	Avi_7617	nikC	nikD	TRUE	0.998	-3.000	0.227	1.000	Y	NA
5477019	5477020	Avi_7617	Avi_7618	nikD	nikE	TRUE	0.998	-3.000	0.161	0.082	Y	NA
5477020	5477021	Avi_7618	Avi_7619	nikE		FALSE	0.076	174.000	0.000	NA		NA
5477021	5477022	Avi_7619	Avi_7621		fnrN	FALSE	0.122	115.000	0.000	NA		NA
5477022	5477023	Avi_7621	Avi_7622	fnrN		TRUE	0.468	19.000	0.000	1.000	N	NA
5477023	5477024	Avi_7622	Avi_7623			TRUE	0.999	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
5477024	5477025	Avi_7623	Avi_7625			TRUE	0.992	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5477025	5477026	Avi_7625	Avi_7626			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5477026	5477027	Avi_7626	Avi_7627		sco1	TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5477027	5477028	Avi_7627	Avi_7628	sco1		TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5477029	5477030	Avi_7629	Avi_7630	moaA		TRUE	0.909	-6.000	0.000	1.000	N	NA
5477030	5477031	Avi_7630	Avi_7631		fdxA	TRUE	0.965	-3.000	0.000	0.039	N	NA
5477031	5477032	Avi_7631	Avi_7633	fdxA		TRUE	0.833	73.000	0.000	0.039	Y	NA
5477033	5477034	Avi_7634	Avi_7635			FALSE	0.122	623.000	0.000	0.006	Y	NA
5477038	5477039	Avi_7645	Avi_7646			TRUE	0.427	46.000	0.000	NA		NA
5477039	5477040	Avi_7646	Avi_7648		acoR	FALSE	0.010	636.000	0.000	1.000		NA
5477040	5477041	Avi_7648	Avi_7649	acoR		FALSE	0.293	165.000	0.167	1.000	N	NA
5477041	5477042	Avi_7649	Avi_7650			FALSE	0.279	116.000	0.077	1.000	N	NA
5477044	5477045	Avi_7653	Avi_7654		accB	FALSE	0.037	176.000	0.000	1.000	N	NA
5477045	5477046	Avi_7654	Avi_7655	accB	accC	TRUE	0.998	-3.000	0.066	0.002	Y	NA
5477046	5477047	Avi_7655	Avi_7656	accC		TRUE	0.994	-3.000	0.014	NA	Y	NA
5477047	5477048	Avi_7656	Avi_7657			TRUE	0.735	0.000	0.000	NA	N	NA
5477048	5477049	Avi_7657	Avi_7658			TRUE	1.000	-3.000	0.750	NA	Y	NA
5477049	5477050	Avi_7658	Avi_7659			TRUE	0.978	16.000	0.464	NA		NA
5477050	5477051	Avi_7659	Avi_7660		aatA	TRUE	0.910	49.000	0.348	1.000		NA
5477053	5477054	Avi_7662	Avi_7663			TRUE	0.998	-3.000	0.640	1.000		NA
5477054	5477055	Avi_7663	Avi_7664			TRUE	1.000	-3.000	0.810	0.010	Y	NA
5477055	5477056	Avi_7664	Avi_7665			TRUE	0.998	6.000	0.714	1.000	Y	NA
5477056	5477057	Avi_7665	Avi_7667			TRUE	0.974	74.000	0.632	1.000	Y	NA
5477057	5477058	Avi_7667	Avi_7669			FALSE	0.021	213.000	0.000	NA	N	NA
5477058	5477059	Avi_7669	Avi_7671			TRUE	0.998	-3.000	0.261	NA	Y	NA
5477060	5477061	Avi_7673	Avi_7674			FALSE	0.168	96.000	0.000	NA		NA
5477061	5477062	Avi_7674	Avi_7675			TRUE	0.988	3.000	0.000	0.032	Y	NA
5477062	5477063	Avi_7675	Avi_7676			TRUE	1.000	0.000	1.000	0.032	Y	NA
5477064	5477065	Avi_7677	Avi_7679			FALSE	0.007	362.000	0.000	NA	N	NA
