MicrobesOnline Operon Predictions for Anaplasma marginale str. Florida

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5499447 5499448 AMF_001 AMF_002 purE   TRUE 0.867 -7.000 0.005 NA   NA
 5499449 5499450 AMF_005 AMF_006 rodA ihfA FALSE 0.325 75.000 0.003 1.000 N NA
 5499450 5499451 AMF_006 AMF_007 ihfA   TRUE 0.989 -3.000 0.535 1.000   NA
 5499451 5499452 AMF_007 AMF_1060     TRUE 0.683 -9.000 0.000 NA   NA
 5499453 5499454 AMF_008 AMF_009     TRUE 0.888 90.000 1.000 NA   NA
 5499455 5499456 AMF_1061 AMF_010   murC FALSE 0.496 13.000 0.000 NA   NA
 5499457 5499458 AMF_011 AMF_012 trpS grpE TRUE 0.972 -3.000 0.016 1.000 N NA
 5499460 5499461 AMF_015 AMF_016 pyrG secG TRUE 0.958 13.000 0.083 1.000 N NA
 5499462 5499463 AMF_017 AMF_018   xerD FALSE 0.637 -7.000 0.003 NA   NA
 5499465 5499466 AMF_020 AMF_021 maeB   FALSE 0.530 174.000 0.200 NA   NA
 5499466 5499467 AMF_021 AMF_022   nuoN FALSE 0.017 220.000 0.000 NA   NA
 5499468 5499469 AMF_1032 AMF_023     FALSE 0.083 135.000 0.000 NA   NA
 5499469 5499470 AMF_023 AMF_024     FALSE 0.221 67.000 0.000 NA   NA
 5499473 5499474 AMF_027 AMF_028 thiS thiG TRUE 0.937 63.000 0.064 1.000 Y NA
 5499476 5499477 AMF_030 AMF_1062 gltX   FALSE 0.016 225.000 0.000 NA   NA
 5499477 5499478 AMF_1062 AMF_031     FALSE 0.083 135.000 0.000 NA   NA
 5499478 5499479 AMF_031 AMF_032     TRUE 0.901 20.000 0.017 1.000   NA
 5499484 5499485 AMF_038 AMF_041 glmU ptr1 FALSE 0.508 181.000 0.167 1.000   NA
 5499485 5499486 AMF_041 AMF_042 ptr1 pheS FALSE 0.319 91.000 0.004 1.000   NA
 5499486 5499487 AMF_042 AMF_043 pheS rplT TRUE 0.985 -37.000 0.202 1.000 Y NA
 5499487 5499488 AMF_043 AMF_1033 rplT rpmI TRUE 0.985 27.000 0.928 0.057 Y NA
 5499489 5499490 AMF_044 AMF_045   rho FALSE 0.231 109.000 0.005 NA   NA
 5499490 5499491 AMF_045 AMF_047 rho   FALSE 0.004 392.000 0.000 NA   NA
 5499491 5499492 AMF_047 AMF_048     FALSE 0.002 1884.000 0.000 NA   NA
 5499492 5499493 AMF_048 AMF_049     FALSE 0.221 67.000 0.000 NA   NA
 5499493 5499494 AMF_049 AMF_050   fpbA FALSE 0.002 542.000 0.000 NA   NA
 5499494 5499495 AMF_050 AMF_1034 fpbA   FALSE 0.461 28.000 0.004 NA   NA
 5499498 5499499 AMF_1063 AMF_053     FALSE 0.203 70.000 0.000 NA   NA
 5499500 5499501 AMF_054 AMF_055     TRUE 0.775 99.000 0.199 NA   NA
 5499501 5499502 AMF_055 AMF_056   omp14 FALSE 0.135 187.000 0.007 NA   NA
 5499503 5499504 AMF_057 AMF_058     FALSE 0.119 104.000 0.000 NA   NA
 5499505 5499506 AMF_059 AMF_061   recA FALSE 0.003 403.000 0.000 NA   NA
 5499506 5499507 AMF_061 AMF_062 recA pyrE FALSE 0.306 95.000 0.004 1.000 N NA
 5499507 5499508 AMF_062 AMF_063 pyrE thiF TRUE 0.894 34.000 0.025 1.000 N NA
 5499511 5499512 AMF_066 AMF_067     TRUE 0.771 85.000 0.042 NA   NA
 5499514 5499515 AMF_069 AMF_070 trxA trbG TRUE 0.921 9.000 0.008 NA N NA
 5499515 5499516 AMF_070 AMF_071 trbG pdhA FALSE 0.012 251.000 0.000 NA N NA
 5499516 5499517 AMF_071 AMF_072 pdhA   TRUE 0.902 -28.000 0.008 NA   NA
 5499518 5499519 AMF_1055 AMF_1058 rrl rrf FALSE 0.183 77.000 0.000 NA   NA
 5499520 5499521 AMF_073 AMF_074 guaB   FALSE 0.615 58.000 0.005 1.000 N NA
 5499521 5499522 AMF_074 AMF_076   rpmE TRUE 0.974 -3.000 0.018 1.000 N NA
 5499523 5499524 AMF_077 AMF_078 fabD tmk TRUE 0.854 2.000 0.003 1.000 N NA
 5499524 5499525 AMF_078 AMF_079 tmk   TRUE 0.667 55.000 0.007 NA N NA
 5499527 5499528 AMF_081 AMF_083 secB   TRUE 0.926 -46.000 0.015 NA N NA
 5499530 5499531 AMF_085 AMF_086     FALSE 0.007 306.000 0.000 1.000   NA
 5499532 5499533 AMF_087 AMF_089 ribE msp1B-2 FALSE 0.007 282.000 0.000 NA   NA
 5499533 5499534 AMF_089 AMF_090 msp1B-2   FALSE 0.014 231.000 0.000 NA   NA
 5499534 5499535 AMF_090 AMF_091   mfd FALSE 0.359 -22.000 0.002 NA   NA
 5499536 5499537 AMF_092 AMF_093 rnhA   TRUE 0.939 10.000 0.014 NA   NA
 5499537 5499538 AMF_093 AMF_094   pyrH FALSE 0.152 43.000 0.002 NA   NA
 5499538 5499539 AMF_094 AMF_095 pyrH rrf TRUE 0.985 9.000 0.626 1.000 N NA
 5499539 5499540 AMF_095 AMF_096 rrf uppS TRUE 0.989 1.000 0.409 1.000 N NA
 5499540 5499541 AMF_096 AMF_097 uppS cdsA TRUE 0.986 -46.000 0.400 1.000 Y NA
 5499542 5499543 AMF_098 AMF_099     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 5499543 5499544 AMF_099 AMF_100   purC FALSE 0.109 144.000 0.004 NA   NA
 5499547 5499548 AMF_103 AMF_104 coxW panB FALSE 0.353 35.000 0.002 1.000 N NA
 5499549 5499550 AMF_105 AMF_106 ccmA murA TRUE 0.842 15.000 0.007 1.000 N NA
 5499550 5499551 AMF_106 AMF_107 murA dcd TRUE 0.942 2.000 0.007 1.000 N NA
 5499551 5499552 AMF_107 AMF_108 dcd   FALSE 0.265 99.000 0.004 NA N NA
 5499553 5499554 AMF_109 AMF_110 cspA ntrY TRUE 0.893 42.000 0.032 1.000 N NA
 5499554 5499555 AMF_110 AMF_111 ntrY rnd TRUE 0.925 -31.000 0.009 1.000 N NA
 5499556 5499557 AMF_112 AMF_113 ligA grxC2 TRUE 0.899 9.000 0.006 1.000 N NA
 5499557 5499558 AMF_113 AMF_114 grxC2   TRUE 0.982 -10.000 0.216 NA N NA
 5499558 5499559 AMF_114 AMF_115   dsbE FALSE 0.297 144.000 0.007 NA   NA
 5499559 5499560 AMF_115 AMF_116 dsbE radA TRUE 0.868 9.000 0.005 1.000   NA
 5499561 5499562 AMF_117 AMF_118     TRUE 0.953 7.000 0.012 NA   NA
 5499562 5499563 AMF_118 AMF_119   rpsF TRUE 0.850 11.000 0.006 1.000   NA
 5499563 5499564 AMF_119 AMF_120 rpsF rpsR TRUE 0.995 1.000 0.319 0.055 Y NA
 5499564 5499565 AMF_120 AMF_121 rpsR rplI TRUE 0.984 20.000 0.499 0.055 Y NA
 5499565 5499566 AMF_121 AMF_122 rplI glyA TRUE 0.748 27.000 0.006 1.000 N NA
 5499566 5499567 AMF_122 AMF_123 glyA cyaY FALSE 0.594 131.000 0.021 NA N NA
 5499567 5499568 AMF_123 AMF_124 cyaY msbA2 TRUE 0.966 -19.000 0.028 NA N NA
 5499568 5499569 AMF_124 AMF_125 msbA2 sdhA FALSE 0.014 271.000 0.000 1.000 N NA
 5499569 5499570 AMF_125 AMF_126 sdhA sdhB TRUE 0.985 25.000 0.604 0.006 Y NA
 5499570 5499571 AMF_126 AMF_127 sdhB thy1 TRUE 0.936 1.000 0.006 1.000 N NA
 5499571 5499572 AMF_127 AMF_128 thy1 bcr2 FALSE 0.188 136.000 0.005 NA N NA
 5499573 5499574 AMF_129 AMF_130 ruvB ruvA TRUE 0.996 -3.000 0.549 0.004 Y NA
 5499574 5499575 AMF_130 AMF_131 ruvA ccmC TRUE 0.934 -3.000 0.007 1.000 N NA
 5499576 5499577 AMF_132 AMF_133 gmk   FALSE 0.104 126.000 0.002 1.000 N NA
 5499577 5499578 AMF_133 AMF_134   folD FALSE 0.571 150.000 0.034 1.000 N NA
 5499578 5499579 AMF_134 AMF_1064 folD   FALSE 0.358 28.000 0.000 NA   NA
