MicrobesOnline Operon Predictions for Acaryochloris marina MBIC11017

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3458193 3458194 AM1_0001 AM1_0003     FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3458195 3458196 AM1_0004 AM1_0005     FALSE 0.417 -22.000 0.000 NA   NA
 3458196 3458197 AM1_0005 AM1_0006     FALSE 0.160 162.000 0.000 NA   NA
 3458197 3458198 AM1_0006 AM1_0007     TRUE 0.918 15.000 0.007 NA   NA
 3458198 3458199 AM1_0007 AM1_0008     TRUE 0.626 187.000 0.011 NA   NA
 3458200 3458201 AM1_0009 AM1_0010   aroH TRUE 0.894 47.000 0.018 1.000   NA
 3458201 3458202 AM1_0010 AM1_0011 aroH sppA TRUE 0.704 192.000 0.207 1.000 N NA
 3458203 3458204 AM1_0012 AM1_0013     FALSE 0.083 255.000 0.000 NA   NA
 3458205 3458206 AM1_0014 AM1_0015     FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3458206 3458207 AM1_0015 AM1_0016     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3458207 3458208 AM1_0016 AM1_0017     TRUE 0.734 94.000 0.000 0.025 Y NA
 3458208 3458209 AM1_0017 AM1_0018     TRUE 0.882 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3458211 3458212 AM1_0020 AM1_0021     FALSE 0.112 261.000 0.000 1.000   NA
 3458212 3458213 AM1_0021 AM1_0022     FALSE 0.244 147.000 0.000 1.000   NA
 3458213 3458214 AM1_0022 AM1_0023     TRUE 0.542 26.000 0.000 1.000   NA
 3458214 3458215 AM1_0023 AM1_0024     FALSE 0.058 342.000 0.000 NA   NA
 3458216 3458217 AM1_0025 AM1_0026     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3458217 3458218 AM1_0026 AM1_0028     FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3458220 3458221 AM1_0029 AM1_0030     FALSE 0.110 212.000 0.000 NA   NA
 3458224 3458225 AM1_0033 AM1_0034     TRUE 0.923 24.000 0.113 NA   NA
 3458225 3458226 AM1_0034 AM1_0035     TRUE 0.920 29.000 0.167 NA   NA
 3458226 3458227 AM1_0035 AM1_0036     TRUE 0.762 125.000 0.038 NA   NA
 3458227 3458228 AM1_0036 AM1_0037     TRUE 0.949 6.000 0.042 1.000   NA
 3458228 3458229 AM1_0037 AM1_0038     TRUE 0.629 237.000 0.467 NA   NA
 3458229 3458230 AM1_0038 AM1_0039     FALSE 0.101 223.000 0.000 NA   NA
 3458230 3458231 AM1_0039 AM1_0040     FALSE 0.067 299.000 0.000 NA   NA
 3458231 3458232 AM1_0040 AM1_0041     FALSE 0.132 191.000 0.000 NA   NA
 3458233 3458234 AM1_0042 AM1_0043   nblB FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3458234 3458235 AM1_0043 AM1_0044 nblB   TRUE 0.560 -10.000 0.000 1.000   NA
 3458235 3458236 AM1_0044 AM1_0045     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3458236 3458237 AM1_0045 AM1_0046     FALSE 0.310 79.000 0.000 NA   NA
 3458237 3458238 AM1_0046 AM1_0047     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3458238 3458239 AM1_0047 AM1_0048     FALSE 0.070 290.000 0.000 NA   NA
 3458240 3458241 AM1_0049 AM1_0050     FALSE 0.197 132.000 0.000 NA   NA
 3458241 3458242 AM1_0050 AM1_0051     FALSE 0.129 193.000 0.000 NA   NA
 3458242 3458243 AM1_0051 AM1_0052     FALSE 0.047 420.000 0.000 NA   NA
 3458245 3458246 AM1_0054 AM1_0055     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3458246 3458247 AM1_0055 AM1_0056     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3458248 3458249 AM1_0057 AM1_0058     FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3458249 3458250 AM1_0058 AM1_0059     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3458250 3458251 AM1_0059 AM1_0060     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3458251 3458252 AM1_0060 AM1_0061     FALSE 0.090 432.000 0.000 0.042   NA
 3458252 3458253 AM1_0061 AM1_0062     TRUE 0.860 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 3458254 3458255 AM1_0063 AM1_0064     FALSE 0.034 605.000 0.000 NA   NA
 3458255 3458256 AM1_0064 AM1_0065     FALSE 0.135 187.000 0.000 NA   NA
 3458256 3458257 AM1_0065 AM1_0066     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3458257 3458258 AM1_0066 AM1_0067   typA FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3458259 3458260 AM1_0068 AM1_0069     FALSE 0.318 349.000 0.000 0.037 Y NA
 3458260 3458261 AM1_0069 AM1_0070     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3458264 3458265 AM1_0073 AM1_0074     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3458266 3458267 AM1_0075 AM1_0076     FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3458267 3458268 AM1_0076 AM1_0077     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3458268 3458269 AM1_0077 AM1_0078     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3458269 3458270 AM1_0078 AM1_0079   corA FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3458270 3458271 AM1_0079 AM1_0080 corA   FALSE 0.253 104.000 0.000 1.000 N NA
 3458271 3458272 AM1_0080 AM1_0081     FALSE 0.207 141.000 0.000 1.000 N NA
 3458272 3458273 AM1_0081 AM1_0082     FALSE 0.098 291.000 0.000 1.000   NA
 3458273 3458274 AM1_0082 AM1_0083     FALSE 0.390 81.000 0.000 1.000   NA
 3458274 3458275 AM1_0083 AM1_0084     FALSE 0.065 434.000 0.000 1.000   NA
 3458279 3458280 AM1_0088 AM1_0089     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3458281 3458282 AM1_0090 AM1_0091     FALSE 0.255 103.000 0.000 1.000 N NA
 3458282 3458283 AM1_0091 AM1_0092     FALSE 0.384 -40.000 0.000 NA   NA
 3458284 3458285 AM1_0093 AM1_0094     FALSE 0.169 156.000 0.000 NA   NA
 3458287 3458288 AM1_0096 AM1_0097     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3458288 3458289 AM1_0097 AM1_0098     TRUE 0.936 -7.000 0.250 NA   NA
 3458295 3458296 AM1_0104 AM1_0105     FALSE 0.068 295.000 0.000 NA   NA
 3458296 3458297 AM1_0105 AM1_0106     FALSE 0.070 289.000 0.000 NA   NA
 3458297 3458298 AM1_0106 AM1_0107     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3458300 3458301 AM1_0109 AM1_0110   coaBC TRUE 0.895 34.000 0.030 NA   NA
 3458303 3458304 AM1_0112 AM1_0113 moaC   FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3458304 3458305 AM1_0113 AM1_0114     FALSE 0.171 154.000 0.000 NA   NA
 3458305 3458306 AM1_0114 AM1_0115     FALSE 0.194 135.000 0.000 NA   NA
 3458308 3458309 AM1_0117 AM1_0118     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3458309 3458310 AM1_0118 AM1_0119   rpoE TRUE 0.912 -36.000 0.333 NA   NA
 3458310 3458311 AM1_0119 AM1_0120 rpoE   FALSE 0.135 187.000 0.000 NA   NA
 3458313 3458314 AM1_0122 AM1_0123     FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3458314 3458315 AM1_0123 AM1_0125     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3458316 10702622 AM1_0124 AM1_0126     FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 10702622 3458317 AM1_0126 AM1_0127     FALSE 0.155 168.000 0.000 NA   NA
 3458317 3458318 AM1_0127 AM1_0128     FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3458318 3458319 AM1_0128 AM1_0129     FALSE 0.192 138.000 0.000 NA   NA
 3458320 3458321 AM1_0130 AM1_0131     FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 3458321 3458322 AM1_0131 AM1_0132   ndhC FALSE 0.142 193.000 0.000 1.000 N NA
 3458322 3458323 AM1_0132 AM1_0133 ndhC ndhJ TRUE 0.946 76.000 0.014 0.003 Y NA
 3458324 3458325 AM1_0134 AM1_0135 ino1   FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3458325 3458326 AM1_0135 AM1_0136     FALSE 0.034 617.000 0.000 NA   NA
 3458326 3458327 AM1_0136 AM1_0137     TRUE 0.755 94.000 0.003 NA N NA
 3458328 3458329 AM1_0138 AM1_0139     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3458329 3458330 AM1_0139 AM1_0140   glk FALSE 0.120 201.000 0.000 NA   NA
 3458330 3458331 AM1_0140 AM1_0141 glk   FALSE 0.274 96.000 0.000 1.000 N NA
 3458331 3458332 AM1_0141 AM1_0142     FALSE 0.257 102.000 0.000 1.000 N NA
 3458332 3458333 AM1_0142 AM1_0143     FALSE 0.039 504.000 0.000 NA   NA
 3458334 3458335 AM1_0144 AM1_0145     FALSE 0.158 164.000 0.000 NA   NA
 3458338 3458339 AM1_0148 AM1_0149   ispG FALSE 0.145 177.000 0.000 NA   NA
 3458341 3458342 AM1_0151 AM1_0152     TRUE 0.946 6.000 0.077 NA   NA
 3458342 3458343 AM1_0152 AM1_0153     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3458343 3458344 AM1_0153 AM1_0154     FALSE 0.065 307.000 0.000 NA   NA
 3458345 3458346 AM1_0155 AM1_0156     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3458346 3458347 AM1_0156 AM1_0157     FALSE 0.209 123.000 0.000 NA   NA
 3458347 3458348 AM1_0157 AM1_0158     FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3458348 3458349 AM1_0158 AM1_0159     FALSE 0.053 369.000 0.000 NA   NA
 3458351 3458352 AM1_0161 AM1_0162     FALSE 0.197 132.000 0.000 NA   NA
 3458352 3458353 AM1_0162 AM1_0163     FALSE 0.319 41.000 0.000 NA N NA
 3458353 3458354 AM1_0163 AM1_0164     FALSE 0.054 362.000 0.000 NA   NA
 3458358 3458359 AM1_0168 AM1_0169 sphX   FALSE 0.225 178.000 0.000 0.027 N NA
 3458359 3458360 AM1_0169 AM1_0170     TRUE 0.986 5.000 1.000 0.027 Y NA
 3458360 3458361 AM1_0170 AM1_0171     TRUE 0.841 40.000 0.000 0.037 Y NA
 3458361 3458362 AM1_0171 AM1_0172     FALSE 0.197 148.000 0.000 1.000 N NA
 3458364 3458365 AM1_0174 AM1_0175 pstB pstA TRUE 0.679 128.000 0.000 0.002 Y NA
 3458365 3458366 AM1_0175 AM1_0176 pstA pstC TRUE 0.983 -3.000 0.485 0.002 Y NA
 3458366 3458367 AM1_0176 AM1_0177 pstC sphX TRUE 0.853 162.000 0.014 1.000 Y NA
 3458368 3458369 AM1_0178 AM1_0179     FALSE 0.043 457.000 0.000 NA   NA
 3458374 3458375 AM1_0184 AM1_0185     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3458375 3458376 AM1_0185 AM1_0186     FALSE 0.067 300.000 0.000 NA   NA
 3458376 3458377 AM1_0186 AM1_0187   hli FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3458377 3458378 AM1_0187 AM1_0188 hli folP FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3458378 3458379 AM1_0188 AM1_0189 folP   FALSE 0.084 254.000 0.000 NA   NA
 3458379 3458380 AM1_0189 AM1_0190     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3458380 3458381 AM1_0190 AM1_0191     FALSE 0.217 117.000 0.000 NA   NA
 3458381 3458382 AM1_0191 AM1_0192     FALSE 0.041 484.000 0.000 NA   NA
 3458385 3458386 AM1_0195 AM1_0196     FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3458386 3458387 AM1_0196 AM1_0197     FALSE 0.116 256.000 0.000 1.000   NA
 3458387 3458388 AM1_0197 AM1_0198     FALSE 0.050 387.000 0.000 NA   NA
 3458391 3458392 AM1_0201 AM1_0202     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3458392 3458393 AM1_0202 AM1_0203     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3458393 3458394 AM1_0203 AM1_0204     TRUE 0.449 65.000 0.000 1.000   NA
 3458394 3458395 AM1_0204 AM1_0205     TRUE 0.454 63.000 0.000 1.000   NA
 3458395 3458396 AM1_0205 AM1_0206     FALSE 0.045 433.000 0.000 NA   NA
 3458397 3458398 AM1_0207 AM1_0209     FALSE 0.036 569.000 0.000 NA   NA
 3458399 3458400 AM1_0208 AM1_0210     FALSE 0.034 607.000 0.000 NA   NA
 3458401 3458402 AM1_0211 AM1_0212     FALSE 0.226 83.000 0.000 NA N NA
 3458402 3458403 AM1_0212 AM1_0213   narK TRUE 0.652 8.000 0.000 1.000   NA
 3458403 3458404 AM1_0213 AM1_0214 narK   TRUE 0.827 106.000 0.029 0.027   NA
 3458406 3458407 AM1_0216 AM1_0217     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3458409 3458410 AM1_0219 AM1_0220     FALSE 0.129 194.000 0.000 NA   NA
 3458411 3458412 AM1_0221 AM1_0222     FALSE 0.046 429.000 0.000 NA   NA
 3458412 3458413 AM1_0222 AM1_0223     FALSE 0.039 509.000 0.000 NA   NA
 3458413 3458414 AM1_0223 AM1_0224     FALSE 0.217 131.000 0.000 1.000 N NA
 3458414 3458415 AM1_0224 AM1_0225     FALSE 0.050 388.000 0.000 NA   NA
 3458415 3458416 AM1_0225 AM1_0226     FALSE 0.036 557.000 0.000 NA   NA
 3458417 3458418 AM1_0227 AM1_0228     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 3458425 3458426 AM1_0235 AM1_0236     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3458426 3458427 AM1_0236 AM1_0237     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3458427 3458428 AM1_0237 AM1_0238     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3458428 3458429 AM1_0238 AM1_0239     FALSE 0.126 196.000 0.000 NA   NA
 3458430 3458431 AM1_0240 AM1_0241     FALSE 0.092 238.000 0.000 NA   NA
 3458434 3458435 AM1_0244 AM1_0245     FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3458435 3458436 AM1_0245 AM1_0246     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3458437 3458438 AM1_0247 AM1_0248     FALSE 0.195 134.000 0.000 NA   NA
 3458441 3458442 AM1_0251 AM1_0252     FALSE 0.047 422.000 0.000 NA   NA
 3458443 3458444 AM1_0253 AM1_0254     FALSE 0.049 402.000 0.000 NA   NA
 3458444 3458445 AM1_0254 AM1_0255     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3458445 3458446 AM1_0255 AM1_0256     FALSE 0.424 72.000 0.000 1.000   NA
 3458447 3458448 AM1_0257 AM1_0258     TRUE 0.655 4.000 0.000 1.000   NA
 3458448 3458449 AM1_0258 AM1_0259     FALSE 0.257 139.000 0.000 1.000   NA
 3458449 3458450 AM1_0259 AM1_0260     TRUE 0.457 62.000 0.000 1.000   NA
 3458450 3458451 AM1_0260 AM1_0261     TRUE 0.545 -48.000 0.000 0.044   NA
 3458451 3458452 AM1_0261 AM1_0262     FALSE 0.085 333.000 0.000 1.000   NA
 3458452 3458453 AM1_0262 AM1_0263     FALSE 0.206 172.000 0.000 1.000   NA
 3458453 3458454 AM1_0263 AM1_0264     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3458454 3458455 AM1_0264 AM1_0265     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3458455 3458456 AM1_0265 AM1_0266     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3458456 3458457 AM1_0266 AM1_0267     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3458457 3458458 AM1_0267 AM1_0268     TRUE 0.850 21.000 0.000 1.000 Y NA
 3458458 3458459 AM1_0268 AM1_0269     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3458460 3458461 AM1_0270 AM1_0271     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3458461 3458462 AM1_0271 AM1_0272     TRUE 0.825 120.000 1.000 NA   NA
 3458462 3458463 AM1_0272 AM1_0273     TRUE 0.928 68.000 0.667 0.002   NA
 3458463 3458464 AM1_0273 AM1_0274     TRUE 0.862 126.000 0.667 0.002   NA
 3458464 3458465 AM1_0274 AM1_0275     TRUE 0.953 2.000 0.300 NA   NA
 3458465 3458466 AM1_0275 AM1_0276     TRUE 0.917 42.000 0.400 NA   NA
 3458466 3458467 AM1_0276 AM1_0277     FALSE 0.170 155.000 0.000 NA   NA
 3458469 3458470 AM1_0279 AM1_0280     FALSE 0.209 123.000 0.000 NA   NA
 3458472 3458473 AM1_0282 AM1_0283     FALSE 0.038 527.000 0.000 NA   NA
 3458474 3458475 AM1_0284 AM1_0285 priA   TRUE 0.510 19.000 0.000 1.000 N NA
 3458475 3458476 AM1_0285 AM1_0286     TRUE 0.832 51.000 0.000 0.036 Y NA
 3458476 3458477 AM1_0286 AM1_0287     FALSE 0.412 226.000 0.000 1.000 Y NA
 3458478 3458479 AM1_0288 AM1_0289     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3458479 3458480 AM1_0289 AM1_0290     FALSE 0.117 204.000 0.000 NA   NA
 3458480 3458481 AM1_0290 AM1_0291     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3458481 3458482 AM1_0291 AM1_0292     FALSE 0.124 198.000 0.000 NA   NA
 3458482 3458483 AM1_0292 AM1_0294     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3458483 3458484 AM1_0294 AM1_0295     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3458484 3458485 AM1_0295 AM1_0296     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3458485 3458486 AM1_0296 AM1_0298     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3458486 3458487 AM1_0298 AM1_0299     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3458487 3458488 AM1_0299 AM1_0300     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3458488 3458489 AM1_0300 AM1_0301     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3458489 3458490 AM1_0301 AM1_0302     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3458490 3458491 AM1_0302 AM1_0303     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3458491 3458492 AM1_0303 AM1_0304     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3458492 3458493 AM1_0304 AM1_0305     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3458493 3458494 AM1_0305 AM1_0306     FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3458494 3458495 AM1_0306 AM1_0307     FALSE 0.409 38.000 0.000 NA   NA
 3458495 3458496 AM1_0307 AM1_0308     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3458496 3458497 AM1_0308 AM1_0309     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3458499 3458500 AM1_0312 AM1_0313     FALSE 0.066 302.000 0.000 NA   NA
 3458500 3458501 AM1_0313 AM1_0314   pheT FALSE 0.089 244.000 0.000 NA   NA
 3458501 3458502 AM1_0314 AM1_0315 pheT   FALSE 0.409 38.000 0.000 NA   NA
 3458502 3458503 AM1_0315 AM1_0316     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3458503 3458504 AM1_0316 AM1_0318     FALSE 0.135 187.000 0.000 NA   NA
 3458504 3458505 AM1_0318 AM1_0319     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3458505 3458506 AM1_0319 AM1_0320     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3458506 3458508 AM1_0320 AM1_0321     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3458508 3458509 AM1_0321 AM1_0322     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3458509 3458510 AM1_0322 AM1_0323     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3458512 3458513 AM1_0325 AM1_0326     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3458513 3458514 AM1_0326 AM1_0327     FALSE 0.093 235.000 0.000 NA   NA
 3458514 3458516 AM1_0327 AM1_0328     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3458516 3458517 AM1_0328 AM1_0329     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3458517 3458518 AM1_0329 AM1_0330     FALSE 0.055 358.000 0.000 NA   NA
 3458520 3458521 AM1_0332 AM1_0333   thiF TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3458521 3458522 AM1_0333 AM1_0334 thiF   FALSE 0.169 156.000 0.000 NA   NA
 3458523 3458524 AM1_0335 AM1_0336 ppk2 glnN FALSE 0.252 142.000 0.000 1.000   NA
 3458524 3458525 AM1_0336 AM1_0337 glnN   FALSE 0.195 134.000 0.000 NA   NA
 3458527 3458528 AM1_0338 AM1_0340     FALSE 0.038 525.000 0.000 NA   NA
 3458529 3458530 AM1_0341 AM1_0342     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3458530 3458531 AM1_0342 AM1_0343     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3458531 3458532 AM1_0343 AM1_0344     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3458532 3458533 AM1_0344 AM1_0345     TRUE 0.429 71.000 0.000 1.000   NA
 3458533 3458534 AM1_0345 AM1_0346     FALSE 0.063 319.000 0.000 NA   NA
 3458535 3458536 AM1_0347 AM1_0348     FALSE 0.206 125.000 0.000 NA   NA
 3458536 3458537 AM1_0348 AM1_0349     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3458537 3458538 AM1_0349 AM1_0350   cysH TRUE 0.955 -18.000 0.003 1.000 Y NA
 3458542 3458543 AM1_0353 AM1_0355     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3458543 3458544 AM1_0355 AM1_0356     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3458544 3458545 AM1_0356 AM1_0357     FALSE 0.097 230.000 0.000 NA   NA
 3458546 3458547 AM1_0358 AM1_0359     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3458548 3458549 AM1_0360 AM1_0361     FALSE 0.045 316.000 0.000 NA N NA
 3458549 3458550 AM1_0361 AM1_0362   dinF FALSE 0.025 571.000 0.000 NA N NA
 3458550 3458551 AM1_0362 AM1_0363 dinF   FALSE 0.403 -28.000 0.000 NA   NA
 3458553 3458554 AM1_0365 AM1_0366     FALSE 0.080 351.000 0.000 1.000   NA
 3458554 3458555 AM1_0366 AM1_0367     FALSE 0.360 127.000 0.000 0.016   NA
 3458555 3458556 AM1_0367 AM1_0368     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3458556 3458557 AM1_0368 AM1_0369     FALSE 0.029 1100.000 0.000 NA   NA
 3458557 3458558 AM1_0369 AM1_0371     FALSE 0.081 258.000 0.000 NA   NA
 3458558 3458559 AM1_0371 AM1_0372     FALSE 0.043 456.000 0.000 NA   NA
 3458561 3458562 AM1_0373 AM1_0375     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3458562 3458563 AM1_0375 AM1_0376     FALSE 0.044 449.000 0.000 NA   NA
 3458563 3458564 AM1_0376 AM1_0377     FALSE 0.030 935.000 0.000 NA   NA
 3458564 3458565 AM1_0377 AM1_0378     TRUE 0.495 43.000 0.000 1.000   NA
 3458565 3458566 AM1_0378 AM1_0379     TRUE 0.484 -36.000 0.000 1.000   NA
 3458566 3458567 AM1_0379 AM1_0380     TRUE 0.908 1.000 0.000 0.023 Y NA
 3458567 3458568 AM1_0380 AM1_0381     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3458568 3458569 AM1_0381 AM1_0382     FALSE 0.209 123.000 0.000 NA   NA
 3458569 3458570 AM1_0382 AM1_0383     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3458570 3458571 AM1_0383 AM1_0384     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3458571 3458572 AM1_0384 AM1_0385     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3458572 3458573 AM1_0385 AM1_0386     FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3458573 3458574 AM1_0386 AM1_0387     FALSE 0.182 158.000 0.000 1.000 N NA
 3458574 3458575 AM1_0387 AM1_0388     FALSE 0.036 562.000 0.000 NA   NA
 3458575 3458576 AM1_0388 AM1_0389     FALSE 0.389 51.000 0.000 NA   NA
 3458576 3458577 AM1_0389 AM1_0390     FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3458577 3458578 AM1_0390 AM1_0391     FALSE 0.120 201.000 0.000 NA   NA
 3458579 3458580 AM1_0392 AM1_0393     FALSE 0.045 433.000 0.000 NA   NA
 3458580 3458581 AM1_0393 AM1_0394     FALSE 0.058 377.000 0.000 1.000 N NA
 3458582 3458583 AM1_0395 AM1_0396     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3458583 3458584 AM1_0396 AM1_0397     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3458585 3458586 AM1_0398 AM1_0399     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3458586 3458587 AM1_0399 AM1_0400     FALSE 0.074 276.000 0.000 NA   NA
 3458588 3458589 AM1_0401 AM1_0402   clpB FALSE 0.290 92.000 0.000 1.000 N NA
 3458589 3458590 AM1_0402 AM1_0403 clpB rfbC FALSE 0.181 159.000 0.000 1.000 N NA
 3458590 3458591 AM1_0403 AM1_0404 rfbC rfbA TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3458591 3458592 AM1_0404 AM1_0405 rfbA rfbB TRUE 0.944 90.000 0.077 0.005 Y NA
 3458592 3458593 AM1_0405 AM1_0406 rfbB cysC TRUE 0.429 43.000 0.000 1.000 N NA
 3458593 3458594 AM1_0406 AM1_0407 cysC   TRUE 0.545 15.000 0.000 1.000 N NA
 3458594 3458595 AM1_0407 AM1_0408     FALSE 0.118 216.000 0.000 1.000 N NA
 3458596 3458597 AM1_0409 AM1_0410 pyrE   FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3458597 3458598 AM1_0410 AM1_0411     FALSE 0.361 -58.000 0.000 NA   NA
 3458598 3458599 AM1_0411 AM1_0412   lysA FALSE 0.167 171.000 0.000 1.000 N NA
 3458599 3458600 AM1_0412 AM1_0413 lysA   TRUE 0.778 113.000 0.040 NA   NA
 3458600 3458601 AM1_0413 AM1_0414   uppS TRUE 0.931 -3.000 0.043 NA   NA
 3458602 3458603 AM1_0415 AM1_0416     TRUE 0.448 338.000 0.051 NA   NA
 3458603 3458604 AM1_0416 AM1_0417   pilC TRUE 0.661 185.000 0.010 1.000   NA
 3458604 3458605 AM1_0417 AM1_0418 pilC pilT TRUE 0.961 58.000 0.218 1.000 Y NA
 3458605 3458606 AM1_0418 AM1_0419 pilT pilB TRUE 0.955 79.000 0.178 0.026 Y NA
 3458606 3458607 AM1_0419 AM1_0420 pilB   TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3458608 3458609 AM1_0421 AM1_0422 grpE dnaK TRUE 0.904 164.000 0.224 0.008 Y NA
 3458609 3458610 AM1_0422 AM1_0423 dnaK dnaJ TRUE 0.969 50.000 0.196 0.005 Y NA
 3458610 3458611 AM1_0423 AM1_0424 dnaJ   TRUE 0.970 21.000 0.067 1.000 Y NA
 3458611 3458612 AM1_0424 AM1_0425   rsgA TRUE 0.942 -3.000 0.058 1.000   NA
 3458614 3458615 AM1_0427 AM1_0428     FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3458618 3458619 AM1_0431 AM1_0432     TRUE 0.913 45.000 0.250 NA   NA
 3458620 3458621 AM1_6413 AM1_0433 ffs   FALSE 0.095 232.000 0.000 NA   NA
 3458623 3458624 AM1_0435 AM1_0436     FALSE 0.400 -30.000 0.000 NA   NA
 3458626 3458627 AM1_0438 AM1_0439   pflB FALSE 0.037 544.000 0.000 NA   NA
 3458627 3458628 AM1_0439 AM1_0440 pflB ppsA FALSE 0.368 70.000 0.000 1.000 N NA
 3458628 3458629 AM1_0440 AM1_0441 ppsA pflA FALSE 0.389 63.000 0.000 1.000 N NA
 3458629 3458630 AM1_0441 AM1_0442 pflA   TRUE 0.429 43.000 0.000 1.000 N NA
 3458630 3458631 AM1_0442 AM1_0443   xfp FALSE 0.325 82.000 0.000 1.000 N NA
 3458631 3458632 AM1_0443 AM1_0444 xfp   TRUE 0.450 -118.000 0.000 1.000   NA
 3458632 3458633 AM1_0444 AM1_0445   ackA TRUE 0.480 52.000 0.000 1.000   NA
 3458634 3458635 AM1_0446 AM1_0447     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3458635 3458636 AM1_0447 AM1_0448   psbA FALSE 0.071 282.000 0.000 NA   NA
 3458636 3458637 AM1_0448 AM1_0449 psbA   FALSE 0.415 35.000 0.000 NA   NA
 3458637 3458638 AM1_0449 AM1_0450     FALSE 0.230 82.000 0.000 NA N NA
 3458638 3458639 AM1_0450 AM1_0451     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3458640 3458641 AM1_0452 AM1_0453 sqr   TRUE 0.433 30.000 0.000 NA   NA
 3458641 3458642 AM1_0453 AM1_0454     FALSE 0.173 153.000 0.000 NA   NA
 3458642 3458643 AM1_0454 AM1_0455     FALSE 0.072 280.000 0.000 NA   NA
 3458643 3458644 AM1_0455 AM1_0456     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3458644 3458645 AM1_0456 AM1_0457   nrdG TRUE 0.484 50.000 0.000 1.000   NA
 3458645 3458646 AM1_0457 AM1_0458 nrdG   FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3458646 3458647 AM1_0458 AM1_0459     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3458647 3458648 AM1_0459 AM1_0460     TRUE 0.572 49.000 0.000 0.045   NA
 3458648 3458649 AM1_0460 AM1_0461     FALSE 0.045 435.000 0.000 NA   NA
 3458649 3458650 AM1_0461 AM1_0462     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3458650 3458651 AM1_0462 AM1_0463     FALSE 0.087 264.000 0.000 1.000 N NA
 3458651 3458652 AM1_0463 AM1_0464     FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3458654 3458655 AM1_0466 AM1_0467   hemN TRUE 0.834 98.000 0.161 1.000 N NA
 3458655 3458656 AM1_0467 AM1_0468 hemN   FALSE 0.356 90.000 0.000 1.000   NA
 3458656 3458657 AM1_0468 AM1_0469     FALSE 0.073 384.000 0.000 1.000   NA
 3458660 3458661 AM1_0472 AM1_0473   feoB TRUE 0.892 37.000 0.030 NA   NA
 3458661 3458662 AM1_0473 AM1_0474 feoB feoA TRUE 0.980 3.000 0.122 1.000 Y NA
 3458665 3458666 AM1_0478 AM1_0479     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3458668 3458669 AM1_0481 AM1_0482     TRUE 0.536 70.000 0.000 0.012   NA
 3458669 3458670 AM1_0482 AM1_0483     FALSE 0.302 106.000 0.000 1.000   NA
 3458670 3458671 AM1_0483 AM1_0484     FALSE 0.279 123.000 0.000 1.000   NA
 3458672 10702623 AM1_0485 AM1_0486     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3458675 3458676 AM1_0489 AM1_0490     FALSE 0.343 93.000 0.000 1.000   NA
 3458678 3458679 AM1_0492 AM1_0494     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3458680 3458681 AM1_0493 AM1_0495     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3458683 3458684 AM1_0497 AM1_0498     FALSE 0.105 218.000 0.000 NA   NA
 3458684 3458685 AM1_0498 AM1_0499     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3458685 3458686 AM1_0499 AM1_0500     FALSE 0.067 422.000 0.000 1.000   NA
 3458686 3458687 AM1_0500 AM1_0501     FALSE 0.343 93.000 0.000 1.000   NA
 3458687 3458688 AM1_0501 AM1_0502     FALSE 0.109 214.000 0.000 NA   NA
 3458688 3458689 AM1_0502 AM1_0503     FALSE 0.052 370.000 0.000 NA   NA
 3458691 10702624 AM1_0504 AM1_0506     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3458695 3458696 AM1_0510 AM1_0511   sodN TRUE 0.477 53.000 0.000 1.000   NA
 3458696 3458697 AM1_0511 AM1_0512 sodN   TRUE 0.457 62.000 0.000 1.000   NA
 3458698 3458699 AM1_0513 AM1_0514   moeB TRUE 0.907 36.000 0.093 NA   NA
 3458700 3458701 AM1_0515 AM1_0516     TRUE 0.984 0.000 0.600 0.041 Y NA
 3458701 3458702 AM1_0516 AM1_0517     FALSE 0.037 533.000 0.000 NA   NA
 3458703 3458704 AM1_0518 AM1_0519   phyH TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3458704 3458705 AM1_0519 AM1_0520 phyH   TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3458705 3458706 AM1_0520 AM1_0521     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3458708 3458709 AM1_0523 AM1_0524     TRUE 0.453 32.000 0.000 1.000 N NA
 3458710 3458711 AM1_0525 AM1_0526 fliA psbO FALSE 0.066 430.000 0.000 1.000   NA
 3458713 3458714 AM1_0528 AM1_0529   pgsA FALSE 0.036 557.000 0.000 NA   NA
 3458714 3458715 AM1_0529 AM1_0530 pgsA   TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3458716 3458717 AM1_0531 AM1_0532     TRUE 0.909 26.000 0.041 NA   NA
 3458718 3458719 AM1_0533 AM1_0534 chlD   FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3458721 3458722 AM1_0536 AM1_0538     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3458722 3458723 AM1_0538 AM1_0539     FALSE 0.041 486.000 0.000 NA   NA
 3458723 3458724 AM1_0539 AM1_0540     FALSE 0.098 228.000 0.000 NA   NA
 3458724 3458725 AM1_0540 AM1_0541     FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3458725 3458726 AM1_0541 AM1_0542     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3458726 3458727 AM1_0542 AM1_0543     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3458727 3458728 AM1_0543 AM1_0544     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3458728 3458729 AM1_0544 AM1_0545     FALSE 0.033 654.000 0.000 NA   NA
 3458731 3458732 AM1_0547 AM1_0548     TRUE 0.906 12.000 0.000 0.014 Y NA
 3458732 3458733 AM1_0548 AM1_0549   hemL FALSE 0.037 622.000 0.000 1.000 N NA
 3458733 3458734 AM1_0549 AM1_0550 hemL   FALSE 0.087 264.000 0.000 1.000 N NA
 3458734 3458735 AM1_0550 AM1_0551     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3458741 3458742 AM1_0557 AM1_0558     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3458743 3458744 AM1_0559 AM1_0560 ppx   FALSE 0.057 259.000 0.000 NA N NA
 3458744 3458745 AM1_0560 AM1_0561     FALSE 0.238 101.000 0.000 NA   NA
 3458745 3458746 AM1_0561 AM1_0563   dxr FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3458747 3458748 AM1_0562 AM1_0564     FALSE 0.050 605.000 0.000 1.000   NA
 3458748 3458749 AM1_0564 AM1_0565     FALSE 0.043 516.000 0.000 1.000 N NA
 3458755 3458756 AM1_0571 AM1_0572     FALSE 0.085 251.000 0.000 NA   NA
 3458758 3458759 AM1_0574 AM1_0575     TRUE 0.487 49.000 0.000 1.000   NA
 3458759 3458760 AM1_0575 AM1_0576     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3458760 3458761 AM1_0576 AM1_0577     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3458762 3458763 AM1_0578 AM1_0579     FALSE 0.052 379.000 0.000 NA   NA
 3458766 3458767 AM1_0581 AM1_0583 lpxB lpxA TRUE 0.979 7.000 0.062 1.000 Y NA
 3458769 3458770 AM1_0584 AM1_0586 fabZ lpxC TRUE 0.912 33.000 0.083 1.000 N NA
 3458770 3458771 AM1_0586 AM1_0587 lpxC   TRUE 0.903 124.000 0.052 1.000 Y NA
 3458771 3458772 AM1_0587 AM1_0588   purC TRUE 0.860 79.000 0.058 1.000 N NA
 3458772 3458773 AM1_0588 AM1_0589 purC   FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3458773 3458774 AM1_0589 AM1_0590     TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3458775 3458776 AM1_0591 AM1_0592     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3458777 3458778 AM1_0593 AM1_0594   arsC FALSE 0.102 237.000 0.000 1.000 N NA
 3458778 3458779 AM1_0594 AM1_0595 arsC acr3 TRUE 0.935 20.000 0.214 1.000 N NA
 3458779 3458780 AM1_0595 AM1_0596 acr3   FALSE 0.394 61.000 0.000 1.000 N NA
 3458780 3458781 AM1_0596 AM1_0597     FALSE 0.137 185.000 0.000 NA   NA
 3458782 3458783 AM1_0598 AM1_0599 glyS   TRUE 0.517 33.000 0.000 1.000   NA
 3458785 3458786 AM1_0601 AM1_0602   murI FALSE 0.043 508.000 0.000 1.000 N NA
 3458786 3458787 AM1_0602 AM1_0603 murI   FALSE 0.135 199.000 0.000 1.000 N NA
 3458787 3458788 AM1_0603 AM1_0604   thiL TRUE 0.872 66.000 0.031 1.000 N NA
 3458788 3458789 AM1_0604 AM1_0605 thiL   FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3458789 3458790 AM1_0605 AM1_0606     FALSE 0.103 221.000 0.000 NA   NA
 3458791 3458792 AM1_0607 AM1_0608   ribAB FALSE 0.091 311.000 0.000 1.000   NA
 3458793 3458794 AM1_0609 AM1_0610 argC   FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3458796 3458797 AM1_0612 AM1_0613   psbP FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3458797 3458798 AM1_0613 AM1_0614 psbP   FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3458798 3458799 AM1_0614 AM1_0615   hemF FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3458801 3458802 AM1_0617 AM1_0618 mtaP   TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3458805 3458806 AM1_0621 AM1_0622     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3458808 3458809 AM1_0624 AM1_0625   birA TRUE 0.595 216.000 0.030 1.000 N NA
 3458810 3458811 AM1_0626 AM1_0627     FALSE 0.414 -24.000 0.000 NA   NA
 3458811 3458812 AM1_0627 AM1_0628     FALSE 0.199 131.000 0.000 NA   NA
 3458813 3458814 AM1_0629 AM1_0630     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3458814 3458815 AM1_0630 AM1_0631     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3458815 3458816 AM1_0631 AM1_0632     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3458817 3458818 AM1_0633 AM1_0634     FALSE 0.054 362.000 0.000 NA   NA
 3458818 3458819 AM1_0634 AM1_0635     TRUE 0.612 -28.000 0.000 0.002   NA
 3458822 3458823 AM1_0638 AM1_0639     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3458823 3458824 AM1_0639 AM1_0640     FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3458824 3458825 AM1_0640 AM1_0641     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3458825 3458826 AM1_0641 AM1_0642   hisS TRUE 0.754 117.000 0.018 NA   NA
 3458829 3458830 AM1_0645 AM1_0646     FALSE 0.129 193.000 0.000 NA   NA
 3458830 3458831 AM1_0646 AM1_0647     TRUE 0.958 3.000 0.185 0.097 N NA
 3458831 3458832 AM1_0647 AM1_0648     TRUE 0.867 16.000 0.000 1.000 Y NA
 3458832 3458833 AM1_0648 AM1_0649     FALSE 0.344 76.000 0.000 1.000 N NA
 3458833 3458834 AM1_0649 AM1_0650     FALSE 0.053 367.000 0.000 NA   NA
 3458834 3458835 AM1_0650 AM1_0651     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3458835 3458836 AM1_0651 AM1_0652   plsX FALSE 0.069 291.000 0.000 NA   NA
 3458836 3458837 AM1_0652 AM1_0653 plsX   TRUE 0.986 3.000 0.380 0.003 Y NA
 3458837 3458838 AM1_0653 AM1_0654     TRUE 0.647 1.000 0.000 1.000   NA
 3458839 3458840 AM1_0655 AM1_0656 ccmK ccmK TRUE 0.961 57.000 0.938 NA Y NA
 3458840 3458841 AM1_0656 AM1_0657 ccmK   FALSE 0.047 417.000 0.000 NA   NA
 3458843 3458844 AM1_0659 AM1_0660     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3458844 3458845 AM1_0660 AM1_0661     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3458847 3458848 AM1_0662 AM1_0664     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3458849 3458850 AM1_0665 AM1_0666     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3458850 3458851 AM1_0666 AM1_0667     FALSE 0.212 168.000 0.000 1.000   NA
 3458851 3458852 AM1_0667 AM1_0668     TRUE 0.551 24.000 0.000 1.000   NA
 3458858 3458859 AM1_0674 AM1_0675     TRUE 0.955 3.000 0.500 NA   NA
 3458859 3458860 AM1_0675 AM1_0676     FALSE 0.132 191.000 0.000 NA   NA
 3458861 3458862 AM1_0677 AM1_0678     FALSE 0.293 58.000 0.000 NA N NA
 3458862 3458863 AM1_0678 AM1_0679     TRUE 0.977 -3.000 0.122 1.000 Y NA
 3458865 3458866 AM1_0680 AM1_0682     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3458866 3458867 AM1_0682 AM1_0683     FALSE 0.194 135.000 0.000 NA   NA
 3458867 10702625 AM1_0683 AM1_0684     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3458868 3458869 AM1_0685 AM1_0686     TRUE 0.877 72.000 0.107 NA   NA
 3458869 3458870 AM1_0686 AM1_0687     FALSE 0.130 192.000 0.000 NA   NA
 3458870 3458871 AM1_0687 AM1_0688     TRUE 0.955 1.000 0.571 NA   NA
 3458872 3458873 AM1_0689 AM1_0690     FALSE 0.152 171.000 0.000 NA   NA
 3458877 3458878 AM1_0694 AM1_0695 secF secD TRUE 0.983 -3.000 0.516 0.001 Y NA
 3458878 3458879 AM1_0695 AM1_0696 secD pdhB TRUE 0.911 35.000 0.091 1.000 N NA
 3458879 3458880 AM1_0696 AM1_0697 pdhB phrB FALSE 0.249 106.000 0.000 1.000 N NA
 3458881 3458882 AM1_0698 AM1_0699     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3458882 3458883 AM1_0699 AM1_0700     TRUE 0.645 11.000 0.000 1.000   NA
 3458884 3458885 AM1_0701 AM1_0702   cyaA FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3458886 3458887 AM1_0703 AM1_0704     FALSE 0.054 360.000 0.000 NA   NA
 3458887 3458888 AM1_0704 AM1_0705   leuA TRUE 0.745 119.000 0.011 NA   NA
 3458888 3458889 AM1_0705 AM1_0706 leuA   FALSE 0.313 78.000 0.000 NA   NA
 3458889 3458890 AM1_0706 AM1_0707     FALSE 0.041 487.000 0.000 NA   NA
 3458890 3458891 AM1_0707 AM1_0709     TRUE 0.546 -48.000 0.000 0.042   NA
 3458893 3458894 AM1_0710 AM1_0711     TRUE 0.946 16.000 0.667 NA   NA
 3458894 3458895 AM1_0711 AM1_0712     FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3458897 3458898 AM1_0714 AM1_0715     FALSE 0.223 160.000 0.000 1.000   NA
 3458898 3458899 AM1_0715 AM1_0716     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3458900 3458901 AM1_0717 AM1_0718     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3458901 3458902 AM1_0718 AM1_0719     FALSE 0.148 174.000 0.000 NA   NA
 3458903 3458904 AM1_0720 AM1_0721   aspH FALSE 0.350 74.000 0.000 1.000 N NA
 3458904 3458905 AM1_0721 AM1_0722 aspH aspH TRUE 0.791 79.000 0.000 0.001 Y NA
 3458905 3458906 AM1_0722 AM1_0723 aspH aspH TRUE 0.802 74.000 0.000 0.001 Y NA
 3458906 3458907 AM1_0723 AM1_0724 aspH   TRUE 0.557 14.000 0.000 1.000 N NA
 3458907 3458908 AM1_0724 AM1_0725     FALSE 0.076 365.000 0.000 1.000   NA
 3458908 3458909 AM1_0725 AM1_0726     TRUE 0.948 -7.000 0.750 1.000   NA
 3458909 3458910 AM1_0726 AM1_0727     FALSE 0.426 15.000 0.000 NA N NA
 3458910 3458911 AM1_0727 AM1_0728     FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3458911 3458912 AM1_0728 AM1_0729     TRUE 0.639 0.000 0.000 1.000   NA
 3458912 3458913 AM1_0729 AM1_0730     TRUE 0.577 19.000 0.000 1.000   NA
 3458916 3458917 AM1_0733 AM1_0734     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3458917 3458918 AM1_0734 AM1_0735     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3458919 3458920 AM1_0736 AM1_0737     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3458920 3458921 AM1_0737 AM1_0738     FALSE 0.094 234.000 0.000 NA   NA
 3458922 3458923 AM1_0740 AM1_0741     FALSE 0.389 -37.000 0.000 NA   NA
 3458924 3458925 AM1_0742 AM1_0743   lys FALSE 0.118 161.000 0.000 NA N NA
 3458925 3458926 AM1_0743 AM1_0744 lys dnaE FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3458926 3458927 AM1_0744 AM1_0745 dnaE   FALSE 0.156 167.000 0.000 NA   NA
 3458927 3458928 AM1_0745 AM1_0746     FALSE 0.238 101.000 0.000 NA   NA
 3458928 3458929 AM1_0746 AM1_0747     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3458929 3458930 AM1_0747 AM1_0748     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3458930 3458931 AM1_0748 AM1_0749     TRUE 0.797 144.000 0.867 NA   NA
 3458931 3458932 AM1_0749 AM1_0750     TRUE 0.957 3.000 0.867 NA   NA
 3458932 3458933 AM1_0750 AM1_0751     FALSE 0.094 234.000 0.000 NA   NA
 3458935 3458936 AM1_0753 AM1_0754     FALSE 0.074 277.000 0.000 NA   NA
 3458936 3458937 AM1_0754 AM1_0755     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3458941 3458942 AM1_0759 AM1_0760     FALSE 0.087 249.000 0.000 NA   NA
 3458943 3458944 AM1_0761 AM1_0762     TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3458944 3458945 AM1_0762 AM1_0763     TRUE 0.929 -15.000 0.400 NA   NA
 3458945 3458946 AM1_0763 AM1_0764     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3458946 3458947 AM1_0764 AM1_0765     FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3458948 3458949 AM1_0766 AM1_0767     FALSE 0.113 209.000 0.000 NA   NA
 3458950 3458951 AM1_0768 AM1_0769   purT FALSE 0.046 425.000 0.000 NA   NA
 3458952 3458953 AM1_0770 AM1_0771 lysC   FALSE 0.091 256.000 0.000 1.000 N NA
 3458954 3458955 AM1_0772 AM1_0773   modA TRUE 0.984 4.000 0.103 0.000 Y NA
 3458957 3458958 AM1_0775 AM1_0776     FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3458958 3458959 AM1_0776 AM1_0777     FALSE 0.059 338.000 0.000 NA   NA
 3458960 3458961 AM1_0778 AM1_0779     FALSE 0.038 523.000 0.000 NA   NA
 3458961 3458962 AM1_0779 AM1_0780     FALSE 0.061 328.000 0.000 NA   NA
 3458962 3458963 AM1_0780 AM1_0781     FALSE 0.234 119.000 0.000 1.000 N NA
 3458963 3458964 AM1_0781 AM1_0782   ppnK TRUE 0.477 65.000 0.000 0.067 N NA
 3458964 3458965 AM1_0782 AM1_0783 ppnK   FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3458965 3458966 AM1_0783 AM1_0784     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3458966 3458967 AM1_0784 AM1_0785     FALSE 0.030 791.000 0.000 NA   NA
 3458967 3458968 AM1_0785 AM1_0786     FALSE 0.068 293.000 0.000 NA   NA
 3458968 3458969 AM1_0786 AM1_0787     FALSE 0.313 78.000 0.000 NA   NA
 3458969 3458970 AM1_0787 AM1_0788   pepE FALSE 0.042 463.000 0.000 NA   NA
 3458970 3458971 AM1_0788 AM1_0789 pepE   FALSE 0.173 197.000 0.000 1.000   NA
 3458972 3458973 AM1_0790 AM1_0791     FALSE 0.334 95.000 0.000 1.000   NA
 3458973 3458974 AM1_0791 AM1_0792     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3458974 3458975 AM1_0792 AM1_0793     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3458975 3458976 AM1_0793 AM1_0794     TRUE 0.908 -19.000 0.066 NA   NA
 3458976 3458977 AM1_0794 AM1_0795     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3458977 3458978 AM1_0795 AM1_0796     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3458978 3458979 AM1_0796 AM1_0797     FALSE 0.170 155.000 0.000 NA   NA
 3458980 3458981 AM1_0798 AM1_0799     FALSE 0.138 184.000 0.000 NA   NA
 3458981 3458982 AM1_0799 AM1_0801     TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3458988 3458989 AM1_0806 AM1_0807 ftsZ prsA TRUE 0.741 113.000 0.002 1.000 N NA
 3458991 3458992 AM1_0809 AM1_0810     FALSE 0.243 110.000 0.000 1.000 N NA
 3458994 3458995 AM1_0812 AM1_0813     FALSE 0.205 126.000 0.000 NA   NA
 3458995 3458996 AM1_0813 AM1_0814     FALSE 0.079 263.000 0.000 NA   NA
 3458997 3458998 AM1_0815 AM1_0816     FALSE 0.108 215.000 0.000 NA   NA
 3458998 3458999 AM1_0816 AM1_0817     FALSE 0.372 -46.000 0.000 NA   NA
 3458999 3459000 AM1_0817 AM1_0818     FALSE 0.048 639.000 0.000 1.000   NA
 3459000 3459001 AM1_0818 AM1_0819     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3459001 3459002 AM1_0819 AM1_0820     FALSE 0.031 739.000 0.000 NA   NA
 3459004 3459005 AM1_0822 AM1_0823 grxC   FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3459006 3459007 AM1_0824 AM1_0825     FALSE 0.392 62.000 0.000 1.000 N NA
 3459007 3459008 AM1_0825 AM1_0826     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3459008 3459009 AM1_0826 AM1_0827     FALSE 0.065 305.000 0.000 NA   NA
 3459010 3459011 AM1_0828 AM1_0829     TRUE 0.843 37.000 0.000 0.040 Y NA
 3459011 3459012 AM1_0829 AM1_0830     FALSE 0.228 123.000 0.000 1.000 N NA
 3459013 3459014 AM1_0831 AM1_0832     FALSE 0.032 700.000 0.000 NA   NA
 3459014 3459015 AM1_0832 AM1_0833     TRUE 0.649 10.000 0.000 1.000   NA
 3459015 3459016 AM1_0833 AM1_0834     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3459016 3459017 AM1_0834 AM1_0835     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3459017 3459018 AM1_0835 AM1_0836     FALSE 0.173 197.000 0.000 1.000   NA
 3459018 3459019 AM1_0836 AM1_0837     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3459025 3459026 AM1_0843 AM1_0844     FALSE 0.085 252.000 0.000 NA   NA
 3459027 3459028 AM1_0845 AM1_0846     TRUE 0.943 -3.000 0.211 NA   NA
 3459028 3459029 AM1_0846 AM1_0847     FALSE 0.072 279.000 0.000 NA   NA
 3459029 3459030 AM1_0847 AM1_0848     TRUE 0.924 22.000 0.098 NA   NA
 3459030 3459031 AM1_0848 AM1_0849   mraW TRUE 0.502 238.000 0.004 NA   NA
 3459033 3459034 AM1_0850 AM1_0852     FALSE 0.048 407.000 0.000 NA   NA
 3459036 3459037 AM1_0854 AM1_0855   nagA TRUE 0.590 7.000 0.000 1.000 N NA
 3459037 3459038 AM1_0855 AM1_0856 nagA   TRUE 0.942 11.000 0.056 NA   NA
 3459039 3459040 AM1_0857 AM1_0858 purE alr TRUE 0.467 28.000 0.000 1.000 N NA
 3459041 3459042 AM1_0859 AM1_0860     FALSE 0.116 163.000 0.000 NA N NA
 3459042 3459043 AM1_0860 AM1_0861     TRUE 0.948 -7.000 0.126 0.016   NA
 3459043 3459044 AM1_0861 AM1_0862     TRUE 0.921 -25.000 0.137 1.000   NA
 3459044 3459045 AM1_0862 AM1_0863     TRUE 0.986 10.000 0.888 0.025 Y NA
 3459045 3459046 AM1_0863 AM1_0864     TRUE 0.961 47.000 0.092 1.000 Y NA
 3459047 3459048 AM1_0865 AM1_0866     FALSE 0.030 887.000 0.000 NA   NA
 3459049 3459050 AM1_0867 AM1_0868 ureG ureF TRUE 0.954 90.000 0.550 0.003 Y NA
 3459050 3459051 AM1_0868 AM1_0869 ureF   FALSE 0.043 451.000 0.000 NA   NA
 3459054 3459055 AM1_0873 AM1_0874     TRUE 0.860 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 3459057 3459058 AM1_0876 AM1_0877 cysH   FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3459058 3459059 AM1_0877 AM1_0878     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3459059 3459060 AM1_0878 AM1_0879     FALSE 0.177 102.000 0.000 NA N NA
 3459060 3459061 AM1_0879 AM1_0880     TRUE 0.920 -19.000 0.217 NA   NA
 3459062 3459063 AM1_0881 AM1_0882     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3459066 3459067 AM1_0885 AM1_0886     FALSE 0.236 102.000 0.000 NA   NA
 3459067 3459068 AM1_0886 AM1_0887     FALSE 0.081 258.000 0.000 NA   NA
 3459069 3459070 AM1_0888 AM1_0889     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3459071 3459072 AM1_0890 AM1_0891 atpI atpB TRUE 0.825 107.000 0.099 1.000   NA
 3459072 3459073 AM1_0891 AM1_0892 atpB atpE TRUE 0.932 131.000 0.679 0.004 Y NA
 3459073 3459074 AM1_0892 AM1_0893 atpE   TRUE 0.922 146.000 0.368 0.004 Y NA
 3459074 3459075 AM1_0893 AM1_0894   atpF TRUE 0.976 33.000 0.569 0.001 Y NA
 3459075 3459076 AM1_0894 AM1_0895 atpF atpH TRUE 0.981 -3.000 0.132 0.004 Y NA
 3459076 3459077 AM1_0895 AM1_0896 atpH atpA TRUE 0.964 74.000 0.864 0.004 Y NA
 3459077 3459078 AM1_0896 AM1_0897 atpA atpG TRUE 0.986 10.000 0.846 0.004 Y NA
 3459082 3459083 AM1_0901 AM1_0902     FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 3459083 3459084 AM1_0902 AM1_0903     FALSE 0.290 115.000 0.000 1.000   NA
 3459084 3459085 AM1_0903 AM1_0905     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3459087 3459088 AM1_0906 AM1_0907     FALSE 0.034 620.000 0.000 NA   NA
 3459088 3459089 AM1_0907 AM1_0908     FALSE 0.033 644.000 0.000 NA   NA
 3459089 3459090 AM1_0908 AM1_0909     TRUE 0.702 104.000 0.000 0.034 Y NA
 3459090 3459091 AM1_0909 AM1_0910     TRUE 0.893 4.000 0.000 1.000 Y NA
 3459093 3459094 AM1_0912 AM1_0913     TRUE 0.915 150.000 0.231 0.005 Y NA
 3459094 3459095 AM1_0913 AM1_0914     TRUE 0.881 20.000 0.000 0.005 Y NA
 3459096 3459097 AM1_0915 AM1_0916     FALSE 0.125 197.000 0.000 NA   NA
 3459099 3459100 AM1_0918 AM1_0919     TRUE 0.934 13.000 0.033 NA   NA
 3459100 3459101 AM1_0919 AM1_0920   thrC TRUE 0.914 44.000 0.215 1.000 N NA
 3459101 3459102 AM1_0920 AM1_0921 thrC   FALSE 0.274 126.000 0.000 1.000   NA
 3459102 3459103 AM1_0921 AM1_0922     FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3459103 3459104 AM1_0922 AM1_0923     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3459105 3459106 AM1_0924 AM1_0925     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3459107 3459108 AM1_0926 AM1_0927 smpB   TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3459109 3459110 AM1_0928 AM1_0929     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3459110 3459111 AM1_0929 AM1_0930     FALSE 0.159 163.000 0.000 NA   NA
 3459111 3459112 AM1_0930 AM1_0931   nusA TRUE 0.906 65.000 0.759 NA   NA
 3459112 3459113 AM1_0931 AM1_0932 nusA infB FALSE 0.415 489.000 0.342 1.000 N NA
 3459113 3459114 AM1_0932 AM1_0933 infB   FALSE 0.086 250.000 0.000 NA   NA
 3459115 3459116 AM1_0934 AM1_0935   cysE TRUE 0.905 28.000 0.070 NA N NA
 3459116 3459117 AM1_0935 AM1_0936 cysE   TRUE 0.918 -18.000 0.167 NA   NA
 3459117 3459118 AM1_0936 AM1_0937     FALSE 0.080 260.000 0.000 NA   NA
 3459119 3459120 AM1_0938 AM1_0939   petL FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3459120 3459121 AM1_0939 AM1_0940 petL gatB FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3459121 3459122 AM1_0940 AM1_0941 gatB   FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3459122 3459123 AM1_0941 AM1_0942     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3459125 3459126 AM1_0944 AM1_0945     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3459126 3459127 AM1_0945 AM1_0946     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3459127 3459128 AM1_0946 AM1_0947     FALSE 0.410 75.000 0.000 1.000   NA
 3459128 3459129 AM1_0947 AM1_0948     FALSE 0.134 189.000 0.000 NA   NA
 3459133 3459134 AM1_0952 AM1_0953     FALSE 0.263 93.000 0.000 NA   NA
 3459134 3459135 AM1_0953 AM1_0955     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3459138 3459139 AM1_0957 AM1_0958     FALSE 0.367 87.000 0.000 1.000   NA
 3459140 3459141 AM1_0959 AM1_0960     FALSE 0.321 83.000 0.000 1.000 N NA
 3459141 3459142 AM1_0960 AM1_0961     FALSE 0.236 102.000 0.000 NA   NA
 3459142 3459143 AM1_0961 AM1_0962     FALSE 0.217 117.000 0.000 NA   NA
 3459144 3459145 AM1_0963 AM1_0964 uppS   TRUE 0.636 190.000 0.003 1.000   NA
 3459146 3459147 AM1_0965 AM1_0966     TRUE 0.648 139.000 0.000 0.033 Y NA
 3459151 3459152 AM1_0970 AM1_0971     FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3459152 3459153 AM1_0971 AM1_0972     FALSE 0.221 112.000 0.000 NA   NA
 3459153 3459154 AM1_0972 AM1_0973     FALSE 0.178 149.000 0.000 NA   NA
 3459154 3459155 AM1_0973 AM1_0975   kmo FALSE 0.106 217.000 0.000 NA   NA
 3459156 3459157 AM1_0974 AM1_0976     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3459157 3459158 AM1_0976 AM1_0977     TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3459158 3459159 AM1_0977 AM1_0978     TRUE 0.783 44.000 0.000 NA Y NA
 3459159 3459160 AM1_0978 AM1_0979     FALSE 0.326 -25.000 0.000 NA N NA
 3459160 3459161 AM1_0979 AM1_0980     FALSE 0.159 163.000 0.000 NA   NA
 3459162 3459163 AM1_0981 AM1_0982     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3459163 3459164 AM1_0982 AM1_0983     FALSE 0.061 328.000 0.000 NA   NA
 3459164 3459165 AM1_0983 AM1_0984     FALSE 0.322 75.000 0.000 NA   NA
 3459165 3459166 AM1_0984 AM1_0985     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3459167 3459168 AM1_0986 AM1_0987     TRUE 0.967 39.000 0.333 1.000 Y NA
 3459168 3459169 AM1_0987 AM1_0988     TRUE 0.982 -3.000 0.600 0.093 Y NA
 3459170 3459171 AM1_0989 AM1_0990     FALSE 0.087 248.000 0.000 NA   NA
 3459171 3459172 AM1_0990 AM1_0991     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3459173 3459174 AM1_0992 AM1_0993 kaiC kaiB TRUE 0.909 72.000 0.927 1.000   NA
 3459174 3459175 AM1_0993 AM1_0994 kaiB kaiA TRUE 0.934 34.000 0.732 1.000   NA
 3459176 3459177 AM1_0995 AM1_0996   glgB FALSE 0.396 60.000 0.000 1.000 N NA
 3459177 3459178 AM1_0996 AM1_0997 glgB   FALSE 0.313 78.000 0.000 NA   NA
 3459182 3459183 AM1_1001 AM1_1002   cysE FALSE 0.086 250.000 0.000 NA   NA
 3459183 3459184 AM1_1002 AM1_1003 cysE   TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3459187 3459188 AM1_1006 AM1_1007     FALSE 0.191 139.000 0.000 NA   NA
 3459188 3459189 AM1_1007 AM1_1008     FALSE 0.059 340.000 0.000 NA   NA
 3459189 3459190 AM1_1008 AM1_1010   ribH FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3459190 3459191 AM1_1010 AM1_1011 ribH psbZ TRUE 0.787 124.000 0.037 1.000   NA
 3459192 3459193 AM1_1012 AM1_1013     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3459193 3459194 AM1_1013 AM1_1014     FALSE 0.368 70.000 0.000 1.000 N NA
 3459194 3459195 AM1_1014 AM1_1015     TRUE 0.983 14.000 0.356 0.005 Y NA
 3459195 3459196 AM1_1015 AM1_1016     TRUE 0.965 35.000 0.128 1.000 Y NA
 3459196 3459197 AM1_1016 AM1_1017     FALSE 0.059 480.000 0.000 1.000   NA
 3459198 3459199 AM1_1018 AM1_1019   chlG TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3459199 3459200 AM1_1019 AM1_1020 chlG   FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3459202 3459203 AM1_1022 AM1_1023     FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3459203 3459204 AM1_1023 AM1_1024     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3459205 3459206 AM1_1025 AM1_1026     FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 3459206 3459207 AM1_1026 AM1_1027     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3459207 3459208 AM1_1027 AM1_1028     TRUE 0.938 3.000 0.028 NA   NA
 3459208 3459209 AM1_1028 AM1_1029     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3459210 3459211 AM1_1030 AM1_1031     FALSE 0.081 257.000 0.000 NA   NA
 3459211 3459212 AM1_1031 AM1_1032     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3459214 3459215 AM1_1034 AM1_1035     FALSE 0.322 75.000 0.000 NA   NA
 3459218 3459219 AM1_1038 AM1_1039     FALSE 0.071 282.000 0.000 NA   NA
 3459219 3459220 AM1_1039 AM1_1040     FALSE 0.074 276.000 0.000 NA   NA
 3459220 3459221 AM1_1040 AM1_1041     TRUE 0.950 4.000 0.143 NA   NA
 3459221 3459222 AM1_1041 AM1_1042     FALSE 0.081 257.000 0.000 NA   NA
 3459222 3459223 AM1_1042 AM1_1043     FALSE 0.271 91.000 0.000 NA   NA
 3459223 3459224 AM1_1043 AM1_1044     TRUE 0.916 30.000 0.113 NA   NA
 3459224 3459225 AM1_1044 AM1_1045     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3459225 3459226 AM1_1045 AM1_1046     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3459226 3459227 AM1_1046 AM1_1047     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3459227 3459228 AM1_1047 AM1_1048     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3459228 3459229 AM1_1048 AM1_1049     FALSE 0.043 453.000 0.000 NA   NA
 3459229 3459230 AM1_1049 AM1_1050     FALSE 0.038 525.000 0.000 NA   NA
 3459230 3459231 AM1_1050 AM1_1051     FALSE 0.091 240.000 0.000 NA   NA
 3459233 3459234 AM1_1053 AM1_1054     FALSE 0.192 138.000 0.000 NA   NA
 3459235 3459236 AM1_1055 AM1_1056     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3459236 3459237 AM1_1056 AM1_1057     FALSE 0.156 166.000 0.000 NA   NA
 3459241 3459242 AM1_1061 AM1_1062   map FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3459242 3459243 AM1_1062 AM1_1063 map   FALSE 0.111 223.000 0.000 1.000 N NA
 3459247 3459248 AM1_1067 AM1_1068   nadA FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3459249 3459250 AM1_1069 AM1_1070   glcD FALSE 0.153 170.000 0.000 NA   NA
 3459250 3459251 AM1_1070 AM1_1071 glcD   FALSE 0.086 250.000 0.000 NA   NA
 3459251 3459252 AM1_1071 AM1_1072     FALSE 0.030 815.000 0.000 NA   NA
 3459253 3459254 AM1_1073 AM1_1074     FALSE 0.064 242.000 0.000 NA N NA
 3459254 3459255 AM1_1074 AM1_1075     TRUE 0.940 6.000 0.034 NA   NA
 3459257 3459258 AM1_1077 AM1_1078     FALSE 0.106 217.000 0.000 NA   NA
 3459258 3459259 AM1_1078 AM1_1079     TRUE 0.487 49.000 0.000 1.000   NA
 3459259 3459260 AM1_1079 AM1_1080     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3459260 3459261 AM1_1080 AM1_1081     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3459261 3459262 AM1_1081 AM1_1082   ycf4 TRUE 0.931 30.000 0.220 1.000   NA
