MicrobesOnline Operon Predictions for Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3671443 3671444 COSY_0001 COSY_0002 dnaA dnaN TRUE 0.799 214.000 0.328 1.000 Y NA
 3671444 3671445 COSY_0002 COSY_0003 dnaN gyrB TRUE 0.782 101.000 0.114 1.000 Y NA
 3671445 3671446 COSY_0003 COSY_0004 gyrB prkB TRUE 0.689 21.000 0.003 1.000 N NA
 3671447 3671448 COSY_0005 COSY_0006 leuS pyrD TRUE 0.647 -3.000 0.002 0.096 N NA
 3671450 3671451 COSY_0008 COSY_0009 sspB sspA TRUE 0.995 -3.000 0.831 NA   NA
 3671451 3671452 COSY_0009 COSY_0010 sspA petC TRUE 0.964 39.000 0.370 NA N NA
 3671452 3671453 COSY_0010 COSY_0011 petC petB TRUE 0.999 5.000 0.630 0.004 Y NA
 3671453 3671454 COSY_0011 COSY_0012 petB petA TRUE 0.996 14.000 0.233 0.004 Y NA
 3671454 3671455 COSY_0012 COSY_0013 petA   FALSE 0.066 109.000 0.000 NA   NA
 3671456 3671457 COSY_0014 COSY_0015 secA pyrC FALSE 0.006 480.000 0.000 1.000 N NA
 3671458 3671459 COSY_0016 COSY_0017 ribF metA FALSE 0.007 319.000 0.000 1.000 N NA
 3671459 3671460 COSY_0017 COSY_0018 metA   TRUE 0.838 0.000 0.005 NA   NA
 3671460 3671461 COSY_0018 COSY_0019     TRUE 0.828 28.000 0.009 NA   NA
 3671461 3671462 COSY_0019 COSY_0020   fkpA TRUE 0.799 31.000 0.009 1.000   NA
 3671462 3671463 COSY_0020 COSY_0021 fkpA   TRUE 0.944 12.000 0.015 NA   NA
 3671463 3671464 COSY_0021 COSY_0022   purC TRUE 0.840 6.000 0.004 NA   NA
 3671466 3671467 COSY_0024 COSY_0025   dxr FALSE 0.325 -25.000 0.002 1.000 N NA
 3671467 3671468 COSY_0025 COSY_0026 dxr cdsA TRUE 0.922 -3.000 0.011 1.000 Y NA
 3671468 3671469 COSY_0026 COSY_0027 cdsA uppS TRUE 0.966 11.000 0.013 1.000 Y NA
 3671470 3671471 COSY_0028 COSY_0029 hisF   FALSE 0.274 69.000 0.002 NA   NA
 3671471 3671472 COSY_0029 COSY_0030   cyoE TRUE 0.943 13.000 0.014 NA   NA
 3671472 3671473 COSY_0030 COSY_0031 cyoE   TRUE 0.838 1.000 0.005 NA   NA
 3671474 3671475 COSY_0032 COSY_0033     FALSE 0.289 101.000 0.006 NA   NA
 3671476 3671477 COSY_0034 COSY_0035 coxB coxA TRUE 0.998 26.000 0.741 0.009 Y NA
 3671477 3671478 COSY_0035 COSY_0036 coxA   TRUE 0.779 91.000 0.268 1.000 N NA
 3671478 3671479 COSY_0036 COSY_0037   coxC TRUE 0.992 18.000 0.536 1.000 N NA
 3671479 3671480 COSY_0037 COSY_0038 coxC   TRUE 0.939 66.000 0.367 NA   NA
 3671480 3671481 COSY_0038 COSY_0039     TRUE 0.994 -3.000 0.789 NA   NA
 3671481 3671482 COSY_0039 COSY_0040   ccoN FALSE 0.383 117.000 0.015 NA   NA
 3671482 3671483 COSY_0040 COSY_0041 ccoN ccoO TRUE 0.995 15.000 0.400 0.009 N NA
 3671483 3671484 COSY_0041 COSY_0042 ccoO ccoQ TRUE 0.974 0.000 0.071 0.009   NA
 3671484 3671485 COSY_0042 COSY_0043 ccoQ ccoP TRUE 0.977 19.000 0.071 0.009   NA
 3671485 3671486 COSY_0043 COSY_t01 ccoP   FALSE 0.061 115.000 0.000 NA   NA
 3671487 3671488 COSY_0044 COSY_0045     TRUE 0.951 0.000 0.014 0.009   NA
 3671488 3671489 COSY_0045 COSY_0046   ftsK TRUE 0.965 -7.000 0.305 1.000   NA
 3671490 3671491 COSY_0047 COSY_t02 trxB   FALSE 0.248 50.000 0.000 NA   NA
 3671492 3671493 COSY_0049 COSY_0050 pyrB   TRUE 0.772 -19.000 0.022 1.000 N NA
 3671493 3671494 COSY_0050 COSY_0051     TRUE 0.690 -3.000 0.003 1.000   NA
 3671494 3671495 COSY_0051 COSY_0052     FALSE 0.053 130.000 0.000 NA   NA
 3671496 3671497 COSY_0053 COSY_0054 apbE   FALSE 0.005 691.000 0.000 1.000 N NA
 3671499 3671500 COSY_t03 COSY_0057     FALSE 0.072 103.000 0.000 NA   NA
 3671500 3671501 COSY_0057 COSY_0058   nusA TRUE 0.988 41.000 0.759 NA   NA
 3671501 3671502 COSY_0058 COSY_0059 nusA infB TRUE 0.935 54.000 0.342 1.000 N NA
 3671502 3671503 COSY_0059 COSY_0060 infB rbfA TRUE 0.997 15.000 0.530 1.000 Y NA
 3671503 3671504 COSY_0060 COSY_0061 rbfA truB TRUE 0.990 23.000 0.318 1.000 Y NA
 3671504 3671505 COSY_0061 COSY_0062 truB purD FALSE 0.008 240.000 0.000 1.000 N NA
 3671510 3671511 COSY_0067 COSY_0068     FALSE 0.023 866.000 0.000 NA   NA
 3671511 3671512 COSY_0068 COSY_0069     FALSE 0.023 1581.000 0.000 NA   NA
 3671513 3671514 COSY_0070 COSY_0071 tktA gapA TRUE 0.654 106.000 0.030 1.000 Y NA
 3671514 3671515 COSY_0071 COSY_0072 gapA pgk FALSE 0.493 448.000 0.015 0.009 Y NA
 3671515 3671516 COSY_0072 COSY_0073 pgk   TRUE 0.858 -7.000 0.002 0.009 Y NA
 3671516 3671517 COSY_0073 COSY_0074   fbaA TRUE 0.861 76.000 0.021 0.009 Y NA
 3671517 3671518 COSY_0074 COSY_0075 fbaA gidA FALSE 0.181 67.000 0.002 1.000 N NA
 3671518 3671519 COSY_0075 COSY_0076 gidA   FALSE 0.027 369.000 0.000 NA   NA
 3671519 3671520 COSY_0076 COSY_0077   tatD TRUE 0.805 7.000 0.003 NA   NA
 3671520 3671521 COSY_0077 COSY_0078 tatD rluC FALSE 0.565 -3.000 0.003 NA N NA
 3671521 3671522 COSY_0078 COSY_0079 rluC ubiA TRUE 0.688 -3.000 0.004 1.000 N NA
 3671524 3671525 COSY_0081 COSY_0082     TRUE 0.936 0.000 0.069 NA N NA
 3671527 3671528 COSY_0084 COSY_0085 polA argS FALSE 0.005 857.000 0.000 1.000 N NA
 3671528 3671529 COSY_0085 COSY_0086 argS   FALSE 0.417 -3.000 0.002 1.000 N NA
 3671531 3671532 COSY_0088 COSY_0089   sat FALSE 0.030 297.000 0.000 NA   NA
 3671532 3671533 COSY_0089 COSY_0090 sat aprM FALSE 0.198 215.000 0.009 NA   NA
 3671533 3671534 COSY_0090 COSY_0091 aprM aprB TRUE 0.942 32.000 0.160 NA   NA
 3671534 3671535 COSY_0091 COSY_0092 aprB aprA TRUE 0.999 0.000 0.925 0.003 Y NA
 3671535 3671536 COSY_0092 COSY_0093 aprA   TRUE 0.857 66.000 0.170 NA   NA
 3671536 3671537 COSY_0093 COSY_0094     TRUE 0.993 6.000 0.500 NA   NA
 3671537 3671538 COSY_0094 COSY_0095     TRUE 0.984 3.000 0.286 NA   NA
 3671539 3671540 COSY_0096 COSY_0097 hppA adk FALSE 0.006 497.000 0.000 1.000 N NA
 3671540 3671541 COSY_0097 COSY_0098 adk pfkA FALSE 0.415 110.000 0.034 1.000 N NA
 3671541 3671542 COSY_0098 COSY_0099 pfkA   FALSE 0.223 53.000 0.000 1.000   NA
 3671542 3671543 COSY_0099 COSY_0100   cysS FALSE 0.023 688.000 0.000 1.000   NA
 3671544 3671545 COSY_0101 COSY_0102 ahpC rubA FALSE 0.074 48.000 0.000 1.000 N NA
 3671545 3671546 COSY_0102 COSY_0103 rubA leuB TRUE 0.661 36.000 0.000 1.000 Y NA
 3671548 3671549 COSY_0105 COSY_0106 nudE lysA FALSE 0.023 725.000 0.000 1.000   NA
 3671549 3671550 COSY_0106 COSY_0107 lysA   FALSE 0.407 -7.000 0.002 NA N NA
 3671550 3671551 COSY_0107 COSY_0108   lpxB TRUE 0.765 7.000 0.003 NA N NA
 3671551 3671552 COSY_0108 COSY_0109 lpxB nadC FALSE 0.328 -49.000 0.002 1.000 N NA
 3671553 3671554 COSY_0110 COSY_t05 cysQ   FALSE 0.027 378.000 0.000 NA   NA
 3671554 3671555 COSY_t05 COSY_0112   rpoD TRUE 0.614 8.000 0.000 NA   NA
 3671555 3671556 COSY_0112 COSY_0113 rpoD prsA FALSE 0.189 100.000 0.004 1.000 N NA
 3671556 3671557 COSY_0113 COSY_t06 prsA   FALSE 0.142 70.000 0.000 NA   NA
 3671557 3671558 COSY_t06 COSY_0115   ispE FALSE 0.263 -20.000 0.000 NA   NA
 3671558 3671559 COSY_0115 COSY_0116 ispE orn TRUE 0.637 -7.000 0.005 1.000 N NA
 3671559 3671560 COSY_0116 COSY_0117 orn   TRUE 0.655 13.000 0.002 1.000 N NA
 3671560 3671561 COSY_0117 COSY_0118   pepP TRUE 0.880 5.000 0.002 1.000 Y NA
 3671563 3671564 COSY_0120 COSY_0121   proC FALSE 0.031 275.000 0.000 NA   NA
 3671565 3671566 COSY_0122 COSY_0123 gph bioA TRUE 0.709 28.000 0.003 1.000   NA
 3671569 3671570 COSY_0126 COSY_0127 mesJ accA TRUE 0.876 -19.000 0.123 1.000 N NA
 3671571 3671572 COSY_0128 COSY_0129     TRUE 0.642 38.000 0.000 NA Y NA
 3671572 3671573 COSY_0129 COSY_0130   pitA TRUE 0.998 12.000 0.937 NA   NA