5477065	5477066	Avi_7679	Avi_7680			FALSE	0.024	202.000	0.000	NA	N	NA
5477067	5477068	Avi_7681	Avi_7682			TRUE	0.601	30.000	0.000	1.000		NA
5477068	5477069	Avi_7682	Avi_7683			FALSE	0.071	329.000	0.000	0.039		NA
5477069	5477070	Avi_7683	Avi_7685			FALSE	0.019	377.000	0.000	NA		NA
5477070	5477071	Avi_7685	Avi_7686		attK	FALSE	0.028	315.000	0.000	NA		NA
5477071	5477072	Avi_7686	Avi_7687	attK	fadD	TRUE	0.838	62.000	0.222	0.049	N	NA
5477072	5477073	Avi_7687	Avi_7688	fadD		FALSE	0.023	240.000	0.000	1.000	N	NA
5477074	5477075	Avi_7689	Avi_7690	mccB		TRUE	0.978	8.000	0.006	1.000	Y	NA
5477075	5477076	Avi_7690	Avi_7691		accC	TRUE	0.982	12.000	0.008	0.049	Y	NA
5477076	5477077	Avi_7691	Avi_7692	accC	hmgL	TRUE	0.915	11.000	0.016	0.049	N	NA
5477080	5477081	Avi_7695	Avi_7697		orfB	FALSE	0.102	129.000	0.000	NA		NA
5481474	5481475	Avi_8000	Avi_8001	repA	repB	TRUE	0.797	85.000	0.444	1.000	N	NA
5481475	5481476	Avi_8001	Avi_8002	repB	repC	TRUE	0.540	156.000	0.333	NA		NA
5481476	5481477	Avi_8002	Avi_8003	repC		FALSE	0.050	235.000	0.000	NA		NA
5481483	5481484	Avi_8011	Avi_8012			TRUE	0.930	40.000	0.000	0.045	Y	NA
5481484	5481485	Avi_8012	Avi_8013			FALSE	0.073	179.000	0.000	NA		NA
5481485	5481486	Avi_8013	Avi_8014			TRUE	0.573	29.000	0.000	NA		NA
5481486	5481487	Avi_8014	Avi_8015			FALSE	0.037	295.000	0.000	1.000		NA
5481487	5481488	Avi_8015	Avi_8016			TRUE	0.999	4.000	1.000	0.000		NA
5481489	5481490	Avi_8017	Avi_8018	ligD		FALSE	0.023	343.000	0.000	NA		NA
5481491	5481492	Avi_8019	Avi_8020			FALSE	0.152	60.000	0.000	NA	N	NA
5481494	5481495	Avi_8024	Avi_8025			FALSE	0.066	197.000	0.000	NA		NA
5481498	5481499	Avi_8030	Avi_8031			TRUE	0.538	34.000	0.000	NA		NA
5481501	5481502	Avi_8034	Avi_8035		tnp	TRUE	0.573	29.000	0.000	NA		NA
5481503	5481504	Avi_8037	Avi_8039			TRUE	0.961	-18.000	0.000	NA		NA
5481507	5481508	Avi_8047	Avi_8048	traG	traD	TRUE	0.960	-13.000	0.000	NA		NA
5481508	5481509	Avi_8048	Avi_8049	traD	traC	TRUE	0.997	5.000	1.000	NA		NA
5481510	5481511	Avi_8050	Avi_8054	traA		TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481512	5481513	Avi_8057	Avi_8059			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481515	5481516	Avi_8061	Avi_8062			FALSE	0.085	151.000	0.000	NA		NA
5481516	5481517	Avi_8062	Avi_8066			FALSE	0.012	514.000	0.000	NA		NA
5481517	5481518	Avi_8066	Avi_8067		exsI	TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5481518	5481519	Avi_8067	Avi_8068	exsI		TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5481521	5481522	Avi_8071	Avi_8072			TRUE	0.491	40.000	0.000	NA		NA
5481522	5481523	Avi_8072	Avi_8073			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481523	5481524	Avi_8073	Avi_8074			FALSE	0.100	130.000	0.000	NA		NA
