MicrobesOnline Operon Predictions for Borrelia duttonii Ly

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5589708 5589709 BDU_1 BDU_2   vlp-c-1 FALSE 0.087 735.000 0.000 NA   NA
 5589709 5589710 BDU_2 BDU_3 vlp-c-1 vlp-c-2 FALSE 0.222 282.000 0.600 NA   NA
 5589710 5589711 BDU_3 BDU_4 vlp-c-2   FALSE 0.134 340.000 0.000 NA   NA
 5589711 5589712 BDU_4 BDU_5   vlp-a FALSE 0.074 1431.000 0.000 NA   NA
 5589712 5589713 BDU_5 BDU_6 vlp-a   FALSE 0.140 332.000 0.000 NA   NA
 5589715 5589716 BDU_8 BDU_9     TRUE 0.551 -67.000 0.025 1.000 Y NA
 5589718 5589719 BDU_11 BDU_12 trsA   TRUE 0.774 -3.000 0.066 NA   NA
 5589719 5589720 BDU_12 BDU_13     FALSE 0.277 114.000 0.106 NA   NA
 5589721 5589722 BDU_14 BDU_15     TRUE 0.804 4.000 0.021 NA   NA
 5589722 5589723 BDU_15 BDU_16     TRUE 0.575 -7.000 0.015 NA   NA
 5589723 5589724 BDU_16 BDU_17     TRUE 0.789 4.000 0.015 NA   NA
 5589724 5589725 BDU_17 BDU_18   hisT TRUE 0.838 1.000 0.054 NA   NA
 5589725 5589726 BDU_18 BDU_19 hisT   TRUE 0.661 -7.000 0.040 NA   NA
 5589726 5589727 BDU_19 BDU_20   priA TRUE 0.564 -7.000 0.010 NA   NA
 5589728 5589729 BDU_21 BDU_22 udk glpE FALSE 0.218 -7.000 0.022 NA N NA
 5589731 5589732 BDU_24 BDU_25     TRUE 0.757 1.000 0.009 NA   NA
 5589732 5589733 BDU_25 BDU_26   pfpB TRUE 0.882 8.000 0.158 NA   NA
 5589733 5589734 BDU_26 BDU_27 pfpB queA FALSE 0.107 70.000 0.008 1.000 N NA
 5589734 5589735 BDU_27 BDU_28 queA ruvB TRUE 0.440 -16.000 0.069 1.000 N NA
 5589735 5589736 BDU_28 BDU_29 ruvB ruvA TRUE 0.953 53.000 0.549 0.011 Y NA
 5589736 5589737 BDU_29 BDU_30 ruvA   FALSE 0.235 83.000 0.002 NA   NA
 5589737 5589738 BDU_30 BDU_31   folD TRUE 0.757 1.000 0.010 NA   NA
 5589739 5589740 BDU_32 BDU_33     TRUE 0.940 8.000 0.600 NA   NA
 5589741 5589742 BDU_34 BDU_35   lepB-1 TRUE 0.771 -10.000 0.000 NA   NA
 5589742 5589743 BDU_35 BDU_36 lepB-1 leB-2 TRUE 0.985 1.000 0.000 0.004   NA
 5589744 5589745 BDU_37 BDU_38   smpB TRUE 0.776 3.000 0.008 NA   NA
 5589746 5589747 BDU_39 BDU_40   parC TRUE 0.677 21.000 0.016 NA   NA
 5589747 5589748 BDU_40 BDU_41 parC parE TRUE 0.984 0.000 0.110 0.005 Y NA
 5589748 5589749 BDU_41 BDU_42 parE plsC TRUE 0.692 12.000 0.064 1.000 N NA
 5589749 5589750 BDU_42 BDU_43 plsC   TRUE 0.927 8.000 0.462 NA   NA
 5589750 5589751 BDU_43 BDU_44     TRUE 0.563 63.000 0.333 NA   NA
 5589753 5589754 BDU_46 BDU_47 phoU   TRUE 0.885 7.000 0.164 NA   NA
 5589754 5589755 BDU_47 BDU_48     TRUE 0.923 -3.000 0.900 NA   NA
 5589755 5589756 BDU_48 BDU_49     TRUE 0.834 28.000 0.310 NA   NA
 5589761 5589762 BDU_54 BDU_55     TRUE 0.566 45.000 0.035 NA   NA
 5589765 5589766 BDU_58 BDU_59   tpi TRUE 0.714 6.000 0.044 1.000 N NA
 5589766 5589767 BDU_59 BDU_60 tpi pgk TRUE 0.941 2.000 0.141 1.000 Y NA
 5589767 5589768 BDU_60 BDU_61 pgk gap TRUE 0.954 30.000 0.003 0.012 Y NA
 5589768 5589769 BDU_61 BDU_62 gap   TRUE 0.549 73.000 0.300 1.000   NA
 5589769 5589770 BDU_62 BDU_63   tlyC TRUE 0.756 -3.000 0.025 1.000   NA
 5589770 5589771 BDU_63 BDU_64 tlyC   TRUE 0.827 -3.000 0.222 NA   NA
 5589771 5589772 BDU_64 BDU_65   trxA FALSE 0.211 87.000 0.009 NA   NA
 5589774 5589775 BDU_67 BDU_68   fmt TRUE 0.701 28.000 0.015 1.000   NA
 5589775 5589776 BDU_68 BDU_69 fmt def TRUE 0.945 -3.000 0.026 0.082 Y NA
 5589776 5589777 BDU_69 BDU_70 def   TRUE 0.803 28.000 0.205 NA   NA
 5589777 5589778 BDU_70 BDU_71     TRUE 0.773 -3.000 0.066 NA   NA
 5589779 5589780 BDU_72 BDU_73     TRUE 0.936 14.000 0.818 1.000   NA
 5589780 5589781 BDU_73 BDU_74     TRUE 0.784 25.000 0.052 1.000   NA
 5589781 5589782 BDU_74 BDU_75     TRUE 0.731 28.000 0.052 NA   NA
 5589782 5589783 BDU_75 BDU_76     TRUE 0.933 0.000 0.643 NA   NA
 5589783 5589784 BDU_76 BDU_77     TRUE 0.907 -3.000 0.643 NA   NA
 5589784 5589785 BDU_77 BDU_78   prfB TRUE 0.593 34.000 0.005 NA   NA
 5589785 5589786 BDU_78 BDU_79 prfB   TRUE 0.441 -18.000 0.010 NA   NA
 5589786 5589787 BDU_79 BDU_80   ftsY TRUE 0.393 52.000 0.009 NA   NA
 5589787 5589788 BDU_80 BDU_81 ftsY   TRUE 0.657 -3.000 0.008 NA   NA
 5589788 5589789 BDU_81 BDU_82     TRUE 0.798 -13.000 0.529 NA   NA
 5589789 5589790 BDU_82 BDU_83     TRUE 0.870 1.000 0.529 NA N NA
 5589790 5589791 BDU_83 BDU_84     TRUE 0.798 -3.000 0.500 NA N NA
 5589792 5589793 BDU_85 BDU_86     TRUE 0.896 -7.000 1.000 NA   NA
 5589794 5589795 BDU_87 BDU_88 nifS   FALSE 0.106 146.000 0.053 1.000 N NA
 5589795 5589796 BDU_88 BDU_89     FALSE 0.131 -45.000 0.006 1.000 N NA
 5589797 5589798 BDU_90 BDU_91 ldh lepA FALSE 0.039 178.000 0.009 1.000 N NA
 5589798 5589799 BDU_91 BDU_92 lepA   FALSE 0.109 179.000 0.009 NA   NA
 5589799 5589800 BDU_92 BDU_93   atpK TRUE 0.667 37.000 0.050 NA   NA
 5589800 5589801 BDU_93 BDU_94 atpK atpI TRUE 0.984 20.000 0.848 0.009   NA
 5589801 5589802 BDU_94 BDU_95 atpI atpD TRUE 0.989 5.000 0.270 0.009 Y NA
 5589802 5589803 BDU_95 BDU_96 atpD atpB TRUE 0.994 3.000 0.903 0.009 Y NA
 5589803 5589804 BDU_96 BDU_97 atpB atpA TRUE 0.994 4.000 0.806 0.009 Y NA
 5589804 5589805 BDU_97 BDU_98 atpA   TRUE 0.931 11.000 0.633 NA   NA
 5589805 5589806 BDU_98 BDU_99   atpE TRUE 0.939 10.000 0.667 NA   NA
 5589806 5589807 BDU_99 BDU_100 atpE   FALSE 0.325 107.000 0.175 NA   NA
 5589807 5589808 BDU_100 BDU_101   mutS_1 TRUE 0.787 1.000 0.023 NA   NA
 5589808 5589809 BDU_101 BDU_102 mutS_1   FALSE 0.372 -52.000 0.016 1.000   NA
 5589809 5589810 BDU_102 BDU_103   murI TRUE 0.728 -3.000 0.015 1.000   NA
 5589811 5589812 BDU_104 BDU_105 asnS   TRUE 0.656 28.000 0.021 NA   NA
 5589813 5589814 BDU_106 BDU_107   htrA FALSE 0.151 350.000 0.000 1.000   NA
 5589814 5589815 BDU_107 BDU_108 htrA map TRUE 0.792 41.000 0.010 0.038 N NA
 5589815 5589816 BDU_108 BDU_109 map   TRUE 0.930 5.000 0.000 1.000   NA
 5589816 5589817 BDU_109 BDU_110   nusB TRUE 0.780 -13.000 0.000 1.000   NA
 5589817 5589818 BDU_110 BDU_111 nusB   TRUE 0.430 19.000 0.016 1.000 N NA
 5589818 5589819 BDU_111 BDU_112   fadA FALSE 0.109 91.000 0.025 1.000 N NA
 5589821 5589822 BDU_114 BDU_115 dnaB rplI TRUE 0.392 19.000 0.009 1.000 N NA
 5589822 5589823 BDU_115 BDU_116 rplI rpsR TRUE 0.978 14.000 0.499 0.051 Y NA
 5589823 5589824 BDU_116 BDU_117 rpsR ssb TRUE 0.486 13.000 0.019 1.000 N NA
 5589824 5589825 BDU_117 BDU_118 ssb rpsF TRUE 0.501 12.000 0.018 1.000 N NA
 5589825 5589826 BDU_118 BDU_119 rpsF malX FALSE 0.011 682.000 0.006 1.000 N NA
 5589828 5589829 BDU_121 BDU_122   cdsA TRUE 0.404 17.000 0.014 1.000 N NA
 5589829 5589830 BDU_122 BDU_123 cdsA uppS TRUE 0.547 -112.000 0.027 1.000 Y NA
 5589830 5589831 BDU_123 BDU_124 uppS frr TRUE 0.884 5.000 0.409 1.000 N NA
 5589831 5589832 BDU_124 BDU_125 frr tsf TRUE 0.787 38.000 0.021 1.000 Y NA
 5589832 5589833 BDU_125 BDU_126 tsf rpsB TRUE 0.954 22.000 0.748 1.000 Y NA
 5589833 5589834 BDU_126 BDU_127 rpsB maf FALSE 0.127 36.000 0.008 NA N NA
 5589834 5589835 BDU_127 BDU_128 maf   TRUE 0.522 -10.000 0.008 NA   NA
 5589835 5589836 BDU_128 BDU_129     TRUE 0.934 14.000 1.000 NA   NA
 5589836 5589837 BDU_129 BDU_130     TRUE 0.431 120.000 0.500 NA   NA
 5589837 5589838 BDU_130 BDU_131   rpsA TRUE 0.641 -7.000 0.003 1.000   NA
 5589838 5589839 BDU_131 BDU_132 rpsA cmk TRUE 0.848 8.000 0.281 1.000 N NA
 5589839 5589840 BDU_132 BDU_133 cmk   TRUE 0.437 -3.000 0.019 1.000 N NA
 5589840 5589841 BDU_133 BDU_134     TRUE 0.479 -28.000 0.060 NA   NA
 5589841 5589842 BDU_134 BDU_135   recA TRUE 0.772 9.000 0.003 NA   NA
 5589842 5589843 BDU_135 BDU_136 recA greA TRUE 0.935 11.000 0.009 0.051   NA
 5589843 5589844 BDU_136 BDU_137 greA   TRUE 0.737 36.000 0.054 1.000   NA
 5589848 5589849 BDU_141 BDU_142     FALSE 0.219 216.000 0.000 NA   NA
 5589849 5589850 BDU_142 BDU_143   acrB TRUE 0.859 13.000 0.250 NA   NA
 5589850 5589851 BDU_143 BDU_144 acrB mtrC TRUE 0.960 4.000 1.000 NA   NA
 5589851 5589852 BDU_144 BDU_145 mtrC   TRUE 0.410 108.000 0.273 1.000   NA
 5589854 5589855 BDU_147 BDU_148 proX proW TRUE 0.980 37.000 1.000 0.026 Y NA
 5589855 5589856 BDU_148 BDU_149 proW proV TRUE 0.958 7.000 0.333 1.000 Y NA
 5589856 5589857 BDU_149 BDU_150 proV flaB TRUE 0.388 125.000 0.750 1.000 N NA
 5589857 5589858 BDU_150 BDU_151 flaB fliD TRUE 0.396 128.000 0.049 1.000 Y NA
 5589859 5589860 BDU_152 BDU_153 nagA nagB TRUE 0.991 0.000 0.500 0.003 Y NA
 5589861 5589862 BDU_154 BDU_155 sodA secA TRUE 0.589 16.000 0.046 1.000 N NA
 5589863 5589864 BDU_156 BDU_157     TRUE 0.891 22.000 0.529 NA   NA
 5589864 5589865 BDU_157 BDU_158     TRUE 0.917 4.000 0.000 NA   NA
 5589865 5589866 BDU_158 BDU_159   alr TRUE 0.419 94.000 0.000 NA   NA
 5589869 5589870 BDU_162 BDU_163     TRUE 0.478 76.000 0.273 NA   NA
 5589870 5589871 BDU_163 BDU_164     TRUE 0.764 25.000 0.035 1.000   NA
 5589871 5589872 BDU_164 BDU_165   malQ TRUE 0.858 60.000 0.035 0.003   NA
 5589876 5589877 BDU_169 BDU_170     TRUE 0.780 -51.000 0.048 0.031   NA
 5589877 5589878 BDU_170 BDU_171     TRUE 0.818 -18.000 0.778 NA   NA
 5589878 5589879 BDU_171 BDU_172     TRUE 0.830 -3.000 0.229 NA   NA
 5589879 5589880 BDU_172 BDU_173     TRUE 0.555 -37.000 0.257 NA   NA
 5589880 5589881 BDU_173 BDU_174     TRUE 0.775 -3.000 0.068 NA   NA
 5589881 5589882 BDU_174 BDU_175   moxR TRUE 0.950 8.000 0.764 NA   NA
 5589882 5589883 BDU_175 BDU_176 moxR gidB FALSE 0.327 70.000 0.009 1.000   NA
 5589883 5589884 BDU_176 BDU_177 gidB gidA TRUE 0.819 -3.000 0.466 1.000 N NA
 5589884 5589885 BDU_177 BDU_178 gidA thdF TRUE 0.572 -15.000 0.020 1.000   NA
 5589886 5589887 BDU_179 BDU_180   flgK TRUE 0.861 19.000 0.321 NA   NA
 5589887 5589888 BDU_180 BDU_181 flgK flgL TRUE 0.990 4.000 0.186 0.004 Y NA
 5589888 5589889 BDU_181 BDU_182 flgL   TRUE 0.919 2.000 0.385 NA   NA
 5589889 5589890 BDU_182 BDU_183   csrA TRUE 0.859 3.000 0.064 NA   NA
 5589891 5589892 BDU_184 BDU_185     FALSE 0.379 -46.000 0.003 1.000   NA
 5589892 5589893 BDU_185 BDU_186     TRUE 0.813 -3.000 0.167 NA   NA
 5589893 5589894 BDU_186 BDU_187   rplT FALSE 0.123 165.000 0.002 NA   NA
 5589894 5589895 BDU_187 BDU_188 rplT rpmI TRUE 0.984 21.000 0.928 0.050 Y NA
 5589895 5589896 BDU_188 BDU_189 rpmI infC TRUE 0.950 23.000 0.652 1.000 Y NA
 5589897 5589898 BDU_190 BDU_191     TRUE 0.948 0.000 1.000 NA   NA
 5589899 5589900 BDU_192 BDU_193     FALSE 0.178 -3.000 0.012 NA N NA
 5589901 5589902 BDU_194 BDU_195 prfA   TRUE 0.921 11.000 0.081 1.000 Y NA
 5589902 5589903 BDU_195 BDU_196   spoT FALSE 0.343 -16.000 0.035 1.000 N NA
 5589903 5589904 BDU_196 BDU_197 spoT   TRUE 0.776 -10.000 0.333 NA   NA
 5589905 5589906 BDU_198 BDU_199 ddlA murE TRUE 0.980 5.000 0.033 0.015 Y NA
 5589907 5589908 BDU_200 BDU_201     TRUE 0.443 89.000 0.000 NA   NA
 5589908 5589909 BDU_201 BDU_202   hflK FALSE 0.213 125.000 0.022 1.000   NA
 5589909 5589910 BDU_202 BDU_203 hflK hflC TRUE 0.992 1.000 0.947 0.015 Y NA
 5589910 5589911 BDU_203 BDU_204 hflC   FALSE 0.115 425.000 0.000 NA   NA
 5589911 5589912 BDU_204 BDU_205     FALSE 0.239 201.000 0.000 NA   NA
 5589914 5589915 BDU_207 BDU_208 gtaB   TRUE 0.941 1.000 0.643 NA   NA
