MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas stutzeri A1501

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3557764 3557765 PST_0001 PST_0002 dnaA dnaN TRUE 0.946 34.000 0.328 1.000 Y NA
 3557765 3557766 PST_0002 PST_0003 dnaN recF TRUE 0.992 10.000 0.318 1.000 Y NA
 3557766 3557767 PST_0003 PST_0004 recF gyrB TRUE 0.998 -3.000 0.249 0.005 Y NA
 3557767 3557768 PST_0004 PST_0005 gyrB ahpF-1 FALSE 0.044 204.000 0.000 1.000 N NA
 3557769 3557770 PST_0006 PST_0007     FALSE 0.362 48.000 0.031 1.000 N NA
 3557770 3557771 PST_0007 PST_0008     TRUE 0.989 -3.000 0.310 1.000 N NA
 3557771 3557772 PST_0008 PST_0009   glyS TRUE 0.859 -31.000 0.123 1.000 N NA
 3557772 3557773 PST_0009 PST_0010 glyS glyQ TRUE 0.999 -3.000 0.651 0.001 Y NA
 3557774 3557775 PST_0011 PST_0012 tag   FALSE 0.200 100.000 0.017 1.000 N NA
 3557776 3557777 PST_0013 PST_0014     FALSE 0.255 64.000 0.000 1.000   NA
 3557777 3557778 PST_0014 PST_0015     TRUE 0.997 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 3557778 3557779 PST_0015 PST_0016     TRUE 0.999 -3.000 0.842 0.014 Y NA
 3557779 3557780 PST_0016 PST_0017     TRUE 0.975 75.000 0.611 0.055 Y NA
 3557780 3557781 PST_0017 PST_0018   trkA FALSE 0.011 340.000 0.000 1.000 N NA
 3557781 3557782 PST_0018 PST_0019 trkA sun TRUE 0.609 75.000 0.122 1.000 N NA
 3557782 3557783 PST_0019 PST_0020 sun fmt TRUE 0.996 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 3557783 3557784 PST_0020 PST_0021 fmt def TRUE 0.918 53.000 0.105 0.022 Y NA
 3557785 3557786 PST_0022 PST_0023     FALSE 0.338 87.000 0.033 1.000   NA
 3557786 3557787 PST_0023 PST_0024     FALSE 0.141 138.000 0.023 NA N NA
 3557789 3557790 PST_0026 PST_0027 hemF aroE TRUE 0.559 73.000 0.093 1.000 N NA
 3557791 3557792 PST_0028 PST_0029     FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 3557793 3557794 PST_0030 PST_0031 pbpG   FALSE 0.005 574.000 0.000 1.000 N NA
 3557794 3557795 PST_0031 PST_0032     TRUE 0.555 -78.000 0.034 NA   NA
 3557797 3557798 PST_0034 PST_0035     TRUE 0.528 84.000 0.091 NA   NA
 3557799 3557800 PST_0036 PST_0037 metQ-2 metI-2 TRUE 0.966 59.000 0.867 NA Y NA
 3557800 3557801 PST_0037 PST_0038 metI-2 metN-2 TRUE 0.997 0.000 0.469 1.000 Y NA
 3557803 3557804 PST_0040 PST_0041     TRUE 0.870 0.000 0.011 NA   NA
 3557804 3557805 PST_0041 PST_0042   znuC TRUE 0.998 2.000 0.755 1.000 Y NA
 3557805 3557806 PST_0042 PST_0043 znuC np20 TRUE 0.909 78.000 0.309 1.000 Y NA
 3557808 3557809 PST_0045 PST_0047     FALSE 0.118 139.000 0.000 NA   NA
 3557811 3557812 PST_0048 PST_0049     TRUE 0.919 -3.000 0.033 NA   NA
 3557812 3557813 PST_0049 PST_0050     FALSE 0.004 1210.000 0.000 1.000   NA
 3557813 3557814 PST_0050 PST_0051     TRUE 0.975 -3.000 0.019 0.028   NA
 3557814 3557815 PST_0051 PST_0052     TRUE 0.932 98.000 0.222 0.028 Y NA
 3557815 3557816 PST_0052 PST_0053   cheY-1 TRUE 0.977 -7.000 0.000 0.028 Y NA
 3557816 3557817 PST_0053 PST_0054 cheY-1   TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.035 Y NA
 3557817 3557818 PST_0054 PST_0055     TRUE 0.971 107.000 0.667 0.035 Y NA
 3557818 3557819 PST_0055 PST_0056     TRUE 0.982 50.000 0.667 0.035 Y NA
 3557820 3557821 PST_0057 PST_0058     FALSE 0.065 318.000 0.118 1.000 N NA
 3557822 3557823 PST_0059 PST_0060     TRUE 0.559 47.000 0.077 NA   NA
 3557823 3557824 PST_0060 PST_0061     TRUE 0.486 101.000 0.084 1.000   NA
 3557824 3557825 PST_0061 PST_0062     FALSE 0.249 125.000 0.032 1.000   NA
 3557825 3557826 PST_0062 PST_0063     TRUE 0.578 75.000 0.105 1.000 N NA
 3557827 3557828 PST_0064 PST_0065     TRUE 0.824 43.000 0.273 1.000   NA
 3557828 3557829 PST_0065 PST_0066     TRUE 0.757 68.000 0.239 1.000 N NA
 3557829 3557830 PST_0066 PST_0067   potF2 FALSE 0.037 217.000 0.000 1.000 N NA
 3557830 3557831 PST_0067 PST_0068 potF2 potF3 FALSE 0.240 278.000 0.000 0.019 Y NA
 3557831 3557832 PST_0068 PST_0069 potF3 potG TRUE 0.759 148.000 0.200 1.000 Y NA
 3557832 3557833 PST_0069 PST_0070 potG potH TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3557833 3557834 PST_0070 PST_0071 potH potI TRUE 0.993 -3.000 0.057 0.055 Y NA
 3557839 3557840 PST_0076 PST_0077 dctM dctQ TRUE 0.998 -3.000 0.882 NA Y NA
 3557840 3557841 PST_0077 PST_0078 dctQ dctP FALSE 0.140 266.000 0.034 NA Y NA
 3557841 3557842 PST_0078 PST_0079 dctP dctD FALSE 0.020 271.000 0.000 1.000 N NA
 3557842 3557843 PST_0079 PST_0080 dctD dctB TRUE 0.996 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 3557843 3557844 PST_0080 PST_0081 dctB   TRUE 0.695 106.000 0.259 1.000 N NA
 3557844 3557845 PST_0081 PST_0082     TRUE 0.995 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 3557845 3557846 PST_0082 PST_0083     TRUE 0.990 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 3557846 3557847 PST_0083 PST_0084   rfbB-2 TRUE 0.999 -3.000 0.381 0.002 Y NA
 3557847 3557848 PST_0084 PST_0085 rfbB-2   FALSE 0.018 278.000 0.000 1.000 N NA
 3557848 3557849 PST_0085 PST_0086     TRUE 0.997 2.000 0.500 0.004   NA
 3557849 3557850 PST_0086 PST_0087     TRUE 0.958 -36.000 0.500 1.000   NA
 3557850 3557851 PST_0087 PST_0088     FALSE 0.192 86.000 0.011 NA   NA
 3557851 3557852 PST_0088 PST_0089     TRUE 0.982 -3.000 0.201 NA   NA
 3557852 3557853 PST_0089 PST_0090     TRUE 0.998 2.000 0.650 NA Y NA
 3557853 3557854 PST_0090 PST_0091     TRUE 0.997 -3.000 0.491 NA Y NA
 3557854 3557855 PST_0091 PST_0092     FALSE 0.042 205.000 0.000 NA   NA
 3557855 3557856 PST_0092 PST_0093     TRUE 0.972 28.000 0.667 0.080   NA
 3557856 3557857 PST_0093 PST_0094     FALSE 0.014 302.000 0.000 NA   NA
 3557858 3557859 PST_0095 PST_0096   gabD-2 TRUE 0.879 16.000 0.000 1.000 Y NA
 3557861 3557862 PST_0098 PST_0099     FALSE 0.034 223.000 0.000 1.000 N NA
 3557862 3557863 PST_0099 PST_0100     TRUE 0.783 44.000 0.050 1.000 Y NA
 3557863 3557864 PST_0100 PST_0101     TRUE 0.987 13.000 0.100 0.005 Y NA
 3557865 3557866 PST_0102 PST_0103     FALSE 0.264 142.000 0.051 NA   NA
 3557869 3557870 PST_0106 PST_0107   rpmB FALSE 0.015 297.000 0.000 1.000 N NA
 3557870 3557871 PST_0107 PST_0108 rpmB rpmG TRUE 0.995 12.000 0.332 0.014 Y NA
 3557871 3557872 PST_0108 PST_0109 rpmG   FALSE 0.153 95.000 0.002 1.000 N NA
 3557872 3557873 PST_0109 PST_0110     TRUE 0.531 59.000 0.081 NA   NA
 3557874 3557875 PST_0111 PST_0112   thrB FALSE 0.208 50.000 0.007 NA   NA
 3557875 3557876 PST_0112 PST_0114 thrB   TRUE 0.849 25.000 0.204 NA   NA
 3557878 3557879 PST_0115 PST_0116     TRUE 0.995 -3.000 0.647 NA   NA
 3557879 3557880 PST_0116 PST_0117     TRUE 0.976 16.000 0.727 NA   NA
 3557880 3557881 PST_0117 PST_0118     TRUE 0.877 109.000 0.800 NA   NA
 3557881 3557882 PST_0118 PST_0119     FALSE 0.006 462.000 0.000 NA   NA
 3557883 3557884 PST_0120 PST_0121     FALSE 0.349 122.000 0.056 1.000   NA
 3557885 3557886 PST_0122 PST_0123 pntB pntAB TRUE 0.987 10.000 0.144 0.001   NA
 3557886 3557887 PST_0123 PST_0124 pntAB pntAA TRUE 0.995 14.000 0.829 0.001   NA
 3557888 3557889 PST_0125 PST_0126 xcpR xcpS TRUE 0.960 151.000 0.653 0.004 Y NA
 3557889 3557890 PST_0126 PST_0127 xcpS xcpT TRUE 0.999 6.000 0.599 0.004 Y NA
 3557890 3557891 PST_0127 PST_0128 xcpT xcpU TRUE 0.998 4.000 0.425 0.004 Y NA
 3557891 3557892 PST_0128 PST_0129 xcpU xcpV TRUE 0.998 -3.000 0.605 0.004   NA
 3557892 3557893 PST_0129 PST_0130 xcpV xcpW TRUE 0.998 0.000 0.569 0.004   NA
 3557893 3557894 PST_0130 PST_0131 xcpW xcpX TRUE 0.979 -3.000 0.024 1.000 Y NA
 3557894 3557895 PST_0131 PST_0132 xcpX xcpY FALSE 0.420 201.000 0.020 0.078 Y NA
 3557895 3557896 PST_0132 PST_0133 xcpY xcpZ TRUE 0.998 3.000 0.811 1.000 Y NA
 3557897 3557898 PST_0134 PST_0135   recG FALSE 0.335 76.000 0.038 NA N NA
 3557898 3557899 PST_0135 PST_0136 recG   TRUE 0.987 5.000 0.117 1.000 Y NA
 3557900 3557901 PST_0137 PST_0138     FALSE 0.053 184.000 0.004 1.000 N NA
 3557901 3557902 PST_0138 PST_0139     TRUE 0.899 60.000 0.667 NA   NA
 3557902 3557903 PST_0139 PST_0140     FALSE 0.202 119.000 0.025 NA   NA
 3557904 3557905 PST_0141 PST_0142     FALSE 0.392 24.000 0.000 NA   NA
 3557905 3557906 PST_0142 PST_0143     FALSE 0.005 519.000 0.000 NA   NA
 3557907 3557908 PST_0144 PST_0145     TRUE 0.928 -3.000 0.037 1.000 N NA
 3557909 3557910 PST_0146 PST_0147     FALSE 0.348 156.000 0.100 NA   NA
 3557911 3557912 PST_0148 PST_0149     TRUE 0.613 86.000 0.149 NA   NA
 3557912 3557913 PST_0149 PST_0150     TRUE 0.953 3.000 0.071 NA   NA
 3557914 3557915 PST_0151 PST_0153     TRUE 0.959 32.000 0.419 1.000 Y NA
 3557916 3557917 PST_0152 PST_0154     FALSE 0.015 295.000 0.000 1.000 N NA
 3557917 3557918 PST_0154 PST_0155     TRUE 0.763 15.000 0.044 1.000 N NA
 3557920 3557921 PST_0157 PST_0158     TRUE 0.983 -3.000 0.214 NA   NA
 3557924 3557925 PST_0161 PST_0162 selB selA TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.001 N NA
 3557925 3557926 PST_0162 PST_0163 selA   TRUE 0.959 -3.000 0.083 NA N NA
 3557926 3557927 PST_0163 PST_0164   fdnI-1 FALSE 0.393 127.000 0.091 NA N NA
 3557927 3557928 PST_0164 PST_0165 fdnI-1 fdnH-1 TRUE 0.980 58.000 0.538 0.002 Y NA
 3557928 3557929 PST_0165 PST_0166 fdnH-1   TRUE 0.994 0.000 0.128 0.002   NA
 3557929 3557930 PST_0166 PST_0167     TRUE 0.856 49.000 0.400 1.000   NA
 3557930 3557931 PST_0167 PST_0168     TRUE 0.560 152.000 0.222 1.000   NA
 3557932 3557933 PST_0169 PST_0170 ohr   TRUE 0.674 39.000 0.105 1.000   NA
 3557934 3557935 PST_0171 PST_0172     FALSE 0.063 186.000 0.007 1.000   NA
 3557935 3557936 PST_0172 PST_0173   uvrD TRUE 0.620 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3557938 3557939 PST_0175 PST_0176     FALSE 0.223 43.000 0.005 NA   NA
 3557939 3557940 PST_0176 PST_0177     FALSE 0.057 185.000 0.010 NA   NA
 3557940 3557941 PST_0177 PST_0178     FALSE 0.033 285.000 0.036 1.000 N NA
 3557941 3557942 PST_0178 PST_0179   ectC TRUE 0.556 69.000 0.079 1.000   NA
 3557942 3557943 PST_0179 PST_0180 ectC ectB TRUE 0.987 11.000 0.572 1.000   NA
 3557943 3557944 PST_0180 PST_0181 ectB ectA TRUE 0.999 -3.000 0.793 0.001   NA
 3557944 3557945 PST_0181 PST_0182 ectA zwf-3 FALSE 0.006 571.000 0.000 1.000   NA
 3557946 3557947 PST_0183 PST_0184     TRUE 0.750 98.000 0.316 NA   NA
 3557949 3557950 PST_0186 PST_0187 accC-2 oadA TRUE 0.988 11.000 0.354 0.068 N NA
 3557950 3557951 PST_0187 PST_0188 oadA   FALSE 0.067 190.000 0.019 NA   NA
 3557951 3557952 PST_0188 PST_0189     TRUE 0.977 2.000 0.162 NA   NA
 3557952 3557953 PST_0189 PST_0190     FALSE 0.216 66.000 0.011 NA   NA
 3557953 3557954 PST_0190 PST_0191     FALSE 0.251 45.000 0.011 1.000 N NA
 3557955 3557956 PST_0192 PST_0193   ansA TRUE 0.518 128.000 0.017 1.000 Y NA
 3557956 3557957 PST_0193 PST_0194 ansA   TRUE 0.934 -37.000 0.095 1.000 Y NA
 3557959 3557960 PST_0196 PST_0197   aspA TRUE 0.871 35.000 0.353 1.000 N NA
 3557961 3557962 PST_0198 PST_0199     FALSE 0.226 200.000 0.133 1.000 N NA
 3557962 3557963 PST_0199 PST_0200     FALSE 0.335 68.000 0.030 1.000 N NA
 3557963 3557964 PST_0200 PST_0201     FALSE 0.360 48.000 0.030 1.000 N NA
 3557964 3557965 PST_0201 PST_0202   purE FALSE 0.049 186.000 0.002 1.000 N NA
 3557965 3557966 PST_0202 PST_0203 purE purK TRUE 0.943 77.000 0.136 0.001 Y NA
 3557966 3557967 PST_0203 PST_0204 purK   FALSE 0.426 85.000 0.050 1.000   NA
 3557967 3557968 PST_0204 PST_0205     TRUE 0.814 53.000 0.333 NA   NA
 3557968 3557969 PST_0205 PST_0206     TRUE 0.778 6.000 0.008 NA   NA
 3557970 3557971 PST_0207 PST_0208 ldhA cysA TRUE 0.818 4.000 0.008 1.000 N NA
 3557971 3557972 PST_0208 PST_0209 cysA cysW TRUE 0.998 -3.000 0.587 1.000 Y NA
 3557972 3557973 PST_0209 PST_0210 cysW cysT TRUE 0.997 11.000 0.935 0.001 N NA
 3557973 3557974 PST_0210 PST_0211 cysT cysP TRUE 0.644 140.000 0.066 0.003 N NA
 3557974 3557975 PST_0211 PST_0212 cysP   FALSE 0.139 271.000 0.188 NA   NA
 3557976 3557977 PST_0213 PST_0214   lsfA FALSE 0.257 65.000 0.000 1.000   NA
 3557980 3557981 PST_0217 PST_0218     FALSE 0.005 542.000 0.000 NA   NA
 3557983 3557984 PST_0220 PST_0221     FALSE 0.409 -64.000 0.000 NA   NA
 3557987 3557988 PST_0224 PST_0225     TRUE 0.997 3.000 1.000 1.000   NA
 3557988 3557989 PST_0225 PST_0226     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3557989 3557990 PST_0226 PST_0227     FALSE 0.215 61.000 0.000 NA   NA
 3557991 3557992 PST_0228 PST_0229     TRUE 0.862 1.000 0.000 NA   NA
 3557992 3557993 PST_0229 PST_0230     TRUE 0.720 11.000 0.000 NA   NA
 3557993 3557994 PST_0230 PST_0231     TRUE 0.776 5.000 0.000 NA N NA
 3557994 3557995 PST_0231 PST_0232     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3557995 3557996 PST_0232 PST_0233     TRUE 0.907 11.000 0.073 NA   NA
 3557996 3557997 PST_0233 PST_0234     FALSE 0.377 85.000 0.045 NA   NA
 3557997 3557998 PST_0234 PST_0235     TRUE 0.960 3.000 0.087 1.000 N NA
 3557998 3557999 PST_0235 PST_0236     FALSE 0.224 63.000 0.000 1.000 N NA
 3557999 3558000 PST_0236 PST_0237     TRUE 0.861 2.000 0.000 1.000 N NA
 3558000 3558001 PST_0237 PST_0238     TRUE 0.947 16.000 0.333 1.000   NA
 3558001 3558002 PST_0238 PST_0239     TRUE 0.527 18.000 0.000 1.000   NA
 3558002 3558003 PST_0239 PST_0240   arsC-3 TRUE 0.834 25.000 0.000 0.002   NA
 3558003 3558004 PST_0240 PST_0241 arsC-3   TRUE 0.980 -3.000 0.179 1.000 N NA
 3558005 3558006 PST_0242 PST_0243     TRUE 0.970 -3.000 0.111 NA   NA
 3558006 3558007 PST_0243 PST_0244     FALSE 0.041 206.000 0.000 NA   NA
 3558007 3558008 PST_0244 PST_0245     TRUE 0.912 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 3558008 3558009 PST_0245 PST_0246     FALSE 0.110 146.000 0.000 NA   NA
 3558009 3558010 PST_0246 PST_0247     FALSE 0.006 470.000 0.000 NA   NA
 3558011 3558012 PST_0248 PST_0249     FALSE 0.039 198.000 0.000 NA N NA
 3558012 3558013 PST_0249 PST_0250     FALSE 0.148 113.000 0.000 NA   NA
 3558013 3558014 PST_0250 PST_0251     TRUE 0.912 -3.000 0.024 1.000   NA
 3558014 3558015 PST_0251 PST_0252     TRUE 0.993 -3.000 0.051 0.070 Y NA
 3558015 3558016 PST_0252 PST_0253     FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 3558016 3558017 PST_0253 PST_0254     TRUE 0.940 49.000 1.000 NA   NA
 3558017 3558018 PST_0254 PST_0256     FALSE 0.003 968.000 0.000 NA   NA
 3558020 3558021 PST_0257 PST_0258     FALSE 0.009 374.000 0.000 NA   NA
 3558021 3558022 PST_0258 PST_0259     TRUE 0.905 -16.000 0.154 NA   NA
 3558022 3558023 PST_0259 PST_0260     FALSE 0.082 167.000 0.000 NA   NA
 3558023 3558024 PST_0260 PST_0261     FALSE 0.167 101.000 0.000 NA   NA
 3558024 3558025 PST_0261 PST_0262     FALSE 0.245 91.000 0.023 NA   NA
 3558025 3558026 PST_0262 PST_0263     TRUE 0.994 -7.000 0.524 1.000 Y NA
 3558028 3558029 PST_0265 PST_0266 osmC   FALSE 0.255 42.000 0.011 NA   NA
 3558029 3558030 PST_0266 PST_0267     FALSE 0.218 70.000 0.000 NA   NA
 3558030 3558031 PST_0267 PST_0268     FALSE 0.169 122.000 0.000 1.000   NA
 3558033 3558034 PST_0270 PST_0271     FALSE 0.449 98.000 0.068 1.000   NA
 3558035 3558036 PST_0272 PST_0273     TRUE 0.947 42.000 0.937 1.000   NA
 3558036 3558037 PST_0273 PST_0274   argE FALSE 0.329 119.000 0.048 1.000   NA
 3558037 3558038 PST_0274 PST_0275 argE argA TRUE 0.852 139.000 0.087 0.003 Y NA
 3558039 3558040 PST_0276 PST_0277 gshA   FALSE 0.221 127.000 0.036 NA N NA
 3558040 3558041 PST_0277 PST_0278     TRUE 0.909 3.000 0.036 NA N NA
 3558041 3558042 PST_0278 PST_0279     FALSE 0.178 98.000 0.000 1.000 N NA
 3558042 3558043 PST_0279 PST_0280     TRUE 0.972 7.000 0.000 0.001   NA
 3558043 3558044 PST_0280 PST_0281   bcsA TRUE 0.988 -3.000 0.045 0.001   NA
 3558044 3558045 PST_0281 PST_0282 bcsA   TRUE 0.993 2.000 0.545 NA N NA
 3558045 3558046 PST_0282 PST_0283     FALSE 0.028 238.000 0.000 NA   NA
 3558046 3558047 PST_0283 PST_0284     FALSE 0.362 176.000 0.167 NA   NA
 3558048 3558049 PST_0285 PST_0286   ompR FALSE 0.151 115.000 0.000 1.000 N NA
 3558049 3558050 PST_0286 PST_0287 ompR envZ TRUE 0.976 77.000 0.584 0.035 Y NA
 3558051 3558052 PST_0288 PST_0289 rimK   TRUE 0.968 -3.000 0.102 1.000 N NA
 3558055 3558056 PST_0292 PST_0293 hslO pckA FALSE 0.451 49.000 0.048 1.000 N NA
 3558056 3558057 PST_0293 PST_0294 pckA   FALSE 0.367 164.000 0.004 1.000 Y NA
 3558061 3558062 PST_0298 PST_0299     FALSE 0.006 451.000 0.000 1.000 N NA
 3558062 3558063 PST_0299 PST_0300     TRUE 0.993 11.000 0.500 NA Y NA
 3558063 3558064 PST_0300 PST_0301     FALSE 0.215 61.000 0.000 NA   NA
 3558064 3558065 PST_0301 PST_0302     FALSE 0.307 112.000 0.047 NA   NA
 3558065 3558066 PST_0302 PST_0303     FALSE 0.250 126.000 0.038 NA   NA
 3558067 3558068 PST_0304 PST_0305     TRUE 0.990 -10.000 0.167 0.021 Y NA
 3558068 3558069 PST_0305 PST_0306     TRUE 0.988 -7.000 0.261 1.000 Y NA
 3558069 3558070 PST_0306 PST_0307     TRUE 0.997 -3.000 0.522 NA Y NA
 3558070 3558071 PST_0307 PST_0308     TRUE 0.818 -55.000 0.000 NA Y NA
 3558071 3558072 PST_0308 PST_0309     FALSE 0.013 281.000 0.000 NA N NA
 3558073 3558074 PST_0310 PST_0311     TRUE 0.997 3.000 0.500 1.000 Y NA
 3558074 3558075 PST_0311 PST_0312     TRUE 0.742 25.000 0.094 1.000 N NA
 3558075 3558076 PST_0312 PST_0313     TRUE 0.770 39.000 0.185 1.000   NA
 3558076 3558077 PST_0313 PST_0314     FALSE 0.215 72.000 0.000 NA   NA
 3558078 3558079 PST_0315 PST_0316     FALSE 0.019 273.000 0.000 1.000 N NA
 3558079 3558080 PST_0316 PST_0317     FALSE 0.014 323.000 0.000 1.000   NA
 3558081 3558082 PST_0318 PST_0319 nudE cysQ TRUE 0.991 -3.000 0.373 1.000   NA
 3558083 3558084 PST_0320 PST_0322     FALSE 0.140 129.000 0.014 NA   NA
 3558085 3558086 PST_0321 PST_0323   glgP FALSE 0.268 40.000 0.000 NA   NA
 3558086 3558087 PST_0323 PST_0324 glgP fbp TRUE 0.597 184.000 0.032 0.014 Y NA
 3558087 3558088 PST_0324 PST_0325 fbp   TRUE 0.963 4.000 0.103 1.000   NA
 3558088 3558089 PST_0325 PST_0326     TRUE 0.609 82.000 0.119 1.000   NA
 3558089 3558090 PST_0326 PST_0327   blc TRUE 0.878 26.000 0.250 1.000   NA
 3558092 3558093 PST_0329 PST_0330 pip dtD TRUE 0.976 -3.000 0.026 0.042   NA
 3558094 3558095 PST_0331 PST_0332     FALSE 0.061 187.000 0.014 NA   NA
 3558095 3558096 PST_0332 PST_0333   tatC TRUE 0.960 -3.000 0.076 NA   NA
 3558096 3558097 PST_0333 PST_0334 tatC tatB TRUE 0.996 -3.000 0.314 NA Y NA
 3558097 3558098 PST_0334 PST_0335 tatB tatA TRUE 0.852 68.000 0.015 0.008 Y NA
 3558098 3558099 PST_0335 PST_0336 tatA hisE FALSE 0.397 21.000 0.007 1.000 N NA
 3558099 3558100 PST_0336 PST_0337 hisE hisI TRUE 0.993 -7.000 0.152 0.004 Y NA
 3558100 3558101 PST_0337 PST_0338 hisI ubiB FALSE 0.309 50.000 0.018 1.000   NA
 3558101 3558102 PST_0338 PST_0339 ubiB   TRUE 0.992 -3.000 0.432 1.000   NA
 3558102 3558103 PST_0339 PST_0340   ubiE TRUE 0.980 0.000 0.145 1.000   NA
 3558103 3558104 PST_0340 PST_0341 ubiE   FALSE 0.109 147.000 0.000 NA   NA
 3558104 3558105 PST_0341 PST_0342     FALSE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 3558105 3558106 PST_0342 PST_0343     FALSE 0.014 302.000 0.000 NA   NA
 3558106 3558107 PST_0343 PST_0344   hslU TRUE 0.531 49.000 0.070 NA   NA
 3558107 3558108 PST_0344 PST_0345 hslU hslV TRUE 0.981 28.000 0.752 1.000 Y NA
 3558108 3558109 PST_0345 PST_0346 hslV   FALSE 0.124 121.000 0.004 1.000 N NA
 3558109 3558110 PST_0346 PST_0347     FALSE 0.194 90.000 0.000 1.000 N NA
 3558112 3558113 PST_0349 PST_0350 ntrC ntrB TRUE 0.999 -3.000 0.587 0.092 Y NA
 3558113 3558114 PST_0350 PST_0351 ntrB   TRUE 0.791 8.000 0.014 NA   NA
 3558114 3558115 PST_0351 PST_0352     TRUE 0.996 -3.000 0.889 NA   NA
 3558115 3558116 PST_0352 PST_0353   glnA FALSE 0.071 165.000 0.005 NA   NA
 3558117 3558118 PST_0354 PST_0355 thiI typA FALSE 0.082 168.000 0.011 1.000 N NA
 3558118 3558119 PST_0355 PST_0356 typA   FALSE 0.070 328.000 0.000 1.000 Y NA
 3558121 3558122 PST_0358 PST_0359     TRUE 0.997 -3.000 0.231 0.092 Y NA
 3558124 3558125 PST_0361 PST_0362     TRUE 0.508 -31.000 0.000 NA   NA
 3558125 3558126 PST_0362 PST_0363     FALSE 0.029 235.000 0.000 NA   NA
 3558126 3558127 PST_0363 PST_0364     TRUE 0.997 -7.000 0.909 1.000 Y NA
 3558127 3558128 PST_0364 PST_0365     FALSE 0.235 64.000 0.014 NA   NA
 3558128 3558129 PST_0365 PST_0366     FALSE 0.112 153.000 0.014 NA   NA
 3558129 3558130 PST_0366 PST_0367     TRUE 0.871 57.000 0.519 1.000 N NA
 3558130 3558131 PST_0367 PST_0368     TRUE 0.583 71.000 0.105 NA   NA
 3558132 3558133 PST_0369 PST_0370     FALSE 0.439 127.000 0.105 NA   NA
 3558133 3558134 PST_0370 PST_0371     TRUE 0.977 -13.000 0.571 1.000 N NA
 3558135 3558136 PST_0372 PST_0373     TRUE 0.966 -3.000 0.085 1.000   NA
 3558136 3558137 PST_0373 PST_0374     TRUE 0.755 114.000 0.400 NA   NA
 3558138 3558139 PST_0375 PST_0376     TRUE 0.977 -9.000 0.475 NA   NA
 3558139 3558140 PST_0376 PST_0377   cstA TRUE 0.993 -3.000 0.512 NA   NA
 3558141 3558142 PST_0378 PST_0379     TRUE 0.978 0.000 0.143 NA   NA
 3558142 3558143 PST_0379 PST_0380     TRUE 0.804 -7.000 0.023 1.000   NA
 3558143 3558144 PST_0380 PST_0381     TRUE 0.776 -7.000 0.023 NA   NA
 3558144 3558145 PST_0381 PST_0382     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 3558145 3558146 PST_0382 PST_0383     TRUE 0.983 -3.000 0.029 0.003   NA
 3558146 3558147 PST_0383 PST_0384     TRUE 0.998 -3.000 0.219 0.002 Y NA
 3558147 3558148 PST_0384 PST_0385     TRUE 0.999 -3.000 0.464 0.002 Y NA
 3558149 3558150 PST_0386 PST_0387     FALSE 0.037 213.000 0.000 NA   NA
 3558150 3558151 PST_0387 PST_0388   phoQ FALSE 0.374 77.000 0.041 NA   NA
 3558151 3558152 PST_0388 PST_0389 phoQ phoP TRUE 0.988 -66.000 0.940 1.000 Y NA
 3558152 3558153 PST_0389 PST_0390 phoP oprH TRUE 0.694 76.000 0.180 1.000   NA
 3558153 3558154 PST_0390 PST_0391 oprH   FALSE 0.018 275.000 0.000 NA   NA
 3558154 3558155 PST_0391 PST_0392     FALSE 0.248 45.000 0.000 NA   NA
 3558155 3558156 PST_0392 PST_0393     TRUE 0.882 18.000 0.000 0.002   NA
 3558156 3558157 PST_0393 PST_0394   corR TRUE 0.937 72.000 1.000 1.000   NA
 3558158 3558159 PST_0395 PST_0396     FALSE 0.415 70.000 0.047 NA   NA
 3558160 3558161 PST_0397 PST_0398   serA FALSE 0.008 401.000 0.000 NA   NA
 3558162 3558163 PST_0399 PST_0400     TRUE 0.669 28.000 0.071 1.000 N NA
 3558163 3558164 PST_0400 PST_0401     TRUE 0.503 33.000 0.041 NA   NA
 3558164 3558165 PST_0401 PST_0402     TRUE 0.638 87.000 0.167 NA   NA
 3558166 3558167 PST_0403 PST_0404   rpiA FALSE 0.118 167.000 0.025 NA   NA
 3558168 3558169 PST_0405 PST_0406 ilvA-2   TRUE 0.584 21.000 0.034 NA   NA
 3558170 3558171 PST_0407 PST_0408     FALSE 0.266 115.000 0.032 1.000   NA
 3558172 3558173 PST_0409 PST_0410   ptsP TRUE 0.737 26.000 0.097 1.000 N NA
 3558175 3558176 PST_0412 PST_0413   lgt TRUE 0.838 11.000 0.030 1.000   NA
 3558176 3558177 PST_0413 PST_0414 lgt thyA TRUE 0.649 82.000 0.164 1.000 N NA
 3558177 3558178 PST_0414 PST_0415 thyA   FALSE 0.031 231.000 0.000 1.000 N NA
 3558179 3558180 PST_0416 PST_0417     TRUE 0.999 0.000 0.902 0.053 Y NA
 3558180 3558181 PST_0417 PST_0418     TRUE 0.997 0.000 0.447 1.000 Y NA
 3558181 3558182 PST_0418 PST_0419     TRUE 0.999 -7.000 1.000 0.022 Y NA
 3558182 3558183 PST_0419 PST_0420     TRUE 0.997 -3.000 0.548 NA Y NA
 3558183 3558184 PST_0420 PST_0421     FALSE 0.006 404.000 0.000 NA N NA
 3558185 3558186 PST_0422 PST_0423     TRUE 0.638 165.000 0.412 1.000 N NA
 3558187 3558188 PST_0424 PST_0425     FALSE 0.051 194.000 0.000 NA   NA
 3558188 3558189 PST_0425 PST_0426   phoR FALSE 0.293 102.000 0.037 NA   NA
 3558189 3558190 PST_0426 PST_0427 phoR phoB TRUE 0.965 69.000 0.453 0.092 Y NA
 3558190 3558191 PST_0427 PST_0428 phoB ubiA FALSE 0.290 119.000 0.043 1.000 N NA
 3558191 3558192 PST_0428 PST_0429 ubiA   TRUE 0.909 44.000 0.248 NA Y NA
 3558192 3558193 PST_0429 PST_0430   glcC FALSE 0.120 109.000 0.010 NA N NA
 3558194 3558195 PST_0431 PST_0432 glcD glcE TRUE 0.996 0.000 0.070 0.017 Y NA
 3558195 3558196 PST_0432 PST_0433 glcE glcF TRUE 0.991 7.000 0.074 0.059 Y NA
 3558196 3558197 PST_0433 PST_0434 glcF glcG FALSE 0.443 74.000 0.057 NA   NA
 3558197 3558198 PST_0434 PST_0435 glcG   TRUE 0.810 21.000 0.125 NA   NA
 3558198 3558199 PST_0435 PST_0436     FALSE 0.194 217.000 0.000 1.000 Y NA
 3558199 3558200 PST_0436 PST_0437   rubA TRUE 0.892 115.000 0.400 1.000 Y NA
 3558200 3558201 PST_0437 PST_0438 rubA rubB TRUE 0.743 36.000 0.042 0.078   NA
 3558201 3558202 PST_0438 PST_0439 rubB hupA TRUE 0.682 105.000 0.229 1.000   NA
 3558202 3558203 PST_0439 PST_0440 hupA   TRUE 0.649 143.000 0.290 1.000   NA
 3558205 3558206 PST_0442 PST_0443 gcdH   TRUE 0.647 66.000 0.143 1.000 N NA
 3558208 3558209 PST_0445 PST_0446     TRUE 0.470 -31.000 0.007 NA   NA
 3558209 3558210 PST_0446 PST_0447     TRUE 0.986 -3.000 0.257 NA   NA
 3558210 3558211 PST_0447 PST_0448     TRUE 0.928 19.000 0.338 NA   NA
 3558216 3558217 PST_0453 PST_0454     TRUE 0.993 12.000 0.286 0.078 Y NA
 3558217 3558218 PST_0454 PST_0455     TRUE 0.998 12.000 0.571 0.001 Y NA
 3558219 3558220 PST_0456 PST_0457     TRUE 0.783 36.000 0.200 NA   NA
 3558221 3558222 PST_0458 PST_0459   spoT TRUE 0.635 105.000 0.215 NA N NA
 3558222 3558223 PST_0459 PST_0460 spoT rpoZ TRUE 0.911 61.000 0.291 1.000 Y NA
 3558223 3558224 PST_0460 PST_0461 rpoZ gmk TRUE 0.782 120.000 0.471 1.000 N NA
 3558224 3558225 PST_0461 PST_0462 gmk   TRUE 0.778 62.000 0.276 NA   NA
 3558226 3558227 PST_0463 PST_0464 rph   TRUE 0.548 17.000 0.018 NA   NA
 3558229 3558230 PST_0466 PST_0467 pyrE   TRUE 0.513 20.000 0.022 NA   NA
 3558230 3558231 PST_0467 PST_0468     FALSE 0.040 207.000 0.000 NA   NA
 3558232 3558233 PST_0469 PST_0470 argB   TRUE 0.713 17.000 0.044 1.000 N NA
 3558233 3558234 PST_0470 PST_0471   dut FALSE 0.425 45.000 0.039 1.000 N NA
 3558234 3558235 PST_0471 PST_0472 dut coaBC TRUE 0.982 2.000 0.201 1.000 N NA
 3558237 3558238 PST_0474 PST_0475     TRUE 0.974 4.000 0.182 NA   NA
 3558239 3558240 PST_0476 PST_0477 paaC   FALSE 0.204 172.000 0.059 1.000 N NA
 3558240 3558241 PST_0477 PST_0478     FALSE 0.188 102.000 0.017 NA   NA
 3558242 3558243 PST_0479 PST_0480     FALSE 0.043 203.000 0.000 NA   NA
 3558243 3558244 PST_0480 PST_0481     FALSE 0.453 91.000 0.069 1.000 N NA
 3558244 3558245 PST_0481 PST_0482   lrp FALSE 0.231 68.000 0.012 1.000 N NA
 3558246 3558247 PST_0483 PST_0484 dadA   FALSE 0.006 462.000 0.000 1.000 N NA
 3558247 3558248 PST_0484 PST_0485   cycB FALSE 0.236 160.000 0.057 1.000 N NA
 3558248 3558249 PST_0485 PST_0486 cycB   FALSE 0.243 134.000 0.035 1.000   NA
 3558250 3558251 PST_0487 PST_0488 xpt   FALSE 0.209 68.000 0.009 NA   NA
 3558251 3558252 PST_0488 PST_0489     TRUE 0.932 10.000 0.095 NA   NA
 3558252 3558253 PST_0489 PST_0490     TRUE 0.998 3.000 0.231 0.006 Y NA
 3558254 3558255 PST_0491 PST_0492     TRUE 0.986 -3.000 0.250 1.000 N NA
 3558255 3558256 PST_0492 PST_0493     TRUE 0.766 65.000 0.250 1.000 N NA
 3558256 3558257 PST_0493 PST_0494   mmsA-1 TRUE 0.977 5.000 0.043 1.000 Y NA
 3558257 3558258 PST_0494 PST_0495 mmsA-1   FALSE 0.353 92.000 0.043 1.000 N NA
 3558259 3558260 PST_0496 PST_0497   rep FALSE 0.193 97.000 0.008 1.000   NA
 3558262 3558263 PST_0499 PST_0500     FALSE 0.114 130.000 0.005 1.000 N NA
 3558263 3558264 PST_0500 PST_0501     TRUE 0.600 37.000 0.074 NA   NA
 3558265 3558266 PST_0502 PST_0503 glnK amtB1 TRUE 0.702 39.000 0.135 1.000 N NA
 3558266 3558267 PST_0503 PST_0504 amtB1 amtB2 TRUE 0.616 192.000 0.026 0.001 Y NA
 3558267 3558268 PST_0504 PST_0505 amtB2   FALSE 0.148 102.000 0.007 NA   NA
 3558268 3558269 PST_0505 PST_0506     FALSE 0.242 78.000 0.018 NA   NA
 3558270 3558271 PST_0507 PST_0508   xerC TRUE 0.991 -3.000 0.367 1.000   NA
 3558271 3558272 PST_0508 PST_0509 xerC   TRUE 0.906 57.000 0.714 NA   NA
 3558272 3558273 PST_0509 PST_0510   dapF TRUE 0.979 -3.000 0.175 NA   NA
 3558273 3558274 PST_0510 PST_0511 dapF lysA TRUE 0.992 11.000 0.104 0.002 Y NA
 3558274 3558275 PST_0511 PST_0512 lysA lppL TRUE 0.869 13.000 0.071 NA   NA
 3558276 3558277 PST_0513 PST_0514 cyaY rnk FALSE 0.069 161.000 0.008 NA N NA
 3558278 3558279 PST_0515 PST_0516   cyaA TRUE 0.562 15.000 0.000 NA   NA
 3558279 3558280 PST_0516 PST_0517 cyaA   TRUE 0.478 151.000 0.164 1.000   NA
 3558280 3558281 PST_0517 PST_0518     TRUE 0.697 79.000 0.200 NA   NA
 3558281 3558282 PST_0518 PST_0519     FALSE 0.459 71.000 0.059 NA   NA
 3558282 3558283 PST_0519 PST_0520     TRUE 0.578 78.000 0.111 NA   NA
 3558283 3558284 PST_0520 PST_0521   argH FALSE 0.185 56.000 0.000 NA N NA
 3558285 3558286 PST_0522 PST_0523   algR TRUE 0.994 -51.000 0.775 0.034 Y NA
 3558286 3558287 PST_0523 PST_0524 algR hemC FALSE 0.183 150.000 0.032 1.000 N NA
 3558287 3558288 PST_0524 PST_0525 hemC hemD TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.002 Y NA
 3558288 3558289 PST_0525 PST_0526 hemD   TRUE 0.981 -61.000 0.600 1.000 Y NA
 3558289 3558290 PST_0526 PST_0527   hemY TRUE 0.998 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 3558290 3558291 PST_0527 PST_0528 hemY dsbH FALSE 0.290 119.000 0.042 1.000 N NA
 3558291 3558292 PST_0528 PST_0529 dsbH algQ FALSE 0.111 264.000 0.133 1.000 N NA
 3558292 3558293 PST_0529 PST_0530 algQ algP FALSE 0.159 105.000 0.000 NA   NA
 3558295 3558296 PST_0532 PST_0533     TRUE 0.969 -3.000 0.108 NA   NA
 3558296 3558297 PST_0533 PST_0534     TRUE 0.800 10.000 0.022 NA   NA
 3558297 3558298 PST_0534 PST_0535     FALSE 0.329 31.000 0.000 1.000 N NA
 3558298 3558299 PST_0535 PST_0536     TRUE 0.530 15.000 0.007 NA   NA
 3558300 3558301 PST_0537 PST_0538     FALSE 0.125 112.000 0.000 NA N NA
 3558301 3558302 PST_0538 PST_0539   elbB TRUE 0.659 69.000 0.021 NA Y NA
 3558303 3558304 PST_0540 PST_0541 hemB ppk TRUE 0.586 21.000 0.033 1.000 N NA
 3558306 3558307 PST_0543 PST_0544 rho   FALSE 0.175 124.000 0.025 NA N NA
 3558307 3558308 PST_0544 PST_0545     TRUE 0.901 -31.000 0.039 NA Y NA
 3558309 3558310 PST_0546 PST_0547   argS TRUE 0.940 1.000 0.052 NA N NA
 3558310 3558311 PST_0547 PST_0549 argS priA FALSE 0.266 115.000 0.036 1.000 N NA
 3558312 3558313 PST_0548 PST_0550   maeB FALSE 0.428 142.000 0.119 1.000 N NA
 3558314 3558315 PST_0551 PST_0552 ponA   FALSE 0.005 511.000 0.000 NA   NA
 3558316 3558317 PST_0553 PST_0554 pilM pilN TRUE 0.998 0.000 0.616 NA Y NA
 3558317 3558318 PST_0554 PST_0555 pilN pilO TRUE 0.998 -3.000 0.770 NA Y NA
 3558318 3558319 PST_0555 PST_0556 pilO pilP TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA Y NA
 3558319 3558320 PST_0556 PST_0557 pilP pilQ TRUE 0.990 15.000 0.668 NA Y NA
 3558320 3558321 PST_0557 PST_0558 pilQ aroK TRUE 0.782 85.000 0.319 1.000 N NA
 3558321 3558322 PST_0558 PST_0559 aroK aroB TRUE 0.946 24.000 0.208 1.000 Y NA
 3558322 3558323 PST_0559 PST_0560 aroB   TRUE 0.797 11.000 0.020 1.000   NA
 3558323 3558324 PST_0560 PST_0561   gltB FALSE 0.160 174.000 0.037 1.000   NA
 3558324 3558325 PST_0561 PST_0562 gltB gltD TRUE 0.960 57.000 0.214 0.001 Y NA
 3558325 3558326 PST_0562 PST_0563 gltD hemE FALSE 0.234 101.000 0.024 1.000 N NA
 3558329 3558330 PST_0566 PST_0567   trxC FALSE 0.206 78.000 0.000 NA   NA
 3558330 3558331 PST_0567 PST_0568 trxC metY FALSE 0.227 69.000 0.000 1.000 N NA
 3558331 3558332 PST_0568 PST_0569 metY   FALSE 0.209 93.000 0.010 1.000   NA
 3558333 3558334 PST_0570 PST_0571     FALSE 0.004 650.000 0.000 NA   NA
 3558334 3558335 PST_0571 PST_0572     TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 3558335 3558336 PST_0572 PST_0573     FALSE 0.050 206.000 0.000 1.000   NA
