MicrobesOnline Operon Predictions for Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu3

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
3678327	3678328	SAHV_0001	SAHV_0002	dnaA	dnaN	FALSE	0.422	278.000	0.328	1.000	Y	NA
3678328	3678329	SAHV_0002	SAHV_0003	dnaN		FALSE	0.056	381.000	0.103	1.000		NA
3678329	3678330	SAHV_0003	SAHV_0004		recF	TRUE	0.973	-3.000	0.209	1.000		NA
3678330	3678331	SAHV_0004	SAHV_0005	recF	gyrB	TRUE	0.986	10.000	0.249	0.006	Y	NA
3678331	3678332	SAHV_0005	SAHV_0006	gyrB	gyrA	TRUE	0.976	37.000	0.306	0.002	Y	NA
3678334	3678335	SAHV_0008	SAHV_0009	hutH	serS	FALSE	0.058	379.000	0.000	0.060	N	NA
3678335	3678336	SAHV_0009	SAHV_0010	serS		FALSE	0.009	651.000	0.000	NA	N	NA
3678336	3678337	SAHV_0010	SAHV_0011			TRUE	0.977	-3.000	0.338	NA		NA
3678337	3678338	SAHV_0011	SAHV_0012			FALSE	0.020	343.000	0.000	NA		NA
3678338	3678339	SAHV_0012	SAHV_0013			FALSE	0.061	236.000	0.011	NA		NA
3678339	3678340	SAHV_0013	SAHV_0014			TRUE	0.774	15.000	0.039	NA		NA
3678340	3678341	SAHV_0014	SAHV_0015		rplI	TRUE	0.926	-3.000	0.008	1.000	N	NA
3678341	3678342	SAHV_0015	SAHV_0016	rplI	dnaC	TRUE	0.728	32.000	0.064	1.000	N	NA
3678342	3678343	SAHV_0016	SAHV_0017	dnaC	purA	FALSE	0.060	278.000	0.018	1.000	N	NA
3678343	3678344	SAHV_0017	SAHV_t0001	purA		FALSE	0.014	429.000	0.000	NA		NA
3678344	3678345	SAHV_t0001	SAHV_t0002			TRUE	0.653	8.000	0.000	NA		NA
3678345	3678346	SAHV_t0002	SAHV_0018		vicR	FALSE	0.010	611.000	0.000	NA		NA
3678346	3678347	SAHV_0018	SAHV_0019	vicR	vicK	TRUE	0.990	13.000	0.597	0.014	Y	NA
3678347	3678348	SAHV_0019	SAHV_0020	vicK		TRUE	0.989	-34.000	0.575	NA		NA
3678348	3678349	SAHV_0020	SAHV_0021			TRUE	0.981	1.000	0.890	NA		NA
3678349	3678350	SAHV_0021	SAHV_0022			FALSE	0.060	389.000	0.176	NA		NA
3678350	3678351	SAHV_0022	SAHV_0023			FALSE	0.066	227.000	0.000	1.000		NA
3678351	3678352	SAHV_0023	SAHV_0024			FALSE	0.018	368.000	0.000	NA		NA
3678352	3678353	SAHV_0024	SAHV_0025			FALSE	0.029	283.000	0.000	NA		NA
3678353	3678354	SAHV_0025	SAHV_0026			FALSE	0.014	415.000	0.000	NA		NA
3678355	3678356	SAHV_0027	SAHV_0028	tnp		TRUE	0.497	91.000	0.000	0.071		NA
3678356	3678357	SAHV_0028	SAHV_0029			TRUE	0.935	4.000	0.000	0.002		NA
3678357	3678358	SAHV_0029	SAHV_0030			TRUE	0.578	25.000	0.000	NA		NA
3678358	3678359	SAHV_0030	SAHV_0031		pre	FALSE	0.173	119.000	0.000	NA		NA
3678360	3678361	SAHV_0032	SAHV_0033			FALSE	0.385	48.000	0.000	NA		NA
3678362	3678363	SAHV_0034	SAHV_0035	bleO	aadD	FALSE	0.209	217.000	0.000	0.009		NA
3678363	3678364	SAHV_0035	SAHV_0036	aadD	tnp	FALSE	0.020	418.000	0.000	1.000		NA
3678365	3678366	SAHV_0037	SAHV_0038			FALSE	0.013	797.000	0.000	1.000		NA
3678366	3678367	SAHV_0038	SAHV_0039			TRUE	0.711	97.000	0.500	1.000	N	NA
3678369	3678370	SAHV_0041	SAHV_0042	mecR1	mecI	TRUE	0.994	0.000	0.667	1.000	Y	NA
3678370	3678371	SAHV_0042	SAHV_0043	mecI	xylR	FALSE	0.086	487.000	0.000	1.000	Y	NA
3678372	3678373	SAHV_0044	SAHV_0045			TRUE	0.713	4.000	0.000	NA		NA
3678373	3678374	SAHV_0045	SAHV_0046			TRUE	0.562	33.000	0.000	1.000		NA
3678375	3678376	SAHV_0047	SAHV_0048			TRUE	0.985	0.000	1.000	NA		NA
3678377	3678378	SAHV_0049	SAHV_0050			FALSE	0.019	353.000	0.000	NA		NA
3678380	3678381	SAHV_0052	SAHV_0053	ant(9)	tnpC	FALSE	0.124	151.000	0.000	NA		NA
3678381	3678382	SAHV_0053	SAHV_0054	tnpC	tnpB	TRUE	0.662	7.000	0.000	NA		NA
3678382	3678383	SAHV_0054	SAHV_0055	tnpB	tnpA	TRUE	0.992	-3.000	0.000	0.009	Y	NA
3678383	3678384	SAHV_0055	SAHV_0056	tnpA		FALSE	0.230	119.000	0.000	1.000		NA
3678384	3678385	SAHV_0056	SAHV_0057			TRUE	0.714	21.000	0.018	NA		NA
3678385	3678386	SAHV_0057	SAHV_0058			TRUE	0.796	6.000	0.036	NA		NA
3678386	3678387	SAHV_0058	SAHV_0059			TRUE	0.701	87.000	0.500	NA		NA
3678387	3678388	SAHV_0059	SAHV_0060		ccrB	FALSE	0.011	518.000	0.000	NA		NA
3678388	3678389	SAHV_0060	SAHV_0061	ccrB	ccrA	TRUE	0.993	22.000	1.000	0.002	Y	NA
3678389	3678390	SAHV_0061	SAHV_0062	ccrA		FALSE	0.242	234.000	0.000	NA	Y	NA
3678390	3678391	SAHV_0062	SAHV_0063			TRUE	0.981	0.000	0.750	NA		NA
3678391	3678392	SAHV_0063	SAHV_0064			FALSE	0.433	193.000	0.667	NA		NA
3678392	3678393	SAHV_0064	SAHV_0065		tnp	FALSE	0.037	251.000	0.000	NA		NA
3678393	3678394	SAHV_0065	SAHV_0066	tnp	tnp	FALSE	0.187	112.000	0.000	NA		NA
3678394	3678395	SAHV_0066	SAHV_0067	tnp		TRUE	0.910	-15.000	0.000	NA		NA
3678395	3678396	SAHV_0067	SAHV_0068			FALSE	0.011	511.000	0.000	NA		NA
3678396	3678397	SAHV_0068	SAHV_0069		kdpE	FALSE	0.012	1064.000	0.000	1.000		NA
3678397	3678398	SAHV_0069	SAHV_0070	kdpE	kdpD	TRUE	0.998	-25.000	1.000	1.000	Y	NA
3678399	3678400	SAHV_0071	SAHV_0072		kdpB	TRUE	0.974	19.000	0.012	0.003	Y	NA
3678400	3678401	SAHV_0072	SAHV_0073	kdpB	kdpC	TRUE	0.982	49.000	0.877	0.003	Y	NA
3678402	3678403	SAHV_0074	SAHV_0075			TRUE	0.959	10.000	1.000	NA		NA
3678405	3678406	SAHV_0077	SAHV_0078			TRUE	0.850	63.000	1.000	NA		NA
3678406	3678407	SAHV_0078	SAHV_0079			TRUE	0.895	45.000	1.000	NA		NA
3678408	3678409	SAHV_0080	SAHV_0081			FALSE	0.010	599.000	0.000	NA		NA
3678410	3678411	SAHV_0082	SAHV_0083			FALSE	0.020	422.000	0.000	1.000		NA
3678411	3678412	SAHV_0083	SAHV_0084			TRUE	0.834	0.000	0.000	NA		NA
3678413	3678414	SAHV_0085	SAHV_0086			TRUE	0.589	31.000	0.000	1.000		NA
3678414	3678415	SAHV_0086	SAHV_0087			TRUE	0.709	19.000	0.000	1.000		NA
3678417	3678418	SAHV_0089	SAHV_0090			FALSE	0.378	49.000	0.000	NA		NA
3678418	3678419	SAHV_0090	SAHV_0091			FALSE	0.066	199.000	0.000	NA		NA
3678419	3678420	SAHV_0091	SAHV_0092			FALSE	0.034	267.000	0.000	NA		NA
3678420	3678421	SAHV_0092	SAHV_0093			FALSE	0.337	57.000	0.000	NA		NA
3678421	3678422	SAHV_0093	SAHV_0094		plc	FALSE	0.062	206.000	0.000	NA		NA
3678422	3678423	SAHV_0094	SAHV_0095	plc		FALSE	0.050	221.000	0.000	NA		NA
3678423	3678424	SAHV_0095	SAHV_0096			FALSE	0.361	52.000	0.000	NA		NA
3678424	3678425	SAHV_0096	SAHV_0097			FALSE	0.275	68.000	0.000	NA		NA
3678425	3678426	SAHV_0097	SAHV_0098			FALSE	0.294	65.000	0.000	NA		NA
3678426	3678427	SAHV_0098	SAHV_0099			FALSE	0.282	67.000	0.000	NA		NA
3678427	3678428	SAHV_0099	SAHV_0100			FALSE	0.209	97.000	0.000	NA		NA
3678428	3678429	SAHV_0100	SAHV_0101			FALSE	0.168	151.000	0.000	1.000		NA
3678429	3678430	SAHV_0101	SAHV_0102			TRUE	0.838	2.000	0.000	1.000		NA
3678431	3678432	SAHV_0103	SAHV_0104			FALSE	0.215	92.000	0.000	NA		NA
3678432	3678433	SAHV_0104	SAHV_0105			FALSE	0.337	57.000	0.000	NA		NA
3678433	3678434	SAHV_0105	SAHV_0106			FALSE	0.094	174.000	0.000	NA		NA
3678435	3678436	SAHV_0107	SAHV_0108			FALSE	0.076	190.000	0.000	NA		NA
3678436	3678437	SAHV_0108	SAHV_0109		lctP	FALSE	0.035	262.000	0.000	NA		NA
3678438	3678439	SAHV_0110	SAHV_0111	spa	sarH1	FALSE	0.020	421.000	0.000	1.000		NA
3678439	3678440	SAHV_0111	SAHV_0112	sarH1	sirC	FALSE	0.025	369.000	0.000	1.000		NA
3678440	3678441	SAHV_0112	SAHV_0113	sirC	sirB	TRUE	0.879	78.000	0.091	0.048	Y	NA
3678441	3678442	SAHV_0113	SAHV_0114	sirB	sirA	TRUE	0.964	16.000	0.111	1.000	Y	NA
3678443	3678444	SAHV_0115	SAHV_0116			TRUE	0.994	-3.000	0.333	1.000	Y	NA
3678444	3678445	SAHV_0116	SAHV_0117			TRUE	0.881	21.000	0.171	1.000	N	NA
3678445	3678446	SAHV_0117	SAHV_0118			TRUE	0.976	-7.000	0.171	1.000	N	NA
3678446	3678447	SAHV_0118	SAHV_0119			TRUE	0.983	-10.000	0.278	1.000	N	NA
3678447	3678448	SAHV_0119	SAHV_0120			TRUE	0.998	-19.000	0.172	0.001	Y	NA
3678448	3678449	SAHV_0120	SAHV_0121			TRUE	0.987	-28.000	0.355	1.000	N	NA
3678449	3678450	SAHV_0121	SAHV_0122			TRUE	0.960	0.000	0.185	1.000	N	NA
3678450	3678451	SAHV_0122	SAHV_0123			TRUE	0.855	4.000	0.037	1.000	N	NA
3678451	3678452	SAHV_0123	SAHV_0124			FALSE	0.069	196.000	0.000	NA		NA
3678452	3678453	SAHV_0124	SAHV_0125		butA	FALSE	0.057	212.000	0.000	NA		NA
3678455	3678456	SAHV_0127	SAHV_0128			TRUE	0.986	-37.000	0.000	NA	Y	NA
3678456	3678457	SAHV_0128	SAHV_0129			FALSE	0.300	210.000	0.000	NA	Y	NA
3678457	3678458	SAHV_0129	SAHV_0130			TRUE	0.912	-19.000	0.000	NA		NA
3678458	3678459	SAHV_0130	SAHV_0131			TRUE	0.906	-10.000	0.000	NA		NA
3678459	3678460	SAHV_0131	SAHV_0132		sodM	FALSE	0.047	268.000	0.000	1.000		NA
3678460	3678461	SAHV_0132	SAHV_0133	sodM		FALSE	0.025	367.000	0.000	1.000		NA
3678463	3678464	SAHV_0135	SAHV_0136	pnp		TRUE	0.870	7.000	0.100	1.000	N	NA
3678464	3678465	SAHV_0136	SAHV_0137		dra	FALSE	0.376	81.000	0.013	1.000	N	NA
3678465	3678466	SAHV_0137	SAHV_0138	dra	drm	TRUE	0.812	28.000	0.000	0.059	N	NA
3678467	3678468	SAHV_0139	SAHV_0140			TRUE	0.998	-3.000	0.689	0.002	Y	NA
3678468	3678469	SAHV_0140	SAHV_0141			TRUE	0.996	2.000	0.654	0.002	Y	NA
3678469	3678470	SAHV_0141	SAHV_0142			TRUE	0.795	195.000	0.308	0.002	Y	NA
3678471	3678472	SAHV_0143	SAHV_0144			TRUE	0.609	51.000	0.091	NA		NA
3678472	3678473	SAHV_0144	SAHV_0145			FALSE	0.116	157.000	0.000	NA		NA
3678473	3678474	SAHV_0145	SAHV_0146			TRUE	0.893	6.000	0.182	NA		NA
3678474	3678475	SAHV_0146	SAHV_0147		adhE	FALSE	0.023	385.000	0.000	1.000	N	NA
3678475	3678476	SAHV_0147	SAHV_0148	adhE	capA	FALSE	0.028	343.000	0.000	1.000	N	NA
3678476	3678477	SAHV_0148	SAHV_0149	capA	capB	TRUE	0.725	16.000	0.000	1.000	N	NA
3678477	3678478	SAHV_0149	SAHV_0150	capB	capC	TRUE	0.804	3.000	0.000	1.000	N	NA
3678478	3678479	SAHV_0150	SAHV_0151	capC	capD	TRUE	0.983	20.000	0.667	1.000	Y	NA
3678479	3678480	SAHV_0151	SAHV_0152	capD	capE	TRUE	0.996	-10.000	1.000	0.019		NA
3678480	3678481	SAHV_0152	SAHV_0153	capE	capF	TRUE	0.767	13.000	0.019	1.000		NA
3678481	3678482	SAHV_0153	SAHV_0154	capF	capG	TRUE	0.993	4.000	0.477	0.004	Y	NA
3678482	3678483	SAHV_0154	SAHV_0155	capG	capH	TRUE	0.839	3.000	0.005	1.000		NA
3678483	3678484	SAHV_0155	SAHV_0156	capH	capI	TRUE	0.797	5.000	0.002	1.000		NA
3678484	3678485	SAHV_0156	SAHV_0157	capI	capJ	TRUE	0.921	14.000	0.000	NA	Y	NA
3678485	3678486	SAHV_0157	SAHV_0158	capJ	capK	TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3678486	3678487	SAHV_0158	SAHV_0159	capK	capL	TRUE	0.808	1.000	0.000	NA		NA
3678487	3678488	SAHV_0159	SAHV_0160	capL	capM	TRUE	0.935	11.000	0.015	NA	Y	NA
3678488	3678489	SAHV_0160	SAHV_0161	capM	capN	TRUE	0.990	0.000	0.297	NA	Y	NA
3678489	3678490	SAHV_0161	SAHV_0162	capN	capO	TRUE	0.834	54.000	0.009	1.000	Y	NA
3678490	3678491	SAHV_0162	SAHV_0163	capO	capP	TRUE	0.899	47.000	0.105	1.000	Y	NA
3678492	3678493	SAHV_0164	SAHV_0165			TRUE	0.662	7.000	0.000	NA		NA
3678494	3678495	SAHV_0166	SAHV_0167	aldA		FALSE	0.014	647.000	0.000	1.000	N	NA
3678496	3678497	SAHV_0168	SAHV_0169			TRUE	0.518	30.000	0.000	NA		NA
3678498	3678499	SAHV_0170	SAHV_0171			FALSE	0.020	342.000	0.000	NA		NA
3678499	3678500	SAHV_0171	SAHV_0172			TRUE	0.957	14.000	0.130	NA	Y	NA
3678500	3678501	SAHV_0172	SAHV_0173			TRUE	0.995	-3.000	0.652	NA	Y	NA
3678501	3678502	SAHV_0173	SAHV_0174			TRUE	0.785	13.000	0.032	1.000	N	NA
3678502	3678503	SAHV_0174	SAHV_0175			FALSE	0.048	226.000	0.000	NA		NA
3678503	3678504	SAHV_0175	SAHV_0176		fdh	FALSE	0.249	75.000	0.000	NA		NA
3678504	3678505	SAHV_0176	SAHV_0177	fdh		FALSE	0.023	386.000	0.000	1.000		NA
3678505	3678506	SAHV_0177	SAHV_0178			FALSE	0.033	447.000	0.049	1.000		NA
3678506	3678507	SAHV_0178	SAHV_0179			TRUE	0.918	13.000	0.333	1.000	N	NA
3678508	3678509	SAHV_0180	SAHV_0181			FALSE	0.037	255.000	0.000	NA		NA
3678509	3678510	SAHV_0181	SAHV_0182		argJ	TRUE	0.975	16.000	0.008	0.004	Y	NA
3678510	3678511	SAHV_0182	SAHV_0183	argJ	argC	TRUE	0.987	12.000	0.303	0.004	Y	NA
3678511	3678512	SAHV_0183	SAHV_0184	argC		TRUE	0.871	39.000	0.004	1.000	Y	NA
3678512	3678513	SAHV_0184	SAHV_0185			FALSE	0.232	259.000	0.000	1.000	Y	NA
3678513	3678514	SAHV_0185	SAHV_0186			FALSE	0.041	279.000	0.000	1.000	N	NA
3678514	3678515	SAHV_0186	SAHV_0187			FALSE	0.210	127.000	0.000	1.000	N	NA
3678515	3678516	SAHV_0187	SAHV_0188		glcA	FALSE	0.213	272.000	0.000	1.000	Y	NA
3678517	3678518	SAHV_0189	SAHV_0190			TRUE	0.974	-3.000	0.234	1.000		NA
3678518	3678519	SAHV_0190	SAHV_0191			TRUE	0.905	12.000	0.250	1.000		NA
3678519	3678520	SAHV_0191	SAHV_0192			TRUE	0.909	3.000	0.100	1.000	N	NA
3678524	3678525	SAHV_0196	SAHV_0197			TRUE	0.985	-3.000	0.652	NA	N	NA
3678525	3678526	SAHV_0197	SAHV_0198			TRUE	0.994	-3.000	0.372	1.000	Y	NA
3678526	3678527	SAHV_0198	SAHV_0199			FALSE	0.061	207.000	0.000	NA		NA
3678527	3678528	SAHV_0199	SAHV_0200			FALSE	0.434	38.000	0.000	NA		NA
3678528	3678529	SAHV_0200	SAHV_0201			FALSE	0.324	59.000	0.000	NA		NA
3678529	3678530	SAHV_0201	SAHV_0202			TRUE	0.617	12.000	0.000	NA		NA
3678530	3678531	SAHV_0202	SAHV_0203			TRUE	0.909	-13.000	0.000	NA		NA
3678533	3678534	SAHV_0205	SAHV_0206			TRUE	0.993	6.000	0.833	0.047	Y	NA
3678534	3678535	SAHV_0206	SAHV_0207		rlp	TRUE	0.977	17.000	0.833	0.047		NA
3678535	3678536	SAHV_0207	SAHV_0208	rlp		TRUE	0.522	38.000	0.000	1.000		NA
3678537	3678538	SAHV_0209	SAHV_0210			FALSE	0.078	189.000	0.000	NA		NA
3678539	3678540	SAHV_0211	SAHV_0212		msmX	FALSE	0.023	384.000	0.000	1.000		NA
3678540	3678541	SAHV_0212	SAHV_0213	msmX		TRUE	0.928	13.000	0.000	1.000	Y	NA
3678541	3678542	SAHV_0213	SAHV_0214			TRUE	0.991	3.000	0.800	1.000	Y	NA
3678542	3678543	SAHV_0214	SAHV_0215			TRUE	0.996	2.000	0.909	0.047	Y	NA
3678543	3678544	SAHV_0215	SAHV_0216			FALSE	0.339	71.000	0.000	1.000		NA
3678544	3678545	SAHV_0216	SAHV_0217			TRUE	0.848	25.000	0.000	0.028		NA
3678545	3678546	SAHV_0217	SAHV_0218			TRUE	0.611	55.000	0.111	NA		NA
3678548	3678549	SAHV_0220	SAHV_0221	uhpT	uhpT	TRUE	0.904	4.000	0.000	0.047		NA
3678550	3678551	SAHV_0222	SAHV_0223			TRUE	0.989	-7.000	0.167	0.014		NA
3678551	3678552	SAHV_0223	SAHV_0224			TRUE	0.969	-3.000	0.167	1.000	N	NA
3678553	3678554	SAHV_0225	SAHV_0226	pflB	pflA	TRUE	0.853	23.000	0.135	1.000	N	NA
3678554	3678555	SAHV_0226	SAHV_0227	pflA		FALSE	0.033	322.000	0.000	1.000	N	NA