 3671573 3671574 COSY_0130 COSY_0131 pitA   TRUE 0.877 4.000 0.007 NA   NA
 3671574 3671575 COSY_0131 COSY_0132   rhlE FALSE 0.011 141.000 0.000 NA N NA
 3671575 3671576 COSY_0132 COSY_0133 rhlE   TRUE 0.628 11.000 0.000 NA   NA
 3671577 3671578 COSY_0134 COSY_0135 tyrS proA TRUE 0.621 6.000 0.002 1.000 N NA
 3671578 3671579 COSY_0135 COSY_0136 proA holA TRUE 0.833 -12.000 0.047 1.000 N NA
 3671579 3671580 COSY_0136 COSY_0137 holA   TRUE 0.920 -10.000 0.199 NA N NA
 3671581 3671582 COSY_0138 COSY_0139 ftsH folP TRUE 0.959 36.000 0.325 1.000 N NA
 3671582 3671583 COSY_0139 COSY_0140 folP glmM TRUE 0.975 2.000 0.260 1.000 N NA
 3671583 3671584 COSY_0140 COSY_0141 glmM   FALSE 0.023 1076.000 0.000 1.000   NA
 3671584 3671585 COSY_0141 COSY_0142   rnfA FALSE 0.037 199.000 0.000 1.000   NA
 3671585 3671586 COSY_0142 COSY_0143 rnfA rnfB TRUE 0.998 7.000 0.564 0.077 Y NA
 3671586 3671587 COSY_0143 COSY_0144 rnfB rnfC TRUE 0.978 3.000 0.018 0.045 Y NA
 3671587 3671588 COSY_0144 COSY_0145 rnfC rnfD TRUE 0.968 -3.000 0.031 0.077 Y NA
 3671588 3671589 COSY_0145 COSY_0146 rnfD rnfG TRUE 0.999 3.000 0.924 0.077 Y NA
 3671589 3671590 COSY_0146 COSY_0147 rnfG queA FALSE 0.098 -9.000 0.000 1.000 N NA
 3671591 3671592 COSY_0148 COSY_0149   sucD TRUE 0.860 -3.000 0.012 NA   NA
 3671592 3671593 COSY_0149 COSY_0150 sucD sucC TRUE 0.999 -3.000 0.806 0.002 Y NA
 3671594 3671595 COSY_0151 COSY_0152 efp genX TRUE 0.944 51.000 0.082 0.091 Y NA
 3671595 3671596 COSY_0152 COSY_0153 genX   FALSE 0.474 25.000 0.000 1.000   NA
 3671596 3671597 COSY_0153 COSY_0154   argG FALSE 0.023 794.000 0.000 1.000   NA
 3671598 3671599 COSY_t07 COSY_t08     FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 3671599 3671600 COSY_t08 COSY_0157   pgsA FALSE 0.188 61.000 0.000 NA   NA
 3671600 3671601 COSY_0157 COSY_t09 pgsA   FALSE 0.336 36.000 0.000 NA   NA
 3671601 3671602 COSY_t09 COSY_0159   murF FALSE 0.218 54.000 0.000 NA   NA
 3671602 3671603 COSY_0159 COSY_0160 murF murE TRUE 0.921 506.000 0.569 0.006 Y NA
 3671606 3671607 COSY_0164 COSY_0165 rpsL rpsG TRUE 0.996 33.000 0.620 0.010 Y NA
 3671607 3671608 COSY_0165 COSY_0166 rpsG fusA TRUE 0.915 25.000 0.007 1.000 Y NA
 3671608 3671609 COSY_0166 COSY_0167 fusA tufA TRUE 0.978 11.000 0.007 0.004 Y NA
 3671609 3671610 COSY_0167 COSY_0168 tufA rpsJ TRUE 0.917 88.000 0.318 1.000 Y NA
 3671610 3671611 COSY_0168 COSY_0169 rpsJ rplC TRUE 0.990 29.000 0.307 0.065 Y NA
 3671611 3671612 COSY_0169 COSY_0170 rplC rplD TRUE 0.998 14.000 0.486 0.048 Y NA
 3671612 3671613 COSY_0170 COSY_0171 rplD rplW TRUE 0.994 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3671613 3671614 COSY_0171 COSY_0172 rplW rplB TRUE 0.999 11.000 0.849 1.000 Y NA
 3671614 3671615 COSY_0172 COSY_0173 rplB rpsS TRUE 0.999 5.000 0.820 0.065 Y NA
 3671615 3671616 COSY_0173 COSY_0174 rpsS rplV TRUE 0.998 21.000 0.769 0.065 Y NA
 3671616 3671617 COSY_0174 COSY_0175 rplV rpsC TRUE 0.999 8.000 0.719 0.065 Y NA
 3671617 3671618 COSY_0175 COSY_0176 rpsC rplP TRUE 0.999 17.000 0.828 0.065 Y NA
 3671618 3671619 COSY_0176 COSY_0177 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.048 Y NA
 3671619 3671620 COSY_0177 COSY_0178 rpmC rpsQ TRUE 0.998 -3.000 0.828 0.048 Y NA
 3671620 3671621 COSY_0178 COSY_0179 rpsQ rplN TRUE 0.998 29.000 0.791 0.065 Y NA
 3671621 3671622 COSY_0179 COSY_0180 rplN rplX TRUE 0.999 0.000 0.810 0.065 Y NA
 3671622 3671623 COSY_0180 COSY_0181 rplX rplE TRUE 0.997 30.000 0.758 0.048 Y NA
 3671623 3671624 COSY_0181 COSY_0182 rplE rpsN TRUE 0.995 6.000 0.309 0.048 Y NA
 3671624 3671625 COSY_0182 COSY_0183 rpsN rpsH TRUE 0.996 12.000 0.295 0.048 Y NA
 3671625 3671626 COSY_0183 COSY_0184 rpsH rplF TRUE 0.999 16.000 0.808 0.048 Y NA
 3671626 3671627 COSY_0184 COSY_0185 rplF rplR TRUE 0.999 18.000 0.815 0.048 Y NA
 3671627 3671628 COSY_0185 COSY_0186 rplR rpsE TRUE 0.996 43.000 0.814 0.065 Y NA
 3671628 3671629 COSY_0186 COSY_0187 rpsE rpmD TRUE 0.998 0.000 0.789 0.065 Y NA
 3671629 3671630 COSY_0187 COSY_0188 rpmD rplO TRUE 0.999 14.000 0.653 0.009 Y NA
 3671630 3671631 COSY_0188 COSY_0189 rplO secY TRUE 0.994 1.000 0.730 1.000 N NA
 3671631 3671632 COSY_0189 COSY_0190 secY rpmJ TRUE 0.972 15.000 0.089 1.000   NA
 3671632 3671633 COSY_0190 COSY_0191 rpmJ rpsM TRUE 0.692 160.000 0.194 0.048   NA
 3671633 3671634 COSY_0191 COSY_0192 rpsM rpsK TRUE 0.999 19.000 0.810 0.048 Y NA
 3671634 3671635 COSY_0192 COSY_0193 rpsK rpsD TRUE 0.998 10.000 0.509 0.065 Y NA
 3671635 3671636 COSY_0193 COSY_0194 rpsD rpoA TRUE 0.994 11.000 0.549 1.000 N NA
 3671636 3671637 COSY_0194 COSY_0195 rpoA rplQ TRUE 0.998 11.000 0.873 1.000 N NA
 3671637 3671638 COSY_0195 COSY_0196 rplQ rpsU TRUE 0.929 12.000 0.000 0.048 Y NA
 3671638 3671639 COSY_0196 COSY_0197 rpsU cca FALSE 0.024 552.000 0.000 1.000   NA
 3671640 3671641 COSY_0198 COSY_0199   engB FALSE 0.280 -16.000 0.000 1.000   NA
 3671642 3671643 COSY_0200 COSY_0201     FALSE 0.368 109.000 0.000 0.018 Y NA
 3671643 3671644 COSY_0201 COSY_0202   tig FALSE 0.013 128.000 0.000 1.000 N NA
 3671644 3671645 COSY_0202 COSY_0203 tig clpP TRUE 0.994 5.000 0.351 1.000 Y NA
 3671645 3671646 COSY_0203 COSY_0204 clpP clpX TRUE 0.977 -25.000 0.352 1.000 Y NA
 3671646 3671647 COSY_0204 COSY_0205 clpX lon TRUE 0.622 438.000 0.201 1.000 Y NA
 3671650 3671651 COSY_0208 COSY_0209     TRUE 0.600 105.000 0.077 NA   NA
 3671651 3671652 COSY_0209 COSY_0210     TRUE 0.996 0.000 0.774 1.000   NA
 3671652 3671653 COSY_0210 COSY_0211     TRUE 0.997 9.000 0.769 NA   NA
 3671653 3671654 COSY_0211 COSY_0212     TRUE 0.993 -3.000 0.744 NA   NA
 3671655 3671656 COSY_0213 COSY_0214 pabC tmk FALSE 0.034 355.000 0.002 1.000 N NA
 3671656 3671657 COSY_0214 COSY_0215 tmk holB TRUE 0.955 -3.000 0.211 1.000 N NA
 3671657 3671658 COSY_0215 COSY_0216 holB hemL TRUE 0.869 15.000 0.008 1.000 N NA
 3671658 3671659 COSY_0216 COSY_0217 hemL   FALSE 0.006 355.000 0.000 1.000 N NA
 3671660 3671661 COSY_0218 COSY_0219     TRUE 0.880 29.000 0.017 NA   NA
 3671661 3671662 COSY_0219 COSY_0220   rpiA FALSE 0.005 847.000 0.000 1.000 N NA
 3671663 3671664 COSY_0221 COSY_0222   hemN TRUE 0.968 0.000 0.218 1.000 N NA
 3671664 3671665 COSY_0222 COSY_0223 hemN argB FALSE 0.035 898.000 0.000 0.091 N NA
 3671665 3671666 COSY_0223 COSY_0224 argB pyrK FALSE 0.397 -13.000 0.003 1.000 N NA
 3671666 3671667 COSY_0224 COSY_0225 pyrK   TRUE 0.794 -3.000 0.006 NA   NA
 3671667 3671668 COSY_0225 COSY_0226     FALSE 0.039 180.000 0.000 NA   NA
 3671668 3671669 COSY_0226 COSY_0227     FALSE 0.028 356.000 0.000 NA   NA
 3671669 3671670 COSY_0227 COSY_0228   tldD TRUE 0.925 -3.000 0.050 NA   NA
 3671670 3671671 COSY_0228 COSY_0229 tldD nuoA FALSE 0.285 97.000 0.005 NA   NA
 3671671 3671672 COSY_0229 COSY_0230 nuoA nuoB TRUE 0.998 4.000 0.507 0.009 Y NA
 3671672 3671673 COSY_0230 COSY_0231 nuoB nuoC TRUE 0.995 0.000 0.328 0.009 Y NA
 3671673 3671674 COSY_0231 COSY_0232 nuoC nuoD TRUE 0.997 2.000 0.483 0.017 Y NA
 3671674 3671675 COSY_0232 COSY_0233 nuoD nuoE TRUE 0.994 -3.000 0.355 0.017 Y NA
 3671675 3671676 COSY_0233 COSY_0234 nuoE nuoF TRUE 0.994 -3.000 0.343 0.017 Y NA
 3671676 3671677 COSY_0234 COSY_0235 nuoF nuoG TRUE 0.997 5.000 0.395 0.017 Y NA
 3671677 3671678 COSY_0235 COSY_0236 nuoG nuoH TRUE 0.997 0.000 0.515 0.017 Y NA