 3558338 3558339 PST_0575 PST_0576     FALSE 0.112 242.000 0.000 0.077   NA
 3558339 3558340 PST_0576 PST_0577     FALSE 0.078 169.000 0.000 NA   NA
 3558342 3558343 PST_0579 PST_0580     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 3558343 3558344 PST_0580 PST_0581     TRUE 0.982 18.000 0.500 1.000 Y NA
 3558344 3558345 PST_0581 PST_0582     FALSE 0.030 567.000 0.000 1.000 Y NA
 3558345 3558346 PST_0582 PST_0583     FALSE 0.244 287.000 0.012 0.005 Y NA
 3558348 3558349 PST_0585 PST_0586     TRUE 0.991 -7.000 0.462 0.067   NA
 3558349 3558350 PST_0586 PST_0587     TRUE 0.990 -3.000 0.375 NA   NA
 3558350 3558351 PST_0587 PST_0588     TRUE 0.979 3.000 0.188 NA   NA
 3558352 3558353 PST_0589 PST_0590     FALSE 0.146 116.000 0.000 NA   NA
 3558353 3558354 PST_0590 PST_0591     FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 3558354 3558355 PST_0591 PST_0592     TRUE 0.582 51.000 0.095 NA   NA
 3558356 3558357 PST_0593 PST_0594     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558357 3558358 PST_0594 PST_0595     TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA   NA
 3558358 3558359 PST_0595 PST_0596     FALSE 0.118 152.000 0.009 1.000   NA
 3558359 3558360 PST_0596 PST_0597     FALSE 0.076 172.000 0.000 NA   NA
 3558361 3558362 PST_0598 PST_0599     TRUE 0.941 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3558362 3558363 PST_0599 PST_0600     FALSE 0.143 120.000 0.000 NA   NA
 3558363 3558364 PST_0600 PST_0601     FALSE 0.108 148.000 0.000 NA   NA
 3558364 3558365 PST_0601 PST_0602     FALSE 0.434 154.000 0.000 0.012   NA
 3558365 3558366 PST_0602 PST_0603     FALSE 0.420 21.000 0.000 NA   NA
 3558366 3558367 PST_0603 PST_0604   fadD FALSE 0.178 95.000 0.000 NA   NA
 3558367 3558368 PST_0604 PST_0605 fadD   FALSE 0.331 224.000 0.000 0.065 Y NA
 3558368 3558369 PST_0605 PST_0606     TRUE 0.926 73.000 0.375 1.000 Y NA
 3558369 3558370 PST_0606 PST_0607     TRUE 0.946 25.000 0.240 NA Y NA
 3558370 3558371 PST_0607 PST_0608     TRUE 0.813 79.000 0.120 NA Y NA
 3558372 3558373 PST_0609 PST_0610     FALSE 0.220 67.000 0.000 NA   NA
 3558374 3558375 PST_0611 PST_0612     FALSE 0.215 77.000 0.000 1.000 N NA
 3558378 3558379 PST_0615 PST_0616     TRUE 0.948 33.000 0.818 NA   NA
 3558379 3558380 PST_0616 PST_0617     TRUE 0.876 71.000 0.545 NA   NA
 3558380 3558381 PST_0617 PST_0618     TRUE 0.956 57.000 0.800 0.074   NA
 3558382 3558383 PST_0619 PST_0620     FALSE 0.003 893.000 0.000 NA   NA
 3558383 3558384 PST_0620 PST_0621     FALSE 0.259 68.000 0.000 1.000   NA
 3558384 3558385 PST_0621 PST_0622     TRUE 0.955 20.000 0.222 NA Y NA
 3558385 3558386 PST_0622 PST_0623     TRUE 0.565 96.000 0.000 NA Y NA
 3558387 3558388 PST_0624 PST_0625     TRUE 0.963 0.000 0.074 NA   NA
 3558389 3558390 PST_0626 PST_0627     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 3558390 3558391 PST_0627 PST_0628     FALSE 0.220 68.000 0.000 NA   NA
 3558391 3558392 PST_0628 PST_0629     FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 3558392 3558393 PST_0629 PST_0630     FALSE 0.216 62.000 0.000 NA   NA
 3558393 3558394 PST_0630 PST_0631     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 3558394 3558395 PST_0631 PST_0632     TRUE 0.562 15.000 0.000 NA   NA
 3558395 3558396 PST_0632 PST_0633     TRUE 0.994 -7.000 0.267 0.067 Y NA
 3558396 3558397 PST_0633 PST_0634     TRUE 0.671 83.000 0.033 NA Y NA
 3558397 3558398 PST_0634 PST_0635   hsdR FALSE 0.050 380.000 0.000 NA Y NA
 3558399 3558400 PST_0636 PST_0637     TRUE 0.747 122.000 0.400 NA   NA
 3558400 3558401 PST_0637 PST_0638     FALSE 0.006 425.000 0.000 NA   NA
 3558401 3558402 PST_0638 PST_0639     TRUE 0.982 0.000 0.020 0.005   NA
 3558402 3558403 PST_0639 PST_0640     FALSE 0.015 1262.000 0.000 0.067   NA
 3558403 3558404 PST_0640 PST_0641     TRUE 0.708 42.000 0.154 NA   NA
 3558404 3558405 PST_0641 PST_0642     FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 3558405 3558406 PST_0642 PST_0643     TRUE 0.997 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 3558407 3558408 PST_0644 PST_0645     TRUE 0.747 122.000 0.400 NA   NA
 3558408 3558409 PST_0645 PST_0646     FALSE 0.011 335.000 0.000 NA   NA
 3558409 3558410 PST_0646 PST_0647     TRUE 0.527 90.000 0.000 0.067   NA
 3558410 3558411 PST_0647 PST_0648     FALSE 0.003 684.000 0.000 NA N NA
 3558411 3558412 PST_0648 PST_0649     TRUE 0.747 122.000 0.400 NA   NA
 3558412 3558413 PST_0649 PST_0650     FALSE 0.009 369.000 0.000 NA   NA
 3558413 3558414 PST_0650 PST_0651     TRUE 0.551 111.000 0.157 NA   NA
 3558415 3558416 PST_0652 PST_0653     FALSE 0.047 198.000 0.000 NA   NA
 3558416 3558417 PST_0653 PST_0654     FALSE 0.004 641.000 0.000 NA   NA
 3558417 3558418 PST_0654 PST_0655     TRUE 0.912 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 3558418 3558419 PST_0655 PST_0656     FALSE 0.008 417.000 0.000 1.000   NA
 3558419 3558420 PST_0656 PST_0657     FALSE 0.007 454.000 0.000 1.000   NA
 3558420 3558421 PST_0657 PST_0658     FALSE 0.005 593.000 0.000 1.000   NA
 3558421 3558422 PST_0658 PST_0659     FALSE 0.177 112.000 0.000 1.000   NA
 3558422 3558423 PST_0659 PST_0660     FALSE 0.073 174.000 0.000 NA   NA
 3558423 3558424 PST_0660 PST_0661     FALSE 0.397 -69.000 0.000 NA   NA
 3558424 3558425 PST_0661 PST_0662     FALSE 0.010 389.000 0.000 1.000   NA
 3558427 3558428 PST_0664 PST_0665 cadA-2   TRUE 0.700 17.000 0.042 NA   NA
 3558428 3558429 PST_0665 PST_0666     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558429 3558430 PST_0666 PST_0667     FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 3558431 3558432 PST_0668 PST_0669     FALSE 0.402 135.000 0.000 0.067   NA
 3558433 3558434 PST_0670 PST_0671     FALSE 0.003 1053.000 0.000 NA   NA
 3558434 3558435 PST_0671 PST_0672     FALSE 0.026 244.000 0.000 NA   NA
 3558436 3558437 PST_0673 PST_0674   arcC-1 FALSE 0.003 1002.000 0.000 1.000 N NA
 3558437 3558438 PST_0674 PST_0675 arcC-1 arcB-1 FALSE 0.369 350.000 0.483 1.000 Y NA
 3558438 3558439 PST_0675 PST_0676 arcB-1 arcA-1 TRUE 0.710 64.000 0.033 1.000 Y NA
 3558439 3558440 PST_0676 PST_0677 arcA-1 arcD-1 TRUE 0.974 52.000 1.000 1.000 Y NA
 3558440 3558441 PST_0677 PST_0678 arcD-1   FALSE 0.115 142.000 0.000 NA   NA
 3558441 3558442 PST_0678 PST_0679     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558442 3558443 PST_0679 PST_0680     FALSE 0.227 66.000 0.000 1.000 N NA
 3558443 3558444 PST_0680 PST_0681     TRUE 0.978 2.000 0.000 0.004   NA
 3558444 3558445 PST_0681 PST_0682     TRUE 0.535 -36.000 0.000 1.000   NA
 3558445 3558446 PST_0682 PST_0683   phaC FALSE 0.377 -123.000 0.000 1.000 N NA
 3558446 3558447 PST_0683 PST_0684 phaC phaA TRUE 0.466 141.000 0.000 1.000 Y NA
 3558447 3558448 PST_0684 PST_0685 phaA phaB TRUE 0.722 37.000 0.000 1.000 Y NA
 3558450 3558451 PST_0687 PST_0688 gltS   FALSE 0.225 70.000 0.000 1.000 N NA
 3558451 3558452 PST_0688 PST_0689   tdcD TRUE 0.946 -3.000 0.054 1.000 N NA
 3558452 3558453 PST_0689 PST_0690 tdcD   TRUE 0.992 -3.000 0.136 1.000 Y NA
 3558453 3558454 PST_0690 PST_0691     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558457 3558458 PST_0694 PST_0695     TRUE 0.961 -3.000 0.078 NA   NA
 3558458 3558459 PST_0695 PST_0696     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3558459 3558460 PST_0696 PST_0697     FALSE 0.004 748.000 0.000 NA   NA
 3558460 3558461 PST_0697 PST_0698     TRUE 0.914 12.000 0.000 0.066   NA
 3558461 3558462 PST_0698 PST_0699     FALSE 0.005 661.000 0.000 1.000   NA
 3558462 3558463 PST_0699 PST_0700     TRUE 0.602 14.000 0.000 NA   NA
 3558463 3558464 PST_0700 PST_0701     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 3558464 3558465 PST_0701 PST_0702     FALSE 0.153 108.000 0.000 NA   NA
 3558468 3558469 PST_0705 PST_0706     FALSE 0.239 48.000 0.000 NA   NA
 3558469 3558470 PST_0706 PST_0707     FALSE 0.294 35.000 0.000 NA   NA
 3558472 3558473 PST_0709 PST_0710     FALSE 0.165 102.000 0.000 NA   NA
 3558473 3558474 PST_0710 PST_0711     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3558474 3558475 PST_0711 PST_0712   rpoD FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 3558475 3558476 PST_0712 PST_0713 rpoD dnaG FALSE 0.353 212.000 0.299 1.000 N NA
 3558476 3558477 PST_0713 PST_0714 dnaG rpsU FALSE 0.333 134.000 0.067 1.000 N NA
 3558480 3558481 PST_0717 PST_0718 folB-1 folK-1 TRUE 0.992 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 3558482 3558483 PST_0719 PST_0720 cca   TRUE 0.513 -126.000 0.032 NA   NA
 3558483 3558484 PST_0720 PST_0721     TRUE 0.990 11.000 0.761 NA   NA
 3558484 3558485 PST_0721 PST_0722   prkA TRUE 0.895 83.000 0.683 NA   NA
 3558485 3558486 PST_0722 PST_0723 prkA glpE FALSE 0.006 401.000 0.000 NA N NA
 3558486 3558487 PST_0723 PST_0724 glpE apaH TRUE 0.944 -3.000 0.045 1.000   NA
 3558487 3558488 PST_0724 PST_0725 apaH apaG TRUE 0.987 -3.000 0.267 NA   NA
 3558488 3558489 PST_0725 PST_0726 apaG ksgA TRUE 0.612 34.000 0.078 NA N NA
 3558489 3558490 PST_0726 PST_0727 ksgA pdxA TRUE 0.554 134.000 0.197 1.000 N NA
 3558490 3558491 PST_0727 PST_0728 pdxA surA TRUE 0.832 110.000 0.561 1.000   NA
 3558491 3558492 PST_0728 PST_0729 surA ostA TRUE 0.729 -67.000 0.070 1.000   NA
 3558493 3558494 PST_0730 PST_0731     TRUE 0.995 -3.000 0.642 NA   NA
 3558494 3558495 PST_0731 PST_0732   djlA TRUE 0.887 2.000 0.019 1.000 N NA
 3558497 3558498 PST_0734 PST_0735   uhpA TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.033 Y NA
 3558498 3558499 PST_0735 PST_0736 uhpA   FALSE 0.390 149.000 0.111 1.000 N NA
 3558499 3558500 PST_0736 PST_0737     TRUE 0.955 48.000 0.556 1.000 Y NA
 3558500 3558501 PST_0737 PST_0738     TRUE 0.910 64.000 0.108 0.051 Y NA
 3558501 3558502 PST_0738 PST_0739     TRUE 0.922 64.000 0.145 0.051 Y NA
 3558502 3558503 PST_0739 PST_0740   gabD-1 TRUE 0.931 13.000 0.167 1.000 N NA
 3558503 3558504 PST_0740 PST_0741 gabD-1 gabT FALSE 0.430 182.000 0.242 1.000 N NA
 3558504 3558505 PST_0741 PST_0742 gabT rpe FALSE 0.072 167.000 0.005 1.000 N NA
 3558505 3558506 PST_0742 PST_0743 rpe gph TRUE 0.974 -3.000 0.120 1.000   NA
 3558506 3558507 PST_0743 PST_0744 gph trpE TRUE 0.759 61.000 0.233 1.000   NA
 3558507 3558508 PST_0744 PST_0745 trpE trpG TRUE 0.998 3.000 0.230 0.001 Y NA
 3558508 3558509 PST_0745 PST_0746 trpG trpD TRUE 0.979 0.000 0.013 1.000 Y NA
 3558509 3558510 PST_0746 PST_0747 trpD trpC TRUE 0.975 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 3558510 3558511 PST_0747 PST_0748 trpC   TRUE 0.643 13.000 0.000 NA   NA
 3558511 3558512 PST_0748 PST_0749     FALSE 0.211 48.000 0.006 NA   NA
 3558515 3558516 PST_0752 PST_0754     FALSE 0.084 174.000 0.016 NA   NA
 3558517 3558518 PST_0753 PST_0755 argC   FALSE 0.233 114.000 0.031 NA   NA
 3558519 3558520 PST_0756 PST_0757 anmK   TRUE 0.833 24.000 0.184 NA N NA
 3558521 3558522 PST_0758 PST_0759 tyrS   FALSE 0.005 569.000 0.000 NA   NA
 3558522 3558523 PST_0759 PST_0760     FALSE 0.204 80.000 0.000 NA   NA
 3558523 3558524 PST_0760 PST_0761     TRUE 0.786 7.000 0.000 NA   NA
 3558524 3558525 PST_0761 PST_0762     FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 3558525 3558526 PST_0762 PST_0762a     FALSE 0.140 123.000 0.000 NA   NA
 3558526 3558527 PST_0762a PST_0763   birA FALSE 0.145 117.000 0.000 NA   NA
 3558527 3558528 PST_0763 PST_0764 birA   TRUE 0.976 -3.000 0.147 1.000 N NA
 3558528 3558529 PST_0764 PST_0765     FALSE 0.385 25.000 0.012 NA   NA
 3558529 3558530 PST_0765 PST_0766     FALSE 0.115 142.000 0.000 NA   NA
 3558530 3558531 PST_0766 PST_0767     FALSE 0.367 26.000 0.000 NA   NA
 3558531 3558532 PST_0767 PST_0768     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3558532 3558533 PST_0768 PST_0769   tuf FALSE 0.196 85.000 0.000 NA   NA
 3558533 3558534 PST_0769 PST_0770 tuf   FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 3558534 3558535 PST_0770 PST_0771   secE FALSE 0.257 43.000 0.000 NA   NA
 3558535 3558536 PST_0771 PST_0772 secE nusG TRUE 0.992 10.000 0.843 1.000 N NA
 3558536 3558537 PST_0772 PST_0773 nusG rplK TRUE 0.858 111.000 0.681 1.000 N NA
 3558537 3558538 PST_0773 PST_0774 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 0.018 Y NA
 3558538 3558539 PST_0774 PST_0775 rplA rplJ TRUE 0.779 210.000 0.302 0.018 Y NA
 3558539 3558540 PST_0775 PST_0776 rplJ rplL TRUE 0.985 81.000 0.884 0.013 Y NA
 3558540 3558541 PST_0776 PST_0777 rplL rpoB FALSE 0.288 213.000 0.223 1.000 N NA
 3558541 3558542 PST_0777 PST_0778 rpoB rpoC TRUE 0.989 66.000 0.851 0.001 Y NA
 3558542 3558543 PST_0778 PST_0779 rpoC rpsL FALSE 0.432 142.000 0.122 1.000 N NA
 3558543 3558544 PST_0779 PST_0780 rpsL rpsG TRUE 0.977 98.000 0.620 0.003 Y NA
 3558544 3558545 PST_0780 PST_0781 rpsG fusA1 TRUE 0.971 31.000 0.579 1.000 Y NA
 3558545 3558546 PST_0781 PST_0782 fusA1 tuf-1 TRUE 0.986 31.000 0.400 0.001 Y NA
 3558546 3558547 PST_0782 PST_0783 tuf-1 rpsJ TRUE 0.822 151.000 0.318 1.000 Y NA
 3558547 3558548 PST_0783 PST_0784 rpsJ rplC TRUE 0.956 83.000 0.307 0.018 Y NA
 3558548 3558549 PST_0784 PST_0785 rplC rplD TRUE 0.996 13.000 0.486 0.013 Y NA
 3558549 3558550 PST_0785 PST_0786 rplD rplW TRUE 0.997 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3558550 3558551 PST_0786 PST_0787 rplW rplB TRUE 0.993 15.000 0.849 1.000 Y NA
 3558551 3558552 PST_0787 PST_0788 rplB rpsS TRUE 0.996 17.000 0.820 0.018 Y NA
 3558552 3558553 PST_0788 PST_0789 rpsS rplV TRUE 0.997 14.000 0.769 0.018 Y NA
 3558553 3558554 PST_0789 PST_0790 rplV rpsC TRUE 0.997 14.000 0.719 0.018 Y NA
 3558554 3558555 PST_0790 PST_0791 rpsC rplP TRUE 0.998 13.000 0.828 0.018 Y NA
 3558555 3558556 PST_0791 PST_0792 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.013 Y NA
 3558556 3558557 PST_0792 PST_0793 rpmC rpsQ TRUE 0.999 3.000 0.828 0.013 Y NA
 3558557 3558558 PST_0793 PST_0794 rpsQ rplN TRUE 0.993 24.000 0.791 0.018 Y NA
 3558558 3558559 PST_0794 PST_0795 rplN rplX TRUE 0.998 12.000 0.810 0.018 Y NA
 3558559 3558560 PST_0795 PST_0796 rplX rplE TRUE 0.994 20.000 0.758 0.013 Y NA
 3558560 3558561 PST_0796 PST_0797 rplE rpsN TRUE 0.993 14.000 0.309 0.013 Y NA
 3558561 3558562 PST_0797 PST_0798 rpsN rpsH TRUE 0.860 181.000 0.295 0.013 Y NA
 3558562 3558563 PST_0798 PST_0799 rpsH rplF TRUE 0.998 13.000 0.808 0.013 Y NA
 3558563 3558564 PST_0799 PST_0800 rplF rplR TRUE 0.986 65.000 0.815 0.013 Y NA
 3558564 3558565 PST_0800 PST_0801 rplR rpsE TRUE 0.999 4.000 0.814 0.018 Y NA
 3558565 3558566 PST_0801 PST_0802 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.018 Y NA
 3558566 3558567 PST_0802 PST_0803 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 3558567 3558568 PST_0803 PST_0804 rplO secY TRUE 0.996 1.000 0.730 1.000 N NA
 3558568 3558569 PST_0804 PST_0805 secY rpmJ TRUE 0.504 30.000 0.036 1.000 N NA
 3558569 3558570 PST_0805 PST_0806 rpmJ rpsM TRUE 0.848 130.000 0.086 0.013 Y NA
 3558570 3558571 PST_0806 PST_0807 rpsM rpsK TRUE 0.991 31.000 0.810 0.013 Y NA
 3558571 3558572 PST_0807 PST_0808 rpsK rpsD TRUE 0.992 18.000 0.509 0.018 Y NA
 3558572 3558573 PST_0808 PST_0809 rpsD rpoA TRUE 0.946 23.000 0.549 1.000 N NA
 3558573 3558574 PST_0809 PST_0810 rpoA rplQ TRUE 0.936 46.000 0.873 1.000 N NA
 3558574 3558575 PST_0810 PST_0811 rplQ katA FALSE 0.076 163.000 0.004 1.000 N NA
 3558577 3558578 PST_0813 PST_0814   ssb FALSE 0.072 177.000 0.011 1.000 N NA
 3558578 3558579 PST_0814 PST_0815 ssb   FALSE 0.023 257.000 0.000 1.000 N NA
 3558579 3558580 PST_0815 PST_0816     TRUE 0.993 -7.000 0.133 0.002 Y NA
 3558582 3558583 PST_0818 PST_0819     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 3558583 3558584 PST_0819 PST_0820   exbB2 TRUE 0.990 -7.000 0.091 0.013 Y NA
 3558584 3558585 PST_0820 PST_0821 exbB2 exbD2 TRUE 0.986 18.000 0.333 0.071 Y NA
 3558585 3558586 PST_0821 PST_0822 exbD2   TRUE 0.985 0.000 0.214 1.000 N NA
 3558586 3558587 PST_0822 PST_0823     TRUE 0.991 2.000 0.400 1.000   NA
 3558588 3558589 PST_0824 PST_0825     TRUE 0.970 -3.000 0.114 NA   NA
 3558589 3558590 PST_0825 PST_0826     TRUE 0.997 4.000 0.605 NA Y NA
 3558590 3558591 PST_0826 PST_0827     TRUE 0.933 18.000 0.336 NA   NA
 3558594 3558595 PST_0830 PST_0831     TRUE 0.921 59.000 0.844 NA   NA
 3558596 3558597 PST_0832 PST_0833 ligT   TRUE 0.872 16.000 0.005 1.000 Y NA
 3558598 3558599 PST_0834 PST_0835   ribD TRUE 0.916 18.000 0.277 NA N NA
 3558599 3558600 PST_0835 PST_0836 ribD ribE-1 FALSE 0.211 538.000 0.456 1.000 Y NA
 3558600 3558601 PST_0836 PST_0837 ribE-1 ribBA-1 TRUE 0.965 12.000 0.065 1.000 Y NA
 3558601 3558602 PST_0837 PST_0838 ribBA-1 ribH TRUE 0.903 61.000 0.049 0.002 Y NA
 3558602 3558603 PST_0838 PST_0839 ribH nusB TRUE 0.990 -3.000 0.347 1.000 N NA
 3558603 3558604 PST_0839 PST_0840 nusB thiL TRUE 0.950 13.000 0.225 1.000 N NA
 3558604 3558605 PST_0840 PST_0841 thiL   TRUE 0.734 52.000 0.206 1.000 N NA
 3558605 3558606 PST_0841 PST_0842     FALSE 0.222 90.000 0.000 1.000   NA
 3558606 3558607 PST_0842 PST_0843   ribA TRUE 0.690 13.000 0.000 1.000   NA
 3558607 3558608 PST_0843 PST_0844 ribA   TRUE 0.943 -3.000 0.050 NA   NA
 3558608 3558609 PST_0844 PST_0845     TRUE 0.959 0.000 0.066 NA   NA
 3558610 3558611 PST_0846 PST_0847   sbcC FALSE 0.007 421.000 0.000 1.000 N NA
 3558611 3558612 PST_0847 PST_0848 sbcC sbcD TRUE 0.998 -3.000 0.669 0.002 N NA
 3558612 3558613 PST_0848 PST_0849 sbcD   FALSE 0.003 710.000 0.000 NA N NA
 3558613 3558614 PST_0849 PST_0850     FALSE 0.004 536.000 0.000 NA N NA
 3558614 3558615 PST_0850 PST_0851     TRUE 0.999 -3.000 0.882 1.000 Y NA
 3558615 3558616 PST_0851 PST_0852     TRUE 0.996 0.000 0.762 1.000   NA
 3558616 3558617 PST_0852 PST_0854     TRUE 0.997 10.000 0.619 0.001   NA
 3558620 3558621 PST_0856 PST_0857     FALSE 0.104 151.000 0.000 NA   NA
 3558621 3558622 PST_0857 PST_0858     TRUE 0.488 -46.000 0.015 1.000 N NA
 3558623 3558624 PST_0859 PST_0860     TRUE 0.996 0.000 0.314 1.000 Y NA
 3558624 3558625 PST_0860 PST_0861     FALSE 0.384 56.000 0.039 1.000 N NA
 3558625 3558626 PST_0861 PST_0862     TRUE 0.705 111.000 0.288 1.000 N NA
 3558626 3558627 PST_0862 PST_0863     FALSE 0.020 271.000 0.000 1.000 N NA
 3558630 3558631 PST_0866 PST_0867   ldh FALSE 0.179 254.000 0.059 0.056 N NA
 3558631 3558632 PST_0867 PST_0868 ldh   FALSE 0.290 129.000 0.044 1.000   NA
 3558632 3558633 PST_0868 PST_0869   hpd FALSE 0.009 411.000 0.000 1.000   NA
 3558633 3558634 PST_0869 PST_0870 hpd   FALSE 0.121 191.000 0.044 1.000 N NA
 3558634 3558635 PST_0870 PST_0871     TRUE 0.994 0.000 0.195 1.000 Y NA
 3558635 3558636 PST_0871 PST_0872     TRUE 0.976 -10.000 0.495 1.000 N NA
 3558636 3558637 PST_0872 PST_0873     FALSE 0.318 82.000 0.027 1.000   NA
 3558637 3558638 PST_0873 PST_0874   pctA FALSE 0.068 188.000 0.000 1.000   NA
 3558638 3558639 PST_0874 PST_0875 pctA   FALSE 0.158 124.000 0.016 NA   NA
 3558640 3558641 PST_0876 PST_0877     TRUE 0.883 -3.000 0.024 NA N NA
 3558643 3558644 PST_0879 PST_0880     TRUE 0.801 102.000 0.448 1.000 N NA
 3558644 3558645 PST_0880 PST_0881     FALSE 0.004 1246.000 0.000 1.000   NA
 3558645 3558646 PST_0881 PST_0882     TRUE 0.647 20.000 0.043 NA   NA
 3558647 3558648 PST_0883 PST_0884   tesB TRUE 0.478 38.000 0.042 1.000 N NA
 3558648 3558649 PST_0884 PST_0885 tesB   TRUE 0.581 33.000 0.052 1.000   NA
 3558650 3558651 PST_0886 PST_0887     FALSE 0.336 119.000 0.057 NA   NA
 3558653 3558654 PST_0889 PST_0890 dnrE   TRUE 0.720 103.000 0.286 NA   NA
 3558654 3558655 PST_0890 PST_0891   narL TRUE 0.540 167.000 0.286 NA   NA
 3558655 3558656 PST_0891 PST_0892 narL narX TRUE 0.973 -22.000 0.062 0.033 Y NA
 3558657 3558658 PST_0893 PST_0894 narK   TRUE 0.848 16.000 0.105 NA   NA
 3558658 3558659 PST_0894 PST_0895   narM TRUE 0.972 15.000 0.545 1.000   NA
 3558659 3558660 PST_0895 PST_0896 narM narG TRUE 0.617 106.000 0.182 1.000   NA
 3558660 3558661 PST_0896 PST_0897 narG narH TRUE 0.998 12.000 0.727 0.001 Y NA
 3558661 3558662 PST_0897 PST_0898 narH narJ TRUE 0.999 4.000 0.818 0.002 Y NA
 3558662 3558663 PST_0898 PST_0899 narJ narI TRUE 0.999 -7.000 0.818 0.002 Y NA
 3558663 3558664 PST_0899 PST_0900 narI   TRUE 0.956 4.000 0.091 1.000 N NA
 3558664 3558665 PST_0900 PST_0901   moaA FALSE 0.312 110.000 0.045 1.000 N NA
 3558665 3558666 PST_0901 PST_0902 moaA moaB2 FALSE 0.390 241.000 0.000 0.002 Y NA
 3558666 3558667 PST_0902 PST_0903 moaB2 moeA1 TRUE 0.996 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 3558668 3558669 PST_0904 PST_0905     TRUE 0.832 59.000 0.400 1.000 N NA
 3558669 3558670 PST_0905 PST_0906     TRUE 0.997 -6.000 1.000 1.000 Y NA
 3558670 3558671 PST_0906 PST_0907     TRUE 0.577 16.000 0.000 1.000   NA
 3558671 3558672 PST_0907 PST_0908     TRUE 0.959 -3.000 0.068 1.000   NA
 3558672 3558673 PST_0908 PST_0909     TRUE 0.973 -13.000 0.500 NA   NA
 3558673 3558674 PST_0909 PST_0910     TRUE 0.969 16.000 0.610 NA   NA
 3558674 3558675 PST_0910 PST_0911     TRUE 0.979 -34.000 0.923 NA   NA
 3558676 3558677 PST_0912 PST_0913   colR FALSE 0.196 85.000 0.000 NA   NA
 3558677 3558678 PST_0913 PST_0914 colR colS TRUE 0.990 -10.000 0.467 1.000 Y NA
 3558678 3558679 PST_0914 PST_0915 colS   TRUE 0.839 82.000 0.429 1.000   NA
 3558679 3558680 PST_0915 PST_0916     TRUE 0.991 3.000 0.429 1.000   NA
 3558680 3558681 PST_0916 PST_0917     TRUE 0.963 -10.000 0.286 1.000   NA
 3558681 3558682 PST_0917 PST_0918     TRUE 0.977 29.000 0.667 1.000 Y NA
 3558683 3558684 PST_0919 PST_0920 trmA   FALSE 0.448 92.000 0.062 1.000   NA
 3558685 3558686 PST_0921 PST_0922     FALSE 0.202 69.000 0.008 NA   NA
 3558686 3558687 PST_0922 PST_0923     TRUE 0.838 -46.000 0.138 NA   NA
 3558687 3558688 PST_0923 PST_0924     FALSE 0.185 125.000 0.023 NA   NA
 3558688 3558689 PST_0924 PST_0925     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.074 Y NA
 3558689 3558690 PST_0925 PST_0926     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 3558692 3558693 PST_0928 PST_0929     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558694 3558695 PST_0930 PST_0931     TRUE 0.708 57.000 0.183 1.000   NA
 3558695 3558696 PST_0931 PST_0932     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3558698 3558699 PST_0934 PST_0935 gdhA   FALSE 0.010 362.000 0.000 1.000 N NA
 3558699 3558700 PST_0935 PST_0936     TRUE 0.872 13.000 0.073 NA   NA
 3558700 3558701 PST_0936 PST_0937     TRUE 0.977 18.000 0.911 NA   NA
 3558701 3558702 PST_0937 PST_0938     TRUE 0.871 16.000 0.133 NA   NA
 3558702 3558703 PST_0938 PST_0939     FALSE 0.093 162.000 0.004 1.000   NA
 3558704 3558705 PST_0940 PST_0941 glyA   FALSE 0.171 142.000 0.032 NA N NA
 3558705 3558706 PST_0941 PST_0942     FALSE 0.339 57.000 0.033 NA   NA
 3558712 3558713 PST_0948 PST_0949     TRUE 0.630 68.000 0.132 NA   NA
 3558713 3558714 PST_0949 PST_0950     FALSE 0.317 155.000 0.082 NA   NA
 3558714 3558715 PST_0950 PST_0951     FALSE 0.294 88.000 0.031 NA   NA
 3558715 3558716 PST_0951 PST_0952     FALSE 0.304 35.000 0.013 NA   NA
 3558716 3558717 PST_0952 PST_0953   fklB-1 FALSE 0.057 198.000 0.000 1.000   NA
 3558718 3558719 PST_0954 PST_0955   ispB FALSE 0.097 146.000 0.007 NA   NA
 3558720 3558721 PST_0956 PST_0957 rplU rpmA TRUE 0.988 36.000 0.667 0.013 Y NA
 3558721 3558722 PST_0957 PST_0958 rpmA obgE TRUE 0.638 158.000 0.335 1.000   NA
 3558722 3558723 PST_0958 PST_0959 obgE proB TRUE 0.649 107.000 0.206 1.000   NA
 3558723 3558724 PST_0959 PST_0960 proB creA TRUE 0.794 9.000 0.017 NA   NA
 3558726 3558727 PST_0962 PST_0963   ribF TRUE 0.667 85.000 0.169 1.000   NA
 3558727 3558728 PST_0963 PST_0964 ribF ileS TRUE 0.986 2.000 0.254 1.000 N NA
 3558728 3558729 PST_0964 PST_0965 ileS lspA TRUE 0.538 112.000 0.147 1.000 N NA
 3558729 3558730 PST_0965 PST_0966 lspA fkpB TRUE 0.979 -7.000 0.417 1.000 N NA
 3558730 3558731 PST_0966 PST_0967 fkpB ispH FALSE 0.287 306.000 0.626 1.000 N NA
 3558732 3558733 PST_0968 PST_0969 pilE pilY2 TRUE 0.982 -7.000 0.500 NA   NA
 3558733 3558734 PST_0969 PST_0970 pilY2 pilY1 TRUE 0.922 3.000 0.038 NA   NA
 3558734 3558735 PST_0970 PST_0971 pilY1 pilX TRUE 0.666 127.000 0.077 NA Y NA
 3558735 3558736 PST_0971 PST_0972 pilX pilW TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 3558736 3558737 PST_0972 PST_0973 pilW pilV TRUE 0.983 11.000 0.500 NA   NA
 3558737 3558738 PST_0973 PST_0974 pilV fimU TRUE 0.987 9.000 0.500 NA   NA
 3558738 3558739 PST_0974 PST_0975 fimU fimT TRUE 0.877 94.000 0.667 NA   NA
 3558740 3558741 PST_0976 PST_0977     FALSE 0.094 150.000 0.006 1.000 N NA
 3558741 3558742 PST_0977 PST_0978   speA FALSE 0.193 124.000 0.023 1.000 N NA
 3558743 3558744 PST_0979 PST_0980   dinF TRUE 0.835 3.000 0.009 NA   NA
 3558744 3558745 PST_0980 PST_0981 dinF   FALSE 0.192 97.000 0.015 NA   NA
 3558747 3558748 PST_0983 PST_0984     TRUE 0.576 85.000 0.118 NA   NA
 3558748 3558749 PST_0984 PST_0985     TRUE 0.683 74.000 0.182 NA   NA
 3558749 3558750 PST_0985 PST_0986     TRUE 0.784 19.000 0.087 NA   NA
 3558750 3558751 PST_0986 PST_0987   fruR FALSE 0.297 36.000 0.000 1.000 N NA
 3558752 3558753 PST_0988 PST_0989 fruB fruK TRUE 0.991 0.000 0.101 1.000 Y NA
 3558753 3558754 PST_0989 PST_0990 fruK fruA TRUE 0.984 18.000 0.562 1.000 Y NA
 3558754 3558755 PST_0990 PST_0991 fruA   TRUE 0.519 123.000 0.000 1.000 Y NA
 3558756 3558757 PST_0992 PST_0993   prfC FALSE 0.333 36.000 0.000 1.000   NA
 3558761 3558762 PST_0997 PST_0998     FALSE 0.443 179.000 0.062 NA Y NA
 3558762 3558763 PST_0998 PST_0999     TRUE 0.981 15.000 0.808 NA   NA
 3558763 3558764 PST_0999 PST_1000     TRUE 0.963 25.000 0.848 NA   NA
 3558764 3558765 PST_1000 PST_1001     FALSE 0.364 74.000 0.038 NA   NA
 3558765 3558766 PST_1001 PST_1002     FALSE 0.090 179.000 0.022 NA   NA
 3558767 3558768 PST_1003 PST_1004     TRUE 0.974 34.000 0.682 1.000 Y NA
 3558768 3558769 PST_1004 PST_1005     FALSE 0.269 128.000 0.038 1.000   NA
 3558769 3558770 PST_1005 PST_1006     FALSE 0.109 177.000 0.022 1.000   NA
 3558770 3558771 PST_1006 PST_1007     TRUE 0.785 -19.000 0.053 NA   NA
 3558771 3558772 PST_1007 PST_1008     TRUE 0.781 17.000 0.069 NA   NA
 3558773 3558774 PST_1009 PST_1010     TRUE 0.981 44.000 0.667 0.072 Y NA
 3558774 3558775 PST_1010 PST_1011     TRUE 0.833 71.000 0.400 NA   NA
 3558775 3558776 PST_1011 PST_1012   gatB FALSE 0.226 40.000 0.002 NA   NA
 3558776 3558777 PST_1012 PST_1013 gatB gatA TRUE 0.996 14.000 0.492 0.001 Y NA
 3558777 3558778 PST_1013 PST_1014 gatA gatC TRUE 0.999 0.000 0.643 0.001 Y NA
 3558779 3558780 PST_1015 PST_1016 mreB mreC TRUE 0.815 144.000 0.689 1.000 N NA
 3558780 3558781 PST_1016 PST_1017 mreC mreD TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 3558781 3558782 PST_1017 PST_1018 mreD   FALSE 0.065 180.000 0.000 NA   NA
 3558782 3558783 PST_1018 PST_1019   maf-2 FALSE 0.169 100.000 0.000 NA   NA
 3558783 3558784 PST_1019 PST_1020 maf-2 cafA TRUE 0.809 88.000 0.417 NA N NA
 3558784 3558785 PST_1020 PST_1021 cafA   TRUE 0.806 50.000 0.296 NA   NA
 3558785 3558786 PST_1021 PST_1022     TRUE 0.846 44.000 0.358 NA   NA
 3558786 3558787 PST_1022 PST_1023     TRUE 0.985 3.000 0.259 NA   NA
 3558789 3558790 PST_1024 PST_1026   pmbA FALSE 0.276 32.000 0.005 NA   NA
 3558791 3558792 PST_1027 PST_1028 ptsO   TRUE 0.913 15.000 0.182 NA   NA
 3558792 3558793 PST_1028 PST_1029   ptsN TRUE 0.902 16.000 0.186 NA   NA
 3558793 3558794 PST_1029 PST_1030 ptsN rpoX TRUE 0.991 9.000 0.728 NA N NA
 3558794 3558795 PST_1030 PST_1031 rpoX rpoN TRUE 0.913 75.000 0.820 NA N NA
 3558795 3558796 PST_1031 PST_1032 rpoN   FALSE 0.114 282.000 0.163 1.000   NA
 3558796 3558797 PST_1032 PST_1033     TRUE 0.994 0.000 0.543 NA   NA
 3558797 3558798 PST_1033 PST_1034     TRUE 0.970 -13.000 0.459 NA   NA
 3558798 3558799 PST_1034 PST_1035     TRUE 0.852 102.000 0.617 NA   NA
 3558799 3558800 PST_1035 PST_1036     TRUE 0.995 0.000 0.598 1.000   NA
 3558801 3558802 PST_1037 PST_1038 ttg2A ttg2B TRUE 0.993 -7.000 0.530 NA Y NA
 3558802 3558803 PST_1038 PST_1039 ttg2B ttg2C TRUE 0.994 0.000 0.562 NA   NA
 3558803 3558804 PST_1039 PST_1040 ttg2C ttg2D TRUE 0.908 12.000 0.091 NA   NA
 3558804 3558805 PST_1040 PST_1041 ttg2D ttg2E TRUE 0.975 -7.000 0.353 NA   NA
 3558805 3558806 PST_1041 PST_1042 ttg2E   TRUE 0.740 14.000 0.028 1.000   NA
 3558806 3558807 PST_1042 PST_1043   ttg2F FALSE 0.201 92.000 0.015 NA   NA
 3558807 3558808 PST_1043 PST_1044 ttg2F murA TRUE 0.685 104.000 0.258 NA N NA
 3558808 3558809 PST_1044 PST_1045 murA hisG TRUE 0.488 124.000 0.123 1.000 N NA
 3558809 3558810 PST_1045 PST_1046 hisG hisD TRUE 0.569 293.000 0.254 0.004 Y NA
 3558810 3558811 PST_1046 PST_1047 hisD hisC TRUE 0.878 113.000 0.087 0.004 Y NA
 3558813 3558814 PST_1049 PST_1050   cysD FALSE 0.091 189.000 0.030 NA   NA
 3558814 3558815 PST_1050 PST_1051 cysD cysN TRUE 0.978 12.000 0.096 0.001 N NA
 3558819 3558820 PST_1055 PST_1056 pilB pilC TRUE 0.998 2.000 0.362 0.013 Y NA
 3558820 3558821 PST_1056 PST_1057 pilC pilD TRUE 0.997 3.000 0.454 1.000 Y NA
 3558821 3558822 PST_1057 PST_1058 pilD coaE TRUE 0.806 -63.000 0.122 1.000 N NA
 3558823 3558824 PST_1059 PST_1060     FALSE 0.235 57.000 0.008 1.000   NA
 3558825 3558826 PST_1061 PST_1062 rplM rpsI TRUE 0.995 16.000 0.601 0.013 Y NA
 3558826 3558827 PST_1062 PST_1063 rpsI petA FALSE 0.021 255.000 0.006 1.000 N NA
 3558827 3558828 PST_1063 PST_1064 petA petB TRUE 0.998 0.000 0.233 0.001 Y NA
 3558828 3558829 PST_1064 PST_1065 petB petC TRUE 0.999 0.000 0.630 0.001 Y NA
 3558829 3558830 PST_1065 PST_1066 petC sspA TRUE 0.793 86.000 0.370 NA N NA
 3558830 3558831 PST_1066 PST_1067 sspA sspB TRUE 0.987 13.000 0.831 NA   NA
 3558832 3558833 PST_1068 PST_1069   gmhA TRUE 0.994 -3.000 0.613 NA   NA
 3558833 3558834 PST_1069 PST_1070 gmhA   FALSE 0.394 176.000 0.187 1.000 N NA
 3558834 3558835 PST_1070 PST_1071     TRUE 0.983 0.000 0.172 1.000   NA
 3558836 3558837 PST_1072 PST_1073     FALSE 0.004 766.000 0.000 NA   NA
 3558837 3558838 PST_1073 PST_1074   mraW TRUE 0.893 63.000 0.635 NA   NA
 3558838 3558839 PST_1074 PST_1075 mraW ftsL TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000 N NA
 3558839 3558840 PST_1075 PST_1076 ftsL ftsI TRUE 0.979 0.000 0.153 1.000 N NA
 3558840 3558841 PST_1076 PST_1077 ftsI murE TRUE 0.989 0.000 0.073 1.000 Y NA
 3558841 3558842 PST_1077 PST_1078 murE murF TRUE 0.998 -7.000 0.569 0.002 Y NA
 3558842 3558843 PST_1078 PST_1079 murF mraY TRUE 0.999 0.000 0.309 0.004 Y NA
 3558843 3558844 PST_1079 PST_1080 mraY murD TRUE 0.999 7.000 0.647 0.004 Y NA
 3558844 3558845 PST_1080 PST_1081 murD ftsW TRUE 0.996 0.000 0.297 0.003 N NA
 3558845 3558846 PST_1081 PST_1082 ftsW murG TRUE 0.983 -10.000 0.647 1.000 N NA
 3558846 3558847 PST_1082 PST_1083 murG murC TRUE 0.989 -7.000 0.283 1.000 Y NA
 3558847 3558848 PST_1083 PST_1084 murC ddl TRUE 0.997 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 3558848 3558849 PST_1084 PST_1085 ddl ftsQ TRUE 0.995 4.000 0.372 NA Y NA
 3558849 3558850 PST_1085 PST_1086 ftsQ ftsA TRUE 0.967 13.000 0.389 NA N NA
 3558850 3558851 PST_1086 PST_1087 ftsA ftsZ TRUE 0.944 49.000 0.460 1.000 Y NA
 3558851 3558852 PST_1087 PST_1088 ftsZ lpxC TRUE 0.516 116.000 0.134 1.000 N NA
 3558852 3558853 PST_1088 PST_1089 lpxC   FALSE 0.108 151.000 0.000 1.000 N NA
 3558854 3558855 PST_1090 PST_1091     FALSE 0.038 226.000 0.000 1.000   NA
 3558855 3558856 PST_1091 PST_1092   osmE TRUE 0.487 52.000 0.056 1.000   NA