3678558	3678559	SAHV_0230	SAHV_0231			TRUE	0.972	30.000	0.588	1.000	Y	NA
3678559	3678560	SAHV_0231	SAHV_0232			FALSE	0.453	186.000	0.012	1.000	Y	NA
3678560	3678561	SAHV_0232	SAHV_0233			TRUE	0.720	112.000	0.046	1.000	Y	NA
3678561	3678562	SAHV_0233	SAHV_0234			TRUE	0.961	26.000	0.046	0.068	Y	NA
3678564	3678565	SAHV_0236	SAHV_0237			FALSE	0.067	198.000	0.000	NA		NA
3678565	3678566	SAHV_0237	SAHV_0238			FALSE	0.116	157.000	0.000	NA		NA
3678566	3678567	SAHV_0238	SAHV_0239			TRUE	0.928	26.000	0.667	NA		NA
3678570	3678571	SAHV_0242	SAHV_0243			FALSE	0.029	337.000	0.000	1.000	N	NA
3678571	3678572	SAHV_0243	SAHV_0244			TRUE	0.993	-15.000	0.308	0.015	N	NA
3678572	3678573	SAHV_0244	SAHV_0245			TRUE	0.979	23.000	0.148	0.012	Y	NA
3678573	3678574	SAHV_0245	SAHV_0246		gatC	TRUE	0.608	227.000	0.148	0.012	Y	NA
3678574	3678575	SAHV_0246	SAHV_0247	gatC		TRUE	0.860	18.000	0.103	1.000	N	NA
3678575	3678576	SAHV_0247	SAHV_0248			TRUE	0.912	2.000	0.103	NA		NA
3678576	3678577	SAHV_0248	SAHV_0249			TRUE	0.840	24.000	0.158	NA		NA
3678577	3678578	SAHV_0249	SAHV_0250			FALSE	0.015	528.000	0.000	1.000	N	NA
3678578	3678579	SAHV_0250	SAHV_0251			TRUE	0.985	-7.000	0.367	1.000	N	NA
3678579	3678580	SAHV_0251	SAHV_0252			TRUE	0.866	22.000	0.148	1.000	N	NA
3678580	3678581	SAHV_0252	SAHV_0253			FALSE	0.210	428.000	0.000	0.003	Y	NA
3678581	3678582	SAHV_0253	SAHV_0254			FALSE	0.044	276.000	0.000	1.000	N	NA
3678582	3678583	SAHV_0254	SAHV_0255			TRUE	0.985	-7.000	0.367	1.000	N	NA
3678583	3678584	SAHV_0255	SAHV_0256			TRUE	0.866	22.000	0.148	1.000	N	NA
3678584	3678585	SAHV_0256	SAHV_0257			TRUE	0.739	33.000	0.125	NA		NA
3678585	3678586	SAHV_0257	SAHV_0258		scdA	FALSE	0.133	144.000	0.000	NA		NA
3678586	3678587	SAHV_0258	SAHV_0259	scdA	lytS	FALSE	0.038	245.000	0.000	NA	N	NA
3678587	3678588	SAHV_0259	SAHV_0260	lytS	lytR	TRUE	0.994	3.000	0.538	0.014	Y	NA
3678588	3678589	SAHV_0260	SAHV_0261	lytR	lrgA	TRUE	0.499	119.000	0.178	1.000		NA
3678589	3678590	SAHV_0261	SAHV_0262	lrgA	lrgB	TRUE	0.992	-7.000	0.869	1.000		NA
3678592	3678593	SAHV_0264	SAHV_0265		bglA	TRUE	0.938	16.000	0.000	1.000	Y	NA
3678594	3678595	SAHV_0266	SAHV_0267		rbsK	FALSE	0.052	251.000	0.000	1.000	N	NA
3678595	3678596	SAHV_0267	SAHV_0268	rbsK	rbsD	TRUE	0.926	28.000	0.030	1.000	Y	NA
3678596	3678597	SAHV_0268	SAHV_0269	rbsD		TRUE	0.980	15.000	0.045	0.002	Y	NA
3678597	3678598	SAHV_0269	SAHV_0270			FALSE	0.062	232.000	0.000	1.000	N	NA
3678601	3678602	SAHV_0273	SAHV_0274		lytM	FALSE	0.032	326.000	0.000	1.000		NA
3678603	3678604	SAHV_0275	SAHV_0276			TRUE	0.951	14.000	0.833	NA		NA
3678604	3678605	SAHV_0276	SAHV_0277			TRUE	0.983	-3.000	0.571	NA		NA
3678605	3678606	SAHV_0277	SAHV_0278			TRUE	0.730	68.000	0.429	NA		NA
3678606	3678607	SAHV_0278	SAHV_0279			FALSE	0.022	331.000	0.000	NA		NA
3678608	3678609	SAHV_0280	SAHV_0281			FALSE	0.369	83.000	0.041	NA		NA
3678609	3678610	SAHV_0281	SAHV_0282			TRUE	0.964	0.000	0.286	NA		NA
3678610	3678611	SAHV_0282	SAHV_0283			TRUE	0.980	-28.000	0.237	NA		NA
3678611	3678612	SAHV_0283	SAHV_0284			TRUE	0.947	13.000	0.833	NA		NA
3678612	3678613	SAHV_0284	SAHV_0285			TRUE	0.934	22.000	0.623	NA		NA
3678613	3678614	SAHV_0285	SAHV_0286			TRUE	0.518	30.000	0.000	NA		NA
3678614	3678615	SAHV_0286	SAHV_0287			TRUE	0.653	16.000	0.000	NA		NA
3678615	3678616	SAHV_0287	SAHV_0288			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3678616	3678617	SAHV_0288	SAHV_0289			TRUE	0.834	0.000	0.000	NA		NA
3678617	3678618	SAHV_0289	SAHV_0290			TRUE	0.642	10.000	0.000	NA		NA
3678618	3678619	SAHV_0290	SAHV_0291			TRUE	0.632	11.000	0.000	NA		NA
3678619	3678620	SAHV_0291	SAHV_0292			FALSE	0.064	203.000	0.000	NA		NA
3678620	3678621	SAHV_0292	SAHV_0293			FALSE	0.131	146.000	0.000	NA		NA
3678621	3678622	SAHV_0293	SAHV_0294			FALSE	0.145	135.000	0.000	NA		NA
3678622	3678623	SAHV_0294	SAHV_0295			FALSE	0.150	132.000	0.000	NA		NA
3678623	3678624	SAHV_0295	SAHV_0296			TRUE	0.902	11.000	0.286	NA		NA
3678624	3678625	SAHV_0296	SAHV_0297			TRUE	0.902	11.000	0.286	NA		NA
3678625	3678626	SAHV_0297	SAHV_0298			TRUE	0.766	49.000	0.286	NA		NA
3678626	3678627	SAHV_0298	SAHV_0299			TRUE	0.902	11.000	0.286	NA		NA
3678627	3678628	SAHV_0299	SAHV_0300			FALSE	0.010	625.000	0.000	NA		NA
3678628	3678629	SAHV_0300	SAHV_0301			FALSE	0.127	150.000	0.000	NA		NA
3678630	3678631	SAHV_0302	SAHV_0303			FALSE	0.058	237.000	0.000	1.000	N	NA
3678632	3678633	SAHV_0304	SAHV_0305			FALSE	0.053	249.000	0.000	1.000		NA
3678633	3678634	SAHV_0305	SAHV_0306			TRUE	0.918	13.000	0.333	1.000	N	NA
3678634	3678635	SAHV_0306	SAHV_0307			FALSE	0.059	208.000	0.000	NA	N	NA
3678635	3678636	SAHV_0307	SAHV_0308			FALSE	0.125	343.000	0.000	NA	Y	NA
3678636	3678637	SAHV_0308	SAHV_0309			TRUE	0.964	-25.000	0.085	NA	N	NA
3678637	3678638	SAHV_0309	SAHV_0310			TRUE	0.700	11.000	0.008	NA	N	NA
3678639	3678640	SAHV_0311	SAHV_0312		nanA	TRUE	0.916	40.000	0.130	1.000	Y	NA
3678646	3678647	SAHV_0318	SAHV_0319			TRUE	0.552	73.000	0.000	0.067	N	NA
3678648	3678649	SAHV_0320	SAHV_0321			TRUE	0.898	34.000	0.571	1.000	N	NA
3678649	3678650	SAHV_0321	SAHV_0322			TRUE	0.924	1.000	0.107	NA		NA
3678650	3678651	SAHV_0322	SAHV_0323			TRUE	0.982	-13.000	0.286	NA		NA
3678651	3678652	SAHV_0323	SAHV_0324			TRUE	0.984	-22.000	0.250	1.000	N	NA
3678652	3678653	SAHV_0324	SAHV_0325			FALSE	0.033	316.000	0.000	1.000	N	NA
3678654	3678655	SAHV_0326	SAHV_0327			TRUE	0.952	15.000	0.182	0.012		NA
3678655	3678656	SAHV_0327	SAHV_0328			TRUE	0.987	2.000	0.026	0.012	Y	NA
3678656	3678657	SAHV_0328	SAHV_0329			TRUE	0.960	5.000	0.182	0.015	N	NA
3678658	3678659	SAHV_0330	SAHV_0331			TRUE	0.750	107.000	0.800	1.000	N	NA
3678659	3678660	SAHV_0331	SAHV_0332			FALSE	0.199	104.000	0.000	NA		NA
3678661	3678662	SAHV_0333	SAHV_0334	glpT	glpT	TRUE	0.685	52.000	0.000	0.046		NA
3678663	3678664	SAHV_0335	SAHV_0336			TRUE	0.708	14.000	0.000	1.000		NA
3678664	3678665	SAHV_0336	SAHV_0337			TRUE	0.911	14.000	0.259	1.000		NA
3678667	3678668	SAHV_0339	SAHV_0340			FALSE	0.033	267.000	0.000	NA	N	NA
3678668	3678669	SAHV_0340	SAHV_0341			TRUE	0.889	111.000	0.812	NA	Y	NA
3678669	3678670	SAHV_0341	SAHV_0342			TRUE	0.992	-22.000	0.119	NA	Y	NA
3678671	3678672	SAHV_0343	SAHV_0344			TRUE	0.922	56.000	0.393	NA	Y	NA
3678672	3678673	SAHV_0344	SAHV_0345			FALSE	0.193	108.000	0.000	NA		NA
3678674	3678675	SAHV_0346	SAHV_0347			TRUE	0.977	-3.000	0.362	NA		NA
3678675	3678676	SAHV_0347	SAHV_0348			TRUE	0.825	25.000	0.143	NA		NA
3678676	3678677	SAHV_0348	SAHV_0349			TRUE	0.975	0.000	0.371	1.000		NA
3678680	3678681	SAHV_0352	SAHV_0353		metE	TRUE	0.500	43.000	0.011	NA		NA
3678681	3678682	SAHV_0353	SAHV_0354	metE		TRUE	0.986	-3.000	0.030	1.000	Y	NA
3678682	3678683	SAHV_0354	SAHV_0355			TRUE	0.994	-31.000	0.162	1.000	Y	NA
3678683	3678684	SAHV_0355	SAHV_0356			TRUE	0.998	-3.000	0.600	0.006	Y	NA
3678685	3678686	SAHV_0357	SAHV_0358			FALSE	0.198	154.000	0.007	1.000	N	NA
3678686	3678687	SAHV_0358	SAHV_0359			TRUE	0.807	30.000	0.171	NA		NA
3678687	3678688	SAHV_0359	SAHV_0360			TRUE	0.787	12.000	0.064	NA		NA
3678690	3678691	SAHV_0362	SAHV_0363	rpsF	ssb	TRUE	0.742	21.000	0.007	1.000	N	NA
3678691	3678692	SAHV_0363	SAHV_0364	ssb	rpsR	TRUE	0.505	52.000	0.007	1.000	N	NA
3678693	3678694	SAHV_0365	SAHV_0366			FALSE	0.361	52.000	0.000	NA		NA
3678695	3678696	SAHV_0367	SAHV_0368			FALSE	0.018	369.000	0.000	NA		NA
3678696	3678697	SAHV_0368	SAHV_0369			FALSE	0.085	181.000	0.000	NA		NA
3678702	3678703	SAHV_0374	SAHV_0375			FALSE	0.033	270.000	0.000	NA		NA
3678703	3678704	SAHV_0375	SAHV_0376			FALSE	0.258	73.000	0.000	NA		NA
3678704	3678705	SAHV_0376	SAHV_0377		ahpF	FALSE	0.087	180.000	0.000	NA		NA
3678705	3678706	SAHV_0377	SAHV_0378	ahpF	ahpC	TRUE	0.983	16.000	0.551	1.000	Y	NA
3678710	3678711	SAHV_0382	SAHV_0383			TRUE	0.716	118.000	0.857	NA		NA
3678711	3678712	SAHV_0383	SAHV_0384			TRUE	0.647	143.000	0.857	NA		NA
3678713	3678714	SAHV_0385	SAHV_0386	xprT	pbuX	TRUE	0.982	0.000	0.037	1.000	Y	NA
3678714	3678715	SAHV_0386	SAHV_0387	pbuX	guaB	TRUE	0.919	38.000	1.000	1.000		NA
3678715	3678716	SAHV_0387	SAHV_0388	guaB	guaA	TRUE	0.908	25.000	0.007	0.001		NA
3678717	3678718	SAHV_0389	SAHV_0390	int		TRUE	0.833	27.000	0.176	NA		NA
3678718	3678719	SAHV_0390	SAHV_0391			FALSE	0.011	498.000	0.000	NA		NA
3678719	3678720	SAHV_0391	SAHV_0392			TRUE	0.989	-3.000	1.000	NA		NA
3678720	3678721	SAHV_0392	SAHV_0393			TRUE	0.645	129.000	0.667	NA		NA
3678723	3678724	SAHV_0395	SAHV_0396	tetM		FALSE	0.017	377.000	0.000	NA		NA
3678724	3678725	SAHV_0396	SAHV_0397			TRUE	0.991	-16.000	0.800	NA		NA
3678725	3678726	SAHV_0397	SAHV_0398			TRUE	0.987	-3.000	0.800	NA		NA
3678726	3678727	SAHV_0398	SAHV_0399			TRUE	0.984	-3.000	0.600	NA		NA
3678727	3678728	SAHV_0399	SAHV_0400			TRUE	0.989	-16.000	0.600	NA		NA
3678728	3678729	SAHV_0400	SAHV_0401			TRUE	0.822	30.000	0.200	NA		NA
3678729	3678730	SAHV_0401	SAHV_0402			TRUE	0.689	56.000	0.200	NA		NA
3678730	3678731	SAHV_0402	SAHV_0403			TRUE	0.663	61.000	0.200	NA		NA
3678731	3678732	SAHV_0403	SAHV_0404			TRUE	0.751	42.000	0.200	NA		NA
3678732	3678733	SAHV_0404	SAHV_0405			FALSE	0.029	284.000	0.000	NA		NA
3678733	3678734	SAHV_0405	SAHV_0406			TRUE	0.533	182.000	0.800	1.000		NA
3678734	3678735	SAHV_0406	SAHV_0407			TRUE	0.913	22.000	0.400	NA		NA
3678735	3678736	SAHV_0407	SAHV_0408			TRUE	0.949	10.000	0.750	NA		NA
3678736	3678737	SAHV_0408	SAHV_0409			TRUE	0.933	21.000	0.571	NA		NA
3678737	3678738	SAHV_0409	SAHV_0410			FALSE	0.186	200.000	0.133	NA		NA
3678738	3678739	SAHV_0410	SAHV_0411			TRUE	0.996	-3.000	0.341	0.066	Y	NA
3678739	3678740	SAHV_0411	SAHV_0412		tnp	TRUE	0.707	134.000	0.000	0.066	Y	NA
3678740	3678741	SAHV_0412	SAHV_0413	tnp		FALSE	0.011	494.000	0.000	NA		NA
3678741	3678742	SAHV_0413	SAHV_0414			FALSE	0.015	392.000	0.000	NA		NA
3678742	3678743	SAHV_0414	SAHV_0415			FALSE	0.052	399.000	0.000	0.066		NA
3678743	3678744	SAHV_0415	SAHV_0416			FALSE	0.042	237.000	0.000	NA		NA
3678744	3678745	SAHV_0416	SAHV_0417			FALSE	0.011	532.000	0.000	NA		NA
3678745	3678746	SAHV_0417	SAHV_0418			TRUE	0.631	19.000	0.000	NA		NA
3678747	3678748	SAHV_0419	SAHV_0420	set6	set7	FALSE	0.109	286.000	0.000	0.020		NA
3678748	3678749	SAHV_0420	SAHV_0421	set7	set8	FALSE	0.107	291.000	0.000	0.020		NA
3678749	3678750	SAHV_0421	SAHV_0422	set8	set9	FALSE	0.074	364.000	0.000	0.020		NA
3678750	3678751	SAHV_0422	SAHV_0423	set9	set10	FALSE	0.074	364.000	0.000	0.020		NA
3678751	3678752	SAHV_0423	SAHV_0424	set10	set11	FALSE	0.053	446.000	0.000	0.020		NA
3678752	3678753	SAHV_0424	SAHV_0425	set11	set12	FALSE	0.083	339.000	0.000	0.020		NA
3678753	3678754	SAHV_0425	SAHV_0426	set12	set13	FALSE	0.068	377.000	0.000	0.020		NA
3678754	3678755	SAHV_0426	SAHV_0427	set13	set14	FALSE	0.073	366.000	0.000	0.020		NA
3678755	3678756	SAHV_0427	SAHV_0428	set14		FALSE	0.354	53.000	0.000	NA		NA
3678756	3678757	SAHV_0428	SAHV_0429		hsdM	FALSE	0.354	53.000	0.000	NA		NA
3678757	3678758	SAHV_0429	SAHV_0430	hsdM	hsdS	TRUE	0.995	-7.000	0.083	0.066	Y	NA
3678758	3678759	SAHV_0430	SAHV_0431	hsdS	set15	FALSE	0.023	383.000	0.000	1.000		NA
3678759	3678760	SAHV_0431	SAHV_0432	set15		TRUE	0.686	22.000	0.000	1.000		NA
3678762	3678763	SAHV_0434	SAHV_0435	lpl1	lpl2	TRUE	0.501	31.000	0.000	NA		NA
3678763	3678764	SAHV_0435	SAHV_0436	lpl2	lpl3	FALSE	0.398	45.000	0.000	NA		NA
3678764	3678765	SAHV_0436	SAHV_0437	lpl3		FALSE	0.023	324.000	0.000	NA		NA
3678765	3678766	SAHV_0437	SAHV_0438			FALSE	0.315	61.000	0.000	NA		NA
3678766	3678767	SAHV_0438	SAHV_0439		lpl5	TRUE	0.631	19.000	0.000	NA		NA
3678767	3678768	SAHV_0439	SAHV_0440	lpl5	lpl6	FALSE	0.337	57.000	0.000	NA		NA
3678768	3678769	SAHV_0440	SAHV_0441	lpl6	lpl7	FALSE	0.361	52.000	0.000	NA		NA
3678769	3678770	SAHV_0441	SAHV_0442	lpl7	lpl8	TRUE	0.631	19.000	0.000	NA		NA
3678770	3678771	SAHV_0442	SAHV_0443	lpl8	lpl9	FALSE	0.089	179.000	0.000	NA		NA
3678771	3678772	SAHV_0443	SAHV_0444	lpl9		TRUE	0.906	-10.000	0.000	NA		NA
3678772	3678773	SAHV_0444	SAHV_0445			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3678773	3678774	SAHV_0445	SAHV_0446			TRUE	0.631	19.000	0.000	NA		NA
3678778	3678779	SAHV_0450	SAHV_0451	ndhF		TRUE	0.900	13.000	0.303	NA		NA
3678779	3678780	SAHV_0451	SAHV_0452			FALSE	0.233	162.000	0.076	NA		NA
3678782	3678783	SAHV_0454	SAHV_0455			TRUE	0.830	37.000	0.273	1.000		NA
3678783	3678784	SAHV_0455	SAHV_0456			FALSE	0.025	369.000	0.000	1.000		NA
3678784	3678785	SAHV_0456	SAHV_0457		cysM	FALSE	0.108	217.000	0.024	1.000		NA
3678785	3678786	SAHV_0457	SAHV_0458	cysM	yrhB	TRUE	0.998	-7.000	0.690	0.018	Y	NA
3678786	3678787	SAHV_0458	SAHV_0459	yrhB		FALSE	0.037	295.000	0.000	1.000	N	NA
3678787	3678788	SAHV_0459	SAHV_0460			TRUE	0.986	4.000	0.487	1.000	Y	NA
3678788	3678789	SAHV_0460	SAHV_0461			TRUE	0.846	37.000	0.000	NA	Y	NA
3678789	3678790	SAHV_0461	SAHV_0462		sle1	FALSE	0.022	332.000	0.000	NA		NA
3678792	3678793	SAHV_0464	SAHV_0465			TRUE	0.976	-10.000	0.150	1.000		NA
3678794	3678795	SAHV_0466	SAHV_0467			TRUE	0.988	-3.000	0.957	NA		NA
3678795	3678796	SAHV_0467	SAHV_0468		gltC	FALSE	0.367	121.000	0.106	NA		NA
3678797	3678798	SAHV_0469	SAHV_0470	gltB	gltD	TRUE	0.987	18.000	0.222	0.002	Y	NA
3678798	3678799	SAHV_0470	SAHV_t0003	gltD		FALSE	0.034	269.000	0.000	NA		NA
3678799	3678800	SAHV_t0003	SAHV_0471		treP	FALSE	0.012	469.000	0.000	NA		NA
3678800	3678801	SAHV_0471	SAHV_0472	treP		TRUE	0.936	64.000	0.650	1.000	Y	NA
3678801	3678802	SAHV_0472	SAHV_0473			TRUE	0.908	25.000	0.336	1.000	N	NA
3678802	3678803	SAHV_0473	SAHV_0474			FALSE	0.014	643.000	0.000	1.000		NA
3678803	3678804	SAHV_0474	SAHV_0475		dnaX	TRUE	0.563	69.000	0.103	1.000		NA
3678804	3678805	SAHV_0475	SAHV_0476	dnaX		FALSE	0.404	90.000	0.071	NA		NA