5481524	5481525	Avi_8074	Avi_8075			TRUE	0.523	36.000	0.000	NA		NA
5481526	5481527	Avi_8076	Avi_8077			TRUE	0.997	-28.000	0.333	NA		NA
5481527	5481528	Avi_8077	Avi_8078			FALSE	0.088	143.000	0.000	NA		NA
5481528	5481529	Avi_8078	Avi_8079			FALSE	0.053	229.000	0.000	NA		NA
5481529	5481530	Avi_8079	Avi_8080			FALSE	0.056	221.000	0.000	NA		NA
5481530	5481531	Avi_8080	Avi_8083			TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5481532	5481533	Avi_8085	Avi_8086		rzcA	TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481533	5481534	Avi_8086	Avi_8089	rzcA		FALSE	0.021	358.000	0.000	NA		NA
5481535	5481536	Avi_8090	Avi_8094	parB		FALSE	0.151	101.000	0.000	NA		NA
5481536	5481537	Avi_8094	Avi_8095			TRUE	0.992	-3.000	0.250	NA		NA
5481537	5481538	Avi_8095	Avi_8097			TRUE	0.995	-3.000	0.375	NA		NA
5481538	5481539	Avi_8097	Avi_8098			FALSE	0.023	346.000	0.000	NA		NA
5481539	5481540	Avi_8098	Avi_8099		ardC	FALSE	0.028	316.000	0.000	NA		NA
5481541	5481542	Avi_8103	Avi_8104			TRUE	0.961	-18.000	0.000	NA		NA
5481542	5481543	Avi_8104	Avi_8105			FALSE	0.043	255.000	0.000	NA		NA
5481546	5481547	Avi_8114	Avi_8115		xerC	TRUE	1.000	-24.000	0.750	0.008	Y	NA
5481547	5481548	Avi_8115	Avi_8116	xerC		TRUE	1.000	-3.000	0.583	0.008	Y	NA
5481548	5481549	Avi_8116	Avi_8119			FALSE	0.025	330.000	0.000	NA		NA
5481549	5481550	Avi_8119	Avi_8120			FALSE	0.089	141.000	0.000	NA		NA
5481550	5481551	Avi_8120	Avi_8121			FALSE	0.090	140.000	0.000	NA		NA
5481552	5481553	Avi_8123	Avi_8126			FALSE	0.211	84.000	0.000	NA		NA
5481553	5481554	Avi_8126	Avi_8127		yci	FALSE	0.375	55.000	0.000	NA		NA
5481554	5481555	Avi_8127	Avi_8128	yci	traG	TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5481555	5481556	Avi_8128	Avi_8129	traG	traD	TRUE	0.965	-13.000	0.000	1.000		NA
5481556	5481557	Avi_8129	Avi_8130	traD	traC	TRUE	0.997	5.000	1.000	NA		NA
5481558	5481559	Avi_8131	Avi_8132	traA	traF	TRUE	0.834	-3.000	0.000	NA	N	NA
5481559	5481560	Avi_8132	Avi_8133	traF	traB	TRUE	0.445	44.000	0.000	NA		NA
5481560	5481561	Avi_8133	Avi_8135	traB	traH	TRUE	0.675	17.000	0.000	NA		NA
5481561	5481562	Avi_8135	Avi_8136	traH		FALSE	0.083	156.000	0.000	NA		NA
5481562	5481563	Avi_8136	Avi_8137			TRUE	0.599	26.000	0.000	NA		NA
5481563	5481564	Avi_8137	Avi_8138		traM	FALSE	0.024	338.000	0.000	NA		NA
5481565	5481566	Avi_8140	Avi_8142	traR	alr	FALSE	0.010	370.000	0.000	1.000	N	NA
5481569	5481570	Avi_8146	Avi_8147			FALSE	0.167	433.000	0.000	0.076	Y	NA
5481570	5481571	Avi_8147	Avi_8148		potB	TRUE	0.989	2.000	0.000	0.076	Y	NA
5481571	5481572	Avi_8148	Avi_8149	potB		TRUE	1.000	-3.000	0.909	0.076	Y	NA