 5589915 5589916 BDU_208 BDU_209     TRUE 0.783 50.000 0.667 NA   NA
 5589916 5589917 BDU_209 BDU_210   lmp1 TRUE 0.944 -7.000 0.000 0.031   NA
 5589917 5589918 BDU_210 BDU_211 lmp1 mutL TRUE 0.877 -3.000 0.000 1.000   NA
 5589918 5589919 BDU_211 BDU_212 mutL   TRUE 0.667 21.000 0.011 NA   NA
 5589919 5589920 BDU_212 BDU_213     TRUE 0.639 56.000 0.000 NA   NA
 5589921 5589922 BDU_214 BDU_215   efp TRUE 0.402 -22.000 0.009 NA   NA
 5589923 5589924 BDU_216 BDU_217 pstS pstC TRUE 0.391 88.000 0.019 NA Y NA
 5589924 5589925 BDU_217 BDU_218 pstC pstA TRUE 0.981 -3.000 0.219 0.004 Y NA
 5589925 5589926 BDU_218 BDU_219 pstA pstB TRUE 0.992 4.000 0.428 0.004 Y NA
 5589927 5589928 BDU_220 BDU_221 gufA alaS TRUE 0.691 28.000 0.009 1.000   NA
 5589928 5589929 BDU_221 BDU_222 alaS fliG-1 TRUE 0.785 0.000 0.009 1.000   NA
 5589929 5589930 BDU_222 BDU_223 fliG-1 pgl FALSE 0.251 -25.000 0.032 1.000 N NA
 5589930 5589931 BDU_223 BDU_224 pgl   TRUE 0.671 17.000 0.014 NA   NA
 5589934 5589935 BDU_227 BDU_228     TRUE 0.774 13.000 0.040 NA   NA
 5589936 5589937 BDU_229 BDU_230 rpmE rho FALSE 0.276 58.000 0.049 1.000 N NA
 5589937 5589938 BDU_230 BDU_231 rho   FALSE 0.081 87.000 0.010 1.000 N NA
 5589938 5589939 BDU_231 BDU_232     TRUE 0.897 4.000 0.476 1.000 N NA
 5589939 5589940 BDU_232 BDU_233   rpsT TRUE 0.474 12.000 0.015 1.000 N NA
 5589940 5589941 BDU_233 BDU_234 rpsT   TRUE 0.780 4.000 0.009 NA   NA
 5589941 5589942 BDU_234 BDU_235     TRUE 0.728 11.000 0.009 NA   NA
 5589942 5589943 BDU_235 BDU_236     TRUE 0.705 25.000 0.007 1.000   NA
 5589945 5589946 BDU_238 BDU_239   dck TRUE 0.664 60.000 0.571 NA   NA
 5589947 5589948 BDU_240 BDU_241 glpF glpK FALSE 0.216 65.000 0.044 1.000 N NA
 5589948 5589949 BDU_241 BDU_242 glpK glpT FALSE 0.056 125.000 0.006 1.000 N NA
 5589949 5589950 BDU_242 BDU_243 glpT glpQ FALSE 0.375 86.000 0.396 1.000 N NA
 5589950 5589951 BDU_243 BDU_244 glpQ glpA TRUE 0.833 34.000 0.034 1.000 Y NA
 5589952 5589953 BDU_245 BDU_246     TRUE 0.653 -10.000 0.062 NA   NA
 5589953 5589954 BDU_246 BDU_247     TRUE 0.958 1.000 0.562 NA Y NA
 5589955 5589956 BDU_248 BDU_249   pepF FALSE 0.053 126.000 0.010 1.000 N NA
 5589956 5589957 BDU_249 BDU_250 pepF   TRUE 0.632 15.000 0.061 1.000 N NA
 5589957 5589958 BDU_250 BDU_251   dedA TRUE 0.821 11.000 0.061 NA   NA
 5589958 5589959 BDU_251 BDU_252 dedA   TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5589959 5589960 BDU_252 BDU_253   leuS TRUE 0.408 98.000 0.000 NA   NA
 5589960 5589961 BDU_253 BDU_254 leuS   TRUE 0.788 11.000 0.003 1.000   NA
 5589963 5589964 BDU_256 BDU_257   recJ TRUE 0.506 -19.000 0.006 1.000   NA
 5589964 5589965 BDU_257 BDU_258 recJ   TRUE 0.522 0.000 0.018 1.000 N NA
 5589965 5589966 BDU_258 BDU_259   rpsU TRUE 0.808 18.000 0.059 1.000   NA
 5589967 5589968 BDU_260 BDU_261 ftsK bacA TRUE 0.444 13.000 0.014 1.000 N NA
 5589968 5589969 BDU_261 BDU_262 bacA   TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5589969 5589970 BDU_262 BDU_263     TRUE 0.834 -19.000 1.000 NA   NA
 5589974 5589975 BDU_267 BDU_268 dnaK-1   TRUE 0.829 -3.000 0.225 NA   NA
 5589975 5589976 BDU_268 BDU_269     TRUE 0.930 21.000 1.000 NA   NA
 5589976 5589977 BDU_269 BDU_270     TRUE 0.864 24.000 0.391 NA   NA
 5589977 5589978 BDU_270 BDU_271     TRUE 0.915 3.000 0.000 NA   NA
 5589978 5589979 BDU_271 BDU_272   ylxH-1 TRUE 0.831 7.000 0.035 NA   NA
 5589979 5589980 BDU_272 BDU_273 ylxH-1 flhF TRUE 0.861 10.000 0.382 1.000 N NA
 5589980 5589981 BDU_273 BDU_274 flhF flhA TRUE 0.889 -10.000 0.440 1.000 Y NA
 5589981 5589982 BDU_274 BDU_275 flhA flhB TRUE 0.981 13.000 0.207 0.010 Y NA
 5589982 5589983 BDU_275 BDU_276 flhB fliR TRUE 0.917 -3.000 0.259 1.000 Y NA
 5589983 5589984 BDU_276 BDU_277 fliR fliQ TRUE 0.981 17.000 0.181 0.004 Y NA
 5589984 5589985 BDU_277 BDU_278 fliQ fliP TRUE 0.985 9.000 0.101 0.010 Y NA
 5589985 5589986 BDU_278 BDU_279 fliP fliZ TRUE 0.803 10.000 0.032 NA   NA
 5589986 5589987 BDU_279 BDU_280 fliZ fliN TRUE 0.661 -7.000 0.042 NA   NA
 5589987 5589988 BDU_280 BDU_281 fliN fliM TRUE 0.969 47.000 0.508 0.004 Y NA
 5589988 5589989 BDU_281 BDU_282 fliM fliL TRUE 0.978 20.000 0.067 0.004 Y NA
 5589989 5589990 BDU_282 BDU_283 fliL motB TRUE 0.906 44.000 0.615 1.000 Y NA
 5589990 5589991 BDU_283 BDU_284 motB motA TRUE 0.950 0.000 0.383 1.000 Y NA
 5589991 5589992 BDU_284 BDU_285 motA flbD TRUE 0.909 -3.000 0.301 NA Y NA
 5589992 5589993 BDU_285 BDU_286 flbD flgE TRUE 0.935 17.000 0.545 NA Y NA
 5589993 5589994 BDU_286 BDU_287 flgE flgD TRUE 0.948 5.000 0.298 NA Y NA
 5589994 5589995 BDU_287 BDU_288 flgD flbC TRUE 0.790 13.000 0.053 NA   NA
 5589995 5589996 BDU_288 BDU_289 flbC flbB TRUE 0.960 4.000 1.000 NA   NA
 5589996 5589997 BDU_289 BDU_290 flbB flbA TRUE 0.896 -7.000 1.000 NA   NA
 5589997 5589998 BDU_290 BDU_291 flbA fliI TRUE 0.880 -3.000 0.474 NA   NA
 5589998 5589999 BDU_291 BDU_292 fliI fliH TRUE 0.909 14.000 0.124 1.000 Y NA
 5589999 5590000 BDU_292 BDU_293 fliH fliG-2 TRUE 0.954 9.000 0.308 1.000 Y NA
 5590000 5590001 BDU_293 BDU_294 fliG-2 fliF TRUE 0.982 16.000 0.477 0.017 Y NA
 5590001 5590002 BDU_294 BDU_295 fliF fliE TRUE 0.975 14.000 0.164 0.017 Y NA
 5590002 5590003 BDU_295 BDU_296 fliE flgC TRUE 0.977 16.000 0.156 0.010 Y NA
 5590003 5590004 BDU_296 BDU_297 flgC flgB TRUE 0.988 21.000 0.804 0.010 Y NA
 5590004 5590005 BDU_297 BDU_298 flgB hslU TRUE 0.396 33.000 0.021 1.000 N NA
 5590005 5590006 BDU_298 BDU_299 hslU hslV TRUE 0.953 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 5590006 5590007 BDU_299 BDU_300 hslV smf TRUE 0.440 13.000 0.005 1.000 N NA
 5590007 5590008 BDU_300 BDU_301 smf   TRUE 0.827 6.000 0.004 1.000   NA
 5590008 5590009 BDU_301 BDU_302   ftsZ TRUE 0.813 1.000 0.002 1.000   NA
 5590009 5590010 BDU_302 BDU_303 ftsZ ftsA TRUE 0.938 21.000 0.460 1.000 Y NA
 5590010 5590011 BDU_303 BDU_304 ftsA divIB TRUE 0.821 0.000 0.389 NA N NA
 5590011 5590012 BDU_304 BDU_305 divIB ftsW FALSE 0.173 32.000 0.015 NA N NA
 5590012 5590013 BDU_305 BDU_306 ftsW mraY TRUE 0.922 11.000 0.018 0.015 N NA
 5590013 5590014 BDU_306 BDU_307 mraY murF TRUE 0.958 24.000 0.018 0.015 Y NA
 5590014 5590015 BDU_307 BDU_308 murF   TRUE 0.800 16.000 0.108 NA   NA
 5590015 5590016 BDU_308 BDU_309     TRUE 0.563 -7.000 0.009 NA   NA
 5590016 5590017 BDU_309 BDU_310     TRUE 0.563 -7.000 0.009 NA   NA
 5590017 5590018 BDU_310 BDU_311     TRUE 0.957 4.000 0.900 NA   NA
 5590018 5590019 BDU_311 BDU_312     TRUE 0.939 11.000 0.800 NA   NA
 5590019 5590020 BDU_312 BDU_313   recN TRUE 0.826 32.000 0.000 NA   NA
 5590020 5590021 BDU_313 BDU_314 recN   FALSE 0.362 27.000 0.031 NA N NA
 5590021 5590022 BDU_314 BDU_315   cheW-1 FALSE 0.341 -67.000 0.191 1.000 N NA
 5590022 5590023 BDU_315 BDU_316 cheW-1 ftsJ TRUE 0.519 41.000 0.188 NA N NA
 5590024 5590025 BDU_317 BDU_318 ispB   TRUE 0.877 -3.000 0.000 1.000   NA
 5590026 5590027 BDU_319 BDU_320     TRUE 0.929 1.000 0.529 NA   NA
 5590027 5590028 BDU_320 BDU_321   mglA-1 TRUE 0.877 -3.000 0.321 1.000   NA
 5590028 5590029 BDU_321 BDU_322 mglA-1 tpn38b TRUE 0.924 4.000 0.281 1.000   NA
 5590029 5590030 BDU_322 BDU_323 tpn38b   FALSE 0.117 400.000 0.000 NA   NA
 5590031 5590032 BDU_324 BDU_325     TRUE 0.419 94.000 0.000 NA   NA
 5590033 5590034 BDU_326 BDU_327     TRUE 0.667 64.000 0.643 NA   NA
 5590034 5590035 BDU_327 BDU_328     TRUE 0.883 15.000 0.000 1.000   NA
 5590036 5590037 BDU_329 BDU_330 oppA-1 oppA-2 TRUE 0.606 346.000 0.667 0.024 Y NA
 5590037 5590038 BDU_330 BDU_331 oppA-2 oppB-1 TRUE 0.496 369.000 0.000 0.024 Y NA
 5590038 5590039 BDU_331 BDU_332 oppB-1 oppC-1 TRUE 0.891 -16.000 0.096 0.024   NA
 5590039 5590040 BDU_332 BDU_333 oppC-1 oppD TRUE 0.873 11.000 0.123 1.000   NA
 5590040 5590041 BDU_333 BDU_334 oppD oppF TRUE 0.982 1.000 0.138 0.002   NA
 5590044 5590045 BDU_337 BDU_338 rpsI rplM TRUE 0.986 11.000 0.601 0.048 Y NA
 5590045 5590046 BDU_338 BDU_339 rplM   TRUE 0.542 80.000 0.000 1.000   NA
 5590046 5590047 BDU_339 BDU_340   gatB TRUE 0.829 -7.000 0.000 1.000   NA
 5590047 5590048 BDU_340 BDU_341 gatB gatA TRUE 0.976 -10.000 0.492 0.004 Y NA
 5590048 5590049 BDU_341 BDU_342 gatA gatC TRUE 0.991 12.000 0.643 0.004 Y NA
 5590049 5590050 BDU_342 BDU_343 gatC uvrD TRUE 0.519 10.000 0.015 1.000 N NA
 5590050 5590051 BDU_343 BDU_344 uvrD   TRUE 0.925 -3.000 0.030 0.048   NA
 5590051 5590052 BDU_344 BDU_345     TRUE 0.876 12.000 0.173 1.000   NA
 5590053 5590054 BDU_346 BDU_347   pyk FALSE 0.184 114.000 0.023 NA   NA
 5590055 5590056 BDU_348 BDU_349 rpmB   TRUE 0.748 10.000 0.009 NA   NA
 5590058 5590059 BDU_351 BDU_352     TRUE 0.949 6.000 0.727 NA   NA
 5590059 5590060 BDU_352 BDU_353     TRUE 0.411 -52.000 0.055 NA   NA
 5590060 5590061 BDU_353 BDU_354     TRUE 0.502 45.000 0.018 NA   NA
 5590061 5590062 BDU_354 BDU_355     TRUE 0.568 -7.000 0.006 NA   NA
 5590062 5590063 BDU_355 BDU_356   ctp TRUE 0.831 4.000 0.033 NA   NA
 5590064 5590065 BDU_357 BDU_358   ylxH-2 TRUE 0.929 4.000 0.444 NA   NA
 5590065 5590066 BDU_358 BDU_359 ylxH-2 lgt TRUE 0.537 11.000 0.021 1.000 N NA
 5590066 5590067 BDU_359 BDU_360 lgt   FALSE 0.056 58.000 0.013 NA N NA
 5590067 5590068 BDU_360 BDU_361   yscI FALSE 0.019 133.000 0.014 NA N NA
 5590068 5590069 BDU_361 BDU_362 yscI   TRUE 0.422 -49.000 0.027 1.000   NA
 5590070 5590071 BDU_363 BDU_364 gpsA clpA TRUE 0.640 25.000 0.089 1.000 N NA
 5590071 5590072 BDU_364 BDU_365 clpA tyrS FALSE 0.304 -10.000 0.019 1.000 N NA
 5590072 5590073 BDU_365 BDU_366 tyrS glyS TRUE 0.918 5.000 0.023 1.000 Y NA
 5590073 5590074 BDU_366 BDU_367 glyS gltX TRUE 0.867 15.000 0.025 1.000 Y NA
 5590074 5590075 BDU_367 BDU_368 gltX   FALSE 0.364 -31.000 0.020 NA   NA
 5590076 5590077 BDU_369 BDU_370   pfs-1 TRUE 0.830 14.000 0.450 1.000 N NA
 5590077 5590078 BDU_370 BDU_371 pfs-1 metK TRUE 0.899 17.000 1.000 1.000 N NA
 5590078 5590079 BDU_371 BDU_372 metK   FALSE 0.170 -87.000 0.029 1.000 N NA
 5590080 5590081 BDU_373 BDU_374 pkcI mgtE TRUE 0.885 36.000 0.051 0.014 N NA
 5590081 5590082 BDU_374 BDU_375 mgtE   TRUE 0.512 55.000 0.300 1.000 N NA
 5590082 5590083 BDU_375 BDU_376   bmpA-1 FALSE 0.184 284.000 0.000 1.000   NA
 5590083 5590084 BDU_376 BDU_377 bmpA-1 bmpC TRUE 0.947 57.000 1.000 0.006   NA
 5590084 5590085 BDU_377 BDU_378 bmpC bmpA-2 TRUE 0.721 159.000 0.333 0.006   NA
 5590085 5590086 BDU_378 BDU_379 bmpA-2 bmpD TRUE 0.972 24.000 0.333 0.006   NA
 5590086 5590087 BDU_379 BDU_380 bmpD rpsG FALSE 0.345 64.000 0.009 1.000   NA
 5590087 5590088 BDU_380 BDU_381 rpsG rpsL TRUE 0.979 15.000 0.224 0.010 Y NA
 5590088 5590089 BDU_381 BDU_382 rpsL rpoC FALSE 0.204 63.000 0.035 1.000 N NA
 5590089 5590090 BDU_382 BDU_383 rpoC rpoB TRUE 0.992 15.000 0.851 0.002 Y NA
 5590090 5590091 BDU_383 BDU_384 rpoB rplL FALSE 0.288 86.000 0.223 1.000 N NA
 5590091 5590092 BDU_384 BDU_385 rplL rplJ TRUE 0.917 73.000 0.884 0.047 Y NA
 5590092 5590093 BDU_385 BDU_386 rplJ rplA TRUE 0.977 11.000 0.302 0.064 Y NA