 3671678 3671679 COSY_0236 COSY_0237 nuoH nuoI TRUE 0.998 14.000 0.500 0.017 Y NA
 3671679 3671680 COSY_0237 COSY_0238 nuoI nuoJ TRUE 0.998 10.000 0.442 0.017 Y NA
 3671680 3671681 COSY_0238 COSY_0239 nuoJ nuoK TRUE 0.997 1.000 0.484 0.009 Y NA
 3671681 3671682 COSY_0239 COSY_0240 nuoK nuoL TRUE 0.997 3.000 0.451 0.017 Y NA
 3671682 3671683 COSY_0240 COSY_0241 nuoL nuoM TRUE 0.993 3.000 0.175 0.005 Y NA
 3671683 3671684 COSY_0241 COSY_0242 nuoM nuoN TRUE 0.997 11.000 0.340 0.005 Y NA
 3671685 3671686 COSY_0243 COSY_0244 bioC   FALSE 0.523 -12.000 0.004 1.000 N NA
 3671686 3671687 COSY_0244 COSY_0245     FALSE 0.023 898.000 0.000 NA   NA
 3671687 3671688 COSY_0245 COSY_0246   frr FALSE 0.053 130.000 0.000 NA   NA
 3671688 3671689 COSY_0246 COSY_0247 frr pyrH TRUE 0.705 4.000 0.003 1.000 N NA
 3671691 3671692 COSY_0249 COSY_0250 purN purM TRUE 0.995 16.000 0.230 0.006 Y NA
 3671693 3671694 COSY_0251 COSY_0252     TRUE 0.922 -3.000 0.045 1.000   NA
 3671698 3671699 COSY_t10 COSY_0257   serB FALSE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 3671699 3671700 COSY_0257 COSY_0258 serB ccmF TRUE 0.767 7.000 0.003 1.000 N NA
 3671700 3671701 COSY_0258 COSY_0259 ccmF   TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3671701 3671702 COSY_0259 COSY_0260   dapE FALSE 0.223 5.000 0.000 1.000 N NA
 3671702 3671703 COSY_0260 COSY_0261 dapE trmD FALSE 0.539 4.000 0.002 1.000 N NA
 3671703 3671704 COSY_0261 COSY_0262 trmD glnK FALSE 0.040 160.000 0.002 1.000 N NA
 3671704 3671705 COSY_0262 COSY_0263 glnK amtB TRUE 0.748 -10.000 0.014 1.000 N NA
 3671705 3671706 COSY_0263 COSY_0264 amtB dapA FALSE 0.011 144.000 0.000 1.000 N NA
 3671706 3671707 COSY_0264 COSY_0265 dapA   TRUE 0.972 3.000 0.041 NA Y NA
 3671707 3671708 COSY_0265 COSY_0266   lig TRUE 0.651 15.000 0.002 NA N NA
 3671708 3671709 COSY_0266 COSY_0267 lig   FALSE 0.007 279.000 0.000 1.000 N NA
 3671709 3671710 COSY_0267 COSY_0268     FALSE 0.026 420.000 0.000 NA   NA
 3671710 3671711 COSY_0268 COSY_0269     FALSE 0.087 92.000 0.000 NA   NA
 3671711 3671712 COSY_0269 COSY_0270   nasT TRUE 0.885 -3.000 0.015 1.000   NA
 3671713 3671714 COSY_0271 COSY_0272 tatC   TRUE 0.990 0.000 0.314 NA Y NA
 3671714 3671715 COSY_0272 COSY_0273     TRUE 0.971 4.000 0.010 0.011 Y NA
 3671715 3671716 COSY_0273 COSY_0274   hisE TRUE 0.794 18.000 0.005 1.000 N NA
 3671716 3671717 COSY_0274 COSY_0275 hisE   TRUE 0.979 -7.000 0.152 0.011 Y NA
 3671717 3671718 COSY_0275 COSY_0276   gor FALSE 0.013 124.000 0.000 1.000 N NA
 3671718 3671719 COSY_0276 COSY_0277 gor   FALSE 0.023 879.000 0.000 NA   NA
 3671719 3671720 COSY_0277 COSY_0278   prfB FALSE 0.040 175.000 0.000 NA   NA
 3671720 3671721 COSY_0278 COSY_0279 prfB rpsO FALSE 0.450 72.000 0.002 1.000 Y NA
 3671721 3671722 COSY_0279 COSY_0280 rpsO htrB FALSE 0.191 55.000 0.002 1.000 N NA
 3671724 3671725 COSY_0282 COSY_0283 mraW   TRUE 0.986 -10.000 0.635 NA   NA
 3671726 3671727 COSY_0284 COSY_0285 parC ptpS FALSE 0.156 102.000 0.003 1.000 N NA
 3671727 3671728 COSY_0285 COSY_0286 ptpS   TRUE 0.905 -3.000 0.023 1.000   NA
 3671728 3671729 COSY_0286 COSY_0287   aroG TRUE 0.755 -6.000 0.007 1.000   NA
 3671729 3671730 COSY_0287 COSY_0288 aroG gyrA FALSE 0.057 112.000 0.002 1.000 N NA
 3671731 3671732 COSY_0289 COSY_0290 prfC   TRUE 0.615 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3671732 3671733 COSY_0290 COSY_0291   mraY FALSE 0.490 3.000 0.002 1.000 N NA
 3671736 3671737 COSY_0294 COSY_0295 glcD   TRUE 0.947 0.000 0.013 0.013   NA
 3671737 3671738 COSY_0295 COSY_0296   glcF TRUE 0.929 0.000 0.009 0.022   NA
 3671738 3671739 COSY_0296 COSY_0298 glcF rumA FALSE 0.159 26.000 0.000 1.000 N NA
 3671739 3671740 COSY_0298 COSY_0299 rumA   FALSE 0.024 582.000 0.000 NA   NA
 3671740 3671741 COSY_0299 COSY_0300     FALSE 0.058 117.000 0.000 NA   NA
 3671743 3671744 COSY_0302 COSY_0303   kamA TRUE 0.905 5.000 0.011 NA   NA
 3671747 3671748 COSY_0306 COSY_0307 gst nadD FALSE 0.009 185.000 0.000 1.000 N NA
 3671748 3671749 COSY_0307 COSY_0308 nadD   TRUE 0.837 4.000 0.004 1.000   NA
 3671750 3671751 COSY_t11 COSY_t12     FALSE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 3671754 3671755 COSY_0313 COSY_0314   mutM FALSE 0.570 -12.000 0.003 NA   NA
 3671756 3671757 COSY_0315 COSY_0316     FALSE 0.030 312.000 0.000 NA   NA
 3671757 3671758 COSY_0316 COSY_0317     FALSE 0.039 179.000 0.000 NA   NA
 3671758 3671759 COSY_0317 COSY_0318   nhaD FALSE 0.250 -34.000 0.000 1.000   NA
 3671759 3671760 COSY_0318 COSY_0319 nhaD   FALSE 0.377 -28.000 0.003 1.000 N NA
 3671760 3671761 COSY_0319 COSY_0320   trpS TRUE 0.633 32.000 0.003 1.000   NA
 3671761 3671762 COSY_0320 COSY_0321 trpS   TRUE 0.884 3.000 0.009 1.000   NA
 3671762 3671763 COSY_0321 COSY_0322   ileS FALSE 0.156 150.000 0.000 1.000 Y NA
 3671763 3671764 COSY_0322 COSY_0323 ileS aroB TRUE 0.795 1.000 0.006 1.000 N NA
 3671764 3671765 COSY_0323 COSY_0324 aroB   TRUE 0.771 7.000 0.002 NA   NA
 3671765 3671766 COSY_0324 COSY_0325   gatC TRUE 0.740 3.000 0.002 NA   NA
 3671766 3671767 COSY_0325 COSY_0326 gatC gatA TRUE 0.998 2.000 0.643 0.004 Y NA
 3671767 3671768 COSY_0326 COSY_0327 gatA gatB TRUE 0.998 2.000 0.492 0.004 Y NA
 3671770 3671771 COSY_0329 COSY_0330 proS psd TRUE 0.673 7.000 0.002 1.000 N NA
 3671772 3671773 COSY_0331 COSY_0332   eno FALSE 0.517 37.000 0.003 NA N NA
 3671775 3671776 COSY_0334 COSY_0335   bipA FALSE 0.115 88.000 0.002 NA N NA
 3671777 3671778 COSY_0336 COSY_0337 ftsJ ispB FALSE 0.417 51.000 0.004 NA N NA
 3671778 3671779 COSY_0337 COSY_0338 ispB dinG TRUE 0.750 5.000 0.004 1.000 N NA
 3671780 3671781 COSY_0339 COSY_0340 trkH trkA TRUE 0.988 13.000 0.018 0.006 Y NA
 3671781 3671782 COSY_0340 COSY_0341 trkA   TRUE 0.941 7.000 0.038 1.000 N NA
 3671782 3671783 COSY_0341 COSY_0342     TRUE 0.980 13.000 0.038 1.000 Y NA
 3671784 3671785 COSY_0343 COSY_0344 ppa   FALSE 0.340 -70.000 0.003 1.000 N NA
 3671785 3671786 COSY_0344 COSY_0345   coaD TRUE 0.991 13.000 0.367 1.000 N NA
 3671786 3671787 COSY_0345 COSY_0346 coaD dnaK FALSE 0.099 77.000 0.002 1.000 N NA
 3671787 3671788 COSY_0346 COSY_0347 dnaK dnaJ TRUE 0.956 72.000 0.236 0.006 Y NA
 3671789 3671790 COSY_0348 COSY_0349 ruvA leuD FALSE 0.098 -9.000 0.000 1.000 N NA
 3671790 3671791 COSY_0349 COSY_0350 leuD leuC TRUE 0.998 1.000 0.463 0.002 Y NA
 3671792 3671793 COSY_0351 COSY_0352 asnB rnhA FALSE 0.487 -10.000 0.003 1.000 N NA
 3671795 3671796 COSY_0354 COSY_0355 smpB ndk FALSE 0.006 520.000 0.000 1.000 N NA
 3671796 3671797 COSY_0355 COSY_0356 ndk   TRUE 0.901 50.000 0.156 1.000   NA
 3671797 3671798 COSY_0356 COSY_0357     FALSE 0.461 -16.000 0.002 NA   NA
 3671798 3671799 COSY_0357 COSY_0358   ispG TRUE 0.647 -3.000 0.002 NA   NA
 3671800 3671801 COSY_0359 COSY_0360   dxs TRUE 0.745 -3.000 0.004 NA   NA
 3671801 3671802 COSY_0360 COSY_0361 dxs   FALSE 0.354 63.000 0.004 1.000 N NA
 3671803 3671804 COSY_0362 COSY_0363     FALSE 0.036 70.000 0.000 1.000 N NA
 3671805 3671806 COSY_0364 COSY_0365 purL   FALSE 0.050 137.000 0.000 NA   NA
 3671806 3671807 COSY_0365 COSY_0366   nadA TRUE 0.612 29.000 0.002 NA   NA
 3671807 3671808 COSY_0366 COSY_0367 nadA aspS TRUE 0.830 7.000 0.006 1.000 N NA
 3671808 3671809 COSY_0367 COSY_0368 aspS   TRUE 0.926 -3.000 0.057 NA   NA
 3671809 3671810 COSY_0368 COSY_0369   map TRUE 0.594 57.000 0.008 NA   NA