5481572	5481573	Avi_8149	Avi_8150		bioA	FALSE	0.056	121.000	0.000	1.000	N	NA
5481573	5481574	Avi_8150	Avi_8152	bioA	potB	FALSE	0.005	588.000	0.000	1.000	N	NA
5481574	5481575	Avi_8152	Avi_8156	potB		TRUE	0.995	-3.000	0.000	0.076	Y	NA
5481575	5481576	Avi_8156	Avi_8157		potF	TRUE	0.930	39.000	0.000	0.076	Y	NA
5481576	5481577	Avi_8157	Avi_8158	potF	potG	TRUE	0.686	85.000	0.000	1.000	Y	NA
5481577	5481578	Avi_8158	Avi_8160	potG	attK	FALSE	0.058	119.000	0.000	1.000	N	NA
5481578	5481579	Avi_8160	Avi_8162	attK	dfpA	FALSE	0.005	525.000	0.000	1.000	N	NA
5481580	5481581	Avi_8163	Avi_8165			FALSE	0.013	322.000	0.000	1.000	N	NA
5481581	5481582	Avi_8165	Avi_8166			TRUE	0.995	-28.000	0.000	1.000	Y	NA
5481582	5481583	Avi_8166	Avi_8168			FALSE	0.141	113.000	0.000	1.000		NA
5481583	5481584	Avi_8168	Avi_8169			FALSE	0.095	155.000	0.000	1.000		NA
5481584	5481585	Avi_8169	Avi_8171		potB	TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.076	Y	NA
5481585	5481586	Avi_8171	Avi_8172	potB	afuC	TRUE	1.000	0.000	1.000	0.076	Y	NA
5481586	5481587	Avi_8172	Avi_8173	afuC		TRUE	0.998	15.000	0.667	0.076	Y	NA
5481587	5481588	Avi_8173	Avi_8174		hyuB	TRUE	0.915	31.000	0.000	1.000	Y	NA
5481588	5481589	Avi_8174	Avi_8176	hyuB	hyuA	TRUE	0.999	13.000	1.000	1.000	Y	NA
5481590	5481591	Avi_8178	Avi_8180			FALSE	0.026	229.000	0.000	1.000	N	NA
5481591	5481592	Avi_8180	Avi_8181			TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.076	Y	NA
5481592	5481593	Avi_8181	Avi_8183			TRUE	0.991	0.000	0.333	1.000		NA
5481593	5481594	Avi_8183	Avi_8184			TRUE	0.980	9.000	0.333	1.000		NA
5481594	5481595	Avi_8184	Avi_8187		adhP	FALSE	0.037	295.000	0.000	1.000		NA
5481595	5481596	Avi_8187	Avi_8188	adhP		TRUE	0.762	37.000	0.000	0.032		NA
5481597	5481598	Avi_8190	Avi_8192	tnp		FALSE	0.090	140.000	0.000	NA		NA
5481601	5481602	Avi_8196	Avi_8198		repA	FALSE	0.016	411.000	0.000	NA		NA
5481602	5481603	Avi_8198	Avi_8200	repA	repB	TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	N	NA
5481603	5481604	Avi_8200	Avi_8201	repB	repC	FALSE	0.046	245.000	0.000	NA		NA
5481605	5481606	Avi_8202	Avi_8501			TRUE	0.582	28.000	0.000	NA		NA
5481608	5481609	Avi_8206	Avi_8208		virD5	FALSE	0.300	66.000	0.000	NA		NA
5481609	5481610	Avi_8208	Avi_8210	virD5	virD4	TRUE	0.666	108.000	0.333	NA		NA
5481610	5481611	Avi_8210	Avi_8211	virD4	virD3	TRUE	0.874	58.000	0.333	NA		NA
5481611	5481612	Avi_8211	Avi_8212	virD3	virD2	TRUE	0.976	14.000	0.400	NA		NA
5481612	5481613	Avi_8212	Avi_8213	virD2	virD1	TRUE	0.986	27.000	0.800	NA		NA
5481614	5481615	Avi_8214	Avi_8215	virC1	virC2	TRUE	0.995	-3.000	0.357	NA		NA