 5590093 5590094 BDU_386 BDU_387 rplA rplK TRUE 0.987 0.000 0.838 0.064 Y NA
 5590094 5590095 BDU_387 BDU_388 rplK nusG TRUE 0.663 56.000 0.681 1.000 N NA
 5590095 5590096 BDU_388 BDU_389 nusG secE TRUE 0.950 11.000 0.843 1.000   NA
 5590096 5590097 BDU_389 BDU_390 secE   TRUE 0.830 31.000 0.000 NA   NA
 5590097 5590098 BDU_390 BDU_391   rpmG TRUE 0.893 11.000 0.000 NA   NA
 5590098 5590099 BDU_391 BDU_392 rpmG   TRUE 0.851 24.000 0.000 NA   NA
 5590099 5590100 BDU_392 BDU_393     TRUE 0.396 103.000 0.000 NA   NA
 5590100 5590101 BDU_393 BDU_394     TRUE 0.886 11.000 0.300 NA   NA
 5590102 5590103 BDU_395 BDU_396     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5590103 5590104 BDU_396 BDU_397     FALSE 0.310 150.000 0.000 NA   NA
 5590106 5590107 BDU_399 BDU_400     TRUE 0.925 24.000 1.000 NA   NA
 5590108 5590109 BDU_401 BDU_402 manA fruA-1 TRUE 0.842 -3.000 0.167 1.000   NA
 5590110 5590111 BDU_403 BDU_404   nucA TRUE 0.808 -3.000 0.155 NA   NA
 5590111 5590112 BDU_404 BDU_405 nucA   TRUE 0.808 -3.000 0.155 NA   NA
 5590113 5590114 BDU_406 BDU_407     TRUE 0.746 0.000 0.107 1.000 N NA
 5590115 5590116 BDU_408 BDU_409 cheR-2 cheB-1 TRUE 0.909 36.000 0.450 1.000 Y NA
 5590116 5590117 BDU_409 BDU_410 cheB-1 traB TRUE 0.810 24.000 0.073 1.000   NA
 5590117 5590118 BDU_410 BDU_411 traB adk TRUE 0.630 40.000 0.022 1.000   NA
 5590118 5590119 BDU_411 BDU_412 adk   TRUE 0.402 100.000 0.000 NA   NA
 5590120 5590121 BDU_413 BDU_414 rrp-1   TRUE 0.982 -3.000 0.429 0.010 Y NA
 5590121 5590122 BDU_414 BDU_415     TRUE 0.613 58.000 0.000 NA   NA
 5590122 5590123 BDU_415 BDU_416     TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 5590123 5590124 BDU_416 BDU_417     FALSE 0.322 139.000 0.000 NA   NA
 5590125 5590126 BDU_418 BDU_419 hpt purA TRUE 0.895 10.000 0.008 1.000 Y NA
 5590126 5590127 BDU_419 BDU_420 purA purB TRUE 0.764 -15.000 0.038 1.000 Y NA
 5590130 5590131 BDU_423 BDU_424     TRUE 0.466 86.000 0.000 NA   NA
 5590131 5590132 BDU_424 BDU_425     FALSE 0.104 495.000 0.000 NA   NA
 5590135 5590136 BDU_428 BDU_429 pepQ pf32 FALSE 0.150 197.000 0.027 1.000   NA
 5590136 5590137 BDU_429 BDU_430 pf32   TRUE 0.859 -10.000 0.769 NA   NA
 5590138 5590139 BDU_431 BDU_432 spo0J gyrA FALSE 0.048 137.000 0.009 1.000 N NA
 5590139 5590140 BDU_432 BDU_433 gyrA gyrB TRUE 0.982 -3.000 0.306 0.005 Y NA
 5590141 5590142 BDU_434 BDU_435 dnaA dnaN FALSE 0.299 264.000 0.328 1.000 Y NA
 5590142 5590143 BDU_435 BDU_436 dnaN recF TRUE 0.927 21.000 0.318 1.000 Y NA
 5590143 5590144 BDU_436 BDU_437 recF   TRUE 0.435 -19.000 0.004 NA   NA
 5590144 5590145 BDU_437 BDU_438   rpmH FALSE 0.185 95.000 0.010 NA   NA
 5590145 5590146 BDU_438 BDU_439 rpmH rnpA TRUE 0.834 -19.000 0.787 1.000   NA
 5590146 5590147 BDU_439 BDU_440 rnpA   TRUE 0.668 -3.000 0.105 1.000 N NA
 5590147 5590148 BDU_440 BDU_441   jag TRUE 0.861 -3.000 0.254 1.000   NA
 5590148 5590149 BDU_441 BDU_442 jag   TRUE 0.456 57.000 0.024 1.000   NA
 5590149 5590150 BDU_442 BDU_443   fba FALSE 0.329 139.000 0.025 1.000 Y NA
 5590150 5590151 BDU_443 BDU_444 fba   FALSE 0.106 232.000 0.000 NA N NA
 5590152 5590153 BDU_445 BDU_446 aspS napA_1 TRUE 0.545 4.000 0.007 1.000 N NA
 5590153 5590154 BDU_446 BDU_447 napA_1 ptsH-1 TRUE 0.907 -3.000 0.029 0.014 N NA
 5590154 5590155 BDU_447 BDU_448 ptsH-1   TRUE 0.411 15.000 0.033 NA N NA
 5590155 5590156 BDU_448 BDU_449   ntrA FALSE 0.268 -25.000 0.071 NA N NA
 5590156 5590157 BDU_449 BDU_450 ntrA   TRUE 0.727 3.000 0.050 1.000 N NA
 5590157 5590158 BDU_450 BDU_451     TRUE 0.992 3.000 0.310 0.002 Y NA
 5590163 5590164 BDU_456 BDU_457     TRUE 0.564 -64.000 0.360 NA   NA
 5590164 5590165 BDU_457 BDU_458     TRUE 0.540 67.000 0.000 NA   NA
 5590165 5590166 BDU_458 BDU_459     TRUE 0.544 66.000 0.000 NA   NA
 5590168 5590169 BDU_461 BDU_462     TRUE 0.860 16.000 0.000 NA   NA
 5590169 5590170 BDU_462 BDU_463   dnaX FALSE 0.186 247.000 0.000 NA   NA
 5590170 5590171 BDU_463 BDU_464 dnaX   TRUE 0.924 3.000 0.411 NA   NA
 5590171 5590172 BDU_464 BDU_465   recR TRUE 0.946 4.000 0.604 NA   NA
 5590172 5590173 BDU_465 BDU_466 recR ndk FALSE 0.114 254.000 0.000 1.000 N NA
 5590173 5590174 BDU_466 BDU_467 ndk   TRUE 0.559 4.000 0.003 1.000 N NA
 5590174 5590175 BDU_467 BDU_468     FALSE 0.224 214.000 0.000 NA   NA
 5590175 5590176 BDU_468 BDU_469     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5590176 5590177 BDU_469 BDU_470     FALSE 0.336 -64.000 0.027 NA   NA
 5590177 5590178 BDU_470 BDU_471     TRUE 0.658 -3.000 0.011 NA   NA
 5590178 5590179 BDU_471 BDU_472     TRUE 0.771 2.000 0.011 NA   NA
 5590179 5590180 BDU_472 BDU_473   lsp TRUE 0.827 10.000 0.050 NA   NA
 5590180 5590181 BDU_473 BDU_474 lsp   TRUE 0.833 -3.000 0.237 NA   NA
 5590181 5590182 BDU_474 BDU_475     TRUE 0.708 15.000 0.024 NA   NA
 5590182 5590183 BDU_475 BDU_476   murA FALSE 0.363 59.000 0.024 NA   NA
 5590183 5590184 BDU_476 BDU_477 murA   FALSE 0.129 237.000 0.000 1.000 N NA
 5590186 5590187 BDU_479 BDU_480 tuf rpsJ TRUE 0.845 46.000 0.318 1.000 Y NA
 5590187 5590188 BDU_480 BDU_481 rpsJ rplC TRUE 0.959 34.000 0.307 0.061 Y NA
 5590188 5590189 BDU_481 BDU_482 rplC rplD TRUE 0.976 2.000 0.040 0.045 Y NA
 5590189 5590190 BDU_482 BDU_483 rplD rplW TRUE 0.925 22.000 0.307 1.000 Y NA
 5590190 5590191 BDU_483 BDU_484 rplW rplB TRUE 0.959 19.000 0.849 1.000 Y NA
 5590191 5590192 BDU_484 BDU_485 rplB rpsS TRUE 0.988 10.000 0.820 0.061 Y NA
 5590192 5590193 BDU_485 BDU_486 rpsS rplV TRUE 0.989 7.000 0.769 0.061 Y NA
 5590193 5590194 BDU_486 BDU_487 rplV rpsC TRUE 0.989 4.000 0.719 0.061 Y NA
 5590194 5590195 BDU_487 BDU_488 rpsC rplP TRUE 0.983 19.000 0.828 0.061 Y NA
 5590195 5590196 BDU_488 BDU_489 rplP rpmC TRUE 0.991 4.000 0.802 0.045 Y NA
 5590196 5590197 BDU_489 BDU_490 rpmC rpsQ TRUE 0.991 6.000 0.828 0.045 Y NA
 5590197 5590198 BDU_490 BDU_491 rpsQ rplN TRUE 0.955 48.000 0.791 0.061 Y NA
 5590198 5590199 BDU_491 BDU_492 rplN rplX TRUE 0.987 11.000 0.810 0.061 Y NA
 5590199 5590200 BDU_492 BDU_493 rplX rplE TRUE 0.991 4.000 0.758 0.045 Y NA
 5590200 5590201 BDU_493 BDU_494 rplE rpsN TRUE 0.979 15.000 0.496 0.045 Y NA
 5590201 5590202 BDU_494 BDU_495 rpsN rpsH TRUE 0.985 10.000 0.473 0.045 Y NA
 5590202 5590203 BDU_495 BDU_496 rpsH rplF TRUE 0.984 20.000 0.808 0.045 Y NA
 5590203 5590204 BDU_496 BDU_497 rplF rplR TRUE 0.984 18.000 0.815 0.045 Y NA
 5590204 5590205 BDU_497 BDU_498 rplR rpsE TRUE 0.986 12.000 0.814 0.061 Y NA
 5590205 5590206 BDU_498 BDU_499 rpsE rpmD TRUE 0.990 4.000 0.789 0.061 Y NA
 5590206 5590207 BDU_499 BDU_500 rpmD rplO TRUE 0.982 -7.000 0.653 0.008 Y NA
 5590207 5590208 BDU_500 BDU_501 rplO secY TRUE 0.891 13.000 0.730 1.000 N NA
 5590208 5590209 BDU_501 BDU_502 secY rpmJ TRUE 0.877 10.000 0.089 1.000   NA
 5590209 5590210 BDU_502 BDU_503 rpmJ rpsM TRUE 0.968 10.000 0.194 0.045   NA
 5590210 5590211 BDU_503 BDU_504 rpsM rpsK TRUE 0.980 31.000 0.810 0.045 Y NA
 5590211 5590212 BDU_504 BDU_505 rpsK rpoA TRUE 0.780 16.000 0.308 1.000 N NA
 5590212 5590213 BDU_505 BDU_506 rpoA rplQ TRUE 0.892 19.000 0.873 1.000 N NA
 5590213 5590214 BDU_506 BDU_507 rplQ   FALSE 0.312 75.000 0.009 1.000   NA
 5590214 5590215 BDU_507 BDU_508     TRUE 0.572 -31.000 0.245 NA   NA
 5590215 5590216 BDU_508 BDU_509   tlyA TRUE 0.456 -19.000 0.019 NA   NA
 5590218 5590219 BDU_511 BDU_512     TRUE 0.655 -3.000 0.009 NA   NA
 5590219 5590220 BDU_512 BDU_513     TRUE 0.925 6.000 0.429 NA   NA
 5590220 5590221 BDU_513 BDU_514     TRUE 0.796 19.000 0.095 NA   NA
 5590221 5590222 BDU_514 BDU_515   pheS TRUE 0.738 11.000 0.002 NA   NA
 5590222 5590223 BDU_515 BDU_516 pheS pheT TRUE 0.968 -7.000 0.046 0.002 Y NA
 5590223 5590224 BDU_516 BDU_517 pheT trxB FALSE 0.168 90.000 0.053 1.000 N NA
 5590225 5590226 BDU_518 BDU_519 yacO dnaJ-1 TRUE 0.536 2.000 0.014 1.000 N NA
 5590226 5590227 BDU_519 BDU_520 dnaJ-1 dnaK-2 TRUE 0.985 0.000 0.196 0.006 Y NA
 5590227 5590228 BDU_520 BDU_521 dnaK-2 grpE TRUE 0.955 44.000 0.224 0.012 Y NA
 5590229 5590230 BDU_522 BDU_523     FALSE 0.324 -13.000 0.025 1.000 N NA
 5590232 5590233 BDU_525 BDU_526     TRUE 0.523 -10.000 0.012 NA   NA
 5590234 5590235 BDU_527 BDU_528     TRUE 0.568 -19.000 0.063 NA   NA
 5590235 5590236 BDU_528 BDU_529     TRUE 0.921 3.000 0.375 NA   NA
 5590237 5590238 BDU_530 BDU_531 phnP exoA TRUE 0.778 12.000 0.015 1.000   NA
 5590238 5590239 BDU_531 BDU_532 exoA   TRUE 0.656 24.000 0.015 NA   NA
 5590239 5590240 BDU_532 BDU_533     TRUE 0.844 -3.000 0.290 NA   NA
 5590241 5590242 BDU_534 BDU_535     TRUE 0.597 59.000 0.000 NA   NA
 5590242 5590243 BDU_535 BDU_536     TRUE 0.913 8.000 0.000 NA   NA
 5590243 5590244 BDU_536 BDU_537     TRUE 0.425 92.000 0.000 NA   NA
 5590244 5590245 BDU_537 BDU_538     TRUE 0.695 49.000 0.000 NA   NA
 5590245 5590246 BDU_538 BDU_539     FALSE 0.256 -34.000 0.095 NA N NA
 5590246 5590247 BDU_539 BDU_540     FALSE 0.326 89.000 0.083 NA   NA
 5590247 5590248 BDU_540 BDU_541   fus-1 TRUE 0.751 13.000 0.029 NA   NA
 5590249 5590250 BDU_542 BDU_543     FALSE 0.198 203.000 0.222 NA   NA
 5590250 5590251 BDU_543 BDU_544     FALSE 0.363 122.000 0.000 NA   NA
 5590251 5590252 BDU_544 BDU_545     TRUE 0.776 55.000 0.778 NA   NA
 5590252 5590253 BDU_545 BDU_546   prs FALSE 0.246 168.000 0.222 NA   NA
 5590253 5590254 BDU_546 BDU_547 prs xylB TRUE 0.801 5.000 0.134 1.000 N NA
 5590255 5590256 BDU_548 BDU_549   coaE TRUE 0.733 0.000 0.008 NA   NA
 5590256 5590257 BDU_549 BDU_550 coaE polA TRUE 0.392 -21.000 0.068 1.000 N NA
 5590257 5590258 BDU_550 BDU_551 polA   TRUE 0.655 -3.000 0.009 NA   NA
 5590258 5590259 BDU_551 BDU_552   flaJ TRUE 0.690 -10.000 0.114 NA   NA
 5590259 5590260 BDU_552 BDU_553 flaJ cheY-1 TRUE 0.747 11.000 0.114 1.000 N NA
 5590263 5590264 BDU_556 BDU_557     TRUE 0.863 -13.000 1.000 NA   NA
 5590264 5590265 BDU_557 BDU_558     TRUE 0.927 -3.000 0.474 NA Y NA
 5590265 5590266 BDU_558 BDU_559   ptsH-2 FALSE 0.091 160.000 0.099 NA N NA
 5590266 5590267 BDU_559 BDU_560 ptsH-2 ptsI TRUE 0.982 1.000 0.099 0.013 Y NA
 5590267 5590268 BDU_560 BDU_561 ptsI crr TRUE 0.985 4.000 0.114 0.013 Y NA
 5590271 5590272 BDU_564 BDU_565     FALSE 0.341 124.000 0.300 NA   NA
 5590272 5590273 BDU_565 BDU_566     FALSE 0.221 215.000 0.000 NA   NA
 5590274 5590275 BDU_567 BDU_568 cheW-2   TRUE 0.906 6.000 0.273 NA   NA
 5590275 5590276 BDU_568 BDU_569   cheA-1 TRUE 0.854 24.000 0.333 NA   NA
 5590276 5590277 BDU_569 BDU_570 cheA-1 cheB-2 TRUE 0.942 62.000 0.692 0.011 Y NA
 5590277 5590278 BDU_570 BDU_571 cheB-2   TRUE 0.751 -21.000 0.562 NA   NA
 5590278 5590279 BDU_571 BDU_572   cheY-2 TRUE 0.835 37.000 0.500 NA   NA
 5590279 5590280 BDU_572 BDU_573 cheY-2   TRUE 0.462 35.000 0.035 1.000 N NA
 5590281 5590282 BDU_574 BDU_575   smbA TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 5590283 5590284 BDU_576 BDU_577 lgtD   FALSE 0.372 62.000 0.310 NA N NA
 5590284 5590285 BDU_577 BDU_578     TRUE 0.800 -7.000 0.321 NA   NA
