MicrobesOnline Operon Predictions for Burkholderia phymatum STM815

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7084862 7084863 Bphy_0001 Bphy_0002 dnaA   FALSE 0.369 257.000 0.328 1.000 Y NA
 7084863 7084864 Bphy_0002 Bphy_0003   gyrB TRUE 0.840 114.000 0.114 1.000 Y NA
 7084865 7084866 Bphy_0004 Bphy_0005     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7084867 7084868 Bphy_0006 Bphy_0007     TRUE 0.950 82.000 0.407 1.000 Y NA
 7084868 7084869 Bphy_0007 Bphy_0008     TRUE 0.999 -3.000 0.859 0.000 Y NA
 7084870 7084871 Bphy_0009 Bphy_0010     FALSE 0.469 80.000 0.014 NA   NA
 7084872 7084873 Bphy_0011 Bphy_0012     FALSE 0.003 437.000 0.000 NA   NA
 7084873 7084874 Bphy_0012 Bphy_0013     TRUE 0.883 15.000 0.053 NA   NA
 7084874 7084875 Bphy_0013 Bphy_0014     FALSE 0.006 327.000 0.000 1.000 N NA
 7084875 7084876 Bphy_0014 Bphy_0015     TRUE 0.725 15.000 0.000 1.000   NA
 7084876 7084877 Bphy_0015 Bphy_0016     TRUE 0.562 34.000 0.000 1.000   NA
 7084877 7084878 Bphy_0016 Bphy_0017     FALSE 0.081 161.000 0.000 NA   NA
 7084878 7084879 Bphy_0017 Bphy_0018     TRUE 0.582 119.000 0.143 NA   NA
 7084879 7084880 Bphy_0018 Bphy_0019     TRUE 0.998 -3.000 0.619 NA Y NA
 7084880 7084881 Bphy_0019 Bphy_0020     FALSE 0.065 172.000 0.000 NA   NA
 7084881 7084882 Bphy_0020 Bphy_0021     FALSE 0.008 303.000 0.000 NA   NA
 7084882 7084883 Bphy_0021 Bphy_0022     FALSE 0.004 391.000 0.000 NA   NA
 7084883 7084884 Bphy_0022 Bphy_0023     TRUE 0.962 39.000 1.000 NA   NA
 7084884 7084885 Bphy_0023 Bphy_0024     FALSE 0.516 34.000 0.000 NA   NA
 7084885 7084886 Bphy_0024 Bphy_0025     FALSE 0.007 317.000 0.000 NA   NA
 7084886 7084887 Bphy_0025 Bphy_0026     TRUE 0.631 20.000 0.000 NA   NA
 7084889 7084890 Bphy_0027 Bphy_0028     TRUE 0.907 52.000 0.486 NA   NA
 7084892 7084893 Bphy_0030 Bphy_0031     FALSE 0.004 332.000 0.000 NA N NA
 7084894 7084895 Bphy_0032 Bphy_0033     FALSE 0.090 238.000 0.087 1.000   NA
 7084895 7084896 Bphy_0033 Bphy_0034     TRUE 0.612 55.000 0.022 1.000   NA
 7084897 7084898 Bphy_0035 Bphy_0036 def fmt TRUE 0.978 26.000 0.105 0.013 Y NA
 7084898 7084899 Bphy_0036 Bphy_0037 fmt   FALSE 0.364 100.000 0.012 1.000 N NA
 7084899 7084900 Bphy_0037 Bphy_0038     FALSE 0.494 104.000 0.062 1.000 N NA
 7084900 7084901 Bphy_0038 Bphy_0039     FALSE 0.040 283.000 0.075 1.000 N NA
 7084901 7084902 Bphy_0039 Bphy_0040     TRUE 0.980 -3.000 0.094 NA   NA
 7084902 7084903 Bphy_0040 Bphy_0041     TRUE 0.993 2.000 0.810 NA   NA
 7084903 7084904 Bphy_0041 Bphy_0042     TRUE 0.992 1.000 0.605 1.000   NA
 7084904 7084905 Bphy_0042 Bphy_R0021     FALSE 0.264 87.000 0.000 NA   NA
 7084905 7084906 Bphy_R0021 Bphy_0043     FALSE 0.004 378.000 0.000 NA   NA
 7084906 7084907 Bphy_0043 Bphy_0044     TRUE 0.832 70.000 0.270 1.000   NA
 7084907 7084908 Bphy_0044 Bphy_0045     TRUE 0.960 7.000 0.139 1.000 N NA
 7084908 7084909 Bphy_0045 Bphy_0046     FALSE 0.043 188.000 0.000 1.000 N NA
 7084909 7084910 Bphy_0046 Bphy_0047     TRUE 0.993 -3.000 0.417 1.000   NA
 7084911 7084912 Bphy_0048 Bphy_0049     TRUE 0.922 11.000 0.073 1.000 N NA
 7084912 7084913 Bphy_0049 Bphy_0050     TRUE 0.819 122.000 0.108 1.000 Y NA
 7084913 7084914 Bphy_0050 Bphy_0051     TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.001 Y NA
 7084914 7084915 Bphy_0051 Bphy_0052     TRUE 0.816 119.000 0.689 1.000 N NA
 7084916 7084917 Bphy_0053 Bphy_0054 gatC gatA TRUE 0.916 154.000 0.643 0.001 Y NA
 7084917 7084918 Bphy_0054 Bphy_0055 gatA gatB TRUE 0.998 2.000 0.492 0.001 Y NA
 7084918 7084919 Bphy_0055 Bphy_0056 gatB   FALSE 0.265 135.000 0.016 NA   NA
 7084919 7084920 Bphy_0056 Bphy_0057     TRUE 0.663 43.000 0.024 NA   NA
 7084921 7084922 Bphy_0058 Bphy_0059     TRUE 0.962 0.000 0.054 NA   NA
 7084922 7084923 Bphy_0059 Bphy_0060     TRUE 0.915 14.000 0.087 NA   NA
 7084923 7084924 Bphy_0060 Bphy_0061   metX TRUE 0.994 -3.000 0.509 NA   NA
 7084924 7084925 Bphy_0061 Bphy_0062 metX slmA FALSE 0.031 244.000 0.006 1.000 N NA
 7084925 7084926 Bphy_0062 Bphy_0063 slmA   TRUE 0.856 37.000 0.122 1.000   NA
 7084926 7084927 Bphy_0063 Bphy_0064     FALSE 0.144 200.000 0.069 1.000   NA
 7084930 7084931 Bphy_0067 Bphy_0068     TRUE 0.999 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 7084932 7084933 Bphy_0069 Bphy_0070 hslU   TRUE 0.996 10.000 0.752 1.000 Y NA
 7084933 7084934 Bphy_0070 Bphy_0071     FALSE 0.008 374.000 0.011 1.000 N NA
 7084934 7084935 Bphy_0071 Bphy_0072     FALSE 0.006 615.000 0.045 NA   NA
 7084935 7084936 Bphy_0072 Bphy_0073     FALSE 0.286 166.000 0.094 NA   NA
 7084936 7084937 Bphy_0073 Bphy_0074   xerC TRUE 0.682 86.000 0.110 1.000   NA
 7084937 7084938 Bphy_0074 Bphy_0075 xerC   TRUE 0.985 11.000 0.714 NA   NA
 7084938 7084939 Bphy_0075 Bphy_0076   dapF TRUE 0.728 87.000 0.175 NA   NA
 7084939 7084940 Bphy_0076 Bphy_0077 dapF   FALSE 0.526 55.000 0.010 1.000 N NA
 7084946 7084947 Bphy_0083 Bphy_0084     FALSE 0.012 270.000 0.000 NA   NA
 7084947 7084948 Bphy_0084 Bphy_0085     TRUE 0.861 -34.000 0.000 NA   NA
 7084949 7084950 Bphy_0086 Bphy_0087     FALSE 0.392 126.000 0.053 NA   NA
 7084950 7084951 Bphy_0087 Bphy_0088     FALSE 0.008 303.000 0.000 NA   NA
 7084952 7084953 Bphy_0089 Bphy_0090     TRUE 0.980 -27.000 0.188 NA   NA
 7084953 7084954 Bphy_0090 Bphy_0091     TRUE 0.984 -9.000 0.184 NA   NA
 7084954 7084955 Bphy_0091 Bphy_0092     TRUE 0.988 6.000 0.645 NA   NA
 7084955 7084956 Bphy_0092 Bphy_0093     FALSE 0.521 134.000 0.133 1.000   NA
 7084956 7084957 Bphy_0093 Bphy_0094     TRUE 0.989 13.000 0.175 0.075 Y NA
 7084957 7084958 Bphy_0094 Bphy_0095     TRUE 0.995 12.000 0.512 0.075 Y NA
 7084958 7084959 Bphy_0095 Bphy_0096     FALSE 0.003 385.000 0.000 1.000 N NA
 7084959 7084960 Bphy_0096 Bphy_0097     FALSE 0.380 138.000 0.075 1.000 N NA
 7084960 7084961 Bphy_0097 Bphy_0098     TRUE 0.961 62.000 0.238 0.031 Y NA
 7084961 7084962 Bphy_0098 Bphy_0099     FALSE 0.002 547.000 0.000 1.000 N NA
 7084962 7084963 Bphy_0099 Bphy_0100     FALSE 0.002 521.000 0.000 1.000 N NA
 7084965 7084966 Bphy_0102 Bphy_0103     TRUE 0.973 29.000 1.000 NA   NA
 7084967 7084968 Bphy_0104 Bphy_0105     FALSE 0.021 231.000 0.000 NA   NA
 7084968 7084969 Bphy_0105 Bphy_0106     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 7084969 7084970 Bphy_0106 Bphy_0107     FALSE 0.078 203.000 0.012 1.000   NA
 7084970 7084971 Bphy_0107 Bphy_0108     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7084971 7084972 Bphy_0108 Bphy_0109     TRUE 0.859 -58.000 0.000 NA   NA
 7084973 7084974 Bphy_0110 Bphy_0111     FALSE 0.371 137.000 0.069 1.000 N NA
 7084975 7084976 Bphy_0112 Bphy_0113     FALSE 0.308 164.000 0.105 NA   NA
 7084978 7084979 Bphy_0115 Bphy_0116     FALSE 0.006 359.000 0.000 1.000   NA
 7084979 7084980 Bphy_0116 Bphy_0117     FALSE 0.019 248.000 0.000 1.000   NA
 7084981 7084982 Bphy_0118 Bphy_0119     TRUE 0.798 104.000 0.395 1.000   NA
 7084982 7084983 Bphy_0119 Bphy_0120     TRUE 0.972 -3.000 0.044 1.000   NA
 7084986 7084987 Bphy_0123 Bphy_0124     FALSE 0.153 226.000 0.187 1.000 N NA
 7084987 7084988 Bphy_0124 Bphy_0125     TRUE 0.969 21.000 0.613 NA   NA
 7084988 7084989 Bphy_0125 Bphy_0126     TRUE 0.972 -3.000 0.054 NA   NA
 7084989 7084990 Bphy_0126 Bphy_R0022     FALSE 0.362 56.000 0.000 NA   NA
 7084990 7084991 Bphy_R0022 Bphy_0127     FALSE 0.071 169.000 0.000 NA   NA
 7084991 7084992 Bphy_0127 Bphy_0128     TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 7084992 7084993 Bphy_0128 Bphy_0129     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 7084993 7084994 Bphy_0129 Bphy_0130     TRUE 0.993 10.000 0.361 NA Y NA
 7084994 7084995 Bphy_0130 Bphy_0131     TRUE 0.988 20.000 0.454 NA Y NA
 7084995 7084996 Bphy_0131 Bphy_0132     TRUE 0.994 -15.000 0.125 NA Y NA
 7084996 7084997 Bphy_0132 Bphy_0133     TRUE 0.895 87.000 0.125 1.000 Y NA
 7084997 7084998 Bphy_0133 Bphy_0134     TRUE 0.997 -3.000 0.083 0.016 Y NA
 7084998 7084999 Bphy_0134 Bphy_0135     TRUE 0.729 124.000 0.000 0.016 Y NA
 7084999 7085000 Bphy_0135 Bphy_0136     FALSE 0.223 100.000 0.000 NA   NA
 7085000 7085001 Bphy_0136 Bphy_0137     FALSE 0.006 342.000 0.000 NA   NA
 7085001 7085002 Bphy_0137 Bphy_0138     FALSE 0.249 175.000 0.105 1.000 N NA
 7085004 7085005 Bphy_0140 Bphy_0141     TRUE 0.617 45.000 0.028 NA N NA
 7085006 7085007 Bphy_0142 Bphy_0143     FALSE 0.445 42.000 0.000 NA   NA
 7085009 7085010 Bphy_0145 Bphy_0146     FALSE 0.365 147.000 0.087 NA   NA
 7085010 7085011 Bphy_0146 Bphy_0147     TRUE 0.704 104.000 0.214 NA   NA
 7085011 7085012 Bphy_0147 Bphy_0148     FALSE 0.545 142.000 0.214 NA   NA
 7085012 7085013 Bphy_0148 Bphy_0149     TRUE 0.961 19.000 0.026 1.000 Y NA
 7085013 7085014 Bphy_0149 Bphy_0150     TRUE 0.983 -3.000 0.128 1.000 N NA
 7085014 7085015 Bphy_0150 Bphy_0151     FALSE 0.016 398.000 0.088 1.000 N NA
 7085015 7085016 Bphy_0151 Bphy_0152     FALSE 0.040 277.000 0.056 1.000   NA
 7085017 7085018 Bphy_0153 Bphy_0154     FALSE 0.002 530.000 0.000 NA   NA
 7085018 7085019 Bphy_0154 Bphy_0155     TRUE 0.568 166.000 0.560 NA N NA
 7085019 7085020 Bphy_0155 Bphy_0156     FALSE 0.273 128.000 0.023 NA N NA
 7085025 7085026 Bphy_0161 Bphy_0162     TRUE 0.970 -3.000 0.035 1.000   NA
 7085026 7085027 Bphy_0162 Bphy_0163     TRUE 0.965 -3.000 0.032 NA   NA
 7085027 7085028 Bphy_0163 Bphy_0164     TRUE 0.973 -3.000 0.055 NA   NA
 7085028 7085029 Bphy_0164 Bphy_0165     TRUE 0.901 22.000 0.119 NA   NA
 7085029 7085030 Bphy_0165 Bphy_0166     TRUE 0.863 117.000 0.176 1.000 Y NA
 7085034 7085035 Bphy_0170 Bphy_0171   bioD TRUE 0.955 37.000 0.025 0.001 Y NA
 7085035 7085036 Bphy_0171 Bphy_0172 bioD   TRUE 0.997 -3.000 0.121 0.001 Y NA
 7085036 7085037 Bphy_0172 Bphy_0173     TRUE 0.995 0.000 0.054 0.001 Y NA
 7085037 7085038 Bphy_0173 Bphy_0174     FALSE 0.002 574.000 0.000 1.000 N NA
 7085038 7085039 Bphy_0174 Bphy_0175     FALSE 0.008 563.000 0.075 NA   NA
 7085039 7085040 Bphy_0175 Bphy_0176     TRUE 0.826 19.000 0.027 NA   NA
 7085040 7085041 Bphy_0176 Bphy_0177     TRUE 0.954 37.000 0.107 1.000 Y NA
 7085041 7085042 Bphy_0177 Bphy_0178     TRUE 0.922 49.000 0.070 1.000 Y NA
 7085042 7085043 Bphy_0178 Bphy_0179     TRUE 0.974 -7.000 0.087 1.000 N NA
 7085043 7085044 Bphy_0179 Bphy_0180   aceK TRUE 0.778 61.000 0.158 1.000 N NA
 7085044 7085045 Bphy_0180 Bphy_0181 aceK   FALSE 0.053 224.000 0.022 1.000 N NA
 7085047 7085048 Bphy_0183 Bphy_0184     FALSE 0.026 214.000 0.000 1.000 N NA
 7085048 7085049 Bphy_0184 Bphy_0185     TRUE 0.970 4.000 0.135 1.000   NA
 7085049 7085050 Bphy_0185 Bphy_0186     TRUE 0.966 19.000 0.434 1.000   NA
 7085050 7085051 Bphy_0186 Bphy_0187     TRUE 0.632 154.000 0.573 NA N NA
 7085051 7085052 Bphy_0187 Bphy_0188   argS FALSE 0.478 101.000 0.062 NA N NA
 7085054 7085055 Bphy_0190 Bphy_0191     TRUE 0.929 62.000 0.041 0.000 Y NA
 7085055 7085056 Bphy_0191 Bphy_0192     FALSE 0.060 316.000 0.216 NA   NA
 7085056 7085057 Bphy_0192 Bphy_0193     FALSE 0.495 118.000 0.081 NA   NA
 7085057 7085058 Bphy_0193 Bphy_0194     FALSE 0.256 217.000 0.348 NA   NA
 7085058 7085059 Bphy_0194 Bphy_0195     TRUE 0.678 126.000 0.304 NA   NA
 7085060 7085061 Bphy_0196 Bphy_0197     FALSE 0.071 200.000 0.022 NA N NA
 7085061 7085062 Bphy_0197 Bphy_0198     TRUE 0.656 82.000 0.111 NA N NA
 7085062 7085063 Bphy_0198 Bphy_0199     FALSE 0.471 177.000 0.413 NA   NA
 7085063 7085064 Bphy_0199 Bphy_0200     FALSE 0.002 560.000 0.000 NA   NA
 7085064 7085065 Bphy_0200 Bphy_0201     FALSE 0.188 125.000 0.000 1.000   NA
 7085066 7085067 Bphy_0202 Bphy_0203     TRUE 0.659 40.000 0.015 NA   NA
 7085067 7085068 Bphy_0203 Bphy_0204     TRUE 0.985 -3.000 0.147 1.000 N NA
 7085069 7085070 Bphy_0205 Bphy_0206     TRUE 0.999 -3.000 0.922 NA Y NA
 7085070 7085071 Bphy_0206 Bphy_0207     TRUE 0.907 142.000 0.750 NA Y NA
 7085071 7085072 Bphy_0207 Bphy_0208     TRUE 0.944 19.000 0.239 NA   NA
 7085072 7085073 Bphy_0208 Bphy_0209     TRUE 0.859 31.000 0.103 NA   NA
 7085073 7085074 Bphy_0209 Bphy_0210     TRUE 0.593 146.000 0.320 NA   NA
 7085074 7085075 Bphy_0210 Bphy_0211     TRUE 0.921 23.000 0.179 NA   NA
 7085075 7085076 Bphy_0211 Bphy_0212     FALSE 0.018 379.000 0.079 NA   NA
 7085076 7085077 Bphy_0212 Bphy_0213     FALSE 0.486 99.000 0.047 NA   NA
 7085079 7085080 Bphy_0215 Bphy_0216   lipB FALSE 0.534 73.000 0.028 NA   NA
 7085080 7085081 Bphy_0216 Bphy_0217 lipB   TRUE 0.993 14.000 0.319 0.001 Y NA
 7085081 7085082 Bphy_0217 Bphy_0218     FALSE 0.018 233.000 0.000 1.000 N NA
 7085084 7085085 Bphy_0220 Bphy_0221 ugpQ   FALSE 0.537 91.000 0.059 1.000 N NA
 7085085 7085086 Bphy_0221 Bphy_0222     TRUE 0.800 109.000 0.301 0.084   NA
 7085086 7085087 Bphy_0222 Bphy_0223     TRUE 0.997 -3.000 0.774 0.084   NA
 7085087 7085088 Bphy_0223 Bphy_0224     TRUE 0.989 21.000 0.461 1.000 Y NA
 7085088 7085089 Bphy_0224 Bphy_0225     FALSE 0.003 410.000 0.000 1.000 N NA
 7085089 7085090 Bphy_0225 Bphy_0226     TRUE 0.966 4.000 0.130 1.000 N NA
 7085090 7085091 Bphy_0226 Bphy_0227     TRUE 0.974 30.000 0.130 0.100 Y NA
 7085095 7085096 Bphy_0231 Bphy_0232     TRUE 0.994 -22.000 0.600 0.072   NA
 7085096 7085097 Bphy_0232 Bphy_0233     TRUE 0.884 -10.000 0.000 NA   NA
 7085097 7085098 Bphy_0233 Bphy_0234     TRUE 0.796 7.000 0.000 NA   NA
 7085100 7085101 Bphy_0236 Bphy_0237     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7085102 7085103 Bphy_0238 Bphy_0239     TRUE 0.892 -7.000 0.000 NA   NA
 7085103 7085104 Bphy_0239 Bphy_0240     TRUE 0.924 3.000 0.000 0.100   NA
 7085104 7085105 Bphy_0240 Bphy_0241     FALSE 0.014 273.000 0.000 1.000   NA
 7085106 7085107 Bphy_0242 Bphy_0243     FALSE 0.003 406.000 0.000 NA   NA
 7085109 7085110 Bphy_0244 Bphy_0245     TRUE 0.971 8.000 0.222 NA   NA
 7085110 7085111 Bphy_0245 Bphy_0246     TRUE 0.996 -7.000 1.000 NA   NA
 7085112 7085113 Bphy_0247 Bphy_0248     FALSE 0.002 549.000 0.000 NA   NA
 7085114 7085115 Bphy_0249 Bphy_0250     FALSE 0.138 135.000 0.000 NA   NA
 7085115 7085116 Bphy_0250 Bphy_0251     FALSE 0.003 425.000 0.000 NA   NA
 7085119 7085120 Bphy_0254 Bphy_0255     FALSE 0.220 101.000 0.000 NA   NA
 7085121 7085122 Bphy_0256 Bphy_0257     TRUE 0.911 27.000 0.189 1.000 N NA
 7085122 7085123 Bphy_0257 Bphy_0258     FALSE 0.017 254.000 0.000 1.000   NA
 7085123 7085124 Bphy_0258 Bphy_0259     FALSE 0.226 190.000 0.120 1.000   NA
 7085124 7085125 Bphy_0259 Bphy_0260     FALSE 0.031 281.000 0.048 1.000 N NA
 7085125 7085126 Bphy_0260 Bphy_0261     TRUE 0.967 62.000 0.261 0.002 Y NA
 7085126 7085127 Bphy_0261 Bphy_0262     TRUE 0.567 220.000 0.205 0.001 Y NA
 7085128 7085129 Bphy_0263 Bphy_0264     FALSE 0.365 143.000 0.082 1.000 N NA
 7085132 7085133 Bphy_0267 Bphy_0268     TRUE 0.961 12.000 0.269 NA N NA
 7085133 7085134 Bphy_0268 Bphy_0269     FALSE 0.269 194.000 0.221 1.000 N NA
 7085134 7085135 Bphy_0269 Bphy_0270   gpsA TRUE 0.883 22.000 0.097 1.000 N NA
 7085135 7085136 Bphy_0270 Bphy_0271 gpsA   FALSE 0.386 154.000 0.127 NA   NA
 7085137 7085138 Bphy_0272 Bphy_0273     TRUE 0.868 18.000 0.045 1.000   NA
 7085139 7085140 Bphy_0274 Bphy_0275     FALSE 0.027 271.000 0.018 NA   NA
 7085140 7085141 Bphy_0275 Bphy_0276     TRUE 0.734 57.000 0.095 NA   NA
 7085141 7085142 Bphy_0276 Bphy_0277     TRUE 0.987 46.000 0.741 0.003 Y NA
 7085142 7085143 Bphy_0277 Bphy_0278     FALSE 0.515 98.000 0.057 NA   NA
 7085143 7085144 Bphy_0278 Bphy_0279     TRUE 0.659 53.000 0.046 NA   NA
 7085144 7085145 Bphy_0279 Bphy_0280     TRUE 0.840 40.000 0.129 NA   NA
 7085145 7085146 Bphy_0280 Bphy_0281     FALSE 0.393 158.000 0.152 NA   NA
 7085148 7085149 Bphy_0283 Bphy_0284     TRUE 0.920 61.000 0.722 NA   NA
 7085149 7085150 Bphy_0284 Bphy_0285     TRUE 0.868 52.000 0.255 1.000   NA
 7085150 7085151 Bphy_0285 Bphy_0286     TRUE 0.994 6.000 0.321 1.000 Y NA
 7085151 7085152 Bphy_0286 Bphy_0287     TRUE 0.919 5.000 0.017 1.000   NA
 7085154 7085155 Bphy_0289 Bphy_0290     FALSE 0.012 246.000 0.000 NA N NA
 7085157 7085158 Bphy_0292 Bphy_0293     TRUE 0.616 80.000 0.073 1.000 N NA
 7085158 7085159 Bphy_0293 Bphy_0294     TRUE 0.970 -7.000 0.073 1.000 N NA
 7085159 7085160 Bphy_0294 Bphy_0295     TRUE 0.918 14.000 0.100 1.000 N NA
 7085160 7085161 Bphy_0295 Bphy_0296     TRUE 0.935 109.000 0.258 0.001 Y NA
 7085162 7085163 Bphy_0297 Bphy_0298     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7085163 7085164 Bphy_0298 Bphy_0299     TRUE 0.979 27.000 0.158 0.074 Y NA
 7085164 7085165 Bphy_0299 Bphy_0300     TRUE 0.984 -10.000 0.188 NA   NA
 7085165 7085166 Bphy_0300 Bphy_0301     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA   NA
 7085167 7085168 Bphy_0302 Bphy_0303     TRUE 0.821 46.000 0.143 NA   NA
 7085169 7085170 Bphy_0304 Bphy_0305     FALSE 0.019 520.000 0.000 1.000 Y NA
 7085171 7085172 Bphy_0306 Bphy_0307     TRUE 0.716 35.000 0.027 1.000 N NA
 7085174 7085175 Bphy_0309 Bphy_0310   coaD TRUE 0.731 118.000 0.367 1.000 N NA
 7085175 7085176 Bphy_0310 Bphy_0311 coaD   FALSE 0.368 147.000 0.088 NA   NA
 7085177 7085178 Bphy_0312 Bphy_0313     TRUE 0.641 40.000 0.014 1.000 N NA
 7085178 7085179 Bphy_0313 Bphy_0314     TRUE 0.942 121.000 0.496 0.013 Y NA
 7085179 7085180 Bphy_0314 Bphy_0315     FALSE 0.352 157.000 0.122 1.000 N NA
 7085180 7085181 Bphy_0315 Bphy_R0024     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7085181 7085182 Bphy_R0024 Bphy_0316   ipk FALSE 0.382 52.000 0.000 NA   NA
 7085182 7085183 Bphy_0316 Bphy_0317 ipk lolB TRUE 0.899 27.000 0.157 1.000 N NA
 7085183 7085184 Bphy_0317 Bphy_0318 lolB   TRUE 0.978 0.000 0.139 1.000 N NA
 7085185 7085186 Bphy_0319 Bphy_0320     TRUE 0.987 8.000 0.021 0.002 Y NA
 7085187 7085188 Bphy_0321 Bphy_0322     TRUE 0.631 60.000 0.047 NA   NA
 7085188 7085189 Bphy_0322 Bphy_0323     TRUE 0.769 78.000 0.194 NA   NA
 7085189 7085190 Bphy_0323 Bphy_0324     FALSE 0.371 235.000 0.177 1.000 Y NA
 7085190 7085191 Bphy_0324 Bphy_0325     FALSE 0.140 250.000 0.309 NA N NA
 7085191 7085192 Bphy_0325 Bphy_0326     FALSE 0.524 174.000 0.574 NA N NA
 7085192 7085193 Bphy_0326 Bphy_0327     FALSE 0.096 228.000 0.075 1.000   NA
 7085193 7085194 Bphy_0327 Bphy_0328     TRUE 0.994 -3.000 0.543 NA   NA
 7085194 7085195 Bphy_0328 Bphy_0329     TRUE 0.944 33.000 0.459 NA   NA
 7085195 7085196 Bphy_0329 Bphy_0330     TRUE 0.995 -3.000 0.617 NA   NA
 7085196 7085197 Bphy_0330 Bphy_0331     TRUE 0.993 0.000 0.598 1.000   NA
 7085198 7085199 Bphy_0332 Bphy_0333     FALSE 0.305 125.000 0.022 1.000 N NA
 7085199 7085200 Bphy_0333 Bphy_0334     TRUE 0.758 26.000 0.022 1.000 N NA
 7085200 7085201 Bphy_0334 Bphy_0335     TRUE 0.786 55.000 0.124 1.000   NA
 7085201 7085202 Bphy_0335 Bphy_0336   purU TRUE 0.926 74.000 0.955 1.000   NA
 7085203 7085204 Bphy_0337 Bphy_0338     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 7085204 7085205 Bphy_0338 Bphy_0339     TRUE 0.752 23.000 0.007 NA   NA
 7085206 7085207 Bphy_0340 Bphy_0341     FALSE 0.267 126.000 0.011 1.000 N NA
 7085212 7085213 Bphy_0346 Bphy_0347     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.012 Y NA
 7085213 7085214 Bphy_0347 Bphy_0348     TRUE 0.997 -13.000 1.000 0.003   NA
 7085214 7085215 Bphy_0348 Bphy_0349     TRUE 0.994 3.000 1.000 NA   NA
 7085215 7085216 Bphy_0349 Bphy_0350     TRUE 0.943 42.000 0.667 NA   NA
 7085216 7085217 Bphy_0350 Bphy_0351     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.012 Y NA
 7085217 7085218 Bphy_0351 Bphy_0352     FALSE 0.003 396.000 0.000 NA N NA
 7085219 7085220 Bphy_0353 Bphy_0354     FALSE 0.002 660.000 0.000 NA   NA
 7085220 7085221 Bphy_0354 Bphy_0355     TRUE 0.934 109.000 0.300 0.025 Y NA
 7085221 7085222 Bphy_0355 Bphy_0356     TRUE 0.987 55.000 1.000 0.025 Y NA
 7085222 7085223 Bphy_0356 Bphy_0357     FALSE 0.047 184.000 0.000 1.000 N NA
 7085223 7085224 Bphy_0357 Bphy_0358     TRUE 0.868 9.000 0.000 0.083 N NA
 7085224 7085225 Bphy_0358 Bphy_0359     FALSE 0.043 192.000 0.000 NA   NA
 7085225 7085226 Bphy_0359 Bphy_0360     FALSE 0.262 168.000 0.081 NA   NA
 7085228 7085229 Bphy_0362 Bphy_0363     TRUE 0.941 37.000 0.553 1.000 N NA
 7085231 7085232 Bphy_0365 Bphy_0366     TRUE 0.988 4.000 0.558 1.000 N NA
 7085232 7085233 Bphy_0366 Bphy_0367     TRUE 0.908 59.000 0.654 NA N NA
 7085234 7085235 Bphy_0368 Bphy_0369 queF   TRUE 0.965 -3.000 0.022 1.000   NA
 7085235 7085236 Bphy_0369 Bphy_0370     TRUE 0.894 10.000 0.019 1.000   NA
 7085237 7085238 Bphy_0371 Bphy_0372     TRUE 0.858 33.000 0.118 1.000 N NA
 7085238 7085239 Bphy_0372 Bphy_0373     TRUE 0.941 9.000 0.084 NA   NA
 7085239 7085240 Bphy_0373 Bphy_0374   ubiE TRUE 0.654 70.000 0.074 NA   NA
 7085240 7085241 Bphy_0374 Bphy_0375 ubiE   TRUE 0.766 37.000 0.044 1.000   NA
 7085241 7085242 Bphy_0375 Bphy_0376     TRUE 0.628 109.000 0.135 1.000   NA
 7085242 7085243 Bphy_0376 Bphy_0377   ubiB TRUE 0.970 16.000 0.432 1.000   NA
 7085243 7085244 Bphy_0377 Bphy_0378 ubiB   TRUE 0.842 23.000 0.044 1.000   NA
 7085244 7085245 Bphy_0378 Bphy_0379     FALSE 0.330 139.000 0.050 NA   NA
 7085245 7085246 Bphy_0379 Bphy_0380     TRUE 0.780 71.000 0.190 NA   NA
 7085246 7085247 Bphy_0380 Bphy_0381   aspS TRUE 0.608 73.000 0.057 NA   NA
 7085247 7085248 Bphy_0381 Bphy_0382 aspS   FALSE 0.210 171.000 0.050 1.000   NA
 7085248 7085249 Bphy_0382 Bphy_0383     TRUE 0.983 -3.000 0.105 1.000   NA
 7085249 7085250 Bphy_0383 Bphy_0384     FALSE 0.131 241.000 0.176 1.000   NA
 7085250 7085251 Bphy_0384 Bphy_0385     TRUE 0.886 95.000 0.767 1.000   NA
 7085251 7085252 Bphy_0385 Bphy_0386     TRUE 0.813 124.000 0.108 1.000 Y NA
 7085252 7085253 Bphy_0386 Bphy_0387     TRUE 0.994 12.000 0.588 1.000 Y NA
 7085253 7085254 Bphy_0387 Bphy_0388     TRUE 0.571 177.000 0.100 1.000 Y NA
 7085256 7085257 Bphy_0390 Bphy_0391     FALSE 0.145 184.000 0.041 NA   NA
 7085260 7085261 Bphy_0394 Bphy_0395     TRUE 0.982 12.000 0.642 NA   NA
 7085262 7085263 Bphy_0396 Bphy_0397     FALSE 0.412 156.000 0.168 1.000 N NA
 7085263 7085264 Bphy_0397 Bphy_0398   pdxA TRUE 0.974 15.000 0.561 1.000 N NA
 7085264 7085265 Bphy_0398 Bphy_0399 pdxA ksgA TRUE 0.928 21.000 0.197 1.000 N NA
 7085265 7085266 Bphy_0399 Bphy_0400 ksgA   FALSE 0.021 224.000 0.000 1.000 N NA
 7085266 7085267 Bphy_0400 Bphy_0401     FALSE 0.435 79.000 0.009 1.000 N NA
 7085268 7085269 Bphy_0402 Bphy_0403     TRUE 0.729 60.000 0.099 NA   NA
 7085269 7085270 Bphy_0403 Bphy_0404     TRUE 0.903 38.000 0.279 1.000 N NA
 7085270 7085271 Bphy_0404 Bphy_0405   glyS TRUE 0.943 11.000 0.123 1.000 N NA
 7085271 7085272 Bphy_0405 Bphy_0406 glyS glyQ TRUE 0.996 16.000 0.651 0.000 Y NA
 7085272 7085273 Bphy_0406 Bphy_0407 glyQ lnt FALSE 0.020 227.000 0.000 1.000 N NA
 7085273 7085274 Bphy_0407 Bphy_0408 lnt   TRUE 0.633 37.000 0.014 NA N NA
 7085274 7085275 Bphy_0408 Bphy_0409     TRUE 0.618 143.000 0.019 NA Y NA
 7085275 7085276 Bphy_0409 Bphy_0410     FALSE 0.447 86.000 0.014 NA   NA
 7085276 7085277 Bphy_0410 Bphy_0411     TRUE 0.947 31.000 0.457 NA   NA
 7085277 7085278 Bphy_0411 Bphy_0412     TRUE 0.904 33.000 0.220 1.000 N NA
 7085278 7085279 Bphy_0412 Bphy_0413     FALSE 0.044 215.000 0.005 NA N NA
 7085280 7085281 Bphy_0414 Bphy_0415     TRUE 0.960 21.000 0.429 NA   NA
 7085281 7085282 Bphy_0415 Bphy_0416     FALSE 0.048 252.000 0.065 NA N NA
 7085282 7085283 Bphy_0416 Bphy_0417     FALSE 0.002 467.000 0.000 1.000 N NA
 7085284 7085285 Bphy_0418 Bphy_0419   glpK FALSE 0.277 129.000 0.004 1.000   NA
 7085285 7085286 Bphy_0419 Bphy_0420 glpK glpD TRUE 0.650 169.000 0.032 0.000 Y NA
 7085288 7085289 Bphy_0422 Bphy_0423     FALSE 0.004 394.000 0.000 NA   NA
 7085290 7085291 Bphy_0424 Bphy_0425     TRUE 0.910 39.000 0.306 NA   NA
 7085292 7085293 Bphy_0426 Bphy_0427     FALSE 0.090 197.000 0.013 1.000   NA
 7085293 7085294 Bphy_0427 Bphy_0428     FALSE 0.149 174.000 0.019 1.000   NA
 7085294 7085295 Bphy_0428 Bphy_0429     TRUE 0.995 21.000 1.000 0.012 Y NA
 7085296 7085297 Bphy_0430 Bphy_0431     TRUE 0.990 -3.000 0.214 1.000   NA
 7085298 7085299 Bphy_0432 Bphy_0433     FALSE 0.008 300.000 0.000 NA   NA
 7085303 7085304 Bphy_R0025 Bphy_0437     FALSE 0.261 88.000 0.000 NA   NA
 7085304 7085305 Bphy_0437 Bphy_0438     FALSE 0.020 228.000 0.000 1.000 N NA
 7085305 7085306 Bphy_0438 Bphy_0439     TRUE 0.996 9.000 0.812 1.000 Y NA
 7085307 7085308 Bphy_0440 Bphy_0441 recA   TRUE 0.978 8.000 0.296 1.000   NA
 7085308 7085309 Bphy_0441 Bphy_0442     FALSE 0.129 171.000 0.010 NA   NA
 7085309 7085310 Bphy_0442 Bphy_0443   sucC TRUE 0.710 56.000 0.076 NA   NA
 7085310 7085311 Bphy_0443 Bphy_0444 sucC   TRUE 0.906 115.000 0.151 0.001 Y NA
 7085311 7085312 Bphy_0444 Bphy_0445     FALSE 0.431 161.000 0.220 1.000 N NA
 7085312 7085313 Bphy_0445 Bphy_0446     TRUE 0.623 151.000 0.462 1.000 N NA
 7085313 7085314 Bphy_0446 Bphy_0447     FALSE 0.001 1240.000 0.000 1.000 N NA
 7085314 7085315 Bphy_0447 Bphy_0448     FALSE 0.371 125.000 0.057 NA N NA
 7085318 7085319 Bphy_0451 Bphy_0452     TRUE 0.981 -7.000 0.131 NA   NA
 7085319 7085320 Bphy_0452 Bphy_0453     FALSE 0.323 151.000 0.075 NA   NA
 7085320 7085321 Bphy_0453 Bphy_0454     FALSE 0.229 177.000 0.088 NA   NA
 7085321 7085322 Bphy_0454 Bphy_0455     FALSE 0.242 188.000 0.138 NA   NA
 7085322 7085323 Bphy_0455 Bphy_0456     TRUE 0.799 72.000 0.223 NA   NA
 7085324 7085325 Bphy_0457 Bphy_0458     TRUE 0.993 -3.000 0.434 NA   NA
 7085325 7085326 Bphy_0458 Bphy_0459   pgk FALSE 0.052 218.000 0.009 NA   NA
 7085326 7085327 Bphy_0459 Bphy_0460 pgk   FALSE 0.052 486.000 0.032 0.003 Y NA
 7085327 7085328 Bphy_0460 Bphy_0461     FALSE 0.421 255.000 0.218 0.003 Y NA
 7085328 7085329 Bphy_0461 Bphy_0462     FALSE 0.366 131.000 0.055 1.000 N NA
 7085329 7085330 Bphy_0462 Bphy_0463     TRUE 0.955 25.000 0.038 1.000 Y NA
 7085330 7085331 Bphy_0463 Bphy_0464     TRUE 0.956 75.000 0.201 0.000 Y NA
 7085331 7085332 Bphy_0464 Bphy_0465     TRUE 0.815 13.000 0.014 NA N NA
 7085333 7085334 Bphy_0466 Bphy_0467     FALSE 0.255 205.000 0.255 NA   NA
 7085334 7085335 Bphy_0467 Bphy_0468     FALSE 0.099 198.000 0.032 NA   NA
 7085336 7085337 Bphy_0469 Bphy_0470     TRUE 0.997 5.000 0.724 1.000 Y NA
 7085337 7085338 Bphy_0470 Bphy_0471     TRUE 0.692 114.000 0.259 1.000 N NA
 7085338 7085339 Bphy_0471 Bphy_0472     FALSE 0.022 242.000 0.000 1.000   NA
 7085339 7085340 Bphy_0472 Bphy_0473     FALSE 0.004 397.000 0.000 NA   NA
 7085340 7085341 Bphy_0473 Bphy_0474     TRUE 0.959 34.000 0.700 NA   NA
 7085345 7085346 Bphy_0478 Bphy_0479     TRUE 0.981 18.000 1.000 1.000 N NA
 7085346 7085347 Bphy_0479 Bphy_0480     TRUE 0.991 11.000 1.000 0.083 N NA
 7085349 7085350 Bphy_0482 Bphy_0483     FALSE 0.036 194.000 0.000 1.000 N NA
 7085350 7085351 Bphy_0483 Bphy_0484     TRUE 0.948 12.000 0.136 1.000   NA
 7085352 7085353 Bphy_0485 Bphy_0486     TRUE 0.998 -7.000 0.379 0.098 Y NA
 7085353 7085354 Bphy_0486 Bphy_0487     TRUE 0.997 -3.000 0.233 1.000 Y NA
 7085354 7085355 Bphy_0487 Bphy_0488     TRUE 0.910 58.000 0.080 NA Y NA
 7085356 7085357 Bphy_0489 Bphy_0490     FALSE 0.541 90.000 0.059 1.000 N NA
 7085357 7085358 Bphy_0490 Bphy_0491     FALSE 0.453 225.000 0.148 0.083 Y NA
 7085358 7085359 Bphy_0491 Bphy_0492     TRUE 0.999 -3.000 0.918 0.083 Y NA
 7085359 7085360 Bphy_0492 Bphy_0493     TRUE 0.967 -3.000 0.027 1.000   NA
 7085360 7085361 Bphy_0493 Bphy_0494     TRUE 0.743 90.000 0.188 1.000   NA
 7085361 7085362 Bphy_0494 Bphy_0495     FALSE 0.125 249.000 0.000 1.000 Y NA
 7085363 7085364 Bphy_0496 Bphy_0497     FALSE 0.442 112.000 0.055 1.000 N NA
 7085364 7085365 Bphy_0497 Bphy_0498     TRUE 0.589 171.000 0.086 1.000 Y NA
 7085366 7085367 Bphy_0499 Bphy_0500     TRUE 0.845 89.000 0.542 NA N NA
 7085367 7085368 Bphy_0500 Bphy_0501     TRUE 0.918 64.000 0.125 NA Y NA
 7085368 7085369 Bphy_0501 Bphy_0502     TRUE 0.996 -13.000 0.111 0.007 Y NA
 7085369 7085370 Bphy_0502 Bphy_0503     TRUE 0.907 45.000 0.407 1.000 N NA
 7085370 7085371 Bphy_0503 Bphy_0504     TRUE 0.746 69.000 0.150 1.000 N NA
 7085371 7085372 Bphy_0504 Bphy_0505     TRUE 0.982 -3.000 0.120 1.000 N NA
 7085373 7085374 Bphy_0506 Bphy_0507     TRUE 0.992 11.000 0.347 1.000 Y NA
 7085374 7085375 Bphy_0507 Bphy_0508     TRUE 0.744 47.000 0.065 1.000   NA
 7085379 7085380 Bphy_0512 Bphy_0513     TRUE 0.830 83.000 0.353 NA   NA
 7085380 7085381 Bphy_0513 Bphy_0514     FALSE 0.148 176.000 0.036 1.000 N NA
 7085383 7085384 Bphy_0516 Bphy_0517     FALSE 0.344 114.000 0.016 NA   NA
 7085386 7085387 Bphy_0519 Bphy_0520     TRUE 0.963 -18.000 0.063 NA   NA
 7085388 7085389 Bphy_0521 Bphy_0522     TRUE 0.700 41.000 0.040 1.000 N NA
 7085389 7085390 Bphy_0522 Bphy_0523   xerD TRUE 0.994 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 7085392 7085393 Bphy_0525 Bphy_0526     FALSE 0.262 158.000 0.061 NA   NA
 7085399 7085400 Bphy_0532 Bphy_0533     TRUE 0.976 -3.000 0.069 NA   NA
 7085401 7085402 Bphy_0534 Bphy_0535   adk FALSE 0.020 228.000 0.000 1.000 N NA
 7085402 7085403 Bphy_0535 Bphy_0536 adk   FALSE 0.043 262.000 0.056 1.000 N NA
 7085403 7085404 Bphy_0536 Bphy_0537     TRUE 0.634 132.000 0.265 NA   NA
 7085404 7085405 Bphy_0537 Bphy_0538     TRUE 0.985 -19.000 0.263 NA   NA
 7085406 7085407 Bphy_0539 Bphy_0540 xseA   FALSE 0.083 208.000 0.037 1.000 N NA
 7085408 7085409 Bphy_0541 Bphy_0542     FALSE 0.261 88.000 0.000 NA   NA
 7085413 7085414 Bphy_0546 Bphy_0547     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA N NA
 7085414 7085415 Bphy_0547 Bphy_0548     FALSE 0.165 116.000 0.000 1.000 N NA
 7085420 7085421 Bphy_0553 Bphy_0554     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 7085422 7085423 Bphy_0555 Bphy_0556     TRUE 0.977 -3.000 0.067 1.000   NA
 7085423 7085424 Bphy_0556 Bphy_0557     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.083 Y NA
 7085424 7085425 Bphy_0557 Bphy_0558     TRUE 0.992 30.000 0.833 0.083 Y NA
 7085425 7085426 Bphy_0558 Bphy_0559     FALSE 0.012 259.000 0.000 1.000 N NA
 7085426 7085427 Bphy_0559 Bphy_0560     TRUE 0.784 29.000 0.042 1.000 N NA
 7085427 7085428 Bphy_0560 Bphy_0561     FALSE 0.064 217.000 0.028 1.000 N NA
 7085428 7085429 Bphy_0561 Bphy_0562     FALSE 0.025 268.000 0.010 NA   NA
 7085432 7085433 Bphy_0565 Bphy_0566     FALSE 0.002 559.000 0.000 NA   NA
 7085435 7085436 Bphy_0568 Bphy_0569 clpS   TRUE 0.995 -3.000 0.596 NA   NA
 7085437 7085438 Bphy_0570 Bphy_0571     FALSE 0.447 65.000 0.009 NA N NA
 7085438 7085439 Bphy_0571 Bphy_0572     FALSE 0.409 74.000 0.008 NA N NA
 7085439 7085440 Bphy_0572 Bphy_0573   lspA FALSE 0.212 150.000 0.024 1.000 N NA
 7085440 7085441 Bphy_0573 Bphy_0574 lspA ileS TRUE 0.966 0.000 0.071 1.000 N NA
 7085441 7085442 Bphy_0574 Bphy_0575 ileS   FALSE 0.324 188.000 0.254 1.000 N NA
 7085443 7085444 Bphy_0576 Bphy_0577     TRUE 0.978 -3.000 0.099 NA N NA
 7085444 7085445 Bphy_0577 Bphy_0578     TRUE 0.594 87.000 0.069 NA   NA
 7085445 7085446 Bphy_0578 Bphy_0579     FALSE 0.141 201.000 0.078 NA   NA
 7085446 7085447 Bphy_0579 Bphy_0580     FALSE 0.254 132.000 0.013 1.000 N NA
 7085447 7085448 Bphy_0580 Bphy_0581     TRUE 0.997 0.000 0.198 0.002 Y NA
 7085449 7085450 Bphy_0582 Bphy_0583   rpmG FALSE 0.036 245.000 0.019 1.000 N NA
 7085450 7085451 Bphy_0583 Bphy_0584 rpmG rpmB TRUE 0.994 11.000 0.332 0.008 Y NA
 7085451 7085452 Bphy_0584 Bphy_0585 rpmB radC FALSE 0.012 259.000 0.000 1.000 N NA
 7085453 7085454 Bphy_0586 Bphy_0587   ispH TRUE 0.990 3.000 0.626 1.000 N NA
 7085454 7085455 Bphy_0587 Bphy_0588 ispH   FALSE 0.002 539.000 0.000 1.000 N NA
 7085455 7085456 Bphy_0588 Bphy_0589     FALSE 0.169 228.000 0.000 1.000 Y NA
 7085456 7085457 Bphy_0589 Bphy_0590     TRUE 0.988 28.000 0.400 0.083 Y NA
 7085457 7085458 Bphy_0590 Bphy_0591     TRUE 0.969 23.000 0.091 1.000 Y NA
 7085458 7085459 Bphy_0591 Bphy_0592     TRUE 0.996 0.000 0.152 0.024 Y NA
 7085460 7085461 Bphy_0593 Bphy_0594   argD TRUE 0.982 -3.000 0.099 1.000   NA
 7085465 7085466 Bphy_0598 Bphy_0599     FALSE 0.364 166.000 0.160 NA   NA
 7085466 7085467 Bphy_0599 Bphy_0600     FALSE 0.007 313.000 0.000 NA   NA
 7085469 7085470 Bphy_R0026 Bphy_0602     FALSE 0.211 105.000 0.000 NA   NA
 7085471 7085472 Bphy_0603 Bphy_0604     FALSE 0.506 90.000 0.040 NA   NA
 7085472 7085473 Bphy_0604 Bphy_0605     TRUE 0.733 74.000 0.140 NA   NA
 7085474 7085475 Bphy_0606 Bphy_R0027 trmB   FALSE 0.034 204.000 0.000 NA   NA
 7085475 7085476 Bphy_R0027 Bphy_0607     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7085476 7085477 Bphy_0607 Bphy_0608     FALSE 0.229 137.000 0.005 NA   NA
 7085477 7085478 Bphy_0608 Bphy_0609     FALSE 0.029 213.000 0.000 NA   NA
 7085482 7085483 Bphy_0613 Bphy_0614     FALSE 0.522 76.000 0.042 NA N NA
 7085485 7085486 Bphy_0616 Bphy_0617   nusB FALSE 0.365 124.000 0.042 1.000 N NA
 7085486 7085487 Bphy_0617 Bphy_0618 nusB ribH TRUE 0.992 -3.000 0.347 1.000 N NA
 7085487 7085488 Bphy_0618 Bphy_0619 ribH   TRUE 0.900 90.000 0.051 0.001 Y NA
 7085488 7085489 Bphy_0619 Bphy_0620     TRUE 0.749 115.000 0.021 1.000 Y NA
 7085489 7085490 Bphy_0620 Bphy_0621     TRUE 0.987 25.000 0.456 1.000 Y NA
 7085490 7085491 Bphy_0621 Bphy_0622     TRUE 0.917 40.000 0.017 1.000 Y NA
 7085491 7085492 Bphy_0622 Bphy_0623     FALSE 0.081 211.000 0.034 NA   NA
 7085494 7085495 Bphy_0625 Bphy_0626     TRUE 0.993 -22.000 0.117 1.000 Y NA
 7085495 7085496 Bphy_0626 Bphy_0627     TRUE 0.649 148.000 0.046 1.000 Y NA
 7085497 7085498 Bphy_0628 Bphy_0629     TRUE 0.825 152.000 0.224 0.082 Y NA
 7085498 7085499 Bphy_0629 Bphy_0630     TRUE 0.999 -10.000 0.816 0.082 Y NA
 7085499 7085500 Bphy_0630 Bphy_0631     TRUE 0.952 119.000 0.723 0.082 Y NA
 7085501 7085502 Bphy_0632 Bphy_0633     TRUE 0.957 16.000 0.281 NA   NA
 7085502 7085503 Bphy_0633 Bphy_0634     FALSE 0.175 178.000 0.053 NA   NA
 7085504 7085505 Bphy_0635 Bphy_0636   lolA TRUE 0.846 37.000 0.130 1.000 N NA
 7085507 7085508 Bphy_0638 Bphy_0639     FALSE 0.010 274.000 0.000 1.000 N NA
 7085510 7085511 Bphy_0641 Bphy_0642     TRUE 0.656 94.000 0.078 0.097 N NA
 7085511 7085512 Bphy_0642 Bphy_R0028     FALSE 0.098 152.000 0.000 NA   NA
 7085512 7085513 Bphy_R0028 Bphy_0643     FALSE 0.009 292.000 0.000 NA   NA
 7085513 7085514 Bphy_0643 Bphy_0644     FALSE 0.003 428.000 0.000 NA   NA
 7085514 7085515 Bphy_0644 Bphy_0645     TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.030 Y NA
 7085515 7085516 Bphy_0645 Bphy_0646     TRUE 0.959 63.000 0.214 0.025 Y NA
 7085516 7085517 Bphy_0646 Bphy_0647     FALSE 0.102 231.000 0.111 1.000 N NA
 7085517 7085518 Bphy_0647 Bphy_0648     TRUE 0.940 50.000 0.833 1.000 N NA
 7085518 7085519 Bphy_0648 Bphy_0649     TRUE 0.993 2.000 0.600 0.082 N NA
 7085519 7085520 Bphy_0649 Bphy_0650     TRUE 0.960 -3.000 0.021 NA   NA
 7085520 7085521 Bphy_0650 Bphy_0651     TRUE 0.965 -3.000 0.032 NA   NA
 7085521 7085522 Bphy_0651 Bphy_0652     TRUE 0.958 -3.000 0.016 NA   NA
 7085522 7085523 Bphy_0652 Bphy_0653     FALSE 0.003 427.000 0.000 NA   NA
 7085523 7085524 Bphy_0653 Bphy_0654     FALSE 0.085 223.000 0.051 1.000   NA
 7085524 7085525 Bphy_0654 Bphy_0655     FALSE 0.089 202.000 0.021 1.000   NA
 7085525 7085526 Bphy_0655 Bphy_0656     TRUE 0.947 90.000 0.466 1.000 Y NA
 7085526 7085527 Bphy_0656 Bphy_0657     TRUE 0.992 16.000 0.618 NA Y NA
 7085527 7085528 Bphy_0657 Bphy_0658     FALSE 0.026 262.000 0.010 NA   NA
 7085528 7085529 Bphy_0658 Bphy_0659     FALSE 0.167 123.000 0.000 NA   NA
 7085532 7085533 Bphy_0662 Bphy_0663     FALSE 0.076 233.000 0.066 NA   NA
 7085533 7085534 Bphy_0663 Bphy_0664     FALSE 0.006 523.000 0.022 1.000   NA
 7085534 7085535 Bphy_0664 Bphy_R0029     FALSE 0.085 159.000 0.000 NA   NA
 7085535 7085536 Bphy_R0029 Bphy_0665     FALSE 0.355 58.000 0.000 NA   NA
 7085536 7085537 Bphy_0665 Bphy_0666     TRUE 0.988 -3.000 0.218 1.000 N NA
 7085537 7085538 Bphy_0666 Bphy_0667   rph TRUE 0.988 -7.000 0.262 1.000 N NA
 7085539 7085540 Bphy_0668 Bphy_0669   gmk TRUE 0.954 17.000 0.276 NA   NA
 7085540 7085541 Bphy_0669 Bphy_0670 gmk   TRUE 0.884 63.000 0.471 1.000 N NA
 7085541 7085542 Bphy_0670 Bphy_0671     TRUE 0.942 76.000 0.291 1.000 Y NA
 7085542 7085543 Bphy_0671 Bphy_0672     FALSE 0.426 86.000 0.009 NA   NA
 7085544 7085545 Bphy_R0030 Bphy_R0031     FALSE 0.249 92.000 0.000 NA   NA
 7085547 7085548 Bphy_0674 Bphy_0675     FALSE 0.002 524.000 0.000 NA   NA
 7085549 7085550 Bphy_0676 Bphy_0677     FALSE 0.103 320.000 0.357 0.071 N NA
 7085551 7085552 Bphy_0678 Bphy_0679     FALSE 0.008 303.000 0.000 NA   NA
 7085553 7085554 Bphy_0680 Bphy_0681     FALSE 0.003 411.000 0.000 NA   NA
 7085556 7085557 Bphy_0683 Bphy_0684     TRUE 0.995 -7.000 0.800 1.000 N NA
 7085558 7085559 Bphy_R0032 Bphy_0685     FALSE 0.283 82.000 0.000 NA   NA
 7085559 7085560 Bphy_0685 Bphy_0686   pepN FALSE 0.032 302.000 0.071 1.000 N NA
 7085563 7085564 Bphy_0689 Bphy_0690     TRUE 0.993 -16.000 0.636 NA   NA
 7085564 7085565 Bphy_0690 Bphy_0691     TRUE 0.969 -19.000 0.075 1.000   NA
 7085565 7085566 Bphy_0691 Bphy_0692     TRUE 0.986 -3.000 0.052 0.002   NA
 7085566 7085567 Bphy_0692 Bphy_0693     TRUE 0.990 0.000 0.422 NA   NA
 7085567 7085568 Bphy_0693 Bphy_0694     TRUE 0.996 -3.000 0.758 NA   NA
 7085568 7085569 Bphy_0694 Bphy_0695     TRUE 0.980 -3.000 0.094 NA   NA
 7085569 7085570 Bphy_0695 Bphy_0696     TRUE 0.989 -13.000 0.333 NA   NA
 7085570 7085571 Bphy_0696 Bphy_0697     TRUE 0.991 -7.000 0.413 NA   NA
 7085571 7085572 Bphy_0697 Bphy_0698     TRUE 0.951 -12.000 0.028 NA   NA
 7085572 7085573 Bphy_0698 Bphy_0699     TRUE 0.971 -3.000 0.049 NA   NA
 7085573 7085574 Bphy_0699 Bphy_0700     TRUE 0.979 -3.000 0.083 NA   NA
 7085574 7085575 Bphy_0700 Bphy_0701     TRUE 0.959 35.000 0.128 NA Y NA
 7085575 7085576 Bphy_0701 Bphy_0702     TRUE 0.995 -3.000 0.103 NA Y NA
 7085576 7085577 Bphy_0702 Bphy_0703     TRUE 0.997 0.000 0.486 1.000 Y NA
 7085577 7085578 Bphy_0703 Bphy_0704     TRUE 0.995 -3.000 0.025 0.022 Y NA
 7085578 7085579 Bphy_0704 Bphy_0705     TRUE 0.659 44.000 0.025 NA   NA
 7085579 7085580 Bphy_0705 Bphy_0706     TRUE 0.937 28.000 0.312 NA   NA
 7085583 7085584 Bphy_0709 Bphy_0710     TRUE 0.957 30.000 0.070 1.000 Y NA
 7085584 7085585 Bphy_0710 Bphy_0711     TRUE 0.592 105.000 0.133 NA N NA
 7085585 7085586 Bphy_0711 Bphy_0712     FALSE 0.453 94.000 0.041 NA N NA
 7085586 7085587 Bphy_0712 Bphy_0713     TRUE 0.995 0.000 0.064 0.001 Y NA
 7085587 7085588 Bphy_0713 Bphy_0714     FALSE 0.007 410.000 0.000 0.072 N NA
 7085588 7085589 Bphy_0714 Bphy_0715     TRUE 0.747 106.000 0.326 1.000 N NA
 7085590 7085591 Bphy_0716 Bphy_0717     FALSE 0.246 157.000 0.041 1.000   NA
 7085591 7085592 Bphy_0717 Bphy_0718     FALSE 0.036 277.000 0.054 NA   NA
 7085593 7085594 Bphy_0719 Bphy_0720     FALSE 0.215 159.000 0.038 NA   NA
 7085597 7085598 Bphy_0723 Bphy_0724     TRUE 0.966 -3.000 0.040 1.000 N NA
 7085598 7085599 Bphy_0724 Bphy_0725     FALSE 0.444 110.000 0.053 1.000 N NA
 7085600 7085601 Bphy_0726 Bphy_0727     TRUE 0.956 22.000 0.175 0.002   NA
 7085601 7085602 Bphy_0727 Bphy_0728     TRUE 0.973 15.000 0.466 1.000   NA
 7085602 7085603 Bphy_0728 Bphy_0729     TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.009 Y NA
 7085604 7085605 Bphy_0730 Bphy_0731     TRUE 0.691 144.000 0.519 NA   NA
 7085608 7085609 Bphy_0734 Bphy_R0001     FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 7085609 7085610 Bphy_R0001 Bphy_0735     FALSE 0.208 106.000 0.000 NA   NA
 7085610 7085611 Bphy_0735 Bphy_0736     TRUE 0.908 38.000 0.259 1.000   NA
 7085611 7085612 Bphy_0736 Bphy_0737     FALSE 0.116 207.000 0.071 1.000 N NA
 7085613 7085614 Bphy_0738 Bphy_0739     FALSE 0.363 117.000 0.025 NA   NA
 7085614 7085615 Bphy_0739 Bphy_0740     FALSE 0.087 213.000 0.044 NA   NA
 7085615 7085616 Bphy_0740 Bphy_0741     TRUE 0.910 73.000 0.121 1.000 Y NA
 7085616 7085617 Bphy_0741 Bphy_0742     TRUE 0.896 79.000 0.098 1.000 Y NA
 7085617 7085618 Bphy_0742 Bphy_0743     TRUE 0.991 9.000 0.198 1.000 Y NA
 7085618 7085619 Bphy_0743 Bphy_0744     TRUE 0.973 20.000 0.100 1.000 Y NA
 7085619 7085620 Bphy_0744 Bphy_0745   cmk TRUE 0.844 49.000 0.209 1.000 N NA
 7085620 7085621 Bphy_0745 Bphy_0746 cmk rpsA TRUE 0.702 114.000 0.281 1.000 N NA
 7085621 7085622 Bphy_0746 Bphy_0747 rpsA ihfB TRUE 0.942 23.000 0.292 1.000 N NA
 7085622 7085623 Bphy_0747 Bphy_0748 ihfB   FALSE 0.035 332.000 0.129 NA   NA
 7085623 7085624 Bphy_0748 Bphy_0749     TRUE 0.836 57.000 0.229 NA   NA
 7085624 7085625 Bphy_0749 Bphy_0750     TRUE 0.765 91.000 0.259 1.000 N NA
 7085625 7085626 Bphy_0750 Bphy_0751     TRUE 0.992 -7.000 0.043 1.000 Y NA
 7085626 7085627 Bphy_0751 Bphy_0752     TRUE 0.922 82.000 0.191 1.000 Y NA
 7085627 7085628 Bphy_0752 Bphy_0753     TRUE 0.618 77.000 0.056 1.000   NA
 7085628 7085629 Bphy_0753 Bphy_0754   cysM FALSE 0.018 305.000 0.006 1.000   NA
 7085631 7085632 Bphy_0756 Bphy_0757     TRUE 0.866 33.000 0.145 NA N NA
 7085634 7085635 Bphy_0759 Bphy_0760     TRUE 0.999 -10.000 0.914 1.000 Y NA
 7085635 7085636 Bphy_0760 Bphy_0761     TRUE 0.983 29.000 0.400 NA Y NA
 7085636 7085637 Bphy_0761 Bphy_0762     FALSE 0.012 244.000 0.000 NA N NA
 7085637 7085638 Bphy_0762 Bphy_0763     TRUE 0.946 28.000 0.000 0.021 Y NA
 7085638 7085639 Bphy_0763 Bphy_0764     FALSE 0.401 103.000 0.000 0.016 N NA
 7085641 7085642 Bphy_0766 Bphy_0767     FALSE 0.482 105.000 0.060 1.000 N NA
 7085644 7085645 Bphy_0769 Bphy_0770 rpsP rimM TRUE 0.951 97.000 0.342 0.008 Y NA
 7085645 7085646 Bphy_0770 Bphy_0771 rimM trmD TRUE 0.990 25.000 0.672 1.000 Y NA
 7085646 7085647 Bphy_0771 Bphy_0772 trmD rplS TRUE 0.885 145.000 0.567 1.000 Y NA
 7085647 7085648 Bphy_0772 Bphy_0773 rplS   FALSE 0.482 94.000 0.027 1.000   NA
 7085648 7085649 Bphy_0773 Bphy_0774     FALSE 0.471 164.000 0.254 1.000   NA
 7085650 7085651 Bphy_0775 Bphy_0776     TRUE 0.895 5.000 0.004 NA   NA
 7085651 7085652 Bphy_0776 Bphy_0777     TRUE 0.972 -3.000 0.046 1.000   NA
 7085654 7085655 Bphy_0779 Bphy_0780 mogA   TRUE 0.974 -19.000 0.117 NA   NA
 7085657 7085658 Bphy_0782 Bphy_0783     FALSE 0.221 140.000 0.012 1.000 N NA
 7085658 7085659 Bphy_0783 Bphy_0784     TRUE 0.894 25.000 0.125 NA   NA
 7085659 7085660 Bphy_0784 Bphy_0785     FALSE 0.203 108.000 0.000 NA   NA
 7085660 7085661 Bphy_0785 Bphy_0786     FALSE 0.002 607.000 0.000 NA   NA
 7085662 7085663 Bphy_0787 Bphy_0788   thyA FALSE 0.043 229.000 0.013 1.000 N NA
 7085664 7085665 Bphy_0789 Bphy_0790     FALSE 0.462 151.000 0.182 NA   NA
 7085666 7085667 Bphy_0791 Bphy_0792     FALSE 0.140 134.000 0.000 NA   NA
 7085667 7085668 Bphy_0792 Bphy_0793     TRUE 0.908 32.000 0.250 NA N NA
 7085668 7085669 Bphy_0793 Bphy_0794     FALSE 0.400 84.000 0.013 NA N NA
 7085670 7085671 Bphy_0795 Bphy_0796 fumC   FALSE 0.237 88.000 0.000 1.000 N NA
 7085671 7085672 Bphy_0796 Bphy_0797     FALSE 0.003 410.000 0.000 1.000 N NA
 7085672 7085673 Bphy_0797 Bphy_0798     FALSE 0.085 211.000 0.029 1.000   NA
 7085674 7085675 Bphy_0799 Bphy_0800     TRUE 0.838 66.000 0.286 NA   NA
 7085675 7085676 Bphy_0800 Bphy_0801     FALSE 0.174 120.000 0.000 NA   NA
 7085677 7085678 Bphy_0802 Bphy_0803     FALSE 0.067 230.000 0.048 NA   NA
 7085678 7085679 Bphy_0803 Bphy_0804     TRUE 0.990 -3.000 0.254 NA   NA
 7085679 7085680 Bphy_0804 Bphy_0805     TRUE 0.719 113.000 0.333 NA N NA
 7085680 7085681 Bphy_0805 Bphy_0806     TRUE 0.730 43.000 0.054 NA   NA
 7085681 7085682 Bphy_0806 Bphy_R0033     FALSE 0.105 149.000 0.000 NA   NA
 7085682 7085683 Bphy_R0033 Bphy_R0034     FALSE 0.332 64.000 0.000 NA   NA
 7085683 7085684 Bphy_R0034 Bphy_0807     FALSE 0.195 111.000 0.000 NA   NA
 7085685 7085686 Bphy_0808 Bphy_0809     FALSE 0.117 210.000 0.063 1.000   NA
 7085686 7085687 Bphy_0809 Bphy_0810     TRUE 0.956 11.000 0.170 NA   NA
 7085687 7085688 Bphy_0810 Bphy_0811     TRUE 0.848 55.000 0.283 NA N NA
 7085688 7085689 Bphy_0811 Bphy_0812     TRUE 0.973 -3.000 0.058 NA   NA
 7085690 7085691 Bphy_0813 Bphy_0814     TRUE 0.990 0.000 0.389 NA   NA
 7085691 7085692 Bphy_0814 Bphy_0815     TRUE 0.805 54.000 0.156 NA   NA
 7085692 7085693 Bphy_0815 Bphy_0816   mobA TRUE 0.927 82.000 0.089 0.002 Y NA
 7085693 7085694 Bphy_0816 Bphy_0817 mobA moaA TRUE 0.984 16.000 0.075 0.002 Y NA
 7085694 7085695 Bphy_0817 Bphy_0818 moaA   FALSE 0.130 187.000 0.042 1.000 N NA
 7085696 7085697 Bphy_0819 Bphy_0820     TRUE 0.990 -19.000 0.389 1.000   NA
 7085697 7085698 Bphy_0820 Bphy_0821     TRUE 0.988 -3.000 0.199 NA   NA
 7085698 7085699 Bphy_0821 Bphy_0822     TRUE 0.848 46.000 0.218 NA N NA
 7085700 7085701 Bphy_0823 Bphy_0824     TRUE 0.982 -3.000 0.107 NA   NA
 7085702 7085703 Bphy_0825 Bphy_0826     TRUE 0.812 114.000 0.599 NA   NA
 7085703 7085704 Bphy_0826 Bphy_0827     TRUE 0.679 137.000 0.418 1.000 N NA
 7085704 7085705 Bphy_0827 Bphy_0828     TRUE 0.998 0.000 0.380 0.003 Y NA
 7085705 7085706 Bphy_0828 Bphy_0829     TRUE 0.935 94.000 0.182 0.003 Y NA
 7085706 7085707 Bphy_0829 Bphy_0830   fabG TRUE 0.973 66.000 0.432 0.003 Y NA
 7085707 7085708 Bphy_0830 Bphy_0831 fabG acpP TRUE 0.883 148.000 0.321 0.003 Y NA
 7085708 7085709 Bphy_0831 Bphy_0832 acpP   FALSE 0.260 306.000 0.346 1.000 Y NA
 7085709 7085710 Bphy_0832 Bphy_0833     FALSE 0.385 113.000 0.028 NA   NA
 7085710 7085711 Bphy_0833 Bphy_0834     FALSE 0.385 133.000 0.062 NA   NA
 7085711 7085712 Bphy_0834 Bphy_0835     TRUE 0.880 85.000 0.705 NA N NA
 7085712 7085713 Bphy_0835 Bphy_0836     TRUE 0.997 5.000 0.856 NA Y NA
 7085713 7085714 Bphy_0836 Bphy_0837     TRUE 0.932 20.000 0.218 NA N NA
 7085714 7085715 Bphy_0837 Bphy_0838     TRUE 0.977 -3.000 0.072 NA   NA
 7085715 7085716 Bphy_0838 Bphy_0839     FALSE 0.146 165.000 0.010 NA   NA
 7085716 7085717 Bphy_0839 Bphy_0840     TRUE 0.926 21.000 0.187 1.000 N NA
 7085717 7085718 Bphy_0840 Bphy_0841     FALSE 0.369 152.000 0.117 1.000 N NA
 7085718 7085719 Bphy_0841 Bphy_0842   era TRUE 0.630 101.000 0.058 0.066   NA
 7085719 7085720 Bphy_0842 Bphy_0843 era recO TRUE 0.963 -13.000 0.049 1.000   NA
 7085720 7085721 Bphy_0843 Bphy_0844 recO   TRUE 0.986 -3.000 0.166 1.000 N NA
 7085721 7085722 Bphy_0844 Bphy_0845   acpS TRUE 0.943 24.000 0.326 1.000 N NA
 7085722 7085723 Bphy_0845 Bphy_0846 acpS   TRUE 0.665 68.000 0.081 1.000 N NA
 7085724 7085725 Bphy_0847 Bphy_0848     FALSE 0.468 124.000 0.080 NA   NA
 7085725 7085726 Bphy_0848 Bphy_0849     FALSE 0.008 303.000 0.000 NA   NA
 7085726 7085727 Bphy_0849 Bphy_0850     FALSE 0.026 329.000 0.074 NA   NA
 7085728 7085729 Bphy_0851 Bphy_0852 uvrC   FALSE 0.550 141.000 0.227 1.000 N NA
 7085731 7085732 Bphy_R0035 Bphy_R0036     FALSE 0.309 70.000 0.000 NA   NA
 7085732 7085733 Bphy_R0036 Bphy_R0037     FALSE 0.096 153.000 0.000 NA   NA
 7085733 7085734 Bphy_R0037 Bphy_0854     FALSE 0.312 69.000 0.000 NA   NA
 7085735 7085736 Bphy_0855 Bphy_0856     TRUE 0.813 53.000 0.167 NA   NA
 7085736 7085737 Bphy_0856 Bphy_0857     TRUE 0.932 18.000 0.167 NA   NA
 7085738 7085739 Bphy_0858 Bphy_0859     TRUE 0.950 53.000 0.079 0.001 Y NA
 7085741 7085742 Bphy_0861 Bphy_0862     FALSE 0.019 239.000 0.000 NA   NA
 7085742 7085743 Bphy_0862 Bphy_0863     TRUE 0.670 79.000 0.096 NA   NA
 7085744 7085745 Bphy_0864 Bphy_0865     TRUE 0.971 -3.000 0.049 NA   NA
 7085745 7085746 Bphy_0865 Bphy_0866     TRUE 0.982 -3.000 0.114 NA   NA
 7085746 7085747 Bphy_0866 Bphy_R0038     FALSE 0.012 270.000 0.000 NA   NA
 7085747 7085748 Bphy_R0038 Bphy_0867     FALSE 0.390 50.000 0.000 NA   NA
 7085748 7085749 Bphy_0867 Bphy_0868     TRUE 0.940 69.000 0.248 1.000 Y NA
 7085749 7085750 Bphy_0868 Bphy_0869     TRUE 0.956 -3.000 0.005 1.000   NA
 7085751 7085752 Bphy_0870 Bphy_0871     FALSE 0.498 156.000 0.233 1.000   NA
 7085752 7085753 Bphy_0871 Bphy_0872     FALSE 0.060 249.000 0.067 NA   NA
 7085753 7085754 Bphy_0872 Bphy_0873     FALSE 0.002 453.000 0.000 NA N NA
 7085754 7085755 Bphy_0873 Bphy_0874   carB TRUE 0.935 122.000 0.345 0.000 Y NA
 7085755 7085756 Bphy_0874 Bphy_0875 carB greA FALSE 0.491 153.000 0.241 1.000 N NA
 7085756 7085757 Bphy_0875 Bphy_0876 greA   TRUE 0.891 20.000 0.089 NA   NA
 7085759 7085760 Bphy_0878 Bphy_0879     FALSE 0.181 187.000 0.095 NA N NA
 7085760 7085761 Bphy_0879 Bphy_0880     FALSE 0.434 173.000 0.325 1.000 N NA
 7085761 7085762 Bphy_0880 Bphy_0881     TRUE 0.924 29.000 0.260 1.000 N NA
 7085762 7085763 Bphy_0881 Bphy_0882     FALSE 0.004 356.000 0.000 1.000 N NA
 7085763 7085764 Bphy_0882 Bphy_0883   pstC TRUE 0.711 150.000 0.020 0.001 Y NA
 7085764 7085765 Bphy_0883 Bphy_0884 pstC pstA TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.001 Y NA
 7085765 7085766 Bphy_0884 Bphy_0885 pstA   TRUE 0.995 16.000 0.526 0.001 Y NA
 7085766 7085767 Bphy_0885 Bphy_0886     TRUE 0.975 35.000 0.317 NA Y NA
 7085767 7085768 Bphy_0886 Bphy_0887     TRUE 0.696 64.000 0.104 NA N NA
 7085768 7085769 Bphy_0887 Bphy_0888     TRUE 0.940 97.000 0.453 1.000 Y NA
 7085772 7085773 Bphy_0891 Bphy_0892     FALSE 0.225 177.000 0.085 NA   NA
 7085773 7085774 Bphy_0892 Bphy_R0039     FALSE 0.024 223.000 0.000 NA   NA
 7085774 7085775 Bphy_R0039 Bphy_0893     FALSE 0.198 110.000 0.000 NA   NA
 7085775 7085776 Bphy_0893 Bphy_0894     FALSE 0.006 343.000 0.000 NA   NA
 7085778 7085779 Bphy_0896 Bphy_0897     TRUE 0.969 -3.000 0.042 NA   NA
 7085779 7085780 Bphy_0897 Bphy_0898     FALSE 0.002 612.000 0.000 NA   NA
 7085780 7085781 Bphy_0898 Bphy_0899     FALSE 0.217 189.000 0.118 NA   NA
 7085781 7085782 Bphy_0899 Bphy_0900     TRUE 0.712 117.000 0.320 1.000 N NA
 7085783 7085784 Bphy_0901 Bphy_0902     FALSE 0.029 213.000 0.000 NA   NA
 7085784 7085785 Bphy_0902 Bphy_R0040     FALSE 0.133 137.000 0.000 NA   NA
 7085787 7085788 Bphy_0904 Bphy_0905     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7085789 7085790 Bphy_0906 Bphy_0907     FALSE 0.227 134.000 0.006 1.000 N NA
 7085790 7085791 Bphy_0907 Bphy_0908     FALSE 0.362 56.000 0.000 NA   NA
 7085792 7085793 Bphy_0909 Bphy_0910     TRUE 0.998 -10.000 0.659 NA Y NA
 7085793 7085794 Bphy_0910 Bphy_0911   rpsF FALSE 0.036 224.000 0.002 NA N NA
 7085794 7085795 Bphy_0911 Bphy_0912 rpsF   TRUE 0.727 66.000 0.122 1.000 N NA
 7085795 7085796 Bphy_0912 Bphy_0913   rpsR TRUE 0.969 3.000 0.128 1.000 N NA
 7085796 7085797 Bphy_0913 Bphy_0914 rpsR   TRUE 0.990 28.000 0.499 0.008 Y NA
 7085797 7085798 Bphy_0914 Bphy_0915     FALSE 0.220 172.000 0.074 1.000 N NA
 7085798 7085799 Bphy_0915 Bphy_0916     FALSE 0.320 149.000 0.085 NA N NA
 7085799 7085800 Bphy_0916 Bphy_0917     TRUE 0.997 0.000 0.396 NA Y NA
 7085801 7085802 Bphy_0918 Bphy_0919     TRUE 0.598 142.000 0.333 NA N NA
 7085802 7085803 Bphy_0919 Bphy_0920     FALSE 0.011 251.000 0.000 NA N NA
 7085803 7085804 Bphy_0920 Bphy_0921     FALSE 0.014 366.000 0.050 1.000 N NA
 7085804 7085805 Bphy_0921 Bphy_0922     FALSE 0.052 227.000 0.023 1.000 N NA
 7085805 7085806 Bphy_0922 Bphy_0923     TRUE 0.992 13.000 0.447 1.000 Y NA
 7085806 7085807 Bphy_0923 Bphy_0924     TRUE 0.989 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7085807 7085808 Bphy_0924 Bphy_0925     TRUE 0.993 -3.000 0.473 NA N NA
 7085808 7085809 Bphy_0925 Bphy_0926     TRUE 0.987 19.000 0.351 NA Y NA
 7085809 7085810 Bphy_0926 Bphy_0927     FALSE 0.012 257.000 0.000 1.000 N NA
 7085810 7085811 Bphy_0927 Bphy_0928     TRUE 0.848 -25.000 0.000 1.000 N NA
 7085811 7085812 Bphy_0928 Bphy_0929     FALSE 0.014 395.000 0.060 NA   NA
 7085813 7085814 Bphy_0930 Bphy_0931     TRUE 0.921 59.000 0.102 1.000 Y NA
 7085814 7085815 Bphy_0931 Bphy_0932     TRUE 0.965 31.000 0.125 1.000 Y NA
 7085815 7085816 Bphy_0932 Bphy_0933     FALSE 0.022 273.000 0.011 1.000 N NA
 7085816 7085817 Bphy_0933 Bphy_0934     TRUE 0.943 64.000 0.095 0.002 Y NA
 7085817 7085818 Bphy_0934 Bphy_0935     TRUE 0.990 33.000 0.501 0.002 Y NA
 7085820 7085821 Bphy_0937 Bphy_0938     FALSE 0.019 276.000 0.011 NA N NA
 7085822 7085823 Bphy_0939 Bphy_0940     TRUE 0.754 132.000 0.571 NA   NA
 7085823 7085824 Bphy_0940 Bphy_0941     FALSE 0.028 226.000 0.000 1.000   NA
 7085824 7085825 Bphy_0941 Bphy_0942     TRUE 0.850 15.000 0.018 1.000   NA
 7085826 7085827 Bphy_0943 Bphy_0944     TRUE 0.988 -3.000 0.200 NA   NA
 7085828 7085829 Bphy_0945 Bphy_0946     TRUE 0.971 3.000 0.154 NA N NA
 7085829 7085830 Bphy_0946 Bphy_0947   rpmE2 FALSE 0.037 275.000 0.067 NA N NA
 7085830 7085831 Bphy_0947 Bphy_0948 rpmE2   FALSE 0.149 171.000 0.022 NA   NA
 7085831 7085832 Bphy_0948 Bphy_0949   rho FALSE 0.097 184.000 0.005 NA   NA
 7085832 7085833 Bphy_0949 Bphy_0950 rho   FALSE 0.046 289.000 0.087 1.000   NA
 7085834 7085835 Bphy_R0002 Bphy_0951 ffs   FALSE 0.057 179.000 0.000 NA   NA
 7085835 7085836 Bphy_0951 Bphy_0952     TRUE 0.853 78.000 0.411 NA   NA
 7085836 7085837 Bphy_0952 Bphy_0953   recR TRUE 0.757 134.000 0.604 NA   NA
 7085837 7085838 Bphy_0953 Bphy_0954 recR   FALSE 0.517 64.000 0.018 1.000 N NA
 7085838 7085839 Bphy_0954 Bphy_0955     TRUE 0.728 84.000 0.172 1.000 N NA
 7085839 7085840 Bphy_0955 Bphy_0956     TRUE 0.980 47.000 0.700 1.000 Y NA
 7085840 7085841 Bphy_0956 Bphy_0957     TRUE 0.998 2.000 0.875 1.000 Y NA
 7085843 7085844 Bphy_0959 Bphy_0960 surE   TRUE 0.993 -3.000 0.353 1.000   NA
 7085844 7085845 Bphy_0960 Bphy_0961     TRUE 0.911 6.000 0.028 1.000 N NA
 7085845 7085846 Bphy_0961 Bphy_0962     TRUE 0.907 17.000 0.101 1.000 N NA
 7085846 7085847 Bphy_0962 Bphy_0963     TRUE 0.950 7.000 0.101 1.000 N NA
 7085851 7085852 Bphy_0967 Bphy_0968     TRUE 0.987 -3.000 0.168 NA   NA
 7085852 7085853 Bphy_0968 Bphy_0969     FALSE 0.006 435.000 0.006 NA   NA
 7085853 7085854 Bphy_0969 Bphy_0970     TRUE 0.683 193.000 0.420 1.000 Y NA
 7085854 7085855 Bphy_0970 Bphy_0971     TRUE 0.783 174.000 0.491 1.000 Y NA
 7085855 7085856 Bphy_0971 Bphy_0972     FALSE 0.416 149.000 0.130 NA   NA
