MicrobesOnline Operon Predictions for Bordetella petrii DSM 12804

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3489043 3489044 Bpet0001 Bpet0002 dnaA dnaN TRUE 0.995 3.000 0.328 1.000 Y NA
 3489044 3489045 Bpet0002 Bpet0003 dnaN gyrB TRUE 0.779 91.000 0.114 1.000 Y NA
 3489045 3489046 Bpet0003 Bpet0004 gyrB   FALSE 0.060 147.000 0.000 1.000   NA
 3489046 3489047 Bpet0004 Bpet0005     TRUE 0.994 0.000 0.652 NA   NA
 3489048 3489049 Bpet0006 Bpet0007 ycaC   FALSE 0.235 87.000 0.000 NA   NA
 3489051 3489052 Bpet0009 Bpet0010 bioD bioF TRUE 0.996 -7.000 0.121 0.001 Y NA
 3489052 3489053 Bpet0010 Bpet0011 bioF bioA TRUE 0.996 2.000 0.054 0.001 Y NA
 3489053 3489054 Bpet0011 Bpet0012 bioA   FALSE 0.005 528.000 0.000 NA   NA
 3489054 3489055 Bpet0012 Bpet0013     TRUE 0.851 10.000 0.000 NA   NA
 3489056 3489057 Bpet0014 Bpet0015   GAF FALSE 0.020 142.000 0.000 NA N NA
 3489057 3489058 Bpet0015 Bpet0016 GAF ampH FALSE 0.023 137.000 0.000 NA N NA
 3489058 3489059 Bpet0016 Bpet0017 ampH   TRUE 0.851 10.000 0.000 NA   NA
 3489059 3489060 Bpet0017 Bpet0018     TRUE 0.860 8.000 0.000 NA   NA
 3489060 3489061 Bpet0018 Bpet0019     FALSE 0.005 129.000 0.000 1.000 N NA
 3489063 3489064 Bpet0021 Bpet0022     FALSE 0.292 89.000 0.011 1.000   NA
 3489064 3489065 Bpet0022 Bpet0023     TRUE 0.733 17.000 0.000 NA   NA
 3489066 3489067 Bpet0024 Bpet0025 ribB1   FALSE 0.006 343.000 0.000 1.000   NA
 3489067 3489068 Bpet0025 Bpet0026     FALSE 0.183 82.000 0.000 1.000   NA
 3489069 3489070 Bpet0027 Bpet0028 ilvG1   FALSE 0.007 111.000 0.000 1.000 N NA
 3489070 3489071 Bpet0028 Bpet0029   bug1 TRUE 0.815 83.000 0.857 1.000   NA
 3489071 3489072 Bpet0029 Bpet0030 bug1   TRUE 0.987 8.000 0.667 1.000   NA
 3489072 3489073 Bpet0030 Bpet0031     TRUE 0.979 7.000 0.667 1.000 N NA
 3489074 3489075 Bpet0032 Bpet0033   idnO TRUE 0.704 71.000 0.118 0.067 N NA
 3489075 3489076 Bpet0033 Bpet0034 idnO topB1 FALSE 0.157 12.000 0.000 1.000 N NA
 3489078 3489079 Bpet0036 Bpet0037     FALSE 0.009 287.000 0.000 1.000   NA
 3489079 3489080 Bpet0037 Bpet0038     TRUE 0.931 4.000 0.008 NA   NA
 3489080 3489081 Bpet0038 Bpet0039     FALSE 0.035 196.000 0.000 NA   NA
 3489081 3489082 Bpet0039 Bpet0040     FALSE 0.189 244.000 0.500 NA   NA
 3489083 3489084 Bpet0041 Bpet0042   argM1 TRUE 0.665 98.000 0.032 NA Y NA
 3489085 3489086 Bpet0043 Bpet0044     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3489086 3489087 Bpet0044 Bpet0045   acd1 TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.009   NA
 3489087 3489088 Bpet0045 Bpet0046 acd1 kduD1 TRUE 0.605 50.000 0.000 1.000 Y NA
 3489088 3489089 Bpet0046 Bpet0047 kduD1   TRUE 0.691 19.000 0.000 NA   NA
 3489089 3489090 Bpet0047 Bpet0048     TRUE 0.923 36.000 0.857 NA   NA
 3489090 3489091 Bpet0048 Bpet0049   bug2 TRUE 0.887 30.000 0.222 NA   NA
 3489091 3489092 Bpet0049 Bpet0050 bug2   TRUE 0.567 26.000 0.000 NA   NA
 3489092 3489093 Bpet0050 Bpet0051   bug3 TRUE 0.833 40.000 0.250 NA   NA
 3489093 3489094 Bpet0051 Bpet0052 bug3   TRUE 0.780 71.000 0.308 NA   NA
 3489094 3489095 Bpet0052 Bpet0053     TRUE 0.996 -3.000 0.714 NA   NA
 3489095 3489096 Bpet0053 Bpet0054     TRUE 0.961 -7.000 0.143 NA N NA
 3489096 3489097 Bpet0054 Bpet0055   accA1 FALSE 0.002 164.000 0.000 1.000 N NA
 3489097 3489098 Bpet0055 Bpet0056 accA1 accB1 TRUE 0.988 22.000 0.158 0.001 Y NA
 3489098 3489099 Bpet0056 Bpet0057 accB1 fadA1 FALSE 0.162 184.000 0.009 1.000 Y NA
 3489099 3489100 Bpet0057 Bpet0058 fadA1 aceK TRUE 0.787 34.000 0.255 1.000 N NA
 3489100 3489101 Bpet0058 Bpet0059 aceK ivd TRUE 0.598 22.000 0.028 1.000 N NA
 3489102 3489103 Bpet0060 Bpet0061   bug4 FALSE 0.194 77.000 0.000 1.000   NA
 3489104 3489105 Bpet0062 Bpet0063     FALSE 0.429 36.000 0.000 NA   NA
 3489109 3489110 Bpet0067 Bpet0068 dsbA   TRUE 0.741 76.000 0.573 NA N NA
 3489110 3489111 Bpet0068 Bpet0069   argS TRUE 0.918 10.000 0.062 NA N NA
 3489112 3489113 Bpet0070 Bpet0071     TRUE 0.624 100.000 0.176 NA   NA
 3489114 3489115 Bpet0072 Bpet0073 ugpE1 ugpA1 TRUE 0.999 -3.000 0.816 0.074 Y NA
 3489115 3489116 Bpet0073 Bpet0074 ugpA1 ugpB1 TRUE 0.996 13.000 0.611 0.074 Y NA
 3489116 3489117 Bpet0074 Bpet0075 ugpB1   TRUE 0.995 12.000 0.357 0.074 Y NA
 3489117 3489118 Bpet0075 Bpet0076     FALSE 0.374 105.000 0.048 1.000   NA
 3489118 3489119 Bpet0076 Bpet0077     TRUE 0.778 63.000 0.382 1.000   NA
 3489119 3489120 Bpet0077 Bpet0078     TRUE 0.993 -63.000 0.632 0.074 Y NA
 3489120 3489121 Bpet0078 Bpet0079     TRUE 0.984 14.000 0.660 0.074 N NA
 3489121 3489122 Bpet0079 Bpet0080     TRUE 0.944 31.000 0.870 0.074 N NA
 3489122 3489123 Bpet0080 Bpet0081     TRUE 0.992 -3.000 0.761 1.000 N NA
 3489125 3489126 Bpet0083 Bpet0084 leuA   FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 3489127 3489128 Bpet0085 Bpet0086 rpoN1   FALSE 0.192 99.000 0.020 NA N NA
 3489128 3489129 Bpet0086 Bpet0087   bfr FALSE 0.066 362.000 0.046 NA Y NA
 3489130 3489131 Bpet0088 Bpet0089   prfC TRUE 0.564 33.000 0.005 NA   NA
 3489131 3489132 Bpet0089 Bpet0090 prfC rhtB1 FALSE 0.103 50.000 0.005 1.000 N NA
 3489132 3489133 Bpet0090 Bpet0091 rhtB1   FALSE 0.451 52.000 0.024 1.000   NA
 3489133 3489134 Bpet0091 Bpet0092   rhlE1 TRUE 0.929 18.000 0.016 0.013   NA
 3489135 3489136 Bpet0093 Bpet0094 lemA   FALSE 0.361 89.000 0.013 NA   NA
 3489137 3489138 Bpet0095 Bpet0096     TRUE 0.998 -3.000 0.713 1.000 Y NA
 3489138 3489139 Bpet0096 Bpet0097     TRUE 0.963 0.000 0.032 1.000   NA
 3489140 3489141 Bpet0098 Bpet0099     TRUE 0.744 -43.000 0.000 NA   NA
 3489142 3489143 Bpet0100 Bpet0101     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3489143 3489144 Bpet0101 Bpet0102     TRUE 0.945 10.000 0.061 1.000   NA
 3489144 3489145 Bpet0102 Bpet0103     TRUE 0.992 11.000 0.097 0.074 Y NA
 3489145 3489146 Bpet0103 Bpet0104     TRUE 0.831 134.000 0.290 0.074 Y NA
 3489146 3489147 Bpet0104 Bpet0105     FALSE 0.000 635.000 0.000 1.000 N NA
 3489147 3489148 Bpet0105 Bpet0106     FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000   NA
 3489148 3489149 Bpet0106 Bpet0107     TRUE 0.988 -13.000 0.904 NA   NA
 3489149 3489150 Bpet0107 Bpet0108     TRUE 0.969 1.000 0.038 NA   NA
 3489150 3489151 Bpet0108 Bpet0109     FALSE 0.482 67.000 0.027 NA   NA
 3489153 3489154 Bpet0111 Bpet0112 fimD1 fimC1 TRUE 0.988 3.000 0.263 NA   NA
 3489154 3489155 Bpet0112 Bpet0113 fimC1 fimB1 TRUE 0.981 24.000 1.000 1.000 Y NA
 3489155 3489156 Bpet0113 Bpet0114 fimB1 fimA1 TRUE 0.857 109.000 0.667 1.000 Y NA
 3489156 3489157 Bpet0114 Bpet0115 fimA1   FALSE 0.000 568.000 0.000 1.000 N NA
 3489157 3489158 Bpet0115 Bpet0116     FALSE 0.356 35.000 0.000 1.000   NA
 3489160 3489161 Bpettrna_01 Bpet0118 b_petrii_trna_01 sspB FALSE 0.269 74.000 0.000 NA   NA
 3489161 3489162 Bpet0118 Bpet0119 sspB sspA TRUE 0.972 19.000 0.831 NA   NA
 3489162 3489163 Bpet0119 Bpet0120 sspA petC FALSE 0.394 144.000 0.370 NA N NA
 3489163 3489164 Bpet0120 Bpet0121 petC petB TRUE 0.994 20.000 0.630 0.001 Y NA
 3489164 3489165 Bpet0121 Bpet0122 petB petA TRUE 0.935 65.000 0.108 0.001 Y NA
 3489169 3489170 Bpet0126 Bpet0127   tatC FALSE 0.311 98.000 0.010 NA   NA
 3489170 3489171 Bpet0127 Bpet0128 tatC tatB TRUE 0.997 -3.000 0.314 NA Y NA
 3489171 3489172 Bpet0128 Bpet0129 tatB tatA TRUE 0.928 78.000 0.157 0.005 Y NA
 3489172 3489173 Bpet0129 Bpet0130 tatA   TRUE 0.806 19.000 0.080 1.000 N NA
 3489173 3489174 Bpet0130 Bpet0131   hisE TRUE 0.880 14.000 0.079 1.000 N NA
 3489174 3489175 Bpet0131 Bpet0132 hisE hisI TRUE 0.998 -3.000 0.152 0.004 Y NA
 3489175 3489176 Bpet0132 Bpet0133 hisI hisF TRUE 0.997 10.000 0.430 0.004 Y NA
 3489176 3489177 Bpet0133 Bpet0134 hisF hisA TRUE 0.999 -3.000 0.433 0.004 Y NA
 3489177 3489178 Bpet0134 Bpet0135 hisA hisH TRUE 0.929 65.000 0.120 0.004 Y NA
 3489178 3489179 Bpet0135 Bpet0136 hisH hisB TRUE 0.983 22.000 0.111 0.004 Y NA
 3489179 3489180 Bpet0136 Bpet0137 hisB hisC1 TRUE 0.994 16.000 0.341 0.004 Y NA
 3489180 3489181 Bpet0137 Bpet0138 hisC1 hisD TRUE 0.998 -3.000 0.165 0.004 Y NA
 3489181 3489182 Bpet0138 Bpet0139 hisD hisG TRUE 0.917 106.000 0.254 0.004 Y NA
 3489182 3489183 Bpet0139 Bpet0140 hisG murA TRUE 0.977 -3.000 0.123 1.000 N NA
 3489183 3489184 Bpet0140 Bpet0141 murA   TRUE 0.977 0.000 0.129 NA N NA
 3489184 3489185 Bpet0141 Bpet0142     TRUE 0.945 6.000 0.088 NA N NA
 3489185 3489186 Bpet0142 Bpet0143     TRUE 0.998 -3.000 0.236 0.093 Y NA
 3489186 3489187 Bpet0143 Bpet0144     FALSE 0.267 86.000 0.028 NA N NA
 3489187 3489188 Bpet0144 Bpet0145     TRUE 0.723 34.000 0.111 NA N NA
 3489188 3489189 Bpet0145 Bpet0146     FALSE 0.351 109.000 0.031 NA   NA
 3489189 3489190 Bpet0146 Bpet0147     TRUE 0.984 13.000 0.562 NA   NA
 3489190 3489191 Bpet0147 Bpet0148     TRUE 0.998 -3.000 0.530 NA Y NA
 3489191 3489192 Bpet0148 Bpet0149     FALSE 0.024 226.000 0.000 NA   NA
 3489194 3489195 Bpet0151 Bpet0152   gltD FALSE 0.002 168.000 0.000 1.000 N NA
 3489195 3489196 Bpet0152 Bpet0153 gltD gltB,asb TRUE 0.992 18.000 0.236 0.001 Y NA
 3489196 3489197 Bpet0153 Bpet0154 gltB,asb   FALSE 0.009 440.000 0.015 1.000   NA
 3489198 3489199 Bpet0155 Bpet0156     TRUE 0.684 26.000 0.019 1.000   NA
 3489199 3489200 Bpet0156 Bpet0157     FALSE 0.462 79.000 0.029 NA   NA
 3489206 3489207 Bpet0163 Bpet0164     TRUE 0.971 33.000 0.864 NA Y NA
 3489207 3489208 Bpet0164 Bpet0165     TRUE 0.918 53.000 0.500 1.000 Y NA
 3489208 3489209 Bpet0165 Bpet0166   ilvD1 TRUE 0.558 67.000 0.000 1.000 Y NA
 3489211 3489212 Bpet0168 Bpet0169 coxB coxA1 TRUE 0.955 98.000 0.741 0.003 Y NA
 3489212 3489213 Bpet0169 Bpet0170 coxA1   TRUE 0.613 31.000 0.008 NA   NA
 3489213 3489214 Bpet0170 Bpet0171     TRUE 0.952 7.000 0.045 NA   NA
 3489214 3489215 Bpet0171 Bpet0172   coxC TRUE 0.783 41.000 0.152 NA   NA
 3489217 3489218 Bpet0174 Bpet0175     TRUE 0.944 28.000 0.722 NA   NA
 3489218 3489219 Bpet0175 Bpet0176   ctaA TRUE 0.967 14.000 0.255 1.000   NA
 3489219 3489220 Bpet0176 Bpet0177 ctaA ubiA1 TRUE 0.963 26.000 0.321 1.000 Y NA
 3489220 3489221 Bpet0177 Bpet0178 ubiA1 senC1 TRUE 0.727 19.000 0.007 1.000   NA
 3489221 3489222 Bpet0178 Bpet0179 senC1   FALSE 0.004 407.000 0.000 1.000   NA
 3489222 3489223 Bpet0179 Bpet0180     TRUE 0.515 29.000 0.000 NA   NA
 3489223 3489224 Bpet0180 Bpet0181   glmU FALSE 0.361 60.000 0.003 NA   NA
 3489224 3489225 Bpet0181 Bpet0182 glmU   TRUE 0.770 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3489225 3489226 Bpet0182 Bpet0183   ugd TRUE 0.720 73.000 0.600 1.000 N NA
 3489226 3489227 Bpet0183 Bpet0184 ugd   TRUE 0.993 -3.000 0.073 1.000 Y NA
 3489230 3489231 Bpet0187 Bpet0188     TRUE 0.908 -25.000 0.036 NA   NA
 3489231 3489232 Bpet0188 Bpet0189   wlbH1 TRUE 0.894 -39.000 0.036 NA   NA
 3489232 3489233 Bpet0189 Bpet0190 wlbH1   FALSE 0.021 203.000 0.000 1.000   NA
 3489233 3489234 Bpet0190 Bpet0191   mreB1 FALSE 0.233 55.000 0.000 1.000   NA
 3489234 3489235 Bpet0191 Bpet0192 mreB1   TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 3489235 3489236 Bpet0192 Bpet0193     FALSE 0.414 37.000 0.000 NA   NA
 3489237 3489238 Bpet0194 Bpet0195 tnp1   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.098 Y NA
 3489238 3489239 Bpet0195 Bpet0196     FALSE 0.017 243.000 0.000 0.098 N NA
 3489239 3489240 Bpet0196 Bpet0197     FALSE 0.404 81.000 0.000 0.098   NA
 3489240 3489241 Bpet0197 Bpet0198     TRUE 0.801 21.000 0.000 0.098   NA
 3489242 3489243 Bpet0199 Bpet0200     FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 3489244 3489245 Bpet0201 Bpet0202     TRUE 0.930 21.000 0.080 0.098   NA
 3489247 3489248 Bpet0204 Bpet0205     FALSE 0.003 1621.000 0.000 NA   NA
 3489248 3489249 Bpet0205 Bpet0206     FALSE 0.031 203.000 0.000 NA   NA
 3489250 3489251 Bpet0207 Bpet0208     TRUE 0.906 51.000 0.667 0.098   NA
 3489253 3489254 Bpet0210 Bpet0211     FALSE 0.055 150.000 0.000 1.000   NA
 3489254 3489255 Bpet0211 Bpet0212   tnp2 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.098 Y NA
 3489255 3489256 Bpet0212 Bpet0213 tnp2   FALSE 0.046 179.000 0.000 NA   NA
 3489256 3489257 Bpet0213 Bpet0214     FALSE 0.260 77.000 0.000 NA   NA
 3489257 3489258 Bpet0214 Bpet0215     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3489258 3489259 Bpet0215 Bpet0216     TRUE 0.987 -3.000 0.042 0.098   NA
 3489259 3489260 Bpet0216 Bpet0217     FALSE 0.226 58.000 0.000 1.000   NA
 3489260 3489261 Bpet0217 Bpet0218     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3489261 3489262 Bpet0218 Bpet0219     TRUE 0.992 3.000 0.556 NA   NA
 3489262 3489263 Bpet0219 Bpet0220     FALSE 0.004 620.000 0.000 NA   NA
 3489263 3489264 Bpet0220 Bpet0221   orfA1 FALSE 0.145 119.000 0.000 NA   NA
 3489264 3489265 Bpet0221 Bpet0222 orfA1   FALSE 0.179 142.000 0.000 0.098   NA
 3489265 3489266 Bpet0222 Bpet0223     TRUE 0.984 9.000 0.390 NA   NA
 3489266 3489267 Bpet0223 Bpet0224     TRUE 0.834 66.000 0.579 NA   NA
 3489267 3489268 Bpet0224 Bpet0225     TRUE 0.984 3.000 0.171 NA   NA
 3489268 3489269 Bpet0225 Bpet0226     FALSE 0.008 368.000 0.000 NA   NA
 3489269 3489270 Bpet0226 Bpet0227     TRUE 0.603 49.000 0.000 0.025   NA
 3489270 3489271 Bpet0227 Bpet0228   orfA2 TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.098   NA
 3489272 3489273 Bpet0229 Bpet0230     FALSE 0.068 156.000 0.000 NA   NA
 3489273 3489274 Bpet0230 Bpet0231     FALSE 0.008 359.000 0.000 NA   NA
 3489274 3489275 Bpet0231 Bpet0232     TRUE 0.994 -3.000 0.400 NA   NA
 3489275 3489276 Bpet0232 Bpet0233     FALSE 0.005 456.000 0.000 NA   NA
 3489276 3489277 Bpet0233 Bpet0234     FALSE 0.302 39.000 0.000 1.000   NA
 3489277 3489278 Bpet0234 Bpet0235     TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.009   NA
 3489278 3489279 Bpet0235 Bpet0236   wza1 TRUE 0.839 43.000 0.080 1.000 Y NA
 3489279 3489280 Bpet0236 Bpet0237 wza1 wzm1 TRUE 0.961 8.000 0.000 NA Y NA
 3489280 3489281 Bpet0237 Bpet0238 wzm1 wzt1 TRUE 0.982 10.000 0.056 NA Y NA
 3489281 3489282 Bpet0238 Bpet0239 wzt1 kpsE1 FALSE 0.388 122.000 0.000 NA Y NA
 3489282 3489283 Bpet0239 Bpet0240 kpsE1   TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3489283 3489284 Bpet0240 Bpet0241     TRUE 0.825 13.000 0.000 NA   NA
 3489285 3489286 Bpet0242 Bpet0243     FALSE 0.001 202.000 0.000 1.000 N NA
 3489287 3489288 Bpet0244 Bpet0245     FALSE 0.076 151.000 0.000 NA   NA
 3489291 3489292 Bpet0248 Bpet0249     FALSE 0.163 94.000 0.000 1.000   NA
 3489292 3489293 Bpet0249 Bpet0250     TRUE 0.968 22.000 0.364 0.079   NA
 3489293 3489294 Bpet0250 Bpet0251     FALSE 0.037 29.000 0.000 1.000 N NA
 3489294 3489295 Bpet0251 Bpet0252     TRUE 0.825 43.000 0.364 1.000   NA
 3489295 3489296 Bpet0252 Bpet0253   bug5 TRUE 0.628 92.000 0.182 1.000   NA
 3489296 3489297 Bpet0253 Bpet0254 bug5 pcaG FALSE 0.005 365.000 0.000 1.000   NA
 3489297 3489298 Bpet0254 Bpet0255 pcaG pcaH TRUE 0.999 4.000 0.782 0.001 Y NA
 3489300 3489301 Bpet0257 Bpet0258 pcaC2 pcaB2 TRUE 0.949 -7.000 0.049 1.000   NA
 3489301 3489302 Bpet0258 Bpet0259 pcaB2 bug6 TRUE 0.965 -3.000 0.021 1.000   NA
 3489303 3489304 Bpet0260 Bpet0261     FALSE 0.064 145.000 0.000 1.000   NA
 3489305 3489306 Bpet0262 Bpet0263     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3489306 3489307 Bpet0263 Bpet0264     TRUE 0.939 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3489308 3489309 Bpet0265 Bpet0266   acd2 FALSE 0.052 24.000 0.000 1.000 N NA
 3489309 3489310 Bpet0266 Bpetpseudo_01 acd2   TRUE 0.866 37.000 0.400 1.000   NA
 3489310 3489311 Bpetpseudo_01 Bpet0267     TRUE 0.879 2.000 0.000 1.000   NA
 3489311 3489312 Bpet0267 Bpet0268     FALSE 0.194 77.000 0.000 1.000   NA
 3489313 3489314 Bpet0269 Bpet0270     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3489315 3489316 Bpet0271 Bpet0272     FALSE 0.032 119.000 0.000 NA N NA
 3489318 3489319 Bpet0274 Bpet0275   otsB FALSE 0.029 207.000 0.000 NA   NA
 3489319 3489320 Bpet0275 Bpet0276 otsB otsA TRUE 0.950 24.000 0.000 0.001 Y NA
 3489320 3489321 Bpet0276 Bpet0277 otsA   FALSE 0.051 96.000 0.000 NA N NA
 3489321 3489322 Bpet0277 Bpet0278     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3489324 3489325 Bpet0280 Bpet0281     FALSE 0.012 304.000 0.000 NA   NA
 3489325 3489326 Bpet0281 Bpet0282     TRUE 0.751 69.000 0.231 NA   NA
 3489326 3489327 Bpet0282 Bpet0283     TRUE 0.972 35.000 0.375 0.073 Y NA
 3489327 3489328 Bpet0283 Bpet0284     TRUE 0.987 22.000 0.375 0.073 Y NA
 3489328 3489329 Bpet0284 Bpet0285     TRUE 0.994 10.000 0.600 1.000 Y NA
 3489329 3489330 Bpet0285 Bpet0286     TRUE 0.962 63.000 0.462 0.004 Y NA
 3489330 3489331 Bpet0286 Bpet0287     TRUE 0.833 24.000 0.000 1.000 Y NA
 3489331 3489332 Bpet0287 Bpet0288     FALSE 0.013 72.000 0.000 1.000 N NA
 3489333 3489334 Bpet0289 Bpet0290     FALSE 0.020 241.000 0.000 NA   NA
 3489334 3489335 Bpet0290 Bpet0291     FALSE 0.003 757.000 0.000 NA   NA
 3489335 3489336 Bpet0291 Bpet0292     FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   NA
 3489336 3489337 Bpet0292 Bpet0293     TRUE 0.976 2.000 0.229 1.000 N NA
 3489337 3489338 Bpet0293 Bpet0294   uahA TRUE 0.996 0.000 0.343 0.001 N NA
 3489339 3489340 Bpet0295 Bpet0296     TRUE 0.981 22.000 0.654 1.000 Y NA
 3489340 3489341 Bpet0296 Bpet0297     TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.073 Y NA
 3489341 3489342 Bpet0297 Bpet0298     TRUE 0.995 -3.000 0.823 1.000   NA
 3489342 3489343 Bpet0298 Bpet0299     TRUE 0.997 2.000 0.731 0.032   NA
 3489343 3489344 Bpet0299 Bpet0300     FALSE 0.014 69.000 0.000 1.000 N NA
 3489345 3489346 Bpet0301 Bpet0302   bug7 TRUE 0.928 -42.000 0.107 1.000   NA
 3489346 3489347 Bpet0302 Bpet0303 bug7   TRUE 0.741 113.000 0.750 NA   NA
 3489347 3489348 Bpet0303 Bpet0304     TRUE 0.988 -7.000 0.500 NA   NA
 3489348 3489349 Bpet0304 Bpet0305     FALSE 0.025 220.000 0.000 NA   NA
 3489349 3489350 Bpet0305 Bpet0306     TRUE 0.643 22.000 0.000 NA   NA
 3489353 3489354 Bpet0309 Bpet0310 aqpZ   FALSE 0.034 31.000 0.000 1.000 N NA
 3489355 3489356 Bpet0311 Bpet0312     TRUE 0.622 52.000 0.083 1.000   NA
 3489357 3489358 Bpet0313 Bpet0314     TRUE 0.983 -3.000 0.061 NA   NA
 3489358 3489359 Bpet0314 Bpet0315     TRUE 0.850 38.000 0.061 1.000 Y NA
 3489360 3489361 Bpet0316 Bpet0317   trpC TRUE 0.584 25.000 0.000 NA   NA
 3489361 3489362 Bpet0317 Bpet0318 trpC trpD TRUE 0.997 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 3489362 3489363 Bpet0318 Bpet0319 trpD trpG TRUE 0.972 16.000 0.105 1.000 Y NA
 3489363 3489364 Bpet0319 Bpet0320 trpG trpE TRUE 0.960 52.000 0.230 0.001 Y NA
 3489364 3489365 Bpet0320 Bpet0321 trpE gph FALSE 0.161 211.000 0.233 1.000   NA
 3489365 3489366 Bpet0321 Bpet0322 gph rpe TRUE 0.973 8.000 0.192 1.000   NA
 3489367 3489368 Bpet0323 Bpet0324   mltA TRUE 0.639 33.000 0.063 NA N NA
 3489368 3489369 Bpet0324 Bpet0325 mltA   TRUE 0.885 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3489369 3489370 Bpet0325 Bpet0326   dsbC TRUE 0.945 20.000 0.814 1.000 N NA
 3489370 3489371 Bpet0326 Bpet0327 dsbC serA1 FALSE 0.368 62.000 0.059 1.000 N NA
 3489372 3489373 Bpet0328 Bpet0329     FALSE 0.036 193.000 0.000 NA   NA
 3489373 3489374 Bpet0329 Bpet0330   folB TRUE 0.864 9.000 0.025 NA N NA
 3489377 3489378 Bpet0333 Bpet0334     FALSE 0.031 203.000 0.000 NA   NA
 3489378 3489379 Bpet0334 Bpet0335     FALSE 0.044 180.000 0.000 NA   NA
 3489379 3489380 Bpet0335 Bpet0336   atpB TRUE 0.756 69.000 0.330 1.000   NA
 3489380 3489381 Bpet0336 Bpet0337 atpB atpE TRUE 0.861 113.000 0.557 0.002   NA
 3489381 3489382 Bpet0337 Bpet0338 atpE atpF TRUE 0.752 149.000 0.666 0.002   NA
 3489382 3489383 Bpet0338 Bpet0339 atpF atpH TRUE 0.996 13.000 0.242 0.002 Y NA
 3489383 3489384 Bpet0339 Bpet0340 atpH atpA TRUE 0.982 40.000 0.864 0.002 Y NA
 3489384 3489385 Bpet0340 Bpet0341 atpA atpG TRUE 0.958 100.000 0.846 0.002 Y NA
 3489385 3489386 Bpet0341 Bpet0342 atpG atpD TRUE 0.978 44.000 0.724 0.002 Y NA
 3489386 3489387 Bpet0342 Bpet0343 atpD atpC TRUE 0.998 10.000 0.837 0.002 Y NA
 3489387 3489388 Bpet0343 Bpet0344 atpC   FALSE 0.015 236.000 0.000 1.000   NA
 3489390 3489391 Bpet0346 Bpet0347 hemE priA FALSE 0.000 348.000 0.000 1.000 N NA
 3489391 3489392 Bpet0347 Bpet0348 priA rep TRUE 0.987 3.000 0.005 0.092 Y NA
 3489392 3489393 Bpet0348 Bpet0349 rep   FALSE 0.097 305.000 0.000 0.012 Y NA
 3489394 3489395 Bpet0350 Bpet0351     TRUE 0.554 35.000 0.006 NA   NA
 3489395 3489396 Bpet0351 Bpet0352     TRUE 0.844 15.000 0.006 NA   NA
 3489396 3489397 Bpet0352 Bpet0353     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.004 Y NA
 3489397 3489398 Bpet0353 Bpet0354     TRUE 0.998 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 3489398 3489399 Bpet0354 Bpet0355     TRUE 0.991 -46.000 0.333 0.073 Y NA
 3489399 3489400 Bpet0355 Bpet0356     TRUE 0.802 43.000 0.000 0.073 Y NA
 3489400 3489401 Bpet0356 Bpet0357     TRUE 0.612 48.000 0.000 1.000 Y NA
 3489403 3489404 Bpet0359 Bpet0360     FALSE 0.015 271.000 0.000 NA   NA
 3489404 3489405 Bpet0360 Bpet0361     FALSE 0.274 97.000 0.004 NA   NA
 3489407 3489408 Bpet0363 Bpet0364     TRUE 0.980 -3.000 0.060 1.000   NA
 3489409 3489410 Bpet0365 Bpet0366   acd3 TRUE 0.762 42.000 0.429 1.000 N NA
 3489410 3489411 Bpet0366 Bpet0367 acd3   FALSE 0.510 139.000 1.000 1.000 N NA
 3489411 3489412 Bpet0367 Bpet0368   paaH TRUE 0.671 37.000 0.143 1.000 N NA
 3489414 3489415 Bpettrna_02 Bpet0370 b_petrii_trna_02   FALSE 0.242 84.000 0.000 NA   NA
 3489416 3489417 Bpet0371 Bpet0372 bug8   FALSE 0.014 241.000 0.000 1.000   NA
 3489418 3489419 Bpet0373 Bpet0374     TRUE 0.810 26.000 0.000 1.000 Y NA
 3489419 3489420 Bpet0374 Bpet0375   pcaI3 TRUE 0.920 15.000 0.000 1.000 Y NA
 3489420 3489421 Bpet0375 Bpet0376 pcaI3 pcaJ3 TRUE 0.981 -16.000 0.000 0.002 Y NA
 3489421 3489422 Bpet0376 Bpet0377 pcaJ3   TRUE 0.530 23.000 0.000 1.000   NA
 3489422 3489423 Bpet0377 Bpet0378     TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.066   NA
 3489423 3489424 Bpet0378 Bpet0379     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3489424 3489425 Bpet0379 Bpet0380     TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 3489426 3489427 Bpet0381 Bpet0382     FALSE 0.214 62.000 0.000 1.000   NA
 3489427 3489428 Bpet0382 Bpet0383     TRUE 0.880 5.000 0.000 NA   NA
 3489429 3489430 Bpet0384 Bpet0385   bug9 FALSE 0.243 50.000 0.000 1.000   NA
 3489430 3489431 Bpet0385 Bpet0386 bug9   TRUE 0.842 31.000 0.118 NA   NA
 3489433 3489434 Bpet0388 Bpet0389 gdH   TRUE 0.900 6.000 0.053 1.000 N NA
 3489435 3489436 Bpet0390 Bpet0391 bug10   TRUE 0.944 12.000 0.071 1.000   NA
 3489436 3489437 Bpet0391 Bpet0392     TRUE 0.993 -3.000 0.071 1.000 Y NA
 3489439 3489440 Bpet0394 Bpet0395   gshA FALSE 0.095 118.000 0.018 1.000 N NA
 3489442 3489443 Bpet0397 Bpet0398     FALSE 0.340 152.000 0.000 0.096 Y NA
 3489444 3489445 Bpet0399 Bpet0400 frdB   TRUE 0.995 -3.000 0.092 0.002   NA
 3489445 3489446 Bpet0400 Bpet0401   sdhC TRUE 0.986 2.000 0.010 0.001   NA
 3489446 3489447 Bpet0401 Bpet0402 sdhC ttdA TRUE 0.849 4.000 0.000 1.000   NA
 3489447 3489448 Bpet0402 Bpet0403 ttdA ttdB TRUE 0.983 21.000 0.667 1.000 Y NA
 3489448 3489449 Bpet0403 Bpet0404 ttdB   TRUE 0.991 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 3489449 3489450 Bpet0404 Bpet0405   bug11 FALSE 0.302 39.000 0.000 1.000   NA
 3489450 3489451 Bpet0405 Bpet0406 bug11 ilvG FALSE 0.208 68.000 0.000 1.000   NA
 3489451 3489452 Bpet0406 Bpet0407 ilvG   TRUE 0.680 16.000 0.000 1.000   NA
 3489453 3489454 Bpet0408 Bpet0409   serA2 FALSE 0.471 192.000 0.458 1.000 Y NA
 3489454 3489455 Bpet0409 Bpet0410 serA2 bug12 FALSE 0.212 63.000 0.000 1.000   NA
 3489455 3489456 Bpet0410 Bpet0411 bug12   FALSE 0.251 47.000 0.000 1.000   NA
 3489456 3489457 Bpet0411 Bpet0412     TRUE 0.988 -7.000 0.111 1.000 Y NA
 3489457 3489458 Bpet0412 Bpet0413     TRUE 0.582 58.000 0.000 1.000 Y NA
 3489458 3489459 Bpet0413 Bpet0414     FALSE 0.002 159.000 0.000 1.000 N NA
 3489459 3489460 Bpet0414 Bpet0415     TRUE 0.940 44.000 0.400 0.001   NA
 3489461 3489462 Bpet0416 Bpet0417   metX FALSE 0.002 172.000 0.000 1.000 N NA
 3489462 3489463 Bpet0417 Bpet0418 metX metW TRUE 0.995 -3.000 0.509 NA   NA
 3489463 3489464 Bpet0418 Bpet0419 metW ampG TRUE 0.704 28.000 0.018 NA   NA
 3489464 3489465 Bpet0419 Bpet0420 ampG   TRUE 0.604 24.000 0.000 NA   NA
 3489466 3489467 Bpet0421 Bpet0422 gdhA1   FALSE 0.000 431.000 0.000 1.000 N NA
 3489469 3489470 Bpet0424 Bpet0425 gatB gatA2 TRUE 0.999 -3.000 0.492 0.002 Y NA
 3489470 3489471 Bpet0425 Bpet0426 gatA2 gatC TRUE 0.998 4.000 0.643 0.002 Y NA
 3489472 3489473 Bpet0427 Bpet0428 mreB2 mreC TRUE 0.720 80.000 0.689 1.000 N NA
 3489473 3489474 Bpet0428 Bpet0429 mreC mreD TRUE 0.997 -13.000 0.550 0.002 Y NA
 3489474 3489475 Bpet0429 Bpet0430 mreD mrdA TRUE 0.942 25.000 0.108 1.000 Y NA
 3489475 3489476 Bpet0430 Bpet0431 mrdA mrdB TRUE 0.965 -3.000 0.073 1.000 N NA
 3489477 3489478 Bpet0432 Bpet0433     TRUE 0.819 31.000 0.122 1.000   NA
 3489478 3489479 Bpet0433 Bpet0434   argB TRUE 0.975 0.000 0.069 1.000   NA
 3489481 3489482 Bpet0436 Bpet0437     TRUE 0.961 0.000 0.017 NA   NA
 3489482 3489483 Bpet0437 Bpet0438     TRUE 0.995 -3.000 0.613 NA   NA
 3489483 3489484 Bpet0438 Bpet0439     TRUE 0.870 21.000 0.187 1.000 N NA
 3489485 3489486 Bpet0440 Bpet0441   ogt TRUE 0.944 -3.000 0.004 1.000   NA
 3489487 3489488 Bpet0442 Bpet0443     TRUE 0.960 -3.000 0.006 NA   NA
 3489489 3489490 Bpet0444 Bpet0445     TRUE 0.996 10.000 0.250 0.013 Y NA
 3489491 3489492 Bpet0446 Bpet0447 ptsO ptsN TRUE 0.968 20.000 0.177 1.000 Y NA
 3489492 3489493 Bpet0447 Bpet0448 ptsN rpoN2 FALSE 0.105 240.000 0.309 NA N NA
 3489493 3489494 Bpet0448 Bpet0449 rpoN2   FALSE 0.027 253.000 0.006 NA   NA
 3489494 3489495 Bpet0449 Bpet0450     TRUE 0.910 35.000 0.543 NA   NA
 3489495 3489496 Bpet0450 Bpet0451     TRUE 0.995 -3.000 0.459 NA   NA
 3489496 3489497 Bpet0451 Bpet0452   kdsC TRUE 0.971 -87.000 0.617 NA   NA
 3489497 3489498 Bpet0452 Bpet0453 kdsC   TRUE 0.991 3.000 0.598 1.000   NA
 3489499 3489500 Bpet0454 Bpet0455 purT   FALSE 0.137 109.000 0.013 NA N NA
 3489500 3489501 Bpet0455 Bpet0456   cydA FALSE 0.226 132.000 0.071 NA N NA
 3489501 3489502 Bpet0456 Bpet0457 cydA cydB TRUE 0.995 16.000 0.953 0.079 Y NA
 3489502 3489503 Bpet0457 Bpet0458 cydB   TRUE 0.974 13.000 0.230 NA   NA
 3489503 3489504 Bpet0458 Bpet0459   cydD TRUE 0.969 -3.000 0.014 NA   NA
 3489504 3489505 Bpet0459 Bpet0460 cydD cydC TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.005 Y NA
 3489505 3489506 Bpet0460 Bpet0461 cydC apt FALSE 0.084 58.000 0.004 1.000 N NA
 3489508 3489509 Bpet0463 Bpet0464     FALSE 0.011 316.000 0.000 NA   NA
 3489511 3489512 Bpet0466 Bpet0467     FALSE 0.486 81.000 0.039 NA   NA
 3489513 3489514 Bpet0468 Bpet0469 bug13   TRUE 0.788 75.000 0.500 1.000   NA
 3489514 3489515 Bpet0469 Bpet0470     FALSE 0.081 18.000 0.000 1.000 N NA
 3489515 3489516 Bpet0470 Bpet0471     FALSE 0.002 159.000 0.000 1.000 N NA
 3489516 3489517 Bpet0471 Bpet0472   gabD1 FALSE 0.014 67.000 0.000 1.000 N NA
 3489519 3489520 Bpet0474 Bpet0475     TRUE 0.931 -58.000 0.101 NA   NA
 3489520 3489521 Bpet0475 Bpet0476     TRUE 0.995 -3.000 0.085 NA Y NA
 3489521 3489522 Bpet0476 Bpet0477     TRUE 0.750 25.000 0.020 NA   NA
 3489524 3489525 Bpet0479 Bpet0480 serA3 phoR FALSE 0.009 97.000 0.000 1.000 N NA
 3489525 3489526 Bpet0480 Bpet0481 phoR phoB TRUE 0.996 13.000 0.453 0.014 Y NA
 3489527 3489528 Bpet0482 Bpet0483 ubiE1   FALSE 0.143 161.000 0.044 1.000   NA
 3489528 3489529 Bpet0483 Bpet0484   ubiB FALSE 0.003 611.000 0.000 1.000   NA
 3489529 3489530 Bpet0484 Bpet0485 ubiB   FALSE 0.069 167.000 0.007 1.000   NA
 3489530 3489531 Bpet0485 Bpet0486     TRUE 0.558 50.000 0.051 1.000   NA
 3489534 3489535 Bpet0489 Bpet0490 pcm1 thiD1 FALSE 0.010 93.000 0.000 1.000 N NA
 3489535 3489536 Bpet0490 Bpet0491 thiD1 thiG TRUE 0.995 -3.000 0.005 0.003 Y NA
 3489536 3489537 Bpet0491 Bpet0492 thiG   FALSE 0.060 82.000 0.003 1.000 N NA
 3489537 3489538 Bpet0492 Bpet0493     TRUE 0.976 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3489544 3489545 Bpet0499 Bpet0500 cheD   FALSE 0.001 262.000 0.000 1.000 N NA
 3489545 3489546 Bpet0500 Bpet0501   ftsE TRUE 0.990 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 3489547 3489548 Bpet0502 Bpet0503     TRUE 0.861 127.000 0.375 0.073 Y NA
 3489548 3489549 Bpet0503 Bpet0504     TRUE 0.998 2.000 0.375 0.011 Y NA
 3489549 3489550 Bpet0504 Bpet0505     TRUE 0.712 61.000 0.028 1.000 Y NA
 3489550 3489551 Bpet0505 Bpet0506   bug14 FALSE 0.273 113.000 0.028 1.000   NA
 3489551 3489552 Bpet0506 Bpet0507 bug14   FALSE 0.095 124.000 0.000 1.000   NA
 3489552 3489553 Bpet0507 Bpet0508     TRUE 0.995 0.000 0.083 0.096 Y NA
 3489554 3489555 Bpet0509 Bpet0510     FALSE 0.488 61.000 0.000 0.078   NA
 3489555 3489556 Bpet0510 Bpet0511   bug15 TRUE 0.915 24.000 0.250 1.000   NA
 3489556 3489557 Bpet0511 Bpet0512 bug15   TRUE 0.827 -7.000 0.000 1.000   NA
 3489557 3489558 Bpet0512 Bpet0513     FALSE 0.042 27.000 0.000 1.000 N NA
 3489558 3489559 Bpet0513 Bpet0514   bug16 FALSE 0.339 36.000 0.000 1.000   NA
 3489559 3489560 Bpet0514 Bpet0515 bug16   TRUE 0.666 91.000 0.235 1.000   NA
 3489560 3489561 Bpet0515 Bpet0516     FALSE 0.228 4.000 0.000 1.000 N NA
 3489561 3489562 Bpet0516 Bpet0517     TRUE 0.909 37.000 0.167 1.000 Y NA
 3489563 3489564 Bpet0518 Bpet0519     FALSE 0.006 411.000 0.000 NA   NA
 3489564 3489565 Bpet0519 Bpet0520     TRUE 0.983 14.000 0.667 NA   NA
 3489565 3489566 Bpet0520 Bpet0521     TRUE 0.969 19.000 0.667 NA   NA
 3489566 3489567 Bpet0521 Bpet0522     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3489567 3489568 Bpet0522 Bpet0523     TRUE 0.685 -202.000 0.000 NA   NA
 3489568 3489569 Bpet0523 Bpet0524     TRUE 0.790 35.000 0.091 NA   NA
 3489570 3489571 Bpet0525 Bpet0526 glpK   FALSE 0.338 53.000 0.006 1.000   NA
 3489572 3489573 Bpet0527 Bpet0528   panC TRUE 0.566 39.000 0.018 NA   NA
 3489573 3489574 Bpet0528 Bpet0529 panC   FALSE 0.006 118.000 0.000 1.000 N NA
 3489575 3489576 Bpet0530 Bpet0531     FALSE 0.005 547.000 0.000 NA   NA
 3489577 3489578 Bpet0532 Bpet0533 pilD coaE FALSE 0.505 64.000 0.122 1.000 N NA
 3489578 3489579 Bpet0533 Bpet0534 coaE   TRUE 0.753 41.000 0.110 NA   NA
 3489579 3489580 Bpet0534 Bpet0535     FALSE 0.227 133.000 0.021 NA   NA
 3489580 3489581 Bpet0535 Bpet0536     TRUE 0.983 -3.000 0.143 NA N NA
 3489581 3489582 Bpet0536 Bpet0537     TRUE 0.998 -3.000 0.741 NA Y NA
 3489582 3489583 Bpet0537 Bpet0538     TRUE 0.992 -3.000 0.556 NA N NA
 3489584 3489585 Bpet0539 Bpet0540 mutT   TRUE 0.946 -7.000 0.045 1.000   NA
 3489585 3489586 Bpet0540 Bpet0541   argJ TRUE 0.799 25.000 0.056 1.000   NA
 3489586 3489587 Bpet0541 Bpet0542 argJ   FALSE 0.000 608.000 0.000 1.000 N NA
 3489587 3489588 Bpet0542 Bpet0543     TRUE 0.914 8.000 0.073 1.000 N NA
 3489589 3489590 Bpet0544 Bpet0545     TRUE 0.917 91.000 0.833 NA Y NA
 3489590 3489591 Bpet0545 Bpet0546     TRUE 0.998 4.000 0.667 0.072 Y NA
 3489591 3489592 Bpet0546 Bpet0547     TRUE 0.938 56.000 1.000 1.000 Y NA
 3489592 3489593 Bpet0547 Bpet0548     TRUE 0.998 -6.000 1.000 0.031 Y NA
 3489593 3489594 Bpet0548 Bpet0549     FALSE 0.000 551.000 0.000 1.000 N NA
 3489594 3489595 Bpet0549 Bpet0550     TRUE 0.986 -3.000 0.068 0.065 N NA
 3489595 3489596 Bpet0550 Bpet0551     TRUE 0.961 20.000 0.113 1.000 Y NA
 3489596 3489597 Bpet0551 Bpet0552   acd4 TRUE 0.997 2.000 0.742 1.000 Y NA
 3489597 3489598 Bpet0552 Bpet0553 acd4   TRUE 0.939 37.000 0.378 1.000 Y NA
 3489598 3489599 Bpet0553 Bpet0554     TRUE 0.961 13.000 0.146 1.000   NA
 3489599 3489600 Bpet0554 Bpet0555     TRUE 0.983 5.000 0.243 NA   NA
 3489601 3489602 Bpet0556 Bpet0557   hemL FALSE 0.000 286.000 0.000 1.000 N NA
 3489602 3489603 Bpet0557 Bpet0558 hemL thiE TRUE 0.991 5.000 0.173 1.000 Y NA
 3489603 3489604 Bpet0558 Bpet0559 thiE thiD2 TRUE 0.996 -3.000 0.209 1.000 Y NA
 3489605 3489606 Bpet0560 Bpet0561 rubA   FALSE 0.184 60.000 0.006 NA N NA
 3489606 3489607 Bpet0561 Bpet0562     TRUE 0.974 -7.000 0.263 NA N NA
 3489607 3489608 Bpet0562 Bpet0563     FALSE 0.003 155.000 0.000 1.000 N NA
 3489609 3489610 Bpet0564 Bpet0565 apaH   TRUE 0.947 -3.000 0.005 1.000   NA
 3489610 3489611 Bpet0565 Bpet0566   mtgA TRUE 0.534 80.000 0.005 0.070   NA
 3489611 3489612 Bpet0566 Bpet0567 mtgA aroE TRUE 0.965 7.000 0.107 1.000   NA
 3489612 3489613 Bpet0567 Bpet0568 aroE   TRUE 0.978 -3.000 0.054 1.000   NA
 3489613 3489614 Bpet0568 Bpet0569   rnb FALSE 0.134 228.000 0.225 1.000   NA
 3489614 3489615 Bpet0569 Bpet0570 rnb   TRUE 0.636 86.000 0.122 NA   NA
 3489615 3489616 Bpet0570 Bpet0571   mpl TRUE 0.985 -3.000 0.072 NA   NA
 3489617 3489618 Bpet0572 Bpet0573   aroQ FALSE 0.118 136.000 0.041 1.000 N NA
 3489618 3489619 Bpet0573 Bpet0574 aroQ accB2 FALSE 0.510 101.000 0.254 1.000 N NA
 3489619 3489620 Bpet0574 Bpet0575 accB2   TRUE 0.997 9.000 0.275 0.001 Y NA
 3489620 3489621 Bpet0575 Bpet0576   prmA TRUE 0.600 46.000 0.152 1.000 N NA
 3489621 3489622 Bpet0576 Bpet0577 prmA   TRUE 0.688 24.000 0.004 NA   NA
 3489622 3489623 Bpet0577 Bpet0578     TRUE 0.894 13.000 0.011 NA   NA
 3489623 3489624 Bpet0578 Bpet0579     FALSE 0.037 148.000 0.011 1.000 N NA
 3489625 3489626 Bpet0580 Bpet0581     FALSE 0.061 178.000 0.010 1.000   NA
 3489626 3489627 Bpet0581 Bpet0582   nrdB FALSE 0.007 316.000 0.000 1.000   NA
 3489627 3489628 Bpet0582 Bpet0583 nrdB nrdA TRUE 0.992 24.000 0.564 0.001 Y NA
 3489628 3489629 Bpet0583 Bpet0584 nrdA iorA2 FALSE 0.000 305.000 0.000 1.000 N NA
 3489630 3489631 Bpet0585 Bpet0586     TRUE 0.935 -31.000 0.083 NA   NA
 3489631 3489632 Bpet0586 Bpet0587     TRUE 0.974 2.000 0.058 NA   NA
 3489636 3489637 Bpet0591 Bpet0592     FALSE 0.158 114.000 0.000 NA   NA
 3489637 3489638 Bpet0592 Bpet0593   rplM FALSE 0.000 299.000 0.000 1.000 N NA
 3489638 3489639 Bpet0593 Bpet0594 rplM rpsI TRUE 0.997 10.000 0.601 0.011 Y NA
 3489639 3489640 Bpet0594 Bpet0595 rpsI argC1 FALSE 0.178 103.000 0.032 1.000 N NA
 3489640 3489641 Bpet0595 Bpet0596 argC1   FALSE 0.393 52.000 0.004 NA   NA
 3489641 3489642 Bpet0596 Bpet0597     FALSE 0.312 88.000 0.005 NA   NA
 3489644 3489645 Bpet0599 Bpet0600   fhaC FALSE 0.009 180.000 0.000 NA N NA
 3489645 3489646 Bpet0600 Bpet0601 fhaC fhaB FALSE 0.438 28.000 0.000 1.000   NA
 3489646 3489647 Bpet0601 Bpet0602 fhaB   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3489647 3489648 Bpet0602 Bpet0603     FALSE 0.007 376.000 0.000 NA   NA
 3489649 3489650 Bpet0604 Bpet0605     TRUE 0.988 -3.000 0.042 0.096   NA
 3489651 3489652 Bpet0606 Bpet0607     TRUE 0.570 39.000 0.000 0.096   NA
 3489652 3489653 Bpet0607 Bpet0608     TRUE 0.598 51.000 0.000 0.024   NA
 3489653 3489654 Bpet0608 Bpet0609     TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 3489655 3489656 Bpet0610 Bpet0611     TRUE 0.893 18.000 0.184 1.000 N NA
 3489657 3489658 Bpet0612 Bpet0613 tyrS   TRUE 0.589 31.000 0.005 NA   NA
 3489658 3489659 Bpet0613 Bpet0614   glyA FALSE 0.004 567.000 0.000 NA   NA
 3489659 3489660 Bpet0614 Bpet0615 glyA   FALSE 0.282 114.000 0.069 NA N NA
 3489660 3489661 Bpet0615 Bpet0616   ribD TRUE 0.845 30.000 0.277 NA N NA
 3489661 3489662 Bpet0616 Bpet0617 ribD ribE TRUE 0.941 38.000 0.456 1.000 Y NA
 3489662 3489663 Bpet0617 Bpet0618 ribE   FALSE 0.002 338.000 0.000 NA N NA
 3489663 3489664 Bpet0618 Bpet0619     TRUE 0.986 13.000 0.683 NA   NA
 3489664 3489665 Bpet0619 Bpet0620     TRUE 0.996 -3.000 0.761 NA   NA
 3489665 3489666 Bpet0620 Bpettrna_03   b_petrii_trna_03 FALSE 0.187 105.000 0.000 NA   NA
 3489666 3489667 Bpettrna_03 Bpet0621 b_petrii_trna_03   FALSE 0.012 304.000 0.000 NA   NA
 3489667 3489668 Bpet0621 Bpet0622   lytR FALSE 0.067 237.000 0.000 0.012   NA
 3489669 3489670 Bpet0623 Bpet0624     FALSE 0.114 135.000 0.000 NA   NA
 3489671 3489672 Bpet0625 Bpet0626   nadC FALSE 0.173 122.000 0.010 1.000   NA
 3489672 3489673 Bpet0626 Bpet0627 nadC   FALSE 0.007 111.000 0.000 1.000 N NA
 3489674 3489675 Bpet0628 Bpet0629 fabI mltD FALSE 0.230 91.000 0.037 1.000 N NA
 3489675 3489676 Bpet0629 Bpet0630 mltD gloB TRUE 0.973 11.000 0.233 1.000   NA
 3489677 3489678 Bpet0631 Bpet0632 rnhA   FALSE 0.028 150.000 0.008 1.000 N NA
 3489678 3489679 Bpet0632 Bpet0633     TRUE 0.993 -3.000 0.900 1.000 N NA
 3489679 3489680 Bpet0633 Bpet0634   dnaQ TRUE 0.675 7.000 0.007 1.000 N NA
 3489680 3489681 Bpet0634 Bpettrna_04 dnaQ b_petrii_trna_04 FALSE 0.276 70.000 0.000 NA   NA