5481616	5481617	Avi_8217	Avi_8218	virG	virB11	FALSE	0.025	231.000	0.000	1.000	N	NA
5481617	5481618	Avi_8218	Avi_8219	virB11	virB10	TRUE	0.993	34.000	0.667	1.000	Y	NA
5481618	5481619	Avi_8219	Avi_8220	virB10	virB9	TRUE	0.999	0.000	1.000	NA	Y	NA
5481619	5481620	Avi_8220	Avi_8221	virB9	virB8	TRUE	1.000	-3.000	1.000	NA	Y	NA
5481620	5481621	Avi_8221	Avi_8336	virB8	virB7	TRUE	0.999	-13.000	0.600	NA		NA
5481621	5481622	Avi_8336	Avi_8222	virB7	virB6	TRUE	0.953	28.000	0.375	NA		NA
5481622	5481623	Avi_8222	Avi_8223	virB6	virB5	TRUE	0.919	60.000	0.500	NA		NA
5481623	5481624	Avi_8223	Avi_8224	virB5	virB4	TRUE	0.980	28.000	0.667	NA		NA
5481624	5481625	Avi_8224	Avi_8225	virB4	virB3	TRUE	0.999	0.000	0.600	NA	Y	NA
5481625	5481626	Avi_8225	Avi_8226	virB3	virB2	TRUE	0.999	-3.000	0.400	NA	Y	NA
5481626	5481627	Avi_8226	Avi_8227	virB2	virB1	TRUE	0.985	16.000	0.600	NA		NA
5481627	5481628	Avi_8227	Avi_8229	virB1		FALSE	0.021	360.000	0.000	NA		NA
5481629	5481630	Avi_8230	Avi_8231			TRUE	0.794	62.000	0.000	NA	Y	NA
5481630	5481631	Avi_8231	Avi_8232			TRUE	0.561	31.000	0.000	NA		NA
5481632	5481633	Avi_8233	Avi_8235			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5481633	5481634	Avi_8235	Avi_8237			FALSE	0.276	71.000	0.000	NA		NA
5481634	5481635	Avi_8237	Avi_8238			TRUE	0.961	-18.000	0.000	NA		NA
5481635	5481636	Avi_8238	Avi_8240			FALSE	0.186	90.000	0.000	NA		NA
5481636	5481637	Avi_8240	Avi_8242		virE3	FALSE	0.064	202.000	0.000	NA		NA
5481637	5481638	Avi_8242	Avi_8243	virE3	virE2	TRUE	0.903	67.000	0.500	NA		NA
5481638	5481639	Avi_8243	Avi_8244	virE2	virE1	TRUE	0.991	14.000	0.750	NA		NA
5481639	5481640	Avi_8244	Avi_8245	virE1		FALSE	0.012	515.000	0.000	NA		NA
5481640	5481641	Avi_8245	Avi_8247			FALSE	0.018	392.000	0.000	NA		NA
5481642	5481643	Avi_8248	Avi_8249			TRUE	0.794	62.000	0.000	NA	Y	NA
5481644	5481645	Avi_8250	Avi_8251	virA	virH1	FALSE	0.033	192.000	0.000	1.000	N	NA
5481646	5481647	Avi_8253	Avi_8254		tnp	TRUE	0.976	-3.000	0.000	0.044		NA
5481648	5481649	Avi_8255	Avi_8256	tnp		FALSE	0.136	116.000	0.000	1.000		NA
5481649	5481650	Avi_8256	Avi_8257			FALSE	0.123	123.000	0.000	1.000		NA
5481650	5481651	Avi_8257	Avi_8258			TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5481651	5481652	Avi_8258	Avi_8259			FALSE	0.056	221.000	0.000	NA		NA
5481652	5481653	Avi_8259	Avi_8260			TRUE	0.997	-10.000	0.000	0.008	Y	NA
5481653	5481654	Avi_8260	Avi_8262			TRUE	0.992	0.000	0.000	0.008	Y	NA
5481654	5481655	Avi_8262	Avi_8264			FALSE	0.196	313.000	0.000	1.000	Y	NA
5481660	5481661	Avi_8272	Avi_8273		tnp	FALSE	0.029	308.000	0.000	NA		NA
5481661	5481662	Avi_8273	Avi_8275	tnp		FALSE	0.008	647.000	0.000	NA		NA