 5590285 5590286 BDU_578 BDU_579   pyrG FALSE 0.077 228.000 0.005 NA   NA
 5590286 5590287 BDU_579 BDU_580 pyrG   FALSE 0.296 63.000 0.003 NA   NA
 5590287 5590288 BDU_580 BDU_581   mcp-1 FALSE 0.372 109.000 0.300 NA   NA
 5590288 5590289 BDU_581 BDU_582 mcp-1 dnaE FALSE 0.055 124.000 0.010 1.000 N NA
 5590289 5590290 BDU_582 BDU_583 dnaE   TRUE 0.714 12.000 0.009 NA   NA
 5590290 5590291 BDU_583 BDU_584   recG TRUE 0.914 10.000 0.429 NA   NA
 5590293 5590294 BDU_586 BDU_587   murD FALSE 0.363 25.000 0.010 1.000 N NA
 5590295 5590296 BDU_588 BDU_589 femA metG TRUE 0.483 22.000 0.024 1.000 N NA
 5590298 5590299 BDU_591 BDU_592 ksgA   TRUE 0.626 31.000 0.016 NA   NA
 5590300 5590301 BDU_593 BDU_594     TRUE 0.892 10.000 0.273 NA   NA
 5590302 5590303 BDU_595 BDU_596 argS   TRUE 0.566 -7.000 0.008 NA   NA
 5590303 5590304 BDU_596 BDU_597   mcp-2 TRUE 0.894 16.000 0.538 NA   NA
 5590307 5590308 BDU_600 BDU_601 cysS   TRUE 0.783 4.000 0.007 NA   NA
 5590308 5590309 BDU_601 BDU_602   glyA TRUE 0.674 -10.000 0.084 NA   NA
 5590309 5590310 BDU_602 BDU_603 glyA dnaJ TRUE 0.828 15.000 0.084 1.000   NA
 5590311 5590312 BDU_604 BDU_605   lctP FALSE 0.162 224.000 0.167 NA   NA
 5590313 5590314 BDU_606 BDU_607 dacA   FALSE 0.111 254.000 0.316 1.000 N NA
 5590314 5590315 BDU_607 BDU_608   pepD FALSE 0.187 179.000 0.000 1.000 N NA
 5590315 5590316 BDU_608 BDU_609 pepD   TRUE 0.399 102.000 0.000 NA   NA
 5590316 5590317 BDU_609 BDU_610     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5590317 5590318 BDU_610 BDU_611     TRUE 0.613 58.000 0.000 NA   NA
 5590318 5590319 BDU_611 BDU_612     TRUE 0.915 6.000 0.000 NA   NA
 5590319 5590320 BDU_612 BDU_613   tig TRUE 0.695 49.000 0.000 NA   NA
 5590320 5590321 BDU_613 BDU_614 tig clpP-1 TRUE 0.949 0.000 0.351 1.000 Y NA
 5590321 5590322 BDU_614 BDU_615 clpP-1 clpX TRUE 0.929 23.000 0.352 1.000 Y NA
 5590322 5590323 BDU_615 BDU_616 clpX lon-2 TRUE 0.540 -55.000 0.015 1.000 Y NA
 5590324 5590325 BDU_617 BDU_618 rpsD   TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5590325 5590326 BDU_618 BDU_619     TRUE 0.639 56.000 0.000 NA   NA
 5590331 5590332 BDU_624 BDU_625   thiJ TRUE 0.860 17.000 0.000 NA   NA
 5590333 5590334 BDU_626 BDU_627 ackA mfd TRUE 0.464 11.000 0.009 1.000 N NA
 5590335 5590336 BDU_628 BDU_629     TRUE 0.475 -64.000 0.180 NA   NA
 5590336 5590337 BDU_629 BDU_630     TRUE 0.507 76.000 0.000 NA   NA
 5590342 5590343 BDU_635 BDU_636   recD TRUE 0.706 48.000 0.000 NA   NA
 5590343 5590344 BDU_636 BDU_637 recD recB TRUE 0.994 9.000 0.688 0.003 Y NA
 5590344 5590345 BDU_637 BDU_638 recB recC TRUE 0.993 7.000 0.542 0.003 Y NA
 5590345 5590346 BDU_638 BDU_639 recC   FALSE 0.150 -30.000 0.011 1.000 N NA
 5590347 5590348 BDU_640 BDU_641 zwf nhaC-2 FALSE 0.039 922.000 0.000 NA N NA
 5590349 5590350 BDU_642 BDU_643 potD potC TRUE 0.977 12.000 0.131 0.022 Y NA
 5590350 5590351 BDU_643 BDU_644 potC potB TRUE 0.987 10.000 0.492 0.022 Y NA
 5590351 5590352 BDU_644 BDU_645 potB potA TRUE 0.993 6.000 0.928 0.022 Y NA
 5590352 5590353 BDU_645 BDU_646 potA   FALSE 0.289 87.000 0.021 1.000   NA
 5590354 5590355 BDU_647 BDU_648   ptsG TRUE 0.863 40.000 0.246 1.000 Y NA
 5590356 5590357 BDU_649 BDU_650   fur TRUE 0.692 13.000 0.184 NA N NA
 5590357 5590358 BDU_650 BDU_651 fur   TRUE 0.390 92.000 0.257 NA   NA
 5590359 5590360 BDU_652 BDU_653 groEL   TRUE 0.605 61.000 0.423 NA   NA
 5590360 5590361 BDU_653 BDU_654   yajC TRUE 0.668 16.000 0.013 NA   NA
 5590361 5590362 BDU_654 BDU_655 yajC secD TRUE 0.523 81.000 0.068 NA Y NA
 5590362 5590363 BDU_655 BDU_656 secD secF TRUE 0.964 -16.000 0.244 0.002 Y NA
 5590363 5590364 BDU_656 BDU_657 secF   TRUE 0.872 24.000 0.450 NA   NA
 5590369 5590370 BDU_662 BDU_663 lysS era TRUE 0.563 50.000 0.038 1.000   NA
 5590371 5590372 BDU_664 BDU_665     TRUE 0.925 13.000 0.727 NA   NA
 5590372 5590373 BDU_665 BDU_666     TRUE 0.707 -3.000 0.026 NA   NA
 5590375 5590376 BDU_668 BDU_669     TRUE 0.481 -37.000 0.105 NA   NA
 5590376 5590377 BDU_669 BDU_670     TRUE 0.593 -19.000 0.095 NA   NA
 5590377 5590378 BDU_670 BDU_671   flaA TRUE 0.526 77.000 0.391 NA   NA
 5590378 5590379 BDU_671 BDU_672 flaA cheA-2 TRUE 0.587 71.000 0.370 1.000   NA
 5590379 5590380 BDU_672 BDU_673 cheA-2 cheW-3 TRUE 0.989 6.000 0.436 0.019 Y NA
 5590380 5590381 BDU_673 BDU_674 cheW-3 cheX TRUE 0.941 12.000 0.436 NA Y NA
 5590381 5590382 BDU_674 BDU_675 cheX cheY-3 TRUE 0.662 49.000 0.625 NA N NA
 5590383 5590384 BDU_676 BDU_677     TRUE 0.922 -3.000 0.889 NA   NA
 5590384 5590385 BDU_677 BDU_678     TRUE 0.816 -6.000 0.000 NA   NA
 5590385 5590386 BDU_678 BDU_679   gph TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5590387 5590388 BDU_680 BDU_681 mglA rbsC-1 TRUE 0.939 4.000 0.438 1.000   NA
 5590388 5590389 BDU_681 BDU_682 rbsC-1 rbsC-2 TRUE 0.922 -28.000 0.720 0.021   NA
 5590389 5590390 BDU_682 BDU_683 rbsC-2 mcp-4 FALSE 0.186 168.000 0.032 1.000   NA
 5590390 5590391 BDU_683 BDU_684 mcp-4 mcp-5 TRUE 0.986 30.000 0.900 0.011 Y NA
 5590393 5590394 BDU_686 BDU_687     TRUE 0.779 -31.000 0.034 0.005 N NA
 5590394 5590395 BDU_687 BDU_688   mvaA TRUE 0.463 -10.000 0.053 1.000 N NA
 5590395 5590396 BDU_688 BDU_689 mvaA mvaD TRUE 0.927 2.000 0.048 1.000 Y NA
 5590396 5590397 BDU_689 BDU_690 mvaD   TRUE 0.956 -12.000 0.082 0.005 Y NA
 5590397 5590398 BDU_690 BDU_691   mvaK TRUE 0.986 1.000 0.109 0.005 Y NA
 5590399 5590400 BDU_692 BDU_693     TRUE 0.765 43.000 0.000 NA   NA
 5590401 5590402 BDU_694 BDU_695 napA_2 fus-2 FALSE 0.156 131.000 0.136 1.000 N NA
 5590402 5590403 BDU_695 BDU_696 fus-2 xylR-1 FALSE 0.084 277.000 0.000 NA N NA
 5590403 5590404 BDU_696 BDU_697 xylR-1 ffh FALSE 0.048 60.000 0.007 NA N NA
 5590404 5590405 BDU_697 BDU_698 ffh rpsP TRUE 0.795 -3.000 0.361 1.000 N NA
 5590405 5590406 BDU_698 BDU_699 rpsP   TRUE 0.924 10.000 0.385 1.000   NA
 5590406 5590407 BDU_699 BDU_700   rimM TRUE 0.931 4.000 0.324 1.000   NA
 5590407 5590408 BDU_700 BDU_701 rimM trmD TRUE 0.951 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 5590408 5590409 BDU_701 BDU_702 trmD rplS TRUE 0.830 -25.000 0.567 1.000 Y NA
 5590409 5590410 BDU_702 BDU_703 rplS   FALSE 0.077 931.000 0.000 NA   NA
 5590410 5590411 BDU_703 BDU_704   kdtB TRUE 0.778 3.000 0.012 NA   NA
 5590411 5590412 BDU_704 BDU_705 kdtB rpmF FALSE 0.183 52.000 0.013 1.000 N NA
 5590412 5590413 BDU_705 BDU_706 rpmF   TRUE 0.561 2.000 0.017 1.000 N NA
 5590413 5590414 BDU_706 BDU_707   rnc TRUE 0.590 6.000 0.019 1.000 N NA
 5590416 5590417 BDU_709 BDU_710     TRUE 0.958 7.000 1.000 NA   NA
 5590417 5590418 BDU_710 BDU_711     TRUE 0.516 74.000 0.000 NA   NA
 5590418 5590419 BDU_711 BDU_712     TRUE 0.917 5.000 0.000 NA   NA
 5590419 5590420 BDU_712 BDU_713     FALSE 0.200 233.000 0.000 NA   NA
 5590420 5590421 BDU_713 BDU_714   dnaG TRUE 0.783 8.000 0.017 NA   NA
 5590421 5590422 BDU_714 BDU_715 dnaG rpoD TRUE 0.686 -7.000 0.299 1.000 N NA
 5590422 5590423 BDU_715 BDU_716 rpoD   TRUE 0.734 -3.000 0.036 NA   NA
 5590423 5590424 BDU_716 BDU_717     FALSE 0.118 395.000 0.000 NA   NA
 5590424 5590425 BDU_717 BDU_718   mreB-1 TRUE 0.760 13.000 0.014 1.000   NA
 5590425 5590426 BDU_718 BDU_719 mreB-1 mreC TRUE 0.923 3.000 0.689 1.000 N NA
 5590426 5590427 BDU_719 BDU_720 mreC   TRUE 0.658 -3.000 0.011 NA   NA
 5590427 5590428 BDU_720 BDU_721   pbp-2 TRUE 0.833 6.000 0.035 NA   NA
 5590428 5590429 BDU_721 BDU_722 pbp-2 mreB-2 TRUE 0.815 4.000 0.161 1.000 N NA
 5590429 5590430 BDU_722 BDU_723 mreB-2 thrZ FALSE 0.047 158.000 0.014 1.000 N NA
 5590430 5590431 BDU_723 BDU_724 thrZ   TRUE 0.522 2.000 0.010 1.000 N NA
 5590431 5590432 BDU_724 BDU_725     TRUE 0.429 -19.000 0.010 NA   NA
 5590434 5590435 BDU_727 BDU_728 ntpJ   TRUE 0.989 7.000 0.270 0.005 Y NA
 5590435 5590436 BDU_728 BDU_729   ylxH-3 TRUE 0.774 13.000 0.231 1.000 N NA
 5590436 5590437 BDU_729 BDU_730 ylxH-3 pfk TRUE 0.752 37.000 0.474 1.000 N NA
 5590438 5590439 BDU_731 BDU_732 nox gltP TRUE 0.846 13.000 0.085 1.000   NA
 5590439 5590440 BDU_732 BDU_733 gltP pgi TRUE 0.670 44.000 0.051 1.000   NA
 5590440 5590441 BDU_733 BDU_734 pgi   TRUE 0.788 37.000 0.200 1.000   NA
 5590441 5590442 BDU_734 BDU_735   pbp-3 TRUE 0.946 7.000 0.560 1.000   NA
 5590443 5590444 BDU_736 BDU_737     TRUE 0.723 -16.000 0.000 NA   NA
 5590448 5590449 BDU_741 BDU_742   valS TRUE 0.885 0.000 0.009 1.000 Y NA
 5590450 5590451 BDU_743 BDU_744   groES FALSE 0.097 196.000 0.011 NA   NA
 5590452 5590453 BDU_745 BDU_746     TRUE 0.694 23.000 0.023 NA   NA
 5590453 5590454 BDU_746 BDU_747     FALSE 0.336 129.000 0.318 NA   NA
 5590455 5590456 BDU_748 BDU_749     TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5590458 5590459 BDU_751 BDU_752 oppC-2 oppB-2 TRUE 0.981 0.000 0.600 0.021   NA
 5590459 5590460 BDU_752 BDU_753 oppB-2   TRUE 0.780 36.000 0.143 1.000   NA
 5590462 5590463 BDU_755 BDU_756     TRUE 0.498 -40.000 0.145 NA   NA
 5590463 5590464 BDU_756 BDU_757     TRUE 0.841 8.000 0.048 NA   NA
 5590464 5590465 BDU_757 BDU_758     TRUE 0.699 -3.000 0.024 NA   NA
 5590465 5590466 BDU_758 BDU_759     TRUE 0.736 22.000 0.016 1.000   NA
 5590466 5590467 BDU_759 BDU_760     FALSE 0.072 306.000 0.005 1.000   NA
 5590468 5590469 BDU_761 BDU_762 clpP-2   FALSE 0.349 -58.000 0.030 NA   NA
 5590469 5590470 BDU_762 BDU_763     TRUE 0.597 59.000 0.000 NA   NA
 5590471 5590472 BDU_764 BDU_765     TRUE 0.852 35.000 0.529 NA   NA
 5590474 5590475 BDU_767 BDU_768 rrp-2   TRUE 0.905 -7.000 0.432 1.000 Y NA
 5590475 5590476 BDU_768 BDU_769     TRUE 0.817 0.000 0.026 1.000   NA
 5590476 5590477 BDU_769 BDU_770     TRUE 0.756 18.000 0.023 1.000   NA
 5590477 5590478 BDU_770 BDU_771   murG TRUE 0.456 -31.000 0.026 1.000   NA
 5590478 5590479 BDU_771 BDU_772 murG pdxK FALSE 0.057 130.000 0.016 1.000 N NA
 5590479 5590480 BDU_772 BDU_773 pdxK gcp FALSE 0.383 -3.000 0.009 1.000 N NA
 5590480 5590481 BDU_773 BDU_774 gcp   TRUE 0.409 -31.000 0.013 1.000   NA
 5590481 5590482 BDU_774 BDU_775   rpoS TRUE 0.616 46.000 0.038 1.000   NA
 5590482 5590483 BDU_775 BDU_776 rpoS flgJ FALSE 0.294 112.000 0.136 NA   NA
 5590483 5590484 BDU_776 BDU_777 flgJ flgI TRUE 0.880 3.000 0.136 NA   NA
 5590484 5590485 BDU_777 BDU_778 flgI   TRUE 0.403 196.000 0.900 NA   NA
 5590485 5590486 BDU_778 BDU_779   flgG TRUE 0.773 -3.000 0.066 NA   NA
 5590486 5590487 BDU_779 BDU_780 flgG flhO TRUE 0.983 15.000 0.180 0.003 Y NA
 5590488 5590489 BDU_781 BDU_782   apt TRUE 0.780 5.000 0.011 NA   NA
 5590489 5590490 BDU_782 BDU_783 apt rplU FALSE 0.051 129.000 0.009 1.000 N NA
 5590490 5590491 BDU_783 BDU_784 rplU   TRUE 0.942 4.000 0.208 NA Y NA
 5590491 5590492 BDU_784 BDU_785   rpmA TRUE 0.809 -13.000 0.203 NA Y NA
 5590492 5590493 BDU_785 BDU_786 rpmA obg TRUE 0.730 50.000 0.335 1.000   NA
 5590493 5590494 BDU_786 BDU_787 obg nadD FALSE 0.317 92.000 0.045 1.000   NA
 5590494 5590495 BDU_787 BDU_788 nadD   FALSE 0.280 1.000 0.003 NA N NA