 5499579 5499580 AMF_1064 AMF_135   msp1B-1 FALSE 0.004 368.000 0.000 NA   NA
 5499580 5499581 AMF_135 AMF_136 msp1B-1   FALSE 0.003 484.000 0.000 NA   NA
 5499582 5499583 AMF_139 AMF_141     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 5499583 5499584 AMF_141 AMF_142   cycM TRUE 0.765 83.000 0.027 1.000   NA
 5499584 5499585 AMF_142 AMF_144 cycM nuoL2 FALSE 0.027 400.000 0.000 1.000 Y NA
 5499585 5499586 AMF_144 AMF_145 nuoL2 ppdK FALSE 0.007 367.000 0.000 1.000 N NA
 5499586 5499587 AMF_145 AMF_146 ppdK   FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 5499587 5499588 AMF_146 AMF_147     TRUE 0.989 3.000 0.500 NA   NA
 5499588 5499589 AMF_147 AMF_148   aspS FALSE 0.017 186.000 0.002 1.000   NA
 5499590 5499591 AMF_149 AMF_150   gshB TRUE 0.923 15.000 0.023 NA   NA
 5499591 5499592 AMF_150 AMF_151 gshB ddlB FALSE 0.164 136.000 0.004 1.000 N NA
 5499592 5499593 AMF_151 AMF_152 ddlB ftsQ TRUE 0.991 -19.000 0.372 NA Y NA
 5499593 5499594 AMF_152 AMF_153 ftsQ ntrX FALSE 0.015 241.000 0.000 NA N NA
 5499594 5499595 AMF_153 AMF_154 ntrX   FALSE 0.004 381.000 0.000 NA   NA
 5499596 5499597 AMF_155 AMF_156   pdhD FALSE 0.308 43.000 0.000 NA   NA
 5499598 5499599 AMF_157 AMF_158     FALSE 0.210 69.000 0.000 NA   NA
 5499599 5499600 AMF_158 AMF_159     TRUE 0.991 0.000 0.889 NA   NA
 5499600 5499601 AMF_159 AMF_160     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA   NA
 5499601 5499602 AMF_160 AMF_161   phnP FALSE 0.345 93.000 0.005 NA   NA
 5499603 5499604 AMF_162 AMF_163 glnA pstC TRUE 0.910 -22.000 0.007 1.000 N NA
 5499606 5499607 AMF_167 AMF_168 sucD sucC TRUE 0.993 9.000 0.256 0.003 Y NA
 5499607 5499608 AMF_168 AMF_169 sucC rpsU TRUE 0.811 70.000 0.028 1.000   NA
 5499608 5499609 AMF_169 AMF_170 rpsU pstS TRUE 0.851 93.000 0.462 1.000   NA
 5499609 5499610 AMF_170 AMF_171 pstS msp5 TRUE 0.927 60.000 0.500 1.000   NA
 5499610 5499611 AMF_171 AMF_172 msp5 fabK FALSE 0.524 183.000 0.097 0.045   NA
 5499611 5499612 AMF_172 AMF_173 fabK cybB TRUE 0.988 3.000 0.086 0.020   NA
 5499614 5499615 AMF_175 AMF_176 aprE   TRUE 0.744 88.000 0.022 1.000   NA
 5499617 5499618 AMF_178 AMF_179 tolB   TRUE 0.865 7.000 0.005 1.000   NA
 5499619 5499620 AMF_180 AMF_181     TRUE 0.931 33.000 0.286 NA   NA
 5499620 5499621 AMF_181 AMF_182   rpsL FALSE 0.038 185.000 0.003 1.000   NA
 5499621 5499622 AMF_182 AMF_183 rpsL rpsG TRUE 0.988 18.000 0.620 0.011 Y NA
 5499622 5499623 AMF_183 AMF_185 rpsG fusA TRUE 0.962 34.000 0.114 1.000 Y NA
 5499623 5499624 AMF_185 AMF_186 fusA tuf TRUE 0.988 12.000 0.102 0.004 Y NA
 5499624 5499625 AMF_186 AMF_1065 tuf   FALSE 0.455 15.000 0.000 NA   NA
 5499625 5499626 AMF_1065 AMF_187     FALSE 0.535 12.000 0.000 NA   NA
 5499626 5499627 AMF_187 AMF_188   nusG TRUE 0.988 -16.000 0.843 1.000   NA
 5499627 5499628 AMF_188 AMF_190 nusG rplK TRUE 0.991 4.000 0.681 1.000 N NA
 5499628 5499629 AMF_190 AMF_191 rplK rplA TRUE 0.987 19.000 0.838 0.072 Y NA
 5499629 5499630 AMF_191 AMF_192 rplA rplJ TRUE 0.973 24.000 0.302 1.000 Y NA
 5499630 5499631 AMF_192 AMF_193 rplJ rplL TRUE 0.911 125.000 0.884 1.000 Y NA
 5499631 5499632 AMF_193 AMF_194 rplL rpoB TRUE 0.942 25.000 0.223 1.000   NA
 5499632 5499633 AMF_194 AMF_195 rpoB rpoC TRUE 0.987 12.000 0.851 0.003   NA
 5499636 5499637 AMF_1035 AMF_1066     FALSE 0.322 36.000 0.000 NA   NA
 5499637 5499638 AMF_1066 AMF_199   bioF FALSE 0.024 198.000 0.000 NA   NA
 5499640 5499641 AMF_201 AMF_203   pyrD TRUE 0.954 7.000 0.010 1.000 N NA
 5499642 5499643 AMF_204 AMF_205 def   FALSE 0.088 132.000 0.000 NA   NA
 5499643 5499644 AMF_205 AMF_206     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 5499644 5499645 AMF_206 AMF_207   pdxH FALSE 0.347 81.000 0.004 1.000   NA
 5499648 5499649 AMF_210 AMF_211 metC bolA TRUE 0.935 -46.000 0.018 NA N NA
 5499650 5499651 AMF_212 AMF_213   dnaE FALSE 0.003 411.000 0.000 NA   NA
 5499651 5499652 AMF_213 AMF_214 dnaE aroA FALSE 0.022 240.000 0.000 1.000 N NA
 5499652 5499653 AMF_214 AMF_1059 aroA rrs FALSE 0.029 188.000 0.000 NA   NA
 5499653 5499654 AMF_1059 AMF_215 rrs sdhC FALSE 0.158 88.000 0.000 NA   NA
 5499654 5499655 AMF_215 AMF_217 sdhC sdhD TRUE 0.991 -9.000 0.453 0.003   NA
 5499655 5499656 AMF_217 AMF_218 sdhD   FALSE 0.295 151.000 0.008 NA   NA
 5499657 5499658 AMF_219 AMF_220 thiD   TRUE 0.971 8.000 0.038 1.000   NA
 5499658 5499659 AMF_220 AMF_221   perM TRUE 0.987 1.000 0.362 NA   NA
 5499659 5499660 AMF_221 AMF_222 perM   FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 5499661 5499662 AMF_223 AMF_1067 rpsD   FALSE 0.455 15.000 0.000 NA   NA
 5499663 5499664 AMF_224 AMF_225     TRUE 0.935 60.000 0.700 1.000   NA
 5499664 5499665 AMF_225 AMF_227   pgpA TRUE 0.949 -33.000 0.018 1.000   NA
 5499666 5499667 AMF_228 AMF_1094     FALSE 0.187 75.000 0.000 NA   NA
 5499667 5499668 AMF_1094 AMF_1068     FALSE 0.088 132.000 0.000 NA   NA
 5499668 5499669 AMF_1068 AMF_229   tig FALSE 0.534 -39.000 0.000 NA   NA
 5499669 5499670 AMF_229 AMF_230 tig clpP TRUE 0.994 5.000 0.351 1.000 Y NA
 5499670 5499671 AMF_230 AMF_231 clpP clpX TRUE 0.989 10.000 0.352 1.000 Y NA
 5499671 5499672 AMF_231 AMF_232 clpX lon TRUE 0.975 19.000 0.201 1.000 Y NA
 5499672 5499673 AMF_232 AMF_1069 lon   FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 5499673 5499674 AMF_1069 AMF_233   fmt FALSE 0.358 28.000 0.000 NA   NA
 5499674 5499675 AMF_233 AMF_234 fmt   FALSE 0.010 159.000 0.002 NA   NA
 5499675 5499676 AMF_234 AMF_235     FALSE 0.115 204.000 0.008 NA   NA
 5499676 5499677 AMF_235 AMF_236   thiE FALSE 0.003 415.000 0.000 NA   NA
 5499679 5499680 AMF_238 AMF_240   ftsK TRUE 0.957 -25.000 0.021 1.000   NA
 5499681 5499682 AMF_241 AMF_243   argD FALSE 0.317 228.000 0.429 NA   NA
 5499684 5499685 AMF_245 AMF_246   tolR TRUE 0.970 -34.000 0.250 NA   NA
 5499685 5499686 AMF_246 AMF_247 tolR tolQ TRUE 0.993 -19.000 0.333 0.023 Y NA
 5499688 5499689 AMF_249 AMF_250 smf trmU FALSE 0.004 535.000 0.000 1.000 N NA
 5499689 5499690 AMF_250 AMF_251 trmU pilT FALSE 0.058 188.000 0.004 NA N NA
 5499690 5499691 AMF_251 AMF_252 pilT fabB FALSE 0.007 301.000 0.000 NA N NA
 5499691 5499692 AMF_252 AMF_253 fabB acpP TRUE 0.869 105.000 0.106 1.000 Y NA
 5499692 5499693 AMF_253 AMF_1036 acpP rpmG FALSE 0.004 587.000 0.000 1.000 N NA