 7085856 7085857 Bphy_0972 Bphy_0973     FALSE 0.011 383.000 0.030 NA   NA
 7085857 7085858 Bphy_0973 Bphy_0974     TRUE 0.915 5.000 0.026 1.000 N NA
 7085858 7085859 Bphy_0974 Bphy_0975     FALSE 0.525 172.000 0.500 1.000 N NA
 7085859 7085860 Bphy_0975 Bphy_0976     TRUE 0.637 156.000 0.550 NA   NA
 7085860 7085861 Bphy_0976 Bphy_0977     TRUE 0.912 41.000 0.348 NA   NA
 7085863 7085864 Bphy_0979 Bphy_0980     FALSE 0.142 184.000 0.029 1.000   NA
 7085864 7085865 Bphy_0980 Bphy_0981     TRUE 0.865 68.000 0.371 1.000   NA
 7085865 7085866 Bphy_0981 Bphy_0982     TRUE 0.640 75.000 0.073 NA   NA
 7085868 7085869 Bphy_0984 Bphy_0985     FALSE 0.299 198.000 0.286 NA   NA
 7085870 7085871 Bphy_0986 Bphy_0987     TRUE 0.978 -3.000 0.081 NA   NA
 7085874 7085875 Bphy_0990 Bphy_0991     FALSE 0.545 174.000 0.068 1.000 Y NA
 7085875 7085876 Bphy_0991 Bphy_0992     TRUE 0.921 82.000 0.091 0.025 Y NA
 7085877 7085878 Bphy_0993 Bphy_0994 mscL   FALSE 0.080 189.000 0.005 1.000 N NA
 7085878 7085879 Bphy_0994 Bphy_0995     TRUE 0.960 67.000 0.441 1.000 Y NA
 7085879 7085880 Bphy_0995 Bphy_0996     TRUE 0.711 133.000 0.000 0.002 Y NA
 7085880 7085881 Bphy_0996 Bphy_0997     TRUE 0.797 5.000 0.000 1.000 N NA
 7085882 7085883 Bphy_0998 Bphy_0999 ispD ispF TRUE 0.956 70.000 0.419 1.000 Y NA
 7085884 7085885 Bphy_1000 Bphy_1001     TRUE 0.601 76.000 0.058 NA   NA
 7085885 7085886 Bphy_1001 Bphy_1002     FALSE 0.035 253.000 0.027 1.000 N NA
 7085886 7085887 Bphy_1002 Bphy_1003   ompR TRUE 0.963 44.000 0.241 1.000 Y NA
 7085888 7085889 Bphy_1004 Bphy_1005     FALSE 0.226 99.000 0.000 NA   NA
 7085892 7085893 Bphy_1007 Bphy_1008     FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7085893 7085894 Bphy_1008 Bphy_1009     TRUE 0.756 64.000 0.143 1.000 N NA
 7085895 7085896 Bphy_1010 Bphy_1011 tig clpP TRUE 0.715 183.000 0.351 1.000 Y NA
 7085896 7085897 Bphy_1011 Bphy_1012 clpP clpX TRUE 0.592 208.000 0.352 1.000 Y NA
 7085897 7085898 Bphy_1012 Bphy_1013 clpX   TRUE 0.692 184.000 0.201 0.095 Y NA
 7085898 7085899 Bphy_1013 Bphy_1014     FALSE 0.012 361.000 0.033 1.000 N NA
 7085899 7085900 Bphy_1014 Bphy_R0042     FALSE 0.312 69.000 0.000 NA   NA
 7085900 7085901 Bphy_R0042 Bphy_R0043     FALSE 0.445 42.000 0.000 NA   NA
 7085901 7085902 Bphy_R0043 Bphy_1015     FALSE 0.239 95.000 0.000 NA   NA
 7085903 7085904 Bphy_1016 Bphy_1017     FALSE 0.207 145.000 0.009 NA   NA
 7085906 7085907 Bphy_1019 Bphy_1020     FALSE 0.131 267.000 0.010 1.000 Y NA
 7085907 7085908 Bphy_1020 Bphy_1021     FALSE 0.529 112.000 0.022 0.005 N NA
 7085910 7085911 Bphy_1023 Bphy_1024     TRUE 0.878 11.000 0.037 NA N NA
 7085911 7085912 Bphy_1024 Bphy_1025     TRUE 0.970 2.000 0.133 NA N NA
 7085912 7085913 Bphy_1025 Bphy_1026     FALSE 0.019 237.000 0.000 NA   NA
 7085914 7085915 Bphy_1027 Bphy_1028     TRUE 0.608 178.000 0.139 1.000 Y NA
 7085915 7085916 Bphy_1028 Bphy_1029     TRUE 0.809 22.000 0.034 1.000 N NA
 7085916 7085917 Bphy_1029 Bphy_1030     FALSE 0.437 99.000 0.034 1.000 N NA
 7085923 7085924 Bphy_1036 Bphy_1037     TRUE 0.918 61.000 0.694 NA   NA
 7085924 7085925 Bphy_1037 Bphy_1038     TRUE 0.859 48.000 0.118 0.058   NA
 7085925 7085926 Bphy_1038 Bphy_1039     TRUE 0.764 86.000 0.125 0.088   NA
 7085927 7085928 Bphy_1040 Bphy_1041     FALSE 0.442 100.000 0.032 NA   NA
 7085929 7085930 Bphy_1042 Bphy_1043   tmk TRUE 0.984 0.000 0.209 NA   NA
 7085930 7085931 Bphy_1043 Bphy_1044 tmk   TRUE 0.720 96.000 0.211 1.000 N NA
 7085931 7085932 Bphy_1044 Bphy_1045     TRUE 0.926 54.000 0.110 NA Y NA
 7085932 7085933 Bphy_1045 Bphy_1046     TRUE 0.664 52.000 0.046 NA   NA
 7085933 7085934 Bphy_1046 Bphy_1047     TRUE 0.638 118.000 0.194 NA   NA
 7085934 7085935 Bphy_1047 Bphy_1048     FALSE 0.015 252.000 0.000 NA   NA
 7085935 7085936 Bphy_1048 Bphy_1049     TRUE 0.776 26.000 0.024 NA   NA
 7085936 7085937 Bphy_1049 Bphy_1050     FALSE 0.019 240.000 0.000 NA   NA
 7085938 7085939 Bphy_1051 Bphy_1052     FALSE 0.004 397.000 0.000 NA   NA
 7085939 7085940 Bphy_1052 Bphy_1053     FALSE 0.008 309.000 0.000 NA   NA
 7085941 7085942 Bphy_1054 Bphy_1055     FALSE 0.002 515.000 0.000 NA   NA
 7085944 7085945 Bphy_1057 Bphy_1058     TRUE 0.973 82.000 1.000 1.000 Y NA
 7085945 7085946 Bphy_1058 Bphy_1059     TRUE 0.940 38.000 0.560 1.000 N NA
 7085946 7085947 Bphy_1059 Bphy_1060     TRUE 0.994 -6.000 0.600 1.000 N NA
 7085947 7085948 Bphy_1060 Bphy_1061     TRUE 0.795 192.000 0.882 1.000 Y NA
 7085948 7085949 Bphy_1061 Bphy_1062     TRUE 0.894 66.000 0.556 NA   NA
 7085949 7085950 Bphy_1062 Bphy_1063     TRUE 0.994 -3.000 0.519 NA   NA
 7085950 7085951 Bphy_1063 Bphy_1064     TRUE 0.985 4.000 0.379 NA   NA
 7085951 7085952 Bphy_1064 Bphy_1065     TRUE 0.991 1.000 0.516 NA   NA
 7085952 7085953 Bphy_1065 Bphy_1066     TRUE 0.979 52.000 0.484 0.021 Y NA
 7085953 7085954 Bphy_1066 Bphy_1067     FALSE 0.008 326.000 0.000 1.000   NA
 7085954 7085955 Bphy_1067 Bphy_1068     TRUE 0.993 0.000 0.652 NA   NA
 7085956 7085957 Bphy_1069 Bphy_1070     TRUE 0.986 -3.000 0.143 1.000   NA
 7085957 7085958 Bphy_1070 Bphy_1071     TRUE 0.953 12.000 0.158 1.000   NA
 7085959 7085960 Bphy_1072 Bphy_1073     TRUE 0.962 20.000 0.400 1.000   NA
 7085960 7085961 Bphy_1073 Bphy_1074     TRUE 0.991 -3.000 0.267 1.000   NA
 7085963 7085964 Bphy_1076 Bphy_1077     FALSE 0.017 246.000 0.000 NA   NA
 7085965 7085966 Bphy_1078 Bphy_1079     TRUE 0.562 34.000 0.000 1.000   NA
 7085967 7085968 Bphy_1080 Bphy_1081     TRUE 0.741 37.000 0.030 1.000   NA
 7085968 7085969 Bphy_1081 Bphy_1082     FALSE 0.023 218.000 0.000 1.000 N NA
 7085969 7085970 Bphy_1082 Bphy_1083     FALSE 0.004 335.000 0.000 NA N NA
 7085970 7085971 Bphy_1083 Bphy_1084     FALSE 0.028 215.000 0.000 NA   NA
 7085972 7085973 Bphy_1085 Bphy_1086     FALSE 0.021 232.000 0.000 NA   NA
 7085973 7085974 Bphy_1086 Bphy_1087     FALSE 0.002 706.000 0.000 NA   NA
 7085975 7085976 Bphy_1088 Bphy_1089     FALSE 0.010 279.000 0.000 NA   NA
 7085976 7085977 Bphy_1089 Bphy_1090     TRUE 0.953 14.000 0.000 1.000 Y NA
 7085978 7085979 Bphy_1091 Bphy_1092     FALSE 0.004 368.000 0.000 NA   NA
 7085979 7085980 Bphy_1092 Bphy_1093     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7085980 7085981 Bphy_1093 Bphy_1094     FALSE 0.174 120.000 0.000 NA   NA
 7085982 7085983 Bphy_1095 Bphy_1096     FALSE 0.086 198.000 0.020 NA   NA
 7085983 7085984 Bphy_1096 Bphy_1097     FALSE 0.143 133.000 0.000 NA   NA
 7085985 7085986 Bphy_1098 Bphy_1099     TRUE 0.978 10.000 0.025 1.000 Y NA
 7085986 7085987 Bphy_1099 Bphy_1100     FALSE 0.437 43.000 0.000 NA   NA
 7085987 7085988 Bphy_1100 Bphy_1101     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 7085990 7085991 Bphy_1103 Bphy_1104     TRUE 0.878 -13.000 0.000 NA   NA
 7085993 7085994 Bphy_1106 Bphy_1107     FALSE 0.223 100.000 0.000 NA   NA
 7085994 7085995 Bphy_1107 Bphy_1108     TRUE 0.758 63.000 0.133 NA   NA
 7085997 7085998 Bphy_1110 Bphy_1111     FALSE 0.172 121.000 0.000 NA   NA
 7085998 7085999 Bphy_1111 Bphy_1112     FALSE 0.045 190.000 0.000 NA   NA
 7086000 7086001 Bphy_1113 Bphy_1114     FALSE 0.012 243.000 0.000 NA N NA
 7086001 7086002 Bphy_1114 Bphy_1115     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086003 7086004 Bphy_1116 Bphy_1117     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 7086006 7086007 Bphy_1119 Bphy_1120     FALSE 0.057 180.000 0.000 NA   NA
 7086007 7086008 Bphy_1120 Bphy_1121     FALSE 0.005 349.000 0.000 NA   NA
 7086008 7086009 Bphy_1121 Bphy_1122     TRUE 0.998 -19.000 0.455 0.003 Y NA
 7086009 7086010 Bphy_1122 Bphy_1123     TRUE 0.999 -13.000 0.697 0.003 Y NA
 7086010 7086011 Bphy_1123 Bphy_1124     TRUE 0.998 8.000 0.727 0.003 Y NA
 7086011 7086012 Bphy_1124 Bphy_1125     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.003 Y NA
 7086012 7086013 Bphy_1125 Bphy_1126     TRUE 0.981 -3.000 0.100 NA   NA
 7086013 7086014 Bphy_1126 Bphy_1127     TRUE 0.967 -7.000 0.057 NA   NA
 7086014 7086015 Bphy_1127 Bphy_1128     TRUE 0.995 -3.000 0.671 NA   NA
 7086015 7086016 Bphy_1128 Bphy_1129     TRUE 0.981 14.000 0.029 0.003 Y NA
 7086018 7086019 Bphy_1131 Bphy_1132     TRUE 0.983 2.000 0.250 NA   NA
 7086020 7086021 Bphy_1133 Bphy_1134     TRUE 0.966 17.000 0.000 0.006 Y NA
 7086021 7086022 Bphy_1134 Bphy_1135     TRUE 0.997 -3.000 0.714 0.006   NA
 7086024 7086025 Bphy_1137 Bphy_1138     FALSE 0.484 170.000 0.000 0.064 Y NA
 7086025 7086026 Bphy_1138 Bphy_1139     FALSE 0.087 168.000 0.000 1.000   NA
 7086026 7086027 Bphy_1139 Bphy_1140     TRUE 0.706 36.000 0.000 0.070   NA
 7086027 7086028 Bphy_1140 Bphy_1141     TRUE 0.915 44.000 0.429 NA   NA
 7086030 7086031 Bphy_1143 Bphy_1144     TRUE 0.996 10.000 0.455 0.029 Y NA
 7086031 7086032 Bphy_1144 Bphy_1145     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.024 Y NA
 7086032 7086033 Bphy_1145 Bphy_1146     FALSE 0.030 212.000 0.000 NA   NA
 7086034 7086035 Bphy_1147 Bphy_1148     FALSE 0.017 245.000 0.000 NA   NA
 7086035 7086036 Bphy_1148 Bphy_1149     TRUE 0.995 0.000 0.875 1.000   NA
 7086036 7086037 Bphy_1149 Bphy_1150     TRUE 0.999 -3.000 0.727 NA Y NA
 7086037 7086038 Bphy_1150 Bphy_1151     FALSE 0.005 349.000 0.000 NA   NA
 7086038 7086039 Bphy_1151 Bphy_1152     FALSE 0.271 85.000 0.000 NA   NA
 7086039 7086040 Bphy_1152 Bphy_1153     TRUE 0.993 -43.000 0.667 1.000   NA
 7086040 7086041 Bphy_1153 Bphy_1154   glnQ TRUE 0.966 11.000 0.227 1.000   NA
 7086041 7086042 Bphy_1154 Bphy_1155 glnQ glnP TRUE 0.997 -3.000 0.244 1.000 Y NA
 7086042 7086043 Bphy_1155 Bphy_1156 glnP glnH TRUE 0.982 27.000 0.218 0.090 Y NA
 7086043 7086044 Bphy_1156 Bphy_1157 glnH   FALSE 0.007 384.000 0.000 0.090 N NA
 7086044 7086045 Bphy_1157 Bphy_1158     FALSE 0.003 427.000 0.000 1.000 N NA
 7086046 7086047 Bphy_1159 Bphy_1160     TRUE 0.972 11.000 0.333 1.000 N NA
 7086047 7086048 Bphy_1160 Bphy_1161     TRUE 0.793 30.000 0.050 1.000 N NA
 7086049 7086050 Bphy_1162 Bphy_1163     FALSE 0.534 98.000 0.064 NA   NA
 7086050 7086051 Bphy_1163 Bphy_1164     FALSE 0.037 200.000 0.000 NA   NA
 7086053 7086054 Bphy_1166 Bphy_1167     FALSE 0.087 168.000 0.000 1.000   NA
 7086054 7086055 Bphy_1167 Bphy_1168     TRUE 0.991 -28.000 0.515 NA   NA
 7086055 7086056 Bphy_1168 Bphy_1169     TRUE 0.993 -3.000 0.394 NA   NA
 7086056 7086057 Bphy_1169 Bphy_1170     FALSE 0.002 609.000 0.000 NA   NA
 7086057 7086058 Bphy_1170 Bphy_1171     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086058 7086059 Bphy_1171 Bphy_1172     TRUE 0.884 -10.000 0.000 NA   NA
 7086059 7086060 Bphy_1172 Bphy_1173     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7086060 7086061 Bphy_1173 Bphy_1174     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086063 7086064 Bphy_1176 Bphy_1177     FALSE 0.002 535.000 0.000 NA   NA
 7086064 7086065 Bphy_1177 Bphy_1178     TRUE 0.952 22.000 0.347 NA   NA
 7086065 7086066 Bphy_1178 Bphy_1179     TRUE 0.995 -3.000 0.527 1.000   NA
 7086066 7086067 Bphy_1179 Bphy_1180     TRUE 0.853 53.000 0.257 1.000 N NA
 7086067 7086068 Bphy_1180 Bphy_1181     FALSE 0.275 84.000 0.000 NA   NA
 7086068 7086069 Bphy_1181 Bphy_1182     FALSE 0.035 202.000 0.000 NA   NA
 7086070 7086071 Bphy_1183 Bphy_1184     TRUE 0.995 -3.000 0.071 1.000 Y NA
 7086071 7086072 Bphy_1184 Bphy_1185     FALSE 0.023 227.000 0.000 NA   NA
 7086073 7086074 Bphy_1186 Bphy_1187     FALSE 0.144 141.000 0.000 1.000   NA
 7086076 7086077 Bphy_1189 Bphy_1190     TRUE 0.999 -3.000 0.897 1.000 Y NA
 7086077 7086078 Bphy_1190 Bphy_1191     TRUE 0.769 36.000 0.041 1.000   NA
 7086078 7086079 Bphy_1191 Bphy_1192     TRUE 0.556 29.000 0.000 NA   NA
 7086079 7086080 Bphy_1192 Bphy_1193     FALSE 0.026 219.000 0.000 NA   NA
 7086083 7086084 Bphy_1196 Bphy_1197     TRUE 0.712 13.000 0.000 NA   NA
 7086087 7086088 Bphy_R0003 Bphy_R0004     FALSE 0.125 140.000 0.000 NA   NA
 7086088 7086089 Bphy_R0004 Bphy_R0044     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7086089 7086090 Bphy_R0044 Bphy_R0045     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7086090 7086091 Bphy_R0045 Bphy_R0005     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 7086091 7086092 Bphy_R0005 Bphy_1200     FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 7086093 7086094 Bphy_1201 Bphy_1202     FALSE 0.044 191.000 0.000 NA   NA
 7086094 7086095 Bphy_1202 Bphy_1203     FALSE 0.020 235.000 0.000 NA   NA
 7086095 7086096 Bphy_1203 Bphy_1204     FALSE 0.039 197.000 0.000 NA   NA
 7086096 7086097 Bphy_1204 Bphy_1205     FALSE 0.138 135.000 0.000 NA   NA
 7086097 7086098 Bphy_1205 Bphy_1206     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7086098 7086099 Bphy_1206 Bphy_1207     FALSE 0.087 158.000 0.000 NA   NA
 7086100 7086101 Bphy_1208 Bphy_1209     FALSE 0.236 96.000 0.000 NA   NA
 7086102 7086103 Bphy_1210 Bphy_1211     FALSE 0.011 275.000 0.000 NA   NA
 7086103 7086104 Bphy_1211 Bphy_1212     FALSE 0.100 151.000 0.000 NA   NA
 7086104 7086105 Bphy_1212 Bphy_1213     TRUE 0.869 -19.000 0.000 NA   NA
 7086105 7086106 Bphy_1213 Bphy_1214     FALSE 0.156 137.000 0.000 1.000   NA
 7086106 7086107 Bphy_1214 Bphy_1215     TRUE 0.563 28.000 0.000 NA   NA
 7086108 7086109 Bphy_1216 Bphy_1217     FALSE 0.279 83.000 0.000 NA   NA
 7086111 7086112 Bphy_1219 Bphy_1220     FALSE 0.005 362.000 0.000 NA   NA
 7086113 7086114 Bphy_1221 Bphy_1222     FALSE 0.172 121.000 0.000 NA   NA
 7086116 7086117 Bphy_1224 Bphy_1225     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 7086118 7086119 Bphy_1226 Bphy_1227     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 7086119 7086120 Bphy_1227 Bphy_1228     TRUE 0.996 -3.000 0.761 NA   NA
 7086120 7086121 Bphy_1228 Bphy_1229     TRUE 0.745 142.000 0.683 NA   NA
 7086123 7086124 Bphy_1231 Bphy_1232     FALSE 0.005 348.000 0.000 1.000 N NA
 7086124 7086125 Bphy_1232 Bphy_1233     FALSE 0.013 253.000 0.000 1.000 N NA
 7086125 7086126 Bphy_1233 Bphy_1234     TRUE 0.838 75.000 0.355 1.000 N NA
 7086126 7086127 Bphy_1234 Bphy_1235     TRUE 0.660 123.000 0.258 1.000 N NA
 7086127 7086128 Bphy_1235 Bphy_1236     TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.006 Y NA
 7086128 7086129 Bphy_1236 Bphy_1237     FALSE 0.045 340.000 0.000 NA Y NA
 7086131 7086132 Bphy_1239 Bphy_1240     FALSE 0.165 189.000 0.069 NA   NA
 7086132 7086133 Bphy_1240 Bphy_1241     FALSE 0.007 319.000 0.000 NA   NA
 7086135 7086136 Bphy_1243 Bphy_1244     FALSE 0.083 225.000 0.067 1.000 N NA
 7086136 7086137 Bphy_1244 Bphy_1245     TRUE 0.717 151.000 0.065 0.096 Y NA
 7086138 7086139 Bphy_1246 Bphy_1247     FALSE 0.431 170.000 0.261 NA   NA
 7086140 7086141 Bphy_1248 Bphy_1249     TRUE 0.880 50.000 0.312 NA   NA
 7086141 7086142 Bphy_1249 Bphy_1250     TRUE 0.807 78.000 0.260 NA   NA
 7086142 7086143 Bphy_1250 Bphy_1251     TRUE 0.972 -3.000 0.060 1.000 N NA
 7086143 7086144 Bphy_1251 Bphy_1252     TRUE 0.970 5.000 0.176 1.000 N NA
 7086144 7086145 Bphy_1252 Bphy_1253     TRUE 0.845 135.000 0.238 1.000 Y NA
 7086145 7086146 Bphy_1253 Bphy_1254     TRUE 0.943 38.000 0.571 NA   NA
 7086146 7086147 Bphy_1254 Bphy_1255     FALSE 0.478 131.000 0.105 NA   NA
 7086148 7086149 Bphy_1256 Bphy_1257     FALSE 0.153 169.000 0.020 NA   NA
 7086149 7086150 Bphy_1257 Bphy_1258     FALSE 0.332 138.000 0.040 1.000   NA
 7086150 7086151 Bphy_1258 Bphy_1259     FALSE 0.204 182.000 0.079 NA   NA
 7086151 7086152 Bphy_1259 Bphy_1260     FALSE 0.006 330.000 0.000 NA   NA
 7086152 7086153 Bphy_1260 Bphy_1261     TRUE 0.809 88.000 0.333 NA   NA
 7086153 7086154 Bphy_1261 Bphy_1262     TRUE 0.827 26.000 0.054 NA   NA
 7086154 7086155 Bphy_1262 Bphy_1263     TRUE 0.607 92.000 0.094 1.000 N NA
 7086157 7086158 Bphy_1265 Bphy_1266     TRUE 0.987 -3.000 0.200 NA N NA
 7086158 7086159 Bphy_1266 Bphy_1267     TRUE 0.990 3.000 0.667 NA N NA
 7086161 7086162 Bphy_1269 Bphy_1270     FALSE 0.002 545.000 0.000 NA   NA
 7086162 7086163 Bphy_1270 Bphy_1271     TRUE 0.861 89.000 0.565 NA   NA
 7086168 7086169 Bphy_1276 Bphy_1277     TRUE 0.999 0.000 0.938 0.079 Y NA
 7086169 7086170 Bphy_1277 Bphy_1278     TRUE 0.997 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 7086170 7086171 Bphy_1278 Bphy_1279     TRUE 0.878 105.000 0.158 1.000 Y NA
 7086172 7086173 Bphy_1280 Bphy_1281     FALSE 0.344 117.000 0.020 NA   NA
 7086174 7086175 Bphy_1282 Bphy_1283     FALSE 0.542 94.000 0.050 1.000   NA
 7086175 7086176 Bphy_1283 Bphy_1284     FALSE 0.170 187.000 0.007 0.057   NA
 7086176 7086177 Bphy_1284 Bphy_1285     FALSE 0.163 168.000 0.014 1.000   NA
 7086177 7086178 Bphy_1285 Bphy_1286     FALSE 0.434 96.000 0.014 1.000   NA
 7086180 7086181 Bphy_1288 Bphy_1289     TRUE 0.740 63.000 0.103 1.000   NA
 7086181 7086182 Bphy_1289 Bphy_1290     TRUE 0.954 32.000 0.359 0.079   NA
 7086182 7086183 Bphy_1290 Bphy_1291     TRUE 0.842 104.000 0.590 1.000   NA
 7086186 7086187 Bphy_1294 Bphy_1295     FALSE 0.264 231.000 0.463 1.000   NA
 7086187 7086188 Bphy_1295 Bphy_1296     FALSE 0.007 324.000 0.000 NA   NA
 7086189 7086190 Bphy_1297 Bphy_1298     TRUE 0.999 -3.000 0.895 1.000 Y NA
 7086190 7086191 Bphy_1298 Bphy_1299     TRUE 0.855 89.000 0.522 NA   NA
 7086191 7086192 Bphy_1299 Bphy_1300     TRUE 0.985 -3.000 0.143 NA   NA
 7086192 7086193 Bphy_1300 Bphy_1301     FALSE 0.439 146.000 0.143 1.000 N NA
 7086193 7086194 Bphy_1301 Bphy_1302     TRUE 0.919 43.000 0.458 1.000 N NA
 7086194 7086195 Bphy_1302 Bphy_1303     FALSE 0.032 383.000 0.208 1.000 N NA
 7086195 7086196 Bphy_1303 Bphy_1304   ldcA FALSE 0.005 326.000 0.000 NA N NA
 7086196 7086197 Bphy_1304 Bphy_1305 ldcA   TRUE 0.919 14.000 0.115 NA N NA
 7086197 7086198 Bphy_1305 Bphy_1306     TRUE 0.972 -3.000 0.053 NA   NA
 7086199 7086200 Bphy_1307 Bphy_1308     FALSE 0.093 155.000 0.000 NA   NA
 7086200 7086201 Bphy_1308 Bphy_1309     FALSE 0.003 443.000 0.000 1.000   NA
 7086201 7086202 Bphy_1309 Bphy_1310     TRUE 0.979 17.000 0.748 1.000   NA
 7086202 7086203 Bphy_1310 Bphy_1311     TRUE 0.557 25.000 0.000 1.000 N NA
 7086204 7086205 Bphy_1312 Bphy_1313 guaA   FALSE 0.059 213.000 0.011 NA   NA
 7086205 7086206 Bphy_1313 Bphy_1314     TRUE 0.906 7.000 0.023 NA   NA
 7086208 7086209 Bphy_1316 Bphy_1317     TRUE 0.966 -3.000 0.033 NA   NA
 7086211 7086212 Bphy_1319 Bphy_1320     TRUE 0.866 91.000 0.091 NA Y NA
 7086212 7086213 Bphy_1320 Bphy_1321     FALSE 0.371 120.000 0.048 NA N NA
 7086215 7086216 Bphy_1323 Bphy_1324   rnhB TRUE 0.716 68.000 0.046 0.010 N NA
 7086216 7086217 Bphy_1324 Bphy_1325 rnhB lpxB TRUE 0.987 -3.000 0.186 1.000 N NA
 7086217 7086218 Bphy_1325 Bphy_1326 lpxB   TRUE 0.995 4.000 0.289 1.000 Y NA
 7086218 7086219 Bphy_1326 Bphy_1327   fabZ TRUE 0.654 169.000 0.850 1.000 N NA
 7086219 7086220 Bphy_1327 Bphy_1328 fabZ lpxD TRUE 0.634 170.000 0.796 1.000 N NA
 7086220 7086221 Bphy_1328 Bphy_1329 lpxD   TRUE 0.958 101.000 0.814 1.000 Y NA
 7086221 7086222 Bphy_1329 Bphy_1330     TRUE 0.972 42.000 0.354 1.000 Y NA
 7086222 7086223 Bphy_1330 Bphy_1331     TRUE 0.938 66.000 0.204 1.000 Y NA
 7086223 7086224 Bphy_1331 Bphy_1332     TRUE 0.985 8.000 0.568 1.000 N NA
 7086224 7086225 Bphy_1332 Bphy_1333     TRUE 0.986 23.000 0.372 1.000 Y NA
 7086225 7086226 Bphy_1333 Bphy_1334     TRUE 0.998 -6.000 0.400 1.000 Y NA
 7086226 7086227 Bphy_1334 Bphy_1335   frr TRUE 0.856 72.000 0.409 1.000 N NA
 7086227 7086228 Bphy_1335 Bphy_1336 frr pyrH FALSE 0.525 93.000 0.058 1.000 N NA
 7086228 7086229 Bphy_1336 Bphy_1337 pyrH tsf FALSE 0.051 244.000 0.047 1.000 N NA
 7086229 7086230 Bphy_1337 Bphy_1338 tsf rpsB TRUE 0.760 194.000 0.748 1.000 Y NA
 7086231 7086232 Bphy_1339 Bphy_1340     TRUE 0.970 26.000 0.817 1.000 N NA
 7086232 7086233 Bphy_1340 Bphy_1341     TRUE 0.972 7.000 0.237 1.000 N NA
 7086234 7086235 Bphy_1342 Bphy_1343     TRUE 0.960 -3.000 0.025 1.000 N NA
 7086237 7086238 Bphy_1345 Bphy_1346     FALSE 0.209 181.000 0.004 0.006   NA
 7086238 7086239 Bphy_1346 Bphy_1347     FALSE 0.131 167.000 0.016 NA N NA
 7086240 7086241 Bphy_1348 Bphy_1349   dapD TRUE 0.892 95.000 0.149 1.000 Y NA
 7086241 7086242 Bphy_1349 Bphy_1350 dapD   TRUE 0.962 0.000 0.061 1.000 N NA
 7086242 7086243 Bphy_1350 Bphy_1351     TRUE 0.774 93.000 0.292 1.000 N NA
 7086243 7086244 Bphy_1351 Bphy_1352     TRUE 0.917 16.000 0.115 1.000 N NA
 7086244 7086245 Bphy_1352 Bphy_1353   cls FALSE 0.018 316.000 0.028 1.000 N NA
 7086247 7086248 Bphy_1355 Bphy_1356     TRUE 0.748 57.000 0.094 1.000   NA
 7086249 7086250 Bphy_1357 Bphy_1358     FALSE 0.242 140.000 0.015 NA   NA
 7086250 7086251 Bphy_1358 Bphy_1359   alr FALSE 0.497 75.000 0.023 1.000 N NA
 7086252 7086253 Bphy_1360 Bphy_1361     TRUE 0.839 80.000 0.366 NA   NA
 7086254 7086255 Bphy_1362 Bphy_1363     TRUE 0.975 -3.000 0.064 NA   NA
 7086255 7086256 Bphy_1363 Bphy_1364     TRUE 0.975 -13.000 0.096 1.000   NA
 7086256 7086257 Bphy_1364 Bphy_1365     TRUE 0.989 -3.000 0.209 1.000   NA
 7086258 7086259 Bphy_1366 Bphy_1367     FALSE 0.002 445.000 0.000 1.000 N NA
 7086259 7086260 Bphy_1367 Bphy_1368     FALSE 0.004 361.000 0.000 1.000 N NA
 7086261 7086262 Bphy_1369 Bphy_1370     FALSE 0.172 238.000 0.300 1.000 N NA
 7086263 7086264 Bphy_1371 Bphy_1372     TRUE 0.730 74.000 0.123 1.000   NA
 7086265 7086266 Bphy_1373 Bphy_1374     TRUE 0.734 53.000 0.084 NA   NA
 7086268 7086269 Bphy_1376 Bphy_R0046     FALSE 0.062 175.000 0.000 NA   NA
 7086269 7086270 Bphy_R0046 Bphy_R0047     FALSE 0.294 77.000 0.000 NA   NA
 7086270 7086271 Bphy_R0047 Bphy_R0048     FALSE 0.320 67.000 0.000 NA   NA
 7086271 7086272 Bphy_R0048 Bphy_R0049     FALSE 0.294 77.000 0.000 NA   NA
 7086272 7086273 Bphy_R0049 Bphy_R0050     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 7086273 7086274 Bphy_R0050 Bphy_1377   gltX FALSE 0.118 143.000 0.000 NA   NA
 7086276 7086277 Bphy_1379 Bphy_1380     FALSE 0.297 163.000 0.094 NA   NA
 7086277 7086278 Bphy_1380 Bphy_1381     TRUE 0.993 -3.000 0.389 1.000   NA
 7086278 7086279 Bphy_1381 Bphy_1382     TRUE 0.993 2.000 0.519 0.078   NA
 7086279 7086280 Bphy_1382 Bphy_1383     TRUE 0.934 78.000 0.815 0.078   NA
 7086282 7086283 Bphy_1385 Bphy_R0051     FALSE 0.003 441.000 0.000 NA   NA
 7086283 7086284 Bphy_R0051 Bphy_1386     FALSE 0.033 205.000 0.000 NA   NA
 7086284 7086285 Bphy_1386 Bphy_1387     FALSE 0.006 473.000 0.023 1.000 N NA
 7086285 7086286 Bphy_1387 Bphy_1388     TRUE 0.797 46.000 0.123 1.000 N NA
 7086286 7086287 Bphy_1388 Bphy_1389     FALSE 0.241 159.000 0.059 1.000 N NA
 7086287 7086288 Bphy_1389 Bphy_1390   cysS TRUE 0.641 48.000 0.036 1.000 N NA
 7086289 7086290 Bphy_1391 Bphy_1392     TRUE 0.698 83.000 0.113 1.000   NA
 7086290 7086291 Bphy_1392 Bphy_1393     TRUE 0.920 147.000 0.577 0.002 Y NA
 7086291 7086292 Bphy_1393 Bphy_1394     TRUE 0.761 67.000 0.136 1.000   NA
 7086293 7086294 Bphy_1395 Bphy_1396     FALSE 0.119 248.000 0.208 1.000 N NA
 7086295 7086296 Bphy_1397 Bphy_1398     FALSE 0.145 132.000 0.000 NA   NA
 7086296 7086297 Bphy_1398 Bphy_1399     FALSE 0.277 122.000 0.003 NA   NA
 7086297 7086298 Bphy_1399 Bphy_1400     TRUE 0.952 -13.000 0.033 NA   NA
 7086301 7086302 Bphy_1403 Bphy_1404     TRUE 0.607 70.000 0.053 NA   NA
 7086302 7086303 Bphy_1404 Bphy_1405     FALSE 0.420 131.000 0.073 NA   NA
 7086305 7086306 Bphy_1407 Bphy_1408     FALSE 0.020 320.000 0.031 1.000   NA
 7086306 7086307 Bphy_1408 Bphy_1409     TRUE 0.943 4.000 0.042 1.000   NA
 7086307 7086308 Bphy_1409 Bphy_1410   hisZ FALSE 0.177 210.000 0.161 1.000 N NA
 7086308 7086309 Bphy_1410 Bphy_1411 hisZ   FALSE 0.066 268.000 0.117 NA   NA
 7086309 7086310 Bphy_1411 Bphy_1412     TRUE 0.903 44.000 0.348 NA   NA
 7086310 7086311 Bphy_1412 Bphy_1413     TRUE 0.996 11.000 0.947 NA Y NA
 7086311 7086312 Bphy_1413 Bphy_1414     TRUE 0.935 31.000 0.184 0.056   NA
 7086312 7086313 Bphy_1414 Bphy_1415   hfq TRUE 0.681 59.000 0.058 1.000   NA
 7086313 7086314 Bphy_1415 Bphy_1416 hfq engA FALSE 0.129 191.000 0.036 1.000   NA
 7086314 7086315 Bphy_1416 Bphy_1417 engA   FALSE 0.031 401.000 0.203 1.000   NA
 7086315 7086316 Bphy_1417 Bphy_1418     TRUE 0.909 54.000 0.492 1.000   NA
 7086316 7086317 Bphy_1418 Bphy_1419   hisS TRUE 0.795 87.000 0.259 1.000   NA
 7086317 7086318 Bphy_1419 Bphy_1420 hisS ispG TRUE 0.898 34.000 0.207 1.000 N NA
 7086318 7086319 Bphy_1420 Bphy_1421 ispG   TRUE 0.661 124.000 0.233 1.000   NA
 7086319 7086320 Bphy_1421 Bphy_1422     FALSE 0.077 210.000 0.020 1.000   NA
 7086320 7086321 Bphy_1422 Bphy_1423   ndk TRUE 0.653 109.000 0.156 1.000   NA
 7086323 7086324 Bphy_1425 Bphy_1426     TRUE 0.911 9.000 0.038 NA   NA
 7086324 7086325 Bphy_1426 Bphy_1427     TRUE 0.810 107.000 0.065 NA Y NA
 7086325 7086326 Bphy_1427 Bphy_1428     TRUE 0.838 43.000 0.147 NA   NA
 7086326 7086327 Bphy_1428 Bphy_1429     TRUE 0.980 0.000 0.148 NA   NA
 7086327 7086328 Bphy_1429 Bphy_1430     TRUE 0.961 10.000 0.158 1.000   NA
 7086328 7086329 Bphy_1430 Bphy_1431     TRUE 0.739 59.000 0.104 NA   NA
 7086329 7086330 Bphy_1431 Bphy_1432     TRUE 0.954 17.000 0.281 NA   NA
 7086330 7086331 Bphy_1432 Bphy_1433     FALSE 0.525 85.000 0.029 1.000   NA
 7086331 7086332 Bphy_1433 Bphy_1434     TRUE 0.684 68.000 0.076 1.000   NA
 7086333 7086334 Bphy_1435 Bphy_1436     TRUE 0.667 65.000 0.061 1.000   NA
 7086334 7086335 Bphy_1436 Bphy_1437     FALSE 0.335 122.000 0.022 NA   NA
 7086336 7086337 Bphy_1438 Bphy_1439 ftsB eno FALSE 0.548 143.000 0.241 1.000 N NA
 7086337 7086338 Bphy_1439 Bphy_1440 eno   FALSE 0.450 140.000 0.125 1.000 N NA
 7086338 7086339 Bphy_1440 Bphy_1441   pyrG TRUE 0.984 -3.000 0.138 1.000 N NA
 7086339 7086340 Bphy_1441 Bphy_1442 pyrG   FALSE 0.220 149.000 0.012 1.000   NA
 7086340 7086341 Bphy_1442 Bphy_1443     TRUE 0.595 52.000 0.012 1.000   NA
 7086341 7086342 Bphy_1443 Bphy_1444     FALSE 0.414 99.000 0.022 NA   NA
 7086342 7086343 Bphy_1444 Bphy_1445     TRUE 0.761 36.000 0.061 NA N NA
 7086343 7086344 Bphy_1445 Bphy_1446     TRUE 0.995 -7.000 0.620 0.089 N NA
 7086345 7086346 Bphy_1447 Bphy_1448     TRUE 0.950 -3.000 0.004 NA   NA
 7086346 7086347 Bphy_1448 Bphy_1449     FALSE 0.004 716.000 0.028 1.000 N NA
 7086347 7086348 Bphy_1449 Bphy_1450   lysS TRUE 0.908 108.000 0.162 0.029 Y NA
 7086348 7086349 Bphy_1450 Bphy_1451 lysS   FALSE 0.004 357.000 0.000 1.000 N NA
 7086350 7086351 Bphy_1452 Bphy_1453     TRUE 0.977 16.000 0.625 1.000   NA
 7086351 7086352 Bphy_1453 Bphy_1454   hscA TRUE 0.877 96.000 0.794 1.000 N NA
 7086352 7086353 Bphy_1454 Bphy_1455 hscA hscB TRUE 0.956 92.000 0.634 1.000 Y NA
 7086353 7086354 Bphy_1455 Bphy_1456 hscB   TRUE 0.791 118.000 0.500 1.000   NA
 7086354 7086355 Bphy_1456 Bphy_1457     TRUE 0.837 115.000 0.359 0.001   NA
 7086355 7086356 Bphy_1457 Bphy_1458     TRUE 0.884 60.000 0.448 1.000 N NA
 7086356 7086357 Bphy_1458 Bphy_1459     TRUE 0.751 70.000 0.160 1.000 N NA
 7086357 7086358 Bphy_1459 Bphy_1460     FALSE 0.385 112.000 0.032 1.000 N NA
 7086358 7086359 Bphy_1460 Bphy_1461     FALSE 0.370 114.000 0.024 NA   NA
 7086361 7086362 Bphy_1463 Bphy_1464     TRUE 0.979 57.000 0.923 NA Y NA
 7086366 7086367 Bphy_1468 Bphy_1469     FALSE 0.400 266.000 0.463 1.000 Y NA
 7086367 7086368 Bphy_1469 Bphy_1470   aceE TRUE 0.892 83.000 0.101 1.000 Y NA
 7086369 7086370 Bphy_1471 Bphy_1472     TRUE 0.999 -3.000 0.632 0.028 Y NA
 7086370 7086371 Bphy_1472 Bphy_1473     FALSE 0.005 353.000 0.000 NA   NA
 7086371 7086372 Bphy_1473 Bphy_1474     TRUE 0.907 90.000 1.000 NA   NA
 7086372 7086373 Bphy_1474 Bphy_1475     FALSE 0.005 352.000 0.000 NA   NA
 7086373 7086374 Bphy_1475 Bphy_1476     FALSE 0.034 426.000 0.318 1.000 N NA
 7086376 7086377 Bphy_R0052 Bphy_1478     FALSE 0.024 224.000 0.000 NA   NA
 7086378 7086379 Bphy_1479 Bphy_1480     TRUE 0.982 47.000 0.587 0.092 Y NA
 7086379 7086380 Bphy_1480 Bphy_1481     FALSE 0.270 150.000 0.053 1.000 N NA
 7086382 7086383 Bphy_1483 Bphy_1484     TRUE 0.852 13.000 0.011 1.000   NA
 7086383 7086384 Bphy_1484 Bphy_1485     FALSE 0.062 219.000 0.023 NA   NA
 7086384 7086385 Bphy_1485 Bphy_1486     FALSE 0.542 82.000 0.040 NA   NA
 7086388 7086389 Bphy_1489 Bphy_1490     TRUE 0.746 56.000 0.123 NA N NA
 7086389 7086390 Bphy_1490 Bphy_1491     FALSE 0.001 743.000 0.000 NA N NA
 7086391 7086392 Bphy_1492 Bphy_1493     TRUE 0.821 17.000 0.018 NA   NA
 7086392 7086393 Bphy_1493 Bphy_1494     TRUE 0.950 4.000 0.067 NA   NA
 7086393 7086394 Bphy_1494 Bphy_1495     FALSE 0.366 116.000 0.025 NA   NA
 7086394 7086395 Bphy_1495 Bphy_1496     TRUE 0.804 22.000 0.025 NA   NA
 7086395 7086396 Bphy_1496 Bphy_1497     FALSE 0.389 128.000 0.055 NA   NA
 7086396 7086397 Bphy_1497 Bphy_1498     FALSE 0.012 271.000 0.000 NA   NA
 7086398 7086399 Bphy_1499 Bphy_1500     FALSE 0.001 995.000 0.000 NA   NA
 7086399 7086400 Bphy_1500 Bphy_1501     TRUE 0.923 60.000 0.761 1.000 N NA
 7086400 7086401 Bphy_1501 Bphy_1502     TRUE 0.997 -3.000 0.870 0.078 N NA
 7086401 7086402 Bphy_1502 Bphy_1503     TRUE 0.991 6.000 0.660 0.078 N NA
 7086402 7086403 Bphy_1503 Bphy_1504     TRUE 0.999 -3.000 0.632 0.078 Y NA
 7086403 7086404 Bphy_1504 Bphy_1505     TRUE 0.686 137.000 0.382 1.000   NA
 7086404 7086405 Bphy_1505 Bphy_1506     FALSE 0.457 127.000 0.083 NA   NA
 7086406 7086407 Bphy_1507 Bphy_1508     TRUE 0.910 33.000 0.107 0.024   NA
 7086407 7086408 Bphy_1508 Bphy_1509     TRUE 0.637 43.000 0.022 1.000 N NA
 7086408 7086409 Bphy_1509 Bphy_1510     FALSE 0.387 97.000 0.011 NA   NA
 7086409 7086410 Bphy_1510 Bphy_1511     FALSE 0.501 93.000 0.042 NA   NA
 7086411 7086412 Bphy_1512 Bphy_1513     FALSE 0.018 251.000 0.000 1.000   NA
 7086416 7086417 Bphy_1517 Bphy_1518     FALSE 0.002 476.000 0.000 NA   NA
 7086417 7086418 Bphy_1518 Bphy_1519     FALSE 0.021 275.000 0.003 NA   NA
 7086418 7086419 Bphy_1519 Bphy_1520     FALSE 0.004 396.000 0.000 NA   NA
 7086419 7086420 Bphy_1520 Bphy_1521     FALSE 0.012 270.000 0.000 NA   NA
 7086420 7086421 Bphy_1521 Bphy_1522     FALSE 0.085 159.000 0.000 NA   NA
 7086423 7086424 Bphy_1524 Bphy_1525     TRUE 0.988 11.000 0.900 NA   NA
 7086425 7086426 Bphy_1526 Bphy_1527     FALSE 0.004 386.000 0.000 NA   NA
 7086426 7086427 Bphy_1527 Bphy_1528     FALSE 0.149 130.000 0.000 NA   NA
 7086427 7086428 Bphy_1528 Bphy_1529     FALSE 0.226 99.000 0.000 NA   NA
 7086428 7086429 Bphy_1529 Bphy_1530     TRUE 0.996 4.000 0.481 1.000 Y NA
 7086429 7086430 Bphy_1530 Bphy_1531     TRUE 0.992 22.000 0.594 0.088 Y NA
 7086430 7086431 Bphy_1531 Bphy_1532     FALSE 0.002 481.000 0.000 1.000 N NA
 7086431 7086432 Bphy_1532 Bphy_1533     TRUE 0.963 33.000 0.124 1.000 Y NA
 7086432 7086433 Bphy_1533 Bphy_1534     TRUE 0.899 58.000 0.053 1.000 Y NA
 7086433 7086434 Bphy_1534 Bphy_1535     TRUE 0.873 50.000 0.301 1.000 N NA
 7086434 7086435 Bphy_1535 Bphy_1536     TRUE 0.782 116.000 0.051 1.000 Y NA
 7086437 7086438 Bphy_1538 Bphy_1539     FALSE 0.459 46.000 0.000 1.000   NA
 7086438 7086439 Bphy_1539 Bphy_1540     FALSE 0.421 53.000 0.000 1.000   NA
 7086439 7086440 Bphy_1540 Bphy_1541     FALSE 0.123 135.000 0.000 1.000 N NA
 7086441 7086442 Bphy_1542 Bphy_1543     FALSE 0.309 70.000 0.000 NA   NA
 7086442 7086443 Bphy_1543 Bphy_1544     TRUE 0.941 9.000 0.084 NA   NA
 7086443 7086444 Bphy_1544 Bphy_1545     FALSE 0.013 263.000 0.000 NA   NA
 7086444 7086445 Bphy_1545 Bphy_1546     FALSE 0.298 75.000 0.000 NA   NA
 7086446 7086447 Bphy_1547 Bphy_1548     FALSE 0.159 104.000 0.000 NA N NA
 7086447 7086448 Bphy_1548 Bphy_1549     FALSE 0.488 26.000 0.000 NA N NA
 7086450 7086451 Bphy_R0053 Bphy_1551     FALSE 0.304 72.000 0.000 NA   NA
 7086451 7086452 Bphy_1551 Bphy_1552     TRUE 0.906 55.000 0.535 1.000 N NA
 7086452 7086453 Bphy_1552 Bphy_1553   pheT TRUE 0.664 112.000 0.208 1.000 N NA
 7086453 7086454 Bphy_1553 Bphy_1554 pheT   TRUE 0.943 132.000 0.574 0.000 Y NA
 7086454 7086455 Bphy_1554 Bphy_1555   rplT TRUE 0.782 150.000 0.202 1.000 Y NA
 7086455 7086456 Bphy_1555 Bphy_1556 rplT rpmI TRUE 0.994 30.000 0.928 0.007 Y NA
 7086456 7086457 Bphy_1556 Bphy_1557 rpmI   FALSE 0.485 257.000 0.652 1.000 Y NA
 7086457 7086458 Bphy_1557 Bphy_1558   thrS TRUE 0.887 105.000 0.186 1.000 Y NA
 7086458 7086459 Bphy_1558 Bphy_R0054 thrS   FALSE 0.011 278.000 0.000 NA   NA
 7086459 7086460 Bphy_R0054 Bphy_1559     FALSE 0.214 104.000 0.000 NA   NA
 7086460 7086461 Bphy_1559 Bphy_1560     TRUE 0.803 59.000 0.202 NA N NA
 7086461 7086462 Bphy_1560 Bphy_1561     TRUE 0.697 104.000 0.202 NA   NA
 7086462 7086463 Bphy_1561 Bphy_1562     FALSE 0.089 210.000 0.041 NA   NA
 7086463 7086464 Bphy_1562 Bphy_1563     TRUE 0.998 3.000 0.789 0.001 Y NA
 7086466 7086467 Bphy_1565 Bphy_1566     FALSE 0.253 216.000 0.300 1.000   NA
 7086469 7086470 Bphy_1568 Bphy_1569     TRUE 0.591 47.000 0.002 1.000   NA
 7086470 7086471 Bphy_1569 Bphy_1570     FALSE 0.166 153.000 0.008 1.000 N NA
 7086471 7086472 Bphy_1570 Bphy_1571     FALSE 0.342 158.000 0.051 0.085   NA
 7086473 7086474 Bphy_1572 Bphy_1573     TRUE 0.994 -3.000 0.556 NA   NA
 7086474 7086475 Bphy_1573 Bphy_1574     FALSE 0.397 140.000 0.085 NA   NA
 7086477 7086478 Bphy_1576 Bphy_1577     TRUE 0.991 3.000 0.657 NA   NA
 7086478 7086479 Bphy_1577 Bphy_1578     FALSE 0.373 112.000 0.023 NA   NA
 7086479 7086480 Bphy_1578 Bphy_1579     TRUE 0.963 40.000 1.000 1.000   NA
 7086481 7086482 Bphy_1580 Bphy_1581     FALSE 0.385 168.000 0.188 NA   NA
 7086483 7086484 Bphy_1582 Bphy_1583     TRUE 0.984 15.000 1.000 NA   NA
 7086484 7086485 Bphy_1583 Bphy_1584     TRUE 0.980 -10.000 0.136 NA   NA
 7086485 7086486 Bphy_1584 Bphy_1585     TRUE 0.923 18.000 0.136 NA   NA
 7086488 7086489 Bphy_1587 Bphy_1588   prpE FALSE 0.044 174.000 0.000 NA N NA
 7086490 7086491 Bphy_1589 Bphy_1590     TRUE 0.967 -3.000 0.043 1.000 N NA
 7086492 7086493 Bphy_1591 Bphy_1592 valS   FALSE 0.430 73.000 0.003 1.000 N NA
 7086494 7086495 Bphy_1593 Bphy_1594     FALSE 0.536 111.000 0.078 1.000   NA
 7086495 7086496 Bphy_1594 Bphy_1595     TRUE 0.995 0.000 0.440 0.000   NA
 7086496 7086497 Bphy_1595 Bphy_1596     TRUE 0.992 -7.000 0.448 1.000   NA
 7086498 7086499 Bphy_1597 Bphy_1598     FALSE 0.020 470.000 0.000 NA Y NA
 7086499 7086500 Bphy_1598 Bphy_1599     TRUE 0.972 18.000 0.289 0.006   NA
 7086500 7086501 Bphy_1599 Bphy_1600     TRUE 0.766 47.000 0.079 1.000   NA
 7086501 7086502 Bphy_1600 Bphy_1601     TRUE 0.958 -3.000 0.021 1.000 N NA
 7086502 7086503 Bphy_1601 Bphy_1602     TRUE 0.921 11.000 0.071 1.000 N NA
 7086503 7086504 Bphy_1602 Bphy_1603     TRUE 0.997 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 7086505 7086506 Bphy_1604 Bphy_1605     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.023 Y NA
 7086506 7086507 Bphy_1605 Bphy_1606     TRUE 0.994 -3.000 0.059 1.000 Y NA
 7086507 7086508 Bphy_1606 Bphy_1607     TRUE 0.995 -7.000 0.059 0.077 Y NA
 7086508 7086509 Bphy_1607 Bphy_1608     TRUE 0.919 4.000 0.020 NA   NA
 7086509 7086510 Bphy_1608 Bphy_1609     TRUE 0.796 30.000 0.046 NA   NA
 7086510 7086511 Bphy_1609 Bphy_1610     FALSE 0.277 73.000 0.000 1.000 N NA
 7086511 7086512 Bphy_1610 Bphy_1611     FALSE 0.067 202.000 0.007 NA   NA
 7086516 7086517 Bphy_1615 Bphy_1616     TRUE 0.798 48.000 0.125 NA   NA
 7086518 7086519 Bphy_1617 Bphy_1618     TRUE 0.947 17.000 0.205 1.000   NA
 7086521 7086522 Bphy_1620 Bphy_1621     TRUE 0.807 110.000 0.495 1.000   NA
 7086522 7086523 Bphy_1621 Bphy_1622     TRUE 0.872 71.000 0.492 1.000 N NA
 7086524 7086525 Bphy_1623 Bphy_1624     FALSE 0.005 330.000 0.000 1.000 N NA
 7086525 7086526 Bphy_1624 Bphy_1625     TRUE 0.610 50.000 0.027 1.000 N NA
 7086526 7086527 Bphy_1625 Bphy_1626     FALSE 0.461 109.000 0.058 1.000 N NA
 7086527 7086528 Bphy_1626 Bphy_1627     TRUE 0.992 16.000 0.587 1.000 Y NA
 7086528 7086529 Bphy_1627 Bphy_1628     TRUE 0.998 -3.000 0.935 0.000 N NA
 7086529 7086530 Bphy_1628 Bphy_1629     TRUE 0.729 96.000 0.097 0.002 N NA
 7086531 7086532 Bphy_1630 Bphy_1631     TRUE 0.855 28.000 0.083 NA   NA
 7086532 7086533 Bphy_1631 Bphy_1632     TRUE 0.834 85.000 0.389 NA   NA
 7086535 7086536 Bphy_1634 Bphy_1635     TRUE 0.969 44.000 0.955 0.002 N NA
 7086537 7086538 Bphy_1636 Bphy_1637     FALSE 0.043 247.000 0.030 NA   NA
 7086538 7086539 Bphy_1637 Bphy_1638     FALSE 0.010 279.000 0.000 NA   NA
 7086540 7086541 Bphy_1639 Bphy_1640     FALSE 0.454 41.000 0.000 NA   NA
 7086542 7086543 Bphy_R0055 Bphy_1641     FALSE 0.246 93.000 0.000 NA   NA
 7086545 7086546 Bphy_1643 Bphy_1644     FALSE 0.271 85.000 0.000 NA   NA
 7086548 7086549 Bphy_1646 Bphy_1647     TRUE 0.910 59.000 0.435 0.091 N NA
 7086549 7086550 Bphy_1647 Bphy_1648     TRUE 0.998 -3.000 0.321 1.000 Y NA
 7086550 7086551 Bphy_1648 Bphy_1649     TRUE 0.882 51.000 0.340 1.000 N NA
 7086552 7086553 Bphy_1650 Bphy_1651     FALSE 0.007 321.000 0.000 NA   NA
 7086554 7086555 Bphy_1652 Bphy_1653     TRUE 0.743 121.000 0.429 1.000 N NA
 7086557 7086558 Bphy_1655 Bphy_1656     FALSE 0.322 228.000 0.667 NA   NA
 7086559 7086560 Bphy_1657 Bphy_1658     TRUE 0.744 137.000 0.600 NA   NA
 7086561 7086562 Bphy_1659 Bphy_1660     TRUE 0.981 4.000 0.273 NA   NA
 7086563 7086564 Bphy_R0056 Bphy_1661     FALSE 0.058 178.000 0.000 NA   NA
 7086564 7086565 Bphy_1661 Bphy_1662   aat TRUE 0.871 17.000 0.058 1.000 N NA
 7086565 7086566 Bphy_1662 Bphy_1663 aat   TRUE 0.733 171.000 0.285 1.000 Y NA
 7086566 7086567 Bphy_1663 Bphy_1664     FALSE 0.417 111.000 0.044 1.000 N NA
 7086568 7086569 Bphy_1665 Bphy_1666     FALSE 0.355 138.000 0.050 1.000   NA
 7086569 7086570 Bphy_1666 Bphy_1667     TRUE 0.854 123.000 0.938 1.000   NA
 7086571 7086572 Bphy_1668 Bphy_1669     FALSE 0.004 397.000 0.000 NA   NA
 7086572 7086573 Bphy_1669 Bphy_1670     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7086573 7086574 Bphy_1670 Bphy_1671     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7086574 7086575 Bphy_1671 Bphy_1672     FALSE 0.002 507.000 0.000 1.000 N NA
 7086575 7086576 Bphy_1672 Bphy_1673     TRUE 0.995 4.000 0.167 0.020 Y NA
 7086576 7086577 Bphy_1673 Bphy_1674     TRUE 0.673 20.000 0.000 1.000   NA
 7086577 7086578 Bphy_1674 Bphy_1675     FALSE 0.118 151.000 0.000 1.000   NA
 7086579 7086580 Bphy_1676 Bphy_1677     FALSE 0.315 61.000 0.000 1.000 N NA
 7086580 7086581 Bphy_1677 Bphy_1678     FALSE 0.181 190.000 0.087 NA   NA
 7086581 7086582 Bphy_1678 Bphy_1679     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 7086582 7086583 Bphy_1679 Bphy_1680     TRUE 0.776 60.000 0.143 NA   NA
 7086583 7086584 Bphy_1680 Bphy_1681     TRUE 0.996 -12.000 0.143 0.020 Y NA
 7086584 7086585 Bphy_1681 Bphy_1682     FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 7086585 7086586 Bphy_1682 Bphy_1683     FALSE 0.055 182.000 0.000 NA   NA
 7086586 7086587 Bphy_1683 Bphy_1684     FALSE 0.004 339.000 0.000 NA N NA
 7086588 7086589 Bphy_1685 Bphy_1686     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 7086592 7086593 Bphy_1689 Bphy_1690     TRUE 0.824 60.000 0.000 1.000 Y NA
 7086593 7086594 Bphy_1690 Bphy_1691     FALSE 0.233 205.000 0.000 1.000 Y NA
 7086594 7086595 Bphy_1691 Bphy_1692     TRUE 0.869 -19.000 0.000 NA   NA
 7086595 7086596 Bphy_1692 Bphy_1693     FALSE 0.009 292.000 0.000 NA   NA
 7086596 7086597 Bphy_1693 Bphy_1694     FALSE 0.284 116.000 0.005 1.000 N NA
 7086599 7086600 Bphy_1696 Bphy_1697     TRUE 0.625 134.000 0.147 0.010 N NA
 7086601 7086602 Bphy_R0057 Bphy_R0058     FALSE 0.067 171.000 0.000 NA   NA
 7086602 7086603 Bphy_R0058 Bphy_1698     FALSE 0.002 520.000 0.000 NA   NA
 7086603 7086604 Bphy_1698 Bphy_1699     FALSE 0.013 253.000 0.000 1.000 N NA
 7086604 7086605 Bphy_1699 Bphy_1700   fadE TRUE 0.620 96.000 0.112 1.000 N NA
 7086605 7086606 Bphy_1700 Bphy_1701 fadE fabG TRUE 0.796 131.000 0.113 1.000 Y NA
 7086606 7086607 Bphy_1701 Bphy_1702 fabG   TRUE 0.843 5.000 0.000 1.000   NA
 7086607 7086608 Bphy_1702 Bphy_1703     FALSE 0.147 140.000 0.000 1.000   NA
 7086608 7086609 Bphy_1703 Bphy_1704     TRUE 0.817 99.000 0.045 1.000 Y NA
 7086610 7086611 Bphy_1705 Bphy_1706     TRUE 0.970 20.000 0.600 NA   NA
 7086611 7086612 Bphy_1706 Bphy_1707     TRUE 0.805 92.000 0.400 NA N NA
 7086612 7086613 Bphy_1707 Bphy_1708     FALSE 0.011 251.000 0.000 NA N NA
 7086613 7086614 Bphy_1708 Bphy_1709     TRUE 0.994 11.000 0.500 NA Y NA
 7086614 7086615 Bphy_1709 Bphy_1710     FALSE 0.516 34.000 0.000 NA   NA
 7086618 7086619 Bphy_1713 Bphy_1714     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086622 7086623 Bphy_1717 Bphy_1718     FALSE 0.448 158.000 0.206 NA   NA
 7086623 7086624 Bphy_1718 Bphy_1719     TRUE 0.611 97.000 0.103 NA   NA
 7086624 7086625 Bphy_1719 Bphy_1720     TRUE 0.840 139.000 0.253 1.000 Y NA
 7086625 7086626 Bphy_1720 Bphy_1721   sucA TRUE 0.902 143.000 0.667 1.000 Y NA
 7086626 7086627 Bphy_1721 Bphy_1722 sucA   FALSE 0.004 376.000 0.000 1.000 N NA
 7086628 7086629 Bphy_1723 Bphy_1724     FALSE 0.493 33.000 0.000 1.000 N NA
 7086629 7086630 Bphy_1724 Bphy_1725     FALSE 0.261 81.000 0.000 1.000 N NA
 7086630 7086631 Bphy_1725 Bphy_1726     FALSE 0.518 39.000 0.000 1.000   NA
 7086632 7086633 Bphy_1727 Bphy_1728 truB rbfA TRUE 0.984 24.000 0.318 1.000 Y NA
 7086633 7086634 Bphy_1728 Bphy_1729 rbfA infB TRUE 0.932 113.000 0.530 1.000 Y NA
 7086634 7086635 Bphy_1729 Bphy_1730 infB nusA TRUE 0.784 97.000 0.342 1.000 N NA
 7086635 7086636 Bphy_1730 Bphy_1731 nusA   TRUE 0.996 -3.000 0.759 NA   NA
 7086636 7086637 Bphy_1731 Bphy_1732     FALSE 0.006 423.000 0.004 NA   NA
 7086637 7086638 Bphy_1732 Bphy_1733     TRUE 0.655 61.000 0.074 NA N NA
 7086638 7086639 Bphy_1733 Bphy_1734     FALSE 0.005 311.000 0.000 NA N NA
 7086639 7086640 Bphy_1734 Bphy_1735     TRUE 0.609 108.000 0.140 1.000 N NA
 7086641 7086642 Bphy_1736 Bphy_1737     FALSE 0.034 343.000 0.133 NA   NA
 7086646 7086647 Bphy_1741 Bphy_1742     FALSE 0.363 221.000 0.733 NA   NA
 7086652 7086653 Bphy_1747 Bphy_1748     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 7086653 7086654 Bphy_1748 Bphy_1749     TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 7086656 7086657 Bphy_1751 Bphy_1752     TRUE 0.557 77.000 0.040 NA   NA
 7086659 7086660 Bphy_1754 Bphy_1755     FALSE 0.118 187.000 0.026 NA   NA
 7086660 7086661 Bphy_1755 Bphy_1756     TRUE 0.701 97.000 0.182 NA   NA
 7086661 7086662 Bphy_1756 Bphy_1757     TRUE 0.731 65.000 0.114 NA   NA
 7086663 7086664 Bphy_1758 Bphy_1759     FALSE 0.311 118.000 0.010 NA   NA
 7086666 7086667 Bphy_1761 Bphy_1762     FALSE 0.007 285.000 0.000 NA N NA
 7086667 7086668 Bphy_1762 Bphy_1763     FALSE 0.095 154.000 0.000 NA   NA
 7086668 7086669 Bphy_1763 Bphy_1764     FALSE 0.203 108.000 0.000 NA   NA
 7086670 7086671 Bphy_1765 Bphy_1766     FALSE 0.183 116.000 0.000 NA   NA
 7086671 7086672 Bphy_1766 Bphy_1767     FALSE 0.191 113.000 0.000 NA   NA
 7086673 7086674 Bphy_1768 Bphy_1769     FALSE 0.002 636.000 0.000 NA   NA
 7086676 7086677 Bphy_1771 Bphy_1772     TRUE 0.939 16.000 0.200 NA N NA
 7086677 7086678 Bphy_1772 Bphy_1773     TRUE 0.975 17.000 0.094 NA Y NA
 7086679 7086680 Bphy_1774 Bphy_1775     FALSE 0.316 124.000 0.019 NA   NA
 7086680 7086681 Bphy_1775 Bphy_1776     FALSE 0.164 162.000 0.029 NA N NA
 7086682 7086683 Bphy_1777 Bphy_1778     TRUE 0.976 68.000 1.000 NA Y NA
 7086684 7086685 Bphy_1779 Bphy_1780     FALSE 0.072 291.000 0.000 NA Y NA
 7086685 7086686 Bphy_1780 Bphy_1781     FALSE 0.275 84.000 0.000 NA   NA
 7086686 7086687 Bphy_1781 Bphy_1782     FALSE 0.002 679.000 0.000 NA   NA
 7086687 7086688 Bphy_1782 Bphy_1783     TRUE 0.990 -16.000 0.027 1.000 Y NA
 7086688 7086689 Bphy_1783 Bphy_1784   astD TRUE 0.949 10.000 0.126 1.000 N NA
 7086689 7086690 Bphy_1784 Bphy_1785 astD   TRUE 0.987 11.000 0.875 1.000 N NA
 7086690 7086691 Bphy_1785 Bphy_1786     TRUE 0.999 -3.000 0.778 0.000 Y NA
 7086691 7086692 Bphy_1786 Bphy_1787   argD TRUE 0.990 29.000 0.833 1.000 Y NA
 7086692 7086693 Bphy_1787 Bphy_1788 argD   TRUE 0.581 125.000 0.176 1.000 N NA
 7086693 7086694 Bphy_1788 Bphy_1789     TRUE 0.905 34.000 0.235 1.000 N NA
 7086694 7086695 Bphy_1789 Bphy_1790     TRUE 0.894 94.000 0.150 1.000 Y NA
 7086695 7086696 Bphy_1790 Bphy_1791     TRUE 0.980 29.000 0.150 0.010 Y NA
 7086698 7086699 Bphy_1793 Bphy_1794     FALSE 0.341 118.000 0.012 1.000   NA
 7086702 7086703 Bphy_1797 Bphy_1798   glgA TRUE 0.699 182.000 0.307 1.000 Y NA
 7086703 7086704 Bphy_1798 Bphy_1799 glgA   FALSE 0.009 278.000 0.000 1.000 N NA
 7086704 7086705 Bphy_1799 Bphy_1800     FALSE 0.009 399.000 0.029 NA   NA
 7086706 7086707 Bphy_1801 Bphy_1802     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 7086709 7086710 Bphy_1804 Bphy_1805     FALSE 0.136 144.000 0.000 1.000   NA
 7086712 7086713 Bphy_1807 Bphy_1808     FALSE 0.005 367.000 0.000 NA   NA
 7086713 7086714 Bphy_1808 Bphy_1809     TRUE 0.775 55.000 0.133 1.000 N NA
 7086714 7086715 Bphy_1809 Bphy_1810     TRUE 0.989 -3.000 0.233 1.000 N NA
 7086715 7086716 Bphy_1810 Bphy_1811     FALSE 0.528 57.000 0.008 NA   NA
 7086716 7086717 Bphy_1811 Bphy_1812     TRUE 0.920 3.000 0.012 NA   NA
 7086717 7086718 Bphy_1812 Bphy_1813     FALSE 0.492 65.000 0.012 1.000 N NA
 7086718 7086719 Bphy_1813 Bphy_1814     TRUE 0.687 31.000 0.008 1.000 N NA
 7086719 7086720 Bphy_1814 Bphy_1815     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086721 7086722 Bphy_1816 Bphy_1817     FALSE 0.430 147.000 0.130 NA   NA
 7086723 7086724 Bphy_1818 Bphy_1819     TRUE 0.895 52.000 0.400 NA   NA
 7086724 7086725 Bphy_1819 Bphy_1820     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7086725 7086726 Bphy_1820 Bphy_1821     FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7086727 7086728 Bphy_1822 Bphy_1823     TRUE 0.996 -3.000 0.812 NA   NA
 7086729 7086730 Bphy_1824 Bphy_1825     TRUE 0.965 19.000 0.429 1.000   NA
 7086736 7086737 Bphy_1831 Bphy_1832     TRUE 0.945 18.000 0.222 NA   NA
 7086737 7086738 Bphy_1832 Bphy_1833     TRUE 0.995 0.000 0.900 NA   NA
 7086738 7086739 Bphy_1833 Bphy_1834     TRUE 0.996 -3.000 0.700 1.000   NA
 7086739 7086740 Bphy_1834 Bphy_1835     TRUE 0.990 -7.000 0.333 NA   NA
 7086740 7086741 Bphy_1835 Bphy_1836     TRUE 0.900 95.000 1.000 NA   NA
 7086741 7086742 Bphy_1836 Bphy_1837     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7086742 7086743 Bphy_1837 Bphy_1839     TRUE 0.884 -10.000 0.000 NA   NA
 7086744 7086745 Bphy_1840 Bphy_1841     TRUE 0.688 88.000 0.143 1.000 N NA
 7086745 7086746 Bphy_1841 Bphy_1842     FALSE 0.011 278.000 0.000 NA   NA
 7086747 7086748 Bphy_1843 Bphy_1844     FALSE 0.195 111.000 0.000 NA   NA
 7086748 7086749 Bphy_1844 Bphy_1845     TRUE 0.558 153.000 0.000 0.093 Y NA
 7086750 7086751 Bphy_1846 Bphy_1847     FALSE 0.257 89.000 0.000 NA   NA
 7086759 7086760 Bphy_R0059 Bphy_1855     FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 7086760 7086761 Bphy_1855 Bphy_1856     FALSE 0.464 40.000 0.000 NA   NA
 7086761 7086762 Bphy_1856 Bphy_1857     TRUE 0.906 56.000 0.517 NA   NA
 7086763 7086764 Bphy_1858 Bphy_1859     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7086764 7086765 Bphy_1859 Bphy_1860     FALSE 0.445 42.000 0.000 NA   NA
 7086765 7086766 Bphy_1860 Bphy_1861     FALSE 0.382 52.000 0.000 NA   NA
 7086766 7086767 Bphy_1861 Bphy_1862     FALSE 0.312 69.000 0.000 NA   NA
 7086767 7086768 Bphy_1862 Bphy_1863     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086768 7086769 Bphy_1863 Bphy_1864     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7086770 7086771 Bphy_1865 Bphy_1866     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7086771 7086772 Bphy_1866 Bphy_1867     FALSE 0.376 53.000 0.000 NA   NA
 7086773 7086774 Bphy_1868 Bphy_1869     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7086774 7086775 Bphy_1869 Bphy_1870     TRUE 0.987 9.000 0.750 NA   NA
 7086775 7086776 Bphy_1870 Bphy_1871     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7086776 7086777 Bphy_1871 Bphy_1872     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086777 7086778 Bphy_1872 Bphy_1873     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086778 7086779 Bphy_1873 Bphy_1874     TRUE 0.953 4.000 0.074 NA   NA
 7086779 7086780 Bphy_1874 Bphy_1875     TRUE 0.982 -3.000 0.111 NA   NA
 7086780 7086781 Bphy_1875 Bphy_1876     TRUE 0.675 119.000 0.250 NA   NA
 7086781 7086782 Bphy_1876 Bphy_1877     TRUE 0.990 4.000 0.667 NA   NA
 7086782 7086783 Bphy_1877 Bphy_1878     FALSE 0.339 62.000 0.000 NA   NA
 7086783 7086784 Bphy_1878 Bphy_1879     TRUE 0.977 3.000 0.182 NA   NA
 7086784 7086785 Bphy_1879 Bphy_1880     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7086785 7086786 Bphy_1880 Bphy_1881     TRUE 0.995 -3.000 0.714 NA   NA
 7086786 7086787 Bphy_1881 Bphy_1882     TRUE 0.987 0.000 0.286 NA   NA
 7086787 7086788 Bphy_1882 Bphy_1883     TRUE 0.818 64.000 0.222 NA   NA
 7086788 7086789 Bphy_1883 Bphy_1884     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 7086789 7086790 Bphy_1884 Bphy_1885     TRUE 0.563 28.000 0.000 NA   NA
 7086790 7086791 Bphy_1885 Bphy_1886     TRUE 0.924 -3.000 0.000 1.000   NA
 7086791 7086792 Bphy_1886 Bphy_1887     FALSE 0.466 45.000 0.000 1.000   NA
 7086792 7086793 Bphy_1887 Bphy_1888     TRUE 0.990 0.000 0.350 1.000   NA
 7086793 7086794 Bphy_1888 Bphy_1889     TRUE 0.968 8.000 0.200 NA   NA
 7086794 7086795 Bphy_1889 Bphy_1890     FALSE 0.376 53.000 0.000 NA   NA
 7086795 7086796 Bphy_1890 Bphy_1891     FALSE 0.071 169.000 0.000 NA   NA
 7086796 7086797 Bphy_1891 Bphy_1892     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7086797 7086798 Bphy_1892 Bphy_1893     FALSE 0.002 509.000 0.000 NA   NA
 7086798 7086799 Bphy_1893 Bphy_1894     FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 7086799 7086800 Bphy_1894 Bphy_1895     TRUE 0.991 -3.000 0.286 NA   NA
 7086800 7086801 Bphy_1895 Bphy_1896     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086801 7086802 Bphy_1896 Bphy_1897     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086802 7086803 Bphy_1897 Bphy_1898     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086803 7086804 Bphy_1898 Bphy_1899     FALSE 0.386 51.000 0.000 NA   NA
 7086804 7086805 Bphy_1899 Bphy_1900     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086805 7086806 Bphy_1900 Bphy_1901     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086806 7086807 Bphy_1901 Bphy_1902     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086807 7086808 Bphy_1902 Bphy_1903     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7086808 7086809 Bphy_1903 Bphy_1904     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086809 7086810 Bphy_1904 Bphy_1905     TRUE 0.873 -16.000 0.000 NA   NA
 7086810 7086811 Bphy_1905 Bphy_1906     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086811 7086812 Bphy_1906 Bphy_1907     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086812 7086813 Bphy_1907 Bphy_1908     TRUE 0.698 14.000 0.000 NA   NA
 7086813 7086814 Bphy_1908 Bphy_1909     FALSE 0.006 330.000 0.000 NA   NA
 7086814 7086815 Bphy_1909 Bphy_1910     FALSE 0.211 105.000 0.000 NA   NA
 7086816 7086817 Bphy_1911 Bphy_1912     FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 7086817 7086818 Bphy_1912 Bphy_1913     FALSE 0.006 339.000 0.000 NA   NA
 7086818 7086819 Bphy_1913 Bphy_1914     TRUE 0.904 45.000 0.367 NA   NA
 7086819 7086820 Bphy_1914 Bphy_1915     FALSE 0.043 192.000 0.000 NA   NA
 7086820 7086821 Bphy_1915 Bphy_1916     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7086821 7086822 Bphy_1916 Bphy_1917     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7086822 7086823 Bphy_1917 Bphy_1918     FALSE 0.540 31.000 0.000 NA   NA
 7086823 7086824 Bphy_1918 Bphy_1919     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7086824 7086825 Bphy_1919 Bphy_1920     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086825 7086826 Bphy_1920 Bphy_1921     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7086826 7086827 Bphy_1921 Bphy_1922     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7086831 7086832 Bphy_1926 Bphy_1927     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7086833 7086834 Bphy_1928 Bphy_1929     TRUE 0.865 1.000 0.000 NA   NA
 7086834 7086835 Bphy_1929 Bphy_1930     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7086835 7086836 Bphy_1930 Bphy_1931     TRUE 0.988 -16.000 0.333 NA   NA
 7086836 7086837 Bphy_1931 Bphy_1932     FALSE 0.454 41.000 0.000 NA   NA
 7086837 7086838 Bphy_1932 Bphy_1933     FALSE 0.003 449.000 0.000 NA   NA
 7086838 7086839 Bphy_1933 Bphy_1934     TRUE 0.712 13.000 0.000 NA   NA
 7086839 7086840 Bphy_1934 Bphy_1935     FALSE 0.033 205.000 0.000 NA   NA
 7086840 7086841 Bphy_1935 Bphy_1936     FALSE 0.006 346.000 0.000 NA   NA
 7086841 7086842 Bphy_1936 Bphy_1937     TRUE 0.996 -3.000 0.916 NA   NA
 7086842 7086843 Bphy_1937 Bphy_1938     FALSE 0.239 168.000 0.067 NA   NA
 7086844 7086845 Bphy_1939 Bphy_1940     FALSE 0.049 303.000 0.133 NA   NA
 7086845 7086846 Bphy_1940 Bphy_1941     TRUE 0.710 58.000 0.079 NA   NA
 7086846 7086847 Bphy_1941 Bphy_1942     FALSE 0.112 174.000 0.009 1.000 N NA
 7086847 7086848 Bphy_1942 Bphy_1943     FALSE 0.337 99.000 0.004 1.000 N NA
 7086848 7086849 Bphy_1943 Bphy_1944     FALSE 0.034 238.000 0.015 NA N NA
 7086849 7086850 Bphy_1944 Bphy_1945     FALSE 0.046 248.000 0.053 NA N NA
 7086850 7086851 Bphy_1945 Bphy_1946     TRUE 0.927 39.000 0.246 0.009 N NA
 7086851 7086852 Bphy_1946 Bphy_1947     TRUE 0.988 17.000 0.200 0.085 Y NA
 7086854 7086855 Bphy_1949 Bphy_1950     FALSE 0.204 149.000 0.014 NA   NA
 7086855 7086856 Bphy_1950 Bphy_1951     TRUE 0.742 40.000 0.049 NA   NA
 7086856 7086857 Bphy_1951 Bphy_1952     FALSE 0.373 142.000 0.077 NA   NA
