MicrobesOnline Operon Predictions for Methanosphaera stadtmanae DSM 3091

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
1109318	1109319	Msp_0002	Msp_0003		pyrB	FALSE	0.057	284.000	0.000	NA		NA
1109319	1109320	Msp_0003	Msp_0004	pyrB		TRUE	0.834	18.000	0.003	1.000	N	NA
1109320	1109321	Msp_0004	Msp_0005			FALSE	0.439	57.000	0.000	1.000	N	NA
1109321	1109322	Msp_0005	Msp_0006			TRUE	0.997	16.000	0.327	0.033	Y	NA
1109322	1109323	Msp_0006	Msp_0007			TRUE	0.971	5.000	0.000	1.000	Y	NA
1109323	1109324	Msp_0007	Msp_0008			FALSE	0.033	444.000	0.000	NA		NA
1109324	1109325	Msp_0008	Msp_0009			TRUE	0.919	29.000	0.061	NA		NA
1109325	1109326	Msp_0009	Msp_0010		rps30p	TRUE	0.988	-34.000	0.177	1.000	N	NA
1109326	1109327	Msp_0010	Msp_0011	rps30p		TRUE	0.630	102.000	0.011	1.000	N	NA
1109327	1109328	Msp_0011	Msp_0012			FALSE	0.449	55.000	0.000	1.000	N	NA
1109330	1109331	Msp_0014	Msp_0015	uppP	ilvE	FALSE	0.161	206.000	0.000	1.000	N	NA
1109331	1109332	Msp_0015	Msp_0016	ilvE		FALSE	0.222	74.000	0.000	NA		NA
1109333	1109334	Msp_0017	Msp_0018			FALSE	0.133	123.000	0.000	NA		NA
1109337	1109338	Msp_0021	Msp_0022		ilvC	FALSE	0.438	108.000	0.004	NA		NA
1109339	1109340	Msp_0023	Msp_0024			FALSE	0.169	103.000	0.000	NA		NA
1109341	1109342	Msp_0025	Msp_0026	ilvH1	ilvB1	TRUE	0.998	2.000	0.109	0.005	Y	NA
1109344	1109345	Msp_0028	Msp_0029	ilvH2	ilvB2	TRUE	0.998	-7.000	0.109	0.005	Y	NA
1109346	1109347	Msp_0030	Msp_0031	purD	argF	FALSE	0.433	214.000	0.014	1.000	N	NA
1109347	1109348	Msp_0031	Msp_0032	argF	hisF	TRUE	0.825	81.000	0.000	1.000	Y	NA
1109348	1109349	Msp_0032	Msp_0033	hisF		FALSE	0.110	196.000	0.000	1.000		NA
1109349	1109350	Msp_0033	Msp_0034			TRUE	0.523	21.000	0.000	1.000		NA
1109355	1109356	Msp_0039	Msp_0040			TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1109357	1109358	Msp_0041	Msp_0042			FALSE	0.180	97.000	0.000	NA		NA
1109358	1109359	Msp_0042	Msp_0043			FALSE	0.095	192.000	0.000	NA		NA
1109359	1109360	Msp_0043	Msp_0044			FALSE	0.085	208.000	0.000	NA		NA
1109360	1109361	Msp_0044	Msp_0045			TRUE	0.670	2.000	0.000	NA		NA
1109361	1109362	Msp_0045	Msp_0046			FALSE	0.081	213.000	0.000	NA		NA
1109363	1109364	Msp_0047	Msp_0048			FALSE	0.055	292.000	0.000	NA		NA
1109364	1109365	Msp_0048	Msp_0049			FALSE	0.032	452.000	0.000	NA		NA
1109365	1109366	Msp_0049	Msp_0050			FALSE	0.483	17.000	0.000	NA		NA
1109366	1109367	Msp_0050	Msp_0051			TRUE	0.973	12.000	0.118	NA		NA
1109367	1109368	Msp_0051	Msp_0052			TRUE	0.982	-3.000	0.000	0.039	Y	NA
1109368	1109369	Msp_0052	Msp_0053			FALSE	0.365	896.000	0.000	0.039	Y	NA
1109369	1109370	Msp_0053	Msp_0054			TRUE	0.797	90.000	0.000	NA	Y	NA
1109370	1109371	Msp_0054	Msp_0055			TRUE	0.750	110.000	0.000	NA	Y	NA
1109371	1109372	Msp_0055	Msp_0056			TRUE	0.971	12.000	0.000	0.039	Y	NA
1109372	1109373	Msp_0056	Msp_0057			TRUE	0.947	29.000	0.000	0.039	Y	NA
1109373	1109374	Msp_0057	Msp_0058			TRUE	0.989	47.000	0.286	1.000	Y	NA
1109378	1109379	Msp_0062	Msp_0063			TRUE	0.665	3.000	0.000	NA		NA
1109379	1109380	Msp_0063	Msp_0064			TRUE	0.658	10.000	0.000	1.000		NA
1109380	1109381	Msp_0064	Msp_0065			TRUE	0.721	-3.000	0.000	1.000		NA
1109381	1109382	Msp_0065	Msp_0066			TRUE	0.510	23.000	0.000	1.000		NA
1109382	1109383	Msp_0066	Msp_0067			FALSE	0.360	45.000	0.000	1.000		NA
1109383	1109384	Msp_0067	Msp_0068			FALSE	0.135	122.000	0.000	NA		NA
1109385	1109386	Msp_0069	Msp_0070		ftr2	TRUE	0.985	10.000	0.333	NA		NA
1109386	1109387	Msp_0070	Msp_0071	ftr2		TRUE	0.988	10.000	0.357	1.000	N	NA
1109387	1109388	Msp_0071	Msp_0072		pdx1	FALSE	0.322	91.000	0.000	1.000	N	NA
1109388	1109389	Msp_0072	Msp_0073	pdx1		FALSE	0.189	91.000	0.000	NA		NA
1109390	1109391	Msp_0074	Msp_0075			FALSE	0.040	391.000	0.000	NA		NA
1109394	1109395	Msp_0078	Msp_0079			TRUE	0.946	48.000	0.333	NA		NA
1109396	1109397	Msp_0080	Msp_0081			TRUE	0.890	1.000	0.003	1.000		NA
1109397	1109398	Msp_0081	Msp_0082			TRUE	0.980	15.000	0.500	NA		NA
1109398	1109399	Msp_0082	Msp_0083		metG	TRUE	0.924	-3.000	0.011	NA		NA
1109400	1109401	Msp_0084	Msp_0085			TRUE	0.998	-3.000	0.085	0.002	Y	NA
1109402	1109403	Msp_0086	Msp_0087		cbiT	FALSE	0.205	154.000	0.000	1.000	N	NA
1109403	1109404	Msp_0087	Msp_0088	cbiT		TRUE	0.961	38.000	0.012	1.000	Y	NA
1109404	1109405	Msp_0088	Msp_0089			TRUE	0.742	11.000	0.000	1.000	N	NA
1109405	1109406	Msp_0089	Msp_0090			TRUE	0.683	70.000	0.007	1.000	N	NA
1109406	1109407	Msp_0090	Msp_0091			TRUE	0.958	14.000	0.055	1.000	N	NA
1109407	1109408	Msp_0091	Msp_0092			TRUE	0.792	121.000	0.091	NA		NA
1109408	1109409	Msp_0092	Msp_0093			FALSE	0.411	29.000	0.000	NA		NA
1109409	1109410	Msp_0093	Msp_0094			TRUE	0.612	10.000	0.000	NA		NA
1109410	1109411	Msp_0094	Msp_0095			TRUE	0.741	144.000	0.078	NA		NA
1109412	1109413	Msp_0096	Msp_0097			FALSE	0.366	36.000	0.000	NA		NA
1109414	1109415	Msp_0098	Msp_0099			FALSE	0.377	34.000	0.000	NA		NA
1109415	1109416	Msp_0099	Msp_0100			TRUE	0.955	27.000	0.118	NA		NA
1109416	1109417	Msp_0100	Msp_0101			FALSE	0.431	33.000	0.000	1.000		NA
1109417	1109418	Msp_0101	Msp_0102		cbiD	TRUE	0.933	5.000	0.008	1.000	N	NA
1109418	1109419	Msp_0102	Msp_0103	cbiD		FALSE	0.130	164.000	0.000	1.000		NA
1109420	1109421	Msp_0104	Msp_0105	aroK		TRUE	0.997	12.000	0.214	0.005	Y	NA
1109421	1109422	Msp_0105	Msp_0106		rps17e	TRUE	0.945	40.000	0.103	1.000	N	NA
1109422	1109423	Msp_0106	Msp_0107	rps17e		FALSE	0.225	558.000	0.019	1.000	N	NA
1109423	1109424	Msp_0107	Msp_0108		dapA	TRUE	0.993	-3.000	0.028	1.000	Y	NA
1109424	1109425	Msp_0108	Msp_0109	dapA	dapB	TRUE	0.990	16.000	0.062	1.000	Y	NA
1109425	1109426	Msp_0109	Msp_0110	dapB	asd	TRUE	0.980	16.000	0.005	0.061	Y	NA
1109426	1109427	Msp_0110	Msp_0111	asd		FALSE	0.385	40.000	0.000	1.000		NA
1109427	1109428	Msp_0111	Msp_0112		mtaA2	FALSE	0.037	498.000	0.000	1.000		NA
1109428	1109429	Msp_0112	Msp_0113	mtaA2		FALSE	0.197	170.000	0.000	1.000	N	NA
1109429	1109430	Msp_0113	Msp_0114		thsB	FALSE	0.114	267.000	0.000	1.000	N	NA
1109430	1109431	Msp_0114	Msp_0115	thsB		FALSE	0.093	194.000	0.000	NA		NA
1109432	1109433	Msp_0116	Msp_0117			TRUE	0.994	33.000	0.565	1.000	Y	NA
1109434	1109435	Msp_0118	Msp_0119			FALSE	0.361	37.000	0.000	NA		NA
1109435	1109436	Msp_0119	Msp_0120			FALSE	0.127	173.000	0.000	1.000		NA
1109436	1109437	Msp_0120	Msp_0121			FALSE	0.219	139.000	0.000	1.000	N	NA
1109437	1109438	Msp_0121	Msp_0122			FALSE	0.088	351.000	0.000	1.000	N	NA
1109438	1109439	Msp_0122	Msp_0123			FALSE	0.107	170.000	0.000	NA		NA
1109439	1109440	Msp_0123	Msp_0124		cysS	FALSE	0.169	103.000	0.000	NA		NA
1109440	1109441	Msp_0124	Msp_0125	cysS	hdrC2	FALSE	0.187	181.000	0.000	1.000	N	NA
1109441	1109442	Msp_0125	Msp_0126	hdrC2	hdrB2	TRUE	0.998	15.000	0.526	0.006	Y	NA
1109442	1109443	Msp_0126	Msp_0127	hdrB2	hdrA2	TRUE	0.997	-7.000	0.069	0.006	Y	NA
1109443	1109444	Msp_0127	Msp_0128	hdrA2		TRUE	0.577	30.000	0.000	1.000	N	NA
1109444	1109445	Msp_0128	Msp_0129			FALSE	0.026	633.000	0.000	NA		NA
1109445	1109446	Msp_0129	Msp_0130		thsA	FALSE	0.029	522.000	0.000	NA		NA
1109447	1109448	Msp_0131	Msp_0132			FALSE	0.142	116.000	0.000	NA		NA
1109448	1109449	Msp_0132	Msp_0133			FALSE	0.237	70.000	0.000	NA		NA
1109450	1109451	Msp_0134	Msp_0135	hisD	aspS	TRUE	0.789	107.000	0.054	1.000	N	NA
1109452	1109453	Msp_0136	Msp_0137			TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1109454	1109455	Msp_0138	Msp_0139			FALSE	0.130	126.000	0.000	NA		NA
1109455	1109456	Msp_0139	Msp_0140			FALSE	0.207	82.000	0.000	NA		NA
1109457	1109458	Msp_0141	Msp_0142			FALSE	0.020	1251.000	0.000	NA		NA
1109459	1109460	Msp_0143	Msp_0144			TRUE	0.986	10.000	0.146	0.061		NA
1109460	1109461	Msp_0144	Msp_0145			FALSE	0.034	422.000	0.000	NA		NA
1109464	1109465	Msp_0148	Msp_0149			FALSE	0.196	171.000	0.000	1.000	N	NA
1109465	1109466	Msp_0149	Msp_0150			FALSE	0.027	837.000	0.000	1.000		NA
1109466	1109467	Msp_0150	Msp_0151			TRUE	0.917	17.000	0.032	1.000		NA
1109468	1109469	Msp_0152	Msp_0153			FALSE	0.057	284.000	0.000	NA		NA
1109469	1109470	Msp_0153	Msp_0154			FALSE	0.036	507.000	0.000	1.000		NA
1109474	1109475	Msp_0158	Msp_0159			TRUE	0.492	16.000	0.000	NA		NA
1109475	1109476	Msp_0159	Msp_0160		thiI	TRUE	0.804	13.000	0.000	0.014		NA
1109478	1109479	Msp_0162	Msp_0163	cbiA	mtd	FALSE	0.453	53.000	0.000	1.000	N	NA
1109480	1109481	Msp_0164	Msp_0165	hisB		TRUE	0.510	23.000	0.000	1.000		NA
1109482	1109483	Msp_0166	Msp_0167			TRUE	0.942	-3.000	0.020	NA		NA
1109484	1109485	Msp_0168	Msp_0169			FALSE	0.102	299.000	0.000	1.000	N	NA
1109486	1109487	Msp_0170	Msp_0171	nadE	leuS	FALSE	0.208	150.000	0.000	1.000	N	NA
1109487	1109488	Msp_0171	Msp_0172	leuS		FALSE	0.157	108.000	0.000	NA		NA
1109488	1109489	Msp_0172	Msp_0173			FALSE	0.078	217.000	0.000	NA		NA
1109489	1109490	Msp_0173	Msp_0174			FALSE	0.198	86.000	0.000	NA		NA
1109491	1109492	Msp_0175	Msp_0176	ribB		FALSE	0.350	39.000	0.000	NA		NA
1109492	1109493	Msp_0176	Msp_0177			FALSE	0.110	161.000	0.000	NA		NA
1109494	1109495	Msp_0178	Msp_0179	hisG		TRUE	0.813	23.000	0.002	1.000	N	NA
1109495	1109496	Msp_0179	Msp_0180		tfrA	TRUE	0.598	28.000	0.000	1.000	N	NA
1109500	1109501	Msp_0184	Msp_0185	mtaB3	mtaC3	TRUE	0.948	63.000	1.000	NA		NA
1109501	1109502	Msp_0185	Msp_0186	mtaC3	mtaB2	TRUE	0.612	529.000	1.000	NA		NA
1109502	1109503	Msp_0186	Msp_0187	mtaB2	mtaC2	TRUE	0.975	28.000	1.000	NA		NA
1109503	1109504	Msp_0187	Msp_0188	mtaC2	mtaB1	TRUE	0.683	392.000	1.000	NA		NA
1109504	1109505	Msp_0188	Msp_0189	mtaB1	mtaC1	TRUE	0.977	25.000	1.000	NA		NA
1109505	1109506	Msp_0189	Msp_0190	mtaC1	mapA	FALSE	0.070	281.000	0.000	1.000		NA
1109506	1109507	Msp_0190	Msp_0191	mapA	mapB	FALSE	0.291	64.000	0.000	1.000		NA
1109508	1109509	Msp_0192	Msp_0193			TRUE	0.671	9.000	0.000	1.000		NA
1109510	1109511	Msp_0194	Msp_0195			TRUE	0.987	11.000	0.429	NA	N	NA
1109511	1109512	Msp_0195	Msp_0196			TRUE	0.808	-13.000	0.000	1.000	N	NA
1109512	1109513	Msp_0196	Msp_0197			TRUE	0.529	19.000	0.000	1.000		NA
1109514	1109515	Msp_0198	Msp_0199	albA	leuA1	TRUE	0.677	117.000	0.027	1.000	N	NA
1109517	1109518	Msp_0201	Msp_0202			FALSE	0.120	141.000	0.000	NA		NA
1109519	1109520	Msp_0203	Msp_0204			FALSE	0.086	230.000	0.000	1.000		NA
1109520	1109521	Msp_0204	Msp_0205			TRUE	0.935	24.000	0.000	1.000	Y	NA
1109521	1109522	Msp_0205	Msp_0206			FALSE	0.274	58.000	0.000	NA		NA
1109522	1109523	Msp_0206	Msp_0207			TRUE	0.951	14.000	0.065	NA		NA
1109523	1109524	Msp_0207	Msp_0208			TRUE	0.893	83.000	0.182	NA		NA
1109524	1109525	Msp_0208	Msp_0209			FALSE	0.483	17.000	0.000	NA		NA
1109525	1109526	Msp_0209	Msp_0210			FALSE	0.468	22.000	0.000	NA		NA
1109527	1109528	Msp_0211	Msp_0212			FALSE	0.052	300.000	0.000	NA		NA
1109529	1109530	Msp_0213	Msp_0214			FALSE	0.033	451.000	0.000	NA		NA
1109530	1109531	Msp_0214	Msp_0215			TRUE	0.949	14.000	0.000	NA	Y	NA
1109531	1109532	Msp_0215	Msp_0216			FALSE	0.124	134.000	0.000	NA		NA
1109532	1109533	Msp_0216	Msp_0217			FALSE	0.350	39.000	0.000	NA		NA
1109534	1109535	Msp_0218	Msp_0219			FALSE	0.133	123.000	0.000	NA		NA
1109535	1109536	Msp_0219	Msp_0220			TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1109536	1109537	Msp_0220	Msp_0221		truD	FALSE	0.092	195.000	0.000	NA		NA
1109537	1109538	Msp_0221	Msp_0222	truD		FALSE	0.202	84.000	0.000	NA		NA
1109540	1109541	Msp_0224	Msp_0225			FALSE	0.135	151.000	0.000	1.000		NA
1109541	1109542	Msp_0225	Msp_0226			FALSE	0.437	26.000	0.000	NA		NA
1109543	1109544	Msp_0227	Msp_0228		thiC1	TRUE	0.926	46.000	0.118	NA		NA
1109544	1109545	Msp_0228	Msp_0229	thiC1	secG	FALSE	0.066	246.000	0.000	NA		NA
1109545	1109546	Msp_0229	Msp_0230	secG		FALSE	0.078	217.000	0.000	NA		NA
1109546	1109547	Msp_0230	Msp_0231			FALSE	0.087	205.000	0.000	NA		NA
1109547	1109548	Msp_0231	Msp_0232			FALSE	0.078	217.000	0.000	NA		NA
1109548	1109549	Msp_0232	Msp_0233			FALSE	0.050	323.000	0.000	NA		NA
1109549	1109550	Msp_0233	Msp_0234		glnA	FALSE	0.084	209.000	0.000	NA		NA
1109550	1109551	Msp_0234	Msp_0235	glnA		TRUE	0.604	183.000	0.044	NA		NA
1109551	1109552	Msp_0235	Msp_0236			FALSE	0.044	355.000	0.000	NA		NA
1109552	1109553	Msp_0236	Msp_0237			TRUE	0.725	17.000	0.000	0.040		NA
1109553	1109554	Msp_0237	Msp_0238			FALSE	0.022	911.000	0.000	NA		NA
1109554	1109555	Msp_0238	Msp_0239			FALSE	0.451	24.000	0.000	NA		NA
1109557	1109558	Msp_0241	Msp_0242	fwdG	fwdD	TRUE	0.881	4.000	0.000	0.005		NA
1109558	1109559	Msp_0242	Msp_0243	fwdD	fwdB	TRUE	0.999	6.000	1.000	0.005	Y	NA
1109559	1109560	Msp_0243	Msp_0244	fwdB	fwdA	TRUE	0.999	2.000	1.000	0.005	Y	NA
1109560	1109561	Msp_0244	Msp_0245	fwdA	fwdC	TRUE	0.999	3.000	1.000	0.005	Y	NA
1109561	1109562	Msp_0245	Msp_0246	fwdC		TRUE	0.625	9.000	0.000	NA		NA
1109567	1109568	Msp_0251	Msp_0252	thiC2		FALSE	0.221	395.000	0.007	1.000	N	NA
1109570	1109571	Msp_0254	Msp_0255		polC	TRUE	0.627	140.000	0.026	1.000	N	NA
1109571	1109572	Msp_0255	Msp_0256	polC		FALSE	0.032	606.000	0.000	1.000		NA
1109573	1109574	Msp_0257	Msp_0258		lig	TRUE	0.625	9.000	0.000	NA		NA
1109574	1109575	Msp_0258	Msp_0259	lig		FALSE	0.385	40.000	0.000	1.000		NA
1109577	1109578	Msp_0261	Msp_0262			TRUE	0.652	5.000	0.000	NA		NA
1109578	1109579	Msp_0262	Msp_0263			FALSE	0.122	138.000	0.000	NA		NA
1109581	1109582	Msp_0265	Msp_0266			TRUE	0.990	6.000	0.731	1.000		NA
1109583	1109584	Msp_0267	Msp_0268	hisE		TRUE	0.930	8.000	0.019	1.000		NA
1109584	1109585	Msp_0268	Msp_0269		gatB	TRUE	0.758	27.000	0.003	1.000		NA
1109585	1109586	Msp_0269	Msp_0270	gatB		FALSE	0.293	225.000	0.002	1.000	N	NA
1109587	1109588	Msp_0271	Msp_0272			TRUE	0.586	11.000	0.000	NA		NA
1109588	1109589	Msp_0272	Msp_0273			FALSE	0.476	20.000	0.000	NA		NA
1109589	1109590	Msp_0273	Msp_0274			FALSE	0.162	105.000	0.000	NA		NA
1109590	1109591	Msp_0274	Msp_0275			FALSE	0.366	36.000	0.000	NA		NA
1109591	1109592	Msp_0275	Msp_0276			FALSE	0.299	48.000	0.000	NA		NA
1109593	1109594	Msp_0277	Msp_0278	comE	comD	TRUE	0.899	-19.000	0.000	0.002		NA
1109594	1109595	Msp_0278	Msp_0279	comD	comC	FALSE	0.414	403.000	0.065	1.000		NA
1109595	1109596	Msp_0279	Msp_0280	comC	purM	TRUE	0.824	28.000	0.005	1.000	N	NA
1109596	1109597	Msp_0280	Msp_0281	purM		FALSE	0.172	353.000	0.004	1.000		NA
1109597	1109598	Msp_0281	Msp_0282		psmB	TRUE	0.516	658.000	0.309	1.000		NA
1109598	1109599	Msp_0282	Msp_0283	psmB		FALSE	0.098	320.000	0.000	1.000	N	NA