 3671810 3671811 COSY_0369 COSY_0370 map   TRUE 0.886 -9.000 0.020 0.030 N NA
 3671811 3671812 COSY_0370 COSY_0371     TRUE 0.729 141.000 0.307 NA   NA
 3671812 3671813 COSY_0371 COSY_t13     FALSE 0.023 768.000 0.000 NA   NA
 3671813 3671814 COSY_t13 COSY_t14     FALSE 0.504 23.000 0.000 NA   NA
 3671814 3671815 COSY_t14 COSY_t15     FALSE 0.234 51.000 0.000 NA   NA
 3671815 3671816 COSY_t15 COSY_0375   dnaQ FALSE 0.024 628.000 0.000 NA   NA
 3671818 3671819 COSY_0377 COSY_0378   hemB TRUE 0.654 42.000 0.005 NA   NA
 3671822 3671823 COSY_0381 COSY_0382 obg proB TRUE 0.963 -3.000 0.206 1.000   NA
 3671823 3671824 COSY_0382 COSY_0383 proB folK FALSE 0.479 -6.000 0.003 1.000 N NA
 3671824 3671825 COSY_0383 COSY_0384 folK panB TRUE 0.971 -3.000 0.117 1.000 Y NA
 3671825 3671826 COSY_0384 COSY_0385 panB panC TRUE 0.997 0.000 0.395 0.002 Y NA
 3671826 3671827 COSY_0385 COSY_0386 panC   FALSE 0.551 -7.000 0.002 1.000   NA
 3671827 3671828 COSY_0386 COSY_0387     FALSE 0.276 45.000 0.000 NA   NA
 3671828 3671829 COSY_0387 COSY_0388   thiL FALSE 0.515 0.000 0.000 NA   NA
 3671831 3671832 COSY_0390 COSY_0391     TRUE 0.796 -16.000 0.006 0.027   NA
 3671832 3671833 COSY_0391 COSY_0392   icd FALSE 0.005 1234.000 0.000 1.000 N NA
 3671833 3671834 COSY_0392 COSY_0393 icd   FALSE 0.024 687.000 0.000 NA   NA
 3671834 3671835 COSY_0393 COSY_t16     FALSE 0.032 254.000 0.000 NA   NA
 3671835 3671836 COSY_t16 COSY_0395     FALSE 0.023 1067.000 0.000 NA   NA
 3671839 3671840 COSY_0398 COSY_0399   aroC FALSE 0.008 247.000 0.000 NA N NA
 3671840 3671841 COSY_0399 COSY_t17 aroC   FALSE 0.025 492.000 0.000 NA   NA
 3671842 3671843 COSY_0401 COSY_t18 pyrF   FALSE 0.533 20.000 0.000 NA   NA
 3671843 3671844 COSY_t18 COSY_0403     FALSE 0.029 326.000 0.000 NA   NA
 3671844 3671845 COSY_0403 COSY_0404   pdxH TRUE 0.909 0.000 0.004 1.000 Y NA
 3671846 3671847 COSY_0405 COSY_0406 aroE   TRUE 0.846 23.000 0.004 0.086 N NA
 3671847 3671848 COSY_0406 COSY_0407     FALSE 0.007 340.000 0.000 1.000 N NA
 3671849 3671850 COSY_0408 COSY_0409   bacA TRUE 0.877 18.000 0.007 NA   NA
 3671850 3671851 COSY_0409 COSY_0410 bacA lpxC FALSE 0.005 1631.000 0.000 1.000 N NA
 3671851 3671852 COSY_0410 COSY_0411 lpxC ilvI FALSE 0.327 65.000 0.003 1.000 N NA
 3671852 3671853 COSY_0411 COSY_0412 ilvI ilvH TRUE 0.996 -3.000 0.371 0.002 Y NA
 3671853 3671854 COSY_0412 COSY_0413 ilvH ilvC TRUE 0.987 24.000 0.092 0.005 Y NA
 3671854 3671855 COSY_0413 COSY_0414 ilvC pssA TRUE 0.775 51.000 0.041 1.000 N NA
 3671855 3671856 COSY_0414 COSY_0415 pssA leuA FALSE 0.375 177.000 0.073 1.000 N NA
 3671856 3671857 COSY_0415 COSY_0416 leuA   TRUE 0.899 -3.000 0.020 NA   NA
 3671857 3671858 COSY_0416 COSY_0417     FALSE 0.295 -12.000 0.000 NA   NA
 3671859 3671860 COSY_0418 COSY_0419 argF argD TRUE 0.984 14.000 0.074 1.000 Y NA
 3671860 3671861 COSY_0419 COSY_0420 argD   FALSE 0.157 68.000 0.000 NA   NA
 3671862 3671863 COSY_0421 COSY_0422   mgtE TRUE 0.677 47.000 0.012 NA N NA
 3671865 3671866 COSY_0424 COSY_0425 rseC aceE TRUE 0.620 61.000 0.015 NA N NA
 3671867 3671868 COSY_0426 COSY_0427 pnp guaB FALSE 0.005 715.000 0.000 1.000 N NA
 3671868 3671869 COSY_0427 COSY_0428 guaB   FALSE 0.546 0.000 0.002 NA N NA
 3671869 3671870 COSY_0428 COSY_0429   valS TRUE 0.619 -3.000 0.003 NA N NA
 3671870 3671871 COSY_0429 COSY_0430 valS   FALSE 0.026 443.000 0.000 NA   NA
 3671871 3671872 COSY_0430 COSY_0431   dnaX TRUE 0.978 -7.000 0.411 NA   NA
 3671872 3671873 COSY_0431 COSY_0432 dnaX   FALSE 0.005 1266.000 0.000 1.000 N NA
 3671873 3671874 COSY_0432 COSY_0433     TRUE 0.956 0.000 0.143 1.000 N NA
 3671874 3671875 COSY_0433 COSY_0434   rodA FALSE 0.052 534.000 0.003 1.000 N NA
 3671875 3671876 COSY_0434 COSY_0435 rodA   TRUE 0.726 -3.000 0.003 NA   NA
 3671877 3671878 COSY_0436 COSY_0437   gltX TRUE 0.875 13.000 0.004 1.000   NA
 3671878 3671879 COSY_0437 COSY_0438 gltX glnD TRUE 0.793 16.000 0.004 1.000 N NA
 3671879 3671880 COSY_0438 COSY_0439 glnD trxA FALSE 0.310 87.000 0.004 1.000   NA
 3671880 3671881 COSY_0439 COSY_0440 trxA rho FALSE 0.565 116.000 0.087 1.000   NA
 3671881 3671882 COSY_0440 COSY_0441 rho   FALSE 0.050 137.000 0.000 1.000   NA
 3671882 3671883 COSY_0441 COSY_0442   folE FALSE 0.155 142.000 0.004 1.000   NA
 3671883 3671884 COSY_0442 COSY_0443 folE pcnB TRUE 0.885 9.000 0.005 1.000   NA
 3671884 3671885 COSY_0443 COSY_0444 pcnB xseB FALSE 0.006 370.000 0.000 1.000 N NA
 3671885 3671886 COSY_0444 COSY_0445 xseB ispA TRUE 0.779 50.000 0.035 1.000 N NA
 3671887 3671888 COSY_0446 COSY_0447 fabH plsX TRUE 0.992 -7.000 0.380 0.013 Y NA
 3671888 3671889 COSY_0447 COSY_0448 plsX rpmF TRUE 0.989 6.000 0.418 1.000 N NA
 3671889 3671890 COSY_0448 COSY_0449 rpmF   TRUE 0.992 24.000 0.599 NA   NA
 3671890 3671891 COSY_0449 COSY_0450   plsC FALSE 0.036 213.000 0.000 NA   NA
 3671896 3671897 COSY_0455 COSY_0456   hemF TRUE 0.907 -3.000 0.058 NA N NA
 3671897 3671898 COSY_0456 COSY_0457 hemF   FALSE 0.549 -10.000 0.004 1.000 N NA
 3671898 3671899 COSY_0457 COSY_0458   glnA FALSE 0.298 133.000 0.009 0.085 N NA
 3671899 3671900 COSY_0458 COSY_0459 glnA bioB FALSE 0.128 98.000 0.003 1.000 N NA
 3671902 3671903 COSY_0461 COSY_0462     FALSE 0.052 133.000 0.000 1.000   NA
 3671903 3671904 COSY_0462 COSY_0463   ribAB TRUE 0.927 -16.000 0.065 1.000 Y NA
 3671904 3671905 COSY_0463 COSY_0464 ribAB ribH TRUE 0.991 11.000 0.049 0.005 Y NA
 3671905 3671906 COSY_0464 COSY_0465 ribH nusB TRUE 0.985 3.000 0.347 1.000 N NA
 3671909 3671910 COSY_0468 COSY_0469 ssb   TRUE 0.868 15.000 0.007 1.000 N NA
 3671910 3671911 COSY_0469 COSY_0470   comL TRUE 0.819 19.000 0.004 1.000   NA
 3671912 3671913 COSY_0471 COSY_0472 spoT   FALSE 0.425 75.000 0.006 1.000   NA
 3671913 3671914 COSY_0472 COSY_0473   tolB TRUE 0.780 -3.000 0.005 1.000   NA
 3671914 3671915 COSY_0473 COSY_0474 tolB pal TRUE 0.995 12.000 0.592 1.000 N NA
 3671915 3671916 COSY_0474 COSY_0475 pal   TRUE 0.881 7.000 0.006 1.000   NA
 3671916 3671917 COSY_0475 COSY_0476     TRUE 0.965 13.000 0.047 1.000   NA
 3671919 3671920 COSY_0478 COSY_0479 hemH nrdA FALSE 0.016 108.000 0.000 1.000 N NA
 3671920 3671921 COSY_0479 COSY_0480 nrdA nrdB TRUE 0.995 16.000 0.222 0.002 Y NA
 3671921 3671922 COSY_0480 COSY_0481 nrdB   TRUE 0.954 9.000 0.057 1.000 N NA
 3671923 3671924 COSY_0482 COSY_0483   rnt FALSE 0.031 273.000 0.000 NA   NA
 3671924 3671925 COSY_0483 COSY_0484 rnt   TRUE 0.689 -10.000 0.009 1.000 N NA
 3671927 3671928 COSY_0486 COSY_0487 vacB purA TRUE 0.867 4.000 0.010 1.000 N NA
 3671928 3671929 COSY_0487 COSY_0488 purA hisZ TRUE 0.945 27.000 0.161 1.000 N NA
 3671929 3671930 COSY_0488 COSY_0489 hisZ hflC TRUE 0.954 13.000 0.045 1.000 N NA
 3671930 3671931 COSY_0489 COSY_0490 hflC hflK TRUE 0.999 0.000 0.947 0.018 Y NA
 3671932 3671933 COSY_0491 COSY_0492     TRUE 0.921 -10.000 0.200 1.000 N NA
 3671933 3671934 COSY_0492 COSY_0493     FALSE 0.515 1.000 0.002 1.000 N NA
 3671935 3671936 COSY_0494 COSY_0495     TRUE 0.715 75.000 0.062 NA   NA
 3671937 3671938 COSY_0496 COSY_0497   lipB TRUE 0.981 7.000 0.219 NA   NA
 3671938 3671939 COSY_0497 COSY_0498 lipB lipA TRUE 0.987 -22.000 0.319 0.002 Y NA
 3671940 3671941 COSY_0499 COSY_0500     TRUE 0.991 7.000 0.449 NA N NA
