MicrobesOnline Operon Predictions for Yersinia pestis Pestoides F

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3575235 3575236 YPDSF_0001 YPDSF_0002 dnaA   TRUE 0.994 5.000 0.328 1.000 Y NA
 3575236 3575237 YPDSF_0002 YPDSF_0003   recF TRUE 0.986 -25.000 0.318 1.000 Y NA
 3575237 3575238 YPDSF_0003 YPDSF_0004 recF gyrB TRUE 0.985 26.000 0.249 0.004 Y NA
 3575238 3575239 YPDSF_0004 YPDSF_0005 gyrB   FALSE 0.065 216.000 0.003 1.000   NA
 3575240 3575241 YPDSF_0006 YPDSF_0007     FALSE 0.001 776.000 0.000 1.000 N NA
 3575241 3575242 YPDSF_0007 YPDSF_0008     TRUE 0.995 -6.000 0.316 1.000 Y NA
 3575243 3575244 YPDSF_0009 YPDSF_0010     TRUE 0.860 -10.000 0.054 NA   NA
 3575246 3575247 YPDSF_0012 YPDSF_0013     FALSE 0.311 281.000 0.099 NA Y NA
 3575247 3575248 YPDSF_0013 YPDSF_0014     FALSE 0.036 373.000 0.069 NA   NA
 3575249 3575250 YPDSF_0015 YPDSF_0016 avtA malS FALSE 0.003 1208.000 0.085 1.000 N NA
 3575250 3575251 YPDSF_0016 YPDSF_0017 malS   FALSE 0.007 289.000 0.000 1.000 N NA
 3575253 3575254 YPDSF_0019 YPDSF_0020     FALSE 0.026 358.000 0.000 1.000   NA
 3575254 3575255 YPDSF_0020 YPDSF_0021     TRUE 0.896 -3.000 0.028 1.000   NA
 3575256 3575257 YPDSF_0022 YPDSF_0023 glyQ glyS TRUE 0.999 10.000 0.651 0.001 Y NA
 3575257 3575258 YPDSF_0023 YPDSF_0024 glyS   FALSE 0.007 473.000 0.003 NA   NA
 3575258 3575259 YPDSF_0024 YPDSF_0025     FALSE 0.007 650.000 0.000 NA   NA
 3575259 3575260 YPDSF_0025 YPDSF_0026     TRUE 0.890 137.000 0.292 1.000 Y NA
 3575260 3575261 YPDSF_0026 YPDSF_0027   mtlR FALSE 0.355 207.000 0.230 NA N NA
 3575261 3575262 YPDSF_0027 YPDSF_0028 mtlR   FALSE 0.106 249.000 0.067 NA   NA
 3575263 3575264 YPDSF_0029 YPDSF_0030     FALSE 0.008 633.000 0.000 NA   NA
 3575264 3575265 YPDSF_0030 YPDSF_0031     FALSE 0.156 190.000 0.000 NA   NA
 3575265 3575266 YPDSF_0031 YPDSF_0032     FALSE 0.004 344.000 0.000 1.000 N NA
 3575266 3575267 YPDSF_0032 YPDSF_0033     FALSE 0.001 436.000 0.029 1.000 N NA
 3575268 3575269 YPDSF_0034 YPDSF_0035     TRUE 0.899 49.000 0.125 0.002   NA
 3575269 3575270 YPDSF_0035 YPDSF_0036     TRUE 0.997 13.000 0.833 0.001   NA
 3575270 3575271 YPDSF_0036 YPDSF_0037     TRUE 1.000 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 3575271 3575272 YPDSF_0037 YPDSF_0038     TRUE 0.966 0.000 0.182 NA N NA
 3575272 3575273 YPDSF_0038 YPDSF_0039     FALSE 0.125 184.000 0.083 NA N NA
 3575273 3575274 YPDSF_0039 YPDSF_0040     TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.001 N NA
 3575277 3575278 YPDSF_0043 YPDSF_0044     FALSE 0.035 323.000 0.000 NA   NA
 3575278 3575279 YPDSF_0044 YPDSF_0045     FALSE 0.348 79.000 0.000 NA   NA
 3575279 3575280 YPDSF_0045 YPDSF_0046     FALSE 0.015 446.000 0.000 NA   NA
 3575280 3575281 YPDSF_0046 YPDSF_0047     FALSE 0.002 473.000 0.000 1.000 N NA
 3575281 3575282 YPDSF_0047 YPDSF_0048     FALSE 0.001 762.000 0.000 1.000 N NA
 3575282 3575283 YPDSF_0048 YPDSF_0049     TRUE 0.835 35.000 0.190 1.000   NA
 3575283 3575284 YPDSF_0049 YPDSF_0050   glpE TRUE 0.959 18.000 0.405 1.000   NA
 3575284 3575285 YPDSF_0050 YPDSF_0051 glpE   FALSE 0.003 375.000 0.000 1.000 N NA
 3575286 3575287 YPDSF_0052 YPDSF_0053   malQ TRUE 0.985 13.000 0.137 0.022 Y NA
 3575288 3575289 YPDSF_0054 YPDSF_0055     TRUE 0.506 60.000 0.066 1.000   NA
 3575290 3575291 YPDSF_0056 YPDSF_0057     FALSE 0.127 170.000 0.010 NA   NA
 3575292 3575293 YPDSF_0058 YPDSF_0059   feoB TRUE 0.942 36.000 0.455 NA   NA
 3575293 3575294 YPDSF_0059 YPDSF_0060 feoB feoA TRUE 0.867 92.000 0.177 1.000 Y NA
 3575294 3575295 YPDSF_0060 YPDSF_0061 feoA   FALSE 0.002 524.000 0.000 1.000 N NA
 3575296 3575297 YPDSF_0062 YPDSF_0063 greB ompR TRUE 0.810 136.000 0.067 0.083 Y NA
 3575297 3575298 YPDSF_0063 YPDSF_0064 ompR envZ TRUE 0.998 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 3575299 3575300 YPDSF_0065 YPDSF_0066   hslO FALSE 0.035 197.000 0.048 1.000 N NA
 3575300 3575301 YPDSF_0066 YPDSF_0067 hslO   FALSE 0.310 163.000 0.140 1.000 N NA
 3575301 3575302 YPDSF_0067 YPDSF_0068     TRUE 0.606 29.000 0.056 1.000   NA
 3575302 3575303 YPDSF_0068 YPDSF_0069     FALSE 0.463 144.000 0.122 1.000   NA
 3575306 3575307 YPDSF_0072 YPDSF_0073     TRUE 0.998 0.000 0.870 NA   NA
 3575307 3575308 YPDSF_0073 YPDSF_0074     TRUE 0.885 -52.000 0.174 NA   NA
 3575308 3575309 YPDSF_0074 YPDSF_0075     TRUE 0.899 -34.000 0.167 NA   NA
 3575311 3575312 YPDSF_0077 YPDSF_0078   aroK FALSE 0.150 349.000 0.319 1.000 N NA
 3575312 3575313 YPDSF_0078 YPDSF_0079 aroK aroB TRUE 0.923 57.000 0.208 1.000 Y NA
 3575313 3575314 YPDSF_0079 YPDSF_0080 aroB   FALSE 0.050 254.000 0.022 NA   NA
 3575314 3575315 YPDSF_0080 YPDSF_0081     TRUE 0.767 84.000 0.234 NA   NA
 3575315 3575316 YPDSF_0081 YPDSF_0082     FALSE 0.012 303.000 0.053 1.000 N NA
 3575316 3575317 YPDSF_0082 YPDSF_0083     TRUE 0.879 -7.000 0.050 1.000   NA
 3575317 3575318 YPDSF_0083 YPDSF_0084     TRUE 0.956 2.000 0.118 1.000   NA
 3575319 3575320 YPDSF_0085 YPDSF_0086 cysG   FALSE 0.182 88.000 0.065 1.000 N NA
 3575320 3575321 YPDSF_0086 YPDSF_0087   nirD TRUE 0.833 179.000 0.283 1.000 Y NA
 3575321 3575322 YPDSF_0087 YPDSF_0088 nirD   TRUE 0.999 -3.000 0.829 0.001 N NA
 3575326 3575327 YPDSF_0092 YPDSF_0093     FALSE 0.074 249.000 0.000 NA   NA
 3575327 3575328 YPDSF_0093 YPDSF_0094     TRUE 0.820 -12.000 0.000 NA   NA
 3575329 3575330 YPDSF_0095 YPDSF_0096     FALSE 0.034 326.000 0.000 1.000   NA
 3575330 3575331 YPDSF_0096 YPDSF_0097     FALSE 0.048 243.000 0.007 1.000   NA
 3575331 3575332 YPDSF_0097 YPDSF_0098   argD TRUE 0.728 133.000 0.088 1.000 Y NA
 3575333 3575334 YPDSF_0099 YPDSF_0100     TRUE 0.548 86.000 0.111 NA   NA
 3575335 3575336 YPDSF_0101 YPDSF_0102     FALSE 0.366 72.000 0.000 NA   NA
 3575337 3575338 YPDSF_0103 YPDSF_0104     TRUE 0.729 149.000 0.303 NA   NA
 3575338 3575339 YPDSF_0104 YPDSF_0105     TRUE 0.985 -3.000 0.222 NA   NA
 3575340 3575341 YPDSF_0106 YPDSF_0107   tauA FALSE 0.021 203.000 0.000 1.000 N NA
 3575341 3575342 YPDSF_0107 YPDSF_0108 tauA tauB TRUE 0.954 9.000 0.023 1.000 Y NA
 3575342 3575343 YPDSF_0108 YPDSF_0109 tauB   TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 3575343 3575344 YPDSF_0109 YPDSF_0110   tauD TRUE 0.972 -3.000 0.214 1.000 N NA
 3575345 3575346 YPDSF_0111 YPDSF_0112     TRUE 0.615 -88.000 0.000 NA   NA
 3575346 3575347 YPDSF_0112 YPDSF_0113     FALSE 0.318 93.000 0.000 NA   NA
 3575347 3575348 YPDSF_0113 YPDSF_0114     FALSE 0.191 135.000 0.020 NA   NA
 3575349 3575350 YPDSF_0115 YPDSF_0116     TRUE 0.997 4.000 0.927 1.000   NA
 3575350 3575351 YPDSF_0116 YPDSF_0117     TRUE 0.963 16.000 0.400 1.000   NA
 3575351 3575352 YPDSF_0117 YPDSF_0118     FALSE 0.381 95.000 0.060 1.000   NA
 3575354 3575355 YPDSF_0120 YPDSF_0121     FALSE 0.405 254.000 0.310 NA   NA
 3575355 3575356 YPDSF_0121 YPDSF_0122     TRUE 0.984 0.000 0.220 NA   NA
 3575356 3575357 YPDSF_0122 YPDSF_0123     TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 3575357 3575358 YPDSF_0123 YPDSF_0124     TRUE 0.994 20.000 0.804 NA Y NA
 3575358 3575359 YPDSF_0124 YPDSF_0125   rpsL FALSE 0.110 138.000 0.058 NA N NA
 3575359 3575360 YPDSF_0125 YPDSF_0126 rpsL   TRUE 0.987 97.000 0.620 0.003 Y NA
 3575360 3575361 YPDSF_0126 YPDSF_0127     TRUE 0.966 94.000 0.579 1.000 Y NA
 3575361 3575362 YPDSF_0127 YPDSF_0128     TRUE 0.898 73.000 0.005 0.001 Y NA
 3575362 3575363 YPDSF_0128 YPDSF_0129     FALSE 0.021 203.000 0.000 1.000 N NA
 3575363 3575364 YPDSF_0129 YPDSF_0130     FALSE 0.030 176.000 0.000 NA N NA
 3575364 3575365 YPDSF_0130 YPDSF_0131     TRUE 0.700 79.000 0.013 NA Y NA
 3575365 3575366 YPDSF_0131 YPDSF_0132     FALSE 0.002 414.000 0.000 1.000 N NA
 3575366 3575367 YPDSF_0132 YPDSF_0133   rplC TRUE 0.983 33.000 0.307 0.019 Y NA
 3575367 3575368 YPDSF_0133 YPDSF_0134 rplC rplD TRUE 0.995 17.000 0.486 0.015 Y NA
 3575368 3575369 YPDSF_0134 YPDSF_0135 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.015 Y NA
 3575369 3575370 YPDSF_0135 YPDSF_0136 rplW rplB TRUE 0.998 17.000 0.849 0.019 Y NA
 3575370 3575371 YPDSF_0136 YPDSF_0137 rplB rpsS TRUE 0.998 15.000 0.820 0.019 Y NA
 3575371 3575372 YPDSF_0137 YPDSF_0138 rpsS rplV TRUE 0.998 15.000 0.769 0.019 Y NA
 3575372 3575373 YPDSF_0138 YPDSF_0139 rplV rpsC TRUE 0.997 18.000 0.719 0.019 Y NA
 3575373 3575374 YPDSF_0139 YPDSF_0140 rpsC rplP TRUE 0.998 13.000 0.828 0.019 Y NA
 3575374 3575375 YPDSF_0140 YPDSF_0141 rplP   TRUE 1.000 0.000 0.802 0.015 Y NA
 3575375 3575376 YPDSF_0141 YPDSF_0142   rpsQ TRUE 1.000 0.000 0.828 0.015 Y NA
 3575376 3575377 YPDSF_0142 YPDSF_0143 rpsQ rplN TRUE 0.978 181.000 0.791 0.019 Y NA
 3575377 3575378 YPDSF_0143 YPDSF_0144 rplN rplX TRUE 0.999 11.000 0.810 0.019 Y NA
 3575378 3575379 YPDSF_0144 YPDSF_0145 rplX rplE TRUE 0.998 15.000 0.758 0.015 Y NA
 3575379 3575380 YPDSF_0145 YPDSF_0146 rplE rpsN TRUE 0.996 14.000 0.496 0.015 Y NA
 3575380 3575381 YPDSF_0146 YPDSF_0147 rpsN rpsH TRUE 0.990 34.000 0.473 0.015 Y NA
 3575381 3575382 YPDSF_0147 YPDSF_0148 rpsH rplF TRUE 0.998 15.000 0.808 0.015 Y NA
 3575382 3575383 YPDSF_0148 YPDSF_0149 rplF rplR TRUE 0.999 10.000 0.815 0.015 Y NA
 3575383 3575384 YPDSF_0149 YPDSF_0150 rplR rpsE TRUE 0.998 15.000 0.814 0.019 Y NA
 3575384 3575385 YPDSF_0150 YPDSF_0151 rpsE rplO TRUE 0.832 186.000 0.148 0.019 Y NA
 3575385 3575386 YPDSF_0151 YPDSF_0152 rplO secY TRUE 0.991 8.000 0.730 1.000 N NA
 3575386 3575387 YPDSF_0152 YPDSF_0153 secY rpsM FALSE 0.002 298.000 0.011 1.000 N NA
 3575387 3575388 YPDSF_0153 YPDSF_0154 rpsM   TRUE 0.998 17.000 0.810 0.015 Y NA
 3575388 3575389 YPDSF_0154 YPDSF_0155   rpsD TRUE 0.992 31.000 0.509 0.019 Y NA
 3575389 3575390 YPDSF_0155 YPDSF_0156 rpsD   TRUE 0.947 26.000 0.549 1.000 N NA
 3575390 3575391 YPDSF_0156 YPDSF_0157   rplQ TRUE 0.971 41.000 0.873 1.000 N NA
 3575391 3575392 YPDSF_0157 YPDSF_0158 rplQ zntR FALSE 0.001 447.000 0.005 1.000 N NA
 3575392 3575393 YPDSF_0158 YPDSF_0159 zntR   TRUE 0.739 88.000 0.219 NA   NA
 3575394 3575395 YPDSF_0160 YPDSF_0161 mscL trkA FALSE 0.014 139.000 0.007 1.000 N NA
 3575395 3575396 YPDSF_0161 YPDSF_0162 trkA   FALSE 0.032 56.000 0.007 1.000 N NA
 3575396 3575397 YPDSF_0162 YPDSF_0163   fmt TRUE 0.921 94.000 0.305 1.000 Y NA
 3575397 3575398 YPDSF_0163 YPDSF_0164 fmt def TRUE 0.949 25.000 0.058 0.022 Y NA
 3575399 3575400 YPDSF_0165 YPDSF_0166     TRUE 0.875 -28.000 0.124 NA   NA
 3575400 3575401 YPDSF_0166 YPDSF_0167     TRUE 0.941 20.000 0.331 NA   NA
 3575401 3575402 YPDSF_0167 YPDSF_0168     TRUE 0.935 2.000 0.137 NA N NA
 3575402 3575403 YPDSF_0168 YPDSF_0169   aroE TRUE 0.778 9.000 0.087 NA N NA
 3575405 3575406 YPDSF_R0001 YPDSF_R0002     FALSE 0.322 91.000 0.000 NA   NA
 3575406 3575407 YPDSF_R0002 YPDSF_R0003     FALSE 0.445 52.000 0.000 NA   NA
 3575407 3575408 YPDSF_R0003 YPDSF_R0004     FALSE 0.109 219.000 0.000 NA   NA
 3575408 3575409 YPDSF_R0004 YPDSF_R0005     FALSE 0.293 105.000 0.000 NA   NA
 3575409 3575410 YPDSF_R0005 YPDSF_R0006     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 3575410 3575411 YPDSF_R0006 YPDSF_R0005b     TRUE 0.523 33.000 0.000 NA   NA
 3575411 3575412 YPDSF_R0005b YPDSF_0171     FALSE 0.006 732.000 0.000 NA   NA
 3575414 3575415 YPDSF_0173 YPDSF_0174     TRUE 0.893 47.000 0.118 1.000 Y NA
 3575415 3575416 YPDSF_0174 YPDSF_0175   aceK FALSE 0.257 256.000 0.273 1.000 N NA
 3575419 3575420 YPDSF_0178 YPDSF_0179     TRUE 0.690 -34.000 0.000 NA   NA
 3575420 3575421 YPDSF_0179 YPDSF_0180     FALSE 0.372 70.000 0.000 NA   NA
 3575421 3575422 YPDSF_0180 YPDSF_0181     FALSE 0.002 481.000 0.000 NA N NA
 3575423 3575424 YPDSF_0182 YPDSF_0183 pgi   FALSE 0.178 135.000 0.015 1.000   NA
 3575425 3575426 YPDSF_0184 YPDSF_0185 malG malF TRUE 0.998 14.000 0.814 0.074 Y NA
 3575426 3575427 YPDSF_0185 YPDSF_0186 malF malE TRUE 0.543 187.000 0.060 1.000 Y NA
 3575428 3575429 YPDSF_0187 YPDSF_0188     TRUE 0.871 4.000 0.000 NA   NA
 3575429 3575430 YPDSF_0188 YPDSF_0189   lamB TRUE 0.857 71.000 0.000 0.094 Y NA
 3575430 3575431 YPDSF_0189 YPDSF_0190 lamB   FALSE 0.083 241.000 0.000 1.000   NA
 3575431 3575432 YPDSF_0190 YPDSF_0191     FALSE 0.031 339.000 0.000 NA   NA
 3575434 3575435 YPDSF_0193 YPDSF_0194     TRUE 0.964 68.000 0.821 NA   NA
 3575435 3575436 YPDSF_0194 YPDSF_0195     TRUE 0.993 7.000 0.627 NA   NA
 3575436 3575437 YPDSF_0195 YPDSF_0196     TRUE 0.996 0.000 0.552 NA   NA
 3575438 3575439 YPDSF_0197 YPDSF_0198     TRUE 0.756 54.000 0.167 NA   NA
 3575440 3575441 YPDSF_0199 YPDSF_0200     TRUE 0.991 -36.000 0.863 NA   NA
 3575441 3575442 YPDSF_0200 YPDSF_0201     TRUE 0.875 126.000 0.510 NA   NA
 3575442 3575443 YPDSF_0201 YPDSF_0202     TRUE 0.998 0.000 0.862 NA   NA
 3575443 3575444 YPDSF_0202 YPDSF_0203     TRUE 0.997 3.000 0.765 NA   NA
 3575444 3575445 YPDSF_0203 YPDSF_0204     TRUE 0.997 0.000 0.673 NA   NA
 3575445 3575446 YPDSF_0204 YPDSF_0205     TRUE 0.982 11.000 0.471 NA   NA
 3575446 3575447 YPDSF_0205 YPDSF_0206     TRUE 0.911 -3.000 0.039 1.000   NA
 3575447 3575448 YPDSF_0206 YPDSF_0207     TRUE 0.928 -3.000 0.053 NA   NA
 3575448 3575449 YPDSF_0207 YPDSF_0208     TRUE 0.995 6.000 0.711 NA   NA
 3575449 3575450 YPDSF_0208 YPDSF_0209     TRUE 0.977 32.000 0.750 NA   NA
 3575450 3575451 YPDSF_0209 YPDSF_0210     TRUE 0.775 125.000 0.312 NA   NA
 3575451 3575452 YPDSF_0210 YPDSF_0211     TRUE 0.611 -93.000 0.000 NA   NA
 3575452 3575453 YPDSF_0211 YPDSF_0212     TRUE 0.596 22.000 0.000 NA   NA
 3575453 3575454 YPDSF_0212 YPDSF_0213     TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 3575454 3575455 YPDSF_0213 YPDSF_0214     TRUE 0.955 -7.000 0.143 NA   NA
 3575455 3575456 YPDSF_0214 YPDSF_0215     TRUE 0.549 28.000 0.000 NA   NA
 3575457 3575458 YPDSF_0216 YPDSF_0217     FALSE 0.355 76.000 0.000 NA   NA
 3575458 3575459 YPDSF_0217 YPDSF_0218     TRUE 0.621 82.000 0.133 NA   NA
 3575460 3575461 YPDSF_0219 YPDSF_0220     TRUE 0.870 22.000 0.182 NA   NA
 3575461 3575462 YPDSF_0220 YPDSF_0221     TRUE 0.883 3.000 0.000 NA   NA
 3575462 3575463 YPDSF_0221 YPDSF_0222     FALSE 0.477 45.000 0.000 NA   NA
 3575463 3575464 YPDSF_0222 YPDSF_0223     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 3575465 3575466 YPDSF_0224 YPDSF_0225     TRUE 0.994 -3.000 0.455 NA   NA
 3575468 3575469 YPDSF_0227 YPDSF_0228     TRUE 0.968 6.000 0.000 1.000 Y NA
 3575469 3575470 YPDSF_0228 YPDSF_0229     FALSE 0.037 157.000 0.000 1.000 N NA
 3575471 3575472 YPDSF_0230 YPDSF_0231     TRUE 0.902 15.000 0.169 1.000   NA
 3575472 3575473 YPDSF_0231 YPDSF_0232     TRUE 0.920 19.000 0.341 1.000 N NA
 3575473 3575474 YPDSF_0232 YPDSF_0233     TRUE 0.943 9.000 0.226 1.000 N NA
 3575474 3575475 YPDSF_0233 YPDSF_0234   ssuB TRUE 0.998 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 3575477 3575478 YPDSF_0236 YPDSF_0237     FALSE 0.028 349.000 0.000 1.000   NA
 3575479 3575480 YPDSF_0238 YPDSF_0239     FALSE 0.228 152.000 0.000 NA   NA
 3575481 3575482 YPDSF_0240 YPDSF_0241     TRUE 0.931 204.000 0.714 NA Y NA
 3575482 3575483 YPDSF_0241 YPDSF_0242     TRUE 0.999 -7.000 0.667 0.014 Y NA
 3575483 3575484 YPDSF_0242 YPDSF_0243     TRUE 1.000 2.000 0.900 0.014 Y NA
 3575484 3575485 YPDSF_0243 YPDSF_0244     TRUE 0.816 19.000 0.184 1.000 N NA
 3575485 3575486 YPDSF_0244 YPDSF_0245     TRUE 0.976 -3.000 0.102 0.022 N NA
 3575491 3575492 YPDSF_0250 YPDSF_0251     FALSE 0.422 260.000 0.000 0.081 Y NA
 3575495 3575496 YPDSF_0254 YPDSF_0255     FALSE 0.389 65.000 0.000 1.000   NA
 3575496 3575497 YPDSF_0255 YPDSF_0256     FALSE 0.333 178.000 0.105 1.000   NA
 3575497 3575498 YPDSF_0256 YPDSF_0257     FALSE 0.399 154.000 0.105 1.000   NA
 3575498 3575499 YPDSF_0257 YPDSF_0258     FALSE 0.323 90.000 0.000 1.000   NA
 3575499 3575500 YPDSF_0258 YPDSF_0259     FALSE 0.386 66.000 0.000 NA   NA
 3575501 3575502 YPDSF_0260 YPDSF_0261 fis   TRUE 0.736 25.000 0.161 1.000 N NA
 3575502 3575503 YPDSF_0261 YPDSF_0262   prmA FALSE 0.047 566.000 0.042 1.000 Y NA
 3575503 3575504 YPDSF_0262 YPDSF_0263 prmA panF FALSE 0.114 43.000 0.041 1.000 N NA
 3575504 3575505 YPDSF_0263 YPDSF_0264 panF   TRUE 0.994 -10.000 0.682 NA   NA
 3575505 3575506 YPDSF_0264 YPDSF_0265     FALSE 0.010 1358.000 0.103 NA   NA
 3575506 3575507 YPDSF_0265 YPDSF_0266     TRUE 0.995 12.000 0.275 0.001 Y NA
 3575507 3575508 YPDSF_0266 YPDSF_0267     TRUE 0.638 113.000 0.254 1.000 N NA
 3575508 3575509 YPDSF_0267 YPDSF_0268     FALSE 0.037 263.000 0.006 1.000   NA
 3575509 3575510 YPDSF_0268 YPDSF_0269     TRUE 0.999 0.000 0.790 0.046   NA
 3575510 3575511 YPDSF_0269 YPDSF_0270     FALSE 0.132 223.000 0.059 1.000   NA
 3575512 3575513 YPDSF_0271 YPDSF_0272     FALSE 0.004 337.000 0.000 1.000 N NA
 3575513 3575514 YPDSF_0272 YPDSF_0273     TRUE 0.768 204.000 0.689 1.000 N NA
 3575514 3575515 YPDSF_0273 YPDSF_0274     TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 3575515 3575516 YPDSF_0274 YPDSF_0275     TRUE 0.937 8.000 0.206 NA N NA
 3575516 3575517 YPDSF_0275 YPDSF_0276     TRUE 0.979 -10.000 0.417 NA N NA
 3575517 3575518 YPDSF_0276 YPDSF_0277     TRUE 0.800 94.000 0.296 NA   NA
 3575518 3575519 YPDSF_0277 YPDSF_0278     TRUE 0.992 -3.000 0.358 NA   NA
 3575519 3575520 YPDSF_0278 YPDSF_0279     TRUE 0.956 12.000 0.259 NA   NA
 3575521 3575522 YPDSF_0280 YPDSF_0281     TRUE 0.946 25.000 0.000 0.014 Y NA
 3575522 3575523 YPDSF_0281 YPDSF_0282     TRUE 0.969 84.000 1.000 NA   NA
 3575523 3575524 YPDSF_0282 YPDSF_0283     TRUE 0.983 -12.000 0.400 NA   NA
 3575524 3575525 YPDSF_0283 YPDSF_0284     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 3575525 3575526 YPDSF_0284 YPDSF_0285     FALSE 0.257 134.000 0.000 NA   NA
 3575526 3575527 YPDSF_0285 YPDSF_0286     TRUE 0.930 57.000 0.500 NA   NA
 3575527 3575528 YPDSF_0286 YPDSF_0287     FALSE 0.490 41.000 0.000 NA   NA
 3575530 3575531 YPDSF_0289 YPDSF_0290     FALSE 0.436 261.000 0.000 0.062 Y NA
 3575532 3575533 YPDSF_0291 YPDSF_0292     TRUE 0.944 8.000 0.150 NA   NA
 3575533 3575534 YPDSF_0292 YPDSF_0293     TRUE 0.998 2.000 1.000 NA   NA
 3575534 3575535 YPDSF_0293 YPDSF_0294     FALSE 0.060 267.000 0.000 NA   NA
 3575535 3575536 YPDSF_0294 YPDSF_0295     TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.054   NA
 3575536 3575537 YPDSF_0295 YPDSF_0296     FALSE 0.147 195.000 0.000 1.000   NA
 3575537 3575538 YPDSF_0296 YPDSF_0297     TRUE 0.984 5.000 0.329 NA   NA
 3575540 3575541 YPDSF_0299 YPDSF_0300     FALSE 0.029 285.000 0.005 NA   NA
 3575541 3575542 YPDSF_0300 YPDSF_0301     FALSE 0.125 208.000 0.000 NA   NA
 3575543 3575544 YPDSF_0302 YPDSF_0303     FALSE 0.004 353.000 0.000 1.000 N NA
 3575544 3575545 YPDSF_0303 YPDSF_0304     TRUE 0.970 95.000 0.650 1.000 Y NA
 3575545 3575546 YPDSF_0304 YPDSF_0305   treR FALSE 0.003 411.000 0.000 1.000 N NA
 3575546 3575547 YPDSF_0305 YPDSF_0306 treR   FALSE 0.089 234.000 0.000 NA   NA
 3575547 3575548 YPDSF_0306 YPDSF_0307     FALSE 0.043 299.000 0.000 NA   NA
 3575548 3575549 YPDSF_0307 YPDSF_0308     FALSE 0.196 138.000 0.084 NA N NA
 3575549 3575550 YPDSF_0308 YPDSF_0309   pyrB TRUE 0.995 9.000 0.197 0.001 Y NA
 3575550 3575551 YPDSF_0309 YPDSF_0310 pyrB   FALSE 0.004 338.000 0.000 1.000 N NA
 3575551 3575552 YPDSF_0310 YPDSF_0311     TRUE 0.980 -3.000 0.182 NA   NA
 3575552 3575553 YPDSF_0311 YPDSF_0312     FALSE 0.165 306.000 0.186 NA   NA
 3575553 3575554 YPDSF_0312 YPDSF_0313     TRUE 0.933 118.000 0.728 NA   NA
 3575554 3575555 YPDSF_0313 YPDSF_0314     TRUE 0.771 7.000 0.016 NA   NA
 3575555 3575556 YPDSF_0314 YPDSF_0315     TRUE 0.984 24.000 0.820 NA   NA
 3575556 3575557 YPDSF_0315 YPDSF_0316     TRUE 0.720 62.000 0.163 1.000   NA
 3575557 3575558 YPDSF_0316 YPDSF_0317     TRUE 0.991 7.000 0.543 NA   NA
 3575558 3575559 YPDSF_0317 YPDSF_0318     TRUE 0.983 -16.000 0.459 NA   NA
 3575559 3575560 YPDSF_0318 YPDSF_0319     TRUE 0.996 -3.000 0.617 NA   NA
 3575560 3575561 YPDSF_0319 YPDSF_0320     TRUE 0.907 109.000 0.598 1.000   NA
 3575561 3575562 YPDSF_0320 YPDSF_0321     TRUE 0.837 24.000 0.226 1.000 N NA
 3575563 3575564 YPDSF_0322 YPDSF_0323     TRUE 0.869 218.000 0.530 NA Y NA
 3575564 3575565 YPDSF_0323 YPDSF_0324     TRUE 0.993 5.000 0.562 NA   NA
 3575565 3575566 YPDSF_0324 YPDSF_0325     TRUE 0.929 13.000 0.188 NA   NA
 3575566 3575567 YPDSF_0325 YPDSF_0326     TRUE 0.904 36.000 0.308 NA   NA
 3575567 3575568 YPDSF_0326 YPDSF_0327     TRUE 0.838 138.000 0.453 NA   NA
 3575568 3575569 YPDSF_0327 YPDSF_0328     TRUE 0.565 154.000 0.258 NA N NA
 3575572 3575573 YPDSF_0331 YPDSF_0332     FALSE 0.180 271.000 0.154 NA   NA
 3575574 3575575 YPDSF_0333 YPDSF_0334   rplM FALSE 0.021 313.000 0.003 NA   NA
 3575575 3575576 YPDSF_0334 YPDSF_0335 rplM rpsI TRUE 0.997 15.000 0.601 0.015 Y NA
 3575576 3575577 YPDSF_0335 YPDSF_0336 rpsI sspA FALSE 0.001 374.000 0.014 NA N NA
 3575577 3575578 YPDSF_0336 YPDSF_0337 sspA   TRUE 0.996 6.000 0.831 NA   NA
 3575579 3575580 YPDSF_0338 YPDSF_0339   gltD FALSE 0.015 441.000 0.000 NA   NA
 3575580 3575581 YPDSF_0339 YPDSF_0340 gltD gltB TRUE 0.990 10.000 0.096 0.001 Y NA
 3575582 3575583 YPDSF_0341 YPDSF_0342     FALSE 0.139 264.000 0.113 1.000   NA
 3575583 3575584 YPDSF_0342 YPDSF_0343     FALSE 0.081 242.000 0.000 NA   NA
 3575584 3575585 YPDSF_0343 YPDSF_0344     TRUE 0.776 -18.000 0.000 NA   NA
 3575585 3575586 YPDSF_0344 YPDSF_0345   mtgA TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3575587 3575588 YPDSF_0346 YPDSF_0347     TRUE 0.988 11.000 0.613 NA   NA
 3575588 3575589 YPDSF_0347 YPDSF_0348     FALSE 0.141 271.000 0.187 1.000 N NA
 3575589 3575590 YPDSF_0348 YPDSF_0349     TRUE 0.681 84.000 0.172 NA   NA
 3575591 3575592 YPDSF_0350 YPDSF_R0007   rnpB TRUE 0.616 20.000 0.000 NA   NA
 3575595 3575596 YPDSF_0353 YPDSF_0354     FALSE 0.332 86.000 0.000 NA   NA
 3575596 3575597 YPDSF_0354 YPDSF_0355     FALSE 0.141 304.000 0.161 NA   NA
 3575597 3575598 YPDSF_0355 YPDSF_0356     TRUE 0.980 -3.000 0.185 NA   NA
 3575598 3575599 YPDSF_0356 YPDSF_0357     TRUE 0.972 3.000 0.185 NA   NA
 3575599 3575600 YPDSF_0357 YPDSF_0358     TRUE 0.860 5.000 0.000 NA   NA
 3575600 3575601 YPDSF_0358 YPDSF_0359     TRUE 0.871 4.000 0.000 NA   NA
 3575601 3575602 YPDSF_0359 YPDSF_0360     TRUE 0.775 226.000 0.684 NA   NA
 3575602 3575603 YPDSF_0360 YPDSF_0361     TRUE 0.965 -3.000 0.118 NA   NA
 3575603 3575604 YPDSF_0361 YPDSF_0362     FALSE 0.053 278.000 0.000 NA   NA
 3575604 3575605 YPDSF_0362 YPDSF_0363     FALSE 0.138 201.000 0.000 NA   NA
 3575605 3575606 YPDSF_0363 YPDSF_0364     FALSE 0.062 263.000 0.000 NA   NA
 3575606 3575607 YPDSF_0364 YPDSF_0365     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 3575608 3575609 YPDSF_0366 YPDSF_0367     TRUE 0.571 199.000 0.095 1.000 Y NA
 3575609 3575610 YPDSF_0367 YPDSF_0368     TRUE 0.971 11.000 0.126 1.000 Y NA
 3575610 3575611 YPDSF_0368 YPDSF_0369     FALSE 0.463 153.000 0.126 NA   NA
 3575612 3575613 YPDSF_0370 YPDSF_0371     FALSE 0.021 201.000 0.000 1.000 N NA
 3575613 3575614 YPDSF_0371 YPDSF_0372     FALSE 0.013 472.000 0.000 1.000   NA
 3575614 3575615 YPDSF_0372 YPDSF_0373     FALSE 0.167 218.000 0.072 NA   NA
 3575615 3575616 YPDSF_0373 YPDSF_0374     FALSE 0.085 239.000 0.000 NA   NA
 3575618 3575619 YPDSF_0376 YPDSF_0377     FALSE 0.118 213.000 0.000 1.000   NA
 3575619 3575620 YPDSF_0377 YPDSF_0378     FALSE 0.020 391.000 0.000 1.000   NA
 3575620 3575621 YPDSF_0378 YPDSF_0379     TRUE 0.945 32.000 0.452 1.000   NA
 3575621 3575622 YPDSF_0379 YPDSF_0380     TRUE 0.998 0.000 0.789 NA   NA
 3575622 3575623 YPDSF_0380 YPDSF_0381     TRUE 0.539 30.000 0.000 NA   NA
 3575623 3575624 YPDSF_0381 YPDSF_0382     TRUE 0.940 102.000 0.750 NA   NA
 3575624 3575625 YPDSF_0382 YPDSF_0383     TRUE 0.868 -61.000 0.164 NA   NA
 3575625 3575626 YPDSF_0383 YPDSF_0384     TRUE 0.847 33.000 0.200 NA   NA
 3575627 3575628 YPDSF_0385 YPDSF_0386     TRUE 0.830 45.000 0.000 NA Y NA
 3575628 3575629 YPDSF_0386 YPDSF_0387     FALSE 0.047 292.000 0.000 NA   NA
 3575629 3575630 YPDSF_0387 YPDSF_0388     FALSE 0.433 55.000 0.000 NA   NA
 3575630 3575631 YPDSF_0388 YPDSF_0389     FALSE 0.010 545.000 0.000 NA   NA
 3575631 3575632 YPDSF_0389 YPDSF_0390     FALSE 0.394 64.000 0.000 NA   NA
 3575633 3575634 YPDSF_0391 YPDSF_0392     FALSE 0.410 60.000 0.000 1.000   NA
 3575634 3575635 YPDSF_0392 YPDSF_0393     FALSE 0.214 102.000 0.016 NA   NA
 3575636 3575637 YPDSF_0394 YPDSF_0395     TRUE 0.715 83.000 0.030 1.000 Y NA
 3575637 3575638 YPDSF_0395 YPDSF_0396     FALSE 0.192 109.000 0.073 1.000 N NA
 3575638 3575639 YPDSF_0396 YPDSF_0397     FALSE 0.308 77.000 0.089 1.000 N NA
 3575639 3575640 YPDSF_0397 YPDSF_0398     TRUE 0.992 54.000 0.733 0.072 Y NA
 3575640 3575641 YPDSF_0398 YPDSF_0399     TRUE 0.994 0.000 0.105 0.072 Y NA
 3575641 3575642 YPDSF_0399 YPDSF_0400     TRUE 0.992 -3.000 0.375 NA   NA
 3575642 3575643 YPDSF_0400 YPDSF_0401     TRUE 0.906 51.000 0.375 NA   NA
 3575644 3575645 YPDSF_0402 YPDSF_0403     TRUE 0.996 5.000 0.750 NA   NA
 3575645 3575646 YPDSF_0403 YPDSF_0404     TRUE 0.995 -16.000 0.889 NA   NA
 3575646 3575647 YPDSF_0404 YPDSF_0405     TRUE 0.993 10.000 0.778 NA   NA
 3575647 3575648 YPDSF_0405 YPDSF_0406     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3575649 3575650 YPDSF_0407 YPDSF_0408     TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 3575650 3575651 YPDSF_0408 YPDSF_0409     TRUE 0.587 -141.000 0.000 NA   NA
 3575651 3575652 YPDSF_0409 YPDSF_0410     TRUE 0.871 4.000 0.000 NA   NA
 3575652 3575653 YPDSF_0410 YPDSF_0411     FALSE 0.257 134.000 0.000 NA   NA
 3575653 3575654 YPDSF_0411 YPDSF_0412     TRUE 0.669 16.000 0.000 NA   NA
 3575654 3575655 YPDSF_0412 YPDSF_0413     FALSE 0.218 285.000 0.000 NA Y NA
 3575656 3575657 YPDSF_0414 YPDSF_0415     FALSE 0.065 260.000 0.000 NA   NA
 3575659 3575660 YPDSF_0417 YPDSF_0418     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3575661 3575662 YPDSF_0419 YPDSF_0420     TRUE 0.902 -66.000 0.000 0.002   NA
 3575664 3575665 YPDSF_0422 YPDSF_0423     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 3575665 3575666 YPDSF_0423 YPDSF_0424     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 3575666 3575667 YPDSF_0424 YPDSF_0425     TRUE 0.652 17.000 0.000 NA   NA
 3575667 3575668 YPDSF_0425 YPDSF_0426     TRUE 0.749 -22.000 0.000 NA   NA
 3575669 3575670 YPDSF_R0008 YPDSF_0427     FALSE 0.146 196.000 0.000 NA   NA
 3575670 3575671 YPDSF_0427 YPDSF_0428   dnaG TRUE 0.605 158.000 0.299 1.000 N NA
 3575671 3575672 YPDSF_0428 YPDSF_0429 dnaG rpsU FALSE 0.140 136.000 0.067 1.000 N NA
 3575675 3575676 YPDSF_0432 YPDSF_0433 folB   FALSE 0.082 274.000 0.128 1.000 N NA
 3575677 3575678 YPDSF_0434 YPDSF_0435 cca   FALSE 0.223 160.000 0.106 NA N NA
 3575679 3575680 YPDSF_0436 YPDSF_0437     FALSE 0.222 171.000 0.053 1.000   NA
 3575680 3575681 YPDSF_0437 YPDSF_0438     FALSE 0.194 135.000 0.083 1.000 N NA
 3575681 3575682 YPDSF_0438 YPDSF_0439     FALSE 0.043 37.000 0.012 1.000 N NA
 3575684 3575685 YPDSF_0441 YPDSF_0442 ribB   FALSE 0.017 442.000 0.048 1.000   NA
 3575686 3575687 YPDSF_0443 YPDSF_0444     TRUE 0.990 10.000 0.632 NA   NA
 3575687 3575688 YPDSF_0444 YPDSF_0445   tolC FALSE 0.424 301.000 0.480 NA   NA
 3575689 3575690 YPDSF_0446 YPDSF_0447 nudF   TRUE 0.942 34.000 0.443 NA   NA
 3575690 3575691 YPDSF_0447 YPDSF_0448     TRUE 0.985 9.000 0.433 NA   NA
 3575691 3575692 YPDSF_0448 YPDSF_0449     TRUE 0.994 0.000 0.427 NA   NA
 3575692 3575693 YPDSF_0449 YPDSF_0450     TRUE 0.706 102.000 0.217 NA   NA
 3575693 3575694 YPDSF_0450 YPDSF_0451     FALSE 0.227 4.000 0.022 1.000 N NA
 3575695 3575696 YPDSF_0452 YPDSF_0453     FALSE 0.362 73.000 0.000 NA   NA
 3575697 3575698 YPDSF_0454 YPDSF_0455     FALSE 0.008 289.000 0.043 1.000 N NA
 3575700 3575701 YPDSF_0457 YPDSF_0458     FALSE 0.030 308.000 0.025 1.000   NA
 3575701 3575702 YPDSF_0458 YPDSF_0459     TRUE 0.705 -15.000 0.012 NA   NA
 3575707 3575708 YPDSF_0464 YPDSF_0465     TRUE 0.493 193.000 0.212 NA   NA
 3575709 3575710 YPDSF_0466 YPDSF_0467     TRUE 0.999 10.000 0.810 0.090 Y NA
 3575711 3575712 YPDSF_0468 YPDSF_0469     TRUE 0.947 39.000 0.500 NA   NA
 3575712 3575713 YPDSF_0469 YPDSF_0470     TRUE 0.949 -16.000 0.200 NA   NA
 3575713 3575714 YPDSF_0470 YPDSF_0471     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 3575714 3575715 YPDSF_0471 YPDSF_0472     TRUE 0.988 -16.000 0.273 1.000 Y NA
 3575715 3575716 YPDSF_0472 YPDSF_0473     TRUE 1.000 -3.000 0.909 0.015 Y NA
 3575716 3575717 YPDSF_0473 YPDSF_0474     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 3575717 3575718 YPDSF_0474 YPDSF_0475     TRUE 0.996 12.000 0.727 NA Y NA
 3575718 3575719 YPDSF_0475 YPDSF_0476     FALSE 0.172 298.000 0.182 NA   NA
 3575719 3575720 YPDSF_0476 YPDSF_0477     TRUE 0.900 15.000 0.000 0.015   NA
 3575720 3575721 YPDSF_0477 YPDSF_0478     TRUE 0.998 -3.000 0.889 NA   NA
 3575721 3575722 YPDSF_0478 YPDSF_0479     TRUE 0.828 52.000 0.222 NA   NA
 3575723 3575724 YPDSF_0480 YPDSF_0481     FALSE 0.004 353.000 0.000 1.000 N NA
 3575724 3575725 YPDSF_0481 YPDSF_0482     TRUE 0.904 18.000 0.000 1.000 Y NA
 3575725 3575726 YPDSF_0482 YPDSF_0483     TRUE 0.570 25.000 0.000 NA   NA
 3575726 3575727 YPDSF_0483 YPDSF_0484     TRUE 0.707 -30.000 0.000 NA   NA
 3575732 3575733 YPDSF_0489 YPDSF_0490 flhA flhB TRUE 0.996 -13.000 0.333 0.015 Y NA
 3575733 3575734 YPDSF_0490 YPDSF_0491 flhB   TRUE 0.999 0.000 1.000 1.000 Y NA
 3575734 3575735 YPDSF_0491 YPDSF_0492     TRUE 0.997 7.000 0.281 0.004 Y NA
 3575735 3575736 YPDSF_0492 YPDSF_0493   fliP TRUE 0.997 2.000 0.263 0.015 Y NA
 3575736 3575737 YPDSF_0493 YPDSF_0494 fliP   TRUE 0.997 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 3575737 3575738 YPDSF_0494 YPDSF_0495     TRUE 0.946 -7.000 0.123 NA   NA
 3575739 3575740 YPDSF_0496 YPDSF_0497     TRUE 0.967 17.000 0.576 1.000 N NA
 3575740 3575741 YPDSF_0497 YPDSF_0498   fliF TRUE 0.999 10.000 1.000 0.011 Y NA
 3575741 3575742 YPDSF_0498 YPDSF_0499 fliF fliG TRUE 0.999 -28.000 0.970 0.011 Y NA
 3575742 3575743 YPDSF_0499 YPDSF_0500 fliG fliH TRUE 0.999 5.000 0.789 0.006 Y NA
 3575743 3575744 YPDSF_0500 YPDSF_0501 fliH fliI TRUE 0.999 -7.000 0.816 1.000 Y NA
 3575744 3575745 YPDSF_0501 YPDSF_0502 fliI   TRUE 0.857 4.000 0.035 1.000   NA
 3575746 3575747 YPDSF_0503 YPDSF_0504     TRUE 0.997 7.000 0.585 0.004   NA
 3575747 3575748 YPDSF_0504 YPDSF_0505   flgA FALSE 0.205 229.000 0.113 NA   NA
 3575749 3575750 YPDSF_0506 YPDSF_0507 flgB flgC TRUE 1.000 3.000 0.972 0.006 Y NA
 3575750 3575751 YPDSF_0507 YPDSF_0508 flgC flgD TRUE 0.999 3.000 0.914 NA Y NA
 3575751 3575752 YPDSF_0508 YPDSF_0509 flgD flgE TRUE 0.991 55.000 0.970 NA Y NA
 3575752 3575753 YPDSF_0509 YPDSF_0510 flgE flgF TRUE 1.000 0.000 1.000 0.008 Y NA
 3575753 3575754 YPDSF_0510 YPDSF_0511 flgF flgG TRUE 0.996 68.000 0.971 0.002 Y NA
 3575754 3575755 YPDSF_0511 YPDSF_0512 flgG flgH TRUE 0.997 35.000 0.941 0.011 Y NA
 3575755 3575756 YPDSF_0512 YPDSF_0513 flgH flgI TRUE 0.999 14.000 0.912 0.014 Y NA
 3575756 3575757 YPDSF_0513 YPDSF_0514 flgI flgJ TRUE 0.984 10.000 0.457 NA   NA
 3575757 3575758 YPDSF_0514 YPDSF_0515 flgJ flgK TRUE 0.864 113.000 0.457 NA   NA
 3575758 3575759 YPDSF_0515 YPDSF_0516 flgK flgL TRUE 0.987 29.000 0.576 0.002   NA
 3575759 3575760 YPDSF_0516 YPDSF_0517 flgL   TRUE 0.989 12.000 0.667 NA   NA
 3575761 3575762 YPDSF_0518 YPDSF_0519     TRUE 0.991 -19.000 0.714 NA   NA
 3575763 3575764 YPDSF_0520 YPDSF_0521     FALSE 0.138 559.000 0.000 0.002 Y NA
 3575764 3575765 YPDSF_0521 YPDSF_0522     FALSE 0.001 661.000 0.000 1.000 N NA
 3575765 3575766 YPDSF_0522 YPDSF_0523     FALSE 0.011 248.000 0.000 1.000 N NA
 3575767 3575768 YPDSF_0524 YPDSF_0525     FALSE 0.356 72.000 0.100 1.000 N NA
 3575768 3575769 YPDSF_0525 YPDSF_0526     TRUE 0.998 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 3575769 3575770 YPDSF_0526 YPDSF_0527     TRUE 0.987 -3.000 0.250 1.000   NA
 3575770 3575771 YPDSF_0527 YPDSF_0528     TRUE 0.989 -16.000 0.609 1.000   NA