 3489681 3489682 Bpettrna_04 Bpet0635 b_petrii_trna_04   FALSE 0.019 242.000 0.000 NA   NA
 3489688 3489689 Bpet0641 Bpet0642     TRUE 0.996 -3.000 0.111 NA Y NA
 3489689 3489690 Bpet0642 Bpet0643     FALSE 0.209 152.000 0.074 1.000   NA
 3489691 3489692 Bpet0644 Bpet0645     FALSE 0.000 447.000 0.000 1.000 N NA
 3489692 3489693 Bpet0645 Bpet0646     TRUE 0.985 -3.000 0.025 0.098   NA
 3489694 3489695 Bpet0647 Bpet0648     TRUE 0.734 70.000 0.200 NA   NA
 3489695 3489696 Bpet0648 Bpet0649     TRUE 0.674 94.000 0.200 NA   NA
 3489696 3489697 Bpet0649 Bpet0650   fusA1 FALSE 0.002 174.000 0.000 1.000 N NA
 3489698 3489699 Bpet0651 Bpet0652     TRUE 0.995 0.000 0.083 0.095 Y NA
 3489699 3489700 Bpet0652 Bpet0653     FALSE 0.108 137.000 0.000 NA   NA
 3489701 3489702 Bpet0654 Bpet0655     TRUE 0.584 25.000 0.000 NA   NA
 3489703 3489704 Bpet0656 Bpet0657   pal TRUE 0.633 86.000 0.167 1.000   NA
 3489704 3489705 Bpet0657 Bpet0658 pal tolB TRUE 0.863 32.000 0.592 1.000 N NA
 3489705 3489706 Bpet0658 Bpet0659 tolB tolA TRUE 0.930 17.000 0.005 0.005   NA
 3489706 3489707 Bpet0659 Bpet0660 tolA tolR TRUE 0.744 34.000 0.015 0.098   NA
 3489707 3489708 Bpet0660 Bpet0661 tolR tolQ TRUE 0.998 0.000 0.556 0.086 Y NA
 3489708 3489709 Bpet0661 Bpet0662 tolQ   TRUE 0.989 4.000 0.593 1.000   NA
 3489709 3489710 Bpet0662 Bpet0663   proS TRUE 0.714 -97.000 0.004 1.000   NA
 3489711 3489712 Bpet0664 Bpet0665     TRUE 0.829 -19.000 0.007 1.000   NA
 3489712 3489713 Bpet0665 Bpet0666     TRUE 0.993 -19.000 0.900 1.000 Y NA
 3489716 3489717 Bpet0669 Bpet0670     FALSE 0.036 192.000 0.000 NA   NA
 3489717 3489718 Bpet0670 Bpet0671     TRUE 0.983 14.000 0.667 NA   NA
 3489719 3489720 Bpet0672 Bpet0673     TRUE 0.948 0.000 0.005 NA   NA
 3489720 3489721 Bpet0673 Bpet0674     FALSE 0.011 305.000 0.000 NA   NA
 3489723 3489724 Bpet0676 Bpet0677 ilvD2 cyt FALSE 0.140 -16.000 0.000 1.000 N NA
 3489724 3489725 Bpet0677 Bpet0678 cyt   FALSE 0.004 145.000 0.000 1.000 N NA
 3489725 3489726 Bpet0678 Bpet0679     TRUE 0.888 25.000 0.176 1.000   NA
 3489726 3489727 Bpet0679 Bpet0680     TRUE 0.990 -3.000 0.220 1.000   NA
 3489729 3489730 Bpet0682 Bpetrrna_01     FALSE 0.003 744.000 0.000 NA   NA
 3489730 3489731 Bpetrrna_01 Bpettrna_05   b_petrii_trna_05 FALSE 0.065 159.000 0.000 NA   NA
 3489731 3489732 Bpettrna_05 Bpettrna_06 b_petrii_trna_05 b_petrii_trna_06 FALSE 0.289 60.000 0.000 NA   NA
 3489732 3489733 Bpettrna_06 Bpetrrna_02 b_petrii_trna_06   FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 3489733 3489734 Bpetrrna_02 Bpetrrna_03     FALSE 0.091 145.000 0.000 NA   NA
 3489734 3489735 Bpetrrna_03 Bpet0684     FALSE 0.042 182.000 0.000 NA   NA
 3489737 3489738 Bpet0686 Bpet0687   pyrC TRUE 0.697 21.000 0.007 1.000   NA
 3489740 3489741 Bpet0689 Bpet0690   mraW TRUE 0.988 9.000 0.635 NA   NA
 3489741 3489742 Bpet0690 Bpet0691 mraW ftsL TRUE 0.980 0.000 0.227 1.000 N NA
 3489742 3489743 Bpet0691 Bpet0692 ftsL ftsI TRUE 0.977 -3.000 0.124 1.000 N NA
 3489743 3489744 Bpet0692 Bpet0693 ftsI murE TRUE 0.994 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 3489744 3489745 Bpet0693 Bpet0694 murE mraY TRUE 0.988 -10.000 0.011 0.003 Y NA
 3489745 3489746 Bpet0694 Bpet0695 mraY murD TRUE 0.999 -3.000 0.647 0.003 Y NA
 3489746 3489747 Bpet0695 Bpet0696 murD ftsW TRUE 0.995 0.000 0.297 0.002 N NA
 3489747 3489748 Bpet0696 Bpet0697 ftsW murG1 TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 3489748 3489749 Bpet0697 Bpet0698 murG1 murC TRUE 0.997 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 3489749 3489750 Bpet0698 Bpet0699 murC ddlB TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.003 Y NA
 3489750 3489751 Bpet0699 Bpet0700 ddlB ftsQ TRUE 0.992 13.000 0.372 NA Y NA
 3489751 3489752 Bpet0700 Bpet0701 ftsQ ftsA TRUE 0.979 5.000 0.389 NA N NA
 3489752 3489753 Bpet0701 Bpet0702 ftsA FtsZ FALSE 0.483 187.000 0.460 1.000 Y NA
 3489753 3489754 Bpet0702 Bpet0703 FtsZ lpxC FALSE 0.291 126.000 0.134 1.000 N NA
 3489756 3489757 Bpet0705 Bpet0706   secA FALSE 0.134 164.000 0.111 1.000 N NA
 3489757 3489758 Bpet0706 Bpet0707 secA   TRUE 0.964 -3.000 0.009 NA   NA
 3489760 3489761 Bpet0709 Bpet0710     TRUE 0.769 40.000 0.400 1.000 N NA
 3489762 3489763 Bpet0711 Bpet0712     TRUE 0.809 13.000 0.018 NA N NA
 3489763 3489764 Bpet0712 Bpet0713     FALSE 0.443 73.000 0.020 NA   NA
 3489769 3489770 Bpet0718 Bpet0719     FALSE 0.001 247.000 0.000 1.000 N NA
 3489770 3489771 Bpet0719 Bpet0720     FALSE 0.009 332.000 0.034 1.000 N NA
 3489771 3489772 Bpet0720 Bpet0721     TRUE 0.990 -43.000 0.914 1.000 Y NA
 3489772 3489773 Bpet0721 Bpet0722     TRUE 0.850 44.000 0.073 NA Y NA
 3489773 3489774 Bpet0722 Bpettrna_07   b_petrii_trna_07 FALSE 0.320 50.000 0.000 NA   NA
 3489776 3489777 Bpet0724 Bpet0725     TRUE 0.993 23.000 0.660 0.001 Y NA
 3489777 3489778 Bpet0725 Bpet0726     TRUE 0.993 -97.000 0.308 0.001 Y NA
 3489780 3489781 Bpet0728 Bpet0729     TRUE 0.663 21.000 0.000 NA   NA
 3489781 3489782 Bpet0729 Bpet0730     TRUE 0.892 4.000 0.000 NA   NA
 3489782 3489783 Bpet0730 Bpet0731     TRUE 0.901 32.000 0.333 NA   NA
 3489783 3489784 Bpet0731 Bpet0732     TRUE 0.946 -16.000 0.167 NA N NA
 3489784 3489785 Bpet0732 Bpet0733   bug17 FALSE 0.374 40.000 0.000 NA   NA
 3489785 3489786 Bpet0733 Bpet0734 bug17   FALSE 0.094 143.000 0.000 NA   NA
 3489786 3489787 Bpet0734 Bpet0735   tagB FALSE 0.308 85.000 0.004 NA   NA
 3489787 3489788 Bpet0735 Bpet0736 tagB   FALSE 0.023 181.000 0.006 NA N NA
 3489792 3489793 Bpet0740 Bpet0741 menG1   FALSE 0.166 30.000 0.000 NA N NA
 3489793 3489794 Bpet0741 Bpet0742   bug18 TRUE 0.691 19.000 0.000 NA   NA
 3489794 3489795 Bpet0742 Bpet0743 bug18   TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3489795 3489796 Bpet0743 Bpet0744     TRUE 0.756 16.000 0.000 NA   NA
 3489796 3489797 Bpet0744 Bpet0745     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3489797 3489798 Bpet0745 Bpettrna_08   b_petrii_trna_08 FALSE 0.047 177.000 0.000 NA   NA
 3489798 3489799 Bpettrna_08 Bpet0746 b_petrii_trna_08   FALSE 0.007 389.000 0.000 NA   NA
 3489799 3489800 Bpet0746 Bpet0747     FALSE 0.320 50.000 0.000 NA   NA
 3489804 3489805 Bpet0751 Bpet0752     FALSE 0.032 178.000 0.000 1.000   NA
 3489805 3489806 Bpet0752 Bpet0753     TRUE 0.676 20.000 0.000 NA   NA
 3489806 3489807 Bpet0753 Bpet0754     TRUE 0.914 2.000 0.000 NA   NA
 3489807 3489808 Bpet0754 Bpet0755     FALSE 0.121 131.000 0.000 NA   NA
 3489808 3489809 Bpet0755 Bpet0756     FALSE 0.117 67.000 0.008 1.000 N NA
 3489810 3489811 Bpet0757 Bpet0758     FALSE 0.185 131.000 0.008 NA   NA
 3489811 3489812 Bpet0758 Bpet0759     TRUE 0.994 0.000 0.642 NA   NA
 3489813 3489814 Bpet0760 Bpet0761 ostA   TRUE 0.981 -3.000 0.168 1.000 N NA
 3489814 3489815 Bpet0761 Bpet0762   ksgA TRUE 0.669 18.000 0.028 1.000 N NA
 3489818 3489819 Bpet0765 Bpet0766     FALSE 0.052 24.000 0.000 1.000 N NA
 3489819 3489820 Bpet0766 Bpet0767     FALSE 0.240 85.000 0.000 NA   NA
 3489820 3489821 Bpet0767 Bpet0768     FALSE 0.374 40.000 0.000 NA   NA
 3489823 3489824 Bpet0770 Bpet0771   gloA TRUE 0.513 20.000 0.014 1.000 N NA
 3489824 3489825 Bpet0771 Bpet0772 gloA citB FALSE 0.347 86.000 0.009 NA   NA
 3489825 3489826 Bpet0772 Bpet0773 citB   TRUE 0.993 2.000 0.618 NA   NA
 3489826 3489827 Bpet0773 Bpet0774     FALSE 0.263 79.000 0.039 1.000 N NA
 3489827 3489828 Bpet0774 Bpet0775     TRUE 0.896 10.000 0.006 NA   NA
 3489828 3489829 Bpet0775 Bpet0776   plsC TRUE 0.948 -22.000 0.099 NA   NA
 3489829 3489830 Bpet0776 Bpet0777 plsC   TRUE 0.974 4.000 0.279 1.000 N NA
 3489830 3489831 Bpet0777 Bpet0778   glyS TRUE 0.977 -3.000 0.123 1.000 N NA
 3489831 3489832 Bpet0778 Bpet0779 glyS glyQ TRUE 0.999 1.000 0.651 0.001 Y NA
 3489833 3489834 Bpet0780 Bpet0781     FALSE 0.316 98.000 0.054 NA N NA
 3489834 3489835 Bpet0781 Bpet0782     TRUE 0.538 9.000 0.000 NA N NA
 3489835 3489836 Bpet0782 Bpet0783     FALSE 0.000 705.000 0.000 1.000 N NA
 3489836 3489837 Bpet0783 Bpet0784   fumA FALSE 0.081 105.000 0.009 1.000 N NA
 3489837 3489838 Bpet0784 Bpet0785 fumA   FALSE 0.003 146.000 0.000 1.000 N NA
 3489838 3489839 Bpet0785 Bpet0786     TRUE 0.995 0.000 0.083 0.094 Y NA
 3489839 3489840 Bpet0786 Bpet0787     FALSE 0.046 178.000 0.000 NA   NA
 3489842 3489843 Bpet0789 Bpet0790     TRUE 0.865 7.000 0.000 NA   NA
 3489844 3489845 Bpet0791 Bpet0792     FALSE 0.003 724.000 0.000 NA   NA
 3489845 3489846 Bpet0792 Bpet0793     FALSE 0.026 214.000 0.000 NA   NA
 3489846 3489847 Bpet0793 Bpet0794     TRUE 0.865 78.000 0.273 1.000 Y NA
 3489847 3489848 Bpet0794 Bpet0795     TRUE 0.981 0.000 0.250 1.000 N NA
 3489848 3489849 Bpet0795 Bpet0796     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.031 Y NA
 3489849 3489850 Bpet0796 Bpet0797     TRUE 0.998 -3.000 0.556 1.000 Y NA
 3489850 3489851 Bpet0797 Bpet0798     TRUE 0.979 36.000 0.778 0.071 Y NA
 3489851 3489852 Bpet0798 Bpet0799     TRUE 0.975 22.000 0.273 NA Y NA
 3489854 3489855 Bpet0801 Bpet0802     FALSE 0.069 20.000 0.000 1.000 N NA
 3489855 3489856 Bpet0802 Bpet0803     TRUE 0.980 8.000 0.000 0.064 Y NA
 3489858 3489859 Bpet0805 Bpet0806     FALSE 0.356 35.000 0.000 1.000   NA
 3489859 3489860 Bpet0806 Bpet0807     FALSE 0.145 13.000 0.000 1.000 N NA
 3489860 3489861 Bpet0807 Bpet0808     FALSE 0.326 48.000 0.000 NA   NA
 3489861 3489862 Bpet0808 Bpet0809     FALSE 0.481 32.000 0.000 NA   NA
 3489863 3489864 Bpet0810 Bpet0811 bug19   FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 3489864 3489865 Bpet0811 Bpet0812     FALSE 0.326 48.000 0.000 NA   NA
 3489866 3489867 Bpet0813 Bpet0814   bug20 TRUE 0.628 18.000 0.000 1.000   NA
 3489868 3489869 Bpet0815 Bpet0816     TRUE 0.984 28.000 0.368 0.008 Y NA
 3489869 3489870 Bpet0816 Bpet0817     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3489870 3489871 Bpet0817 Bpet0818     FALSE 0.139 121.000 0.000 NA   NA
 3489871 3489872 Bpet0818 Bpet0819     TRUE 0.651 57.000 0.081 NA   NA
 3489872 3489873 Bpet0819 Bpet0820     TRUE 0.987 0.000 0.500 1.000 N NA
 3489874 3489875 Bpet0821 Bpet0822 folK pcnB TRUE 0.985 -3.000 0.234 1.000 N NA
 3489875 3489876 Bpet0822 Bpet0823 pcnB   TRUE 0.844 0.000 0.011 1.000 N NA
 3489876 3489877 Bpet0823 Bpet0824     TRUE 0.960 -3.000 0.015 1.000   NA
 3489879 3489880 Bpet0826 Bpet0827 miaA mutL TRUE 0.777 46.000 0.188 0.089 N NA
 3489882 3489883 Bpet0829 Bpet0830   amiC FALSE 0.222 94.000 0.000 NA   NA
 3489883 3489884 Bpet0830 Bpet0831 amiC   TRUE 0.721 -69.000 0.000 NA   NA
 3489890 3489891 Bpet0837 Bpet0838   bug22 TRUE 0.983 13.000 0.667 1.000   NA
 3489891 3489892 Bpet0838 Bpet0839 bug22   FALSE 0.267 100.000 0.014 1.000   NA
 3489897 3489898 Bpet0844 Bpet0845     FALSE 0.013 71.000 0.000 1.000 N NA
 3489898 3489899 Bpet0845 Bpet0846   gatA3 FALSE 0.275 2.000 0.000 1.000 N NA
 3489899 3489900 Bpet0846 Bpet0847 gatA3   FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3489900 3489901 Bpet0847 Bpet0848     TRUE 0.953 -13.000 0.000 NA Y NA
 3489901 3489902 Bpet0848 Bpet0849     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3489902 3489903 Bpet0849 Bpet0850     TRUE 0.628 18.000 0.000 1.000   NA
 3489903 3489904 Bpet0850 Bpet0851   acd5 TRUE 0.894 32.000 0.400 1.000   NA
 3489904 3489905 Bpet0851 Bpet0852 acd5   TRUE 0.989 -3.000 0.400 1.000 N NA
 3489905 3489906 Bpet0852 Bpet0853     TRUE 0.990 -3.000 0.500 1.000 N NA
 3489906 3489907 Bpet0853 Bpet0854     FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3489907 3489908 Bpet0854 Bpet0855     TRUE 0.937 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 3489909 3489910 Bpet0856 Bpet0857   purU FALSE 0.127 14.000 0.000 1.000 N NA
 3489910 3489911 Bpet0857 Bpet0858 purU   FALSE 0.471 42.000 0.018 1.000   NA
 3489911 3489912 Bpet0858 Bpet0859     TRUE 0.948 14.000 0.018 0.064   NA
 3489912 3489913 Bpet0859 Bpet0860   pdxH TRUE 0.938 -40.000 0.006 0.005   NA
 3489913 3489914 Bpet0860 Bpet0861 pdxH   FALSE 0.354 69.000 0.004 NA   NA
 3489915 3489916 Bpet0862 Bpet0863 tnp3   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.094 Y NA
 3489917 3489918 Bpet0864 Bpet0865     TRUE 0.984 -3.000 0.070 NA   NA
 3489920 3489921 Bpet0867 Bpet0868     TRUE 0.979 3.000 0.333 1.000 N NA
 3489922 3489923 Bpet0869 Bpet0870 bug23   TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000   NA
 3489924 3489925 Bpet0871 Bpet0872     TRUE 0.945 29.000 0.219 1.000 Y NA
 3489925 3489926 Bpet0872 Bpet0873   uvrA1 TRUE 0.710 7.000 0.009 1.000 N NA
 3489927 3489928 Bpet0874 Bpet0875   kdgA FALSE 0.074 19.000 0.000 1.000 N NA
 3489928 3489929 Bpet0875 Bpet0876 kdgA   TRUE 0.958 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3489933 3489934 Bpet0880 Bpet0881     FALSE 0.269 76.000 0.004 1.000   NA
 3489934 3489935 Bpet0881 Bpet0882     FALSE 0.302 66.000 0.005 1.000   NA
 3489935 3489936 Bpet0882 Bpet0883   osmB FALSE 0.047 206.000 0.008 NA   NA
 3489938 3489939 Bpet0885 Bpet0886     TRUE 0.974 -136.000 0.229 1.000 Y NA
 3489939 3489940 Bpet0886 Bpet0887     FALSE 0.390 54.000 0.057 1.000 N NA
 3489940 3489941 Bpet0887 Bpet0888     TRUE 0.890 79.000 0.333 NA Y NA
 3489941 3489942 Bpet0888 Bpet0889     TRUE 0.984 24.000 1.000 NA Y NA
 3489942 3489943 Bpet0889 Bpet0890     FALSE 0.030 34.000 0.000 1.000 N NA
 3489944 3489945 Bpet0891 Bpet0892 minE minD TRUE 0.996 4.000 0.618 NA Y NA
 3489945 3489946 Bpet0892 Bpet0893 minD minC TRUE 0.829 110.000 0.466 1.000 Y NA
 3489946 3489947 Bpet0893 Bpet0894 minC glnS TRUE 0.541 14.000 0.006 1.000 N NA
 3489948 3489949 Bpet0895 Bpet0896     TRUE 0.999 -3.000 0.886 0.076 Y NA
 3489950 3489951 Bpet0897 Bpet0898     TRUE 0.992 14.000 0.667 1.000 Y NA
 3489952 3489953 Bpet0899 Bpet0900   recQ FALSE 0.337 79.000 0.005 NA   NA
 3489955 3489956 Bpet0902 Bpet0903     FALSE 0.440 74.000 0.006 0.054 N NA
 3489957 3489958 Bpet0904 Bpet0905 ruvA ruvC TRUE 0.951 79.000 0.451 0.011 Y NA
 3489958 3489959 Bpet0905 Bpet0906 ruvC purH TRUE 0.896 0.000 0.023 1.000 N NA
 3489959 3489960 Bpet0906 Bpet0907 purH fis FALSE 0.092 46.000 0.003 1.000 N NA
 3489960 3489961 Bpet0907 Bpet0908 fis   FALSE 0.129 36.000 0.003 1.000 N NA
 3489961 3489962 Bpet0908 Bpet0909   ubiH TRUE 0.753 31.000 0.019 0.017 N NA
 3489967 3489968 Bpet0914 Bpet0915     FALSE 0.231 90.000 0.000 NA   NA
 3489971 3489972 Bpet0918 Bpet0919     TRUE 0.951 7.000 0.044 NA   NA
 3489972 3489973 Bpet0919 Bpet0920     TRUE 0.959 8.000 0.065 NA   NA
 3489973 3489974 Bpet0920 Bpet0921   ilvE TRUE 0.803 44.000 0.223 NA   NA
 3489975 3489976 Bpet0922 Bpet0923     TRUE 0.994 -3.000 0.434 NA   NA
 3489976 3489977 Bpet0923 Bpet0924   rhlE2 FALSE 0.388 104.000 0.034 NA   NA
 3489979 3489980 Bpet0926 Bpet0927     TRUE 0.926 -61.000 0.123 1.000   NA
 3489980 3489981 Bpet0927 Bpet0928     FALSE 0.077 158.000 0.006 1.000   NA
 3489984 3489985 Bpet0931 Bpet0932 pyrD ate FALSE 0.410 40.000 0.044 1.000 N NA
 3489985 3489986 Bpet0932 Bpet0933 ate aat TRUE 0.883 61.000 0.285 1.000 Y NA
 3489986 3489987 Bpet0933 Bpet0934 aat   TRUE 0.931 3.000 0.058 1.000 N NA
 3489987 3489988 Bpet0934 Bpet0935     FALSE 0.333 46.000 0.000 NA   NA
 3489988 3489989 Bpet0935 Bpet0936     FALSE 0.242 84.000 0.000 NA   NA
 3489989 3489990 Bpet0936 Bpet0937     FALSE 0.043 214.000 0.000 0.025 N NA
 3489991 3489992 Bpet0938 Bpet0939     FALSE 0.279 66.000 0.000 NA   NA
 3489992 3489993 Bpet0939 Bpet0940     FALSE 0.055 170.000 0.000 NA   NA
 3489993 3489994 Bpet0940 Bpet0941     FALSE 0.012 304.000 0.000 NA   NA
 3489995 3489996 Bpet0942 Bpet0943     FALSE 0.044 180.000 0.000 NA   NA
 3489996 3489997 Bpet0943 Bpet0944     FALSE 0.033 200.000 0.000 NA   NA
 3489997 3489998 Bpet0944 Bpet0945     TRUE 0.914 2.000 0.000 NA   NA
 3489998 3489999 Bpet0945 Bpet0946     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3489999 3490000 Bpet0946 Bpet0947     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490002 3490003 Bpet0949 Bpet0950   recF TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490003 3490004 Bpet0950 Bpet0951 recF   TRUE 0.880 5.000 0.000 NA   NA
 3490004 3490005 Bpet0951 Bpet0952   recT FALSE 0.016 267.000 0.000 NA   NA
 3490005 3490006 Bpet0952 Bpet0953 recT recB FALSE 0.280 65.000 0.000 NA   NA
 3490006 3490007 Bpet0953 Bpet0954 recB   TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3490007 3490008 Bpet0954 Bpet0955     FALSE 0.034 197.000 0.000 NA   NA
 3490008 3490009 Bpet0955 Bpet0956     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490009 3490010 Bpet0956 Bpet0957     FALSE 0.024 222.000 0.000 NA   NA
 3490010 3490011 Bpet0957 Bpet0958     FALSE 0.021 239.000 0.000 NA   NA
 3490011 3490012 Bpet0958 Bpet0959     FALSE 0.063 161.000 0.000 NA   NA
 3490012 3490013 Bpet0959 Bpet0960     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3490013 3490014 Bpet0960 Bpet0961     FALSE 0.311 53.000 0.000 NA   NA
 3490014 3490015 Bpet0961 Bpet0962     FALSE 0.211 97.000 0.000 NA   NA
 3490015 3490016 Bpet0962 Bpet0963     TRUE 0.643 22.000 0.000 NA   NA
 3490019 3490020 Bpet0966 Bpet0967     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3490022 3490023 Bpet0969 Bpet0970     TRUE 0.801 -19.000 0.000 NA   NA
 3490023 3490024 Bpet0970 Bpet0971     FALSE 0.218 95.000 0.000 NA   NA
 3490024 3490025 Bpet0971 Bpet0972     FALSE 0.088 146.000 0.000 NA   NA
 3490025 3490026 Bpet0972 Bpet0973     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3490028 3490029 Bpet0975 Bpet0976     TRUE 0.962 2.000 0.026 NA   NA
 3490029 3490030 Bpet0976 Bpet0977     TRUE 0.981 3.000 0.111 NA   NA
 3490030 3490031 Bpet0977 Bpet0978     TRUE 0.945 -64.000 0.167 NA   NA
 3490031 3490032 Bpet0978 Bpet0979     TRUE 0.973 11.000 0.174 NA   NA
 3490032 3490033 Bpet0979 Bpet0980     TRUE 0.963 10.000 0.087 NA   NA
 3490033 3490034 Bpet0980 Bpet0981     TRUE 0.644 67.000 0.091 NA   NA
 3490034 3490035 Bpet0981 Bpet0982     TRUE 0.914 2.000 0.000 NA   NA
 3490035 3490036 Bpet0982 Bpet0983     TRUE 0.904 3.000 0.000 NA   NA
 3490036 3490037 Bpet0983 Bpet0984     TRUE 0.835 -13.000 0.000 NA   NA
 3490037 3490038 Bpet0984 Bpet0985     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3490038 3490039 Bpet0985 Bpet0986     TRUE 0.559 155.000 1.000 NA   NA
 3490039 3490040 Bpet0986 Bpet0987     TRUE 0.780 58.000 0.250 NA   NA
 3490040 3490041 Bpet0987 Bpet0988     TRUE 0.977 12.000 0.250 NA   NA
 3490041 3490042 Bpet0988 Bpet0989     TRUE 0.993 0.000 0.429 NA   NA
 3490042 3490043 Bpet0989 Bpet0990     FALSE 0.078 150.000 0.000 NA   NA
 3490043 3490044 Bpet0990 Bpet0991     TRUE 0.990 -3.000 0.133 NA   NA
 3490044 3490045 Bpet0991 Bpet0992     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3490045 3490046 Bpet0992 Bpet0993     TRUE 0.979 -13.000 0.286 NA   NA
 3490046 3490047 Bpet0993 Bpet0994     TRUE 0.995 -3.000 0.571 NA   NA
 3490047 3490048 Bpet0994 Bpet0995     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490048 3490049 Bpet0995 Bpet0996     TRUE 0.623 23.000 0.000 NA   NA
 3490049 3490050 Bpet0996 Bpet0997     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3490050 3490051 Bpet0997 Bpet0998     TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 3490051 3490052 Bpet0998 Bpet0999     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490052 3490053 Bpet0999 Bpet1000     TRUE 0.851 10.000 0.000 NA   NA
 3490053 3490054 Bpet1000 Bpet1001     TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3490054 3490055 Bpet1001 Bpet1002     FALSE 0.269 74.000 0.000 NA   NA
 3490055 3490056 Bpet1002 Bpet1003     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490056 3490057 Bpet1003 Bpet1004     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 3490058 3490059 Bpet1005 Bpet1006     FALSE 0.034 199.000 0.000 NA   NA
 3490059 3490060 Bpet1006 Bpet1007     FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 3490060 3490061 Bpet1007 Bpet1008     TRUE 0.623 23.000 0.000 NA   NA
 3490061 3490062 Bpet1008 Bpettrna_09   b_petrii_trna_09 FALSE 0.011 313.000 0.000 NA   NA
 3490062 3490063 Bpettrna_09 Bpet1009 b_petrii_trna_09 arsH1 FALSE 0.005 466.000 0.000 NA   NA
 3490063 3490064 Bpet1009 Bpet1010 arsH1   FALSE 0.009 344.000 0.000 NA   NA
 3490065 3490066 Bpet1011 Bpet1012     TRUE 0.780 12.000 0.000 1.000   NA
 3490066 3490067 Bpet1012 Bpet1013     FALSE 0.007 391.000 0.000 NA   NA
 3490067 3490068 Bpet1013 Bpet1014     FALSE 0.387 39.000 0.000 NA   NA
 3490068 3490069 Bpet1014 Bpet1015     TRUE 0.690 -33.000 0.000 1.000   NA
 3490069 3490070 Bpet1015 Bpet1016     FALSE 0.313 52.000 0.000 NA   NA
 3490071 3490072 Bpet1017 Bpet1018     FALSE 0.013 70.000 0.000 1.000 N NA
 3490072 3490073 Bpet1018 Bpet1019     FALSE 0.153 150.000 0.000 0.092   NA
 3490074 3490075 Bpet1020 Bpet1021     FALSE 0.095 124.000 0.000 1.000   NA
 3490076 3490077 Bpet1022 Bpet1023 arsC1   TRUE 0.984 -27.000 0.250 1.000 Y NA
 3490077 3490078 Bpet1023 Bpet1024     TRUE 0.980 11.000 1.000 1.000 N NA
 3490078 3490079 Bpet1024 Bpet1025     TRUE 0.971 13.000 0.250 1.000   NA
 3490079 3490080 Bpet1025 Bpet1026     TRUE 0.980 13.000 0.500 1.000   NA
 3490081 3490082 Bpet1027 Bpet1028   alpA1 TRUE 0.513 119.000 0.149 NA   NA
 3490082 3490083 Bpet1028 Bpet1029 alpA1 parA1 TRUE 0.615 43.000 0.106 NA N NA
 3490083 3490084 Bpet1029 Bpet1030 parA1   TRUE 0.986 -16.000 0.800 NA   NA
 3490084 3490085 Bpet1030 Bpet1031     TRUE 0.991 -7.000 0.800 NA   NA
 3490085 3490086 Bpet1031 Bpet1032     TRUE 0.984 15.000 1.000 NA   NA
 3490086 3490087 Bpet1032 Bpet1033     TRUE 0.992 4.000 0.714 NA   NA
 3490087 3490088 Bpet1033 Bpet1034     FALSE 0.006 431.000 0.000 NA   NA
 3490088 3490089 Bpet1034 Bpet1035     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 3490089 3490090 Bpet1035 Bpet1036   ssb1 FALSE 0.267 75.000 0.000 NA   NA
 3490090 3490091 Bpet1036 Bpet1037 ssb1 topB2 FALSE 0.046 276.000 0.000 1.000 Y NA
 3490091 3490092 Bpet1037 Bpet1038 topB2   FALSE 0.003 532.000 0.000 1.000   NA
 3490093 3490094 Bpet1039 Bpet1040     TRUE 0.985 -7.000 0.000 0.011 Y NA
 3490094 3490095 Bpet1040 Bpet1041     TRUE 0.999 0.000 0.545 0.011 Y NA
 3490096 3490097 Bpet1042 Bpet1043     FALSE 0.019 244.000 0.000 NA   NA
 3490097 3490098 Bpet1043 Bpet1044     FALSE 0.308 55.000 0.000 NA   NA
 3490098 3490099 Bpet1044 Bpet1045     FALSE 0.006 434.000 0.000 NA   NA
 3490099 3490100 Bpet1045 Bpet1046     TRUE 0.643 22.000 0.000 NA   NA
 3490100 3490101 Bpet1046 Bpet1047     TRUE 0.736 -51.000 0.000 NA   NA
 3490101 3490102 Bpet1047 Bpet1048     TRUE 0.843 84.000 1.000 NA   NA
 3490102 3490103 Bpet1048 Bpet1049     TRUE 0.805 97.000 0.800 NA   NA
 3490103 3490104 Bpet1049 Bpet1050     FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 3490104 3490105 Bpet1050 Bpet1051     FALSE 0.139 121.000 0.000 NA   NA
 3490105 3490106 Bpet1051 Bpet1052     FALSE 0.008 363.000 0.000 NA   NA
 3490106 3490107 Bpet1052 Bpet1053     FALSE 0.091 145.000 0.000 NA   NA
 3490107 3490108 Bpet1053 Bpet1054     TRUE 0.741 95.000 0.364 NA   NA
 3490108 3490109 Bpet1054 Bpet1055     TRUE 0.657 95.000 0.182 NA   NA
 3490109 3490110 Bpet1055 Bpet1056     TRUE 0.754 107.000 0.667 NA   NA
 3490110 3490111 Bpet1056 Bpet1057     FALSE 0.004 602.000 0.000 NA   NA
 3490111 3490112 Bpet1057 Bpet1058     FALSE 0.025 219.000 0.000 NA   NA
 3490112 3490113 Bpet1058 Bpet1059     FALSE 0.260 77.000 0.000 NA   NA
 3490113 3490114 Bpet1059 Bpet1060     FALSE 0.003 728.000 0.000 NA   NA
 3490114 3490115 Bpet1060 Bpet1061     FALSE 0.086 131.000 0.000 1.000   NA
 3490115 3490116 Bpet1061 Bpet1062     FALSE 0.313 52.000 0.000 NA   NA
 3490116 3490117 Bpet1062 Bpet1063     TRUE 0.746 90.000 0.333 NA   NA
 3490117 3490118 Bpet1063 Bpet1064     FALSE 0.172 109.000 0.000 NA   NA
 3490118 3490119 Bpet1064 Bpet1065     FALSE 0.158 114.000 0.000 NA   NA
 3490119 3490120 Bpet1065 Bpet1066     FALSE 0.063 161.000 0.000 NA   NA
 3490120 3490121 Bpet1066 Bpet1067     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490121 3490122 Bpet1067 Bpet1068     TRUE 0.977 15.000 0.500 NA   NA
 3490122 3490123 Bpet1068 Bpet1069     TRUE 0.982 -18.000 0.600 NA   NA
 3490123 3490124 Bpet1069 Bpet1070     TRUE 0.992 -3.000 0.227 NA   NA
 3490124 3490125 Bpet1070 Bpet1071     TRUE 0.992 5.000 1.000 NA   NA
 3490125 3490126 Bpet1071 Bpet1072     TRUE 0.993 -3.000 0.273 NA   NA
 3490126 3490127 Bpet1072 Bpet1073     FALSE 0.202 99.000 0.000 NA   NA
 3490127 3490128 Bpet1073 Bpet1074     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490128 3490129 Bpet1074 Bpet1075     TRUE 0.733 17.000 0.000 NA   NA
 3490129 3490130 Bpet1075 Bpet1076     TRUE 0.825 13.000 0.000 NA   NA
 3490130 3490131 Bpet1076 Bpet1077     TRUE 0.996 -3.000 0.955 NA   NA
 3490131 3490132 Bpet1077 Bpet1078     TRUE 0.996 -3.000 0.955 NA   NA
 3490132 3490133 Bpet1078 Bpet1079     TRUE 0.990 -10.000 1.000 NA   NA
 3490133 3490134 Bpet1079 Bpet1080     TRUE 0.801 -19.000 0.000 NA   NA
 3490134 3490135 Bpet1080 Bpet1081     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3490135 3490136 Bpet1081 Bpet1082     TRUE 0.978 14.000 0.600 1.000   NA
 3490136 3490137 Bpet1082 Bpet1083   radC1 FALSE 0.320 175.000 1.000 1.000 N NA
 3490137 3490138 Bpet1083 Bpet1084 radC1   FALSE 0.406 164.000 0.400 NA   NA
 3490138 3490139 Bpet1084 Bpet1085     TRUE 0.937 27.000 0.500 NA   NA
 3490139 3490140 Bpet1085 Bpet1086     TRUE 0.851 10.000 0.000 NA   NA
 3490140 3490141 Bpet1086 Bpet1087     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 3490141 3490142 Bpet1087 Bpet1088     TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 3490143 3490144 Bpet1089 Bpet1090     TRUE 0.721 82.000 0.231 NA   NA
 3490144 3490145 Bpet1090 Bpet1091     TRUE 0.986 13.000 0.769 NA   NA
 3490150 3490151 Bpet1096 Bpet1097   bug25 FALSE 0.010 320.000 0.000 NA   NA
 3490155 3490156 Bpet1101 Bpet1102     TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3490156 3490157 Bpet1102 Bpet1103     FALSE 0.042 182.000 0.000 NA   NA
 3490157 3490158 Bpet1103 Bpet1104     FALSE 0.119 111.000 0.000 1.000   NA
 3490158 3490159 Bpet1104 Bpet1105     FALSE 0.226 58.000 0.000 1.000   NA
 3490159 3490160 Bpet1105 Bpet1106     TRUE 0.988 -3.000 0.042 0.091   NA
 3490161 3490162 Bpet1107 Bpet1108     FALSE 0.047 177.000 0.000 NA   NA
 3490162 3490163 Bpet1108 Bpet1109     FALSE 0.154 150.000 0.000 0.091   NA
 3490163 3490164 Bpet1109 Bpet1110     TRUE 0.880 5.000 0.000 NA   NA
 3490164 3490165 Bpet1110 Bpet1111     FALSE 0.235 87.000 0.000 NA   NA
 3490165 3490166 Bpet1111 Bpet1112   hyuA FALSE 0.100 16.000 0.000 1.000 N NA
 3490166 3490167 Bpet1112 Bpet1113 hyuA   FALSE 0.057 149.000 0.000 1.000   NA
 3490167 3490168 Bpet1113 Bpet1114     TRUE 0.988 -3.000 0.042 0.091   NA
 3490168 3490169 Bpet1114 Bpet1115     FALSE 0.146 226.000 0.042 0.022   NA
 3490170 3490171 Bpet1116 Bpet1117 acd6   FALSE 0.238 52.000 0.000 1.000   NA
 3490172 3490173 Bpet1118 Bpet1119     FALSE 0.508 28.000 0.000 0.097 N NA
 3490174 3490175 Bpet1120 Bpet1121     FALSE 0.029 124.000 0.000 NA N NA
 3490175 3490176 Bpet1121 Bpet1122     TRUE 0.815 65.000 0.080 NA Y NA
 3490176 3490177 Bpet1122 Bpet1123     TRUE 0.656 91.000 0.000 0.097 Y NA
 3490177 3490178 Bpet1123 Bpet1124     FALSE 0.005 135.000 0.000 1.000 N NA
 3490178 3490179 Bpet1124 Bpetpseudo_02   lcf' TRUE 0.923 0.000 0.034 1.000 N NA
 3490180 3490181 Bpet1125 Bpet1126   tnp4 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.091 Y NA
 3490182 3490183 Bpetpseudo_03 Bpet1127 'lcf   TRUE 0.972 -3.000 0.034 1.000   NA
 3490183 3490184 Bpet1127 Bpet1128     TRUE 0.998 4.000 0.667 0.068 Y NA
 3490184 3490185 Bpet1128 Bpet1129     TRUE 0.913 75.000 0.500 NA Y NA
 3490185 3490186 Bpet1129 Bpet1130     TRUE 0.741 76.000 0.036 NA Y NA
 3490186 3490187 Bpet1130 Bpet1131     FALSE 0.157 12.000 0.000 1.000 N NA
 3490187 3490188 Bpet1131 Bpet1132   kduD2 TRUE 0.741 55.000 0.000 0.097 Y NA
 3490190 3490191 Bpet1134 Bpet1135     FALSE 0.238 52.000 0.000 1.000   NA
 3490191 3490192 Bpet1135 Bpet1136     TRUE 0.584 25.000 0.000 NA   NA
 3490192 3490193 Bpet1136 Bpet1137     FALSE 0.009 341.000 0.000 NA   NA
 3490193 3490194 Bpet1137 Bpet1138     FALSE 0.008 363.000 0.000 NA   NA
 3490195 3490196 Bpet1139 Bpet1140     TRUE 0.988 -3.000 0.042 0.090   NA
 3490197 3490198 Bpet1141 Bpet1142     FALSE 0.308 55.000 0.000 NA   NA
 3490198 3490199 Bpet1142 Bpet1143     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490199 3490200 Bpet1143 Bpet1144     FALSE 0.251 80.000 0.000 NA   NA
 3490201 3490202 Bpet1145 Bpet1146   istB FALSE 0.016 262.000 0.000 NA   NA
 3490202 3490203 Bpet1146 Bpet1147 istB   TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 3490203 3490204 Bpet1147 Bpet1148     TRUE 0.762 -34.000 0.000 NA   NA
 3490204 3490205 Bpet1148 Bpet1149     TRUE 0.623 23.000 0.000 NA   NA
 3490205 3490206 Bpet1149 Bpet1150     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3490207 3490208 Bpet1151 Bpet1152     TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 3490208 3490209 Bpet1152 Bpet1153   pccB FALSE 0.472 33.000 0.000 NA   NA
 3490209 3490210 Bpet1153 Bpet1154 pccB pccA TRUE 0.994 4.000 0.019 0.001 Y NA
 3490210 3490211 Bpet1154 Bpet1155 pccA   TRUE 0.715 -52.000 0.000 0.097 N NA
 3490211 3490212 Bpet1155 Bpet1156     FALSE 0.105 40.000 0.000 NA N NA
 3490212 3490213 Bpet1156 Bpet1157   bug26 FALSE 0.278 68.000 0.000 NA   NA
 3490213 3490214 Bpet1157 Bpet1158 bug26   FALSE 0.202 74.000 0.000 1.000   NA
 3490214 3490215 Bpet1158 Bpet1159     TRUE 0.988 3.000 0.000 0.052 Y NA
 3490216 3490217 Bpet1160 Bpet1161     TRUE 0.984 3.000 0.000 0.090 Y NA
 3490217 3490218 Bpet1161 Bpet1162     FALSE 0.012 80.000 0.000 1.000 N NA
 3490218 3490219 Bpet1162 Bpet1163     FALSE 0.374 40.000 0.000 NA   NA
 3490219 3490220 Bpet1163 Bpet1164     TRUE 0.974 16.000 0.500 NA   NA
 3490220 3490221 Bpet1164 Bpet1165     TRUE 0.754 47.000 0.500 1.000 N NA
 3490221 3490222 Bpet1165 Bpet1166     TRUE 0.993 -10.000 0.103 0.029 Y NA
 3490222 3490223 Bpet1166 Bpet1167     TRUE 0.986 8.000 0.106 1.000 Y NA
 3490223 3490224 Bpet1167 Bpet1168     TRUE 0.991 -7.000 0.043 0.068 Y NA
 3490224 3490225 Bpet1168 Bpet1169     TRUE 0.931 50.000 0.667 1.000 Y NA
 3490225 3490226 Bpet1169 Bpet1170     TRUE 0.627 74.000 0.286 1.000 N NA
 3490226 3490227 Bpet1170 Bpet1171     TRUE 0.985 15.000 0.286 1.000 Y NA
 3490228 3490229 Bpet1172 Bpet1173   scoA FALSE 0.130 115.000 0.028 1.000 N NA
 3490229 3490230 Bpet1173 Bpet1174 scoA scoB TRUE 0.989 13.000 0.028 0.002 Y NA
 3490231 3490232 Bpet1175 Bpet1176     FALSE 0.148 33.000 0.000 NA N NA
 3490232 3490233 Bpet1176 Bpet1177     TRUE 0.721 48.000 0.007 NA Y NA
 3490233 3490234 Bpet1177 Bpet1178     TRUE 0.980 14.000 0.087 NA Y NA
 3490234 3490235 Bpet1178 Bpet1179     FALSE 0.510 123.000 0.400 NA N NA
 3490236 3490237 Bpet1180 Bpet1181     TRUE 0.982 12.000 0.400 NA   NA
 3490238 3490239 Bpet1182 Bpet1183     TRUE 0.958 -16.000 0.250 NA N NA
 3490240 3490241 Bpet1184 Bpet1185     TRUE 0.875 49.000 0.180 1.000 Y NA
 3490241 3490242 Bpet1185 Bpet1186     TRUE 0.993 13.000 0.180 0.068 Y NA
 3490242 3490243 Bpet1186 Bpet1187     TRUE 0.995 -10.000 0.909 1.000 Y NA
 3490243 3490244 Bpet1187 Bpet1188     TRUE 0.997 9.000 0.625 0.029 Y NA
 3490244 3490245 Bpet1188 Bpet1189     TRUE 0.551 52.000 0.125 1.000 N NA
 3490247 3490248 Bpet1191 Bpet1192 bug27   TRUE 0.653 17.000 0.000 1.000   NA
 3490250 3490251 Bpet1194 Bpet1195     TRUE 0.736 14.000 0.000 1.000   NA
 3490251 3490252 Bpet1195 Bpet1196     TRUE 0.866 3.000 0.000 1.000   NA
 3490252 3490253 Bpet1196 Bpet1197     TRUE 0.650 -55.000 0.000 1.000   NA
 3490253 3490254 Bpet1197 Bpet1198     TRUE 0.742 33.000 0.000 0.022   NA
 3490255 3490256 Bpet1199 Bpet1200     TRUE 0.988 -3.000 0.042 0.090   NA
 3490256 3490257 Bpet1200 Bpet1201     FALSE 0.052 152.000 0.000 1.000   NA
 3490257 3490258 Bpet1201 Bpet1202     FALSE 0.010 94.000 0.000 1.000 N NA
 3490258 3490259 Bpet1202 Bpet1203     TRUE 0.738 -40.000 0.000 0.093 N NA
 3490260 3490261 Bpet1204 Bpet1205     TRUE 0.988 -3.000 0.042 0.090   NA
 3490261 3490262 Bpet1205 Bpet1206     TRUE 0.792 36.000 0.042 0.090   NA
 3490262 3490263 Bpet1206 Bpet1207     TRUE 0.988 -3.000 0.042 0.090   NA
 3490263 3490264 Bpet1207 Bpet1208     FALSE 0.035 194.000 0.000 NA   NA
 3490264 3490265 Bpet1208 Bpet1209   bug28 FALSE 0.326 48.000 0.000 NA   NA
 3490265 3490266 Bpet1209 Bpet1210 bug28   FALSE 0.073 139.000 0.000 1.000   NA
 3490266 3490267 Bpet1210 Bpet1211   acd7 FALSE 0.004 145.000 0.000 1.000 N NA
 3490267 3490268 Bpet1211 Bpet1212 acd7   FALSE 0.036 308.000 0.000 1.000 Y NA
 3490268 3490269 Bpet1212 Bpet1213     TRUE 0.988 0.000 0.000 0.097 Y NA
 3490269 3490270 Bpet1213 Bpet1214   acd8 TRUE 0.674 39.000 0.000 1.000 Y NA
 3490270 3490271 Bpet1214 Bpet1215 acd8   FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3490271 3490272 Bpet1215 Bpet1216     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3490272 3490273 Bpet1216 Bpet1217     FALSE 0.051 173.000 0.000 NA   NA
 3490273 3490274 Bpet1217 Bpet1218     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3490274 3490275 Bpet1218 Bpet1219     FALSE 0.017 50.000 0.000 1.000 N NA
 3490275 3490276 Bpet1219 Bpet1220     FALSE 0.009 97.000 0.000 1.000 N NA
 3490276 3490277 Bpet1220 Bpet1221     TRUE 0.816 44.000 0.000 0.052 Y NA
 3490278 3490279 Bpet1222 Bpet1223     FALSE 0.130 120.000 0.000 0.097 N NA
 3490279 3490280 Bpet1223 Bpet1224     FALSE 0.262 64.000 0.000 0.097 N NA
 3490280 3490281 Bpet1224 Bpet1225   bug29 TRUE 0.736 14.000 0.000 1.000   NA
 3490281 3490282 Bpet1225 Bpet1226 bug29 bug30 TRUE 0.859 63.000 0.222 0.048   NA
 3490282 3490283 Bpet1226 Bpet1227 bug30   FALSE 0.194 77.000 0.000 1.000   NA
 3490283 3490284 Bpet1227 Bpet1228     FALSE 0.287 55.000 0.000 0.097 N NA
 3490284 3490285 Bpet1228 Bpet1229     TRUE 0.903 66.000 0.333 NA Y NA
 3490285 3490286 Bpet1229 Bpet1230     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490286 3490287 Bpet1230 Bpet1231     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490287 3490288 Bpet1231 Bpet1232     FALSE 0.006 429.000 0.000 NA   NA
 3490288 3490289 Bpet1232 Bpet1233   bug31 FALSE 0.053 172.000 0.000 NA   NA
 3490290 3490291 Bpet1234 Bpet1235     FALSE 0.004 235.000 0.000 NA N NA
 3490292 3490293 Bpet1236 Bpet1237     FALSE 0.002 324.000 0.000 NA N NA
 3490294 3490295 Bpet1238 Bpet1239     FALSE 0.463 41.000 0.000 0.052 N NA
 3490295 3490296 Bpet1239 Bpet1240     TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.096 Y NA
 3490296 3490297 Bpet1240 Bpet1241     TRUE 0.996 4.000 0.211 0.096 Y NA
 3490297 3490298 Bpet1241 Bpet1242   acd9 TRUE 0.915 44.000 0.333 1.000 Y NA
 3490298 3490299 Bpet1242 Bpet1243 acd9 hbd TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 3490299 3490300 Bpet1243 Bpet1244 hbd   TRUE 0.994 6.000 0.333 0.002   NA
 3490300 3490301 Bpet1244 Bpet1245     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   NA
 3490301 3490302 Bpet1245 Bpet1246     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3490303 3490304 Bpet1247 Bpet1248     FALSE 0.002 715.000 0.000 1.000   NA
 3490304 3490305 Bpet1248 Bpet1249     TRUE 0.792 -21.000 0.000 NA   NA
 3490305 3490306 Bpet1249 Bpet1250   bug32 FALSE 0.010 317.000 0.000 NA   NA
 3490306 3490307 Bpet1250 Bpet1251 bug32   TRUE 0.761 69.000 0.250 NA   NA
 3490307 3490308 Bpet1251 Bpet1252     FALSE 0.068 156.000 0.000 NA   NA
 3490312 3490313 Bpet1256 Bpet1257   bug34 FALSE 0.047 158.000 0.000 1.000   NA
 3490313 3490314 Bpet1257 Bpet1258 bug34   FALSE 0.020 208.000 0.000 1.000   NA
 3490314 3490315 Bpet1258 Bpet1259     FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3490315 3490316 Bpet1259 Bpet1260   dadA FALSE 0.388 112.000 0.000 1.000 Y NA
 3490316 3490317 Bpet1260 Bpet1261 dadA mdh3 FALSE 0.023 38.000 0.000 1.000 N NA
 3490317 3490318 Bpet1261 Bpet1262 mdh3   TRUE 0.675 18.000 0.029 1.000 N NA
 3490318 3490319 Bpet1262 Bpet1263     FALSE 0.283 50.000 0.029 1.000 N NA
 3490319 3490320 Bpet1263 Bpet1264     TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 3490320 3490321 Bpet1264 Bpet1265     TRUE 0.567 26.000 0.000 NA   NA
 3490321 3490322 Bpet1265 Bpet1266     FALSE 0.018 46.000 0.000 1.000 N NA
 3490322 3490323 Bpet1266 Bpet1267     TRUE 0.995 -7.000 0.650 1.000 Y NA
 3490323 3490324 Bpet1267 Bpet1268     TRUE 0.997 4.000 0.154 0.010 Y NA