 7086858 7086859 Bphy_1953 Bphy_1954     TRUE 0.784 38.000 0.067 NA   NA
 7086859 7086860 Bphy_1954 Bphy_1955     TRUE 0.988 -3.000 0.233 NA N NA
 7086860 7086861 Bphy_1955 Bphy_1956     TRUE 0.922 63.000 0.775 NA   NA
 7086861 7086862 Bphy_1956 Bphy_1957     TRUE 0.826 88.000 0.386 NA   NA
 7086862 7086863 Bphy_1957 Bphy_1958     FALSE 0.004 348.000 0.000 NA N NA
 7086865 7086866 Bphy_1960 Bphy_1961     TRUE 0.979 23.000 1.000 1.000   NA
 7086867 7086868 Bphy_1962 Bphy_1963     FALSE 0.083 217.000 0.048 NA   NA
 7086869 7086870 Bphy_1964 Bphy_1965     FALSE 0.087 158.000 0.000 NA   NA
 7086870 7086871 Bphy_1965 Bphy_1966     FALSE 0.341 204.000 0.438 NA   NA
 7086871 7086872 Bphy_1966 Bphy_1967     FALSE 0.010 282.000 0.000 NA   NA
 7086873 7086874 Bphy_1968 Bphy_1969     TRUE 0.827 16.000 0.022 1.000 N NA
 7086875 7086876 Bphy_1970 Bphy_1971     TRUE 0.997 5.000 0.750 1.000 Y NA
 7086876 7086877 Bphy_1971 Bphy_1972     TRUE 0.859 -70.000 0.000 NA   NA
 7086877 7086878 Bphy_1972 Bphy_R0006     FALSE 0.003 435.000 0.000 NA   NA
 7086878 7086879 Bphy_R0006 Bphy_R0007     FALSE 0.125 140.000 0.000 NA   NA
 7086879 7086880 Bphy_R0007 Bphy_R0060     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7086880 7086881 Bphy_R0060 Bphy_R0061     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7086881 7086882 Bphy_R0061 Bphy_R0008     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 7086882 7086883 Bphy_R0008 Bphy_1973     FALSE 0.003 464.000 0.000 NA   NA
 7086884 7086885 Bphy_1974 Bphy_1975     FALSE 0.199 199.000 0.139 NA   NA
 7086885 7086886 Bphy_1975 Bphy_1976     TRUE 0.695 94.000 0.163 NA   NA
 7086886 7086887 Bphy_1976 Bphy_1977     FALSE 0.158 217.000 0.152 NA   NA
 7086888 7086889 Bphy_1978 Bphy_1979     TRUE 0.803 30.000 0.050 NA   NA
 7086890 7086891 Bphy_1980 Bphy_1981     TRUE 0.871 78.000 0.500 NA   NA
 7086893 7086894 Bphy_1983 Bphy_1984     TRUE 0.997 0.000 0.438 1.000 Y NA
 7086894 7086895 Bphy_1984 Bphy_1985     TRUE 0.994 -3.000 0.531 1.000 N NA
 7086895 7086896 Bphy_1985 Bphy_1986     TRUE 0.946 34.000 0.500 NA   NA
 7086896 7086897 Bphy_1986 Bphy_1987     TRUE 0.895 74.000 0.643 NA   NA
 7086897 7086898 Bphy_1987 Bphy_1988     FALSE 0.273 160.000 0.088 NA N NA
 7086899 7086900 Bphy_1989 Bphy_1990     TRUE 0.998 -3.000 0.224 0.055 Y NA
 7086900 7086901 Bphy_1990 Bphy_1991     TRUE 0.937 34.000 0.030 1.000 Y NA
 7086901 7086902 Bphy_1991 Bphy_1992     TRUE 0.989 11.000 0.087 0.003 Y NA
 7086902 7086903 Bphy_1992 Bphy_1993     TRUE 0.798 56.000 0.155 NA   NA
 7086903 7086904 Bphy_1993 Bphy_1994     FALSE 0.056 241.000 0.046 NA   NA
 7086904 7086905 Bphy_1994 Bphy_1995     TRUE 0.742 42.000 0.058 NA   NA
 7086905 7086906 Bphy_1995 Bphy_1996     TRUE 0.984 0.000 0.202 NA   NA
 7086906 7086907 Bphy_1996 Bphy_1997     TRUE 0.989 26.000 0.340 0.001 Y NA
 7086907 7086908 Bphy_1997 Bphy_1998     TRUE 0.986 23.000 0.175 0.001 Y NA
 7086908 7086909 Bphy_1998 Bphy_1999     TRUE 0.993 19.000 0.451 0.004 Y NA
 7086909 7086910 Bphy_1999 Bphy_2000     TRUE 0.993 20.000 0.484 0.002 Y NA
 7086910 7086911 Bphy_2000 Bphy_2001     TRUE 0.874 160.000 0.442 0.004 Y NA
 7086911 7086912 Bphy_2001 Bphy_2002     TRUE 0.995 15.000 0.500 0.004 Y NA
 7086912 7086913 Bphy_2002 Bphy_2003     TRUE 0.998 1.000 0.515 0.004 Y NA
 7086913 7086914 Bphy_2003 Bphy_2004     TRUE 0.956 96.000 0.395 0.004 Y NA
 7086914 7086915 Bphy_2004 Bphy_2005     TRUE 0.998 -3.000 0.343 0.004 Y NA
 7086915 7086916 Bphy_2005 Bphy_2006     TRUE 0.828 171.000 0.355 0.004 Y NA
 7086916 7086917 Bphy_2006 Bphy_2007     TRUE 0.996 10.000 0.483 0.004 Y NA
 7086917 7086918 Bphy_2007 Bphy_2008     TRUE 0.991 19.000 0.328 0.002 Y NA
 7086918 7086919 Bphy_2008 Bphy_2009     TRUE 0.978 63.000 0.507 0.002 Y NA
 7086919 7086920 Bphy_2009 Bphy_R0062     FALSE 0.081 161.000 0.000 NA   NA
 7086920 7086921 Bphy_R0062 Bphy_2010   secG FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7086921 7086922 Bphy_2010 Bphy_2011 secG tpiA TRUE 0.729 87.000 0.184 1.000 N NA
 7086922 7086923 Bphy_2011 Bphy_2012 tpiA   FALSE 0.325 156.000 0.099 1.000 N NA
 7086923 7086924 Bphy_2012 Bphy_2013     FALSE 0.321 129.000 0.034 1.000 N NA
 7086924 7086925 Bphy_2013 Bphy_2014     FALSE 0.239 315.000 0.335 1.000 Y NA
 7086925 7086926 Bphy_2014 Bphy_2015     FALSE 0.134 168.000 0.020 NA N NA
 7086928 7086929 Bphy_2017 Bphy_2018     FALSE 0.010 462.000 0.073 1.000 N NA
 7086929 7086930 Bphy_2018 Bphy_2019     TRUE 0.989 21.000 0.466 1.000 Y NA
 7086930 7086931 Bphy_2019 Bphy_2020     FALSE 0.367 125.000 0.046 1.000 N NA
 7086931 7086932 Bphy_2020 Bphy_2021   ilvH TRUE 0.905 100.000 0.092 0.001 Y NA
 7086932 7086933 Bphy_2021 Bphy_2022 ilvH   TRUE 0.945 112.000 0.371 0.001 Y NA
 7086934 7086935 Bphy_2023 Bphy_2024     TRUE 0.968 -3.000 0.039 NA   NA
 7086935 7086936 Bphy_2024 Bphy_2025     TRUE 0.884 17.000 0.064 NA   NA
 7086936 7086937 Bphy_2025 Bphy_2026     TRUE 0.863 58.000 0.310 NA   NA
 7086937 7086938 Bphy_2026 Bphy_2027     FALSE 0.006 489.000 0.021 NA   NA
 7086938 7086939 Bphy_2027 Bphy_2028     TRUE 0.911 35.000 0.255 NA   NA
 7086939 7086940 Bphy_2028 Bphy_2029     FALSE 0.446 230.000 0.256 1.000 Y NA
 7086940 7086941 Bphy_2029 Bphy_2030     FALSE 0.201 217.000 0.246 1.000 N NA
 7086941 7086942 Bphy_2030 Bphy_2031     TRUE 0.983 3.000 0.273 NA   NA
 7086942 7086943 Bphy_2031 Bphy_2032     TRUE 0.711 41.000 0.039 NA   NA
 7086943 7086944 Bphy_2032 Bphy_2033     FALSE 0.010 257.000 0.000 NA N NA
 7086945 7086946 Bphy_2034 Bphy_2035     TRUE 0.974 -3.000 0.061 NA   NA
 7086948 7086949 Bphy_2037 Bphy_2038     TRUE 0.995 0.000 0.929 1.000   NA
 7086949 7086950 Bphy_2038 Bphy_2039     TRUE 0.935 60.000 0.923 NA   NA
 7086950 7086951 Bphy_2039 Bphy_2040     TRUE 0.823 66.000 0.250 NA   NA
 7086951 7086952 Bphy_2040 Bphy_2041     TRUE 0.968 3.000 0.125 1.000 N NA
 7086952 7086953 Bphy_2041 Bphy_2042     TRUE 0.993 -3.000 0.417 NA   NA
 7086953 7086954 Bphy_2042 Bphy_2043     TRUE 0.887 88.000 0.727 NA   NA
 7086955 7086956 Bphy_2044 Bphy_2045     TRUE 0.605 23.000 0.000 NA   NA
 7086956 7086957 Bphy_2045 Bphy_2046     FALSE 0.002 736.000 0.000 NA   NA
 7086957 7086958 Bphy_2046 Bphy_2047     TRUE 0.980 -3.000 0.091 NA   NA
 7086958 7086959 Bphy_2047 Bphy_2048     TRUE 0.984 -3.000 0.127 NA   NA
 7086960 7086961 Bphy_2049 Bphy_2050     TRUE 0.789 45.000 0.102 NA   NA
 7086961 7086962 Bphy_2050 Bphy_2051     TRUE 0.980 -3.000 0.091 NA   NA
 7086962 7086963 Bphy_2051 Bphy_2052     FALSE 0.020 395.000 0.114 NA   NA
 7086963 7086964 Bphy_2052 Bphy_2053     FALSE 0.326 149.000 0.077 1.000 N NA
 7086964 7086965 Bphy_2053 Bphy_2054     TRUE 0.997 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 7086965 7086966 Bphy_2054 Bphy_2055     FALSE 0.003 741.000 0.006 1.000 N NA
 7086966 7086967 Bphy_2055 Bphy_2056     TRUE 0.987 55.000 0.877 0.001 Y NA
 7086967 7086968 Bphy_2056 Bphy_2057     TRUE 0.948 58.000 0.091 0.001 Y NA
 7086968 7086969 Bphy_2057 Bphy_2058     TRUE 0.993 -3.000 0.192 0.001   NA
 7086969 7086970 Bphy_2058 Bphy_2059     TRUE 0.967 0.000 0.071 NA   NA
 7086970 7086971 Bphy_2059 Bphy_2060     FALSE 0.058 229.000 0.031 NA   NA
 7086971 7086972 Bphy_2060 Bphy_2061   mgsA TRUE 0.558 65.000 0.032 1.000 N NA
 7086972 7086973 Bphy_2061 Bphy_2062 mgsA   TRUE 0.568 72.000 0.046 1.000 N NA
 7086974 7086975 Bphy_2063 Bphy_2064 upp   FALSE 0.009 365.000 0.002 NA   NA
 7086975 7086976 Bphy_2064 Bphy_2065     FALSE 0.027 287.000 0.034 NA   NA
 7086976 7086977 Bphy_2065 Bphy_2066     FALSE 0.037 262.000 0.043 1.000 N NA
 7086977 7086978 Bphy_2066 Bphy_2067     TRUE 0.986 7.000 0.066 1.000 Y NA
 7086978 7086979 Bphy_2067 Bphy_2068     TRUE 0.944 3.000 0.044 NA   NA
 7086979 7086980 Bphy_2068 Bphy_2069     TRUE 0.839 68.000 0.307 NA   NA
 7086980 7086981 Bphy_2069 Bphy_2070     FALSE 0.271 161.000 0.074 NA   NA
 7086981 7086982 Bphy_2070 Bphy_2071     TRUE 0.977 10.000 0.417 NA N NA
 7086982 7086983 Bphy_2071 Bphy_2072     FALSE 0.294 77.000 0.000 NA   NA
 7086983 7086984 Bphy_2072 Bphy_2073     FALSE 0.035 202.000 0.000 NA   NA
 7086984 7086985 Bphy_2073 Bphy_2074     FALSE 0.155 127.000 0.000 NA   NA
 7086986 7086987 Bphy_2075 Bphy_2076     FALSE 0.119 248.000 0.000 NA Y NA
 7086987 7086988 Bphy_2076 Bphy_2077     FALSE 0.165 116.000 0.000 1.000 N NA
 7086991 7086992 Bphy_2080 Bphy_2081     TRUE 0.582 75.000 0.039 1.000   NA
 7086993 7086994 Bphy_2082 Bphy_2083     FALSE 0.002 460.000 0.000 1.000 N NA
 7086994 7086995 Bphy_2083 Bphy_2084     TRUE 0.767 83.000 0.218 1.000 N NA
 7086995 7086996 Bphy_2084 Bphy_2085     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 7086996 7086997 Bphy_2085 Bphy_2086     TRUE 0.901 69.000 0.647 NA   NA
 7086997 7086998 Bphy_2086 Bphy_2087   purT TRUE 0.754 44.000 0.070 NA   NA
 7086999 7087000 Bphy_2088 Bphy_2089     FALSE 0.489 112.000 0.068 NA   NA
 7087004 7087005 Bphy_2093 Bphy_2094     FALSE 0.068 221.000 0.050 NA N NA
 7087007 7087008 Bphy_2096 Bphy_2097     TRUE 0.909 10.000 0.048 1.000 N NA
 7087008 7087009 Bphy_2097 Bphy_2098     FALSE 0.506 75.000 0.021 NA   NA
 7087010 7087011 Bphy_2099 Bphy_2100     TRUE 0.961 111.000 0.688 0.011 Y NA
 7087012 7087013 Bphy_2101 Bphy_2102     TRUE 0.933 37.000 0.431 NA   NA
 7087013 7087014 Bphy_2102 Bphy_2103     FALSE 0.427 126.000 0.067 NA   NA
 7087014 7087015 Bphy_2103 Bphy_2104     FALSE 0.037 250.000 0.025 1.000 N NA
 7087015 7087016 Bphy_2104 Bphy_2105     FALSE 0.044 191.000 0.000 NA   NA
 7087017 7087018 Bphy_2106 Bphy_2107     FALSE 0.368 133.000 0.055 NA   NA
 7087018 7087019 Bphy_2107 Bphy_2108     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 7087019 7087020 Bphy_2108 Bphy_2109     FALSE 0.023 379.000 0.115 NA   NA
 7087020 7087021 Bphy_2109 Bphy_2110     TRUE 0.967 -3.000 0.053 NA N NA
 7087021 7087022 Bphy_2110 Bphy_2111     TRUE 0.952 0.000 0.047 NA N NA
 7087024 7087025 Bphy_2113 Bphy_2114     FALSE 0.329 124.000 0.028 1.000 N NA
 7087026 7087027 Bphy_2115 Bphy_2116     FALSE 0.549 30.000 0.000 NA   NA
 7087027 7087028 Bphy_2116 Bphy_2117     TRUE 0.770 66.000 0.155 NA   NA
 7087028 7087029 Bphy_2117 Bphy_2118     TRUE 0.654 112.000 0.216 NA N NA
 7087029 7087030 Bphy_2118 Bphy_2119     FALSE 0.242 170.000 0.075 NA   NA
 7087030 7087031 Bphy_2119 Bphy_2120     FALSE 0.003 540.000 0.000 1.000   NA
 7087031 7087032 Bphy_2120 Bphy_2121     FALSE 0.516 166.000 0.394 1.000 N NA
 7087033 7087034 Bphy_2122 Bphy_2123     FALSE 0.060 186.000 0.000 1.000   NA
 7087034 7087035 Bphy_2123 Bphy_2124     TRUE 0.954 55.000 0.106 0.001 Y NA
 7087035 7087036 Bphy_2124 Bphy_2125     FALSE 0.027 310.000 0.007 0.088   NA
 7087036 7087037 Bphy_2125 Bphy_2126     FALSE 0.058 225.000 0.024 NA   NA
 7087040 7087041 Bphy_R0063 Bphy_2129     FALSE 0.214 104.000 0.000 NA   NA
 7087042 7087043 Bphy_2131 Bphy_2132     FALSE 0.011 370.000 0.000 0.064   NA
 7087043 7087044 Bphy_2132 Bphy_2133     FALSE 0.103 158.000 0.000 1.000   NA
 7087044 7087045 Bphy_2133 Bphy_2134     FALSE 0.002 1037.000 0.000 1.000   NA
 7087046 7087047 Bphy_2135 Bphy_2136     FALSE 0.292 78.000 0.000 NA   NA
 7087049 7087050 Bphy_2138 Bphy_2139     FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 7087050 7087051 Bphy_2139 Bphy_2140     FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 7087051 7087052 Bphy_2140 Bphy_2141     TRUE 0.993 0.000 0.024 0.064 Y NA
 7087052 7087053 Bphy_2141 Bphy_2142     FALSE 0.134 173.000 0.016 NA   NA
 7087053 7087054 Bphy_2142 Bphy_2143     FALSE 0.527 142.000 0.196 NA   NA
 7087054 7087055 Bphy_2143 Bphy_2144     FALSE 0.235 157.000 0.044 NA   NA
 7087056 7087057 Bphy_2145 Bphy_2146     FALSE 0.368 201.000 0.467 NA   NA
 7087057 7087058 Bphy_2146 Bphy_2147     FALSE 0.039 197.000 0.000 NA   NA
 7087058 7087059 Bphy_2147 Bphy_2148     FALSE 0.121 142.000 0.000 NA   NA
 7087059 7087060 Bphy_2148 Bphy_2149     FALSE 0.036 201.000 0.000 NA   NA
 7087060 7087061 Bphy_2149 Bphy_2150     TRUE 0.919 82.000 1.000 NA   NA
 7087062 7087063 Bphy_2151 Bphy_2152     FALSE 0.261 88.000 0.000 NA   NA
 7087063 7087064 Bphy_2152 Bphy_2153     FALSE 0.003 429.000 0.000 NA   NA
 7087064 7087065 Bphy_2153 Bphy_2154     TRUE 0.995 -3.000 0.647 NA   NA
 7087066 7087067 Bphy_2155 Bphy_2156     TRUE 0.931 23.000 0.000 1.000 Y NA
 7087068 7087069 Bphy_2157 Bphy_2158     FALSE 0.105 149.000 0.000 NA   NA
 7087070 7087071 Bphy_2159 Bphy_2160     TRUE 0.994 -28.000 0.136 1.000 Y NA
 7087074 7087075 Bphy_2163 Bphy_2164     FALSE 0.071 328.000 0.000 0.084 Y NA
 7087075 7087076 Bphy_2164 Bphy_2165     TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.010 Y NA
 7087076 7087077 Bphy_2165 Bphy_2166     TRUE 0.977 31.000 0.267 1.000 Y NA
 7087077 7087078 Bphy_2166 Bphy_2167     FALSE 0.002 581.000 0.000 1.000 N NA
 7087079 7087080 Bphy_2168 Bphy_2169   nadE FALSE 0.248 130.000 0.009 1.000 N NA
 7087081 7087082 Bphy_2170 Bphy_2171     TRUE 0.823 19.000 0.025 NA   NA
 7087082 7087083 Bphy_2171 Bphy_2172     FALSE 0.207 155.000 0.000 0.060   NA
 7087085 7087086 Bphy_2174 Bphy_2175   fabG TRUE 0.912 67.000 0.529 0.081 N NA
 7087086 7087087 Bphy_2175 Bphy_2176 fabG   FALSE 0.267 231.000 0.588 NA N NA
 7087088 7087089 Bphy_2177 Bphy_2178     TRUE 0.998 3.000 0.765 1.000 Y NA
 7087089 7087090 Bphy_2178 Bphy_2179     TRUE 0.994 0.000 0.023 0.001 Y NA
 7087093 7087094 Bphy_2182 Bphy_2183     FALSE 0.290 127.000 0.006 1.000   NA
 7087094 7087095 Bphy_2183 Bphy_2184     FALSE 0.078 164.000 0.000 NA   NA
 7087096 7087097 Bphy_2185 Bphy_2186     TRUE 0.972 3.000 0.141 NA   NA
 7087097 7087098 Bphy_2186 Bphy_2187   dcd TRUE 0.651 85.000 0.105 1.000 N NA
 7087098 7087099 Bphy_2187 Bphy_2188 dcd   FALSE 0.007 309.000 0.000 1.000 N NA
 7087099 7087100 Bphy_2188 Bphy_2189     FALSE 0.348 103.000 0.011 1.000 N NA
 7087101 7087102 Bphy_2190 Bphy_2191   metG FALSE 0.002 599.000 0.000 1.000 N NA
 7087102 7087103 Bphy_2191 Bphy_2192 metG   FALSE 0.006 326.000 0.000 NA   NA
 7087104 7087105 Bphy_2193 Bphy_2194     TRUE 0.973 17.000 0.575 NA   NA
 7087106 7087107 Bphy_2195 Bphy_2196     TRUE 0.954 1.000 0.048 NA   NA
 7087107 7087108 Bphy_2196 Bphy_2197   panC FALSE 0.037 248.000 0.018 NA   NA
 7087108 7087109 Bphy_2197 Bphy_2198 panC   TRUE 0.987 19.000 0.342 1.000 Y NA
 7087111 7087112 Bphy_2200 Bphy_2201     FALSE 0.140 134.000 0.000 NA   NA
 7087113 7087114 Bphy_2202 Bphy_2203     FALSE 0.276 124.000 0.005 NA   NA
 7087115 7087116 Bphy_2204 Bphy_2205   cobD TRUE 0.997 -3.000 0.191 1.000 Y NA
 7087116 7087117 Bphy_2205 Bphy_2206 cobD   TRUE 0.991 4.000 0.463 0.007 N NA
 7087117 7087118 Bphy_2206 Bphy_2207     TRUE 0.968 6.000 0.180 1.000 N NA
 7087119 7087120 Bphy_2208 Bphy_2209   cobS TRUE 0.930 -15.000 0.010 1.000 N NA
 7087120 7087121 Bphy_2209 Bphy_2210 cobS cobT TRUE 0.959 56.000 0.164 0.007 Y NA
 7087121 7087122 Bphy_2210 Bphy_2211 cobT   TRUE 0.983 7.000 0.042 1.000 Y NA
 7087122 7087123 Bphy_2211 Bphy_2212     TRUE 0.994 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 7087123 7087124 Bphy_2212 Bphy_2213     TRUE 0.588 111.000 0.071 0.074 N NA
 7087125 7087126 Bphy_2214 Bphy_2215     TRUE 0.963 -3.000 0.025 NA   NA
 7087126 7087127 Bphy_2215 Bphy_2216     FALSE 0.212 144.000 0.010 NA   NA
 7087127 7087128 Bphy_2216 Bphy_2217     FALSE 0.508 69.000 0.016 NA   NA
 7087128 7087129 Bphy_2217 Bphy_2218     FALSE 0.112 194.000 0.038 NA   NA
 7087130 7087131 Bphy_2219 Bphy_2220     FALSE 0.440 71.000 0.005 1.000 N NA
 7087132 7087133 Bphy_2221 Bphy_2222     FALSE 0.296 157.000 0.083 1.000 N NA
 7087134 7087135 Bphy_2223 Bphy_2224     FALSE 0.450 94.000 0.025 NA   NA
 7087135 7087136 Bphy_2224 Bphy_2225     TRUE 0.913 47.000 0.494 1.000 N NA
 7087137 7087138 Bphy_2226 Bphy_2227     TRUE 0.993 4.000 0.631 0.053   NA
 7087138 7087139 Bphy_2227 Bphy_2228     TRUE 0.841 27.000 0.059 1.000   NA
 7087140 7087141 Bphy_2229 Bphy_2230     FALSE 0.045 186.000 0.000 1.000 N NA
 7087141 7087142 Bphy_2230 Bphy_2231     TRUE 0.931 36.000 0.411 1.000 N NA
 7087142 7087143 Bphy_2231 Bphy_2232     TRUE 0.978 26.000 0.636 0.000 N NA
 7087143 7087144 Bphy_2232 Bphy_2233     TRUE 0.804 106.000 0.048 1.000 Y NA
 7087144 7087145 Bphy_2233 Bphy_2234     TRUE 0.985 -3.000 0.139 NA   NA
 7087145 7087146 Bphy_2234 Bphy_2235     TRUE 0.950 19.000 0.273 NA   NA
 7087147 7087148 Bphy_2236 Bphy_2237     TRUE 0.757 102.000 0.341 NA N NA
 7087151 7087152 Bphy_2240 Bphy_2241     TRUE 0.674 75.000 0.093 NA   NA
 7087152 7087153 Bphy_2241 Bphy_2242     TRUE 0.844 83.000 0.040 NA Y NA
 7087153 7087154 Bphy_2242 Bphy_2243     FALSE 0.449 199.000 0.109 NA Y NA
 7087154 7087155 Bphy_2243 Bphy_2244     TRUE 0.999 -19.000 0.857 0.006 Y NA
 7087155 7087156 Bphy_2244 Bphy_2245     TRUE 0.920 13.000 0.094 1.000 N NA
 7087157 7087158 Bphy_2246 Bphy_2247     TRUE 0.894 32.000 0.200 NA N NA
 7087158 7087159 Bphy_2247 Bphy_2248     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 7087159 7087160 Bphy_2248 Bphy_2249     TRUE 0.990 -3.000 0.250 NA   NA
 7087162 7087163 Bphy_2251 Bphy_2252     TRUE 0.936 114.000 0.654 NA Y NA
 7087163 7087164 Bphy_2252 Bphy_2253     TRUE 0.998 2.000 0.758 0.074 Y NA
 7087164 7087165 Bphy_2253 Bphy_2254     TRUE 0.996 -3.000 0.823 1.000   NA
 7087165 7087166 Bphy_2254 Bphy_2255     TRUE 0.939 69.000 0.731 0.022   NA
 7087166 7087167 Bphy_2255 Bphy_2256     TRUE 0.891 37.000 0.221 1.000 N NA
 7087167 7087168 Bphy_2256 Bphy_2257     FALSE 0.073 195.000 0.009 1.000 N NA
 7087168 7087169 Bphy_2257 Bphy_2258   ureA TRUE 0.728 119.000 0.015 1.000 Y NA
 7087169 7087170 Bphy_2258 Bphy_2259 ureA   TRUE 0.997 11.000 0.595 0.001 Y NA
 7087170 7087171 Bphy_2259 Bphy_2260   ureC TRUE 0.967 89.000 0.486 0.001 Y NA
 7087171 7087172 Bphy_2260 Bphy_2261 ureC ureE TRUE 0.946 2.000 0.000 0.001 N NA
 7087172 7087173 Bphy_2261 Bphy_2262 ureE   TRUE 0.991 -13.000 0.000 0.002 Y NA
 7087173 7087174 Bphy_2262 Bphy_2263     TRUE 0.992 26.000 0.550 0.002 Y NA
 7087175 7087176 Bphy_2264 Bphy_2265     FALSE 0.482 104.000 0.052 NA   NA
 7087176 7087177 Bphy_2265 Bphy_2266     TRUE 0.936 31.000 0.349 NA   NA
 7087177 7087178 Bphy_2266 Bphy_2267     FALSE 0.012 427.000 0.067 1.000 N NA
 7087179 7087180 Bphy_2268 Bphy_2269     TRUE 0.983 -3.000 0.116 NA   NA
 7087180 7087181 Bphy_2269 Bphy_2270     TRUE 0.798 31.000 0.050 NA   NA
 7087181 7087182 Bphy_2270 Bphy_2271     TRUE 0.980 12.000 0.067 1.000 Y NA
 7087182 7087183 Bphy_2271 Bphy_2272     FALSE 0.002 460.000 0.000 1.000 N NA
 7087183 7087184 Bphy_2272 Bphy_2273     TRUE 0.993 -3.000 0.250 0.054   NA
 7087184 7087185 Bphy_2273 Bphy_2274     TRUE 0.986 -3.000 0.143 1.000   NA
 7087185 7087186 Bphy_2274 Bphy_2275     FALSE 0.125 233.000 0.066 0.052   NA
 7087186 7087187 Bphy_2275 Bphy_2276     FALSE 0.183 116.000 0.000 NA   NA
 7087187 7087188 Bphy_2276 Bphy_2277     FALSE 0.123 141.000 0.000 NA   NA
 7087188 7087189 Bphy_2277 Bphy_2278     FALSE 0.003 451.000 0.000 NA   NA
 7087189 7087190 Bphy_2278 Bphy_2279     FALSE 0.002 653.000 0.000 NA   NA
 7087190 7087191 Bphy_2279 Bphy_2280     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7087191 7087192 Bphy_2280 Bphy_2281     FALSE 0.057 180.000 0.000 NA   NA
 7087194 7087195 Bphy_2283 Bphy_2284     FALSE 0.001 1075.000 0.000 NA   NA
 7087195 7087196 Bphy_2284 Bphy_2285     FALSE 0.002 480.000 0.000 NA   NA
 7087196 7087197 Bphy_2285 Bphy_2286     FALSE 0.002 610.000 0.000 NA   NA
 7087200 7087201 Bphy_2289 Bphy_2290     TRUE 0.990 6.000 0.129 1.000 Y NA
 7087201 7087202 Bphy_2290 Bphy_2291     TRUE 0.992 8.000 0.250 1.000 Y NA
 7087202 7087203 Bphy_2291 Bphy_2292     TRUE 0.978 -3.000 0.080 NA   NA
 7087204 7087205 Bphy_2293 Bphy_2294     FALSE 0.126 148.000 0.000 1.000   NA
 7087205 7087206 Bphy_2294 Bphy_2295     FALSE 0.023 316.000 0.000 0.002   NA
 7087206 7087207 Bphy_2295 Bphy_2296     TRUE 0.824 56.000 0.000 NA Y NA
 7087207 7087208 Bphy_2296 Bphy_2297     TRUE 0.988 -3.000 0.000 NA Y NA
 7087208 7087209 Bphy_2297 Bphy_2298     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 7087209 7087210 Bphy_2298 Bphy_2299     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7087211 7087212 Bphy_2300 Bphy_2301     FALSE 0.038 183.000 0.000 NA N NA
 7087212 7087213 Bphy_2301 Bphy_2302     FALSE 0.083 160.000 0.000 NA   NA
 7087214 7087215 Bphy_2303 Bphy_2304     TRUE 0.890 23.000 0.105 NA   NA
 7087216 7087217 Bphy_2305 Bphy_2306     FALSE 0.121 150.000 0.000 1.000   NA
 7087217 7087218 Bphy_2306 Bphy_2307     FALSE 0.386 51.000 0.000 NA   NA
 7087218 7087219 Bphy_2307 Bphy_2308     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7087219 7087220 Bphy_2308 Bphy_2309     FALSE 0.515 85.000 0.035 NA   NA
 7087220 7087221 Bphy_2309 Bphy_2310     TRUE 0.965 -13.000 0.064 NA   NA
 7087221 7087222 Bphy_2310 Bphy_2311     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7087222 7087223 Bphy_2311 Bphy_2312     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7087223 7087224 Bphy_2312 Bphy_2313     FALSE 0.540 31.000 0.000 NA   NA
 7087224 7087225 Bphy_2313 Bphy_2314     TRUE 0.995 -10.000 0.070 0.087 Y NA
 7087225 7087226 Bphy_2314 Bphy_2315     FALSE 0.089 157.000 0.000 NA   NA
 7087226 7087227 Bphy_2315 Bphy_2316     TRUE 0.986 -18.000 0.269 NA   NA
 7087227 7087228 Bphy_2316 Bphy_2317     TRUE 0.995 8.000 0.455 1.000 Y NA
 7087228 7087229 Bphy_2317 Bphy_2318     TRUE 0.996 -15.000 0.214 1.000 Y NA
 7087229 7087230 Bphy_2318 Bphy_2319     TRUE 0.985 11.000 0.027 0.005 Y NA
 7087230 7087231 Bphy_2319 Bphy_2320     FALSE 0.355 200.000 0.000 0.004 Y NA
 7087233 7087234 Bphy_2322 Bphy_2323     TRUE 0.658 51.000 0.047 1.000 N NA
 7087234 7087235 Bphy_2323 Bphy_2324   pyrB TRUE 0.976 42.000 0.452 1.000 Y NA
 7087235 7087236 Bphy_2324 Bphy_2325 pyrB   TRUE 0.941 68.000 0.247 1.000 Y NA
 7087236 7087237 Bphy_2325 Bphy_2326     TRUE 0.974 -13.000 0.109 1.000 N NA
 7087237 7087238 Bphy_2326 Bphy_2327     TRUE 0.989 -3.000 0.263 NA N NA
 7087238 7087239 Bphy_2327 Bphy_2328     FALSE 0.030 256.000 0.012 NA   NA
 7087239 7087240 Bphy_2328 Bphy_2329     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7087240 7087241 Bphy_2329 Bphy_2330     FALSE 0.283 82.000 0.000 NA   NA
 7087242 7087243 Bphy_2331 Bphy_2332     FALSE 0.005 339.000 0.000 1.000 N NA
 7087244 7087245 Bphy_2333 Bphy_2334 groEL groES TRUE 0.983 45.000 0.600 0.087 Y NA
 7087247 7087248 Bphy_2336 Bphy_2337     FALSE 0.005 361.000 0.000 NA   NA
 7087248 7087249 Bphy_2337 Bphy_2338     FALSE 0.376 53.000 0.000 NA   NA
 7087249 7087250 Bphy_2338 Bphy_2339     FALSE 0.004 415.000 0.000 1.000   NA
 7087250 7087251 Bphy_2339 Bphy_2340     TRUE 0.999 -3.000 0.469 0.006 Y NA
 7087251 7087252 Bphy_2340 Bphy_2341     TRUE 0.973 76.000 0.518 0.006 Y NA
 7087252 7087253 Bphy_2341 Bphy_2342     FALSE 0.280 214.000 0.020 1.000 Y NA
 7087254 7087255 Bphy_2343 Bphy_2344     TRUE 0.928 23.000 0.216 1.000 N NA
 7087255 7087256 Bphy_2344 Bphy_2345     FALSE 0.016 247.000 0.000 NA   NA
 7087258 7087259 Bphy_2347 Bphy_2348     FALSE 0.217 103.000 0.000 NA   NA
 7087260 7087261 Bphy_2349 Bphy_2350     TRUE 0.996 15.000 0.889 0.073 Y NA
 7087261 7087262 Bphy_2350 Bphy_2351     TRUE 0.975 71.000 0.667 0.073 Y NA
 7087262 7087263 Bphy_2351 Bphy_2352     TRUE 0.974 67.000 0.800 1.000 Y NA
 7087263 7087264 Bphy_2352 Bphy_2353     TRUE 0.995 12.000 0.800 1.000 Y NA
 7087265 7087266 Bphy_2354 Bphy_2355     FALSE 0.107 285.000 0.000 0.089 Y NA
 7087267 7087268 Bphy_2356 Bphy_2357     FALSE 0.404 169.000 0.000 1.000 Y NA
 7087271 7087272 Bphy_2360 Bphy_2361     FALSE 0.532 32.000 0.000 NA   NA
 7087273 7087274 Bphy_2362 Bphy_2363     TRUE 0.671 48.000 0.048 1.000 N NA
 7087274 7087275 Bphy_2363 Bphy_2364     FALSE 0.148 177.000 0.032 NA   NA
 7087277 7087278 Bphy_2366 Bphy_2367     TRUE 0.990 3.000 0.067 1.000 Y NA
 7087278 7087279 Bphy_2367 Bphy_2368     TRUE 0.999 -3.000 0.867 1.000 Y NA
 7087279 7087280 Bphy_2368 Bphy_2369     TRUE 0.971 82.000 0.633 0.073 Y NA
 7087282 7087283 Bphy_2371 Bphy_2372     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7087284 7087285 Bphy_2373 Bphy_2374     FALSE 0.083 160.000 0.000 NA   NA
 7087286 7087287 Bphy_2375 Bphy_2376     FALSE 0.002 724.000 0.000 NA   NA
 7087287 7087288 Bphy_2376 Bphy_2377     TRUE 0.993 -3.000 0.375 NA   NA
 7087290 7087291 Bphy_2379 Bphy_2380     TRUE 0.816 95.000 0.031 1.000 Y NA
 7087291 7087292 Bphy_2380 Bphy_2381     TRUE 0.988 5.000 0.024 0.073 Y NA
 7087292 7087293 Bphy_2381 Bphy_2382     TRUE 0.980 12.000 0.024 0.073 Y NA
 7087293 7087294 Bphy_2382 Bphy_2383     TRUE 0.989 36.000 1.000 1.000 Y NA
 7087294 7087295 Bphy_2383 Bphy_2384     FALSE 0.228 185.000 0.118 1.000 N NA
 7087295 7087296 Bphy_2384 Bphy_2385     FALSE 0.010 272.000 0.000 1.000 N NA
 7087296 7087297 Bphy_2385 Bphy_2386     FALSE 0.036 211.000 0.000 1.000   NA
 7087297 7087298 Bphy_2386 Bphy_2387     FALSE 0.056 181.000 0.000 NA   NA
 7087298 7087299 Bphy_2387 Bphy_2388     FALSE 0.012 267.000 0.000 NA   NA
 7087299 7087300 Bphy_2388 Bphy_2389     FALSE 0.039 197.000 0.000 NA   NA
 7087300 7087301 Bphy_2389 Bphy_2390     FALSE 0.045 190.000 0.000 NA   NA
 7087301 7087302 Bphy_2390 Bphy_2391     TRUE 0.614 22.000 0.000 NA   NA
 7087306 7087307 Bphy_2395 Bphy_2396     FALSE 0.236 96.000 0.000 NA   NA
 7087307 7087308 Bphy_2396 Bphy_2397     TRUE 0.729 103.000 0.250 NA   NA
 7087310 7087311 Bphy_2399 Bphy_2400     TRUE 0.946 41.000 0.100 1.000 Y NA
 7087311 7087312 Bphy_2400 Bphy_2401     TRUE 0.649 104.000 0.136 1.000   NA
 7087312 7087313 Bphy_2401 Bphy_2402     FALSE 0.546 105.000 0.071 1.000   NA
 7087313 7087314 Bphy_2402 Bphy_2403     FALSE 0.060 171.000 0.000 1.000 N NA
 7087314 7087315 Bphy_2403 Bphy_2404     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7087315 7087316 Bphy_2404 Bphy_2405     TRUE 0.861 18.000 0.038 1.000   NA
 7087317 7087318 Bphy_2406 Bphy_2407     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7087318 7087319 Bphy_2407 Bphy_2408     FALSE 0.176 119.000 0.000 NA   NA
 7087319 7087320 Bphy_2408 Bphy_2409     FALSE 0.002 533.000 0.000 1.000 N NA
 7087320 7087321 Bphy_2409 Bphy_2410     TRUE 0.717 100.000 0.000 1.000 Y NA
 7087321 7087322 Bphy_2410 Bphy_2411     TRUE 0.975 11.000 0.436 NA N NA
 7087322 7087323 Bphy_2411 Bphy_2412     FALSE 0.197 88.000 0.000 NA N NA
 7087326 7087327 Bphy_2415 Bphy_2416     FALSE 0.004 390.000 0.000 NA   NA
 7087328 7087329 Bphy_2417 Bphy_2418     TRUE 0.572 187.000 0.867 NA   NA
 7087329 7087330 Bphy_2418 Bphy_2419     FALSE 0.311 231.000 0.688 1.000 N NA
 7087331 7087332 Bphy_2420 Bphy_2421     TRUE 0.893 23.000 0.109 NA   NA
 7087332 7087333 Bphy_2421 Bphy_2422     TRUE 0.983 34.000 0.241 0.001 Y NA
 7087335 7087336 Bphy_2424 Bphy_2425     FALSE 0.008 301.000 0.000 NA   NA
 7087336 7087337 Bphy_2425 Bphy_2426     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7087337 7087338 Bphy_2426 Bphy_2427     FALSE 0.208 106.000 0.000 NA   NA
 7087339 7087340 Bphy_2428 Bphy_2429     TRUE 0.608 64.000 0.049 1.000 N NA
 7087342 7087343 Bphy_2431 Bphy_2432     FALSE 0.025 201.000 0.000 NA N NA
 7087343 7087344 Bphy_2432 Bphy_2433     TRUE 0.930 78.000 0.233 NA Y NA
 7087345 7087346 Bphy_2434 Bphy_2435     TRUE 0.998 -3.000 0.316 1.000 Y NA
 7087351 7087352 Bphy_2440 Bphy_2441     FALSE 0.549 120.000 0.121 NA   NA
 7087352 7087353 Bphy_2441 Bphy_2442     TRUE 0.862 43.000 0.194 NA   NA
 7087354 7087355 Bphy_2443 Bphy_2444     TRUE 0.922 24.000 0.192 NA   NA
 7087355 7087356 Bphy_2444 Bphy_2445     TRUE 0.994 -3.000 0.483 NA   NA
 7087356 7087357 Bphy_2445 Bphy_2446     TRUE 0.987 -3.000 0.172 NA   NA
 7087357 7087358 Bphy_2446 Bphy_2447     TRUE 0.989 -3.000 0.222 NA   NA
 7087358 7087359 Bphy_2447 Bphy_2448   nrdR FALSE 0.106 173.000 0.012 NA N NA
 7087359 7087360 Bphy_2448 Bphy_2449 nrdR glyA TRUE 0.932 7.000 0.069 NA N NA
 7087361 7087362 Bphy_2450 Bphy_2451     FALSE 0.432 125.000 0.058 1.000   NA
 7087362 7087363 Bphy_2451 Bphy_2452     TRUE 0.624 164.000 0.593 1.000   NA
 7087363 7087364 Bphy_2452 Bphy_2453     TRUE 0.995 12.000 0.556 0.082 Y NA
 7087364 7087365 Bphy_2453 Bphy_2454     TRUE 0.994 -3.000 0.460 1.000   NA
 7087365 7087366 Bphy_2454 Bphy_2455   tolB TRUE 0.771 117.000 0.215 0.004   NA
 7087366 7087367 Bphy_2455 Bphy_2456 tolB   TRUE 0.968 20.000 0.592 1.000 N NA
 7087367 7087368 Bphy_2456 Bphy_2457     TRUE 0.942 16.000 0.167 1.000   NA
 7087368 7087369 Bphy_2457 Bphy_R0064     FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 7087370 7087371 Bphy_2458 Bphy_2459     TRUE 0.985 0.000 0.200 1.000   NA
 7087373 7087374 Bphy_2461 Bphy_2462     TRUE 0.737 125.000 0.000 0.003 Y NA
 7087375 7087376 Bphy_2463 Bphy_2464     FALSE 0.185 176.000 0.056 NA   NA
 7087377 7087378 Bphy_2465 Bphy_2466     FALSE 0.037 258.000 0.022 1.000   NA
 7087380 7087381 Bphy_2468 Bphy_2469     TRUE 0.835 113.000 0.035 0.019 Y NA
 7087381 7087382 Bphy_2469 Bphy_2470     TRUE 0.849 107.000 0.105 1.000 Y NA
 7087382 7087383 Bphy_2470 Bphy_2471     TRUE 0.994 6.000 0.158 0.011 Y NA
 7087383 7087384 Bphy_2471 Bphy_2472     TRUE 0.955 115.000 1.000 1.000 Y NA
 7087384 7087385 Bphy_2472 Bphy_2473     TRUE 0.954 93.000 0.600 1.000 Y NA
 7087385 7087386 Bphy_2473 Bphy_2474     TRUE 0.973 56.000 0.600 1.000 Y NA
 7087386 7087387 Bphy_2474 Bphy_2475     TRUE 0.966 70.000 0.600 1.000 Y NA
 7087387 7087388 Bphy_2475 Bphy_2476     TRUE 0.883 77.000 0.600 1.000 N NA
 7087389 7087390 Bphy_2477 Bphy_2478     FALSE 0.003 527.000 0.000 1.000   NA
 7087392 7087393 Bphy_2480 Bphy_2481     FALSE 0.144 141.000 0.000 1.000   NA
 7087393 7087394 Bphy_2481 Bphy_2482     FALSE 0.056 181.000 0.000 NA   NA
 7087394 7087395 Bphy_2482 Bphy_2483     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 7087397 7087398 Bphy_2485 Bphy_2486 mutL miaA TRUE 0.915 35.000 0.188 0.086 N NA
 7087400 7087401 Bphy_2488 Bphy_2489     TRUE 0.837 55.000 0.217 NA   NA
 7087401 7087402 Bphy_2489 Bphy_2490     TRUE 0.974 -7.000 0.104 NA N NA
 7087402 7087403 Bphy_2490 Bphy_2491     TRUE 0.975 -3.000 0.071 1.000 N NA
 7087403 7087404 Bphy_2491 Bphy_2492     TRUE 0.853 49.000 0.234 1.000 N NA
 7087404 7087405 Bphy_2492 Bphy_2493     TRUE 0.973 -3.000 0.063 1.000 N NA
 7087405 7087406 Bphy_2493 Bphy_2494   panB TRUE 0.721 43.000 0.055 1.000 N NA
 7087407 7087408 Bphy_2495 Bphy_2496     TRUE 0.825 25.000 0.054 1.000 N NA
 7087408 7087409 Bphy_2496 Bphy_2497   dnaK FALSE 0.434 256.000 0.236 0.002 Y NA
 7087409 7087410 Bphy_2497 Bphy_2498 dnaK   FALSE 0.179 155.000 0.012 NA   NA
 7087410 7087411 Bphy_2498 Bphy_2499     TRUE 0.960 17.000 0.333 NA   NA
 7087413 7087414 Bphy_2501 Bphy_2502   hemH TRUE 0.676 43.000 0.035 1.000 N NA
 7087414 7087415 Bphy_2502 Bphy_2503 hemH hrcA FALSE 0.210 158.000 0.048 NA N NA
 7087416 7087417 Bphy_2504 Bphy_2505 ppnK   TRUE 0.672 99.000 0.170 1.000 N NA
 7087419 7087420 Bphy_2507 Bphy_2508     TRUE 0.592 150.000 0.358 NA   NA
 7087420 7087421 Bphy_2508 Bphy_2509     TRUE 0.749 98.000 0.259 NA   NA
 7087421 7087422 Bphy_2509 Bphy_2510     FALSE 0.004 382.000 0.000 NA   NA
 7087422 7087423 Bphy_2510 Bphy_2511     FALSE 0.261 88.000 0.000 NA   NA
 7087425 7087426 Bphy_2513 Bphy_2514     TRUE 0.936 65.000 0.070 0.001 Y NA
 7087426 7087427 Bphy_2514 Bphy_2515   glcE TRUE 0.623 161.000 0.013 0.014 Y NA
 7087427 7087428 Bphy_2515 Bphy_2516 glcE glcF TRUE 0.985 8.000 0.013 0.053 Y NA
 7087428 7087429 Bphy_2516 Bphy_2517 glcF   FALSE 0.437 115.000 0.052 NA   NA
 7087429 7087430 Bphy_2517 Bphy_2518     TRUE 0.965 15.000 0.357 NA   NA
 7087431 7087432 Bphy_2519 Bphy_2520     FALSE 0.182 160.000 0.027 1.000 N NA
 7087432 7087433 Bphy_2520 Bphy_2521     FALSE 0.024 449.000 0.000 1.000 Y NA
 7087433 7087434 Bphy_2521 Bphy_2522     FALSE 0.004 381.000 0.000 1.000 N NA
 7087434 7087435 Bphy_2522 Bphy_2523     TRUE 0.819 124.000 0.117 1.000 Y NA
 7087436 7087437 Bphy_2524 Bphy_2525 queA tgt TRUE 0.964 85.000 0.360 0.000 Y NA
 7087437 7087438 Bphy_2525 Bphy_2526 tgt yajC FALSE 0.294 198.000 0.325 NA N NA
 7087438 7087439 Bphy_2526 Bphy_2527 yajC secD TRUE 0.793 121.000 0.083 NA Y NA
 7087439 7087440 Bphy_2527 Bphy_2528 secD secF TRUE 0.992 18.000 0.332 0.001 Y NA
 7087441 7087442 Bphy_2529 Bphy_2530     FALSE 0.017 246.000 0.000 NA   NA
 7087442 7087443 Bphy_2530 Bphy_2531     TRUE 0.644 53.000 0.040 NA   NA
 7087443 7087444 Bphy_2531 Bphy_2532     TRUE 0.966 9.000 0.200 NA   NA
 7087445 7087446 Bphy_2533 Bphy_2534     TRUE 0.991 8.000 1.000 NA   NA
 7087446 7087447 Bphy_2534 Bphy_2535     TRUE 0.986 -7.000 0.200 NA   NA
 7087447 7087448 Bphy_2535 Bphy_2536     TRUE 0.988 -3.000 0.200 NA   NA
 7087448 7087449 Bphy_2536 Bphy_2537     FALSE 0.245 132.000 0.004 NA   NA
 7087449 7087450 Bphy_2537 Bphy_2538     FALSE 0.120 172.000 0.006 NA   NA
 7087450 7087451 Bphy_2538 Bphy_2539     TRUE 0.851 84.000 0.452 NA   NA
 7087452 7087453 Bphy_2540 Bphy_2541     FALSE 0.060 176.000 0.000 NA   NA
 7087453 7087454 Bphy_2541 Bphy_2542     TRUE 0.988 1.000 0.144 0.001   NA
 7087454 7087455 Bphy_2542 Bphy_2543     TRUE 0.950 70.000 0.829 0.001   NA
 7087456 7087457 Bphy_2544 Bphy_2545   mnmA TRUE 0.834 44.000 0.158 1.000 N NA
 7087457 7087458 Bphy_2545 Bphy_2546 mnmA   FALSE 0.009 376.000 0.021 1.000 N NA
 7087459 7087460 Bphy_2547 Bphy_2548     FALSE 0.208 210.000 0.000 NA Y NA
 7087461 7087462 Bphy_2549 Bphy_2550     TRUE 0.951 24.000 0.396 1.000 N NA
 7087462 7087463 Bphy_2550 Bphy_2551     FALSE 0.150 196.000 0.019 0.014 N NA
 7087463 7087464 Bphy_2551 Bphy_2552     TRUE 0.986 -3.000 0.161 1.000 N NA
 7087464 7087465 Bphy_2552 Bphy_2553   purH TRUE 0.780 45.000 0.101 1.000 N NA
 7087465 7087466 Bphy_2553 Bphy_2554 purH ruvC FALSE 0.374 107.000 0.023 1.000 N NA
 7087468 7087469 Bphy_2556 Bphy_2557 ruvA ruvB TRUE 0.888 83.000 0.011 0.001 Y NA
 7087470 7087471 Bphy_2558 Bphy_2559     TRUE 0.760 25.000 0.021 1.000 N NA
 7087471 7087472 Bphy_2559 Bphy_2560     TRUE 0.937 44.000 0.026 0.027 Y NA
 7087474 7087475 Bphy_2562 Bphy_2563   rpsI FALSE 0.022 270.000 0.003 NA   NA
 7087475 7087476 Bphy_2563 Bphy_2564 rpsI rplM TRUE 0.996 12.000 0.601 0.007 Y NA
 7087478 7087479 Bphy_R0009 Bphy_2566     TRUE 0.861 -38.000 0.000 NA   NA
 7087479 7087480 Bphy_2566 Bphy_2567     TRUE 0.866 17.000 0.048 NA   NA
 7087482 7087483 Bphy_2569 Bphy_2570     FALSE 0.012 266.000 0.000 NA   NA
 7087483 7087484 Bphy_2570 Bphy_2571     TRUE 0.994 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 7087484 7087485 Bphy_2571 Bphy_2572     TRUE 0.999 0.000 0.933 0.009 Y NA
 7087485 7087486 Bphy_2572 Bphy_2573     TRUE 0.944 89.000 0.267 0.072 Y NA
 7087486 7087487 Bphy_2573 Bphy_2574     FALSE 0.064 370.000 0.044 1.000 Y NA
 7087487 7087488 Bphy_2574 Bphy_2575     FALSE 0.349 164.000 0.147 1.000 N NA
 7087490 7087491 Bphy_2577 Bphy_2578     TRUE 0.993 11.000 0.370 1.000 Y NA
 7087491 7087492 Bphy_2578 Bphy_2579     FALSE 0.152 259.000 0.021 1.000 Y NA
 7087492 7087493 Bphy_2579 Bphy_2580     TRUE 0.991 17.000 0.523 1.000 Y NA
 7087497 7087498 Bphy_2584 Bphy_2585   proA TRUE 0.780 27.000 0.028 NA   NA
 7087498 7087499 Bphy_2585 Bphy_2586 proA holA FALSE 0.071 223.000 0.047 1.000 N NA
 7087499 7087500 Bphy_2586 Bphy_2587 holA   TRUE 0.850 43.000 0.199 NA N NA
 7087500 7087501 Bphy_2587 Bphy_2588   leuS TRUE 0.852 41.000 0.182 NA N NA
 7087501 7087502 Bphy_2588 Bphy_2589 leuS   FALSE 0.029 248.000 0.007 1.000 N NA
 7087502 7087503 Bphy_2589 Bphy_2590     TRUE 0.972 57.000 0.400 0.082 Y NA
 7087503 7087504 Bphy_2590 Bphy_2591     TRUE 0.560 63.000 0.029 1.000 N NA
 7087504 7087505 Bphy_2591 Bphy_2592     FALSE 0.123 166.000 0.002 1.000 N NA
 7087507 7087508 Bphy_2594 Bphy_2595     TRUE 0.912 31.000 0.000 1.000 Y NA
 7087508 7087509 Bphy_2595 Bphy_2596     FALSE 0.470 109.000 0.061 1.000 N NA
 7087511 7087512 Bphy_2598 Bphy_2599     TRUE 0.883 110.000 0.198 1.000 Y NA
 7087513 7087514 Bphy_2600 Bphy_2601     TRUE 0.954 5.000 0.087 NA   NA
 7087515 7087516 Bphy_2602 Bphy_2603     TRUE 0.963 17.000 0.381 NA   NA
 7087516 7087517 Bphy_2603 Bphy_2604     FALSE 0.019 381.000 0.098 1.000 N NA
 7087518 7087519 Bphy_2605 Bphy_2606     TRUE 0.984 -10.000 0.206 1.000 N NA
 7087519 7087520 Bphy_2606 Bphy_2607     TRUE 0.848 40.000 0.141 NA   NA
 7087520 7087521 Bphy_2607 Bphy_2608     TRUE 0.586 51.000 0.016 NA   NA
 7087522 7087523 Bphy_2609 Bphy_2610 pyrF   FALSE 0.264 124.000 0.007 1.000 N NA
 7087523 7087524 Bphy_2610 Bphy_2611     FALSE 0.221 205.000 0.000 NA Y NA
 7087524 7087525 Bphy_2611 Bphy_2612     TRUE 0.962 -3.000 0.039 NA N NA
 7087525 7087526 Bphy_2612 Bphy_2613   araH TRUE 0.770 52.000 0.118 1.000 N NA
 7087526 7087527 Bphy_2613 Bphy_2614 araH araG TRUE 0.962 98.000 0.510 0.006 Y NA
 7087527 7087528 Bphy_2614 Bphy_2615 araG   TRUE 0.979 84.000 0.857 0.006 Y NA
 7087528 7087529 Bphy_2615 Bphy_2616     FALSE 0.347 186.000 0.273 1.000 N NA
 7087529 7087530 Bphy_2616 Bphy_2617     TRUE 0.988 -3.000 0.133 0.079 N NA
 7087530 7087531 Bphy_2617 Bphy_2618     TRUE 0.898 53.000 0.036 1.000 Y NA
 7087531 7087532 Bphy_2618 Bphy_2619     TRUE 0.980 -3.000 0.103 1.000 N NA
 7087534 7087535 Bphy_2621 Bphy_2622 mtgA aroE TRUE 0.788 50.000 0.107 1.000   NA
 7087535 7087536 Bphy_2622 Bphy_2623 aroE   TRUE 0.964 -3.000 0.034 1.000 N NA
 7087536 7087537 Bphy_2623 Bphy_2624     FALSE 0.155 127.000 0.000 NA   NA
 7087537 7087538 Bphy_2624 Bphy_2625     TRUE 0.952 -3.000 0.006 NA   NA
 7087539 7087540 Bphy_2626 Bphy_2627     TRUE 0.934 27.000 0.280 NA   NA
 7087540 7087541 Bphy_2627 Bphy_2628     FALSE 0.107 195.000 0.041 1.000 N NA
 7087541 7087542 Bphy_2628 Bphy_2629     TRUE 0.812 69.000 0.254 1.000 N NA
 7087542 7087543 Bphy_2629 Bphy_2630     TRUE 0.934 113.000 0.275 0.001 Y NA
 7087543 7087544 Bphy_2630 Bphy_2631   prmA TRUE 0.969 4.000 0.152 1.000 N NA
 7087544 7087545 Bphy_2631 Bphy_2632 prmA   FALSE 0.457 70.000 0.003 NA   NA
 7087545 7087546 Bphy_2632 Bphy_2633     FALSE 0.379 94.000 0.004 NA   NA
 7087546 7087547 Bphy_2633 Bphy_2634     FALSE 0.423 110.000 0.045 1.000 N NA
 7087547 7087548 Bphy_2634 Bphy_2635     FALSE 0.402 89.000 0.011 1.000 N NA
 7087549 7087550 Bphy_2636 Bphy_2637     TRUE 0.919 31.000 0.250 NA   NA
 7087550 7087551 Bphy_2637 Bphy_2638     TRUE 0.637 80.000 0.077 NA   NA
 7087551 7087552 Bphy_2638 Bphy_2639     FALSE 0.147 612.000 0.564 0.000 Y NA
 7087552 7087553 Bphy_2639 Bphy_2640     FALSE 0.002 487.000 0.000 1.000 N NA
 7087553 7087554 Bphy_2640 Bphy_2641     TRUE 0.956 -3.000 0.013 NA   NA
 7087554 7087555 Bphy_2641 Bphy_2642     TRUE 0.895 6.000 0.010 NA   NA
 7087556 7087557 Bphy_2643 Bphy_2644     FALSE 0.182 155.000 0.018 1.000 N NA
 7087558 7087559 Bphy_2645 Bphy_2646     TRUE 0.825 13.000 0.018 NA N NA
 7087560 7087561 Bphy_2647 Bphy_2648     TRUE 0.644 76.000 0.075 NA   NA
 7087562 7087563 Bphy_2649 Bphy_2650   obgE TRUE 0.791 78.000 0.206 1.000   NA
 7087563 7087564 Bphy_2650 Bphy_2651 obgE rpmA FALSE 0.389 189.000 0.335 1.000   NA
 7087564 7087565 Bphy_2651 Bphy_2652 rpmA rplU TRUE 0.993 25.000 0.667 0.007 Y NA
 7087566 7087567 Bphy_2653 Bphy_R0065     FALSE 0.382 52.000 0.000 NA   NA
 7087567 7087568 Bphy_R0065 Bphy_2654     FALSE 0.016 249.000 0.000 NA   NA
 7087568 7087569 Bphy_2654 Bphy_2655     TRUE 0.665 49.000 0.056 NA N NA
 7087569 7087570 Bphy_2655 Bphy_2656     TRUE 0.994 -3.000 0.048 1.000 Y NA
 7087570 7087571 Bphy_2656 Bphy_2657     TRUE 0.983 32.000 0.454 1.000 Y NA
 7087571 7087572 Bphy_2657 Bphy_2658   coaE TRUE 0.964 4.000 0.122 1.000 N NA
 7087572 7087573 Bphy_2658 Bphy_2659 coaE   FALSE 0.184 196.000 0.110 NA   NA
 7087573 7087574 Bphy_2659 Bphy_2660     TRUE 0.871 60.000 0.356 NA   NA
 7087575 7087576 Bphy_2661 Bphy_2662     TRUE 0.983 -3.000 0.105 1.000   NA
 7087576 7087577 Bphy_2662 Bphy_2663   argJ TRUE 0.764 41.000 0.056 1.000   NA
 7087577 7087578 Bphy_2663 Bphy_2664 argJ   FALSE 0.359 150.000 0.102 1.000 N NA
 7087580 7087581 Bphy_2666 Bphy_2667 lpxC   FALSE 0.023 270.000 0.012 1.000 N NA
 7087581 7087582 Bphy_2667 Bphy_2668     FALSE 0.040 237.000 0.018 1.000 N NA
 7087582 7087583 Bphy_2668 Bphy_2669     TRUE 0.914 122.000 0.460 1.000 Y NA
 7087583 7087584 Bphy_2669 Bphy_2670     TRUE 0.940 28.000 0.389 NA N NA
 7087584 7087585 Bphy_2670 Bphy_2671   ddl TRUE 0.989 16.000 0.372 NA Y NA
 7087585 7087586 Bphy_2671 Bphy_2672 ddl murC TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.003 Y NA
 7087586 7087587 Bphy_2672 Bphy_2673 murC murG TRUE 0.997 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 7087587 7087588 Bphy_2673 Bphy_2674 murG   TRUE 0.995 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7087588 7087589 Bphy_2674 Bphy_2675   murD TRUE 0.994 -3.000 0.297 0.002 N NA
 7087589 7087590 Bphy_2675 Bphy_2676 murD mraY TRUE 0.981 61.000 0.647 0.003 Y NA
 7087590 7087591 Bphy_2676 Bphy_2677 mraY   TRUE 0.992 18.000 0.309 0.003 Y NA
 7087591 7087592 Bphy_2677 Bphy_2678   murE TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.001 Y NA
 7087592 7087593 Bphy_2678 Bphy_2679 murE   TRUE 0.995 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 7087593 7087594 Bphy_2679 Bphy_2680     TRUE 0.983 -3.000 0.124 1.000 N NA
 7087594 7087595 Bphy_2680 Bphy_2681   mraW TRUE 0.989 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7087595 7087596 Bphy_2681 Bphy_2682 mraW   TRUE 0.976 16.000 0.635 NA   NA
 7087596 7087597 Bphy_2682 Bphy_2683     FALSE 0.002 500.000 0.000 NA   NA
 7087599 7087600 Bphy_2685 Bphy_2686     FALSE 0.152 175.000 0.037 1.000 N NA
 7087602 7087603 Bphy_R0010 Bphy_R0011     FALSE 0.125 140.000 0.000 NA   NA
 7087603 7087604 Bphy_R0011 Bphy_R0066     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7087604 7087605 Bphy_R0066 Bphy_R0067     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7087605 7087606 Bphy_R0067 Bphy_R0012     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 7087606 7087607 Bphy_R0012 Bphy_2688     FALSE 0.003 452.000 0.000 NA   NA
 7087608 7087609 Bphy_2689 Bphy_2690     FALSE 0.384 142.000 0.089 1.000 N NA
 7087609 7087610 Bphy_2690 Bphy_2691     TRUE 0.925 43.000 0.051 1.000 Y NA
 7087610 7087611 Bphy_2691 Bphy_2692     TRUE 0.979 2.000 0.204 NA N NA
 7087611 7087612 Bphy_2692 Bphy_2693     TRUE 0.634 77.000 0.088 NA N NA
 7087613 7087614 Bphy_2694 Bphy_2695   apaG FALSE 0.412 119.000 0.063 NA N NA
 7087615 7087616 Bphy_2696 Bphy_2697     TRUE 0.981 2.000 0.192 1.000   NA
 7087616 7087617 Bphy_2697 Bphy_2698     FALSE 0.031 421.000 0.233 1.000   NA
 7087617 7087618 Bphy_2698 Bphy_2699     TRUE 0.993 13.000 0.230 0.000 Y NA
 7087618 7087619 Bphy_2699 Bphy_2700   trpD TRUE 0.973 21.000 0.105 1.000 Y NA
 7087619 7087620 Bphy_2700 Bphy_2701 trpD trpC TRUE 0.986 19.000 0.293 1.000 Y NA
 7087620 7087621 Bphy_2701 Bphy_2702 trpC   TRUE 0.822 30.000 0.054 1.000   NA
 7087621 7087622 Bphy_2702 Bphy_2703     TRUE 0.777 91.000 0.250 1.000   NA
 7087623 7087624 Bphy_2704 Bphy_2705     FALSE 0.118 217.000 0.081 1.000   NA
 7087624 7087625 Bphy_2705 Bphy_2706     TRUE 0.692 101.000 0.174 1.000   NA
 7087625 7087626 Bphy_2706 Bphy_2707     TRUE 0.667 164.000 0.814 1.000 N NA
 7087627 7087628 Bphy_2708 Bphy_2709     FALSE 0.010 272.000 0.000 1.000 N NA
 7087628 7087629 Bphy_2709 Bphy_2710     TRUE 0.967 100.000 0.793 0.072 Y NA
 7087629 7087630 Bphy_2710 Bphy_2711     TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.072 Y NA
 7087630 7087631 Bphy_2711 Bphy_2712   ugpC TRUE 0.992 13.000 0.272 0.072 Y NA
 7087631 7087632 Bphy_2712 Bphy_2713 ugpC   FALSE 0.069 219.000 0.000 0.021   NA
 7087632 7087633 Bphy_2713 Bphy_2714     FALSE 0.024 223.000 0.000 NA   NA
 7087634 7087635 Bphy_2715 Bphy_2716     TRUE 0.991 -3.000 0.156 0.036   NA
 7087635 7087636 Bphy_2716 Bphy_2717     FALSE 0.527 93.000 0.058 1.000 N NA
 7087636 7087637 Bphy_2717 Bphy_2718     TRUE 0.903 20.000 0.109 NA   NA
 7087638 7087639 Bphy_2719 Bphy_2720   hemA FALSE 0.517 56.000 0.009 1.000 N NA
 7087639 7087640 Bphy_2720 Bphy_2721 hemA prfA TRUE 0.644 133.000 0.171 0.026 N NA
 7087640 7087641 Bphy_2721 Bphy_2722 prfA   TRUE 0.991 10.000 0.229 1.000 Y NA
 7087641 7087642 Bphy_2722 Bphy_2723     TRUE 0.570 113.000 0.124 1.000 N NA
 7087642 7087643 Bphy_2723 Bphy_2724     TRUE 0.922 25.000 0.211 1.000 N NA
 7087643 7087644 Bphy_2724 Bphy_2725     FALSE 0.398 123.000 0.039 1.000   NA
 7087649 7087650 Bphy_2730 Bphy_2731     FALSE 0.199 157.000 0.040 NA N NA
 7087651 7087652 Bphy_2732 Bphy_2733     TRUE 0.798 28.000 0.041 NA   NA
 7087657 7087658 Bphy_2738 Bphy_R0068     FALSE 0.123 141.000 0.000 NA   NA
 7087658 7087659 Bphy_R0068 Bphy_2739     TRUE 0.631 20.000 0.000 NA   NA
 7087659 7087660 Bphy_2739 Bphy_2740     TRUE 0.913 76.000 0.831 NA   NA
 7087660 7087661 Bphy_2740 Bphy_2741     TRUE 0.781 97.000 0.370 NA N NA
 7087661 7087662 Bphy_2741 Bphy_2742     TRUE 0.993 24.000 0.630 0.001 Y NA
 7087662 7087663 Bphy_2742 Bphy_2743     TRUE 0.996 0.000 0.108 0.001 Y NA
 7087663 7087664 Bphy_2743 Bphy_2744     FALSE 0.053 220.000 0.013 NA   NA
 7087666 7087667 Bphy_2746 Bphy_2747   tatB TRUE 0.953 43.000 0.167 NA Y NA
 7087667 7087668 Bphy_2747 Bphy_2748 tatB tatA TRUE 0.976 56.000 0.402 0.004 Y NA
 7087668 7087669 Bphy_2748 Bphy_2749 tatA   FALSE 0.031 313.000 0.080 1.000 N NA
 7087669 7087670 Bphy_2749 Bphy_2750     TRUE 0.728 38.000 0.037 NA   NA
 7087670 7087671 Bphy_2750 Bphy_2751   hisE FALSE 0.353 143.000 0.070 NA   NA
 7087671 7087672 Bphy_2751 Bphy_2752 hisE hisI TRUE 0.998 -3.000 0.152 0.003 Y NA
 7087672 7087673 Bphy_2752 Bphy_2753 hisI   TRUE 0.997 5.000 0.430 0.003 Y NA
 7087673 7087674 Bphy_2753 Bphy_2754     TRUE 0.882 157.000 0.433 0.003 Y NA
 7087674 7087675 Bphy_2754 Bphy_2755   hisH FALSE 0.534 210.000 0.120 0.003 Y NA
 7087675 7087676 Bphy_2755 Bphy_2756 hisH   TRUE 0.974 -3.000 0.074 NA N NA
 7087676 7087677 Bphy_2756 Bphy_2757   hisB FALSE 0.504 61.000 0.020 NA N NA
 7087677 7087678 Bphy_2757 Bphy_2758 hisB   TRUE 0.975 54.000 0.341 0.003 Y NA
 7087678 7087679 Bphy_2758 Bphy_2759   hisD TRUE 0.809 156.000 0.165 0.003 Y NA
 7087679 7087680 Bphy_2759 Bphy_2760 hisD hisG TRUE 0.969 56.000 0.254 0.003 Y NA
 7087680 7087681 Bphy_2760 Bphy_2761 hisG   TRUE 0.982 -3.000 0.123 1.000 N NA
 7087681 7087682 Bphy_2761 Bphy_2762     FALSE 0.092 240.000 0.129 NA N NA
 7087682 7087683 Bphy_2762 Bphy_2763     TRUE 0.924 11.000 0.088 NA N NA
 7087683 7087684 Bphy_2763 Bphy_2764     TRUE 0.998 -3.000 0.236 0.085 Y NA
 7087684 7087685 Bphy_2764 Bphy_2765     FALSE 0.067 289.000 0.174 NA   NA
 7087685 7087686 Bphy_2765 Bphy_2766     TRUE 0.959 -3.000 0.017 NA   NA
 7087686 7087687 Bphy_2766 Bphy_2767     FALSE 0.515 140.000 0.200 NA N NA
 7087687 7087688 Bphy_2767 Bphy_2768     TRUE 0.884 14.000 0.049 NA   NA
 7087688 7087689 Bphy_2768 Bphy_2769     TRUE 0.879 79.000 0.562 NA   NA
 7087689 7087690 Bphy_2769 Bphy_2770     TRUE 0.998 -3.000 0.530 NA Y NA
 7087690 7087691 Bphy_2770 Bphy_2771     TRUE 0.611 78.000 0.069 1.000 N NA
 7087691 7087692 Bphy_2771 Bphy_2772   thiG TRUE 0.997 -3.000 0.118 0.005 Y NA
 7087692 7087693 Bphy_2772 Bphy_2773 thiG   TRUE 0.931 43.000 0.064 1.000 Y NA
 7087693 7087694 Bphy_2773 Bphy_2774     TRUE 0.972 11.000 0.342 1.000 N NA
 7087695 7087696 Bphy_2775 Bphy_2776     FALSE 0.005 362.000 0.000 NA   NA
 7087696 7087697 Bphy_2776 Bphy_2777     TRUE 0.836 88.000 0.429 NA   NA
 7087697 7087698 Bphy_2777 Bphy_2778     FALSE 0.177 236.000 0.286 NA   NA
 7087699 7087700 Bphy_2779 Bphy_2780     TRUE 0.931 54.000 0.750 NA   NA
 7087700 7087701 Bphy_2780 Bphy_2781     TRUE 0.971 31.000 1.000 NA   NA
 7087701 7087702 Bphy_2781 Bphy_2782     TRUE 0.664 17.000 0.000 NA   NA
 7087703 7087704 Bphy_2783 Bphy_2784     TRUE 0.997 8.000 1.000 1.000 Y NA
 7087705 7087706 Bphy_2785 Bphy_2786     FALSE 0.006 300.000 0.000 NA N NA
 7087706 7087707 Bphy_2786 Bphy_2787   gltD FALSE 0.020 228.000 0.000 1.000 N NA
 7087707 7087708 Bphy_2787 Bphy_2788 gltD   TRUE 0.964 64.000 0.236 0.001 Y NA
 7087708 7087709 Bphy_2788 Bphy_2789     FALSE 0.015 320.000 0.022 1.000 N NA
 7087710 7087711 Bphy_2790 Bphy_2791     FALSE 0.005 350.000 0.000 NA   NA
 7087712 7087713 Bphy_2792 Bphy_2793   aroB TRUE 0.673 54.000 0.060 1.000 N NA
 7087713 7087714 Bphy_2793 Bphy_2794 aroB aroK TRUE 0.992 8.000 0.208 1.000 Y NA
 7087714 7087715 Bphy_2794 Bphy_2795 aroK   TRUE 0.649 138.000 0.319 1.000   NA
 7087715 7087716 Bphy_2795 Bphy_2796     TRUE 0.960 -3.000 0.021 NA   NA
 7087716 7087717 Bphy_2796 Bphy_2797     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 7087717 7087718 Bphy_2797 Bphy_2798     TRUE 0.959 -3.000 0.018 NA   NA
 7087721 7087722 Bphy_2801 Bphy_2802     TRUE 0.930 10.000 0.071 NA   NA
 7087723 7087724 Bphy_2803 Bphy_2804     TRUE 0.989 12.000 0.790 0.063   NA
 7087724 7087725 Bphy_2804 Bphy_2805     FALSE 0.232 184.000 0.097 1.000   NA
 7087725 7087726 Bphy_2805 Bphy_2806     TRUE 0.995 5.000 0.399 NA Y NA
 7087726 7087727 Bphy_2806 Bphy_2807     TRUE 0.560 128.000 0.186 NA N NA
 7087728 7087729 Bphy_2808 Bphy_2809 engB   FALSE 0.062 227.000 0.024 1.000   NA
 7087730 7087731 Bphy_2810 Bphy_2811     TRUE 0.938 -7.000 0.007 1.000 N NA
 7087731 7087732 Bphy_2811 Bphy_2812   rplQ FALSE 0.209 148.000 0.020 1.000 N NA
 7087732 7087733 Bphy_2812 Bphy_2813 rplQ   TRUE 0.733 152.000 0.873 1.000 N NA
 7087733 7087734 Bphy_2813 Bphy_2814   rpsD TRUE 0.764 125.000 0.549 1.000 N NA
 7087734 7087735 Bphy_2814 Bphy_2815 rpsD   TRUE 0.911 147.000 0.509 0.009 Y NA
 7087735 7087736 Bphy_2815 Bphy_2816   rpsM TRUE 0.993 29.000 0.810 0.007 Y NA
 7087736 7087737 Bphy_2816 Bphy_2817 rpsM rpmJ TRUE 0.918 42.000 0.194 0.007   NA
 7087737 7087738 Bphy_2817 Bphy_2818 rpmJ infA TRUE 0.903 21.000 0.104 1.000   NA
 7087738 7087739 Bphy_2818 Bphy_2819 infA secY TRUE 0.937 9.000 0.083 1.000 N NA
 7087739 7087740 Bphy_2819 Bphy_2820 secY rplO TRUE 0.936 47.000 0.730 1.000 N NA
 7087740 7087741 Bphy_2820 Bphy_2821 rplO rpmD TRUE 0.992 31.000 0.653 0.001 Y NA
 7087741 7087742 Bphy_2821 Bphy_2822 rpmD rpsE TRUE 0.997 11.000 0.789 0.009 Y NA
 7087742 7087743 Bphy_2822 Bphy_2823 rpsE rplR TRUE 0.996 15.000 0.814 0.009 Y NA
 7087743 7087744 Bphy_2823 Bphy_2824 rplR rplF TRUE 0.997 13.000 0.815 0.007 Y NA
 7087744 7087745 Bphy_2824 Bphy_2825 rplF rpsH TRUE 0.995 20.000 0.808 0.007 Y NA
 7087745 7087746 Bphy_2825 Bphy_2826 rpsH rpsN TRUE 0.992 15.000 0.295 0.007 Y NA
 7087746 7087747 Bphy_2826 Bphy_2827 rpsN rplE TRUE 0.995 8.000 0.309 0.007 Y NA
 7087747 7087748 Bphy_2827 Bphy_2828 rplE rplX TRUE 0.996 14.000 0.758 0.007 Y NA
 7087748 7087749 Bphy_2828 Bphy_2829 rplX rplN TRUE 0.997 10.000 0.810 0.009 Y NA
 7087749 7087750 Bphy_2829 Bphy_2830 rplN   TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 7087750 7087751 Bphy_2830 Bphy_2831   rpsQ FALSE 0.140 134.000 0.000 NA   NA
 7087751 7087752 Bphy_2831 Bphy_2832 rpsQ   TRUE 0.999 -3.000 0.828 0.007 Y NA
 7087752 7087753 Bphy_2832 Bphy_2833   rplP TRUE 0.998 8.000 0.802 0.007 Y NA
 7087753 7087754 Bphy_2833 Bphy_2834 rplP rpsC TRUE 0.998 3.000 0.828 0.009 Y NA
 7087754 7087755 Bphy_2834 Bphy_2835 rpsC rplV TRUE 0.996 12.000 0.719 0.009 Y NA
 7087755 7087756 Bphy_2835 Bphy_2836 rplV rpsS TRUE 0.996 13.000 0.769 0.009 Y NA
 7087756 7087757 Bphy_2836 Bphy_2837 rpsS rplB TRUE 0.997 11.000 0.820 0.009 Y NA
 7087757 7087758 Bphy_2837 Bphy_2838 rplB rplW TRUE 0.998 3.000 0.849 1.000 Y NA
 7087758 7087759 Bphy_2838 Bphy_2839 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 7087759 7087760 Bphy_2839 Bphy_2840 rplD rplC TRUE 0.998 0.000 0.486 0.007 Y NA
 7087760 7087761 Bphy_2840 Bphy_2841 rplC rpsJ TRUE 0.747 188.000 0.307 0.009 Y NA
 7087761 7087762 Bphy_2841 Bphy_2842 rpsJ   TRUE 0.679 127.000 0.003 1.000 Y NA
 7087762 7087763 Bphy_2842 Bphy_2843     TRUE 0.927 49.000 0.005 0.001 Y NA
 7087763 7087764 Bphy_2843 Bphy_2844     TRUE 0.916 129.000 0.579 1.000 Y NA
 7087764 7087765 Bphy_2844 Bphy_2845   rpsL TRUE 0.859 180.000 0.620 0.001 Y NA
 7087765 7087766 Bphy_2845 Bphy_2846 rpsL   FALSE 0.018 232.000 0.000 1.000 N NA
 7087766 7087767 Bphy_2846 Bphy_2847     FALSE 0.064 202.000 0.008 1.000 N NA
 7087767 7087768 Bphy_2847 Bphy_2848   rpoB TRUE 0.986 22.000 0.851 0.001   NA
 7087768 7087769 Bphy_2848 Bphy_2849 rpoB rplL FALSE 0.041 371.000 0.223 1.000   NA
 7087769 7087770 Bphy_2849 Bphy_2850 rplL rplJ TRUE 0.982 76.000 0.884 0.007 Y NA
 7087770 7087771 Bphy_2850 Bphy_2851 rplJ rplA FALSE 0.324 304.000 0.302 0.009 Y NA
 7087771 7087772 Bphy_2851 Bphy_2852 rplA rplK TRUE 0.999 1.000 0.838 0.009 Y NA
 7087772 7087773 Bphy_2852 Bphy_2853 rplK nusG TRUE 0.691 152.000 0.681 1.000 N NA
 7087773 7087774 Bphy_2853 Bphy_2854 nusG secE TRUE 0.993 2.000 0.843 1.000 N NA
 7087774 7087775 Bphy_2854 Bphy_R0069 secE   FALSE 0.497 36.000 0.000 NA   NA
 7087775 7087776 Bphy_R0069 Bphy_2855     FALSE 0.306 71.000 0.000 NA   NA
 7087776 7087777 Bphy_2855 Bphy_R0070     FALSE 0.328 65.000 0.000 NA   NA
 7087777 7087778 Bphy_R0070 Bphy_R0071     TRUE 0.622 21.000 0.000 NA   NA
 7087778 7087779 Bphy_R0071 Bphy_R0072     FALSE 0.413 46.000 0.000 NA   NA
 7087779 7087780 Bphy_R0072 Bphy_R0013     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 7087780 7087781 Bphy_R0013 Bphy_R0014     FALSE 0.125 140.000 0.000 NA   NA
 7087781 7087782 Bphy_R0014 Bphy_R0073     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7087782 7087783 Bphy_R0073 Bphy_R0074     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7087783 7087784 Bphy_R0074 Bphy_R0015     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 7087784 7087785 Bphy_R0015 Bphy_2856     FALSE 0.003 452.000 0.000 NA   NA
 7087786 7087787 Bphy_2857 Bphy_2858 paaA paaB TRUE 0.959 40.000 0.920 NA   NA
 7087787 7087788 Bphy_2858 Bphy_2859 paaB   TRUE 0.989 10.000 0.943 NA   NA
 7087788 7087789 Bphy_2859 Bphy_2860     TRUE 0.971 29.000 0.919 NA   NA