 3671942 3671943 COSY_0501 COSY_0502 pdxA ksgA TRUE 0.902 -19.000 0.197 1.000 N NA
 3671943 3671944 COSY_0502 COSY_0503 ksgA apaG TRUE 0.856 -16.000 0.078 NA N NA
 3671944 3671945 COSY_0503 COSY_0504 apaG apaH TRUE 0.980 0.000 0.267 NA   NA
 3671947 3671948 COSY_0506 COSY_0507     TRUE 0.909 16.000 0.002 1.000 Y NA
 3671948 3671949 COSY_0507 COSY_0508   lpxD TRUE 0.859 39.000 0.009 1.000 Y NA
 3671949 3671950 COSY_0508 COSY_0509 lpxD fabZ TRUE 0.995 2.000 0.796 1.000 N NA
 3671950 3671951 COSY_0509 COSY_0510 fabZ lpxA TRUE 0.995 26.000 0.850 1.000 N NA
 3671951 3671952 COSY_0510 COSY_0511 lpxA mviN TRUE 0.840 18.000 0.004 1.000   NA
 3671952 3671953 COSY_0511 COSY_0512 mviN   TRUE 0.812 0.000 0.004 NA   NA
 3671953 3671954 COSY_0512 COSY_0513   gmk FALSE 0.108 -7.000 0.000 NA N NA
 3671954 3671955 COSY_0513 COSY_0514 gmk rpoH FALSE 0.069 50.000 0.000 1.000 N NA
 3671955 3671956 COSY_0514 COSY_0515 rpoH groES FALSE 0.392 67.000 0.005 1.000 N NA
 3671956 3671957 COSY_0515 COSY_0516 groES groEL TRUE 0.985 13.000 0.015 0.015 Y NA
 3671957 3671958 COSY_0516 COSY_0517 groEL   FALSE 0.050 137.000 0.000 NA   NA
 3671958 3671959 COSY_0517 COSY_0518   parE FALSE 0.111 81.000 0.000 NA   NA
 3671959 3671960 COSY_0518 COSY_0519 parE exsB TRUE 0.665 -7.000 0.004 1.000   NA
 3671960 3671961 COSY_0519 COSY_0520 exsB acpP FALSE 0.166 109.000 0.003 1.000   NA
 3671961 3671962 COSY_0520 COSY_0521 acpP fabF TRUE 0.941 79.000 0.346 1.000 Y NA
 3671963 3671964 COSY_0522 COSY_0523   prlC TRUE 0.809 -7.000 0.012 NA   NA
 3671964 3671965 COSY_0523 COSY_t19 prlC   TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 3671965 3671966 COSY_t19 COSY_0525   metG FALSE 0.038 188.000 0.000 NA   NA
 3671968 3671969 COSY_0527 COSY_0528 fdx hscA TRUE 0.995 23.000 0.794 1.000 N NA
 3671969 3671970 COSY_0528 COSY_0529 hscA hscB TRUE 0.997 16.000 0.634 1.000 Y NA
 3671970 3671971 COSY_0529 COSY_0530 hscB iscA TRUE 0.995 13.000 0.500 1.000   NA
 3671971 3671972 COSY_0530 COSY_0531 iscA iscU TRUE 0.995 7.000 0.359 0.006   NA
 3671972 3671973 COSY_0531 COSY_0532 iscU iscS TRUE 0.930 68.000 0.448 1.000 N NA
 3671973 3671974 COSY_0532 COSY_0533 iscS iscR TRUE 0.988 3.000 0.424 1.000 N NA
 3671974 3671975 COSY_0533 COSY_0534 iscR cysE TRUE 0.811 83.000 0.271 1.000 N NA
 3671975 3671976 COSY_0534 COSY_0535 cysE   TRUE 0.592 69.000 0.017 1.000 N NA
 3671976 3671977 COSY_0535 COSY_0536     TRUE 0.721 -19.000 0.015 NA N NA
 3671977 3671978 COSY_0536 COSY_0537     FALSE 0.006 540.000 0.000 NA N NA
 3671978 3671979 COSY_0537 COSY_0538   aroK TRUE 0.738 -3.000 0.007 1.000 N NA
 3671979 3671980 COSY_0538 COSY_0539 aroK ilvE FALSE 0.127 202.000 0.000 1.000 Y NA
 3671980 3671981 COSY_0539 COSY_0540 ilvE   TRUE 0.905 3.000 0.003 1.000 Y NA
 3671982 3671983 COSY_0541 COSY_0542     FALSE 0.181 63.000 0.000 1.000   NA
 3671983 3671984 COSY_0542 COSY_0543     FALSE 0.061 115.000 0.000 1.000   NA
 3671985 3671986 COSY_0544 COSY_t20     FALSE 0.030 314.000 0.000 NA   NA
 3671986 3671987 COSY_t20 COSY_0546     FALSE 0.085 94.000 0.000 NA   NA
 3671987 3671988 COSY_0546 COSY_0547   rpsA FALSE 0.561 33.000 0.003 1.000 N NA
 3671988 3671989 COSY_0547 COSY_0548 rpsA cmk TRUE 0.767 99.000 0.281 1.000 N NA
 3671989 3671990 COSY_0548 COSY_0549 cmk lysS FALSE 0.007 274.000 0.000 1.000 N NA
 3671990 3671991 COSY_0549 COSY_0550 lysS ccmH FALSE 0.005 630.000 0.000 NA N NA
 3671992 3671993 COSY_0551 COSY_0552 uup   FALSE 0.197 136.000 0.005 NA   NA
 3671993 3671994 COSY_0552 COSY_0553     FALSE 0.023 1517.000 0.000 NA   NA
 3671994 3671995 COSY_0553 COSY_0554   murA TRUE 0.753 0.000 0.004 NA N NA
 3671995 3671996 COSY_0554 COSY_0555 murA hisG TRUE 0.965 7.000 0.123 1.000 N NA
 3671996 3671997 COSY_0555 COSY_0556 hisG hisD TRUE 0.990 -3.000 0.254 0.010 Y NA
 3672001 3672002 COSY_0560 COSY_0561   ubiG FALSE 0.511 -3.000 0.002 1.000 N NA
 3672002 3672003 COSY_0561 COSY_0562 ubiG   TRUE 0.683 36.000 0.004 NA   NA
 3672004 3672005 COSY_0563 COSY_0564 acpS pdxJ TRUE 0.973 -3.000 0.326 1.000 N NA
 3672005 3672006 COSY_0564 COSY_0565 pdxJ era FALSE 0.026 428.000 0.000 1.000   NA
 3672006 3672007 COSY_0565 COSY_0566 era rnc TRUE 0.933 -39.000 0.127 0.030   NA
 3672009 3672010 COSY_0568 COSY_0569 thyA lgt TRUE 0.944 -3.000 0.164 1.000 N NA
 3672010 3672011 COSY_0569 COSY_t21 lgt   TRUE 0.599 16.000 0.000 NA   NA
 3672011 3672012 COSY_t21 COSY_0571     FALSE 0.533 20.000 0.000 NA   NA
 3672012 3672013 COSY_0571 COSY_0572     TRUE 0.977 7.000 0.222 NA N NA
 3672017 3672018 COSY_0576 COSY_0577 aroA   TRUE 0.981 5.000 0.100 1.000 Y NA
 3672018 3672019 COSY_0577 COSY_0578     FALSE 0.433 -3.000 0.000 NA   NA
 3672019 3672020 COSY_0578 COSY_0579   pheA FALSE 0.072 103.000 0.000 NA   NA
 3672020 3672021 COSY_0579 COSY_0580 pheA serA TRUE 0.977 11.000 0.028 1.000 Y NA
 3672021 3672022 COSY_0580 COSY_0581 serA serC TRUE 0.987 0.000 0.238 1.000 Y NA
 3672023 3672024 COSY_0582 COSY_0583   cobO TRUE 0.591 7.000 0.000 NA   NA
 3672025 3672026 COSY_0584 COSY_t22 glyA   FALSE 0.024 587.000 0.000 NA   NA
 3672026 3672027 COSY_t22 COSY_0586   moeB FALSE 0.326 -9.000 0.000 NA   NA
 3672027 3672028 COSY_0586 COSY_0587 moeB msrA TRUE 0.801 -3.000 0.010 1.000 N NA
 3672030 3672031 COSY_0589 COSY_0590 himA pheT TRUE 0.966 0.000 0.208 1.000 N NA
 3672031 3672032 COSY_0590 COSY_0591 pheT pheS TRUE 0.997 -3.000 0.574 0.002 Y NA
 3672032 3672033 COSY_0591 COSY_0592 pheS rplT TRUE 0.638 360.000 0.202 1.000 Y NA
 3672033 3672034 COSY_0592 COSY_0593 rplT rpmI TRUE 0.999 13.000 0.928 0.044 Y NA
 3672034 3672035 COSY_0593 COSY_0594 rpmI infC TRUE 0.987 55.000 0.652 1.000 Y NA
 3672035 3672036 COSY_0594 COSY_0595 infC thrS TRUE 0.933 60.000 0.186 1.000 Y NA
 3672036 3672037 COSY_0595 COSY_0596 thrS recJ FALSE 0.281 55.000 0.002 1.000 N NA
 3672037 3672038 COSY_0596 COSY_0597 recJ   FALSE 0.537 -10.000 0.002 NA   NA
 3672038 3672039 COSY_0597 COSY_0598     TRUE 0.864 -7.000 0.020 NA   NA
 3672039 3672040 COSY_0598 COSY_0599   lspA TRUE 0.787 -12.000 0.020 1.000 N NA
 3672042 3672043 COSY_0601 COSY_t23     FALSE 0.042 162.000 0.000 NA   NA
 3672043 3672044 COSY_t23 COSY_t24     TRUE 0.635 12.000 0.000 NA   NA
 3672044 3672045 COSY_t24 COSY_0604   hupB FALSE 0.259 49.000 0.000 NA   NA
 3672045 3672046 COSY_0604 COSY_0605 hupB dsbE FALSE 0.013 128.000 0.000 1.000 N NA
 3672046 3672047 COSY_0605 COSY_0606 dsbE ccmE TRUE 0.881 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 3672047 3672048 COSY_0606 COSY_0607 ccmE ccmC TRUE 0.735 172.000 0.067 0.008 Y NA
 3672048 3672049 COSY_0607 COSY_0608 ccmC   TRUE 0.713 39.000 0.002 1.000 Y NA
 3672050 3672051 COSY_0609 COSY_0610 rpsF rpsR TRUE 0.994 0.000 0.319 0.043 Y NA
 3672051 3672052 COSY_0610 COSY_0611 rpsR rplI TRUE 0.998 10.000 0.499 0.043 Y NA
 3672052 3672053 COSY_0611 COSY_0612 rplI dnaB FALSE 0.104 86.000 0.002 1.000 N NA
 3672053 3672054 COSY_0612 COSY_0613 dnaB alr TRUE 0.998 9.000 1.000 1.000 N NA
 3672054 3672055 COSY_0613 COSY_0614 alr   TRUE 0.860 -3.000 0.012 1.000   NA
 3672055 3672056 COSY_0614 COSY_0615     FALSE 0.034 217.000 0.000 1.000   NA
 3672056 3672057 COSY_0615 COSY_0616     FALSE 0.049 138.000 0.000 1.000   NA
 3672059 3672060 COSY_0618 COSY_0619 hisS   TRUE 0.970 -3.000 0.259 1.000   NA
 3672060 3672061 COSY_0619 COSY_0620     TRUE 0.906 7.000 0.009 1.000   NA