 3575771 3575772 YPDSF_0528 YPDSF_0529     TRUE 0.745 93.000 0.000 0.001   NA
 3575774 3575775 YPDSF_0531 YPDSF_0532     FALSE 0.022 377.000 0.000 1.000   NA
 3575778 3575779 YPDSF_0535 YPDSF_0536     FALSE 0.015 451.000 0.000 NA   NA
 3575779 3575780 YPDSF_0536 YPDSF_0537     FALSE 0.377 68.000 0.000 NA   NA
 3575780 3575781 YPDSF_0537 YPDSF_0538     FALSE 0.004 1945.000 0.000 NA   NA
 3575781 3575782 YPDSF_0538 YPDSF_0539     FALSE 0.461 49.000 0.000 NA   NA
 3575782 3575783 YPDSF_0539 YPDSF_0540     TRUE 0.749 12.000 0.000 NA   NA
 3575783 3575784 YPDSF_0540 YPDSF_0541     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 3575784 3575785 YPDSF_0541 YPDSF_0542     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3575787 3575788 YPDSF_0544 YPDSF_0545     FALSE 0.031 418.000 0.083 NA   NA
 3575788 3575789 YPDSF_0545 YPDSF_0546     TRUE 0.968 -3.000 0.125 NA   NA
 3575789 3575790 YPDSF_0546 YPDSF_0547     TRUE 0.963 16.000 0.400 NA   NA
 3575790 3575791 YPDSF_0547 YPDSF_0548     TRUE 0.808 -13.000 0.000 NA   NA
 3575791 3575792 YPDSF_0548 YPDSF_0549     FALSE 0.309 96.000 0.000 NA   NA
 3575792 3575793 YPDSF_0549 YPDSF_0550     TRUE 0.905 54.000 0.000 0.031 Y NA
 3575793 3575794 YPDSF_0550 YPDSF_0551     FALSE 0.008 608.000 0.000 NA   NA
 3575794 3575795 YPDSF_0551 YPDSF_0552     FALSE 0.337 84.000 0.000 NA   NA
 3575797 3575798 YPDSF_0553 YPDSF_0554     TRUE 0.585 -145.000 0.000 NA   NA
 3575798 3575799 YPDSF_0554 YPDSF_0555     FALSE 0.001 556.000 0.000 NA N NA
 3575799 3575800 YPDSF_0555 YPDSF_0556     TRUE 0.980 46.000 0.545 NA Y NA
 3575800 3575801 YPDSF_0556 YPDSF_0557     TRUE 0.995 33.000 0.727 0.013 Y NA
 3575802 3575803 YPDSF_0558 YPDSF_0559     TRUE 0.985 -7.000 0.128 1.000 Y NA
 3575803 3575804 YPDSF_0559 YPDSF_0560   mltC FALSE 0.006 299.000 0.000 NA N NA
 3575804 3575805 YPDSF_0560 YPDSF_0561 mltC   FALSE 0.264 171.000 0.128 NA N NA
 3575805 3575806 YPDSF_0561 YPDSF_0562     FALSE 0.296 178.000 0.150 1.000 N NA
 3575807 3575808 YPDSF_0563 YPDSF_0564 trmB   TRUE 0.956 0.000 0.092 NA   NA
 3575808 3575809 YPDSF_0564 YPDSF_0565     TRUE 0.527 111.000 0.123 NA   NA
 3575809 3575810 YPDSF_0565 YPDSF_0566     FALSE 0.350 112.000 0.059 NA   NA
 3575810 3575811 YPDSF_0566 YPDSF_0567     TRUE 0.661 -42.000 0.000 NA   NA
 3575811 3575812 YPDSF_0567 YPDSF_0568     FALSE 0.012 496.000 0.000 NA   NA
 3575813 3575814 YPDSF_0569 YPDSF_0570     TRUE 0.918 -19.000 0.218 1.000 N NA
 3575814 3575815 YPDSF_0570 YPDSF_0571     FALSE 0.216 100.000 0.016 NA   NA
 3575815 3575816 YPDSF_0571 YPDSF_0572     TRUE 0.950 -3.000 0.081 NA   NA
 3575816 3575817 YPDSF_0572 YPDSF_0573     FALSE 0.116 288.000 0.117 NA   NA
 3575817 3575818 YPDSF_0573 YPDSF_0574     TRUE 0.498 133.000 0.125 NA   NA
 3575820 3575821 YPDSF_0576 YPDSF_0577     TRUE 0.933 4.000 0.095 1.000   NA
 3575821 3575822 YPDSF_0577 YPDSF_0578     FALSE 0.106 180.000 0.004 1.000   NA
 3575822 3575823 YPDSF_0578 YPDSF_0579     TRUE 0.980 0.000 0.263 NA N NA
 3575823 3575824 YPDSF_0579 YPDSF_0580     FALSE 0.337 116.000 0.120 NA N NA
 3575824 3575825 YPDSF_0580 YPDSF_0581     TRUE 0.844 26.000 0.173 NA   NA
 3575827 3575828 YPDSF_0583 YPDSF_0584     TRUE 0.701 98.000 0.210 1.000   NA
 3575828 3575829 YPDSF_0584 YPDSF_0585     FALSE 0.202 148.000 0.030 1.000   NA
 3575830 3575831 YPDSF_0586 YPDSF_0587     FALSE 0.012 160.000 0.006 1.000 N NA
 3575833 3575834 YPDSF_0589 YPDSF_0590     FALSE 0.006 308.000 0.000 1.000 N NA
 3575834 3575835 YPDSF_0590 YPDSF_0591     FALSE 0.004 341.000 0.000 1.000 N NA
 3575835 3575836 YPDSF_0591 YPDSF_0592   pgk TRUE 0.884 103.000 0.070 0.006 Y NA
 3575836 3575837 YPDSF_0592 YPDSF_0593 pgk   TRUE 0.865 120.000 0.056 0.006 Y NA
 3575837 3575838 YPDSF_0593 YPDSF_0594     FALSE 0.002 438.000 0.038 NA N NA
 3575838 3575839 YPDSF_0594 YPDSF_0595     FALSE 0.070 263.000 0.049 NA   NA
 3575839 3575840 YPDSF_0595 YPDSF_0596     FALSE 0.293 169.000 0.075 NA   NA
 3575842 3575843 YPDSF_0598 YPDSF_0599     FALSE 0.002 307.000 0.029 1.000 N NA
 3575843 3575844 YPDSF_0599 YPDSF_0600     FALSE 0.003 389.000 0.000 1.000 N NA
 3575845 3575846 YPDSF_0601 YPDSF_R0011     FALSE 0.269 127.000 0.000 NA   NA
 3575846 3575847 YPDSF_R0011 YPDSF_0602     FALSE 0.428 56.000 0.000 NA   NA
 3575848 3575849 YPDSF_0603 YPDSF_0604     FALSE 0.442 88.000 0.073 NA   NA
 3575849 3575850 YPDSF_0604 YPDSF_0605     FALSE 0.092 86.000 0.047 1.000 N NA
 3575850 3575851 YPDSF_0605 YPDSF_0606     TRUE 0.991 50.000 0.474 0.001 Y NA
 3575851 3575852 YPDSF_0606 YPDSF_0607   gcvT FALSE 0.000 721.000 0.004 1.000 N NA
 3575852 3575853 YPDSF_0607 YPDSF_0608 gcvT   TRUE 0.979 69.000 0.317 0.001 Y NA
 3575853 3575854 YPDSF_0608 YPDSF_0609     TRUE 0.734 212.000 0.249 1.000 Y NA
 3575854 3575855 YPDSF_0609 YPDSF_0610     FALSE 0.022 378.000 0.000 NA   NA
 3575855 3575856 YPDSF_0610 YPDSF_0611     FALSE 0.024 371.000 0.000 NA   NA
 3575856 3575857 YPDSF_0611 YPDSF_0612     FALSE 0.010 552.000 0.000 NA   NA
 3575857 3575858 YPDSF_0612 YPDSF_0613     TRUE 0.523 33.000 0.000 NA   NA
 3575858 3575859 YPDSF_0613 YPDSF_0614     FALSE 0.295 104.000 0.000 NA   NA
 3575859 3575860 YPDSF_0614 YPDSF_0615     FALSE 0.136 202.000 0.000 NA   NA
 3575860 3575861 YPDSF_0615 YPDSF_0616     FALSE 0.066 258.000 0.000 NA   NA
 3575863 3575864 YPDSF_0618 YPDSF_0619     TRUE 0.820 -19.000 0.061 NA   NA
 3575864 3575865 YPDSF_0619 YPDSF_0620     TRUE 0.927 0.000 0.051 NA   NA
 3575865 3575866 YPDSF_0620 YPDSF_0621     TRUE 0.993 25.000 0.776 1.000 Y NA
 3575866 3575867 YPDSF_0621 YPDSF_0622     TRUE 0.714 100.000 0.311 NA N NA
 3575869 3575870 YPDSF_0624 YPDSF_0625 xerD   FALSE 0.426 31.000 0.079 1.000 N NA
 3575870 3575871 YPDSF_0625 YPDSF_0626     TRUE 0.781 7.000 0.082 1.000 N NA
 3575871 3575872 YPDSF_0626 YPDSF_0627   prfB FALSE 0.001 345.000 0.028 1.000 N NA
 3575872 3575873 YPDSF_0627 YPDSF_0628 prfB lysS TRUE 0.990 10.000 0.162 0.049 Y NA
 3575873 3575874 YPDSF_0628 YPDSF_R0012 lysS   FALSE 0.149 194.000 0.000 NA   NA
 3575874 3575875 YPDSF_R0012 YPDSF_0629     FALSE 0.202 166.000 0.000 NA   NA
 3575876 3575877 YPDSF_0630 YPDSF_0631     FALSE 0.298 101.000 0.000 NA   NA
 3575878 3575879 YPDSF_0632 YPDSF_0633     FALSE 0.205 164.000 0.000 NA   NA
 3575879 3575880 YPDSF_0633 YPDSF_0634     TRUE 0.998 0.000 0.857 NA   NA
 3575883 3575884 YPDSF_0637 YPDSF_0638     FALSE 0.171 182.000 0.000 NA   NA
 3575884 3575885 YPDSF_0638 YPDSF_0639     TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 3575885 3575886 YPDSF_0639 YPDSF_0640     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 3575887 3575888 YPDSF_0641 YPDSF_0642     FALSE 0.011 507.000 0.000 1.000   NA
 3575888 3575889 YPDSF_0642 YPDSF_0643     TRUE 0.976 -3.000 0.160 NA   NA
 3575889 3575890 YPDSF_0643 YPDSF_0644     FALSE 0.005 1281.000 0.000 NA   NA
 3575890 3575891 YPDSF_0644 YPDSF_0645     TRUE 0.972 -30.000 0.429 NA   NA
 3575891 3575892 YPDSF_0645 YPDSF_0646     FALSE 0.008 605.000 0.000 NA   NA
 3575892 3575893 YPDSF_0646 YPDSF_0647     FALSE 0.112 217.000 0.000 NA   NA
 3575894 3575895 YPDSF_0648 YPDSF_0649     TRUE 0.940 0.000 0.065 NA   NA
 3575895 3575896 YPDSF_0649 YPDSF_0650     FALSE 0.017 424.000 0.000 NA   NA
 3575896 3575897 YPDSF_0650 YPDSF_0651     FALSE 0.023 376.000 0.000 NA   NA
 3575897 3575898 YPDSF_0651 YPDSF_0652     FALSE 0.006 779.000 0.000 NA   NA
 3575898 3575899 YPDSF_0652 YPDSF_0653     FALSE 0.382 435.000 0.217 0.013 Y NA
 3575899 3575900 YPDSF_0653 YPDSF_0654     TRUE 0.953 72.000 0.200 0.013 Y NA
 3575900 3575901 YPDSF_0654 YPDSF_0655     FALSE 0.053 539.000 0.000 1.000 Y NA
 3575902 3575903 YPDSF_0656 YPDSF_0657     FALSE 0.212 160.000 0.000 NA   NA
 3575903 3575904 YPDSF_0657 YPDSF_0658     TRUE 0.722 -27.000 0.000 NA   NA
 3575904 3575905 YPDSF_0658 YPDSF_0659     TRUE 0.999 12.000 0.885 0.069 Y NA
 3575905 3575906 YPDSF_0659 YPDSF_0660     TRUE 0.994 5.000 0.308 1.000 Y NA
 3575906 3575907 YPDSF_0660 YPDSF_0661     FALSE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 3575907 3575908 YPDSF_0661 YPDSF_0662     TRUE 0.749 12.000 0.000 NA   NA
 3575908 3575909 YPDSF_0662 YPDSF_0663     FALSE 0.287 112.000 0.000 NA   NA
 3575912 3575913 YPDSF_0666 YPDSF_0667     TRUE 0.898 151.000 0.341 1.000 Y NA
 3575915 3575916 YPDSF_0669 YPDSF_0670   gatY TRUE 0.829 24.000 0.148 NA   NA
 3575916 3575917 YPDSF_0670 YPDSF_0671 gatY   TRUE 0.749 111.000 0.261 NA   NA
 3575917 3575918 YPDSF_0671 YPDSF_0672     TRUE 0.931 123.000 0.727 NA   NA
 3575918 3575919 YPDSF_0672 YPDSF_0673     TRUE 0.975 21.000 0.615 1.000   NA
 3575919 3575920 YPDSF_0673 YPDSF_0674     FALSE 0.242 244.000 0.000 0.025   NA
 3575920 3575921 YPDSF_0674 YPDSF_0675     TRUE 0.970 16.000 0.462 1.000   NA
 3575921 3575922 YPDSF_0675 YPDSF_0676     FALSE 0.023 196.000 0.000 1.000 N NA
 3575922 3575923 YPDSF_0676 YPDSF_0677     TRUE 0.985 3.000 0.104 1.000 Y NA
 3575923 3575924 YPDSF_0677 YPDSF_0678     TRUE 0.993 86.000 0.833 0.009 Y NA
 3575924 3575925 YPDSF_0678 YPDSF_0679     TRUE 0.999 -10.000 0.917 0.009 Y NA
 3575925 3575926 YPDSF_0679 YPDSF_0680     TRUE 0.996 47.000 0.909 0.009 Y NA
 3575926 3575927 YPDSF_0680 YPDSF_0681     TRUE 0.772 18.000 0.150 1.000 N NA
 3575927 3575928 YPDSF_0681 YPDSF_0682     TRUE 0.978 -3.000 0.240 1.000 N NA
 3575928 3575929 YPDSF_0682 YPDSF_0683     TRUE 0.967 50.000 0.400 1.000 Y NA
 3575932 3575933 YPDSF_0686 YPDSF_0687     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3575934 3575935 YPDSF_0688 YPDSF_0689     TRUE 0.900 70.000 0.444 1.000   NA
 3575935 3575936 YPDSF_0689 YPDSF_0690     TRUE 0.670 168.000 0.286 1.000   NA
 3575936 3575937 YPDSF_0690 YPDSF_0691     FALSE 0.008 603.000 0.000 NA   NA
 3575938 3575939 YPDSF_0692 YPDSF_0693     FALSE 0.005 1197.000 0.000 NA   NA
 3575939 3575940 YPDSF_0693 YPDSF_0694     TRUE 0.939 81.000 0.667 NA   NA
 3575940 3575941 YPDSF_0694 YPDSF_0695     TRUE 0.574 147.000 0.012 1.000 Y NA
 3575941 3575942 YPDSF_0695 YPDSF_0696     TRUE 0.944 172.000 0.653 1.000 Y NA
 3575942 3575943 YPDSF_0696 YPDSF_0697     TRUE 0.996 20.000 0.599 0.003 Y NA
 3575943 3575944 YPDSF_0697 YPDSF_0698     TRUE 0.977 -43.000 0.087 0.003 Y NA
 3575944 3575945 YPDSF_0698 YPDSF_0699     TRUE 0.842 83.000 0.132 0.003   NA
 3575945 3575946 YPDSF_0699 YPDSF_0700     FALSE 0.008 598.000 0.000 1.000   NA
 3575946 3575947 YPDSF_0700 YPDSF_0701     TRUE 0.997 -16.000 0.537 0.083 Y NA
 3575947 3575948 YPDSF_0701 YPDSF_0702     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3575948 3575949 YPDSF_0702 YPDSF_0703     TRUE 0.560 26.000 0.000 NA   NA
 3575954 3575955 YPDSF_0708 YPDSF_0709     TRUE 0.570 25.000 0.000 NA   NA
 3575955 3575956 YPDSF_0709 YPDSF_0710     FALSE 0.377 68.000 0.000 NA   NA
 3575956 3575957 YPDSF_0710 YPDSF_0711     TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.006 Y NA
 3575957 3575958 YPDSF_0711 YPDSF_0712     TRUE 0.999 0.000 0.857 1.000 Y NA
 3575958 3575959 YPDSF_0712 YPDSF_0713     TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 3575961 3575962 YPDSF_0715 YPDSF_0716     FALSE 0.005 1329.000 0.000 NA   NA
 3575963 3575964 YPDSF_0717 YPDSF_0718     TRUE 0.685 205.000 0.186 1.000 Y NA
 3575964 3575965 YPDSF_0718 YPDSF_0719   rpmI TRUE 0.970 97.000 0.652 1.000 Y NA
 3575965 3575966 YPDSF_0719 YPDSF_0720 rpmI rplT TRUE 0.997 38.000 0.928 0.014 Y NA
 3575966 3575967 YPDSF_0720 YPDSF_0721 rplT pheS FALSE 0.157 499.000 0.202 1.000 Y NA
 3575967 3575968 YPDSF_0721 YPDSF_0722 pheS pheT TRUE 0.998 14.000 0.574 0.001 Y NA
 3575968 3575969 YPDSF_0722 YPDSF_0723 pheT ihfA TRUE 0.951 5.000 0.208 1.000 N NA
 3575969 3575970 YPDSF_0723 YPDSF_0724 ihfA   FALSE 0.024 373.000 0.000 NA   NA
 3575970 3575971 YPDSF_0724 YPDSF_0725     FALSE 0.125 212.000 0.044 NA   NA
 3575971 3575972 YPDSF_0725 YPDSF_0726     FALSE 0.301 70.000 0.084 1.000 N NA
 3575972 3575973 YPDSF_0726 YPDSF_0727     FALSE 0.098 25.000 0.036 1.000 N NA
 3575973 3575974 YPDSF_0727 YPDSF_0728     FALSE 0.043 350.000 0.129 1.000 N NA
 3575974 3575975 YPDSF_0728 YPDSF_0729     TRUE 0.993 -13.000 0.378 NA Y NA
 3575975 3575976 YPDSF_0729 YPDSF_0730     TRUE 0.995 -3.000 0.220 NA Y NA
 3575976 3575977 YPDSF_0730 YPDSF_0731     TRUE 0.998 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 3575977 3575978 YPDSF_0731 YPDSF_0732   arnT TRUE 0.812 -3.000 0.061 1.000 N NA
 3575978 3575979 YPDSF_0732 YPDSF_0733 arnT   TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000   NA
 3575979 3575980 YPDSF_0733 YPDSF_0734     TRUE 0.996 -3.000 0.613 NA   NA
 3575980 3575981 YPDSF_0734 YPDSF_0735     FALSE 0.174 280.000 0.161 NA   NA
 3575981 3575982 YPDSF_0735 YPDSF_0736   lplA FALSE 0.238 125.000 0.091 NA N NA
 3575982 3575983 YPDSF_0736 YPDSF_0737 lplA   FALSE 0.315 52.000 0.006 NA   NA
 3575984 3575985 YPDSF_0738 YPDSF_0739     TRUE 0.522 157.000 0.165 1.000   NA
 3575988 3575989 YPDSF_0742 YPDSF_0743     FALSE 0.372 122.000 0.129 NA N NA
 3575989 3575990 YPDSF_0743 YPDSF_0744   sufA FALSE 0.008 616.000 0.000 NA   NA
 3575990 3575991 YPDSF_0744 YPDSF_0745 sufA   TRUE 0.691 15.000 0.041 NA   NA
 3575991 3575992 YPDSF_0745 YPDSF_0746   sufC TRUE 0.895 186.000 0.466 1.000 Y NA
 3575992 3575993 YPDSF_0746 YPDSF_0747 sufC   TRUE 0.992 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 3575993 3575994 YPDSF_0747 YPDSF_0748     TRUE 0.968 -3.000 0.193 1.000 N NA
 3575994 3575995 YPDSF_0748 YPDSF_0749     TRUE 0.689 89.000 0.183 NA   NA
 3575995 3575996 YPDSF_0749 YPDSF_0750     FALSE 0.119 271.000 0.103 NA   NA
 3575997 3575998 YPDSF_0751 YPDSF_0752     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3575998 3575999 YPDSF_0752 YPDSF_0753     FALSE 0.082 582.000 0.000 0.091 Y NA
 3575999 10163952 YPDSF_0753 YPDSF_5000   lpp FALSE 0.024 191.000 0.000 1.000 N NA
 10163952 3576000 YPDSF_5000 YPDSF_0754 lpp   FALSE 0.005 321.000 0.000 1.000 N NA
 3576000 3576001 YPDSF_0754 YPDSF_R0013     FALSE 0.009 576.000 0.000 NA   NA
 3576001 3576002 YPDSF_R0013 YPDSF_R0014     FALSE 0.412 60.000 0.000 NA   NA
 3576002 3576003 YPDSF_R0014 YPDSF_0755     FALSE 0.080 243.000 0.000 NA   NA
 3576005 3576006 YPDSF_0757 YPDSF_0758     FALSE 0.002 480.000 0.000 1.000 N NA
 3576008 3576009 YPDSF_0760 YPDSF_0761     FALSE 0.001 527.000 0.000 1.000 N NA
 3576009 3576010 YPDSF_0761 YPDSF_0762     FALSE 0.001 378.000 0.015 NA N NA
 3576012 3576013 YPDSF_0764 YPDSF_0765     FALSE 0.469 79.000 0.136 1.000 N NA
 3576015 3576016 YPDSF_0767 YPDSF_0768     TRUE 0.783 88.000 0.362 1.000 N NA
 3576016 3576017 YPDSF_0768 YPDSF_0769     FALSE 0.252 223.000 0.128 1.000   NA
 3576018 3576019 YPDSF_0770 YPDSF_0771     FALSE 0.272 132.000 0.045 NA   NA
 3576019 3576020 YPDSF_0771 YPDSF_0772     FALSE 0.006 798.000 0.000 1.000   NA
 3576022 3576023 YPDSF_0774 YPDSF_0775 anmK   FALSE 0.403 55.000 0.034 NA   NA
 3576023 3576024 YPDSF_0775 YPDSF_0776     TRUE 0.563 22.000 0.034 NA   NA
 3576024 3576025 YPDSF_0776 YPDSF_0777     FALSE 0.057 182.000 0.054 1.000 N NA
 3576025 3576026 YPDSF_0777 YPDSF_0778     FALSE 0.038 155.000 0.041 1.000 N NA
 3576027 3576028 YPDSF_0779 YPDSF_0780     FALSE 0.106 245.000 0.062 NA   NA
 3576028 3576029 YPDSF_0780 YPDSF_0781     FALSE 0.077 246.000 0.000 NA   NA
 3576029 3576030 YPDSF_0781 YPDSF_0782   tppB FALSE 0.068 255.000 0.000 NA   NA
 3576030 3576031 YPDSF_0782 YPDSF_0783 tppB   FALSE 0.007 643.000 0.000 NA   NA
 3576031 3576032 YPDSF_0783 YPDSF_0784     FALSE 0.020 390.000 0.000 NA   NA
 3576032 3576033 YPDSF_0784 YPDSF_0785     TRUE 0.999 0.000 0.684 0.024 Y NA
 3576033 3576034 YPDSF_0785 YPDSF_0786     TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y NA
 3576034 3576035 YPDSF_0786 YPDSF_0787     TRUE 0.994 -13.000 0.284 0.069 Y NA
 3576035 3576036 YPDSF_0787 YPDSF_0788     TRUE 0.990 -3.000 0.264 0.069 N NA
 3576039 3576040 YPDSF_0791 YPDSF_0792   pspB TRUE 0.906 162.000 0.739 NA   NA
 3576040 3576041 YPDSF_0792 YPDSF_0793 pspB   TRUE 0.998 0.000 0.913 NA   NA
 3576041 3576042 YPDSF_0793 YPDSF_0794     TRUE 0.666 85.000 0.167 NA   NA
 3576042 3576043 YPDSF_0794 YPDSF_0795     TRUE 0.795 -19.000 0.052 NA   NA
 3576043 3576044 YPDSF_0795 YPDSF_0796     TRUE 0.998 -3.000 0.791 NA   NA
 3576045 3576046 YPDSF_0797 YPDSF_0798     TRUE 0.901 62.000 0.412 NA   NA
 3576048 3576049 YPDSF_0800 YPDSF_0801     TRUE 0.617 149.000 0.000 1.000 Y NA
 3576049 3576050 YPDSF_0801 YPDSF_0802     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3576050 3576051 YPDSF_0802 YPDSF_0803   tpx FALSE 0.009 262.000 0.000 1.000 N NA
 3576054 3576055 YPDSF_0806 YPDSF_0807   zntB FALSE 0.006 213.000 0.019 1.000 N NA
 3576055 3576056 YPDSF_0807 YPDSF_0808 zntB   FALSE 0.285 115.000 0.000 NA   NA
 3576057 3576058 YPDSF_0809 YPDSF_0810     FALSE 0.005 312.000 0.000 1.000 N NA
 3576058 3576059 YPDSF_0810 YPDSF_0811     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA N NA
 3576059 3576060 YPDSF_0811 YPDSF_0812     FALSE 0.008 275.000 0.000 NA N NA
 3576064 3576065 YPDSF_0816 YPDSF_0817     FALSE 0.025 70.000 0.024 NA N NA
 3576066 3576067 YPDSF_0818 YPDSF_0819     TRUE 0.933 -3.000 0.057 NA   NA
 3576067 3576068 YPDSF_0819 YPDSF_0820     TRUE 0.993 10.000 0.726 NA   NA
 3576072 3576073 YPDSF_0824 YPDSF_0825     FALSE 0.001 665.000 0.000 1.000 N NA
 3576074 3576075 YPDSF_0826 YPDSF_0827     FALSE 0.032 334.000 0.000 NA   NA
 3576076 3576077 YPDSF_0828 YPDSF_0829     TRUE 0.976 26.000 0.676 NA   NA
 3576077 3576078 YPDSF_0829 YPDSF_0830     FALSE 0.009 565.000 0.000 NA   NA
 3576079 3576080 YPDSF_0831 YPDSF_0832     TRUE 0.883 3.000 0.000 NA   NA
 3576082 3576083 YPDSF_0834 YPDSF_0835     TRUE 0.719 94.000 0.300 1.000 N NA
 3576083 3576084 YPDSF_0835 YPDSF_0836     TRUE 0.945 28.000 0.181 1.000 Y NA
 3576086 3576087 YPDSF_0838 YPDSF_0839     FALSE 0.171 270.000 0.143 NA   NA
 3576088 3576089 YPDSF_0840 YPDSF_0841 pntA pntB TRUE 0.994 73.000 0.745 0.001 Y NA
 3576090 3576091 YPDSF_0842 YPDSF_0843     TRUE 0.958 135.000 0.619 1.000 Y NA
 3576091 3576092 YPDSF_0843 YPDSF_0844     FALSE 0.053 73.000 0.038 1.000 N NA
 3576093 3576094 YPDSF_0845 YPDSF_0846     FALSE 0.010 546.000 0.000 NA   NA
 3576094 3576095 YPDSF_0846 YPDSF_0847     FALSE 0.235 131.000 0.033 NA   NA
 3576096 3576097 YPDSF_0848 YPDSF_0849     TRUE 0.998 2.000 0.649 0.002   NA
 3576099 3576100 YPDSF_0851 YPDSF_0852     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 3576100 3576101 YPDSF_0852 YPDSF_0853     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3576101 3576102 YPDSF_0853 YPDSF_0854     TRUE 0.938 5.000 0.111 NA   NA
 3576104 3576105 YPDSF_0856 YPDSF_0857     TRUE 0.995 10.000 0.520 1.000 Y NA
 3576105 3576106 YPDSF_0857 YPDSF_0858     TRUE 0.998 4.000 0.520 0.068 Y NA
 3576107 3576108 YPDSF_0859 YPDSF_0860     FALSE 0.240 144.000 0.000 NA   NA
 3576108 3576109 YPDSF_0860 YPDSF_0861     FALSE 0.362 73.000 0.000 NA   NA
 3576109 3576110 YPDSF_0861 YPDSF_0862     FALSE 0.005 856.000 0.000 NA   NA
 3576110 3576111 YPDSF_0862 YPDSF_0863     FALSE 0.272 146.000 0.053 NA   NA
 3576112 3576113 YPDSF_0864 YPDSF_0865     TRUE 0.535 224.000 0.455 NA N NA
 3576113 3576114 YPDSF_0865 YPDSF_0866     TRUE 0.829 214.000 0.408 NA Y NA
 3576115 3576116 YPDSF_0867 YPDSF_0868     FALSE 0.020 346.000 0.018 1.000   NA
 3576118 3576119 YPDSF_0870 YPDSF_0871     TRUE 0.782 240.000 0.778 NA   NA
 3576120 3576121 YPDSF_0872 YPDSF_0873     FALSE 0.128 206.000 0.000 NA   NA
 3576121 3576122 YPDSF_0873 YPDSF_0874     FALSE 0.148 194.000 0.000 1.000   NA
 3576122 3576123 YPDSF_0874 YPDSF_0875     TRUE 0.740 128.000 0.276 1.000   NA
 3576123 3576124 YPDSF_0875 YPDSF_0876     FALSE 0.106 221.000 0.000 NA   NA
 3576124 3576125 YPDSF_0876 YPDSF_0877     TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 3576125 3576126 YPDSF_0877 YPDSF_0878   araG TRUE 0.639 18.000 0.000 NA   NA
 3576126 3576127 YPDSF_0878 YPDSF_0879 araG   TRUE 0.992 98.000 0.917 0.013 Y NA
 3576128 3576129 YPDSF_0880 YPDSF_0881     FALSE 0.089 84.000 0.046 1.000 N NA
 3576130 3576131 YPDSF_0882 YPDSF_0883     TRUE 0.993 2.000 0.255 0.011   NA
 3576131 3576132 YPDSF_0883 YPDSF_0884     TRUE 0.925 -24.000 0.000 0.011   NA
 3576132 3576133 YPDSF_0884 YPDSF_0885     TRUE 0.846 25.000 0.170 1.000   NA
 3576133 3576134 YPDSF_0885 YPDSF_0886     TRUE 0.643 -52.000 0.000 1.000   NA
 3576135 3576136 YPDSF_0887 YPDSF_0888     FALSE 0.293 105.000 0.000 NA   NA
 3576136 3576137 YPDSF_0888 YPDSF_0889     TRUE 0.562 128.000 0.148 NA   NA
 3576137 3576138 YPDSF_0889 YPDSF_0890     TRUE 0.999 0.000 0.564 0.043 Y NA
 3576138 3576139 YPDSF_0890 YPDSF_0891     TRUE 0.999 -7.000 0.537 0.012 Y NA
 3576141 3576142 YPDSF_0893 YPDSF_0894 rnfD   TRUE 0.999 10.000 0.924 0.043 Y NA
 3576142 3576143 YPDSF_0894 YPDSF_0895     TRUE 1.000 -3.000 0.908 0.043 Y NA
 3576143 3576144 YPDSF_0895 YPDSF_0896     TRUE 0.922 -3.000 0.109 1.000 N NA
 3576145 3576146 YPDSF_0897 YPDSF_0898     TRUE 0.895 38.000 0.103 1.000 Y NA
 3576147 3576148 YPDSF_0899 YPDSF_0900     FALSE 0.004 350.000 0.000 1.000 N NA
 3576148 3576149 YPDSF_0900 YPDSF_0901     TRUE 0.886 -31.000 0.143 NA   NA
 3576154 3576155 YPDSF_0906 YPDSF_0907     TRUE 0.666 0.000 0.045 1.000 N NA
 3576157 3576158 YPDSF_0909 YPDSF_0910     TRUE 0.992 7.000 0.576 1.000   NA
 3576158 3576159 YPDSF_0910 YPDSF_0911     FALSE 0.451 169.000 0.143 1.000   NA
 3576161 3576162 YPDSF_0913 YPDSF_0914     FALSE 0.026 364.000 0.000 NA   NA
 3576162 3576163 YPDSF_0914 YPDSF_0915   cysB FALSE 0.032 336.000 0.000 NA   NA
 3576163 3576164 YPDSF_0915 YPDSF_0916 cysB   FALSE 0.002 420.000 0.000 1.000 N NA
 3576164 3576165 YPDSF_0916 YPDSF_0917     FALSE 0.354 230.000 0.000 1.000 Y NA
 3576168 3576169 YPDSF_0920 YPDSF_0921     FALSE 0.333 -37.000 0.050 1.000 N NA
 3576170 3576171 YPDSF_0922 YPDSF_0923     FALSE 0.172 347.000 0.075 NA Y NA
 3576171 3576172 YPDSF_0923 YPDSF_0924     TRUE 0.937 17.000 0.281 NA   NA
 3576173 3576174 YPDSF_0925 YPDSF_0926     TRUE 1.000 0.000 0.703 0.001 Y NA
 3576174 3576175 YPDSF_0926 YPDSF_0927   trpD TRUE 0.943 15.000 0.083 1.000 Y NA
 3576175 3576176 YPDSF_0927 YPDSF_0928 trpD   TRUE 0.994 4.000 0.293 1.000 Y NA
 3576176 3576177 YPDSF_0928 YPDSF_0929     TRUE 0.939 157.000 0.221 0.001 Y NA
 3576177 3576178 YPDSF_0929 YPDSF_0930   trpA TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 3576178 3576179 YPDSF_0930 YPDSF_0931 trpA   TRUE 0.712 14.000 0.000 NA   NA
 3576179 3576180 YPDSF_0931 YPDSF_0932     FALSE 0.175 180.000 0.000 NA   NA
 3576181 3576182 YPDSF_0933 YPDSF_0934     FALSE 0.306 97.000 0.000 NA   NA
 3576184 3576185 YPDSF_0936 YPDSF_0937     TRUE 0.528 32.000 0.000 NA   NA
 3576186 3576187 YPDSF_0938 YPDSF_0939     TRUE 0.540 80.000 0.167 NA N NA
 3576187 3576188 YPDSF_0939 YPDSF_0940     FALSE 0.042 148.000 0.000 NA N NA
 3576190 3576191 YPDSF_0942 YPDSF_0943     FALSE 0.102 223.000 0.000 NA   NA
 3576192 3576193 YPDSF_0944 YPDSF_0945     FALSE 0.282 118.000 0.000 NA   NA
 3576193 3576194 YPDSF_0945 YPDSF_0946     TRUE 0.730 -25.000 0.000 NA   NA
 3576195 3576196 YPDSF_0947 YPDSF_0948 cls   TRUE 0.683 135.000 0.231 NA   NA
 3576197 3576198 YPDSF_0949 YPDSF_0950     FALSE 0.009 561.000 0.000 NA   NA
 3576198 3576199 YPDSF_0950 YPDSF_0951   oppD TRUE 0.999 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 3576199 3576200 YPDSF_0951 YPDSF_0952 oppD   TRUE 0.994 12.000 0.554 1.000 Y NA
 3576200 3576201 YPDSF_0952 YPDSF_0953   oppB TRUE 0.997 19.000 0.870 0.067 Y NA
 3576201 3576202 YPDSF_0953 YPDSF_0954 oppB   TRUE 0.918 87.000 0.151 0.067 Y NA
 3576202 3576203 YPDSF_0954 YPDSF_0955     FALSE 0.001 837.000 0.000 NA N NA
 3576207 3576208 YPDSF_0959 YPDSF_0960     FALSE 0.002 517.000 0.000 1.000 N NA
 3576208 3576209 YPDSF_0960 YPDSF_0961     FALSE 0.006 307.000 0.000 1.000 N NA
 3576210 3576211 YPDSF_0962 YPDSF_0963   purU TRUE 0.719 84.000 0.200 NA   NA
 3576211 3576212 YPDSF_0963 YPDSF_R0015 purU   FALSE 0.233 149.000 0.000 NA   NA
 3576212 3576213 YPDSF_R0015 YPDSF_0964     FALSE 0.019 404.000 0.000 NA   NA
 3576215 3576216 YPDSF_0966 YPDSF_0967     FALSE 0.128 98.000 0.056 1.000 N NA
 3576217 3576218 YPDSF_0968 YPDSF_0969     TRUE 0.967 -3.000 0.123 NA   NA
 3576218 3576219 YPDSF_0969 YPDSF_0970     FALSE 0.070 75.000 0.041 1.000 N NA
 3576219 3576220 YPDSF_0970 YPDSF_0971     FALSE 0.005 225.000 0.033 1.000 N NA
 3576221 3576222 YPDSF_0972 YPDSF_0973   ansA FALSE 0.313 117.000 0.113 1.000 N NA
 3576222 3576223 YPDSF_0973 YPDSF_0974 ansA   FALSE 0.211 15.000 0.040 1.000 N NA
 3576224 3576225 YPDSF_0975 YPDSF_0976     TRUE 0.929 -31.000 0.216 NA   NA
 3576226 3576227 YPDSF_0977 YPDSF_0978     FALSE 0.320 314.000 0.154 1.000 Y NA
 3576229 3576230 YPDSF_0980 YPDSF_0981     TRUE 0.905 150.000 0.683 NA   NA
 3576230 3576231 YPDSF_0981 YPDSF_0982     FALSE 0.194 108.000 0.007 NA   NA
 3576233 3576234 YPDSF_0984 YPDSF_0985     FALSE 0.061 265.000 0.000 NA   NA
 3576238 3576239 YPDSF_0989 YPDSF_0990 nhaB   TRUE 0.737 221.000 0.723 1.000 N NA
 3576241 3576242 YPDSF_0992 YPDSF_0993     TRUE 0.563 17.000 0.019 NA   NA
 3576242 3576243 YPDSF_0993 YPDSF_0994     TRUE 0.822 4.000 0.019 NA   NA
 3576243 3576244 YPDSF_0994 YPDSF_0995     FALSE 0.362 73.000 0.000 NA   NA
 3576245 3576246 YPDSF_0996 YPDSF_0997     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3576246 3576247 YPDSF_0997 YPDSF_0998     TRUE 0.769 11.000 0.000 NA   NA
 3576247 3576248 YPDSF_0998 YPDSF_0999     TRUE 0.652 17.000 0.000 NA   NA
 3576248 3576249 YPDSF_0999 YPDSF_1000     TRUE 0.975 -15.000 0.333 NA   NA
 3576249 3576250 YPDSF_1000 YPDSF_1001     FALSE 0.009 572.000 0.000 NA   NA
 3576250 3576251 YPDSF_1001 YPDSF_1002     FALSE 0.018 414.000 0.000 NA   NA
 3576251 3576252 YPDSF_1002 YPDSF_1003     FALSE 0.301 99.000 0.000 NA   NA
 3576254 3576255 YPDSF_1005 YPDSF_1006     FALSE 0.006 713.000 0.000 NA   NA
 3576255 3576256 YPDSF_1006 YPDSF_1007     TRUE 0.996 3.000 0.714 NA   NA
 3576256 3576257 YPDSF_1007 YPDSF_1008     FALSE 0.279 120.000 0.000 NA   NA
 3576257 3576258 YPDSF_1008 YPDSF_1009     FALSE 0.486 252.000 0.000 0.029 Y NA
 3576258 3576259 YPDSF_1009 YPDSF_1010     FALSE 0.040 306.000 0.000 NA   NA
 3576259 3576260 YPDSF_1010 YPDSF_1011     TRUE 0.952 3.000 0.120 NA   NA
 3576260 3576261 YPDSF_1011 YPDSF_1012     FALSE 0.039 309.000 0.000 NA   NA
 3576261 3576262 YPDSF_1012 YPDSF_1013     TRUE 0.869 13.000 0.111 NA   NA
 3576262 3576263 YPDSF_1013 YPDSF_1014     TRUE 0.890 66.000 0.400 NA   NA
 3576263 3576264 YPDSF_1014 YPDSF_1015     TRUE 0.989 -3.000 0.294 NA   NA
 3576264 3576265 YPDSF_1015 YPDSF_1016     TRUE 0.982 2.000 0.235 NA   NA
 3576265 3576266 YPDSF_1016 YPDSF_1017     FALSE 0.423 57.000 0.000 NA   NA
 3576266 3576267 YPDSF_1017 YPDSF_1018     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3576267 3576268 YPDSF_1018 YPDSF_1019     TRUE 0.985 0.000 0.222 NA   NA
 3576268 3576269 YPDSF_1019 YPDSF_1020     TRUE 0.994 14.000 1.000 NA   NA
 3576269 3576270 YPDSF_1020 YPDSF_1021     TRUE 0.960 122.000 1.000 NA   NA
 3576270 3576271 YPDSF_1021 YPDSF_1022     TRUE 0.901 1.000 0.000 NA   NA
 3576271 3576272 YPDSF_1022 YPDSF_1023     TRUE 0.627 19.000 0.000 NA   NA
 3576272 3576273 YPDSF_1023 YPDSF_1024     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3576273 3576274 YPDSF_1024 YPDSF_1025     TRUE 0.796 10.000 0.000 NA   NA
 3576274 3576275 YPDSF_1025 YPDSF_1026     TRUE 0.971 31.000 0.667 NA   NA
 3576275 3576276 YPDSF_1026 YPDSF_1027     FALSE 0.014 457.000 0.000 1.000   NA
 3576276 3576277 YPDSF_1027 YPDSF_1028     FALSE 0.010 546.000 0.000 1.000   NA
 3576277 3576278 YPDSF_1028 YPDSF_1029     TRUE 0.793 -15.000 0.000 1.000   NA
 3576278 3576279 YPDSF_1029 YPDSF_1030     FALSE 0.006 746.000 0.000 NA   NA
 3576279 3576280 YPDSF_1030 YPDSF_1031     FALSE 0.014 460.000 0.000 NA   NA
 3576280 3576281 YPDSF_1031 YPDSF_1032     FALSE 0.057 271.000 0.000 NA   NA
 3576281 3576282 YPDSF_1032 YPDSF_1033     TRUE 0.901 1.000 0.000 NA   NA
 3576282 3576283 YPDSF_1033 YPDSF_1034     FALSE 0.359 74.000 0.000 NA   NA
 3576285 3576286 YPDSF_1036 YPDSF_1037     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3576288 3576289 YPDSF_1039 YPDSF_1040     FALSE 0.449 103.000 0.088 NA   NA
 3576289 3576290 YPDSF_1040 YPDSF_1041     FALSE 0.103 71.000 0.046 NA N NA
 3576290 3576291 YPDSF_1041 YPDSF_1042     TRUE 0.788 141.000 0.363 NA   NA
 3576292 3576293 YPDSF_1043 YPDSF_1044 minC   TRUE 0.983 25.000 0.466 1.000 Y NA
 3576293 3576294 YPDSF_1044 YPDSF_1045   minE TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 3576295 3576296 YPDSF_1046 YPDSF_1047     FALSE 0.313 121.000 0.115 1.000 N NA
 3576296 3576297 YPDSF_1047 YPDSF_1048     FALSE 0.008 610.000 0.000 NA   NA
 3576297 3576298 YPDSF_1048 YPDSF_1049     TRUE 0.588 23.000 0.000 NA   NA
 3576298 3576299 YPDSF_1049 YPDSF_1050     FALSE 0.251 137.000 0.000 NA   NA
 3576299 3576300 YPDSF_1050 YPDSF_1051     FALSE 0.286 72.000 0.082 1.000 N NA
 3576302 3576303 YPDSF_1053 YPDSF_1054     TRUE 0.999 -13.000 0.869 0.080 Y NA
 3576303 3576304 YPDSF_1054 YPDSF_1055     FALSE 0.001 715.000 0.000 1.000 N NA
 3576304 3576305 YPDSF_1055 YPDSF_1056     FALSE 0.307 242.000 0.034 1.000 Y NA
 3576306 3576307 YPDSF_1057 YPDSF_1058     FALSE 0.005 330.000 0.000 1.000 N NA
 3576308 3576309 YPDSF_1059 YPDSF_1060     FALSE 0.260 267.000 0.299 1.000 N NA
 3576309 3576310 YPDSF_1060 YPDSF_1061   znuA TRUE 0.709 21.000 0.131 1.000 N NA
 3576311 3576312 YPDSF_1062 YPDSF_1063 znuC znuB TRUE 0.999 -3.000 0.755 1.000 Y NA
 3576313 3576314 YPDSF_1064 YPDSF_1065 ruvB ruvA TRUE 0.976 162.000 0.549 0.002 Y NA
 3576314 3576315 YPDSF_1065 YPDSF_1066 ruvA ruvC TRUE 0.922 217.000 0.451 0.011 Y NA
 3576315 3576316 YPDSF_1066 YPDSF_1067 ruvC   TRUE 0.526 209.000 0.277 NA   NA
 3576316 3576317 YPDSF_1067 YPDSF_1068   ntpA FALSE 0.392 58.000 0.035 NA   NA
 3576317 3576318 YPDSF_1068 YPDSF_1069 ntpA aspS TRUE 0.727 0.000 0.050 1.000 N NA
 3576319 3576320 YPDSF_1070 YPDSF_1071     FALSE 0.382 180.000 0.126 NA   NA
 3576320 3576321 YPDSF_1071 YPDSF_1072     FALSE 0.263 191.000 0.089 NA   NA
 3576321 3576322 YPDSF_1072 YPDSF_1073     TRUE 0.990 -3.000 0.315 NA   NA
 3576323 3576324 YPDSF_1074 YPDSF_1075     FALSE 0.115 232.000 0.057 NA   NA
 3576325 3576326 YPDSF_1076 YPDSF_1077   argS FALSE 0.019 402.000 0.000 NA   NA
 3576327 3576328 YPDSF_1078 YPDSF_1079     TRUE 0.980 150.000 1.000 NA Y NA
 3576328 3576329 YPDSF_1079 YPDSF_1080     FALSE 0.014 456.000 0.000 NA   NA
 3576329 3576330 YPDSF_1080 YPDSF_1081     FALSE 0.043 267.000 0.022 1.000   NA
 3576330 3576331 YPDSF_1081 YPDSF_1082     TRUE 0.826 8.000 0.000 1.000   NA
 3576332 3576333 YPDSF_1083 YPDSF_1084     FALSE 0.091 395.000 0.196 NA   NA
 3576334 3576335 YPDSF_1085 YPDSF_1086     TRUE 0.934 37.000 0.417 1.000   NA
 3576337 3576338 YPDSF_1087 YPDSF_1088     TRUE 0.950 14.000 0.375 NA N NA
 3576341 3576342 YPDSF_1091 YPDSF_1092     TRUE 0.999 -3.000 0.400 0.066 Y NA
 3576342 3576343 YPDSF_1092 YPDSF_1093     TRUE 0.999 -3.000 0.440 0.066 Y NA
 3576343 3576344 YPDSF_1093 YPDSF_1094     TRUE 0.981 20.000 0.480 0.066   NA
 3576344 3576345 YPDSF_1094 YPDSF_1095     FALSE 0.042 301.000 0.000 1.000   NA
 3576345 3576346 YPDSF_1095 YPDSF_R0017     FALSE 0.243 142.000 0.000 NA   NA
 3576346 3576347 YPDSF_R0017 YPDSF_1096     FALSE 0.005 836.000 0.000 NA   NA
 3576348 3576349 YPDSF_1097 YPDSF_1098     FALSE 0.469 96.000 0.089 1.000   NA
 3576349 3576350 YPDSF_1098 YPDSF_1099     TRUE 0.981 -3.000 0.195 NA   NA
 3576350 3576351 YPDSF_1099 YPDSF_1100     TRUE 0.609 64.000 0.109 NA   NA
 3576351 3576352 YPDSF_1100 YPDSF_1101   prfA TRUE 0.998 0.000 0.229 0.046 Y NA
 3576352 3576353 YPDSF_1101 YPDSF_1102 prfA hemA TRUE 0.872 33.000 0.171 0.046 N NA
 3576354 3576355 YPDSF_1103 YPDSF_1104 lolB   TRUE 0.945 2.000 0.157 1.000 N NA
 3576359 3576360 YPDSF_1108 YPDSF_1109     TRUE 0.788 164.000 0.184 1.000 Y NA
 3576360 3576361 YPDSF_1109 YPDSF_1110     FALSE 0.118 213.000 0.000 1.000   NA
 3576361 3576362 YPDSF_1110 YPDSF_1111     TRUE 0.936 18.000 0.286 1.000   NA