 3490324 3490325 Bpet1268 Bpet1269     TRUE 0.917 64.000 0.154 0.068 Y NA
 3490325 3490326 Bpet1269 Bpet1270   dapA1 TRUE 0.511 84.000 0.000 1.000 Y NA
 3490327 3490328 Bpet1271 Bpet1272     FALSE 0.104 254.000 0.000 0.090 Y NA
 3490331 3490332 Bpet1275 Bpettrna_10 intB13 b_petrii_trna_10 FALSE 0.023 227.000 0.000 NA   NA
 3490333 3490334 Bpet1276 Bpet1277     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490337 3490338 Bpet1280 Bpet1281 gst1   FALSE 0.006 118.000 0.000 1.000 N NA
 3490339 3490340 Bpet1282 Bpet1283 bug35   TRUE 0.953 21.000 0.500 1.000   NA
 3490340 3490341 Bpet1283 Bpet1284     TRUE 0.996 -3.000 0.900 1.000   NA
 3490341 3490342 Bpet1284 Bpet1285     TRUE 0.866 3.000 0.000 1.000   NA
 3490342 3490343 Bpet1285 Bpet1286     TRUE 0.961 -39.000 0.000 0.061 Y NA
 3490345 3490346 Bpet1288 Bpet1289     FALSE 0.020 480.000 0.000 NA Y NA
 3490346 3490347 Bpet1289 Bpet1290   parA2 TRUE 0.708 38.000 0.149 NA N NA
 3490347 3490348 Bpet1290 ig_0609 parA2   TRUE 0.983 -16.000 0.571 NA   NA
 3490348 3490349 ig_0609 Bpet1291     TRUE 0.986 -7.000 0.333 NA   NA
 3490349 3490350 Bpet1291 Bpet1292     TRUE 0.987 12.000 0.750 NA   NA
 3490350 3490351 Bpet1292 Bpet1293     TRUE 0.992 3.000 0.556 NA   NA
 3490351 3490352 Bpet1293 Bpet1294     FALSE 0.029 603.000 0.200 NA   NA
 3490352 3490353 Bpet1294 Bpet1295     TRUE 0.996 -3.000 0.900 NA   NA
 3490353 3490354 Bpet1295 Bpet1296     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490354 3490355 Bpet1296 Bpet1297   ssb2 TRUE 0.626 45.000 0.000 1.000 Y NA
 3490355 3490356 Bpet1297 Bpet1298 ssb2 top3A FALSE 0.021 406.000 0.000 1.000 Y NA
 3490356 3490357 Bpet1298 Bpet1299 top3A tnp5 TRUE 0.561 64.000 0.000 1.000 Y NA
 3490357 3490358 Bpet1299 Bpet1300 tnp5   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.090 Y NA
 3490358 3490359 Bpet1300 Bpet1301   top3B FALSE 0.185 81.000 0.000 1.000   NA
 3490359 3490360 Bpet1301 Bpet1302 top3B   FALSE 0.003 554.000 0.000 1.000   NA
 3490360 3490361 Bpet1302 Bpet1303     FALSE 0.062 206.000 0.000 0.090   NA
 3490361 3490362 Bpet1303 Bpet1304     TRUE 0.999 0.000 0.545 0.011 Y NA
 3490362 3490363 Bpet1304 Bpet1305     TRUE 0.985 -7.000 0.000 0.011 Y NA
 3490363 3490364 Bpet1305 Bpet1306     FALSE 0.269 119.000 0.000 0.090   NA
 3490365 3490366 Bpet1307 Bpet1308     TRUE 0.994 0.000 0.714 1.000   NA
 3490367 3490368 Bpet1309 Bpet1310     FALSE 0.067 158.000 0.000 NA   NA
 3490368 3490369 Bpet1310 Bpet1311     FALSE 0.017 254.000 0.000 NA   NA
 3490369 3490370 Bpet1311 Bpet1312     FALSE 0.010 322.000 0.000 NA   NA
 3490370 3490371 Bpet1312 Bpet1313     FALSE 0.184 106.000 0.000 NA   NA
 3490371 3490372 Bpet1313 Bpet1314     FALSE 0.006 408.000 0.000 NA   NA
 3490372 3490373 Bpet1314 Bpet1315     TRUE 0.763 107.000 0.727 NA   NA
 3490373 3490374 Bpet1315 Bpet1316     FALSE 0.257 78.000 0.000 NA   NA
 3490374 3490375 Bpet1316 Bpet1317     FALSE 0.021 235.000 0.000 NA   NA
 3490375 3490376 Bpet1317 Bpet1318     FALSE 0.106 138.000 0.000 NA   NA
 3490376 3490377 Bpet1318 Bpet1319     FALSE 0.279 66.000 0.000 NA   NA
 3490377 3490378 Bpet1319 Bpet1320     FALSE 0.251 80.000 0.000 NA   NA
 3490378 3490379 Bpet1320 Bpet1321     FALSE 0.231 90.000 0.000 NA   NA
 3490379 3490380 Bpet1321 Bpet1322     FALSE 0.128 126.000 0.000 NA   NA
 3490380 3490381 Bpet1322 Bpet1323     FALSE 0.192 103.000 0.000 NA   NA
 3490383 3490384 Bpet1325 Bpet1326     TRUE 0.974 1.000 0.074 1.000   NA
 3490384 3490385 Bpet1326 Bpet1327     TRUE 0.982 -3.000 0.077 1.000   NA
 3490385 3490386 Bpet1327 Bpet1328   asnB TRUE 0.776 30.000 0.077 1.000   NA
 3490386 3490387 Bpet1328 Bpet1329 asnB   TRUE 0.900 22.000 0.333 1.000 N NA
 3490387 3490388 Bpet1329 Bpet1330     FALSE 0.000 900.000 0.000 1.000 N NA
 3490388 3490389 Bpet1330 Bpet1331     TRUE 0.947 23.000 0.000 0.003 Y NA
 3490389 3490390 Bpet1331 Bpet1332     FALSE 0.210 66.000 0.000 1.000   NA
 3490390 3490391 Bpet1332 Bpet1333     TRUE 0.775 82.000 0.522 1.000   NA
 3490391 3490392 Bpet1333 Bpet1334     TRUE 0.605 19.000 0.000 1.000   NA
 3490393 3490394 Bpet1335 Bpet1336     FALSE 0.079 189.000 0.021 NA   NA
 3490395 3490396 Bpet1337 Bpet1338 tnp6   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.089 Y NA
 3490397 3490398 Bpet1339 Bpet1340     FALSE 0.280 65.000 0.000 NA   NA
 3490398 3490399 Bpet1340 Bpet1341     TRUE 0.879 2.000 0.000 1.000   NA
 3490399 3490400 Bpet1341 Bpet1342   alaS1 FALSE 0.197 100.000 0.000 NA   NA
 3490401 3490402 Bpet1343 Bpet1344     FALSE 0.229 91.000 0.000 NA   NA
 3490402 3490403 Bpet1344 Bpet1345     TRUE 0.995 -3.000 0.636 NA   NA
 3490403 3490404 Bpet1345 Bpet1346     TRUE 0.851 10.000 0.000 NA   NA
 3490404 3490405 Bpet1346 Bpet1347     TRUE 0.827 -15.000 0.000 NA   NA
 3490405 3490406 Bpet1347 Bpet1348     TRUE 0.994 -3.000 0.409 NA   NA
 3490406 3490407 Bpet1348 Bpet1349     TRUE 0.989 11.000 1.000 NA   NA
 3490407 3490408 Bpet1349 Bpet1350     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490408 3490409 Bpet1350 Bpet1351   csrA FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   NA
 3490410 3490411 Bpet1352 Bpet1353     TRUE 0.989 -3.000 0.115 NA   NA
 3490412 3490413 Bpet1354 Bpet1355     TRUE 0.996 -3.000 0.800 NA   NA
 3490413 3490414 Bpet1355 Bpet1356     TRUE 0.958 17.000 0.250 NA   NA
 3490414 3490415 Bpet1356 Bpet1357     TRUE 0.964 10.000 0.091 NA   NA
 3490415 3490416 Bpet1357 Bpet1358     TRUE 0.996 -3.000 0.955 NA   NA
 3490416 3490417 Bpet1358 Bpet1359     TRUE 0.996 -3.000 0.955 NA   NA
 3490417 3490418 Bpet1359 Bpet1360     TRUE 0.990 -10.000 1.000 NA   NA
 3490418 3490419 Bpet1360 Bpet1361     TRUE 0.973 -19.000 0.273 NA   NA
 3490419 3490420 Bpet1361 Bpet1362     TRUE 0.994 0.000 0.600 NA   NA
 3490423 3490424 Bpet1365 Bpet1366     FALSE 0.004 427.000 0.000 1.000   NA
 3490424 3490425 Bpet1366 Bpet1367     TRUE 0.648 -58.000 0.000 1.000   NA
 3490425 3490426 Bpet1367 Bpet1368     FALSE 0.001 239.000 0.000 1.000 N NA
 3490429 3490430 Bpet1371 Bpet1372   rhtB2 TRUE 0.527 57.000 0.030 NA   NA
 3490430 3490431 Bpet1372 Bpet1373 rhtB2   TRUE 0.972 13.000 0.044 1.000 Y NA
 3490431 3490432 Bpet1373 Bpet1374     FALSE 0.026 215.000 0.000 NA   NA
 3490432 3490433 Bpet1374 Bpet1375     TRUE 0.994 -3.000 0.333 NA   NA
 3490433 3490434 Bpet1375 Bpet1376     TRUE 0.914 2.000 0.000 NA   NA
 3490434 3490435 Bpet1376 Bpet1377     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490435 3490436 Bpet1377 Bpet1378     TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 3490437 3490438 Bpet1379 Bpet1380     TRUE 0.625 63.000 0.080 NA   NA
 3490438 3490439 Bpet1380 Bpet1381     FALSE 0.280 65.000 0.000 NA   NA
 3490441 3490442 Bpet1383 Bpet1384     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 3490442 3490443 Bpet1384 Bpet1385   benE TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490443 3490444 Bpet1385 Bpet1386 benE   TRUE 0.600 28.000 0.000 0.064 N NA
 3490444 3490445 Bpet1386 Bpet1387   areB FALSE 0.012 81.000 0.000 1.000 N NA
 3490445 3490446 Bpet1387 Bpet1388 areB   TRUE 0.993 11.000 0.109 0.060 Y NA
 3490446 3490447 Bpet1388 Bpet1389     FALSE 0.218 60.000 0.000 1.000   NA
 3490447 3490448 Bpet1389 Bpet1390     FALSE 0.093 125.000 0.000 1.000   NA
 3490448 3490449 Bpet1390 Bpet1391     FALSE 0.369 34.000 0.000 1.000   NA
 3490449 3490450 Bpet1391 Bpet1392     TRUE 0.845 11.000 0.000 NA   NA
 3490450 3490451 Bpet1392 Bpet1393     TRUE 0.819 -16.000 0.000 NA   NA
 3490451 3490452 Bpet1393 Bpet1394   benK TRUE 0.511 24.000 0.000 1.000   NA
 3490452 3490453 Bpet1394 Bpet1395 benK   FALSE 0.116 38.000 0.000 NA N NA
 3490453 3490454 Bpet1395 Bpet1396   benD FALSE 0.478 57.000 0.070 NA N NA
 3490454 3490455 Bpet1396 Bpet1397 benD benC TRUE 0.946 13.000 0.209 1.000 N NA
 3490455 3490456 Bpet1397 Bpet1398 benC benB TRUE 0.958 18.000 0.250 0.072 N NA
 3490456 3490457 Bpet1398 Bpet1399 benB benA TRUE 0.998 -3.000 0.953 0.000 N NA
 3490457 3490458 Bpet1399 Bpet1400 benA catA2 FALSE 0.330 127.000 0.188 1.000 N NA
 3490458 3490459 Bpet1400 Bpet1401 catA2 catB1 TRUE 0.515 43.000 0.086 1.000 N NA
 3490460 3490461 Bpet1402 Bpet1403 catR1   FALSE 0.007 394.000 0.000 NA   NA
 3490461 3490462 Bpet1403 Bpet1404     TRUE 0.973 -30.000 0.400 NA   NA
 3490463 3490464 Bpet1405 Bpet1406     FALSE 0.448 74.000 0.000 0.089   NA
 3490465 3490466 Bpet1407 Bpet1408     FALSE 0.191 232.000 0.364 NA   NA
 3490466 3490467 Bpet1408 Bpet1409     FALSE 0.011 311.000 0.000 NA   NA
 3490468 3490469 Bpet1410 Bpet1411     TRUE 0.856 54.000 0.250 0.089   NA
 3490469 3490470 Bpet1411 Bpet1412     FALSE 0.235 87.000 0.000 NA   NA
 3490470 3490471 Bpet1412 Bpet1413     FALSE 0.400 180.000 0.684 NA   NA
 3490471 3490472 Bpet1413 Bpet1414     FALSE 0.365 41.000 0.000 NA   NA
 3490472 3490473 Bpet1414 Bpet1415   nthB TRUE 0.998 3.000 0.761 0.000   NA
 3490473 3490474 Bpet1415 Bpet1416 nthB nthA TRUE 0.996 11.000 0.761 0.001   NA
 3490474 3490475 Bpet1416 Bpet1417 nthA   FALSE 0.082 134.000 0.000 1.000   NA
 3490475 3490476 Bpet1417 Bpet1418     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490479 3490480 Bpet1421 Bpet1422     FALSE 0.235 87.000 0.000 NA   NA
 3490482 3490483 Bpet1424 Bpet1425     FALSE 0.026 214.000 0.000 NA   NA
 3490483 3490484 Bpet1425 Bpet1426     TRUE 0.592 79.000 0.000 0.002   NA
 3490484 3490485 Bpet1426 Bpet1427     FALSE 0.008 295.000 0.000 1.000   NA
 3490486 3490487 Bpet1428 Bpet1429     TRUE 0.865 17.000 0.105 1.000 N NA
 3490487 3490488 Bpet1429 Bpet1430     TRUE 0.920 30.000 0.105 1.000 Y NA
 3490490 3490491 Bpet1432 Bpet1433 tnp7   FALSE 0.005 402.000 0.000 1.000   NA
 3490492 3490493 Bpet1434 Bpet1435     FALSE 0.049 292.000 0.000 NA Y NA
 3490493 3490494 Bpet1435 Bpet1436     TRUE 0.595 85.000 0.294 1.000 N NA
 3490496 3490497 Bpet1438 Bpet1439   alpA3 FALSE 0.332 120.000 0.043 NA   NA
 3490497 3490498 Bpet1439 Bpet1440 alpA3 parA3 FALSE 0.443 44.000 0.043 NA N NA
 3490498 3490499 Bpet1440 Bpet1441 parA3   TRUE 0.819 -16.000 0.000 NA   NA
 3490499 3490500 Bpet1441 Bpet1442     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3490500 3490501 Bpet1442 Bpet1443     TRUE 0.966 16.000 0.286 NA   NA
 3490501 3490502 Bpet1443 Bpet1444     TRUE 0.987 4.000 0.286 NA   NA
 3490502 3490503 Bpet1444 Bpet1445     FALSE 0.010 331.000 0.000 NA   NA
 3490503 3490504 Bpet1445 Bpet1446     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 3490504 3490505 Bpet1446 Bpet1447   ssb3 TRUE 0.862 74.000 1.000 NA   NA
 3490505 3490506 Bpet1447 Bpet1448 ssb3 topB3 FALSE 0.045 279.000 0.000 1.000 Y NA
 3490506 3490507 Bpet1448 Bpet1449 topB3   FALSE 0.003 537.000 0.000 1.000   NA
 3490507 3490508 Bpet1449 Bpet1450     FALSE 0.063 206.000 0.000 0.088   NA
 3490508 3490509 Bpet1450 Bpet1451     TRUE 0.999 0.000 0.545 0.011 Y NA
 3490510 3490511 Bpet1452 Bpet1453   tnp8 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.088 Y NA
 3490512 3490513 Bpet1454 Bpet1455 int1   FALSE 0.273 119.000 0.000 0.088   NA
 3490513 3490514 Bpet1455 Bpet1456     FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 3490514 3490515 Bpet1456 Bpet1457     FALSE 0.466 157.000 0.500 NA   NA
 3490515 3490516 Bpet1457 Bpet1458     TRUE 0.968 22.000 1.000 NA   NA
 3490516 3490517 Bpet1458 Bpet1459     FALSE 0.448 173.000 0.750 NA   NA
 3490517 3490518 Bpet1459 Bpet1460     TRUE 0.783 80.000 0.400 NA   NA
 3490518 3490519 Bpet1460 Bpet1461     TRUE 0.777 98.000 0.625 NA   NA
 3490519 3490520 Bpet1461 Bpet1462     FALSE 0.269 74.000 0.000 NA   NA
 3490521 3490522 Bpet1463 Bpet1464   tnp9 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.088 Y NA
 3490523 3490524 Bpet1465 Bpet1466     FALSE 0.088 146.000 0.000 NA   NA
 3490526 3490527 Bpet1468 Bpet1469     TRUE 0.816 58.000 0.375 NA   NA
 3490527 3490528 Bpet1469 Bpet1470     TRUE 0.696 96.000 0.250 NA   NA
 3490528 3490529 Bpet1470 Bpet1471     TRUE 0.763 97.000 0.500 NA   NA
 3490529 3490530 Bpet1471 Bpet1472     TRUE 0.971 17.000 0.500 NA   NA
 3490530 3490531 Bpet1472 Bpet1473     TRUE 0.808 77.000 0.500 NA   NA
 3490531 3490532 Bpet1473 Bpet1474     TRUE 0.824 65.000 0.500 NA   NA
 3490532 3490533 Bpet1474 Bpet1475   ltrA2 FALSE 0.002 1021.000 0.000 1.000   NA
 3490533 3490534 Bpet1475 Bpet1476 ltrA2   FALSE 0.016 228.000 0.000 1.000   NA
 3490534 3490535 Bpet1476 Bpet1477     TRUE 0.647 114.000 0.333 NA   NA
 3490535 3490536 Bpet1477 Bpet1478     FALSE 0.328 161.000 0.200 NA   NA
 3490536 3490537 Bpet1478 Bpet1479     TRUE 0.996 -3.000 0.700 NA   NA
 3490537 3490538 Bpet1479 Bpet1480     TRUE 0.984 15.000 1.000 NA   NA
 3490538 3490539 Bpet1480 Bpet1481     TRUE 0.975 -18.000 0.286 NA   NA
 3490539 3490540 Bpet1481 Bpet1482     TRUE 0.987 -3.000 0.091 NA   NA
 3490540 3490541 Bpet1482 Bpet1483     TRUE 0.992 5.000 1.000 NA   NA
 3490541 3490542 Bpet1483 Bpet1484     TRUE 0.987 -3.000 0.091 NA   NA
 3490544 3490545 Bpet1486 Bpet1487     TRUE 0.993 -3.000 0.286 NA   NA
 3490545 3490546 Bpet1487 Bpet1488     TRUE 0.980 11.000 0.286 NA   NA
 3490546 3490547 Bpet1488 Bpet1489     TRUE 0.957 13.000 0.091 NA   NA
 3490547 3490548 Bpet1489 Bpet1490     TRUE 0.996 -3.000 0.955 NA   NA
 3490548 3490549 Bpet1490 Bpet1491     TRUE 0.996 -3.000 0.955 NA   NA
 3490549 3490550 Bpet1491 Bpet1492     TRUE 0.990 -10.000 1.000 NA   NA
 3490550 3490551 Bpet1492 Bpet1493     TRUE 0.949 -19.000 0.091 NA   NA
 3490551 3490552 Bpet1493 bp050705_PS_02     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3490552 3490553 bp050705_PS_02 Bpetpseudo_04     TRUE 0.679 -1088.000 0.000 NA   NA
 3490553 3490554 Bpetpseudo_04 Bpet1494   tnp10 FALSE 0.472 33.000 0.000 NA   NA
 3490554 3490555 Bpet1494 Bpet1495 tnp10   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.088 Y NA
 3490555 3490556 Bpet1495 Bpetpseudo_05     FALSE 0.255 46.000 0.000 1.000   NA
 3490556 3490557 Bpetpseudo_05 Bpet1496     TRUE 0.985 14.000 0.857 NA   NA
 3490557 3490558 Bpet1496 Bpet1497     FALSE 0.370 184.000 0.667 NA   NA
 3490558 3490559 Bpet1497 Bpet1498     FALSE 0.231 56.000 0.000 1.000   NA
 3490559 3490560 Bpet1498 Bpet1499     TRUE 0.999 -3.000 0.357 0.010 Y NA
 3490560 3490561 Bpet1499 Bpet1500     TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.010 Y NA
 3490561 3490562 Bpet1500 Bpet1501     FALSE 0.005 500.000 0.000 NA   NA
 3490562 3490563 Bpet1501 Bpet1502     TRUE 0.973 -123.000 0.833 NA   NA
 3490563 3490564 Bpet1502 Bpet1503     TRUE 0.987 10.000 0.571 NA   NA
 3490564 3490565 Bpet1503 Bpet1504     TRUE 0.996 -3.000 0.857 NA   NA
 3490565 3490566 Bpet1504 Bpet1505     TRUE 0.978 16.000 0.667 NA   NA
 3490567 3490568 Bpet1506 Bpet1507     TRUE 0.941 28.000 0.667 NA   NA
 3490568 3490569 Bpet1507 Bpet1508     TRUE 0.993 0.000 0.400 NA   NA
 3490571 3490572 Bpet1510 Bpet1511     FALSE 0.429 36.000 0.000 NA   NA
 3490572 3490573 Bpet1511 Bpet1512     FALSE 0.002 182.000 0.000 1.000 N NA
 3490573 3490574 Bpet1512 Bpet1513     TRUE 0.516 82.000 0.000 1.000 Y NA
 3490574 3490575 Bpet1513 Bpetpseudo_06     FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 3490575 3490576 Bpetpseudo_06 Bpet1514     FALSE 0.374 40.000 0.000 NA   NA
 3490576 3490577 Bpet1514 Bpet1515     FALSE 0.125 109.000 0.000 1.000   NA
 3490577 3490578 Bpet1515 Bpet1516     FALSE 0.426 -21.000 0.000 NA N NA
 3490578 3490579 Bpet1516 Bpet1517     FALSE 0.304 19.000 0.000 NA N NA
 3490579 3490580 Bpet1517 Bpet1518     FALSE 0.314 -111.000 0.000 NA N NA
 3490580 3490581 Bpet1518 Bpet1519   gst2 TRUE 0.880 69.000 0.222 NA Y NA
 3490581 3490582 Bpet1519 Bpet1520 gst2   FALSE 0.127 14.000 0.000 1.000 N NA
 3490582 3490583 Bpet1520 Bpet1521     TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3490583 3490584 Bpet1521 Bpet1522     TRUE 0.894 13.000 0.011 NA   NA
 3490584 3490585 Bpet1522 Bpet1523     FALSE 0.034 198.000 0.000 NA   NA
 3490585 3490586 Bpet1523 Bpet1524     FALSE 0.007 440.000 0.029 NA N NA
 3490586 3490587 Bpet1524 Bpet1525     TRUE 0.992 -3.000 0.031 NA Y NA
 3490587 3490588 Bpet1525 Bpet1526     TRUE 0.964 -7.000 0.088 1.000   NA
 3490588 3490589 Bpet1526 Bpet1527     TRUE 0.895 -16.000 0.026 1.000   NA
 3490589 3490590 Bpet1527 Bpet1528     FALSE 0.286 61.000 0.000 NA   NA
 3490590 3490591 Bpet1528 Bpet1529     FALSE 0.007 403.000 0.000 NA   NA
 3490592 3490593 Bpet1530 Bpet1531     FALSE 0.015 233.000 0.000 1.000   NA
 3490593 3490594 Bpet1531 Bpet1532     TRUE 0.899 18.000 0.000 0.009   NA
 3490596 3490597 Bpet1534 Bpet1535 clcA catB2 TRUE 0.993 -3.000 1.000 1.000 N NA
 3490597 3490598 Bpet1535 Bpet1536 catB2 bug36 TRUE 0.947 27.000 1.000 1.000   NA
 3490598 3490599 Bpet1536 Bpet1537 bug36   TRUE 0.963 22.000 1.000 1.000   NA
 3490599 3490600 Bpet1537 Bpet1538     TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.093 N NA
 3490600 3490601 Bpet1538 Bpet1539     FALSE 0.449 116.000 0.286 1.000 N NA
 3490601 3490602 Bpet1539 Bpet1540     FALSE 0.002 796.000 0.000 1.000   NA
 3490602 3490603 Bpet1540 Bpet1541     TRUE 0.998 3.000 1.000 0.001   NA
 3490603 3490604 Bpet1541 Bpet1542     TRUE 0.776 98.000 0.500 0.071 N NA
 3490604 3490605 Bpet1542 Bpet1543     FALSE 0.001 205.000 0.000 1.000 N NA
 3490605 3490606 Bpet1543 Bpet1544     TRUE 0.852 -94.000 0.025 NA   NA
 3490607 3490608 Bpet1545 Bpettrna_11 intB13 b_petrii_trna_11 FALSE 0.039 185.000 0.000 NA   NA
 3490610 3490611 Bpet1547 Bpet1548 dapB omlA FALSE 0.341 61.000 0.049 1.000 N NA
 3490613 3490614 Bpet1550 Bpet1551 recN ppnK TRUE 0.948 10.000 0.170 1.000 N NA
 3490615 3490616 Bpet1552 Bpet1553 hrcA hemH FALSE 0.358 55.000 0.048 1.000 N NA
 3490616 3490617 Bpet1553 Bpet1554 hemH   FALSE 0.254 79.000 0.000 NA   NA
 3490617 3490618 Bpet1554 Bpet1555   grpE FALSE 0.232 89.000 0.000 NA   NA
 3490618 3490619 Bpet1555 Bpet1556 grpE   TRUE 0.982 6.000 0.333 1.000   NA
 3490619 3490620 Bpet1556 Bpet1557   dnaK FALSE 0.378 57.000 0.012 1.000   NA
 3490620 3490621 Bpet1557 Bpet1558 dnaK dnaJ TRUE 0.911 109.000 0.236 0.002 Y NA
 3490622 3490623 Bpet1559 Bpet1560     FALSE 0.014 280.000 0.000 NA   NA
 3490625 3490626 Bpet1562 Bpet1563     TRUE 0.956 21.000 0.431 NA   NA
 3490627 3490628 Bpet1564 Bpet1565     TRUE 0.986 15.000 0.048 0.012 Y NA
 3490630 3490631 Bpet1567 Bpet1568 icd   FALSE 0.000 442.000 0.000 1.000 N NA
 3490631 3490632 Bpet1568 Bpet1569     FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 3490632 3490633 Bpet1569 Bpet1570     TRUE 0.995 0.000 0.916 NA   NA
 3490634 3490635 Bpet1571 Bpet1572     TRUE 0.976 -3.000 0.047 1.000   NA
 3490635 3490636 Bpet1572 Bpet1573   trxB1 TRUE 0.940 -10.000 0.053 1.000   NA
 3490637 3490638 Bpet1574 Bpet1575 ftsK lolA TRUE 0.971 0.000 0.130 1.000 N NA
 3490638 3490639 Bpet1575 Bpet1576 lolA   TRUE 0.623 23.000 0.000 NA   NA
 3490640 3490641 Bpet1577 Bpet1578     TRUE 0.993 -3.000 0.654 NA N NA
 3490641 3490642 Bpet1578 Bpet1579     TRUE 0.980 5.000 0.558 1.000 N NA
 3490642 3490643 Bpet1579 Bpet1580     FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3490643 3490644 Bpet1580 Bpet1581     TRUE 0.999 -3.000 0.436 0.003 Y NA
 3490644 3490645 Bpet1581 Bpet1582     TRUE 0.990 3.000 0.091 1.000 Y NA
 3490645 3490646 Bpet1582 Bpet1583     TRUE 0.998 2.000 0.625 0.065 Y NA
 3490646 3490647 Bpet1583 Bpet1584     TRUE 0.987 25.000 0.542 0.065 Y NA
 3490647 3490648 Bpet1584 Bpet1585   dsd TRUE 0.653 41.000 0.000 1.000 Y NA
 3490649 3490650 Bpet1586 Bpet1587   serS TRUE 0.682 46.000 0.078 0.082 N NA
 3490650 3490651 Bpet1587 Bpet1588 serS   FALSE 0.025 220.000 0.000 NA   NA
 3490658 3490659 Bpet1595 Bpet1596     TRUE 0.993 -3.000 0.058 1.000 Y NA
 3490661 3490662 Bpet1598 Bpet1599     FALSE 0.487 63.000 0.083 NA N NA
 3490662 3490663 Bpet1599 Bpettrna_12   b_petrii_trna_12 FALSE 0.003 826.000 0.000 NA   NA
 3490664 3490665 Bpet1600 Bpet1601     FALSE 0.445 45.000 0.007 NA   NA
 3490665 3490666 Bpet1601 Bpet1602     TRUE 0.882 12.000 0.004 NA   NA
 3490668 3490669 Bpet1604 Bpet1605 ilvG2 ilvH TRUE 0.997 11.000 0.371 0.002 Y NA
 3490669 3490670 Bpet1605 Bpet1606 ilvH ilvC TRUE 0.924 67.000 0.092 0.002 Y NA
 3490670 3490671 Bpet1606 Bpet1607 ilvC pssA FALSE 0.042 185.000 0.041 1.000 N NA
 3490673 3490674 Bpet1609 Bpet1610 rpsO pnp TRUE 0.861 91.000 0.335 1.000 Y NA
 3490674 3490675 Bpet1610 Bpet1611 pnp   FALSE 0.113 146.000 0.002 NA   NA
 3490675 3490676 Bpet1611 Bpet1612   tdcB FALSE 0.398 62.000 0.009 NA   NA
 3490678 3490679 Bpet1614 Bpet1615     TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 3490679 3490680 Bpet1615 Bpet1616     FALSE 0.387 39.000 0.000 NA   NA
 3490680 3490681 Bpet1616 Bpet1617     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490681 3490682 Bpet1617 Bpet1618     TRUE 0.880 5.000 0.000 NA   NA
 3490682 3490683 Bpet1618 Bpet1619     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3490683 3490684 Bpet1619 Bpet1620     TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3490684 3490685 Bpet1620 Bpet1621     TRUE 0.725 -63.000 0.000 NA   NA
 3490686 3490687 Bpet1622 Bpet1623     FALSE 0.492 31.000 0.000 NA   NA
 3490687 3490688 Bpet1623 Bpettrna_13   b_petrii_trna_13 FALSE 0.086 147.000 0.000 NA   NA
 3490688 3490689 Bpettrna_13 Bpettrna_14 b_petrii_trna_13 b_petrii_trna_14 TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 3490690 3490691 Bpet1624 Bpet1625   tpi FALSE 0.376 96.000 0.099 1.000 N NA
 3490691 3490692 Bpet1625 Bpet1626 tpi secG TRUE 0.903 17.000 0.184 1.000 N NA
 3490695 3490696 Bpet1628 Bpet1629     FALSE 0.002 949.000 0.000 1.000   NA
 3490696 3490697 Bpet1629 Bpet1630     FALSE 0.257 78.000 0.000 NA   NA
 3490699 3490700 Bpet1632 Bpet1633 bug37   TRUE 0.991 -3.000 0.250 1.000   NA
 3490702 3490703 Bpet1635 Bpet1636 pcaJ1 pcaI1 TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.002 Y NA
 3490703 3490704 Bpet1636 Bpet1637 pcaI1   TRUE 0.652 50.000 0.000 NA Y NA
 3490704 3490705 Bpet1637 Bpet1638     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490709 3490710 Bpet1642 Bpet1643     TRUE 0.842 -12.000 0.000 NA   NA
 3490710 3490711 Bpet1643 Bpet1644     FALSE 0.161 113.000 0.000 NA   NA
 3490713 3490714 Bpet1646 Bpet1647     TRUE 0.940 28.000 0.154 1.000 Y NA
 3490714 3490715 Bpet1647 Bpet1648     TRUE 0.987 -3.000 0.125 1.000   NA
 3490715 3490716 Bpet1648 Bpet1649     FALSE 0.049 155.000 0.000 1.000   NA
 3490717 3490718 Bpet1650 Bpet1651   bug38 TRUE 0.769 75.000 0.400 1.000   NA
 3490718 3490719 Bpet1651 Bpet1652 bug38   TRUE 0.588 20.000 0.000 1.000   NA
 3490719 3490720 Bpet1652 Bpet1653     TRUE 0.628 18.000 0.000 1.000   NA
 3490720 3490721 Bpet1653 Bpet1654     FALSE 0.490 25.000 0.000 1.000   NA
 3490721 3490722 Bpet1654 Bpet1655     TRUE 0.941 0.000 0.000 0.065 N NA
 3490722 3490723 Bpet1655 Bpet1656     TRUE 0.901 -10.000 0.000 0.028 N NA
 3490723 3490724 Bpet1656 Bpet1657     TRUE 0.620 46.000 0.000 1.000 Y NA
 3490724 3490725 Bpet1657 Bpet1658   pcaC1 FALSE 0.111 115.000 0.000 1.000   NA
 3490725 3490726 Bpet1658 Bpet1659 pcaC1   TRUE 0.918 14.000 0.053 1.000   NA
 3490726 3490727 Bpet1659 Bpet1660     TRUE 0.981 14.000 0.714 1.000   NA
 3490727 3490728 Bpet1660 Bpet1661     TRUE 0.845 11.000 0.000 NA   NA
 3490728 3490729 Bpet1661 Bpet1662     FALSE 0.018 252.000 0.000 NA   NA
 3490729 3490730 Bpet1662 Bpet1663   bug39 FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 3490730 3490731 Bpet1663 Bpet1664 bug39   TRUE 0.959 21.000 0.667 1.000   NA
 3490731 3490732 Bpet1664 Bpet1665   leuC1 TRUE 0.970 12.000 0.500 1.000 N NA
 3490732 3490733 Bpet1665 Bpet1666 leuC1   TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.001 Y NA
 3490733 3490734 Bpet1666 Bpet1667     TRUE 0.975 0.000 0.167 1.000 N NA
 3490734 3490735 Bpet1667 Bpet1668     FALSE 0.011 83.000 0.000 1.000 N NA
 3490737 3490738 Bpet1670 Bpet1671     TRUE 0.970 -3.000 0.030 1.000   NA
 3490738 3490739 Bpet1671 Bpet1672     TRUE 0.935 24.000 0.069 0.010   NA
 3490740 3490741 Bpet1673 Bpet1674     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490741 3490742 Bpet1674 Bpet1675     TRUE 0.931 2.000 0.033 NA N NA
 3490743 3490744 Bpet1676 Bpet1677   nuoA FALSE 0.012 202.000 0.009 1.000 N NA
 3490744 3490745 Bpet1677 Bpet1678 nuoA nuoB TRUE 0.996 -30.000 0.507 0.002 Y NA
 3490745 3490746 Bpet1678 Bpet1679 nuoB nuoC TRUE 0.957 68.000 0.328 0.002 Y NA
 3490746 3490747 Bpet1679 Bpet1680 nuoC nuoD TRUE 0.998 4.000 0.483 0.005 Y NA
 3490747 3490748 Bpet1680 Bpet1681 nuoD nuoE TRUE 0.971 40.000 0.355 0.005 Y NA
 3490748 3490749 Bpet1681 Bpet1682 nuoE nuoF TRUE 0.999 -3.000 0.343 0.005 Y NA
 3490749 3490750 Bpet1682 Bpet1683 nuoF nuoG TRUE 0.995 16.000 0.395 0.005 Y NA
 3490750 3490751 Bpet1683 Bpet1684 nuoG nuoH TRUE 0.999 2.000 0.515 0.005 Y NA
 3490751 3490752 Bpet1684 Bpet1685 nuoH nuoI TRUE 0.992 22.000 0.500 0.005 Y NA
 3490752 3490753 Bpet1685 Bpet1686 nuoI nuoJ TRUE 0.992 21.000 0.442 0.005 Y NA
 3490753 3490754 Bpet1686 Bpet1687 nuoJ nuoK TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.002 Y NA
 3490754 3490755 Bpet1687 Bpet1688 nuoK nuoL TRUE 0.993 18.000 0.451 0.005 Y NA
 3490755 3490756 Bpet1688 Bpet1689 nuoL nuoM TRUE 0.999 -3.000 0.175 0.001 Y NA
 3490756 3490757 Bpet1689 Bpet1690 nuoM nuoN TRUE 0.997 10.000 0.340 0.001 Y NA
 3490757 3490758 Bpet1690 Bpet1691 nuoN   TRUE 0.976 11.000 0.202 NA   NA
 3490758 3490759 Bpet1691 Bpet1692     FALSE 0.013 285.000 0.000 NA   NA
 3490760 3490761 Bpet1693 Bpet1694 serB mfd FALSE 0.272 36.000 0.014 1.000 N NA
 3490762 3490763 Bpet1695 Bpet1696 ispD ispF TRUE 0.997 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 3490764 3490765 Bpet1697 Bpet1698 ahpD ahpC TRUE 0.609 56.000 0.058 NA   NA
 3490765 3490766 Bpet1698 Bpet1699 ahpC risS FALSE 0.245 60.000 0.027 1.000 N NA
 3490766 3490767 Bpet1699 Bpet1700 risS risA TRUE 0.932 35.000 0.241 1.000 Y NA
 3490768 3490769 Bpet1701 Bpet1702     TRUE 0.729 -3.000 0.002 1.000 N NA
 3490771 3490772 Bpet1704 Bpet1705     TRUE 0.658 63.000 0.006 0.007   NA
 3490772 3490773 Bpet1705 Bpet1706   ligA TRUE 0.929 0.000 0.004 1.000   NA
 3490774 3490775 Bpet1707 Bpet1708     TRUE 0.956 10.000 0.162 NA N NA
 3490775 3490776 Bpet1708 Bpet1709   ispA TRUE 0.939 -16.000 0.133 NA N NA
 3490776 3490777 Bpet1709 Bpet1710 ispA msrB1 TRUE 0.969 1.000 0.136 1.000 N NA
 3490778 3490779 Bpet1711 Bpet1712     TRUE 0.998 -3.000 0.729 1.000 Y NA
 3490779 3490780 Bpet1712 Bpet1713     TRUE 0.850 36.000 0.211 NA   NA
 3490780 3490781 Bpet1713 Bpet1714     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 3490781 3490782 Bpet1714 Bpet1715     TRUE 0.674 136.000 0.167 NA Y NA
 3490782 3490783 Bpet1715 Bpet1716     TRUE 0.994 6.000 0.125 0.065 Y NA
 3490783 3490784 Bpet1716 Bpet1717     TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.028 Y NA
 3490785 3490786 Bpet1718 Bpet1719     TRUE 0.888 67.000 0.333 1.000 Y NA
 3490786 3490787 Bpet1719 Bpet1720     TRUE 0.633 200.000 0.500 0.065 Y NA
 3490787 3490788 Bpet1720 Bpet1721     TRUE 0.997 -3.000 0.091 0.065 Y NA
 3490788 3490789 Bpet1721 Bpet1722     TRUE 0.748 94.000 0.068 NA Y NA
 3490789 3490790 Bpet1722 Bpet1723     TRUE 0.804 59.000 0.059 NA Y NA
 3490790 3490791 Bpet1723 Bpet1724     TRUE 0.999 -3.000 0.716 0.028 Y NA
 3490791 3490792 Bpet1724 Bpet1725   nth FALSE 0.003 146.000 0.000 1.000 N NA
 3490792 3490793 Bpet1725 Bpet1726 nth rnfB TRUE 0.953 -3.000 0.048 1.000 N NA
 3490793 3490794 Bpet1726 Bpet1727 rnfB phaZ FALSE 0.197 47.000 0.014 1.000 N NA
 3490794 3490795 Bpet1727 Bpet1728 phaZ fpr1 FALSE 0.087 140.000 0.029 1.000 N NA
 3490795 3490796 Bpet1728 Bpet1729 fpr1 fdx1 TRUE 0.870 46.000 0.029 0.070 Y NA
 3490797 3490798 Bpet1730 Bpet1731 pncB   FALSE 0.242 52.000 0.011 NA N NA
 3490798 3490799 Bpet1731 Bpet1732     FALSE 0.044 180.000 0.000 NA   NA
 3490800 3490801 Bpet1733 Bpet1734     TRUE 0.969 -3.000 0.015 NA   NA
 3490802 3490803 Bpet1735 Bpet1736 relA argE1 FALSE 0.314 56.000 0.039 1.000 N NA
 3490803 3490804 Bpet1736 Bpet1737 argE1 trpB TRUE 0.567 92.000 0.008 1.000 Y NA
 3490804 3490805 Bpet1737 Bpet1738 trpB trpA TRUE 0.998 5.000 0.344 0.000 Y NA
 3490805 3490806 Bpet1738 Bpet1739 trpA accD TRUE 0.735 37.000 0.232 1.000 N NA
 3490806 3490807 Bpet1739 Bpet1740 accD   FALSE 0.039 169.000 0.000 1.000   NA
 3490808 3490809 Bpet1741 Bpet1742   rne TRUE 0.681 -37.000 0.000 1.000   NA
 3490810 3490811 Bpet1743 Bpet1744 rluC   TRUE 0.988 3.000 0.389 1.000   NA
 3490811 3490812 Bpet1744 Bpet1745     FALSE 0.306 86.000 0.013 1.000   NA
 3490812 3490813 Bpet1745 Bpet1746     TRUE 0.989 15.000 0.790 0.070   NA
 3490814 3490815 Bpet1747 Bpet1748     TRUE 0.804 -99.000 0.021 1.000   NA
 3490815 3490816 Bpet1748 Bpet1749     TRUE 0.988 -3.000 0.107 NA   NA
 3490817 3490818 Bpet1750 Bpet1751   rpmF TRUE 0.856 52.000 0.599 NA   NA
 3490818 3490819 Bpet1751 Bpet1752 rpmF   TRUE 0.724 51.000 0.418 1.000 N NA
 3490819 3490820 Bpet1752 Bpet1753   fabH TRUE 0.999 0.000 0.380 0.003 Y NA
 3490820 3490821 Bpet1753 Bpet1754 fabH fabD TRUE 0.935 78.000 0.182 0.003 Y NA
 3490821 3490822 Bpet1754 Bpet1755 fabD fabG TRUE 0.998 7.000 0.432 0.003 Y NA
 3490822 3490823 Bpet1755 Bpet1756 fabG acpP TRUE 0.890 126.000 0.321 0.003 Y NA
 3490823 3490824 Bpet1756 Bpet1757 acpP fabF FALSE 0.468 184.000 0.346 1.000 Y NA
 3490824 3490825 Bpet1757 Bpet1758 fabF   FALSE 0.002 403.000 0.005 1.000 N NA
 3490825 3490826 Bpet1758 Bpet1759     TRUE 0.986 13.000 0.705 NA   NA
 3490826 3490827 Bpet1759 Bpet1760   mucB TRUE 0.942 30.000 0.856 NA   NA
 3490827 3490828 Bpet1760 Bpet1761 mucB mucD TRUE 0.700 45.000 0.218 NA N NA
 3490828 3490829 Bpet1761 Bpet1762 mucD lepA FALSE 0.002 497.000 0.008 1.000 N NA
 3490829 3490830 Bpet1762 Bpet1763 lepA lepB TRUE 0.884 19.000 0.187 1.000 N NA
 3490830 3490831 Bpet1763 Bpet1764 lepB rnc TRUE 0.964 2.000 0.117 1.000 N NA
 3490831 3490832 Bpet1764 Bpet1765 rnc   TRUE 0.992 -3.000 0.058 0.044   NA
 3490832 3490833 Bpet1765 Bpet1766   recO TRUE 0.949 -7.000 0.049 1.000   NA
 3490834 3490835 Bpet1767 Bpet1768     FALSE 0.020 240.000 0.000 NA   NA
 3490835 3490836 Bpet1768 Bpet1769     FALSE 0.313 101.000 0.014 NA   NA
 3490836 3490837 Bpet1769 Bpet1770   holC TRUE 0.841 16.000 0.009 NA   NA
 3490837 3490838 Bpet1770 Bpet1771 holC pepA TRUE 0.969 12.000 0.494 1.000 N NA
 3490841 3490842 Bpet1774 Bpet1775   mmsA1 TRUE 0.696 76.000 0.375 NA N NA
 3490842 3490843 Bpet1775 Bpet1776 mmsA1   FALSE 0.001 206.000 0.000 1.000 N NA
 3490843 3490844 Bpet1776 Bpet1777     FALSE 0.037 189.000 0.000 NA   NA
 3490846 3490847 Bpet1779 Bpet1780 prpE   TRUE 0.983 -3.000 0.060 NA   NA
 3490847 3490848 Bpet1780 Bpet1781     FALSE 0.406 60.000 0.009 NA   NA
 3490848 3490849 Bpet1781 Bpet1782     FALSE 0.064 168.000 0.006 1.000   NA
 3490849 3490850 Bpet1782 Bpet1783     FALSE 0.271 108.000 0.022 1.000   NA
 3490850 3490851 Bpet1783 Bpet1784   ltaE FALSE 0.391 71.000 0.021 1.000   NA
 3490852 3490853 Bpet1785 Bpet1786     FALSE 0.415 -42.000 0.004 1.000 N NA
 3490853 3490854 Bpet1786 Bpet1787     TRUE 0.667 7.000 0.007 1.000 N NA
 3490855 3490856 Bpet1788 Bpet1789 fcbC lpsI TRUE 0.529 72.000 0.042 NA   NA
 3490856 3490857 Bpet1789 Bpet1790 lpsI lpsJ1 TRUE 0.998 13.000 0.789 0.002 Y NA
 3490857 3490858 Bpet1790 Bpet1791 lpsJ1   FALSE 0.056 167.000 0.034 1.000 N NA
 3490858 3490859 Bpet1791 Bpet1792     TRUE 0.987 -3.000 0.292 1.000 N NA
 3490859 3490860 Bpet1792 Bpet1793     TRUE 0.704 51.000 0.146 1.000   NA
 3490860 3490861 Bpet1793 Bpet1794     TRUE 0.762 37.000 0.117 1.000   NA
 3490861 3490862 Bpet1794 Bpet1795     TRUE 0.956 79.000 0.803 0.065 Y NA
 3490862 3490863 Bpet1795 Bpet1796     TRUE 0.997 8.000 0.689 0.065 Y NA
 3490863 3490864 Bpet1796 Bpet1797     TRUE 0.993 9.000 0.354 NA Y NA
 3490864 3490865 Bpet1797 Bpet1798     TRUE 0.906 43.000 0.190 NA Y NA
 3490865 3490866 Bpet1798 Bpet1799     TRUE 0.976 9.000 0.022 NA Y NA
 3490866 3490867 Bpet1799 Bpet1800   pyrG FALSE 0.001 213.000 0.000 1.000 N NA
 3490867 3490868 Bpet1800 Bpet1801 pyrG kdsA TRUE 0.969 1.000 0.138 1.000 N NA
 3490868 3490869 Bpet1801 Bpet1802 kdsA eno TRUE 0.568 48.000 0.125 1.000 N NA
 3490869 3490870 Bpet1802 Bpet1803 eno   TRUE 0.607 67.000 0.241 1.000 N NA
 3490871 3490872 Bpet1804 Bpet1805   hslO FALSE 0.092 111.000 0.005 NA N NA
 3490872 3490873 Bpet1805 Bpet1806 hslO   TRUE 0.693 36.000 0.061 1.000   NA
 3490873 3490874 Bpet1806 Bpet1807     TRUE 0.712 22.000 0.012 1.000   NA
 3490874 3490875 Bpet1807 Bpet1808     FALSE 0.129 138.000 0.008 1.000   NA
 3490875 3490876 Bpet1808 Bpet1809     FALSE 0.008 363.000 0.000 NA   NA
 3490876 3490877 Bpet1809 Bpet1810     FALSE 0.054 186.000 0.004 NA   NA
 3490877 3490878 Bpet1810 Bpet1811     TRUE 0.707 31.000 0.029 NA   NA
 3490878 3490879 Bpet1811 Bpet1812   prpD FALSE 0.012 304.000 0.000 NA   NA
 3490880 3490881 Bpet1813 Bpet1814   acnA1 TRUE 0.906 -3.000 0.018 1.000 N NA
 3490881 3490882 Bpet1814 Bpet1815 acnA1   TRUE 0.843 75.000 0.733 NA   NA
 3490883 3490884 Bpet1816 Bpet1817 prpC prpB TRUE 0.716 64.000 0.502 1.000 N NA
 3490884 3490885 Bpet1817 Bpet1818 prpB mdh1 FALSE 0.006 259.000 0.008 1.000 N NA
 3490886 3490887 Bpet1819 Bpet1820   sdhC FALSE 0.350 122.000 0.185 1.000 N NA
 3490887 3490888 Bpet1820 Bpet1821 sdhC sdhD TRUE 0.999 1.000 0.453 0.001 Y NA
 3490888 3490889 Bpet1821 Bpet1822 sdhD sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.002 Y NA
 3490889 3490890 Bpet1822 Bpet1823 sdhA sdhB TRUE 0.997 14.000 0.604 0.002 Y NA
 3490890 3490891 Bpet1823 Bpet1824 sdhB   TRUE 0.919 22.000 0.151 NA   NA
 3490891 3490892 Bpet1824 Bpet1825   gltA TRUE 0.921 21.000 0.136 NA   NA
 3490895 3490896 Bpet1828 Bpet1829 maeB1 aceE1 FALSE 0.102 345.000 0.043 0.092 Y NA
 3490897 3490898 Bpet1830 Bpet1831     FALSE 0.498 62.000 0.029 NA   NA
 3490898 3490899 Bpet1831 Bpet1832   odhA FALSE 0.009 337.000 0.000 NA   NA
 3490899 3490900 Bpet1832 Bpet1833 odhA odhB TRUE 0.935 46.000 0.667 1.000 Y NA
 3490900 3490901 Bpet1833 Bpet1834 odhB odhL TRUE 0.816 100.000 0.253 1.000 Y NA
 3490901 3490902 Bpet1834 Bpet1835 odhL   FALSE 0.033 401.000 0.103 NA   NA
 3490902 3490903 Bpet1835 Bpet1836     FALSE 0.108 137.000 0.000 NA   NA
 3490903 3490904 Bpet1836 Bpet1837     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3490904 3490905 Bpet1837 Bpet1838     TRUE 0.991 0.000 0.300 NA   NA
 3490905 3490906 Bpet1838 Bpet1839   trpS FALSE 0.429 72.000 0.017 NA   NA
 3490907 3490908 Bpet1840 Bpet1841     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 3490910 3490911 Bpet1843 Bpet1844   tex FALSE 0.257 78.000 0.000 NA   NA
 3490914 3490915 Bpet1847 Bpet1848 rluD   TRUE 0.972 -12.000 0.168 NA   NA
 3490915 3490916 Bpet1848 Bpet1849   phbC FALSE 0.063 182.000 0.006 NA   NA
 3490916 3490917 Bpet1849 Bpet1850 phbC phbB TRUE 0.910 73.000 0.049 0.000 Y NA
 3490917 3490918 Bpet1850 Bpet1851 phbB phbF TRUE 0.610 97.000 0.130 NA   NA
 3490918 3490919 Bpet1851 Bpet1852 phbF   FALSE 0.181 140.000 0.016 NA   NA
 3490919 3490920 Bpet1852 Bpet1853     TRUE 0.990 3.000 0.386 NA   NA
 3490920 3490921 Bpet1853 Bpet1854     TRUE 0.984 14.000 0.775 NA   NA
 3490921 3490922 Bpet1854 Bpet1855     TRUE 0.675 57.000 0.233 NA N NA
 3490922 3490923 Bpet1855 Bpet1856     TRUE 0.528 49.000 0.025 NA   NA
 3490924 3490925 Bpet1857 Bpet1858     TRUE 0.665 61.000 0.100 NA   NA
 3490925 3490926 Bpet1858 Bpet1859     TRUE 0.844 31.000 0.120 NA   NA
 3490926 3490927 Bpet1859 Bpet1860   cphA1 FALSE 0.026 217.000 0.000 NA   NA
 3490927 3490928 Bpet1860 Bpet1861 cphA1 cphA2 TRUE 0.995 21.000 0.871 0.001 Y NA
 3490929 3490930 Bpet1862 Bpet1863     TRUE 0.973 19.000 0.848 NA   NA
 3490932 3490933 Bpet1865 Bpet1866     FALSE 0.335 82.000 0.016 1.000   NA
 3490935 3490936 Bpet1868 Bpet1869     FALSE 0.013 72.000 0.000 1.000 N NA
 3490940 3490941 Bpet1873 Bpet1874     FALSE 0.163 94.000 0.000 1.000   NA
 3490942 3490943 Bpet1875 Bpet1876 msrA1 msrB2 TRUE 0.999 -3.000 0.404 0.001 Y NA
 3490943 3490944 Bpet1876 Bpet1877 msrB2   TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 3490944 3490945 Bpet1877 Bpet1878     TRUE 0.818 46.000 0.286 NA   NA
 3490945 3490946 Bpet1878 Bpet1879     FALSE 0.000 622.000 0.000 1.000 N NA
 3490946 3490947 Bpet1879 Bpet1880     FALSE 0.011 262.000 0.000 1.000   NA
 3490947 3490948 Bpet1880 Bpet1881   ubiG TRUE 0.992 -3.000 0.259 1.000   NA
 3490948 3490949 Bpet1881 Bpet1882 ubiG ompA2 FALSE 0.353 82.000 0.071 1.000 N NA
 3490950 3490951 Bpet1883 Bpet1884 gyrA serC TRUE 0.951 0.000 0.067 1.000 N NA