1109599	1109600	Msp_0283	Msp_0284			FALSE	0.077	249.000	0.000	1.000		NA
1109600	1109601	Msp_0284	Msp_0285			TRUE	0.983	-15.000	0.114	NA		NA
1109602	1109603	Msp_0286	Msp_0287	comB1		TRUE	0.913	17.000	0.033	NA		NA
1109603	1109604	Msp_0287	Msp_0288			TRUE	0.953	10.000	0.041	NA		NA
1109605	1109606	Msp_0289	Msp_0290			FALSE	0.381	63.000	0.000	NA	N	NA
1109609	1109610	Msp_0293	Msp_0294			FALSE	0.096	215.000	0.000	1.000		NA
1109610	1109611	Msp_0294	Msp_0295			TRUE	0.923	6.000	0.016	NA		NA
1109611	1109612	Msp_0295	Msp_0296		cofG	TRUE	0.864	39.000	0.035	NA		NA
1109613	1109614	Msp_0297	Msp_0298			FALSE	0.460	23.000	0.000	NA		NA
1109615	1109616	Msp_0299	Msp_0300	mcrC	mtrE	TRUE	0.948	15.000	0.000	1.000	Y	NA
1109616	1109617	Msp_0300	Msp_0301	mtrE	mtrD	TRUE	0.999	3.000	0.914	0.003	Y	NA
1109617	1109618	Msp_0301	Msp_0302	mtrD	mtrC	TRUE	0.999	1.000	0.842	0.007	Y	NA
1109618	1109619	Msp_0302	Msp_0303	mtrC	mtrB	TRUE	0.999	1.000	0.842	0.007	Y	NA
1109619	1109620	Msp_0303	Msp_0304	mtrB	mtrA	TRUE	0.965	17.000	0.000	0.007	Y	NA
1109620	1109621	Msp_0304	Msp_0305	mtrA	mtrF	TRUE	0.982	5.000	0.000	0.007	Y	NA
1109621	1109622	Msp_0305	Msp_0306	mtrF	mtrG	TRUE	0.999	0.000	0.607	0.007	Y	NA
1109622	1109623	Msp_0306	Msp_0307	mtrG	mtrH	TRUE	0.997	28.000	0.571	0.007	Y	NA
1109623	1109624	Msp_0307	Msp_0308	mtrH		TRUE	0.977	5.000	0.081	NA		NA
1109626	1109627	Msp_0310	Msp_0311			TRUE	0.743	93.000	0.040	NA		NA
1109628	1109629	Msp_0312	Msp_0313			TRUE	0.996	3.000	0.092	1.000	Y	NA
1109630	1109631	Msp_0314	Msp_0315	mvhD1	mvhG	TRUE	0.998	4.000	0.692	1.000	Y	NA
1109631	1109632	Msp_0315	Msp_0316	mvhG	mvhA	TRUE	0.996	23.000	0.857	1.000	Y	NA
1109634	1109635	Msp_0318	Msp_0319	mrtB	mrtD	TRUE	0.998	10.000	0.500	0.013	Y	NA
1109635	1109636	Msp_0319	Msp_0320	mrtD	mrtG	TRUE	0.999	7.000	0.500	0.013	Y	NA
1109636	1109637	Msp_0320	Msp_0321	mrtG	mrtA	TRUE	0.999	0.000	0.875	0.003	Y	NA
1109637	1109638	Msp_0321	Msp_0322	mrtA		FALSE	0.030	500.000	0.000	NA		NA
1109640	1109641	Msp_0324	Msp_0325			TRUE	0.920	-9.000	0.009	NA		NA
1109643	1109644	Msp_0327	Msp_0328	rpl10e	ppsA	TRUE	0.676	163.000	0.040	1.000	N	NA
1109644	1109645	Msp_0328	Msp_0329	ppsA	mfnA	TRUE	0.706	289.000	0.167	1.000	N	NA
1109646	1109647	Msp_0330	Msp_0331			TRUE	0.953	4.000	0.023	NA	N	NA
1109650	1109651	Msp_0334	Msp_0335	porC	porD	TRUE	0.996	16.000	0.128	0.004	Y	NA
1109651	1109652	Msp_0335	Msp_0336	porD	porA	TRUE	0.999	3.000	0.500	0.004	Y	NA
1109652	1109653	Msp_0336	Msp_0337	porA	porB	TRUE	0.998	7.000	0.296	0.004	Y	NA
1109653	1109654	Msp_0337	Msp_0338	porB		TRUE	0.682	165.000	0.000	1.000	Y	NA
1109655	1109656	Msp_0339	Msp_0340		pstB	TRUE	0.991	29.000	0.130	NA	Y	NA
1109656	1109657	Msp_0340	Msp_0341	pstB	pstA	TRUE	0.997	2.000	0.052	0.003	Y	NA
1109657	1109658	Msp_0341	Msp_0342	pstA	pstC	TRUE	0.999	-3.000	0.219	0.003	Y	NA
1109658	1109659	Msp_0342	Msp_0343	pstC	pstS	TRUE	0.920	31.000	0.000	1.000	Y	NA
1109659	1109660	Msp_0343	Msp_0344	pstS		FALSE	0.465	338.000	0.000	1.000	Y	NA
1109662	1109663	Msp_0346	Msp_0347			FALSE	0.111	158.000	0.000	NA		NA
1109663	1109664	Msp_0347	Msp_0348			FALSE	0.323	44.000	0.000	NA		NA
1109664	1109665	Msp_0348	Msp_0349			FALSE	0.390	32.000	0.000	NA		NA
1109666	1109667	Msp_0350	Msp_0351	rrsA	rrlA	FALSE	0.027	581.000	0.000	NA		NA
1109667	1109668	Msp_0351	Msp_0352	rrlA	rrfA	FALSE	0.036	416.000	0.000	NA		NA
1109668	1109669	Msp_0352	Msp_0353	rrfA		FALSE	0.246	66.000	0.000	NA		NA
1109674	1109675	Msp_0358	Msp_0359		tyrS	TRUE	0.779	20.000	0.003	NA		NA
1109675	1109676	Msp_0359	Msp_0360	tyrS		TRUE	0.962	32.000	0.010	NA	Y	NA
1109676	1109677	Msp_0360	Msp_0361			TRUE	0.942	112.000	0.061	NA	Y	NA
1109677	1109678	Msp_0361	Msp_0362			TRUE	0.773	148.000	0.074	1.000	N	NA
1109680	1109681	Msp_0364	Msp_0365			TRUE	0.975	6.000	0.078	NA		NA
1109684	1109685	Msp_0368	Msp_0369		radB	FALSE	0.118	184.000	0.000	1.000		NA
1109685	1109686	Msp_0369	Msp_0370	radB		TRUE	0.942	23.000	0.051	1.000	N	NA
1109688	1109689	Msp_0372	Msp_0373			FALSE	0.137	149.000	0.000	1.000		NA
1109689	1109690	Msp_0373	Msp_0374		leuD2	TRUE	0.981	12.000	0.278	1.000		NA
1109690	1109691	Msp_0374	Msp_0375	leuD2		TRUE	0.976	3.000	0.074	NA		NA
1109691	1109692	Msp_0375	Msp_0376			TRUE	0.753	24.000	0.003	NA		NA
1109692	1109693	Msp_0376	Msp_0377			FALSE	0.319	57.000	0.000	1.000		NA
1109694	1109695	Msp_0378	Msp_0379			FALSE	0.468	22.000	0.000	NA		NA
1109696	1109697	Msp_0380	Msp_0381			TRUE	0.934	56.000	0.250	NA		NA
1109697	1109698	Msp_0381	Msp_0382			TRUE	0.652	5.000	0.000	NA		NA
1109699	1109700	Msp_0383	Msp_0384			FALSE	0.056	346.000	0.000	1.000		NA
1109702	1109703	Msp_0386	Msp_0387			TRUE	0.947	25.000	0.076	1.000		NA
1109703	1109704	Msp_0387	Msp_0388		truA	TRUE	0.559	15.000	0.000	1.000		NA
1109705	1109706	Msp_0389	Msp_0390	hisA		TRUE	0.826	26.000	0.004	1.000	N	NA
1109706	1109707	Msp_0390	Msp_0391			FALSE	0.091	197.000	0.000	NA		NA
1109707	1109708	Msp_0391	Msp_0392		cofH	FALSE	0.038	402.000	0.000	NA		NA
1109710	1109711	Msp_0394	Msp_0395		dys	TRUE	0.868	74.000	0.067	1.000	N	NA
1109711	1109712	Msp_0395	Msp_0396	dys		TRUE	0.986	11.000	0.714	NA		NA
1109714	1109715	Msp_0398	Msp_0399	cbiM1	cbiN	TRUE	0.999	2.000	0.861	0.024	Y	NA
1109715	1109716	Msp_0399	Msp_0400	cbiN	cbiQ1	TRUE	0.984	141.000	0.804	0.004	Y	NA
1109716	1109717	Msp_0400	Msp_0401	cbiQ1	cbiO1	TRUE	0.992	29.000	0.070	0.004	Y	NA
1109717	1109718	Msp_0401	Msp_0402	cbiO1		FALSE	0.025	661.000	0.000	NA		NA
1109718	1109719	Msp_0402	Msp_0403			TRUE	0.926	3.000	0.014	NA		NA
1109719	1109720	Msp_0403	Msp_0404			TRUE	0.765	40.000	0.014	NA		NA
1109720	1109721	Msp_0404	Msp_0405			FALSE	0.079	216.000	0.000	NA		NA
1109721	1109722	Msp_0405	Msp_0406		pgk2-2	FALSE	0.179	163.000	0.000	NA	N	NA
1109722	1109723	Msp_0406	Msp_0407	pgk2-2		TRUE	0.832	51.000	0.032	1.000		NA
1109723	1109724	Msp_0407	Msp_0408			TRUE	0.529	19.000	0.000	1.000		NA
1109725	1109726	Msp_0409	Msp_0410		nadC	FALSE	0.112	194.000	0.000	1.000		NA
1109727	1109728	Msp_0411	Msp_0412	rnz		FALSE	0.130	126.000	0.000	NA		NA
1109728	1109729	Msp_0412	Msp_0413		rfcS	FALSE	0.048	328.000	0.000	NA		NA
1109729	1109730	Msp_0413	Msp_0414	rfcS	rfcL	TRUE	0.998	3.000	0.087	0.002	Y	NA
1109730	1109731	Msp_0414	Msp_0415	rfcL		FALSE	0.267	111.000	0.000	1.000	N	NA
1109731	1109732	Msp_0415	Msp_0416		hemB	TRUE	0.563	77.000	0.000	0.017	N	NA
1109732	1109733	Msp_0416	Msp_0417	hemB		FALSE	0.025	658.000	0.000	NA		NA
1109733	1109734	Msp_0417	Msp_0418			FALSE	0.021	935.000	0.000	NA		NA
1109734	1109735	Msp_0418	Msp_0419			TRUE	0.983	8.000	0.194	NA		NA
1109735	1109736	Msp_0419	Msp_0420			TRUE	0.989	-7.000	0.441	NA		NA
1109736	1109737	Msp_0420	Msp_0421			TRUE	0.997	12.000	0.603	NA	Y	NA
1109737	1109738	Msp_0421	Msp_0422			TRUE	0.990	-16.000	0.629	NA		NA
1109738	1109739	Msp_0422	Msp_0423			TRUE	0.978	13.000	0.258	NA		NA
1109739	1109740	Msp_0423	Msp_0424			TRUE	0.993	-12.000	0.035	NA	Y	NA
1109740	1109741	Msp_0424	Msp_0425			TRUE	0.996	-6.000	0.086	NA	Y	NA
1109743	1109744	Msp_0427	Msp_0428			FALSE	0.040	385.000	0.000	NA		NA
1109744	1109745	Msp_0428	Msp_0429		pheS	TRUE	0.813	24.000	0.004	NA	N	NA
1109745	1109746	Msp_0429	Msp_0430	pheS		FALSE	0.103	206.000	0.000	1.000		NA
1109746	1109747	Msp_0430	Msp_0431		guaB	TRUE	0.542	111.000	0.012	1.000		NA
1109747	1109748	Msp_0431	Msp_0432	guaB		FALSE	0.026	903.000	0.000	1.000		NA
1109749	1109750	Msp_0433	Msp_0434			TRUE	0.687	6.000	0.000	1.000		NA
1109750	1109751	Msp_0434	Msp_0435			FALSE	0.471	28.000	0.000	1.000		NA
1109752	1109753	Msp_0436	Msp_0437			FALSE	0.333	41.000	0.000	NA		NA
1109754	1109755	Msp_0438	Msp_0439			TRUE	0.530	18.000	0.000	1.000		NA
1109756	1109757	Msp_0440	Msp_0441			FALSE	0.051	318.000	0.000	NA		NA
1109757	1109758	Msp_0441	Msp_0442			TRUE	0.652	5.000	0.000	NA		NA
1109759	1109760	Msp_0443	Msp_0444	pgk2-1		FALSE	0.104	263.000	0.000	NA	N	NA
1109760	1109761	Msp_0444	Msp_0445			TRUE	0.630	291.000	0.000	0.012	Y	NA
1109761	1109762	Msp_0445	Msp_0446			FALSE	0.253	116.000	0.000	1.000	N	NA
1109762	1109763	Msp_0446	Msp_0447			FALSE	0.311	96.000	0.000	1.000	N	NA
1109767	1109768	Msp_0451	Msp_0452			TRUE	0.677	0.000	0.000	NA		NA
1109768	1109769	Msp_0452	Msp_0453		pyrG	FALSE	0.404	38.000	0.000	1.000		NA
1109769	1109770	Msp_0453	Msp_0454	pyrG		FALSE	0.036	410.000	0.000	NA		NA
1109771	1109772	Msp_0455	Msp_0456			FALSE	0.031	469.000	0.000	NA		NA
1109772	1109773	Msp_0456	Msp_0457			FALSE	0.087	205.000	0.000	NA		NA
1109773	1109774	Msp_0457	Msp_0458			FALSE	0.116	148.000	0.000	NA		NA
1109774	1109775	Msp_0458	Msp_0459			FALSE	0.383	33.000	0.000	NA		NA
1109775	1109776	Msp_0459	Msp_0460			FALSE	0.024	670.000	0.000	NA		NA
1109776	1109777	Msp_0460	Msp_0461			TRUE	0.679	-3.000	0.000	NA		NA
1109777	1109778	Msp_0461	Msp_0462			FALSE	0.061	264.000	0.000	NA		NA
1109779	1109780	Msp_0463	Msp_0464			FALSE	0.055	293.000	0.000	NA		NA
1109780	1109781	Msp_0464	Msp_0465			FALSE	0.066	244.000	0.000	NA		NA
1109781	1109782	Msp_0465	Msp_0466			FALSE	0.150	112.000	0.000	NA		NA
1109783	1109784	Msp_0467	Msp_0468			TRUE	0.695	23.000	0.000	0.086		NA
1109784	1109785	Msp_0468	Msp_0469			TRUE	0.989	6.000	0.565	NA		NA
1109785	1109786	Msp_0469	Msp_0470			TRUE	0.982	10.000	0.227	NA		NA
1109786	1109787	Msp_0470	Msp_0471			FALSE	0.102	181.000	0.000	NA		NA
1109787	1109788	Msp_0471	Msp_0472			FALSE	0.222	74.000	0.000	NA		NA
1109788	1109789	Msp_0472	Msp_0473			TRUE	0.741	15.000	0.000	0.041		NA
1109789	1109790	Msp_0473	Msp_0474			TRUE	0.509	15.000	0.000	NA		NA
1109790	1109791	Msp_0474	Msp_0475			FALSE	0.383	33.000	0.000	NA		NA
1109791	1109792	Msp_0475	Msp_0476			FALSE	0.169	103.000	0.000	NA		NA
1109794	1109795	Msp_0478	Msp_0479			TRUE	0.975	-13.000	0.039	0.041		NA
1109795	1109796	Msp_0479	Msp_0480		hsdS	TRUE	0.996	11.000	0.083	0.041	Y	NA
1109796	1109797	Msp_0480	Msp_0481	hsdS		FALSE	0.123	136.000	0.000	NA		NA
1109797	1109798	Msp_0481	Msp_0482			TRUE	0.677	0.000	0.000	NA		NA
1109798	1109799	Msp_0482	Msp_0483			FALSE	0.307	119.000	0.000	0.041		NA
1109800	1109801	Msp_0484	Msp_0485		apgM1	FALSE	0.191	178.000	0.000	1.000	N	NA
1109801	1109802	Msp_0485	Msp_0486	apgM1		FALSE	0.200	85.000	0.000	NA		NA
1109802	1109803	Msp_0486	Msp_0487			FALSE	0.147	114.000	0.000	NA		NA
1109803	1109804	Msp_0487	Msp_0488			TRUE	0.996	15.000	0.615	1.000	Y	NA
1109804	1109805	Msp_0488	Msp_0489			TRUE	0.974	-3.000	0.061	1.000		NA
1109805	1109806	Msp_0489	Msp_0490			FALSE	0.171	115.000	0.000	1.000		NA
1109806	1109807	Msp_0490	Msp_0491			FALSE	0.244	67.000	0.000	NA		NA
1109807	1109808	Msp_0491	Msp_0492			FALSE	0.166	104.000	0.000	NA		NA
1109808	1109809	Msp_0492	Msp_0493			FALSE	0.024	704.000	0.000	NA		NA
1109811	1109812	Msp_0495	Msp_0496			TRUE	0.968	6.000	0.000	NA	Y	NA
1109812	1109813	Msp_0496	Msp_0497			FALSE	0.160	188.000	0.000	NA	N	NA
1109813	1109814	Msp_0497	Msp_0498		aroA	TRUE	0.827	21.000	0.003	1.000	N	NA
1109814	1109815	Msp_0498	Msp_0499	aroA	valS	TRUE	0.677	56.000	0.003	1.000	N	NA
1109817	1109818	Msp_0501	Msp_0502			FALSE	0.043	356.000	0.000	NA		NA
1109819	1109820	Msp_0503	Msp_0504			FALSE	0.133	123.000	0.000	NA		NA
1109824	1109825	Msp_0508	Msp_0509			FALSE	0.171	102.000	0.000	NA		NA
1109826	1109827	Msp_0510	Msp_0511			TRUE	0.885	64.000	0.066	1.000	N	NA
1109827	1109828	Msp_0511	Msp_0512			FALSE	0.256	115.000	0.000	1.000	N	NA
1109828	1109829	Msp_0512	Msp_0513			TRUE	0.498	43.000	0.000	1.000	N	NA
1109830	1109831	Msp_0514	Msp_0515			FALSE	0.036	519.000	0.000	1.000		NA
1109831	1109832	Msp_0515	Msp_0516			FALSE	0.404	38.000	0.000	1.000		NA
1109833	1109834	Msp_0517	Msp_0518			FALSE	0.164	204.000	0.000	1.000	N	NA
1109835	1109836	Msp_0519	Msp_0520			FALSE	0.212	145.000	0.000	1.000	N	NA
1109836	1109837	Msp_0520	Msp_0521		pyrI	TRUE	0.647	21.000	0.000	1.000	N	NA
1109837	1109838	Msp_0521	Msp_0522	pyrI		TRUE	0.612	10.000	0.000	NA		NA
1109839	1109840	Msp_0523	Msp_0524			TRUE	0.652	5.000	0.000	NA		NA
1109840	1109841	Msp_0524	Msp_0525		pheT	FALSE	0.065	295.000	0.000	1.000		NA
1109841	1109842	Msp_0525	Msp_0526	pheT		TRUE	0.642	101.000	0.024	NA		NA
1109843	1109844	Msp_0527	Msp_0528		gshA	FALSE	0.120	182.000	0.000	1.000		NA
1109845	1109846	Msp_0529	Msp_0530			TRUE	0.946	17.000	0.029	0.008		NA
1109847	1109848	Msp_0531	Msp_0532			TRUE	0.996	20.000	0.624	1.000	Y	NA
1109848	1109849	Msp_0532	Msp_0533			TRUE	0.998	-31.000	0.247	1.000	Y	NA
1109849	1109850	Msp_0533	Msp_0534			TRUE	0.723	18.000	0.000	0.040		NA
1109850	1109851	Msp_0534	Msp_0535			TRUE	0.586	11.000	0.000	NA		NA
1109851	1109852	Msp_0535	Msp_0536			TRUE	0.506	36.000	0.000	NA	N	NA
1109852	1109853	Msp_0536	Msp_0537			TRUE	0.957	19.000	0.039	0.040	N	NA
1109853	1109854	Msp_0537	Msp_0538			TRUE	0.936	22.000	0.000	NA	Y	NA
1109854	1109855	Msp_0538	Msp_0539			TRUE	0.818	80.000	0.000	NA	Y	NA
1109855	1109856	Msp_0539	Msp_0540			FALSE	0.237	70.000	0.000	NA		NA
1109856	1109857	Msp_0540	Msp_0541			TRUE	0.786	122.000	0.088	NA		NA
1109857	1109858	Msp_0541	Msp_0542			TRUE	0.974	16.000	0.311	NA		NA
1109858	1109859	Msp_0542	Msp_0543			FALSE	0.089	202.000	0.000	NA		NA
1109859	1109860	Msp_0543	Msp_0544			TRUE	0.972	2.000	0.065	NA		NA
1109860	1109861	Msp_0544	Msp_0545			TRUE	0.899	109.000	0.571	NA		NA
1109861	1109862	Msp_0545	Msp_0546			TRUE	0.990	1.000	0.714	NA		NA
1109862	1109863	Msp_0546	Msp_0547			FALSE	0.483	17.000	0.000	NA		NA
1109863	1109864	Msp_0547	Msp_0548			FALSE	0.481	18.000	0.000	NA		NA
1109864	1109865	Msp_0548	Msp_0549		argJ	FALSE	0.162	105.000	0.000	NA		NA
1109865	1109866	Msp_0549	Msp_0550	argJ	argB	TRUE	0.997	23.000	0.239	0.003	Y	NA
1109866	1109867	Msp_0550	Msp_0551	argB		TRUE	0.891	-7.000	0.000	0.041	N	NA
1109867	1109868	Msp_0551	Msp_0552		argC	TRUE	0.739	28.000	0.000	0.041	N	NA
1109868	1109869	Msp_0552	Msp_0553	argC		TRUE	0.671	9.000	0.000	1.000		NA
1109869	1109870	Msp_0553	Msp_0554			FALSE	0.161	321.000	0.000	0.008		NA
1109870	1109871	Msp_0554	Msp_0555			TRUE	0.880	2.000	0.000	0.008		NA
1109871	1109872	Msp_0555	Msp_0556			TRUE	0.509	15.000	0.000	NA		NA
1109874	1109875	Msp_0558	Msp_0559			TRUE	0.999	-13.000	0.860	0.001	Y	NA
1109875	1109876	Msp_0559	Msp_0560			FALSE	0.151	130.000	0.000	1.000		NA
1109876	1109877	Msp_0560	Msp_0561			TRUE	0.811	21.000	0.005	1.000		NA
1109877	1109878	Msp_0561	Msp_0562			TRUE	0.937	14.000	0.042	NA		NA
1109879	1109880	Msp_0563	Msp_0564			TRUE	0.531	163.000	0.026	NA		NA
1109882	1109883	Msp_0566	Msp_0567			TRUE	0.986	0.000	0.182	NA		NA