3678805	3678806	SAHV_0476	SAHV_0477		recR	TRUE	0.947	7.000	0.604	NA		NA
3678806	3678807	SAHV_0477	SAHV_r0001	recR		FALSE	0.009	860.000	0.000	NA		NA
3678807	3678808	SAHV_r0001	SAHV_r0002			FALSE	0.018	365.000	0.000	NA		NA
3678808	3678809	SAHV_r0002	SAHV_r0003			FALSE	0.258	73.000	0.000	NA		NA
3678809	3678810	SAHV_r0003	SAHV_0478			FALSE	0.009	903.000	0.000	NA		NA
3678810	3678811	SAHV_0478	SAHV_0479		tmk	TRUE	0.872	2.000	0.010	1.000	N	NA
3678811	3678812	SAHV_0479	SAHV_0480	tmk		TRUE	0.693	28.000	0.038	NA		NA
3678812	3678813	SAHV_0480	SAHV_0481		holB	FALSE	0.085	214.000	0.021	NA		NA
3678813	3678814	SAHV_0481	SAHV_0482	holB		FALSE	0.430	169.000	0.372	NA		NA
3678814	3678815	SAHV_0482	SAHV_0483			TRUE	0.969	-4.000	0.183	NA		NA
3678815	3678816	SAHV_0483	SAHV_0484			FALSE	0.121	274.000	0.193	NA		NA
3678816	3678817	SAHV_0484	SAHV_0485			TRUE	0.979	-7.000	0.209	1.000		NA
3678817	3678818	SAHV_0485	SAHV_0486			TRUE	0.900	2.000	0.041	1.000		NA
3678818	3678819	SAHV_0486	SAHV_0487		metS	FALSE	0.056	285.000	0.018	1.000		NA
3678819	3678820	SAHV_0487	SAHV_0488	metS		TRUE	0.819	31.000	0.221	NA	N	NA
3678820	3678821	SAHV_0488	SAHV_0489			TRUE	0.546	167.000	0.058	NA	Y	NA
3678821	3678822	SAHV_0489	SAHV_0490		ksgA	TRUE	0.849	11.000	0.093	1.000	N	NA
3678822	3678823	SAHV_0490	SAHV_0491	ksgA	veg	FALSE	0.321	100.000	0.035	NA		NA
3678823	3678824	SAHV_0491	SAHV_0492	veg		FALSE	0.048	310.000	0.046	NA		NA
3678824	3678825	SAHV_0492	SAHV_0493		purR	TRUE	0.826	14.000	0.062	1.000	N	NA
3678825	3678826	SAHV_0493	SAHV_0494	purR		TRUE	0.896	17.000	0.227	NA	N	NA
3678826	3678827	SAHV_0494	SAHV_0495		spoVG	TRUE	0.668	48.000	0.131	NA	N	NA
3678827	3678828	SAHV_0495	SAHV_0496	spoVG	gcaD	FALSE	0.119	407.000	0.003	1.000	Y	NA
3678828	3678829	SAHV_0496	SAHV_0497	gcaD	prs	FALSE	0.304	147.000	0.069	1.000	N	NA
3678829	3678830	SAHV_0497	SAHV_0498	prs	rplY	FALSE	0.244	150.000	0.027	1.000	N	NA
3678830	3678831	SAHV_0498	SAHV_0499	rplY	pth	TRUE	0.554	311.000	0.496	0.034	Y	NA
3678831	3678832	SAHV_0499	SAHV_0500	pth	mfd	TRUE	0.952	0.000	0.137	1.000	N	NA
3678832	3678833	SAHV_0500	SAHV_0501	mfd		TRUE	0.957	-10.000	0.033	1.000		NA
3678833	3678834	SAHV_0501	SAHV_0502			TRUE	0.933	0.000	0.058	1.000		NA
3678834	3678835	SAHV_0502	SAHV_0503			TRUE	0.948	-3.000	0.054	1.000		NA
3678835	3678836	SAHV_0503	SAHV_0504			TRUE	0.826	18.000	0.053	1.000	N	NA
3678836	3678837	SAHV_0504	SAHV_0505			FALSE	0.492	105.000	0.134	1.000	N	NA
3678837	3678838	SAHV_0505	SAHV_0506			FALSE	0.179	180.000	0.031	1.000	N	NA
3678838	3678839	SAHV_0506	SAHV_0507			TRUE	0.931	5.000	0.067	0.055	N	NA
3678839	3678840	SAHV_0507	SAHV_0508		ftsH	FALSE	0.157	257.000	0.192	1.000	N	NA
3678840	3678841	SAHV_0508	SAHV_0509	ftsH		FALSE	0.348	228.000	0.041	1.000	Y	NA
3678841	3678842	SAHV_0509	SAHV_0510		cysK	FALSE	0.207	179.000	0.053	1.000	N	NA
3678842	3678843	SAHV_0510	SAHV_0511	cysK	folP	FALSE	0.090	216.000	0.005	1.000	N	NA
3678843	3678844	SAHV_0511	SAHV_0512	folP	folB	TRUE	0.991	-22.000	0.024	1.000	Y	NA
3678844	3678845	SAHV_0512	SAHV_0513	folB	folK	TRUE	0.991	-3.000	0.142	1.000	Y	NA
3678845	3678846	SAHV_0513	SAHV_0514	folK	lysS	FALSE	0.015	539.000	0.000	1.000	N	NA
3678846	3678847	SAHV_0514	SAHV_r0004	lysS		FALSE	0.010	558.000	0.000	NA		NA
3678847	3678848	SAHV_r0004	SAHV_t0004			TRUE	0.614	13.000	0.000	NA		NA
3678848	3678849	SAHV_t0004	SAHV_t0005			TRUE	0.650	17.000	0.000	NA		NA
3678849	3678850	SAHV_t0005	SAHV_t0006			TRUE	0.676	6.000	0.000	NA		NA
3678850	3678851	SAHV_t0006	SAHV_t0007			TRUE	0.518	30.000	0.000	NA		NA
3678851	3678852	SAHV_t0007	SAHV_t0008			TRUE	0.662	7.000	0.000	NA		NA
3678852	3678853	SAHV_t0008	SAHV_t0009			TRUE	0.692	5.000	0.000	NA		NA
3678853	3678854	SAHV_t0009	SAHV_t0010			TRUE	0.615	21.000	0.000	NA		NA
3678854	3678855	SAHV_t0010	SAHV_t0011			TRUE	0.622	20.000	0.000	NA		NA
3678855	3678856	SAHV_t0011	SAHV_r0005			FALSE	0.171	120.000	0.000	NA		NA
3678856	3678857	SAHV_r0005	SAHV_t0012			FALSE	0.215	92.000	0.000	NA		NA
3678857	3678858	SAHV_t0012	SAHV_r0006			FALSE	0.107	166.000	0.000	NA		NA
3678858	3678859	SAHV_r0006	SAHV_r0007			FALSE	0.258	73.000	0.000	NA		NA
3678861	3678862	SAHV_0516	SAHV_0517			TRUE	0.984	4.000	0.488	NA	Y	NA
3678864	3678865	SAHV_0519	SAHV_0520	ctsR		TRUE	0.945	19.000	0.681	NA		NA
3678865	3678866	SAHV_0520	SAHV_0521			TRUE	0.992	-10.000	0.848	1.000		NA
3678866	3678867	SAHV_0521	SAHV_0522		clpC	TRUE	0.933	14.000	0.425	1.000	N	NA
3678867	3678868	SAHV_0522	SAHV_0523	clpC	radA	FALSE	0.223	485.000	0.062	0.011	Y	NA
3678868	3678869	SAHV_0523	SAHV_0524	radA		TRUE	0.748	25.000	0.056	NA		NA
3678869	3678870	SAHV_0524	SAHV_0525		gltX	FALSE	0.016	557.000	0.021	NA		NA
3678870	3678871	SAHV_0525	SAHV_0526	gltX	cysE	FALSE	0.025	429.000	0.008	1.000	N	NA
3678871	3678872	SAHV_0526	SAHV_0527	cysE	cysS	TRUE	0.982	-16.000	0.039	0.054	N	NA
3678872	3678873	SAHV_0527	SAHV_0528	cysS	cysS	TRUE	0.971	-7.000	0.129	1.000		NA
3678873	3678874	SAHV_0528	SAHV_0529	cysS		TRUE	0.953	8.000	0.150	0.004		NA
3678874	3678875	SAHV_0529	SAHV_0530			TRUE	0.936	0.000	0.109	NA		NA
3678875	3678876	SAHV_0530	SAHV_0531			FALSE	0.365	81.000	0.036	NA		NA
3678876	3678877	SAHV_0531	SAHV_0532		secE	FALSE	0.033	314.000	0.000	1.000	N	NA
3678877	3678878	SAHV_0532	SAHV_0533	secE	nusG	TRUE	0.954	13.000	0.843	1.000	N	NA
3678878	3678879	SAHV_0533	SAHV_0534	nusG		FALSE	0.139	138.000	0.000	NA		NA
3678879	3678880	SAHV_0534	SAHV_0535		rplK	TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3678880	3678881	SAHV_0535	SAHV_0536	rplK	rplA	TRUE	0.816	208.000	0.838	0.029	Y	NA
3678881	3678882	SAHV_0536	SAHV_0537	rplA	rplJ	TRUE	0.567	272.000	0.302	0.029	Y	NA
3678882	3678883	SAHV_0537	SAHV_0538	rplJ	rplL	TRUE	0.981	43.000	0.884	0.022	Y	NA
3678883	3678884	SAHV_0538	SAHV_0539	rplL		TRUE	0.538	175.000	0.050	1.000	Y	NA
3678884	3678885	SAHV_0539	SAHV_0540		rpoB	FALSE	0.095	215.000	0.008	1.000	N	NA
3678885	3678886	SAHV_0540	SAHV_0541	rpoB	rpoC	TRUE	0.937	137.000	0.851	0.002	Y	NA
3678886	3678887	SAHV_0541	SAHV_0542	rpoC		FALSE	0.273	137.000	0.065	NA	N	NA
3678887	3678888	SAHV_0542	SAHV_0543		rpsL	TRUE	0.819	98.000	0.239	NA	Y	NA
3678888	3678889	SAHV_0543	SAHV_0544	rpsL	rpsG	TRUE	0.942	66.000	0.224	0.004	Y	NA
3678889	3678890	SAHV_0544	SAHV_0545	rpsG	fus	TRUE	0.864	123.000	0.579	1.000	Y	NA
3678890	3678891	SAHV_0545	SAHV_0546	fus	tufA	TRUE	0.765	217.000	0.400	0.002	Y	NA
3678893	3678894	SAHV_0548	SAHV_0549			FALSE	0.033	270.000	0.000	NA		NA
3678894	3678895	SAHV_0549	SAHV_0550		araB	FALSE	0.112	159.000	0.000	NA		NA
3678895	3678896	SAHV_0550	SAHV_0551	araB		FALSE	0.075	214.000	0.000	1.000	N	NA
3678896	3678897	SAHV_0551	SAHV_0552		ilvE	FALSE	0.030	336.000	0.000	1.000	N	NA
3678897	3678898	SAHV_0552	SAHV_0553	ilvE		FALSE	0.053	250.000	0.000	1.000		NA
3678899	3678900	SAHV_0554	SAHV_0555			TRUE	0.998	-7.000	0.255	0.001	Y	NA
3678901	3678902	SAHV_0556	SAHV_0557			FALSE	0.432	147.000	0.013	0.022		NA
3678902	3678903	SAHV_0557	SAHV_0558			TRUE	0.872	22.000	0.159	1.000		NA
3678903	3678904	SAHV_0558	SAHV_0559		sdrC	FALSE	0.019	430.000	0.000	1.000		NA
3678904	3678905	SAHV_0559	SAHV_0560	sdrC	sdrD	FALSE	0.086	367.000	0.000	0.004		NA
3678905	3678906	SAHV_0560	SAHV_0561	sdrD	sdrE	FALSE	0.074	394.000	0.000	0.004		NA
3678906	3678907	SAHV_0561	SAHV_0562	sdrE		FALSE	0.223	121.000	0.000	1.000		NA
3678908	3678909	SAHV_0563	SAHV_0564			FALSE	0.041	282.000	0.000	1.000		NA
3678909	3678910	SAHV_0564	SAHV_0565			TRUE	0.732	13.000	0.026	NA		NA
3678910	3678911	SAHV_0565	SAHV_0566			TRUE	0.941	14.000	0.644	NA		NA
3678912	3678913	SAHV_0567	SAHV_0568	nagB		TRUE	0.914	77.000	0.600	1.000	Y	NA
3678913	3678914	SAHV_0568	SAHV_0569			TRUE	0.976	2.000	0.667	1.000	N	NA
3678914	3678915	SAHV_0569	SAHV_0570			FALSE	0.244	113.000	0.000	1.000		NA
3678915	3678916	SAHV_0570	SAHV_0571		proP	FALSE	0.016	502.000	0.000	1.000		NA
3678916	3678917	SAHV_0571	SAHV_0572	proP		FALSE	0.021	335.000	0.000	NA		NA
3678917	3678918	SAHV_0572	SAHV_0573		vraA	TRUE	0.834	0.000	0.000	NA		NA
3678918	3678919	SAHV_0573	SAHV_0574	vraA	vraB	TRUE	0.992	2.000	0.576	1.000	Y	NA
3678919	3678920	SAHV_0574	SAHV_0575	vraB	vraC	TRUE	0.967	-25.000	0.101	NA		NA
3678920	3678921	SAHV_0575	SAHV_0576	vraC		TRUE	0.959	3.000	0.500	NA		NA
3678922	3678923	SAHV_0577	SAHV_0578			FALSE	0.011	507.000	0.000	NA		NA
3678924	3678925	SAHV_0579	SAHV_0580	ung		TRUE	0.979	1.000	0.800	NA		NA
3678925	3678926	SAHV_0580	SAHV_0581			FALSE	0.225	133.000	0.024	NA		NA
3678926	3678927	SAHV_0581	SAHV_0582			FALSE	0.246	121.000	0.021	NA		NA
3678928	3678929	SAHV_0583	SAHV_0584			TRUE	0.954	13.000	1.000	NA		NA
3678929	3678930	SAHV_0584	SAHV_0585			FALSE	0.010	663.000	0.000	NA		NA
3678931	3678932	SAHV_0586	SAHV_0587	pta		TRUE	0.917	3.000	0.123	1.000	N	NA
3678932	3678933	SAHV_0587	SAHV_0588		mvaK1	FALSE	0.013	668.000	0.000	1.000	N	NA
3678933	3678934	SAHV_0588	SAHV_0589	mvaK1	mvaD	TRUE	0.990	5.000	0.281	0.004	Y	NA
3678934	3678935	SAHV_0589	SAHV_0590	mvaD	mvaK2	TRUE	0.987	13.000	0.312	0.004	Y	NA
3678935	3678936	SAHV_0590	SAHV_0591	mvaK2		FALSE	0.151	177.000	0.030	NA		NA
3678937	3678938	SAHV_0592	SAHV_0593			TRUE	0.967	-139.000	0.103	NA	N	NA
3678939	3678940	SAHV_0594	SAHV_0595			TRUE	0.713	4.000	0.000	NA		NA
3678940	3678941	SAHV_0595	SAHV_0596			FALSE	0.391	47.000	0.000	NA		NA
3678941	3678942	SAHV_0596	SAHV_0597			FALSE	0.137	140.000	0.000	NA		NA
3678942	3678943	SAHV_0597	SAHV_0598			FALSE	0.013	448.000	0.000	NA		NA
3678943	3678944	SAHV_0598	SAHV_0599			FALSE	0.031	446.000	0.071	NA		NA
3678944	3678945	SAHV_0599	SAHV_0600			FALSE	0.196	168.000	0.051	NA		NA
3678945	3678946	SAHV_0600	SAHV_0601			TRUE	0.619	40.000	0.025	1.000		NA
3678946	3678947	SAHV_0601	SAHV_0602			TRUE	0.545	43.000	0.028	NA		NA
3678947	3678948	SAHV_0602	SAHV_0603		adh1	FALSE	0.011	499.000	0.000	NA		NA
3678948	3678949	SAHV_0603	SAHV_0604	adh1		FALSE	0.035	264.000	0.000	NA		NA
3678949	3678950	SAHV_0604	SAHV_0605		argS	TRUE	0.944	-3.000	0.079	NA		NA
3678950	3678951	SAHV_0605	SAHV_0606	argS		FALSE	0.056	270.000	0.004	1.000	N	NA
3678951	3678952	SAHV_0606	SAHV_0607			FALSE	0.051	252.000	0.000	1.000	N	NA
3678952	3678953	SAHV_0607	SAHV_0608			TRUE	0.621	149.000	0.046	1.000	Y	NA
3678953	3678954	SAHV_0608	SAHV_0609			TRUE	0.811	55.000	0.412	1.000		NA
3678954	3678955	SAHV_0609	SAHV_0610			TRUE	0.994	-16.000	0.412	0.022		NA
3678955	3678956	SAHV_0610	SAHV_0611			TRUE	0.590	136.000	0.556	NA		NA
3678956	3678957	SAHV_0611	SAHV_0612			TRUE	0.519	162.000	0.571	NA		NA
3678957	3678958	SAHV_0612	SAHV_0613			FALSE	0.382	169.000	0.286	NA		NA
3678959	3678960	SAHV_0614	SAHV_0615	sarA		FALSE	0.009	948.000	0.000	NA		NA
3678960	3678961	SAHV_0615	SAHV_0616			FALSE	0.070	195.000	0.000	NA		NA
3678961	3678962	SAHV_0616	SAHV_0617			TRUE	0.897	17.000	0.233	NA		NA
3678963	3678964	SAHV_0618	SAHV_0619			TRUE	0.959	19.000	0.857	1.000		NA
3678964	3678965	SAHV_0619	SAHV_0620			TRUE	0.997	-13.000	0.636	NA	Y	NA
3678965	3678966	SAHV_0620	SAHV_0621			TRUE	0.995	-3.000	0.636	NA	Y	NA
3678966	3678967	SAHV_0621	SAHV_0622			TRUE	0.999	-10.000	1.000	0.003	Y	NA
3678967	3678968	SAHV_0622	SAHV_0623			TRUE	0.992	1.000	0.500	1.000	Y	NA
3678968	3678969	SAHV_0623	SAHV_0624			TRUE	0.997	-3.000	0.429	0.074	Y	NA
3678969	3678970	SAHV_0624	SAHV_0625			TRUE	0.995	-25.000	0.273	1.000	Y	NA
3678970	3678971	SAHV_0625	SAHV_0626			FALSE	0.146	340.000	0.000	1.000	Y	NA
3678972	3678973	SAHV_0627	SAHV_0628	tnp		FALSE	0.012	1120.000	0.000	1.000	N	NA
3678973	3678974	SAHV_0628	SAHV_0629			TRUE	0.991	-3.000	0.154	1.000	Y	NA
3678974	3678975	SAHV_0629	SAHV_0630			TRUE	0.994	-6.000	0.286	1.000	Y	NA
3678980	3678981	SAHV_0635	SAHV_0636	tagG	tagB	FALSE	0.066	732.000	0.138	0.089		NA
3678981	3678982	SAHV_0636	SAHV_0637	tagB	tagX	FALSE	0.370	51.000	0.000	NA		NA
3678982	3678983	SAHV_0637	SAHV_0638	tagX	tagD	FALSE	0.304	63.000	0.000	NA		NA
3678985	3678986	SAHV_0640	SAHV_0641			FALSE	0.270	69.000	0.000	NA		NA
3678986	3678987	SAHV_0641	SAHV_0642			FALSE	0.060	208.000	0.000	NA		NA
3678987	3678988	SAHV_0642	SAHV_0643			FALSE	0.009	747.000	0.000	NA		NA
3678988	3678989	SAHV_0643	SAHV_0644		fhuA	FALSE	0.029	282.000	0.000	NA		NA
3678989	3678990	SAHV_0644	SAHV_0645	fhuA	fhuB	TRUE	0.934	36.000	0.179	1.000	Y	NA
3678990	3678991	SAHV_0645	SAHV_0646	fhuB	fhuG	TRUE	0.998	-3.000	0.857	0.043	Y	NA
3678991	3678992	SAHV_0646	SAHV_0647	fhuG		FALSE	0.058	237.000	0.000	1.000	N	NA
3678992	3678993	SAHV_0647	SAHV_0648			TRUE	0.975	42.000	0.316	0.001	Y	NA
3678993	3678994	SAHV_0648	SAHV_0649			TRUE	0.974	-7.000	0.155	1.000		NA
3678994	3678995	SAHV_0649	SAHV_0650			TRUE	0.596	116.000	0.385	NA		NA
3678995	3678996	SAHV_0650	SAHV_0651			FALSE	0.010	544.000	0.000	NA		NA
3678996	3678997	SAHV_0651	SAHV_0652			FALSE	0.362	151.000	0.135	1.000		NA
3678997	3678998	SAHV_0652	SAHV_0653			FALSE	0.022	329.000	0.000	NA		NA
3679000	3679001	SAHV_0655	SAHV_0656		graR	TRUE	0.891	16.000	0.208	NA	N	NA
3679001	3679002	SAHV_0656	SAHV_0657	graR	graS	TRUE	0.997	-7.000	0.958	1.000	Y	NA
3679002	3679003	SAHV_0657	SAHV_0658	graS	vraF	FALSE	0.472	144.000	0.250	1.000	N	NA
3679003	3679004	SAHV_0658	SAHV_0659	vraF	vraG	TRUE	0.992	-22.000	0.714	1.000		NA
3679004	3679005	SAHV_0659	SAHV_0660	vraG		FALSE	0.009	723.000	0.000	NA		NA
3679005	3679006	SAHV_0660	SAHV_0661			TRUE	0.945	16.000	0.033	NA	Y	NA
3679008	3679009	SAHV_0663	SAHV_0664			FALSE	0.009	697.000	0.000	NA		NA
3679009	3679010	SAHV_0664	SAHV_0665			TRUE	0.792	80.000	0.875	NA		NA
3679010	3679011	SAHV_0665	SAHV_0666			FALSE	0.012	466.000	0.000	NA		NA
3679011	3679012	SAHV_0666	SAHV_0667			FALSE	0.028	285.000	0.000	NA		NA
3679012	3679013	SAHV_0667	SAHV_0668			FALSE	0.019	353.000	0.000	NA		NA
3679013	3679014	SAHV_0668	SAHV_0669			FALSE	0.075	302.000	0.114	NA		NA