 5499694 5499695 AMF_255 AMF_256     TRUE 0.973 -12.000 0.045 NA   NA
 5499695 5499696 AMF_256 AMF_1037     FALSE 0.046 173.000 0.000 NA   NA
 5499696 5499697 AMF_1037 AMF_257     FALSE 0.002 552.000 0.000 NA   NA
 5499699 5499700 AMF_259 AMF_261   coq7 FALSE 0.109 115.000 0.000 NA   NA
 5499700 5499701 AMF_261 AMF_262 coq7   TRUE 0.763 46.000 0.008 NA   NA
 5499702 5499703 AMF_264 AMF_265     FALSE 0.101 123.000 0.000 NA   NA
 5499703 5499704 AMF_265 AMF_266     FALSE 0.641 8.000 0.000 NA   NA
 5499704 5499705 AMF_266 AMF_267     FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 5499705 5499706 AMF_267 AMF_1038     FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 5499706 5499707 AMF_1038 AMF_268     FALSE 0.005 335.000 0.000 NA   NA
 5499707 5499708 AMF_268 AMF_269     FALSE 0.006 287.000 0.000 NA   NA
 5499708 5499709 AMF_269 AMF_271   uvrD FALSE 0.002 670.000 0.000 NA   NA
 5499710 5499711 AMF_272 AMF_273   gyrA FALSE 0.002 1149.000 0.000 NA   NA
 5499711 5499712 AMF_273 AMF_274 gyrA nth TRUE 0.967 0.000 0.005 1.000 Y NA
 5499712 5499713 AMF_274 AMF_275 nth   FALSE 0.004 353.000 0.000 NA   NA
 5499713 5499714 AMF_275 AMF_276   htpG TRUE 0.702 65.000 0.008 NA   NA
 5499714 5499715 AMF_276 AMF_1039 htpG   FALSE 0.011 246.000 0.000 NA   NA
 5499716 5499717 AMF_1040 AMF_279   purB FALSE 0.002 918.000 0.000 NA   NA
 5499718 5499719 AMF_1095 AMF_1070     FALSE 0.271 56.000 0.000 NA   NA
 5499719 5499720 AMF_1070 AMF_280   uvrC FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 5499721 5499722 AMF_281 AMF_282   birA FALSE 0.003 462.000 0.000 NA   NA
 5499722 5499723 AMF_282 AMF_283 birA gst TRUE 0.963 9.000 0.023 1.000 N NA
 5499723 5499724 AMF_283 AMF_284 gst   TRUE 0.700 83.000 0.015 NA   NA
 5499725 5499726 AMF_285 AMF_286 potA recR FALSE 0.007 340.000 0.000 1.000 N NA
 5499728 5499729 AMF_288 AMF_289 znuC ubiB TRUE 0.972 -7.000 0.022 1.000   NA
 5499729 5499730 AMF_289 AMF_290 ubiB   FALSE 0.559 38.000 0.005 NA   NA
 5499731 5499732 AMF_291 AMF_293 miaB   FALSE 0.022 137.000 0.002 NA   NA
 5499732 5499733 AMF_293 AMF_294     FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 5499735 5499736 AMF_296 AMF_297   dapA FALSE 0.018 217.000 0.000 NA   NA
 5499736 5499737 AMF_297 AMF_299 dapA pkcI FALSE 0.038 217.000 0.003 1.000 N NA
 5499737 5499738 AMF_299 AMF_300 pkcI   TRUE 0.956 -3.000 0.010 NA   NA
 5499739 5499740 AMF_301 AMF_302 mutS   FALSE 0.635 -19.000 0.000 NA   NA
 5499740 5499741 AMF_302 AMF_303   proP FALSE 0.066 148.000 0.000 NA   NA
 5499741 5499742 AMF_303 AMF_304 proP proP TRUE 0.869 129.000 1.000 0.017   NA
 5499743 5499744 AMF_305 AMF_306 nadE hemB TRUE 0.979 7.000 0.010 1.000 Y NA
 5499745 5499746 AMF_307 AMF_308 pbpA2   TRUE 0.919 40.000 0.182 NA N NA
 5499746 5499747 AMF_308 AMF_309   proP FALSE 0.623 162.000 0.333 NA   NA
 5499749 5499750 AMF_311 AMF_312 mcd gatB TRUE 0.829 13.000 0.006 1.000   NA
 5499750 5499751 AMF_312 AMF_1071 gatB   FALSE 0.003 419.000 0.000 NA   NA
 5499751 5499752 AMF_1071 AMF_313   fab1 FALSE 0.641 8.000 0.000 NA   NA
 5499752 5499753 AMF_313 AMF_314 fab1 dnaA FALSE 0.020 242.000 0.000 1.000 N NA
 5499755 5499756 AMF_316 AMF_318 nadD pdxJ FALSE 0.331 174.000 0.005 1.000 Y NA
 5499757 5499758 AMF_1041 AMF_319 hupB dnaX FALSE 0.132 210.000 0.000 1.000 Y NA
 5499758 5499759 AMF_319 AMF_320 dnaX   TRUE 0.945 -18.000 0.010 NA N NA
 5499761 5499762 AMF_322 AMF_323 thiC   FALSE 0.626 45.000 0.006 NA   NA
 5499762 5499763 AMF_323 AMF_324   rpoZ TRUE 0.674 65.000 0.008 NA   NA
 5499763 5499764 AMF_324 AMF_325 rpoZ   FALSE 0.033 335.000 0.008 1.000   NA
 5499765 5499766 AMF_327 AMF_328 leuS   FALSE 0.006 318.000 0.000 NA N NA
 5499766 5499767 AMF_328 AMF_329   pyrF TRUE 0.704 -43.000 0.004 NA N NA
 5499768 5499769 AMF_330 AMF_331 ccmE surE FALSE 0.566 122.000 0.013 1.000   NA
 5499769 5499770 AMF_331 AMF_332 surE nuoC1 FALSE 0.003 959.000 0.000 1.000   NA
 5499770 5499771 AMF_332 AMF_333 nuoC1 nuoB TRUE 0.995 6.000 0.328 0.009 Y NA
 5499771 5499772 AMF_333 AMF_334 nuoB nuoA TRUE 0.992 -40.000 0.507 0.009 Y NA
 5499772 5499773 AMF_334 AMF_335 nuoA uvrA FALSE 0.009 317.000 0.000 1.000 N NA
 5499773 5499774 AMF_335 AMF_336 uvrA nusB FALSE 0.457 34.000 0.003 1.000 N NA
 5499774 5499775 AMF_336 AMF_337 nusB ribH TRUE 0.986 -7.000 0.347 1.000 N NA
 5499775 5499776 AMF_337 AMF_339 ribH yidC TRUE 0.918 -52.000 0.011 1.000 N NA
 5499776 5499777 AMF_339 AMF_340 yidC pssA FALSE 0.232 91.000 0.000 1.000 N NA
 5499777 5499778 AMF_340 AMF_341 pssA psd TRUE 0.961 61.000 0.466 1.000 Y NA
 5499778 5499779 AMF_341 AMF_342 psd   FALSE 0.016 259.000 0.000 1.000 N NA
 5499779 5499780 AMF_342 AMF_343     FALSE 0.003 418.000 0.000 NA   NA
 5499781 5499782 AMF_344 AMF_345 murG efp FALSE 0.053 147.000 0.002 1.000 N NA
 5499782 5499783 AMF_345 AMF_346 efp suhB TRUE 0.982 3.000 0.047 1.000 N NA
 5499783 5499784 AMF_346 AMF_347 suhB rluC TRUE 0.896 -3.000 0.005 1.000 N NA
 5499785 5499786 AMF_349 AMF_350     FALSE 0.317 197.000 0.029 1.000 N NA
 5499786 5499787 AMF_350 AMF_351     TRUE 0.967 -34.000 0.160 NA   NA
 5499787 5499788 AMF_351 AMF_352   gdh TRUE 0.949 -145.000 0.120 NA   NA
 5499789 5499790 AMF_353 AMF_354   cysS TRUE 0.686 2.000 0.003 NA   NA
 5499790 5499791 AMF_354 AMF_355 cysS nrdB FALSE 0.045 191.000 0.000 1.000 N NA
 5499791 5499792 AMF_355 AMF_357 nrdB   TRUE 0.967 -22.000 0.032 1.000   NA
 5499794 5499795 AMF_360 AMF_361   dnaG FALSE 0.043 128.000 0.002 NA   NA
 5499795 5499796 AMF_361 AMF_1042 dnaG   FALSE 0.570 -31.000 0.000 NA   NA
 5499797 5499798 AMF_363 AMF_365 rpoD nifR3 FALSE 0.106 161.000 0.003 1.000 N NA
 5499800 5499801 AMF_367 AMF_368   cutA FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 5499801 5499802 AMF_368 AMF_369 cutA dhkA TRUE 0.749 44.000 0.007 1.000 N NA
 5499802 5499803 AMF_369 AMF_370 dhkA   FALSE 0.004 499.000 0.000 1.000   NA
 5499804 5499805 AMF_371 AMF_372     FALSE 0.021 203.000 0.000 NA   NA
 5499805 5499806 AMF_372 AMF_373   topA FALSE 0.123 125.000 0.000 NA N NA
 5499807 5499808 AMF_374 AMF_1072     FALSE 0.003 489.000 0.000 NA   NA
 5499808 5499809 AMF_1072 AMF_375   acpS FALSE 0.003 435.000 0.000 NA   NA
 5499809 5499810 AMF_375 AMF_377 acpS proS TRUE 0.965 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5499810 5499811 AMF_377 AMF_378 proS   FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 5499811 5499812 AMF_378 AMF_1073     FALSE 0.271 56.000 0.000 NA   NA