5481664	5481665	Avi_8277	Avi_8278			FALSE	0.026	324.000	0.000	NA		NA
5481668	5481669	Avi_8282	Avi_8283			TRUE	0.963	-34.000	0.000	NA		NA
5481671	5481672	Avi_8285	Avi_8287		tms2	FALSE	0.007	832.000	0.000	NA		NA
5481674	5481675	Avi_8289	Avi_8291	tnp		FALSE	0.109	123.000	0.000	NA		NA
5481675	5481676	Avi_8291	Avi_8292		istA	FALSE	0.087	145.000	0.000	NA		NA
5481678	5481679	Avi_8295	Avi_8296			FALSE	0.054	242.000	0.000	1.000		NA
5481681	5481682	Avi_8300	Avi_8301	traR	noxA	FALSE	0.062	224.000	0.000	1.000		NA
5481682	5481683	Avi_8301	Avi_8303	noxA	noxB	FALSE	0.099	283.000	0.000	0.032		NA
5481683	5481684	Avi_8303	Avi_8304	noxB		TRUE	0.771	69.000	0.000	1.000	Y	NA
5481684	5481685	Avi_8304	Avi_8305		attA2	TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.075	Y	NA
5481685	5481686	Avi_8305	Avi_8306	attA2		TRUE	1.000	-3.000	0.833	0.075	Y	NA
5481686	5481687	Avi_8306	Avi_8307			TRUE	0.942	147.000	0.667	0.075	Y	NA
5481689	5481690	Avi_8310	Avi_8311	moaD	dppC	TRUE	0.943	-3.000	0.000	1.000		NA
5481690	5481691	Avi_8311	Avi_8312	dppC		TRUE	1.000	-3.000	0.667	0.075	Y	NA
5481691	5481692	Avi_8312	Avi_8313			TRUE	0.549	155.000	0.000	0.075	Y	NA
5481693	5481694	Avi_8314	Avi_8316		noxA	TRUE	0.977	-3.000	0.000	0.038		NA
5481694	5481695	Avi_8316	Avi_8317	noxA		TRUE	0.999	-7.000	1.000	NA		NA
5481696	5481697	Avi_8319	Avi_8320	hyuB	hyuA	TRUE	1.000	3.000	1.000	0.002	Y	NA
5481697	5481698	Avi_8320	Avi_8321	hyuA	noxB	TRUE	0.642	94.000	0.000	1.000	Y	NA
5481700	5481701	Avi_8323	Avi_8324	trbI	trbH	TRUE	0.729	13.000	0.000	NA		NA
5481701	5481702	Avi_8324	Avi_8325	trbH	trbG	TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5481702	5481703	Avi_8325	Avi_8326	trbG	trbF	TRUE	0.943	17.000	0.000	NA	Y	NA
5481703	5481704	Avi_8326	Avi_8328	trbF	trbL	TRUE	0.950	15.000	0.000	NA	Y	NA
5481704	5481705	Avi_8328	Avi_8329	trbL	trbK	FALSE	0.085	150.000	0.000	NA		NA
5481705	5481706	Avi_8329	Avi_8330	trbK	trbJ	TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481706	5481707	Avi_8330	Avi_8331	trbJ	trbE	TRUE	0.995	-28.000	0.000	NA	Y	NA
5481707	5481708	Avi_8331	Avi_8332	trbE	trbD	TRUE	0.962	11.000	0.000	NA	Y	NA
5481708	5481709	Avi_8332	Avi_8333	trbD	trbC	TRUE	0.994	-7.000	0.000	NA	Y	NA
5481709	5481710	Avi_8333	Avi_8334	trbC	trbB	TRUE	0.995	-10.000	0.000	NA	Y	NA
5481710	5481711	Avi_8334	Avi_8335	trbB	traI	TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5481712	5481713	Avi_9501	Avi_9502	repA	repB	TRUE	0.997	-3.000	0.556	1.000	N	NA
5481713	5481714	Avi_9502	Avi_9503	repB	repC	FALSE	0.071	183.000	0.000	NA		NA
5481716	5481717	Avi_9505	Avi_9506			FALSE	0.079	168.000	0.000	NA		NA
5481717	5481718	Avi_9506	Avi_9507			TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