 3576363 3576364 YPDSF_1112 YPDSF_1113     FALSE 0.217 8.000 0.034 NA N NA
 3576364 3576365 YPDSF_1113 YPDSF_1114     TRUE 0.968 -3.000 0.125 NA   NA
 3576367 3576368 YPDSF_1116 YPDSF_1117     TRUE 0.876 15.000 0.133 NA   NA
 3576368 3576369 YPDSF_1117 YPDSF_1118     FALSE 0.154 191.000 0.000 NA   NA
 3576370 3576371 YPDSF_1119 YPDSF_1120     TRUE 0.668 27.000 0.000 0.073 N NA
 3576371 3576372 YPDSF_1120 YPDSF_1121     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3576372 3576373 YPDSF_1121 YPDSF_1122     FALSE 0.121 39.000 0.000 1.000 N NA
 3576373 3576374 YPDSF_1122 YPDSF_1123     TRUE 0.999 12.000 0.793 0.012 Y NA
 3576374 3576375 YPDSF_1123 YPDSF_1124     FALSE 0.053 277.000 0.000 1.000   NA
 3576375 3576376 YPDSF_1124 YPDSF_1125     TRUE 0.736 55.000 0.154 1.000   NA
 3576376 3576377 YPDSF_1125 YPDSF_1126     FALSE 0.118 213.000 0.000 NA   NA
 3576377 3576378 YPDSF_1126 YPDSF_1127     FALSE 0.006 791.000 0.000 NA   NA
 3576378 3576379 YPDSF_1127 YPDSF_1128     TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 3576379 3576380 YPDSF_1128 YPDSF_1129     TRUE 0.808 -13.000 0.000 NA   NA
 3576380 3576381 YPDSF_1129 YPDSF_1130     FALSE 0.030 341.000 0.000 NA   NA
 3576381 3576382 YPDSF_1130 YPDSF_1131     TRUE 0.598 105.000 0.000 0.049   NA
 3576383 3576384 YPDSF_1132 YPDSF_1133     FALSE 0.075 247.000 0.000 1.000   NA
 3576387 3576388 YPDSF_1136 YPDSF_1137     FALSE 0.195 170.000 0.000 NA   NA
 3576389 3576390 YPDSF_1138 YPDSF_1139     TRUE 0.977 -3.000 0.167 NA   NA
 3576390 3576391 YPDSF_1139 YPDSF_1140     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3576391 3576392 YPDSF_1140 YPDSF_1141     TRUE 0.915 0.000 0.000 1.000   NA
 3576392 3576393 YPDSF_1141 YPDSF_1142     FALSE 0.057 185.000 0.054 NA N NA
 3576393 3576394 YPDSF_1142 YPDSF_1143     TRUE 0.996 -3.000 0.550 NA   NA
 3576394 3576395 YPDSF_1143 YPDSF_1144     TRUE 0.952 -7.000 0.133 1.000   NA
 3576395 3576396 YPDSF_1144 YPDSF_1145     TRUE 0.926 14.000 0.200 NA   NA
 3576396 3576397 YPDSF_1145 YPDSF_1146     TRUE 0.775 -31.000 0.067 NA   NA
 3576399 3576400 YPDSF_1148 YPDSF_1149     TRUE 0.941 0.000 0.067 NA   NA
 3576401 3576402 YPDSF_1150 YPDSF_1151     FALSE 0.007 204.000 0.010 1.000 N NA
 3576402 3576403 YPDSF_1151 YPDSF_1152     FALSE 0.061 91.000 0.000 1.000 N NA
 3576403 3576404 YPDSF_1152 YPDSF_1153     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3576404 3576405 YPDSF_1153 YPDSF_1154     FALSE 0.218 16.000 0.000 1.000 N NA
 3576406 3576407 YPDSF_1155 YPDSF_1156     FALSE 0.002 463.000 0.000 1.000 N NA
 3576407 3576408 YPDSF_1156 YPDSF_1157     FALSE 0.001 736.000 0.000 1.000 N NA
 3576408 3576409 YPDSF_1157 YPDSF_1158     TRUE 0.813 61.000 0.063 1.000 Y NA
 3576409 3576410 YPDSF_1158 YPDSF_1159     TRUE 0.887 24.000 0.306 1.000 N NA
 3576410 3576411 YPDSF_1159 YPDSF_1160     TRUE 0.735 -3.000 0.051 1.000 N NA
 3576411 3576412 YPDSF_1160 YPDSF_1161     TRUE 0.976 30.000 0.400 1.000 Y NA
 3576412 3576413 YPDSF_1161 YPDSF_1162     FALSE 0.118 541.000 0.000 0.016 Y NA
 3576414 3576415 YPDSF_1163 YPDSF_1164     FALSE 0.011 685.000 0.000 0.079 N NA
 3576416 3576417 YPDSF_1165 YPDSF_1166     TRUE 0.503 60.000 0.065 NA   NA
 3576417 3576418 YPDSF_1166 YPDSF_1167     FALSE 0.016 433.000 0.000 NA   NA
 3576418 3576419 YPDSF_1167 YPDSF_1168     FALSE 0.011 522.000 0.000 NA   NA
 3576419 3576420 YPDSF_1168 YPDSF_1169     TRUE 0.975 -3.000 0.154 NA   NA
 3576420 3576421 YPDSF_1169 YPDSF_1170     TRUE 0.589 -49.000 0.087 1.000 N NA
 3576421 3576422 YPDSF_1170 YPDSF_1171     TRUE 0.989 13.000 0.696 1.000   NA
 3576422 3576423 YPDSF_1171 YPDSF_1172     FALSE 0.007 669.000 0.000 1.000   NA
 3576423 3576424 YPDSF_1172 YPDSF_1173     FALSE 0.151 141.000 0.071 1.000 N NA
 3576424 3576425 YPDSF_1173 YPDSF_1174     FALSE 0.112 173.000 0.071 1.000 N NA
 3576425 3576426 YPDSF_1174 YPDSF_1175     TRUE 0.988 -3.000 0.176 0.012 N NA
 3576426 3576427 YPDSF_1175 YPDSF_1176     TRUE 0.554 -43.000 0.078 1.000 N NA
 3576427 3576428 YPDSF_1176 YPDSF_1177     TRUE 0.943 4.000 0.175 NA N NA
 3576428 3576429 YPDSF_1177 YPDSF_1178     TRUE 0.994 -10.000 0.878 NA N NA
 3576429 3576430 YPDSF_1178 YPDSF_1179     TRUE 0.995 3.000 0.625 NA   NA
 3576430 3576431 YPDSF_1179 YPDSF_1180     FALSE 0.394 285.000 0.386 NA   NA
 3576431 3576432 YPDSF_1180 YPDSF_1181     FALSE 0.131 204.000 0.000 NA   NA
 3576432 3576433 YPDSF_1181 YPDSF_1182     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 3576433 3576434 YPDSF_1182 YPDSF_1183     FALSE 0.009 581.000 0.000 NA   NA
 3576434 3576435 YPDSF_1183 YPDSF_1184     FALSE 0.017 111.000 0.028 1.000 N NA
 3576435 3576436 YPDSF_1184 YPDSF_1185     FALSE 0.014 452.000 0.000 NA   NA
 3576437 3576438 YPDSF_1186 YPDSF_1187     FALSE 0.001 722.000 0.000 1.000 N NA
 3576442 3576443 YPDSF_1191 YPDSF_1192     TRUE 0.897 66.000 0.417 1.000   NA
 3576443 3576444 YPDSF_1192 YPDSF_1193     FALSE 0.108 220.000 0.000 NA   NA
 3576444 3576445 YPDSF_1193 YPDSF_1194     TRUE 0.570 25.000 0.000 NA   NA
 3576447 3576448 YPDSF_1196 YPDSF_1197     TRUE 0.913 65.000 0.600 1.000 N NA
 3576448 3576449 YPDSF_1197 YPDSF_1198     TRUE 0.928 23.000 0.417 1.000 N NA
 3576449 3576450 YPDSF_1198 YPDSF_1199     FALSE 0.001 826.000 0.000 1.000 N NA
 3576450 3576451 YPDSF_1199 YPDSF_1200     TRUE 0.974 -25.000 0.037 0.010 Y NA
 3576451 3576452 YPDSF_1200 YPDSF_1201     FALSE 0.003 381.000 0.000 1.000 N NA
 3576452 3576453 YPDSF_1201 YPDSF_1202     TRUE 0.849 93.000 0.154 1.000 Y NA
 3576453 3576454 YPDSF_1202 YPDSF_1203     TRUE 0.976 49.000 0.500 1.000 Y NA
 3576454 3576455 YPDSF_1203 YPDSF_1204     TRUE 0.983 16.000 0.667 NA   NA
 3576455 3576456 YPDSF_1204 YPDSF_1205     TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 3576456 3576457 YPDSF_1205 YPDSF_1206     FALSE 0.084 62.000 0.000 1.000 N NA
 3576457 3576458 YPDSF_1206 YPDSF_1207     TRUE 0.580 24.000 0.000 NA   NA
 3576458 3576459 YPDSF_1207 YPDSF_R0018     FALSE 0.041 303.000 0.000 NA   NA
 3576459 3576460 YPDSF_R0018 YPDSF_1208     FALSE 0.209 162.000 0.000 NA   NA
 3576461 3576462 YPDSF_1209 YPDSF_1210     TRUE 0.750 28.000 0.176 NA N NA
 3576462 3576463 YPDSF_1210 YPDSF_1211     TRUE 0.698 -115.000 0.130 NA N NA
 3576463 3576464 YPDSF_1211 YPDSF_1212     TRUE 0.999 -13.000 0.913 0.006 Y NA
 3576465 3576466 YPDSF_1213 YPDSF_1214     TRUE 0.544 191.000 0.333 1.000 N NA
 3576466 3576467 YPDSF_1214 YPDSF_1215     TRUE 0.950 88.000 0.158 0.001 Y NA
 3576467 3576468 YPDSF_1215 YPDSF_1216     TRUE 0.998 -3.000 0.333 0.024 Y NA
 3576468 3576469 YPDSF_1216 YPDSF_1217     TRUE 0.991 12.000 0.406 1.000 Y NA
 3576469 3576470 YPDSF_1217 YPDSF_1218     TRUE 0.982 4.000 0.094 1.000 Y NA
 3576470 3576471 YPDSF_1218 YPDSF_1219     FALSE 0.334 131.000 0.125 1.000 N NA
 3576471 3576472 YPDSF_1219 YPDSF_1220     FALSE 0.005 1246.000 0.000 NA   NA
 3576472 3576473 YPDSF_1220 YPDSF_1221     FALSE 0.247 140.000 0.000 NA   NA
 3576473 3576474 YPDSF_1221 YPDSF_1222     TRUE 0.627 19.000 0.000 NA   NA
 3576474 3576475 YPDSF_1222 YPDSF_1223     TRUE 0.990 6.000 0.500 NA   NA
 3576475 3576476 YPDSF_1223 YPDSF_1224     TRUE 0.731 -10.000 0.002 1.000   NA
 3576476 3576477 YPDSF_1224 YPDSF_1225     FALSE 0.080 243.000 0.000 NA   NA
 3576478 3576479 YPDSF_1226 YPDSF_1227     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3576480 3576481 YPDSF_1228 YPDSF_1229     TRUE 0.669 16.000 0.000 NA   NA
 3576482 3576483 YPDSF_1230 YPDSF_1231     TRUE 0.596 -114.000 0.000 1.000   NA
 3576483 3576484 YPDSF_1231 YPDSF_1232     TRUE 0.876 25.000 0.000 1.000 Y NA
 3576484 3576485 YPDSF_1232 YPDSF_1233     TRUE 0.986 -7.000 0.000 0.065 Y NA
 3576485 3576486 YPDSF_1233 YPDSF_1234     TRUE 0.873 67.000 0.000 0.065 Y NA
 3576486 3576487 YPDSF_1234 YPDSF_1235     TRUE 0.538 30.000 0.000 1.000   NA
 3576487 3576488 YPDSF_1235 YPDSF_1236     FALSE 0.007 668.000 0.000 1.000   NA
 3576490 3576491 YPDSF_1238 YPDSF_1239     FALSE 0.438 54.000 0.000 NA   NA
 3576492 3576493 YPDSF_1240 YPDSF_1241     TRUE 0.749 12.000 0.000 NA   NA
 3576494 3576495 YPDSF_1242 YPDSF_1243     TRUE 0.976 0.000 0.000 0.028   NA
 3576495 3576496 YPDSF_1243 YPDSF_1244     FALSE 0.466 48.000 0.000 1.000   NA
 3576496 3576497 YPDSF_1244 YPDSF_1245     FALSE 0.386 66.000 0.000 NA   NA
 3576497 3576498 YPDSF_1245 YPDSF_1246     TRUE 0.943 -19.000 0.200 NA   NA
 3576499 3576500 YPDSF_1247 YPDSF_1248     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 3576500 3576501 YPDSF_1248 YPDSF_1249     TRUE 0.652 17.000 0.000 NA   NA
 3576501 3576502 YPDSF_1249 YPDSF_1250     FALSE 0.016 435.000 0.000 NA   NA
 3576502 3576503 YPDSF_1250 YPDSF_1251     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3576503 3576504 YPDSF_1251 YPDSF_1252     FALSE 0.017 424.000 0.000 NA   NA
 3576504 3576505 YPDSF_1252 YPDSF_1253     FALSE 0.288 111.000 0.000 NA   NA
 3576505 3576506 YPDSF_1253 YPDSF_1254     TRUE 0.952 72.000 0.521 0.086   NA
 3576506 3576507 YPDSF_1254 YPDSF_1255     FALSE 0.108 220.000 0.000 NA   NA
 3576508 3576509 YPDSF_1256 YPDSF_1257     FALSE 0.006 760.000 0.000 NA   NA
 3576511 3576512 YPDSF_R0019 YPDSF_R0020     TRUE 0.769 11.000 0.000 NA   NA
 3576512 3576513 YPDSF_R0020 YPDSF_R0021     FALSE 0.441 53.000 0.000 NA   NA
 3576513 3576514 YPDSF_R0021 YPDSF_1259     FALSE 0.239 145.000 0.000 NA   NA
 3576514 3576515 YPDSF_1259 YPDSF_1260   uvrC TRUE 0.727 59.000 0.227 1.000 N NA
 3576515 3576516 YPDSF_1260 YPDSF_1261 uvrC   TRUE 0.892 -28.000 0.086 0.025 N NA
 3576517 3576518 YPDSF_1262 YPDSF_1263     FALSE 0.411 125.000 0.085 NA   NA
 3576519 3576520 YPDSF_1264 YPDSF_1265     FALSE 0.030 340.000 0.000 NA   NA
 3576520 3576521 YPDSF_1265 YPDSF_R0022     FALSE 0.007 687.000 0.000 NA   NA
 3576525 3576526 YPDSF_1269 YPDSF_1270     TRUE 0.991 11.000 0.378 NA Y NA
 3576526 3576527 YPDSF_1270 YPDSF_1271     TRUE 0.973 30.000 0.356 NA Y NA
 3576527 3576528 YPDSF_1271 YPDSF_1272     FALSE 0.005 333.000 0.000 1.000 N NA
 3576528 3576529 YPDSF_1272 YPDSF_1273     TRUE 0.539 30.000 0.000 NA   NA
 3576530 3576531 YPDSF_1274 YPDSF_1275 putA   FALSE 0.013 464.000 0.000 NA   NA
 3576531 3576532 YPDSF_1275 YPDSF_1276     TRUE 0.937 0.000 0.061 NA   NA
 3576533 3576534 YPDSF_1277 YPDSF_1278     TRUE 0.989 3.000 0.150 1.000 Y NA
 3576534 3576535 YPDSF_1278 YPDSF_1279     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3576535 3576536 YPDSF_1279 YPDSF_1280     TRUE 0.599 -112.000 0.000 NA   NA
 3576536 3576537 YPDSF_1280 YPDSF_1281     FALSE 0.292 106.000 0.000 NA   NA
 3576537 3576538 YPDSF_1281 YPDSF_1282     FALSE 0.066 289.000 0.062 1.000   NA
 3576538 3576539 YPDSF_1282 YPDSF_1283   fliA FALSE 0.216 222.000 0.108 1.000   NA
 3576539 3576540 YPDSF_1283 YPDSF_1284 fliA   FALSE 0.004 347.000 0.000 1.000 N NA
 3576541 3576542 YPDSF_1285 YPDSF_1286 fliD fliS TRUE 0.995 11.000 0.284 0.003 Y NA
 3576542 3576543 YPDSF_1286 YPDSF_1287 fliS   TRUE 0.970 11.000 0.324 1.000   NA
 3576543 3576544 YPDSF_1287 YPDSF_1288     FALSE 0.042 301.000 0.000 1.000   NA
 3576544 3576545 YPDSF_1288 YPDSF_1289     FALSE 0.004 354.000 0.000 1.000 N NA
 3576545 3576546 YPDSF_1289 YPDSF_1290     FALSE 0.011 161.000 0.006 1.000 N NA
 3576547 3576548 YPDSF_1291 YPDSF_1292     TRUE 0.675 11.000 0.013 NA   NA
 3576548 3576549 YPDSF_1292 YPDSF_1293   fliE FALSE 0.017 420.000 0.000 NA   NA
 3576550 3576551 YPDSF_1294 YPDSF_1295 fliF fliG TRUE 0.998 -3.000 0.220 0.010 Y NA
 3576551 3576552 YPDSF_1295 YPDSF_1296 fliG fliH TRUE 0.874 75.000 0.007 0.006 Y NA
 3576552 3576553 YPDSF_1296 YPDSF_1297 fliH fliI TRUE 0.974 -103.000 0.115 0.006 Y NA
 3576553 3576554 YPDSF_1297 YPDSF_1298 fliI fliJ TRUE 0.879 100.000 0.073 0.012 Y NA
 3576554 3576555 YPDSF_1298 YPDSF_1299 fliJ   TRUE 0.998 -3.000 0.317 0.010 Y NA
 3576555 3576556 YPDSF_1299 YPDSF_1300   fliL TRUE 0.682 174.000 0.119 1.000 Y NA
 3576556 3576557 YPDSF_1300 YPDSF_1301 fliL fliM TRUE 1.000 6.000 0.957 0.002 Y NA
 3576557 3576558 YPDSF_1301 YPDSF_1302 fliM fliN TRUE 0.997 -3.000 0.137 0.002 Y NA
 3576558 3576559 YPDSF_1302 YPDSF_1303 fliN   TRUE 0.998 0.000 0.443 1.000 Y NA
 3576559 3576560 YPDSF_1303 YPDSF_1304   fliP TRUE 0.994 -3.000 0.203 1.000 Y NA
 3576560 3576561 YPDSF_1304 YPDSF_1305 fliP fliQ TRUE 0.990 106.000 0.827 0.014 Y NA
 3576561 3576562 YPDSF_1305 YPDSF_1306 fliQ fliR TRUE 0.968 -69.000 0.069 0.004 Y NA
 3576562 3576563 YPDSF_1306 YPDSF_1307 fliR   FALSE 0.016 434.000 0.000 1.000   NA
 3576564 3576565 YPDSF_1308 YPDSF_1309     TRUE 0.820 49.000 0.000 NA Y NA
 3576565 3576566 YPDSF_1309 YPDSF_1310     TRUE 0.998 3.000 0.286 0.012 Y NA
 3576566 3576567 YPDSF_1310 YPDSF_1311     TRUE 0.770 66.000 0.000 NA Y NA
 3576567 3576568 YPDSF_1311 YPDSF_1312     TRUE 0.993 43.000 1.000 NA Y NA
 3576568 3576569 YPDSF_1312 YPDSF_1313     FALSE 0.262 130.000 0.000 1.000   NA
 3576571 3576572 YPDSF_1315 YPDSF_1316 flgL flgK TRUE 0.931 106.000 0.142 0.002 Y NA
 3576572 3576573 YPDSF_1316 YPDSF_1317 flgK flgJ TRUE 0.906 299.000 0.705 0.003 Y NA
 3576573 3576574 YPDSF_1317 YPDSF_1318 flgJ flgI TRUE 0.994 0.000 0.048 0.012 Y NA
 3576574 3576575 YPDSF_1318 YPDSF_1319 flgI flgH TRUE 0.976 15.000 0.085 0.012 Y NA
 3576575 3576576 YPDSF_1319 YPDSF_1320 flgH   TRUE 0.874 144.000 0.268 1.000 Y NA
 3576576 3576577 YPDSF_1320 YPDSF_1321   flgF TRUE 0.997 -19.000 0.420 0.001 Y NA
 3576577 3576578 YPDSF_1321 YPDSF_1322 flgF flgE TRUE 0.969 22.000 0.095 0.007 Y NA
 3576578 3576579 YPDSF_1322 YPDSF_1323 flgE flgD FALSE 0.456 202.000 0.000 NA Y NA
 3576579 3576580 YPDSF_1323 YPDSF_1324 flgD flgC TRUE 0.970 15.000 0.186 NA Y NA
 3576580 3576581 YPDSF_1324 YPDSF_1325 flgC flgB TRUE 0.999 6.000 0.824 0.006 Y NA
 3576582 3576583 YPDSF_1326 YPDSF_1327 flgA   TRUE 0.893 151.000 0.330 NA Y NA
 3576583 3576584 YPDSF_1327 YPDSF_1328     TRUE 0.992 19.000 0.361 0.004 Y NA
 3576585 3576586 YPDSF_1329 YPDSF_1330     FALSE 0.324 90.000 0.000 NA   NA
 3576586 3576587 YPDSF_1330 YPDSF_1331     TRUE 0.832 -10.000 0.000 1.000   NA
 3576587 3576588 YPDSF_1331 YPDSF_1332     FALSE 0.007 664.000 0.000 1.000   NA
 3576588 3576589 YPDSF_1332 YPDSF_1333   flhA TRUE 0.983 0.000 0.053 0.004   NA
 3576589 3576590 YPDSF_1333 YPDSF_1334 flhA flhB TRUE 0.998 0.000 0.287 0.014 Y NA
 3576591 3576592 YPDSF_1335 YPDSF_1336     TRUE 0.997 -6.000 0.800 NA   NA
 3576592 3576593 YPDSF_1336 YPDSF_R0023     FALSE 0.102 223.000 0.000 NA   NA
 3576594 3576595 YPDSF_R0024 YPDSF_1337     FALSE 0.210 161.000 0.000 NA   NA
 3576595 3576596 YPDSF_1337 YPDSF_1338     TRUE 0.936 97.000 0.704 NA   NA
 3576596 3576597 YPDSF_1338 YPDSF_1339     TRUE 0.995 3.000 0.613 1.000   NA
 3576597 3576598 YPDSF_1339 YPDSF_1340     FALSE 0.015 406.000 0.029 1.000   NA
 3576600 3576601 YPDSF_1342 YPDSF_1343     FALSE 0.023 722.000 0.000 0.024   NA
 3576601 3576602 YPDSF_1343 YPDSF_1344     FALSE 0.033 329.000 0.000 NA   NA
 3576602 3576603 YPDSF_1344 YPDSF_1345     FALSE 0.345 92.000 0.048 NA   NA
 3576603 3576604 YPDSF_1345 YPDSF_1346     TRUE 0.543 40.000 0.053 NA   NA
 3576604 3576605 YPDSF_1346 YPDSF_1347     FALSE 0.225 94.000 0.014 NA   NA
 3576608 3576609 YPDSF_1350 YPDSF_1351     TRUE 0.964 -3.000 0.116 1.000   NA
 3576609 3576610 YPDSF_1351 YPDSF_1352     FALSE 0.081 708.000 0.409 1.000   NA
 3576611 3576612 YPDSF_1353 YPDSF_1354     TRUE 0.970 21.000 0.226 0.001   NA
 3576612 3576613 YPDSF_1354 YPDSF_1355     FALSE 0.077 68.000 0.000 1.000 N NA
 3576613 3576614 YPDSF_1355 YPDSF_1356     TRUE 0.946 26.000 0.175 1.000 Y NA
 3576614 3576615 YPDSF_1356 YPDSF_1357     TRUE 0.970 11.000 0.439 1.000 N NA
 3576615 3576616 YPDSF_1357 YPDSF_1358     TRUE 0.973 -6.000 0.282 1.000 N NA
 3576616 3576617 YPDSF_1358 YPDSF_1359     TRUE 0.929 25.000 0.330 1.000   NA
 3576617 3576618 YPDSF_1359 YPDSF_1360     TRUE 0.825 119.000 0.378 1.000   NA
 3576618 3576619 YPDSF_1360 YPDSF_1361     TRUE 0.996 -3.000 0.510 0.048 N NA
 3576619 3576620 YPDSF_1361 YPDSF_1362     TRUE 1.000 -3.000 0.618 0.001 Y NA
 3576622 3576623 YPDSF_1364 YPDSF_1365     TRUE 0.655 -45.000 0.000 NA   NA
 3576624 3576625 YPDSF_1366 YPDSF_1367     TRUE 0.888 92.000 0.064 0.009 Y NA
 3576625 3576626 YPDSF_1367 YPDSF_1368     TRUE 0.998 16.000 0.939 0.009 Y NA
 3576626 3576627 YPDSF_1368 YPDSF_1369     TRUE 0.860 200.000 0.755 NA   NA
 3576627 3576628 YPDSF_1369 YPDSF_1370     FALSE 0.016 429.000 0.000 NA   NA
 3576629 3576630 YPDSF_1371 YPDSF_1372     FALSE 0.320 92.000 0.000 NA   NA
 3576631 3576632 YPDSF_1373 YPDSF_1374     FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 3576637 3576638 YPDSF_1379 YPDSF_1380     TRUE 0.578 237.000 0.429 NA   NA
 3576638 3576639 YPDSF_1380 YPDSF_1381     TRUE 0.931 43.000 0.429 NA   NA
 3576639 3576640 YPDSF_1381 YPDSF_1382     FALSE 0.159 263.000 0.125 NA   NA
 3576647 3576648 YPDSF_1389 YPDSF_1390     FALSE 0.086 237.000 0.000 NA   NA
 3576648 3576649 YPDSF_1390 YPDSF_1391     FALSE 0.020 390.000 0.000 NA   NA
 3576649 3576650 YPDSF_1391 YPDSF_R0025     FALSE 0.179 178.000 0.000 NA   NA
 3576652 3576653 YPDSF_1393 YPDSF_1394 lacY   FALSE 0.349 78.000 0.000 1.000   NA
 3576654 3576655 YPDSF_1395 YPDSF_1396     TRUE 0.833 -10.000 0.000 NA   NA
 3576656 3576657 YPDSF_1397 YPDSF_1398     TRUE 0.982 124.000 0.947 NA Y NA
 3576657 3576658 YPDSF_1398 YPDSF_1399     TRUE 0.995 20.000 0.905 NA Y NA
 3576658 3576659 YPDSF_1399 YPDSF_1400     FALSE 0.010 258.000 0.000 1.000 N NA
 3576659 3576660 YPDSF_1400 YPDSF_R0026     FALSE 0.015 446.000 0.000 NA   NA
 3576661 3576662 YPDSF_1401 YPDSF_1402     FALSE 0.324 90.000 0.000 NA   NA
 3576663 3576664 YPDSF_1403 YPDSF_1404     TRUE 0.636 36.000 0.136 1.000 N NA
 3576667 3576668 YPDSF_1407 YPDSF_1408 lldD   FALSE 0.006 297.000 0.000 1.000 N NA
 3576668 3576669 YPDSF_1408 YPDSF_1409     TRUE 0.932 32.000 0.290 0.023 N NA
 3576669 3576670 YPDSF_1409 YPDSF_1410     TRUE 0.980 48.000 0.333 0.048 Y NA
 3576673 3576674 YPDSF_1413 YPDSF_1414     FALSE 0.007 669.000 0.000 NA   NA
 3576675 3576676 YPDSF_1415 YPDSF_1416     FALSE 0.024 371.000 0.000 NA   NA
 3576676 3576677 YPDSF_1416 YPDSF_1417     FALSE 0.016 434.000 0.000 NA   NA
 11426269 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 35.000 0.000 NA   NA
 11568632 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 35.000 0.000 NA   NA
 11711024 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 35.000 0.000 NA   NA
 11426270 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 63.000 0.000 NA   NA
 11568633 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 63.000 0.000 NA   NA
 11711025 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 63.000 0.000 NA   NA
 11426271 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 95.000 0.000 NA   NA
 11568634 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 95.000 0.000 NA   NA
 11711026 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 95.000 0.000 NA   NA
 11426272 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 123.000 0.000 NA   NA
 11568635 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 123.000 0.000 NA   NA
 11711027 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 123.000 0.000 NA   NA
 11426273 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 155.000 0.000 NA   NA
 11568636 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 155.000 0.000 NA   NA
 11711028 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 155.000 0.000 NA   NA
 11426274 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 183.000 0.000 NA   NA
 11568637 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 183.000 0.000 NA   NA
 11711029 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 183.000 0.000 NA   NA
 11426275 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 215.000 0.000 NA   NA
 11568638 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 215.000 0.000 NA   NA
 11711030 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 215.000 0.000 NA   NA
 11426276 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 243.000 0.000 NA   NA
 11568639 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 243.000 0.000 NA   NA
 11711031 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 243.000 0.000 NA   NA
 11426277 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11568640 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11711032 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11426278 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 304.000 0.000 NA   NA
 11568641 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 304.000 0.000 NA   NA
 11711033 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 304.000 0.000 NA   NA
 11426279 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 336.000 0.000 NA   NA
 11568642 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 336.000 0.000 NA   NA
 11711034 3576678   YPDSF_1418   sbcB FALSE NA 336.000 0.000 NA   NA
 3576679 3576680 YPDSF_1419 YPDSF_1420     FALSE 0.002 459.000 0.000 1.000 N NA
 3576681 3576682 YPDSF_1421 YPDSF_1422     TRUE 0.796 10.000 0.000 NA   NA
 3576682 3576683 YPDSF_1422 YPDSF_1423     TRUE 0.604 -105.000 0.000 NA   NA
 3576683 3576684 YPDSF_1423 YPDSF_1424     TRUE 0.999 -3.000 0.952 0.012   NA
 3576684 3576685 YPDSF_1424 YPDSF_1425     FALSE 0.078 245.000 0.000 NA   NA
 3576687 3576688 YPDSF_1427 YPDSF_1428 hisG hisD TRUE 0.996 4.000 0.171 0.003 Y NA
 3576688 3576689 YPDSF_1428 YPDSF_1429 hisD   TRUE 0.998 3.000 0.294 0.003 Y NA
 3576689 3576690 YPDSF_1429 YPDSF_1430     TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 3576690 3576691 YPDSF_1430 YPDSF_1431   hisH TRUE 0.997 0.000 0.128 0.003 Y NA
 3576691 3576692 YPDSF_1431 YPDSF_1432 hisH   TRUE 0.996 6.000 0.210 0.003 Y NA
 3576692 3576693 YPDSF_1432 YPDSF_1433     TRUE 0.997 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 3576693 3576694 YPDSF_1433 YPDSF_1434     TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 3576695 3576696 YPDSF_1435 YPDSF_1436     FALSE 0.003 386.000 0.000 1.000 N NA
 3576696 3576697 YPDSF_1436 YPDSF_1437     TRUE 0.937 84.000 0.111 0.001 Y NA
 3576698 3576699 YPDSF_1438 YPDSF_1439     TRUE 0.792 213.000 0.455 0.003 N NA
 3576699 3576700 YPDSF_1439 YPDSF_1440     TRUE 0.939 90.000 0.364 1.000 Y NA
 3576700 3576701 YPDSF_1440 YPDSF_1441     TRUE 0.998 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 3576701 3576702 YPDSF_1441 YPDSF_1442     TRUE 0.999 -13.000 0.818 0.064 Y NA
 3576702 3576703 YPDSF_1442 YPDSF_1443     TRUE 0.998 -3.000 0.583 1.000 Y NA
 3576704 3576705 YPDSF_1444 YPDSF_1445     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 3576705 3576706 YPDSF_1445 YPDSF_1446     TRUE 0.604 0.000 0.000 NA N NA
 3576706 3576707 YPDSF_1446 YPDSF_1447     TRUE 0.954 35.000 0.667 1.000 N NA
 3576707 3576708 YPDSF_1447 YPDSF_1448     FALSE 0.228 152.000 0.000 NA   NA
 3576710 3576711 YPDSF_1450 YPDSF_1451   dcd FALSE 0.065 187.000 0.057 NA N NA
 3576711 3576712 YPDSF_1451 YPDSF_1452 dcd   TRUE 0.773 105.000 0.098 1.000 Y NA
 3576712 3576713 YPDSF_1452 YPDSF_1453     FALSE 0.047 245.000 0.073 1.000 N NA
 3576715 3576716 YPDSF_1455 YPDSF_1456     FALSE 0.111 218.000 0.000 NA   NA
 3576717 3576718 YPDSF_1457 YPDSF_1458     TRUE 0.886 18.000 0.177 NA   NA
 3576718 3576719 YPDSF_1458 YPDSF_1459     FALSE 0.032 333.000 0.000 NA   NA
 3576719 3576720 YPDSF_1459 YPDSF_1460     FALSE 0.185 242.000 0.021 0.076   NA
 3576720 3576721 YPDSF_1460 YPDSF_1461     TRUE 0.991 -3.000 0.340 NA   NA
 3576721 3576722 YPDSF_1461 YPDSF_1462     FALSE 0.087 336.000 0.198 NA N NA
 3576722 3576723 YPDSF_1462 YPDSF_1463     FALSE 0.001 356.000 0.022 1.000 N NA
 3576723 3576724 YPDSF_1463 YPDSF_1464     FALSE 0.055 281.000 0.045 NA   NA
 3576726 3576727 YPDSF_1466 YPDSF_1467     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3576728 3576729 YPDSF_1468 YPDSF_1469     TRUE 0.998 21.000 0.905 0.012 Y NA
 3576729 3576730 YPDSF_1469 YPDSF_1470     TRUE 0.679 230.000 0.250 NA Y NA
 3576730 3576731 YPDSF_1470 YPDSF_1471     FALSE 0.006 748.000 0.000 NA   NA
 3576731 3576732 YPDSF_1471 YPDSF_1472   folE TRUE 0.963 55.000 0.719 NA   NA
 3576732 3576733 YPDSF_1472 YPDSF_1473 folE   TRUE 0.693 142.000 0.250 NA   NA
 3576734 3576735 YPDSF_1474 YPDSF_1475     TRUE 0.515 274.000 0.636 1.000 N NA
 3576735 3576736 YPDSF_1475 YPDSF_1476     TRUE 0.922 21.000 0.273 1.000   NA
 3576736 3576737 YPDSF_1476 YPDSF_1477     FALSE 0.010 553.000 0.000 NA   NA
 3576737 3576738 YPDSF_1477 YPDSF_1478     TRUE 0.993 2.000 0.500 NA   NA
 3576738 3576739 YPDSF_1478 YPDSF_1479     TRUE 0.879 2.000 0.094 1.000 N NA
 3576739 3576740 YPDSF_1479 YPDSF_1480     TRUE 0.888 10.000 0.094 1.000   NA
 3576740 3576741 YPDSF_1480 YPDSF_1481     FALSE 0.010 535.000 0.000 1.000   NA
 3576741 3576742 YPDSF_1481 YPDSF_1482     TRUE 0.998 2.000 0.323 0.003 Y NA
 3576743 3576744 YPDSF_1483 YPDSF_1484     FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 3576746 3576747 YPDSF_1486 YPDSF_1487     TRUE 0.570 25.000 0.000 NA   NA
 3576747 3576748 YPDSF_1487 YPDSF_1488     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3576748 3576749 YPDSF_1488 YPDSF_1489     TRUE 0.990 -25.000 0.750 NA   NA
 3576749 3576750 YPDSF_1489 YPDSF_1490     TRUE 0.988 -36.000 0.750 NA   NA
 3576750 3576751 YPDSF_1490 YPDSF_1491     FALSE 0.106 221.000 0.000 NA   NA
 3576751 3576752 YPDSF_1491 YPDSF_1492     TRUE 0.989 0.000 0.286 NA   NA
 3576752 3576753 YPDSF_1492 YPDSF_1493     TRUE 0.634 18.000 0.040 NA   NA
 3576753 3576754 YPDSF_1493 YPDSF_1494     TRUE 0.711 44.000 0.120 NA   NA
 3576754 3576755 YPDSF_1494 YPDSF_1495     TRUE 0.996 -3.000 0.625 NA   NA
 3576756 3576757 YPDSF_1496 YPDSF_1497     FALSE 0.290 109.000 0.000 NA   NA
 3576757 3576758 YPDSF_1497 YPDSF_1498     FALSE 0.261 131.000 0.000 NA   NA
 3576759 3576760 YPDSF_1499 YPDSF_1500     TRUE 0.669 16.000 0.000 NA   NA
 3576760 3576761 YPDSF_1500 YPDSF_1501     FALSE 0.225 154.000 0.000 NA   NA
 3576761 3576762 YPDSF_1501 YPDSF_1502     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3576762 3576763 YPDSF_1502 YPDSF_1503     TRUE 0.866 85.000 0.400 NA   NA
 3576763 3576764 YPDSF_1503 YPDSF_1504     TRUE 0.955 3.000 0.125 NA   NA
 3576764 3576765 YPDSF_1504 YPDSF_1505     FALSE 0.038 388.000 0.083 NA   NA
 3576767 3576768 YPDSF_1507 YPDSF_1508     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3576768 3576769 YPDSF_1508 YPDSF_1509     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 3576769 3576770 YPDSF_1509 YPDSF_1510     TRUE 0.749 12.000 0.000 NA   NA
 3576770 3576771 YPDSF_1510 YPDSF_1511     FALSE 0.461 49.000 0.000 NA   NA
 3576771 3576772 YPDSF_1511 YPDSF_1512     FALSE 0.005 989.000 0.000 NA   NA
 3576772 3576773 YPDSF_1512 YPDSF_1513     FALSE 0.021 385.000 0.000 NA   NA
 3576773 3576774 YPDSF_1513 YPDSF_1514     TRUE 0.500 39.000 0.000 NA   NA
 3576774 3576775 YPDSF_1514 YPDSF_1515     TRUE 0.990 3.000 0.051 0.046 Y NA
 3576775 3576776 YPDSF_1515 YPDSF_1516     TRUE 0.984 -22.000 0.120 0.023 Y NA
 3576776 3576777 YPDSF_1516 YPDSF_1517     TRUE 0.984 -7.000 0.120 1.000 Y NA
 3576777 3576778 YPDSF_1517 YPDSF_1518     TRUE 0.983 16.000 0.333 1.000 Y NA
 3576778 3576779 YPDSF_1518 YPDSF_1519     TRUE 0.974 -7.000 0.056 1.000 Y NA
 3576779 3576780 YPDSF_1519 YPDSF_1520     TRUE 0.974 -10.000 0.083 NA Y NA
 3576780 3576781 YPDSF_1520 YPDSF_1521     FALSE 0.061 264.000 0.000 NA   NA
 3576782 3576783 YPDSF_1522 YPDSF_1523     FALSE 0.376 154.000 0.000 0.023 N NA
 3576784 3576785 YPDSF_1524 YPDSF_1525     FALSE 0.163 186.000 0.000 NA   NA
 3576785 3576786 YPDSF_1525 YPDSF_1526     FALSE 0.006 733.000 0.000 NA   NA
 3576786 3576787 YPDSF_1526 YPDSF_R0027     FALSE 0.017 420.000 0.000 NA   NA
 3576790 3576791 YPDSF_1529 YPDSF_1530     TRUE 0.583 61.000 0.094 NA   NA
 3576793 3576794 YPDSF_1532 YPDSF_1533   mgsA FALSE 0.212 179.000 0.055 NA   NA
 3576796 3576797 YPDSF_1535 YPDSF_1536     TRUE 0.699 30.000 0.090 NA   NA
 3576799 3576800 YPDSF_1538 YPDSF_1539     FALSE 0.004 358.000 0.000 1.000 N NA
 3576800 3576801 YPDSF_1539 YPDSF_1540     FALSE 0.024 191.000 0.000 1.000 N NA
 3576803 3576804 YPDSF_1542 YPDSF_1543     TRUE 0.914 -39.000 0.290 1.000 N NA
 3576804 3576805 YPDSF_1543 YPDSF_1544     FALSE 0.007 700.000 0.000 1.000   NA
 3576805 3576806 YPDSF_1544 YPDSF_1545     TRUE 0.711 14.000 0.000 1.000   NA
 3576806 3576807 YPDSF_1545 YPDSF_1546     TRUE 0.676 118.000 0.000 1.000 Y NA
 3576807 3576808 YPDSF_1546 YPDSF_1547     FALSE 0.218 16.000 0.000 1.000 N NA
 3576809 3576810 YPDSF_1548 YPDSF_1549   acpS FALSE 0.021 202.000 0.000 1.000 N NA
 3576810 3576811 YPDSF_1549 YPDSF_1550 acpS   TRUE 0.986 0.000 0.326 1.000 N NA
 3576811 3576812 YPDSF_1550 YPDSF_1551   recO FALSE 0.372 159.000 0.166 1.000 N NA
 3576812 3576813 YPDSF_1551 YPDSF_1552 recO era TRUE 0.903 10.000 0.109 1.000   NA
 3576813 3576814 YPDSF_1552 YPDSF_1553 era rnc TRUE 0.987 -3.000 0.127 0.046   NA
 3576814 3576815 YPDSF_1553 YPDSF_1554 rnc   FALSE 0.068 352.000 0.117 1.000   NA
 3576815 3576816 YPDSF_1554 YPDSF_1555     TRUE 0.948 10.000 0.187 1.000   NA
 3576818 3576819 YPDSF_1557 YPDSF_1558   rseB TRUE 0.999 -3.000 0.609 NA Y NA
 3576819 3576820 YPDSF_1558 YPDSF_1559 rseB   TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 3576820 3576821 YPDSF_1559 YPDSF_1560     TRUE 0.966 26.000 0.705 NA N NA
 3576825 3576826 YPDSF_1564 YPDSF_1565     TRUE 0.865 78.000 0.375 NA   NA
 3576826 3576827 YPDSF_1565 YPDSF_1566     FALSE 0.176 179.000 0.000 1.000   NA
 3576829 3576830 YPDSF_1568 YPDSF_1569     TRUE 0.972 10.000 0.300 NA   NA
 3576830 3576831 YPDSF_1569 YPDSF_1570     TRUE 0.998 -3.000 0.939 NA   NA
 3576831 3576832 YPDSF_1570 YPDSF_1571     TRUE 0.679 85.000 0.173 NA   NA
 3576832 3576833 YPDSF_1571 YPDSF_1572     TRUE 0.983 -3.000 0.211 NA   NA
 3576833 3576834 YPDSF_1572 YPDSF_1573     TRUE 0.933 105.000 0.379 NA Y NA
 3576834 3576835 YPDSF_1573 YPDSF_1574     FALSE 0.009 619.000 0.050 NA   NA
 3576835 3576836 YPDSF_1574 YPDSF_1575     FALSE 0.171 140.000 0.013 NA   NA
 3576836 3576837 YPDSF_1575 YPDSF_1576     FALSE 0.192 -9.000 0.008 1.000 N NA
 3576837 3576838 YPDSF_1576 YPDSF_1577     FALSE 0.197 130.000 0.019 NA   NA
 3576838 3576839 YPDSF_1577 YPDSF_1578     FALSE 0.151 354.000 0.231 NA   NA
 3576840 3576841 YPDSF_1579 YPDSF_1580     TRUE 0.993 1.000 0.172 0.001   NA
 3576841 3576842 YPDSF_1580 YPDSF_1581     TRUE 0.957 94.000 0.201 0.001 Y NA
 3576842 3576843 YPDSF_1581 YPDSF_1582     TRUE 0.990 164.000 0.877 0.001 Y NA
 3576843 3576844 YPDSF_1582 YPDSF_1583     TRUE 0.796 10.000 0.000 NA   NA
 3576844 3576845 YPDSF_1583 YPDSF_1584     TRUE 0.650 -49.000 0.000 NA   NA
 3576845 3576846 YPDSF_1584 YPDSF_1585     FALSE 0.212 160.000 0.000 NA   NA
 3576846 3576847 YPDSF_1585 YPDSF_1586     TRUE 0.577 95.000 0.129 1.000   NA
 3576848 3576849 YPDSF_1587 YPDSF_1588     FALSE 0.484 43.000 0.000 NA   NA
 3576849 3576850 YPDSF_1588 YPDSF_1589     FALSE 0.111 218.000 0.000 NA   NA
 3576850 3576851 YPDSF_1589 YPDSF_1590     TRUE 0.689 31.000 0.151 1.000 N NA
 3576853 3576854 YPDSF_1592 YPDSF_1593     TRUE 0.827 52.000 0.222 1.000   NA
 3576854 3576855 YPDSF_1593 YPDSF_1594     TRUE 0.953 49.000 0.727 1.000 N NA
 3576855 3576856 YPDSF_1594 YPDSF_1595     TRUE 0.986 167.000 0.833 0.006 Y NA
 3576856 3576857 YPDSF_1595 YPDSF_1596     TRUE 0.994 11.000 0.250 0.006 Y NA
 3576858 3576859 YPDSF_1597 YPDSF_1598     FALSE 0.326 89.000 0.000 NA   NA
 3576859 3576860 YPDSF_1598 YPDSF_1599   ccrB TRUE 0.985 16.000 0.233 0.099 Y NA
 3576863 3576864 YPDSF_1602 YPDSF_1603     FALSE 0.470 149.000 0.095 0.075 N NA
 3576864 3576865 YPDSF_1603 YPDSF_1604     FALSE 0.152 192.000 0.000 NA   NA
 3576865 3576866 YPDSF_1604 YPDSF_1605     TRUE 0.560 26.000 0.000 NA   NA
 3576866 3576867 YPDSF_1605 YPDSF_1606     TRUE 0.996 -3.000 0.095 0.002 Y NA
 3576867 3576868 YPDSF_1606 YPDSF_1607     TRUE 0.880 127.000 0.064 0.002 Y NA
 3576868 3576869 YPDSF_1607 YPDSF_1608   ureE TRUE 0.994 22.000 0.460 0.002 Y NA
 3576869 3576870 YPDSF_1608 YPDSF_1609 ureE ureC FALSE 0.186 296.000 0.067 0.001 N NA