 5499814 5499815 AMF_380 AMF_381 trxB tdpX1 TRUE 0.989 -3.000 0.024 1.000 Y NA
 5499817 5499818 AMF_383 AMF_384 ppiD   FALSE 0.224 52.000 0.002 1.000   NA
 5499818 5499819 AMF_384 AMF_385     FALSE 0.568 19.000 0.003 1.000 N NA
 5499819 5499820 AMF_385 AMF_1074     FALSE 0.002 1363.000 0.000 NA   NA
 5499823 5499824 AMF_389 AMF_390 truB rpsO TRUE 0.963 39.000 0.211 1.000 Y NA
 5499824 5499825 AMF_390 AMF_391 rpsO pnp TRUE 0.962 52.000 0.335 1.000 Y NA
 5499825 5499826 AMF_391 AMF_392 pnp   TRUE 0.928 6.000 0.007 1.000   NA
 5499826 5499827 AMF_392 AMF_393   lepA FALSE 0.215 135.000 0.005 1.000   NA
 5499829 5499830 AMF_395 AMF_396 msp1a mlp2 FALSE 0.002 555.000 0.000 NA   NA
 5499830 5499831 AMF_396 AMF_398 mlp2 mlp3 FALSE 0.003 474.000 0.000 NA   NA
 5499831 5499832 AMF_398 AMF_399 mlp3 mlp4 FALSE 0.003 423.000 0.000 NA   NA
 5499832 5499833 AMF_399 AMF_400 mlp4   FALSE 0.383 22.000 0.000 NA   NA
 5499833 5499834 AMF_400 AMF_401     FALSE 0.002 824.000 0.000 NA   NA
 5499834 5499835 AMF_401 AMF_402     TRUE 0.910 62.000 0.400 NA   NA
 5499835 5499836 AMF_402 AMF_403     FALSE 0.004 400.000 0.000 NA   NA
 5499836 5499837 AMF_403 AMF_405     FALSE 0.002 577.000 0.000 NA   NA
 5499837 5499838 AMF_405 AMF_1043     FALSE 0.383 22.000 0.000 NA   NA
 5499838 5499839 AMF_1043 AMF_406     FALSE 0.035 183.000 0.000 NA   NA
 5499839 5499840 AMF_406 AMF_407     FALSE 0.002 800.000 0.000 NA   NA
 5499840 5499841 AMF_407 AMF_408     FALSE 0.036 182.000 0.000 NA   NA
 5499843 5499844 AMF_412 AMF_413   bioA FALSE 0.097 182.000 0.005 1.000   NA
 5499844 5499845 AMF_413 AMF_1075 bioA   FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 5499845 5499846 AMF_1075 AMF_414     FALSE 0.194 73.000 0.000 NA   NA
 5499848 5499849 AMF_1076 AMF_416   tpiA FALSE 0.490 -57.000 0.000 NA   NA
 5499849 5499850 AMF_416 AMF_417 tpiA   TRUE 0.983 -16.000 0.353 1.000   NA
 5499850 5499851 AMF_417 AMF_418   gcp TRUE 0.913 10.000 0.008 1.000   NA
 5499853 5499854 AMF_420 AMF_421 folB mdh TRUE 0.839 52.000 0.015 1.000 N NA
 5499858 5499859 AMF_425 AMF_426 rpiB ubiG TRUE 0.642 93.000 0.011 1.000 N NA
 5499860 5499861 AMF_427 AMF_428 gcp   TRUE 0.903 10.000 0.008 NA   NA
 5499861 5499862 AMF_428 AMF_429     FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 5499862 5499863 AMF_429 AMF_430     FALSE 0.628 -21.000 0.000 NA   NA
 5499863 5499864 AMF_430 AMF_431     FALSE 0.288 51.000 0.000 NA   NA
 5499864 5499865 AMF_431 AMF_432     TRUE 0.980 -25.000 0.500 NA   NA
 5499865 5499866 AMF_432 AMF_433     TRUE 0.987 -3.000 0.429 NA   NA
 5499866 5499867 AMF_433 AMF_434     TRUE 0.973 9.000 0.143 NA   NA
 5499867 5499868 AMF_434 AMF_435   putA FALSE 0.003 502.000 0.000 NA   NA
 5499870 5499871 AMF_438 AMF_1077 putA   FALSE 0.002 626.000 0.000 NA   NA
 5499873 5499874 AMF_440 AMF_441 rlpA xthA2 FALSE 0.177 199.000 0.010 NA   NA
 5499874 5499875 AMF_441 AMF_442 xthA2   TRUE 0.980 6.000 0.069 1.000   NA
 5499876 5499877 AMF_443 AMF_444 rpmJ   FALSE 0.438 29.000 0.000 1.000   NA
 5499878 5499879 AMF_445 AMF_1078     FALSE 0.490 -57.000 0.000 NA   NA
 5499879 5499880 AMF_1078 AMF_446   rpmA TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 5499880 5499881 AMF_446 AMF_447 rpmA rplU TRUE 0.996 4.000 0.667 0.047 Y NA
 5499882 5499883 AMF_448 AMF_449 eno hflX TRUE 0.959 2.000 0.009 1.000   NA
 5499884 5499885 AMF_450 AMF_451 purA   TRUE 0.678 -10.000 0.000 NA   NA
 5499885 5499886 AMF_451 AMF_452   mraW TRUE 0.722 3.000 0.000 NA   NA
 5499886 5499887 AMF_452 AMF_453 mraW ygfA FALSE 0.041 172.000 0.002 1.000 N NA
 5499888 5499889 AMF_457 AMF_458     FALSE 0.016 223.000 0.000 NA   NA
 5499890 5499891 AMF_459 AMF_460     TRUE 0.806 133.000 1.000 NA   NA
 5499891 5499892 AMF_460 AMF_461   trxB2 FALSE 0.020 205.000 0.000 NA   NA
 5499892 5499893 AMF_461 AMF_462 trxB2 pmbA FALSE 0.394 79.000 0.005 NA   NA
 5499893 5499894 AMF_462 AMF_463 pmbA folE TRUE 0.943 10.000 0.015 NA   NA
 5499894 5499895 AMF_463 AMF_464 folE atpG TRUE 0.946 7.000 0.008 1.000 N NA
 5499896 5499897 AMF_465 AMF_466 nuoD nuoE TRUE 0.996 5.000 0.355 0.010 Y NA
 5499897 5499898 AMF_466 AMF_467 nuoE dnaQ TRUE 0.933 -10.000 0.007 1.000 N NA
 5499900 5499901 AMF_470 AMF_471     FALSE 0.003 436.000 0.000 NA   NA
 5499902 5499903 AMF_472 AMF_473   rpoH TRUE 0.695 -6.000 0.000 NA   NA
 5499904 5499905 AMF_474 AMF_475     TRUE 0.712 -3.000 0.000 NA   NA
 5499905 5499906 AMF_475 AMF_476     FALSE 0.003 440.000 0.000 NA   NA
 5499907 5499908 AMF_477 AMF_478 nuoH nuoG TRUE 0.996 2.000 0.515 0.024 Y NA
 5499908 5499909 AMF_478 AMF_479 nuoG   TRUE 0.967 8.000 0.033 NA   NA
 5499909 5499910 AMF_479 AMF_480   gyrB2 FALSE 0.073 181.000 0.004 NA   NA
 5499912 5499913 AMF_482 AMF_483     FALSE 0.003 494.000 0.000 NA   NA
 5499913 5499914 AMF_483 AMF_484   adx1 TRUE 0.957 -28.000 0.029 NA   NA
 5499914 5499915 AMF_484 AMF_485 adx1 hscA TRUE 0.927 26.000 0.091 NA N NA
 5499915 5499916 AMF_485 AMF_486 hscA hscB TRUE 0.993 -12.000 0.634 NA Y NA
 5499916 5499917 AMF_486 AMF_487 hscB   TRUE 0.967 -22.000 0.046 NA   NA
 5499917 5499918 AMF_487 AMF_488   nifU TRUE 0.968 -22.000 0.056 NA   NA
 5499918 5499919 AMF_488 AMF_489 nifU nifS TRUE 0.986 -12.000 0.448 1.000 N NA
 5499919 5499920 AMF_489 AMF_490 nifS nifS TRUE 0.970 33.000 0.052 0.002 Y NA
 5499921 5499922 AMF_491 AMF_492   lysS FALSE 0.008 303.000 0.000 1.000   NA
 5499922 5499923 AMF_492 AMF_493 lysS   TRUE 0.923 50.000 0.017 NA Y NA
 5499924 5499925 AMF_494 AMF_495 truA pyrB TRUE 0.902 -3.000 0.005 1.000 N NA
 5499925 5499926 AMF_495 AMF_498 pyrB   FALSE 0.047 163.000 0.002 1.000 N NA
 5499926 5499927 AMF_498 AMF_499   atpC TRUE 0.704 -3.000 0.002 1.000 N NA
 5499927 5499928 AMF_499 AMF_500 atpC atpD TRUE 0.969 70.000 0.837 0.011 Y NA
 5499928 5499929 AMF_500 AMF_1079 atpD   FALSE 0.203 70.000 0.000 NA   NA
 5499932 5499933 AMF_502 AMF_503 ftsJ   FALSE 0.003 492.000 0.000 NA   NA
 5499933 5499934 AMF_503 AMF_504     FALSE 0.293 50.000 0.000 NA   NA
 5499934 5499935 AMF_504 AMF_505     FALSE 0.002 654.000 0.000 NA   NA
 5499936 5499937 AMF_507 AMF_509     FALSE 0.002 605.000 0.000 NA   NA
 5499937 5499938 AMF_509 AMF_510   argS FALSE 0.120 102.000 0.000 NA   NA