 3459263 3459264 AM1_1083 AM1_1084 psbD psbC TRUE 0.932 -94.000 0.878 0.002   NA
 3459264 3459265 AM1_1084 AM1_1085 psbC   TRUE 0.697 188.000 0.051 1.000   NA
 3459265 3459266 AM1_1085 AM1_1087   secA FALSE 0.160 206.000 0.000 1.000   NA
 3459267 3459268 AM1_1086 AM1_1088     FALSE 0.115 206.000 0.000 NA   NA
 3459268 3459269 AM1_1088 AM1_1089     FALSE 0.075 275.000 0.000 NA   NA
 3459270 3459271 AM1_1090 AM1_1092     FALSE 0.219 162.000 0.000 1.000   NA
 3459272 3459273 AM1_1091 AM1_1093     FALSE 0.040 563.000 0.000 1.000 N NA
 3459274 3459275 AM1_1094 AM1_1095 argJ   FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3459275 3459276 AM1_1095 AM1_1096     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3459276 3459277 AM1_1096 AM1_1097     TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3459278 3459279 AM1_1098 AM1_1099     FALSE 0.169 156.000 0.000 NA   NA
 3459279 3459280 AM1_1099 AM1_1100     TRUE 0.444 -15.000 0.000 NA   NA
 3459282 3459283 AM1_1101 AM1_1103     TRUE 0.964 62.000 0.118 0.004 Y NA
 3459283 3459284 AM1_1103 AM1_1104     TRUE 0.905 176.000 1.000 0.004 Y NA
 3459284 3459285 AM1_1104 AM1_1105     FALSE 0.405 106.000 0.000 0.004   NA
 3459285 3459286 AM1_1105 AM1_1106     TRUE 0.638 12.000 0.000 1.000   NA
 3459286 3459287 AM1_1106 AM1_1107     TRUE 0.822 59.000 0.000 0.033 Y NA
 3459287 3459288 AM1_1107 AM1_1108   menD FALSE 0.054 409.000 0.000 1.000 N NA
 3459288 3459289 AM1_1108 AM1_1109 menD   TRUE 0.696 93.000 0.000 1.000 Y NA
 3459290 3459291 AM1_1110 AM1_1111 menA   FALSE 0.069 320.000 0.000 1.000 N NA
 3459291 3459292 AM1_1111 AM1_1112     FALSE 0.297 90.000 0.000 1.000 N NA
 3459292 3459293 AM1_1112 AM1_1113   ppnK TRUE 0.974 21.000 0.314 1.000 Y NA
 3459294 3459295 AM1_1114 AM1_1115     FALSE 0.077 267.000 0.000 NA   NA
 3459295 3459296 AM1_1115 AM1_1116   uvrC FALSE 0.417 -22.000 0.000 NA   NA
 3459296 3459297 AM1_1116 AM1_1117 uvrC   FALSE 0.105 218.000 0.000 NA   NA
 3459297 3459298 AM1_1117 AM1_1118   glgA FALSE 0.160 162.000 0.000 NA   NA
 3459298 3459299 AM1_1118 AM1_1119 glgA   FALSE 0.093 235.000 0.000 NA   NA
 3459302 3459303 AM1_1122 AM1_1123     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3459303 3459304 AM1_1123 AM1_1124     FALSE 0.043 460.000 0.000 NA   NA
 3459304 3459305 AM1_1124 AM1_1125     TRUE 0.753 88.000 0.000 0.032 Y NA
 3459305 3459306 AM1_1125 AM1_1126     FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 3459306 3459307 AM1_1126 AM1_1127     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3459308 3459309 AM1_1128 AM1_1129   psbF FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3459309 3459310 AM1_1129 AM1_1130 psbF psbE TRUE 0.966 13.000 0.837 0.002   NA
 3459312 3459313 AM1_1132 AM1_1133     FALSE 0.063 316.000 0.000 NA   NA
 3459314 3459315 AM1_1134 AM1_1135   hli TRUE 0.436 69.000 0.000 1.000   NA
 3459315 3459316 AM1_1135 AM1_1136 hli   FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3459316 3459317 AM1_1136 AM1_1137     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3459318 3459319 AM1_1138 AM1_1139   aroC TRUE 0.489 23.000 0.000 1.000 N NA
 3459319 3459320 AM1_1139 AM1_1140 aroC   FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3459320 3459321 AM1_1140 AM1_1142   hrcA FALSE 0.118 203.000 0.000 NA   NA
 3459321 3459322 AM1_1142 AM1_1143 hrcA   TRUE 0.891 30.000 0.031 NA N NA
 3459323 3459324 AM1_1144 AM1_6414   ssrA FALSE 0.192 138.000 0.000 NA   NA
 3459324 3459325 AM1_6414 AM1_1145 ssrA   FALSE 0.037 534.000 0.000 NA   NA
 3459325 3459326 AM1_1145 AM1_1146     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3459326 3459327 AM1_1146 AM1_1148     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3459328 3459329 AM1_1147 AM1_1149     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3459329 3459330 AM1_1149 AM1_1150     FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3459330 3459331 AM1_1150 AM1_1151     FALSE 0.037 547.000 0.000 NA   NA
 3459331 10702626 AM1_1151 AM1_1152     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3459332 3459333 AM1_1153 AM1_1154   hup FALSE 0.061 251.000 0.000 NA N NA
 3459337 3459338 AM1_1158 AM1_1159     FALSE 0.250 74.000 0.000 NA N NA
 3459339 3459340 AM1_1160 AM1_1161     TRUE 0.503 251.000 0.007 1.000 N NA
 3459341 3459342 AM1_1162 AM1_1163     TRUE 0.795 137.000 0.353 NA   NA
 3459342 3459343 AM1_1163 AM1_1164     TRUE 0.482 51.000 0.000 1.000   NA
 3459343 3459344 AM1_1164 AM1_1165     FALSE 0.034 412.000 0.000 NA N NA
 3459344 3459345 AM1_1165 AM1_1166   putP FALSE 0.101 182.000 0.000 NA N NA
 3459345 3459346 AM1_1166 AM1_1167 putP   FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3459346 3459347 AM1_1167 AM1_1168     FALSE 0.046 432.000 0.000 NA   NA
 3459347 3459348 AM1_1168 AM1_1169     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3459348 3459349 AM1_1169 AM1_1170     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3459353 3459354 AM1_1174 AM1_1175     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3459354 3459355 AM1_1175 AM1_1176     FALSE 0.394 -34.000 0.000 NA   NA
 3459355 3459356 AM1_1176 AM1_1177     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3459356 3459357 AM1_1177 AM1_1179     FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3459358 3459359 AM1_1178 AM1_1180     TRUE 0.654 6.000 0.000 1.000   NA
 3459360 3459361 AM1_1181 AM1_1182     FALSE 0.271 91.000 0.000 NA   NA
 3459362 3459363 AM1_1183 AM1_1184     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3459364 3459365 AM1_1185 AM1_1186     FALSE 0.315 154.000 0.000 0.011   NA
 3459366 3459367 AM1_1187 AM1_1188 ligA   FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3459367 3459368 AM1_1188 AM1_1189     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3459369 3459370 AM1_1190 AM1_1191   por FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3459371 3459372 AM1_1192 AM1_1193     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3459372 3459373 AM1_1193 AM1_1194   nthA TRUE 0.959 17.000 0.583 0.001   NA
 3459373 3459374 AM1_1194 AM1_1195 nthA nthB TRUE 0.970 4.000 0.917 0.001   NA
 3459374 3459375 AM1_1195 AM1_1196 nthB   TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3459375 3459376 AM1_1196 AM1_1197     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3459379 3459380 AM1_1200 AM1_1201     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3459385 3459386 AM1_1206 AM1_1207   rpoE TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3459386 3459387 AM1_1207 AM1_1208 rpoE   TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3459388 3459389 AM1_1209 AM1_1210     FALSE 0.153 170.000 0.000 NA   NA
 3459389 3459390 AM1_1210 AM1_1211     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3459391 3459392 AM1_1212 AM1_1213     FALSE 0.042 477.000 0.000 NA   NA
 3459396 3459397 AM1_1217 AM1_1218     FALSE 0.029 1336.000 0.000 NA   NA
 3459397 3459398 AM1_1218 AM1_1219     FALSE 0.325 74.000 0.000 NA   NA
 3459398 3459399 AM1_1219 AM1_1220     TRUE 0.946 16.000 1.000 NA   NA
 3459399 3459400 AM1_1220 AM1_1221   nifS FALSE 0.183 190.000 0.000 1.000   NA
 3459400 3459401 AM1_1221 AM1_1222 nifS sufD TRUE 0.930 19.000 0.081 1.000 N NA
 3459401 3459402 AM1_1222 AM1_1223 sufD sufC TRUE 0.982 0.000 0.482 1.000 Y NA
 3459402 3459403 AM1_1223 AM1_1224 sufC sufB TRUE 0.966 52.000 0.466 1.000 Y NA
 3459403 3459404 AM1_1224 AM1_1225 sufB   FALSE 0.236 102.000 0.000 NA   NA
 3459405 3459406 AM1_1226 AM1_1227     FALSE 0.165 159.000 0.000 NA   NA
 3459407 3459408 AM1_1228 AM1_1229     FALSE 0.075 369.000 0.000 1.000   NA
 3459408 3459409 AM1_1229 AM1_1230     FALSE 0.198 93.000 0.000 NA N NA
 3459409 3459410 AM1_1230 AM1_1231     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3459410 3459411 AM1_1231 AM1_1232     TRUE 0.903 35.000 0.057 NA   NA
 3459411 3459412 AM1_1232 AM1_1233     FALSE 0.060 332.000 0.000 NA   NA
 3459414 3459415 AM1_1234 AM1_1236     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3459415 3459416 AM1_1236 AM1_1237     FALSE 0.238 101.000 0.000 NA   NA
 3459418 3459419 AM1_1238 AM1_1240     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3459419 3459420 AM1_1240 AM1_1241     FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3459422 3459423 AM1_1243 AM1_1244     TRUE 0.966 5.000 0.385 0.064   NA
 3459425 3459426 AM1_1246 AM1_1247   prfA FALSE 0.205 126.000 0.000 NA   NA
 3459426 3459427 AM1_1247 AM1_1248 prfA rpmE TRUE 0.959 55.000 0.110 1.000 Y NA
 3459427 3459428 AM1_1248 AM1_1249 rpmE rpsI TRUE 0.966 47.000 0.062 0.010 Y NA
 3459428 3459429 AM1_1249 AM1_1250 rpsI rplM TRUE 0.985 0.000 0.601 0.010 Y NA
 3459429 3459430 AM1_1250 AM1_1251 rplM truA TRUE 0.963 33.000 0.058 1.000 Y NA
 3459430 3459431 AM1_1251 AM1_1252 truA rplQ TRUE 0.972 20.000 0.102 1.000 Y NA
 3459431 3459432 AM1_1252 AM1_1253 rplQ rpoA TRUE 0.956 12.000 0.873 1.000 N NA
 3459432 3459433 AM1_1253 AM1_1254 rpoA rpsK TRUE 0.643 228.000 0.308 1.000 N NA
 3459433 3459434 AM1_1254 AM1_1255 rpsK rpsM TRUE 0.970 60.000 0.810 0.010 Y NA
 3459435 3459436 AM1_1256 AM1_1257 metH   FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3459437 3459438 AM1_1258 AM1_1259     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3459440 3459441 AM1_1261 AM1_1262     TRUE 0.450 33.000 0.000 1.000 N NA
 3459443 3459444 AM1_1264 AM1_1265     TRUE 0.510 35.000 0.000 1.000   NA
 3459444 3459445 AM1_1265 AM1_1266     TRUE 0.875 57.000 0.005 1.000   NA
 3459445 3459446 AM1_1266 AM1_1267     FALSE 0.216 118.000 0.000 NA   NA
 3459446 3459447 AM1_1267 AM1_1268     FALSE 0.030 859.000 0.000 NA   NA
 3459447 3459448 AM1_1268 AM1_1269     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3459451 3459452 AM1_1272 AM1_1273     FALSE 0.152 125.000 0.000 NA N NA
 3459452 3459453 AM1_1273 AM1_1274   serA TRUE 0.604 138.000 0.000 1.000 Y NA
 3459453 3459454 AM1_1274 AM1_1275 serA prmA TRUE 0.942 0.000 0.053 1.000 N NA
 3459454 3459455 AM1_1275 AM1_1276 prmA   FALSE 0.029 1459.000 0.000 NA   NA
 3459459 3459460 AM1_1280 AM1_1281     FALSE 0.062 321.000 0.000 NA   NA
 3459460 3459461 AM1_1281 AM1_1282     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3459463 3459464 AM1_1284 AM1_1285     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3459464 3459465 AM1_1285 AM1_1286     FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3459466 3459467 AM1_1287 AM1_1288     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3459467 3459468 AM1_1288 AM1_1289     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3459469 3459470 AM1_1290 AM1_1291     FALSE 0.130 192.000 0.000 NA   NA
 3459470 3459471 AM1_1291 AM1_1292     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3459471 3459472 AM1_1292 AM1_1293     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3459472 3459473 AM1_1293 AM1_1295     FALSE 0.421 -21.000 0.000 NA   NA
 3459475 3459476 AM1_1296 AM1_1297     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3459476 3459477 AM1_1297 AM1_1298     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3459477 3459478 AM1_1298 AM1_1300     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3459478 3459479 AM1_1300 AM1_1301     FALSE 0.362 -51.000 0.000 NA   NA
 3459480 3459481 AM1_1302 AM1_1303     TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3459482 3459483 AM1_1304 AM1_1305 hli rpoD FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3459485 3459486 AM1_1307 AM1_1308   ftsH FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3459486 3459487 AM1_1308 AM1_1309 ftsH   FALSE 0.055 396.000 0.000 1.000 N NA
 3459489 3459490 AM1_1311 AM1_1312     FALSE 0.156 166.000 0.000 NA   NA
 3459493 3459494 AM1_1315 AM1_1316     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3459496 3459497 AM1_1318 AM1_1319     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3459502 3459503 AM1_1324 AM1_1325     TRUE 0.661 13.000 0.000 0.041 N NA
 3459503 3459504 AM1_1325 AM1_1326     FALSE 0.397 79.000 0.000 1.000   NA
 3459504 3459505 AM1_1326 AM1_1327     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3459505 3459506 AM1_1327 AM1_1328     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3459506 3459507 AM1_1328 AM1_1329     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3459507 3459508 AM1_1329 AM1_1330     FALSE 0.059 340.000 0.000 NA   NA
 3459508 3459509 AM1_1330 AM1_1331     FALSE 0.150 172.000 0.000 NA   NA
 3459509 3459510 AM1_1331 AM1_1332     FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3459511 3459512 AM1_1333 AM1_1334     FALSE 0.085 251.000 0.000 NA   NA
 3459513 3459514 AM1_1335 AM1_1336     TRUE 0.601 140.000 0.000 1.000 Y NA
 3459516 3459517 AM1_1338 AM1_1339     FALSE 0.047 417.000 0.000 NA   NA
 3459518 3459519 AM1_1340 AM1_1341     TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3459519 3459520 AM1_1341 AM1_1342     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3459522 3459523 AM1_1344 AM1_1346     FALSE 0.047 423.000 0.000 NA   NA
 3459523 3459524 AM1_1346 AM1_1347   trpA FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3459524 3459525 AM1_1347 AM1_1348 trpA   TRUE 0.957 3.000 0.175 1.000   NA
 3459525 3459526 AM1_1348 AM1_1349     TRUE 0.957 5.000 0.925 NA   NA
 3459526 3459527 AM1_1349 AM1_1350   lpxD FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3459527 3459528 AM1_1350 AM1_1351 lpxD   TRUE 0.894 34.000 0.005 1.000   NA
 3459529 3459530 AM1_1352 AM1_1353 pdhA   FALSE 0.224 126.000 0.000 1.000 N NA
 3459531 3459532 AM1_1354 AM1_1355     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3459538 3459539 AM1_1361 AM1_1362     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3459540 3459541 AM1_1363 AM1_1364     TRUE 0.938 16.000 0.114 1.000 N NA
 3459542 3459543 AM1_1365 AM1_1366   comB FALSE 0.113 208.000 0.000 NA   NA
 3459545 3459546 AM1_1368 AM1_1369 hli hli FALSE 0.161 269.000 0.000 0.003   NA
 3459547 3459548 AM1_1370 AM1_1371   ndhK FALSE 0.063 318.000 0.000 NA   NA
 3459548 3459549 AM1_1371 AM1_1373 ndhK pheS FALSE 0.293 91.000 0.000 1.000 N NA
 3459551 3459552 AM1_1374 AM1_1375 dus   TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3459552 3459553 AM1_1375 AM1_1376     FALSE 0.394 -34.000 0.000 NA   NA
 3459553 3459554 AM1_1376 AM1_1377     FALSE 0.048 450.000 0.000 1.000 N NA
 3459554 3459555 AM1_1377 AM1_1378     FALSE 0.226 449.000 0.000 1.000 Y NA
 3459555 3459556 AM1_1378 AM1_1379     TRUE 0.687 122.000 0.000 0.004 Y NA
 3459561 3459562 AM1_1384 AM1_1385     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3459562 3459563 AM1_1385 AM1_1386     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3459563 3459564 AM1_1386 AM1_1387     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3459565 3459566 AM1_1388 AM1_1389 hemD aroG FALSE 0.350 74.000 0.000 1.000 N NA
 3459568 3459569 AM1_1391 AM1_1392     FALSE 0.038 520.000 0.000 NA   NA
 3459570 3459571 AM1_1393 AM1_1394   fumC FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3459572 3459573 AM1_1395 AM1_1396 pilM pilN TRUE 0.977 5.000 0.087 NA Y NA
 3459573 3459574 AM1_1396 AM1_1397 pilN pilO TRUE 0.949 -3.000 0.760 NA   NA
 3459574 3459575 AM1_1397 AM1_1398 pilO   TRUE 0.833 99.000 0.240 NA   NA
 3459576 3459577 AM1_1399 AM1_1400 rpe   FALSE 0.212 135.000 0.000 1.000 N NA
 3459577 3459578 AM1_1400 AM1_1401     TRUE 0.519 43.000 0.000 0.089 N NA
 3459578 3459579 AM1_1401 AM1_1402     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3459581 3459582 AM1_1404 AM1_1405 murE   TRUE 0.916 23.000 0.049 NA   NA
 3459582 3459583 AM1_1405 AM1_1406     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3459583 3459584 AM1_1406 AM1_1407     FALSE 0.076 272.000 0.000 NA   NA
 3459585 3459586 AM1_1408 AM1_1409     TRUE 0.689 15.000 0.000 0.041   NA
 3459586 3459587 AM1_1409 AM1_1410     TRUE 0.507 36.000 0.000 1.000   NA
 3459588 3459589 AM1_1411 AM1_1412     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3459589 3459590 AM1_1412 AM1_1413     TRUE 0.946 5.000 0.075 NA   NA
 3459590 3459591 AM1_1413 AM1_1414     TRUE 0.956 2.000 0.805 NA   NA
 3459591 3459592 AM1_1414 AM1_1415     FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3459592 3459593 AM1_1415 AM1_1416     FALSE 0.076 294.000 0.000 1.000 N NA
 3459595 3459596 AM1_1418 AM1_6415     FALSE 0.076 271.000 0.000 NA   NA
 3459596 3459597 AM1_6415 AM1_6416     FALSE 0.263 93.000 0.000 NA   NA
 3459597 3459598 AM1_6416 AM1_1420     FALSE 0.126 196.000 0.000 NA   NA
 3459598 3459599 AM1_1420 AM1_1421     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3459599 3459600 AM1_1421 AM1_6417     FALSE 0.153 170.000 0.000 NA   NA
 3459600 3459601 AM1_6417 AM1_1422     FALSE 0.057 347.000 0.000 NA   NA
 3459601 3459602 AM1_1422 AM1_1423     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3459602 3459603 AM1_1423 AM1_1424     FALSE 0.409 38.000 0.000 NA   NA
 3459605 3459606 AM1_1426 AM1_1427     FALSE 0.360 89.000 0.000 1.000   NA
 3459606 3459607 AM1_1427 AM1_1428   pcrA TRUE 0.498 41.000 0.000 1.000   NA
 3459607 3459608 AM1_1428 AM1_1429 pcrA   FALSE 0.047 417.000 0.000 NA   NA
 3459608 3459609 AM1_1429 AM1_1430   pabA TRUE 0.907 52.000 0.231 NA   NA
 3459609 3459610 AM1_1430 AM1_1431 pabA   TRUE 0.820 113.000 0.231 1.000 N NA
 3459610 3459611 AM1_1431 AM1_1432     TRUE 0.718 172.000 0.123 NA   NA
 3459611 3459612 AM1_1432 AM1_1433     TRUE 0.920 19.000 0.039 NA   NA
 3459612 3459613 AM1_1433 AM1_1434   purQ FALSE 0.132 191.000 0.000 NA   NA
 3459613 3459614 AM1_1434 AM1_1435 purQ purS TRUE 0.984 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 3459614 3459615 AM1_1435 AM1_1436 purS gcvT TRUE 0.433 70.000 0.000 1.000   NA
 3459617 3459618 AM1_1438 AM1_1439   psaJ FALSE 0.206 125.000 0.000 NA   NA
 3459618 3459619 AM1_1439 AM1_1440 psaJ psaF TRUE 0.966 5.000 0.318 0.012   NA
 3459620 3459621 AM1_1441 AM1_1442     TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3459622 3459623 AM1_1443 AM1_1444   chlN FALSE 0.050 602.000 0.000 1.000   NA
 3459623 3459624 AM1_1444 AM1_1445 chlN chlL TRUE 0.856 92.000 0.039 0.001 N NA
 3459624 3459625 AM1_1445 AM1_1446 chlL   FALSE 0.083 255.000 0.000 NA   NA
 3459626 3459627 AM1_1447 AM1_1448     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3459627 3459628 AM1_1448 AM1_1449     FALSE 0.135 188.000 0.000 NA   NA
 3459628 3459629 AM1_1449 AM1_1450     TRUE 0.955 55.000 0.041 1.000 Y NA
 3459629 3459630 AM1_1450 AM1_1451     TRUE 0.813 83.000 0.006 NA   NA
 3459631 3459632 AM1_1452 AM1_1453   rpsA FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3459632 3459633 AM1_1453 AM1_1454 rpsA   FALSE 0.115 257.000 0.000 1.000   NA
 3459634 3459635 AM1_1455 AM1_1456     TRUE 0.873 86.000 0.619 NA   NA
 3459636 3459637 AM1_1457 AM1_1458     FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3459638 3459639 AM1_1459 AM1_1460     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3459639 3459640 AM1_1460 AM1_1461     TRUE 0.433 30.000 0.000 NA   NA
 3459641 3459642 AM1_1462 AM1_1463     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3459642 3459643 AM1_1463 AM1_1464     FALSE 0.078 214.000 0.000 NA N NA
 3459643 3459644 AM1_1464 AM1_1465     FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3459644 3459645 AM1_1465 AM1_1466     FALSE 0.215 119.000 0.000 NA   NA
 3459645 3459646 AM1_1466 AM1_1467     FALSE 0.066 304.000 0.000 NA   NA
 3459647 3459648 AM1_1468 AM1_1469     TRUE 0.979 16.000 1.000 1.000 Y NA
 3459648 3459649 AM1_1469 AM1_1470     FALSE 0.173 153.000 0.000 NA   NA
 3459649 3459650 AM1_1470 AM1_1471     FALSE 0.057 348.000 0.000 NA   NA
 3459650 3459651 AM1_1471 AM1_1472     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3459651 3459652 AM1_1472 AM1_1473     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3459653 3459654 AM1_1474 AM1_1475     TRUE 0.477 53.000 0.000 1.000   NA
 3459655 3459656 AM1_1476 AM1_1477     FALSE 0.106 217.000 0.000 NA   NA
 3459657 3459658 AM1_1478 AM1_1479     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3459658 3459659 AM1_1479 AM1_1480     FALSE 0.168 157.000 0.000 NA   NA
 3459659 3459660 AM1_1480 AM1_1481     TRUE 0.891 -3.000 0.000 0.088 Y NA
 3459660 3459661 AM1_1481 AM1_1482     TRUE 0.952 13.000 0.167 1.000   NA
 3459661 3459662 AM1_1482 AM1_1483     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3459662 3459663 AM1_1483 AM1_1484     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3459664 3459665 AM1_1485 AM1_1486     FALSE 0.130 192.000 0.000 NA   NA
 3459665 10702627 AM1_1486 AM1_1487     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 10702627 3459666 AM1_1487 AM1_1488     FALSE 0.097 229.000 0.000 NA   NA
 3459667 3459668 AM1_1489 AM1_1490   upp FALSE 0.221 161.000 0.000 1.000   NA
 3459669 3459670 AM1_1491 AM1_1492     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3459670 3459671 AM1_1492 AM1_1493     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3459671 3459672 AM1_1493 AM1_1494     FALSE 0.271 91.000 0.000 NA   NA
 3459673 3459674 AM1_1495 AM1_1496     FALSE 0.037 539.000 0.000 NA   NA
 3459675 3459676 AM1_1497 AM1_1498 glnA   FALSE 0.038 521.000 0.000 NA   NA
 3459676 3459677 AM1_1498 AM1_1499     FALSE 0.075 274.000 0.000 NA   NA
 3459677 3459678 AM1_1499 AM1_1500     FALSE 0.269 446.000 0.000 0.019 Y NA
 3459678 3459679 AM1_1500 AM1_1501     TRUE 0.873 21.000 0.000 0.032 Y NA
 3459679 3459680 AM1_1501 AM1_1502     FALSE 0.268 130.000 0.000 1.000   NA
 3459680 3459681 AM1_1502 AM1_1503     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3459683 3459684 AM1_1505 AM1_1506   fba FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3459685 3459686 AM1_1507 AM1_1508     FALSE 0.389 51.000 0.000 NA   NA
 3459686 3459687 AM1_1508 AM1_1509     FALSE 0.035 742.000 0.000 1.000 N NA
 3459687 3459688 AM1_1509 AM1_1510   gshA TRUE 0.912 27.000 0.021 1.000   NA
 3459689 3459690 AM1_1511 AM1_1512     TRUE 0.547 -48.000 0.000 0.038   NA
 3459693 3459694 AM1_1515 AM1_1516     FALSE 0.193 137.000 0.000 NA   NA
 3459694 3459695 AM1_1516 AM1_1517     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 3459695 3459696 AM1_1517 AM1_1518     TRUE 0.908 34.000 0.087 NA   NA
 3459696 3459697 AM1_1518 AM1_1519     FALSE 0.326 97.000 0.000 1.000   NA
 3459697 3459698 AM1_1519 AM1_1520     FALSE 0.160 162.000 0.000 NA   NA
 3459698 3459699 AM1_1520 AM1_1521     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3459699 3459700 AM1_1521 AM1_1522     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3459700 3459701 AM1_1522 AM1_1523     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3459701 3459702 AM1_1523 AM1_1524     TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3459702 3459703 AM1_1524 AM1_1525   murD FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3459703 3459704 AM1_1525 AM1_1526 murD   FALSE 0.355 73.000 0.000 1.000 N NA
 3459704 3459705 AM1_1526 AM1_1527     FALSE 0.311 121.000 0.000 0.040 N NA
 3459707 3459708 AM1_1529 AM1_1530     TRUE 0.636 180.000 0.009 NA   NA
 3459708 3459709 AM1_1530 AM1_1531   gcvH FALSE 0.116 205.000 0.000 NA   NA
 3459709 3459710 AM1_1531 AM1_1532 gcvH gcvT TRUE 0.961 77.000 0.317 0.001 Y NA
 3459710 3459711 AM1_1532 AM1_1533 gcvT   FALSE 0.193 181.000 0.000 1.000   NA
 3459711 3459712 AM1_1533 AM1_1534     FALSE 0.085 336.000 0.000 1.000   NA
 3459712 3459713 AM1_1534 AM1_1535     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3459715 3459716 AM1_1537 AM1_1538     FALSE 0.050 393.000 0.000 NA   NA
 3459716 3459717 AM1_1538 AM1_1539   chlB FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3459718 3459719 AM1_1540 AM1_1541 thrS   FALSE 0.403 -28.000 0.000 NA   NA
 3459719 3459720 AM1_1541 AM1_1542     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3459720 3459721 AM1_1542 AM1_1543     FALSE 0.197 132.000 0.000 NA   NA
 3459721 3459722 AM1_1543 AM1_1544     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3459722 3459723 AM1_1544 AM1_1545     FALSE 0.048 407.000 0.000 NA   NA
 3459723 3459724 AM1_1545 AM1_1546     TRUE 0.955 2.000 0.500 NA   NA
 3459724 3459725 AM1_1546 AM1_1547     FALSE 0.048 407.000 0.000 NA   NA
 3459725 10702628 AM1_1547 AM1_1548     TRUE 0.444 -15.000 0.000 NA   NA
 10702628 3459726 AM1_1548 AM1_1549     FALSE 0.271 91.000 0.000 NA   NA
 3459727 3459728 AM1_1550 AM1_1551 nrdG   FALSE 0.242 148.000 0.000 1.000   NA
 3459730 3459731 AM1_1553 AM1_1554     FALSE 0.057 348.000 0.000 NA   NA
 3459732 3459733 AM1_1555 AM1_1556     FALSE 0.072 280.000 0.000 NA   NA
 3459734 3459735 AM1_1557 AM1_1558   apcA FALSE 0.045 720.000 0.000 1.000   NA
 3459735 3459736 AM1_1558 AM1_1559 apcA   TRUE 0.620 27.000 0.000 0.047   NA
 3459737 3459738 AM1_1560 AM1_1561 ccb2   TRUE 0.857 69.000 0.021 NA   NA
 3459742 3459743 AM1_1565 AM1_1566     TRUE 0.981 -3.000 0.176 0.037 Y NA
 3459743 3459744 AM1_1566 AM1_1567     FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3459745 3459746 AM1_1568 AM1_1569     TRUE 0.452 86.000 0.000 0.062   NA
 3459746 3459747 AM1_1569 AM1_1570     FALSE 0.258 176.000 0.000 0.062   NA
 3459747 3459748 AM1_1570 AM1_1571     TRUE 0.692 181.000 0.061 1.000 N NA
 3459749 3459750 AM1_1572 AM1_1573     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3459750 3459751 AM1_1573 AM1_1574     FALSE 0.070 290.000 0.000 NA   NA
 3459751 3459752 AM1_1574 AM1_1575     TRUE 0.955 6.000 0.400 NA   NA
 3459753 3459754 AM1_1576 AM1_1577     FALSE 0.085 252.000 0.000 NA   NA
 3459754 3459755 AM1_1577 AM1_1578     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3459756 3459757 AM1_1579 AM1_1580     FALSE 0.143 179.000 0.000 NA   NA
 3459758 3459759 AM1_1581 AM1_1582     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3459761 3459762 AM1_1584 AM1_1585     FALSE 0.236 117.000 0.000 1.000 N NA
 3459764 3459765 AM1_1587 AM1_1588     FALSE 0.033 632.000 0.000 NA   NA
 3459765 3459766 AM1_1588 AM1_1589     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3459767 3459768 AM1_1590 AM1_1591     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3459770 3459771 AM1_1593 AM1_1594   hli FALSE 0.067 297.000 0.000 NA   NA
 3459771 3459772 AM1_1594 AM1_1595 hli   TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3459772 3459773 AM1_1595 AM1_1596     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3459773 3459774 AM1_1596 AM1_1597     FALSE 0.032 707.000 0.000 NA   NA
 3459774 3459775 AM1_1597 AM1_1598     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3459775 3459776 AM1_1598 AM1_1599   ftsH FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3459776 3459777 AM1_1599 AM1_1600 ftsH   FALSE 0.121 200.000 0.000 NA   NA
 3459778 3459779 AM1_1601 AM1_1602     TRUE 0.965 58.000 0.714 1.000 Y NA
 3459779 3459780 AM1_1602 AM1_1603     FALSE 0.143 179.000 0.000 NA   NA
 3459781 3459782 AM1_1604 AM1_1605     FALSE 0.058 343.000 0.000 NA   NA
 3459782 3459783 AM1_1605 AM1_1606     TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3459784 3459785 AM1_1607 AM1_1608     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3459788 3459789 AM1_1611 AM1_1612     FALSE 0.217 117.000 0.000 NA   NA
 3459789 10702629 AM1_1612 AM1_1613     TRUE 0.444 -15.000 0.000 NA   NA
 10702629 3459790 AM1_1613 AM1_1614     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3459790 3459791 AM1_1614 AM1_1615     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3459791 3459792 AM1_1615 AM1_1616     TRUE 0.547 -48.000 0.000 0.038   NA
 3459794 3459795 AM1_1618 AM1_1619     FALSE 0.289 116.000 0.000 1.000   NA
 3459797 3459798 AM1_1621 AM1_1622     TRUE 0.456 0.000 0.000 NA N NA
 3459798 3459799 AM1_1622 AM1_1623     TRUE 0.939 14.000 0.188 NA N NA
 3459800 3459801 AM1_1624 AM1_1625     FALSE 0.058 342.000 0.000 NA   NA
 3459801 3459802 AM1_1625 AM1_1626     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3459802 3459803 AM1_1626 AM1_1627     FALSE 0.045 440.000 0.000 NA   NA
 3459804 3459805 AM1_1628 AM1_1629     TRUE 0.654 6.000 0.000 1.000   NA
 3459806 3459807 AM1_1630 AM1_1631 acnB   FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3459807 3459808 AM1_1631 AM1_1632     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3459809 10702630 AM1_1633 AM1_1634     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3459810 3459811 AM1_1636 AM1_1637   psaK FALSE 0.241 149.000 0.000 1.000   NA
 3459812 3459813 AM1_1638 AM1_1639 trpF   FALSE 0.110 225.000 0.000 1.000 N NA
 3459814 3459815 AM1_1640 AM1_1641 pyrD   TRUE 0.432 40.000 0.000 1.000 N NA
 3459815 3459816 AM1_1641 AM1_1642   secG TRUE 0.915 18.000 0.014 1.000 N NA
 3459816 3459817 AM1_1642 AM1_1643 secG gpmI TRUE 0.793 106.000 0.041 1.000 N NA
 3459817 3459818 AM1_1643 AM1_1644 gpmI   FALSE 0.159 177.000 0.000 1.000 N NA
 3459819 3459820 AM1_1645 AM1_1646 ppsA   TRUE 0.434 39.000 0.000 1.000 N NA
 3459821 3459822 AM1_1647 AM1_1648     FALSE 0.170 155.000 0.000 NA   NA
 3459822 3459823 AM1_1648 AM1_1649     FALSE 0.042 333.000 0.000 NA N NA
 3459823 3459824 AM1_1649 AM1_1650     FALSE 0.060 252.000 0.000 NA N NA
 3459825 3459826 AM1_1651 AM1_1652 ndhN   TRUE 0.897 79.000 0.595 1.000   NA
 3459826 3459827 AM1_1652 AM1_1653     TRUE 0.921 41.000 0.189 1.000   NA
 3459827 3459828 AM1_1653 AM1_1655     FALSE 0.343 93.000 0.000 1.000   NA
 3459830 3459831 AM1_1656 AM1_1657     FALSE 0.021 962.000 0.000 NA N NA
 3459832 3459833 AM1_1658 AM1_1659 speA   FALSE 0.409 38.000 0.000 NA   NA
 3459833 3459834 AM1_1659 AM1_1660   psaC TRUE 0.778 116.000 0.043 NA   NA
 3459834 3459835 AM1_1660 AM1_1661 psaC   FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3459835 3459836 AM1_1661 AM1_1662   gltB FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3459838 3459839 AM1_1664 AM1_1665     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3459839 3459840 AM1_1665 AM1_1666     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3459843 3459844 AM1_1669 AM1_1670     FALSE 0.031 784.000 0.000 NA   NA
 3459845 3459846 AM1_1671 AM1_1672     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3459846 3459847 AM1_1672 AM1_1673     FALSE 0.047 423.000 0.000 NA   NA
 3459847 3459848 AM1_1673 AM1_1674     FALSE 0.119 202.000 0.000 NA   NA
 3459848 3459849 AM1_1674 AM1_1675   recF TRUE 0.503 38.000 0.000 1.000   NA
 3459849 3459850 AM1_1675 AM1_1676 recF rnd TRUE 0.653 7.000 0.000 1.000   NA
 3459851 3459852 AM1_1677 AM1_1678     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3459852 3459853 AM1_1678 AM1_1679     FALSE 0.399 -31.000 0.000 NA   NA
 3459853 3459854 AM1_1679 AM1_1680     FALSE 0.153 170.000 0.000 NA   NA
 3459854 3459855 AM1_1680 AM1_1681     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3459855 3459856 AM1_1681 AM1_1682     FALSE 0.170 155.000 0.000 NA   NA
 3459859 3459860 AM1_1685 AM1_1686 ggpS   TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3459861 3459862 AM1_1687 AM1_1688   glpK TRUE 0.952 18.000 0.200 0.015   NA
 3459862 3459863 AM1_1688 AM1_1689 glpK   FALSE 0.054 537.000 0.000 1.000   NA
 3459863 3459864 AM1_1689 AM1_1690     TRUE 0.623 27.000 0.000 0.038   NA
 3459865 3459866 AM1_1691 AM1_1692 stpA   TRUE 0.487 49.000 0.000 1.000   NA
 3459866 3459867 AM1_1692 AM1_1693     FALSE 0.239 150.000 0.000 1.000   NA
 3459868 3459869 AM1_1694 AM1_1695     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3459869 3459870 AM1_1695 AM1_1696     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3459870 3459871 AM1_1696 AM1_1697     FALSE 0.389 -37.000 0.000 NA   NA
 3459871 3459872 AM1_1697 AM1_1698   lipA FALSE 0.214 133.000 0.000 1.000 N NA
 3459872 3459873 AM1_1698 AM1_1699 lipA   TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3459873 3459874 AM1_1699 AM1_1700     FALSE 0.140 182.000 0.000 NA   NA
 3459874 3459875 AM1_1700 AM1_1701     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3459875 3459876 AM1_1701 AM1_1702     TRUE 0.656 342.000 0.017 1.000 Y NA
 3459878 3459879 AM1_1704 AM1_1705 cobS rne FALSE 0.045 489.000 0.000 1.000 N NA
 3459883 3459884 AM1_1709 AM1_1710     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3459884 3459885 AM1_1710 AM1_1711     FALSE 0.193 181.000 0.000 1.000   NA
 3459886 3459887 AM1_1712 AM1_1713     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3459887 3459888 AM1_1713 AM1_1714     FALSE 0.053 369.000 0.000 NA   NA
 3459888 3459889 AM1_1714 AM1_1715     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3459889 3459890 AM1_1715 AM1_1716     FALSE 0.168 157.000 0.000 NA   NA
 3459891 3459892 AM1_6418 AM1_1717 rnpB rnc FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3459892 3459893 AM1_1717 AM1_1718 rnc ccsA FALSE 0.315 85.000 0.000 1.000 N NA
 3459900 3459901 AM1_1725 AM1_1726     TRUE 0.865 -13.000 0.000 0.031 Y NA
 3459901 3459902 AM1_1726 AM1_1727     TRUE 0.948 -3.000 0.143 1.000   NA
 3459902 3459903 AM1_1727 AM1_1728   trmE FALSE 0.044 786.000 0.000 1.000   NA
 3459904 3459905 AM1_1729 AM1_1730     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3459905 3459906 AM1_1730 AM1_1731   speE TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3459906 3459907 AM1_1731 AM1_1732 speE   TRUE 0.910 20.000 0.019 NA   NA
 3459907 3459908 AM1_1732 AM1_1733   bioB FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3459913 3459914 AM1_1737 AM1_1739 folC   TRUE 0.450 33.000 0.000 1.000 N NA
 3459914 3459915 AM1_1739 AM1_1740     TRUE 0.953 0.000 0.550 NA   NA
 3459915 3459916 AM1_1740 AM1_1741     TRUE 0.904 67.000 1.000 NA   NA
 3459916 3459917 AM1_1741 AM1_1742     FALSE 0.039 509.000 0.000 NA   NA
 3459917 3459918 AM1_1742 AM1_1743     FALSE 0.082 256.000 0.000 NA   NA
 3459919 3459920 AM1_1744 AM1_1746   cytM FALSE 0.352 91.000 0.000 1.000   NA
 3459921 3459922 AM1_1745 AM1_1747     TRUE 0.954 12.000 0.625 NA   NA
 3459923 3459924 AM1_1748 AM1_1749     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3459925 3459926 AM1_1750 AM1_1751     FALSE 0.292 113.000 0.000 1.000   NA
 3459926 3459927 AM1_1751 AM1_1752   ispE FALSE 0.218 130.000 0.000 1.000 N NA
 3459927 3459928 AM1_1752 AM1_1753 ispE ksgA TRUE 0.875 49.000 0.007 1.000 N NA
 3459929 3459930 AM1_1754 AM1_1755     FALSE 0.075 274.000 0.000 NA   NA
 3459930 3459931 AM1_1755 AM1_1756     FALSE 0.153 170.000 0.000 NA   NA
 3459931 3459932 AM1_1756 AM1_1757     FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3459932 3459933 AM1_1757 AM1_1758     FALSE 0.098 226.000 0.000 NA   NA
 3459933 3459934 AM1_1758 AM1_1759     TRUE 0.822 34.000 0.000 1.000 Y NA
 3459934 3459935 AM1_1759 AM1_1760     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3459935 3459936 AM1_1760 AM1_1761     FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3459936 3459937 AM1_1761 AM1_1762     FALSE 0.168 157.000 0.000 NA   NA
 3459937 3459938 AM1_1762 AM1_1763     FALSE 0.057 347.000 0.000 NA   NA
 3459938 3459939 AM1_1763 AM1_1764     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3459939 3459940 AM1_1764 AM1_1765     TRUE 0.943 3.000 0.054 NA   NA
 3459940 3459941 AM1_1765 AM1_1766     FALSE 0.081 349.000 0.000 1.000   NA
 3459941 3459942 AM1_1766 AM1_1767     FALSE 0.232 121.000 0.000 1.000 N NA
 3459942 3459943 AM1_1767 AM1_1768     FALSE 0.075 275.000 0.000 NA   NA
 3459944 3459945 AM1_1769 AM1_1770     FALSE 0.067 297.000 0.000 NA   NA
 3459945 3459946 AM1_1770 AM1_1771     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 3459946 3459947 AM1_1771 AM1_1772     FALSE 0.238 101.000 0.000 NA   NA
 3459949 3459950 AM1_1774 AM1_1775     FALSE 0.034 611.000 0.000 NA   NA
 3459950 3459951 AM1_1775 AM1_1776     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3459951 3459952 AM1_1776 AM1_1777     FALSE 0.132 191.000 0.000 NA   NA
 3459954 3459955 AM1_1778 AM1_1780     FALSE 0.035 583.000 0.000 NA   NA
 3459955 3459956 AM1_1780 AM1_1781     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3459956 3459957 AM1_1781 AM1_1782     FALSE 0.242 111.000 0.000 1.000 N NA
 3459957 3459958 AM1_1782 AM1_1783   rbcS FALSE 0.117 217.000 0.000 1.000 N NA
 3459958 3459959 AM1_1783 AM1_1784 rbcS   TRUE 0.915 53.000 0.913 NA   NA
 3459959 3459960 AM1_1784 AM1_1785   rbcL TRUE 0.808 133.000 0.792 NA   NA
 3459962 3459963 AM1_1787 AM1_1788     FALSE 0.343 93.000 0.000 1.000   NA
 3459963 3459964 AM1_1788 AM1_1789   lnt FALSE 0.268 130.000 0.000 1.000   NA
 3459965 3459966 AM1_1790 AM1_1791     TRUE 0.894 62.000 0.148 NA   NA
 3459967 3459968 AM1_1792 AM1_1793 ion rpsJ TRUE 0.796 107.000 0.025 1.000   NA
 3459968 3459969 AM1_1793 AM1_1794 rpsJ tufB TRUE 0.907 145.000 0.318 1.000 Y NA
 3459969 3459970 AM1_1794 AM1_1795 tufB fusA TRUE 0.978 26.000 0.400 0.001 Y NA
 3459970 3459971 AM1_1795 AM1_1796 fusA rpsG TRUE 0.936 98.000 0.579 1.000 Y NA
 3459971 3459972 AM1_1796 AM1_1797 rpsG rpsL TRUE 0.875 210.000 0.620 0.002 Y NA
 3459972 3459973 AM1_1797 AM1_1798 rpsL   FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3459973 3459974 AM1_1798 AM1_1799   murB TRUE 0.745 132.000 0.030 NA   NA
 3459974 3459975 AM1_1799 AM1_1800 murB murC TRUE 0.981 -3.000 0.136 0.003 Y NA
 3459977 3459978 AM1_1802 AM1_1803     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3459979 3459980 AM1_1804 AM1_1805     FALSE 0.322 39.000 0.000 NA N NA
 3459980 3459981 AM1_1805 AM1_1806     FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3459981 3459982 AM1_1806 AM1_1808     FALSE 0.312 149.000 0.000 0.035   NA
 3459983 3459984 AM1_1807 AM1_1809   ccsB FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3459984 3459985 AM1_1809 AM1_1810 ccsB ccdA TRUE 0.965 34.000 0.371 NA Y NA
 3459985 3459986 AM1_1810 AM1_1811 ccdA   TRUE 0.910 51.000 0.202 1.000 N NA
 3459986 3459987 AM1_1811 AM1_1812     FALSE 0.295 110.000 0.000 1.000   NA
 3459989 3459990 AM1_1814 AM1_1815     FALSE 0.262 134.000 0.000 1.000   NA
 3459990 3459991 AM1_1815 AM1_1816     FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3459991 3459992 AM1_1816 AM1_1817     FALSE 0.363 -49.000 0.000 NA   NA
 3459992 3459993 AM1_1817 AM1_1818     FALSE 0.375 -45.000 0.000 NA   NA
 3459993 3459994 AM1_1818 AM1_1819     FALSE 0.050 386.000 0.000 NA   NA
 3459994 3459995 AM1_1819 AM1_1820     TRUE 0.892 3.000 0.000 1.000 Y NA
 3459995 3459996 AM1_1820 AM1_1821     TRUE 0.977 10.000 0.115 NA Y NA
 3459997 3459998 AM1_1822 AM1_1823     FALSE 0.165 159.000 0.000 NA   NA
 3459999 3460000 AM1_1824 AM1_1825     TRUE 0.897 68.000 0.111 1.000   NA
 3460006 3460007 AM1_1831 AM1_1832 synA dacB TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3460008 3460009 AM1_1833 AM1_1834     FALSE 0.192 138.000 0.000 NA   NA
 3460009 3460010 AM1_1834 AM1_1835     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3460013 3460014 AM1_1837 AM1_1839     FALSE 0.263 133.000 0.000 1.000   NA
 3460016 3460017 AM1_1841 AM1_1842   cobF FALSE 0.053 551.000 0.000 1.000   NA
 3460019 3460020 AM1_1843 AM1_1845     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3460023 3460024 AM1_1848 AM1_1849     TRUE 0.589 3.000 0.000 1.000 N NA
 3460024 3460025 AM1_1849 AM1_1850     TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3460026 3460027 AM1_1851 AM1_1852     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3460027 3460028 AM1_1852 AM1_1853     FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3460028 3460029 AM1_1853 AM1_1854     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3460032 3460033 AM1_1857 AM1_1858     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3460033 3460034 AM1_1858 AM1_1859     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3460034 3460035 AM1_1859 AM1_1860     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3460035 3460036 AM1_1860 AM1_1861     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3460037 3460038 AM1_1862 AM1_1863     TRUE 0.868 52.000 0.007 NA   NA
 3460039 3460040 AM1_1864 AM1_1865   ilvB TRUE 0.949 11.000 0.118 1.000 N NA
 3460040 3460041 AM1_1865 AM1_1866 ilvB   FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3460041 3460042 AM1_1866 AM1_1867   gauB TRUE 0.649 180.000 0.019 NA   NA
 3460042 3460043 AM1_1867 AM1_1868 gauB trx FALSE 0.105 276.000 0.000 1.000   NA
 3460043 3460044 AM1_1868 AM1_1869 trx   FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3460044 3460045 AM1_1869 AM1_1870     FALSE 0.065 310.000 0.000 NA   NA
 3460048 3460049 AM1_1873 AM1_1874     FALSE 0.138 184.000 0.000 NA   NA
 3460049 3460050 AM1_1874 AM1_1875     FALSE 0.051 381.000 0.000 NA   NA
 3460050 3460051 AM1_1875 AM1_1876     FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3460051 3460052 AM1_1876 AM1_1877     FALSE 0.034 618.000 0.000 NA   NA
 3460053 3460054 AM1_1878 AM1_1879     FALSE 0.216 118.000 0.000 NA   NA
 3460054 3460055 AM1_1879 AM1_1880     FALSE 0.033 632.000 0.000 NA   NA
 3460055 3460056 AM1_1880 AM1_1881     TRUE 0.438 37.000 0.000 1.000 N NA
 3460060 3460061 AM1_1885 AM1_1886     TRUE 0.939 -3.000 0.117 NA   NA
 3460062 3460063 AM1_1887 AM1_1888     FALSE 0.082 256.000 0.000 NA   NA
 3460063 3460064 AM1_1888 AM1_1889     FALSE 0.059 339.000 0.000 NA   NA
 3460065 3460066 AM1_1890 AM1_1891     TRUE 0.501 39.000 0.000 1.000   NA
 3460067 3460068 AM1_1892 AM1_1893     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3460068 3460069 AM1_1893 AM1_1894     FALSE 0.235 118.000 0.000 1.000 N NA
 3460069 3460070 AM1_1894 AM1_1895     TRUE 0.528 30.000 0.000 1.000   NA
 3460070 3460071 AM1_1895 AM1_1896     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3460071 3460072 AM1_1896 AM1_1897     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3460072 10702631 AM1_1897 AM1_1898     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 10702631 3460073 AM1_1898 AM1_1900     FALSE 0.035 593.000 0.000 NA   NA
 3460073 3460074 AM1_1900 AM1_1901     FALSE 0.291 114.000 0.000 1.000   NA
 3460074 3460075 AM1_1901 AM1_1902     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3460075 3460076 AM1_1902 AM1_1903     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3460076 3460077 AM1_1903 AM1_1904     FALSE 0.096 231.000 0.000 NA   NA
 3460077 3460078 AM1_1904 AM1_1905     FALSE 0.389 -37.000 0.000 NA   NA
 3460078 3460079 AM1_1905 AM1_1906     FALSE 0.055 355.000 0.000 NA   NA
 3460079 3460080 AM1_1906 AM1_1907     TRUE 0.546 25.000 0.000 1.000   NA
 3460080 3460081 AM1_1907 AM1_1908     TRUE 0.446 66.000 0.000 1.000   NA
 3460081 3460082 AM1_1908 AM1_1909     TRUE 0.564 21.000 0.000 1.000   NA
 3460082 3460083 AM1_1909 AM1_1910     TRUE 0.587 35.000 0.000 0.085   NA
 3460083 3460084 AM1_1910 AM1_1911     TRUE 0.983 11.000 0.667 1.000 Y NA
 3460084 3460085 AM1_1911 AM1_1912     FALSE 0.048 454.000 0.000 1.000 N NA
 3460085 3460086 AM1_1912 AM1_1913     FALSE 0.051 381.000 0.000 NA   NA
 3460086 3460087 AM1_1913 AM1_1914     FALSE 0.137 185.000 0.000 NA   NA
 3460087 3460088 AM1_1914 AM1_1915   asnB FALSE 0.070 287.000 0.000 NA   NA
 3460088 3460089 AM1_1915 AM1_1916 asnB   TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3460089 3460090 AM1_1916 AM1_1917     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3460090 3460091 AM1_1917 AM1_1918     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3460091 3460092 AM1_1918 AM1_1919     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3460092 3460093 AM1_1919 AM1_1920     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3460093 3460094 AM1_1920 AM1_1921     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3460094 3460095 AM1_1921 AM1_1922     FALSE 0.184 189.000 0.000 1.000   NA
 3460097 3460098 AM1_1924 AM1_1925     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3460098 3460099 AM1_1925 AM1_1926     TRUE 0.946 -3.000 0.333 NA   NA
 3460099 3460100 AM1_1926 AM1_1927     FALSE 0.148 174.000 0.000 NA   NA
 3460101 3460102 AM1_1928 AM1_1930   trmB FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3460103 3460104 AM1_1929 AM1_1931 glgC   FALSE 0.301 89.000 0.000 1.000 N NA
 3460106 3460107 AM1_1933 AM1_1934 rpsF   FALSE 0.109 172.000 0.000 NA N NA
 3460107 3460108 AM1_1934 AM1_1935     FALSE 0.119 202.000 0.000 NA   NA
 3460108 3460109 AM1_1935 AM1_1936     FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3460109 3460110 AM1_1936 AM1_1937     TRUE 0.762 146.000 0.118 NA   NA
 3460111 3460112 AM1_1938 AM1_1939 glyA   TRUE 0.782 138.000 0.137 1.000 N NA
 3460114 3460115 AM1_1941 AM1_1942 cinA   TRUE 0.619 181.000 0.004 NA   NA
 3460115 3460116 AM1_1942 AM1_1943   aroQ TRUE 0.790 141.000 0.333 NA   NA
 3460116 3460117 AM1_1943 AM1_1944 aroQ   FALSE 0.291 114.000 0.000 1.000   NA
 3460117 3460118 AM1_1944 AM1_1945     FALSE 0.273 127.000 0.000 1.000   NA
 3460118 3460119 AM1_1945 AM1_1946   rimI TRUE 0.499 40.000 0.000 1.000   NA
 3460119 3460120 AM1_1946 AM1_1947 rimI clpC TRUE 0.598 229.000 0.032 1.000   NA
 3460120 3460121 AM1_1947 AM1_1948 clpC   FALSE 0.325 82.000 0.000 1.000 N NA
 3460121 3460122 AM1_1948 AM1_1949     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3460122 3460123 AM1_1949 AM1_1950   rlpA FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3460124 3460125 AM1_1951 AM1_1952     FALSE 0.046 427.000 0.000 NA   NA
 3460128 3460129 AM1_1955 AM1_1956     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3460129 3460130 AM1_1956 AM1_1957     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3460130 3460131 AM1_1957 AM1_1958   thiS TRUE 0.905 143.000 0.219 1.000 Y NA
 3460131 3460132 AM1_1958 AM1_1959 thiS hemH TRUE 0.509 183.000 0.000 1.000 Y NA
 3460133 3460134 AM1_1960 AM1_1961     FALSE 0.281 94.000 0.000 1.000 N NA
 3460135 3460136 AM1_1962 AM1_1963 ccp   TRUE 0.575 0.000 0.000 1.000 N NA
 3460136 3460137 AM1_1963 AM1_1964     FALSE 0.074 277.000 0.000 NA   NA
 3460137 3460138 AM1_1964 AM1_1965     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3460138 3460139 AM1_1965 AM1_1966     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3460140 3460141 AM1_1967 AM1_1968     TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3460144 3460145 AM1_1971 AM1_1972     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3460145 3460146 AM1_1972 AM1_1973     FALSE 0.231 155.000 0.000 1.000   NA
 3460146 3460147 AM1_1973 AM1_1974     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3460147 3460148 AM1_1974 AM1_1975     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3460148 3460149 AM1_1975 AM1_1976     FALSE 0.322 75.000 0.000 NA   NA
 3460149 3460150 AM1_1976 AM1_1978     FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3460151 3460152 AM1_1977 AM1_1979     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3460152 3460153 AM1_1979 AM1_1980     FALSE 0.124 198.000 0.000 NA   NA
 3460153 3460154 AM1_1980 AM1_1981     FALSE 0.075 275.000 0.000 NA   NA
 3460154 3460155 AM1_1981 AM1_1982     TRUE 0.930 16.000 0.054 NA   NA
 3460156 3460157 AM1_1983 AM1_1984 ribC   FALSE 0.100 224.000 0.000 NA   NA
 3460157 3460158 AM1_1984 AM1_1986     FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3460159 3460160 AM1_1985 AM1_1987     FALSE 0.342 125.000 0.000 0.084   NA
 3460160 3460161 AM1_1987 AM1_1988     TRUE 0.958 0.000 0.446 1.000   NA
 3460161 3460162 AM1_1988 AM1_1989     FALSE 0.206 125.000 0.000 NA   NA
 3460162 3460163 AM1_1989 AM1_1990     FALSE 0.148 174.000 0.000 NA   NA
 3460163 3460164 AM1_1990 AM1_1991     FALSE 0.033 662.000 0.000 NA   NA
 3460164 3460165 AM1_1991 AM1_1992     FALSE 0.041 480.000 0.000 NA   NA
 3460166 3460167 AM1_1993 AM1_1994     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3460167 3460168 AM1_1994 AM1_1995     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3460168 3460169 AM1_1995 AM1_1997     FALSE 0.411 -25.000 0.000 NA   NA
 3460170 3460171 AM1_1998 AM1_1999     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3460174 3460175 AM1_2002 AM1_2003     FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3460175 3460176 AM1_2003 AM1_2004     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3460177 3460178 AM1_2005 AM1_2006     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3460178 3460179 AM1_2006 AM1_2007     FALSE 0.421 -21.000 0.000 NA   NA
 3460179 3460180 AM1_2007 AM1_2008     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3460182 3460183 AM1_2009 AM1_2011     FALSE 0.083 340.000 0.000 1.000   NA
 3460183 3460184 AM1_2011 AM1_2012     TRUE 0.649 10.000 0.000 1.000   NA
 3460186 3460187 AM1_2014 AM1_2015 proA   TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3460188 3460189 AM1_2016 AM1_2017     FALSE 0.407 76.000 0.000 1.000   NA
 3460193 3460194 AM1_2021 AM1_2022   glgA FALSE 0.185 156.000 0.000 1.000 N NA
 3460194 3460195 AM1_2022 AM1_2023 glgA   FALSE 0.091 312.000 0.000 1.000   NA
 3460196 3460197 AM1_2024 AM1_2025 psbM   TRUE 0.766 160.000 0.139 1.000   NA
 3460199 3460200 AM1_2027 AM1_2028 rimM avtA TRUE 0.883 35.000 0.005 1.000 N NA
 3460202 3460203 AM1_2030 AM1_2031     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3460203 3460204 AM1_2031 AM1_2032     FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3460204 3460205 AM1_2032 AM1_2033     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3460205 3460206 AM1_2033 AM1_2034     TRUE 0.933 -3.000 0.054 NA   NA
 3460208 3460209 AM1_2035 AM1_2037     FALSE 0.197 132.000 0.000 NA   NA
 3460211 3460212 AM1_2039 AM1_2040     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3460212 3460213 AM1_2040 AM1_2041     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3460213 3460214 AM1_2041 AM1_2042     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3460214 3460215 AM1_2042 AM1_2043   topA FALSE 0.142 180.000 0.000 NA   NA
 3460220 3460221 AM1_2048 AM1_2049 panB hisH FALSE 0.274 96.000 0.000 1.000 N NA
 3460221 3460222 AM1_2049 AM1_2050 hisH   TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3460222 3460223 AM1_2050 AM1_2051     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3460224 3460225 AM1_2052 AM1_2053 petG   FALSE 0.057 1800.000 0.000 0.045   NA
 3460225 3460226 AM1_2053 AM1_2054     FALSE 0.195 149.000 0.000 1.000 N NA
 3460226 3460227 AM1_2054 AM1_2055     FALSE 0.035 588.000 0.000 NA   NA
 3460230 3460231 AM1_2058 AM1_2059   galE FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3460231 3460232 AM1_2059 AM1_2060 galE   TRUE 0.963 53.000 0.250 1.000 Y NA
 3460233 3460234 AM1_2061 AM1_2062 thrA   FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3460234 3460235 AM1_2062 AM1_2063     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3460235 3460236 AM1_2063 AM1_2064     FALSE 0.193 137.000 0.000 NA   NA
 3460237 3460238 AM1_2065 AM1_2066     FALSE 0.041 481.000 0.000 NA   NA
 3460240 3460241 AM1_2068 AM1_2069   serS FALSE 0.113 167.000 0.000 NA N NA
 3460241 3460242 AM1_2069 AM1_2070 serS sppA FALSE 0.105 232.000 0.000 1.000 N NA
 3460242 3460243 AM1_2070 AM1_2071 sppA   TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3460243 3460244 AM1_2071 AM1_2072     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3460247 3460248 AM1_2075 AM1_2076     FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3460249 3460250 AM1_2077 AM1_2078     TRUE 0.890 42.000 0.033 NA   NA
 3460251 3460252 AM1_2079 AM1_2080 appC   TRUE 0.986 8.000 0.738 0.022 Y NA
 3460252 3460253 AM1_2080 AM1_2081     TRUE 0.985 0.000 0.619 0.022 Y NA
 3460253 3460254 AM1_2081 AM1_2082     FALSE 0.110 212.000 0.000 NA   NA
 3460254 3460255 AM1_2082 AM1_2083     FALSE 0.098 228.000 0.000 NA   NA
 3460255 3460256 AM1_2083 AM1_2084     FALSE 0.041 539.000 0.000 1.000 N NA
 3460256 3460257 AM1_2084 AM1_2085   ccp TRUE 0.850 72.000 0.014 1.000 N NA
 3460257 3460258 AM1_2085 AM1_2086 ccp   FALSE 0.141 181.000 0.000 NA   NA
 3460258 3460259 AM1_2086 AM1_2087     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3460260 3460261 AM1_2088 AM1_2089     FALSE 0.032 693.000 0.000 NA   NA
 3460262 3460263 AM1_2090 AM1_2091   gnd FALSE 0.322 75.000 0.000 NA   NA
 3460264 3460265 AM1_2092 AM1_2093     FALSE 0.169 156.000 0.000 NA   NA
 3460265 3460266 AM1_2093 AM1_2094     FALSE 0.289 116.000 0.000 1.000   NA
 3460268 3460269 AM1_2096 AM1_2098     TRUE 0.929 26.000 0.333 NA   NA
 3460270 3460271 AM1_2097 AM1_2099     FALSE 0.120 159.000 0.000 NA N NA
 3460271 3460272 AM1_2099 AM1_2100     TRUE 0.945 15.000 0.303 NA   NA
 3460273 3460274 AM1_2101 AM1_2102     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3460275 3460276 AM1_2103 AM1_2104 malQ   TRUE 0.532 16.000 0.000 1.000 N NA
 3460277 3460278 AM1_2105 AM1_2106     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3460278 3460279 AM1_2106 AM1_2107     TRUE 0.473 -9.000 0.000 NA   NA
 3460281 3460282 AM1_2109 AM1_2111 rpoD   FALSE 0.156 225.000 0.000 0.039 N NA
 3460283 3460284 AM1_2110 AM1_2112     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3460284 3460285 AM1_2112 AM1_2113     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3460285 3460286 AM1_2113 AM1_2114   glgP TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3460287 3460288 AM1_2115 AM1_2116 msrB   FALSE 0.193 136.000 0.000 NA   NA
 3460288 3460289 AM1_2116 AM1_2117     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3460289 3460290 AM1_2117 AM1_2118   ilvN TRUE 0.903 56.000 0.065 1.000   NA
 3460291 3460292 AM1_2119 AM1_2120   psbX FALSE 0.044 445.000 0.000 NA   NA
 3460294 3460295 AM1_2122 AM1_2124 accC rplT FALSE 0.032 2514.000 0.000 1.000 N NA
 3460295 3460296 AM1_2124 AM1_2123 rplT rpmI TRUE 0.958 84.000 0.928 0.009 Y NA
 3460298 3460299 AM1_2126 AM1_2127 nuoM nuoL TRUE 0.965 -73.000 0.151 0.002 Y NA
 3460300 3460301 AM1_2128 AM1_2129     FALSE 0.090 242.000 0.000 NA   NA
 3460301 3460302 AM1_2129 AM1_2130   ftsH FALSE 0.060 333.000 0.000 NA   NA
 3460302 3460303 AM1_2130 AM1_2131 ftsH   FALSE 0.236 152.000 0.000 1.000   NA
 3460303 3460304 AM1_2131 AM1_2132     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3460304 3460305 AM1_2132 AM1_2133     FALSE 0.043 450.000 0.000 NA   NA
 3460305 3460306 AM1_2133 AM1_2134     TRUE 0.443 67.000 0.000 1.000   NA
 3460306 3460307 AM1_2134 AM1_2136     FALSE 0.077 363.000 0.000 1.000   NA
 3460308 3460309 AM1_2135 AM1_2137 mdh   TRUE 0.889 41.000 0.029 NA   NA
 3460309 3460310 AM1_2137 AM1_2138     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3460311 3460312 AM1_2139 AM1_2140     FALSE 0.065 309.000 0.000 NA   NA
 3460312 3460313 AM1_2140 AM1_2141     FALSE 0.103 221.000 0.000 NA   NA
 3460313 3460314 AM1_2141 AM1_2142     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3460314 3460315 AM1_2142 AM1_2143     FALSE 0.415 35.000 0.000 NA   NA
 3460315 3460316 AM1_2143 AM1_2144     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3460316 3460317 AM1_2144 AM1_2145     FALSE 0.216 118.000 0.000 NA   NA