 3558856 3558857 PST_1092 PST_1093 osmE   FALSE 0.420 58.000 0.042 1.000   NA
 3558857 3558858 PST_1093 PST_1094     TRUE 0.601 24.000 0.042 NA   NA
 3558858 3558859 PST_1094 PST_1095     FALSE 0.396 59.000 0.043 NA   NA
 3558859 3558860 PST_1095 PST_1096     FALSE 0.146 157.000 0.027 NA   NA
 3558860 3558861 PST_1096 PST_1097     FALSE 0.265 91.000 0.027 NA   NA
 3558861 3558862 PST_1097 PST_1098     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 3558865 3558866 PST_1101 PST_1102   mqoB FALSE 0.019 407.000 0.050 NA   NA
 3558872 3558873 PST_1107 PST_1109     TRUE 0.991 0.000 0.364 NA   NA
 3558873 3558874 PST_1109 PST_1110     TRUE 0.974 11.000 0.320 NA   NA
 3558877 3558878 PST_1114 PST_1115     FALSE 0.183 85.000 0.008 NA   NA
 3558878 3558879 PST_1115 PST_1116   rsmC FALSE 0.021 262.000 0.000 NA   NA
 3558879 3558880 PST_1116 PST_1117 rsmC hprA FALSE 0.398 72.000 0.042 1.000 N NA
 3558881 3558882 PST_1118 PST_1119   alkK-1 TRUE 0.530 98.000 0.114 1.000 N NA
 3558884 3558885 PST_1121 PST_1122     FALSE 0.175 139.000 0.021 1.000   NA
 3558885 3558886 PST_1122 PST_1123     FALSE 0.112 148.000 0.000 1.000 N NA
 3558886 3558887 PST_1123 PST_1124     TRUE 0.902 127.000 0.200 0.025 Y NA
 3558888 3558889 PST_1125 PST_1126   pta TRUE 0.723 133.000 0.170 0.062   NA
 3558889 3558890 PST_1126 PST_1127 pta   FALSE 0.234 165.000 0.057 1.000   NA
 3558891 3558892 PST_1128 PST_1129 slyD   TRUE 0.570 115.000 0.024 1.000 Y NA
 3558892 3558893 PST_1129 PST_1130     FALSE 0.056 200.000 0.018 1.000 N NA
 3558893 3558894 PST_1130 PST_1131     TRUE 0.742 20.000 0.070 1.000 N NA
 3558895 3558896 PST_1132 PST_1133 cysZ   FALSE 0.037 213.000 0.000 NA   NA
 3558896 3558897 PST_1133 PST_1134     TRUE 0.970 0.000 0.097 NA   NA
 3558897 3558898 PST_1134 PST_1135   folX TRUE 0.552 38.000 0.061 NA   NA
 3558898 3558899 PST_1135 PST_1136 folX   TRUE 0.577 18.000 0.024 1.000 N NA
 3558899 3558900 PST_1136 PST_1137     FALSE 0.387 67.000 0.040 NA   NA
 3558901 3558902 PST_1138 PST_1139     FALSE 0.254 107.000 0.032 1.000 N NA
 3558903 3558904 PST_1140 PST_1141     FALSE 0.435 39.000 0.036 NA   NA
 3558904 3558905 PST_1141 PST_1142     TRUE 0.988 1.000 0.286 NA   NA
 3558906 3558907 PST_1143 PST_1144     FALSE 0.100 258.000 0.000 0.062   NA
 3558907 3558908 PST_1144 PST_1145     TRUE 0.549 -51.000 0.021 1.000   NA
 3558908 3558909 PST_1145 PST_1146     FALSE 0.261 40.000 0.010 NA   NA
 3558911 3558912 PST_1148 PST_1149     FALSE 0.385 -94.000 0.000 1.000 N NA
 3558914 3558915 PST_1151 PST_1152     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3558915 3558916 PST_1152 PST_1153     FALSE 0.277 38.000 0.000 NA   NA
 3558917 3558918 PST_1154 PST_1155     TRUE 0.980 -3.000 0.182 NA   NA
 3558918 3558919 PST_1155 PST_1156     TRUE 0.994 -3.000 0.583 NA   NA
 3558919 3558920 PST_1156 PST_1157     TRUE 0.997 -3.000 0.955 NA   NA
 3558920 3558921 PST_1157 PST_1158     TRUE 0.904 -13.000 0.129 NA   NA
 3558921 3558922 PST_1158 PST_1159     TRUE 0.995 -3.000 0.708 NA   NA
 3558924 3558925 PST_1161 PST_1162 mvaT   FALSE 0.027 242.000 0.000 NA   NA
 3558925 3558926 PST_1162 PST_1163     FALSE 0.177 112.000 0.000 1.000   NA
 3558926 3558927 PST_1163 PST_1164     FALSE 0.005 594.000 0.000 1.000   NA
 3558928 3558929 PST_1165 PST_1166 purU   TRUE 0.885 16.000 0.157 NA   NA
 3558929 3558930 PST_1166 PST_1167     FALSE 0.378 22.000 0.007 NA   NA
 3558931 3558932 PST_1168 PST_1169   algA FALSE 0.062 183.000 0.000 NA   NA
 3558932 3558933 PST_1169 PST_1170 algA   FALSE 0.004 739.000 0.000 NA   NA
 3558934 3558935 PST_1171 PST_1172     FALSE 0.023 258.000 0.000 1.000 N NA
 3558935 3558936 PST_1172 PST_1173   moaC FALSE 0.177 103.000 0.013 1.000 N NA
 3558936 3558937 PST_1173 PST_1174 moaC moaD TRUE 0.993 -3.000 0.175 1.000 Y NA
 3558937 3558938 PST_1174 PST_1175 moaD moaE TRUE 0.997 3.000 0.501 1.000 Y NA
 3558939 3558940 PST_1176 PST_1177   rhlB FALSE 0.117 143.000 0.013 NA   NA
 3558940 3558941 PST_1177 PST_1178 rhlB   FALSE 0.131 178.000 0.031 1.000   NA
 3558942 3558943 PST_1179 PST_1180   purL FALSE 0.160 113.000 0.007 1.000   NA
 3558944 3558945 PST_1181 PST_1182     FALSE 0.137 125.000 0.000 NA   NA
 3558945 3558946 PST_1182 PST_1183     TRUE 0.518 47.000 0.065 NA   NA
 3558947 3558948 PST_1184 PST_1185     FALSE 0.433 113.000 0.078 1.000   NA
 3558948 3558949 PST_1185 PST_1186     TRUE 0.952 -3.000 0.062 NA   NA
 3558949 3558950 PST_1186 PST_1187   purT TRUE 0.682 48.000 0.154 NA   NA
 3558951 3558952 PST_1188 PST_1189     TRUE 0.935 18.000 0.349 NA   NA
 3558953 3558954 PST_1190 PST_1191 ffh rpsP TRUE 0.466 195.000 0.361 1.000 N NA
 3558954 3558955 PST_1191 PST_1192 rpsP rimM TRUE 0.998 6.000 0.342 0.013 Y NA
 3558955 3558956 PST_1192 PST_1193 rimM trmD TRUE 0.997 6.000 0.672 1.000 Y NA
 3558956 3558957 PST_1193 PST_1194 trmD rplS TRUE 0.958 46.000 0.567 1.000 Y NA
 3558957 3558958 PST_1194 PST_1195 rplS xerD FALSE 0.072 182.000 0.015 1.000 N NA
 3558958 3558959 PST_1195 PST_1196 xerD dsbC FALSE 0.164 147.000 0.026 1.000 N NA
 3558959 3558960 PST_1196 PST_1197 dsbC   FALSE 0.310 105.000 0.037 1.000   NA
 3558960 3558961 PST_1197 PST_1198   hom FALSE 0.154 112.000 0.004 1.000   NA
 3558961 3558962 PST_1198 PST_1199 hom thrC TRUE 0.835 72.000 0.125 1.000 Y NA
 3558963 3558964 PST_1200 PST_1201 rnt pyrC TRUE 0.494 60.000 0.068 1.000 N NA
 3558965 3558966 PST_1202 PST_1203   argG FALSE 0.212 85.000 0.013 1.000 N NA
 3558966 3558967 PST_1203 PST_1204 argG gloA1 TRUE 0.571 96.000 0.006 1.000 Y NA
 3558968 3558969 PST_1205 PST_1206   nth FALSE 0.152 109.000 0.012 NA   NA
 3558969 3558970 PST_1206 PST_1207 nth   TRUE 0.932 11.000 0.109 1.000 N NA
 3558970 3558971 PST_1207 PST_1208     TRUE 0.999 -3.000 0.908 0.072 Y NA
 3558971 3558972 PST_1208 PST_1209     TRUE 0.999 2.000 0.924 0.072 Y NA
 3558972 3558973 PST_1209 PST_1210     TRUE 0.972 108.000 0.814 0.072 Y NA
 3558973 3558974 PST_1210 PST_1211     TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.027 Y NA
 3558974 3558975 PST_1211 PST_1212     TRUE 0.999 -3.000 0.564 0.072 Y NA
 3558975 3558976 PST_1212 PST_1213     FALSE 0.004 663.000 0.000 1.000 N NA
 3558976 3558977 PST_1213 PST_1214     TRUE 0.989 34.000 0.627 0.003 Y NA
 3558977 3558978 PST_1214 PST_1215     FALSE 0.232 157.000 0.059 NA N NA
 3558980 3558981 PST_1217 PST_1218     FALSE 0.235 143.000 0.043 NA   NA
 3558981 3558982 PST_1218 PST_1219     FALSE 0.257 108.000 0.034 NA   NA
 3558983 3558984 PST_1220 PST_1221     TRUE 0.686 -16.000 0.027 NA   NA
 3558986 3558987 PST_1223 PST_1224 algU mucA TRUE 0.984 -10.000 0.705 NA N NA
 3558987 3558988 PST_1224 PST_1225 mucA mucB TRUE 0.997 9.000 0.856 NA Y NA
 3558988 3558989 PST_1225 PST_1226 mucB mucC TRUE 0.998 -3.000 0.609 NA Y NA
 3558989 3558990 PST_1226 PST_1227 mucC mucD TRUE 0.780 36.000 0.206 NA N NA
 3558990 3558991 PST_1227 PST_1228 mucD lepA FALSE 0.084 180.000 0.020 1.000 N NA
 3558991 3558992 PST_1228 PST_1229 lepA lepB TRUE 0.981 2.000 0.187 1.000 N NA
 3558992 3558993 PST_1229 PST_1230 lepB   TRUE 0.572 93.000 0.133 NA   NA
 3558993 3558994 PST_1230 PST_1231   rnc FALSE 0.339 60.000 0.033 NA   NA
 3558994 3558995 PST_1231 PST_1232 rnc era TRUE 0.963 -13.000 0.127 0.042   NA
 3558995 3558996 PST_1232 PST_1233 era recO TRUE 0.751 28.000 0.109 1.000   NA
 3558996 3558997 PST_1233 PST_1234 recO pdxJ TRUE 0.947 -7.000 0.166 1.000 N NA
 3558998 3558999 PST_1235 PST_1236     TRUE 0.579 -15.000 0.009 NA   NA
 3558999 3559000 PST_1236 PST_1237     FALSE 0.006 431.000 0.000 NA   NA
 3559000 3559001 PST_1237 PST_1238     TRUE 0.931 -36.000 0.315 NA   NA
 3559001 3559002 PST_1238 PST_1239     TRUE 0.629 -21.000 0.021 NA   NA
 3559002 3559003 PST_1239 PST_1240   lon-1 FALSE 0.278 120.000 0.041 NA   NA
 3559004 3559005 PST_1241 PST_1242   putA FALSE 0.021 264.000 0.000 1.000 N NA
 3559005 3559006 PST_1242 PST_1243 putA putP-1 FALSE 0.009 424.000 0.020 1.000 N NA
 3559008 3559009 PST_1245 PST_1246   putP-2 TRUE 0.695 12.000 0.000 1.000 N NA
 3559011 3559012 PST_1248 PST_1249 pcaQ pcaH TRUE 0.820 111.000 0.153 0.001 N NA
 3559012 3559013 PST_1249 PST_1250 pcaH pcaG TRUE 0.998 13.000 0.782 0.001 Y NA
 3559013 3559014 PST_1250 PST_1251 pcaG   TRUE 0.700 -10.000 0.019 NA   NA
 3559014 3559015 PST_1251 PST_1252     FALSE 0.227 113.000 0.029 NA   NA
 3559015 3559016 PST_1252 PST_1253   pcaR FALSE 0.258 69.000 0.000 1.000   NA
 3559016 3559017 PST_1253 PST_1254 pcaR pcaI TRUE 0.468 102.000 0.087 1.000 N NA
 3559017 3559018 PST_1254 PST_1255 pcaI pcaJ TRUE 0.999 0.000 0.739 0.001 Y NA
 3559018 3559019 PST_1255 PST_1256 pcaJ pcaF TRUE 0.996 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 3559019 3559020 PST_1256 PST_1257 pcaF pcaB FALSE 0.228 223.000 0.000 0.001 N NA
 3559020 3559021 PST_1257 PST_1258 pcaB pcaD TRUE 0.923 9.000 0.063 1.000   NA
 3559021 3559022 PST_1258 PST_1259 pcaD pcaC TRUE 0.642 96.000 0.174 1.000   NA
 3559023 3559024 PST_1260 PST_1261     FALSE 0.204 80.000 0.000 NA   NA
 3559024 3559025 PST_1261 PST_1262   metG FALSE 0.118 264.000 0.000 1.000 Y NA
 3559029 3559030 PST_1266 PST_1267 napC napB TRUE 0.979 11.000 0.143 NA Y NA
 3559030 3559031 PST_1267 PST_1268 napB napA TRUE 0.994 12.000 0.643 NA Y NA
 3559031 3559032 PST_1268 PST_1269 napA napD TRUE 0.970 0.000 0.106 NA N NA
 3559032 3559033 PST_1269 PST_1270 napD napE TRUE 0.913 12.000 0.109 NA N NA
 3559035 3559036 PST_1272 PST_1273     FALSE 0.233 64.000 0.014 NA   NA
 3559036 3559037 PST_1273 PST_1274     FALSE 0.362 163.000 0.125 NA   NA
 3559037 3559038 PST_1274 PST_1275     FALSE 0.313 140.000 0.066 NA   NA
 3559039 3559040 PST_1276 PST_1277   aroF-2 FALSE 0.004 556.000 0.000 NA N NA
 3559040 3559041 PST_1277 PST_1278 aroF-2   FALSE 0.338 109.000 0.053 1.000 N NA
 3559041 3559042 PST_1278 PST_1279     FALSE 0.298 59.000 0.026 NA   NA
 3559042 3559043 PST_1279 PST_1280     TRUE 0.782 106.000 0.429 NA   NA
 3559043 3559044 PST_1280 PST_1281   cydA1 FALSE 0.005 520.000 0.000 NA   NA
 3559044 3559045 PST_1281 PST_1282 cydA1 cydB1 TRUE 0.992 -55.000 0.727 0.072 Y NA
 3559045 3559046 PST_1282 PST_1283 cydB1   TRUE 0.772 9.000 0.000 1.000 N NA
 3559046 3559047 PST_1283 PST_1284     FALSE 0.363 -139.000 0.000 NA   NA
 3559047 3559048 PST_1284 PST_1285     FALSE 0.003 1230.000 0.000 NA   NA
 3559048 3559049 PST_1285 PST_1286     TRUE 0.967 77.000 0.909 NA Y NA
 3559049 3559050 PST_1286 PST_1287     FALSE 0.167 188.000 0.071 NA N NA
 3559052 3559053 PST_1289 PST_1290     TRUE 0.592 47.000 0.091 NA   NA
 3559053 3559054 PST_1290 PST_1291   cobO TRUE 0.898 -3.000 0.024 NA   NA
 3559054 3559055 PST_1291 PST_1292 cobO cobB TRUE 0.816 133.000 0.054 0.006 Y NA
 3559055 3559056 PST_1292 PST_1293 cobB   TRUE 0.514 66.000 0.071 1.000 N NA
 3559056 3559057 PST_1293 PST_1294     TRUE 0.884 -3.000 0.018 1.000 N NA
 3559057 3559058 PST_1294 PST_1295   cobD TRUE 0.893 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3559058 3559059 PST_1295 PST_1296 cobD cobC TRUE 0.993 -7.000 0.463 0.006 N NA
 3559059 3559060 PST_1296 PST_1297 cobC cobQ TRUE 0.981 -3.000 0.033 0.006 N NA
 3559060 3559061 PST_1297 PST_1298 cobQ cobU TRUE 0.987 3.000 0.079 1.000 Y NA
 3559061 3559062 PST_1298 PST_1299 cobU cobT TRUE 0.993 0.000 0.138 1.000 Y NA
 3559062 3559063 PST_1299 PST_1300 cobT   TRUE 0.745 -63.000 0.090 NA N NA
 3559063 3559064 PST_1300 PST_1301   cobS TRUE 0.773 10.000 0.021 NA N NA
 3559065 3559066 PST_1302 PST_1303     TRUE 0.765 5.000 0.010 NA N NA
 3559066 3559067 PST_1303 PST_1304   nifQ TRUE 0.880 -3.000 0.017 NA   NA
 3559067 3559068 PST_1304 PST_1305 nifQ   TRUE 0.957 -3.000 0.062 1.000   NA
 3559068 3559069 PST_1305 PST_1305a   fdxN TRUE 0.966 11.000 0.086 0.072   NA
 3559069 3559070 PST_1305a PST_1306 fdxN nifB TRUE 0.863 12.000 0.047 1.000   NA
 3559076 3559077 PST_1312 PST_1313 tpmA nifA FALSE 0.199 101.000 0.000 1.000   NA
 3559077 3559078 PST_1313 PST_1314 nifA nifL TRUE 0.985 15.000 0.214 0.084 Y NA
 3559079 3559080 PST_1315 PST_1316 rnfA rnfB TRUE 0.924 38.000 0.098 0.072 Y NA
 3559080 3559081 PST_1316 PST_1317 rnfB rnfC TRUE 0.926 43.000 0.092 0.027 Y NA
 3559081 3559082 PST_1317 PST_1318 rnfC rnfD TRUE 0.999 -3.000 0.905 0.072 Y NA
 3559082 3559083 PST_1318 PST_1319 rnfD rnfG TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.072 Y NA
 3559083 3559084 PST_1319 PST_1320 rnfG rnfE TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.072 Y NA
 3559084 3559085 PST_1320 PST_1321 rnfE rnfH TRUE 0.917 26.000 0.419 NA   NA
 3559085 3559086 PST_1321 PST_1322 rnfH nifY2 FALSE 0.265 41.000 0.000 NA   NA
 3559086 3559087 PST_1322 PST_1323 nifY2   TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559088 3559089 PST_1324 PST_1325     TRUE 0.685 28.000 0.080 NA   NA
 3559090 3559091 PST_1326 PST_1327 nifH nifD TRUE 0.644 112.000 0.026 0.001 N NA
 3559091 3559092 PST_1327 PST_1328 nifD nifK TRUE 0.986 103.000 0.902 0.001 Y NA
 3559092 3559093 PST_1328 PST_1329 nifK nifT TRUE 0.789 92.000 0.100 0.004 N NA
 3559093 3559094 PST_1329 PST_1330 nifT nifY TRUE 0.910 4.000 0.038 NA   NA
 3559094 3559095 PST_1330 PST_1331 nifY   TRUE 0.974 -3.000 0.136 NA   NA
 3559095 3559096 PST_1331 PST_1332     FALSE 0.158 256.000 0.182 NA   NA
 3559096 3559097 PST_1332 PST_1333   nifE FALSE 0.009 412.000 0.000 1.000   NA
 3559097 3559098 PST_1333 PST_1334 nifE nifN TRUE 0.998 11.000 0.475 0.002 Y NA
 3559098 3559099 PST_1334 PST_1335 nifN nifX TRUE 0.926 4.000 0.048 NA   NA
 3559099 3559100 PST_1335 PST_1336 nifX   TRUE 0.764 29.000 0.143 NA   NA
 3559100 3559101 PST_1336 PST_1337     TRUE 0.950 15.000 0.321 NA   NA
 3559101 3559102 PST_1337 PST_1338     TRUE 0.505 83.000 0.080 NA   NA
 3559102 3559103 PST_1338 PST_1339     TRUE 0.836 13.000 0.053 NA   NA
 3559103 3559104 PST_1339 PST_1340     TRUE 0.826 4.000 0.000 NA   NA
 3559104 3559105 PST_1340 PST_1341     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3559105 3559106 PST_1341 PST_1342     TRUE 0.909 -7.000 0.080 NA   NA
 3559106 3559107 PST_1342 PST_1343     TRUE 0.961 -3.000 0.080 NA   NA
 3559108 3559109 PST_1344 PST_1345   modC FALSE 0.140 109.000 0.008 NA   NA
 3559109 3559110 PST_1345 PST_1346 modC modB TRUE 0.995 13.000 0.308 0.001 Y NA
 3559110 3559111 PST_1346 PST_1347 modB modA TRUE 0.999 7.000 0.660 0.001 Y NA
 3559111 3559112 PST_1347 PST_1348 modA   TRUE 0.963 12.000 0.031 0.001   NA
 3559113 3559114 PST_1349 PST_1350 hesB nifU TRUE 0.725 62.000 0.210 NA   NA
 3559114 3559115 PST_1350 PST_1351 nifU nifS TRUE 0.995 2.000 0.716 1.000 N NA
 3559115 3559116 PST_1351 PST_1352 nifS nifV TRUE 0.922 41.000 0.250 1.000 Y NA
 3559116 3559117 PST_1352 PST_1353 nifV cysE TRUE 0.994 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 3559117 3559118 PST_1353 PST_1354 cysE   TRUE 0.962 13.000 0.286 1.000   NA
 3559118 3559119 PST_1354 PST_1355   nifW TRUE 0.964 -3.000 0.078 1.000   NA
 3559119 3559120 PST_1355 PST_1356 nifW nifZ TRUE 0.935 20.000 0.111 0.004   NA
 3559120 3559121 PST_1356 PST_1357 nifZ nifM TRUE 0.984 -10.000 0.643 1.000   NA
 3559121 3559122 PST_1357 PST_1358 nifM clpX TRUE 0.991 -3.000 0.004 0.007 Y NA
 3559122 3559123 PST_1358 PST_1359 clpX nifF FALSE 0.038 200.000 0.002 1.000 N NA
 3559123 3559124 PST_1359 PST_1360 nifF   FALSE 0.059 187.000 0.000 1.000 N NA
 3559125 3559126 PST_1361 PST_1362     FALSE 0.046 197.000 0.008 1.000 N NA
 3559127 3559128 PST_1363 PST_1364 rnd   TRUE 0.958 -3.000 0.073 NA   NA
 3559128 3559129 PST_1364 PST_1365     FALSE 0.209 91.000 0.016 NA   NA
 3559129 3559130 PST_1365 PST_1366     FALSE 0.159 97.000 0.008 NA   NA
 3559130 3559131 PST_1366 PST_1367     FALSE 0.347 73.000 0.034 NA   NA
 3559131 3559132 PST_1367 PST_1368     FALSE 0.352 43.000 0.021 1.000   NA
 3559132 3559133 PST_1368 PST_1369   alaS FALSE 0.177 93.000 0.009 1.000 N NA
 3559133 3559134 PST_1369 PST_1370 alaS lysC TRUE 0.469 80.000 0.065 1.000 N NA
 3559134 3559135 PST_1370 PST_1371 lysC csrA FALSE 0.218 181.000 0.079 1.000 N NA
 3559135 3559136 PST_1371 PST_1372 csrA   FALSE 0.217 63.000 0.000 NA   NA
 3559136 3559137 PST_1372 PST_1373     FALSE 0.150 111.000 0.000 NA   NA
 3559137 3559138 PST_1373 PST_1374     FALSE 0.218 70.000 0.000 NA   NA
 3559140 3559141 PST_1376 PST_1377 mgtE   FALSE 0.033 406.000 0.000 0.061 N NA
 3559141 3559142 PST_1377 PST_1378     TRUE 0.999 11.000 0.886 0.001 Y NA
 3559143 3559144 PST_1379 PST_1380 algZ   FALSE 0.103 152.000 0.000 NA   NA
 3559146 3559147 PST_1382 PST_1383     FALSE 0.215 60.000 0.000 NA   NA
 3559147 3559148 PST_1383 PST_1384   flgM FALSE 0.008 403.000 0.000 NA   NA
 3559148 3559149 PST_1384 PST_1385 flgM flgA TRUE 0.879 117.000 0.371 NA Y NA
 3559150 3559151 PST_1386 PST_1387 cheV-3 cheR TRUE 0.944 127.000 0.838 1.000 Y NA
 3559151 3559152 PST_1387 PST_1388 cheR flgB FALSE 0.403 189.000 0.059 1.000 Y NA
 3559152 3559153 PST_1388 PST_1389 flgB flgC TRUE 0.986 56.000 0.800 0.004 Y NA
 3559153 3559154 PST_1389 PST_1390 flgC flgD TRUE 0.979 13.000 0.207 NA Y NA
 3559154 3559155 PST_1390 PST_1391 flgD flgE TRUE 0.986 23.000 0.875 NA Y NA
 3559155 3559156 PST_1391 PST_1392 flgE flgF FALSE 0.456 327.000 0.594 1.000 Y NA
 3559156 3559157 PST_1392 PST_1393 flgF flgG TRUE 0.968 43.000 0.207 0.001 Y NA
 3559157 3559158 PST_1393 PST_1394 flgG flgH TRUE 0.981 72.000 0.632 0.006 Y NA
 3559158 3559159 PST_1394 PST_1395 flgH flgI TRUE 0.984 15.000 0.128 0.008 Y NA
 3559159 3559160 PST_1395 PST_1396 flgI flgJ TRUE 0.994 15.000 0.405 0.008 Y NA
 3559160 3559161 PST_1396 PST_1397 flgJ flgK TRUE 0.999 4.000 0.705 0.002 Y NA
 3559161 3559162 PST_1397 PST_1398 flgK flgL TRUE 0.989 12.000 0.057 0.001 Y NA
 3559162 3559163 PST_1398 PST_1399 flgL   FALSE 0.054 190.000 0.000 NA   NA
 3559163 3559164 PST_1399 PST_1400   cysC FALSE 0.006 467.000 0.000 NA   NA
 3559164 3559165 PST_1400 PST_1401 cysC   FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 3559165 3559166 PST_1401 PST_1402     FALSE 0.219 55.000 0.000 NA   NA
 3559166 3559167 PST_1402 PST_1403     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559167 3559168 PST_1403 PST_1404   fliC FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 3559168 3559169 PST_1404 PST_1405 fliC   TRUE 0.670 67.000 0.025 NA Y NA
 3559169 3559170 PST_1405 PST_1406     TRUE 0.713 128.000 0.117 NA Y NA
 3559170 3559171 PST_1406 PST_1407     FALSE 0.134 129.000 0.000 1.000 N NA
 3559171 3559172 PST_1407 PST_1408     FALSE 0.008 398.000 0.000 NA   NA
 3559172 3559173 PST_1408 PST_1409     TRUE 0.704 159.000 0.500 NA   NA
 3559173 3559174 PST_1409 PST_1410     TRUE 0.960 18.000 0.562 NA   NA
 3559174 3559175 PST_1410 PST_1411     TRUE 0.809 51.000 0.312 NA   NA
 3559176 3559177 PST_1412 PST_1414   prc FALSE 0.010 452.000 0.029 1.000 N NA
 3559179 3559180 PST_1415 PST_1416     FALSE 0.420 21.000 0.000 NA   NA
 3559180 3559181 PST_1416 PST_1417     TRUE 0.983 -7.000 0.522 NA   NA
 3559181 3559182 PST_1417 PST_1418     FALSE 0.299 43.000 0.000 1.000   NA
 3559182 3559183 PST_1418 PST_1419     TRUE 0.995 -3.000 0.722 NA   NA
 3559183 3559184 PST_1419 PST_1420     TRUE 0.988 5.000 0.426 NA   NA
 3559184 3559185 PST_1420 PST_1421     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3559185 3559186 PST_1421 PST_1422   rluA FALSE 0.147 148.000 0.022 1.000 N NA
 3559186 3559187 PST_1422 PST_1423 rluA minE FALSE 0.119 105.000 0.008 NA N NA
 3559187 3559188 PST_1423 PST_1424 minE minD TRUE 0.998 -3.000 0.618 NA Y NA
 3559188 3559189 PST_1424 PST_1425 minD minC TRUE 0.537 263.000 0.466 1.000 Y NA
 3559191 3559192 PST_1427 PST_1428     FALSE 0.190 95.000 0.014 NA   NA
 3559192 3559193 PST_1428 PST_1429     TRUE 0.957 -7.000 0.204 NA   NA
 3559193 3559194 PST_1429 PST_1430     FALSE 0.103 193.000 0.038 NA   NA
 3559195 3559196 PST_1431 PST_1432     TRUE 0.996 0.000 0.733 NA   NA
 3559196 3559197 PST_1432 PST_1433     FALSE 0.035 236.000 0.000 1.000   NA
 3559197 3559198 PST_1433 PST_1434     TRUE 0.519 104.000 0.107 1.000   NA
 3559198 3559199 PST_1434 PST_1435     TRUE 0.683 113.000 0.267 NA   NA
 3559200 3559201 PST_1436 PST_1437     FALSE 0.405 44.000 0.036 NA   NA
 3559201 3559202 PST_1437 PST_1438     FALSE 0.217 197.000 0.125 NA N NA
 3559202 3559203 PST_1438 PST_1439     TRUE 0.759 126.000 0.471 NA N NA
 3559203 3559204 PST_1439 PST_1440   asnB TRUE 0.768 138.000 0.514 1.000 N NA
 3559206 3559207 PST_1442 PST_1443     TRUE 0.962 4.000 0.111 NA   NA
 3559207 3559208 PST_1443 PST_1444     TRUE 0.963 3.000 0.097 NA   NA
 3559210 3559211 PST_1446 PST_1448     TRUE 0.884 10.000 0.048 NA   NA
 3559213 3559214 PST_1449 PST_1450     FALSE 0.008 391.000 0.000 NA   NA
 3559214 3559215 PST_1450 PST_1451     TRUE 0.674 79.000 0.182 NA   NA
 3559215 3559216 PST_1451 PST_1452     FALSE 0.329 119.000 0.056 NA   NA
 3559216 3559217 PST_1452 PST_1453     FALSE 0.415 85.000 0.056 NA   NA
 3559218 3559219 PST_1454 PST_1455     FALSE 0.432 156.000 0.016 1.000 Y NA
 3559219 3559220 PST_1455 PST_1456     TRUE 0.525 -19.000 0.006 NA   NA
 3559221 3559222 PST_1457 PST_1458     TRUE 0.844 5.000 0.020 NA   NA
 3559223 3559224 PST_1459 PST_1460     FALSE 0.039 210.000 0.000 NA   NA
 3559224 3559225 PST_1460 PST_1461     TRUE 0.976 -3.000 0.154 NA   NA
 3559225 3559226 PST_1461 PST_1462     TRUE 0.992 -3.000 0.462 NA   NA
 3559226 3559227 PST_1462 PST_1463     FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 3559227 3559228 PST_1463 PST_1464     FALSE 0.194 86.000 0.000 NA   NA
 3559228 3559229 PST_1464 PST_1465     FALSE 0.336 29.000 0.000 NA   NA
 3559229 3559230 PST_1465 PST_1466     FALSE 0.183 92.000 0.000 NA   NA
 3559230 3559231 PST_1466 PST_1467   hsdR FALSE 0.086 164.000 0.000 NA   NA
 3559231 3559232 PST_1467 PST_1468 hsdR   FALSE 0.220 69.000 0.000 NA   NA
 3559232 3559233 PST_1468 PST_1469     FALSE 0.109 147.000 0.000 NA   NA
 3559233 3559234 PST_1469 PST_1470     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3559234 3559235 PST_1470 PST_1471   hsdS TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3559235 3559236 PST_1471 PST_1472 hsdS   TRUE 0.500 17.000 0.000 NA   NA
 3559236 3559237 PST_1472 PST_1473     FALSE 0.369 42.000 0.029 NA   NA
 3559237 3559238 PST_1473 PST_1474     TRUE 0.991 0.000 0.360 NA   NA
 3559238 3559239 PST_1474 PST_1475     TRUE 0.975 -3.000 0.147 NA   NA
 3559239 3559240 PST_1475 PST_1476     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 3559241 3559242 PST_1477 PST_1478     TRUE 0.912 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 3559243 3559244 PST_1479 PST_1480     TRUE 0.989 0.000 0.293 NA   NA
 3559244 3559245 PST_1480 PST_1481     FALSE 0.025 250.000 0.000 NA   NA
 3559245 3559246 PST_1481 PST_1482     FALSE 0.005 523.000 0.000 NA   NA
 3559247 3559248 PST_1483 PST_1484     FALSE 0.012 318.000 0.000 NA   NA
 3559248 3559249 PST_1484 PST_1485     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3559249 3559250 PST_1485 PST_1486     FALSE 0.011 333.000 0.000 NA   NA
 3559250 3559251 PST_1486 PST_1487     TRUE 0.854 27.000 0.071 0.061   NA
 3559251 3559252 PST_1487 PST_1488     FALSE 0.236 49.000 0.000 NA   NA
 3559252 3559253 PST_1488 PST_1489     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559256 3559257 PST_1491 PST_1492     FALSE 0.004 649.000 0.000 NA   NA
 3559259 3559260 PST_1495 PST_1497     FALSE 0.054 190.000 0.000 NA   NA
 3559260 3559261 PST_1497 PST_1498     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 3559262 3559263 PST_1499 PST_1500     FALSE 0.110 178.000 0.023 1.000   NA
 3559263 3559264 PST_1500 PST_1501     TRUE 0.955 -7.000 0.182 1.000   NA
 3559264 3559265 PST_1501 PST_1502     TRUE 0.957 -3.000 0.071 NA   NA
 3559265 3559266 PST_1502 PST_1503     FALSE 0.420 88.000 0.059 NA   NA
 3559267 3559268 PST_1504 PST_1505 fdxA mutS FALSE 0.179 122.000 0.020 1.000 N NA
 3559269 3559270 PST_1506 PST_1507     TRUE 0.518 -28.000 0.011 NA   NA
 3559270 3559271 PST_1507 PST_1508   recA TRUE 0.507 84.000 0.082 NA   NA
 3559271 3559272 PST_1508 PST_1509 recA recX TRUE 0.813 51.000 0.296 1.000   NA
 3559273 3559274 PST_1510 PST_1511     FALSE 0.435 113.000 0.089 NA   NA
 3559282 3559283 PST_1519 PST_1520     TRUE 0.936 -49.000 0.407 NA   NA
 3559286 3559287 PST_1523 PST_1524 dinG estC FALSE 0.178 112.000 0.017 1.000 N NA
 3559287 3559288 PST_1524 PST_1525 estC   TRUE 0.897 76.000 0.667 1.000 N NA
 3559288 3559289 PST_1525 PST_1526   pdxH FALSE 0.075 192.000 0.023 1.000 N NA
 3559291 3559292 PST_1528 PST_1529     FALSE 0.035 221.000 0.000 1.000 N NA
 3559292 3559293 PST_1529 PST_1530     TRUE 1.000 0.000 0.881 0.003 Y NA
 3559293 3559294 PST_1530 PST_1531     TRUE 0.999 -3.000 0.976 0.003 Y NA
 3559294 3559295 PST_1531 PST_1532     TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 3559295 3559296 PST_1532 PST_1533     TRUE 0.997 -15.000 0.937 0.068 Y NA
 3559296 3559297 PST_1533 PST_1534     TRUE 0.997 10.000 0.937 1.000 Y NA
 3559298 3559299 PST_1535 PST_1536 glnD map TRUE 0.925 37.000 0.651 1.000 N NA
 3559300 3559301 PST_1537 PST_1538 rpsB tsf TRUE 0.935 128.000 0.748 1.000 Y NA
 3559301 3559302 PST_1538 PST_1539 tsf pyrH FALSE 0.055 200.000 0.017 1.000 N NA
 3559302 3559303 PST_1539 PST_1540 pyrH frr FALSE 0.439 33.000 0.030 1.000 N NA
 3559303 3559304 PST_1540 PST_1541 frr uppS TRUE 0.873 41.000 0.409 1.000 N NA
 3559304 3559305 PST_1541 PST_1542 uppS cdsA TRUE 0.880 129.000 0.400 1.000 Y NA
 3559305 3559306 PST_1542 PST_1543 cdsA dxr TRUE 0.996 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 3559306 3559307 PST_1543 PST_1544 dxr   TRUE 0.881 61.000 0.568 1.000 N NA
 3559307 3559308 PST_1544 PST_1545     TRUE 0.557 106.000 0.014 1.000 Y NA
 3559308 3559309 PST_1545 PST_1546   ompH TRUE 0.951 13.000 0.050 1.000 Y NA
 3559309 3559310 PST_1546 PST_1547 ompH lpxD TRUE 0.994 14.000 0.814 1.000 Y NA
 3559310 3559311 PST_1547 PST_1548 lpxD fabZ TRUE 0.883 105.000 0.796 1.000 N NA
 3559311 3559312 PST_1548 PST_1549 fabZ lpxA TRUE 0.996 -3.000 0.850 1.000 N NA
 3559312 3559313 PST_1549 PST_1550 lpxA lpxB TRUE 0.844 131.000 0.289 1.000 Y NA
 3559313 3559314 PST_1550 PST_1551 lpxB rnhB TRUE 0.983 0.000 0.186 1.000 N NA
 3559314 3559315 PST_1551 PST_1552 rnhB dnaE FALSE 0.206 287.000 0.104 1.000 Y NA
 3559315 3559316 PST_1552 PST_1553 dnaE accA FALSE 0.269 185.000 0.122 1.000 N NA
 3559316 3559317 PST_1553 PST_1554 accA   FALSE 0.105 267.000 0.123 1.000 N NA
 3559317 3559318 PST_1554 PST_1555   pyrG FALSE 0.093 168.000 0.016 1.000 N NA
 3559318 3559319 PST_1555 PST_1556 pyrG kdsA TRUE 0.975 -3.000 0.138 1.000 N NA
 3559319 3559320 PST_1556 PST_1557 kdsA eno TRUE 0.841 -40.000 0.125 1.000 N NA
 3559320 3559321 PST_1557 PST_1558 eno   TRUE 0.710 93.000 0.241 1.000 N NA
 3559321 3559322 PST_1558 PST_1559   ispD TRUE 0.981 -3.000 0.185 1.000 N NA
 3559323 3559324 PST_1560 PST_1561     FALSE 0.287 77.000 0.026 NA   NA
 3559324 3559325 PST_1561 PST_1562     TRUE 0.545 118.000 0.160 NA   NA
 3559326 3559327 PST_1563 PST_1564 adhC   TRUE 0.869 89.000 0.567 1.000   NA
 3559329 3559330 PST_1566 PST_1567 ispF truD TRUE 0.981 -3.000 0.173 1.000   NA
 3559330 3559331 PST_1567 PST_1568 truD surE TRUE 0.988 0.000 0.235 1.000   NA
 3559331 3559332 PST_1568 PST_1569 surE pcm TRUE 0.991 -3.000 0.353 1.000   NA
 3559332 3559333 PST_1569 PST_1570 pcm   TRUE 0.660 20.000 0.046 NA   NA
 3559333 3559334 PST_1570 PST_1571   nlpD FALSE 0.389 68.000 0.040 NA   NA
 3559334 3559335 PST_1571 PST_1572 nlpD rpoS TRUE 0.463 99.000 0.081 1.000 N NA
 3559335 3559336 PST_1572 PST_1573 rpoS   FALSE 0.005 503.000 0.000 NA   NA
 3559338 3559339 PST_1574 PST_1576     FALSE 0.013 307.000 0.000 NA   NA
 3559340 3559341 PST_1577 PST_1578     TRUE 0.749 7.000 0.004 NA   NA
 3559341 3559342 PST_1578 PST_1579     FALSE 0.065 190.000 0.000 1.000   NA
 3559344 3559345 PST_1581 PST_1582     FALSE 0.142 98.000 0.002 NA   NA
 3559346 3559347 PST_1583 PST_1584     FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 3559348 3559349 PST_1585 PST_1586     FALSE 0.308 103.000 0.041 NA   NA
 3559349 3559350 PST_1586 PST_1587     FALSE 0.346 90.000 0.041 NA   NA
 3559351 3559352 PST_1588 PST_1589 dgt   FALSE 0.008 401.000 0.000 1.000 N NA
 3559356 3559357 PST_1593 PST_1594     FALSE 0.182 184.000 0.067 NA   NA
 3559357 3559358 PST_1594 PST_1595     FALSE 0.013 305.000 0.000 NA   NA
 3559361 3559362 PST_1598 PST_1599     FALSE 0.201 100.000 0.000 1.000   NA
 3559362 3559363 PST_1599 PST_1600     FALSE 0.023 271.000 0.000 1.000   NA
 3559363 3559364 PST_1600 PST_1601   glpD FALSE 0.065 190.000 0.000 1.000   NA
 3559364 3559365 PST_1601 PST_1602 glpD glpR FALSE 0.007 430.000 0.000 1.000 N NA
 3559365 3559366 PST_1602 PST_1603 glpR glpK FALSE 0.296 133.000 0.055 1.000 N NA
 3559366 3559367 PST_1603 PST_1604 glpK glpF TRUE 0.724 13.000 0.023 1.000 N NA
 3559367 3559368 PST_1604 PST_1605 glpF   FALSE 0.059 185.000 0.000 NA   NA
 3559368 3559369 PST_1605 PST_1606     FALSE 0.206 78.000 0.000 NA   NA
 3559369 3559370 PST_1606 PST_1607     FALSE 0.214 93.000 0.000 1.000   NA
 3559373 3559374 PST_1610 PST_1611     TRUE 0.980 20.000 0.667 0.069 N NA
 3559374 3559375 PST_1611 PST_1612     TRUE 0.705 28.000 0.100 NA N NA
 3559375 3559376 PST_1612 PST_1613     FALSE 0.011 302.000 0.000 NA N NA
 3559377 3559378 PST_1614 PST_1615     FALSE 0.388 25.000 0.000 1.000 N NA
 3559378 3559379 PST_1615 PST_1616     FALSE 0.098 157.000 0.000 NA   NA
 3559380 3559381 PST_1617 PST_1618     TRUE 0.503 -61.000 0.023 NA   NA
 3559385 3559386 PST_1622 PST_1623     TRUE 0.469 95.000 0.080 NA   NA
 3559389 3559390 PST_1626 PST_1627     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3559390 3559391 PST_1627 PST_1628     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 3559392 3559393 PST_1629 PST_1630 katG   FALSE 0.138 142.000 0.000 1.000   NA
 3559396 3559397 PST_1633 PST_1634     FALSE 0.003 893.000 0.000 NA   NA
 3559397 3559398 PST_1634 PST_1635     FALSE 0.148 113.000 0.000 NA   NA
 3559398 3559399 PST_1635 PST_1636   nrdB FALSE 0.083 166.000 0.000 NA   NA
 3559399 3559400 PST_1636 PST_1637 nrdB nrdA TRUE 0.748 299.000 0.564 0.001 Y NA
 3559401 3559402 PST_1638 PST_1639     TRUE 0.944 12.000 0.024 1.000 Y NA
 3559403 3559404 PST_1640 PST_1641 fadE   FALSE 0.171 113.000 0.022 NA N NA
 3559404 3559405 PST_1641 PST_1642     FALSE 0.186 127.000 0.029 NA N NA
 3559405 3559406 PST_1642 PST_1643     FALSE 0.115 142.000 0.000 NA   NA
 3559408 3559409 PST_1645 PST_1646     FALSE 0.062 183.000 0.000 NA   NA
 3559410 3559411 PST_1647 PST_1648     TRUE 0.515 130.000 0.033 0.037 N NA
 3559411 3559412 PST_1648 PST_1649   argD FALSE 0.202 142.000 0.033 1.000 N NA
 3559412 3559413 PST_1649 PST_1650 argD   TRUE 0.626 57.000 0.133 NA   NA
 3559413 3559414 PST_1650 PST_1651   astE TRUE 0.988 13.000 0.909 NA   NA
 3559414 3559415 PST_1651 PST_1652 astE   FALSE 0.058 191.000 0.013 1.000 N NA
 3559415 3559416 PST_1652 PST_1653     TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 3559416 3559417 PST_1653 PST_1654   queF TRUE 0.752 28.000 0.110 1.000   NA
 3559421 3559422 PST_1658 PST_1659     TRUE 0.996 -3.000 0.408 NA Y NA
 3559423 3559424 PST_1660 PST_1661 tal   FALSE 0.246 132.000 0.039 1.000 N NA
 3559424 3559425 PST_1661 PST_1662     FALSE 0.031 233.000 0.000 1.000 N NA
 3559425 3559426 PST_1662 PST_1663     TRUE 0.974 -3.000 0.000 NA Y NA
 3559426 3559427 PST_1663 PST_1664     TRUE 0.660 47.000 0.000 NA Y NA