3679014	3679015	SAHV_0669	SAHV_0670			FALSE	0.372	138.000	0.159	NA	N	NA
3679015	3679016	SAHV_0670	SAHV_0671			TRUE	0.925	-3.000	0.034	NA		NA
3679018	3679019	SAHV_0673	SAHV_0674			FALSE	0.282	67.000	0.000	NA		NA
3679019	3679020	SAHV_0674	SAHV_0675			FALSE	0.466	138.000	0.286	NA		NA
3679020	3679021	SAHV_0675	SAHV_0676			FALSE	0.381	80.000	0.043	NA		NA
3679022	3679023	SAHV_0677	SAHV_0678			TRUE	0.849	2.000	0.017	NA		NA
3679023	3679024	SAHV_0678	SAHV_0679			TRUE	0.800	3.000	0.007	NA		NA
3679024	3679025	SAHV_0679	SAHV_0680		bacA	FALSE	0.097	172.000	0.000	NA		NA
3679026	3679027	SAHV_0681	SAHV_0682	graA		TRUE	0.996	-3.000	0.222	0.005	Y	NA
3679029	3679030	SAHV_0684	SAHV_0685			FALSE	0.269	103.000	0.012	NA		NA
3679030	3679031	SAHV_0685	SAHV_0686			TRUE	0.556	35.000	0.012	NA		NA
3679031	3679032	SAHV_0686	SAHV_0687			FALSE	0.029	283.000	0.000	NA		NA
3679032	3679033	SAHV_0687	SAHV_0688			FALSE	0.355	86.000	0.010	1.000	N	NA
3679034	3679035	SAHV_0689	SAHV_0690			TRUE	0.942	-3.000	0.069	NA		NA
3679035	3679036	SAHV_0690	SAHV_0691			FALSE	0.082	183.000	0.000	NA		NA
3679037	3679038	SAHV_0692	SAHV_0693	norA		FALSE	0.027	293.000	0.000	NA		NA
3679038	3679039	SAHV_0693	SAHV_0694			FALSE	0.129	174.000	0.010	NA		NA
3679039	3679040	SAHV_0694	SAHV_0695			FALSE	0.141	253.000	0.004	0.054		NA
3679040	3679041	SAHV_0695	SAHV_0696		fruB	TRUE	0.988	-3.000	0.063	1.000	Y	NA
3679041	3679042	SAHV_0696	SAHV_0697	fruB	fruA	TRUE	0.989	6.000	0.889	1.000	Y	NA
3679042	3679043	SAHV_0697	SAHV_0698	fruA	nagA	FALSE	0.171	308.000	0.000	1.000	Y	NA
3679043	3679044	SAHV_0698	SAHV_0699	nagA		FALSE	0.070	221.000	0.000	1.000		NA
3679044	3679045	SAHV_0699	SAHV_0700			FALSE	0.151	222.000	0.100	1.000		NA
3679045	3679046	SAHV_0700	SAHV_0701			FALSE	0.330	132.000	0.100	NA		NA
3679047	3679048	SAHV_0702	SAHV_0703	saeS	saeR	TRUE	0.993	0.000	0.500	1.000	Y	NA
3679048	3679049	SAHV_0703	SAHV_0704	saeR		TRUE	0.981	-25.000	0.250	NA		NA
3679049	3679050	SAHV_0704	SAHV_0705			FALSE	0.010	634.000	0.000	NA		NA
3679050	3679051	SAHV_0705	SAHV_0706			FALSE	0.030	280.000	0.000	NA		NA
3679051	3679052	SAHV_0706	SAHV_0707			FALSE	0.394	99.000	0.080	NA		NA
3679052	3679053	SAHV_0707	SAHV_0708			TRUE	0.943	4.000	0.307	1.000	N	NA
3679053	3679054	SAHV_0708	SAHV_0709			TRUE	0.899	2.000	0.041	1.000		NA
3679055	3679056	SAHV_0710	SAHV_0711			TRUE	0.995	-16.000	0.027	0.017	Y	NA
3679056	3679057	SAHV_0711	SAHV_0712			TRUE	0.990	0.000	0.219	1.000	Y	NA
3679057	3679058	SAHV_0712	SAHV_0713			FALSE	0.392	66.000	0.019	NA		NA
3679058	3679059	SAHV_0713	SAHV_0714			TRUE	0.657	88.000	0.375	NA		NA
3679059	3679060	SAHV_0714	SAHV_0715			TRUE	0.998	-16.000	0.194	0.002	Y	NA
3679060	3679061	SAHV_0715	SAHV_0716			FALSE	0.017	474.000	0.000	1.000	N	NA
3679061	3679062	SAHV_0716	SAHV_0717			FALSE	0.044	276.000	0.000	1.000		NA
3679062	3679063	SAHV_0717	SAHV_0718		recQ	TRUE	0.776	12.000	0.022	1.000		NA
3679063	3679064	SAHV_0718	SAHV_0719	recQ		FALSE	0.104	222.000	0.029	1.000	N	NA
3679064	3679065	SAHV_0719	SAHV_0720			TRUE	0.985	-7.000	0.382	1.000	N	NA
3679065	3679066	SAHV_0720	SAHV_0721			FALSE	0.087	240.000	0.027	1.000	N	NA
3679066	3679067	SAHV_0721	SAHV_0722			FALSE	0.057	339.000	0.102	NA		NA
3679068	3679069	SAHV_0723	SAHV_0724			FALSE	0.085	270.000	0.057	1.000	N	NA
3679069	3679070	SAHV_0724	SAHV_0725			FALSE	0.029	341.000	0.000	1.000		NA
3679070	3679071	SAHV_0725	SAHV_0726			TRUE	0.746	20.000	0.005	1.000		NA
3679072	3679073	SAHV_0727	SAHV_0728	nrdI	nrdE	TRUE	0.999	-88.000	0.533	0.001	Y	NA
3679073	3679074	SAHV_0728	SAHV_0729	nrdE	nrdF	TRUE	0.955	118.000	0.875	0.001	Y	NA
3679074	3679075	SAHV_0729	SAHV_0730	nrdF		FALSE	0.024	375.000	0.000	1.000	N	NA
3679075	3679076	SAHV_0730	SAHV_0731			TRUE	0.999	-13.000	0.870	0.043	Y	NA
3679076	3679077	SAHV_0731	SAHV_0732			TRUE	0.997	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
3679077	3679078	SAHV_0732	SAHV_0733			TRUE	0.687	119.000	0.031	1.000	Y	NA
3679079	3679080	SAHV_0734	SAHV_0735			TRUE	0.780	18.000	0.014	1.000		NA
3679080	3679081	SAHV_0735	SAHV_0736			FALSE	0.222	127.000	0.014	NA		NA
3679082	3679083	SAHV_0737	SAHV_0738			FALSE	0.245	154.000	0.069	NA		NA
3679083	3679084	SAHV_0738	SAHV_0739			FALSE	0.014	424.000	0.000	NA		NA
3679085	3679086	SAHV_0740	SAHV_0741	pepT		TRUE	0.844	14.000	0.127	NA		NA
3679086	3679087	SAHV_0741	SAHV_0742			TRUE	0.956	18.000	0.875	NA		NA
3679087	3679088	SAHV_0742	SAHV_0743			FALSE	0.147	196.000	0.067	NA		NA
3679091	3679092	SAHV_0746	SAHV_0747			FALSE	0.045	544.000	0.214	NA		NA
3679092	3679093	SAHV_0747	SAHV_0748			TRUE	0.971	-7.000	0.130	1.000		NA
3679093	3679094	SAHV_0748	SAHV_0749			TRUE	0.536	61.000	0.080	NA		NA
3679094	3679095	SAHV_0749	SAHV_0750		secA	FALSE	0.027	414.000	0.041	NA	N	NA
3679095	3679096	SAHV_0750	SAHV_0751	secA	prfB	FALSE	0.035	433.000	0.052	1.000	N	NA
3679096	3679097	SAHV_0751	SAHV_0752	prfB		FALSE	0.021	409.000	0.000	1.000		NA
3679097	3679098	SAHV_0752	SAHV_0753			FALSE	0.165	174.000	0.010	1.000		NA
3679098	3679099	SAHV_0753	SAHV_0754			TRUE	0.948	-3.000	0.093	NA		NA
3679099	3679100	SAHV_0754	SAHV_0755		uvrB	FALSE	0.047	263.000	0.007	NA		NA
3679100	3679101	SAHV_0755	SAHV_0756	uvrB	uvrA	TRUE	0.987	8.000	0.154	0.001	Y	NA
3679101	3679102	SAHV_0756	SAHV_0757	uvrA	hprK	FALSE	0.016	664.000	0.002	1.000	N	NA
3679102	3679103	SAHV_0757	SAHV_0758	hprK	lgt	TRUE	0.950	6.000	0.494	1.000	N	NA
3679103	3679104	SAHV_0758	SAHV_0759	lgt		TRUE	0.827	8.000	0.045	1.000		NA
3679104	3679105	SAHV_0759	SAHV_0760			TRUE	0.897	8.000	0.169	1.000		NA
3679105	3679106	SAHV_0760	SAHV_0761		trxB	TRUE	0.656	67.000	0.183	1.000		NA
3679106	3679107	SAHV_0761	SAHV_0762	trxB		FALSE	0.018	945.000	0.050	NA		NA
3679107	3679108	SAHV_0762	SAHV_0763			TRUE	0.968	-3.000	0.214	NA		NA
3679108	3679109	SAHV_0763	SAHV_0764			TRUE	0.638	111.000	0.470	NA		NA
3679113	3679114	SAHV_0767	SAHV_0768		gapR	FALSE	0.009	925.000	0.000	NA		NA
3679114	3679115	SAHV_0768	SAHV_0769	gapR	gap	TRUE	0.624	53.000	0.076	1.000	N	NA
3679115	3679116	SAHV_0769	SAHV_0770	gap	pgk	TRUE	0.757	139.000	0.006	0.006	Y	NA
3679116	3679117	SAHV_0770	SAHV_0771	pgk	tpi	TRUE	0.753	122.000	0.141	1.000	Y	NA
3679117	3679118	SAHV_0771	SAHV_0772	tpi	pgm	TRUE	0.978	3.000	0.138	1.000	Y	NA
3679118	3679119	SAHV_0772	SAHV_0773	pgm	eno	TRUE	0.735	130.000	0.136	1.000	Y	NA
3679119	3679120	SAHV_0773	SAHV_0774	eno		FALSE	0.027	339.000	0.005	NA		NA
3679120	3679121	SAHV_0774	SAHV_0775		secG	FALSE	0.350	67.000	0.007	NA		NA
3679121	3679122	SAHV_0775	SAHV_0776	secG		FALSE	0.338	116.000	0.032	1.000		NA
3679122	3679123	SAHV_0776	SAHV_0777			TRUE	0.709	34.000	0.060	1.000		NA
3679123	3679124	SAHV_0777	SAHV_0778		ssrP	TRUE	0.931	22.000	0.143	0.023	N	NA
3679124	3679125	SAHV_0778	SAHV_tm0001	ssrP		FALSE	0.218	91.000	0.000	NA		NA
3679126	3679127	SAHV_0779	SAHV_0780			TRUE	0.884	6.000	0.000	0.062		NA
3679128	3679129	SAHV_0781	SAHV_0782			TRUE	0.541	36.000	0.000	1.000		NA
3679129	3679130	SAHV_0782	SAHV_0783			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3679130	3679131	SAHV_0783	SAHV_0784			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3679131	3679132	SAHV_0784	SAHV_0785			TRUE	0.746	3.000	0.000	NA		NA
3679132	3679133	SAHV_0785	SAHV_0786			FALSE	0.282	67.000	0.000	NA		NA
3679133	3679134	SAHV_0786	SAHV_0787			TRUE	0.960	17.000	1.000	NA		NA
3679134	3679135	SAHV_0787	SAHV_0788			FALSE	0.065	202.000	0.000	NA		NA
3679135	3679136	SAHV_0788	SAHV_0789			TRUE	0.979	2.000	1.000	NA		NA
3679136	3679137	SAHV_0789	SAHV_0790			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3679137	3679138	SAHV_0790	SAHV_0791			FALSE	0.013	450.000	0.000	NA		NA
3679138	3679139	SAHV_0791	SAHV_0792			TRUE	0.617	12.000	0.000	NA		NA
3679139	3679140	SAHV_0792	SAHV_0793			TRUE	0.640	18.000	0.000	NA		NA
3679140	3679141	SAHV_0793	SAHV_0794			FALSE	0.370	51.000	0.000	NA		NA
3679141	3679142	SAHV_0794	SAHV_0795			TRUE	0.913	-33.000	0.000	NA		NA
3679142	3679143	SAHV_0795	SAHV_0796			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3679143	3679144	SAHV_0796	SAHV_0797			FALSE	0.030	277.000	0.000	NA	N	NA
3679144	3679145	SAHV_0797	SAHV_0798			FALSE	0.048	225.000	0.000	NA		NA
3679145	3679146	SAHV_0798	SAHV_0799			FALSE	0.010	545.000	0.000	NA		NA
3679146	3679147	SAHV_0799	SAHV_0800			FALSE	0.326	58.000	0.000	NA	N	NA
3679147	3679148	SAHV_0800	SAHV_0801			FALSE	0.017	376.000	0.000	NA		NA
3679148	3679149	SAHV_0801	SAHV_0802			FALSE	0.299	64.000	0.000	NA		NA
3679150	3679151	SAHV_0803	SAHV_0804			FALSE	0.017	375.000	0.000	NA		NA
3679152	3679153	SAHV_0805	SAHV_0806			FALSE	0.138	139.000	0.000	NA		NA
3679153	3679154	SAHV_0806	SAHV_0807		fnb	FALSE	0.049	263.000	0.000	1.000		NA
3679154	3679155	SAHV_0807	SAHV_0808	fnb	graB	FALSE	0.050	221.000	0.000	NA		NA
3679155	3679156	SAHV_0808	SAHV_0809	graB	ssp	FALSE	0.019	353.000	0.000	NA		NA
3679156	3679157	SAHV_0809	SAHV_0810	ssp		FALSE	0.021	335.000	0.000	NA		NA
3679157	3679158	SAHV_0810	SAHV_0811		nuc	FALSE	0.021	341.000	0.000	NA		NA
3679158	3679159	SAHV_0811	SAHV_0812	nuc	cspC	FALSE	0.026	357.000	0.000	1.000	N	NA
3679160	3679161	SAHV_0813	SAHV_0814			TRUE	0.814	62.000	0.667	NA		NA
3679161	3679162	SAHV_0814	SAHV_0815			FALSE	0.224	88.000	0.000	NA		NA
3679162	3679163	SAHV_0815	SAHV_0816			FALSE	0.386	188.000	0.444	NA		NA
3679163	3679164	SAHV_0816	SAHV_0817			TRUE	0.873	29.000	0.333	NA		NA
3679168	3679169	SAHV_0821	SAHV_0822			FALSE	0.382	155.000	0.167	1.000		NA
3679172	3679173	SAHV_0825	SAHV_0826			FALSE	0.392	83.000	0.022	1.000	N	NA
3679175	3679176	SAHV_0828	SAHV_0829			FALSE	0.373	158.000	0.170	1.000	N	NA
3679176	3679177	SAHV_0829	SAHV_0830			FALSE	0.089	179.000	0.000	NA		NA
3679177	3679178	SAHV_0830	SAHV_0831			FALSE	0.009	797.000	0.000	NA		NA
3679178	3679179	SAHV_0831	SAHV_0832			TRUE	0.984	-7.000	0.443	NA		NA
3679179	3679180	SAHV_0832	SAHV_0833			FALSE	0.038	250.000	0.000	NA		NA
3679180	3679181	SAHV_0833	SAHV_0834			TRUE	0.997	-7.000	0.642	1.000	Y	NA
3679181	3679182	SAHV_0834	SAHV_0835			TRUE	0.952	18.000	0.085	NA	Y	NA
3679182	3679183	SAHV_0835	SAHV_0836			FALSE	0.019	354.000	0.000	NA		NA
3679185	3679186	SAHV_0838	SAHV_0839			TRUE	0.800	98.000	0.139	1.000	Y	NA
3679186	3679187	SAHV_0839	SAHV_0840			TRUE	0.702	115.000	0.606	1.000	N	NA
3679187	3679188	SAHV_0840	SAHV_0841			TRUE	0.984	-10.000	0.292	1.000	N	NA
3679188	3679189	SAHV_0841	SAHV_0842			TRUE	0.629	151.000	0.152	0.002	N	NA
3679192	3679193	SAHV_0845	SAHV_0846			TRUE	0.812	32.000	0.222	NA		NA
3679193	3679194	SAHV_0846	SAHV_0847			TRUE	0.614	13.000	0.000	NA		NA
3679197	3679198	SAHV_0850	SAHV_0851			TRUE	0.808	1.000	0.000	NA		NA
3679198	3679199	SAHV_0851	SAHV_0852			FALSE	0.424	40.000	0.000	NA		NA
3679201	3679202	SAHV_0854	SAHV_0855			FALSE	0.039	247.000	0.000	NA		NA
3679204	3679205	SAHV_0857	SAHV_0858			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3679205	3679206	SAHV_0858	SAHV_0859			FALSE	0.011	502.000	0.000	NA		NA
3679206	3679207	SAHV_0859	SAHV_0860			TRUE	0.941	11.000	0.500	1.000		NA
3679207	3679208	SAHV_0860	SAHV_0861			TRUE	0.971	1.000	0.500	NA		NA
3679210	3679211	SAHV_0863	SAHV_0864			TRUE	0.614	13.000	0.000	NA		NA
3679211	3679212	SAHV_0864	SAHV_0865			TRUE	0.973	-3.000	0.286	NA		NA
3679212	3679213	SAHV_0865	SAHV_0866			TRUE	0.940	13.000	0.667	NA		NA
3679213	3679214	SAHV_0866	SAHV_0867			TRUE	0.642	10.000	0.000	NA		NA
3679214	3679215	SAHV_0867	SAHV_0868			FALSE	0.075	191.000	0.000	NA		NA
3679215	3679216	SAHV_0868	SAHV_0869			TRUE	0.808	1.000	0.000	NA		NA
3679216	3679217	SAHV_0869	SAHV_0870			TRUE	0.617	12.000	0.000	NA		NA
3679217	3679218	SAHV_0870	SAHV_0871			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3679218	3679219	SAHV_0871	SAHV_0872			FALSE	0.444	37.000	0.000	NA		NA
3679219	3679220	SAHV_0872	SAHV_0873			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3679220	3679221	SAHV_0873	SAHV_0874			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3679221	3679222	SAHV_0874	SAHV_0875			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3679222	3679223	SAHV_0875	SAHV_0876			TRUE	0.906	-10.000	0.000	NA		NA
3679223	3679224	SAHV_0876	SAHV_0877			TRUE	0.834	0.000	0.000	NA		NA
3679224	3679225	SAHV_0877	SAHV_0878			FALSE	0.330	58.000	0.000	NA		NA
3679225	3679226	SAHV_0878	SAHV_0879			TRUE	0.645	15.000	0.000	NA		NA
3679226	3679227	SAHV_0879	SAHV_0880			FALSE	0.079	187.000	0.000	NA		NA
3679227	3679228	SAHV_0880	SAHV_0881			TRUE	0.983	-13.000	0.000	0.002		NA
3679228	3679229	SAHV_0881	SAHV_0882			TRUE	0.919	11.000	0.375	NA		NA
3679229	3679230	SAHV_0882	SAHV_0883			TRUE	0.911	7.000	0.278	NA		NA
3679230	3679231	SAHV_0883	SAHV_0884			FALSE	0.258	73.000	0.000	NA		NA
3679231	3679232	SAHV_0884	SAHV_0885			FALSE	0.145	135.000	0.000	NA		NA
3679232	3679233	SAHV_0885	SAHV_0886			TRUE	0.808	14.000	0.077	NA		NA
3679233	3679234	SAHV_0886	SAHV_0887			FALSE	0.150	132.000	0.000	NA		NA
3679234	3679235	SAHV_0887	SAHV_0888			TRUE	0.605	22.000	0.000	NA		NA
3679235	3679236	SAHV_0888	SAHV_0889			TRUE	0.908	9.000	0.286	NA		NA
3679236	3679237	SAHV_0889	SAHV_0890			TRUE	0.980	-3.000	0.429	NA		NA
3679237	3679238	SAHV_0890	SAHV_0891			TRUE	0.961	0.000	0.250	NA		NA
3679238	3679239	SAHV_0891	SAHV_0892			TRUE	0.907	12.000	0.333	NA		NA
3679239	3679240	SAHV_0892	SAHV_0893			TRUE	0.768	19.000	0.041	NA		NA
3679240	3679241	SAHV_0893	SAHV_0894			TRUE	0.546	62.000	0.093	NA		NA
3679241	3679242	SAHV_0894	SAHV_0895			TRUE	0.544	120.000	0.312	NA		NA
3679242	3679243	SAHV_0895	SAHV_0896			TRUE	0.650	17.000	0.000	NA		NA
3679243	3679244	SAHV_0896	SAHV_0897			TRUE	0.614	13.000	0.000	NA		NA
3679244	3679245	SAHV_0897	SAHV_0898			TRUE	0.960	9.000	1.000	NA		NA
3679245	3679246	SAHV_0898	SAHV_0899			TRUE	0.879	15.000	0.182	NA		NA
3679246	3679247	SAHV_0899	SAHV_0900			TRUE	0.953	0.000	0.182	NA		NA