 5590495 5590496 BDU_788 BDU_789     FALSE 0.331 -34.000 0.014 NA   NA
 5590496 5590497 BDU_789 BDU_790     FALSE 0.179 99.000 0.009 NA   NA
 5590497 5590498 BDU_790 BDU_791     TRUE 0.526 71.000 0.000 NA   NA
 5590498 5590499 BDU_791 BDU_792   ctc TRUE 0.856 23.000 0.000 NA   NA
 5590499 5590500 BDU_792 BDU_793 ctc pth TRUE 0.986 6.000 0.496 0.063 Y NA
 5590500 5590501 BDU_793 BDU_794 pth   TRUE 0.852 -3.000 0.025 0.063 N NA
 5590501 5590502 BDU_794 BDU_795   ftsH TRUE 0.693 -3.000 0.145 1.000 N NA
 5590502 5590503 BDU_795 BDU_796 ftsH   TRUE 0.673 23.000 0.017 NA   NA
 5590503 5590504 BDU_796 BDU_797     TRUE 0.854 14.000 0.273 NA   NA
 5590504 5590505 BDU_797 BDU_798   tdk FALSE 0.311 36.000 0.006 1.000 N NA
 5590506 5590507 BDU_799 BDU_800   tmk TRUE 0.596 33.000 0.010 NA   NA
 5590508 5590509 BDU_801 BDU_802     FALSE 0.340 -52.000 0.025 NA   NA
 5590509 5590510 BDU_802 BDU_803     TRUE 0.874 33.000 0.123 1.000 Y NA
 5590512 5590513 BDU_805 BDU_806 mutS_2   TRUE 0.917 9.000 0.273 1.000   NA
 5590513 5590514 BDU_806 BDU_807     FALSE 0.160 114.000 0.010 NA   NA
 5590514 5590515 BDU_807 BDU_808   nusA TRUE 0.759 -25.000 0.759 NA   NA
 5590515 5590516 BDU_808 BDU_809 nusA infB TRUE 0.600 -19.000 0.342 1.000 N NA
 5590516 5590517 BDU_809 BDU_810 infB rbfA TRUE 0.901 -10.000 0.530 1.000 Y NA
 5590517 5590518 BDU_810 BDU_811 rbfA truB TRUE 0.932 10.000 0.111 1.000 Y NA
 5590518 5590519 BDU_811 BDU_812 truB rpsO FALSE 0.199 222.000 0.013 1.000 Y NA
 5590519 5590520 BDU_812 BDU_813 rpsO pnpA TRUE 0.934 14.000 0.335 1.000 Y NA
 5590520 5590521 BDU_813 BDU_814 pnpA   TRUE 0.749 10.000 0.010 NA   NA
 5590521 5590522 BDU_814 BDU_815     FALSE 0.374 -25.000 0.016 NA   NA
 5590522 5590523 BDU_815 BDU_816     TRUE 0.868 -144.000 0.631 0.039   NA
 5590523 5590524 BDU_816 BDU_817   tgt TRUE 0.770 18.000 0.028 1.000   NA
 5590524 5590525 BDU_817 BDU_818 tgt mviN TRUE 0.672 -7.000 0.024 1.000   NA
 5590525 5590526 BDU_818 BDU_819 mviN   TRUE 0.735 -3.000 0.018 1.000   NA
 5590528 5590529 BDU_821 BDU_822 panF_1 rluA_1 TRUE 0.591 5.000 0.019 1.000 N NA
 5590529 5590530 BDU_822 BDU_823 rluA_1   FALSE 0.371 -31.000 0.021 NA   NA
 5590530 5590531 BDU_823 BDU_824   murC_1 FALSE 0.294 -52.000 0.010 NA   NA
 5590531 5590532 BDU_824 BDU_825 murC_1   TRUE 0.733 12.000 0.018 NA   NA
 5590532 5590533 BDU_825 BDU_826   panF_2 TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5590533 5590534 BDU_826 BDU_827 panF_2 rluA_2 TRUE 0.591 5.000 0.019 1.000 N NA
 5590534 5590535 BDU_827 BDU_828 rluA_2   FALSE 0.371 -31.000 0.021 NA   NA
 5590535 5590536 BDU_828 BDU_829   murC_2 FALSE 0.294 -52.000 0.010 NA   NA
 5590536 5590537 BDU_829 BDU_830 murC_2   TRUE 0.733 12.000 0.018 NA   NA
 5590537 5590538 BDU_830 BDU_831     TRUE 0.698 -3.000 0.024 NA   NA
 5590538 5590539 BDU_831 BDU_832     TRUE 0.771 -10.000 0.000 NA   NA
 5590539 5590540 BDU_832 BDU_833   miaA TRUE 0.746 -13.000 0.000 NA   NA
 5590543 5590544 BDU_836 BDU_837     TRUE 0.857 -7.000 0.600 NA   NA
 5590544 5590545 BDU_837 BDU_838   nagE TRUE 0.490 82.000 0.333 NA   NA
 5590545 5590546 BDU_838 BDU_839 nagE hrpA FALSE 0.073 91.000 0.009 1.000 N NA
 5590546 5590547 BDU_839 BDU_840 hrpA topA TRUE 0.910 4.000 0.010 1.000 Y NA
 5590548 5590549 BDU_841 BDU_842 sbcD sbcC TRUE 0.702 -13.000 0.019 NA Y NA
 5590549 5590550 BDU_842 BDU_843 sbcC xylR-2 TRUE 0.701 36.000 0.429 NA N NA
 5590550 5590551 BDU_843 BDU_844 xylR-2 cutC TRUE 0.499 1.000 0.030 NA N NA
 5590552 5590553 BDU_845 BDU_846   ileS TRUE 0.507 -12.000 0.014 NA   NA
 5590553 5590554 BDU_846 BDU_847 ileS clpC FALSE 0.249 -15.000 0.016 1.000 N NA
 5590554 5590555 BDU_847 BDU_848 clpC cpsG TRUE 0.747 17.000 0.231 1.000 N NA
 5590556 5590557 BDU_849 BDU_850 uvrB uvrA TRUE 0.978 28.000 0.154 0.003 Y NA
 5590557 5590558 BDU_850 BDU_851 uvrA   FALSE 0.064 -45.000 0.017 NA N NA
 5590559 5590560 BDU_852 BDU_853     TRUE 0.779 7.000 0.005 NA   NA
 5590561 5590562 BDU_854 BDU_855 arcA arcB TRUE 0.622 -36.000 0.034 1.000 Y NA
 5590562 5590563 BDU_855 BDU_856 arcB   TRUE 0.808 53.000 1.000 NA   NA
 5590563 5590564 BDU_856 BDU_857   arcC TRUE 0.847 19.000 0.273 NA   NA
 5590564 5590565 BDU_857 BDU_858 arcC   FALSE 0.166 326.000 0.000 1.000   NA
 5589098 5589099 BDU_10002 BDU_10003   pf49 FALSE 0.149 309.000 0.000 NA   NA
 5589099 5589100 BDU_10003 BDU_10004 pf49 pf32 TRUE 0.906 31.000 0.857 NA   NA
 5589100 5589101 BDU_10004 BDU_10005 pf32 ppap1 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589101 5589102 BDU_10005 BDU_10006 ppap1 ppap2 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589103 5589104 BDU_10007 BDU_10008   ssb FALSE 0.277 200.000 0.000 1.000   NA
 5589104 5589105 BDU_10008 BDU_10009 ssb bppB TRUE 0.726 46.000 0.000 NA   NA
 5589106 5589107 BDU_10010 BDU_10011 bppC   FALSE 0.114 434.000 0.000 NA   NA
 5589108 5589109 BDU_10012 BDU_10013   bsr TRUE 0.917 5.000 0.000 NA   NA
 5589109 5589110 BDU_10013 BDU_10014 bsr bdr TRUE 0.887 12.000 0.000 NA   NA
 5589110 5589111 BDU_10014 BDU_10015 bdr   FALSE 0.316 145.000 0.000 NA   NA
 5589111 5589112 BDU_10015 BDU_10016     TRUE 0.914 7.000 0.000 NA   NA
 5589112 5589113 BDU_10016 BDU_10017     TRUE 0.887 12.000 0.000 NA   NA
 5589113 5589114 BDU_10017 BDU_10018     TRUE 0.895 0.000 0.000 NA   NA
 5589114 5589115 BDU_10018 BDU_10019     TRUE 0.856 23.000 0.000 NA   NA
 5589115 5589116 BDU_10019 BDU_10020     TRUE 0.860 16.000 0.000 NA   NA
 5589116 5589117 BDU_10020 BDU_10021     TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589117 5589118 BDU_10021 BDU_10022     TRUE 0.684 -21.000 0.000 NA   NA
 5589118 5589119 BDU_10022 BDU_10023     TRUE 0.723 -16.000 0.000 NA   NA
 5589119 5589120 BDU_10023 BDU_10024     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589120 5589121 BDU_10024 BDU_10025     TRUE 0.771 -10.000 0.000 NA   NA
 5589121 5589122 BDU_10025 BDU_10026     TRUE 0.895 0.000 0.000 NA   NA
 5589122 5589123 BDU_10026 BDU_10027     TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 5589123 5589124 BDU_10027 BDU_10028     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589124 5589125 BDU_10028 BDU_10029     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589125 5589126 BDU_10029 BDU_10030     TRUE 0.887 12.000 0.000 NA   NA
 5589126 5589127 BDU_10030 BDU_10031     TRUE 0.917 5.000 0.000 NA   NA
 5589127 5589128 BDU_10031 BDU_10032     TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5589128 5589129 BDU_10032 BDU_10033     TRUE 0.567 62.000 0.000 NA   NA
 5589129 5589130 BDU_10033 BDU_10034     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589130 5589131 BDU_10034 BDU_10035     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589131 5589132 BDU_10035 BDU_10036     TRUE 0.532 -103.000 0.000 NA   NA
 5589133 5589134 BDU_1001 BDU_1002     FALSE 0.341 129.000 0.000 NA   NA
 5589134 5589135 BDU_1002 BDU_1003     FALSE 0.348 127.000 0.000 NA   NA
 5589135 5589136 BDU_1003 BDU_1004     FALSE 0.230 209.000 0.000 NA   NA
 5589136 5589137 BDU_1004 BDU_1005     FALSE 0.177 253.000 0.000 NA   NA
 5589137 5589138 BDU_1005 BDU_1006     FALSE 0.182 251.000 0.000 NA   NA
 5589138 5589139 BDU_1006 BDU_1007     FALSE 0.191 243.000 0.000 NA   NA
 5589139 5589140 BDU_1007 BDU_1008     FALSE 0.303 155.000 0.000 NA   NA
 5589140 5589141 BDU_1008 BDU_1009     FALSE 0.235 203.000 0.000 NA   NA
 5589141 5589142 BDU_1009 BDU_1010     FALSE 0.167 266.000 0.000 NA   NA
 5589142 5589143 BDU_1010 BDU_1011     FALSE 0.179 252.000 0.000 NA   NA
 5589143 5589144 BDU_1011 BDU_1012     FALSE 0.167 266.000 0.000 NA   NA
 5589144 5589145 BDU_1012 BDU_1013     FALSE 0.168 265.000 0.000 NA   NA
 5589145 5589146 BDU_1013 BDU_1014     FALSE 0.190 244.000 0.000 NA   NA
 5589146 5589147 BDU_1014 BDU_1015     FALSE 0.341 129.000 0.000 NA   NA
 5589147 5589148 BDU_1015 BDU_1016     FALSE 0.341 129.000 0.000 NA   NA
 5589148 5589149 BDU_1016 BDU_1017     FALSE 0.385 111.000 0.000 NA   NA
 5589149 5589150 BDU_1017 BDU_1018     FALSE 0.385 111.000 0.000 NA   NA
 5589150 5589151 BDU_1018 BDU_1019     TRUE 0.576 61.000 0.000 NA   NA
 5589151 5589152 BDU_1019 BDU_1020     FALSE 0.332 132.000 0.000 NA   NA
 5589152 5589153 BDU_1020 BDU_1021     FALSE 0.379 112.000 0.000 NA   NA
 5589153 5589154 BDU_1021 BDU_1022     FALSE 0.379 112.000 0.000 NA   NA
 5589154 5589155 BDU_1022 BDU_1023     FALSE 0.253 195.000 0.000 NA   NA
 5589155 5589156 BDU_1023 BDU_1024     FALSE 0.166 273.000 0.000 NA   NA
 5589156 5589157 BDU_1024 BDU_1025     FALSE 0.121 381.000 0.000 NA   NA
 5589157 5589158 BDU_1025 BDU_1026     FALSE 0.211 223.000 0.000 NA   NA
 5589158 5589159 BDU_1026 BDU_1027     FALSE 0.363 122.000 0.000 NA   NA
 5589160 5589161 BDU_1028 BDU_1029     FALSE 0.293 165.000 0.000 NA   NA
 5589161 5589162 BDU_1029 BDU_1030     FALSE 0.132 343.000 0.000 NA   NA
 5589162 5589163 BDU_1030 BDU_1031     FALSE 0.084 794.000 0.000 NA   NA
 5589163 5589164 BDU_1031 BDU_1032     FALSE 0.112 443.000 0.000 NA   NA
 5589164 5589165 BDU_1032 BDU_1033     FALSE 0.232 207.000 0.000 NA   NA
 5589165 5589166 BDU_1033 BDU_1034     FALSE 0.116 423.000 0.000 NA   NA
 5589167 5589168 BDU_1035 BDU_1036     FALSE 0.244 199.000 0.000 NA   NA
 5589168 5589169 BDU_1036 BDU_1037     FALSE 0.149 309.000 0.000 NA   NA
 5589169 5589170 BDU_1037 BDU_1038     FALSE 0.145 317.000 0.000 NA   NA
 5589170 5589171 BDU_1038 BDU_1039     FALSE 0.314 146.000 0.000 NA   NA
 5589171 5589172 BDU_1039 BDU_1040     FALSE 0.136 338.000 0.000 NA   NA
 5589172 5589173 BDU_1040 BDU_1041     FALSE 0.135 339.000 0.000 NA   NA
 5589173 5589174 BDU_1041 BDU_1042     FALSE 0.321 140.000 0.000 NA   NA
 5589174 5589175 BDU_1042 BDU_1043     FALSE 0.177 253.000 0.000 NA   NA
 5589175 5589176 BDU_1043 BDU_1044     FALSE 0.227 213.000 0.000 NA   NA
 5589178 5589179 BDU_1046 BDU_1047     FALSE 0.097 559.000 0.000 NA   NA
 5589179 5589180 BDU_1047 BDU_1048     FALSE 0.156 288.000 0.000 NA   NA
 5589181 5589182 BDU_1049 BDU_1050     FALSE 0.110 451.000 0.000 NA   NA
 5589182 5589183 BDU_1050 BDU_1051     FALSE 0.131 347.000 0.000 NA   NA
 5589183 5589184 BDU_1051 BDU_1052     FALSE 0.161 282.000 0.000 NA   NA
 5589185 5589186 BDU_1053 BDU_1054     FALSE 0.127 357.000 0.000 NA   NA
 5589186 5589187 BDU_1054 BDU_1055     FALSE 0.305 154.000 0.000 NA   NA
 5589187 5589188 BDU_1055 BDU_1056     FALSE 0.216 218.000 0.000 NA   NA
 5589188 5589189 BDU_1056 BDU_1057     FALSE 0.327 136.000 0.000 NA   NA
 5589189 5589190 BDU_1057 BDU_1058     TRUE 0.839 28.000 0.000 NA   NA
 5589190 5589191 BDU_1058 BDU_1059     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5589191 5589192 BDU_1059 BDU_1060     FALSE 0.081 850.000 0.000 NA   NA
 5589192 5589193 BDU_1060 BDU_1061     FALSE 0.134 340.000 0.000 NA   NA
 5589193 5589194 BDU_1061 BDU_1062     FALSE 0.202 230.000 0.000 NA   NA
 5589194 5589195 BDU_1062 BDU_1063     FALSE 0.199 234.000 0.000 NA   NA
 5589195 5589196 BDU_1063 BDU_1064     FALSE 0.136 338.000 0.000 NA   NA