 3559427 3559428 PST_1664 PST_1665     FALSE 0.444 24.000 0.000 1.000   NA
 3559429 3559430 PST_1666 PST_1667 benR benA FALSE 0.012 326.000 0.000 1.000 N NA
 3559430 3559431 PST_1667 PST_1668 benA benB TRUE 0.999 3.000 0.953 0.001 N NA
 3559431 3559432 PST_1668 PST_1669 benB benC TRUE 0.994 11.000 0.672 0.069 N NA
 3559432 3559433 PST_1669 PST_1670 benC benD TRUE 0.883 72.000 0.574 1.000 N NA
 3559433 3559434 PST_1670 PST_1671 benD benK TRUE 0.636 108.000 0.209 1.000 N NA
 3559434 3559435 PST_1671 PST_1672 benK catB TRUE 0.894 29.000 0.364 1.000 N NA
 3559435 3559436 PST_1672 PST_1673 catB catC TRUE 0.968 15.000 0.500 1.000 N NA
 3559436 3559437 PST_1673 PST_1674 catC catA TRUE 0.643 159.000 0.114 1.000 Y NA
 3559437 3559438 PST_1674 PST_1675 catA benE TRUE 0.724 128.000 0.114 1.000 Y NA
 3559438 3559439 PST_1675 PST_1676 benE benF TRUE 0.937 108.000 0.800 0.067   NA
 3559439 3559440 PST_1676 PST_1677 benF   FALSE 0.004 633.000 0.000 NA   NA
 3559440 3559441 PST_1677 PST_1678     FALSE 0.204 80.000 0.000 NA   NA
 3559441 3559442 PST_1678 PST_1679     TRUE 0.786 7.000 0.000 NA   NA
 3559442 3559443 PST_1679 PST_1680     FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 3559443 3559444 PST_1680 PST_1680a     FALSE 0.140 123.000 0.000 NA   NA
 3559448 3559449 PST_1684 PST_1685     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 3559449 3559450 PST_1685 PST_1686     FALSE 0.375 84.000 0.038 1.000   NA
 3559450 3559451 PST_1686 PST_1687     TRUE 0.979 -7.000 0.407 1.000 N NA
 3559451 3559452 PST_1687 PST_1688     FALSE 0.079 172.000 0.000 1.000 N NA
 3559455 3559456 PST_1691 PST_1692     FALSE 0.360 165.000 0.133 NA   NA
 3559457 3559458 PST_1693 PST_1694     TRUE 0.731 71.000 0.216 NA   NA
 3559458 3559459 PST_1694 PST_1695     FALSE 0.162 114.000 0.021 NA N NA
 3559459 3559460 PST_1695 PST_1696     TRUE 0.889 -3.000 0.021 NA   NA
 3559460 3559461 PST_1696 PST_1697     TRUE 0.960 14.000 0.324 1.000   NA
 3559461 3559462 PST_1697 PST_1698     TRUE 0.944 21.000 0.500 1.000 N NA
 3559462 3559463 PST_1698 PST_1699     TRUE 0.990 10.000 0.250 1.000 Y NA
 3559463 3559464 PST_1699 PST_1700     FALSE 0.418 81.000 0.045 1.000   NA
 3559464 3559465 PST_1700 PST_1701     FALSE 0.232 50.000 0.000 NA   NA
 3559466 3559467 PST_1702 PST_1703     TRUE 0.927 21.000 0.160 0.060   NA
 3559468 3559469 PST_1704 PST_1705     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3559470 3559471 PST_1706 PST_1707     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3559471 3559472 PST_1707 PST_1708     TRUE 0.974 0.000 0.000 0.047   NA
 3559472 3559473 PST_1708 PST_1709     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.047   NA
 3559473 3559474 PST_1709 PST_1710     TRUE 0.777 -64.000 0.000 0.047 N NA
 3559474 3559475 PST_1710 PST_1711   exbD1 FALSE 0.376 149.000 0.000 0.047 N NA
 3559475 3559476 PST_1711 PST_1712 exbD1 exbB1 TRUE 0.999 2.000 1.000 0.065 Y NA
 3559476 3559477 PST_1712 PST_1713 exbB1   TRUE 0.954 122.000 1.000 0.012 N NA
 3559477 3559478 PST_1713 PST_1714     FALSE 0.004 593.000 0.000 NA   NA
 3559478 3559479 PST_1714 PST_1715     TRUE 0.985 -3.000 0.233 NA   NA
 3559479 3559480 PST_1715 PST_1716   mvaB FALSE 0.007 409.000 0.000 NA   NA
 3559480 3559481 PST_1716 PST_1717 mvaB   TRUE 0.964 13.000 0.115 0.037 N NA
 3559482 3559483 PST_1718 PST_1719     TRUE 0.602 14.000 0.000 NA   NA
 3559483 3559484 PST_1719 PST_1720     FALSE 0.110 146.000 0.000 NA   NA
 3559487 3559488 PST_1724 PST_1725     FALSE 0.235 88.000 0.020 NA   NA
 3559489 3559490 PST_1726 PST_1727 fadB fadA TRUE 0.984 19.000 0.607 1.000 Y NA
 3559490 3559491 PST_1727 PST_1728 fadA   TRUE 0.499 73.000 0.070 NA   NA
 3559491 3559492 PST_1728 PST_1729   topA FALSE 0.013 287.000 0.007 NA   NA
 3559492 3559493 PST_1729 PST_1730 topA   FALSE 0.121 136.000 0.011 NA   NA
 3559496 3559497 PST_1733 PST_1734   lexA-2 TRUE 0.938 11.000 0.122 1.000 N NA
 3559498 3559499 PST_1735 PST_1736 psrA   TRUE 0.678 40.000 0.121 NA   NA
 3559499 3559500 PST_1736 PST_1737   nagZ FALSE 0.073 216.000 0.038 NA   NA
 3559500 3559501 PST_1737 PST_1738 nagZ   TRUE 0.472 25.000 0.018 1.000   NA
 3559501 3559502 PST_1738 PST_1739     FALSE 0.115 147.000 0.005 1.000   NA
 3559502 3559503 PST_1739 PST_1740     FALSE 0.043 204.000 0.000 NA   NA
 3559503 3559504 PST_1740 PST_1741     TRUE 0.480 71.000 0.064 NA   NA
 3559505 3559506 PST_1742 PST_1743     FALSE 0.155 111.000 0.013 NA   NA
 3559507 3559508 PST_1744 PST_1745   betB FALSE 0.188 93.000 0.012 1.000 N NA
 3559508 3559509 PST_1745 PST_1746 betB betA TRUE 0.971 16.000 0.634 1.000 N NA
 3559510 3559511 PST_1747 PST_1748     FALSE 0.376 26.000 0.000 1.000 N NA
 3559511 3559512 PST_1748 PST_1749     TRUE 0.773 23.000 0.105 NA   NA
 3559512 3559513 PST_1749 PST_1750     FALSE 0.025 247.000 0.000 NA   NA
 3559513 3559514 PST_1750 PST_1751     TRUE 0.943 46.000 1.000 NA   NA
 3559514 3559515 PST_1751 PST_1752     TRUE 0.933 60.000 1.000 NA   NA
 3559515 3559516 PST_1752 PST_1753     TRUE 0.832 56.000 0.400 NA   NA
 3559516 3559517 PST_1753 PST_1754     TRUE 0.501 179.000 0.286 1.000   NA
 3559517 3559518 PST_1754 PST_1755     TRUE 0.894 17.000 0.188 NA   NA
 3559518 3559519 PST_1755 PST_1756     TRUE 0.873 -106.000 0.250 NA   NA
 3559519 3559520 PST_1756 PST_1757     FALSE 0.261 55.000 0.018 1.000 N NA
 3559520 3559521 PST_1757 PST_1758     FALSE 0.262 52.000 0.018 NA   NA
 3559521 3559522 PST_1758 PST_1759     FALSE 0.356 44.000 0.029 NA   NA
 3559522 3559523 PST_1759 PST_1760     TRUE 0.912 50.000 0.286 NA Y NA
 3559523 3559524 PST_1760 PST_1761     TRUE 0.829 -31.000 0.095 NA   NA
 3559524 3559525 PST_1761 PST_1762     TRUE 0.558 23.000 0.027 1.000   NA
 3559525 3559526 PST_1762 PST_1763     FALSE 0.223 76.000 0.014 NA   NA
 3559526 3559527 PST_1763 PST_1764     FALSE 0.003 846.000 0.000 NA   NA
 3559527 3559528 PST_1764 PST_1765     FALSE 0.092 160.000 0.000 NA   NA
 3559529 3559530 PST_1766 PST_1767     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3559530 3559531 PST_1767 PST_1768     FALSE 0.112 144.000 0.000 NA   NA
 3559535 3559536 PST_1772 PST_1773 leuC leuD TRUE 0.997 12.000 0.463 0.001 Y NA
 3559536 3559537 PST_1773 PST_1774 leuD leuB TRUE 0.817 184.000 0.159 0.001 Y NA
 3559537 3559538 PST_1774 PST_1775 leuB asd-1 TRUE 0.940 55.000 0.196 0.037 Y NA
 3559538 3559539 PST_1775 PST_1776 asd-1 asd-2 TRUE 0.801 135.000 0.025 0.001 Y NA
 3559539 3559540 PST_1776 PST_1777 asd-2   FALSE 0.133 145.000 0.017 1.000 N NA
 3559540 3559541 PST_1777 PST_1778   truA TRUE 0.917 3.000 0.035 1.000 N NA
 3559541 3559542 PST_1778 PST_1779 truA trpF TRUE 0.615 83.000 0.139 1.000 N NA
 3559542 3559543 PST_1779 PST_1780 trpF accD FALSE 0.033 216.000 0.007 1.000 N NA
 3559543 3559544 PST_1780 PST_1781 accD folC TRUE 0.807 87.000 0.383 1.000 N NA
 3559544 3559545 PST_1781 PST_1782 folC   TRUE 0.932 -16.000 0.216 NA   NA
 3559545 3559546 PST_1782 PST_1783     TRUE 0.658 42.000 0.116 NA   NA
 3559546 3559547 PST_1783 PST_1784   purF TRUE 0.783 72.000 0.262 1.000   NA
 3559547 3559548 PST_1784 PST_1785 purF metZ TRUE 0.707 42.000 0.153 1.000 N NA
 3559549 3559550 PST_1786 PST_1787 xcpQ xcpP TRUE 0.831 4.000 0.013 NA   NA
 3559551 3559552 PST_1788 PST_1789     FALSE 0.277 38.000 0.000 NA   NA
 3559553 3559554 PST_1790 PST_1791   soxR TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559554 3559555 PST_1791 PST_1792 soxR   FALSE 0.139 127.000 0.000 1.000 N NA
 3559555 3559556 PST_1792 PST_1793     FALSE 0.095 169.000 0.000 1.000   NA
 3559556 3559557 PST_1793 PST_1794     FALSE 0.017 280.000 0.000 NA   NA
 3559557 3559558 PST_1794 PST_1795     TRUE 0.996 0.000 0.778 NA   NA
 3559558 3559559 PST_1795 PST_1796   cobN TRUE 0.901 -49.000 0.263 NA N NA
 3559559 3559560 PST_1796 PST_1797 cobN   FALSE 0.275 194.000 0.158 1.000 N NA
 3559560 3559561 PST_1797 PST_1798   rpmE2 FALSE 0.194 90.000 0.000 1.000 N NA
 3559564 3559565 PST_1801 PST_1802     TRUE 0.995 -3.000 0.600 1.000   NA
 3559568 3559569 PST_1805 PST_1806     TRUE 0.962 10.000 0.194 NA   NA
 3559570 3559571 PST_1807 PST_1808 cydA2 cydB2 TRUE 0.999 4.000 0.750 0.068 Y NA
 3559571 3559572 PST_1808 PST_1809 cydB2   TRUE 0.964 0.000 0.075 NA   NA
 3559573 3559574 PST_1810 PST_1811     TRUE 0.995 -3.000 0.615 1.000   NA
 3559575 3559576 PST_1812 PST_1813 fadH1   TRUE 0.531 33.000 0.047 NA   NA
 3559576 3559577 PST_1813 PST_1814     FALSE 0.041 206.000 0.000 NA   NA
 3559577 3559578 PST_1814 PST_1815     TRUE 0.940 9.000 0.099 NA   NA
 3559578 3559579 PST_1815 PST_1816     FALSE 0.100 138.000 0.000 NA N NA
 3559581 3559582 PST_1818 PST_1819 pdxB   FALSE 0.003 1115.000 0.000 1.000 N NA
 3559582 3559583 PST_1819 PST_1820   dnaX TRUE 0.544 108.000 0.000 1.000 Y NA
 3559583 3559584 PST_1820 PST_1821 dnaX   TRUE 0.840 65.000 0.411 NA   NA
 3559584 3559585 PST_1821 PST_1822   recR TRUE 0.878 81.000 0.604 NA   NA
 3559585 3559586 PST_1822 PST_1823 recR   FALSE 0.138 104.000 0.002 1.000 N NA
 3559586 3559587 PST_1823 PST_1824     TRUE 0.811 91.000 0.130 1.000 Y NA
 3559587 3559588 PST_1824 PST_1825     TRUE 0.987 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 3559588 3559589 PST_1825 PST_1826     TRUE 0.993 11.000 0.500 0.046   NA
 3559590 3559591 PST_1827 PST_1828   apt FALSE 0.277 39.000 0.002 1.000   NA
 3559591 3559592 PST_1828 PST_1829 apt anr FALSE 0.398 27.000 0.016 1.000 N NA
 3559592 3559593 PST_1829 PST_1830 anr   FALSE 0.431 112.000 0.084 1.000 N NA
 3559595 3559596 PST_1832 PST_1833   ccoS TRUE 0.728 95.000 0.266 NA   NA
 3559596 3559597 PST_1833 PST_1834 ccoS   TRUE 0.949 93.000 0.713 NA Y NA
 3559597 3559598 PST_1834 PST_1835     TRUE 0.968 8.000 0.197 NA   NA
 3559598 3559599 PST_1835 PST_1836     TRUE 0.487 108.000 0.111 NA   NA
 3559599 3559600 PST_1836 PST_1837     TRUE 0.931 138.000 0.364 0.025 Y NA
 3559600 3559601 PST_1837 PST_1838   ccoQ-2 TRUE 0.988 1.000 0.061 0.003 N NA
 3559601 3559602 PST_1838 PST_1839 ccoQ-2   TRUE 0.978 4.000 0.030 0.003 N NA
 3559602 3559603 PST_1839 PST_1840   ccoN-2 TRUE 0.996 13.000 1.000 0.003 N NA
 3559603 3559604 PST_1840 PST_1841 ccoN-2   FALSE 0.067 353.000 0.000 0.003 N NA
 3559604 3559605 PST_1841 PST_1842     TRUE 0.971 98.000 0.500 0.003 Y NA
 3559605 3559606 PST_1842 PST_1843   ccoN-1 TRUE 0.979 14.000 0.222 0.003 N NA
 3559608 3559609 PST_1845 PST_1846 aer-2 acnA FALSE 0.009 350.000 0.004 1.000 N NA
 3559610 3559611 PST_1847 PST_1848     FALSE 0.409 73.000 0.047 NA   NA
 3559612 3559613 PST_1849 PST_1850     TRUE 0.811 -43.000 0.105 NA   NA
 3559613 3559614 PST_1850 PST_1851     TRUE 0.999 -3.000 0.905 0.003 Y NA
 3559614 3559615 PST_1851 PST_1852     TRUE 0.816 22.000 0.143 NA   NA
 3559615 3559616 PST_1852 PST_1853     FALSE 0.158 106.000 0.012 NA   NA
 3559617 3559618 PST_1854 PST_1855 moaA2   FALSE 0.030 235.000 0.000 1.000 N NA
 3559618 3559619 PST_1855 PST_1856   zipA TRUE 0.779 175.000 0.115 0.010 Y NA
 3559619 3559620 PST_1856 PST_1857 zipA ligA FALSE 0.122 244.000 0.106 1.000 N NA
 3559620 3559621 PST_1857 PST_1858 ligA   FALSE 0.008 389.000 0.000 NA   NA
 3559622 3559623 PST_1859 PST_1860     TRUE 0.855 27.000 0.071 0.060   NA
 3559624 3559625 PST_1861 PST_1862     FALSE 0.248 58.000 0.018 NA   NA
 3559625 3559626 PST_1862 PST_1863     TRUE 0.822 66.000 0.117 NA Y NA
 3559627 3559628 PST_1864 PST_1865     TRUE 0.991 33.000 1.000 0.060 Y NA
 3559629 3559630 PST_1866 PST_1867 fliS   TRUE 0.992 -3.000 0.478 NA   NA
 3559630 3559631 PST_1867 PST_1868     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3559632 3559633 PST_1869 PST_1870   gltA FALSE 0.006 426.000 0.000 NA   NA
 3559634 3559635 PST_1871 PST_1872 sdhC sdhD TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 3559635 3559636 PST_1872 PST_1873 sdhD sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 3559636 3559637 PST_1873 PST_1874 sdhA sdhB TRUE 0.998 11.000 0.604 0.001 Y NA
 3559637 3559638 PST_1874 PST_1875 sdhB kgd FALSE 0.160 293.000 0.067 1.000 Y NA
 3559638 3559639 PST_1875 PST_1876 kgd sucB TRUE 0.958 72.000 0.667 1.000 Y NA
 3559639 3559640 PST_1876 PST_1877 sucB lpdG TRUE 0.876 96.000 0.253 1.000 Y NA
 3559640 3559641 PST_1877 PST_1878 lpdG sucC FALSE 0.409 194.000 0.069 1.000 Y NA
 3559641 3559642 PST_1878 PST_1879 sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 3559642 3559643 PST_1879 PST_1880 sucD braB FALSE 0.009 368.000 0.000 1.000 N NA
 3559643 3559644 PST_1880 PST_1881 braB   FALSE 0.374 90.000 0.048 NA   NA
 3559644 3559645 PST_1881 PST_1882     FALSE 0.460 58.000 0.060 NA   NA
 3559645 3559646 PST_1882 PST_1883     TRUE 0.998 -3.000 0.845 NA Y NA
 3559646 3559647 PST_1883 PST_1884     FALSE 0.446 67.000 0.054 NA   NA
 3559647 3559648 PST_1884 PST_1885   htpG FALSE 0.127 121.000 0.007 NA   NA
 3559650 3559651 PST_1887 PST_1888     TRUE 0.820 65.000 0.357 NA   NA
 3559651 3559652 PST_1888 PST_1889     FALSE 0.100 155.000 0.000 NA   NA
 3559652 3559653 PST_1889 PST_1890     FALSE 0.449 206.000 0.000 0.013 Y NA
 3559653 3559654 PST_1890 PST_1891     FALSE 0.075 178.000 0.013 1.000 N NA
 3559655 3559656 PST_1892 PST_1893 fabB fabA TRUE 0.992 12.000 0.451 1.000 Y NA
 3559657 3559658 PST_1894 PST_1895 gpsA   TRUE 0.974 10.000 0.273 NA   NA
 3559658 3559659 PST_1895 PST_1896   sixA TRUE 0.559 87.000 0.114 NA   NA
 3559659 3559660 PST_1896 PST_1897 sixA   FALSE 0.371 77.000 0.045 NA N NA
 3559660 3559661 PST_1897 PST_1898     TRUE 0.813 -40.000 0.101 NA   NA
 3559661 3559662 PST_1898 PST_1899     TRUE 0.991 -3.000 0.096 0.002   NA
 3559662 3559663 PST_1899 PST_1900     FALSE 0.165 218.000 0.118 NA   NA
 3559663 3559664 PST_1900 PST_1901     TRUE 0.837 86.000 0.478 NA   NA
 3559666 3559667 PST_1903 PST_1904 selD   TRUE 0.619 120.000 0.214 NA   NA
 3559667 3559668 PST_1904 PST_1905     FALSE 0.340 29.000 0.012 NA   NA
 3559668 3559669 PST_1905 PST_1906     FALSE 0.301 34.000 0.000 NA   NA
 3559669 3559670 PST_1906 PST_1907     FALSE 0.327 30.000 0.000 NA   NA
 3559670 3559671 PST_1907 PST_1908     TRUE 0.938 35.000 0.739 NA   NA
 3559671 3559672 PST_1908 PST_1909     TRUE 0.995 -3.000 0.727 NA   NA
 3559672 3559673 PST_1909 PST_1910     FALSE 0.027 242.000 0.000 NA   NA
 3559675 3559676 PST_1912 PST_1913     FALSE 0.215 61.000 0.000 NA   NA
 3559676 3559677 PST_1913 PST_1914     FALSE 0.202 68.000 0.008 NA   NA
 3559677 3559678 PST_1914 PST_1915     FALSE 0.144 186.000 0.050 1.000 N NA
 3559678 3559679 PST_1915 PST_1916   fadAx TRUE 0.944 87.000 0.575 1.000 Y NA
 3559679 3559680 PST_1916 PST_1917 fadAx   TRUE 0.994 11.000 0.529 1.000 Y NA
 3559680 3559681 PST_1917 PST_1918   alkK-2 TRUE 0.700 114.000 0.074 1.000 Y NA
 3559681 3559682 PST_1918 PST_1919 alkK-2   TRUE 0.796 73.000 0.111 0.037 N NA
 3559682 3559683 PST_1919 PST_1920     FALSE 0.017 279.000 0.000 NA   NA
 3559683 3559684 PST_1920 PST_1921     FALSE 0.004 754.000 0.000 NA   NA
 3559685 3559686 PST_1922 PST_1923 acdA   TRUE 0.936 38.000 0.300 1.000 Y NA
 3559686 3559687 PST_1923 PST_1924   mmsB TRUE 0.998 3.000 0.600 1.000 Y NA
 3559687 3559688 PST_1924 PST_1925 mmsB fadB1x TRUE 0.843 79.000 0.154 1.000 Y NA
 3559688 3559689 PST_1925 PST_1926 fadB1x mmsA-2 TRUE 0.685 48.000 0.154 1.000 N NA
 3559690 3559691 PST_1927 PST_1928     FALSE 0.204 80.000 0.000 NA   NA
 3559692 3559693 PST_1929 PST_1930     FALSE 0.213 72.000 0.011 NA   NA
 3559693 3559694 PST_1930 PST_1931     FALSE 0.133 179.000 0.038 NA   NA
 3559695 3559696 PST_1932 PST_1933     FALSE 0.271 132.000 0.054 NA N NA
 3559698 3559699 PST_1935 PST_1936     FALSE 0.145 123.000 0.000 1.000 N NA
 3559699 3559700 PST_1936 PST_1937     TRUE 0.968 47.000 0.293 0.006 Y NA
 3559700 3559701 PST_1937 PST_1938     FALSE 0.171 120.000 0.000 1.000   NA
 3559702 3559703 PST_1939 PST_1940     TRUE 0.988 81.000 1.000 0.003 Y NA
 3559703 3559704 PST_1940 PST_1941     TRUE 0.653 108.000 0.222 1.000 N NA
 3559704 3559705 PST_1941 PST_1942     TRUE 0.880 150.000 0.222 0.047 Y NA
 3559705 3559706 PST_1942 PST_1943     TRUE 0.959 8.000 0.150 1.000 N NA
 3559707 3559708 PST_1944 PST_1945     TRUE 0.716 75.000 0.220 NA N NA
 3559708 3559709 PST_1945 PST_1946   tolQ-1 FALSE 0.253 68.000 0.023 NA N NA
 3559709 3559710 PST_1946 PST_1947 tolQ-1 tolR-1 TRUE 0.997 12.000 0.556 0.064 Y NA
 3559710 3559711 PST_1947 PST_1948 tolR-1   TRUE 0.940 0.000 0.040 1.000 N NA
 3559711 3559712 PST_1948 PST_1949   uxpB TRUE 0.907 30.000 0.444 NA   NA
 3559715 3559716 PST_1952 PST_1953     FALSE 0.251 247.000 0.275 1.000 N NA
 3559716 3559717 PST_1953 PST_1954     FALSE 0.425 167.000 0.029 1.000 Y NA
 3559717 3559718 PST_1954 PST_1955     TRUE 0.999 0.000 0.656 0.001 N NA
 3559718 3559719 PST_1955 PST_1956     FALSE 0.009 391.000 0.000 1.000 N NA
 3559721 3559722 PST_1958 PST_1959     FALSE 0.316 52.000 0.026 1.000 N NA
 3559722 3559723 PST_1959 PST_1960     TRUE 0.957 -13.000 0.311 NA   NA
 3559723 3559724 PST_1960 PST_1961     TRUE 0.995 -3.000 0.722 NA   NA
 3559724 3559725 PST_1961 PST_1962     TRUE 0.992 3.000 0.217 0.051   NA
 3559725 3559726 PST_1962 PST_1963     TRUE 0.993 -3.000 0.533 NA   NA
 3559726 3559727 PST_1963 PST_1964   phrB TRUE 0.941 -3.000 0.048 NA   NA
 3559727 3559728 PST_1964 PST_1965 phrB   TRUE 0.883 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3559728 3559729 PST_1965 PST_1966     TRUE 0.958 3.000 0.083 NA   NA
 3559730 3559731 PST_1967 PST_1968   hemH FALSE 0.290 76.000 0.020 1.000   NA
 3559732 3559733 PST_1969 PST_1970     TRUE 0.673 177.000 0.222 0.020   NA
 3559733 3559734 PST_1970 PST_1971     FALSE 0.220 85.000 0.016 NA   NA
 3559734 3559735 PST_1971 PST_1972     TRUE 0.980 9.000 0.323 NA   NA
 3559735 3559736 PST_1972 PST_1973     TRUE 0.986 -3.000 0.247 NA   NA
 3559736 3559737 PST_1973 PST_1974   folX TRUE 0.751 10.000 0.012 NA   NA
 3559737 3559738 PST_1974 PST_1975 folX folE-1 TRUE 0.979 0.000 0.012 1.000 Y NA
 3559738 3559739 PST_1975 PST_1976 folE-1   FALSE 0.035 217.000 0.000 NA   NA
 3559740 3559741 PST_1977 PST_1978   pqqF TRUE 0.720 35.000 0.133 1.000 N NA
 3559741 3559742 PST_1978 PST_1979 pqqF   FALSE 0.027 258.000 0.000 1.000   NA
 3559742 3559743 PST_1979 PST_1980     FALSE 0.075 351.000 0.182 NA   NA
 3559743 3559744 PST_1980 PST_1981     TRUE 0.883 -70.000 0.250 NA   NA
 3559745 3559746 PST_1982 PST_1983     FALSE 0.378 85.000 0.051 NA N NA
 3559746 3559747 PST_1983 PST_1984     FALSE 0.264 159.000 0.072 NA N NA
 3559747 3559748 PST_1984 PST_1985     TRUE 0.601 137.000 0.060 NA Y NA
 3559748 3559749 PST_1985 PST_1986     TRUE 0.998 0.000 0.790 NA Y NA
 3559752 3559753 PST_1989 PST_1990     FALSE 0.018 273.000 0.000 NA   NA
 3559754 3559755 PST_1991 PST_1992 ttgR   FALSE 0.304 65.000 0.031 NA N NA
 3559755 3559756 PST_1992 PST_1993     TRUE 0.633 16.000 0.031 NA N NA
 3559758 3559759 PST_1995 PST_1996     TRUE 0.984 -3.000 0.222 NA   NA
 3559759 3559760 PST_1996 PST_1997     FALSE 0.232 50.000 0.000 NA   NA
 3559760 3559761 PST_1997 PST_1998     TRUE 0.931 -3.000 0.040 NA   NA
 3559761 3559762 PST_1998 PST_1999     TRUE 0.931 -3.000 0.040 NA   NA
 3559762 3559763 PST_1999 PST_2000     TRUE 0.694 42.000 0.143 NA   NA
 3559763 3559764 PST_2000 PST_2001     TRUE 0.999 0.000 0.500 0.051 Y NA
 3559764 3559765 PST_2001 PST_2002     TRUE 0.998 2.000 0.250 0.051 Y NA
 3559765 3559766 PST_2002 PST_2003     TRUE 0.585 46.000 0.095 NA N NA
 3559766 3559767 PST_2003 PST_2004     FALSE 0.005 449.000 0.000 NA N NA
 3559767 3559768 PST_2004 PST_2005     FALSE 0.236 133.000 0.038 1.000 N NA
 3559768 3559769 PST_2005 PST_2006     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 3559769 3559770 PST_2006 PST_2008     FALSE 0.094 159.000 0.000 NA   NA
 3559770 3559771 PST_2008 PST_2009     TRUE 0.986 14.000 0.931 NA   NA
 3559771 3559772 PST_2009 PST_2010     TRUE 0.973 2.000 0.118 1.000   NA
 3559772 3559773 PST_2010 PST_2011     TRUE 0.994 -3.000 0.220 1.000 Y NA
 3559773 3559774 PST_2011 PST_2012     FALSE 0.007 422.000 0.000 1.000 N NA
 3559774 3559775 PST_2012 PST_2013   mttC FALSE 0.292 161.000 0.089 NA N NA
 3559777 3559778 PST_2015 PST_2016 lipH lipC TRUE 0.611 64.000 0.109 1.000   NA
 3559778 3559779 PST_2016 PST_2017 lipC greB FALSE 0.016 313.000 0.000 1.000   NA
 3559779 3559780 PST_2017 PST_2018 greB   TRUE 0.661 20.000 0.053 NA N NA
 3559780 3559781 PST_2018 PST_2019     TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 3559782 3559783 PST_2020 PST_2021 tesA   TRUE 0.826 4.000 0.000 NA   NA
 3559787 3559788 PST_2025 PST_2026 panE-1 cysB FALSE 0.089 177.000 0.019 1.000 N NA
 3559791 3559792 PST_2029 PST_2030 pabB   FALSE 0.443 51.000 0.042 1.000   NA
 3559792 3559793 PST_2030 PST_2031     TRUE 0.996 4.000 0.923 NA   NA
 3559793 3559794 PST_2031 PST_2032     TRUE 0.961 6.000 0.141 NA   NA
 3559795 3559796 PST_2033 PST_2034   prpB TRUE 0.962 -3.000 0.080 1.000 N NA
 3559796 3559797 PST_2034 PST_2035 prpB prpC TRUE 0.836 97.000 0.502 1.000 N NA
 3559797 3559798 PST_2035 PST_2036 prpC   TRUE 0.966 20.000 0.289 1.000 Y NA
 3559798 3559799 PST_2036 PST_2037     TRUE 0.968 19.000 0.733 NA   NA
 3559801 3559802 PST_2039 PST_2040 ppsA menG FALSE 0.115 145.000 0.018 NA N NA
 3559802 3559803 PST_2040 PST_2041 menG cmaX TRUE 0.779 19.000 0.093 NA N NA
 3559803 3559804 PST_2041 PST_2042 cmaX crfX TRUE 0.559 57.000 0.093 NA   NA
 3559804 3559805 PST_2042 PST_2043 crfX cmpX TRUE 0.986 -3.000 0.256 NA   NA
 3559805 3559806 PST_2043 PST_2044 cmpX sigX TRUE 0.784 67.000 0.279 NA   NA
 3559806 3559807 PST_2044 PST_2045 sigX oprF TRUE 0.637 139.000 0.280 1.000 N NA
 3559812 3559813 PST_2050 PST_2051 lpxH ppiB TRUE 0.977 7.000 0.237 1.000   NA
 3559814 3559815 PST_2052 PST_2053 glnS cysS TRUE 0.993 0.000 0.032 0.036 Y NA
 3559817 3559818 PST_2055 PST_2056     FALSE 0.301 34.000 0.000 NA   NA
 3559818 3559819 PST_2056 PST_2057     FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 3559819 3559820 PST_2057 PST_2058     FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 3559820 3559821 PST_2058 PST_2059     TRUE 0.918 9.000 0.059 1.000   NA
 3559821 3559822 PST_2059 PST_2060   tig FALSE 0.091 173.000 0.000 1.000   NA
 3559822 3559823 PST_2060 PST_2061 tig clpP TRUE 0.524 108.000 0.002 1.000 Y NA
 3559823 3559824 PST_2061 PST_2062 clpP clpX TRUE 0.637 53.000 0.002 1.000 Y NA
 3559824 3559825 PST_2062 PST_2063 clpX lon TRUE 0.790 133.000 0.201 1.000 Y NA
 3559825 3559826 PST_2063 PST_2064 lon hupB FALSE 0.251 131.000 0.040 1.000 N NA
 3559826 3559827 PST_2064 PST_2065 hupB ppiD FALSE 0.058 206.000 0.017 1.000   NA
 3559828 3559829 PST_2066 PST_2067     TRUE 0.523 -19.000 0.006 NA   NA
 3559829 3559830 PST_2067 PST_2068     FALSE 0.218 84.000 0.015 NA   NA
 3559830 3559831 PST_2068 PST_2069     TRUE 0.928 -31.000 0.045 0.002   NA
 3559831 3559832 PST_2069 PST_2070     TRUE 0.696 56.000 0.000 0.002   NA
 3559833 3559834 PST_2071 PST_2072   morB FALSE 0.311 241.000 0.000 0.050 Y NA
 3559834 3559835 PST_2072 PST_2073 morB pqqB FALSE 0.017 299.000 0.000 1.000   NA
 3559835 3559836 PST_2073 PST_2074 pqqB pqqC TRUE 0.921 165.000 0.825 0.002   NA
 3559836 3559837 PST_2074 PST_2075 pqqC   TRUE 0.901 86.000 0.246 0.002   NA
 3559837 3559838 PST_2075 PST_2076     TRUE 0.768 161.000 0.211 0.002   NA
 3559838 3559839 PST_2076 PST_2077     TRUE 0.967 -3.000 0.088 1.000   NA
 3559839 3559840 PST_2077 PST_2078     FALSE 0.376 79.000 0.041 1.000 N NA
 3559840 3559841 PST_2078 PST_2079     TRUE 0.879 -16.000 0.108 1.000 N NA
 3559841 3559842 PST_2079 PST_2080     TRUE 0.637 53.000 0.133 NA   NA
 3559842 3559843 PST_2080 PST_2081     TRUE 0.582 91.000 0.133 NA   NA
 3559843 3559844 PST_2081 PST_2082     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3559844 3559845 PST_2082 PST_2083     TRUE 0.989 -3.000 0.333 1.000 N NA
 3559847 3559848 PST_2085 PST_2086 gacA uvrC TRUE 0.791 66.000 0.086 0.016 N NA
 3559848 3559849 PST_2086 PST_2087 uvrC pgsA TRUE 0.928 -22.000 0.227 1.000 N NA
 3559849 3559850 PST_2087 PST_2088 pgsA   FALSE 0.218 70.000 0.000 NA   NA
 3559850 3559851 PST_2088 PST_2090     FALSE 0.243 47.000 0.000 NA   NA
 3559851 3559852 PST_2090 PST_2089     FALSE 0.106 150.000 0.000 NA   NA
 3559853 3559854 PST_2091 PST_2092     TRUE 0.752 119.000 0.400 NA   NA
 3559854 3559855 PST_2092 PST_2093     TRUE 0.913 -3.000 0.030 NA   NA
 3559855 3559856 PST_2093 PST_2094     FALSE 0.225 79.000 0.015 NA   NA
 3559856 3559857 PST_2094 PST_2095     TRUE 0.726 49.000 0.032 1.000 Y NA
 3559858 3559859 PST_2096 PST_2097 arsR-2 arsH FALSE 0.268 40.000 0.000 NA   NA
 3559859 3559860 PST_2097 PST_2098 arsH   FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 3559860 3559861 PST_2098 PST_2099     TRUE 0.508 -31.000 0.000 NA   NA
 3559861 3559862 PST_2099 PST_2100     TRUE 0.464 27.000 0.026 NA   NA
 3559862 3559863 PST_2100 PST_2101     TRUE 0.950 91.000 0.689 NA Y NA
 3559864 3559865 PST_2102 PST_2103     TRUE 0.801 146.000 0.667 NA   NA
 3559865 3559866 PST_2103 PST_2104     TRUE 0.707 -31.000 0.042 NA   NA
 3559866 3559867 PST_2104 PST_2105     TRUE 0.966 -6.000 0.208 NA   NA
 3559867 3559868 PST_2105 PST_2106     FALSE 0.033 223.000 0.000 NA   NA
 3559868 3559869 PST_2106 PST_2107     FALSE 0.188 90.000 0.000 NA   NA
 3559869 3559870 PST_2107 PST_2108     TRUE 0.870 -150.000 0.254 NA   NA
 3559870 3559871 PST_2108 PST_2109     FALSE 0.228 135.000 0.038 NA   NA
 3559871 3559872 PST_2109 PST_2110     FALSE 0.035 221.000 0.000 1.000 N NA
 3559876 3559877 PST_2114 PST_2115     FALSE 0.119 138.000 0.000 NA   NA
 3559877 3559878 PST_2115 PST_2116     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559878 3559879 PST_2116 PST_2117     TRUE 0.899 -3.000 0.024 NA   NA
 3559879 3559880 PST_2117 PST_2118     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 3559880 3559881 PST_2118 PST_2119   pobR FALSE 0.188 90.000 0.000 NA   NA
 3559882 3559883 PST_2120 PST_2121     TRUE 0.949 -3.000 0.059 NA   NA
 3559883 3559884 PST_2121 PST_2122     TRUE 0.964 4.000 0.118 NA   NA
 3559884 3559885 PST_2122 PST_2123     TRUE 0.972 -3.000 0.120 1.000 N NA
 3559885 3559886 PST_2123 PST_2124     TRUE 0.966 0.000 0.080 1.000 N NA
 3559886 3559887 PST_2124 PST_2125     FALSE 0.035 217.000 0.000 NA   NA
 3559889 3559890 PST_2127 PST_2128     FALSE 0.125 137.000 0.000 1.000 N NA
 3559891 3559892 PST_2129 PST_2130 poxB ligD FALSE 0.224 63.000 0.000 1.000 N NA
 3559892 3559893 PST_2130 PST_2131 ligD   TRUE 0.573 29.000 0.049 NA   NA
 3559893 3559894 PST_2131 PST_2132     FALSE 0.062 183.000 0.000 NA   NA
 3559894 3559895 PST_2132 PST_2133     FALSE 0.083 166.000 0.000 NA   NA
 3559895 3559896 PST_2133 PST_2134     TRUE 0.962 7.000 0.154 NA   NA
 3559899 3559900 PST_2137 PST_2138 glgA   TRUE 0.995 13.000 0.917 1.000 Y NA
 3559900 3559901 PST_2138 PST_2139   malQ TRUE 0.998 -3.000 0.204 0.005 Y NA
 3559901 3559902 PST_2139 PST_2140 malQ   TRUE 0.997 -3.000 0.141 0.005 Y NA
 3559902 3559903 PST_2140 PST_2141     TRUE 0.844 -3.000 0.008 NA   NA
 3559903 3559904 PST_2141 PST_2142   glgX TRUE 0.601 100.000 0.167 NA   NA
 3559904 3559905 PST_2142 PST_2143 glgX   FALSE 0.016 288.000 0.000 1.000 N NA
 3559906 3559907 PST_2144 PST_2145     TRUE 0.771 28.000 0.024 0.050   NA
 3559908 3559909 PST_2146 PST_2147     FALSE 0.015 297.000 0.000 1.000 N NA
 3559909 3559910 PST_2147 PST_2148     TRUE 0.895 15.000 0.150 NA   NA
 3559910 3559911 PST_2148 PST_2149     TRUE 0.978 -3.000 0.167 NA   NA
 3559911 3559912 PST_2149 PST_2150     TRUE 0.987 -3.000 0.273 NA   NA
 3559912 3559913 PST_2150 PST_2151     TRUE 0.529 180.000 0.357 NA   NA
 3559914 3559915 PST_2152 PST_2153 glgB   TRUE 0.963 -172.000 0.115 0.005 Y NA
 3559915 3559916 PST_2153 PST_2154     TRUE 0.891 198.000 0.544 0.005 Y NA
 3559918 3559919 PST_2156 PST_2157   fdnI-2 TRUE 0.835 23.000 0.182 NA N NA
 3559919 3559920 PST_2157 PST_2158 fdnI-2 fdnH-2 TRUE 0.997 -3.000 0.118 0.002 Y NA
 3559920 3559921 PST_2158 PST_2159 fdnH-2   TRUE 0.997 11.000 1.000 0.002   NA
 3559921 3559922 PST_2159 PST_2160     TRUE 0.943 49.000 1.000 1.000   NA
 3559922 3559923 PST_2160 PST_2161     FALSE 0.095 169.000 0.000 1.000   NA
 3559923 3559924 PST_2161 PST_2162     TRUE 0.901 4.000 0.029 1.000   NA
 3559924 3559925 PST_2162 PST_2163     FALSE 0.452 34.000 0.029 1.000   NA
 3559925 3559926 PST_2163 PST_2164     TRUE 0.723 107.000 0.118 0.050 N NA
 3559927 3559928 PST_2165 PST_2166 mexT mexE FALSE 0.017 281.000 0.000 1.000 N NA
 3559928 3559929 PST_2166 PST_2167 mexE   FALSE 0.170 99.000 0.000 NA   NA
 3559929 3559930 PST_2167 PST_2169   oprN TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559930 3559931 PST_2169 PST_2170 oprN   FALSE 0.209 76.000 0.000 NA   NA
 3559931 3559932 PST_2170 PST_2171     FALSE 0.392 24.000 0.000 NA   NA
 3559932 3559933 PST_2171 PST_2172     TRUE 0.904 -3.000 0.026 NA   NA
 3559933 3559934 PST_2172 PST_2173     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 3559935 3559936 PST_2174 PST_2175     TRUE 0.874 69.000 0.556 NA N NA
 3559936 3559937 PST_2175 PST_2176     TRUE 0.978 29.000 0.741 NA Y NA
 3559937 3559938 PST_2176 PST_2177     TRUE 0.994 -3.000 0.619 NA N NA
 3559940 3559941 PST_2179 PST_2180 strU   TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559941 3559942 PST_2180 PST_2181   tpx FALSE 0.221 54.000 0.000 NA   NA
 3559942 3559943 PST_2181 PST_2182 tpx   FALSE 0.110 137.000 0.007 1.000 N NA
 3559943 3559944 PST_2182 PST_2183     FALSE 0.005 482.000 0.000 NA   NA
 3559944 3559945 PST_2183 PST_2184     TRUE 0.994 -3.000 0.575 NA   NA
 3559945 3559946 PST_2184 PST_2185     FALSE 0.373 64.000 0.033 1.000   NA
 3559947 3559948 PST_2186 PST_2187 xthA   FALSE 0.403 92.000 0.056 1.000 N NA
 3559948 3559949 PST_2187 PST_2188   mtlZ FALSE 0.181 97.000 0.000 1.000 N NA
 3559949 3559950 PST_2188 PST_2189 mtlZ mltR FALSE 0.227 67.000 0.000 1.000 N NA
 3559950 3559951 PST_2189 PST_2190 mltR   FALSE 0.015 297.000 0.000 1.000 N NA
 3559951 3559952 PST_2190 PST_2191     TRUE 0.867 83.000 0.056 0.045 Y NA
 3559952 3559953 PST_2191 PST_2192   mtlG TRUE 0.998 11.000 0.918 0.045 Y NA
 3559953 3559954 PST_2192 PST_2193 mtlG mtlK TRUE 0.949 39.000 0.173 0.045 Y NA
 3559954 3559955 PST_2193 PST_2194 mtlK uxuB TRUE 0.983 -40.000 0.524 1.000 Y NA
 3559955 3559956 PST_2194 PST_2195 uxuB xylB TRUE 0.979 11.000 0.118 1.000 Y NA
 3559959 3559960 PST_2198 PST_2199 gntR   FALSE 0.096 224.000 0.061 1.000 N NA
 3559960 3559961 PST_2199 PST_2200     TRUE 0.943 62.000 0.500 1.000 Y NA
 3559961 3559962 PST_2200 PST_2201     TRUE 0.819 51.000 0.091 1.000 Y NA
 3559963 3559964 PST_2202 PST_2203     TRUE 0.720 11.000 0.000 NA   NA
 3559966 3559967 PST_2205 PST_2206     FALSE 0.161 104.000 0.000 NA   NA
 3559971 3559972 PST_2211 PST_2213     FALSE 0.392 24.000 0.000 NA   NA
 3559972 3559973 PST_2213 PST_2214     FALSE 0.175 97.000 0.000 NA   NA
 3559973 3559974 PST_2214 PST_2215     FALSE 0.020 263.000 0.000 NA   NA
 3559974 3559975 PST_2215 PST_2216     FALSE 0.449 94.000 0.071 NA   NA
 3559975 3559976 PST_2216 PST_2217     FALSE 0.263 37.000 0.008 NA   NA
 3559977 3559978 PST_2218 PST_2219     TRUE 0.968 75.000 0.902 1.000 Y NA
 3559978 3559979 PST_2219 PST_2220     FALSE 0.051 196.000 0.000 1.000 N NA
 3559979 3559980 PST_2220 PST_2221   yhgI FALSE 0.053 202.000 0.000 1.000   NA
 3559980 3559981 PST_2221 PST_2222 yhgI cti TRUE 0.555 124.000 0.030 0.020   NA
 3559982 3559983 PST_2223 PST_2224 metH   TRUE 0.500 55.000 0.069 NA   NA