5481718	5481719	Avi_9507	Avi_9508			FALSE	0.311	64.000	0.000	NA		NA
5481720	5481721	Avi_9510	Avi_9511	intX		TRUE	0.445	44.000	0.000	NA		NA
5481723	5481724	Avi_9514	Avi_9516		rpsB	TRUE	0.762	11.000	0.000	NA		NA
5481727	5481728	Avi_9520	Avi_9521			FALSE	0.050	235.000	0.000	NA		NA
5481728	5481729	Avi_9521	Avi_9522			FALSE	0.104	127.000	0.000	NA		NA
5481729	5481730	Avi_9522	Avi_9524			FALSE	0.013	473.000	0.000	NA		NA
5481730	5481731	Avi_9524	Avi_9525			TRUE	0.887	0.000	0.000	NA		NA
5481732	5481733	Avi_9526	Avi_9527			FALSE	0.071	184.000	0.000	NA		NA
5481734	5481735	Avi_9528	Avi_9529			FALSE	0.091	139.000	0.000	NA		NA
5481736	5481737	Avi_9530	Avi_9531			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481737	5481738	Avi_9531	Avi_9532		pbpB2	FALSE	0.010	560.000	0.000	NA		NA
5481738	5481739	Avi_9532	Avi_9533	pbpB2		FALSE	0.029	211.000	0.000	1.000	N	NA
5481739	5481740	Avi_9533	Avi_9535			TRUE	0.938	37.000	0.000	0.019	Y	NA
5481741	5481742	Avi_9536	Avi_9537			TRUE	0.457	43.000	0.000	NA		NA
5481742	5481743	Avi_9537	Avi_9538			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481743	5481744	Avi_9538	Avi_9539			TRUE	0.729	13.000	0.000	NA		NA
5481744	5481745	Avi_9539	Avi_9541			FALSE	0.147	102.000	0.000	NA		NA
5481747	5481748	Avi_9545	Avi_9546			TRUE	0.689	16.000	0.000	NA		NA
5481749	5481750	Avi_9549	Avi_9550			TRUE	0.997	6.000	1.000	NA		NA
5481750	5481751	Avi_9550	Avi_9551			FALSE	0.410	49.000	0.000	NA		NA
5481752	5481753	Avi_9553	Avi_9554	parB		TRUE	0.881	94.000	0.667	NA		NA
5481753	5481754	Avi_9554	Avi_9555			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481754	5481755	Avi_9555	Avi_9556			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481757	5481758	Avi_9558	Avi_9559			FALSE	0.122	115.000	0.000	NA		NA
5481758	5481759	Avi_9559	Avi_9561			TRUE	0.661	18.000	0.000	NA		NA
5481759	5481760	Avi_9561	Avi_9564		ardC	FALSE	0.060	211.000	0.000	NA		NA
5481760	5481761	Avi_9564	Avi_9566	ardC		TRUE	0.990	0.000	0.333	NA		NA
5481761	5481762	Avi_9566	Avi_9567			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481763	5481764	Avi_9569	Avi_9570			FALSE	0.083	157.000	0.000	NA		NA
5481765	5481766	Avi_9572	Avi_9577			FALSE	0.007	735.000	0.000	NA		NA
5481766	5481767	Avi_9577	Avi_9580			FALSE	0.017	399.000	0.000	NA		NA
5481770	5481771	Avi_9587	Avi_9588			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA		NA
5481771	5481772	Avi_9588	Avi_9589		traG	FALSE	0.073	179.000	0.000	NA		NA
5481772	5481773	Avi_9589	Avi_9590	traG	traD	TRUE	0.965	-13.000	0.000	1.000		NA
5481773	5481774	Avi_9590	Avi_9593	traD	traC	TRUE	0.573	29.000	0.000	NA		NA