 3490951 3490952 Bpet1884 Bpet1885 serC pheA TRUE 0.988 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 3490952 3490953 Bpet1885 Bpet1886 pheA hisC2 TRUE 0.938 25.000 0.098 1.000 Y NA
 3490953 3490954 Bpet1886 Bpet1887 hisC2 tyrA TRUE 0.996 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 3490954 3490955 Bpet1887 Bpet1888 tyrA aroA TRUE 0.985 8.000 0.100 1.000 Y NA
 3490955 3490956 Bpet1888 Bpet1889 aroA cmk TRUE 0.954 -10.000 0.209 1.000 N NA
 3490956 3490957 Bpet1889 Bpet1890 cmk rpsA TRUE 0.524 100.000 0.281 1.000 N NA
 3490957 3490958 Bpet1890 Bpet1891 rpsA ihfB TRUE 0.978 3.000 0.292 1.000 N NA
 3490958 3490959 Bpet1891 Bpet1892 ihfB   FALSE 0.368 145.000 0.129 NA   NA
 3490959 3490960 Bpet1892 Bpet1893     TRUE 0.797 46.000 0.229 NA   NA
 3490960 3490961 Bpet1893 Bpet1894   rfaE TRUE 0.926 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3490961 3490962 Bpet1894 Bpet1895 rfaE rfaD TRUE 0.998 -3.000 0.191 0.009 Y NA
 3490962 3490963 Bpet1895 Bpet1896 rfaD   FALSE 0.147 140.000 0.006 NA   NA
 3490963 3490964 Bpet1896 Bpet1897   cysM FALSE 0.353 77.000 0.006 NA   NA
 3490966 3490967 Bpet1899 Bpet1900 hda etfB1 FALSE 0.435 68.000 0.065 NA N NA
 3490967 3490968 Bpet1900 Bpet1901 etfB1 etfA1 TRUE 0.994 -49.000 0.600 0.018 Y NA
 3490968 3490969 Bpet1901 Bpet1902 etfA1   FALSE 0.012 388.000 0.000 0.015 N NA
 3490969 3490970 Bpet1902 Bpet1903   lsfA1 FALSE 0.060 147.000 0.021 1.000 N NA
 3490970 3490971 Bpet1903 Bpet1904 lsfA1   FALSE 0.001 201.000 0.000 1.000 N NA
 3490971 3490972 Bpet1904 Bpet1905   cysT TRUE 0.938 23.000 0.097 0.001 N NA
 3490972 3490973 Bpet1905 Bpet1906 cysT cysW TRUE 0.998 -3.000 0.935 0.000 N NA
 3490973 3490974 Bpet1906 Bpet1907 cysW cysA TRUE 0.991 14.000 0.587 1.000 Y NA
 3490974 3490975 Bpet1907 Bpet1908 cysA cysH TRUE 0.848 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3490975 3490976 Bpet1908 Bpet1909 cysH cysD TRUE 0.958 10.000 0.003 1.000 Y NA
 3490976 3490977 Bpet1909 Bpet1910 cysD cysN TRUE 0.902 25.000 0.045 0.000 N NA
 3490977 3490978 Bpet1910 Bpet1911 cysN   FALSE 0.001 201.000 0.000 1.000 N NA
 3490978 3490979 Bpet1911 Bpet1912     TRUE 0.874 14.000 0.009 NA   NA
 3490981 3490982 Bpet1914 Bpet1915 rplS   FALSE 0.169 91.000 0.000 1.000   NA
 3490982 3490983 Bpet1915 Bpet1916   tnp11 FALSE 0.379 33.000 0.000 1.000   NA
 3490983 3490984 Bpet1916 Bpet1917 tnp11   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.085 Y NA
 3490984 3490985 Bpet1917 Bpet1918     FALSE 0.032 178.000 0.000 1.000   NA
 3490986 3490987 Bpet1919 Bpet1920     TRUE 0.976 -3.000 0.046 1.000   NA
 3490988 3490989 Bpet1921 Bpet1922 orn   TRUE 0.728 22.000 0.005 NA   NA
 3490991 3490992 Bpet1924 Bpet1925 paaA paaB TRUE 0.864 65.000 0.920 NA   NA
 3490992 3490993 Bpet1925 Bpet1926 paaB paaC TRUE 0.989 10.000 0.943 NA   NA
 3490993 3490994 Bpet1926 Bpet1927 paaC paaD TRUE 0.996 -3.000 0.919 NA   NA
 3490994 3490995 Bpet1927 Bpet1928 paaD paaE TRUE 0.966 19.000 0.571 NA   NA
 3490995 3490996 Bpet1928 Bpet1929 paaE paaZ1 TRUE 0.824 46.000 0.075 1.000 Y NA
 3490997 3490998 Bpet1930 Bpet1931   tnp12 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.085 Y NA
 3490999 3491000 Bpet1932 Bpet1933   paaG TRUE 0.961 14.000 0.139 NA   NA
 3491000 3491001 Bpet1933 Bpet1934 paaG paaI TRUE 0.982 0.000 0.204 NA N NA
 3491001 3491002 Bpet1934 Bpet1935 paaI paaK FALSE 0.306 76.000 0.031 NA N NA
 3491004 3491005 Bpet1937 Bpet1938     TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3491005 3491006 Bpet1938 Bpet1939     TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 3491006 3491007 Bpet1939 Bpet1940   bug40 FALSE 0.208 69.000 0.000 1.000   NA
 3491008 3491009 Bpet1941 Bpet1942     FALSE 0.492 31.000 0.000 NA   NA
 3491009 3491010 Bpet1942 Bpet1943     TRUE 0.943 59.000 1.000 NA Y NA
 3491010 3491011 Bpet1943 Bpet1944     TRUE 0.794 96.000 0.115 NA Y NA
 3491012 3491013 Bpet1945 Bpet1946     TRUE 0.985 -3.000 0.102 1.000   NA
 3491013 3491014 Bpet1946 Bpet1947     TRUE 0.887 -10.000 0.012 1.000   NA
 3491014 3491015 Bpet1947 Bpet1948   potF FALSE 0.002 496.000 0.013 1.000 N NA
 3491015 3491016 Bpet1948 Bpet1949 potF potG TRUE 0.989 6.000 0.158 1.000 Y NA
 3491016 3491017 Bpet1949 Bpet1950 potG potH TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3491017 3491018 Bpet1950 Bpet1951 potH potI TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.064 Y NA
 3491018 3491019 Bpet1951 Bpet1952 potI   TRUE 0.851 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3491019 3491020 Bpet1952 Bpet1953     TRUE 0.767 3.000 0.008 1.000 N NA
 3491022 3491023 Bpet1955 Bpet1956     FALSE 0.369 60.000 0.004 NA   NA
 3491023 3491024 Bpet1956 Bpet1957   rpiA FALSE 0.085 47.000 0.003 1.000 N NA
 3491024 3491025 Bpet1957 Bpet1958 rpiA   FALSE 0.037 196.000 0.024 NA N NA
 3491026 3491027 Bpet1959 Bpet1960     FALSE 0.401 37.000 0.000 0.091 N NA
 3491027 3491028 Bpet1960 Bpet1961   bug41 TRUE 0.962 13.000 0.154 1.000   NA
 3491030 3491031 Bpet1963 Bpet1964     FALSE 0.054 254.000 0.123 NA N NA
 3491031 3491032 Bpet1964 Bpet1965     FALSE 0.005 125.000 0.000 1.000 N NA
 3491034 3491035 Bpetpseudo_07 Bpet1967   glnE TRUE 0.739 22.000 0.007 NA   NA
 3491037 3491038 Bpet1969 Bpet1970   rho FALSE 0.000 551.000 0.000 1.000 N NA
 3491038 3491039 Bpet1970 Bpet1971 rho trxA FALSE 0.403 115.000 0.087 1.000   NA
 3491040 3491041 Bpet1972 Bpet1973 parE parC TRUE 0.953 42.000 0.106 0.001 Y NA
 3491042 3491043 Bpet1974 Bpet1975     FALSE 0.234 88.000 0.000 NA   NA
 3491043 3491044 Bpet1975 Bpet1976     FALSE 0.004 628.000 0.000 NA   NA
 3491044 3491045 Bpet1976 Bpet1977     FALSE 0.392 133.000 0.098 NA   NA
 3491045 3491046 Bpet1977 Bpet1978     FALSE 0.366 120.000 0.056 NA   NA
 3491046 3491047 Bpet1978 Bpet1979     TRUE 0.590 82.000 0.268 1.000 N NA
 3491048 3491049 Bpet1980 Bpet1981   ectA TRUE 0.974 -3.000 0.039 1.000   NA
 3491049 3491050 Bpet1981 Bpet1982 ectA ectB TRUE 0.898 110.000 0.793 0.000   NA
 3491050 3491051 Bpet1982 Bpet1983 ectB ectC TRUE 0.994 -3.000 0.572 1.000   NA
 3491051 3491052 Bpet1983 Bpet1984 ectC   TRUE 0.863 18.000 0.046 1.000   NA
 3491052 3491053 Bpet1984 Bpet1985   kdgT FALSE 0.016 226.000 0.000 1.000   NA
 3491053 3491054 Bpet1985 Bpet1986 kdgT   TRUE 0.925 -135.000 0.118 NA   NA
 3491054 3491055 Bpet1986 Bpet1987   pdxA1 TRUE 0.987 -3.000 0.098 NA   NA
 3491055 3491056 Bpet1987 Bpet1988 pdxA1   TRUE 0.958 5.000 0.158 1.000 N NA
 3491056 3491057 Bpet1988 Bpet1989     TRUE 0.621 68.000 0.105 1.000   NA
 3491059 3491060 Bpet1991 Bpet1992 ascD   FALSE 0.026 184.000 0.020 1.000 N NA
 3491060 3491061 Bpet1992 Bpet1993   ugpB2 TRUE 0.973 5.000 0.333 1.000 N NA
 3491061 3491062 Bpet1993 Bpet1994 ugpB2   FALSE 0.028 211.000 0.000 NA   NA
 3491062 3491063 Bpet1994 Bpet1995     TRUE 0.990 -3.000 0.143 NA   NA
 3491063 3491064 Bpet1995 Bpet1996     TRUE 0.990 1.000 0.286 NA   NA
 3491064 3491065 Bpet1996 Bpet1997     TRUE 0.984 -13.000 0.500 NA   NA
 3491065 3491066 Bpet1997 Bpet1998     TRUE 0.941 -88.000 0.154 NA   NA
 3491066 3491067 Bpet1998 Bpet1999     TRUE 0.991 -7.000 0.800 NA   NA
 3491067 3491068 Bpet1999 Bpet2000     TRUE 0.880 44.000 0.667 NA   NA
 3491068 3491069 Bpet2000 Bpet2001     TRUE 0.971 12.000 0.167 NA   NA
 3491069 3491070 Bpet2001 Bpet2002   alaS2 FALSE 0.276 70.000 0.000 NA   NA
 3491070 3491071 Bpet2002 Bpet2003 alaS2   TRUE 0.921 -13.000 0.006 0.027 N NA
 3491071 3491072 Bpet2003 Bpet2004   rpsP FALSE 0.004 141.000 0.000 1.000 N NA
 3491072 3491073 Bpet2004 Bpet2005 rpsP rimM TRUE 0.964 45.000 0.342 0.009 Y NA
 3491073 3491074 Bpet2005 Bpet2006 rimM trmD TRUE 0.997 0.000 0.672 1.000 Y NA
 3491074 3491075 Bpet2006 Bpet2007 trmD   FALSE 0.001 192.000 0.000 1.000 N NA
 3491075 3491076 Bpet2007 Bpet2008     TRUE 0.540 97.000 0.263 1.000 N NA
 3491076 3491077 Bpet2008 Bpet2009     TRUE 0.954 75.000 0.633 0.064 Y NA
 3491077 3491078 Bpet2009 Bpet2010     TRUE 0.998 -3.000 0.867 1.000 Y NA
 3491078 3491079 Bpet2010 Bpet2011     TRUE 0.990 10.000 0.233 1.000 Y NA
 3491080 3491081 Bpet2012 Bpet2013     TRUE 0.891 99.000 0.833 1.000 Y NA
 3491084 3491085 Bpet2016 Bpet2017 ndk   TRUE 0.860 28.000 0.156 1.000   NA
 3491085 3491086 Bpet2017 Bpet2018     TRUE 0.964 -3.000 0.020 1.000   NA
 3491086 3491087 Bpet2018 Bpet2019   ispG TRUE 0.965 14.000 0.233 1.000   NA
 3491087 3491088 Bpet2019 Bpet2020 ispG hisS TRUE 0.638 48.000 0.207 1.000 N NA
 3491088 3491089 Bpet2020 Bpet2021 hisS   TRUE 0.987 2.000 0.259 1.000   NA
 3491089 3491090 Bpet2021 Bpet2022     TRUE 0.986 5.000 0.492 1.000   NA
 3491090 3491091 Bpet2022 Bpet2023   engA TRUE 0.904 24.000 0.203 1.000   NA
 3491091 3491092 Bpet2023 Bpet2024 engA hisC3 TRUE 0.891 4.000 0.003 1.000   NA
 3491092 3491093 Bpet2024 Bpet2025 hisC3 hfq FALSE 0.120 148.000 0.015 1.000   NA
 3491093 3491094 Bpet2025 Bpet2026 hfq hflX FALSE 0.486 82.000 0.058 1.000   NA
 3491094 3491095 Bpet2026 Bpet2027 hflX hflK TRUE 0.977 -34.000 0.184 0.061   NA
 3491095 3491096 Bpet2027 Bpet2028 hflK hflC TRUE 0.995 19.000 0.947 0.007 Y NA
 3491096 3491097 Bpet2028 Bpet2029 hflC   FALSE 0.000 1064.000 0.000 1.000 N NA
 3491097 3491098 Bpet2029 Bpet2030   hisZ FALSE 0.001 240.000 0.000 1.000 N NA
 3491098 3491099 Bpet2030 Bpet2031 hisZ purA FALSE 0.510 80.000 0.161 1.000 N NA
 3491099 3491100 Bpet2031 Bpet2032 purA   FALSE 0.356 105.000 0.042 1.000   NA
 3491100 3491101 Bpet2032 Bpet2033   rpsU FALSE 0.009 286.000 0.000 1.000   NA
 3491101 3491102 Bpet2033 Bpet2034 rpsU dnaG TRUE 0.741 22.000 0.067 1.000 N NA
 3491102 3491103 Bpet2034 Bpet2035 dnaG rpoD FALSE 0.031 397.000 0.299 1.000 N NA
 3491103 3491104 Bpet2035 Bpettrna_16 rpoD b_petrii_trna_16 TRUE 0.860 8.000 0.000 NA   NA
 3491104 3491105 Bpettrna_16 Bpet2036 b_petrii_trna_16   FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 3491107 3491108 Bpet2038 Bpet2039     FALSE 0.037 191.000 0.000 NA   NA
 3491109 3491110 Bpet2040 Bpet2041     TRUE 0.552 81.000 0.065 NA   NA
 3491110 3491111 Bpet2041 Bpet2042     TRUE 0.587 70.000 0.065 NA   NA
 3491114 3491115 Bpettrna_17 Bpet2046 b_petrii_trna_17   FALSE 0.184 106.000 0.000 NA   NA
 3491117 3491118 Bpet2048 Bpet2049     TRUE 0.985 -21.000 1.000 NA   NA
 3491118 3491119 Bpet2049 Bpet2050   pyrB FALSE 0.335 73.000 0.003 NA   NA
 3491122 3491123 Bpet2053 Bpet2054     FALSE 0.061 187.000 0.070 1.000 N NA
 3491123 3491124 Bpet2054 Bpet2055     TRUE 0.850 116.000 0.812 1.000 Y NA
 3491125 3491126 Bpet2056 Bpet2057 recA   TRUE 0.992 -3.000 0.296 1.000   NA
 3491128 3491129 Bpet2059 Bpet2060 metE   FALSE 0.119 132.000 0.000 NA   NA
 3491129 3491130 Bpet2060 Bpet2061   sucC TRUE 0.957 11.000 0.076 NA   NA
 3491130 3491131 Bpet2061 Bpet2062 sucC sucD TRUE 0.990 19.000 0.151 0.000 Y NA
 3491131 3491132 Bpet2062 Bpet2063 sucD   FALSE 0.062 254.000 0.220 1.000 N NA
 3491132 3491133 Bpet2063 Bpet2064     TRUE 0.845 114.000 0.150 0.061 Y NA
 3491133 3491134 Bpet2064 Bpet2065   hemC FALSE 0.039 109.000 0.003 1.000 N NA
 3491134 3491135 Bpet2065 Bpet2066 hemC hemD TRUE 0.963 44.000 0.205 0.001 Y NA
 3491135 3491136 Bpet2066 Bpet2067 hemD hemX TRUE 0.945 39.000 0.600 1.000 Y NA
 3491136 3491137 Bpet2067 Bpet2068 hemX hemY TRUE 0.927 4.000 0.016 1.000   NA
 3491137 3491138 Bpet2068 Bpet2069 hemY ppa TRUE 0.906 4.000 0.006 1.000   NA
 3491138 3491139 Bpet2069 Bpet2070 ppa   FALSE 0.001 239.000 0.000 1.000 N NA
 3491139 3491140 Bpet2070 Bpet2071     TRUE 0.824 28.000 0.100 1.000   NA
 3491140 3491141 Bpet2071 Bpet2072     FALSE 0.149 180.000 0.067 NA   NA
 3491141 3491142 Bpet2072 Bpet2073     TRUE 0.993 -3.000 0.273 NA   NA
 3491142 3491143 Bpet2073 Bpet2074     TRUE 0.993 -3.000 0.273 NA   NA
 3491143 3491144 Bpet2074 Bpet2075     TRUE 0.991 4.000 0.667 NA   NA
 3491144 3491145 Bpet2075 Bpet2076     TRUE 0.984 -3.000 0.062 NA   NA
 3491145 3491146 Bpet2076 Bpet2077     TRUE 0.996 -3.000 0.125 NA Y NA
 3491146 3491147 Bpet2077 Bpet2078     TRUE 0.975 -48.000 0.154 1.000 Y NA
 3491147 3491148 Bpet2078 Bpet2079     TRUE 0.997 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 3491148 3491149 Bpet2079 Bpet2080     TRUE 0.997 9.000 0.381 0.007 Y NA
 3491149 3491150 Bpet2080 Bpet2081     TRUE 0.958 -18.000 0.111 NA   NA
 3491151 3491152 Bpet2082 Bpet2083     FALSE 0.222 94.000 0.000 NA   NA
 3491153 3491154 Bpet2084 Bpet2085 guaB guaA TRUE 0.931 97.000 0.190 0.000 Y NA
 3491155 3491156 Bpet2086 Bpet2087     TRUE 0.979 3.000 0.099 NA   NA
 3491162 3491163 Bpet2093 Bpet2094   tnp13 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.084 Y NA
 3491163 3491164 Bpet2094 Bpet2095 tnp13 fliC FALSE 0.001 281.000 0.000 1.000 N NA
 3491164 3491165 Bpet2095 Bpet2096 fliC fliA FALSE 0.033 155.000 0.012 1.000 N NA
 3491166 3491167 Bpet2097 Bpet2098 flhD flhC TRUE 0.998 0.000 1.000 0.002   NA
 3491167 3491168 Bpet2098 Bpet2099 flhC motA FALSE 0.354 115.000 0.061 1.000   NA
 3491168 3491169 Bpet2099 Bpet2100 motA motB TRUE 0.983 13.000 0.122 1.000 Y NA
 3491169 3491170 Bpet2100 Bpet2101 motB cheY1 TRUE 0.969 3.000 0.176 1.000 N NA
 3491170 3491171 Bpet2101 Bpet2102 cheY1 cheA TRUE 0.939 29.000 0.176 1.000 Y NA
 3491171 3491172 Bpet2102 Bpet2103 cheA cheW TRUE 0.993 14.000 0.128 0.003 Y NA
 3491172 3491173 Bpet2103 Bpet2104 cheW tsr1 TRUE 0.871 84.000 0.043 0.003 Y NA
 3491173 3491174 Bpet2104 Bpet2105 tsr1 cheR TRUE 0.971 10.000 0.025 1.000 Y NA
 3491174 3491175 Bpet2105 Bpet2106 cheR cheB TRUE 0.980 5.000 0.037 1.000 Y NA
 3491175 3491176 Bpet2106 Bpet2107 cheB cheY2 TRUE 0.942 49.000 0.150 0.011 Y NA
 3491176 3491177 Bpet2107 Bpet2108 cheY2 cheZ TRUE 0.995 9.000 0.741 1.000 Y NA
 3491177 3491178 Bpet2108 Bpet2109 cheZ   TRUE 0.710 36.000 0.000 1.000 Y NA
 3491178 3491179 Bpet2109 Bpet2110   flhB TRUE 0.578 110.000 0.000 0.087 Y NA
 3491179 3491180 Bpet2110 bp050705_PS_01 flhB flhA TRUE 0.515 29.000 0.000 NA   NA
 3491180 3491181 bp050705_PS_01 Bpet2111 flhA flhA1 TRUE 0.681 -839.000 0.000 NA   NA
 3491182 3491183 Bpet2112 Bpet2113     TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.084 Y NA
 3491184 3491185 Bpet2114 Bpet2115 flhA2 flhF TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.087 Y NA
 3491186 3491187 Bpet2116 Bpet2117 flgN flgM TRUE 0.981 30.000 0.211 0.001 Y NA
 3491188 3491189 Bpet2118 Bpet2119     TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.084 Y NA
 3491191 3491192 Bpet2121 Bpet2122 flgB flgC TRUE 0.997 16.000 1.000 0.003 Y NA
 3491192 3491193 Bpet2122 Bpet2123 flgC flgD TRUE 0.940 21.000 0.035 NA Y NA
 3491193 3491194 Bpet2123 Bpet2124 flgD flgE TRUE 0.790 49.000 0.035 NA Y NA
 3491194 3491195 Bpet2124 Bpet2125 flgE flgF TRUE 0.987 30.000 0.600 0.003 Y NA
 3491195 3491196 Bpet2125 Bpet2126 flgF flgG TRUE 0.946 54.000 0.119 0.001 Y NA
 3491196 3491197 Bpet2126 Bpet2127 flgG flgH TRUE 0.998 6.000 0.463 0.005 Y NA
 3491197 3491198 Bpet2127 Bpet2128 flgH flgI TRUE 0.995 3.000 0.037 0.005 Y NA
 3491198 3491199 Bpet2128 Bpet2129 flgI flgJ TRUE 0.995 0.000 0.018 0.005 Y NA
 3491199 3491200 Bpet2129 Bpet2130 flgJ flgK TRUE 0.970 70.000 0.705 0.002 Y NA
 3491200 3491201 Bpet2130 Bpet2131 flgK flgL TRUE 0.969 36.000 0.142 0.001 Y NA
 3491201 3491202 Bpet2131 Bpet2132 flgL tsr2 TRUE 0.818 49.000 0.077 1.000 Y NA
 3491202 3491203 Bpet2132 Bpet2133 tsr2   FALSE 0.447 35.000 0.000 NA   NA
 3491203 3491204 Bpet2133 Bpet2134   tsr3 FALSE 0.222 94.000 0.000 NA   NA
 3491205 3491206 Bpet2135 Bpet2136 fliR fliQ TRUE 0.970 35.000 0.125 0.001 Y NA
 3491206 3491207 Bpet2136 Bpet2137 fliQ fliP TRUE 0.997 13.000 0.827 0.007 Y NA
 3491207 3491208 Bpet2137 Bpet2138 fliP fliO TRUE 0.977 17.000 0.203 1.000 Y NA
 3491208 3491209 Bpet2138 Bpet2139 fliO fliN TRUE 0.993 8.000 0.443 1.000 Y NA
 3491209 3491210 Bpet2139 Bpet2140 fliN fliM TRUE 0.998 -7.000 0.741 0.001 Y NA
 3491210 3491211 Bpet2140 Bpet2141 fliM fliL TRUE 0.994 3.000 0.018 0.001 Y NA
 3491211 3491212 Bpet2141 Bpet2142 fliL fliK FALSE 0.261 163.000 0.019 1.000 Y NA
 3491212 3491213 Bpet2142 Bpet2143 fliK fliJ TRUE 0.964 45.000 0.317 0.005 Y NA
 3491213 3491214 Bpet2143 Bpet2144 fliJ fliI TRUE 0.994 -7.000 0.070 0.005 Y NA
 3491214 3491215 Bpet2144 Bpet2145 fliI fliH TRUE 0.998 -3.000 0.115 0.003 Y NA
 3491215 3491216 Bpet2145 Bpet2146 fliH fliG TRUE 0.997 -7.000 0.320 0.003 Y NA
 3491216 3491217 Bpet2146 Bpet2147 fliG fliF TRUE 0.996 -10.000 0.220 0.005 Y NA
 3491219 3491220 Bpet2149 Bpet2150     TRUE 0.878 16.000 0.025 NA   NA
 3491220 3491221 Bpet2150 Bpet2151     TRUE 0.992 -3.000 0.279 1.000   NA
 3491221 3491222 Bpet2151 Bpet2152   fliT TRUE 0.648 41.000 0.070 1.000   NA
 3491222 3491223 Bpet2152 Bpet2153 fliT fliS TRUE 0.609 38.000 0.041 1.000   NA
 3491223 3491224 Bpet2153 Bpet2154 fliS fliD TRUE 0.978 20.000 0.041 0.002 Y NA
 3491224 3491225 Bpet2154 Bpet2155 fliD flaG FALSE 0.339 93.000 0.011 NA   NA
 3491227 3491228 Bpet2157 Bpet2158 acd11   TRUE 0.965 0.000 0.100 1.000 N NA
 3491228 3491229 Bpet2158 Bpet2159   bug42 TRUE 0.992 -3.000 0.286 1.000   NA
 3491229 3491230 Bpet2159 Bpet2160 bug42   FALSE 0.218 60.000 0.000 1.000   NA
 3491231 3491232 Bpet2161 Bpet2162 folC   TRUE 0.690 55.000 0.100 NA   NA
 3491232 3491233 Bpet2162 Bpet2163   cvpA TRUE 0.984 -3.000 0.066 NA   NA
 3491233 3491234 Bpet2163 Bpet2164 cvpA purF TRUE 0.930 22.000 0.262 1.000   NA
 3491234 3491235 Bpet2164 Bpet2165 purF dsbB FALSE 0.093 61.000 0.005 1.000 N NA
 3491235 3491236 Bpet2165 Bpet2166 dsbB int2 FALSE 0.000 386.000 0.000 1.000 N NA
 3491236 3491237 Bpet2166 Bpet2167 int2   TRUE 0.861 39.000 0.333 NA   NA
 3491237 3491238 Bpet2167 Bpet2168     TRUE 0.990 4.000 0.500 NA   NA
 3491238 3491239 Bpet2168 Bpet2169     FALSE 0.447 35.000 0.000 NA   NA
 3491239 3491240 Bpet2169 Bpet2170     TRUE 0.766 -31.000 0.000 NA   NA
 3491240 3491241 Bpet2170 Bpet2171     TRUE 0.987 -13.000 0.750 NA   NA
 3491241 3491242 Bpet2171 Bpet2172   radC2 FALSE 0.009 335.000 0.000 NA   NA
 3491242 3491243 Bpet2172 Bpet2173 radC2   FALSE 0.007 392.000 0.000 NA   NA
 3491245 3491246 Bpet2175 Bpet2176     TRUE 0.823 66.000 0.500 NA   NA
 3491246 3491247 Bpet2176 Bpet2177     FALSE 0.282 63.000 0.000 NA   NA
 3491247 3491248 Bpet2177 Bpet2178     FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 3491248 3491249 Bpet2178 Bpet2179     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3491249 3491250 Bpet2179 Bpet2180     FALSE 0.003 802.000 0.000 NA   NA
 3491252 3491253 Bpet2182 Bpet2183     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 3491253 3491254 Bpet2183 Bpet2184     FALSE 0.277 69.000 0.000 NA   NA
 3491254 3491255 Bpet2184 Bpet2185     TRUE 0.942 27.000 0.600 NA   NA
 3491255 3491256 Bpet2185 Bpet2186     FALSE 0.003 254.000 0.000 NA N NA
 3491256 3491257 Bpet2186 Bpet2187     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3491257 3491258 Bpet2187 Bpet2188     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 3491258 3491259 Bpet2188 Bpet2189   traF1 TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 3491259 3491260 Bpet2189 Bpet2190 traF1 virD2 FALSE 0.029 377.000 0.000 NA Y NA
 3491261 3491262 Bpet2191 Bpet2192 fadA2   FALSE 0.000 324.000 0.000 1.000 N NA
 3491262 3491263 Bpet2192 Bpet2193     TRUE 0.622 28.000 0.000 0.057 N NA
 3491263 3491264 Bpet2193 Bpet2194   fadA3 TRUE 0.981 13.000 0.095 1.000 Y NA
 3491264 3491265 Bpet2194 Bpet2195 fadA3   FALSE 0.289 20.000 0.000 NA N NA
 3491266 3491267 Bpet2196 Bpet2197     TRUE 0.984 -3.000 0.222 1.000 N NA
 3491267 3491268 Bpet2197 Bpetpseudo_08   nerA FALSE 0.241 51.000 0.000 1.000   NA
 3491268 3491269 Bpetpseudo_08 Bpetpseudo_09 nerA   TRUE 0.762 -34.000 0.000 NA   NA
 3491271 3491272 Bpet2199 Bpet2200     FALSE 0.090 127.000 0.000 1.000   NA
 3491272 3491273 Bpet2200 Bpet2201     TRUE 0.710 -25.000 0.000 1.000   NA
 3491273 3491274 Bpet2201 Bpet2202     FALSE 0.015 57.000 0.000 1.000 N NA
 3491274 3491275 Bpet2202 Bpet2203     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3491275 3491276 Bpet2203 Bpet2204   traG1 FALSE 0.021 237.000 0.000 NA   NA
 3491276 3491277 Bpet2204 Bpet2205 traG1   TRUE 0.995 -3.000 0.833 1.000   NA
 3491277 3491278 Bpet2205 Bpet2206   trbB1 TRUE 0.991 -3.000 0.227 1.000   NA
 3491278 3491279 Bpet2206 Bpet2207 trbB1 trbC1 TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3491279 3491280 Bpet2207 Bpet2208 trbC1 trbD1 TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3491280 3491281 Bpet2208 Bpet2209 trbD1 trbE1 TRUE 0.992 13.000 0.375 NA Y NA
 3491281 3491282 Bpet2209 Bpet2210 trbE1 trbJ1 TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3491282 3491283 Bpet2210 Bpet2211 trbJ1   TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 3491283 3491284 Bpet2211 Bpet2212   trbL1 TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3491284 3491285 Bpet2212 Bpet2213 trbL1 trbF1 TRUE 0.990 13.000 0.333 1.000 Y NA
 3491285 3491286 Bpet2213 Bpet2214 trbF1 trbG1 TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA Y NA
 3491286 3491287 Bpet2214 Bpet2215 trbG1 trbI1 TRUE 0.974 3.000 0.000 NA Y NA
 3491287 3491288 Bpet2215 Bpet2216 trbI1   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3491289 3491290 Bpet2217 Bpet2218   ugpQ TRUE 0.845 16.000 0.010 NA   NA
 3491299 3491300 Bpet2227 Bpet2228     FALSE 0.010 321.000 0.000 NA   NA
 3491300 3491301 Bpet2228 Bpet2229     FALSE 0.473 87.000 0.105 NA N NA
 3491301 3491302 Bpet2229 Bpet2230     TRUE 0.989 -3.000 0.273 NA N NA
 3491302 3491303 Bpet2230 Bpet2231     TRUE 0.567 44.000 0.044 1.000   NA
 3491303 3491304 Bpet2231 Bpet2232     TRUE 0.764 61.000 0.326 1.000   NA
 3491304 3491305 Bpet2232 Bpet2233     TRUE 0.553 38.000 0.013 NA   NA
 3491306 3491307 Bpet2234 Bpet2235     FALSE 0.004 136.000 0.000 1.000 N NA
 3491307 3491308 Bpet2235 Bpet2236     TRUE 0.984 -7.000 0.688 NA N NA
 3491308 3491309 Bpet2236 Bpet2237     TRUE 0.995 7.000 0.656 NA Y NA
 3491310 3491311 Bpet2238 Bpet2239   oplAH FALSE 0.385 67.000 0.069 1.000 N NA
 3491313 3491314 Bpet2241 Bpet2242 glnH1 glnP1 TRUE 0.763 105.000 0.038 0.075 Y NA
 3491314 3491315 Bpet2242 Bpet2243 glnP1 glnQ1 TRUE 0.996 -3.000 0.244 1.000 Y NA
 3491318 3491319 Bpet2246 Bpet2247 spoT rpoZ TRUE 0.972 22.000 0.291 1.000 Y NA
 3491319 3491320 Bpet2247 Bpet2248 rpoZ gmk TRUE 0.776 41.000 0.471 1.000 N NA
 3491325 3491326 Bpet2253 Bpet2254 amn   FALSE 0.130 107.000 0.000 1.000   NA
 3491326 3491327 Bpet2254 Bpet2255     TRUE 0.983 -3.000 0.059 NA   NA
 3491330 3491331 Bpet2258 Bpet2259   bug44 TRUE 0.927 29.000 0.667 1.000   NA
 3491332 3491333 Bpet2260 Bpet2261 galU2   FALSE 0.016 51.000 0.000 1.000 N NA
 3491333 3491334 Bpet2261 Bpet2262     FALSE 0.313 52.000 0.000 NA   NA
 3491334 3491335 Bpet2262 Bpet2263     FALSE 0.317 51.000 0.000 NA   NA
 3491337 3491338 Bpet2265 Bpet2266     TRUE 0.604 24.000 0.000 NA   NA
 3491341 3491342 Bpet2269 Bpet2270   acd12 TRUE 0.952 6.000 0.059 1.000   NA
 3491343 3491344 Bpet2271 Bpet2272     FALSE 0.016 54.000 0.000 1.000 N NA
 3491344 3491345 Bpet2272 Bpet2273     TRUE 0.810 28.000 0.218 1.000 N NA
 3491345 3491346 Bpet2273 Bpet2274   glnA FALSE 0.016 356.000 0.002 0.027 N NA
 3491346 3491347 Bpet2274 Bpet2275 glnA ntrB FALSE 0.112 147.000 0.053 1.000 N NA
 3491347 3491348 Bpet2275 Bpet2276 ntrB ntrC TRUE 0.999 -3.000 0.587 0.079 Y NA
 3491350 3491351 Bpet2278 Bpet2279     FALSE 0.491 106.000 0.081 NA   NA
 3491352 3491353 Bpet2280 Bpet2281     TRUE 0.831 5.000 0.021 1.000 N NA
 3491353 3491354 Bpet2281 Bpet2282     FALSE 0.404 176.000 0.026 0.063 Y NA
 3491356 3491357 Bpet2284 Bpet2285   bug45 FALSE 0.037 294.000 0.000 0.044   NA
 3491357 3491358 Bpet2285 Bpet2286 bug45   TRUE 0.818 46.000 0.286 NA   NA
 3491358 3491359 Bpet2286 Bpet2287     TRUE 0.995 -3.000 0.619 NA   NA
 3491360 3491361 Bpet2288 Bpet2289     FALSE 0.002 328.000 0.000 NA N NA
 3491361 3491362 Bpet2289 Bpet2290   recG TRUE 0.669 33.000 0.076 NA N NA
 3491362 3491363 Bpet2290 Bpet2291 recG   TRUE 0.842 55.000 0.117 1.000 Y NA
 3491363 3491364 Bpet2291 Bpet2292     FALSE 0.142 117.000 0.034 1.000 N NA
 3491364 3491365 Bpet2292 Bpet2293     FALSE 0.172 109.000 0.000 NA   NA
 3491365 3491366 Bpet2293 Bpet2294   wcbP TRUE 0.733 17.000 0.000 NA   NA
 3491366 3491367 Bpet2294 Bpet2295 wcbP wcbQ TRUE 0.992 -7.000 0.392 0.089   NA
 3491367 3491368 Bpet2295 Bpet2296 wcbQ kpsE2 FALSE 0.071 231.000 0.000 1.000 Y NA
 3491368 3491369 Bpet2296 Bpet2297 kpsE2 wza2 TRUE 0.989 13.000 0.086 0.086 Y NA
 3491369 3491370 Bpet2297 Bpet2298 wza2 wzm2 TRUE 0.989 9.000 0.056 0.086 Y NA
 3491370 3491371 Bpet2298 Bpet2299 wzm2 wzt2 TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.079 Y NA
 3491371 3491372 Bpet2299 Bpet2300 wzt2   FALSE 0.174 87.000 0.000 1.000   NA
 3491372 3491373 Bpet2300 Bpet2301     TRUE 0.850 -10.000 0.000 NA   NA
 3491373 3491374 Bpet2301 Bpet2302     FALSE 0.481 32.000 0.000 NA   NA
 3491374 3491375 Bpet2302 Bpet2303     TRUE 0.991 3.000 0.678 1.000   NA
 3491375 3491376 Bpet2303 Bpet2304   neuA TRUE 0.870 78.000 0.296 1.000 Y NA
 3491376 3491377 Bpet2304 Bpet2305 neuA murG2 TRUE 0.992 -9.000 0.355 1.000 Y NA
 3491377 3491378 Bpet2305 Bpet2306 murG2   TRUE 0.619 36.000 0.097 1.000 N NA
 3491378 3491379 Bpet2306 Bpet2307   neuB TRUE 0.927 9.000 0.093 1.000 N NA
 3491379 3491380 Bpet2307 Bpet2308 neuB wcbA TRUE 0.626 45.000 0.000 1.000 Y NA
 3491380 3491381 Bpet2308 Bpet2309 wcbA wcbO TRUE 0.998 2.000 0.315 0.001 Y NA
 3491382 3491383 Bpet2310 Bpet2311 wcbT wcbR TRUE 0.987 6.000 0.259 0.016 N NA
 3491383 3491384 Bpet2311 Bpet2312 wcbR livJ1 FALSE 0.000 785.000 0.000 1.000 N NA
 3491386 3491387 Bpet2314 Bpet2315   ugpC FALSE 0.002 866.000 0.000 1.000   NA
 3491387 3491388 Bpet2315 Bpet2316 ugpC ugpE2 TRUE 0.971 38.000 0.464 0.063 Y NA
 3491388 3491389 Bpet2316 Bpet2317 ugpE2 ugpA2 TRUE 0.991 20.000 0.559 0.063 Y NA
 3491389 3491390 Bpet2317 Bpet2318 ugpA2 ugpB3 TRUE 0.930 109.000 0.793 0.063 Y NA
 3491390 3491391 Bpet2318 Bpet2319 ugpB3   FALSE 0.042 182.000 0.000 NA   NA
 3491391 3491392 Bpet2319 Bpet2320   proC TRUE 0.967 -3.000 0.012 NA   NA
 3491393 3491394 Bpet2321 Bpet2322 livJ2 livH TRUE 0.794 107.000 0.250 1.000 Y NA
 3491394 3491395 Bpet2322 Bpet2323 livH livM TRUE 0.999 0.000 0.574 0.063 Y NA
 3491395 3491396 Bpet2323 Bpet2324 livM livG TRUE 0.998 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 3491396 3491397 Bpet2324 Bpet2325 livG livF TRUE 0.999 -3.000 0.967 0.027 Y NA
 3491398 3491399 Bpet2326 Bpet2327     FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3491399 3491400 Bpet2327 Bpet2328   bug46 TRUE 0.552 22.000 0.000 1.000   NA
 3491401 3491402 Bpet2329 Bpet2330     FALSE 0.038 171.000 0.000 1.000   NA
 3491404 3491405 Bpet2332 Bpet2333     TRUE 0.897 -3.000 0.016 1.000 N NA
 3491406 3491407 Bpet2334 Bpet2335     FALSE 0.274 71.000 0.000 NA   NA
 3491409 3491410 Bpet2337 Bpet2338 psd   FALSE 0.351 97.000 0.017 NA   NA
 3491410 3491411 Bpet2338 Bpet2339   aldH FALSE 0.289 60.000 0.000 NA   NA
 3491411 3491412 Bpet2339 Bpet2340 aldH amaB1 TRUE 0.738 86.000 1.000 1.000 N NA
 3491412 3491413 Bpet2340 Bpet2341 amaB1 ilvG3 TRUE 0.989 14.000 0.400 1.000 Y NA
 3491413 3491414 Bpet2341 Bpet2342 ilvG3 citE TRUE 0.973 -3.000 0.100 1.000 N NA
 3491414 3491415 Bpet2342 Bpet2343 citE   TRUE 0.994 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 3491415 3491416 Bpet2343 Bpet2344     TRUE 0.995 5.000 0.444 NA Y NA
 3491416 3491417 Bpet2344 Bpet2345     TRUE 0.997 0.000 0.333 NA Y NA
 3491417 3491418 Bpet2345 Bpet2346     TRUE 0.629 60.000 0.250 1.000 N NA
 3491419 3491420 Bpet2347 Bpet2348     FALSE 0.447 35.000 0.000 NA   NA
 3491421 3491422 Bpet2349 Bpet2350   rpoN3 FALSE 0.074 152.000 0.000 NA   NA
 3491424 3491425 Bpet2352 Bpet2353     TRUE 0.597 55.000 0.051 NA   NA
 3491427 3491428 Bpet2355 Bpet2356     TRUE 0.997 -3.000 0.330 NA Y NA
 3491428 3491429 Bpet2356 Bpet2357     FALSE 0.070 68.000 0.000 NA N NA
 3491429 3491430 Bpet2357 Bpet2358     FALSE 0.075 138.000 0.000 1.000   NA
 3491430 3491431 Bpet2358 Bpet2359     FALSE 0.359 42.000 0.000 NA   NA
 3491431 3491432 Bpet2359 Bpet2360   coxA2 TRUE 0.930 5.000 0.012 NA   NA
 3491432 3491433 Bpet2360 Bpet2361 coxA2   FALSE 0.313 52.000 0.000 NA   NA
 3491433 3491434 Bpet2361 Bpet2362     TRUE 0.980 -19.000 0.500 NA   NA
 3491434 3491435 Bpet2362 Bpet2363     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 3491437 3491438 Bpet2365 Bpet2366 glgY malQ TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.002 Y NA
 3491438 3491439 Bpet2366 Bpet2367 malQ   TRUE 0.999 -3.000 0.167 0.002 Y NA
 3491439 3491440 Bpet2367 Bpet2368   glgX TRUE 0.943 48.000 0.107 0.002 Y NA
 3491440 3491441 Bpet2368 Bpet2369 glgX glgB TRUE 0.997 0.000 0.091 0.002 Y NA
 3491441 3491442 Bpet2369 Bpet2370 glgB treS TRUE 0.996 -3.000 0.009 0.002 Y NA
 3491442 3491443 Bpet2370 Bpet2371 treS   TRUE 0.992 14.000 0.544 0.002   NA
 3491443 3491444 Bpet2371 Bpet2372   glgA TRUE 0.881 14.000 0.024 1.000   NA
 3491444 3491445 Bpet2372 Bpet2373 glgA mscS FALSE 0.004 140.000 0.000 1.000 N NA
 3491445 3491446 Bpet2373 Bpet2374 mscS   FALSE 0.025 37.000 0.000 1.000 N NA
 3491447 3491448 Bpet2375 Bpet2376     FALSE 0.084 143.000 0.031 1.000 N NA
 3491448 3491449 Bpet2376 Bpet2377     TRUE 0.558 47.000 0.031 NA   NA
 3491449 3491450 Bpet2377 Bpet2378     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3491450 3491451 Bpet2378 Bpet2379     FALSE 0.226 92.000 0.000 NA   NA
 3491451 3491452 Bpet2379 Bpet2380     FALSE 0.267 75.000 0.000 NA   NA
 3491452 3491453 Bpet2380 Bpet2381   osmY FALSE 0.074 152.000 0.000 NA   NA
 3491453 3491454 Bpet2381 Bpet2382 osmY   TRUE 0.827 36.000 0.154 NA   NA
 3491454 3491455 Bpet2382 Bpet2383     FALSE 0.260 77.000 0.000 NA   NA
 3491455 3491456 Bpet2383 Bpet2384     TRUE 0.976 -9.000 0.239 1.000   NA
 3491456 3491457 Bpet2384 Bpet2385     TRUE 0.980 -3.000 0.160 1.000 N NA
 3491457 3491458 Bpet2385 Bpet2386     TRUE 0.737 31.000 0.143 1.000 N NA
 3491458 3491459 Bpet2386 Bpet2387     TRUE 0.991 -3.000 0.406 NA N NA
 3491459 3491460 Bpet2387 Bpet2388     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3491460 3491461 Bpet2388 Bpet2389     TRUE 0.776 -13.000 0.000 1.000   NA
 3491461 3491462 Bpet2389 Bpet2390     TRUE 0.937 9.000 0.044 1.000   NA
 3491462 3491463 Bpet2390 Bpet2391     TRUE 0.914 2.000 0.000 NA   NA
 3491463 3491464 Bpet2391 Bpet2392     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3491464 3491465 Bpet2392 Bpet2393     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3491465 3491466 Bpet2393 Bpet2394     FALSE 0.260 77.000 0.000 NA   NA
 3491467 3491468 Bpet2395 Bpet2396 topI   TRUE 0.951 2.000 0.012 NA   NA
 3491468 3491469 Bpet2396 Bpet2397     FALSE 0.497 53.000 0.021 NA   NA
 3491469 3491470 Bpet2397 Bpet2398     TRUE 0.970 -13.000 0.221 1.000   NA
 3491471 3491472 Bpet2399 Bpet2400     FALSE 0.019 212.000 0.000 1.000   NA
 3491472 3491473 Bpet2400 Bpet2401     TRUE 0.955 15.000 0.193 1.000   NA
 3491473 3491474 Bpet2401 Bpet2402   ssuD TRUE 0.776 24.000 0.102 1.000 N NA
 3491474 3491475 Bpet2402 Bpet2403 ssuD   TRUE 0.988 -3.000 0.340 1.000 N NA
 3491477 3491478 Bpet2405 Bpet2406     FALSE 0.242 84.000 0.000 NA   NA
 3491479 3491480 Bpet2407 Bpet2408   appF TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3491480 3491481 Bpet2408 Bpet2409 appF   TRUE 0.995 -27.000 0.350 0.003 Y NA
 3491481 3491482 Bpet2409 Bpet2410     TRUE 0.908 68.000 0.528 1.000 Y NA
 3491482 3491483 Bpet2410 Bpet2411     TRUE 0.998 4.000 0.694 0.062 Y NA
 3491483 3491484 Bpet2411 Bpet2412   appA TRUE 0.980 35.000 0.697 0.062 Y NA
 3491487 3491488 Bpet2416 Bpet2417     FALSE 0.175 163.000 0.000 1.000 Y NA
 3491488 3491489 Bpet2417 Bpet2418     TRUE 0.980 30.000 0.461 0.062 Y NA
 3491489 3491490 Bpet2418 Bpet2419     TRUE 0.952 32.000 0.364 1.000 Y NA
 3491490 3491491 Bpet2419 Bpet2420   penA FALSE 0.064 145.000 0.000 1.000   NA
 3491492 3491493 Bpet2421 Bpet2422 nhaA rhtB3 FALSE 0.008 105.000 0.000 1.000 N NA
 3491493 3491494 Bpet2422 Bpet2423 rhtB3   FALSE 0.356 35.000 0.000 1.000   NA
 3491495 3491496 Bpet2424 Bpet2425     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3491496 3491497 Bpet2425 Bpet2426   arcD1 FALSE 0.299 58.000 0.000 NA   NA
 3491497 3491498 Bpet2426 Bpet2427 arcD1 arcA TRUE 0.987 14.000 0.261 1.000 Y NA
 3491498 3491499 Bpet2427 Bpet2428 arcA arcD2 TRUE 0.991 2.000 0.087 1.000 Y NA
 3491499 3491500 Bpet2428 Bpet2429 arcD2   FALSE 0.308 55.000 0.000 NA   NA
 3491500 3491501 Bpet2429 Bpet2430   slyB FALSE 0.333 46.000 0.000 NA   NA
 3491503 3491504 Bpet2432 Bpet2433     FALSE 0.049 176.000 0.000 NA   NA
 3491504 3491505 Bpet2433 Bpet2434     FALSE 0.279 67.000 0.000 NA   NA
 3491505 3491506 Bpet2434 Bpet2435     FALSE 0.442 35.000 0.000 0.089 N NA
 3491506 3491507 Bpet2435 Bpet2436   bug47 FALSE 0.236 53.000 0.000 1.000   NA
 3491508 3491509 Bpet2437 Bpet2438     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.021   NA
 3491509 3491510 Bpet2438 Bpet2439   tnp14 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.083 Y NA
 3491511 3491512 Bpet2440 Bpet2441     FALSE 0.492 31.000 0.000 NA   NA
 3491516 3491517 Bpet2445 Bpet2446     TRUE 0.845 27.000 0.085 NA   NA
 3491517 3491518 Bpet2446 Bpet2447     TRUE 0.992 4.000 0.821 NA   NA
 3491518 3491519 Bpet2447 Bpet2448     TRUE 0.611 99.000 0.149 NA   NA
 3491519 3491520 Bpet2448 Bpet2449     TRUE 0.726 44.000 0.103 NA   NA
 3491520 3491521 Bpet2449 Bpet2450     TRUE 0.965 4.000 0.052 NA   NA
 3491521 3491522 Bpet2450 Bpet2451     TRUE 0.957 -36.000 0.188 NA   NA
 3491522 3491523 Bpet2451 Bpet2452     TRUE 0.990 -3.000 0.157 NA   NA
 3491523 3491524 Bpet2452 Bpet2453     TRUE 0.976 5.000 0.118 NA   NA
 3491524 3491525 Bpet2453 Bpet2454     TRUE 0.860 8.000 0.000 NA   NA
 3491525 3491526 Bpet2454 Bpet2455     TRUE 0.835 -13.000 0.000 NA   NA
 3491526 3491527 Bpet2455 Bpet2456     TRUE 0.811 -18.000 0.000 NA   NA
 3491527 3491528 Bpet2456 Bpet2457     TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 3491528 3491529 Bpet2457 Bpet2458     TRUE 0.856 9.000 0.000 NA   NA
 3491529 3491530 Bpet2458 Bpet2459     TRUE 0.942 25.000 0.465 NA   NA
 3491530 3491531 Bpet2459 Bpet2460     TRUE 0.992 4.000 0.744 NA   NA
 3491531 3491532 Bpet2460 Bpet2461     TRUE 0.867 28.000 0.125 NA   NA
 3491532 3491533 Bpet2461 Bpet2462     FALSE 0.235 87.000 0.000 NA   NA
 3491533 3491534 Bpet2462 Bpet2463     FALSE 0.023 227.000 0.000 NA   NA
 3491534 3491535 Bpet2463 Bpet2464     FALSE 0.282 63.000 0.000 NA   NA
 3491536 3491537 Bpet2465 Bpet2466     TRUE 0.998 -3.000 0.566 1.000 Y NA
 3491538 3491539 Bpet2467 Bpet2468     TRUE 0.991 12.000 0.500 0.067   NA
 3491539 3491540 Bpet2468 Bpet2469     TRUE 0.759 48.000 0.163 NA   NA
 3491540 3491541 Bpet2469 Bpet2470   msrB3 FALSE 0.271 73.000 0.000 NA   NA
 3491541 3491542 Bpet2470 Bpet2471 msrB3 msrA2 TRUE 0.976 26.000 0.080 0.001 Y NA
 3491542 3491543 Bpet2471 Bpet2472 msrA2   FALSE 0.242 84.000 0.000 NA   NA
 3491543 3491544 Bpet2472 Bpet2473     TRUE 0.990 -3.000 0.138 NA   NA
 3491544 3491545 Bpet2473 Bpet2474     FALSE 0.078 57.000 0.000 NA N NA
 3491545 3491546 Bpet2474 Bpet2475     TRUE 0.999 -3.000 0.417 0.067 Y NA
 3491546 3491547 Bpet2475 Bpet2476     TRUE 0.996 3.000 0.452 0.018   NA
 3491547 3491548 Bpet2476 Bpet2477     FALSE 0.147 99.000 0.000 1.000   NA
 3491549 3491550 Bpet2478 Bpet2479     TRUE 0.991 -3.000 0.194 NA   NA
 3491551 3491552 Bpet2480 Bpet2481     FALSE 0.064 160.000 0.000 NA   NA
 3491553 3491554 Bpet2482 Bpet2483 arsC2 caiB TRUE 0.571 61.000 0.073 1.000   NA
 3491554 3491555 Bpet2483 Bpet2484 caiB   FALSE 0.127 108.000 0.000 1.000   NA
 3491558 3491559 Bpet2487 Bpet2488   gst4 FALSE 0.081 135.000 0.000 1.000   NA
 3491559 3491560 Bpet2488 Bpet2489 gst4   TRUE 0.918 8.000 0.024 1.000   NA
 3491560 3491561 Bpet2489 Bpet2490     TRUE 0.712 18.000 0.000 NA   NA
 3491561 3491562 Bpet2490 Bpet2491     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3491562 3491563 Bpet2491 Bpet2492     TRUE 0.978 0.000 0.059 NA   NA
 3491564 3491565 Bpet2493 Bpet2494 gdhA2 hutG1 FALSE 0.421 130.000 0.016 1.000 Y NA
 3491565 3491566 Bpet2494 Bpet2495 hutG1 glnQ2 TRUE 0.992 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 3491566 3491567 Bpet2495 Bpet2496 glnQ2 glnP2 TRUE 0.998 -3.000 0.647 1.000 Y NA
 3491567 3491568 Bpet2496 Bpet2497 glnP2 glnH2 TRUE 0.998 -3.000 0.261 0.074 Y NA
 3491568 3491569 Bpet2497 Bpet2498 glnH2   TRUE 0.634 57.000 0.239 1.000 N NA
 3491570 3491571 Bpet2499 Bpet2500     TRUE 0.880 5.000 0.000 NA   NA
 3491572 3491573 Bpet2501 Bpet2502     TRUE 0.543 72.000 0.046 NA   NA