 3559983 3559984 PST_2224 PST_2225     FALSE 0.014 295.000 0.000 NA   NA
 3559984 3559985 PST_2225 PST_2226     TRUE 0.570 -18.000 0.000 NA   NA
 3559985 3559986 PST_2226 PST_2227     TRUE 0.970 -30.000 0.242 NA Y NA
 3559987 3559988 PST_2228 PST_2229     TRUE 0.512 41.000 0.056 NA   NA
 3559989 3559990 PST_2230 PST_2231     TRUE 0.799 23.000 0.125 NA   NA
 3559990 3559991 PST_2231 PST_2232     FALSE 0.287 92.000 0.026 1.000   NA
 3559991 3559992 PST_2232 PST_2233     FALSE 0.435 29.000 0.026 NA   NA
 3559992 3559993 PST_2233 PST_2234     FALSE 0.291 152.000 0.069 NA   NA
 3559993 3559994 PST_2234 PST_2235     FALSE 0.246 128.000 0.038 NA   NA
 3559994 3559995 PST_2235 PST_2236   cysI FALSE 0.023 338.000 0.038 NA   NA
 3559995 3559996 PST_2236 PST_2237 cysI   TRUE 0.910 -16.000 0.165 NA   NA
 3559996 3559997 PST_2237 PST_2238     FALSE 0.243 47.000 0.000 NA   NA
 3559998 3559999 PST_2239 PST_2240     TRUE 0.727 15.000 0.036 1.000 N NA
 3560000 3560001 PST_2241 PST_2242     TRUE 0.989 -3.000 0.344 NA N NA
 3560001 3560002 PST_2242 PST_2243     FALSE 0.049 207.000 0.000 1.000   NA
 3560002 3560003 PST_2243 PST_2244     TRUE 0.617 57.000 0.115 1.000   NA
 3560006 3560007 PST_2247 PST_2248 nudC   TRUE 0.944 0.000 0.045 NA   NA
 3560007 3560008 PST_2248 PST_2249     TRUE 0.816 38.000 0.250 NA   NA
 3560008 3560009 PST_2249 PST_2250     FALSE 0.130 178.000 0.035 1.000 N NA
 3560009 3560010 PST_2250 PST_2251   dnaQ FALSE 0.221 95.000 0.019 1.000 N NA
 3560010 3560011 PST_2251 PST_2252 dnaQ rnhA TRUE 0.976 15.000 0.248 1.000 Y NA
 3560011 3560012 PST_2252 PST_2253 rnhA   FALSE 0.315 37.000 0.009 1.000   NA
 3560013 3560014 PST_2254 PST_2255 gloB mltD TRUE 0.698 101.000 0.233 1.000   NA
 3560016 3560017 PST_2256 PST_2258     TRUE 0.996 -3.000 0.159 0.045 Y NA
 3560017 3560018 PST_2258 PST_2259     TRUE 0.998 3.000 1.000 0.045   NA
 3560018 3560019 PST_2259 PST_2260     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.045   NA
 3560019 3560020 PST_2260 PST_2261     TRUE 0.985 -22.000 1.000 1.000   NA
 3560020 3560021 PST_2261 PST_2262     TRUE 0.811 -19.000 0.057 1.000   NA
 3560026 3560027 PST_2267 PST_2268     TRUE 0.933 47.000 0.857 NA   NA
 3560027 3560028 PST_2268 PST_2269     FALSE 0.005 515.000 0.000 NA   NA
 3560028 3560029 PST_2269 PST_2271   exaB TRUE 0.948 0.000 0.048 1.000 N NA
 3560030 3560031 PST_2270 PST_2272     TRUE 0.760 158.000 0.625 NA   NA
 3560031 3560032 PST_2272 PST_2273     FALSE 0.436 136.000 0.118 NA   NA
 3560032 3560033 PST_2273 PST_2274     FALSE 0.369 65.000 0.032 1.000   NA
 3560033 3560034 PST_2274 PST_2275     FALSE 0.022 259.000 0.000 NA   NA
 3560035 3560036 PST_2276 PST_2277     FALSE 0.012 328.000 0.000 1.000 N NA
 3560036 3560037 PST_2277 PST_2278     TRUE 0.999 0.000 0.545 0.029 Y NA
 3560037 3560038 PST_2278 PST_2279     TRUE 0.892 41.000 0.500 NA   NA
 3560039 3560040 PST_2280 PST_2281     FALSE 0.389 130.000 0.095 NA N NA
 3560040 3560041 PST_2281 PST_2282     TRUE 0.845 3.000 0.000 NA   NA
 3560041 3560042 PST_2282 PST_2283     TRUE 0.504 19.000 0.000 1.000   NA
 3560042 3560043 PST_2283 PST_2284     TRUE 0.982 -3.000 0.189 1.000   NA
 3560043 3560044 PST_2284 PST_2285     TRUE 0.998 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 3560044 3560045 PST_2285 PST_2286     FALSE 0.413 104.000 0.070 NA   NA
 3560045 3560046 PST_2286 PST_2287   agmR TRUE 0.649 54.000 0.146 NA   NA
 3560047 3560048 PST_2288 PST_2289 cysG serS FALSE 0.321 79.000 0.031 1.000 N NA
 3560048 3560049 PST_2289 PST_2290 serS crcB FALSE 0.275 73.000 0.028 NA N NA
 3560049 3560050 PST_2290 PST_2291 crcB   TRUE 0.892 -3.000 0.027 NA N NA
 3560050 3560051 PST_2291 PST_2292   lolA TRUE 0.672 74.000 0.167 1.000 N NA
 3560051 3560052 PST_2292 PST_2293 lolA ftsK TRUE 0.988 -3.000 0.305 1.000 N NA
 3560053 3560054 PST_2294 PST_2295 trxB1 aat TRUE 0.770 46.000 0.046 1.000 Y NA
 3560054 3560055 PST_2295 PST_2296 aat   TRUE 0.912 53.000 0.285 1.000 Y NA
 3560055 3560056 PST_2296 PST_2297   infA FALSE 0.459 98.000 0.078 1.000 N NA
 3560057 3560058 PST_2298 PST_2299 clpA clpS TRUE 0.931 30.000 0.596 NA   NA
 3560061 3560062 PST_2302 PST_2303 idh   FALSE 0.263 105.000 0.032 1.000 N NA
 3560062 3560063 PST_2303 PST_2304   trmU TRUE 0.668 68.000 0.158 1.000 N NA
 3560063 3560064 PST_2304 PST_2305 trmU   TRUE 0.980 -3.000 0.180 NA   NA
 3560064 3560065 PST_2305 PST_2306   purB TRUE 0.558 59.000 0.093 NA   NA
 3560065 3560066 PST_2306 PST_2307 purB   FALSE 0.334 78.000 0.029 1.000   NA
 3560066 3560067 PST_2307 PST_2308     TRUE 0.951 -7.000 0.167 1.000   NA
 3560067 3560068 PST_2308 PST_2309     TRUE 0.969 7.000 0.191 NA   NA
 3560068 3560069 PST_2309 PST_2310     TRUE 0.987 -3.000 0.280 NA   NA
 3560069 3560070 PST_2310 PST_2311     FALSE 0.006 434.000 0.000 NA   NA
 3560070 3560071 PST_2311 PST_2312     FALSE 0.131 185.000 0.044 NA   NA
 3560073 3560074 PST_2314 PST_2315     TRUE 0.857 27.000 0.071 0.057   NA
 3560075 3560076 PST_2316 PST_2317     FALSE 0.072 185.000 0.000 1.000   NA
 3560076 3560077 PST_2317 PST_2317a     FALSE 0.107 149.000 0.000 NA   NA
 3560077 3560078 PST_2317a PST_2318     FALSE 0.140 123.000 0.000 NA   NA
 3560078 3560079 PST_2318 PST_2319     FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 3560079 3560080 PST_2319 PST_2320     TRUE 0.786 7.000 0.000 NA   NA
 3560080 3560081 PST_2320 PST_2321     FALSE 0.186 91.000 0.000 NA   NA
 3560082 3560083 PST_2322 PST_2323   ubiG FALSE 0.430 129.000 0.104 1.000 N NA
 3560083 3560084 PST_2323 PST_2324 ubiG gph-2 TRUE 0.989 0.000 0.259 1.000   NA
 3560084 3560085 PST_2324 PST_2325 gph-2   TRUE 0.760 85.000 0.098 0.056   NA
 3560086 3560087 PST_2326 PST_2327   eda FALSE 0.010 339.000 0.008 1.000 N NA
 3560087 3560088 PST_2327 PST_2328 eda   TRUE 0.917 18.000 0.064 1.000 Y NA
 3560088 3560089 PST_2328 PST_2329     TRUE 0.972 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 3560089 3560090 PST_2329 PST_2330     FALSE 0.041 209.000 0.000 1.000 N NA
 3560091 3560092 PST_2331 PST_2332     FALSE 0.214 58.000 0.000 NA   NA
 3560092 3560093 PST_2332 PST_2333   folE FALSE 0.155 99.000 0.008 NA   NA
 3560094 3560095 PST_2334 PST_2335     TRUE 0.662 47.000 0.131 1.000 N NA
 3560097 3560098 PST_2337 PST_2338 rpsA cmk TRUE 0.676 125.000 0.281 1.000 N NA
 3560098 3560099 PST_2338 PST_2339 cmk   TRUE 0.983 -3.000 0.209 1.000 N NA
 3560099 3560100 PST_2339 PST_2340   hisC2 TRUE 0.579 120.000 0.029 1.000 Y NA
 3560100 3560101 PST_2340 PST_2341 hisC2 pheA TRUE 0.729 118.000 0.098 1.000 Y NA
 3560101 3560102 PST_2341 PST_2342 pheA serC TRUE 0.992 0.000 0.121 1.000 Y NA
 3560102 3560103 PST_2342 PST_2343 serC gyrA TRUE 0.498 54.000 0.067 1.000 N NA
 3560103 3560104 PST_2343 PST_2345 gyrA mtnA FALSE 0.092 155.000 0.007 1.000 N NA
 3560105 3560106 PST_2344 PST_2346     TRUE 0.991 9.000 0.667 NA   NA
 3560106 3560107 PST_2346 PST_2347   dnaE2 TRUE 0.935 -120.000 0.500 1.000   NA
 3560107 3560108 PST_2347 PST_2348 dnaE2   FALSE 0.012 318.000 0.000 NA   NA
 3560108 3560109 PST_2348 PST_2349     FALSE 0.007 424.000 0.000 NA   NA
 3560109 3560110 PST_2349 PST_2350     TRUE 0.913 105.000 0.469 1.000 Y NA
 3560110 3560111 PST_2350 PST_2351     TRUE 0.995 -3.000 0.100 0.062 Y NA
 3560111 3560112 PST_2351 PST_2352     TRUE 0.993 0.000 0.150 1.000 Y NA
 3560112 3560113 PST_2352 PST_2353     FALSE 0.327 30.000 0.000 NA   NA
 3560114 3560115 PST_2354 PST_2355     TRUE 0.474 18.000 0.000 NA   NA
 3560115 3560116 PST_2355 PST_2356   kefC TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3560116 3560117 PST_2356 PST_2357 kefC   FALSE 0.055 324.000 0.000 0.063   NA
 3560117 3560118 PST_2357 PST_2358     FALSE 0.034 237.000 0.000 1.000   NA
 3560119 3560120 PST_2359 PST_2360     TRUE 0.821 22.000 0.000 1.000 Y NA
 3560121 3560122 PST_2361 PST_2362     FALSE 0.194 86.000 0.000 NA   NA
 3560122 3560123 PST_2362 PST_2363   ihfA TRUE 0.970 -19.000 0.535 1.000 N NA
 3560123 3560124 PST_2363 PST_2364 ihfA pheT TRUE 0.979 4.000 0.208 1.000 N NA
 3560124 3560125 PST_2364 PST_2365 pheT pheS TRUE 0.988 37.000 0.574 0.001 Y NA
 3560125 3560126 PST_2365 PST_2366 pheS rplT TRUE 0.674 175.000 0.202 1.000 Y NA
 3560126 3560127 PST_2366 PST_2367 rplT rpmI TRUE 0.993 28.000 0.928 0.012 Y NA
 3560127 3560128 PST_2367 PST_2368 rpmI infC TRUE 0.957 60.000 0.652 1.000 Y NA
 3560128 3560129 PST_2368 PST_2369 infC thrS TRUE 0.957 18.000 0.186 1.000 Y NA
 3560129 3560130 PST_2369 PST_2370 thrS   FALSE 0.030 229.000 0.000 NA   NA
 3560132 3560133 PST_2372 PST_2373     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3560136 3560137 PST_2376 PST_2377 mobA   TRUE 0.556 14.000 0.005 NA   NA
 3560137 3560138 PST_2377 PST_2378     FALSE 0.112 144.000 0.000 NA   NA
 3560140 3560141 PST_2380 PST_2381     FALSE 0.031 227.000 0.000 NA   NA
 3560141 3560142 PST_2381 PST_2382     TRUE 0.598 15.000 0.016 NA   NA
 3560142 3560143 PST_2382 PST_2383     TRUE 0.899 -3.000 0.024 NA   NA
 3560143 3560144 PST_2383 PST_2384     FALSE 0.098 158.000 0.012 NA   NA
 3560144 3560145 PST_2384 PST_2385     FALSE 0.326 68.000 0.030 NA   NA
 3560150 3560151 PST_2390 PST_2392 pyrD   FALSE 0.179 112.000 0.019 NA   NA
 3560154 3560155 PST_2394 PST_2395     TRUE 0.982 0.000 0.179 NA   NA
 3560155 3560156 PST_2395 PST_2396     TRUE 0.992 -3.000 0.484 NA   NA
 3560156 3560157 PST_2396 PST_2397     TRUE 0.972 -7.000 0.314 NA   NA
 3560157 3560158 PST_2397 PST_2398     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3560158 3560159 PST_2398 PST_2399     FALSE 0.382 -90.000 0.000 NA   NA
 3560159 3560160 PST_2399 PST_2400   nasS TRUE 0.493 -94.000 0.028 NA   NA
 3560160 3560161 PST_2400 PST_2401 nasS nasT TRUE 0.901 -34.000 0.218 NA N NA
 3560161 3560162 PST_2401 PST_2402 nasT   FALSE 0.218 70.000 0.000 NA   NA
 3560162 3560163 PST_2402 PST_2403     FALSE 0.108 196.000 0.042 NA   NA
 3560165 3560166 PST_2405 PST_2406   nasA TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3560166 3560167 PST_2406 PST_2407 nasA   TRUE 0.908 -88.000 0.337 1.000 N NA
 3560169 3560170 PST_2409 PST_2410     TRUE 0.981 24.000 0.539 0.001 N NA
 3560170 3560171 PST_2410 PST_2411     TRUE 0.908 43.000 0.294 0.065 N NA
 3560171 3560172 PST_2411 PST_2412   cobA TRUE 0.629 -76.000 0.048 1.000 N NA
 3560173 3560174 PST_2413 PST_2414     TRUE 0.976 17.000 0.409 0.063   NA
 3560174 3560175 PST_2414 PST_2415   pepN FALSE 0.013 350.000 0.000 1.000   NA
 3560175 3560176 PST_2415 PST_2416 pepN   FALSE 0.097 219.000 0.059 NA   NA
 3560176 3560177 PST_2416 PST_2417     TRUE 0.770 33.000 0.168 NA   NA
 3560177 3560178 PST_2417 PST_2418     TRUE 0.616 72.000 0.124 NA   NA
 3560178 3560179 PST_2418 PST_2419     TRUE 0.975 -3.000 0.131 1.000   NA
 3560179 3560180 PST_2419 PST_2420   ppnK TRUE 0.950 0.000 0.045 1.000   NA
 3560181 3560182 PST_2421 PST_2422     FALSE 0.276 59.000 0.022 NA   NA
 3560185 3560186 PST_2425 PST_2426   speE FALSE 0.012 314.000 0.000 NA   NA
 3560188 3560189 PST_2428 PST_2429     TRUE 0.826 4.000 0.000 NA   NA
 3560189 3560190 PST_2429 PST_2430     TRUE 0.786 7.000 0.000 NA   NA
 3560190 3560191 PST_2430 PST_2431     FALSE 0.039 209.000 0.000 NA   NA
 3560191 3560192 PST_2431 PST_2432     FALSE 0.050 237.000 0.026 1.000   NA
 3560192 3560193 PST_2432 PST_2433   aroC TRUE 0.475 66.000 0.055 1.000   NA
 3560194 3560195 PST_2434 PST_2435     TRUE 0.718 81.000 0.219 NA   NA
 3560196 3560197 PST_2436 PST_2437   gltK TRUE 0.868 105.000 0.108 0.061 Y NA
 3560197 3560198 PST_2437 PST_2438 gltK   TRUE 0.998 12.000 0.723 0.044 Y NA
 3560198 3560199 PST_2438 PST_2439     TRUE 0.998 -7.000 0.816 0.044 Y NA
 3560199 3560200 PST_2439 PST_2440     TRUE 0.944 110.000 0.367 0.044 Y NA
 3560200 3560201 PST_2440 PST_2441     TRUE 0.813 79.000 0.367 1.000 N NA
 3560201 3560202 PST_2441 PST_2442   gltR TRUE 0.994 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 3560202 3560203 PST_2442 PST_2443 gltR glk TRUE 0.820 58.000 0.364 1.000 N NA
 3560203 3560204 PST_2443 PST_2444 glk   TRUE 0.982 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 3560204 3560205 PST_2444 PST_2445     FALSE 0.064 173.000 0.012 NA N NA
 3560205 3560206 PST_2445 PST_2446     TRUE 0.836 -22.000 0.083 NA   NA
 3560206 3560207 PST_2446 PST_2447     FALSE 0.386 106.000 0.065 NA   NA
 3560207 3560208 PST_2447 PST_2448     FALSE 0.041 201.000 0.008 NA   NA
 3560208 3560209 PST_2448 PST_2449     TRUE 0.951 14.000 0.281 NA   NA
 3560210 3560211 PST_2450 PST_2451     FALSE 0.391 74.000 0.043 NA   NA
 3560211 3560212 PST_2451 PST_2452     TRUE 0.966 14.000 0.409 NA   NA
 3560212 3560213 PST_2452 PST_2453     TRUE 0.528 158.000 0.227 NA   NA
 3560213 3560214 PST_2453 PST_2454     TRUE 0.776 91.000 0.333 NA   NA
 3560215 3560216 PST_2455 PST_2456     FALSE 0.196 92.000 0.014 NA   NA
 3560218 3560219 PST_2458 PST_2459     FALSE 0.040 208.000 0.000 NA   NA
 3560220 3560221 PST_2460 PST_2461     FALSE 0.043 261.000 0.038 NA   NA
 3560221 3560222 PST_2461 PST_2462     TRUE 0.902 9.000 0.051 1.000 N NA
 3560222 3560223 PST_2462 PST_2463     FALSE 0.366 169.000 0.154 NA   NA
 3560226 3560227 PST_2466 PST_2467   recQ FALSE 0.377 163.000 0.024 0.038 N NA
 3560228 3560229 PST_2468 PST_2469     FALSE 0.195 186.000 0.077 NA   NA
 3560232 3560233 PST_2472 PST_2473   aceK FALSE 0.047 198.000 0.000 NA   NA
 3560236 3560237 PST_2475 PST_2477     FALSE 0.219 146.000 0.041 NA   NA
 3560237 3560238 PST_2477 PST_2478     FALSE 0.309 53.000 0.020 1.000   NA
 3560238 3560239 PST_2478 PST_2479     FALSE 0.307 44.000 0.021 NA   NA
 3560240 3560241 PST_2480 PST_2481     TRUE 0.893 -6.000 0.053 NA   NA
 3560241 3560242 PST_2481 PST_2482     FALSE 0.462 45.000 0.048 NA   NA
 3560244 3560245 PST_2484 PST_2485     FALSE 0.144 155.000 0.019 1.000   NA
 3560247 3560248 PST_2487 PST_2488   chev-2 TRUE 0.605 79.000 0.116 1.000   NA
 3560248 3560249 PST_2488 PST_2489 chev-2   FALSE 0.339 113.000 0.056 1.000 N NA
 3560250 3560251 PST_2490 PST_2491     FALSE 0.124 134.000 0.000 NA   NA
 3560251 3560252 PST_2491 PST_2492     FALSE 0.127 173.000 0.036 NA N NA
 3560252 3560253 PST_2492 PST_2493     TRUE 0.533 72.000 0.080 1.000 N NA
 3560253 3560254 PST_2493 PST_2494     TRUE 0.881 132.000 1.000 1.000 N NA
 3560254 3560255 PST_2494 PST_2495     TRUE 0.566 19.000 0.027 NA   NA
 3560255 3560256 PST_2495 PST_2496     FALSE 0.401 51.000 0.041 NA   NA
 3560256 3560257 PST_2496 PST_2497     TRUE 0.484 65.000 0.065 NA   NA
 3560257 3560258 PST_2497 PST_2498     TRUE 0.525 45.000 0.065 NA   NA
 3560258 3560259 PST_2498 PST_2499     TRUE 0.586 -40.000 0.028 NA   NA
 3560259 3560260 PST_2499 PST_2500     TRUE 0.825 -7.000 0.034 NA   NA
 3560260 3560261 PST_2500 PST_2501     FALSE 0.045 409.000 0.000 1.000 Y NA
 3560262 3560263 PST_2502 PST_2503     FALSE 0.028 280.000 0.029 NA   NA
 3560264 3560265 PST_2504 PST_2505     FALSE 0.083 166.000 0.000 NA   NA
 3560266 3560267 PST_2506 PST_2507 ihfB   FALSE 0.140 254.000 0.000 1.000 Y NA
 3560267 3560268 PST_2507 PST_2508     FALSE 0.012 332.000 0.000 1.000 N NA
 3560268 3560269 PST_2508 PST_2509     FALSE 0.015 296.000 0.000 1.000 N NA
 3560270 3560271 PST_2510 PST_2511     FALSE 0.122 142.000 0.012 1.000 N NA
 3560272 3560273 PST_2512 PST_2513 efp   TRUE 0.557 46.000 0.074 NA   NA
 3560273 3560274 PST_2513 PST_2514     FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 3560275 3560276 PST_2515 PST_2516     FALSE 0.222 102.000 0.017 1.000   NA
 3560276 3560277 PST_2516 PST_2517     TRUE 0.998 3.000 0.913 1.000 Y NA
 3560279 3560280 PST_2519 PST_2520     TRUE 0.989 5.000 0.484 NA N NA
 3560280 3560281 PST_2520 PST_2521     TRUE 0.986 -7.000 0.647 NA N NA
 3560281 3560282 PST_2521 PST_2522     FALSE 0.253 162.000 0.059 1.000   NA
 3560282 3560283 PST_2522 PST_2523     TRUE 0.529 25.000 0.027 1.000   NA
 3560283 3560284 PST_2523 PST_2524     TRUE 0.918 -3.000 0.027 1.000   NA
 3560284 3560285 PST_2524 PST_2525     TRUE 0.990 -3.000 0.107 NA Y NA
 3560286 3560287 PST_2526 PST_2527     TRUE 0.947 3.000 0.062 NA   NA
 3560287 3560288 PST_2527 PST_2528     TRUE 0.987 -3.000 0.271 NA   NA
 3560290 3560291 PST_2530 PST_2532     TRUE 0.474 18.000 0.000 NA   NA
 3560292 3560293 PST_2531 PST_2533     TRUE 0.777 55.000 0.267 NA   NA
 3560294 3560295 PST_2534 PST_2535     FALSE 0.202 88.000 0.006 1.000   NA
 3560295 3560296 PST_2535 PST_2536     TRUE 0.901 17.000 0.036 1.000 Y NA
 3560297 3560298 PST_2537 PST_2538     TRUE 0.895 5.000 0.036 NA   NA
 3560298 3560299 PST_2538 PST_2539   htpX FALSE 0.280 89.000 0.029 NA   NA
 3560299 3560300 PST_2539 PST_2540 htpX   FALSE 0.247 51.000 0.014 NA   NA
 3560301 3560302 PST_2541 PST_2542   fleR FALSE 0.296 57.000 0.020 1.000   NA
 3560302 3560303 PST_2542 PST_2543 fleR fleS TRUE 0.919 179.000 0.679 0.075 Y NA
 3560303 3560304 PST_2543 PST_2544 fleS fleQ TRUE 0.924 134.000 0.377 0.075 Y NA
 3560304 3560305 PST_2544 PST_2545 fleQ   FALSE 0.031 339.000 0.056 NA   NA
 3560305 3560306 PST_2545 PST_2546     TRUE 0.511 142.000 0.182 NA   NA
 3560306 3560307 PST_2546 PST_2547   cycH TRUE 0.869 18.000 0.167 NA   NA
 3560307 3560308 PST_2547 PST_2548 cycH cycL TRUE 0.997 -3.000 0.522 NA Y NA
 3560308 3560309 PST_2548 PST_2549 cycL ccmG TRUE 0.993 -3.000 0.196 NA Y NA
 3560309 3560310 PST_2549 PST_2550 ccmG ccmF TRUE 0.996 17.000 0.804 0.003 Y NA
 3560310 3560311 PST_2550 PST_2551 ccmF ccmE TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.003 Y NA
 3560311 3560312 PST_2551 PST_2552 ccmE ccmD TRUE 0.990 -3.000 0.344 1.000 N NA
 3560312 3560313 PST_2552 PST_2553 ccmD ccmC TRUE 0.993 -3.000 0.501 1.000 N NA
 3560313 3560314 PST_2553 PST_2554 ccmC ccmB TRUE 0.900 88.000 0.051 0.001 Y NA
 3560314 3560315 PST_2554 PST_2555 ccmB ccmA TRUE 0.996 -3.000 0.074 0.003 Y NA
 3560316 3560317 PST_2556 PST_2557     TRUE 0.989 -3.000 0.286 1.000   NA
 3560318 3560319 PST_2558 PST_2559     FALSE 0.333 125.000 0.060 NA   NA
 3560319 3560320 PST_2559 PST_2560   cheW-2 TRUE 0.994 4.000 0.743 NA   NA
 3560320 3560321 PST_2560 PST_2561 cheW-2   TRUE 0.966 82.000 0.886 0.013   NA
 3560321 3560322 PST_2561 PST_2562     TRUE 0.838 87.000 0.454 1.000   NA
 3560322 3560323 PST_2562 PST_2563   motB TRUE 0.679 87.000 0.199 1.000 N NA
 3560323 3560324 PST_2563 PST_2564 motB   TRUE 0.992 6.000 0.248 1.000 Y NA
 3560324 3560325 PST_2564 PST_2565   cheB TRUE 0.780 114.000 0.153 1.000 Y NA
 3560325 3560326 PST_2565 PST_2566 cheB cheA TRUE 0.966 51.000 0.327 0.015 Y NA
 3560326 3560327 PST_2566 PST_2567 cheA cheZ TRUE 0.989 12.000 0.341 1.000 Y NA
 3560327 3560328 PST_2567 PST_2568 cheZ cheY TRUE 0.959 24.000 0.284 1.000 Y NA
 3560328 3560329 PST_2568 PST_2569 cheY fliA TRUE 0.794 74.000 0.145 0.075 N NA
 3560329 3560330 PST_2569 PST_2570 fliA fleN TRUE 0.951 18.000 0.482 1.000 N NA
 3560330 3560331 PST_2570 PST_2571 fleN flhF TRUE 0.864 92.000 0.241 0.017 N NA
 3560331 3560332 PST_2571 PST_2572 flhF flhA TRUE 0.963 16.000 0.178 1.000 Y NA
 3560334 3560335 PST_2574 PST_2575 flhB fliR TRUE 0.890 34.000 0.129 1.000 Y NA
 3560335 3560336 PST_2575 PST_2576 fliR fliQ TRUE 0.999 5.000 1.000 0.002 Y NA
 3560336 3560337 PST_2576 PST_2577 fliQ fliP TRUE 0.998 13.000 1.000 0.007 Y NA
 3560337 3560338 PST_2577 PST_2578 fliP fliO TRUE 0.473 177.000 0.061 1.000 Y NA
 3560338 3560339 PST_2578 PST_2579 fliO fliN TRUE 0.997 2.000 0.443 1.000 Y NA
 3560339 3560340 PST_2579 PST_2580 fliN fliM TRUE 0.995 -58.000 0.741 0.001 Y NA
 3560340 3560341 PST_2580 PST_2581 fliM fliL TRUE 0.984 -43.000 0.171 0.001 Y NA
 3560341 3560342 PST_2581 PST_2582 fliL fliK FALSE 0.266 246.000 0.075 1.000 Y NA
 3560342 3560343 PST_2582 PST_2583 fliK   FALSE 0.098 160.000 0.019 NA N NA
 3560343 3560344 PST_2583 PST_2584     TRUE 0.908 28.000 0.143 NA Y NA
 3560344 3560345 PST_2584 PST_2585     TRUE 0.916 92.000 0.429 NA Y NA
 3560345 3560346 PST_2585 PST_2586   fliJ FALSE 0.024 263.000 0.022 NA N NA
 3560346 3560347 PST_2586 PST_2587 fliJ fliI TRUE 0.994 4.000 0.070 0.007 Y NA
 3560347 3560348 PST_2587 PST_2588 fliI fliH TRUE 0.980 -31.000 0.115 0.004 Y NA
 3560348 3560349 PST_2588 PST_2589 fliH fliG TRUE 0.988 20.000 0.320 0.004 Y NA
 3560349 3560350 PST_2589 PST_2590 fliG fliF TRUE 0.994 -7.000 0.189 0.005 Y NA
 3560350 3560351 PST_2590 PST_2591 fliF fliE TRUE 0.991 41.000 0.910 0.005 Y NA
 3560356 3560357 PST_2596 PST_2597     FALSE 0.270 115.000 0.038 NA   NA
 3560358 3560359 PST_2598 PST_2599     TRUE 0.857 37.000 0.333 NA   NA
 3560359 3560360 PST_2599 PST_2600     TRUE 0.722 107.000 0.308 1.000 N NA
 3560360 3560361 PST_2600 PST_2601     TRUE 0.995 3.000 0.692 NA   NA
 3560361 3560362 PST_2601 PST_2603     TRUE 0.993 9.000 0.818 NA   NA
 3560364 3560365 PST_2604 PST_2605 etfA etfB TRUE 0.998 1.000 0.250 0.024 Y NA
 3560365 3560366 PST_2605 PST_2606 etfB   FALSE 0.148 113.000 0.000 NA   NA
 3560368 3560369 PST_2608 PST_2609     TRUE 0.490 51.000 0.062 NA   NA
 3560369 3560370 PST_2609 PST_2610     TRUE 0.777 -40.000 0.077 NA   NA
 3560370 3560371 PST_2610 PST_2611     TRUE 0.681 22.000 0.058 1.000 N NA
 3560373 3560374 PST_2613 PST_2614 aroP1   FALSE 0.139 80.000 0.003 NA N NA
 3560374 3560375 PST_2614 PST_2615   pilZ FALSE 0.415 113.000 0.089 NA N NA
 3560375 3560376 PST_2615 PST_2616 pilZ holB TRUE 0.882 32.000 0.382 NA N NA
 3560376 3560377 PST_2616 PST_2617 holB tmk TRUE 0.960 -7.000 0.211 1.000 N NA
 3560377 3560378 PST_2617 PST_2618 tmk   TRUE 0.983 -3.000 0.209 NA   NA
 3560378 3560379 PST_2618 PST_2619   pabC TRUE 0.982 -3.000 0.204 NA   NA
 3560379 3560380 PST_2619 PST_2620 pabC fabF TRUE 0.992 -3.000 0.187 0.034 N NA
 3560380 3560381 PST_2620 PST_2621 fabF acpP TRUE 0.799 165.000 0.346 1.000 Y NA
 3560381 3560382 PST_2621 PST_2622 acpP fabG TRUE 0.848 194.000 0.321 0.004 Y NA
 3560382 3560383 PST_2622 PST_2623 fabG   TRUE 0.994 15.000 0.432 0.004 Y NA
 3560383 3560384 PST_2623 PST_2624   plsX TRUE 0.927 62.000 0.106 0.004 Y NA
 3560384 3560385 PST_2624 PST_2625 plsX rpmF TRUE 0.892 34.000 0.418 1.000 N NA
 3560385 3560386 PST_2625 PST_2626 rpmF   TRUE 0.981 13.000 0.599 NA   NA
 3560388 3560389 PST_2628 PST_2629 sppA   TRUE 0.925 -10.000 0.134 1.000   NA
 3560389 3560390 PST_2629 PST_2630   rluC TRUE 0.978 -7.000 0.389 1.000   NA
 3560392 3560393 PST_2632 PST_2633 murB   TRUE 0.944 -3.000 0.050 1.000 N NA
 3560393 3560394 PST_2633 PST_2634   kdsB TRUE 0.943 2.000 0.050 1.000 N NA
 3560394 3560395 PST_2634 PST_2635 kdsB   TRUE 0.626 138.000 0.265 NA   NA
 3560395 3560396 PST_2635 PST_2636   lpxK TRUE 0.799 46.000 0.263 NA   NA
 3560396 3560397 PST_2636 PST_2637 lpxK   TRUE 0.971 0.000 0.096 1.000 N NA
 3560397 3560398 PST_2637 PST_2638     TRUE 0.999 -3.000 0.746 0.060 Y NA
 3560398 3560399 PST_2638 PST_2639     FALSE 0.346 105.000 0.045 1.000   NA
 3560401 3560402 PST_2641 PST_2642 lolE   TRUE 0.910 120.000 0.620 0.060 N NA
 3560402 3560403 PST_2642 PST_2644   lolC TRUE 0.932 -7.000 0.025 0.060 N NA
 3560404 3560405 PST_2643 PST_2645     TRUE 0.989 4.000 0.407 NA   NA
 3560405 3560406 PST_2645 PST_2646     TRUE 0.980 -3.000 0.185 NA   NA
 3560407 3560408 PST_2647 PST_2648 sthA   FALSE 0.418 145.000 0.121 NA   NA
 3560408 3560409 PST_2648 PST_2649     TRUE 0.974 -3.000 0.137 NA   NA
 3560409 3560410 PST_2649 PST_2650   nqrF TRUE 0.981 2.000 0.189 1.000 N NA
 3560410 3560411 PST_2650 PST_2651 nqrF nqrE TRUE 0.996 16.000 0.700 0.002 Y NA
 3560411 3560412 PST_2651 PST_2652 nqrE nqrD TRUE 0.998 0.000 0.240 0.002 Y NA
 3560412 3560413 PST_2652 PST_2653 nqrD nqrC TRUE 0.997 3.000 0.188 0.002 Y NA
 3560413 3560414 PST_2653 PST_2654 nqrC nqrB TRUE 0.998 -7.000 0.538 0.002 Y NA
 3560414 3560415 PST_2654 PST_2655 nqrB nqrA TRUE 0.999 4.000 0.618 0.002 Y NA
 3560415 3560416 PST_2655 PST_2656 nqrA gap-2 FALSE 0.010 363.000 0.000 1.000 N NA
 3560417 3560418 PST_2657 PST_2658 mfd   TRUE 0.958 1.000 0.071 NA   NA
 3560418 3560419 PST_2658 PST_2659     TRUE 0.553 60.000 0.091 NA   NA
 3560419 3560420 PST_2659 PST_2660     FALSE 0.178 134.000 0.026 NA   NA
 3560420 3560421 PST_2660 PST_2661     FALSE 0.116 142.000 0.012 NA   NA
 3560421 3560422 PST_2661 PST_2662     TRUE 0.913 56.000 0.751 1.000 N NA
 3560422 3560423 PST_2662 PST_2663     TRUE 0.984 -3.000 0.214 1.000   NA
 3560423 3560424 PST_2663 PST_2664     TRUE 0.778 125.000 0.460 1.000   NA
 3560427 3560428 PST_2667 PST_2668   mazG FALSE 0.151 115.000 0.013 NA   NA
 3560428 3560429 PST_2668 PST_2669 mazG relA FALSE 0.033 294.000 0.035 1.000   NA
 3560429 3560430 PST_2669 PST_2670 relA rumA FALSE 0.325 106.000 0.047 1.000 N NA
 3560430 3560431 PST_2670 PST_2671 rumA cysM FALSE 0.439 43.000 0.039 1.000 N NA
 3560431 3560432 PST_2671 PST_2672 cysM   FALSE 0.292 32.000 0.006 1.000 N NA
 3560433 3560434 PST_2673 PST_2674   gacS FALSE 0.144 133.000 0.017 NA   NA
 3560434 3560435 PST_2674 PST_2675 gacS mnmC FALSE 0.196 67.000 0.004 1.000 N NA
 3560435 3560436 PST_2675 PST_2676 mnmC   FALSE 0.167 104.000 0.004 1.000   NA
 3560436 3560437 PST_2676 PST_2677     FALSE 0.348 52.000 0.027 1.000   NA
 3560443 3560444 PST_2683 PST_2684     FALSE 0.378 25.000 0.000 NA   NA
 3560444 3560445 PST_2684 PST_2685   ppiA TRUE 0.719 -31.000 0.044 1.000 N NA
 3560445 3560446 PST_2685 PST_2686 ppiA   TRUE 0.644 98.000 0.182 1.000   NA
 3560447 3560448 PST_2687 PST_2688   oprO FALSE 0.182 86.000 0.008 NA   NA
 3560448 3560449 PST_2688 PST_2689 oprO   FALSE 0.068 169.000 0.005 1.000 N NA
 3560450 3560451 PST_2690 PST_2691 dapE rrmA TRUE 0.750 45.000 0.033 0.008   NA
 3560451 3560452 PST_2691 PST_2692 rrmA   TRUE 0.536 60.000 0.083 NA   NA
 3560453 3560454 PST_2693 PST_2694     TRUE 0.849 0.000 0.000 NA N NA
 3560454 3560455 PST_2694 PST_2695     TRUE 0.983 10.000 0.435 NA   NA
 3560455 3560456 PST_2695 PST_2697     TRUE 0.992 -3.000 0.426 1.000   NA
 3560457 3560458 PST_2696 PST_2698     TRUE 0.653 77.000 0.000 0.005   NA
 3560458 3560459 PST_2698 PST_2699     FALSE 0.265 43.000 0.000 1.000 N NA
 3560459 3560460 PST_2699 PST_2700     FALSE 0.227 68.000 0.000 1.000 N NA
 3560460 3560461 PST_2700 PST_2701     TRUE 0.647 -10.000 0.000 NA   NA
 3560461 3560462 PST_2701 PST_2702     FALSE 0.213 73.000 0.000 NA   NA
 3560462 3560463 PST_2702 PST_2703   plsB FALSE 0.190 89.000 0.000 NA   NA
 3560466 3560467 PST_2706 PST_2707 dsbG   TRUE 0.986 -3.000 0.067 NA Y NA
 3560467 3560468 PST_2707 PST_2708   dsbD-2 TRUE 0.999 0.000 0.286 0.003 Y NA
 3560469 3560470 PST_2709 PST_2710     TRUE 0.998 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 3560471 3560472 PST_2711 PST_2712     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 3560473 3560474 PST_2713 PST_2714     TRUE 0.590 21.000 0.035 NA   NA
 3560474 3560475 PST_2714 PST_2715   pcoA FALSE 0.004 605.000 0.000 NA   NA
 3560475 3560476 PST_2715 PST_2716 pcoA   TRUE 0.975 12.000 0.400 NA   NA
 3560476 3560477 PST_2716 PST_2717   pcoB TRUE 0.863 62.000 0.500 NA   NA
 3560477 3560478 PST_2717 PST_2718 pcoB   TRUE 0.984 11.000 0.500 1.000   NA
 3560481 3560482 PST_2721 PST_2722     FALSE 0.417 71.000 0.048 NA   NA
 3560484 3560485 PST_2724 PST_2725 mgoH mdoG TRUE 0.981 11.000 0.469 NA N NA
 3560485 3560486 PST_2725 PST_2726 mdoG bglX FALSE 0.038 214.000 0.000 1.000 N NA
 3560486 3560487 PST_2726 PST_2727 bglX   FALSE 0.428 97.000 0.061 1.000   NA
 3560487 3560488 PST_2727 PST_2728     FALSE 0.284 145.000 0.061 NA   NA
 3560488 3560489 PST_2728 PST_2729     TRUE 0.980 -3.000 0.182 NA   NA
 3560490 3560491 PST_2730 PST_2731     TRUE 0.984 8.000 0.385 1.000 N NA
 3560492 3560493 PST_2732 PST_2733     FALSE 0.365 50.000 0.033 NA   NA
 3560493 3560494 PST_2733 PST_2735     FALSE 0.431 -54.000 0.000 NA   NA
 3560496 3560497 PST_2736 PST_2738     TRUE 0.985 5.000 0.354 NA N NA
 3560499 3560500 PST_2739 PST_2740     FALSE 0.245 72.000 0.017 NA   NA
 3560500 3560501 PST_2740 PST_2741     FALSE 0.370 69.000 0.037 NA   NA
 3560501 3560502 PST_2741 PST_2742     FALSE 0.376 126.000 0.074 NA   NA
 3560502 3560503 PST_2742 PST_2743     FALSE 0.202 62.000 0.008 NA   NA
 3560503 3560504 PST_2743 PST_2744   adk FALSE 0.248 81.000 0.019 1.000 N NA
 3560504 3560505 PST_2744 PST_2745 adk ppc FALSE 0.028 243.000 0.000 1.000 N NA
 3560506 3560507 PST_2746 PST_2747     FALSE 0.017 278.000 0.000 NA   NA
 3560507 3560508 PST_2747 PST_2748     FALSE 0.229 51.000 0.000 NA   NA
 3560509 3560510 PST_2749 PST_2750     FALSE 0.310 31.000 0.010 NA   NA
 3560510 3560511 PST_2750 PST_2751     FALSE 0.206 58.000 0.010 NA   NA
 3560511 3560512 PST_2751 PST_2752     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3560512 3560513 PST_2752 PST_2753     FALSE 0.251 44.000 0.000 NA   NA
 3560513 3560514 PST_2753 PST_2754   lysS FALSE 0.155 91.000 0.003 NA   NA
 3560514 3560515 PST_2754 PST_2755 lysS   FALSE 0.442 286.000 0.162 0.034 Y NA
 3560515 3560516 PST_2755 PST_2756     FALSE 0.007 408.000 0.000 NA   NA
 3560516 3560517 PST_2756 PST_2757     FALSE 0.400 35.000 0.028 NA   NA
 3560517 3560518 PST_2757 PST_2758     TRUE 0.816 94.000 0.032 0.047 Y NA
 3560518 3560519 PST_2758 PST_2759   recJ FALSE 0.319 -162.000 0.002 1.000 N NA
 3560519 3560520 PST_2759 PST_2760 recJ   FALSE 0.086 156.000 0.004 1.000 N NA
 3560521 3560522 PST_2761 PST_2762     TRUE 0.997 -3.000 0.909 1.000   NA
 3560522 3560523 PST_2762 PST_2763     TRUE 0.999 -3.000 0.909 NA Y NA
 3560523 3560524 PST_2763 PST_2764     TRUE 0.797 6.000 0.000 NA   NA
 3560524 3560525 PST_2764 PST_2765     TRUE 0.609 39.000 0.082 NA   NA
 3560526 3560527 PST_2766 PST_2767     FALSE 0.304 42.000 0.000 1.000   NA
 3560527 3560528 PST_2767 PST_2768     FALSE 0.301 34.000 0.000 NA   NA
 3560530 3560531 PST_2770 PST_2771 fklB-2   FALSE 0.022 257.000 0.000 NA   NA
 3560531 3560532 PST_2771 PST_2772     TRUE 0.602 14.000 0.000 NA   NA
 3560534 3560535 PST_2774 PST_2775     TRUE 0.858 -3.000 0.011 NA   NA
 3560535 3560536 PST_2775 PST_2776   azlC TRUE 0.986 -3.000 0.254 NA   NA
 3560536 3560537 PST_2776 PST_2777 azlC   FALSE 0.356 154.000 0.111 NA N NA
 3560538 3560539 PST_2778 PST_2779     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3560539 3560540 PST_2779 PST_2780     FALSE 0.014 398.000 0.030 NA   NA
 3560541 3560542 PST_2781 PST_2782     FALSE 0.220 69.000 0.000 NA   NA
 3560543 3560544 PST_2783 PST_2784     TRUE 0.582 -16.000 0.000 NA   NA
 3560545 3560546 PST_2785 PST_2786   polB FALSE 0.298 43.000 0.018 NA   NA
 3560546 3560547 PST_2786 PST_2787 polB   FALSE 0.108 148.000 0.000 NA   NA
 3560547 3560548 PST_2787 PST_2788     FALSE 0.145 117.000 0.000 NA   NA
 3560548 3560549 PST_2788 PST_2789     FALSE 0.144 89.000 0.008 NA N NA
 3560549 3560550 PST_2789 PST_2790   dapA TRUE 0.933 17.000 0.088 NA Y NA
 3560551 3560552 PST_2791 PST_2792   bcp TRUE 0.855 15.000 0.102 NA N NA
 3560553 3560554 PST_2793 PST_2794     FALSE 0.101 268.000 0.121 NA   NA
 3560556 3560557 PST_2796 PST_2797 nadA   FALSE 0.456 -48.000 0.000 1.000 N NA
 3560557 3560558 PST_2797 PST_2798     FALSE 0.033 221.000 0.000 NA   NA
 3560558 3560559 PST_2798 PST_2799   exsB FALSE 0.153 108.000 0.000 NA   NA
 3560559 3560560 PST_2799 PST_2800 exsB   TRUE 0.949 -16.000 0.270 1.000   NA
 3560560 3560561 PST_2800 PST_2801     FALSE 0.367 120.000 0.059 1.000   NA
 3560561 3560562 PST_2801 PST_2802   oprL TRUE 0.981 7.000 0.278 1.000   NA
 3560562 3560563 PST_2802 PST_2803 oprL tolB TRUE 0.896 49.000 0.592 1.000 N NA
 3560563 3560564 PST_2803 PST_2804 tolB tolA TRUE 0.789 144.000 0.215 0.006   NA