3679247	3679248	SAHV_0900	SAHV_0901			TRUE	0.834	0.000	0.000	NA		NA
3679248	3679249	SAHV_0901	SAHV_0902			TRUE	0.713	4.000	0.000	NA		NA
3679249	3679250	SAHV_0902	SAHV_0903			FALSE	0.419	41.000	0.000	NA		NA
3679250	3679251	SAHV_0903	SAHV_0904			FALSE	0.141	137.000	0.000	NA		NA
3679251	3679252	SAHV_0904	SAHV_0905			TRUE	0.694	13.000	0.000	1.000		NA
3679252	3679253	SAHV_0905	SAHV_0906			TRUE	0.676	6.000	0.000	NA		NA
3679253	3679254	SAHV_0906	SAHV_0907			FALSE	0.342	56.000	0.000	NA		NA
3679254	3679255	SAHV_0907	SAHV_0908			TRUE	0.988	-19.000	0.500	NA		NA
3679255	3679256	SAHV_0908	SAHV_0909			FALSE	0.034	267.000	0.000	NA		NA
3679256	3679257	SAHV_0909	SAHV_0910			FALSE	0.265	71.000	0.000	NA		NA
3679257	3679258	SAHV_0910	SAHV_0911			FALSE	0.011	520.000	0.000	NA		NA
3679258	3679259	SAHV_0911	SAHV_0912			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3679261	3679262	SAHV_0914	SAHV_0915			TRUE	0.814	14.000	0.085	NA		NA
3679262	3679263	SAHV_0915	SAHV_0916			FALSE	0.040	385.000	0.079	NA		NA
3679263	3679264	SAHV_0916	SAHV_0917			TRUE	0.899	13.000	0.303	NA		NA
3679264	3679265	SAHV_0917	SAHV_0918			TRUE	0.892	27.000	0.299	1.000		NA
3679265	3679266	SAHV_0918	SAHV_0919		lipA	FALSE	0.365	84.000	0.012	1.000	N	NA
3679266	3679267	SAHV_0919	SAHV_0920	lipA		FALSE	0.227	130.000	0.021	NA		NA
3679267	3679268	SAHV_0920	SAHV_0921		tnp	FALSE	0.062	206.000	0.000	NA		NA
3679270	3679271	SAHV_0923	SAHV_0924			TRUE	0.960	0.000	0.237	NA		NA
3679271	3679272	SAHV_0924	SAHV_0925			TRUE	0.851	33.000	0.082	0.059	N	NA
3679272	3679273	SAHV_0925	SAHV_0926		dltX	FALSE	0.015	412.000	0.000	NA		NA
3679273	3679274	SAHV_0926	SAHV_0927	dltX	dltA	TRUE	0.941	16.000	0.549	NA		NA
3679274	3679275	SAHV_0927	SAHV_0928	dltA	dltB	TRUE	0.980	-3.000	0.435	NA	N	NA
3679275	3679276	SAHV_0928	SAHV_0929	dltB	dltC	TRUE	0.923	18.000	0.387	NA		NA
3679276	3679277	SAHV_0929	SAHV_0930	dltC	dltD	TRUE	0.939	-3.000	0.064	NA		NA
3679281	3679282	SAHV_0934	SAHV_0935			TRUE	0.701	13.000	0.012	NA		NA
3679282	3679283	SAHV_0935	SAHV_0936			FALSE	0.013	454.000	0.000	NA		NA
3679283	3679284	SAHV_0936	SAHV_0937		ampA	FALSE	0.376	131.000	0.097	1.000	N	NA
3679284	3679285	SAHV_0937	SAHV_0938	ampA		FALSE	0.032	411.000	0.025	1.000		NA
3679285	3679286	SAHV_0938	SAHV_0939			TRUE	0.782	19.000	0.052	NA		NA
3679287	3679288	SAHV_0940	SAHV_0941		mnhG	FALSE	0.202	249.000	0.364	NA	N	NA
3679288	3679289	SAHV_0941	SAHV_0942	mnhG	mnhF	TRUE	0.995	-22.000	0.244	1.000	Y	NA
3679289	3679290	SAHV_0942	SAHV_0943	mnhF	mnhE	TRUE	0.997	0.000	0.829	0.069	Y	NA
3679290	3679291	SAHV_0943	SAHV_0944	mnhE	mnhD	TRUE	0.997	2.000	0.842	0.005	Y	NA
3679291	3679292	SAHV_0944	SAHV_0945	mnhD	mnhC	TRUE	0.997	-7.000	0.211	0.003	Y	NA
3679292	3679293	SAHV_0945	SAHV_0946	mnhC	mnhB	TRUE	0.987	0.000	0.195	NA	Y	NA
3679293	3679294	SAHV_0946	SAHV_0947	mnhB	mnhA	TRUE	0.995	-7.000	0.439	NA	Y	NA
3679294	3679295	SAHV_0947	SAHV_0948	mnhA		FALSE	0.440	131.000	0.206	NA		NA
3679296	3679297	SAHV_0949	SAHV_0950			FALSE	0.037	532.000	0.110	1.000	N	NA
3679297	3679298	SAHV_0950	SAHV_0951			FALSE	0.040	362.000	0.027	1.000	N	NA
3679298	3679299	SAHV_0951	SAHV_0952		rocD	FALSE	0.035	308.000	0.000	1.000	N	NA
3679299	3679300	SAHV_0952	SAHV_0953	rocD	gudB	TRUE	0.700	109.000	0.019	1.000	Y	NA
3679301	3679302	SAHV_0954	SAHV_0955	glpQ	argH	FALSE	0.068	242.000	0.003	1.000	N	NA
3679302	3679303	SAHV_0955	SAHV_0956	argH	argG	TRUE	0.995	-10.000	0.278	1.000	Y	NA
3679304	3679305	SAHV_0957	SAHV_0958	pgi		FALSE	0.030	325.000	0.005	NA		NA
3679305	3679306	SAHV_0958	SAHV_0959		spsA	TRUE	0.871	5.000	0.115	NA		NA
3679306	3679307	SAHV_0959	SAHV_0960	spsA	spsB	TRUE	0.988	16.000	0.184	0.001	Y	NA
3679307	3679308	SAHV_0960	SAHV_0961	spsB		FALSE	0.254	160.000	0.057	1.000	N	NA
3679308	3679309	SAHV_0961	SAHV_0962			TRUE	0.993	4.000	0.408	0.003	Y	NA
3679309	3679310	SAHV_0962	SAHV_0963			FALSE	0.265	166.000	0.075	1.000	N	NA
3679310	3679311	SAHV_0963	SAHV_0964			FALSE	0.038	329.000	0.028	NA		NA
3679312	3679313	SAHV_0965	SAHV_0966	cdr		TRUE	0.726	52.000	0.171	1.000		NA
3679316	3679317	SAHV_0969	SAHV_0970		clpB	FALSE	0.087	203.000	0.000	1.000	N	NA
3679319	3679320	SAHV_0972	SAHV_0973			TRUE	0.909	-16.000	0.000	NA	N	NA
3679320	3679321	SAHV_0973	SAHV_0974			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3679321	3679322	SAHV_0974	SAHV_0975			TRUE	0.912	-22.000	0.000	NA		NA
3679322	3679323	SAHV_0975	SAHV_0976			FALSE	0.024	311.000	0.000	NA		NA
3679325	3679326	SAHV_0978	SAHV_0979	fabH		TRUE	0.928	12.000	0.000	1.000	Y	NA
3679328	3679329	SAHV_0981	SAHV_0982	oppB		TRUE	0.991	0.000	0.062	0.040	Y	NA
3679329	3679330	SAHV_0982	SAHV_0983		oppD	TRUE	0.987	16.000	0.857	1.000	Y	NA
3679330	3679331	SAHV_0983	SAHV_0984	oppD	oppF	TRUE	0.997	-10.000	0.111	0.002	Y	NA
3679331	3679332	SAHV_0984	SAHV_0985	oppF		TRUE	0.955	19.000	0.074	1.000	Y	NA
3679332	3679333	SAHV_0985	SAHV_0986			FALSE	0.471	212.000	0.000	0.040	Y	NA
3679333	3679334	SAHV_0986	SAHV_0987			TRUE	0.826	51.000	0.000	1.000	Y	NA
3679334	3679335	SAHV_0987	SAHV_0988		appF	TRUE	0.994	3.000	0.333	0.001	Y	NA
3679335	3679336	SAHV_0988	SAHV_0989	appF	oppB	TRUE	0.990	-7.000	0.045	1.000	Y	NA
3679336	3679337	SAHV_0989	SAHV_0990	oppB		TRUE	0.979	12.000	0.159	0.040	Y	NA
3679339	3679340	SAHV_0992	SAHV_0993			FALSE	0.039	371.000	0.063	NA	N	NA
3679340	3679341	SAHV_0993	SAHV_0994			FALSE	0.356	121.000	0.098	NA		NA
3679341	3679342	SAHV_0994	SAHV_0995			TRUE	0.605	48.000	0.075	NA		NA
3679343	3679344	SAHV_0996	SAHV_0997	yjbM		TRUE	0.691	44.000	0.138	NA		NA
3679344	3679345	SAHV_0997	SAHV_0998			FALSE	0.415	104.000	0.063	1.000		NA
3679346	3679347	SAHV_0999	SAHV_1000			TRUE	0.908	17.000	0.283	NA		NA
3679347	3679348	SAHV_1000	SAHV_1001			TRUE	0.957	17.000	0.725	1.000		NA
3679348	3679349	SAHV_1001	SAHV_1002			TRUE	0.984	-3.000	0.480	1.000	N	NA
3679349	3679350	SAHV_1002	SAHV_1003			TRUE	0.878	21.000	0.163	1.000	N	NA
3679350	3679351	SAHV_1003	SAHV_1004			TRUE	0.960	10.000	0.094	1.000	Y	NA
3679351	3679352	SAHV_1004	SAHV_1005		fabI	FALSE	0.059	278.000	0.016	1.000	N	NA
3679354	3679355	SAHV_1007	SAHV_1008			FALSE	0.129	145.000	0.000	NA	N	NA
3679355	3679356	SAHV_1008	SAHV_1009			FALSE	0.294	194.000	0.287	NA	N	NA
3679357	3679358	SAHV_1010	SAHV_1011			TRUE	0.983	-22.000	0.239	1.000	N	NA
3679359	3679360	SAHV_1012	SAHV_1013	murE		TRUE	0.934	-10.000	0.012	NA		NA
3679360	3679361	SAHV_1013	SAHV_1014			FALSE	0.026	361.000	0.009	NA		NA
3679361	3679362	SAHV_1014	SAHV_1015			FALSE	0.036	302.000	0.000	1.000	N	NA
3679362	3679363	SAHV_1015	SAHV_1016		htrA	FALSE	0.133	234.000	0.095	1.000	N	NA
3679363	3679364	SAHV_1016	SAHV_1017	htrA		TRUE	0.861	17.000	0.096	1.000	N	NA
3679364	3679365	SAHV_1017	SAHV_1018			FALSE	0.328	136.000	0.068	1.000	N	NA
3679366	3679367	SAHV_t0014	SAHV_t0015			TRUE	0.784	2.000	0.000	NA		NA
3679367	3679368	SAHV_t0015	SAHV_1019			FALSE	0.136	142.000	0.000	NA		NA
3679371	3679372	SAHV_1022	SAHV_1023			TRUE	0.874	15.000	0.167	NA		NA
3679372	3679373	SAHV_1023	SAHV_1024			FALSE	0.059	209.000	0.000	NA		NA
3679373	3679374	SAHV_1024	SAHV_1025			FALSE	0.010	657.000	0.000	NA		NA
3679374	3679375	SAHV_1025	SAHV_1026			FALSE	0.402	44.000	0.000	NA		NA
3679375	3679376	SAHV_1026	SAHV_1027			TRUE	0.746	3.000	0.000	NA		NA
3679376	3679377	SAHV_1027	SAHV_1028			TRUE	0.982	-3.000	0.500	NA		NA
3679378	3679379	SAHV_1029	SAHV_1030			FALSE	0.015	412.000	0.000	NA		NA
3679384	3679385	SAHV_1035	SAHV_1036		menD	TRUE	0.994	-13.000	0.142	1.000	Y	NA
3679385	3679386	SAHV_1036	SAHV_1037	menD		TRUE	0.985	-13.000	0.355	NA		NA
3679386	3679387	SAHV_1037	SAHV_1038		menB	TRUE	0.978	-7.000	0.280	NA		NA
3679388	3679389	SAHV_1039	SAHV_1040	sspC	sspB	TRUE	0.522	38.000	0.000	1.000		NA
3679389	3679390	SAHV_1040	SAHV_1041	sspB	sspA	TRUE	0.552	82.000	0.000	0.029		NA
3679390	3679391	SAHV_1041	SAHV_1042	sspA		FALSE	0.081	528.000	0.000	1.000	Y	NA
3679391	3679392	SAHV_1042	SAHV_1043			FALSE	0.245	196.000	0.158	1.000	N	NA
3679394	3679395	SAHV_1045	SAHV_1046			FALSE	0.065	228.000	0.000	1.000		NA
3679395	3679396	SAHV_1046	SAHV_1047			FALSE	0.463	155.000	0.364	NA		NA
3679396	3679397	SAHV_1047	SAHV_1048			TRUE	0.871	48.000	0.800	NA		NA
3679399	3679400	SAHV_1050	SAHV_1051		qoxC	TRUE	0.997	-3.000	0.959	1.000	Y	NA
3679400	3679401	SAHV_1051	SAHV_1052	qoxC	qoxB	TRUE	0.999	-10.000	0.957	0.028	Y	NA
3679401	3679402	SAHV_1052	SAHV_1053	qoxB		TRUE	0.997	0.000	0.489	0.004	Y	NA
3679402	3679403	SAHV_1053	SAHV_1054			FALSE	0.010	571.000	0.000	NA		NA
3679403	3679404	SAHV_1054	SAHV_1055		folD	FALSE	0.009	864.000	0.000	NA		NA
3679405	3679406	SAHV_1056	SAHV_1057		purK	TRUE	0.996	-13.000	0.008	0.001	Y	NA
3679406	3679407	SAHV_1057	SAHV_1058	purK	purC	TRUE	0.960	4.000	0.015	1.000	Y	NA
3679407	3679408	SAHV_1058	SAHV_1059	purC		TRUE	0.993	0.000	0.460	1.000	Y	NA
3679408	3679409	SAHV_1059	SAHV_1060		purQ	TRUE	0.997	2.000	0.656	0.001	Y	NA
3679409	3679410	SAHV_1060	SAHV_1061	purQ	purL	TRUE	0.998	-7.000	0.346	0.001	Y	NA
3679410	3679411	SAHV_1061	SAHV_1062	purL	purF	TRUE	0.995	-21.000	0.223	1.000	Y	NA
3679411	3679412	SAHV_1062	SAHV_1063	purF	purM	TRUE	0.994	-7.000	0.248	1.000	Y	NA
3679412	3679413	SAHV_1063	SAHV_1064	purM	purN	TRUE	0.992	3.000	0.238	0.003	Y	NA
3679413	3679414	SAHV_1064	SAHV_1065	purN	purH	TRUE	0.969	12.000	0.225	1.000	Y	NA
3679414	3679415	SAHV_1065	SAHV_1066	purH	purD	TRUE	0.784	130.000	0.238	1.000	Y	NA
3679416	3679417	SAHV_1067	SAHV_1068			TRUE	0.987	-7.000	0.469	1.000		NA
3679417	3679418	SAHV_1068	SAHV_1069			TRUE	0.898	15.000	0.241	NA		NA
3679418	3679419	SAHV_1069	SAHV_1070			FALSE	0.017	381.000	0.000	NA		NA
3679419	3679420	SAHV_1070	SAHV_1071		graF	TRUE	0.676	6.000	0.000	NA		NA
3679421	3679422	SAHV_1072	SAHV_1073			FALSE	0.028	425.000	0.050	NA		NA
3679422	3679423	SAHV_1073	SAHV_1074			TRUE	0.599	54.000	0.100	NA		NA
3679423	3679424	SAHV_1074	SAHV_1075		ptsH	FALSE	0.217	154.000	0.047	NA		NA
3679424	3679425	SAHV_1075	SAHV_1076	ptsH	ptsI	TRUE	0.986	3.000	0.054	0.013	Y	NA
3679427	3679428	SAHV_1078	SAHV_1079			TRUE	0.998	-3.000	0.778	0.028	Y	NA
3679428	3679429	SAHV_1079	SAHV_1080			FALSE	0.440	133.000	0.163	1.000	N	NA
3679430	3679431	SAHV_1081	SAHV_1082			TRUE	0.978	0.000	0.576	NA		NA
3679431	3679432	SAHV_1082	SAHV_1083		pdf1	FALSE	0.020	482.000	0.025	NA		NA
3679433	3679434	SAHV_1084	SAHV_1085		pdhA	FALSE	0.181	171.000	0.046	NA		NA
3679434	3679435	SAHV_1085	SAHV_1086	pdhA	phdB	TRUE	0.994	4.000	0.484	0.002	Y	NA
3679435	3679436	SAHV_1086	SAHV_1087	phdB	pdhC	TRUE	0.951	91.000	0.883	0.057	Y	NA
3679436	3679437	SAHV_1087	SAHV_1088	pdhC	pdhD	TRUE	0.991	4.000	0.948	1.000	Y	NA
3679437	3679438	SAHV_1088	SAHV_1089	pdhD		FALSE	0.242	168.000	0.096	NA		NA
3679438	3679439	SAHV_1089	SAHV_1090			FALSE	0.219	144.000	0.034	NA		NA
3679439	3679440	SAHV_1090	SAHV_1091		potA	TRUE	0.916	13.000	0.326	1.000	N	NA
3679440	3679441	SAHV_1091	SAHV_1092	potA	potB	TRUE	0.998	-7.000	0.928	0.040	Y	NA
3679441	3679442	SAHV_1092	SAHV_1093	potB	potC	TRUE	0.990	6.000	0.492	0.040	Y	NA
3679442	3679443	SAHV_1093	SAHV_1094	potC	potD	TRUE	0.994	0.000	0.253	0.040	Y	NA
3679443	3679444	SAHV_1094	SAHV_1095	potD		FALSE	0.469	74.000	0.089	NA		NA
3679444	3679445	SAHV_1095	SAHV_1096			FALSE	0.029	283.000	0.000	NA		NA
3679446	3679447	SAHV_1097	SAHV_1098			FALSE	0.145	184.000	0.041	NA		NA
3679451	3679452	SAHV_1102	SAHV_1103			TRUE	0.934	2.000	0.173	NA		NA
3679453	3679454	SAHV_1104	SAHV_1105			FALSE	0.014	419.000	0.000	NA		NA
3679454	3679455	SAHV_1105	SAHV_1106		pycA	FALSE	0.014	554.000	0.000	1.000	N	NA
3679457	3679458	SAHV_1108	SAHV_1109	ctaB		TRUE	0.703	25.000	0.027	NA		NA
3679458	3679459	SAHV_1109	SAHV_1110			FALSE	0.046	327.000	0.052	NA		NA
3679459	3679460	SAHV_1110	SAHV_1111			TRUE	0.913	16.000	0.301	NA		NA
3679464	3679465	SAHV_1115	SAHV_1116			TRUE	0.965	2.000	0.367	1.000	N	NA
3679467	3679468	SAHV_1118	SAHV_1119		rpmF	TRUE	0.739	80.000	0.599	NA		NA
3679469	3679470	SAHV_1120	SAHV_1121			TRUE	0.542	203.000	0.000	0.009	Y	NA
3679471	3679472	SAHV_1122	SAHV_1123			TRUE	0.834	0.000	0.000	NA		NA
3679472	3679473	SAHV_1123	SAHV_1124			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3679473	3679474	SAHV_1124	SAHV_1125			TRUE	0.849	157.000	0.877	1.000	Y	NA
3679474	3679475	SAHV_1125	SAHV_1126			FALSE	0.309	62.000	0.000	NA		NA
3679475	3679476	SAHV_1126	SAHV_1127			TRUE	0.724	28.000	0.058	NA		NA
3679476	3679477	SAHV_1127	SAHV_1128			FALSE	0.023	384.000	0.000	1.000		NA
3679477	3679478	SAHV_1128	SAHV_1129		pheS	FALSE	0.134	380.000	0.006	1.000	Y	NA
3679478	3679479	SAHV_1129	SAHV_1130	pheS	pheT	TRUE	0.997	0.000	0.574	0.001	Y	NA
3679481	3679482	SAHV_1132	SAHV_1133			TRUE	0.918	1.000	0.091	NA		NA
3679482	3679483	SAHV_1133	SAHV_1134			TRUE	0.502	73.000	0.066	1.000		NA
3679483	3679484	SAHV_1134	SAHV_1135		mutS2	TRUE	0.962	10.000	0.114	1.000	Y	NA
3679484	3679485	SAHV_1135	SAHV_1136	mutS2	trxA	FALSE	0.179	173.000	0.018	1.000		NA
3679485	3679486	SAHV_1136	SAHV_1137	trxA	uvrC	FALSE	0.048	324.000	0.023	1.000		NA
3679486	3679487	SAHV_1137	SAHV_1138	uvrC	sdhC	FALSE	0.032	324.000	0.000	1.000	N	NA
3679487	3679488	SAHV_1138	SAHV_1139	sdhC	sdhA	TRUE	0.960	52.000	0.184	0.001	Y	NA
3679488	3679489	SAHV_1139	SAHV_1140	sdhA	sdhB	TRUE	0.996	0.000	0.231	0.001	Y	NA
3679489	3679490	SAHV_1140	SAHV_1141	sdhB	murI	FALSE	0.072	236.000	0.002	1.000	N	NA
3679490	3679491	SAHV_1141	SAHV_1142	murI		TRUE	0.789	12.000	0.034	1.000	N	NA
3679491	3679492	SAHV_1142	SAHV_1143			TRUE	0.965	-7.000	0.085	1.000		NA
3679492	3679493	SAHV_1143	SAHV_1144			FALSE	0.114	158.000	0.000	NA		NA
3679493	3679494	SAHV_1144	SAHV_1145			FALSE	0.071	194.000	0.000	NA		NA
3679496	3679497	SAHV_1147	SAHV_1148			FALSE	0.036	260.000	0.000	NA		NA
3679497	3679498	SAHV_1148	SAHV_1149			FALSE	0.127	150.000	0.000	NA		NA