1109884	1109885	Msp_0568	Msp_0569			FALSE	0.476	20.000	0.000	NA		NA
1109885	1109886	Msp_0569	Msp_0570			TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1109886	1109887	Msp_0570	Msp_0571			TRUE	0.660	4.000	0.000	NA		NA
1109889	1109890	Msp_0573	Msp_0574	uvrB	uvrA	TRUE	0.998	4.000	0.154	0.002	Y	NA
1109890	1109891	Msp_0574	Msp_0575	uvrA		FALSE	0.121	181.000	0.000	1.000		NA
1109891	1109892	Msp_0575	Msp_0576			FALSE	0.468	22.000	0.000	NA		NA
1109892	1109893	Msp_0576	Msp_0577		aroD	FALSE	0.069	239.000	0.000	NA		NA
1109893	1109894	Msp_0577	Msp_0578	aroD		TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1109894	1109895	Msp_0578	Msp_0579		aroC	FALSE	0.483	17.000	0.000	NA		NA
1109896	1109897	Msp_0580	Msp_0581			TRUE	0.991	2.000	0.796	1.000		NA
1109898	1109899	Msp_0582	Msp_0583		sucD	TRUE	0.681	250.000	0.167	NA		NA
1109899	1109900	Msp_0583	Msp_0584	sucD	hmgA	TRUE	0.714	192.000	0.068	1.000	N	NA
1109900	1109901	Msp_0584	Msp_0585	hmgA		TRUE	0.881	37.000	0.041	NA		NA
1109901	1109902	Msp_0585	Msp_0586			TRUE	0.509	15.000	0.000	NA		NA
1109902	1109903	Msp_0586	Msp_0587			FALSE	0.147	114.000	0.000	NA		NA
1109903	1109904	Msp_0587	Msp_0588		thrC	FALSE	0.035	421.000	0.000	NA		NA
1109904	1109905	Msp_0588	Msp_0589	thrC		FALSE	0.455	52.000	0.000	1.000	N	NA
1109905	1109906	Msp_0589	Msp_0590			FALSE	0.029	681.000	0.000	1.000		NA
1109906	1109907	Msp_0590	Msp_0591			FALSE	0.088	226.000	0.000	1.000		NA
1109907	1109908	Msp_0591	Msp_0592		rnp4	FALSE	0.149	216.000	0.000	1.000	N	NA
1109908	1109909	Msp_0592	Msp_0593	rnp4		TRUE	0.988	26.000	0.070	NA	Y	NA
1109909	1109910	Msp_0593	Msp_0594		rps19e	TRUE	0.970	60.000	0.056	NA	Y	NA
1109910	1109911	Msp_0594	Msp_0595	rps19e		TRUE	0.953	46.000	0.399	1.000		NA
1109911	1109912	Msp_0595	Msp_0596			TRUE	0.963	30.000	0.262	1.000		NA
1109912	1109913	Msp_0596	Msp_0597		rpl31e	TRUE	0.630	204.000	0.000	1.000	Y	NA
1109913	1109914	Msp_0597	Msp_0598	rpl31e	eif6	TRUE	0.951	228.000	0.474	1.000	Y	NA
1109914	1109915	Msp_0598	Msp_0599	eif6	rplX	TRUE	0.998	-3.000	0.324	1.000	Y	NA
1109915	1109916	Msp_0599	Msp_0600	rplX		TRUE	0.960	45.000	0.348	1.000	N	NA
1109916	1109917	Msp_0600	Msp_0601			FALSE	0.164	204.000	0.000	1.000	N	NA
1109918	1109919	Msp_0602	Msp_0603			FALSE	0.460	23.000	0.000	NA		NA
1109920	1109921	Msp_0604	Msp_0605			TRUE	0.922	18.000	0.027	1.000	N	NA
1109921	1109922	Msp_0605	Msp_0606			FALSE	0.022	895.000	0.000	NA		NA
1109923	1109924	Msp_0607	Msp_0608			TRUE	0.676	-10.000	0.000	NA		NA
1109924	1109925	Msp_0608	Msp_0609			FALSE	0.253	77.000	0.000	1.000		NA
1109925	1109926	Msp_0609	Msp_0610			TRUE	0.984	-12.000	0.120	1.000		NA
1109928	1109929	Msp_0612	Msp_0613			TRUE	0.772	14.000	0.000	0.033		NA
1109930	1109931	Msp_0614	Msp_0615			FALSE	0.025	656.000	0.000	NA		NA
1109931	1109932	Msp_0615	Msp_0616			TRUE	0.678	-7.000	0.000	NA		NA
1109932	1109933	Msp_0616	Msp_0617			TRUE	0.492	16.000	0.000	NA		NA
1109934	1109935	Msp_0618	Msp_0619	argH		FALSE	0.041	438.000	0.000	1.000		NA
1109935	1109936	Msp_0619	Msp_0620			FALSE	0.025	1006.000	0.000	1.000		NA
1109936	1109937	Msp_0620	Msp_0621		rps24e	TRUE	0.997	23.000	0.487	0.031	Y	NA
1109937	1109938	Msp_0621	Msp_0622	rps24e		TRUE	0.986	8.000	0.362	NA		NA
1109938	1109939	Msp_0622	Msp_0623		rpoE2	TRUE	0.979	18.000	0.695	NA		NA
1109939	1109940	Msp_0623	Msp_0624	rpoE2	rpoE1	TRUE	0.997	26.000	0.429	0.009	Y	NA
1109940	1109941	Msp_0624	Msp_0625	rpoE1	ppa	TRUE	0.963	18.000	0.080	1.000	N	NA
1109941	1109942	Msp_0625	Msp_0626	ppa		TRUE	0.839	39.000	0.028	NA		NA
1109942	1109943	Msp_0626	Msp_0627			TRUE	0.968	31.000	0.511	NA		NA
1109943	1109944	Msp_0627	Msp_0628			TRUE	0.986	59.000	0.222	1.000	Y	NA
1109944	1109945	Msp_0628	Msp_0629		infB	TRUE	0.980	73.000	0.132	1.000	Y	NA
1109945	1109946	Msp_0629	Msp_0630	infB	ndk	FALSE	0.395	392.000	0.037	1.000	N	NA
1109946	1109947	Msp_0630	Msp_0631	ndk	rpl24e	TRUE	0.977	-3.000	0.054	1.000	N	NA
1109947	1109948	Msp_0631	Msp_0632	rpl24e	rps28e	TRUE	0.992	70.000	0.761	0.031	Y	NA
1109948	1109949	Msp_0632	Msp_0633	rps28e	rpl7Ae	TRUE	0.969	219.000	0.602	0.031	Y	NA
1109950	1109951	Msp_0634	Msp_0635		cdc6-2	TRUE	0.573	27.000	0.000	NA	N	NA
1109954	1109955	Msp_0638	Msp_0639	mvhD2	fdhB	TRUE	0.998	2.000	0.444	1.000	Y	NA
1109955	1109956	Msp_0639	Msp_0640	fdhB	fdhA	TRUE	0.847	13.000	0.000	0.001		NA
1109957	1109958	Msp_0641	Msp_0642			TRUE	0.941	6.000	0.025	NA		NA
1109958	1109959	Msp_0642	Msp_0643		nadA	FALSE	0.406	64.000	0.000	1.000	N	NA
1109959	1109960	Msp_0643	Msp_0644	nadA		FALSE	0.180	97.000	0.000	NA		NA
1109960	1109961	Msp_0644	Msp_0645			FALSE	0.056	291.000	0.000	NA		NA
1109961	1109962	Msp_0645	Msp_0646			TRUE	0.598	28.000	0.000	1.000	N	NA
1109964	1109965	Msp_0648	Msp_0649	hisS	hisI	TRUE	0.920	9.000	0.007	1.000	N	NA
1109965	1109966	Msp_0649	Msp_0650	hisI		TRUE	0.924	13.000	0.026	1.000		NA
1109966	1109967	Msp_0650	Msp_0651			TRUE	0.972	11.000	0.052	0.024		NA
1109967	1109968	Msp_0651	Msp_0652		endA	TRUE	0.777	22.000	0.000	0.040	N	NA
1109968	1109969	Msp_0652	Msp_0653	endA	trpS	TRUE	0.987	39.000	0.095	1.000	Y	NA
1109969	1109970	Msp_0653	Msp_0654	trpS		FALSE	0.065	248.000	0.000	NA		NA
1109970	1109971	Msp_0654	Msp_0655		cbiM2	FALSE	0.020	1085.000	0.000	NA		NA
1109971	1109972	Msp_0655	Msp_0656	cbiM2		TRUE	0.977	6.000	0.089	NA		NA
1109972	1109973	Msp_0656	Msp_0657		cbiQ2	FALSE	0.458	161.000	0.017	NA		NA
1109973	1109974	Msp_0657	Msp_0658	cbiQ2		FALSE	0.054	295.000	0.000	NA		NA
1109978	1109979	Msp_0662	Msp_0663			FALSE	0.119	257.000	0.000	1.000	N	NA
1109979	1109980	Msp_0663	Msp_0664			TRUE	0.957	19.000	0.069	1.000	N	NA
1109981	1109982	Msp_0665	Msp_0666	fno		FALSE	0.108	200.000	0.000	1.000		NA
1109982	1109983	Msp_0666	Msp_0667			TRUE	0.935	24.000	0.000	1.000	Y	NA
1109983	1109984	Msp_0667	Msp_0668			TRUE	0.973	1.000	0.021	0.027	N	NA
1109984	1109985	Msp_0668	Msp_0669			TRUE	0.992	-3.000	0.500	1.000	N	NA
1109985	1109986	Msp_0669	Msp_0670			TRUE	0.996	19.000	0.103	0.002	Y	NA
1109986	1109987	Msp_0670	Msp_0671			TRUE	0.945	-12.000	0.011	1.000	N	NA
1109987	1109988	Msp_0671	Msp_0672			FALSE	0.064	448.000	0.000	1.000	N	NA
1109988	1109989	Msp_0672	Msp_0673			FALSE	0.070	281.000	0.000	1.000		NA
1109990	1109991	Msp_0674	Msp_0675			FALSE	0.156	193.000	0.000	NA	N	NA
1109992	1109993	Msp_0676	Msp_0677	metX		TRUE	0.734	235.000	0.006	1.000	Y	NA
1109994	1109995	Msp_0678	Msp_0679			FALSE	0.023	724.000	0.000	NA		NA
1109995	1109996	Msp_0679	Msp_0680			TRUE	0.988	8.000	0.556	NA		NA
1109996	1109997	Msp_0680	Msp_0681			TRUE	0.886	118.000	0.556	NA		NA
1109997	1109998	Msp_0681	Msp_0682		thiM1	FALSE	0.162	105.000	0.000	NA		NA
1109998	1109999	Msp_0682	Msp_0683	thiM1		TRUE	0.873	11.000	0.000	0.009	N	NA
1110000	1110001	Msp_0684	Msp_0685			FALSE	0.233	71.000	0.000	NA		NA
1110001	1110002	Msp_0685	Msp_0686			FALSE	0.021	970.000	0.000	NA		NA
1110002	1110003	Msp_0686	Msp_0687			TRUE	0.674	1.000	0.000	NA		NA
1110003	1110004	Msp_0687	Msp_0688			TRUE	0.973	20.000	0.329	NA		NA
1110004	1110005	Msp_0688	Msp_0689			FALSE	0.189	91.000	0.000	NA		NA
1110006	1110007	Msp_0690	Msp_0691			FALSE	0.060	267.000	0.000	NA		NA
1110008	1110009	Msp_0692	Msp_0693			FALSE	0.043	358.000	0.000	NA		NA
1110009	1110010	Msp_0693	Msp_0694		thiM2	TRUE	0.900	6.000	0.007	NA		NA
1110010	1110011	Msp_0694	Msp_0695	thiM2		FALSE	0.115	149.000	0.000	NA		NA
1110013	1110014	Msp_0697	Msp_0698			TRUE	0.612	10.000	0.000	NA		NA
1110015	1110016	Msp_0699	Msp_0700			FALSE	0.291	52.000	0.000	NA		NA
1110020	1110021	Msp_0704	Msp_0705			FALSE	0.025	665.000	0.000	NA		NA
1110021	1110022	Msp_0705	Msp_0706			FALSE	0.122	137.000	0.000	NA		NA
1110022	1110023	Msp_0706	Msp_0707			TRUE	0.679	-3.000	0.000	NA		NA
1110025	1110026	Msp_0709	Msp_0710			TRUE	0.678	-7.000	0.000	NA		NA
1110026	1110027	Msp_0710	Msp_0711			TRUE	0.660	4.000	0.000	NA		NA
1110027	1110028	Msp_0711	Msp_0712			FALSE	0.194	89.000	0.000	NA		NA
1110028	1110029	Msp_0712	Msp_0713			FALSE	0.024	697.000	0.000	NA		NA
1110032	1110033	Msp_0716	Msp_0717			FALSE	0.115	190.000	0.000	1.000		NA
1110033	1110034	Msp_0717	Msp_0718			TRUE	0.484	45.000	0.000	1.000	N	NA
1110034	1110035	Msp_0718	Msp_0719			FALSE	0.037	408.000	0.000	NA		NA
1110035	1110036	Msp_0719	Msp_0720		ppk	FALSE	0.048	330.000	0.000	NA		NA
1110036	1110037	Msp_0720	Msp_0721	ppk		TRUE	0.975	-7.000	0.070	NA		NA
1110037	1110038	Msp_0721	Msp_0722			FALSE	0.108	165.000	0.000	NA		NA
1110040	1110041	Msp_0724	Msp_0725			TRUE	0.545	13.000	0.000	NA		NA
1110041	1110042	Msp_0725	Msp_0726			TRUE	0.988	10.000	1.000	NA		NA
1110043	1110044	Msp_0727	Msp_0728			FALSE	0.183	93.000	0.000	NA		NA
1110045	1110046	Msp_0729	Msp_0730			TRUE	0.679	-3.000	0.000	NA		NA
1110046	1110047	Msp_0730	Msp_0731			FALSE	0.046	349.000	0.000	NA		NA
1110048	1110049	Msp_0732	Msp_0733			TRUE	0.677	0.000	0.000	NA		NA
1110050	1110051	Msp_0734	Msp_0735			TRUE	0.669	-61.000	0.000	NA		NA
1110051	1110052	Msp_0735	Msp_0736			FALSE	0.020	1579.000	0.000	NA		NA
1110054	1110055	Msp_0738	Msp_0739			FALSE	0.123	180.000	0.000	1.000		NA
1110058	1110059	Msp_0742	Msp_0743	rrsB		FALSE	0.166	104.000	0.000	NA		NA
1110059	1110060	Msp_0743	Msp_0744		rrlB	FALSE	0.028	534.000	0.000	NA		NA
1110060	1110061	Msp_0744	Msp_0745	rrlB	rrfB	FALSE	0.035	418.000	0.000	NA		NA
1110062	1110063	Msp_0746	Msp_0747			FALSE	0.269	60.000	0.000	NA		NA
1110064	1110065	Msp_0748	Msp_0749			FALSE	0.211	81.000	0.000	NA		NA
1110067	1110068	Msp_0751	Msp_0752			FALSE	0.044	353.000	0.000	NA		NA
1110068	1110069	Msp_0752	Msp_0753			FALSE	0.071	231.000	0.000	NA		NA
1110069	1110070	Msp_0753	Msp_0754			TRUE	0.635	7.000	0.000	NA		NA
1110070	1110071	Msp_0754	Msp_0755			FALSE	0.125	132.000	0.000	NA		NA
1110073	1110074	Msp_0757	Msp_0758			FALSE	0.026	608.000	0.000	NA		NA
1110077	1110078	Msp_0761	Msp_0762	mtaA1		FALSE	0.025	1007.000	0.000	1.000		NA
1110081	1110082	Msp_0765	Msp_0766			FALSE	0.157	108.000	0.000	NA		NA
1110082	1110083	Msp_0766	Msp_0767			FALSE	0.339	40.000	0.000	NA		NA
1110084	1110085	Msp_0768	Msp_0769			FALSE	0.027	587.000	0.000	NA		NA
1110085	1110086	Msp_0769	Msp_0770			FALSE	0.046	402.000	0.000	1.000		NA
1110087	1110088	Msp_0771	Msp_0772			FALSE	0.089	203.000	0.000	NA		NA
1110088	1110089	Msp_0772	Msp_0773			FALSE	0.229	72.000	0.000	NA		NA
1110089	1110090	Msp_0773	Msp_0774		mtaA3	FALSE	0.042	360.000	0.000	NA		NA
1110090	1110091	Msp_0774	Msp_0775	mtaA3		FALSE	0.026	627.000	0.000	NA		NA
1110091	1110092	Msp_0775	Msp_0776			FALSE	0.451	24.000	0.000	NA		NA
1110092	1110093	Msp_0776	Msp_0777			FALSE	0.142	348.000	0.000	0.013		NA
1110094	1110095	Msp_0778	Msp_0779			FALSE	0.217	77.000	0.000	NA		NA
1110095	1110096	Msp_0779	Msp_0780			FALSE	0.159	107.000	0.000	NA		NA
1110097	1110098	Msp_0781	Msp_0782	dtd		TRUE	0.528	14.000	0.000	NA		NA
1110098	1110099	Msp_0782	Msp_0783			TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1110099	1110100	Msp_0783	Msp_0784			FALSE	0.443	25.000	0.000	NA		NA
1110100	1110101	Msp_0784	Msp_0785			TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1110102	1110103	Msp_0786	Msp_0787		fprA	FALSE	0.162	105.000	0.000	NA		NA
1110103	1110104	Msp_0787	Msp_0788	fprA	rbo	TRUE	0.782	150.000	0.000	0.026	Y	NA
1110104	1110105	Msp_0788	Msp_0789	rbo		TRUE	0.969	44.000	0.017	0.052	Y	NA
1110105	1110106	Msp_0789	Msp_0790			FALSE	0.067	242.000	0.000	NA		NA
1110107	1110108	Msp_0791	Msp_0792			TRUE	0.679	-3.000	0.000	NA		NA
1110108	1110109	Msp_0792	Msp_0793			FALSE	0.057	285.000	0.000	NA		NA
1110109	1110110	Msp_0793	Msp_0794			TRUE	0.509	15.000	0.000	NA		NA
1110113	1110114	Msp_0797	Msp_0798			FALSE	0.326	78.000	0.000	NA	N	NA
1110114	1110115	Msp_0798	Msp_0799			TRUE	0.997	13.000	0.667	NA	Y	NA
1110117	1110118	Msp_0801	Msp_0802			FALSE	0.194	89.000	0.000	NA		NA
1110118	1110119	Msp_0802	Msp_0803			FALSE	0.063	255.000	0.000	NA		NA
1110119	1110120	Msp_0803	Msp_0804			TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1110120	1110121	Msp_0804	Msp_0805			FALSE	0.038	396.000	0.000	NA		NA
1110121	1110122	Msp_0805	Msp_0806			FALSE	0.443	25.000	0.000	NA		NA
1110122	1110123	Msp_0806	Msp_0807			TRUE	0.677	0.000	0.000	NA		NA
1110123	1110124	Msp_0807	Msp_0808			FALSE	0.042	361.000	0.000	NA		NA
1110124	1110125	Msp_0808	Msp_0809			TRUE	0.979	10.000	0.000	0.011	Y	NA
1110125	1110126	Msp_0809	Msp_0810			TRUE	0.961	11.000	0.000	1.000	Y	NA
1110126	1110127	Msp_0810	Msp_0811			TRUE	0.999	-10.000	1.000	0.011	Y	NA
1110127	1110128	Msp_0811	Msp_0812			TRUE	0.877	88.000	0.000	0.011	Y	NA
1110130	1110131	Msp_0814	Msp_0815	rrfC	rrlC	FALSE	0.035	418.000	0.000	NA		NA
1110131	1110132	Msp_0815	Msp_0816	rrlC		FALSE	0.029	531.000	0.000	NA		NA
1110132	1110133	Msp_0816	Msp_0817		rrsC	FALSE	0.171	102.000	0.000	NA		NA
1110133	1110134	Msp_0817	Msp_0818	rrsC	mtaC4	FALSE	0.024	711.000	0.000	NA		NA
1110134	1110135	Msp_0818	Msp_0819	mtaC4	mtaB4	TRUE	0.948	63.000	1.000	NA		NA
1110135	1110136	Msp_0819	Msp_0820	mtaB4		FALSE	0.028	541.000	0.000	NA		NA
1110139	1110140	Msp_0823	Msp_0824			TRUE	0.811	-7.000	0.000	1.000	N	NA
1110140	1110141	Msp_0824	Msp_0825			FALSE	0.030	511.000	0.000	NA		NA
1110141	1110142	Msp_0825	Msp_0826			TRUE	0.933	65.000	0.363	NA		NA
1110142	1110143	Msp_0826	Msp_0827			FALSE	0.162	105.000	0.000	NA		NA
1110143	1110144	Msp_0827	Msp_0828			FALSE	0.061	264.000	0.000	NA		NA
1110144	1110145	Msp_0828	Msp_0829			FALSE	0.031	474.000	0.000	NA		NA
1110145	1110146	Msp_0829	Msp_0830			FALSE	0.137	121.000	0.000	NA		NA
1110147	1110148	Msp_0831	Msp_0832			TRUE	0.528	14.000	0.000	NA		NA
1110148	1110149	Msp_0832	Msp_0833			TRUE	0.670	2.000	0.000	NA		NA
1110149	1110150	Msp_0833	Msp_0834			FALSE	0.205	83.000	0.000	NA		NA
1110151	1110152	Msp_0835	Msp_0836			FALSE	0.033	439.000	0.000	NA		NA
1110153	1110154	Msp_0837	Msp_0838			TRUE	0.923	-28.000	0.011	NA		NA
1110154	1110155	Msp_0838	Msp_0839			FALSE	0.026	602.000	0.000	NA		NA
1110155	1110156	Msp_0839	Msp_0840			FALSE	0.451	24.000	0.000	NA		NA
1110156	1110157	Msp_0840	Msp_0841			FALSE	0.295	51.000	0.000	NA		NA
1110157	1110158	Msp_0841	Msp_0842			FALSE	0.166	104.000	0.000	NA		NA
1110158	1110159	Msp_0842	Msp_0843			FALSE	0.046	349.000	0.000	NA		NA
1110160	1110161	Msp_0844	Msp_0845			FALSE	0.246	81.000	0.000	1.000		NA
1110161	1110162	Msp_0845	Msp_0846			FALSE	0.145	115.000	0.000	NA		NA
1110163	1110164	Msp_0847	Msp_0848			TRUE	0.983	4.000	0.000	0.011	Y	NA