 3460319 3460320 AM1_2147 AM1_2148     TRUE 0.956 38.000 0.019 1.000 Y NA
 3460320 3460321 AM1_2148 AM1_2149     TRUE 0.968 42.000 0.588 1.000 Y NA
 3460321 3460322 AM1_2149 AM1_2150     TRUE 0.680 305.000 0.015 1.000 Y NA
 3460324 3460325 AM1_2152 AM1_2153     FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3460327 3460328 AM1_2155 AM1_2156   sixA TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3460328 3460329 AM1_2156 AM1_2157 sixA gltA TRUE 0.860 87.000 0.171 1.000 N NA
 3460329 3460330 AM1_2157 AM1_2158 gltA ndhA TRUE 0.889 156.000 0.137 1.000 Y NA
 3460330 3460331 AM1_2158 AM1_2159 ndhA ndhI TRUE 0.962 72.000 0.242 0.005 Y NA
 3460331 3460332 AM1_2159 AM1_2160 ndhI ndhG TRUE 0.985 4.000 0.192 0.005 Y NA
 3460332 3460333 AM1_2160 AM1_2161 ndhG ndhE TRUE 0.973 45.000 0.506 0.002 Y NA
 3460333 3460334 AM1_2161 AM1_2162 ndhE   FALSE 0.382 83.000 0.000 1.000   NA
 3460334 3460335 AM1_2162 AM1_2163   uvrA TRUE 0.457 62.000 0.000 1.000   NA
 3460335 3460336 AM1_2163 AM1_2164 uvrA   FALSE 0.287 118.000 0.000 1.000   NA
 3460336 3460337 AM1_2164 AM1_2165     TRUE 0.655 4.000 0.000 1.000   NA
 3460338 3460339 AM1_2166 AM1_2167 psbA   TRUE 0.725 142.000 0.003 1.000   NA
 3460339 3460340 AM1_2167 AM1_2168     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3460341 3460342 AM1_2169 AM1_2170     FALSE 0.277 124.000 0.000 1.000   NA
 3460342 3460343 AM1_2170 AM1_2171     TRUE 0.738 148.000 0.039 1.000 N NA
 3460344 3460345 AM1_2172 AM1_2173 purD   TRUE 0.429 71.000 0.000 1.000   NA
 3460345 3460346 AM1_2173 AM1_2174     TRUE 0.898 45.000 0.062 NA   NA
 3460350 3460351 AM1_2178 AM1_2179     FALSE 0.230 165.000 0.000 0.099 N NA
 3460354 3460355 AM1_2182 AM1_2183 gidA   FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3460355 3460356 AM1_2183 AM1_2184     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3460356 3460357 AM1_2184 AM1_2185   algI FALSE 0.178 149.000 0.000 NA   NA
 3460357 3460358 AM1_2185 AM1_2186 algI   TRUE 0.862 87.000 0.250 NA   NA
 3460358 3460359 AM1_2186 AM1_2187     FALSE 0.374 58.000 0.000 NA   NA
 3460359 3460360 AM1_2187 AM1_2188   rfbF FALSE 0.146 176.000 0.000 NA   NA
 3460360 3460361 AM1_2188 AM1_2189 rfbF   TRUE 0.982 0.000 0.624 1.000 Y NA
 3460361 3460362 AM1_2189 AM1_2190   rfbC TRUE 0.958 34.000 0.021 1.000 Y NA
 3460362 3460363 AM1_2190 AM1_2191 rfbC   TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3460363 3460364 AM1_2191 AM1_2192     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3460364 3460365 AM1_2192 AM1_2193     FALSE 0.116 205.000 0.000 NA   NA
 3460365 3460366 AM1_2193 AM1_2194   kdsB TRUE 0.971 -3.000 0.020 1.000 Y NA
 3460366 3460367 AM1_2194 AM1_2195 kdsB kdsA TRUE 0.977 -3.000 0.032 0.025 Y NA
 3460367 3460368 AM1_2195 AM1_2196 kdsA kdsC TRUE 0.944 0.000 0.032 1.000   NA
 3460368 3460369 AM1_2196 AM1_2197 kdsC   TRUE 0.664 23.000 0.000 0.003   NA
 3460369 3460370 AM1_2197 AM1_2198     TRUE 0.718 87.000 0.000 1.000 Y NA
 3460370 3460371 AM1_2198 AM1_2199     FALSE 0.247 107.000 0.000 1.000 N NA
 3460371 3460372 AM1_2199 AM1_2200     FALSE 0.175 163.000 0.000 1.000 N NA
 3460372 3460373 AM1_2200 AM1_2202     FALSE 0.341 77.000 0.000 1.000 N NA
 3460374 3460375 AM1_2201 AM1_2203     FALSE 0.141 181.000 0.000 NA   NA
 3460377 3460378 AM1_2205 AM1_2206     FALSE 0.045 437.000 0.000 NA   NA
 3460378 3460379 AM1_2206 AM1_2207     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3460379 3460380 AM1_2207 AM1_2208     FALSE 0.170 155.000 0.000 NA   NA
 3460380 3460381 AM1_2208 AM1_2209     FALSE 0.124 198.000 0.000 NA   NA
 3460381 3460382 AM1_2209 AM1_2210     FALSE 0.326 97.000 0.000 1.000   NA
 3460383 3460384 AM1_2211 AM1_2212     FALSE 0.056 350.000 0.000 NA   NA
 3460385 3460386 AM1_2213 AM1_2214     FALSE 0.031 776.000 0.000 NA   NA
 3460386 3460387 AM1_2214 AM1_2215     FALSE 0.109 214.000 0.000 NA   NA
 3460387 3460388 AM1_2215 AM1_2216   rfc FALSE 0.221 112.000 0.000 NA   NA
 3460388 3460389 AM1_2216 AM1_2217 rfc   TRUE 0.472 6.000 0.000 NA N NA
 3460390 3460391 AM1_2218 AM1_2219     FALSE 0.133 190.000 0.000 NA   NA
 3460391 3460392 AM1_2219 AM1_2220     FALSE 0.097 229.000 0.000 NA   NA
 3460394 3460395 AM1_2222 AM1_2223     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3460395 3460396 AM1_2223 AM1_2224     TRUE 0.938 -10.000 1.000 NA   NA
 3460398 3460399 AM1_2226 AM1_2227     FALSE 0.049 401.000 0.000 NA   NA
 3460399 3460400 AM1_2227 AM1_2228     TRUE 0.929 31.000 0.791 NA   NA
 3460400 3460401 AM1_2228 AM1_2229     TRUE 0.961 10.000 0.660 1.000   NA
 3460401 3460402 AM1_2229 AM1_2230     TRUE 0.920 71.000 0.623 0.058   NA
 3460402 3460403 AM1_2230 AM1_2232   thiL TRUE 0.960 0.000 0.944 1.000   NA
 3460404 3460405 AM1_2231 AM1_2233     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3460405 3460406 AM1_2233 AM1_2234     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3460406 3460407 AM1_2234 AM1_2235     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3460407 3460408 AM1_2235 AM1_2236     TRUE 0.433 30.000 0.000 NA   NA
 3460408 3460409 AM1_2236 AM1_2237     TRUE 0.972 41.000 0.564 0.090 Y NA
 3460412 3460413 AM1_2240 AM1_2241     FALSE 0.071 282.000 0.000 NA   NA
 3460413 3460414 AM1_2241 AM1_2242     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3460415 3460416 AM1_2243 AM1_2244     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3460417 3460418 AM1_2245 AM1_2246     FALSE 0.350 74.000 0.000 1.000 N NA
 3460418 3460419 AM1_2246 AM1_2247     FALSE 0.333 34.000 0.000 NA N NA
 3460419 3460420 AM1_2247 AM1_2248     TRUE 0.428 -3.000 0.000 NA N NA
 3460420 3460421 AM1_2248 AM1_2249     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3460421 3460422 AM1_2249 AM1_2251   grxC FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3460423 3460424 AM1_2250 AM1_2252     FALSE 0.075 274.000 0.000 NA   NA
 3460427 3460428 AM1_2255 AM1_2256     FALSE 0.072 279.000 0.000 NA   NA
 3460429 3460430 AM1_2257 AM1_2258     FALSE 0.360 -85.000 0.000 NA   NA
 3460430 3460431 AM1_2258 AM1_2259     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3460432 3460433 AM1_2260 AM1_2261     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 3460433 3460434 AM1_2261 AM1_2263     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3460436 3460437 AM1_2264 AM1_2265 rpoZ   TRUE 0.924 -3.000 0.021 NA   NA
 3460437 3460438 AM1_2265 AM1_2266     TRUE 0.954 10.000 0.357 NA   NA
 3460438 3460439 AM1_2266 AM1_2267     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3460439 3460440 AM1_2267 AM1_2269     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3460440 3460441 AM1_2269 AM1_2270     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3460441 3460442 AM1_2270 AM1_2271     FALSE 0.120 201.000 0.000 NA   NA
 3460442 3460443 AM1_2271 AM1_2272     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3460443 3460444 AM1_2272 AM1_2273     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3460447 3460448 AM1_2276 AM1_2277     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3460448 3460449 AM1_2277 AM1_2278     FALSE 0.029 1265.000 0.000 NA   NA
 3460449 3460450 AM1_2278 AM1_2279     FALSE 0.411 -25.000 0.000 NA   NA
 3460451 3460452 AM1_2280 AM1_2281     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3460453 3460454 AM1_2282 AM1_2283 glgC glpX TRUE 0.743 79.000 0.000 1.000 Y NA
 3460454 3460455 AM1_2283 AM1_2284 glpX   FALSE 0.281 88.000 0.000 NA   NA
 3460455 3460456 AM1_2284 AM1_2285     FALSE 0.038 519.000 0.000 NA   NA
 3460456 10702632 AM1_2285 AM1_2286     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3460457 3460458 AM1_2287 AM1_2288     FALSE 0.050 388.000 0.000 NA   NA
 3460458 3460459 AM1_2288 AM1_2289     FALSE 0.041 487.000 0.000 NA   NA
 3460461 3460462 AM1_2291 AM1_2292   dnaX FALSE 0.043 461.000 0.000 NA   NA
 3460463 3460464 AM1_2293 AM1_2294     FALSE 0.124 210.000 0.000 1.000 N NA
 3460464 3460465 AM1_2294 AM1_2295   acsF FALSE 0.209 170.000 0.000 1.000   NA
 3460467 3460468 AM1_2297 AM1_2298     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3460468 3460469 AM1_2298 AM1_2299     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3460470 3460471 AM1_2300 AM1_2301     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3460471 3460472 AM1_2301 AM1_2302     TRUE 0.732 192.000 0.048 0.002   NA
 3460472 3460473 AM1_2302 AM1_2303     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3460473 3460474 AM1_2303 AM1_2304     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3460474 3460475 AM1_2304 AM1_2305     FALSE 0.046 430.000 0.000 NA   NA
 3460476 3460477 AM1_2306 AM1_2307   ppa FALSE 0.238 151.000 0.000 1.000   NA
 3460477 3460478 AM1_2307 AM1_2308 ppa   FALSE 0.050 392.000 0.000 NA   NA
 3460482 3460483 AM1_2312 AM1_2313     TRUE 0.932 1.000 0.016 NA   NA
 3460483 3460484 AM1_2313 AM1_2314   metG TRUE 0.777 105.000 0.027 NA   NA
 3460484 3460485 AM1_2314 AM1_2315 metG   FALSE 0.240 159.000 0.000 0.098 N NA
 3460485 3460486 AM1_2315 AM1_2316     FALSE 0.164 160.000 0.000 NA   NA
 3460486 3460487 AM1_2316 AM1_2317     FALSE 0.322 75.000 0.000 NA   NA
 3460487 3460488 AM1_2317 AM1_2318     TRUE 0.961 52.000 0.500 NA Y NA
 3460491 3460492 AM1_2321 AM1_2322 proS   FALSE 0.066 303.000 0.000 NA   NA
 3460492 3460493 AM1_2322 AM1_2323     FALSE 0.130 192.000 0.000 NA   NA
 3460497 3460498 AM1_2327 AM1_2328     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3460498 3460499 AM1_2328 AM1_2329     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3460500 3460501 AM1_2330 AM1_2331 clpP clpP TRUE 0.974 45.000 0.745 0.001 Y NA
 3460502 3460503 AM1_2332 AM1_2333     TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3460504 3460505 AM1_2334 AM1_2335     TRUE 0.937 16.000 0.143 NA   NA
 3460507 3460508 AM1_2337 AM1_2338     TRUE 0.598 16.000 0.000 1.000   NA
 3460508 3460509 AM1_2338 AM1_2339     TRUE 0.746 137.000 0.037 NA   NA
 3460510 3460511 AM1_2340 AM1_2341 rpoD sfsA FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3460511 3460512 AM1_2341 AM1_2343 sfsA   FALSE 0.192 138.000 0.000 NA   NA
 3460513 3460514 AM1_2342 AM1_2344   exsB TRUE 0.867 66.000 0.005 1.000   NA
 3460517 3460518 AM1_2347 AM1_2348     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3460520 3460521 AM1_2350 AM1_2351     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3460521 3460522 AM1_2351 AM1_2352     TRUE 0.457 62.000 0.000 1.000   NA
 3460522 3460523 AM1_2352 AM1_2353     FALSE 0.213 88.000 0.000 NA N NA
 3460523 3460524 AM1_2353 AM1_2354     TRUE 0.969 -10.000 0.202 NA Y NA
 3460524 3460525 AM1_2354 AM1_2355     FALSE 0.095 232.000 0.000 NA   NA
 3460526 3460527 AM1_2356 AM1_2357   kmo FALSE 0.038 511.000 0.000 NA   NA
 3460527 3460528 AM1_2357 AM1_2358 kmo panD TRUE 0.696 93.000 0.000 1.000 Y NA
 3460529 3460530 AM1_2359 AM1_2360     TRUE 0.945 -3.000 0.273 NA   NA
 3460530 3460531 AM1_2360 AM1_2361   moxR TRUE 0.932 -3.000 0.047 NA   NA
 3460531 3460532 AM1_2361 AM1_2362 moxR   TRUE 0.948 -3.000 0.648 NA   NA
 3460532 3460533 AM1_2362 AM1_2363     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3460533 3460534 AM1_2363 AM1_2364     FALSE 0.091 239.000 0.000 NA   NA
 3460534 3460535 AM1_2364 AM1_2365     FALSE 0.130 192.000 0.000 NA   NA
 3460535 3460536 AM1_2365 AM1_2366   tuaD TRUE 0.926 107.000 0.291 1.000 Y NA
 3460537 3460538 AM1_2367 AM1_2368     FALSE 0.192 138.000 0.000 NA   NA
 3460541 3460542 AM1_2371 AM1_2372     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3460544 3460545 AM1_2374 AM1_2375   glmS TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3460548 3460549 AM1_2378 AM1_2379     TRUE 0.490 48.000 0.000 1.000   NA
 3460549 3460550 AM1_2379 AM1_2380     FALSE 0.339 94.000 0.000 1.000   NA
 3460551 3460552 AM1_2381 AM1_2382     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3460552 3460553 AM1_2382 AM1_2383   nrd FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3460553 3460554 AM1_2383 AM1_2385 nrd nrdE FALSE 0.415 35.000 0.000 NA   NA
 3460555 3460556 AM1_2384 AM1_2386 pgp cruP FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3460556 3460557 AM1_2386 AM1_2387 cruP   FALSE 0.325 37.000 0.000 NA N NA
 3460557 3460558 AM1_2387 AM1_2388     FALSE 0.035 583.000 0.000 NA   NA
 3460559 3460560 AM1_2389 AM1_2390     FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3460560 3460561 AM1_2390 AM1_2391   phkA FALSE 0.105 218.000 0.000 NA   NA
 3460562 3460563 AM1_2392 AM1_2393   tpm FALSE 0.378 84.000 0.000 1.000   NA
 3460563 3460564 AM1_2393 AM1_2394 tpm nmrA TRUE 0.622 14.000 0.000 1.000   NA
 3460564 3460565 AM1_2394 AM1_2395 nmrA   FALSE 0.191 139.000 0.000 NA   NA
 3460565 3460566 AM1_2395 AM1_2396     FALSE 0.040 490.000 0.000 NA   NA
 3460566 3460567 AM1_2396 AM1_2397     TRUE 0.504 74.000 0.000 0.028   NA
 3460567 3460568 AM1_2397 AM1_2398     FALSE 0.394 -34.000 0.000 NA   NA
 3460573 3460574 AM1_2403 AM1_2404     TRUE 0.879 -6.000 0.000 0.089 Y NA
 10702633 3460577 AM1_2407 AM1_2409     FALSE 0.031 722.000 0.000 NA   NA
 3460577 3460578 AM1_2409 AM1_2410     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3460578 3460579 AM1_2410 AM1_2411     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3460579 3460580 AM1_2411 AM1_2412     TRUE 0.917 26.000 0.087 NA   NA
 3460580 3460581 AM1_2412 AM1_2413   tktA FALSE 0.060 332.000 0.000 NA   NA
 3460581 3460582 AM1_2413 AM1_2414 tktA adk FALSE 0.106 231.000 0.000 1.000 N NA
 3460584 3460585 AM1_2416 AM1_2417   cysK FALSE 0.183 190.000 0.000 1.000   NA
 3460585 3460586 AM1_2417 AM1_2418 cysK   TRUE 0.874 73.000 0.235 NA N NA
 3460586 3460587 AM1_2418 AM1_2419   pilD FALSE 0.164 113.000 0.000 NA N NA
 3460587 3460588 AM1_2419 AM1_2420 pilD   TRUE 0.749 131.000 0.033 NA   NA
 3460589 3460590 AM1_2421 AM1_2422   phhB FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3460590 3460591 AM1_2422 AM1_2423 phhB gidB TRUE 0.484 24.000 0.000 1.000 N NA
 3460592 3460593 AM1_2424 AM1_2425     FALSE 0.067 297.000 0.000 NA   NA
 3460594 3460595 AM1_2426 AM1_2427     FALSE 0.061 326.000 0.000 NA   NA
 3460596 3460597 AM1_2428 AM1_2429 phrB   TRUE 0.589 3.000 0.000 1.000 N NA
 3460597 3460598 AM1_2429 AM1_2430     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3460598 3460599 AM1_2430 AM1_2431     FALSE 0.047 424.000 0.000 NA   NA
 3460599 3460600 AM1_2431 AM1_2432     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3460600 3460601 AM1_2432 AM1_2433     TRUE 0.905 -28.000 0.109 NA   NA
 3460601 3460602 AM1_2433 AM1_2434     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3460604 3460605 AM1_2436 AM1_2437 ftsH   FALSE 0.386 82.000 0.000 1.000   NA
 3460605 3460606 AM1_2437 AM1_2438     FALSE 0.102 279.000 0.000 1.000   NA
 3460607 3460608 AM1_2439 AM1_2440   dnaK FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3460608 3460609 AM1_2440 AM1_2441 dnaK   FALSE 0.065 432.000 0.000 1.000   NA
 3460611 3460612 AM1_2443 AM1_2444   thiD FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3460612 3460613 AM1_2444 AM1_2445 thiD   FALSE 0.052 372.000 0.000 NA   NA
 3460613 3460614 AM1_2445 AM1_2446     FALSE 0.168 157.000 0.000 NA   NA
 3460614 3460615 AM1_2446 AM1_2448     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3460616 3460617 AM1_2447 AM1_2449     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3460617 3460618 AM1_2449 AM1_2450     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3460618 3460619 AM1_2450 AM1_2451     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3460620 3460621 AM1_2452 AM1_2453     TRUE 0.524 31.000 0.000 1.000   NA
 3460622 3460623 AM1_2454 AM1_2455     FALSE 0.203 128.000 0.000 NA   NA
 3460623 3460624 AM1_2455 AM1_2456     FALSE 0.171 154.000 0.000 NA   NA
 3460625 3460626 AM1_2457 AM1_2458 psaA psaB TRUE 0.948 23.000 0.154 0.001   NA
 3460627 3460628 AM1_2459 AM1_2460     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3460628 3460629 AM1_2460 AM1_2461     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3460630 3460631 AM1_2462 AM1_2463     FALSE 0.219 86.000 0.000 NA N NA
 3460631 3460632 AM1_2463 AM1_2464     FALSE 0.032 1128.000 0.000 1.000 N NA
 3460633 3460634 AM1_2465 AM1_2466     TRUE 0.875 75.000 0.146 NA   NA
 3460635 3460636 AM1_2467 AM1_2468     FALSE 0.426 46.000 0.000 1.000 N NA
 3460639 3460640 AM1_2471 AM1_2472     TRUE 0.545 -13.000 0.000 1.000   NA
 3460640 3460641 AM1_2472 AM1_2473     FALSE 0.197 179.000 0.000 1.000   NA
 3460642 3460643 AM1_2474 AM1_2475     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3460643 3460644 AM1_2475 AM1_2476     FALSE 0.091 313.000 0.000 1.000   NA
 3460644 3460645 AM1_2476 AM1_2477     TRUE 0.879 -6.000 0.000 0.088 Y NA
 3460645 3460646 AM1_2477 AM1_2478     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3460646 3460647 AM1_2478 AM1_2479     FALSE 0.171 154.000 0.000 NA   NA
 3460647 3460648 AM1_2479 AM1_2480     TRUE 0.780 156.000 0.085 0.006 N NA
 3460650 3460651 AM1_2482 AM1_2483   miaE TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3460651 3460652 AM1_2483 AM1_2484 miaE   TRUE 0.846 92.000 0.176 NA   NA
 3460652 3460653 AM1_2484 AM1_2485     FALSE 0.069 292.000 0.000 NA   NA
 3460654 3460655 AM1_2486 AM1_2487     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3460655 3460656 AM1_2487 AM1_2488     FALSE 0.134 189.000 0.000 NA   NA
 3460656 3460657 AM1_2488 AM1_2489     TRUE 0.801 94.000 0.024 NA   NA
 3460658 3460659 AM1_2490 AM1_2491     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3460659 3460660 AM1_2491 AM1_2492     TRUE 0.473 5.000 0.000 NA N NA
 3460660 3460661 AM1_2492 AM1_2493     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3460661 3460662 AM1_2493 AM1_2494     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3460662 3460663 AM1_2494 AM1_2495   trx TRUE 0.905 46.000 0.124 NA   NA
 3460663 3460664 AM1_2495 AM1_2496 trx nuoL TRUE 0.828 182.000 0.009 1.000 Y NA
 3460664 3460665 AM1_2496 AM1_2497 nuoL ndhM TRUE 0.963 57.000 0.050 0.002 Y NA
 3460665 3460666 AM1_2497 AM1_2498 ndhM   FALSE 0.073 278.000 0.000 NA   NA
 3460666 3460667 AM1_2498 AM1_2499     FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3460670 3460671 AM1_2501 AM1_2503 mutM psaE TRUE 0.889 42.000 0.006 1.000   NA
 3460671 3460672 AM1_2503 AM1_2504 psaE sasA FALSE 0.236 152.000 0.000 1.000   NA
 3460672 3460673 AM1_2504 AM1_2505 sasA   FALSE 0.141 181.000 0.000 NA   NA
 3460673 3460674 AM1_2505 AM1_2506     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3460674 3460675 AM1_2506 AM1_2507     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3460676 3460677 AM1_2508 AM1_2509     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3460678 3460679 AM1_2510 AM1_2511     FALSE 0.062 320.000 0.000 NA   NA
 3460679 3460680 AM1_2511 AM1_2512   dnaE FALSE 0.199 131.000 0.000 NA   NA
 3460680 3460681 AM1_2512 AM1_2513 dnaE   FALSE 0.389 -37.000 0.000 NA   NA
 3460682 3460683 AM1_2514 AM1_2515     FALSE 0.072 279.000 0.000 NA   NA
 3460683 3460684 AM1_2515 AM1_2516     TRUE 0.818 108.000 0.222 NA   NA
 3460684 3460685 AM1_2516 AM1_2517     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3460686 3460687 AM1_2518 AM1_2519     FALSE 0.117 255.000 0.000 1.000   NA
 3460687 3460688 AM1_2519 AM1_2520     TRUE 0.652 8.000 0.000 1.000   NA
 3460688 3460689 AM1_2520 AM1_2521     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3460690 3460691 AM1_2522 AM1_2523     FALSE 0.411 -25.000 0.000 NA   NA
 3460693 3460694 AM1_2525 AM1_2526     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3460694 3460695 AM1_2526 AM1_2527   mpg FALSE 0.037 539.000 0.000 NA   NA
 3460695 3460696 AM1_2527 AM1_2528 mpg umuD FALSE 0.042 476.000 0.000 NA   NA
 3460696 3460697 AM1_2528 AM1_2529 umuD umuC FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3460700 3460701 AM1_2531 AM1_2533     FALSE 0.389 51.000 0.000 NA   NA
 3460701 3460702 AM1_2533 AM1_2534     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3460702 3460703 AM1_2534 AM1_2535     FALSE 0.062 320.000 0.000 NA   NA
 3460703 3460704 AM1_2535 AM1_2536     FALSE 0.058 491.000 0.000 1.000   NA
 3460705 3460706 AM1_2537 AM1_2538     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3460708 3460709 AM1_2540 AM1_2541     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3460710 3460711 AM1_2542 AM1_2543     TRUE 0.554 30.000 0.000 0.080 N NA
 3460713 3460714 AM1_2544 AM1_2546     FALSE 0.064 313.000 0.000 NA   NA
 3460714 3460715 AM1_2546 AM1_2547     FALSE 0.070 289.000 0.000 NA   NA
 3460717 3460718 AM1_2549 AM1_2550     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3460718 3460719 AM1_2550 AM1_2551     TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3460719 3460720 AM1_2551 AM1_2552     FALSE 0.077 267.000 0.000 NA   NA
 3460720 3460721 AM1_2552 AM1_2553     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3460721 3460722 AM1_2553 AM1_2554     FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3460722 3460723 AM1_2554 AM1_2555     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3460725 3460726 AM1_2557 AM1_2558   hisI TRUE 0.589 3.000 0.000 1.000 N NA
 3460727 3460728 AM1_2559 AM1_2560     FALSE 0.090 242.000 0.000 NA   NA
 3460729 3460730 AM1_2561 AM1_2562 trx dnaG FALSE 0.213 134.000 0.000 1.000 N NA
 3460731 3460732 AM1_2563 AM1_2564     FALSE 0.263 93.000 0.000 NA   NA
 3460732 3460733 AM1_2564 AM1_2565     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3460733 3460734 AM1_2565 AM1_2566     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3460734 3460735 AM1_2566 AM1_2567     TRUE 0.927 33.000 0.200 1.000   NA
 3460735 3460736 AM1_2567 AM1_2568     TRUE 0.912 53.000 0.429 NA   NA
 3460736 3460737 AM1_2568 AM1_2569     TRUE 0.822 108.000 0.286 NA   NA
 3460739 3460740 AM1_2571 AM1_2572   devC TRUE 0.891 -3.000 0.000 0.080 Y NA
 3460740 3460741 AM1_2572 AM1_2573 devC   TRUE 0.893 4.000 0.000 1.000 Y NA
 3460741 3460742 AM1_2573 AM1_2574   lepB FALSE 0.039 598.000 0.000 1.000 N NA
 3460742 3460743 AM1_2574 AM1_2575 lepB   TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3460746 3460747 AM1_2578 AM1_2579     TRUE 0.786 110.000 0.050 NA   NA
 3460748 3460749 AM1_2580 AM1_2581 rpoE   TRUE 0.734 173.000 0.250 NA   NA
 3460750 3460751 AM1_2582 AM1_2583   dcm FALSE 0.389 51.000 0.000 NA   NA
 3460751 3460752 AM1_2583 AM1_2584 dcm   TRUE 0.932 -7.000 0.156 NA   NA
 3460752 3460753 AM1_2584 AM1_2585     FALSE 0.138 184.000 0.000 NA   NA
 3460755 3460756 AM1_2588 AM1_2589     FALSE 0.129 193.000 0.000 NA   NA
 3460756 3460757 AM1_2589 AM1_2590     FALSE 0.106 275.000 0.000 1.000   NA
 3460757 3460758 AM1_2590 AM1_2591     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3460758 3460759 AM1_2591 AM1_2592     FALSE 0.394 -34.000 0.000 NA   NA
 3460760 3460761 AM1_2593 AM1_2594     FALSE 0.086 330.000 0.000 1.000   NA
 3460761 3460762 AM1_2594 AM1_2595   ddl FALSE 0.190 184.000 0.000 1.000   NA
 3460762 3460763 AM1_2595 AM1_2596 ddl   TRUE 0.646 -3.000 0.000 0.035 N NA
 3460764 3460765 AM1_2597 AM1_2598 vanW mdh TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3460765 3460766 AM1_2598 AM1_2599 mdh   TRUE 0.428 -3.000 0.000 NA N NA
 3460767 3460768 AM1_2600 AM1_2601     TRUE 0.924 -16.000 0.250 NA   NA
 3460768 3460769 AM1_2601 AM1_2602     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3460770 3460771 AM1_2603 AM1_2604     TRUE 0.928 -19.000 0.875 NA   NA
 3460772 3460773 AM1_2605 AM1_2606     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3460773 3460774 AM1_2606 AM1_2607     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3460775 3460776 AM1_2608 AM1_2609     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3460776 3460777 AM1_2609 AM1_2610     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3460779 3460780 AM1_2612 AM1_2613 purL purF TRUE 0.944 86.000 0.223 1.000 Y NA
 3460781 3460782 AM1_2614 AM1_2615   valS TRUE 0.655 5.000 0.000 1.000   NA
 3460783 3460784 AM1_2616 AM1_2617     FALSE 0.062 450.000 0.000 1.000   NA
 3460786 3460787 AM1_2619 AM1_2620   cmk FALSE 0.157 209.000 0.000 1.000   NA
 3460787 3460788 AM1_2620 AM1_2621 cmk   FALSE 0.188 154.000 0.000 1.000 N NA
 3460788 3460789 AM1_2621 AM1_2622   cruP FALSE 0.063 244.000 0.000 NA N NA
 3460789 3460790 AM1_2622 AM1_2623 cruP   FALSE 0.217 117.000 0.000 NA   NA
 3460790 3460791 AM1_2623 AM1_2624     FALSE 0.215 119.000 0.000 NA   NA
 3460794 3460795 AM1_2626 AM1_2628 bioD   TRUE 0.556 23.000 0.000 1.000   NA
 3460795 3460796 AM1_2628 AM1_2629   psbJ FALSE 0.061 463.000 0.000 1.000   NA
 3460796 3460797 AM1_2629 AM1_6425 psbJ psbL TRUE 0.899 92.000 0.878 0.002   NA
 3460797 3460798 AM1_6425 AM1_2630 psbL psbE TRUE 0.792 153.000 0.047 0.002   NA
 3460798 3460799 AM1_2630 AM1_2631 psbE   TRUE 0.808 131.000 0.625 NA   NA
 3460799 3460800 AM1_2631 AM1_2632   rubR TRUE 0.829 109.000 0.521 NA   NA
 3460803 3460804 AM1_2634 AM1_2635   cbiT TRUE 0.924 26.000 0.130 1.000 N NA
 3460804 3460805 AM1_2635 AM1_2636 cbiT   FALSE 0.033 644.000 0.000 NA   NA
 3460805 3460806 AM1_2636 AM1_2637   pgl TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3460806 3460807 AM1_2637 AM1_2638 pgl   TRUE 0.451 347.000 0.076 NA   NA
 3460807 3460808 AM1_2638 AM1_2639     TRUE 0.951 5.000 0.154 NA   NA
 3460808 3460809 AM1_2639 AM1_2640     FALSE 0.292 113.000 0.000 1.000   NA
 3460810 3460811 AM1_2641 AM1_2642     TRUE 0.952 12.000 0.400 NA   NA
 3460811 3460812 AM1_2642 AM1_2643     FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3460813 3460814 AM1_2644 AM1_2645 fusA   FALSE 0.098 226.000 0.000 NA   NA
 3460814 3460815 AM1_2645 AM1_2646     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3460816 3460817 AM1_2647 AM1_2648     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3460817 3460818 AM1_2648 AM1_2649     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3460819 3460820 AM1_2650 AM1_2651 surE   FALSE 0.291 114.000 0.000 1.000   NA
 3460820 3460821 AM1_2651 AM1_2652   ribF TRUE 0.887 39.000 0.003 1.000   NA
 3460821 3460822 AM1_2652 AM1_2653 ribF   TRUE 0.918 20.000 0.013 1.000   NA
 3460822 3460823 AM1_2653 AM1_2654     FALSE 0.087 248.000 0.000 NA   NA
 3460823 3460824 AM1_2654 AM1_2655   gidA FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3460824 3460825 AM1_2655 AM1_2656 gidA   FALSE 0.104 277.000 0.000 1.000   NA
 3460827 3460828 AM1_2658 AM1_2659     FALSE 0.413 16.000 0.000 NA N NA
 3460829 3460830 AM1_2660 AM1_2661     FALSE 0.157 121.000 0.000 NA N NA
 3460832 3460833 AM1_2663 AM1_2664     FALSE 0.118 161.000 0.000 NA N NA
 3460834 3460835 AM1_2665 AM1_2666     TRUE 0.573 61.000 0.000 0.003   NA
 3460835 3460836 AM1_2666 AM1_2667     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3460837 3460838 AM1_2670 AM1_2671     FALSE 0.061 326.000 0.000 NA   NA
 3460839 3460840 AM1_2672 AM1_2673     TRUE 0.744 8.000 0.000 0.006   NA
 3460841 3460842 AM1_2674 AM1_2675     TRUE 0.671 90.000 0.000 NA Y NA
 3460842 3460843 AM1_2675 AM1_2676     FALSE 0.110 212.000 0.000 NA   NA
 3460844 3460845 AM1_2678 AM1_2679     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3460846 3460847 AM1_2680 AM1_2681     TRUE 0.955 10.000 0.538 NA   NA
 3460847 3460848 AM1_2681 AM1_2682     FALSE 0.030 866.000 0.000 NA   NA
 3460848 3460849 AM1_2682 AM1_2684     FALSE 0.205 126.000 0.000 NA   NA
 3460851 3460852 AM1_2685 AM1_2686     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3460854 3460855 AM1_2688 AM1_2689     TRUE 0.908 53.000 0.263 NA   NA
 3460855 3460856 AM1_2689 AM1_2690     TRUE 0.841 96.000 0.250 NA   NA
 3460856 3460857 AM1_2690 AM1_2691     TRUE 0.876 80.000 0.292 NA   NA
 3460859 3460860 AM1_2693 AM1_2695   rpmB FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3460860 3460861 AM1_2695 AM1_2696 rpmB   TRUE 0.971 0.000 0.002 1.000 Y NA
 3460861 3460862 AM1_2696 AM1_2697     FALSE 0.355 73.000 0.000 1.000 N NA
 3460862 3460863 AM1_2697 AM1_2698     FALSE 0.207 189.000 0.000 0.036 N NA
 3460865 3460866 AM1_2700 AM1_2701     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3460866 3460867 AM1_2701 AM1_2702     TRUE 0.927 44.000 0.500 1.000   NA
 3460867 3460868 AM1_2702 AM1_2703     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3460868 3460869 AM1_2703 AM1_2704     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3460869 3460870 AM1_2704 AM1_2705     TRUE 0.794 140.000 0.400 NA   NA
 3460870 3460871 AM1_2705 AM1_2706     TRUE 0.918 59.000 0.400 1.000   NA
 3460871 3460872 AM1_2706 AM1_2707     FALSE 0.263 99.000 0.000 1.000 N NA
 3460872 3460873 AM1_2707 AM1_2708     TRUE 0.630 13.000 0.000 1.000   NA
 3460873 3460874 AM1_2708 AM1_2709     TRUE 0.454 63.000 0.000 1.000   NA
 3460874 3460875 AM1_2709 AM1_2710     FALSE 0.056 504.000 0.000 1.000   NA
 3460875 3460876 AM1_2710 AM1_2711     FALSE 0.413 74.000 0.000 1.000   NA
 3460877 3460878 AM1_2712 AM1_2713     TRUE 0.929 26.000 0.333 NA   NA
 3460881 3460882 AM1_2716 AM1_2717     FALSE 0.032 715.000 0.000 NA   NA
 3460884 3460885 AM1_2719 AM1_2721     FALSE 0.030 817.000 0.000 NA   NA
 3460887 3460888 AM1_2722 AM1_2723     FALSE 0.179 148.000 0.000 NA   NA
 3460888 3460889 AM1_2723 AM1_2724     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3460890 3460891 AM1_2725 AM1_2726     FALSE 0.059 336.000 0.000 NA   NA
 3460893 3460894 AM1_2728 AM1_2729     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3460895 3460896 AM1_2730 AM1_2732     FALSE 0.205 126.000 0.000 NA   NA
 3460898 3460899 AM1_2733 AM1_2734     FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3460899 3460900 AM1_2734 AM1_2735     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3460900 3460901 AM1_2735 AM1_2736     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3460901 3460902 AM1_2736 AM1_2737     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3460905 3460906 AM1_2740 AM1_2741     TRUE 0.954 10.000 0.444 NA   NA
 3460906 3460907 AM1_2741 AM1_2742     FALSE 0.054 362.000 0.000 NA   NA
 3460907 3460908 AM1_2742 AM1_2743     TRUE 0.888 31.000 0.009 NA   NA
 3460908 3460909 AM1_2743 AM1_2744     TRUE 0.982 0.000 0.153 0.036 Y NA
 3460909 3460910 AM1_2744 AM1_2745     FALSE 0.100 224.000 0.000 NA   NA
 3460910 3460911 AM1_2745 AM1_2746     FALSE 0.060 331.000 0.000 NA   NA
 3460912 3460913 AM1_2747 AM1_2748   acsA FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3460915 3460916 AM1_2750 AM1_2751     TRUE 0.927 -13.000 0.217 NA   NA
 3460918 3460919 AM1_2753 AM1_2754     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3460919 3460920 AM1_2754 AM1_2755     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3460920 3460921 AM1_2755 AM1_2756   petJ FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3460921 3460922 AM1_2756 AM1_2757 petJ   TRUE 0.546 25.000 0.000 1.000   NA
 3460922 3460923 AM1_2757 AM1_2758   pdxJ TRUE 0.499 40.000 0.000 1.000   NA
 3460925 3460926 AM1_2760 AM1_2761     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3460926 3460927 AM1_2761 AM1_2762     FALSE 0.060 333.000 0.000 NA   NA
 3460927 3460928 AM1_2762 AM1_2763     FALSE 0.185 144.000 0.000 NA   NA
 3460928 3460929 AM1_2763 AM1_2764     FALSE 0.104 219.000 0.000 NA   NA
 3460929 3460930 AM1_2764 AM1_2765     FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3460930 3460931 AM1_2765 AM1_2766   recN FALSE 0.104 219.000 0.000 NA   NA
 3460931 3460932 AM1_2766 AM1_2767 recN   FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3460932 3460933 AM1_2767 AM1_2768     TRUE 0.909 -27.000 0.143 NA   NA
 3460933 3460934 AM1_2768 AM1_2769     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3460936 3460937 AM1_2771 AM1_2772     FALSE 0.044 449.000 0.000 NA   NA
 3460937 3460938 AM1_2772 AM1_2773     FALSE 0.042 462.000 0.000 NA   NA
 3460938 3460939 AM1_2773 AM1_2774     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3460940 3460941 AM1_2775 AM1_2776     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3460944 3460945 AM1_2779 AM1_2780     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3460945 3460946 AM1_2780 AM1_2781     TRUE 0.638 12.000 0.000 1.000   NA
 3460946 3460947 AM1_2781 AM1_2782     FALSE 0.384 -40.000 0.000 NA   NA
 3460950 3460951 AM1_2785 AM1_2786     FALSE 0.031 757.000 0.000 NA   NA
 3460954 3460955 AM1_2789 AM1_2791     FALSE 0.157 208.000 0.000 1.000   NA
 3460957 3460958 AM1_2792 AM1_2793     FALSE 0.109 213.000 0.000 NA   NA
 3460958 3460959 AM1_2793 AM1_2794     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3460961 3460962 AM1_2796 AM1_2797     FALSE 0.046 483.000 0.000 1.000 N NA
 3460962 3460963 AM1_2797 AM1_2798   cyaA TRUE 0.583 18.000 0.000 1.000   NA
 3460964 3460965 AM1_2799 AM1_2800     TRUE 0.550 31.000 0.000 0.078 N NA
 3460965 3460966 AM1_2800 AM1_2801     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3460966 3460967 AM1_2801 AM1_2802   msrA FALSE 0.079 261.000 0.000 NA   NA
 3460968 3460969 AM1_2803 AM1_2804     FALSE 0.044 792.000 0.000 1.000   NA
 3460969 3460970 AM1_2804 AM1_2805     FALSE 0.191 183.000 0.000 1.000   NA
 3460971 3460972 AM1_2806 AM1_2807     FALSE 0.143 135.000 0.000 NA N NA
 3460972 3460973 AM1_2807 AM1_2808     FALSE 0.032 1125.000 0.000 1.000 N NA
 3460974 3460975 AM1_2809 AM1_2810     FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3460975 3460976 AM1_2810 AM1_2811     FALSE 0.220 113.000 0.000 NA   NA
 3460977 3460978 AM1_2812 AM1_2813     FALSE 0.087 263.000 0.000 1.000 N NA
 3460979 3460980 AM1_2814 AM1_2816     TRUE 0.579 53.000 0.000 0.013   NA
 3460983 3460984 AM1_2818 AM1_2819     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3460984 3460985 AM1_2819 AM1_2820     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3460986 3460987 AM1_2821 AM1_2822     FALSE 0.363 304.000 0.000 0.009 Y NA
 3460987 3460988 AM1_2822 AM1_2823     TRUE 0.744 89.000 0.000 0.094 Y NA
 3460990 3460991 AM1_2825 AM1_2826     FALSE 0.195 134.000 0.000 NA   NA
 3460991 3460992 AM1_2826 AM1_2827   ycf3 FALSE 0.168 157.000 0.000 NA   NA
 3460994 3460995 AM1_2829 AM1_2830     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3460995 3460996 AM1_2830 AM1_2831     FALSE 0.050 387.000 0.000 NA   NA
 3460996 3460997 AM1_2831 AM1_2832     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3460997 3460998 AM1_2832 AM1_2833   speB FALSE 0.064 443.000 0.000 1.000   NA
 3460998 3460999 AM1_2833 AM1_2834 speB hypA TRUE 0.948 4.000 0.035 1.000   NA
 3460999 3461000 AM1_2834 AM1_2835 hypA hypB TRUE 0.944 -16.000 0.215 0.002   NA
 3461000 3461001 AM1_2835 AM1_2836 hypB   TRUE 0.915 28.000 0.062 1.000 N NA
 3461001 3461002 AM1_2836 AM1_2837     TRUE 0.950 88.000 0.204 0.021 Y NA
 3461002 3461003 AM1_2837 AM1_2838     TRUE 0.982 3.000 0.314 1.000 Y NA
 3461004 3461005 AM1_2839 AM1_2840   anmK TRUE 0.861 63.000 0.015 NA   NA
 3461005 3461006 AM1_2840 AM1_2841 anmK   TRUE 0.653 3.000 0.000 1.000   NA
 3461006 3461007 AM1_2841 AM1_2842     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3461007 3461008 AM1_2842 AM1_2843     TRUE 0.954 0.000 0.667 NA   NA
 3461008 3461009 AM1_2843 AM1_2844     TRUE 0.953 5.000 0.250 NA   NA
 3461010 3461011 AM1_2845 AM1_2846     FALSE 0.197 132.000 0.000 NA   NA
 3461012 3461013 AM1_2847 AM1_2848     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3461013 3461014 AM1_2848 AM1_2849   frhB TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3461014 3461015 AM1_2849 AM1_2850 frhB   FALSE 0.260 136.000 0.000 1.000   NA
 3461015 3461016 AM1_2850 AM1_2851     FALSE 0.195 134.000 0.000 NA   NA
 3461017 3461018 AM1_2852 AM1_2853   murF FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3461019 3461020 AM1_2854 AM1_2855 rph   FALSE 0.071 286.000 0.000 NA   NA
 3461021 3461022 AM1_2856 AM1_2857 btuR dcd TRUE 0.940 17.000 0.091 1.000   NA
 3461023 3461024 AM1_2858 AM1_2859   cobK FALSE 0.403 57.000 0.000 1.000 N NA
 3461025 3461026 AM1_2860 AM1_2861   rplS FALSE 0.238 115.000 0.000 1.000 N NA
 3461026 3461027 AM1_2861 AM1_2862 rplS   FALSE 0.195 134.000 0.000 NA   NA
 3461027 3461028 AM1_2862 AM1_2863     FALSE 0.072 280.000 0.000 NA   NA
 3461028 3461029 AM1_2863 AM1_2864   nusG TRUE 0.958 7.000 0.843 1.000 N NA
 3461029 3461030 AM1_2864 AM1_2865 nusG rplK TRUE 0.958 8.000 0.681 1.000 N NA
 3461030 3461031 AM1_2865 AM1_2866 rplK rplA TRUE 0.953 91.000 0.838 0.011 Y NA
 3461031 3461032 AM1_2866 AM1_2867 rplA rplJ TRUE 0.824 254.000 0.302 0.011 Y NA
 3461032 3461033 AM1_2867 AM1_2868 rplJ rplL TRUE 0.973 45.000 0.884 0.009 Y NA
 3461036 3461037 AM1_2871 AM1_2872     FALSE 0.068 295.000 0.000 NA   NA
 3461038 3461039 AM1_2873 AM1_2874     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3461039 3461040 AM1_2874 AM1_2875   fbp FALSE 0.193 136.000 0.000 NA   NA
 3461040 3461041 AM1_2875 AM1_2876 fbp tal TRUE 0.954 45.000 0.019 1.000 Y NA
 3461041 3461042 AM1_2876 AM1_2877 tal zwf TRUE 0.900 122.000 0.037 1.000 Y NA
 3461042 3461043 AM1_2877 AM1_2878 zwf opcA TRUE 0.961 43.000 0.080 1.000 Y NA
 3461044 3461045 AM1_2879 AM1_2880     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3461047 3461048 AM1_2882 AM1_2883   ruvA FALSE 0.100 224.000 0.000 NA   NA
 3461048 3461049 AM1_2883 AM1_2884 ruvA spp TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3461050 3461051 AM1_2885 AM1_2886     FALSE 0.160 176.000 0.000 1.000 N NA
 3461054 3461055 AM1_2889 AM1_2890 psbA   FALSE 0.083 255.000 0.000 NA   NA
 3461056 3461057 AM1_2891 AM1_2892 recJ   FALSE 0.066 303.000 0.000 NA   NA
 3461057 3461058 AM1_2892 AM1_2893     TRUE 0.924 19.000 0.055 NA   NA
 3461058 3461059 AM1_2893 AM1_2894     TRUE 0.929 20.000 0.013 0.078   NA
 3461059 3461060 AM1_2894 AM1_2895     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3461060 3461061 AM1_2895 AM1_2896     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3461062 3461063 AM1_2897 AM1_2898     FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3461063 3461064 AM1_2898 AM1_2899     FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 3461065 3461066 AM1_2900 AM1_2901     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3461066 3461067 AM1_2901 AM1_2902   hisD FALSE 0.101 223.000 0.000 NA   NA
 3461067 3461068 AM1_2902 AM1_2903 hisD   TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3461068 3461069 AM1_2903 AM1_2904   rimL FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3461069 3461070 AM1_2904 AM1_2905 rimL pao FALSE 0.034 771.000 0.000 1.000 N NA
 3461070 3461071 AM1_2905 AM1_2906 pao   FALSE 0.035 597.000 0.000 NA   NA
 3461071 3461072 AM1_2906 AM1_2907     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3461073 3461074 AM1_2908 AM1_2909     FALSE 0.193 136.000 0.000 NA   NA
 3461075 3461076 AM1_2910 AM1_2911     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461076 3461077 AM1_2911 AM1_2912     FALSE 0.417 -22.000 0.000 NA   NA
 3461077 3461078 AM1_2912 AM1_2914   pyrG TRUE 0.454 63.000 0.000 1.000   NA
 3461079 3461080 AM1_2913 AM1_2915   ispF TRUE 0.484 24.000 0.000 1.000 N NA
 3461081 3461082 AM1_2916 AM1_2917     FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3461082 3461083 AM1_2917 AM1_2918     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3461085 3461086 AM1_2920 AM1_2921     TRUE 0.873 82.000 0.308 NA   NA
 3461087 3461088 AM1_2922 AM1_2923     FALSE 0.305 105.000 0.000 1.000   NA
 3461089 3461090 AM1_2924 AM1_2925     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3461090 3461091 AM1_2925 AM1_2926     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3461091 3461092 AM1_2926 AM1_2927     TRUE 0.520 32.000 0.000 1.000   NA
 3461093 3461094 AM1_2928 AM1_2929     FALSE 0.033 633.000 0.000 NA   NA
 3461094 3461095 AM1_2929 AM1_2930     FALSE 0.164 160.000 0.000 NA   NA
 3461095 3461096 AM1_2930 AM1_2931     TRUE 0.793 112.000 0.072 NA   NA
 3461096 3461097 AM1_2931 AM1_2932   trpD FALSE 0.289 60.000 0.000 NA N NA
 3461097 3461098 AM1_2932 AM1_2933 trpD   TRUE 0.936 5.000 0.002 1.000   NA
 3461098 3461099 AM1_2933 AM1_2934     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3461101 3461102 AM1_2936 AM1_2937   rpmF TRUE 0.937 6.000 0.004 1.000   NA
 3461103 3461104 AM1_2938 AM1_2939     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3461104 3461105 AM1_2939 AM1_2940     TRUE 0.471 27.000 0.000 1.000 N NA
 3461106 3461107 AM1_2941 AM1_2942 petH tyrA FALSE 0.244 147.000 0.000 1.000   NA
 3461107 3461108 AM1_2942 AM1_2943 tyrA   TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461108 3461109 AM1_2943 AM1_2944     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3461109 3461110 AM1_2944 AM1_2945   apt TRUE 0.501 39.000 0.000 1.000   NA
 3461111 3461112 AM1_2946 AM1_2947     TRUE 0.957 6.000 0.750 NA   NA
 3461112 3461113 AM1_2947 AM1_2948     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3461113 3461114 AM1_2948 AM1_2949     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3461114 3461115 AM1_2949 AM1_2950     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3461115 3461116 AM1_2950 AM1_2951     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3461116 10702636 AM1_2951 AM1_2952     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 10702636 3461117 AM1_2952 AM1_2953     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3461117 3461118 AM1_2953 AM1_2954     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3461118 3461119 AM1_2954 AM1_2955     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461120 3461121 AM1_2956 AM1_2957     TRUE 0.944 0.000 0.034 1.000   NA
 3461124 3461125 AM1_2960 AM1_2961     TRUE 0.981 4.000 0.043 0.021 Y NA
 3461125 3461126 AM1_2961 AM1_2962     FALSE 0.104 234.000 0.000 1.000 N NA
 3461131 3461132 AM1_2967 AM1_2968     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3461132 3461133 AM1_2968 AM1_2969     TRUE 0.910 54.000 0.379 NA   NA
 3461133 3461134 AM1_2969 AM1_2970     TRUE 0.949 -3.000 0.710 NA   NA
 3461137 3461138 AM1_2973 AM1_2974     FALSE 0.108 215.000 0.000 NA   NA
 3461138 3461139 AM1_2974 AM1_2975     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3461143 3461144 AM1_2979 AM1_2980     FALSE 0.179 148.000 0.000 NA   NA
 3461144 3461145 AM1_2980 AM1_2981     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3461146 3461147 AM1_2982 AM1_2983     FALSE 0.171 154.000 0.000 NA   NA
 3461148 3461149 AM1_2984 AM1_2985 nirA nrtP TRUE 0.876 76.000 0.056 1.000   NA
 3461149 3461150 AM1_2985 AM1_2986 nrtP   FALSE 0.099 392.000 0.000 0.033   NA
 3461150 3461151 AM1_2986 AM1_2987   mopB FALSE 0.097 293.000 0.000 1.000   NA
 3461151 3461152 AM1_2987 AM1_2988 mopB   FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3461152 3461153 AM1_2988 AM1_2989     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3461153 3461154 AM1_2989 AM1_2990     FALSE 0.069 319.000 0.000 1.000 N NA
 3461154 3461155 AM1_2990 AM1_2991     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3461155 3461156 AM1_2991 AM1_2992     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3461159 3461160 AM1_2995 AM1_2996     FALSE 0.393 80.000 0.000 1.000   NA
 3461160 3461161 AM1_2996 AM1_2997     TRUE 0.897 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 3461161 3461162 AM1_2997 AM1_2998     TRUE 0.653 7.000 0.000 1.000   NA
 3461162 3461163 AM1_2998 AM1_2999   ompA TRUE 0.956 7.000 0.154 1.000   NA
 3461163 3461164 AM1_2999 AM1_3000 ompA   TRUE 0.702 188.000 0.192 NA   NA
 3461164 3461165 AM1_3000 AM1_3001     FALSE 0.117 204.000 0.000 NA   NA
 3461165 3461166 AM1_3001 AM1_3002   thiC TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3461167 3461168 AM1_3003 AM1_3004   truB TRUE 0.647 1.000 0.000 1.000   NA
 3461168 3461169 AM1_3004 AM1_3005 truB   FALSE 0.246 146.000 0.000 1.000   NA
 3461169 3461170 AM1_3005 AM1_3006     FALSE 0.107 216.000 0.000 NA   NA
 3461176 3461177 AM1_3012 AM1_3013     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3461177 3461178 AM1_3013 AM1_3014     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3461179 3461180 AM1_3015 AM1_3016     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3461180 3461181 AM1_3016 AM1_3017     FALSE 0.374 58.000 0.000 NA   NA
 3461183 3461184 AM1_3019 AM1_3020   cadC FALSE 0.311 86.000 0.000 1.000 N NA
 3461185 3461186 AM1_3021 AM1_3022     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3461186 3461187 AM1_3022 AM1_3023     FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3461187 3461188 AM1_3023 AM1_3024     TRUE 0.929 26.000 0.333 NA   NA
 3461189 3461190 AM1_3025 AM1_3026     FALSE 0.414 -24.000 0.000 NA   NA
 3461190 3461191 AM1_3026 AM1_3027     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3461193 3461194 AM1_3029 AM1_3030     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3461194 3461195 AM1_3030 AM1_3031     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3461196 3461197 AM1_3032 AM1_3033     FALSE 0.051 382.000 0.000 NA   NA
 3461199 3461200 AM1_3035 AM1_3036     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3461200 3461201 AM1_3036 AM1_3037     FALSE 0.063 319.000 0.000 NA   NA
 3461202 3461203 AM1_3038 AM1_3039     FALSE 0.118 203.000 0.000 NA   NA
 3461203 3461204 AM1_3039 AM1_3040     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461206 3461207 AM1_3041 AM1_3043     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3461211 3461212 AM1_3047 AM1_3048     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3461212 3461213 AM1_3048 AM1_3049     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3461213 3461214 AM1_3049 AM1_3050     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3461214 3461215 AM1_3050 AM1_3051     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3461215 3461216 AM1_3051 AM1_3052   ccmM FALSE 0.080 259.000 0.000 NA   NA
 3461216 3461217 AM1_3052 AM1_3053 ccmM   TRUE 0.888 38.000 0.003 1.000   NA
 3461217 3461218 AM1_3053 AM1_3054     TRUE 0.870 46.000 0.005 NA   NA
 3461218 3461219 AM1_3054 AM1_3055   thrS TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3461220 3461221 AM1_3056 AM1_3057 folE   TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3461221 3461222 AM1_3057 AM1_3058     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461222 3461223 AM1_3058 AM1_3059     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3461223 3461224 AM1_3059 AM1_3060     TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3461225 3461226 AM1_3061 AM1_3062     TRUE 0.953 11.000 0.375 NA   NA
 3461226 3461227 AM1_3062 AM1_3063     TRUE 0.932 -10.000 0.250 NA   NA
 3461228 3461229 AM1_3064 AM1_3065     FALSE 0.310 79.000 0.000 NA   NA
 3461229 3461230 AM1_3065 AM1_3066     FALSE 0.039 506.000 0.000 NA   NA
 3461231 3461232 AM1_3067 AM1_3068     FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 3461232 3461233 AM1_3068 AM1_3069     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461234 3461235 AM1_3070 AM1_3071   hemB FALSE 0.085 252.000 0.000 NA   NA
 3461235 3461236 AM1_3071 AM1_3072 hemB   TRUE 0.874 46.000 0.005 1.000 N NA
 3461236 3461237 AM1_3072 AM1_3073     TRUE 0.981 12.000 0.339 1.000 Y NA
 3461237 3461238 AM1_3073 AM1_3074     TRUE 0.976 17.000 0.080 0.091 Y NA
 3461241 3461242 AM1_3077 AM1_3078     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461242 3461243 AM1_3078 AM1_3079   dam TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3461244 3461245 AM1_3080 AM1_3081   rbfA TRUE 0.868 65.000 0.030 NA   NA
 3461245 3461246 AM1_3081 AM1_3082 rbfA   TRUE 0.933 13.000 0.025 1.000 N NA
 3461246 3461247 AM1_3082 AM1_3083     FALSE 0.093 235.000 0.000 NA   NA
 3461248 3461249 AM1_3084 AM1_3085   ilvB TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3461249 3461250 AM1_3085 AM1_3086 ilvB   TRUE 0.731 147.000 0.030 1.000 N NA
 3461250 3461251 AM1_3086 AM1_3087   hli FALSE 0.076 217.000 0.000 NA N NA
 3461252 3461253 AM1_3088 AM1_3089 lipB moaE TRUE 0.805 50.000 0.000 1.000 Y NA
 3461254 3461255 AM1_3090 AM1_3091     TRUE 0.890 32.000 0.015 NA   NA
 3461255 3461256 AM1_3091 AM1_3092   oxaA TRUE 0.959 6.000 0.254 1.000   NA
 3461256 3461257 AM1_3092 AM1_3093 oxaA   TRUE 0.536 253.000 0.043 NA   NA
 3461257 3461258 AM1_3093 AM1_3094   rnpA TRUE 0.903 31.000 0.041 NA   NA
 3461259 3461260 AM1_3095 AM1_3096 dnaA dnaN TRUE 0.599 627.000 0.328 1.000 Y NA
 3461260 3461261 AM1_3096 AM1_3097 dnaN   FALSE 0.105 218.000 0.000 NA   NA
 3461262 3461263 AM1_3098 AM1_3099     FALSE 0.268 130.000 0.000 1.000   NA
 3461265 3461266 AM1_3100 AM1_3102     FALSE 0.426 15.000 0.000 NA N NA
 3461266 3461267 AM1_3102 AM1_3103     TRUE 0.942 7.000 0.095 NA N NA
 3461267 3461268 AM1_3103 AM1_3104     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3461273 3461274 AM1_3109 AM1_3110     TRUE 0.760 73.000 0.000 1.000 Y NA
 3461275 3461276 AM1_3111 AM1_3112     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3461276 3461277 AM1_3112 AM1_3113   gyrA FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3461278 3461279 AM1_3114 AM1_3115     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3461279 3461280 AM1_3115 AM1_3116     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461281 3461282 AM1_3117 AM1_3118   wecB FALSE 0.149 173.000 0.000 NA   NA
 3461282 3461283 AM1_3118 AM1_3119 wecB   TRUE 0.728 159.000 0.077 NA   NA
 3461284 3461285 AM1_3120 AM1_3121 pilT   TRUE 0.915 63.000 0.462 1.000   NA
 3461285 3461286 AM1_3121 AM1_3122     FALSE 0.173 197.000 0.000 1.000   NA
 3461288 3461289 AM1_3124 AM1_3125 ddl   FALSE 0.217 117.000 0.000 NA   NA
 3461289 3461290 AM1_3125 AM1_3126     FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3461292 3461293 AM1_3128 AM1_3129   aacC FALSE 0.130 192.000 0.000 NA   NA
 3461294 3461295 AM1_3130 AM1_3131     FALSE 0.374 58.000 0.000 NA   NA
 3461295 3461296 AM1_3131 AM1_3132     TRUE 0.452 64.000 0.000 1.000   NA
 3461298 3461299 AM1_3133 AM1_3135     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3461299 3461300 AM1_3135 AM1_3136     FALSE 0.126 196.000 0.000 NA   NA
 3461301 3461302 AM1_3137 AM1_3138     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3461302 3461303 AM1_3138 AM1_3139     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3461304 3461305 AM1_3140 AM1_3141 lepB lepB TRUE 0.694 121.000 0.000 0.001 Y NA
 3461305 3461306 AM1_3141 AM1_3142 lepB   FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3461308 3461309 AM1_3144 AM1_3145     FALSE 0.117 204.000 0.000 NA   NA
 3461311 3461312 AM1_3146 AM1_3148     FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3461316 3461317 AM1_3152 AM1_3153     FALSE 0.031 757.000 0.000 NA   NA
 3461317 3461318 AM1_3153 AM1_3154     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3461320 3461321 AM1_3156 AM1_3157   aroE FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 3461321 3461322 AM1_3157 AM1_3158 aroE glnB TRUE 0.950 63.000 0.032 1.000 Y NA
 3461324 3461325 AM1_3159 AM1_3161     TRUE 0.554 161.000 0.000 1.000 Y NA
 3461325 3461326 AM1_3161 AM1_3162     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3461326 3461327 AM1_3162 AM1_3163   glyQ FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3461327 3461328 AM1_3163 AM1_3164 glyQ   FALSE 0.197 132.000 0.000 NA   NA
 3461330 3461331 AM1_3165 AM1_3167     FALSE 0.140 182.000 0.000 NA   NA
 3461332 3461333 AM1_3168 AM1_3169     TRUE 0.754 144.000 0.029 1.000   NA
 3461335 3461336 AM1_3171 AM1_3172     FALSE 0.421 -21.000 0.000 NA   NA
 3461336 3461337 AM1_3172 AM1_3173     FALSE 0.291 85.000 0.000 NA   NA
 3461337 3461338 AM1_3173 AM1_3174     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3461338 3461339 AM1_3174 AM1_3175     FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3461345 3461346 AM1_3181 AM1_3182     TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3461346 3461347 AM1_3182 AM1_3183     TRUE 0.898 -3.000 0.000 0.005 Y NA
 3461348 3461349 AM1_3184 AM1_3185     FALSE 0.154 169.000 0.000 NA   NA
 3461349 3461350 AM1_3185 AM1_3186     FALSE 0.132 234.000 0.000 1.000   NA
 3461350 3461351 AM1_3186 AM1_3187     FALSE 0.206 172.000 0.000 1.000   NA
 3461351 3461352 AM1_3187 AM1_3188     FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3461352 3461353 AM1_3188 AM1_3189   cyaA FALSE 0.049 406.000 0.000 NA   NA
 3461356 3461357 AM1_3192 AM1_3193   hli FALSE 0.050 390.000 0.000 NA   NA
 3461358 3461359 AM1_3194 AM1_3195     FALSE 0.034 772.000 0.000 1.000 N NA
 3461360 3461361 AM1_3196 AM1_3197     TRUE 0.790 74.000 0.000 0.032 Y NA
 3461361 3461362 AM1_3197 AM1_3198   nuoK TRUE 0.688 95.000 0.000 1.000 Y NA
 3461362 3461363 AM1_3198 AM1_3199 nuoK ndhD TRUE 0.982 -3.000 0.306 0.005 Y NA
 3461363 3461364 AM1_3199 AM1_3200 ndhD   TRUE 0.947 -3.000 0.404 NA   NA
 3461364 3461365 AM1_3200 AM1_3201     TRUE 0.949 -3.000 0.913 NA   NA
 3461365 3461366 AM1_3201 AM1_3202     TRUE 0.948 -3.000 0.605 NA   NA
 3461366 3461367 AM1_3202 AM1_3203     TRUE 0.954 0.000 0.605 NA   NA
 3461367 3461368 AM1_3203 AM1_3204   mnhB TRUE 0.977 -3.000 0.489 NA Y NA
 3461368 3461369 AM1_3204 AM1_3205 mnhB   FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3461370 3461371 AM1_3206 AM1_3207   nirD FALSE 0.271 128.000 0.000 1.000   NA
 3461376 3461377 AM1_3212 AM1_3213     FALSE 0.156 167.000 0.000 NA   NA
 3461377 3461378 AM1_3213 AM1_3214   groL FALSE 0.036 559.000 0.000 NA   NA
 3461378 3461379 AM1_3214 AM1_3215 groL   FALSE 0.047 421.000 0.000 NA   NA
 3461380 3461381 AM1_3216 AM1_3217     FALSE 0.040 496.000 0.000 NA   NA
 3461381 3461382 AM1_3217 AM1_3218     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3461383 3461384 AM1_3219 AM1_3220     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3461384 3461385 AM1_3220 AM1_3221     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3461388 3461389 AM1_3224 AM1_3225     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3461389 3461390 AM1_3225 AM1_3226     TRUE 0.928 24.000 0.068 1.000   NA
 3461394 3461395 AM1_3230 AM1_3231     FALSE 0.179 148.000 0.000 NA   NA
 3461396 3461397 AM1_3232 AM1_3233   hli FALSE 0.042 465.000 0.000 NA   NA
 3461397 3461398 AM1_3233 AM1_3234 hli rpoD FALSE 0.221 112.000 0.000 NA   NA
 3461398 3461399 AM1_3234 AM1_3235 rpoD   FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3461399 3461400 AM1_3235 AM1_3236     FALSE 0.199 131.000 0.000 NA   NA
 3461400 3461401 AM1_3236 AM1_3237   ftsH FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3461401 3461402 AM1_3237 AM1_3238 ftsH   FALSE 0.052 370.000 0.000 NA   NA
 3461403 3461404 AM1_3239 AM1_3240     TRUE 0.948 11.000 0.154 NA   NA