 5499939 5499940 AMF_511 AMF_512 recO   FALSE 0.084 79.000 0.002 NA   NA
 5499940 5499941 AMF_512 AMF_1044     FALSE 0.535 12.000 0.000 NA   NA
 5499942 5499943 AMF_513 AMF_514   ileS FALSE 0.009 268.000 0.000 NA   NA
 5499944 5499945 AMF_515 AMF_516 bcp   TRUE 0.869 -34.000 0.007 NA   NA
 5499948 5499949 AMF_519 AMF_520 prfB   FALSE 0.006 300.000 0.000 NA   NA
 5499949 5499950 AMF_520 AMF_521   gatA FALSE 0.006 329.000 0.003 NA   NA
 5499951 5499952 AMF_522 AMF_523 folC hemC FALSE 0.340 158.000 0.003 1.000 Y NA
 5499952 5499953 AMF_523 AMF_524 hemC murB TRUE 0.887 -25.000 0.006 1.000 N NA
 5499953 5499954 AMF_524 AMF_526 murB ankA FALSE 0.010 282.000 0.000 1.000   NA
 5499955 5499956 AMF_527 AMF_528 nuoI lepB TRUE 0.905 16.000 0.013 1.000 N NA
 5499956 5499957 AMF_528 AMF_529 lepB   TRUE 0.921 11.000 0.010 NA   NA
 5499959 5499960 AMF_531 AMF_532     FALSE 0.002 582.000 0.000 NA   NA
 5499963 5499964 AMF_535 AMF_536     FALSE 0.221 67.000 0.000 NA   NA
 5499965 5499966 AMF_537 AMF_538 typA clpA FALSE 0.635 55.000 0.003 0.030 N NA
 5499968 5499969 AMF_541 AMF_542 rbfA infB TRUE 0.995 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 5499969 5499970 AMF_542 AMF_543 infB nusA TRUE 0.962 16.000 0.342 1.000 N NA
 5499970 5499971 AMF_543 AMF_544 nusA acrD FALSE 0.007 512.000 0.005 NA N NA
 5499971 5499972 AMF_544 AMF_545 acrD tatC FALSE 0.142 230.000 0.014 NA N NA
 5499972 5499973 AMF_545 AMF_546 tatC gcpE FALSE 0.454 98.000 0.007 NA N NA
 5499973 5499974 AMF_546 AMF_547 gcpE   TRUE 0.956 4.000 0.009 NA   NA
 5499974 5499975 AMF_547 AMF_548   dxr FALSE 0.191 98.000 0.004 NA   NA
 5499975 5499976 AMF_548 AMF_549 dxr nuoN1 TRUE 0.857 14.000 0.007 1.000 N NA
 5499976 5499977 AMF_549 AMF_550 nuoN1 nuoM TRUE 0.996 3.000 0.453 0.008 Y NA
 5499977 5499978 AMF_550 AMF_551 nuoM nuoL TRUE 0.995 -3.000 0.251 0.008 Y NA
 5499978 5499979 AMF_551 AMF_552 nuoL nuoK TRUE 0.962 68.000 0.451 0.024 Y NA
 5499979 5499980 AMF_552 AMF_553 nuoK nuoJ TRUE 0.977 49.000 0.484 0.008 Y NA
 5499980 5499981 AMF_553 AMF_555 nuoJ nuoF FALSE 0.330 189.000 0.005 0.008 Y NA
 5499981 5499982 AMF_555 AMF_556 nuoF fadB FALSE 0.514 79.000 0.006 1.000 N NA
 5499982 5499983 AMF_556 AMF_557 fadB   TRUE 0.969 6.000 0.019 NA   NA
 5499985 5499986 AMF_560 AMF_561     FALSE 0.053 164.000 0.000 NA   NA
 5499988 5499989 AMF_563 AMF_564   hemF FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 5499989 5499990 AMF_564 AMF_565 hemF agk FALSE 0.066 170.000 0.003 1.000 N NA
 5499990 5499991 AMF_565 AMF_566 agk engB TRUE 0.950 -55.000 0.046 1.000   NA
 5499993 5499994 AMF_569 AMF_570 pccB fpg FALSE 0.019 246.000 0.000 1.000 N NA
 5499997 5499998 AMF_572 AMF_573 gltX2   TRUE 0.807 5.000 0.004 NA   NA
 5499999 5500000 AMF_574 AMF_575     FALSE 0.011 435.000 0.000 0.015   NA
 5500000 5500001 AMF_575 AMF_576     TRUE 0.961 28.000 1.000 NA   NA
 5500001 5500002 AMF_576 AMF_577     FALSE 0.549 -36.000 0.000 NA   NA
 5500002 5500003 AMF_577 AMF_578   petC FALSE 0.007 286.000 0.000 NA   NA
 5500003 5500004 AMF_578 AMF_580 petC petB TRUE 0.997 1.000 0.630 0.005 Y NA
 5500004 5500005 AMF_580 AMF_581 petB petA TRUE 0.965 12.000 0.024 0.005   NA
 5500005 5500006 AMF_581 AMF_582 petA petA TRUE 0.887 -16.000 0.000 0.005   NA
 5500006 5500007 AMF_582 AMF_583 petA   FALSE 0.032 186.000 0.000 NA   NA
 5500007 5500008 AMF_583 AMF_584   znuB FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 5500008 5500009 AMF_584 AMF_585 znuB   TRUE 0.974 6.000 0.032 NA   NA
 5500009 5500010 AMF_585 AMF_586   tsf FALSE 0.129 22.000 0.002 NA   NA
 5500010 5500011 AMF_586 AMF_587 tsf rpsB TRUE 0.976 36.000 0.748 1.000 Y NA
 5500011 5500012 AMF_587 AMF_588 rpsB maf TRUE 0.777 35.000 0.008 NA N NA
 5500012 5500013 AMF_588 AMF_589 maf infA TRUE 0.960 -6.000 0.012 NA N NA
 5500013 5500014 AMF_589 AMF_590 infA hlyD TRUE 0.925 -3.000 0.006 1.000 N NA
 5500014 5500015 AMF_590 AMF_591 hlyD lpdA TRUE 0.945 -34.000 0.015 1.000 N NA
 5500015 5500016 AMF_591 AMF_592 lpdA   TRUE 0.954 8.000 0.015 NA   NA
 5500019 5500020 AMF_595 AMF_597 carA lytB FALSE 0.041 184.000 0.002 1.000 N NA
 5500020 5500021 AMF_597 AMF_598 lytB dut FALSE 0.026 202.000 0.002 1.000 N NA
 5500024 5500025 AMF_602 AMF_603     TRUE 0.991 -37.000 0.429 0.005 Y NA
 5500025 5500026 AMF_603 AMF_604     TRUE 0.990 12.000 0.333 0.005 Y NA
 5500026 5500027 AMF_604 AMF_605   virB6 TRUE 0.980 53.000 0.818 0.005 Y NA
 5500027 5500028 AMF_605 AMF_606 virB6 virB4 TRUE 0.986 -58.000 0.579 1.000 Y NA
 5500028 5500029 AMF_606 AMF_607 virB4 virB3 TRUE 0.995 4.000 0.789 NA Y NA
 5500029 5500030 AMF_607 AMF_608 virB3 sodB FALSE 0.547 73.000 0.007 NA N NA
 5500032 5500033 AMF_1082 AMF_610   lipA FALSE 0.585 10.000 0.000 NA   NA
 5500033 5500034 AMF_610 AMF_612 lipA   FALSE 0.002 683.000 0.000 NA   NA
 5500034 5500035 AMF_612 AMF_613     TRUE 0.810 107.000 0.500 NA   NA
 5500035 5500036 AMF_613 AMF_614   pycA TRUE 0.697 93.000 0.021 NA   NA
 5500038 5500039 AMF_617 AMF_618 rpmB priA FALSE 0.004 504.000 0.000 1.000 N NA
 5500039 5500040 AMF_618 AMF_619 priA   FALSE 0.008 218.000 0.002 1.000   NA
 5500040 5500041 AMF_619 AMF_620   hemD FALSE 0.108 126.000 0.003 1.000   NA
 5500041 5500042 AMF_620 AMF_622 hemD   FALSE 0.265 188.000 0.013 1.000 N NA
 5500042 5500043 AMF_622 AMF_623     TRUE 0.697 127.000 0.022 0.031   NA
 5500043 5500044 AMF_623 AMF_624     FALSE 0.005 387.000 0.000 1.000   NA
 5500044 5500045 AMF_624 AMF_625   era TRUE 0.959 -24.000 0.021 1.000   NA
 5500045 5500046 AMF_625 AMF_626 era ffh FALSE 0.336 95.000 0.003 0.022   NA
 5500046 5500047 AMF_626 AMF_628 ffh nuoL3 TRUE 0.949 -7.000 0.008 1.000 N NA
 5500047 5500048 AMF_628 AMF_629 nuoL3   FALSE 0.429 63.000 0.004 NA N NA
 5500048 5500049 AMF_629 AMF_630   dnaK FALSE 0.019 227.000 0.000 NA N NA
 5500049 5500050 AMF_630 AMF_631 dnaK rne FALSE 0.148 200.000 0.008 1.000 N NA
 5500050 5500051 AMF_631 AMF_633 rne   TRUE 0.686 95.000 0.016 1.000 N NA
 5500051 5500052 AMF_633 AMF_634     TRUE 0.796 88.000 0.093 NA   NA
 5500052 5500053 AMF_634 AMF_635     FALSE 0.519 -43.000 0.000 NA   NA
 5500053 5500054 AMF_635 AMF_636     TRUE 0.984 1.000 0.184 NA   NA
 5500054 5500055 AMF_636 AMF_637     TRUE 0.988 7.000 0.655 1.000   NA
 5500055 5500056 AMF_637 AMF_638   tktA TRUE 0.934 18.000 0.045 1.000   NA