 3576870 3576871 YPDSF_1609 YPDSF_1610 ureC ureB TRUE 0.969 90.000 0.267 0.001 Y NA
 3576871 3576872 YPDSF_1610 YPDSF_1611 ureB ureA TRUE 0.992 -40.000 0.267 0.001 Y NA
 3576872 3576873 YPDSF_1611 YPDSF_1612 ureA   FALSE 0.025 1199.000 0.000 1.000 Y NA
 3576873 3576874 YPDSF_1612 YPDSF_1613     TRUE 0.996 -7.000 0.500 0.022   NA
 3576874 3576875 YPDSF_1613 YPDSF_1614     TRUE 0.999 0.000 1.000 1.000   NA
 3576875 3576876 YPDSF_1614 YPDSF_1615     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.062 Y NA
 3576876 3576877 YPDSF_1615 YPDSF_1616     TRUE 0.999 -15.000 1.000 0.062 Y NA
 3576877 3576878 YPDSF_1616 YPDSF_1617     FALSE 0.001 835.000 0.000 1.000 N NA
 3576879 3576880 YPDSF_1618 YPDSF_1619     TRUE 0.504 165.000 0.167 NA   NA
 3576881 3576882 YPDSF_1620 YPDSF_1621     FALSE 0.013 478.000 0.000 NA   NA
 3576883 3576884 YPDSF_1622 YPDSF_1623 nrdI   TRUE 0.983 -18.000 0.216 NA Y NA
 3576884 3576885 YPDSF_1623 YPDSF_1624   nrdF TRUE 0.941 125.000 0.190 0.002 Y NA
 3576885 3576886 YPDSF_1624 YPDSF_1625 nrdF   FALSE 0.001 676.000 0.000 1.000 N NA
 3576886 3576887 YPDSF_1625 YPDSF_1626     TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.099 Y NA
 3576887 3576888 YPDSF_1626 YPDSF_1627   proX TRUE 0.993 48.000 0.695 0.062 Y NA
 3576891 3576892 YPDSF_R0028 YPDSF_1630     FALSE 0.286 113.000 0.000 NA   NA
 3576895 3576896 YPDSF_1633 YPDSF_1634     TRUE 0.875 33.000 0.233 1.000   NA
 3576897 3576898 YPDSF_1635 YPDSF_1636   dkgB FALSE 0.005 881.000 0.000 NA   NA
 3576898 3576899 YPDSF_1636 YPDSF_R0029 dkgB   FALSE 0.021 387.000 0.000 NA   NA
 3576899 3576900 YPDSF_R0029 YPDSF_R0030     FALSE 0.278 121.000 0.000 NA   NA
 3576900 3576901 YPDSF_R0030 YPDSF_R0031     FALSE 0.293 105.000 0.000 NA   NA
 3576901 3576902 YPDSF_R0031 YPDSF_R0032     FALSE 0.071 253.000 0.000 NA   NA
 3576902 3576903 YPDSF_R0032 YPDSF_R0033     FALSE 0.257 134.000 0.000 NA   NA
 3576903 3576904 YPDSF_R0033 YPDSF_1637     FALSE 0.015 442.000 0.000 NA   NA
 3576905 3576906 YPDSF_1638 YPDSF_1639 metN   TRUE 0.997 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 3576906 3576907 YPDSF_1639 YPDSF_1640   metQ TRUE 0.960 64.000 0.411 NA Y NA
 3576907 3576908 YPDSF_1640 YPDSF_1641 metQ rcsF TRUE 0.876 118.000 0.500 NA   NA
 3576908 3576909 YPDSF_1641 YPDSF_1642 rcsF   TRUE 0.986 -3.000 0.247 NA   NA
 3576909 3576910 YPDSF_1642 YPDSF_1643     FALSE 0.319 104.000 0.048 NA   NA
 3576911 3576912 YPDSF_1644 YPDSF_1645     FALSE 0.283 85.000 0.027 NA   NA
 3576912 3576913 YPDSF_1645 YPDSF_1646     TRUE 0.731 -21.000 0.034 1.000   NA
 3576914 3576915 YPDSF_1647 YPDSF_1648     TRUE 0.949 -13.000 0.179 NA   NA
 3576916 3576917 YPDSF_1649 YPDSF_1650   tilS FALSE 0.004 237.000 0.005 1.000 N NA
 3576917 3576918 YPDSF_1650 YPDSF_1651 tilS   FALSE 0.270 2.000 0.015 NA N NA
 3576918 3576919 YPDSF_1651 YPDSF_1652     FALSE 0.009 184.000 0.008 NA N NA
 3576919 3576920 YPDSF_1652 YPDSF_1653   dnaE TRUE 0.784 13.000 0.122 1.000 N NA
 3576920 3576921 YPDSF_1653 YPDSF_1654 dnaE rnhB TRUE 0.752 130.000 0.104 1.000 Y NA
 3576921 3576922 YPDSF_1654 YPDSF_1655 rnhB lpxB TRUE 0.967 -3.000 0.186 1.000 N NA
 3576922 3576923 YPDSF_1655 YPDSF_1656 lpxB   TRUE 0.994 4.000 0.289 1.000 Y NA
 3576923 3576924 YPDSF_1656 YPDSF_1657   fabZ TRUE 0.995 4.000 0.850 1.000 N NA
 3576924 3576925 YPDSF_1657 YPDSF_1658 fabZ lpxD TRUE 0.886 158.000 0.796 1.000 N NA
 3576925 3576926 YPDSF_1658 YPDSF_1659 lpxD   TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 3576926 3576927 YPDSF_1659 YPDSF_1660     TRUE 0.927 107.000 0.354 1.000 Y NA
 3576927 3576928 YPDSF_1660 YPDSF_1661     TRUE 0.942 37.000 0.204 1.000 Y NA
 3576928 3576929 YPDSF_1661 YPDSF_1662   cdsA FALSE 0.437 29.000 0.080 1.000 N NA
 3576929 3576930 YPDSF_1662 YPDSF_1663 cdsA   TRUE 0.993 10.000 0.400 1.000 Y NA
 3576930 3576931 YPDSF_1663 YPDSF_1664     FALSE 0.345 224.000 0.025 1.000 Y NA
 3576931 3576932 YPDSF_1664 YPDSF_1665   frr FALSE 0.006 214.000 0.032 1.000 N NA
 3576932 3576933 YPDSF_1665 YPDSF_1666 frr pyrH TRUE 0.855 136.000 0.626 1.000 N NA
 3576935 3576936 YPDSF_1668 YPDSF_1669 tsf rpsB TRUE 0.972 128.000 0.748 1.000 Y NA
 3576937 3576938 YPDSF_1670 YPDSF_1671     TRUE 0.743 60.000 0.243 1.000 N NA
 3576938 3576939 YPDSF_1671 YPDSF_1672   dapD FALSE 0.171 175.000 0.097 1.000 N NA
 3576939 3576940 YPDSF_1672 YPDSF_1673 dapD   FALSE 0.255 124.000 0.035 NA   NA
 3576941 3576942 YPDSF_1674 YPDSF_1675     TRUE 0.793 28.000 0.209 1.000 N NA
 3576942 3576943 YPDSF_1675 YPDSF_1676     TRUE 0.995 0.000 0.518 NA   NA
 3576943 3576944 YPDSF_1676 YPDSF_1677     FALSE 0.069 254.000 0.000 NA   NA
 3576944 3576945 YPDSF_1677 YPDSF_R0034     FALSE 0.238 146.000 0.000 NA   NA
 3576945 3576946 YPDSF_R0034 YPDSF_1678     FALSE 0.062 263.000 0.000 NA   NA
 3576947 3576948 YPDSF_1679 YPDSF_1680 queF   FALSE 0.337 153.000 0.079 NA   NA
 3576948 3576949 YPDSF_1680 YPDSF_1681   xni FALSE 0.234 260.000 0.178 NA   NA
 3576950 3576951 YPDSF_1682 YPDSF_1683     TRUE 0.956 -7.000 0.144 NA   NA
 3576951 3576952 YPDSF_1683 YPDSF_1684     FALSE 0.312 166.000 0.081 NA   NA
 3576953 3576954 YPDSF_1685 YPDSF_1686     TRUE 0.792 135.000 0.122 0.001   NA
 3576955 3576956 YPDSF_1687 YPDSF_1688   mltA FALSE 0.014 143.000 0.021 1.000 N NA
 3576957 3576958 YPDSF_R0035 YPDSF_R0036     FALSE 0.274 124.000 0.000 NA   NA
 3576958 3576959 YPDSF_R0036 YPDSF_R0037     FALSE 0.274 124.000 0.000 NA   NA
 3576961 3576962 YPDSF_1690 YPDSF_1691     FALSE 0.341 82.000 0.000 1.000   NA
 3576962 3576963 YPDSF_1691 YPDSF_1692     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3576963 3576964 YPDSF_1692 YPDSF_1693     FALSE 0.121 39.000 0.000 1.000 N NA
 3576965 3576966 YPDSF_1694 YPDSF_1695 RecD RecB TRUE 1.000 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 3576966 3576967 YPDSF_1695 YPDSF_1696 RecB   TRUE 0.901 -3.000 0.092 1.000 N NA
 3576967 3576968 YPDSF_1696 YPDSF_1697   recC FALSE 0.304 82.000 0.092 1.000 N NA
 3576968 3576969 YPDSF_1697 YPDSF_1698 recC   FALSE 0.178 135.000 0.076 NA N NA
 3576969 3576970 YPDSF_1698 YPDSF_1699     TRUE 0.958 33.000 0.538 NA   NA
 3576970 3576971 YPDSF_1699 YPDSF_1700     TRUE 0.992 -3.000 0.373 NA   NA
 3576971 3576972 YPDSF_1700 YPDSF_1701     TRUE 0.967 -9.000 0.000 NA Y NA
 3576972 3576973 YPDSF_1701 YPDSF_1702   thyA FALSE 0.013 236.000 0.000 NA N NA
 3576973 3576974 YPDSF_1702 YPDSF_1703 thyA   TRUE 0.917 7.000 0.164 1.000 N NA
 3576974 3576975 YPDSF_1703 YPDSF_1704     FALSE 0.003 251.000 0.003 1.000 N NA
 3576975 3576976 YPDSF_1704 YPDSF_1705     FALSE 0.106 13.000 0.012 1.000 N NA
 3576977 3576978 YPDSF_1706 YPDSF_1707     FALSE 0.001 389.000 0.015 1.000 N NA
 3576978 3576979 YPDSF_1707 YPDSF_1708     FALSE 0.007 707.000 0.000 NA   NA
 3576980 3576981 YPDSF_1709 YPDSF_1710     TRUE 0.968 -3.000 0.124 NA   NA
 3576981 3576982 YPDSF_1710 YPDSF_1711     FALSE 0.002 449.000 0.000 1.000 N NA
 3576986 3576987 YPDSF_1715 YPDSF_1716     FALSE 0.003 369.000 0.000 1.000 N NA
 3576988 3576989 YPDSF_1717 YPDSF_1718     TRUE 0.600 113.000 0.157 1.000   NA
 3576990 3576991 YPDSF_1719 YPDSF_1720     FALSE 0.205 164.000 0.000 NA   NA
 3576991 3576992 YPDSF_1720 YPDSF_1721     FALSE 0.484 43.000 0.000 NA   NA
 3576992 3576993 YPDSF_1721 YPDSF_1722     FALSE 0.467 48.000 0.000 NA   NA
 3576994 3576995 YPDSF_1723 YPDSF_1724     TRUE 0.715 47.000 0.192 1.000 N NA
 3576995 3576996 YPDSF_1724 YPDSF_1725     FALSE 0.032 336.000 0.000 1.000   NA
 3576996 3576997 YPDSF_1725 YPDSF_1726     TRUE 0.845 41.000 0.217 1.000   NA
 3576997 3576998 YPDSF_1726 YPDSF_1727     TRUE 0.999 -7.000 0.917 0.062 Y NA
 3576998 3576999 YPDSF_1727 YPDSF_1728     TRUE 0.981 14.000 0.131 0.062 Y NA
 3576999 3577000 YPDSF_1728 YPDSF_1729     TRUE 0.971 16.000 0.101 0.062 Y NA
 3577000 3577001 YPDSF_1729 YPDSF_1730     FALSE 0.133 298.000 0.000 0.062   NA
 3577001 3577002 YPDSF_1730 YPDSF_1731     FALSE 0.009 570.000 0.000 NA   NA
 3577002 3577003 YPDSF_1731 YPDSF_1732     FALSE 0.251 204.000 0.102 NA   NA
 3577004 3577005 YPDSF_1733 YPDSF_1734     FALSE 0.003 385.000 0.000 1.000 N NA
 3577005 3577006 YPDSF_1734 YPDSF_1735     FALSE 0.066 187.000 0.059 1.000 N NA
 3577008 3577009 YPDSF_1737 YPDSF_1738     TRUE 0.993 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 3577009 3577010 YPDSF_1738 YPDSF_1739     TRUE 0.993 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 3577010 3577011 YPDSF_1739 YPDSF_1740     TRUE 0.981 82.000 0.750 1.000 Y NA
 3577011 3577012 YPDSF_1740 YPDSF_1741     TRUE 0.966 153.000 0.750 1.000 Y NA
 3577012 3577013 YPDSF_1741 YPDSF_1742     FALSE 0.001 658.000 0.000 1.000 N NA
 3577013 3577014 YPDSF_1742 YPDSF_1743     FALSE 0.030 455.000 0.042 0.023 N NA
 3577014 3577015 YPDSF_1743 YPDSF_1744     TRUE 0.900 20.000 0.304 NA N NA
 3577015 3577016 YPDSF_1744 YPDSF_1745     TRUE 0.765 96.000 0.081 NA Y NA
 3577017 3577018 YPDSF_1746 YPDSF_1747     TRUE 0.991 -31.000 0.840 NA   NA
 3577018 3577019 YPDSF_1747 YPDSF_1748     FALSE 0.012 480.000 0.000 NA   NA
 3577019 3577020 YPDSF_1748 YPDSF_1749     TRUE 0.965 6.000 0.192 NA   NA
 3577020 3577021 YPDSF_1749 YPDSF_1750     TRUE 0.981 21.000 0.714 NA   NA
 3577021 3577022 YPDSF_1750 YPDSF_1751     TRUE 0.868 31.000 0.219 NA   NA
 3577022 3577023 YPDSF_1751 YPDSF_1752     TRUE 0.961 188.000 0.879 NA Y NA
 3577023 3577024 YPDSF_1752 YPDSF_1753     TRUE 0.874 206.000 0.848 NA   NA
 3577024 3577025 YPDSF_1753 YPDSF_1754     FALSE 0.125 208.000 0.000 NA   NA
 3577027 3577028 YPDSF_1756 YPDSF_1757     TRUE 0.712 14.000 0.000 NA   NA
 3577028 3577029 YPDSF_1757 YPDSF_1758     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3577030 3577031 YPDSF_1759 YPDSF_1760     FALSE 0.020 393.000 0.000 NA   NA
 3577033 3577034 YPDSF_1762 YPDSF_1763     FALSE 0.299 100.000 0.000 NA   NA
 3577034 3577035 YPDSF_1763 YPDSF_1764     TRUE 0.871 -124.000 0.000 0.007   NA
 3577035 3577036 YPDSF_1764 YPDSF_1765     FALSE 0.004 357.000 0.000 1.000 N NA
 3577038 3577039 YPDSF_1767 YPDSF_1768     TRUE 0.991 10.000 0.333 1.000 Y NA
 3577039 3577040 YPDSF_1768 YPDSF_1769     TRUE 0.937 160.000 0.286 0.010 Y NA
 3577040 3577041 YPDSF_1769 YPDSF_1770     TRUE 0.988 0.000 0.087 1.000 Y NA
 3577041 3577042 YPDSF_1770 YPDSF_1771     TRUE 0.804 158.000 0.188 1.000 Y NA
 3577042 3577043 YPDSF_1771 YPDSF_1772     TRUE 0.959 184.000 0.429 0.001 Y NA
 3577043 3577044 YPDSF_1772 YPDSF_1773     FALSE 0.083 241.000 0.000 NA   NA
 3577044 3577045 YPDSF_1773 YPDSF_1774     FALSE 0.260 132.000 0.000 NA   NA
 3577045 3577046 YPDSF_1774 YPDSF_1775     FALSE 0.011 528.000 0.000 NA   NA
 3577046 3577047 YPDSF_1775 YPDSF_1776     FALSE 0.013 475.000 0.000 NA   NA
 3577048 3577049 YPDSF_1777 YPDSF_1778     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA N NA
 3577049 3577050 YPDSF_1778 YPDSF_1779     TRUE 0.958 13.000 0.400 NA N NA
 3577051 3577052 YPDSF_1780 YPDSF_1781     TRUE 0.965 163.000 0.447 0.003 Y NA
 3577052 3577053 YPDSF_1781 YPDSF_1782   motB TRUE 0.996 17.000 0.913 1.000 Y NA
 3577053 3577054 YPDSF_1782 YPDSF_1783 motB   TRUE 0.998 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 3577054 3577055 YPDSF_1783 YPDSF_1784     TRUE 0.668 205.000 0.408 1.000   NA
 3577055 3577056 YPDSF_1784 YPDSF_1785     TRUE 0.911 98.000 0.250 0.001   NA
 3577056 3577057 YPDSF_1785 YPDSF_1786     FALSE 0.005 1188.000 0.000 1.000   NA
 3577057 3577058 YPDSF_1786 YPDSF_1787     FALSE 0.028 401.000 0.065 1.000   NA
 3577059 3577060 YPDSF_1788 YPDSF_1789     TRUE 0.993 -46.000 0.667 0.006   NA
 3577061 3577062 YPDSF_1790 YPDSF_1791     FALSE 0.229 215.000 0.105 NA   NA
 3577063 3577064 YPDSF_1792 YPDSF_1793 lacZ   FALSE 0.003 407.000 0.000 1.000 N NA
 3577064 3577065 YPDSF_1793 YPDSF_1794     FALSE 0.051 283.000 0.000 NA   NA
 3577065 3577066 YPDSF_1794 YPDSF_1795     FALSE 0.328 88.000 0.000 NA   NA
 3577066 3577067 YPDSF_1795 YPDSF_1796     FALSE 0.062 263.000 0.000 NA   NA
 3577067 3577068 YPDSF_1796 YPDSF_1797     FALSE 0.335 92.000 0.045 NA   NA
 3577068 3577069 YPDSF_1797 YPDSF_1798     FALSE 0.041 303.000 0.000 NA   NA
 3577072 3577073 YPDSF_1801 YPDSF_1802     TRUE 0.506 37.000 0.000 NA   NA
 3577074 3577075 YPDSF_1803 YPDSF_1804     FALSE 0.001 920.000 0.000 1.000 N NA
 3577075 3577076 YPDSF_1804 YPDSF_1805     TRUE 0.524 120.000 0.125 NA   NA
 3577076 3577077 YPDSF_1805 YPDSF_1806     FALSE 0.054 276.000 0.000 NA   NA
 3577079 3577080 YPDSF_1808 YPDSF_1809     TRUE 0.943 -7.000 0.182 1.000 N NA
 3577080 3577081 YPDSF_1809 YPDSF_1810   trmU FALSE 0.284 187.000 0.158 1.000 N NA
 3577081 3577082 YPDSF_1810 YPDSF_1811 trmU   TRUE 0.762 58.000 0.180 NA   NA
 3577082 3577083 YPDSF_1811 YPDSF_1812     TRUE 0.581 61.000 0.093 NA   NA
 3577083 3577084 YPDSF_1812 YPDSF_1813     FALSE 0.092 188.000 0.002 1.000   NA
 3577084 3577085 YPDSF_1813 YPDSF_1814     FALSE 0.121 211.000 0.000 1.000   NA
 3577085 3577086 YPDSF_1814 YPDSF_1815     TRUE 0.999 6.000 0.940 1.000 Y NA
 3577086 3577087 YPDSF_1815 YPDSF_1816     TRUE 0.941 30.000 0.408 NA   NA
 3577088 3577089 YPDSF_1817 YPDSF_1818     FALSE 0.001 330.000 0.019 1.000 N NA
 3577089 3577090 YPDSF_1818 YPDSF_1819     TRUE 0.692 49.000 0.119 NA   NA
 3577090 3577091 YPDSF_1819 YPDSF_1820     TRUE 0.704 -22.000 0.028 NA   NA
 3577091 3577092 YPDSF_1820 YPDSF_1821     TRUE 0.861 19.000 0.225 1.000 N NA
 3577092 3577093 YPDSF_1821 YPDSF_1822   lolD TRUE 0.976 0.000 0.125 0.077 N NA
 3577093 3577094 YPDSF_1822 YPDSF_1823 lolD   TRUE 0.972 -7.000 0.175 0.077 N NA
 3577096 3577097 YPDSF_1825 YPDSF_1826     FALSE 0.033 330.000 0.000 1.000   NA
 3577097 3577098 YPDSF_1826 YPDSF_1827     FALSE 0.309 96.000 0.000 NA   NA
 3577098 3577099 YPDSF_1827 YPDSF_1828     TRUE 0.827 8.000 0.000 NA   NA
 3577099 3577100 YPDSF_1828 YPDSF_1829     FALSE 0.069 254.000 0.000 NA   NA
 3577100 3577101 YPDSF_1829 YPDSF_1830     FALSE 0.192 171.000 0.000 NA   NA
 3577101 3577102 YPDSF_1830 YPDSF_1831     FALSE 0.030 375.000 0.057 NA   NA
 3577102 3577103 YPDSF_1831 YPDSF_1832     FALSE 0.421 128.000 0.091 NA   NA
 3577103 3577104 YPDSF_1832 YPDSF_1833     FALSE 0.209 83.000 0.069 1.000 N NA
 3577104 3577105 YPDSF_1833 YPDSF_1834     TRUE 0.968 -19.000 0.310 NA   NA
 3577105 3577106 YPDSF_1834 YPDSF_1835     TRUE 0.949 41.000 0.516 NA   NA
 3577106 3577107 YPDSF_1835 YPDSF_1836     TRUE 0.555 35.000 0.051 NA   NA
 3577107 3577108 YPDSF_1836 YPDSF_1837     FALSE 0.010 174.000 0.003 1.000 N NA
 3577108 3577109 YPDSF_1837 YPDSF_1838     FALSE 0.002 443.000 0.000 1.000 N NA
 3577109 3577110 YPDSF_1838 YPDSF_1839     FALSE 0.025 190.000 0.000 1.000 N NA
 3577110 3577111 YPDSF_1839 YPDSF_1840     FALSE 0.002 306.000 0.004 NA N NA
 3577111 3577112 YPDSF_1840 YPDSF_1841     TRUE 0.952 15.000 0.110 NA Y NA
 3577112 3577113 YPDSF_1841 YPDSF_1842   tdk TRUE 0.972 0.000 0.211 1.000 N NA
 3577113 3577114 YPDSF_1842 YPDSF_1843 tdk   TRUE 0.964 -10.000 0.209 NA   NA
 3577114 3577115 YPDSF_1843 YPDSF_1844     FALSE 0.244 269.000 0.204 NA   NA
 3577115 3577116 YPDSF_1844 YPDSF_1845     FALSE 0.002 416.000 0.000 1.000 N NA
 3577116 3577117 YPDSF_1845 YPDSF_1846     FALSE 0.022 200.000 0.000 1.000 N NA
 3577117 3577118 YPDSF_1846 YPDSF_1847   acpP TRUE 0.932 95.000 0.346 1.000 Y NA
 3577118 3577119 YPDSF_1847 YPDSF_1848 acpP fabG TRUE 0.953 154.000 0.321 0.003 Y NA
 3577119 3577120 YPDSF_1848 YPDSF_1849 fabG   TRUE 0.996 14.000 0.432 0.003 Y NA
 3577120 3577121 YPDSF_1849 YPDSF_1850     TRUE 0.975 38.000 0.182 0.003 Y NA
 3577121 3577122 YPDSF_1850 YPDSF_1851     TRUE 0.998 7.000 0.380 0.003 Y NA
 3577122 3577123 YPDSF_1851 YPDSF_1852   rpmF TRUE 0.908 34.000 0.418 1.000 N NA
 3577123 3577124 YPDSF_1852 YPDSF_1853 rpmF   TRUE 0.985 13.000 0.599 NA   NA
 3577128 3577129 YPDSF_1857 YPDSF_1858     FALSE 0.314 94.000 0.000 NA   NA
 3577130 3577131 YPDSF_1859 YPDSF_1860     FALSE 0.031 313.000 0.031 NA   NA
 3577131 3577132 YPDSF_1860 YPDSF_1861   bssS FALSE 0.011 506.000 0.000 NA   NA
 3577134 3577135 YPDSF_1863 YPDSF_1864 solA   FALSE 0.009 267.000 0.000 1.000 N NA
 3577136 3577137 YPDSF_1865 YPDSF_1866 tqsA   FALSE 0.206 149.000 0.033 NA   NA
 3577137 3577138 YPDSF_1866 YPDSF_1867     FALSE 0.481 44.000 0.000 NA   NA
 3577138 3577139 YPDSF_1867 YPDSF_1868     FALSE 0.160 187.000 0.000 NA   NA
 3577143 3577144 YPDSF_1872 YPDSF_1873     FALSE 0.126 487.000 0.000 0.051 Y NA
 3577145 3577146 YPDSF_1874 YPDSF_1875     TRUE 0.880 47.000 0.286 1.000   NA
 3577146 3577147 YPDSF_1875 YPDSF_1876     TRUE 0.991 11.000 0.714 1.000   NA
 3577148 3577149 YPDSF_1877 YPDSF_1878     TRUE 0.982 11.000 0.468 NA   NA
 3577149 3577150 YPDSF_1878 YPDSF_1879     TRUE 0.986 18.000 0.787 NA   NA
 3577150 3577151 YPDSF_1879 YPDSF_1880     TRUE 0.998 -3.000 0.895 NA   NA
 3577151 3577152 YPDSF_1880 YPDSF_1881     FALSE 0.271 409.000 0.528 NA   NA
 3577152 3577153 YPDSF_1881 YPDSF_1882     TRUE 0.997 -3.000 0.707 NA   NA
 11426280 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 360.000 0.000 NA   NA
 11568643 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 360.000 0.000 NA   NA
 11711035 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 360.000 0.000 NA   NA
 11426281 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 388.000 0.000 NA   NA
 11568644 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 388.000 0.000 NA   NA
 11711036 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 388.000 0.000 NA   NA
 11426282 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 420.000 0.000 NA   NA
 11568645 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 420.000 0.000 NA   NA
 11711037 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 420.000 0.000 NA   NA
 11426283 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 448.000 0.000 NA   NA
 11568646 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 448.000 0.000 NA   NA
 11711038 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 448.000 0.000 NA   NA
 11426284 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 480.000 0.000 NA   NA
 11568647 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 480.000 0.000 NA   NA
 11711039 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 480.000 0.000 NA   NA
 11426285 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 508.000 0.000 NA   NA
 11568648 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 508.000 0.000 NA   NA
 11711040 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 508.000 0.000 NA   NA
 11426286 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 540.000 0.000 NA   NA
 11568649 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 540.000 0.000 NA   NA
 11711041 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 540.000 0.000 NA   NA
 11426287 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 568.000 0.000 NA   NA
 11568650 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 568.000 0.000 NA   NA
 11711042 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 568.000 0.000 NA   NA
 11426288 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 600.000 0.000 NA   NA
 11568651 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 600.000 0.000 NA   NA
 11711043 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 600.000 0.000 NA   NA
 11426289 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11568652 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11711044 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11426290 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 660.000 0.000 NA   NA
 11568653 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 660.000 0.000 NA   NA
 11711045 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 660.000 0.000 NA   NA
 11426291 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 688.000 0.000 NA   NA
 11568654 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 688.000 0.000 NA   NA
 11711046 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 688.000 0.000 NA   NA
 11426292 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 722.000 0.000 NA   NA
 11568655 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 722.000 0.000 NA   NA
 11711047 3577153   YPDSF_1882     FALSE NA 722.000 0.000 NA   NA
 3577155 3577156 YPDSF_1884 YPDSF_1885     TRUE 0.500 39.000 0.000 NA   NA
 3577156 3577157 YPDSF_1885 YPDSF_1886     FALSE 0.283 117.000 0.000 NA   NA
 3577157 3577158 YPDSF_1886 YPDSF_1887     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 3577158 3577159 YPDSF_1887 YPDSF_1888     TRUE 0.623 147.000 0.000 NA Y NA
 3577159 3577160 YPDSF_1888 YPDSF_1889     TRUE 0.999 1.000 0.711 0.060 Y NA
 3577160 3577161 YPDSF_1889 YPDSF_1890     TRUE 0.986 109.000 0.733 0.060 Y NA
 3577162 3577163 YPDSF_1891 YPDSF_1892     FALSE 0.205 17.000 0.000 1.000 N NA
 3577163 3577164 YPDSF_1892 YPDSF_1893     TRUE 0.695 100.000 0.000 1.000 Y NA
 3577165 3577166 YPDSF_1894 YPDSF_1895     TRUE 0.749 12.000 0.000 NA   NA
 3577166 3577167 YPDSF_1895 YPDSF_1896     FALSE 0.056 273.000 0.000 NA   NA
 3577167 3577168 YPDSF_1896 YPDSF_1897     FALSE 0.008 601.000 0.000 NA   NA
 3577168 3577169 YPDSF_1897 YPDSF_1898     FALSE 0.134 203.000 0.000 NA   NA
 3577169 3577170 YPDSF_1898 YPDSF_1899     TRUE 0.796 10.000 0.000 NA   NA
 3577170 3577171 YPDSF_1899 YPDSF_1900     FALSE 0.007 664.000 0.000 NA   NA
 3577171 3577172 YPDSF_1900 YPDSF_1901     FALSE 0.078 245.000 0.000 NA   NA
 3577172 3577173 YPDSF_1901 YPDSF_1902     TRUE 0.894 2.000 0.000 NA   NA
 3577173 3577174 YPDSF_1902 YPDSF_1903     FALSE 0.446 204.000 0.000 1.000 Y NA
 3577174 3577175 YPDSF_1903 YPDSF_1904     FALSE 0.001 653.000 0.000 1.000 N NA
 3577175 3577176 YPDSF_1904 YPDSF_1905     FALSE 0.474 96.000 0.000 0.038 N NA
 3577176 3577177 YPDSF_1905 YPDSF_1906     FALSE 0.466 117.000 0.167 1.000 N NA
 3577177 3577178 YPDSF_1906 YPDSF_1907     FALSE 0.036 782.000 0.333 1.000 N NA
 3577179 3577180 YPDSF_1908 YPDSF_1909     FALSE 0.491 247.000 0.000 0.051 Y NA
 3577181 3577182 YPDSF_1910 YPDSF_1911     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3577182 3577183 YPDSF_1911 YPDSF_1912     TRUE 0.580 -190.000 0.000 NA   NA
 3577183 3577184 YPDSF_1912 YPDSF_1913     TRUE 0.494 40.000 0.000 NA   NA
 3577184 3577185 YPDSF_1913 YPDSF_1914     FALSE 0.241 175.000 0.125 1.000 N NA
 3577185 3577186 YPDSF_1914 YPDSF_1915     FALSE 0.008 583.000 0.000 NA   NA
 3577186 3577187 YPDSF_1915 YPDSF_1916     FALSE 0.243 142.000 0.000 NA   NA
 3577187 3577188 YPDSF_1916 YPDSF_1917     FALSE 0.086 238.000 0.000 NA   NA
 3577188 3577189 YPDSF_1917 YPDSF_1918   ompX FALSE 0.005 316.000 0.000 1.000 N NA
 3577190 3577191 YPDSF_1919 YPDSF_1920     TRUE 0.568 16.000 0.016 1.000   NA
 3577191 3577192 YPDSF_1920 YPDSF_1921     TRUE 0.838 23.000 0.000 0.044   NA
 3577192 3577193 YPDSF_1921 YPDSF_1922     FALSE 0.066 257.000 0.000 1.000   NA
 3577193 3577194 YPDSF_1922 YPDSF_1923     FALSE 0.036 320.000 0.000 1.000   NA
 3577194 3577195 YPDSF_1923 YPDSF_1924   glnH FALSE 0.009 570.000 0.000 1.000   NA
 3577195 3577196 YPDSF_1924 YPDSF_1925 glnH glnP TRUE 0.944 35.000 0.103 0.076 Y NA
 3577196 3577197 YPDSF_1925 YPDSF_1926 glnP glnQ TRUE 0.901 -90.000 0.051 1.000 Y NA
 3577202 3577203 YPDSF_1931 YPDSF_1932     FALSE 0.090 233.000 0.000 NA   NA
 3577203 3577204 YPDSF_1932 YPDSF_1933     FALSE 0.080 66.000 0.000 1.000 N NA
 3577204 3577205 YPDSF_1933 YPDSF_1934     TRUE 0.988 -12.000 0.283 0.001 N NA
 3577205 3577206 YPDSF_1934 YPDSF_1935     TRUE 0.998 0.000 0.171 0.001 Y NA
 3577206 3577207 YPDSF_1935 YPDSF_1936     TRUE 0.951 14.000 0.280 NA   NA
 3577207 3577208 YPDSF_1936 YPDSF_1937     TRUE 0.992 -3.000 0.355 NA   NA
 3577208 3577209 YPDSF_1937 YPDSF_1938     TRUE 0.708 228.000 0.281 1.000 Y NA
 3577209 3577210 YPDSF_1938 YPDSF_1939     FALSE 0.011 522.000 0.000 NA   NA
 3577210 3577211 YPDSF_1939 YPDSF_1940     FALSE 0.010 555.000 0.000 NA   NA
 3577212 3577213 YPDSF_1941 YPDSF_1942     FALSE 0.185 174.000 0.000 NA   NA
 3577214 3577215 YPDSF_1943 YPDSF_1944     TRUE 0.698 10.000 0.008 NA   NA
 3577215 3577216 YPDSF_1944 YPDSF_1945     TRUE 0.519 30.000 0.036 NA   NA
 3577216 3577217 YPDSF_1945 YPDSF_1946     FALSE 0.168 546.000 0.667 1.000 N NA
 3577217 3577218 YPDSF_1946 YPDSF_1947     FALSE 0.002 466.000 0.000 1.000 N NA
 3577219 3577220 YPDSF_1948 YPDSF_1949     FALSE 0.007 654.000 0.000 1.000   NA
 3577220 3577221 YPDSF_1949 YPDSF_1950     FALSE 0.432 49.000 0.095 1.000 N NA
 3577221 3577222 YPDSF_1950 YPDSF_1951     TRUE 0.813 78.000 0.095 NA Y NA
 3577223 3577224 YPDSF_1952 YPDSF_1953     FALSE 0.055 236.000 0.011 NA   NA
 3577224 3577225 YPDSF_1953 YPDSF_1954     TRUE 0.998 7.000 0.437 0.001 Y NA
 3577225 3577226 YPDSF_1954 YPDSF_1955     TRUE 0.996 40.000 0.713 0.001 Y NA
 3577226 3577227 YPDSF_1955 YPDSF_1956     TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 3577227 3577228 YPDSF_1956 YPDSF_1957     TRUE 0.998 -3.000 0.269 0.002 Y NA
 3577228 3577229 YPDSF_1957 YPDSF_1958     TRUE 0.996 13.000 0.428 0.004 Y NA
 3577229 3577230 YPDSF_1958 YPDSF_1959     TRUE 0.995 15.000 0.423 0.004 Y NA
 3577230 3577231 YPDSF_1959 YPDSF_1960     TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 3577231 3577232 YPDSF_1960 YPDSF_1961     TRUE 0.947 87.000 0.180 0.004 Y NA
 3577232 3577233 YPDSF_1961 YPDSF_1962     TRUE 0.998 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 3577233 3577234 YPDSF_1962 YPDSF_1963     TRUE 0.999 3.000 0.407 0.004 Y NA
 3577234 3577235 YPDSF_1963 YPDSF_1964     TRUE 0.987 141.000 0.691 0.002 Y NA
 3577235 3577236 YPDSF_1964 YPDSF_1965     TRUE 0.975 102.000 0.377 0.002 Y NA
 3577236 3577237 YPDSF_1965 YPDSF_1966     FALSE 0.001 679.000 0.000 1.000 N NA
 3577238 3577239 YPDSF_1967 YPDSF_1968     FALSE 0.402 151.000 0.104 1.000   NA
 3577240 3577241 YPDSF_1969 YPDSF_1970     FALSE 0.243 232.000 0.136 1.000   NA
 3577241 3577242 YPDSF_1970 YPDSF_1971     TRUE 0.752 165.000 0.375 NA   NA
 3577242 3577243 YPDSF_1971 YPDSF_1972     FALSE 0.212 298.000 0.221 NA   NA
 3577244 3577245 YPDSF_1973 YPDSF_1974     TRUE 0.869 168.000 0.634 1.000   NA
 3577247 3577248 YPDSF_1976 YPDSF_1977     TRUE 0.868 169.000 0.130 0.006 Y NA
 3577248 3577249 YPDSF_1977 YPDSF_1978   ulaA TRUE 0.988 13.000 0.377 0.008   NA
 3577250 3577251 YPDSF_1979 YPDSF_1980     FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 3577251 3577252 YPDSF_1980 YPDSF_1981     TRUE 0.699 -31.000 0.000 NA   NA
 3577252 3577253 YPDSF_1981 YPDSF_1982     FALSE 0.158 188.000 0.000 NA   NA
 3577255 3577256 YPDSF_1984 YPDSF_1985     TRUE 0.994 14.000 0.643 1.000 Y NA
 3577256 3577257 YPDSF_1985 YPDSF_1986     TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.016 Y NA
 3577257 3577258 YPDSF_1986 YPDSF_1987     TRUE 0.989 103.000 0.833 0.060 Y NA
 3577258 3577259 YPDSF_1987 YPDSF_1988     FALSE 0.002 525.000 0.000 1.000 N NA
 3577259 3577260 YPDSF_1988 YPDSF_1989     FALSE 0.026 247.000 0.056 1.000 N NA
 3577260 3577261 YPDSF_1989 YPDSF_1990     TRUE 0.953 13.000 0.262 1.000   NA
 3577261 3577262 YPDSF_1990 YPDSF_1991     FALSE 0.091 312.000 0.116 1.000   NA
 3577262 3577263 YPDSF_1991 YPDSF_1992     TRUE 0.684 120.000 0.216 1.000   NA
 3577263 3577264 YPDSF_1992 YPDSF_1993     FALSE 0.390 249.000 0.383 1.000 N NA
 3577264 3577265 YPDSF_1993 YPDSF_1994     FALSE 0.066 231.000 0.020 NA   NA
 3577265 3577266 YPDSF_1994 YPDSF_1995   truA FALSE 0.209 157.000 0.038 NA   NA
 3577266 3577267 YPDSF_1995 YPDSF_1996 truA   TRUE 0.570 0.000 0.040 1.000 N NA
 3577267 3577268 YPDSF_1996 YPDSF_1997     TRUE 0.835 170.000 0.097 0.009 Y NA
 3577268 3577269 YPDSF_1997 YPDSF_1998     FALSE 0.402 -13.000 0.043 1.000 N NA
 3577270 3577271 YPDSF_1999 YPDSF_2000     FALSE 0.119 285.000 0.118 NA   NA
 3577276 3577277 YPDSF_2005 YPDSF_2006     TRUE 0.911 58.000 0.425 NA   NA
 3577277 3577278 YPDSF_2006 YPDSF_2007     TRUE 0.608 100.000 0.153 NA   NA
 3577278 3577279 YPDSF_2007 YPDSF_2008   mepA TRUE 0.962 4.000 0.160 1.000   NA
 3577279 3577280 YPDSF_2008 YPDSF_2009 mepA   FALSE 0.038 45.000 0.025 1.000 N NA
 3577280 3577281 YPDSF_2009 YPDSF_2010     FALSE 0.269 77.000 0.081 1.000 N NA
 3577283 3577284 YPDSF_2012 YPDSF_2013   fadJ FALSE 0.001 569.000 0.000 1.000 N NA
 3577284 3577285 YPDSF_2013 YPDSF_2014 fadJ fadI TRUE 0.998 0.000 0.430 1.000 Y NA
 3577285 3577286 YPDSF_2014 YPDSF_2015 fadI   FALSE 0.067 287.000 0.061 NA   NA
 3577288 3577289 YPDSF_2017 YPDSF_2018     TRUE 0.810 36.000 0.239 1.000 N NA
 3577289 3577290 YPDSF_2018 YPDSF_2019     TRUE 0.999 0.000 0.727 NA Y NA
 3577290 3577291 YPDSF_2019 YPDSF_2020     TRUE 0.998 -3.000 0.578 NA Y NA
 3577291 3577292 YPDSF_2020 YPDSF_2021     TRUE 1.000 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 3577292 3577293 YPDSF_2021 YPDSF_2022     TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 3577293 3577294 YPDSF_2022 YPDSF_2023     TRUE 0.987 -3.000 0.344 1.000 N NA
 3577294 3577295 YPDSF_2023 YPDSF_2024     TRUE 0.993 -3.000 0.501 1.000 N NA
 3577295 3577296 YPDSF_2024 YPDSF_2025     TRUE 0.990 63.000 0.501 0.001 Y NA
 3577296 3577297 YPDSF_2025 YPDSF_2026     TRUE 0.997 -30.000 0.503 0.002 Y NA
 3577297 3577298 YPDSF_2026 YPDSF_2027     FALSE 0.015 445.000 0.000 NA   NA
 3577298 3577299 YPDSF_2027 YPDSF_R0039     FALSE 0.068 255.000 0.000 NA   NA
 3577300 3577301 YPDSF_2028 YPDSF_2029     TRUE 0.743 -55.000 0.074 NA   NA
 3577301 3577302 YPDSF_2029 YPDSF_2030     FALSE 0.023 376.000 0.000 NA   NA
 3577303 3577304 YPDSF_2031 YPDSF_2032     TRUE 0.837 7.000 0.000 NA   NA
 3577304 3577305 YPDSF_2032 YPDSF_2033     TRUE 0.970 81.000 1.000 NA   NA
 3577305 3577306 YPDSF_2033 YPDSF_2034     TRUE 0.987 20.000 0.833 NA   NA
 3577306 3577307 YPDSF_2034 YPDSF_2035     TRUE 0.982 0.000 0.200 NA   NA
 3577307 3577308 YPDSF_2035 YPDSF_2036     TRUE 0.685 99.000 0.200 NA   NA
 3577308 3577309 YPDSF_2036 YPDSF_2037     FALSE 0.046 294.000 0.000 NA   NA
 3577309 3577310 YPDSF_2037 YPDSF_2038     FALSE 0.487 42.000 0.000 NA   NA
 3577310 3577311 YPDSF_2038 YPDSF_2039     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 3577311 3577312 YPDSF_2039 YPDSF_2040     TRUE 0.668 16.000 0.000 1.000   NA
 3577312 3577313 YPDSF_2040 YPDSF_2041     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3577313 3577314 YPDSF_2041 YPDSF_2042     TRUE 0.712 14.000 0.000 NA   NA
 3577314 3577315 YPDSF_2042 YPDSF_2043     TRUE 0.989 -3.000 0.294 NA   NA
 3577315 3577316 YPDSF_2043 YPDSF_2044     TRUE 0.997 4.000 0.833 NA   NA
 3577316 3577317 YPDSF_2044 YPDSF_2045     FALSE 0.438 253.000 0.333 NA   NA
 3577317 3577318 YPDSF_2045 YPDSF_2046     TRUE 0.614 242.000 0.500 NA   NA
 3577318 3577319 YPDSF_2046 YPDSF_2047     TRUE 0.983 24.000 0.800 NA   NA
 3577319 3577320 YPDSF_2047 YPDSF_2048     TRUE 0.924 105.000 0.667 NA   NA
 3577320 3577321 YPDSF_2048 YPDSF_2049     TRUE 0.994 -15.000 0.833 1.000   NA
 3577323 3577324 YPDSF_2051 YPDSF_2052     TRUE 0.958 128.000 1.000 1.000   NA
 3577324 3577325 YPDSF_2052 YPDSF_2053     TRUE 0.978 157.000 1.000 1.000 Y NA
 3577325 3577326 YPDSF_2053 YPDSF_2054     TRUE 0.872 201.000 1.000 1.000 N NA
 3577327 3577328 YPDSF_2055 YPDSF_2056     TRUE 0.998 0.000 0.833 NA   NA
 3577328 3577329 YPDSF_2056 YPDSF_2057     FALSE 0.400 62.000 0.000 NA   NA
 3577329 3577330 YPDSF_2057 YPDSF_2058     TRUE 0.964 99.000 1.000 NA   NA
 3577330 3577331 YPDSF_2058 YPDSF_2059     TRUE 0.994 7.000 0.714 NA   NA
 3577331 3577332 YPDSF_2059 YPDSF_2060     TRUE 0.971 40.000 0.714 NA   NA
 3577332 3577333 YPDSF_2060 YPDSF_2061     TRUE 0.977 -54.000 0.600 NA   NA
 3577333 3577334 YPDSF_2061 YPDSF_2062     TRUE 0.992 1.000 0.400 NA   NA
 3577334 3577335 YPDSF_2062 YPDSF_2063     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 3577336 3577337 YPDSF_2064 YPDSF_2065     FALSE 0.001 1262.000 0.000 NA N NA
 3577338 3577339 YPDSF_2066 YPDSF_2067     TRUE 0.994 56.000 0.824 0.059 Y NA
 3577339 3577340 YPDSF_2067 YPDSF_2068     TRUE 0.991 -3.000 0.275 0.059 N NA
 3577344 3577345 YPDSF_2072 YPDSF_2073     TRUE 0.997 12.000 0.500 0.037 Y NA