 7087789 7087790 Bphy_2860 Bphy_2861     TRUE 0.991 2.000 0.571 NA   NA
 7087790 7087791 Bphy_2861 Bphy_2862     FALSE 0.204 200.000 0.150 NA   NA
 7087791 7087792 Bphy_2862 Bphy_2863     TRUE 0.962 18.000 0.383 NA   NA
 7087792 7087793 Bphy_2863 Bphy_2864     FALSE 0.013 252.000 0.000 1.000 N NA
 7087798 7087799 Bphy_2869 Bphy_2870     FALSE 0.008 297.000 0.000 1.000 N NA
 7087802 7087803 Bphy_2873 Bphy_2874     FALSE 0.415 110.000 0.036 NA   NA
 7087803 7087804 Bphy_2874 Bphy_2875     FALSE 0.403 171.000 0.214 1.000   NA
 7087805 7087806 Bphy_2876 Bphy_2877     FALSE 0.444 149.000 0.165 1.000 N NA
 7087807 7087808 Bphy_2878 Bphy_2879     FALSE 0.439 90.000 0.018 NA   NA
 7087811 7087812 Bphy_2882 Bphy_2883     FALSE 0.003 457.000 0.000 NA   NA
 7087813 7087814 Bphy_2884 Bphy_2885     FALSE 0.005 316.000 0.000 NA N NA
 7087814 7087815 Bphy_2885 Bphy_2886     TRUE 0.614 22.000 0.000 NA   NA
 7087817 7087818 Bphy_2888 Bphy_2889     FALSE 0.006 328.000 0.000 NA   NA
 7087819 7087820 Bphy_2890 Bphy_2891     TRUE 0.865 58.000 0.005 1.000 Y NA
 7087820 7087821 Bphy_2891 Bphy_2892     FALSE 0.306 110.000 0.014 NA N NA
 7087821 7087822 Bphy_2892 Bphy_2893     TRUE 0.938 4.000 0.059 NA N NA
 7087822 7087823 Bphy_2893 Bphy_2894     TRUE 0.826 74.000 0.316 1.000 N NA
 7087824 7087825 Bphy_2895 Bphy_2896     TRUE 0.838 25.000 0.058 NA   NA
 7087826 7087827 Bphy_2897 Bphy_2898 cca   TRUE 0.978 -3.000 0.087 1.000 N NA
 7087827 7087828 Bphy_2898 Bphy_2899     TRUE 0.794 33.000 0.060 1.000 N NA
 7087828 7087829 Bphy_2899 Bphy_2900     TRUE 0.879 93.000 0.110 1.000 Y NA
 7087832 7087833 Bphy_2903 Bphy_2904     TRUE 0.994 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 7087833 7087834 Bphy_2904 Bphy_2905     TRUE 0.853 17.000 0.028 1.000   NA
 7087834 7087835 Bphy_2905 Bphy_2906     FALSE 0.074 277.000 0.173 NA   NA
 7087835 7087836 Bphy_2906 Bphy_2907     TRUE 0.996 -3.000 0.939 NA   NA
 7087836 7087837 Bphy_2907 Bphy_2908     FALSE 0.023 226.000 0.000 NA   NA
 7087838 7087839 Bphy_2909 Bphy_2910   dppF TRUE 0.985 -7.000 0.188 NA   NA
 7087839 7087840 Bphy_2910 Bphy_2911 dppF   TRUE 0.999 -3.000 0.377 0.002 Y NA
 7087840 7087841 Bphy_2911 Bphy_2912     TRUE 0.997 2.000 0.560 1.000 Y NA
 7087841 7087842 Bphy_2912 Bphy_2913     TRUE 0.973 88.000 0.779 0.071 Y NA
 7087842 7087843 Bphy_2913 Bphy_2914     TRUE 0.717 155.000 0.072 0.071 Y NA
 7087843 7087844 Bphy_2914 Bphy_2915     TRUE 0.635 186.000 0.133 0.071 Y NA
 7087844 7087845 Bphy_2915 Bphy_2916     FALSE 0.206 215.000 0.000 1.000 Y NA
 7087845 7087846 Bphy_2916 Bphy_2917     TRUE 0.907 19.000 0.109 NA   NA
 7087846 7087847 Bphy_2917 Bphy_2918     TRUE 0.569 74.000 0.042 NA   NA
 7087847 7087848 Bphy_2918 Bphy_2919     FALSE 0.038 198.000 0.000 NA   NA
 7087848 7087849 Bphy_2919 Bphy_2920     FALSE 0.170 122.000 0.000 NA   NA
 7087849 7087850 Bphy_2920 Bphy_2921     TRUE 0.974 24.000 0.840 NA   NA
 7087853 7087854 Bphy_2924 Bphy_2925     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7087855 7087856 Bphy_2926 Bphy_2927     TRUE 0.960 0.000 0.041 1.000   NA
 7087856 7087857 Bphy_2927 Bphy_2928     TRUE 0.791 80.000 0.214 1.000   NA
 7087857 7087858 Bphy_2928 Bphy_2929     TRUE 0.989 -3.000 0.189 1.000   NA
 7087858 7087859 Bphy_2929 Bphy_2930     FALSE 0.148 376.000 0.149 0.002 Y NA
 7087860 7087861 Bphy_2931 Bphy_2932 fliF fliG TRUE 0.997 -10.000 0.220 0.004 Y NA
 7087861 7087862 Bphy_2932 Bphy_2933 fliG fliH TRUE 0.998 -13.000 0.320 0.002 Y NA
 7087862 7087863 Bphy_2933 Bphy_2934 fliH   TRUE 0.995 -6.000 0.115 1.000 Y NA
 7087863 7087864 Bphy_2934 Bphy_2935     TRUE 0.974 16.000 0.070 1.000 Y NA
 7087864 7087865 Bphy_2935 Bphy_2936     TRUE 0.968 65.000 0.317 0.004 Y NA
 7087865 7087866 Bphy_2936 Bphy_2937   fliL FALSE 0.026 433.000 0.000 1.000 Y NA
 7087866 7087867 Bphy_2937 Bphy_2938 fliL fliM TRUE 0.943 65.000 0.094 0.001 Y NA
 7087867 7087868 Bphy_2938 Bphy_2939 fliM   TRUE 0.999 -7.000 0.741 0.001 Y NA
 7087868 7087869 Bphy_2939 Bphy_2940     TRUE 0.998 -3.000 0.443 1.000 Y NA
 7087869 7087870 Bphy_2940 Bphy_2941   fliP TRUE 0.996 0.000 0.203 1.000 Y NA
 7087870 7087871 Bphy_2941 Bphy_2942 fliP   TRUE 0.994 28.000 0.827 0.007 Y NA
 7087871 7087872 Bphy_2942 Bphy_2943     TRUE 0.981 35.000 0.208 0.001 Y NA
 7087873 7087874 Bphy_2944 Bphy_2945     FALSE 0.074 167.000 0.000 NA   NA
 7087874 7087875 Bphy_2945 Bphy_2946     TRUE 0.939 98.000 0.211 0.001 Y NA
 7087875 7087876 Bphy_2946 Bphy_2947     TRUE 0.911 106.000 0.330 NA Y NA
 7087877 7087878 Bphy_2948 Bphy_2949 flgB flgC TRUE 0.966 107.000 0.714 0.002 Y NA
 7087878 7087879 Bphy_2949 Bphy_2950 flgC flgD TRUE 0.988 12.000 0.221 NA Y NA
 7087879 7087880 Bphy_2950 Bphy_2951 flgD   TRUE 0.935 34.000 0.035 NA Y NA
 7087880 7087881 Bphy_2951 Bphy_2952   flgF TRUE 0.987 23.000 0.200 0.002 Y NA
 7087881 7087882 Bphy_2952 Bphy_2953 flgF flgG TRUE 0.978 51.000 0.357 0.001 Y NA
 7087882 7087883 Bphy_2953 Bphy_2954 flgG flgH TRUE 0.987 36.000 0.463 0.004 Y NA
 7087883 7087884 Bphy_2954 Bphy_2955 flgH flgI TRUE 0.997 3.000 0.256 0.004 Y NA
 7087884 7087885 Bphy_2955 Bphy_2956 flgI flgJ TRUE 0.989 13.000 0.131 0.004 Y NA
 7087885 7087886 Bphy_2956 Bphy_2957 flgJ   FALSE 0.003 395.000 0.000 NA N NA
 7087886 7087887 Bphy_2957 Bphy_2958   flgK FALSE 0.004 1003.000 0.057 NA N NA
 7087887 7087888 Bphy_2958 Bphy_2959 flgK flgL TRUE 0.985 15.000 0.074 0.001 Y NA
 7087889 7087890 Bphy_2960 Bphy_2961 fliA   TRUE 0.761 24.000 0.018 1.000 N NA
 7087890 7087891 Bphy_2961 Bphy_2962   flhF TRUE 0.925 -19.000 0.008 1.000 N NA
 7087891 7087892 Bphy_2962 Bphy_2963 flhF flhA FALSE 0.110 294.000 0.028 1.000 Y NA
 7087892 7087893 Bphy_2963 Bphy_2964 flhA flhB TRUE 0.997 -3.000 0.088 0.007 Y NA
 7087893 7087894 Bphy_2964 Bphy_2965 flhB   FALSE 0.115 185.000 0.012 1.000   NA
 7087894 7087895 Bphy_2965 Bphy_2966     TRUE 0.983 17.000 1.000 NA   NA
 7087895 7087896 Bphy_2966 Bphy_2967     FALSE 0.005 353.000 0.000 NA   NA
 7087896 7087897 Bphy_2967 Bphy_2968     TRUE 0.998 2.000 0.741 1.000 Y NA
 7087897 7087898 Bphy_2968 Bphy_2969     TRUE 0.964 73.000 0.350 0.022 Y NA
 7087898 7087899 Bphy_2969 Bphy_2970     TRUE 0.986 6.000 0.056 1.000 Y NA
 7087899 7087900 Bphy_2970 Bphy_2971     TRUE 0.998 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 7087900 7087901 Bphy_2971 Bphy_2972     FALSE 0.070 301.000 0.000 1.000 Y NA
 7087901 7087902 Bphy_2972 Bphy_2973     TRUE 0.940 54.000 0.064 0.008 Y NA
 7087902 7087903 Bphy_2973 Bphy_2974     TRUE 0.956 41.000 0.064 0.008 Y NA
 7087903 7087904 Bphy_2974 Bphy_2975     TRUE 0.925 74.000 0.176 1.000 Y NA
 7087904 7087905 Bphy_2975 Bphy_2976   motB TRUE 0.915 70.000 0.824 1.000 N NA
 7087905 7087906 Bphy_2976 Bphy_2977 motB   TRUE 0.990 13.000 0.306 1.000 Y NA
 7087906 7087907 Bphy_2977 Bphy_2978     FALSE 0.446 161.000 0.204 1.000   NA
 7087907 7087908 Bphy_2978 Bphy_2979     TRUE 0.889 130.000 0.938 0.002   NA
 7087912 7087913 Bphy_2983 Bphy_2984     TRUE 0.676 103.000 0.176 NA   NA
 7087914 7087915 Bphy_2985 Bphy_2986     FALSE 0.003 454.000 0.000 NA   NA
 7087916 7087917 Bphy_2987 Bphy_2988     FALSE 0.011 296.000 0.000 1.000   NA
 7087918 7087919 Bphy_2989 Bphy_2990     TRUE 0.676 172.000 0.188 1.000 Y NA
 7087919 7087920 Bphy_2990 Bphy_2991     TRUE 0.926 30.000 0.267 NA   NA
 7087921 7087922 Bphy_2992 Bphy_2993     TRUE 0.971 13.000 0.000 0.011 Y NA
 7087922 7087923 Bphy_2993 Bphy_2994     TRUE 0.665 21.000 0.000 1.000   NA
 7087923 7087924 Bphy_2994 Bphy_2995     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000   NA
 7087924 7087925 Bphy_2995 Bphy_2996     TRUE 0.996 -3.000 0.800 1.000 N NA
 7087925 7087926 Bphy_2996 Bphy_2997     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 7087926 7087927 Bphy_2997 Bphy_2998     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 7087927 7087928 Bphy_2998 Bphy_R0075     FALSE 0.006 330.000 0.000 NA   NA
 7087931 7087932 Bphy_3001 Bphy_3002     TRUE 0.753 131.000 0.556 NA   NA
 7087932 7087933 Bphy_3002 Bphy_3003   gcvT FALSE 0.002 547.000 0.000 NA   NA
 7087933 7087934 Bphy_3003 Bphy_3004 gcvT   TRUE 0.935 117.000 0.317 0.001 Y NA
 7087934 7087935 Bphy_3004 Bphy_3005     TRUE 0.944 65.000 0.249 1.000 Y NA
 7087936 7087937 Bphy_3006 Bphy_3007     TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.003 N NA
 7087937 7087938 Bphy_3007 Bphy_3008     TRUE 0.953 -3.000 0.012 1.000 N NA
 7087938 7087939 Bphy_3008 Bphy_3009     TRUE 0.863 84.000 0.056 1.000 Y NA
 7087939 7087940 Bphy_3009 Bphy_3010     TRUE 0.997 -3.000 0.296 1.000 Y NA
 7087940 7087941 Bphy_3010 Bphy_3011     TRUE 0.996 -3.000 0.678 1.000   NA
 7087941 7087942 Bphy_3011 Bphy_3012     FALSE 0.340 74.000 0.000 1.000   NA
 7087943 7087944 Bphy_3013 Bphy_3014     FALSE 0.011 277.000 0.000 NA   NA
 7087944 7087945 Bphy_3014 Bphy_3015     FALSE 0.309 85.000 0.000 1.000   NA
 7087945 7087946 Bphy_3015 Bphy_3016     TRUE 0.913 75.000 0.133 1.000 Y NA
 7087947 7087948 Bphy_3017 Bphy_3018   putA TRUE 0.688 88.000 0.143 1.000 N NA
 7087950 7087951 Bphy_3020 Bphy_3021     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 7087951 7087952 Bphy_3021 Bphy_3022     FALSE 0.099 182.000 0.003 NA   NA
 7087952 7087953 Bphy_3022 Bphy_3023   hemE FALSE 0.003 442.000 0.000 1.000 N NA
 7087955 7087956 Bphy_3025 Bphy_3026   atpC FALSE 0.059 202.000 0.002 1.000 N NA
 7087956 7087957 Bphy_3026 Bphy_3027 atpC   TRUE 0.931 152.000 0.837 0.003 Y NA
 7087957 7087958 Bphy_3027 Bphy_3028     TRUE 0.974 91.000 0.724 0.003 Y NA
 7087958 7087959 Bphy_3028 Bphy_3029     TRUE 0.977 91.000 0.846 0.003 Y NA
 7087959 7087960 Bphy_3029 Bphy_3030     TRUE 0.986 59.000 0.864 0.003 Y NA
 7087960 7087961 Bphy_3030 Bphy_3031     TRUE 0.996 3.000 0.242 0.003 Y NA
 7087961 7087962 Bphy_3031 Bphy_3032     TRUE 0.937 139.000 0.666 0.003 Y NA
 7087962 7087963 Bphy_3032 Bphy_3033     TRUE 0.970 87.000 0.557 0.003 Y NA
 7087963 7087964 Bphy_3033 Bphy_3034     TRUE 0.827 147.000 0.291 1.000 Y NA
 7087964 7087965 Bphy_3034 Bphy_3035     FALSE 0.009 282.000 0.000 1.000 N NA
 7087965 7087966 Bphy_3035 Bphy_3036     TRUE 0.838 13.000 0.016 1.000 N NA
 7087966 7087967 Bphy_3036 Bphy_3037     TRUE 0.996 -3.000 0.827 1.000 N NA
 7087967 7087968 Bphy_3037 Bphy_3038   gidB TRUE 0.883 50.000 0.339 1.000 N NA
 7087968 7087969 Bphy_3038 Bphy_3039 gidB   TRUE 0.993 -3.000 0.466 1.000 N NA
 7087969 7087970 Bphy_3039 Bphy_3040     FALSE 0.123 170.000 0.009 1.000 N NA
 7087970 7087971 Bphy_3040 Bphy_3041     TRUE 0.998 0.000 0.600 0.021 Y NA
 7087971 7087972 Bphy_3041 Bphy_3042     TRUE 0.997 5.000 0.525 0.071 Y NA
 7087972 7087973 Bphy_3042 Bphy_3043     FALSE 0.495 222.000 0.320 NA Y NA
 7087973 7087974 Bphy_3043 Bphy_3044     FALSE 0.013 262.000 0.000 NA   NA
 7087974 7087975 Bphy_3044 Bphy_3045     FALSE 0.002 500.000 0.000 NA   NA
 7087975 7087976 Bphy_3045 Bphy_3046     TRUE 0.995 0.000 0.091 0.071 Y NA
 7087976 7087977 Bphy_3046 Bphy_3047     TRUE 0.860 131.000 0.273 NA Y NA
 7087977 7087978 Bphy_3047 Bphy_3048     TRUE 0.951 61.000 0.294 NA Y NA
 7087978 7087979 Bphy_3048 Bphy_3049     TRUE 0.999 -3.000 0.716 0.021 Y NA
 7087979 7087980 Bphy_3049 Bphy_3050     FALSE 0.156 233.000 0.000 1.000 Y NA
 7087980 7087981 Bphy_3050 Bphy_3051     FALSE 0.179 118.000 0.000 NA   NA
 7087982 7087983 Bphy_3052 Bphy_3053     FALSE 0.045 280.000 0.089 1.000 N NA
 7087987 7087988 Bphy_3057 Bphy_3058     TRUE 0.843 175.000 0.833 1.000 Y NA
 7087989 7087990 Bphy_3059 Bphy_3060     FALSE 0.041 264.000 0.040 1.000   NA
 7087990 7087991 Bphy_3060 Bphy_3061     FALSE 0.282 93.000 0.000 1.000   NA
 7087991 7087992 Bphy_3061 Bphy_3062     TRUE 0.917 10.000 0.043 1.000   NA
 7087992 7087993 Bphy_3062 Bphy_3063     FALSE 0.449 148.000 0.163 1.000 N NA
 7087993 7087994 Bphy_3063 Bphy_3064     FALSE 0.002 670.000 0.000 1.000   NA
 7087994 7087995 Bphy_3064 Bphy_3065     TRUE 0.748 154.000 0.907 1.000   NA
 7087995 7087996 Bphy_3065 Bphy_3066   mnmC FALSE 0.001 877.000 0.000 1.000 N NA
 7087998 7087999 Bphy_3068 Bphy_3069     TRUE 0.657 138.000 0.360 NA   NA
 7088000 7088001 Bphy_3070 Bphy_3071     TRUE 0.999 -3.000 0.776 0.002 Y NA
 7088001 7088002 Bphy_3071 Bphy_3072     TRUE 0.998 5.000 0.653 0.002 Y NA
 7088004 7088005 Bphy_3074 Bphy_3075     TRUE 0.942 55.000 0.063 0.002 Y NA
 7088005 7088006 Bphy_3075 Bphy_3076     TRUE 0.987 0.000 0.116 0.002   NA
 7088006 7088007 Bphy_3076 Bphy_3077     TRUE 0.966 -22.000 0.078 NA   NA
 7088007 7088008 Bphy_3077 Bphy_3078     TRUE 0.988 10.000 0.153 NA Y NA
 7088008 7088009 Bphy_3078 Bphy_3079     TRUE 0.932 29.000 0.150 0.051   NA
 7088009 7088010 Bphy_3079 Bphy_3080     TRUE 0.996 -3.000 0.811 1.000   NA
 7088010 7088011 Bphy_3080 Bphy_3081     TRUE 0.970 23.000 0.649 1.000   NA
 7088012 7088013 Bphy_3082 Bphy_3083     FALSE 0.042 193.000 0.000 NA   NA
 7088013 7088014 Bphy_3083 Bphy_3084     FALSE 0.304 72.000 0.000 NA   NA
 7088014 7088015 Bphy_3084 Bphy_3085     FALSE 0.208 106.000 0.000 NA   NA
 7088015 7088016 Bphy_3085 Bphy_3086     FALSE 0.019 239.000 0.000 NA   NA
 7088016 7088017 Bphy_3086 Bphy_3087     FALSE 0.074 220.000 0.048 1.000 N NA
 7088017 7088018 Bphy_3087 Bphy_3088     TRUE 0.982 -3.000 0.058 0.061 N NA
 7088020 7088021 Bphy_3090 Bphy_3091     FALSE 0.007 453.000 0.028 NA   NA
 7088022 7088023 Bphy_3092 Bphy_3093     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 7088023 7088024 Bphy_3093 Bphy_3094     FALSE 0.003 443.000 0.000 NA   NA
 7088025 7088026 Bphy_3095 Bphy_3096   trmE FALSE 0.347 112.000 0.006 1.000   NA
 7088028 7088029 Bphy_3098 Bphy_3099     TRUE 0.948 31.000 0.461 NA   NA
 7088029 7088030 Bphy_3099 Bphy_3100     TRUE 0.881 74.000 0.540 NA   NA
 7088030 7088031 Bphy_3100 Bphy_3101   rpmH TRUE 0.972 26.000 0.787 1.000   NA
 7088032 7088033 Bphy_3102 Bphy_3103     FALSE 0.191 113.000 0.000 NA   NA
 7088036 7088037 Bphy_3106 Bphy_3107     FALSE 0.464 40.000 0.000 NA   NA
 7088037 7088038 Bphy_3107 Bphy_3108     FALSE 0.271 85.000 0.000 NA   NA
 7088038 7088039 Bphy_3108 Bphy_3109     TRUE 0.860 105.000 0.833 NA N NA
 7088040 7088041 Bphy_3110 Bphy_3111     FALSE 0.244 202.000 0.000 1.000 Y NA
 7088041 7088042 Bphy_3111 Bphy_3112     FALSE 0.020 234.000 0.000 NA   NA
 7088043 7088044 Bphy_3113 Bphy_3114     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 7088044 7088045 Bphy_3114 Bphy_3115     FALSE 0.347 60.000 0.000 NA   NA
 7088045 7088046 Bphy_3115 Bphy_3116     FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 7088047 7088048 Bphy_3117 Bphy_3118     FALSE 0.060 176.000 0.000 NA   NA
 7088048 7088049 Bphy_3118 Bphy_3119     FALSE 0.002 487.000 0.000 NA   NA
 7088049 7088050 Bphy_3119 Bphy_3120     FALSE 0.063 174.000 0.000 NA   NA
 7088050 7088051 Bphy_3120 Bphy_3121     FALSE 0.035 197.000 0.000 1.000 N NA
 7088053 7088054 Bphy_3123 Bphy_3124     FALSE 0.078 164.000 0.000 NA   NA
 7088054 7088055 Bphy_3124 Bphy_3125     TRUE 0.987 -3.000 0.182 NA   NA
 7088055 7088056 Bphy_3125 Bphy_3126     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 7088056 7088057 Bphy_3126 Bphy_3127     TRUE 0.715 68.000 0.118 1.000 N NA
 7088057 7088058 Bphy_3127 Bphy_3128     TRUE 0.984 24.000 0.341 NA Y NA
 7088061 7088062 Bphy_3131 Bphy_3132     FALSE 0.121 142.000 0.000 NA   NA
 7088063 7088064 Bphy_3133 Bphy_3134     FALSE 0.156 105.000 0.000 NA N NA
 7088064 7088065 Bphy_3134 Bphy_3135     FALSE 0.285 92.000 0.000 1.000   NA
 7088065 7088066 Bphy_3135 Bphy_3136     TRUE 0.569 61.000 0.024 NA   NA
 7088067 7088068 Bphy_3137 Bphy_3138     TRUE 0.992 -3.000 0.357 NA   NA
 7088069 7088070 Bphy_3139 Bphy_3140     TRUE 0.997 -3.000 0.076 0.006 Y NA
 7088070 7088071 Bphy_3140 Bphy_3141   cbiD TRUE 0.997 -3.000 0.123 0.006 Y NA
 7088071 7088072 Bphy_3141 Bphy_3142 cbiD   TRUE 0.994 0.000 0.043 0.006 Y NA
 7088073 7088074 Bphy_3143 Bphy_3144   cobH TRUE 0.977 -19.000 0.149 1.000 N NA
 7088074 7088075 Bphy_3144 Bphy_3145 cobH   TRUE 0.997 1.000 0.191 0.006 Y NA
 7088075 7088076 Bphy_3145 Bphy_3146     TRUE 0.997 -3.000 0.097 0.006 Y NA
 7088076 7088077 Bphy_3146 Bphy_3147     FALSE 0.096 161.000 0.000 1.000   NA
 7088078 7088079 Bphy_3148 Bphy_3149     FALSE 0.426 52.000 0.000 1.000   NA
 7088079 7088080 Bphy_3149 Bphy_3150     FALSE 0.003 453.000 0.000 NA   NA
 7088080 7088081 Bphy_3150 Bphy_3151     TRUE 0.986 30.000 0.568 NA Y NA
 7088081 7088082 Bphy_3151 Bphy_3152   cobN TRUE 0.995 -3.000 0.081 1.000 Y NA
 7088082 7088083 Bphy_3152 Bphy_3153 cobN   TRUE 0.886 11.000 0.020 1.000   NA
 7088084 7088085 Bphy_3154 Bphy_3155     TRUE 0.981 -3.000 0.087 1.000   NA
 7088085 7088086 Bphy_3155 Bphy_3156     TRUE 0.978 -3.000 0.005 0.006   NA
 7088086 7088087 Bphy_3156 Bphy_3157     TRUE 0.993 4.000 0.069 0.006 Y NA
 7088087 7088088 Bphy_3157 Bphy_3158     TRUE 0.944 -16.000 0.027 1.000 N NA
 7088089 7088090 Bphy_3159 Bphy_3160     FALSE 0.012 863.000 0.000 1.000 Y NA
 7088094 7088095 Bphy_3164 Bphy_3165     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7088095 7088096 Bphy_3165 Bphy_3166     FALSE 0.191 113.000 0.000 NA   NA
 7088096 7088097 Bphy_3166 Bphy_3167     FALSE 0.176 119.000 0.000 NA   NA
 7088097 7088098 Bphy_3167 Bphy_3168     FALSE 0.006 328.000 0.000 NA   NA
 7088098 7088099 Bphy_3168 Bphy_3169     FALSE 0.002 742.000 0.000 NA   NA
 7088100 7088101 Bphy_3170 Bphy_3171     FALSE 0.042 193.000 0.000 NA   NA
 7088103 7088104 Bphy_3173 Bphy_3174     TRUE 0.879 -7.000 0.000 1.000 N NA
 7088104 7088105 Bphy_3174 Bphy_3175     FALSE 0.004 365.000 0.000 1.000 N NA
 7088105 7088106 Bphy_3175 Bphy_3176     FALSE 0.198 102.000 0.000 1.000 N NA
 7088108 7088109 Bphy_3178 Bphy_3179     TRUE 0.992 -3.000 0.250 0.077 N NA
 7088109 7088110 Bphy_3179 Bphy_3180     FALSE 0.384 46.000 0.000 1.000 N NA
 7088110 7088111 Bphy_3180 Bphy_3181     TRUE 0.997 0.000 0.333 1.000 Y NA
 7088111 7088112 Bphy_3181 Bphy_3182     FALSE 0.445 42.000 0.000 NA   NA
 7088112 7088113 Bphy_3182 Bphy_3183     TRUE 0.712 13.000 0.000 NA   NA
 7088113 7088114 Bphy_3183 Bphy_3184     TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7088114 7088115 Bphy_3184 Bphy_3185     FALSE 0.258 82.000 0.000 1.000 N NA
 7088116 7088117 Bphy_3186 Bphy_3187     FALSE 0.011 264.000 0.000 1.000 N NA
 7088118 7088119 Bphy_3188 Bphy_3189     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7088119 7088120 Bphy_3189 Bphy_3190     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7088120 7088121 Bphy_3190 Bphy_3191     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088121 7088122 Bphy_3191 Bphy_3192     FALSE 0.351 59.000 0.000 NA   NA
 7088125 7088126 Bphy_3195 Bphy_3196     FALSE 0.012 262.000 0.000 1.000 N NA
 7088126 7088127 Bphy_3196 Bphy_3197     FALSE 0.104 144.000 0.000 1.000 N NA
 7088127 7088128 Bphy_3197 Bphy_3198     TRUE 0.981 5.000 0.333 1.000 N NA
 7088128 7088129 Bphy_3198 Bphy_3199     FALSE 0.384 46.000 0.000 1.000 N NA
 7088129 7088130 Bphy_3199 Bphy_3200     FALSE 0.315 61.000 0.000 1.000 N NA
 7088130 7088131 Bphy_3200 Bphy_3201     FALSE 0.062 185.000 0.000 1.000   NA
 7088133 7088134 Bphy_3203 Bphy_3204     TRUE 0.995 -3.000 0.588 1.000   NA
 7088134 7088135 Bphy_3204 Bphy_3205     TRUE 0.991 -7.000 0.167 0.001   NA
 7088135 7088136 Bphy_3205 Bphy_3206     TRUE 0.897 0.000 0.000 1.000   NA
 7088136 7088137 Bphy_3206 Bphy_3207     TRUE 0.704 75.000 0.103 1.000   NA
 7088137 7088138 Bphy_3207 Bphy_3208     TRUE 0.984 5.000 0.382 1.000   NA
 7088138 7088139 Bphy_3208 Bphy_3209     TRUE 0.991 -3.000 0.300 NA   NA
 7088141 7088142 Bphy_3211 Bphy_3212     FALSE 0.003 369.000 0.000 NA N NA
 7088142 7088143 Bphy_3212 Bphy_3213     FALSE 0.002 494.000 0.000 NA   NA
 7088143 7088144 Bphy_3213 Bphy_3214     FALSE 0.002 720.000 0.000 NA   NA
 7088144 7088145 Bphy_3214 Bphy_3215     TRUE 0.880 35.000 0.147 1.000   NA
 7088146 7088147 Bphy_3216 Bphy_3217     FALSE 0.093 307.000 0.000 0.057 Y NA
 7088148 7088149 Bphy_3218 Bphy_3219     FALSE 0.279 83.000 0.000 NA   NA
 7088149 7088150 Bphy_3219 Bphy_3220     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7088150 7088151 Bphy_3220 Bphy_3221     FALSE 0.133 137.000 0.000 NA   NA
 7088151 7088152 Bphy_3221 Bphy_3222     FALSE 0.200 87.000 0.000 NA N NA
 7088152 7088153 Bphy_3222 Bphy_3223     TRUE 0.924 29.000 0.250 NA   NA
 7088153 7088154 Bphy_3223 Bphy_3224     TRUE 0.997 -3.000 0.625 0.035   NA
 7088154 7088155 Bphy_3224 Bphy_3225     FALSE 0.003 1024.000 0.000 0.077   NA
 7088155 7088156 Bphy_3225 Bphy_3226     FALSE 0.001 724.000 0.000 1.000 N NA
 7088156 7088157 Bphy_3226 Bphy_3227     FALSE 0.002 577.000 0.000 1.000 N NA
 7088157 7088158 Bphy_3227 Bphy_3228     FALSE 0.010 252.000 0.000 NA N NA
 7088160 7088161 Bphy_3230 Bphy_3231     FALSE 0.014 620.000 0.000 NA Y NA
 7088161 7088162 Bphy_3231 Bphy_3232     FALSE 0.028 401.000 0.000 NA Y NA
 7088162 7088163 Bphy_3232 Bphy_3233     FALSE 0.001 858.000 0.000 1.000 N NA
 7088163 7088164 Bphy_3233 Bphy_3234     TRUE 0.849 28.000 0.077 NA   NA
 7088164 7088165 Bphy_3234 Bphy_3235     TRUE 0.873 64.000 0.400 NA   NA
 7088167 7088168 Bphy_3237 Bphy_3238     FALSE 0.242 94.000 0.000 NA   NA
 7088168 7088169 Bphy_3238 Bphy_3239     FALSE 0.022 410.000 0.133 1.000   NA
 7088169 7088170 Bphy_3239 Bphy_3240     FALSE 0.030 221.000 0.000 1.000   NA
 7088172 7088173 Bphy_3242 Bphy_3243     FALSE 0.021 231.000 0.000 NA   NA
 7088174 7088175 Bphy_3244 Bphy_3245     FALSE 0.141 173.000 0.021 NA   NA
 7088177 7088178 Bphy_3247 Bphy_3248     TRUE 0.959 44.000 0.128 0.080 Y NA
 7088178 7088179 Bphy_3248 Bphy_3249     TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 7088180 7088181 Bphy_3250 Bphy_3251     TRUE 0.997 12.000 0.875 0.062 Y NA
 7088181 7088182 Bphy_3251 Bphy_3252     TRUE 0.998 2.000 0.571 0.001 Y NA
 7088182 7088183 Bphy_3252 Bphy_3253     FALSE 0.008 294.000 0.000 1.000 N NA
 7088183 7088184 Bphy_3253 Bphy_3254     TRUE 0.847 -27.000 0.000 1.000 N NA
 7088184 7088185 Bphy_3254 Bphy_3255     TRUE 0.991 2.000 0.500 1.000   NA
 7088185 7088186 Bphy_3255 Bphy_3256     TRUE 0.991 4.000 0.364 0.001   NA
 7088186 7088187 Bphy_3256 Bphy_3257     TRUE 0.992 -3.000 0.375 1.000 N NA
 7088187 7088188 Bphy_3257 Bphy_3258     TRUE 0.990 -3.000 0.250 NA   NA
 7088188 7088189 Bphy_3258 Bphy_3259     TRUE 0.830 98.000 0.500 NA   NA
 7088190 7088191 Bphy_3260 Bphy_3261     FALSE 0.252 91.000 0.000 NA   NA
 7088195 7088196 Bphy_3265 Bphy_3266     FALSE 0.003 455.000 0.000 1.000   NA
 7088197 7088198 Bphy_3267 Bphy_3268     FALSE 0.355 58.000 0.000 NA   NA
 7088198 7088199 Bphy_3268 Bphy_3269     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 7088199 7088200 Bphy_3269 Bphy_3270     TRUE 0.992 -3.000 0.160 0.019   NA
 7088200 7088201 Bphy_3270 Bphy_3271     TRUE 0.994 0.000 0.750 1.000   NA
 7088201 7088202 Bphy_3271 Bphy_3272     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000 N NA
 7088202 7088203 Bphy_3272 Bphy_3273     TRUE 0.913 27.000 0.066 0.002   NA
 7088203 7088204 Bphy_3273 Bphy_3274     FALSE 0.139 143.000 0.000 1.000   NA
 7088204 7088205 Bphy_3274 Bphy_3275     FALSE 0.002 704.000 0.000 NA   NA
 7088205 7088206 Bphy_3275 Bphy_3276     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 7088206 7088207 Bphy_3276 Bphy_3277     TRUE 0.884 19.000 0.080 1.000 N NA
 7088207 7088208 Bphy_3277 Bphy_3278     FALSE 0.312 62.000 0.000 1.000 N NA
 7088212 7088213 Bphy_3282 Bphy_3283     TRUE 0.860 55.000 0.281 NA   NA
 7088213 7088214 Bphy_3283 Bphy_3284     TRUE 0.837 87.000 0.419 NA   NA
 7088214 7088215 Bphy_3284 Bphy_3285     TRUE 0.929 50.000 0.608 1.000   NA
 7088215 7088216 Bphy_3285 Bphy_3286     FALSE 0.518 87.000 0.029 1.000   NA
 7088218 7088219 Bphy_3288 Bphy_3289     FALSE 0.100 242.000 0.074 0.070 N NA
 7088219 7088220 Bphy_3289 Bphy_3290     TRUE 0.872 42.000 0.218 1.000 N NA
 7088221 7088222 Bphy_3291 Bphy_3292   purU TRUE 0.589 148.000 0.343 1.000 N NA
 7088223 7088224 Bphy_3293 Bphy_3294     TRUE 0.851 137.000 0.269 1.000 Y NA
 7088224 7088225 Bphy_3294 Bphy_3295     FALSE 0.394 199.000 0.538 1.000 N NA
 7088225 7088226 Bphy_3295 Bphy_3296     TRUE 0.949 53.000 0.773 0.062 N NA
 7088226 7088227 Bphy_3296 Bphy_3297     TRUE 0.933 42.000 0.364 0.062 N NA
 7088227 7088228 Bphy_3297 Bphy_3298     TRUE 0.999 -3.000 0.776 0.018 Y NA
 7088228 7088229 Bphy_3298 Bphy_3299     TRUE 0.997 4.000 0.667 1.000 Y NA
 7088229 7088230 Bphy_3299 Bphy_3300     TRUE 0.998 3.000 0.574 0.051 Y NA
 7088230 7088231 Bphy_3300 Bphy_3301     TRUE 0.944 54.000 0.912 1.000   NA
 7088231 7088232 Bphy_3301 Bphy_3302     TRUE 0.967 34.000 0.868 1.000   NA
 7088232 7088233 Bphy_3302 Bphy_3303     TRUE 0.972 44.000 0.395 1.000 Y NA
 7088234 7088235 Bphy_3304 Bphy_3305     FALSE 0.001 686.000 0.000 1.000 N NA
 7088235 7088236 Bphy_3305 Bphy_3306     FALSE 0.218 102.000 0.000 NA   NA
 7088238 7088239 Bphy_3308 Bphy_3309     TRUE 0.899 53.000 0.459 1.000 N NA
 7088239 7088240 Bphy_3309 Bphy_3310     TRUE 0.981 12.000 0.634 1.000 N NA
 7088240 7088241 Bphy_3310 Bphy_3311     FALSE 0.100 146.000 0.000 1.000 N NA
 7088242 7088243 Bphy_3312 Bphy_3313     FALSE 0.021 243.000 0.000 1.000   NA
 7088243 7088244 Bphy_3313 Bphy_3314     FALSE 0.001 760.000 0.000 1.000 N NA
 7088244 7088245 Bphy_3314 Bphy_3315     TRUE 0.876 32.000 0.143 1.000 N NA
 7088245 7088246 Bphy_3315 Bphy_3316     FALSE 0.242 94.000 0.000 NA   NA
 7088246 7088247 Bphy_3316 Bphy_3317     FALSE 0.191 113.000 0.000 NA   NA
 7088249 7088250 Bphy_3319 Bphy_3320     FALSE 0.174 120.000 0.000 NA   NA
 7088255 7088256 Bphy_3325 Bphy_3326     FALSE 0.060 186.000 0.000 1.000   NA
 7088257 7088258 Bphy_3327 Bphy_3328     FALSE 0.002 570.000 0.000 NA   NA
 7088258 7088259 Bphy_3328 Bphy_3329     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7088259 7088260 Bphy_3329 Bphy_3330     TRUE 0.969 30.000 0.882 1.000 N NA
 7088260 7088261 Bphy_3330 Bphy_3331     TRUE 0.997 -10.000 1.000 0.001   NA
 7088261 7088262 Bphy_3331 Bphy_3332     TRUE 0.997 -3.000 0.588 0.001   NA
 7088262 7088263 Bphy_3332 Bphy_3333     TRUE 0.948 79.000 0.167 0.001 Y NA
 7088263 7088264 Bphy_3333 Bphy_3334     TRUE 0.967 35.000 0.176 1.000 Y NA
 7088269 7088270 Bphy_3339 Bphy_3340     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088270 7088271 Bphy_3340 Bphy_3341     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7088272 7088273 Bphy_3342 Bphy_3343     FALSE 0.010 272.000 0.000 1.000 N NA
 7088273 7088274 Bphy_3343 Bphy_3344     TRUE 0.929 24.000 0.000 1.000 Y NA
 7088274 7088275 Bphy_3344 Bphy_3345     FALSE 0.167 123.000 0.000 NA   NA
 7088275 7088276 Bphy_3345 Bphy_3346     TRUE 0.987 -3.000 0.176 NA   NA
 7088278 7088279 Bphy_3348 Bphy_3349     TRUE 0.989 -3.000 0.200 1.000   NA
 7088282 7088283 Bphy_3352 Bphy_3353     TRUE 0.973 5.000 0.000 NA Y NA
 7088283 7088284 Bphy_3353 Bphy_3354     FALSE 0.200 87.000 0.000 NA N NA
 7088285 7088286 Bphy_3355 Bphy_3356     FALSE 0.004 373.000 0.000 1.000 N NA
 7088287 7088288 Bphy_3357 Bphy_3358     FALSE 0.004 436.000 0.000 1.000   NA
 7088288 7088289 Bphy_3358 Bphy_3359     TRUE 0.729 120.000 0.333 1.000   NA
 7088290 7088291 Bphy_3360 Bphy_3361     TRUE 0.960 9.000 0.080 0.079   NA
 7088291 7088292 Bphy_3361 Bphy_3362     TRUE 0.996 -7.000 0.880 1.000   NA
 7088297 7088298 Bphy_3367 Bphy_3368     TRUE 0.866 23.000 0.079 1.000 N NA
 7088298 7088299 Bphy_3368 Bphy_3369     TRUE 0.870 76.000 0.452 1.000   NA
 7088299 7088300 Bphy_3369 Bphy_3370     FALSE 0.002 585.000 0.000 NA   NA
 7088300 7088301 Bphy_3370 Bphy_3371     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA   NA
 7088301 7088302 Bphy_3371 Bphy_3372     FALSE 0.257 89.000 0.000 NA   NA
 7088302 7088303 Bphy_3372 Bphy_3373     FALSE 0.040 196.000 0.000 NA   NA
 7088303 7088304 Bphy_3373 Bphy_3374     TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 7088304 7088305 Bphy_3374 Bphy_3375     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7088305 7088306 Bphy_3375 Bphy_3376     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7088306 7088307 Bphy_3376 Bphy_3377     FALSE 0.003 415.000 0.000 NA   NA
 7088308 7088309 Bphy_3378 Bphy_3379     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7088311 7088312 Bphy_3381 Bphy_3382     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 7088312 7088313 Bphy_3382 Bphy_3383     TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 7088313 7088314 Bphy_3383 Bphy_3384     TRUE 0.985 10.000 0.667 NA   NA
 7088314 7088315 Bphy_3384 Bphy_3385     TRUE 0.989 -3.000 0.222 NA   NA
 7088315 7088316 Bphy_3385 Bphy_3386     TRUE 0.993 -3.000 0.444 NA   NA
 7088316 7088317 Bphy_3386 Bphy_3387     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 7088317 7088318 Bphy_3387 Bphy_3388     FALSE 0.047 189.000 0.000 NA   NA
 7088318 7088319 Bphy_3388 Bphy_3389     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7088319 7088320 Bphy_3389 Bphy_3390     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088320 7088321 Bphy_3390 Bphy_3391     TRUE 0.994 -7.000 0.635 NA   NA
 7088321 7088322 Bphy_3391 Bphy_3392     TRUE 0.988 -3.000 0.186 NA   NA
 7088322 7088323 Bphy_3392 Bphy_3393     TRUE 0.939 3.000 0.035 NA   NA
 7088323 7088324 Bphy_3393 Bphy_3394     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7088324 7088325 Bphy_3394 Bphy_3395     TRUE 0.698 14.000 0.000 NA   NA
 7088325 7088326 Bphy_3395 Bphy_3396     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7088326 7088327 Bphy_3396 Bphy_3397     TRUE 0.952 16.000 0.241 NA   NA
 7088327 7088328 Bphy_3397 Bphy_3398     TRUE 0.984 -40.000 0.264 NA   NA
 7088328 7088329 Bphy_3398 Bphy_3399     TRUE 0.983 -16.000 0.000 NA Y NA
 7088329 7088330 Bphy_3399 Bphy_3400     TRUE 0.985 6.000 0.286 0.060   NA
 7088330 7088331 Bphy_3400 Bphy_3401     FALSE 0.003 451.000 0.000 NA   NA
 7088331 7088332 Bphy_3401 Bphy_3402     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088332 7088333 Bphy_3402 Bphy_3403     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088333 7088334 Bphy_3403 Bphy_3404     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088334 7088335 Bphy_3404 Bphy_3405     TRUE 0.878 -13.000 0.000 NA   NA
 7088335 7088336 Bphy_3405 Bphy_3406     FALSE 0.128 139.000 0.000 NA   NA
 7088336 7088337 Bphy_3406 Bphy_3407     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7088337 7088338 Bphy_3407 Bphy_3408     TRUE 0.861 -39.000 0.000 NA   NA
 7088338 7088339 Bphy_3408 Bphy_3409     TRUE 0.987 8.000 0.667 NA   NA
 7088339 7088340 Bphy_3409 Bphy_3410     TRUE 0.866 3.000 0.000 1.000   NA
 7088340 7088341 Bphy_3410 Bphy_3411     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7088341 7088342 Bphy_3411 Bphy_3412     TRUE 0.869 -19.000 0.000 NA   NA
 7088342 7088343 Bphy_3412 Bphy_3413     TRUE 0.698 14.000 0.000 NA   NA
 7088344 7088345 Bphy_3414 Bphy_3415     TRUE 0.980 -7.000 0.125 NA   NA
 7088345 7088346 Bphy_3415 Bphy_3416     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088346 7088347 Bphy_3416 Bphy_3417     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088347 7088348 Bphy_3417 Bphy_3418     TRUE 0.991 3.000 0.667 NA   NA
 7088348 7088349 Bphy_3418 Bphy_3419     TRUE 0.892 -7.000 0.000 NA   NA
 7088349 7088350 Bphy_3419 Bphy_3420     FALSE 0.413 46.000 0.000 NA   NA
 7088350 7088351 Bphy_3420 Bphy_3421     FALSE 0.002 593.000 0.000 NA   NA
 7088351 7088352 Bphy_3421 Bphy_3422     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7088352 7088353 Bphy_3422 Bphy_3423     FALSE 0.148 131.000 0.000 NA   NA
 7088354 7088355 Bphy_3424 Bphy_3425     FALSE 0.013 265.000 0.000 NA   NA
 7088355 7088356 Bphy_3425 Bphy_3426     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 7088357 7088358 Bphy_3427 Bphy_3428     TRUE 0.833 57.000 0.233 1.000 N NA
 7088359 7088360 Bphy_3429 Bphy_3430     FALSE 0.518 70.000 0.021 NA   NA
 7088360 7088361 Bphy_3430 Bphy_3431     TRUE 0.810 91.000 0.357 NA   NA
 7088362 7088363 Bphy_3432 Bphy_3433     TRUE 0.892 133.000 0.429 1.000 Y NA
 7088366 7088367 Bphy_3436 Bphy_3437     TRUE 0.963 22.000 0.500 NA   NA
 7088370 7088371 Bphy_3440 Bphy_3441     FALSE 0.002 523.000 0.000 NA   NA
 7088371 7088372 Bphy_3441 Bphy_3442     TRUE 0.761 137.000 0.667 NA   NA
 7088374 7088375 Bphy_3444 Bphy_3445     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA N NA
 7088375 7088376 Bphy_3445 Bphy_3446     TRUE 0.959 11.000 0.218 NA N NA
 7088377 7088378 Bphy_3447 Bphy_3448     TRUE 0.933 52.000 0.765 1.000 N NA
 7088378 7088379 Bphy_3448 Bphy_3449     TRUE 0.785 134.000 0.762 1.000 N NA
 7088379 7088380 Bphy_3449 Bphy_3450     TRUE 0.997 -7.000 0.288 1.000 Y NA
 7088382 7088383 Bphy_3452 Bphy_3453     FALSE 0.054 183.000 0.000 NA   NA
 7088383 7088384 Bphy_3453 Bphy_3454     TRUE 0.964 -7.000 0.054 1.000 N NA
 7088384 7088385 Bphy_3454 Bphy_3455     TRUE 0.989 6.000 0.111 1.000 Y NA
 7088385 7088386 Bphy_3455 Bphy_3456     TRUE 0.900 44.000 0.333 NA   NA
 7088390 7088391 Bphy_3460 Bphy_3461     TRUE 0.951 68.000 0.364 NA Y NA
 7088391 7088392 Bphy_3461 Bphy_3462     TRUE 0.998 -7.000 0.333 0.006 Y NA
 7088392 7088393 Bphy_3462 Bphy_3463     TRUE 0.999 -3.000 0.826 0.006 Y NA
 7088393 7088394 Bphy_3463 Bphy_3464     TRUE 0.848 49.000 0.190 1.000   NA
 7088394 7088395 Bphy_3464 Bphy_3465     TRUE 0.658 45.000 0.028 NA   NA
 7088397 7088398 Bphy_3467 Bphy_3468     TRUE 0.929 15.000 0.075 0.076 N NA
 7088398 7088399 Bphy_3468 Bphy_3469     TRUE 0.793 41.000 0.104 NA N NA
 7088399 7088400 Bphy_3469 Bphy_3470     TRUE 0.864 74.000 0.500 NA N NA
 7088401 7088402 Bphy_3471 Bphy_3472     FALSE 0.006 334.000 0.000 NA   NA
 7088402 7088403 Bphy_3472 Bphy_3473     TRUE 0.672 140.000 0.424 NA   NA
 7088403 7088404 Bphy_3473 Bphy_3474     FALSE 0.504 109.000 0.061 1.000   NA
 7088404 7088405 Bphy_3474 Bphy_3475     TRUE 0.987 9.000 0.750 1.000 N NA
 7088405 7088406 Bphy_3475 Bphy_3476     TRUE 0.778 122.000 0.061 1.000 Y NA
 7088406 7088407 Bphy_3476 Bphy_3477     FALSE 0.532 32.000 0.000 NA   NA
 7088408 7088409 Bphy_3478 Bphy_3479     FALSE 0.091 156.000 0.000 NA   NA
 7088411 7088412 Bphy_3481 Bphy_3482     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7088412 7088413 Bphy_3482 Bphy_3483     TRUE 0.566 67.000 0.032 NA   NA
 7088413 7088414 Bphy_3483 Bphy_3484     TRUE 0.892 -7.000 0.000 NA   NA
 7088416 7088417 Bphy_3486 Bphy_3487     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 7088417 7088418 Bphy_3487 Bphy_3488     TRUE 0.968 8.000 0.000 NA Y NA
 7088418 7088419 Bphy_3488 Bphy_3489     TRUE 0.860 26.000 0.100 NA N NA
 7088419 7088420 Bphy_3489 Bphy_3490     FALSE 0.294 190.000 0.000 1.000 Y NA
 7088420 7088421 Bphy_3490 Bphy_3491     TRUE 0.844 12.000 0.000 0.069 N NA
 7088421 7088422 Bphy_3491 Bphy_3492     TRUE 0.659 15.000 0.000 1.000 N NA
 7088423 7088424 Bphy_3493 Bphy_3494     FALSE 0.123 250.000 0.000 1.000 Y NA
 7088424 7088425 Bphy_3494 Bphy_3495     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7088426 7088427 Bphy_3496 Bphy_3497     FALSE 0.078 164.000 0.000 NA   NA
 7088427 7088428 Bphy_3497 Bphy_3498     TRUE 0.997 5.000 0.875 NA Y NA
 7088429 7088430 Bphy_3499 Bphy_3500     TRUE 0.982 -3.000 0.111 NA   NA
 7088430 7088431 Bphy_3500 Bphy_3501     FALSE 0.021 231.000 0.000 NA   NA
 7088431 7088432 Bphy_3501 Bphy_3502     FALSE 0.043 201.000 0.000 1.000   NA
 7088432 7088433 Bphy_3502 Bphy_3503     FALSE 0.051 192.000 0.000 1.000   NA
 7088433 7088434 Bphy_3503 Bphy_3504     FALSE 0.035 381.000 0.000 1.000 Y NA
 7088435 7088436 Bphy_3505 Bphy_3506     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA N NA
 7088436 7088437 Bphy_3506 Bphy_3507     TRUE 0.997 -3.000 0.154 0.100 Y NA
 7088437 7088438 Bphy_3507 Bphy_3508     FALSE 0.002 665.000 0.000 NA   NA
 7088438 7088439 Bphy_3508 Bphy_3509     FALSE 0.549 30.000 0.000 NA   NA
 7088439 7088440 Bphy_3509 Bphy_3510     FALSE 0.003 408.000 0.000 1.000 N NA
 7088440 7088441 Bphy_3510 Bphy_3511     TRUE 0.984 12.000 0.778 1.000 N NA
 7088441 7088442 Bphy_3511 Bphy_3512     TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 7088442 7088443 Bphy_3512 Bphy_3513     TRUE 0.948 26.000 0.400 1.000 N NA
 7088443 7088444 Bphy_3513 Bphy_3514     TRUE 0.993 -3.000 0.182 0.008   NA
 7088444 7088445 Bphy_3514 Bphy_3515     TRUE 0.971 25.000 0.455 0.034   NA
 7088446 7088447 Bphy_3516 Bphy_3517     TRUE 0.796 7.000 0.000 NA   NA
 7088448 7088449 Bphy_3518 Bphy_3519     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088449 7088450 Bphy_3519 Bphy_3520     FALSE 0.005 347.000 0.000 NA   NA
 7088450 7088451 Bphy_3520 Bphy_3521     FALSE 0.279 83.000 0.000 NA   NA
 7088451 7088452 Bphy_3521 Bphy_3522     FALSE 0.427 44.000 0.000 NA   NA
 7088454 7088455 Bphy_3524 Bphy_3525     FALSE 0.009 285.000 0.000 1.000 N NA
 7088455 7088456 Bphy_3525 Bphy_3526     TRUE 0.963 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7088456 7088457 Bphy_3526 Bphy_3527     FALSE 0.198 110.000 0.000 NA   NA
 7088457 7088458 Bphy_3527 Bphy_3528     FALSE 0.294 77.000 0.000 NA   NA
 7088458 7088459 Bphy_3528 Bphy_3529     FALSE 0.011 276.000 0.000 NA   NA
 7088459 7088460 Bphy_3529 Bphy_3530     TRUE 0.733 108.000 0.286 NA   NA
 7088460 7088461 Bphy_3530 Bphy_3531     TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.034 Y NA
 7088461 7088462 Bphy_3531 Bphy_3532     TRUE 0.942 36.000 0.500 NA   NA
 7088464 7088465 Bphy_3534 Bphy_3535     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 7088465 7088466 Bphy_3535 Bphy_3536     TRUE 0.630 58.000 0.043 NA   NA
 7088466 7088467 Bphy_3536 Bphy_3537     FALSE 0.316 125.000 0.021 NA   NA
 7088467 7088468 Bphy_3537 Bphy_3538     TRUE 0.988 3.000 0.500 NA N NA
 7088468 7088469 Bphy_3538 Bphy_3539     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 7088471 7088472 Bphy_3541 Bphy_3542     FALSE 0.098 152.000 0.000 NA   NA
 7088474 7088475 Bphy_3544 Bphy_3545     FALSE 0.042 202.000 0.000 1.000   NA
 7088475 7088476 Bphy_3545 Bphy_3546     FALSE 0.497 36.000 0.000 NA   NA
 7088476 7088477 Bphy_3546 Bphy_3547     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088477 7088478 Bphy_3547 Bphy_3548     TRUE 0.859 83.000 0.500 1.000 N NA
 7088480 7088481 Bphy_3550 Bphy_3551     FALSE 0.421 53.000 0.000 1.000   NA
 7088482 7088483 Bphy_3552 Bphy_3553     FALSE 0.174 120.000 0.000 NA   NA
 7088483 7088484 Bphy_3553 Bphy_3554     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088484 7088485 Bphy_3554 Bphy_3555     FALSE 0.002 495.000 0.000 NA   NA
 7088485 7088486 Bphy_3555 Bphy_3556     FALSE 0.002 669.000 0.000 NA   NA
 7088486 7088487 Bphy_3556 Bphy_3557     FALSE 0.158 126.000 0.000 NA   NA
 7088487 7088488 Bphy_3557 Bphy_3558     FALSE 0.237 70.000 0.000 NA N NA
 7088489 7088490 Bphy_3559 Bphy_3560     TRUE 0.896 61.000 0.012 0.075 Y NA
 7088490 7088491 Bphy_3560 Bphy_3561     TRUE 0.945 25.000 0.009 1.000 Y NA
 7088491 7088492 Bphy_3561 Bphy_3562     TRUE 0.986 20.000 0.316 1.000 Y NA
 7088493 7088494 Bphy_3563 Bphy_3564     FALSE 0.008 304.000 0.000 NA   NA
 7088497 7088498 Bphy_3567 Bphy_3568     TRUE 0.640 24.000 0.000 1.000   NA
 7088499 7088500 Bphy_3569 Bphy_3570     FALSE 0.355 58.000 0.000 NA   NA
 7088500 7088501 Bphy_3570 Bphy_3571     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7088501 7088502 Bphy_3571 Bphy_3572     TRUE 0.570 33.000 0.000 1.000   NA
 7088502 7088503 Bphy_3572 Bphy_3573     FALSE 0.319 60.000 0.000 1.000 N NA
 7088503 7088504 Bphy_3573 Bphy_3574     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 7088505 7088506 Bphy_3575 Bphy_3576     FALSE 0.003 455.000 0.000 NA   NA
 7088507 7088508 Bphy_3577 Bphy_3578     FALSE 0.110 147.000 0.000 NA   NA
 7088511 7088512 Bphy_3581 Bphy_3582     FALSE 0.237 70.000 0.000 NA N NA
 7088513 7088514 Bphy_3583 Bphy_3584     FALSE 0.026 219.000 0.000 NA   NA
 7088515 7088516 Bphy_3585 Bphy_3586     FALSE 0.002 472.000 0.000 NA   NA
 7088516 7088517 Bphy_3586 Bphy_3587     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 7088517 7088518 Bphy_3587 Bphy_3588     TRUE 0.788 93.000 0.312 NA   NA
 7088518 7088519 Bphy_3588 Bphy_3589     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7088519 7088520 Bphy_3589 Bphy_3590     TRUE 0.968 17.000 0.294 0.099   NA
 7088520 7088521 Bphy_3590 Bphy_3591     FALSE 0.024 234.000 0.000 1.000   NA
 7088522 7088523 Bphy_3592 Bphy_3593     TRUE 0.876 121.000 0.676 0.006   NA
 7088523 7088524 Bphy_3593 Bphy_3594     TRUE 0.974 24.000 0.797 1.000   NA
 7088524 7088525 Bphy_3594 Bphy_3595     TRUE 0.947 4.000 0.061 NA   NA
 7088527 7088528 Bphy_3597 Bphy_3598     FALSE 0.383 118.000 0.041 1.000 N NA
 7088531 7088532 Bphy_3601 Bphy_3602     TRUE 0.999 -3.000 0.795 1.000 Y NA
 7088532 7088533 Bphy_3602 Bphy_3603     FALSE 0.408 269.000 0.553 NA Y NA
 7088533 7088534 Bphy_3603 Bphy_3604     TRUE 0.927 46.000 0.647 NA N NA
 7088535 7088536 Bphy_3605 Bphy_3606     FALSE 0.008 308.000 0.000 NA   NA
 7088536 7088537 Bphy_3606 Bphy_3607     FALSE 0.028 215.000 0.000 NA   NA
 7088537 7088538 Bphy_3607 Bphy_3608     FALSE 0.004 377.000 0.000 NA   NA
 7088539 7088540 Bphy_3609 Bphy_3610     FALSE 0.174 120.000 0.000 NA   NA
 7088542 7088543 Bphy_3612 Bphy_3613     FALSE 0.243 159.000 0.059 1.000 N NA
 7088543 7088544 Bphy_3613 Bphy_3614     TRUE 0.569 82.000 0.012 0.075 N NA
 7088544 7088545 Bphy_3614 Bphy_3615     FALSE 0.001 848.000 0.000 NA   NA
 7088545 7088546 Bphy_3615 Bphy_3616     TRUE 0.865 -22.000 0.000 NA   NA
 7088546 7088547 Bphy_3616 Bphy_3617     TRUE 0.553 123.000 0.118 1.000   NA
 7088547 7088548 Bphy_3617 Bphy_3618     TRUE 0.888 27.000 0.134 1.000 N NA
 7088548 7088549 Bphy_3618 Bphy_3619     FALSE 0.054 231.000 0.034 1.000 N NA
 7088551 7088552 Bphy_3621 Bphy_3622     FALSE 0.002 455.000 0.000 NA N NA
 7088552 7088553 Bphy_3622 Bphy_3623     FALSE 0.002 567.000 0.000 NA   NA
 7088556 7088557 Bphy_3626 Bphy_3627     FALSE 0.540 27.000 0.000 1.000 N NA
 7088557 7088558 Bphy_3627 Bphy_3628     TRUE 0.981 -7.000 0.143 1.000 N NA
 7088558 7088559 Bphy_3628 Bphy_3629     TRUE 0.982 0.000 0.152 1.000   NA
 7088559 7088560 Bphy_3629 Bphy_3630     FALSE 0.087 158.000 0.000 NA   NA
 7088561 7088562 Bphy_3631 Bphy_3632     FALSE 0.007 320.000 0.000 NA   NA
 7088562 7088563 Bphy_3632 Bphy_3633     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088563 7088564 Bphy_3633 Bphy_3634     FALSE 0.300 74.000 0.000 NA   NA
 7088566 7088567 Bphy_3636 Bphy_3637     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7088567 7088568 Bphy_3637 Bphy_3638     FALSE 0.008 307.000 0.000 NA   NA
 7088568 7088569 Bphy_3638 Bphy_3639     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7088569 7088570 Bphy_3639 Bphy_3640     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088570 7088571 Bphy_3640 Bphy_3641     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7088571 7088572 Bphy_3641 Bphy_3642     FALSE 0.006 337.000 0.000 NA   NA
 7088572 7088573 Bphy_3642 Bphy_3643     TRUE 0.650 125.000 0.250 NA   NA
 7088573 7088574 Bphy_3643 Bphy_3644     FALSE 0.003 407.000 0.000 NA   NA
 7088574 7088575 Bphy_3644 Bphy_3645     FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 7088577 7088578 Bphy_3646 Bphy_3647     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.060 Y NA
 7088578 7088579 Bphy_3647 Bphy_3648     TRUE 0.998 0.000 0.333 0.003 Y NA
 7088579 7088580 Bphy_3648 Bphy_3649     TRUE 0.996 4.000 0.222 0.003 Y NA
 7088580 7088581 Bphy_3649 Bphy_3650     FALSE 0.007 318.000 0.000 NA   NA
 7088581 7088582 Bphy_3650 Bphy_3651     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7088583 7088584 Bphy_3652 Bphy_3653     FALSE 0.063 174.000 0.000 NA   NA
 7088587 7088588 Bphy_3656 Bphy_3657     TRUE 0.721 193.000 0.551 1.000 Y NA
 7088590 7088591 Bphy_3659 Bphy_3660     FALSE 0.145 132.000 0.000 NA   NA
 7088591 7088592 Bphy_3660 Bphy_3661     FALSE 0.023 227.000 0.000 NA   NA
 7088594 7088595 Bphy_3663 Bphy_3664     TRUE 0.873 -16.000 0.000 NA   NA
 7088595 7088596 Bphy_3664 Bphy_3665     TRUE 0.739 94.000 0.000 1.000 Y NA
 7088596 7088597 Bphy_3665 Bphy_3666     FALSE 0.003 403.000 0.000 NA   NA
 7088598 7088599 Bphy_3667 Bphy_3668     FALSE 0.382 52.000 0.000 NA   NA
 7088601 7088602 Bphy_3670 Bphy_3671     FALSE 0.003 430.000 0.000 NA   NA
 7088602 7088603 Bphy_3671 Bphy_3672     TRUE 0.996 -3.000 0.778 NA   NA
 7088603 7088604 Bphy_3672 Bphy_3673     TRUE 0.962 34.000 0.778 NA   NA
 7088606 7088607 Bphy_3675 Bphy_3676     TRUE 0.874 91.000 0.667 NA   NA
 7088607 7088608 Bphy_3676 Bphy_3677     FALSE 0.386 51.000 0.000 NA   NA
 7088609 7088610 Bphy_3678 Bphy_3679     TRUE 0.825 7.000 0.000 1.000   NA
 7088610 7088611 Bphy_3679 Bphy_3680     FALSE 0.549 30.000 0.000 NA   NA
 7088611 7088612 Bphy_3680 Bphy_3681     FALSE 0.532 32.000 0.000 NA   NA
 7088612 7088613 Bphy_3681 Bphy_3682     FALSE 0.172 121.000 0.000 NA   NA
 7088614 7088615 Bphy_3683 Bphy_3684     FALSE 0.004 391.000 0.000 NA   NA
 7088615 7088616 Bphy_3684 Bphy_3685     TRUE 0.859 85.000 0.500 NA   NA
 7088616 7088617 Bphy_3685 Bphy_3686     TRUE 0.990 19.000 0.500 1.000 Y NA
 7088617 7088618 Bphy_3686 Bphy_3687     TRUE 0.921 3.000 0.018 1.000 N NA
 7088618 7088619 Bphy_3687 Bphy_3688     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7088619 7088620 Bphy_3688 Bphy_3689     TRUE 0.869 -19.000 0.000 NA   NA
 7088620 7088621 Bphy_3689 Bphy_3690     FALSE 0.011 276.000 0.000 NA   NA
 7088622 7088623 Bphy_3691 Bphy_3692     FALSE 0.110 147.000 0.000 NA   NA
 7088623 7088624 Bphy_3692 Bphy_3693     FALSE 0.002 511.000 0.000 NA   NA
 7088624 7088625 Bphy_3693 Bphy_3694     TRUE 0.824 57.000 0.109 0.075   NA
 7088625 7088626 Bphy_3694 Bphy_3695     FALSE 0.379 156.000 0.140 1.000 N NA
 7088626 7088627 Bphy_3695 Bphy_3696     FALSE 0.235 71.000 0.000 NA N NA
 7088631 7088632 Bphy_3700 Bphy_3701     FALSE 0.004 356.000 0.000 1.000 N NA
 7088633 7088634 Bphy_3702 Bphy_3703     FALSE 0.261 88.000 0.000 NA   NA
 7088634 7088635 Bphy_3703 Bphy_3704     FALSE 0.208 106.000 0.000 NA   NA
 7088636 7088637 Bphy_3705 Bphy_3706     FALSE 0.026 218.000 0.000 NA   NA
 7088638 7088639 Bphy_3707 Bphy_3708     FALSE 0.205 107.000 0.000 NA   NA
 7088640 7088641 Bphy_3709 Bphy_3710     TRUE 0.993 25.000 0.820 0.098 Y NA
 7088641 7088642 Bphy_3710 Bphy_3711     TRUE 0.992 22.000 0.839 1.000 Y NA
 7088642 7088643 Bphy_3711 Bphy_3712     TRUE 0.996 -3.000 0.810 1.000 N NA
 7088644 7088645 Bphy_3713 Bphy_3714     FALSE 0.003 359.000 0.000 NA N NA
 7088645 7088646 Bphy_3714 Bphy_3715     FALSE 0.009 297.000 0.000 NA   NA
 7088646 7088647 Bphy_3715 Bphy_3716     FALSE 0.116 144.000 0.000 NA   NA
 7088647 7088648 Bphy_3716 Bphy_3717     FALSE 0.153 122.000 0.000 1.000 N NA
 7088648 7088649 Bphy_3717 Bphy_3718     FALSE 0.004 398.000 0.000 NA   NA
 7088649 7088650 Bphy_3718 Bphy_3719     TRUE 0.986 -3.000 0.150 NA   NA
 7088650 7088651 Bphy_3719 Bphy_3720     TRUE 0.799 53.000 0.146 NA   NA
 7088652 7088653 Bphy_3721 Bphy_3722     FALSE 0.003 466.000 0.000 NA   NA
 7088653 7088654 Bphy_3722 Bphy_3723     FALSE 0.128 139.000 0.000 NA   NA
 7088654 7088655 Bphy_3723 Bphy_3724     FALSE 0.143 133.000 0.000 NA   NA
 7088655 7088656 Bphy_3724 Bphy_3725     TRUE 0.983 42.000 0.750 NA Y NA
 7088657 7088658 Bphy_3726 Bphy_3727     TRUE 0.571 27.000 0.000 NA   NA
 7088659 7088660 Bphy_3728 Bphy_3729     TRUE 0.942 59.000 1.000 1.000   NA
 7088660 7088661 Bphy_3729 Bphy_3730     TRUE 0.946 34.000 0.500 NA   NA
 7088661 7088662 Bphy_3730 Bphy_3731     TRUE 0.830 98.000 0.500 NA   NA
 7088662 7088663 Bphy_3731 Bphy_3732     TRUE 0.992 -16.000 0.500 1.000   NA
 7088663 7088664 Bphy_3732 Bphy_3733     TRUE 0.970 62.000 0.600 1.000 Y NA
 7088665 7088666 Bphy_3734 Bphy_3735     TRUE 0.973 22.000 0.750 NA   NA
 7088667 7088668 Bphy_3736 Bphy_3737     FALSE 0.002 835.000 0.000 1.000   NA
 7088668 7088669 Bphy_3737 Bphy_3738     FALSE 0.223 100.000 0.000 NA   NA
 7088669 7088670 Bphy_3738 Bphy_3739     FALSE 0.011 274.000 0.000 NA   NA
 7088671 7088672 Bphy_3740 Bphy_3741     FALSE 0.336 76.000 0.000 1.000   NA
 7088672 7088673 Bphy_3741 Bphy_3742     FALSE 0.128 139.000 0.000 NA   NA
 7088675 7088676 Bphy_3744 Bphy_3745     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7088677 7088678 Bphy_3746 Bphy_3747     FALSE 0.151 129.000 0.000 NA   NA
 7088678 7088679 Bphy_3747 Bphy_3748     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 7088679 7088680 Bphy_3748 Bphy_3749     FALSE 0.203 108.000 0.000 NA   NA
 7088680 7088681 Bphy_3749 Bphy_3750     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7088681 7088682 Bphy_3750 Bphy_3751     TRUE 0.887 -9.000 0.000 NA   NA
 7088682 7088683 Bphy_3751 Bphy_3752     FALSE 0.516 34.000 0.000 NA   NA
 7088683 7088684 Bphy_3752 Bphy_R0016     FALSE 0.003 451.000 0.000 NA   NA
 7088684 7088685 Bphy_R0016 Bphy_R0077     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7088685 7088686 Bphy_R0077 Bphy_R0078     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7088686 7088687 Bphy_R0078 Bphy_R0017     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 7088690 7088691 Bphy_3755 Bphy_3756     TRUE 0.734 127.000 0.467 1.000 N NA
 7088692 7088693 Bphy_3757 Bphy_3758     TRUE 0.924 3.000 0.008 1.000   NA
 7088693 7088694 Bphy_3758 Bphy_3759     TRUE 0.928 38.000 0.375 1.000   NA
 7088694 7088695 Bphy_3759 Bphy_3760     TRUE 0.991 39.000 0.804 0.002 Y NA
 7088695 7088696 Bphy_3760 Bphy_3761     TRUE 0.686 77.000 0.043 0.074   NA
 7088699 7088700 Bphy_3764 Bphy_3765     TRUE 0.924 -3.000 0.000 1.000   NA
 7088700 7088701 Bphy_3765 Bphy_3766     FALSE 0.014 257.000 0.000 NA   NA
 7088704 7088705 Bphy_3769 Bphy_3770     FALSE 0.401 101.000 0.020 NA   NA
 7088705 7088706 Bphy_3770 Bphy_3771     TRUE 0.991 -3.000 0.296 NA   NA
 7088706 7088707 Bphy_3771 Bphy_3772     TRUE 0.980 -3.000 0.096 NA   NA
 7088708 7088709 Bphy_3773 Bphy_3774   phnH TRUE 0.999 0.000 0.967 0.001 Y NA
 7088709 7088710 Bphy_3774 Bphy_3775 phnH   TRUE 0.999 0.000 0.960 0.001 Y NA
 7088710 7088711 Bphy_3775 Bphy_3776     TRUE 0.999 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 7088711 7088712 Bphy_3776 Bphy_3777   phnK TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 7088712 7088713 Bphy_3777 Bphy_3778 phnK   TRUE 0.996 14.000 0.859 0.020 Y NA
 7088713 7088714 Bphy_3778 Bphy_3779     TRUE 0.950 25.000 0.024 1.000 Y NA
 7088714 7088715 Bphy_3779 Bphy_3780     FALSE 0.004 358.000 0.000 1.000 N NA
 7088715 7088716 Bphy_3780 Bphy_3781     FALSE 0.010 298.000 0.000 1.000   NA
 7088716 7088717 Bphy_3781 Bphy_3782     FALSE 0.008 321.000 0.000 1.000   NA
 7088718 7088719 Bphy_3783 Bphy_3784     FALSE 0.340 130.000 0.037 NA   NA
 7088719 7088720 Bphy_3784 Bphy_3785     TRUE 0.973 -10.000 0.091 NA   NA
 7088721 7088722 Bphy_3786 Bphy_3787     FALSE 0.296 76.000 0.000 NA   NA
 7088722 7088723 Bphy_3787 Bphy_3788     FALSE 0.525 129.000 0.133 NA   NA
 7088723 7088724 Bphy_3788 Bphy_3789     FALSE 0.070 170.000 0.000 NA   NA
 7088726 7088727 Bphy_3791 Bphy_3792     FALSE 0.032 208.000 0.000 NA   NA
 7088728 7088729 Bphy_3793 Bphy_3794     FALSE 0.117 138.000 0.000 1.000 N NA
 7088729 7088730 Bphy_3794 Bphy_3795     TRUE 0.997 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 7088730 7088731 Bphy_3795 Bphy_3796     FALSE 0.020 236.000 0.000 NA   NA
 7088731 7088732 Bphy_3796 Bphy_3797     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7088732 7088733 Bphy_3797 Bphy_3798     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 7088733 7088734 Bphy_3798 Bphy_3799     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 7088735 7088736 Bphy_3800 Bphy_3801     FALSE 0.005 349.000 0.000 NA   NA
 7088736 7088737 Bphy_3801 Bphy_3802     TRUE 0.995 -3.000 0.625 NA   NA
 7088737 7088738 Bphy_3802 Bphy_3803     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7088738 7088739 Bphy_3803 Bphy_3804     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 7088739 7088740 Bphy_3804 Bphy_3805     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088740 7088741 Bphy_3805 Bphy_3806     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7088741 7088742 Bphy_3806 Bphy_3807     FALSE 0.292 78.000 0.000 NA   NA
 7088742 7088743 Bphy_3807 Bphy_3808     FALSE 0.158 126.000 0.000 NA   NA
 7088743 7088744 Bphy_3808 Bphy_3809     FALSE 0.041 203.000 0.000 1.000   NA
 7088744 7088745 Bphy_3809 Bphy_3810     TRUE 0.991 8.000 0.500 0.000   NA
 7088745 7088746 Bphy_3810 Bphy_3811     TRUE 0.997 -3.000 0.529 0.000   NA
 7088746 7088747 Bphy_3811 Bphy_3812     TRUE 0.955 42.000 0.824 1.000   NA
 7088747 7088748 Bphy_3812 Bphy_3813     TRUE 0.995 -3.000 0.333 0.060   NA
 7088748 7088749 Bphy_3813 Bphy_3814     TRUE 0.996 -3.000 0.500 0.010   NA
 7088749 7088750 Bphy_3814 Bphy_3815     TRUE 0.951 25.000 0.364 1.000   NA
 7088750 7088751 Bphy_3815 Bphy_3816     TRUE 0.715 109.000 0.273 1.000 N NA
 7088752 7088753 Bphy_3817 Bphy_3818     FALSE 0.296 76.000 0.000 NA   NA
 7088755 7088756 Bphy_3820 Bphy_3821     TRUE 0.978 0.000 0.114 1.000   NA
 7088756 7088757 Bphy_3821 Bphy_3822     TRUE 0.996 -3.000 0.714 1.000   NA
 7088758 7088759 Bphy_3823 Bphy_3824     FALSE 0.008 293.000 0.000 1.000 N NA
 7088761 7088762 Bphy_3826 Bphy_3827     TRUE 0.947 40.000 0.667 NA   NA
 7088762 7088763 Bphy_3827 Bphy_3828     FALSE 0.022 230.000 0.000 NA   NA
 7088764 7088765 Bphy_3829 Bphy_3830     TRUE 0.921 79.000 1.000 NA   NA
 7088766 7088767 Bphy_3831 Bphy_3832     TRUE 0.985 6.000 0.500 NA   NA
 7088768 7088769 Bphy_3833 Bphy_3834     TRUE 0.987 -3.000 0.113 0.080 N NA
 7088769 7088770 Bphy_3834 Bphy_3835     TRUE 0.966 35.000 1.000 1.000 N NA