 5500056 5500057 AMF_638 AMF_639 tktA   TRUE 0.952 16.000 0.118 1.000 N NA
 5500058 5500059 AMF_640 AMF_641 pal purA FALSE 0.009 294.000 0.000 1.000   NA
 5500060 5500061 AMF_642 AMF_643 hflX yqgF FALSE 0.214 38.000 0.002 1.000   NA
 5500061 5500062 AMF_643 AMF_644 yqgF nrdA TRUE 0.717 45.000 0.007 1.000 N NA
 5500062 5500063 AMF_644 AMF_1083 nrdA   FALSE 0.029 188.000 0.000 NA   NA
 5500064 5500065 AMF_645 AMF_646 ispA   TRUE 0.968 -3.000 0.016 NA   NA
 5500066 5500067 AMF_647 AMF_648 thiO dnaB FALSE 0.495 136.000 0.011 1.000 N NA
 5500067 5500068 AMF_648 AMF_649 dnaB   TRUE 0.836 51.000 0.017 NA   NA
 5500070 5500071 AMF_651 AMF_652 fabH plsX TRUE 0.996 -3.000 0.380 0.009 Y NA
 5500071 5500072 AMF_652 AMF_1047 plsX rpmF TRUE 0.989 0.000 0.418 1.000 N NA
 5500074 5500075 AMF_655 AMF_656 pstB dapB TRUE 0.894 -60.000 0.009 1.000 N NA
 5500075 5500076 AMF_656 AMF_657 dapB   TRUE 0.929 11.000 0.011 1.000   NA
 5500076 5500077 AMF_657 AMF_658   ubiA TRUE 0.933 13.000 0.018 1.000   NA
 5500077 5500078 AMF_658 AMF_659 ubiA aaap FALSE 0.060 152.000 0.000 NA   NA
 5500078 5500079 AMF_659 AMF_660 aaap alp1 FALSE 0.043 176.000 0.000 NA   NA
 5500079 5500080 AMF_660 AMF_662 alp1 alp2 FALSE 0.075 140.000 0.000 NA   NA
 5500080 5500081 AMF_662 AMF_663 alp2 aaap FALSE 0.041 178.000 0.000 NA   NA
 5500081 5500082 AMF_663 AMF_664 aaap alp3 FALSE 0.043 176.000 0.000 NA   NA
 5500083 5500084 AMF_1048 AMF_665 rpmH   TRUE 0.974 -60.000 0.787 1.000   NA
 5500084 5500085 AMF_665 AMF_667     TRUE 0.833 13.000 0.006 1.000   NA
 5500086 5500087 AMF_669 AMF_670   pheT FALSE 0.007 282.000 0.000 NA   NA
 5500087 5500088 AMF_670 AMF_671 pheT rplQ TRUE 0.972 4.000 0.006 1.000 Y NA
 5500088 5500089 AMF_671 AMF_672 rplQ rpoA TRUE 0.956 41.000 0.873 1.000 N NA
 5500089 5500090 AMF_672 AMF_673 rpoA rpsK TRUE 0.951 21.000 0.308 1.000 N NA
 5500090 5500091 AMF_673 AMF_675 rpsK rpsM TRUE 0.981 43.000 0.810 0.039 Y NA
 5500091 5500092 AMF_675 AMF_676 rpsM adk TRUE 0.824 64.000 0.017 1.000 N NA
 5500092 5500093 AMF_676 AMF_677 adk secY TRUE 0.981 -18.000 0.241 1.000 N NA
 5500093 5500094 AMF_677 AMF_678 secY rplO TRUE 0.977 13.000 0.730 1.000 N NA
 5500094 5500095 AMF_678 AMF_679 rplO rpsE TRUE 0.984 14.000 0.148 0.053 Y NA
 5500095 5500096 AMF_679 AMF_680 rpsE rplR TRUE 0.993 11.000 0.814 0.053 Y NA
 5500096 5500097 AMF_680 AMF_681 rplR rplF TRUE 0.997 2.000 0.815 0.039 Y NA
 5500097 5500098 AMF_681 AMF_682 rplF rpsH TRUE 0.995 -15.000 0.808 0.039 Y NA
 5500098 5500099 AMF_682 AMF_683 rpsH rpsN TRUE 0.983 18.000 0.295 0.039 Y NA
 5500099 5500100 AMF_683 AMF_684 rpsN rplE TRUE 0.955 69.000 0.309 0.039 Y NA
 5500100 5500101 AMF_684 AMF_685 rplE rplX TRUE 0.993 1.000 0.758 0.039   NA
 5500101 5500102 AMF_685 AMF_686 rplX rplN TRUE 0.931 71.000 0.810 0.053   NA
 5500102 5500103 AMF_686 AMF_687 rplN rpsQ TRUE 0.991 13.000 0.791 0.053 Y NA
 5500103 5500104 AMF_687 AMF_688 rpsQ rpmC TRUE 0.992 -10.000 0.828 0.039   NA
 5500104 5500105 AMF_688 AMF_689 rpmC rplP TRUE 0.990 8.000 0.802 0.039   NA
 5500105 5500106 AMF_689 AMF_690 rplP rpsC TRUE 0.996 -3.000 0.828 0.053 Y NA
 5500106 5500107 AMF_690 AMF_691 rpsC rplV TRUE 0.994 4.000 0.109 0.053 Y NA
 5500107 5500108 AMF_691 AMF_692 rplV rpsS TRUE 0.994 4.000 0.119 0.053 Y NA
 5500108 5500109 AMF_692 AMF_693 rpsS rplB TRUE 0.996 6.000 0.820 0.053 Y NA
 5500109 5500110 AMF_693 AMF_694 rplB rplW TRUE 0.996 -3.000 0.849 1.000 Y NA
 5500110 5500111 AMF_694 AMF_695 rplW rplD TRUE 0.991 -25.000 0.513 1.000 Y NA
 5500111 5500112 AMF_695 AMF_696 rplD rplC TRUE 0.986 18.000 0.486 0.039 Y NA
 5500112 5500113 AMF_696 AMF_697 rplC rpsJ TRUE 0.995 2.000 0.307 0.053 Y NA
 5500113 5500114 AMF_697 AMF_698 rpsJ tuf TRUE 0.992 7.000 0.318 1.000 Y NA
 5500114 5500115 AMF_698 AMF_1096 tuf   FALSE 0.358 28.000 0.000 NA   NA
 5500115 5500116 AMF_1096 AMF_1084     FALSE 0.613 9.000 0.000 NA   NA
 5500117 5500118 AMF_699 AMF_700 trmH cmk TRUE 0.879 -13.000 0.005 1.000 N NA
 5500118 5500119 AMF_700 AMF_701 cmk rpsA TRUE 0.902 65.000 0.281 1.000 N NA
 5500119 5500120 AMF_701 AMF_702 rpsA sppA TRUE 0.982 4.000 0.057 1.000 N NA
 5500120 5500121 AMF_702 AMF_703 sppA   FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 5500121 5500122 AMF_703 AMF_704     TRUE 0.951 1.000 0.008 NA   NA
 5500122 5500123 AMF_704 AMF_705     FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 5500123 5500124 AMF_705 AMF_706   hemH FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 5500125 5500126 AMF_707 AMF_708     FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 5500126 5500127 AMF_708 AMF_709   hflK FALSE 0.002 538.000 0.000 NA   NA
 5500127 5500128 AMF_709 AMF_710 hflK   TRUE 0.773 62.000 0.012 NA   NA
 5500130 5500131 AMF_712 AMF_713 qor aprD TRUE 0.749 106.000 0.100 1.000   NA
 5500132 5500133 AMF_714 AMF_716 folP carB FALSE 0.005 459.000 0.000 1.000 N NA
 5500134 5500135 AMF_717 AMF_718   fumC FALSE 0.298 165.000 0.009 NA   NA
 5500136 5500137 AMF_719 AMF_720 dfp pyrC TRUE 0.773 1.000 0.003 1.000   NA
 5500138 5500139 AMF_721 AMF_722 glmM lipB FALSE 0.388 37.000 0.003 1.000 N NA
 5500139 5500140 AMF_722 AMF_723 lipB radC FALSE 0.342 91.000 0.004 1.000 N NA
 5500141 5500142 AMF_724 AMF_725 groES groEL TRUE 0.952 48.000 0.079 1.000 Y NA
 5500145 5500146 AMF_729 AMF_730     FALSE 0.014 231.000 0.000 NA   NA
 5500146 5500147 AMF_730 AMF_731   pcxB FALSE 0.641 105.000 0.019 NA   NA
 5500148 5500149 AMF_1056 AMF_1057   pepA FALSE 0.586 -28.000 0.000 NA   NA
 5500149 5500150 AMF_1057 AMF_733 pepA purN TRUE 0.900 16.000 0.012 1.000 N NA
 5500151 5500152 AMF_735 AMF_736   purQ FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 5500155 5500156 AMF_739 AMF_740     FALSE 0.492 164.000 0.040 NA   NA
 5500156 5500157 AMF_740 AMF_741     TRUE 0.728 101.000 0.060 NA   NA
 5500157 5500158 AMF_741 AMF_742   bioB TRUE 0.781 -13.000 0.004 NA   NA
 5500158 5500159 AMF_742 AMF_743 bioB purL FALSE 0.003 728.000 0.000 1.000 N NA
 5500159 5500160 AMF_743 AMF_744 purL folP FALSE 0.007 373.000 0.000 1.000 N NA
 5500161 5500162 AMF_745 AMF_747     TRUE 0.732 99.000 0.059 NA   NA
 5500163 5500164 AMF_748 AMF_749     FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 5500168 5500169 AMF_753 AMF_1049 gpsA omp15 TRUE 0.712 -3.000 0.000 NA   NA