1110164	1110165	Msp_0848	Msp_0849			TRUE	0.996	16.000	1.000	1.000	Y	NA
1110165	1110166	Msp_0849	Msp_0850			TRUE	0.984	-16.000	0.000	0.011	Y	NA
1110166	1110167	Msp_0850	Msp_0851			TRUE	0.650	266.000	0.000	0.011	Y	NA
1110167	1110168	Msp_0851	Msp_0852			FALSE	0.050	642.000	0.000	1.000	N	NA
1110168	1110169	Msp_0852	Msp_0853			FALSE	0.150	112.000	0.000	NA		NA
1110169	1110170	Msp_0853	Msp_0854		idsA	FALSE	0.186	92.000	0.000	NA		NA
1110170	1110171	Msp_0854	Msp_0855	idsA		TRUE	0.986	6.000	0.258	1.000		NA
1110171	1110172	Msp_0855	Msp_0856		fni	TRUE	0.712	2.000	0.000	1.000		NA
1110172	1110173	Msp_0856	Msp_0857	fni		FALSE	0.425	34.000	0.000	1.000		NA
1110173	1110174	Msp_0857	Msp_0858		mvk	TRUE	0.965	25.000	0.185	1.000		NA
1110176	1110177	Msp_0860	Msp_0861			FALSE	0.307	61.000	0.000	1.000		NA
1110177	1110178	Msp_0861	Msp_0862		eno	TRUE	0.594	13.000	0.000	1.000		NA
1110178	1110179	Msp_0862	Msp_0863	eno	rpoK	TRUE	0.829	127.000	0.100	1.000	N	NA
1110179	1110180	Msp_0863	Msp_0864	rpoK	rpoN	TRUE	0.955	157.000	0.064	0.004	Y	NA
1110180	1110181	Msp_0864	Msp_0865	rpoN	rps9p	TRUE	0.991	7.000	0.536	1.000	N	NA
1110181	1110182	Msp_0865	Msp_0866	rps9p	rpl13p	TRUE	0.997	24.000	0.515	0.036	Y	NA
1110182	1110183	Msp_0866	Msp_0867	rpl13p	rpl18e	TRUE	0.997	10.000	0.075	0.003	Y	NA
1110183	1110184	Msp_0867	Msp_0868	rpl18e	rpoD	TRUE	0.962	6.000	0.031	1.000	N	NA
1110184	1110185	Msp_0868	Msp_0869	rpoD	rps11p	TRUE	0.948	22.000	0.058	1.000	N	NA
1110185	1110186	Msp_0869	Msp_0870	rps11p		TRUE	0.988	42.000	0.073	0.036	Y	NA
1110186	1110187	Msp_0870	Msp_0871		rps13p	TRUE	0.991	72.000	0.512	0.019	Y	NA
1110187	1110188	Msp_0871	Msp_0872	rps13p		FALSE	0.052	300.000	0.000	NA		NA
1110188	1110189	Msp_0872	Msp_0873		truB	FALSE	0.040	378.000	0.000	NA		NA
1110191	1110192	Msp_0875	Msp_0876			FALSE	0.026	634.000	0.000	NA		NA
1110192	1110193	Msp_0876	Msp_0877			TRUE	0.509	15.000	0.000	NA		NA
1110193	1110194	Msp_0877	Msp_0878		nudC	FALSE	0.027	579.000	0.000	NA		NA
1110196	1110197	Msp_0880	Msp_0881	rpl14e	cmk	TRUE	0.903	15.000	0.025	NA		NA
1110197	1110198	Msp_0881	Msp_0882	cmk	rpl34e	TRUE	0.974	-3.000	0.042	1.000	N	NA
1110198	1110199	Msp_0882	Msp_0883	rpl34e		TRUE	0.873	81.000	0.092	1.000		NA
1110199	1110200	Msp_0883	Msp_0884		adkA	TRUE	0.972	24.000	0.329	1.000		NA
1110200	1110201	Msp_0884	Msp_0885	adkA	secY	TRUE	0.899	110.000	0.288	1.000	N	NA
1110201	1110202	Msp_0885	Msp_0886	secY	rpl15p	TRUE	0.958	43.000	0.261	1.000	N	NA
1110202	1110203	Msp_0886	Msp_0887	rpl15p		TRUE	0.997	18.000	0.471	0.036	Y	NA
1110203	1110204	Msp_0887	Msp_0888			TRUE	0.997	17.000	0.475	0.036	Y	NA
1110204	1110205	Msp_0888	Msp_0889		rpl18p	TRUE	0.997	-3.000	0.072	0.036	Y	NA
1110205	1110206	Msp_0889	Msp_0890	rpl18p	rpl19e	TRUE	0.997	4.000	0.079	0.029	Y	NA
1110206	1110207	Msp_0890	Msp_0891	rpl19e	rpl32e	TRUE	0.990	81.000	0.529	0.029	Y	NA
1110207	1110208	Msp_0891	Msp_0892	rpl32e		TRUE	0.996	26.000	0.465	0.029	Y	NA
1110208	1110209	Msp_0892	Msp_0893			TRUE	0.993	16.000	0.068	0.029	Y	NA
1110209	1110210	Msp_0893	Msp_0894		rps14p	TRUE	0.985	17.000	0.473	0.029		NA
1110210	1110211	Msp_0894	Msp_0895	rps14p		TRUE	0.989	12.000	0.496	0.029		NA
1110211	1110212	Msp_0895	Msp_0896			TRUE	0.997	3.000	0.073	0.029	Y	NA
1110212	1110213	Msp_0896	Msp_0897		rpl24p	TRUE	0.999	3.000	0.478	0.036	Y	NA
1110213	1110214	Msp_0897	Msp_0898	rpl24p	rpl14p	TRUE	0.998	10.000	0.472	0.036	Y	NA
1110214	1110215	Msp_0898	Msp_0899	rpl14p	rps17p	TRUE	0.999	6.000	0.506	0.029	Y	NA
1110215	1110216	Msp_0899	Msp_0900	rps17p	rnp1	TRUE	0.998	5.000	0.468	1.000	Y	NA
1110216	1110217	Msp_0900	Msp_0901	rnp1		TRUE	0.961	95.000	0.070	1.000	Y	NA
1110217	1110218	Msp_0901	Msp_0902		rpl29p	TRUE	0.990	8.000	0.023	1.000	Y	NA
1110218	1110219	Msp_0902	Msp_0903	rpl29p		TRUE	0.995	13.000	0.074	0.036	Y	NA
1110219	1110220	Msp_0903	Msp_0904		rpl22p	TRUE	0.997	7.000	0.074	0.036	Y	NA
1110220	1110221	Msp_0904	Msp_0905	rpl22p	rps19p	TRUE	0.989	19.000	0.029	0.036	Y	NA
1110221	1110222	Msp_0905	Msp_0906	rps19p		TRUE	0.985	15.000	0.014	0.036	Y	NA
1110222	1110223	Msp_0906	Msp_0907		rpl23p	TRUE	0.997	27.000	0.849	0.029	Y	NA
1110223	1110224	Msp_0907	Msp_0908	rpl23p		TRUE	0.997	6.000	0.075	0.029	Y	NA
1110224	1110225	Msp_0908	Msp_0909			TRUE	0.997	19.000	0.885	0.029	Y	NA
1110225	1110226	Msp_0909	Msp_0910			TRUE	0.930	68.000	0.359	NA		NA
1110226	1110227	Msp_0910	Msp_0911			FALSE	0.027	583.000	0.000	NA		NA
1110227	1110228	Msp_0911	Msp_0912			FALSE	0.145	374.000	0.000	0.004		NA
1110228	1110229	Msp_0912	Msp_0913			FALSE	0.049	376.000	0.000	1.000		NA
1110229	1110230	Msp_0913	Msp_0914		pycA	FALSE	0.034	551.000	0.000	1.000		NA
1110232	1110233	Msp_0916	Msp_0917			FALSE	0.074	225.000	0.000	NA		NA
1110235	1110236	Msp_0919	Msp_0920			FALSE	0.135	231.000	0.000	1.000	N	NA
1110236	1110237	Msp_0920	Msp_0921			FALSE	0.202	159.000	0.000	1.000	N	NA
1110237	1110238	Msp_0921	Msp_0922			FALSE	0.145	115.000	0.000	NA		NA
1110239	1110240	Msp_0923	Msp_0924	gltX		TRUE	0.916	14.000	0.018	1.000	N	NA
1110241	1110242	Msp_0925	Msp_0926			FALSE	0.045	352.000	0.000	NA		NA
1110243	1110244	Msp_0927	Msp_0928			TRUE	0.612	10.000	0.000	NA		NA
1110245	1110246	Msp_0929	Msp_0930			TRUE	0.851	22.000	0.015	NA		NA
1110246	1110247	Msp_0930	Msp_0931			FALSE	0.120	141.000	0.000	NA		NA
1110249	1110250	Msp_0933	Msp_0934			TRUE	0.660	4.000	0.000	NA		NA
1110250	1110251	Msp_0934	Msp_0935			FALSE	0.258	63.000	0.000	NA		NA
1110251	1110252	Msp_0935	Msp_0936			FALSE	0.186	92.000	0.000	NA		NA
1110252	1110253	Msp_0936	Msp_0937			FALSE	0.047	337.000	0.000	NA		NA
1110253	1110254	Msp_0937	Msp_0938			FALSE	0.479	19.000	0.000	NA		NA
1110254	1110255	Msp_0938	Msp_0939			FALSE	0.103	180.000	0.000	NA		NA
1110256	1110257	Msp_0940	Msp_0941			TRUE	0.974	5.000	0.074	NA		NA
1110257	1110258	Msp_0941	Msp_0942			TRUE	0.983	10.000	0.259	NA		NA
1110258	1110259	Msp_0942	Msp_0943			TRUE	0.981	-18.000	0.097	NA		NA
1110259	1110260	Msp_0943	Msp_0944			TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1110260	1110261	Msp_0944	Msp_0945			TRUE	0.971	2.000	0.000	NA	Y	NA
1110261	1110262	Msp_0945	Msp_0946			TRUE	0.997	-19.000	0.136	NA	Y	NA
1110262	1110263	Msp_0946	Msp_0947			TRUE	0.997	3.000	0.224	NA	Y	NA
11491270	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	124.000	0.000	NA		NA
11633633	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	124.000	0.000	NA		NA
11776025	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	124.000	0.000	NA		NA
1110264	1110265	Msp_0948	Msp_0949			FALSE	0.479	19.000	0.000	NA		NA
11491271	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	154.000	0.000	NA		NA
11633634	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	154.000	0.000	NA		NA
11776026	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	154.000	0.000	NA		NA
11491272	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	191.000	0.000	NA		NA
11633635	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	191.000	0.000	NA		NA
11776027	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	191.000	0.000	NA		NA
11491273	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	221.000	0.000	NA		NA
11633636	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	221.000	0.000	NA		NA
11776028	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	221.000	0.000	NA		NA
11491274	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	257.000	0.000	NA		NA
11633637	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	257.000	0.000	NA		NA
11776029	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	257.000	0.000	NA		NA
11491275	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	287.000	0.000	NA		NA
11633638	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	287.000	0.000	NA		NA
11776030	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	287.000	0.000	NA		NA
1110265	1110266	Msp_0949	Msp_0950			FALSE	0.094	193.000	0.000	NA		NA
11491276	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	323.000	0.000	NA		NA
11633639	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	323.000	0.000	NA		NA
11776031	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	323.000	0.000	NA		NA
11491277	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	353.000	0.000	NA		NA
11633640	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	353.000	0.000	NA		NA
11776032	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	353.000	0.000	NA		NA
11491278	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	390.000	0.000	NA		NA
11633641	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	390.000	0.000	NA		NA
11776033	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	390.000	0.000	NA		NA
11491279	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	420.000	0.000	NA		NA
11633642	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	420.000	0.000	NA		NA
11776034	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	420.000	0.000	NA		NA
11491280	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	456.000	0.000	NA		NA
11633643	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	456.000	0.000	NA		NA
11776035	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	456.000	0.000	NA		NA
11491281	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	486.000	0.000	NA		NA
11633644	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	486.000	0.000	NA		NA
11776036	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	486.000	0.000	NA		NA
11491282	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	523.000	0.000	NA		NA
11633645	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	523.000	0.000	NA		NA
11776037	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	523.000	0.000	NA		NA
11491283	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	553.000	0.000	NA		NA
11633646	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	553.000	0.000	NA		NA
11776038	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	553.000	0.000	NA		NA
11491284	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	589.000	0.000	NA		NA
11633647	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	589.000	0.000	NA		NA
11776039	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	589.000	0.000	NA		NA
11491285	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	619.000	0.000	NA		NA
11633648	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	619.000	0.000	NA		NA
11776040	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	619.000	0.000	NA		NA
1110266	1110267	Msp_0950	Msp_0951			FALSE	0.090	200.000	0.000	NA		NA
11491286	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	656.000	0.000	NA		NA
11633649	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	656.000	0.000	NA		NA
11776041	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	656.000	0.000	NA		NA
11491287	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	686.000	0.000	NA		NA
11633650	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	686.000	0.000	NA		NA
11776042	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	686.000	0.000	NA		NA
11491288	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	722.000	0.000	NA		NA
11633651	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	722.000	0.000	NA		NA
11776043	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	722.000	0.000	NA		NA
11491289	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	752.000	0.000	NA		NA
11633652	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	752.000	0.000	NA		NA
11776044	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	752.000	0.000	NA		NA
11491290	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	789.000	0.000	NA		NA
11633653	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	789.000	0.000	NA		NA
11776045	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	789.000	0.000	NA		NA
11491291	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	819.000	0.000	NA		NA
11633654	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	819.000	0.000	NA		NA
11776046	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	819.000	0.000	NA		NA
11491292	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	855.000	0.000	NA		NA
11633655	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	855.000	0.000	NA		NA
11776047	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	855.000	0.000	NA		NA
11491293	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	885.000	0.000	NA		NA
11633656	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	885.000	0.000	NA		NA
11776048	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	885.000	0.000	NA		NA
11491294	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	922.000	0.000	NA		NA
11633657	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	922.000	0.000	NA		NA
11776049	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	922.000	0.000	NA		NA
11491295	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	952.000	0.000	NA		NA
11633658	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	952.000	0.000	NA		NA
11776050	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	952.000	0.000	NA		NA
11491296	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	988.000	0.000	NA		NA
11633659	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	988.000	0.000	NA		NA
11776051	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	988.000	0.000	NA		NA
11491297	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1018.000	0.000	NA		NA
11633660	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1018.000	0.000	NA		NA
11776052	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1018.000	0.000	NA		NA
11491298	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1054.000	0.000	NA		NA
11633661	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1054.000	0.000	NA		NA
11776053	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1054.000	0.000	NA		NA
11491299	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1084.000	0.000	NA		NA
11633662	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1084.000	0.000	NA		NA
11776054	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1084.000	0.000	NA		NA
1110267	1110268	Msp_0951	Msp_0952			FALSE	0.027	572.000	0.000	NA		NA
11491300	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1122.000	0.000	NA		NA