 3491573 3491574 Bpet2502 Bpet2503   holB TRUE 0.824 61.000 0.110 1.000 Y NA
 3491574 3491575 Bpet2503 Bpet2504 holB tmk TRUE 0.984 -3.000 0.211 1.000 N NA
 3491575 3491576 Bpet2504 Bpet2505 tmk   TRUE 0.841 37.000 0.209 NA   NA
 3491578 3491579 Bpet2507 Bpet2508     TRUE 0.740 25.000 0.018 NA   NA
 3491579 3491580 Bpet2508 Bpet2509   mmsB TRUE 0.955 -3.000 0.034 NA N NA
 3491580 3491581 Bpet2509 Bpet2510 mmsB   TRUE 0.885 98.000 0.687 1.000 Y NA
 3491581 3491582 Bpet2510 Bpet2511   acd13 TRUE 0.992 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 3491582 3491583 Bpet2511 Bpet2512 acd13   FALSE 0.084 182.000 0.019 NA   NA
 3491583 3491584 Bpet2512 Bpet2513     TRUE 0.955 -10.000 0.063 NA   NA
 3491586 3491587 Bpet2515 Bpet2516     TRUE 0.778 36.000 0.091 NA   NA
 3491591 3491592 Bpet2520 Bpet2521   rnhB TRUE 0.987 -3.000 0.046 0.012 N NA
 3491592 3491593 Bpet2521 Bpet2522 rnhB lpxB TRUE 0.694 38.000 0.186 1.000 N NA
 3491593 3491594 Bpet2522 Bpet2523 lpxB lpxA TRUE 0.997 -3.000 0.289 1.000 Y NA
 3491594 3491595 Bpet2523 Bpet2524 lpxA fabZ TRUE 0.968 15.000 0.850 1.000 N NA
 3491595 3491596 Bpet2524 Bpet2525 fabZ lpxD TRUE 0.763 63.000 0.796 1.000 N NA
 3491596 3491597 Bpet2525 Bpet2526 lpxD   TRUE 0.987 18.000 0.814 1.000 Y NA
 3491597 3491598 Bpet2526 Bpet2527     TRUE 0.805 112.000 0.354 1.000 Y NA
 3491598 3491599 Bpet2527 Bpet2528   ecfE TRUE 0.875 55.000 0.204 1.000 Y NA
 3491599 3491600 Bpet2528 Bpet2529 ecfE dxr TRUE 0.892 27.000 0.568 1.000 N NA
 3491600 3491601 Bpet2529 Bpet2530 dxr cdsA TRUE 0.997 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 3491601 3491602 Bpet2530 Bpet2531 cdsA uppS TRUE 0.953 33.000 0.400 1.000 Y NA
 3491602 3491603 Bpet2531 Bpet2532 uppS frr TRUE 0.829 34.000 0.409 1.000 N NA
 3491603 3491604 Bpet2532 Bpet2533 frr pyrH TRUE 0.816 16.000 0.058 1.000 N NA
 3491604 3491605 Bpet2533 Bpet2534 pyrH tsf FALSE 0.255 95.000 0.047 1.000 N NA
 3491605 3491606 Bpet2534 Bpet2535 tsf rpsB TRUE 0.644 169.000 0.748 1.000 Y NA
 3491607 3491608 Bpet2536 Bpet2537 map glnD TRUE 0.975 13.000 0.817 1.000 N NA
 3491609 3491610 Bpet2538 Bpet2539 pdhD   TRUE 0.818 62.000 0.204 0.005 N NA
 3491610 3491611 Bpet2539 Bpet2540     FALSE 0.072 139.000 0.021 1.000 N NA
 3491612 3491613 Bpet2541 Bpet2542   cueR FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3491614 3491615 Bpet2543 Bpet2544 rumA   FALSE 0.313 82.000 0.004 NA   NA
 3491615 3491616 Bpet2544 Bpet2545     FALSE 0.011 312.000 0.000 NA   NA
 3491616 3491617 Bpet2545 Bpet2546     FALSE 0.261 111.000 0.024 1.000   NA
 3491617 3491618 Bpet2546 Bpet2547   nlpD TRUE 0.920 -3.000 0.024 1.000 N NA
 3491618 3491619 Bpet2547 Bpet2548 nlpD pcm2 TRUE 0.552 18.000 0.014 1.000 N NA
 3491619 3491620 Bpet2548 Bpet2549 pcm2 surE TRUE 0.976 -15.000 0.353 1.000   NA
 3491623 3491624 Bpet2552 Bpet2553     FALSE 0.013 294.000 0.000 NA   NA
 3491624 3491625 Bpet2553 Bpet2554   trxC TRUE 0.565 106.000 0.011 NA Y NA
 3491626 3491627 Bpet2555 Bpet2556     FALSE 0.395 40.000 0.005 1.000   NA
 3491627 3491628 Bpet2556 Bpet2557     TRUE 0.949 34.000 0.500 0.062   NA
 3491628 3491629 Bpet2557 Bpet2558     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.062 Y NA
 3491629 3491630 Bpet2558 Bpet2559     TRUE 0.769 98.000 0.130 1.000 Y NA
 3491630 3491631 Bpet2559 Bpet2560     FALSE 0.411 135.000 0.021 0.027   NA
 3491632 3491633 Bpet2561 Bpet2562 dctP dctQ1 TRUE 0.841 125.000 0.743 NA Y NA
 3491633 3491634 Bpet2562 Bpet2563 dctQ1 dctM TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 3491634 3491635 Bpet2563 Bpet2564 dctM   TRUE 0.821 30.000 0.087 NA   NA
 3491636 3491637 Bpet2565 Bpet2566 ldcA cumB TRUE 0.980 -3.000 0.115 NA N NA
 3491637 3491638 Bpet2566 Bpet2567 cumB   TRUE 0.919 8.000 0.012 NA   NA
 3491638 3491639 Bpet2567 Bpet2568     FALSE 0.461 86.000 0.035 NA   NA
 3491639 3491640 Bpet2568 Bpet2569     FALSE 0.416 86.000 0.024 NA   NA
 3491640 3491641 Bpet2569 Bpet2570     TRUE 0.998 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 3491641 3491642 Bpet2570 Bpet2571     TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.059 Y NA
 3491642 3491643 Bpet2571 Bpet2572   phaD TRUE 0.998 0.000 0.944 1.000 Y NA
 3491643 3491644 Bpet2572 Bpet2573 phaD phaC TRUE 0.993 24.000 0.976 0.004 Y NA
 3491644 3491645 Bpet2573 Bpet2574 phaC   TRUE 0.999 0.000 0.881 0.004 Y NA
 3491647 3491648 Bpet2576 Bpet2577     TRUE 0.997 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 3491648 3491649 Bpet2577 Bpet2578     FALSE 0.005 272.000 0.007 1.000 N NA
 3491650 3491651 Bpet2579 Bpet2580     FALSE 0.476 46.000 0.012 NA   NA
 3491651 3491652 Bpet2580 Bpet2581     FALSE 0.020 347.000 0.029 NA   NA
 3491653 3491654 Bpet2582 Bpet2583     TRUE 0.774 99.000 0.640 NA   NA
 3491654 3491655 Bpet2583 Bpet2584     TRUE 0.987 13.000 0.854 NA   NA
 3491655 3491656 Bpet2584 Bpet2585     TRUE 0.998 -7.000 0.922 0.062 Y NA
 3491656 3491657 Bpet2585 Bpet2586     TRUE 0.999 -3.000 0.847 0.062 Y NA
 3491657 3491658 Bpet2586 Bpet2587     TRUE 0.999 0.000 0.865 0.002 Y NA
 3491659 3491660 Bpet2588 Bpet2589 glpR glpA FALSE 0.470 27.000 0.024 1.000 N NA
 3491660 3491661 Bpet2589 Bpet2590 glpA   FALSE 0.012 79.000 0.000 1.000 N NA
 3491661 3491662 Bpet2590 Bpet2591   hlyD TRUE 0.960 4.000 0.149 1.000 N NA
 3491662 3491663 Bpet2591 Bpet2592 hlyD   TRUE 0.998 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 3491663 3491664 Bpet2592 Bpet2593     TRUE 0.996 -3.000 0.671 0.077 N NA
 3491664 3491665 Bpet2593 Bpet2594     TRUE 0.973 5.000 0.085 0.074 N NA
 3491665 3491666 Bpet2594 Bpet2595     TRUE 0.757 -37.000 0.000 NA   NA
 3491666 3491667 Bpet2595 Bpet2596     TRUE 0.873 14.000 0.009 NA   NA
 3491667 3491668 Bpet2596 Bpet2597     FALSE 0.005 898.000 0.009 NA   NA
 3491668 3491669 Bpet2597 Bpet2598     FALSE 0.308 55.000 0.000 NA   NA
 3491671 3491672 Bpet2600 Bpet2601     TRUE 0.751 29.000 0.139 1.000 N NA
 3491673 3491674 Bpet2602 Bpet2603     TRUE 0.869 12.000 0.049 1.000 N NA
 3491675 3491676 Bpet2604 Bpet2605   slyA FALSE 0.000 334.000 0.000 1.000 N NA
 3491676 3491677 Bpet2605 Bpet2606 slyA   TRUE 0.993 -3.000 0.261 NA   NA
 3491677 3491678 Bpet2606 Bpet2607     TRUE 0.991 -3.000 0.174 NA   NA
 3491678 3491679 Bpet2607 Bpet2608     TRUE 0.880 5.000 0.000 NA   NA
 3491679 3491680 Bpet2608 Bpet2609     TRUE 0.943 -3.000 0.000 0.084 N NA
 3491682 3491683 Bpet2611 Bpet2612     TRUE 0.977 -70.000 1.000 NA   NA
 3491683 3491684 Bpet2612 Bpet2613   dnaE1 TRUE 0.896 40.000 1.000 1.000   NA
 3491685 3491686 Bpet2614 Bpet2615     FALSE 0.068 171.000 0.033 NA N NA
 3491686 3491687 Bpet2615 Bpet2616   fhp TRUE 0.802 19.000 0.056 NA N NA
 3491692 3491693 Bpet2621 Bpet2622   mrcA1 FALSE 0.126 116.000 0.028 1.000 N NA
 3491693 3491694 Bpet2622 Bpet2623 mrcA1   FALSE 0.006 447.000 0.000 NA   NA
 3491694 3491695 Bpet2623 Bpet2624     TRUE 0.993 -3.000 0.300 NA   NA
 3491697 3491698 Bpet2626 Bpet2627     TRUE 0.804 7.000 0.020 1.000 N NA
 3491699 3491700 Bpet2628 Bpet2629   pmi TRUE 0.745 109.000 0.667 NA   NA
 3491700 3491701 Bpet2629 Bpet2630 pmi   TRUE 0.922 37.000 1.000 NA   NA
 3491701 3491702 Bpet2630 Bpet2631     FALSE 0.457 177.000 1.000 NA   NA
 3491702 3491703 Bpet2631 Bpet2632     FALSE 0.311 53.000 0.000 NA   NA
 3491704 3491705 Bpet2633 Bpet2634   hpaH FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 3491705 3491706 Bpet2634 Bpet2635 hpaH   TRUE 0.980 12.000 0.439 1.000   NA
 3491709 3491710 Bpettrna_18 Bpet2638 b_petrii_trna_18   FALSE 0.254 79.000 0.000 NA   NA
 3491710 3491711 Bpet2638 Bpet2639   ihfA TRUE 0.736 58.000 0.535 1.000 N NA
 3491711 3491712 Bpet2639 Bpet2640 ihfA pheT TRUE 0.928 15.000 0.208 1.000 N NA
 3491712 3491713 Bpet2640 Bpet2641 pheT pheS TRUE 0.997 14.000 0.574 0.000 Y NA
 3491713 3491714 Bpet2641 Bpet2642 pheS rplT TRUE 0.727 119.000 0.202 1.000 Y NA
 3491714 3491715 Bpet2642 Bpet2643 rplT rpmI TRUE 0.996 16.000 0.928 0.009 Y NA
 3491715 3491716 Bpet2643 Bpet2644 rpmI   FALSE 0.001 265.000 0.000 1.000 N NA
 3491716 3491717 Bpet2644 Bpet2645     FALSE 0.294 103.000 0.010 NA   NA
 3491718 3491719 Bpet2646 Bpet2647 glnB2 amtB FALSE 0.388 38.000 0.034 1.000 N NA
 3491722 3491723 Bpet2650 Bpet2651     TRUE 0.997 -3.000 0.053 0.026 Y NA
 3491723 3491724 Bpet2651 Bpet2652     TRUE 0.992 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 3491724 3491725 Bpet2652 Bpet2653     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.061 Y NA
 3491725 3491726 Bpet2653 Bpet2654     TRUE 0.814 115.000 0.333 NA Y NA
 3491726 3491727 Bpet2654 Bpet2655   putA FALSE 0.004 238.000 0.000 NA N NA
 3491727 3491728 Bpet2655 Bpet2656 putA   TRUE 0.564 154.000 1.000 NA   NA
 3491728 3491729 Bpet2656 Bpet2657     TRUE 0.993 4.000 1.000 NA   NA
 3491729 3491730 Bpet2657 Bpet2658     TRUE 0.790 22.000 0.032 1.000   NA
 3491730 3491731 Bpet2658 Bpet2659   clpA TRUE 0.867 10.000 0.006 1.000   NA
 3491731 3491732 Bpet2659 Bpet2660 clpA pbpC FALSE 0.154 39.000 0.006 1.000 N NA
 3491732 3491733 Bpet2660 Bpet2661 pbpC   TRUE 0.973 -45.000 0.711 1.000   NA
 3491733 3491734 Bpet2661 Bpet2662   clpS FALSE 0.356 79.000 0.008 NA   NA
 3491735 3491736 Bpet2663 Bpet2664     FALSE 0.236 116.000 0.010 NA   NA
 3491737 3491738 Bpet2665 Bpet2666 fadA4   FALSE 0.371 152.000 0.667 1.000 N NA
 3491738 3491739 Bpet2666 Bpet2667   sodB TRUE 0.907 -109.000 0.004 1.000 Y NA
 3491739 3491740 Bpet2667 Bpet2668 sodB   FALSE 0.219 95.000 0.037 1.000 N NA
 3491741 3491742 Bpet2669 Bpet2670 exbB1 lpxK FALSE 0.000 416.000 0.000 1.000 N NA
 3491742 3491743 Bpet2670 Bpet2671 lpxK   TRUE 0.825 43.000 0.263 NA   NA
 3491743 3491744 Bpet2671 Bpet2672   kdsB TRUE 0.882 34.000 0.265 NA   NA
 3491744 3491745 Bpet2672 Bpet2673 kdsB adk FALSE 0.286 94.000 0.056 1.000 N NA
 3491745 3491746 Bpet2673 Bpet2674 adk   TRUE 0.522 23.000 0.021 1.000 N NA
 3491746 3491747 Bpet2674 Bpet2675   mviN FALSE 0.344 52.000 0.006 1.000   NA
 3491747 3491748 Bpet2675 Bpet2676 mviN fecR1 FALSE 0.111 136.000 0.000 NA   NA
 3491748 3491749 Bpet2676 Bpet2677 fecR1 rpsT FALSE 0.107 91.000 0.002 NA N NA
 3491750 3491751 Bpet2678 Bpet2679   ilvD5 TRUE 0.605 50.000 0.000 1.000 Y NA
 3491751 3491752 Bpet2679 Bpet2680 ilvD5 mdh2 TRUE 0.768 62.000 0.250 0.087 N NA
 3491752 3491753 Bpet2680 Bpet2681 mdh2   TRUE 0.623 62.000 0.250 1.000 N NA
 3491753 3491754 Bpet2681 Bpet2682     FALSE 0.012 80.000 0.000 1.000 N NA
 3491754 3491755 Bpet2682 Bpet2683   dapA2 FALSE 0.011 85.000 0.000 1.000 N NA
 3491756 3491757 Bpet2684 Bpet2685 bug49 bug50 TRUE 0.536 72.000 0.000 0.043   NA
 3491757 3491758 Bpet2685 Bpet2686 bug50   TRUE 0.517 91.000 0.083 1.000   NA
 3491760 3491761 Bpet2688 Bpet2689 argF argG FALSE 0.134 273.000 0.088 1.000 Y NA
 3491762 3491763 Bpet2690 Bpet2691 kup   TRUE 0.995 -3.000 0.500 0.084 N NA
 3491763 3491764 Bpet2691 Bpet2692   basR TRUE 0.996 3.000 0.500 1.000 Y NA
 3491764 3491765 Bpet2692 Bpet2693 basR exbD FALSE 0.396 59.000 0.067 1.000 N NA
 3491765 3491766 Bpet2693 Bpet2694 exbD exbB2 TRUE 0.997 0.000 0.156 0.073 Y NA
 3491766 3491767 Bpet2694 Bpet2695 exbB2 tonB TRUE 0.990 2.000 0.154 0.007 N NA
 3491767 3491768 Bpet2695 Bpet2696 tonB   FALSE 0.004 145.000 0.000 1.000 N NA
 3491769 3491770 Bpet2697 Bpet2698 regS regR TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3491770 3491771 Bpet2698 Bpet2699 regR cyoA1 FALSE 0.007 110.000 0.000 1.000 N NA
 3491771 3491772 Bpet2699 Bpet2700 cyoA1 cyoB1 TRUE 0.999 0.000 0.615 0.011 Y NA
 3491772 3491773 Bpet2700 Bpet2701 cyoB1 cyoC1 TRUE 0.997 4.000 0.444 0.066 Y NA
 3491773 3491774 Bpet2701 Bpet2702 cyoC1 cyoD1 TRUE 0.998 0.000 0.444 0.066 Y NA
 3491774 3491775 Bpet2702 Bpettrna_19 cyoD1 b_petrii_trna_19 FALSE 0.165 111.000 0.000 NA   NA
 3491776 3491777 Bpet2703 Bpet2704 hupB   FALSE 0.007 329.000 0.000 1.000   NA
 3491777 3491778 Bpet2704 Bpet2705   metY TRUE 0.697 28.000 0.029 1.000   NA
 3491778 3491779 Bpet2705 Bpet2706 metY   FALSE 0.011 170.000 0.003 1.000 N NA
 3491779 3491780 Bpet2706 Bpet2707   vacB TRUE 0.554 127.000 0.147 0.012 N NA
 3491785 3491786 Bpet2710 Bpet2711   arsB TRUE 0.931 13.000 0.000 0.059   NA
 3491786 3491787 Bpet2711 Bpet2712 arsB   FALSE 0.014 60.000 0.000 1.000 N NA
 3491788 3491789 Bpet2713 Bpet2714     TRUE 0.931 16.000 0.083 NA   NA
 3491790 3491791 Bpet2715 Bpet2716     TRUE 0.923 16.000 0.069 NA   NA
 3491791 3491792 Bpet2716 Bpettrna_22   b_petrii_trna_22 FALSE 0.179 107.000 0.000 NA   NA
 3491793 3491794 Bpet2717 Bpet2718     FALSE 0.088 146.000 0.000 NA   NA
 3491794 3491795 Bpet2718 Bpet2719     FALSE 0.445 69.000 0.019 NA   NA
 3491796 3491797 Bpet2720 Bpet2721     FALSE 0.007 393.000 0.000 NA   NA
 3491797 3491798 Bpet2721 Bpet2722     FALSE 0.494 76.000 0.035 NA   NA
 3491799 3491800 Bpet2723 Bpet2724   purB FALSE 0.076 51.000 0.003 1.000 N NA
 3491802 3491803 Bpet2726 Bpet2727   trmU FALSE 0.297 63.000 0.005 1.000   NA
 3491803 3491804 Bpet2727 Bpet2728 trmU   FALSE 0.475 13.000 0.003 1.000 N NA
 3491805 3491806 Bpet2729 Bpet2730 bug51   TRUE 0.828 46.000 0.455 1.000   NA
 3491806 3491807 Bpet2730 Bpet2731   pntA1 FALSE 0.001 186.000 0.000 1.000 N NA
 3491807 3491808 Bpet2731 Bpet2732 pntA1 pntAB TRUE 0.997 4.000 0.829 0.001   NA
 3491808 3491809 Bpet2732 Bpet2733 pntAB pntB1 TRUE 0.997 -3.000 0.144 0.001   NA
 3491810 3491811 Bpet2734 Bpet2735 glcF glcE TRUE 0.991 7.000 0.013 0.001 Y NA
 3491811 3491812 Bpet2735 Bpet2736 glcE glcD TRUE 0.988 13.000 0.013 0.001 Y NA
 3491812 3491813 Bpet2736 Bpet2737 glcD   TRUE 0.870 90.000 0.070 0.015 Y NA
 3491813 3491814 Bpet2737 Bpet2738   aroG1 FALSE 0.118 110.000 0.021 1.000 N NA
 3491814 3491815 Bpet2738 Bpet2739 aroG1 tldD FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 3491815 3491816 Bpet2739 Bpet2740 tldD   TRUE 0.972 14.000 0.259 NA   NA
 3491819 3491820 Bpet2743 Bpet2744 pepN fbp TRUE 0.513 39.000 0.071 1.000 N NA
 3491821 3491822 Bpet2745 Bpet2746   thrC FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 3491822 3491823 Bpet2746 Bpet2747 thrC hom TRUE 0.995 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 3491823 3491824 Bpet2747 Bpet2748 hom yfdZ TRUE 0.832 85.000 0.202 1.000 Y NA
 3491825 3491826 Bpet2749 Bpet2750   bcp TRUE 0.972 -3.000 0.020 NA   NA
 3491826 3491827 Bpet2750 Bpet2751 bcp   FALSE 0.356 58.000 0.050 1.000 N NA
 3491827 3491828 Bpet2751 Bpet2752   pdxA2 TRUE 0.890 0.000 0.020 1.000 N NA
 3491828 3491829 Bpet2752 Bpet2753 pdxA2   FALSE 0.307 125.000 0.060 1.000   NA
 3491830 3491831 Bpet2754 Bpet2755   dapE1 TRUE 0.930 10.000 0.025 NA   NA
 3491831 3491832 Bpet2755 Bpet2756 dapE1   FALSE 0.147 99.000 0.000 1.000   NA
 3491832 3491833 Bpet2756 Bpet2757   purL FALSE 0.073 139.000 0.000 1.000   NA
 3491833 3491834 Bpet2757 Bpet2758 purL greB FALSE 0.000 524.000 0.000 1.000 N NA
 3491834 3491835 Bpet2758 Bpet2759 greB   TRUE 0.953 8.000 0.007 0.081   NA
 3491835 3491836 Bpet2759 Bpet2760     FALSE 0.401 42.000 0.007 1.000   NA
 3491836 3491837 Bpet2760 Bpet2761     TRUE 0.677 51.000 0.004 0.009   NA
 3491837 3491838 Bpet2761 Bpet2762     FALSE 0.458 70.000 0.022 NA   NA
 3491838 3491839 Bpet2762 Bpet2763   lolD TRUE 0.719 26.000 0.061 NA N NA
 3491839 3491840 Bpet2763 Bpet2764 lolD lolC TRUE 0.980 -7.000 0.620 1.000 N NA
 3491841 3491842 Bpet2765 Bpet2766 recJ prfB FALSE 0.083 140.000 0.028 1.000 N NA
 3491842 3491843 Bpet2766 Bpet2767 prfB   FALSE 0.376 51.000 0.010 1.000   NA
 3491843 3491844 Bpet2767 Bpet2768   lysS TRUE 0.900 7.000 0.012 1.000   NA
 3491844 3491845 Bpet2768 Bpet2769 lysS   TRUE 0.712 18.000 0.000 NA   NA
 3491846 3491847 Bpet2770 Bpet2771     FALSE 0.324 70.000 0.009 1.000   NA
 3491847 3491848 Bpet2771 Bpet2772   fdx2 TRUE 0.993 0.000 0.625 1.000   NA
 3491848 3491849 Bpet2772 Bpet2773 fdx2 hscA TRUE 0.953 18.000 0.794 1.000 N NA
 3491849 3491850 Bpet2773 Bpet2774 hscA hscB TRUE 0.920 59.000 0.634 1.000 Y NA
 3491850 3491851 Bpet2774 Bpet2775 hscB   TRUE 0.988 4.000 0.500 1.000   NA
 3491851 3491852 Bpet2775 Bpet2776   nifU TRUE 0.997 2.000 0.359 0.001   NA
 3491852 3491853 Bpet2776 Bpet2777 nifU iscS TRUE 0.850 31.000 0.448 1.000 N NA
 3491853 3491854 Bpet2777 Bpet2778 iscS   TRUE 0.866 20.000 0.160 1.000 N NA
 3491854 3491855 Bpet2778 Bpet2779   ptpA FALSE 0.057 162.000 0.032 1.000 N NA
 3491855 3491856 Bpet2779 Bpet2780 ptpA uvrB FALSE 0.007 218.000 0.006 1.000 N NA
 3491857 3491858 Bpet2781 Bpet2782 tyrB lexA FALSE 0.019 185.000 0.013 1.000 N NA
 3491860 3491861 Bpet2784 Bpet2785     TRUE 0.897 5.000 0.045 1.000 N NA
 3491861 3491862 Bpet2785 Bpet2786     FALSE 0.045 26.000 0.000 1.000 N NA
 3491862 3491863 Bpet2786 Bpet2787     TRUE 0.959 70.000 0.818 0.073 Y NA
 3491863 3491864 Bpet2787 Bpet2788     TRUE 0.996 4.000 0.769 1.000 Y NA
 3491865 3491866 Bpet2789 Bpet2790 lon clpX TRUE 0.599 177.000 0.201 0.077 Y NA
 3491866 3491867 Bpet2790 Bpet2791 clpX clpP TRUE 0.811 110.000 0.352 1.000 Y NA
 3491867 3491868 Bpet2791 Bpet2792 clpP tig TRUE 0.994 5.000 0.351 1.000 Y NA
 3491868 3491869 Bpet2792 Bpet2793 tig   FALSE 0.295 135.000 0.000 1.000 Y NA
 3491869 3491870 Bpet2793 Bpet2794   cspA2 FALSE 0.001 209.000 0.000 1.000 N NA
 3491870 3491871 Bpet2794 Bpet2795 cspA2 cspA1 FALSE 0.116 246.000 0.000 0.081 Y NA
 3491871 3491872 Bpet2795 Bpet2796 cspA1   FALSE 0.015 270.000 0.000 NA   NA
 3491872 3491873 Bpet2796 Bpet2797     TRUE 0.796 95.000 0.667 NA   NA
 3491873 3491874 Bpet2797 Bpettrna_23   b_petrii_trna_23 FALSE 0.106 138.000 0.000 NA   NA
 3491875 3491876 Bpet2798 Bpet2799 dapC dapD TRUE 0.943 27.000 0.149 1.000 Y NA
 3491876 3491877 Bpet2799 Bpet2800 dapD dapE2 TRUE 0.998 0.000 0.109 0.002 Y NA
 3491877 3491878 Bpet2800 Bpet2801 dapE2   TRUE 0.939 8.000 0.115 1.000 N NA
 3491878 3491879 Bpet2801 Bpet2802     TRUE 0.741 -109.000 0.007 1.000   NA
 3491881 3491882 Bpet2804 Bpet2805     TRUE 0.995 5.000 0.750 0.001 N NA
 3491882 3491883 Bpet2805 Bpet2806     TRUE 0.988 10.000 0.579 0.066 N NA
 3491884 3491885 Bpet2807 Bpet2808 tyrA   FALSE 0.194 6.000 0.000 1.000 N NA
 3491885 3491886 Bpet2808 Bpet2809     TRUE 0.834 0.000 0.010 1.000 N NA
 3491888 3491889 Bpet2811 Bpet2812     TRUE 0.512 69.000 0.099 NA N NA
 3491890 3491891 Bpet2813 Bpet2814 ribF ileS TRUE 0.961 -10.000 0.254 1.000 N NA
 3491891 3491892 Bpet2814 Bpet2815 ileS lspA TRUE 0.932 4.000 0.071 1.000 N NA
 3491892 3491893 Bpet2815 Bpet2816 lspA dfp FALSE 0.241 57.000 0.024 1.000 N NA
 3491897 3491898 Bpet2820 Bpet2821     FALSE 0.257 78.000 0.000 NA   NA
 3491899 3491900 Bpet2822 Bpet2823     TRUE 0.997 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 3491900 3491901 Bpet2823 Bpet2824     TRUE 0.999 -3.000 0.842 0.009 Y NA
 3491901 3491902 Bpet2824 Bpet2825     TRUE 0.957 64.000 0.611 0.061 Y NA
 3491902 3491903 Bpet2825 Bpet2826     FALSE 0.283 188.000 0.062 NA Y NA
 3491903 3491904 Bpet2826 Bpet2827     TRUE 0.828 54.000 0.071 NA Y NA
 3491906 3491907 Bpet2829 Bpet2830 ptsI ptsH TRUE 0.952 62.000 0.205 0.001 Y NA
 3491907 3491908 Bpet2830 Bpet2831 ptsH   TRUE 0.926 107.000 0.261 0.001 Y NA
 3491908 3491909 Bpet2831 Bpet2832   gshB TRUE 0.902 5.000 0.048 1.000 N NA
 3491909 3491910 Bpet2832 Bpet2833 gshB infC FALSE 0.296 142.000 0.003 1.000 Y NA
 3491910 3491911 Bpet2833 Bpet2834 infC thrS TRUE 0.849 72.000 0.186 1.000 Y NA
 3491912 3491913 Bpet2835 Bpet2836     TRUE 0.871 6.000 0.000 NA   NA
 3491914 3491915 Bpet2837 Bpet2838     TRUE 0.637 77.000 0.333 1.000 N NA
 3491915 3491916 Bpet2838 Bpet2839     FALSE 0.002 304.000 0.000 NA N NA
 3491916 3491917 Bpet2839 Bpet2840     TRUE 0.718 29.000 0.026 NA   NA
 3491917 3491918 Bpet2840 Bpet2841     FALSE 0.011 267.000 0.000 1.000   NA
 3491918 3491919 Bpet2841 Bpettrna_24   b_petrii_trna_24 FALSE 0.009 342.000 0.000 NA   NA
 3491919 3491920 Bpettrna_24 Bpet2842 b_petrii_trna_24 trpF TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 3491920 3491921 Bpet2842 Bpet2843 trpF   TRUE 0.537 7.000 0.003 1.000 N NA
 3491921 3491922 Bpet2843 Bpet2844     TRUE 0.996 3.000 0.465 NA Y NA
 3491922 3491923 Bpet2844 Bpet2845     FALSE 0.102 211.000 0.000 NA Y NA
 3491923 3491924 Bpet2845 Bpet2846   truA FALSE 0.042 107.000 0.003 1.000 N NA
 3491924 3491925 Bpet2846 Bpet2847 truA   TRUE 0.926 6.000 0.025 1.000   NA
 3491925 3491926 Bpet2847 Bpet2848   asd FALSE 0.201 187.000 0.034 0.026   NA
 3491926 3491927 Bpet2848 Bpet2849 asd   FALSE 0.003 637.000 0.000 1.000   NA
 3491927 3491928 Bpet2849 Bpet2850     TRUE 0.981 -3.000 0.071 1.000   NA
 3491928 3491929 Bpet2850 Bpet2851     TRUE 0.999 -3.000 0.762 0.061 Y NA
 3491929 3491930 Bpet2851 Bpet2852     TRUE 0.870 90.000 0.088 0.061 Y NA
 3491930 3491931 Bpet2852 Bpet2853     TRUE 0.751 82.000 0.073 1.000 Y NA
 3491932 3491933 Bpet2854 Bpet2855     FALSE 0.123 130.000 0.000 NA   NA
 3491933 3491934 Bpet2855 Bpet2856   gspG FALSE 0.433 55.000 0.010 NA   NA
 3491934 3491935 Bpet2856 Bpet2857 gspG gspH TRUE 0.981 -28.000 0.010 0.002 Y NA
 3491935 3491936 Bpet2857 Bpet2858 gspH gspI TRUE 0.956 -13.000 0.000 0.002   NA
 3491936 3491937 Bpet2858 Bpet2859 gspI gspJ TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3491937 3491938 Bpet2859 Bpet2860 gspJ gspK TRUE 0.992 -3.000 0.034 NA Y NA
 3491938 3491939 Bpet2860 Bpet2861 gspK gspL TRUE 0.978 -21.000 0.136 0.058   NA
 3491939 3491940 Bpet2861 Bpet2862 gspL gspM TRUE 0.912 -27.000 0.061 1.000   NA
 3491940 3491941 Bpet2862 Bpet2863 gspM gspN TRUE 0.995 -3.000 0.649 1.000   NA
 3491942 3491943 Bpet2864 Bpet2865 gspE gspD TRUE 0.999 -3.000 0.776 0.002 Y NA
 3491945 3491946 Bpet2867 Bpet2868 glnB1 nadE TRUE 0.816 41.000 0.288 1.000   NA
 3491946 3491947 Bpet2868 Bpet2869 nadE   FALSE 0.485 40.000 0.017 1.000   NA
 3491949 3491950 Bpet2871 Bpet2872     FALSE 0.066 111.000 0.008 1.000 N NA
 3491951 3491952 Bpet2873 Bpet2874   fliY FALSE 0.002 169.000 0.000 1.000 N NA
 3491952 3491953 Bpet2874 Bpet2875 fliY   TRUE 0.960 58.000 0.594 0.061 Y NA
 3491953 3491954 Bpet2875 Bpet2876     TRUE 0.997 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 3491955 3491956 Bpet2877 Bpet2878 bug52   TRUE 0.767 62.000 0.333 1.000   NA
 3491956 3491957 Bpet2878 Bpet2879     TRUE 0.886 30.000 0.286 1.000   NA
 3491958 3491959 Bpet2880 Bpet2881 cynR int3 FALSE 0.000 323.000 0.000 1.000 N NA
 3491959 3491960 Bpet2881 Bpet2882 int3   FALSE 0.011 91.000 0.000 1.000 N NA
 3491960 3491961 Bpet2882 Bpet2883     TRUE 0.756 16.000 0.000 NA   NA
 3491961 3491962 Bpet2883 Bpet2884     TRUE 0.889 -6.000 0.000 NA   NA
 3491962 3491963 Bpet2884 Bpet2885     FALSE 0.003 925.000 0.000 NA   NA
 3491963 3491964 Bpet2885 Bpet2886     FALSE 0.003 1019.000 0.000 NA   NA
 3491964 3491965 Bpet2886 Bpet2887     FALSE 0.260 77.000 0.000 NA   NA
 3491965 3491966 Bpet2887 Bpet2888     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3491966 3491967 Bpet2888 Bpet2889     FALSE 0.119 132.000 0.000 NA   NA
 3491967 3491968 Bpet2889 Bpettrna_25   b_petrii_trna_25 FALSE 0.081 149.000 0.000 NA   NA
 3491969 3491970 Bpet2890 Bpet2891     TRUE 0.915 16.000 0.056 NA   NA
 3491970 3491971 Bpet2891 Bpet2892     FALSE 0.150 225.000 0.197 NA   NA
 3491972 3491973 Bpet2893 Bpet2894 mntH   FALSE 0.226 92.000 0.000 NA   NA
 3491973 3491974 Bpet2894 Bpet2895     TRUE 0.691 48.000 0.222 NA N NA
 3491974 3491975 Bpet2895 Bpet2896     FALSE 0.168 110.000 0.000 NA   NA
 3491975 3491976 Bpet2896 Bpet2897   pdxK TRUE 0.986 -3.000 0.080 NA   NA
 3491978 3491979 Bpet2899 Bpet2900     FALSE 0.145 119.000 0.000 NA   NA
 3491979 3491980 Bpet2900 Bpet2901     FALSE 0.211 97.000 0.000 NA   NA
 3491980 3491981 Bpet2901 Bpet2902     FALSE 0.096 142.000 0.000 NA   NA
 3491982 3491983 Bpet2903 Bpet2904     TRUE 0.953 9.000 0.188 1.000 N NA
 3491984 3491985 Bpet2905 Bpet2906     TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 3491985 3491986 Bpet2906 Bpet2907     FALSE 0.006 351.000 0.000 1.000   NA
 3491986 3491987 Bpet2907 Bpet2908     TRUE 0.680 16.000 0.000 1.000   NA
 3491992 3491993 Bpet2913 Bpet2914     TRUE 0.912 6.000 0.006 NA   NA
 3491993 3491994 Bpet2914 Bpet2915   pckA FALSE 0.068 170.000 0.009 1.000   NA
 3491995 3491996 Bpet2916 Bpet2917 norM1 amaB2 FALSE 0.212 70.000 0.023 1.000 N NA
 3491996 3491997 Bpet2917 Bpet2918 amaB2   FALSE 0.440 73.000 0.019 NA   NA
 3491997 3491998 Bpet2918 Bpet2919     TRUE 0.939 5.000 0.019 NA   NA
 3492002 3492003 Bpet2923 Bpet2924     FALSE 0.013 71.000 0.000 1.000 N NA
 3492005 3492006 Bpet2926 Bpet2927 aroG2 iorA1 FALSE 0.005 133.000 0.000 1.000 N NA
 3492006 3492007 Bpet2927 Bpet2928 iorA1 iorB1 TRUE 0.995 16.000 0.364 0.001 Y NA
 3492007 3492008 Bpet2928 Bpet2929 iorB1   FALSE 0.084 -73.000 0.000 1.000 N NA
 3492008 3492009 Bpet2929 Bpet2930     FALSE 0.244 83.000 0.000 NA   NA
 3492009 3492010 Bpet2930 Bpet2931     FALSE 0.277 69.000 0.000 NA   NA
 3492010 3492011 Bpet2931 Bpet2932   alkB TRUE 0.839 31.000 0.114 NA   NA
 3492013 3492014 Bpet2934 Bpet2935 phnB1   TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 3492014 3492015 Bpet2935 Bpet2936     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3492016 3492017 Bpet2937 Bpet2938     TRUE 0.801 27.000 0.000 1.000 Y NA
 3492017 3492018 Bpet2938 Bpet2939     FALSE 0.326 37.000 0.000 1.000   NA
 3492018 3492019 Bpet2939 Bpet2940     FALSE 0.231 90.000 0.000 NA   NA
 3492020 3492021 Bpet2941 Bpet2942     TRUE 0.693 123.000 0.680 NA   NA
 3492021 3492022 Bpet2942 Bpet2943     TRUE 0.717 49.000 0.111 NA   NA
 3492022 3492023 Bpet2943 Bpet2944     TRUE 0.926 -177.000 0.123 NA   NA
 3492023 3492024 Bpet2944 Bpet2945     FALSE 0.117 133.000 0.000 NA   NA
 3492024 3492025 Bpet2945 Bpet2946     FALSE 0.013 291.000 0.000 NA   NA
 3492025 3492026 Bpet2946 Bpet2947     TRUE 0.998 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 3492028 3492029 Bpet2949 Bpet2950     TRUE 0.853 18.000 0.000 0.080   NA
 3492029 3492030 Bpet2950 Bpet2951     FALSE 0.486 111.000 0.316 1.000 N NA
 3492031 3492032 Bpet2952 Bpet2953     TRUE 0.871 6.000 0.000 NA   NA
 3492032 3492033 Bpet2953 Bpet2954     TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 3492033 3492034 Bpet2954 Bpet2955     FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3492036 3492037 Bpet2957 Bpet2958     TRUE 0.712 18.000 0.000 NA   NA
 3492037 3492038 Bpet2958 Bpet2959     FALSE 0.222 94.000 0.000 NA   NA
 3492041 3492042 Bpet2962 Bpet2963 fadB1 fadA5 TRUE 0.875 49.000 0.179 1.000 Y NA
 3492042 3492043 Bpet2963 Bpet2964 fadA5   TRUE 0.982 15.000 0.200 1.000 Y NA
 3492043 3492044 Bpet2964 Bpet2965     TRUE 0.994 13.000 0.175 0.007 Y NA
 3492044 3492045 Bpet2965 Bpet2966     FALSE 0.208 5.000 0.000 1.000 N NA
 3492045 3492046 Bpet2966 Bpet2967   bug54 TRUE 0.877 35.000 0.375 1.000   NA
 3492046 3492047 Bpet2967 Bpet2968 bug54 bug55 TRUE 0.877 75.000 0.333 0.042   NA
 3492047 3492048 Bpet2968 Bpet2969 bug55 bug56 FALSE 0.224 147.000 0.000 0.042   NA
 3492048 3492049 Bpet2969 Bpet2970 bug56   FALSE 0.191 78.000 0.000 1.000   NA
 3492049 3492050 Bpet2970 Bpet2971     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3492051 3492052 Bpet2972 Bpet2973     TRUE 0.987 -3.000 0.300 1.000 N NA
 3492052 3492053 Bpet2973 Bpet2974     FALSE 0.010 93.000 0.000 1.000 N NA
 3492053 3492054 Bpet2974 Bpet2975     FALSE 0.011 310.000 0.000 NA   NA
 3492057 3492058 Bpet2978 Bpet2979   gst6 FALSE 0.009 102.000 0.000 1.000 N NA
 3492058 3492059 Bpet2979 Bpet2980 gst6   FALSE 0.275 2.000 0.000 1.000 N NA
 3492061 3492062 Bpet2982 Bpet2983     TRUE 0.995 -3.000 0.625 NA   NA
 3492062 3492063 Bpet2983 Bpet2984     TRUE 0.979 13.000 0.333 NA   NA
 3492064 3492065 Bpet2985 Bpet2986     FALSE 0.418 119.000 0.195 NA N NA
 3492065 3492066 Bpet2986 Bpet2987     FALSE 0.070 68.000 0.000 NA N NA
 3492066 3492067 Bpet2987 Bpet2988     FALSE 0.004 145.000 0.000 1.000 N NA
 3492071 3492072 Bpet2992 Bpet2993   bug58 FALSE 0.271 73.000 0.000 NA   NA
 3492072 3492073 Bpet2993 Bpet2994 bug58   FALSE 0.133 106.000 0.000 1.000   NA
 3492073 3492074 Bpet2994 Bpet2995     TRUE 0.639 81.000 0.375 1.000 N NA
 3492074 3492075 Bpet2995 Bpet2996     TRUE 0.961 58.000 0.625 0.058 Y NA
 3492076 3492077 Bpet2997 Bpet2998 cbpA   TRUE 0.990 3.000 0.388 NA   NA
 3492077 3492078 Bpet2998 Bpet2999     FALSE 0.022 233.000 0.000 NA   NA
 3492078 3492079 Bpet2999 Bpet3000     FALSE 0.172 109.000 0.000 NA   NA
 3492079 3492080 Bpet3000 Bpet3001     FALSE 0.133 124.000 0.000 NA   NA
 3492082 3492083 Bpet3003 Bpet3004     TRUE 0.733 17.000 0.000 NA   NA
 3492083 3492084 Bpet3004 Bpet3005     TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 3492089 3492090 Bpet3010 Bpet3011     FALSE 0.222 94.000 0.000 NA   NA
 3492090 3492091 Bpet3011 Bpet3012     FALSE 0.472 26.000 0.000 1.000   NA
 3492092 3492093 Bpet3013 Bpet3014   tnp15 TRUE 0.559 64.000 0.000 0.020   NA
 3492093 3492094 Bpet3014 Bpet3015 tnp15   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.080 Y NA
 3492094 3492095 Bpet3015 Bpet3016     FALSE 0.012 79.000 0.000 1.000 N NA
 3492096 3492097 Bpet3017 Bpet3018   aceF TRUE 0.992 12.000 0.463 1.000 Y NA
 3492097 3492098 Bpet3018 Bpet3019 aceF aceE2 TRUE 0.978 13.000 0.075 1.000 Y NA
 3492099 3492100 Bpet3020 Bpet3021 fixL fixJ TRUE 0.999 -3.000 0.632 0.012 Y NA
 3492100 3492101 Bpet3021 Bpet3022 fixJ folD TRUE 0.989 -3.000 0.404 1.000 N NA
 3492101 3492102 Bpet3022 Bpet3023 folD prlC FALSE 0.026 452.000 0.318 1.000 N NA
 3492102 3492103 Bpet3023 Bpet3024 prlC senC2 FALSE 0.003 627.000 0.000 1.000   NA
 3492103 3492104 Bpet3024 Bpet3025 senC2   FALSE 0.289 150.000 0.125 1.000   NA
 3492105 3492106 Bpet3026 Bpet3027 cusC1   TRUE 0.995 -3.000 0.375 0.060 N NA
 3492106 3492107 Bpet3027 Bpet3028   acrA TRUE 0.949 10.000 0.174 1.000 N NA
 3492112 3492113 Bpet3033 Bpet3034     TRUE 0.648 46.000 0.000 0.008   NA
 3492114 3492115 Bpet3035 Bpet3036 leuB leuD1 TRUE 0.959 40.000 0.141 0.002 Y NA
 3492115 3492116 Bpet3036 Bpet3037 leuD1 leuC2 TRUE 0.995 12.000 0.141 0.001 Y NA
 3492116 3492117 Bpet3037 Bpet3038 leuC2   FALSE 0.063 152.000 0.029 1.000 N NA
 3492117 3492118 Bpet3038 Bpet3039   aroC FALSE 0.083 75.000 0.005 1.000 N NA
 3492118 3492119 Bpet3039 Bpet3040 aroC   FALSE 0.240 85.000 0.000 NA   NA
 3492119 3492120 Bpet3040 Bpet3041     TRUE 0.960 -3.000 0.006 NA   NA
 3492121 3492122 Bpet3042 Bpet3043     TRUE 0.909 -6.000 0.009 1.000   NA
 3492124 3492125 Bpet3045 Bpet3046 thrB   TRUE 0.765 57.000 0.209 NA   NA
 3492127 3492128 Bpet3048 Bpet3049     TRUE 0.977 53.000 0.791 0.001 Y NA
 3492128 3492129 Bpet3049 Bpet3050     TRUE 0.825 13.000 0.000 NA   NA
 3492129 3492130 Bpet3050 Bpet3051   lsfA2 FALSE 0.323 49.000 0.000 NA   NA
 3492131 3492132 Bpet3052 Bpet3053 dnaB   TRUE 0.921 9.000 0.015 NA   NA
 3492132 3492133 Bpet3053 Bpet3054   rplI FALSE 0.292 89.000 0.003 NA   NA
 3492133 3492134 Bpet3054 Bpet3055 rplI rpsR TRUE 0.995 16.000 0.499 0.009 Y NA
 3492134 3492135 Bpet3055 Bpet3056 rpsR priB FALSE 0.494 76.000 0.128 1.000 N NA
 3492135 3492136 Bpet3056 Bpet3057 priB rpsF TRUE 0.622 39.000 0.122 1.000 N NA
 3492136 3492137 Bpet3057 Bpet3058 rpsF   FALSE 0.006 438.000 0.000 NA   NA
 3492137 3492138 Bpet3058 Bpet3059     TRUE 0.856 9.000 0.000 NA   NA
 3492138 3492139 Bpet3059 Bpet3060   dxs FALSE 0.277 137.000 0.069 1.000   NA
 3492139 3492140 Bpet3060 Bpet3061 dxs   TRUE 0.990 9.000 0.246 1.000 Y NA
 3492140 3492141 Bpet3061 Bpet3062     TRUE 0.960 5.000 0.177 1.000 N NA
 3492141 3492142 Bpet3062 Bpet3063     FALSE 0.045 96.000 0.002 1.000 N NA
 3492143 3492144 Bpet3064 Bpet3065 bug59   FALSE 0.436 123.000 0.133 1.000   NA
 3492144 3492145 Bpet3065 Bpet3066     FALSE 0.153 150.000 0.034 1.000   NA
 3492146 3492147 Bpet3067 Bpet3068     TRUE 0.721 25.000 0.025 1.000   NA
 3492149 3492150 Bpet3070 Bpet3071 qor2   FALSE 0.469 73.000 0.042 1.000   NA
 3492151 3492152 Bpet3072 Bpet3073     TRUE 0.642 62.000 0.115 1.000   NA
 3492152 3492153 Bpet3073 Bpet3074     TRUE 0.714 40.000 0.250 1.000 N NA
 3492153 3492154 Bpet3074 Bpet3075     TRUE 0.944 21.000 0.250 0.082 N NA
 3492154 3492155 Bpet3075 Bpet3076     TRUE 0.991 -3.000 0.231 1.000   NA
 3492156 3492157 Bpet3077 Bpet3078 yeaU1   TRUE 0.767 63.000 0.059 1.000 Y NA
 3492158 3492159 Bpet3079 Bpet3080     TRUE 0.922 106.000 0.500 0.060 Y NA
 3492159 3492160 Bpet3080 Bpet3081     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.060 Y NA
 3492160 3492161 Bpet3081 Bpet3082     TRUE 0.987 10.000 0.833 1.000   NA
 3492161 3492162 Bpet3082 Bpet3083   goaG1 TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   NA
 3492162 3492163 Bpet3083 Bpet3084 goaG1   TRUE 0.854 29.000 0.118 NA   NA
 3492163 3492164 Bpet3084 Bpet3085   aphA1 TRUE 0.949 14.000 0.088 NA   NA
 3492164 3492165 Bpet3085 Bpet3086 aphA1   FALSE 0.246 82.000 0.000 NA   NA
 3492167 3492168 Bpet3088 Bpet3089 nrdD   TRUE 0.797 67.000 0.356 NA   NA
 3492168 3492169 Bpet3089 Bpet3090   pflA TRUE 0.859 -37.000 0.015 NA   NA
 3492169 3492170 Bpet3090 Bpet3091 pflA   FALSE 0.185 81.000 0.000 1.000   NA
 3492171 3492172 Bpet3092 Bpet3093     TRUE 0.974 5.000 0.106 NA   NA
 3492172 3492173 Bpet3093 Bpet3094     TRUE 0.985 -3.000 0.235 1.000 N NA
 3492173 3492174 Bpet3094 Bpet3095     TRUE 0.999 6.000 0.948 0.001 Y NA
 3492174 3492175 Bpet3095 Bpet3096   ycdW1 FALSE 0.009 101.000 0.000 1.000 N NA
 3492178 3492179 Bpet3099 Bpet3100   purD FALSE 0.421 96.000 0.034 NA   NA
 3492179 3492180 Bpet3100 Bpet3101 purD hemF TRUE 0.759 17.000 0.043 1.000 N NA
 3492180 3492181 Bpet3101 Bpet3102 hemF nadD TRUE 0.993 -3.000 0.066 1.000 Y NA
 3492181 3492182 Bpet3102 Bpet3103 nadD   TRUE 0.574 56.000 0.044 NA   NA
 3492182 3492183 Bpet3103 Bpet3104     TRUE 0.982 9.000 0.307 NA   NA
 3492183 3492184 Bpet3104 Bpet3105     TRUE 0.967 5.000 0.074 NA   NA
 3492185 3492186 Bpet3106 Bpetrrna_04 waaQ   FALSE 0.024 224.000 0.000 NA   NA
 3492186 3492187 Bpetrrna_04 Bpetrrna_05     FALSE 0.083 148.000 0.000 NA   NA
 3492187 3492188 Bpetrrna_05 Bpettrna_26   b_petrii_trna_26 FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 3492188 3492189 Bpettrna_26 Bpettrna_27 b_petrii_trna_26 b_petrii_trna_27 FALSE 0.289 60.000 0.000 NA   NA
 3492189 3492190 Bpettrna_27 Bpetrrna_06 b_petrii_trna_27   FALSE 0.065 159.000 0.000 NA   NA
 3492192 3492193 Bpet3109 Bpet3110   msbA1 FALSE 0.137 140.000 0.000 0.058 N NA
 3492194 3492195 Bpet3111 Bpet3112 waaF   TRUE 0.793 20.000 0.013 NA   NA
 3492195 3492196 Bpet3112 Bpet3113     TRUE 0.971 -3.000 0.018 NA   NA
 3492197 3492198 Bpet3114 Bpet3115   waaE TRUE 0.988 -3.000 0.014 1.000 Y NA
 3492198 3492199 Bpet3115 Bpet3116 waaE   TRUE 0.905 -3.000 0.018 1.000 N NA
 3492199 3492200 Bpet3116 Bpet3117     TRUE 0.984 -3.000 0.222 1.000 N NA
 3492200 3492201 Bpet3117 Bpet3118   dnaE2 TRUE 0.720 0.000 0.003 1.000 N NA
 3492204 3492205 Bpet3121 Bpet3122   bug60 FALSE 0.040 168.000 0.000 1.000   NA
 3492205 3492206 Bpet3122 Bpet3123 bug60 bug61 TRUE 0.850 86.000 0.286 0.042   NA
 3492207 3492208 Bpet3124 Bpet3125     TRUE 0.592 41.000 0.117 1.000 N NA
 3492208 3492209 Bpet3125 Bpet3126   polA FALSE 0.068 65.000 0.003 1.000 N NA
 3492213 3492214 Bpet3130 Bpet3131 typA truB TRUE 0.913 -3.000 0.020 1.000 N NA
 3492214 3492215 Bpet3131 Bpet3132 truB rbfA TRUE 0.912 44.000 0.318 1.000 Y NA
 3492215 3492216 Bpet3132 Bpet3133 rbfA infB TRUE 0.971 26.000 0.530 1.000 Y NA
 3492216 3492217 Bpet3133 Bpet3134 infB nusA TRUE 0.606 90.000 0.342 1.000 N NA
 3492217 3492218 Bpet3134 Bpet3135 nusA   TRUE 0.996 -3.000 0.759 NA   NA
 3492218 3492219 Bpet3135 Bpet3136     FALSE 0.009 412.000 0.004 NA   NA
 3492219 3492220 Bpet3136 Bpet3137     TRUE 0.624 36.000 0.074 NA N NA
 3492222 3492223 Bpet3138 Bpet3139     FALSE 0.329 47.000 0.000 NA   NA
 3492230 3492231 Bpet3144 Bpet3145     FALSE 0.222 94.000 0.000 NA   NA
 3492232 3492233 Bpet3146 Bpet3147   lytB FALSE 0.242 39.000 0.014 1.000 N NA
 3492233 3492234 Bpet3147 Bpet3148 lytB fkpB TRUE 0.989 0.000 0.626 1.000 N NA
 3492235 3492236 Bpet3149 Bpet3150 radC3   TRUE 0.709 82.000 0.273 1.000   NA
 3492236 3492237 Bpet3150 Bpet3151     FALSE 0.440 58.000 0.025 1.000   NA
 3492237 3492238 Bpet3151 Bpet3152   rpmE FALSE 0.450 -46.000 0.006 1.000 N NA
 3492238 3492239 Bpet3152 Bpet3153 rpmE   FALSE 0.249 121.000 0.067 NA N NA
 3492239 3492240 Bpet3153 Bpet3154   norM2 TRUE 0.984 -3.000 0.154 NA N NA
 3492241 3492242 Bpet3155 Bpet3156     FALSE 0.052 233.000 0.027 NA   NA
 3492242 3492243 Bpet3156 Bpet3157   radA FALSE 0.284 64.000 0.003 1.000   NA
 3492244 3492245 Bpet3158 Bpet3159     TRUE 0.991 -3.000 0.168 NA   NA