 7088770 7088771 Bphy_3835 Bphy_3836     TRUE 0.884 98.000 0.889 1.000 N NA
 7088771 7088772 Bphy_3836 Bphy_3837     TRUE 0.994 -13.000 0.800 NA   NA
 7088772 7088773 Bphy_3837 Bphy_3838     FALSE 0.185 248.000 0.400 NA   NA
 7088773 7088774 Bphy_3838 Bphy_3839     FALSE 0.110 253.000 0.200 NA   NA
 7088774 7088775 Bphy_3839 Bphy_3840     FALSE 0.007 318.000 0.000 NA   NA
 7088775 7088776 Bphy_3840 Bphy_3841     TRUE 0.892 63.000 0.500 NA   NA
 7088779 7088780 Bphy_3844 Bphy_3845     TRUE 0.883 92.000 0.750 NA   NA
 7088780 7088781 Bphy_3845 Bphy_3846     FALSE 0.426 178.000 0.333 NA   NA
 7088781 7088782 Bphy_3846 Bphy_3847     FALSE 0.019 237.000 0.000 NA   NA
 7088782 7088783 Bphy_3847 Bphy_3848     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 7088784 7088785 Bphy_3849 Bphy_3850     FALSE 0.347 60.000 0.000 NA   NA
 7088786 7088787 Bphy_3851 Bphy_3852     FALSE 0.191 113.000 0.000 NA   NA
 7088790 7088791 Bphy_3855 Bphy_3856     FALSE 0.309 128.000 0.022 NA   NA
 7088791 7088792 Bphy_3856 Bphy_3857     TRUE 0.570 119.000 0.133 NA   NA
 7088792 7088793 Bphy_3857 Bphy_3858     FALSE 0.420 110.000 0.043 1.000 N NA
 7088793 7088794 Bphy_3858 Bphy_3859     TRUE 0.948 37.000 0.640 1.000 N NA
 7088794 7088795 Bphy_3859 Bphy_3860     FALSE 0.207 170.000 0.060 1.000 N NA
 7088795 7088796 Bphy_3860 Bphy_3861     TRUE 0.919 16.000 0.098 1.000   NA
 7088796 7088797 Bphy_3861 Bphy_3862     TRUE 0.986 5.000 0.444 1.000   NA
 7088797 7088798 Bphy_3862 Bphy_3863     TRUE 0.993 10.000 0.333 1.000 Y NA
 7088798 7088799 Bphy_3863 Bphy_3864   eutB TRUE 0.999 -3.000 0.780 1.000 Y NA
 7088799 7088800 Bphy_3864 Bphy_3865 eutB   TRUE 0.842 156.000 0.268 0.018 Y NA
 7088801 7088802 Bphy_3866 Bphy_3867     TRUE 0.778 196.000 0.611 0.067 Y NA
 7088802 7088803 Bphy_3867 Bphy_3868     TRUE 0.999 -3.000 0.842 0.009 Y NA
 7088803 7088804 Bphy_3868 Bphy_3869     TRUE 0.998 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 7088805 7088806 Bphy_3870 Bphy_3871     FALSE 0.090 228.000 0.067 1.000   NA
 7088806 7088807 Bphy_3871 Bphy_3872     TRUE 0.959 22.000 0.433 NA   NA
 7088807 7088808 Bphy_3872 Bphy_3873     TRUE 0.983 12.000 0.727 NA   NA
 7088808 7088809 Bphy_3873 Bphy_3874     TRUE 0.996 -3.000 0.727 NA   NA
 7088811 7088812 Bphy_3876 Bphy_3877     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 7088815 7088816 Bphy_3880 Bphy_3881     FALSE 0.011 273.000 0.000 NA   NA
 7088816 7088817 Bphy_3881 Bphy_3882     TRUE 0.884 -10.000 0.000 NA   NA
 7088817 7088818 Bphy_3882 Bphy_3883     TRUE 0.750 84.000 0.188 NA   NA
 7088819 7088820 Bphy_3884 Bphy_3885     TRUE 0.583 124.000 0.086 0.049 N NA
 7088822 7088823 Bphy_3887 Bphy_3888     FALSE 0.462 116.000 0.069 1.000 N NA
 7088824 7088825 Bphy_3889 Bphy_3890     TRUE 0.999 3.000 0.782 0.000 Y NA
 7088826 7088827 Bphy_3891 Bphy_3892     FALSE 0.322 82.000 0.000 1.000   NA
 7088827 7088828 Bphy_3892 Bphy_3893     FALSE 0.004 376.000 0.000 NA   NA
 7088828 7088829 Bphy_3893 Bphy_3894     FALSE 0.041 194.000 0.000 NA   NA
 7088829 7088830 Bphy_3894 Bphy_3895     FALSE 0.487 37.000 0.000 NA   NA
 7088831 7088832 Bphy_3896 Bphy_3897     FALSE 0.121 142.000 0.000 NA   NA
 7088832 7088833 Bphy_3897 Bphy_3898     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7088834 7088835 Bphy_3899 Bphy_3900     FALSE 0.068 165.000 0.000 1.000 N NA
 7088835 7088836 Bphy_3900 Bphy_3901     TRUE 0.996 -3.000 0.947 NA   NA
 7088836 7088837 Bphy_3901 Bphy_3902     FALSE 0.040 196.000 0.000 NA   NA
 7088838 7088839 Bphy_3903 Bphy_3904     TRUE 0.777 43.000 0.081 NA   NA
 7088839 7088840 Bphy_3904 Bphy_3905     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 7088840 7088841 Bphy_3905 Bphy_3906     FALSE 0.050 186.000 0.000 NA   NA
 7088841 7088842 Bphy_3906 Bphy_3907     FALSE 0.063 174.000 0.000 NA   NA
 7088842 7088843 Bphy_3907 Bphy_3908     FALSE 0.389 38.000 0.000 NA N NA
 7088843 7088844 Bphy_3908 Bphy_3909     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088844 7088845 Bphy_3909 Bphy_3910     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7088849 7088850 Bphy_3914 Bphy_3915     FALSE 0.195 111.000 0.000 NA   NA
 7088850 7088851 Bphy_3915 Bphy_3916     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7088851 7088852 Bphy_3916 Bphy_3917     FALSE 0.532 32.000 0.000 NA   NA
 7088855 7088856 Bphy_3920 Bphy_3921     FALSE 0.298 88.000 0.000 1.000   NA
 7088858 7088859 Bphy_3923 Bphy_3924     TRUE 0.789 75.000 0.000 1.000 Y NA
 7088859 7088860 Bphy_3924 Bphy_3925     TRUE 0.950 2.000 0.000 0.004   NA
 7088863 7088864 Bphy_3928 Bphy_3929     TRUE 0.998 -7.000 0.591 1.000 Y NA
 7088865 7088866 Bphy_3930 Bphy_3931     FALSE 0.309 70.000 0.000 NA   NA
 7088866 7088867 Bphy_3931 Bphy_3932     FALSE 0.254 216.000 0.333 NA   NA
 7088869 7088870 Bphy_3934 Bphy_3935     FALSE 0.047 184.000 0.000 1.000 N NA
 7088870 7088871 Bphy_3935 Bphy_3936     FALSE 0.533 37.000 0.000 1.000   NA
 7088871 7088872 Bphy_3936 Bphy_3937     FALSE 0.549 30.000 0.000 NA   NA
 7088872 7088873 Bphy_3937 Bphy_3938     TRUE 0.596 24.000 0.000 NA   NA
 7088874 7088875 Bphy_3939 Bphy_3940     FALSE 0.105 149.000 0.000 NA   NA
 7088876 7088877 Bphy_3941 Bphy_3942   dnaG FALSE 0.033 426.000 0.299 1.000 N NA
 7088877 7088878 Bphy_3942 Bphy_3943 dnaG   TRUE 0.654 103.000 0.137 1.000   NA
 7088878 7088879 Bphy_3943 Bphy_3944   rpsU FALSE 0.100 296.000 0.173 0.010   NA
 7088879 7088880 Bphy_3944 Bphy_3945 rpsU   FALSE 0.448 110.000 0.039 1.000   NA
 7088882 7088883 Bphy_3947 Bphy_3948     FALSE 0.345 148.000 0.069 1.000   NA
 7088883 7088884 Bphy_3948 Bphy_3949     TRUE 0.913 97.000 0.246 1.000 Y NA
 7088884 7088885 Bphy_3949 Bphy_3950     TRUE 0.941 15.000 0.177 1.000 N NA
 7088886 7088887 Bphy_3951 Bphy_3952     TRUE 0.772 125.000 0.066 1.000 Y NA
 7088890 7088891 Bphy_3955 Bphy_3956     FALSE 0.015 267.000 0.000 1.000   NA
 7088891 7088892 Bphy_3956 Bphy_3957     FALSE 0.126 148.000 0.000 1.000   NA
 7088892 7088893 Bphy_3957 Bphy_3958     TRUE 0.991 17.000 0.500 1.000 Y NA
 7088894 7088895 Bphy_3959 Bphy_3960     TRUE 0.937 45.000 0.091 1.000 Y NA
 7088895 7088896 Bphy_3960 Bphy_3961     TRUE 0.992 25.000 0.914 1.000 Y NA
 7088896 7088897 Bphy_3961 Bphy_3962     FALSE 0.067 166.000 0.000 1.000 N NA
 7088897 7088898 Bphy_3962 Bphy_3963     TRUE 0.998 0.000 0.429 0.001 Y NA
 7088899 7088900 Bphy_3964 Bphy_3965     TRUE 0.996 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 7088900 7088901 Bphy_3965 Bphy_3966     FALSE 0.258 82.000 0.000 1.000 N NA
 7088901 7088902 Bphy_3966 Bphy_3967     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 7088903 7088904 Bphy_3968 Bphy_3969     TRUE 0.998 3.000 0.750 0.003 Y NA
 7088904 7088905 Bphy_3969 Bphy_3970     TRUE 0.999 0.000 0.750 0.003 Y NA
 7088905 7088906 Bphy_3970 Bphy_3971     TRUE 0.999 1.000 1.000 0.059 Y NA
 7088908 7088909 Bphy_3973 Bphy_3974     FALSE 0.003 366.000 0.000 NA N NA
 7088909 7088910 Bphy_3974 Bphy_3975     TRUE 0.988 31.000 0.719 NA Y NA
 7088910 7088911 Bphy_3975 Bphy_3976     TRUE 0.997 -3.000 0.220 1.000 Y NA
 7088911 7088912 Bphy_3976 Bphy_3977     TRUE 0.844 37.000 0.118 NA   NA
 7088912 7088913 Bphy_3977 Bphy_3978     TRUE 0.983 16.000 0.931 NA   NA
 7088913 7088914 Bphy_3978 Bphy_3979     FALSE 0.507 197.000 0.835 NA   NA
 7088914 7088915 Bphy_3979 Bphy_3980     TRUE 0.917 43.000 0.437 1.000 N NA
 7088915 7088916 Bphy_3980 Bphy_3981     FALSE 0.006 366.000 0.000 1.000   NA
 7088918 7088919 Bphy_3983 Bphy_3984     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 7088919 7088920 Bphy_3984 Bphy_3985     FALSE 0.013 264.000 0.000 NA   NA
 7088921 7088922 Bphy_3986 Bphy_3987     FALSE 0.165 124.000 0.000 NA   NA
 7088922 7088923 Bphy_3987 Bphy_3988     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA N NA
 7088923 7088924 Bphy_3988 Bphy_3989     FALSE 0.036 201.000 0.000 NA   NA
 7088927 7088928 Bphy_3992 Bphy_3993     FALSE 0.234 89.000 0.000 1.000 N NA
 7088928 7088929 Bphy_3993 Bphy_3994     TRUE 0.579 26.000 0.000 NA   NA
 7088932 7088933 Bphy_3997 Bphy_3998     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 7088934 7088935 Bphy_3999 Bphy_4000     FALSE 0.013 241.000 0.000 NA N NA
 7088937 7088938 Bphy_4002 Bphy_4003     TRUE 0.941 6.000 0.069 1.000 N NA
 7088938 7088939 Bphy_4003 Bphy_4004     TRUE 0.728 59.000 0.103 1.000 N NA
 7088939 7088940 Bphy_4004 Bphy_4005     TRUE 0.997 13.000 1.000 0.067 Y NA
 7088940 7088941 Bphy_4005 Bphy_4006     TRUE 0.936 59.000 0.088 0.067 Y NA
 7088941 7088942 Bphy_4006 Bphy_4007     TRUE 0.992 2.000 0.088 1.000 Y NA
 7088942 7088943 Bphy_4007 Bphy_4008     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.020 Y NA
 7088944 7088945 Bphy_4009 Bphy_4010     TRUE 0.742 71.000 0.143 NA   NA
 7088945 7088946 Bphy_4010 Bphy_4011     TRUE 0.959 12.000 0.214 NA   NA
 7088946 7088947 Bphy_4011 Bphy_4012     TRUE 0.929 29.000 0.167 0.049 N NA
 7088951 7088952 Bphy_4016 Bphy_4017     TRUE 0.998 -12.000 0.300 0.001 Y NA
 7088952 7088953 Bphy_4017 Bphy_4018     FALSE 0.001 644.000 0.000 NA N NA
 7088953 7088954 Bphy_4018 Bphy_4019     TRUE 0.987 -3.000 0.176 NA   NA
 7088954 7088955 Bphy_4019 Bphy_4020     FALSE 0.002 564.000 0.000 NA   NA
 7088955 7088956 Bphy_4020 Bphy_4021     TRUE 0.924 72.000 1.000 1.000 N NA
 7088956 7088957 Bphy_4021 Bphy_4022     TRUE 0.973 35.000 1.000 0.097 N NA
 7088957 7088958 Bphy_4022 Bphy_4023     TRUE 0.940 36.000 0.500 1.000 N NA
 7088958 7088959 Bphy_4023 Bphy_4024     TRUE 0.865 164.000 0.500 0.054 Y NA
 7088959 7088960 Bphy_4024 Bphy_4025     TRUE 0.821 88.000 0.000 0.054 Y NA
 7088962 7088963 Bphy_4027 Bphy_4028     TRUE 0.608 130.000 0.000 1.000 Y NA
 7088963 7088964 Bphy_4028 Bphy_4029     TRUE 0.886 80.000 0.650 1.000 N NA
 7088965 7088966 Bphy_4030 Bphy_4031     FALSE 0.003 466.000 0.000 NA   NA
 7088967 7088968 Bphy_4032 Bphy_4033     FALSE 0.015 244.000 0.000 1.000 N NA
 7088970 7088971 Bphy_4035 Bphy_4036     FALSE 0.309 70.000 0.000 NA   NA
 7088971 7088972 Bphy_4036 Bphy_4037     FALSE 0.253 65.000 0.000 NA N NA
 7088972 7088973 Bphy_4037 Bphy_4038     TRUE 0.841 -10.000 0.000 NA N NA
 7088973 7088974 Bphy_4038 Bphy_4039     TRUE 0.976 12.000 0.000 0.001 Y NA
 7088976 7088977 Bphy_4041 Bphy_4042     TRUE 0.974 -3.000 0.062 NA   NA
 7088977 7088978 Bphy_4042 Bphy_4043     TRUE 0.963 3.000 0.092 NA   NA
 7088978 7088979 Bphy_4043 Bphy_4044     TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 7088979 7088980 Bphy_4044 Bphy_4045     TRUE 0.988 -3.000 0.176 1.000   NA
 7088980 7088981 Bphy_4045 Bphy_4046     TRUE 0.662 139.000 0.382 NA   NA
 7088981 7088982 Bphy_4046 Bphy_4047     TRUE 0.884 52.000 0.342 NA   NA
 7088982 7088983 Bphy_4047 Bphy_4048     FALSE 0.004 359.000 0.000 1.000 N NA
 7088983 7088984 Bphy_4048 Bphy_4049     TRUE 0.557 113.000 0.106 NA   NA
 7088984 7088985 Bphy_4049 Bphy_4050     TRUE 0.946 41.000 0.681 NA   NA
 7088985 7088986 Bphy_4050 Bphy_4051     TRUE 0.898 44.000 0.297 1.000   NA
 7088987 7088988 Bphy_4052 Bphy_4053     TRUE 0.999 -3.000 0.545 0.057 Y NA
 7088989 7088990 Bphy_4054 Bphy_4055     TRUE 0.885 58.000 0.429 1.000 N NA
 7088990 7088991 Bphy_4055 Bphy_4056     TRUE 0.580 50.000 0.018 1.000 N NA
 7088992 7088993 Bphy_4057 Bphy_4058     TRUE 0.789 173.000 0.320 0.067 Y NA
 7088993 7088994 Bphy_4058 Bphy_4059     TRUE 0.998 -3.000 0.429 0.067 Y NA
 7088994 7088995 Bphy_4059 Bphy_4060     FALSE 0.013 261.000 0.000 NA   NA
 7088995 7088996 Bphy_4060 Bphy_4061     FALSE 0.050 186.000 0.000 NA   NA
 7088997 7088998 Bphy_4062 Bphy_4063     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 7088998 7088999 Bphy_4063 Bphy_4064     FALSE 0.205 119.000 0.000 1.000   NA
 7088999 7089000 Bphy_4064 Bphy_4065     FALSE 0.012 260.000 0.000 1.000 N NA
 7089003 7089004 Bphy_4068 Bphy_4069     TRUE 0.970 0.000 0.087 1.000 N NA
 7089004 7089005 Bphy_4069 Bphy_4070     TRUE 0.989 -3.000 0.220 1.000 N NA
 7089005 7089006 Bphy_4070 Bphy_4071     TRUE 0.951 28.000 0.484 1.000 N NA
 7089006 7089007 Bphy_4071 Bphy_4072     TRUE 0.998 2.000 0.742 1.000 Y NA
 7089007 7089008 Bphy_4072 Bphy_4073     TRUE 0.974 -3.000 0.051 1.000   NA
 7089008 7089009 Bphy_4073 Bphy_4074     TRUE 0.976 -3.000 0.068 NA   NA
 7089009 7089010 Bphy_4074 Bphy_4075     TRUE 0.792 64.000 0.207 NA N NA
 7089010 7089011 Bphy_4075 Bphy_4076     FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
 7089011 7089012 Bphy_4076 Bphy_4077     FALSE 0.191 113.000 0.000 NA   NA
 7089013 7089014 Bphy_4078 Bphy_4079     FALSE 0.327 133.000 0.037 NA   NA
 7089014 7089015 Bphy_4079 Bphy_4080     FALSE 0.015 252.000 0.000 NA   NA
 7089017 7089018 Bphy_4082 Bphy_4083     FALSE 0.223 100.000 0.000 NA   NA
 7089018 7089019 Bphy_4083 Bphy_4084     FALSE 0.547 84.000 0.046 NA   NA
 7089019 7089020 Bphy_4084 Bphy_4085     FALSE 0.098 152.000 0.000 NA   NA
 7089020 7089021 Bphy_4085 Bphy_4086     FALSE 0.342 61.000 0.000 NA   NA
 7089021 7089022 Bphy_4086 Bphy_4087     TRUE 0.986 3.000 0.378 NA   NA
 7089022 7089023 Bphy_4087 Bphy_4088     TRUE 0.647 115.000 0.194 NA   NA
 7089023 7089024 Bphy_4088 Bphy_4089     TRUE 0.987 -3.000 0.174 NA   NA
 7089024 7089025 Bphy_4089 Bphy_4090     TRUE 0.978 -3.000 0.078 NA   NA
 7089026 7089027 Bphy_4091 Bphy_4092     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7089027 7089028 Bphy_4092 Bphy_4093     FALSE 0.151 129.000 0.000 NA   NA
 7089030 7089031 Bphy_4095 Bphy_4096     TRUE 0.817 32.000 0.067 NA   NA
 7089032 7089033 Bphy_4097 Bphy_4098     TRUE 0.977 0.000 0.123 NA   NA
 7089033 7089034 Bphy_4098 Bphy_4099     TRUE 0.778 50.000 0.111 NA   NA
 7089034 7089035 Bphy_4099 Bphy_4100     TRUE 0.824 117.000 0.680 NA   NA
 7089037 7089038 Bphy_4102 Bphy_4103     FALSE 0.057 180.000 0.000 NA   NA
 7089038 7089039 Bphy_4103 Bphy_4104     FALSE 0.045 270.000 0.080 NA N NA
 7089039 7089040 Bphy_4104 Bphy_4105     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7089041 7089042 Bphy_4106 Bphy_4107     FALSE 0.140 134.000 0.000 NA   NA
 7089042 7089043 Bphy_4107 Bphy_4108     FALSE 0.264 87.000 0.000 NA   NA
 7089044 7089045 Bphy_4109 Bphy_4110     FALSE 0.294 89.000 0.000 1.000   NA
 7089045 7089046 Bphy_4110 Bphy_4111     FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 7089046 7089047 Bphy_4111 Bphy_4112     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089049 7089050 Bphy_4114 Bphy_4115     TRUE 0.942 26.000 0.328 NA   NA
 7089050 7089051 Bphy_4115 Bphy_4116     TRUE 0.643 206.000 0.281 0.048 Y NA
 7089052 7089053 Bphy_4117 Bphy_4118     FALSE 0.019 240.000 0.000 NA   NA
 7089053 7089054 Bphy_4118 Bphy_4119     TRUE 0.986 -7.000 0.211 NA   NA
 7089057 7089058 Bphy_4122 Bphy_4123     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089061 7089062 Bphy_4126 Bphy_4127     FALSE 0.353 118.000 0.023 NA   NA
 7089063 7089064 Bphy_4128 Bphy_4129     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089065 7089066 Bphy_4130 Bphy_4131 ispH   TRUE 0.947 23.000 0.293 1.000   NA
 7089068 7089069 Bphy_4133 Bphy_4134     TRUE 0.945 11.000 0.133 1.000 N NA
 7089070 7089071 Bphy_4135 Bphy_4136     FALSE 0.269 138.000 0.022 NA   NA
 7089071 7089072 Bphy_4136 Bphy_4137     TRUE 0.993 0.000 0.633 1.000   NA
 7089072 7089073 Bphy_4137 Bphy_4138     TRUE 0.991 -3.000 0.269 1.000   NA
 7089073 7089074 Bphy_4138 Bphy_4139     TRUE 0.989 0.000 0.315 1.000   NA
 7089076 7089077 Bphy_4141 Bphy_4142     TRUE 0.998 -3.000 0.636 NA Y NA
 7089077 7089078 Bphy_4142 Bphy_4143     TRUE 0.999 -7.000 0.875 NA Y NA
 7089079 7089080 Bphy_4144 Bphy_4145     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 7089086 7089087 Bphy_4151 Bphy_4152     TRUE 0.973 25.000 0.882 1.000 N NA
 7089089 7089090 Bphy_4154 Bphy_4155     FALSE 0.001 1267.000 0.000 NA   NA
 7089091 7089092 Bphy_4156 Bphy_4157     TRUE 0.751 125.000 0.483 NA   NA
 7089092 7089093 Bphy_4157 Bphy_4158     TRUE 0.794 83.000 0.254 NA   NA
 7089094 7089095 Bphy_4159 Bphy_4160   tdh TRUE 0.968 19.000 0.547 1.000 N NA
 7089097 7089098 Bphy_4162 Bphy_4163     TRUE 0.927 23.000 0.200 NA   NA
 7089098 7089099 Bphy_4163 Bphy_4164     FALSE 0.029 214.000 0.000 NA   NA
 7089099 7089100 Bphy_4164 Bphy_4165     FALSE 0.005 356.000 0.000 NA   NA
 7089101 7089102 Bphy_4166 Bphy_4167     FALSE 0.003 393.000 0.000 1.000 N NA
 7089105 7089106 Bphy_4170 Bphy_4171     FALSE 0.191 113.000 0.000 NA   NA
 7089106 7089107 Bphy_4171 Bphy_4172     FALSE 0.102 150.000 0.000 NA   NA
 7089108 7089109 Bphy_4173 Bphy_4174     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 7089111 7089112 Bphy_4176 Bphy_4177     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089112 7089113 Bphy_4177 Bphy_4178     FALSE 0.031 209.000 0.000 NA   NA
 7089113 7089114 Bphy_4178 Bphy_4179     FALSE 0.130 138.000 0.000 NA   NA
 7089114 7089115 Bphy_4179 Bphy_4180     TRUE 0.989 -3.000 0.205 1.000   NA
 7089116 7089117 Bphy_4181 Bphy_4182     FALSE 0.524 33.000 0.000 NA   NA
 7089118 7089119 Bphy_4183 Bphy_4184     TRUE 0.887 37.000 0.200 NA   NA
 7089119 7089120 Bphy_4184 Bphy_4185     TRUE 0.734 38.000 0.040 NA   NA
 7089120 7089121 Bphy_4185 Bphy_4186     FALSE 0.060 171.000 0.000 1.000 N NA
 7089121 7089122 Bphy_4186 Bphy_4187     TRUE 0.766 39.000 0.050 1.000   NA
 7089122 7089123 Bphy_4187 Bphy_4188     FALSE 0.006 328.000 0.000 NA   NA
 7089123 7089124 Bphy_4188 Bphy_4189     TRUE 0.980 8.000 0.386 NA   NA
 7089125 7089126 Bphy_4190 Bphy_4191     FALSE 0.018 219.000 0.000 NA N NA
 7089126 7089127 Bphy_4191 Bphy_4192     FALSE 0.506 24.000 0.000 NA N NA
 7089127 7089128 Bphy_4192 Bphy_4193     TRUE 0.954 29.000 0.500 NA   NA
 7089131 7089132 Bphy_4196 Bphy_4197     FALSE 0.031 219.000 0.000 1.000   NA
 7089133 7089134 Bphy_4198 Bphy_4199     TRUE 0.946 38.000 0.571 1.000   NA
 7089136 7089137 Bphy_4201 Bphy_4202     FALSE 0.073 168.000 0.000 NA   NA
 7089138 7089139 Bphy_4203 Bphy_4204     FALSE 0.008 307.000 0.000 NA   NA
 7089139 7089140 Bphy_4204 Bphy_4205     TRUE 0.973 24.000 0.129 1.000 Y NA
 7089140 7089141 Bphy_4205 Bphy_4206     FALSE 0.005 351.000 0.000 NA   NA
 7089141 7089142 Bphy_4206 Bphy_4207     FALSE 0.043 192.000 0.000 NA   NA
 7089142 7089143 Bphy_4207 Bphy_4208     TRUE 0.988 -3.000 0.176 1.000   NA
 7089143 7089144 Bphy_4208 Bphy_4209     TRUE 0.849 85.000 0.416 1.000   NA
 7089144 7089145 Bphy_4209 Bphy_4210     TRUE 0.979 20.000 0.156 1.000 Y NA
 7089145 7089146 Bphy_4210 Bphy_4211     FALSE 0.006 337.000 0.000 NA   NA
 7089151 7089152 Bphy_4216 Bphy_4217     TRUE 0.664 94.000 0.119 1.000   NA
 7089152 7089153 Bphy_4217 Bphy_4218   araG TRUE 0.993 14.000 0.333 0.005 Y NA
 7089153 7089154 Bphy_4218 Bphy_4219 araG araH TRUE 0.562 78.000 0.000 0.005   NA
 7089154 7089155 Bphy_4219 Bphy_4220 araH   FALSE 0.279 83.000 0.000 NA   NA
 7089156 7089157 Bphy_4221 Bphy_4222     TRUE 0.993 -3.000 0.038 NA Y NA
 7089157 7089158 Bphy_4222 Bphy_4223     TRUE 0.998 -3.000 0.354 NA Y NA
 7089158 7089159 Bphy_4223 Bphy_4224     TRUE 0.997 8.000 0.689 0.066 Y NA
 7089159 7089160 Bphy_4224 Bphy_4225     TRUE 0.972 92.000 0.803 0.066 Y NA
 7089160 7089161 Bphy_4225 Bphy_4226     FALSE 0.499 104.000 0.050 1.000   NA
 7089161 7089162 Bphy_4226 Bphy_4227     TRUE 0.719 52.000 0.062 1.000   NA
 7089162 7089163 Bphy_4227 Bphy_4228     TRUE 0.973 -3.000 0.062 1.000 N NA
 7089166 7089167 Bphy_4231 Bphy_4232     TRUE 0.992 2.000 0.645 NA   NA
 7089167 7089168 Bphy_4232 Bphy_4233     TRUE 0.932 44.000 0.588 NA   NA
 7089168 7089169 Bphy_4233 Bphy_4234     TRUE 0.989 -7.000 0.351 NA N NA
 7089169 7089170 Bphy_4234 Bphy_4235     TRUE 0.928 35.000 0.328 1.000   NA
 7089170 7089171 Bphy_4235 Bphy_4236     TRUE 0.652 47.000 0.031 NA   NA
 7089171 7089172 Bphy_4236 Bphy_4237     TRUE 0.986 -3.000 0.154 NA   NA
 7089172 7089173 Bphy_4237 Bphy_4238     TRUE 0.987 0.000 0.295 1.000 N NA
 7089173 7089174 Bphy_4238 Bphy_4239     TRUE 0.961 -7.000 0.045 1.000 N NA
 7089174 7089175 Bphy_4239 Bphy_4240     TRUE 0.761 29.000 0.017 1.000   NA
 7089175 7089176 Bphy_4240 Bphy_4241     TRUE 0.964 12.000 0.235 1.000   NA
 7089176 7089177 Bphy_4241 Bphy_4242     TRUE 0.963 14.000 0.308 NA   NA
 7089177 7089178 Bphy_4242 Bphy_4243     TRUE 0.994 -7.000 0.700 NA   NA
 7089178 7089179 Bphy_4243 Bphy_4244     TRUE 0.964 24.000 0.520 1.000   NA
 7089180 7089181 Bphy_4245 Bphy_4246     FALSE 0.504 73.000 0.023 1.000 N NA
 7089182 7089183 Bphy_4247 Bphy_4248     TRUE 0.887 -9.000 0.000 NA   NA
 7089183 7089184 Bphy_4248 Bphy_4249     TRUE 0.820 111.000 0.625 1.000 N NA
 7089184 7089185 Bphy_4249 Bphy_4250     TRUE 0.996 -3.000 0.688 0.072 N NA
 7089185 7089186 Bphy_4250 Bphy_4251     TRUE 0.906 68.000 0.750 NA N NA
 7089188 7089189 Bphy_4253 Bphy_4254     FALSE 0.204 253.000 0.600 NA N NA
 7089189 7089190 Bphy_4254 Bphy_4255     TRUE 0.995 -7.000 0.800 NA N NA
 7089190 7089191 Bphy_4255 Bphy_4256     TRUE 0.812 36.000 0.085 1.000 N NA
 7089192 7089193 Bphy_4257 Bphy_4258     FALSE 0.025 215.000 0.000 1.000 N NA
 7089194 7089195 Bphy_4259 Bphy_4260     FALSE 0.021 232.000 0.000 NA   NA
 7089195 7089196 Bphy_4260 Bphy_4261     FALSE 0.357 152.000 0.100 NA   NA
 7089196 7089197 Bphy_4261 Bphy_4262     TRUE 0.652 103.000 0.150 NA   NA
 7089198 7089199 Bphy_4263 Bphy_4264     FALSE 0.071 169.000 0.000 NA   NA
 7089199 7089200 Bphy_4264 Bphy_4265     FALSE 0.022 230.000 0.000 NA   NA
 7089200 7089201 Bphy_4265 Bphy_4266     TRUE 0.810 62.000 0.200 NA   NA
 7089201 7089202 Bphy_4266 Bphy_4267     FALSE 0.119 297.000 0.467 NA   NA
 7089205 7089206 Bphy_4270 Bphy_4271     FALSE 0.017 293.000 0.000 0.095 N NA
 7089208 7089209 Bphy_4273 Bphy_4274     TRUE 0.631 20.000 0.000 NA   NA
 7089209 7089210 Bphy_4274 Bphy_4275     FALSE 0.249 92.000 0.000 NA   NA
 7089210 7089211 Bphy_4275 Bphy_4276     FALSE 0.002 699.000 0.000 NA   NA
 7089211 7089212 Bphy_4276 Bphy_4277     TRUE 0.983 17.000 1.000 NA   NA
 7089214 7089215 Bphy_4279 Bphy_4280     FALSE 0.246 93.000 0.000 NA   NA
 7089215 7089216 Bphy_4280 Bphy_4281     TRUE 0.806 74.000 0.250 NA   NA
 7089216 7089217 Bphy_4281 Bphy_4282     TRUE 0.875 -15.000 0.000 NA   NA
 7089217 7089218 Bphy_4282 Bphy_4283     FALSE 0.497 36.000 0.000 NA   NA
 7089218 7089219 Bphy_4283 Bphy_4284     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 7089219 7089220 Bphy_4284 Bphy_4285     FALSE 0.165 124.000 0.000 NA   NA
 7089220 7089221 Bphy_4285 Bphy_4286     FALSE 0.002 548.000 0.000 NA   NA
 7089221 7089222 Bphy_4286 Bphy_4287   prfC FALSE 0.057 179.000 0.000 NA   NA
 7089226 7089227 Bphy_4291 Bphy_4292     FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 7089227 7089228 Bphy_4292 Bphy_4293     TRUE 0.796 7.000 0.000 NA   NA
 7089229 7089230 Bphy_4294 Bphy_4295     TRUE 0.946 57.000 0.121 0.072 Y NA
 7089230 7089231 Bphy_4295 Bphy_4296     TRUE 0.732 87.000 0.091 0.072   NA
 7089231 7089232 Bphy_4296 Bphy_4297     TRUE 0.973 16.000 0.500 1.000   NA
 7089232 7089233 Bphy_4297 Bphy_4298     TRUE 0.941 42.000 0.667 1.000 N NA
 7089233 7089234 Bphy_4298 Bphy_4299     TRUE 0.964 16.000 0.143 0.000   NA
 7089234 7089235 Bphy_4299 Bphy_4300     TRUE 0.991 2.000 0.571 1.000   NA
 7089235 7089236 Bphy_4300 Bphy_4301     TRUE 0.997 -10.000 0.364 1.000 Y NA
 7089236 7089237 Bphy_4301 Bphy_4302     TRUE 0.997 -3.000 0.250 NA Y NA
 7089242 7089243 Bphy_4307 Bphy_4308     TRUE 0.560 127.000 0.154 NA   NA
 7089243 7089244 Bphy_4308 Bphy_4309     FALSE 0.006 334.000 0.000 NA   NA
 7089244 7089245 Bphy_4309 Bphy_4310     FALSE 0.003 437.000 0.000 NA   NA
 7089245 7089246 Bphy_4310 Bphy_4311     FALSE 0.056 181.000 0.000 NA   NA
 7089246 7089247 Bphy_4311 Bphy_4312     FALSE 0.437 43.000 0.000 NA   NA
 7089250 7089251 Bphy_4315 Bphy_4316     FALSE 0.130 132.000 0.000 1.000 N NA
 7089252 7089253 Bphy_4317 Bphy_4318     FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 7089253 7089254 Bphy_4318 Bphy_4319     FALSE 0.010 288.000 0.000 NA   NA
 7089256 7089257 Bphy_4321 Bphy_4322     TRUE 0.978 59.000 0.833 1.000 Y NA
 7089257 7089258 Bphy_4322 Bphy_4323     TRUE 0.859 106.000 0.060 0.065 Y NA
 7089258 7089259 Bphy_4323 Bphy_4324     TRUE 0.982 11.000 0.024 0.065 Y NA
 7089259 7089260 Bphy_4324 Bphy_4325     FALSE 0.105 157.000 0.000 1.000   NA
 7089261 7089262 Bphy_4326 Bphy_4327     TRUE 0.946 12.000 0.085 0.074 N NA
 7089262 7089263 Bphy_4327 Bphy_4328     TRUE 0.996 -3.000 0.671 0.078 N NA
 7089263 7089264 Bphy_4328 Bphy_4329     TRUE 0.999 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 7089264 7089265 Bphy_4329 Bphy_4330     TRUE 0.985 -3.000 0.149 1.000 N NA
 7089266 7089267 Bphy_4331 Bphy_4332     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089268 7089269 Bphy_4333 Bphy_4334     TRUE 0.971 13.000 0.000 0.020 Y NA
 7089270 7089271 Bphy_4335 Bphy_4336     TRUE 0.614 22.000 0.000 NA   NA
 7089272 7089273 Bphy_4337 Bphy_4338     FALSE 0.372 54.000 0.000 NA   NA
 7089274 7089275 Bphy_4339 Bphy_4340     TRUE 0.966 24.000 0.615 NA   NA
 7089275 7089276 Bphy_4340 Bphy_4341     TRUE 0.994 -3.000 0.455 NA   NA
 7089276 7089277 Bphy_4341 Bphy_4342     TRUE 0.991 -3.000 0.273 NA   NA
 7089277 7089278 Bphy_4342 Bphy_4343     TRUE 0.993 -19.000 0.667 NA   NA
 7089278 7089279 Bphy_4343 Bphy_4344     TRUE 0.867 20.000 0.062 NA   NA
 7089279 7089280 Bphy_4344 Bphy_4345     TRUE 0.983 32.000 0.469 NA Y NA
 7089280 7089281 Bphy_4345 Bphy_4346     TRUE 0.997 6.000 0.692 1.000 Y NA
 7089281 7089282 Bphy_4346 Bphy_4347     TRUE 0.985 26.000 0.452 NA Y NA
 7089282 7089283 Bphy_4347 Bphy_4348     TRUE 0.982 6.000 0.381 NA   NA
 7089283 7089284 Bphy_4348 Bphy_4349     TRUE 0.982 -3.000 0.111 NA   NA
 7089284 7089285 Bphy_4349 Bphy_4350     TRUE 0.970 -3.000 0.046 NA   NA
 7089285 7089286 Bphy_4350 Bphy_4351     TRUE 0.975 0.000 0.111 NA   NA
 7089287 7089288 Bphy_4352 Bphy_4353 acnA prpD TRUE 0.666 51.000 0.035 1.000   NA
 7089288 7089289 Bphy_4353 Bphy_4354 prpD   TRUE 0.866 25.000 0.082 NA   NA
 7089289 7089290 Bphy_4354 Bphy_4355     FALSE 0.384 100.000 0.013 NA   NA
 7089290 7089291 Bphy_4355 Bphy_4356   prpB TRUE 0.957 26.000 0.502 1.000 N NA
 7089291 7089292 Bphy_4356 Bphy_4357 prpB   TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7089292 7089293 Bphy_4357 Bphy_4358     FALSE 0.070 222.000 0.045 1.000 N NA
 7089293 7089294 Bphy_4358 Bphy_4359     TRUE 0.705 31.000 0.009 NA   NA
 7089295 7089296 Bphy_4360 Bphy_4361     FALSE 0.444 153.000 0.185 1.000 N NA
 7089296 7089297 Bphy_4361 Bphy_4362     TRUE 0.997 4.000 0.453 0.001 Y NA
 7089297 7089298 Bphy_4362 Bphy_4363   sdhA TRUE 0.998 5.000 0.705 0.001 Y NA
 7089298 7089299 Bphy_4363 Bphy_4364 sdhA sdhB TRUE 0.991 32.000 0.604 0.001 Y NA
 7089299 7089300 Bphy_4364 Bphy_4365 sdhB   TRUE 0.980 0.000 0.151 NA   NA
 7089300 7089301 Bphy_4365 Bphy_4366   gltA TRUE 0.679 91.000 0.136 NA   NA
 7089301 7089302 Bphy_4366 Bphy_4367 gltA   FALSE 0.017 296.000 0.011 1.000 N NA
 7089302 7089303 Bphy_4367 Bphy_4368   leuD FALSE 0.402 249.000 0.141 0.000 Y NA
 7089303 7089304 Bphy_4368 Bphy_4369 leuD   TRUE 0.951 66.000 0.141 0.001 Y NA
 7089304 7089305 Bphy_4369 Bphy_4370     FALSE 0.254 309.000 0.196 0.024 Y NA
 7089305 7089306 Bphy_4370 Bphy_4371     FALSE 0.207 145.000 0.010 NA   NA
 7089306 7089307 Bphy_4371 Bphy_4372   truA TRUE 0.932 0.000 0.003 NA   NA
 7089307 7089308 Bphy_4372 Bphy_4373 truA   TRUE 0.984 -3.000 0.139 1.000 N NA
 7089308 7089309 Bphy_4373 Bphy_4374     TRUE 0.975 59.000 0.375 0.001 Y NA
 7089309 7089310 Bphy_4374 Bphy_4375     TRUE 0.892 12.000 0.048 1.000 N NA
 7089310 7089311 Bphy_4375 Bphy_4376   trpA TRUE 0.812 33.000 0.071 1.000 N NA
 7089311 7089312 Bphy_4376 Bphy_4377 trpA   TRUE 0.780 81.000 0.232 1.000 N NA
 7089312 7089313 Bphy_4377 Bphy_4378     TRUE 0.701 128.000 0.383 1.000 N NA
 7089313 7089314 Bphy_4378 Bphy_4379     TRUE 0.869 28.000 0.100 NA   NA
 7089314 7089315 Bphy_4379 Bphy_4380     TRUE 0.935 8.000 0.066 NA   NA
 7089315 7089316 Bphy_4380 Bphy_4381     TRUE 0.630 136.000 0.262 1.000   NA
 7089316 7089317 Bphy_4381 Bphy_4382     FALSE 0.547 127.000 0.153 1.000 N NA
 7089318 7089319 Bphy_4383 Bphy_4384     TRUE 0.865 32.000 0.104 1.000   NA
 7089320 7089321 Bphy_4385 Bphy_4386     TRUE 0.599 116.000 0.148 NA   NA
 7089322 7089323 Bphy_4387 Bphy_4388     TRUE 0.997 -3.000 0.141 0.004 Y NA
 7089323 7089324 Bphy_4388 Bphy_4389     TRUE 0.994 6.000 0.167 0.004 Y NA
 7089324 7089325 Bphy_4389 Bphy_4390     TRUE 0.926 87.000 0.107 0.002 Y NA
 7089325 7089326 Bphy_4390 Bphy_4391     FALSE 0.294 264.000 0.091 0.002 Y NA
 7089326 7089327 Bphy_4391 Bphy_4392     TRUE 0.994 -7.000 0.013 0.004 Y NA
 7089327 7089328 Bphy_4392 Bphy_4393     TRUE 0.989 10.000 0.544 0.004   NA
 7089328 7089329 Bphy_4393 Bphy_4394     FALSE 0.002 541.000 0.000 NA   NA
 7089329 7089330 Bphy_4394 Bphy_4395     FALSE 0.017 246.000 0.000 NA   NA
 7089332 7089333 Bphy_4397 Bphy_4398     TRUE 0.994 -3.000 0.562 NA   NA
 7089336 7089337 Bphy_4401 Bphy_4402     TRUE 0.566 93.000 0.059 1.000   NA
 7089338 7089339 Bphy_4403 Bphy_4404     TRUE 0.997 2.000 0.500 1.000 Y NA
 7089339 7089340 Bphy_4404 Bphy_4405     TRUE 0.996 14.000 0.583 0.000 Y NA
 7089340 7089341 Bphy_4405 Bphy_4406     TRUE 0.696 117.000 0.250 1.000   NA
 7089342 7089343 Bphy_4407 Bphy_4408     TRUE 0.846 107.000 0.682 NA   NA
 7089344 7089345 Bphy_4409 Bphy_4410     FALSE 0.004 355.000 0.000 1.000 N NA
 7089345 7089346 Bphy_4410 Bphy_4411     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7089346 7089347 Bphy_4411 Bphy_4412     TRUE 0.698 14.000 0.000 NA   NA
 7089347 7089348 Bphy_4412 Bphy_4413     FALSE 0.413 143.000 0.104 NA   NA
 7089350 7089351 Bphy_4415 Bphy_4416     TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.001 Y NA
 7089354 7089355 Bphy_4419 Bphy_4420     FALSE 0.033 238.000 0.005 1.000 N NA
 7089355 7089356 Bphy_4420 Bphy_4421     TRUE 0.588 94.000 0.087 1.000 N NA
 7089356 7089357 Bphy_4421 Bphy_4422     FALSE 0.004 363.000 0.000 1.000 N NA
 7089357 7089358 Bphy_4422 Bphy_4423     FALSE 0.361 50.000 0.000 1.000 N NA
 7089358 7089359 Bphy_4423 Bphy_4424     TRUE 0.631 20.000 0.000 NA   NA
 7089359 7089360 Bphy_4424 Bphy_4425     TRUE 0.961 -3.000 0.022 NA   NA
 7089360 7089361 Bphy_4425 Bphy_4426     TRUE 0.872 100.000 0.140 NA Y NA
 7089361 7089362 Bphy_4426 Bphy_4427     TRUE 0.975 25.000 0.184 NA Y NA
 7089362 7089363 Bphy_4427 Bphy_4428     TRUE 0.955 45.000 0.184 1.000 Y NA
 7089364 7089365 Bphy_4429 Bphy_4430     TRUE 0.805 37.000 0.077 NA   NA
 7089365 7089366 Bphy_4430 Bphy_4431     FALSE 0.519 129.000 0.115 1.000   NA
 7089366 7089367 Bphy_4431 Bphy_4432     FALSE 0.179 118.000 0.000 NA   NA
 7089367 7089368 Bphy_4432 Bphy_4433     TRUE 0.717 151.000 0.750 NA   NA
 7089368 7089369 Bphy_4433 Bphy_4434     FALSE 0.135 244.000 0.000 1.000 Y NA
 7089370 7089371 Bphy_4435 Bphy_4436     FALSE 0.111 146.000 0.000 NA   NA
 7089375 7089376 Bphy_4440 Bphy_4441     FALSE 0.286 81.000 0.000 NA   NA
 7089376 7089377 Bphy_4441 Bphy_4442     TRUE 0.763 122.000 0.500 1.000 N NA
 7089377 7089378 Bphy_4442 Bphy_4443     FALSE 0.015 264.000 0.000 1.000   NA
 7089378 7089379 Bphy_4443 Bphy_4444     TRUE 0.746 150.000 0.562 0.065   NA
 7089379 7089380 Bphy_4444 Bphy_4445     TRUE 0.996 -3.000 0.594 0.065 N NA
 7089380 7089381 Bphy_4445 Bphy_4446     TRUE 0.996 0.000 0.864 0.065 N NA
 7089381 7089382 Bphy_4446 Bphy_4447     TRUE 0.988 10.000 0.150 1.000 Y NA
 7089383 7089384 Bphy_4448 Bphy_4449     FALSE 0.232 170.000 0.069 NA   NA
 7089385 7089386 Bphy_4450 Bphy_4451     TRUE 0.585 160.000 0.467 NA   NA
 7089386 7089387 Bphy_4451 Bphy_4452     TRUE 0.767 38.000 0.062 1.000 N NA
 7089387 7089388 Bphy_4452 Bphy_4453     TRUE 0.762 101.000 0.281 1.000   NA
 7089389 7089390 Bphy_4454 Bphy_4455     TRUE 0.736 106.000 0.295 1.000 N NA
 7089391 7089392 Bphy_4456 Bphy_4457     FALSE 0.053 312.000 0.179 1.000 N NA
 7089392 7089393 Bphy_4457 Bphy_4458     TRUE 0.996 12.000 0.487 0.001 Y NA
 7089393 7089394 Bphy_4458 Bphy_4459     TRUE 0.736 55.000 0.099 1.000 N NA
 7089394 7089395 Bphy_4459 Bphy_4460     TRUE 0.902 22.000 0.106 1.000   NA
 7089395 7089396 Bphy_4460 Bphy_4461     TRUE 0.992 -3.000 0.326 1.000   NA
 7089396 7089397 Bphy_4461 Bphy_4462     FALSE 0.017 254.000 0.000 1.000   NA
 7089397 7089398 Bphy_4462 Bphy_4463     TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 7089398 7089399 Bphy_4463 Bphy_4464     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.019 Y NA
 7089399 7089400 Bphy_4464 Bphy_4465     TRUE 0.619 124.000 0.000 NA Y NA
 7089405 7089406 Bphy_4470 Bphy_4471     FALSE 0.158 126.000 0.000 NA   NA
 7089406 7089407 Bphy_4471 Bphy_4472     FALSE 0.281 217.000 0.000 0.006 Y NA
 7089407 7089408 Bphy_4472 Bphy_4473     TRUE 0.985 11.000 0.750 NA   NA
 7089408 7089409 Bphy_4473 Bphy_4474     FALSE 0.007 313.000 0.000 NA   NA
 7089409 7089410 Bphy_4474 Bphy_4475     FALSE 0.155 127.000 0.000 NA   NA
 7089410 7089411 Bphy_4475 Bphy_4476     FALSE 0.302 73.000 0.000 NA   NA
 7089412 7089413 Bphy_4477 Bphy_4478     FALSE 0.016 242.000 0.000 1.000 N NA
 7089413 7089414 Bphy_4478 Bphy_4479     TRUE 0.786 55.000 0.137 NA   NA
 7089414 7089415 Bphy_4479 Bphy_4480     TRUE 0.982 17.000 0.972 NA   NA
 7089415 7089416 Bphy_4480 Bphy_4481     TRUE 0.676 72.000 0.089 NA   NA
 7089417 7089418 Bphy_4482 Bphy_4483     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 7089418 7089419 Bphy_4483 Bphy_4484     FALSE 0.136 136.000 0.000 NA   NA
 7089419 7089420 Bphy_4484 Bphy_4485     TRUE 0.897 39.000 0.264 1.000 N NA
 7089420 7089421 Bphy_4485 Bphy_4486     TRUE 0.791 60.000 0.174 1.000 N NA
 7089424 7089425 Bphy_4489 Bphy_4490     TRUE 0.930 50.000 0.667 NA   NA
 7089425 7089426 Bphy_4490 Bphy_4491     TRUE 0.996 -3.000 0.734 NA   NA
 7089426 7089427 Bphy_4491 Bphy_4492     FALSE 0.227 75.000 0.000 NA N NA
 7089427 7089428 Bphy_4492 Bphy_4493     TRUE 0.967 64.000 0.333 0.053 Y NA
 7089428 7089429 Bphy_4493 Bphy_4494     TRUE 0.668 86.000 0.121 1.000 N NA
 7089429 7089430 Bphy_4494 Bphy_4495     TRUE 0.949 22.000 0.293 1.000   NA
 7089430 7089431 Bphy_4495 Bphy_4496     TRUE 0.844 47.000 0.171 1.000   NA
 7089431 7089432 Bphy_4496 Bphy_4497     TRUE 0.641 84.000 0.095 1.000 N NA
 7089432 7089433 Bphy_4497 Bphy_4498     FALSE 0.327 109.000 0.011 1.000 N NA
 7089433 7089434 Bphy_4498 Bphy_4499     FALSE 0.294 77.000 0.000 NA   NA
 7089435 7089436 Bphy_4500 Bphy_4501     TRUE 0.667 155.000 0.588 1.000   NA
 7089436 7089437 Bphy_4501 Bphy_4502     TRUE 0.998 -3.000 0.198 0.002 Y NA
 7089437 7089438 Bphy_4502 Bphy_4503     TRUE 0.997 2.000 0.554 1.000 Y NA
 7089438 7089439 Bphy_4503 Bphy_4504     TRUE 0.998 6.000 0.870 0.065 Y NA
 7089439 7089440 Bphy_4504 Bphy_4505     TRUE 0.983 19.000 0.123 0.065 Y NA
 7089440 7089441 Bphy_4505 Bphy_4506     FALSE 0.416 209.000 0.667 1.000   NA
 7089442 7089443 Bphy_4507 Bphy_4508     FALSE 0.040 195.000 0.000 NA   NA
 7089444 7089445 Bphy_4509 Bphy_4510     FALSE 0.007 329.000 0.000 1.000   NA
 7089446 7089447 Bphy_4511 Bphy_4512     TRUE 0.839 119.000 0.805 NA   NA
 7089447 7089448 Bphy_4512 Bphy_4513     TRUE 0.968 14.000 0.365 NA   NA
 7089448 7089449 Bphy_4513 Bphy_4514     TRUE 0.663 134.000 0.383 NA N NA
 7089450 7089451 Bphy_4515 Bphy_4516     FALSE 0.004 395.000 0.000 1.000   NA
 7089452 7089453 Bphy_4517 Bphy_4518     TRUE 0.682 49.000 0.000 0.002   NA
 7089453 7089454 Bphy_4518 Bphy_4519     TRUE 0.988 10.000 0.410 0.000   NA
 7089454 7089455 Bphy_4519 Bphy_4520     TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.000 Y NA
 7089455 7089456 Bphy_4520 Bphy_4521     TRUE 0.570 95.000 0.091 NA N NA
 7089456 7089457 Bphy_4521 Bphy_4522     TRUE 0.741 45.000 0.083 NA N NA
 7089457 7089458 Bphy_4522 Bphy_4523     TRUE 0.997 -3.000 0.569 0.000 N NA
 7089458 7089459 Bphy_4523 Bphy_4524     FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 7089459 7089460 Bphy_4524 Bphy_4525     FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 7089462 7089463 Bphy_4527 Bphy_4528     TRUE 0.785 28.000 0.025 1.000   NA
 7089463 7089464 Bphy_4528 Bphy_4529     TRUE 0.980 13.000 0.400 0.077   NA
 7089464 7089465 Bphy_4529 Bphy_4530     TRUE 0.998 3.000 0.667 0.013 Y NA
 7089465 7089466 Bphy_4530 Bphy_4531     FALSE 0.001 861.000 0.000 NA   NA
 7089466 7089467 Bphy_4531 Bphy_4532     TRUE 0.853 48.000 0.214 NA   NA
 7089467 7089468 Bphy_4532 Bphy_4533     TRUE 0.959 12.000 0.214 NA   NA
 7089470 7089471 Bphy_4535 Bphy_4536 mhpA mhpB TRUE 0.993 2.000 0.444 0.007   NA
 7089471 7089472 Bphy_4536 Bphy_4537 mhpB   TRUE 0.993 4.000 1.000 1.000   NA
 7089472 7089473 Bphy_4537 Bphy_4538     TRUE 0.991 18.000 0.500 1.000 Y NA
 7089473 7089474 Bphy_4538 Bphy_4539     TRUE 0.960 19.000 0.400 1.000 N NA
 7089474 7089475 Bphy_4539 Bphy_4540     TRUE 0.908 59.000 0.600 1.000 N NA
 7089475 7089476 Bphy_4540 Bphy_4541     TRUE 0.974 15.000 0.500 1.000   NA
 7089477 7089478 Bphy_4542 Bphy_4543     FALSE 0.426 134.000 0.103 NA N NA
 7089478 7089479 Bphy_4543 Bphy_4544     FALSE 0.295 136.000 0.034 1.000 N NA
 7089479 7089480 Bphy_4544 Bphy_4545     TRUE 0.837 82.000 0.000 0.053 Y NA
 7089481 7089482 Bphy_4546 Bphy_4547     TRUE 0.939 21.000 0.211 1.000   NA
 7089482 7089483 Bphy_4547 Bphy_4548     TRUE 0.999 -3.000 0.632 0.001 Y NA
 7089483 7089484 Bphy_4548 Bphy_4549     TRUE 0.999 -3.000 0.429 0.001 Y NA
 7089484 7089485 Bphy_4549 Bphy_4550     TRUE 0.948 26.000 0.375 NA   NA
 7089485 7089486 Bphy_4550 Bphy_4551     TRUE 0.985 3.000 0.333 NA   NA
 7089486 7089487 Bphy_4551 Bphy_4552     TRUE 0.974 -3.000 0.061 NA   NA
 7089487 7089488 Bphy_4552 Bphy_4553     TRUE 0.970 0.000 0.081 NA   NA
 7089488 7089489 Bphy_4553 Bphy_4554     TRUE 0.596 75.000 0.054 NA   NA
 7089490 7089491 Bphy_4555 Bphy_4556     TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 7089491 7089492 Bphy_4556 Bphy_4557     TRUE 0.998 -3.000 0.300 0.008 Y NA
 7089492 7089493 Bphy_4557 Bphy_4558     TRUE 0.984 22.000 0.182 0.065 Y NA
 7089493 7089494 Bphy_4558 Bphy_4559     FALSE 0.077 291.000 0.000 1.000 Y NA
 7089495 7089496 Bphy_4560 Bphy_4561     TRUE 0.978 18.000 0.791 NA   NA
 7089496 7089497 Bphy_4561 Bphy_4562     TRUE 0.973 20.000 0.660 1.000   NA
 7089497 7089498 Bphy_4562 Bphy_4563     TRUE 0.993 3.000 0.623 0.071   NA
 7089498 7089499 Bphy_4563 Bphy_4564     TRUE 0.997 -3.000 0.944 1.000   NA
 7089499 7089500 Bphy_4564 Bphy_4565     TRUE 0.989 -3.000 0.194 1.000   NA
 7089500 7089501 Bphy_4565 Bphy_4566     TRUE 0.919 24.000 0.179 NA   NA
 7089501 7089502 Bphy_4566 Bphy_4567     TRUE 0.889 67.000 0.520 NA   NA
 7089502 7089503 Bphy_4567 Bphy_4568     TRUE 0.981 3.000 0.240 NA   NA
 7089503 7089504 Bphy_4568 Bphy_4569     TRUE 0.959 -3.000 0.017 NA   NA
 7089504 7089505 Bphy_4569 Bphy_4570     FALSE 0.133 137.000 0.000 NA   NA
 7089505 7089506 Bphy_4570 Bphy_4571     TRUE 0.980 3.000 0.221 NA   NA
 7089506 7089507 Bphy_4571 Bphy_4572     FALSE 0.033 386.000 0.000 1.000 Y NA
 7089507 7089508 Bphy_4572 Bphy_4573     TRUE 0.571 27.000 0.000 NA   NA
 7089508 7089509 Bphy_4573 Bphy_4574     FALSE 0.294 77.000 0.000 NA   NA
 7089509 7089510 Bphy_4574 Bphy_4575     FALSE 0.004 429.000 0.000 1.000   NA
 7089510 7089511 Bphy_4575 Bphy_4576     FALSE 0.076 159.000 0.000 1.000 N NA
 7089511 7089512 Bphy_4576 Bphy_4577     TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7089512 7089513 Bphy_4577 Bphy_4578     FALSE 0.083 283.000 0.000 1.000 Y NA
 7089514 7089515 Bphy_4579 Bphy_4580     FALSE 0.257 89.000 0.000 NA   NA
 7089516 7089517 Bphy_4581 Bphy_4582     FALSE 0.006 332.000 0.000 NA   NA
 7089517 7089518 Bphy_4582 Bphy_4583     TRUE 0.891 23.000 0.106 NA   NA
 7089521 7089522 Bphy_4586 Bphy_4587     FALSE 0.195 111.000 0.000 NA   NA
 7089522 7089523 Bphy_4587 Bphy_4588     FALSE 0.159 136.000 0.000 1.000   NA
 7089523 7089524 Bphy_4588 Bphy_4589     FALSE 0.210 117.000 0.000 1.000   NA
 7089524 7089525 Bphy_4589 Bphy_4590     FALSE 0.045 186.000 0.000 1.000 N NA
 7089526 7089527 Bphy_4591 Bphy_4592     TRUE 0.943 100.000 0.571 NA Y NA
 7089527 7089528 Bphy_4592 Bphy_4593     TRUE 0.871 58.000 0.389 NA N NA
 7089528 7089529 Bphy_4593 Bphy_4594     FALSE 0.062 313.000 0.000 1.000 Y NA
 7089535 7089536 Bphy_4600 Bphy_4601     FALSE 0.050 186.000 0.000 NA   NA
 7089536 7089537 Bphy_4601 Bphy_4602     FALSE 0.007 319.000 0.000 NA   NA
 7089537 7089538 Bphy_4602 Bphy_4603     FALSE 0.217 103.000 0.000 NA   NA
 7089538 7089539 Bphy_4603 Bphy_4604     FALSE 0.128 139.000 0.000 NA   NA
 7089539 7089540 Bphy_4604 Bphy_4605     FALSE 0.004 372.000 0.000 NA   NA
 7089541 7089542 Bphy_4606 Bphy_4607     TRUE 0.610 66.000 0.048 NA   NA
 7089543 7089544 Bphy_4608 Bphy_4609     FALSE 0.203 108.000 0.000 NA   NA
 7089544 7089545 Bphy_4609 Bphy_4610     FALSE 0.339 62.000 0.000 NA   NA
 7089547 7089548 Bphy_4612 Bphy_4613     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 7089548 7089549 Bphy_4613 Bphy_4614     FALSE 0.148 131.000 0.000 NA   NA
 7089549 7089550 Bphy_4614 Bphy_4615     FALSE 0.302 73.000 0.000 NA   NA
 7089550 7089551 Bphy_4615 Bphy_4616     FALSE 0.003 454.000 0.000 NA   NA
 7089552 7089553 Bphy_4617 Bphy_4618     TRUE 0.651 101.000 0.154 1.000 N NA
 7089555 7089556 Bphy_4620 Bphy_4621     FALSE 0.159 136.000 0.000 1.000   NA
 7089556 7089557 Bphy_4621 Bphy_4622     TRUE 0.999 -3.000 0.330 0.000 Y NA
 7089557 7089558 Bphy_4622 Bphy_4623     TRUE 0.955 95.000 0.337 0.001 Y NA
 7089559 7089560 Bphy_4624 Bphy_4625     TRUE 0.994 -3.000 0.538 NA   NA
 7089560 7089561 Bphy_4625 Bphy_4626     FALSE 0.011 277.000 0.000 NA   NA
 7089561 7089562 Bphy_4626 Bphy_4627     TRUE 0.581 136.000 0.000 1.000 Y NA
 7089562 7089563 Bphy_4627 Bphy_4628     FALSE 0.397 44.000 0.000 1.000 N NA
 7089563 7089564 Bphy_4628 Bphy_4629     FALSE 0.011 251.000 0.000 NA N NA
 7089565 7089566 Bphy_4630 Bphy_4631     FALSE 0.015 253.000 0.000 NA   NA
 7089566 7089567 Bphy_4631 Bphy_4632     FALSE 0.043 192.000 0.000 NA   NA
 7089568 7089569 Bphy_4633 Bphy_4634     TRUE 0.909 36.000 0.277 1.000 N NA
 7089569 7089570 Bphy_4634 Bphy_4635     TRUE 0.743 71.000 0.153 1.000 N NA
 7089570 7089571 Bphy_4635 Bphy_4636     TRUE 0.956 15.000 0.167 0.064 N NA
 7089571 7089572 Bphy_4636 Bphy_4637     FALSE 0.048 225.000 0.000 0.064 N NA
 7089573 7089574 Bphy_4638 Bphy_4639     TRUE 0.989 17.000 1.000 0.002   NA
 7089574 7089575 Bphy_4639 Bphy_4640     FALSE 0.002 548.000 0.000 NA   NA
 7089575 7089576 Bphy_4640 Bphy_4641     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7089576 7089577 Bphy_4641 Bphy_4642     FALSE 0.268 86.000 0.000 NA   NA
 7089577 7089578 Bphy_4642 Bphy_4643     TRUE 0.932 10.000 0.065 1.000   NA
 7089579 7089580 Bphy_4644 Bphy_4645     FALSE 0.038 198.000 0.000 NA   NA
 7089580 7089581 Bphy_4645 Bphy_4646     TRUE 0.812 39.000 0.091 NA   NA
 7089581 7089582 Bphy_4646 Bphy_4647     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7089582 7089583 Bphy_4647 Bphy_4648     FALSE 0.165 124.000 0.000 NA   NA
 7089584 7089585 Bphy_4649 Bphy_4650     TRUE 0.945 16.000 0.000 NA Y NA
 7089585 7089586 Bphy_4650 Bphy_4651     FALSE 0.015 253.000 0.000 NA   NA
 7089587 7089588 Bphy_4652 Bphy_4653     TRUE 0.959 14.000 0.277 1.000 N NA
 7089588 7089589 Bphy_4653 Bphy_4654     TRUE 0.585 81.000 0.061 1.000 N NA
 7089589 7089590 Bphy_4654 Bphy_4655     TRUE 0.990 6.000 0.134 1.000 Y NA
 7089590 7089591 Bphy_4655 Bphy_4656     TRUE 0.850 50.000 0.000 1.000 Y NA
 7089591 7089592 Bphy_4656 Bphy_4657     TRUE 0.949 100.000 0.667 NA Y NA
 7089592 7089593 Bphy_4657 Bphy_4658     TRUE 0.943 78.000 0.333 NA Y NA
 7089593 7089594 Bphy_4658 Bphy_4659     TRUE 0.998 2.000 0.429 0.005 Y NA
 7089596 7089597 Bphy_4661 Bphy_4662     TRUE 0.835 50.000 0.188 NA   NA
 7089598 7089599 Bphy_4663 Bphy_4664     TRUE 0.860 87.000 0.600 NA N NA
 7089602 7089603 Bphy_4667 Bphy_4668     TRUE 0.994 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 7089603 7089604 Bphy_4668 Bphy_4669     TRUE 0.974 -7.000 0.071 1.000   NA
 7089604 7089605 Bphy_4669 Bphy_4670     TRUE 0.996 -3.000 0.600 0.057   NA
 7089605 7089606 Bphy_4670 Bphy_4671     TRUE 0.824 80.000 0.289 1.000   NA
 7089606 7089607 Bphy_4671 Bphy_4672     TRUE 0.860 23.000 0.068 NA   NA
 7089608 7089609 Bphy_4673 Bphy_4674     FALSE 0.058 178.000 0.000 NA   NA
 7089609 7089610 Bphy_4674 Bphy_4675     FALSE 0.009 291.000 0.000 NA   NA
 7089610 7089611 Bphy_4675 Bphy_4676     FALSE 0.172 121.000 0.000 NA   NA
 7089611 7089612 Bphy_4676 Bphy_4677     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7089612 7089613 Bphy_4677 Bphy_4678     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7089613 7089614 Bphy_4678 Bphy_4679     FALSE 0.010 279.000 0.000 NA   NA
 7089614 7089615 Bphy_4679 Bphy_4680     FALSE 0.272 75.000 0.000 1.000 N NA
 7089615 7089616 Bphy_4680 Bphy_4681     TRUE 0.995 -3.000 0.751 NA N NA
 7089616 7089617 Bphy_4681 Bphy_4682     FALSE 0.033 205.000 0.000 NA   NA
 7089620 7089621 Bphy_4685 Bphy_4686     TRUE 0.995 -3.000 0.411 0.076 N NA
 7089621 7089622 Bphy_4686 Bphy_4687     FALSE 0.318 112.000 0.000 0.076 N NA
 7089623 7089624 Bphy_4688 Bphy_4689     TRUE 0.821 23.000 0.040 NA   NA
 7089625 7089626 Bphy_4690 Bphy_4691     TRUE 0.965 8.000 0.176 NA   NA
 7089627 7089628 Bphy_4692 Bphy_4693     TRUE 0.982 37.000 0.256 0.001 Y NA
 7089629 7089630 Bphy_4694 Bphy_4695     FALSE 0.298 75.000 0.000 NA   NA
 7089631 7089632 Bphy_4696 Bphy_4697     TRUE 0.851 97.000 0.600 NA   NA
 7089633 7089634 Bphy_4698 Bphy_4699     TRUE 0.953 34.000 0.667 NA N NA
 7089634 7089635 Bphy_4699 Bphy_4700     TRUE 0.864 69.000 0.429 1.000 N NA
 7089636 7089637 Bphy_4701 Bphy_4702     FALSE 0.459 192.000 0.600 NA   NA
 7089638 7089639 Bphy_4703 Bphy_4704     FALSE 0.079 163.000 0.000 NA   NA
 7089639 7089640 Bphy_4704 Bphy_4705     FALSE 0.042 193.000 0.000 NA   NA
 7089642 7089643 Bphy_4707 Bphy_4708     TRUE 0.671 123.000 0.278 1.000 N NA
 7089643 7089644 Bphy_4708 Bphy_4709     TRUE 0.975 41.000 0.393 1.000 Y NA
 7089644 7089645 Bphy_4709 Bphy_4710     FALSE 0.444 48.000 0.000 1.000   NA
 7089645 7089646 Bphy_4710 Bphy_4711     FALSE 0.357 117.000 0.024 NA   NA
 7089646 7089647 Bphy_4711 Bphy_4712     TRUE 0.919 7.000 0.037 NA   NA
 7089647 7089648 Bphy_4712 Bphy_4713     TRUE 0.653 45.000 0.019 1.000   NA
 7089648 7089649 Bphy_4713 Bphy_4714     TRUE 0.896 7.000 0.014 NA   NA
 7089649 7089650 Bphy_4714 Bphy_4715     FALSE 0.016 316.000 0.014 NA   NA
 7089650 7089651 Bphy_4715 Bphy_4716     FALSE 0.006 336.000 0.000 NA   NA
 7089652 7089653 Bphy_4717 Bphy_4718     TRUE 0.857 73.000 0.400 NA   NA
 7089654 7089655 Bphy_4719 Bphy_4720     FALSE 0.069 274.000 0.143 NA   NA
 7089657 7089658 Bphy_4722 Bphy_4723     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7089659 7089660 Bphy_4724 Bphy_4725     TRUE 0.572 145.000 0.273 NA   NA
 7089660 7089661 Bphy_4725 Bphy_4726     FALSE 0.073 168.000 0.000 NA   NA
 7089661 7089662 Bphy_4726 Bphy_4727     FALSE 0.015 330.000 0.023 NA   NA
 7089662 7089663 Bphy_4727 Bphy_4728     TRUE 0.999 -3.000 0.909 0.001 Y NA
 7089663 7089664 Bphy_4728 Bphy_4729     TRUE 0.996 13.000 0.818 0.057 Y NA
 7089664 7089665 Bphy_4729 Bphy_4730     FALSE 0.005 329.000 0.000 1.000 N NA
 7089666 7089667 Bphy_4731 Bphy_4732     FALSE 0.024 225.000 0.000 NA   NA
 7089667 7089668 Bphy_4732 Bphy_4733     TRUE 0.955 -7.000 0.027 NA   NA
 7089668 7089669 Bphy_4733 Bphy_4734     TRUE 0.945 2.000 0.034 NA   NA
 7089670 7089671 Bphy_4735 Bphy_4736     FALSE 0.025 215.000 0.000 1.000 N NA
 7089672 7089673 Bphy_4737 Bphy_4738 ftrA rdgC FALSE 0.106 143.000 0.000 1.000 N NA
 7089674 7089675 Bphy_4739 Bphy_4740     FALSE 0.236 96.000 0.000 NA   NA
 7089675 7089676 Bphy_4740 Bphy_4741     FALSE 0.028 215.000 0.000 NA   NA
 7089676 7089677 Bphy_4741 Bphy_4742     TRUE 0.622 21.000 0.000 NA   NA
 7089677 7089678 Bphy_4742 Bphy_4743     FALSE 0.001 936.000 0.000 NA   NA
 7089679 7089680 Bphy_4744 Bphy_4745     TRUE 0.562 34.000 0.000 1.000   NA
 7089680 7089681 Bphy_4745 Bphy_4746     FALSE 0.002 649.000 0.000 1.000   NA
 7089681 7089682 Bphy_4746 Bphy_4747     FALSE 0.223 100.000 0.000 NA   NA
 7089682 7089683 Bphy_4747 Bphy_4748     FALSE 0.009 297.000 0.000 NA   NA
 7089685 7089686 Bphy_4750 Bphy_4751     FALSE 0.008 312.000 0.000 NA   NA
 7089687 7089688 Bphy_4752 Bphy_4753     FALSE 0.022 220.000 0.000 1.000 N NA
 7089690 7089691 Bphy_4755 Bphy_4756     FALSE 0.139 143.000 0.000 1.000   NA
 7089693 7089694 Bphy_4758 Bphy_4759     FALSE 0.026 213.000 0.000 1.000 N NA
 7089694 7089695 Bphy_4759 Bphy_4760     FALSE 0.322 82.000 0.000 1.000   NA
 7089696 7089697 Bphy_4761 Bphy_4762     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089698 7089699 Bphy_4763 Bphy_4764     FALSE 0.002 542.000 0.000 NA   NA
 7089699 7089700 Bphy_4764 Bphy_4765     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 7089700 7089701 Bphy_4765 Bphy_4766     TRUE 0.563 28.000 0.000 NA   NA
 7089701 7089702 Bphy_4766 Bphy_4767     FALSE 0.294 77.000 0.000 NA   NA
 7089702 7089703 Bphy_4767 Bphy_4768     FALSE 0.123 141.000 0.000 NA   NA
 7089703 7089704 Bphy_4768 Bphy_4769     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089704 7089705 Bphy_4769 Bphy_4770     FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7089705 7089706 Bphy_4770 Bphy_4771     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7089708 7089709 Bphy_4773 Bphy_4774     TRUE 0.723 111.000 0.286 NA   NA
 7089710 7089711 Bphy_4775 Bphy_4776     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7089711 7089712 Bphy_4776 Bphy_4777     FALSE 0.198 110.000 0.000 NA   NA
 7089712 7089713 Bphy_4777 Bphy_4778   nadE FALSE 0.360 107.000 0.013 NA   NA
 7089715 7089716 Bphy_4780 Bphy_4781     FALSE 0.318 83.000 0.000 1.000   NA
 7089716 7089717 Bphy_4781 Bphy_4782     FALSE 0.073 168.000 0.000 NA   NA
 7089717 7089718 Bphy_4782 Bphy_4783     FALSE 0.336 63.000 0.000 NA   NA
 7089718 7089719 Bphy_4783 Bphy_4784     TRUE 0.941 19.000 0.000 1.000 Y NA
 7089719 7089720 Bphy_4784 Bphy_4785     TRUE 0.822 90.000 0.000 0.020 Y NA
 7089720 7089721 Bphy_4785 Bphy_4786     TRUE 0.877 60.000 0.000 0.023 Y NA
 7089722 7089723 Bphy_4787 Bphy_4788     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 7089723 7089724 Bphy_4788 Bphy_4789     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7089724 7089725 Bphy_4789 Bphy_4790     FALSE 0.279 83.000 0.000 NA   NA
 7089726 7089727 Bphy_4791 Bphy_4792     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7089727 7089728 Bphy_4792 Bphy_4793     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 7089728 7089729 Bphy_4793 Bphy_4794     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089729 7089730 Bphy_4794 Bphy_4795     TRUE 0.984 -3.000 0.125 NA   NA
 7089730 7089731 Bphy_4795 Bphy_4796     TRUE 0.988 -3.000 0.188 NA   NA
 7089732 7089733 Bphy_4797 Bphy_4798     FALSE 0.327 58.000 0.000 1.000 N NA
 7089735 7089736 Bphy_4800 Bphy_4801     FALSE 0.006 329.000 0.000 NA   NA
 7089736 7089737 Bphy_4801 Bphy_4802     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7089737 7089738 Bphy_4802 Bphy_4803     FALSE 0.003 437.000 0.000 NA   NA
 7089740 7089741 Bphy_4805 Bphy_4806     TRUE 0.563 28.000 0.000 NA   NA
 7089743 7089744 Bphy_4808 Bphy_4809     TRUE 0.817 79.000 0.310 1.000 N NA
 7089744 7089745 Bphy_4809 Bphy_4810     FALSE 0.002 704.000 0.000 NA   NA
 7089746 7089747 Bphy_4811 Bphy_4812     FALSE 0.233 97.000 0.000 NA   NA
 7089747 7089748 Bphy_4812 Bphy_4813     FALSE 0.167 123.000 0.000 NA   NA
 7089750 7089751 Bphy_4815 Bphy_4816     FALSE 0.279 83.000 0.000 NA   NA
 7089753 7089754 Bphy_4818 Bphy_4819     FALSE 0.003 422.000 0.000 NA   NA
 7089755 7089756 Bphy_4820 Bphy_4821     FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 7089757 7089758 Bphy_4822 Bphy_4823     FALSE 0.004 368.000 0.000 NA   NA
 7089758 7089759 Bphy_4823 Bphy_4824     FALSE 0.516 34.000 0.000 NA   NA
 7089762 7089763 Bphy_4827 Bphy_4828     TRUE 0.613 147.000 0.000 0.056 Y NA
 7089763 7089764 Bphy_4828 Bphy_4829     TRUE 0.944 29.000 0.000 0.017 Y NA
 7089765 7089766 Bphy_4830 Bphy_4831     TRUE 0.996 0.000 0.148 0.017 Y NA
 7089766 7089767 Bphy_4831 Bphy_4832     TRUE 0.943 16.000 0.079 0.012   NA
 7089767 7089768 Bphy_4832 Bphy_4833     TRUE 0.729 57.000 0.079 1.000   NA
 7089768 7089769 Bphy_4833 Bphy_4834     FALSE 0.003 387.000 0.000 1.000 N NA
 7089769 7089770 Bphy_4834 Bphy_4835     TRUE 0.832 6.000 0.000 1.000   NA
 7089772 7089773 Bphy_4837 Bphy_4838     FALSE 0.009 314.000 0.000 1.000   NA
 7089773 7089774 Bphy_4838 Bphy_4839     FALSE 0.003 387.000 0.000 1.000 N NA
 7089774 7089775 Bphy_4839 Bphy_4840     FALSE 0.251 84.000 0.000 1.000 N NA
 7089775 7089776 Bphy_4840 Bphy_4841     TRUE 0.872 58.000 0.000 0.070 Y NA
 7089776 7089777 Bphy_4841 Bphy_4842     FALSE 0.098 147.000 0.000 1.000 N NA
 7089779 7089780 Bphy_4844 Bphy_4845     FALSE 0.093 155.000 0.000 NA   NA
 7089780 7089781 Bphy_4845 Bphy_4846     FALSE 0.464 170.000 0.333 1.000 N NA
 7089781 7089782 Bphy_4846 Bphy_4847     TRUE 0.879 51.000 0.333 1.000 N NA
 7089782 7089783 Bphy_4847 Bphy_4848     TRUE 0.986 37.000 0.500 0.070 Y NA
 7089783 7089784 Bphy_4848 Bphy_4849     FALSE 0.043 230.000 0.000 0.070 N NA
 7089785 7089786 Bphy_4850 Bphy_4851     TRUE 0.596 150.000 0.385 1.000 N NA
 7089787 7089788 Bphy_4852 Bphy_4853     FALSE 0.024 451.000 0.000 1.000 Y NA
 7089788 7089789 Bphy_4853 Bphy_4854     FALSE 0.002 510.000 0.000 NA   NA
 7089790 7089791 Bphy_4855 Bphy_4856     FALSE 0.030 271.000 0.000 0.055   NA
 7089791 7089792 Bphy_4856 Bphy_4857     FALSE 0.386 189.000 0.364 NA   NA
 7089793 7089794 Bphy_4858 Bphy_4859     FALSE 0.004 535.000 0.000 0.075 N NA