 3461405 3461406 AM1_3241 AM1_3243     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3461408 3461409 AM1_3244 AM1_3245 gdhA   FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3461410 3461411 AM1_3246 AM1_3247     FALSE 0.040 496.000 0.000 NA   NA
 3461413 3461414 AM1_3249 AM1_3250     FALSE 0.081 257.000 0.000 NA   NA
 3461418 3461419 AM1_3254 AM1_3255     TRUE 0.461 30.000 0.000 1.000 N NA
 3461419 3461420 AM1_3255 AM1_3256     FALSE 0.097 399.000 0.000 0.035   NA
 3461421 3461422 AM1_3257 AM1_3258     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3461427 3461428 AM1_3263 AM1_3264     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 3461428 3461429 AM1_3264 AM1_3265     FALSE 0.206 125.000 0.000 NA   NA
 3461429 3461430 AM1_3265 AM1_3266     FALSE 0.074 277.000 0.000 NA   NA
 3461430 3461431 AM1_3266 AM1_3267     FALSE 0.181 191.000 0.000 1.000   NA
 10702637 3461434 AM1_3270 AM1_3271     FALSE 0.375 -45.000 0.000 NA   NA
 3461434 10702638 AM1_3271 AM1_3272     FALSE 0.409 38.000 0.000 NA   NA
 3461435 3461436 AM1_3273 AM1_3274     FALSE 0.073 278.000 0.000 NA   NA
 3461436 3461437 AM1_3274 AM1_3275     FALSE 0.064 314.000 0.000 NA   NA
 3461437 3461438 AM1_3275 AM1_3276     FALSE 0.146 176.000 0.000 NA   NA
 3461438 3461439 AM1_3276 AM1_3277     FALSE 0.194 135.000 0.000 NA   NA
 3461439 3461440 AM1_3277 AM1_3278     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461440 3461441 AM1_3278 AM1_3279     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3461442 3461443 AM1_3280 AM1_3281 ccmK   FALSE 0.080 259.000 0.000 NA   NA
 3461443 3461444 AM1_3281 AM1_3282     FALSE 0.046 425.000 0.000 NA   NA
 3461444 3461445 AM1_3282 AM1_3283     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3461445 3461446 AM1_3283 AM1_3284     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3461446 3461447 AM1_3284 AM1_3285     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3461448 3461449 AM1_3286 AM1_3287     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3461449 3461450 AM1_3287 AM1_3288     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3461450 3461451 AM1_3288 AM1_3289     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3461451 3461452 AM1_3289 AM1_3290     FALSE 0.120 201.000 0.000 NA   NA
 3461452 3461453 AM1_3290 AM1_3291     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3461453 3461454 AM1_3291 AM1_3292     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3461455 3461456 AM1_3293 AM1_3294     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3461456 3461457 AM1_3294 AM1_3295     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3461457 3461458 AM1_3295 AM1_3296     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3461458 3461459 AM1_3296 AM1_3297     FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3461459 3461460 AM1_3297 AM1_3298     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3461460 3461461 AM1_3298 AM1_3299     FALSE 0.411 -25.000 0.000 NA   NA
 3461461 3461462 AM1_3299 AM1_3300     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3461462 3461463 AM1_3300 AM1_3301     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3461463 3461464 AM1_3301 AM1_3302     FALSE 0.033 641.000 0.000 NA   NA
 3461464 3461465 AM1_3302 AM1_3303     FALSE 0.066 301.000 0.000 NA   NA
 3461465 3461466 AM1_3303 AM1_3304     FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3461467 3461468 AM1_3305 AM1_3306     TRUE 0.546 25.000 0.000 1.000   NA
 3461470 3461471 AM1_3308 AM1_3309     TRUE 0.863 63.000 0.018 NA   NA
 3461473 3461474 AM1_3311 AM1_3312     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461474 3461475 AM1_3312 AM1_3313     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3461475 3461476 AM1_3313 AM1_3314     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3461476 3461477 AM1_3314 AM1_3315   pykF TRUE 0.835 82.000 0.028 NA   NA
 3461479 3461480 AM1_3317 AM1_3318     FALSE 0.337 250.000 0.000 NA Y NA
 3461480 3461481 AM1_3318 AM1_3319     TRUE 0.914 36.000 0.200 NA   NA
 3461481 3461482 AM1_3319 AM1_3320     FALSE 0.154 169.000 0.000 NA   NA
 3461483 3461484 AM1_3321 AM1_3322     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3461484 3461485 AM1_3322 AM1_3323     TRUE 0.797 140.000 0.500 NA   NA
 3461485 3461486 AM1_3323 AM1_3324     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3461486 3461487 AM1_3324 AM1_3325     FALSE 0.217 117.000 0.000 NA   NA
 3461487 3461488 AM1_3325 AM1_3326   cbiB TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3461489 3461490 AM1_3327 AM1_3328     TRUE 0.913 20.000 0.026 NA   NA
 3461492 3461493 AM1_3329 AM1_3331     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3461494 3461495 AM1_3332 AM1_3333 gatC ndhH FALSE 0.142 194.000 0.000 1.000 N NA
 3461495 3461496 AM1_3333 AM1_3334 ndhH   TRUE 0.467 58.000 0.000 1.000   NA
 3461496 3461497 AM1_3334 AM1_3335     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3461497 3461498 AM1_3335 AM1_3336     FALSE 0.042 462.000 0.000 NA   NA
 3461499 3461500 AM1_3337 AM1_3338     TRUE 0.592 5.000 0.000 1.000 N NA
 3461500 3461501 AM1_3338 AM1_3339     TRUE 0.934 11.000 0.021 NA   NA
 3461501 3461502 AM1_3339 AM1_3340     FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3461504 3461505 AM1_3342 AM1_3343     FALSE 0.228 123.000 0.000 1.000 N NA
 3461505 3461506 AM1_3343 AM1_3344   xseA TRUE 0.979 -10.000 0.412 0.000 Y NA
 3461506 3461507 AM1_3344 AM1_3345 xseA   FALSE 0.315 85.000 0.000 1.000 N NA
 3461507 3461508 AM1_3345 AM1_3346     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3461510 3461511 AM1_3348 AM1_3349   fhuG TRUE 0.976 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 3461511 3461512 AM1_3349 AM1_3350 fhuG   TRUE 0.981 -3.000 0.169 0.020 Y NA
 3461514 3461515 AM1_3352 AM1_3353     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3461516 3461517 AM1_3354 AM1_3355     FALSE 0.038 514.000 0.000 NA   NA
 3461517 3461518 AM1_3355 AM1_3356     FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3461519 3461520 AM1_3357 AM1_3358     TRUE 0.792 59.000 0.000 1.000 Y NA
 3461522 3461523 AM1_3360 AM1_3361     FALSE 0.166 109.000 0.000 NA N NA
 3461524 3461525 AM1_3362 AM1_3363 hli   FALSE 0.178 149.000 0.000 NA   NA
 3461525 3461526 AM1_3363 AM1_3364   hli FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3461526 3461527 AM1_3364 AM1_3366 hli hli FALSE 0.193 236.000 0.000 0.002   NA
 3461528 3461529 AM1_3365 AM1_3367     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3461529 3461530 AM1_3367 AM1_3368     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3461530 3461531 AM1_3368 AM1_3369   petE FALSE 0.113 209.000 0.000 NA   NA
 3461531 3461532 AM1_3369 AM1_3370 petE   FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3461532 3461533 AM1_3370 AM1_3371     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3461534 3461535 AM1_3372 AM1_3373     FALSE 0.184 145.000 0.000 NA   NA
 3461535 3461536 AM1_3373 AM1_3374   tcmP FALSE 0.052 370.000 0.000 NA   NA
 3461537 3461538 AM1_3375 AM1_3376     TRUE 0.490 48.000 0.000 1.000   NA
 3461538 3461539 AM1_3376 AM1_3377     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3461540 3461541 AM1_3378 AM1_3379     FALSE 0.265 173.000 0.000 0.052   NA
 3461541 3461542 AM1_3379 AM1_3381     FALSE 0.125 197.000 0.000 NA   NA
 3461544 3461545 AM1_3382 AM1_3383     FALSE 0.228 123.000 0.000 1.000 N NA
 3461545 3461546 AM1_3383 AM1_3384     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3461546 3461547 AM1_3384 AM1_3385     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3461547 3461548 AM1_3385 AM1_3386     FALSE 0.195 134.000 0.000 NA   NA
 3461548 3461549 AM1_3386 AM1_3387     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3461550 3461551 AM1_3388 AM1_3389     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3461551 3461552 AM1_3389 AM1_3390     FALSE 0.051 382.000 0.000 NA   NA
 3461552 3461553 AM1_3390 AM1_3391     FALSE 0.132 191.000 0.000 NA   NA
 3461553 3461554 AM1_3391 AM1_3392     TRUE 0.512 -22.000 0.000 1.000   NA
 3461554 3461555 AM1_3392 AM1_3393     TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3461555 3461556 AM1_3393 AM1_3394     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3461558 3461559 AM1_3396 AM1_3397     FALSE 0.208 140.000 0.000 1.000 N NA
 3461559 3461560 AM1_3397 AM1_3398     TRUE 0.982 2.000 0.400 1.000 Y NA
 3461560 3461561 AM1_3398 AM1_3399     TRUE 0.803 137.000 0.400 1.000 N NA
 3461561 3461562 AM1_3399 AM1_3400     FALSE 0.074 277.000 0.000 NA   NA
 3461562 3461563 AM1_3400 AM1_3401     FALSE 0.096 231.000 0.000 NA   NA
 3461563 3461564 AM1_3401 AM1_3402     TRUE 0.866 29.000 0.000 0.002 Y NA
 3461564 3461565 AM1_3402 AM1_3403     TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3461566 3461567 AM1_3404 AM1_3405     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461568 3461569 AM1_3406 AM1_3407     TRUE 0.592 5.000 0.000 1.000 N NA
 3461569 3461570 AM1_3407 AM1_3408     FALSE 0.171 154.000 0.000 NA   NA
 3461572 3461573 AM1_3410 AM1_3411     TRUE 0.859 -16.000 0.000 0.027 Y NA
 3461573 3461574 AM1_3411 AM1_3412     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3461575 3461576 AM1_3413 AM1_3414     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3461576 3461577 AM1_3414 AM1_3415     TRUE 0.983 3.000 0.385 1.000 Y NA
 3461577 3461578 AM1_3415 AM1_3416     TRUE 0.856 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3461578 3461579 AM1_3416 AM1_3417     FALSE 0.253 339.000 0.000 NA Y NA
 3461579 3461580 AM1_3417 AM1_3418     TRUE 0.917 -3.000 0.021 NA N NA
 3461580 3461581 AM1_3418 AM1_3419     FALSE 0.068 326.000 0.000 1.000 N NA
 3461581 3461582 AM1_3419 AM1_3420     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3461583 3461584 AM1_3421 AM1_3422     FALSE 0.061 329.000 0.000 NA   NA
 3461585 3461586 AM1_3423 AM1_3424     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3461587 3461588 AM1_3425 AM1_3426     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3461588 3461589 AM1_3426 AM1_3427   tsf TRUE 0.630 180.000 0.006 NA   NA
 3461589 3461590 AM1_3427 AM1_3428 tsf rpsB TRUE 0.856 104.000 0.748 1.000   NA
 3461591 3461592 AM1_3429 AM1_3430     TRUE 0.914 -21.000 0.143 NA   NA
 3461596 3461597 AM1_3434 AM1_3436     TRUE 0.909 62.000 0.810 NA   NA
 3461599 3461600 AM1_3437 AM1_3438   hflX FALSE 0.386 82.000 0.000 1.000   NA
 3461600 3461601 AM1_3438 AM1_3439 hflX   FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3461601 3461602 AM1_3439 AM1_3441     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3461604 3461605 AM1_3442 AM1_3443     TRUE 0.576 252.000 0.049 1.000   NA
 3461608 3461609 AM1_3445 AM1_3447 dapA asd TRUE 0.794 227.000 0.052 1.000 Y NA
 3461610 3461611 AM1_3448 AM1_3449 tig clpP TRUE 0.869 154.000 0.025 1.000 Y NA
 3461611 3461612 AM1_3449 AM1_3450 clpP clpX TRUE 0.977 10.000 0.037 1.000 Y NA
 3461612 3461613 AM1_3450 AM1_3451 clpX   TRUE 0.900 25.000 0.009 1.000 N NA
 3461613 3461614 AM1_3451 AM1_3452   mutL TRUE 0.587 2.000 0.000 1.000 N NA
 3461614 3461615 AM1_3452 AM1_3453 mutL   TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3461616 3461617 AM1_3454 AM1_3455     FALSE 0.164 173.000 0.000 1.000 N NA
 3461617 3461618 AM1_3455 AM1_3456     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461618 3461619 AM1_3456 AM1_3457     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3461619 3461620 AM1_3457 AM1_3458     TRUE 0.867 85.000 0.286 NA   NA
 3461620 3461621 AM1_3458 AM1_3459     FALSE 0.160 162.000 0.000 NA   NA
 3461621 3461622 AM1_3459 AM1_3461     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3461622 3461623 AM1_3461 AM1_3462     TRUE 0.908 6.000 0.000 0.066 Y NA
 3461624 3461625 AM1_3463 AM1_3464 grx   FALSE 0.209 170.000 0.000 1.000   NA
 3461626 3461627 AM1_3465 AM1_3466     TRUE 0.962 53.000 0.200 1.000 Y NA
 3461627 3461628 AM1_3466 AM1_3467     FALSE 0.330 35.000 0.000 NA N NA
 3461628 3461629 AM1_3467 AM1_3468     FALSE 0.175 103.000 0.000 NA N NA
 3461629 3461630 AM1_3468 AM1_3469     FALSE 0.062 354.000 0.000 1.000 N NA
 3461630 3461631 AM1_3469 AM1_3470     TRUE 0.462 203.000 0.000 1.000 Y NA
 3461632 3461633 AM1_3471 AM1_3472     FALSE 0.040 495.000 0.000 NA   NA
 3461633 3461634 AM1_3472 AM1_3473     FALSE 0.096 231.000 0.000 NA   NA
 3461634 3461635 AM1_3473 AM1_3474     FALSE 0.074 276.000 0.000 NA   NA
 3461637 3461638 AM1_3476 AM1_3478     FALSE 0.185 144.000 0.000 NA   NA
 3461640 3461641 AM1_3479 AM1_3481     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3461641 3461642 AM1_3481 AM1_3482     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3461642 3461643 AM1_3482 AM1_3483     FALSE 0.160 162.000 0.000 NA   NA
 3461643 3461644 AM1_3483 AM1_3484     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3461644 3461645 AM1_3484 AM1_3485     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3461646 3461647 AM1_3486 AM1_3487     FALSE 0.061 323.000 0.000 NA   NA
 3461647 3461648 AM1_3487 AM1_3488   pstB FALSE 0.192 138.000 0.000 NA   NA
 3461648 3461649 AM1_3488 AM1_3489 pstB pstA TRUE 0.983 -3.000 0.400 0.001 Y NA
 3461649 3461650 AM1_3489 AM1_3490 pstA pstC TRUE 0.985 2.000 0.231 0.001 Y NA
 3461650 3461651 AM1_3490 AM1_3491 pstC   TRUE 0.969 -19.000 0.269 1.000 Y NA
 3461651 3461652 AM1_3491 AM1_3492     TRUE 0.445 395.000 0.154 1.000 N NA
 3461653 3461654 AM1_3493 AM1_3494     FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 3461654 3461655 AM1_3494 AM1_3495     FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 3461656 3461657 AM1_3496 AM1_3497     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3461658 3461659 AM1_3498 AM1_3499     FALSE 0.084 253.000 0.000 NA   NA
 3461659 3461660 AM1_3499 AM1_3500     FALSE 0.039 500.000 0.000 NA   NA
 3461668 3461669 AM1_3508 AM1_3509   aqpZ FALSE 0.050 601.000 0.000 1.000   NA
 3461669 3461670 AM1_3509 AM1_3510 aqpZ   FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3461671 3461672 AM1_3511 AM1_3512     FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3461673 3461674 AM1_3513 AM1_3514   fabD FALSE 0.313 78.000 0.000 NA   NA
 3461674 3461675 AM1_3514 AM1_3515 fabD   TRUE 0.734 82.000 0.000 1.000 Y NA
 3461675 3461676 AM1_3515 AM1_3516     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3461676 3461677 AM1_3516 AM1_3517   def FALSE 0.291 85.000 0.000 NA   NA
 3461679 3461680 AM1_3519 AM1_3520     FALSE 0.168 157.000 0.000 NA   NA
 3461681 3461682 AM1_3521 AM1_3522     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3461682 3461683 AM1_3522 AM1_3523     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3461686 3461687 AM1_3526 AM1_3527   speE FALSE 0.063 317.000 0.000 NA   NA
 3461687 3461688 AM1_3527 AM1_3528 speE speB TRUE 0.975 5.000 0.010 1.000 Y NA
 3461693 3461694 AM1_3533 AM1_3534 amtB amtB FALSE 0.289 428.000 0.000 0.001 Y NA
 3461697 3461698 AM1_3537 AM1_3538 rfc   FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3461698 3461699 AM1_3538 AM1_3539     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3461700 3461701 AM1_3540 AM1_3541     FALSE 0.036 566.000 0.000 NA   NA
 3461701 3461702 AM1_3541 AM1_3542     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461702 3461703 AM1_3542 AM1_3543     FALSE 0.129 194.000 0.000 NA   NA
 3461703 3461704 AM1_3543 AM1_3544     FALSE 0.057 347.000 0.000 NA   NA
 3461706 3461707 AM1_3546 AM1_3547     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3461708 3461709 AM1_3548 AM1_3549     FALSE 0.053 364.000 0.000 NA   NA
 3461709 3461710 AM1_3549 AM1_3550   recA FALSE 0.286 119.000 0.000 1.000   NA
 3461711 3461712 AM1_3551 AM1_3552     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3461712 3461713 AM1_3552 AM1_3553     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3461714 3461715 AM1_3554 AM1_3555     FALSE 0.148 174.000 0.000 NA   NA
 3461715 3461716 AM1_3555 AM1_3557     FALSE 0.077 363.000 0.000 1.000   NA
 3461721 3461722 AM1_3561 AM1_3562     FALSE 0.074 277.000 0.000 NA   NA
 3461722 3461723 AM1_3562 AM1_3563     FALSE 0.364 88.000 0.000 1.000   NA
 3461723 3461724 AM1_3563 AM1_3564     FALSE 0.298 108.000 0.000 1.000   NA
 3461725 3461726 AM1_3565 AM1_3566     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3461726 3461727 AM1_3566 AM1_3567     TRUE 0.889 16.000 0.000 0.026 Y NA
 3461727 3461728 AM1_3567 AM1_3568     TRUE 0.865 -13.000 0.000 0.026 Y NA
 3461728 3461729 AM1_3568 AM1_3569     TRUE 0.879 20.000 0.000 0.011 Y NA
 3461732 3461733 AM1_3572 AM1_3573     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461734 3461735 AM1_3574 AM1_3575 nifU   TRUE 0.927 0.000 0.008 NA   NA
 3461735 3461736 AM1_3575 AM1_3576   gldA TRUE 0.853 81.000 0.066 NA   NA
 3461736 3461737 AM1_3576 AM1_3577 gldA   TRUE 0.941 -3.000 0.105 1.000 N NA
 3461737 3461738 AM1_3577 AM1_3578     FALSE 0.335 79.000 0.000 1.000 N NA
 3461738 3461739 AM1_3578 AM1_3579     TRUE 0.973 43.000 0.469 0.003 Y NA
 3461739 3461740 AM1_3579 AM1_3580   era TRUE 0.490 48.000 0.000 1.000   NA
 3461741 3461742 AM1_3581 AM1_3582   pyr FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3461742 3461743 AM1_3582 AM1_3583 pyr phoE TRUE 0.867 51.000 0.003 1.000 N NA
 3461746 3461747 AM1_3586 AM1_3587     TRUE 0.818 118.000 0.379 NA   NA
 3461747 3461748 AM1_3587 AM1_3588     FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3461750 3461751 AM1_3590 AM1_3591 rpsT   TRUE 0.815 86.000 0.034 NA N NA
 3461751 3461752 AM1_3591 AM1_3592   rpoB TRUE 0.810 80.000 0.012 NA N NA
 3461752 3461753 AM1_3592 AM1_3593 rpoB rpoC1 TRUE 0.952 94.000 0.851 0.001 Y NA
 3461753 3461754 AM1_3593 AM1_3594 rpoC1 rpoC2 TRUE 0.976 17.000 0.031 0.001 Y NA
 3461754 3461755 AM1_3594 AM1_3595 rpoC2   FALSE 0.298 108.000 0.000 1.000   NA
 3461756 3461757 AM1_3596 AM1_3597     FALSE 0.142 180.000 0.000 NA   NA
 3461757 3461758 AM1_3597 AM1_3598     FALSE 0.138 184.000 0.000 NA   NA
 3461758 3461759 AM1_3598 AM1_3599   thiG TRUE 0.568 203.000 0.003 NA   NA
 3461760 3461761 AM1_3600 AM1_3601 rpoE   TRUE 0.505 254.000 0.019 NA   NA
 3461762 3461763 AM1_3602 AM1_3603 ubiA   FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3461763 3461764 AM1_3603 AM1_3604     FALSE 0.194 135.000 0.000 NA   NA
 3461764 3461765 AM1_3604 AM1_3605     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3461765 3461766 AM1_3605 AM1_3606     FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3461766 3461767 AM1_3606 AM1_6419   ssaA FALSE 0.195 134.000 0.000 NA   NA
 3461767 3461768 AM1_6419 AM1_3607 ssaA   FALSE 0.032 667.000 0.000 NA   NA
 3461768 3461769 AM1_3607 AM1_3608     TRUE 0.910 10.000 0.000 0.017 Y NA
 3461771 3461772 AM1_3610 AM1_3611     TRUE 0.522 73.000 0.000 0.012   NA
 3461772 3461773 AM1_3611 AM1_3612     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3461773 3461774 AM1_3612 AM1_3613     FALSE 0.032 686.000 0.000 NA   NA
 3461774 3461775 AM1_3613 AM1_3614     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3461775 3461776 AM1_3614 AM1_3615     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3461776 3461777 AM1_3615 AM1_3616     TRUE 0.443 67.000 0.000 1.000   NA
 3461777 3461778 AM1_3616 AM1_3617     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3461778 3461779 AM1_3617 AM1_3618     TRUE 0.884 -18.000 0.005 NA   NA
 3461779 3461780 AM1_3618 AM1_3619     TRUE 0.906 -7.000 0.007 NA   NA
 3461780 3461781 AM1_3619 AM1_3620     TRUE 0.728 108.000 0.006 NA N NA
 3461781 3461782 AM1_3620 AM1_3621     TRUE 0.922 21.000 0.026 1.000   NA
 3461782 3461783 AM1_3621 AM1_3622     TRUE 0.923 25.000 0.045 1.000   NA
 3461783 3461784 AM1_3622 AM1_3623     TRUE 0.978 10.000 0.048 1.000 Y NA
 3461784 3461785 AM1_3623 AM1_3624     TRUE 0.933 -7.000 0.059 1.000   NA
 3461785 3461786 AM1_3624 AM1_3625     TRUE 0.920 28.000 0.047 1.000   NA
 3461786 3461787 AM1_3625 AM1_3626     FALSE 0.297 321.000 0.000 1.000 Y NA
 3461787 3461788 AM1_3626 AM1_3627     FALSE 0.029 1425.000 0.000 NA   NA
 3461788 3461789 AM1_3627 AM1_3628     FALSE 0.085 252.000 0.000 NA   NA
 3461789 3461790 AM1_3628 AM1_3629     FALSE 0.203 128.000 0.000 NA   NA
 3461790 3461791 AM1_3629 AM1_3630     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3461791 3461792 AM1_3630 AM1_3631   rpmA FALSE 0.169 156.000 0.000 NA   NA
 3461792 3461793 AM1_3631 AM1_3632 rpmA rplU TRUE 0.972 51.000 0.667 0.008 Y NA
 3461793 3461794 AM1_3632 AM1_3633 rplU   FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3461794 3461795 AM1_3633 AM1_3634     TRUE 0.840 93.000 0.149 NA   NA
 3461799 3461800 AM1_3638 AM1_3639     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3461800 3461801 AM1_3639 AM1_3640     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3461802 3461803 AM1_3641 AM1_3642     TRUE 0.742 115.000 0.006 NA   NA
 3461804 3461805 AM1_3643 AM1_3644     TRUE 0.489 -6.000 0.000 NA   NA
 3461805 3461806 AM1_3644 AM1_3645     FALSE 0.041 488.000 0.000 NA   NA
 3461806 3461807 AM1_3645 AM1_3646   ilvE FALSE 0.207 141.000 0.000 1.000 N NA
 3461810 3461811 AM1_3649 AM1_3650   mpgP TRUE 0.939 -7.000 0.126 1.000   NA
 3461811 3461812 AM1_3650 AM1_3651 mpgP   FALSE 0.082 256.000 0.000 NA   NA
 3461813 3461814 AM1_3652 AM1_3653 lspA   TRUE 0.956 4.000 0.554 NA   NA
 3461815 3461816 AM1_3654 AM1_3655 hli hli FALSE 0.160 274.000 0.000 0.002   NA
 3461819 3461820 AM1_3658 AM1_3659     TRUE 0.645 11.000 0.000 1.000   NA
 3461820 3461821 AM1_3659 AM1_3660     TRUE 0.902 60.000 0.250 NA   NA
 3461821 3461822 AM1_3660 AM1_3661     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3461822 3461823 AM1_3661 AM1_3662     FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3461823 3461824 AM1_3662 AM1_3663   holA TRUE 0.509 234.000 0.004 NA   NA
 3461825 3461826 AM1_3664 AM1_3665     TRUE 0.981 0.000 0.054 0.009 Y NA
 3461828 3461829 AM1_3667 AM1_3668 frdB hli TRUE 0.828 114.000 0.167 1.000   NA
 3461830 3461831 AM1_3669 AM1_3670     FALSE 0.076 294.000 0.000 1.000 N NA
 3461833 3461834 AM1_3672 AM1_3673     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3461834 3461835 AM1_3673 AM1_3674   chlM TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3461835 3461836 AM1_3674 AM1_3675 chlM   FALSE 0.094 234.000 0.000 NA   NA
 3461838 3461839 AM1_3677 AM1_3678     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3461839 3461840 AM1_3678 AM1_3679     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3461841 3461842 AM1_3680 AM1_3681   gor FALSE 0.244 109.000 0.000 1.000 N NA
 3461842 3461843 AM1_3681 AM1_3683 gor   TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3461844 3461845 AM1_3682 AM1_3684     FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3461846 3461847 AM1_3685 AM1_3686     FALSE 0.062 320.000 0.000 NA   NA
 3461847 3461848 AM1_3686 AM1_3687     TRUE 0.721 161.000 0.067 NA   NA
 3461848 3461849 AM1_3687 AM1_3688     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3461849 3461850 AM1_3688 AM1_3689     TRUE 0.945 16.000 0.649 NA   NA
 3461850 3461851 AM1_3689 AM1_3690     TRUE 0.955 11.000 0.571 NA   NA
 3461853 3461854 AM1_3692 AM1_3693     TRUE 0.932 -15.000 0.800 NA   NA
 3461854 3461855 AM1_3693 AM1_3694     FALSE 0.374 58.000 0.000 NA   NA
 3461855 3461856 AM1_3694 AM1_3695     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3461856 3461857 AM1_3695 AM1_3696     TRUE 0.842 40.000 0.000 0.029 Y NA
 3461857 3461858 AM1_3696 AM1_3697     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3461858 3461859 AM1_3697 AM1_3698     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461862 3461863 AM1_3701 AM1_3702     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3461863 3461864 AM1_3702 AM1_3703     FALSE 0.145 177.000 0.000 NA   NA
 3461865 3461866 AM1_3704 AM1_3706     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3461867 3461868 AM1_3705 AM1_3707     FALSE 0.051 570.000 0.000 1.000   NA
 3461868 3461869 AM1_3707 AM1_3708   prfB TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3461869 3461870 AM1_3708 AM1_3709 prfB   TRUE 0.722 122.000 0.002 NA   NA
 3461873 3461874 AM1_3712 AM1_3713     TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3461877 3461878 AM1_3716 AM1_3717     TRUE 0.922 40.000 0.500 1.000 N NA
 3461878 3461879 AM1_3717 AM1_3718     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3461880 3461881 AM1_3719 AM1_3720   phnC TRUE 0.974 41.000 0.690 0.000 Y NA
 3461881 3461882 AM1_3720 AM1_3721 phnC   FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3461883 3461884 AM1_3722 AM1_3723     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3461886 3461887 AM1_3725 AM1_3726     FALSE 0.150 172.000 0.000 NA   NA
 3461887 3461888 AM1_3726 AM1_3727     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3461888 3461889 AM1_3727 AM1_6426   psaM FALSE 0.062 322.000 0.000 NA   NA
 3461890 3461891 AM1_3728 AM1_3729   terC FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3461892 3461893 AM1_3730 AM1_3731     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3461893 3461894 AM1_3731 AM1_3732     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3461894 3461895 AM1_3732 AM1_3733   ndk FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3461895 3461896 AM1_3733 AM1_3734 ndk   FALSE 0.289 116.000 0.000 1.000   NA
 3461896 3461897 AM1_3734 AM1_3735     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3461898 3461899 AM1_3736 AM1_3737     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3461899 3461900 AM1_3737 AM1_3738     FALSE 0.361 121.000 0.000 0.032   NA
 3461901 3461902 AM1_3739 AM1_3740     TRUE 0.954 90.000 0.600 0.003 Y NA
 3461902 3461903 AM1_3740 AM1_3741     TRUE 0.953 91.000 0.600 0.003 Y NA
 3461903 3461904 AM1_3741 AM1_3742     TRUE 0.983 1.000 0.800 1.000 Y NA
 3461904 3461905 AM1_3742 AM1_3743     TRUE 0.937 117.000 0.750 0.026 Y NA
 3461906 3461907 AM1_3744 AM1_3745     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3461907 3461908 AM1_3745 AM1_3746     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3461910 3461911 AM1_3748 AM1_3749     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3461911 3461912 AM1_3749 AM1_3750     FALSE 0.047 419.000 0.000 NA   NA
 3461913 3461914 AM1_3751 AM1_3752 dacB   FALSE 0.384 65.000 0.000 1.000 N NA
 3461915 3461916 AM1_3753 AM1_3754 menC menE TRUE 0.916 47.000 0.283 1.000 N NA
 3461917 3461918 AM1_3755 AM1_3756     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3461918 3461919 AM1_3756 AM1_3757     FALSE 0.044 447.000 0.000 NA   NA
 3461922 3461923 AM1_3760 AM1_3761     FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3461923 3461924 AM1_3761 AM1_3763     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3461924 3461925 AM1_3763 AM1_3764     FALSE 0.048 411.000 0.000 NA   NA
 3461925 3461926 AM1_3764 AM1_3765     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3461926 3461927 AM1_3765 AM1_3767     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3461928 3461929 AM1_3766 AM1_3768     FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3461929 3461930 AM1_3768 AM1_3769     TRUE 0.866 88.000 0.433 NA   NA
 3461931 3461932 AM1_3770 AM1_3771     TRUE 0.870 84.000 0.103 1.000   NA
 3461933 3461934 AM1_3772 AM1_3773     TRUE 0.909 21.000 0.021 NA   NA
 3461934 3461935 AM1_3773 AM1_3774     FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3461935 3461936 AM1_3774 AM1_3775     FALSE 0.137 185.000 0.000 NA   NA
 3461937 3461938 AM1_3776 AM1_3777 lipA   FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3461938 3461939 AM1_3777 AM1_3778     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3461939 3461940 AM1_3778 AM1_3779     FALSE 0.096 297.000 0.000 1.000   NA
 3461941 3461942 AM1_3780 AM1_3781     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3461944 3461945 AM1_3783 AM1_3784     TRUE 0.565 56.000 0.000 0.025   NA
 3461945 3461946 AM1_3784 AM1_3785     FALSE 0.165 202.000 0.000 1.000   NA
 3461947 3461948 AM1_3786 AM1_3787 nusB   TRUE 0.876 55.000 0.004 1.000   NA
 3461948 3461949 AM1_3787 AM1_3788     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3461949 3461950 AM1_3788 AM1_3789     FALSE 0.093 235.000 0.000 NA   NA
 3461950 3461951 AM1_3789 AM1_3791     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3461952 3461953 AM1_3790 AM1_3792     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3461955 3461956 AM1_3793 AM1_3795   psbQ FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3461956 3461957 AM1_3795 AM1_3796 psbQ   FALSE 0.132 191.000 0.000 NA   NA
 3461959 3461960 AM1_3798 AM1_3799   psbI FALSE 0.040 495.000 0.000 NA   NA
 3461960 3461961 AM1_3799 AM1_3800 psbI   TRUE 0.894 54.000 0.081 NA   NA
 3461964 3461965 AM1_3803 AM1_3804     FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3461965 3461966 AM1_3804 AM1_3805     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3461968 3461969 AM1_3807 AM1_3808     FALSE 0.059 483.000 0.000 1.000   NA
 3461969 3461970 AM1_3808 AM1_3809     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3461970 3461971 AM1_3809 AM1_3810     TRUE 0.827 93.000 0.070 NA   NA
 3461972 3461973 AM1_3811 AM1_3812     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3461973 3461974 AM1_3812 AM1_3813     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3461974 3461975 AM1_3813 AM1_3814     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3461977 3461978 AM1_3816 AM1_3817     FALSE 0.126 196.000 0.000 NA   NA
 3461978 3461979 AM1_3817 AM1_3818     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3461979 3461980 AM1_3818 AM1_3819     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3461983 3461984 AM1_3822 AM1_3824 moaB   FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3461987 3461988 AM1_3826 AM1_3827     FALSE 0.138 226.000 0.000 1.000   NA
 3461988 3461989 AM1_3827 AM1_3828     FALSE 0.137 185.000 0.000 NA   NA
 3461990 3461991 AM1_3830 AM1_3831     TRUE 0.460 61.000 0.000 1.000   NA
 3461996 3461997 AM1_3836 AM1_3837     FALSE 0.089 244.000 0.000 NA   NA
 3461997 3461998 AM1_3837 AM1_3838     FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3462000 3462001 AM1_3840 AM1_3841     FALSE 0.201 175.000 0.000 1.000   NA
 3462001 3462002 AM1_3841 AM1_3842     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3462002 3462003 AM1_3842 AM1_3843     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3462003 3462004 AM1_3843 AM1_3844     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3462004 3462005 AM1_3844 AM1_3845   prfC FALSE 0.169 169.000 0.000 1.000 N NA
 3462005 3462006 AM1_3845 AM1_3846 prfC   FALSE 0.259 101.000 0.000 1.000 N NA
 3462006 3462007 AM1_3846 AM1_3847     FALSE 0.040 493.000 0.000 NA   NA
 3462007 3462008 AM1_3847 AM1_3848     TRUE 0.887 72.000 0.241 NA   NA
 3462009 3462010 AM1_3849 AM1_3850   tgt FALSE 0.108 215.000 0.000 NA   NA
 3462010 3462011 AM1_3850 AM1_3851 tgt psbK TRUE 0.689 186.000 0.034 1.000   NA
 3462014 3462015 AM1_3854 AM1_3855     FALSE 0.185 144.000 0.000 NA   NA
 3462015 3462016 AM1_3855 AM1_3856     FALSE 0.043 454.000 0.000 NA   NA
 3462016 3462017 AM1_3856 AM1_3857     FALSE 0.363 -49.000 0.000 NA   NA
 3462017 3462018 AM1_3857 AM1_3858     FALSE 0.100 224.000 0.000 NA   NA
 3462019 3462020 AM1_3859 AM1_3860     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3462021 3462022 AM1_3861 AM1_3862     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3462022 3462023 AM1_3862 AM1_3863     TRUE 0.683 15.000 0.000 0.078   NA
 3462023 3462024 AM1_3863 AM1_3864     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462026 3462027 AM1_3866 AM1_3867     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3462027 3462028 AM1_3867 AM1_3868     TRUE 0.503 38.000 0.000 1.000   NA
 3462028 3462029 AM1_3868 AM1_3869     TRUE 0.590 34.000 0.000 0.086   NA
 3462029 3462030 AM1_3869 AM1_3870     FALSE 0.071 625.000 0.000 0.016   NA
 3462030 3462031 AM1_3870 AM1_3871     FALSE 0.059 1033.000 0.000 0.030   NA
 3462031 3462032 AM1_3871 AM1_3872     FALSE 0.095 232.000 0.000 NA   NA
 3462032 3462033 AM1_3872 AM1_3873     FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3462033 3462034 AM1_3873 AM1_3874     FALSE 0.148 174.000 0.000 NA   NA
 3462035 3462036 AM1_3875 AM1_3877     FALSE 0.228 157.000 0.000 1.000   NA
 3462037 3462038 AM1_3876 AM1_3878     TRUE 0.946 6.000 0.071 NA   NA
 3462038 3462039 AM1_3878 AM1_3879     FALSE 0.165 159.000 0.000 NA   NA
 3462039 3462040 AM1_3879 AM1_3880   cysI TRUE 0.610 31.000 0.000 0.038   NA
 3462040 3462041 AM1_3880 AM1_3881 cysI   FALSE 0.402 373.000 0.036 NA   NA
 3462042 3462043 AM1_3882 AM1_3883 accD   FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3462043 3462044 AM1_3883 AM1_3884     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3462044 3462045 AM1_3884 AM1_3885   psbV FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3462045 3462046 AM1_3885 AM1_3886 psbV   TRUE 0.853 122.000 0.242 0.009   NA
 3462046 3462047 AM1_3886 AM1_3887   petJ FALSE 0.181 242.000 0.000 0.009   NA
 3462047 3462048 AM1_3887 AM1_3888 petJ   FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3462048 3462049 AM1_3888 AM1_3889     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3462049 3462050 AM1_3889 AM1_3890     TRUE 0.433 92.000 0.000 0.033   NA
 3462050 3462051 AM1_3890 AM1_3891     FALSE 0.343 93.000 0.000 1.000   NA
 3462052 3462053 AM1_3892 AM1_3893     FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3462053 3462054 AM1_3893 AM1_3894     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462054 3462055 AM1_3894 AM1_3895     FALSE 0.215 119.000 0.000 NA   NA
 3462055 3462056 AM1_3895 AM1_3896   clpS TRUE 0.953 4.000 0.255 NA   NA
 3462057 3462058 AM1_3897 AM1_3898   hli FALSE 0.100 283.000 0.000 1.000   NA
 3462058 3462059 AM1_3898 AM1_3899 hli   FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3462059 3462060 AM1_3899 AM1_3900     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3462060 3462061 AM1_3900 AM1_3901     FALSE 0.040 494.000 0.000 NA   NA
 3462061 3462062 AM1_3901 AM1_3902     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3462067 3462068 AM1_3907 AM1_3908 ileS   FALSE 0.262 134.000 0.000 1.000   NA
 3462068 3462069 AM1_3908 AM1_3909     FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3462069 3462070 AM1_3909 AM1_3910     TRUE 0.825 120.000 1.000 NA   NA
 3462070 3462071 AM1_3910 AM1_3911     FALSE 0.078 265.000 0.000 NA   NA
 3462071 3462072 AM1_3911 AM1_3912     FALSE 0.209 123.000 0.000 NA   NA
 3462072 3462073 AM1_3912 AM1_3913     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3462077 3462078 AM1_3917 AM1_3918 recR mutY TRUE 0.956 43.000 0.003 0.029 Y NA
 3462079 3462080 AM1_3919 AM1_3920     FALSE 0.042 462.000 0.000 NA   NA
 3462080 3462081 AM1_3920 AM1_3921     FALSE 0.071 283.000 0.000 NA   NA
 3462081 3462082 AM1_3921 AM1_3922     FALSE 0.136 186.000 0.000 NA   NA
 3462082 3462083 AM1_3922 AM1_3923     FALSE 0.409 38.000 0.000 NA   NA
 3462083 3462084 AM1_3923 AM1_3924     TRUE 0.755 88.000 0.000 0.025 Y NA
 3462085 3462086 AM1_3925 AM1_3926 rpoD   FALSE 0.076 292.000 0.000 1.000 N NA
 3462087 3462088 AM1_3927 AM1_3928     TRUE 0.750 133.000 0.037 NA   NA
 3462088 3462089 AM1_3928 AM1_3929     FALSE 0.044 444.000 0.000 NA   NA
 3462089 3462090 AM1_3929 AM1_3931     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462093 3462094 AM1_3932 AM1_3934 accB efp TRUE 0.938 16.000 0.120 1.000 N NA
 3462096 3462097 AM1_3935 AM1_3937     TRUE 0.481 217.000 0.000 0.030 Y NA
 3462097 3462098 AM1_3937 AM1_3938   exoD FALSE 0.051 384.000 0.000 NA   NA
 3462099 3462100 AM1_3939 AM1_3940   ahcY FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3462100 3462101 AM1_3940 AM1_3942 ahcY   FALSE 0.106 274.000 0.000 1.000   NA
 3462102 3462103 AM1_3941 AM1_3943     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3462103 3462104 AM1_3943 AM1_3944   hemC FALSE 0.216 132.000 0.000 1.000 N NA
 3462104 3462105 AM1_3944 AM1_3945 hemC   FALSE 0.176 162.000 0.000 1.000 N NA
 3462110 3462111 AM1_3950 AM1_3951     FALSE 0.134 189.000 0.000 NA   NA
 3462112 3462113 AM1_3952 AM1_3953     FALSE 0.129 238.000 0.000 1.000   NA
 3462113 3462114 AM1_3953 AM1_3954     FALSE 0.081 349.000 0.000 1.000   NA
 3462115 3462116 AM1_3955 AM1_3956     FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 3462117 3462118 AM1_3957 AM1_3958     FALSE 0.374 58.000 0.000 NA   NA
 3462118 3462119 AM1_3958 AM1_3959     FALSE 0.051 382.000 0.000 NA   NA
 3462119 3462120 AM1_3959 AM1_3960     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3462120 3462121 AM1_3960 AM1_3961     TRUE 0.931 28.000 0.667 NA   NA
 3462121 3462122 AM1_3961 AM1_3962   scpA FALSE 0.047 421.000 0.000 NA   NA
 3462122 3462123 AM1_3962 AM1_3963 scpA   TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3462125 3462126 AM1_3965 AM1_3966 nadB psbU TRUE 0.730 154.000 0.021 1.000   NA
 3462126 3462127 AM1_3966 AM1_3967 psbU   TRUE 0.791 140.000 0.100 1.000   NA
 3462127 3462128 AM1_3967 AM1_3968     FALSE 0.399 59.000 0.000 1.000 N NA
 3462130 3462131 AM1_3970 AM1_3971     FALSE 0.419 73.000 0.000 1.000   NA
 3462131 3462132 AM1_3971 AM1_3972     TRUE 0.956 35.000 0.044 NA Y NA
 3462134 3462135 AM1_3974 AM1_3975     FALSE 0.039 508.000 0.000 NA   NA
 3462136 3462137 AM1_3976 AM1_3977     FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3462139 3462140 AM1_3979 AM1_3980 gloA   FALSE 0.199 131.000 0.000 NA   NA
 3462140 3462141 AM1_3980 AM1_3981     FALSE 0.139 183.000 0.000 NA   NA
 3462144 3462145 AM1_3984 AM1_3985 ispD   TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3462148 3462149 AM1_3988 AM1_3989     TRUE 0.944 4.000 0.042 1.000 N NA
 3462149 3462150 AM1_3989 AM1_3990     TRUE 0.798 96.000 0.005 1.000   NA
 3462150 3462151 AM1_3990 AM1_3991   hisZ TRUE 0.937 1.000 0.006 1.000   NA
 3462151 3462152 AM1_3991 AM1_3992 hisZ hisG TRUE 0.970 50.000 0.239 0.002 Y NA
 3462155 3462156 AM1_3995 AM1_3996     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3462156 3462157 AM1_3996 AM1_3997     TRUE 0.851 79.000 0.045 NA   NA
 3462161 3462162 AM1_4001 AM1_4002   gltA TRUE 0.843 24.000 0.000 1.000 Y NA
 3462162 3462163 AM1_4002 AM1_4003 gltA   FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3462164 3462165 AM1_4004 AM1_4005     FALSE 0.149 173.000 0.000 NA   NA
 3462165 3462166 AM1_4005 AM1_4006     FALSE 0.042 476.000 0.000 NA   NA
 3462166 3462167 AM1_4006 AM1_4007     FALSE 0.032 678.000 0.000 NA   NA
 3462167 3462168 AM1_4007 AM1_4008     FALSE 0.035 595.000 0.000 NA   NA
 3462169 3462170 AM1_4009 AM1_4010     FALSE 0.415 35.000 0.000 NA   NA
 3462170 3462171 AM1_4010 AM1_4011     FALSE 0.052 378.000 0.000 NA   NA
 3462171 3462172 AM1_4011 AM1_4012     FALSE 0.028 1736.000 0.000 NA   NA
 3462173 3462174 AM1_4013 AM1_4014     FALSE 0.216 118.000 0.000 NA   NA
 3462174 3462175 AM1_4014 AM1_4015     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3462175 3462176 AM1_4015 AM1_4016     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3462176 3462177 AM1_4016 AM1_4017     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3462177 3462178 AM1_4017 AM1_4018     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3462180 3462181 AM1_4020 AM1_4021     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3462181 3462182 AM1_4021 AM1_4022     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3462183 3462184 AM1_4023 AM1_4024     TRUE 0.890 97.000 1.000 0.002   NA
 3462184 3462185 AM1_4024 AM1_4025     FALSE 0.087 248.000 0.000 NA   NA
 3462185 3462186 AM1_4025 AM1_4026     FALSE 0.034 612.000 0.000 NA   NA
 3462186 3462187 AM1_4026 AM1_4027     FALSE 0.124 198.000 0.000 NA   NA
 3462187 3462188 AM1_4027 AM1_4028     TRUE 0.907 24.000 0.005 1.000   NA
 3462188 3462189 AM1_4028 AM1_4029     TRUE 0.886 45.000 0.027 NA   NA
 3462189 3462190 AM1_4029 AM1_4030     TRUE 0.868 73.000 0.066 NA   NA
 3462190 3462191 AM1_4030 AM1_4031     TRUE 0.943 0.000 0.090 NA   NA
 3462192 3462193 AM1_4032 AM1_4033   ubiH FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3462196 3462197 AM1_4036 AM1_4037     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3462200 3462201 AM1_4040 AM1_4041     FALSE 0.101 280.000 0.000 1.000   NA
 3462201 3462202 AM1_4041 AM1_4042     TRUE 0.651 273.000 0.659 0.032   NA
 3462203 3462204 AM1_4043 AM1_4044     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3462204 3462205 AM1_4044 AM1_4045     FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3462208 3462209 AM1_4048 AM1_4049     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3462210 3462211 AM1_4050 AM1_4051     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3462213 3462214 AM1_4052 AM1_4054     TRUE 0.855 80.000 0.017 0.084 N NA
 3462214 3462215 AM1_4054 AM1_4055     TRUE 0.966 70.000 0.524 0.003 Y NA
 3462215 3462216 AM1_4055 AM1_4056     TRUE 0.891 194.000 0.762 0.003 Y NA
 3462216 3462217 AM1_4056 AM1_4057     TRUE 0.983 7.000 0.857 1.000 Y NA
 3462219 3462220 AM1_4059 AM1_4060     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3462220 3462221 AM1_4060 AM1_4061     FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3462222 3462223 AM1_4062 AM1_4063     FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3462223 3462224 AM1_4063 AM1_4064   nth TRUE 0.937 4.000 0.018 1.000 N NA
 3462224 3462225 AM1_4064 AM1_4065 nth rpsN TRUE 0.832 79.000 0.010 1.000 N NA
 3462226 3462227 AM1_4066 AM1_4067     TRUE 0.900 50.000 0.100 NA   NA
 3462227 3462228 AM1_4067 AM1_4068   coaD TRUE 0.906 21.000 0.015 NA   NA
 3462230 3462231 AM1_4069 AM1_4071     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3462234 3462235 AM1_4074 AM1_4075     TRUE 0.574 12.000 0.000 1.000 N NA
 3462236 3462237 AM1_4076 AM1_4077     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3462239 3462240 AM1_4079 AM1_4080     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3462240 3462241 AM1_4080 AM1_4081     FALSE 0.104 219.000 0.000 NA   NA
 3462241 3462242 AM1_4081 AM1_4082     TRUE 0.531 29.000 0.000 1.000   NA
 3462242 3462243 AM1_4082 AM1_4083     FALSE 0.291 85.000 0.000 NA   NA
 3462243 3462244 AM1_4083 AM1_4084   psbD FALSE 0.046 425.000 0.000 NA   NA
 3462244 3462245 AM1_4084 AM1_4085 psbD   FALSE 0.110 264.000 0.000 1.000   NA
 3462245 3462246 AM1_4085 AM1_4086     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3462246 3462247 AM1_4086 AM1_4087     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3462247 3462248 AM1_4087 AM1_4088     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3462248 3462249 AM1_4088 AM1_4089     FALSE 0.054 362.000 0.000 NA   NA
 3462249 3462250 AM1_4089 AM1_4090     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3462250 3462251 AM1_4090 AM1_4091     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3462251 3462252 AM1_4091 AM1_4092     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3462252 3462253 AM1_4092 AM1_4093     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3462253 3462254 AM1_4093 AM1_4094   gntK FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3462254 3462255 AM1_4094 AM1_4095 gntK   FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3462255 3462256 AM1_4095 AM1_4096     FALSE 0.134 189.000 0.000 NA   NA
 3462256 3462257 AM1_4096 AM1_4097     FALSE 0.038 511.000 0.000 NA   NA
 3462258 3462259 AM1_4098 AM1_4099 rpsP   TRUE 0.952 12.000 0.385 NA   NA
 3462259 3462260 AM1_4099 AM1_4100   phoH TRUE 0.761 98.000 0.002 NA   NA
 3462261 3462262 AM1_4101 AM1_4102     FALSE 0.053 369.000 0.000 NA   NA
 3462265 3462266 AM1_4105 AM1_4107   rnhB FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3462267 3462268 AM1_4106 AM1_4108 trmD argB FALSE 0.216 132.000 0.000 1.000 N NA
 3462268 3462269 AM1_4108 AM1_4109 argB   FALSE 0.072 279.000 0.000 NA   NA
 3462270 3462271 AM1_4110 AM1_4111     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3462271 3462272 AM1_4111 AM1_4112     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 3462272 3462273 AM1_4112 AM1_4113     FALSE 0.170 155.000 0.000 NA   NA
 3462273 3462274 AM1_4113 AM1_4114     FALSE 0.029 1216.000 0.000 NA   NA
 3462274 3462275 AM1_4114 AM1_4115     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3462275 3462276 AM1_4115 AM1_4116     FALSE 0.079 261.000 0.000 NA   NA
 3462276 3462277 AM1_4116 AM1_4117     FALSE 0.139 183.000 0.000 NA   NA
 3462277 3462278 AM1_4117 AM1_4118     FALSE 0.092 238.000 0.000 NA   NA
 3462278 3462279 AM1_4118 AM1_4119     TRUE 0.920 110.000 0.154 1.000 Y NA
 3462284 3462285 AM1_4124 AM1_4125   ppk FALSE 0.284 120.000 0.000 1.000   NA
 3462286 3462287 AM1_4126 AM1_4127     FALSE 0.178 149.000 0.000 NA   NA
 3462290 3462291 AM1_4130 AM1_4131     FALSE 0.322 75.000 0.000 NA   NA
 3462292 3462293 AM1_4132 AM1_4133   epsH FALSE 0.238 101.000 0.000 NA   NA
 3462293 3462294 AM1_4133 AM1_4134 epsH   FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3462294 3462295 AM1_4134 AM1_4135     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3462295 3462296 AM1_4135 AM1_4136     FALSE 0.158 179.000 0.000 1.000 N NA
 3462296 3462297 AM1_4136 AM1_4137   ffh FALSE 0.408 54.000 0.000 1.000 N NA
 3462298 3462299 AM1_4138 AM1_4139     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3462300 3462301 AM1_4140 AM1_4141     FALSE 0.035 576.000 0.000 NA   NA
 3462305 3462306 AM1_4145 AM1_4146     FALSE 0.191 139.000 0.000 NA   NA
 3462309 3462310 AM1_4149 AM1_4150 ung   FALSE 0.065 310.000 0.000 NA   NA
 3462310 3462311 AM1_4150 AM1_4151     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3462311 3462312 AM1_4151 AM1_4152     FALSE 0.119 202.000 0.000 NA   NA
 3462312 3462313 AM1_4152 AM1_4153     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3462313 3462314 AM1_4153 AM1_4154     FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3462314 3462315 AM1_4154 AM1_4155     FALSE 0.203 128.000 0.000 NA   NA
 3462316 3462317 AM1_4156 AM1_4157     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3462317 3462318 AM1_4157 AM1_4158     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3462318 3462319 AM1_4158 AM1_4159     TRUE 0.957 3.000 0.875 NA   NA
 3462319 3462320 AM1_4159 AM1_4160     TRUE 0.952 1.000 0.250 NA   NA
 3462322 3462323 AM1_4162 AM1_4163     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3462323 3462324 AM1_4163 AM1_4164     FALSE 0.041 480.000 0.000 NA   NA
 3462324 3462325 AM1_4164 AM1_4165     TRUE 0.824 113.000 0.444 NA   NA
 3462325 10702639 AM1_4165 AM1_4166     FALSE 0.153 170.000 0.000 NA   NA
 10702639 3462326 AM1_4166 AM1_4167     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3462326 3462327 AM1_4167 AM1_4168     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3462330 3462331 AM1_4171 AM1_4172     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3462331 3462332 AM1_4172 AM1_4173     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3462336 3462337 AM1_4177 AM1_4178     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3462338 3462339 AM1_4179 AM1_4180     FALSE 0.070 287.000 0.000 NA   NA
 3462339 3462340 AM1_4180 AM1_4181     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3462340 3462341 AM1_4181 AM1_4182     FALSE 0.140 182.000 0.000 NA   NA
 3462341 3462342 AM1_4182 AM1_4183     FALSE 0.220 113.000 0.000 NA   NA
 3462342 3462343 AM1_4183 AM1_4184     FALSE 0.067 297.000 0.000 NA   NA
 3462345 3462346 AM1_4186 AM1_4187     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3462347 3462348 AM1_4188 AM1_4189     FALSE 0.173 153.000 0.000 NA   NA
 3462349 3462350 AM1_4190 AM1_4191     FALSE 0.094 301.000 0.000 1.000   NA
 3462350 3462351 AM1_4191 AM1_4192     FALSE 0.088 245.000 0.000 NA   NA
 3462352 3462353 AM1_4193 AM1_4194     TRUE 0.586 47.000 0.000 0.024   NA
 3462353 3462354 AM1_4194 AM1_4195     TRUE 0.433 70.000 0.000 1.000   NA
 3462354 3462355 AM1_4195 AM1_4196     FALSE 0.303 150.000 0.000 0.076   NA
 3462355 3462356 AM1_4196 AM1_4197     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3462356 3462357 AM1_4197 AM1_4198     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3462357 3462358 AM1_4198 AM1_4199     FALSE 0.068 296.000 0.000 NA   NA
 3462358 3462359 AM1_4199 AM1_4200     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3462360 3462361 AM1_4201 AM1_4202     FALSE 0.129 194.000 0.000 NA   NA
 3462361 3462362 AM1_4202 AM1_4203     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3462362 3462363 AM1_4203 AM1_4204     FALSE 0.209 123.000 0.000 NA   NA
 3462363 3462364 AM1_4204 AM1_4205     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3462364 3462365 AM1_4205 AM1_4206     FALSE 0.313 78.000 0.000 NA   NA
 3462365 3462366 AM1_4206 AM1_4207     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3462367 3462368 AM1_4208 AM1_4209     FALSE 0.031 740.000 0.000 NA   NA
 3462370 3462371 AM1_4211 AM1_4212     FALSE 0.314 101.000 0.000 1.000   NA
 3462371 3462372 AM1_4212 AM1_4213     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3462374 3462375 AM1_4215 AM1_4216   zam TRUE 0.477 53.000 0.000 1.000   NA
 3462375 3462376 AM1_4216 AM1_4217 zam phoU FALSE 0.328 487.000 0.049 NA N NA
 3462376 3462377 AM1_4217 AM1_4218 phoU   FALSE 0.108 215.000 0.000 NA   NA
 3462378 3462379 AM1_4219 AM1_4220     FALSE 0.112 210.000 0.000 NA   NA
 3462380 3462381 AM1_4221 AM1_4222     FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3462381 3462382 AM1_4222 AM1_4223     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3462382 3462383 AM1_4223 AM1_4224     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3462384 3462385 AM1_4225 AM1_4226     FALSE 0.106 217.000 0.000 NA   NA
 3462385 3462386 AM1_4226 AM1_4228     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3462391 3462392 AM1_4232 AM1_4233     FALSE 0.394 -34.000 0.000 NA   NA
 3462395 3462396 AM1_4236 AM1_4237     TRUE 0.903 51.000 0.143 NA   NA
 3462396 3462397 AM1_4237 AM1_4238     TRUE 0.918 49.000 0.762 NA   NA
 3462397 3462398 AM1_4238 AM1_4239     FALSE 0.171 154.000 0.000 NA   NA
 3462398 3462399 AM1_4239 AM1_4240     TRUE 0.436 69.000 0.000 1.000   NA
 3462399 3462400 AM1_4240 AM1_4241     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3462400 3462401 AM1_4241 AM1_4242     FALSE 0.384 -40.000 0.000 NA   NA
 3462404 3462405 AM1_4245 AM1_4246 cobQ   TRUE 0.937 0.000 0.036 NA   NA
 3462405 3462406 AM1_4246 AM1_4247     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3462406 3462407 AM1_4247 AM1_4248     TRUE 0.841 79.000 0.029 NA   NA
 3462408 3462409 AM1_4249 AM1_4250     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3462409 3462410 AM1_4250 AM1_4251     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3462410 3462411 AM1_4251 AM1_4252     FALSE 0.079 261.000 0.000 NA   NA
 3462411 3462412 AM1_4252 AM1_4253     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3462412 3462413 AM1_4253 AM1_4254     FALSE 0.322 75.000 0.000 NA   NA
 3462413 3462414 AM1_4254 AM1_4255     FALSE 0.118 203.000 0.000 NA   NA
 3462414 3462415 AM1_4255 AM1_4256     FALSE 0.048 411.000 0.000 NA   NA
 3462415 3462416 AM1_4256 AM1_4257     FALSE 0.372 -46.000 0.000 NA   NA
 3462416 3462417 AM1_4257 AM1_4258     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3462420 3462421 AM1_4261 AM1_4262     FALSE 0.394 -34.000 0.000 NA   NA
 3462421 3462422 AM1_4262 AM1_4263     FALSE 0.081 258.000 0.000 NA   NA
 3462428 3462429 AM1_4269 AM1_4270 vanW   FALSE 0.215 119.000 0.000 NA   NA
 3462429 3462430 AM1_4270 AM1_4271     TRUE 0.942 -10.000 0.361 1.000   NA
 3462431 3462432 AM1_4272 AM1_4273 pgi   FALSE 0.146 176.000 0.000 NA   NA
 3462434 3462435 AM1_4275 AM1_4276     FALSE 0.216 118.000 0.000 NA   NA
 3462435 3462436 AM1_4276 AM1_4278     FALSE 0.055 357.000 0.000 NA   NA
 3462438 3462439 AM1_4279 AM1_4280     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3462442 3462443 AM1_4283 AM1_4284     FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3462445 3462446 AM1_4286 AM1_4287     FALSE 0.033 637.000 0.000 NA   NA
 3462446 3462447 AM1_4287 AM1_4288     TRUE 0.929 26.000 0.333 NA   NA
 3462453 3462454 AM1_4294 AM1_4295     FALSE 0.096 296.000 0.000 1.000   NA
 3462456 3462457 AM1_4297 AM1_4298     FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3462457 3462458 AM1_4298 AM1_4299     FALSE 0.413 74.000 0.000 1.000   NA
 3462458 3462459 AM1_4299 AM1_4300     TRUE 0.551 -48.000 0.000 0.030   NA
 3462459 3462460 AM1_4300 AM1_4301     FALSE 0.184 157.000 0.000 1.000 N NA
 3462460 3462461 AM1_4301 AM1_4302     FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3462464 3462465 AM1_4305 AM1_4306     FALSE 0.144 192.000 0.000 1.000 N NA
 3462466 3462467 AM1_4307 AM1_4308     FALSE 0.195 180.000 0.000 1.000   NA
 3462467 3462468 AM1_4308 AM1_4309     FALSE 0.055 357.000 0.000 NA   NA
 3462468 3462469 AM1_4309 AM1_4310     FALSE 0.199 131.000 0.000 NA   NA
 3462469 3462470 AM1_4310 AM1_4311     FALSE 0.040 492.000 0.000 NA   NA
 3462470 3462471 AM1_4311 AM1_4312     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3462474 3462475 AM1_4315 AM1_4316     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3462475 3462476 AM1_4316 AM1_4317     FALSE 0.041 479.000 0.000 NA   NA
 3462476 3462477 AM1_4317 AM1_4318     FALSE 0.070 289.000 0.000 NA   NA
 3462477 3462478 AM1_4318 AM1_4319     TRUE 0.705 107.000 0.000 0.008 Y NA
 3462478 3462479 AM1_4319 AM1_4320     TRUE 0.714 103.000 0.000 0.008 Y NA
 3462479 3462480 AM1_4320 AM1_4321     TRUE 0.722 99.000 0.000 0.008 Y NA
 3462480 3462481 AM1_4321 AM1_4322     TRUE 0.733 96.000 0.000 0.008 Y NA
 3462481 3462482 AM1_4322 AM1_4323     TRUE 0.744 93.000 0.000 0.008 Y NA
 3462482 3462483 AM1_4323 AM1_4324     FALSE 0.203 174.000 0.000 1.000   NA
 3462485 3462486 AM1_4326 AM1_4327   pex FALSE 0.035 588.000 0.000 NA   NA
 3462486 3462487 AM1_4327 AM1_4328 pex   FALSE 0.087 248.000 0.000 NA   NA
 3462487 3462488 AM1_4328 AM1_4329   hemK FALSE 0.399 -31.000 0.000 NA   NA
 3462488 3462489 AM1_4329 AM1_4330 hemK   FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3462489 3462490 AM1_4330 AM1_4331   ald TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3462490 3462491 AM1_4331 AM1_4332 ald   FALSE 0.375 68.000 0.000 1.000 N NA
 3462491 3462492 AM1_4332 AM1_4333     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3462492 3462493 AM1_4333 AM1_4334     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3462493 3462494 AM1_4334 AM1_4335     FALSE 0.169 156.000 0.000 NA   NA
 3462495 3462496 AM1_4336 AM1_4337     FALSE 0.199 131.000 0.000 NA   NA
 3462499 3462500 AM1_4340 AM1_4342     FALSE 0.138 184.000 0.000 NA   NA