 3577345 3577346 YPDSF_2073 YPDSF_2074     TRUE 0.996 2.000 0.667 1.000   NA
 3577346 3577347 YPDSF_2074 YPDSF_2075     FALSE 0.026 358.000 0.000 1.000   NA
 3577347 3577348 YPDSF_2075 YPDSF_2076     TRUE 0.996 -3.000 0.333 0.037   NA
 3577349 3577350 YPDSF_2077 YPDSF_2078     TRUE 0.997 -3.000 0.740 NA   NA
 3577350 3577351 YPDSF_2078 YPDSF_2079     TRUE 0.989 -18.000 0.625 NA   NA
 3577353 3577354 YPDSF_2081 YPDSF_2082     FALSE 0.005 226.000 0.009 1.000 N NA
 3577356 3577357 YPDSF_2084 YPDSF_2085 glk   FALSE 0.188 181.000 0.048 NA   NA
 3577358 3577359 YPDSF_2086 YPDSF_2087     FALSE 0.076 136.000 0.050 1.000 N NA
 3577359 3577360 YPDSF_2087 YPDSF_2088     FALSE 0.274 171.000 0.071 NA   NA
 3577362 3577363 YPDSF_2090 YPDSF_2091     TRUE 0.918 18.000 0.000 0.001   NA
 3577364 3577365 YPDSF_R0040 YPDSF_R0041     FALSE 0.140 200.000 0.000 NA   NA
 3577365 3577366 YPDSF_R0041 YPDSF_R0042     FALSE 0.477 45.000 0.000 NA   NA
 3577366 3577367 YPDSF_R0042 YPDSF_R0043     TRUE 0.506 37.000 0.000 NA   NA
 3577368 3577369 YPDSF_2092 YPDSF_R0044 gltX   FALSE 0.091 232.000 0.000 NA   NA
 3577369 3577370 YPDSF_R0044 YPDSF_2093     FALSE 0.173 181.000 0.000 NA   NA
 3577370 3577371 YPDSF_2093 YPDSF_2094     FALSE 0.060 267.000 0.000 NA   NA
 3577371 3577372 YPDSF_2094 YPDSF_2095     FALSE 0.216 132.000 0.027 NA   NA
 3577373 3577374 YPDSF_2096 YPDSF_2097   ligA TRUE 0.516 20.000 0.017 NA   NA
 3577374 3577375 YPDSF_2097 YPDSF_2098 ligA   FALSE 0.020 91.000 0.013 1.000 N NA
 3577376 3577377 YPDSF_2099 YPDSF_2100     TRUE 0.731 157.000 0.122 1.000 Y NA
 3577377 3577378 YPDSF_2100 YPDSF_2101     FALSE 0.001 499.000 0.019 1.000 N NA
 3577378 3577379 YPDSF_2101 YPDSF_2102     TRUE 0.922 49.000 0.033 0.007 Y NA
 3577379 3577380 YPDSF_2102 YPDSF_2103     TRUE 0.924 49.000 0.038 0.007 Y NA
 3577381 3577382 YPDSF_2104 YPDSF_2105     FALSE 0.008 270.000 0.000 1.000 N NA
 3577382 3577383 YPDSF_2105 YPDSF_2106     TRUE 0.956 26.000 0.216 1.000 Y NA
 3577384 3577385 YPDSF_2107 YPDSF_2108     TRUE 0.992 4.000 0.439 0.093 N NA
 3577386 3577387 YPDSF_2109 YPDSF_2110     FALSE 0.410 60.000 0.000 1.000   NA
 3577387 3577388 YPDSF_2110 YPDSF_2111     FALSE 0.146 337.000 0.000 1.000 Y NA
 3577388 3577389 YPDSF_2111 YPDSF_2112     TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.001   NA
 3577389 3577390 YPDSF_2112 YPDSF_2113     TRUE 0.516 34.000 0.000 1.000   NA
 3577391 3577392 YPDSF_2114 YPDSF_2115     FALSE 0.090 233.000 0.000 NA   NA
 3577392 3577393 YPDSF_2115 YPDSF_2116     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3577394 3577395 YPDSF_2117 YPDSF_2118   cysM FALSE 0.078 245.000 0.000 NA   NA
 3577395 3577396 YPDSF_2118 YPDSF_2119 cysM   FALSE 0.050 171.000 0.049 1.000 N NA
 3577396 3577397 YPDSF_2119 YPDSF_2120   cysW TRUE 0.986 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 3577397 3577398 YPDSF_2120 YPDSF_2121 cysW   TRUE 0.998 0.000 0.583 0.001 N NA
 3577398 3577399 YPDSF_2121 YPDSF_2122     TRUE 0.997 0.000 0.479 0.002 N NA
 3577399 3577400 YPDSF_2122 YPDSF_2123     FALSE 0.005 315.000 0.000 1.000 N NA
 3577400 3577401 YPDSF_2123 YPDSF_2124     FALSE 0.001 605.000 0.000 1.000 N NA
 3577401 3577402 YPDSF_2124 YPDSF_2125     FALSE 0.271 189.000 0.154 NA N NA
 3577402 3577403 YPDSF_2125 YPDSF_2126     TRUE 0.863 82.000 0.154 NA Y NA
 3577404 3577405 YPDSF_2127 YPDSF_2128     FALSE 0.127 206.000 0.000 1.000   NA
 3577405 3577406 YPDSF_2128 YPDSF_2129     FALSE 0.337 63.000 0.087 1.000 N NA
 3577407 3577408 YPDSF_2130 YPDSF_2131     FALSE 0.179 178.000 0.000 NA   NA
 3577408 3577409 YPDSF_2131 YPDSF_2132     TRUE 0.629 -61.000 0.000 NA   NA
 3577410 3577411 YPDSF_2133 YPDSF_2134     FALSE 0.010 556.000 0.000 NA   NA
 3577412 3577413 YPDSF_2135 YPDSF_2136     FALSE 0.013 473.000 0.000 NA   NA
 3577414 3577415 YPDSF_2137 YPDSF_2138     TRUE 0.876 0.000 0.016 NA   NA
 3577416 3577417 YPDSF_2139 YPDSF_2140     FALSE 0.332 196.000 0.047 0.006 N NA
 3577417 3577418 YPDSF_2140 YPDSF_2141     FALSE 0.130 157.000 0.070 1.000 N NA
 3577418 3577419 YPDSF_2141 YPDSF_2142   napB TRUE 0.983 28.000 0.490 NA Y NA
 3577419 3577420 YPDSF_2142 YPDSF_2143 napB   TRUE 0.716 83.000 0.031 NA Y NA
 3577420 3577421 YPDSF_2143 YPDSF_2144     TRUE 0.997 -3.000 0.875 NA N NA
 3577421 3577422 YPDSF_2144 YPDSF_2145     TRUE 0.964 -10.000 0.209 NA   NA
 3577425 3577426 YPDSF_2148 YPDSF_2149     FALSE 0.092 231.000 0.000 NA   NA
 3577426 3577427 YPDSF_2149 YPDSF_2150     FALSE 0.048 289.000 0.000 NA   NA
 3577428 3577429 YPDSF_2151 YPDSF_2152     TRUE 0.946 58.000 0.600 1.000   NA
 3577429 3577430 YPDSF_2152 YPDSF_2153     FALSE 0.002 478.000 0.000 1.000 N NA
 3577430 3577431 YPDSF_2153 YPDSF_2154     TRUE 0.995 -7.000 0.585 0.059 N NA
 3577431 3577432 YPDSF_2154 YPDSF_2155     TRUE 0.986 95.000 0.688 0.059 Y NA
 3577433 3577434 YPDSF_2156 YPDSF_2157     FALSE 0.133 160.000 0.006 1.000   NA
 3577434 3577435 YPDSF_2157 YPDSF_2158     TRUE 0.979 2.000 0.292 1.000 N NA
 3577435 3577436 YPDSF_2158 YPDSF_2159     TRUE 0.985 -3.000 0.163 0.022 N NA
 3577436 3577437 YPDSF_2159 YPDSF_2160     TRUE 0.648 68.000 0.130 NA   NA
 3577438 3577439 YPDSF_2161 YPDSF_2162     TRUE 0.949 2.000 0.100 NA   NA
 3577439 3577440 YPDSF_2162 YPDSF_2163     FALSE 0.236 94.000 0.018 NA   NA
 3577440 3577441 YPDSF_2163 YPDSF_2164     FALSE 0.064 219.000 0.004 1.000   NA
 3577441 3577442 YPDSF_2164 YPDSF_2165     FALSE 0.041 148.000 0.000 1.000 N NA
 3577442 3577443 YPDSF_2165 YPDSF_2166     FALSE 0.031 175.000 0.000 NA N NA
 3577443 3577444 YPDSF_2166 YPDSF_2167     TRUE 0.898 18.000 0.032 NA Y NA
 3577445 3577446 YPDSF_2168 YPDSF_2169 gcvR bcp TRUE 0.881 3.000 0.102 1.000 N NA
 3577447 3577448 YPDSF_2170 YPDSF_2171     FALSE 0.179 178.000 0.000 NA   NA
 3577448 3577449 YPDSF_2171 YPDSF_2172     FALSE 0.054 276.000 0.000 NA   NA
 3577450 3577451 YPDSF_2173 YPDSF_2174     TRUE 0.749 107.000 0.259 1.000   NA
 3577452 3577453 YPDSF_2175 YPDSF_2176     FALSE 0.157 188.000 0.000 1.000   NA
 3577453 3577454 YPDSF_2176 YPDSF_2177   upp FALSE 0.030 176.000 0.000 1.000 N NA
 3577455 3577456 YPDSF_2178 YPDSF_2179   purN TRUE 0.954 115.000 0.230 0.002 Y NA
 3577456 3577457 YPDSF_2179 YPDSF_2180 purN   FALSE 0.005 229.000 0.017 1.000 N NA
 3577458 3577459 YPDSF_2181 YPDSF_2182     TRUE 0.739 -24.000 0.000 NA   NA
 3577459 3577460 YPDSF_2182 YPDSF_2183     FALSE 0.116 214.000 0.000 NA   NA
 3577460 3577461 YPDSF_2183 YPDSF_2184     TRUE 0.994 28.000 0.511 0.002 Y NA
 3577461 3577462 YPDSF_2184 YPDSF_2185     TRUE 0.997 0.000 0.489 0.093   NA
 3577463 3577464 YPDSF_2186 YPDSF_2187     TRUE 0.993 11.000 0.486 1.000 Y NA
 3577464 3577465 YPDSF_2187 YPDSF_2188     FALSE 0.306 112.000 0.047 NA   NA
 3577465 3577466 YPDSF_2188 YPDSF_2189     FALSE 0.377 52.000 0.024 NA   NA
 3577466 3577467 YPDSF_2189 YPDSF_2190     FALSE 0.043 140.000 0.000 1.000 N NA
 3577468 3577469 YPDSF_2191 YPDSF_2192     TRUE 0.906 62.000 0.072 0.058 Y NA
 3577469 3577470 YPDSF_2192 YPDSF_2193     TRUE 0.911 47.000 0.000 0.058 Y NA
 3577470 3577471 YPDSF_2193 YPDSF_2194     TRUE 0.808 53.000 0.000 1.000 Y NA
 3577472 3577473 YPDSF_2195 YPDSF_2196     FALSE 0.106 383.000 0.000 1.000 Y NA
 3577473 3577474 YPDSF_2196 YPDSF_2197     FALSE 0.004 364.000 0.000 1.000 N NA
 3577474 3577475 YPDSF_2197 YPDSF_2198     TRUE 0.998 0.000 1.000 1.000 N NA
 3577475 3577476 YPDSF_2198 YPDSF_2199     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3577476 3577477 YPDSF_2199 YPDSF_2200     TRUE 0.624 -64.000 0.000 NA   NA
 3577477 3577478 YPDSF_2200 YPDSF_2201     TRUE 0.518 34.000 0.000 NA   NA
 3577478 3577479 YPDSF_2201 YPDSF_2202     TRUE 0.788 31.000 0.139 1.000   NA
 3577479 3577480 YPDSF_2202 YPDSF_2203     TRUE 0.996 10.000 0.591 1.000 Y NA
 3577480 3577481 YPDSF_2203 YPDSF_2204     FALSE 0.320 137.000 0.062 NA   NA
 3577481 3577482 YPDSF_2204 YPDSF_2205     FALSE 0.033 275.000 0.008 NA   NA
 3577482 3577483 YPDSF_2205 YPDSF_2206     FALSE 0.001 636.000 0.000 1.000 N NA
 3577487 3577488 YPDSF_2210 YPDSF_2211     FALSE 0.416 59.000 0.000 NA   NA
 3577491 3577492 YPDSF_2214 YPDSF_2215   guaA FALSE 0.003 375.000 0.000 1.000 N NA
 3577492 3577493 YPDSF_2215 YPDSF_2216 guaA   TRUE 0.908 180.000 0.190 0.001 Y NA
 3577495 3577496 YPDSF_2218 YPDSF_2219     TRUE 0.518 49.000 0.055 NA   NA
 3577496 3577497 YPDSF_2219 YPDSF_2220   engA FALSE 0.065 347.000 0.003 0.070   NA
 3577497 3577498 YPDSF_2220 YPDSF_2221 engA   TRUE 0.612 148.000 0.203 1.000   NA
 3577498 3577499 YPDSF_2221 YPDSF_2222     TRUE 0.981 12.000 0.492 1.000   NA
 3577499 3577500 YPDSF_2222 YPDSF_2223   hisS TRUE 0.947 14.000 0.259 1.000   NA
 3577500 3577501 YPDSF_2223 YPDSF_2224 hisS ispG FALSE 0.306 209.000 0.207 1.000 N NA
 3577501 3577502 YPDSF_2224 YPDSF_2225 ispG   TRUE 0.810 62.000 0.233 1.000   NA
 3577502 3577503 YPDSF_2225 YPDSF_2226     TRUE 0.948 -10.000 0.153 1.000   NA
 3577503 3577504 YPDSF_2226 YPDSF_2227     FALSE 0.301 154.000 0.067 1.000   NA
 3577504 3577505 YPDSF_2227 YPDSF_2228   ndk FALSE 0.201 262.000 0.156 1.000   NA
 3577505 3577506 YPDSF_2228 YPDSF_2229 ndk   FALSE 0.034 327.000 0.000 NA   NA
 3577507 3577508 YPDSF_2230 YPDSF_2231     FALSE 0.042 558.000 0.000 0.008   NA
 3577508 3577509 YPDSF_2231 YPDSF_2232     TRUE 0.689 -34.000 0.000 1.000   NA
 3577510 3577511 YPDSF_2233 YPDSF_2234     TRUE 0.791 79.000 0.253 NA   NA
 3577511 3577512 YPDSF_2234 YPDSF_2235     TRUE 0.576 140.000 0.171 1.000   NA
 3577512 3577513 YPDSF_2235 YPDSF_2236     TRUE 0.968 30.000 0.625 1.000   NA
 3577513 3577514 YPDSF_2236 YPDSF_2237   hscA TRUE 0.995 3.000 0.794 1.000 N NA
 3577514 3577515 YPDSF_2237 YPDSF_2238 hscA hscB TRUE 0.859 243.000 0.634 1.000 Y NA
 3577515 3577516 YPDSF_2238 YPDSF_2239 hscB iscA TRUE 0.879 111.000 0.500 1.000   NA
 3577516 3577517 YPDSF_2239 YPDSF_2240 iscA   TRUE 0.669 270.000 0.359 0.002   NA
 3577517 3577518 YPDSF_2240 YPDSF_2241     TRUE 0.920 31.000 0.448 1.000 N NA
 3577518 3577519 YPDSF_2241 YPDSF_2242     TRUE 0.879 54.000 0.424 1.000 N NA
 3577519 3577520 YPDSF_2242 YPDSF_2243     FALSE 0.293 156.000 0.126 1.000 N NA
 3577522 3577523 YPDSF_2245 YPDSF_2246     TRUE 0.951 -9.000 0.150 NA   NA
 3577525 3577526 YPDSF_2248 YPDSF_2249     FALSE 0.024 370.000 0.000 1.000   NA
 3577526 3577527 YPDSF_2249 YPDSF_2250     FALSE 0.289 110.000 0.000 NA   NA
 3577527 3577528 YPDSF_2250 YPDSF_2251   glyA FALSE 0.286 113.000 0.000 NA   NA
 3577529 3577530 YPDSF_2252 YPDSF_2253     FALSE 0.007 287.000 0.000 1.000 N NA
 3577530 3577531 YPDSF_2253 YPDSF_2254     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3577531 3577532 YPDSF_2254 YPDSF_2255     FALSE 0.032 336.000 0.000 NA   NA
 3577533 3577534 YPDSF_2256 YPDSF_2257   nadE TRUE 0.814 15.000 0.151 1.000 N NA
 3577534 3577535 YPDSF_2257 YPDSF_2258 nadE   FALSE 0.350 160.000 0.065 0.096 N NA
 3577535 3577536 YPDSF_2258 YPDSF_2259     TRUE 0.864 -37.000 0.130 NA   NA
 3577536 3577537 YPDSF_2259 YPDSF_2260     TRUE 0.954 4.000 0.132 NA   NA
 3577537 3577538 YPDSF_2260 YPDSF_2261     FALSE 0.016 221.000 0.000 1.000 N NA
 3577539 3577540 YPDSF_R0045 YPDSF_2262     FALSE 0.009 580.000 0.000 NA   NA
 3577540 3577541 YPDSF_2262 YPDSF_2263     FALSE 0.035 323.000 0.000 NA   NA
 3577544 3577545 YPDSF_2266 YPDSF_2267     FALSE 0.145 110.000 0.062 NA N NA
 3577545 3577546 YPDSF_2267 YPDSF_2268   murQ TRUE 0.500 227.000 0.316 NA   NA
 3577547 3577548 YPDSF_2269 YPDSF_2270     FALSE 0.251 162.000 0.056 1.000   NA
 3577549 3577550 YPDSF_2271 YPDSF_2272     FALSE 0.023 198.000 0.000 NA N NA
 3577550 3577551 YPDSF_2272 YPDSF_2273     FALSE 0.058 270.000 0.000 NA   NA
 3577551 3577552 YPDSF_2273 YPDSF_2274     TRUE 0.995 -3.000 0.531 NA   NA
 3577552 3577553 YPDSF_2274 YPDSF_2275     TRUE 0.989 -40.000 0.819 NA   NA
 3577553 3577554 YPDSF_2275 YPDSF_2276     FALSE 0.311 129.000 0.054 NA   NA
 3577554 3577555 YPDSF_2276 YPDSF_2277     TRUE 0.887 6.000 0.061 1.000   NA
 3577557 3577558 YPDSF_2279 YPDSF_2280     FALSE 0.267 183.000 0.081 NA   NA
 3577558 3577559 YPDSF_2280 YPDSF_2281     FALSE 0.000 618.000 0.014 1.000 N NA
 3577560 3577561 YPDSF_2282 YPDSF_2283   asnC FALSE 0.001 499.000 0.034 1.000 N NA
 3577561 3577562 YPDSF_2283 YPDSF_2284 asnC   FALSE 0.006 298.000 0.000 1.000 N NA
 3577562 3577563 YPDSF_2284 YPDSF_2285     FALSE 0.012 242.000 0.000 1.000 N NA
 3577564 3577565 YPDSF_2286 YPDSF_2287     TRUE 0.575 61.000 0.089 NA   NA
 3577565 3577566 YPDSF_2287 YPDSF_2288     TRUE 0.565 224.000 0.372 NA   NA
 3577566 3577567 YPDSF_2288 YPDSF_2289     FALSE 0.050 284.000 0.000 1.000   NA
 3577567 3577568 YPDSF_2289 YPDSF_2290   mukB FALSE 0.168 216.000 0.000 0.077 N NA
 3577568 3577569 YPDSF_2290 YPDSF_2291 mukB   TRUE 1.000 -3.000 0.786 0.001 Y NA
 3577569 3577570 YPDSF_2291 YPDSF_2292     TRUE 0.980 -19.000 0.196 NA Y NA
 3577570 3577571 YPDSF_2292 YPDSF_2293     TRUE 0.985 -3.000 0.325 NA N NA
 3577571 3577572 YPDSF_2293 YPDSF_2294     FALSE 0.006 791.000 0.000 NA   NA
 3577572 3577573 YPDSF_2294 YPDSF_2295     FALSE 0.026 324.000 0.023 NA   NA
 3577573 3577574 YPDSF_2295 YPDSF_2296     TRUE 0.988 -3.000 0.265 NA   NA
 3577574 3577575 YPDSF_2296 YPDSF_2297     FALSE 0.006 548.000 0.004 NA   NA
 3577577 3577578 YPDSF_2299 YPDSF_2300 lpxK   TRUE 0.971 -3.000 0.205 1.000 N NA
 3577578 3577579 YPDSF_2300 YPDSF_2301     TRUE 0.820 36.000 0.075 0.070   NA
 3577579 3577580 YPDSF_2301 YPDSF_2302   ihfB FALSE 0.006 547.000 0.003 1.000   NA
 3577580 3577581 YPDSF_2302 YPDSF_2303 ihfB rpsA TRUE 0.784 61.000 0.292 1.000 N NA
 3577581 3577582 YPDSF_2303 YPDSF_2304 rpsA cmk TRUE 0.530 174.000 0.281 1.000 N NA
 3577582 3577583 YPDSF_2304 YPDSF_2305 cmk   FALSE 0.112 312.000 0.209 1.000 N NA
 3577583 3577584 YPDSF_2305 YPDSF_2306     TRUE 0.564 163.000 0.033 1.000 Y NA
 3577584 3577585 YPDSF_2306 YPDSF_2307     FALSE 0.025 367.000 0.000 NA   NA
 3577585 3577586 YPDSF_2307 YPDSF_2308     TRUE 0.606 21.000 0.000 NA   NA
 3577586 3577587 YPDSF_2308 YPDSF_2309   ansB FALSE 0.058 269.000 0.000 1.000   NA
 3577588 3577589 YPDSF_2310 YPDSF_2311     FALSE 0.007 698.000 0.000 NA   NA
 3577589 3577590 YPDSF_2311 YPDSF_2312     TRUE 0.639 56.000 0.172 1.000 N NA
 3577593 3577594 YPDSF_2315 YPDSF_2316     FALSE 0.014 231.000 0.000 1.000 N NA
 3577594 3577595 YPDSF_2316 YPDSF_2317     FALSE 0.170 242.000 0.078 0.095 N NA
 3577595 3577596 YPDSF_2317 YPDSF_2318   lolA TRUE 0.883 11.000 0.167 1.000 N NA
 3577596 3577597 YPDSF_2318 YPDSF_2319 lolA   TRUE 0.500 193.000 0.305 1.000 N NA
 3577597 3577598 YPDSF_2319 YPDSF_2320     TRUE 0.727 123.000 0.345 1.000 N NA
 3577599 3577600 YPDSF_2321 YPDSF_2322     FALSE 0.073 459.000 0.049 1.000 Y NA
 3577600 3577601 YPDSF_2322 YPDSF_2323     TRUE 0.999 3.000 0.631 0.005 Y NA
 3577601 3577602 YPDSF_2323 YPDSF_2324   aat FALSE 0.410 219.000 0.049 1.000 Y NA
 3577602 3577603 YPDSF_2324 YPDSF_2325 aat infA FALSE 0.011 166.000 0.020 1.000 N NA
 3577604 3577605 YPDSF_2326 YPDSF_2327   clpA FALSE 0.007 293.000 0.000 1.000 N NA
 3577605 3577606 YPDSF_2327 YPDSF_2328 clpA clpS TRUE 0.968 26.000 0.596 NA   NA
 3577606 3577607 YPDSF_2328 YPDSF_2329 clpS   TRUE 0.699 -31.000 0.000 NA   NA
 3577609 3577610 YPDSF_2331 YPDSF_2332     TRUE 0.998 0.000 0.789 0.092 N NA
 3577611 3577612 YPDSF_2333 YPDSF_2334     TRUE 0.549 28.000 0.000 NA   NA
 3577614 3577615 YPDSF_2336 YPDSF_2337     FALSE 0.111 203.000 0.028 NA   NA
 3577615 3577616 YPDSF_2337 YPDSF_2338     TRUE 0.881 114.000 0.085 0.011 Y NA
 3577616 3577617 YPDSF_2338 YPDSF_2339     FALSE 0.014 144.000 0.017 1.000 N NA
 3577617 3577618 YPDSF_2339 YPDSF_2340     FALSE 0.161 313.000 0.031 1.000 Y NA
 3577618 3577619 YPDSF_2340 YPDSF_2341     TRUE 0.864 -3.000 0.074 1.000 N NA
 3577619 3577620 YPDSF_2341 YPDSF_2342     TRUE 0.858 100.000 0.022 0.003 Y NA
 3577620 3577621 YPDSF_2342 YPDSF_2343     TRUE 0.637 97.000 0.167 NA   NA
 3577623 3577624 YPDSF_2345 YPDSF_2346   artP FALSE 0.202 295.000 0.000 1.000 Y NA
 3577624 3577625 YPDSF_2346 YPDSF_2347 artP   TRUE 0.977 21.000 0.323 1.000 Y NA
 3577625 3577626 YPDSF_2347 YPDSF_2348     TRUE 0.991 12.000 0.260 0.073 Y NA
 3577626 3577627 YPDSF_2348 YPDSF_2349   artM TRUE 0.999 0.000 0.714 0.016 Y NA
 3577627 3577628 YPDSF_2349 YPDSF_2350 artM   TRUE 0.669 16.000 0.000 NA   NA
 3577629 3577630 YPDSF_2351 YPDSF_2352     TRUE 0.968 -3.000 0.125 NA   NA
 3577630 3577631 YPDSF_2352 YPDSF_2353     TRUE 0.950 -37.000 0.312 NA   NA
 3577631 3577632 YPDSF_2353 YPDSF_2354     TRUE 0.819 -12.000 0.000 1.000   NA
 3577632 3577633 YPDSF_2354 YPDSF_2355     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3577633 3577634 YPDSF_2355 YPDSF_2356     TRUE 0.607 154.000 0.000 1.000 Y NA
 3577634 3577635 YPDSF_2356 YPDSF_2357     FALSE 0.003 412.000 0.000 1.000 N NA
 3577635 3577636 YPDSF_2357 YPDSF_2358     FALSE 0.030 341.000 0.000 NA   NA
 3577638 3577639 YPDSF_2360 YPDSF_2361 rumB   TRUE 0.571 84.000 0.119 NA   NA
 3577639 3577640 YPDSF_2361 YPDSF_2362     TRUE 0.736 125.000 0.264 NA   NA
 3577640 3577641 YPDSF_2362 YPDSF_2363     TRUE 0.999 -3.000 0.528 0.058 Y NA
 3577641 3577642 YPDSF_2363 YPDSF_2364   potG TRUE 0.994 25.000 0.857 1.000 Y NA
 3577644 3577645 YPDSF_2366 YPDSF_2367     FALSE 0.014 459.000 0.000 NA   NA
 3577645 3577646 YPDSF_2367 YPDSF_2368     TRUE 0.611 142.000 0.194 NA   NA
 3577647 3577648 YPDSF_2369 YPDSF_2370 grxA   FALSE 0.018 410.000 0.000 1.000   NA
 3577648 3577649 YPDSF_2370 YPDSF_2371     FALSE 0.022 378.000 0.000 1.000   NA
 3577649 3577650 YPDSF_2371 YPDSF_2372     TRUE 0.859 30.000 0.106 0.092   NA
 3577650 3577651 YPDSF_2372 YPDSF_2373     FALSE 0.066 258.000 0.000 1.000   NA
 3577651 3577652 YPDSF_2373 YPDSF_2374     FALSE 0.004 230.000 0.030 1.000 N NA
 3577652 3577653 YPDSF_2374 YPDSF_2375     FALSE 0.001 1100.000 0.000 1.000 N NA
 3577654 3577655 YPDSF_2376 YPDSF_2377     FALSE 0.005 335.000 0.000 1.000 N NA
 3577655 3577656 YPDSF_2377 YPDSF_2378     TRUE 0.989 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 3577656 3577657 YPDSF_2378 YPDSF_2379     TRUE 0.997 -3.000 0.323 NA Y NA
 3577657 3577658 YPDSF_2379 YPDSF_2380     FALSE 0.309 228.000 0.174 NA   NA
 3577659 3577660 YPDSF_2381 YPDSF_2382     FALSE 0.087 154.000 0.056 1.000 N NA
 3577661 3577662 YPDSF_2383 YPDSF_2384     FALSE 0.270 260.000 0.000 1.000 Y NA
 3577662 3577663 YPDSF_2384 YPDSF_2385     TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 3577663 3577664 YPDSF_2385 YPDSF_2386     TRUE 0.754 175.000 0.175 1.000 Y NA
 3577664 3577665 YPDSF_2386 YPDSF_2387     FALSE 0.004 340.000 0.000 1.000 N NA
 3577665 3577666 YPDSF_2387 YPDSF_2388     FALSE 0.022 199.000 0.000 1.000 N NA
 3577666 3577667 YPDSF_2388 YPDSF_2389     FALSE 0.203 258.000 0.222 1.000 N NA
 3577668 3577669 YPDSF_2390 YPDSF_2391     FALSE 0.202 164.000 0.040 NA   NA
 3577670 3577671 YPDSF_2392 YPDSF_2393     TRUE 0.730 84.000 0.000 1.000 Y NA
 3577671 3577672 YPDSF_2393 YPDSF_2394     TRUE 0.826 127.000 0.400 NA   NA
 3577672 3577673 YPDSF_2394 YPDSF_2395     FALSE 0.010 545.000 0.000 NA   NA
 3577673 3577674 YPDSF_2395 YPDSF_2396     TRUE 0.996 -15.000 1.000 NA   NA
 3577674 3577675 YPDSF_2396 YPDSF_2397     FALSE 0.005 325.000 0.000 1.000 N NA
 3577675 3577676 YPDSF_2397 YPDSF_2398   fruK TRUE 0.992 15.000 0.562 1.000 Y NA
 3577676 3577677 YPDSF_2398 YPDSF_2399 fruK   TRUE 0.990 -3.000 0.112 1.000 Y NA
 3577679 3577680 YPDSF_2401 YPDSF_2402     TRUE 0.987 36.000 0.375 0.011 Y NA
 3577680 3577681 YPDSF_2402 YPDSF_2403     TRUE 0.931 109.000 0.375 NA Y NA
 3577681 3577682 YPDSF_2403 YPDSF_2404     TRUE 0.679 116.000 0.000 NA Y NA
 3577682 3577683 YPDSF_2404 YPDSF_2405     TRUE 0.895 20.000 0.000 1.000 Y NA
 3577683 3577684 YPDSF_2405 YPDSF_2406     TRUE 0.754 4.000 0.065 1.000 N NA
 3577685 3577686 YPDSF_2407 YPDSF_2408     TRUE 0.899 12.000 0.017 0.043   NA
 3577686 3577687 YPDSF_2408 YPDSF_2409     TRUE 0.869 11.000 0.000 0.043 N NA
 3577689 3577690 YPDSF_2411 YPDSF_2412     FALSE 0.450 104.000 0.153 1.000 N NA
 3577693 3577694 YPDSF_2415 YPDSF_2416     TRUE 0.715 -28.000 0.000 NA   NA
 3577695 3577696 YPDSF_2417 YPDSF_2418     TRUE 0.847 59.000 0.275 NA   NA
 3577696 3577697 YPDSF_2418 YPDSF_2419     FALSE 0.015 442.000 0.000 NA   NA
 3577697 3577698 YPDSF_2419 YPDSF_2420     FALSE 0.023 696.000 0.219 NA N NA
 3577698 3577699 YPDSF_2420 YPDSF_2421     TRUE 0.809 82.000 0.394 NA N NA
 3577699 3577700 YPDSF_2421 YPDSF_2422     TRUE 0.997 10.000 0.848 0.058   NA
 3577700 3577701 YPDSF_2422 YPDSF_2423     TRUE 0.999 0.000 0.833 0.058   NA
 3577701 3577702 YPDSF_2423 YPDSF_2424     TRUE 0.997 2.000 0.758 1.000   NA
 3577703 3577704 YPDSF_2425 YPDSF_2426     FALSE 0.018 414.000 0.000 NA   NA
 3577704 3577705 YPDSF_2426 YPDSF_2427     FALSE 0.018 413.000 0.000 NA   NA
 3577705 3577706 YPDSF_2427 YPDSF_2428     FALSE 0.432 104.000 0.145 1.000 N NA
 3577707 3577708 YPDSF_2429 YPDSF_2430     FALSE 0.350 162.000 0.024 0.012 N NA
 3577709 3577710 YPDSF_2431 YPDSF_2432     FALSE 0.138 201.000 0.000 NA   NA
 3577711 3577712 YPDSF_2433 YPDSF_2434     TRUE 0.543 28.000 0.040 NA   NA
 3577712 3577713 YPDSF_2434 YPDSF_R0046     FALSE 0.293 105.000 0.000 NA   NA
 3577713 3577714 YPDSF_R0046 YPDSF_2435     FALSE 0.453 50.000 0.000 NA   NA
 3577714 3577715 YPDSF_2435 YPDSF_2436     FALSE 0.027 357.000 0.000 NA   NA
 3577715 3577716 YPDSF_2436 YPDSF_2437     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 3577716 3577717 YPDSF_2437 YPDSF_2438     FALSE 0.057 271.000 0.000 NA   NA
 3577718 3577719 YPDSF_2439 YPDSF_2440     FALSE 0.098 291.000 0.000 0.017 N NA
 3577719 3577720 YPDSF_2440 YPDSF_2441     FALSE 0.044 298.000 0.000 NA   NA
 3577720 3577721 YPDSF_2441 YPDSF_2442     FALSE 0.306 97.000 0.000 NA   NA
 3577721 3577722 YPDSF_2442 YPDSF_2443     TRUE 0.633 -60.000 0.000 NA   NA
 3577722 3577723 YPDSF_2443 YPDSF_2444     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 3577723 3577724 YPDSF_2444 YPDSF_2445     TRUE 0.998 4.000 1.000 NA   NA
 3577724 3577725 YPDSF_2445 YPDSF_2446     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 3577725 3577726 YPDSF_2446 YPDSF_2447     TRUE 0.898 209.000 1.000 NA   NA
 3577726 3577727 YPDSF_2447 YPDSF_2448     TRUE 0.947 -3.000 0.074 NA   NA
 3577727 3577728 YPDSF_2448 YPDSF_2449     FALSE 0.095 267.000 0.074 NA   NA
 3577728 3577729 YPDSF_2449 YPDSF_2450     TRUE 0.919 121.000 0.667 NA   NA
 3577731 3577732 YPDSF_2452 YPDSF_2453     TRUE 0.989 22.000 1.000 NA   NA
 3577732 3577733 YPDSF_2453 YPDSF_2454     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 3577733 3577734 YPDSF_2454 YPDSF_2455     TRUE 0.991 5.000 0.500 NA   NA
 3577734 3577735 YPDSF_2455 YPDSF_2456     FALSE 0.474 46.000 0.000 NA   NA
 3577735 3577736 YPDSF_2456 YPDSF_2457     FALSE 0.008 597.000 0.000 NA   NA
 3577736 3577737 YPDSF_2457 YPDSF_2458     TRUE 0.990 -24.000 0.400 1.000 Y NA
 3577737 3577738 YPDSF_2458 YPDSF_2459     TRUE 0.971 3.000 0.015 1.000 Y NA
 3577738 3577739 YPDSF_2459 YPDSF_2460     TRUE 0.918 -3.000 0.044 NA   NA
 3577739 3577740 YPDSF_2460 YPDSF_2461     FALSE 0.122 211.000 0.000 NA   NA
 3577743 3577744 YPDSF_2464 YPDSF_2465     FALSE 0.188 172.000 0.000 1.000   NA
 3577744 3577745 YPDSF_2465 YPDSF_2466     FALSE 0.002 482.000 0.000 1.000 N NA
 3577747 3577748 YPDSF_2468 YPDSF_2469     FALSE 0.008 275.000 0.000 NA N NA
 3577749 3577750 YPDSF_R0047 YPDSF_R0048     TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 3577750 3577751 YPDSF_R0048 YPDSF_2470     FALSE 0.022 384.000 0.000 NA   NA
 3577752 3577753 YPDSF_R0049 YPDSF_2471     FALSE 0.007 706.000 0.000 NA   NA
 3577753 3577754 YPDSF_2471 YPDSF_2472     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3577754 3577755 YPDSF_2472 YPDSF_2473     TRUE 0.580 24.000 0.000 NA   NA
 3577755 3577756 YPDSF_2473 YPDSF_2474     TRUE 0.661 168.000 0.070 0.001   NA
 3577756 3577757 YPDSF_2474 YPDSF_2475     TRUE 0.994 3.000 0.558 1.000   NA
 3577758 3577759 YPDSF_2476 YPDSF_2477     FALSE 0.054 281.000 0.013 0.094 N NA
 3577760 3577761 YPDSF_2478 YPDSF_2479     FALSE 0.002 494.000 0.000 1.000 N NA
 3577761 3577762 YPDSF_2479 YPDSF_2480   nrdB TRUE 0.991 163.000 1.000 0.002 Y NA
 3577762 3577763 YPDSF_2480 YPDSF_2481 nrdB   FALSE 0.291 4.000 0.034 1.000 N NA
 3577763 3577764 YPDSF_2481 YPDSF_2482     FALSE 0.438 35.000 0.023 NA   NA
 3577772 3577773 YPDSF_2490 YPDSF_2491     FALSE 0.477 110.000 0.103 NA   NA
 3577774 3577775 YPDSF_2492 YPDSF_2493     FALSE 0.333 85.000 0.000 1.000   NA
 3577775 3577776 YPDSF_2493 YPDSF_2494     TRUE 0.516 34.000 0.000 1.000   NA
 3577776 3577777 YPDSF_2494 YPDSF_2495     TRUE 0.829 70.000 0.286 1.000   NA
 3577779 3577780 YPDSF_2497 YPDSF_2498     TRUE 0.998 -3.000 0.542 1.000 Y NA
 3577780 3577781 YPDSF_2498 YPDSF_2499     TRUE 0.998 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 3577781 3577782 YPDSF_2499 YPDSF_2500     FALSE 0.471 261.000 0.521 1.000 N NA
 3577784 3577785 YPDSF_2502 YPDSF_2503     TRUE 0.580 24.000 0.000 NA   NA
 3577785 3577786 YPDSF_2503 YPDSF_2504     FALSE 0.285 115.000 0.000 NA   NA
 3577786 3577787 YPDSF_2504 YPDSF_2505     TRUE 0.971 94.000 0.731 0.020   NA
 3577787 3577788 YPDSF_2505 YPDSF_2506     TRUE 0.998 -3.000 0.823 1.000   NA
 3577788 3577789 YPDSF_2506 YPDSF_2507     TRUE 1.000 0.000 0.758 0.057 Y NA
 3577789 3577790 YPDSF_2507 YPDSF_2508     TRUE 0.965 124.000 0.654 1.000 Y NA
 3577790 3577791 YPDSF_2508 YPDSF_2509     FALSE 0.016 428.000 0.000 NA   NA
 3577791 3577792 YPDSF_2509 YPDSF_2510     FALSE 0.077 246.000 0.000 NA   NA
 3577792 3577793 YPDSF_2510 YPDSF_2511     TRUE 0.999 3.000 0.491 0.001 Y NA
 3577793 3577794 YPDSF_2511 YPDSF_2512     TRUE 0.986 103.000 0.568 0.001 Y NA
 3577794 3577795 YPDSF_2512 YPDSF_2513     TRUE 0.994 37.000 0.589 0.002 Y NA
 3577795 3577796 YPDSF_2513 YPDSF_2514     FALSE 0.164 172.000 0.032 1.000   NA
 3577796 3577797 YPDSF_2514 YPDSF_2515     FALSE 0.360 185.000 0.125 NA   NA
 3577797 3577798 YPDSF_2515 YPDSF_2516     FALSE 0.243 142.000 0.000 NA   NA
 3577804 3577805 YPDSF_2522 YPDSF_2523     FALSE 0.046 294.000 0.000 NA   NA
 3577805 3577806 YPDSF_2523 YPDSF_2524     FALSE 0.017 415.000 0.000 NA   NA
 3577806 3577807 YPDSF_2524 YPDSF_2525     TRUE 0.832 -10.000 0.000 1.000   NA
 3577807 3577808 YPDSF_2525 YPDSF_2526     FALSE 0.445 139.000 0.111 1.000   NA
 3577810 3577811 YPDSF_2528 YPDSF_2529     FALSE 0.014 232.000 0.000 1.000 N NA
 3577812 3577813 YPDSF_2530 YPDSF_2531     TRUE 0.884 58.000 0.459 1.000 N NA
 3577813 3577814 YPDSF_2531 YPDSF_2532     TRUE 0.962 23.000 0.634 1.000 N NA
 3577815 3577816 YPDSF_2533 YPDSF_2534     FALSE 0.089 235.000 0.000 NA   NA
 3577816 3577817 YPDSF_2534 YPDSF_2535   MoaE FALSE 0.197 143.000 0.025 NA   NA
 3577817 3577818 YPDSF_2535 YPDSF_2536 MoaE moaD TRUE 0.999 3.000 0.501 0.003 Y NA
 3577818 3577819 YPDSF_2536 YPDSF_2537 moaD moaC TRUE 0.997 -3.000 0.175 0.003 Y NA
 3577819 3577820 YPDSF_2537 YPDSF_2538 moaC moaA TRUE 0.869 101.000 0.039 0.003 Y NA
 3577822 3577823 YPDSF_2540 YPDSF_2541     FALSE 0.026 292.000 0.003 NA   NA
 3577825 3577826 YPDSF_2543 YPDSF_2544 bioD   TRUE 0.992 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 3577826 3577827 YPDSF_2544 YPDSF_2545     TRUE 0.991 -16.000 0.133 0.002 Y NA
 3577827 3577828 YPDSF_2545 YPDSF_2546     TRUE 0.998 0.000 0.168 0.002 Y NA
 3577832 3577833 YPDSF_2550 YPDSF_2551 modC modB TRUE 0.999 -6.000 0.537 0.001 Y NA
 3577833 3577834 YPDSF_2551 YPDSF_2552 modB modA TRUE 1.000 0.000 0.627 0.001 Y NA
 3577834 3577835 YPDSF_2552 YPDSF_2553 modA   FALSE 0.135 235.000 0.072 NA   NA
 3577836 3577837 YPDSF_2554 YPDSF_2555     TRUE 0.512 110.000 0.028 0.094   NA
 3577837 3577838 YPDSF_2555 YPDSF_2556     FALSE 0.112 217.000 0.000 NA   NA
 3577838 3577839 YPDSF_2556 YPDSF_2557     TRUE 0.624 -64.000 0.000 NA   NA
 3577839 3577840 YPDSF_2557 YPDSF_2558     FALSE 0.026 360.000 0.000 NA   NA
 3577840 3577841 YPDSF_2558 YPDSF_2559     TRUE 0.943 10.000 0.053 0.001 N NA
 3577841 3577842 YPDSF_2559 YPDSF_2560     TRUE 0.996 -3.000 0.370 0.001 N NA
 3577842 3577843 YPDSF_2560 YPDSF_2561     TRUE 0.880 -6.000 0.000 NA   NA
 3577843 3577844 YPDSF_2561 YPDSF_2562   galM TRUE 0.606 21.000 0.000 NA   NA
 3577844 3577845 YPDSF_2562 YPDSF_2563 galM   FALSE 0.046 293.000 0.000 NA   NA
 3577845 3577846 YPDSF_2563 YPDSF_2564     FALSE 0.029 347.000 0.000 NA   NA
 3577849 3577850 YPDSF_2568 YPDSF_2569     TRUE 0.640 122.000 0.023 1.000 Y NA
 3577850 3577851 YPDSF_2569 YPDSF_R0050     FALSE 0.025 369.000 0.000 NA   NA
 3577851 3577852 YPDSF_R0050 YPDSF_R0051     FALSE 0.303 98.000 0.000 NA   NA
 3577852 3577854 YPDSF_R0051 YPDSF_R0052     TRUE 0.544 29.000 0.000 NA   NA
 3577854 3577855 YPDSF_R0052 YPDSF_R0053     TRUE 0.549 28.000 0.000 NA   NA
 3577855 3577856 YPDSF_R0053 YPDSF_2570     FALSE 0.154 191.000 0.000 NA   NA
 3577856 3577857 YPDSF_2570 YPDSF_2571     TRUE 0.883 10.000 0.088 1.000   NA
 3577857 3577858 YPDSF_2571 YPDSF_2572   tolB TRUE 0.928 51.000 0.592 1.000 N NA
 3577858 3577859 YPDSF_2572 YPDSF_2573 tolB tolA FALSE 0.090 120.000 0.051 NA N NA
 3577859 3577860 YPDSF_2573 YPDSF_2574 tolA   FALSE 0.341 97.000 0.114 NA N NA
 3577860 3577861 YPDSF_2574 YPDSF_2575     TRUE 0.996 13.000 0.556 0.072 Y NA
 3577861 3577862 YPDSF_2575 YPDSF_2576     TRUE 0.996 0.000 0.593 1.000   NA
 3577862 3577863 YPDSF_2576 YPDSF_2577     FALSE 0.420 132.000 0.095 NA   NA
 3577863 3577864 YPDSF_2577 YPDSF_2578     TRUE 0.507 92.000 0.100 NA   NA
 3577864 3577865 YPDSF_2578 YPDSF_2579     TRUE 0.993 15.000 0.348 0.036 Y NA
 3577865 3577866 YPDSF_2579 YPDSF_2580     FALSE 0.001 806.000 0.000 1.000 N NA
 3577866 3577867 YPDSF_2580 YPDSF_2581     FALSE 0.018 214.000 0.000 1.000 N NA
 3577867 3577868 YPDSF_2581 YPDSF_2582   sucC TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 3577868 3577869 YPDSF_2582 YPDSF_2583 sucC   TRUE 0.814 113.000 0.136 1.000 Y NA
 3577869 3577870 YPDSF_2583 YPDSF_2584   kgd TRUE 0.989 30.000 0.667 1.000 Y NA
 3577870 3577871 YPDSF_2584 YPDSF_2585 kgd sdhB FALSE 0.154 356.000 0.067 1.000 Y NA
 3577871 3577872 YPDSF_2585 YPDSF_2586 sdhB sdhA TRUE 0.993 50.000 0.604 0.002 Y NA
 3577872 3577873 YPDSF_2586 YPDSF_2587 sdhA sdhD TRUE 1.000 1.000 0.705 0.002 Y NA
 3577873 3577874 YPDSF_2587 YPDSF_2588 sdhD sdhC TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 3577877 3577878 YPDSF_2591 YPDSF_2592 ppnK   TRUE 0.533 87.000 0.170 1.000 N NA
 3577878 3577879 YPDSF_2592 YPDSF_2593     FALSE 0.083 114.000 0.049 1.000 N NA
 3577880 3577881 YPDSF_2594 YPDSF_2595     TRUE 0.946 -7.000 0.124 NA   NA
 3577882 3577883 YPDSF_2596 YPDSF_R0054 smpB ssrA FALSE 0.461 49.000 0.000 NA   NA
 3577883 3577884 YPDSF_R0054 YPDSF_2597 ssrA   FALSE 0.102 223.000 0.000 NA   NA
 3577884 3577885 YPDSF_2597 YPDSF_2598     TRUE 0.542 224.000 0.000 0.075 Y NA
 3577885 3577886 YPDSF_2598 YPDSF_2599     FALSE 0.348 79.000 0.000 NA   NA
 3577886 3577887 YPDSF_2599 YPDSF_2600     TRUE 0.851 51.000 0.250 NA   NA
 3577887 3577888 YPDSF_2600 YPDSF_2601     FALSE 0.054 276.000 0.000 NA   NA
 3577888 3577889 YPDSF_2601 YPDSF_2602     FALSE 0.005 852.000 0.000 NA   NA
 3577889 3577890 YPDSF_2602 YPDSF_2603     TRUE 0.938 22.000 0.333 NA   NA
 3577890 3577891 YPDSF_2603 YPDSF_2604     TRUE 0.995 -7.000 0.667 NA   NA
 3577891 3577892 YPDSF_2604 YPDSF_2605     TRUE 0.998 0.000 0.750 NA   NA
 3577892 3577893 YPDSF_2605 YPDSF_2606     TRUE 0.991 -7.000 0.500 NA   NA
 3577893 3577894 YPDSF_2606 YPDSF_2607     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3577895 3577896 YPDSF_2608 YPDSF_2609     TRUE 0.886 6.000 0.061 NA   NA
 3577897 3577898 YPDSF_2610 YPDSF_2611     TRUE 0.712 14.000 0.000 NA   NA
 3577898 3577899 YPDSF_2611 YPDSF_2612     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3577899 3577900 YPDSF_2612 YPDSF_2613     TRUE 0.669 16.000 0.000 NA   NA
 3577900 3577901 YPDSF_2613 YPDSF_2614     FALSE 0.461 49.000 0.000 NA   NA
 3577901 3577902 YPDSF_2614 YPDSF_2615     FALSE 0.340 83.000 0.000 NA   NA