 7089794 7089795 Bphy_4859 Bphy_4860     TRUE 0.998 -3.000 0.462 1.000 Y NA
 7089795 7089796 Bphy_4860 Bphy_4861     TRUE 0.998 -3.000 0.286 0.008 Y NA
 7089796 7089797 Bphy_4861 Bphy_4862     TRUE 0.754 191.000 0.429 0.064 Y NA
 7089797 7089798 Bphy_4862 Bphy_4863     FALSE 0.239 203.000 0.000 1.000 Y NA
 7089798 7089799 Bphy_4863 Bphy_4864     FALSE 0.001 1084.000 0.000 NA   NA
 7089799 7089800 Bphy_4864 Bphy_4865     TRUE 0.885 76.000 0.583 NA   NA
 7089800 7089801 Bphy_4865 Bphy_4866     TRUE 0.973 18.000 0.333 0.045   NA
 7089801 7089802 Bphy_4866 Bphy_4867     FALSE 0.039 207.000 0.000 1.000   NA
 7089802 7089803 Bphy_4867 Bphy_4868     TRUE 0.759 104.000 0.333 1.000 N NA
 7089803 7089804 Bphy_4868 Bphy_4869     FALSE 0.005 351.000 0.000 1.000 N NA
 7089804 7089805 Bphy_4869 Bphy_4870     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA   NA
 7089805 7089806 Bphy_4870 Bphy_4871     FALSE 0.013 262.000 0.000 NA   NA
 7089807 7089808 Bphy_4872 Bphy_4873     FALSE 0.063 157.000 0.000 NA N NA
 7089808 7089809 Bphy_4873 Bphy_4874     FALSE 0.002 603.000 0.000 NA   NA
 7089809 7089810 Bphy_4874 Bphy_4875     FALSE 0.487 37.000 0.000 NA   NA
 7089811 7089812 Bphy_4876 Bphy_4877     FALSE 0.009 261.000 0.000 NA N NA
 7089814 7089815 Bphy_4879 Bphy_4880     FALSE 0.509 31.000 0.000 1.000 N NA
 7089815 7089816 Bphy_4880 Bphy_4881     FALSE 0.350 43.000 0.000 NA N NA
 7089816 7089817 Bphy_4881 Bphy_4882     TRUE 0.571 27.000 0.000 NA   NA
 7089817 7089818 Bphy_4882 Bphy_4883     TRUE 0.764 12.000 0.000 1.000   NA
 7089818 7089819 Bphy_4883 Bphy_4884     TRUE 0.947 84.000 0.250 0.070 Y NA
 7089819 7089820 Bphy_4884 Bphy_4885     FALSE 0.267 78.000 0.000 1.000 N NA
 7089820 7089821 Bphy_4885 Bphy_4886     FALSE 0.006 324.000 0.000 1.000 N NA
 7089822 7089823 Bphy_4887 Bphy_4888     FALSE 0.300 74.000 0.000 NA   NA
 7089823 7089824 Bphy_4888 Bphy_4889     FALSE 0.183 116.000 0.000 NA   NA
 7089824 7089825 Bphy_4889 Bphy_4890     FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 7089826 7089827 Bphy_4891 Bphy_4892     TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.055 Y NA
 7089827 7089828 Bphy_4892 Bphy_4893     FALSE 0.003 437.000 0.000 1.000 N NA
 7089828 7089829 Bphy_4893 Bphy_4894     FALSE 0.441 32.000 0.000 NA N NA
 7089829 7089830 Bphy_4894 Bphy_4895     FALSE 0.001 565.000 0.000 NA N NA
 7089831 7089832 Bphy_4896 Bphy_4897     FALSE 0.040 196.000 0.000 NA   NA
 7089832 7089833 Bphy_4897 Bphy_4898     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.009 Y NA
 7089833 7089834 Bphy_4898 Bphy_4899     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.009 Y NA
 7089836 7089837 Bphy_4901 Bphy_4902     FALSE 0.030 271.000 0.000 0.055   NA
 7089837 7089838 Bphy_4902 Bphy_4903     FALSE 0.386 189.000 0.364 NA   NA
 7089841 7089842 Bphy_4906 Bphy_4907     FALSE 0.394 49.000 0.000 NA   NA
 7089843 7089844 Bphy_4908 Bphy_4909     TRUE 0.879 2.000 0.000 1.000   NA
 7089844 7089845 Bphy_4909 Bphy_4910     FALSE 0.037 371.000 0.000 1.000 Y NA
 7089845 7089846 Bphy_4910 Bphy_4911     FALSE 0.018 232.000 0.000 1.000 N NA
 7089846 7089847 Bphy_4911 Bphy_4912     TRUE 0.991 -3.000 0.312 1.000 N NA
 7089847 7089848 Bphy_4912 Bphy_4913     FALSE 0.002 593.000 0.000 1.000 N NA
 7089848 7089849 Bphy_4913 Bphy_4914     FALSE 0.324 66.000 0.000 NA   NA
 7089849 7089850 Bphy_4914 Bphy_4915     FALSE 0.268 86.000 0.000 NA   NA
 7089850 7089851 Bphy_4915 Bphy_4916     FALSE 0.008 306.000 0.000 NA   NA
 7089852 7089853 Bphy_4917 Bphy_4918     TRUE 0.864 -24.000 0.000 NA   NA
 7089853 7089854 Bphy_4918 Bphy_4919     TRUE 0.948 32.000 0.061 NA Y NA
 7089855 7089856 Bphy_4920 Bphy_4921     FALSE 0.028 215.000 0.000 NA   NA
 7089856 7089857 Bphy_4921 Bphy_4922     TRUE 0.995 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 7089858 7089859 Bphy_4923 Bphy_4924     FALSE 0.001 972.000 0.000 1.000 N NA
 7089859 7089860 Bphy_4924 Bphy_4925     FALSE 0.285 92.000 0.000 1.000   NA
 7089860 7089861 Bphy_4925 Bphy_4926     FALSE 0.154 128.000 0.000 NA   NA
 7089861 7089862 Bphy_4926 Bphy_4927     FALSE 0.033 380.000 0.000 NA Y NA
 7089864 7089865 Bphy_4929 Bphy_4930     TRUE 0.950 103.000 0.667 1.000 Y NA
 7089865 7089866 Bphy_4930 Bphy_4931     TRUE 0.966 35.000 1.000 1.000 N NA
 7089866 7089867 Bphy_4931 Bphy_4932     TRUE 0.956 41.000 1.000 NA N NA
 7089867 7089868 Bphy_4932 Bphy_4933     FALSE 0.376 53.000 0.000 NA   NA
 7089868 7089869 Bphy_4933 Bphy_4934     FALSE 0.487 37.000 0.000 NA   NA
 7089871 7089872 Bphy_4936 Bphy_4937     TRUE 0.605 23.000 0.000 NA   NA
 7089874 7089875 Bphy_4939 Bphy_4940     TRUE 0.991 14.000 0.250 0.069 Y NA
 7089875 7089876 Bphy_4940 Bphy_4941     TRUE 0.991 20.000 0.575 1.000 Y NA
 7089876 7089877 Bphy_4941 Bphy_4942     FALSE 0.203 108.000 0.000 NA   NA
 7089877 7089878 Bphy_4942 Bphy_4943     FALSE 0.002 571.000 0.000 NA   NA
 7089878 7089879 Bphy_4943 Bphy_4944     FALSE 0.002 630.000 0.000 1.000 N NA
 7089879 7089880 Bphy_4944 Bphy_4945     FALSE 0.231 90.000 0.000 1.000 N NA
 7089880 7089881 Bphy_4945 Bphy_4946     TRUE 0.882 25.000 0.111 1.000 N NA
 7089882 7089883 Bphy_4947 Bphy_4948   fabG FALSE 0.011 273.000 0.000 NA   NA
 7089883 7089884 Bphy_4948 Bphy_4949 fabG   TRUE 0.949 27.000 0.273 0.069 N NA
 7089884 7089885 Bphy_4949 Bphy_4950     FALSE 0.027 210.000 0.000 1.000 N NA
 7089885 7089886 Bphy_4950 Bphy_4951     FALSE 0.165 124.000 0.000 NA   NA
 7089887 7089888 Bphy_4952 Bphy_4953     TRUE 0.596 57.000 0.000 0.054   NA
 7089888 7089889 Bphy_4953 Bphy_4954     FALSE 0.001 2832.000 0.000 NA   NA
 7089889 7089890 Bphy_4954 Bphy_4955     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089892 7089893 Bphy_4957 Bphy_4958     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7089896 7089897 Bphy_4961 Bphy_4962     TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.054 Y NA
 7089898 7089899 Bphy_4963 Bphy_4964     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7089899 7089900 Bphy_4964 Bphy_4965     FALSE 0.091 156.000 0.000 NA   NA
 7089901 7089902 Bphy_4966 Bphy_4967     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7089902 7089903 Bphy_4967 Bphy_4968     FALSE 0.464 40.000 0.000 NA   NA
 7089904 7089905 Bphy_4969 Bphy_4970     TRUE 0.631 20.000 0.000 NA   NA
 7089905 7089906 Bphy_4970 Bphy_4971     TRUE 0.892 -7.000 0.000 NA   NA
 7089906 7089907 Bphy_4971 Bphy_4972     FALSE 0.306 86.000 0.000 1.000   NA
 7089907 7089908 Bphy_4972 Bphy_4973     FALSE 0.516 34.000 0.000 NA   NA
 7089908 7089909 Bphy_4973 Bphy_4974     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7089909 7089910 Bphy_4974 Bphy_4975     FALSE 0.252 91.000 0.000 NA   NA
 7089912 7089913 Bphy_4977 Bphy_4978     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 7089913 7089914 Bphy_4978 Bphy_4979     TRUE 0.631 20.000 0.000 NA   NA
 7089915 7089916 Bphy_4980 Bphy_4981     TRUE 0.980 -3.000 0.091 NA   NA
 7089917 7089918 Bphy_4982 Bphy_4983     FALSE 0.020 236.000 0.000 NA   NA
 7089918 7089919 Bphy_4983 Bphy_4984     FALSE 0.001 1067.000 0.000 NA   NA
 7089919 7089920 Bphy_4984 Bphy_4985     TRUE 0.712 13.000 0.000 NA   NA
 7089921 7089922 Bphy_4986 Bphy_4987     FALSE 0.275 84.000 0.000 NA   NA
 7089925 7089926 Bphy_4990 Bphy_4991     TRUE 0.850 40.000 0.172 NA N NA
 7089926 7089927 Bphy_4991 Bphy_4992     TRUE 0.943 11.000 0.138 NA N NA
 7089927 7089928 Bphy_4992 Bphy_4993     TRUE 0.947 15.000 0.227 NA N NA
 7089928 7089929 Bphy_4993 Bphy_4994     TRUE 0.571 27.000 0.000 NA   NA
 7089929 7089930 Bphy_4994 Bphy_4995     FALSE 0.007 342.000 0.000 1.000   NA
 7089930 7089931 Bphy_4995 Bphy_4996     FALSE 0.011 278.000 0.000 NA   NA
 7089932 7089933 Bphy_4997 Bphy_4998     FALSE 0.003 532.000 0.000 1.000   NA
 7089933 7089934 Bphy_4998 Bphy_4999     TRUE 0.995 -3.000 0.423 0.091 N NA
 7089934 7089935 Bphy_4999 Bphy_5000     TRUE 0.968 13.000 0.385 NA N NA
 7089939 7089940 Bphy_5004 Bphy_5005     FALSE 0.320 120.000 0.029 NA N NA
 7089940 7089941 Bphy_5005 Bphy_5006     FALSE 0.320 67.000 0.000 NA   NA
 7089942 7089943 Bphy_5007 Bphy_5008     FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 7089943 7089944 Bphy_5008 Bphy_5009     TRUE 0.878 -13.000 0.000 NA   NA
 7089948 7089949 Bphy_5013 Bphy_5014     FALSE 0.271 85.000 0.000 NA   NA
 7089949 7089950 Bphy_5014 Bphy_5015     FALSE 0.320 67.000 0.000 NA   NA
 7089951 7089952 Bphy_5016 Bphy_5017     FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7089952 7089953 Bphy_5017 Bphy_5018     TRUE 0.995 -3.000 0.700 NA   NA
 7089954 7089955 Bphy_5019 Bphy_5020     TRUE 0.964 21.000 0.286 0.056   NA
 7089955 7089956 Bphy_5020 Bphy_5021     TRUE 0.689 69.000 0.093 NA   NA
 7089958 7089959 Bphy_5023 Bphy_5024     TRUE 0.777 91.000 0.286 1.000 N NA
 7089960 7089961 Bphy_5025 Bphy_5026     FALSE 0.014 257.000 0.000 NA   NA
 7089961 7089962 Bphy_5026 Bphy_5027     TRUE 0.873 -16.000 0.000 NA   NA
 7089962 7089963 Bphy_5027 Bphy_5028     TRUE 0.990 0.000 0.000 0.006 Y NA
 7089963 7089964 Bphy_5028 Bphy_5029     TRUE 0.992 -3.000 0.364 NA   NA
 7089964 7089965 Bphy_5029 Bphy_5030     TRUE 0.989 2.000 0.444 NA   NA
 7089966 7089967 Bphy_5031 Bphy_5032     FALSE 0.176 119.000 0.000 NA   NA
 7089968 7089969 Bphy_5033 Bphy_5034     FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 7089969 7089970 Bphy_5034 Bphy_5035     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 7089971 7089972 Bphy_5036 Bphy_5037     FALSE 0.080 171.000 0.000 1.000   NA
 7089973 7089974 Bphy_5038 Bphy_5039     FALSE 0.257 89.000 0.000 NA   NA
 7089974 7089975 Bphy_5039 Bphy_5040     FALSE 0.028 215.000 0.000 NA   NA
 7089975 7089976 Bphy_5040 Bphy_5041     FALSE 0.002 518.000 0.000 NA   NA
 7089976 7089977 Bphy_5041 Bphy_5042     FALSE 0.076 165.000 0.000 NA   NA
 7089977 7089978 Bphy_5042 Bphy_5043     FALSE 0.020 228.000 0.000 1.000 N NA
 7089978 7089979 Bphy_5043 Bphy_5044     TRUE 0.746 67.000 0.143 1.000 N NA
 7089979 7089980 Bphy_5044 Bphy_5045     TRUE 0.954 24.000 0.031 1.000 Y NA
 7089980 7089981 Bphy_5045 Bphy_5046     TRUE 0.829 41.000 0.123 NA   NA
 7089981 7089982 Bphy_5046 Bphy_5047     TRUE 0.758 25.000 0.014 NA   NA
 7089982 7089983 Bphy_5047 Bphy_5048     FALSE 0.021 232.000 0.000 NA   NA
 7089983 7089984 Bphy_5048 Bphy_5049     TRUE 0.668 108.000 0.188 NA   NA
 7089989 7089990 Bphy_5054 Bphy_5055     TRUE 0.677 152.000 0.333 0.013   NA
 7089990 7089991 Bphy_5055 Bphy_5056     FALSE 0.172 204.000 0.125 NA   NA
 7089991 7089992 Bphy_5056 Bphy_5057     TRUE 0.886 104.000 1.000 NA   NA
 7089992 7089993 Bphy_5057 Bphy_5058     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7089996 7089997 Bphy_5061 Bphy_5062     FALSE 0.347 105.000 0.007 NA   NA
 7090000 7090001 Bphy_5065 Bphy_5066     TRUE 0.826 124.000 0.576 0.063 N NA
 7090001 7090002 Bphy_5066 Bphy_5067     TRUE 0.993 -22.000 0.500 0.063 N NA
 7090002 7090003 Bphy_5067 Bphy_5068     TRUE 0.990 0.000 0.281 0.063 N NA
 7090003 7090004 Bphy_5068 Bphy_5069     TRUE 0.822 81.000 0.333 1.000 N NA
 7090004 7090005 Bphy_5069 Bphy_5070     TRUE 0.866 45.000 0.200 1.000   NA
 7090005 7090006 Bphy_5070 Bphy_5071     TRUE 0.996 -3.000 0.867 1.000   NA
 7090006 7090007 Bphy_5071 Bphy_5072     TRUE 0.971 5.000 0.154 1.000   NA
 7090007 7090008 Bphy_5072 Bphy_5073     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 7090008 7090009 Bphy_5073 Bphy_R0018     FALSE 0.041 194.000 0.000 NA   NA
 7090009 7090010 Bphy_R0018 Bphy_R0079     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 7090010 7090011 Bphy_R0079 Bphy_R0080     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7090011 7090012 Bphy_R0080 Bphy_R0019     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7090014 7090015 Bphy_5075 Bphy_5076     FALSE 0.534 144.000 0.214 NA   NA
 7090015 7090016 Bphy_5076 Bphy_5077     FALSE 0.356 137.000 0.058 NA   NA
 7090018 7090019 Bphy_5079 Bphy_5080     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7090020 7090021 Bphy_5081 Bphy_5082     TRUE 0.994 0.000 0.651 1.000   NA
 7090021 7090022 Bphy_5082 Bphy_5083     TRUE 0.992 -3.000 0.339 1.000   NA
 7090022 7090023 Bphy_5083 Bphy_5084     TRUE 0.997 -3.000 0.700 0.001   NA
 7090023 7090024 Bphy_5084 Bphy_5085     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 7090024 7090025 Bphy_5085 Bphy_5086     TRUE 0.985 6.000 0.475 NA   NA
 7090025 7090026 Bphy_5086 Bphy_5087     TRUE 0.988 5.000 0.508 1.000   NA
 7090026 7090027 Bphy_5087 Bphy_5088     TRUE 0.951 8.000 0.091 1.000   NA
 7090030 7090031 Bphy_5091 Bphy_5092     FALSE 0.016 248.000 0.000 NA   NA
 7090031 7090032 Bphy_5092 Bphy_5093     FALSE 0.174 239.000 0.294 NA   NA
 7090032 7090033 Bphy_5093 Bphy_5094     TRUE 0.930 11.000 0.088 1.000 N NA
 7090033 7090034 Bphy_5094 Bphy_5095     FALSE 0.159 119.000 0.000 1.000 N NA
 7090034 7090035 Bphy_5095 Bphy_5096     FALSE 0.376 53.000 0.000 NA   NA
 7090035 7090036 Bphy_5096 Bphy_5097     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090037 7090038 Bphy_5098 Bphy_5099     TRUE 0.733 92.000 0.200 NA   NA
 7090039 7090040 Bphy_5100 Bphy_5101     TRUE 0.960 108.000 0.722 0.071 Y NA
 7090040 7090041 Bphy_5101 Bphy_5102     TRUE 0.996 16.000 0.889 0.008 Y NA
 7090041 7090042 Bphy_5102 Bphy_5103     TRUE 0.991 22.000 0.727 1.000 Y NA
 7090042 7090043 Bphy_5103 Bphy_5104     TRUE 0.980 44.000 0.615 1.000 Y NA
 7090043 7090044 Bphy_5104 Bphy_5105     TRUE 0.757 67.000 0.154 1.000 N NA
 7090045 7090046 Bphy_5106 Bphy_5107     TRUE 0.648 105.000 0.167 1.000 N NA
 7090046 7090047 Bphy_5107 Bphy_5108     TRUE 0.963 40.000 0.188 1.000 Y NA
 7090047 7090048 Bphy_5108 Bphy_5109     TRUE 0.996 14.000 0.812 0.008 Y NA
 7090048 7090049 Bphy_5109 Bphy_5110     TRUE 0.978 82.000 0.846 0.063 Y NA
 7090050 7090051 Bphy_5111 Bphy_5112     TRUE 0.991 -3.000 0.150 0.046   NA
 7090052 7090053 Bphy_5113 Bphy_5114     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 7090054 7090055 Bphy_5115 Bphy_5116     FALSE 0.007 321.000 0.000 NA   NA
 7090056 7090057 Bphy_5117 Bphy_5118     FALSE 0.002 656.000 0.000 NA   NA
 7090057 7090058 Bphy_5118 Bphy_5119     TRUE 0.994 -22.000 0.800 NA   NA
 7090058 7090059 Bphy_5119 Bphy_5120     TRUE 0.981 30.000 0.200 0.055 Y NA
 7090059 7090060 Bphy_5120 Bphy_5121     FALSE 0.003 1010.000 0.000 0.091   NA
 7090060 7090061 Bphy_5121 Bphy_5122     FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 7090061 7090062 Bphy_5122 Bphy_5123     FALSE 0.096 153.000 0.000 NA   NA
 7090062 7090063 Bphy_5123 Bphy_5124     TRUE 0.997 -3.000 0.330 NA Y NA
 7090063 7090064 Bphy_5124 Bphy_5125     FALSE 0.062 244.000 0.075 NA N NA
 7090065 7090066 Bphy_5126 Bphy_5127     TRUE 0.858 171.000 0.857 1.000 Y NA
 7090066 7090067 Bphy_5127 Bphy_5128     TRUE 0.959 37.000 0.857 1.000 N NA
 7090067 7090068 Bphy_5128 Bphy_5129     FALSE 0.005 704.000 0.000 0.001 N NA
 7090068 7090069 Bphy_5129 Bphy_5130     TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 7090069 7090070 Bphy_5130 Bphy_5131     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.003 Y NA
 7090070 7090071 Bphy_5131 Bphy_5132     FALSE 0.003 396.000 0.000 1.000 N NA
 7090071 7090072 Bphy_5132 Bphy_5133     TRUE 0.995 11.000 0.444 0.055 Y NA
 7090072 7090073 Bphy_5133 Bphy_5134     TRUE 0.991 22.000 0.333 0.001 Y NA
 7090074 7090075 Bphy_5135 Bphy_5136     TRUE 0.778 29.000 0.048 NA N NA
 7090075 7090076 Bphy_5136 Bphy_5137     TRUE 0.941 17.000 0.223 NA N NA
 7090077 7090078 Bphy_5138 Bphy_5139     TRUE 0.985 -3.000 0.143 NA   NA
 7090078 7090079 Bphy_5139 Bphy_5140     FALSE 0.036 201.000 0.000 NA   NA
 7090079 7090080 Bphy_5140 Bphy_5141     FALSE 0.336 63.000 0.000 NA   NA
 7090080 7090081 Bphy_5141 Bphy_5142     TRUE 0.984 -13.000 0.208 NA   NA
 7090081 7090082 Bphy_5142 Bphy_5143     TRUE 0.661 123.000 0.250 NA   NA
 7090083 7090084 Bphy_5144 Bphy_5145     TRUE 0.976 14.000 0.062 1.000 Y NA
 7090084 7090085 Bphy_5145 Bphy_5146     TRUE 0.985 59.000 1.000 0.063 Y NA
 7090085 7090086 Bphy_5146 Bphy_5147     TRUE 0.907 70.000 0.667 1.000   NA
 7090086 7090087 Bphy_5147 Bphy_5148     TRUE 0.719 139.000 0.500 1.000   NA
 7090087 7090088 Bphy_5148 Bphy_5149     TRUE 0.896 138.000 0.250 0.000 Y NA
 7090089 7090090 Bphy_5150 Bphy_5151     TRUE 0.977 0.000 0.069 0.063 N NA
 7090091 7090092 Bphy_5152 Bphy_5153     FALSE 0.275 84.000 0.000 NA   NA
 7090093 7090094 Bphy_5154 Bphy_5155     TRUE 0.939 46.000 0.120 NA Y NA
 7090094 7090095 Bphy_5155 Bphy_5156     TRUE 0.938 47.000 0.750 1.000 N NA
 7090095 7090096 Bphy_5156 Bphy_5157     FALSE 0.011 251.000 0.000 NA N NA
 7090096 7090097 Bphy_5157 Bphy_5158     TRUE 0.921 66.000 0.143 NA Y NA
 7090097 7090098 Bphy_5158 Bphy_5159     TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 7090098 7090099 Bphy_5159 Bphy_5160     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.063 Y NA
 7090099 7090100 Bphy_5160 Bphy_5161     TRUE 0.956 49.000 0.143 0.091 Y NA
 7090100 7090101 Bphy_5161 Bphy_5162     TRUE 0.988 32.000 0.750 NA Y NA
 7090101 7090102 Bphy_5162 Bphy_5163     FALSE 0.004 382.000 0.000 NA   NA
 7090102 7090103 Bphy_5163 Bphy_5164     FALSE 0.454 41.000 0.000 NA   NA
 7090103 7090104 Bphy_5164 Bphy_5165     FALSE 0.503 71.000 0.000 0.046 N NA
 7090106 7090107 Bphy_5167 Bphy_5168     FALSE 0.012 268.000 0.000 NA   NA
 7090108 7090109 Bphy_5169 Bphy_5170     TRUE 0.770 84.000 0.000 1.000 Y NA
 7090109 7090110 Bphy_5170 Bphy_5171     FALSE 0.051 383.000 0.000 0.019 Y NA
 7090113 7090114 Bphy_5174 Bphy_5175     FALSE 0.002 539.000 0.000 NA   NA
 7090114 7090115 Bphy_5175 Bphy_5176     FALSE 0.279 83.000 0.000 NA   NA
 7090116 7090117 Bphy_5177 Bphy_5178     TRUE 0.950 14.000 0.182 1.000   NA
 7090120 7090121 Bphy_5181 Bphy_5182     TRUE 0.862 55.000 0.286 NA   NA
 7090121 7090122 Bphy_5182 Bphy_5183     FALSE 0.009 290.000 0.000 NA   NA
 7090123 7090124 Bphy_5184 Bphy_5185     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 7090129 7090130 Bphy_5190 Bphy_5191     TRUE 0.850 63.000 0.326 1.000 N NA
 7090130 7090131 Bphy_5191 Bphy_5192     TRUE 0.791 52.000 0.118 1.000   NA
 7090131 7090132 Bphy_5192 Bphy_5193     FALSE 0.049 194.000 0.000 1.000   NA
 7090132 7090133 Bphy_5193 Bphy_5194     FALSE 0.068 180.000 0.000 1.000   NA
 7090135 7090136 Bphy_5196 Bphy_5197     FALSE 0.004 397.000 0.000 NA   NA
 7090136 7090137 Bphy_5197 Bphy_5198     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7090137 7090138 Bphy_5198 Bphy_5199     FALSE 0.001 794.000 0.000 NA   NA
 7090138 7090139 Bphy_5199 Bphy_5200     TRUE 0.869 -19.000 0.000 NA   NA
 7090139 7090140 Bphy_5200 Bphy_5201     FALSE 0.339 62.000 0.000 NA   NA
 7090140 7090141 Bphy_5201 Bphy_5202     FALSE 0.013 260.000 0.000 NA   NA
 7090141 7090142 Bphy_5202 Bphy_5203     FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 7090144 7090145 Bphy_5205 Bphy_5206 gltA   FALSE 0.004 367.000 0.000 1.000 N NA
 7090145 7090146 Bphy_5206 Bphy_5207     FALSE 0.376 53.000 0.000 NA   NA
 7090146 7090147 Bphy_5207 Bphy_5208     FALSE 0.045 190.000 0.000 NA   NA
 7090147 7090148 Bphy_5208 Bphy_5209     TRUE 0.924 -3.000 0.000 1.000   NA
 7090148 7090149 Bphy_5209 Bphy_5210     FALSE 0.045 190.000 0.000 NA   NA
 7090149 7090150 Bphy_5210 Bphy_5211     FALSE 0.080 162.000 0.000 NA   NA
 7090150 7090151 Bphy_5211 Bphy_5212     FALSE 0.009 290.000 0.000 NA   NA
 7090151 7090152 Bphy_5212 Bphy_5213     FALSE 0.014 255.000 0.000 NA   NA
 7090154 7090155 Bphy_5215 Bphy_5216     FALSE 0.038 209.000 0.000 1.000   NA
 7090155 7090156 Bphy_5216 Bphy_5217     TRUE 0.997 -3.000 0.312 NA Y NA
 7090156 7090157 Bphy_5217 Bphy_5218     FALSE 0.154 106.000 0.000 NA N NA
 7090157 7090158 Bphy_5218 Bphy_5219     FALSE 0.464 115.000 0.054 1.000   NA
 7090158 7090159 Bphy_5219 Bphy_5220     TRUE 0.745 36.000 0.028 1.000   NA
 7090159 7090160 Bphy_5220 Bphy_5221     TRUE 0.914 30.000 0.211 NA   NA
 7090162 7090163 Bphy_5223 Bphy_5224     FALSE 0.344 104.000 0.011 1.000 N NA
 7090164 7090165 Bphy_5225 Bphy_5226     FALSE 0.002 413.000 0.000 NA N NA
 7090167 7090168 Bphy_5228 Bphy_5229     TRUE 0.976 -46.000 0.130 1.000   NA
 7090169 7090170 Bphy_5230 Bphy_5231     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7090171 7090172 Bphy_5232 Bphy_5233     TRUE 0.994 -3.000 0.511 NA   NA
 7090172 7090173 Bphy_5233 Bphy_5234     TRUE 0.973 0.000 0.085 1.000   NA
 7090173 7090174 Bphy_5234 Bphy_5235     TRUE 0.963 12.000 0.256 1.000 N NA
 7090179 7090180 Bphy_5240 Bphy_5241     FALSE 0.055 182.000 0.000 NA   NA
 7090180 7090181 Bphy_5241 Bphy_5242     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090182 7090183 Bphy_5243 Bphy_5244     TRUE 0.888 23.000 0.089 1.000   NA
 7090183 7090184 Bphy_5244 Bphy_5245     TRUE 0.970 -10.000 0.067 1.000   NA
 7090184 7090185 Bphy_5245 Bphy_5246     TRUE 0.994 -3.000 0.058 NA Y NA
 7090185 7090186 Bphy_5246 Bphy_5247     TRUE 0.992 -3.000 0.406 NA N NA
 7090186 7090187 Bphy_5247 Bphy_5248     TRUE 0.984 -3.000 0.143 1.000 N NA
 7090187 7090188 Bphy_5248 Bphy_5249     TRUE 0.986 -3.000 0.160 1.000 N NA
 7090188 7090189 Bphy_5249 Bphy_5250     TRUE 0.909 33.000 0.241 1.000 N NA
 7090191 7090192 Bphy_5252 Bphy_5253     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090192 7090193 Bphy_5253 Bphy_5254     FALSE 0.007 319.000 0.000 NA   NA
 7090194 7090195 Bphy_5255 Bphy_5256     FALSE 0.017 236.000 0.000 1.000 N NA
 7090195 7090196 Bphy_5256 Bphy_5257     TRUE 0.552 157.000 0.000 0.062 Y NA
 7090197 7090198 Bphy_5258 Bphy_5259     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090198 7090199 Bphy_5259 Bphy_5260     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7090199 7090200 Bphy_5260 Bphy_5261     FALSE 0.007 323.000 0.000 NA   NA
 7090200 7090201 Bphy_5261 Bphy_5262     TRUE 0.953 13.000 0.000 NA Y NA
 7090202 7090203 Bphy_5263 Bphy_5264     FALSE 0.002 522.000 0.000 NA   NA
 7090205 7090206 Bphy_5266 Bphy_5267     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 7090206 7090207 Bphy_5267 Bphy_5268     FALSE 0.002 536.000 0.000 NA   NA
 7090207 7090208 Bphy_5268 Bphy_5269     TRUE 0.645 47.000 0.000 0.053   NA
 7090209 7090210 Bphy_5270 Bphy_5271     FALSE 0.023 226.000 0.000 NA   NA
 7090212 7090213 Bphy_5273 Bphy_5274     FALSE 0.024 277.000 0.000 0.090   NA
 7090213 7090214 Bphy_5274 Bphy_5275     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 7090215 7090216 Bphy_5276 Bphy_5277     TRUE 0.698 83.000 0.135 1.000 N NA
 7090216 7090217 Bphy_5277 Bphy_5278     FALSE 0.005 485.000 0.000 0.068 N NA
 7090222 7090223 Bphy_5283 Bphy_5284     FALSE 0.148 131.000 0.000 NA   NA
 7090223 7090224 Bphy_5284 Bphy_5285     TRUE 0.976 17.000 0.667 NA   NA
 7090224 7090225 Bphy_5285 Bphy_5286     TRUE 0.966 11.000 0.222 1.000   NA
 7090225 7090226 Bphy_5286 Bphy_5287     TRUE 0.994 -13.000 0.700 NA   NA
 7090226 7090227 Bphy_5287 Bphy_5288     FALSE 0.268 86.000 0.000 NA   NA
 7090227 7090228 Bphy_5288 Bphy_5289     TRUE 0.588 25.000 0.000 NA   NA
 7090228 7090229 Bphy_5289 Bphy_5290     TRUE 0.961 -25.000 0.067 NA   NA
 7090229 7090230 Bphy_5290 Bphy_5291     FALSE 0.006 334.000 0.000 NA   NA
 7090230 7090231 Bphy_5291 Bphy_5292     TRUE 0.889 23.000 0.104 NA   NA
 7090231 7090232 Bphy_5292 Bphy_5293     FALSE 0.170 122.000 0.000 NA   NA
 7090232 7090233 Bphy_5293 Bphy_5294     FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 7090234 7090235 Bphy_5295 Bphy_5296     FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 7090237 7090238 Bphy_5298 Bphy_5299     FALSE 0.454 41.000 0.000 NA   NA
 7090238 7090239 Bphy_5299 Bphy_5300     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090245 7090246 Bphy_5306 Bphy_5307     FALSE 0.019 240.000 0.000 NA   NA
 7090246 7090247 Bphy_5307 Bphy_5308     FALSE 0.350 70.000 0.000 1.000   NA
 7090247 7090248 Bphy_5308 Bphy_5309     TRUE 0.991 -3.000 0.254 1.000   NA
 7090248 7090249 Bphy_5309 Bphy_5310     FALSE 0.125 140.000 0.000 NA   NA
 7090250 7090251 Bphy_5311 Bphy_5312     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7090251 7090252 Bphy_5312 Bphy_5313     FALSE 0.423 106.000 0.033 NA   NA
 7090252 7090253 Bphy_5313 Bphy_5314     FALSE 0.091 165.000 0.000 1.000   NA
 7090253 7090254 Bphy_5314 Bphy_5315     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 7090255 7090256 Bphy_5316 Bphy_5317     TRUE 0.865 43.000 0.000 NA Y NA
 7090256 7090257 Bphy_5317 Bphy_5318     TRUE 0.830 90.000 0.043 NA Y NA
 7090257 7090258 Bphy_5318 Bphy_5319     FALSE 0.004 387.000 0.000 NA   NA
 7090258 7090259 Bphy_5319 Bphy_5320     FALSE 0.332 64.000 0.000 NA   NA
 7090259 7090260 Bphy_5320 Bphy_5321     TRUE 0.970 73.000 0.794 NA Y NA
 7090260 7090261 Bphy_5321 Bphy_5322     TRUE 0.930 36.000 0.383 NA   NA
 7090261 7090262 Bphy_5322 Bphy_5323     TRUE 0.551 97.000 0.069 NA   NA
 7090262 7090263 Bphy_5323 Bphy_5324     TRUE 0.921 41.000 0.030 1.000 Y NA
 7090263 7090264 Bphy_5324 Bphy_5325     TRUE 0.992 19.000 0.712 NA Y NA
 7090264 7090265 Bphy_5325 Bphy_5326     TRUE 0.963 84.000 0.712 NA Y NA
 7090265 7090266 Bphy_5326 Bphy_5327     FALSE 0.006 345.000 0.000 NA   NA
 7090266 7090267 Bphy_5327 Bphy_5328     FALSE 0.065 172.000 0.000 NA   NA
 7090267 7090268 Bphy_5328 Bphy_5329     TRUE 0.705 41.000 0.036 NA   NA
 7090268 7090269 Bphy_5329 Bphy_5330     FALSE 0.085 159.000 0.000 NA   NA
 7090269 7090270 Bphy_5330 Bphy_5331     FALSE 0.246 93.000 0.000 NA   NA
 7090270 7090271 Bphy_5331 Bphy_5332     FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 7090273 7090274 Bphy_5334 Bphy_5335     FALSE 0.118 143.000 0.000 NA   NA
 7090275 7090276 Bphy_5336 Bphy_5337 glgA   FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
 7090276 7090277 Bphy_5337 Bphy_5338     FALSE 0.020 236.000 0.000 NA   NA
 7090279 7090280 Bphy_5340 Bphy_5341     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090280 7090281 Bphy_5341 Bphy_5342     FALSE 0.083 160.000 0.000 NA   NA
 7090281 7090282 Bphy_5342 Bphy_5343     FALSE 0.015 269.000 0.000 1.000   NA
 7090282 7090283 Bphy_5343 Bphy_5344     FALSE 0.026 219.000 0.000 NA   NA
 7090285 7090286 Bphy_5346 Bphy_5347     TRUE 0.981 -3.000 0.100 NA   NA
 7090286 7090287 Bphy_5347 Bphy_5348     FALSE 0.275 194.000 0.000 1.000 Y NA
 7090287 7090288 Bphy_5348 Bphy_5349   benD FALSE 0.003 411.000 0.000 1.000 N NA
 7090288 7090289 Bphy_5349 Bphy_5350 benD   TRUE 0.986 6.000 0.574 1.000 N NA
 7090289 7090290 Bphy_5350 Bphy_5351     TRUE 0.953 46.000 0.672 0.055 N NA
 7090290 7090291 Bphy_5351 Bphy_5352     TRUE 0.998 -3.000 0.953 0.000 N NA
 7090294 7090295 Bphy_5355 Bphy_5356     FALSE 0.005 347.000 0.000 1.000 N NA
 7090296 7090297 Bphy_5357 Bphy_5358     FALSE 0.014 257.000 0.000 NA   NA
 7090297 7090298 Bphy_5358 Bphy_5359     FALSE 0.524 33.000 0.000 NA   NA
 7090298 7090299 Bphy_5359 Bphy_5360     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 7090299 7090300 Bphy_5360 Bphy_5361     FALSE 0.165 124.000 0.000 NA   NA
 7090300 7090301 Bphy_5361 Bphy_5362     TRUE 0.875 -15.000 0.000 NA   NA
 7090303 7090304 Bphy_5364 Bphy_5365     FALSE 0.329 79.000 0.000 1.000   NA
 7090304 7090305 Bphy_5365 Bphy_5366     FALSE 0.376 53.000 0.000 NA   NA
 7090306 7090307 Bphy_5367 Bphy_5368     TRUE 0.999 -13.000 0.865 0.003 Y NA
 7090307 7090308 Bphy_5368 Bphy_5369     TRUE 0.999 -3.000 0.847 0.062 Y NA
 7090308 7090309 Bphy_5369 Bphy_5370     TRUE 0.999 -7.000 0.922 0.062 Y NA
 7090309 7090310 Bphy_5370 Bphy_5371     TRUE 0.995 0.000 0.854 NA   NA
 7090310 7090311 Bphy_5371 Bphy_5372     TRUE 0.873 89.000 0.640 NA   NA
 7090311 7090312 Bphy_5372 Bphy_5373     FALSE 0.005 342.000 0.000 1.000 N NA
 7090312 7090313 Bphy_5373 Bphy_5374     TRUE 0.825 100.000 0.463 1.000   NA
 7090314 7090315 Bphy_5375 Bphy_5376     TRUE 0.821 118.000 0.098 1.000 Y NA
 7090315 7090316 Bphy_5376 Bphy_5377     TRUE 0.997 -3.000 0.639 0.001   NA
 7090316 7090317 Bphy_5377 Bphy_5378     TRUE 0.988 -3.000 0.194 NA   NA
 7090319 7090320 Bphy_5380 Bphy_5381     FALSE 0.060 171.000 0.000 1.000 N NA
 7090321 7090322 Bphy_5382 Bphy_5383     FALSE 0.058 172.000 0.000 1.000 N NA
 7090322 7090323 Bphy_5383 Bphy_5384     FALSE 0.073 168.000 0.000 NA   NA
 7090323 7090324 Bphy_5384 Bphy_5385     FALSE 0.031 210.000 0.000 NA   NA
 7090324 7090325 Bphy_5385 Bphy_5386     TRUE 0.960 28.000 0.667 NA N NA
 7090325 7090326 Bphy_5386 Bphy_5387     FALSE 0.202 86.000 0.000 NA N NA
 7090326 7090327 Bphy_5387 Bphy_5388     TRUE 0.612 83.000 0.087 NA N NA
 7090328 7090329 Bphy_5389 Bphy_5390     TRUE 0.925 109.000 0.240 0.019 Y NA
 7090329 7090330 Bphy_5390 Bphy_5391     TRUE 0.996 -3.000 0.054 0.007 Y NA
 7090330 7090331 Bphy_5391 Bphy_5392     TRUE 0.999 -3.000 0.587 0.007 Y NA
 7090331 7090332 Bphy_5392 Bphy_5393     TRUE 0.997 -19.000 0.558 1.000 Y NA
 7090332 7090333 Bphy_5393 Bphy_5394     TRUE 0.998 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 7090333 7090334 Bphy_5394 Bphy_5395     TRUE 0.986 43.000 0.600 0.007 Y NA
 7090334 7090335 Bphy_5395 Bphy_5396     FALSE 0.013 254.000 0.000 1.000 N NA
 7090336 7090337 Bphy_5397 Bphy_5398     FALSE 0.437 43.000 0.000 NA   NA
 7090338 7090339 Bphy_5399 Bphy_5400     FALSE 0.205 107.000 0.000 NA   NA
 7090341 7090342 Bphy_5402 Bphy_5403     FALSE 0.464 40.000 0.000 NA   NA
 7090345 7090346 Bphy_5406 Bphy_5407     FALSE 0.217 95.000 0.000 1.000 N NA
 7090348 7090349 Bphy_5409 Bphy_5410     FALSE 0.128 139.000 0.000 NA   NA
 7090350 7090351 Bphy_5411 Bphy_5412     TRUE 0.961 -3.000 0.022 NA   NA
 7090352 7090353 Bphy_5413 Bphy_5414     FALSE 0.386 51.000 0.000 NA   NA
 7090355 7090356 Bphy_5416 Bphy_5417     TRUE 0.955 12.000 0.169 1.000   NA
 7090356 7090357 Bphy_5417 Bphy_5418     TRUE 0.993 -3.000 0.409 NA   NA
 7090359 7090360 Bphy_5420 Bphy_5421     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 7090360 7090361 Bphy_5421 Bphy_5422     FALSE 0.480 27.000 0.000 NA N NA
 7090362 7090363 Bphy_5423 Bphy_5424     TRUE 0.948 44.000 0.130 1.000 Y NA
 7090363 7090364 Bphy_5424 Bphy_5425     TRUE 0.941 41.000 0.080 1.000 Y NA
 7090365 7090366 Bphy_5426 Bphy_5427     TRUE 0.998 -3.000 0.566 1.000 Y NA
 7090366 7090367 Bphy_5427 Bphy_5428     FALSE 0.347 60.000 0.000 NA   NA
 7090367 7090368 Bphy_5428 Bphy_5429     TRUE 0.563 28.000 0.000 NA   NA
 7090368 7090369 Bphy_5429 Bphy_5430     TRUE 0.991 0.000 0.462 1.000 N NA
 7090369 7090370 Bphy_5430 Bphy_5431     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7090370 7090371 Bphy_5431 Bphy_5432     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 7090373 7090374 Bphy_5434 Bphy_5435     TRUE 0.916 81.000 0.160 1.000 Y NA
 7090374 7090375 Bphy_5435 Bphy_5436     TRUE 0.998 7.000 1.000 0.061 Y NA
 7090375 7090376 Bphy_5436 Bphy_5437     TRUE 0.998 0.000 0.333 0.061 Y NA
 7090376 7090377 Bphy_5437 Bphy_5438     TRUE 0.994 19.000 0.714 0.061 Y NA
 7090377 7090378 Bphy_5438 Bphy_5439     TRUE 0.941 38.000 0.571 1.000 N NA
 7090378 7090379 Bphy_5439 Bphy_5440     FALSE 0.033 200.000 0.000 1.000 N NA
 7090379 7090380 Bphy_5440 Bphy_5441     FALSE 0.003 442.000 0.000 NA   NA
 7090380 7090381 Bphy_5441 Bphy_5442     FALSE 0.497 36.000 0.000 NA   NA
 7090383 7090384 Bphy_5444 Bphy_5445     TRUE 0.914 23.000 0.167 1.000 N NA
 7090384 7090385 Bphy_5445 Bphy_5446     TRUE 0.942 23.000 0.292 1.000 N NA
 7090385 7090386 Bphy_5446 Bphy_5447     FALSE 0.433 40.000 0.000 1.000 N NA
 7090387 7090388 Bphy_5448 Bphy_5449     FALSE 0.120 137.000 0.000 1.000 N NA
 7090389 7090390 Bphy_5450 Bphy_5451     FALSE 0.219 80.000 0.000 NA N NA
 7090390 7090391 Bphy_5451 Bphy_5452     FALSE 0.300 52.000 0.000 NA N NA
 7090391 7090392 Bphy_5452 Bphy_5453     FALSE 0.061 159.000 0.000 NA N NA
 7090392 7090393 Bphy_5453 Bphy_5454     TRUE 0.698 77.000 0.114 NA   NA
 7090395 7090396 Bphy_5456 Bphy_5457     FALSE 0.143 133.000 0.000 NA   NA
 7090396 7090397 Bphy_5457 Bphy_5458     FALSE 0.342 61.000 0.000 NA   NA
 7090398 7090399 Bphy_5459 Bphy_5460     TRUE 0.997 -3.000 0.800 0.089 N NA
 7090399 7090400 Bphy_5460 Bphy_5461     TRUE 0.994 -3.000 0.529 NA   NA
 7090400 7090401 Bphy_5461 Bphy_5462     TRUE 0.928 35.000 0.353 NA   NA
 7090401 7090402 Bphy_5462 Bphy_5463     TRUE 0.984 6.000 0.444 NA   NA
 7090402 7090403 Bphy_5463 Bphy_5464     FALSE 0.093 155.000 0.000 NA   NA
 7090403 7090404 Bphy_5464 Bphy_5465     FALSE 0.312 69.000 0.000 NA   NA
 7090404 7090405 Bphy_5465 Bphy_5466     TRUE 0.983 -3.000 0.136 NA N NA
 7090405 7090406 Bphy_5466 Bphy_5467     TRUE 0.937 19.000 0.000 NA Y NA
 7090406 7090407 Bphy_5467 Bphy_5468     TRUE 0.888 38.000 0.222 1.000 N NA
 7090411 7090412 Bphy_5472 Bphy_5473     TRUE 0.988 -7.000 0.267 NA   NA
 7090412 7090413 Bphy_5473 Bphy_5474     FALSE 0.006 327.000 0.000 NA   NA
 7090417 7090418 Bphy_5478 Bphy_5479     TRUE 0.703 12.000 0.000 1.000 N NA
 7090418 7090419 Bphy_5479 Bphy_5480     TRUE 0.888 39.000 0.000 1.000 Y NA
 7090419 7090420 Bphy_5480 Bphy_5481     TRUE 0.843 73.000 0.000 0.070 Y NA
 7090420 7090421 Bphy_5481 Bphy_5482     TRUE 0.912 31.000 0.000 1.000 Y NA
 7090421 7090422 Bphy_5482 Bphy_5483     FALSE 0.091 156.000 0.000 NA   NA
 7090423 7090424 Bphy_5484 Bphy_5485     TRUE 0.997 -3.000 0.719 0.054 N NA
 7090425 7090426 Bphy_5486 Bphy_5487     FALSE 0.167 133.000 0.000 1.000   NA
 7090426 7090427 Bphy_5487 Bphy_5488     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7090427 7090428 Bphy_5488 Bphy_5489     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090428 7090429 Bphy_5489 Bphy_5490     TRUE 0.998 -3.000 0.214 0.002 Y NA
 7090429 7090430 Bphy_5490 Bphy_5491     TRUE 0.997 11.000 0.786 0.002 Y NA
 7090430 7090431 Bphy_5491 Bphy_5492     FALSE 0.040 272.000 0.062 1.000 N NA
 7090431 7090432 Bphy_5492 Bphy_5493     FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 7090432 7090433 Bphy_5493 Bphy_5494     FALSE 0.005 350.000 0.000 NA   NA
 7090433 7090434 Bphy_5494 Bphy_5495     TRUE 0.563 28.000 0.000 NA   NA
 7090434 7090435 Bphy_5495 Bphy_5496     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7090435 7090436 Bphy_5496 Bphy_5497     FALSE 0.053 184.000 0.000 NA   NA
 7090438 7090439 Bphy_5499 Bphy_5500     FALSE 0.195 111.000 0.000 NA   NA
 7090439 7090440 Bphy_5500 Bphy_5501     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090441 7090442 Bphy_5502 Bphy_5503     FALSE 0.312 162.000 0.111 1.000 N NA
 7090442 7090443 Bphy_5503 Bphy_5504     TRUE 0.940 50.000 0.833 1.000 N NA
 7090443 7090444 Bphy_5504 Bphy_5505     TRUE 0.993 2.000 0.600 0.061 N NA
 7090444 7090445 Bphy_5505 Bphy_5506     FALSE 0.302 73.000 0.000 NA   NA
 7090445 7090446 Bphy_5506 Bphy_5507     TRUE 0.958 -3.000 0.016 NA   NA
 7090447 7090448 Bphy_5508 Bphy_5509     FALSE 0.312 69.000 0.000 NA   NA
 7090448 7090449 Bphy_5509 Bphy_5510     FALSE 0.001 794.000 0.000 NA   NA
 7090450 7090451 Bphy_5511 Bphy_5512     FALSE 0.031 210.000 0.000 NA   NA
 7090451 7090452 Bphy_5512 Bphy_5513     TRUE 0.962 27.000 0.600 NA   NA
 7090452 7090453 Bphy_5513 Bphy_5514     FALSE 0.279 83.000 0.000 NA   NA
 7090454 7090455 Bphy_5515 Bphy_5516     TRUE 0.999 -3.000 0.865 0.005 Y NA
 7090455 7090456 Bphy_5516 Bphy_5517     TRUE 0.998 -3.000 0.506 1.000 Y NA
 7090456 7090457 Bphy_5517 Bphy_5518     TRUE 0.975 61.000 0.804 NA Y NA
 7090457 7090458 Bphy_5518 Bphy_5519     FALSE 0.002 502.000 0.000 NA   NA
 7090458 7090459 Bphy_5519 Bphy_5520     TRUE 0.759 72.000 0.167 NA   NA
 7090460 7090461 Bphy_5521 Bphy_5522     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7090463 7090464 Bphy_5524 Bphy_5525     FALSE 0.007 315.000 0.000 NA   NA
 7090464 7090465 Bphy_5525 Bphy_5526     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7090465 7090466 Bphy_5526 Bphy_5527     TRUE 0.970 67.000 0.667 1.000 Y NA
 7090466 7090467 Bphy_5527 Bphy_5528     TRUE 0.985 11.000 0.667 1.000   NA
 7090471 7090472 Bphy_5532 Bphy_5533     FALSE 0.006 331.000 0.000 NA   NA
 7090473 7090474 Bphy_5534 Bphy_5535     FALSE 0.351 59.000 0.000 NA   NA
 7090476 7090477 Bphy_5537 Bphy_5538     FALSE 0.359 57.000 0.000 NA   NA
 7090478 7090479 Bphy_5539 Bphy_5540     TRUE 0.996 -3.000 0.800 NA   NA
 7090479 7090480 Bphy_5540 Bphy_5541     TRUE 0.986 13.000 0.095 0.072 Y NA
 7090481 7088032 Bphy_5542 Bphy_3102     FALSE 0.217 103.000 0.000 NA   NA
 7090483 7090484 Bphy_5544 Bphy_5545     FALSE 0.002 572.000 0.000 1.000 N NA
 7090485 7090486 Bphy_5546 Bphy_5547     FALSE 0.125 140.000 0.000 NA   NA
 7090487 7090488 Bphy_5548 Bphy_5549     TRUE 0.798 66.000 0.000 NA Y NA
 7090488 7090489 Bphy_5549 Bphy_5550     FALSE 0.174 97.000 0.000 NA N NA
 7090491 7090492 Bphy_5552 Bphy_5553     FALSE 0.007 325.000 0.000 NA   NA
 7090494 7090495 Bphy_5555 Bphy_5556     TRUE 0.676 82.000 0.105 NA   NA
 7090495 7090496 Bphy_5556 Bphy_5557     FALSE 0.382 52.000 0.000 NA   NA
 7090496 7090497 Bphy_5557 Bphy_5558     TRUE 0.614 22.000 0.000 NA   NA
 7090500 7090501 Bphy_R0081 Bphy_5561     FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7090501 7090502 Bphy_5561 Bphy_5562     FALSE 0.008 312.000 0.000 NA   NA
 7090503 7090504 Bphy_5563 Bphy_5564     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7090504 7090505 Bphy_5564 Bphy_5565     TRUE 0.982 0.000 0.172 NA   NA
 7090506 7090507 Bphy_5566 Bphy_5567     TRUE 0.833 36.000 0.105 1.000 N NA
 7090507 7090508 Bphy_5567 Bphy_5568     TRUE 0.853 73.000 0.439 NA N NA
 7090508 7090509 Bphy_5568 Bphy_5569     FALSE 0.079 147.000 0.000 NA N NA
 7090509 7090510 Bphy_5569 Bphy_5570     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 7090513 7090514 Bphy_5573 Bphy_5574     FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 7090514 7090515 Bphy_5574 Bphy_5575     FALSE 0.013 254.000 0.000 1.000 N NA
 7090517 7090518 Bphy_5577 Bphy_5578     FALSE 0.035 213.000 0.000 1.000   NA
 7090518 7090519 Bphy_5578 Bphy_5579     FALSE 0.003 467.000 0.000 1.000   NA
 7090519 7090520 Bphy_5579 Bphy_5580     TRUE 0.984 4.000 0.356 NA   NA
 7090520 7090521 Bphy_5580 Bphy_5581     TRUE 0.980 19.000 0.911 NA   NA
 7090521 7090522 Bphy_5581 Bphy_5582     TRUE 0.983 3.000 0.293 NA   NA
 7090526 7090527 Bphy_5586 Bphy_5587     TRUE 0.997 4.000 0.453 0.001 Y NA
 7090527 7090528 Bphy_5587 Bphy_5588   sdhA TRUE 0.998 5.000 0.705 0.001 Y NA
 7090528 7090529 Bphy_5588 Bphy_5589 sdhA sdhB TRUE 0.991 32.000 0.604 0.001 Y NA
 7090529 7090530 Bphy_5589 Bphy_5590 sdhB   TRUE 0.980 0.000 0.151 NA   NA
 7090530 7090531 Bphy_5590 Bphy_5591     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 7090531 7090532 Bphy_5591 Bphy_5592     FALSE 0.157 262.000 0.000 0.007 Y NA
 7090535 7090536 Bphy_5595 Bphy_5596     TRUE 0.938 107.000 0.591 NA Y NA
 7090536 7090537 Bphy_5596 Bphy_5597     TRUE 0.995 20.000 0.765 0.005 Y NA
 7090537 7090538 Bphy_5597 Bphy_5598     TRUE 0.696 48.000 0.059 1.000 N NA
 7090539 7090540 Bphy_5599 Bphy_5600     TRUE 0.766 27.000 0.000 0.067   NA
 7090541 7090542 Bphy_5601 Bphy_5602     TRUE 0.922 32.000 0.286 1.000 N NA
 7090542 7090543 Bphy_5602 Bphy_5603     FALSE 0.285 194.000 0.250 1.000 N NA
 7090544 7090545 Bphy_5604 Bphy_5605     FALSE 0.023 227.000 0.000 NA   NA
 7090545 7090546 Bphy_5605 Bphy_5606     FALSE 0.003 421.000 0.000 NA   NA
 7090549 7090550 Bphy_5609 Bphy_5610     FALSE 0.002 631.000 0.000 1.000 N NA
 7090550 7090551 Bphy_5610 Bphy_5611     TRUE 0.986 -3.000 0.167 NA   NA
 7090551 7090552 Bphy_5611 Bphy_5612     TRUE 0.975 -10.000 0.100 NA   NA
 7090552 7090553 Bphy_5612 Bphy_5613     FALSE 0.002 465.000 0.000 1.000 N NA
 7090553 7090554 Bphy_5613 Bphy_5614     FALSE 0.459 46.000 0.000 1.000   NA
 7090554 7090555 Bphy_5614 Bphy_5615     FALSE 0.007 332.000 0.000 1.000   NA
 7090555 7090556 Bphy_5615 Bphy_5616     FALSE 0.004 419.000 0.000 1.000   NA
 7090556 7090557 Bphy_5616 Bphy_5617     FALSE 0.067 171.000 0.000 NA   NA
 7090558 7090559 Bphy_5618 Bphy_5619     TRUE 0.655 98.000 0.148 1.000 N NA
 7090559 7090560 Bphy_5619 Bphy_5620     FALSE 0.299 185.000 0.185 NA   NA
 7090560 7090561 Bphy_5620 Bphy_5621     TRUE 0.954 45.000 1.000 NA   NA
 7090561 7090562 Bphy_5621 Bphy_5622     TRUE 0.963 36.000 0.875 NA   NA
 7090562 7090563 Bphy_5622 Bphy_5623     TRUE 0.995 14.000 0.625 0.044 Y NA
 7090563 7090564 Bphy_5623 Bphy_5624     TRUE 0.967 31.000 0.857 1.000 N NA
 7090564 7090565 Bphy_5624 Bphy_5625     TRUE 0.974 -3.000 0.062 NA   NA
 7090565 7090566 Bphy_5625 Bphy_5626     TRUE 0.974 -3.000 0.062 NA   NA
 7090566 7090567 Bphy_5626 Bphy_5627     FALSE 0.309 70.000 0.000 NA   NA
 7090567 7090568 Bphy_5627 Bphy_5628     FALSE 0.004 368.000 0.000 NA   NA
 7090568 7090569 Bphy_5628 Bphy_5629     FALSE 0.001 722.000 0.000 1.000 N NA
 7090569 7090570 Bphy_5629 Bphy_5630     TRUE 0.978 10.000 0.000 0.012 Y NA
 7090571 7090572 Bphy_5631 Bphy_5632     FALSE 0.037 199.000 0.000 NA   NA
 7090572 7090573 Bphy_5632 Bphy_5633     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.000 Y NA
 7090574 7090575 Bphy_5634 Bphy_5635     TRUE 0.992 3.000 0.778 NA   NA
 7090575 7090576 Bphy_5635 Bphy_5636     FALSE 0.133 137.000 0.000 NA   NA
 7090576 7090577 Bphy_5636 Bphy_5637     TRUE 0.748 134.000 0.600 1.000 N NA
 7090577 7090578 Bphy_5637 Bphy_5638     TRUE 0.969 -3.000 0.047 1.000 N NA
 7090578 7090579 Bphy_5638 Bphy_5639     TRUE 0.628 43.000 0.019 1.000 N NA
 7090579 7090580 Bphy_5639 Bphy_5640     FALSE 0.176 119.000 0.000 NA   NA
 7090581 7090582 Bphy_5641 Bphy_5642 glcF glcE TRUE 0.945 14.000 0.074 0.044   NA
 7090582 7090583 Bphy_5642 Bphy_5643 glcE   TRUE 0.982 0.000 0.070 0.012   NA
 7090585 7090586 Bphy_5645 Bphy_5646     FALSE 0.008 310.000 0.000 NA   NA
 7090588 7090589 Bphy_5648 Bphy_5649     FALSE 0.003 433.000 0.000 NA   NA
 7090592 7090593 Bphy_5652 Bphy_5653     FALSE 0.050 186.000 0.000 NA   NA
 7090594 7090595 Bphy_5654 Bphy_5655     FALSE 0.532 112.000 0.109 NA N NA
 7090598 7090599 Bphy_5658 Bphy_5659     TRUE 0.932 34.000 0.413 NA N NA
 7090599 7090600 Bphy_5659 Bphy_5660     TRUE 0.962 44.000 0.676 0.000 N NA
 7090600 7090601 Bphy_5660 Bphy_5661     TRUE 0.832 33.000 0.088 1.000 N NA
 7090601 7090602 Bphy_5661 Bphy_5662     FALSE 0.115 139.000 0.000 1.000 N NA
 7090602 7090603 Bphy_5662 Bphy_5663     FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 7090603 7090604 Bphy_5663 Bphy_5664     TRUE 0.675 119.000 0.250 NA   NA
 7090604 7090605 Bphy_5664 Bphy_5665     FALSE 0.497 36.000 0.000 NA   NA
 7090607 7090608 Bphy_5667 Bphy_5668     TRUE 0.791 74.000 0.231 1.000 N NA
 7090608 7090609 Bphy_5668 Bphy_5669     TRUE 0.998 -10.000 0.387 0.072 Y NA
 7090612 7090613 Bphy_5672 Bphy_5673     FALSE 0.001 796.000 0.000 NA   NA
 7090617 7090618 Bphy_5677 Bphy_5678     FALSE 0.174 120.000 0.000 NA   NA
 7090618 7090619 Bphy_5678 Bphy_5679     FALSE 0.208 106.000 0.000 NA   NA
 7090619 7090620 Bphy_5679 Bphy_5680     FALSE 0.011 336.000 0.000 0.099 N NA
 7090621 7090622 Bphy_5681 Bphy_5682     FALSE 0.013 262.000 0.000 NA   NA
 7090623 7090624 Bphy_5683 Bphy_5684     FALSE 0.444 48.000 0.000 1.000   NA
 7090628 7090629 Bphy_5688 Bphy_5689     FALSE 0.100 151.000 0.000 NA   NA
 7090630 7090631 Bphy_5690 Bphy_5691     FALSE 0.020 236.000 0.000 NA   NA
 7090631 7090632 Bphy_5691 Bphy_5692     FALSE 0.203 246.000 0.235 0.022   NA
 7090632 7090633 Bphy_5692 Bphy_5693     TRUE 0.996 -10.000 0.118 0.022 Y NA
 7090633 7090634 Bphy_5693 Bphy_5694     FALSE 0.012 357.000 0.000 0.022 N NA
 7090634 7090635 Bphy_5694 Bphy_5695     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 7090636 7090637 Bphy_5696 Bphy_5697     TRUE 0.992 31.000 0.750 0.054 Y NA
 7090637 7090638 Bphy_5697 Bphy_5698     TRUE 0.994 -7.000 0.083 1.000 Y NA
 7090639 7090640 Bphy_5699 Bphy_5700     FALSE 0.306 71.000 0.000 NA   NA
 7090641 7090642 Bphy_5701 Bphy_5702     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7090642 7090643 Bphy_5702 Bphy_5703     FALSE 0.017 236.000 0.000 1.000 N NA
 7090643 7090644 Bphy_5703 Bphy_5704     TRUE 0.999 -3.000 0.423 0.054 Y NA
 7090644 7090645 Bphy_5704 Bphy_5705     TRUE 0.996 -3.000 0.545 0.016   NA
 7090645 7090646 Bphy_5705 Bphy_5706     TRUE 0.596 57.000 0.000 0.054   NA
 7090647 7090648 Bphy_5707 Bphy_5708     FALSE 0.067 171.000 0.000 NA   NA
 7090648 7090649 Bphy_5708 Bphy_5709     FALSE 0.437 43.000 0.000 NA   NA
 7090649 7090650 Bphy_5709 Bphy_5710     FALSE 0.172 121.000 0.000 NA   NA
 7090650 7090651 Bphy_5710 Bphy_5711     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090653 7090654 Bphy_5713 Bphy_5714     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090654 7090655 Bphy_5714 Bphy_5715     TRUE 0.865 1.000 0.000 NA   NA
 7090657 7090658 Bphy_5717 Bphy_5718     FALSE 0.017 257.000 0.000 1.000   NA
 7090658 7090659 Bphy_5718 Bphy_5719     FALSE 0.134 145.000 0.000 1.000   NA
 7090659 7090660 Bphy_5719 Bphy_5720     FALSE 0.017 257.000 0.000 1.000   NA
 7090660 7090661 Bphy_5720 Bphy_5721     TRUE 0.776 113.000 0.400 1.000   NA
 7090661 7090662 Bphy_5721 Bphy_5722     TRUE 0.941 15.000 0.167 NA   NA
 7090662 7090663 Bphy_5722 Bphy_5723     TRUE 0.984 -6.000 0.167 NA   NA
 7090663 7090664 Bphy_5723 Bphy_5724     TRUE 0.762 105.000 0.333 NA   NA
 7090664 7090665 Bphy_5724 Bphy_5725     TRUE 0.993 -18.000 0.667 NA   NA
 7090665 7090666 Bphy_5725 Bphy_5726     TRUE 0.839 55.000 0.222 NA   NA
 7090666 7090667 Bphy_5726 Bphy_5727     TRUE 0.941 27.000 0.333 NA   NA
 7090668 7090669 Bphy_5728 Bphy_5729     TRUE 0.796 7.000 0.000 NA   NA
 7090669 7090670 Bphy_5729 Bphy_5730     FALSE 0.294 77.000 0.000 NA   NA
 7090670 7090671 Bphy_5730 Bphy_5731     TRUE 0.622 21.000 0.000 NA   NA
 7090671 7090672 Bphy_5731 Bphy_5732     FALSE 0.001 794.000 0.000 NA   NA
 7090672 7090673 Bphy_5732 Bphy_5733     FALSE 0.058 187.000 0.000 1.000   NA
 7090673 7090674 Bphy_5733 Bphy_5734     FALSE 0.002 572.000 0.000 NA   NA
 7090674 7090675 Bphy_5734 Bphy_5735     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7090675 7090676 Bphy_5735 Bphy_5736     FALSE 0.008 311.000 0.000 NA   NA
 7090676 7090677 Bphy_5736 Bphy_5737     FALSE 0.390 50.000 0.000 NA   NA
 7090677 7090678 Bphy_5737 Bphy_5738     TRUE 0.664 17.000 0.000 NA   NA
 7090678 7090679 Bphy_5738 Bphy_5739     FALSE 0.487 37.000 0.000 NA   NA
 7090679 7090680 Bphy_5739 Bphy_5740     FALSE 0.007 325.000 0.000 NA   NA
 7090680 7090681 Bphy_5740 Bphy_5741     FALSE 0.060 176.000 0.000 NA   NA
 7090681 7090682 Bphy_5741 Bphy_5742     FALSE 0.320 67.000 0.000 NA   NA
 7090682 7090683 Bphy_5742 Bphy_5743     TRUE 0.945 8.000 0.087 NA   NA
 7090683 7090684 Bphy_5743 Bphy_5744     TRUE 0.563 28.000 0.000 NA   NA
 7090684 7090685 Bphy_5744 Bphy_5745     FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7090687 7090688 Bphy_5747 Bphy_5748     FALSE 0.328 65.000 0.000 NA   NA
 7090688 7090689 Bphy_5748 Bphy_5749     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090689 7090690 Bphy_5749 Bphy_5750     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090690 7090691 Bphy_5750 Bphy_5751     FALSE 0.018 241.000 0.000 NA   NA
 7090691 7090692 Bphy_5751 Bphy_5752     FALSE 0.002 500.000 0.000 NA   NA
 7090692 7090693 Bphy_5752 Bphy_5753     FALSE 0.087 158.000 0.000 NA   NA
 7090693 7090694 Bphy_5753 Bphy_5754     FALSE 0.487 37.000 0.000 NA   NA
 7090694 7090695 Bphy_5754 Bphy_5755     FALSE 0.359 57.000 0.000 NA   NA
 7090695 7090696 Bphy_5755 Bphy_5756     TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 7090696 7090697 Bphy_5756 Bphy_5757     FALSE 0.001 946.000 0.000 NA   NA
 7090697 7090698 Bphy_5757 Bphy_5758     FALSE 0.004 397.000 0.000 NA   NA
 7090698 7090699 Bphy_5758 Bphy_5759     TRUE 0.892 88.000 0.800 1.000 N NA
 7090699 7090700 Bphy_5759 Bphy_5760     TRUE 0.901 26.000 0.154 1.000 N NA
 7090702 7090703 Bphy_5762 Bphy_5763     FALSE 0.235 71.000 0.000 NA N NA
 7090706 7090707 Bphy_5766 Bphy_5767     TRUE 0.776 23.000 0.008 1.000   NA
 7090707 7090708 Bphy_5767 Bphy_5768     FALSE 0.130 138.000 0.000 NA   NA
 7090708 7090709 Bphy_5768 Bphy_5769     FALSE 0.002 488.000 0.000 NA   NA
 7090709 7090710 Bphy_5769 Bphy_5770     FALSE 0.151 123.000 0.000 1.000 N NA
 7090710 7090711 Bphy_5770 Bphy_5771     FALSE 0.151 129.000 0.000 NA   NA
 7090711 7090712 Bphy_5771 Bphy_5772     FALSE 0.004 380.000 0.000 NA   NA
 7090712 7090713 Bphy_5772 Bphy_5773     FALSE 0.201 216.000 0.000 1.000 Y NA
 7090714 7090715 Bphy_5774 Bphy_5775     FALSE 0.445 42.000 0.000 NA   NA
 7090716 7090717 Bphy_5776 Bphy_5777     FALSE 0.072 161.000 0.000 1.000 N NA
 7090717 7090718 Bphy_5777 Bphy_5778     FALSE 0.106 143.000 0.000 1.000 N NA
 7090718 7090719 Bphy_5778 Bphy_5779     FALSE 0.050 334.000 0.000 1.000 Y NA
 7090719 7090720 Bphy_5779 Bphy_5780     TRUE 0.846 48.000 0.182 1.000   NA
 7090720 7090721 Bphy_5780 Bphy_5781     FALSE 0.491 42.000 0.000 1.000   NA
 7090723 7090724 Bphy_5783 Bphy_5784     FALSE 0.008 307.000 0.000 NA   NA
 7090726 7090727 Bphy_5786 Bphy_5787     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 7090728 7090729 Bphy_5788 Bphy_5789     FALSE 0.203 108.000 0.000 NA   NA
 7090730 7090731 Bphy_5790 Bphy_5791     TRUE 0.948 13.000 0.154 1.000   NA
 7090731 7090732 Bphy_5791 Bphy_5792     TRUE 0.983 -10.000 0.154 1.000   NA
 7090732 7090733 Bphy_5792 Bphy_5793     TRUE 0.948 29.000 0.400 1.000   NA
 7090733 7090734 Bphy_5793 Bphy_5794     TRUE 0.870 31.000 0.118 NA   NA
 7090734 7090735 Bphy_5794 Bphy_5795     TRUE 0.949 13.000 0.176 NA   NA
 7090735 7090736 Bphy_5795 Bphy_5796     TRUE 0.947 23.000 0.333 1.000 N NA
 7090736 7090737 Bphy_5796 Bphy_5797     FALSE 0.434 131.000 0.079 NA   NA
 7090737 7090738 Bphy_5797 Bphy_5798     TRUE 0.686 78.000 0.105 NA   NA
 7090738 7090739 Bphy_5798 Bphy_5799     TRUE 0.887 32.000 0.167 1.000 N NA
 7090739 7090740 Bphy_5799 Bphy_5800     TRUE 0.995 -3.000 0.714 NA   NA
 7090740 7090741 Bphy_5800 Bphy_5801     TRUE 0.754 63.000 0.129 NA   NA
 7090741 7090742 Bphy_5801 Bphy_5802     TRUE 0.553 94.000 0.065 NA   NA
 7090742 7090743 Bphy_5802 Bphy_5803     FALSE 0.002 568.000 0.000 1.000 N NA
 7090744 7090745 Bphy_5804 Bphy_5805     FALSE 0.072 151.000 0.000 NA N NA
 7090746 7090747 Bphy_5806 Bphy_5807     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7090747 7090748 Bphy_5807 Bphy_5808     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7090749 7090750 Bphy_5809 Bphy_5810     FALSE 0.014 258.000 0.000 NA   NA
 7090750 7090751 Bphy_5810 Bphy_5811     FALSE 0.005 349.000 0.000 NA   NA
 7090751 7090752 Bphy_5811 Bphy_5812     TRUE 0.975 14.000 0.333 0.098   NA
 7090752 7090753 Bphy_5812 Bphy_5813     TRUE 0.691 113.000 0.111 0.018   NA
 7090753 7090754 Bphy_5813 Bphy_5814     FALSE 0.008 318.000 0.000 1.000   NA
 7090754 7090755 Bphy_5814 Bphy_5815     TRUE 0.810 26.000 0.000 0.005   NA
 7090756 7090757 Bphy_5816 Bphy_5817     FALSE 0.247 104.000 0.000 1.000   NA
 7090757 7090758 Bphy_5817 Bphy_5818     FALSE 0.385 61.000 0.000 1.000   NA
 7090759 7090760 Bphy_5819 Bphy_5820     FALSE 0.104 144.000 0.000 1.000 N NA
 7090761 7090762 Bphy_5821 Bphy_5822     FALSE 0.019 289.000 0.000 0.066 N NA
 7090764 7090765 Bphy_5824 Bphy_5825     TRUE 0.998 6.000 0.615 0.003 Y NA
 7090765 7090766 Bphy_5825 Bphy_5826     TRUE 0.998 3.000 0.444 0.003 Y NA
 7090766 7090767 Bphy_5826 Bphy_5827     TRUE 0.999 -3.000 0.444 0.053 Y NA
 7090768 7090769 Bphy_5828 Bphy_5829     TRUE 0.995 -3.000 0.586 NA   NA
 7090769 7090770 Bphy_5829 Bphy_5830     FALSE 0.026 219.000 0.000 NA   NA
 7090770 7090771 Bphy_5830 Bphy_5831     FALSE 0.239 95.000 0.000 NA   NA
 7090774 7090775 Bphy_5834 Bphy_5835     FALSE 0.008 303.000 0.000 NA   NA
 7090775 7090776 Bphy_5835 Bphy_5836     TRUE 0.983 -3.000 0.118 NA   NA
 7090776 7090777 Bphy_5836 Bphy_5837   pdxA TRUE 0.968 10.000 0.235 NA   NA
 7090777 7090778 Bphy_5837 Bphy_5838 pdxA   TRUE 0.711 70.000 0.120 1.000 N NA
 7090778 7090779 Bphy_5838 Bphy_5839     FALSE 0.084 154.000 0.000 1.000 N NA
 7090779 7090780 Bphy_5839 Bphy_5840     FALSE 0.547 77.000 0.037 NA   NA
 7090781 7090782 Bphy_5841 Bphy_5842     TRUE 0.930 20.000 0.167 1.000   NA
 7090785 7090786 Bphy_5845 Bphy_5846     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 7090786 7090787 Bphy_5846 Bphy_5847     FALSE 0.126 148.000 0.000 1.000   NA
 7090788 7090789 Bphy_5848 Bphy_5849     FALSE 0.427 44.000 0.000 NA   NA
 7090789 7090790 Bphy_5849 Bphy_5850     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA N NA
 7090793 7090794 Bphy_5853 Bphy_5854     FALSE 0.437 43.000 0.000 NA   NA
 7090795 7090796 Bphy_5855 Bphy_5856     FALSE 0.002 476.000 0.000 NA   NA
 7090796 7090797 Bphy_5856 Bphy_5857     FALSE 0.138 135.000 0.000 NA   NA
 7090798 7090799 Bphy_5858 Bphy_5859     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7090800 7090801 Bphy_5860 Bphy_5861     FALSE 0.325 81.000 0.000 1.000   NA
 7090802 7090803 Bphy_5862 Bphy_5863     FALSE 0.002 748.000 0.000 NA   NA
 7090804 7090805 Bphy_5864 Bphy_5865     TRUE 0.867 -21.000 0.000 NA   NA
 7090807 7090808 Bphy_5867 Bphy_5868     TRUE 0.614 22.000 0.000 NA   NA
 7090811 7090812 Bphy_5871 Bphy_5872     FALSE 0.002 513.000 0.000 NA   NA
 7090812 7090813 Bphy_5872 Bphy_5873   actP TRUE 0.995 -3.000 0.684 NA   NA
 7090813 7090814 Bphy_5873 Bphy_5874 actP   FALSE 0.002 2640.000 0.000 1.000   NA
 7090814 7090815 Bphy_5874 Bphy_5875     TRUE 0.714 97.000 0.208 1.000 N NA
 7090815 7090816 Bphy_5875 Bphy_5876     FALSE 0.530 147.000 0.264 NA N NA
 7090816 7090817 Bphy_5876 Bphy_5877     TRUE 0.972 30.000 0.188 NA Y NA
 7090817 7090818 Bphy_5877 Bphy_5878     TRUE 0.999 -3.000 0.812 0.000 Y NA
 7090819 7090820 Bphy_5879 Bphy_5880     FALSE 0.497 36.000 0.000 NA   NA
 7090820 7090821 Bphy_5880 Bphy_5881     TRUE 0.932 19.000 0.188 1.000 N NA