11633663	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1122.000	0.000	NA		NA
11776055	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1122.000	0.000	NA		NA
11491301	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1152.000	0.000	NA		NA
11633664	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1152.000	0.000	NA		NA
11776056	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1152.000	0.000	NA		NA
11491302	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1188.000	0.000	NA		NA
11633665	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1188.000	0.000	NA		NA
11776057	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1188.000	0.000	NA		NA
11491303	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1218.000	0.000	NA		NA
11633666	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1218.000	0.000	NA		NA
11776058	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1218.000	0.000	NA		NA
11491304	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1254.000	0.000	NA		NA
11633667	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1254.000	0.000	NA		NA
11776059	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1254.000	0.000	NA		NA
11491305	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1284.000	0.000	NA		NA
11633668	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1284.000	0.000	NA		NA
11776060	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1284.000	0.000	NA		NA
11491306	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1321.000	0.000	NA		NA
11633669	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1321.000	0.000	NA		NA
11776061	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1321.000	0.000	NA		NA
11491307	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1351.000	0.000	NA		NA
11633670	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1351.000	0.000	NA		NA
11776062	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1351.000	0.000	NA		NA
11491308	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1387.000	0.000	NA		NA
11633671	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1387.000	0.000	NA		NA
11776063	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1387.000	0.000	NA		NA
11491309	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1417.000	0.000	NA		NA
11633672	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1417.000	0.000	NA		NA
11776064	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1417.000	0.000	NA		NA
11491310	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1454.000	0.000	NA		NA
11633673	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1454.000	0.000	NA		NA
11776065	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1454.000	0.000	NA		NA
11491311	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1484.000	0.000	NA		NA
11633674	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1484.000	0.000	NA		NA
11776066	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1484.000	0.000	NA		NA
11491312	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1519.000	0.000	NA		NA
11633675	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1519.000	0.000	NA		NA
11776067	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1519.000	0.000	NA		NA
11491313	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1549.000	0.000	NA		NA
11633676	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1549.000	0.000	NA		NA
11776068	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1549.000	0.000	NA		NA
11491314	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1585.000	0.000	NA		NA
11633677	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1585.000	0.000	NA		NA
11776069	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1585.000	0.000	NA		NA
11491315	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1615.000	0.000	NA		NA
11633678	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1615.000	0.000	NA		NA
11776070	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1615.000	0.000	NA		NA
11491316	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1652.000	0.000	NA		NA
11633679	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1652.000	0.000	NA		NA
11776071	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1652.000	0.000	NA		NA
11491317	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1682.000	0.000	NA		NA
11633680	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1682.000	0.000	NA		NA
11776072	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1682.000	0.000	NA		NA
11491318	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1718.000	0.000	NA		NA
11633681	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1718.000	0.000	NA		NA
11776073	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1718.000	0.000	NA		NA
11491319	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1748.000	0.000	NA		NA
11633682	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1748.000	0.000	NA		NA
11776074	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1748.000	0.000	NA		NA
11491320	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1785.000	0.000	NA		NA
11633683	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1785.000	0.000	NA		NA
11776075	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1785.000	0.000	NA		NA
11491321	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1815.000	0.000	NA		NA
11633684	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1815.000	0.000	NA		NA
11776076	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1815.000	0.000	NA		NA
1110268	1110269	Msp_0952	Msp_0953			TRUE	0.672	-19.000	0.000	NA		NA
11491322	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1852.000	0.000	NA		NA
11633685	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1852.000	0.000	NA		NA
11776077	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1852.000	0.000	NA		NA
11491323	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1882.000	0.000	NA		NA
11633686	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1882.000	0.000	NA		NA
11776078	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1882.000	0.000	NA		NA
11491324	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1918.000	0.000	NA		NA
11633687	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1918.000	0.000	NA		NA
11776079	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1918.000	0.000	NA		NA
11491325	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1948.000	0.000	NA		NA
11633688	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1948.000	0.000	NA		NA
11776080	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1948.000	0.000	NA		NA
11491326	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1985.000	0.000	NA		NA
11633689	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1985.000	0.000	NA		NA
11776081	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	1985.000	0.000	NA		NA
11491327	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2015.000	0.000	NA		NA
11633690	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2015.000	0.000	NA		NA
11776082	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2015.000	0.000	NA		NA
11491328	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2050.000	0.000	NA		NA
11633691	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2050.000	0.000	NA		NA
11776083	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2050.000	0.000	NA		NA
11491329	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2080.000	0.000	NA		NA
11633692	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2080.000	0.000	NA		NA
11776084	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2080.000	0.000	NA		NA
11491330	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2116.000	0.000	NA		NA
11633693	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2116.000	0.000	NA		NA
11776085	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2116.000	0.000	NA		NA
11491331	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2146.000	0.000	NA		NA
11633694	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2146.000	0.000	NA		NA
11776086	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2146.000	0.000	NA		NA
1110269	1110270	Msp_0953	Msp_0954			FALSE	0.023	757.000	0.000	NA		NA
11491332	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2183.000	0.000	NA		NA
11633695	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2183.000	0.000	NA		NA
11776087	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2183.000	0.000	NA		NA
11491333	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2213.000	0.000	NA		NA
11633696	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2213.000	0.000	NA		NA
11776088	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2213.000	0.000	NA		NA
11491334	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2249.000	0.000	NA		NA
11633697	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2249.000	0.000	NA		NA
11776089	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2249.000	0.000	NA		NA
11491335	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2279.000	0.000	NA		NA
11633698	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2279.000	0.000	NA		NA
11776090	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2279.000	0.000	NA		NA
11491336	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2315.000	0.000	NA		NA
11633699	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2315.000	0.000	NA		NA
11776091	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2315.000	0.000	NA		NA
11491337	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2345.000	0.000	NA		NA
11633700	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2345.000	0.000	NA		NA
11776092	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2345.000	0.000	NA		NA
11491338	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2382.000	0.000	NA		NA
11633701	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2382.000	0.000	NA		NA
11776093	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2382.000	0.000	NA		NA
11491339	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2412.000	0.000	NA		NA
11633702	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2412.000	0.000	NA		NA
11776094	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2412.000	0.000	NA		NA
11491340	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2448.000	0.000	NA		NA
11633703	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2448.000	0.000	NA		NA
11776095	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2448.000	0.000	NA		NA
11491341	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2478.000	0.000	NA		NA
11633704	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2478.000	0.000	NA		NA
11776096	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2478.000	0.000	NA		NA
11491342	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2516.000	0.000	NA		NA
11633705	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2516.000	0.000	NA		NA
11776097	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2516.000	0.000	NA		NA
11491343	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2546.000	0.000	NA		NA
11633706	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2546.000	0.000	NA		NA
11776098	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2546.000	0.000	NA		NA
11491344	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2581.000	0.000	NA		NA
11633707	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2581.000	0.000	NA		NA
11776099	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2581.000	0.000	NA		NA
11491345	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2611.000	0.000	NA		NA
11633708	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2611.000	0.000	NA		NA
11776100	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2611.000	0.000	NA		NA
11491346	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2648.000	0.000	NA		NA
11633709	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2648.000	0.000	NA		NA
11776101	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2648.000	0.000	NA		NA
11491347	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2678.000	0.000	NA		NA
11633710	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2678.000	0.000	NA		NA
11776102	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2678.000	0.000	NA		NA
11491348	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2715.000	0.000	NA		NA
11633711	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2715.000	0.000	NA		NA
11776103	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2715.000	0.000	NA		NA
11491349	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2745.000	0.000	NA		NA
11633712	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2745.000	0.000	NA		NA
11776104	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2745.000	0.000	NA		NA
11491350	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2782.000	0.000	NA		NA
11633713	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2782.000	0.000	NA		NA
11776105	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2782.000	0.000	NA		NA
11491351	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2812.000	0.000	NA		NA
11633714	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2812.000	0.000	NA		NA
11776106	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2812.000	0.000	NA		NA
11491352	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2848.000	0.000	NA		NA
11633715	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2848.000	0.000	NA		NA
11776107	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2848.000	0.000	NA		NA
11491353	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2878.000	0.000	NA		NA
11633716	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2878.000	0.000	NA		NA
11776108	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2878.000	0.000	NA		NA
11491354	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2916.000	0.000	NA		NA
11633717	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2916.000	0.000	NA		NA
11776109	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2916.000	0.000	NA		NA
11491355	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2946.000	0.000	NA		NA