 5589196 5589197 BDU_1064 BDU_1065     TRUE 0.839 28.000 0.000 NA   NA
 5589197 5589198 BDU_1065 BDU_1066     TRUE 0.402 100.000 0.000 NA   NA
 5589198 5589199 BDU_1066 BDU_1067     FALSE 0.285 170.000 0.000 NA   NA
 5589199 5589200 BDU_1067 BDU_1068     FALSE 0.268 186.000 0.000 NA   NA
 5589200 5589201 BDU_1068 BDU_1069     TRUE 0.860 16.000 0.000 NA   NA
 5589201 5589202 BDU_1069 BDU_1070     FALSE 0.261 188.000 0.000 NA   NA
 5589202 5589203 BDU_1070 BDU_1071     FALSE 0.076 1097.000 0.000 NA   NA
 5589203 5589204 BDU_1071 BDU_1072     FALSE 0.260 189.000 0.000 NA   NA
 5589204 5589205 BDU_1072 BDU_1073     FALSE 0.310 150.000 0.000 NA   NA
 5589205 5589206 BDU_1073 BDU_1074     FALSE 0.144 321.000 0.000 NA   NA
 5589206 5589207 BDU_1074 BDU_1075   nrdF FALSE 0.139 336.000 0.000 NA   NA
 5589207 5589208 BDU_1075 BDU_1076 nrdF nrdE TRUE 0.973 45.000 0.400 0.002 Y NA
 5589208 5589209 BDU_1076 BDU_1077 nrdE nrdI TRUE 0.673 -76.000 0.000 NA Y NA
 5589209 5589210 BDU_1077 BDU_1078 nrdI   TRUE 0.646 76.000 0.000 NA Y NA
 5589211 5589212 BDU_1079 BDU_1080     FALSE 0.152 302.000 0.000 NA   NA
 5589213 5589214 BDU_1081 BDU_1082     FALSE 0.281 175.000 0.000 NA   NA
 5589214 5589215 BDU_1082 BDU_1083     TRUE 0.816 34.000 0.000 NA   NA
 5589215 5589216 BDU_1083 BDU_1084     FALSE 0.379 112.000 0.000 NA   NA
 5589216 5589217 BDU_1084 BDU_1085     TRUE 0.782 39.000 0.000 NA   NA
 5589217 5589218 BDU_1085 BDU_1086     TRUE 0.846 25.000 0.000 NA   NA
 5589218 5589219 BDU_1086 BDU_1087     TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5589219 5589220 BDU_1087 BDU_1088     TRUE 0.846 25.000 0.000 NA   NA
 5589220 5589221 BDU_1088 BDU_1089     TRUE 0.917 4.000 0.000 NA   NA
 5589221 5589222 BDU_1089 BDU_1090     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589222 5589223 BDU_1090 BDU_1091     TRUE 0.726 46.000 0.000 NA   NA
 5589223 5589224 BDU_1091 BDU_1092     TRUE 0.822 33.000 0.000 NA   NA
 5589224 5589225 BDU_1092 BDU_1093     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589225 5589226 BDU_1093 BDU_1094     TRUE 0.785 -9.000 0.000 NA   NA
 5589226 5589227 BDU_1094 BDU_1095     TRUE 0.412 97.000 0.000 NA   NA
 5589227 5589228 BDU_1095 BDU_1096     TRUE 0.639 56.000 0.000 NA   NA
 5589228 5589229 BDU_1096 BDU_1097     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589229 5589230 BDU_1097 BDU_1098     FALSE 0.173 256.000 0.000 NA   NA
 5589231 5589232 BDU_1099 BDU_1100     FALSE 0.146 314.000 0.000 NA   NA
 5589232 5589233 BDU_1100 BDU_1101     FALSE 0.276 179.000 0.000 NA   NA
 5589233 5589234 BDU_1101 BDU_1102     FALSE 0.368 120.000 0.000 NA   NA
 5589234 5589235 BDU_1102 BDU_1103     FALSE 0.224 214.000 0.000 NA   NA
 5589235 5589236 BDU_1103 BDU_1104     FALSE 0.316 145.000 0.000 NA   NA
 5589236 5589237 BDU_1104 BDU_1105     FALSE 0.283 171.000 0.000 NA   NA
 5589238 5589239 BDU_1106 BDU_1107     FALSE 0.257 190.000 0.000 NA   NA
 5589239 5589240 BDU_1107 BDU_1108     FALSE 0.254 194.000 0.000 NA   NA
 5589240 5589241 BDU_1108 BDU_1109     TRUE 0.842 47.000 1.000 NA   NA
 5589242 5589243 BDU_1110 BDU_1111     FALSE 0.169 264.000 0.000 NA   NA
 5589243 5589244 BDU_1111 BDU_1112     FALSE 0.101 522.000 0.000 NA   NA
 5589245 5589246 BDU_1113 BDU_1114 bsr   TRUE 0.915 3.000 0.000 NA   NA
 5589246 5589247 BDU_1114 BDU_1115   pf49 FALSE 0.085 784.000 0.000 NA   NA
 5589247 5589248 BDU_1115 BDU_1116 pf49 pf32 TRUE 0.675 51.000 0.000 NA   NA
 5589248 5589249 BDU_1116 BDU_1117 pf32 ppap1 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589249 5589250 BDU_1117 BDU_1118 ppap1 ppap2 TRUE 0.839 28.000 0.000 NA   NA
 5589250 5589251 BDU_1118 BDU_1119 ppap2   FALSE 0.110 453.000 0.000 NA   NA
 5589253 5589254 BDU_1121 BDU_1122     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589254 5589255 BDU_1122 BDU_1123     FALSE 0.134 340.000 0.000 NA   NA
 5589255 5589256 BDU_1123 BDU_1124     TRUE 0.788 38.000 0.000 NA   NA
 5589256 5589257 BDU_1124 BDU_1125     TRUE 0.917 4.000 0.000 NA   NA
 5589257 5589258 BDU_1125 BDU_1126     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589259 5589260 BDU_1127 BDU_1128     FALSE 0.104 499.000 0.000 NA   NA
 5589260 5589261 BDU_1128 BDU_1129     FALSE 0.227 213.000 0.000 NA   NA
 5589261 5589262 BDU_1129 BDU_1130     FALSE 0.334 131.000 0.000 NA   NA
 5589262 5589263 BDU_1130 BDU_1131     FALSE 0.353 125.000 0.000 NA   NA
 5589263 5589264 BDU_1131 BDU_1132     FALSE 0.089 653.000 0.000 NA   NA
 5589264 5589265 BDU_1132 BDU_1133     FALSE 0.219 216.000 0.000 NA   NA
 5589265 5589266 BDU_1133 BDU_1134     TRUE 0.490 81.000 0.000 NA   NA
 5589266 5589267 BDU_1134 BDU_1135     TRUE 0.597 59.000 0.000 NA   NA
 5589267 5589268 BDU_1135 BDU_1136     FALSE 0.143 323.000 0.000 NA   NA
 5589268 5589269 BDU_1136 BDU_1137     FALSE 0.126 362.000 0.000 NA   NA
 5589269 5589270 BDU_1137 BDU_1138   pncA TRUE 0.412 97.000 0.000 NA   NA
 5589270 5589271 BDU_1138 BDU_1139 pncA   FALSE 0.231 208.000 0.000 NA   NA
 5589271 5589272 BDU_1139 BDU_1140     FALSE 0.285 170.000 0.000 NA   NA
 5589272 5589273 BDU_1140 BDU_1141     FALSE 0.159 283.000 0.000 NA   NA
 5589273 5589274 BDU_1141 BDU_1142   guaA FALSE 0.211 223.000 0.000 NA   NA
 5589274 5589275 BDU_1142 BDU_1143 guaA   TRUE 0.979 30.000 0.190 0.003 Y NA
 5589275 5589276 BDU_1143 BDU_1144     FALSE 0.164 276.000 0.000 NA   NA
 5589277 5589278 BDU_7001 BDU_7002     FALSE 0.108 460.000 0.000 NA   NA
 5589278 5589279 BDU_7002 BDU_7003   vsp FALSE 0.143 322.000 0.000 NA   NA
 5589279 5589280 BDU_7003 BDU_7004 vsp vlp-b TRUE 0.389 109.000 0.000 NA   NA
 5589280 5589281 BDU_7004 BDU_7005 vlp-b vlp-d_1 FALSE 0.339 193.000 0.600 NA   NA
 5589281 5589282 BDU_7005 BDU_7006 vlp-d_1   FALSE 0.272 184.000 0.000 NA   NA
 5589282 5589283 BDU_7006 BDU_7007   vlp-c_1 FALSE 0.157 286.000 0.000 NA   NA
 5589283 5589284 BDU_7007 BDU_7008 vlp-c_1 vlp-d_2 FALSE 0.306 212.000 0.600 NA   NA
 5589284 5589285 BDU_7008 BDU_7009 vlp-d_2   FALSE 0.155 290.000 0.000 NA   NA
 5589285 5589286 BDU_7009 BDU_7010     TRUE 0.523 -256.000 0.000 NA   NA
 5589286 5589287 BDU_7010 BDU_7011     FALSE 0.224 214.000 0.000 NA   NA
 5589287 5589288 BDU_7011 BDU_7012   vlp-c_2 FALSE 0.105 494.000 0.000 NA   NA
 5589288 5589289 BDU_7012 BDU_7013 vlp-c_2 vlp-d_3 FALSE 0.333 196.000 0.600 NA   NA
 5589289 5589290 BDU_7013 BDU_7014 vlp-d_3   FALSE 0.094 582.000 0.000 NA   NA
 5589290 5589291 BDU_7014 BDU_7015     FALSE 0.098 550.000 0.000 NA   NA
 5589291 5589292 BDU_7015 BDU_7016     FALSE 0.327 136.000 0.000 NA   NA
 5589292 5589293 BDU_7016 BDU_7017     FALSE 0.237 202.000 0.000 NA   NA
 5589293 5589294 BDU_7017 BDU_7018     FALSE 0.191 243.000 0.000 NA   NA
 5589294 5589295 BDU_7018 BDU_7019     FALSE 0.182 251.000 0.000 NA   NA
 5589295 5589296 BDU_7019 BDU_7020     TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589296 5589297 BDU_7020 BDU_7021     FALSE 0.152 302.000 0.000 NA   NA
 5589297 5589298 BDU_7021 BDU_7022   vlp-d_4 FALSE 0.205 226.000 0.000 NA   NA
 5589298 5589299 BDU_7022 BDU_7023 vlp-d_4 vlp-d_5 FALSE 0.341 190.000 0.600 NA   NA
 5589299 5589300 BDU_7023 BDU_7024 vlp-d_5 vlp-c_3 FALSE 0.180 351.000 0.600 NA   NA
 5589300 5589301 BDU_7024 BDU_7025 vlp-c_3 pf49 FALSE 0.083 815.000 0.000 NA   NA
 5589301 5589302 BDU_7025 BDU_7026 pf49 pf32 TRUE 0.917 5.000 0.000 NA   NA
 5589302 5589303 BDU_7026 BDU_7027 pf32 ppap1 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589303 5589304 BDU_7027 BDU_7028 ppap1   TRUE 0.834 29.000 0.000 NA   NA
 5589304 5589305 BDU_7028 BDU_7029     FALSE 0.111 447.000 0.000 NA   NA
 5589306 5589307 BDU_7030 BDU_7031     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589310 5589311 BDU_6002 BDU_6003 vlp-d_1   FALSE 0.085 785.000 0.000 NA   NA
 5589311 5589312 BDU_6003 BDU_6004     TRUE 0.583 60.000 0.000 NA   NA
 5589312 5589313 BDU_6004 BDU_6005     FALSE 0.102 507.000 0.000 NA   NA
 5589313 5589314 BDU_6005 BDU_6006   vlp-d_2 FALSE 0.078 927.000 0.000 NA   NA
 5589314 5589315 BDU_6006 BDU_6007 vlp-d_2   FALSE 0.268 186.000 0.000 NA   NA
 5589315 5589316 BDU_6007 BDU_6008   vlp-a_1 FALSE 0.086 778.000 0.000 NA   NA
 5589316 5589317 BDU_6008 BDU_6009 vlp-a_1 vlp-d_3 FALSE 0.304 213.000 0.600 NA   NA
 5589317 5589318 BDU_6009 BDU_6010 vlp-d_3 vlp-a_2 FALSE 0.268 237.000 0.600 NA   NA
 5589318 5589319 BDU_6010 BDU_6011 vlp-a_2   FALSE 0.119 386.000 0.000 NA   NA
 5589320 5589321 BDU_6012 BDU_6013   ppap2 FALSE 0.088 702.000 0.000 NA   NA
 5589321 5589322 BDU_6013 BDU_6014 ppap2 ppap1 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589322 5589323 BDU_6014 BDU_6015 ppap1 pf32 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589323 5589324 BDU_6015 BDU_6016 pf32 pf49 TRUE 0.811 35.000 0.000 NA   NA
 5589326 5589327 BDU_6018 BDU_6019     FALSE 0.074 1371.000 0.000 NA   NA
 5589329 5589330 BDU_6021 BDU_6022 vsp_1 vlp-c FALSE 0.095 580.000 0.000 NA   NA
 5589330 5589331 BDU_6022 BDU_6023 vlp-c vlp-a_3 FALSE 0.141 538.000 0.600 NA   NA
 5589331 5589332 BDU_6023 BDU_6024 vlp-a_3   FALSE 0.074 1336.000 0.000 NA   NA
 5589332 5589333 BDU_6024 BDU_6025   vsp_2 TRUE 0.490 81.000 0.000 NA   NA
 5589333 5589334 BDU_6025 BDU_6026 vsp_2   FALSE 0.075 1202.000 0.000 NA   NA
 5589335 5589336 BDU_5001 BDU_5002     FALSE 0.090 639.000 0.000 NA   NA
 5589338 5589339 BDU_5004 BDU_5005   vlp-a_1 TRUE 0.597 59.000 0.000 NA   NA
 5589339 5589340 BDU_5005 BDU_5006 vlp-a_1   FALSE 0.312 148.000 0.000 NA   NA
 5589340 5589341 BDU_5006 BDU_5007     FALSE 0.139 334.000 0.000 NA   NA
 5589341 5589342 BDU_5007 BDU_5008   vlp-a_2 TRUE 0.455 87.000 0.000 NA   NA
 5589342 5589343 BDU_5008 BDU_5009 vlp-a_2   FALSE 0.221 215.000 0.000 NA   NA
 5589343 5589344 BDU_5009 BDU_5010   vlp-c_1 FALSE 0.185 249.000 0.000 NA   NA
 5589344 5589345 BDU_5010 BDU_5011 vlp-c_1   FALSE 0.182 251.000 0.000 NA   NA
 5589345 5589346 BDU_5011 BDU_5012     TRUE 0.684 -21.000 0.000 NA   NA
 5589346 5589347 BDU_5012 BDU_5013   vlp-a_3 FALSE 0.095 580.000 0.000 NA   NA
 5589347 5589348 BDU_5013 BDU_5014 vlp-a_3 bdr_1 FALSE 0.113 439.000 0.000 NA   NA
 5589348 5589349 BDU_5014 BDU_5015 bdr_1   TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589349 5589350 BDU_5015 BDU_5016     TRUE 0.886 -1.000 0.000 NA   NA
 5589351 5589352 BDU_5017 BDU_5018     FALSE 0.123 376.000 0.000 NA   NA
 5589352 5589353 BDU_5018 BDU_5019     FALSE 0.093 596.000 0.000 NA   NA
 5589354 5589355 BDU_5020 BDU_5021   ssb TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5589355 5589356 BDU_5021 BDU_5022 ssb   FALSE 0.244 199.000 0.000 NA   NA
 5589357 5589358 BDU_5023 BDU_5024 ppap2 ppap1 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589358 5589359 BDU_5024 BDU_5025 ppap1 pf32 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589359 5589360 BDU_5025 BDU_5026 pf32 pf49 TRUE 0.796 37.000 0.000 NA   NA
 5589360 5589361 BDU_5026 BDU_5027 pf49   FALSE 0.109 455.000 0.000 NA   NA