 3492245 3492246 Bpet3159 Bpet3160     TRUE 0.970 -3.000 0.017 NA   NA
 3492247 3492248 Bpet3161 Bpet3162   dadX TRUE 0.892 23.000 0.333 1.000 N NA
 3492249 3492250 Bpet3163 Bpet3164 crtA crtB TRUE 0.963 38.000 0.118 0.001 Y NA
 3492250 3492251 Bpet3164 Bpet3165 crtB crtD TRUE 0.987 -3.000 0.130 1.000   NA
 3492253 3492254 Bpet3167 Bpet3168 tnp16   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.079 Y NA
 3492254 3492255 Bpet3168 Bpet3169     FALSE 0.232 89.000 0.000 NA   NA
 3492255 3492256 Bpet3169 Bpet3170     TRUE 0.963 23.000 0.848 NA   NA
 3492256 3492257 Bpet3170 Bpet3171     TRUE 0.953 26.000 0.808 NA   NA
 3492257 3492258 Bpet3171 Bpet3172   apbE TRUE 0.927 22.000 0.462 NA N NA
 3492258 3492259 Bpet3172 Bpet3173 apbE   TRUE 0.984 9.000 0.500 1.000   NA
 3492261 3492262 Bpet3175 Bpet3176 btr   TRUE 0.970 15.000 0.300 NA   NA
 3492263 3492264 Bpet3177 Bpet3178   nudF TRUE 0.835 -30.000 0.006 NA   NA
 3492264 3492265 Bpet3178 Bpet3179 nudF   FALSE 0.289 60.000 0.000 NA   NA
 3492266 3492267 Bpet3180 Bpet3181     TRUE 0.515 60.000 0.032 NA   NA
 3492269 3492270 Bpet3183 Bpet3184     FALSE 0.395 106.000 0.143 1.000 N NA
 3492271 3492272 Bpet3185 Bpet3186     FALSE 0.009 336.000 0.000 NA   NA
 3492272 3492273 Bpet3186 Bpet3187     FALSE 0.313 52.000 0.000 NA   NA
 3492273 3492274 Bpet3187 Bpet3188     FALSE 0.157 134.000 0.057 1.000 N NA
 3492274 3492275 Bpet3188 Bpet3189     FALSE 0.178 85.000 0.000 1.000   NA
 3492278 3492279 Bpet3192 Bpet3193     FALSE 0.098 141.000 0.000 NA   NA
 3492279 3492280 Bpet3193 Bpet3194     FALSE 0.305 56.000 0.000 NA   NA
 3492280 3492281 Bpet3194 Bpet3195     FALSE 0.438 28.000 0.000 1.000   NA
 3492281 3492282 Bpet3195 Bpet3196     FALSE 0.010 278.000 0.000 1.000   NA
 3492282 3492283 Bpet3196 Bpet3197     FALSE 0.117 171.000 0.000 0.081   NA
 3492285 3492286 Bpet3199 Bpet3200     TRUE 0.772 75.000 0.417 1.000   NA
 3492287 3492288 Bpet3201 Bpet3202     FALSE 0.014 64.000 0.000 1.000 N NA
 3492288 3492289 Bpet3202 Bpet3203     TRUE 0.692 97.000 0.833 1.000 N NA
 3492289 3492290 Bpet3203 Bpet3204     TRUE 0.612 100.000 0.000 0.097 Y NA
 3492291 3492292 Bpet3205 Bpet3206     TRUE 0.985 28.000 0.556 0.054 Y NA
 3492292 3492293 Bpet3206 Bpet3207   bug62 TRUE 0.769 99.000 0.800 1.000   NA
 3492293 3492294 Bpet3207 Bpet3208 bug62   TRUE 0.653 17.000 0.000 1.000   NA
 3492294 3492295 Bpet3208 Bpet3209   speE FALSE 0.122 148.000 0.000 0.045 N NA
 3492295 3492296 Bpet3209 Bpet3210 speE   FALSE 0.002 173.000 0.000 1.000 N NA
 3492296 3492297 Bpet3210 Bpet3211     FALSE 0.000 345.000 0.000 1.000 N NA
 3492298 3492299 Bpet3212 Bpet3213     TRUE 0.942 13.000 0.000 0.011   NA
 3492300 3492301 Bpet3214 Bpet3215 ctaC   TRUE 0.999 -3.000 0.792 0.002 Y NA
 3492301 3492302 Bpet3215 Bpet3216     TRUE 0.943 26.000 0.542 NA   NA
 3492302 3492303 Bpet3216 Bpet3217     FALSE 0.271 73.000 0.000 NA   NA
 3492303 3492304 Bpet3217 Bpet3218     FALSE 0.015 269.000 0.000 NA   NA
 3492304 3492305 Bpet3218 Bpet3219     FALSE 0.278 68.000 0.000 NA   NA
 3492305 3492306 Bpet3219 Bpet3220   ggt3 TRUE 0.985 21.000 1.000 1.000 Y NA
 3492306 3492307 Bpet3220 Bpet3221 ggt3   TRUE 0.822 6.000 0.000 1.000   NA
 3492309 3492310 Bpet3223 Bpet3224 ilvD3   TRUE 0.860 36.000 0.600 NA N NA
 3492310 3492311 Bpet3224 Bpet3225   bug63 TRUE 0.773 50.000 0.200 NA   NA
 3492313 3492314 Bpet3227 Bpet3228   phnB2 FALSE 0.408 107.000 0.046 NA   NA
 3492318 3492319 Bpet3232 Bpet3233     TRUE 0.960 15.000 0.054 0.064   NA
 3492322 3492323 Bpet3236 Bpet3237 hadL   TRUE 0.652 -54.000 0.000 1.000   NA
 3492323 3492324 Bpet3237 Bpet3238     TRUE 0.990 -3.000 0.048 0.075   NA
 3492324 3492325 Bpet3238 Bpet3239   fepD FALSE 0.003 866.000 0.000 NA   NA
 3492325 3492326 Bpet3239 Bpet3240 fepD   TRUE 0.965 12.000 0.114 NA   NA
 3492326 3492327 Bpet3240 Bpet3241     TRUE 0.901 22.000 0.102 NA   NA
 3492327 3492328 Bpet3241 Bpet3242   ccoN3 TRUE 0.995 13.000 0.231 0.017 Y NA
 3492328 3492329 Bpet3242 Bpet3243 ccoN3 ccoQ TRUE 0.996 -3.000 0.128 0.002   NA
 3492329 3492330 Bpet3243 Bpet3244 ccoQ ccoN2 TRUE 0.995 3.000 0.250 0.002   NA
 3492330 3492331 Bpet3244 Bpet3245 ccoN2 ccoN1 TRUE 0.991 11.000 0.525 0.002 N NA
 3492331 3492332 Bpet3245 Bpet3246 ccoN1   FALSE 0.393 87.000 0.070 NA N NA
 3492332 3492333 Bpet3246 Bpet3247     TRUE 0.996 -3.000 0.713 NA   NA
 3492334 3492335 Bpet3248 Bpet3249     TRUE 0.826 21.000 0.083 NA N NA
 3492335 3492336 Bpet3249 Bpet3250     FALSE 0.344 44.000 0.000 NA   NA
 3492339 3492340 Bpet3253 Bpet3254     FALSE 0.004 143.000 0.000 1.000 N NA
 3492340 3492341 Bpet3254 Bpet3255   pgsA FALSE 0.390 80.000 0.003 0.057 N NA
 3492341 3492342 Bpet3255 Bpet3256 pgsA uvrC TRUE 0.709 39.000 0.227 1.000 N NA
 3492342 3492343 Bpet3256 Bpet3257 uvrC nagZ FALSE 0.125 53.000 0.007 1.000 N NA
 3492343 3492344 Bpet3257 Bpet3258 nagZ acpS TRUE 0.511 42.000 0.081 1.000 N NA
 3492344 3492345 Bpet3258 Bpet3259 acpS pdxJ FALSE 0.076 77.000 0.004 1.000 N NA
 3492345 3492346 Bpet3259 Bpet3260 pdxJ   TRUE 0.764 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3492346 3492347 Bpet3260 Bpet3261     TRUE 0.991 -3.000 0.176 NA   NA
 3492347 3492348 Bpet3261 Bpet3262     TRUE 0.929 -108.000 0.118 NA   NA
 3492348 3492349 Bpet3262 Bpet3263     TRUE 0.565 62.000 0.176 1.000 N NA
 3492349 3492350 Bpet3263 Bpet3264     FALSE 0.049 155.000 0.000 1.000   NA
 3492350 3492351 Bpet3264 Bpet3265     FALSE 0.018 218.000 0.000 1.000   NA
 3492351 3492352 Bpet3265 Bpet3266     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3492354 3492355 Bpet3268 Bpet3269     TRUE 0.992 3.000 0.771 1.000   NA
 3492355 3492356 Bpet3269 Bpet3270     TRUE 0.731 108.000 0.562 NA   NA
 3492356 3492357 Bpet3270 Bpet3271     FALSE 0.067 158.000 0.000 NA   NA
 3492357 3492358 Bpet3271 Bpet3272     TRUE 0.998 -3.000 0.900 NA Y NA
 3492358 3492359 Bpet3272 Bpet3273     TRUE 0.918 59.000 0.436 NA Y NA
 3492359 3492360 Bpet3273 Bpet3274     FALSE 0.004 144.000 0.000 1.000 N NA
 3492360 3492361 Bpet3274 Bpet3275     TRUE 0.997 6.000 0.462 0.045 Y NA
 3492361 3492362 Bpet3275 Bpet3276     TRUE 0.945 8.000 0.054 1.000   NA
 3492362 3492363 Bpet3276 Bpet3277     TRUE 0.948 -94.000 0.270 1.000   NA
 3492363 3492364 Bpet3277 Bpet3278     FALSE 0.198 117.000 0.038 NA N NA
 3492366 3492367 Bpet3280 Bpet3281     TRUE 0.776 32.000 0.000 0.007   NA
 3492367 3492368 Bpet3281 Bpet3282   bug64 TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3492368 3492369 Bpet3282 Bpet3283 bug64   TRUE 0.892 28.000 0.200 NA   NA
 3492369 3492370 Bpet3283 Bpet3284     TRUE 0.986 -3.000 0.200 NA N NA
 3492372 3492373 Bpet3286 Bpet3287 fadA6   FALSE 0.495 90.000 0.000 1.000 Y NA
 3492373 3492374 Bpet3287 Bpet3288     FALSE 0.011 86.000 0.000 1.000 N NA
 3492374 3492375 Bpet3288 Bpet3289   tnp17 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.079 Y NA
 3492376 3492377 Bpet3290 Bpet3291     TRUE 0.951 12.000 0.000 0.007   NA
 3492377 3492378 Bpet3291 Bpet3292     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3492378 3492379 Bpet3292 Bpet3293   qor3 TRUE 0.947 11.000 0.000 1.000 Y NA
 3492379 3492380 Bpet3293 Bpet3294 qor3   FALSE 0.048 25.000 0.000 1.000 N NA
 3492380 3492381 Bpet3294 Bpet3295     FALSE 0.011 85.000 0.000 1.000 N NA
 3492381 3492382 Bpet3295 Bpet3296     TRUE 0.968 29.000 0.667 1.000 Y NA
 3492382 3492383 Bpet3296 Bpet3297     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.059 Y NA
 3492383 3492384 Bpet3297 Bpet3298     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 3492384 3492385 Bpet3298 Bpet3299     TRUE 0.997 3.000 0.182 0.026 Y NA
 3492385 3492386 Bpet3299 Bpet3300     FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3492386 3492387 Bpet3300 Bpet3301     FALSE 0.130 107.000 0.000 1.000   NA
 3492391 3492392 Bpet3305 Bpet3306     TRUE 0.996 -3.000 0.727 0.084 N NA
 3492392 3492393 Bpet3306 Bpet3307   bug65 TRUE 0.859 50.000 0.778 1.000   NA
 3492394 3492395 Bpet3308 Bpet3309   proW TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.081 Y NA
 3492395 3492396 Bpet3309 Bpet3310 proW   TRUE 0.566 173.000 0.100 0.059 Y NA
 3492396 3492397 Bpet3310 Bpet3311   cmaS FALSE 0.000 466.000 0.000 1.000 N NA
 3492398 3492399 Bpet3312 Bpet3313   rpmB FALSE 0.001 203.000 0.000 1.000 N NA
 3492399 3492400 Bpet3313 Bpet3314 rpmB rpmG TRUE 0.976 35.000 0.332 0.009 Y NA
 3492400 3492401 Bpet3314 Bpet3315 rpmG   FALSE 0.043 98.000 0.002 1.000 N NA
 3492401 3492402 Bpet3315 Bpet3316     TRUE 0.997 0.000 0.536 1.000 Y NA
 3492402 3492403 Bpet3316 Bpet3317     TRUE 0.998 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 3492404 3492405 Bpet3318 Bpet3319     FALSE 0.206 98.000 0.000 NA   NA
 3492405 3492406 Bpet3319 Bpet3320     FALSE 0.492 31.000 0.000 NA   NA
 3492406 3492407 Bpet3320 Bpet3321     FALSE 0.018 45.000 0.000 1.000 N NA
 3492408 3492409 Bpet3322 Bpet3323 bph2   FALSE 0.116 113.000 0.000 1.000   NA
 3492409 3492410 Bpet3323 Bpet3324   leuS FALSE 0.055 83.000 0.003 1.000 N NA
 3492410 3492411 Bpet3324 Bpet3325 leuS   TRUE 0.957 11.000 0.182 NA N NA
 3492411 3492412 Bpet3325 Bpet3326   holA TRUE 0.972 4.000 0.199 NA N NA
 3492412 3492413 Bpet3326 Bpet3327 holA proA FALSE 0.305 76.000 0.047 1.000 N NA
 3492413 3492414 Bpet3327 Bpet3328 proA   FALSE 0.414 45.000 0.003 NA   NA
 3492416 3492417 Bpet3330 Bpet3331     FALSE 0.246 49.000 0.000 1.000   NA
 3492417 3492418 Bpet3331 Bpet3332     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3492419 3492420 Bpet3333 Bpetrrna_07     FALSE 0.012 300.000 0.000 NA   NA
 3492420 3492421 Bpetrrna_07 Bpetrrna_08     FALSE 0.083 148.000 0.000 NA   NA
 3492421 3492422 Bpetrrna_08 Bpettrna_31   b_petrii_trna_31 FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 3492422 3492423 Bpettrna_31 Bpettrna_32 b_petrii_trna_31 b_petrii_trna_32 FALSE 0.289 60.000 0.000 NA   NA
 3492423 3492424 Bpettrna_32 Bpetrrna_09 b_petrii_trna_32   FALSE 0.065 159.000 0.000 NA   NA
 3492424 3492425 Bpetrrna_09 Bpet3335     FALSE 0.004 626.000 0.000 NA   NA
 3492426 3492427 Bpet3336 Bpet3337     FALSE 0.035 30.000 0.000 1.000 N NA
 3492429 3492430 Bpet3339 Bpet3340   dctQ2 TRUE 0.792 76.000 1.000 NA N NA
 3492430 3492431 Bpet3340 Bpet3341 dctQ2   TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA N NA
 3492431 3492432 Bpet3341 Bpet3342   mvaA FALSE 0.245 38.000 0.013 1.000 N NA
 3492433 3492434 Bpet3343 Bpet3344     TRUE 0.626 51.000 0.083 1.000   NA
 3492434 3492435 Bpet3344 Bpet3345     TRUE 0.566 60.000 0.048 NA   NA
 3492437 3492438 Bpet3347 Bpet3348   catR2 FALSE 0.109 -28.000 0.000 1.000 N NA
 3492439 3492440 Bpet3349 Bpet3350 catB3 bug66 FALSE 0.206 71.000 0.000 1.000   NA
 3492440 3492441 Bpet3350 Bpet3351 bug66   FALSE 0.189 79.000 0.000 1.000   NA
 3492442 3492443 Bpet3352 Bpet3353   polC FALSE 0.006 116.000 0.000 1.000 N NA
 3492444 3492445 Bpet3354 Bpet3355 acnB   FALSE 0.005 129.000 0.000 1.000 N NA
 3492445 3492446 Bpet3355 Bpet3356   serA4 FALSE 0.006 120.000 0.000 1.000 N NA
 3492446 3492447 Bpet3356 Bpet3357 serA4 bug67 TRUE 0.684 57.000 0.136 1.000   NA
 3492448 3492449 Bpet3358 Bpet3359     FALSE 0.012 164.000 0.000 NA N NA
 3492449 3492450 Bpet3359 Bpet3360     FALSE 0.059 84.000 0.000 NA N NA
 3492451 3492452 Bpet3361 Bpet3362     FALSE 0.329 47.000 0.000 NA   NA
 3492454 3492455 Bpet3364 Bpet3365   acnA2 FALSE 0.001 200.000 0.000 1.000 N NA
 3492455 3492456 Bpet3365 Bpet3366 acnA2   FALSE 0.095 156.000 0.004 NA   NA
 3492456 3492457 Bpet3366 Bpet3367     FALSE 0.140 166.000 0.033 NA   NA
 3492457 3492458 Bpet3367 Bpet3368   efp FALSE 0.251 151.000 0.074 NA   NA
 3492458 3492459 Bpet3368 Bpet3369 efp   FALSE 0.081 149.000 0.000 NA   NA
 3492460 3492461 Bpet3370 Bpet3371     FALSE 0.240 85.000 0.000 NA   NA
 3492461 3492462 Bpet3371 Bpet3372     TRUE 0.604 24.000 0.000 NA   NA
 3492462 3492463 Bpet3372 Bpet3373     TRUE 0.870 24.000 0.083 NA   NA
 3492463 3492464 Bpet3373 Bpet3374   tadD TRUE 0.846 52.000 0.500 NA   NA
 3492464 3492465 Bpet3374 Bpet3375 tadD tadC TRUE 0.997 0.000 0.620 1.000 Y NA
 3492465 3492466 Bpet3375 Bpet3376 tadC tadB TRUE 0.998 11.000 0.844 0.007 Y NA
 3492466 3492467 Bpet3376 Bpet3377 tadB tadA TRUE 0.997 0.000 0.822 1.000 Y NA
 3492467 3492468 Bpet3377 Bpet3378 tadA cpaE TRUE 0.953 38.000 0.732 1.000 Y NA
 3492468 3492469 Bpet3378 Bpet3379 cpaE cpaC TRUE 0.995 6.000 0.696 1.000 Y NA
 3492469 3492470 Bpet3379 Bpet3380 cpaC cpaB TRUE 0.949 38.000 0.468 NA Y NA
 3492470 3492471 Bpet3380 Bpet3381 cpaB tadG1 TRUE 0.984 -3.000 0.069 NA   NA
 3492471 3492472 Bpet3381 Bpet3382 tadG1 tadG2 TRUE 0.991 4.000 0.667 NA   NA
 3492472 3492473 Bpet3382 ig_1633 tadG2 cpaA TRUE 0.957 -15.000 0.091 NA   NA
 3492473 3492474 ig_1633 Bpet3383 cpaA flp FALSE 0.103 139.000 0.000 NA   NA
 3492474 3492475 Bpet3383 Bpet3384 flp   FALSE 0.365 41.000 0.000 NA   NA
 3492476 3492477 Bpet3385 Bpet3386     FALSE 0.012 299.000 0.000 NA   NA
 3492477 3492478 Bpet3386 Bpet3387     TRUE 0.917 32.000 0.500 NA   NA
 3492479 3492480 Bpet3388 Bpet3389     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3492480 3492481 Bpet3389 Bpet3390     TRUE 0.982 6.000 0.000 0.059 Y NA
 3492481 3492482 Bpet3390 Bpet3391     TRUE 0.999 -3.000 0.619 0.059 Y NA
 3492482 3492483 Bpet3391 Bpet3392     FALSE 0.009 101.000 0.000 1.000 N NA
 3492483 3492484 Bpet3392 Bpet3393     FALSE 0.010 94.000 0.000 1.000 N NA
 3492484 3492485 Bpet3393 Bpet3394     FALSE 0.214 62.000 0.000 1.000   NA
 3492486 3492487 Bpet3395 Bpet3396 cyoA2 cyoB2 TRUE 0.972 58.000 0.915 0.010 Y NA
 3492487 3492488 Bpet3396 Bpet3397 cyoB2 cyoC2 TRUE 0.998 -7.000 0.847 0.064 Y NA
 3492488 3492489 Bpet3397 Bpet3398 cyoC2 cyoD2 TRUE 0.999 -3.000 0.906 0.064 Y NA
 3492489 3492490 Bpet3398 Bpet3399 cyoD2   TRUE 0.846 78.000 0.849 NA   NA
 3492494 3492495 Bpet3403 Bpet3404 goaG2 gabD2 FALSE 0.444 99.000 0.167 1.000 N NA
 3492495 3492496 Bpet3404 Bpet3405 gabD2   FALSE 0.103 176.000 0.100 1.000 N NA
 3492497 3492498 Bpet3406 Bpet3407   srpH TRUE 0.532 18.000 0.012 1.000 N NA
 3492499 3492500 Bpet3408 Bpet3409   fadE1 FALSE 0.160 154.000 0.112 1.000 N NA
 3492500 3492501 Bpet3409 Bpet3410 fadE1 fadA7 TRUE 0.977 18.000 0.242 1.000 Y NA
 3492501 3492502 Bpet3410 Bpet3411 fadA7 fadB2 TRUE 0.996 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 3492502 3492503 Bpet3411 Bpet3412 fadB2 fadL TRUE 0.729 56.000 0.028 1.000 Y NA
 3492503 3492504 Bpet3412 Bpet3413 fadL fadB1 TRUE 0.793 39.000 0.027 1.000 Y NA
 3492504 3492505 Bpet3413 Bpet3414 fadB1 fadA8 TRUE 0.987 17.000 0.588 1.000 Y NA
 3492505 3492506 Bpet3414 Bpet3415 fadA8   TRUE 0.910 12.000 0.015 NA   NA
 3492506 3492507 Bpet3415 Bpet3416   fadD2 TRUE 0.854 17.000 0.020 NA   NA
 3492508 3492509 Bpet3417 Bpet3418   bug68 TRUE 0.927 16.000 0.100 1.000   NA
 3492510 3492511 Bpet3419 Bpet3420     FALSE 0.000 318.000 0.000 1.000 N NA
 3492512 3492513 Bpet3421 Bpet3422 bug69   FALSE 0.210 66.000 0.000 1.000   NA
 3492513 3492514 Bpet3422 Bpet3423     TRUE 0.851 10.000 0.000 NA   NA
 3492516 3492517 Bpettrna_33 Bpet3425 b_petrii_trna_33   FALSE 0.472 33.000 0.000 NA   NA
 3492518 3492519 Bpet3426 Bpet3427     FALSE 0.489 141.000 0.000 0.040 Y NA
 3492519 3492520 Bpet3427 Bpet3428   nemA TRUE 0.647 49.000 0.224 1.000 N NA
 3492520 3492521 Bpet3428 Bpet3429 nemA fabK FALSE 0.142 172.000 0.000 0.053   NA
 3492522 3492523 Bpet3430 Bpet3431 bug70   FALSE 0.209 67.000 0.000 1.000   NA
 3492523 3492524 Bpet3431 Bpet3432     TRUE 0.994 -3.000 0.222 0.045 N NA
 3492524 3492525 Bpet3432 Bpet3433     FALSE 0.004 141.000 0.000 1.000 N NA
 3492525 3492526 Bpet3433 Bpet3434     FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3492526 3492527 Bpet3434 Bpet3435     TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.045 N NA
 3492527 3492528 Bpet3435 Bpet3436     TRUE 0.980 -10.000 0.000 0.045 Y NA
 3492529 3492530 Bpet3437 Bpet3438 bug71   TRUE 0.530 23.000 0.000 1.000   NA
 3492533 3492534 Bpettrna_34 Bpet3441 b_petrii_trna_34   FALSE 0.161 113.000 0.000 NA   NA
 3492534 3492535 Bpet3441 Bpet3442     TRUE 0.988 3.000 0.371 1.000   NA
 3492536 3492537 Bpet3443 Bpet3444     FALSE 0.147 99.000 0.000 1.000   NA
 3492540 3492541 Bpettrna_35 Bpet3447 b_petrii_trna_35 lysC FALSE 0.274 71.000 0.000 NA   NA
 3492541 3492542 Bpet3447 Bpet3448 lysC mesJ FALSE 0.104 120.000 0.023 1.000 N NA
 3492542 3492543 Bpet3448 Bpet3449 mesJ accA2 TRUE 0.529 58.000 0.123 1.000 N NA
 3492543 3492544 Bpet3449 Bpet3450 accA2   FALSE 0.408 49.000 0.059 1.000 N NA
 3492544 3492545 Bpet3450 Bpet3451   cysS TRUE 0.777 15.000 0.036 1.000 N NA
 3492546 3492547 Bpet3452 Bpet3453   ppiB FALSE 0.208 135.000 0.031 1.000   NA
 3492547 3492548 Bpet3453 Bpet3454 ppiB lpxH TRUE 0.972 -7.000 0.136 1.000   NA
 3492549 3492550 Bpet3455 Bpet3456 bacA   TRUE 0.751 22.000 0.020 1.000   NA
 3492550 3492551 Bpet3456 Bpet3457   suhB FALSE 0.061 169.000 0.005 1.000   NA
 3492555 3492556 Bpet3461 Bpet3462     FALSE 0.186 140.000 0.018 NA   NA
 3492556 3492557 Bpet3462 Bpet3463     TRUE 0.982 -19.000 0.620 NA   NA
 3492557 3492558 Bpet3463 Bpet3464     TRUE 0.957 24.000 0.713 NA   NA
 3492558 3492559 Bpet3464 Bpet3465     TRUE 0.973 12.000 0.436 NA N NA
 3492559 3492560 Bpet3465 Bpet3466     FALSE 0.223 125.000 0.014 NA   NA
 3492561 3492562 Bpet3467 Bpet3468     FALSE 0.211 97.000 0.000 NA   NA
 3492564 3492565 Bpet3470 Bpet3471 mutS   TRUE 0.958 -3.000 0.004 NA   NA
 3492566 3492567 Bpet3472 Bpet3473     FALSE 0.086 147.000 0.000 NA   NA
 3492567 3492568 Bpet3473 Bpet3474   dapA3 TRUE 0.949 16.000 0.014 NA Y NA
 3492568 3492569 Bpet3474 Bpet3475 dapA3   FALSE 0.268 86.000 0.007 1.000   NA
 3492569 3492570 Bpet3475 Bpet3476     TRUE 0.888 13.000 0.009 NA   NA
 3492571 3492572 Bpet3477 Bpet3478     TRUE 0.838 -118.000 0.023 NA   NA
 3492572 3492573 Bpet3478 Bpet3479     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3492574 3492575 Bpet3480 Bpet3481     FALSE 0.096 142.000 0.000 NA   NA
 3492575 3492576 Bpet3481 Bpet3482     FALSE 0.009 336.000 0.000 NA   NA
 3492576 3492577 Bpet3482 Bpet3483     FALSE 0.504 30.000 0.000 NA   NA
 3492579 3492580 Bpet3485 Bpet3486     FALSE 0.176 108.000 0.000 NA   NA
 3492584 3492585 Bpet3489 Bpettrna_37 pcaB1 b_petrii_trna_37 FALSE 0.017 257.000 0.000 NA   NA
 3492585 3492586 Bpettrna_37 Bpet3490 b_petrii_trna_37   FALSE 0.284 62.000 0.000 NA   NA
 3492586 3492587 Bpet3490 Bpet3491     FALSE 0.157 12.000 0.000 1.000 N NA
 3492587 3492588 Bpet3491 Bpet3492     TRUE 0.760 31.000 0.000 1.000 Y NA
 3492588 3492589 Bpet3492 Bpet3493     TRUE 0.999 3.000 0.667 0.009 Y NA
 3492589 3492590 Bpet3493 Bpet3494     TRUE 0.962 16.000 0.000 0.058 Y NA
 3492590 3492591 Bpet3494 Bpet3495     FALSE 0.351 120.000 0.000 1.000 Y NA
 3492592 3492593 Bpet3496 Bpet3497     TRUE 0.537 36.000 0.065 1.000 N NA
 3492594 3492595 Bpet3498 Bpet3499     FALSE 0.461 34.000 0.000 NA   NA
 3492596 3492597 Bpet3500 Bpet3501     TRUE 0.994 -3.000 0.400 NA   NA
 3492597 3492598 Bpet3501 Bpet3502     FALSE 0.056 169.000 0.000 NA   NA
 3492600 3492601 Bpet3504 Bpet3505   bug73 FALSE 0.024 196.000 0.000 1.000   NA
 3492602 3492603 Bpet3506 Bpet3507     FALSE 0.387 39.000 0.000 NA   NA
 3492603 3492604 Bpet3507 Bpet3508     FALSE 0.013 244.000 0.000 1.000   NA
 3492604 3492605 Bpet3508 Bpet3509   bkdB TRUE 0.993 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 3492605 3492606 Bpet3509 Bpet3510 bkdB bkdA2 TRUE 0.992 2.000 0.022 0.083 Y NA
 3492606 3492607 Bpet3510 Bpet3511 bkdA2 bkdA1 TRUE 0.999 3.000 0.558 0.000 Y NA
 3492608 3492609 Bpet3512 Bpet3513     FALSE 0.194 27.000 0.000 NA N NA
 3492611 3492612 Bpettrna_38 Bpet3515 b_petrii_trna_38   FALSE 0.005 497.000 0.000 NA   NA
 3492613 3492614 Bpet3516 Bpet3517   attL TRUE 0.892 4.000 0.000 NA   NA
 3492617 3492618 Bpet3520 Bpet3521     TRUE 0.984 0.000 0.097 NA   NA
 3492619 3492620 Bpet3522 Bpet3523 pstB pstA TRUE 0.983 36.000 0.526 0.001 Y NA
 3492620 3492621 Bpet3523 Bpet3524 pstA pstC TRUE 0.995 -54.000 0.537 0.001 Y NA
 3492621 3492622 Bpet3524 Bpet3525 pstC pstS TRUE 0.871 106.000 0.072 0.001 Y NA
 3492622 3492623 Bpet3525 Bpet3526 pstS ppk FALSE 0.145 184.000 0.004 1.000 Y NA
 3492625 3492626 Bpet3528 Bpet3529     FALSE 0.028 209.000 0.000 NA   NA
 3492626 3492627 Bpet3529 Bpet3530   folP TRUE 0.986 -3.000 0.260 1.000 N NA
 3492627 3492628 Bpet3530 Bpet3531 folP ftsH TRUE 0.952 14.000 0.325 1.000 N NA
 3492628 3492629 Bpet3531 Bpet3532 ftsH ftsJ FALSE 0.078 204.000 0.095 NA N NA
 3492631 3492632 Bpet3534 Bpet3535   greA TRUE 0.804 33.000 0.089 NA   NA
 3492632 3492633 Bpet3535 Bpet3536 greA ycdG FALSE 0.000 578.000 0.000 1.000 N NA
 3492634 3492635 Bpet3537 Bpet3538     TRUE 0.794 102.000 0.625 0.058 N NA
 3492635 3492636 Bpet3538 Bpet3539     TRUE 0.996 -3.000 0.625 0.025 N NA
 3492636 3492637 Bpet3539 Bpet3540     TRUE 0.979 10.000 0.800 1.000 N NA
 3492637 3492638 Bpet3540 Bpet3541   gpmB TRUE 0.976 7.000 0.500 1.000 N NA
 3492639 3492640 Bpet3542 Bpet3543   carB FALSE 0.238 84.000 0.003 1.000   NA
 3492640 3492641 Bpet3543 Bpet3544 carB carA TRUE 0.997 11.000 0.345 0.000 Y NA
 3492643 3492644 Bpet3546 Bpet3547     FALSE 0.333 46.000 0.000 NA   NA
 3492644 3492645 Bpet3547 Bpet3548     TRUE 0.988 18.000 0.875 1.000 Y NA
 3492645 3492646 Bpet3548 Bpet3549     TRUE 0.995 -7.000 0.700 1.000 Y NA
 3492646 3492647 Bpet3549 Bpet3550     FALSE 0.483 93.000 0.172 1.000 N NA
 3492647 3492648 Bpet3550 Bpet3551   recR FALSE 0.471 24.000 0.018 1.000 N NA
 3492648 3492649 Bpet3551 Bpet3552 recR   TRUE 0.965 20.000 0.604 NA   NA
 3492649 3492650 Bpet3552 Bpet3553   dnaX TRUE 0.813 62.000 0.411 NA   NA
 3492650 3492651 Bpet3553 Bpet3554 dnaX   FALSE 0.136 285.000 0.003 0.009 Y NA
 3492651 3492652 Bpet3554 Bpet3555     TRUE 0.993 -3.000 0.098 0.077   NA
 3492652 3492653 Bpet3555 Bpet3556     TRUE 0.603 -144.000 0.000 1.000   NA
 3492654 3492655 Bpettrna_39 Bpet3557 b_petrii_trna_39 pbpG FALSE 0.059 165.000 0.000 NA   NA
 3492656 3492657 Bpet3558 Bpet3559     TRUE 0.520 124.000 0.188 NA   NA
 3492657 3492658 Bpet3559 Bpet3560     FALSE 0.212 63.000 0.000 1.000   NA
 3492658 3492659 Bpet3560 Bpet3561     TRUE 0.648 30.000 0.056 NA N NA
 3492659 3492660 Bpet3561 Bpet3562     FALSE 0.022 232.000 0.000 NA   NA
 3492660 3492661 Bpet3562 Bpet3563     FALSE 0.337 80.000 0.015 1.000   NA
 3492661 3492662 Bpet3563 Bpet3564     FALSE 0.101 47.000 0.004 1.000 N NA
 3492663 3492664 Bpet3565 Bpet3566 ilvG5 acd14 FALSE 0.327 58.000 0.043 1.000 N NA
 3492665 3492666 Bpet3567 Bpet3568   petH FALSE 0.011 85.000 0.000 1.000 N NA
 3492666 3492667 Bpet3568 Bpet3569 petH pbcA TRUE 0.628 18.000 0.000 1.000   NA
 3492667 3492668 Bpet3569 Bpet3570 pbcA   FALSE 0.302 39.000 0.000 1.000   NA
 3492668 3492669 Bpet3570 Bpet3571   aroK1 FALSE 0.004 138.000 0.000 1.000 N NA
 3492670 3492671 Bpet3572 Bpet3573   paaZ2 TRUE 0.982 -3.000 0.055 NA   NA
 3492671 3492672 Bpet3573 Bpet3574 paaZ2   TRUE 0.664 44.000 0.062 0.083 N NA
 3492672 3492673 Bpet3574 Bpet3575     TRUE 0.986 -3.000 0.084 NA   NA
 3492673 3492674 Bpet3575 Bpet3576     TRUE 0.647 37.000 0.032 NA   NA
 3492674 3492675 Bpet3576 Bpet3577     TRUE 0.979 23.000 0.500 NA Y NA
 3492675 3492676 Bpet3577 Bpet3578     TRUE 0.997 8.000 0.385 0.058 Y NA
 3492676 3492677 Bpet3578 Bpet3579     TRUE 0.994 -7.000 0.385 1.000 Y NA
 3492677 3492678 Bpet3579 Bpet3580     TRUE 0.997 -12.000 0.833 0.025 Y NA
 3492680 3492681 Bpet3582 Bpet3583     TRUE 0.997 -3.000 0.571 0.058   NA
 3492681 3492682 Bpet3583 Bpet3584     TRUE 0.967 11.000 0.154 1.000   NA
 3492682 3492683 Bpet3584 Bpet3585     FALSE 0.169 -10.000 0.000 1.000 N NA
 3492684 3492685 Bpet3586 Bpet3587     FALSE 0.003 152.000 0.000 1.000 N NA
 3492686 3492687 Bpet3588 Bpet3589   bug74 FALSE 0.031 180.000 0.000 1.000   NA
 3492687 3492688 Bpet3589 Bpet3590 bug74 pcaI2 FALSE 0.186 80.000 0.000 1.000   NA
 3492688 3492689 Bpet3590 Bpet3591 pcaI2 pcaJ2 TRUE 0.998 8.000 0.667 0.002 Y NA
 3492689 3492690 Bpet3591 Bpet3592 pcaJ2 pcaR1 FALSE 0.307 0.000 0.000 1.000 N NA
 3492691 3492692 Bpet3593 Bpet3594   purK TRUE 0.903 7.000 0.041 NA N NA
 3492692 3492693 Bpet3594 Bpet3595 purK purE TRUE 0.975 36.000 0.201 0.000 Y NA
 3492693 3492694 Bpet3595 Bpet3596 purE   FALSE 0.019 138.000 0.002 1.000 N NA
 3492694 3492695 Bpet3596 Bpet3597     TRUE 0.990 10.000 1.000 NA   NA
 3492695 3492696 Bpet3597 Bpet3598   purC FALSE 0.063 161.000 0.000 NA   NA
 3492698 3492699 Bpet3600 Bpet3601 fda   FALSE 0.022 232.000 0.000 NA   NA
 3492700 3492701 Bpet3602 Bpet3603   infA1 FALSE 0.005 384.000 0.000 1.000   NA
 3492701 3492702 Bpet3603 Bpet3604 infA1   TRUE 0.908 37.000 0.667 NA   NA
 3492703 3492704 Bpet3605 Bpet3606     TRUE 0.994 -3.000 0.353 NA   NA
 3492704 3492705 Bpet3606 Bpet3607   bug75 TRUE 0.540 59.000 0.038 NA   NA
 3492707 3492708 Bpet3609 Bpet3610     TRUE 0.921 -9.000 0.015 NA   NA
 3492708 3492709 Bpet3610 Bpet3611   mogA FALSE 0.413 58.000 0.008 NA   NA
 3492711 3492712 Bpet3613 Bpet3614     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3492713 3492714 Bpet3615 Bpet3616     TRUE 0.545 59.000 0.040 NA   NA
 3492714 3492715 Bpet3616 Bpet3617     TRUE 0.979 -3.000 0.040 NA   NA
 3492715 3492716 Bpet3617 Bpet3618     FALSE 0.482 93.000 0.048 NA   NA
 3492716 3492717 Bpet3618 Bpet3619     TRUE 0.707 0.000 0.000 NA N NA
 3492717 3492718 Bpet3619 Bpet3620     FALSE 0.030 122.000 0.000 NA N NA
 3492718 3492719 Bpet3620 Bpet3621   cynS TRUE 0.759 -3.000 0.000 NA N NA
 3492720 3492721 Bpet3622 Bpet3623 pgk gap TRUE 0.991 6.000 0.017 0.002 Y NA
 3492721 3492722 Bpet3623 Bpet3624 gap tktA TRUE 0.958 15.000 0.033 1.000 Y NA
 3492724 3492725 Bpet3626 Bpet3627     TRUE 0.974 -3.000 0.026 NA   NA
 3492725 3492726 Bpet3627 Bpet3628   maeB2 TRUE 0.883 -19.000 0.026 1.000   NA
 3492726 3492727 Bpet3628 Bpet3629 maeB2   FALSE 0.032 660.000 0.286 NA   NA
 3492728 3492729 Bpet3630 Bpet3631     FALSE 0.017 259.000 0.000 NA   NA
 3492732 3492733 Bpet3634 Bpet3635     TRUE 0.936 5.000 0.016 NA   NA
 3492733 3492734 Bpet3635 Bpet3636     TRUE 0.602 44.000 0.040 NA   NA
 3492734 3492735 Bpet3636 Bpet3637     TRUE 0.809 83.000 0.600 NA   NA
 3492735 3492736 Bpet3637 Bpet3638   nasA FALSE 0.034 197.000 0.000 NA   NA
 3492736 3492737 Bpet3638 Bpet3639 nasA nasE TRUE 0.977 -3.000 0.048 1.000   NA
 3492737 3492738 Bpet3639 Bpet3640 nasE nasD TRUE 0.993 8.000 0.539 0.000 N NA
 3492738 3492739 Bpet3640 Bpet3641 nasD   FALSE 0.202 99.000 0.000 NA   NA
 3492740 3492741 Bpet3642 Bpet3643   cysG1 FALSE 0.044 104.000 0.000 NA N NA
 3492742 3492743 Bpet3644 Bpet3645 upp dacB FALSE 0.064 83.000 0.004 1.000 N NA
 3492744 3492745 Bpet3646 Bpet3647 queA tgt TRUE 0.999 -3.000 0.360 0.000 Y NA
 3492745 3492746 Bpet3647 Bpet3648 tgt yajC FALSE 0.377 143.000 0.325 NA N NA
 3492746 3492747 Bpet3648 Bpet3649 yajC secD TRUE 0.816 67.000 0.083 NA Y NA
 3492747 3492748 Bpet3649 Bpet3650 secD secF TRUE 0.967 51.000 0.332 0.001 Y NA
 3492748 3492749 Bpet3650 Bpet3651 secF   FALSE 0.001 231.000 0.000 1.000 N NA
 3492749 3492750 Bpet3651 Bpet3652     FALSE 0.009 100.000 0.000 1.000 N NA
 3492752 3492753 Bpet3654 Bpet3655   ybeZ TRUE 0.984 -3.000 0.220 1.000 N NA
 3492753 3492754 Bpet3655 Bpet3656 ybeZ   TRUE 0.985 -10.000 0.457 NA   NA
 3492754 3492755 Bpet3656 Bpet3657     TRUE 0.668 83.000 0.150 NA   NA
 3492755 3492756 Bpet3657 Bpet3658   lnt TRUE 0.972 -3.000 0.071 NA N NA
 3492756 3492757 Bpet3658 Bpettrna_40 lnt b_petrii_trna_40 FALSE 0.091 145.000 0.000 NA   NA
 3492757 3492758 Bpettrna_40 Bpettrna_41 b_petrii_trna_40 b_petrii_trna_41 FALSE 0.359 42.000 0.000 NA   NA
 3492758 3492759 Bpettrna_41 Bpettrna_42 b_petrii_trna_41 b_petrii_trna_42 FALSE 0.401 38.000 0.000 NA   NA
 3492760 3492761 Bpet3659 Bpet3660     FALSE 0.326 48.000 0.000 NA   NA
 3492761 3492762 Bpet3660 Bpet3661     FALSE 0.263 76.000 0.000 NA   NA
 3492762 3492763 Bpet3661 Bpet3662     FALSE 0.461 34.000 0.000 NA   NA
 3492764 3492765 Bpet3663 Bpet3664 bioB   TRUE 0.958 -3.000 0.004 NA   NA
 3492766 3492767 Bpet3665 Bpet3666     TRUE 0.514 78.000 0.065 1.000   NA
 3492770 3492771 Bpet3669 Bpet3670 moaC moaD TRUE 0.994 -19.000 0.175 0.003 Y NA
 3492771 3492772 Bpet3670 Bpet3671 moaD moaE TRUE 0.998 6.000 0.501 0.003 Y NA
 3492772 3492773 Bpet3671 Bpet3672 moaE moaB TRUE 0.996 -3.000 0.018 0.003 Y NA
 3492773 3492774 Bpet3672 Bpet3673 moaB moeA TRUE 0.996 -3.000 0.009 0.003 Y NA
 3492775 3492776 Bpet3674 Bpet3675   bug76 FALSE 0.167 92.000 0.000 1.000   NA
 3492777 3492778 Bpet3676 Bpet3677     TRUE 0.985 7.000 0.241 0.044 N NA
 3492778 3492779 Bpet3677 Bpet3678   gctA TRUE 0.968 22.000 0.069 0.082 Y NA
 3492779 3492780 Bpet3678 Bpet3679 gctA gctB TRUE 0.999 -3.000 0.824 0.000 Y NA
 3492780 3492781 Bpet3679 Bpet3680 gctB   TRUE 0.989 -22.000 0.133 0.082 Y NA
 3492782 3492783 Bpet3681 Bpet3682 moaA1   FALSE 0.387 40.000 0.040 1.000 N NA
 3492784 3492785 Bpet3683 Bpet3684 fdsG fdsB TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.002 Y NA
 3492785 3492786 Bpet3684 Bpet3685 fdsB fdsA TRUE 0.986 18.000 0.466 0.002   NA
 3492786 3492787 Bpet3685 Bpet3686 fdsA fdsC TRUE 0.964 17.000 0.049 0.002   NA
 3492787 3492788 Bpet3686 Bpet3687 fdsC fdsD TRUE 0.990 5.000 0.104 0.002   NA
 3492788 3492789 Bpet3687 Bpet3688 fdsD   FALSE 0.448 94.000 0.057 1.000   NA
 3492789 3492790 Bpet3688 Bpet3689     FALSE 0.007 330.000 0.000 1.000   NA
 3492791 3492792 Bpet3690 Bpet3691     TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.001 Y NA
 3492793 3492794 Bpet3692 Bpet3693     FALSE 0.448 70.000 0.034 1.000   NA
 3492794 3492795 Bpet3693 Bpet3694   hutG2 TRUE 0.552 26.000 0.034 1.000 N NA
 3492796 3492797 Bpet3695 Bpet3696 prtR1   TRUE 0.997 2.000 0.619 NA Y NA
 3492797 3492798 Bpet3696 Bpet3697     TRUE 0.938 18.000 0.143 NA   NA
 3492798 3492799 Bpet3697 Bpet3698     FALSE 0.141 140.000 0.005 NA   NA
 3492800 3492801 Bpet3699 Bpet3700     FALSE 0.240 85.000 0.000 NA   NA
 3492801 3492802 Bpet3700 Bpet3701   trbM FALSE 0.326 48.000 0.000 NA   NA
 3492802 3492803 Bpet3701 Bpet3702 trbM virB1 TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 3492803 3492804 Bpet3702 Bpet3703 virB1 trwL FALSE 0.229 91.000 0.000 NA   NA
 3492804 3492805 Bpet3703 Bpet3704 trwL virB3 TRUE 0.892 4.000 0.000 NA   NA
 3492805 3492806 Bpet3704 Bpet3705 virB3 virB4 TRUE 0.989 12.000 0.192 NA Y NA
 3492806 3492807 Bpet3705 Bpet3706 virB4   TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 3492807 3492808 Bpet3706 Bpet3707     FALSE 0.037 191.000 0.000 NA   NA
 3492808 3492809 Bpet3707 Bpet3708   virB5 FALSE 0.387 39.000 0.000 NA   NA
 3492809 3492810 Bpet3708 Bpet3709 virB5 virB6 TRUE 0.851 10.000 0.000 NA   NA
 3492810 3492811 Bpet3709 Bpet3710 virB6 trwH FALSE 0.234 88.000 0.000 NA   NA
 3492811 3492812 Bpet3710 Bpet3711 trwH virB8 TRUE 0.892 4.000 0.000 NA   NA
 3492812 3492813 Bpet3711 Bpet3712 virB8 virB9 TRUE 0.975 28.000 0.667 NA Y NA
 3492813 3492814 Bpet3712 Bpet3713 virB9 virB10 TRUE 0.998 -3.000 0.857 NA Y NA
 3492814 3492815 Bpet3713 Bpet3714 virB10 virB11 TRUE 0.992 -22.000 0.857 1.000 Y NA
 3492815 3492816 Bpet3714 Bpet3715 virB11 trfA FALSE 0.083 148.000 0.000 NA   NA
 3492816 3492817 Bpet3715 Bpet3716 trfA   FALSE 0.005 452.000 0.000 NA   NA
 3492817 3492818 Bpet3716 Bpet3717     FALSE 0.006 431.000 0.000 NA   NA
 3492818 3492819 Bpet3717 Bpet3718     TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 3492819 3492820 Bpet3718 Bpet3719   virD4 TRUE 0.825 13.000 0.000 NA   NA
 3492820 3492821 Bpet3719 Bpet3720 virD4 tnp18 FALSE 0.000 299.000 0.000 1.000 N NA
 3492821 3492822 Bpet3720 Bpet3721 tnp18   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.076 Y NA
 3492822 3492823 Bpet3721 Bpet3722   tnp19 TRUE 0.746 60.000 0.000 0.076 Y NA
 3492823 3492824 Bpet3722 Bpet3723 tnp19   FALSE 0.006 118.000 0.000 1.000 N NA
 3492825 3492826 Bpet3724 Bpet3725     FALSE 0.307 0.000 0.000 1.000 N NA
 3492826 3492827 Bpet3725 Bpet3726     TRUE 0.696 41.000 0.000 NA Y NA
 3492827 3492828 Bpet3726 Bpet3727   gst7 TRUE 0.997 -3.000 0.222 NA Y NA
 3492829 3492830 Bpet3728 Bpet3729     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3492830 3492831 Bpet3729 Bpet3730     TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3492831 3492832 Bpet3730 Bpet3731     TRUE 0.966 0.000 0.000 0.082   NA
 3492832 3492833 Bpet3731 Bpet3732     FALSE 0.172 109.000 0.000 NA   NA
 3492833 3492834 Bpet3732 Bpet3733     TRUE 0.995 -3.000 0.521 NA   NA
 3492834 3492835 Bpet3733 Bpet3734   catB4 FALSE 0.271 43.000 0.000 1.000   NA
 3492835 3492836 Bpet3734 Bpet3735 catB4   TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3492836 3492837 Bpet3735 Bpet3736     FALSE 0.005 386.000 0.000 1.000   NA
 3492837 3492838 Bpet3736 Bpet3737     FALSE 0.012 255.000 0.000 1.000   NA
 3492838 3492839 Bpet3737 Bpet3738     TRUE 0.981 -91.000 0.286 0.010   NA
 3492839 3492840 Bpet3738 Bpet3739     TRUE 0.788 110.000 0.600 0.010 N NA
 3492840 3492841 Bpet3739 Bpet3740     TRUE 0.981 9.000 0.208 0.062 N NA
 3492841 3492842 Bpet3740 Bpet3741     TRUE 0.995 0.000 0.250 0.052   NA
 3492842 3492843 Bpet3741 Bpet3742   hcaB TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.052   NA
 3492843 3492844 Bpet3742 Bpet3743 hcaB   FALSE 0.187 124.000 0.000 0.052 N NA
 3492844 3492845 Bpet3743 Bpet3744     TRUE 0.981 -13.000 0.200 0.010 N NA
 3492845 3492846 Bpet3744 Bpet3745     TRUE 0.937 10.000 0.000 0.069   NA
 3492846 3492847 Bpet3745 Bpet3746     FALSE 0.147 99.000 0.000 1.000   NA
 3492849 3492850 Bpet3748 Bpet3749 catA1 catB5 FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3492850 3492851 Bpet3749 Bpet3750 catB5 bug77 FALSE 0.202 74.000 0.000 1.000   NA
 3492851 3492852 Bpet3750 Bpet3751 bug77   TRUE 0.552 22.000 0.000 1.000   NA
 3492852 3492853 Bpet3751 Bpet3752     FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3492853 3492854 Bpet3752 Bpet3753     FALSE 0.002 962.000 0.000 1.000   NA
 3492855 3492856 Bpet3754 Bpet3755     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.025 Y NA
 3492856 3492857 Bpet3755 Bpet3756     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3492858 3492859 Bpet3757 Bpet3758     FALSE 0.202 99.000 0.000 NA   NA
 3492859 3492860 Bpet3758 Bpet3759     TRUE 0.981 -3.000 0.071 1.000   NA
 3492860 3492861 Bpet3759 Bpet3760     TRUE 0.814 7.000 0.000 1.000   NA
 3492861 3492862 Bpet3760 Bpet3761     TRUE 0.960 -19.000 0.133 NA   NA
 3492862 3492863 Bpet3761 Bpet3762     FALSE 0.211 97.000 0.000 NA   NA
 3492863 3492864 Bpet3762 Bpet3763     FALSE 0.333 46.000 0.000 NA   NA
 3492864 3492865 Bpet3763 Bpet3764     TRUE 0.914 2.000 0.000 NA   NA
 3492866 3492867 Bpet3765 Bpet3766   tnp20 FALSE 0.078 150.000 0.000 NA   NA
 3492868 3492869 Bpet3767 Bpet3768 tnp21   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.076 Y NA
 3492869 3492870 Bpet3768 Bpet3769   traA FALSE 0.284 137.000 0.000 1.000 Y NA
 3492870 3492871 Bpet3769 Bpet3770 traA   FALSE 0.005 484.000 0.000 NA   NA
 3492872 3492873 Bpet3771 Bpet3772 ssb4   FALSE 0.263 76.000 0.000 NA   NA
 3492873 3492874 Bpet3772 Bpet3773   radC4 FALSE 0.004 566.000 0.000 NA   NA
 3492875 3492876 Bpet3774 Bpet3775 cycK dsbE TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.003 Y NA
 3492876 3492877 Bpet3775 Bpet3776 dsbE   TRUE 0.998 -3.000 0.400 NA Y NA
 3492877 3492878 Bpet3776 Bpet3777   cycH1 TRUE 0.998 -3.000 0.429 NA Y NA
 3492878 3492879 Bpet3777 Bpet3778 cycH1   FALSE 0.004 421.000 0.000 1.000   NA
 3492880 3492881 Bpet3779 Bpet3780     FALSE 0.289 60.000 0.000 NA   NA
 3492881 3492882 Bpet3780 Bpet3781   tnp22 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.076 Y NA
 3492882 3492883 Bpet3781 Bpet3782 tnp22   FALSE 0.000 749.000 0.000 1.000 N NA
 3492883 3492884 Bpet3782 Bpet3783     FALSE 0.002 182.000 0.000 1.000 N NA
 3492884 3492885 Bpet3783 Bpet3784     FALSE 0.241 51.000 0.000 1.000   NA
 3492885 3492886 Bpet3784 Bpet3785     TRUE 0.736 14.000 0.000 1.000   NA
 3492886 3492887 Bpet3785 Bpet3786   acd15 TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3492887 3492888 Bpet3786 Bpet3787 acd15   TRUE 0.631 44.000 0.000 1.000 Y NA
 3492889 3492890 Bpet3788 Bpet3789   bug78 FALSE 0.333 46.000 0.000 NA   NA
 3492890 3492891 Bpet3789 Bpet3790 bug78   TRUE 0.736 14.000 0.000 1.000   NA
 3492891 3492892 Bpet3790 Bpet3791     TRUE 0.756 -16.000 0.000 1.000   NA
 3492892 3492893 Bpet3791 Bpet3792   etfB2 FALSE 0.094 192.000 0.000 0.062   NA