 3672064 3672065 COSY_0623 COSY_0624     FALSE 0.269 -19.000 0.000 NA   NA
 3672065 3672066 COSY_0624 COSY_0625     TRUE 0.721 -3.000 0.000 0.026   NA
 3672066 3672067 COSY_0625 COSY_0626     FALSE 0.310 -10.000 0.000 1.000   NA
 3672067 3672068 COSY_0626 COSY_0627     TRUE 0.877 -7.000 0.030 1.000   NA
 3672068 3672069 COSY_0627 COSY_0628     FALSE 0.536 2.000 0.000 NA   NA
 3672069 3672070 COSY_0628 COSY_0629     FALSE 0.276 45.000 0.000 NA   NA
 3672070 3672071 COSY_0629 COSY_0630     TRUE 0.873 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3672071 3672072 COSY_0630 COSY_0631     TRUE 0.932 6.000 0.016 NA   NA
 3672072 3672073 COSY_0631 COSY_0632   csp TRUE 0.859 -6.000 0.016 NA   NA
 3672074 3672075 COSY_0633 COSY_0634   ung TRUE 0.779 -18.000 0.022 1.000 N NA
 3672075 3672076 COSY_0634 COSY_0635 ung pdxB TRUE 0.863 0.000 0.012 1.000 N NA
 3672077 3672078 COSY_0636 COSY_0637     TRUE 0.994 3.000 0.667 1.000 N NA
 3672078 3672079 COSY_0637 COSY_0638   nirB TRUE 0.904 3.000 0.017 1.000 N NA
 3672082 3672083 COSY_0641 COSY_0642 moeA moaC TRUE 0.940 -3.000 0.004 0.008 Y NA
 3672083 3672084 COSY_0642 COSY_0643 moaC moaA TRUE 0.917 -7.000 0.004 0.008 Y NA
 3672084 3672085 COSY_0643 COSY_0644 moaA moaD TRUE 0.966 19.000 0.006 0.008 Y NA
 3672086 3672087 COSY_0645 COSY_0646   narI TRUE 0.591 7.000 0.000 NA   NA
 3672087 3672088 COSY_0646 COSY_0647 narI narJ TRUE 0.938 16.000 0.000 0.006 Y NA
 3672088 3672089 COSY_0647 COSY_0648 narJ narH TRUE 0.886 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 3672089 3672090 COSY_0648 COSY_0649 narH narG TRUE 0.922 0.000 0.000 0.002 Y NA
 3672092 3672093 COSY_0651 COSY_0652 cbbO cbbQ TRUE 0.991 16.000 0.357 NA   NA
 3672093 3672094 COSY_0652 COSY_0653 cbbQ cbbM TRUE 0.711 88.000 0.108 1.000   NA
 3672096 3672097 COSY_0655 COSY_0656 argJ   FALSE 0.108 109.000 0.003 1.000 N NA
 3672097 3672098 COSY_0656 COSY_0657     TRUE 0.991 82.000 0.844 0.009 Y NA
 3672098 3672099 COSY_0657 COSY_0658     TRUE 0.823 56.000 0.014 1.000 Y NA
 3672099 3672100 COSY_0658 COSY_0659     FALSE 0.568 67.000 0.014 1.000 N NA
 3672100 3672101 COSY_0659 COSY_0660     FALSE 0.050 61.000 0.000 NA N NA
 3672101 3672102 COSY_0660 COSY_0661     TRUE 0.833 -16.000 0.023 NA   NA
 3672102 3672103 COSY_0661 COSY_0662     TRUE 0.996 7.000 0.713 NA   NA
 3672103 3672104 COSY_0662 COSY_0663     TRUE 0.961 -22.000 0.436 NA N NA
 3672105 3672106 COSY_0664 COSY_0665     FALSE 0.006 348.000 0.000 1.000 N NA
 3672107 3672108 COSY_0666 COSY_0667     TRUE 0.790 -3.000 0.006 NA   NA
 3672108 3672109 COSY_0667 COSY_0668     TRUE 0.973 4.000 0.167 NA   NA
 3672109 3672110 COSY_0668 COSY_0669   glyS FALSE 0.026 421.000 0.000 NA   NA
 3672110 3672111 COSY_0669 COSY_0670 glyS   FALSE 0.023 715.000 0.000 NA   NA
 3672111 3672112 COSY_0670 COSY_0671     TRUE 0.981 0.000 0.286 NA   NA
 3672112 3672113 COSY_0671 COSY_0672   tolR TRUE 0.883 0.000 0.010 NA   NA
 3672113 3672114 COSY_0672 COSY_0673 tolR tolQ TRUE 0.995 -7.000 0.556 0.019 Y NA
 3672114 3672115 COSY_0673 COSY_0674 tolQ ruvB FALSE 0.096 393.000 0.007 1.000 N NA
 3672116 3672117 COSY_0675 COSY_0676 hemA prfA TRUE 0.973 0.000 0.171 0.081 N NA
 3672118 3672119 COSY_0677 COSY_0678   fur TRUE 0.882 -9.000 0.011 1.000 Y NA
 3672122 3672123 COSY_0681 COSY_0682 ccmA ccmB TRUE 0.997 -3.000 0.503 0.008 Y NA
 3672123 3672124 COSY_0682 COSY_0683 ccmB metK FALSE 0.077 154.000 0.003 1.000 N NA
 3672124 3672125 COSY_0683 COSY_0684 metK ahcY TRUE 0.989 25.000 0.114 0.002 Y NA
 3672125 3672126 COSY_0684 COSY_0685 ahcY glyQ FALSE 0.144 92.000 0.003 1.000 N NA
 3672126 3672127 COSY_0685 COSY_0686 glyQ   TRUE 0.799 2.000 0.003 NA   NA
 3672127 3672128 COSY_0686 COSY_0687     FALSE 0.269 -19.000 0.000 NA   NA
 3672128 3672129 COSY_0687 COSY_0688   miaB FALSE 0.044 154.000 0.000 1.000   NA
 3672130 3672131 COSY_0689 COSY_0690     FALSE 0.308 344.000 0.042 NA   NA
 3672132 3672133 COSY_0691 COSY_0692 trmU   TRUE 0.973 3.000 0.180 NA   NA
 3672133 3672134 COSY_0692 COSY_0693   rpsT FALSE 0.178 88.000 0.002 NA   NA
 3672134 3672135 COSY_0693 COSY_0694 rpsT   FALSE 0.043 157.000 0.000 NA   NA
 3672135 3672136 COSY_0694 COSY_0695   xseA FALSE 0.562 5.000 0.000 NA   NA
 3672136 3672137 COSY_0695 COSY_0696 xseA   FALSE 0.023 952.000 0.000 NA   NA
 3672137 3672138 COSY_0696 COSY_0697   ispD FALSE 0.027 376.000 0.000 NA   NA
 3672138 3672139 COSY_0697 COSY_0698 ispD ispF TRUE 0.991 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 3672139 3672140 COSY_0698 COSY_0699 ispF murC FALSE 0.532 0.000 0.002 1.000 N NA
 3672140 3672141 COSY_0699 COSY_0700 murC murB TRUE 0.994 12.000 0.136 0.008 Y NA
 3672141 3672142 COSY_0700 COSY_0701 murB ddlB TRUE 0.982 -3.000 0.074 0.008 Y NA
 3672146 3672147 COSY_0705 COSY_0706   thrA FALSE 0.025 503.000 0.000 NA   NA
 3672147 3672148 COSY_0706 COSY_0707 thrA thrC TRUE 0.990 11.000 0.194 1.000 Y NA
 3672148 3672149 COSY_0707 COSY_0708 thrC cysM TRUE 0.908 19.000 0.000 0.019 Y NA
 3672149 3672150 COSY_0708 COSY_0709 cysM   TRUE 0.733 -3.000 0.006 1.000 N NA
 3672154 3672155 COSY_0713 COSY_0714   argH FALSE 0.115 79.000 0.000 NA   NA
 3672155 3672156 COSY_0714 COSY_0715 argH fmt FALSE 0.475 0.000 0.002 1.000 N NA
 3672156 3672157 COSY_0715 COSY_0716 fmt clpB FALSE 0.007 249.000 0.000 1.000 N NA
 3672157 3672158 COSY_0716 COSY_0717 clpB rnfE FALSE 0.036 70.000 0.000 1.000 N NA
 3672158 3672159 COSY_0717 COSY_0718 rnfE hemK FALSE 0.008 245.000 0.000 1.000 N NA
 3672161 3672162 COSY_0720 COSY_0721 mreB mreC TRUE 0.985 37.000 0.689 1.000 N NA
 3672162 3672163 COSY_0721 COSY_0722 mreC mreD TRUE 0.997 3.000 0.550 0.008   NA
 3672163 3672164 COSY_0722 COSY_0723 mreD mrdA TRUE 0.630 -42.000 0.006 1.000   NA
 3672165 3672166 COSY_0724 COSY_0725 tgt   FALSE 0.092 -10.000 0.000 1.000 N NA
 3672167 3672168 COSY_0726 COSY_0727 ribD dfp TRUE 0.802 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 3672169 3672170 COSY_0728 COSY_0729 dnaE   FALSE 0.103 142.000 0.002 NA   NA
 3672170 3672171 COSY_0729 COSY_0730   soxA TRUE 0.972 15.000 0.091 NA   NA
 3672171 3672172 COSY_0730 COSY_0731 soxA soxZ TRUE 0.951 28.000 0.136 NA   NA
 3672172 3672173 COSY_0731 COSY_0732 soxZ soxY TRUE 0.902 34.000 0.062 NA   NA
 3672173 3672174 COSY_0732 COSY_0733 soxY soxX TRUE 0.988 11.000 0.281 NA   NA
 3672174 3672175 COSY_0733 COSY_0734 soxX   FALSE 0.034 224.000 0.000 1.000   NA
 3672175 3672176 COSY_0734 COSY_0735   rpoC FALSE 0.095 88.000 0.002 1.000 N NA
 3672176 3672177 COSY_0735 COSY_0736 rpoC rpoB TRUE 0.999 14.000 0.851 0.002   NA
 3672177 3672178 COSY_0736 COSY_0737 rpoB rplL TRUE 0.617 170.000 0.223 1.000   NA
 3672178 3672179 COSY_0737 COSY_0738 rplL rplJ TRUE 0.998 23.000 0.884 1.000 Y NA
 3672179 3672180 COSY_0738 COSY_0739 rplJ rplA TRUE 0.779 201.000 0.302 1.000 Y NA
 3672180 3672181 COSY_0739 COSY_0740 rplA rplK TRUE 0.999 5.000 0.838 0.057 Y NA
 3672181 3672182 COSY_0740 COSY_0741 rplK nusG TRUE 0.929 91.000 0.681 1.000 N NA
 3672182 3672183 COSY_0741 COSY_0742 nusG secE TRUE 0.997 11.000 0.843 1.000 N NA
 3672183 3672184 COSY_0742 COSY_t25 secE   FALSE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 3672184 3672185 COSY_t25 COSY_0744   tufB FALSE 0.115 79.000 0.000 NA   NA
 3672185 3672186 COSY_0744 COSY_t26 tufB   FALSE 0.346 35.000 0.000 NA   NA