 3462502 3462503 AM1_4343 AM1_4344     FALSE 0.244 147.000 0.000 1.000   NA
 3462503 3462504 AM1_4344 AM1_4345     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3462504 3462505 AM1_4345 AM1_4346     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3462505 3462506 AM1_4346 AM1_4347   pntA FALSE 0.030 791.000 0.000 NA   NA
 3462506 3462507 AM1_4347 AM1_4348 pntA pntB TRUE 0.961 81.000 0.745 0.000 Y NA
 3462507 3462508 AM1_4348 AM1_4349 pntB   FALSE 0.112 261.000 0.000 1.000   NA
 3462508 3462509 AM1_4349 AM1_4350   cpmA TRUE 0.492 46.000 0.000 1.000   NA
 3462509 3462510 AM1_4350 AM1_4351 cpmA   TRUE 0.655 5.000 0.000 1.000   NA
 3462512 3462513 AM1_4353 AM1_4355     TRUE 0.647 1.000 0.000 1.000   NA
 3462514 3462515 AM1_4354 AM1_4356     TRUE 0.897 -19.000 0.005 1.000   NA
 3462515 3462516 AM1_4356 AM1_4357   purN FALSE 0.191 152.000 0.000 1.000 N NA
 3462516 3462517 AM1_4357 AM1_4358 purN   FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3462517 3462518 AM1_4358 AM1_4359     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3462518 3462519 AM1_4359 AM1_4360   trpC TRUE 0.757 112.000 0.015 NA   NA
 3462519 3462520 AM1_4360 AM1_4361 trpC lpdA TRUE 0.839 89.000 0.057 1.000 N NA
 3462520 3462521 AM1_4361 AM1_4362 lpdA   FALSE 0.298 108.000 0.000 1.000   NA
 3462521 3462522 AM1_4362 AM1_4363     FALSE 0.286 119.000 0.000 1.000   NA
 3462523 3462524 AM1_4364 AM1_4365 ftsH   TRUE 0.551 24.000 0.000 1.000   NA
 3462524 3462525 AM1_4365 AM1_4366   cysG TRUE 0.911 29.000 0.022 1.000   NA
 3462525 3462526 AM1_4366 AM1_4367 cysG pyrF TRUE 0.446 34.000 0.000 1.000 N NA
 3462526 3462527 AM1_4367 AM1_4368 pyrF radC FALSE 0.155 181.000 0.000 1.000 N NA
 3462527 3462528 AM1_4368 AM1_4369 radC gapA FALSE 0.189 153.000 0.000 1.000 N NA
 3462529 3462530 AM1_4370 AM1_4371     FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3462531 3462532 AM1_4372 AM1_4373     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3462533 3462534 AM1_4374 AM1_4375 fni   FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3462534 3462535 AM1_4375 AM1_4376     FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3462535 3462536 AM1_4376 AM1_4377     FALSE 0.241 112.000 0.000 1.000 N NA
 3462539 3462540 AM1_4380 AM1_4381     FALSE 0.069 292.000 0.000 NA   NA
 3462540 3462541 AM1_4381 AM1_4382     TRUE 0.928 23.000 0.189 NA   NA
 3462541 3462542 AM1_4382 AM1_4383     FALSE 0.038 530.000 0.000 NA   NA
 3462543 3462544 AM1_4384 AM1_4385     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3462544 3462545 AM1_4385 AM1_4386     FALSE 0.396 60.000 0.000 1.000 N NA
 3462545 3462546 AM1_4386 AM1_4387     TRUE 0.848 84.000 0.051 1.000 N NA
 3462547 3462548 AM1_4388 AM1_4389   tpiA FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3462548 3462549 AM1_4389 AM1_4390 tpiA   FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3462552 3462553 AM1_4393 AM1_4394     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3462553 3462554 AM1_4394 AM1_4395     FALSE 0.079 263.000 0.000 NA   NA
 3462554 3462555 AM1_4395 AM1_4396     TRUE 0.937 21.000 0.561 NA   NA
 3462555 3462556 AM1_4396 AM1_4397     FALSE 0.310 79.000 0.000 NA   NA
 3462557 3462558 AM1_4398 AM1_4399     FALSE 0.113 209.000 0.000 NA   NA
 3462560 3462561 AM1_4401 AM1_4402     FALSE 0.091 240.000 0.000 NA   NA
 3462561 3462562 AM1_4402 AM1_4403     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3462562 3462563 AM1_4403 AM1_4404     FALSE 0.389 51.000 0.000 NA   NA
 3462563 3462564 AM1_4404 AM1_4405     FALSE 0.090 242.000 0.000 NA   NA
 3462564 3462565 AM1_4405 AM1_4406     FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3462565 3462566 AM1_4406 AM1_4407     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3462566 3462567 AM1_4407 AM1_4409     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3462567 3462568 AM1_4409 AM1_4410     FALSE 0.143 179.000 0.000 NA   NA
 3462569 3462570 AM1_4411 AM1_4412 groL groS TRUE 0.945 103.000 0.905 0.006 Y NA
 3462570 3462571 AM1_4412 AM1_4413 groS pyrR FALSE 0.164 173.000 0.000 1.000 N NA
 3462573 3462574 AM1_4415 AM1_4416 argH   TRUE 0.882 37.000 0.013 NA   NA
 3462574 3462575 AM1_4416 AM1_4417     FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3462575 3462576 AM1_4417 AM1_4418     FALSE 0.136 186.000 0.000 NA   NA
 3462576 3462577 AM1_4418 AM1_4419     FALSE 0.036 570.000 0.000 NA   NA
 3462577 3462578 AM1_4419 AM1_4420     FALSE 0.035 578.000 0.000 NA   NA
 3462578 3462579 AM1_4420 AM1_4421   aspS FALSE 0.149 187.000 0.000 1.000 N NA
 3462579 3462580 AM1_4421 AM1_4422 aspS   FALSE 0.038 521.000 0.000 NA   NA
 3462580 3462581 AM1_4422 AM1_4423     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3462583 3462584 AM1_4425 AM1_4426   psb27 TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3462585 3462586 AM1_4427 AM1_4428 cbiD guaA TRUE 0.729 145.000 0.023 1.000 N NA
 3462586 3462587 AM1_4428 AM1_4429 guaA   FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3462590 3462591 AM1_4432 AM1_4433     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3462591 3462592 AM1_4433 AM1_4434     FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3462592 3462593 AM1_4434 AM1_4435     FALSE 0.406 -27.000 0.000 NA   NA
 3462593 3462594 AM1_4435 AM1_4436     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3462594 3462595 AM1_4436 AM1_4437     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3462595 3462596 AM1_4437 AM1_4438     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3462596 3462597 AM1_4438 AM1_4439     TRUE 0.929 26.000 0.333 NA   NA
 3462597 3462598 AM1_4439 AM1_4440     FALSE 0.030 846.000 0.000 NA   NA
 3462599 3462600 AM1_4441 AM1_4442     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3462600 3462601 AM1_4442 AM1_4443     TRUE 0.446 66.000 0.000 1.000   NA
 3462606 3462607 AM1_4448 AM1_4449   petA FALSE 0.082 256.000 0.000 NA   NA
 3462607 3462608 AM1_4449 AM1_4450 petA petC TRUE 0.918 74.000 0.881 0.037   NA
 3462611 3462612 AM1_4453 AM1_4454     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3462613 3462614 AM1_4455 AM1_4456     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3462615 3462616 AM1_4457 AM1_4458   thyX FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3462616 3462617 AM1_4458 AM1_4459 thyX   TRUE 0.450 33.000 0.000 1.000 N NA
 3462618 3462619 AM1_4460 AM1_4461     TRUE 0.939 -7.000 0.128 1.000   NA
 3462619 3462620 AM1_4461 AM1_4462   ilvA TRUE 0.655 4.000 0.000 1.000   NA
 3462620 3462621 AM1_4462 AM1_4463 ilvA   FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3462622 3462623 AM1_4464 AM1_4465     TRUE 0.942 -3.000 0.182 NA   NA
 3462623 3462624 AM1_4465 AM1_4466     TRUE 0.956 9.000 0.786 NA   NA
 3462624 3462625 AM1_4466 AM1_4467     TRUE 0.948 19.000 0.800 1.000   NA
 3462625 3462626 AM1_4467 AM1_4468     TRUE 0.927 49.000 0.667 1.000   NA
 3462626 3462627 AM1_4468 AM1_4469   apcA TRUE 0.620 28.000 0.000 0.037   NA
 3462627 3462628 AM1_4469 AM1_4470 apcA   TRUE 0.492 46.000 0.000 1.000   NA
 3462629 3462630 AM1_4471 AM1_4472     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3462630 3462631 AM1_4472 AM1_4473     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3462631 3462632 AM1_4473 AM1_4474     TRUE 0.504 164.000 0.000 NA Y NA
 3462632 3462633 AM1_4474 AM1_4475     TRUE 0.788 39.000 0.000 NA Y NA
 3462635 3462636 AM1_4477 AM1_4478     FALSE 0.215 119.000 0.000 NA   NA
 3462637 3462638 AM1_4479 AM1_4481     FALSE 0.052 380.000 0.000 NA   NA
 3462641 3462642 AM1_4483 AM1_4484     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3462642 3462643 AM1_4484 AM1_4485     TRUE 0.939 0.000 0.045 NA   NA
 3462643 3462644 AM1_4485 AM1_4486     FALSE 0.098 227.000 0.000 NA   NA
 3462644 3462645 AM1_4486 AM1_4487     FALSE 0.217 117.000 0.000 NA   NA
 3462646 3462647 AM1_4488 AM1_4489   epsH FALSE 0.406 -27.000 0.000 NA   NA
 3462647 3462648 AM1_4489 AM1_4490 epsH   TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462655 3462656 AM1_4497 AM1_4498   miaA FALSE 0.393 80.000 0.000 1.000   NA
 3462657 3462658 AM1_4499 AM1_4500 gyrB   TRUE 0.650 9.000 0.000 1.000   NA
 3462659 3462660 AM1_4501 AM1_4502   cdsA TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3462660 3462661 AM1_4502 AM1_4503 cdsA   FALSE 0.091 240.000 0.000 NA   NA
 3462665 3462666 AM1_4507 AM1_4508     FALSE 0.206 125.000 0.000 NA   NA
 3462666 3462667 AM1_4508 AM1_4509     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3462667 3462668 AM1_4509 AM1_4510     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3462668 3462669 AM1_4510 AM1_4511     TRUE 0.947 10.000 0.103 NA   NA
 3462669 3462670 AM1_4511 AM1_4512   purU FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3462671 3462672 AM1_4513 AM1_4514     TRUE 0.468 9.000 0.000 NA N NA
 3462674 3462675 AM1_4516 AM1_4517   xylB TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3462675 3462676 AM1_4517 AM1_4518 xylB   TRUE 0.922 -3.000 0.015 NA   NA
 3462678 3462679 AM1_4520 AM1_4521     TRUE 0.951 13.000 0.429 NA   NA
 3462679 3462680 AM1_4521 AM1_4522     TRUE 0.952 13.000 0.571 NA   NA
 3462681 3462682 AM1_4523 AM1_4524     FALSE 0.325 74.000 0.000 NA   NA
 3462682 3462683 AM1_4524 AM1_4525     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3462683 3462684 AM1_4525 AM1_4526     TRUE 0.931 35.000 0.500 1.000   NA
 3462684 3462685 AM1_4526 AM1_4527     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3462685 3462686 AM1_4527 AM1_4528     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3462686 3462687 AM1_4528 AM1_4529     TRUE 0.928 -13.000 0.250 NA   NA
 3462690 3462691 AM1_4532 AM1_4534     FALSE 0.041 487.000 0.000 NA   NA
 3462692 3462693 AM1_4533 AM1_4535     FALSE 0.067 298.000 0.000 NA   NA
 3462693 3462694 AM1_4535 AM1_4536     TRUE 0.541 168.000 0.000 1.000 Y NA
 3462694 3462695 AM1_4536 AM1_4537     TRUE 0.980 -7.000 0.667 0.028 Y NA
 3462695 3462696 AM1_4537 AM1_4538   argS FALSE 0.047 894.000 0.000 0.081 N NA
 3462696 3462697 AM1_4538 AM1_6424 argS petN FALSE 0.174 196.000 0.000 1.000   NA
 3462698 3462699 AM1_4539 AM1_4540     FALSE 0.363 63.000 0.000 NA   NA
 3462699 3462700 AM1_4540 AM1_4541     TRUE 0.939 -3.000 0.091 1.000 N NA
 3462703 3462704 AM1_4544 AM1_4545     FALSE 0.097 229.000 0.000 NA   NA
 3462704 3462705 AM1_4545 AM1_4546     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3462708 3462709 AM1_4549 AM1_4550   hppD FALSE 0.095 251.000 0.000 1.000 N NA
 3462710 3462711 AM1_4551 AM1_4552     TRUE 0.456 -12.000 0.000 NA   NA
 3462713 3462714 AM1_4554 AM1_4555 pdxA rpsA TRUE 0.890 45.000 0.009 1.000   NA
 3462714 3462715 AM1_4555 AM1_4556 rpsA nrdR TRUE 0.527 246.000 0.025 NA   NA
 3462715 3462716 AM1_4556 AM1_4557 nrdR   TRUE 0.801 86.000 0.004 NA   NA
 3462716 3462717 AM1_4557 AM1_4558     FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3462721 3462722 AM1_4561 AM1_4563     TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3462723 3462724 AM1_4564 AM1_4565 sat   TRUE 0.792 106.000 0.018 1.000   NA
 3462725 3462726 AM1_4566 AM1_4567     TRUE 0.921 0.000 0.002 NA   NA
 3462727 3462728 AM1_4568 AM1_4569 dtd glmS FALSE 0.272 152.000 0.000 0.021 N NA
 3462729 3462730 AM1_4570 AM1_4571     FALSE 0.401 58.000 0.000 1.000 N NA
 3462730 3462731 AM1_4571 AM1_4572     FALSE 0.035 704.000 0.000 1.000 N NA
 3462731 3462732 AM1_4572 AM1_4573     FALSE 0.077 266.000 0.000 NA   NA
 3462732 3462733 AM1_4573 AM1_4574     FALSE 0.050 388.000 0.000 NA   NA
 3462733 3462734 AM1_4574 AM1_4575     FALSE 0.394 -34.000 0.000 NA   NA
 3462734 3462735 AM1_4575 AM1_4576     FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3462735 3462736 AM1_4576 AM1_4577     TRUE 0.944 2.000 0.025 1.000   NA
 3462737 3462738 AM1_4578 AM1_4579     TRUE 0.927 27.000 0.274 NA   NA
 3462738 3462739 AM1_4579 AM1_4580     TRUE 0.886 49.000 0.032 NA   NA
 3462739 3462740 AM1_4580 AM1_4581   lgt FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3462740 3462741 AM1_4581 AM1_4582 lgt cobM TRUE 0.894 54.000 0.061 1.000 N NA
 3462741 3462742 AM1_4582 AM1_4583 cobM hli FALSE 0.050 386.000 0.000 NA   NA
 3462742 3462743 AM1_4583 AM1_4584 hli hli FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3462743 3462744 AM1_4584 AM1_4585 hli hli FALSE 0.059 339.000 0.000 NA   NA
 3462744 3462745 AM1_4585 AM1_4586 hli rpoD FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3462747 3462748 AM1_4588 AM1_4589     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3462748 3462749 AM1_4589 AM1_4590   ftsH TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3462752 3462753 AM1_4593 AM1_4594     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3462753 3462754 AM1_4594 AM1_4595     FALSE 0.392 108.000 0.000 0.011   NA
 3462754 3462755 AM1_4595 AM1_4596     TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3462756 3462757 AM1_4597 AM1_4598 pdxH   TRUE 0.929 14.000 0.004 1.000   NA
 3462757 3462758 AM1_4598 AM1_4599     FALSE 0.363 63.000 0.000 NA   NA
 3462758 3462759 AM1_4599 AM1_4600     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3462759 3462760 AM1_4600 AM1_4601     FALSE 0.033 626.000 0.000 NA   NA
 3462760 3462761 AM1_4601 AM1_4602     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3462761 3462762 AM1_4602 AM1_4603     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3462762 3462763 AM1_4603 AM1_4604     FALSE 0.077 266.000 0.000 NA   NA
 3462763 3462764 AM1_4604 AM1_4605     FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3462766 3462767 AM1_4607 AM1_4608     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3462768 3462769 AM1_4609 AM1_4610     FALSE 0.179 148.000 0.000 NA   NA
 3462770 3462771 AM1_4611 AM1_4612     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3462772 3462773 AM1_4613 AM1_4614     FALSE 0.125 197.000 0.000 NA   NA
 3462773 3462774 AM1_4614 AM1_4615     TRUE 0.939 -3.000 0.114 NA   NA
 3462774 3462775 AM1_4615 AM1_4616     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3462775 3462776 AM1_4616 AM1_4617     TRUE 0.968 27.000 0.091 1.000 Y NA
 3462776 3462777 AM1_4617 AM1_4618   nadC FALSE 0.085 268.000 0.000 1.000 N NA
 3462777 3462778 AM1_4618 AM1_4619 nadC ctaE TRUE 0.591 6.000 0.000 1.000 N NA
 3462778 3462779 AM1_4619 AM1_4620 ctaE ctaD TRUE 0.850 43.000 0.000 0.000 Y NA
 3462779 3462780 AM1_4620 AM1_4621 ctaD coxB TRUE 0.963 68.000 0.132 0.000 Y NA
 3462781 3462782 AM1_4622 AM1_4623   cyoE TRUE 0.955 64.000 0.090 1.000 Y NA
 3462782 3462783 AM1_4623 AM1_4624 cyoE   TRUE 0.446 332.000 0.033 1.000 N NA
 3462783 3462784 AM1_4624 AM1_4625     TRUE 0.899 83.000 0.321 0.080   NA
 3462785 3462786 AM1_4626 AM1_4627     FALSE 0.109 214.000 0.000 NA   NA
 3462788 3462789 AM1_4629 AM1_4630   petH FALSE 0.098 227.000 0.000 NA   NA
 3462789 3462790 AM1_4630 AM1_4631 petH   FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3462791 3462792 AM1_4632 AM1_4633   deoC FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3462792 3462793 AM1_4633 AM1_4634 deoC recO TRUE 0.770 106.000 0.014 1.000 N NA
 3462793 3462794 AM1_4634 AM1_4635 recO   TRUE 0.922 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3462794 3462795 AM1_4635 AM1_4636     TRUE 0.943 6.000 0.039 1.000 N NA
 3462797 3462798 AM1_4638 AM1_4639     FALSE 0.032 677.000 0.000 NA   NA
 3462798 3462799 AM1_4639 AM1_4641     FALSE 0.104 219.000 0.000 NA   NA
 3462800 3462801 AM1_4640 AM1_4642     TRUE 0.747 107.000 0.004 NA   NA
 3462803 3462804 AM1_4644 AM1_4645 minE minD TRUE 0.930 95.000 0.347 NA Y NA
 3462804 3462805 AM1_4645 AM1_4646 minD minC TRUE 0.953 77.000 0.368 1.000 Y NA
 3462805 3462806 AM1_4646 AM1_4647 minC   TRUE 0.923 13.000 0.006 NA   NA
 3462808 3462809 AM1_4649 AM1_4650   dppB FALSE 0.222 206.000 0.000 0.018   NA
 3462809 3462810 AM1_4650 AM1_4651 dppB   TRUE 0.985 9.000 0.267 0.018 Y NA
 3462810 3462811 AM1_4651 AM1_4652     TRUE 0.674 184.000 0.050 NA   NA
 3462814 3462815 AM1_4655 AM1_4656 rpoE   TRUE 0.947 -3.000 0.409 NA   NA
 3462815 3462816 AM1_4656 AM1_4658     TRUE 0.456 -12.000 0.000 NA   NA
 3462817 3462818 AM1_4657 AM1_4659 aroK   TRUE 0.589 3.000 0.000 1.000 N NA
 3462820 3462821 AM1_4661 AM1_4662     FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3462821 3462822 AM1_4662 AM1_4663   def FALSE 0.220 129.000 0.000 1.000 N NA
 3462822 3462823 AM1_4663 AM1_4664 def   FALSE 0.098 228.000 0.000 NA   NA
 3462823 3462824 AM1_4664 AM1_4665   petD FALSE 0.031 762.000 0.000 NA   NA
 3462824 3462825 AM1_4665 AM1_4666 petD petB TRUE 0.858 118.000 0.471 0.067   NA
 3462826 3462827 AM1_4667 AM1_4668     TRUE 0.905 -16.000 0.011 1.000   NA
 3462827 3462828 AM1_4668 AM1_4669     FALSE 0.088 246.000 0.000 NA   NA
 3462831 3462832 AM1_4671 AM1_4673     FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3462834 3462835 AM1_4674 AM1_4676   proB FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3462835 3462836 AM1_4676 AM1_4677 proB   FALSE 0.033 656.000 0.000 NA   NA
 3462837 3462838 AM1_4678 AM1_4679     FALSE 0.154 169.000 0.000 NA   NA
 3462838 3462839 AM1_4679 AM1_4680     FALSE 0.367 87.000 0.000 1.000   NA
 3462839 3462840 AM1_4680 AM1_4682     TRUE 0.454 63.000 0.000 1.000   NA
 3462843 3462844 AM1_4686 AM1_4687     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3462846 3462847 AM1_4689 AM1_4690     FALSE 0.064 311.000 0.000 NA   NA
 3462847 3462848 AM1_4690 AM1_4691     FALSE 0.132 191.000 0.000 NA   NA
 3462848 3462849 AM1_4691 AM1_4692     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3462849 3462850 AM1_4692 AM1_4693     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3462850 3462851 AM1_4693 AM1_4694     FALSE 0.263 93.000 0.000 NA   NA
 3462851 3462852 AM1_4694 AM1_4695     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3462852 3462853 AM1_4695 AM1_4696   rplC FALSE 0.055 354.000 0.000 NA   NA
 3462853 3462854 AM1_4696 AM1_4697 rplC rplD TRUE 0.972 42.000 0.361 0.008 Y NA
 3462854 3462855 AM1_4697 AM1_4698 rplD rplW TRUE 0.980 -7.000 0.513 0.008 Y NA
 3462855 3462856 AM1_4698 AM1_4699 rplW rplB TRUE 0.974 39.000 0.849 0.010 Y NA
 3462856 3462857 AM1_4699 AM1_4700 rplB rpsS TRUE 0.974 42.000 0.820 0.010 Y NA
 3462857 3462858 AM1_4700 AM1_4701 rpsS rplV TRUE 0.986 10.000 0.769 0.010 Y NA
 3462858 3462859 AM1_4701 AM1_4702 rplV rpsC TRUE 0.975 36.000 0.719 0.010 Y NA
 3462859 3462860 AM1_4702 AM1_4703 rpsC rplP TRUE 0.969 64.000 0.828 0.010 Y NA
 3462860 3462861 AM1_4703 AM1_4704 rplP rpmC TRUE 0.986 4.000 0.802 0.008 Y NA
 3462861 3462862 AM1_4704 AM1_4705 rpmC rpsQ TRUE 0.971 54.000 0.828 0.008 Y NA
 3462862 3462863 AM1_4705 AM1_4706 rpsQ rplN TRUE 0.985 12.000 0.791 0.010 Y NA
 3462863 3462864 AM1_4706 AM1_4707 rplN rplX TRUE 0.985 0.000 0.810 0.010 Y NA
 3462864 3462865 AM1_4707 AM1_4708 rplX rplE TRUE 0.972 51.000 0.758 0.008 Y NA
 3462865 3462866 AM1_4708 AM1_4709 rplE rpsH TRUE 0.968 36.000 0.059 0.008 Y NA
 3462866 3462867 AM1_4709 AM1_4710 rpsH rplF TRUE 0.974 39.000 0.808 0.008 Y NA
 3462867 3462868 AM1_4710 AM1_4711 rplF rplR TRUE 0.985 0.000 0.815 0.008 Y NA
 3462868 3462869 AM1_4711 AM1_4712 rplR rpsE TRUE 0.983 15.000 0.814 0.010 Y NA
 3462869 3462870 AM1_4712 AM1_4713 rpsE rplO TRUE 0.965 60.000 0.148 0.010 Y NA
 3462870 3462871 AM1_4713 AM1_4714 rplO secY TRUE 0.923 43.000 0.730 1.000 N NA
 3462871 3462872 AM1_4714 AM1_4715 secY adk TRUE 0.934 0.000 0.020 1.000 N NA
 3462872 3462873 AM1_4715 AM1_4716 adk infA TRUE 0.828 83.000 0.015 1.000 N NA
 3462873 3462874 AM1_4716 AM1_4717 infA   FALSE 0.276 66.000 0.000 NA N NA
 3462874 3462875 AM1_4717 AM1_4718     FALSE 0.162 115.000 0.000 NA N NA
 3462877 3462878 AM1_4720 AM1_4721     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462878 3462879 AM1_4721 AM1_4722     TRUE 0.839 105.000 1.000 NA   NA
 3462879 3462880 AM1_4722 AM1_4723     TRUE 0.502 486.000 0.500 0.002   NA
 3462880 3462881 AM1_4723 AM1_4724     TRUE 0.954 0.000 0.600 NA   NA
 3462881 3462882 AM1_4724 AM1_4725     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3462882 3462883 AM1_4725 AM1_4726     FALSE 0.217 117.000 0.000 NA   NA
 3462883 3462884 AM1_4726 AM1_4727     FALSE 0.081 557.000 0.000 0.002   NA
 3462885 3462886 AM1_4728 AM1_4729     FALSE 0.082 256.000 0.000 NA   NA
 3462886 3462887 AM1_4729 AM1_4730     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3462889 3462890 AM1_4732 AM1_4733     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462890 3462891 AM1_4733 AM1_4734     FALSE 0.093 236.000 0.000 NA   NA
 3462891 3462892 AM1_4734 AM1_4735     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3462893 3462894 AM1_4736 AM1_4737     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3462894 3462895 AM1_4737 AM1_4738     FALSE 0.221 112.000 0.000 NA   NA
 3462895 3462896 AM1_4738 AM1_4739     TRUE 0.551 -12.000 0.000 1.000   NA
 3462898 3462899 AM1_4741 AM1_4742     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3462899 3462900 AM1_4742 AM1_4743   ompA TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462900 3462901 AM1_4743 AM1_4744 ompA   TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3462903 3462904 AM1_4746 AM1_4747     FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3462905 3462906 AM1_4748 AM1_4749     FALSE 0.381 110.000 0.000 0.023   NA
 3462906 3462907 AM1_4749 AM1_4750     TRUE 0.553 62.000 0.000 0.023   NA
 3462907 3462908 AM1_4750 AM1_4751     FALSE 0.054 360.000 0.000 NA   NA
 3462908 3462909 AM1_4751 AM1_4752     FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3462909 3462910 AM1_4752 AM1_4753   ruvB FALSE 0.285 93.000 0.000 1.000 N NA
 3462910 3462911 AM1_4753 AM1_4754 ruvB   FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3462913 3462914 AM1_4756 AM1_4757   fliA FALSE 0.038 528.000 0.000 NA   NA
 3462915 3462916 AM1_4758 AM1_4759     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3462917 3462918 AM1_4760 AM1_4761   purK TRUE 0.532 16.000 0.000 1.000 N NA
 3462918 3462919 AM1_4761 AM1_4762 purK   TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3462919 3462920 AM1_4762 AM1_4763     TRUE 0.863 92.000 0.800 NA   NA
 3462921 3462922 AM1_4764 AM1_4766     FALSE 0.080 260.000 0.000 NA   NA
 3462924 3462925 AM1_4767 AM1_4768 glpD   TRUE 0.969 29.000 0.028 0.000 Y NA
 3462925 3462926 AM1_4768 AM1_4769     FALSE 0.085 267.000 0.000 1.000 N NA
 3462927 3462928 AM1_4770 AM1_4771     FALSE 0.150 172.000 0.000 NA   NA
 3462928 3462929 AM1_4771 AM1_4772     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3462930 3462931 AM1_4773 AM1_4774     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 11496272 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3053.000 0.000 NA   NA
 11638635 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3053.000 0.000 NA   NA
 11781027 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3053.000 0.000 NA   NA
 11496273 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3090.000 0.000 NA   NA
 11638636 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3090.000 0.000 NA   NA
 11781028 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3090.000 0.000 NA   NA
 11496274 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3125.000 0.000 NA   NA
 11638637 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3125.000 0.000 NA   NA
 11781029 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3125.000 0.000 NA   NA
 11496275 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3162.000 0.000 NA   NA
 11638638 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3162.000 0.000 NA   NA
 11781030 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3162.000 0.000 NA   NA
 11496276 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3197.000 0.000 NA   NA
 11638639 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3197.000 0.000 NA   NA
 11781031 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3197.000 0.000 NA   NA
 11496277 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3234.000 0.000 NA   NA
 11638640 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3234.000 0.000 NA   NA
 11781032 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3234.000 0.000 NA   NA
 11496278 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3269.000 0.000 NA   NA
 11638641 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3269.000 0.000 NA   NA
 11781033 3462926   AM1_4769     FALSE NA 3269.000 0.000 NA   NA
 3462932 3462933 AM1_4775 AM1_4776     FALSE 0.156 167.000 0.000 NA   NA
 3462933 3462934 AM1_4776 AM1_4777     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3462934 3462935 AM1_4777 AM1_4778     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3462935 3462936 AM1_4778 AM1_4779     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462936 3462937 AM1_4779 AM1_4780     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3462937 3462938 AM1_4780 AM1_4781     TRUE 0.524 67.000 0.000 0.072   NA
 3462938 3462939 AM1_4781 AM1_4782     TRUE 0.489 -6.000 0.000 NA   NA
 3462941 3462942 AM1_4783 AM1_4785     TRUE 0.456 -12.000 0.000 NA   NA
 3462942 3462943 AM1_4785 AM1_4786     TRUE 0.652 -7.000 0.000 0.072   NA
 3462946 3462947 AM1_4789 AM1_4790     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3462947 3462948 AM1_4790 AM1_4792     FALSE 0.041 480.000 0.000 NA   NA
 3462949 3462950 AM1_4791 AM1_4793     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3462950 3462951 AM1_4793 AM1_4794     TRUE 0.895 -3.000 0.000 0.024 Y NA
 3462951 3462952 AM1_4794 AM1_4795     TRUE 0.811 43.000 0.000 1.000 Y NA
 3462952 3462953 AM1_4795 AM1_4796     TRUE 0.582 -46.000 0.000 0.002   NA
 3462953 3462954 AM1_4796 AM1_4797     FALSE 0.039 509.000 0.000 NA   NA
 3462955 3462956 AM1_4798 AM1_4799     FALSE 0.363 63.000 0.000 NA   NA
 3462956 3462957 AM1_4799 AM1_4800     TRUE 0.954 -3.000 0.500 1.000   NA
 3462957 3462958 AM1_4800 AM1_4801     FALSE 0.197 179.000 0.000 1.000   NA
 3462961 3462962 AM1_4804 AM1_4805   trpB FALSE 0.352 91.000 0.000 1.000   NA
 3462963 3462964 AM1_4806 AM1_4807     FALSE 0.136 186.000 0.000 NA   NA
 3462964 3462965 AM1_4807 AM1_4808     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462968 3462969 AM1_4810 AM1_4812   rpsR TRUE 0.830 86.000 0.027 1.000 N NA
 3462969 3462970 AM1_4812 AM1_4813 rpsR rpmG TRUE 0.968 33.000 0.037 0.007 Y NA
 3462970 3462971 AM1_4813 AM1_4814 rpmG   FALSE 0.041 1463.000 0.000 1.000   NA
 3462972 3462973 AM1_4815 AM1_4817     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3462975 3462976 AM1_4818 AM1_4819   rmlD TRUE 0.583 -6.000 0.000 1.000   NA
 3462977 3462978 AM1_4820 AM1_4821   cutA TRUE 0.898 22.000 0.005 NA   NA
 3462979 3462980 AM1_4822 AM1_4823     FALSE 0.133 249.000 0.000 0.079 N NA
 3462981 3462982 AM1_4824 AM1_4825   psy FALSE 0.251 105.000 0.000 1.000 N NA
 3462982 3462983 AM1_4825 AM1_4826 psy crtP TRUE 0.938 -16.000 0.691 1.000   NA
 3462984 3462985 AM1_4827 AM1_4828     FALSE 0.149 187.000 0.000 1.000 N NA
 3462986 3462987 AM1_4829 AM1_4830     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3462988 3462989 AM1_4831 AM1_4832     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3462989 3462990 AM1_4832 AM1_4833     FALSE 0.287 118.000 0.000 1.000   NA
 3462990 3462991 AM1_4833 AM1_4834     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462991 3462992 AM1_4834 AM1_4835     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3462996 3462997 AM1_4839 AM1_4840 trx   FALSE 0.286 119.000 0.000 1.000   NA
 3462998 3462999 AM1_4841 AM1_4842     FALSE 0.093 236.000 0.000 NA   NA
 3463000 3463001 AM1_4843 AM1_4844     FALSE 0.320 40.000 0.000 NA N NA
 3463005 3463006 AM1_4848 AM1_4849     FALSE 0.039 579.000 0.000 1.000 N NA
 3463007 3463008 AM1_4850 AM1_4851     FALSE 0.047 417.000 0.000 NA   NA
 3463008 3463009 AM1_4851 AM1_4852   chlH FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3463009 3463010 AM1_4852 AM1_4853 chlH   FALSE 0.168 157.000 0.000 NA   NA
 3463010 3463011 AM1_4853 AM1_4854     TRUE 0.912 42.000 0.214 NA   NA
 3463015 3463016 AM1_4857 AM1_4859     TRUE 0.966 6.000 0.259 0.010   NA
 3463018 3463019 AM1_4861 AM1_4862     FALSE 0.033 980.000 0.000 1.000 N NA
 3463019 3463020 AM1_4862 AM1_4863     FALSE 0.047 464.000 0.000 1.000 N NA
 3463020 3463021 AM1_4863 AM1_4864     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3463021 3463022 AM1_4864 AM1_4865     TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3463022 3463023 AM1_4865 AM1_4866     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3463023 3463024 AM1_4866 AM1_4867     FALSE 0.109 214.000 0.000 NA   NA
 3463024 3463025 AM1_4867 AM1_4868   glmU FALSE 0.216 118.000 0.000 NA   NA
 3463026 3463027 AM1_4869 AM1_4870     FALSE 0.036 573.000 0.000 NA   NA
 3463027 3463028 AM1_4870 AM1_4871     FALSE 0.070 289.000 0.000 NA   NA
 3463028 3463029 AM1_4871 AM1_4872   topA TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3463031 3463032 AM1_4874 AM1_4875     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3463032 3463033 AM1_4875 AM1_4877     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3463034 3463035 AM1_4876 AM1_4878     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3463037 3463038 AM1_4880 AM1_4881     FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3463038 3463039 AM1_4881 AM1_4882     FALSE 0.141 181.000 0.000 NA   NA
 3463040 3463041 AM1_4883 AM1_4884     FALSE 0.238 101.000 0.000 NA   NA
 3463041 3463042 AM1_4884 AM1_4885   pep TRUE 0.944 16.000 0.021 0.000   NA
 3463042 3463043 AM1_4885 AM1_4886 pep   FALSE 0.080 352.000 0.000 1.000   NA
 3463044 3463045 AM1_4887 AM1_4888     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3463045 3463046 AM1_4888 AM1_4889   eda FALSE 0.297 109.000 0.000 1.000   NA
 3463046 3463047 AM1_4889 AM1_4890 eda   TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3463047 3463048 AM1_4890 AM1_4891   psb29 TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3463050 3463051 AM1_4893 AM1_4894     TRUE 0.893 58.000 0.220 NA N NA
 3463051 3463052 AM1_4894 AM1_4895     TRUE 0.816 99.000 0.092 NA   NA
 3463053 3463054 AM1_4896 AM1_4897 pncB nadD TRUE 0.962 41.000 0.014 0.001 Y NA
 3463054 3463055 AM1_4897 AM1_4898 nadD   TRUE 0.883 39.000 0.010 1.000 N NA
 3463055 3463056 AM1_4898 AM1_4899   nadE TRUE 0.946 10.000 0.067 1.000 N NA
 3463059 3463060 AM1_4902 AM1_4903 exbD exbB TRUE 0.975 34.000 0.810 0.024 Y NA
 3463061 3463062 AM1_4904 AM1_4905   fcbC TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3463062 3463063 AM1_4905 AM1_4906 fcbC   FALSE 0.041 479.000 0.000 NA   NA
 3463064 3463065 AM1_4907 AM1_4908 chlI lepB FALSE 0.194 150.000 0.000 1.000 N NA
 3463065 3463066 AM1_4908 AM1_4909 lepB sds TRUE 0.899 54.000 0.098 1.000 N NA
 3463066 3463067 AM1_4909 AM1_4910 sds   FALSE 0.235 118.000 0.000 1.000 N NA
 3463068 3463069 AM1_4911 AM1_4912     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3463069 3463070 AM1_4912 AM1_4913   prk FALSE 0.090 242.000 0.000 NA   NA
 3463072 3463073 AM1_4915 AM1_4916 folB hli FALSE 0.116 205.000 0.000 NA   NA
 3463073 3463074 AM1_4916 AM1_4917 hli ftsH FALSE 0.035 588.000 0.000 NA   NA
 3463074 3463075 AM1_4917 AM1_4918 ftsH   FALSE 0.118 203.000 0.000 NA   NA
 3463079 3463080 AM1_4922 AM1_4923     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3463080 3463081 AM1_4923 AM1_4924     FALSE 0.179 148.000 0.000 NA   NA
 3463081 3463082 AM1_4924 AM1_4925     TRUE 0.428 -3.000 0.000 NA N NA
 3463082 3463083 AM1_4925 AM1_4926     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3463083 3463084 AM1_4926 AM1_4927     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3463084 3463085 AM1_4927 AM1_4928     FALSE 0.058 344.000 0.000 NA   NA
 3463085 3463086 AM1_4928 AM1_4929     FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3463086 3463087 AM1_4929 AM1_4930     FALSE 0.170 155.000 0.000 NA   NA
 3463087 3463088 AM1_4930 AM1_4931     FALSE 0.082 256.000 0.000 NA   NA
 3463089 3463090 AM1_4932 AM1_4933     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3463090 3463091 AM1_4933 AM1_4934     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3463092 3463093 AM1_4935 AM1_4936     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3463093 3463094 AM1_4936 AM1_4937     FALSE 0.070 290.000 0.000 NA   NA
 3463094 3463095 AM1_4937 AM1_4938     FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3463095 3463096 AM1_4938 AM1_4939   panF TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3463096 3463097 AM1_4939 AM1_4940 panF   TRUE 0.532 16.000 0.000 1.000 N NA
 3463098 3463099 AM1_4941 AM1_4942     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3463099 3463100 AM1_4942 AM1_4943     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3463102 3463103 AM1_4945 AM1_4946     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3463104 3463105 AM1_4947 AM1_4948     FALSE 0.057 348.000 0.000 NA   NA
 3463105 3463106 AM1_4948 AM1_4949     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3463107 3463108 AM1_4950 AM1_4951 ispH   FALSE 0.168 170.000 0.000 1.000 N NA
 3463108 3463109 AM1_4951 AM1_4952     TRUE 0.978 22.000 0.500 0.078 Y NA
 3463111 3463112 AM1_4954 AM1_4955     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3463112 3463113 AM1_4955 AM1_4956     TRUE 0.888 62.000 0.091 NA   NA
 3463115 3463116 AM1_4958 AM1_4959     FALSE 0.041 487.000 0.000 NA   NA
 3463116 3463117 AM1_4959 AM1_4960     FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3463118 3463119 AM1_4961 AM1_4962     FALSE 0.032 715.000 0.000 NA   NA
 3463121 3463122 AM1_4964 AM1_4965     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3463122 3463123 AM1_4965 AM1_4966     FALSE 0.045 766.000 0.000 1.000   NA
 3463123 3463124 AM1_4966 AM1_4967     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3463124 3463125 AM1_4967 AM1_4968     FALSE 0.079 263.000 0.000 NA   NA
 3463125 3463126 AM1_4968 AM1_4969     FALSE 0.136 186.000 0.000 NA   NA
 3463127 3463128 AM1_4971 AM1_4972     FALSE 0.108 215.000 0.000 NA   NA
 3463128 3463129 AM1_4972 AM1_4973     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3463132 3463133 AM1_4976 AM1_4977     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3463133 3463134 AM1_4977 AM1_4978     FALSE 0.152 214.000 0.000 1.000   NA
 3463134 3463135 AM1_4978 AM1_4979     FALSE 0.055 399.000 0.000 1.000 N NA
 3463136 3463137 AM1_4980 AM1_4981     TRUE 0.688 119.000 0.000 0.010 Y NA
 3463137 3463138 AM1_4981 AM1_4982     FALSE 0.049 610.000 0.000 1.000   NA
 3463138 3463139 AM1_4982 AM1_4983     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3463139 3463140 AM1_4983 AM1_4984   fliA FALSE 0.150 172.000 0.000 NA   NA
 3463140 3463141 AM1_4984 AM1_4985 fliA   FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3463144 3463145 AM1_4988 AM1_4989     TRUE 0.622 14.000 0.000 1.000   NA
 3463145 3463146 AM1_4989 AM1_4990     FALSE 0.411 -25.000 0.000 NA   NA
 3463146 3463147 AM1_4990 AM1_4991     FALSE 0.118 203.000 0.000 NA   NA
 3463147 3463148 AM1_4991 AM1_4992     FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 3463148 3463149 AM1_4992 AM1_4993     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3463150 3463151 AM1_4994 AM1_4995     FALSE 0.116 205.000 0.000 NA   NA
 3463152 3463153 AM1_4996 AM1_4997     FALSE 0.126 196.000 0.000 NA   NA
 3463153 3463154 AM1_4997 AM1_4998     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3463154 3463155 AM1_4998 AM1_4999     FALSE 0.291 85.000 0.000 NA   NA
 3463155 3463156 AM1_4999 AM1_5000     FALSE 0.310 79.000 0.000 NA   NA
 3463157 3463158 AM1_5001 AM1_5002     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3463158 3463159 AM1_5002 AM1_5003   rbn FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3463159 3463160 AM1_5003 AM1_5004 rbn   FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3463160 3463161 AM1_5004 AM1_5005     FALSE 0.154 169.000 0.000 NA   NA
 3463162 3463163 AM1_5006 AM1_5007     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3463163 3463164 AM1_5007 AM1_5009   hli FALSE 0.179 148.000 0.000 NA   NA
 10702641 3463166 AM1_5010 AM1_5012     FALSE 0.031 758.000 0.000 NA   NA
 3463166 3463167 AM1_5012 AM1_5013   ubiG FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3463167 3463168 AM1_5013 AM1_5015 ubiG   TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3463174 3463175 AM1_5020 AM1_5021     FALSE 0.047 420.000 0.000 NA   NA
 3463175 3463176 AM1_5021 AM1_5022     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3463176 3463177 AM1_5022 AM1_5023     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3463177 3463178 AM1_5023 AM1_5024     TRUE 0.959 9.000 0.308 1.000   NA
 3463179 3463180 AM1_5025 AM1_5026   ldh FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3463182 3463183 AM1_5028 AM1_5029     TRUE 0.950 2.000 0.174 NA   NA
 3463183 3463184 AM1_5029 AM1_5030     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3463185 3463186 AM1_5031 AM1_5032 recA   FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3463186 3463187 AM1_5032 AM1_5033     FALSE 0.171 154.000 0.000 NA   NA
 3463187 3463188 AM1_5033 AM1_5034     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3463190 3463191 AM1_5036 AM1_5037     FALSE 0.182 158.000 0.000 1.000 N NA
 3463191 3463192 AM1_5037 AM1_5038     TRUE 0.985 3.000 0.800 0.065 Y NA
 3463192 3463193 AM1_5038 AM1_5039     TRUE 0.867 16.000 0.000 1.000 Y NA
 3463194 3463195 AM1_5040 AM1_5041     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3463195 3463196 AM1_5041 AM1_5042     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3463206 3463207 AM1_5051 AM1_5052     TRUE 0.815 39.000 0.000 1.000 Y NA
 3463207 3463208 AM1_5052 AM1_5053     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3463208 3463209 AM1_5053 AM1_5054     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3463210 3463211 AM1_5055 AM1_5056     TRUE 0.437 215.000 0.000 1.000 Y NA
 3463211 3463212 AM1_5056 AM1_5057     TRUE 0.905 0.000 0.000 0.023 Y NA
 3463212 3463213 AM1_5057 AM1_5058     TRUE 0.978 20.000 0.231 0.014 Y NA
 3463213 3463214 AM1_5058 AM1_5059     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3463214 3463215 AM1_5059 AM1_5060     FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3463215 3463216 AM1_5060 AM1_5061     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3463217 3463218 AM1_5062 AM1_5063     FALSE 0.042 478.000 0.000 NA   NA
 3463220 3463221 AM1_5065 AM1_5066     FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3463222 3463223 AM1_5067 AM1_5068     TRUE 0.808 48.000 0.000 1.000 Y NA
 3463224 3463225 AM1_5069 AM1_5070     FALSE 0.075 274.000 0.000 NA   NA
 3463228 3463229 AM1_5073 AM1_5074     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3463229 3463230 AM1_5074 AM1_5075     TRUE 0.639 0.000 0.000 1.000   NA
 3463231 3463232 AM1_5076 AM1_5077     TRUE 0.958 -3.000 0.250 0.023   NA
 3463232 3463233 AM1_5077 AM1_5078     TRUE 0.936 112.000 0.250 0.003 Y NA
 3463233 3463234 AM1_5078 AM1_5079   cheW TRUE 0.937 104.000 0.182 0.003 Y NA
 3463234 3463235 AM1_5079 AM1_5080 cheW   TRUE 0.822 34.000 0.000 1.000 Y NA
 3463235 3463236 AM1_5080 AM1_5081     FALSE 0.309 364.000 0.000 0.023 Y NA
 3463237 3463238 AM1_5082 AM1_5083     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3463238 3463239 AM1_5083 AM1_5084     TRUE 0.917 34.000 0.021 0.046   NA
 3463239 3463240 AM1_5084 AM1_5085     TRUE 0.892 29.000 0.011 NA   NA
 3463240 3463241 AM1_5085 AM1_5086     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3463242 3463243 AM1_5087 AM1_5088     FALSE 0.191 139.000 0.000 NA   NA
 3463243 3463244 AM1_5088 AM1_5089     FALSE 0.079 262.000 0.000 NA   NA
 3463244 3463245 AM1_5089 AM1_5090     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3463248 3463249 AM1_5093 AM1_5094 aat   FALSE 0.311 86.000 0.000 1.000 N NA
 3463249 3463250 AM1_5094 AM1_5095     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3463250 3463251 AM1_5095 AM1_5096     FALSE 0.053 369.000 0.000 NA   NA
 3463253 3463254 AM1_5098 AM1_5099     FALSE 0.176 151.000 0.000 NA   NA
 3463258 3463259 AM1_5103 AM1_5104 ureD ureA TRUE 0.961 14.000 0.664 0.002 N NA
 3463259 3463260 AM1_5104 AM1_5105 ureA   TRUE 0.524 31.000 0.000 1.000   NA
 3463260 3463261 AM1_5105 AM1_5106   ureB FALSE 0.403 77.000 0.000 1.000   NA
 3463261 3463262 AM1_5106 AM1_5107 ureB   FALSE 0.115 257.000 0.000 1.000   NA
 3463262 3463263 AM1_5107 AM1_5108     TRUE 0.657 -10.000 0.000 0.014   NA
 3463263 3463264 AM1_5108 AM1_5109   ureC FALSE 0.181 159.000 0.000 1.000 N NA
 3463264 3463265 AM1_5109 AM1_5110 ureC   FALSE 0.030 797.000 0.000 NA   NA
 3463265 3463266 AM1_5110 AM1_5112     FALSE 0.044 443.000 0.000 NA   NA
 3463267 10702642 AM1_5111 AM1_5113     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3463268 3463269 AM1_5114 AM1_5115     TRUE 0.572 47.000 0.000 0.071   NA
 3463269 3463270 AM1_5115 AM1_5116     TRUE 0.490 48.000 0.000 1.000   NA
 3463270 3463271 AM1_5116 AM1_5117     TRUE 0.647 1.000 0.000 1.000   NA
 3463273 3463274 AM1_5119 AM1_5121     FALSE 0.049 406.000 0.000 NA   NA
 3463276 3463277 AM1_5122 AM1_5123     FALSE 0.278 95.000 0.000 1.000 N NA
 3463277 3463278 AM1_5123 AM1_5124     FALSE 0.137 185.000 0.000 NA   NA
 3463280 3463281 AM1_5126 AM1_5127     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3463282 3463283 AM1_5128 AM1_5129 glnS   FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3463283 3463284 AM1_5129 AM1_5130     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3463285 3463286 AM1_5131 AM1_5133     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3463287 3463288 AM1_5132 AM1_5134     FALSE 0.092 238.000 0.000 NA   NA
 3463292 3463293 AM1_5137 AM1_5139     TRUE 0.951 4.000 0.155 NA   NA
 3463293 3463294 AM1_5139 AM1_5140     TRUE 0.719 165.000 0.083 NA   NA
 3463296 3463297 AM1_5141 AM1_5143   trpE TRUE 0.589 3.000 0.000 1.000 N NA
 3463297 3463298 AM1_5143 AM1_5144 trpE psaD TRUE 0.738 172.000 0.091 1.000   NA
 3463298 3463299 AM1_5144 AM1_5145 psaD   TRUE 0.813 120.000 0.095 1.000   NA
 3463300 3463301 AM1_5146 AM1_5147     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3463303 3463304 AM1_5149 AM1_5150     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3463304 3463305 AM1_5150 AM1_5151     FALSE 0.372 -46.000 0.000 NA   NA
 3463305 3463306 AM1_5151 AM1_5152     FALSE 0.313 78.000 0.000 NA   NA
 3463307 3463308 AM1_5153 AM1_5154     FALSE 0.214 133.000 0.000 1.000 N NA
 3463309 3463310 AM1_5155 AM1_5156     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3463310 3463311 AM1_5156 AM1_5157     FALSE 0.057 348.000 0.000 NA   NA
 3463311 3463312 AM1_5157 AM1_5158     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3463313 3463314 AM1_5159 AM1_5160     TRUE 0.940 -3.000 0.140 NA   NA
 3463315 3463316 AM1_5161 AM1_5162     FALSE 0.206 125.000 0.000 NA   NA
 3463316 3463317 AM1_5162 AM1_5163     FALSE 0.088 246.000 0.000 NA   NA
 3463317 3463318 AM1_5163 AM1_5164   purB FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3463319 3463320 AM1_5165 AM1_5166 cynS nrtC TRUE 0.950 58.000 0.021 1.000 Y NA
 3463320 3463321 AM1_5166 AM1_5167 nrtC nrtB TRUE 0.982 -3.000 0.162 0.000 Y NA
 3463321 3463322 AM1_5167 AM1_5168 nrtB nrtA TRUE 0.977 12.000 0.189 NA Y NA
 3463322 3463323 AM1_5168 AM1_5169 nrtA   FALSE 0.028 489.000 0.000 NA N NA
 3463326 3463327 AM1_5172 AM1_5173     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3463327 3463328 AM1_5173 AM1_5174     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3463328 3463329 AM1_5174 AM1_5175     FALSE 0.143 179.000 0.000 NA   NA
 3463329 3463330 AM1_5175 AM1_5176     FALSE 0.036 573.000 0.000 NA   NA
 3463333 3463334 AM1_5179 AM1_5180     FALSE 0.103 221.000 0.000 NA   NA
 3463335 3463336 AM1_5181 AM1_5182     FALSE 0.406 -27.000 0.000 NA   NA
 3463337 3463338 AM1_5183 AM1_5184     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3463338 3463339 AM1_5184 AM1_5185     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3463339 3463340 AM1_5185 AM1_5186   dxs TRUE 0.880 35.000 0.004 1.000 N NA
 3463340 3463341 AM1_5186 AM1_5187 dxs   FALSE 0.175 163.000 0.000 1.000 N NA
 3463341 3463342 AM1_5187 AM1_5188   mreC TRUE 0.970 -46.000 0.550 0.001 Y NA
 3463342 3463343 AM1_5188 AM1_5189 mreC   TRUE 0.620 211.000 0.043 1.000 N NA
 3463343 3463344 AM1_5189 AM1_5190     FALSE 0.209 139.000 0.000 1.000 N NA
 3463344 3463345 AM1_5190 AM1_5191     FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3463346 3463347 AM1_5192 AM1_5193   carA FALSE 0.319 41.000 0.000 NA N NA
 3463347 3463348 AM1_5193 AM1_5195 carA   TRUE 0.598 16.000 0.000 1.000   NA
 3463349 3463350 AM1_5194 AM1_5196     TRUE 0.787 102.000 0.031 NA   NA
 3463350 3463351 AM1_5196 AM1_5197     TRUE 0.920 66.000 0.150 0.002   NA
 3463351 3463352 AM1_5197 AM1_5198     TRUE 0.805 108.000 0.113 NA   NA
 3463352 3463353 AM1_5198 AM1_5199     FALSE 0.042 463.000 0.000 NA   NA
 3463354 3463355 AM1_5200 AM1_5201     FALSE 0.265 132.000 0.000 1.000   NA
 3463355 3463356 AM1_5201 AM1_5202     TRUE 0.866 77.000 0.035 1.000   NA
 3463357 3463358 AM1_5203 AM1_5204     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3463359 3463360 AM1_5205 AM1_5206     FALSE 0.094 234.000 0.000 NA   NA
 3463365 3463366 AM1_5211 AM1_5212     FALSE 0.061 328.000 0.000 NA   NA
 3463366 3463367 AM1_5212 AM1_5213     FALSE 0.325 74.000 0.000 NA   NA
 3463368 3463369 AM1_5214 AM1_5215     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3463369 3463370 AM1_5215 AM1_5216     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3463370 3463371 AM1_5216 AM1_5217     FALSE 0.055 358.000 0.000 NA   NA
 3463373 3463374 AM1_5219 AM1_5220     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3463374 3463375 AM1_5220 AM1_5221     FALSE 0.039 500.000 0.000 NA   NA
 3463375 3463376 AM1_5221 AM1_5222     TRUE 0.948 1.000 0.143 NA   NA
 3463376 3463377 AM1_5222 AM1_5223   dut FALSE 0.134 200.000 0.000 1.000 N NA
 3463378 3463379 AM1_5224 AM1_5225   recG FALSE 0.065 307.000 0.000 NA   NA
 3463379 3463380 AM1_5225 AM1_5226 recG   FALSE 0.405 56.000 0.000 1.000 N NA
 3463380 3463381 AM1_5226 AM1_5227     TRUE 0.430 42.000 0.000 1.000 N NA
 3463381 3463382 AM1_5227 AM1_5228     FALSE 0.314 155.000 0.000 0.010   NA
 3463382 3463383 AM1_5228 AM1_5229     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3463384 3463385 AM1_5230 AM1_5231     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3463385 3463386 AM1_5231 AM1_5232     FALSE 0.133 190.000 0.000 NA   NA
 3463386 3463387 AM1_5232 AM1_5234     FALSE 0.092 237.000 0.000 NA   NA
 3463388 3463389 AM1_5233 AM1_5235     FALSE 0.054 360.000 0.000 NA   NA
 3463390 3463391 AM1_5236 AM1_5237     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3463391 3463392 AM1_5237 AM1_5239   sodCC FALSE 0.216 118.000 0.000 NA   NA
 3463394 3463395 AM1_5240 AM1_5241     FALSE 0.029 999.000 0.000 NA   NA
 3463395 3463396 AM1_5241 AM1_5242     FALSE 0.236 102.000 0.000 NA   NA
 3463396 3463397 AM1_5242 AM1_5243     FALSE 0.063 318.000 0.000 NA   NA
 3463398 3463399 AM1_5244 AM1_5245     FALSE 0.281 88.000 0.000 NA   NA
 3463399 3463400 AM1_5245 AM1_5246     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3463400 3463401 AM1_5246 AM1_5247     TRUE 0.957 5.000 0.916 NA   NA
 3463401 3463402 AM1_5247 AM1_5248     FALSE 0.039 498.000 0.000 NA   NA
 3463402 3463403 AM1_5248 AM1_5249     FALSE 0.045 728.000 0.000 1.000   NA
 3463404 3463405 AM1_5250 AM1_5251     FALSE 0.135 187.000 0.000 NA   NA
 3463406 3463407 AM1_5252 AM1_5253     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3463407 3463408 AM1_5253 AM1_5254     FALSE 0.029 984.000 0.000 NA   NA
 3463411 3463412 AM1_5257 AM1_5258   menB TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3463415 3463416 AM1_5261 AM1_5262     TRUE 0.962 44.000 0.099 1.000 Y NA
 3463416 3463417 AM1_5262 AM1_5263     FALSE 0.169 169.000 0.000 1.000 N NA
 3463417 3463418 AM1_5263 AM1_5264   gltS TRUE 0.612 132.000 0.000 1.000 Y NA
 3463418 3463419 AM1_5264 AM1_5265 gltS rumA TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3463421 10702643 AM1_5267 AM1_5268     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3463423 3463424 AM1_5270 AM1_5271     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3463425 3463426 AM1_5272 AM1_5273     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3463426 3463427 AM1_5273 AM1_5274     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3463427 3463428 AM1_5274 AM1_5275     FALSE 0.095 232.000 0.000 NA   NA
 3463428 3463429 AM1_5275 AM1_5276     TRUE 0.965 4.000 0.200 0.011   NA
 3463429 3463430 AM1_5276 AM1_5277     TRUE 0.956 4.000 0.500 NA   NA
 3463430 3463431 AM1_5277 AM1_5278     TRUE 0.944 -3.000 0.250 NA   NA
 3463435 3463436 AM1_5282 AM1_5283     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3463438 3463439 AM1_5285 AM1_5286     TRUE 0.472 -43.000 0.000 1.000   NA
 3463439 3463440 AM1_5286 AM1_5287     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3463441 10702644 AM1_5288 AM1_5289     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 10702644 3463442 AM1_5289 AM1_5290     FALSE 0.032 664.000 0.000 NA   NA
 3463442 3463443 AM1_5290 AM1_5291     FALSE 0.193 137.000 0.000 NA   NA
 3463443 3463444 AM1_5291 AM1_5292     TRUE 0.930 7.000 0.007 NA   NA
 3463445 3463446 AM1_5294 AM1_5296     FALSE 0.059 336.000 0.000 NA   NA
 3463447 3463448 AM1_5297 AM1_5298     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3463449 3463450 AM1_5299 AM1_5300     FALSE 0.170 155.000 0.000 NA   NA
 3463450 3463451 AM1_5300 AM1_5301     FALSE 0.417 -22.000 0.000 NA   NA
 3463452 3463453 AM1_5302 AM1_5304     TRUE 0.721 8.000 0.000 0.076   NA
 3463455 3463456 AM1_5305 AM1_5307     FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 3463457 3463458 AM1_5306 AM1_5308     FALSE 0.058 345.000 0.000 NA   NA
 3463458 3463459 AM1_5308 AM1_5309     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3463462 3463463 AM1_5312 AM1_5313     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3463464 3463465 AM1_5314 AM1_5315     FALSE 0.031 771.000 0.000 NA   NA
 3463465 3463466 AM1_5315 AM1_5316   add FALSE 0.378 67.000 0.000 1.000 N NA
 3463467 3463468 AM1_5317 AM1_5318     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3463469 3463470 AM1_5319 AM1_5320     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3463474 3463475 AM1_5324 AM1_5325     TRUE 0.867 57.000 0.014 NA   NA
 3463475 3463476 AM1_5325 AM1_5326     FALSE 0.043 864.000 0.000 1.000   NA
 3463476 3463477 AM1_5326 AM1_5327   atpC FALSE 0.246 146.000 0.000 1.000   NA
 3463477 3463478 AM1_5327 AM1_5328 atpC atpD TRUE 0.986 10.000 0.837 0.002 Y NA
 3463478 3463479 AM1_5328 AM1_5329 atpD   FALSE 0.081 209.000 0.000 NA N NA
 3463486 3463487 AM1_5336 AM1_5337     FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3463488 3463489 AM1_5338 AM1_5339     FALSE 0.038 512.000 0.000 NA   NA
 3463489 3463490 AM1_5339 AM1_5340     FALSE 0.092 237.000 0.000 NA   NA
 3463490 3463491 AM1_5340 AM1_5341     FALSE 0.055 358.000 0.000 NA   NA
 3463492 3463493 AM1_5342 AM1_5343     FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3463493 3463494 AM1_5343 AM1_5344     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3463494 3463495 AM1_5344 AM1_5345     TRUE 0.430 -18.000 0.000 NA   NA
 3463497 3463498 AM1_5347 AM1_5348     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3463499 3463500 AM1_5349 AM1_5350 dnaB rplI TRUE 0.871 71.000 0.048 1.000 N NA
 3463501 3463502 AM1_5351 AM1_5352     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3463502 3463503 AM1_5352 AM1_5353     FALSE 0.051 385.000 0.000 NA   NA
 3463504 3463505 AM1_5354 AM1_5355     FALSE 0.045 441.000 0.000 NA   NA
 3463507 3463508 AM1_5357 AM1_5358     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3463508 3463509 AM1_5358 AM1_5359     FALSE 0.293 112.000 0.000 1.000   NA
 3463509 3463510 AM1_5359 AM1_5360     TRUE 0.967 42.000 0.375 1.000 Y NA
 3463510 3463511 AM1_5360 AM1_5361     TRUE 0.543 230.000 0.012 1.000 N NA
 3463512 3463513 AM1_5362 AM1_5363   pabB TRUE 0.926 23.000 0.106 1.000 N NA
 3463513 3463514 AM1_5363 AM1_5364 pabB   FALSE 0.052 380.000 0.000 NA   NA
 3463514 3463515 AM1_5364 AM1_5365     TRUE 0.941 0.000 0.065 NA   NA
 3463515 3463516 AM1_5365 AM1_5366     FALSE 0.384 499.000 0.194 NA   NA
 3463516 3463517 AM1_5366 AM1_5367   proC TRUE 0.813 114.000 0.224 NA   NA
 3463519 3463520 AM1_5369 AM1_5370     FALSE 0.079 261.000 0.000 NA   NA
 3463520 3463521 AM1_5370 AM1_5371     TRUE 0.639 208.000 0.091 NA   NA
 3463521 3463522 AM1_5371 AM1_5372     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3463527 3463528 AM1_5377 AM1_5378   ndhM TRUE 0.916 50.000 0.625 NA   NA
 3463528 3463529 AM1_5378 AM1_5379 ndhM ndhF TRUE 0.973 49.000 0.875 0.002 Y NA
 3463530 3463531 AM1_5380 AM1_5381 ccmK ccmK TRUE 0.907 109.000 0.105 NA Y NA
 3463531 3463532 AM1_5381 AM1_5382 ccmK ccmL TRUE 0.979 13.000 0.818 NA Y NA
 3463532 3463533 AM1_5382 AM1_5383 ccmL ccmM TRUE 0.526 222.000 0.002 NA   NA
 3463533 3463534 AM1_5383 AM1_5384 ccmM   TRUE 0.879 73.000 0.006 0.003   NA
 3463534 3463535 AM1_5384 AM1_5385   ccmK TRUE 0.786 92.000 0.005 NA   NA
 3463535 3463536 AM1_5385 AM1_5386 ccmK purA FALSE 0.111 170.000 0.000 NA N NA
 3463536 3463537 AM1_5386 AM1_5387 purA   FALSE 0.268 130.000 0.000 1.000   NA
 3463538 3463539 AM1_5388 AM1_5389     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3463539 3463540 AM1_5389 AM1_5390     FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3463540 3463541 AM1_5390 AM1_5391     TRUE 0.549 67.000 0.000 0.010   NA
 3463542 3463543 AM1_5392 AM1_5393     FALSE 0.191 139.000 0.000 NA   NA
 3463543 3463544 AM1_5393 AM1_5394     FALSE 0.044 448.000 0.000 NA   NA
 3463545 3463546 AM1_5395 AM1_5396     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3463546 3463547 AM1_5396 AM1_5397     FALSE 0.031 747.000 0.000 NA   NA
 3463547 3463548 AM1_5397 AM1_5398     FALSE 0.049 405.000 0.000 NA   NA
 3463549 3463550 AM1_5399 AM1_5400     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3463552 3463553 AM1_5402 AM1_5403     FALSE 0.313 78.000 0.000 NA   NA
 3463553 3463554 AM1_5403 AM1_5404     TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3463555 3463556 AM1_5405 AM1_5406 infC   FALSE 0.047 461.000 0.000 1.000 N NA
 3463557 3463558 AM1_5407 AM1_5408     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3463563 3463564 AM1_5413 AM1_5414 carB   FALSE 0.271 358.000 0.000 1.000 Y NA
 3463568 3463569 AM1_5418 AM1_5419     FALSE 0.067 300.000 0.000 NA   NA