 3560564 3560565 PST_2804 PST_2805 tolA tolR TRUE 0.993 0.000 0.460 1.000   NA
 3560565 3560566 PST_2805 PST_2806 tolR tolQ TRUE 0.997 12.000 0.556 0.059 Y NA
 3560566 3560567 PST_2806 PST_2807 tolQ   TRUE 0.935 30.000 0.593 1.000   NA
 3560567 3560568 PST_2807 PST_2808   ruvB TRUE 0.736 25.000 0.082 1.000   NA
 3560568 3560569 PST_2808 PST_2809 ruvB ruvA TRUE 0.991 4.000 0.011 0.002 Y NA
 3560569 3560570 PST_2809 PST_2810 ruvA ruvC TRUE 0.842 61.000 0.011 0.010 Y NA
 3560570 3560571 PST_2810 PST_2811 ruvC   TRUE 0.558 162.000 0.277 NA   NA
 3560571 3560572 PST_2811 PST_2813   aspS FALSE 0.203 151.000 0.039 NA   NA
 3560573 3560574 PST_2812 PST_2814     FALSE 0.071 176.000 0.000 NA   NA
 3560574 3560575 PST_2814 PST_2815     FALSE 0.142 125.000 0.000 1.000 N NA
 3560576 3560577 PST_2816 PST_2817     TRUE 0.923 -3.000 0.035 NA   NA
 3560578 3560579 PST_2818 PST_2819 oprQ proS FALSE 0.101 156.000 0.002 1.000   NA
 3560579 3560580 PST_2819 PST_2820 proS   TRUE 0.759 10.000 0.013 NA   NA
 3560580 3560581 PST_2820 PST_2821     TRUE 0.896 6.000 0.039 NA   NA
 3560585 3560586 PST_2824 PST_2826 arsC-1   TRUE 0.988 -3.000 0.112 0.063   NA
 3560586 3560587 PST_2826 PST_2827     TRUE 0.987 -7.000 0.657 NA   NA
 3560588 3560589 PST_2828 PST_2829     TRUE 0.828 30.000 0.217 NA   NA
 3560590 3560591 PST_2830 PST_2831 purM purN TRUE 0.998 0.000 0.230 0.002 Y NA
 3560591 3560592 PST_2831 PST_2832 purN   TRUE 0.917 9.000 0.065 NA   NA
 3560592 3560593 PST_2832 PST_2833     FALSE 0.452 54.000 0.056 NA   NA
 3560593 3560594 PST_2833 PST_2834     FALSE 0.268 51.000 0.018 NA   NA
 3560595 3560596 PST_2835 PST_2837     TRUE 0.937 15.000 0.250 NA   NA
 3560597 3560598 PST_2836 PST_2838     FALSE 0.142 127.000 0.006 1.000   NA
 3560598 3560599 PST_2838 PST_2839   dapD TRUE 0.547 45.000 0.069 1.000 N NA
 3560599 3560600 PST_2839 PST_2840 dapD csdA TRUE 0.896 72.000 0.244 1.000 Y NA
 3560600 3560601 PST_2840 PST_2841 csdA sufE TRUE 0.971 -3.000 0.116 NA   NA
 3560602 3560603 PST_2842 PST_2843     FALSE 0.019 256.000 0.000 NA N NA
 3560603 3560604 PST_2843 PST_2844     TRUE 0.998 -3.000 0.371 0.015 Y NA
 3560611 3560612 PST_2851 PST_2852   metR FALSE 0.102 154.000 0.012 NA   NA
 3560613 3560614 PST_2853 PST_2854     FALSE 0.330 95.000 0.041 NA   NA
 3560614 3560615 PST_2854 PST_2855     FALSE 0.292 74.000 0.026 NA   NA
 3560616 3560617 PST_2856 PST_2857     TRUE 0.954 -3.000 0.059 1.000   NA
 3560617 3560618 PST_2857 PST_2858     TRUE 0.995 -3.000 0.723 NA   NA
 3560618 3560619 PST_2858 PST_2859   csgG TRUE 0.570 49.000 0.085 NA   NA
 3560619 3560620 PST_2859 PST_2860 csgG   FALSE 0.054 190.000 0.000 NA   NA
 3560620 3560621 PST_2860 PST_2861     TRUE 0.939 48.000 0.333 0.002   NA
 3560621 3560622 PST_2861 PST_2862     FALSE 0.009 367.000 0.000 NA   NA
 3560622 3560623 PST_2862 PST_2863     FALSE 0.007 380.000 0.000 NA N NA
 3560623 3560624 PST_2863 PST_2864     TRUE 0.993 5.000 0.080 0.043 Y NA
 3560624 3560625 PST_2864 PST_2865     TRUE 0.654 58.000 0.154 1.000 N NA
 3560627 3560628 PST_2867 PST_2868     FALSE 0.301 34.000 0.000 NA   NA
 3560629 3560630 PST_2869 PST_2871     FALSE 0.150 117.000 0.000 1.000 N NA
 3560632 3560633 PST_2872 PST_2873     FALSE 0.259 67.000 0.000 1.000   NA
 3560633 3560634 PST_2873 PST_2874     FALSE 0.014 302.000 0.000 NA   NA
 3560634 3560635 PST_2874 PST_2875     TRUE 0.936 4.000 0.059 NA   NA
 3560635 3560636 PST_2875 PST_2876     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA Y NA
 3560636 3560637 PST_2876 PST_2877   algI TRUE 0.765 21.000 0.100 NA N NA
 3560637 3560638 PST_2877 PST_2878 algI   FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 3560638 3560639 PST_2878 PST_2879     FALSE 0.268 40.000 0.000 NA   NA
 3560639 3560640 PST_2879 PST_2880     FALSE 0.020 264.000 0.000 NA   NA
 3560640 3560641 PST_2880 PST_2881     FALSE 0.005 558.000 0.000 1.000 N NA
 3560643 3560644 PST_2883 PST_2884     TRUE 0.503 17.000 0.012 NA   NA
 3560645 3560646 PST_2885 PST_2886     TRUE 0.975 -16.000 0.217 1.000 Y NA
 3560647 3560648 PST_2887 PST_2888     TRUE 0.982 -3.000 0.200 NA   NA
 3560648 3560649 PST_2888 PST_2889     TRUE 0.990 -3.000 0.348 1.000   NA
 3560649 3560650 PST_2889 PST_2890   glf FALSE 0.325 99.000 0.036 1.000   NA
 3560650 3560651 PST_2890 PST_2891 glf   TRUE 0.863 -12.000 0.065 1.000   NA
 3560653 3560654 PST_2893 PST_2894   trpI FALSE 0.272 179.000 0.111 NA   NA
 3560655 3560656 PST_2895 PST_2896   trpA TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.001 Y NA
 3560656 3560657 PST_2896 PST_2897 trpA   FALSE 0.010 387.000 0.000 1.000   NA
 3560657 3560658 PST_2897 PST_2898     TRUE 0.982 -7.000 0.500 NA   NA
 3560658 3560659 PST_2898 PST_2899     TRUE 0.747 51.000 0.231 NA N NA
 3560659 3560660 PST_2899 PST_2900     TRUE 0.996 5.000 0.538 NA Y NA
 3560660 3560661 PST_2900 PST_2901     TRUE 0.960 -55.000 0.250 1.000 Y NA
 3560661 3560662 PST_2901 PST_2902     TRUE 0.660 37.000 0.100 1.000 N NA
 3560662 3560663 PST_2902 PST_2903     FALSE 0.291 124.000 0.040 1.000   NA
 3560663 3560664 PST_2903 PST_2904     TRUE 0.720 11.000 0.000 NA   NA
 3560665 3560666 PST_2905 PST_2906     FALSE 0.308 33.000 0.000 NA   NA
 3560667 3560668 PST_2907 PST_2908     TRUE 0.982 13.000 0.590 1.000   NA
 3560668 3560669 PST_2908 PST_2909     TRUE 0.838 66.000 0.154 0.042   NA
 3560670 3560671 PST_2910 PST_2911     FALSE 0.222 73.000 0.013 NA   NA
 3560672 3560673 PST_2912 PST_2913   topB FALSE 0.005 531.000 0.000 1.000 N NA
 3560674 3560675 PST_2914 PST_2916     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3560678 3560679 PST_2918 PST_2919     FALSE 0.158 136.000 0.021 NA   NA
 3560679 3560680 PST_2919 PST_2920     FALSE 0.212 74.000 0.000 NA   NA
 3560680 3560681 PST_2920 PST_2921     FALSE 0.451 -46.000 0.000 NA   NA
 3560682 3560683 PST_2922 PST_2923     FALSE 0.227 68.000 0.000 1.000 N NA
 3560683 3560684 PST_2923 PST_2924     FALSE 0.004 688.000 0.000 NA   NA
 3560686 3560687 PST_2926 PST_2927     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 3560688 3560689 PST_2928 PST_2929     TRUE 0.574 128.000 0.200 NA   NA
 3560689 3560690 PST_2929 PST_2930     FALSE 0.077 171.000 0.000 NA   NA
 3560691 3560692 PST_2931 PST_2932     TRUE 0.996 -7.000 0.756 1.000 Y NA
 3560692 3560693 PST_2932 PST_2933     TRUE 0.999 -3.000 0.628 0.042 Y NA
 3560693 3560694 PST_2933 PST_2934     FALSE 0.171 112.000 0.016 1.000 N NA
 3560695 3560696 PST_2935 PST_2936 cpg2   FALSE 0.432 119.000 0.080 1.000   NA
 3560696 3560697 PST_2936 PST_2937     TRUE 0.515 78.000 0.080 NA   NA
 3560697 3560698 PST_2937 PST_2938     TRUE 0.605 92.000 0.154 NA   NA
 3560698 3560699 PST_2938 PST_2939     FALSE 0.248 121.000 0.035 NA   NA
 3560699 3560700 PST_2939 PST_2940     TRUE 0.840 18.000 0.123 NA   NA
 3560700 3560701 PST_2940 PST_2941     FALSE 0.128 195.000 0.053 NA   NA
 3560703 3560704 PST_2943 PST_2944     FALSE 0.184 64.000 0.004 NA   NA
 3560704 3560705 PST_2944 PST_2945     TRUE 0.627 84.000 0.000 0.012   NA
 3560705 3560706 PST_2945 PST_2946     FALSE 0.417 154.000 0.000 0.012 N NA
 3560707 3560708 PST_2947 PST_2948   ftsJ FALSE 0.005 504.000 0.000 NA   NA
 3560709 3560710 PST_2949 PST_2950     TRUE 0.709 12.000 0.007 1.000   NA
 3560710 3560711 PST_2950 PST_2951     FALSE 0.406 -69.000 0.000 1.000 N NA
 3560711 3560712 PST_2951 PST_2952     TRUE 0.955 19.000 0.200 1.000 Y NA
 3560712 3560713 PST_2952 PST_2953     TRUE 0.939 58.000 0.500 NA Y NA
 3560714 3560715 PST_2954 PST_2955 rarD-2 hrpA TRUE 0.746 8.000 0.006 NA   NA
 3560715 3560716 PST_2955 PST_2956 hrpA   FALSE 0.393 -94.000 0.006 1.000   NA
 3560716 3560717 PST_2956 PST_2957     TRUE 0.776 8.000 0.000 NA   NA
 3560717 3560718 PST_2957 PST_2958     FALSE 0.378 25.000 0.000 NA   NA
 3560718 3560719 PST_2958 PST_2959     TRUE 0.982 108.000 1.000 0.012 Y NA
 3560719 3560720 PST_2959 PST_2960   fadD1 FALSE 0.379 177.000 0.182 1.000 N NA
 3560720 3560721 PST_2960 PST_2961 fadD1   FALSE 0.454 224.000 0.000 0.001 Y NA
 3560722 3560723 PST_2962 PST_2963 phaJ1   FALSE 0.297 36.000 0.000 1.000 N NA
 3560724 3560725 PST_2964 PST_2965     TRUE 0.797 6.000 0.000 NA   NA
 3560725 3560726 PST_2965 PST_2966     FALSE 0.219 55.000 0.000 NA   NA
 3560726 3560727 PST_2966 PST_2967     TRUE 0.939 -10.000 0.188 NA   NA
 3560727 3560728 PST_2967 PST_2968     TRUE 0.916 -13.000 0.156 NA   NA
 3560730 3560731 PST_2970 PST_2971   yegD FALSE 0.151 105.000 0.009 NA   NA
 3560731 3560732 PST_2971 PST_2972 yegD   FALSE 0.149 109.000 0.009 1.000 N NA
 3560732 3560733 PST_2972 PST_2973     TRUE 0.846 64.000 0.143 1.000 Y NA
 3560733 3560734 PST_2973 PST_2974     TRUE 0.993 -3.000 0.533 1.000 N NA
 3560735 3560736 PST_2975 PST_2976     FALSE 0.327 30.000 0.000 NA   NA
 3560736 3560737 PST_2976 PST_2977     FALSE 0.054 190.000 0.000 NA   NA
 3560737 3560738 PST_2977 PST_2978     TRUE 0.978 119.000 0.690 0.001 Y NA
 3560738 3560739 PST_2978 PST_2979     TRUE 0.999 -6.000 0.696 0.001 Y NA
 3560739 3560740 PST_2979 PST_2980     TRUE 0.998 -3.000 0.222 0.001 Y NA
 3560742 3560743 PST_2982 PST_2983 braC braD FALSE 0.170 256.000 0.033 1.000 Y NA
 3560743 3560744 PST_2983 PST_2984 braD livM TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.042 Y NA
 3560744 3560745 PST_2984 PST_2985 livM livG TRUE 0.998 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 3560745 3560746 PST_2985 PST_2986 livG   TRUE 0.999 3.000 0.967 0.017 Y NA
 3560746 3560747 PST_2986 PST_2987     FALSE 0.154 165.000 0.034 1.000 N NA
 3560747 3560748 PST_2987 PST_2988     FALSE 0.017 280.000 0.000 NA   NA
 3560748 3560749 PST_2988 PST_2989     TRUE 0.974 -3.000 0.135 NA   NA
 3560750 3560751 PST_2990 PST_2991 dinP   FALSE 0.013 342.000 0.000 1.000   NA
 3560751 3560752 PST_2991 PST_2992     FALSE 0.029 235.000 0.000 NA   NA
 3560752 3560753 PST_2992 PST_2993     FALSE 0.257 43.000 0.000 NA   NA
 3560753 3560754 PST_2993 PST_2994     FALSE 0.251 44.000 0.000 NA   NA
 3560754 3560755 PST_2994 PST_2995     FALSE 0.220 66.000 0.000 NA   NA
 3560755 3560756 PST_2995 PST_2996   gltX FALSE 0.080 168.000 0.000 NA   NA
 3560756 3560757 PST_2996 PST_2997 gltX uvrB FALSE 0.280 159.000 0.005 0.100 N NA
 3560758 3560759 PST_2998 PST_2999 aspC   FALSE 0.167 101.000 0.000 NA   NA
 3560763 3560764 PST_3003 PST_3004 argF   TRUE 0.832 -81.000 0.025 1.000 Y NA
 3560765 3560766 PST_3005 PST_3006 cumB cumA FALSE 0.416 65.000 0.045 1.000 N NA
 3560766 3560767 PST_3006 PST_3007 cumA guaA FALSE 0.130 111.000 0.004 1.000 N NA
 3560767 3560768 PST_3007 PST_3008 guaA guaB TRUE 0.932 117.000 0.190 0.001 Y NA
 3560768 3560769 PST_3008 PST_3009 guaB   FALSE 0.121 127.000 0.008 NA   NA
 3560770 3560771 PST_3010 PST_3011 xseA   FALSE 0.290 94.000 0.032 1.000 N NA
 3560771 3560772 PST_3011 PST_3012     FALSE 0.154 104.000 0.008 1.000 N NA
 3560772 3560773 PST_3012 PST_3013     FALSE 0.157 80.000 0.008 NA N NA
 3560774 3560775 PST_3014 PST_3015 oprC   TRUE 0.859 -3.000 0.012 NA   NA
 3560776 3560777 PST_3016 PST_3017 leuA   FALSE 0.031 249.000 0.000 1.000   NA
 3560777 3560778 PST_3017 PST_3018     FALSE 0.260 90.000 0.019 1.000   NA
 3560778 3560779 PST_3018 PST_3019   endA FALSE 0.228 103.000 0.019 1.000   NA
 3560779 3560780 PST_3019 PST_3020 endA   TRUE 0.477 35.000 0.039 NA   NA
 3560780 3560781 PST_3020 PST_3021     TRUE 0.859 5.000 0.024 NA   NA
 3560781 3560782 PST_3021 PST_3022     TRUE 0.491 -34.000 0.000 NA   NA
 3560782 3560783 PST_3022 PST_3023     TRUE 0.871 3.000 0.000 1.000   NA
 3560784 3560785 PST_3024 PST_3025     TRUE 0.899 -12.000 0.099 1.000   NA
 3560787 3560788 PST_3027 PST_3028 engA   TRUE 0.658 103.000 0.203 1.000   NA
 3560788 3560789 PST_3028 PST_3029     TRUE 0.991 4.000 0.492 1.000   NA
 3560789 3560790 PST_3029 PST_3030   hisS TRUE 0.874 28.000 0.259 1.000   NA
 3560790 3560791 PST_3030 PST_3031 hisS ispG TRUE 0.905 17.000 0.207 1.000 N NA
 3560791 3560792 PST_3031 PST_3032 ispG   TRUE 0.689 104.000 0.233 1.000   NA
 3560792 3560793 PST_3032 PST_3033   pilF TRUE 0.984 -3.000 0.204 1.000   NA
 3560793 3560794 PST_3033 PST_3034 pilF   TRUE 0.912 12.000 0.086 1.000   NA
 3560794 3560795 PST_3034 PST_3035   ndk TRUE 0.545 125.000 0.156 1.000   NA
 3560795 3560796 PST_3035 PST_3036 ndk   FALSE 0.133 158.000 0.017 1.000   NA
 3560796 3560797 PST_3036 PST_3037   fdx2 TRUE 0.988 11.000 0.625 1.000   NA
 3560797 3560798 PST_3037 PST_3038 fdx2 hscA TRUE 0.994 6.000 0.794 1.000 N NA
 3560798 3560799 PST_3038 PST_3039 hscA hscB TRUE 0.966 40.000 0.634 1.000 Y NA
 3560799 3560800 PST_3039 PST_3040 hscB   TRUE 0.988 8.000 0.500 NA   NA
 3560800 3560801 PST_3040 PST_3041   iscU TRUE 0.573 172.000 0.359 NA   NA
 3560801 3560802 PST_3041 PST_3042 iscU iscS TRUE 0.872 44.000 0.448 1.000 N NA
 3560802 3560803 PST_3042 PST_3043 iscS   TRUE 0.899 32.000 0.424 1.000 N NA
 3560803 3560804 PST_3043 PST_3044   cysE2 TRUE 0.706 105.000 0.271 1.000 N NA
 3560804 3560805 PST_3044 PST_3045 cysE2   TRUE 0.985 0.000 0.208 1.000 N NA
 3560807 3560808 PST_3047 PST_3048   secF TRUE 0.663 24.000 0.050 1.000   NA
 3560808 3560809 PST_3048 PST_3049 secF secD TRUE 0.993 13.000 0.171 0.001 Y NA
 3560809 3560810 PST_3049 PST_3050 secD yajC FALSE 0.251 206.000 0.031 NA Y NA
 3560810 3560811 PST_3050 PST_3051 yajC tgt TRUE 0.829 43.000 0.325 NA N NA
 3560811 3560812 PST_3051 PST_3052 tgt queA TRUE 0.999 -3.000 0.360 0.001 Y NA
 3560813 3560814 PST_3053 PST_3054     FALSE 0.008 399.000 0.000 NA   NA
 3560814 3560815 PST_3054 PST_3055     FALSE 0.398 98.000 0.061 NA   NA
 3560816 3560817 PST_3056 PST_3057     TRUE 0.994 -7.000 0.631 0.060   NA
 3560818 3560819 PST_3058 PST_3059 pepA holC TRUE 0.863 68.000 0.494 1.000 N NA
 3560819 3560820 PST_3059 PST_3060 holC   FALSE 0.371 50.000 0.034 NA   NA
 3560820 3560821 PST_3060 PST_3061   valS FALSE 0.157 102.000 0.009 NA   NA
 3560821 3560822 PST_3061 PST_3062 valS   FALSE 0.010 355.000 0.000 1.000 N NA
 3560822 3560823 PST_3062 PST_3063     TRUE 0.570 58.000 0.100 NA   NA
 3560823 3560824 PST_3063 PST_3064     FALSE 0.192 177.000 0.061 NA   NA
 3560824 3560825 PST_3064 PST_3065     FALSE 0.411 32.000 0.030 NA N NA
 3560825 3560826 PST_3065 PST_3066     FALSE 0.205 58.000 0.010 NA   NA
 3560827 3560828 PST_3067 PST_3068     FALSE 0.006 438.000 0.000 NA   NA
 3560828 3560829 PST_3068 PST_3069     TRUE 0.611 102.000 0.049 0.059 N NA
 3560830 3560831 PST_3070 PST_3071     FALSE 0.112 158.000 0.017 NA   NA
 3560831 3560832 PST_3071 PST_3072     TRUE 0.848 -3.000 0.008 NA   NA
 3560833 3560834 PST_3073 PST_3074     FALSE 0.131 178.000 0.041 NA N NA
 3560837 3560838 PST_3077 PST_3078   atzB FALSE 0.214 210.000 0.135 1.000   NA
 3560838 3560839 PST_3078 PST_3079 atzB   TRUE 0.553 -93.000 0.030 1.000   NA
 3560839 3560840 PST_3079 PST_3080     FALSE 0.426 140.000 0.106 1.000   NA
 3560840 3560841 PST_3080 PST_3081   xdhA FALSE 0.016 309.000 0.000 1.000   NA
 3560841 3560842 PST_3081 PST_3082 xdhA xdhB TRUE 0.996 -7.000 0.269 0.001 Y NA
 3560842 3560843 PST_3082 PST_3083 xdhB   FALSE 0.409 219.000 0.463 NA N NA
 3560843 3560844 PST_3083 PST_3084   guaD TRUE 0.666 90.000 0.203 NA N NA
 3560845 3560846 PST_3085 PST_3086     FALSE 0.262 42.000 0.000 NA   NA
 3560846 3560847 PST_3086 PST_3088     FALSE 0.094 159.000 0.000 NA   NA
 3560847 3560848 PST_3088 PST_3089     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3560849 3560850 PST_3090 PST_3091     TRUE 0.729 65.000 0.200 1.000   NA
 3560852 3560853 PST_3093 PST_3094     TRUE 0.970 0.000 0.097 NA   NA
 3560853 3560854 PST_3094 PST_3095   alc TRUE 0.891 76.000 0.647 NA   NA
 3560854 3560855 PST_3095 PST_3096 alc allA TRUE 0.942 100.000 0.647 1.000 Y NA
 3560855 3560856 PST_3096 PST_3097 allA   TRUE 0.869 84.000 0.538 1.000   NA
 3560856 3560857 PST_3097 PST_3098     FALSE 0.007 471.000 0.000 1.000   NA
 3560857 3560858 PST_3098 PST_3099     FALSE 0.004 492.000 0.000 NA N NA
 3560860 3560861 PST_3101 PST_3102     FALSE 0.139 124.000 0.000 NA   NA
 3560861 3560862 PST_3102 PST_3103     TRUE 0.994 -3.000 0.578 NA   NA
 3560865 3560866 PST_3106 PST_3107     FALSE 0.391 137.000 0.095 NA   NA
 3560866 3560867 PST_3107 PST_3108     FALSE 0.236 137.000 0.045 NA N NA
 3560867 3560868 PST_3108 PST_3109     FALSE 0.178 169.000 0.045 1.000 N NA
 3560868 3560869 PST_3109 PST_3110   irlR TRUE 0.999 -3.000 0.889 0.027 Y NA
 3560870 3560871 PST_3111 PST_3112     TRUE 0.949 17.000 0.409 NA   NA
 3560873 3560874 PST_3114 PST_3115 gcl   TRUE 0.651 174.000 0.495 1.000   NA
 3560874 3560875 PST_3115 PST_3116   glxR TRUE 0.857 73.000 0.492 1.000 N NA
 3560875 3560876 PST_3116 PST_3117 glxR   TRUE 0.842 20.000 0.154 1.000 N NA
 3560876 3560877 PST_3117 PST_3118   pykF TRUE 0.788 57.000 0.074 1.000 Y NA
 3560877 3560878 PST_3118 PST_3119 pykF   FALSE 0.112 181.000 0.032 1.000 N NA
 3560878 3560879 PST_3119 PST_3120     FALSE 0.217 56.000 0.000 NA   NA
 3560879 3560880 PST_3120 PST_3121   hmpA TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3560880 3560881 PST_3121 PST_3122 hmpA   FALSE 0.288 50.000 0.021 NA   NA
 3560881 3560882 PST_3122 PST_3123     FALSE 0.036 214.000 0.000 NA   NA
 3560882 3560883 PST_3123 PST_3124     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 3560883 3560884 PST_3124 PST_3125   pncB1 FALSE 0.143 120.000 0.000 NA   NA
 3560890 3560891 PST_3131 PST_3132   sodB FALSE 0.009 403.000 0.009 1.000   NA
 3560891 3560892 PST_3132 PST_3133 sodB   FALSE 0.008 369.000 0.004 1.000 N NA
 3560892 3560893 PST_3133 PST_3134     TRUE 0.463 106.000 0.083 1.000   NA
 3560894 3560895 PST_3135 PST_3136     TRUE 0.995 2.000 0.722 NA   NA
 3560896 3560897 PST_3137 PST_3138     TRUE 0.618 168.000 0.436 NA N NA
 3560897 3560898 PST_3138 PST_3139     TRUE 0.908 69.000 0.713 NA   NA
 3560898 3560899 PST_3139 PST_3140     TRUE 0.994 2.000 0.620 NA   NA
 3560899 3560900 PST_3140 PST_3141     FALSE 0.240 85.000 0.020 NA   NA
 3560900 3560901 PST_3141 PST_3142     FALSE 0.034 223.000 0.000 1.000 N NA
 3560901 3560902 PST_3142 PST_3143     FALSE 0.217 292.000 0.429 NA N NA
 3560903 3560904 PST_3144 PST_3145   groEL FALSE 0.105 159.000 0.015 NA   NA
 3560904 3560905 PST_3145 PST_3146 groEL groES TRUE 0.950 48.000 0.177 0.006 Y NA
 3560905 3560906 PST_3146 PST_3147 groES fxsA FALSE 0.040 249.000 0.028 NA   NA
 3560906 3560907 PST_3147 PST_3148 fxsA   FALSE 0.278 81.000 0.026 NA   NA
 3560911 3560912 PST_3152 PST_3153     FALSE 0.239 90.000 0.021 NA   NA
 3560913 3560914 PST_3154 PST_3155   panE-2 TRUE 0.872 5.000 0.027 1.000 N NA
 3560914 3560915 PST_3155 PST_3156 panE-2   TRUE 0.466 47.000 0.049 1.000 N NA
 3560915 3560916 PST_3156 PST_3157     TRUE 0.897 14.000 0.030 0.099   NA
 3560916 3560917 PST_3157 PST_3158     TRUE 0.669 -7.000 0.005 NA   NA
 3560918 3560919 PST_3159 PST_3160     TRUE 0.945 -13.000 0.221 1.000   NA
 3560919 3560920 PST_3160 PST_3161   ahpF-2 FALSE 0.327 37.000 0.000 1.000   NA
 3560920 3560921 PST_3161 PST_3162 ahpF-2 ahpC TRUE 0.918 121.000 0.551 1.000 Y NA
 3560921 3560922 PST_3162 PST_3163 ahpC   FALSE 0.070 169.000 0.006 1.000 N NA
 3560922 3560923 PST_3163 PST_3164     TRUE 0.936 -3.000 0.042 1.000 N NA
 3560923 3560924 PST_3164 PST_3165   argJ FALSE 0.142 124.000 0.011 1.000 N NA
 3560924 3560925 PST_3165 PST_3166 argJ secA FALSE 0.463 115.000 0.102 1.000 N NA
 3560926 3560927 PST_3167 PST_3168     FALSE 0.190 58.000 0.006 NA   NA
 3560927 3560928 PST_3168 PST_3169     FALSE 0.249 97.000 0.027 NA   NA
 3560928 3560929 PST_3169 PST_3170     FALSE 0.206 121.000 0.027 NA   NA
 3560930 3560931 PST_3171 PST_3172     FALSE 0.278 250.000 0.333 NA   NA
 3560931 3560932 PST_3172 PST_3173     TRUE 0.823 158.000 0.857 NA   NA
 3560932 3560933 PST_3173 PST_3174   hpt FALSE 0.005 569.000 0.000 NA   NA
 3560934 3560935 PST_3175 PST_3176 upp uraA TRUE 0.989 3.000 0.101 1.000 Y NA
 3560935 3560936 PST_3176 PST_3177 uraA   FALSE 0.165 89.000 0.006 NA   NA
 3560937 3560938 PST_3178 PST_3179   murI TRUE 0.531 -28.000 0.002 1.000   NA
 3560938 3560939 PST_3179 PST_3180 murI moeB TRUE 0.728 -7.000 0.013 1.000 N NA
 3560939 3560940 PST_3180 PST_3181 moeB hemK TRUE 0.707 23.000 0.068 1.000 N NA
 3560940 3560941 PST_3181 PST_3182 hemK prfA TRUE 0.926 35.000 0.229 1.000 Y NA
 3560941 3560942 PST_3182 PST_3183 prfA hemA TRUE 0.992 -3.000 0.171 0.033 N NA
 3560943 3560944 PST_3184 PST_3185   lolB TRUE 0.952 4.000 0.072 1.000   NA
 3560944 3560945 PST_3185 PST_3186 lolB ipk TRUE 0.960 1.000 0.072 1.000 N NA
 3560945 3560946 PST_3186 PST_3187 ipk   FALSE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 3560946 3560947 PST_3187 PST_3188     FALSE 0.214 59.000 0.000 NA   NA
 3560947 3560948 PST_3188 PST_3189   prsA FALSE 0.186 91.000 0.000 NA   NA
 3560948 3560949 PST_3189 PST_3190 prsA   TRUE 0.496 120.000 0.122 1.000 N NA
 3560949 3560950 PST_3190 PST_3191   pth TRUE 0.791 238.000 0.496 0.017 Y NA
 3560950 3560951 PST_3191 PST_3192 pth ychF TRUE 0.937 25.000 0.184 1.000 Y NA
 3560951 3560952 PST_3192 PST_3193 ychF   FALSE 0.243 39.000 0.004 1.000 N NA
 3560952 3560953 PST_3193 PST_3194     FALSE 0.026 261.000 0.000 1.000   NA
 3560953 3560954 PST_3194 PST_3195     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3560954 3560955 PST_3195 PST_3196     TRUE 0.905 -10.000 0.000 0.053   NA
 3560955 3560956 PST_3196 PST_3197     FALSE 0.003 1789.000 0.000 NA   NA
 3560956 3560957 PST_3197 PST_3198     TRUE 0.985 -3.000 0.237 NA   NA
 3560959 3560960 PST_3200 PST_3201     TRUE 0.982 -3.000 0.200 NA   NA
 3560960 3560961 PST_3201 PST_3202     TRUE 0.747 122.000 0.400 NA   NA
 3560962 3560963 PST_3203 PST_3204     FALSE 0.004 678.000 0.000 NA   NA
 3560963 3560964 PST_3204 PST_3205     TRUE 0.998 3.000 0.462 0.041 Y NA
 3560964 3560965 PST_3205 PST_3206     TRUE 0.927 70.000 0.400 NA Y NA
 3560965 3560966 PST_3206 PST_3207     FALSE 0.238 237.000 0.059 NA Y NA
 3560966 3560967 PST_3207 PST_3208   braF-2 TRUE 0.999 -3.000 0.716 0.017 Y NA
 3560967 3560968 PST_3208 PST_3209 braF-2   FALSE 0.015 322.000 0.000 1.000   NA
 3560968 3560969 PST_3209 PST_3210     FALSE 0.195 103.000 0.019 NA   NA
 3560969 3560970 PST_3210 PST_3211     FALSE 0.253 58.000 0.019 NA   NA
 3560970 3560971 PST_3211 PST_3212     FALSE 0.013 307.000 0.000 1.000 N NA
 3560972 3560973 PST_3213 PST_3214     TRUE 0.875 110.000 0.316 1.000 Y NA
 3560973 3560974 PST_3214 PST_3215     TRUE 0.872 58.000 0.189 1.000 Y NA
 3560974 3560975 PST_3215 PST_3216     TRUE 0.997 0.000 0.205 0.052 Y NA
 3560975 3560976 PST_3216 PST_3217     TRUE 0.697 163.000 0.229 0.052 N NA
 3560976 3560977 PST_3217 PST_3218     TRUE 0.572 86.000 0.021 0.052 N NA
 3560977 3560978 PST_3218 PST_3219     TRUE 0.999 5.000 0.789 0.001 Y NA
 3560978 3560979 PST_3219 PST_3220     FALSE 0.129 258.000 0.000 1.000 Y NA
 3560979 3560980 PST_3220 PST_3221     FALSE 0.301 74.000 0.026 1.000 N NA
 3560980 3560981 PST_3221 PST_3222     FALSE 0.008 406.000 0.000 1.000 N NA
 3560981 3560982 PST_3222 PST_3223     TRUE 0.970 76.000 1.000 NA Y NA
 3560982 3560983 PST_3223 PST_3224     TRUE 0.977 17.000 0.375 NA Y NA
 3560983 3560984 PST_3224 PST_3225     TRUE 0.611 77.000 0.125 1.000 N NA
 3560984 3560985 PST_3225 PST_3226     FALSE 0.433 112.000 0.087 NA   NA
 3560985 3560986 PST_3226 PST_3227     FALSE 0.025 252.000 0.000 NA   NA
 3560987 3560988 PST_3228 PST_3229     FALSE 0.179 94.000 0.000 NA   NA
 3560988 3560989 PST_3229 PST_3230     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 3560989 3560990 PST_3230 PST_3231     FALSE 0.036 234.000 0.000 1.000   NA
 3560990 3560991 PST_3231 PST_3232     FALSE 0.004 837.000 0.000 NA   NA
 3560991 3560992 PST_3232 PST_3233     FALSE 0.088 163.000 0.000 NA   NA
 3560992 3560993 PST_3233 PST_3234     TRUE 0.889 0.000 0.016 NA   NA
 3560993 3560994 PST_3234 PST_3235     FALSE 0.207 81.000 0.011 1.000 N NA
 3560994 3560995 PST_3235 PST_3236     TRUE 0.978 17.000 0.068 0.001 Y NA
 3560997 3560998 PST_3238 PST_3239 rimI   TRUE 0.823 10.000 0.027 NA   NA
 3560998 3560999 PST_3239 PST_3240     FALSE 0.278 36.000 0.010 NA   NA
 3560999 3561000 PST_3240 PST_3241     FALSE 0.054 381.000 0.000 1.000 Y NA
 3561000 3561001 PST_3241 PST_3242   nspC TRUE 0.936 72.000 0.444 1.000 Y NA
 3561002 3561003 PST_3243 PST_3244     TRUE 0.932 67.000 0.947 NA   NA
 3561003 3561004 PST_3244 PST_3245     TRUE 0.997 -3.000 0.950 NA   NA
 3561005 3561006 PST_3246 PST_3247     TRUE 0.990 -7.000 0.840 NA   NA
 3561006 3561007 PST_3247 PST_3248     TRUE 0.893 -13.000 0.114 NA   NA
 3561007 3561008 PST_3248 PST_3248a     FALSE 0.007 405.000 0.000 NA   NA
 3561008 3561009 PST_3248a PST_3249     FALSE 0.112 144.000 0.000 NA   NA
 3561009 3561010 PST_3249 PST_3250     FALSE 0.024 253.000 0.000 NA   NA
 3561010 3561011 PST_3250 PST_3251     FALSE 0.320 31.000 0.000 NA   NA
 3561011 3561012 PST_3251 PST_3252     FALSE 0.186 91.000 0.000 NA   NA
 3561012 3561013 PST_3252 PST_3253     FALSE 0.004 572.000 0.000 NA   NA
 3561013 3561014 PST_3253 PST_3254     TRUE 0.998 0.000 0.790 0.060   NA
 3561014 3561015 PST_3254 PST_3255   pssA FALSE 0.353 55.000 0.029 1.000   NA
 3561015 3561016 PST_3255 PST_3256 pssA ilvC FALSE 0.211 154.000 0.041 1.000 N NA
 3561016 3561017 PST_3256 PST_3257 ilvC ilvH TRUE 0.931 77.000 0.092 0.001 Y NA
 3561017 3561018 PST_3257 PST_3258 ilvH ilvI TRUE 0.999 3.000 0.371 0.001 Y NA
 3561020 3561021 PST_3260 PST_3261     TRUE 0.951 0.000 0.055 NA   NA
 3561021 3561022 PST_3261 PST_3262   mrcB FALSE 0.289 109.000 0.035 1.000   NA
 3561023 3561024 PST_3263 PST_3264     FALSE 0.220 67.000 0.000 NA   NA
 3561024 3561025 PST_3264 PST_3265     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 3561025 3561026 PST_3265 PST_3266     TRUE 0.811 26.000 0.167 NA   NA
 3561027 3561028 PST_3267 PST_3268     TRUE 0.748 12.000 0.021 NA   NA
 3561028 3561029 PST_3268 PST_3269     TRUE 0.996 0.000 0.292 1.000 Y NA
 3561030 3561031 PST_3270 PST_3271   dipZ TRUE 0.635 32.000 0.071 1.000 N NA
 3561031 3561032 PST_3271 PST_3272 dipZ aroQ FALSE 0.037 212.000 0.010 1.000 N NA
 3561032 3561033 PST_3272 PST_3273 aroQ accB TRUE 0.759 77.000 0.254 1.000 N NA
 3561033 3561034 PST_3273 PST_3274 accB accC TRUE 0.990 18.000 0.275 0.001 Y NA
 3561034 3561035 PST_3274 PST_3275 accC prmA TRUE 0.655 69.000 0.152 1.000 N NA
 3561035 3561036 PST_3275 PST_3276 prmA   FALSE 0.127 113.000 0.006 NA   NA
 3561036 3561037 PST_3276 PST_3277     FALSE 0.038 198.000 0.003 NA   NA
 3561037 3561038 PST_3277 PST_3278   fis TRUE 0.978 -3.000 0.161 1.000 N NA
 3561038 3561039 PST_3278 PST_3279 fis purH TRUE 0.568 77.000 0.101 1.000 N NA
 3561039 3561040 PST_3279 PST_3280 purH purD TRUE 0.592 200.000 0.238 1.000 Y NA
 3561040 3561041 PST_3280 PST_3281 purD   TRUE 0.517 75.000 0.010 0.098 N NA
 3561043 3561044 PST_3283 PST_3284     FALSE 0.261 110.000 0.035 NA   NA
 3561045 3561046 PST_3285 PST_3286     FALSE 0.241 105.000 0.023 1.000   NA
 3561046 3561047 PST_3286 PST_3287   sfsA FALSE 0.021 260.000 0.000 NA   NA
 3561047 3561048 PST_3287 PST_3288 sfsA   FALSE 0.327 90.000 0.038 NA   NA
 3561049 3561050 PST_3289 PST_3290 dksA   TRUE 0.714 90.000 0.231 1.000 N NA
 3561050 3561051 PST_3290 PST_3291     FALSE 0.331 106.000 0.042 1.000   NA
 3561051 3561052 PST_3291 PST_3292     TRUE 0.955 -16.000 0.312 1.000   NA
 3561052 3561053 PST_3292 PST_3293     TRUE 0.914 62.000 0.453 0.098 N NA
 3561053 3561054 PST_3293 PST_3294   pcnB FALSE 0.004 722.000 0.000 1.000 N NA
 3561054 3561055 PST_3294 PST_3295 pcnB folK TRUE 0.930 -22.000 0.234 1.000 N NA
 3561055 3561056 PST_3295 PST_3296 folK panB FALSE 0.320 244.000 0.117 1.000 Y NA
 3561056 3561057 PST_3296 PST_3297 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 3561057 3561058 PST_3297 PST_3298 panC   TRUE 0.913 84.000 0.342 1.000 Y NA
 3561058 3561059 PST_3298 PST_3299   pgi FALSE 0.008 353.000 0.004 1.000 N NA
 3561059 3561060 PST_3299 PST_3300 pgi   FALSE 0.201 129.000 0.029 NA   NA
 3561060 3561061 PST_3300 PST_3301     FALSE 0.079 218.000 0.044 NA   NA
 3561061 3561062 PST_3301 PST_3302     FALSE 0.229 128.000 0.034 NA   NA
 3561062 3561063 PST_3302 PST_3303     FALSE 0.424 52.000 0.046 NA   NA
 3561063 3561064 PST_3303 PST_3304     TRUE 0.969 18.000 0.714 NA   NA
 3561065 3561066 PST_3305 PST_3306   pnp FALSE 0.019 271.000 0.000 NA   NA
 3561066 3561067 PST_3306 PST_3307 pnp rpsO TRUE 0.785 168.000 0.335 1.000 Y NA
 3561067 3561068 PST_3307 PST_3308 rpsO truB TRUE 0.826 116.000 0.211 1.000 Y NA
 3561068 3561069 PST_3308 PST_3309 truB rbfA TRUE 0.995 3.000 0.318 1.000 Y NA
 3561069 3561070 PST_3309 PST_3310 rbfA infB TRUE 0.926 103.000 0.530 1.000 Y NA
 3561070 3561071 PST_3310 PST_3311 infB nusA TRUE 0.890 29.000 0.342 1.000 N NA
 3561071 3561072 PST_3311 PST_3312 nusA   TRUE 0.923 48.000 0.759 NA   NA
 3561072 3561073 PST_3312 PST_3313     FALSE 0.272 39.000 0.000 NA   NA
 3561073 3561074 PST_3313 PST_3314     FALSE 0.178 95.000 0.000 NA   NA
 3561074 3561075 PST_3314 PST_3315   secG TRUE 0.776 8.000 0.000 NA   NA
 3561075 3561076 PST_3315 PST_3316 secG tpiA TRUE 0.883 -37.000 0.184 1.000 N NA
 3561076 3561077 PST_3316 PST_3317 tpiA glmM TRUE 0.802 66.000 0.082 1.000 Y NA
 3561077 3561078 PST_3317 PST_3318 glmM folP TRUE 0.686 110.000 0.260 1.000 N NA
 3561078 3561079 PST_3318 PST_3319 folP ftsH TRUE 0.560 169.000 0.325 1.000 N NA
 3561081 3561082 PST_3321 PST_3322   greA TRUE 0.572 -22.000 0.014 NA   NA
 3561082 3561083 PST_3322 PST_3323 greA carB TRUE 0.985 -3.000 0.241 1.000 N NA
 3561083 3561084 PST_3323 PST_3324 carB carA TRUE 0.981 37.000 0.345 0.001 Y NA
 3561084 3561085 PST_3324 PST_3325 carA dapB FALSE 0.246 217.000 0.034 1.000 Y NA
 3561085 3561086 PST_3325 PST_3326 dapB dnaJ FALSE 0.368 82.000 0.041 1.000 N NA
 3561086 3561087 PST_3326 PST_3327 dnaJ dnaK TRUE 0.768 211.000 0.236 0.003 Y NA
 3561087 3561088 PST_3327 PST_3328 dnaK grpE TRUE 0.860 99.000 0.049 0.006 Y NA
 3561092 3561093 PST_3332 PST_3333     TRUE 0.913 -7.000 0.086 NA   NA
 3561096 3561097 PST_3336 PST_3337     FALSE 0.197 255.000 0.045 1.000 Y NA
 3561097 3561098 PST_3337 PST_3338     TRUE 0.998 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 3561098 3561099 PST_3338 PST_3339     TRUE 0.998 -3.000 0.639 0.001   NA
 3561099 3561100 PST_3339 PST_3340     TRUE 0.984 -3.000 0.203 1.000   NA
 3561100 3561101 PST_3340 PST_3341     FALSE 0.360 44.000 0.029 NA   NA
 3561101 3561102 PST_3341 PST_3342     FALSE 0.006 436.000 0.000 NA   NA
 3561102 3561104 PST_3342 PST_3343     FALSE 0.003 1201.000 0.000 NA   NA
 3561104 3561105 PST_3343 PST_3344     FALSE 0.398 163.000 0.000 0.010   NA
 3561105 3561106 PST_3344 PST_3345     FALSE 0.236 49.000 0.000 NA   NA
 3561106 3561107 PST_3345 PST_3346     FALSE 0.003 984.000 0.000 NA   NA
 3561107 3561108 PST_3346 PST_3347     TRUE 0.928 21.000 0.160 0.053   NA
 3561108 3561109 PST_3347 PST_3348     TRUE 0.643 13.000 0.000 NA   NA
 3561111 3561112 PST_3350 PST_3351     FALSE 0.233 84.000 0.018 NA   NA
 3561113 3561114 PST_3352 PST_3353     TRUE 0.987 -3.000 0.059 0.010   NA
 3561114 3561115 PST_3353 PST_3354     FALSE 0.254 56.000 0.000 1.000   NA
 3561115 3561116 PST_3354 PST_3355   rulA TRUE 0.611 -13.000 0.000 NA   NA
 3561117 3561118 PST_3356 PST_3357     FALSE 0.006 464.000 0.000 NA   NA
 3561121 3561122 PST_3360 PST_3361   czcA TRUE 0.748 -6.000 0.000 NA   NA
 3561122 3561123 PST_3361 PST_3362 czcA   TRUE 0.994 3.000 0.667 1.000 N NA