11633718	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2946.000	0.000	NA		NA
11776110	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2946.000	0.000	NA		NA
11491356	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2984.000	0.000	NA		NA
11633719	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2984.000	0.000	NA		NA
11776111	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	2984.000	0.000	NA		NA
11491357	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3014.000	0.000	NA		NA
11633720	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3014.000	0.000	NA		NA
11776112	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3014.000	0.000	NA		NA
11491358	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3050.000	0.000	NA		NA
11633721	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3050.000	0.000	NA		NA
11776113	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3050.000	0.000	NA		NA
11491359	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3080.000	0.000	NA		NA
11633722	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3080.000	0.000	NA		NA
11776114	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3080.000	0.000	NA		NA
11491360	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3116.000	0.000	NA		NA
11633723	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3116.000	0.000	NA		NA
11776115	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3116.000	0.000	NA		NA
11491361	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3146.000	0.000	NA		NA
11633724	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3146.000	0.000	NA		NA
11776116	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3146.000	0.000	NA		NA
1110270	1110271	Msp_0954	Msp_0955			TRUE	0.669	-94.000	0.000	NA		NA
11491362	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3182.000	0.000	NA		NA
11633725	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3182.000	0.000	NA		NA
11776117	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3182.000	0.000	NA		NA
11491363	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3212.000	0.000	NA		NA
11633726	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3212.000	0.000	NA		NA
11776118	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3212.000	0.000	NA		NA
11491364	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3248.000	0.000	NA		NA
11633727	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3248.000	0.000	NA		NA
11776119	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3248.000	0.000	NA		NA
11491365	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3278.000	0.000	NA		NA
11633728	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3278.000	0.000	NA		NA
11776120	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3278.000	0.000	NA		NA
11491366	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3315.000	0.000	NA		NA
11633729	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3315.000	0.000	NA		NA
11776121	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3315.000	0.000	NA		NA
11491367	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3345.000	0.000	NA		NA
11633730	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3345.000	0.000	NA		NA
11776122	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3345.000	0.000	NA		NA
11491368	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3381.000	0.000	NA		NA
11633731	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3381.000	0.000	NA		NA
11776123	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3381.000	0.000	NA		NA
11491369	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3411.000	0.000	NA		NA
11633732	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3411.000	0.000	NA		NA
11776124	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3411.000	0.000	NA		NA
11491370	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3447.000	0.000	NA		NA
11633733	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3447.000	0.000	NA		NA
11776125	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3447.000	0.000	NA		NA
11491371	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3477.000	0.000	NA		NA
11633734	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3477.000	0.000	NA		NA
11776126	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3477.000	0.000	NA		NA
11491372	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3514.000	0.000	NA		NA
11633735	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3514.000	0.000	NA		NA
11776127	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3514.000	0.000	NA		NA
11491373	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3544.000	0.000	NA		NA
11633736	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3544.000	0.000	NA		NA
11776128	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3544.000	0.000	NA		NA
11491374	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3580.000	0.000	NA		NA
11633737	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3580.000	0.000	NA		NA
11776129	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3580.000	0.000	NA		NA
11491375	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3610.000	0.000	NA		NA
11633738	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3610.000	0.000	NA		NA
11776130	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3610.000	0.000	NA		NA
11491376	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3647.000	0.000	NA		NA
11633739	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3647.000	0.000	NA		NA
11776131	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3647.000	0.000	NA		NA
11491377	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3677.000	0.000	NA		NA
11633740	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3677.000	0.000	NA		NA
11776132	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3677.000	0.000	NA		NA
11491378	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3713.000	0.000	NA		NA
11633741	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3713.000	0.000	NA		NA
11776133	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3713.000	0.000	NA		NA
11491379	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3743.000	0.000	NA		NA
11633742	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3743.000	0.000	NA		NA
11776134	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3743.000	0.000	NA		NA
11491380	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3780.000	0.000	NA		NA
11633743	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3780.000	0.000	NA		NA
11776135	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3780.000	0.000	NA		NA
11491381	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3810.000	0.000	NA		NA
11633744	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3810.000	0.000	NA		NA
11776136	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3810.000	0.000	NA		NA
11491382	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3847.000	0.000	NA		NA
11633745	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3847.000	0.000	NA		NA
11776137	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	3847.000	0.000	NA		NA
1110272	1110273	Msp_0956	Msp_0957			TRUE	0.679	-3.000	0.000	NA		NA
11491383	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4722.000	0.000	NA		NA
11633746	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4722.000	0.000	NA		NA
11776138	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4722.000	0.000	NA		NA
11491384	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4744.000	0.000	NA		NA
11633747	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4744.000	0.000	NA		NA
11776139	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4744.000	0.000	NA		NA
11491385	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4789.000	0.000	NA		NA
11633748	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4789.000	0.000	NA		NA
11776140	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4789.000	0.000	NA		NA
11491386	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4811.000	0.000	NA		NA
11633749	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4811.000	0.000	NA		NA
11776141	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4811.000	0.000	NA		NA
11491387	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4855.000	0.000	NA		NA
11633750	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4855.000	0.000	NA		NA
11776142	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4855.000	0.000	NA		NA
11491388	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4877.000	0.000	NA		NA
11633751	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4877.000	0.000	NA		NA
11776143	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4877.000	0.000	NA		NA
11491389	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4921.000	0.000	NA		NA
11633752	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4921.000	0.000	NA		NA
11776144	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4921.000	0.000	NA		NA
11491390	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4943.000	0.000	NA		NA
11633753	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4943.000	0.000	NA		NA
11776145	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4943.000	0.000	NA		NA
11491391	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4986.000	0.000	NA		NA
11633754	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4986.000	0.000	NA		NA
11776146	1110263		Msp_0947			FALSE	NA	4986.000	0.000	NA		NA
1110274	1110275	Msp_0958	Msp_0959			TRUE	0.997	11.000	0.364	1.000	Y	NA
1110275	1110276	Msp_0959	Msp_0960			TRUE	0.997	16.000	0.461	0.009	Y	NA
1110276	1110277	Msp_0960	Msp_0961			FALSE	0.048	332.000	0.000	NA		NA
1110277	1110278	Msp_0961	Msp_0962			FALSE	0.113	153.000	0.000	NA		NA
1110278	1110279	Msp_0962	Msp_0963			FALSE	0.020	1115.000	0.000	NA		NA
1110280	1110281	Msp_0964	Msp_0965			FALSE	0.022	883.000	0.000	NA		NA
1110282	1110283	Msp_0966	Msp_0967		adh	FALSE	0.213	144.000	0.000	1.000	N	NA
1110283	1110284	Msp_0967	Msp_0968	adh		FALSE	0.034	430.000	0.000	NA		NA
1110286	1110287	Msp_0970	Msp_0971			FALSE	0.106	173.000	0.000	NA		NA
1110287	1110288	Msp_0971	Msp_0972			FALSE	0.139	118.000	0.000	NA		NA
1110289	1110290	Msp_0973	Msp_0974	comB2		TRUE	0.647	15.000	0.000	NA	N	NA
1110290	1110291	Msp_0974	Msp_0975			FALSE	0.451	24.000	0.000	NA		NA
1110292	1110293	Msp_0976	Msp_0977			FALSE	0.153	127.000	0.000	1.000		NA
1110293	1110294	Msp_0977	Msp_0978			FALSE	0.050	366.000	0.000	1.000		NA
1110294	1110295	Msp_0978	Msp_0979			FALSE	0.339	40.000	0.000	NA		NA
1110296	1110297	Msp_0980	Msp_0981			FALSE	0.135	151.000	0.000	1.000		NA
1110299	1110300	Msp_0983	Msp_0984			FALSE	0.050	322.000	0.000	NA		NA
1110302	1110303	Msp_0986	Msp_0987	purA		FALSE	0.041	366.000	0.000	NA		NA
1110304	1110305	Msp_0988	Msp_0989	cbiF		FALSE	0.260	104.000	0.000	NA	N	NA
1110306	1110307	Msp_0990	Msp_0991			TRUE	0.930	27.000	0.000	1.000	Y	NA
1110310	1110311	Msp_0994	Msp_0995		rpiA	TRUE	0.509	15.000	0.000	NA		NA
1110311	1110312	Msp_0995	Msp_0996	rpiA		TRUE	0.848	13.000	0.006	NA		NA
1110312	1110313	Msp_0996	Msp_0997		egsA	TRUE	0.967	22.000	0.194	NA		NA
1110314	1110315	Msp_0998	Msp_0999	aqpM1		FALSE	0.049	325.000	0.000	NA		NA
1110316	1110317	Msp_1000	Msp_1001			TRUE	0.996	6.000	0.081	1.000	Y	NA
1110318	1110319	Msp_1002	Msp_1003	iscS		TRUE	0.908	15.000	0.018	1.000	N	NA
1110321	1110322	Msp_1005	Msp_1006			FALSE	0.222	74.000	0.000	NA		NA
1110322	1110323	Msp_1006	Msp_1007		thiD	TRUE	0.671	-22.000	0.000	NA		NA
1110324	1110325	Msp_1008	Msp_1009			TRUE	0.952	12.000	0.026	0.031		NA
1110325	1110326	Msp_1009	Msp_1010			TRUE	0.912	11.000	0.017	1.000		NA
1110326	1110327	Msp_1010	Msp_1011			TRUE	0.612	178.000	0.043	NA		NA
1110327	1110328	Msp_1011	Msp_1012			TRUE	0.991	-10.000	0.800	NA		NA
1110328	1110329	Msp_1012	Msp_1013		hdrB1	FALSE	0.065	248.000	0.000	NA		NA
1110329	1110330	Msp_1013	Msp_1014	hdrB1	hdrC1	TRUE	0.997	32.000	0.667	0.003	Y	NA
1110332	1110333	Msp_1016	Msp_1017		dphB	FALSE	0.141	117.000	0.000	NA		NA
1110333	1110334	Msp_1017	Msp_1018	dphB	rrfD	FALSE	0.068	240.000	0.000	NA		NA
1110334	1110335	Msp_1018	Msp_1019	rrfD	rrlD	FALSE	0.035	420.000	0.000	NA		NA
1110335	1110336	Msp_1019	Msp_1020	rrlD		FALSE	0.028	534.000	0.000	NA		NA
1110336	1110337	Msp_1020	Msp_1021		rrsD	FALSE	0.174	101.000	0.000	NA		NA
1110339	1110340	Msp_1023	Msp_1024			FALSE	0.483	101.000	0.004	1.000		NA
1110340	1110341	Msp_1024	Msp_1025			TRUE	0.951	30.000	0.121	NA		NA
1110341	1110342	Msp_1025	Msp_1026			TRUE	0.975	19.000	0.420	NA		NA
1110342	1110343	Msp_1026	Msp_1027			TRUE	0.989	-7.000	0.420	NA		NA
1110343	1110344	Msp_1027	Msp_1028			FALSE	0.401	30.000	0.000	NA		NA
1110344	1110345	Msp_1028	Msp_1029			TRUE	0.674	1.000	0.000	NA		NA
1110345	1110346	Msp_1029	Msp_1030			TRUE	0.925	83.000	0.559	NA		NA
1110348	1110349	Msp_1032	Msp_1033			TRUE	0.889	87.000	0.152	1.000		NA
1110349	1110350	Msp_1033	Msp_1034			TRUE	0.928	13.000	0.031	NA		NA
1110351	1110352	Msp_1035	Msp_1036		pyrE	TRUE	0.887	13.000	0.016	NA		NA
1110352	1110353	Msp_1036	Msp_1037	pyrE		FALSE	0.124	134.000	0.000	NA		NA
1110355	1110356	Msp_1039	Msp_1040			FALSE	0.185	151.000	0.000	NA	N	NA
1110356	1110357	Msp_1040	Msp_1041			TRUE	0.958	13.000	0.034	0.031		NA
1110358	1110359	Msp_1042	Msp_1043	iorB	iorA	TRUE	0.996	7.000	0.050	0.001	Y	NA
1110361	1110362	Msp_1045	Msp_1046			FALSE	0.147	114.000	0.000	NA		NA
1110363	1110364	Msp_1047	Msp_1048		dcd	TRUE	0.939	4.000	0.010	1.000	N	NA
1110364	1110365	Msp_1048	Msp_1049	dcd	glyS	TRUE	0.938	0.000	0.008	1.000	N	NA
1110365	1110366	Msp_1049	Msp_1050	glyS		TRUE	0.586	11.000	0.000	NA		NA
1110366	1110367	Msp_1050	Msp_1051			FALSE	0.295	51.000	0.000	NA		NA
1110368	1110369	Msp_1052	Msp_1053			TRUE	0.678	-7.000	0.000	NA		NA
1110369	1110370	Msp_1053	Msp_1054			FALSE	0.028	536.000	0.000	NA		NA
1110370	1110371	Msp_1054	Msp_1055			FALSE	0.120	141.000	0.000	NA		NA
1110371	1110372	Msp_1055	Msp_1056			TRUE	0.652	5.000	0.000	NA		NA
1110373	1110374	Msp_1057	Msp_1058	sfsA		TRUE	0.679	-3.000	0.000	NA		NA
1110374	1110375	Msp_1058	Msp_1059			FALSE	0.118	142.000	0.000	NA		NA
1110375	1110376	Msp_1059	Msp_1060			TRUE	0.721	-3.000	0.000	1.000		NA
1110376	1110377	Msp_1060	Msp_1061			FALSE	0.368	44.000	0.000	1.000		NA