 3492893 3492894 Bpet3792 Bpet3793 etfB2 etfA2 TRUE 0.962 17.000 0.000 0.017 Y NA
 3492894 3492895 Bpet3793 Bpet3794 etfA2   FALSE 0.377 115.000 0.000 0.014   NA
 3492896 3492897 Bpetpseudo_10 Bpetpseudo_11     TRUE 0.700 -114.000 0.000 NA   NA
 3492898 3492899 Bpet3795 Bpet3796     FALSE 0.002 708.000 0.000 1.000   NA
 3492899 3492900 Bpet3796 Bpet3797     FALSE 0.165 111.000 0.000 NA   NA
 3492900 3492901 Bpet3797 Bpet3798     TRUE 0.993 -3.000 0.262 NA   NA
 3492901 3492902 Bpet3798 Bpet3799     FALSE 0.108 137.000 0.000 NA   NA
 3492903 3492904 Bpet3800 Bpet3801 bug79   FALSE 0.136 105.000 0.000 1.000   NA
 3492904 3492905 Bpet3801 Bpet3802     FALSE 0.128 36.000 0.000 NA N NA
 3492905 3492906 Bpet3802 Bpet3803   serA5 TRUE 0.759 -3.000 0.000 NA N NA
 3492906 3492907 Bpet3803 Bpet3804 serA5   FALSE 0.023 38.000 0.000 1.000 N NA
 3492908 3492909 Bpet3805 Bpet3806 ilvG6   FALSE 0.002 171.000 0.000 1.000 N NA
 3492911 3492912 Bpet3808 Bpet3809     FALSE 0.172 109.000 0.000 NA   NA
 3492912 3492913 Bpet3809 Bpet3810     FALSE 0.133 124.000 0.000 NA   NA
 3492915 3492916 Bpet3812 Bpet3813 bug80 fumC FALSE 0.438 28.000 0.000 1.000   NA
 3492919 3492920 Bpet3816 Bpet3817   serA6 TRUE 0.997 -3.000 0.455 0.082   NA
 3492920 3492921 Bpet3817 Bpet3818 serA6 rbsR TRUE 0.990 -3.000 0.455 1.000 N NA
 3492922 3492923 Bpet3819 Bpet3820     TRUE 0.899 19.000 0.000 NA Y NA
 3492923 3492924 Bpet3820 Bpet3821     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3492925 3492926 Bpet3822 Bpet3823     TRUE 0.816 35.000 0.167 1.000   NA
 3492926 3492927 Bpet3823 Bpet3824   narI1 TRUE 0.914 17.000 0.091 1.000   NA
 3492927 3492928 Bpet3824 Bpet3825 narI1 narJ1 TRUE 0.997 -7.000 0.235 0.002 Y NA
 3492928 3492929 Bpet3825 Bpet3826 narJ1 narH1 TRUE 0.987 7.000 0.000 0.002 Y NA
 3492929 3492930 Bpet3826 Bpet3827 narH1 narG1 TRUE 0.992 24.000 0.500 0.001 Y NA
 3492931 3492932 Bpet3828 Bpet3829     FALSE 0.034 198.000 0.000 NA   NA
 3492932 3492933 Bpet3829 Bpet3830     TRUE 0.734 -19.000 0.000 1.000   NA
 3492933 3492934 Bpet3830 Bpet3831     TRUE 0.522 93.000 0.219 1.000 N NA
 3492934 3492935 Bpet3831 Bpet3832     FALSE 0.228 97.000 0.000 0.078 N NA
 3492935 3492936 Bpet3832 Bpet3833     TRUE 0.978 -10.000 0.000 0.062 Y NA
 3492936 3492937 Bpet3833 Bpet3834     FALSE 0.003 657.000 0.000 1.000   NA
 3492937 3492938 Bpet3834 Bpet3835     TRUE 0.996 -7.000 0.500 0.000   NA
 3492938 3492939 Bpet3835 Bpet3836     TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.062 N NA
 3492940 3492941 Bpet3837 Bpet3838     FALSE 0.081 -94.000 0.000 1.000 N NA
 3492941 3492942 Bpet3838 Bpet3839     FALSE 0.071 154.000 0.000 NA   NA
 3492942 3492943 Bpet3839 Bpet3840     FALSE 0.215 96.000 0.000 NA   NA
 3492943 3492944 Bpet3840 Bpet3841   tpm FALSE 0.294 59.000 0.000 NA   NA
 3492944 3492945 Bpet3841 Bpet3842 tpm   FALSE 0.299 58.000 0.000 NA   NA
 3492945 3492946 Bpet3842 Bpet3843     TRUE 0.782 -25.000 0.000 NA   NA
 3492946 3492947 Bpet3843 Bpet3844     FALSE 0.281 64.000 0.000 NA   NA
 3492949 3492950 Bpet3846 Bpet3847     FALSE 0.202 99.000 0.000 NA   NA
 3492951 3492952 Bpet3848 Bpet3849   pepT FALSE 0.025 193.000 0.000 1.000   NA
 3492952 3492953 Bpet3849 Bpet3850 pepT   FALSE 0.234 88.000 0.000 NA   NA
 3492953 3492954 Bpet3850 Bpet3851     FALSE 0.158 114.000 0.000 NA   NA
 3492955 3492956 Bpet3852 Bpet3853 Ion2   TRUE 0.998 -3.000 0.385 NA Y NA
 3492956 3492957 Bpet3853 Bpet3854     FALSE 0.001 417.000 0.000 NA N NA
 3492958 3492959 Bpet3855 Bpet3856   bug81 TRUE 0.902 26.000 0.250 1.000   NA
 3492959 3492960 Bpet3856 Bpet3857 bug81   TRUE 0.993 -3.000 0.333 1.000   NA
 3492960 3492961 Bpet3857 Bpet3858     FALSE 0.011 310.000 0.000 NA   NA
 3492961 3492962 Bpet3858 Bpet3859     TRUE 0.890 27.000 0.167 NA   NA
 3492964 3492965 Bpet3861 Bpet3862     TRUE 0.974 12.000 0.195 NA   NA
 3492965 3492966 Bpet3862 Bpet3863     TRUE 0.996 -3.000 0.679 NA   NA
 3492966 3492967 Bpet3863 Bpet3864     TRUE 0.990 -7.000 0.717 NA   NA
 3492968 3492969 Bpet3865 Bpet3866 ampC   FALSE 0.305 56.000 0.000 NA   NA
 3492969 3492970 Bpet3866 Bpet3867     TRUE 0.988 -3.000 0.100 NA   NA
 3492971 3492972 Bpet3868 Bpet3869     FALSE 0.005 524.000 0.000 NA   NA
 3492973 3492974 Bpet3870 Bpet3871 serA7   FALSE 0.289 70.000 0.000 0.081 N NA
 3492974 3492975 Bpet3871 Bpet3872     TRUE 0.552 22.000 0.000 1.000   NA
 3492975 3492976 Bpet3872 Bpet3873     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000   NA
 3492976 3492977 Bpet3873 Bpet3874     TRUE 0.998 3.000 0.667 0.057 Y NA
 3492977 3492978 Bpet3874 Bpet3875     TRUE 0.960 82.000 1.000 0.057 Y NA
 3492978 3492979 Bpet3875 Bpet3876   kdgD TRUE 0.573 106.000 0.026 1.000 Y NA
 3492979 3492980 Bpet3876 Bpet3877 kdgD   FALSE 0.232 64.000 0.026 1.000 N NA
 3492982 3492983 Bpet3879 Bpet3880     FALSE 0.020 41.000 0.000 1.000 N NA
 3492985 3492986 Bpet3881 Bpet3882     FALSE 0.482 104.000 0.000 NA Y NA
 3492988 3492989 Bpet3884 Bpet3885     TRUE 0.908 6.000 0.005 NA   NA
 3492990 3492991 Bpet3886 Bpet3887 selD   TRUE 0.989 0.000 0.214 NA   NA
 3492991 3492992 Bpet3887 Bpet3888     FALSE 0.267 75.000 0.000 NA   NA
 3492993 3492994 Bpet3889 Bpet3890     FALSE 0.031 180.000 0.000 1.000   NA
 3492995 3492996 Bpet3891 Bpet3892     TRUE 0.880 19.000 0.000 1.000 Y NA
 3492998 3492999 Bpet3894 Bpet3895     FALSE 0.031 121.000 0.000 NA N NA
 3492999 3493000 Bpet3895 Bpet3896     TRUE 0.669 26.000 0.000 0.044 N NA
 3493000 3493001 Bpet3896 Bpet3897     FALSE 0.481 40.000 0.000 0.044 N NA
 3493001 3493002 Bpet3897 Bpet3898     FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3493002 3493003 Bpet3898 Bpet3899   bug82 FALSE 0.302 39.000 0.000 1.000   NA
 3493003 3493004 Bpet3899 Bpet3900 bug82   FALSE 0.183 82.000 0.000 1.000   NA
 3493005 3493006 Bpet3901 Bpet3902     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493006 3493007 Bpet3902 Bpet3903     TRUE 0.584 25.000 0.000 NA   NA
 3493007 3493008 Bpet3903 Bpet3904     FALSE 0.481 32.000 0.000 NA   NA
 3493008 3493009 Bpet3904 Bpet3905   bug83 FALSE 0.243 50.000 0.000 1.000   NA
 3493009 3493010 Bpet3905 Bpet3906 bug83 bug84 TRUE 0.553 62.000 0.000 0.040   NA
 3493010 3493011 Bpet3906 Bpet3907 bug84   FALSE 0.130 125.000 0.000 NA   NA
 3493012 3493013 Bpet3908 Bpet3909     FALSE 0.014 61.000 0.000 1.000 N NA
 3493013 3493014 Bpet3909 Bpet3910     TRUE 0.965 35.000 1.000 1.000 Y NA
 3493014 3493015 Bpet3910 Bpet3911     TRUE 0.993 5.000 0.059 0.057 Y NA
 3493015 3493016 Bpet3911 Bpet3912     TRUE 0.998 -3.000 0.647 1.000 Y NA
 3493016 3493017 Bpet3912 Bpet3913     TRUE 0.997 -3.000 0.086 0.025 Y NA
 3493017 3493018 Bpet3913 Bpet3914     TRUE 0.766 -15.000 0.000 1.000   NA
 3493018 3493019 Bpet3914 Bpet3915     TRUE 0.752 26.000 0.000 0.081   NA
 3493020 3493021 Bpet3916 Bpet3917   bug85 FALSE 0.490 25.000 0.000 1.000   NA
 3493021 3493022 Bpet3917 Bpet3918 bug85   TRUE 0.553 148.000 0.857 1.000   NA
 3493022 3493023 Bpet3918 Bpet3919     FALSE 0.011 87.000 0.000 1.000 N NA
 3493023 3493024 Bpet3919 Bpet3920     FALSE 0.002 162.000 0.000 1.000 N NA
 3493026 3493027 Bpet3922 Bpet3923   bug86 FALSE 0.302 39.000 0.000 1.000   NA
 3493027 3493028 Bpet3923 Bpet3924 bug86   FALSE 0.073 139.000 0.000 1.000   NA
 3493028 3493029 Bpet3924 Bpet3925     FALSE 0.172 89.000 0.000 1.000   NA
 3493029 3493030 Bpet3925 Bpet3926     FALSE 0.022 226.000 0.000 0.093 N NA
 3493031 3493032 Bpet3927 Bpet3928     FALSE 0.044 161.000 0.000 1.000   NA
 3493034 3493035 Bpet3930 Bpet3931   groES FALSE 0.045 248.000 0.000 0.072   NA
 3493035 3493036 Bpet3931 Bpet3932 groES groEL TRUE 0.986 34.000 0.750 0.004 Y NA
 3493036 3493037 Bpet3932 Bpet3933 groEL   FALSE 0.380 135.000 0.125 1.000   NA
 3493038 3493039 Bpet3934 Bpet3935 yagR yagS TRUE 0.997 12.000 0.333 0.000 Y NA
 3493039 3493040 Bpet3935 Bpet3936 yagS yagT TRUE 0.982 6.000 0.000 0.062 Y NA
 3493040 3493041 Bpet3936 Bpet3937 yagT   TRUE 0.558 67.000 0.000 1.000 Y NA
 3493041 3493042 Bpet3937 Bpet3938     FALSE 0.016 51.000 0.000 1.000 N NA
 3493042 3493043 Bpet3938 Bpet3939   tnp23 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.076 Y NA
 3493043 3493044 Bpet3939 Bpet3940 tnp23   FALSE 0.002 177.000 0.000 1.000 N NA
 3493044 3493045 Bpet3940 Bpet3941     TRUE 0.988 5.000 0.429 0.081 N NA
 3493045 3493046 Bpet3941 Bpet3942     FALSE 0.014 63.000 0.000 1.000 N NA
 3493046 3493047 Bpet3942 Bpet3943     FALSE 0.090 17.000 0.000 1.000 N NA
 3493047 3493048 Bpet3943 Bpet3944     TRUE 0.786 44.000 0.000 0.081 Y NA
 3493048 3493049 Bpet3944 Bpet3945     FALSE 0.015 57.000 0.000 1.000 N NA
 3493049 3493050 Bpet3945 Bpet3946     TRUE 0.989 18.000 0.824 NA Y NA
 3493050 3493051 Bpet3946 Bpet3947     TRUE 0.874 60.000 0.176 NA Y NA
 3493051 3493052 Bpet3947 Bpet3948   gutB FALSE 0.014 68.000 0.000 1.000 N NA
 3493052 3493053 Bpet3948 Bpet3949 gutB   FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3493054 3493055 Bpet3950 Bpet3951 dgkA ndh FALSE 0.012 716.000 0.200 1.000 N NA
 3493055 3493056 Bpet3951 Bpet3952 ndh pyrF TRUE 0.631 11.000 0.007 1.000 N NA
 3493057 3493058 Bpet3953 Bpet3954   pgpA TRUE 0.990 -3.000 0.141 NA   NA
 3493058 3493059 Bpet3954 Bpet3955 pgpA thiL TRUE 0.687 7.000 0.008 1.000 N NA
 3493059 3493060 Bpet3955 Bpet3956 thiL nusB FALSE 0.113 42.000 0.004 1.000 N NA
 3493060 3493061 Bpet3956 Bpet3957 nusB ribH TRUE 0.700 53.000 0.347 1.000 N NA
 3493061 3493062 Bpet3957 Bpet3958 ribH ribB2 TRUE 0.998 -3.000 0.051 0.001 Y NA
 3493062 3493063 Bpet3958 Bpet3959 ribB2   FALSE 0.005 127.000 0.000 1.000 N NA
 3493063 3493064 Bpet3959 Bpet3960     FALSE 0.081 54.000 0.000 NA N NA
 3493064 3493065 Bpet3960 Bpet3961     TRUE 0.604 38.000 0.077 NA N NA
 3493065 3493066 Bpet3961 Bpet3962     TRUE 0.998 -3.000 0.192 0.062 Y NA
 3493066 3493067 Bpet3962 Bpet3963   bug87 TRUE 0.909 26.000 0.286 1.000   NA
 3493068 3493069 Bpet3964 Bpet3965     TRUE 0.957 -3.000 0.012 1.000   NA
 3493069 3493070 Bpet3965 Bpet3966     FALSE 0.065 166.000 0.043 1.000 N NA
 3493070 3493071 Bpet3966 Bpet3967     TRUE 0.999 4.000 0.667 0.001 Y NA
 3493071 3493072 Bpet3967 Bpet3968     TRUE 0.998 -12.000 0.667 0.001 Y NA
 3493072 3493073 Bpet3968 Bpet3969     TRUE 0.999 -3.000 0.915 0.000 Y NA
 3493073 3493074 Bpet3969 Bpet3970     FALSE 0.007 316.000 0.000 1.000   NA
 3493076 3493077 Bpet3972 Bpet3973   coaD TRUE 0.688 59.000 0.367 1.000 N NA
 3493077 3493078 Bpet3973 Bpet3974 coaD fdx3 TRUE 0.616 58.000 0.088 1.000   NA
 3493078 3493079 Bpet3974 Bpet3975 fdx3   TRUE 0.961 -3.000 0.015 1.000   NA
 3493080 3493081 Bpet3976 Bpet3977     TRUE 0.969 -3.000 0.015 NA   NA
 3493082 3493083 Bpet3978 Bpet3979 add   FALSE 0.001 194.000 0.000 1.000 N NA
 3493085 3493086 Bpet3981 Bpet3982     TRUE 0.877 24.000 0.223 NA N NA
 3493088 3493089 Bpet3984 Bpet3985     FALSE 0.218 60.000 0.000 1.000   NA
 3493089 3493090 Bpet3985 Bpet3986     TRUE 0.845 -127.000 0.000 0.076   NA
 3493091 3493092 Bpet3987 Bpet3988     TRUE 0.604 39.000 0.000 0.076   NA
 3493092 3493093 Bpet3988 Bpet3989     FALSE 0.021 338.000 0.000 0.076   NA
 3493093 3493094 Bpet3989 Bpet3990     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3493094 3493095 Bpet3990 Bpet3991   hsdM TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493095 3493096 Bpet3991 Bpetpseudo_13 hsdM   TRUE 0.965 26.000 0.564 0.076   NA
 3493097 3493098 Bpet3992 Bpet3993 tnp24   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.076 Y NA
 3493099 3493100 Bpetpseudo_14 Bpet3994 hsdR   FALSE 0.007 112.000 0.000 1.000 N NA
 3493100 3493101 Bpet3994 Bpet3995     FALSE 0.006 340.000 0.000 1.000   NA
 3493101 3493102 Bpet3995 Bpet3996     FALSE 0.005 497.000 0.004 1.000   NA
 3493102 3493103 Bpet3996 Bpet3997     FALSE 0.037 217.000 0.000 0.055 N NA
 3493105 3493106 Bpet3999 Bpet4000   pth TRUE 0.900 6.000 0.003 NA   NA
 3493106 3493107 Bpet4000 Bpet4001 pth rplY TRUE 0.960 59.000 0.496 0.013 Y NA
 3493107 3493108 Bpet4001 Bpet4002 rplY prsA FALSE 0.251 135.000 0.122 1.000 N NA
 3493108 3493109 Bpet4002 Bpettrna_43 prsA b_petrii_trna_43 FALSE 0.121 131.000 0.000 NA   NA
 3493109 3493110 Bpettrna_43 Bpet4003 b_petrii_trna_43 ispE TRUE 0.914 2.000 0.000 NA   NA
 3493110 3493111 Bpet4003 Bpet4004 ispE lolB TRUE 0.946 10.000 0.157 1.000 N NA
 3493111 3493112 Bpet4004 Bpet4005 lolB   TRUE 0.972 0.000 0.139 1.000 N NA
 3493113 3493114 Bpet4006 Bpet4007 fpg   FALSE 0.005 474.000 0.003 1.000   NA
 3493114 3493115 Bpet4007 Bpet4008     TRUE 0.649 103.000 0.297 1.000   NA
 3493115 3493116 Bpet4008 Bpet4009     TRUE 0.983 14.000 0.681 NA   NA
 3493118 3493119 Bpet4011 Bpet4012   bug88 TRUE 0.943 19.000 0.273 1.000   NA
 3493119 3493120 Bpet4012 Bpet4013 bug88   TRUE 0.869 23.000 0.073 NA   NA
 3493120 3493121 Bpet4013 Bpet4014     TRUE 0.680 31.000 0.073 NA N NA
 3493123 3493124 Bpet4016 Bpet4017 hmgA fahA TRUE 0.989 8.000 0.188 1.000 Y NA
 3493125 3493126 Bpet4018 Bpet4019     TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 3493126 3493127 Bpet4019 Bpet4020     TRUE 0.801 35.000 0.333 1.000 N NA
 3493128 3493129 Bpet4021 Bpet4022 pgm pgi TRUE 0.921 19.000 0.017 1.000 Y NA
 3493130 3493131 Bpet4023 Bpet4024 wbpU wbpT TRUE 0.998 -3.000 0.089 0.014 Y NA
 3493131 3493132 Bpet4024 Bpet4025 wbpT   TRUE 0.987 -39.000 0.087 0.014 Y NA
 3493132 3493133 Bpet4025 Bpet4026   wbpS TRUE 0.948 -3.000 0.042 1.000 N NA
 3493133 3493134 Bpet4026 Bpet4027 wbpS   TRUE 0.580 27.000 0.042 1.000 N NA
 3493134 3493135 Bpet4027 Bpet4028     TRUE 0.993 0.000 0.600 1.000   NA
 3493135 3493136 Bpet4028 Bpet4029   wbpP TRUE 0.723 23.000 0.018 1.000   NA
 3493136 3493137 Bpet4029 Bpet4030 wbpP wbpO TRUE 0.989 10.000 0.212 1.000 Y NA
 3493137 3493138 Bpet4030 Bpet4031 wbpO wecA TRUE 0.513 107.000 0.012 1.000 Y NA
 3493138 3493139 Bpet4031 Bpet4032 wecA   FALSE 0.000 740.000 0.000 1.000 N NA
 3493140 3493141 Bpet4033 Bpet4034   thyA FALSE 0.143 40.000 0.006 1.000 N NA
 3493141 3493142 Bpet4034 Bpet4035 thyA folA TRUE 0.978 -3.000 0.134 1.000 N NA
 3493144 3493145 Bpet4037 Bpet4038   mmsA2 TRUE 0.972 6.000 0.360 1.000 N NA
 3493145 3493146 Bpet4038 Bpet4039 mmsA2   FALSE 0.462 110.000 0.080 NA   NA
 3493146 3493147 Bpet4039 Bpet4040     TRUE 0.781 81.000 0.400 NA   NA
 3493147 3493148 Bpet4040 Bpet4041     TRUE 0.994 19.000 1.000 0.057 Y NA
 3493148 3493149 Bpet4041 Bpet4042     TRUE 0.999 3.000 1.000 0.057 Y NA
 3493149 3493150 Bpet4042 Bpet4043     TRUE 0.990 5.000 0.800 1.000   NA
 3493150 3493151 Bpet4043 Bpet4044     TRUE 0.818 77.000 0.750 1.000   NA
 3493151 3493152 Bpet4044 Bpet4045     FALSE 0.474 155.000 0.500 NA   NA
 3493152 3493153 Bpet4045 Bpet4046   cysG2 FALSE 0.076 151.000 0.000 NA   NA
 3493153 3493154 Bpet4046 Bpet4047 cysG2   FALSE 0.028 35.000 0.000 1.000 N NA
 3493155 3493156 Bpet4048 Bpet4049 norD norB TRUE 0.862 121.000 0.118 0.001 Y NA
 3493156 3493157 Bpet4049 Bpet4050 norB norC TRUE 0.997 4.000 0.794 0.001   NA
 3493157 3493158 Bpet4050 Bpet4051 norC   FALSE 0.168 110.000 0.000 NA   NA
 3493158 3493159 Bpet4051 Bpet4052   norE TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493159 3493160 Bpet4052 Bpet4053 norE norQ TRUE 0.866 44.000 0.071 0.001   NA
 3493161 3493162 Bpet4054 Bpet4055 nirS nirT TRUE 0.909 58.000 0.070 0.010 Y NA
 3493162 3493163 Bpet4055 Bpet4056 nirT nirB TRUE 0.734 34.000 0.070 1.000   NA
 3493163 3493164 Bpet4056 Bpet4057 nirB nirC TRUE 0.653 17.000 0.000 1.000   NA
 3493164 3493165 Bpet4057 Bpet4058 nirC nirF TRUE 0.997 -3.000 0.372 0.010   NA
 3493165 3493166 Bpet4058 Bpet4059 nirF nirD TRUE 0.946 -16.000 0.070 NA   NA
 3493166 3493167 Bpet4059 Bpet4060 nirD nirL TRUE 0.997 -3.000 0.333 NA Y NA
 3493167 3493168 Bpet4060 Bpet4061 nirL nirG TRUE 0.993 -7.000 0.241 NA Y NA
 3493168 3493169 Bpet4061 Bpet4062 nirG nirH TRUE 0.990 -25.000 0.483 NA Y NA
 3493169 3493170 Bpet4062 Bpet4063 nirH nirJ TRUE 0.589 122.000 0.391 1.000   NA
 3493170 3493171 Bpet4063 Bpet4064 nirJ nirE TRUE 0.900 25.000 0.217 1.000   NA
 3493171 3493172 Bpet4064 Bpet4065 nirE nirN TRUE 0.967 -9.000 0.125 1.000   NA
 3493172 3493173 Bpet4065 Bpet4066 nirN ccmA TRUE 0.789 11.000 0.000 1.000   NA
 3493173 3493174 Bpet4066 Bpet4067 ccmA ccmB TRUE 0.998 -3.000 0.074 0.003 Y NA
 3493174 3493175 Bpet4067 Bpet4068 ccmB ccmC TRUE 0.943 39.000 0.051 0.001 Y NA
 3493175 3493176 Bpet4068 Bpet4069 ccmC ccmE TRUE 0.578 173.000 0.067 0.003 Y NA
 3493176 3493177 Bpet4069 Bpet4070 ccmE ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.211 0.003 Y NA
 3493177 3493178 Bpet4070 Bpet4071 ccmF ccmG TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.003 Y NA
 3493178 3493179 Bpet4071 Bpet4072 ccmG ccmH TRUE 0.997 -3.000 0.196 NA Y NA
 3493179 3493180 Bpet4072 Bpet4073 ccmH cycH2 TRUE 0.995 -3.000 0.087 NA Y NA
 3493181 3493182 Bpet4074 Bpet4075 gcvP gcvH TRUE 0.870 65.000 0.249 1.000 Y NA
 3493182 3493183 Bpet4075 Bpet4076 gcvH gcvT TRUE 0.981 34.000 0.317 0.001 Y NA
 3493184 3493185 Bpet4077 Bpet4078 napF napD TRUE 0.984 -3.000 0.070 NA   NA
 3493185 3493186 Bpet4078 Bpet4079 napD napA TRUE 0.978 -9.000 0.500 NA N NA
 3493186 3493187 Bpet4079 Bpet4080 napA napG TRUE 0.866 36.000 0.081 0.061   NA
 3493187 3493188 Bpet4080 Bpet4081 napG napH TRUE 0.998 -3.000 0.795 0.010   NA
 3493188 3493189 Bpet4081 Bpet4082 napH napB TRUE 0.997 -3.000 0.316 NA Y NA
 3493189 3493190 Bpet4082 Bpet4083 napB napC TRUE 0.976 14.000 0.061 NA Y NA
 3493191 3493192 Bpet4084 Bpet4085     TRUE 0.861 98.000 0.464 1.000 Y NA
 3493192 3493193 Bpet4085 Bpet4086     FALSE 0.189 107.000 0.004 1.000   NA
 3493193 3493194 Bpet4086 Bpet4087   adi TRUE 0.543 30.000 0.007 1.000   NA
 3493194 3493195 Bpet4087 Bpet4088 adi   FALSE 0.123 176.000 0.035 NA   NA
 3493196 3493197 Bpet4089 Bpet4090     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3493198 3493199 Bpet4091 Bpet4092 dcd   FALSE 0.357 85.000 0.010 NA   NA
 3493199 3493200 Bpet4092 Bpet4093     TRUE 0.995 -3.000 0.575 NA   NA
 3493200 3493201 Bpet4093 Bpet4094   mrp1 TRUE 0.767 4.000 0.010 1.000 N NA
 3493202 3493203 Bpet4095 Bpet4096   metG FALSE 0.211 146.000 0.036 NA   NA
 3493204 3493205 Bpet4097 Bpet4098     FALSE 0.375 73.000 0.008 NA   NA
 3493207 3493208 Bpet4100 Bpet4101     FALSE 0.481 32.000 0.000 NA   NA
 3493208 3493209 Bpet4101 Bpet4102     TRUE 0.884 43.000 0.667 NA   NA
 3493209 3493210 Bpet4102 Bpet4103     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3493210 3493211 Bpet4103 Bpet4104     TRUE 0.901 20.000 0.083 NA   NA
 3493211 3493212 Bpet4104 Bpet4105     TRUE 0.839 59.000 0.542 NA   NA
 3493214 3493215 Bpet4107 Bpet4108     TRUE 0.794 34.000 0.087 NA   NA
 3493215 3493216 Bpet4108 Bpet4109     TRUE 0.917 32.000 0.500 NA   NA
 3493216 3493217 Bpet4109 Bpet4110     TRUE 0.986 -3.000 0.087 NA   NA
 3493217 3493218 Bpet4110 Bpet4111     TRUE 0.977 3.000 0.087 NA   NA
 3493218 3493219 Bpet4111 Bpet4112     TRUE 0.741 46.000 0.125 NA   NA
 3493219 3493220 Bpet4112 Bpet4113     TRUE 0.990 0.000 0.244 NA   NA
 3493220 3493221 Bpet4113 Bpet4114     TRUE 0.988 0.000 0.178 NA   NA
 3493221 3493222 Bpet4114 Bpet4115     TRUE 0.659 109.000 0.300 NA   NA
 3493222 3493223 Bpet4115 Bpet4116     TRUE 0.718 55.000 0.125 NA   NA
 3493223 3493224 Bpet4116 Bpet4117     TRUE 0.973 19.000 0.917 NA   NA
 3493224 3493225 Bpet4117 Bpet4118     TRUE 0.849 45.000 0.419 NA   NA
 3493226 3493227 Bpet4119 Bpet4120     TRUE 0.782 -25.000 0.000 NA   NA
 3493229 3493230 Bpet4122 Bpet4123     FALSE 0.234 88.000 0.000 NA   NA
 3493230 3493231 Bpet4123 Bpet4124   alkA FALSE 0.056 88.000 0.000 NA N NA
 3493232 3493233 Bpet4125 Bpet4126 iorB2 iorA2 TRUE 0.999 -3.000 0.200 0.001 Y NA
 3493233 3493234 Bpet4126 Bpet4127 iorA2   FALSE 0.001 213.000 0.000 1.000 N NA
 3493234 3493235 Bpet4127 Bpet4128     TRUE 0.972 -3.000 0.020 NA   NA
 3493235 3493236 Bpet4128 Bpet4129   fimD2 TRUE 0.691 19.000 0.000 NA   NA
 3493236 3493237 Bpet4129 Bpet4130 fimD2 fimC2 TRUE 0.785 -12.000 0.000 1.000   NA
 3493237 3493238 Bpet4130 Bpet4131 fimC2 fimB2 TRUE 0.933 48.000 0.667 1.000 Y NA
 3493238 3493239 Bpet4131 Bpet4132 fimB2 fimA2 FALSE 0.029 337.000 0.000 1.000 Y NA
 3493239 3493240 Bpet4132 Bpet4133 fimA2   TRUE 0.925 20.000 0.133 NA   NA
 3493242 3493243 Bpet4135 Bpet4136     FALSE 0.178 85.000 0.000 1.000   NA
 3493245 3493246 Bpet4138 Bpet4139     TRUE 0.833 24.000 0.000 1.000 Y NA
 3493246 3493247 Bpet4139 Bpet4140     TRUE 0.989 3.000 0.000 0.009 Y NA
 3493247 3493248 Bpet4140 Bpet4141     TRUE 0.801 48.000 0.000 0.056 Y NA
 3493248 3493249 Bpet4141 Bpet4142     FALSE 0.244 23.000 0.000 NA N NA
 3493249 3493250 Bpet4142 Bpet4143   metC2 TRUE 0.759 -3.000 0.000 NA N NA
 3493250 3493251 Bpet4143 Bpet4144 metC2   TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3493255 3493256 Bpet4148 Bpet4149   bug89 TRUE 0.814 7.000 0.000 1.000   NA
 3493256 3493257 Bpet4149 Bpet4150 bug89   FALSE 0.504 30.000 0.000 NA   NA
 3493257 3493258 Bpet4150 Bpet4151     TRUE 0.691 19.000 0.000 NA   NA
 3493258 3493259 Bpet4151 Bpet4152     TRUE 0.978 3.000 0.095 NA   NA
 3493260 3493261 Bpet4153 Bpet4154     TRUE 0.604 24.000 0.000 NA   NA
 3493262 3493263 Bpet4155 Bpet4156     FALSE 0.202 99.000 0.000 NA   NA
 3493265 3493266 Bpet4158 Bpet4159     TRUE 0.705 108.000 0.435 NA   NA
 3493266 3493267 Bpet4159 Bpet4160     FALSE 0.032 201.000 0.000 NA   NA
 3493267 3493268 Bpet4160 Bpet4161     TRUE 0.996 -3.000 0.571 0.043 N NA
 3493268 3493269 Bpet4161 Bpet4162   bug90 TRUE 0.917 32.000 0.667 1.000   NA
 3493273 3493274 Bpet4166 Bpet4167 bug91   FALSE 0.298 101.000 0.022 1.000   NA
 3493274 3493275 Bpet4167 Bpet4168   dapA4 TRUE 0.559 52.000 0.033 0.080 N NA
 3493275 3493276 Bpet4168 Bpet4169 dapA4 metC3 TRUE 0.556 69.000 0.000 1.000 Y NA
 3493277 3493278 Bpet4170 Bpet4171 pntA2 pntB2 TRUE 0.990 29.000 0.745 0.001 Y NA
 3493282 3493283 Bpet4175 Bpet4176     TRUE 0.950 13.000 0.000 NA Y NA
 3493283 3493284 Bpet4176 Bpet4177     TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 3493284 3493285 Bpet4177 Bpet4178     TRUE 0.983 0.000 0.091 NA   NA
 3493285 3493286 Bpet4178 Bpet4179     FALSE 0.063 161.000 0.000 NA   NA
 3493286 3493287 Bpet4179 Bpet4180   lpsJ2 FALSE 0.003 148.000 0.000 1.000 N NA
 3493287 3493288 Bpet4180 Bpet4181 lpsJ2 fadA9 TRUE 0.626 45.000 0.000 1.000 Y NA
 3493289 3493290 Bpet4182 Bpet4183     TRUE 0.770 -30.000 0.000 NA   NA
 3493290 3493291 Bpet4183 Bpet4184     FALSE 0.004 564.000 0.000 NA   NA
 3493291 3493292 Bpet4184 Bpet4185     TRUE 0.976 2.000 0.000 0.006   NA
 3493292 3493293 Bpet4185 Bpet4186     TRUE 0.573 21.000 0.000 1.000   NA
 3493293 3493294 Bpet4186 Bpet4187   cusC2 FALSE 0.181 8.000 0.000 1.000 N NA
 3493294 3493295 Bpet4187 Bpet4188 cusC2   TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.056 N NA
 3493295 3493296 Bpet4188 Bpet4189     FALSE 0.170 10.000 0.000 1.000 N NA
 3493297 3493298 Bpet4190 Bpet4191     TRUE 0.814 58.000 0.000 0.006 Y NA
 3493299 3493300 Bpet4192 Bpet4193     FALSE 0.279 67.000 0.000 NA   NA
 3493300 3493301 Bpet4193 Bpet4194     FALSE 0.027 186.000 0.000 1.000   NA
 3493301 3493302 Bpet4194 Bpet4195     TRUE 0.908 36.000 0.800 1.000   NA
 3493302 3493303 Bpet4195 Bpet4196     TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.043   NA
 3493304 3493305 Bpet4197 Bpet4198     FALSE 0.015 58.000 0.000 1.000 N NA
 3493306 3493307 Bpet4199 Bpet4200     FALSE 0.211 64.000 0.000 1.000   NA
 3493307 3493308 Bpet4200 Bpetpseudo_15     FALSE 0.251 80.000 0.000 NA   NA
 3493308 3493309 Bpetpseudo_15 Bpet4203     TRUE 0.910 -214.000 0.091 NA   NA
 3493309 3493310 Bpet4203 Bpet4204     TRUE 0.992 5.000 1.000 NA   NA
 3493310 3493311 Bpet4204 Bpet4205     TRUE 0.811 -18.000 0.000 NA   NA
 3493311 3493312 Bpet4205 Bpet4206     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493312 3493313 Bpet4206 Bpetpseudo_16   fhuC` FALSE 0.029 208.000 0.000 NA   NA
 3493313 3493314 Bpetpseudo_16 Bpetpseudo_17 fhuC` fhuC` TRUE 0.770 -30.000 0.000 NA   NA
 3493314 3493315 Bpetpseudo_17 Bpet4207 fhuC`   TRUE 0.992 3.000 0.031 0.071 Y NA
 3493315 3493316 Bpet4207 Bpet4208   fhuB TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3493316 3493317 Bpet4208 Bpet4209 fhuB fhuD TRUE 0.969 3.000 0.000 1.000 Y NA
 3493317 3493318 Bpet4209 Bpet4210 fhuD   TRUE 0.920 15.000 0.000 1.000 Y NA
 3493320 3493321 Bpet4212 Bpet4213   ssb5 FALSE 0.028 210.000 0.000 NA   NA
 3493321 3493322 Bpet4213 Bpet4214 ssb5   FALSE 0.003 598.000 0.000 1.000   NA
 3493322 3493323 Bpet4214 Bpet4215     TRUE 0.992 -7.000 1.000 NA   NA
 3493323 3493324 Bpet4215 Bpet4216   parA4 TRUE 0.982 -16.000 0.500 NA   NA
 3493325 3493326 Bpet4217 Bpet4218     FALSE 0.197 100.000 0.000 NA   NA
 3493327 3493328 Bpet4219 Bpet4220     FALSE 0.002 162.000 0.000 1.000 N NA
 3493330 3493331 Bpet4222 Bpet4223   rob FALSE 0.000 526.000 0.000 1.000 N NA
 3493331 3493332 Bpet4223 Bpet4224 rob   FALSE 0.008 353.000 0.000 NA   NA
 3493334 3493335 Bpet4226 Bpet4227     FALSE 9.872730042543e-05 1331.000 0.000 1.000 N NA
 3493335 3493336 Bpet4227 Bpet4228     FALSE 0.010 94.000 0.000 1.000 N NA
 3493336 3493337 Bpet4228 Bpet4229   mexD TRUE 0.969 18.000 0.529 NA   NA
 3493337 3493338 Bpet4229 Bpet4230 mexD   FALSE 0.128 126.000 0.000 NA   NA
 3493341 3493342 Bpet4233 Bpet4234     TRUE 0.970 13.000 0.024 NA Y NA
 3493342 3493343 Bpet4234 Bpet4235     TRUE 0.995 -3.000 0.565 NA   NA
 3493343 3493344 Bpet4235 Bpet4236   mod FALSE 0.359 42.000 0.000 NA   NA
 3493344 3493345 Bpet4236 Bpet4237 mod res TRUE 0.859 12.000 0.000 0.074 N NA
 3493345 3493346 Bpet4237 Bpet4238 res   FALSE 0.442 81.000 0.026 NA   NA
 3493346 3493347 Bpet4238 Bpet4239     TRUE 0.967 0.000 0.026 NA   NA
 3493347 3493348 Bpet4239 Bpet4240     TRUE 0.733 17.000 0.000 NA   NA
 3493349 3493350 Bpet4241 Bpet4242     FALSE 0.027 519.000 0.042 0.074   NA
 3493351 3493352 Bpet4243 Bpet4244     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493352 3493353 Bpet4244 Bpet4245     FALSE 0.025 220.000 0.000 NA   NA
 3493353 3493354 Bpet4245 Bpet4246     TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.074   NA
 3493354 3493355 Bpet4246 Bpet4247     TRUE 0.988 -3.000 0.105 NA   NA
 3493355 3493356 Bpet4247 Bpet4248     TRUE 0.992 -3.000 0.222 NA   NA
 3493356 3493357 Bpet4248 Bpet4249     TRUE 0.955 -7.000 0.065 1.000   NA
 3493357 3493358 Bpet4249 Bpet4250     TRUE 0.985 -3.000 0.097 1.000   NA
 3493358 3493359 Bpet4250 Bpet4251     TRUE 0.992 -6.000 0.750 NA   NA
 3493359 3493360 Bpet4251 Bpet4252     TRUE 0.904 3.000 0.000 NA   NA
 3493360 3493361 Bpet4252 Bpet4253     FALSE 0.003 846.000 0.000 NA   NA
 3493363 3493364 Bpet4255 Bpet4256     TRUE 0.995 0.000 0.750 NA   NA
 3493364 3493365 Bpet4256 Bpet4257     TRUE 0.911 28.000 0.286 NA   NA
 3493366 3493367 Bpet4258 Bpet4259     TRUE 0.978 16.000 0.667 NA   NA
 3493367 3493368 Bpet4259 Bpet4260     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 3493368 3493369 Bpet4260 Bpet4261     TRUE 0.987 11.000 0.667 NA   NA
 3493369 3493370 Bpet4261 Bpet4262     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3493370 3493371 Bpet4262 Bpet4263   radC5 TRUE 0.513 165.000 1.000 NA   NA
 3493371 3493372 Bpet4263 Bpet4264 radC5   FALSE 0.295 179.000 0.667 NA N NA
 3493372 3493373 Bpet4264 Bpet4265     TRUE 0.902 43.000 1.000 NA   NA
 3493373 3493374 Bpet4265 Bpet4266     TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 3493374 3493375 Bpet4266 Bpet4267     TRUE 0.965 -19.000 0.182 NA   NA
 3493375 3493376 Bpet4267 Bpet4268     TRUE 0.990 -10.000 1.000 NA   NA
 3493376 3493377 Bpet4268 Bpet4269     TRUE 0.996 -3.000 0.955 NA   NA
 3493377 3493378 Bpet4269 Bpet4270     TRUE 0.996 -3.000 0.955 NA   NA
 3493378 3493379 Bpet4270 Bpet4271     TRUE 0.950 14.000 0.091 NA   NA
 3493379 3493380 Bpet4271 Bpet4272     TRUE 0.979 17.000 1.000 NA   NA
 3493380 3493381 Bpet4272 Bpet4273     TRUE 0.971 -3.000 0.018 NA   NA
 3493381 3493382 Bpet4273 Bpet4274     FALSE 0.344 99.000 0.018 NA   NA
 3493382 3493383 Bpet4274 Bpet4275     TRUE 0.990 -3.000 0.136 NA   NA
 3493383 3493384 Bpet4275 Bpet4276     TRUE 0.910 -214.000 0.091 NA   NA
 3493384 3493385 Bpet4276 Bpet4277     TRUE 0.992 5.000 1.000 NA   NA
 3493385 3493386 Bpet4277 Bpet4278     TRUE 0.987 -3.000 0.091 NA   NA
 3493386 3493387 Bpet4278 Bpet4279     TRUE 0.986 -18.000 1.000 NA   NA
 3493387 3493388 Bpet4279 Bpet4280     TRUE 0.984 15.000 1.000 NA   NA
 3493388 3493389 Bpet4280 Bpet4281     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 3493389 3493390 Bpet4281 Bpet4282     FALSE 0.505 143.000 0.333 NA   NA
 3493390 3493391 Bpet4282 Bpet4283     TRUE 0.957 66.000 0.667 0.070 Y NA
 3493391 3493392 Bpet4283 Bpet4284     FALSE 0.123 173.000 0.000 0.070   NA
 3493392 3493393 Bpet4284 Bpet4285   ltrA1 FALSE 0.069 141.000 0.000 1.000   NA
 3493393 3493394 Bpet4285 Bpet4286 ltrA1   FALSE 0.004 583.000 0.000 NA   NA
 3493394 3493395 Bpet4286 Bpet4287     FALSE 0.111 136.000 0.000 NA   NA
 3493395 3493396 Bpet4287 Bpet4288     FALSE 0.276 70.000 0.000 NA   NA
 3493396 3493397 Bpet4288 Bpet4289     FALSE 0.192 103.000 0.000 NA   NA
 3493397 3493398 Bpet4289 Bpet4290     FALSE 0.086 131.000 0.000 1.000   NA
 3493399 3493400 Bpet4291 Bpet4292 tnp25   TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.074 Y NA
 3493401 3493402 Bpet4293 Bpet4294     FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 3493402 3493403 Bpet4294 Bpet4295     FALSE 0.004 602.000 0.000 NA   NA
 3493403 3493404 Bpet4295 Bpet4296     TRUE 0.796 95.000 0.667 NA   NA
 3493404 3493405 Bpet4296 Bpet4297     TRUE 0.822 96.000 1.000 NA   NA
 3493405 3493406 Bpet4297 Bpet4298     TRUE 0.581 151.000 1.000 NA   NA
 3493406 3493407 Bpet4298 Bpet4299     FALSE 0.007 379.000 0.000 NA   NA
 3493407 3493408 Bpet4299 Bpet4300     FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   NA
 3493408 3493409 Bpet4300 Bpet4301     TRUE 0.770 95.000 0.500 NA   NA
 3493409 3493410 Bpet4301 Bpet4302     FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 3493410 3493411 Bpet4302 Bpet4303     TRUE 0.968 22.000 1.000 NA   NA
 3493411 3493412 Bpet4303 Bpet4304     FALSE 0.010 329.000 0.000 NA   NA
 3493412 3493413 Bpet4304 Bpet4305   topB4 FALSE 0.005 524.000 0.000 NA   NA
 3493413 3493414 Bpet4305 Bpet4306 topB4 ssb6 FALSE 0.048 270.000 0.000 1.000 Y NA
 3493414 3493415 Bpet4306 Bpet4307 ssb6   TRUE 0.862 74.000 1.000 NA   NA
 3493415 3493416 Bpet4307 Bpet4308     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 3493416 3493417 Bpet4308 Bpet4309     FALSE 0.010 318.000 0.000 NA   NA
 3493417 3493418 Bpet4309 Bpet4310     TRUE 0.989 4.000 0.400 NA   NA
 3493418 3493419 Bpet4310 Bpet4311     TRUE 0.981 16.000 1.000 NA   NA
 3493419 3493420 Bpet4311 Bpet4312     TRUE 0.990 -7.000 0.667 NA   NA
 3493420 3493421 Bpet4312 Bpet4313   parA5 TRUE 0.978 -16.000 0.333 NA   NA
 3493421 3493422 Bpet4313 Bpet4314 parA5 alpA2 FALSE 0.452 43.000 0.043 NA N NA
 3493422 3493423 Bpet4314 Bpet4315 alpA2   FALSE 0.467 119.000 0.106 NA   NA
 3493423 3493424 Bpet4315 Bpet4316   intB13 FALSE 0.004 565.000 0.000 NA   NA
 3493424 3493425 Bpet4316 Bpettrna_44 intB13 b_petrii_trna_44 FALSE 0.020 241.000 0.000 NA   NA
 3493425 3493426 Bpettrna_44 Bpet4317 b_petrii_trna_44 bug92 FALSE 0.103 139.000 0.000 NA   NA
 3493426 3493427 Bpet4317 Bpet4318 bug92   TRUE 0.742 65.000 0.269 1.000   NA
 3493427 3493428 Bpet4318 Bpet4319     TRUE 0.996 -3.000 0.577 0.042 N NA
 3493428 3493429 Bpet4319 Bpet4320     FALSE 0.504 118.000 0.450 1.000 N NA
 3493430 3493431 Bpet4321 Bpet4322 trmB   TRUE 0.915 3.000 0.006 1.000   NA
 3493431 3493432 Bpet4322 Bpet4323   thiS TRUE 0.885 -19.000 0.027 1.000   NA
 3493432 3493433 Bpet4323 Bpet4324 thiS   FALSE 0.002 173.000 0.000 1.000 N NA
 3493433 3493434 Bpet4324 Bpet4325     FALSE 0.068 142.000 0.000 1.000   NA
 3493436 3493437 Bpet4327 Bpet4328     TRUE 0.879 2.000 0.000 1.000   NA
 3493437 3493438 Bpet4328 Bpet4329   ampD FALSE 0.205 72.000 0.000 1.000   NA
 3493438 3493439 Bpet4329 Bpet4330 ampD   TRUE 0.665 14.000 0.013 1.000 N NA
 3493441 3493442 Bpet4332 Bpet4333     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3493442 3493443 Bpet4333 Bpetpseudo_18     FALSE 0.267 75.000 0.000 NA   NA
 3493443 3493444 Bpetpseudo_18 Bpet4334     TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 3493444 3493445 Bpet4334 Bpet4335     TRUE 0.830 21.000 0.000 0.074   NA
 3493445 3493446 Bpet4335 Bpetpseudo_19     FALSE 0.214 62.000 0.000 1.000   NA
 3493448 3493449 Bpet4337 Bpet4338 azu nosR FALSE 0.004 144.000 0.000 1.000 N NA
 3493449 3493450 Bpet4338 Bpet4339 nosR nosZ TRUE 0.561 41.000 0.018 0.076 N NA
 3493450 3493451 Bpet4339 Bpet4340 nosZ nosD TRUE 0.987 7.000 0.146 0.000 N NA
 3493451 3493452 Bpet4340 Bpet4341 nosD nosF TRUE 0.993 -3.000 0.963 1.000 N NA
 3493452 3493453 Bpet4341 Bpet4342 nosF nosY TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 3493453 3493454 Bpet4342 Bpet4343 nosY nosL TRUE 0.995 -3.000 0.519 NA   NA
 3493454 3493455 Bpet4343 Bpet4344 nosL nosX TRUE 0.951 17.000 0.464 NA N NA
 3493455 3493456 Bpet4344 Bpettrna_45 nosX b_petrii_trna_45 FALSE 0.284 62.000 0.000 NA   NA
 3493457 3493458 Bpet4345 Bpet4346     TRUE 0.830 21.000 0.000 0.074   NA
 3493460 3493461 Bpet4348 Bpet4349     FALSE 0.157 12.000 0.000 1.000 N NA
 3493462 3493463 Bpet4350 Bpet4351     FALSE 0.397 152.000 0.333 1.000   NA
 3493463 3493464 Bpet4351 Bpet4352     TRUE 0.756 16.000 0.000 NA   NA
 3493464 3493465 Bpet4352 Bpet4353     TRUE 0.791 67.000 0.333 NA   NA
 3493465 3493466 Bpet4353 Bpet4354     TRUE 0.914 2.000 0.000 NA   NA
 3493466 3493467 Bpet4354 Bpet4355     TRUE 0.746 43.000 0.074 0.042 N NA
 3493467 3493468 Bpet4355 Bpet4356     FALSE 0.078 150.000 0.000 NA   NA
 3493469 3493470 Bpet4357 Bpet4358   rbsA FALSE 0.029 182.000 0.000 1.000   NA
 3493470 3493471 Bpet4358 Bpet4359 rbsA rbsB TRUE 0.947 12.000 0.056 NA   NA
 3493471 3493472 Bpet4359 Bpet4360 rbsB rbsC TRUE 0.976 22.000 0.286 NA Y NA
 3493472 3493473 Bpet4360 Bpet4361 rbsC   TRUE 0.620 88.000 0.018 1.000 Y NA
 3493473 3493474 Bpet4361 Bpet4362     FALSE 0.090 127.000 0.000 1.000   NA
 3493474 3493475 Bpet4362 Bpet4363     FALSE 0.122 180.000 0.000 0.050   NA
 3493475 3493476 Bpet4363 Bpet4364     FALSE 0.307 0.000 0.000 1.000 N NA
 3493476 3493477 Bpet4364 Bpet4365     TRUE 0.910 16.000 0.000 1.000 Y NA
 3493478 3493479 Bpet4366 Bpet4367     TRUE 0.783 35.000 0.278 1.000 N NA
 3493479 3493480 Bpet4367 Bpet4368     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3493480 3493481 Bpet4368 Bpet4369   endI FALSE 0.472 33.000 0.000 NA   NA
 3493481 3493482 Bpet4369 Bpet4370 endI   TRUE 0.970 2.000 0.044 NA   NA
 3493482 3493483 Bpet4370 Bpet4371     TRUE 0.781 25.000 0.029 NA   NA
 3493485 3493486 Bpet4373 Bpet4374     TRUE 0.982 14.000 0.636 NA   NA
 3493486 3493487 Bpet4374 Bpet4375     TRUE 0.986 -13.000 0.170 1.000 Y NA
 3493487 3493488 Bpet4375 Bpet4376     TRUE 0.992 15.000 0.117 0.002 Y NA
 3493488 3493489 Bpet4376 Bpet4377     TRUE 0.975 -27.000 0.422 NA   NA
 3493489 3493490 Bpet4377 Bpet4378     TRUE 0.977 -51.000 0.758 NA   NA
 3493490 3493491 Bpet4378 Bpet4379     TRUE 0.953 -19.000 0.103 NA   NA
 3493491 3493492 Bpet4379 Bpet4380     TRUE 0.985 -3.000 0.080 NA   NA
 3493492 3493493 Bpet4380 Bpet4381     TRUE 0.953 -22.000 0.167 1.000   NA
 3493493 3493494 Bpet4381 Bpet4382     TRUE 0.969 -3.000 0.028 1.000   NA
 3493494 3493495 Bpet4382 Bpet4383     TRUE 0.921 -25.000 0.049 NA   NA
 3493497 3493498 Bpet4385 Bpet4386 ner   TRUE 0.737 107.000 0.200 0.073   NA
 3493498 3493499 Bpet4386 Bpet4387   muA TRUE 0.995 -3.000 0.182 0.073   NA
 3493499 3493500 Bpet4387 Bpet4388 muA muB TRUE 0.510 84.000 0.000 0.018   NA
 3493500 3493501 Bpet4388 Bpet4389 muB   FALSE 0.461 34.000 0.000 NA   NA
 3493501 3493502 Bpet4389 Bpet4390     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493502 3493503 Bpet4390 Bpet4391   gp05 TRUE 0.515 29.000 0.000 NA   NA
 3493503 3493504 Bpet4391 Bpet4392 gp05   FALSE 0.005 485.000 0.000 NA   NA
 3493504 3493505 Bpet4392 Bpet4393     TRUE 0.904 3.000 0.000 NA   NA
 3493505 3493506 Bpet4393 Bpet4394   gp16 TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493506 3493507 Bpet4394 Bpet4395 gp16   TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3493507 3493508 Bpet4395 Bpet4396     TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3493508 3493509 Bpet4396 Bpet4397     TRUE 0.992 -7.000 1.000 NA   NA