 5500170 5500171 AMF_755 AMF_756     FALSE 0.221 67.000 0.000 NA   NA
 5500173 5500174 AMF_758 AMF_1050 rho   FALSE 0.009 270.000 0.000 NA   NA
 5500175 5500176 AMF_759 AMF_760 hslV hslU TRUE 0.995 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 5500176 5500177 AMF_760 AMF_761 hslU ubiE TRUE 0.955 4.000 0.008 1.000 N NA
 5500181 5500182 AMF_766 AMF_767 coxB coxA TRUE 0.947 98.000 0.741 0.004 Y NA
 5500182 5500183 AMF_767 AMF_768 coxA ctaB TRUE 0.982 10.000 0.153 0.004 N NA
 5500185 5500186 AMF_770 AMF_771 purD yajC FALSE 0.159 31.000 0.002 NA N NA
 5500186 5500187 AMF_771 AMF_772 yajC glmS FALSE 0.521 69.000 0.006 NA N NA
 5500188 5500189 AMF_773 AMF_774 dnaN rnd FALSE 0.070 221.000 0.003 0.004   NA
 5500189 5500190 AMF_774 AMF_775 rnd czcR TRUE 0.851 65.000 0.036 1.000   NA
 5500190 5500191 AMF_775 AMF_776 czcR   FALSE 0.047 295.000 0.000 1.000 Y NA
 5500191 5500192 AMF_776 AMF_777   ppa FALSE 0.003 844.000 0.000 1.000 N NA
 5500192 5500193 AMF_777 AMF_1051 ppa   FALSE 0.002 1650.000 0.000 NA   NA
 5500193 5500194 AMF_1051 AMF_778   rpsI FALSE 0.467 -64.000 0.000 NA   NA
 5500194 5500195 AMF_778 AMF_779 rpsI rplM TRUE 0.991 -28.000 0.231 0.038 Y NA
 5500196 5500197 AMF_780 AMF_781 tolC   TRUE 0.941 19.000 0.146 NA   NA
 5500199 5500200 AMF_784 AMF_785 prsA gatC TRUE 0.961 -3.000 0.009 1.000 N NA
 5500201 5500202 AMF_786 AMF_787 acnA apaG FALSE 0.006 319.000 0.000 NA N NA
 5500205 5500206 AMF_790 AMF_792     FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 5500207 5500208 AMF_793 AMF_794     FALSE 0.022 201.000 0.000 NA   NA
 5500208 5500209 AMF_794 AMF_795     FALSE 0.005 335.000 0.000 NA   NA
 5500209 5500210 AMF_795 AMF_796   virB4 FALSE 0.002 554.000 0.000 NA   NA
 5500210 5500211 AMF_796 AMF_797 virB4   TRUE 0.680 133.000 0.133 NA   NA
 5500211 5500212 AMF_797 AMF_798     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 5500212 5500213 AMF_798 AMF_799     FALSE 0.002 787.000 0.000 NA   NA
 5500213 5500214 AMF_799 AMF_1052     FALSE 0.585 10.000 0.000 NA   NA
 5500215 5500216 AMF_800 AMF_801     FALSE 0.221 67.000 0.000 NA   NA
 5500216 5500217 AMF_801 AMF_802   msp3 FALSE 0.091 131.000 0.000 NA   NA
 5500217 5500218 AMF_802 AMF_803 msp3 hflK FALSE 0.033 247.000 0.000 0.055   NA
 5500218 5500219 AMF_803 AMF_804 hflK hflC TRUE 0.991 -82.000 0.947 0.013 Y NA
 5500219 5500220 AMF_804 AMF_805 hflC   TRUE 0.994 3.000 0.084 0.013 Y NA
 5500220 5500221 AMF_805 AMF_806     TRUE 0.961 -7.000 0.011 1.000 N NA
 5500221 5500222 AMF_806 AMF_807   rnc TRUE 0.853 -13.000 0.004 1.000 N NA
 5500222 5500223 AMF_807 AMF_808 rnc cox11 TRUE 0.741 31.000 0.006 1.000 N NA
 5500224 5500225 AMF_809 AMF_811   ana29 FALSE 0.004 339.000 0.000 NA   NA
 5500227 5500228 AMF_813 AMF_814     FALSE 0.207 197.000 0.013 NA   NA
 5500228 5500229 AMF_814 AMF_815     TRUE 0.982 13.000 0.598 0.008   NA
 5500229 5500230 AMF_815 AMF_816   lspA TRUE 0.969 -37.000 0.038 0.027   NA
 5500230 5500231 AMF_816 AMF_817 lspA ribF TRUE 0.727 79.000 0.013 1.000 N NA
 5500233 5500234 AMF_819 AMF_820 hemK map FALSE 0.567 181.000 0.018 1.000 Y NA
 5500234 5500235 AMF_820 AMF_821 map sucB TRUE 0.919 4.000 0.005 1.000 N NA
 5500235 5500236 AMF_821 AMF_822 sucB   TRUE 0.762 31.000 0.007 1.000   NA
 5500236 5500237 AMF_822 AMF_823   panC FALSE 0.281 46.000 0.002 1.000   NA
 5500239 5500240 AMF_825 AMF_826 dsbD   TRUE 0.760 44.000 0.008 NA   NA
 5500241 5500242 AMF_827 AMF_828   oma87 TRUE 0.987 -3.000 0.016 1.000 Y NA
 5500242 5500243 AMF_828 AMF_829 oma87   TRUE 0.990 -13.000 0.089 1.000 Y NA
 5500243 5500244 AMF_829 AMF_830   fabZ TRUE 0.983 6.000 0.102 1.000 N NA
 5500244 5500245 AMF_830 AMF_831 fabZ purH TRUE 0.823 15.000 0.006 1.000 N NA
 5500247 5500248 AMF_834 AMF_835   slt TRUE 0.883 28.000 0.016 1.000   NA
 5500254 5500255 AMF_841 AMF_842 atpE   TRUE 0.988 7.000 0.278 0.009   NA
 5500255 5500256 AMF_842 AMF_843     TRUE 0.985 -3.000 0.032 0.010   NA
 5500257 5500258 AMF_844 AMF_845 ftsA trkH TRUE 0.888 32.000 0.018 1.000 N NA
 5500259 5500260 AMF_846 AMF_1085 mesJ   FALSE 0.459 -134.000 0.000 NA   NA
 5500260 5500261 AMF_1085 AMF_847   ftsH FALSE 0.002 1384.000 0.000 NA   NA
 5500261 5500262 AMF_847 AMF_848 ftsH secA FALSE 0.350 121.000 0.004 0.046 N NA
 5500263 5500264 AMF_1053 AMF_849     FALSE 0.410 19.000 0.000 NA   NA
 5500264 5500265 AMF_849 AMF_850   czcD TRUE 0.976 4.000 0.025 NA N NA
 5500265 5500266 AMF_850 AMF_1086 czcD   FALSE 0.527 -41.000 0.000 NA   NA
 5500266 5500267 AMF_1086 AMF_851   ccmB FALSE 0.079 136.000 0.000 NA   NA
 5500270 5500271 AMF_854 AMF_855 ftsY icd FALSE 0.013 275.000 0.000 1.000 N NA
 5500271 5500272 AMF_855 AMF_856 icd recJ FALSE 0.161 141.000 0.004 1.000 N NA
 5500276 5500277 AMF_860 AMF_861   omp1 FALSE 0.005 415.000 0.000 1.000   NA
 5500277 5500278 AMF_861 AMF_862 omp1 opag3 TRUE 0.691 165.000 0.333 0.017   NA
 5500278 5500279 AMF_862 AMF_864 opag3 opag2 TRUE 0.976 15.000 0.500 0.017   NA
 5500279 5500280 AMF_864 AMF_865 opag2 opag1 FALSE 0.535 12.000 0.000 NA   NA
 5500280 5500281 AMF_865 AMF_866 opag1 msp2 FALSE 0.496 13.000 0.000 NA   NA
 5500284 5500285 AMF_869 AMF_870     FALSE 0.013 232.000 0.000 NA   NA
 5500289 5500290 AMF_875 AMF_876 omp2 omp3 FALSE 0.171 81.000 0.000 NA   NA
 5500291 5500292 AMF_877 AMF_878   omp4 FALSE 0.009 270.000 0.000 NA   NA
 5500292 5500293 AMF_878 AMF_879 omp4   FALSE 0.618 -22.000 0.000 NA   NA
 5500293 5500294 AMF_879 AMF_880   omp5 FALSE 0.105 119.000 0.000 NA   NA
 5500295 5500296 AMF_881 AMF_882   ccmF TRUE 0.736 51.000 0.007 1.000   NA
 5500298 5500299 AMF_884 AMF_885 smpB ribB TRUE 0.819 3.000 0.000 1.000 N NA
 5500299 5500300 AMF_885 AMF_886 ribB greA FALSE 0.547 19.000 0.000 1.000 N NA
 5500300 5500301 AMF_886 AMF_887 greA atpA TRUE 0.960 -3.000 0.009 1.000 N NA
 5500301 5500302 AMF_887 AMF_888 atpA atpH TRUE 0.988 20.000 0.864 0.009 Y NA
 5500302 5500303 AMF_888 AMF_889 atpH   FALSE 0.002 576.000 0.000 NA   NA
 5500303 5500304 AMF_889 AMF_890     TRUE 0.977 4.000 0.033 NA   NA
 5500304 5500305 AMF_890 AMF_891     TRUE 0.979 -3.000 0.058 NA   NA
 5500305 5500306 AMF_891 AMF_893   lolE TRUE 0.975 5.000 0.030 NA   NA
 5500308 5500309 AMF_895 AMF_896 gshA gltA FALSE 0.006 363.000 0.000 1.000   NA
 5500309 5500310 AMF_896 AMF_897 gltA guaA TRUE 0.745 7.000 0.003 1.000 N NA