 3577902 3577903 YPDSF_2615 YPDSF_2616     FALSE 0.005 1125.000 0.000 NA   NA
 3577903 3577904 YPDSF_2616 YPDSF_2617     FALSE 0.208 332.000 0.276 1.000   NA
 3577904 3577905 YPDSF_2617 YPDSF_2618     FALSE 0.309 96.000 0.000 NA   NA
 3577905 3577906 YPDSF_2618 YPDSF_2619     FALSE 0.362 73.000 0.000 NA   NA
 3577906 3577907 YPDSF_2619 YPDSF_2620   fur FALSE 0.049 367.000 0.156 1.000 N NA
 3577908 3577909 YPDSF_2621 YPDSF_2622     TRUE 0.676 -61.000 0.054 1.000   NA
 3577909 3577910 YPDSF_2622 YPDSF_2623     FALSE 0.033 328.000 0.000 1.000   NA
 3577910 3577911 YPDSF_2623 YPDSF_2624     FALSE 0.007 706.000 0.000 1.000   NA
 3577911 3577912 YPDSF_2624 YPDSF_2625     FALSE 0.006 215.000 0.018 1.000 N NA
 3577913 3577914 YPDSF_2626 YPDSF_2627 nagB nagA TRUE 0.996 20.000 0.557 0.001 Y NA
 3577914 3577915 YPDSF_2627 YPDSF_2628 nagA   TRUE 0.994 -22.000 0.571 1.000 Y NA
 3577915 3577916 YPDSF_2628 YPDSF_2629     TRUE 0.793 73.000 0.070 1.000 Y NA
 3577916 3577917 YPDSF_2629 YPDSF_2630   asnB FALSE 0.004 355.000 0.000 1.000 N NA
 3577917 3577918 YPDSF_2630 YPDSF_R0055 asnB   FALSE 0.014 458.000 0.000 NA   NA
 3577918 3577919 YPDSF_R0055 YPDSF_R0056     TRUE 0.827 8.000 0.000 NA   NA
 3577919 3577920 YPDSF_R0056 YPDSF_R0057     TRUE 0.539 30.000 0.000 NA   NA
 3577920 3577921 YPDSF_R0057 YPDSF_R0058     FALSE 0.337 84.000 0.000 NA   NA
 3577921 3577922 YPDSF_R0058 YPDSF_R0059     TRUE 0.523 33.000 0.000 NA   NA
 3577922 3577923 YPDSF_R0059 YPDSF_R0060     TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 3577925 3577926 YPDSF_2632 YPDSF_2633     FALSE 0.110 327.000 0.220 1.000 N NA
 3577926 3577927 YPDSF_2633 YPDSF_2634     TRUE 0.994 -3.000 0.457 NA   NA
 3577929 3577930 YPDSF_2636 YPDSF_2637   lnt TRUE 0.971 -31.000 0.557 1.000 N NA
 3577930 3577931 YPDSF_2637 YPDSF_2638 lnt   FALSE 0.001 765.000 0.000 1.000 N NA
 3577931 3577932 YPDSF_2638 YPDSF_2639     TRUE 0.843 174.000 0.150 0.056 Y NA
 3577932 3577933 YPDSF_2639 YPDSF_2640     TRUE 1.000 0.000 0.933 0.015 Y NA
 3577933 3577934 YPDSF_2640 YPDSF_2641     TRUE 0.997 0.000 0.379 1.000 Y NA
 3577936 3577937 YPDSF_2643 YPDSF_2644 leuS   TRUE 0.855 15.000 0.182 NA N NA
 3577937 3577938 YPDSF_2644 YPDSF_2645   holA TRUE 0.969 -3.000 0.199 NA N NA
 3577938 3577939 YPDSF_2645 YPDSF_2646 holA nadD FALSE 0.469 -10.000 0.045 1.000 N NA
 3577939 3577940 YPDSF_2646 YPDSF_2647 nadD   FALSE 0.086 224.000 0.032 NA   NA
 3577940 3577941 YPDSF_2647 YPDSF_2648     TRUE 0.984 4.000 0.307 NA   NA
 3577941 3577942 YPDSF_2648 YPDSF_2649     FALSE 0.302 82.000 0.031 NA   NA
 3577942 3577943 YPDSF_2649 YPDSF_2650     FALSE 0.031 200.000 0.046 1.000 N NA
 3577943 3577944 YPDSF_2650 YPDSF_2651     FALSE 0.220 10.000 0.035 NA N NA
 3577944 3577945 YPDSF_2651 YPDSF_2652     FALSE 0.467 403.000 0.475 NA Y NA
 3577945 3577946 YPDSF_2652 YPDSF_2653     FALSE 0.230 198.000 0.081 NA   NA
 3577946 3577947 YPDSF_2653 YPDSF_2654   lipB FALSE 0.441 212.000 0.219 NA   NA
 3577947 3577948 YPDSF_2654 YPDSF_2655 lipB   TRUE 0.935 193.000 0.319 0.001 Y NA
 3577949 3577950 YPDSF_2656 YPDSF_2657 tatE   FALSE 0.433 55.000 0.000 NA   NA
 3577955 3577956 YPDSF_2662 YPDSF_2663     FALSE 0.353 77.000 0.000 NA   NA
 3577959 3577960 YPDSF_2666 YPDSF_2667     FALSE 0.001 570.000 0.000 1.000 N NA
 3577960 3577961 YPDSF_2667 YPDSF_2668     TRUE 0.984 10.000 0.199 1.000 Y NA
 3577961 3577962 YPDSF_2668 YPDSF_2669     TRUE 0.944 15.000 0.086 1.000 Y NA
 3577962 3577963 YPDSF_2669 YPDSF_2670     TRUE 0.617 32.000 0.064 1.000   NA
 3577963 3577964 YPDSF_2670 YPDSF_2671     TRUE 0.857 24.000 0.176 1.000   NA
 3577964 3577965 YPDSF_2671 YPDSF_2672     TRUE 0.996 12.000 0.444 0.011 Y NA
 3577965 3577966 YPDSF_2672 YPDSF_2673     TRUE 0.993 49.000 0.667 0.011 Y NA
 3577966 3577967 YPDSF_2673 YPDSF_2674     TRUE 0.869 126.000 0.500 1.000   NA
 3577967 3577968 YPDSF_2674 YPDSF_2675     TRUE 0.940 -28.000 0.000 0.001   NA
 3577968 3577969 YPDSF_2675 YPDSF_2676     FALSE 0.046 294.000 0.000 1.000   NA
 3577969 3577970 YPDSF_2676 YPDSF_2677     TRUE 0.812 42.000 0.023 0.003   NA
 3577971 3577972 YPDSF_2678 YPDSF_2679     FALSE 0.005 1708.000 0.000 1.000   NA
 11426293 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 4.000 0.000 NA   NA
 11568656 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 4.000 0.000 NA   NA
 11711048 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 4.000 0.000 NA   NA
 11426294 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 32.000 0.000 NA   NA
 11568657 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 32.000 0.000 NA   NA
 11711049 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 32.000 0.000 NA   NA
 11426295 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 64.000 0.000 NA   NA
 11568658 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 64.000 0.000 NA   NA
 11711050 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 64.000 0.000 NA   NA
 11426296 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 92.000 0.000 NA   NA
 11568659 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 92.000 0.000 NA   NA
 11711051 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 92.000 0.000 NA   NA
 11426297 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 125.000 0.000 NA   NA
 11568660 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 125.000 0.000 NA   NA
 11711052 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 125.000 0.000 NA   NA
 11426298 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 153.000 0.000 NA   NA
 11568661 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 153.000 0.000 NA   NA
 11711053 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 153.000 0.000 NA   NA
 11426299 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 186.000 0.000 NA   NA
 11568662 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 186.000 0.000 NA   NA
 11711054 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 186.000 0.000 NA   NA
 11426300 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 214.000 0.000 NA   NA
 11568663 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 214.000 0.000 NA   NA
 11711055 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 214.000 0.000 NA   NA
 11426301 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 246.000 0.000 NA   NA
 11568664 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 246.000 0.000 NA   NA
 11711056 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 246.000 0.000 NA   NA
 11426302 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 274.000 0.000 NA   NA
 11568665 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 274.000 0.000 NA   NA
 11711057 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 274.000 0.000 NA   NA
 11426303 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 306.000 0.000 NA   NA
 11568666 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 306.000 0.000 NA   NA
 11711058 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 306.000 0.000 NA   NA
 11426304 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 334.000 0.000 NA   NA
 11568667 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 334.000 0.000 NA   NA
 11711059 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 334.000 0.000 NA   NA
 11426305 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 366.000 0.000 NA   NA
 11568668 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 366.000 0.000 NA   NA
 11711060 3577971   YPDSF_2678     FALSE NA 366.000 0.000 NA   NA
 3577972 3577973 YPDSF_2679 YPDSF_2680     TRUE 0.650 57.000 0.116 1.000   NA
 3577975 3577976 YPDSF_2682 YPDSF_2683     FALSE 0.366 72.000 0.000 NA   NA
 3577977 3577978 YPDSF_2684 YPDSF_2685     TRUE 0.580 24.000 0.000 NA   NA
 3577979 3577980 YPDSF_2686 YPDSF_2687     FALSE 0.011 535.000 0.000 NA   NA
 3577981 3577982 YPDSF_2688 YPDSF_2689     FALSE 0.348 79.000 0.000 NA   NA
 3577983 3577984 YPDSF_2690 YPDSF_2691     TRUE 0.907 -7.000 0.068 NA   NA
 3577984 3577985 YPDSF_2691 YPDSF_2692     FALSE 0.215 159.000 0.000 NA   NA
 3577986 3577987 YPDSF_2693 YPDSF_2694     FALSE 0.219 157.000 0.000 NA   NA
 3577988 3577989 YPDSF_2695 YPDSF_2696     TRUE 0.950 26.000 0.438 1.000   NA
 3577991 3577992 YPDSF_2698 YPDSF_2699     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3577993 3577994 YPDSF_2700 YPDSF_2701     TRUE 0.831 -18.000 0.063 NA   NA
 3577994 3577995 YPDSF_2701 YPDSF_2702     TRUE 0.993 -7.000 0.285 NA Y NA
 3577995 3577996 YPDSF_2702 YPDSF_2703     TRUE 0.984 -3.000 0.054 NA Y NA
 3577996 3577997 YPDSF_2703 YPDSF_2704     TRUE 0.963 10.000 0.238 1.000   NA
 3577997 3577998 YPDSF_2704 YPDSF_2705     TRUE 0.989 -7.000 0.179 0.002   NA
 3577999 3578000 YPDSF_2706 YPDSF_2707     FALSE 0.019 406.000 0.000 NA   NA
 3578002 3578003 YPDSF_2708 YPDSF_2709     TRUE 0.738 15.000 0.055 1.000   NA
 3578004 3578005 YPDSF_2710 YPDSF_2711   cysS FALSE 0.004 347.000 0.000 1.000 N NA
 3578006 3578007 YPDSF_2712 YPDSF_2713     TRUE 0.956 11.000 0.237 1.000   NA
 3578007 3578008 YPDSF_2713 YPDSF_2714     FALSE 0.030 296.000 0.016 1.000   NA
 3578008 3578009 YPDSF_2714 YPDSF_2715     TRUE 0.997 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 3578010 3578011 YPDSF_2716 YPDSF_2717     TRUE 0.998 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 3578012 3578013 YPDSF_2718 YPDSF_2719     FALSE 0.033 387.000 0.072 1.000   NA
 3578013 3578014 YPDSF_2719 YPDSF_2720     TRUE 0.588 77.000 0.118 1.000   NA
 3578014 3578015 YPDSF_2720 YPDSF_2721     TRUE 0.550 195.000 0.075 1.000 Y NA
 3578015 3578016 YPDSF_2721 YPDSF_2722     TRUE 0.995 3.000 0.313 NA Y NA
 3578018 3578019 YPDSF_2724 YPDSF_2725     FALSE 0.013 397.000 0.018 NA   NA
 3578019 3578020 YPDSF_2725 YPDSF_2726     FALSE 0.049 255.000 0.022 NA   NA
 3578020 3578021 YPDSF_2726 YPDSF_2727     FALSE 0.031 337.000 0.000 NA   NA
 3578022 3578023 YPDSF_2728 YPDSF_2729     TRUE 0.978 -6.000 0.039 0.001   NA
 3578023 3578024 YPDSF_2729 YPDSF_2730     TRUE 0.896 -187.000 0.039 0.001   NA
 3578025 3578026 YPDSF_2731 YPDSF_2732     TRUE 0.640 -54.000 0.000 NA   NA
 3578026 3578027 YPDSF_2732 YPDSF_2733     FALSE 0.089 235.000 0.000 NA   NA
 3578028 3578029 YPDSF_2734 YPDSF_2735     FALSE 0.020 204.000 0.000 1.000 N NA
 3578029 3578030 YPDSF_2735 YPDSF_2736     FALSE 0.108 48.000 0.000 1.000 N NA
 3578030 3578031 YPDSF_2736 YPDSF_2737     TRUE 0.586 5.000 0.049 NA N NA
 3578031 3578032 YPDSF_2737 YPDSF_2738     TRUE 0.981 3.000 0.073 NA Y NA
 3578032 3578033 YPDSF_2738 YPDSF_2739     FALSE 0.479 187.000 0.028 1.000 Y NA
 3578033 3578034 YPDSF_2739 YPDSF_2740     TRUE 0.964 6.000 0.000 0.007   NA
 3578034 3578035 YPDSF_2740 YPDSF_2741     TRUE 0.910 -82.000 0.000 0.001   NA
 3578035 3578036 YPDSF_2741 YPDSF_2742     TRUE 0.668 16.000 0.000 1.000   NA
 3578036 3578037 YPDSF_2742 YPDSF_2743     FALSE 0.074 249.000 0.000 NA   NA
 3578037 3578038 YPDSF_2743 YPDSF_2744     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3578038 3578039 YPDSF_2744 YPDSF_2745     FALSE 0.022 380.000 0.000 NA   NA
 3578039 3578040 YPDSF_2745 YPDSF_2746     TRUE 0.769 11.000 0.000 NA   NA
 3578040 3578041 YPDSF_2746 YPDSF_2747     FALSE 0.177 179.000 0.000 NA   NA
 3578041 3578042 YPDSF_2747 YPDSF_2748     TRUE 0.563 1.000 0.000 NA N NA
 3578042 3578043 YPDSF_2748 YPDSF_2749     TRUE 0.928 37.000 0.000 0.020 Y NA
 3578043 3578044 YPDSF_2749 YPDSF_2750     TRUE 0.973 18.000 0.247 1.000 Y NA
 3578044 3578045 YPDSF_2750 YPDSF_2751     TRUE 0.971 85.000 0.624 1.000 Y NA
 3578045 3578046 YPDSF_2751 YPDSF_2752     FALSE 0.108 26.000 0.038 1.000 N NA
 3578046 3578047 YPDSF_2752 YPDSF_2753   hemH FALSE 0.001 598.000 0.000 1.000 N NA
 3578047 3578048 YPDSF_2753 YPDSF_2754 hemH adk FALSE 0.020 90.000 0.008 1.000 N NA
 3578048 3578049 YPDSF_2754 YPDSF_2755 adk   FALSE 0.130 227.000 0.035 0.091 N NA
 3578049 3578050 YPDSF_2755 YPDSF_2756     TRUE 0.627 19.000 0.000 NA   NA
 3578050 3578051 YPDSF_2756 YPDSF_2757   recR TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 3578051 3578052 YPDSF_2757 YPDSF_2758 recR   TRUE 0.996 0.000 0.604 NA   NA
 3578052 3578053 YPDSF_2758 YPDSF_2759     TRUE 0.911 56.000 0.411 NA   NA
 3578053 3578054 YPDSF_2759 YPDSF_2760     FALSE 0.006 656.000 0.088 1.000 N NA
 3578054 3578055 YPDSF_2760 YPDSF_2761     FALSE 0.086 239.000 0.043 NA   NA
 3578056 3578057 YPDSF_2762 YPDSF_2763     TRUE 0.798 171.000 0.474 NA   NA
 3578058 3578059 YPDSF_2764 YPDSF_2765     FALSE 0.007 376.000 0.054 NA N NA
 3578059 3578060 YPDSF_2765 YPDSF_2766     TRUE 0.627 13.000 0.075 NA N NA
 3578061 3578062 YPDSF_2767 YPDSF_2768     TRUE 0.957 17.000 0.500 1.000 N NA
 3578062 3578063 YPDSF_2768 YPDSF_2769   rpmE2 FALSE 0.008 186.000 0.008 1.000 N NA
 3578063 3578064 YPDSF_2769 YPDSF_2770 rpmE2 rpmJ TRUE 0.925 16.000 0.083 0.011   NA
 3578064 3578065 YPDSF_2770 YPDSF_2771 rpmJ   FALSE 0.005 874.000 0.000 1.000   NA
 3578065 3578066 YPDSF_2771 YPDSF_2772     TRUE 0.779 159.000 0.400 NA   NA
 3578066 3578067 YPDSF_2772 YPDSF_2773     TRUE 0.599 49.000 0.080 NA   NA
 3578072 3578073 YPDSF_2777 YPDSF_2778     TRUE 0.666 40.000 0.156 1.000 N NA
 3578073 3578074 YPDSF_2778 YPDSF_2779     FALSE 0.001 414.000 0.028 1.000 N NA
 3578074 3578075 YPDSF_2779 YPDSF_2780     TRUE 1.000 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 3578075 3578076 YPDSF_2780 YPDSF_2781     TRUE 0.515 102.000 0.179 1.000 N NA
 3578079 3578080 YPDSF_2784 YPDSF_2785     FALSE 0.034 289.000 0.019 1.000   NA
 3578081 3578082 YPDSF_2786 YPDSF_2787     FALSE 0.027 354.000 0.000 1.000   NA
 3578082 3578083 YPDSF_2787 YPDSF_2788     FALSE 0.043 140.000 0.000 1.000 N NA
 3578083 3578084 YPDSF_2788 YPDSF_2789     FALSE 0.006 298.000 0.000 1.000 N NA
 3578084 3578085 YPDSF_2789 YPDSF_2790     FALSE 0.436 256.000 0.000 0.073 Y NA
 3578085 3578086 YPDSF_2790 YPDSF_2791     FALSE 0.005 218.000 0.005 1.000 N NA
 3578086 3578087 YPDSF_2791 YPDSF_2792   clpX TRUE 0.901 141.000 0.201 0.091 Y NA
 3578087 3578088 YPDSF_2792 YPDSF_2793 clpX clpP TRUE 0.819 206.000 0.352 1.000 Y NA
 3578088 3578089 YPDSF_2793 YPDSF_2794 clpP tig FALSE 0.297 462.000 0.351 1.000 Y NA
 3578089 3578090 YPDSF_2794 YPDSF_2795 tig   FALSE 0.002 417.000 0.000 NA N NA
 3578091 3578092 YPDSF_2796 YPDSF_2797   ampG TRUE 0.636 118.000 0.256 NA N NA
 3578092 3578093 YPDSF_2797 YPDSF_2798 ampG   FALSE 0.047 292.000 0.000 NA   NA
 3578093 3578094 YPDSF_2798 YPDSF_2799     FALSE 0.024 370.000 0.000 NA   NA
 3578094 3578095 YPDSF_2799 YPDSF_2800     TRUE 0.997 5.000 0.204 0.001 Y NA
 3578095 3578096 YPDSF_2800 YPDSF_2801     TRUE 0.999 -10.000 0.697 0.001 Y NA
 3578096 3578097 YPDSF_2801 YPDSF_2802     TRUE 0.999 0.000 0.485 0.035 Y NA
 3578097 3578098 YPDSF_2802 YPDSF_2803     TRUE 0.902 14.000 0.118 0.066 N NA
 3578098 3578099 YPDSF_2803 YPDSF_2804     FALSE 0.026 484.000 0.061 0.066 N NA
 3578101 3578102 YPDSF_2806 YPDSF_2807     TRUE 0.885 -37.000 0.155 NA   NA
 3578103 3578104 YPDSF_2808 YPDSF_2809     FALSE 0.303 98.000 0.000 NA   NA
 3578105 3578106 YPDSF_2810 YPDSF_2811     FALSE 0.285 5.000 0.035 1.000 N NA
 3578106 3578107 YPDSF_2811 YPDSF_2812     TRUE 0.639 156.000 0.060 1.000 Y NA
 3578108 3578109 YPDSF_2813 YPDSF_2814     FALSE 0.018 213.000 0.000 1.000 N NA
 3578109 3578110 YPDSF_2814 YPDSF_2815     TRUE 0.952 -7.000 0.206 1.000 N NA
 3578110 3578111 YPDSF_2815 YPDSF_2816   nusB FALSE 0.249 241.000 0.225 1.000 N NA
 3578111 3578112 YPDSF_2816 YPDSF_2817 nusB ribH TRUE 0.915 21.000 0.347 1.000 N NA
 3578112 3578113 YPDSF_2817 YPDSF_2818 ribH ribD TRUE 0.858 136.000 0.034 0.001 Y NA
 3578113 3578114 YPDSF_2818 YPDSF_2819 ribD   TRUE 0.596 150.000 0.277 NA N NA
 3578114 3578115 YPDSF_2819 YPDSF_2820     FALSE 0.369 71.000 0.000 NA   NA
 3578115 3578116 YPDSF_2820 YPDSF_2821     TRUE 0.523 33.000 0.000 NA   NA
 3578116 3578117 YPDSF_2821 YPDSF_2822     FALSE 0.044 298.000 0.000 NA   NA
 3578117 3578118 YPDSF_2822 YPDSF_2823   secF FALSE 0.019 207.000 0.000 1.000 N NA
 3578118 3578119 YPDSF_2823 YPDSF_2824 secF secD TRUE 0.994 11.000 0.206 0.001 Y NA
 3578119 3578120 YPDSF_2824 YPDSF_2825 secD yajC TRUE 0.870 28.000 0.045 NA Y NA
 3578120 3578121 YPDSF_2825 YPDSF_2826 yajC tgt TRUE 0.716 112.000 0.325 NA N NA
 3578121 3578122 YPDSF_2826 YPDSF_2827 tgt queA TRUE 0.978 93.000 0.360 0.001 Y NA
 3578123 3578124 YPDSF_2828 YPDSF_2829     FALSE 0.034 279.000 0.014 1.000   NA
 3578124 3578125 YPDSF_2829 YPDSF_2830     FALSE 0.021 389.000 0.000 1.000   NA
 3578125 3578126 YPDSF_2830 YPDSF_2831     TRUE 0.935 15.000 0.043 0.001   NA
 3578127 3578128 YPDSF_2832 YPDSF_2833     FALSE 0.192 155.000 0.031 1.000   NA
 3578128 3578129 YPDSF_2833 YPDSF_2834     FALSE 0.013 561.000 0.123 1.000 N NA
 3578129 3578130 YPDSF_2834 YPDSF_2835     TRUE 0.957 76.000 0.261 0.066 Y NA
 3578130 3578131 YPDSF_2835 YPDSF_2836     FALSE 0.002 474.000 0.000 1.000 N NA
 3578131 3578132 YPDSF_2836 YPDSF_2837   phoR TRUE 0.771 22.000 0.168 1.000 N NA
 3578132 3578133 YPDSF_2837 YPDSF_2838 phoR   TRUE 0.991 25.000 0.453 0.061 Y NA
 3578134 3578135 YPDSF_2839 YPDSF_2840     TRUE 1.000 -3.000 0.669 0.001 Y NA
 3578138 3578139 YPDSF_2843 YPDSF_2844   aroL FALSE 0.008 490.000 0.016 NA   NA
 3578139 3578140 YPDSF_2844 YPDSF_2845 aroL   FALSE 0.011 247.000 0.000 1.000 N NA
 3578140 3578141 YPDSF_2845 YPDSF_2846     FALSE 0.001 730.000 0.000 1.000 N NA
 3578141 3578142 YPDSF_2846 YPDSF_2847     TRUE 0.644 -52.000 0.000 NA   NA
 3578142 3578143 YPDSF_2847 YPDSF_2848     TRUE 0.749 -22.000 0.000 NA   NA
 3578143 3578144 YPDSF_2848 YPDSF_2849     FALSE 0.167 198.000 0.053 NA   NA
 3578144 3578145 YPDSF_2849 YPDSF_2850   proA FALSE 0.005 337.000 0.000 NA N NA
 3578145 3578146 YPDSF_2850 YPDSF_2851 proA   TRUE 0.985 10.000 0.026 0.001 Y NA
 3578146 3578147 YPDSF_2851 YPDSF_2852     TRUE 0.619 177.000 0.262 NA   NA
 3578147 3578148 YPDSF_2852 YPDSF_2853   frsA TRUE 0.593 60.000 0.095 NA   NA
 3578148 3578149 YPDSF_2853 YPDSF_2854 frsA   TRUE 0.495 127.000 0.120 NA   NA
 3578155 3578156 YPDSF_2860 YPDSF_2861     TRUE 0.979 13.000 0.481 NA   NA
 3578156 3578157 YPDSF_2861 YPDSF_2862     TRUE 0.979 -16.000 0.519 1.000 N NA
 3578157 3578158 YPDSF_2862 YPDSF_2863     TRUE 0.997 16.000 0.551 0.002 Y NA
 3578158 3578159 YPDSF_2863 YPDSF_2864     TRUE 0.995 7.000 0.188 0.002 Y NA
 3578159 3578160 YPDSF_2864 YPDSF_2865     TRUE 0.998 -7.000 0.312 0.002 Y NA
 3578160 3578161 YPDSF_2865 YPDSF_2866     TRUE 0.999 -10.000 0.603 0.002 Y NA
 3578161 3578162 YPDSF_2866 YPDSF_2867     TRUE 1.000 4.000 0.854 0.002 Y NA
 3578163 3578164 YPDSF_2868 YPDSF_2869     FALSE 0.114 215.000 0.000 NA   NA
 3578165 3578166 YPDSF_2870 YPDSF_2871   gmhA FALSE 0.491 203.000 0.229 1.000   NA
 3578168 3578169 YPDSF_2873 YPDSF_2874     FALSE 0.051 282.000 0.000 1.000   NA
 3578169 3578170 YPDSF_2874 YPDSF_2875     TRUE 0.894 2.000 0.000 1.000   NA
 3578170 3578171 YPDSF_2875 YPDSF_2876     FALSE 0.448 155.000 0.125 1.000   NA
 3578171 3578172 YPDSF_2876 YPDSF_2877     TRUE 0.820 41.000 0.188 NA   NA
 3578172 3578173 YPDSF_2877 YPDSF_2878   mtnK FALSE 0.005 906.000 0.000 NA   NA
 3578175 3578176 YPDSF_2880 YPDSF_2881     TRUE 0.783 73.000 0.231 1.000   NA
 3578176 3578177 YPDSF_2881 YPDSF_2882     TRUE 0.963 -3.000 0.174 1.000 N NA
 3578178 3578179 YPDSF_2883 YPDSF_2884     TRUE 0.851 -12.000 0.055 1.000   NA
 3578180 3578181 YPDSF_2885 YPDSF_2886     TRUE 0.962 0.000 0.108 1.000   NA
 3578182 3578183 YPDSF_2887 YPDSF_2888     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3578184 3578185 YPDSF_2889 YPDSF_2890     TRUE 0.869 32.000 0.054 1.000 Y NA
 3578185 3578186 YPDSF_2890 YPDSF_2891     TRUE 0.994 -19.000 0.532 1.000 Y NA
 3578186 3578187 YPDSF_2891 YPDSF_2892     TRUE 0.999 -3.000 0.433 0.015 Y NA
 3578187 3578188 YPDSF_2892 YPDSF_2893     TRUE 0.998 13.000 0.765 0.055 Y NA
 3578188 3578189 YPDSF_2893 YPDSF_2894     FALSE 0.005 328.000 0.000 1.000 N NA
 3578189 3578190 YPDSF_2894 YPDSF_2895     FALSE 0.169 183.000 0.000 NA   NA
 3578191 3578192 YPDSF_2896 YPDSF_2897     TRUE 0.967 -3.000 0.122 NA   NA
 3578192 3578193 YPDSF_2897 YPDSF_2898     TRUE 0.825 45.000 0.203 NA   NA
 3578193 3578194 YPDSF_2898 YPDSF_2899     FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 3578194 3578195 YPDSF_2899 YPDSF_2900     FALSE 0.096 160.000 0.060 NA N NA
 3578195 3578196 YPDSF_2900 YPDSF_2901     TRUE 0.998 -3.000 0.915 NA   NA
 3578196 3578197 YPDSF_2901 YPDSF_2902     FALSE 0.254 172.000 0.065 NA   NA
 3578197 3578198 YPDSF_2902 YPDSF_2903     FALSE 0.023 384.000 0.107 1.000 N NA
 3578198 3578199 YPDSF_2903 YPDSF_2904     TRUE 0.972 39.000 0.875 1.000 N NA
 3578201 3578202 YPDSF_2906 YPDSF_2907     FALSE 0.308 170.000 0.084 NA   NA
 3578202 3578203 YPDSF_2907 YPDSF_2908     TRUE 0.849 43.000 0.222 NA   NA
 3578203 3578204 YPDSF_2908 YPDSF_2909   pssA FALSE 0.488 176.000 0.121 0.041 N NA
 3578204 3578205 YPDSF_2909 YPDSF_2910 pssA   TRUE 0.570 62.000 0.089 NA   NA
 3578206 3578207 YPDSF_R0063 YPDSF_R0064     FALSE 0.306 97.000 0.000 NA   NA
 3578207 3578208 YPDSF_R0064 YPDSF_R0065     FALSE 0.071 253.000 0.000 NA   NA
 3578208 3578209 YPDSF_R0065 YPDSF_R0066     FALSE 0.257 134.000 0.000 NA   NA
 3578209 3578210 YPDSF_R0066 YPDSF_2911     FALSE 0.011 517.000 0.000 NA   NA
 3578210 3578211 YPDSF_2911 YPDSF_2912     FALSE 0.457 130.000 0.108 NA   NA
 3578211 3578212 YPDSF_2912 YPDSF_2913   rluD TRUE 0.972 2.000 0.168 NA   NA
 3578213 3578214 YPDSF_2914 YPDSF_2915     FALSE 0.015 355.000 0.004 NA   NA
 3578217 3578218 YPDSF_2918 YPDSF_2919 tyrA   TRUE 0.663 13.000 0.023 1.000   NA
 3578218 3578219 YPDSF_2919 YPDSF_2920     TRUE 0.498 39.000 0.000 1.000   NA
 3578219 3578220 YPDSF_2920 YPDSF_2921     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3578222 3578223 YPDSF_2923 YPDSF_2924     TRUE 0.688 186.000 0.356 NA   NA
 3578223 3578224 YPDSF_2924 YPDSF_2925   coaE TRUE 0.963 -3.000 0.110 NA   NA
 3578226 3578227 YPDSF_2927 YPDSF_2928     TRUE 0.977 60.000 0.571 1.000 Y NA
 3578227 3578228 YPDSF_2928 YPDSF_2929     TRUE 0.994 -25.000 0.556 NA Y NA
 3578228 3578229 YPDSF_2929 YPDSF_2930     FALSE 0.007 203.000 0.015 NA N NA
 3578230 3578231 YPDSF_2931 YPDSF_2932     TRUE 0.502 290.000 0.249 1.000 Y NA
 3578233 3578234 YPDSF_2934 YPDSF_2935 pdhR aceE FALSE 0.456 196.000 0.276 1.000 N NA
 3578234 3578235 YPDSF_2935 YPDSF_2936 aceE   TRUE 0.978 14.000 0.220 1.000 Y NA
 3578235 3578236 YPDSF_2936 YPDSF_2937     TRUE 0.639 18.000 0.000 NA   NA
 3578236 3578237 YPDSF_2937 YPDSF_2938     FALSE 0.269 127.000 0.000 NA   NA
 3578237 3578238 YPDSF_2938 YPDSF_2939     FALSE 0.012 243.000 0.000 1.000 N NA
 3578238 3578239 YPDSF_2939 YPDSF_2940     FALSE 0.001 570.000 0.000 1.000 N NA
 3578239 3578240 YPDSF_2940 YPDSF_2941     FALSE 0.064 299.000 0.068 NA   NA
 3578241 3578242 YPDSF_2942 YPDSF_2943     FALSE 0.015 438.000 0.000 1.000   NA
 3578242 3578243 YPDSF_2943 YPDSF_2944     TRUE 0.871 78.000 0.162 1.000 Y NA
 3578243 3578244 YPDSF_2944 YPDSF_2945     TRUE 0.815 117.000 0.354 NA   NA
 3578245 3578246 YPDSF_2946 YPDSF_2947     FALSE 0.006 211.000 0.010 1.000 N NA
 3578248 3578249 YPDSF_2949 YPDSF_2950     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.090 Y NA
 3578249 3578250 YPDSF_2950 YPDSF_2951     FALSE 0.126 207.000 0.000 NA   NA
 3578250 3578251 YPDSF_2951 YPDSF_2952     TRUE 0.608 -103.000 0.000 NA   NA
 3578252 3578253 YPDSF_2953 YPDSF_2954   panC FALSE 0.356 411.000 0.342 1.000 Y NA
 3578253 3578254 YPDSF_2954 YPDSF_2955 panC panB TRUE 0.981 88.000 0.395 0.000 Y NA
 3578254 3578255 YPDSF_2955 YPDSF_2956 panB   FALSE 0.364 269.000 0.117 1.000 Y NA
 3578255 3578256 YPDSF_2956 YPDSF_2957   pcnB TRUE 0.949 8.000 0.234 1.000 N NA
 3578256 3578257 YPDSF_2957 YPDSF_2958 pcnB   TRUE 0.836 89.000 0.131 1.000 Y NA
 3578257 3578258 YPDSF_2958 YPDSF_2959     TRUE 0.613 108.000 0.231 1.000 N NA
 3578258 3578259 YPDSF_2959 YPDSF_2960     FALSE 0.465 170.000 0.151 NA   NA
 3578259 3578260 YPDSF_2960 YPDSF_2961     TRUE 0.840 -10.000 0.045 NA   NA
 3578261 3578262 YPDSF_2962 YPDSF_2963   mrcB TRUE 0.729 109.000 0.158 0.012 N NA
 3578262 3578263 YPDSF_2963 YPDSF_2964 mrcB   FALSE 0.036 322.000 0.000 NA   NA
 3578263 3578264 YPDSF_2964 YPDSF_2965     TRUE 0.665 -40.000 0.000 NA   NA
 3578264 3578265 YPDSF_2965 YPDSF_2966     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3578265 3578266 YPDSF_2966 YPDSF_2967     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3578268 3578269 YPDSF_2969 YPDSF_2970     FALSE 0.221 136.000 0.031 NA   NA
 3578270 3578271 YPDSF_2971 YPDSF_2972     FALSE 0.238 146.000 0.000 NA   NA
 3578271 3578272 YPDSF_2972 YPDSF_2973     TRUE 0.983 0.000 0.213 NA   NA
 3578272 3578273 YPDSF_2973 YPDSF_2974     TRUE 0.861 0.000 0.073 1.000 N NA
 3578274 3578275 YPDSF_2975 YPDSF_2976 dgt   FALSE 0.140 198.000 0.101 1.000 N NA
 3578277 3578278 YPDSF_2978 YPDSF_2979     TRUE 0.669 16.000 0.000 NA   NA
 3578278 3578279 YPDSF_2979 YPDSF_2980   relA TRUE 0.796 10.000 0.000 NA   NA
 3578279 3578280 YPDSF_2980 YPDSF_2981 relA mazG FALSE 0.133 202.000 0.040 1.000   NA
 3578280 3578281 YPDSF_2981 YPDSF_2982 mazG   FALSE 0.094 212.000 0.025 1.000   NA
 3578281 3578282 YPDSF_2982 YPDSF_2983   eno FALSE 0.218 75.000 0.068 1.000 N NA
 3578282 3578283 YPDSF_2983 YPDSF_2984 eno   FALSE 0.003 372.000 0.000 1.000 N NA
 3578283 3578284 YPDSF_2984 YPDSF_2985     FALSE 0.018 104.000 0.004 1.000 N NA
 3578286 3578287 YPDSF_2987 YPDSF_2988 cysJ   TRUE 1.000 0.000 0.791 0.000 Y NA
 3578287 3578288 YPDSF_2988 YPDSF_2989     TRUE 0.964 -3.000 0.116 1.000   NA
 3578288 3578289 YPDSF_2989 YPDSF_2990     TRUE 0.936 -25.000 0.003 0.000   NA
 3578290 3578291 YPDSF_2991 YPDSF_2992     TRUE 0.516 106.000 0.118 NA   NA
 3578292 3578293 YPDSF_2993 YPDSF_2994     TRUE 0.992 11.000 0.417 1.000 Y NA
 3578293 3578294 YPDSF_2994 YPDSF_2995   cysN TRUE 0.993 12.000 0.574 0.000 N NA
 3578294 3578295 YPDSF_2995 YPDSF_2996 cysN   TRUE 0.996 2.000 0.340 1.000 Y NA
 3578295 3578296 YPDSF_2996 YPDSF_2997     FALSE 0.473 191.000 0.198 NA   NA
 3578296 3578297 YPDSF_2997 YPDSF_2998   ftsB FALSE 0.030 315.000 0.028 NA   NA
 3578297 3578298 YPDSF_2998 YPDSF_2999 ftsB ispD TRUE 0.947 4.000 0.185 1.000 N NA
 3578298 3578299 YPDSF_2999 YPDSF_3000 ispD ispF TRUE 0.927 139.000 0.419 1.000 Y NA
 3578299 3578300 YPDSF_3000 YPDSF_3001 ispF truD TRUE 0.933 11.000 0.173 1.000   NA
 3578300 3578301 YPDSF_3001 YPDSF_3002 truD surE TRUE 0.951 -22.000 0.235 1.000   NA
 3578301 3578302 YPDSF_3002 YPDSF_3003 surE pcm TRUE 0.988 -6.000 0.353 1.000   NA
 3578302 3578303 YPDSF_3003 YPDSF_3004 pcm   FALSE 0.018 104.000 0.030 1.000 N NA
 3578303 3578304 YPDSF_3004 YPDSF_3005     TRUE 0.572 55.000 0.142 1.000 N NA
 3578308 3578309 YPDSF_3009 YPDSF_3010     TRUE 0.579 64.000 0.000 0.020 N NA
 3578309 3578310 YPDSF_3010 YPDSF_3011     FALSE 0.152 87.000 0.058 1.000 N NA
 3578310 3578311 YPDSF_3011 YPDSF_3012     TRUE 0.996 7.000 0.211 0.000 Y NA
 3578312 3578313 YPDSF_3013 YPDSF_3014     FALSE 0.001 555.000 0.000 1.000 N NA
 3578313 3578314 YPDSF_3014 YPDSF_3015     FALSE 0.065 85.000 0.000 1.000 N NA
 3578314 3578315 YPDSF_3015 YPDSF_3016     FALSE 0.006 721.000 0.000 NA   NA
 3578315 3578316 YPDSF_3016 YPDSF_3017     FALSE 0.017 421.000 0.000 NA   NA
 3578316 3578317 YPDSF_3017 YPDSF_3018     FALSE 0.074 71.000 0.000 1.000 N NA
 3578317 3578318 YPDSF_3018 YPDSF_3019     FALSE 0.086 237.000 0.000 NA   NA
 3578319 3578320 YPDSF_3020 YPDSF_3021     FALSE 0.016 433.000 0.000 NA   NA
 3578320 3578321 YPDSF_3021 YPDSF_3022     FALSE 0.207 163.000 0.000 NA   NA
 3578322 3578323 YPDSF_3023 YPDSF_3024     TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 3578323 3578324 YPDSF_3024 YPDSF_3025     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3578324 3578325 YPDSF_3025 YPDSF_3026     FALSE 0.169 183.000 0.000 NA   NA
 3578325 3578326 YPDSF_3026 YPDSF_3027     FALSE 0.003 398.000 0.000 1.000 N NA
 3578326 3578327 YPDSF_3027 YPDSF_3028     TRUE 0.999 11.000 1.000 0.016 Y NA
 3578327 3578328 YPDSF_3028 YPDSF_3029     TRUE 0.750 206.000 0.250 1.000 Y NA
 3578328 3578329 YPDSF_3029 YPDSF_3030     TRUE 0.999 13.000 0.938 0.010 Y NA
 3578329 3578330 YPDSF_3030 YPDSF_3031     TRUE 1.000 -7.000 0.941 0.010 Y NA
 3578330 3578331 YPDSF_3031 YPDSF_3032     TRUE 0.978 149.000 0.941 NA Y NA
 3578331 3578332 YPDSF_3032 YPDSF_3033     TRUE 0.843 158.000 0.235 NA Y NA
 3578333 3578334 YPDSF_3034 YPDSF_3035 araD   FALSE 0.002 463.000 0.000 1.000 N NA
 3578334 3578335 YPDSF_3035 YPDSF_3036     TRUE 0.982 12.000 0.103 0.034 Y NA
 3578335 3578336 YPDSF_3036 YPDSF_3037     TRUE 0.993 2.000 0.500 1.000   NA
 3578336 3578337 YPDSF_3037 YPDSF_3038     FALSE 0.469 146.000 0.125 1.000   NA
 3578338 3578339 YPDSF_3039 YPDSF_3040     TRUE 0.789 148.000 0.000 0.034 Y NA
 3578339 3578340 YPDSF_3040 YPDSF_3041     TRUE 0.613 77.000 0.000 0.004 N NA
 3578341 3578342 YPDSF_3042 YPDSF_3043     TRUE 0.786 93.000 0.280 NA   NA
 3578342 3578343 YPDSF_3043 YPDSF_3044     TRUE 0.989 0.000 0.292 NA   NA
 3578343 3578344 YPDSF_3044 YPDSF_3045     TRUE 1.000 -3.000 0.793 0.010 Y NA
 3578344 3578345 YPDSF_3045 YPDSF_3046     FALSE 0.355 251.000 0.075 1.000 Y NA
 3578345 3578346 YPDSF_3046 YPDSF_3047     TRUE 1.000 -7.000 0.860 0.001 Y NA
 3578346 3578347 YPDSF_3047 YPDSF_3048     TRUE 0.992 3.000 0.596 1.000 N NA
 3578347 3578348 YPDSF_3048 YPDSF_3049     TRUE 0.697 21.000 0.127 1.000 N NA
 3578349 3578350 YPDSF_3050 YPDSF_3051     TRUE 0.652 17.000 0.000 NA   NA
 3578350 3578351 YPDSF_3051 YPDSF_3052     FALSE 0.074 248.000 0.000 1.000   NA
 3578352 3578353 YPDSF_3053 YPDSF_3054   recA FALSE 0.417 115.000 0.082 NA   NA
 3578353 3578354 YPDSF_3054 YPDSF_3055 recA recX TRUE 0.742 138.000 0.296 1.000   NA
 3578354 3578355 YPDSF_3055 YPDSF_3056 recX alaS FALSE 0.379 140.000 0.085 1.000   NA
 3578355 3578356 YPDSF_3056 YPDSF_3057 alaS   FALSE 0.003 250.000 0.020 1.000 N NA
 3578356 3578357 YPDSF_3057 YPDSF_R0067     FALSE 0.026 363.000 0.000 NA   NA
 3578357 3578358 YPDSF_R0067 YPDSF_R0068     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 3578358 3578359 YPDSF_R0068 YPDSF_R0069     FALSE 0.419 58.000 0.000 NA   NA
 3578359 3578360 YPDSF_R0069 YPDSF_3058     FALSE 0.017 423.000 0.000 NA   NA
 3578360 3578361 YPDSF_3058 YPDSF_3059     TRUE 0.941 -3.000 0.067 NA   NA
 3578361 3578362 YPDSF_3059 YPDSF_3060     TRUE 0.593 44.000 0.071 NA   NA
 3578362 3578363 YPDSF_3060 YPDSF_3061     FALSE 0.159 168.000 0.087 1.000 N NA
 3578364 3578365 YPDSF_3062 YPDSF_3063     TRUE 0.868 69.000 0.349 NA   NA
 3578368 3578369 YPDSF_3066 YPDSF_3067 rpsP rimM TRUE 0.990 22.000 0.342 0.011 Y NA
 3578369 3578370 YPDSF_3067 YPDSF_3068 rimM trmD TRUE 0.988 39.000 0.672 1.000 Y NA
 3578370 3578371 YPDSF_3068 YPDSF_3069 trmD rplS TRUE 0.969 81.000 0.567 1.000 Y NA
 3578372 3578373 YPDSF_3070 YPDSF_3071     FALSE 0.035 323.000 0.000 NA   NA
 3578373 3578374 YPDSF_3071 YPDSF_3072     TRUE 0.778 69.000 0.033 0.001   NA
 3578374 3578375 YPDSF_3072 YPDSF_3073     FALSE 0.016 429.000 0.000 1.000   NA
 3578376 3578377 YPDSF_3074 YPDSF_3075     FALSE 0.146 27.000 0.000 1.000 N NA
 3578377 3578378 YPDSF_3075 YPDSF_3076     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3578379 3578380 YPDSF_3077 YPDSF_3078   secA FALSE 0.002 295.000 0.003 1.000 N NA
 3578380 3578381 YPDSF_3078 YPDSF_3079 secA   FALSE 0.440 78.000 0.065 1.000   NA
 3578383 3578384 YPDSF_3081 YPDSF_3082 lpxC   FALSE 0.452 85.000 0.134 1.000 N NA
 3578384 3578385 YPDSF_3082 YPDSF_3083   ftsA TRUE 0.961 73.000 0.460 1.000 Y NA
 3578385 3578386 YPDSF_3083 YPDSF_3084 ftsA   TRUE 0.910 27.000 0.389 NA N NA
 3578386 3578387 YPDSF_3084 YPDSF_3085   ddl TRUE 0.996 2.000 0.372 NA Y NA
 3578387 3578388 YPDSF_3085 YPDSF_3086 ddl murC TRUE 0.995 -7.000 0.153 0.003 Y NA
 3578388 3578389 YPDSF_3086 YPDSF_3087 murC murG TRUE 0.918 90.000 0.283 1.000 Y NA
 3578389 3578390 YPDSF_3087 YPDSF_3088 murG   TRUE 0.995 -3.000 0.647 1.000 N NA