1110377	1110378	Msp_1061	Msp_1062			TRUE	0.796	11.000	0.000	0.041		NA
1110378	1110379	Msp_1062	Msp_1063			TRUE	0.547	35.000	0.000	1.000	N	NA
1110379	1110380	Msp_1063	Msp_1064			TRUE	0.881	54.000	0.069	NA		NA
1110380	1110381	Msp_1064	Msp_1065			FALSE	0.111	158.000	0.000	NA		NA
1110382	1110383	Msp_1066	Msp_1067			FALSE	0.137	212.000	0.000	NA	N	NA
1110386	1110387	Msp_1070	Msp_1071	trpE	trpG	TRUE	0.997	0.000	0.063	0.001	Y	NA
1110387	1110388	Msp_1071	Msp_1072	trpG	trpC	TRUE	0.986	7.000	0.008	1.000	Y	NA
1110388	1110389	Msp_1072	Msp_1073	trpC	trpF	TRUE	0.997	17.000	0.264	0.002	Y	NA
1110389	1110390	Msp_1073	Msp_1074	trpF	trpB	TRUE	0.992	11.000	0.019	0.002	Y	NA
1110390	1110391	Msp_1074	Msp_1075	trpB	trpA	TRUE	0.999	-3.000	0.947	0.001	Y	NA
1110391	1110392	Msp_1075	Msp_1076	trpA	trpD	TRUE	0.982	6.000	0.002	1.000	Y	NA
1110392	1110393	Msp_1076	Msp_1077	trpD		FALSE	0.235	125.000	0.000	1.000	N	NA
1110394	1110395	Msp_1078	Msp_1079			FALSE	0.048	327.000	0.000	NA		NA
1110395	1110396	Msp_1079	Msp_1080			FALSE	0.118	142.000	0.000	NA		NA
1110396	1110397	Msp_1080	Msp_1081			TRUE	0.648	100.000	0.024	NA		NA
1110398	1110399	Msp_1082	Msp_1083			FALSE	0.129	127.000	0.000	NA		NA
1110399	1110400	Msp_1083	Msp_1084		cdcH	FALSE	0.129	402.000	0.000	0.061	N	NA
1110400	1110401	Msp_1084	Msp_1085	cdcH	ahcY	FALSE	0.384	173.000	0.003	1.000	N	NA
1110402	1110403	Msp_1086	Msp_1087	fen		TRUE	0.528	14.000	0.000	NA		NA
1110403	1110404	Msp_1087	Msp_1088		exoB	TRUE	0.660	4.000	0.000	NA		NA
1110407	1110408	Msp_1091	Msp_1092			FALSE	0.021	1074.000	0.000	NA		NA
1110408	1110409	Msp_1092	Msp_1093			TRUE	0.955	29.000	0.153	NA		NA
1110409	1110410	Msp_1093	Msp_1094		mre11	TRUE	0.972	15.000	0.207	NA		NA
1110410	1110411	Msp_1094	Msp_1095	mre11	rad50	TRUE	0.999	-13.000	0.331	0.002	Y	NA
1110412	1110413	Msp_1096	Msp_1097		tbp	TRUE	0.628	218.000	0.071	1.000		NA
1110414	1110415	Msp_1098	Msp_1099		leuA2	FALSE	0.307	486.000	0.031	1.000	N	NA
1110415	1110416	Msp_1099	Msp_1100	leuA2	leuC2	TRUE	0.995	10.000	0.093	1.000	Y	NA
1110417	1110418	Msp_1101	Msp_1102			TRUE	0.976	11.000	0.000	0.018	Y	NA
1110421	1110422	Msp_1105	Msp_1106			TRUE	0.959	29.000	0.207	NA		NA
1110422	1110423	Msp_1106	Msp_1107			TRUE	0.677	0.000	0.000	NA		NA
1110423	1110424	Msp_1107	Msp_1108			FALSE	0.022	823.000	0.000	NA		NA
1110424	1110425	Msp_1108	Msp_1109			FALSE	0.064	249.000	0.000	NA		NA
1110425	1110426	Msp_1109	Msp_1110		cobN	FALSE	0.070	233.000	0.000	NA		NA
1110427	1110428	Msp_1111	Msp_1112		cbiO2	TRUE	0.963	-12.000	0.039	NA		NA
1110428	1110429	Msp_1112	Msp_1113	cbiO2		TRUE	0.991	-12.000	0.673	1.000		NA
1110429	1110430	Msp_1113	Msp_1114			FALSE	0.100	307.000	0.000	1.000	N	NA
1110430	1110431	Msp_1114	Msp_1115			FALSE	0.024	704.000	0.000	NA		NA
1110432	1110433	Msp_1116	Msp_1117			FALSE	0.021	976.000	0.000	NA		NA
1110436	1110437	Msp_1120	Msp_1121	nifH		TRUE	0.956	4.000	0.022	1.000	N	NA
1110437	1110438	Msp_1121	Msp_1122		purF	TRUE	0.882	52.000	0.045	1.000	N	NA
1110438	1110439	Msp_1122	Msp_1123	purF		FALSE	0.129	165.000	0.000	1.000		NA
1110443	1110444	Msp_1127	Msp_1128		mer	TRUE	0.594	13.000	0.000	1.000		NA
1110444	1110445	Msp_1128	Msp_1129	mer		FALSE	0.083	210.000	0.000	NA		NA
1110446	1110447	Msp_1130	Msp_1131			FALSE	0.177	100.000	0.000	NA		NA
1110448	1110449	Msp_1132	Msp_1133		ahaD	FALSE	0.100	210.000	0.000	1.000		NA
1110449	1110450	Msp_1133	Msp_1134	ahaD	ahaB	TRUE	0.991	56.000	0.119	0.002	Y	NA
1110450	1110451	Msp_1134	Msp_1135	ahaB	ahaA	TRUE	0.999	-3.000	0.632	0.002	Y	NA
1110451	1110452	Msp_1135	Msp_1136	ahaA	ahaF	TRUE	0.999	-3.000	0.437	0.004	Y	NA
1110452	1110453	Msp_1136	Msp_1137	ahaF	ahaC	TRUE	0.999	-3.000	0.462	0.004	Y	NA
1110453	1110454	Msp_1137	Msp_1138	ahaC	ahaE	TRUE	0.997	19.000	0.236	0.004	Y	NA
1110454	1110455	Msp_1138	Msp_1139	ahaE	ahaK	TRUE	0.970	59.000	0.489	0.002		NA
1110455	1110456	Msp_1139	Msp_1140	ahaK	ahaI	TRUE	0.964	74.000	0.848	0.004		NA
1110456	1110457	Msp_1140	Msp_1141	ahaI	ahaH	TRUE	0.961	11.000	0.025	0.004		NA
1110457	1110458	Msp_1141	Msp_1142	ahaH		FALSE	0.041	431.000	0.000	1.000		NA
1110462	1110463	Msp_1146	Msp_1147			TRUE	0.854	48.000	0.044	NA		NA
1110463	1110464	Msp_1147	Msp_1148			TRUE	0.811	72.000	0.050	NA		NA
1110464	1110465	Msp_1148	Msp_1149			TRUE	0.957	24.000	0.109	NA		NA
1110467	1110468	Msp_1151	Msp_1152			TRUE	0.625	9.000	0.000	NA		NA
1110468	1110469	Msp_1152	Msp_1153		pepQ	TRUE	0.570	77.000	0.005	1.000		NA
1110470	1110471	Msp_1154	Msp_1155			FALSE	0.273	214.000	0.004	NA		NA
1110471	1110472	Msp_1155	Msp_1156		pth	TRUE	0.586	11.000	0.000	NA		NA
1110472	1110473	Msp_1156	Msp_1157	pth		TRUE	0.855	11.000	0.003	1.000		NA
1110473	1110474	Msp_1157	Msp_1158			TRUE	0.948	2.000	0.023	1.000		NA
1110474	1110475	Msp_1158	Msp_1159			TRUE	0.993	40.000	0.511	1.000	Y	NA
1110475	1110476	Msp_1159	Msp_1160			TRUE	0.570	117.000	0.022	NA		NA
1110478	1110479	Msp_1162	Msp_1163			TRUE	0.721	-3.000	0.000	1.000		NA
1110481	1110482	Msp_1165	Msp_1166			FALSE	0.165	118.000	0.000	1.000		NA
1110483	1110484	Msp_1167	Msp_1168		cobS	TRUE	0.841	19.000	0.008	1.000		NA
1110484	1110485	Msp_1168	Msp_1169	cobS		TRUE	0.811	14.000	0.003	NA		NA
1110486	1110487	Msp_1170	Msp_1171			TRUE	0.910	1.000	0.007	NA		NA
1110487	1110488	Msp_1171	Msp_1172			TRUE	0.612	10.000	0.000	NA		NA
1110489	1110490	Msp_1173	Msp_1174	pycB	rpl37e	FALSE	0.084	358.000	0.000	1.000	N	NA
1110490	1110491	Msp_1174	Msp_1175	rpl37e		TRUE	0.820	221.000	0.439	1.000	N	NA
1110492	1110493	Msp_1176	Msp_1177			TRUE	0.939	15.000	0.053	NA		NA
1110495	1110496	Msp_1179	Msp_1180	cbiC	hemL	TRUE	0.984	16.000	0.028	1.000	Y	NA
1110496	1110497	Msp_1180	Msp_1181	hemL		TRUE	0.620	129.000	0.030	1.000		NA
1110497	1110498	Msp_1181	Msp_1182		uppS	TRUE	0.927	71.000	0.107	0.030		NA
1110498	1110499	Msp_1182	Msp_1183	uppS		TRUE	0.939	22.000	0.048	NA	N	NA
1110499	1110500	Msp_1183	Msp_1184			TRUE	0.545	13.000	0.000	NA		NA
1110500	1110501	Msp_1184	Msp_1185			TRUE	0.680	7.000	0.000	1.000		NA
1110504	1110505	Msp_1188	Msp_1189		recJ	TRUE	0.668	184.000	0.046	1.000	N	NA
1110505	1110506	Msp_1189	Msp_1190	recJ	srp19	TRUE	0.881	48.000	0.041	1.000	N	NA
1110506	1110507	Msp_1190	Msp_1191	srp19	hemD	TRUE	0.925	15.000	0.025	1.000	N	NA
1110507	1110508	Msp_1191	Msp_1192	hemD	cobA	TRUE	0.993	0.000	0.028	1.000	Y	NA
1110508	1110509	Msp_1192	Msp_1193	cobA	purQ	TRUE	0.497	131.000	0.007	1.000	N	NA
1110509	1110510	Msp_1193	Msp_1194	purQ		TRUE	0.999	3.000	0.656	0.001	Y	NA
1110510	1110511	Msp_1194	Msp_1195		purC	TRUE	0.991	46.000	0.460	1.000	Y	NA
1110512	1110513	Msp_1196	Msp_1197	glmS		FALSE	0.395	31.000	0.000	NA		NA
1110513	1110514	Msp_1197	Msp_1198			FALSE	0.169	103.000	0.000	NA		NA
1110515	1110516	Msp_1199	Msp_1200		carB	TRUE	0.810	89.000	0.000	1.000	Y	NA
1110516	1110517	Msp_1200	Msp_1201	carB	carA	TRUE	0.995	45.000	0.356	0.001	Y	NA
1110517	1110518	Msp_1201	Msp_1202	carA		FALSE	0.306	419.000	0.034	1.000		NA
1110519	1110520	Msp_1203	Msp_1204			TRUE	0.964	9.000	0.060	NA		NA
1110520	1110521	Msp_1204	Msp_1205		cbiJ	FALSE	0.287	324.000	0.010	1.000	N	NA
1110524	1110525	Msp_1208	Msp_1209			TRUE	0.801	84.000	0.059	NA		NA
1110525	1110526	Msp_1209	Msp_1210			TRUE	0.990	0.000	0.500	NA		NA
1110526	1110527	Msp_1210	Msp_1211			FALSE	0.067	242.000	0.000	NA		NA
1110527	1110528	Msp_1211	Msp_1212			TRUE	0.999	-13.000	0.500	0.002	Y	NA
1110528	1110529	Msp_1212	Msp_1213			TRUE	0.781	188.000	0.000	0.002	Y	NA
1110529	1110530	Msp_1213	Msp_1214			TRUE	0.970	21.000	0.005	1.000	Y	NA
1110530	1110531	Msp_1214	Msp_1215			FALSE	0.311	228.000	0.004	1.000	N	NA
1110531	1110532	Msp_1215	Msp_1216			TRUE	0.939	12.000	0.034	1.000		NA
1110532	1110533	Msp_1216	Msp_1217			FALSE	0.422	143.000	0.007	1.000		NA
1110533	1110534	Msp_1217	Msp_1218			FALSE	0.157	416.000	0.006	1.000		NA
1110535	1110536	Msp_1219	Msp_1220			FALSE	0.148	113.000	0.000	NA		NA
1110536	1110537	Msp_1220	Msp_1221			TRUE	0.586	11.000	0.000	NA		NA
1110537	1110538	Msp_1221	Msp_1222			FALSE	0.266	61.000	0.000	NA		NA
1110538	1110539	Msp_1222	Msp_1223		trkA2	FALSE	0.113	153.000	0.000	NA		NA
1110539	1110540	Msp_1223	Msp_1224	trkA2		FALSE	0.451	24.000	0.000	NA		NA
1110540	1110541	Msp_1224	Msp_1225			FALSE	0.430	27.000	0.000	NA		NA
1110543	1110544	Msp_1227	Msp_1228			FALSE	0.188	284.000	0.000	0.060	N	NA
1110546	1110547	Msp_1230	Msp_1231	hypA	hypB	TRUE	0.992	-7.000	0.162	0.002		NA
1110547	1110548	Msp_1231	Msp_1232	hypB		TRUE	0.787	63.000	0.031	NA		NA
1110550	1110551	Msp_1234	Msp_1235			FALSE	0.198	86.000	0.000	NA		NA
1110551	1110552	Msp_1235	Msp_1236		metE	FALSE	0.244	121.000	0.000	1.000	N	NA
1110552	1110553	Msp_1236	Msp_1237	metE	thyA	TRUE	0.798	4.000	0.000	1.000	N	NA
1110553	1110554	Msp_1237	Msp_1238	thyA	mch	TRUE	0.684	135.000	0.035	1.000	N	NA
1110554	1110555	Msp_1238	Msp_1239	mch	ribC	TRUE	0.930	27.000	0.000	1.000	Y	NA
1110555	1110556	Msp_1239	Msp_1240	ribC	aqpM2	FALSE	0.071	412.000	0.000	1.000	N	NA
1110556	1110557	Msp_1240	Msp_1241	aqpM2		FALSE	0.031	469.000	0.000	NA		NA
1110559	1110560	Msp_1243	Msp_1244	rpl15e		TRUE	0.997	1.000	0.114	NA	Y	NA
1110560	1110561	Msp_1244	Msp_1245		rnp3	TRUE	0.968	61.000	0.052	NA	Y	NA
1110561	1110562	Msp_1245	Msp_1246	rnp3	rnp2	TRUE	0.994	29.000	0.096	0.002	Y	NA
1110562	1110563	Msp_1246	Msp_1247	rnp2	purB	FALSE	0.168	200.000	0.000	1.000	N	NA
1110563	1110564	Msp_1247	Msp_1248	purB	psmA	FALSE	0.086	353.000	0.000	1.000	N	NA
1110564	1110565	Msp_1248	Msp_1249	psmA		TRUE	0.764	245.000	0.274	NA	N	NA
1110565	1110566	Msp_1249	Msp_1250			TRUE	0.996	15.000	0.335	NA	Y	NA
1110566	1110567	Msp_1250	Msp_1251			TRUE	0.998	10.000	0.266	0.015	Y	NA
1110567	1110568	Msp_1251	Msp_1252			TRUE	0.998	0.000	0.143	0.001	Y	NA
1110568	1110569	Msp_1252	Msp_1253			TRUE	0.913	312.000	0.222	1.000	Y	NA
1110569	10706997	Msp_1253	Msp_1688			TRUE	0.956	3.000	0.029	1.000		NA
10706997	1110570	Msp_1688	Msp_1254			TRUE	0.901	97.000	0.308	1.000		NA
1110570	1110571	Msp_1254	Msp_1255			TRUE	0.943	17.000	0.068	NA		NA
1110571	1110572	Msp_1255	Msp_1256			TRUE	0.878	101.000	0.216	NA		NA
1110572	1110573	Msp_1256	Msp_1257			FALSE	0.046	401.000	0.000	1.000		NA
1110573	1110574	Msp_1257	Msp_1258			TRUE	0.670	-55.000	0.000	NA		NA
1110575	1110576	Msp_1259	Msp_1260			FALSE	0.186	92.000	0.000	NA		NA
1110576	1110577	Msp_1260	Msp_1261			FALSE	0.227	89.000	0.000	1.000		NA
1110577	1110578	Msp_1261	Msp_1262		alaS	FALSE	0.362	257.000	0.021	1.000		NA
1110578	1110579	Msp_1262	Msp_1263	alaS	rpl12p	TRUE	0.576	297.000	0.084	1.000		NA
1110579	1110580	Msp_1263	Msp_1264	rpl12p	rpl10p	TRUE	0.881	139.000	0.758	1.000		NA
1110580	1110581	Msp_1264	Msp_1265	rpl10p		TRUE	0.996	1.000	0.076	1.000	Y	NA
1110581	1110582	Msp_1265	Msp_1266		rpl11p	TRUE	0.981	166.000	0.838	0.023	Y	NA
1110582	1110583	Msp_1266	Msp_1267	rpl11p		TRUE	0.971	0.000	0.038	1.000	N	NA
1110583	1110584	Msp_1267	Msp_1268			TRUE	0.901	124.000	0.506	1.000	N	NA
1110584	1110585	Msp_1268	Msp_1269		ftsZ	TRUE	0.737	294.000	0.272	1.000	N	NA
1110586	1110587	Msp_1270	Msp_1271	comA		FALSE	0.315	45.000	0.000	NA		NA
1110587	1110588	Msp_1271	Msp_1272			FALSE	0.326	271.000	0.020	NA		NA
1110588	1110589	Msp_1272	Msp_1273			TRUE	0.889	74.000	0.105	1.000		NA
1110589	1110590	Msp_1273	Msp_1274			TRUE	0.674	1.000	0.000	NA		NA
1110590	1110591	Msp_1274	Msp_1275			TRUE	0.926	5.000	0.017	NA		NA
1110592	1110593	Msp_1276	Msp_1277		serS	FALSE	0.133	157.000	0.000	1.000		NA
1110593	1110594	Msp_1277	Msp_1278	serS		FALSE	0.383	33.000	0.000	NA		NA
1110594	1110595	Msp_1278	Msp_1279		hypE1	TRUE	0.906	9.000	0.011	NA		NA
1110596	1110597	Msp_1280	Msp_1281	rps8e		TRUE	0.942	-3.000	0.018	1.000		NA
1110598	1110599	Msp_1282	Msp_1283			FALSE	0.135	122.000	0.000	NA		NA
1110599	1110600	Msp_1283	Msp_1284			FALSE	0.047	343.000	0.000	NA		NA
1110600	1110601	Msp_1284	Msp_1285			TRUE	0.528	14.000	0.000	NA		NA
1110602	1110603	Msp_1286	Msp_1287			FALSE	0.207	82.000	0.000	NA		NA
1110603	1110604	Msp_1287	Msp_1288			FALSE	0.053	297.000	0.000	NA		NA
1110604	1110605	Msp_1288	Msp_1289			TRUE	0.913	101.000	0.667	NA		NA
1110606	1110607	Msp_1290	Msp_1291		pcrB	FALSE	0.053	297.000	0.000	NA		NA
1110607	1110608	Msp_1291	Msp_1292	pcrB	rpl40e	TRUE	0.731	176.000	0.086	NA		NA
1110608	1110609	Msp_1292	Msp_1293	rpl40e		TRUE	0.982	2.000	0.109	NA		NA
1110610	1110611	Msp_1294	Msp_1295			FALSE	0.045	352.000	0.000	NA		NA
1110611	1110612	Msp_1295	Msp_1296			FALSE	0.077	218.000	0.000	NA		NA
1110612	1110613	Msp_1296	Msp_1297		rps3Ae	FALSE	0.032	462.000	0.000	NA		NA
1110613	1110614	Msp_1297	Msp_1298	rps3Ae		TRUE	0.575	105.000	0.018	NA		NA
1110614	1110615	Msp_1298	Msp_1299		apgM2	TRUE	0.964	5.000	0.048	NA		NA
1110615	1110616	Msp_1299	Msp_1300	apgM2		TRUE	0.882	236.000	0.063	1.000	Y	NA
1110616	1110617	Msp_1300	Msp_1301			TRUE	0.793	146.000	0.083	1.000	N	NA
1110617	1110618	Msp_1301	Msp_1302		frhA	FALSE	0.061	484.000	0.000	1.000	N	NA
1110618	1110619	Msp_1302	Msp_1303	frhA	frhD	TRUE	0.998	15.000	0.357	0.002	Y	NA
1110619	1110620	Msp_1303	Msp_1304	frhD	frhG	TRUE	0.994	47.000	0.357	0.002	Y	NA
1110620	1110621	Msp_1304	Msp_1305	frhG	frhB	TRUE	0.998	15.000	0.833	0.002	Y	NA
1110623	1110624	Msp_1307	Msp_1308		ade	FALSE	0.060	487.000	0.000	1.000	N	NA
1110625	1110626	Msp_1309	Msp_1310			TRUE	0.545	13.000	0.000	NA		NA
1110627	1110628	Msp_1311	Msp_1312			TRUE	0.984	31.000	0.019	0.001	Y	NA
1110628	1110629	Msp_1312	Msp_1313			FALSE	0.169	116.000	0.000	1.000		NA
1110631	1110632	Msp_1315	Msp_1316			TRUE	0.528	14.000	0.000	NA		NA
1110633	1110634	Msp_1317	Msp_1318			TRUE	0.958	5.000	0.037	NA		NA
1110634	1110635	Msp_1318	Msp_1319			TRUE	0.763	10.000	0.000	1.000	N	NA
1110635	1110636	Msp_1319	Msp_1320			TRUE	0.808	-15.000	0.000	1.000	N	NA
1110636	1110637	Msp_1320	Msp_1321			FALSE	0.191	90.000	0.000	NA		NA
1110639	1110640	Msp_1323	Msp_1324			TRUE	0.935	6.000	0.010	1.000	N	NA
1110641	1110642	Msp_1325	Msp_1326		hisC	TRUE	0.887	13.000	0.012	1.000		NA
1110644	1110645	Msp_1328	Msp_1329	lon	suhB	FALSE	0.228	130.000	0.000	1.000	N	NA
1110645	1110646	Msp_1329	Msp_1330	suhB	ppnK	TRUE	0.989	14.000	0.039	1.000	Y	NA
1110646	1110647	Msp_1330	Msp_1331	ppnK		TRUE	0.918	30.000	0.039	1.000	N	NA
1110647	1110648	Msp_1331	Msp_1332		hemC	FALSE	0.273	239.000	0.002	1.000	N	NA
1110648	1110649	Msp_1332	Msp_1333	hemC		TRUE	0.907	-3.000	0.004	1.000		NA
1110649	1110650	Msp_1333	Msp_1334			TRUE	0.907	11.000	0.015	1.000		NA