 3672186 3672187 COSY_t26 COSY_t27     TRUE 0.599 16.000 0.000 NA   NA
 3672187 3672188 COSY_t27 COSY_t28     FALSE 0.533 20.000 0.000 NA   NA
 3672188 3672189 COSY_t28 COSY_0748   maeB FALSE 0.084 96.000 0.000 NA   NA
 3672189 3672190 COSY_0748 COSY_0749 maeB   FALSE 0.006 500.000 0.000 1.000 N NA
 3672190 3672191 COSY_0749 COSY_0750     FALSE 0.006 504.000 0.000 NA N NA
 3672193 3672194 COSY_0752 COSY_0753     TRUE 0.599 16.000 0.000 NA   NA
 3672194 3672195 COSY_0753 COSY_0754   dapB FALSE 0.030 281.000 0.000 1.000   NA
 3672195 3672196 COSY_0754 COSY_0755 dapB kdsA FALSE 0.071 150.000 0.000 0.080 N NA
 3672197 3672198 COSY_0756 COSY_0757     TRUE 0.879 -3.000 0.023 1.000 N NA
 3672198 3672199 COSY_0757 COSY_t29     FALSE 0.025 520.000 0.000 NA   NA
 3672199 3672200 COSY_t29 COSY_0759   thiG FALSE 0.056 125.000 0.000 NA   NA
 3672200 3672201 COSY_0759 COSY_0760 thiG bioF FALSE 0.087 549.000 0.000 1.000 Y NA
 3672201 3672202 COSY_0760 COSY_0761 bioF bioH TRUE 0.945 -10.000 0.092 0.018   NA
 3672202 3672203 COSY_0761 COSY_0762 bioH purE TRUE 0.761 15.000 0.002 1.000   NA
 3672203 3672204 COSY_0762 COSY_0763 purE purK TRUE 0.992 4.000 0.136 0.002 Y NA
 3672205 3672206 COSY_0764 COSY_0765   folD TRUE 0.825 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3672206 3672207 COSY_0765 COSY_0766 folD kdsB TRUE 0.785 4.000 0.005 1.000 N NA
 3672207 3672208 COSY_0766 COSY_0767 kdsB   TRUE 0.979 0.000 0.265 NA   NA
 3672208 3672209 COSY_0767 COSY_0768   lpxK TRUE 0.971 -3.000 0.263 NA   NA
 3672210 3672211 COSY_0769 COSY_0770 lolE lolD TRUE 0.990 -7.000 0.620 0.018 N NA
 3672212 3672213 COSY_0771 COSY_0772 panD oadB TRUE 0.799 10.000 0.004 1.000 N NA
 3672213 3672214 COSY_0772 COSY_0773 oadB oadA TRUE 1.000 15.000 0.886 0.002 Y NA
 3672214 3672215 COSY_0773 COSY_t30 oadA   FALSE 0.029 323.000 0.000 NA   NA
 3672215 3672216 COSY_t30 COSY_0775   infA TRUE 0.620 9.000 0.000 NA   NA
 3672218 3672219 COSY_0777 COSY_0778   hemD TRUE 0.889 18.000 0.008 NA   NA
 3672219 3672220 COSY_0778 COSY_0779 hemD   TRUE 0.886 4.000 0.008 NA   NA
 3672221 3672222 COSY_0780 COSY_0781     FALSE 0.545 -15.000 0.003 NA   NA
 3672223 3672224 COSY_0782 COSY_0783 dsrR dsrN TRUE 0.908 -3.000 0.025 NA   NA
 3672224 3672225 COSY_0783 COSY_0784 dsrN dsrP TRUE 0.904 28.000 0.060 NA N NA
 3672225 3672226 COSY_0784 COSY_0785 dsrP dsrO TRUE 0.985 26.000 0.258 NA Y NA
 3672226 3672227 COSY_0785 COSY_0786 dsrO dsrJ FALSE 0.433 -3.000 0.000 NA   NA
 3672227 3672228 COSY_0786 COSY_0787 dsrJ dsrL FALSE 0.385 30.000 0.000 NA   NA
 3672228 3672229 COSY_0787 COSY_0788 dsrL dsrK TRUE 0.912 56.000 0.183 0.019 N NA
 3672229 3672230 COSY_0788 COSY_0789 dsrK dsrM TRUE 0.998 2.000 0.766 0.066 Y NA
 3672230 3672231 COSY_0789 COSY_0790 dsrM dsrC TRUE 0.678 77.000 0.083 1.000 N NA
 3672231 3672232 COSY_0790 COSY_0791 dsrC dsrH TRUE 0.987 27.000 0.317 NA Y NA
 3672232 3672233 COSY_0791 COSY_0792 dsrH dsrF TRUE 0.999 12.000 0.804 NA Y NA
 3672233 3672234 COSY_0792 COSY_0793 dsrF dsrE TRUE 0.998 4.000 0.790 NA Y NA
 3672234 3672235 COSY_0793 COSY_0794 dsrE dsrB TRUE 0.956 13.000 0.054 NA N NA
 3672235 3672236 COSY_0794 COSY_0795 dsrB dsrA TRUE 0.994 76.000 0.879 0.004 Y NA
 3672236 3672237 COSY_0795 COSY_0796 dsrA gltD FALSE 0.054 233.000 0.000 0.066 N NA
 3672239 3672240 COSY_0798 COSY_0799 greA carB TRUE 0.974 3.000 0.241 1.000 N NA
 3672240 3672241 COSY_0799 COSY_0800 carB vacJ TRUE 0.657 23.000 0.003 1.000 N NA
 3672241 3672242 COSY_0800 COSY_0801 vacJ carA FALSE 0.515 -3.000 0.002 1.000 N NA
 3672243 3672244 COSY_0802 COSY_0803   thiS TRUE 0.895 -3.000 0.018 1.000   NA
 3672247 3672248 COSY_0806 COSY_0807 alaS   FALSE 0.575 49.000 0.000 NA Y NA
 3672248 3672249 COSY_0807 COSY_0808     TRUE 0.966 -6.000 0.281 NA   NA
 3672250 3672251 COSY_0809 COSY_0810 glmS pgi TRUE 0.793 6.000 0.005 1.000 N NA
 3672251 3672252 COSY_0810 COSY_0811 pgi galU TRUE 0.741 -3.000 0.007 1.000 N NA
 3672252 3672253 COSY_0811 COSY_0812 galU   FALSE 0.023 711.000 0.000 NA   NA
 3672253 3672254 COSY_0812 COSY_0813     FALSE 0.024 620.000 0.000 NA   NA
 3672254 3672255 COSY_0813 COSY_0814     TRUE 0.986 1.000 0.333 NA   NA
 3672255 3672256 COSY_0814 COSY_0815     TRUE 0.873 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3672256 3672257 COSY_0815 COSY_0816   glnS FALSE 0.005 1043.000 0.000 1.000 N NA
 3672258 3672259 COSY_0817 COSY_0818 surE clpA TRUE 0.802 23.000 0.004 1.000   NA
 3672259 3672260 COSY_0818 COSY_0819 clpA   FALSE 0.034 217.000 0.000 1.000   NA
 3672261 3672262 COSY_0820 COSY_0821 guaA   TRUE 0.916 -9.000 0.019 1.000 Y NA
 3672263 3672264 COSY_0822 COSY_0823 fabG fabD TRUE 0.995 -3.000 0.432 0.012 Y NA
 3672264 3672265 COSY_0823 COSY_0824 fabD rpmA FALSE 0.084 88.000 0.002 1.000 N NA
 3672265 3672266 COSY_0824 COSY_0825 rpmA rplU TRUE 0.999 12.000 0.667 0.041 Y NA
 3672267 3672268 COSY_0826 COSY_0827 ppiB lpxH TRUE 0.969 3.000 0.136 1.000   NA
 3672269 3672270 COSY_0828 COSY_0829   gcvH TRUE 0.852 9.000 0.006 1.000 N NA
 3672270 3672271 COSY_0829 COSY_0830 gcvH gcvT TRUE 0.988 44.000 0.317 0.003 Y NA
 3672271 3672272 COSY_0830 COSY_0831 gcvT ispZ TRUE 0.728 0.000 0.004 1.000 N NA
 3672272 3672273 COSY_0831 COSY_0832 ispZ   TRUE 0.860 1.000 0.007 1.000   NA
 3672274 3672275 COSY_t31 COSY_0834     FALSE 0.036 206.000 0.000 NA   NA
 3672275 3672276 COSY_0834 COSY_0835   recG TRUE 0.701 71.000 0.076 NA N NA
 3672276 3672277 COSY_0835 COSY_0836 recG ubiC TRUE 0.857 32.000 0.031 NA N NA
 3672277 3672278 COSY_0836 COSY_0837 ubiC   FALSE 0.093 448.000 0.000 NA Y NA
 3672278 3672279 COSY_0837 COSY_0838     TRUE 0.847 4.000 0.008 NA N NA
 3672279 3672280 COSY_0838 COSY_0839   grxC TRUE 0.914 7.000 0.015 NA N NA
 3672280 3672281 COSY_0839 COSY_0840 grxC gpsA TRUE 0.848 -3.000 0.015 1.000 N NA
 3672281 3672282 COSY_0840 COSY_0841 gpsA cobC FALSE 0.146 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3672283 3672284 COSY_0842 COSY_0843 rpsI rplM TRUE 0.999 13.000 0.601 0.041 Y NA
 3672285 3672286 COSY_0844 COSY_0845 deaD cspC FALSE 0.085 694.000 0.000 1.000 Y NA
 3672286 3672287 COSY_0845 COSY_0846 cspC sbcB FALSE 0.005 791.000 0.000 1.000 N NA
 3672287 3672288 COSY_0846 COSY_0847 sbcB nth TRUE 0.649 70.000 0.002 0.028 Y NA
 3672289 3672290 COSY_0848 COSY_0849 hisH   TRUE 0.991 7.000 0.111 0.009 Y NA
 3672290 3672291 COSY_0849 COSY_0850     TRUE 0.621 15.000 0.000 NA   NA
 3672291 3672292 COSY_0850 COSY_0851   asd FALSE 0.127 75.000 0.000 NA   NA
 3672292 3672293 COSY_0851 COSY_0852 asd   FALSE 0.024 606.000 0.000 NA   NA
 3672293 3672294 COSY_0852 COSY_0853   hisC TRUE 0.866 10.000 0.004 NA   NA
 3672294 3672295 COSY_0853 COSY_0854 hisC thiD TRUE 0.656 -3.000 0.004 1.000 N NA
 3672295 3672296 COSY_0854 COSY_0855 thiD dsbA TRUE 0.883 -7.000 0.034 1.000   NA
 3672296 3672297 COSY_0855 COSY_0856 dsbA   TRUE 0.928 3.000 0.017 1.000   NA
 3672297 3672298 COSY_0856 COSY_0857   folB TRUE 0.990 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 3672299 3672300 COSY_0858 COSY_0859   ppk FALSE 0.078 100.000 0.000 1.000   NA
 3672300 3672301 COSY_0859 COSY_0860 ppk   FALSE 0.433 -3.000 0.000 NA   NA
 3672302 3672303 COSY_0861 COSY_0862     TRUE 0.993 0.000 0.688 1.000 N NA
 3672304 3672305 COSY_0863 COSY_0864 aceF lpdA TRUE 0.907 -7.000 0.014 1.000 Y NA