 3463570 3463571 AM1_5420 AM1_5421 rpsO   TRUE 0.919 19.000 0.037 NA   NA
 3463571 3463572 AM1_5421 AM1_5422   ccmA TRUE 0.944 11.000 0.071 NA   NA
 3463572 3463573 AM1_5422 AM1_5423 ccmA   TRUE 0.559 22.000 0.000 1.000   NA
 3463576 3463577 AM1_5426 AM1_5427     FALSE 0.029 964.000 0.000 NA   NA
 3463577 3463578 AM1_5427 AM1_5428     FALSE 0.091 240.000 0.000 NA   NA
 3463578 3463579 AM1_5428 AM1_5429     FALSE 0.055 355.000 0.000 NA   NA
 3463579 3463580 AM1_5429 AM1_5430     TRUE 0.937 22.000 0.667 NA   NA
 3463580 3463581 AM1_5430 AM1_5431     FALSE 0.040 491.000 0.000 NA   NA
 3463583 3463584 AM1_5433 AM1_5434     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3463584 3463585 AM1_5434 AM1_5435     FALSE 0.036 568.000 0.000 NA   NA
 3463585 3463586 AM1_5435 AM1_5436     FALSE 0.043 460.000 0.000 NA   NA
 3463586 3463587 AM1_5436 AM1_5437     FALSE 0.330 96.000 0.000 1.000   NA
 3463587 3463588 AM1_5437 AM1_5438     FALSE 0.388 344.000 0.006 NA   NA
 3463590 3463591 AM1_5440 AM1_5441     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3463592 3463593 AM1_5442 AM1_5443   trx TRUE 0.707 15.000 0.000 0.009   NA
 3463593 3463594 AM1_5443 AM1_5444 trx   FALSE 0.130 192.000 0.000 NA   NA
 3463594 3463595 AM1_5444 AM1_5445     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3463596 3463597 AM1_5446 AM1_5447     FALSE 0.400 78.000 0.000 1.000   NA
 3463598 3463599 AM1_5448 AM1_5449     FALSE 0.220 113.000 0.000 NA   NA
 3463600 3463601 AM1_5450 AM1_5451     TRUE 0.552 -48.000 0.000 0.027   NA
 3463601 3463602 AM1_5451 AM1_5452     TRUE 0.908 10.000 0.000 0.027 Y NA
 3463603 3463604 AM1_5453 AM1_5454     FALSE 0.406 -27.000 0.000 NA   NA
 3463604 3463605 AM1_5454 AM1_5455     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3463605 3463606 AM1_5455 AM1_5456     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3463607 3463608 AM1_5457 AM1_5458   lysS FALSE 0.407 76.000 0.000 1.000   NA
 3463608 3463609 AM1_5458 AM1_5459 lysS   FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3463609 3463610 AM1_5459 AM1_5460     FALSE 0.055 356.000 0.000 NA   NA
 3463612 3463613 AM1_5461 AM1_5463     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3463613 3463614 AM1_5463 AM1_5464     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3463616 3463617 AM1_5466 AM1_5467     FALSE 0.113 208.000 0.000 NA   NA
 3463617 3463618 AM1_5467 AM1_5468     FALSE 0.090 315.000 0.000 1.000   NA
 3463618 3463619 AM1_5468 AM1_5469     TRUE 0.538 27.000 0.000 1.000   NA
 3463622 3463623 AM1_5472 AM1_5473     FALSE 0.281 122.000 0.000 1.000   NA
 3463625 3463626 AM1_5475 AM1_5476     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3463626 3463627 AM1_5476 AM1_5477     FALSE 0.193 136.000 0.000 NA   NA
 3463627 3463628 AM1_5477 AM1_5478     FALSE 0.048 416.000 0.000 NA   NA
 3463628 3463629 AM1_5478 AM1_5480     FALSE 0.101 182.000 0.000 NA N NA
 3463630 3463631 AM1_5479 AM1_5481     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3463634 3463635 AM1_5484 AM1_5485     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3463635 3463636 AM1_5485 AM1_5486   dinB TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3463636 3463637 AM1_5486 AM1_5487 dinB   FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3463641 3463642 AM1_5491 AM1_5493     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3463643 3463644 AM1_5492 AM1_5494     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3463644 3463645 AM1_5494 AM1_5495     FALSE 0.089 244.000 0.000 NA   NA
 3463645 3463646 AM1_5495 AM1_5497   gmk TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3463650 3463651 AM1_5501 AM1_5502     FALSE 0.137 185.000 0.000 NA   NA
 3463651 3463652 AM1_5502 AM1_5503     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3463652 3463653 AM1_5503 AM1_5504     FALSE 0.055 354.000 0.000 NA   NA
 3463653 3463654 AM1_5504 AM1_5505     TRUE 0.467 58.000 0.000 1.000   NA
 3463655 3463656 AM1_6422 AM1_5507 pyrH frr TRUE 0.952 14.000 0.626 1.000 N NA
 3463656 3463657 AM1_5507 AM1_5508 frr   TRUE 0.938 2.000 0.022 1.000 N NA
 3463657 3463658 AM1_5508 AM1_5509     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3463659 3463660 AM1_5510 AM1_5511 ompA psbN FALSE 0.271 128.000 0.000 1.000   NA
 3463661 3463662 AM1_5512 AM1_5513 psbH   TRUE 0.734 183.000 0.167 1.000   NA
 3463662 3463663 AM1_5513 AM1_5514   pth TRUE 0.932 1.000 0.009 1.000 N NA
 3463663 3463664 AM1_5514 AM1_5515 pth petF1 FALSE 0.049 448.000 0.000 1.000 N NA
 3463664 3463665 AM1_5515 AM1_5516 petF1 moaA FALSE 0.213 134.000 0.000 1.000 N NA
 3463665 3463666 AM1_5516 AM1_5518 moaA   FALSE 0.069 319.000 0.000 1.000 N NA
 3463669 3463670 AM1_5519 AM1_5521   tktA FALSE 0.063 316.000 0.000 NA   NA
 3463670 3463671 AM1_5521 AM1_5522 tktA fabF TRUE 0.752 147.000 0.062 1.000 N NA
 3463671 3463672 AM1_5522 AM1_5523 fabF acpP TRUE 0.948 84.000 0.346 1.000 Y NA
 3463672 3463673 AM1_5523 AM1_5524 acpP   FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3463673 3463674 AM1_5524 AM1_5525   pip TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3463675 3463676 AM1_5526 AM1_5527     FALSE 0.111 224.000 0.000 1.000 N NA
 3463677 3463678 AM1_5528 AM1_5529   uvrB FALSE 0.115 277.000 0.000 0.075 N NA
 3463680 3463681 AM1_5531 AM1_5532     FALSE 0.042 467.000 0.000 NA   NA
 3463682 3463683 AM1_5533 AM1_5534     FALSE 0.085 251.000 0.000 NA   NA
 3463683 3463684 AM1_5534 AM1_5535     FALSE 0.054 362.000 0.000 NA   NA
 3463684 3463685 AM1_5535 AM1_5536     FALSE 0.052 374.000 0.000 NA   NA
 3463685 3463686 AM1_5536 AM1_5537     FALSE 0.049 398.000 0.000 NA   NA
 3463686 3463687 AM1_5537 AM1_5538     FALSE 0.064 313.000 0.000 NA   NA
 3463688 3463689 AM1_5539 AM1_5540     TRUE 0.972 -34.000 0.571 0.026 Y NA
 3463689 3463690 AM1_5540 AM1_5541     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3463690 3463691 AM1_5541 AM1_5542     FALSE 0.071 282.000 0.000 NA   NA
 3463691 3463692 AM1_5542 AM1_5543   rnz FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3463694 3463695 AM1_5545 AM1_5546     TRUE 0.822 97.000 0.094 NA   NA
 3463695 3463696 AM1_5546 AM1_5547     TRUE 0.880 178.000 0.068 0.014 Y NA
 3463696 3463697 AM1_5547 AM1_5548     TRUE 0.960 65.000 0.068 0.014 Y NA
 3463697 3463698 AM1_5548 AM1_5549     TRUE 0.979 16.000 0.111 0.014 Y NA
 3463698 3463699 AM1_5549 AM1_5550     FALSE 0.184 157.000 0.000 1.000 N NA
 3463700 3463701 AM1_5551 AM1_5552 dapB psb28 FALSE 0.132 234.000 0.000 1.000   NA
 3463704 3463705 AM1_5555 AM1_5556 ilvC rpsU FALSE 0.119 252.000 0.000 1.000   NA
 3463709 3463710 AM1_5560 AM1_5561     FALSE 0.061 327.000 0.000 NA   NA
 3463710 3463711 AM1_5561 AM1_5562     TRUE 0.931 25.000 0.388 NA   NA
 3463711 3463712 AM1_5562 AM1_5563     FALSE 0.199 131.000 0.000 NA   NA
 3463715 3463716 AM1_5566 AM1_5568     FALSE 0.032 686.000 0.000 NA   NA
 3463717 3463718 AM1_5567 AM1_5569     FALSE 0.148 217.000 0.000 1.000   NA
 3463720 3463721 AM1_5570 AM1_5572     TRUE 0.945 3.000 0.063 NA   NA
 3463721 3463722 AM1_5572 AM1_5573     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3463723 3463724 AM1_5574 AM1_5575   grxC TRUE 0.630 13.000 0.000 1.000   NA
 3463724 3463725 AM1_5575 AM1_5576 grxC gshB TRUE 0.587 9.000 0.000 1.000 N NA
 3463725 3463726 AM1_5576 AM1_5577 gshB galE TRUE 0.929 11.000 0.005 1.000 N NA
 3463728 3463729 AM1_6420 AM1_5579     FALSE 0.152 171.000 0.000 NA   NA
 3463729 3463730 AM1_5579 AM1_5580     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3463730 3463731 AM1_5580 AM1_6421     FALSE 0.126 196.000 0.000 NA   NA
 3463731 3463732 AM1_6421 AM1_5506     FALSE 0.363 63.000 0.000 NA   NA
 3463732 3463733 AM1_5506 AM1_5582     FALSE 0.193 136.000 0.000 NA   NA
 3463733 3463734 AM1_5582 AM1_5583     TRUE 0.647 1.000 0.000 1.000   NA
 3463737 3463738 AM1_5586 AM1_5587     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3463738 3463739 AM1_5587 AM1_5588     FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3463742 3463743 AM1_5591 AM1_5592 recQ   FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3463743 3463744 AM1_5592 AM1_5593     FALSE 0.030 798.000 0.000 NA   NA
 3463744 3463745 AM1_5593 AM1_5594     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3463745 10702646 AM1_5594 AM1_5595     FALSE 0.091 240.000 0.000 NA   NA
 10702646 3463746 AM1_5595 AM1_5596   mutS FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3463746 3463747 AM1_5596 AM1_5597 mutS   FALSE 0.298 108.000 0.000 1.000   NA
 3463747 3463748 AM1_5597 AM1_5598     FALSE 0.097 230.000 0.000 NA   NA
 3463748 3463749 AM1_5598 AM1_5599   recJ TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3463749 3463750 AM1_5599 AM1_5600 recJ   TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3463751 3463752 AM1_5601 AM1_5602     TRUE 0.956 3.000 0.152 1.000   NA
 3463752 3463753 AM1_5602 AM1_5603     TRUE 0.980 0.000 0.210 1.000 Y NA
 3463754 3463755 AM1_5604 AM1_5606     TRUE 0.643 180.000 0.015 NA   NA
 3463756 3463757 AM1_5605 AM1_5607     TRUE 0.804 132.000 0.483 NA   NA
 3463757 3463758 AM1_5607 AM1_5608     TRUE 0.953 0.000 0.591 NA   NA
 3463758 3463759 AM1_5608 AM1_5609     FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3463761 3463762 AM1_5611 AM1_5612     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3463762 3463763 AM1_5612 AM1_5613   sun FALSE 0.098 228.000 0.000 NA   NA
 3463766 3463767 AM1_5616 AM1_5617     FALSE 0.150 172.000 0.000 NA   NA
 3463767 3463768 AM1_5617 AM1_5618     FALSE 0.199 131.000 0.000 NA   NA
 3463768 3463769 AM1_5618 AM1_5619     TRUE 0.880 63.000 0.051 NA   NA
 3463769 3463770 AM1_5619 AM1_5620   argF FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3463770 3463771 AM1_5620 AM1_5621 argF   TRUE 0.450 33.000 0.000 1.000 N NA
 3463773 3463774 AM1_5623 AM1_5624     TRUE 0.542 167.000 0.000 1.000 Y NA
 3463775 3463776 AM1_5625 AM1_5626     TRUE 0.922 -15.000 0.150 NA   NA
 3463778 3463779 AM1_5628 AM1_5629     FALSE 0.221 112.000 0.000 NA   NA
 3463779 3463780 AM1_5629 AM1_5630     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3463781 3463782 AM1_5631 AM1_5632   fabG FALSE 0.372 69.000 0.000 1.000 N NA
 3463782 3463783 AM1_5632 AM1_5633 fabG accA TRUE 0.501 215.000 0.000 0.002 Y NA
 3463783 3463784 AM1_5633 AM1_5634 accA   TRUE 0.619 219.000 0.033 1.000   NA
 3463784 3463785 AM1_5634 AM1_5635   folE TRUE 0.915 62.000 0.391 1.000   NA
 3463785 3463786 AM1_5635 AM1_5636 folE   FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3463787 3463788 AM1_5637 AM1_5638     FALSE 0.326 288.000 0.000 1.000 Y NA
 3463789 3463790 AM1_5639 AM1_5640     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3463792 3463793 AM1_5642 AM1_5643     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3463795 3463796 AM1_5645 AM1_5646     FALSE 0.299 408.000 0.000 0.001 Y NA
 3463796 3463797 AM1_5646 AM1_5647     FALSE 0.123 211.000 0.000 1.000 N NA
 3463797 3463798 AM1_5647 AM1_5649     FALSE 0.046 431.000 0.000 NA   NA
 3463800 3463801 AM1_5653 AM1_5654     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3463801 3463802 AM1_5654 AM1_5655     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3463802 3463803 AM1_5655 AM1_5656     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3463803 3463804 AM1_5656 AM1_5657     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3463805 3463806 AM1_5658 AM1_5659     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3463806 3463807 AM1_5659 AM1_5660     FALSE 0.263 93.000 0.000 NA   NA
 3463807 3463808 AM1_5660 AM1_5661     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3463808 3463809 AM1_5661 AM1_5662   radA FALSE 0.135 187.000 0.000 NA   NA
 3463814 3463815 AM1_5667 AM1_5668     FALSE 0.345 311.000 0.000 0.055 Y NA
 3463816 3463817 AM1_5669 AM1_5670     FALSE 0.089 243.000 0.000 NA   NA
 3463817 3463818 AM1_5670 AM1_5671     FALSE 0.179 148.000 0.000 NA   NA
 3463819 3463820 AM1_5672 AM1_5673     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3463821 3463822 AM1_5674 AM1_5675     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3463823 3463824 AM1_5676 AM1_5677     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3463824 3463825 AM1_5677 AM1_5678     TRUE 0.928 39.000 0.400 1.000   NA
 3463826 3463827 AM1_5679 AM1_5680     TRUE 0.510 74.000 0.000 0.022   NA
 3463827 3463828 AM1_5680 AM1_5681     FALSE 0.090 241.000 0.000 NA   NA
 3463829 3463830 AM1_5682 AM1_5683     TRUE 0.552 -48.000 0.000 0.027   NA
 3463832 3463833 AM1_5685 AM1_5686     FALSE 0.034 615.000 0.000 NA   NA
 3463833 3463834 AM1_5686 AM1_5687     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3463836 3463837 AM1_5689 AM1_5690     TRUE 0.936 -10.000 0.597 NA   NA
 3463837 3463838 AM1_5690 AM1_5691     TRUE 0.833 87.000 0.043 NA   NA
 3463838 3463839 AM1_5691 AM1_5692   dnaK FALSE 0.074 277.000 0.000 NA   NA
 3463839 3463840 AM1_5692 AM1_5693 dnaK   TRUE 0.972 50.000 0.390 0.003 Y NA
 3463845 3463846 AM1_5698 AM1_5699     FALSE 0.275 125.000 0.000 1.000   NA
 3463846 3463847 AM1_5699 AM1_5700     TRUE 0.517 205.000 0.000 0.007 Y NA
 3463849 3463850 AM1_5701 AM1_5703 metK   TRUE 0.761 141.000 0.030 1.000   NA
 3463851 3463852 AM1_5704 AM1_5705     TRUE 0.471 56.000 0.000 1.000   NA
 3463853 3463854 AM1_5706 AM1_5707     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3463855 3463856 AM1_5708 AM1_5709     FALSE 0.389 51.000 0.000 NA   NA
 3463856 3463857 AM1_5709 AM1_5710     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3463857 3463858 AM1_5710 AM1_5711     FALSE 0.044 787.000 0.000 1.000   NA
 3463859 3463860 AM1_5712 AM1_5713     FALSE 0.077 269.000 0.000 NA   NA
 3463860 3463861 AM1_5713 AM1_5714     TRUE 0.788 39.000 0.000 NA Y NA
 3463861 3463862 AM1_5714 AM1_5715     TRUE 0.798 33.000 0.000 NA Y NA
 3463862 3463863 AM1_5715 AM1_5716     FALSE 0.393 80.000 0.000 1.000   NA
 3463863 3463864 AM1_5716 AM1_5717     TRUE 0.601 50.000 0.000 0.002   NA
 3463864 3463865 AM1_5717 AM1_5718     TRUE 0.462 60.000 0.000 1.000   NA
 3463865 3463866 AM1_5718 AM1_5719     FALSE 0.207 171.000 0.000 1.000   NA
 3463866 3463867 AM1_5719 AM1_5720     FALSE 0.125 243.000 0.000 1.000   NA
 3463867 3463868 AM1_5720 AM1_5721     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3463868 3463869 AM1_5721 AM1_5722     FALSE 0.146 176.000 0.000 NA   NA
 3463869 3463870 AM1_5722 AM1_5723     TRUE 0.551 24.000 0.000 1.000   NA
 3463870 3463871 AM1_5723 AM1_5724   rfc FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3463871 3463872 AM1_5724 AM1_5726 rfc   FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3463872 3463873 AM1_5726 AM1_5727     TRUE 0.534 171.000 0.000 1.000 Y NA
 3463873 3463874 AM1_5727 AM1_5728     FALSE 0.076 272.000 0.000 NA   NA
 3463874 3463875 AM1_5728 AM1_5729     FALSE 0.368 -48.000 0.000 NA   NA
 3463876 3463877 AM1_5730 AM1_5731     FALSE 0.221 112.000 0.000 NA   NA
 3463878 3463879 AM1_5732 AM1_5733   hisC FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3463879 3463880 AM1_5733 AM1_5734 hisC   TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3463882 3463883 AM1_5736 AM1_5737   gyrA FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3463885 3463886 AM1_5739 AM1_5740   cobU TRUE 0.767 111.000 0.025 NA   NA
 3463888 3463889 AM1_5742 AM1_5743     TRUE 0.924 30.000 0.278 NA   NA
 3463889 3463890 AM1_5743 AM1_5744     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3463890 3463891 AM1_5744 AM1_5745     FALSE 0.092 237.000 0.000 NA   NA
 3463891 3463892 AM1_5745 AM1_5746     FALSE 0.197 132.000 0.000 NA   NA
 3463893 3463894 AM1_5747 AM1_5748     FALSE 0.049 404.000 0.000 NA   NA
 3463894 3463895 AM1_5748 AM1_5749   gmd FALSE 0.274 96.000 0.000 1.000 N NA
 3463895 3463896 AM1_5749 AM1_5750 gmd   FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3463896 3463897 AM1_5750 AM1_5751     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3463897 3463898 AM1_5751 AM1_5752     TRUE 0.948 -3.000 0.648 NA   NA
 3463900 3463901 AM1_5754 AM1_5756 icd   FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3463903 3463904 AM1_5757 AM1_5758   glpX FALSE 0.079 261.000 0.000 NA   NA
 3463904 3463905 AM1_5758 AM1_5760 glpX hemA TRUE 0.866 72.000 0.038 1.000 N NA
 3463907 3463908 AM1_5761 AM1_5762     TRUE 0.610 133.000 0.000 1.000 Y NA
 3463908 3463909 AM1_5762 AM1_5763     TRUE 0.983 -3.000 0.511 0.027 Y NA
 3463909 3463910 AM1_5763 AM1_5764   asnB TRUE 0.953 4.000 0.178 1.000 N NA
 3463910 3463911 AM1_5764 AM1_5765 asnB   TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3463911 3463912 AM1_5765 AM1_5766     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3463912 3463913 AM1_5766 AM1_5767     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3463915 3463916 AM1_5769 AM1_5770     TRUE 0.950 0.000 0.079 1.000   NA
 3463916 3463917 AM1_5770 AM1_5771     TRUE 0.560 -10.000 0.000 1.000   NA
 3463917 3463918 AM1_5771 AM1_5772     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3463918 3463919 AM1_5772 AM1_5773     FALSE 0.058 345.000 0.000 NA   NA
 3463919 3463920 AM1_5773 AM1_5774     FALSE 0.415 35.000 0.000 NA   NA
 3463920 3463921 AM1_5774 AM1_5775     TRUE 0.675 19.000 0.000 0.010   NA
 3463923 3463924 AM1_5777 AM1_5778   ccmK FALSE 0.083 255.000 0.000 NA   NA
 3463924 3463925 AM1_5778 AM1_5779 ccmK purH FALSE 0.216 87.000 0.000 NA N NA
 3463927 3463928 AM1_5781 AM1_5782     FALSE 0.109 213.000 0.000 NA   NA
 3463929 3463930 AM1_5783 AM1_5784     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3463931 3463932 AM1_5785 AM1_5786     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3463932 3463933 AM1_5786 AM1_5787   mraY TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3463935 3463936 AM1_5789 AM1_5790   hisF FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3463936 3463937 AM1_5790 AM1_5791 hisF   TRUE 0.849 73.000 0.021 NA   NA
 3463940 3463941 AM1_5794 AM1_5795     TRUE 0.491 -33.000 0.000 1.000   NA
 3463941 3463942 AM1_5795 AM1_5796     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3463942 3463943 AM1_5796 AM1_5797     TRUE 0.524 31.000 0.000 1.000   NA
 3463943 3463944 AM1_5797 AM1_5798     FALSE 0.256 140.000 0.000 1.000   NA
 3463945 3463946 AM1_5799 AM1_5800     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3463946 3463947 AM1_5800 AM1_5801     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3463947 3463948 AM1_5801 AM1_5802     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3463948 3463949 AM1_5802 AM1_5804     FALSE 0.142 180.000 0.000 NA   NA
 3463950 3463951 AM1_5803 AM1_5805     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3463953 3463954 AM1_5807 AM1_5808     TRUE 0.477 53.000 0.000 1.000   NA
 3463956 3463957 AM1_5810 AM1_5811 apcA   TRUE 0.637 24.000 0.000 0.033   NA
 3463957 3463958 AM1_5811 AM1_5812     TRUE 0.919 61.000 0.667 1.000   NA
 3463958 3463959 AM1_5812 AM1_5814   bchJ FALSE 0.068 881.000 0.000 0.001   NA
 3463959 3463960 AM1_5814 AM1_5815 bchJ   FALSE 0.029 1016.000 0.000 NA   NA
 3463963 3463964 AM1_5818 AM1_5819     FALSE 0.049 396.000 0.000 NA   NA
 3463964 3463965 AM1_5819 AM1_5820     FALSE 0.038 520.000 0.000 NA   NA
 3463965 3463966 AM1_5820 AM1_5821     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3463966 3463967 AM1_5821 AM1_5822     FALSE 0.417 -22.000 0.000 NA   NA
 3463967 3463968 AM1_5822 AM1_5823     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3463968 3463969 AM1_5823 AM1_5824     FALSE 0.071 281.000 0.000 NA   NA
 3463969 3463970 AM1_5824 AM1_5825     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3463970 10702649 AM1_5825 AM1_5826     FALSE 0.087 248.000 0.000 NA   NA
 10702649 3463971 AM1_5826 AM1_5828     FALSE 0.031 764.000 0.000 NA   NA
 3463973 3463974 AM1_5830 AM1_5831     FALSE 0.421 -21.000 0.000 NA   NA
 3463974 3463975 AM1_5831 AM1_5832     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3463975 3463976 AM1_5832 AM1_5833     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3463976 3463977 AM1_5833 AM1_5834     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3463977 3463978 AM1_5834 AM1_5835     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3463978 3463979 AM1_5835 AM1_5836     TRUE 0.490 48.000 0.000 1.000   NA
 3463981 3463982 AM1_5838 AM1_5839     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3463982 3463983 AM1_5839 AM1_5840     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3463983 3463984 AM1_5840 AM1_5841     FALSE 0.406 -27.000 0.000 NA   NA
 3463985 3463986 AM1_5842 AM1_5843     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3463986 3463987 AM1_5843 AM1_5844     FALSE 0.305 105.000 0.000 1.000   NA
 3463988 3463989 AM1_5845 AM1_5847     FALSE 0.363 63.000 0.000 NA   NA
 3463991 3463992 AM1_5848 AM1_5849     FALSE 0.081 257.000 0.000 NA   NA
 3463992 3463993 AM1_5849 AM1_5850     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3463994 3463995 AM1_5851 AM1_5852     FALSE 0.391 -36.000 0.000 NA   NA
 3463995 3463996 AM1_5852 AM1_5853     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3463996 3463997 AM1_5853 AM1_5854     FALSE 0.391 -36.000 0.000 NA   NA
 3463997 3463998 AM1_5854 AM1_5855     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464000 3464001 AM1_5857 AM1_5858     FALSE 0.092 238.000 0.000 NA   NA
 3464001 3464002 AM1_5858 AM1_5859     TRUE 0.907 12.000 0.000 0.009 Y NA
 3464002 3464003 AM1_5859 AM1_5860     FALSE 0.403 -28.000 0.000 NA   NA
 3464003 3464004 AM1_5860 AM1_5861     FALSE 0.220 113.000 0.000 NA   NA
 3464004 3464005 AM1_5861 AM1_5862     FALSE 0.038 514.000 0.000 NA   NA
 3464005 3464006 AM1_5862 AM1_5863     FALSE 0.059 337.000 0.000 NA   NA
 3464006 3464007 AM1_5863 AM1_5864     FALSE 0.043 460.000 0.000 NA   NA
 3464008 3464009 AM1_5865 AM1_5866     FALSE 0.080 259.000 0.000 NA   NA
 3464010 3464011 AM1_5867 AM1_5868     FALSE 0.096 231.000 0.000 NA   NA
 3464011 3464012 AM1_5868 AM1_5869     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3464013 3464014 AM1_5870 AM1_5871     FALSE 0.085 251.000 0.000 NA   NA
 3464014 3464015 AM1_5871 AM1_5872     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3464015 3464016 AM1_5872 AM1_5873     FALSE 0.236 102.000 0.000 NA   NA
 3464016 3464017 AM1_5873 AM1_5874     FALSE 0.139 183.000 0.000 NA   NA
 3464017 3464018 AM1_5874 AM1_5875     TRUE 0.940 -7.000 0.600 NA   NA
 3464019 3464020 AM1_5876 AM1_5877     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3464022 3464023 AM1_5879 AM1_5880     TRUE 0.941 -3.000 0.150 NA   NA
 3464023 3464024 AM1_5880 AM1_5881     TRUE 0.913 -22.000 0.150 NA   NA
 3464024 3464025 AM1_5881 AM1_5882     TRUE 0.908 58.000 0.400 NA   NA
 3464026 3464027 AM1_5885 AM1_5886     FALSE 0.184 145.000 0.000 NA   NA
 3464027 3464028 AM1_5886 AM1_5887     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3464028 3464029 AM1_5887 AM1_5888     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3464029 3464030 AM1_5888 AM1_5889     FALSE 0.223 160.000 0.000 1.000   NA
 3464030 3464031 AM1_5889 AM1_5890     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3464031 3464032 AM1_5890 AM1_5891     FALSE 0.066 304.000 0.000 NA   NA
 3464032 3464033 AM1_5891 AM1_5892     TRUE 0.702 15.000 0.000 0.014   NA
 3464033 3464034 AM1_5892 AM1_5893     FALSE 0.046 430.000 0.000 NA   NA
 3464035 3464036 AM1_5894 AM1_5895 bphP   TRUE 0.698 15.000 0.000 0.022   NA
 3464037 3464038 AM1_5896 AM1_5897     TRUE 0.604 161.000 0.000 0.026 Y NA
 3464041 3464042 AM1_5900 AM1_5901     FALSE 0.075 275.000 0.000 NA   NA
 3464045 3464046 AM1_5904 AM1_5905     TRUE 0.910 34.000 0.078 1.000 N NA
 3464046 3464047 AM1_5905 AM1_5906   hup TRUE 0.915 31.000 0.091 1.000 N NA
 3464048 3464049 AM1_5907 AM1_5908     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3464049 3464050 AM1_5908 AM1_5909     TRUE 0.952 13.000 0.600 NA   NA
 3464050 3464051 AM1_5909 AM1_5910     TRUE 0.433 30.000 0.000 NA   NA
 3464051 3464052 AM1_5910 AM1_5911     TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3464052 3464053 AM1_5911 AM1_5912     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3464054 3464055 AM1_5913 AM1_5914     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3464059 3464060 AM1_5918 AM1_5919     FALSE 0.029 992.000 0.000 NA   NA
 3464060 3464061 AM1_5919 AM1_5920   pnp FALSE 0.065 308.000 0.000 NA   NA
 3464061 3464062 AM1_5920 AM1_5921 pnp   FALSE 0.041 484.000 0.000 NA   NA
 3464064 3464065 AM1_5923 AM1_5924     FALSE 0.037 541.000 0.000 NA   NA
 3464070 3464071 AM1_5929 AM1_5930     FALSE 0.119 202.000 0.000 NA   NA
 3464072 3464073 AM1_5931 AM1_5932     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3464073 3464074 AM1_5932 AM1_5933     FALSE 0.231 155.000 0.000 1.000   NA
 3464076 3464077 AM1_5935 AM1_5936     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3464077 3464078 AM1_5936 AM1_5937   engA FALSE 0.116 205.000 0.000 NA   NA
 3464078 3464079 AM1_5937 AM1_5938 engA   TRUE 0.498 41.000 0.000 1.000   NA
 3464079 3464080 AM1_5938 AM1_5939     FALSE 0.250 143.000 0.000 1.000   NA
 3464081 3464082 AM1_5940 AM1_5942     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3464084 3464085 AM1_5943 AM1_5944     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3464085 3464086 AM1_5944 AM1_5945     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3464086 3464087 AM1_5945 AM1_5946     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3464087 3464088 AM1_5946 AM1_5947     FALSE 0.034 607.000 0.000 NA   NA
 3464088 3464089 AM1_5947 AM1_5948     TRUE 0.944 8.000 0.059 NA   NA
 3464090 10702651 AM1_5949 AM1_5950     FALSE 0.281 88.000 0.000 NA   NA
 10702651 3464091 AM1_5950 AM1_5952     FALSE 0.031 786.000 0.000 NA   NA
 3464093 3464094 AM1_5954 AM1_5955   gcvP FALSE 0.056 353.000 0.000 NA   NA
 3464094 3464095 AM1_5955 AM1_5956 gcvP   FALSE 0.109 213.000 0.000 NA   NA
 3464095 3464096 AM1_5956 AM1_5957     TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3464099 3464100 AM1_5960 AM1_5961     FALSE 0.052 380.000 0.000 NA   NA
 3464100 3464101 AM1_5961 AM1_5962     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3464101 3464102 AM1_5962 AM1_5963     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464103 3464104 AM1_5964 AM1_5965 cobW   TRUE 0.903 29.000 0.033 NA   NA
 3464104 3464105 AM1_5965 AM1_5966     FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3464106 3464107 AM1_5967 AM1_5968     FALSE 0.039 509.000 0.000 NA   NA
 3464107 3464108 AM1_5968 AM1_5969     FALSE 0.060 1279.000 0.000 0.021   NA
 3464109 3464110 AM1_5970 AM1_5971     TRUE 0.909 62.000 1.000 NA   NA
 3464110 3464111 AM1_5971 AM1_5972     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464111 3464112 AM1_5972 AM1_5973     TRUE 0.957 4.000 0.750 NA   NA
 3464112 3464113 AM1_5973 AM1_5974     FALSE 0.053 368.000 0.000 NA   NA
 3464113 3464114 AM1_5974 AM1_5975     FALSE 0.363 100.000 0.000 0.013 N NA
 3464115 3464116 AM1_5976 AM1_5977     FALSE 0.086 329.000 0.000 1.000   NA
 3464116 3464117 AM1_5977 AM1_5978     FALSE 0.150 215.000 0.000 1.000   NA
 3464118 3464119 AM1_5979 AM1_5980     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3464123 3464124 AM1_5988 AM1_5989     TRUE 0.735 11.000 0.000 0.010   NA
 3464124 3464125 AM1_5989 AM1_5990     TRUE 0.534 28.000 0.000 1.000   NA
 3464125 3464126 AM1_5990 AM1_5991     TRUE 0.972 49.000 0.500 0.016 Y NA
 3464126 3464127 AM1_5991 AM1_5992     TRUE 0.926 102.000 0.750 NA Y NA
 3464128 3464129 AM1_5993 AM1_5994 amiE fmdA FALSE 0.046 690.000 0.000 1.000   NA
 3464129 3464130 AM1_5994 AM1_5995 fmdA   TRUE 0.799 129.000 0.250 NA   NA
 3464130 3464131 AM1_5995 AM1_5996     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3464131 3464132 AM1_5996 AM1_5997     FALSE 0.034 792.000 0.000 1.000 N NA
 3464132 3464133 AM1_5997 AM1_5998     FALSE 0.039 500.000 0.000 NA   NA
 3464133 3464134 AM1_5998 AM1_5999     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3464134 3464135 AM1_5999 AM1_6000     FALSE 0.073 278.000 0.000 NA   NA
 3464136 3464137 AM1_6001 AM1_6002     FALSE 0.042 466.000 0.000 NA   NA
 3464138 3464139 AM1_6003 AM1_6004 isiA isiB TRUE 0.801 143.000 0.214 1.000   NA
 3464139 3464140 AM1_6004 AM1_6005 isiB   TRUE 0.861 87.000 0.235 NA   NA
 3464140 3464141 AM1_6005 AM1_6006     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3464142 3464143 AM1_6007 AM1_6008     FALSE 0.263 99.000 0.000 1.000 N NA
 3464143 3464144 AM1_6008 AM1_6009     FALSE 0.087 264.000 0.000 1.000 N NA
 3464144 3464145 AM1_6009 AM1_6010     FALSE 0.112 261.000 0.000 1.000   NA
 3464145 3464146 AM1_6010 AM1_6011   tal FALSE 0.054 528.000 0.000 1.000   NA
 3464146 3464147 AM1_6011 AM1_6012 tal   FALSE 0.069 291.000 0.000 NA   NA
 3464148 3464149 AM1_6013 AM1_6014     FALSE 0.060 335.000 0.000 NA   NA
 3464149 3464150 AM1_6014 AM1_6015     FALSE 0.071 397.000 0.000 1.000   NA
 3464150 3464151 AM1_6015 AM1_6016     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3464151 3464152 AM1_6016 AM1_6017     FALSE 0.087 249.000 0.000 NA   NA
 3464152 3464153 AM1_6017 AM1_6019     FALSE 0.029 1401.000 0.000 NA   NA
 3464155 3464156 AM1_6020 AM1_6021     FALSE 0.103 278.000 0.000 1.000   NA
 3464156 3464157 AM1_6021 AM1_6022     TRUE 0.645 11.000 0.000 1.000   NA
 3464157 3464158 AM1_6022 AM1_6023     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3464158 3464159 AM1_6023 AM1_6024     FALSE 0.263 93.000 0.000 NA   NA
 3464159 3464160 AM1_6024 AM1_6025     FALSE 0.083 255.000 0.000 NA   NA
 3464160 3464161 AM1_6025 AM1_6026     TRUE 0.553 -48.000 0.000 0.026   NA
 3464164 3464165 AM1_6029 AM1_6030 cydB cydA TRUE 0.985 11.000 0.750 0.032 Y NA
 3464165 3464166 AM1_6030 AM1_6031 cydA   FALSE 0.193 136.000 0.000 NA   NA
 3464166 3464167 AM1_6031 AM1_6032     FALSE 0.077 266.000 0.000 NA   NA
 3464167 3464168 AM1_6032 AM1_6033     TRUE 0.955 7.000 0.467 NA   NA
 3464168 3464169 AM1_6033 AM1_6034     FALSE 0.209 123.000 0.000 NA   NA
 3464170 3464171 AM1_6035 AM1_6036     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3464173 3464174 AM1_6038 AM1_6039     TRUE 0.952 1.000 0.286 NA   NA
 3464175 3464176 AM1_6040 AM1_6041 holB tmk TRUE 0.952 0.000 0.254 1.000 N NA
 3464176 3464177 AM1_6041 AM1_6042 tmk   FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3464178 3464179 AM1_6043 AM1_6044     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3464181 3464182 AM1_6046 AM1_6047     FALSE 0.158 164.000 0.000 NA   NA
 3464183 3464184 AM1_6048 AM1_6049     FALSE 0.168 157.000 0.000 NA   NA
 3464184 3464185 AM1_6049 AM1_6050     TRUE 0.809 127.000 0.423 NA   NA
 3464185 3464186 AM1_6050 AM1_6051     TRUE 0.891 82.000 0.404 1.000   NA
 3464186 3464187 AM1_6051 AM1_6052   surE FALSE 0.284 120.000 0.000 1.000   NA
 3464187 3464188 AM1_6052 AM1_6053 surE   TRUE 0.460 61.000 0.000 1.000   NA
 3464190 3464191 AM1_6055 AM1_6056 ggt   FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3464192 3464193 AM1_6057 AM1_6058     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3464193 3464194 AM1_6058 AM1_6059     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464194 3464195 AM1_6059 AM1_6060   hdc FALSE 0.123 246.000 0.000 1.000   NA
 3464195 3464196 AM1_6060 AM1_6061 hdc   FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3464197 3464198 AM1_6062 AM1_6063     FALSE 0.079 261.000 0.000 NA   NA
 3464202 3464203 AM1_6067 AM1_6068     FALSE 0.051 384.000 0.000 NA   NA
 3464203 3464204 AM1_6068 AM1_6069     FALSE 0.077 268.000 0.000 NA   NA
 3464204 3464205 AM1_6069 AM1_6070     TRUE 0.979 20.000 0.400 0.022 Y NA
 3464205 3464206 AM1_6070 AM1_6071     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3464206 3464207 AM1_6071 AM1_6072     FALSE 0.029 956.000 0.000 NA   NA
 3464207 3464208 AM1_6072 AM1_6073     FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3464208 3464209 AM1_6073 AM1_6074     FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3464211 3464212 AM1_6076 AM1_6077     FALSE 0.054 360.000 0.000 NA   NA
 3464213 3464214 AM1_6078 AM1_6079     FALSE 0.057 348.000 0.000 NA   NA
 3464214 3464215 AM1_6079 AM1_6080     FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3464215 3464216 AM1_6080 AM1_6081     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3464217 3464218 AM1_6082 AM1_6083     TRUE 0.893 15.000 0.000 0.028 Y NA
 3464218 3464219 AM1_6083 AM1_6084     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3464219 3464220 AM1_6084 AM1_6085     TRUE 0.795 146.000 1.000 NA   NA
 3464220 3464221 AM1_6085 AM1_6086     TRUE 0.860 30.000 0.000 0.013 Y NA
 3464223 3464224 AM1_6087 AM1_6089     FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3464224 3464225 AM1_6089 AM1_6090     FALSE 0.374 58.000 0.000 NA   NA
 3464225 3464226 AM1_6090 AM1_6091     TRUE 0.473 5.000 0.000 NA N NA
 3464232 3464233 AM1_6097 AM1_6098     TRUE 0.912 11.000 0.000 0.002 Y NA
 3464233 3464234 AM1_6098 AM1_6099     FALSE 0.360 72.000 0.000 1.000 N NA
 3464234 3464235 AM1_6099 AM1_6100     FALSE 0.234 119.000 0.000 1.000 N NA
 3464235 3464236 AM1_6100 AM1_6101     FALSE 0.105 218.000 0.000 NA   NA
 3464236 3464237 AM1_6101 AM1_6102     FALSE 0.031 731.000 0.000 NA   NA
 3464238 3464239 AM1_6103 AM1_6104 trpF1   TRUE 0.471 56.000 0.000 1.000   NA
 3464239 3464240 AM1_6104 AM1_6105     FALSE 0.082 256.000 0.000 NA   NA
 3464242 3464243 AM1_6107 AM1_6108     TRUE 0.758 125.000 0.033 NA   NA
 3464243 3464244 AM1_6108 AM1_6109     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3464245 3464246 AM1_6110 AM1_6111 lys   FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3464246 3464247 AM1_6111 AM1_6112     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3464248 3464249 AM1_6113 AM1_6114     FALSE 0.114 364.000 0.000 0.005   NA
 3464249 3464250 AM1_6114 AM1_6115     FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3464250 3464251 AM1_6115 AM1_6116     FALSE 0.173 153.000 0.000 NA   NA
 3464251 3464252 AM1_6116 AM1_6117     TRUE 0.433 30.000 0.000 NA   NA
 3464252 3464253 AM1_6117 AM1_6118     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3464253 3464254 AM1_6118 AM1_6119     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3464258 3464259 AM1_6123 AM1_6124     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3464260 3464261 AM1_6125 AM1_6126 xerC   TRUE 0.576 43.000 0.000 0.065   NA
 3464261 3464262 AM1_6126 AM1_6127     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3464263 3464264 AM1_6128 AM1_6129     TRUE 0.932 -13.000 0.556 NA   NA
 3464264 3464265 AM1_6129 AM1_6130     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3464265 3464266 AM1_6130 AM1_6131     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3464266 3464267 AM1_6131 AM1_6132     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3464267 3464268 AM1_6132 AM1_6133     FALSE 0.066 304.000 0.000 NA   NA
 3464272 3464273 AM1_6137 AM1_6138     FALSE 0.032 717.000 0.000 NA   NA
 3464273 3464274 AM1_6138 AM1_6139     TRUE 0.575 0.000 0.000 1.000 N NA
 3464274 3464275 AM1_6139 AM1_6140     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3464275 3464276 AM1_6140 AM1_6141     FALSE 0.263 93.000 0.000 NA   NA
 3464276 3464277 AM1_6141 AM1_6142     TRUE 0.469 57.000 0.000 1.000   NA
 3464277 3464278 AM1_6142 AM1_6143     FALSE 0.326 97.000 0.000 1.000   NA
 3464278 3464279 AM1_6143 AM1_6144     FALSE 0.127 206.000 0.000 1.000 N NA
 3464279 3464280 AM1_6144 AM1_6145     TRUE 0.899 15.000 0.000 0.002 Y NA
 3464280 3464281 AM1_6145 AM1_6146     FALSE 0.242 148.000 0.000 1.000   NA
 3464281 3464282 AM1_6146 AM1_6147     TRUE 0.499 40.000 0.000 1.000   NA
 3464282 3464283 AM1_6147 AM1_6148     FALSE 0.281 122.000 0.000 1.000   NA
 3464283 3464284 AM1_6148 AM1_6149     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3464284 3464285 AM1_6149 AM1_6150     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3464286 3464287 AM1_6151 AM1_6152     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3464288 3464289 AM1_6153 AM1_6154     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464289 3464290 AM1_6154 AM1_6155     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3464290 3464291 AM1_6155 AM1_6156     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3464291 3464292 AM1_6156 AM1_6157     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3464292 3464293 AM1_6157 AM1_6158     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3464293 3464294 AM1_6158 AM1_6159     FALSE 0.054 363.000 0.000 NA   NA
 3464294 3464295 AM1_6159 AM1_6160     FALSE 0.101 223.000 0.000 NA   NA
 3464296 3464297 AM1_6161 AM1_6162     TRUE 0.490 48.000 0.000 1.000   NA
 3464301 3464302 AM1_6166 AM1_6167     FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3464302 3464303 AM1_6167 AM1_6168     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3464303 3464304 AM1_6168 AM1_6169     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3464304 3464305 AM1_6169 AM1_6170     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3464305 3464306 AM1_6170 AM1_6171   rpoD FALSE 0.032 685.000 0.000 NA   NA
 3464308 3464309 AM1_6173 AM1_6174 hup   FALSE 0.117 204.000 0.000 NA   NA
 3464311 3464312 AM1_6176 AM1_6177     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464313 3464314 AM1_6178 AM1_6179     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3464315 3464316 AM1_6180 AM1_6181     TRUE 0.592 5.000 0.000 1.000 N NA
 3464317 3464318 AM1_6182 AM1_6183     FALSE 0.061 328.000 0.000 NA   NA
 3464318 3464319 AM1_6183 AM1_6184     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3464321 3464322 AM1_6186 AM1_6187     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3464322 3464323 AM1_6187 AM1_6188     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3464327 3464328 AM1_6192 AM1_6193     FALSE 0.072 279.000 0.000 NA   NA
 3464335 3464336 AM1_6200 AM1_6201     FALSE 0.082 256.000 0.000 NA   NA
 3464336 3464337 AM1_6201 AM1_6202     FALSE 0.039 502.000 0.000 NA   NA
 3464337 3464338 AM1_6202 AM1_6203     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3464338 3464339 AM1_6203 AM1_6204     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3464339 3464340 AM1_6204 AM1_6205     FALSE 0.062 321.000 0.000 NA   NA
 3464340 3464341 AM1_6205 AM1_6206     TRUE 0.970 -28.000 0.219 0.053 Y NA
 3464341 3464342 AM1_6206 AM1_6207     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464342 3464343 AM1_6207 AM1_6208     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3464343 3464344 AM1_6208 AM1_6209     FALSE 0.149 270.000 0.000 0.027   NA
 3464344 3464345 AM1_6209 AM1_6210     FALSE 0.136 186.000 0.000 NA   NA
 3464345 3464346 AM1_6210 AM1_6211     FALSE 0.073 278.000 0.000 NA   NA
 3464349 3464350 AM1_6214 AM1_6215     TRUE 0.933 -10.000 0.316 NA   NA
 3464351 3464352 AM1_6216 AM1_6217     FALSE 0.039 502.000 0.000 NA   NA
 3464352 3464353 AM1_6217 AM1_6218     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3464353 3464354 AM1_6218 AM1_6219     FALSE 0.120 350.000 0.000 0.006   NA
 3464356 3464357 AM1_6221 AM1_6222     FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3464358 3464359 AM1_6223 AM1_6224     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3464359 3464360 AM1_6224 AM1_6225     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3464360 3464361 AM1_6225 AM1_6226     FALSE 0.049 612.000 0.000 1.000   NA
 3464361 3464362 AM1_6226 AM1_6227     TRUE 0.644 113.000 0.000 1.000 Y NA
 3464364 3464365 AM1_6229 AM1_6230     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3464365 3464366 AM1_6230 AM1_6231     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3464368 3464369 AM1_6233 AM1_6234     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3464370 3464371 AM1_6235 AM1_6236     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3464372 3464373 AM1_6237 AM1_6238     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3464374 3464375 AM1_6239 AM1_6240     FALSE 0.032 713.000 0.000 NA   NA
 3464377 3464378 AM1_6241 AM1_6243     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3464379 3464380 AM1_6244 AM1_6245     FALSE 0.064 312.000 0.000 NA   NA
 3464380 3464381 AM1_6245 AM1_6246     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3464383 3464384 AM1_6248 AM1_6249     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3464388 3464389 AM1_6253 AM1_6254     TRUE 0.456 -12.000 0.000 NA   NA
 3464390 3464391 AM1_6255 AM1_6256     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3464391 3464392 AM1_6256 AM1_6257     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3464392 3464393 AM1_6257 AM1_6258     FALSE 0.206 125.000 0.000 NA   NA
 3464393 3464394 AM1_6258 AM1_6259     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3464396 3464397 AM1_6261 AM1_6262     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3464398 3464399 AM1_6263 AM1_6264 rpiB   FALSE 0.108 270.000 0.000 1.000   NA
 3464402 3464403 AM1_6267 AM1_6268     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3464403 3464404 AM1_6268 AM1_6269     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3464404 3464405 AM1_6269 AM1_6270     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3464406 3464407 AM1_6271 AM1_6272     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464408 3464409 AM1_6273 AM1_6274     FALSE 0.134 189.000 0.000 NA   NA
 3464409 3464410 AM1_6274 AM1_6275     TRUE 0.444 -15.000 0.000 NA   NA
 3464410 3464411 AM1_6275 AM1_6276     FALSE 0.363 -49.000 0.000 NA   NA
 3464411 3464412 AM1_6276 AM1_6277     FALSE 0.088 245.000 0.000 NA   NA
 3464412 3464413 AM1_6277 AM1_6278     FALSE 0.045 436.000 0.000 NA   NA
 3464414 3464415 AM1_6279 AM1_6281     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3464416 3464417 AM1_6282 AM1_6283     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3464417 3464418 AM1_6283 AM1_6284     TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3464418 3464419 AM1_6284 AM1_6285     TRUE 0.494 44.000 0.000 1.000   NA
 3464419 3464420 AM1_6285 AM1_6286     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3464420 3464421 AM1_6286 AM1_6287     FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3464422 3464423 AM1_6288 AM1_6289     FALSE 0.091 240.000 0.000 NA   NA
 3464423 3464424 AM1_6289 AM1_6290     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3464426 3464427 AM1_6292 AM1_6293     FALSE 0.274 90.000 0.000 NA   NA
 3464428 3464429 AM1_6294 AM1_6295     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3464433 3464434 AM1_6299 AM1_6300     FALSE 0.054 363.000 0.000 NA   NA
 3464437 3464438 AM1_6303 AM1_6304     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3464438 3464439 AM1_6304 AM1_6305     FALSE 0.173 153.000 0.000 NA   NA
 3464439 3464440 AM1_6305 AM1_6306     TRUE 0.641 25.000 0.000 0.021   NA
 3464441 3464442 AM1_6307 AM1_6308     FALSE 0.404 265.000 0.000 0.013 Y NA
 3464442 3464443 AM1_6308 AM1_6309     FALSE 0.394 61.000 0.000 1.000 N NA
 3464443 3464444 AM1_6309 AM1_6310     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3464447 3464448 AM1_6313 AM1_6314   dsbA FALSE 0.116 256.000 0.000 1.000   NA
 3464448 3464449 AM1_6314 AM1_6315 dsbA   FALSE 0.134 231.000 0.000 1.000   NA
 3464449 3464450 AM1_6315 AM1_6316     TRUE 0.629 153.000 0.000 0.009 Y NA
 3464450 3464451 AM1_6316 AM1_6317     FALSE 0.058 343.000 0.000 NA   NA
 3464451 3464452 AM1_6317 AM1_6318   tal FALSE 0.153 170.000 0.000 NA   NA
 3464452 3464453 AM1_6318 AM1_6319 tal gnd TRUE 0.924 135.000 0.208 0.002 Y NA
 3464453 3464454 AM1_6319 AM1_6320 gnd zwf TRUE 0.975 11.000 0.021 1.000 Y NA
 3464454 3464455 AM1_6320 AM1_6321 zwf fbp TRUE 0.890 10.000 0.000 1.000 Y NA
 3464455 3464456 AM1_6321 AM1_6322 fbp   FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3464456 3464457 AM1_6322 AM1_6323     FALSE 0.094 234.000 0.000 NA   NA
 3464457 3464458 AM1_6323 AM1_6324     TRUE 0.450 33.000 0.000 1.000 N NA
 3464459 3464460 AM1_6325 AM1_6326     FALSE 0.124 198.000 0.000 NA   NA
 3464460 3464461 AM1_6326 AM1_6327     FALSE 0.378 56.000 0.000 NA   NA
 3464461 3464462 AM1_6327 AM1_6328     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3464462 3464463 AM1_6328 AM1_6329     FALSE 0.209 170.000 0.000 1.000   NA
 3464463 3464464 AM1_6329 AM1_6330     FALSE 0.206 216.000 0.000 0.021   NA
 3464465 3464466 AM1_6331 AM1_6332     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3464466 3464467 AM1_6332 AM1_6333     TRUE 0.976 -6.000 0.300 1.000 Y NA
 3464467 3464468 AM1_6333 AM1_6334     FALSE 0.360 259.000 0.000 1.000 Y NA
 3464468 3464469 AM1_6334 AM1_6335     FALSE 0.093 254.000 0.000 1.000 N NA
 3464469 3464470 AM1_6335 AM1_6336     FALSE 0.399 59.000 0.000 1.000 N NA
 3464471 3464472 AM1_6337 AM1_6338     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3464472 3464473 AM1_6338 AM1_6339     TRUE 0.885 77.000 0.500 NA   NA
 3464473 3464474 AM1_6339 AM1_6340     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464475 3464476 AM1_6341 AM1_6342     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3464476 3464477 AM1_6342 AM1_6343     FALSE 0.046 426.000 0.000 NA   NA
 3464477 3464478 AM1_6343 AM1_6344     FALSE 0.083 340.000 0.000 1.000   NA
 3464478 3464479 AM1_6344 AM1_6345     TRUE 0.510 35.000 0.000 1.000   NA
 3464479 3464480 AM1_6345 AM1_6346     TRUE 0.916 19.000 0.005 1.000   NA
 3464481 3464482 AM1_6347 AM1_6348     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3464484 3464485 AM1_6350 AM1_6351   hemE FALSE 0.037 544.000 0.000 NA   NA
 3464485 3464486 AM1_6351 AM1_6352 hemE   FALSE 0.224 126.000 0.000 1.000 N NA
 3464488 3464489 AM1_6354 AM1_6355     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3464491 3464492 AM1_6357 AM1_6358     TRUE 0.575 178.000 0.000 0.013 Y NA
 3464492 3464493 AM1_6358 AM1_6359     TRUE 0.645 144.000 0.000 0.013 Y NA
 3464496 3464497 AM1_6362 AM1_6363     FALSE 0.053 550.000 0.000 1.000   NA
 3464497 3464498 AM1_6363 AM1_6364     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3464498 3464499 AM1_6364 AM1_6365     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3464499 3464500 AM1_6365 AM1_6366     FALSE 0.136 198.000 0.000 1.000 N NA
 3464501 3464502 AM1_6367 AM1_6368     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3464504 3464505 AM1_6370 AM1_6371     TRUE 0.894 80.000 0.455 1.000   NA
 3464505 3464506 AM1_6371 AM1_6372   ndhB TRUE 0.927 50.000 0.857 1.000   NA
 3464506 3464507 AM1_6372 AM1_6373 ndhB ndhF TRUE 0.965 73.000 0.714 0.001 Y NA
 3464507 3464508 AM1_6373 AM1_6374 ndhF   FALSE 0.097 247.000 0.000 1.000 N NA
 3464508 3464509 AM1_6374 AM1_6375     TRUE 0.650 2.000 0.000 1.000   NA
 3464509 3464510 AM1_6375 AM1_6376     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3464510 3464511 AM1_6376 AM1_6377     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3464511 3464512 AM1_6377 AM1_6378     FALSE 0.091 240.000 0.000 NA   NA
 3464514 3464515 AM1_6379 AM1_6381     FALSE 0.184 145.000 0.000 NA   NA
 3464515 3464516 AM1_6381 AM1_6382     FALSE 0.418 50.000 0.000 1.000 N NA
 3464516 3464517 AM1_6382 AM1_6383     TRUE 0.570 20.000 0.000 1.000   NA
 3464517 3464518 AM1_6383 AM1_6384     TRUE 0.695 18.000 0.000 0.001   NA
 3464518 3464519 AM1_6384 AM1_6385     TRUE 0.929 43.000 0.070 0.001   NA
 3464519 3464520 AM1_6385 AM1_6386     FALSE 0.081 349.000 0.000 1.000   NA
 3464520 3464521 AM1_6386 AM1_6387     TRUE 0.928 129.000 0.375 0.021 Y NA
 3464521 3464522 AM1_6387 AM1_6388     FALSE 0.180 160.000 0.000 1.000 N NA
 3464522 3464523 AM1_6388 AM1_6389     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3464525 3464526 AM1_6390 AM1_6392     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3464527 3464528 AM1_6393 AM1_6394     TRUE 0.875 78.000 0.211 NA   NA
 3464533 3464534 AM1_6399 AM1_6400     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3464534 3464535 AM1_6400 AM1_6401     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3464535 3464536 AM1_6401 AM1_6402     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3464536 3464537 AM1_6402 AM1_6403     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3464537 3464538 AM1_6403 AM1_6404     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3464538 3464539 AM1_6404 AM1_6405     FALSE 0.310 79.000 0.000 NA   NA
 3464539 3464540 AM1_6405 AM1_6406     TRUE 0.955 8.000 0.400 NA   NA
 3464541 10702654 AM1_6407 AM1_6408 ndhM   FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 10702654 3464542 AM1_6408 AM1_6409   aroH FALSE 0.361 -58.000 0.000 NA   NA
 3464542 3464543 AM1_6409 AM1_6410 aroH   TRUE 0.894 47.000 0.018 1.000   NA
 3464544 3458193 AM1_6411 AM1_0001     FALSE 0.029 1175.000 0.000 NA   NA
 3464546 3464547 AM1_A0002 AM1_A0003     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3464548 3464549 AM1_A0004 AM1_A0005     FALSE 0.125 197.000 0.000 NA   NA
 3464549 3464550 AM1_A0005 AM1_A0006     FALSE 0.031 733.000 0.000 NA   NA
 3464550 3464551 AM1_A0006 AM1_A0007     FALSE 0.178 149.000 0.000 NA   NA
 3464551 3464552 AM1_A0007 AM1_A0008     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3464552 3464553 AM1_A0008 AM1_A0009   ndhK FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3464553 3464554 AM1_A0009 AM1_A0010 ndhK   FALSE 0.053 367.000 0.000 NA   NA
 3464554 3464555 AM1_A0010 AM1_A0011     FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3464556 3464557 AM1_A0012 AM1_A0013     FALSE 0.059 339.000 0.000 NA   NA
 3464558 3464559 AM1_A0014 AM1_A0015     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3464560 3464561 AM1_A0016 AM1_A0017   dcm FALSE 0.076 273.000 0.000 NA   NA
 3464561 3464562 AM1_A0017 AM1_A0018 dcm   FALSE 0.174 164.000 0.000 1.000 N NA
 3464562 3464563 AM1_A0018 AM1_A0019     TRUE 0.650 2.000 0.000 1.000   NA
 3464563 3464564 AM1_A0019 AM1_A0020     FALSE 0.043 461.000 0.000 NA   NA
 3464565 3464566 AM1_A0021 AM1_A0022   dacB FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3464566 3464567 AM1_A0022 AM1_A0023 dacB   FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3464569 3464570 AM1_A0025 AM1_A0026     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3464570 3464571 AM1_A0026 AM1_A0027     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3464571 3464572 AM1_A0027 AM1_A0028     TRUE 0.956 8.000 0.667 NA   NA
 3464572 3464573 AM1_A0028 AM1_A0029     TRUE 0.938 -10.000 1.000 NA   NA
 3464573 3464574 AM1_A0029 AM1_A0030     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3464574 3464575 AM1_A0030 AM1_A0031     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3464575 3464576 AM1_A0031 AM1_A0032     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3464576 3464577 AM1_A0032 AM1_A0033     FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3464577 3464578 AM1_A0033 AM1_A0034     FALSE 0.059 336.000 0.000 NA   NA
 3464578 3464579 AM1_A0034 AM1_A0035     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3464579 3464580 AM1_A0035 AM1_A0036     FALSE 0.031 774.000 0.000 NA   NA
 3464582 3464583 AM1_A0038 AM1_A0039     FALSE 0.335 131.000 0.000 0.064   NA
 3464585 3464586 AM1_A0041 AM1_A0042     FALSE 0.042 473.000 0.000 NA   NA
 3464587 3464588 AM1_A0043 AM1_A0044     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3464596 3464597 AM1_A0052 AM1_A0053     FALSE 0.149 173.000 0.000 NA   NA
 3464600 3464601 AM1_A0056 AM1_A0057     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3464602 3464603 AM1_A0058 AM1_A0060     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3464605 3464606 AM1_A0061 AM1_A0062     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3464607 3464608 AM1_A0063 AM1_A0064     FALSE 0.358 65.000 0.000 NA   NA
 3464608 3464609 AM1_A0064 AM1_A0065     FALSE 0.415 35.000 0.000 NA   NA
 3464610 3464611 AM1_A0066 AM1_A0067     FALSE 0.059 364.000 0.000 1.000 N NA
 3464611 3464612 AM1_A0067 AM1_A0068     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3464616 3464617 AM1_A0072 AM1_A0074     FALSE 0.387 -39.000 0.000 NA   NA
 3464618 3464619 AM1_A0073 AM1_A0075     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3464621 3464622 AM1_A0077 AM1_A0078     FALSE 0.090 242.000 0.000 NA   NA
 3464626 3464627 AM1_A0082 AM1_A0083     FALSE 0.121 200.000 0.000 NA   NA
 3464627 3464628 AM1_A0083 AM1_A0084   aacC3 FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3464628 3464629 AM1_A0084 AM1_A0085 aacC3   FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3464629 3464630 AM1_A0085 AM1_A0086     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3464630 3464631 AM1_A0086 AM1_A0087     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3464633 3464634 AM1_A0089 AM1_A0090     FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3464634 3464635 AM1_A0090 AM1_A0091     FALSE 0.114 221.000 0.000 1.000 N NA
 3464635 3464636 AM1_A0091 AM1_A0092   recA TRUE 0.743 93.000 0.000 0.009 Y NA
 3464637 3464638 AM1_A0093 AM1_A0094     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464638 3464639 AM1_A0094 AM1_A0095     FALSE 0.386 82.000 0.000 1.000   NA
 3464641 3464642 AM1_A0097 AM1_A0098     FALSE 0.143 179.000 0.000 NA   NA
 3464642 3464643 AM1_A0098 AM1_A0099     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3464643 3464644 AM1_A0099 AM1_A0101     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3464646 3464647 AM1_A0102 AM1_A0103     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3464647 3464648 AM1_A0103 AM1_A0104     FALSE 0.417 -22.000 0.000 NA   NA
 3464648 3464649 AM1_A0104 AM1_A0105     FALSE 0.415 35.000 0.000 NA   NA
 3464651 3464652 AM1_A0107 AM1_A0108     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3464652 3464653 AM1_A0108 AM1_A0109     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3464653 3464654 AM1_A0109 AM1_A0110     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3464654 3464655 AM1_A0110 AM1_A0111     FALSE 0.160 162.000 0.000 NA   NA
 3464655 3464656 AM1_A0111 AM1_A0112     FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3464657 3464658 AM1_A0113 AM1_A0114     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3464658 3464659 AM1_A0114 AM1_A0115     FALSE 0.030 798.000 0.000 NA   NA
 3464659 3464660 AM1_A0115 AM1_A0116     FALSE 0.030 815.000 0.000 NA   NA
 3464663 3464664 AM1_A0119 AM1_A0120     TRUE 0.454 231.000 0.000 0.027 Y NA
 3464664 3464665 AM1_A0120 AM1_A0121     FALSE 0.053 540.000 0.000 1.000   NA
 3464665 3464666 AM1_A0121 AM1_A0122     FALSE 0.420 96.000 0.000 0.023   NA
 3464667 3464668 AM1_A0123 AM1_A0124     FALSE 0.129 204.000 0.000 1.000 N NA