1110650	1110651	Msp_1334	Msp_1335			FALSE	0.143	220.000	0.000	1.000	N	NA
1110651	1110652	Msp_1335	Msp_1336			FALSE	0.449	55.000	0.000	1.000	N	NA
1110652	1110653	Msp_1336	Msp_1337			FALSE	0.465	48.000	0.000	1.000	N	NA
1110653	1110654	Msp_1337	Msp_1338			TRUE	0.687	345.000	0.387	1.000		NA
1110654	1110655	Msp_1338	Msp_1339			TRUE	0.514	366.000	0.086	1.000		NA
1110655	1110656	Msp_1339	Msp_1340			TRUE	0.997	17.000	0.328	0.001	Y	NA
1110656	1110657	Msp_1340	Msp_1341			FALSE	0.350	39.000	0.000	NA		NA
1110657	1110658	Msp_1341	Msp_1342			FALSE	0.468	22.000	0.000	NA		NA
1110659	1110660	Msp_1343	Msp_1344			TRUE	0.696	5.000	0.000	1.000		NA
1110661	1110662	Msp_1345	Msp_1346		gap	FALSE	0.083	211.000	0.000	NA		NA
1110662	1110663	Msp_1346	Msp_1347	gap		FALSE	0.120	182.000	0.000	1.000		NA
1110663	1110664	Msp_1347	Msp_1348			FALSE	0.088	226.000	0.000	1.000		NA
1110665	1110666	Msp_1349	Msp_1350			TRUE	0.671	9.000	0.000	1.000		NA
1110668	1110669	Msp_1352	Msp_1353			FALSE	0.061	263.000	0.000	NA		NA
1110671	1110672	Msp_1355	Msp_1356			TRUE	0.895	110.000	0.016	1.000	Y	NA
1110673	1110674	Msp_1357	Msp_1358			TRUE	0.750	67.000	0.026	NA		NA
1110674	1110675	Msp_1358	Msp_1359			FALSE	0.056	456.000	0.000	NA	N	NA
1110675	1110676	Msp_1359	Msp_1360		tfb	TRUE	0.497	789.000	0.188	1.000	N	NA
1110677	1110678	Msp_1361	Msp_1362		pyrH	FALSE	0.476	20.000	0.000	NA		NA
1110680	1110681	Msp_1364	Msp_1365		rps10p	FALSE	0.202	84.000	0.000	NA		NA
1110681	1110682	Msp_1365	Msp_1366	rps10p	tuf	TRUE	0.959	175.000	0.249	1.000	Y	NA
1110682	1110683	Msp_1366	Msp_1367	tuf	fusA	TRUE	0.915	380.000	0.095	0.001	Y	NA
1110683	1110684	Msp_1367	Msp_1368	fusA		TRUE	0.954	187.000	0.211	1.000	Y	NA
1110684	1110685	Msp_1368	Msp_1369		rps12p	TRUE	0.996	29.000	0.410	0.004	Y	NA
1110685	1110686	Msp_1369	Msp_1370	rps12p	nusA	TRUE	0.576	259.000	0.057	1.000	N	NA
1110686	1110687	Msp_1370	Msp_1371	nusA	rpl30e	TRUE	0.975	9.000	0.068	1.000	N	NA
1110687	1110688	Msp_1371	Msp_1372	rpl30e	rpoA2	TRUE	0.913	11.000	0.017	1.000		NA
1110688	1110689	Msp_1372	Msp_1373	rpoA2	rpoA1	TRUE	0.982	16.000	0.172	0.005		NA
1110689	1110690	Msp_1373	Msp_1374	rpoA1	rpoB1	TRUE	0.951	29.000	0.054	0.005		NA
1110690	1110691	Msp_1374	Msp_1375	rpoB1	rpoB2	TRUE	0.979	30.000	0.294	0.005		NA
1110691	1110692	Msp_1375	Msp_1376	rpoB2	rpoH	TRUE	0.523	1039.000	0.125	0.005		NA
1110692	1110693	Msp_1376	Msp_1377	rpoH		FALSE	0.092	195.000	0.000	NA		NA
1110693	1110694	Msp_1377	Msp_1378			FALSE	0.481	18.000	0.000	NA		NA
1110694	1110695	Msp_1378	Msp_1379			FALSE	0.123	135.000	0.000	NA		NA
1110695	10706998	Msp_1379	MSP_0			TRUE	0.612	10.000	0.000	NA		NA
10706998	1110696	MSP_0	Msp_1380			TRUE	0.509	15.000	0.000	NA		NA
1110696	1110697	Msp_1380	Msp_1381		pgk	FALSE	0.109	164.000	0.000	NA		NA
1110697	1110698	Msp_1381	Msp_1382	pgk	tpiA	TRUE	0.951	35.000	0.004	1.000	Y	NA
1110699	1110700	Msp_1383	Msp_1384			TRUE	0.809	36.000	0.019	NA		NA
1110700	1110701	Msp_1384	Msp_1385			FALSE	0.106	173.000	0.000	NA		NA
1110702	1110703	Msp_1386	Msp_1387	sucC	korC	TRUE	0.995	11.000	0.111	1.000	Y	NA
1110703	1110704	Msp_1387	Msp_1388	korC	korB	TRUE	0.999	3.000	0.548	0.002	Y	NA
1110704	1110705	Msp_1388	Msp_1389	korB	korA	TRUE	0.999	5.000	0.520	0.002	Y	NA
1110705	1110706	Msp_1389	Msp_1390	korA	korD	TRUE	0.985	2.000	0.000	0.002	Y	NA
1110708	1110709	Msp_1392	Msp_1393			FALSE	0.401	30.000	0.000	NA		NA
1110709	1110710	Msp_1393	Msp_1394			TRUE	0.744	62.000	0.022	NA		NA
1110711	1110712	Msp_1395	Msp_1396	rnhB		TRUE	0.578	151.000	0.020	1.000	N	NA
1110712	1110713	Msp_1396	Msp_1397			TRUE	0.970	28.000	0.102	0.012		NA
1110713	1110714	Msp_1397	Msp_1398		purO	FALSE	0.303	62.000	0.000	1.000		NA
1110714	1110715	Msp_1398	Msp_1399	purO		FALSE	0.028	773.000	0.000	1.000		NA
1110717	1110718	Msp_1401	Msp_1402		cofE	FALSE	0.067	243.000	0.000	NA		NA
1110718	1110719	Msp_1402	Msp_1403	cofE	cofD	TRUE	0.949	8.000	0.032	NA		NA
1110719	1110720	Msp_1403	Msp_1404	cofD	gch3	TRUE	0.843	77.000	0.073	NA		NA
1110720	1110721	Msp_1404	Msp_1405	gch3		TRUE	0.764	85.000	0.037	1.000		NA
1110721	1110722	Msp_1405	Msp_1406			FALSE	0.219	121.000	0.000	NA	N	NA
1110722	1110723	Msp_1406	Msp_1407			TRUE	0.937	58.000	0.179	NA	N	NA
1110723	1110724	Msp_1407	Msp_1408		hemA	TRUE	0.880	156.000	0.024	1.000	Y	NA
1110726	1110727	Msp_1410	Msp_1411		gatD	FALSE	0.060	490.000	0.000	1.000	N	NA
1110727	1110728	Msp_1411	Msp_1412	gatD	gatE	TRUE	0.997	16.000	0.301	0.002	Y	NA
1110728	1110729	Msp_1412	Msp_1413	gatE		TRUE	0.610	129.000	0.020	1.000	N	NA
1110729	1110730	Msp_1413	Msp_1414			TRUE	0.586	11.000	0.000	NA		NA
1110730	1110731	Msp_1414	Msp_1415			FALSE	0.422	28.000	0.000	NA		NA
1110731	1110732	Msp_1415	Msp_1416		gdhA	FALSE	0.040	440.000	0.000	1.000		NA
1110735	1110736	Msp_1419	Msp_1420		pyrK	FALSE	0.049	379.000	0.000	1.000		NA
1110736	1110737	Msp_1420	Msp_1421	pyrK	pyrD	TRUE	0.980	12.000	0.124	1.000	N	NA
1110738	1110739	Msp_1422	Msp_1423		flpA	TRUE	0.996	15.000	0.720	NA	Y	NA
1110740	1110741	Msp_1424	Msp_1425			TRUE	0.529	19.000	0.000	1.000		NA
1110741	1110742	Msp_1425	Msp_1426			FALSE	0.443	25.000	0.000	NA		NA
1110742	1110743	Msp_1426	Msp_1427		pheA	FALSE	0.315	45.000	0.000	NA		NA
1110743	1110744	Msp_1427	Msp_1428	pheA		FALSE	0.213	144.000	0.000	1.000	N	NA
1110744	1110745	Msp_1428	Msp_1429			FALSE	0.338	121.000	0.000	0.028		NA
1110745	1110746	Msp_1429	Msp_1430			TRUE	0.614	42.000	0.000	0.028		NA
1110746	1110747	Msp_1430	Msp_1431			FALSE	0.434	317.000	0.034	NA	N	NA
1110747	1110748	Msp_1431	Msp_1432			TRUE	0.661	155.000	0.039	NA	N	NA
1110748	1110749	Msp_1432	Msp_1433			TRUE	0.924	14.000	0.031	NA		NA
1110751	1110752	Msp_1435	Msp_1436		ehbQ	FALSE	0.057	284.000	0.000	NA		NA
1110752	1110753	Msp_1436	Msp_1437	ehbQ		FALSE	0.023	793.000	0.000	NA		NA
1110753	1110754	Msp_1437	Msp_1438			FALSE	0.118	142.000	0.000	NA		NA
1110754	1110755	Msp_1438	Msp_1440		feoB	FALSE	0.100	183.000	0.000	NA		NA
1110755	1110756	Msp_1440	Msp_1441	feoB	feoA	TRUE	0.923	150.000	0.055	1.000	Y	NA
1110756	1110757	Msp_1441	Msp_1442	feoA	ehbP	FALSE	0.042	362.000	0.000	NA		NA
1110757	1110758	Msp_1442	Msp_1443	ehbP	ehbO	TRUE	0.970	20.000	0.235	NA		NA
1110758	1110759	Msp_1443	Msp_1444	ehbO	ehbN	TRUE	0.997	12.000	0.235	0.038	Y	NA
1110759	1110760	Msp_1444	Msp_1445	ehbN	ehbM	TRUE	0.994	18.000	0.176	1.000	Y	NA
1110760	1110761	Msp_1445	Msp_1446	ehbM	ehbL	TRUE	0.995	11.000	0.101	1.000	Y	NA
1110761	1110762	Msp_1446	Msp_1447	ehbL	ehbK	TRUE	0.984	-3.000	0.000	0.019	Y	NA
1110762	1110763	Msp_1447	Msp_1448	ehbK	ehbJ	TRUE	0.492	16.000	0.000	NA		NA
1110763	1110764	Msp_1448	Msp_1449	ehbJ	ehbI	TRUE	0.562	12.000	0.000	NA		NA
1110764	1110765	Msp_1449	Msp_1450	ehbI	ehbH	TRUE	0.972	-7.000	0.061	NA		NA
1110765	1110766	Msp_1450	Msp_1451	ehbH	ehbG	TRUE	0.987	1.000	0.250	NA		NA
1110766	1110767	Msp_1451	Msp_1452	ehbG	ehbF	TRUE	0.972	13.000	0.123	NA		NA
1110767	1110768	Msp_1452	Msp_1453	ehbF	ehbE	TRUE	0.995	34.000	0.263	0.002	Y	NA
1110768	1110769	Msp_1453	Msp_1454	ehbE	ehbD	TRUE	0.997	0.000	0.118	NA	Y	NA
1110769	1110770	Msp_1454	Msp_1455	ehbD	ehbC	TRUE	0.986	2.000	0.211	NA		NA
1110770	1110771	Msp_1455	Msp_1456	ehbC	ehbB	TRUE	0.719	0.000	0.000	1.000		NA
1110771	1110772	Msp_1456	Msp_1457	ehbB	ehbA	TRUE	0.984	16.000	0.263	0.017		NA
1110772	1110773	Msp_1457	Msp_1458	ehbA		TRUE	0.552	146.000	0.026	NA		NA
1110775	1110776	Msp_1460	Msp_1461			FALSE	0.386	98.000	0.000	0.038		NA
1110776	1110777	Msp_1461	Msp_1462			TRUE	0.895	-3.000	0.000	0.038	N	NA
1110777	1110778	Msp_1462	Msp_1463			TRUE	0.742	11.000	0.000	1.000	N	NA
1110778	1110779	Msp_1463	Msp_1464		cbiE	TRUE	0.769	185.000	0.088	1.000	N	NA
1110779	1110780	Msp_1464	Msp_1465	cbiE		FALSE	0.124	178.000	0.000	1.000		NA
1110780	1110781	Msp_1465	Msp_1466			FALSE	0.098	213.000	0.000	1.000		NA
1110781	1110782	Msp_1466	Msp_1467		purL	TRUE	0.652	19.000	0.000	1.000	N	NA
1110782	1110783	Msp_1467	Msp_1468	purL	ileS	TRUE	0.908	26.000	0.009	0.028	N	NA
1110786	1110787	Msp_1471	Msp_1472			FALSE	0.361	37.000	0.000	NA		NA
1110787	1110788	Msp_1472	Msp_1473			TRUE	0.696	5.000	0.000	1.000		NA
1110789	1110790	Msp_1474	Msp_1475		glyA	FALSE	0.266	72.000	0.000	1.000		NA
1110790	1110791	Msp_1475	Msp_1476	glyA	hdrA1	FALSE	0.046	715.000	0.000	1.000	N	NA
1110791	1110792	Msp_1476	Msp_1477	hdrA1		FALSE	0.102	207.000	0.000	1.000		NA
1110792	1110793	Msp_1477	Msp_1478			FALSE	0.095	216.000	0.000	1.000		NA
1110793	1110794	Msp_1478	Msp_1479			FALSE	0.238	112.000	0.000	NA	N	NA
1110794	1110795	Msp_1479	Msp_1480		purE	TRUE	0.826	25.000	0.005	NA	N	NA
1110797	1110798	Msp_1481	Msp_1482			TRUE	0.735	176.000	0.088	NA		NA
1110798	1110799	Msp_1482	Msp_1483		ribH	TRUE	0.568	68.000	0.004	NA		NA
1110799	1110800	Msp_1483	Msp_1484	ribH	leuB	FALSE	0.095	324.000	0.000	1.000	N	NA
1110800	1110801	Msp_1484	Msp_1485	leuB	leuD1	TRUE	0.997	14.000	0.176	0.002	Y	NA
1110801	1110802	Msp_1485	Msp_1486	leuD1	leuC1	TRUE	0.996	19.000	0.132	0.002	Y	NA
1110803	1110804	Msp_1487	Msp_1488		radA	TRUE	0.985	29.000	0.059	1.000	Y	NA
1110804	1110805	Msp_1488	Msp_1489	radA		FALSE	0.063	464.000	0.000	1.000	N	NA
1110805	1110806	Msp_1489	Msp_1490			FALSE	0.067	242.000	0.000	NA		NA
1110808	1110809	Msp_1492	Msp_1493			FALSE	0.125	132.000	0.000	NA		NA
1110810	1110811	Msp_1494	Msp_1495			TRUE	0.983	14.000	0.857	NA		NA
1110817	1110818	Msp_1501	Msp_1502		ftr1	TRUE	0.624	17.000	0.000	NA	N	NA
1110818	1110819	Msp_1502	Msp_1503	ftr1		TRUE	0.900	63.000	0.103	NA		NA
1110821	1110822	Msp_1505	Msp_1506			TRUE	0.594	13.000	0.000	1.000		NA
1110823	1110824	Msp_1507	Msp_1508	pol		FALSE	0.207	82.000	0.000	NA		NA
1110824	1110825	Msp_1508	Msp_1509			FALSE	0.029	532.000	0.000	NA		NA
1110825	1110826	Msp_1509	Msp_1510		hisH	FALSE	0.374	226.000	0.009	1.000	N	NA
1110826	1110827	Msp_1510	Msp_1511	hisH	hypE2	TRUE	0.751	115.000	0.043	1.000	N	NA
1110827	1110828	Msp_1511	Msp_1512	hypE2		TRUE	0.678	-7.000	0.000	NA		NA
1110829	10706999	Msp_1513	MSP_t0			FALSE	0.308	46.000	0.000	NA		NA
10706999	1110830	MSP_t0	Msp_1514			FALSE	0.135	122.000	0.000	NA		NA
1110830	1110831	Msp_1514	Msp_1515			FALSE	0.186	92.000	0.000	NA		NA
1110831	1110832	Msp_1515	Msp_1516		dnaJ	FALSE	0.152	111.000	0.000	NA		NA
1110832	1110833	Msp_1516	Msp_1517	dnaJ	dnaK	TRUE	0.956	251.000	0.196	0.003	Y	NA
1110833	1110834	Msp_1517	Msp_1518	dnaK	grpE	TRUE	0.991	65.000	0.224	0.004	Y	NA
1110835	1110836	Msp_1519	Msp_1520			FALSE	0.233	71.000	0.000	NA		NA
1110837	1110838	Msp_1521	Msp_1522			FALSE	0.277	57.000	0.000	NA		NA
1110838	1110839	Msp_1522	Msp_1523			FALSE	0.111	158.000	0.000	NA		NA
1110839	1110840	Msp_1523	Msp_1524			TRUE	0.953	32.000	0.176	NA		NA
1110840	1110841	Msp_1524	Msp_1525			TRUE	0.949	44.000	0.305	NA		NA
1110841	1110842	Msp_1525	Msp_1526			FALSE	0.212	124.000	0.000	NA	N	NA
1110842	1110843	Msp_1526	Msp_1527			FALSE	0.256	115.000	0.000	1.000	N	NA
1110843	1110844	Msp_1527	Msp_1528		rps27e	TRUE	0.995	35.000	0.386	0.029	Y	NA
1110844	1110845	Msp_1528	Msp_1529	rps27e	rpl44e	TRUE	0.985	108.000	0.436	0.022	Y	NA
1110845	1110846	Msp_1529	Msp_1530	rpl44e		FALSE	0.428	431.000	0.077	NA		NA
1110846	1110847	Msp_1530	Msp_1531		pcn	TRUE	0.805	104.000	0.075	NA		NA
1110847	1110848	Msp_1531	Msp_1532	pcn		FALSE	0.097	189.000	0.000	NA		NA
1110848	1110849	Msp_1532	Msp_1533		rpoM1	FALSE	0.074	225.000	0.000	NA		NA
1110849	1110850	Msp_1533	Msp_1534	rpoM1		TRUE	0.752	92.000	0.028	1.000	N	NA
1110850	1110851	Msp_1534	Msp_1535		rpoL	FALSE	0.142	224.000	0.000	1.000	N	NA
1110851	1110852	Msp_1535	Msp_1536	rpoL		TRUE	0.986	-13.000	0.109	1.000	N	NA
1110852	1110853	Msp_1536	Msp_1537			TRUE	0.961	108.000	0.093	NA	Y	NA
1110853	1110854	Msp_1537	Msp_1538		apt	TRUE	0.957	15.000	0.066	NA	N	NA
1110857	1110858	Msp_1541	Msp_1542		rpl21e	TRUE	0.880	405.000	0.255	NA	Y	NA
1110858	1110859	Msp_1542	Msp_1543	rpl21e		TRUE	0.989	6.000	0.479	1.000		NA
1110859	1110860	Msp_1543	Msp_1544		ksgA	FALSE	0.208	100.000	0.000	1.000		NA
1110860	1110861	Msp_1544	Msp_1545	ksgA		TRUE	0.993	-3.000	0.028	1.000	Y	NA
1110862	1110863	Msp_1546	Msp_1547			FALSE	0.282	56.000	0.000	NA		NA
1110863	1110864	Msp_1547	Msp_1548			FALSE	0.059	272.000	0.000	NA		NA
1110864	1110865	Msp_1548	Msp_1549			TRUE	0.625	9.000	0.000	NA		NA
1110865	1110866	Msp_1549	Msp_1550			TRUE	0.989	28.000	0.077	1.000	Y	NA
1110866	1110867	Msp_1550	Msp_1551			TRUE	0.939	40.000	0.135	NA		NA
1110867	1110868	Msp_1551	Msp_1552			TRUE	0.977	15.000	0.333	NA		NA
1110870	1110871	Msp_1554	Msp_1555			TRUE	0.526	20.000	0.000	1.000		NA
1110871	1110872	Msp_1555	Msp_1556			FALSE	0.431	33.000	0.000	1.000		NA
1110872	1110873	Msp_1556	Msp_1557			FALSE	0.063	252.000	0.000	NA		NA
1110873	1110874	Msp_1557	Msp_1558			FALSE	0.103	179.000	0.000	NA		NA
1110874	1110875	Msp_1558	Msp_1559			FALSE	0.240	69.000	0.000	NA		NA
1110875	1110876	Msp_1559	Msp_1560			FALSE	0.127	130.000	0.000	NA		NA
1110877	1110878	Msp_1561	Msp_1562			FALSE	0.083	210.000	0.000	NA		NA
1110878	1110879	Msp_1562	Msp_1563		cbiX	TRUE	0.945	-28.000	0.023	NA		NA
1110879	1110880	Msp_1563	Msp_1564	cbiX	thiL	TRUE	0.575	64.000	0.003	1.000		NA
1110880	1110881	Msp_1564	Msp_1565	thiL		TRUE	0.928	1.000	0.004	1.000	N	NA
1110882	1110883	Msp_1566	Msp_1567			TRUE	0.826	90.000	0.074	NA		NA
1110883	1110884	Msp_1567	Msp_1568			TRUE	0.679	110.000	0.035	NA		NA
1110886	1110887	Msp_1570	Msp_1571			TRUE	0.909	-7.000	0.006	NA		NA
1110887	1110888	Msp_1571	Msp_1572			FALSE	0.093	194.000	0.000	NA		NA
1110888	1110889	Msp_1572	Msp_1573		thrS	FALSE	0.052	301.000	0.000	NA		NA
1110889	1110890	Msp_1573	Msp_1574	thrS	argS	TRUE	0.675	235.000	0.000	0.027	Y	NA
1110890	1110891	Msp_1574	Msp_1575	argS		TRUE	0.740	32.000	0.004	1.000		NA
1110891	1110892	Msp_1575	Msp_1576		ilvD	TRUE	0.691	45.000	0.005	1.000		NA
1110893	1110894	Msp_1577	Msp_1578		lysA	FALSE	0.111	160.000	0.000	NA		NA
1110894	1110895	Msp_1578	Msp_1579	lysA	dapF	TRUE	0.998	-3.000	0.104	0.002	Y	NA
1110895	1110896	Msp_1579	Msp_1580	dapF		FALSE	0.372	35.000	0.000	NA		NA
1110896	1110897	Msp_1580	Msp_1581			TRUE	0.669	-70.000	0.000	NA		NA
1110898	1110899	Msp_1582	Msp_1583	cbiH		FALSE	0.314	232.000	0.011	NA		NA
1110900	1110901	Msp_1584	Msp_1585	polB		TRUE	0.941	13.000	0.028	1.000	N	NA
1110902	1110903	Msp_1586	Msp_1587		cbiG	FALSE	0.160	395.000	0.006	NA		NA
1110903	1110904	Msp_1587	Msp_1588	cbiG	cobD	TRUE	0.987	14.000	0.010	0.012	Y	NA