 3672305 3672306 COSY_0864 COSY_0865 lpdA pcm TRUE 0.893 12.000 0.009 1.000 N NA
 3672306 3672307 COSY_0865 COSY_0866 pcm   TRUE 0.892 3.000 0.009 1.000   NA
 3672307 3672308 COSY_0866 COSY_0867   nadB TRUE 0.651 60.000 0.011 1.000   NA
 3672308 3672309 COSY_0867 COSY_0868 nadB def TRUE 0.809 -3.000 0.011 1.000 N NA
 3672309 3672310 COSY_0868 COSY_0869 def purH FALSE 0.005 684.000 0.000 1.000 N NA
 3672313 3672314 COSY_0872 COSY_0873   pmbA TRUE 0.835 0.000 0.005 NA   NA
 3672314 3672315 COSY_0873 COSY_0874 pmbA   FALSE 0.571 54.000 0.005 NA   NA
 3672315 3672316 COSY_0874 COSY_0875   corC TRUE 0.857 0.000 0.007 NA   NA
 3672316 3672317 COSY_0875 COSY_0876 corC   TRUE 0.755 39.000 0.010 NA   NA
 3672317 3672318 COSY_0876 COSY_0877   hisA TRUE 0.580 -10.000 0.003 NA   NA
 3672318 3672319 COSY_0877 COSY_0878 hisA gcp FALSE 0.005 1310.000 0.000 1.000 N NA
 3672319 3672320 COSY_0878 COSY_0879 gcp   FALSE 0.460 38.000 0.002 1.000   NA
 3672320 3672321 COSY_0879 COSY_0880   birA FALSE 0.031 271.000 0.000 1.000   NA
 3672322 3672323 COSY_0881 COSY_0882 truA   FALSE 0.032 265.000 0.000 1.000   NA
 3672323 3672324 COSY_0882 COSY_0883   cynT TRUE 0.784 66.000 0.067 1.000   NA
 3672325 3672326 COSY_0884 COSY_0885 rimM rpsP TRUE 0.900 151.000 0.342 0.041 Y NA
 3672326 3672327 COSY_0885 COSY_0886 rpsP purB FALSE 0.147 65.000 0.002 1.000 N NA
 3672329 3672330 COSY_0888 COSY_0889 rpmG rpmB TRUE 0.993 -3.000 0.332 0.041 Y NA
 3672333 3672334 COSY_0892 COSY_0893 xthA   FALSE 0.023 743.000 0.000 1.000   NA
 3672334 3672335 COSY_0893 COSY_0894     TRUE 0.823 2.000 0.004 1.000   NA
 3672335 3672336 COSY_0894 COSY_0895   folC TRUE 0.637 -12.000 0.004 1.000   NA
 3672336 3672337 COSY_0895 COSY_0896 folC   TRUE 0.609 46.000 0.004 1.000   NA
 3672337 3672338 COSY_0896 COSY_0897   purF TRUE 0.887 11.000 0.005 1.000   NA
 3672338 3672339 COSY_0897 COSY_0898 purF metB TRUE 0.947 26.000 0.153 1.000 N NA
 3672339 3672340 COSY_0898 COSY_0899 metB fabA TRUE 0.727 29.000 0.007 1.000 N NA
 3672340 3672341 COSY_0899 COSY_0900 fabA fabB TRUE 0.994 0.000 0.451 1.000 Y NA
 3672342 3672343 COSY_0901 COSY_0902 secF secD TRUE 0.995 -3.000 0.332 0.002 Y NA
 3672343 3672344 COSY_0902 COSY_0903 secD yajC TRUE 0.983 16.000 0.083 NA Y NA
 3672344 3672345 COSY_0903 COSY_0904 yajC serS TRUE 0.820 22.000 0.008 NA N NA
 3672346 3672347 COSY_0905 COSY_0906     TRUE 0.947 34.000 0.200 NA   NA
 3672347 3672348 COSY_0906 COSY_0907   trxC FALSE 0.248 50.000 0.000 NA   NA
 3672349 3672350 COSY_0907a COSY_0907b     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 3672350 3672351 COSY_0907b COSY_t33     FALSE 0.025 462.000 0.000 NA   NA
 3672351 10726509 COSY_t33 COSY_0907c     FALSE 0.515 0.000 0.000 NA   NA
 10726509 3672352 COSY_0907c COSY_t34     FALSE 0.515 0.000 0.000 NA   NA
 3672352 3672353 COSY_t34 COSY_0907d     FALSE 0.061 115.000 0.000 NA   NA
 3672353 3672354 COSY_0907d COSY_0913     FALSE 0.029 331.000 0.000 NA   NA
 3672354 3672355 COSY_0913 COSY_0914   narL TRUE 0.949 6.000 0.071 NA N NA
 3672355 3672356 COSY_0914 COSY_0915 narL narX TRUE 0.998 -3.000 0.686 0.004 Y NA
 3672356 3672357 COSY_0915 COSY_0916 narX trmE TRUE 0.699 41.000 0.003 0.053   NA
 3672357 3672358 COSY_0916 COSY_0917 trmE gshA TRUE 0.739 0.000 0.003 1.000   NA
 3672359 3672360 COSY_0918 COSY_0919   gltB FALSE 0.006 449.000 0.000 1.000 N NA
 3672362 3672363 COSY_0921 COSY_0922 maf mfd FALSE 0.557 3.000 0.002 NA N NA
 3672364 3672365 COSY_0923 COSY_0924   lytB FALSE 0.412 69.000 0.007 1.000 N NA
 3672365 3672366 COSY_0924 COSY_0925 lytB   TRUE 0.989 -3.000 0.626 1.000 N NA
 3672366 3672367 COSY_0925 COSY_0926   accD FALSE 0.107 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3672367 3672368 COSY_0926 COSY_0927 accD trpA TRUE 0.972 20.000 0.232 1.000 N NA
 3672368 3672369 COSY_0927 COSY_0928 trpA hemE TRUE 0.626 2.000 0.002 1.000 N NA
 3672369 3672370 COSY_0928 COSY_0929 hemE rpmE FALSE 0.144 86.000 0.002 1.000 N NA
 3672370 3672371 COSY_0929 COSY_0930 rpmE   FALSE 0.222 82.000 0.004 1.000 N NA
 3672372 3672373 COSY_0931 COSY_0932   glmU TRUE 0.795 10.000 0.002 NA   NA
 3672374 3672375 COSY_0933 COSY_0934 trpB trpF TRUE 0.995 -3.000 0.375 0.004 Y NA
 3672375 3672376 COSY_0934 COSY_0935 trpF   TRUE 0.779 1.000 0.003 NA   NA
 3672376 3672377 COSY_0935 COSY_0936   topA FALSE 0.023 763.000 0.000 NA   NA
 3672377 3672378 COSY_0936 COSY_0937 topA smg TRUE 0.940 0.000 0.040 NA   NA
 3672379 3672380 COSY_0938 COSY_0939 rpmH rnpA TRUE 0.997 10.000 0.787 1.000   NA
 3672380 3672381 COSY_0939 COSY_0940 rnpA   TRUE 0.992 0.000 0.540 NA   NA
 3672381 3672382 COSY_0940 COSY_0941     TRUE 0.991 20.000 0.461 NA   NA
 3672382 3672383 COSY_0941 COSY_0942     TRUE 0.817 9.000 0.003 1.000   NA
 3672383 3672384 COSY_0942 COSY_0943   kdsC FALSE 0.027 414.000 0.000 1.000   NA
 3672385 3672386 COSY_0944 COSY_0945 atpC atpD TRUE 0.999 1.000 0.837 0.008 Y NA
 3672386 3672387 COSY_0945 COSY_0946 atpD atpG TRUE 0.998 23.000 0.724 0.008 Y NA
 3672387 3672388 COSY_0946 COSY_0947 atpG atpA TRUE 0.999 14.000 0.846 0.008 Y NA
 3672388 3672389 COSY_0947 COSY_0948 atpA atpH TRUE 0.999 27.000 0.864 0.008 Y NA
 3672389 3672390 COSY_0948 COSY_0949 atpH atpF TRUE 0.995 7.000 0.242 0.008 Y NA
 3672390 3672391 COSY_0949 COSY_0950 atpF atpE TRUE 0.994 36.000 0.666 0.008   NA
 3672391 3672392 COSY_0950 COSY_0951 atpE atpB TRUE 0.994 28.000 0.557 0.008   NA
 3672392 3672393 COSY_0951 COSY_0952 atpB   TRUE 0.985 0.000 0.330 1.000   NA
 3672396 3672397 COSY_0955 COSY_0956 grpE dsbD FALSE 0.084 1084.000 0.000 1.000 Y NA
 3672397 3672398 COSY_0956 COSY_0957 dsbD aroQ FALSE 0.205 89.000 0.004 1.000 N NA
 3672398 3672399 COSY_0957 COSY_0958 aroQ accB TRUE 0.973 1.000 0.254 1.000 N NA
 3672399 3672400 COSY_0958 COSY_0959 accB accC TRUE 0.996 6.000 0.275 0.004 Y NA
 3672400 3672401 COSY_0959 COSY_0960 accC argC FALSE 0.569 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3672401 3672402 COSY_0960 COSY_0961 argC   TRUE 0.957 10.000 0.031 NA   NA
 3672402 3672403 COSY_0961 COSY_0962   gltA TRUE 0.911 4.000 0.012 NA   NA
 3672403 3672404 COSY_0962 COSY_0963 gltA ubiE TRUE 0.595 3.000 0.002 1.000 N NA
 3672404 3672405 COSY_0963 COSY_0964 ubiE   FALSE 0.034 229.000 0.000 NA   NA
 3672405 3672406 COSY_0964 COSY_0965   ubiB FALSE 0.257 -24.000 0.000 NA   NA
 3672406 3672407 COSY_0965 COSY_0966 ubiB rplY FALSE 0.099 157.000 0.002 1.000   NA
 3672407 3672408 COSY_0966 COSY_0967 rplY pth TRUE 0.998 12.000 0.496 0.063 Y NA
 3672408 3672409 COSY_0967 COSY_0968 pth   TRUE 0.990 13.000 0.184 1.000 Y NA
 3672409 3672410 COSY_0968 COSY_0969   gpm FALSE 0.254 43.000 0.002 1.000 N NA
 3672410 3672411 COSY_0969 COSY_0970 gpm rpe TRUE 0.827 31.000 0.003 1.000 Y NA
 3672411 3672412 COSY_0970 COSY_0971 rpe rpsB FALSE 0.007 265.000 0.000 1.000 N NA
 3672412 3672413 COSY_0971 COSY_0972 rpsB tsf TRUE 0.930 200.000 0.748 1.000 Y NA
 3672414 3672415 COSY_0973 COSY_0974     FALSE 0.024 634.000 0.000 NA   NA
 3672415 3672416 COSY_0974 COSY_t35     FALSE 0.023 691.000 0.000 NA   NA
 3672416 3672417 COSY_t35 COSY_0976   secG FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 3672417 3672418 COSY_0976 COSY_0977 secG tpiA TRUE 0.962 0.000 0.184 1.000 N NA
 3672418 3672419 COSY_0977 COSY_0978 tpiA   FALSE 0.142 70.000 0.000 NA   NA