3679499	3679500	SAHV_1150	SAHV_1151			FALSE	0.010	622.000	0.000	NA		NA
3679504	3679505	SAHV_1155	SAHV_1156			FALSE	0.150	132.000	0.000	NA		NA
3679505	3679506	SAHV_1156	SAHV_1157			TRUE	0.510	108.000	0.000	0.018		NA
3679506	3679507	SAHV_1157	SAHV_1158			TRUE	0.538	95.000	0.000	0.018		NA
3679508	3679509	SAHV_1159	SAHV_1160	argF		TRUE	0.985	23.000	1.000	1.000	Y	NA
3679509	3679510	SAHV_1160	SAHV_1161			FALSE	0.133	172.000	0.000	1.000		NA
3679510	3679511	SAHV_1161	SAHV_1162			FALSE	0.025	307.000	0.000	NA		NA
3679517	3679518	SAHV_1167	SAHV_1168			FALSE	0.206	144.000	0.025	NA		NA
3679518	3679519	SAHV_1168	SAHV_1169			TRUE	0.946	16.000	0.635	NA		NA
3679519	3679520	SAHV_1169	SAHV_1170		ftsL	TRUE	0.838	14.000	0.077	1.000	N	NA
3679520	3679521	SAHV_1170	SAHV_1171	ftsL	pbpA	TRUE	0.989	-19.000	0.456	1.000	N	NA
3679521	3679522	SAHV_1171	SAHV_1172	pbpA	mraY	FALSE	0.231	292.000	0.038	1.000	Y	NA
3679522	3679523	SAHV_1172	SAHV_1173	mraY	murD	TRUE	0.996	2.000	0.647	0.007	Y	NA
3679523	3679524	SAHV_1173	SAHV_1174	murD	div1b	TRUE	0.938	16.000	0.008	NA	Y	NA
3679524	3679525	SAHV_1174	SAHV_1175	div1b	ftsA	TRUE	0.619	106.000	0.389	NA	N	NA
3679525	3679526	SAHV_1175	SAHV_1176	ftsA	ftsZ	TRUE	0.962	33.000	0.460	1.000	Y	NA
3679526	3679527	SAHV_1176	SAHV_1177	ftsZ		FALSE	0.086	260.000	0.082	NA		NA
3679527	3679528	SAHV_1177	SAHV_1178			TRUE	0.799	18.000	0.061	NA		NA
3679528	3679529	SAHV_1178	SAHV_1179			TRUE	0.966	-3.000	0.194	NA		NA
3679529	3679530	SAHV_1179	SAHV_1180			TRUE	0.913	12.000	0.370	NA		NA
3679530	3679531	SAHV_1180	SAHV_1181			FALSE	0.200	251.000	0.287	1.000		NA
3679531	3679532	SAHV_1181	SAHV_1182			TRUE	0.927	24.000	0.579	NA		NA
3679532	3679533	SAHV_1182	SAHV_1183		ileS	FALSE	0.071	221.000	0.012	NA	N	NA
3679533	3679534	SAHV_1183	SAHV_1184	ileS		FALSE	0.038	291.000	0.000	1.000		NA
3679536	3679537	SAHV_1186	SAHV_1187	lsp		TRUE	0.901	0.000	0.008	1.000	N	NA
3679537	3679538	SAHV_1187	SAHV_1188		pyrR	FALSE	0.038	400.000	0.048	1.000	N	NA
3679538	3679539	SAHV_1188	SAHV_1189	pyrR	pyrP	FALSE	0.455	218.000	0.140	1.000	Y	NA
3679539	3679540	SAHV_1189	SAHV_1190	pyrP	pyrB	TRUE	0.935	28.000	0.064	1.000	Y	NA
3679540	3679541	SAHV_1190	SAHV_1191	pyrB	pyrC	TRUE	0.980	18.000	0.452	1.000	Y	NA
3679541	3679542	SAHV_1191	SAHV_1192	pyrC	pyrAA	TRUE	0.983	2.000	0.155	1.000	Y	NA
3679542	3679543	SAHV_1192	SAHV_1193	pyrAA	pyrAB	TRUE	0.997	-7.000	0.117	0.001	Y	NA
3679543	3679544	SAHV_1193	SAHV_1194	pyrAB	pyrF	TRUE	0.697	110.000	0.018	1.000	Y	NA
3679544	3679545	SAHV_1194	SAHV_1195	pyrF	pyrE	TRUE	0.978	0.000	0.006	1.000	Y	NA
3679545	3679546	SAHV_1195	SAHV_1196	pyrE		TRUE	0.518	30.000	0.000	NA		NA
3679546	3679547	SAHV_1196	SAHV_1197			FALSE	0.013	437.000	0.000	NA		NA
3679549	3679550	SAHV_1199	SAHV_1200	gmk		TRUE	0.978	0.000	0.471	1.000	N	NA
3679550	3679551	SAHV_1200	SAHV_1201			FALSE	0.217	216.000	0.192	1.000	N	NA
3679551	3679552	SAHV_1201	SAHV_1202		priA	TRUE	0.944	0.000	0.099	1.000	N	NA
3679552	3679553	SAHV_1202	SAHV_1203	priA		FALSE	0.011	506.000	0.000	NA		NA
3679555	3679556	SAHV_1205	SAHV_1206			TRUE	0.994	-7.000	0.031	0.030	Y	NA
3679556	3679557	SAHV_1206	SAHV_1207			TRUE	0.996	-81.000	0.305	1.000	Y	NA
3679557	3679558	SAHV_1207	SAHV_1208			TRUE	0.921	3.000	0.135	1.000		NA
3679558	3679559	SAHV_1208	SAHV_1209			TRUE	0.874	7.000	0.105	1.000		NA
3679559	3679560	SAHV_1209	SAHV_1210			TRUE	0.996	-3.000	0.704	1.000	Y	NA
3679560	3679561	SAHV_1210	SAHV_1211			FALSE	0.197	228.000	0.196	1.000		NA
3679561	3679562	SAHV_1211	SAHV_1212		cfxE	TRUE	0.893	1.000	0.013	1.000		NA
3679562	3679563	SAHV_1212	SAHV_1213	cfxE		TRUE	0.800	7.000	0.019	1.000	N	NA
3679565	3679566	SAHV_1215	SAHV_1216			TRUE	0.940	15.000	0.567	NA		NA
3679566	3679567	SAHV_1216	SAHV_1217		recG	FALSE	0.200	190.000	0.074	1.000		NA
3679567	3679568	SAHV_1217	SAHV_1218	recG		FALSE	0.117	218.000	0.078	NA	N	NA
3679568	3679569	SAHV_1218	SAHV_1219		plsX	TRUE	0.778	5.000	0.020	NA	N	NA
3679569	3679570	SAHV_1219	SAHV_1220	plsX	fabD	TRUE	0.996	-7.000	0.106	0.005	Y	NA
3679570	3679571	SAHV_1220	SAHV_1221	fabD	fabG	TRUE	0.997	-13.000	0.149	0.005	Y	NA
3679571	3679572	SAHV_1221	SAHV_1222	fabG	hmrB	FALSE	0.274	435.000	0.100	0.005	Y	NA
3679572	3679573	SAHV_1222	SAHV_1223	hmrB	rnc	FALSE	0.391	116.000	0.068	1.000	N	NA
3679573	3679574	SAHV_1223	SAHV_1224	rnc	smc	FALSE	0.358	147.000	0.120	1.000	N	NA
3679574	3679575	SAHV_1224	SAHV_1225	smc		TRUE	0.981	0.000	0.165	0.010	N	NA
3679575	3679576	SAHV_1225	SAHV_1226			TRUE	0.969	-13.000	0.081	1.000		NA
3679576	3679577	SAHV_1226	SAHV_1227		ffh	TRUE	0.851	26.000	0.151	1.000		NA
3679577	3679578	SAHV_1227	SAHV_1228	ffh	rpsP	FALSE	0.091	435.000	0.361	1.000	N	NA
3679578	3679579	SAHV_1228	SAHV_1229	rpsP	rimM	TRUE	0.792	188.000	0.342	0.019	Y	NA
3679579	3679580	SAHV_1229	SAHV_1230	rimM	trmD	TRUE	0.994	0.000	0.672	1.000	Y	NA
3679580	3679581	SAHV_1230	SAHV_1231	trmD	rplS	TRUE	0.888	103.000	0.567	1.000	Y	NA
3679583	3679584	SAHV_1233	SAHV_1234		rnhB	TRUE	0.978	-16.000	0.148	1.000		NA
3679584	3679585	SAHV_1234	SAHV_1235	rnhB	sucC	FALSE	0.321	109.000	0.015	1.000	N	NA
3679585	3679586	SAHV_1235	SAHV_1236	sucC	sucD	TRUE	0.985	22.000	0.173	0.001	Y	NA
3679586	3679587	SAHV_1236	SAHV_1237	sucD	lytN	FALSE	0.105	227.000	0.034	1.000		NA
3679587	3679588	SAHV_1237	SAHV_1238	lytN	fmhC	TRUE	0.918	28.000	0.500	1.000		NA
3679588	3679589	SAHV_1238	SAHV_1239	fmhC		FALSE	0.129	173.000	0.000	1.000	N	NA
3679589	3679590	SAHV_1239	SAHV_1240			TRUE	0.653	180.000	0.238	1.000	Y	NA
3679590	3679591	SAHV_1240	SAHV_1241		gid	FALSE	0.347	156.000	0.137	1.000	N	NA
3679591	3679592	SAHV_1241	SAHV_1242	gid	xerC	FALSE	0.048	418.000	0.105	1.000	N	NA
3679592	3679593	SAHV_1242	SAHV_1243	xerC	clpQ	TRUE	0.961	-3.000	0.113	1.000	N	NA
3679593	3679594	SAHV_1243	SAHV_1244	clpQ	clpY	TRUE	0.939	66.000	0.752	1.000	Y	NA
3679594	3679595	SAHV_1244	SAHV_1245	clpY	codY	TRUE	0.843	25.000	0.131	1.000	N	NA
3679595	3679596	SAHV_1245	SAHV_1246	codY	rpsB	FALSE	0.035	347.000	0.006	1.000	N	NA
3679596	3679597	SAHV_1246	SAHV_1247	rpsB		TRUE	0.772	182.000	0.748	1.000	Y	NA
3679597	3679598	SAHV_1247	SAHV_1248		smbA	TRUE	0.572	137.000	0.416	1.000	N	NA
3679598	3679599	SAHV_1248	SAHV_1249	smbA	frr	TRUE	0.948	19.000	0.626	1.000	N	NA
3679599	3679600	SAHV_1249	SAHV_1250	frr	uppS	FALSE	0.125	373.000	0.409	1.000	N	NA
3679600	3679601	SAHV_1250	SAHV_1251	uppS	cdsA	TRUE	0.965	7.000	0.113	1.000	Y	NA
3679601	3679602	SAHV_1251	SAHV_1252	cdsA		FALSE	0.127	212.000	0.040	1.000	N	NA
3679602	3679603	SAHV_1252	SAHV_1253		proS	TRUE	0.845	20.000	0.095	1.000	N	NA
3679603	3679604	SAHV_1253	SAHV_1254	proS	polC	FALSE	0.190	258.000	0.070	0.048	N	NA
3679604	3679605	SAHV_1254	SAHV_1255	polC		FALSE	0.059	290.000	0.059	NA		NA
3679605	3679606	SAHV_1255	SAHV_1256		nusA	TRUE	0.944	21.000	0.759	NA		NA
3679606	3679607	SAHV_1256	SAHV_1257	nusA		TRUE	0.970	21.000	0.323	NA	Y	NA
3679607	3679608	SAHV_1257	SAHV_1258			TRUE	0.979	-3.000	0.408	NA	N	NA
3679608	3679609	SAHV_1258	SAHV_1259		infB	TRUE	0.977	5.000	0.223	1.000	Y	NA
3679609	3679610	SAHV_1259	SAHV_1260	infB	rbfA	FALSE	0.334	386.000	0.530	1.000	Y	NA
3679610	3679611	SAHV_1260	SAHV_1261	rbfA	truB	TRUE	0.619	169.000	0.111	1.000	Y	NA
3679611	3679612	SAHV_1261	SAHV_1262	truB	ribC	TRUE	0.924	15.000	0.308	1.000	N	NA
3679612	3679613	SAHV_1262	SAHV_1263	ribC	rpsO	FALSE	0.453	115.000	0.119	1.000	N	NA
3679613	3679614	SAHV_1263	SAHV_1264	rpsO	pnpA	FALSE	0.302	369.000	0.335	1.000	Y	NA
3679614	3679615	SAHV_1264	SAHV_1265	pnpA		FALSE	0.073	236.000	0.002	1.000		NA
3679615	3679616	SAHV_1265	SAHV_1266		spoIIIE	FALSE	0.078	257.000	0.026	1.000		NA
3679616	3679617	SAHV_1266	SAHV_1267	spoIIIE		TRUE	0.892	5.000	0.115	1.000	N	NA
3679617	3679618	SAHV_1267	SAHV_1268			TRUE	0.770	31.000	0.093	1.000		NA
3679618	3679619	SAHV_1268	SAHV_1269			TRUE	0.993	0.000	0.872	0.005		NA
3679619	3679620	SAHV_1269	SAHV_1270			TRUE	0.975	0.000	0.397	1.000		NA
3679620	3679621	SAHV_1270	SAHV_1271			TRUE	0.643	105.000	0.114	0.056		NA
3679621	3679622	SAHV_1271	SAHV_1272			TRUE	0.886	19.000	0.163	1.000		NA
3679622	3679623	SAHV_1272	SAHV_1273		pgsA	TRUE	0.621	34.000	0.009	1.000		NA
3679623	3679624	SAHV_1273	SAHV_1274	pgsA	cinA	FALSE	0.181	224.000	0.151	1.000		NA
3679624	3679625	SAHV_1274	SAHV_1275	cinA	recA	FALSE	0.277	165.000	0.083	1.000		NA
3679625	3679626	SAHV_1275	SAHV_1276	recA		FALSE	0.039	354.000	0.018	1.000		NA
3679628	3679629	SAHV_1278	SAHV_1279			FALSE	0.252	140.000	0.021	1.000		NA
3679629	3679630	SAHV_1279	SAHV_1280			TRUE	0.996	1.000	0.437	0.001	Y	NA
3679630	3679631	SAHV_1280	SAHV_1281			FALSE	0.213	94.000	0.000	NA		NA
3679631	3679632	SAHV_1281	SAHV_1282			FALSE	0.181	134.000	0.002	NA		NA
3679632	3679633	SAHV_1282	SAHV_1283			TRUE	0.891	1.000	0.041	NA		NA
3679633	3679634	SAHV_1283	SAHV_1284			TRUE	0.771	27.000	0.091	NA		NA
3679634	3679635	SAHV_1284	SAHV_1285		mutS	FALSE	0.033	303.000	0.003	NA		NA
3679635	3679636	SAHV_1285	SAHV_1286	mutS	mutL	TRUE	0.986	13.000	0.220	0.002	Y	NA
3679636	3679637	SAHV_1286	SAHV_1287	mutL	glpP	TRUE	0.789	15.000	0.020	1.000	N	NA
3679639	3679640	SAHV_1289	SAHV_1290	glpF	glpK	FALSE	0.336	129.000	0.057	1.000	N	NA
3679640	3679641	SAHV_1290	SAHV_1291	glpK	glpD	TRUE	0.854	110.000	0.013	0.001	Y	NA
3679641	3679642	SAHV_1291	SAHV_1292	glpD		FALSE	0.245	150.000	0.029	1.000	N	NA
3679642	3679643	SAHV_1292	SAHV_1293		miaA	TRUE	0.794	18.000	0.025	1.000	N	NA
3679643	3679644	SAHV_1293	SAHV_1294	miaA		TRUE	0.786	15.000	0.016	1.000		NA
3679646	3679647	SAHV_1296	SAHV_1297			TRUE	0.832	19.000	0.065	1.000		NA
3679647	3679648	SAHV_1297	SAHV_1298		glnR	FALSE	0.095	243.000	0.046	1.000	N	NA
3679648	3679649	SAHV_1298	SAHV_1299	glnR	glnA	TRUE	0.855	19.000	0.103	1.000	N	NA
3679649	3679650	SAHV_1299	SAHV_1300	glnA		FALSE	0.008	1895.000	0.000	NA		NA
3679650	3679651	SAHV_1300	SAHV_1301			FALSE	0.009	1234.000	0.000	NA		NA
3679651	3679652	SAHV_1301	SAHV_1302			FALSE	0.009	743.000	0.000	NA		NA
3679652	3679653	SAHV_1302	SAHV_1303			FALSE	0.009	723.000	0.000	NA		NA
3679655	3679656	SAHV_1305	SAHV_1306			TRUE	0.933	21.000	0.571	NA		NA
3679656	3679657	SAHV_1306	SAHV_1307			FALSE	0.194	184.000	0.057	1.000	N	NA
3679657	3679658	SAHV_1307	SAHV_1308			FALSE	0.299	64.000	0.000	NA		NA
3679658	3679659	SAHV_1308	SAHV_1309			TRUE	0.913	-31.000	0.000	NA		NA
3679659	3679660	SAHV_1309	SAHV_1310			TRUE	0.959	4.000	0.500	1.000		NA
3679660	3679661	SAHV_1310	SAHV_1311			TRUE	0.998	-3.000	0.857	0.011	Y	NA
3679667	3679668	SAHV_1317	SAHV_1318	dhoM	thrC	TRUE	0.954	6.000	0.021	1.000	Y	NA
3679668	3679669	SAHV_1318	SAHV_1319	thrC	thrB	TRUE	0.986	2.000	0.221	1.000	Y	NA
3679669	3679670	SAHV_1319	SAHV_1320	thrB		FALSE	0.492	58.000	0.013	1.000		NA
3679671	3679672	SAHV_1321	SAHV_1322			FALSE	0.345	218.000	0.667	NA		NA
3679673	3679674	SAHV_1323	SAHV_1324	katA	rpmG	FALSE	0.329	91.000	0.006	1.000	N	NA
3679674	3679675	SAHV_1324	SAHV_1325	rpmG	rpsN	FALSE	0.219	454.000	0.052	0.019	Y	NA
3679675	3679676	SAHV_1325	SAHV_1326	rpsN		FALSE	0.207	157.000	0.015	1.000	N	NA
3679676	3679677	SAHV_1326	SAHV_1327			TRUE	0.759	22.000	0.049	NA		NA
3679679	3679680	SAHV_1329	SAHV_1330			FALSE	0.413	137.000	0.200	NA		NA
3679680	3679681	SAHV_1330	SAHV_1331		tkt	FALSE	0.493	121.000	0.240	NA		NA
3679681	3679682	SAHV_1331	SAHV_1332	tkt		FALSE	0.043	278.000	0.000	1.000		NA
3679682	3679683	SAHV_1332	SAHV_1333			FALSE	0.143	179.000	0.026	NA		NA
3679683	3679684	SAHV_1333	SAHV_1334			FALSE	0.212	124.000	0.010	NA	N	NA
3679684	3679685	SAHV_1334	SAHV_1335			TRUE	0.987	4.000	0.669	NA	Y	NA
3679687	3679688	SAHV_1337	SAHV_1338	opuD	citB	FALSE	0.012	947.000	0.000	1.000	N	NA
3679688	3679689	SAHV_1338	SAHV_1339	citB		FALSE	0.161	180.000	0.015	1.000		NA
3679690	3679691	SAHV_1340	SAHV_1341			FALSE	0.024	376.000	0.008	NA		NA
3679692	3679693	SAHV_1342	SAHV_1343	parE	parC	TRUE	0.997	0.000	0.552	0.002	Y	NA
3679693	3679694	SAHV_1343	SAHV_1344	parC	alsT	FALSE	0.052	250.000	0.000	1.000	N	NA
3679694	3679695	SAHV_1344	SAHV_1345	alsT	glcT	FALSE	0.041	500.000	0.119	1.000		NA
3679695	3679696	SAHV_1345	SAHV_1346	glcT		FALSE	0.391	47.000	0.000	NA		NA
3679696	3679697	SAHV_1346	SAHV_1347			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3679697	3679698	SAHV_1347	SAHV_1348		fmtC	FALSE	0.018	481.000	0.018	NA		NA
3679704	3679705	SAHV_1354	SAHV_1355			FALSE	0.016	492.000	0.000	1.000	N	NA
3679705	3679706	SAHV_1355	SAHV_1356		trpG	TRUE	0.994	-3.000	0.021	0.001	Y	NA
3679706	3679707	SAHV_1356	SAHV_1357	trpG	trpD	TRUE	0.950	6.000	0.006	1.000	Y	NA
3679707	3679708	SAHV_1357	SAHV_1358	trpD	trpC	TRUE	0.986	2.000	0.216	1.000	Y	NA
3679708	3679709	SAHV_1358	SAHV_1359	trpC	trpF	TRUE	0.996	0.000	0.264	0.002	Y	NA
3679709	3679710	SAHV_1359	SAHV_1360	trpF	trpB	TRUE	0.998	-7.000	0.375	0.002	Y	NA
3679710	3679711	SAHV_1360	SAHV_1361	trpB	trpA	TRUE	0.998	-7.000	0.248	0.001	Y	NA
3679711	3679712	SAHV_1361	SAHV_1362	trpA	femA	FALSE	0.033	322.000	0.000	1.000	N	NA
3679712	3679713	SAHV_1362	SAHV_1363	femA	femB	TRUE	0.993	19.000	1.000	0.006	Y	NA
3679713	3679714	SAHV_1363	SAHV_1364	femB		FALSE	0.028	289.000	0.000	NA		NA
3679714	3679715	SAHV_1364	SAHV_1365			FALSE	0.046	230.000	0.000	NA		NA
3679716	3679717	SAHV_1366	SAHV_1367			FALSE	0.215	124.000	0.000	1.000		NA
3679717	3679718	SAHV_1367	SAHV_1368			TRUE	0.995	-7.000	0.059	0.024	Y	NA
3679718	3679719	SAHV_1368	SAHV_1369			TRUE	0.996	-13.000	0.353	1.000	Y	NA
3679719	3679720	SAHV_1369	SAHV_1370			TRUE	0.998	-7.000	0.647	0.038	Y	NA
3679720	3679721	SAHV_1370	SAHV_1371			FALSE	0.095	304.000	0.182	NA		NA
3679723	3679724	SAHV_1373	SAHV_1374		pstB	TRUE	0.967	7.000	0.182	NA	Y	NA
3679724	3679725	SAHV_1374	SAHV_1375	pstB		TRUE	0.956	47.000	0.125	0.002	Y	NA
3679725	3679726	SAHV_1375	SAHV_1376			TRUE	0.996	2.000	0.485	0.002	Y	NA