 3464668 3464669 AM1_A0124 AM1_A0125   menF FALSE 0.042 531.000 0.000 1.000 N NA
 3464671 3464672 AM1_A0127 AM1_A0128     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3464672 3464673 AM1_A0128 AM1_A0129     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3464673 3464674 AM1_A0129 AM1_A0130     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3464674 3464675 AM1_A0130 AM1_A0131     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3464675 3464676 AM1_A0131 AM1_A0132     TRUE 0.932 -13.000 0.556 NA   NA
 3464677 3464678 AM1_A0133 AM1_A0134     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3464678 3464679 AM1_A0134 AM1_A0135   xerC TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3464679 3464680 AM1_A0135 AM1_A0136 xerC   FALSE 0.125 197.000 0.000 NA   NA
 3464681 3464682 AM1_A0137 AM1_A0138     FALSE 0.209 123.000 0.000 NA   NA
 3464682 3464683 AM1_A0138 AM1_A0139     TRUE 0.491 47.000 0.000 1.000   NA
 3464684 3464685 AM1_A0140 AM1_A0141     FALSE 0.152 171.000 0.000 NA   NA
 3464686 3464687 AM1_A0142 AM1_A0144     FALSE 0.400 -30.000 0.000 NA   NA
 3464687 3464688 AM1_A0144 AM1_A0145     FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3464689 3464690 AM1_A0146 AM1_A0147 feoA feoB TRUE 0.980 3.000 0.122 1.000 Y NA
 3464690 3464691 AM1_A0147 AM1_A0148 feoB   TRUE 0.809 93.000 0.030 NA   NA
 3464691 3464692 AM1_A0148 AM1_A0149     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3464694 3464695 AM1_A0151 AM1_A0152     TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3464696 3464697 AM1_A0153 AM1_A0154     TRUE 0.936 -3.000 0.081 NA   NA
 3464697 3464698 AM1_A0154 AM1_A0155     FALSE 0.044 446.000 0.000 NA   NA
 3464698 3464699 AM1_A0155 AM1_A0156     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3464699 3464700 AM1_A0156 AM1_A0157     TRUE 0.824 33.000 0.000 1.000 Y NA
 3464700 3464701 AM1_A0157 AM1_A0158     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3464701 3464702 AM1_A0158 AM1_A0159     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464702 3464703 AM1_A0159 AM1_A0160     FALSE 0.080 210.000 0.000 NA N NA
 3464703 3464704 AM1_A0160 AM1_A0161     TRUE 0.484 -12.000 0.000 1.000 N NA
 3464704 3464705 AM1_A0161 AM1_A0162     TRUE 0.976 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 3464705 3464706 AM1_A0162 AM1_A0163     TRUE 0.981 -3.000 0.169 0.015 Y NA
 3464706 3464707 AM1_A0163 AM1_A0164     FALSE 0.385 94.000 0.000 0.015 N NA
 3464707 3464708 AM1_A0164 AM1_A0165     TRUE 0.860 -16.000 0.000 0.021 Y NA
 3464708 3464709 AM1_A0165 AM1_A0166     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3464710 3464711 AM1_A0167 AM1_A0168     FALSE 0.129 193.000 0.000 NA   NA
 3464711 3464712 AM1_A0168 AM1_A0169     FALSE 0.063 350.000 0.000 1.000 N NA
 3464712 3464713 AM1_A0169 AM1_A0170     FALSE 0.038 607.000 0.000 1.000 N NA
 3464713 3464714 AM1_A0170 AM1_A0171     TRUE 0.472 6.000 0.000 NA N NA
 3464714 3464715 AM1_A0171 AM1_A0172     FALSE 0.119 160.000 0.000 NA N NA
 3464715 3464716 AM1_A0172 AM1_A0173     TRUE 0.972 -43.000 0.913 0.003 Y NA
 3464720 3464721 AM1_A0177 AM1_A0178     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3464721 3464722 AM1_A0178 AM1_A0179     FALSE 0.068 296.000 0.000 NA   NA
 3464722 3464723 AM1_A0179 AM1_A0180     TRUE 0.557 64.000 0.000 0.010   NA
 3464724 3464725 AM1_A0181 AM1_A0182     FALSE 0.096 231.000 0.000 NA   NA
 3464725 3464726 AM1_A0182 AM1_A0183     TRUE 0.866 29.000 0.000 0.002 Y NA
 3464726 3464727 AM1_A0183 AM1_A0184     TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3464727 3464728 AM1_A0184 AM1_A0185     FALSE 0.345 272.000 0.000 1.000 Y NA
 3464729 3464730 AM1_A0186 AM1_A0188     TRUE 0.554 -48.000 0.000 0.025   NA
 3464731 3464732 AM1_A0187 AM1_A0189     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3464732 3464733 AM1_A0189 AM1_A0190   fhuC FALSE 0.135 187.000 0.000 NA   NA
 3464733 3464734 AM1_A0190 AM1_A0191 fhuC   TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3464734 3464735 AM1_A0191 AM1_A0192     FALSE 0.220 113.000 0.000 NA   NA
 3464735 3464736 AM1_A0192 AM1_A0193     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3464736 3464737 AM1_A0193 AM1_A0194     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3464737 10702596 AM1_A0194 AM1_A0195     FALSE 0.091 240.000 0.000 NA   NA
 10702596 3464738 AM1_A0195 AM1_A0196     FALSE 0.098 227.000 0.000 NA   NA
 3464738 3464739 AM1_A0196 AM1_A0197     FALSE 0.305 105.000 0.000 1.000   NA
 3464739 3464740 AM1_A0197 AM1_A0198     TRUE 0.559 22.000 0.000 1.000   NA
 3464740 3464741 AM1_A0198 AM1_A0199     TRUE 0.796 145.000 0.500 1.000 N NA
 3464741 3464742 AM1_A0199 AM1_A0200     FALSE 0.325 74.000 0.000 NA   NA
 3464743 3464744 AM1_A0201 AM1_A0202     FALSE 0.028 1493.000 0.000 NA   NA
 3464745 3464746 AM1_A0203 AM1_A0204     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3464746 3464747 AM1_A0204 AM1_A0205     FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3464747 3464748 AM1_A0205 AM1_A0206     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3464748 3464749 AM1_A0206 AM1_A0207     FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3464750 3464751 AM1_A0208 AM1_A0209     TRUE 0.927 27.000 0.286 NA   NA
 3464751 3464752 AM1_A0209 AM1_A0210     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3464752 3464753 AM1_A0210 AM1_A0212     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3464755 3464756 AM1_A0213 AM1_A0214     FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3464757 3464758 AM1_A0215 AM1_A0216     FALSE 0.066 302.000 0.000 NA   NA
 3464758 3464759 AM1_A0216 AM1_A0217     FALSE 0.069 292.000 0.000 NA   NA
 3464759 3464760 AM1_A0217 AM1_A0218     FALSE 0.389 -37.000 0.000 NA   NA
 3464761 3464762 AM1_A0219 AM1_A0220     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3464764 3464765 AM1_A0222 AM1_A0223     FALSE 0.409 38.000 0.000 NA   NA
 3464765 3464766 AM1_A0223 AM1_A0224     FALSE 0.098 384.000 0.000 0.063   NA
 3464766 3464767 AM1_A0224 AM1_A0225     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3464767 3464768 AM1_A0225 AM1_A0226     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3464768 3464769 AM1_A0226 AM1_A0227     TRUE 0.711 8.000 0.000 0.002 N NA
 3464769 3464770 AM1_A0227 AM1_A0228     TRUE 0.978 18.000 0.667 1.000 Y NA
 3464770 3464771 AM1_A0228 AM1_A0229     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3464771 3464772 AM1_A0229 AM1_A0230     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464772 3464773 AM1_A0230 AM1_A0231     FALSE 0.391 280.000 0.000 0.002 Y NA
 3464773 3464774 AM1_A0231 AM1_A0232     TRUE 0.900 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 3464774 3464775 AM1_A0232 AM1_A0233     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3464775 3464776 AM1_A0233 AM1_A0234   ectB TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3464776 3464777 AM1_A0234 AM1_A0235 ectB   FALSE 0.311 86.000 0.000 1.000 N NA
 3464777 3464778 AM1_A0235 AM1_A0236     TRUE 0.901 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 3464778 3464779 AM1_A0236 AM1_A0237     TRUE 0.845 36.000 0.000 0.040 Y NA
 3464780 3464781 AM1_A0238 AM1_A0239     TRUE 0.927 27.000 0.286 NA   NA
 3464782 3464783 AM1_A0240 AM1_A0241     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3464783 3464784 AM1_A0241 AM1_A0242     TRUE 0.944 -3.000 0.222 NA   NA
 3464784 3464785 AM1_A0242 AM1_A0243     TRUE 0.949 -3.000 0.875 NA   NA
 3464785 3464786 AM1_A0243 AM1_A0244     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3464786 3464787 AM1_A0244 AM1_A0245     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3464787 3464788 AM1_A0245 AM1_A0246   badA TRUE 0.645 11.000 0.000 1.000   NA
 3464788 3464789 AM1_A0246 AM1_A0247 badA   TRUE 0.427 45.000 0.000 1.000 N NA
 3464789 3464790 AM1_A0247 AM1_A0248   acpS TRUE 0.586 10.000 0.000 1.000 N NA
 3464790 3464791 AM1_A0248 AM1_A0249 acpS   FALSE 0.352 28.000 0.000 NA N NA
 3464791 3464792 AM1_A0249 AM1_A0250     TRUE 0.940 19.000 0.500 NA   NA
 3464792 3464793 AM1_A0250 AM1_A0251     FALSE 0.030 788.000 0.000 NA   NA
 3464793 3464794 AM1_A0251 AM1_A0252     FALSE 0.423 48.000 0.000 1.000 N NA
 3464794 3464795 AM1_A0252 AM1_A0253     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3464796 10702597 AM1_A0254 AM1_A0255     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 10702597 3464797 AM1_A0255 AM1_A0256     FALSE 0.158 164.000 0.000 NA   NA
 3464797 10702598 AM1_A0256 AM1_A0257     FALSE 0.034 612.000 0.000 NA   NA
 3464799 3464800 AM1_A0259 AM1_A0260     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3464802 3464803 AM1_A0262 AM1_A0263     TRUE 0.638 12.000 0.000 1.000   NA
 3464803 3464804 AM1_A0263 AM1_A0264     FALSE 0.403 77.000 0.000 1.000   NA
 3464804 3464805 AM1_A0264 AM1_A0265     FALSE 0.419 73.000 0.000 1.000   NA
 3464808 3464809 AM1_A0268 AM1_A0269     FALSE 0.049 614.000 0.000 1.000   NA
 3464810 3464811 AM1_A0270 AM1_A0271     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3464811 3464812 AM1_A0271 AM1_A0272     FALSE 0.052 380.000 0.000 NA   NA
 3464812 3464813 AM1_A0272 AM1_A0273     FALSE 0.391 50.000 0.000 NA   NA
 3464813 3464814 AM1_A0273 AM1_A0274     FALSE 0.426 15.000 0.000 NA N NA
 3464814 3464815 AM1_A0274 AM1_A0275     FALSE 0.211 137.000 0.000 1.000 N NA
 3464815 3464816 AM1_A0275 AM1_A0276     FALSE 0.120 201.000 0.000 NA   NA
 3464816 3464817 AM1_A0276 AM1_A0277     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3464817 3464818 AM1_A0277 AM1_A0278     FALSE 0.096 231.000 0.000 NA   NA
 3464818 3464819 AM1_A0278 AM1_A0279     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3464821 3464822 AM1_A0281 AM1_A0282     TRUE 0.899 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 3464822 3464823 AM1_A0282 AM1_A0283     TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3464823 3464824 AM1_A0283 AM1_A0284     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3464824 3464825 AM1_A0284 AM1_A0285     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3464825 3464826 AM1_A0285 AM1_A0286     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3464826 3464827 AM1_A0286 AM1_A0287     FALSE 0.211 122.000 0.000 NA   NA
 3464829 3464830 AM1_A0289 AM1_A0290 hlyC   FALSE 0.365 312.000 0.000 0.001 Y NA
 3464830 3464831 AM1_A0290 AM1_A0291     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3464831 3464832 AM1_A0291 AM1_A0292     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3464832 3464833 AM1_A0292 AM1_A0293     FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3464833 3464834 AM1_A0293 AM1_A0294     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3464834 3464835 AM1_A0294 AM1_A0295     FALSE 0.038 524.000 0.000 NA   NA
 3464835 3464836 AM1_A0295 AM1_A0296     FALSE 0.058 345.000 0.000 NA   NA
 3464839 3464840 AM1_A0299 AM1_A0300     FALSE 0.058 377.000 0.000 1.000 N NA
 3464840 3464841 AM1_A0300 AM1_A0301     FALSE 0.411 53.000 0.000 1.000 N NA
 3464841 3464842 AM1_A0301 AM1_A0302     FALSE 0.330 96.000 0.000 1.000   NA
 3464842 3464843 AM1_A0302 AM1_A0303   cysK TRUE 0.649 10.000 0.000 1.000   NA
 3464847 3464848 AM1_A0307 AM1_A0308     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3464848 3464849 AM1_A0308 AM1_A0309     FALSE 0.220 113.000 0.000 NA   NA
 3464851 3464852 AM1_A0311 AM1_A0312     FALSE 0.072 279.000 0.000 NA   NA
 3464853 3464854 AM1_A0313 AM1_A0314     TRUE 0.450 33.000 0.000 1.000 N NA
 3464854 3464855 AM1_A0314 AM1_A0315     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3464855 3464856 AM1_A0315 AM1_A0316     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3464856 3464857 AM1_A0316 AM1_A0317     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3464857 3464858 AM1_A0317 AM1_A0318     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3464858 3464859 AM1_A0318 AM1_A0319     FALSE 0.209 123.000 0.000 NA   NA
 3464859 3464860 AM1_A0319 AM1_A0320     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3464860 3464861 AM1_A0320 AM1_A0321     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3464861 3464862 AM1_A0321 AM1_A0322     FALSE 0.171 154.000 0.000 NA   NA
 3464862 3464863 AM1_A0322 AM1_A0323     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3464863 3464864 AM1_A0323 AM1_A0324     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3464864 3464865 AM1_A0324 AM1_A0325     FALSE 0.173 153.000 0.000 NA   NA
 3464865 3464866 AM1_A0325 AM1_A0326     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3464866 3464867 AM1_A0326 AM1_A0327     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464867 3464868 AM1_A0327 AM1_A0328     FALSE 0.184 145.000 0.000 NA   NA
 3464868 3464869 AM1_A0328 AM1_A0329   dcm TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3464870 3464871 AM1_A0330 AM1_A0331     FALSE 0.032 688.000 0.000 NA   NA
 3464874 3464875 AM1_A0334 AM1_A0335     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3464875 3464876 AM1_A0335 AM1_A0336     FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3464876 3464877 AM1_A0336 AM1_A0337     FALSE 0.178 149.000 0.000 NA   NA
 3464877 3464878 AM1_A0337 AM1_A0338     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3464880 3464881 AM1_A0340 AM1_A0341     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3464881 3464882 AM1_A0341 AM1_A0342     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3464882 3464883 AM1_A0342 AM1_A0343     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3464884 3464885 AM1_A0344 AM1_A0345     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3464886 3464887 AM1_A0346 AM1_A0347     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3464889 3464890 AM1_A0349 AM1_A0350     FALSE 0.065 307.000 0.000 NA   NA
 3464890 3464891 AM1_A0350 AM1_A0351     FALSE 0.148 174.000 0.000 NA   NA
 3464892 3464893 AM1_A0352 AM1_A0353   hup FALSE 0.120 201.000 0.000 NA   NA
 3464893 3464894 AM1_A0353 AM1_A0354 hup rpoD FALSE 0.160 176.000 0.000 1.000 N NA
 3464895 3464896 AM1_A0355 AM1_A0356     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3464897 3464898 AM1_A0357 AM1_A0358     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3464899 3464900 AM1_A0359 AM1_A0360     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3464901 3464902 AM1_A0361 AM1_A0362     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3464904 3464905 AM1_A0364 AM1_A0365     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3464907 3464908 AM1_A0367 AM1_A0368     FALSE 0.056 352.000 0.000 NA   NA
 3464908 3464909 AM1_A0368 AM1_A0369     TRUE 0.447 91.000 0.000 0.020   NA
 3464909 3464910 AM1_A0369 AM1_A0370     FALSE 0.050 435.000 0.000 1.000 N NA
 3464911 3464912 AM1_A0371 AM1_A0372     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3464914 3464915 AM1_A0373 AM1_A0375     FALSE 0.389 51.000 0.000 NA   NA
 3464915 3464916 AM1_A0375 AM1_A0376     FALSE 0.101 223.000 0.000 NA   NA
 3464918 3464919 AM1_A0378 AM1_A0379     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3464919 3464920 AM1_A0379 AM1_A0380     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3464920 3464921 AM1_A0380 AM1_A0381     FALSE 0.403 -28.000 0.000 NA   NA
 3464921 3464922 AM1_A0381 AM1_A0382     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3464922 3464923 AM1_A0382 AM1_A0383     FALSE 0.115 206.000 0.000 NA   NA
 3464923 3464924 AM1_A0383 AM1_A0384     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3464925 3464926 AM1_A0385 AM1_A0387     FALSE 0.060 331.000 0.000 NA   NA
 3464927 3464928 AM1_A0386 AM1_A0388     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3464928 3464929 AM1_A0388 AM1_A0389     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3464929 3464930 AM1_A0389 AM1_A0390     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3464930 3464931 AM1_A0390 AM1_A0391     FALSE 0.163 174.000 0.000 1.000 N NA
 3464545 3464546 AM1_A0001 AM1_A0002     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3464933 3464934 AM1_B0002 AM1_B0003     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3464935 10702614 AM1_B0004 AM1_B0005     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 10702614 3464936 AM1_B0005 AM1_B0006     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3464937 3464938 AM1_B0007 AM1_B0008     FALSE 0.281 88.000 0.000 NA   NA
 3464938 3464939 AM1_B0008 AM1_B0009     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3464939 3464940 AM1_B0009 AM1_B0010     FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3464941 3464942 AM1_B0012 AM1_B0013     TRUE 0.443 -205.000 0.000 1.000   NA
 3464945 3464946 AM1_B0015 AM1_B0016     FALSE 0.060 335.000 0.000 NA   NA
 3464946 3464947 AM1_B0016 AM1_B0017     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3464947 3464948 AM1_B0017 AM1_B0018     TRUE 0.515 -21.000 0.000 1.000   NA
 3464948 3464949 AM1_B0018 AM1_B0019     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3464950 3464951 AM1_B0020 AM1_B0021     FALSE 0.199 131.000 0.000 NA   NA
 3464951 3464952 AM1_B0021 AM1_B0022     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3464952 3464953 AM1_B0022 AM1_B0023     FALSE 0.203 128.000 0.000 NA   NA
 3464953 3464954 AM1_B0023 AM1_B0024     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3464956 3464957 AM1_B0026 AM1_B0027     FALSE 0.160 162.000 0.000 NA   NA
 3464957 3464958 AM1_B0027 AM1_B0028     TRUE 0.509 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3464959 3464960 AM1_B0029 AM1_B0030     TRUE 0.927 27.000 0.286 NA   NA
 3464961 3464962 AM1_B0031 AM1_B0032     TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3464962 3464963 AM1_B0032 AM1_B0033     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3464963 3464964 AM1_B0033 AM1_B0034     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3464964 3464965 AM1_B0034 AM1_B0035     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3464965 3464966 AM1_B0035 AM1_B0036     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3464966 3464967 AM1_B0036 AM1_B0037     FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3464967 3464968 AM1_B0037 AM1_B0038     FALSE 0.411 -25.000 0.000 NA   NA
 3464968 3464969 AM1_B0038 AM1_B0039     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3464969 3464970 AM1_B0039 AM1_B0040     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3464970 3464971 AM1_B0040 AM1_B0041     FALSE 0.078 499.000 0.000 0.040   NA
 3464971 3464972 AM1_B0041 AM1_B0042     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3464976 3464977 AM1_B0046 AM1_B0047     FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3464977 3464978 AM1_B0047 AM1_B0049     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3464982 3464983 AM1_B0052 AM1_B0054     TRUE 0.793 74.000 0.000 0.020 Y NA
 3464985 3464986 AM1_B0055 AM1_B0056     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3464986 3464987 AM1_B0056 AM1_B0057     TRUE 0.957 5.000 0.857 NA   NA
 3464987 3464988 AM1_B0057 AM1_B0058     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3464988 3464989 AM1_B0058 AM1_B0059     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3464989 3464990 AM1_B0059 AM1_B0060     TRUE 0.487 49.000 0.000 1.000   NA
 3464990 3464991 AM1_B0060 AM1_B0061     FALSE 0.128 152.000 0.000 NA N NA
 3464993 3464994 AM1_B0063 AM1_B0064     FALSE 0.138 197.000 0.000 1.000 N NA
 3464995 3464996 AM1_B0065 AM1_B0066     FALSE 0.135 188.000 0.000 NA   NA
 3464996 3464997 AM1_B0066 AM1_B0067     FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3464998 3464999 AM1_B0068 AM1_B0069     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3464999 3465000 AM1_B0069 AM1_B0070     FALSE 0.383 -42.000 0.000 NA   NA
 3465000 3465001 AM1_B0070 AM1_B0071     FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3465001 3465002 AM1_B0071 AM1_B0072     FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 3465003 3465004 AM1_B0073 AM1_B0074     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465004 3465005 AM1_B0074 AM1_B0075     FALSE 0.094 234.000 0.000 NA   NA
 3465007 3465008 AM1_B0077 AM1_B0078     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3465009 3465010 AM1_B0079 AM1_B0080     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3465010 3465011 AM1_B0080 AM1_B0081     FALSE 0.044 448.000 0.000 NA   NA
 3465011 3465012 AM1_B0081 AM1_B0082     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3465012 3465013 AM1_B0082 AM1_B0083     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3465013 3465014 AM1_B0083 AM1_B0084     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3465014 3465015 AM1_B0084 AM1_B0085     FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3465015 3465016 AM1_B0085 AM1_B0086   hup FALSE 0.118 203.000 0.000 NA   NA
 3465016 3465017 AM1_B0086 AM1_B0087 hup rpoD FALSE 0.160 176.000 0.000 1.000 N NA
 3465020 3465021 AM1_B0090 AM1_B0091     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3465022 3465023 AM1_B0092 AM1_B0093     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3465023 3465024 AM1_B0093 AM1_B0094     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3465025 3465026 AM1_B0095 AM1_B0096     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3465026 3465027 AM1_B0096 AM1_B0097     FALSE 0.034 612.000 0.000 NA   NA
 3465028 3465029 AM1_B0098 AM1_B0099     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3465029 3465030 AM1_B0099 AM1_B0100     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3465031 3465032 AM1_B0101 AM1_B0102     FALSE 0.033 659.000 0.000 NA   NA
 3465032 3465033 AM1_B0102 AM1_B0103     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3465033 3465034 AM1_B0103 AM1_B0104     FALSE 0.197 132.000 0.000 NA   NA
 3465035 3465036 AM1_B0105 AM1_B0106     FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3465036 3465037 AM1_B0106 AM1_B0107     FALSE 0.409 38.000 0.000 NA   NA
 3465037 3465038 AM1_B0107 AM1_B0108     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3465038 3465039 AM1_B0108 AM1_B0109     TRUE 0.482 51.000 0.000 1.000   NA
 3465039 3465040 AM1_B0109 AM1_B0110     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3465040 3465041 AM1_B0110 AM1_B0111     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3465041 3465042 AM1_B0111 AM1_B0112     FALSE 0.037 538.000 0.000 NA   NA
 3465042 3465043 AM1_B0112 AM1_B0114     FALSE 0.096 231.000 0.000 NA   NA
 3465047 3465048 AM1_B0117 AM1_B0118     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3465051 3465052 AM1_B0121 AM1_B0122     TRUE 0.861 -16.000 0.000 0.020 Y NA
 3465052 3465053 AM1_B0122 AM1_B0123     FALSE 0.175 216.000 0.000 0.020 N NA
 3465053 3465054 AM1_B0123 AM1_B0124     TRUE 0.559 22.000 0.000 1.000   NA
 3465054 3465055 AM1_B0124 AM1_B0125     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3465055 3465056 AM1_B0125 AM1_B0126     FALSE 0.404 17.000 0.000 NA N NA
 3465056 3465057 AM1_B0126 AM1_B0127     TRUE 0.917 25.000 0.167 NA N NA
 3465058 3465059 AM1_B0128 AM1_B0129     FALSE 0.384 -40.000 0.000 NA   NA
 3465059 3465060 AM1_B0129 AM1_B0131     TRUE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 3465061 3465062 AM1_B0130 AM1_B0132     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3465062 3465063 AM1_B0132 AM1_B0133     TRUE 0.901 37.000 0.057 NA   NA
 3465063 3465064 AM1_B0133 AM1_B0134     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3465064 3465065 AM1_B0134 AM1_B0135   grxC TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465065 3465066 AM1_B0135 AM1_B0136 grxC   TRUE 0.840 42.000 0.000 0.030 Y NA
 3465068 3465069 AM1_B0138 AM1_B0139     FALSE 0.132 191.000 0.000 NA   NA
 3465072 3465073 AM1_B0142 AM1_B0143     TRUE 0.489 -6.000 0.000 NA   NA
 3465074 3465075 AM1_B0144 AM1_B0145     FALSE 0.159 163.000 0.000 NA   NA
 3465076 3465077 AM1_B0146 AM1_B0147     FALSE 0.087 249.000 0.000 NA   NA
 3465077 3465078 AM1_B0147 AM1_B0148     FALSE 0.165 172.000 0.000 1.000 N NA
 3465078 3465079 AM1_B0148 AM1_B0149     FALSE 0.193 136.000 0.000 NA   NA
 3465079 3465080 AM1_B0149 AM1_B0150     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 3465080 3465081 AM1_B0150 AM1_B0151   priA FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 3465082 3465083 AM1_B0152 AM1_B0154     FALSE 0.029 1084.000 0.000 NA   NA
 3465085 3465086 AM1_B0156 AM1_B0157   cobW FALSE 0.071 392.000 0.000 1.000   NA
 3465086 3465087 AM1_B0157 AM1_B0158 cobW   TRUE 0.901 59.000 0.211 NA   NA
 3465087 3465088 AM1_B0158 AM1_B0159     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3465088 3465089 AM1_B0159 AM1_B0160     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3465089 3465090 AM1_B0160 AM1_B0161     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3465090 3465091 AM1_B0161 AM1_B0162     FALSE 0.033 641.000 0.000 NA   NA
 3465094 3465095 AM1_B0166 AM1_B0167 cysS   FALSE 0.040 497.000 0.000 NA   NA
 3465099 3465100 AM1_B0171 AM1_B0172     TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3465101 3465102 AM1_B0173 AM1_B0174 folE   FALSE 0.185 144.000 0.000 NA   NA
 3465102 3465103 AM1_B0174 AM1_B0175     FALSE 0.107 216.000 0.000 NA   NA
 3465105 3465106 AM1_B0177 AM1_B0178 dacB   FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3465106 3465107 AM1_B0178 AM1_B0179   pyr TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465108 3465109 AM1_B0180 AM1_B0181     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3465109 3465110 AM1_B0181 AM1_B0183     FALSE 0.074 277.000 0.000 NA   NA
 3465110 3465111 AM1_B0183 AM1_B0184     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3465111 3465112 AM1_B0184 AM1_B0185     FALSE 0.087 248.000 0.000 NA   NA
 3465114 3465115 AM1_B0186 AM1_B0188     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3465115 3465116 AM1_B0188 AM1_B0189     TRUE 0.952 0.000 0.349 NA   NA
 3465117 3465118 AM1_B0190 AM1_B0191     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465118 3465119 AM1_B0191 AM1_B0192     FALSE 0.121 200.000 0.000 NA   NA
 3465119 3465120 AM1_B0192 AM1_B0193     TRUE 0.957 6.000 0.679 NA   NA
 3465120 3465121 AM1_B0193 AM1_B0194     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3465122 3465123 AM1_B0195 AM1_B0196   umuD FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3465123 3465124 AM1_B0196 AM1_B0197 umuD udk FALSE 0.325 82.000 0.000 1.000 N NA
 3465124 3465125 AM1_B0197 AM1_B0198 udk   TRUE 0.564 6.000 0.000 NA   NA
 3465126 3465127 AM1_B0199 AM1_B0200     FALSE 0.216 118.000 0.000 NA   NA
 3465127 3465128 AM1_B0200 AM1_B0201     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3465128 3465129 AM1_B0201 AM1_B0202     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3465129 3465130 AM1_B0202 AM1_B0203     TRUE 0.496 42.000 0.000 1.000   NA
 3465131 3465132 AM1_B0204 AM1_B0205     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3465132 3465133 AM1_B0205 AM1_B0206     FALSE 0.040 490.000 0.000 NA   NA
 3465133 3465134 AM1_B0206 AM1_B0207     FALSE 0.371 253.000 0.000 1.000 Y NA
 3465134 3465135 AM1_B0207 AM1_B0208     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3465135 3465136 AM1_B0208 AM1_B0209     FALSE 0.102 222.000 0.000 NA   NA
 3465136 3465137 AM1_B0209 AM1_B0210     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465137 3465138 AM1_B0210 AM1_B0211     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465138 3465139 AM1_B0211 AM1_B0212     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465139 3465140 AM1_B0212 AM1_B0213     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3465140 3465141 AM1_B0213 AM1_B0214     FALSE 0.325 74.000 0.000 NA   NA
 3465141 3465142 AM1_B0214 AM1_B0215     FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3465142 3465143 AM1_B0215 AM1_B0216     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3465143 3465144 AM1_B0216 AM1_B0217     FALSE 0.145 177.000 0.000 NA   NA
 3465144 3465145 AM1_B0217 AM1_B0218     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3465146 3465147 AM1_B0219 AM1_B0220     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3465147 3465148 AM1_B0220 AM1_B0221     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3465148 3465149 AM1_B0221 AM1_B0223     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3465152 3465153 AM1_B0225 AM1_B0226     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3465154 3465155 AM1_B0227 AM1_B0228     FALSE 0.036 565.000 0.000 NA   NA
 3465155 3465156 AM1_B0228 AM1_B0229     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3465156 3465157 AM1_B0229 AM1_B0230     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3465157 3465158 AM1_B0230 AM1_B0231     FALSE 0.081 257.000 0.000 NA   NA
 3465160 3465161 AM1_B0233 AM1_B0234     FALSE 0.194 135.000 0.000 NA   NA
 3465162 3465163 AM1_B0235 AM1_B0236     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465163 3465164 AM1_B0236 AM1_B0237     FALSE 0.193 136.000 0.000 NA   NA
 3465165 3465166 AM1_B0238 AM1_B0239     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3465166 3465167 AM1_B0239 AM1_B0240     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3465167 3465168 AM1_B0240 AM1_B0241     FALSE 0.236 102.000 0.000 NA   NA
 3465170 3465171 AM1_B0243 AM1_B0244     TRUE 0.433 30.000 0.000 NA   NA
 3465171 3465172 AM1_B0244 AM1_B0246     FALSE 0.064 311.000 0.000 NA   NA
 3465175 3465176 AM1_B0248 AM1_B0249     FALSE 0.037 531.000 0.000 NA   NA
 3465176 3465177 AM1_B0249 AM1_B0250     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465178 3465179 AM1_B0251 AM1_B0252     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3465180 3465181 AM1_B0253 AM1_B0254     FALSE 0.376 57.000 0.000 NA   NA
 3465181 3465182 AM1_B0254 AM1_B0255     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465182 3465183 AM1_B0255 AM1_B0256     FALSE 0.076 273.000 0.000 NA   NA
 3465183 3465184 AM1_B0256 AM1_B0257     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3465184 3465185 AM1_B0257 AM1_B0258     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3465189 3465190 AM1_B0261 AM1_B0263     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3465190 3465191 AM1_B0263 AM1_B0264     FALSE 0.035 602.000 0.000 NA   NA
 3465191 3465192 AM1_B0264 AM1_B0265     FALSE 0.036 554.000 0.000 NA   NA
 3465192 3465193 AM1_B0265 AM1_B0266     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3465193 3465194 AM1_B0266 AM1_B0267     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3465194 3465195 AM1_B0267 AM1_B0268     TRUE 0.643 27.000 0.000 0.008   NA
 3465199 3465200 AM1_B0271 AM1_B0273     FALSE 0.284 87.000 0.000 NA   NA
 3465200 3465201 AM1_B0273 AM1_B0274     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3465201 3465202 AM1_B0274 AM1_B0275     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3465202 3465203 AM1_B0275 AM1_B0276     FALSE 0.203 128.000 0.000 NA   NA
 3465203 3465204 AM1_B0276 AM1_B0277     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3465204 3465205 AM1_B0277 AM1_B0278     FALSE 0.028 2173.000 0.000 NA   NA
 3465205 3465206 AM1_B0278 AM1_B0279     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465206 3465207 AM1_B0279 AM1_B0280     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3465207 3465208 AM1_B0280 AM1_B0281     FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3465208 3465209 AM1_B0281 AM1_B0282     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 3465209 3465210 AM1_B0282 AM1_B0283     TRUE 0.949 -3.000 0.667 NA   NA
 3465210 3465211 AM1_B0283 AM1_B0284     TRUE 0.958 5.000 1.000 NA   NA
 3465211 3465212 AM1_B0284 AM1_B0285     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3465212 3465213 AM1_B0285 AM1_B0286     FALSE 0.110 212.000 0.000 NA   NA
 3465213 3465214 AM1_B0286 AM1_B0287     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3465218 3465219 AM1_B0291 AM1_B0292     FALSE 0.065 308.000 0.000 NA   NA
 3465219 3465220 AM1_B0292 AM1_B0293     FALSE 0.056 353.000 0.000 NA   NA
 3465220 3465221 AM1_B0293 AM1_B0294     FALSE 0.038 528.000 0.000 NA   NA
 3465221 3465222 AM1_B0294 AM1_B0295     FALSE 0.155 168.000 0.000 NA   NA
 3465222 3465223 AM1_B0295 AM1_B0296     FALSE 0.043 455.000 0.000 NA   NA
 3465224 3465225 AM1_B0297 AM1_B0298     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3465225 3465226 AM1_B0298 AM1_B0300     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3465227 3465228 AM1_B0299 AM1_B0301     TRUE 0.718 13.000 0.000 0.019   NA
 3465228 3465229 AM1_B0301 AM1_B0302     TRUE 0.495 43.000 0.000 1.000   NA
 3465231 3465232 AM1_B0304 AM1_B0305     FALSE 0.076 272.000 0.000 NA   NA
 3465232 3465233 AM1_B0305 AM1_B0306     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3465233 3465234 AM1_B0306 AM1_B0307     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3465235 3465236 AM1_B0308 AM1_B0309     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3465237 3465238 AM1_B0310 AM1_B0311     TRUE 0.777 67.000 0.000 1.000 Y NA
 3465238 3465239 AM1_B0311 AM1_B0312     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3465239 3465240 AM1_B0312 AM1_B0313     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3465241 3465242 AM1_B0314 AM1_B0315 umuD umuC TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3465243 3465244 AM1_B0316 AM1_B0317     FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3465246 3465247 AM1_B0319 AM1_B0320     FALSE 0.097 230.000 0.000 NA   NA
 3465247 3465248 AM1_B0320 AM1_B0321     FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3465248 3465249 AM1_B0321 AM1_B0322     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3465249 3465250 AM1_B0322 AM1_B0323     TRUE 0.941 -10.000 0.286 1.000   NA
 3465252 3465253 AM1_B0325 AM1_B0326     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3465253 3465254 AM1_B0326 AM1_B0327     FALSE 0.156 166.000 0.000 NA   NA
 3465256 3465257 AM1_B0329 AM1_B0330     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3465258 3465259 AM1_B0331 AM1_B0332     FALSE 0.185 224.000 0.000 0.060   NA
 3465259 3465260 AM1_B0332 AM1_B0333     FALSE 0.042 464.000 0.000 NA   NA
 3465260 3465261 AM1_B0333 AM1_B0334     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3465261 10702616 AM1_B0334 AM1_B0335     FALSE 0.158 164.000 0.000 NA   NA
 3465264 3465265 AM1_B0338 AM1_B0339     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3465265 3465266 AM1_B0339 AM1_B0340     TRUE 0.947 -3.000 0.424 NA   NA
 3465266 3465267 AM1_B0340 AM1_B0341     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3465267 3465268 AM1_B0341 AM1_B0342     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3465268 3465269 AM1_B0342 AM1_B0343     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3465269 3465270 AM1_B0343 AM1_B0344     TRUE 0.947 -3.000 0.500 NA   NA
 3465270 3465271 AM1_B0344 AM1_B0345     FALSE 0.125 197.000 0.000 NA   NA
 3465272 3465273 AM1_B0346 AM1_B0347     TRUE 0.935 -10.000 0.400 NA   NA
 3465273 3465274 AM1_B0347 AM1_B0348     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465274 3465275 AM1_B0348 AM1_B0349     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465276 3465277 AM1_B0350 AM1_B0351     FALSE 0.056 353.000 0.000 NA   NA
 3465277 3465278 AM1_B0351 AM1_B0352     FALSE 0.135 188.000 0.000 NA   NA
 3465278 3465279 AM1_B0352 AM1_B0353     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3465281 3465282 AM1_B0355 AM1_B0356     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3465287 3465288 AM1_B0361 AM1_B0362     FALSE 0.185 144.000 0.000 NA   NA
 3465288 3465289 AM1_B0362 AM1_B0363     FALSE 0.278 89.000 0.000 NA   NA
 3465289 3465290 AM1_B0363 AM1_B0364     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3465290 3465291 AM1_B0364 AM1_B0365     TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3465292 3465293 AM1_B0366 AM1_B0367     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3465293 3465294 AM1_B0367 AM1_B0368     FALSE 0.064 438.000 0.000 1.000   NA
 3465295 3465296 AM1_B0369 AM1_B0370     FALSE 0.047 424.000 0.000 NA   NA
 3465297 3465298 AM1_B0371 AM1_B0372     FALSE 0.062 321.000 0.000 NA   NA
 3465300 3465301 AM1_B0374 AM1_B0375     TRUE 0.947 0.000 0.143 NA   NA
 3465301 3465302 AM1_B0375 AM1_B0376     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3465302 3465303 AM1_B0376 AM1_B0377     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3465303 3465304 AM1_B0377 AM1_B0378     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3465304 3465305 AM1_B0378 AM1_B0379     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3465305 3465306 AM1_B0379 AM1_B0380     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3465306 3465307 AM1_B0380 AM1_B0381     FALSE 0.057 349.000 0.000 NA   NA
 3465308 3465309 AM1_B0382 AM1_B0383     FALSE 0.033 625.000 0.000 NA   NA
 3465309 3465310 AM1_B0383 AM1_B0384     FALSE 0.033 655.000 0.000 NA   NA
 3465311 3465312 AM1_B0385 AM1_B0386     FALSE 0.031 735.000 0.000 NA   NA
 3465312 3465313 AM1_B0386 AM1_B0387     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3465313 3465314 AM1_B0387 AM1_B0388     FALSE 0.092 238.000 0.000 NA   NA
 3465314 3465315 AM1_B0388 AM1_B0389     FALSE 0.097 229.000 0.000 NA   NA
 3465316 3465317 AM1_B0390 AM1_B0391     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3465321 3465322 AM1_B0395 AM1_B0396     FALSE 0.036 568.000 0.000 NA   NA
 3465322 3465323 AM1_B0396 AM1_B0397     FALSE 0.058 345.000 0.000 NA   NA
 3465323 3465324 AM1_B0397 AM1_B0398     FALSE 0.081 257.000 0.000 NA   NA
 3465324 3465325 AM1_B0398 AM1_B0399     FALSE 0.220 113.000 0.000 NA   NA
 3465325 3465326 AM1_B0399 AM1_B0400     FALSE 0.051 384.000 0.000 NA   NA
 3465326 3465327 AM1_B0400 AM1_B0401     FALSE 0.048 411.000 0.000 NA   NA
 3465327 3465328 AM1_B0401 AM1_B0402     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3465328 3465329 AM1_B0402 AM1_B0403     FALSE 0.061 329.000 0.000 NA   NA
 3465330 3465331 AM1_B0404 AM1_B0405 aacC3   FALSE 0.173 153.000 0.000 NA   NA
 3465331 3465332 AM1_B0405 AM1_B0406     FALSE 0.117 204.000 0.000 NA   NA
 3465332 3465333 AM1_B0406 AM1_B0407     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3465333 3465334 AM1_B0407 AM1_B0408     TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3465336 3465337 AM1_B0410 AM1_B0411     FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3465339 3465340 AM1_B0413 AM1_B0414   recA TRUE 0.814 68.000 0.000 0.008 Y NA
 3465341 3465342 AM1_B0415 AM1_B0416     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465342 3465343 AM1_B0416 AM1_B0417     TRUE 0.450 33.000 0.000 1.000 N NA
 3465343 3464932 AM1_B0417 AM1_B0001     FALSE 0.261 100.000 0.000 1.000 N NA
 3465346 3465347 AM1_C0003 AM1_C0004     FALSE 0.125 197.000 0.000 NA   NA
 3465347 3465348 AM1_C0004 AM1_C0005     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3465348 3465349 AM1_C0005 AM1_C0006     FALSE 0.047 419.000 0.000 NA   NA
 3465349 3465350 AM1_C0006 AM1_C0007     FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3465350 3465351 AM1_C0007 AM1_C0008     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3465351 3465352 AM1_C0008 AM1_C0009     FALSE 0.135 188.000 0.000 NA   NA
 3465352 3465353 AM1_C0009 AM1_C0010     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3465353 3465354 AM1_C0010 AM1_C0011     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3465355 3465356 AM1_C0012 AM1_C0013     FALSE 0.032 707.000 0.000 NA   NA
 3465357 3465358 AM1_C0014 AM1_C0015     FALSE 0.050 389.000 0.000 NA   NA
 3465359 3465360 AM1_C0016 AM1_C0017     TRUE 0.985 6.000 0.333 0.023 Y NA
 3465360 3465361 AM1_C0017 AM1_C0018     FALSE 0.050 438.000 0.000 1.000 N NA
 3465361 3465362 AM1_C0018 AM1_C0019     TRUE 0.868 0.000 0.000 NA Y NA
 3465362 3465363 AM1_C0019 AM1_C0020     FALSE 0.129 194.000 0.000 NA   NA
 3465363 3465364 AM1_C0020 AM1_C0021     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3465364 3465365 AM1_C0021 AM1_C0022     FALSE 0.150 172.000 0.000 NA   NA
 3465365 3465366 AM1_C0022 AM1_C0023     FALSE 0.050 602.000 0.000 1.000   NA
 3465367 3465368 AM1_C0024 AM1_C0025     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3465368 3465369 AM1_C0025 AM1_C0026     FALSE 0.403 -28.000 0.000 NA   NA
 3465369 3465370 AM1_C0026 AM1_C0027     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3465370 3465371 AM1_C0027 AM1_C0028     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3465371 3465372 AM1_C0028 AM1_C0029     FALSE 0.028 1886.000 0.000 NA   NA
 3465372 3465373 AM1_C0029 AM1_C0030     TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3465373 3465374 AM1_C0030 AM1_C0031     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465374 3465375 AM1_C0031 AM1_C0032     TRUE 0.433 30.000 0.000 NA   NA
 3465375 3465376 AM1_C0032 AM1_C0033     TRUE 0.956 8.000 0.667 NA   NA
 3465376 3465377 AM1_C0033 AM1_C0034     TRUE 0.938 -10.000 1.000 NA   NA
 3465377 3465378 AM1_C0034 AM1_C0035     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3465378 3465379 AM1_C0035 AM1_C0036     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3465379 3465380 AM1_C0036 AM1_C0037     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3465380 3465381 AM1_C0037 AM1_C0038     FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 3465381 3465382 AM1_C0038 AM1_C0039     FALSE 0.281 88.000 0.000 NA   NA
 3465382 3465383 AM1_C0039 AM1_C0040     FALSE 0.035 583.000 0.000 NA   NA
 3465383 3465384 AM1_C0040 AM1_C0041     FALSE 0.032 680.000 0.000 NA   NA
 3465384 3465385 AM1_C0041 AM1_C0042     FALSE 0.301 152.000 0.000 0.060   NA
 3465386 3465387 AM1_C0043 AM1_C0044     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3465387 3465388 AM1_C0044 AM1_C0045     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3465391 3465392 AM1_C0048 AM1_C0049     FALSE 0.406 -27.000 0.000 NA   NA
 3465393 3465394 AM1_C0050 AM1_C0051     TRUE 0.639 0.000 0.000 1.000   NA
 3465396 3465397 AM1_C0053 AM1_C0054     FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3465399 3465400 AM1_C0056 AM1_C0057     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3465400 3465401 AM1_C0057 AM1_C0058     FALSE 0.372 86.000 0.000 1.000   NA
 3465401 3465402 AM1_C0058 AM1_C0059     FALSE 0.046 428.000 0.000 NA   NA
 3465404 3465405 AM1_C0061 AM1_C0062     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465405 3465406 AM1_C0062 AM1_C0063     FALSE 0.116 205.000 0.000 NA   NA
 3465406 3465407 AM1_C0063 AM1_C0064     FALSE 0.363 -49.000 0.000 NA   NA
 3465407 3465408 AM1_C0064 AM1_C0065     FALSE 0.039 501.000 0.000 NA   NA
 3465409 3465410 AM1_C0066 AM1_C0067     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3465414 3465415 AM1_C0071 AM1_C0072     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3465415 3465416 AM1_C0072 AM1_C0073     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3465416 3465417 AM1_C0073 AM1_C0074     FALSE 0.271 91.000 0.000 NA   NA
 3465417 3465418 AM1_C0074 AM1_C0075     FALSE 0.125 243.000 0.000 1.000   NA
 3465418 3465419 AM1_C0075 AM1_C0076     FALSE 0.166 201.000 0.000 1.000   NA
 3465419 3465420 AM1_C0076 AM1_C0077     TRUE 0.474 54.000 0.000 1.000   NA
 3465421 3465422 AM1_C0078 AM1_C0079     TRUE 0.441 -211.000 0.000 1.000   NA
 3465423 3465424 AM1_C0080 AM1_C0081     TRUE 0.954 -6.000 0.400 0.059   NA
 3465424 3465425 AM1_C0081 AM1_C0082     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3465425 3465426 AM1_C0082 AM1_C0084     FALSE 0.043 454.000 0.000 NA   NA
 3465426 3465427 AM1_C0084 AM1_C0085   comB TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465428 3465429 AM1_C0086 AM1_C0087     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3465432 3465433 AM1_C0090 AM1_C0091     FALSE 0.072 280.000 0.000 NA   NA
 3465435 3465436 AM1_C0093 AM1_C0094 cpcD cpcC TRUE 0.712 15.000 0.000 0.003   NA
 3465437 3465438 AM1_C0095 AM1_C0097     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3465439 3465440 AM1_C0096 AM1_C0098 cpcA cpcB TRUE 0.491 85.000 0.000 0.002   NA
 3465440 3465441 AM1_C0098 AM1_C0099 cpcB cpcA FALSE 0.075 628.000 0.000 0.002   NA
 3465441 3465442 AM1_C0099 AM1_C0100 cpcA cpcB TRUE 0.554 69.000 0.000 0.002   NA
 3465442 3465443 AM1_C0100 AM1_C0101 cpcB   FALSE 0.091 313.000 0.000 1.000   NA
 3465443 3465444 AM1_C0101 AM1_C0102   cpcG FALSE 0.082 346.000 0.000 1.000   NA
 3465445 3465446 AM1_C0103 AM1_C0104     FALSE 0.220 113.000 0.000 NA   NA
 3465446 3465447 AM1_C0104 AM1_C0105   hli FALSE 0.036 551.000 0.000 NA   NA
 3465449 3465450 AM1_C0107 AM1_C0108 hemH   FALSE 0.176 162.000 0.000 1.000 N NA
 3465453 3465454 AM1_C0110 AM1_C0112     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3465454 3465455 AM1_C0112 AM1_C0113     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3465456 10702599 AM1_C0114 AM1_C0115     FALSE 0.056 353.000 0.000 NA   NA
 10702599 3465457 AM1_C0115 AM1_C0117     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3465459 3465460 AM1_C0118 AM1_C0119 cpcE cpcT FALSE 0.039 501.000 0.000 NA   NA
 3465460 3465461 AM1_C0119 AM1_C0120 cpcT   FALSE 0.048 410.000 0.000 NA   NA
 3465461 3465462 AM1_C0120 AM1_C0121     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3465463 3465464 AM1_C0122 AM1_C0123     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3465465 3465466 AM1_C0124 AM1_C0125     FALSE 0.078 265.000 0.000 NA   NA
 3465469 3465470 AM1_C0128 AM1_C0129     FALSE 0.179 148.000 0.000 NA   NA
 3465470 3465471 AM1_C0129 AM1_C0130     FALSE 0.384 -40.000 0.000 NA   NA
 3465471 3465472 AM1_C0130 AM1_C0131     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3465472 3465473 AM1_C0131 AM1_C0132     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3465473 3465474 AM1_C0132 AM1_C0133     TRUE 0.932 -13.000 0.556 NA   NA
 3465476 3465477 AM1_C0135 AM1_C0136     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3465477 3465478 AM1_C0136 AM1_C0137     FALSE 0.067 297.000 0.000 NA   NA
 3465479 3465480 AM1_C0138 AM1_C0139     FALSE 0.372 59.000 0.000 NA   NA
 3465481 3465482 AM1_C0140 AM1_C0141     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 3465484 3465485 AM1_C0142 AM1_C0144     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3465485 3465486 AM1_C0144 AM1_C0145     FALSE 0.059 337.000 0.000 NA   NA
 3465487 3465488 AM1_C0146 AM1_C0147   glnB TRUE 0.941 5.000 0.038 NA   NA
 3465489 3465490 AM1_C0148 AM1_C0149     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 10702600 3465492 AM1_C0151 AM1_C0153     FALSE 0.030 808.000 0.000 NA   NA
 3465492 3465493 AM1_C0153 AM1_C0154     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3465493 3465494 AM1_C0154 AM1_C0155     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 3465497 3465498 AM1_C0158 AM1_C0159     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3465500 3465501 AM1_C0163 AM1_C0164     FALSE 0.070 289.000 0.000 NA   NA
 3465503 3465504 AM1_C0166 AM1_C0167     TRUE 0.907 35.000 0.087 NA   NA
 3465504 3465505 AM1_C0167 AM1_C0168     FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 3465506 3465507 AM1_C0169 AM1_C0170     TRUE 0.443 27.000 0.000 NA   NA
 3465508 3465509 AM1_C0171 AM1_C0172     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3465509 3465510 AM1_C0172 AM1_C0173     FALSE 0.065 306.000 0.000 NA   NA
 3465510 10702602 AM1_C0173 AM1_C0174     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA   NA
 10702602 3465511 AM1_C0174 AM1_C0176     FALSE 0.029 1143.000 0.000 NA   NA
 3465511 3465512 AM1_C0176 AM1_C0177     FALSE 0.052 372.000 0.000 NA   NA
 3465512 3465513 AM1_C0177 AM1_C0178   putA FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3465514 3465515 AM1_C0179 AM1_C0180     FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3465516 3465517 AM1_C0181 AM1_C0182     FALSE 0.414 -24.000 0.000 NA   NA
 3465517 3465518 AM1_C0182 AM1_C0183     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3465518 3465519 AM1_C0183 AM1_C0184     FALSE 0.397 -33.000 0.000 NA   NA
 3465521 3465522 AM1_C0186 AM1_C0187     FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3465522 3465523 AM1_C0187 AM1_C0188     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3465524 3465525 AM1_C0189 AM1_C0190     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3465526 3465527 AM1_C0191 AM1_C0192 cpcA cpcB TRUE 0.554 69.000 0.000 0.002   NA
 3465527 3465528 AM1_C0192 AM1_C0193 cpcB   FALSE 0.109 267.000 0.000 1.000   NA
 3465528 3465529 AM1_C0193 AM1_C0194     TRUE 0.457 89.000 0.000 0.019   NA
 3465529 3465530 AM1_C0194 AM1_C0195     FALSE 0.171 198.000 0.000 1.000   NA
 3465530 10702603 AM1_C0195 AM1_C0196     FALSE 0.372 -46.000 0.000 NA   NA
 10702603 3465531 AM1_C0196 AM1_C0197     FALSE 0.080 260.000 0.000 NA   NA
 3465531 3465532 AM1_C0197 AM1_C0199     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3465532 3465533 AM1_C0199 AM1_C0200     FALSE 0.046 431.000 0.000 NA   NA
 3465534 3465535 AM1_C0201 AM1_C0202     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3465537 3465538 AM1_C0204 AM1_C0205 hemH   FALSE 0.176 162.000 0.000 1.000 N NA
 3465538 3465539 AM1_C0205 AM1_C0206     FALSE 0.066 304.000 0.000 NA   NA
 3465539 3465540 AM1_C0206 AM1_C0207     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3465540 3465541 AM1_C0207 AM1_C0208     FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3465541 10702604 AM1_C0208 AM1_C0209     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 10702604 3465542 AM1_C0209 AM1_C0210     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3465542 3465543 AM1_C0210 AM1_C0211     FALSE 0.365 114.000 0.000 0.059   NA
 3465543 3465544 AM1_C0211 AM1_C0212   cpcB FALSE 0.055 513.000 0.000 1.000   NA
 3465544 3465545 AM1_C0212 AM1_C0213 cpcB cpcA TRUE 0.491 85.000 0.000 0.002   NA
 3465545 3465546 AM1_C0213 AM1_C0214 cpcA   FALSE 0.092 238.000 0.000 NA   NA
 3465546 3465547 AM1_C0214 AM1_C0215   cpcC TRUE 0.473 -9.000 0.000 NA   NA
 3465547 3465548 AM1_C0215 AM1_C0216 cpcC cpcD TRUE 0.712 15.000 0.000 0.003   NA
 3465548 3465549 AM1_C0216 AM1_C0217 cpcD cpcS FALSE 0.051 572.000 0.000 1.000   NA
 3465549 10702605 AM1_C0217 AM1_C0218 cpcS   FALSE 0.029 1145.000 0.000 NA   NA
 10702605 3465550 AM1_C0218 AM1_C0219     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3465551 3465552 AM1_C0220 AM1_C0221     FALSE 0.048 407.000 0.000 NA   NA
 3465552 3465553 AM1_C0221 AM1_C0222     FALSE 0.143 179.000 0.000 NA   NA
 3465555 3465556 AM1_C0224 AM1_C0225     TRUE 0.927 27.000 0.286 NA   NA
 3465556 3465557 AM1_C0225 AM1_C0226     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3465557 3465558 AM1_C0226 AM1_C0227     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3465558 3465559 AM1_C0227 AM1_C0228     FALSE 0.322 75.000 0.000 NA   NA
 3465560 10702606 AM1_C0229 AM1_C0230     FALSE 0.310 79.000 0.000 NA   NA
 10702606 3465561 AM1_C0230 AM1_C0231     FALSE 0.030 832.000 0.000 NA   NA
 3465566 3465567 AM1_C0236 AM1_C0237     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465568 3465569 AM1_C0238 AM1_C0239     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3465569 3465570 AM1_C0239 AM1_C0240     FALSE 0.143 179.000 0.000 NA   NA
 3465570 3465571 AM1_C0240 AM1_C0241     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3465572 3465573 AM1_C0242 AM1_C0243     FALSE 0.217 116.000 0.000 NA   NA
 3465574 3465575 AM1_C0244 AM1_C0246     TRUE 0.475 20.000 0.000 NA   NA
 3465577 10702608 AM1_C0248 AM1_C0249     FALSE 0.417 -22.000 0.000 NA   NA
 10702608 3465578 AM1_C0249 AM1_C0250     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3465578 3465579 AM1_C0250 AM1_C0251     TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3465582 3465583 AM1_C0255 AM1_C0256     FALSE 0.173 153.000 0.000 NA   NA
 3465583 3465584 AM1_C0256 AM1_C0257     FALSE 0.080 260.000 0.000 NA   NA
 3465585 3465586 AM1_C0258 AM1_C0259     TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3465587 3465588 AM1_C0260 AM1_C0261     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3465590 3465591 AM1_C0263 AM1_C0264     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3465591 3465592 AM1_C0264 AM1_C0265     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3465593 3465594 AM1_C0266 AM1_C0267     FALSE 0.085 252.000 0.000 NA   NA
 3465597 3465598 AM1_C0270 AM1_C0271     FALSE 0.061 330.000 0.000 NA   NA
 3465598 3465599 AM1_C0271 AM1_C0272   cpcF FALSE 0.124 245.000 0.000 1.000   NA
 3465600 3465601 AM1_C0273 AM1_C0274     FALSE 0.029 1220.000 0.000 NA   NA
 3465601 3465602 AM1_C0274 AM1_C0275     FALSE 0.056 352.000 0.000 NA   NA
 3465602 3465603 AM1_C0275 AM1_C0276     FALSE 0.165 159.000 0.000 NA   NA
 3465603 3465604 AM1_C0276 AM1_C0277     FALSE 0.407 109.000 0.000 0.001   NA
 3465606 3465607 AM1_C0279 AM1_C0280     FALSE 0.143 179.000 0.000 NA   NA
 3465607 3465608 AM1_C0280 AM1_C0281     FALSE 0.411 -25.000 0.000 NA   NA
 3465608 3465609 AM1_C0281 AM1_C0282     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3465613 3465614 AM1_C0286 AM1_C0287     FALSE 0.126 196.000 0.000 NA   NA
 3465614 3465615 AM1_C0287 AM1_C0288     TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3465618 3465619 AM1_C0291 AM1_C0292     FALSE 0.146 176.000 0.000 NA   NA
 3465619 3465620 AM1_C0292 AM1_C0293     FALSE 0.050 386.000 0.000 NA   NA
 3465620 3465621 AM1_C0293 AM1_C0294     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3465621 3465622 AM1_C0294 AM1_C0295     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3465623 3465624 AM1_C0296 AM1_C0297     FALSE 0.405 40.000 0.000 NA   NA
 3465625 3465626 AM1_C0298 AM1_C0299     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3465626 3465627 AM1_C0299 AM1_C0300     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3465627 3465628 AM1_C0300 AM1_C0302     FALSE 0.115 206.000 0.000 NA   NA
 3465628 3465629 AM1_C0302 AM1_C0303     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3465630 3465631 AM1_C0304 AM1_C0305     TRUE 0.979 17.000 0.219 0.053 Y NA
 3465631 3465632 AM1_C0305 AM1_C0306     FALSE 0.070 287.000 0.000 NA   NA
 3465635 3465636 AM1_C0309 AM1_C0310     TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3465636 3465637 AM1_C0310 AM1_C0311     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3465637 3465638 AM1_C0311 AM1_C0312     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 3465640 3465641 AM1_C0314 AM1_C0315     FALSE 0.293 84.000 0.000 NA   NA