 7090822 7090823 Bphy_5882 Bphy_5883     FALSE 0.464 40.000 0.000 NA   NA
 7090823 7090824 Bphy_5883 Bphy_5884     FALSE 0.012 271.000 0.000 NA   NA
 7090824 7090825 Bphy_5884 Bphy_5885     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 7090825 7090826 Bphy_5885 Bphy_5886     FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 7090827 7090828 Bphy_5887 Bphy_5888     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 7090828 7090829 Bphy_5888 Bphy_5889     FALSE 0.003 431.000 0.000 1.000 N NA
 7090831 7090832 Bphy_5891 Bphy_5892     TRUE 0.896 82.000 0.667 1.000   NA
 7090834 7090835 Bphy_5894 Bphy_5895     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7090835 7090836 Bphy_5895 Bphy_5896     FALSE 0.286 81.000 0.000 NA   NA
 7090836 7090837 Bphy_5896 Bphy_5897     FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 7090837 7090838 Bphy_5897 Bphy_5898     FALSE 0.165 124.000 0.000 NA   NA
 7090838 7090839 Bphy_5898 Bphy_5899     FALSE 0.003 405.000 0.000 NA   NA
 7090839 7090840 Bphy_5899 Bphy_5900     FALSE 0.001 1065.000 0.000 1.000 N NA
 7090840 7090841 Bphy_5900 Bphy_5901     TRUE 0.999 2.000 0.882 0.060 Y NA
 7090841 7090842 Bphy_5901 Bphy_5902     TRUE 0.976 32.000 0.281 NA Y NA
 7090842 7090843 Bphy_5902 Bphy_5903     TRUE 0.979 47.000 0.737 NA Y NA
 7090844 7090845 Bphy_5904 Bphy_5905     TRUE 0.996 -3.000 0.800 1.000 N NA
 7090845 7090846 Bphy_5905 Bphy_5906     TRUE 0.992 2.000 0.667 1.000   NA
 7090846 7090847 Bphy_5906 Bphy_5907     FALSE 0.006 358.000 0.000 1.000   NA
 7090849 7090850 Bphy_5909 Bphy_5910     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7090850 7090851 Bphy_5910 Bphy_5911     FALSE 0.275 84.000 0.000 NA   NA
 7090851 7090852 Bphy_5911 Bphy_5912     TRUE 0.682 135.000 0.000 0.021 Y NA
 7090852 7090853 Bphy_5912 Bphy_5913   purU FALSE 0.006 325.000 0.000 1.000 N NA
 7090853 7090854 Bphy_5913 Bphy_5914 purU   TRUE 0.646 72.000 0.078 1.000 N NA
 7090854 7090855 Bphy_5914 Bphy_5915     TRUE 0.996 15.000 0.750 0.001 Y NA
 7090855 7090856 Bphy_5915 Bphy_5916     TRUE 0.997 1.000 0.875 0.001   NA
 7090856 7090857 Bphy_5916 Bphy_5917     TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.001   NA
 7090857 7090858 Bphy_5917 Bphy_5918     TRUE 0.624 96.000 0.095 1.000   NA
 7090858 7090859 Bphy_5918 Bphy_5919     TRUE 0.967 51.000 0.381 1.000 Y NA
 7090859 7090860 Bphy_5919 Bphy_5920     TRUE 0.994 -12.000 0.114 1.000 Y NA
 7090860 7090861 Bphy_5920 Bphy_5921     TRUE 0.995 16.000 0.901 1.000 Y NA
 7090861 7090862 Bphy_5921 Bphy_5922     TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7090862 7090863 Bphy_5922 Bphy_5923     FALSE 0.532 28.000 0.000 1.000 N NA
 7090864 7090865 Bphy_5924 Bphy_5925     TRUE 0.829 47.000 0.173 1.000 N NA
 7090865 7090866 Bphy_5925 Bphy_5926     TRUE 0.915 50.000 0.058 1.000 Y NA
 7090866 7090867 Bphy_5926 Bphy_5927     TRUE 0.991 12.000 0.140 0.001 Y NA
 7090867 7090868 Bphy_5927 Bphy_5928     TRUE 0.888 50.000 0.000 0.066 Y NA
 7090868 7090869 Bphy_5928 Bphy_5929     TRUE 0.865 68.000 0.269 0.066 N NA
 7090869 7090870 Bphy_5929 Bphy_5930     TRUE 0.935 47.000 0.032 0.016 Y NA
 7090872 7090873 Bphy_5932 Bphy_5933     TRUE 0.996 -3.000 0.129 1.000 Y NA
 7090873 7090874 Bphy_5933 Bphy_5934     TRUE 0.985 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7090874 7090875 Bphy_5934 Bphy_5935     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7090876 7090877 Bphy_5936 Bphy_5937     TRUE 0.992 -10.000 0.485 1.000   NA
 7090877 7090878 Bphy_5937 Bphy_5938     TRUE 0.726 31.000 0.008 1.000   NA
 7090879 7090880 Bphy_5939 Bphy_5940     TRUE 0.983 -3.000 0.107 1.000   NA
 7090880 7090881 Bphy_5940 Bphy_5941     TRUE 0.974 3.000 0.140 1.000   NA
 7090881 7090882 Bphy_5941 Bphy_5942     TRUE 0.971 0.000 0.093 1.000 N NA
 7090884 7090885 Bphy_5944 Bphy_5945     TRUE 0.995 0.000 0.154 NA Y NA
 7090885 7090886 Bphy_5945 Bphy_5946     TRUE 0.995 2.000 0.198 1.000 Y NA
 7090886 7090887 Bphy_5946 Bphy_5947     TRUE 0.984 -25.000 0.233 1.000   NA
 7090887 7090888 Bphy_5947 Bphy_5948     TRUE 0.816 8.000 0.000 1.000   NA
 7090888 7090889 Bphy_5948 Bphy_5949     FALSE 0.357 68.000 0.000 1.000   NA
 7090889 7090890 Bphy_5949 Bphy_5950     FALSE 0.050 193.000 0.000 1.000   NA
 7090891 7090892 Bphy_5951 Bphy_5952     TRUE 0.938 15.000 0.074 0.010 N NA
 7090892 7090893 Bphy_5952 Bphy_5953     TRUE 0.611 48.000 0.011 1.000   NA
 7090894 7090895 Bphy_5954 Bphy_5955     FALSE 0.197 241.000 0.000 0.048 Y NA
 7090895 7090896 Bphy_5955 Bphy_5956     FALSE 0.023 219.000 0.000 1.000 N NA
 7090896 7090897 Bphy_5956 Bphy_5957     TRUE 0.999 0.000 0.800 0.016 Y NA
 7090897 7090898 Bphy_5957 Bphy_5958     TRUE 0.978 -3.000 0.069 1.000   NA
 7090898 7090899 Bphy_5958 Bphy_5959     TRUE 0.842 31.000 0.071 1.000   NA
 7090899 7090900 Bphy_5959 Bphy_5960     TRUE 0.730 163.000 0.107 0.044 Y NA
 7090900 7090901 Bphy_5960 Bphy_5961     FALSE 0.068 165.000 0.000 1.000 N NA
 7090902 7090903 Bphy_5962 Bphy_5963     TRUE 0.973 16.000 0.543 NA   NA
 7090903 7090904 Bphy_5963 Bphy_5964     FALSE 0.055 182.000 0.000 NA   NA
 7090904 7090905 Bphy_5964 Bphy_5965     TRUE 0.911 12.000 0.062 NA   NA
 7090905 7090906 Bphy_5965 Bphy_5966     FALSE 0.121 142.000 0.000 NA   NA
 7090909 7090910 Bphy_5969 Bphy_5970     FALSE 0.454 41.000 0.000 NA   NA
 7090910 7090911 Bphy_5970 Bphy_5971     FALSE 0.353 178.000 0.000 1.000 Y NA
 7090912 7090913 Bphy_5972 Bphy_5973     FALSE 0.043 192.000 0.000 NA   NA
 7090913 7090914 Bphy_5973 Bphy_5974     FALSE 0.013 260.000 0.000 NA   NA
 7090914 7090915 Bphy_5974 Bphy_5975     TRUE 0.975 10.000 0.000 0.071 Y NA
 7090916 7090917 Bphy_5976 Bphy_5977     FALSE 0.332 64.000 0.000 NA   NA
 7090918 7090919 Bphy_5978 Bphy_5979     TRUE 0.927 67.000 0.920 NA   NA
 7090919 7090920 Bphy_5979 Bphy_5980     TRUE 0.704 69.000 0.104 NA   NA
 7090920 7090921 Bphy_5980 Bphy_5981     TRUE 0.881 76.000 0.556 NA   NA
 7090921 7090922 Bphy_5981 Bphy_5982     TRUE 0.988 -10.000 0.300 NA   NA
 7090922 7090923 Bphy_5982 Bphy_5983     TRUE 0.988 -45.000 0.400 NA   NA
 7090923 7090924 Bphy_5983 Bphy_5984     TRUE 0.961 12.000 0.233 NA   NA
 7090924 7090925 Bphy_5984 Bphy_5985     TRUE 0.962 5.000 0.116 NA   NA
 7090925 7090926 Bphy_5985 Bphy_5986     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7090926 7090927 Bphy_5986 Bphy_5987     TRUE 0.919 23.000 0.174 NA   NA
 7090927 7090928 Bphy_5987 Bphy_5988     FALSE 0.427 44.000 0.000 NA   NA
 7090928 7090929 Bphy_5988 Bphy_5989     TRUE 0.698 14.000 0.000 NA   NA
 7090929 7090930 Bphy_5989 Bphy_5990     TRUE 0.952 32.000 0.583 1.000 N NA
 7090930 7090931 Bphy_5990 Bphy_5991     TRUE 0.979 9.000 0.400 1.000 N NA
 7090931 7090932 Bphy_5991 Bphy_5992     TRUE 0.990 -3.000 0.267 1.000 N NA
 7090932 7090933 Bphy_5992 Bphy_5993     TRUE 0.992 -3.000 0.364 NA   NA
 7090933 7090934 Bphy_5993 Bphy_5994     TRUE 0.990 -3.000 0.256 NA   NA
 7090934 7090935 Bphy_5994 Bphy_5995     TRUE 0.920 62.000 0.744 NA   NA
 7090935 7090936 Bphy_5995 Bphy_5996     TRUE 0.795 89.000 0.300 NA   NA
 7090936 7090937 Bphy_5996 Bphy_5997     TRUE 0.987 -3.000 0.176 NA   NA
 7090937 7090938 Bphy_5997 Bphy_5998     FALSE 0.087 158.000 0.000 NA   NA
 7090938 7090939 Bphy_5998 Bphy_5999     FALSE 0.033 216.000 0.000 1.000   NA
 7090939 7090940 Bphy_5999 Bphy_6000     FALSE 0.110 147.000 0.000 NA   NA
 7090941 7090942 Bphy_6001 Bphy_6002     FALSE 0.093 155.000 0.000 NA   NA
 7090942 7090943 Bphy_6002 Bphy_6003     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 7090943 7090944 Bphy_6003 Bphy_6004     FALSE 0.002 702.000 0.000 NA   NA
 7090945 7090946 Bphy_6005 Bphy_6006     TRUE 0.588 25.000 0.000 NA   NA
 7090946 7090947 Bphy_6006 Bphy_6007     TRUE 0.978 19.000 0.057 0.042 Y NA
 7090949 7090950 Bphy_6009 Bphy_6010     TRUE 0.991 -3.000 0.286 1.000 N NA
 7090951 7090952 Bphy_6011 Bphy_6012     TRUE 0.909 55.000 0.357 0.060 N NA
 7090952 7090953 Bphy_6012 Bphy_6013     FALSE 0.023 207.000 0.000 NA N NA
 7090953 7090954 Bphy_6013 Bphy_6014     TRUE 0.992 11.000 0.371 NA Y NA
 7090954 7090955 Bphy_6014 Bphy_6015     FALSE 0.003 398.000 0.000 1.000 N NA
 7090955 7090956 Bphy_6015 Bphy_6016     TRUE 0.686 67.000 0.086 NA   NA
 7090956 7090957 Bphy_6016 Bphy_6017     TRUE 0.993 -13.000 0.618 NA   NA
 7090957 7090958 Bphy_6017 Bphy_6018     TRUE 0.597 94.000 0.092 1.000 N NA
 7090958 7090959 Bphy_6018 Bphy_6019     TRUE 0.696 126.000 0.000 0.073 Y NA
 7090960 7090961 Bphy_6020 Bphy_6021     TRUE 0.969 -3.000 0.042 NA   NA
 7090961 7090962 Bphy_6021 Bphy_6022     TRUE 0.987 3.000 0.429 NA   NA
 7090962 7090963 Bphy_6022 Bphy_6023     TRUE 0.993 0.000 0.476 0.065 N NA
 7090963 7090964 Bphy_6023 Bphy_6024     TRUE 0.895 8.000 0.022 1.000 N NA
 7090964 7090965 Bphy_6024 Bphy_6025     TRUE 0.955 20.000 0.014 1.000 Y NA
 7090967 7090968 Bphy_6027 Bphy_6028     TRUE 0.997 0.000 0.341 NA Y NA
 7090968 7090969 Bphy_6028 Bphy_6029     TRUE 0.915 23.000 0.185 NA N NA
 7090969 7090970 Bphy_6029 Bphy_6030     TRUE 0.807 71.000 0.278 NA N NA
 7090970 7090971 Bphy_6030 Bphy_6031     TRUE 0.853 46.000 0.231 NA N NA
 7090971 7090972 Bphy_6031 Bphy_6032     TRUE 0.976 11.000 0.375 1.000   NA
 7090972 7090973 Bphy_6032 Bphy_6033     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   NA
 7090973 7090974 Bphy_6033 Bphy_6034     TRUE 0.987 -3.000 0.176 NA   NA
 7090974 7090975 Bphy_6034 Bphy_6035     TRUE 0.953 12.000 0.176 NA   NA
 7090976 7090977 Bphy_6036 Bphy_6037     TRUE 0.987 31.000 0.386 0.060 Y NA
 7090977 7090978 Bphy_6037 Bphy_6038     TRUE 0.965 26.000 0.036 0.060 Y NA
 7090978 7090979 Bphy_6038 Bphy_6039     TRUE 0.993 2.000 0.108 1.000 Y NA
 7090979 7090980 Bphy_6039 Bphy_6040     TRUE 0.850 33.000 0.108 1.000 N NA
 7090980 7090981 Bphy_6040 Bphy_6041     FALSE 0.206 201.000 0.167 1.000 N NA
 7090982 7090983 Bphy_6042 Bphy_6043     TRUE 0.885 54.000 0.425 NA N NA
 7090983 7090984 Bphy_6043 Bphy_6044     TRUE 0.977 11.000 0.419 NA   NA
 7090984 7090985 Bphy_6044 Bphy_6045     TRUE 0.989 -7.000 0.279 NA   NA
 7090987 7090988 Bphy_6047 Bphy_6048     TRUE 0.688 105.000 0.182 1.000   NA
 7090988 7090989 Bphy_6048 Bphy_6049     TRUE 0.989 -3.000 0.200 1.000   NA
 7090989 7090990 Bphy_6049 Bphy_6050     FALSE 0.002 473.000 0.000 1.000 N NA
 7090991 7090992 Bphy_6051 Bphy_6052     TRUE 0.795 132.000 0.750 NA   NA
 7090992 7090993 Bphy_6052 Bphy_6053     FALSE 0.002 522.000 0.000 NA   NA
 7090993 7090994 Bphy_6053 Bphy_6054     FALSE 0.001 749.000 0.000 NA   NA
 7090994 7090995 Bphy_6054 Bphy_6055     FALSE 0.215 115.000 0.000 1.000   NA
 7090995 7090996 Bphy_6055 Bphy_6056     FALSE 0.001 777.000 0.000 NA   NA
 7090996 7090997 Bphy_6056 Bphy_6057     FALSE 0.008 308.000 0.000 NA   NA
 7090999 7091000 Bphy_6059 Bphy_6060     FALSE 0.102 150.000 0.000 NA   NA
 7091000 7091001 Bphy_6060 Bphy_6061     FALSE 0.302 73.000 0.000 NA   NA
 7091001 7091002 Bphy_6061 Bphy_6062     TRUE 0.588 25.000 0.000 NA   NA
 7091002 7091003 Bphy_6062 Bphy_6063     TRUE 0.907 57.000 0.545 NA   NA
 7091003 7091004 Bphy_6063 Bphy_6064     FALSE 0.060 176.000 0.000 NA   NA
 7091005 7091006 Bphy_6065 Bphy_6066     TRUE 0.998 -3.000 0.398 1.000 Y NA
 7091006 7091007 Bphy_6066 Bphy_6067     TRUE 0.998 1.000 0.679 NA Y NA
 7091007 7091008 Bphy_6067 Bphy_6068     TRUE 0.998 -7.000 0.864 NA Y NA
 7091008 7091009 Bphy_6068 Bphy_6069     TRUE 0.998 4.000 0.659 0.003 Y NA
 7091009 7091010 Bphy_6069 Bphy_6070     TRUE 0.999 0.000 0.631 0.001 Y NA
 7091010 7091011 Bphy_6070 Bphy_6071     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7091011 7091012 Bphy_6071 Bphy_6072     TRUE 0.712 13.000 0.000 NA   NA
 7091012 7091013 Bphy_6072 Bphy_6073     FALSE 0.052 185.000 0.000 NA   NA
 7091013 7091014 Bphy_6073 Bphy_6074     FALSE 0.002 643.000 0.000 NA   NA
 7091014 7091015 Bphy_6074 Bphy_6075     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7091015 7091016 Bphy_6075 Bphy_6076     TRUE 0.999 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 7091016 7091017 Bphy_6076 Bphy_6077     TRUE 0.997 5.000 0.556 0.065 Y NA
 7091017 7091018 Bphy_6077 Bphy_6078     FALSE 0.007 330.000 0.000 1.000   NA
 7091018 7091019 Bphy_6078 Bphy_6079     TRUE 0.698 114.000 0.235 1.000   NA
 7091019 7091020 Bphy_6079 Bphy_6080     FALSE 0.002 522.000 0.000 1.000 N NA
 7091020 7091021 Bphy_6080 Bphy_6081     TRUE 0.998 -3.000 0.302 1.000 Y NA
 7091021 7091022 Bphy_6081 Bphy_6082     TRUE 0.998 0.000 0.728 1.000 Y NA
 7091023 7091024 Bphy_6083 Bphy_6084     TRUE 0.803 55.000 0.143 1.000   NA
 7091024 7091025 Bphy_6084 Bphy_6085     TRUE 0.821 46.000 0.143 NA   NA
 7091025 7091026 Bphy_6085 Bphy_6086     TRUE 0.963 13.000 0.273 NA   NA
 7091026 7091027 Bphy_6086 Bphy_6087     TRUE 0.997 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 7091027 7091028 Bphy_6087 Bphy_6088     TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 7091028 7091029 Bphy_6088 Bphy_6089     TRUE 0.995 16.000 0.600 0.008 Y NA
 7091029 7091030 Bphy_6089 Bphy_6090     TRUE 0.995 19.000 0.833 0.059 Y NA
 7091031 7091032 Bphy_6091 Bphy_6092     FALSE 0.003 411.000 0.000 1.000 N NA
 7091033 7091034 Bphy_6093 Bphy_6094     FALSE 0.021 291.000 0.000 0.052 N NA
 7091034 7091035 Bphy_6094 Bphy_6095     FALSE 0.055 175.000 0.000 1.000 N NA
 7091035 7091036 Bphy_6095 Bphy_6096     FALSE 0.347 53.000 0.000 1.000 N NA
 7091036 7091037 Bphy_6096 Bphy_6097     TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7091037 7091038 Bphy_6097 Bphy_6098     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091038 7091039 Bphy_6098 Bphy_6099     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7091042 7091043 Bphy_6102 Bphy_6103     TRUE 0.978 -3.000 0.078 NA   NA
 7091043 7091044 Bphy_6103 Bphy_6104     TRUE 0.760 45.000 0.078 NA   NA
 7091044 7091045 Bphy_6104 Bphy_6105     TRUE 0.803 118.000 0.086 NA Y NA
 7091045 7091046 Bphy_6105 Bphy_6106     TRUE 0.841 99.000 0.600 1.000 N NA
 7091047 7091048 Bphy_6107 Bphy_6108     TRUE 0.571 27.000 0.000 NA   NA
 7091048 7091049 Bphy_6108 Bphy_6109     TRUE 0.901 31.000 0.182 NA   NA
 7091049 7091050 Bphy_6109 Bphy_6110     TRUE 0.883 68.000 0.500 NA   NA
 7091050 7091051 Bphy_6110 Bphy_6111     TRUE 0.977 24.000 1.000 NA   NA
 7091051 7091052 Bphy_6111 Bphy_6112     TRUE 0.799 118.000 0.583 NA   NA
 7091052 7091053 Bphy_6112 Bphy_6113     TRUE 0.916 79.000 0.909 NA   NA
 7091053 7091054 Bphy_6113 Bphy_6114     TRUE 0.975 25.000 0.909 NA   NA
 7091054 7091055 Bphy_6114 Bphy_6115     TRUE 0.941 50.000 0.818 NA   NA
 7091056 7091057 Bphy_6116 Bphy_6117     TRUE 0.994 -3.000 0.556 NA   NA
 7091057 7091058 Bphy_6117 Bphy_6118     TRUE 0.992 -13.000 0.571 NA   NA
 7091058 7091059 Bphy_6118 Bphy_6119     TRUE 0.969 27.000 0.786 NA   NA
 7091059 7091060 Bphy_6119 Bphy_6120     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7091060 7091061 Bphy_6120 Bphy_6121     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091061 7091062 Bphy_6121 Bphy_6122     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7091062 7091063 Bphy_6122 Bphy_6123     TRUE 0.884 -10.000 0.000 NA   NA
 7091063 7091064 Bphy_6123 Bphy_6124     FALSE 0.053 184.000 0.000 NA   NA
 7091064 7091065 Bphy_6124 Bphy_6125     FALSE 0.437 43.000 0.000 NA   NA
 7091065 7091066 Bphy_6125 Bphy_6126     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091066 7091067 Bphy_6126 Bphy_6127     FALSE 0.464 40.000 0.000 NA   NA
 7091067 7091068 Bphy_6127 Bphy_6128     FALSE 0.532 32.000 0.000 NA   NA
 7091068 7091069 Bphy_6128 Bphy_6129     TRUE 0.896 -6.000 0.000 NA   NA
 7091069 7091070 Bphy_6129 Bphy_6131     FALSE 0.347 60.000 0.000 NA   NA
 7091070 7091071 Bphy_6131 Bphy_6132     FALSE 0.320 67.000 0.000 NA   NA
 7091071 7091072 Bphy_6132 Bphy_6133     FALSE 0.155 127.000 0.000 NA   NA
 7091072 7091073 Bphy_6133 Bphy_6134     FALSE 0.067 171.000 0.000 NA   NA
 7091074 7091075 Bphy_6135 Bphy_6136     TRUE 0.981 -30.000 0.000 NA Y NA
 7091076 7091077 Bphy_6137 Bphy_6138     FALSE 0.183 116.000 0.000 NA   NA
 7091077 7091078 Bphy_6138 Bphy_6139     FALSE 0.540 31.000 0.000 NA   NA
 7091078 7091079 Bphy_6139 Bphy_6140     TRUE 0.596 24.000 0.000 NA   NA
 7091082 7091083 Bphy_6143 Bphy_6144     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA   NA
 7091083 7091084 Bphy_6144 Bphy_6145     TRUE 0.898 83.000 0.750 NA   NA
 7091084 7091085 Bphy_6145 Bphy_6146     FALSE 0.002 701.000 0.000 NA   NA
 7091085 7091086 Bphy_6146 Bphy_6147     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7091087 7091088 Bphy_6148 Bphy_6149     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 7091088 7091089 Bphy_6149 Bphy_6150     FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 7091089 7091090 Bphy_6150 Bphy_6151     TRUE 0.985 20.000 0.300 1.000 Y NA
 7091090 7091091 Bphy_6151 Bphy_6152     TRUE 0.986 39.000 0.882 NA Y NA
 7091091 7091092 Bphy_6152 Bphy_6153     FALSE 0.052 324.000 0.000 NA Y NA
 7091093 7091094 Bphy_6154 Bphy_6155     FALSE 0.002 615.000 0.000 NA   NA
 7091094 7091095 Bphy_6155 Bphy_6156     FALSE 0.003 463.000 0.000 1.000   NA
 7091096 7091097 Bphy_6157 Bphy_6158     FALSE 0.423 41.000 0.000 1.000 N NA
 7091097 7091098 Bphy_6158 Bphy_6159     TRUE 0.802 65.000 0.211 1.000 N NA
 7091098 7091099 Bphy_6159 Bphy_6160     FALSE 0.198 189.000 0.105 1.000 N NA
 7091099 7091100 Bphy_6160 Bphy_6161     FALSE 0.174 120.000 0.000 NA   NA
 7091100 7091101 Bphy_6161 Bphy_6162     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 7091102 7091103 Bphy_6163 Bphy_6164     FALSE 0.200 109.000 0.000 NA   NA
 7091104 7091105 Bphy_6165 Bphy_6166     TRUE 0.748 13.000 0.000 1.000   NA
 7091105 7091106 Bphy_6166 Bphy_6167     FALSE 0.334 56.000 0.000 1.000 N NA
 7091106 7091107 Bphy_6167 Bphy_6168     TRUE 0.722 11.000 0.000 1.000 N NA
 7091107 7091108 Bphy_6168 Bphy_6169     TRUE 0.935 11.000 0.032 0.065   NA
 7091110 7091111 Bphy_6171 Bphy_6172     TRUE 0.696 117.000 0.250 1.000   NA
 7091111 7091112 Bphy_6172 Bphy_6173     FALSE 0.215 115.000 0.000 1.000   NA
 7091112 7091113 Bphy_6173 Bphy_6174     FALSE 0.034 204.000 0.000 NA   NA
 7091114 7091115 Bphy_6175 Bphy_6176     TRUE 0.579 26.000 0.000 NA   NA
 7091115 7091116 Bphy_6176 Bphy_6177     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7091117 7091118 Bphy_6178 Bphy_6179     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 7091118 7091119 Bphy_6179 Bphy_6180     FALSE 0.002 590.000 0.000 NA   NA
 7091119 7091120 Bphy_6180 Bphy_6181     FALSE 0.006 339.000 0.000 NA   NA
 7091122 7091123 Bphy_6183 Bphy_6184     TRUE 0.950 18.000 0.271 1.000 N NA
 7091123 7091124 Bphy_6184 Bphy_6185     TRUE 0.991 28.000 0.500 0.000 Y NA
 7091124 7091125 Bphy_6185 Bphy_6186     TRUE 0.997 4.000 0.375 0.001 Y NA
 7091125 7091126 Bphy_6186 Bphy_6187     TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 7091126 7091127 Bphy_6187 Bphy_6188     TRUE 0.966 12.000 0.258 1.000   NA
 7091127 7091128 Bphy_6188 Bphy_6189     FALSE 0.336 63.000 0.000 NA   NA
 7091128 7091129 Bphy_6189 Bphy_6190     TRUE 0.975 -3.000 0.062 NA   NA
 7091129 7091130 Bphy_6190 Bphy_6191     TRUE 0.705 42.000 0.039 NA   NA
 7091130 7091131 Bphy_6191 Bphy_6192     TRUE 0.999 -3.000 0.686 0.022 Y NA
 7091132 7091133 Bphy_6193 Bphy_6194     TRUE 0.979 72.000 0.750 0.011 Y NA
 7091136 7091137 Bphy_6197 Bphy_6198     FALSE 0.342 61.000 0.000 NA   NA
 7091137 7091138 Bphy_6198 Bphy_6199     TRUE 0.835 94.000 0.500 1.000 N NA
 7091138 7091139 Bphy_6199 Bphy_6200     TRUE 0.800 74.000 0.250 1.000 N NA
 7091140 7091141 Bphy_6201 Bphy_6202     TRUE 0.897 36.000 0.000 1.000 Y NA
 7091141 7091142 Bphy_6202 Bphy_6203     TRUE 0.985 25.000 0.223 0.059 Y NA
 7091142 7091143 Bphy_6203 Bphy_6204     FALSE 0.025 222.000 0.000 NA   NA
 7091144 7091145 Bphy_6205 Bphy_6206     TRUE 0.766 85.000 0.231 1.000 N NA
 7091145 7091146 Bphy_6206 Bphy_6207     TRUE 0.934 37.000 0.409 1.000   NA
 7091147 7091148 Bphy_6208 Bphy_6209     TRUE 0.988 0.000 0.110 0.000   NA
 7091149 7091150 Bphy_6210 Bphy_6211     FALSE 0.006 327.000 0.000 1.000 N NA
 7091151 7091152 Bphy_6212 Bphy_6213     TRUE 0.959 29.000 0.548 1.000   NA
 7091152 7091153 Bphy_6213 Bphy_6214     TRUE 0.939 35.000 0.042 1.000 Y NA
 7091155 7091156 Bphy_6216 Bphy_6217     TRUE 0.692 74.000 0.125 NA N NA
 7091156 7091157 Bphy_6217 Bphy_6218     TRUE 0.995 -3.000 0.500 0.065 N NA
 7091159 7091160 Bphy_6220 Bphy_6221     TRUE 0.872 98.000 0.786 1.000 N NA
 7091162 7091163 Bphy_6223 Bphy_6224     FALSE 0.508 176.000 0.052 1.000 Y NA
 7091163 7091164 Bphy_6224 Bphy_6225     TRUE 0.945 20.000 0.259 NA   NA
 7091164 7091165 Bphy_6225 Bphy_6226     FALSE 0.274 178.000 0.130 NA   NA
 7091166 7091167 Bphy_6227 Bphy_6228     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7091167 7091168 Bphy_6228 Bphy_6229     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7091168 7091169 Bphy_6229 Bphy_6230     FALSE 0.015 252.000 0.000 NA   NA
 7091169 7091170 Bphy_6230 Bphy_6231     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7091171 7091172 Bphy_6232 Bphy_6233     TRUE 0.993 0.000 0.071 1.000 Y NA
 7091173 7091174 Bphy_6234 Bphy_6235     TRUE 0.933 36.000 0.222 0.052   NA
 7091175 7091176 Bphy_6236 Bphy_6237     FALSE 0.004 397.000 0.000 NA   NA
 7091176 7091177 Bphy_6237 Bphy_6238     FALSE 0.002 721.000 0.000 NA   NA
 7091177 7091178 Bphy_6238 Bphy_6239     FALSE 0.525 86.000 0.041 NA   NA
 7091179 7091180 Bphy_6240 Bphy_6241     TRUE 0.965 12.000 0.271 NA   NA
 7091180 7091181 Bphy_6241 Bphy_6242     TRUE 0.965 2.000 0.083 NA   NA
 7091181 7091182 Bphy_6242 Bphy_6243     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 7091182 7091183 Bphy_6243 Bphy_6244     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 7091183 7091184 Bphy_6244 Bphy_6245     FALSE 0.283 82.000 0.000 NA   NA
 7091184 7091185 Bphy_6245 Bphy_6246     FALSE 0.002 552.000 0.000 NA   NA
 7091185 7091186 Bphy_6246 Bphy_6247     FALSE 0.324 66.000 0.000 NA   NA
 7091189 7091190 Bphy_6250 Bphy_6251     TRUE 0.999 -3.000 0.819 0.085 Y NA
 7091190 7091191 Bphy_6251 Bphy_6252     TRUE 0.995 -6.000 0.849 1.000 N NA
 7091191 7091192 Bphy_6252 Bphy_6253     FALSE 0.020 245.000 0.000 1.000   NA
 7091192 7091193 Bphy_6253 Bphy_6254     FALSE 0.001 767.000 0.000 NA   NA
 7091195 7091196 Bphy_6256 Bphy_6257     TRUE 0.986 0.000 0.255 1.000 N NA
 7091196 7091197 Bphy_6257 Bphy_6258     TRUE 0.996 -3.000 0.673 1.000   NA
 7091198 7091199 Bphy_6259 Bphy_6260     TRUE 0.989 0.000 0.341 NA   NA
 7091201 7091202 Bphy_6262 Bphy_6263     FALSE 0.286 81.000 0.000 NA   NA
 7091205 7091206 Bphy_6266 Bphy_6267     FALSE 0.309 70.000 0.000 NA   NA
 7091206 7091207 Bphy_6267 Bphy_6268     FALSE 0.081 161.000 0.000 NA   NA
 7091207 7091208 Bphy_6268 Bphy_6269     FALSE 0.002 621.000 0.000 1.000   NA
 7091210 7091211 Bphy_6271 Bphy_6272     TRUE 0.979 40.000 0.304 0.059 Y NA
 7091211 7091212 Bphy_6272 Bphy_6273     TRUE 0.998 -3.000 0.308 0.059 Y NA
 7091212 7091213 Bphy_6273 Bphy_6274     TRUE 0.995 6.000 0.269 0.059 Y NA
 7091213 7091214 Bphy_6274 Bphy_6275     FALSE 0.081 161.000 0.000 NA   NA
 7091214 7091215 Bphy_6275 Bphy_6276     FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7091217 7091218 Bphy_6278 Bphy_6279     FALSE 0.004 383.000 0.000 NA   NA
 7091218 7091219 Bphy_6279 Bphy_6280     FALSE 0.220 94.000 0.000 1.000 N NA
 7091219 7091220 Bphy_6280 Bphy_6281     FALSE 0.022 222.000 0.000 1.000 N NA
 7091220 7091221 Bphy_6281 Bphy_6282     TRUE 0.664 17.000 0.000 NA   NA
 7091221 7091222 Bphy_6282 Bphy_6283     TRUE 0.588 25.000 0.000 NA   NA
 7091222 7091223 Bphy_6283 Bphy_6284     TRUE 0.925 64.000 0.136 1.000 Y NA
 7091223 7091224 Bphy_6284 Bphy_6285     FALSE 0.074 160.000 0.000 1.000 N NA
 7091224 7091225 Bphy_6285 Bphy_6286     FALSE 0.497 36.000 0.000 NA   NA
 7091225 7091226 Bphy_6286 Bphy_6287     FALSE 0.089 157.000 0.000 NA   NA
 7091226 7091227 Bphy_6287 Bphy_6288     TRUE 0.977 7.000 0.286 NA   NA
 7091231 7091232 Bphy_6292 Bphy_6293     TRUE 0.892 -7.000 0.000 NA   NA
 7091235 7091236 Bphy_6296 Bphy_6297     FALSE 0.155 127.000 0.000 NA   NA
 7091236 7091237 Bphy_6297 Bphy_6298     FALSE 0.045 199.000 0.000 1.000   NA
 7091237 7091238 Bphy_6298 Bphy_6299     FALSE 0.005 374.000 0.000 1.000   NA
 7091238 7091239 Bphy_6299 Bphy_6300     TRUE 0.999 -3.000 0.876 1.000 Y NA
 7091239 7091240 Bphy_6300 Bphy_6301     TRUE 0.995 -3.000 0.112 NA Y NA
 7091240 7091241 Bphy_6301 Bphy_6302     TRUE 0.923 31.000 0.308 NA N NA
 7091241 7091242 Bphy_6302 Bphy_6303     FALSE 0.330 57.000 0.000 1.000 N NA
 7091242 7091243 Bphy_6303 Bphy_6304     FALSE 0.271 85.000 0.000 NA   NA
 7091243 7091244 Bphy_6304 Bphy_6305     FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 7091244 7091245 Bphy_6305 Bphy_6306     TRUE 0.566 24.000 0.000 1.000 N NA
 7091245 7091246 Bphy_6306 Bphy_6307     TRUE 0.812 65.000 0.000 1.000 Y NA
 7091246 7091247 Bphy_6307 Bphy_6308     TRUE 0.671 14.000 0.000 1.000 N NA
 7091247 7091248 Bphy_6308 Bphy_6309     TRUE 0.942 17.000 0.000 NA Y NA
 7091248 7091249 Bphy_6309 Bphy_6310     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7091249 7091250 Bphy_6310 Bphy_6311     TRUE 0.984 -13.000 0.211 NA   NA
 7091250 7091251 Bphy_6311 Bphy_6312     TRUE 0.986 -3.000 0.158 NA   NA
 7091251 7091252 Bphy_6312 Bphy_6313     TRUE 0.874 -9.000 0.000 1.000 N NA
 7091252 7091253 Bphy_6313 Bphy_6314     FALSE 0.298 75.000 0.000 NA   NA
 7091253 7091254 Bphy_6314 Bphy_6315     FALSE 0.413 46.000 0.000 NA   NA
 7091257 7091258 Bphy_6318 Bphy_6319 sucA   FALSE 0.031 202.000 0.000 1.000 N NA
 7091258 7091259 Bphy_6319 Bphy_6320     FALSE 0.002 564.000 0.000 1.000 N NA
 7091259 7091260 Bphy_6320 Bphy_6321     FALSE 0.260 99.000 0.000 1.000   NA
 7091263 7091264 Bphy_6324 Bphy_6325     TRUE 0.951 30.000 0.486 NA   NA
 7091264 7091265 Bphy_6325 Bphy_6326     TRUE 0.994 -13.000 0.743 NA   NA
 7091266 7091267 Bphy_6327 Bphy_6328     TRUE 0.851 58.000 0.286 1.000 N NA
 7091267 7091268 Bphy_6328 Bphy_6329     TRUE 0.693 71.000 0.100 NA   NA
 7091271 7091272 Bphy_6332 Bphy_6333     TRUE 0.957 48.000 0.686 0.008   NA
 7091272 7091273 Bphy_6333 Bphy_6334     TRUE 0.991 -28.000 0.286 0.052   NA
 7091273 7091274 Bphy_6334 Bphy_6335     TRUE 0.951 19.000 0.300 1.000 N NA
 7091274 7091275 Bphy_6335 Bphy_6336     TRUE 0.995 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 7091275 7091276 Bphy_6336 Bphy_6337     FALSE 0.044 191.000 0.000 NA   NA
 7091277 7091278 Bphy_6338 Bphy_6339     TRUE 0.870 30.000 0.111 NA   NA
 7091278 7091279 Bphy_6339 Bphy_6340     FALSE 0.413 46.000 0.000 NA   NA
 7091279 7091280 Bphy_6340 Bphy_6341     TRUE 0.891 28.000 0.147 1.000 N NA
 7091280 7091281 Bphy_6341 Bphy_6342     FALSE 0.070 163.000 0.000 1.000 N NA
 7091281 7091282 Bphy_6342 Bphy_6343     TRUE 0.826 97.000 0.533 NA N NA
 7091282 7091283 Bphy_6343 Bphy_6344     TRUE 0.905 59.000 0.550 NA   NA
 7091283 7091284 Bphy_6344 Bphy_6345     TRUE 0.996 -7.000 0.600 0.005   NA
 7091285 7091286 Bphy_6346 Bphy_6347     FALSE 0.021 226.000 0.000 1.000 N NA
 7091287 7091288 Bphy_6348 Bphy_6349     FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 7091289 7091290 Bphy_6350 Bphy_6351     FALSE 0.324 66.000 0.000 NA   NA
 7091290 7091291 Bphy_6351 Bphy_6352     TRUE 0.995 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 7091291 7091292 Bphy_6352 Bphy_6353     TRUE 0.812 39.000 0.091 NA   NA
 7091292 7091293 Bphy_6353 Bphy_6354     FALSE 0.009 297.000 0.000 NA   NA
 7091294 7091295 Bphy_6355 Bphy_6356     FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 7091295 7091296 Bphy_6356 Bphy_6357     FALSE 0.205 107.000 0.000 NA   NA
 7091296 7091297 Bphy_6357 Bphy_6358     FALSE 0.412 160.000 0.182 NA   NA
 7091298 7091299 Bphy_6359 Bphy_6360     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091300 7091301 Bphy_6361 Bphy_6362     FALSE 0.060 176.000 0.000 NA   NA
 7091303 7091304 Bphy_6364 Bphy_6365     TRUE 0.979 15.000 0.316 0.000   NA
 7091304 7091305 Bphy_6365 Bphy_6366     TRUE 0.916 15.000 0.085 1.000   NA
 7091305 7091306 Bphy_6366 Bphy_6367     TRUE 0.999 -7.000 0.889 0.003 Y NA
 7091306 7091307 Bphy_6367 Bphy_6368     TRUE 0.992 4.000 0.889 NA   NA
 7091307 7091308 Bphy_6368 Bphy_6369     TRUE 0.996 -3.000 0.941 NA   NA
 7091308 7091309 Bphy_6369 Bphy_6370     TRUE 0.999 -3.000 0.882 0.058 Y NA
 7091309 7091310 Bphy_6370 Bphy_6371     TRUE 0.980 75.000 0.889 0.058 Y NA
 7091310 7091311 Bphy_6371 Bphy_6372     TRUE 0.827 114.000 0.094 1.000 Y NA
 7091311 7091312 Bphy_6372 Bphy_6373     FALSE 0.005 310.000 0.000 NA N NA
 7091312 7091313 Bphy_6373 Bphy_6374     TRUE 0.920 8.000 0.059 NA N NA
 7091313 7091314 Bphy_6374 Bphy_6375     TRUE 0.988 2.000 0.382 1.000   NA
 7091314 7091315 Bphy_6375 Bphy_6376     TRUE 0.743 73.000 0.133 1.000   NA
 7091315 7091316 Bphy_6376 Bphy_6377     TRUE 0.855 96.000 0.571 1.000   NA
 7091316 7091317 Bphy_6377 Bphy_6378     TRUE 0.715 63.000 0.095 NA   NA
 7091322 7091323 Bphy_6383 Bphy_6384     TRUE 0.881 20.000 0.083 1.000 N NA
 7091323 7091324 Bphy_6384 Bphy_6385     FALSE 0.044 191.000 0.000 NA   NA
 7091325 7091326 Bphy_6386 Bphy_6387     TRUE 0.571 46.000 0.000 0.085 N NA
 7091326 7091327 Bphy_6387 Bphy_6388     FALSE 0.391 159.000 0.167 1.000 N NA
 7091332 7091333 Bphy_6393 Bphy_6394     FALSE 0.021 232.000 0.000 NA   NA
 7091335 7091336 Bphy_6396 Bphy_6397     FALSE 0.292 78.000 0.000 NA   NA
 7091336 7091337 Bphy_6397 Bphy_6398     FALSE 0.126 148.000 0.000 1.000   NA
 7091337 7091338 Bphy_6398 Bphy_6399     TRUE 0.861 82.000 0.235 0.007   NA
 7091338 7091339 Bphy_6399 Bphy_6400     TRUE 0.560 116.000 0.118 NA   NA
 7091339 7091340 Bphy_6400 Bphy_6401     TRUE 0.984 -13.000 0.200 NA   NA
 7091340 7091341 Bphy_6401 Bphy_6402     FALSE 0.011 274.000 0.000 NA   NA
 7091341 7091342 Bphy_6402 Bphy_6403     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7091344 7091345 Bphy_6405 Bphy_6406     FALSE 0.125 140.000 0.000 NA   NA
 7091345 7091346 Bphy_6406 Bphy_6407     TRUE 0.988 -3.000 0.200 NA   NA
 7091349 7091350 Bphy_6410 Bphy_6411     TRUE 0.884 39.000 0.188 1.000   NA
 7091353 7091354 Bphy_6414 Bphy_6415     FALSE 0.009 287.000 0.000 1.000 N NA
 7091354 7091355 Bphy_6415 Bphy_6416     TRUE 0.995 -3.000 0.455 0.064 N NA
 7091355 7091356 Bphy_6416 Bphy_6417     FALSE 0.416 35.000 0.000 NA N NA
 7091359 7091360 Bphy_6420 Bphy_6421     FALSE 0.130 138.000 0.000 NA   NA
 7091360 7091361 Bphy_6421 Bphy_6422     TRUE 0.909 72.000 0.750 NA   NA
 7091361 7091362 Bphy_6422 Bphy_6423     TRUE 0.995 4.000 1.000 0.052   NA
 7091362 7091363 Bphy_6423 Bphy_6424     FALSE 0.084 154.000 0.000 1.000 N NA
 7091365 7091366 Bphy_6426 Bphy_6427     TRUE 0.994 -7.000 0.717 NA   NA
 7091366 7091367 Bphy_6427 Bphy_6428     TRUE 0.995 -3.000 0.679 NA   NA
 7091367 7091368 Bphy_6428 Bphy_6429     TRUE 0.960 11.000 0.195 NA   NA
 7091368 7091369 Bphy_6429 Bphy_6430     FALSE 0.059 177.000 0.000 NA   NA
 7091369 7091370 Bphy_6430 Bphy_6431     FALSE 0.002 564.000 0.000 1.000   NA
 7091370 7091371 Bphy_6431 Bphy_6432     FALSE 0.010 284.000 0.000 NA   NA
 7091371 7091372 Bphy_6432 Bphy_6433     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7091372 7091373 Bphy_6433 Bphy_6434     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091374 7091375 Bphy_6435 Bphy_6436     TRUE 0.817 17.000 0.016 NA   NA
 7091375 7091376 Bphy_6436 Bphy_6437     FALSE 0.159 104.000 0.000 NA N NA
 7091377 7091378 Bphy_6438 Bphy_6439     FALSE 0.008 308.000 0.000 NA   NA
 7091378 7091379 Bphy_6439 Bphy_6440     FALSE 0.336 63.000 0.000 NA   NA
 7091379 7091380 Bphy_6440 Bphy_6441     FALSE 0.003 379.000 0.000 NA N NA
 7091380 7091381 Bphy_6441 Bphy_6442     TRUE 0.944 95.000 0.483 1.000 Y NA
 7091381 7091382 Bphy_6442 Bphy_6443     TRUE 0.946 41.000 0.100 1.000 Y NA
 7091382 7091383 Bphy_6443 Bphy_6444     FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 7091384 7091385 Bphy_6445 Bphy_6446     TRUE 0.982 33.000 0.429 1.000 Y NA
 7091385 7091386 Bphy_6446 Bphy_6447     TRUE 0.941 19.000 0.000 1.000 Y NA
 7091387 7091388 Bphy_6448 Bphy_6449     TRUE 0.579 26.000 0.000 NA   NA
 7091388 7091389 Bphy_6449 Bphy_6450     FALSE 0.296 76.000 0.000 NA   NA
 7091389 7091390 Bphy_6450 Bphy_6451     FALSE 0.052 185.000 0.000 NA   NA
 7091390 7091391 Bphy_6451 Bphy_6452     FALSE 0.516 34.000 0.000 NA   NA
 7091391 7091392 Bphy_6452 Bphy_6453     TRUE 0.960 13.000 0.250 NA   NA
 7091392 7091393 Bphy_6453 Bphy_6454     TRUE 0.981 8.000 0.407 NA   NA
 7091393 7091394 Bphy_6454 Bphy_6455     TRUE 0.992 -3.000 0.260 0.084 N NA
 7091394 7091395 Bphy_6455 Bphy_6456     TRUE 0.937 19.000 0.200 NA   NA
 7091395 7091396 Bphy_6456 Bphy_6457     FALSE 0.004 389.000 0.000 NA   NA
 7091396 7091397 Bphy_6457 Bphy_6458     FALSE 0.003 433.000 0.000 NA   NA
 7091397 7091398 Bphy_6458 Bphy_6459     TRUE 0.862 18.000 0.000 0.002   NA
 7091398 7091399 Bphy_6459 Bphy_6460     TRUE 0.632 25.000 0.000 1.000   NA
 7091399 7091400 Bphy_6460 Bphy_6461     FALSE 0.005 362.000 0.000 NA   NA
 7091402 7091403 Bphy_6463 Bphy_6464     TRUE 0.982 3.000 0.267 NA   NA
 7091404 7091405 Bphy_6465 Bphy_6466     TRUE 0.668 39.000 0.016 NA   NA
 7091408 7091409 Bphy_6469 Bphy_6470     TRUE 0.996 -3.000 0.050 0.021 Y NA
 7091410 7091411 Bphy_6471 Bphy_6472     TRUE 0.712 13.000 0.000 NA   NA
 7091412 7091413 Bphy_6473 Bphy_6474     FALSE 0.011 268.000 0.000 1.000 N NA
 7091413 7091414 Bphy_6474 Bphy_6475     TRUE 0.659 68.000 0.073 NA   NA
 7091414 7091415 Bphy_6475 Bphy_6476     TRUE 0.986 -3.000 0.160 NA   NA
 7091415 7091416 Bphy_6476 Bphy_6477     TRUE 0.858 89.000 0.500 1.000   NA
 7091416 7091417 Bphy_6477 Bphy_6478     TRUE 0.592 176.000 0.444 0.051   NA
 7091417 7091418 Bphy_6478 Bphy_6479     FALSE 0.454 41.000 0.000 NA   NA
 7091419 7091420 Bphy_6480 Bphy_6481     FALSE 0.029 259.000 0.012 NA   NA
 7091420 7091421 Bphy_6481 Bphy_6482     FALSE 0.261 88.000 0.000 NA   NA
 7091421 7091422 Bphy_6482 Bphy_6483     TRUE 0.673 20.000 0.000 1.000   NA
 7091422 7091423 Bphy_6483 Bphy_6484     TRUE 0.984 -25.000 0.233 1.000   NA
 7091423 7091424 Bphy_6484 Bphy_6485     TRUE 0.997 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 7091424 7091425 Bphy_6485 Bphy_6486     TRUE 0.995 -13.000 0.154 NA Y NA
 7091425 7091426 Bphy_6486 Bphy_6487     FALSE 0.325 134.000 0.038 NA   NA
 7091426 7091427 Bphy_6487 Bphy_6488     FALSE 0.398 140.000 0.086 NA   NA
 7091429 7091430 Bphy_6490 Bphy_6491     TRUE 0.988 -10.000 0.300 1.000 N NA
 7091430 7091431 Bphy_6491 Bphy_6492     TRUE 0.968 -21.000 0.093 1.000 N NA
 7091432 7091433 Bphy_6493 Bphy_6494     TRUE 0.864 38.000 0.074 0.010 N NA
 7091433 7091434 Bphy_6494 Bphy_6495     TRUE 0.931 10.000 0.064 1.000   NA
 7091434 7091435 Bphy_6495 Bphy_6496     TRUE 0.981 -3.000 0.085 1.000   NA
 7091435 7091436 Bphy_6496 Bphy_6497   rbcL TRUE 0.970 39.000 0.750 0.000 N NA
 7091437 7091438 Bphy_6498 Bphy_6499     TRUE 0.884 25.000 0.107 NA   NA
 7091439 7091440 Bphy_6500 Bphy_6501     FALSE 0.314 168.000 0.121 NA   NA
 7091440 7091441 Bphy_6501 Bphy_6502     TRUE 0.991 -18.000 0.485 NA   NA
 7091442 7091443 Bphy_6503 Bphy_6504     FALSE 0.011 292.000 0.000 1.000   NA
 7091443 7091444 Bphy_6504 Bphy_6505     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7091444 7091445 Bphy_6505 Bphy_6506     TRUE 0.996 13.000 1.000 1.000 Y NA
 7091445 7091446 Bphy_6506 Bphy_6507     TRUE 0.995 -3.000 0.097 1.000 Y NA
 7091446 7091447 Bphy_6507 Bphy_6508     TRUE 0.960 32.000 0.097 1.000 Y NA
 7091447 7091448 Bphy_6508 Bphy_6509     FALSE 0.347 71.000 0.000 1.000   NA
 7091448 7091449 Bphy_6509 Bphy_6510     TRUE 0.975 38.000 0.825 0.001   NA
 7091449 7091450 Bphy_6510 Bphy_6511     TRUE 0.984 -3.000 0.026 0.001   NA
 7091450 7091451 Bphy_6511 Bphy_6512     TRUE 0.963 5.000 0.023 0.001   NA
 7091451 7091452 Bphy_6512 Bphy_6513     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091452 7091453 Bphy_6513 Bphy_6514     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7091454 7091455 Bphy_6515 Bphy_6516     FALSE 0.075 166.000 0.000 NA   NA
 7091455 7091456 Bphy_6516 Bphy_6517     FALSE 0.003 413.000 0.000 NA   NA
 7091456 7091457 Bphy_6517 Bphy_6518     FALSE 0.151 129.000 0.000 NA   NA
 7091457 7091458 Bphy_6518 Bphy_6519     TRUE 0.999 -3.000 0.793 0.001 Y NA
 7091458 7091459 Bphy_6519 Bphy_6520     TRUE 0.694 78.000 0.120 1.000 N NA
 7091459 7091460 Bphy_6520 Bphy_6521     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.084 Y NA
 7091460 7091461 Bphy_6521 Bphy_6522     TRUE 0.973 -7.000 0.095 NA N NA
 7091466 7091467 Bphy_6527 Bphy_6528     TRUE 0.810 43.000 0.120 1.000 N NA
 7091467 7091468 Bphy_6528 Bphy_6529     FALSE 0.500 32.000 0.000 1.000 N NA
 7091468 7091469 Bphy_6529 Bphy_6530     FALSE 0.226 92.000 0.000 1.000 N NA
 7091469 7091470 Bphy_6530 Bphy_6531     TRUE 0.925 83.000 0.123 0.064 Y NA
 7091471 7091472 Bphy_6532 Bphy_6533     FALSE 0.287 80.000 0.000 NA   NA
 7091475 7091476 Bphy_6536 Bphy_6537     FALSE 0.161 118.000 0.000 1.000 N NA
 7091476 7091477 Bphy_6537 Bphy_6538     FALSE 0.366 41.000 0.000 NA N NA
 7091477 7091478 Bphy_6538 Bphy_6539     TRUE 0.894 35.000 0.000 NA Y NA
 7091478 7091479 Bphy_6539 Bphy_6540     FALSE 0.237 107.000 0.000 1.000   NA
 7091479 7091480 Bphy_6540 Bphy_6541     TRUE 0.715 16.000 0.000 1.000   NA
 7091481 7091482 Bphy_6542 Bphy_6543     TRUE 0.904 -9.000 0.000 1.000   NA
 7091485 7091486 Bphy_6546 Bphy_6547     FALSE 0.145 132.000 0.000 NA   NA
 7091487 7091488 Bphy_6548 Bphy_6549     FALSE 0.472 39.000 0.000 NA   NA
 7091490 7091491 Bphy_6551 Bphy_6552     FALSE 0.195 123.000 0.000 1.000   NA
 7091492 7091493 Bphy_6553 Bphy_6554     TRUE 0.959 50.000 0.167 0.071 Y NA
 7091494 7091495 Bphy_6555 Bphy_6556     FALSE 0.044 191.000 0.000 NA   NA
 7091495 7091496 Bphy_6556 Bphy_6557     FALSE 0.003 423.000 0.000 NA   NA
 7091496 7091497 Bphy_6557 Bphy_6558     FALSE 0.172 121.000 0.000 NA   NA
 7091497 7091498 Bphy_6558 Bphy_6559     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.018 Y NA
 7091498 7091499 Bphy_6559 Bphy_6560     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 7091499 7091500 Bphy_6560 Bphy_6561     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7091501 7091502 Bphy_6562 Bphy_6563     TRUE 0.939 59.000 1.000 NA   NA
 7091502 7091503 Bphy_6563 Bphy_6564     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 7091505 7091506 Bphy_6566 Bphy_6567     TRUE 0.993 4.000 1.000 1.000   NA
 7091506 7091507 Bphy_6567 Bphy_6568     TRUE 0.797 163.000 0.375 1.000 Y NA
 7091507 7091508 Bphy_6568 Bphy_6569     TRUE 0.903 45.000 0.381 1.000 N NA
 7091510 7091511 Bphy_6571 Bphy_6572     TRUE 0.988 39.000 0.667 0.064 Y NA
 7091511 7091512 Bphy_6572 Bphy_6573     TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.064   NA
 7091512 7091513 Bphy_6573 Bphy_6574     FALSE 0.454 41.000 0.000 NA   NA
 7091513 7091514 Bphy_6574 Bphy_6575     FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 7091514 7091515 Bphy_6575 Bphy_6576     TRUE 0.930 61.000 0.143 1.000 Y NA
 7091516 7091517 Bphy_6577 Bphy_6578     TRUE 0.903 21.000 0.125 1.000 N NA
 7091517 7091518 Bphy_6578 Bphy_6579     TRUE 0.999 -3.000 0.812 0.058 Y NA
 7091518 7091519 Bphy_6579 Bphy_6580     TRUE 0.994 0.000 0.125 1.000 Y NA
 7091519 7091520 Bphy_6580 Bphy_6581     TRUE 0.993 3.000 0.800 1.000   NA
 7091520 7091521 Bphy_6581 Bphy_6582     TRUE 0.873 70.000 0.429 1.000   NA
 7091523 7091524 Bphy_6584 Bphy_6585     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000 N NA
 7091524 7091525 Bphy_6585 Bphy_6586     TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.042   NA
 7091525 7091526 Bphy_6586 Bphy_6587     TRUE 0.990 -21.000 0.250 0.051   NA
 7091526 7091527 Bphy_6587 Bphy_6588     TRUE 0.991 -3.000 0.250 1.000   NA
 7091527 7091528 Bphy_6588 Bphy_6589     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   NA
 7091528 7091529 Bphy_6589 Bphy_6590     TRUE 0.998 -3.000 0.375 0.058 Y NA
 7091529 7091530 Bphy_6590 Bphy_6591     TRUE 0.931 68.000 0.100 0.058 Y NA
 7091530 7091531 Bphy_6591 Bphy_6592     TRUE 0.859 93.000 0.075 1.000 Y NA
 7091531 7091532 Bphy_6592 Bphy_6593     TRUE 0.962 41.000 1.000 1.000   NA
 7091532 7091533 Bphy_6593 Bphy_6594     FALSE 0.081 204.000 0.000 0.063   NA
 7091537 7091538 Bphy_6598 Bphy_6599     FALSE 0.080 162.000 0.000 NA   NA
 7091538 7091539 Bphy_6599 Bphy_6600     FALSE 0.167 115.000 0.000 1.000 N NA
 7091542 7091543 Bphy_6603 Bphy_6604     FALSE 0.421 53.000 0.000 1.000   NA
 7091543 7091544 Bphy_6604 Bphy_6605     FALSE 0.024 216.000 0.000 1.000 N NA
 7091544 7091545 Bphy_6605 Bphy_6606     TRUE 0.970 9.000 0.116 0.050   NA
 7091545 7091546 Bphy_6606 Bphy_6607     FALSE 0.003 458.000 0.000 1.000   NA
 7091548 7091549 Bphy_6609 Bphy_6610     TRUE 0.629 64.000 0.052 NA   NA
 7091550 7091551 Bphy_6611 Bphy_6612     TRUE 0.696 96.000 0.182 1.000 N NA
 7091551 7091552 Bphy_6612 Bphy_6613     TRUE 0.973 13.000 0.455 1.000 N NA
 7091556 7091557 Bphy_6617 Bphy_6618     FALSE 0.001 1102.000 0.000 NA   NA
 7091557 7091558 Bphy_6618 Bphy_6619     TRUE 0.889 92.000 0.129 1.000 Y NA
 7091558 7091559 Bphy_6619 Bphy_6620     TRUE 0.985 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7091561 7091562 Bphy_6622 Bphy_6623     TRUE 0.588 89.000 0.062 1.000   NA
 7091562 7091563 Bphy_6623 Bphy_6624     FALSE 0.003 441.000 0.000 1.000 N NA
 7091563 7091564 Bphy_6624 Bphy_6625     TRUE 0.999 -3.000 0.895 1.000 Y NA
 7091564 7091565 Bphy_6625 Bphy_6626     TRUE 0.997 -7.000 0.944 0.042   NA
 7091565 7091566 Bphy_6626 Bphy_6627     TRUE 0.992 -3.000 0.167 0.051   NA
 7091566 7091567 Bphy_6627 Bphy_6628     TRUE 0.983 0.000 0.176 1.000   NA
 7091567 7091568 Bphy_6628 Bphy_6629     TRUE 0.995 24.000 1.000 0.058 Y NA
 7091568 7091569 Bphy_6629 Bphy_6630     TRUE 0.999 -7.000 0.889 0.058 Y NA
 7091571 7091572 Bphy_6632 Bphy_6633     FALSE 0.167 123.000 0.000 NA   NA
 7091572 7091573 Bphy_6633 Bphy_6634     FALSE 0.049 187.000 0.000 NA   NA
 7091577 7091578 Bphy_6638 Bphy_6639     TRUE 0.776 109.000 0.400 NA   NA
 7091578 7091579 Bphy_6639 Bphy_6640     FALSE 0.524 33.000 0.000 NA   NA
 7091579 7091580 Bphy_6640 Bphy_6641     FALSE 0.070 170.000 0.000 NA   NA
 7091580 7091581 Bphy_6641 Bphy_6642     FALSE 0.049 182.000 0.000 1.000 N NA
 7091581 7091582 Bphy_6642 Bphy_6643     FALSE 0.019 230.000 0.000 1.000 N NA
 7091582 7091583 Bphy_6643 Bphy_6644     FALSE 0.050 181.000 0.000 1.000 N NA
 7091583 7091584 Bphy_6644 Bphy_6645     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA N NA
 7091584 7091585 Bphy_6645 Bphy_6646     FALSE 0.010 280.000 0.000 NA   NA
 7091587 7091588 Bphy_6648 Bphy_6649     TRUE 0.906 52.000 0.048 1.000 Y NA
 7091588 7091589 Bphy_6649 Bphy_6650     TRUE 0.999 0.000 0.762 0.058 Y NA
 7091589 7091590 Bphy_6650 Bphy_6651     TRUE 0.990 6.000 0.059 0.058 Y NA
 7091590 7091591 Bphy_6651 Bphy_6652     TRUE 0.927 73.000 0.182 1.000 Y NA
 7091591 7091592 Bphy_6652 Bphy_6653     TRUE 0.998 -3.000 0.160 0.001 Y NA
 7091595 7091596 Bphy_6656 Bphy_6657     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 7091597 7091598 Bphy_6658 Bphy_6659     FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7091598 7091599 Bphy_6659 Bphy_6660     TRUE 0.882 32.000 0.154 1.000 N NA
 7091599 7091600 Bphy_6660 Bphy_6661     TRUE 0.784 58.000 0.154 1.000 N NA
 7091600 7091601 Bphy_6661 Bphy_6662     TRUE 0.990 5.000 0.750 1.000 N NA
 7091601 7091602 Bphy_6662 Bphy_6663     TRUE 0.961 11.000 0.214 1.000 N NA
 7091602 7091603 Bphy_6663 Bphy_6664     TRUE 0.999 -12.000 0.929 0.058 Y NA
 7091603 7091604 Bphy_6664 Bphy_6665     TRUE 0.964 105.000 0.750 0.058 Y NA
 7091606 7091607 Bphy_6667 Bphy_6668     TRUE 0.782 96.000 0.333 1.000 N NA
 7091607 7091608 Bphy_6668 Bphy_6669     TRUE 0.795 45.000 0.115 1.000 N NA
 7091608 7091609 Bphy_6669 Bphy_6670     TRUE 0.997 6.000 0.577 0.029 Y NA
 7091609 7091610 Bphy_6670 Bphy_6671     TRUE 0.994 -7.000 0.667 1.000 N NA
 7091610 7091611 Bphy_6671 Bphy_6672     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.001 Y NA
 7091611 7091612 Bphy_6672 Bphy_6673     TRUE 0.999 -3.000 0.824 0.051 Y NA
 7091612 7091613 Bphy_6673 Bphy_6674     TRUE 0.986 -3.000 0.176 1.000 N NA
 7091613 7091614 Bphy_6674 Bphy_6675     TRUE 0.991 -7.000 0.031 NA Y NA
 7091615 7091616 Bphy_6676 Bphy_6677     FALSE 0.004 355.000 0.000 1.000 N NA
 7091616 7091617 Bphy_6677 Bphy_6678     TRUE 0.987 50.000 0.875 0.058 Y NA
 7091617 7091618 Bphy_6678 Bphy_6679     TRUE 0.995 23.000 1.000 0.008 Y NA
 7091618 7091619 Bphy_6679 Bphy_6680     TRUE 0.998 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 7091619 7091620 Bphy_6680 Bphy_6681     TRUE 0.622 108.000 0.150 1.000 N NA
 7091620 7091621 Bphy_6681 Bphy_6682     FALSE 0.041 189.000 0.000 1.000 N NA
 7091621 7091622 Bphy_6682 Bphy_6683     FALSE 0.012 266.000 0.000 NA   NA
 7091623 7091624 Bphy_6684 Bphy_6685     FALSE 0.005 359.000 0.000 NA   NA
 7091624 7091625 Bphy_6685 Bphy_6686     FALSE 0.009 284.000 0.000 1.000 N NA
 7091627 7091628 Bphy_6688 Bphy_6689     FALSE 0.236 96.000 0.000 NA   NA
 7091629 7091630 Bphy_6690 Bphy_6691     TRUE 0.805 45.000 0.118 NA   NA
 7091631 7091632 Bphy_6692 Bphy_6693     FALSE 0.012 257.000 0.000 1.000 N NA
 7091632 7091633 Bphy_6693 Bphy_6694     FALSE 0.016 247.000 0.000 NA   NA
 7091635 7091636 Bphy_6696 Bphy_6697     FALSE 0.320 67.000 0.000 NA   NA
 7091637 7091638 Bphy_6698 Bphy_6699     FALSE 0.088 152.000 0.000 1.000 N NA
 7091640 7091641 Bphy_6701 Bphy_6702     FALSE 0.014 258.000 0.000 NA   NA
 7091641 7091642 Bphy_6702 Bphy_6703     FALSE 0.002 459.000 0.000 1.000 N NA
 7091642 7091643 Bphy_6703 Bphy_6704     FALSE 0.181 117.000 0.000 NA   NA
 7091645 7091646 Bphy_6706 Bphy_6707 prpB   TRUE 0.964 21.000 0.502 1.000 N NA
 7091646 7091647 Bphy_6707 Bphy_6708     TRUE 0.655 189.000 0.289 1.000 Y NA
 7091647 7091648 Bphy_6708 Bphy_6709     TRUE 0.892 85.000 0.733 NA   NA
 7091649 7091650 Bphy_6710 Bphy_6711     FALSE 0.125 140.000 0.000 NA   NA
 7091650 7091651 Bphy_6711 Bphy_6712     TRUE 0.909 44.000 0.438 NA N NA
 7091651 7091652 Bphy_6712 Bphy_6713     TRUE 0.690 75.000 0.125 NA N NA
 7091652 7091653 Bphy_6713 Bphy_6714     TRUE 0.937 17.000 0.103 0.063 N NA
 7091655 7091656 Bphy_6716 Bphy_6717     TRUE 0.951 15.000 0.000 1.000 Y NA
 7091659 7091660 Bphy_6720 Bphy_6721     FALSE 0.031 210.000 0.000 NA   NA
 7091660 7091661 Bphy_6721 Bphy_6722     FALSE 0.018 242.000 0.000 NA   NA
 7091661 7091662 Bphy_6722 Bphy_6723     FALSE 0.004 381.000 0.000 NA   NA
 7091662 7091663 Bphy_6723 Bphy_6724     FALSE 0.001 774.000 0.000 NA   NA
 7091664 7091665 Bphy_6725 Bphy_6726     TRUE 0.935 46.000 0.018 0.004 Y NA
 7091665 7091666 Bphy_6726 Bphy_6727     FALSE 0.328 65.000 0.000 NA   NA
 7091666 7091667 Bphy_6727 Bphy_6728     TRUE 0.943 26.000 0.333 NA   NA
 7091667 7091668 Bphy_6728 Bphy_6729     FALSE 0.347 71.000 0.000 1.000   NA
 7091668 7091669 Bphy_6729 Bphy_6730     TRUE 0.616 27.000 0.000 1.000   NA
 7091669 7091670 Bphy_6730 Bphy_6731     TRUE 0.622 21.000 0.000 NA   NA
 7091670 7091671 Bphy_6731 Bphy_6732     FALSE 0.487 37.000 0.000 NA   NA
 7091671 7091672 Bphy_6732 Bphy_6733     TRUE 0.839 54.000 0.000 1.000 Y NA
 7091672 7091673 Bphy_6733 Bphy_6734     TRUE 0.788 76.000 0.000 1.000 Y NA
 7091673 7091674 Bphy_6734 Bphy_6735     TRUE 0.654 119.000 0.000 1.000 Y NA
 7091676 7091677 Bphy_6737 Bphy_6738     FALSE 0.041 245.000 0.000 0.010 N NA
 7091678 7091679 Bphy_6739 Bphy_6740     FALSE 0.183 116.000 0.000 NA   NA
 7091679 7091680 Bphy_6740 Bphy_6741     FALSE 0.019 237.000 0.000 NA   NA
 7091683 7091684 Bphy_6744 Bphy_6745     FALSE 0.094 149.000 0.000 1.000 N NA
 7091685 7091686 Bphy_6746 Bphy_6747     FALSE 0.226 111.000 0.000 1.000   NA
 7091690 7091691 Bphy_6751 Bphy_6752     TRUE 0.992 0.000 0.460 1.000   NA
 7091691 7091692 Bphy_6752 Bphy_6753     FALSE 0.309 85.000 0.000 1.000   NA
 7091692 7091693 Bphy_6753 Bphy_6754     TRUE 0.971 14.000 0.037 1.000 Y NA
 7091694 7091695 Bphy_6755 Bphy_6756     TRUE 0.766 56.000 0.120 NA   NA
 7091695 7091696 Bphy_6756 Bphy_6757     FALSE 0.004 381.000 0.000 NA   NA
 7091696 7091697 Bphy_6757 Bphy_6758     FALSE 0.236 96.000 0.000 NA   NA
 7091698 7091699 Bphy_6759 Bphy_6760     FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7091699 7091700 Bphy_6760 Bphy_6761     FALSE 0.286 81.000 0.000 NA   NA
 7091703 7091704 Bphy_6764 Bphy_6765     FALSE 0.300 74.000 0.000 NA   NA
 7091705 7091706 Bphy_6766 Bphy_6767     FALSE 0.004 398.000 0.000 NA   NA
 7091707 7091708 Bphy_6768 Bphy_6769     FALSE 0.002 703.000 0.000 NA   NA
 7091709 7091710 Bphy_6770 Bphy_6771     FALSE 0.002 510.000 0.000 NA   NA
 7091713 7091714 Bphy_6774 Bphy_6775     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091714 7091715 Bphy_6775 Bphy_6776     TRUE 0.622 21.000 0.000 NA   NA
 7091715 7091716 Bphy_6776 Bphy_6777     TRUE 0.967 21.000 0.636 NA N NA
 7091716 7091717 Bphy_6777 Bphy_6778     FALSE 0.375 40.000 0.000 NA N NA
 7091720 7091721 Bphy_6781 Bphy_6782     FALSE 0.001 752.000 0.000 NA   NA
 7091722 7091723 Bphy_6783 Bphy_6784     FALSE 0.003 427.000 0.000 NA   NA
 7091724 7091725 Bphy_6785 Bphy_6786     FALSE 0.032 208.000 0.000 NA   NA
 7091725 7091726 Bphy_6786 Bphy_6787     FALSE 0.322 207.000 0.000 0.006 Y NA
 7091726 7091727 Bphy_6787 Bphy_6788     FALSE 0.049 187.000 0.000 NA   NA
 7091727 7091728 Bphy_6788 Bphy_6789     FALSE 0.249 92.000 0.000 NA   NA
 7091730 7091731 Bphy_6791 Bphy_6792     TRUE 0.939 5.000 0.000 0.001   NA
 7091731 7091732 Bphy_6792 Bphy_6793     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7091732 7091733 Bphy_6793 Bphy_6794     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7091733 7091734 Bphy_6794 Bphy_6795     FALSE 0.324 66.000 0.000 NA   NA
 7091734 7091735 Bphy_6795 Bphy_6796     TRUE 0.948 6.000 0.080 NA   NA
 7091735 7091736 Bphy_6796 Bphy_6797     FALSE 0.001 1138.000 0.000 NA   NA
 7091736 7091737 Bphy_6797 Bphy_6798     FALSE 0.249 92.000 0.000 NA   NA
 7091738 7091739 Bphy_6799 Bphy_6800     TRUE 0.988 33.000 0.500 0.051 Y NA
 7091739 7091740 Bphy_6800 Bphy_6801     TRUE 0.999 -16.000 0.875 0.051 Y NA
 7091740 7091741 Bphy_6801 Bphy_6802     FALSE 0.001 750.000 0.000 NA   NA
 7091741 7091742 Bphy_6802 Bphy_6803     TRUE 0.963 29.000 0.667 NA   NA
 7091742 7091743 Bphy_6803 Bphy_6804     FALSE 0.016 247.000 0.000 NA   NA
 7091743 7091744 Bphy_6804 Bphy_6805     FALSE 0.055 164.000 0.000 NA N NA
 7091744 7091745 Bphy_6805 Bphy_6806     FALSE 0.018 287.000 0.000 0.083 N NA
 7091746 7091747 Bphy_6807 Bphy_6808     TRUE 0.862 -30.000 0.000 NA   NA
 7091748 7091749 Bphy_6809 Bphy_6810     FALSE 0.253 101.000 0.000 1.000   NA
 7091750 7091751 Bphy_6811 Bphy_6812     FALSE 0.023 237.000 0.000 1.000   NA
 7091752 7091753 Bphy_6813 Bphy_6814     FALSE 0.158 162.000 0.000 0.057 N NA
 7091753 7091754 Bphy_6814 Bphy_6815     FALSE 0.273 215.000 0.000 0.057 Y NA
 7091754 7091755 Bphy_6815 Bphy_6816     TRUE 0.822 99.000 0.049 1.000 Y NA
 7091755 7091756 Bphy_6816 Bphy_6817     TRUE 0.930 39.000 0.049 NA Y NA
 7091756 7091757 Bphy_6817 Bphy_6818     FALSE 0.520 144.000 0.000 NA Y NA
 7091757 7091758 Bphy_6818 Bphy_6819     FALSE 0.221 79.000 0.000 NA N NA
 7091758 7091759 Bphy_6819 Bphy_6820     FALSE 0.229 91.000 0.000 1.000 N NA
 7091760 7091761 Bphy_6821 Bphy_6822     FALSE 0.010 280.000 0.000 NA   NA
 7091761 7091762 Bphy_6822 Bphy_6823     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA N NA
 7091762 7091763 Bphy_6823 Bphy_6824     FALSE 0.005 554.000 0.000 0.042   NA
 7091764 7091765 Bphy_6825 Bphy_6826     FALSE 0.011 273.000 0.000 NA   NA
 7091766 7091767 Bphy_6827 Bphy_6828     FALSE 0.291 90.000 0.000 1.000   NA
 7091769 7091770 Bphy_6830 Bphy_6831     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA N NA
 7091772 7091773 Bphy_6833 Bphy_6834     FALSE 0.007 313.000 0.000 NA   NA
 7091773 7091774 Bphy_6834 Bphy_6835     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 7091774 7091775 Bphy_6835 Bphy_6836     FALSE 0.003 425.000 0.000 NA   NA
 7091779 7091780 Bphy_6840 Bphy_6841     TRUE 0.556 29.000 0.000 NA   NA
 7091781 7091782 Bphy_6842 Bphy_6843     FALSE 0.023 226.000 0.000 NA   NA
 7091784 7091785 Bphy_6845 Bphy_6846     FALSE 0.122 136.000 0.000 1.000 N NA
 7091785 7091786 Bphy_6846 Bphy_6847     FALSE 0.029 207.000 0.000 1.000 N NA
 7091786 7091787 Bphy_6847 Bphy_6848     FALSE 0.286 81.000 0.000 NA   NA
 7091787 7091788 Bphy_6848 Bphy_6849     FALSE 0.017 246.000 0.000 NA   NA
 7091788 7091789 Bphy_6849 Bphy_6850     FALSE 0.003 450.000 0.000 1.000   NA
 7091789 7091790 Bphy_6850 Bphy_6851     FALSE 0.072 161.000 0.000 1.000 N NA
 7091790 7091791 Bphy_6851 Bphy_6852     TRUE 0.673 39.000 0.000 0.042 N NA
 7091791 7091792 Bphy_6852 Bphy_6853     FALSE 0.138 128.000 0.000 1.000 N NA
 7091792 7091793 Bphy_6853 Bphy_6854     FALSE 0.002 950.000 0.000 1.000   NA
 7091793 7091794 Bphy_6854 Bphy_6855     FALSE 0.001 2164.000 0.000 NA   NA
 7091794 7091795 Bphy_6855 Bphy_6856     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7091795 7091796 Bphy_6856 Bphy_6857     TRUE 0.968 15.000 0.250 0.051 N NA
 7091796 7091797 Bphy_6857 Bphy_6858     TRUE 0.772 119.000 0.500 1.000 N NA
 7091797 7091798 Bphy_6858 Bphy_6859     FALSE 0.475 35.000 0.000 1.000 N NA
 7091798 7091799 Bphy_6859 Bphy_6860     TRUE 0.605 23.000 0.000 NA   NA
 7091799 7091800 Bphy_6860 Bphy_6861     FALSE 0.332 64.000 0.000 NA   NA
 7091800 7091801 Bphy_6861 Bphy_6862     TRUE 0.868 60.000 0.000 0.070 Y NA
 7091801 7091802 Bphy_6862 Bphy_6863     FALSE 0.084 154.000 0.000 1.000 N NA