 5589361 5589362 BDU_5027 BDU_5028     TRUE 0.796 37.000 0.000 NA   NA
 5589364 5589365 BDU_5030 BDU_5031     TRUE 0.915 6.000 0.000 NA   NA
 5589365 5589366 BDU_5031 BDU_5032   bdr_2 TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5589366 5589367 BDU_5032 BDU_5033 bdr_2 vlp-d FALSE 0.121 381.000 0.000 NA   NA
 5589367 5589368 BDU_5033 BDU_5034 vlp-d vlp-c_2 FALSE 0.314 203.000 0.600 NA   NA
 5589368 5589369 BDU_5034 BDU_5035 vlp-c_2 vsp_1 FALSE 0.130 349.000 0.000 NA   NA
 5589369 5589370 BDU_5035 BDU_5036 vsp_1   FALSE 0.099 546.000 0.000 NA   NA
 5589370 5589371 BDU_5036 BDU_5037     FALSE 0.141 328.000 0.000 NA   NA
 5589371 5589372 BDU_5037 BDU_5038   vsp_2 FALSE 0.096 578.000 0.000 NA   NA
 5589372 5589373 BDU_5038 BDU_5039 vsp_2   FALSE 0.107 464.000 0.000 NA   NA
 5589373 5589374 BDU_5039 BDU_5040     TRUE 0.782 39.000 0.000 NA   NA
 5589374 5589375 BDU_5040 BDU_5041     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589375 5589376 BDU_5041 BDU_5042   vlp-a_4 FALSE 0.188 246.000 0.000 NA   NA
 5589377 5589378 BDU_4001 BDU_4002   vlp-d_1 FALSE 0.073 1591.000 0.000 NA   NA
 5589378 5589379 BDU_4002 BDU_4003 vlp-d_1 vlp-d_2 FALSE 0.289 220.000 0.600 NA   NA
 5589379 5589380 BDU_4003 BDU_4004 vlp-d_2 vlp-d_3 FALSE 0.226 276.000 0.600 NA   NA
 5589380 5589381 BDU_4004 BDU_4005 vlp-d_3   FALSE 0.196 238.000 0.000 NA   NA
 5589381 5589382 BDU_4005 BDU_4006     FALSE 0.125 369.000 0.000 NA   NA
 5589382 5589383 BDU_4006 BDU_4007   vlp_1 FALSE 0.170 262.000 0.000 NA   NA
 5589383 5589384 BDU_4007 BDU_4008 vlp_1 bdr_1 FALSE 0.172 258.000 0.000 NA   NA
 5589384 5589385 BDU_4008 BDU_4009 bdr_1   TRUE 0.914 7.000 0.000 NA   NA
 5589385 5589386 BDU_4009 BDU_4010     TRUE 0.796 37.000 0.000 NA   NA
 5589387 5589388 BDU_4011 BDU_4012     FALSE 0.124 371.000 0.000 NA   NA
 5589389 5589390 BDU_4013 BDU_4014   pf49 FALSE 0.151 303.000 0.000 NA   NA
 5589390 5589391 BDU_4014 BDU_4015 pf49 pf32 TRUE 0.535 69.000 0.000 NA   NA
 5589391 5589392 BDU_4015 BDU_4016 pf32 ppap1 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589392 5589393 BDU_4016 BDU_4017 ppap1 ppap2 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589394 5589395 BDU_4018 BDU_4019     FALSE 0.217 217.000 0.000 NA   NA
 5589396 5589397 BDU_4020 BDU_4021     FALSE 0.193 242.000 0.000 NA   NA
 5589398 5589399 BDU_4022 BDU_4023     TRUE 0.887 12.000 0.000 NA   NA
 5589399 5589400 BDU_4023 BDU_4024   bdr_2 TRUE 0.472 84.000 0.000 NA   NA
 5589400 5589401 BDU_4024 BDU_4025 bdr_2 vsp FALSE 0.092 612.000 0.000 NA   NA
 5589401 5589402 BDU_4025 BDU_4026 vsp vlp-c_1 FALSE 0.102 521.000 0.000 NA   NA
 5589402 5589403 BDU_4026 BDU_4027 vlp-c_1   FALSE 0.363 122.000 0.000 NA   NA
 5589405 5589406 BDU_4029 BDU_4030     TRUE 0.887 12.000 0.000 NA   NA
 5589406 5589407 BDU_4030 BDU_4031   bdr_3 TRUE 0.756 44.000 0.000 NA   NA
 5589407 5589408 BDU_4031 BDU_4032 bdr_3 vlp-c_2 FALSE 0.103 500.000 0.000 NA   NA
 5589408 5589409 BDU_4032 BDU_4033 vlp-c_2 vlp-d_4 FALSE 0.348 187.000 0.600 NA   NA
 5589409 5589410 BDU_4033 BDU_4034 vlp-d_4 vlp-b FALSE 0.355 185.000 0.600 NA   NA
 5589410 5589411 BDU_4034 BDU_4035 vlp-b vlp-d_5 FALSE 0.192 337.000 0.600 NA   NA
 5589411 5589412 BDU_4035 BDU_4036 vlp-d_5 vlp_2 FALSE 0.116 863.000 0.600 NA   NA
 5589412 5589413 BDU_4036 BDU_4037 vlp_2   FALSE 0.076 1094.000 0.000 NA   NA
 5589415 5589416 BDU_3001 BDU_3002 vlp-d_1   FALSE 0.233 205.000 0.000 NA   NA
 5589416 5589417 BDU_3002 BDU_3003     TRUE 0.886 -1.000 0.000 NA   NA
 5589417 5589418 BDU_3003 BDU_3004   vlp-c_1 FALSE 0.179 252.000 0.000 NA   NA
 5589418 5589419 BDU_3004 BDU_3005 vlp-c_1   FALSE 0.244 199.000 0.000 NA   NA
 5589419 5589420 BDU_3005 BDU_3006   vlp-b FALSE 0.127 357.000 0.000 NA   NA
 5589420 5589421 BDU_3006 BDU_3007 vlp-b   FALSE 0.082 827.000 0.000 NA   NA
 5589421 5589422 BDU_3007 BDU_3008   bsr TRUE 0.915 6.000 0.000 NA   NA
 5589422 5589423 BDU_3008 BDU_3009 bsr   FALSE 0.122 379.000 0.000 NA   NA
 5589424 5589425 BDU_3010 BDU_3011     FALSE 0.194 241.000 0.000 NA   NA
 5589426 5589427 BDU_3012 BDU_3013 bppB_1   TRUE 0.782 39.000 0.000 NA   NA
 5589427 5589428 BDU_3013 BDU_3014     FALSE 0.114 429.000 0.000 NA   NA
 5589428 5589429 BDU_3014 BDU_3015     FALSE 0.079 920.000 0.000 NA   NA
 5589429 5589430 BDU_3015 BDU_3016   pf49 FALSE 0.153 294.000 0.000 NA   NA
 5589430 5589431 BDU_3016 BDU_3017 pf49 pf32 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589431 5589432 BDU_3017 BDU_3018 pf32 ppap1 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589432 5589433 BDU_3018 BDU_3019 ppap1 ppap2 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589434 5589435 BDU_3020 BDU_3021   bppB_2 FALSE 0.327 136.000 0.000 NA   NA
 5589436 5589437 BDU_3022 BDU_3023     FALSE 0.082 840.000 0.000 NA   NA
 5589438 5589439 BDU_3024 BDU_3025   bdr TRUE 0.915 6.000 0.000 NA   NA
 5589439 5589440 BDU_3025 BDU_3026 bdr   FALSE 0.319 143.000 0.000 NA   NA
 5589440 5589441 BDU_3026 BDU_3027     TRUE 0.478 83.000 0.000 NA   NA
 5589441 5589442 BDU_3027 BDU_3028   vlp-a FALSE 0.268 186.000 0.000 NA   NA
 5589442 5589443 BDU_3028 BDU_3029 vlp-a   TRUE 0.437 90.000 0.000 NA   NA
 5589443 5589444 BDU_3029 BDU_3030   vlp FALSE 0.276 179.000 0.000 NA   NA
 5589444 5589445 BDU_3030 BDU_3031 vlp   FALSE 0.093 583.000 0.000 NA   NA
 5589445 5589446 BDU_3031 BDU_3032   vlp-c_2 FALSE 0.086 761.000 0.000 NA   NA
 5589446 5589447 BDU_3032 BDU_3033 vlp-c_2 vsp FALSE 0.107 620.000 0.000 1.000   NA
 5589447 5589448 BDU_3033 BDU_3034 vsp   FALSE 0.156 287.000 0.000 NA   NA
 5589448 5589449 BDU_3034 BDU_3035   vlp-c_3 FALSE 0.297 162.000 0.000 NA   NA
 5589449 5589450 BDU_3035 BDU_3036 vlp-c_3   FALSE 0.182 251.000 0.000 NA   NA
 5589450 5589451 BDU_3036 BDU_3037     TRUE 0.886 -1.000 0.000 NA   NA
 5589451 5589452 BDU_3037 BDU_3038   vlp-d_2 FALSE 0.264 187.000 0.000 NA   NA
 5589452 5589453 BDU_3038 BDU_3039 vlp-d_2   FALSE 0.072 2201.000 0.000 NA   NA
 5589454 5589455 BDU_2001 BDU_2002   bdr_1 FALSE 0.092 615.000 0.000 NA   NA
 5589455 5589456 BDU_2002 BDU_2003 bdr_1   FALSE 0.184 250.000 0.000 NA   NA
 5589456 5589457 BDU_2003 BDU_2004     FALSE 0.198 235.000 0.000 NA   NA
 5589457 5589458 BDU_2004 BDU_2005     TRUE 0.801 -7.000 0.000 NA   NA
 5589458 5589459 BDU_2005 BDU_2006     TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5589459 5589460 BDU_2006 BDU_2007     FALSE 0.130 349.000 0.000 NA   NA
 5589460 5589461 BDU_2007 BDU_2008     TRUE 0.822 33.000 0.000 NA   NA
 5589461 5589462 BDU_2008 BDU_2009     TRUE 0.695 49.000 0.000 NA   NA
 5589462 5589463 BDU_2009 BDU_2010     TRUE 0.859 22.000 0.000 NA   NA
 5589463 5589464 BDU_2010 BDU_2011     TRUE 0.628 -28.000 0.000 NA   NA
 5589464 5589465 BDU_2011 BDU_2012     TRUE 0.895 0.000 0.000 NA   NA
 5589465 5589466 BDU_2012 BDU_2013     TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 5589466 5589467 BDU_2013 BDU_2014     TRUE 0.917 4.000 0.000 NA   NA
 5589467 5589468 BDU_2014 BDU_2015     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5589468 5589469 BDU_2015 BDU_2016     TRUE 0.816 -6.000 0.000 NA   NA
 5589469 5589470 BDU_2016 BDU_2017     TRUE 0.895 0.000 0.000 NA   NA
 5589470 5589471 BDU_2017 BDU_2018     TRUE 0.887 12.000 0.000 NA   NA
 5589471 5589472 BDU_2018 BDU_2019     TRUE 0.860 16.000 0.000 NA   NA
 5589472 5589473 BDU_2019 BDU_2020     TRUE 0.846 25.000 0.000 NA   NA
 5589473 5589474 BDU_2020 BDU_2021     TRUE 0.746 -13.000 0.000 NA   NA
 5589475 5589476 BDU_2022 BDU_2023     FALSE 0.120 382.000 0.000 NA   NA
 5589476 5589477 BDU_2023 BDU_2024     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589478 5589479 BDU_2025 BDU_2026 bdr_2   TRUE 0.500 77.000 0.000 NA   NA
 5589481 5589482 BDU_2028 BDU_2029 vlp-a bdr_3 FALSE 0.084 787.000 0.000 NA   NA
 5589482 5589483 BDU_2029 BDU_2030 bdr_3   TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5589483 5589484 BDU_2030 BDU_2031     TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5589485 5589486 BDU_2032 BDU_2033     FALSE 0.308 151.000 0.000 NA   NA
 5589487 5589488 BDU_2034 BDU_2035     FALSE 0.205 226.000 0.000 NA   NA
 5589488 5589489 BDU_2035 BDU_2036     TRUE 0.843 27.000 0.000 NA   NA
 5589489 5589490 BDU_2036 BDU_2037   bppA FALSE 0.242 200.000 0.000 NA   NA
 5589491 5589492 BDU_2038 BDU_2039 ppap2 ppap1 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589492 5589493 BDU_2039 BDU_2040 ppap1 pf32 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589493 5589494 BDU_2040 BDU_2041 pf32 pf49 TRUE 0.768 42.000 0.000 NA   NA
 5589494 5589495 BDU_2041 BDU_2042 pf49   FALSE 0.107 492.000 0.000 NA   NA
 5589496 5589497 BDU_2043 BDU_2044     FALSE 0.123 372.000 0.000 NA   NA
 5589498 5589499 BDU_2045 BDU_2046 vlp-d_1 vlp-b_1 TRUE 0.571 201.000 0.600 0.094   NA
 5589499 5589500 BDU_2046 BDU_2047 vlp-b_1   FALSE 0.281 175.000 0.000 NA   NA
 5589500 5589501 BDU_2047 BDU_2048   vsp_1 FALSE 0.175 254.000 0.000 NA   NA
 5589501 5589502 BDU_2048 BDU_2049 vsp_1 vlp-c_1 FALSE 0.102 750.000 0.000 1.000   NA
 5589502 5589503 BDU_2049 BDU_2050 vlp-c_1   FALSE 0.100 532.000 0.000 NA   NA
 5589503 5589504 BDU_2050 BDU_2051     FALSE 0.096 562.000 0.000 NA   NA
 5589504 5589505 BDU_2051 BDU_2052     FALSE 0.138 337.000 0.000 NA   NA
 5589505 5589506 BDU_2052 BDU_2053     FALSE 0.075 1224.000 0.000 NA   NA
 5589506 5589507 BDU_2053 BDU_2054   vsp_2 FALSE 0.088 713.000 0.000 NA   NA
 5589507 5589508 BDU_2054 BDU_2055 vsp_2 vsp_3 FALSE 0.321 871.000 0.000 0.010   NA
 5589508 5589509 BDU_2055 BDU_2056 vsp_3 vlp-d_2 FALSE 0.208 252.000 0.000 1.000   NA
 5589509 5589510 BDU_2056 BDU_2057 vlp-d_2 vlp-c_2 TRUE 0.677 135.000 0.600 0.093   NA
 5589510 5589511 BDU_2057 BDU_2058 vlp-c_2 vlp-b_2 FALSE 0.373 377.000 0.600 0.093   NA
 5589511 5589512 BDU_2058 BDU_2059 vlp-b_2   FALSE 0.105 494.000 0.000 NA   NA
 5589512 5589513 BDU_2059 BDU_2060     FALSE 0.083 816.000 0.000 NA   NA
 5589513 5589514 BDU_2060 BDU_2061     FALSE 0.341 129.000 0.000 NA   NA
 5589515 5589516 BDU_13001 BDU_13002     FALSE 0.116 423.000 0.000 NA   NA
 5589516 5589517 BDU_13002 BDU_13003   guaB FALSE 0.164 276.000 0.000 NA   NA
 5589517 5589518 BDU_13003 BDU_13004 guaB   TRUE 0.822 33.000 0.000 NA   NA
 5589518 5589519 BDU_13004 BDU_13005     FALSE 0.090 643.000 0.000 NA   NA
 5589519 5589520 BDU_13005 BDU_13006     FALSE 0.363 122.000 0.000 NA   NA
 5589520 5589521 BDU_13006 BDU_13007     TRUE 0.782 39.000 0.000 NA   NA
 5589524 5589525 BDU_13010 BDU_13011   malX FALSE 0.083 813.000 0.000 NA   NA
 5589525 5589526 BDU_13011 BDU_13012 malX acyP FALSE 0.356 83.000 0.000 1.000 N NA
 5589527 5589528 BDU_13013 BDU_13014   resT TRUE 0.639 56.000 0.000 NA   NA
 5589528 5589529 BDU_13014 BDU_13015 resT   TRUE 0.455 87.000 0.000 NA   NA
 5589530 5589531 BDU_13016 BDU_13017   ppap1 TRUE 0.826 32.000 0.000 NA   NA
 5589531 5589532 BDU_13017 BDU_13018 ppap1 pf32 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589532 5589533 BDU_13018 BDU_13019 pf32 pf49 TRUE 0.639 56.000 0.000 NA   NA