 3578390 3578391 YPDSF_3088 YPDSF_3089   murD TRUE 0.995 0.000 0.297 0.002 N NA
 3578391 3578392 YPDSF_3089 YPDSF_3090 murD mraY TRUE 0.999 3.000 0.647 0.003 Y NA
 3578392 3578393 YPDSF_3090 YPDSF_3091 mraY murF TRUE 0.998 -6.000 0.309 0.003 Y NA
 3578393 3578394 YPDSF_3091 YPDSF_3092 murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 3578394 3578395 YPDSF_3092 YPDSF_3093 murE   TRUE 0.963 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 3578395 3578396 YPDSF_3093 YPDSF_3094     FALSE 0.465 66.000 0.124 1.000 N NA
 3578396 3578397 YPDSF_3094 YPDSF_3095   mraW TRUE 0.976 -3.000 0.227 1.000 N NA
 3578397 3578398 YPDSF_3095 YPDSF_3096 mraW   TRUE 0.995 3.000 0.635 NA   NA
 3578400 3578401 YPDSF_3098 YPDSF_3099     FALSE 0.027 184.000 0.000 1.000 N NA
 3578401 3578402 YPDSF_3099 YPDSF_3100     FALSE 0.002 505.000 0.000 1.000 N NA
 3578402 3578403 YPDSF_3100 YPDSF_3101   ilvH FALSE 0.022 199.000 0.000 1.000 N NA
 3578403 3578404 YPDSF_3101 YPDSF_3102 ilvH   TRUE 0.999 3.000 0.371 0.001 Y NA
 3578404 3578405 YPDSF_3102 YPDSF_3103     FALSE 0.002 500.000 0.000 1.000 N NA
 3578405 3578406 YPDSF_3103 YPDSF_3104     FALSE 0.071 75.000 0.000 1.000 N NA
 3578406 3578407 YPDSF_3104 YPDSF_3105   leuO FALSE 0.002 571.000 0.050 1.000 N NA
 3578408 3578409 YPDSF_3106 YPDSF_3107     TRUE 0.996 3.000 0.126 0.001 Y NA
 3578409 3578410 YPDSF_3107 YPDSF_3108     TRUE 0.998 2.000 0.275 0.001 Y NA
 3578410 3578411 YPDSF_3108 YPDSF_3109   leuD TRUE 0.995 15.000 0.309 0.000 Y NA
 3578413 3578414 YPDSF_3111 YPDSF_3112   tbpA FALSE 0.013 856.000 0.014 0.069   NA
 3578414 3578415 YPDSF_3112 YPDSF_3113 tbpA thiP TRUE 0.989 -36.000 0.697 0.069 N NA
 3578415 3578416 YPDSF_3113 YPDSF_3114 thiP thiQ TRUE 0.992 -13.000 0.522 0.015 N NA
 3578418 3578419 YPDSF_3116 YPDSF_3117     FALSE 0.194 445.000 0.098 0.072 Y NA
 3578420 3578421 YPDSF_3118 YPDSF_3119     TRUE 0.989 22.000 1.000 NA   NA
 3578421 3578422 YPDSF_3119 YPDSF_3120     TRUE 0.991 9.000 0.615 NA   NA
 3578422 3578423 YPDSF_3120 YPDSF_3121     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3578423 3578424 YPDSF_3121 YPDSF_3122     FALSE 0.279 120.000 0.000 NA   NA
 3578424 3578425 YPDSF_3122 YPDSF_3123     TRUE 0.995 -7.000 0.667 NA   NA
 3578425 3578426 YPDSF_3123 YPDSF_3124     TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 3578426 3578427 YPDSF_3124 YPDSF_3125     TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 3578427 3578428 YPDSF_3125 YPDSF_3126     TRUE 0.560 26.000 0.000 NA   NA
 3578428 3578429 YPDSF_3126 YPDSF_3127     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 3578429 3578430 YPDSF_3127 YPDSF_3128     FALSE 0.295 104.000 0.000 NA   NA
 3578430 3578431 YPDSF_3128 YPDSF_3129     TRUE 0.958 18.000 0.400 NA   NA
 3578431 3578432 YPDSF_3129 YPDSF_3130     TRUE 0.992 -7.000 0.533 NA   NA
 3578432 3578433 YPDSF_3130 YPDSF_3131     TRUE 0.957 33.000 0.533 NA   NA
 3578433 3578434 YPDSF_3131 YPDSF_3132     TRUE 0.950 74.000 0.714 NA   NA
 3578434 3578435 YPDSF_3132 YPDSF_3133     TRUE 0.825 163.000 0.500 NA   NA
 3578435 3578436 YPDSF_3133 YPDSF_3134     TRUE 0.997 0.000 0.700 NA   NA
 3578436 3578437 YPDSF_3134 YPDSF_3135     TRUE 0.995 11.000 1.000 NA   NA
 3578438 3578439 YPDSF_3136 YPDSF_3137     FALSE 0.005 1223.000 0.000 NA   NA
 3578441 3578442 YPDSF_3139 YPDSF_3140     TRUE 0.609 68.000 0.182 1.000 N NA
 3578442 3578443 YPDSF_3140 YPDSF_3141   pdxA TRUE 0.976 -25.000 0.561 1.000 N NA
 3578443 3578444 YPDSF_3141 YPDSF_3142 pdxA ksgA TRUE 0.948 -7.000 0.197 1.000 N NA
 3578444 3578445 YPDSF_3142 YPDSF_3143 ksgA apaG TRUE 0.616 14.000 0.078 NA N NA
 3578445 3578446 YPDSF_3143 YPDSF_3144 apaG apaH TRUE 0.898 17.000 0.267 NA N NA
 3578449 3578450 YPDSF_3147 YPDSF_3148 folA   FALSE 0.405 150.000 0.104 NA   NA
 3578450 3578451 YPDSF_3148 YPDSF_3149     TRUE 0.997 -3.000 0.704 NA   NA
 3578453 3578454 YPDSF_3151 YPDSF_3152 carB   TRUE 0.995 16.000 0.345 0.000 Y NA
 3578454 3578455 YPDSF_3152 YPDSF_3153     FALSE 0.062 473.000 0.034 1.000 Y NA
 3578455 3578456 YPDSF_3153 YPDSF_3154   ispH FALSE 0.000 582.000 0.009 1.000 N NA
 3578456 3578457 YPDSF_3154 YPDSF_3155 ispH   TRUE 0.983 -19.000 0.626 1.000 N NA
 3578457 3578458 YPDSF_3155 YPDSF_3156   lspA TRUE 0.927 -7.000 0.154 1.000 N NA
 3578458 3578459 YPDSF_3156 YPDSF_3157 lspA ileS TRUE 0.661 0.000 0.045 1.000 N NA
 3578459 3578460 YPDSF_3157 YPDSF_3158 ileS   TRUE 0.831 32.000 0.254 1.000 N NA
 3578462 3578463 YPDSF_3160 YPDSF_3161 nhaR   TRUE 0.657 130.000 0.292 1.000 N NA
 3578463 3578464 YPDSF_3161 YPDSF_3162     FALSE 0.004 243.000 0.022 1.000 N NA
 3578464 3578465 YPDSF_3162 YPDSF_3163     TRUE 0.956 112.000 0.236 0.002 Y NA
 3578466 3578467 YPDSF_3164 YPDSF_3165     FALSE 0.048 289.000 0.000 1.000   NA
 3578468 3578469 YPDSF_3166 YPDSF_3167   mogA FALSE 0.039 128.000 0.039 1.000 N NA
 3578469 3578470 YPDSF_3167 YPDSF_3168 mogA   FALSE 0.332 86.000 0.000 NA   NA
 3578470 3578471 YPDSF_3168 YPDSF_3169     FALSE 0.481 44.000 0.000 NA   NA
 3578471 3578472 YPDSF_3169 YPDSF_3170     FALSE 0.381 67.000 0.000 NA   NA
 3578474 3578475 YPDSF_3172 YPDSF_3173     TRUE 0.992 4.000 0.233 1.000 Y NA
 3578475 3578476 YPDSF_3173 YPDSF_3174   thrA TRUE 0.988 3.000 0.133 1.000 Y NA
 3578477 3578478 YPDSF_3175 YPDSF_3176     FALSE 0.301 99.000 0.000 NA   NA
 3578483 3578484 YPDSF_3181 YPDSF_3182     FALSE 0.179 236.000 0.167 1.000 N NA
 3578485 3578486 YPDSF_3183 YPDSF_3184     FALSE 0.023 375.000 0.000 NA   NA
 3578486 3578487 YPDSF_3184 YPDSF_3185     TRUE 0.987 -3.000 0.259 NA   NA
 3578487 3578488 YPDSF_3185 YPDSF_3186     TRUE 0.922 15.000 0.290 1.000 N NA
 3578488 3578489 YPDSF_3186 YPDSF_3187     FALSE 0.104 183.000 0.005 1.000   NA
 3578490 3578491 YPDSF_3188 YPDSF_3189     TRUE 0.896 -105.000 0.000 0.002   NA
 3578491 3578492 YPDSF_3189 YPDSF_3190     FALSE 0.218 157.000 0.000 1.000   NA
 3578492 3578493 YPDSF_3190 YPDSF_3191     FALSE 0.012 159.000 0.021 1.000 N NA
 3578493 3578494 YPDSF_3191 YPDSF_3192   serB FALSE 0.021 88.000 0.024 1.000 N NA
 3578496 3578497 YPDSF_3194 YPDSF_3195 deoD   TRUE 0.770 125.000 0.414 1.000 N NA
 3578497 3578498 YPDSF_3195 YPDSF_3196   deoA TRUE 0.741 132.000 0.398 1.000 N NA
 3578498 3578499 YPDSF_3196 YPDSF_3197 deoA   TRUE 0.966 28.000 0.286 1.000 Y NA
 3578499 3578500 YPDSF_3197 YPDSF_3198     FALSE 0.043 584.000 0.000 1.000 Y NA
 3578500 3578501 YPDSF_3198 YPDSF_3199     FALSE 0.000 702.000 0.027 NA N NA
 3578501 3578502 YPDSF_3199 YPDSF_3200     TRUE 0.726 16.000 0.057 NA   NA
 3578502 3578503 YPDSF_3200 YPDSF_3201     TRUE 0.747 77.000 0.211 NA   NA
 3578503 3578504 YPDSF_3201 YPDSF_3202     FALSE 0.451 167.000 0.140 NA   NA
 3578504 3578505 YPDSF_3202 YPDSF_3203   prfC FALSE 0.034 327.000 0.000 NA   NA
 3578505 3578506 YPDSF_3203 YPDSF_3204 prfC rimI FALSE 0.142 179.000 0.026 1.000   NA
 3578507 3578508 YPDSF_3205 YPDSF_R0070 rsmC   FALSE 0.067 257.000 0.000 NA   NA
 3578512 3578513 YPDSF_3209 YPDSF_3210     TRUE 0.817 147.000 0.429 NA   NA
 3578514 3578515 YPDSF_3211 YPDSF_3212     TRUE 0.967 0.000 0.185 NA N NA
 3578515 3578516 YPDSF_3212 YPDSF_3213     FALSE 0.445 52.000 0.000 NA   NA
 3578516 3578517 YPDSF_3213 YPDSF_3214     FALSE 0.006 810.000 0.000 NA   NA
 3578517 3578518 YPDSF_3214 YPDSF_3215     TRUE 0.883 48.000 0.105 NA Y NA
 3578518 3578519 YPDSF_3215 YPDSF_3216     FALSE 0.005 316.000 0.000 1.000 N NA
 3578519 3578520 YPDSF_3216 YPDSF_3217     FALSE 0.412 171.000 0.200 1.000 N NA
 3578521 3578522 YPDSF_3218 YPDSF_3219     FALSE 0.131 204.000 0.000 NA   NA
 3578522 3578523 YPDSF_3219 YPDSF_3220     TRUE 0.999 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 3578523 3578524 YPDSF_3220 YPDSF_3221     TRUE 1.000 -3.000 0.788 0.010 Y NA
 3578524 3578525 YPDSF_3221 YPDSF_3222     TRUE 0.986 73.000 0.844 NA Y NA
 3578525 3578526 YPDSF_3222 YPDSF_3223     TRUE 0.826 56.000 0.062 NA Y NA
 3578526 3578527 YPDSF_3223 YPDSF_3224     FALSE 0.341 64.000 0.028 1.000   NA
 3578527 3578528 YPDSF_3224 YPDSF_3225     FALSE 0.035 323.000 0.000 NA   NA
 3578530 3578531 YPDSF_3227 YPDSF_3228     TRUE 0.727 341.000 0.400 0.005 Y NA
 3578531 3578532 YPDSF_3228 YPDSF_3229     TRUE 0.876 93.000 0.000 0.005 Y NA
 3578533 3578534 YPDSF_3230 YPDSF_3231     TRUE 0.894 2.000 0.000 1.000   NA
 3578535 3578536 YPDSF_3232 YPDSF_3233     TRUE 0.989 11.000 0.637 NA   NA
 3578537 3578538 YPDSF_3234 YPDSF_3235     TRUE 0.942 -3.000 0.068 NA   NA
 3578538 3578539 YPDSF_3235 YPDSF_3236     FALSE 0.342 82.000 0.000 NA   NA
 3578541 3578542 YPDSF_3238 YPDSF_3239     TRUE 0.715 -28.000 0.000 NA   NA
 3578542 3578543 YPDSF_3239 YPDSF_3240     FALSE 0.453 50.000 0.000 NA   NA
 3578545 3578546 YPDSF_3242 YPDSF_3243     TRUE 0.999 -3.000 0.759 NA Y NA
 3578547 3578548 YPDSF_3244 YPDSF_3245     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3578549 3578550 YPDSF_3246 YPDSF_3247     TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 3578550 3578551 YPDSF_3247 YPDSF_3248     FALSE 0.342 82.000 0.000 NA   NA
 3578551 3578552 YPDSF_3248 YPDSF_R0071     FALSE 0.142 199.000 0.000 NA   NA
 3578552 3578553 YPDSF_R0071 YPDSF_3249     FALSE 0.293 105.000 0.000 NA   NA
 3578553 3578554 YPDSF_3249 YPDSF_3250     TRUE 0.998 0.000 0.631 0.064   NA
 3578555 3578556 YPDSF_3251 YPDSF_3252     TRUE 0.773 151.000 0.494 1.000 N NA
 3578556 3578557 YPDSF_3252 YPDSF_3253   valS TRUE 0.688 13.000 0.089 1.000 N NA
 3578557 3578558 YPDSF_3253 YPDSF_3254 valS   TRUE 0.578 143.000 0.008 1.000 Y NA
 3578562 3578563 YPDSF_3258 YPDSF_3259     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 3578563 3578564 YPDSF_3259 YPDSF_3260     TRUE 0.852 96.000 0.400 NA   NA
 3578564 3578565 YPDSF_3260 YPDSF_3261     TRUE 0.993 19.000 0.441 0.053 Y NA
 3578565 3578566 YPDSF_3261 YPDSF_3262     TRUE 0.983 -37.000 0.324 1.000 Y NA
 3578566 3578567 YPDSF_3262 YPDSF_3263     TRUE 0.998 -13.000 0.550 0.019 Y NA
 3578567 3578568 YPDSF_3263 YPDSF_3264     FALSE 0.002 434.000 0.000 1.000 N NA
 3578568 3578569 YPDSF_3264 YPDSF_3265   nrdG TRUE 0.606 207.000 0.464 1.000 N NA
 3578569 3578570 YPDSF_3265 YPDSF_3266 nrdG   FALSE 0.005 328.000 0.000 1.000 N NA
 3578570 3578571 YPDSF_3266 YPDSF_3267     TRUE 0.995 1.000 0.691 1.000 N NA
 3578571 3578572 YPDSF_3267 YPDSF_3268   phnH TRUE 1.000 0.000 0.967 0.002 Y NA
 3578572 3578573 YPDSF_3268 YPDSF_3269 phnH   TRUE 1.000 0.000 0.960 0.002 Y NA
 3578573 3578574 YPDSF_3269 YPDSF_3270     TRUE 0.999 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 3578574 3578575 YPDSF_3270 YPDSF_3271   phnK TRUE 0.999 0.000 0.883 1.000 Y NA
 3578575 3578576 YPDSF_3271 YPDSF_3272 phnK   TRUE 0.844 389.000 0.859 0.019 Y NA
 3578576 3578577 YPDSF_3272 YPDSF_3273     TRUE 0.997 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 3578577 3578578 YPDSF_3273 YPDSF_3274     TRUE 0.995 0.000 0.235 NA Y NA
 3578578 3578579 YPDSF_3274 YPDSF_3275   phnP TRUE 0.968 -9.000 0.214 NA   NA
 3578580 3578581 YPDSF_3276 YPDSF_3277     FALSE 0.274 152.000 0.056 1.000   NA
 3578581 3578582 YPDSF_3277 YPDSF_3278     FALSE 0.300 84.000 0.032 1.000   NA
 3578582 3578583 YPDSF_3278 YPDSF_3279     TRUE 0.945 15.000 0.273 1.000   NA
 3578583 3578584 YPDSF_3279 YPDSF_3280     TRUE 0.995 12.000 0.364 0.053 Y NA
 3578584 3578585 YPDSF_3280 YPDSF_3281     TRUE 0.995 19.000 0.611 0.053 Y NA
 3578585 3578586 YPDSF_3281 YPDSF_3282     TRUE 0.998 8.000 0.611 0.053 Y NA
 3578587 3578588 YPDSF_3283 YPDSF_3284     TRUE 0.982 24.000 0.400 0.001   NA
 3578588 3578589 YPDSF_3284 YPDSF_3285     FALSE 0.092 231.000 0.000 1.000   NA
 3578590 3578591 YPDSF_3286 YPDSF_3287     TRUE 0.984 -6.000 0.295 1.000   NA
 3578592 3578593 YPDSF_3288 YPDSF_3289     FALSE 0.289 110.000 0.000 NA   NA
 3578593 3578594 YPDSF_3289 YPDSF_3290     TRUE 0.999 12.000 0.948 0.002 Y NA
 3578595 3578596 YPDSF_3291 YPDSF_3292     TRUE 0.993 2.000 0.367 0.053 N NA
 3578596 3578597 YPDSF_3292 YPDSF_3293     TRUE 0.916 4.000 0.133 1.000 N NA
 3578599 3578600 YPDSF_3295 YPDSF_3296     FALSE 0.016 435.000 0.000 NA   NA
 3578600 3578601 YPDSF_3296 YPDSF_3297     TRUE 0.616 20.000 0.000 NA   NA
 3578601 3578602 YPDSF_3297 YPDSF_3298     FALSE 0.184 187.000 0.053 1.000   NA
 3578602 3578603 YPDSF_3298 YPDSF_3299     FALSE 0.370 125.000 0.071 1.000   NA
 3578604 3578605 YPDSF_R0072 YPDSF_3300     FALSE 0.008 623.000 0.000 NA   NA
 3578608 3578609 YPDSF_3303 YPDSF_3304   glgA TRUE 0.819 169.000 0.228 1.000 Y NA
 3578609 3578610 YPDSF_3304 YPDSF_3305 glgA glgC TRUE 0.939 68.000 0.307 1.000 Y NA
 3578610 3578611 YPDSF_3305 YPDSF_3306 glgC   TRUE 0.986 10.000 0.228 1.000 Y NA
 3578611 3578612 YPDSF_3306 YPDSF_3307     TRUE 0.994 2.000 0.069 0.002 Y NA
 3578614 3578615 YPDSF_3309 YPDSF_3310     FALSE 0.005 1736.000 0.000 NA   NA
 3578615 3578616 YPDSF_3310 YPDSF_3311     TRUE 0.837 7.000 0.000 NA   NA
 3578616 3578617 YPDSF_3311 YPDSF_3312     FALSE 0.083 241.000 0.000 NA   NA
 3578617 3578618 YPDSF_3312 YPDSF_3313     FALSE 0.197 169.000 0.000 NA   NA
 3578620 3578621 YPDSF_3315 YPDSF_3316     FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 3578621 3578622 YPDSF_3316 YPDSF_3317     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3578622 3578623 YPDSF_3317 YPDSF_3318     FALSE 0.171 182.000 0.000 NA   NA
 3578625 3578626 YPDSF_3320 YPDSF_3321     FALSE 0.419 129.000 0.091 NA   NA
 3578628 3578629 YPDSF_3323 YPDSF_3324     TRUE 0.982 10.000 0.180 NA Y NA
 3578629 3578630 YPDSF_3324 YPDSF_3325     TRUE 0.818 26.000 0.149 NA   NA
 3578630 3578631 YPDSF_3325 YPDSF_3326     TRUE 0.533 75.000 0.095 NA   NA
 3578631 3578632 YPDSF_3326 YPDSF_3327     TRUE 0.951 31.000 0.238 0.010   NA
 3578632 3578633 YPDSF_3327 YPDSF_3328     TRUE 0.966 -7.000 0.000 0.010   NA
 3578634 3578635 YPDSF_3329 YPDSF_3330     TRUE 0.785 -16.000 0.000 NA   NA
 3578637 3578638 YPDSF_3332 YPDSF_3333     FALSE 0.009 266.000 0.000 1.000 N NA
 3578640 3578641 YPDSF_3335 YPDSF_3336     FALSE 0.011 247.000 0.000 1.000 N NA
 3578641 3578642 YPDSF_3336 YPDSF_3337     FALSE 0.010 254.000 0.000 1.000 N NA
 3578643 3578644 YPDSF_3338 YPDSF_3339     TRUE 0.935 4.000 0.098 NA   NA
 3578645 3578646 YPDSF_3340 YPDSF_3341     TRUE 0.549 28.000 0.000 NA   NA
 3578646 3578647 YPDSF_3341 YPDSF_3342     FALSE 0.288 189.000 0.100 1.000   NA
 3578647 3578648 YPDSF_3342 YPDSF_3343     FALSE 0.024 193.000 0.000 NA N NA
 3578650 3578651 YPDSF_3345 YPDSF_3346     TRUE 0.988 11.000 0.295 1.000 Y NA
 3578652 3578653 YPDSF_3347 YPDSF_3348     FALSE 0.377 68.000 0.000 NA   NA
 3578653 3578654 YPDSF_3348 YPDSF_3349     TRUE 0.894 2.000 0.000 NA   NA
 3578654 3578655 YPDSF_3349 YPDSF_3350     FALSE 0.328 88.000 0.000 NA   NA
 3578656 3578657 YPDSF_3351 YPDSF_3352     TRUE 0.851 4.000 0.033 1.000   NA
 3578658 3578659 YPDSF_3353 YPDSF_3354     FALSE 0.006 305.000 0.000 NA N NA
 3578660 3578661 YPDSF_3355 YPDSF_3356     FALSE 0.052 279.000 0.000 1.000   NA
 3578662 3578663 YPDSF_3357 YPDSF_3358     FALSE 0.048 365.000 0.088 1.000   NA
 3578663 3578664 YPDSF_3358 YPDSF_3359     FALSE 0.014 455.000 0.000 1.000   NA
 3578664 3578665 YPDSF_3359 YPDSF_3360     FALSE 0.272 125.000 0.000 NA   NA
 3578665 3578666 YPDSF_3360 YPDSF_3361     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 3578666 3578667 YPDSF_3361 YPDSF_3362     FALSE 0.077 246.000 0.000 NA   NA
 3578667 3578668 YPDSF_3362 YPDSF_3363     FALSE 0.022 640.000 0.000 0.084   NA
 3578668 3578669 YPDSF_3363 YPDSF_3364     FALSE 0.042 143.000 0.000 1.000 N NA
 3578669 3578670 YPDSF_3364 YPDSF_3365   dppF FALSE 0.005 319.000 0.000 1.000 N NA
 3578670 3578671 YPDSF_3365 YPDSF_3366 dppF dppD TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 3578671 3578672 YPDSF_3366 YPDSF_3367 dppD   TRUE 0.973 67.000 0.560 1.000 Y NA
 3578672 3578673 YPDSF_3367 YPDSF_3368     TRUE 0.998 11.000 0.779 0.053 Y NA
 3578673 3578674 YPDSF_3368 YPDSF_3369     FALSE 0.463 283.000 0.087 0.053 Y NA
 3578674 3578675 YPDSF_3369 YPDSF_3370     FALSE 0.001 669.000 0.000 NA N NA
 3578675 3578676 YPDSF_3370 YPDSF_3371     TRUE 0.591 194.000 0.286 NA   NA
 3578676 3578677 YPDSF_3371 YPDSF_R0073     FALSE 0.038 313.000 0.000 NA   NA
 3578677 3578678 YPDSF_R0073 YPDSF_3372     FALSE 0.283 117.000 0.000 NA   NA
 3578678 3578679 YPDSF_3372 YPDSF_3373     TRUE 0.973 95.000 1.000 0.064 N NA
 3578679 3578680 YPDSF_3373 YPDSF_3374     TRUE 0.997 -3.000 0.148 0.010 Y NA
 3578680 3578681 YPDSF_3374 YPDSF_3375     FALSE 0.470 116.000 0.103 1.000   NA
 3578681 3578682 YPDSF_3375 YPDSF_3376     FALSE 0.368 71.000 0.000 1.000   NA
 3578682 3578683 YPDSF_3376 YPDSF_3377     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3578684 3578685 YPDSF_3378 YPDSF_3379     FALSE 0.121 211.000 0.000 1.000   NA
 3578686 3578687 YPDSF_3380 YPDSF_3381   murB TRUE 0.972 -3.000 0.211 1.000 N NA
 3578687 3578688 YPDSF_3381 YPDSF_R0074 murB   FALSE 0.014 456.000 0.000 NA   NA
 3578688 3578689 YPDSF_R0074 YPDSF_R0075     FALSE 0.306 97.000 0.000 NA   NA
 3578689 3578690 YPDSF_R0075 YPDSF_R0076     FALSE 0.109 219.000 0.000 NA   NA
 3578690 3578691 YPDSF_R0076 YPDSF_R0077     FALSE 0.445 52.000 0.000 NA   NA
 3578691 3578692 YPDSF_R0077 YPDSF_R0078     FALSE 0.299 100.000 0.000 NA   NA
 3578692 3578693 YPDSF_R0078 YPDSF_3382   hemG FALSE 0.013 475.000 0.000 NA   NA
 3578693 3578694 YPDSF_3382 YPDSF_3383 hemG   TRUE 0.939 22.000 0.455 1.000 N NA
 3578694 3578695 YPDSF_3383 YPDSF_3384     TRUE 0.834 40.000 0.202 1.000   NA
 3578695 3578696 YPDSF_3384 YPDSF_3385     TRUE 0.969 0.000 0.127 1.000   NA
 3578697 3578698 YPDSF_3386 YPDSF_3387 fadB fadA TRUE 0.995 12.000 0.607 1.000 Y NA
 3578699 3578700 YPDSF_3388 YPDSF_3389 fre   TRUE 0.857 55.000 0.090 NA Y NA
 3578702 3578703 YPDSF_3391 YPDSF_3392     FALSE 0.089 15.000 0.031 NA N NA
 3578703 3578704 YPDSF_3392 YPDSF_3393     TRUE 0.497 56.000 0.121 NA N NA
 3578704 3578705 YPDSF_3393 YPDSF_3394     TRUE 0.995 3.000 0.333 NA Y NA
 3578705 3578706 YPDSF_3394 YPDSF_3395     TRUE 0.986 4.000 0.130 1.000 Y NA
 3578706 3578707 YPDSF_3395 YPDSF_3396   ubiB FALSE 0.138 180.000 0.025 1.000   NA
 3578707 3578708 YPDSF_3396 YPDSF_3397 ubiB   TRUE 0.994 0.000 0.432 1.000   NA
 3578708 3578709 YPDSF_3397 YPDSF_3398   ubiE TRUE 0.894 14.000 0.145 1.000   NA
 3578709 3578710 YPDSF_3398 YPDSF_3399 ubiE   FALSE 0.341 92.000 0.047 NA   NA
 3578710 3578711 YPDSF_3399 YPDSF_3400     FALSE 0.288 208.000 0.125 NA   NA
 3578711 3578712 YPDSF_3400 YPDSF_3401     FALSE 0.055 272.000 0.041 NA   NA
 3578712 3578713 YPDSF_3401 YPDSF_3402     FALSE 0.123 364.000 0.000 1.000 Y NA
 3578713 3578714 YPDSF_3402 YPDSF_3403     FALSE 0.016 121.000 0.030 1.000 N NA
 3578718 3578719 YPDSF_3407 YPDSF_3408     FALSE 0.110 320.000 0.000 0.064   NA
 3578719 3578720 YPDSF_3408 YPDSF_3409   ugpQ FALSE 0.237 101.000 0.023 1.000   NA
 3578720 3578721 YPDSF_3409 YPDSF_3410 ugpQ ugpC FALSE 0.319 -3.000 0.024 1.000 N NA
 3578721 3578722 YPDSF_3410 YPDSF_3411 ugpC   TRUE 0.996 7.000 0.272 0.053 Y NA
 3578722 3578723 YPDSF_3411 YPDSF_3412     TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.053 Y NA
 3578723 3578724 YPDSF_3412 YPDSF_3413     TRUE 0.903 298.000 0.793 0.053 Y NA
 3578725 3578726 YPDSF_3414 YPDSF_3415     FALSE 0.060 267.000 0.000 NA   NA
 3578726 3578727 YPDSF_3415 YPDSF_3416     TRUE 0.936 18.000 0.286 NA   NA
 3578727 3578728 YPDSF_3416 YPDSF_3417     TRUE 0.984 -28.000 0.600 NA   NA
 3578728 3578729 YPDSF_3417 YPDSF_3418     TRUE 0.942 62.000 0.600 NA   NA
 3578729 3578730 YPDSF_3418 YPDSF_3419     TRUE 0.976 64.000 1.000 NA   NA
 3578731 3578732 YPDSF_3420 YPDSF_3421   livF FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 3578732 3578733 YPDSF_3421 YPDSF_3422 livF livG TRUE 0.999 15.000 0.967 0.019 Y NA
 3578733 3578734 YPDSF_3422 YPDSF_3423 livG livM TRUE 0.998 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 3578734 3578735 YPDSF_3423 YPDSF_3424 livM   TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.053 Y NA
 3578735 3578736 YPDSF_3424 YPDSF_3425     TRUE 0.781 181.000 0.217 1.000 Y NA
 3578738 3578739 YPDSF_3427 YPDSF_3428     FALSE 0.018 214.000 0.000 1.000 N NA
 3578739 3578740 YPDSF_3428 YPDSF_3429   ftsX FALSE 0.010 311.000 0.051 1.000 N NA
 3578740 3578741 YPDSF_3429 YPDSF_3430 ftsX   TRUE 0.980 -10.000 0.121 1.000 Y NA
 3578741 3578742 YPDSF_3430 YPDSF_3431     TRUE 0.951 6.000 0.117 0.087 N NA
 3578743 3578744 YPDSF_3432 YPDSF_3433     TRUE 0.877 -10.000 0.063 NA   NA
 3578745 3578746 YPDSF_3434 YPDSF_3435     FALSE 0.153 212.000 0.058 NA   NA
 3578747 3578748 YPDSF_3436 YPDSF_3437   zntA FALSE 0.258 414.000 0.325 0.063   NA
 3578750 3578751 YPDSF_3439 YPDSF_3440     FALSE 0.344 130.000 0.066 NA   NA
 3578752 3578753 YPDSF_3441 YPDSF_3442 glpC   TRUE 0.998 -3.000 0.547 0.001 N NA
 3578753 3578754 YPDSF_3442 YPDSF_3443   glpA TRUE 0.996 -10.000 0.650 0.001 N NA
 3578756 3578757 YPDSF_3445 YPDSF_3446     FALSE 0.053 277.000 0.000 1.000   NA
 3578757 3578758 YPDSF_3446 YPDSF_3447     TRUE 0.966 -133.000 0.524 1.000   NA
 3578760 3578761 YPDSF_3449 YPDSF_3450     FALSE 0.060 107.000 0.043 1.000 N NA
 3578761 3578762 YPDSF_3450 YPDSF_3451     FALSE 0.158 78.000 0.057 1.000 N NA
 3578763 3578764 YPDSF_3452 YPDSF_3453     TRUE 0.516 87.000 0.099 NA   NA
 3578765 3578766 YPDSF_3454 YPDSF_3455     FALSE 0.007 649.000 0.000 1.000   NA
 3578766 3578767 YPDSF_3455 YPDSF_3456     TRUE 0.715 14.000 0.042 NA   NA
 3578769 3578770 YPDSF_3458 YPDSF_3459 uvrD   TRUE 0.559 102.000 0.128 1.000   NA
 3578770 3578771 YPDSF_3459 YPDSF_3460   xerC TRUE 0.992 0.000 0.367 1.000   NA
 3578771 3578772 YPDSF_3460 YPDSF_3461 xerC   TRUE 0.997 -3.000 0.714 NA   NA
 3578772 3578773 YPDSF_3461 YPDSF_3462   dapF TRUE 0.732 65.000 0.175 NA   NA
 3578773 3578774 YPDSF_3462 YPDSF_3463 dapF   FALSE 0.009 184.000 0.021 NA N NA
 3578777 3578778 YPDSF_3466 YPDSF_3467   hemC FALSE 0.106 221.000 0.000 NA   NA
 3578778 3578779 YPDSF_3467 YPDSF_3468 hemC hemD TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 3578779 3578780 YPDSF_3468 YPDSF_3469 hemD   TRUE 0.986 31.000 0.600 1.000 Y NA
 3578780 3578781 YPDSF_3469 YPDSF_3470     TRUE 0.988 3.000 0.144 1.000 Y NA
 3578782 3578783 YPDSF_3471 YPDSF_R0079     FALSE 0.005 867.000 0.000 NA   NA
 3578783 3578784 YPDSF_R0079 YPDSF_R0080     FALSE 0.355 76.000 0.000 NA   NA
 3578784 3578785 YPDSF_R0080 YPDSF_R0081     TRUE 0.652 17.000 0.000 NA   NA
 3578785 3578786 YPDSF_R0081 YPDSF_R0082     FALSE 0.337 84.000 0.000 NA   NA
 3578786 3578787 YPDSF_R0082 YPDSF_3472     FALSE 0.233 149.000 0.000 NA   NA
 3578787 3578788 YPDSF_3472 YPDSF_3473     FALSE 0.002 524.000 0.000 1.000 N NA
 3578788 3578789 YPDSF_3473 YPDSF_3474     TRUE 0.928 9.000 0.126 1.000   NA
 3578789 3578790 YPDSF_3474 YPDSF_3475     TRUE 0.997 -3.000 0.684 1.000   NA
 3578790 3578791 YPDSF_3475 YPDSF_3476     TRUE 0.972 23.000 0.605 1.000   NA
 3578791 3578792 YPDSF_3476 YPDSF_3477     TRUE 0.980 2.000 0.218 1.000   NA
 3578792 3578793 YPDSF_3477 YPDSF_3478     TRUE 0.983 2.000 0.248 1.000   NA
 3578793 3578794 YPDSF_3478 YPDSF_3479     TRUE 0.864 -49.000 0.145 1.000   NA
 3578794 3578795 YPDSF_3479 YPDSF_3480     TRUE 0.930 278.000 0.739 0.003 Y NA
 3578795 3578796 YPDSF_3480 YPDSF_3481   wecC TRUE 0.992 -9.000 0.273 1.000 Y NA
 3578796 3578797 YPDSF_3481 YPDSF_3482 wecC   TRUE 0.997 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 3578797 3578798 YPDSF_3482 YPDSF_3483     TRUE 0.920 278.000 0.677 0.003 Y NA
 3578798 3578799 YPDSF_3483 YPDSF_3484     TRUE 0.997 21.000 0.735 0.003 Y NA
 3578799 3578800 YPDSF_3484 YPDSF_3485   rho FALSE 0.001 550.000 0.000 1.000 N NA
 3578800 3578801 YPDSF_3485 YPDSF_3486 rho   FALSE 0.010 480.000 0.087 1.000 N NA
 3578802 3578803 YPDSF_3487 YPDSF_3488     TRUE 0.983 4.000 0.406 1.000 N NA
 3578805 3578806 YPDSF_3490 YPDSF_3491     FALSE 0.084 239.000 0.000 1.000   NA
 3578806 3578807 YPDSF_3491 YPDSF_3492     FALSE 0.001 792.000 0.000 1.000 N NA
 3578807 3578808 YPDSF_3492 YPDSF_3493     TRUE 0.990 64.000 1.000 1.000 Y NA
 3578808 3578809 YPDSF_3493 YPDSF_3494     TRUE 0.983 28.000 0.500 1.000 Y NA
 3578809 3578810 YPDSF_3494 YPDSF_3495     TRUE 0.991 5.000 0.500 1.000   NA
 3578810 3578811 YPDSF_3495 YPDSF_3496     TRUE 0.993 -34.000 1.000 1.000   NA
 3578812 3578813 YPDSF_3498 YPDSF_3499     FALSE 0.011 516.000 0.000 NA   NA
 3578813 3578814 YPDSF_3499 YPDSF_3500     FALSE 0.146 196.000 0.000 NA   NA
 3578814 3578815 YPDSF_3500 YPDSF_3501     FALSE 0.173 181.000 0.000 NA   NA
 3578818 3578819 YPDSF_3504 YPDSF_3505     TRUE 0.932 93.000 0.667 NA   NA
 3578819 3578820 YPDSF_3505 YPDSF_3506     TRUE 0.991 -16.000 0.667 NA   NA
 3578820 3578821 YPDSF_3506 YPDSF_3507     FALSE 0.346 80.000 0.000 NA   NA
 3578821 3578822 YPDSF_3507 YPDSF_3508     FALSE 0.346 80.000 0.000 NA   NA
 3578823 3578824 YPDSF_3509 YPDSF_3510     TRUE 0.980 6.000 0.106 1.000 Y NA
 3578824 3578825 YPDSF_3510 YPDSF_3511     FALSE 0.221 311.000 0.075 1.000 Y NA
 3578825 3578826 YPDSF_3511 YPDSF_3512   ilvM TRUE 0.881 23.000 0.205 1.000   NA
 3578826 3578827 YPDSF_3512 YPDSF_3513 ilvM   TRUE 0.999 -3.000 0.943 0.001   NA
 3578831 3578832 YPDSF_3517 YPDSF_3518     TRUE 1.000 0.000 0.865 0.010 Y NA
 3578832 3578833 YPDSF_3518 YPDSF_3519     TRUE 0.997 12.000 0.506 0.010 Y NA
 3578833 3578834 YPDSF_3519 YPDSF_3520     TRUE 0.982 86.000 0.804 NA Y NA
 3578834 3578835 YPDSF_3520 YPDSF_R0083     FALSE 0.005 985.000 0.000 NA   NA
 3578835 3578836 YPDSF_R0083 YPDSF_R0084     TRUE 0.817 9.000 0.000 NA   NA
 3578836 3578837 YPDSF_R0084 YPDSF_R0085     FALSE 0.281 119.000 0.000 NA   NA
 3578837 3578838 YPDSF_R0085 YPDSF_R0086     FALSE 0.296 103.000 0.000 NA   NA
 3578838 3578839 YPDSF_R0086 YPDSF_R0087     FALSE 0.071 253.000 0.000 NA   NA
 3578839 3578840 YPDSF_R0087 YPDSF_R0088     FALSE 0.257 134.000 0.000 NA   NA
 3578840 3578841 YPDSF_R0088 YPDSF_3521     FALSE 0.014 457.000 0.000 NA   NA
 3578841 3578842 YPDSF_3521 YPDSF_3522   btuB FALSE 0.071 -55.000 0.025 1.000 N NA
 3578844 3578845 YPDSF_3524 YPDSF_3525     TRUE 0.981 13.000 0.508 NA   NA
 3578848 3578849 YPDSF_3528 YPDSF_3529     TRUE 0.818 95.000 0.204 0.004 N NA
 3578850 3578851 YPDSF_3530 YPDSF_3531     TRUE 0.969 65.000 0.667 0.007 N NA
 3578851 3578852 YPDSF_3531 YPDSF_3532     TRUE 0.988 76.000 1.000 0.007   NA
 3578852 3578853 YPDSF_3532 YPDSF_3533     FALSE 0.219 157.000 0.000 NA   NA
 3578853 3578854 YPDSF_3533 YPDSF_3534     FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 3578854 3578855 YPDSF_3534 YPDSF_3535     FALSE 0.001 599.000 0.000 1.000 N NA
 3578855 3578856 YPDSF_3535 YPDSF_3536     TRUE 0.527 167.000 0.017 1.000 Y NA
 3578856 3578857 YPDSF_3536 YPDSF_3537   argC TRUE 0.861 166.000 0.097 0.002 Y NA
 3578858 3578859 YPDSF_3538 YPDSF_3539     FALSE 0.007 374.000 0.053 1.000 N NA
 3578862 3578863 YPDSF_3542 YPDSF_3543 rpsO truB TRUE 0.864 123.000 0.211 1.000 Y NA
 3578863 3578864 YPDSF_3543 YPDSF_3544 truB rbfA TRUE 0.997 0.000 0.318 1.000 Y NA
 3578864 3578865 YPDSF_3544 YPDSF_3545 rbfA infB TRUE 0.971 66.000 0.530 1.000 Y NA
 3578865 3578866 YPDSF_3545 YPDSF_3546 infB nusA TRUE 0.901 25.000 0.342 1.000 N NA
 3578866 3578867 YPDSF_3546 YPDSF_3547 nusA   TRUE 0.983 22.000 0.759 NA   NA
 3578867 3578868 YPDSF_3547 YPDSF_R0090     FALSE 0.113 216.000 0.000 NA   NA
 3578868 3578869 YPDSF_R0090 YPDSF_R0091     FALSE 0.406 61.000 0.000 NA   NA
 3578869 3578870 YPDSF_R0091 YPDSF_3548   secG FALSE 0.318 93.000 0.000 NA   NA
 3578870 3578871 YPDSF_3548 YPDSF_3549 secG glmM FALSE 0.005 223.000 0.016 1.000 N NA
 3578871 3578872 YPDSF_3549 YPDSF_3550 glmM folP TRUE 0.946 10.000 0.260 1.000 N NA
 3578872 3578873 YPDSF_3550 YPDSF_3551 folP hflB TRUE 0.709 120.000 0.325 1.000 N NA
 3578873 3578874 YPDSF_3551 YPDSF_3552 hflB rrmJ TRUE 0.589 57.000 0.152 1.000 N NA
 3578877 3578878 YPDSF_3555 YPDSF_3556     TRUE 0.847 6.000 0.101 1.000 N NA
 3578878 3578879 YPDSF_3556 YPDSF_3557     TRUE 0.997 -3.000 0.381 1.000 Y NA
 3578880 3578881 YPDSF_3558 YPDSF_3559 obgE   TRUE 0.852 1.000 0.015 1.000   NA
 3578881 3578882 YPDSF_3559 YPDSF_3560   rpmA FALSE 0.250 88.000 0.019 1.000   NA
 3578882 3578883 YPDSF_3560 YPDSF_3561 rpmA rplU TRUE 0.997 20.000 0.667 0.011 Y NA
 3578888 3578889 YPDSF_3566 YPDSF_3567     FALSE 0.021 389.000 0.000 NA   NA
 3578891 3578892 YPDSF_3569 YPDSF_3570     FALSE 0.024 200.000 0.043 1.000 N NA
 3578893 3578894 YPDSF_3571 YPDSF_3572     TRUE 0.968 3.000 0.167 NA   NA
 3578894 3578895 YPDSF_3572 YPDSF_3573     TRUE 0.996 -3.000 0.575 NA   NA
 3578896 3578897 YPDSF_3574 YPDSF_3575     FALSE 0.066 259.000 0.042 NA   NA
 3578901 3578902 YPDSF_3579 YPDSF_3580 cpdB   FALSE 0.012 155.000 0.030 NA N NA
 3578904 3578905 YPDSF_3582 YPDSF_3583     FALSE 0.263 140.000 0.047 NA   NA
 3578906 3578907 YPDSF_3584 YPDSF_3585   rplI FALSE 0.023 196.000 0.000 1.000 N NA
 3578907 3578908 YPDSF_3585 YPDSF_3586 rplI rpsR TRUE 0.990 40.000 0.499 0.011 Y NA
 3578908 3578909 YPDSF_3586 YPDSF_3587 rpsR rpsF TRUE 0.675 331.000 0.319 0.011 Y NA
 3578909 3578910 YPDSF_3587 YPDSF_3588 rpsF   FALSE 0.014 367.000 0.005 1.000   NA
 3578910 3578911 YPDSF_3588 YPDSF_3589     TRUE 0.498 39.000 0.000 1.000   NA
 3578911 3578912 YPDSF_3589 YPDSF_3590     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3578914 3578915 YPDSF_3592 YPDSF_3593     FALSE 0.001 408.000 0.005 1.000 N NA
 3578915 3578916 YPDSF_3593 YPDSF_3594     TRUE 0.685 129.000 0.147 0.013 N NA
 3578916 3578917 YPDSF_3594 YPDSF_3595     FALSE 0.320 241.000 0.038 NA Y NA
 3578917 3578918 YPDSF_3595 YPDSF_3596     FALSE 0.002 310.000 0.010 NA N NA
 3578918 3578919 YPDSF_3596 YPDSF_3597     FALSE 0.333 100.000 0.051 NA   NA
 3578919 3578920 YPDSF_3597 YPDSF_3598     TRUE 0.718 172.000 0.348 NA   NA
 3578920 3578921 YPDSF_3598 YPDSF_3599     TRUE 1.000 4.000 0.947 0.012 Y NA
 3578921 3578922 YPDSF_3599 YPDSF_3600     FALSE 0.471 241.000 0.184 0.063   NA
 3578922 3578923 YPDSF_3600 YPDSF_3601   hfq TRUE 0.586 99.000 0.141 1.000   NA
 3578923 3578924 YPDSF_3601 YPDSF_3602 hfq miaA TRUE 0.888 116.000 0.531 1.000   NA
 3578924 3578925 YPDSF_3602 YPDSF_3603 miaA mutL TRUE 0.975 -7.000 0.188 0.086 N NA
 3578925 3578926 YPDSF_3603 YPDSF_3604 mutL   TRUE 0.629 16.000 0.092 1.000 N NA
 3578926 3578927 YPDSF_3604 YPDSF_3605     TRUE 0.919 8.000 0.109 NA   NA
 3578927 3578928 YPDSF_3605 YPDSF_3606     TRUE 0.897 11.000 0.118 NA   NA
 3578930 3578931 YPDSF_R0092 YPDSF_3608     FALSE 0.009 558.000 0.000 NA   NA
 3578934 3578935 YPDSF_3611 YPDSF_3612     TRUE 0.640 42.000 0.148 1.000 N NA
 3578937 3578938 YPDSF_3614 YPDSF_3615     TRUE 0.999 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 3578938 3578939 YPDSF_3615 YPDSF_3616     TRUE 0.995 17.000 0.454 0.002 Y NA
 3578939 3578940 YPDSF_3616 YPDSF_3617     TRUE 0.998 17.000 0.787 0.002 Y NA
 3578941 3578942 YPDSF_3618 YPDSF_3619     FALSE 0.056 100.000 0.000 1.000 N NA
 3578944 3578945 YPDSF_3621 YPDSF_3622   groEL FALSE 0.008 624.000 0.000 NA   NA
 3578945 3578946 YPDSF_3622 YPDSF_3623 groEL groES TRUE 0.993 47.000 0.631 0.005 Y NA
 3578946 3578947 YPDSF_3623 YPDSF_3624 groES fxsA FALSE 0.066 255.000 0.040 1.000   NA
 3578948 3578949 YPDSF_3625 YPDSF_3626 aspA   FALSE 0.219 120.000 0.023 1.000   NA
 3578949 3578950 YPDSF_3626 YPDSF_3627     FALSE 0.103 185.000 0.007 1.000   NA
 3578950 3578951 YPDSF_3627 YPDSF_3628   dipZ TRUE 0.703 -24.000 0.092 1.000 N NA
 3578952 3578953 YPDSF_3629 YPDSF_3630     TRUE 0.953 23.000 0.231 0.033   NA
 3578953 3578954 YPDSF_3630 YPDSF_3631     TRUE 0.937 23.000 0.222 0.010 N NA
 3578955 3578956 YPDSF_3632 YPDSF_R0093     FALSE 0.239 145.000 0.000 NA   NA
 3578957 3578958 YPDSF_3633 YPDSF_3634     TRUE 0.539 30.000 0.000 NA   NA
 3578958 3578959 YPDSF_3634 YPDSF_3635     FALSE 0.006 718.000 0.000 NA   NA
 3578959 3578960 YPDSF_3635 YPDSF_3636     FALSE 0.369 71.000 0.000 NA   NA
 3578961 3578962 YPDSF_3637 YPDSF_3638     TRUE 0.730 -25.000 0.000 NA   NA
 3578963 3578964 YPDSF_3639 YPDSF_3640     TRUE 0.987 133.000 0.800 0.020 Y NA
 3578965 3578966 YPDSF_3641 YPDSF_3642   rhaB FALSE 0.263 130.000 0.000 NA   NA