 5500310 5500311 AMF_897 AMF_898 guaA   FALSE 0.108 117.000 0.000 NA   NA
 5500312 5500313 AMF_899 AMF_900   pdhC FALSE 0.002 611.000 0.000 NA   NA
 5500313 5500314 AMF_900 AMF_901 pdhC fbaB FALSE 0.010 298.000 0.000 1.000 N NA
 5500314 5500315 AMF_901 AMF_1087 fbaB   TRUE 0.722 3.000 0.000 NA   NA
 5500316 5500317 AMF_902 AMF_903 pbpA1 secF TRUE 0.968 -19.000 0.026 1.000 N NA
 5500319 5500320 AMF_905 AMF_906 hemA tyrS FALSE 0.347 170.000 0.010 1.000 N NA
 5500320 5500321 AMF_906 AMF_1088 tyrS   FALSE 0.577 -29.000 0.000 NA   NA
 5500322 5500323 AMF_907 AMF_908 glnA mraY1 FALSE 0.492 11.000 0.002 1.000 N NA
 5500323 5500324 AMF_908 AMF_909 mraY1 ispB FALSE 0.516 10.000 0.002 1.000 N NA
 5500325 5500326 AMF_910 AMF_911   mkl FALSE 0.621 127.000 0.029 NA   NA
 5500326 5500327 AMF_911 AMF_912 mkl   TRUE 0.992 5.000 0.178 NA Y NA
 5500327 5500328 AMF_912 AMF_913   rpe TRUE 0.688 19.000 0.005 NA N NA
 5500328 5500329 AMF_913 AMF_914 rpe polA FALSE 0.275 77.000 0.003 1.000 N NA
 5500330 5500331 AMF_915 AMF_916   argF FALSE 0.379 23.000 0.000 NA   NA
 5500331 5500332 AMF_916 AMF_917 argF recF TRUE 0.644 10.000 0.003 1.000 N NA
 5500333 5500334 AMF_918 AMF_919 omp6 omp7 TRUE 0.953 40.000 1.000 NA   NA
 5500334 5500335 AMF_919 AMF_920 omp7 omp8 TRUE 0.952 65.000 1.000 0.016   NA
 5500335 5500336 AMF_920 AMF_921 omp8 omp9 TRUE 0.956 62.000 1.000 0.016   NA
 5500336 5500337 AMF_921 AMF_922 omp9 omp10 TRUE 0.956 62.000 1.000 0.016   NA
 5500337 5500338 AMF_922 AMF_923 omp10   FALSE 0.003 429.000 0.000 NA   NA
 5500340 5500341 AMF_926 AMF_929   mviN FALSE 0.210 151.000 0.006 NA   NA
 5500342 5500343 AMF_930 AMF_1054 lgt   FALSE 0.013 240.000 0.000 NA   NA
 5500344 5500345 AMF_931 AMF_932 rpsT plsC FALSE 0.562 89.000 0.007 1.000 N NA
 5500346 5500347 AMF_933 AMF_934 def   FALSE 0.119 247.000 0.014 1.000 N NA
 5500347 5500348 AMF_934 AMF_936     FALSE 0.072 142.000 0.000 NA   NA
 5500349 5500350 AMF_937 AMF_938     TRUE 0.941 59.000 1.000 NA   NA
 5500350 5500351 AMF_938 AMF_939     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 5500351 5500352 AMF_939 AMF_940     TRUE 0.951 45.000 1.000 NA   NA
 5500352 5500353 AMF_940 AMF_941   uvrB FALSE 0.003 413.000 0.000 NA   NA
 5500354 5500355 AMF_942 AMF_944 secD   FALSE 0.003 490.000 0.000 NA   NA
 5500357 5500358 AMF_946 AMF_947     FALSE 0.221 67.000 0.000 NA   NA
 5500359 5500360 AMF_948 AMF_949 ubiD omp11 FALSE 0.500 110.000 0.009 NA   NA
 5500360 5500361 AMF_949 AMF_950 omp11 omp12 FALSE 0.634 194.000 1.000 0.016   NA
 5500361 5500362 AMF_950 AMF_951 omp12 omp13 FALSE 0.019 208.000 0.000 NA   NA
 5500363 5500364 AMF_952 AMF_953 ftsZ   FALSE 0.004 377.000 0.000 NA   NA
 5500364 5500365 AMF_953 AMF_954   parA FALSE 0.196 74.000 0.003 NA   NA
 5500365 5500366 AMF_954 AMF_955 parA parB TRUE 0.991 -3.000 0.827 1.000 N NA
 5500366 5500367 AMF_955 AMF_957 parB rimM TRUE 0.775 12.000 0.004 1.000 N NA
 5500367 5500368 AMF_957 AMF_958 rimM trmD TRUE 0.995 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 5500368 5500369 AMF_958 AMF_959 trmD rplS TRUE 0.994 -7.000 0.567 1.000 Y NA
 5500371 5500372 AMF_961 AMF_962 thrS infC TRUE 0.967 30.000 0.186 1.000 Y NA
 5500373 5500374 AMF_963 AMF_964     TRUE 0.839 4.000 0.004 NA   NA
 5500374 5500375 AMF_964 AMF_965   asd FALSE 0.115 118.000 0.003 NA   NA
 5500375 5500376 AMF_965 AMF_966 asd   TRUE 0.926 2.000 0.007 NA   NA
 5500376 5500377 AMF_966 AMF_967   dnaZ TRUE 0.986 6.000 0.411 NA   NA
 5500377 5500378 AMF_967 AMF_968 dnaZ gapA FALSE 0.339 66.000 0.000 1.000 N NA
 5500379 5500380 AMF_970 AMF_971   elbB TRUE 0.915 16.000 0.021 NA   NA
 5500381 5500382 AMF_972 AMF_973 ftsW metK TRUE 0.959 -18.000 0.014 1.000 N NA
 5500383 5500384 AMF_1089 AMF_974   ubiH FALSE 0.395 20.000 0.000 NA   NA
 5500385 5500386 AMF_975 AMF_1090     FALSE 0.330 34.000 0.000 NA   NA
 5500387 5500388 AMF_976 AMF_977 glyQ glyS TRUE 0.997 2.000 0.651 0.002 Y NA
 5500388 5500389 AMF_977 AMF_978 glyS dnaJ TRUE 0.734 82.000 0.009 0.099 N NA
 5500392 5500393 AMF_981 AMF_982 ruvC coxC TRUE 0.886 19.000 0.011 1.000 N NA
 5500393 5500394 AMF_982 AMF_983 coxC hemE FALSE 0.638 70.000 0.007 1.000 N NA
 5500396 5500397 AMF_985 AMF_986     TRUE 0.972 -16.000 0.055 NA   NA
 5500398 5500399 AMF_987 AMF_988   nadA TRUE 0.925 20.000 0.008 1.000 Y NA
 5500402 5500403 AMF_991 AMF_992 infC virD4 FALSE 0.603 0.000 0.002 1.000   NA
 5500403 5500404 AMF_992 AMF_993 virD4 virB11 TRUE 0.966 48.000 0.405 1.000 Y NA
 5500404 5500405 AMF_993 AMF_994 virB11 virB10 TRUE 0.970 42.000 0.452 1.000 Y NA
 5500405 5500406 AMF_994 AMF_995 virB10 virB9 TRUE 0.992 8.000 0.526 NA Y NA
 5500406 5500407 AMF_995 AMF_996 virB9 virB8 TRUE 0.993 -13.000 0.579 NA Y NA
 5500407 5500408 AMF_996 AMF_997 virB8 ribA TRUE 0.722 119.000 0.095 NA N NA
 5500408 5500409 AMF_997 AMF_1091 ribA   FALSE 0.577 -29.000 0.000 NA   NA
 5500409 5500410 AMF_1091 AMF_998     FALSE 0.267 58.000 0.000 NA   NA
 5500410 5500411 AMF_998 AMF_999     TRUE 0.961 -43.000 0.133 NA   NA
 5500411 5500412 AMF_999 AMF_1002   dapF FALSE 0.137 61.000 0.002 NA   NA
 5500412 5500413 AMF_1002 AMF_1003 dapF   FALSE 0.346 12.000 0.002 NA   NA
 5500413 5500414 AMF_1003 AMF_1004     TRUE 0.666 142.000 0.250 NA   NA
 5500416 5500417 AMF_1006 AMF_1007 xseA   TRUE 0.897 -25.000 0.007 NA   NA
 5500418 5500419 AMF_1009 AMF_1010 dapD thdF TRUE 0.730 1.000 0.003 1.000   NA
 5500421 5500422 AMF_1012 AMF_1013 recG   FALSE 0.183 182.000 0.007 1.000 N NA
 5500423 5500424 AMF_1014 AMF_1015 purF pth FALSE 0.050 151.000 0.002 1.000 N NA
 5500424 5500425 AMF_1015 AMF_1016 pth rplY TRUE 0.996 5.000 0.496 0.056 Y NA
 5500429 5500430 AMF_1020 AMF_1021 comF dapE TRUE 0.827 -61.000 0.007 1.000   NA
 5500430 5500431 AMF_1021 AMF_1022 dapE kefB FALSE 0.162 170.000 0.005 1.000 N NA
 5500431 5500432 AMF_1022 AMF_1023 kefB   TRUE 0.951 14.000 0.057 1.000 N NA
 5500432 5500433 AMF_1023 AMF_1024     FALSE 0.151 228.000 0.016 NA   NA
 5500433 5500434 AMF_1024 AMF_1025   pdhB FALSE 0.247 131.000 0.005 NA   NA
 5500434 5500435 AMF_1025 AMF_1026 pdhB   FALSE 0.504 65.000 0.005 NA   NA
 5500435 5500436 AMF_1026 AMF_1093     FALSE 0.004 346.000 0.000 NA   NA
 5500438 5500439 AMF_1028 AMF_1029 ychF ispF FALSE 0.060 181.000 0.003 1.000 N NA
 5500439 5500440 AMF_1029 AMF_1030 ispF ispD FALSE 0.411 250.000 0.419 1.000 Y NA