 3493509 3493510 Bpet4397 Bpet4398     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3493510 3493511 Bpet4398 Bpet4399   gp21 FALSE 0.184 106.000 0.000 NA   NA
 3493511 3493512 Bpet4399 Bpet4400 gp21 gp22 TRUE 0.991 2.000 0.400 NA   NA
 3493512 3493513 Bpet4400 Bpet4401 gp22   TRUE 0.988 -6.000 0.400 NA   NA
 3493513 3493514 Bpet4401 Bpet4402     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3493514 3493515 Bpet4402 Bpet4403     TRUE 0.716 -88.000 0.000 NA   NA
 3493515 3493516 Bpet4403 Bpet4404     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3493516 3493517 Bpet4404 Bpet4405   gp26 TRUE 0.986 4.000 0.250 NA   NA
 3493517 3493518 Bpet4405 Bpet4406 gp26 gp27 TRUE 0.989 2.000 0.273 NA   NA
 3493518 3493519 Bpet4406 Bpet4407 gp27 gp28 TRUE 0.989 3.000 0.308 NA   NA
 3493519 3493520 Bpet4407 Bpet4408 gp28 gp29 TRUE 0.992 1.000 0.385 NA   NA
 3493520 3493521 Bpet4408 Bpet4409 gp29 gpF TRUE 0.987 1.000 0.167 NA   NA
 3493521 3493522 Bpet4409 Bpet4410 gpF gpG TRUE 0.880 5.000 0.000 NA   NA
 3493522 3493523 Bpet4410 Bpet4411 gpG gp32 FALSE 0.016 263.000 0.000 NA   NA
 3493523 3493524 Bpet4411 Bpet4412 gp32   TRUE 0.880 5.000 0.000 NA   NA
 3493524 3493525 Bpet4412 Bpet4413   gp34 TRUE 0.917 25.000 0.231 NA   NA
 3493525 3493526 Bpet4413 Bpet4414 gp34   FALSE 0.281 64.000 0.000 NA   NA
 3493526 3493527 Bpet4414 Bpet4415   gp36 TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493527 3493528 Bpet4415 Bpet4416 gp36 gp37 TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 3493528 3493529 Bpet4416 Bpet4417 gp37   TRUE 0.983 -3.000 0.059 NA   NA
 3493529 3493530 Bpet4417 Bpet4418   gpL TRUE 0.981 0.000 0.080 NA   NA
 3493530 3493531 Bpet4418 Bpet4419 gpL gpM TRUE 0.948 27.000 0.720 NA   NA
 3493531 3493532 Bpet4419 Bpet4420 gpM   TRUE 0.978 4.000 0.111 NA   NA
 3493532 3493533 Bpet4420 Bpet4421     TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3493533 3493534 Bpet4421 Bpet4422     TRUE 0.676 20.000 0.000 NA   NA
 3493534 3493535 Bpet4422 Bpet4423   gpN FALSE 0.021 235.000 0.000 NA   NA
 3493535 3493536 Bpet4423 Bpet4424 gpN gpP TRUE 0.986 -7.000 0.375 NA   NA
 3493536 3493537 Bpet4424 Bpet4425 gpP gp45 TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493537 3493538 Bpet4425 Bpet4426 gp45 gp46 TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3493538 3493539 Bpet4426 Bpet4427 gp46 gp47 TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 3493539 3493540 Bpet4427 Bpet4428 gp47 gp48 TRUE 0.973 -15.000 0.208 NA   NA
 3493540 3493541 Bpet4428 Bpet4429 gp48   TRUE 0.904 3.000 0.000 NA   NA
 3493541 3493542 Bpet4429 Bpet4430     FALSE 0.005 548.000 0.000 NA   NA
 3493542 3493543 Bpet4430 Bpet4431     FALSE 0.014 277.000 0.000 NA   NA
 3493545 3493546 Bpet4433 Bpet4434     TRUE 0.985 6.000 0.329 NA   NA
 3493546 3493547 Bpet4434 Bpet4435     TRUE 0.943 10.000 0.041 NA   NA
 3493547 3493548 Bpet4435 Bpet4436     TRUE 0.988 -3.000 0.110 NA   NA
 3493548 3493549 Bpet4436 Bpet4437     TRUE 0.998 -3.000 0.514 NA Y NA
 3493549 3493550 Bpet4437 Bpet4438     TRUE 0.995 5.000 0.397 NA Y NA
 3493550 3493551 Bpet4438 Bpet4439     TRUE 0.997 0.000 0.486 1.000 Y NA
 3493551 3493552 Bpet4439 Bpet4440     FALSE 0.323 49.000 0.000 NA   NA
 3493552 3493553 Bpet4440 Bpet4441   bug93 FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 3493553 3493554 Bpet4441 Bpet4442 bug93   FALSE 0.260 45.000 0.000 1.000   NA
 3493555 3493556 Bpet4443 Bpet4444     TRUE 0.979 16.000 0.190 1.000 Y NA
 3493556 3493557 Bpet4444 Bpet4445     TRUE 0.996 7.000 0.143 0.008 Y NA
 3493557 3493558 Bpet4445 Bpet4446     TRUE 0.990 24.000 0.750 0.055 Y NA
 3493558 3493559 Bpet4446 Bpet4447   aspC TRUE 0.958 20.000 0.100 1.000 Y NA
 3493559 3493560 Bpet4447 Bpet4448 aspC menG2 TRUE 0.965 7.000 0.200 NA N NA
 3493560 3493561 Bpet4448 Bpet4449 menG2   FALSE 0.003 273.000 0.000 NA N NA
 3493562 3493563 Bpet4450 Bpet4451     FALSE 0.275 2.000 0.000 1.000 N NA
 3493563 3493564 Bpet4451 Bpet4452   bug94 FALSE 0.181 83.000 0.000 1.000   NA
 3493564 3493565 Bpet4452 Bpet4453 bug94   TRUE 0.515 29.000 0.000 NA   NA
 3493567 3493568 Bpet4455 Bpet4456   fecR2 TRUE 0.759 -3.000 0.000 NA N NA
 3493568 3493569 Bpet4456 Bpet4457 fecR2   FALSE 0.063 260.000 0.000 NA Y NA
 3493569 3493570 Bpet4457 Bpet4458     FALSE 0.002 976.000 0.000 1.000   NA
 3493571 3493572 Bpet4459 Bpet4460   bug95 TRUE 0.670 -42.000 0.000 1.000   NA
 3493572 3493573 Bpet4460 Bpet4461 bug95 tauD FALSE 0.210 66.000 0.000 1.000   NA
 3493574 3493575 Bpet4462 Bpet4463   kynU FALSE 0.014 64.000 0.000 1.000 N NA
 3493575 3493576 Bpet4463 Bpet4464 kynU fimA3 FALSE 0.002 172.000 0.000 1.000 N NA
 3493576 3493577 Bpet4464 Bpet4465 fimA3 fimA4 FALSE 0.363 180.000 0.000 0.001 Y NA
 3493577 3493578 Bpet4465 Bpet4466 fimA4 fimB3 FALSE 0.310 131.000 0.000 1.000 Y NA
 3493578 3493579 Bpet4466 Bpet4467 fimB3 fimC3 TRUE 0.776 29.000 0.000 1.000 Y NA
 3493579 3493580 Bpet4467 Bpet4468 fimC3 fimD3 TRUE 0.582 138.000 0.111 1.000 Y NA
 3493580 3493581 Bpet4468 Bpet4469 fimD3 bvgS1 FALSE 0.008 105.000 0.000 1.000 N NA
 3493582 3493583 Bpet4470 Bpet4471   bvgA TRUE 0.987 5.000 0.400 NA   NA
 3493583 3493584 Bpet4471 Bpet4472 bvgA bvgS2 TRUE 0.986 5.000 0.000 0.009 Y NA
 3493584 3493585 Bpet4472 Bpet4473 bvgS2   FALSE 0.049 175.000 0.000 0.089 N NA
 3493586 3493587 Bpet4474 Bpet4475     FALSE 0.339 36.000 0.000 1.000   NA
 3493587 3493588 Bpet4475 Bpet4476   yeaU2 FALSE 0.140 103.000 0.000 1.000   NA
 3493588 3493589 Bpet4476 Bpet4477 yeaU2 bug96 TRUE 0.691 40.000 0.087 1.000   NA
 3493589 3493590 Bpet4477 Bpet4478 bug96   FALSE 0.003 643.000 0.000 1.000   NA
 3493590 3493591 Bpet4478 Bpet4479     TRUE 0.996 0.000 0.083 0.073 Y NA
 3493593 3493594 Bpet4481 Bpet4482     TRUE 0.996 0.000 0.292 1.000 Y NA
 3493596 3493597 Bpet4484 Bpet4485     FALSE 0.205 72.000 0.000 1.000   NA
 3493597 3493598 Bpet4485 Bpet4486     FALSE 0.111 115.000 0.000 1.000   NA
 3493599 3493600 Bpet4487 Bpet4488 lysP   FALSE 0.003 147.000 0.000 1.000 N NA
 3493601 3493602 Bpet4489 Bpet4490     FALSE 0.001 201.000 0.000 1.000 N NA
 3493602 3493603 Bpet4490 Bpet4491     TRUE 0.778 137.000 0.667 1.000 Y NA
 3493603 3493604 Bpet4491 Bpet4492     TRUE 0.998 9.000 0.800 0.055 Y NA
 3493604 3493605 Bpet4492 Bpet4493     TRUE 0.994 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 3493605 3493606 Bpet4493 Bpet4494     TRUE 0.992 -13.000 0.093 0.024 Y NA
 3493606 3493607 Bpet4494 Bpet4495     FALSE 0.003 1263.000 0.000 NA   NA
 3493607 3493608 Bpet4495 Bpet4496     FALSE 0.308 55.000 0.000 NA   NA
 3493608 3493609 Bpet4496 Bpet4497     TRUE 0.856 9.000 0.000 NA   NA
 3493609 3493610 Bpet4497 Bpet4498     FALSE 0.126 127.000 0.000 NA   NA
 3493610 3493611 Bpet4498 Bpet4499     FALSE 0.004 636.000 0.000 NA   NA
 3493611 3493612 Bpet4499 Bpet4500     FALSE 0.235 87.000 0.000 NA   NA
 3493612 3493613 Bpet4500 Bpet4501     FALSE 0.004 675.000 0.000 NA   NA
 3493615 3493616 Bpet4503 Bpet4504     FALSE 0.007 200.000 0.000 NA N NA
 3493617 3493618 Bpet4505 Bpet4506     TRUE 0.553 74.000 0.052 NA   NA
 3493618 3493619 Bpet4506 Bpet4507     TRUE 0.755 28.000 0.034 NA   NA
 3493620 3493621 Bpet4508 Bpet4509     TRUE 0.871 17.000 0.111 1.000 N NA
 3493621 3493622 Bpet4509 Bpet4510   oprM TRUE 0.975 9.000 0.111 0.055 N NA
 3493622 3493623 Bpet4510 Bpet4511 oprM   FALSE 0.001 269.000 0.000 1.000 N NA
 3493623 3493624 Bpet4511 Bpet4512     TRUE 0.770 16.000 0.005 1.000   NA
 3493624 3493625 Bpet4512 Bpet4513     FALSE 0.234 150.000 0.083 1.000   NA
 3493627 3493628 Bpet4515 Bpet4516     FALSE 0.226 58.000 0.000 1.000   NA
 3493628 3493629 Bpet4516 Bpet4517     TRUE 0.874 -115.000 0.000 0.049   NA
 3493630 3493631 Bpet4518 Bpet4519 ilvD6   FALSE 0.005 133.000 0.000 1.000 N NA
 3493632 3493633 Bpet4520 Bpet4521     TRUE 0.968 10.000 0.109 NA   NA
 3493635 3493636 Bpet4523 Bpet4524 ppc   FALSE 0.000 958.000 0.000 1.000 N NA
 3493636 3493637 Bpet4524 Bpet4525   atoE TRUE 0.829 103.000 0.333 1.000 Y NA
 3493637 3493638 Bpet4525 Bpet4526 atoE   TRUE 0.977 20.000 0.333 1.000 Y NA
 3493640 3493641 Bpet4528 Bpet4529 pcaI4 pcaJ4 TRUE 0.998 -3.000 0.077 0.002 Y NA
 3493641 3493642 Bpet4529 Bpet4530 pcaJ4 catC TRUE 0.912 20.000 0.333 1.000 N NA
 3493642 3493643 Bpet4530 Bpet4531 catC   TRUE 0.942 19.000 0.200 NA   NA
 3493643 3493644 Bpet4531 Bpet4532     TRUE 0.869 29.000 0.150 NA   NA
 3493644 3493645 Bpet4532 Bpet4533     TRUE 0.989 5.000 0.500 NA   NA
 3493645 3493646 Bpet4533 Bpet4534     FALSE 0.238 86.000 0.000 NA   NA
 3493646 3493647 Bpet4534 Bpet4535     FALSE 0.163 112.000 0.000 NA   NA
 3493647 3493648 Bpet4535 Bpet4536     FALSE 0.408 15.000 0.000 NA N NA
 3493648 3493649 Bpet4536 Bpet4537   cysI FALSE 0.005 214.000 0.000 NA N NA
 3493649 3493650 Bpet4537 Bpet4538 cysI   TRUE 0.981 -7.000 0.207 NA   NA
 3493651 3493652 Bpet4539 Bpet4540 ubiX   TRUE 0.984 -3.000 0.211 1.000 N NA
 3493652 3493653 Bpet4540 Bpet4541   hemK TRUE 0.569 46.000 0.124 1.000 N NA
 3493653 3493654 Bpet4541 Bpet4542 hemK prfA TRUE 0.992 -7.000 0.229 1.000 Y NA
 3493654 3493655 Bpet4542 Bpet4543 prfA hemA TRUE 0.717 94.000 0.171 0.023 N NA
 3493656 3493657 Bpettrna_46 Bpet4544 b_petrii_trna_46   FALSE 0.051 173.000 0.000 NA   NA
 3493659 3493660 Bpet4546 Bpet4547     TRUE 0.982 -19.000 0.654 NA   NA
 3493660 3493661 Bpet4547 Bpet4548     FALSE 0.004 666.000 0.000 NA   NA
 3493662 3493663 Bpet4549 Bpet4550 arsH2 arsC3 TRUE 0.964 -22.000 0.200 NA   NA
 3493663 3493664 Bpet4550 Bpet4551 arsC3   TRUE 0.939 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3493664 3493665 Bpet4551 Bpet4552     TRUE 0.967 8.000 0.300 1.000 N NA
 3493665 3493666 Bpet4552 Bpet4553   arsR FALSE 0.208 5.000 0.000 1.000 N NA
 3493667 3493668 Bpet4554 Bpet4555     FALSE 0.005 467.000 0.000 NA   NA
 3493668 3493669 Bpet4555 Bpet4556     FALSE 0.010 329.000 0.000 NA   NA
 3493669 3493670 Bpet4556 Bpet4557     FALSE 0.001 233.000 0.000 1.000 N NA
 3493670 3493671 Bpet4557 Bpet4558     FALSE 0.003 857.000 0.000 NA   NA
 3493671 3493672 Bpet4558 Bpet4559     FALSE 0.003 907.000 0.000 NA   NA
 3493674 3493675 Bpet4561 Bpet4562     FALSE 0.158 114.000 0.000 NA   NA
 3493675 3493676 Bpet4562 Bpet4563     FALSE 0.111 136.000 0.000 NA   NA
 3493676 3493677 Bpet4563 Bpet4564     TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 3493677 3493678 Bpet4564 Bpet4565     TRUE 0.541 -9.000 0.000 NA N NA
 3493678 3493679 Bpet4565 Bpet4566     FALSE 0.020 241.000 0.000 NA   NA
 3493679 3493680 Bpet4566 Bpet4567   traF2 TRUE 0.990 -7.000 0.667 NA   NA
 3493680 3493681 Bpet4567 Bpet4568 traF2 virD2 FALSE 0.022 445.000 0.000 NA Y NA
 3493682 3493683 Bpet4569 Bpet4570 sufI   FALSE 0.001 252.000 0.000 1.000 N NA
 3493684 3493685 Bpet4571 Bpet4572     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 3493685 3493686 Bpet4572 Bpet4573     TRUE 0.992 -3.000 0.667 1.000 N NA
 3493686 3493687 Bpet4573 Bpet4574     FALSE 0.125 128.000 0.000 NA   NA
 3493687 3493688 Bpet4574 Bpet4575     FALSE 0.117 133.000 0.000 NA   NA
 3493688 3493689 Bpet4575 Bpet4576     FALSE 0.046 178.000 0.000 NA   NA
 3493689 3493690 Bpet4576 Bpet4577     FALSE 0.020 240.000 0.000 NA   NA
 3493690 3493691 Bpet4577 Bpet4578     FALSE 0.317 51.000 0.000 NA   NA
 3493691 3493692 Bpet4578 Bpet4579     FALSE 0.032 201.000 0.000 NA   NA
 3493692 3493693 Bpet4579 Bpet4580     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3493693 3493694 Bpet4580 Bpet4581     FALSE 0.148 118.000 0.000 NA   NA
 3493695 3493696 Bpet4582 Bpet4583     FALSE 0.121 131.000 0.000 NA   NA
 3493696 3493697 Bpet4583 Bpet4584     FALSE 0.026 214.000 0.000 NA   NA
 3493698 3493699 Bpet4585 Bpet4586     TRUE 0.834 21.000 0.000 0.072   NA
 3493702 3493703 Bpet4589 Bpet4590   copB FALSE 0.414 37.000 0.000 NA   NA
 3493703 3493704 Bpet4590 Bpet4591 copB copA FALSE 0.027 292.000 0.000 0.003 N NA
 3493704 3493705 Bpet4591 Bpet4592 copA copC2 TRUE 0.881 48.000 0.333 0.003 N NA
 3493705 3493706 Bpet4592 Bpet4593 copC2 copS FALSE 0.012 77.000 0.000 1.000 N NA
 3493706 3493707 Bpet4593 Bpet4594 copS copR TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 3493708 3493709 Bpet4595 Bpet4596     FALSE 0.145 119.000 0.000 NA   NA
 3493709 3493710 Bpet4596 Bpet4597     FALSE 0.003 933.000 0.000 NA   NA
 3493710 3493711 Bpet4597 Bpet4598     FALSE 0.067 158.000 0.000 NA   NA
 3493713 3493714 Bpet4600 Bpet4601     TRUE 0.989 -3.000 0.042 0.072   NA
 3493714 3493715 Bpet4601 Bpet4602     FALSE 0.011 265.000 0.000 1.000   NA
 3493716 3493717 Bpet4603 Bpet4604     TRUE 0.990 -13.000 0.222 NA Y NA
 3493717 3493718 Bpet4604 Bpet4605     FALSE 0.042 182.000 0.000 NA   NA
 3493718 3493719 Bpet4605 Bpet4606   czcA TRUE 0.996 -3.000 0.714 NA   NA
 3493719 3493720 Bpet4606 Bpet4607 czcA czcB TRUE 0.983 3.000 0.500 1.000 N NA
 3493720 3493721 Bpet4607 Bpet4608 czcB czcC FALSE 0.067 235.000 0.000 1.000 Y NA
 3493722 3493723 Bpet4609 Bpet4610     TRUE 0.993 0.000 0.000 0.001 Y NA
 3493723 3493724 Bpet4610 Bpet4611     FALSE 0.066 383.000 0.000 0.011 Y NA
 3493726 3493727 Bpet4613 Bpet4614     FALSE 0.008 371.000 0.000 NA   NA
 3493727 3493728 Bpet4614 Bpet4615   traG2 FALSE 0.000 333.000 0.000 1.000 N NA
 3493728 3493729 Bpet4615 Bpet4616 traG2   TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3493729 3493730 Bpet4616 Bpet4617   trbB2 TRUE 0.827 -7.000 0.000 1.000   NA
 3493730 3493731 Bpet4617 Bpet4618 trbB2 trbC2 TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3493731 3493732 Bpet4618 Bpet4619 trbC2 trbD2 TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3493732 3493733 Bpet4619 Bpet4620 trbD2 trbE2 TRUE 0.993 10.000 0.333 NA Y NA
 3493733 3493734 Bpet4620 Bpet4621 trbE2 trbJ2 TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3493734 3493735 Bpet4621 Bpet4622 trbJ2   TRUE 0.515 29.000 0.000 NA   NA
 3493735 3493736 Bpet4622 Bpet4623   trbL2 TRUE 0.712 18.000 0.000 NA   NA
 3493736 3493737 Bpet4623 Bpet4624 trbL2 trbF2 TRUE 0.944 12.000 0.000 1.000 Y NA
 3493737 3493738 Bpet4624 Bpet4625 trbF2 trbG2 FALSE 0.100 213.000 0.000 NA Y NA
 3493738 3493739 Bpet4625 Bpet4626 trbG2 trbI2 TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3493739 3493740 Bpet4626 Bpet4627 trbI2   TRUE 0.880 5.000 0.000 NA   NA
 3493741 3493742 Bpet4628 Bpet4629     TRUE 0.825 13.000 0.000 NA   NA
 3493744 3493745 Bpet4631 Bpet4632     FALSE 0.008 346.000 0.000 NA   NA
 3493745 3493746 Bpet4632 Bpet4633     TRUE 0.762 -34.000 0.000 NA   NA
 3493746 3493747 Bpet4633 Bpet4634     TRUE 0.658 36.000 0.000 0.072   NA
 3493748 3493749 Bpet4635 Bpet4636 orfA4   TRUE 0.658 36.000 0.000 0.072   NA
 3493749 3493750 Bpet4636 Bpet4637     FALSE 0.387 39.000 0.000 NA   NA
 3493751 3493752 Bpet4638 Bpet4639     TRUE 0.987 -7.000 0.520 1.000   NA
 3493752 3493753 Bpet4639 Bpet4640     FALSE 0.002 828.000 0.000 1.000   NA
 3493753 3493754 Bpet4640 Bpet4641     TRUE 0.795 -10.000 0.000 1.000   NA
 3493754 3493755 Bpet4641 Bpet4642     FALSE 0.202 99.000 0.000 NA   NA
 3493755 3493756 Bpet4642 Bpet4643     TRUE 0.797 50.000 0.250 NA   NA
 3493758 3493759 Bpet4645 Bpet4646   sndH FALSE 0.366 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3493759 3493760 Bpet4646 Bpet4647 sndH   TRUE 0.993 -3.000 0.317 NA   NA
 3493761 3493762 Bpet4648 Bpet4649     FALSE 0.007 113.000 0.000 1.000 N NA
 3493762 3493763 Bpet4649 Bpet4650   tagA TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3493763 3493764 Bpet4650 Bpet4651 tagA   FALSE 0.060 82.000 0.000 NA N NA
 3493764 3493765 Bpet4651 Bpet4652     FALSE 0.192 103.000 0.000 NA   NA
 3493766 3493767 Bpet4653 Bpet4654     TRUE 0.925 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3493767 3493768 Bpet4654 Bpet4655     TRUE 0.932 -3.000 0.029 1.000 N NA
 3493770 3493771 Bpet4657 Bpet4658     TRUE 0.986 -3.000 0.084 NA   NA
 3493771 3493772 Bpet4658 Bpet4659   fdhC TRUE 0.948 18.000 0.205 NA   NA
 3493772 3493773 Bpet4659 Bpet4660 fdhC   TRUE 0.974 13.000 0.241 NA   NA
 3493773 3493774 Bpet4660 Bpet4661   fdhB TRUE 0.994 -3.000 0.333 NA   NA
 3493774 3493775 Bpet4661 Bpet4662 fdhB fdhA TRUE 0.997 10.000 0.350 0.002 Y NA
 3493775 3493776 Bpet4662 Bpet4663 fdhA   TRUE 0.971 12.000 0.162 NA   NA
 3493776 3493777 Bpet4663 Bpet4664   torD TRUE 0.533 69.000 0.042 NA   NA
 3493777 3493778 Bpet4664 Bpet4665 torD   TRUE 0.996 -3.000 0.221 0.058   NA
 3493778 3493779 Bpet4665 Bpet4666     TRUE 0.904 27.000 0.218 NA   NA
 3493779 3493780 Bpet4666 Bpet4667     TRUE 0.996 -3.000 0.901 NA   NA
 3493780 3493781 Bpet4667 Bpet4668   mrp2 TRUE 0.622 41.000 0.039 NA   NA
 3493782 3493783 Bpet4669 Bpet4670 mobA moeA TRUE 0.998 -3.000 0.089 0.002 Y NA
 3493783 3493784 Bpet4670 Bpet4671 moeA mobB TRUE 0.957 21.000 0.000 0.002 Y NA
 3493784 3493785 Bpet4671 Bpet4672 mobB nudC FALSE 0.005 124.000 0.000 1.000 N NA
 3493785 3493786 Bpet4672 Bpet4673 nudC   FALSE 0.017 49.000 0.000 1.000 N NA
 3493787 3493788 Bpettrna_47 Bpet4674 b_petrii_trna_47   FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 3493788 3493789 Bpet4674 Bpet4675     FALSE 0.043 182.000 0.004 1.000   NA
 3493790 3493791 Bpet4676 Bpet4677   rplU FALSE 0.002 160.000 0.000 1.000 N NA
 3493791 3493792 Bpet4677 Bpet4678 rplU rpmA TRUE 0.980 38.000 0.667 0.008 Y NA
 3493792 3493793 Bpet4678 Bpet4679 rpmA   TRUE 0.762 71.000 0.335 1.000   NA
 3493793 3493794 Bpet4679 Bpet4680   proB TRUE 0.706 68.000 0.206 1.000   NA
 3493799 3493800 Bpet4685 Bpet4686     TRUE 0.902 107.000 0.286 0.049 Y NA
 3493800 3493801 Bpet4686 Bpet4687     TRUE 0.993 -3.000 0.857 1.000 N NA
 3493801 3493802 Bpet4687 Bpet4688     FALSE 0.013 74.000 0.000 1.000 N NA
 3493806 3493807 Bpet4691 Bpet4692 thiF ctpA TRUE 0.968 -3.000 0.082 1.000 N NA
 3493807 3493808 Bpet4692 Bpet4693 ctpA   TRUE 0.947 27.000 0.408 0.017 N NA
 3493808 3493809 Bpet4693 Bpet4694   gpmA TRUE 0.904 4.000 0.043 1.000 N NA
 3493810 3493811 Bpet4695 Bpet4696   grxC FALSE 0.443 14.000 0.000 NA N NA
 3493811 3493812 Bpet4696 Bpet4697 grxC secB FALSE 0.218 49.000 0.018 1.000 N NA
 3493812 3493813 Bpet4697 Bpet4698 secB gpsA TRUE 0.922 11.000 0.097 1.000 N NA
 3493813 3493814 Bpet4698 Bpet4699 gpsA bug97 TRUE 0.571 84.000 0.102 1.000   NA
 3493814 3493815 Bpet4699 Bpet4700 bug97   FALSE 0.024 197.000 0.000 1.000   NA
 3493820 3493821 Bpet4705 Bpet4706   trkH FALSE 0.003 542.000 0.000 1.000   NA
 3493821 3493822 Bpet4706 Bpet4707 trkH trkA TRUE 0.890 59.000 0.028 0.002 Y NA
 3493822 3493823 Bpet4707 Bpet4708 trkA ntrX TRUE 0.965 -3.000 0.020 1.000   NA
 3493823 3493824 Bpet4708 Bpet4709 ntrX ntrY TRUE 0.983 12.000 0.605 1.000   NA
 3493824 3493825 Bpet4709 Bpet4710 ntrY   TRUE 0.996 -3.000 0.810 NA   NA
 3493825 3493826 Bpet4710 Bpet4711     TRUE 0.762 38.000 0.094 NA   NA
 3493827 3493828 Bpet4712 Bpet4713     FALSE 0.013 76.000 0.000 1.000 N NA
 3493828 3493829 Bpet4713 Bpet4714     FALSE 0.251 159.000 0.317 1.000 N NA
 3493829 3493830 Bpet4714 Bpet4715     TRUE 0.977 5.000 0.439 1.000 N NA
 3493831 3493832 Bpet4716 Bpet4717   bug98 FALSE 0.207 70.000 0.000 1.000   NA
 3493832 3493833 Bpet4717 Bpet4718 bug98   FALSE 0.138 104.000 0.000 1.000   NA
 3493833 3493834 Bpet4718 Bpet4719     TRUE 0.997 -3.000 0.800 0.041 N NA
 3493835 3493836 Bpet4720 Bpet4721     FALSE 0.012 79.000 0.000 1.000 N NA
 3493838 3493839 Bpet4723 Bpet4724     FALSE 0.492 31.000 0.000 NA   NA
 3493839 3493840 Bpet4724 Bpet4725     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3493841 3493842 Bpet4726 Bpet4727 fmt def TRUE 0.995 6.000 0.105 0.013 Y NA
 3493843 3493844 Bpet4728 Bpet4729     FALSE 0.035 116.000 0.003 1.000 N NA
 3493844 3493845 Bpet4729 Bpet4730     FALSE 0.418 82.000 0.021 NA   NA
 3493848 3493849 Bpet4733 Bpet4734     FALSE 0.508 45.000 0.017 NA   NA
 3493850 3493851 Bpet4735 Bpet4736 yggA   FALSE 0.004 421.000 0.000 1.000   NA
 3493852 3493853 Bpet4737 Bpet4738     TRUE 0.736 51.000 0.479 1.000 N NA
 3493853 3493854 Bpet4738 Bpet4739     TRUE 0.901 56.000 0.250 NA Y NA
 3493854 3493855 Bpet4739 Bpet4740     TRUE 0.833 108.000 0.326 NA Y NA
 3493855 3493856 Bpet4740 Bpet4741     TRUE 0.996 13.000 0.556 0.054 Y NA
 3493856 3493857 Bpet4741 Bpet4742     TRUE 0.986 16.000 0.421 1.000 Y NA
 3493857 3493858 Bpet4742 Bpet4743     TRUE 0.980 4.000 0.474 1.000 N NA
 3493859 3493860 Bpet4744 Bpet4745     FALSE 0.142 120.000 0.000 NA   NA
 3493860 3493861 Bpet4745 Bpet4746     TRUE 0.833 19.000 0.022 NA   NA
 3493861 3493862 Bpet4746 Bpet4747     TRUE 0.956 -3.000 0.010 1.000   NA
 3493866 3493867 Bpet4751 Bpet4752 ung2 rhlE3 FALSE 0.047 273.000 0.000 1.000 Y NA
 3493867 3493868 Bpet4752 Bpet4753 rhlE3   TRUE 0.542 36.000 0.007 NA   NA
 3493869 3493870 Bpet4754 Bpet4755 cca   TRUE 0.972 -3.000 0.034 1.000   NA
 3493871 3493872 Bpet4756 Bpet4757     FALSE 0.003 1104.000 0.000 NA   NA
 3493872 3493873 Bpet4757 Bpet4758     TRUE 0.993 3.000 0.805 NA   NA
 3493873 3493874 Bpet4758 Bpet4759     TRUE 0.962 18.000 0.365 NA   NA
 3493874 3493875 Bpet4759 Bpet4760     TRUE 0.675 83.000 0.383 NA N NA
 3493876 3493877 Bpet4761 Bpet4762 metF   TRUE 0.961 13.000 0.109 NA   NA
 3493877 3493878 Bpet4762 Bpet4763   acyH FALSE 0.499 80.000 0.042 NA   NA
 3493878 3493879 Bpet4763 Bpet4764 acyH   FALSE 0.000 363.000 0.000 1.000 N NA
 3493879 3493880 Bpet4764 Bpet4765     TRUE 0.999 -3.000 0.759 0.011 Y NA
 3493881 3493882 Bpet4766 Bpet4767     TRUE 0.598 103.000 0.017 NA Y NA
 3493882 3493883 Bpet4767 Bpet4768     TRUE 0.998 -3.000 0.882 NA Y NA
 3493884 3493885 Bpet4769 Bpet4770 gtrA   FALSE 0.004 672.000 0.000 NA   NA
 3493885 3493886 Bpet4770 Bpet4771     FALSE 0.222 94.000 0.000 NA   NA
 3493886 3493887 Bpet4771 Bpet4772     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3493887 3493888 Bpet4772 Bpet4773   leuD2 TRUE 0.652 64.000 0.125 1.000   NA
 3493888 3493889 Bpet4773 Bpet4774 leuD2 leuC3 TRUE 0.998 -3.000 0.116 0.001 Y NA
 3493889 3493890 Bpet4774 Bpet4775 leuC3 bug99 TRUE 0.602 28.000 0.010 1.000   NA
 3493892 3493893 Bpet4777 Bpet4778     TRUE 0.623 115.000 1.000 1.000 N NA
 3493894 3493895 Bpet4779 Bpet4780 bug100   TRUE 0.966 17.000 0.500 1.000   NA
 3493897 3493898 Bpet4782 Bpet4783     TRUE 0.997 -7.000 0.255 0.001 Y NA
 3493898 3493899 Bpet4783 Bpet4784   dapF FALSE 0.157 47.000 0.009 1.000 N NA
 3493899 3493900 Bpet4784 Bpet4785 dapF   TRUE 0.976 8.000 0.175 NA   NA
 3493900 3493901 Bpet4785 Bpet4786     TRUE 0.908 38.000 0.714 NA   NA
 3493902 3493903 Bpet4787 Bpet4788     FALSE 0.177 151.000 0.048 1.000   NA
 3493903 3493904 Bpet4788 Bpet4789     TRUE 0.994 -3.000 0.420 NA   NA
 3493904 3493905 Bpet4789 Bpet4790     TRUE 0.907 -42.000 0.050 NA   NA
 3493905 3493906 Bpet4790 Bpet4791     TRUE 0.910 53.000 0.400 1.000 Y NA
 3493906 3493907 Bpet4791 Bpet4792     TRUE 0.999 -3.000 0.465 0.068 Y NA
 3493908 3493909 Bpet4793 Bpet4794     FALSE 0.015 269.000 0.000 NA   NA
 3493909 3493910 Bpet4794 Bpet4795   dksA TRUE 0.576 57.000 0.045 NA   NA
 3493910 3493911 Bpet4795 Bpet4796 dksA hslV FALSE 0.027 163.000 0.011 1.000 N NA
 3493911 3493912 Bpet4796 Bpet4797 hslV hslU TRUE 0.956 37.000 0.752 1.000 Y NA
 3493914 3493915 Bpet4799 Bpet4800   rfbB FALSE 0.470 35.000 0.005 1.000   NA
 3493915 3493916 Bpet4800 Bpet4801 rfbB rfbD TRUE 0.993 -63.000 0.318 0.002 Y NA
 3493916 3493917 Bpet4801 Bpet4802 rfbD   TRUE 0.989 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 3493918 3493919 Bpet4803 Bpet4804 lipA lipB TRUE 0.962 65.000 0.319 0.000 Y NA
 3493919 3493920 Bpet4804 Bpet4805 lipB   TRUE 0.926 23.000 0.219 NA   NA
 3493920 3493921 Bpet4805 Bpet4806     TRUE 0.920 22.000 0.155 NA   NA
 3493921 3493922 Bpet4806 Bpet4807     TRUE 0.694 59.000 0.390 1.000 N NA
 3493922 3493923 Bpet4807 Bpet4808     FALSE 0.249 152.000 0.079 NA   NA
 3493924 3493925 Bpet4809 Bpet4810 birA baf TRUE 0.979 -3.000 0.147 1.000 N NA
 3493925 3493926 Bpet4810 Bpet4811 baf   TRUE 0.879 11.000 0.003 NA   NA
 3493927 3493928 Bpet4812 Bpet4813 waaA waaC TRUE 0.748 48.000 0.028 1.000 Y NA
 3493930 3493931 Bpet4815 Bpet4816   tnp26 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.071 Y NA
 3493932 3493933 Bpet4817 Bpet4818 wlbB wlbC TRUE 0.940 -15.000 0.000 1.000 Y NA
 3493933 3493934 Bpet4818 Bpet4819 wlbC wlbD TRUE 0.959 14.000 0.024 1.000 Y NA
 3493934 3493935 Bpet4819 Bpet4820 wlbD   TRUE 0.576 59.000 0.000 1.000 Y NA
 3493935 3493936 Bpet4820 Bpet4821   wlbE TRUE 0.837 32.000 0.020 1.000 Y NA
 3493936 3493937 Bpet4821 Bpet4822 wlbE wlbH2 FALSE 0.463 175.000 0.033 0.014 Y NA
 3493937 3493938 Bpet4822 Bpet4823 wlbH2 wlbI TRUE 0.978 -3.000 0.036 NA   NA
 3493938 3493939 Bpet4823 Bpet4824 wlbI   TRUE 0.908 -25.000 0.036 NA   NA
 3493939 3493940 Bpet4824 Bpet4825   wlbL1 TRUE 0.899 39.000 0.667 NA   NA
 3493940 3493941 Bpet4825 Bpet4826 wlbL1   FALSE 0.205 72.000 0.000 1.000   NA
 3493941 3493942 Bpet4826 Bpet4827     TRUE 0.660 36.000 0.000 0.071   NA
 3493942 3493943 Bpet4827 Bpet4828   wlbL2 FALSE 0.438 28.000 0.000 1.000   NA
 3493944 3493945 Bpet4829 Bpet4830     TRUE 0.946 -10.000 0.044 NA   NA
 3493945 3493946 Bpet4830 Bpet4831     FALSE 0.492 31.000 0.000 NA   NA
 3493946 3493947 Bpet4831 Bpet4832     TRUE 0.986 0.000 0.024 1.000 Y NA
 3493947 3493948 Bpet4832 Bpet4833     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 3493948 3493949 Bpet4833 Bpet4834     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 3493949 3493950 Bpet4834 Bpet4835   msbA2 FALSE 0.447 35.000 0.000 NA   NA
 3493953 3493954 Bpet4838 Bpet4839     TRUE 0.807 38.000 0.150 NA   NA
 3493954 3493955 Bpet4839 Bpet4840     TRUE 0.978 16.000 1.000 1.000   NA
 3493955 3493956 Bpet4840 Bpet4841     FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 3493956 3493957 Bpet4841 Bpet4842     TRUE 0.904 3.000 0.000 NA   NA
 3493957 3493958 Bpet4842 Bpet4843     FALSE 0.158 114.000 0.000 NA   NA
 3493958 3493959 Bpet4843 Bpet4844     TRUE 0.676 20.000 0.000 NA   NA
 3493960 3493961 Bpet4845 Bpet4846     TRUE 0.993 -3.000 0.294 NA   NA
 3493961 3493962 Bpet4846 Bpet4847   aspS FALSE 0.209 114.000 0.004 NA   NA
 3493962 3493963 Bpet4847 Bpet4848 aspS   TRUE 0.669 41.000 0.057 NA   NA
 3493963 3493964 Bpet4848 Bpet4849     TRUE 0.951 17.000 0.190 NA   NA
 3493964 3493965 Bpet4849 Bpet4850     FALSE 0.028 253.000 0.007 NA   NA
 3493965 3493966 Bpet4850 Bpet4851     TRUE 0.545 71.000 0.047 NA   NA
 3493967 3493968 Bpet4852 Bpet4853     TRUE 0.986 -3.000 0.105 1.000   NA
 3493969 3493970 Bpet4854 Bpet4855     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 3493970 3493971 Bpet4855 Bpet4856     TRUE 0.981 16.000 0.167 NA Y NA
 3493971 3493972 Bpet4856 Bpet4857     TRUE 0.974 -178.000 0.182 NA Y NA
 3493972 3493973 Bpet4857 Bpet4858     FALSE 0.001 575.000 0.000 NA N NA
 3493973 3493974 Bpet4858 Bpet4859     FALSE 0.004 246.000 0.000 NA N NA
 3493975 3493976 Bpet4860 Bpet4861   ubiA2 FALSE 0.486 69.000 0.007 0.014 N NA
 3493976 3493977 Bpet4861 Bpet4862 ubiA2   FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 3493977 3493978 Bpet4862 Bpet4863     FALSE 0.015 274.000 0.000 NA   NA
 3493978 3493979 Bpet4863 Bpet4864     FALSE 0.024 222.000 0.000 NA   NA
 3493981 3493982 Bpet4866 Bpet4867 glcB   FALSE 0.006 118.000 0.000 1.000 N NA
 3493982 3493983 Bpet4867 Bpet4868   ilvD7 TRUE 0.882 19.000 0.182 1.000 N NA
 3493983 3493984 Bpet4868 Bpet4869 ilvD7   TRUE 0.982 -3.000 0.182 1.000 N NA
 3493984 3493985 Bpet4869 Bpet4870     FALSE 0.425 71.000 0.000 0.008 N NA
 3493985 3493986 Bpet4870 Bpet4871     TRUE 0.851 42.000 0.087 1.000 Y NA
 3493986 3493987 Bpet4871 Bpet4872     TRUE 0.884 74.000 0.250 NA Y NA
 3493987 3493988 Bpet4872 Bpet4873     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 3493988 3493989 Bpet4873 Bpet4874     FALSE 0.254 79.000 0.000 NA   NA
 3493990 3493991 Bpet4875 Bpet4876 ycdW2   TRUE 0.576 59.000 0.000 1.000 Y NA
 3493992 3493993 Bpet4877 Bpet4878 nadA nadB TRUE 0.994 15.000 0.210 0.002 Y NA
 3493995 3493996 Bpet4880 Bpet4881   pnbA TRUE 0.759 -3.000 0.000 NA N NA
 3493998 3493999 Bpet4883 Bpet4884   argE3 TRUE 0.759 -3.000 0.000 NA N NA
 3493999 3494000 Bpet4884 Bpet4885 argE3   FALSE 0.048 25.000 0.000 1.000 N NA
 3494000 3494001 Bpet4885 Bpet4886     FALSE 0.014 61.000 0.000 1.000 N NA
 3494001 3494002 Bpet4886 Bpet4887   aphA2 FALSE 0.014 155.000 0.000 NA N NA
 3494002 3494003 Bpet4887 Bpet4888 aphA2   FALSE 0.123 130.000 0.000 NA   NA
 3494003 3494004 Bpet4888 Bpet4889   azlC TRUE 0.973 19.000 0.880 NA   NA
 3494004 3494005 Bpet4889 Bpet4890 azlC bug101 FALSE 0.032 201.000 0.000 NA   NA
 3494006 3494007 Bpet4891 Bpet4892     TRUE 0.754 79.000 1.000 1.000 N NA
 3494007 3494008 Bpet4892 Bpet4893     TRUE 0.789 65.000 0.080 1.000 Y NA
 3494008 3494009 Bpet4893 Bpet4894     TRUE 0.994 -7.000 0.080 0.023 Y NA
 3494009 3494010 Bpet4894 Bpet4895     TRUE 0.987 3.000 0.051 1.000 Y NA
 3494010 3494011 Bpet4895 Bpet4896     TRUE 0.987 14.000 0.051 0.053 Y NA
 3494013 3494014 Bpet4898 Bpet4899 yodB   TRUE 0.998 -3.000 0.719 0.058   NA
 3494015 3494016 Bpet4900 Bpet4901   prtR2 TRUE 0.998 -3.000 0.525 NA Y NA
 3494016 3494017 Bpet4901 Bpet4902 prtR2   FALSE 0.083 51.000 0.000 NA N NA
 3494017 3494018 Bpet4902 Bpet4903     FALSE 0.133 106.000 0.000 1.000   NA
 3494018 3494019 Bpet4903 Bpet4904     FALSE 0.508 58.000 0.000 0.076   NA
 3494020 3494021 Bpet4905 Bpet4906 ssb7   FALSE 0.001 265.000 0.000 1.000 N NA
 3494022 3494023 Bpet4907 Bpet4908 uvrA2   FALSE 0.052 93.000 0.003 1.000 N NA
 3494024 3494025 Bpet4909 Bpet4910 dgt aroB TRUE 0.710 23.000 0.060 1.000 N NA
 3494025 3494026 Bpet4910 Bpet4911 aroB aroK2 TRUE 0.996 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 3494030 3494031 Bpet4915 Bpet4916     TRUE 0.994 9.000 0.399 NA Y NA
 3494031 3494032 Bpet4916 Bpet4917     FALSE 0.171 116.000 0.028 NA N NA
 3494033 3494034 Bpet4918 Bpet4919   hemB TRUE 0.967 -3.000 0.024 1.000   NA
 3494035 3494036 Bpet4920 Bpet4921 dsbD   TRUE 0.614 -19.000 0.010 1.000 N NA
 3494038 3494039 Bpet4923 Bpet4924 rplQ rpoA TRUE 0.659 106.000 0.873 1.000 N NA
 3494039 3494040 Bpet4924 Bpet4925 rpoA rpsD FALSE 0.187 199.000 0.549 1.000 N NA
 3494040 3494041 Bpet4925 Bpet4926 rpsD rpsK TRUE 0.997 12.000 0.509 0.011 Y NA
 3494041 3494042 Bpet4926 Bpet4927 rpsK rpsM TRUE 0.996 16.000 0.810 0.008 Y NA
 3494042 3494043 Bpet4927 Bpet4928 rpsM rpmJ TRUE 0.901 43.000 0.194 0.008   NA
 3494043 3494044 Bpet4928 Bpet4929 rpmJ infA2 TRUE 0.783 34.000 0.104 1.000   NA
 3494044 3494045 Bpet4929 Bpet4930 infA2 secY TRUE 0.915 10.000 0.083 1.000 N NA
 3494045 3494046 Bpet4930 Bpet4931 secY rplO TRUE 0.965 15.000 0.730 1.000 N NA
 3494046 3494047 Bpet4931 Bpet4932 rplO rpmD TRUE 0.998 10.000 0.653 0.001 Y NA
 3494047 3494048 Bpet4932 Bpet4933 rpmD rpsE TRUE 0.998 4.000 0.789 0.011 Y NA
 3494048 3494049 Bpet4933 Bpet4934 rpsE rplR TRUE 0.996 16.000 0.814 0.011 Y NA
 3494049 3494050 Bpet4934 Bpet4935 rplR rplF TRUE 0.993 22.000 0.815 0.008 Y NA
 3494050 3494051 Bpet4935 Bpet4936 rplF rpsH TRUE 0.997 13.000 0.808 0.008 Y NA
 3494051 3494052 Bpet4936 Bpet4937 rpsH rpsN TRUE 0.996 11.000 0.295 0.008 Y NA
 3494052 3494053 Bpet4937 Bpet4938 rpsN rplE TRUE 0.996 13.000 0.309 0.008 Y NA
 3494053 3494054 Bpet4938 Bpet4939 rplE rplX TRUE 0.997 13.000 0.758 0.008 Y NA
 3494054 3494055 Bpet4939 Bpet4940 rplX rplN TRUE 0.998 11.000 0.810 0.011 Y NA
 3494056 3494057 Bpet4941 Bpet4942     FALSE 0.083 148.000 0.000 NA   NA
 3494058 3494059 Bpet4943 Bpet4944 rpsQ rpmC TRUE 0.999 3.000 0.828 0.008 Y NA
 3494059 3494060 Bpet4944 Bpet4945 rpmC rplP TRUE 0.998 11.000 0.802 0.008 Y NA
 3494060 3494061 Bpet4945 Bpet4946 rplP rpsC TRUE 0.999 3.000 0.828 0.011 Y NA
 3494061 3494062 Bpet4946 Bpet4947 rpsC rplV TRUE 0.998 10.000 0.719 0.011 Y NA
 3494062 3494063 Bpet4947 Bpet4948 rplV rpsS TRUE 0.998 4.000 0.769 0.011 Y NA
 3494063 3494064 Bpet4948 Bpet4949 rpsS rplB TRUE 0.997 13.000 0.820 0.011 Y NA
 3494064 3494065 Bpet4949 Bpet4950 rplB rblG TRUE 0.997 1.000 0.849 1.000 Y NA
 3494065 3494066 Bpet4950 Bpet4951 rblG rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3494066 3494067 Bpet4951 Bpet4952 rplD rplC TRUE 0.998 6.000 0.486 0.008 Y NA
 3494067 3494068 Bpet4952 Bpet4953 rplC rpsJ TRUE 0.605 203.000 0.307 0.011 Y NA
 3494068 3494069 Bpet4953 Bpet4954 rpsJ tuf1 TRUE 0.597 72.000 0.003 1.000 Y NA
 3494069 3494070 Bpet4954 Bpet4955 tuf1 fusA2 TRUE 0.973 79.000 1.000 0.001 Y NA
 3494070 3494071 Bpet4955 Bpet4956 fusA2 rpsG TRUE 0.899 19.000 0.003 1.000 Y NA
 3494071 3494072 Bpet4956 Bpet4957 rpsG rpsL TRUE 0.805 174.000 0.620 0.002 Y NA
 3494072 3494073 Bpet4957 Bpet4958 rpsL   FALSE 0.000 431.000 0.000 1.000 N NA
 3494074 3494075 Bpet4959 Bpet4960     TRUE 0.861 27.000 0.138 1.000   NA
 3494075 3494076 Bpet4960 Bpet4961     TRUE 0.901 18.000 0.086 1.000   NA
 3494079 3494080 Bpet4964 Bpet4965 rpoC rpoB TRUE 0.998 0.000 0.851 0.000   NA
 3494080 3494081 Bpet4965 Bpet4966 rpoB rplL FALSE 0.294 164.000 0.223 1.000   NA
 3494081 3494082 Bpet4966 Bpet4967 rplL rplJ TRUE 0.967 77.000 0.884 0.008 Y NA
 3494082 3494083 Bpet4967 Bpet4968 rplJ rplA FALSE 0.464 253.000 0.302 0.011 Y NA
 3494083 3494084 Bpet4968 Bpet4969 rplA rplK TRUE 0.999 3.000 0.838 0.011 Y NA
 3494084 3494085 Bpet4969 Bpet4970 rplK nusG TRUE 0.749 64.000 0.681 1.000 N NA
 3494085 3494086 Bpet4970 Bpet4971 nusG secE TRUE 0.980 10.000 0.843 1.000 N NA
 3494086 3494087 Bpet4971 Bpettrna_48 secE b_petrii_trna_48 FALSE 0.072 153.000 0.000 NA   NA
 3494087 3494088 Bpettrna_48 Bpet4972 b_petrii_trna_48 tuf2 FALSE 0.154 115.000 0.000 NA   NA
 3494088 3494089 Bpet4972 Bpettrna_49 tuf2 b_petrii_trna_49 FALSE 0.308 55.000 0.000 NA   NA
 3494089 3494090 Bpettrna_49 Bpettrna_50 b_petrii_trna_49 b_petrii_trna_50 TRUE 0.865 7.000 0.000 NA   NA
 3494090 3494091 Bpettrna_50 Bpettrna_51 b_petrii_trna_50 b_petrii_trna_51 FALSE 0.133 124.000 0.000 NA   NA
 3494091 3494092 Bpettrna_51 Bpet4973 b_petrii_trna_51 ansB FALSE 0.267 75.000 0.000 NA   NA
 3494092 3494093 Bpet4973 Bpet4974 ansB parB TRUE 0.599 -7.000 0.004 1.000 N NA
 3494093 3494094 Bpet4974 Bpet4975 parB   FALSE 0.278 180.000 0.827 1.000 N NA
 3494094 3494095 Bpet4975 Bpet4976   gidB TRUE 0.988 -3.000 0.339 1.000 N NA
 3494095 3494096 Bpet4976 Bpet4977 gidB gidA TRUE 0.990 -3.000 0.466 1.000 N NA
 3494096 3494097 Bpet4977 Bpet4978 gidA   FALSE 0.000 793.000 0.000 1.000 N NA
 3494099 3494100 Bpet4980 Bpet4981     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3494100 3494101 Bpet4981 Bpet4982     TRUE 0.825 58.000 0.426 NA   NA
 3494101 3494102 Bpet4982 Bpet4983     FALSE 0.406 122.000 0.106 1.000   NA
 3494102 3494103 Bpet4983 Bpet4984     TRUE 0.987 -124.000 1.000 1.000 Y NA
 3494106 3494107 Bpet4987 Bpet4988   narK TRUE 0.952 68.000 0.458 0.051 Y NA
 3494107 3494108 Bpet4988 Bpet4989 narK narG2 FALSE 0.191 149.000 0.125 1.000 N NA
 3494108 3494109 Bpet4989 Bpet4990 narG2 narH2 TRUE 0.999 -3.000 0.526 0.001 Y NA
 3494109 3494110 Bpet4990 Bpet4991 narH2 narJ2 TRUE 0.973 16.000 0.000 0.002 Y NA
 3494110 3494111 Bpet4991 Bpet4992 narJ2 narI2 TRUE 0.969 17.000 0.000 0.002 Y NA
 3494111 3494112 Bpet4992 Bpet4993 narI2   TRUE 0.677 43.000 0.091 1.000   NA
 3494112 3494113 Bpet4993 Bpet4994   moaA2 TRUE 0.789 11.000 0.000 1.000   NA
 3494113 3494114 Bpet4994 Bpet4995 moaA2   FALSE 0.253 3.000 0.000 1.000 N NA
 3494114 3494115 Bpet4995 Bpet4996   narX FALSE 0.011 83.000 0.000 1.000 N NA
 3494115 3494116 Bpet4996 Bpet4997 narX narL TRUE 0.997 14.000 0.686 0.011 Y NA
 3494116 3494117 Bpet4997 Bpet4998 narL   FALSE 0.030 34.000 0.000 1.000 N NA
 3494118 3494119 Bpet4999 Bpet5000     TRUE 0.933 16.000 0.275 1.000 N NA
 3494119 3494120 Bpet5000 Bpet5001   trmE FALSE 0.008 300.000 0.000 1.000   NA
 3494121 3494122 Bpet5002 Bpet5003     TRUE 0.993 19.000 0.750 0.053 Y NA
 3494122 3494123 Bpet5003 Bpet5004     TRUE 0.999 -3.000 0.429 0.053 Y NA
 3494123 3494124 Bpet5004 Bpet5005     TRUE 0.988 15.000 0.429 1.000 Y NA
 3494124 3494125 Bpet5005 Bpet5006     TRUE 0.999 0.000 0.750 0.003 Y NA
 3494125 3494126 Bpet5006 Bpet5007     FALSE 0.325 186.000 0.667 1.000   NA
 3494126 3494127 Bpet5007 Bpet5008     FALSE 0.445 96.000 0.059 1.000   NA
 3494127 3494128 Bpet5008 Bpet5009     FALSE 0.086 175.000 0.079 1.000 N NA
 3494128 3494129 Bpet5009 Bpet5010     TRUE 0.984 21.000 0.795 1.000 Y NA
 3494130 3494131 Bpet5011 Bpet5012 yidC   TRUE 0.819 62.000 0.461 NA   NA
 3494131 3494132 Bpet5012 Bpet5013   rnpA TRUE 0.988 6.000 0.540 NA   NA
 3494132 3494133 Bpet5013 Bpet5014 rnpA rpmH TRUE 0.858 51.000 0.787 1.000   NA