 7091802 7091803 Bphy_6863 Bphy_6864     FALSE 0.339 55.000 0.000 1.000 N NA
 7091803 7091804 Bphy_6864 Bphy_6865     TRUE 0.947 18.000 0.138 0.042 N NA
 7091804 7091805 Bphy_6865 Bphy_6866     TRUE 0.991 7.000 0.167 1.000 Y NA
 7091805 7091806 Bphy_6866 Bphy_6867     TRUE 0.921 65.000 0.125 1.000 Y NA
 7091806 7091807 Bphy_6867 Bphy_6868     TRUE 0.906 80.000 0.125 1.000 Y NA
 7091807 7091808 Bphy_6868 Bphy_6869     TRUE 0.913 94.000 0.125 0.057 Y NA
 7091808 7091809 Bphy_6869 Bphy_6870     TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.083 Y NA
 7091810 7091811 Bphy_6871 Bphy_6872     FALSE 0.497 36.000 0.000 NA   NA
 7091811 7091812 Bphy_6872 Bphy_6873     FALSE 0.025 220.000 0.000 NA   NA
 7091813 7091814 Bphy_6874 Bphy_6875     FALSE 0.002 569.000 0.000 NA   NA
 7091814 7091815 Bphy_6875 Bphy_6876     TRUE 0.941 34.000 0.500 NA N NA
 7091815 7091816 Bphy_6876 Bphy_6877     TRUE 0.956 59.000 0.333 NA Y NA
 7091817 7091818 Bphy_6878 Bphy_6879     TRUE 0.872 90.000 0.667 1.000 N NA
 7091818 7091819 Bphy_6879 Bphy_6880     TRUE 0.917 41.000 0.400 1.000 N NA
 7091819 7091820 Bphy_6880 Bphy_6881     FALSE 0.001 758.000 0.000 NA   NA
 7091820 7091821 Bphy_6881 Bphy_6882     FALSE 0.151 129.000 0.000 NA   NA
 7091821 7091822 Bphy_6882 Bphy_6883     FALSE 0.540 31.000 0.000 NA   NA
 7091822 7091823 Bphy_6883 Bphy_6884     FALSE 0.002 541.000 0.000 NA   NA
 7091824 7091825 Bphy_6885 Bphy_6886     FALSE 0.001 1286.000 0.000 NA   NA
 7091826 7091827 Bphy_6887 Bphy_6888     TRUE 0.563 28.000 0.000 NA   NA
 7091827 7091828 Bphy_6888 Bphy_6889     FALSE 0.058 178.000 0.000 NA   NA
 7091828 7091829 Bphy_6889 Bphy_6890     TRUE 0.904 59.000 0.500 1.000   NA
 7091830 7091831 Bphy_6891 Bphy_6892     FALSE 0.018 523.000 0.000 NA Y NA
 7091831 7091832 Bphy_6892 Bphy_6893     FALSE 0.007 317.000 0.000 NA   NA
 7091837 7091838 Bphy_6898 Bphy_6899     FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 7091838 7091839 Bphy_6899 Bphy_6900     FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 7091839 7091840 Bphy_6900 Bphy_6901     TRUE 0.960 -16.000 0.054 NA   NA
 7091841 7091842 Bphy_6902 Bphy_6903     TRUE 0.839 66.000 0.333 NA N NA
 7091844 7091845 Bphy_6905 Bphy_6906     TRUE 0.909 30.000 0.000 NA Y NA
 7091845 7091846 Bphy_6906 Bphy_6907     FALSE 0.001 820.000 0.000 NA   NA
 7091850 7091851 Bphy_6911 Bphy_6912     TRUE 0.909 41.000 0.333 NA   NA
 7091851 7091852 Bphy_6912 Bphy_6913     TRUE 0.892 38.000 0.222 NA   NA
 7091854 7091855 Bphy_6915 Bphy_6916     TRUE 0.588 25.000 0.000 NA   NA
 7091856 7091857 Bphy_6917 Bphy_6918     TRUE 0.622 21.000 0.000 NA   NA
 7091858 7091859 Bphy_6919 Bphy_6920     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7091859 7091860 Bphy_6920 Bphy_6921     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091861 7091862 Bphy_6922 Bphy_6923     FALSE 0.183 116.000 0.000 NA   NA
 7091862 7091863 Bphy_6923 Bphy_6924     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7091864 7091865 Bphy_6925 Bphy_6926     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 7091866 7091867 Bphy_6927 Bphy_6928     TRUE 0.712 13.000 0.000 NA   NA
 7091868 7091869 Bphy_6929 Bphy_6930     FALSE 0.009 295.000 0.000 NA   NA
 7091869 7091870 Bphy_6930 Bphy_6931     FALSE 0.195 111.000 0.000 NA   NA
 7091870 7091871 Bphy_6931 Bphy_6932     FALSE 0.010 287.000 0.000 NA   NA
 7091871 7091872 Bphy_6932 Bphy_6933     TRUE 0.985 6.000 0.490 NA   NA
 7091872 7091873 Bphy_6933 Bphy_6934     FALSE 0.298 75.000 0.000 NA   NA
 7091874 7091875 Bphy_6935 Bphy_6936     FALSE 0.002 620.000 0.000 NA   NA
 7091875 7091876 Bphy_6936 Bphy_6937     FALSE 0.145 132.000 0.000 NA   NA
 7091876 7091877 Bphy_6937 Bphy_6938     FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 7091877 7091878 Bphy_6938 Bphy_6939     FALSE 0.167 133.000 0.000 1.000   NA
 7091881 7091882 Bphy_6942 Bphy_6943     FALSE 0.195 111.000 0.000 NA   NA
 7091883 7091884 Bphy_6944 Bphy_6945     FALSE 0.176 119.000 0.000 NA   NA
 7091884 7091885 Bphy_6945 Bphy_6946     FALSE 0.042 193.000 0.000 NA   NA
 7091888 7091889 Bphy_6949 Bphy_6950     FALSE 0.031 271.000 0.000 0.049   NA
 7091889 7091890 Bphy_6950 Bphy_6951     FALSE 0.386 189.000 0.364 NA   NA
 7091891 7091892 Bphy_6952 Bphy_6953     TRUE 0.859 -1854.000 0.000 NA   NA
 7091892 7091893 Bphy_6953 Bphy_6954     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 7091893 7091894 Bphy_6954 Bphy_6955     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.008 Y NA
 7091895 7091896 Bphy_6956 Bphy_6957     TRUE 0.970 9.000 0.116 0.049   NA
 7091896 7091897 Bphy_6957 Bphy_6958     FALSE 0.004 380.000 0.000 NA   NA
 7091897 7091898 Bphy_6958 Bphy_6959     FALSE 0.002 622.000 0.000 NA   NA
 7091898 7091899 Bphy_6959 Bphy_6960     FALSE 0.226 99.000 0.000 NA   NA
 7091899 7091900 Bphy_6960 Bphy_6961     TRUE 0.987 -3.000 0.182 NA   NA
 7091900 7091901 Bphy_6961 Bphy_6962     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7091902 7091903 Bphy_6963 Bphy_6964     FALSE 0.002 654.000 0.000 NA   NA
 7091903 7091904 Bphy_6964 Bphy_6965     FALSE 0.102 150.000 0.000 NA   NA
 7091904 7091905 Bphy_6965 Bphy_6966     TRUE 0.878 -13.000 0.000 NA   NA
 7091905 7091906 Bphy_6966 Bphy_6967     FALSE 0.010 297.000 0.000 1.000   NA
 7091906 7091907 Bphy_6967 Bphy_6968     FALSE 0.093 155.000 0.000 NA   NA
 7091907 7091908 Bphy_6968 Bphy_6969     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7091909 7091910 Bphy_6970 Bphy_6971     FALSE 0.249 92.000 0.000 NA   NA
 7091910 7091911 Bphy_6971 Bphy_6972     FALSE 0.008 306.000 0.000 NA   NA
 7091911 7091912 Bphy_6972 Bphy_6973     FALSE 0.006 327.000 0.000 NA   NA
 7091913 7091914 Bphy_6974 Bphy_6975     TRUE 0.869 -19.000 0.000 NA   NA
 7091915 7091916 Bphy_6976 Bphy_6977     FALSE 0.009 288.000 0.000 1.000 N NA
 7091916 7091917 Bphy_6977 Bphy_6978     TRUE 0.885 -24.000 0.000 1.000   NA
 7091917 7091918 Bphy_6978 Bphy_6979     TRUE 0.897 0.000 0.000 1.000   NA
 7091918 7091919 Bphy_6979 Bphy_6980     TRUE 0.984 5.000 0.364 1.000   NA
 7091919 7091920 Bphy_6980 Bphy_6981     TRUE 0.930 27.000 0.273 1.000 N NA
 7091920 7091921 Bphy_6981 Bphy_6982     TRUE 0.862 59.000 0.333 1.000 N NA
 7091922 7091923 Bphy_6983 Bphy_6984     FALSE 0.138 128.000 0.000 1.000 N NA
 7091924 7091925 Bphy_6985 Bphy_6986     FALSE 0.452 47.000 0.000 1.000   NA
 7091926 7091927 Bphy_6987 Bphy_6988     TRUE 0.840 118.000 0.800 NA   NA
 7091927 7091928 Bphy_6988 Bphy_6989     TRUE 0.952 25.000 0.400 NA   NA
 7091928 7091929 Bphy_6989 Bphy_6990     TRUE 0.556 29.000 0.000 NA   NA
 7091931 7091932 Bphy_6992 Bphy_6993     TRUE 0.992 16.000 0.583 NA Y NA
 7091932 7091933 Bphy_6993 Bphy_6994     TRUE 0.952 20.000 0.333 1.000 N NA
 7091933 7091934 Bphy_6994 Bphy_6995     TRUE 0.985 5.000 0.455 1.000 N NA
 7091934 7091935 Bphy_6995 Bphy_6996     TRUE 0.996 -3.000 0.455 0.062   NA
 7091937 7091938 Bphy_6998 Bphy_6999     TRUE 0.969 14.000 0.000 0.041 Y NA
 7091938 7091939 Bphy_6999 Bphy_7000     TRUE 0.959 27.000 0.500 1.000   NA
 7091943 7091944 Bphy_7004 Bphy_7005     FALSE 0.001 1028.000 0.000 1.000 N NA
 7091944 7091945 Bphy_7005 Bphy_7006     TRUE 0.804 93.000 0.000 0.062 Y NA
 7091946 7091947 Bphy_7007 Bphy_7008     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091947 7091948 Bphy_7008 Bphy_7009     TRUE 0.993 -22.000 0.500 0.082   NA
 7091948 7091949 Bphy_7009 Bphy_7010     TRUE 0.990 -3.000 0.234 1.000   NA
 7091949 7091950 Bphy_7010 Bphy_7011     TRUE 0.991 3.000 0.660 1.000 N NA
 7091950 7091951 Bphy_7011 Bphy_7012     FALSE 0.286 69.000 0.000 1.000 N NA
 7091951 7091952 Bphy_7012 Bphy_7013     FALSE 0.002 586.000 0.000 NA   NA
 7091952 7091953 Bphy_7013 Bphy_7014     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091953 7091954 Bphy_7014 Bphy_7015     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091954 7091955 Bphy_7015 Bphy_7016     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7091955 7091956 Bphy_7016 Bphy_7017     FALSE 0.300 74.000 0.000 NA   NA
 7091956 7091957 Bphy_7017 Bphy_7018     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7091957 7091958 Bphy_7018 Bphy_7019     TRUE 0.874 97.000 0.750 NA   NA
 7091958 7091959 Bphy_7019 Bphy_7020     TRUE 0.994 2.000 1.000 NA   NA
 7091959 7091960 Bphy_7020 Bphy_7021     TRUE 0.990 -3.000 0.250 NA   NA
 7091960 7091961 Bphy_7021 Bphy_7022     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7091961 7091962 Bphy_7022 Bphy_7023     FALSE 0.271 85.000 0.000 NA   NA
 7091962 7091963 Bphy_7023 Bphy_7024     FALSE 0.004 375.000 0.000 NA   NA
 7091963 7091964 Bphy_7024 Bphy_7025     FALSE 0.010 280.000 0.000 NA   NA
 7091964 7091965 Bphy_7025 Bphy_7026     FALSE 0.126 148.000 0.000 1.000   NA
 7091965 7091966 Bphy_7026 Bphy_7027     TRUE 0.995 2.000 0.667 0.049   NA
 7091967 7091968 Bphy_7028 Bphy_7029     TRUE 0.981 -3.000 0.052 0.062 N NA
 7091968 7091969 Bphy_7029 Bphy_7030     TRUE 0.999 -3.000 0.456 0.001 Y NA
 7091969 7091970 Bphy_7030 Bphy_7031     TRUE 0.965 30.000 0.053 0.062 Y NA
 7091970 7091971 Bphy_7031 Bphy_7032     TRUE 0.993 -3.000 0.371 1.000   NA
 7091972 7091973 Bphy_7033 Bphy_7034     FALSE 0.183 116.000 0.000 NA   NA
 7091973 7091974 Bphy_7034 Bphy_7035     FALSE 0.020 236.000 0.000 NA   NA
 7091974 7091975 Bphy_7035 Bphy_7036     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7091975 7091976 Bphy_7036 Bphy_7037     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7091976 7091977 Bphy_7037 Bphy_7038     TRUE 0.588 25.000 0.000 NA   NA
 7091977 7091978 Bphy_7038 Bphy_7039     FALSE 0.275 95.000 0.000 1.000   NA
 7091978 7091979 Bphy_7039 Bphy_7040     FALSE 0.306 86.000 0.000 1.000   NA
 7091979 7091980 Bphy_7040 Bphy_7041     FALSE 0.067 171.000 0.000 NA   NA
 7091982 7091983 Bphy_7043 Bphy_7044     FALSE 0.026 218.000 0.000 NA   NA
 7091983 7091984 Bphy_7044 Bphy_7045     FALSE 0.004 399.000 0.000 NA   NA
 7091985 7091986 Bphy_7046 Bphy_7047     FALSE 0.007 317.000 0.000 NA   NA
 7091988 7091989 Bphy_7049 Bphy_7050     TRUE 0.982 74.000 1.000 0.056 Y NA
 7091989 7091990 Bphy_7050 Bphy_7051     TRUE 0.998 -13.000 0.500 0.056 Y NA
 7091990 7091991 Bphy_7051 Bphy_7052     TRUE 0.997 5.000 0.400 0.056 Y NA
 7091991 7091992 Bphy_7052 Bphy_7053     TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 7091992 7091993 Bphy_7053 Bphy_7054     TRUE 0.990 8.000 0.857 1.000   NA
 7091993 7091994 Bphy_7054 Bphy_7055     TRUE 0.997 -10.000 0.857 0.050   NA
 7091994 7091995 Bphy_7055 Bphy_7056     TRUE 0.995 -7.000 0.500 0.041   NA
 7091995 7091996 Bphy_7056 Bphy_7057     TRUE 0.872 60.000 0.417 NA N NA
 7091996 7091997 Bphy_7057 Bphy_7058     FALSE 0.002 569.000 0.000 NA   NA
 7091997 7091998 Bphy_7058 Bphy_7059     FALSE 0.158 126.000 0.000 NA   NA
 7091999 7092000 Bphy_7060 Bphy_7061     TRUE 0.860 68.000 0.400 1.000 N NA
 7092000 7092001 Bphy_7061 Bphy_7062     TRUE 0.911 28.000 0.200 1.000 N NA
 7092001 7092002 Bphy_7062 Bphy_7063     TRUE 0.974 10.000 0.200 0.056 N NA
 7092002 7092003 Bphy_7063 Bphy_7064     TRUE 0.993 11.000 0.222 0.056 Y NA
 7092003 7092004 Bphy_7064 Bphy_7065     TRUE 0.836 54.000 0.222 1.000 N NA
 7092008 7092009 Bphy_7069 Bphy_7070     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 7092009 7092010 Bphy_7070 Bphy_7071     FALSE 0.336 63.000 0.000 NA   NA
 7092010 7092011 Bphy_7071 Bphy_7072     FALSE 0.134 145.000 0.000 1.000   NA
 7092011 7092012 Bphy_7072 Bphy_7073     FALSE 0.011 277.000 0.000 NA   NA
 7092012 7092013 Bphy_7073 Bphy_7074     FALSE 0.002 623.000 0.000 NA   NA
 7092013 7092014 Bphy_7074 Bphy_7075     FALSE 0.003 445.000 0.000 NA   NA
 7092014 7092015 Bphy_7075 Bphy_7076     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7092015 7092016 Bphy_7076 Bphy_7077     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 7092016 7092017 Bphy_7077 Bphy_7078     FALSE 0.089 157.000 0.000 NA   NA
 7092017 7092018 Bphy_7078 Bphy_7079     TRUE 0.904 19.000 0.103 NA   NA
 7092018 7092019 Bphy_7079 Bphy_7080     TRUE 0.712 13.000 0.000 NA   NA
 7092021 7092022 Bphy_7082 Bphy_7083     TRUE 0.883 15.000 0.000 0.001   NA
 7092028 7092029 Bphy_7089 Bphy_7090     TRUE 0.929 4.000 0.000 0.050   NA
 7092029 7092030 Bphy_7090 Bphy_7091     TRUE 0.750 28.000 0.000 0.082   NA
 7092030 7092031 Bphy_7091 Bphy_7092     TRUE 0.994 -3.000 0.524 NA   NA
 7092032 7092033 Bphy_7093 Bphy_7094     FALSE 0.002 439.000 0.000 NA N NA
 7092033 7092034 Bphy_7094 Bphy_7095     TRUE 0.628 60.000 0.036 1.000   NA
 7092035 7092036 Bphy_7096 Bphy_7097     TRUE 0.601 29.000 0.000 1.000   NA
 7092036 7092037 Bphy_7097 Bphy_7098     FALSE 0.040 196.000 0.000 NA   NA
 7092038 7092039 Bphy_7099 Bphy_7100     TRUE 0.861 64.000 0.000 0.069 Y NA
 7092039 7092040 Bphy_7100 Bphy_7101     FALSE 0.174 120.000 0.000 NA   NA
 7092041 7092042 Bphy_7102 Bphy_7103     FALSE 0.006 333.000 0.000 NA   NA
 7092045 7092046 Bphy_7106 Bphy_7107     FALSE 0.004 379.000 0.000 NA   NA
 7092046 7092047 Bphy_7107 Bphy_7108     FALSE 0.043 192.000 0.000 NA   NA
 7092048 7092049 Bphy_7109 Bphy_7110     FALSE 0.003 401.000 0.000 1.000 N NA
 7092053 7092054 Bphy_7114 Bphy_7115     FALSE 0.044 191.000 0.000 NA   NA
 7092054 7092055 Bphy_7115 Bphy_7116     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7092055 7092056 Bphy_7116 Bphy_7117     FALSE 0.300 74.000 0.000 NA   NA
 7092056 7092057 Bphy_7117 Bphy_7118     FALSE 0.208 106.000 0.000 NA   NA
 7092057 7092058 Bphy_7118 Bphy_7119     FALSE 0.009 298.000 0.000 NA   NA
 7092058 7092059 Bphy_7119 Bphy_7120     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092059 7092060 Bphy_7120 Bphy_7121     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7092060 7092061 Bphy_7121 Bphy_7122     FALSE 0.236 96.000 0.000 NA   NA
 7092061 7092062 Bphy_7122 Bphy_7123     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7092062 7092063 Bphy_7123 Bphy_7124     FALSE 0.464 40.000 0.000 NA   NA
 7092063 7092064 Bphy_7124 Bphy_7125     FALSE 0.516 34.000 0.000 NA   NA
 7092064 7092065 Bphy_7125 Bphy_7126     FALSE 0.096 153.000 0.000 NA   NA
 7092066 7092067 Bphy_7127 Bphy_7128     FALSE 0.279 83.000 0.000 NA   NA
 7092067 7092068 Bphy_7128 Bphy_7129     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092068 7092069 Bphy_7129 Bphy_7130     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092069 7092070 Bphy_7130 Bphy_7131     FALSE 0.005 357.000 0.000 NA   NA
 7092072 7092073 Bphy_7133 Bphy_7134     FALSE 0.002 595.000 0.000 NA   NA
 7092073 7092074 Bphy_7134 Bphy_7135     FALSE 0.009 317.000 0.000 1.000   NA
 7092074 7092075 Bphy_7135 Bphy_7136     TRUE 0.854 4.000 0.000 1.000   NA
 7092075 7092076 Bphy_7136 Bphy_7137     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092076 7092077 Bphy_7137 Bphy_7138     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7092077 7092078 Bphy_7138 Bphy_7139     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7092078 7092079 Bphy_7139 Bphy_7140     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7092079 7092080 Bphy_7140 Bphy_7141     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092080 7092081 Bphy_7141 Bphy_7142     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7092081 7092082 Bphy_7142 Bphy_7143     TRUE 0.864 -25.000 0.000 NA   NA
 7092082 7092083 Bphy_7143 Bphy_7144     FALSE 0.236 96.000 0.000 NA   NA
 7092083 7092084 Bphy_7144 Bphy_7145     TRUE 0.902 19.000 0.100 NA   NA
 7092084 7092085 Bphy_7145 Bphy_7146     TRUE 0.913 50.000 0.500 NA   NA
 7092085 7092086 Bphy_7146 Bphy_7147     TRUE 0.962 -3.000 0.023 NA   NA
 7092086 7092087 Bphy_7147 Bphy_7148     TRUE 0.985 -7.000 0.186 NA   NA
 7092087 7092088 Bphy_7148 Bphy_7149     TRUE 0.995 -3.000 0.635 NA   NA
 7092088 7092089 Bphy_7149 Bphy_7150     TRUE 0.835 61.000 0.250 NA   NA
 7092089 7092090 Bphy_7150 Bphy_7151     TRUE 0.963 11.000 0.214 NA   NA
 7092090 7092091 Bphy_7151 Bphy_7152     FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7092091 7092092 Bphy_7152 Bphy_7153     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7092092 7092093 Bphy_7153 Bphy_7154     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 7092093 7092094 Bphy_7154 Bphy_7155     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7092094 7092095 Bphy_7155 Bphy_7156     TRUE 0.796 7.000 0.000 NA   NA
 7092095 7092096 Bphy_7156 Bphy_7157     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7092096 7092097 Bphy_7157 Bphy_7158     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7092097 7092098 Bphy_7158 Bphy_7159     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7092098 7092099 Bphy_7159 Bphy_7160     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 7092099 7092100 Bphy_7160 Bphy_7161     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7092100 7092101 Bphy_7161 Bphy_7162     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 7092101 7092102 Bphy_7162 Bphy_7163     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7092102 7092103 Bphy_7163 Bphy_7164     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7092103 7092104 Bphy_7164 Bphy_7165     FALSE 0.002 662.000 0.000 NA   NA
 7092107 7092108 Bphy_7168 Bphy_7169     FALSE 0.110 147.000 0.000 NA   NA
 7092110 7092111 Bphy_7171 Bphy_7172     FALSE 0.047 184.000 0.000 1.000 N NA
 7092111 7092112 Bphy_7172 Bphy_7173     FALSE 0.035 197.000 0.000 1.000 N NA
 7092113 7092114 Bphy_7174 Bphy_7175     TRUE 0.748 13.000 0.000 1.000   NA
 7092114 7092115 Bphy_7175 Bphy_7176     TRUE 0.984 2.000 0.273 1.000 N NA
 7092115 7092116 Bphy_7176 Bphy_7177     TRUE 0.849 97.000 0.545 1.000   NA
 7092116 7092117 Bphy_7177 Bphy_7178     FALSE 0.073 168.000 0.000 NA   NA
 7092117 7092118 Bphy_7178 Bphy_7179     TRUE 0.622 21.000 0.000 NA   NA
 7092118 7092119 Bphy_7179 Bphy_7180     TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 7092119 7092120 Bphy_7180 Bphy_7181     FALSE 0.306 71.000 0.000 NA   NA
 7092121 7092122 Bphy_7182 Bphy_7183     FALSE 0.056 181.000 0.000 NA   NA
 7092123 7092124 Bphy_7184 Bphy_7185     FALSE 0.158 126.000 0.000 NA   NA
 7092124 7092125 Bphy_7185 Bphy_7186     FALSE 0.324 66.000 0.000 NA   NA
 7092125 7092126 Bphy_7186 Bphy_7187     FALSE 0.045 190.000 0.000 NA   NA
 7092128 7092129 Bphy_7189 Bphy_7190     FALSE 0.007 330.000 0.000 1.000   NA
 7092131 7092132 Bphy_7192 Bphy_7193     TRUE 0.929 72.000 0.643 0.049   NA
 7092132 7092133 Bphy_7193 Bphy_7194     FALSE 0.004 372.000 0.000 NA   NA
 7092133 7092134 Bphy_7194 Bphy_7195     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7092134 7092135 Bphy_7195 Bphy_7196     FALSE 0.312 69.000 0.000 NA   NA
 7092135 7092136 Bphy_7196 Bphy_7197     FALSE 0.158 126.000 0.000 NA   NA
 7092141 7092142 Bphy_7202 Bphy_7203     FALSE 0.001 2404.000 0.000 NA   NA
 7092142 7092143 Bphy_7203 Bphy_7204     TRUE 0.975 13.000 0.500 1.000 N NA
 7092143 7092144 Bphy_7204 Bphy_7205     FALSE 0.302 87.000 0.000 1.000   NA
 7092144 7092145 Bphy_7205 Bphy_7206     FALSE 0.001 1077.000 0.000 NA   NA
 7092146 7092147 Bphy_7207 Bphy_7208     FALSE 0.397 186.000 0.000 0.068 Y NA
 7092148 7092149 Bphy_7209 Bphy_7210     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7092149 7092150 Bphy_7210 Bphy_7211     TRUE 0.994 23.000 0.875 0.081 Y NA
 7092150 7092151 Bphy_7211 Bphy_7212     TRUE 0.977 10.000 0.429 NA N NA
 7092153 7092154 Bphy_7214 Bphy_7215     TRUE 0.996 4.000 0.214 0.001 Y NA
 7092156 7092157 Bphy_7217 Bphy_7218     TRUE 0.991 -3.000 0.333 1.000 N NA
 7092157 7092158 Bphy_7218 Bphy_7219     FALSE 0.004 398.000 0.000 NA   NA
 7092158 7092159 Bphy_7219 Bphy_7220     FALSE 0.198 110.000 0.000 NA   NA
 7092159 7092160 Bphy_7220 Bphy_7221     FALSE 0.026 219.000 0.000 NA   NA
 7092160 7092161 Bphy_7221 Bphy_7222     FALSE 0.011 278.000 0.000 NA   NA
 7092161 7092162 Bphy_7222 Bphy_7223     FALSE 0.332 64.000 0.000 NA   NA
 7092164 7092165 Bphy_7225 Bphy_7226     FALSE 0.037 199.000 0.000 NA   NA
 7092166 7092167 Bphy_7227 Bphy_7228     TRUE 0.996 8.000 0.395 0.056 Y NA
 7092167 7092168 Bphy_7228 Bphy_7229     TRUE 0.999 -3.000 0.692 0.007 Y NA
 7092168 7092169 Bphy_7229 Bphy_7230     TRUE 0.553 35.000 0.000 1.000   NA
 7092169 7092170 Bphy_7230 Bphy_7231     TRUE 0.996 -7.000 0.667 0.049   NA
 7092171 7092172 Bphy_7232 Bphy_7233     TRUE 0.933 44.000 0.667 NA N NA
 7092172 7092173 Bphy_7233 Bphy_7234     TRUE 0.975 27.000 0.176 1.000 Y NA
 7092173 7092174 Bphy_7234 Bphy_7235     TRUE 0.983 24.000 0.176 0.056 Y NA
 7092174 7092175 Bphy_7235 Bphy_7236     TRUE 0.997 12.000 1.000 0.056 Y NA
 7092175 7092176 Bphy_7236 Bphy_7237     FALSE 0.382 62.000 0.000 1.000   NA
 7092176 7092177 Bphy_7237 Bphy_7238     FALSE 0.060 186.000 0.000 1.000   NA
 7092177 7092178 Bphy_7238 Bphy_7239     FALSE 0.025 202.000 0.000 NA N NA
 7092178 7092179 Bphy_7239 Bphy_7240     FALSE 0.336 63.000 0.000 NA   NA
 7092181 7092182 Bphy_7242 Bphy_7243     FALSE 0.426 52.000 0.000 1.000   NA
 7092182 7092183 Bphy_7243 Bphy_7244     TRUE 0.986 -10.000 0.235 NA   NA
 7092183 7092184 Bphy_7244 Bphy_7245     TRUE 0.991 -7.000 0.375 NA   NA
 7092184 7092185 Bphy_7245 Bphy_7246     TRUE 0.865 71.000 0.429 NA   NA
 7092185 7090482 Bphy_7246 Bphy_5543     FALSE 0.001 911.000 0.000 1.000 N NA
 7092188 7092189 Bphy_7249 Bphy_7250     FALSE 0.151 129.000 0.000 NA   NA
 7092190 7092191 Bphy_7251 Bphy_7252     TRUE 0.995 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 7092191 7092192 Bphy_7252 Bphy_7253     TRUE 0.999 -3.000 0.917 NA Y NA
 7092192 7092193 Bphy_7253 Bphy_7254     TRUE 0.975 14.000 0.069 NA Y NA
 7092193 7092194 Bphy_7254 Bphy_7255     TRUE 0.984 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 7092194 7092195 Bphy_7255 Bphy_7256     FALSE 0.281 150.000 0.000 0.001   NA
 7092195 7092196 Bphy_7256 Bphy_7257     TRUE 0.892 -7.000 0.000 NA   NA
 7092196 7092197 Bphy_7257 Bphy_7258     TRUE 0.990 -3.000 0.255 NA   NA
 7092197 7092198 Bphy_7258 Bphy_7259     TRUE 0.985 0.000 0.218 NA   NA
 7092198 7092199 Bphy_7259 Bphy_7260     TRUE 0.996 -3.000 0.769 NA   NA
 7092199 7092200 Bphy_7260 Bphy_7261     TRUE 0.991 -3.000 0.308 NA   NA
 7092200 7092201 Bphy_7261 Bphy_7262     TRUE 0.986 0.000 0.250 NA   NA
 7092201 7092202 Bphy_7262 Bphy_7263     TRUE 0.993 4.000 0.177 1.000 Y NA
 7092202 7092203 Bphy_7263 Bphy_7264     TRUE 0.985 34.000 0.355 0.049 Y NA
 7092203 7092204 Bphy_7264 Bphy_7265     TRUE 0.999 -3.000 0.611 0.000 Y NA
 7092205 7092206 Bphy_7266 Bphy_7267     FALSE 0.002 586.000 0.000 NA   NA
 7092206 7092207 Bphy_7267 Bphy_7268     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7092207 7092208 Bphy_7268 Bphy_7269     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092208 7092209 Bphy_7269 Bphy_7270     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7092209 7092210 Bphy_7270 Bphy_7271     TRUE 0.594 83.000 0.011 0.028 N NA
 7092210 7092211 Bphy_7271 Bphy_7272     TRUE 0.994 -6.000 0.079 1.000 Y NA
 7092211 7092212 Bphy_7272 Bphy_7273     FALSE 0.223 100.000 0.000 NA   NA
 7092214 7092215 Bphy_7275 Bphy_7276     FALSE 0.001 1028.000 0.000 NA   NA
 7092215 7092216 Bphy_7276 Bphy_7277     FALSE 0.020 235.000 0.000 NA   NA
 7092216 7092217 Bphy_7277 Bphy_7278     TRUE 0.966 19.000 0.436 1.000   NA
 7092218 7092219 Bphy_7279 Bphy_7280     TRUE 0.982 0.000 0.170 NA   NA
 7092219 7092220 Bphy_7280 Bphy_7281     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7092220 7092221 Bphy_7281 Bphy_7282     TRUE 0.579 26.000 0.000 NA   NA
 7092222 7092223 Bphy_7283 Bphy_7284     TRUE 0.884 -10.000 0.000 NA   NA
 7092223 7092224 Bphy_7284 Bphy_7285     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7092224 7092225 Bphy_7285 Bphy_7286     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 7092225 7092226 Bphy_7286 Bphy_7287     FALSE 0.007 323.000 0.000 NA   NA
 7092226 7092227 Bphy_7287 Bphy_7288     FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 7092227 7092228 Bphy_7288 Bphy_7289     TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 7092230 7092231 Bphy_7291 Bphy_7292     TRUE 0.873 -16.000 0.000 NA   NA
 7092231 7092232 Bphy_7292 Bphy_7293     TRUE 0.679 130.000 0.333 NA   NA
 7092232 7092233 Bphy_7293 Bphy_7294     FALSE 0.005 362.000 0.000 NA   NA
 7092233 7092234 Bphy_7294 Bphy_7295     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 7092234 7092235 Bphy_7295 Bphy_7296     TRUE 0.867 -21.000 0.000 NA   NA
 7092235 7092236 Bphy_7296 Bphy_7297     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092236 7092237 Bphy_7297 Bphy_7298     TRUE 0.871 98.000 0.750 NA   NA
 7092237 7092238 Bphy_7298 Bphy_7299     FALSE 0.001 1145.000 0.000 NA   NA
 7092238 7092239 Bphy_7299 Bphy_7300     TRUE 0.888 -1.000 0.000 NA   NA
 7092239 7092240 Bphy_7300 Bphy_7301     FALSE 0.024 224.000 0.000 NA   NA
 7092240 7092241 Bphy_7301 Bphy_7302     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7092242 7092243 Bphy_7303 Bphy_7304     TRUE 0.993 -40.000 0.763 NA   NA
 7092244 7092245 Bphy_7305 Bphy_7306     FALSE 0.085 205.000 0.000 0.048   NA
 7092245 7092246 Bphy_7306 Bphy_7307     FALSE 0.005 371.000 0.000 1.000   NA
 7092246 7092247 Bphy_7307 Bphy_7308     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7092247 7092248 Bphy_7308 Bphy_7309     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7092248 7092249 Bphy_7309 Bphy_7310     FALSE 0.214 104.000 0.000 NA   NA
 7092249 7092250 Bphy_7310 Bphy_7311     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 7092250 7092251 Bphy_7311 Bphy_7312     FALSE 0.275 84.000 0.000 NA   NA
 7092251 7092252 Bphy_7312 Bphy_7313     TRUE 0.730 7.000 0.000 NA N NA
 7092252 7092253 Bphy_7313 Bphy_7314     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 7092254 7092255 Bphy_7315 Bphy_7316     TRUE 0.996 -3.000 0.857 NA   NA
 7092255 7092256 Bphy_7316 Bphy_7317     FALSE 0.013 263.000 0.000 NA   NA
 7092256 7092257 Bphy_7317 Bphy_7318     FALSE 0.005 359.000 0.000 NA   NA
 7092258 7092259 Bphy_7319 Bphy_7320     TRUE 0.991 -10.000 0.410 1.000   NA
 7092259 7092260 Bphy_7320 Bphy_7321     FALSE 0.005 369.000 0.000 1.000   NA
 7092261 7092262 Bphy_7322 Bphy_7323     TRUE 0.884 -10.000 0.000 NA   NA
 7092263 7092264 Bphy_7324 Bphy_7325     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7092267 7092268 Bphy_7328 Bphy_7329     FALSE 0.064 173.000 0.000 NA   NA
 7092268 7092269 Bphy_7329 Bphy_7330     TRUE 0.845 69.000 0.333 NA   NA
 7092269 7092270 Bphy_7330 Bphy_7331     FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 7092270 7092271 Bphy_7331 Bphy_7332     FALSE 0.057 179.000 0.000 NA   NA
 7092271 7092272 Bphy_7332 Bphy_7333     FALSE 0.151 129.000 0.000 NA   NA
 7092272 7092273 Bphy_7333 Bphy_7334     TRUE 0.972 4.000 0.167 NA   NA
 7092273 7092274 Bphy_7334 Bphy_7335     TRUE 0.995 0.000 0.833 NA   NA
 7092274 7092275 Bphy_7335 Bphy_7336     FALSE 0.017 245.000 0.000 NA   NA
 7092275 7092276 Bphy_7336 Bphy_7337     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7092276 7092277 Bphy_7337 Bphy_7338     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092277 7092278 Bphy_7338 Bphy_7339     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7092278 7092279 Bphy_7339 Bphy_7340     FALSE 0.039 197.000 0.000 NA   NA
 7092279 7092280 Bphy_7340 Bphy_7341     FALSE 0.002 635.000 0.000 NA   NA
 7092280 7092281 Bphy_7341 Bphy_7342     FALSE 0.008 310.000 0.000 NA   NA
 7092281 7092282 Bphy_7342 Bphy_7343     FALSE 0.054 183.000 0.000 NA   NA
 7092282 7092283 Bphy_7343 Bphy_7344     TRUE 0.857 14.000 0.026 NA   NA
 7092283 7092284 Bphy_7344 Bphy_7345     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 7092284 7092285 Bphy_7345 Bphy_7346     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092286 7092287 Bphy_7347 Bphy_7348     FALSE 0.002 589.000 0.000 NA   NA
 7092287 7092288 Bphy_7348 Bphy_7349     FALSE 0.413 46.000 0.000 NA   NA
 7092288 7092289 Bphy_7349 Bphy_7350     FALSE 0.302 73.000 0.000 NA   NA
 7092289 7092290 Bphy_7350 Bphy_7351     FALSE 0.362 56.000 0.000 NA   NA
 7092292 7092293 Bphy_7353 Bphy_7354     FALSE 0.017 246.000 0.000 NA   NA
 7092293 7092294 Bphy_7354 Bphy_7355     TRUE 0.994 -3.000 0.273 0.047   NA
 7092294 7092295 Bphy_7355 Bphy_7356     FALSE 0.427 44.000 0.000 NA   NA
 7092296 7092297 Bphy_7357 Bphy_7358     FALSE 0.001 794.000 0.000 NA   NA
 7092297 7092298 Bphy_7358 Bphy_7359     FALSE 0.382 52.000 0.000 NA   NA
 7092298 7092299 Bphy_7359 Bphy_7360     FALSE 0.009 298.000 0.000 NA   NA
 7092299 7092300 Bphy_7360 Bphy_7361     FALSE 0.001 1754.000 0.000 NA   NA
 7092300 7092301 Bphy_7361 Bphy_7362     TRUE 0.588 25.000 0.000 NA   NA
 7092301 7092302 Bphy_7362 Bphy_7363     FALSE 0.300 74.000 0.000 NA   NA
 7092302 7092303 Bphy_7363 Bphy_7364     FALSE 0.001 780.000 0.000 NA   NA
 7092304 7092305 Bphy_7365 Bphy_7366     FALSE 0.002 612.000 0.000 NA   NA
 7092305 7092306 Bphy_7366 Bphy_7367     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7092307 7092308 Bphy_7368 Bphy_7369     FALSE 0.167 123.000 0.000 NA   NA
 7092308 7092309 Bphy_7369 Bphy_7370     FALSE 0.003 420.000 0.000 NA   NA
 7092310 7092311 Bphy_7371 Bphy_7372     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 7092312 7092313 Bphy_7373 Bphy_7374     TRUE 0.614 22.000 0.000 NA   NA
 7092313 7092314 Bphy_7374 Bphy_7375     FALSE 0.320 67.000 0.000 NA   NA
 7092314 7092315 Bphy_7375 Bphy_7376     FALSE 0.249 92.000 0.000 NA   NA
 7092316 7092317 Bphy_7377 Bphy_7378     TRUE 0.847 18.000 0.000 0.010   NA
 7092317 7092318 Bphy_7378 Bphy_7379     FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 7092318 7092319 Bphy_7379 Bphy_7380     FALSE 0.312 69.000 0.000 NA   NA
 7092324 7092325 Bphy_7385 Bphy_7386     TRUE 0.996 -3.000 0.727 NA   NA
 7092325 7092326 Bphy_7386 Bphy_7387     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 7092329 7092330 Bphy_7390 Bphy_7391     TRUE 0.865 96.000 0.667 NA   NA
 7092331 7092332 Bphy_7392 Bphy_7393     FALSE 0.020 235.000 0.000 NA   NA
 7092336 7092337 Bphy_7397 Bphy_7398     FALSE 0.464 40.000 0.000 NA   NA
 7092337 7092338 Bphy_7398 Bphy_7399     TRUE 0.892 -7.000 0.000 NA   NA
 7092338 7092339 Bphy_7399 Bphy_7400     FALSE 0.347 60.000 0.000 NA   NA
 7092339 7092340 Bphy_7400 Bphy_7401     FALSE 0.487 37.000 0.000 NA   NA
 7092340 7092341 Bphy_7401 Bphy_7402     FALSE 0.003 420.000 0.000 NA   NA
 7092343 7092344 Bphy_7404 Bphy_7405     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7092345 7092346 Bphy_7406 Bphy_7407     FALSE 0.294 89.000 0.000 1.000   NA
 7092346 7092347 Bphy_7407 Bphy_7408     FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 7092347 7092348 Bphy_7408 Bphy_7409     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7092348 7092349 Bphy_7409 Bphy_7410     FALSE 0.372 54.000 0.000 NA   NA
 7092349 7092350 Bphy_7410 Bphy_7411     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7092351 7092352 Bphy_7412 Bphy_7413     FALSE 0.516 34.000 0.000 NA   NA
 7092352 7092353 Bphy_7413 Bphy_7414     FALSE 0.437 43.000 0.000 NA   NA
 7092353 7092354 Bphy_7414 Bphy_7415     TRUE 0.616 61.000 0.000 0.006   NA
 7092355 7092356 Bphy_7416 Bphy_7417     FALSE 0.246 93.000 0.000 NA   NA
 7092356 7092357 Bphy_7417 Bphy_7418     FALSE 0.002 593.000 0.000 NA   NA
 7092357 7092358 Bphy_7418 Bphy_7419     TRUE 0.993 -13.000 0.600 1.000   NA
 7092359 7092360 Bphy_7420 Bphy_7421     FALSE 0.001 690.000 0.000 1.000 N NA
 7092360 7092361 Bphy_7421 Bphy_7422     FALSE 0.012 520.000 0.121 1.000 N NA
 7092363 7092364 Bphy_7424 Bphy_7425     FALSE 0.294 77.000 0.000 NA   NA
 7092364 7092365 Bphy_7425 Bphy_7426     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7092365 7092366 Bphy_7426 Bphy_7427     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092366 7092367 Bphy_7427 Bphy_7428     FALSE 0.226 99.000 0.000 NA   NA
 7092368 7092369 Bphy_7429 Bphy_7430     FALSE 0.009 292.000 0.000 NA   NA
 7092370 7092371 Bphy_7431 Bphy_7432     FALSE 0.009 296.000 0.000 NA   NA
 7092371 7092372 Bphy_7432 Bphy_7433     FALSE 0.010 285.000 0.000 NA   NA
 7092372 7092373 Bphy_7433 Bphy_7434     TRUE 0.747 121.000 0.000 0.006 Y NA
 7092373 7092374 Bphy_7434 Bphy_7435     TRUE 0.798 70.000 0.000 1.000 Y NA
 7092374 7092375 Bphy_7435 Bphy_7436     TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 7092376 7092377 Bphy_7437 Bphy_7438     FALSE 0.386 189.000 0.364 NA   NA
 7092377 7092378 Bphy_7438 Bphy_7439     FALSE 0.031 271.000 0.000 0.047   NA
 7092379 7092380 Bphy_7440 Bphy_7441     FALSE 0.217 103.000 0.000 NA   NA
 7092380 7092381 Bphy_7441 Bphy_7442     TRUE 0.553 35.000 0.000 1.000   NA
 7092381 7092382 Bphy_7442 Bphy_7443     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092382 7092383 Bphy_7443 Bphy_7444     FALSE 0.064 173.000 0.000 NA   NA
 7092383 7092384 Bphy_7444 Bphy_7445     FALSE 0.283 82.000 0.000 NA   NA
 7092384 7092385 Bphy_7445 Bphy_7446     TRUE 0.991 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 7092385 7092386 Bphy_7446 Bphy_7447     TRUE 0.970 -7.000 0.021 0.060 N NA
 7092386 7092387 Bphy_7447 Bphy_7448     TRUE 0.980 0.000 0.167 1.000 N NA
 7092387 7092388 Bphy_7448 Bphy_7449     TRUE 0.995 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 7092388 7092389 Bphy_7449 Bphy_7450     TRUE 0.997 13.000 0.950 0.055 Y NA
 7092389 7092390 Bphy_7450 Bphy_7451     TRUE 0.967 101.000 0.783 0.055 Y NA
 7092393 7092394 Bphy_7454 Bphy_7455   glcE TRUE 0.995 0.000 0.070 0.011 Y NA
 7092394 7092395 Bphy_7455 Bphy_7456 glcE   TRUE 0.945 14.000 0.074 0.040   NA
 7092396 7092397 Bphy_7457 Bphy_7458     FALSE 0.105 149.000 0.000 NA   NA
 7092397 7092398 Bphy_7458 Bphy_7459     TRUE 0.990 -13.000 0.000 0.008 Y NA
 7092398 7092399 Bphy_7459 Bphy_7460     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 7092399 7092400 Bphy_7460 Bphy_7461     FALSE 0.006 512.000 0.000 0.047   NA
 7092400 7092401 Bphy_7461 Bphy_7462     TRUE 0.970 9.000 0.116 0.047   NA
 7092401 7092402 Bphy_7462 Bphy_7463     FALSE 0.050 186.000 0.000 NA   NA
 7092402 7092403 Bphy_7463 Bphy_7464     TRUE 0.859 -2235.000 0.000 NA   NA
 7092403 7092404 Bphy_7464 Bphy_7465     FALSE 0.010 1441.000 0.000 NA Y NA
 7092404 7092405 Bphy_7465 Bphy_7466     TRUE 0.989 0.000 0.333 NA   NA
 7092405 7092406 Bphy_7466 Bphy_7467     FALSE 0.268 86.000 0.000 NA   NA
 7092406 7092407 Bphy_7467 Bphy_7468     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7092407 7092408 Bphy_7468 Bphy_7469     FALSE 0.002 671.000 0.000 NA   NA
 7092408 7092409 Bphy_7469 Bphy_7470     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 7092412 7092413 Bphy_7473 Bphy_7474     FALSE 0.362 56.000 0.000 NA   NA
 7092417 7092418 Bphy_7478 Bphy_7479     TRUE 0.947 19.000 0.267 1.000 N NA
 7092418 7092419 Bphy_7479 Bphy_7480     FALSE 0.011 276.000 0.000 NA   NA
 7092419 7092420 Bphy_7480 Bphy_7481     FALSE 0.172 121.000 0.000 NA   NA
 7092422 7092423 Bphy_7483 Bphy_7484     FALSE 0.006 346.000 0.000 NA   NA
 7092424 7092425 Bphy_7485 Bphy_7486     FALSE 0.004 418.000 0.000 1.000   NA
 7092425 7092426 Bphy_7486 Bphy_7487     FALSE 0.003 431.000 0.000 NA   NA
 7092426 7092427 Bphy_7487 Bphy_7488     FALSE 0.304 72.000 0.000 NA   NA
 7092427 7092428 Bphy_7488 Bphy_7489     FALSE 0.047 189.000 0.000 NA   NA
 7092428 7092429 Bphy_7489 Bphy_7490     FALSE 0.010 284.000 0.000 NA   NA
 7092429 7092430 Bphy_7490 Bphy_7491     TRUE 0.566 24.000 0.000 1.000 N NA
 7092432 7092433 Bphy_7493 Bphy_7494     FALSE 0.005 502.000 0.000 0.055 N NA
 7092433 7092434 Bphy_7494 Bphy_7495     FALSE 0.018 242.000 0.000 NA   NA
 7092434 7092435 Bphy_7495 Bphy_7496     FALSE 0.158 126.000 0.000 NA   NA
 7092435 7092436 Bphy_7496 Bphy_7497     FALSE 0.016 259.000 0.000 1.000   NA
 7092436 7092437 Bphy_7497 Bphy_7498     FALSE 0.196 103.000 0.000 1.000 N NA
 7092437 7092438 Bphy_7498 Bphy_7499     TRUE 0.984 -6.000 0.077 0.060   NA
 7092438 7092439 Bphy_7499 Bphy_7500     TRUE 0.649 23.000 0.000 1.000   NA
 7092439 7092440 Bphy_7500 Bphy_7501     TRUE 0.640 123.000 0.000 1.000 Y NA
 7092440 7092441 Bphy_7501 Bphy_7502     TRUE 0.973 26.000 0.150 1.000 Y NA
 7092441 7092442 Bphy_7502 Bphy_7503     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7092442 7092443 Bphy_7503 Bphy_7504     FALSE 0.342 61.000 0.000 NA   NA
 7092444 7092445 Bphy_7505 Bphy_7506     FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7092445 7092446 Bphy_7506 Bphy_7507     FALSE 0.304 72.000 0.000 NA   NA
 7092447 7092448 Bphy_7508 Bphy_7509     TRUE 0.796 7.000 0.000 NA   NA
 7092448 7092449 Bphy_7509 Bphy_7510     TRUE 0.996 13.000 0.804 0.060 Y NA
 7092451 7092452 Bphy_7512 Bphy_7513     TRUE 0.896 -4.000 0.000 NA   NA
 7092453 7092454 Bphy_7514 Bphy_7515     FALSE 0.359 57.000 0.000 NA   NA
 7092455 7092456 Bphy_7516 Bphy_7517     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7092456 7092457 Bphy_7517 Bphy_7518     FALSE 0.010 286.000 0.000 NA   NA
 7092457 7092458 Bphy_7518 Bphy_7519     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 7092458 7092459 Bphy_7519 Bphy_7520     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7092459 7092460 Bphy_7520 Bphy_7521     FALSE 0.306 71.000 0.000 NA   NA
 7092460 7092461 Bphy_7521 Bphy_7522     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092461 7092462 Bphy_7522 Bphy_7523     FALSE 0.048 188.000 0.000 NA   NA
 7092462 7092463 Bphy_7523 Bphy_7524     FALSE 0.001 907.000 0.000 NA   NA
 7092463 7092464 Bphy_7524 Bphy_7525     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092464 7092465 Bphy_7525 Bphy_7526     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092465 7092466 Bphy_7526 Bphy_7527     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 7092466 7092467 Bphy_7527 Bphy_7528     TRUE 0.805 6.000 0.000 NA   NA
 7092467 7092468 Bphy_7528 Bphy_7529     TRUE 0.986 18.000 0.286 NA Y NA
 7092468 7092469 Bphy_7529 Bphy_7530     TRUE 0.998 -3.000 0.333 NA Y NA
 7092469 7092470 Bphy_7530 Bphy_7531     FALSE 0.008 310.000 0.000 NA   NA
 7092470 7092471 Bphy_7531 Bphy_7532     TRUE 0.596 24.000 0.000 NA   NA
 7092471 7092472 Bphy_7532 Bphy_7533     TRUE 0.884 -10.000 0.000 NA   NA
 7092472 7092473 Bphy_7533 Bphy_7534     TRUE 0.712 13.000 0.000 NA   NA
 7092473 7092474 Bphy_7534 Bphy_7535     TRUE 0.992 0.000 0.500 NA   NA
 7092474 7092475 Bphy_7535 Bphy_7536     TRUE 0.981 10.000 0.500 NA   NA
 7092475 7092476 Bphy_7536 Bphy_7537     FALSE 0.427 44.000 0.000 NA   NA
 7092478 7092479 Bphy_7539 Bphy_7540     FALSE 0.376 53.000 0.000 NA   NA
 7092480 7092481 Bphy_7541 Bphy_7542     FALSE 0.002 525.000 0.000 NA   NA
 7092481 7092482 Bphy_7542 Bphy_7543     TRUE 0.869 -19.000 0.000 NA   NA
 7092482 7092483 Bphy_7543 Bphy_7544     FALSE 0.002 705.000 0.000 NA   NA
 7092483 7092484 Bphy_7544 Bphy_7545     TRUE 0.995 -3.000 0.650 1.000   NA
 7092485 7092486 Bphy_7546 Bphy_7547     FALSE 0.083 160.000 0.000 NA   NA
 7092486 7092487 Bphy_7547 Bphy_7548     FALSE 0.003 449.000 0.000 NA   NA
 7092487 7092488 Bphy_7548 Bphy_7549     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000 N NA
 7092492 7092493 Bphy_7553 Bphy_7554     TRUE 0.664 17.000 0.000 NA   NA
 7092493 7092494 Bphy_7554 Bphy_7555     FALSE 0.007 325.000 0.000 NA   NA
 7092494 7092495 Bphy_7555 Bphy_7556     FALSE 0.015 252.000 0.000 NA   NA
 7092495 7092496 Bphy_7556 Bphy_7557     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7092496 7092497 Bphy_7557 Bphy_7558     FALSE 0.382 52.000 0.000 NA   NA
 7092500 7092501 Bphy_7561 Bphy_7562     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 7092501 7092502 Bphy_7562 Bphy_7563     TRUE 0.865 1.000 0.000 NA   NA
 7092502 7092503 Bphy_7563 Bphy_7564     TRUE 0.829 4.000 0.000 NA   NA
 7092503 7092504 Bphy_7564 Bphy_7565     FALSE 0.138 135.000 0.000 NA   NA
 7092504 7092505 Bphy_7565 Bphy_7566     FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 7092505 7092506 Bphy_7566 Bphy_7567     FALSE 0.309 70.000 0.000 NA   NA
 7092506 7092507 Bphy_7567 Bphy_7568     FALSE 0.004 376.000 0.000 NA   NA
 7092507 7092508 Bphy_7568 Bphy_7569     FALSE 0.002 626.000 0.000 NA   NA
 7092508 7092509 Bphy_7569 Bphy_7570     FALSE 0.003 468.000 0.000 NA   NA
 7092512 7092513 Bphy_7573 Bphy_7574     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 7092513 7092514 Bphy_7574 Bphy_7575     TRUE 0.870 40.000 0.182 NA   NA
 7092515 7092516 Bphy_7576 Bphy_7577     FALSE 0.399 48.000 0.000 NA   NA
 7092517 7092518 Bphy_7578 Bphy_7579     FALSE 0.009 297.000 0.000 NA   NA
 7092519 7092520 Bphy_7580 Bphy_7581     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7092521 7092522 Bphy_7582 Bphy_7583     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7092522 7092523 Bphy_7583 Bphy_7584     TRUE 0.865 -22.000 0.000 NA   NA
 7092523 7092524 Bphy_7584 Bphy_7585     FALSE 0.246 93.000 0.000 NA   NA
 7092524 7092525 Bphy_7585 Bphy_7586     FALSE 0.071 169.000 0.000 NA   NA
 7092525 7092526 Bphy_7586 Bphy_7587     FALSE 0.540 31.000 0.000 NA   NA
 7092526 7092527 Bphy_7587 Bphy_7588     FALSE 0.087 168.000 0.000 1.000   NA
 7092528 7092529 Bphy_7589 Bphy_7590     TRUE 0.964 4.000 0.115 NA   NA
 7092532 7092533 Bphy_7593 Bphy_7594     TRUE 0.999 -7.000 0.500 0.008 Y NA
 7092533 7092534 Bphy_7594 Bphy_7595     TRUE 0.998 -3.000 0.357 0.008 Y NA
 7092536 7092537 Bphy_7597 Bphy_7598     FALSE 0.217 103.000 0.000 NA   NA
 7092537 7092538 Bphy_7598 Bphy_7599     TRUE 0.990 -3.000 0.238 NA   NA
 7092538 7092539 Bphy_7599 Bphy_7600     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7092539 7092540 Bphy_7600 Bphy_7601     FALSE 0.239 95.000 0.000 NA   NA
 7092541 7092542 Bphy_7602 Bphy_7603     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092542 7092543 Bphy_7603 Bphy_7604     TRUE 0.861 -34.000 0.000 NA   NA
 7092543 7092544 Bphy_7604 Bphy_7605     TRUE 0.995 -3.000 0.375 0.008   NA
 7092544 7092545 Bphy_7605 Bphy_7606     TRUE 0.991 -3.000 0.312 NA   NA
 7092548 7092549 Bphy_7609 Bphy_7610     FALSE 0.133 137.000 0.000 NA   NA
 7092549 7092550 Bphy_7610 Bphy_7611     FALSE 0.376 53.000 0.000 NA   NA
 7092553 7092554 Bphy_7615 Bphy_7616     TRUE 0.995 0.000 0.833 NA   NA
 7092554 7092555 Bphy_7616 Bphy_7617     FALSE 0.223 100.000 0.000 NA   NA
 7092556 7092557 Bphy_7618 Bphy_7619     TRUE 0.970 9.000 0.116 0.047   NA
 7092557 7092558 Bphy_7619 Bphy_7620     FALSE 0.152 264.000 0.000 0.008 Y NA
 7092558 7092559 Bphy_7620 Bphy_7621     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.008 Y NA
 7092559 7092560 Bphy_7621 Bphy_7622     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 7092560 7092561 Bphy_7622 Bphy_7623     TRUE 0.842 53.000 0.000 1.000 Y NA
 7092561 7092562 Bphy_7623 Bphy_7624     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7092563 7092564 Bphy_7625 Bphy_7626     FALSE 0.386 189.000 0.364 NA   NA
 7092564 7092565 Bphy_7626 Bphy_7627     TRUE 0.927 21.000 0.182 NA   NA
 7092565 7092566 Bphy_7627 Bphy_7628     TRUE 0.984 -10.000 0.188 NA   NA
 7092566 7092567 Bphy_7628 Bphy_7629     FALSE 0.001 930.000 0.000 NA   NA
 7092567 7092568 Bphy_7629 Bphy_7630     FALSE 0.170 122.000 0.000 NA   NA
 7092569 7092570 Bphy_7631 Bphy_7632     FALSE 0.123 141.000 0.000 NA   NA
 7092571 7092572 Bphy_7633 Bphy_7634     FALSE 0.005 329.000 0.000 1.000 N NA
 7092572 7092573 Bphy_7634 Bphy_7635     FALSE 0.076 165.000 0.000 NA   NA
 7092573 7092574 Bphy_7635 Bphy_7636     FALSE 0.309 70.000 0.000 NA   NA
 7092574 7092575 Bphy_7636 Bphy_7637     TRUE 0.974 16.000 0.273 0.003   NA
 7092576 7092577 Bphy_7638 Bphy_7639     TRUE 0.571 27.000 0.000 NA   NA
 7092577 7092578 Bphy_7639 Bphy_7640     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 7092578 7092579 Bphy_7640 Bphy_7641     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 7092579 7092580 Bphy_7641 Bphy_7642     TRUE 0.867 -21.000 0.000 NA   NA
 7092581 7092582 Bphy_7643 Bphy_7644     FALSE 0.005 367.000 0.000 NA   NA
 7092582 7092583 Bphy_7644 Bphy_7645     TRUE 0.997 11.000 0.923 0.054 Y NA
 7092583 7092584 Bphy_7645 Bphy_7646     TRUE 0.972 59.000 0.382 0.054 Y NA
 7092584 7092585 Bphy_7646 Bphy_7647     TRUE 0.994 2.000 0.176 1.000 Y NA
 7092585 7092586 Bphy_7647 Bphy_7648     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.016 Y NA
 7092586 7092587 Bphy_7648 Bphy_7649     FALSE 0.055 182.000 0.000 NA   NA
 7092587 7092588 Bphy_7649 Bphy_7650     FALSE 0.151 129.000 0.000 NA   NA
 7092588 7092589 Bphy_7650 Bphy_7651     FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 7092589 7092590 Bphy_7651 Bphy_7652     FALSE 0.179 95.000 0.000 NA N NA
 7092592 7092593 Bphy_7654 Bphy_7655     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092593 7092594 Bphy_7655 Bphy_7656     FALSE 0.007 320.000 0.000 NA   NA
 7092594 7092595 Bphy_7656 Bphy_7657     FALSE 0.096 153.000 0.000 NA   NA
 7092598 7092599 Bphy_7660 Bphy_7661     FALSE 0.261 88.000 0.000 NA   NA
 7092599 7092600 Bphy_7661 Bphy_7662     FALSE 0.003 432.000 0.000 NA   NA
 7092600 7092601 Bphy_7662 Bphy_7663     TRUE 0.998 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 7092601 7092602 Bphy_7663 Bphy_7664     FALSE 0.324 66.000 0.000 NA   NA
 7092606 7092607 Bphy_7668 Bphy_7669     FALSE 0.386 189.000 0.364 NA   NA
 7092608 7092609 Bphy_7670 Bphy_7671     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7092609 7092610 Bphy_7671 Bphy_7672     FALSE 0.254 90.000 0.000 NA   NA
 7092610 7092611 Bphy_7672 Bphy_7673     FALSE 0.362 56.000 0.000 NA   NA
 7092611 7092612 Bphy_7673 Bphy_7674     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 7092612 7092613 Bphy_7674 Bphy_7675     FALSE 0.038 198.000 0.000 NA   NA
 7092616 7092617 Bphy_7678 Bphy_7679     TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 7092619 7092620 Bphy_7681 Bphy_7682     FALSE 0.172 121.000 0.000 NA   NA
 7092620 7092621 Bphy_7682 Bphy_7683     FALSE 0.001 856.000 0.000 NA   NA
 7092621 7092622 Bphy_7683 Bphy_7684     FALSE 0.145 132.000 0.000 NA   NA
 7092622 7092623 Bphy_7684 Bphy_7685     FALSE 0.413 46.000 0.000 NA   NA
 7092626 7092627 Bphy_7688 Bphy_7689     FALSE 0.002 650.000 0.000 NA   NA
 7092627 7092628 Bphy_7689 Bphy_7690     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 7092628 7092629 Bphy_7690 Bphy_7691     FALSE 0.006 349.000 0.000 1.000   NA
 7092630 7092631 Bphy_7692 Bphy_7693     FALSE 0.070 170.000 0.000 NA   NA
 7092631 7092632 Bphy_7693 Bphy_7694     FALSE 0.283 82.000 0.000 NA   NA
 7092632 7092633 Bphy_7694 Bphy_7695     FALSE 0.406 47.000 0.000 NA   NA
 7092633 7092634 Bphy_7695 Bphy_7696     FALSE 0.254 90.000 0.000 NA   NA
 7092634 7092635 Bphy_7696 Bphy_7697     TRUE 0.979 21.000 1.000 NA   NA
 7092636 7092637 Bphy_7698 Bphy_7699     FALSE 0.064 173.000 0.000 NA   NA
 7092637 7092638 Bphy_7699 Bphy_7700     TRUE 0.563 28.000 0.000 NA   NA
 7092638 7092639 Bphy_7700 Bphy_7701     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092644 7092645 Bphy_7706 Bphy_7707     TRUE 0.958 0.000 0.059 NA N NA
 7092645 7092646 Bphy_7707 Bphy_7708     FALSE 0.148 131.000 0.000 NA   NA
 7092646 7092647 Bphy_7708 Bphy_7709     FALSE 0.275 84.000 0.000 NA   NA
 7092647 7092648 Bphy_7709 Bphy_7710     TRUE 0.910 -3.000 0.000 NA   NA
 7092648 7092649 Bphy_7710 Bphy_7711     FALSE 0.268 86.000 0.000 NA   NA
 7092649 7092650 Bphy_7711 Bphy_7712     TRUE 0.894 12.000 0.059 NA N NA
 7092650 7092651 Bphy_7712 Bphy_7713     TRUE 0.870 98.000 0.059 0.078 Y NA
 7092651 7092652 Bphy_7713 Bphy_7714     FALSE 0.026 212.000 0.000 1.000 N NA
 7092652 7092653 Bphy_7714 Bphy_7715     FALSE 0.232 209.000 0.250 1.000 N NA
 7092653 7092654 Bphy_7715 Bphy_7716     TRUE 0.983 13.000 0.700 1.000   NA
 7092654 7092655 Bphy_7716 Bphy_7717     TRUE 0.802 90.000 0.300 1.000   NA
 7092655 7092656 Bphy_7717 Bphy_7718     FALSE 0.034 215.000 0.000 1.000   NA
 7092656 7092657 Bphy_7718 Bphy_7719     FALSE 0.479 98.000 0.033 1.000   NA
 7092657 7092658 Bphy_7719 Bphy_7720     TRUE 0.981 1.000 0.082 0.001 N NA
 7092658 7092659 Bphy_7720 Bphy_7721     TRUE 0.691 67.000 0.096 1.000 N NA
 7092659 7092660 Bphy_7721 Bphy_7722     FALSE 0.015 450.000 0.120 1.000 N NA
 7092662 7092663 Bphy_7724 Bphy_7725     TRUE 0.971 13.000 0.000 0.027 Y NA
 7092663 7092664 Bphy_7725 Bphy_7726     TRUE 0.728 12.000 0.000 NA   NA
 7092665 7092666 Bphy_7727 Bphy_7728     FALSE 0.018 766.000 0.000 0.065 Y NA
 7092666 7092667 Bphy_7728 Bphy_7729     FALSE 0.126 187.000 0.000 0.002 N NA
 7092667 7092668 Bphy_7729 Bphy_7730     TRUE 0.993 22.000 0.475 0.001 Y NA
 7092668 7092669 Bphy_7730 Bphy_7731     TRUE 0.950 57.000 0.663 0.002   NA
 7092669 7092670 Bphy_7731 Bphy_7732     FALSE 0.517 76.000 0.025 NA   NA
 7092670 7092671 Bphy_7732 Bphy_7733     TRUE 0.990 -3.000 0.253 NA   NA
 7092671 7092672 Bphy_7733 Bphy_7734     TRUE 0.973 11.000 0.307 1.000   NA
 7092673 7092674 Bphy_7735 Bphy_7736     TRUE 0.553 74.000 0.026 1.000   NA
 7092674 7092675 Bphy_7736 Bphy_7737     TRUE 0.999 -3.000 0.461 0.047 Y NA
 7092675 7092676 Bphy_7737 Bphy_7738     TRUE 0.998 0.000 0.491 0.047 Y NA
 7092676 7092677 Bphy_7738 Bphy_7739     TRUE 0.998 -3.000 0.330 0.014 Y NA
 7092677 7092678 Bphy_7739 Bphy_7740     TRUE 0.949 15.000 0.189 1.000   NA
 7092678 7092679 Bphy_7740 Bphy_7741     TRUE 0.902 43.000 0.300 1.000   NA
 7092680 7092681 Bphy_7742 Bphy_7743     TRUE 0.682 68.000 0.087 NA   NA
 7092681 7092682 Bphy_7743 Bphy_7744     TRUE 0.862 66.000 0.367 NA   NA
 7092682 7092683 Bphy_7744 Bphy_7745     TRUE 0.741 34.000 0.029 NA   NA
 7092683 7092684 Bphy_7745 Bphy_7746     TRUE 0.975 16.000 0.286 0.002   NA
 7092684 7092685 Bphy_7746 Bphy_7747     TRUE 0.939 21.000 0.089 0.002   NA
 7092685 7092686 Bphy_7747 Bphy_7748     TRUE 0.966 2.000 0.089 NA   NA
 7092687 7092688 Bphy_7749 Bphy_7750     FALSE 0.002 540.000 0.000 NA   NA
 7092688 7092689 Bphy_7750 Bphy_7751     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7092689 7092690 Bphy_7751 Bphy_7752     FALSE 0.324 66.000 0.000 NA   NA
 7092691 7092692 Bphy_7753 Bphy_7754 nifH   TRUE 0.797 72.000 0.098 0.001 N NA
 7092692 7092693 Bphy_7754 Bphy_7755     TRUE 0.984 72.000 0.902 0.001 Y NA
 7092696 7092697 Bphy_7758 Bphy_7759     TRUE 0.923 13.000 0.091 NA   NA
 7092698 7092699 Bphy_7760 Bphy_7761     TRUE 0.996 -3.000 0.050 0.020 Y NA
 7092701 7092702 Bphy_7763 Bphy_7764     FALSE 0.002 509.000 0.000 NA   NA
 7092705 7092706 Bphy_7767 Bphy_7768     FALSE 0.468 86.000 0.025 1.000 N NA
 7092706 7092707 Bphy_7768 Bphy_7769     TRUE 0.924 31.000 0.286 1.000 N NA
 7092707 7092708 Bphy_7769 Bphy_7770     FALSE 0.028 208.000 0.000 1.000 N NA
 7092709 7092710 Bphy_7771 Bphy_7772     FALSE 0.347 60.000 0.000 NA   NA
 7092710 7092711 Bphy_7772 Bphy_7773     FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 7092711 7092712 Bphy_7773 Bphy_7774     FALSE 0.002 479.000 0.000 NA   NA
 7092712 7092713 Bphy_7774 Bphy_7775     TRUE 0.862 66.000 0.367 NA   NA
 7092713 7092714 Bphy_7775 Bphy_7776     TRUE 0.741 34.000 0.029 NA   NA
 7092714 7092715 Bphy_7776 Bphy_7777     FALSE 0.123 327.000 0.354 0.002   NA
 7092715 7092716 Bphy_7777 Bphy_7778     FALSE 0.001 1122.000 0.000 1.000 N NA
 7092716 7092717 Bphy_7778 Bphy_7779     TRUE 0.992 2.000 0.021 0.014 Y NA
 7092717 7092718 Bphy_7779 Bphy_7780     TRUE 0.730 30.000 0.021 1.000 N NA
 7092718 7092719 Bphy_7780 Bphy_7781     TRUE 0.992 0.000 0.500 1.000   NA
 7092719 7092720 Bphy_7781 Bphy_7782     TRUE 0.753 59.000 0.103 1.000   NA
 7092720 7092721 Bphy_7782 Bphy_7783     TRUE 0.813 86.000 0.008 1.000 Y NA
 7092721 7092722 Bphy_7783 Bphy_7784     TRUE 0.837 73.000 0.008 1.000 Y NA
 7092722 7092723 Bphy_7784 Bphy_7785     FALSE 0.188 114.000 0.000 NA   NA
 7092723 7092724 Bphy_7785 Bphy_7786     FALSE 0.018 242.000 0.000 NA   NA
 7092725 7092726 Bphy_7787 Bphy_7788     FALSE 0.001 758.000 0.000 NA   NA
 7092728 7092729 Bphy_7790 Bphy_7791     FALSE 0.002 653.000 0.000 NA   NA
 7092729 7092730 Bphy_7791 Bphy_7792     FALSE 0.328 65.000 0.000 NA   NA
 7092730 7092731 Bphy_7792 Bphy_7793     TRUE 0.764 10.000 0.000 NA   NA
 7092731 7092732 Bphy_7793 Bphy_7794     FALSE 0.369 48.000 0.000 1.000 N NA
 7092732 7092733 Bphy_7794 Bphy_7795     TRUE 0.890 79.000 0.667 1.000 N NA
 7092734 7092735 Bphy_7796 Bphy_7797     FALSE 0.026 212.000 0.000 1.000 N NA
 7092735 7092736 Bphy_7797 Bphy_7798     FALSE 0.347 53.000 0.000 1.000 N NA
 7092736 7092737 Bphy_7798 Bphy_7799     TRUE 0.963 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7092737 7092738 Bphy_7799 Bphy_7800     TRUE 0.979 3.000 0.000 1.000 Y NA
 7092738 7092739 Bphy_7800 Bphy_7801     TRUE 0.997 3.000 0.386 0.053 Y NA
 7092739 7092740 Bphy_7801 Bphy_7802     TRUE 0.966 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7092741 7092742 Bphy_7803 Bphy_7804     TRUE 0.998 1.000 0.600 0.014 Y NA
 7092742 7092743 Bphy_7804 Bphy_7805     FALSE 0.264 79.000 0.000 1.000 N NA
 7092743 7092744 Bphy_7805 Bphy_7806     FALSE 0.003 445.000 0.000 NA   NA
 7092744 7092745 Bphy_7806 Bphy_7807     FALSE 0.031 209.000 0.000 NA   NA
 7092746 7092747 Bphy_7808 Bphy_7809 nifH   FALSE 0.304 72.000 0.000 NA   NA
 7092749 7092750 Bphy_7811 Bphy_7812     FALSE 0.007 317.000 0.000 NA   NA
 7092750 7092751 Bphy_7812 Bphy_7813     FALSE 0.014 258.000 0.000 NA   NA
 7092752 7092753 Bphy_7814 Bphy_7815     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 7092753 7092754 Bphy_7815 Bphy_7816     FALSE 0.073 168.000 0.000 NA   NA
 7092756 7092757 Bphy_7818 Bphy_7819     FALSE 0.229 98.000 0.000 NA   NA
 7092758 7092759 Bphy_7820 Bphy_7821     FALSE 0.342 61.000 0.000 NA   NA