 3561123 3561124 PST_3362 PST_3363     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 3561125 3561126 PST_3364 PST_3365     TRUE 0.562 15.000 0.000 NA   NA
 3561126 3561127 PST_3365 PST_3366     TRUE 0.536 142.000 0.034 0.013   NA
 3561127 3561128 PST_3366 PST_3367     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3561128 3561129 PST_3367 PST_3368     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3561132 3561133 PST_3371 PST_3372     FALSE 0.049 196.000 0.000 NA   NA
 3561134 3561135 PST_3373 PST_3374     FALSE 0.037 213.000 0.000 NA   NA
 3561135 3561136 PST_3374 PST_3375     FALSE 0.071 176.000 0.000 NA   NA
 3561137 3561138 PST_3376 PST_3377     TRUE 0.955 -10.000 0.250 NA   NA
 3561138 3561139 PST_3377 PST_3378     TRUE 0.747 122.000 0.400 NA   NA
 3561139 3561140 PST_3378 PST_3379     TRUE 0.982 -3.000 0.200 NA   NA
 3561140 3561141 PST_3379 PST_3380     FALSE 0.239 48.000 0.000 NA   NA
 3561141 3561142 PST_3380 PST_3381   copB TRUE 0.992 9.000 0.750 1.000   NA
 3561142 3561143 PST_3381 PST_3382 copB   TRUE 0.986 -10.000 0.750 NA   NA
 3561143 3561144 PST_3382 PST_3383   copA TRUE 0.969 13.000 0.375 NA   NA
 3561144 3561145 PST_3383 PST_3384 copA dipZ FALSE 0.005 547.000 0.000 1.000 N NA
 3561145 3561146 PST_3384 PST_3385 dipZ   FALSE 0.062 183.000 0.000 NA   NA
 3561146 3561147 PST_3385 PST_3386     TRUE 0.495 -33.000 0.000 NA   NA
 3561147 3561148 PST_3386 PST_3387     TRUE 0.853 74.000 0.000 0.003 Y NA
 3561148 3561149 PST_3387 PST_3388     TRUE 0.976 6.000 0.222 NA   NA
 3561150 3561151 PST_3389 PST_3390     FALSE 0.217 63.000 0.000 NA   NA
 3561151 3561152 PST_3390 PST_3391     TRUE 0.991 39.000 0.800 0.002 Y NA
 3561153 3561154 PST_3392 PST_3393     FALSE 0.018 277.000 0.000 NA   NA
 3561154 3561155 PST_3393 PST_3395     FALSE 0.181 93.000 0.000 NA   NA
 3561156 3561157 PST_3394 PST_3396     TRUE 0.912 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 3561157 3561158 PST_3396 PST_3397     FALSE 0.017 280.000 0.000 NA   NA
 3561159 3561160 PST_3398 PST_3399     FALSE 0.180 110.000 0.000 1.000   NA
 3561160 3561161 PST_3399 PST_3400     FALSE 0.005 593.000 0.000 1.000   NA
 3561161 3561162 PST_3400 PST_3401     FALSE 0.314 32.000 0.000 NA   NA
 3561162 3561163 PST_3401 PST_3403     TRUE 0.647 -10.000 0.000 NA   NA
 3561166 3561167 PST_3405 PST_3406     FALSE 0.039 225.000 0.000 1.000   NA
 3561167 3561168 PST_3406 PST_3407     FALSE 0.006 572.000 0.000 1.000   NA
 3561168 3561169 PST_3407 PST_3408     FALSE 0.018 272.000 0.000 NA   NA
 3561169 3561170 PST_3408 PST_3409     FALSE 0.057 187.000 0.000 NA   NA
 3561170 3561171 PST_3409 PST_3410     TRUE 0.982 18.000 0.500 1.000 Y NA
 3561171 3561172 PST_3410 PST_3411     FALSE 0.257 43.000 0.000 NA   NA
 3561172 3561173 PST_3411 PST_3412     FALSE 0.020 264.000 0.000 NA   NA
 3561175 3561176 PST_3414 PST_3415     FALSE 0.309 56.000 0.028 NA   NA
 3561181 3561182 PST_3420 PST_3421   czrR-2 TRUE 0.496 129.000 0.000 1.000 Y NA
 3561182 3561183 PST_3421 PST_3422 czrR-2   FALSE 0.026 260.000 0.000 1.000   NA
 3561184 3561185 PST_3423 PST_3424     TRUE 0.941 42.000 0.368 1.000 Y NA
 3561185 3561186 PST_3424 PST_3425     TRUE 0.823 86.000 0.421 1.000 N NA
 3561187 3561188 PST_3426 PST_3427     FALSE 0.192 87.000 0.000 NA   NA
 3561190 3561191 PST_3429 PST_3430     FALSE 0.206 78.000 0.000 NA   NA
 3561191 3561192 PST_3430 PST_3431     TRUE 0.720 11.000 0.000 NA   NA
 3561193 3561194 PST_3432 PST_3433     TRUE 0.980 13.000 0.154 0.001   NA
 3561194 3561195 PST_3433 PST_3434     TRUE 0.959 8.000 0.154 NA   NA
 3561196 3561197 PST_3435 PST_3436     TRUE 0.963 4.000 0.115 NA   NA
 3561197 3561198 PST_3436 PST_3437     TRUE 0.995 0.000 0.615 NA   NA
 3561198 3561199 PST_3437 PST_3438     FALSE 0.051 193.000 0.000 NA   NA
 3561201 3561202 PST_3440 PST_3441     TRUE 0.996 -3.000 0.409 0.096   NA
 3561202 3561203 PST_3441 PST_3442     TRUE 0.845 3.000 0.000 NA   NA
 3561203 3561204 PST_3442 PST_3443     FALSE 0.219 65.000 0.000 NA   NA
 3561204 3561205 PST_3443 PST_3444     FALSE 0.167 101.000 0.000 NA   NA
 3561205 3561206 PST_3444 PST_3445     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3561206 3561207 PST_3445 PST_3446     TRUE 0.983 -25.000 1.000 NA   NA
 3561207 3561208 PST_3446 PST_3447     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3561208 3561209 PST_3447 PST_3448     TRUE 0.950 14.000 0.250 1.000   NA
 3561209 3561210 PST_3448 PST_3449     FALSE 0.030 228.000 0.000 NA   NA
 3561210 3561211 PST_3449 PST_3450     FALSE 0.216 62.000 0.000 NA   NA
 3561212 3561213 PST_3451 PST_3452     FALSE 0.220 66.000 0.000 NA   NA
 3561213 3561214 PST_3452 PST_3453     FALSE 0.048 197.000 0.000 NA   NA
 3561214 3561215 PST_3453 PST_3454     TRUE 0.765 9.000 0.000 NA   NA
 3561215 3561216 PST_3454 PST_3455     FALSE 0.200 83.000 0.000 NA   NA
 3561216 3561217 PST_3455 PST_3456     FALSE 0.215 72.000 0.000 NA   NA
 3561217 3561218 PST_3456 PST_3457     FALSE 0.245 46.000 0.000 NA   NA
 3561219 3561220 PST_3458 PST_3459     FALSE 0.007 410.000 0.000 NA   NA
 3561220 3561221 PST_3459 PST_3460     TRUE 0.986 -3.000 0.250 NA   NA
 3561221 3561222 PST_3460 PST_3461     FALSE 0.011 327.000 0.000 NA   NA
 3561222 3561223 PST_3461 PST_3462     TRUE 0.965 -25.000 0.515 NA   NA
 3561223 3561224 PST_3462 PST_3463     TRUE 0.733 126.000 0.394 NA   NA
 3561224 3561225 PST_3463 PST_3464     FALSE 0.039 210.000 0.000 NA   NA
 3561225 3561226 PST_3464 PST_3465     FALSE 0.004 837.000 0.000 NA   NA
 3561226 3561227 PST_3465 PST_3466     FALSE 0.121 137.000 0.000 NA   NA
 3561228 3561229 PST_3467 PST_3468     FALSE 0.005 471.000 0.000 NA   NA
 3561229 3561230 PST_3468 PST_3469     FALSE 0.175 97.000 0.000 NA   NA
 3561231 3561232 PST_3470 PST_3471     TRUE 0.955 -10.000 0.250 NA   NA
 3561232 3561233 PST_3471 PST_3472     TRUE 0.747 122.000 0.400 NA   NA
 3561233 3561234 PST_3472 PST_3473     TRUE 0.982 -3.000 0.200 NA   NA
 3561234 3561235 PST_3473 PST_3474     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 3561235 3561236 PST_3474 PST_3475     FALSE 0.030 228.000 0.000 NA   NA
 3561237 3561238 PST_3476 PST_3477     FALSE 0.418 110.000 0.000 0.100 N NA
 3561239 3561240 PST_3478 PST_3479 malK-2   TRUE 0.817 77.000 0.111 1.000 Y NA
 3561240 3561241 PST_3479 PST_3480     TRUE 0.492 85.000 0.069 1.000   NA
 3561243 3561244 PST_3482 PST_3483     FALSE 0.160 137.000 0.022 NA   NA
 3561244 3561245 PST_3483 PST_3484   malG FALSE 0.402 43.000 0.033 1.000 N NA
 3561245 3561246 PST_3484 PST_3485 malG malF TRUE 0.998 11.000 0.814 0.040 Y NA
 3561246 3561247 PST_3485 PST_3486 malF malE TRUE 0.954 -25.000 0.120 1.000 Y NA
 3561248 3561249 PST_3487 PST_3488 malS   TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3561251 3561252 PST_3490 PST_3491 lamB   FALSE 0.441 -49.000 0.000 NA   NA
 3561253 3561254 PST_3492 PST_3493 sugE   FALSE 0.068 188.000 0.000 1.000   NA
 3561254 3561255 PST_3493 PST_3494     TRUE 0.906 13.000 0.008 0.044   NA
 3561255 3561256 PST_3494 PST_3495   eda-1 TRUE 0.575 69.000 0.008 0.050 N NA
 3561256 3561257 PST_3495 PST_3496 eda-1   TRUE 0.910 19.000 0.064 1.000 Y NA
 3561257 3561258 PST_3496 PST_3497     TRUE 0.972 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 3561260 3561261 PST_3499 PST_3500 glk   TRUE 0.975 -3.000 0.008 1.000 Y NA
 3561261 3561262 PST_3500 PST_3501     FALSE 0.159 98.000 0.008 NA   NA
 3561262 3561263 PST_3501 PST_3502     FALSE 0.215 72.000 0.000 NA   NA
 3561264 3561265 PST_3503 PST_3504     TRUE 0.992 0.000 0.386 NA   NA
 3561265 3561266 PST_3504 PST_3505     TRUE 0.967 20.000 0.775 NA   NA
 3561266 3561267 PST_3505 PST_3506     TRUE 0.985 -3.000 0.233 1.000 N NA
 3561268 3561269 PST_3507 PST_3508     TRUE 0.652 69.000 0.152 NA   NA
 3561269 3561270 PST_3508 PST_3509     TRUE 0.815 73.000 0.356 NA   NA
 3561271 3561272 PST_3510 PST_3511 dnrS   FALSE 0.400 49.000 0.038 NA   NA
 3561273 3561274 PST_3512 PST_3513     TRUE 0.998 15.000 0.948 0.003 Y NA
 3561274 3561275 PST_3513 PST_3514     FALSE 0.043 204.000 0.000 NA   NA
 3561275 3561276 PST_3514 PST_3516   norR FALSE 0.416 74.000 0.049 NA   NA
 3561277 3561278 PST_3515 PST_3517 dnrN dnrO TRUE 0.980 -3.000 0.182 NA   NA
 3561278 3561279 PST_3517 PST_3518 dnrO dnrD TRUE 0.680 135.000 0.333 NA   NA
 3561279 3561280 PST_3518 PST_3519 dnrD dnrP TRUE 0.989 2.000 0.333 NA   NA
 3561281 3561282 PST_3520 PST_3521 norD norB TRUE 0.935 84.000 0.118 0.001 Y NA
 3561282 3561283 PST_3521 PST_3522 norB norC TRUE 0.978 44.000 0.794 0.001   NA
 3561283 3561284 PST_3522 PST_3523 norC nirH FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 3561284 3561285 PST_3523 PST_3524 nirH nirG TRUE 0.984 -25.000 0.483 NA Y NA
 3561285 3561286 PST_3524 PST_3525 nirG nirL TRUE 0.986 -7.000 0.241 NA Y NA
 3561286 3561287 PST_3525 PST_3526 nirL nirD TRUE 0.992 -3.000 0.167 NA Y NA
 3561287 3561288 PST_3526 PST_3527 nirD nirF TRUE 0.986 2.000 0.256 NA   NA
 3561288 3561289 PST_3527 PST_3528 nirF nirC TRUE 0.996 -3.000 0.372 0.014   NA
 3561289 3561290 PST_3528 PST_3529 nirC nirM TRUE 0.908 19.000 0.062 0.014   NA
 3561290 3561291 PST_3529 PST_3530 nirM nirB FALSE 0.012 321.000 0.000 NA   NA
 3561291 3561292 PST_3530 PST_3531 nirB nirT FALSE 0.392 111.000 0.070 NA   NA
 3561292 3561293 PST_3531 PST_3532 nirT nirS TRUE 0.903 70.000 0.070 0.014 Y NA
 3561294 3561295 PST_3533 PST_3534 nirQ nirO TRUE 0.857 44.000 0.071 0.001   NA
 3561295 3561296 PST_3534 PST_3535 nirO nirP TRUE 0.990 11.000 0.750 NA   NA
 3561296 3561297 PST_3535 PST_3536 nirP nirJ FALSE 0.312 159.000 0.087 NA   NA
 3561297 3561298 PST_3536 PST_3537 nirJ nirE TRUE 0.747 62.000 0.217 1.000   NA
 3561298 3561299 PST_3537 PST_3538 nirE nirN TRUE 0.922 -9.000 0.125 1.000 N NA
 3561299 3561300 PST_3538 PST_3539 nirN nirY FALSE 0.023 237.000 0.000 NA N NA
 3561301 3561302 PST_3540 PST_3541     FALSE 0.057 198.000 0.000 1.000   NA
 3561302 3561303 PST_3541 PST_3542     FALSE 0.023 271.000 0.000 1.000   NA
 3561303 3561304 PST_3542 PST_3543     TRUE 0.690 13.000 0.000 1.000   NA
 3561304 3561305 PST_3543 PST_3544     FALSE 0.431 119.000 0.100 NA N NA
 3561305 3561306 PST_3544 PST_3545   tatA-1 FALSE 0.010 315.000 0.000 NA N NA
 3561306 3561307 PST_3545 PST_3546 tatA-1 nosL TRUE 0.739 33.000 0.154 NA N NA
 3561307 3561308 PST_3546 PST_3547 nosL nosY TRUE 0.782 26.000 0.135 NA   NA
 3561308 3561309 PST_3547 PST_3548 nosY nosF TRUE 0.974 -3.000 0.135 NA   NA
 3561309 3561310 PST_3548 PST_3549 nosF nosD TRUE 0.996 -3.000 0.750 1.000 N NA
 3561310 3561311 PST_3549 PST_3550 nosD nosZ FALSE 0.225 231.000 0.035 0.004 N NA
 3561311 3561312 PST_3550 PST_3551 nosZ nosR TRUE 0.743 68.000 0.088 0.099 N NA
 3561312 3561313 PST_3551 PST_3552 nosR   FALSE 0.022 261.000 0.000 1.000 N NA
 3561313 3561314 PST_3552 PST_3553     FALSE 0.364 184.000 0.200 NA   NA
 3561314 3561315 PST_3553 PST_3554     TRUE 0.712 71.000 0.200 NA   NA
 3561317 3561318 PST_3556 PST_3558     FALSE 0.147 366.000 0.000 0.014 Y NA
 3561319 3561320 PST_3557 PST_3559   sda-2 TRUE 0.464 50.000 0.053 1.000 N NA
 3561320 3561321 PST_3559 PST_3560 sda-2   TRUE 0.662 43.000 0.118 1.000 N NA
 3561323 3561324 PST_3562 PST_3563 phhA phhB TRUE 0.553 140.000 0.203 1.000 N NA
 3561324 3561325 PST_3563 PST_3564 phhB phhC TRUE 0.936 0.000 0.037 1.000 N NA
 3561325 3561326 PST_3564 PST_3565 phhC   TRUE 0.853 22.000 0.200 NA N NA
 3561326 3561327 PST_3565 PST_3566   cynS FALSE 0.163 85.000 0.011 NA N NA
 3561328 3561329 PST_3567 PST_3568   katB TRUE 0.669 112.000 0.250 NA   NA
 3561330 3561331 PST_3569 PST_3570 codB codA TRUE 0.980 14.000 0.250 1.000 Y NA
 3561332 3561333 PST_3571 PST_3572     FALSE 0.020 263.000 0.000 NA   NA
 3561334 3561335 PST_3573 PST_3574   phnA FALSE 0.101 114.000 0.004 NA N NA
 3561340 3561341 PST_3579 PST_3580     TRUE 0.998 0.000 0.600 0.040   NA
 3561341 3561342 PST_3580 PST_3581     TRUE 0.983 -7.000 0.500 1.000   NA
 3561342 3561343 PST_3581 PST_3583     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000   NA
 3561343 3561344 PST_3583 PST_3582     TRUE 0.904 -465.000 0.375 NA   NA
 3561344 3561345 PST_3582 PST_3584     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 3561345 3561346 PST_3584 PST_3585     FALSE 0.032 224.000 0.000 NA   NA
 3561347 3561348 PST_3586 PST_3587     TRUE 0.992 -3.000 0.488 NA   NA
 3561351 3561352 PST_3590 PST_3591     TRUE 0.826 4.000 0.000 NA   NA
 3561353 3561354 PST_3592 PST_3593     TRUE 0.889 37.000 0.000 0.005 Y NA
 3561354 3561355 PST_3593 PST_3594     TRUE 0.526 87.000 0.083 1.000   NA
 3561356 3561357 PST_3595 PST_3596     FALSE 0.155 107.000 0.000 NA   NA
 3561358 3561359 PST_3597 PST_3598     TRUE 0.995 0.000 0.621 NA N NA
 3561359 3561360 PST_3598 PST_3599     TRUE 0.982 10.000 0.442 NA N NA
 3561360 3561361 PST_3599 PST_3600     TRUE 0.824 66.000 0.365 NA   NA
 3561361 3561362 PST_3600 PST_3601     TRUE 0.971 11.000 0.256 1.000   NA
 3561362 3561363 PST_3601 PST_3602     TRUE 0.990 14.000 0.625 0.044   NA
 3561363 3561364 PST_3602 PST_3603     FALSE 0.012 361.000 0.000 1.000   NA
 3561364 3561365 PST_3603 PST_3604     TRUE 0.903 10.000 0.061 NA   NA
 3561365 3561366 PST_3604 PST_3605     TRUE 0.990 0.000 0.333 NA   NA
 3561368 3561369 PST_3607 PST_3608   add FALSE 0.007 459.000 0.000 1.000   NA
 3561369 3561370 PST_3608 PST_3609 add   FALSE 0.173 101.000 0.013 NA   NA
 3561374 3561375 PST_3613 PST_3614     TRUE 0.992 14.000 0.667 0.004 N NA
 3561375 3561376 PST_3614 PST_3615     TRUE 0.586 105.000 0.167 1.000 N NA
 3561378 3561379 PST_3617 PST_3618     TRUE 0.968 5.000 0.174 NA N NA
 3561379 3561380 PST_3618 PST_3619     TRUE 0.978 -3.000 0.174 NA N NA
 3561382 3561383 PST_3621 PST_3622     TRUE 0.483 22.000 0.021 NA   NA
 3561383 3561384 PST_3622 PST_3623     FALSE 0.190 89.000 0.000 NA   NA
 3561385 3561386 PST_3624 PST_3625     FALSE 0.025 344.000 0.042 1.000 N NA
 3561386 3561387 PST_3625 PST_3626   ampD TRUE 0.972 16.000 0.249 1.000 Y NA
 3561387 3561388 PST_3626 PST_3627 ampD   FALSE 0.151 104.000 0.007 1.000 N NA
 3561390 3561391 PST_3629 PST_3630   trpS FALSE 0.214 169.000 0.061 NA   NA
 3561391 3561392 PST_3630 PST_3631 trpS   FALSE 0.462 52.000 0.048 1.000   NA
 3561395 3561396 PST_3634 PST_3635   ndh FALSE 0.010 344.000 0.000 NA   NA
 3561396 3561397 PST_3635 PST_3636 ndh   FALSE 0.392 24.000 0.000 NA   NA
 3561398 3561399 PST_3637 PST_3638     TRUE 0.797 6.000 0.000 NA   NA
 3561399 3561400 PST_3638 PST_3639     TRUE 0.747 10.000 0.000 NA   NA
 3561400 3561401 PST_3639 PST_3640   clpB FALSE 0.056 188.000 0.000 NA   NA
 3561401 3561402 PST_3640 PST_3641 clpB   FALSE 0.343 160.000 0.108 NA   NA
 3561402 3561403 PST_3641 PST_3642   rluD TRUE 0.979 -3.000 0.168 NA   NA
 3561404 3561405 PST_3643 PST_3644 comL   FALSE 0.316 35.000 0.015 NA   NA
 3561405 3561406 PST_3644 PST_3645   pilS TRUE 0.945 -10.000 0.206 NA   NA
 3561406 3561407 PST_3645 PST_3646 pilS pilR TRUE 0.970 77.000 0.556 0.094 Y NA
 3561409 3561410 PST_3648 PST_3649   ctpL TRUE 0.868 128.000 0.350 1.000 Y NA
 3561411 3561412 PST_3650 PST_3651   dadX FALSE 0.003 2109.000 0.000 1.000 N NA
 3561412 3561413 PST_3651 PST_3652 dadX dnaB FALSE 0.176 125.000 0.020 1.000 N NA
 3561413 3561414 PST_3652 PST_3653 dnaB rplI FALSE 0.106 234.000 0.074 1.000 N NA
 3561414 3561415 PST_3653 PST_3654 rplI   TRUE 0.570 22.000 0.034 NA   NA
 3561415 3561416 PST_3654 PST_3655   rpsR FALSE 0.446 35.000 0.034 NA   NA
 3561416 3561417 PST_3655 PST_3656 rpsR rpsF TRUE 0.980 29.000 0.319 0.010 Y NA
 3561417 3561418 PST_3656 PST_3657 rpsF   FALSE 0.067 180.000 0.000 1.000 N NA
 3561418 3561419 PST_3657 PST_3658     FALSE 0.078 173.000 0.000 1.000 N NA
 3561419 3561420 PST_3658 PST_3659   vacB TRUE 0.991 -3.000 0.147 0.014 N NA
 3561424 3561425 PST_3663 PST_3664 purA hisZ FALSE 0.317 184.000 0.161 1.000 N NA
 3561425 3561426 PST_3664 PST_3665 hisZ hflC FALSE 0.039 285.000 0.045 1.000 N NA
 3561426 3561427 PST_3665 PST_3666 hflC hflK TRUE 1.000 0.000 0.947 0.008 Y NA
 3561427 3561428 PST_3666 PST_3667 hflK hflX TRUE 0.804 99.000 0.184 0.056   NA
 3561428 3561429 PST_3667 PST_3668 hflX hfq TRUE 0.661 54.000 0.141 1.000   NA
 3561429 3561430 PST_3668 PST_3669 hfq miaA TRUE 0.854 93.000 0.531 1.000   NA
 3561430 3561431 PST_3669 PST_3670 miaA mutL TRUE 0.831 55.000 0.188 0.094 N NA
 3561431 3561432 PST_3670 PST_3671 mutL amiB TRUE 0.914 -3.000 0.030 1.000 N NA
 3561432 3561433 PST_3671 PST_3672 amiB   TRUE 0.881 6.000 0.033 NA   NA
 3561433 3561434 PST_3672 PST_3673     TRUE 0.905 -12.000 0.118 NA   NA
 3561436 3561437 PST_3675 PST_3676 ftsH-2   FALSE 0.450 130.000 0.118 NA   NA
 3561437 3561438 PST_3676 PST_3677     TRUE 0.956 2.000 0.070 NA   NA
 3561438 3561439 PST_3677 PST_3678   mpl FALSE 0.123 312.000 0.235 1.000 N NA
 3561440 3561441 PST_3679 PST_3680     FALSE 0.053 199.000 0.016 1.000 N NA
 3561441 3561442 PST_3680 PST_3681   eutB TRUE 0.991 12.000 0.407 1.000 Y NA
 3561442 3561443 PST_3681 PST_3682 eutB eutC TRUE 0.983 122.000 0.859 0.000 Y NA
 3561444 3561445 PST_3683 PST_3684     FALSE 0.167 85.000 0.000 NA N NA
 3561446 3561447 PST_3685 PST_3686   ppa-1 FALSE 0.196 109.000 0.022 NA   NA
 3561449 3561450 PST_3688 PST_3689     FALSE 0.113 143.000 0.000 NA   NA
 3561450 3561451 PST_3689 PST_3690     TRUE 0.785 -6.000 0.000 1.000   NA
 3561451 3561452 PST_3690 PST_3691     FALSE 0.401 -724.000 0.000 1.000   NA
 3561452 3561453 PST_3691 PST_3692     FALSE 0.199 87.000 0.000 1.000 N NA
 3561454 3561455 PST_3693 PST_3694     TRUE 0.979 16.000 0.840 NA   NA
 3561455 3561456 PST_3694 PST_3695     TRUE 0.988 11.000 0.667 NA   NA
 3561456 3561457 PST_3695 PST_3696     TRUE 0.852 46.000 0.000 0.022 Y NA
 3561457 3561458 PST_3696 PST_3697     FALSE 0.088 163.000 0.000 NA   NA
 3561459 3561460 PST_3698 PST_3699     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA N NA
 3561460 3561461 PST_3699 PST_3700     TRUE 0.600 24.000 0.048 NA N NA
 3561461 3561462 PST_3700 PST_3701     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3561462 3561463 PST_3701 PST_3702     TRUE 0.963 -3.000 0.083 NA   NA
 3561463 3561464 PST_3702 PST_3703     TRUE 0.855 -16.000 0.083 NA   NA
 3561464 3561465 PST_3703 PST_3704   xseB FALSE 0.181 56.000 0.002 NA   NA
 3561465 3561466 PST_3704 PST_3705 xseB ispA TRUE 0.982 0.000 0.177 1.000 N NA
 3561466 3561467 PST_3705 PST_3706 ispA dxs TRUE 0.851 108.000 0.246 1.000 Y NA
 3561469 3561470 PST_3708 PST_3709     FALSE 0.208 77.000 0.000 NA   NA
 3561473 3561474 PST_3712 PST_3713     FALSE 0.215 60.000 0.000 NA   NA
 3561475 3561476 PST_3714 PST_3715     TRUE 0.507 26.000 0.031 NA   NA
 3561476 3561477 PST_3715 PST_3716     FALSE 0.013 316.000 0.000 1.000 N NA
 3561477 3561478 PST_3716 PST_3717     FALSE 0.220 149.000 0.036 1.000   NA
 3561478 3561479 PST_3717 PST_3718     FALSE 0.105 206.000 0.051 NA   NA
 3561481 3561482 PST_3720 PST_3721     TRUE 0.859 177.000 0.654 1.000 Y NA
 3561482 3561483 PST_3721 PST_3722     TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.039 Y NA
 3561483 3561484 PST_3722 PST_3723     TRUE 0.996 -3.000 0.823 1.000   NA
 3561484 3561485 PST_3723 PST_3724     TRUE 0.934 126.000 0.731 0.016   NA
 3561485 3561486 PST_3724 PST_3725     FALSE 0.447 105.000 0.014 0.094 N NA
 3561486 3561487 PST_3725 PST_3726   ureD-2 FALSE 0.411 -67.000 0.000 1.000 N NA
 3561487 3561488 PST_3726 PST_3727 ureD-2 ureA TRUE 0.924 141.000 0.664 0.002 N NA
 3561488 3561489 PST_3727 PST_3728 ureA ureB TRUE 0.509 563.000 0.595 0.001 Y NA
 3561489 3561490 PST_3728 PST_3729 ureB ureC TRUE 0.992 21.000 0.486 0.001 Y NA
 3561490 3561491 PST_3729 PST_3730 ureC   FALSE 0.133 130.000 0.000 1.000 N NA
 3561494 3561495 PST_3733 PST_3734 bcpA   TRUE 0.721 101.000 0.069 1.000 Y NA
 3561496 3561497 PST_3735 PST_3736   ureE FALSE 0.101 164.000 0.010 1.000   NA
 3561497 3561498 PST_3736 PST_3737 ureE ureF-2 TRUE 0.976 96.000 0.560 0.002 Y NA
 3561498 3561499 PST_3737 PST_3738 ureF-2 ureG FALSE 0.382 1109.000 0.550 0.002 Y NA
 3561499 3561500 PST_3738 PST_3739 ureG ureJ TRUE 0.853 30.000 0.068 NA Y NA
 3561500 3561501 PST_3739 PST_3740 ureJ   FALSE 0.090 162.000 0.000 NA   NA
 3561501 3561502 PST_3740 PST_3741     TRUE 0.747 10.000 0.000 NA   NA
 3561503 3561504 PST_3742 PST_3743 amn   TRUE 0.564 15.000 0.011 1.000 N NA
 3561505 3561506 PST_3744 PST_3745     FALSE 0.122 154.000 0.000 1.000   NA
 3561506 3561507 PST_3745 PST_3746     TRUE 0.845 115.000 0.664 NA   NA
 3561507 3561508 PST_3746 PST_3747     TRUE 0.996 -3.000 0.891 NA   NA
 3561508 3561509 PST_3747 PST_3748     TRUE 0.997 -3.000 0.948 NA   NA
 3561509 3561510 PST_3748 PST_3749     TRUE 0.985 20.000 0.711 NA Y NA
 3561510 3561511 PST_3749 PST_3750     TRUE 0.939 121.000 0.773 NA Y NA
 3561511 3561512 PST_3750 PST_3751     TRUE 0.998 1.000 0.882 NA Y NA
 11502314 3561507   PST_3746     FALSE NA 4827.000 0.000 NA   NA
 11644677 3561507   PST_3746     FALSE NA 4827.000 0.000 NA   NA
 11787069 3561507   PST_3746     FALSE NA 4827.000 0.000 NA   NA
 11502315 3561507   PST_3746     FALSE NA 4859.000 0.000 NA   NA
 11644678 3561507   PST_3746     FALSE NA 4859.000 0.000 NA   NA
 11787070 3561507   PST_3746     FALSE NA 4859.000 0.000 NA   NA
 11502316 3561507   PST_3746     FALSE NA 4895.000 0.000 NA   NA
 11644679 3561507   PST_3746     FALSE NA 4895.000 0.000 NA   NA
 11787071 3561507   PST_3746     FALSE NA 4895.000 0.000 NA   NA
 11502317 3561507   PST_3746     FALSE NA 4927.000 0.000 NA   NA
 11644680 3561507   PST_3746     FALSE NA 4927.000 0.000 NA   NA
 11787072 3561507   PST_3746     FALSE NA 4927.000 0.000 NA   NA
 11502318 3561507   PST_3746     FALSE NA 4961.000 0.000 NA   NA
 11644681 3561507   PST_3746     FALSE NA 4961.000 0.000 NA   NA
 11787073 3561507   PST_3746     FALSE NA 4961.000 0.000 NA   NA
 11502319 3561507   PST_3746     FALSE NA 4993.000 0.000 NA   NA
 11644682 3561507   PST_3746     FALSE NA 4993.000 0.000 NA   NA
 11787074 3561507   PST_3746     FALSE NA 4993.000 0.000 NA   NA
 11502320 3561507   PST_3746     FALSE NA 5028.000 0.000 NA   NA
 11644683 3561507   PST_3746     FALSE NA 5028.000 0.000 NA   NA
 11787075 3561507   PST_3746     FALSE NA 5028.000 0.000 NA   NA
 11502321 3561507   PST_3746     FALSE NA 5060.000 0.000 NA   NA
 11644684 3561507   PST_3746     FALSE NA 5060.000 0.000 NA   NA
 11787076 3561507   PST_3746     FALSE NA 5060.000 0.000 NA   NA
 11502322 3561507   PST_3746     FALSE NA 5098.000 0.000 NA   NA
 11644685 3561507   PST_3746     FALSE NA 5098.000 0.000 NA   NA
 11787077 3561507   PST_3746     FALSE NA 5098.000 0.000 NA   NA
 11502323 3561507   PST_3746     FALSE NA 5130.000 0.000 NA   NA
 11644686 3561507   PST_3746     FALSE NA 5130.000 0.000 NA   NA
 11787078 3561507   PST_3746     FALSE NA 5130.000 0.000 NA   NA
 11502324 3561507   PST_3746     FALSE NA 5164.000 0.000 NA   NA
 11644687 3561507   PST_3746     FALSE NA 5164.000 0.000 NA   NA
 11787079 3561507   PST_3746     FALSE NA 5164.000 0.000 NA   NA
 11502325 3561507   PST_3746     FALSE NA 5196.000 0.000 NA   NA
 11644688 3561507   PST_3746     FALSE NA 5196.000 0.000 NA   NA
 11787080 3561507   PST_3746     FALSE NA 5196.000 0.000 NA   NA
 11502326 3561507   PST_3746     FALSE NA 5230.000 0.000 NA   NA
 11644689 3561507   PST_3746     FALSE NA 5230.000 0.000 NA   NA
 11787081 3561507   PST_3746     FALSE NA 5230.000 0.000 NA   NA
 11502327 3561507   PST_3746     FALSE NA 5262.000 0.000 NA   NA
 11644690 3561507   PST_3746     FALSE NA 5262.000 0.000 NA   NA
 11787082 3561507   PST_3746     FALSE NA 5262.000 0.000 NA   NA
 11502328 3561507   PST_3746     FALSE NA 5296.000 0.000 NA   NA
 11644691 3561507   PST_3746     FALSE NA 5296.000 0.000 NA   NA
 11787083 3561507   PST_3746     FALSE NA 5296.000 0.000 NA   NA
 11502329 3561507   PST_3746     FALSE NA 5328.000 0.000 NA   NA
 11644692 3561507   PST_3746     FALSE NA 5328.000 0.000 NA   NA
 11787084 3561507   PST_3746     FALSE NA 5328.000 0.000 NA   NA
 11502330 3561507   PST_3746     FALSE NA 5362.000 0.000 NA   NA
 11644693 3561507   PST_3746     FALSE NA 5362.000 0.000 NA   NA
 11787085 3561507   PST_3746     FALSE NA 5362.000 0.000 NA   NA
 11502331 3561507   PST_3746     FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11644694 3561507   PST_3746     FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11787086 3561507   PST_3746     FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11502332 3561507   PST_3746     FALSE NA 5429.000 0.000 NA   NA
 11644695 3561507   PST_3746     FALSE NA 5429.000 0.000 NA   NA
 11787087 3561507   PST_3746     FALSE NA 5429.000 0.000 NA   NA
 11502333 3561507   PST_3746     FALSE NA 5461.000 0.000 NA   NA
 11644696 3561507   PST_3746     FALSE NA 5461.000 0.000 NA   NA
 11787088 3561507   PST_3746     FALSE NA 5461.000 0.000 NA   NA
 11502334 3561507   PST_3746     FALSE NA 5495.000 0.000 NA   NA
 11644697 3561507   PST_3746     FALSE NA 5495.000 0.000 NA   NA
 11787089 3561507   PST_3746     FALSE NA 5495.000 0.000 NA   NA
 11502335 3561507   PST_3746     FALSE NA 5527.000 0.000 NA   NA
 11644698 3561507   PST_3746     FALSE NA 5527.000 0.000 NA   NA
 11787090 3561507   PST_3746     FALSE NA 5527.000 0.000 NA   NA
 11502336 3561507   PST_3746     FALSE NA 5561.000 0.000 NA   NA
 11644699 3561507   PST_3746     FALSE NA 5561.000 0.000 NA   NA
 11787091 3561507   PST_3746     FALSE NA 5561.000 0.000 NA   NA
 11502337 3561507   PST_3746     FALSE NA 5593.000 0.000 NA   NA
 11644700 3561507   PST_3746     FALSE NA 5593.000 0.000 NA   NA
 11787092 3561507   PST_3746     FALSE NA 5593.000 0.000 NA   NA
 11502338 3561507   PST_3746     FALSE NA 5627.000 0.000 NA   NA
 11644701 3561507   PST_3746     FALSE NA 5627.000 0.000 NA   NA
 11787093 3561507   PST_3746     FALSE NA 5627.000 0.000 NA   NA
 11502339 3561507   PST_3746     FALSE NA 5659.000 0.000 NA   NA
 11644702 3561507   PST_3746     FALSE NA 5659.000 0.000 NA   NA
 11787094 3561507   PST_3746     FALSE NA 5659.000 0.000 NA   NA
 11502340 3561507   PST_3746     FALSE NA 5693.000 0.000 NA   NA
 11644703 3561507   PST_3746     FALSE NA 5693.000 0.000 NA   NA
 11787095 3561507   PST_3746     FALSE NA 5693.000 0.000 NA   NA
 11502341 3561507   PST_3746     FALSE NA 5725.000 0.000 NA   NA
 11644704 3561507   PST_3746     FALSE NA 5725.000 0.000 NA   NA
 11787096 3561507   PST_3746     FALSE NA 5725.000 0.000 NA   NA
 11502342 3561507   PST_3746     FALSE NA 5760.000 0.000 NA   NA
 11644705 3561507   PST_3746     FALSE NA 5760.000 0.000 NA   NA
 11787097 3561507   PST_3746     FALSE NA 5760.000 0.000 NA   NA
 11502343 3561507   PST_3746     FALSE NA 5792.000 0.000 NA   NA
 11644706 3561507   PST_3746     FALSE NA 5792.000 0.000 NA   NA
 11787098 3561507   PST_3746     FALSE NA 5792.000 0.000 NA   NA
 11502344 3561507   PST_3746     FALSE NA 5826.000 0.000 NA   NA
 11644707 3561507   PST_3746     FALSE NA 5826.000 0.000 NA   NA
 11787099 3561507   PST_3746     FALSE NA 5826.000 0.000 NA   NA
 11502345 3561507   PST_3746     FALSE NA 5858.000 0.000 NA   NA
 11644708 3561507   PST_3746     FALSE NA 5858.000 0.000 NA   NA
 11787100 3561507   PST_3746     FALSE NA 5858.000 0.000 NA   NA
 11502346 3561507   PST_3746     FALSE NA 5892.000 0.000 NA   NA
 11644709 3561507   PST_3746     FALSE NA 5892.000 0.000 NA   NA
 11787101 3561507   PST_3746     FALSE NA 5892.000 0.000 NA   NA
 11502347 3561507   PST_3746     FALSE NA 5924.000 0.000 NA   NA
 11644710 3561507   PST_3746     FALSE NA 5924.000 0.000 NA   NA
 11787102 3561507   PST_3746     FALSE NA 5924.000 0.000 NA   NA
 11502348 3561507   PST_3746     FALSE NA 5961.000 0.000 NA   NA
 11644711 3561507   PST_3746     FALSE NA 5961.000 0.000 NA   NA
 11787103 3561507   PST_3746     FALSE NA 5961.000 0.000 NA   NA
 11502349 3561507   PST_3746     FALSE NA 5993.000 0.000 NA   NA
 11644712 3561507   PST_3746     FALSE NA 5993.000 0.000 NA   NA
 11787104 3561507   PST_3746     FALSE NA 5993.000 0.000 NA   NA
 11502350 3561507   PST_3746     FALSE NA 6027.000 0.000 NA   NA
 11644713 3561507   PST_3746     FALSE NA 6027.000 0.000 NA   NA
 11787105 3561507   PST_3746     FALSE NA 6027.000 0.000 NA   NA
 11502351 3561507   PST_3746     FALSE NA 6059.000 0.000 NA   NA
 11644714 3561507   PST_3746     FALSE NA 6059.000 0.000 NA   NA
 11787106 3561507   PST_3746     FALSE NA 6059.000 0.000 NA   NA
 11502352 3561507   PST_3746     FALSE NA 6093.000 0.000 NA   NA
 11644715 3561507   PST_3746     FALSE NA 6093.000 0.000 NA   NA
 11787107 3561507   PST_3746     FALSE NA 6093.000 0.000 NA   NA
 11502353 3561507   PST_3746     FALSE NA 6125.000 0.000 NA   NA
 11644716 3561507   PST_3746     FALSE NA 6125.000 0.000 NA   NA
 11787108 3561507   PST_3746     FALSE NA 6125.000 0.000 NA   NA
 11502354 3561507   PST_3746     FALSE NA 6158.000 0.000 NA   NA
 11644717 3561507   PST_3746     FALSE NA 6158.000 0.000 NA   NA
 11787109 3561507   PST_3746     FALSE NA 6158.000 0.000 NA   NA
 11502355 3561507   PST_3746     FALSE NA 6190.000 0.000 NA   NA
 11644718 3561507   PST_3746     FALSE NA 6190.000 0.000 NA   NA
 11787110 3561507   PST_3746     FALSE NA 6190.000 0.000 NA   NA
 11502356 3561507   PST_3746     FALSE NA 6224.000 0.000 NA   NA
 11644719 3561507   PST_3746     FALSE NA 6224.000 0.000 NA   NA
 11787111 3561507   PST_3746     FALSE NA 6224.000 0.000 NA   NA
 11502357 3561507   PST_3746     FALSE NA 6256.000 0.000 NA   NA
 11644720 3561507   PST_3746     FALSE NA 6256.000 0.000 NA   NA
 11787112 3561507   PST_3746     FALSE NA 6256.000 0.000 NA   NA
 11502358 3561507   PST_3746     FALSE NA 6290.000 0.000 NA   NA
 11644721 3561507   PST_3746     FALSE NA 6290.000 0.000 NA   NA
 11787113 3561507   PST_3746     FALSE NA 6290.000 0.000 NA   NA
 11502359 3561507   PST_3746     FALSE NA 6322.000 0.000 NA   NA
 11644722 3561507   PST_3746     FALSE NA 6322.000 0.000 NA   NA
 11787114 3561507   PST_3746     FALSE NA 6322.000 0.000 NA   NA
 11502360 3561507   PST_3746     FALSE NA 6355.000 0.000 NA   NA
 11644723 3561507   PST_3746     FALSE NA 6355.000 0.000 NA   NA
 11787115 3561507   PST_3746     FALSE NA 6355.000 0.000 NA   NA
 11502361 3561507   PST_3746     FALSE NA 6387.000 0.000 NA   NA
 11644724 3561507   PST_3746     FALSE NA 6387.000 0.000 NA   NA
 11787116 3561507   PST_3746     FALSE NA 6387.000 0.000 NA   NA
 11502362 3561507   PST_3746     FALSE NA 6422.000 0.000 NA   NA
 11644725 3561507   PST_3746     FALSE NA 6422.000 0.000 NA   NA
 11787117 3561507   PST_3746     FALSE NA 6422.000 0.000 NA   NA
 11502363 3561507   PST_3746     FALSE NA 6454.000 0.000 NA   NA
 11644726 3561507   PST_3746     FALSE NA 6454.000 0.000 NA   NA
 11787118 3561507   PST_3746     FALSE NA 6454.000 0.000 NA   NA
 11502364 3561507   PST_3746     FALSE NA 6489.000 0.000 NA   NA
 11644727 3561507   PST_3746     FALSE NA 6489.000 0.000 NA   NA
 11787119 3561507   PST_3746     FALSE NA 6489.000 0.000 NA   NA
 11502365 3561507   PST_3746     FALSE NA 6521.000 0.000 NA   NA
 11644728 3561507   PST_3746     FALSE NA 6521.000 0.000 NA   NA
 11787120 3561507   PST_3746     FALSE NA 6521.000 0.000 NA   NA
 11502366 3561507   PST_3746     FALSE NA 6556.000 0.000 NA   NA
 11644729 3561507   PST_3746     FALSE NA 6556.000 0.000 NA   NA
 11787121 3561507   PST_3746     FALSE NA 6556.000 0.000 NA   NA
 11502367 3561507   PST_3746     FALSE NA 6588.000 0.000 NA   NA
 11644730 3561507   PST_3746     FALSE NA 6588.000 0.000 NA   NA