 3578966 3578967 YPDSF_3642 YPDSF_3643 rhaB   TRUE 0.997 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 3578967 3578968 YPDSF_3643 YPDSF_3644     TRUE 0.982 13.000 0.247 1.000 Y NA
 3578968 3578969 YPDSF_3644 YPDSF_3645     TRUE 0.635 67.000 0.041 0.005 N NA
 3578969 3578970 YPDSF_3645 YPDSF_3646     TRUE 0.778 14.000 0.063 NA   NA
 3578973 3578974 YPDSF_3649 YPDSF_3650     FALSE 0.011 527.000 0.000 NA   NA
 3578974 3578975 YPDSF_3650 YPDSF_3651   alr FALSE 0.332 186.000 0.181 1.000 N NA
 3578975 3578976 YPDSF_3651 YPDSF_3652 alr   TRUE 0.724 97.000 0.317 1.000 N NA
 3578978 3578979 YPDSF_3654 YPDSF_3655 pspG   FALSE 0.018 516.000 0.070 NA   NA
 3578981 3578982 YPDSF_3657 YPDSF_3658     FALSE 0.393 125.000 0.141 1.000 N NA
 3578984 3578985 YPDSF_3660 YPDSF_3661 ubiA ubiC TRUE 0.836 166.000 0.248 NA Y NA
 3578986 3578987 YPDSF_3662 YPDSF_3663     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3578988 3578989 YPDSF_3664 YPDSF_3665     FALSE 0.005 1009.000 0.000 1.000   NA
 3578989 3578990 YPDSF_3665 YPDSF_3666     FALSE 0.005 1193.000 0.000 NA   NA
 3578990 3578991 YPDSF_3666 YPDSF_3667     TRUE 0.769 11.000 0.000 NA   NA
 3578991 3578992 YPDSF_3667 YPDSF_3668     TRUE 0.972 72.000 0.571 NA Y NA
 3578992 3578993 YPDSF_3668 YPDSF_3669     FALSE 0.072 251.000 0.000 NA   NA
 3578993 3578994 YPDSF_3669 YPDSF_3670     FALSE 0.006 713.000 0.000 NA   NA
 3578994 3578995 YPDSF_3670 YPDSF_3671     TRUE 0.931 184.000 0.310 0.003 Y NA
 3578995 3578996 YPDSF_3671 YPDSF_3672     FALSE 0.082 64.000 0.000 1.000 N NA
 3578996 3578997 YPDSF_3672 YPDSF_3673     TRUE 0.887 22.000 0.000 NA Y NA
 3578997 3578998 YPDSF_3673 YPDSF_3674     TRUE 0.847 33.000 0.200 NA   NA
 3578998 3578999 YPDSF_3674 YPDSF_3675     TRUE 0.984 0.000 0.054 0.003   NA
 3579000 3579001 YPDSF_3676 YPDSF_3677     TRUE 0.944 12.000 0.217 1.000   NA
 3579001 3579002 YPDSF_3677 YPDSF_3678     TRUE 0.949 -7.000 0.126 NA   NA
 3579002 3579003 YPDSF_3678 YPDSF_3679     TRUE 0.982 -7.000 0.296 NA   NA
 3579003 3579004 YPDSF_3679 YPDSF_3680     TRUE 0.993 0.000 0.420 NA   NA
 3579004 3579005 YPDSF_3680 YPDSF_3681     FALSE 0.020 397.000 0.000 NA   NA
 3579005 3579006 YPDSF_3681 YPDSF_3682     FALSE 0.037 315.000 0.000 NA   NA
 3579006 3579007 YPDSF_3682 YPDSF_3683     FALSE 0.004 341.000 0.000 1.000 N NA
 3579007 3579008 YPDSF_3683 YPDSF_3684     TRUE 0.947 -3.000 0.135 1.000 N NA
 3579008 3579009 YPDSF_3684 YPDSF_3685     FALSE 0.244 34.000 0.054 1.000 N NA
 3579009 3579010 YPDSF_3685 YPDSF_3686     FALSE 0.241 86.000 0.015 NA   NA
 3579010 3579011 YPDSF_3686 YPDSF_3687     FALSE 0.209 130.000 0.023 NA   NA
 3579011 3579012 YPDSF_3687 YPDSF_3688     TRUE 0.715 119.000 0.064 1.000 Y NA
 3579012 3579013 YPDSF_3688 YPDSF_3689     TRUE 0.997 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 3579013 3579014 YPDSF_3689 YPDSF_3690     TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 3579014 3579015 YPDSF_3690 YPDSF_3691     TRUE 0.991 -7.000 0.220 1.000 Y NA
 3579016 3579017 YPDSF_3692 YPDSF_3693     TRUE 0.830 46.000 0.043 NA Y NA
 3579019 3579020 YPDSF_3695 YPDSF_3696     TRUE 0.998 -3.000 0.844 NA   NA
 3579020 3579021 YPDSF_3696 YPDSF_3697     FALSE 0.023 383.000 0.045 NA   NA
 3579021 3579022 YPDSF_3697 YPDSF_3698     TRUE 0.997 -10.000 0.406 0.062 Y NA
 3579022 3579023 YPDSF_3698 YPDSF_3699     TRUE 0.999 2.000 0.516 0.062 Y NA
 3579023 3579024 YPDSF_3699 YPDSF_3700     TRUE 0.996 -3.000 0.136 0.011 Y NA
 3579024 3579025 YPDSF_3700 YPDSF_3701     TRUE 0.881 67.000 0.154 1.000 Y NA
 3579025 3579026 YPDSF_3701 YPDSF_3702     TRUE 0.950 -22.000 0.231 NA   NA
 3579026 3579027 YPDSF_3702 YPDSF_3703     TRUE 0.995 -19.000 1.000 NA   NA
 3579027 3579028 YPDSF_3703 YPDSF_3704     TRUE 0.979 -3.000 0.176 NA   NA
 3579028 3579029 YPDSF_3704 YPDSF_3705     TRUE 0.998 -22.000 0.647 0.007 Y NA
 3579029 3579030 YPDSF_3705 YPDSF_3706     TRUE 0.560 26.000 0.000 NA   NA
 3579030 3579031 YPDSF_3706 YPDSF_3707     TRUE 0.995 -3.000 0.538 NA   NA
 3579031 3579032 YPDSF_3707 YPDSF_3708     TRUE 0.902 172.000 0.786 NA   NA
 3579032 3579033 YPDSF_3708 YPDSF_3709     TRUE 0.997 -3.000 0.407 0.011   NA
 3579033 3579034 YPDSF_3709 YPDSF_3710     TRUE 0.854 98.000 0.407 NA   NA
 3579034 3579035 YPDSF_3710 YPDSF_3711     FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 3579035 3579036 YPDSF_3711 YPDSF_3712     FALSE 0.290 107.000 0.000 1.000   NA
 3579036 3579037 YPDSF_3712 YPDSF_3713     TRUE 0.853 19.000 0.146 NA   NA
 3579037 3579038 YPDSF_3713 YPDSF_3714     TRUE 0.985 2.000 0.268 NA   NA
 3579039 3579040 YPDSF_3715 YPDSF_3716     TRUE 0.998 13.000 0.688 0.008 Y NA
 3579042 3579043 YPDSF_3718 YPDSF_3719     TRUE 0.719 57.000 0.147 NA   NA
 3579043 3579044 YPDSF_3719 YPDSF_3720   actP TRUE 0.997 -3.000 0.733 NA   NA
 3579046 3579047 YPDSF_3722 YPDSF_3723     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3579048 3579049 YPDSF_3724 YPDSF_3725     TRUE 0.631 78.000 0.000 0.069   NA
 3579049 3579050 YPDSF_3725 YPDSF_R0094     FALSE 0.014 459.000 0.000 NA   NA
 3579050 3579051 YPDSF_R0094 YPDSF_R0095     FALSE 0.306 97.000 0.000 NA   NA
 3579051 3579052 YPDSF_R0095 YPDSF_R0096     FALSE 0.071 253.000 0.000 NA   NA
 3579052 3579053 YPDSF_R0096 YPDSF_R0097     FALSE 0.257 134.000 0.000 NA   NA
 3579054 3579055 YPDSF_3726 YPDSF_3727 purH   TRUE 0.932 60.000 0.238 1.000 Y NA
 3579056 3579057 YPDSF_3728 YPDSF_3729     TRUE 0.908 50.000 0.375 NA   NA
 3579057 3579058 YPDSF_3729 YPDSF_3730     TRUE 0.676 189.000 0.355 NA   NA
 3579058 3579059 YPDSF_3730 YPDSF_3731     TRUE 0.630 46.000 0.086 NA   NA
 3579059 3579060 YPDSF_3731 YPDSF_3732   hemE FALSE 0.049 30.000 0.028 1.000 N NA
 3579060 3579061 YPDSF_3732 YPDSF_3733 hemE   FALSE 0.281 119.000 0.000 NA   NA
 3579061 3579062 YPDSF_3733 YPDSF_3734   nudC FALSE 0.254 135.000 0.000 NA   NA
 3579063 3579064 YPDSF_3735 YPDSF_3736     FALSE 0.003 376.000 0.000 1.000 N NA
 3579064 3579065 YPDSF_3736 YPDSF_3737     TRUE 0.988 -13.000 0.063 0.002 Y NA
 3579065 3579066 YPDSF_3737 YPDSF_3738     TRUE 0.990 -10.000 0.242 1.000 Y NA
 3579066 3579067 YPDSF_3738 YPDSF_3739     TRUE 0.998 -3.000 0.548 1.000 Y NA
 3579067 3579068 YPDSF_3739 YPDSF_3740     TRUE 0.894 2.000 0.000 NA   NA
 3579068 3579069 YPDSF_3740 YPDSF_3741     TRUE 0.669 -39.000 0.000 NA   NA
 3579069 3579070 YPDSF_3741 YPDSF_3742     TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 3579070 3579071 YPDSF_3742 YPDSF_3743     TRUE 0.808 -13.000 0.000 NA   NA
 3579072 3579073 YPDSF_3744 YPDSF_3745   rpoB TRUE 0.985 93.000 0.851 0.001   NA
 3579073 3579074 YPDSF_3745 YPDSF_3746 rpoB rplL FALSE 0.156 343.000 0.223 1.000   NA
 3579074 3579075 YPDSF_3746 YPDSF_3747 rplL rplJ TRUE 0.995 67.000 0.884 0.010 Y NA
 3579075 3579076 YPDSF_3747 YPDSF_3748 rplJ rplA TRUE 0.591 365.000 0.302 0.013 Y NA
 3579076 3579077 YPDSF_3748 YPDSF_3749 rplA rplK TRUE 0.999 4.000 0.838 0.013 Y NA
 3579077 3579078 YPDSF_3749 YPDSF_3750 rplK nusG TRUE 0.794 191.000 0.681 1.000 N NA
 3579078 3579079 YPDSF_3750 YPDSF_3751 nusG secE TRUE 0.996 2.000 0.843 1.000 N NA
 3579079 3579080 YPDSF_3751 YPDSF_3752 secE   FALSE 0.003 251.000 0.009 1.000 N NA
 3579080 3579081 YPDSF_3752 YPDSF_R0098     FALSE 0.290 109.000 0.000 NA   NA
 3579081 3579082 YPDSF_R0098 YPDSF_R0099     TRUE 0.837 7.000 0.000 NA   NA
 3579082 3579083 YPDSF_R0099 YPDSF_R0100     FALSE 0.231 150.000 0.000 NA   NA
 3579083 3579084 YPDSF_R0100 YPDSF_R0101     TRUE 0.627 19.000 0.000 NA   NA
 3579084 3579085 YPDSF_R0101 YPDSF_3753     FALSE 0.013 464.000 0.000 NA   NA
 3579085 3579086 YPDSF_3753 YPDSF_3754     TRUE 0.609 83.000 0.000 0.085   NA
 3579086 3579087 YPDSF_3754 YPDSF_3755     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3579087 3579088 YPDSF_3755 YPDSF_3756     FALSE 0.001 617.000 0.000 NA N NA
 3579090 3579091 YPDSF_3758 YPDSF_3759     FALSE 0.069 418.000 0.006 1.000 Y NA
 3579091 3579092 YPDSF_3759 YPDSF_3760     TRUE 0.999 -3.000 0.315 0.000 Y NA
 3579093 3579094 YPDSF_3761 YPDSF_3762     TRUE 0.997 -3.000 0.800 1.000 N NA
 3579094 3579095 YPDSF_3762 YPDSF_3763     TRUE 0.782 83.000 0.250 1.000   NA
 3579095 3579096 YPDSF_3763 YPDSF_3764     TRUE 0.965 2.000 0.138 1.000   NA
 3579096 3579097 YPDSF_3764 YPDSF_3765     FALSE 0.002 523.000 0.000 1.000 N NA
 3579097 3579098 YPDSF_3765 YPDSF_3766     TRUE 0.992 10.000 0.356 1.000 Y NA
 3579098 3579099 YPDSF_3766 YPDSF_3767     TRUE 0.999 -10.000 0.870 0.052 Y NA
 3579099 3579100 YPDSF_3767 YPDSF_3768     TRUE 0.999 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 3579101 3579102 YPDSF_3769 YPDSF_3770     FALSE 0.187 173.000 0.000 NA   NA
 3579103 3579104 YPDSF_3771 YPDSF_3772     FALSE 0.150 193.000 0.000 1.000   NA
 3579104 3579105 YPDSF_3772 YPDSF_3773     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3579106 3579107 YPDSF_3774 YPDSF_3775     TRUE 0.900 -106.000 0.222 NA   NA
 3579107 3579108 YPDSF_3775 YPDSF_R0102     FALSE 0.202 166.000 0.000 NA   NA
 3579108 3579109 YPDSF_R0102 YPDSF_3776     FALSE 0.263 130.000 0.000 NA   NA
 3579109 3579110 YPDSF_3776 YPDSF_3777     FALSE 0.468 90.000 0.146 1.000 N NA
 3579110 3579111 YPDSF_3777 YPDSF_3778     TRUE 0.998 -13.000 0.469 0.010 Y NA
 3579111 3579112 YPDSF_3778 YPDSF_3779   xylF TRUE 0.944 208.000 0.518 0.010 Y NA
 3579113 3579114 YPDSF_3780 YPDSF_3781     TRUE 0.632 124.000 0.020 1.000 Y NA
 3579115 3579116 YPDSF_3782 YPDSF_3783     TRUE 0.947 39.000 0.500 1.000   NA
 3579116 3579117 YPDSF_3783 YPDSF_3784     TRUE 0.893 93.000 0.500 1.000   NA
 3579117 3579118 YPDSF_3784 YPDSF_3785     TRUE 0.819 26.000 0.000 0.052   NA
 3579118 3579119 YPDSF_3785 YPDSF_3786     TRUE 0.964 76.000 0.500 1.000 Y NA
 3579119 3579120 YPDSF_3786 YPDSF_3787     FALSE 0.005 877.000 0.000 1.000   NA
 3579121 3579122 YPDSF_3788 YPDSF_3789     TRUE 0.909 54.000 0.167 1.000 Y NA
 3579123 3579124 YPDSF_3790 YPDSF_3791 metF metL FALSE 0.306 233.000 0.017 1.000 Y NA
 3579124 3579125 YPDSF_3791 YPDSF_3792 metL   TRUE 0.997 3.000 0.428 1.000 Y NA
 3579126 3579127 YPDSF_3793 YPDSF_3794     TRUE 0.715 -28.000 0.000 NA   NA
 3579127 3579128 YPDSF_3794 YPDSF_3795     FALSE 0.148 195.000 0.000 NA   NA
 3579130 3579131 YPDSF_3797 YPDSF_3798     FALSE 0.001 377.000 0.013 1.000 N NA
 3579131 3579132 YPDSF_3798 YPDSF_3799     TRUE 0.723 66.000 0.245 NA N NA
 3579132 3579133 YPDSF_3799 YPDSF_3800     FALSE 0.362 100.000 0.122 NA N NA
 3579133 3579134 YPDSF_3800 YPDSF_3801   hslU TRUE 0.983 71.000 0.752 1.000 Y NA
 3579134 3579135 YPDSF_3801 YPDSF_3802 hslU   FALSE 0.027 224.000 0.051 1.000 N NA
 3579135 3579136 YPDSF_3802 YPDSF_3803     TRUE 0.799 142.000 0.158 NA Y NA
 3579137 3579138 YPDSF_3804 YPDSF_3805     FALSE 0.040 306.000 0.000 NA   NA
 3579138 3579139 YPDSF_3805 YPDSF_3806     FALSE 0.183 175.000 0.000 NA   NA
 3579140 3579141 YPDSF_3807 YPDSF_3808     TRUE 0.992 -7.000 0.250 1.000 Y NA
 3579145 3579146 YPDSF_3812 YPDSF_3813     FALSE 0.010 177.000 0.013 1.000 N NA
 3579146 3579147 YPDSF_3813 YPDSF_3814   glpX FALSE 0.004 237.000 0.025 1.000 N NA
 3579147 3579148 YPDSF_3814 YPDSF_3815 glpX   FALSE 0.257 155.000 0.117 1.000 N NA
 3579150 3579151 YPDSF_3817 YPDSF_3818   tpiA FALSE 0.324 129.000 0.058 NA   NA
 3579153 3579154 YPDSF_3820 YPDSF_3821     TRUE 0.992 -3.000 0.353 NA   NA
 3579154 3579155 YPDSF_3821 YPDSF_3822     FALSE 0.386 66.000 0.000 NA   NA
 3579155 3579156 YPDSF_3822 YPDSF_3823     FALSE 0.192 171.000 0.000 NA   NA
 3579156 3579157 YPDSF_3823 YPDSF_3824     FALSE 0.282 118.000 0.000 NA   NA
 3579158 3579159 YPDSF_3825 YPDSF_3826     FALSE 0.027 221.000 0.049 1.000 N NA
 3579159 3579160 YPDSF_3826 YPDSF_3827   fieF FALSE 0.014 218.000 0.040 1.000 N NA
 3579160 3579161 YPDSF_3827 YPDSF_3828 fieF   FALSE 0.009 562.000 0.000 NA   NA
 3579161 3579162 YPDSF_3828 YPDSF_3829     FALSE 0.477 45.000 0.000 NA   NA
 3579165 3579166 YPDSF_3832 YPDSF_3833   cpxA TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 3579169 3579170 YPDSF_3836 YPDSF_3837 cysE gpsA FALSE 0.380 266.000 0.429 1.000 N NA
 3579170 3579171 YPDSF_3837 YPDSF_3838 gpsA   TRUE 0.971 0.000 0.206 1.000 N NA
 3579171 3579172 YPDSF_3838 YPDSF_3839     FALSE 0.048 88.000 0.038 1.000 N NA
 3579172 3579173 YPDSF_3839 YPDSF_3840     FALSE 0.079 119.000 0.048 NA N NA
 3579174 3579175 YPDSF_3841 YPDSF_3842     TRUE 0.900 10.000 0.170 1.000 N NA
 3579175 3579176 YPDSF_3842 YPDSF_3843     TRUE 0.729 24.000 0.088 1.000   NA
 3579176 3579177 YPDSF_3843 YPDSF_3844     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.003   NA
 3579178 3579179 YPDSF_3845 YPDSF_3846 tdh   TRUE 0.982 10.000 0.547 1.000 N NA
 3579180 3579181 YPDSF_3847 YPDSF_3848 rfaD   TRUE 0.929 31.000 0.146 1.000 Y NA
 3579181 3579182 YPDSF_3848 YPDSF_3849     TRUE 0.998 0.000 0.205 0.001 Y NA
 3579182 3579183 YPDSF_3849 YPDSF_3850     FALSE 0.161 312.000 0.028 1.000 Y NA
 3579183 3579184 YPDSF_3850 YPDSF_3851     TRUE 0.985 1.000 0.083 NA Y NA
 3579184 3579185 YPDSF_3851 YPDSF_3852   coaD FALSE 0.319 -3.000 0.023 NA N NA
 3579186 3579187 YPDSF_3853 YPDSF_3854   rpmG FALSE 0.029 83.000 0.034 1.000 N NA
 3579187 3579188 YPDSF_3854 YPDSF_3855 rpmG rpmB TRUE 0.995 12.000 0.332 0.010 Y NA
 3579188 3579189 YPDSF_3855 YPDSF_3856 rpmB radC FALSE 0.003 263.000 0.002 1.000 N NA
 3579190 3579191 YPDSF_3857 YPDSF_3858   dut TRUE 0.899 -22.000 0.201 1.000 N NA
 3579191 3579192 YPDSF_3858 YPDSF_3859 dut slmA FALSE 0.131 122.000 0.060 1.000 N NA
 3579193 3579194 YPDSF_3860 YPDSF_3861 pyrE rph FALSE 0.214 167.000 0.108 1.000 N NA
 3579195 3579196 YPDSF_3862 YPDSF_3863     FALSE 0.019 403.000 0.000 NA   NA
 3579198 3579199 YPDSF_3865 YPDSF_3866 gmk   TRUE 0.893 55.000 0.471 1.000 N NA
 3579199 3579200 YPDSF_3866 YPDSF_3867     TRUE 0.975 20.000 0.291 1.000 Y NA
 3579200 3579201 YPDSF_3867 YPDSF_3868     TRUE 0.837 6.000 0.095 1.000 N NA
 3579201 3579202 YPDSF_3868 YPDSF_3869     TRUE 0.851 1.000 0.076 1.000 N NA
 3579204 3579205 YPDSF_3871 YPDSF_3872     TRUE 0.689 148.000 0.257 NA   NA
 3579207 3579208 YPDSF_3874 YPDSF_3875     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3579209 3579210 YPDSF_3876 YPDSF_3877   rbn TRUE 0.887 7.000 0.069 1.000   NA
 3579210 3579211 YPDSF_3877 YPDSF_3878 rbn   FALSE 0.462 37.000 0.031 1.000   NA
 3579211 3579212 YPDSF_3878 YPDSF_3879     FALSE 0.021 322.000 0.007 1.000   NA
 3579213 3579214 YPDSF_3880 YPDSF_3881 glnA glnL FALSE 0.031 223.000 0.053 1.000 N NA
 3579214 3579215 YPDSF_3881 YPDSF_3882 glnL glnG TRUE 0.998 8.000 0.587 0.057 Y NA
 3579216 3579217 YPDSF_3883 YPDSF_3884     FALSE 0.323 183.000 0.107 NA   NA
 3579217 3579218 YPDSF_3884 YPDSF_R0103     FALSE 0.239 145.000 0.000 NA   NA
 3579220 3579221 YPDSF_R0104 YPDSF_3886     FALSE 0.215 159.000 0.000 NA   NA
 3579221 3579222 YPDSF_3886 YPDSF_3887     FALSE 0.012 492.000 0.000 1.000   NA
 3579222 3579223 YPDSF_3887 YPDSF_3888     TRUE 0.746 28.000 0.111 NA   NA
 3579223 3579224 YPDSF_3888 YPDSF_3889     TRUE 0.524 91.000 0.106 NA   NA
 3579225 3579226 YPDSF_3890 YPDSF_3891 mobA   TRUE 0.995 0.000 0.064 0.002 Y NA
 3579227 3579228 YPDSF_3892 YPDSF_R0105     FALSE 0.012 495.000 0.000 NA   NA
 3579228 3579229 YPDSF_R0105 YPDSF_R0106     FALSE 0.306 97.000 0.000 NA   NA
 3579229 3579230 YPDSF_R0106 YPDSF_R0107     FALSE 0.071 253.000 0.000 NA   NA
 3579230 3579231 YPDSF_R0107 YPDSF_R0108     FALSE 0.257 134.000 0.000 NA   NA
 3579232 3579233 YPDSF_3893 YPDSF_3894     TRUE 0.624 80.000 0.133 1.000   NA
 3579234 3579235 YPDSF_3895 YPDSF_3896     FALSE 0.441 53.000 0.000 NA   NA
 3579235 3579236 YPDSF_3896 YPDSF_3897     FALSE 0.285 115.000 0.000 NA   NA
 3579236 3579237 YPDSF_3897 YPDSF_3898     FALSE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 3579237 3579238 YPDSF_3898 YPDSF_3899   trkD FALSE 0.006 205.000 0.010 1.000 N NA
 3579239 3579240 YPDSF_3900 YPDSF_3901   yieM TRUE 0.990 4.000 0.443 NA   NA
 3579242 3579243 YPDSF_3903 YPDSF_3904     TRUE 0.501 93.000 0.165 1.000 N NA
 3579243 3579244 YPDSF_3904 YPDSF_3905     FALSE 0.003 381.000 0.000 1.000 N NA
 3579244 3579245 YPDSF_3905 YPDSF_3906   gidB TRUE 0.770 146.000 0.466 1.000 N NA
 3579245 3579246 YPDSF_3906 YPDSF_3907 gidB   FALSE 0.000 667.000 0.005 1.000 N NA
 3579246 3579247 YPDSF_3907 YPDSF_3908     TRUE 0.984 40.000 0.291 0.003 Y NA
 3579247 3579248 YPDSF_3908 YPDSF_3909     TRUE 0.992 50.000 0.557 0.003 Y NA
 3579248 3579249 YPDSF_3909 YPDSF_3910     TRUE 0.992 62.000 0.666 0.003 Y NA
 3579249 3579250 YPDSF_3910 YPDSF_3911     TRUE 0.991 15.000 0.242 0.003 Y NA
 3579250 3579251 YPDSF_3911 YPDSF_3912     TRUE 0.999 15.000 0.864 0.003 Y NA
 3579251 3579252 YPDSF_3912 YPDSF_3913     TRUE 0.995 62.000 0.846 0.003 Y NA
 3579252 3579253 YPDSF_3913 YPDSF_3914     TRUE 0.985 156.000 0.724 0.003 Y NA
 3579253 3579254 YPDSF_3914 YPDSF_3915   atpC TRUE 0.998 22.000 0.837 0.003 Y NA
 3579254 3579255 YPDSF_3915 YPDSF_3916 atpC glmU FALSE 0.004 621.000 0.067 1.000 N NA
 3579255 3579256 YPDSF_3916 YPDSF_3917 glmU   FALSE 0.489 201.000 0.055 1.000 Y NA
 3579256 3579257 YPDSF_3917 YPDSF_3918     FALSE 0.002 483.000 0.000 1.000 N NA
 3579257 3579258 YPDSF_3918 YPDSF_3919   pstC TRUE 0.813 214.000 0.145 0.002 Y NA
 3579258 3579259 YPDSF_3919 YPDSF_3920 pstC pstA TRUE 0.999 2.000 0.537 0.002 Y NA
 3579259 3579260 YPDSF_3920 YPDSF_3921 pstA   TRUE 0.987 81.000 0.526 0.002 Y NA
 3579260 3579261 YPDSF_3921 YPDSF_3922     TRUE 0.929 88.000 0.317 NA Y NA
 3579261 3579262 YPDSF_3922 YPDSF_3923     FALSE 0.007 296.000 0.000 NA N NA
 3579262 3579263 YPDSF_3923 YPDSF_3924     FALSE 0.017 220.000 0.000 NA N NA
 3579263 3579264 YPDSF_3924 YPDSF_3925     TRUE 0.897 183.000 0.263 0.051 Y NA
 3579264 3579265 YPDSF_3925 YPDSF_3926     TRUE 0.998 2.000 0.282 0.014 Y NA
 3579267 3579268 YPDSF_3928 YPDSF_3929     FALSE 0.010 545.000 0.000 NA   NA
 3579269 3579270 YPDSF_3930 YPDSF_3931   trmE FALSE 0.096 186.000 0.003 1.000   NA
 3579270 3579271 YPDSF_3931 YPDSF_3932 trmE   TRUE 0.798 143.000 0.221 0.061   NA
 3579271 3579272 YPDSF_3932 YPDSF_3933     TRUE 0.992 3.000 0.461 NA   NA
 3579272 3579273 YPDSF_3933 YPDSF_3934   rnpA TRUE 0.978 -36.000 0.540 NA   NA
 3579273 3579274 YPDSF_3934 YPDSF_3935 rnpA rpmH TRUE 0.985 19.000 0.787 1.000   NA
 3579275 3579276 YPDSF_3936 YPDSF_3937     FALSE 0.064 262.000 0.000 NA   NA
 3579276 3579277 YPDSF_3937 YPDSF_3938     FALSE 0.412 60.000 0.000 NA   NA
 3579277 3579278 YPDSF_3938 YPDSF_3939     TRUE 0.907 138.000 0.667 1.000   NA
 3579280 3579281 YPDSF_3941 YPDSF_3942     FALSE 0.005 1173.000 0.000 NA   NA
 3579281 3579282 YPDSF_3942 YPDSF_3943     FALSE 0.189 172.000 0.000 NA   NA
 3579282 3579283 YPDSF_3943 YPDSF_3944     FALSE 0.006 742.000 0.000 NA   NA
 3579283 3579284 YPDSF_3944 YPDSF_3945     FALSE 0.020 396.000 0.000 NA   NA
 3579284 3579285 YPDSF_3945 YPDSF_3946     FALSE 0.052 281.000 0.000 NA   NA
 3579287 3579288 YPDSF_3948 YPDSF_3949     FALSE 0.051 283.000 0.000 NA   NA
 3579289 3579290 YPDSF_3950 YPDSF_3951     FALSE 0.287 112.000 0.000 NA   NA
 3579290 3579291 YPDSF_3951 YPDSF_3952     TRUE 0.498 39.000 0.000 1.000   NA
 3579291 3579292 YPDSF_3952 YPDSF_3953     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3579292 3579293 YPDSF_3953 YPDSF_3954     TRUE 0.682 82.000 0.000 0.014   NA
 3579293 3579294 YPDSF_3954 YPDSF_3955     TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 3579294 3579295 YPDSF_3955 YPDSF_3956     TRUE 0.579 24.000 0.000 1.000   NA
 3579295 3579296 YPDSF_3956 YPDSF_3957     FALSE 0.010 548.000 0.000 1.000   NA
 3579296 3579297 YPDSF_3957 YPDSF_3958     FALSE 0.098 225.000 0.000 1.000   NA
 3579297 3579298 YPDSF_3958 YPDSF_3959     TRUE 0.991 -21.000 0.727 1.000   NA
 3579298 3579299 YPDSF_3959 YPDSF_3960     TRUE 0.998 0.000 0.800 1.000   NA
 3579299 3579300 YPDSF_3960 YPDSF_3961     TRUE 0.992 7.000 0.333 0.011   NA
 3579300 3579301 YPDSF_3961 YPDSF_3962     TRUE 0.996 1.000 0.333 0.006   NA
 3579301 3579302 YPDSF_3962 YPDSF_3963     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.006   NA
 3579302 3579303 YPDSF_3963 YPDSF_3964     TRUE 0.998 2.000 0.556 0.006   NA
 3579303 3579304 YPDSF_3964 YPDSF_3965     TRUE 0.997 1.000 0.417 0.006   NA
 3579304 3579305 YPDSF_3965 YPDSF_3966     TRUE 0.988 -3.000 0.268 NA   NA
 3579305 3579306 YPDSF_3966 YPDSF_3967     TRUE 0.984 -3.000 0.220 NA   NA
 3579306 3579307 YPDSF_3967 YPDSF_3968     TRUE 0.995 6.000 0.750 1.000   NA
 3579307 3579308 YPDSF_3968 YPDSF_3969     FALSE 0.019 403.000 0.000 1.000   NA
 3579308 3579309 YPDSF_3969 YPDSF_3970     FALSE 0.001 1094.000 0.000 1.000 N NA
 3579309 3579310 YPDSF_3970 YPDSF_3971     TRUE 0.999 0.000 0.548 0.061 Y NA
 3579310 3579311 YPDSF_3971 YPDSF_3972     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.061 Y NA
 3579311 3579312 YPDSF_3972 YPDSF_3973     TRUE 0.992 2.000 0.000 0.011 Y NA
 3579312 3579313 YPDSF_3973 YPDSF_3974     TRUE 0.998 -3.000 0.529 1.000 Y NA
 3579313 3579314 YPDSF_3974 YPDSF_3975     TRUE 0.995 -3.000 0.235 0.008   NA
 3579314 3579315 YPDSF_3975 YPDSF_3976     TRUE 0.975 0.000 0.150 NA   NA
 3579315 3579316 YPDSF_3976 YPDSF_3977     TRUE 0.990 -3.000 0.300 NA   NA
 3579317 3579318 YPDSF_3978 YPDSF_3979     TRUE 0.903 -19.000 0.125 NA   NA
 3579318 3579319 YPDSF_3979 YPDSF_3980     TRUE 0.959 -13.000 0.214 NA   NA
 3579319 3579320 YPDSF_3980 YPDSF_3981     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3579320 3579321 YPDSF_3981 YPDSF_3982     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3579321 3579322 YPDSF_3982 YPDSF_3983     TRUE 0.854 -13.000 0.062 1.000   NA
 3579322 3579323 YPDSF_3983 YPDSF_3984     TRUE 0.988 -3.000 0.281 NA   NA
 3579323 3579324 YPDSF_3984 YPDSF_3985     TRUE 0.983 42.000 1.000 NA   NA
 3579324 3579325 YPDSF_3985 YPDSF_3986     TRUE 0.995 2.000 0.556 NA   NA
 3579325 3579326 YPDSF_3986 YPDSF_3987     TRUE 0.980 3.000 0.235 1.000   NA
 3579326 3579327 YPDSF_3987 YPDSF_3988     TRUE 0.987 -22.000 0.632 1.000   NA
 3579327 3579328 YPDSF_3988 YPDSF_3989     TRUE 0.971 19.000 0.526 NA   NA
 3579328 3579329 YPDSF_3989 YPDSF_3990     FALSE 0.010 543.000 0.000 NA   NA
 3579330 3579331 YPDSF_3991 YPDSF_3992     TRUE 0.514 35.000 0.000 NA   NA
 3579331 3579332 YPDSF_3992 YPDSF_3993     TRUE 0.560 26.000 0.000 NA   NA
 3579333 3579334 YPDSF_3994 YPDSF_3995     FALSE 0.288 111.000 0.000 NA   NA
 3579334 3579335 YPDSF_3995 YPDSF_3996     FALSE 0.025 365.000 0.000 NA   NA
 3579338 3579339 YPDSF_3999 YPDSF_4000     FALSE 0.009 565.000 0.000 NA   NA
 3579339 3579340 YPDSF_4000 YPDSF_4001     TRUE 0.984 24.000 0.500 0.006   NA
 3579341 3579342 YPDSF_4002 YPDSF_4003     FALSE 0.097 227.000 0.000 NA   NA
 3579342 3579343 YPDSF_4003 YPDSF_4004     FALSE 0.290 107.000 0.000 1.000   NA
 3579343 3579344 YPDSF_4004 YPDSF_4005     TRUE 0.951 24.000 0.250 0.067   NA
 3579344 3579345 YPDSF_4005 YPDSF_4006     TRUE 0.628 112.000 0.000 0.013   NA
 3579347 3579348 YPDSF_4008 YPDSF_4009     TRUE 0.989 -3.000 0.400 1.000 N NA
 3579350 3579351 YPDSF_4011 YPDSF_4012     TRUE 0.978 -7.000 0.250 NA   NA
 3579355 3579356 YPDSF_4016 YPDSF_4017     TRUE 0.999 0.000 1.000 1.000   NA
 3579356 3579357 YPDSF_4017 YPDSF_4018     FALSE 0.029 344.000 0.000 1.000   NA
 3579358 3579359 YPDSF_4019 YPDSF_4020     TRUE 0.635 78.000 0.000 0.067   NA
 3579359 3579360 YPDSF_4020 YPDSF_4021     FALSE 0.016 1051.000 0.000 0.067   NA
 3579363 3579364 YPDSF_4024 YPDSF_4025     FALSE 0.276 123.000 0.000 NA   NA
 3579366 3579367 YPDSF_4027 YPDSF_4028     FALSE 0.189 172.000 0.000 NA   NA
 3579367 3579275 YPDSF_4028 YPDSF_3936     FALSE 0.350 78.000 0.000 NA   NA
 3579368 3579369 YPDSF_4029 YPDSF_4030     TRUE 0.983 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3579370 3579371 YPDSF_4031 YPDSF_4032     FALSE 0.042 302.000 0.000 NA   NA
 3579371 3579372 YPDSF_4032 YPDSF_4033     FALSE 0.345 81.000 0.000 NA   NA
 3579372 3579373 YPDSF_4033 YPDSF_4034     TRUE 0.639 18.000 0.000 NA   NA
 3579373 3579374 YPDSF_4034 YPDSF_4035     TRUE 0.938 22.000 0.333 NA   NA
 3579374 3579375 YPDSF_4035 YPDSF_4036     TRUE 0.995 -12.000 0.800 NA   NA
 3579375 3579376 YPDSF_4036 YPDSF_4037     TRUE 0.945 32.000 0.444 NA   NA
 3579376 3579377 YPDSF_4037 YPDSF_4038     FALSE 0.324 90.000 0.000 NA   NA
 3579377 3579378 YPDSF_4038 YPDSF_4039     FALSE 0.487 42.000 0.000 NA   NA
 3579378 3579379 YPDSF_4039 YPDSF_4040     TRUE 0.994 8.000 0.750 NA   NA
 3579379 3579380 YPDSF_4040 YPDSF_4041     FALSE 0.283 117.000 0.000 NA   NA
 3579380 3579381 YPDSF_4041 YPDSF_4042     FALSE 0.412 60.000 0.000 NA   NA
 3579381 3579382 YPDSF_4042 YPDSF_4043     TRUE 0.851 75.000 0.333 NA   NA
 3579382 3579383 YPDSF_4043 YPDSF_4044     TRUE 0.996 2.000 0.667 NA   NA
 3579383 3579384 YPDSF_4044 YPDSF_4045     TRUE 0.994 -9.000 0.667 NA   NA
 3579384 3579385 YPDSF_4045 YPDSF_4046     TRUE 0.927 98.000 0.667 NA   NA
 3579385 3579386 YPDSF_4046 YPDSF_4047     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA   NA
 3579386 3579387 YPDSF_4047 YPDSF_4048     TRUE 0.965 44.000 0.667 NA   NA
 3579387 3579388 YPDSF_4048 YPDSF_4049     TRUE 0.548 75.000 0.100 NA   NA
 3579388 3579389 YPDSF_4049 YPDSF_4050     TRUE 0.731 27.000 0.100 NA   NA
 3579389 3579390 YPDSF_4050 YPDSF_4051     TRUE 0.909 23.000 0.250 NA   NA
 3579390 3579391 YPDSF_4051 YPDSF_4052     TRUE 0.952 19.000 0.375 NA   NA
 3579391 3579392 YPDSF_4052 YPDSF_4053     TRUE 0.995 3.000 0.667 1.000   NA
 3579392 3579393 YPDSF_4053 YPDSF_4054     TRUE 0.834 196.000 0.667 NA   NA
 3579393 3579394 YPDSF_4054 YPDSF_4055     TRUE 0.996 10.000 1.000 NA   NA
 3579394 3579395 YPDSF_4055 YPDSF_4056     TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 3579395 3579396 YPDSF_4056 YPDSF_4057     TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 3579396 3579397 YPDSF_4057 YPDSF_4058     TRUE 0.942 -3.000 0.068 1.000   NA
 3579397 3579398 YPDSF_4058 YPDSF_4059     TRUE 0.997 0.000 0.222 0.067 Y NA
 3579399 3579400 YPDSF_4060 YPDSF_4061     TRUE 0.968 3.000 0.167 NA   NA
 3579400 3579401 YPDSF_4061 YPDSF_4062     TRUE 0.702 60.000 0.143 NA   NA
 3579401 3579402 YPDSF_4062 YPDSF_4063     TRUE 0.954 5.000 0.143 NA   NA
 3579402 3579403 YPDSF_4063 YPDSF_4064     FALSE 0.035 324.000 0.000 NA   NA
 3579403 3579404 YPDSF_4064 YPDSF_4151     TRUE 0.936 85.000 0.667 NA   NA
 3579404 3579405 YPDSF_4151 YPDSF_4065     FALSE 0.098 226.000 0.000 NA   NA
 3579406 3579407 YPDSF_4066 YPDSF_4067     FALSE 0.128 206.000 0.000 NA   NA
 3579407 3579408 YPDSF_4067 YPDSF_4068     FALSE 0.140 200.000 0.000 NA   NA
 3579408 3579409 YPDSF_4068 YPDSF_4069     FALSE 0.084 239.000 0.000 1.000   NA
 3579409 3579410 YPDSF_4069 YPDSF_4070   nrdB FALSE 0.126 199.000 0.034 1.000   NA
 3579410 3579411 YPDSF_4070 YPDSF_4071 nrdB   TRUE 0.982 108.000 0.500 0.002 Y NA
 3579411 3579412 YPDSF_4071 YPDSF_4072     FALSE 0.227 78.000 0.002 1.000   NA
 3579412 3579413 YPDSF_4072 YPDSF_4150     TRUE 0.599 13.000 0.002 NA   NA
 3579413 3579414 YPDSF_4150 YPDSF_4073     TRUE 0.985 -10.000 0.400 NA   NA
 3579414 3579415 YPDSF_4073 YPDSF_4074     FALSE 0.093 230.000 0.000 1.000   NA
 3579419 3579420 YPDSF_4078 YPDSF_4079     TRUE 0.997 0.000 0.667 NA   NA
 3579420 3579421 YPDSF_4079 YPDSF_4152     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3579421 3579422 YPDSF_4152 YPDSF_4080     TRUE 0.984 41.000 1.000 NA   NA
 3579422 3579423 YPDSF_4080 YPDSF_4081     TRUE 0.974 68.000 1.000 NA   NA
 3579423 3579424 YPDSF_4081 YPDSF_4082     TRUE 0.991 -16.000 0.667 NA   NA
 3579424 3579425 YPDSF_4082 YPDSF_4083     TRUE 0.895 154.000 0.667 NA   NA
 3579425 3579426 YPDSF_4083 YPDSF_4153     TRUE 0.995 4.000 0.667 NA   NA
 3579426 3579427 YPDSF_4153 YPDSF_4084     FALSE 0.206 91.000 0.002 NA   NA
 3579427 3579428 YPDSF_4084 YPDSF_4085     TRUE 0.883 3.000 0.000 NA   NA
 3579428 3579429 YPDSF_4085 YPDSF_4086     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3579429 3579430 YPDSF_4086 YPDSF_4087     FALSE 0.372 61.000 0.033 NA   NA
 3579430 3579431 YPDSF_4087 YPDSF_4088     TRUE 0.960 120.000 1.000 NA   NA
 3579433 3579434 YPDSF_4090 YPDSF_4091     TRUE 0.875 -3.000 0.016 NA   NA
 3579434 3579435 YPDSF_4091 YPDSF_4092     FALSE 0.119 181.000 0.016 1.000   NA
 3579435 3579436 YPDSF_4092 YPDSF_4093     TRUE 0.928 97.000 0.667 NA   NA
 3579436 3579437 YPDSF_4093 YPDSF_4094     TRUE 0.923 110.000 0.667 NA   NA
 3579439 3579440 YPDSF_4095 YPDSF_4154     FALSE 0.006 758.000 0.000 NA   NA
 3579440 3579441 YPDSF_4154 YPDSF_4097     TRUE 0.970 81.000 1.000 NA   NA
 3579441 3579442 YPDSF_4097 YPDSF_4098     TRUE 0.990 25.000 0.667 1.000 Y NA
 3579444 3579445 YPDSF_4099 YPDSF_4100     FALSE 0.238 146.000 0.000 NA   NA
 3579445 3579446 YPDSF_4100 YPDSF_4101     FALSE 0.212 160.000 0.000 NA   NA
 3579446 3579447 YPDSF_4101 YPDSF_4102     FALSE 0.413 35.000 0.017 NA   NA
 3579447 3579448 YPDSF_4102 YPDSF_4103     FALSE 0.342 82.000 0.000 NA   NA
 3579449 3579450 YPDSF_4156 YPDSF_4104     TRUE 0.518 34.000 0.000 NA   NA
 3579451 3579452 YPDSF_4105 YPDSF_4106     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3579452 3579453 YPDSF_4106 YPDSF_4107     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3579453 3579454 YPDSF_4107 YPDSF_4108     TRUE 0.833 -10.000 0.000 NA   NA
 3579454 3579455 YPDSF_4108 YPDSF_4109     TRUE 0.652 17.000 0.000 NA   NA
 3579455 3579456 YPDSF_4109 YPDSF_4110     FALSE 0.072 251.000 0.000 NA   NA
 3579456 3579457 YPDSF_4110 YPDSF_4111     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3579457 3579458 YPDSF_4111 YPDSF_4112     TRUE 0.592 -124.000 0.000 NA   NA
 3579458 3579459 YPDSF_4112 YPDSF_4113     FALSE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 3579459 3579460 YPDSF_4113 YPDSF_4114     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 3579460 3579461 YPDSF_4114 YPDSF_4115     TRUE 0.915 -3.000 0.000 NA   NA
 3579461 3579462 YPDSF_4115 YPDSF_4116     TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 3579462 3579463 YPDSF_4116 YPDSF_4117     FALSE 0.005 911.000 0.000 NA   NA
 3579463 3579464 YPDSF_4117 YPDSF_4118     TRUE 0.596 22.000 0.000 NA   NA
 3579464 3579465 YPDSF_4118 YPDSF_4119     TRUE 0.807 -13.000 0.000 1.000   NA
 3579465 3579466 YPDSF_4119 YPDSF_4120     TRUE 0.959 -13.000 0.000 0.002   NA
 3579466 3579467 YPDSF_4120 YPDSF_4121     TRUE 0.926 15.000 0.000 0.002   NA
 3579467 3579468 YPDSF_4121 YPDSF_4122     TRUE 0.626 151.000 0.000 0.002   NA
 3579468 3579469 YPDSF_4122 YPDSF_4123     FALSE 0.122 210.000 0.000 1.000   NA
 3579470 3579471 YPDSF_4124 YPDSF_4125     TRUE 0.984 0.000 0.000 0.002   NA
 3579471 3579472 YPDSF_4125 YPDSF_4126     TRUE 0.989 2.000 0.333 NA   NA
 3579472 3579473 YPDSF_4126 YPDSF_4127     TRUE 0.948 67.000 0.667 NA   NA
 3579473 3579474 YPDSF_4127 YPDSF_4128     TRUE 0.863 -7.000 0.000 1.000   NA
 3579474 3579475 YPDSF_4128 YPDSF_4129     FALSE 0.234 148.000 0.000 1.000   NA
 3579475 3579476 YPDSF_4129 YPDSF_4130     FALSE 0.018 410.000 0.000 1.000   NA
 3579476 3579477 YPDSF_4130 YPDSF_4131     FALSE 0.005 1207.000 0.000 1.000   NA
 3579479 3579480 YPDSF_4157 YPDSF_4133     FALSE 0.008 607.000 0.000 NA   NA
 3579481 3579482 YPDSF_4134 YPDSF_4135     TRUE 0.680 78.000 0.000 0.018   NA
 3579484 3579485 YPDSF_4137 YPDSF_4138     FALSE 0.386 66.000 0.000 NA   NA
 3579485 3579486 YPDSF_4138 YPDSF_4139     FALSE 0.011 526.000 0.000 NA   NA
 3579487 3579488 YPDSF_4140 YPDSF_4141     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000 N NA
 3579492 3579493 YPDSF_4143 YPDSF_4144     TRUE 0.997 0.000 0.667 NA   NA
 3579493 3579494 YPDSF_4144 YPDSF_4145     TRUE 0.990 11.000 0.667 NA   NA
 3579494 3579495 YPDSF_4145 YPDSF_4146     TRUE 0.958 54.000 0.667 NA   NA
 3579495 3579496 YPDSF_4146 YPDSF_4147     FALSE 0.019 399.000 0.000 NA   NA
 3579496 3579497 YPDSF_4147 YPDSF_4148     FALSE 0.006 713.000 0.000 NA   NA
 3579497 3579498 YPDSF_4148 YPDSF_4149     FALSE 0.362 73.000 0.000 NA   NA
 3579498 3579368 YPDSF_4149 YPDSF_4029     FALSE 0.393 124.000 0.000 0.066 N NA