3679726	3679727	SAHV_1376	SAHV_1377			TRUE	0.506	191.000	0.077	1.000	Y	NA
3679730	3679731	SAHV_1380	SAHV_1381		lysC	FALSE	0.012	1062.000	0.000	1.000		NA
3679731	3679732	SAHV_1381	SAHV_1382	lysC	asd	TRUE	0.860	64.000	0.119	1.000	Y	NA
3679732	3679733	SAHV_1382	SAHV_1383	asd	dapA	TRUE	0.972	2.000	0.015	1.000	Y	NA
3679733	3679734	SAHV_1383	SAHV_1384	dapA	dapB	TRUE	0.985	-3.000	0.014	1.000	Y	NA
3679734	3679735	SAHV_1384	SAHV_1385	dapB	dapD	TRUE	0.931	27.000	0.036	1.000	Y	NA
3679735	3679736	SAHV_1385	SAHV_1386	dapD		TRUE	0.544	143.000	0.372	1.000		NA
3679736	3679737	SAHV_1386	SAHV_1387			TRUE	0.861	5.000	0.058	1.000		NA
3679737	3679738	SAHV_1387	SAHV_1388		lysA	TRUE	0.947	-10.000	0.008	1.000	N	NA
3679739	3679740	SAHV_1389	SAHV_1390		cspA	FALSE	0.068	197.000	0.000	NA		NA
3679740	3679741	SAHV_1390	SAHV_1391	cspA		FALSE	0.240	171.000	0.105	NA		NA
3679742	3679743	SAHV_1392	SAHV_1393			TRUE	0.762	25.000	0.067	NA		NA
3679743	3679744	SAHV_1393	SAHV_1394			TRUE	0.861	32.000	0.373	NA		NA
3679745	3679746	SAHV_1395	SAHV_1396	braB		FALSE	0.141	226.000	0.136	NA	N	NA
3679746	3679747	SAHV_1396	SAHV_1397			TRUE	0.950	14.000	0.822	NA		NA
3679747	3679748	SAHV_1397	SAHV_1398			FALSE	0.254	181.000	0.156	NA		NA
3679748	3679749	SAHV_1398	SAHV_1399			TRUE	0.857	29.000	0.280	NA		NA
3679749	3679750	SAHV_1399	SAHV_1400		odhB	FALSE	0.010	580.000	0.000	NA		NA
3679750	3679751	SAHV_1400	SAHV_1401	odhB	odhA	TRUE	0.984	14.000	0.667	1.000	Y	NA
3679751	3679752	SAHV_1401	SAHV_1402	odhA	arlS	FALSE	0.050	284.000	0.006	1.000	N	NA
3679752	3679753	SAHV_1402	SAHV_1403	arlS		TRUE	0.997	-3.000	0.438	0.078	Y	NA
3679753	3679754	SAHV_1403	SAHV_1404			FALSE	0.012	471.000	0.000	NA		NA
3679754	3679755	SAHV_1404	SAHV_1405			FALSE	0.178	117.000	0.000	NA		NA
3679755	3679756	SAHV_1405	SAHV_1406		murG	TRUE	0.788	17.000	0.016	1.000	N	NA
3679756	3679757	SAHV_1406	SAHV_1407	murG		TRUE	0.763	12.000	0.014	1.000		NA
3679757	3679758	SAHV_1407	SAHV_1408		ctpA	FALSE	0.038	400.000	0.046	1.000		NA
3679758	3679759	SAHV_1408	SAHV_1409	ctpA		FALSE	0.137	192.000	0.045	NA		NA
3679759	3679760	SAHV_1409	SAHV_1410			TRUE	0.926	0.000	0.080	NA		NA
3679760	3679761	SAHV_1410	SAHV_1411			TRUE	0.874	12.000	0.154	1.000	N	NA
3679761	3679762	SAHV_1411	SAHV_1412			TRUE	0.998	-7.000	0.615	0.002	Y	NA
3679762	3679763	SAHV_1412	SAHV_1413			FALSE	0.227	86.000	0.000	NA		NA
3679763	3679764	SAHV_1413	SAHV_1414		dfrA	TRUE	0.645	15.000	0.000	NA		NA
3679764	3679765	SAHV_1414	SAHV_1415	dfrA	thyA	FALSE	0.312	200.000	0.295	1.000	N	NA
3679765	3679766	SAHV_1415	SAHV_1416	thyA		FALSE	0.018	424.000	0.003	NA		NA
3679766	3679767	SAHV_1416	SAHV_1417			TRUE	0.653	16.000	0.000	NA		NA
3679767	3679768	SAHV_1417	SAHV_1418			TRUE	0.787	38.000	0.000	0.007		NA
3679768	3679769	SAHV_1418	SAHV_1419			TRUE	0.860	12.000	0.167	NA		NA
3679770	3679771	SAHV_1420	SAHV_1421			FALSE	0.022	483.000	0.039	NA		NA
3679772	3679773	SAHV_1422	SAHV_1423	ebhA	ebhB	TRUE	0.885	61.000	0.000	0.014	Y	NA
3679773	3679774	SAHV_1423	SAHV_1424	ebhB		FALSE	0.021	398.000	0.000	1.000		NA
3679774	3679775	SAHV_1424	SAHV_1425			FALSE	0.159	156.000	0.000	1.000		NA
3679775	3679776	SAHV_1425	SAHV_1426			TRUE	0.901	31.000	0.006	1.000	Y	NA
3679776	3679777	SAHV_1426	SAHV_1427			TRUE	0.718	95.000	0.012	1.000	Y	NA
3679777	3679778	SAHV_1427	SAHV_1428			FALSE	0.017	476.000	0.000	1.000	N	NA
3679778	3679779	SAHV_1428	SAHV_1429			TRUE	0.701	20.000	0.000	1.000		NA
3679781	3679782	SAHV_1431	SAHV_1432			FALSE	0.231	84.000	0.000	NA		NA
3679782	3679783	SAHV_1432	SAHV_1433			FALSE	0.013	434.000	0.000	NA		NA
3679783	3679784	SAHV_1433	SAHV_1434			FALSE	0.201	101.000	0.000	NA		NA
3679784	3679785	SAHV_1434	SAHV_1435			TRUE	0.938	14.000	0.579	NA		NA
3679785	3679786	SAHV_1435	SAHV_1436			TRUE	0.970	-7.000	0.165	NA		NA
3679787	3679788	SAHV_1437	SAHV_1438	recU	pbp2	TRUE	0.979	-3.000	0.319	1.000		NA
3679789	3679790	SAHV_1439	SAHV_1440		nth	TRUE	0.759	5.000	0.009	NA		NA
3679790	3679791	SAHV_1440	SAHV_1441	nth		TRUE	0.991	-10.000	0.075	NA	Y	NA
3679791	3679792	SAHV_1441	SAHV_1442		asnS	FALSE	0.096	328.000	0.234	NA	N	NA
3679792	3679793	SAHV_1442	SAHV_1443	asnS	dinG	FALSE	0.051	322.000	0.030	1.000	N	NA
3679793	3679794	SAHV_1443	SAHV_1444	dinG		TRUE	0.811	24.000	0.074	1.000	N	NA
3679794	3679795	SAHV_1444	SAHV_1445			TRUE	0.955	-13.000	0.023	1.000	N	NA
3679795	3679796	SAHV_1445	SAHV_1446			TRUE	0.896	5.000	0.126	1.000	N	NA
3679796	3679797	SAHV_1446	SAHV_1447			FALSE	0.072	244.000	0.038	NA		NA
3679797	3679798	SAHV_1447	SAHV_1448			FALSE	0.032	336.000	0.013	NA		NA
3679798	3679799	SAHV_1448	SAHV_1449			TRUE	0.579	54.000	0.083	NA		NA
3679799	3679800	SAHV_1449	SAHV_1450			TRUE	0.968	-10.000	0.127	NA		NA
3679800	3679801	SAHV_1450	SAHV_1451			TRUE	0.915	14.000	0.353	NA		NA
3679801	3679802	SAHV_1451	SAHV_1452		aroA	TRUE	0.779	7.000	0.007	1.000	N	NA
3679802	3679803	SAHV_1452	SAHV_1453	aroA	aroB	TRUE	0.953	10.000	0.051	1.000	Y	NA
3679803	3679804	SAHV_1453	SAHV_1454	aroB	aroC	TRUE	0.977	26.000	0.110	0.002	Y	NA
3679804	3679805	SAHV_1454	SAHV_1455	aroC		FALSE	0.016	386.000	0.000	NA		NA
3679805	3679806	SAHV_1455	SAHV_1456			TRUE	0.531	29.000	0.000	NA		NA
3679806	3679807	SAHV_1456	SAHV_1457		ndk	FALSE	0.346	55.000	0.000	NA		NA
3679807	3679808	SAHV_1457	SAHV_1458	ndk	gerCC	FALSE	0.423	92.000	0.054	1.000	N	NA
3679808	3679809	SAHV_1458	SAHV_1459	gerCC	gerCB	TRUE	0.973	2.000	0.020	1.000	Y	NA
3679809	3679810	SAHV_1459	SAHV_1460	gerCB		TRUE	0.802	3.000	0.008	NA		NA
3679810	3679811	SAHV_1460	SAHV_1461		hu	FALSE	0.014	431.000	0.000	NA		NA
3679811	3679812	SAHV_1461	SAHV_1462	hu	gpsA	FALSE	0.193	171.000	0.025	1.000	N	NA
3679812	3679813	SAHV_1462	SAHV_1463	gpsA		TRUE	0.844	17.000	0.068	1.000		NA
3679813	3679814	SAHV_1463	SAHV_1464			FALSE	0.107	222.000	0.032	1.000		NA
3679814	3679815	SAHV_1464	SAHV_1465			FALSE	0.011	529.000	0.000	NA		NA
3679815	3679816	SAHV_1465	SAHV_1466		cmk	FALSE	0.196	106.000	0.000	NA		NA
3679818	3679819	SAHV_1468	SAHV_1469		ebpS	FALSE	0.031	402.000	0.022	1.000		NA
3679819	3679820	SAHV_1469	SAHV_1470	ebpS		FALSE	0.302	153.000	0.079	1.000		NA
3679820	3679821	SAHV_1470	SAHV_1471			TRUE	0.988	-10.000	0.508	NA		NA
3679823	3679824	SAHV_1473	SAHV_1474			FALSE	0.015	402.000	0.000	NA		NA
3679824	3679825	SAHV_1474	SAHV_1475		graD	FALSE	0.012	471.000	0.000	NA		NA
3679825	3679826	SAHV_1475	SAHV_1476	graD		FALSE	0.330	58.000	0.000	NA		NA
3679826	3679827	SAHV_1476	SAHV_1477			FALSE	0.221	90.000	0.000	NA		NA
3679827	3679828	SAHV_1477	SAHV_1478			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3679828	3679829	SAHV_1478	SAHV_1479		srrB	FALSE	0.025	304.000	0.000	NA		NA
3679829	3679830	SAHV_1479	SAHV_1480	srrB	srrA	TRUE	0.993	-34.000	0.111	1.000	Y	NA
3679830	3679831	SAHV_1480	SAHV_1481	srrA	rluB	FALSE	0.305	133.000	0.046	1.000	N	NA
3679831	3679832	SAHV_1481	SAHV_1482	rluB		TRUE	0.975	-7.000	0.224	NA	N	NA
3679832	3679833	SAHV_1482	SAHV_1483			TRUE	0.987	-7.000	0.570	NA		NA
3679835	3679836	SAHV_1485	SAHV_1486	xerD		TRUE	0.577	49.000	0.029	1.000	N	NA
3679836	3679837	SAHV_1486	SAHV_1487			FALSE	0.341	105.000	0.021	1.000	N	NA
3679839	3679840	SAHV_1489	SAHV_1490			TRUE	0.653	16.000	0.000	NA		NA
3679843	3679844	SAHV_1493	SAHV_1494		graE	FALSE	0.063	230.000	0.000	1.000	N	NA
3679845	3679846	SAHV_1495	SAHV_1496	malA	malR	TRUE	0.946	16.000	0.500	1.000	N	NA
3679846	3679847	SAHV_1496	SAHV_1497	malR		FALSE	0.099	194.000	0.000	1.000		NA
3679847	3679848	SAHV_1497	SAHV_1498			FALSE	0.017	467.000	0.000	1.000		NA
3679848	3679849	SAHV_1498	SAHV_1499		gnd	FALSE	0.164	316.000	0.000	1.000	Y	NA
3679849	3679850	SAHV_1499	SAHV_1500	gnd		FALSE	0.471	68.000	0.035	1.000	N	NA
3679850	3679851	SAHV_1500	SAHV_1501			FALSE	0.010	569.000	0.000	NA		NA
3679851	3679852	SAHV_1501	SAHV_1502			TRUE	0.823	14.000	0.097	NA		NA
3679852	3679853	SAHV_1502	SAHV_1503		bmfBB	FALSE	0.042	351.000	0.058	NA		NA
3679853	3679854	SAHV_1503	SAHV_1504	bmfBB	bfmBAB	TRUE	0.991	13.000	0.882	0.055	Y	NA
3679854	3679855	SAHV_1504	SAHV_1505	bfmBAB	bfmBAA	TRUE	0.998	0.000	0.897	0.001	Y	NA
3679855	3679856	SAHV_1505	SAHV_1506	bfmBAA		TRUE	0.980	16.000	0.414	1.000	Y	NA
3679856	3679857	SAHV_1506	SAHV_1507		recN	FALSE	0.197	151.000	0.002	1.000	N	NA
3679857	3679858	SAHV_1507	SAHV_1508	recN	ahrC	TRUE	0.836	16.000	0.056	1.000	N	NA
3679858	3679859	SAHV_1508	SAHV_1509	ahrC	ispA	FALSE	0.019	432.000	0.000	1.000	N	NA
3679859	3679860	SAHV_1509	SAHV_1510	ispA		TRUE	0.972	-22.000	0.100	1.000	N	NA
3679860	3679861	SAHV_1510	SAHV_1511			TRUE	0.998	-7.000	0.412	0.001	Y	NA
3679861	3679862	SAHV_1511	SAHV_1512			TRUE	0.779	17.000	0.011	1.000	N	NA
3679862	3679863	SAHV_1512	SAHV_1513			TRUE	0.708	60.000	0.265	NA		NA
3679863	3679864	SAHV_1513	SAHV_1514		accC	TRUE	0.923	15.000	0.373	NA		NA
3679864	3679865	SAHV_1514	SAHV_1515	accC	accB	TRUE	0.993	0.000	0.086	0.003	Y	NA
3679865	3679866	SAHV_1515	SAHV_1516	accB		FALSE	0.043	474.000	0.120	1.000	N	NA
3679866	3679867	SAHV_1516	SAHV_1517			TRUE	0.854	26.000	0.160	1.000	N	NA
3679868	3679869	SAHV_1518	SAHV_1519			TRUE	0.956	14.000	1.000	NA		NA
3679872	3679873	SAHV_1522	SAHV_1523			TRUE	0.998	-7.000	0.316	0.001	Y	NA
3679873	3679874	SAHV_1523	SAHV_1524			TRUE	0.982	20.000	0.092	0.001	Y	NA
3679874	3679875	SAHV_1524	SAHV_1525			TRUE	0.555	159.000	0.019	1.000	Y	NA
3679875	3679876	SAHV_1525	SAHV_1526			FALSE	0.075	233.000	0.029	NA	N	NA
3679876	3679877	SAHV_1526	SAHV_1527			TRUE	0.958	-82.000	0.054	NA		NA
3679877	3679878	SAHV_1527	SAHV_1528			TRUE	0.909	-13.000	0.000	NA		NA
3679878	3679879	SAHV_1528	SAHV_1529			TRUE	0.985	-10.000	0.000	NA	Y	NA
3679879	3679880	SAHV_1529	SAHV_1530			TRUE	0.986	14.000	0.861	1.000	Y	NA
3679880	3679881	SAHV_1530	SAHV_1531			TRUE	0.997	-28.000	0.639	1.000	Y	NA
3679881	3679882	SAHV_1531	SAHV_1532			TRUE	0.531	52.000	0.015	1.000		NA
3679882	3679883	SAHV_1532	SAHV_1533			TRUE	0.911	-3.000	0.015	NA		NA
3679883	3679884	SAHV_1533	SAHV_1534		glcK	TRUE	0.894	0.000	0.024	NA		NA
3679884	3679885	SAHV_1534	SAHV_1535	glcK		TRUE	0.982	-3.000	0.496	NA		NA
3679885	3679886	SAHV_1535	SAHV_1536			TRUE	0.958	-19.000	0.058	NA		NA
3679886	3679887	SAHV_1536	SAHV_1537			TRUE	0.743	12.000	0.006	1.000		NA
3679887	3679888	SAHV_1537	SAHV_1538		rpmG	FALSE	0.136	209.000	0.045	1.000	N	NA
3679888	3679889	SAHV_1538	SAHV_1539	rpmG	pbp3	FALSE	0.316	113.000	0.019	1.000	N	NA
3679889	3679890	SAHV_1539	SAHV_1540	pbp3	sodA	FALSE	0.389	121.000	0.085	1.000	N	NA
3679890	3679891	SAHV_1540	SAHV_1541	sodA		FALSE	0.208	276.000	0.000	1.000	Y	NA
3679891	3679892	SAHV_1541	SAHV_1542			TRUE	0.997	-13.000	0.480	1.000	Y	NA
3679892	3679893	SAHV_1542	SAHV_1543			TRUE	0.947	42.000	0.148	0.099	Y	NA
3679893	3679894	SAHV_1543	SAHV_1544			FALSE	0.227	144.000	0.012	1.000	N	NA
3679894	3679895	SAHV_1544	SAHV_1545			TRUE	0.961	10.000	0.104	1.000	Y	NA
3679895	3679896	SAHV_1545	SAHV_1546			FALSE	0.288	114.000	0.032	NA		NA
3679896	3679897	SAHV_1546	SAHV_1547			TRUE	0.940	3.000	0.283	NA		NA
3679897	3679898	SAHV_1547	SAHV_1548		sigA	FALSE	0.465	131.000	0.239	NA		NA
3679898	3679899	SAHV_1548	SAHV_1549	sigA	dnaG	FALSE	0.210	224.000	0.209	1.000	N	NA
3679899	3679900	SAHV_1549	SAHV_1550	dnaG		FALSE	0.400	61.000	0.011	NA		NA
3679900	3679901	SAHV_1550	SAHV_1551			TRUE	0.941	11.000	0.621	NA		NA
3679903	3679904	SAHV_1553	SAHV_1554		bex	TRUE	0.845	22.000	0.108	1.000		NA
3679904	3679905	SAHV_1554	SAHV_1555	bex	cdd	TRUE	0.935	1.000	0.098	1.000		NA
3679905	3679906	SAHV_1555	SAHV_1556	cdd		TRUE	0.859	11.000	0.108	1.000	N	NA
3679906	3679907	SAHV_1556	SAHV_1557			TRUE	0.800	3.000	0.007	NA		NA
3679907	3679908	SAHV_1557	SAHV_1558		phoH	TRUE	0.969	1.000	0.457	NA		NA
3679908	3679909	SAHV_1558	SAHV_1559	phoH		FALSE	0.025	304.000	0.000	NA		NA
3679909	3679910	SAHV_1559	SAHV_1560			TRUE	0.800	17.000	0.055	NA		NA
3679910	3679911	SAHV_1560	SAHV_1561			TRUE	0.900	18.000	0.258	NA		NA
3679911	3679912	SAHV_1561	SAHV_1562		rpsU	FALSE	0.071	220.000	0.011	NA		NA
3679912	3679913	SAHV_1562	SAHV_1563	rpsU		FALSE	0.053	293.000	0.016	1.000		NA
3679913	3679914	SAHV_1563	SAHV_1564			TRUE	0.880	7.000	0.163	NA		NA
3679914	3679915	SAHV_1564	SAHV_1565			TRUE	0.944	2.000	0.227	NA		NA
3679915	3679916	SAHV_1565	SAHV_1566		dnaJ	TRUE	0.907	4.000	0.133	1.000	N	NA
3679916	3679917	SAHV_1566	SAHV_1567	dnaJ	dnaK	TRUE	0.873	136.000	0.196	0.002	Y	NA
3679917	3679918	SAHV_1567	SAHV_1568	dnaK	grpE	TRUE	0.936	69.000	0.224	0.005	Y	NA
3679918	3679919	SAHV_1568	SAHV_1569	grpE	hrcA	TRUE	0.855	32.000	0.286	1.000	N	NA
3679919	3679920	SAHV_1569	SAHV_1570	hrcA	hemN	FALSE	0.440	101.000	0.082	1.000	N	NA
3679924	3679925	SAHV_1574	SAHV_1575			TRUE	0.697	57.000	0.163	1.000		NA
3679925	3679926	SAHV_1575	SAHV_1576		comEB	TRUE	0.860	5.000	0.055	1.000		NA
3679926	3679927	SAHV_1576	SAHV_1577	comEB		FALSE	0.475	92.000	0.095	1.000	N	NA
3679927	3679928	SAHV_1577	SAHV_1578			TRUE	0.587	49.000	0.033	1.000		NA
3679928	3679929	SAHV_1578	SAHV_1579			TRUE	0.884	3.000	0.085	NA		NA
3679929	3679930	SAHV_1579	SAHV_1580			TRUE	0.937	1.000	0.149	NA		NA
3679930	3679931	SAHV_1580	SAHV_1581			TRUE	0.994	-10.000	0.199	1.000	Y	NA
3679931	3679932	SAHV_1581	SAHV_1582			TRUE	0.912	3.000	0.150	NA	N	NA
3679932	3679933	SAHV_1582	SAHV_1583		aroE	TRUE	0.866	4.000	0.089	NA	N	NA
3679933	3679934	SAHV_1583	SAHV_1584	aroE		TRUE	0.925	14.000	0.336	1.000		NA
3679934	3679935	SAHV_1584	SAHV_1585			TRUE	0.977	1.000	0.555	1.000		NA
3679935	3679936	SAHV_1585	SAHV_1586		pfs	TRUE	0.774	20.000	0.019	1.000		NA
3679938	3679939	SAHV_1588	SAHV_1589			FALSE	0.393	149.000	0.000	0.017		NA
3679939	3679940	SAHV_1589	SAHV_1590			FALSE	0.013	707.000	0.000	1.000		NA
3679940	3679941	SAHV_1590	SAHV_1591			FALSE	0.039	289.000	0.000	1.000		NA
3679941	3679942	SAHV_1591	SAHV_1592			TRUE	0.835	13.000	0.084	1.000		NA