5481775	5481776	Avi_9595	Avi_9596	traA	traF	TRUE	0.834	-3.000	0.000	NA	N	NA
5481776	5481777	Avi_9596	Avi_9597	traF	traB	TRUE	0.675	17.000	0.000	NA		NA
5481777	5481778	Avi_9597	Avi_9599	traB	traH	FALSE	0.015	439.000	0.000	NA		NA
5481779	5481780	Avi_9601	Avi_9603			FALSE	0.020	376.000	0.000	NA		NA
5481782	5481783	Avi_9606	Avi_9607		hisC	FALSE	0.159	99.000	0.000	NA		NA
5481783	5481784	Avi_9607	Avi_9608	hisC		TRUE	0.798	63.000	0.000	1.000	Y	NA
5481784	5481785	Avi_9608	Avi_9609		mmsB	FALSE	0.082	99.000	0.000	1.000	N	NA
5481785	5481786	Avi_9609	Avi_9610	mmsB		FALSE	0.042	154.000	0.000	1.000	N	NA
5481786	5481787	Avi_9610	Avi_9611			FALSE	0.331	61.000	0.000	NA		NA
5481787	5481788	Avi_9611	Avi_9612			FALSE	0.402	50.000	0.000	NA		NA
5481790	5481791	Avi_9616	Avi_9617	istB		TRUE	0.708	266.000	0.846	1.000		NA
5481792	5481793	Avi_9618	Avi_9620			FALSE	0.410	49.000	0.000	NA		NA
5481793	5481794	Avi_9620	Avi_9622			TRUE	0.946	16.000	0.000	NA	Y	NA
5481794	5481795	Avi_9622	Avi_9623			TRUE	0.782	64.000	0.000	NA	Y	NA
5481795	5481796	Avi_9623	Avi_9625			FALSE	0.086	148.000	0.000	NA		NA
5481797	5481798	Avi_9626	Avi_9629		cysN	FALSE	0.145	73.000	0.000	1.000	N	NA
5481798	5481799	Avi_9629	Avi_9630	cysN		TRUE	0.954	0.000	0.000	0.001	N	NA
5481799	5481800	Avi_9630	Avi_9632			FALSE	0.267	77.000	0.000	1.000		NA
5481800	5481801	Avi_9632	Avi_9634		leuD	FALSE	0.201	92.000	0.000	1.000		NA
5481801	5481802	Avi_9634	Avi_9636	leuD	leuC	TRUE	1.000	-3.000	0.571	0.001	Y	NA
5481803	5481804	Avi_9638	Avi_9641			TRUE	0.771	12.000	0.000	1.000		NA
5481804	5481805	Avi_9641	Avi_9643			TRUE	0.997	-7.000	0.000	0.002	Y	NA
5481805	5481806	Avi_9643	Avi_9644			FALSE	0.035	185.000	0.000	1.000	N	NA
5481806	5481807	Avi_9644	Avi_9645			FALSE	0.230	85.000	0.000	1.000		NA
5481808	5481809	Avi_9646	Avi_9647		trbI	TRUE	0.875	1.000	0.000	NA		NA
5481809	5481810	Avi_9647	Avi_9648	trbI	trbH	TRUE	0.715	14.000	0.000	NA		NA
5481810	5481811	Avi_9648	Avi_9650	trbH	trbG	TRUE	0.839	4.000	0.000	NA		NA
5481811	5481812	Avi_9650	Avi_9651	trbG	trbF	TRUE	0.937	19.000	0.000	NA	Y	NA
5481812	5481813	Avi_9651	Avi_9653	trbF	trbL	TRUE	0.880	41.000	0.000	NA	Y	NA
5481813	5481814	Avi_9653	Avi_9655	trbL	trbJ	FALSE	0.240	273.000	0.000	NA	Y	NA
5481814	5481815	Avi_9655	Avi_9656	trbJ	trbE	TRUE	0.998	-25.000	0.125	NA	Y	NA
5481815	5481816	Avi_9656	Avi_9658	trbE	trbD	FALSE	0.135	379.000	0.000	NA	Y	NA
5481816	5481817	Avi_9658	Avi_9659	trbD	trbC	TRUE	0.994	-7.000	0.000	NA	Y	NA
5481817	5481818	Avi_9659	Avi_9661	trbC	trbB	TRUE	0.940	18.000	0.000	NA	Y	NA
5481819	5481820	Avi_9665	Avi_9666			FALSE	0.122	80.000	0.000	1.000	N	NA
5481820	5481712	Avi_9666	Avi_9501		repA	FALSE	0.003	843.000	0.000	1.000	N	NA