 5589535 5589536 BDU_13021 BDU_13022 vlp-d vlp FALSE 0.276 863.000 0.600 0.092   NA
 5589539 5589540 BDU_14003 BDU_14004     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589540 5589541 BDU_14004 BDU_14005   pf49 FALSE 0.112 442.000 0.000 NA   NA
 5589541 5589542 BDU_14005 BDU_14006 pf49 pf32 TRUE 0.915 3.000 0.000 NA   NA
 5589543 5589544 BDU_14007 BDU_14008 vlp-b   FALSE 0.108 460.000 0.000 NA   NA
 5589544 5589545 BDU_14008 BDU_14009   vlp_1 FALSE 0.289 168.000 0.000 NA   NA
 5589545 5589546 BDU_14009 BDU_14010 vlp_1   FALSE 0.091 617.000 0.000 NA   NA
 5589546 5589547 BDU_14010 BDU_14011   vsp FALSE 0.247 198.000 0.000 NA   NA
 5589547 5589548 BDU_14011 BDU_14012 vsp   FALSE 0.098 548.000 0.000 NA   NA
 5589548 5589549 BDU_14012 BDU_14013   vlp_2 FALSE 0.172 258.000 0.000 NA   NA
 5589549 5589550 BDU_14013 BDU_14014 vlp_2 vlp-d_1 FALSE 0.294 716.000 0.600 0.092   NA
 5589550 5589551 BDU_14014 BDU_14015 vlp-d_1 vlp-d_2 TRUE 0.604 189.000 0.600 0.092   NA
 5589552 5589553 BDU_12001 BDU_12002   ppap1 TRUE 0.834 29.000 0.000 NA   NA
 5589553 5589554 BDU_12002 BDU_12003 ppap1 pf32 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589554 5589555 BDU_12003 BDU_12004 pf32 pf49 TRUE 0.639 56.000 0.000 NA   NA
 5589555 5589556 BDU_12004 BDU_12005 pf49 bppA FALSE 0.116 418.000 0.000 NA   NA
 5589556 5589557 BDU_12005 BDU_12006 bppA ssb FALSE 0.335 164.000 0.000 1.000   NA
 5589557 5589558 BDU_12006 BDU_12007 ssb bppB TRUE 0.726 46.000 0.000 NA   NA
 5589559 5589560 BDU_12008 BDU_12009 bppC   FALSE 0.109 455.000 0.000 NA   NA
 5589561 5589562 BDU_12010 BDU_12011   bsr TRUE 0.917 5.000 0.000 NA   NA
 5589562 5589563 BDU_12011 BDU_12012 bsr bdr TRUE 0.887 12.000 0.000 NA   NA
 5589563 5589564 BDU_12012 BDU_12013 bdr   FALSE 0.305 154.000 0.000 NA   NA
 5589564 5589565 BDU_12013 BDU_12014     TRUE 0.914 7.000 0.000 NA   NA
 5589565 5589566 BDU_12014 BDU_12015     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589566 5589567 BDU_12015 BDU_12016     TRUE 0.895 0.000 0.000 NA   NA
 5589567 5589568 BDU_12016 BDU_12017     TRUE 0.856 23.000 0.000 NA   NA
 5589568 5589569 BDU_12017 BDU_12018     TRUE 0.860 16.000 0.000 NA   NA
 5589569 5589570 BDU_12018 BDU_12019     TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589570 5589571 BDU_12019 BDU_12020     TRUE 0.684 -21.000 0.000 NA   NA
 5589571 5589572 BDU_12020 BDU_12021     TRUE 0.723 -16.000 0.000 NA   NA
 5589572 5589573 BDU_12021 BDU_12022     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589573 5589574 BDU_12022 BDU_12023     TRUE 0.771 -10.000 0.000 NA   NA
 5589574 5589575 BDU_12023 BDU_12024     TRUE 0.895 0.000 0.000 NA   NA
 5589575 5589576 BDU_12024 BDU_12025     TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 5589576 5589577 BDU_12025 BDU_12026     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589577 5589578 BDU_12026 BDU_12027     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589578 5589579 BDU_12027 BDU_12028     TRUE 0.887 12.000 0.000 NA   NA
 5589579 5589580 BDU_12028 BDU_12029     TRUE 0.917 5.000 0.000 NA   NA
 5589580 5589581 BDU_12029 BDU_12030     TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5589581 5589582 BDU_12030 BDU_12031     TRUE 0.567 62.000 0.000 NA   NA
 5589582 5589583 BDU_12031 BDU_12032     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589583 5589584 BDU_12032 BDU_12033     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589584 5589585 BDU_12033 BDU_12034     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589586 5589587 BDU_9001 BDU_9002 vlp-d   FALSE 0.186 247.000 0.000 NA   NA
 5589587 5589588 BDU_9002 BDU_9003     FALSE 0.132 343.000 0.000 NA   NA
 5589588 5589589 BDU_9003 BDU_9004     FALSE 0.307 153.000 0.000 NA   NA
 5589590 5589591 BDU_9005 BDU_9006     FALSE 0.188 245.000 0.000 NA   NA
 5589591 5589592 BDU_9006 BDU_9007     FALSE 0.147 313.000 0.000 NA   NA
 5589592 5589593 BDU_9007 BDU_9008   mlpJ FALSE 0.142 326.000 0.000 NA   NA
 5589594 5589595 BDU_9009 BDU_9010 bppB ssb TRUE 0.726 46.000 0.000 NA   NA
 5589595 5589596 BDU_9010 BDU_9011 ssb   FALSE 0.117 397.000 0.000 NA   NA
 5589596 5589597 BDU_9011 BDU_9012   pf49 FALSE 0.106 493.000 0.000 NA   NA
 5589597 5589598 BDU_9012 BDU_9013 pf49 pf32 TRUE 0.597 59.000 0.000 NA   NA
 5589598 5589599 BDU_9013 BDU_9014 pf32 ppap1 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589599 5589600 BDU_9014 BDU_9015 ppap1 ppap2 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589601 5589602 BDU_9016 BDU_9017     TRUE 0.602 -33.000 0.000 NA   NA
 5589604 5589605 BDU_9019 BDU_9020     TRUE 0.886 -1.000 0.000 NA   NA
 5589606 5589607 BDU_9021 BDU_9022     FALSE 0.076 1047.000 0.000 NA   NA
 5589608 5589609 BDU_9023 BDU_9024     FALSE 0.190 244.000 0.000 NA   NA
 5589609 5589610 BDU_9024 BDU_9025   bdr_1 TRUE 0.756 44.000 0.000 NA   NA
 5589610 5589611 BDU_9025 BDU_9026 bdr_1 vsp FALSE 0.092 614.000 0.000 NA   NA
 5589611 5589612 BDU_9026 BDU_9027 vsp vlp-c_1 FALSE 0.120 521.000 0.000 1.000   NA
 5589612 5589613 BDU_9027 BDU_9028 vlp-c_1   FALSE 0.363 122.000 0.000 NA   NA
 5589615 5589616 BDU_9030 BDU_9031     TRUE 0.887 12.000 0.000 NA   NA
 5589616 5589617 BDU_9031 BDU_9032   bdr_2 TRUE 0.756 44.000 0.000 NA   NA
 5589617 5589618 BDU_9032 BDU_9033 bdr_2 vlp-c_2 FALSE 0.103 500.000 0.000 NA   NA
 5589619 5589620 BDU_8001 BDU_8002     FALSE 0.080 897.000 0.000 NA   NA
 5589620 5589621 BDU_8002 BDU_8003     TRUE 0.735 -15.000 0.000 NA   NA
 5589621 5589622 BDU_8003 BDU_8004   vlp-a FALSE 0.173 256.000 0.000 NA   NA
 5589622 5589623 BDU_8004 BDU_8005 vlp-a vlp-d_1 TRUE 0.613 187.000 0.600 0.088   NA
 5589623 5589624 BDU_8005 BDU_8006 vlp-d_1 vlp-c TRUE 0.549 218.000 0.600 0.088   NA
 5589624 5589625 BDU_8006 BDU_8007 vlp-c   FALSE 0.250 196.000 0.000 NA   NA
 5589625 5589626 BDU_8007 BDU_8008   vlp-d_2 FALSE 0.272 184.000 0.000 NA   NA
 5589626 5589627 BDU_8008 BDU_8009 vlp-d_2   FALSE 0.145 318.000 0.000 NA   NA
 5589627 5589628 BDU_8009 BDU_8010     FALSE 0.165 274.000 0.000 NA   NA
 5589628 5589629 BDU_8010 BDU_8011   vsp FALSE 0.154 291.000 0.000 NA   NA
 5589629 5589630 BDU_8011 BDU_8012 vsp vlp-d_3 FALSE 0.274 201.000 0.000 1.000   NA
 5589630 5589631 BDU_8012 BDU_8013 vlp-d_3   FALSE 0.153 301.000 0.000 NA   NA
 5589631 5589632 BDU_8013 BDU_8014     FALSE 0.119 389.000 0.000 NA   NA
 5589636 5589637 BDU_8018 BDU_8019   pf49 FALSE 0.159 283.000 0.000 NA   NA
 5589637 5589638 BDU_8019 BDU_8020 pf49 pf32 TRUE 0.856 23.000 0.000 NA   NA
 5589638 5589639 BDU_8020 BDU_8021 pf32 ppap1 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589639 5589640 BDU_8021 BDU_8022 ppap1   TRUE 0.821 -16.000 0.750 NA   NA
 5589641 5589642 BDU_8023 BDU_8024   vlp-b FALSE 0.207 225.000 0.000 NA   NA
 5589642 5589643 BDU_8024 BDU_8025 vlp-b   FALSE 0.125 369.000 0.000 NA   NA
 5589643 5589644 BDU_8025 BDU_8026     FALSE 0.148 312.000 0.000 NA   NA
 5589644 5589645 BDU_8026 BDU_8027     FALSE 0.079 899.000 0.000 NA   NA
 5589645 5589646 BDU_8027 BDU_8028     FALSE 0.078 929.000 0.000 NA   NA
 5589646 5589647 BDU_8028 BDU_8029   bdrR FALSE 0.161 282.000 0.000 NA   NA
 5589650 5589651 BDU_11001 BDU_11002 bppA ssb FALSE 0.247 220.000 0.000 1.000   NA
 5589651 5589652 BDU_11002 BDU_11003 ssb bppB TRUE 0.822 33.000 0.000 NA   NA
 5589653 5589654 BDU_11004 BDU_11005 bppC   FALSE 0.111 448.000 0.000 NA   NA
 5589655 5589656 BDU_11006 BDU_11007   bsr FALSE 0.302 157.000 0.000 NA   NA
 5589656 5589657 BDU_11007 BDU_11008 bsr bdr TRUE 0.925 9.000 0.000 1.000   NA
 5589657 5589658 BDU_11008 BDU_11009 bdr   FALSE 0.293 165.000 0.000 NA   NA
 5589658 5589659 BDU_11009 BDU_11010     TRUE 0.914 7.000 0.000 NA   NA
 5589659 5589660 BDU_11010 BDU_11011     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589660 5589661 BDU_11011 BDU_11012     TRUE 0.895 0.000 0.000 NA   NA
 5589661 5589662 BDU_11012 BDU_11013     TRUE 0.860 16.000 0.000 NA   NA
 5589662 5589663 BDU_11013 BDU_11014     TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589663 5589664 BDU_11014 BDU_11015     TRUE 0.684 -21.000 0.000 NA   NA
 5589664 5589665 BDU_11015 BDU_11016     TRUE 0.723 -16.000 0.000 NA   NA
 5589665 5589666 BDU_11016 BDU_11017     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589666 5589667 BDU_11017 BDU_11018     TRUE 0.771 -10.000 0.000 NA   NA
 5589667 5589668 BDU_11018 BDU_11019     TRUE 0.895 0.000 0.000 NA   NA
 5589668 5589669 BDU_11019 BDU_11020     TRUE 0.816 34.000 0.000 NA   NA
 5589669 5589670 BDU_11020 BDU_11021     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589670 5589671 BDU_11021 BDU_11022     TRUE 0.818 -4.000 0.000 NA   NA
 5589671 5589672 BDU_11022 BDU_11023     FALSE 0.318 144.000 0.000 NA   NA
 5589672 5589673 BDU_11023 BDU_11024     TRUE 0.917 5.000 0.000 NA   NA
 5589673 5589674 BDU_11024 BDU_11025     TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5589674 5589675 BDU_11025 BDU_11026     TRUE 0.567 62.000 0.000 NA   NA
 5589675 5589676 BDU_11026 BDU_11027     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589676 5589677 BDU_11027 BDU_11028     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589677 5589678 BDU_11028 BDU_11029     TRUE 0.877 13.000 0.000 NA   NA
 5589678 5589679 BDU_11029 BDU_11030     FALSE 0.095 580.000 0.000 NA   NA
 5589679 5589680 BDU_11030 BDU_11031     TRUE 0.912 2.000 0.000 NA   NA
 5589681 5589682 BDU_11032 BDU_11033   pf49 FALSE 0.100 528.000 0.000 NA   NA
 5589682 5589683 BDU_11033 BDU_11034 pf49 pf32 TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5589683 5589684 BDU_11034 BDU_11035 pf32 ppap1 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589684 5589685 BDU_11035 BDU_11036 ppap1 ppap2 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589687 5589688 BDU_16002 BDU_16003     FALSE 0.073 1765.000 0.000 NA   NA
 5589688 5589689 BDU_16003 BDU_16004   thyl FALSE 0.207 225.000 0.000 NA   NA
 5589689 5589690 BDU_16004 BDU_16005 thyl   FALSE 0.195 240.000 0.000 NA   NA
 5589691 5589692 BDU_16006 BDU_16007     FALSE 0.098 550.000 0.000 NA   NA
 5589692 5589693 BDU_16007 BDU_16008     FALSE 0.341 129.000 0.000 NA   NA
 5589695 5589696 BDU_15002 BDU_15003     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 5589697 5589698 BDU_15004 BDU_15005     TRUE 0.540 67.000 0.000 NA   NA
 5589698 5589699 BDU_15005 BDU_15006     TRUE 0.826 32.000 0.000 NA   NA
 5589701 5589702 BDU_15008 BDU_15009 ppap2 ppap1 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5589702 5589703 BDU_15009 BDU_15010 ppap1 pf32 TRUE 0.660 -24.000 0.000 NA   NA
 5589703 5589704 BDU_15010 BDU_15011 pf32 pf49 TRUE 0.742 45.000 0.000 NA   NA
 5589704 5589705 BDU_15011 BDU_15012 pf49 vlp-c FALSE 0.073 1618.000 0.000 NA   NA
 5589705 5589706 BDU_15012 BDU_15013 vlp-c vsp FALSE 0.239 225.000 0.000 1.000   NA
 5589706 5589707 BDU_15013 BDU_15014 vsp   FALSE 0.077 971.000 0.000 NA   NA