 3465641 3465642 AM1_C0315 AM1_C0316     FALSE 0.297 83.000 0.000 NA   NA
 3465642 3465643 AM1_C0316 AM1_C0317     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3465644 3465645 AM1_C0318 AM1_C0319     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3465647 3465648 AM1_C0321 AM1_C0322     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465648 3465649 AM1_C0322 AM1_C0323     FALSE 0.307 80.000 0.000 NA   NA
 3465651 10702610 AM1_C0325 AM1_C0326     FALSE 0.154 169.000 0.000 NA   NA
 10702610 3465652 AM1_C0326 AM1_C0327     FALSE 0.100 224.000 0.000 NA   NA
 3465654 3465655 AM1_C0329 AM1_C0330     FALSE 0.055 355.000 0.000 NA   NA
 3465655 3465656 AM1_C0330 AM1_C0331     FALSE 0.055 357.000 0.000 NA   NA
 3465656 3465657 AM1_C0331 AM1_C0332     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3465657 3465658 AM1_C0332 AM1_C0333     FALSE 0.154 169.000 0.000 NA   NA
 3465662 3465663 AM1_C0337 AM1_C0338   hup FALSE 0.144 178.000 0.000 NA   NA
 3465663 3465664 AM1_C0338 AM1_C0339 hup rpoD FALSE 0.155 181.000 0.000 1.000 N NA
 3465665 3465666 AM1_C0340 AM1_C0341     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3465666 3465667 AM1_C0341 AM1_C0342     FALSE 0.029 949.000 0.000 NA   NA
 3465669 3465670 AM1_C0344 AM1_C0345     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3465671 3465672 AM1_C0346 AM1_C0347     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3465672 3465673 AM1_C0347 AM1_C0348     FALSE 0.044 445.000 0.000 NA   NA
 3465673 3465674 AM1_C0348 AM1_C0349     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3465674 3465675 AM1_C0349 AM1_C0350     FALSE 0.291 85.000 0.000 NA   NA
 3465675 3465676 AM1_C0350 AM1_C0351     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3465676 3465677 AM1_C0351 AM1_C0352     FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3465677 3465678 AM1_C0352 AM1_C0353   hup FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3465680 3465681 AM1_C0355 AM1_C0356 rpoD   FALSE 0.145 177.000 0.000 NA   NA
 3465681 3465682 AM1_C0356 AM1_C0357     FALSE 0.240 100.000 0.000 NA   NA
 3465682 3465683 AM1_C0357 AM1_C0358     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3465683 3465684 AM1_C0358 AM1_C0360     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3465685 3465686 AM1_C0359 AM1_C0361     FALSE 0.384 -40.000 0.000 NA   NA
 3465687 3465688 AM1_C0362 AM1_C0363     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3465690 3465691 AM1_C0365 AM1_C0366     TRUE 0.748 91.000 0.000 0.019 Y NA
 3465691 3465692 AM1_C0366 AM1_C0367     FALSE 0.050 435.000 0.000 1.000 N NA
 3465693 3465694 AM1_C0368 AM1_C0369     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3465694 3465695 AM1_C0369 AM1_C0370     FALSE 0.105 218.000 0.000 NA   NA
 3465695 3465696 AM1_C0370 AM1_C0371     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3465696 3465697 AM1_C0371 AM1_C0372     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3465699 3465700 AM1_C0373 AM1_C0375     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3465704 3465705 AM1_C0378 AM1_C0380     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3465705 3465706 AM1_C0380 AM1_C0381     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3465706 3465707 AM1_C0381 AM1_C0382     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465708 3465344 AM1_C0383 AM1_C0001     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465344 3465345 AM1_C0001 AM1_C0002     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3465710 3465711 AM1_D0002 AM1_D0003     FALSE 0.212 167.000 0.000 1.000   NA
 3465712 3465713 AM1_D0004 AM1_D0005     FALSE 0.181 147.000 0.000 NA   NA
 3465713 3465714 AM1_D0005 AM1_D0006     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3465715 3465716 AM1_D0007 AM1_D0008     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3465718 3465719 AM1_D0010 AM1_D0011     FALSE 0.093 235.000 0.000 NA   NA
 3465719 3465720 AM1_D0011 AM1_D0012     FALSE 0.164 160.000 0.000 NA   NA
 3465720 3465721 AM1_D0012 AM1_D0013     TRUE 0.439 28.000 0.000 NA   NA
 3465721 3465722 AM1_D0013 AM1_D0014     FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3465722 3465723 AM1_D0014 AM1_D0015     FALSE 0.387 -39.000 0.000 NA   NA
 3465723 3465724 AM1_D0015 AM1_D0016     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3465726 3465727 AM1_D0018 AM1_D0019     TRUE 0.610 -25.000 0.000 0.009   NA
 3465727 3465728 AM1_D0019 AM1_D0020     TRUE 0.583 18.000 0.000 1.000   NA
 3465728 3465729 AM1_D0020 AM1_D0021     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3465730 3465731 AM1_D0022 AM1_D0023     FALSE 0.087 440.000 0.000 0.058   NA
 3465731 3465732 AM1_D0023 AM1_D0024     FALSE 0.033 656.000 0.000 NA   NA
 3465732 3465733 AM1_D0024 AM1_D0025     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465733 3465734 AM1_D0025 AM1_D0026     FALSE 0.106 217.000 0.000 NA   NA
 3465734 3465735 AM1_D0026 AM1_D0027     FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3465735 3465736 AM1_D0027 AM1_D0028     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3465736 3465737 AM1_D0028 AM1_D0029     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3465737 3465738 AM1_D0029 AM1_D0030     FALSE 0.092 238.000 0.000 NA   NA
 3465738 3465739 AM1_D0030 AM1_D0031     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465741 3465742 AM1_D0033 AM1_D0034     FALSE 0.160 162.000 0.000 NA   NA
 3465742 3465743 AM1_D0034 AM1_D0035     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3465743 3465744 AM1_D0035 AM1_D0036     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3465744 3465745 AM1_D0036 AM1_D0037     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465745 3465746 AM1_D0037 AM1_D0038     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465746 3465747 AM1_D0038 AM1_D0039     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465747 3465748 AM1_D0039 AM1_D0040     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3465748 3465749 AM1_D0040 AM1_D0041     TRUE 0.949 -3.000 1.000 NA   NA
 3465749 3465750 AM1_D0041 AM1_D0042     FALSE 0.042 465.000 0.000 NA   NA
 3465752 3465753 AM1_D0044 AM1_D0045     TRUE 0.744 169.000 0.286 NA   NA
 3465757 3465758 AM1_D0049 AM1_D0050     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465758 3465759 AM1_D0050 AM1_D0051     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3465759 3465760 AM1_D0051 AM1_D0052     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3465760 3465761 AM1_D0052 AM1_D0053     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3465761 3465762 AM1_D0053 AM1_D0054     FALSE 0.154 169.000 0.000 NA   NA
 3465762 3465763 AM1_D0054 AM1_D0056     FALSE 0.352 -205.000 0.000 NA   NA
 3465763 3465764 AM1_D0056 AM1_D0058     FALSE 0.104 219.000 0.000 NA   NA
 3465765 3465766 AM1_D0057 AM1_D0059     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3465766 3465767 AM1_D0059 AM1_D0060     FALSE 0.193 137.000 0.000 NA   NA
 3465767 3465768 AM1_D0060 AM1_D0061     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3465769 3465770 AM1_D0062 AM1_D0063     FALSE 0.192 138.000 0.000 NA   NA
 3465770 3465771 AM1_D0063 AM1_D0064     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3465771 3465772 AM1_D0064 AM1_D0065     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3465772 3465773 AM1_D0065 AM1_D0066     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465774 3465775 AM1_D0067 AM1_D0068     FALSE 0.109 213.000 0.000 NA   NA
 3465778 3465779 AM1_D0071 AM1_D0072     FALSE 0.192 138.000 0.000 NA   NA
 3465779 3465780 AM1_D0072 AM1_D0073     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3465780 3465781 AM1_D0073 AM1_D0074     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3465781 3465782 AM1_D0074 AM1_D0075     FALSE 0.203 128.000 0.000 NA   NA
 3465784 3465785 AM1_D0077 AM1_D0078     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3465787 3465788 AM1_D0080 AM1_D0081     FALSE 0.197 132.000 0.000 NA   NA
 3465790 3465791 AM1_D0083 AM1_D0084     TRUE 0.958 5.000 1.000 NA   NA
 3465791 3465792 AM1_D0084 AM1_D0085     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465792 3465793 AM1_D0085 AM1_D0086     FALSE 0.141 223.000 0.000 1.000   NA
 3465794 3465795 AM1_D0087 AM1_D0088 topA   FALSE 0.417 -22.000 0.000 NA   NA
 3465795 3465796 AM1_D0088 AM1_D0089   rpoD TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3465796 3465797 AM1_D0089 AM1_D0090 rpoD   FALSE 0.201 175.000 0.000 1.000   NA
 3465797 3465798 AM1_D0090 AM1_D0091     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3465798 3465799 AM1_D0091 AM1_D0092     FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3465799 3465800 AM1_D0092 AM1_D0093     FALSE 0.159 163.000 0.000 NA   NA
 3465802 3465803 AM1_D0095 AM1_D0096     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3465804 3465805 AM1_D0097 AM1_D0098     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3465808 3465809 AM1_D0101 AM1_D0102     TRUE 0.690 85.000 0.000 NA Y NA
 3465809 3465810 AM1_D0102 AM1_D0103     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3465810 3465811 AM1_D0103 AM1_D0104     FALSE 0.121 200.000 0.000 NA   NA
 3465811 3465812 AM1_D0104 AM1_D0105     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465813 3465814 AM1_D0106 AM1_D0107     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3465814 3465815 AM1_D0107 AM1_D0108     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3465819 3465820 AM1_D0112 AM1_D0114     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3465822 3465823 AM1_D0115 AM1_D0116     TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3465823 3465824 AM1_D0116 AM1_D0117     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3465824 3465825 AM1_D0117 AM1_D0118     FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3465825 3465826 AM1_D0118 AM1_D0119     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3465830 3465831 AM1_D0123 AM1_D0124     FALSE 0.063 318.000 0.000 NA   NA
 3465834 3465835 AM1_D0127 AM1_D0128     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3465835 3465836 AM1_D0128 AM1_D0129     FALSE 0.035 595.000 0.000 NA   NA
 3465836 3465837 AM1_D0129 AM1_D0130     FALSE 0.291 85.000 0.000 NA   NA
 3465839 3465840 AM1_D0132 AM1_D0133     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3465841 3465842 AM1_D0134 AM1_D0135     TRUE 0.638 12.000 0.000 1.000   NA
 3465843 3465844 AM1_D0136 AM1_D0137     FALSE 0.372 -46.000 0.000 NA   NA
 3465845 3465846 AM1_D0138 AM1_D0139 psbU   FALSE 0.100 285.000 0.000 1.000   NA
 3465846 3465847 AM1_D0139 AM1_D0140     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3465847 3465848 AM1_D0140 AM1_D0141   pyrD TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3465850 3465851 AM1_D0143 AM1_D0144 pfkA hypD TRUE 0.547 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3465851 3465852 AM1_D0144 AM1_D0145 hypD   FALSE 0.221 112.000 0.000 NA   NA
 3465853 3465854 AM1_D0146 AM1_D0147     FALSE 0.113 208.000 0.000 NA   NA
 3465855 3465856 AM1_D0148 AM1_D0149     FALSE 0.195 180.000 0.000 1.000   NA
 3465856 3465857 AM1_D0149 AM1_D0150     TRUE 0.945 -6.000 0.849 1.000 N NA
 3465857 3465858 AM1_D0150 AM1_D0151     TRUE 0.715 215.000 0.819 0.052 N NA
 3465858 3465859 AM1_D0151 AM1_D0152     FALSE 0.227 107.000 0.000 NA   NA
 3465859 3465860 AM1_D0152 AM1_D0153     TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3465860 3465861 AM1_D0153 AM1_D0154   hypE TRUE 0.433 30.000 0.000 NA   NA
 3465861 3465862 AM1_D0154 AM1_D0155 hypE   TRUE 0.556 1.000 0.000 NA   NA
 3465862 3465863 AM1_D0155 AM1_D0156   ppsA FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3465863 3465864 AM1_D0156 AM1_D0157 ppsA atpD FALSE 0.139 242.000 0.000 0.062 N NA
 3465864 3465865 AM1_D0157 AM1_D0158 atpD atpC TRUE 0.979 -10.000 0.443 0.002 Y NA
 3465865 3465866 AM1_D0158 AM1_D0159 atpC   TRUE 0.948 15.000 0.671 NA   NA
 3465866 3465867 AM1_D0159 AM1_D0160     TRUE 0.919 -7.000 0.038 NA   NA
 3465867 3465868 AM1_D0160 AM1_D0161     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3465868 3465869 AM1_D0161 AM1_D0162   atpB TRUE 0.765 142.000 0.103 NA   NA
 3465869 3465870 AM1_D0162 AM1_D0163 atpB atpE TRUE 0.981 -7.000 0.900 0.002 Y NA
 3465870 3465871 AM1_D0163 AM1_D0164 atpE atpF TRUE 0.986 3.000 0.767 0.002 Y NA
 3465871 3465872 AM1_D0164 AM1_D0165 atpF atpA TRUE 0.986 4.000 0.808 0.002 Y NA
 3465872 3465873 AM1_D0165 AM1_D0167 atpA atpG TRUE 0.950 95.000 0.742 0.002 Y NA
 3465874 3465875 AM1_D0166 AM1_D0168     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3465875 3465876 AM1_D0168 AM1_D0169     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3465876 3465877 AM1_D0169 AM1_D0170     FALSE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 3465878 3465879 AM1_D0171 AM1_D0172     FALSE 0.164 173.000 0.000 1.000 N NA
 3465881 3465882 AM1_D0174 AM1_D0175     FALSE 0.087 262.000 0.000 1.000 N NA
 3465882 3465883 AM1_D0175 AM1_D0176   hoxE TRUE 0.896 48.000 0.044 1.000 N NA
 3465883 3465884 AM1_D0176 AM1_D0177 hoxE hoxF TRUE 0.986 1.000 0.667 0.003 Y NA
 3465884 3465885 AM1_D0177 AM1_D0178 hoxF   FALSE 0.138 197.000 0.000 1.000 N NA
 3465885 3465886 AM1_D0178 AM1_D0179     TRUE 0.456 -12.000 0.000 NA   NA
 3465886 3465887 AM1_D0179 AM1_D0180     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3465887 3465888 AM1_D0180 AM1_D0181     FALSE 0.067 299.000 0.000 NA   NA
 3465888 3465889 AM1_D0181 AM1_D0182   hoxU FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3465889 3465890 AM1_D0182 AM1_D0183 hoxU   TRUE 0.862 121.000 0.404 0.003   NA
 3465890 3465891 AM1_D0183 AM1_D0184     FALSE 0.350 74.000 0.000 1.000 N NA
 3465891 3465892 AM1_D0184 AM1_D0185     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3465892 3465893 AM1_D0185 AM1_D0186     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3465893 3465894 AM1_D0186 AM1_D0187   hoxH TRUE 0.503 38.000 0.000 1.000   NA
 3465895 3465896 AM1_D0188 AM1_D0189 hypC hypF TRUE 0.970 -9.000 0.181 NA Y NA
 3465896 3465897 AM1_D0189 AM1_D0190 hypF   TRUE 0.447 26.000 0.000 NA   NA
 3465897 3465898 AM1_D0190 AM1_D0191     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3465898 3465899 AM1_D0191 AM1_D0192   hypB FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3465899 3465900 AM1_D0192 AM1_D0193 hypB hypA TRUE 0.962 2.000 0.105 0.002   NA
 3465900 3465901 AM1_D0193 AM1_D0194 hypA   TRUE 0.575 -7.000 0.000 1.000   NA
 3465902 3465903 AM1_D0195 AM1_D0196   ubiA FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3465904 3465905 AM1_D0197 AM1_D0198 hypE   TRUE 0.467 28.000 0.000 1.000 N NA
 3465906 3465907 AM1_D0199 AM1_D0200   glgP FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3465908 3465909 AM1_D0201 AM1_D0202 rpoD   FALSE 0.316 77.000 0.000 NA   NA
 3465909 3465910 AM1_D0202 AM1_D0203     FALSE 0.062 322.000 0.000 NA   NA
 3465910 3465911 AM1_D0203 AM1_D0204     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3465911 3465912 AM1_D0204 AM1_D0205     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3465913 3465914 AM1_D0206 AM1_D0207   groS FALSE 0.267 92.000 0.000 NA   NA
 3465914 3465915 AM1_D0207 AM1_D0208 groS groL TRUE 0.972 26.000 0.048 0.004 Y NA
 3465915 3465916 AM1_D0208 AM1_D0209 groL   FALSE 0.122 199.000 0.000 NA   NA
 3465916 3465917 AM1_D0209 AM1_D0210     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3465917 3465918 AM1_D0210 AM1_D0211     FALSE 0.413 36.000 0.000 NA   NA
 3465920 3465921 AM1_D0213 AM1_D0214     FALSE 0.066 304.000 0.000 NA   NA
 3465922 3465923 AM1_D0215 AM1_D0216     FALSE 0.048 413.000 0.000 NA   NA
 3465923 3465924 AM1_D0216 AM1_D0217     FALSE 0.216 118.000 0.000 NA   NA
 3465924 3465925 AM1_D0217 AM1_D0218     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3465925 3465926 AM1_D0218 AM1_D0219     TRUE 0.469 21.000 0.000 NA   NA
 3465927 10702620 AM1_D0220 AM1_D0221     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3465929 3465930 AM1_D0224 AM1_D0225     FALSE 0.368 -48.000 0.000 NA   NA
 3465930 3465931 AM1_D0225 AM1_D0226     TRUE 0.582 50.000 0.000 0.021   NA
 3465933 3465934 AM1_D0228 AM1_D0229     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3465935 3465936 AM1_D0230 AM1_D0231     FALSE 0.228 106.000 0.000 NA   NA
 3465936 3465937 AM1_D0231 AM1_D0232     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3465938 3465939 AM1_D0233 AM1_D0234     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3465940 3465941 AM1_D0235 AM1_D0236     FALSE 0.389 -37.000 0.000 NA   NA
 3465941 3465942 AM1_D0236 AM1_D0237   ftsH FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3465943 3465944 AM1_D0238 AM1_D0239     FALSE 0.189 185.000 0.000 1.000   NA
 3465944 10702621 AM1_D0239 AM1_D0240     FALSE 0.410 37.000 0.000 NA   NA
 10702621 3465945 AM1_D0240 AM1_D0242     FALSE 0.037 541.000 0.000 NA   NA
 3465945 3465946 AM1_D0242 AM1_D0243     FALSE 0.108 215.000 0.000 NA   NA
 3465946 3465947 AM1_D0243 AM1_D0244     FALSE 0.120 201.000 0.000 NA   NA
 3465947 3465948 AM1_D0244 AM1_D0245     TRUE 0.897 32.000 0.029 NA   NA
 3465949 3465950 AM1_D0246 AM1_D0247     TRUE 0.433 30.000 0.000 NA   NA
 3465950 3465951 AM1_D0247 AM1_D0248     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3465951 3465952 AM1_D0248 AM1_D0249     FALSE 0.381 54.000 0.000 NA   NA
 3465953 3465954 AM1_D0250 AM1_D0251     FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3465955 3465956 AM1_D0252 AM1_D0253     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3465956 3465957 AM1_D0253 AM1_D0254     TRUE 0.538 13.000 0.000 NA   NA
 3465957 3465958 AM1_D0254 AM1_D0255     TRUE 0.960 64.000 0.042 0.001 Y NA
 3465958 3465959 AM1_D0255 AM1_D0256     TRUE 0.936 20.000 0.111 1.000   NA
 3465959 3465960 AM1_D0256 AM1_D0257     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3465960 3465961 AM1_D0257 AM1_D0258   nifJ FALSE 0.252 96.000 0.000 NA   NA
 3465964 3465965 AM1_D0261 AM1_D0262     FALSE 0.361 -66.000 0.000 NA   NA
 3465965 3465966 AM1_D0262 AM1_D0263     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3465966 3465967 AM1_D0263 AM1_D0264     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3465967 3465968 AM1_D0264 AM1_D0265     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3465970 3465971 AM1_D0267 AM1_D0268     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3465972 3465973 AM1_D0269 AM1_D0270     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3465974 3465975 AM1_D0271 AM1_D0272     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3465975 3465976 AM1_D0272 AM1_D0273     FALSE 0.102 279.000 0.000 1.000   NA
 3465977 3465978 AM1_D0274 AM1_D0275     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3465979 3465980 AM1_D0276 AM1_D0277 recA   TRUE 0.649 10.000 0.000 1.000   NA
 3465981 3465982 AM1_D0278 AM1_D0279     FALSE 0.165 159.000 0.000 NA   NA
 3465984 3465985 AM1_E0002 AM1_E0003     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3465985 3465986 AM1_E0003 AM1_E0004     FALSE 0.238 101.000 0.000 NA   NA
 3465986 3465987 AM1_E0004 AM1_E0005     FALSE 0.032 667.000 0.000 NA   NA
 3465992 3465993 AM1_E0010 AM1_E0011     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3465993 3465994 AM1_E0011 AM1_E0012     FALSE 0.375 -45.000 0.000 NA   NA
 3465994 3465995 AM1_E0012 AM1_E0013     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3465996 3465997 AM1_E0014 AM1_E0015     FALSE 0.056 352.000 0.000 NA   NA
 3465997 3465998 AM1_E0015 AM1_E0016     FALSE 0.048 412.000 0.000 NA   NA
 3465998 3465999 AM1_E0016 AM1_E0017     FALSE 0.036 563.000 0.000 NA   NA
 3465999 3466000 AM1_E0017 AM1_E0018     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3466000 3466001 AM1_E0018 AM1_E0019     TRUE 0.436 29.000 0.000 NA   NA
 3466001 3466002 AM1_E0019 AM1_E0020     FALSE 0.281 88.000 0.000 NA   NA
 3466002 3466003 AM1_E0020 AM1_E0021     FALSE 0.066 303.000 0.000 NA   NA
 3466003 3466004 AM1_E0021 AM1_E0022     FALSE 0.068 294.000 0.000 NA   NA
 3466004 3466005 AM1_E0022 AM1_E0023     TRUE 0.589 17.000 0.000 1.000   NA
 3466008 3466009 AM1_E0026 AM1_E0027     FALSE 0.029 1106.000 0.000 NA   NA
 3466009 3466010 AM1_E0027 AM1_E0028     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466010 3466011 AM1_E0028 AM1_E0029     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3466012 3466013 AM1_E0030 AM1_E0031     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3466013 3466014 AM1_E0031 AM1_E0032     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3466014 3466015 AM1_E0032 AM1_E0033     TRUE 0.488 18.000 0.000 NA   NA
 3466015 3466016 AM1_E0033 AM1_E0034     FALSE 0.399 45.000 0.000 NA   NA
 3466016 3466017 AM1_E0034 AM1_E0035     FALSE 0.162 161.000 0.000 NA   NA
 3466017 3466018 AM1_E0035 AM1_E0036     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3466018 3466019 AM1_E0036 AM1_E0037     FALSE 0.142 180.000 0.000 NA   NA
 3466023 3466024 AM1_E0041 AM1_E0042     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3466024 3466025 AM1_E0042 AM1_E0043     FALSE 0.224 109.000 0.000 NA   NA
 3466025 3466026 AM1_E0043 AM1_E0044     FALSE 0.150 172.000 0.000 NA   NA
 3466026 3466027 AM1_E0044 AM1_E0045     FALSE 0.200 130.000 0.000 NA   NA
 3466028 3466029 AM1_E0046 AM1_E0047     TRUE 0.957 7.000 0.667 NA   NA
 3466029 3466030 AM1_E0047 AM1_E0048     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3466031 3466032 AM1_E0049 AM1_E0050     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466035 3466036 AM1_E0053 AM1_E0054     FALSE 0.185 144.000 0.000 NA   NA
 3466037 3466038 AM1_E0055 AM1_E0056     FALSE 0.235 103.000 0.000 NA   NA
 3466038 3466039 AM1_E0056 AM1_E0057     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3466042 3466043 AM1_E0060 AM1_E0061     FALSE 0.403 -28.000 0.000 NA   NA
 3466043 3466044 AM1_E0061 AM1_E0062     FALSE 0.049 399.000 0.000 NA   NA
 3466044 3466045 AM1_E0062 AM1_E0063     FALSE 0.103 221.000 0.000 NA   NA
 3466045 3466046 AM1_E0063 AM1_E0064     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3466046 3466047 AM1_E0064 AM1_E0065     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3466047 3466048 AM1_E0065 AM1_E0066     FALSE 0.048 410.000 0.000 NA   NA
 3466048 3466049 AM1_E0066 AM1_E0067     FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 3466049 3466050 AM1_E0067 AM1_E0068     FALSE 0.426 -19.000 0.000 NA   NA
 3466053 3466054 AM1_E0071 AM1_E0072     FALSE 0.051 381.000 0.000 NA   NA
 3466055 3466056 AM1_E0073 AM1_E0074     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3466056 3466057 AM1_E0074 AM1_E0075     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3466057 3466058 AM1_E0075 AM1_E0076     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3466059 3466060 AM1_E0077 AM1_E0078     TRUE 0.441 -259.000 0.000 1.000   NA
 3466060 3466061 AM1_E0078 AM1_E0079     TRUE 0.850 21.000 0.000 1.000 Y NA
 3466061 3466062 AM1_E0079 AM1_E0080     TRUE 0.490 48.000 0.000 1.000   NA
 3466063 10702611 AM1_E0081 AM1_E0082     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3466064 3466065 AM1_E0083 AM1_E0084     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3466068 3466069 AM1_E0087 AM1_E0088     TRUE 0.951 0.000 0.323 NA   NA
 3466072 3466073 AM1_E0091 AM1_E0092     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3466074 3466075 AM1_E0093 AM1_E0094     FALSE 0.286 119.000 0.000 1.000   NA
 3466075 3466076 AM1_E0094 AM1_E0095     FALSE 0.287 118.000 0.000 1.000   NA
 3466076 3466077 AM1_E0095 AM1_E0096     FALSE 0.401 58.000 0.000 1.000 N NA
 3466077 3466078 AM1_E0096 AM1_E0097     FALSE 0.048 407.000 0.000 NA   NA
 3466078 3466079 AM1_E0097 AM1_E0098     FALSE 0.113 208.000 0.000 NA   NA
 3466079 3466080 AM1_E0098 AM1_E0099     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 3466080 3466081 AM1_E0099 AM1_E0100     FALSE 0.380 55.000 0.000 NA   NA
 3466081 3466082 AM1_E0100 AM1_E0101     TRUE 0.558 10.000 0.000 NA   NA
 3466084 3466085 AM1_E0102 AM1_E0104     FALSE 0.399 -31.000 0.000 NA   NA
 3466085 3466086 AM1_E0104 AM1_E0105     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3466086 3466087 AM1_E0105 AM1_E0106     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3466095 3466096 AM1_E0114 AM1_E0115     FALSE 0.313 78.000 0.000 NA   NA
 3466096 3466097 AM1_E0115 AM1_E0116     FALSE 0.030 921.000 0.000 NA   NA
 3466097 3466098 AM1_E0116 AM1_E0117     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3466098 3466099 AM1_E0117 AM1_E0118     FALSE 0.052 377.000 0.000 NA   NA
 3466099 3466100 AM1_E0118 AM1_E0119     FALSE 0.233 104.000 0.000 NA   NA
 3466104 3466105 AM1_E0123 AM1_E0124   recA FALSE 0.047 424.000 0.000 NA   NA
 3466105 3466106 AM1_E0124 AM1_E0125 recA   TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466108 3466109 AM1_E0127 AM1_E0128     FALSE 0.374 58.000 0.000 NA   NA
 3466110 3466111 AM1_E0129 AM1_E0130     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3466111 3466112 AM1_E0130 AM1_E0131     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3466112 3466113 AM1_E0131 AM1_E0132     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3466113 3466114 AM1_E0132 AM1_E0133     TRUE 0.443 67.000 0.000 1.000   NA
 3466115 3466116 AM1_E0134 AM1_E0135     FALSE 0.426 32.000 0.000 NA   NA
 3466116 3466117 AM1_E0135 AM1_E0136     FALSE 0.041 488.000 0.000 NA   NA
 3466117 3466118 AM1_E0136 AM1_E0137     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3466120 3466121 AM1_E0139 AM1_E0140     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3466121 3466122 AM1_E0140 AM1_E0141     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3466122 3466123 AM1_E0141 AM1_E0142     FALSE 0.325 74.000 0.000 NA   NA
 3466123 3466124 AM1_E0142 AM1_E0143     FALSE 0.238 101.000 0.000 NA   NA
 3466124 3466125 AM1_E0143 AM1_E0144     FALSE 0.411 -25.000 0.000 NA   NA
 3466127 3466128 AM1_E0146 AM1_E0147     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3466129 3466130 AM1_E0148 AM1_E0149     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 3466130 3466131 AM1_E0149 AM1_E0151     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3466133 3466134 AM1_E0152 AM1_E0153     FALSE 0.291 85.000 0.000 NA   NA
 3466134 3466135 AM1_E0153 AM1_E0154     TRUE 0.559 2.000 0.000 NA   NA
 3466136 3466137 AM1_E0155 AM1_E0156     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3466138 3466139 AM1_E0157 AM1_E0158     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3466140 3466141 AM1_E0159 AM1_E0160     FALSE 0.164 160.000 0.000 NA   NA
 3466142 3466143 AM1_E0161 AM1_E0162     FALSE 0.136 186.000 0.000 NA   NA
 3466143 3466144 AM1_E0162 AM1_E0163   rpoD FALSE 0.090 242.000 0.000 NA   NA
 3466144 3466145 AM1_E0163 AM1_E0164 rpoD   FALSE 0.132 191.000 0.000 NA   NA
 3466147 3466148 AM1_E0166 AM1_E0167     FALSE 0.077 266.000 0.000 NA   NA
 3466148 3466149 AM1_E0167 AM1_E0168     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3466149 3466150 AM1_E0168 AM1_E0169     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3466150 3466151 AM1_E0169 AM1_E0170     FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3466152 3466153 AM1_E0171 AM1_E0172     FALSE 0.066 304.000 0.000 NA   NA
 3466155 3466156 AM1_E0174 AM1_E0175     FALSE 0.034 620.000 0.000 NA   NA
 3466156 3466157 AM1_E0175 AM1_E0176     TRUE 0.443 -205.000 0.000 1.000   NA
 3466157 3466158 AM1_E0176 AM1_E0177     FALSE 0.074 276.000 0.000 NA   NA
 3466158 3466159 AM1_E0177 AM1_E0178     FALSE 0.040 492.000 0.000 NA   NA
 3466159 3466160 AM1_E0178 AM1_E0179     FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3466160 3466161 AM1_E0179 AM1_E0180     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3466161 3466162 AM1_E0180 AM1_E0181     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3466162 3466163 AM1_E0181 AM1_E0182     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3466163 3466164 AM1_E0182 AM1_E0183     FALSE 0.033 661.000 0.000 NA   NA
 3466166 3466167 AM1_E0185 AM1_E0186     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466167 3466168 AM1_E0186 AM1_E0187     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3466168 3466169 AM1_E0187 AM1_E0188     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3466170 3466171 AM1_E0189 AM1_E0190     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3466171 3466172 AM1_E0190 AM1_E0191     FALSE 0.215 119.000 0.000 NA   NA
 3466172 3466173 AM1_E0191 AM1_E0192     FALSE 0.058 344.000 0.000 NA   NA
 3466174 3466175 AM1_E0193 AM1_E0194     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3466175 3466176 AM1_E0194 AM1_E0195     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3466176 3466177 AM1_E0195 AM1_E0196     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3466177 3466178 AM1_E0196 AM1_E0197     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466178 3466179 AM1_E0197 AM1_E0198     FALSE 0.101 223.000 0.000 NA   NA
 3466181 3466182 AM1_E0199 AM1_E0201     FALSE 0.037 550.000 0.000 NA   NA
 3466182 3466183 AM1_E0201 AM1_E0202     FALSE 0.055 354.000 0.000 NA   NA
 3466183 3466184 AM1_E0202 AM1_E0203     FALSE 0.165 159.000 0.000 NA   NA
 3466184 3466185 AM1_E0203 AM1_E0204     TRUE 0.949 -3.000 1.000 NA   NA
 3466185 3466186 AM1_E0204 AM1_E0205     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3466186 3466187 AM1_E0205 AM1_E0206     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3466187 3466188 AM1_E0206 AM1_E0207     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466188 3466189 AM1_E0207 AM1_E0208     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3466189 3466190 AM1_E0208 AM1_E0209     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3466190 3466191 AM1_E0209 AM1_E0210     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3466191 3466192 AM1_E0210 AM1_E0211     TRUE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 3466192 3466193 AM1_E0211 AM1_E0212     FALSE 0.155 168.000 0.000 NA   NA
 3466193 3466194 AM1_E0212 AM1_E0213     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3466194 3466195 AM1_E0213 AM1_E0214     FALSE 0.100 224.000 0.000 NA   NA
 3466196 3466197 AM1_E0215 AM1_E0216     TRUE 0.923 -16.000 0.217 NA   NA
 3466200 3466201 AM1_E0219 AM1_E0220     TRUE 0.451 25.000 0.000 NA   NA
 3466201 3466202 AM1_E0220 AM1_E0221     FALSE 0.133 190.000 0.000 NA   NA
 3466203 3466204 AM1_E0222 AM1_E0223     FALSE 0.394 -34.000 0.000 NA   NA
 3466204 3465983 AM1_E0223 AM1_E0001     FALSE 0.049 397.000 0.000 NA   NA
 3465983 3465984 AM1_E0001 AM1_E0002     FALSE 0.057 346.000 0.000 NA   NA
 3466205 3466206 AM1_F0001 AM1_F0002     FALSE 0.127 318.000 0.000 0.020   NA
 3466207 3466208 AM1_F0003 AM1_F0004     TRUE 0.547 164.000 0.000 1.000 Y NA
 3466208 3466209 AM1_F0004 AM1_F0005     FALSE 0.049 612.000 0.000 1.000   NA
 3466210 3466211 AM1_F0006 AM1_F0007     FALSE 0.379 -43.000 0.000 NA   NA
 3466212 3466213 AM1_F0008 AM1_F0009     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3466214 3466215 AM1_F0010 AM1_F0011     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3466217 3466218 AM1_F0013 AM1_F0014     FALSE 0.053 369.000 0.000 NA   NA
 3466218 3466219 AM1_F0014 AM1_F0015     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3466219 3466220 AM1_F0015 AM1_F0016     FALSE 0.349 68.000 0.000 NA   NA
 3466220 3466221 AM1_F0016 AM1_F0017     TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3466221 3466222 AM1_F0017 AM1_F0018     FALSE 0.153 170.000 0.000 NA   NA
 3466222 3466223 AM1_F0018 AM1_F0019     FALSE 0.411 -25.000 0.000 NA   NA
 3466223 3466224 AM1_F0019 AM1_F0020     FALSE 0.037 540.000 0.000 NA   NA
 3466224 3466225 AM1_F0020 AM1_F0021     FALSE 0.399 -31.000 0.000 NA   NA
 3466225 3466226 AM1_F0021 AM1_F0022     FALSE 0.052 377.000 0.000 NA   NA
 3466226 3466227 AM1_F0022 AM1_F0023     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466227 3466228 AM1_F0023 AM1_F0025     FALSE 0.045 440.000 0.000 NA   NA
 3466230 3466231 AM1_F0026 AM1_F0027     FALSE 0.050 392.000 0.000 NA   NA
 3466231 3466232 AM1_F0027 AM1_F0028     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3466232 3466233 AM1_F0028 AM1_F0029     FALSE 0.375 -45.000 0.000 NA   NA
 3466233 3466234 AM1_F0029 AM1_F0030     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3466238 3466239 AM1_F0034 AM1_F0035     FALSE 0.063 319.000 0.000 NA   NA
 3466239 3466240 AM1_F0035 AM1_F0036     FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3466240 3466241 AM1_F0036 AM1_F0037     TRUE 0.940 -13.000 0.500 1.000   NA
 3466243 3466244 AM1_F0039 AM1_F0041     FALSE 0.045 441.000 0.000 NA   NA
 3466245 3466246 AM1_F0040 AM1_F0042   metE FALSE 0.042 476.000 0.000 NA   NA
 3466246 3466247 AM1_F0042 AM1_F0043 metE   TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3466248 3466249 AM1_F0044 AM1_F0046     FALSE 0.049 402.000 0.000 NA   NA
 3466251 3466252 AM1_F0047 AM1_F0048 nrdA nrdB TRUE 0.974 42.000 0.564 0.000 Y NA
 3466252 3466253 AM1_F0048 AM1_F0049 nrdB   FALSE 0.205 126.000 0.000 NA   NA
 3466253 3466254 AM1_F0049 AM1_F0051     TRUE 0.504 16.000 0.000 NA   NA
 3466255 3466256 AM1_F0050 AM1_F0052     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466257 3466258 AM1_F0053 AM1_F0054 cobW   FALSE 0.054 535.000 0.000 1.000   NA
 3466261 3466262 AM1_F0057 AM1_F0058 priA   FALSE 0.097 229.000 0.000 NA   NA
 10702617 3466264 AM1_F0060 AM1_F0061     FALSE 0.158 164.000 0.000 NA   NA
 3466264 10702618 AM1_F0061 AM1_F0062     FALSE 0.034 612.000 0.000 NA   NA
 10702618 3466265 AM1_F0062 AM1_F0063     FALSE 0.121 200.000 0.000 NA   NA
 3466267 3466268 AM1_F0064 AM1_F0066     FALSE 0.343 93.000 0.000 1.000   NA
 3466268 3466269 AM1_F0066 AM1_F0067     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3466269 3466270 AM1_F0067 AM1_F0068     FALSE 0.335 72.000 0.000 NA   NA
 3466272 3466273 AM1_F0070 AM1_F0071     FALSE 0.167 171.000 0.000 1.000 N NA
 3466273 3466274 AM1_F0071 AM1_F0072     FALSE 0.087 249.000 0.000 NA   NA
 3466275 3466276 AM1_F0073 AM1_F0074     FALSE 0.159 163.000 0.000 NA   NA
 3466278 3466279 AM1_F0076 AM1_F0077     TRUE 0.493 45.000 0.000 1.000   NA
 3466279 3466280 AM1_F0077 AM1_F0078     FALSE 0.387 52.000 0.000 NA   NA
 3466280 3466281 AM1_F0078 AM1_F0079     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3466281 3466282 AM1_F0079 AM1_F0081     FALSE 0.175 152.000 0.000 NA   NA
 3466284 3466285 AM1_F0082 AM1_F0083     FALSE 0.084 254.000 0.000 NA   NA
 3466285 3466286 AM1_F0083 AM1_F0084     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3466288 3466289 AM1_F0086 AM1_F0087     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3466292 3466293 AM1_F0090 AM1_F0091     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3466294 3466295 AM1_F0092 AM1_F0093     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3466295 3466296 AM1_F0093 AM1_F0095     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3466298 3466299 AM1_F0096 AM1_F0097     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3466299 3466300 AM1_F0097 AM1_F0099     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3466304 3466305 AM1_F0102 AM1_F0103     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3466307 3466308 AM1_F0105 AM1_F0106     FALSE 0.363 -49.000 0.000 NA   NA
 3466308 3466309 AM1_F0106 AM1_F0107     FALSE 0.401 43.000 0.000 NA   NA
 3466309 3466310 AM1_F0107 AM1_F0108     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3466315 3466316 AM1_F0113 AM1_F0114     FALSE 0.186 143.000 0.000 NA   NA
 3466316 3466317 AM1_F0114 AM1_F0115     FALSE 0.047 419.000 0.000 NA   NA
 3466317 3466318 AM1_F0115 AM1_F0116     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000   NA
 3466319 3466320 AM1_F0117 AM1_F0118     FALSE 0.271 91.000 0.000 NA   NA
 3466321 3466322 AM1_F0119 AM1_F0120     FALSE 0.204 173.000 0.000 1.000   NA
 3466325 3466326 AM1_F0123 AM1_F0124     TRUE 0.892 7.000 0.000 1.000 Y NA
 3466326 3466327 AM1_F0124 AM1_F0126     TRUE 0.539 -15.000 0.000 1.000   NA
 3466328 3466329 AM1_F0125 AM1_F0127     FALSE 0.289 116.000 0.000 1.000   NA
 3466329 3466330 AM1_F0127 AM1_F0128     TRUE 0.675 16.000 0.000 0.060   NA
 3466331 3466332 AM1_F0129 AM1_F0130     FALSE 0.220 200.000 0.000 0.055   NA
 3466332 3466333 AM1_F0130 AM1_F0131     FALSE 0.035 595.000 0.000 NA   NA
 3466333 3466334 AM1_F0131 AM1_F0132     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3466336 3466337 AM1_F0134 AM1_F0135     FALSE 0.374 58.000 0.000 NA   NA
 3466337 3466338 AM1_F0135 AM1_F0136     TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3466338 3466339 AM1_F0136 AM1_F0137     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3466339 3466340 AM1_F0137 AM1_F0138     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3466340 3466341 AM1_F0138 AM1_F0139     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466341 3466342 AM1_F0139 AM1_F0140     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466342 3466343 AM1_F0140 AM1_F0141     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3466343 3466344 AM1_F0141 AM1_F0142     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3466344 3466345 AM1_F0142 AM1_F0143     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3466345 3466346 AM1_F0143 AM1_F0144     TRUE 0.958 5.000 1.000 NA   NA
 3466346 3466347 AM1_F0144 AM1_F0145     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3466347 3466348 AM1_F0145 AM1_F0146     FALSE 0.396 48.000 0.000 NA   NA
 3466348 3466349 AM1_F0146 AM1_F0147     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3466349 3466350 AM1_F0147 AM1_F0148     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3466350 3466351 AM1_F0148 AM1_F0149     FALSE 0.281 88.000 0.000 NA   NA
 3466351 3466352 AM1_F0149 AM1_F0150     FALSE 0.145 177.000 0.000 NA   NA
 3466352 3466353 AM1_F0150 AM1_F0151     FALSE 0.035 581.000 0.000 NA   NA
 3466353 3466354 AM1_F0151 AM1_F0152     TRUE 0.441 -259.000 0.000 1.000   NA
 3466357 3466358 AM1_F0155 AM1_F0156     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3466358 3466359 AM1_F0156 AM1_F0157     FALSE 0.169 156.000 0.000 NA   NA
 3466359 3466360 AM1_F0157 AM1_F0158     FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3466360 3466361 AM1_F0158 AM1_F0159     FALSE 0.208 124.000 0.000 NA   NA
 3466362 3466363 AM1_F0160 AM1_F0161     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3466363 3466364 AM1_F0161 AM1_F0162     TRUE 0.562 3.000 0.000 NA   NA
 3466364 3466365 AM1_F0162 AM1_F0163     TRUE 0.450 -13.000 0.000 NA   NA
 3466365 3466366 AM1_F0163 AM1_F0164     FALSE 0.409 38.000 0.000 NA   NA
 3466366 3466367 AM1_F0164 AM1_F0165     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3466367 3466368 AM1_F0165 AM1_F0166     FALSE 0.223 110.000 0.000 NA   NA
 3466369 3466370 AM1_F0167 AM1_F0168     FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3466370 3466371 AM1_F0168 AM1_F0169     FALSE 0.035 590.000 0.000 NA   NA
 3466371 3466372 AM1_F0169 AM1_F0170     FALSE 0.087 249.000 0.000 NA   NA
 3466373 3466374 AM1_F0171 AM1_F0173     FALSE 0.049 401.000 0.000 NA   NA
 3466377 3466378 AM1_F0175 AM1_F0176   rpoD FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3466380 3466381 AM1_F0178 AM1_F0179     FALSE 0.147 175.000 0.000 NA   NA
 3466381 3466382 AM1_F0179 AM1_F0180     FALSE 0.120 201.000 0.000 NA   NA
 3466382 3466383 AM1_F0180 AM1_F0181     FALSE 0.046 432.000 0.000 NA   NA
 3466385 3466386 AM1_F0183 AM1_F0184     FALSE 0.051 385.000 0.000 NA   NA
 3466386 3466387 AM1_F0184 AM1_F0185     FALSE 0.067 299.000 0.000 NA   NA
 3466390 3466391 AM1_F0188 AM1_F0189     FALSE 0.177 150.000 0.000 NA   NA
 3466391 10702619 AM1_F0189 AM1_F0190     FALSE 0.121 200.000 0.000 NA   NA
 10702619 3466392 AM1_F0190 AM1_F0191     FALSE 0.034 612.000 0.000 NA   NA
 3466392 3466205 AM1_F0191 AM1_F0001     FALSE 0.050 605.000 0.000 1.000   NA
 3466394 3466395 AM1_G0002 AM1_G0003     FALSE 0.133 190.000 0.000 NA   NA
 3466395 3466396 AM1_G0003 AM1_G0004     FALSE 0.112 361.000 0.000 0.017   NA
 3466396 3466397 AM1_G0004 AM1_G0005     FALSE 0.394 -34.000 0.000 NA   NA
 3466397 3466398 AM1_G0005 AM1_G0006     FALSE 0.281 88.000 0.000 NA   NA
 3466399 3466400 AM1_G0007 AM1_G0008     FALSE 0.193 137.000 0.000 NA   NA
 3466401 3466402 AM1_G0009 AM1_G0010     FALSE 0.162 204.000 0.000 1.000   NA
 3466402 3466403 AM1_G0010 AM1_G0011     FALSE 0.260 136.000 0.000 1.000   NA
 3466404 3466405 AM1_G0012 AM1_G0013     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3466405 3466406 AM1_G0013 AM1_G0014     FALSE 0.109 213.000 0.000 NA   NA
 3466408 3466409 AM1_G0016 AM1_G0017     FALSE 0.066 304.000 0.000 NA   NA
 3466409 3466410 AM1_G0017 AM1_G0018     FALSE 0.079 263.000 0.000 NA   NA
 3466410 3466411 AM1_G0018 AM1_G0019     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3466411 3466412 AM1_G0019 AM1_G0020     TRUE 0.655 4.000 0.000 1.000   NA
 3466412 3466413 AM1_G0020 AM1_G0021     TRUE 0.956 9.000 0.600 NA   NA
 3466413 3466414 AM1_G0021 AM1_G0022     FALSE 0.404 41.000 0.000 NA   NA
 3466414 3466415 AM1_G0022 AM1_G0023     FALSE 0.183 146.000 0.000 NA   NA
 3466416 3466417 AM1_G0024 AM1_G0025     FALSE 0.363 63.000 0.000 NA   NA
 3466417 3466418 AM1_G0025 AM1_G0026     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3466418 3466419 AM1_G0026 AM1_G0027     FALSE 0.322 75.000 0.000 NA   NA
 3466420 3466421 AM1_G0028 AM1_G0029     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3466422 3466423 AM1_G0030 AM1_G0031     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3466423 3466424 AM1_G0031 AM1_G0032     FALSE 0.300 158.000 0.000 0.023   NA
 3466424 3466425 AM1_G0032 AM1_G0033     FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3466425 3466426 AM1_G0033 AM1_G0034     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3466426 3466427 AM1_G0034 AM1_G0035     FALSE 0.204 127.000 0.000 NA   NA
 3466430 3466431 AM1_G0038 AM1_G0039     FALSE 0.304 81.000 0.000 NA   NA
 3466431 3466432 AM1_G0039 AM1_G0040     FALSE 0.110 212.000 0.000 NA   NA
 3466432 3466433 AM1_G0040 AM1_G0041   amtB TRUE 0.980 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 3466433 3466434 AM1_G0041 AM1_G0042 amtB   FALSE 0.158 164.000 0.000 NA   NA
 3466434 3466435 AM1_G0042 AM1_G0043     FALSE 0.044 443.000 0.000 NA   NA
 3466436 3466437 AM1_G0044 AM1_G0045     FALSE 0.069 291.000 0.000 NA   NA
 3466440 3466441 AM1_G0048 AM1_G0049     FALSE 0.071 283.000 0.000 NA   NA
 3466442 3466443 AM1_G0050 AM1_G0051     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466444 3466445 AM1_G0052 AM1_G0053     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 3466445 3466446 AM1_G0053 AM1_G0055     FALSE 0.397 47.000 0.000 NA   NA
 3466448 3466449 AM1_G0056 AM1_G0057     FALSE 0.368 61.000 0.000 NA   NA
 3466449 3466450 AM1_G0057 AM1_G0058     FALSE 0.291 85.000 0.000 NA   NA
 3466450 3466451 AM1_G0058 AM1_G0059     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3466453 3466454 AM1_G0061 AM1_G0062     TRUE 0.919 44.000 0.667 NA   NA
 3466454 3466455 AM1_G0062 AM1_G0063     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3466455 3466456 AM1_G0063 AM1_G0065     TRUE 0.481 -7.000 0.000 NA   NA
 3466458 3466459 AM1_G0066 AM1_G0067     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3466459 3466460 AM1_G0067 AM1_G0068     FALSE 0.148 174.000 0.000 NA   NA
 3466460 3466461 AM1_G0068 AM1_G0069     FALSE 0.042 463.000 0.000 NA   NA
 3466461 3466462 AM1_G0069 AM1_G0070     FALSE 0.032 681.000 0.000 NA   NA
 3466462 3466463 AM1_G0070 AM1_G0071     FALSE 0.288 86.000 0.000 NA   NA
 3466463 3466464 AM1_G0071 AM1_G0072     TRUE 0.529 14.000 0.000 NA   NA
 3466466 3466467 AM1_G0074 AM1_G0075   dacB FALSE 0.040 495.000 0.000 NA   NA
 3466467 3466468 AM1_G0075 AM1_G0076 dacB   TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 3466468 3466469 AM1_G0076 AM1_G0077     FALSE 0.370 60.000 0.000 NA   NA
 3466471 3466472 AM1_G0079 AM1_G0080     TRUE 0.454 63.000 0.000 1.000   NA
 3466472 3466473 AM1_G0080 AM1_G0081     TRUE 0.449 65.000 0.000 1.000   NA
 3466473 3466474 AM1_G0081 AM1_G0082     TRUE 0.460 61.000 0.000 1.000   NA
 3466475 3466476 AM1_G0083 AM1_G0084     TRUE 0.922 37.000 0.167 1.000   NA
 3466476 3466477 AM1_G0084 AM1_G0085     TRUE 0.643 24.000 0.000 0.023   NA
 3466477 3466478 AM1_G0085 AM1_G0086     TRUE 0.456 24.000 0.000 NA   NA
 3466481 3466482 AM1_G0089 AM1_G0090     FALSE 0.068 296.000 0.000 NA   NA
 3466482 3466483 AM1_G0090 AM1_G0091     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3466485 3466486 AM1_G0093 AM1_G0094     FALSE 0.089 244.000 0.000 NA   NA
 3466487 3466488 AM1_G0095 AM1_G0096     FALSE 0.051 383.000 0.000 NA   NA
 3466488 3466489 AM1_G0096 AM1_G0097     FALSE 0.134 189.000 0.000 NA   NA
 3466492 3466493 AM1_G0100 AM1_G0101     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3466493 3466494 AM1_G0101 AM1_G0102     FALSE 0.360 64.000 0.000 NA   NA
 3466494 3466495 AM1_G0102 AM1_G0103     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3466495 3466496 AM1_G0103 AM1_G0104     FALSE 0.072 280.000 0.000 NA   NA
 3466496 3466497 AM1_G0104 AM1_G0105     FALSE 0.053 364.000 0.000 NA   NA
 3466497 3466498 AM1_G0105 AM1_G0106     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466498 3466499 AM1_G0106 AM1_G0107     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 3466500 3466501 AM1_G0108 AM1_G0109     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 3466502 3466503 AM1_G0110 AM1_G0111     FALSE 0.032 670.000 0.000 NA   NA
 3466504 3466505 AM1_G0112 AM1_G0113     FALSE 0.044 444.000 0.000 NA   NA
 3466506 3466507 AM1_G0114 AM1_G0115 psbU   FALSE 0.226 158.000 0.000 1.000   NA
 3466509 3466510 AM1_G0117 AM1_G0118     FALSE 0.045 441.000 0.000 NA   NA
 3466510 3466511 AM1_G0118 AM1_G0119     TRUE 0.449 -136.000 0.000 1.000   NA
 3466512 3466513 AM1_G0120 AM1_G0121     FALSE 0.310 79.000 0.000 NA   NA
 3466515 3466516 AM1_G0123 AM1_G0124     FALSE 0.384 -40.000 0.000 NA   NA
 3466516 3466517 AM1_G0124 AM1_G0125     FALSE 0.069 292.000 0.000 NA   NA
 3466517 3466518 AM1_G0125 AM1_G0126     FALSE 0.189 141.000 0.000 NA   NA
 3466519 3466520 AM1_G0127 AM1_G0128     FALSE 0.368 -48.000 0.000 NA   NA
 3466521 3466522 AM1_G0129 AM1_G0130     TRUE 0.811 43.000 0.000 1.000 Y NA
 3466525 3466526 AM1_G0133 AM1_G0134     TRUE 0.564 4.000 0.000 NA   NA
 3466526 3466527 AM1_G0134 AM1_G0135     FALSE 0.033 638.000 0.000 NA   NA
 3466530 3466531 AM1_G0138 AM1_G0139     FALSE 0.313 78.000 0.000 NA   NA
 3466531 3466532 AM1_G0139 AM1_G0140     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466533 3466534 AM1_G0141 AM1_G0142     FALSE 0.339 71.000 0.000 NA   NA
 3466534 3466535 AM1_G0142 AM1_G0143     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3466535 3466536 AM1_G0143 AM1_G0144     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3466536 3466537 AM1_G0144 AM1_G0145     FALSE 0.218 115.000 0.000 NA   NA
 3466537 3466538 AM1_G0145 AM1_G0146     FALSE 0.238 101.000 0.000 NA   NA
 3466538 3466539 AM1_G0146 AM1_G0147     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3466539 3466540 AM1_G0147 AM1_G0148     FALSE 0.325 74.000 0.000 NA   NA
 3466540 3466541 AM1_G0148 AM1_G0149     FALSE 0.201 129.000 0.000 NA   NA
 3466541 3466542 AM1_G0149 AM1_G0150     FALSE 0.104 219.000 0.000 NA   NA
 3466542 3466543 AM1_G0150 AM1_G0151     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466543 3466544 AM1_G0151 AM1_G0152     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466545 3466546 AM1_G0153 AM1_G0154     FALSE 0.061 330.000 0.000 NA   NA
 3466546 3466547 AM1_G0154 AM1_G0155     FALSE 0.036 554.000 0.000 NA   NA
 3466550 3466551 AM1_G0158 AM1_G0159 umuD umuC FALSE 0.360 72.000 0.000 1.000 N NA
 3466552 3466553 AM1_G0160 AM1_G0161     FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3466555 3466556 AM1_G0163 AM1_G0164     FALSE 0.286 119.000 0.000 1.000   NA
 3466559 3466560 AM1_G0167 AM1_G0168     FALSE 0.352 67.000 0.000 NA   NA
 3466560 3466561 AM1_G0168 AM1_G0169     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3466561 3466562 AM1_G0169 AM1_G0170     FALSE 0.044 447.000 0.000 NA   NA
 3466563 3466564 AM1_G0171 AM1_G0172     FALSE 0.118 203.000 0.000 NA   NA
 3466393 3466394 AM1_G0001 AM1_G0002     FALSE 0.160 162.000 0.000 NA   NA
 3466566 3466567 AM1_H0001 AM1_H0002     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3466568 3466569 AM1_H0003 AM1_H0004     FALSE 0.033 663.000 0.000 NA   NA
 3466570 3466571 AM1_H0005 AM1_H0006     FALSE 0.047 420.000 0.000 NA   NA
 3466571 3466572 AM1_H0006 AM1_H0007     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466572 3466573 AM1_H0007 AM1_H0008     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3466573 3466574 AM1_H0008 AM1_H0009     TRUE 0.560 9.000 0.000 NA   NA
 3466574 3466575 AM1_H0009 AM1_H0010     TRUE 0.519 -3.000 0.000 NA   NA
 3466575 3466576 AM1_H0010 AM1_H0011     TRUE 0.495 17.000 0.000 NA   NA
 3466576 3466577 AM1_H0011 AM1_H0012     FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3466577 3466578 AM1_H0012 AM1_H0013     TRUE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3466578 3466579 AM1_H0013 AM1_H0014     FALSE 0.259 94.000 0.000 NA   NA
 3466579 3466580 AM1_H0014 AM1_H0015     FALSE 0.066 301.000 0.000 NA   NA
 3466580 3466581 AM1_H0015 AM1_H0016     FALSE 0.157 165.000 0.000 NA   NA
 3466583 3466584 AM1_H0018 AM1_H0019     FALSE 0.095 232.000 0.000 NA   NA
 3466585 3466586 AM1_H0020 AM1_H0021     FALSE 0.063 315.000 0.000 NA   NA
 3466586 3466587 AM1_H0021 AM1_H0022     TRUE 0.744 169.000 0.286 NA   NA
 3466587 3466588 AM1_H0022 AM1_H0023     FALSE 0.039 500.000 0.000 NA   NA
 3466588 3466589 AM1_H0023 AM1_H0024     TRUE 0.461 23.000 0.000 NA   NA
 3466590 3466591 AM1_H0028 AM1_H0030     FALSE 0.384 53.000 0.000 NA   NA
 3466594 3466595 AM1_H0032 AM1_H0033     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 3466597 3466598 AM1_H0035 AM1_H0036     TRUE 0.561 8.000 0.000 NA   NA
 3466598 3466599 AM1_H0036 AM1_H0037     FALSE 0.407 39.000 0.000 NA   NA
 3466600 3466601 AM1_H0038 AM1_H0039     FALSE 0.342 70.000 0.000 NA   NA
 3466601 3466602 AM1_H0039 AM1_H0040     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 3466602 3466603 AM1_H0040 AM1_H0041     FALSE 0.225 108.000 0.000 NA   NA
 3466605 3466606 AM1_H0043 AM1_H0044     FALSE 0.242 99.000 0.000 NA   NA
 3466606 3466607 AM1_H0044 AM1_H0045     FALSE 0.325 74.000 0.000 NA   NA
 3466607 3466608 AM1_H0045 AM1_H0046     FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 3466608 3466609 AM1_H0046 AM1_H0047     FALSE 0.185 144.000 0.000 NA   NA
 3466610 3466611 AM1_H0048 AM1_H0049     FALSE 0.213 120.000 0.000 NA   NA
 3466611 3466612 AM1_H0049 AM1_H0050     FALSE 0.068 296.000 0.000 NA   NA
 3466613 3466614 AM1_H0051 AM1_H0052     FALSE 0.040 497.000 0.000 NA   NA
 3466614 3466615 AM1_H0052 AM1_H0053     FALSE 0.072 279.000 0.000 NA   NA
 3466618 3466619 AM1_H0056 AM1_H0057     FALSE 0.076 271.000 0.000 NA   NA
 3466621 3466622 AM1_H0059 AM1_H0060     FALSE 0.098 291.000 0.000 1.000   NA
 3466622 3466623 AM1_H0060 AM1_H0061     TRUE 0.878 62.000 0.014 1.000   NA
 3466625 3466626 AM1_H0063 AM1_H0064     FALSE 0.162 204.000 0.000 1.000   NA
 3466626 3466627 AM1_H0064 AM1_H0065     FALSE 0.261 135.000 0.000 1.000   NA
 3466628 3466629 AM1_H0066 AM1_H0067     TRUE 0.437 -16.000 0.000 NA   NA
 3466630 3466631 AM1_H0068 AM1_H0069     FALSE 0.046 432.000 0.000 NA   NA
 3466631 3466632 AM1_H0069 AM1_H0070     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3466632 3466633 AM1_H0070 AM1_H0071     FALSE 0.030 937.000 0.000 NA   NA
 3466633 3466634 AM1_H0071 AM1_H0072     TRUE 0.954 0.000 0.750 NA   NA
 3466634 3466635 AM1_H0072 AM1_H0073     FALSE 0.033 636.000 0.000 NA   NA
 3466636 3466637 AM1_H0074 AM1_H0075     TRUE 0.446 -172.000 0.000 1.000   NA
 3466638 3466639 AM1_H0076 AM1_H0077     TRUE 0.548 0.000 0.000 NA   NA
 3466641 3466642 AM1_H0079 AM1_H0080     FALSE 0.301 82.000 0.000 NA   NA
 3466642 3466643 AM1_H0080 AM1_H0081     FALSE 0.219 114.000 0.000 NA   NA
 3466647 3466648 AM1_H0085 AM1_H0086     TRUE 0.565 5.000 0.000 NA   NA
 3466648 3466649 AM1_H0086 AM1_H0087     FALSE 0.030 853.000 0.000 NA   NA
 3466649 3466650 AM1_H0087 AM1_H0088     FALSE 0.166 158.000 0.000 NA   NA
 3466650 3466651 AM1_H0088 AM1_H0089     FALSE 0.156 166.000 0.000 NA   NA
 3466651 3466652 AM1_H0089 AM1_H0090     FALSE 0.194 135.000 0.000 NA   NA
 3466655 3466656 AM1_H0093 AM1_H0094     FALSE 0.291 85.000 0.000 NA   NA
 3466656 3466657 AM1_H0094 AM1_H0095     TRUE 0.547 12.000 0.000 NA   NA
 3466657 3466658 AM1_H0095 AM1_H0096     TRUE 0.957 4.000 1.000 NA   NA
 3466658 3466659 AM1_H0096 AM1_H0097     TRUE 0.933 26.000 0.667 NA   NA
 3466659 3466660 AM1_H0097 AM1_H0098     FALSE 0.319 76.000 0.000 NA   NA
 3466660 3466661 AM1_H0098 AM1_H0099     TRUE 0.562 7.000 0.000 NA   NA
 3466661 3466662 AM1_H0099 AM1_H0100     FALSE 0.418 34.000 0.000 NA   NA
 3466663 3466664 AM1_H0101 AM1_H0102     FALSE 0.035 581.000 0.000 NA   NA
 3466664 3466665 AM1_H0102 AM1_H0103     FALSE 0.145 177.000 0.000 NA   NA
 3466665 3466666 AM1_H0103 AM1_H0104     FALSE 0.031 720.000 0.000 NA   NA
 3466668 3466669 AM1_H0105 AM1_H0107     FALSE 0.096 231.000 0.000 NA   NA
 3466670 3466671 AM1_H0108 AM1_H0109     TRUE 0.465 -10.000 0.000 NA   NA
 3466671 3466672 AM1_H0109 AM1_H0110     FALSE 0.037 548.000 0.000 NA   NA
 3466672 3466673 AM1_H0110 AM1_H0111     FALSE 0.036 554.000 0.000 NA   NA
 3466673 3466674 AM1_H0111 AM1_H0112     FALSE 0.062 321.000 0.000 NA   NA
 3466674 3466675 AM1_H0112 AM1_H0113     FALSE 0.187 142.000 0.000 NA   NA
 3466675 3466676 AM1_H0113 AM1_H0114     FALSE 0.064 311.000 0.000 NA   NA
 3466676 3466677 AM1_H0114 AM1_H0115     FALSE 0.092 238.000 0.000 NA   NA
 3466677 3466678 AM1_H0115 AM1_H0116     FALSE 0.032 682.000 0.000 NA   NA
 3466678 3466679 AM1_H0116 AM1_H0117     TRUE 0.465 22.000 0.000 NA   NA
 3466679 3466680 AM1_H0117 AM1_H0118     FALSE 0.070 288.000 0.000 NA   NA
 3466680 3466681 AM1_H0118 AM1_H0119     TRUE 0.472 55.000 0.000 1.000   NA
 3466683 3466684 AM1_I0001 AM1_I0002     TRUE 0.559 22.000 0.000 1.000   NA
 3466684 3466685 AM1_I0002 AM1_I0003     FALSE 0.040 495.000 0.000 NA   NA
 3466685 3466686 AM1_I0003 AM1_I0004     FALSE 0.222 111.000 0.000 NA   NA
 3466686 3466683 AM1_I0004 AM1_I0001     TRUE 0.493 45.000 0.000 1.000   NA