 11787122 3561507   PST_3746     FALSE NA 6588.000 0.000 NA   NA
 11502368 3561507   PST_3746     FALSE NA 6625.000 0.000 NA   NA
 11644731 3561507   PST_3746     FALSE NA 6625.000 0.000 NA   NA
 11787123 3561507   PST_3746     FALSE NA 6625.000 0.000 NA   NA
 11502369 3561507   PST_3746     FALSE NA 6657.000 0.000 NA   NA
 11644732 3561507   PST_3746     FALSE NA 6657.000 0.000 NA   NA
 11787124 3561507   PST_3746     FALSE NA 6657.000 0.000 NA   NA
 11502370 3561507   PST_3746     FALSE NA 6692.000 0.000 NA   NA
 11644733 3561507   PST_3746     FALSE NA 6692.000 0.000 NA   NA
 11787125 3561507   PST_3746     FALSE NA 6692.000 0.000 NA   NA
 11502371 3561507   PST_3746     FALSE NA 6724.000 0.000 NA   NA
 11644734 3561507   PST_3746     FALSE NA 6724.000 0.000 NA   NA
 11787126 3561507   PST_3746     FALSE NA 6724.000 0.000 NA   NA
 11502372 3561507   PST_3746     FALSE NA 6759.000 0.000 NA   NA
 11644735 3561507   PST_3746     FALSE NA 6759.000 0.000 NA   NA
 11787127 3561507   PST_3746     FALSE NA 6759.000 0.000 NA   NA
 11502373 3561507   PST_3746     FALSE NA 6791.000 0.000 NA   NA
 11644736 3561507   PST_3746     FALSE NA 6791.000 0.000 NA   NA
 11787128 3561507   PST_3746     FALSE NA 6791.000 0.000 NA   NA
 11502374 3561507   PST_3746     FALSE NA 6826.000 0.000 NA   NA
 11644737 3561507   PST_3746     FALSE NA 6826.000 0.000 NA   NA
 11787129 3561507   PST_3746     FALSE NA 6826.000 0.000 NA   NA
 11502375 3561507   PST_3746     FALSE NA 6858.000 0.000 NA   NA
 11644738 3561507   PST_3746     FALSE NA 6858.000 0.000 NA   NA
 11787130 3561507   PST_3746     FALSE NA 6858.000 0.000 NA   NA
 11502376 3561507   PST_3746     FALSE NA 6895.000 0.000 NA   NA
 11644739 3561507   PST_3746     FALSE NA 6895.000 0.000 NA   NA
 11787131 3561507   PST_3746     FALSE NA 6895.000 0.000 NA   NA
 11502377 3561507   PST_3746     FALSE NA 6927.000 0.000 NA   NA
 11644740 3561507   PST_3746     FALSE NA 6927.000 0.000 NA   NA
 11787132 3561507   PST_3746     FALSE NA 6927.000 0.000 NA   NA
 11502378 3561507   PST_3746     FALSE NA 6961.000 0.000 NA   NA
 11644741 3561507   PST_3746     FALSE NA 6961.000 0.000 NA   NA
 11787133 3561507   PST_3746     FALSE NA 6961.000 0.000 NA   NA
 11502379 3561507   PST_3746     FALSE NA 6993.000 0.000 NA   NA
 11644742 3561507   PST_3746     FALSE NA 6993.000 0.000 NA   NA
 11787134 3561507   PST_3746     FALSE NA 6993.000 0.000 NA   NA
 11502380 3561507   PST_3746     FALSE NA 7028.000 0.000 NA   NA
 11644743 3561507   PST_3746     FALSE NA 7028.000 0.000 NA   NA
 11787135 3561507   PST_3746     FALSE NA 7028.000 0.000 NA   NA
 11502381 3561507   PST_3746     FALSE NA 7060.000 0.000 NA   NA
 11644744 3561507   PST_3746     FALSE NA 7060.000 0.000 NA   NA
 11787136 3561507   PST_3746     FALSE NA 7060.000 0.000 NA   NA
 11502382 3561507   PST_3746     FALSE NA 7093.000 0.000 NA   NA
 11644745 3561507   PST_3746     FALSE NA 7093.000 0.000 NA   NA
 11787137 3561507   PST_3746     FALSE NA 7093.000 0.000 NA   NA
 11502383 3561507   PST_3746     FALSE NA 7125.000 0.000 NA   NA
 11644746 3561507   PST_3746     FALSE NA 7125.000 0.000 NA   NA
 11787138 3561507   PST_3746     FALSE NA 7125.000 0.000 NA   NA
 11502384 3561507   PST_3746     FALSE NA 7158.000 0.000 NA   NA
 11644747 3561507   PST_3746     FALSE NA 7158.000 0.000 NA   NA
 11787139 3561507   PST_3746     FALSE NA 7158.000 0.000 NA   NA
 11502385 3561507   PST_3746     FALSE NA 7190.000 0.000 NA   NA
 11644748 3561507   PST_3746     FALSE NA 7190.000 0.000 NA   NA
 11787140 3561507   PST_3746     FALSE NA 7190.000 0.000 NA   NA
 11502386 3561507   PST_3746     FALSE NA 7224.000 0.000 NA   NA
 11644749 3561507   PST_3746     FALSE NA 7224.000 0.000 NA   NA
 11787141 3561507   PST_3746     FALSE NA 7224.000 0.000 NA   NA
 11502387 3561507   PST_3746     FALSE NA 7256.000 0.000 NA   NA
 11644750 3561507   PST_3746     FALSE NA 7256.000 0.000 NA   NA
 11787142 3561507   PST_3746     FALSE NA 7256.000 0.000 NA   NA
 11502388 3561507   PST_3746     FALSE NA 7289.000 0.000 NA   NA
 11644751 3561507   PST_3746     FALSE NA 7289.000 0.000 NA   NA
 11787143 3561507   PST_3746     FALSE NA 7289.000 0.000 NA   NA
 11502389 3561507   PST_3746     FALSE NA 7321.000 0.000 NA   NA
 11644752 3561507   PST_3746     FALSE NA 7321.000 0.000 NA   NA
 11787144 3561507   PST_3746     FALSE NA 7321.000 0.000 NA   NA
 11502390 3561507   PST_3746     FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11644753 3561507   PST_3746     FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11787145 3561507   PST_3746     FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11502391 3561507   PST_3746     FALSE NA 7388.000 0.000 NA   NA
 11644754 3561507   PST_3746     FALSE NA 7388.000 0.000 NA   NA
 11787146 3561507   PST_3746     FALSE NA 7388.000 0.000 NA   NA
 11502392 3561507   PST_3746     FALSE NA 7422.000 0.000 NA   NA
 11644755 3561507   PST_3746     FALSE NA 7422.000 0.000 NA   NA
 11787147 3561507   PST_3746     FALSE NA 7422.000 0.000 NA   NA
 11502393 3561507   PST_3746     FALSE NA 7454.000 0.000 NA   NA
 11644756 3561507   PST_3746     FALSE NA 7454.000 0.000 NA   NA
 11787148 3561507   PST_3746     FALSE NA 7454.000 0.000 NA   NA
 11502394 3561507   PST_3746     FALSE NA 7488.000 0.000 NA   NA
 11644757 3561507   PST_3746     FALSE NA 7488.000 0.000 NA   NA
 11787149 3561507   PST_3746     FALSE NA 7488.000 0.000 NA   NA
 11502395 3561507   PST_3746     FALSE NA 7520.000 0.000 NA   NA
 11644758 3561507   PST_3746     FALSE NA 7520.000 0.000 NA   NA
 11787150 3561507   PST_3746     FALSE NA 7520.000 0.000 NA   NA
 11502396 3561507   PST_3746     FALSE NA 7554.000 0.000 NA   NA
 11644759 3561507   PST_3746     FALSE NA 7554.000 0.000 NA   NA
 11787151 3561507   PST_3746     FALSE NA 7554.000 0.000 NA   NA
 11502397 3561507   PST_3746     FALSE NA 7586.000 0.000 NA   NA
 11644760 3561507   PST_3746     FALSE NA 7586.000 0.000 NA   NA
 11787152 3561507   PST_3746     FALSE NA 7586.000 0.000 NA   NA
 11502398 3561507   PST_3746     FALSE NA 7619.000 0.000 NA   NA
 11644761 3561507   PST_3746     FALSE NA 7619.000 0.000 NA   NA
 11787153 3561507   PST_3746     FALSE NA 7619.000 0.000 NA   NA
 3561515 3561516 PST_3754 PST_3755     TRUE 0.890 -64.000 0.250 1.000 N NA
 3561517 3561518 PST_3756 PST_3757 thiD thiE TRUE 0.972 15.000 0.209 1.000 Y NA
 3561518 3561519 PST_3757 PST_3758 thiE hemL TRUE 0.867 54.000 0.173 1.000 Y NA
 3561519 3561520 PST_3758 PST_3759 hemL   TRUE 0.858 -3.000 0.011 NA   NA
 3561520 3561521 PST_3759 PST_3760     TRUE 0.514 118.000 0.136 NA   NA
 3561521 3561522 PST_3760 PST_3761   miaB FALSE 0.049 197.000 0.002 1.000   NA
 3561522 3561523 PST_3761 PST_3762 miaB   TRUE 0.596 132.000 0.220 1.000 N NA
 3561523 3561524 PST_3762 PST_3763     TRUE 0.980 -7.000 0.457 NA   NA
 3561524 3561525 PST_3763 PST_3764     TRUE 0.951 10.000 0.150 NA   NA
 3561525 3561526 PST_3764 PST_3765   lnt TRUE 0.872 62.000 0.557 NA N NA
 3561527 3561528 PST_3766 PST_3767     TRUE 0.847 66.000 0.435 NA   NA
 3561529 3561530 PST_3768 PST_3769 leuS   TRUE 0.720 44.000 0.182 NA N NA
 3561530 3561531 PST_3769 PST_3770   holA TRUE 0.758 38.000 0.199 NA N NA
 3561531 3561532 PST_3770 PST_3771 holA   FALSE 0.256 37.000 0.007 NA   NA
 3561532 3561533 PST_3771 PST_3772     TRUE 0.809 21.000 0.123 NA   NA
 3561534 3561535 PST_3773 PST_3774   lipA FALSE 0.109 147.000 0.000 NA   NA
 3561535 3561536 PST_3774 PST_3775 lipA lipB TRUE 0.997 -7.000 0.319 0.000 Y NA
 3561536 3561537 PST_3775 PST_3776 lipB   TRUE 0.984 -3.000 0.219 NA   NA
 3561537 3561538 PST_3776 PST_3777   dacA TRUE 0.522 67.000 0.074 NA   NA
 3561538 3561539 PST_3777 PST_3778 dacA   TRUE 0.902 48.000 0.241 NA Y NA
 3561539 3561540 PST_3778 PST_3779   mltB TRUE 0.995 -3.000 0.298 NA Y NA
 3561540 3561541 PST_3779 PST_3780 mltB rodA TRUE 0.579 48.000 0.096 NA N NA
 3561541 3561542 PST_3780 PST_3781 rodA mrdA-2 TRUE 0.845 -3.000 0.006 1.000 N NA
 3561542 3561543 PST_3781 PST_3782 mrdA-2   FALSE 0.408 19.000 0.005 NA   NA
 3561543 3561544 PST_3782 PST_3783     TRUE 0.985 4.000 0.307 NA   NA
 3561544 3561545 PST_3783 PST_3784   nadD TRUE 0.918 16.000 0.221 NA   NA
 3561545 3561546 PST_3784 PST_3785 nadD proA TRUE 0.679 57.000 0.170 1.000 N NA
 3561548 3561549 PST_3787 PST_3788     TRUE 0.827 11.000 0.027 1.000   NA
 3561549 3561550 PST_3788 PST_3789     TRUE 0.983 0.000 0.182 1.000   NA
 3561551 3561552 PST_3790 PST_3791     TRUE 0.757 78.000 0.243 1.000   NA
 3561552 3561553 PST_3791 PST_3792     TRUE 0.717 20.000 0.056 1.000   NA
 3561554 3561555 PST_3793 PST_3794 orn   FALSE 0.297 29.000 0.005 NA   NA
 3561557 3561558 PST_3796 PST_3797 motB motA TRUE 0.996 10.000 0.722 1.000 Y NA
 3561559 3561560 PST_3798 PST_3799   rhdA TRUE 0.686 48.000 0.156 NA   NA
 3561560 3561561 PST_3799 PST_3800 rhdA psd TRUE 0.929 12.000 0.125 1.000 N NA
 3561561 3561562 PST_3800 PST_3801 psd   FALSE 0.150 145.000 0.023 NA   NA
 3561562 3561563 PST_3801 PST_3802     TRUE 0.615 167.000 0.400 NA   NA
 3561563 3561564 PST_3802 PST_3803     FALSE 0.190 134.000 0.028 1.000 N NA
 3561567 3561568 PST_3806 PST_3807   parC FALSE 0.075 174.000 0.012 NA   NA
 3561568 3561569 PST_3807 PST_3808 parC   TRUE 0.893 -3.000 0.016 1.000   NA
 3561569 3561570 PST_3808 PST_3809     TRUE 0.658 33.000 0.086 NA   NA
 3561570 3561571 PST_3809 PST_3810   parE TRUE 0.883 -3.000 0.019 NA   NA
 3561571 3561572 PST_3810 PST_3811 parE   TRUE 0.643 13.000 0.000 NA   NA
 3561572 3561573 PST_3811 PST_3812     FALSE 0.262 42.000 0.000 NA   NA
 3561573 3561574 PST_3812 PST_3813     TRUE 0.635 167.000 0.433 NA   NA
 3561574 3561575 PST_3813 PST_3814     TRUE 0.992 -3.000 0.443 NA   NA
 3561580 3561581 PST_3819 PST_3820     TRUE 0.834 56.000 0.400 1.000 N NA
 3561581 3561582 PST_3820 PST_3821     TRUE 0.999 -3.000 0.441 0.041 Y NA
 3561582 3561583 PST_3821 PST_3822     TRUE 0.792 86.000 0.324 1.000   NA
 3561583 3561584 PST_3822 PST_3823     FALSE 0.042 205.000 0.000 NA   NA
 3561584 3561585 PST_3823 PST_3824     TRUE 0.970 -30.000 0.625 NA   NA
 3561588 3561589 PST_3827 PST_3828     TRUE 0.891 62.000 0.625 NA   NA
 3561589 3561590 PST_3828 PST_3829     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3561590 3561591 PST_3829 PST_3830   msbA TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.087   NA
 3561593 3561594 PST_3832 PST_3833     TRUE 0.898 9.000 0.050 NA   NA
 3561594 3561595 PST_3833 PST_3834     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 3561595 3561596 PST_3834 PST_3835     FALSE 0.132 128.000 0.000 NA   NA
 3561596 3561597 PST_3835 PST_3836     TRUE 0.911 12.000 0.093 1.000 N NA
 3561597 3561598 PST_3836 PST_3837     TRUE 0.952 -3.000 0.061 1.000 N NA
 3561598 3561599 PST_3837 PST_3838     TRUE 0.976 3.000 0.022 1.000 Y NA
 3561599 3561600 PST_3838 PST_3839   wbpE TRUE 0.996 -3.000 0.296 1.000 Y NA
 3561600 3561601 PST_3839 PST_3840 wbpE   TRUE 0.994 4.000 0.678 1.000   NA
 3561601 3561602 PST_3840 PST_3841     FALSE 0.117 141.000 0.000 NA   NA
 3561602 3561603 PST_3841 PST_3842     FALSE 0.243 47.000 0.000 NA   NA
 3561603 3561604 PST_3842 PST_3843     TRUE 0.487 84.000 0.067 1.000   NA
 3561604 3561605 PST_3843 PST_3844     TRUE 0.991 -3.000 0.095 0.002   NA
 3561605 3561606 PST_3844 PST_3845     TRUE 0.879 48.000 0.133 0.002   NA
 3561606 3561607 PST_3845 PST_3846   waaP TRUE 0.954 18.000 0.133 0.002   NA
 3561607 3561608 PST_3846 PST_3847 waaP waaG TRUE 0.757 77.000 0.241 1.000   NA
 3561608 3561609 PST_3847 PST_3848 waaG waaC TRUE 0.838 107.000 0.217 1.000 Y NA
 3561609 3561610 PST_3848 PST_3849 waaC waaF TRUE 0.897 160.000 0.205 0.001 Y NA
 3561610 3561611 PST_3849 PST_3850 waaF ilvE FALSE 0.358 55.000 0.034 1.000 N NA
 3561611 3561612 PST_3850 PST_3851 ilvE glnE TRUE 0.553 50.000 0.078 1.000 N NA
 3561613 3561614 PST_3852 PST_3853 aceE aceF TRUE 0.923 28.000 0.167 1.000 Y NA
 3561616 3561617 PST_3855 PST_3856   msrA TRUE 0.772 13.000 0.032 1.000 N NA
 3561618 3561619 PST_3857 PST_3858     FALSE 0.015 288.000 0.000 NA   NA
 3561619 3561620 PST_3858 PST_3859     FALSE 0.123 139.000 0.000 1.000 N NA
 3561620 3561621 PST_3859 PST_3860     FALSE 0.027 245.000 0.000 1.000 N NA
 3561621 3561622 PST_3860 PST_3861     FALSE 0.012 314.000 0.000 NA   NA
 3561622 3561623 PST_3861 PST_3862   bioD TRUE 0.757 65.000 0.244 NA   NA
 3561623 3561624 PST_3862 PST_3863 bioD bioC TRUE 0.980 -25.000 0.063 0.001 Y NA
 3561624 3561625 PST_3863 PST_3864 bioC bioH TRUE 0.946 -7.000 0.163 NA   NA
 3561625 3561626 PST_3864 PST_3865 bioH bioF TRUE 0.918 -7.000 0.092 NA   NA
 3561626 3561627 PST_3865 PST_3866 bioF bioB TRUE 0.930 107.000 0.168 0.001 Y NA
 3561628 3561629 PST_3867 PST_3868     FALSE 0.201 55.000 0.008 NA   NA
 3561631 3561632 PST_3870 PST_3871   crtZ FALSE 0.259 83.000 0.022 NA   NA
 3561633 3561634 PST_3872 PST_3873     TRUE 0.989 -3.000 0.332 1.000 N NA
 3561634 3561635 PST_3873 PST_3874     TRUE 0.994 -3.000 0.163 0.001 N NA
 3561635 3561636 PST_3874 PST_3875     TRUE 0.981 -10.000 0.217 1.000 Y NA
 3561636 3561637 PST_3875 PST_3876     TRUE 0.834 20.000 0.011 1.000 Y NA
 3561638 3561639 PST_3877 PST_3878     FALSE 0.261 103.000 0.031 1.000 N NA
 3561639 3561640 PST_3878 PST_3879     FALSE 0.270 133.000 0.046 1.000 N NA
 3561640 3561641 PST_3879 PST_3880     TRUE 0.730 127.000 0.379 1.000 N NA
 3561641 3561642 PST_3880 PST_3881     FALSE 0.267 92.000 0.028 NA   NA
 3561643 3561644 PST_3882 PST_3883     TRUE 0.989 3.000 0.353 1.000   NA
 3561644 3561645 PST_3883 PST_3884     TRUE 0.812 96.000 0.416 1.000   NA
 3561645 3561646 PST_3884 PST_3885     TRUE 0.987 2.000 0.065 1.000 Y NA
 3561646 3561647 PST_3885 PST_3886     FALSE 0.063 193.000 0.000 1.000   NA
 3561649 3561650 PST_3888 PST_3889     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3561651 3561652 PST_3890 PST_3891     TRUE 0.986 -10.000 0.330 NA Y NA
 3561652 3561653 PST_3891 PST_3892     TRUE 0.870 1.000 0.006 1.000   NA
 3561653 3561654 PST_3892 PST_3893     FALSE 0.182 108.000 0.000 1.000   NA
 3561655 3561656 PST_3894 PST_3895 treA   TRUE 0.862 -21.000 0.100 1.000 N NA
 3561659 3561660 PST_3898 PST_3899     FALSE 0.110 158.000 0.015 1.000 N NA
 3561660 3561661 PST_3899 PST_3900     TRUE 0.845 -3.000 0.007 1.000 N NA
 3561662 3561663 PST_3901 PST_3902     FALSE 0.316 98.000 0.040 NA   NA
 3561663 3561664 PST_3902 PST_3903     TRUE 0.995 6.000 0.916 NA   NA
 3561664 3561665 PST_3903 PST_3904     FALSE 0.006 465.000 0.000 NA   NA
 3561666 3561667 PST_3905 PST_3906 dbpA   FALSE 0.209 55.000 0.010 NA   NA
 3561670 3561671 PST_3909 PST_3910     FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 3561671 3561672 PST_3910 PST_3911     FALSE 0.321 132.000 0.062 NA   NA
 3561672 3561673 PST_3911 PST_3912     FALSE 0.043 203.000 0.000 NA   NA
 3561673 3561674 PST_3912 PST_3913     TRUE 0.670 91.000 0.200 NA   NA
 3561674 3561675 PST_3913 PST_3914     FALSE 0.354 109.000 0.059 NA   NA
 3561677 3561678 PST_3916 PST_3917 fda   FALSE 0.223 182.000 0.084 NA   NA
 3561678 3561679 PST_3917 PST_3918   pgk FALSE 0.011 328.000 0.000 NA   NA
 3561679 3561680 PST_3918 PST_3919 pgk epd TRUE 0.970 -43.000 0.070 0.003 Y NA
 3561680 3561681 PST_3919 PST_3920 epd tktA TRUE 0.870 106.000 0.285 1.000 Y NA
 3561681 3561682 PST_3920 PST_3921 tktA   FALSE 0.314 97.000 0.038 1.000 N NA
 3561682 3561683 PST_3921 PST_3922     TRUE 0.747 10.000 0.000 NA   NA
 3561684 3561685 PST_3923 PST_3924     TRUE 0.960 -3.000 0.069 1.000   NA
 3561685 3561686 PST_3924 PST_3925     FALSE 0.192 83.000 0.008 1.000 N NA
 3561686 3561687 PST_3925 PST_3926   metK TRUE 0.729 15.000 0.036 1.000 N NA
 3561687 3561688 PST_3926 PST_3927 metK   FALSE 0.034 218.000 0.000 NA   NA
 3561689 3561690 PST_3928 PST_3929     TRUE 0.992 13.000 0.303 0.087 Y NA
 3561691 3561692 PST_3930 PST_3931   ligB FALSE 0.438 -36.000 0.002 1.000 N NA
 3561692 3561693 PST_3931 PST_3932 ligB   FALSE 0.179 61.000 0.002 NA   NA
 3561694 3561695 PST_3933 PST_3934     FALSE 0.436 105.000 0.080 NA   NA
 3561696 3561697 PST_3935 PST_3936 sahH metF TRUE 0.469 74.000 0.061 1.000 N NA
 3561697 3561698 PST_3936 PST_3937 metF   FALSE 0.031 232.000 0.000 1.000 N NA
 3561699 3561700 PST_3938 PST_3939 oprM ttgB TRUE 0.997 -3.000 0.538 0.037 N NA
 3561700 3561701 PST_3939 PST_3940 ttgB ttgA TRUE 0.972 15.000 0.565 1.000 N NA
 3561701 3561702 PST_3940 PST_3941 ttgA   FALSE 0.025 247.000 0.000 NA   NA
 3561702 3561703 PST_3941 PST_3942     TRUE 0.956 24.000 0.676 NA   NA
 3561703 3561704 PST_3942 PST_3943     FALSE 0.367 26.000 0.000 NA   NA
 3561705 3561706 PST_3944 PST_3945 bioA   FALSE 0.354 87.000 0.041 NA   NA
 3561707 3561708 PST_3946 PST_3947     TRUE 0.997 -3.000 0.517 0.010   NA
 3561708 3561709 PST_3947 PST_3948     TRUE 0.994 -7.000 0.217 0.012 Y NA
 3561709 3561710 PST_3948 PST_3949   pilK TRUE 0.984 12.000 0.217 1.000 Y NA
 3561710 3561711 PST_3949 PST_3950 pilK pilJ TRUE 0.895 61.000 0.241 1.000 Y NA
 3561711 3561712 PST_3950 PST_3951 pilJ pilI TRUE 0.984 79.000 0.795 0.010 Y NA
 3561712 3561713 PST_3951 PST_3952 pilI pilH TRUE 0.911 51.000 0.266 1.000 Y NA
 3561713 3561714 PST_3952 PST_3953 pilH pilG TRUE 0.966 45.000 0.296 0.018 Y NA
 3561715 3561716 PST_3954 PST_3955 gshB   TRUE 0.706 28.000 0.089 1.000 N NA
 3561716 3561717 PST_3955 PST_3956   algH FALSE 0.460 66.000 0.064 NA N NA
 3561717 3561718 PST_3956 PST_3957 algH   TRUE 0.986 -3.000 0.263 NA N NA
 3561718 3561719 PST_3957 PST_3958   pyrR TRUE 0.826 18.000 0.109 1.000 N NA
 3561719 3561720 PST_3958 PST_3959 pyrR pyrB TRUE 0.900 54.000 0.247 1.000 Y NA
 3561720 3561721 PST_3959 PST_3960 pyrB pyrC TRUE 0.997 0.000 0.452 1.000 Y NA
 3561723 3561724 PST_3962 PST_3963     TRUE 0.996 0.000 0.748 NA   NA
 3561725 3561726 PST_3964 PST_3965 pilU pilT TRUE 0.942 141.000 0.436 0.014 Y NA
 3561727 3561728 PST_3966 PST_3967   proC TRUE 0.680 50.000 0.158 NA   NA
 3561728 3561729 PST_3967 PST_3968 proC   TRUE 0.955 10.000 0.152 1.000   NA
 3561729 3561730 PST_3968 PST_3969     FALSE 0.022 276.000 0.000 1.000   NA
 3561730 3561731 PST_3969 PST_3970   metX FALSE 0.213 131.000 0.027 1.000   NA
 3561731 3561732 PST_3970 PST_3971 metX metW TRUE 0.986 10.000 0.509 NA   NA
 3561732 3561733 PST_3971 PST_3972 metW   TRUE 0.749 25.000 0.100 NA   NA
 3561733 3561734 PST_3972 PST_3973     TRUE 0.943 -3.000 0.050 NA   NA
 3561734 3561735 PST_3973 PST_3974     TRUE 0.984 -3.000 0.218 1.000 N NA
 3561735 3561736 PST_3974 PST_3975     TRUE 0.743 10.000 0.011 NA   NA
 3561738 3561739 PST_3977 PST_3978 arcD-2 arcA-2 TRUE 0.967 92.000 1.000 1.000 Y NA
 3561739 3561740 PST_3978 PST_3979 arcA-2 arcB-2 TRUE 0.719 52.000 0.033 1.000 Y NA
 3561740 3561741 PST_3979 PST_3980 arcB-2 arcC-2 TRUE 0.954 41.000 0.483 1.000 Y NA
 3561742 3561743 PST_3981 PST_3982   trmB FALSE 0.029 217.000 0.004 NA   NA
 3561743 3561744 PST_3982 PST_3983 trmB thiG TRUE 0.496 66.000 0.060 1.000   NA
 3561744 3561745 PST_3983 PST_3984 thiG thiS TRUE 0.832 77.000 0.130 1.000 Y NA
 3561745 3561746 PST_3984 PST_3985 thiS   TRUE 0.587 31.000 0.058 NA   NA
 3561747 3561748 PST_3986 PST_3987 mtgA   FALSE 0.147 125.000 0.006 1.000   NA
 3561748 3561749 PST_3987 PST_3988     FALSE 0.161 349.000 0.000 0.016 Y NA
 3561750 3561751 PST_3989 PST_3990 rpoH ftsX FALSE 0.335 113.000 0.054 1.000 N NA
 3561751 3561752 PST_3990 PST_3991 ftsX ftsE TRUE 0.984 0.000 0.035 1.000 Y NA
 3561752 3561753 PST_3991 PST_3992 ftsE ftsY TRUE 0.987 -3.000 0.117 0.087 N NA
 3561754 3561755 PST_3993 PST_3994     TRUE 0.988 -31.000 0.598 0.004   NA
 3561755 3561756 PST_3994 PST_3995     TRUE 0.965 0.000 0.070 1.000   NA
 3561760 3561761 PST_3999 PST_4000     TRUE 0.929 -36.000 0.308 NA   NA
 3561761 3561762 PST_4000 PST_4001     TRUE 0.983 15.000 0.886 NA   NA
 3561762 3561763 PST_4001 PST_4002   coaD TRUE 0.554 -22.000 0.011 1.000 N NA
 3561763 3561764 PST_4002 PST_4003 coaD fdx1 TRUE 0.468 108.000 0.088 1.000   NA
 3561764 3561765 PST_4003 PST_4004 fdx1   TRUE 0.967 0.000 0.076 1.000   NA
 3561766 3561767 PST_4005 PST_4006     TRUE 0.551 149.000 0.222 NA   NA
 3561767 3561768 PST_4006 PST_4007   mutM FALSE 0.176 82.000 0.006 NA   NA
 3561768 3561769 PST_4007 PST_4008 mutM   FALSE 0.203 57.000 0.015 NA N NA
 3561770 3561771 PST_4009 PST_4010 pfpI   FALSE 0.283 103.000 0.031 1.000   NA
 3561774 3561775 PST_4013 PST_4014     FALSE 0.443 -49.000 0.012 NA   NA
 3561777 3561778 PST_4016 PST_4017   folA FALSE 0.226 88.000 0.018 NA   NA
 3561779 3561780 PST_4018 PST_4019 glpQ   FALSE 0.421 93.000 0.063 NA   NA
 3561780 3561781 PST_4019 PST_4020     TRUE 0.991 -7.000 0.904 NA   NA
 3561784 3561785 PST_4023 PST_4024 phoU   TRUE 0.543 230.000 0.330 NA Y NA
 3561785 3561786 PST_4024 PST_4025     TRUE 0.976 98.000 0.511 0.001 Y NA
 3561786 3561787 PST_4025 PST_4026     TRUE 0.959 28.000 0.489 0.090   NA
 3561787 3561788 PST_4026 PST_4027     TRUE 0.700 162.000 0.211 0.050   NA
 3561792 3561793 PST_4031 PST_4032   recD FALSE 0.161 95.000 0.008 NA   NA
 3561793 3561794 PST_4032 PST_4033 recD recB TRUE 0.987 71.000 0.688 0.001 Y NA
 3561794 3561795 PST_4033 PST_4034 recB recC FALSE 0.441 664.000 0.542 0.001 Y NA
 3561796 3561797 PST_4035 PST_4036     TRUE 0.553 136.000 0.200 NA   NA
 3561798 3561799 PST_4037 PST_4038     TRUE 0.987 2.000 0.286 NA   NA
 3561799 3561800 PST_4038 PST_4039     TRUE 0.996 2.000 0.857 NA   NA
 3561800 3561801 PST_4039 PST_4040     TRUE 0.767 79.000 0.277 NA   NA
 3561801 3561802 PST_4040 PST_4041     TRUE 0.775 28.000 0.128 1.000   NA
 3561803 3561804 PST_4042 PST_4043 tctD   TRUE 0.981 -7.000 0.161 1.000 Y NA
 3561805 3561806 PST_4044 PST_4045     TRUE 0.797 128.000 0.200 1.000 Y NA
 3561806 3561807 PST_4045 PST_4046     TRUE 0.750 188.000 1.000 NA   NA
 3561807 3561808 PST_4046 PST_4047   aer FALSE 0.018 275.000 0.000 NA   NA
 3561809 3561810 PST_4048 PST_4049     FALSE 0.239 118.000 0.033 NA   NA
 3561812 3561813 PST_4051 PST_4052     FALSE 0.050 195.000 0.000 NA   NA
 3561813 3561814 PST_4052 PST_4053   algB FALSE 0.451 -46.000 0.000 NA   NA
 3561814 3561815 PST_4053 PST_4054 algB   TRUE 0.999 -3.000 0.455 0.023 Y NA
 3561815 3561816 PST_4054 PST_4055     TRUE 0.634 25.000 0.054 NA   NA
 3561817 3561818 PST_4056 PST_4057     TRUE 0.700 132.000 0.350 1.000 N NA
 3561818 3561819 PST_4057 PST_4058     TRUE 0.975 -3.000 0.147 NA   NA
 3561819 3561820 PST_4058 PST_4059   dsbA TRUE 0.963 7.000 0.162 NA   NA
 3561820 3561821 PST_4059 PST_4060 dsbA   FALSE 0.229 183.000 0.088 1.000 N NA
 3561823 3561824 PST_4062 PST_4063 gcvP-2 gcvH1 TRUE 0.897 60.000 0.249 1.000 Y NA
 3561824 3561825 PST_4063 PST_4064 gcvH1 gcvT TRUE 0.972 53.000 0.317 0.001 Y NA
 3561825 3561826 PST_4064 PST_4065 gcvT   FALSE 0.185 212.000 0.017 0.036 N NA
 3561826 3561827 PST_4065 PST_4066     TRUE 0.975 116.000 0.844 0.036 Y NA
 3561827 3561828 PST_4066 PST_4067   ubiF TRUE 0.717 111.000 0.312 1.000 N NA
 3561828 3561829 PST_4067 PST_4068 ubiF   TRUE 0.965 0.000 0.079 NA   NA
 3561829 3561830 PST_4068 PST_4069   ubiH TRUE 0.811 -10.000 0.042 NA   NA
 3561830 3561831 PST_4069 PST_4070 ubiH pepP TRUE 0.992 0.000 0.396 1.000 N NA
 3561831 3561832 PST_4070 PST_4071 pepP   TRUE 0.807 65.000 0.329 NA   NA
 3561833 3561834 PST_4072 PST_4073     FALSE 0.004 634.000 0.000 NA   NA
 3561835 3561836 PST_4074 PST_4075     FALSE 0.004 648.000 0.000 NA   NA
 3561838 3561839 PST_4077 PST_4078 secB grx TRUE 0.742 65.000 0.221 1.000 N NA
 3561839 3561840 PST_4078 PST_4079 grx   TRUE 0.974 3.000 0.166 NA N NA
 3561841 3561842 PST_4080 PST_4081 gpmA   FALSE 0.093 306.000 0.170 1.000 N NA
 3561842 3561843 PST_4081 PST_4082     TRUE 0.925 72.000 0.408 0.018 N NA
 3561843 3561844 PST_4082 PST_4083     TRUE 0.983 3.000 0.210 1.000   NA
 3561845 3561846 PST_4084 PST_4085     FALSE 0.251 44.000 0.000 NA   NA
 3561846 3561847 PST_4085 PST_4086     FALSE 0.251 44.000 0.000 NA   NA
 3561847 3561848 PST_4086 PST_4087   hisF1 TRUE 0.614 81.000 0.006 1.000 Y NA
 3561848 3561849 PST_4087 PST_4088 hisF1 hisA TRUE 0.967 97.000 0.433 0.003 Y NA
 3561849 3561850 PST_4088 PST_4089 hisA   FALSE 0.308 37.000 0.016 NA   NA
 3561850 3561851 PST_4089 PST_4090   hisB FALSE 0.004 639.000 0.000 NA   NA
 3561852 3561853 PST_4091 PST_4092 nasR nasF FALSE 0.010 359.000 0.000 NA   NA
 3561853 3561854 PST_4092 PST_4093 nasF nasE TRUE 0.955 105.000 0.915 NA Y NA
 3561854 3561855 PST_4093 PST_4094 nasE nasD TRUE 0.997 12.000 0.323 0.000 Y NA
 3561855 3561856 PST_4094 PST_4095 nasD   FALSE 0.324 50.000 0.021 1.000   NA
 3561856 3561857 PST_4095 PST_4096     FALSE 0.048 203.000 0.015 NA   NA
 3561857 3561858 PST_4096 PST_4097   mutY TRUE 0.910 -3.000 0.033 NA N NA
 3561858 3561859 PST_4097 PST_4098 mutY   TRUE 0.974 -3.000 0.150 NA N NA
 3561859 3561860 PST_4098 PST_4099     FALSE 0.181 93.000 0.000 NA   NA
 3561860 3561861 PST_4099 PST_4100     FALSE 0.071 176.000 0.000 NA   NA
 3561861 3561862 PST_4100 PST_4101     TRUE 0.522 187.000 0.400 1.000 N NA
 3561862 3561863 PST_4101 PST_4102     TRUE 0.589 155.000 0.091 0.036 N NA
 3561863 3561864 PST_4102 PST_4103     FALSE 0.228 54.000 0.000 1.000 N NA
 3561864 3561865 PST_4103 PST_4104     TRUE 0.993 15.000 0.824 1.000 Y NA
 3561865 3561866 PST_4104 PST_4105     TRUE 0.934 65.000 0.169 0.036 Y NA
 3561866 3561867 PST_4105 PST_4106     TRUE 0.997 -3.000 0.195 0.009 Y NA
 3561867 3561868 PST_4106 PST_4107     FALSE 0.161 101.000 0.008 1.000 N NA
 3561868 3561869 PST_4107 PST_4108     FALSE 0.088 163.000 0.000 NA   NA
 3561869 3561870 PST_4108 PST_4109     FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 3561871 3561872 PST_4110 PST_4111     FALSE 0.009 388.000 0.000 1.000 N NA
 3561872 3561873 PST_4111 PST_4112   madM FALSE 0.073 174.000 0.000 NA   NA
 3561873 3561874 PST_4112 PST_4113 madM madL TRUE 0.995 6.000 0.945 NA   NA
 3561874 3561875 PST_4113 PST_4114 madL   TRUE 0.593 128.000 0.200 1.000   NA
 3561875 3561876 PST_4114 PST_4115     TRUE 0.995 -3.000 0.651 1.000   NA
 3561876 3561877 PST_4115 PST_4116   mdcE TRUE 0.812 71.000 0.339 NA   NA
 3561877 3561878 PST_4116 PST_4117 mdcE mdcD TRUE 0.995 -3.000 0.700 NA   NA
 3561878 3561879 PST_4117 PST_4118 mdcD mdcC TRUE 0.978 -7.000 0.400 NA   NA
 3561879 3561880 PST_4118 PST_4119 mdcC mdcB TRUE 0.991 3.000 0.475 NA   NA
 3561880 3561881 PST_4119 PST_4120 mdcB mdcA TRUE 0.994 0.000 0.508 1.000   NA
 3561881 3561882 PST_4120 PST_4121 mdcA   FALSE 0.342 164.000 0.012 0.045   NA
 3561885 3561886 PST_4124 PST_4125     TRUE 0.791 137.000 0.588 NA   NA
 3561886 3561887 PST_4125 PST_4126     TRUE 0.905 30.000 0.433 NA   NA
 3561887 3561888 PST_4126 PST_4127     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 3561889 3561890 PST_4128 PST_4129     TRUE 0.955 11.000 0.000 0.002   NA
 3561890 3561891 PST_4129 PST_4131     FALSE 0.047 211.000 0.000 1.000   NA
 3561892 3561893 PST_4130 PST_4132     TRUE 0.769 94.000 0.333 NA   NA
 3561893 3561894 PST_4132 PST_4133     FALSE 0.043 197.000 0.007 NA   NA
 3561894 3561895 PST_4133 PST_4134     FALSE 0.099 127.000 0.007 NA N NA
 3561897 3561898 PST_4136 PST_4137     FALSE 0.014 302.000 0.000 NA   NA
 3561898 3561899 PST_4137 PST_4138     FALSE 0.066 179.000 0.000 NA   NA
 3561902 3561903 PST_4141 PST_4142     TRUE 0.529 -27.000 0.000 NA   NA
 3561903 3561904 PST_4142 PST_4143     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3561904 3561905 PST_4143 PST_4144     FALSE 0.109 150.000 0.000 1.000 N NA
 3561907 3561908 PST_4146 PST_4147     FALSE 0.033 223.000 0.000 NA   NA
 3561909 3561910 PST_4148 PST_4149     FALSE 0.374 113.000 0.067 NA   NA
 3561911 3561912 PST_4150 PST_4151     FALSE 0.420 185.000 0.250 NA   NA
 3561917 3561918 PST_4156 PST_4157 prlC   FALSE 0.017 279.000 0.000 NA   NA
 3561920 3561921 PST_4159 PST_4160     FALSE 0.046 201.000 0.000 1.000 N NA
 3561921 3561922 PST_4160 PST_4161     TRUE 0.892 76.000 0.241 1.000 Y NA
 3561922 3561923 PST_4161 PST_4162     FALSE 0.167 101.000 0.000 NA   NA
 3561923 3561924 PST_4162 PST_4163   coxB FALSE 0.022 257.000 0.000 NA   NA
 3561924 3561925 PST_4163 PST_4164 coxB coxA TRUE 0.976 124.000 0.741 0.003 Y NA
 3561925 3561926 PST_4164 PST_4165 coxA ctaG TRUE 0.780 65.000 0.268 1.000 N NA
 3561926 3561927 PST_4165 PST_4166 ctaG coIII TRUE 0.994 -3.000 0.536 1.000 N NA
 3561929 3561930 PST_4168 PST_4169     TRUE 0.976 -25.000 0.722 NA   NA
 3561930 3561931 PST_4169 PST_4170     TRUE 0.774 53.000 0.255 NA   NA
 3561931 3561932 PST_4170 PST_4171   cyoE-1 TRUE 0.973 18.000 0.321 1.000 Y NA
 3561932 3561933 PST_4171 PST_4172 cyoE-1   FALSE 0.272 179.000 0.099 1.000   NA
 3561934 3561935 PST_4173 PST_4174     TRUE 0.710 39.000 0.147 NA   NA
 3561935 3561936 PST_4174 PST_4175     TRUE 0.775 100.000 0.120 NA Y NA
 3561936 3561937 PST_4175 PST_4176     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA N NA
 3561941 3561942 PST_4180 PST_4181     FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 3561943 3561944 PST_4182 PST_4183     TRUE 0.998 0.000 0.395 0.062 Y NA
 3561944 3561945 PST_4183 PST_4184     TRUE 0.928 64.000 0.140 0.018 Y NA
 3561945 3561946 PST_4184 PST_4185     TRUE 0.666 -7.000 0.000 NA N NA
 3561947 3561948 PST_4186 PST_4187 glmS   TRUE 0.990 3.000 0.412 1.000 N NA
 3561948 3561949 PST_4187 PST_4188     FALSE 0.271 100.000 0.031 1.000 N NA
 3561949 3561950 PST_4188 PST_4189   glmU FALSE 0.153 95.000 0.002 1.000 N NA
 3561950 3561951 PST_4189 PST_4190 glmU atpC FALSE 0.308 145.000 0.067 1.000 N NA
 3561951 3561952 PST_4190 PST_4191 atpC atpD TRUE 0.988 70.000 0.837 0.002 Y NA
 3561952 3561953 PST_4191 PST_4192 atpD atpG TRUE 0.992 31.000 0.724 0.002 Y NA
 3561953 3561954 PST_4192 PST_4193 atpG atpA TRUE 0.989 51.000 0.846 0.002 Y NA
 3561954 3561955 PST_4193 PST_4194 atpA atpH TRUE 0.997 16.000 0.864 0.002 Y NA
 3561955 3561956 PST_4194 PST_4195 atpH atpF TRUE 0.994 13.000 0.242 0.002 Y NA
 3561956 3561957 PST_4195 PST_4196 atpF atpE TRUE 0.956 93.000 0.666 0.002   NA
 3561957 3561958 PST_4196 PST_4197 atpE atpB TRUE 0.958 69.000 0.557 0.002   NA
 3561958 3561959 PST_4197 PST_4198 atpB atpI TRUE 0.979 15.000 0.291 1.000 Y NA
 3561959 3561960 PST_4198 PST_4199 atpI parB FALSE 0.114 206.000 0.056 1.000 N NA
 3561960 3561961 PST_4199 PST_4200 parB   TRUE 0.992 10.000 0.827 1.000 N NA
 3561961 3561962 PST_4200 PST_4201   gidB TRUE 0.929 19.000 0.339 1.000 N NA
 3561962 3561963 PST_4201 PST_4202 gidB gidA TRUE 0.993 0.000 0.466 1.000 N NA
 3561963 3561964 PST_4202 PST_4203 gidA   FALSE 0.007 409.000 0.000 1.000 N NA
 3561964 3561965 PST_4203 PST_4204     TRUE 0.980 24.000 0.614 1.000 Y NA
 3561965 3561966 PST_4204 PST_4205     TRUE 0.990 3.000 0.020 0.051 Y NA
 3561966 3561967 PST_4205 PST_4206     TRUE 0.983 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 3561967 3561968 PST_4206 PST_4207     TRUE 0.999 -3.000 0.896 0.002 Y NA
 3561968 3561969 PST_4207 PST_4208     TRUE 0.993 2.000 0.500 NA   NA
 3561969 3561970 PST_4208 PST_4209     TRUE 0.993 -3.000 0.493 NA   NA
 3561970 3561971 PST_4209 PST_4210   trmE FALSE 0.020 285.000 0.000 1.000   NA
 3561971 3561972 PST_4210 PST_4211 trmE yidC TRUE 0.869 73.000 0.221 0.051   NA
 3561972 3561973 PST_4211 PST_4212 yidC   TRUE 0.991 3.000 0.461 NA   NA
 3561973 3561974 PST_4212 PST_4213   rnpA TRUE 0.984 -7.000 0.540 NA   NA
 3561974 3561975 PST_4213 PST_4214 rnpA rpmH TRUE 0.981 15.000 0.787 1.000   NA