3679942	3679943	SAHV_1592	SAHV_1593			TRUE	0.934	0.000	0.062	1.000		NA
3679943	3679944	SAHV_1593	SAHV_1594			TRUE	0.976	14.000	0.031	0.003	Y	NA
3679944	3679945	SAHV_1594	SAHV_1595			TRUE	0.968	2.000	0.429	1.000	N	NA
3679945	3679946	SAHV_1595	SAHV_1596			TRUE	0.997	-10.000	0.184	0.002	Y	NA
3679946	3679947	SAHV_1596	SAHV_1597		greA	FALSE	0.031	326.000	0.000	1.000	N	NA
3679947	3679948	SAHV_1597	SAHV_1598	greA	udk	TRUE	0.799	28.000	0.095	1.000	N	NA
3679948	3679949	SAHV_1598	SAHV_1599	udk		TRUE	0.944	0.000	0.100	1.000	N	NA
3679949	3679950	SAHV_1599	SAHV_1600			TRUE	0.985	12.000	0.156	0.001	Y	NA
3679950	3679951	SAHV_1600	SAHV_1601			TRUE	0.924	3.000	0.142	1.000		NA
3679951	3679952	SAHV_1601	SAHV_1602			FALSE	0.028	285.000	0.000	NA		NA
3679952	3679953	SAHV_1602	SAHV_1603			TRUE	0.945	15.000	0.651	NA		NA
3679953	3679954	SAHV_1603	SAHV_1604			TRUE	0.794	61.000	0.537	NA		NA
3679954	3679955	SAHV_1604	SAHV_1605		alaS	TRUE	0.563	63.000	0.110	NA		NA
3679955	3679956	SAHV_1605	SAHV_1606	alaS		FALSE	0.028	343.000	0.000	1.000	N	NA
3679956	3679957	SAHV_1606	SAHV_1607			TRUE	0.958	2.000	0.281	1.000		NA
3679957	3679958	SAHV_1607	SAHV_1608			FALSE	0.022	695.000	0.038	1.000		NA
3679958	3679959	SAHV_1608	SAHV_1609			TRUE	0.926	1.000	0.072	1.000	N	NA
3679961	3679962	SAHV_1611	SAHV_1612		csbD	FALSE	0.424	40.000	0.000	NA		NA
3679962	3679963	SAHV_1612	SAHV_1613	csbD		FALSE	0.203	100.000	0.000	NA		NA
3679965	3679966	SAHV_1615	SAHV_1616			FALSE	0.055	214.000	0.000	NA		NA
3679966	3679967	SAHV_1616	SAHV_1617		aspS	FALSE	0.131	146.000	0.000	NA		NA
3679967	3679968	SAHV_1617	SAHV_1618	aspS	hisS	TRUE	0.982	16.000	0.161	0.046	Y	NA
3679968	3679969	SAHV_1618	SAHV_1619	hisS	lytH	FALSE	0.017	461.000	0.000	1.000	N	NA
3679969	3679970	SAHV_1619	SAHV_1620	lytH		TRUE	0.928	-3.000	0.010	1.000	N	NA
3679970	3679971	SAHV_1620	SAHV_1621		relA	TRUE	0.883	12.000	0.177	1.000	N	NA
3679971	3679972	SAHV_1621	SAHV_1622	relA	apt	FALSE	0.039	428.000	0.068	1.000	N	NA
3679972	3679973	SAHV_1622	SAHV_1623	apt		TRUE	0.855	22.000	0.128	1.000	N	NA
3679973	3679974	SAHV_1623	SAHV_1624		secF	FALSE	0.110	203.000	0.007	1.000	N	NA
3679974	3679975	SAHV_1624	SAHV_1625	secF		FALSE	0.204	275.000	0.005	NA	Y	NA
3679975	3679976	SAHV_1625	SAHV_1626		tgt	TRUE	0.909	19.000	0.325	NA	N	NA
3679976	3679977	SAHV_1626	SAHV_1627	tgt	queA	TRUE	0.989	23.000	0.360	0.001	Y	NA
3679977	3679978	SAHV_1627	SAHV_1628	queA	ruvB	TRUE	0.914	2.000	0.069	1.000	N	NA
3679978	3679979	SAHV_1628	SAHV_1629	ruvB	ruvA	TRUE	0.985	32.000	0.549	0.002	Y	NA
3679979	3679980	SAHV_1629	SAHV_1630	ruvA		TRUE	0.762	14.000	0.009	1.000		NA
3679980	3679981	SAHV_1630	SAHV_1631		obg	TRUE	0.796	10.000	0.024	1.000		NA
3679981	3679982	SAHV_1631	SAHV_1632	obg	rpmA	FALSE	0.124	354.000	0.335	1.000		NA
3679982	3679983	SAHV_1632	SAHV_1633	rpmA		TRUE	0.963	12.000	0.203	NA	Y	NA
3679983	3679984	SAHV_1633	SAHV_1634		rplU	TRUE	0.971	6.000	0.208	NA	Y	NA
3679984	3679985	SAHV_1634	SAHV_1635	rplU		FALSE	0.077	236.000	0.008	1.000	N	NA
3679985	3679986	SAHV_1635	SAHV_1636			TRUE	0.997	0.000	0.550	0.003	Y	NA
3679986	3679987	SAHV_1636	SAHV_1637			FALSE	0.015	392.000	0.000	NA		NA
3679989	3679990	SAHV_1639	SAHV_1640			FALSE	0.014	429.000	0.000	NA		NA
3679990	3679991	SAHV_1640	SAHV_1641			FALSE	0.019	359.000	0.000	NA		NA
3679993	3679994	SAHV_1643	SAHV_1644	ant(9)	tnpC	FALSE	0.124	151.000	0.000	NA		NA
3679994	3679995	SAHV_1644	SAHV_1645	tnpC	tnpB	TRUE	0.662	7.000	0.000	NA		NA
3679995	3679996	SAHV_1645	SAHV_1646	tnpB	tnpA	TRUE	0.992	-3.000	0.000	0.007	Y	NA
3679996	3679997	SAHV_1646	SAHV_1647	tnpA		TRUE	0.628	119.000	0.000	1.000	Y	NA
3679997	3679998	SAHV_1647	SAHV_1648			TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3679998	3679999	SAHV_1648	SAHV_1649		folC	FALSE	0.046	270.000	0.000	1.000	N	NA
3679999	3680000	SAHV_1649	SAHV_1650	folC	valS	TRUE	0.864	13.000	0.006	0.098	N	NA
3680002	3680003	SAHV_1652	SAHV_1653			FALSE	0.465	34.000	0.000	NA		NA
3680003	3680004	SAHV_1653	SAHV_1654		hemL	FALSE	0.258	73.000	0.000	NA		NA
3680004	3680005	SAHV_1654	SAHV_1655	hemL	hemB	TRUE	0.956	48.000	0.126	0.002	Y	NA
3680005	3680006	SAHV_1655	SAHV_1656	hemB	hemD	TRUE	0.987	3.000	0.042	0.002	Y	NA
3680006	3680007	SAHV_1656	SAHV_1657	hemD	hemC	TRUE	0.973	22.000	0.020	0.002	Y	NA
3680007	3680008	SAHV_1657	SAHV_1658	hemC	hemX	TRUE	0.631	42.000	0.040	1.000	N	NA
3680008	3680009	SAHV_1658	SAHV_1659	hemX	hemA	TRUE	0.942	22.000	0.613	1.000	N	NA
3680009	3680010	SAHV_1659	SAHV_1660	hemA		FALSE	0.104	217.000	0.020	1.000		NA
3680010	3680011	SAHV_1660	SAHV_1661		clpX	FALSE	0.254	154.000	0.043	1.000		NA
3680011	3680012	SAHV_1661	SAHV_1662	clpX	tig	TRUE	0.783	151.000	0.033	0.002	Y	NA
3680012	3680013	SAHV_1662	SAHV_1663	tig		FALSE	0.153	163.000	0.012	NA		NA
3680013	3680014	SAHV_1663	SAHV_1664			TRUE	0.877	19.000	0.195	NA		NA
3680014	3680015	SAHV_1664	SAHV_1665		rplT	FALSE	0.218	142.000	0.004	1.000		NA
3680015	3680016	SAHV_1665	SAHV_1666	rplT	rpmI	TRUE	0.981	47.000	0.928	0.018	Y	NA
3680016	3680017	SAHV_1666	SAHV_1667	rpmI	infC	TRUE	0.975	29.000	0.652	1.000	Y	NA
3680017	3680018	SAHV_1667	SAHV_1668	infC		FALSE	0.070	238.000	0.004	1.000	N	NA
3680018	3680019	SAHV_1668	SAHV_1669		thrS	FALSE	0.019	426.000	0.000	1.000	N	NA
3680019	3680020	SAHV_1669	SAHV_1670	thrS	dnaI	FALSE	0.048	413.000	0.000	0.098	N	NA
3680020	3680021	SAHV_1670	SAHV_1671	dnaI	dnaB	TRUE	0.994	0.000	0.817	NA	Y	NA
3680021	3680022	SAHV_1671	SAHV_1672	dnaB		TRUE	0.924	1.000	0.109	NA	N	NA
3680022	3680023	SAHV_1672	SAHV_1673		gapB	FALSE	0.073	211.000	0.004	NA	N	NA
3680023	3680024	SAHV_1673	SAHV_1674	gapB		FALSE	0.188	170.000	0.020	1.000	N	NA
3680024	3680025	SAHV_1674	SAHV_1675			TRUE	0.844	16.000	0.066	1.000	N	NA
3680025	3680026	SAHV_1675	SAHV_1676		polA	TRUE	0.963	16.000	0.101	1.000	Y	NA
3680026	3680027	SAHV_1676	SAHV_1677	polA		FALSE	0.027	294.000	0.000	NA		NA
3680027	3680028	SAHV_1677	SAHV_1678		phoR	FALSE	0.011	499.000	0.000	NA		NA
3680028	3680029	SAHV_1678	SAHV_1679	phoR	phoP	TRUE	0.995	-3.000	0.159	0.047	Y	NA
3680029	3680030	SAHV_1679	SAHV_1680	phoP	citC	FALSE	0.022	390.000	0.000	1.000	N	NA
3680030	3680031	SAHV_1680	SAHV_1681	citC	citZ	TRUE	0.904	49.000	0.140	1.000	Y	NA
3680033	3680034	SAHV_1683	SAHV_1684	pykA	pfk	TRUE	0.985	22.000	0.261	0.005	Y	NA
3680036	3680037	SAHV_1686	SAHV_1687	accA		TRUE	0.996	0.000	0.234	0.001	Y	NA
3680037	3680038	SAHV_1687	SAHV_1688			FALSE	0.125	195.000	0.010	1.000	N	NA
3680038	3680039	SAHV_1688	SAHV_1689		dnaE	FALSE	0.047	450.000	0.127	1.000	N	NA
3680039	3680040	SAHV_1689	SAHV_1690	dnaE		TRUE	0.877	21.000	0.159	1.000		NA
3680040	3680041	SAHV_1690	SAHV_1691			FALSE	0.083	312.000	0.113	1.000		NA
3680047	3680048	SAHV_1697	SAHV_1698	ackA		TRUE	0.606	88.000	0.217	1.000	N	NA
3680048	3680049	SAHV_1698	SAHV_1699			FALSE	0.386	123.000	0.089	1.000	N	NA
3680049	3680050	SAHV_1699	SAHV_1700			FALSE	0.330	98.000	0.009	1.000		NA
3680050	3680051	SAHV_1700	SAHV_1701			TRUE	0.577	44.000	0.016	1.000		NA
3680051	3680052	SAHV_1701	SAHV_1702			TRUE	0.974	0.000	0.349	1.000	N	NA
3680052	3680053	SAHV_1702	SAHV_1703			FALSE	0.083	373.000	0.201	1.000	N	NA
3680054	3680055	SAHV_1704	SAHV_1705		rpsD	FALSE	0.051	244.000	0.005	NA	N	NA
3680055	3680056	SAHV_1705	SAHV_1706	rpsD	tnp	FALSE	0.101	192.000	0.000	1.000	N	NA
3680058	3680059	SAHV_1708	SAHV_1709			FALSE	0.331	115.000	0.027	1.000	N	NA
3680059	3680060	SAHV_1709	SAHV_1710		serA	TRUE	0.993	-13.000	0.113	1.000	Y	NA
3680061	3680062	SAHV_1711	SAHV_1712		ptaA	FALSE	0.354	107.000	0.062	NA		NA
3680062	3680063	SAHV_1712	SAHV_1713	ptaA		FALSE	0.291	128.000	0.025	1.000	N	NA
3680067	3680068	SAHV_1717	SAHV_1718		fhs	FALSE	0.031	333.000	0.000	1.000		NA
3680068	3680069	SAHV_1718	SAHV_1719	fhs	acsA	FALSE	0.018	440.000	0.000	1.000	N	NA
3680070	3680071	SAHV_1720	SAHV_1721	acuA	acuC	TRUE	0.807	25.000	0.075	1.000		NA
3680072	3680073	SAHV_1722	SAHV_1723	ccpA		FALSE	0.020	585.000	0.017	1.000	N	NA
3680073	3680074	SAHV_1723	SAHV_1724			FALSE	0.009	694.000	0.000	NA		NA
3680074	3680075	SAHV_1724	SAHV_1725			TRUE	0.607	74.000	0.222	NA		NA
3680075	3680076	SAHV_1725	SAHV_1726		murC	FALSE	0.336	74.000	0.014	NA		NA
3680076	3680077	SAHV_1726	SAHV_1727	murC		TRUE	0.897	24.000	0.017	0.005	N	NA
3680077	3680078	SAHV_1727	SAHV_1728			TRUE	0.870	21.000	0.143	1.000		NA
3680078	3680079	SAHV_1728	SAHV_1729			TRUE	0.904	29.000	0.511	NA		NA
3680079	3680080	SAHV_1729	SAHV_1730			TRUE	0.672	100.000	0.500	NA		NA
3680080	3680081	SAHV_1730	SAHV_1731			TRUE	0.565	65.000	0.081	1.000	N	NA
3680083	3680084	SAHV_1733	SAHV_1734			FALSE	0.044	471.000	0.117	1.000		NA
3680084	3680085	SAHV_1734	SAHV_1735			TRUE	0.888	15.000	0.154	1.000		NA
3680085	3680086	SAHV_1735	SAHV_1736			FALSE	0.014	550.000	0.000	1.000	N	NA
3680086	3680087	SAHV_1736	SAHV_1737			TRUE	0.975	4.000	0.143	1.000	Y	NA
3680087	3680088	SAHV_1737	SAHV_1738			FALSE	0.010	558.000	0.000	NA		NA
3680088	3680089	SAHV_1738	SAHV_1739			TRUE	0.897	17.000	0.233	NA		NA
3680089	3680090	SAHV_1739	SAHV_1740			TRUE	0.974	-3.000	0.233	1.000		NA
3680091	3680092	SAHV_1741	SAHV_1742			TRUE	0.952	-25.000	0.037	NA		NA
3680093	3680094	SAHV_1743	SAHV_1744	mrp	mrp	TRUE	0.877	0.000	0.000	1.000		NA
3680094	3680095	SAHV_1744	SAHV_1745	mrp		FALSE	0.022	326.000	0.000	NA	N	NA
3680095	3680096	SAHV_1745	SAHV_1746		leuS	TRUE	0.670	22.000	0.007	NA	N	NA
3680096	3680097	SAHV_1746	SAHV_1747	leuS		FALSE	0.038	291.000	0.000	1.000	N	NA
3680098	3680099	SAHV_1748	SAHV_1749			TRUE	0.982	-3.000	0.408	1.000		NA
3680100	3680101	SAHV_1750	SAHV_1751	rot		FALSE	0.016	510.000	0.000	1.000		NA
3680103	3680104	SAHV_1753	SAHV_1754		ribA	TRUE	0.975	13.000	0.022	0.002	Y	NA
3680104	3680105	SAHV_1754	SAHV_1755	ribA	ribB	TRUE	0.946	11.000	0.026	1.000	Y	NA
3680105	3680106	SAHV_1755	SAHV_1756	ribB	ribD	TRUE	0.982	7.000	0.456	1.000	Y	NA
3680106	3680107	SAHV_1756	SAHV_1757	ribD		FALSE	0.012	481.000	0.000	NA		NA
3680108	3680109	SAHV_1758	SAHV_1759			TRUE	0.875	0.000	0.000	1.000	N	NA
3680110	3680111	SAHV_1760	SAHV_1761			FALSE	0.032	276.000	0.000	NA		NA
3680112	3680113	SAHV_1762	SAHV_1763			FALSE	0.446	113.000	0.150	NA		NA
3680117	3680118	SAHV_1767	SAHV_1768			FALSE	0.155	178.000	0.034	NA		NA
3680118	3680119	SAHV_1768	SAHV_1769			TRUE	0.993	-3.000	0.069	0.075	Y	NA
3680119	3680120	SAHV_1769	SAHV_1770			FALSE	0.012	462.000	0.000	NA	N	NA
3680120	3680121	SAHV_1770	SAHV_1771			FALSE	0.092	176.000	0.000	NA		NA
3680121	3680122	SAHV_1771	SAHV_1772			TRUE	0.914	-81.000	0.000	NA		NA
3680123	3680124	SAHV_1773	SAHV_1774			FALSE	0.216	212.000	0.222	NA		NA
3680124	3680125	SAHV_1774	SAHV_1775		metK	FALSE	0.309	119.000	0.054	NA		NA
3680126	3680127	SAHV_1776	SAHV_1777	pckA		FALSE	0.161	124.000	0.000	NA		NA
3680128	3680129	SAHV_1778	SAHV_1779			TRUE	0.980	-19.000	0.182	1.000		NA
3680131	3680132	SAHV_1781	SAHV_1782	menC	menE	TRUE	0.835	5.000	0.029	1.000	N	NA
3680132	3680133	SAHV_1782	SAHV_1783	menE		FALSE	0.112	159.000	0.000	NA		NA
3680134	3680135	SAHV_1784	SAHV_1785			FALSE	0.236	81.000	0.000	NA		NA
3680135	3680136	SAHV_1785	SAHV_1786			FALSE	0.249	75.000	0.000	NA		NA
3680136	3680137	SAHV_1786	SAHV_1787			FALSE	0.419	41.000	0.000	NA		NA
3680137	3680138	SAHV_1787	SAHV_1788			FALSE	0.201	101.000	0.000	NA		NA
3680139	3680140	SAHV_1789	SAHV_1790			TRUE	0.605	22.000	0.000	NA		NA
3680140	3680141	SAHV_1790	SAHV_1791		tnp	FALSE	0.009	755.000	0.000	NA		NA
3680141	3680142	SAHV_1791	SAHV_1792	tnp		FALSE	0.046	452.000	0.000	0.053		NA
3680142	3680143	SAHV_1792	SAHV_1793			TRUE	0.993	-7.000	0.011	0.053	Y	NA
3680143	3680144	SAHV_1793	SAHV_1794		splF	FALSE	0.026	361.000	0.000	1.000	N	NA
3680144	3680145	SAHV_1794	SAHV_1795	splF	splD	TRUE	0.831	158.000	0.200	0.004	Y	NA
3680145	3680146	SAHV_1795	SAHV_1796	splD	splC	TRUE	0.885	121.000	0.200	0.004	Y	NA
3680146	3680147	SAHV_1796	SAHV_1797	splC	splB	TRUE	0.949	58.000	0.200	0.004	Y	NA
3680147	3680148	SAHV_1797	SAHV_1798	splB	splA	TRUE	0.879	125.000	0.200	0.004	Y	NA
3680148	3680149	SAHV_1798	SAHV_1799	splA		FALSE	0.013	436.000	0.000	NA		NA
3680152	3680153	SAHV_1802	SAHV_1803			TRUE	0.865	5.000	0.103	NA		NA
3680154	3680155	SAHV_1804	SAHV_1805	lukD	lukE	TRUE	0.949	2.000	0.000	0.004		NA
3680156	3680157	SAHV_1806	SAHV_1807			FALSE	0.009	834.000	0.000	NA		NA
3680157	3680158	SAHV_1807	SAHV_1808			FALSE	0.021	335.000	0.000	NA		NA
3680159	3680160	SAHV_1809	SAHV_1810	seg	sen	FALSE	0.119	283.000	0.000	0.016		NA
3680160	3680161	SAHV_1810	SAHV_1811	sen	yent2	TRUE	0.889	18.000	0.000	0.016		NA
3680161	3680162	SAHV_1811	SAHV_1812	yent2	yent1	TRUE	0.980	-40.000	0.000	0.016		NA
3680162	3680163	SAHV_1812	SAHV_1813	yent1	sei	FALSE	0.381	154.000	0.000	0.016		NA
3680163	3680164	SAHV_1813	SAHV_1814	sei	sem	TRUE	0.793	35.000	0.000	0.016		NA
3680164	3680165	SAHV_1814	SAHV_1815	sem	seo	FALSE	0.121	281.000	0.000	0.016		NA
3680165	3680166	SAHV_1815	SAHV_t0017	seo		FALSE	0.058	211.000	0.000	NA		NA
3680166	3680167	SAHV_t0017	SAHV_t0018			FALSE	0.370	51.000	0.000	NA		NA
3680167	3680168	SAHV_t0018	SAHV_t0019			TRUE	0.834	0.000	0.000	NA		NA
3680168	3680169	SAHV_t0019	SAHV_t0020			TRUE	0.653	16.000	0.000	NA		NA
3680169	3680170	SAHV_t0020	SAHV_t0021			TRUE	0.629	14.000	0.000	NA		NA
3680170	3680171	SAHV_t0021	SAHV_t0022			TRUE	0.642	10.000	0.000	NA		NA
3680171	3680172	SAHV_t0022	SAHV_t0023			TRUE	0.650	17.000	0.000	NA		NA
3680172	3680173	SAHV_t0023	SAHV_t0024			TRUE	0.631	19.000	0.000	NA		NA
3680173	3680174	SAHV_t0024	SAHV_1816			FALSE	0.015	401.000	0.000	NA		NA
3680174	3680175	SAHV_1816	SAHV_1817		hemY	FALSE	0.049	323.000	0.057	NA		NA
3680175	3680176	SAHV_1817	SAHV_1818	hemY	hemH	TRUE	0.970	24.000	0.069	0.026	Y	NA
3680176	3680177	SAHV_1818	SAHV_1819	hemH	hemE	TRUE	0.881	58.000	0.131	1.000	Y	NA
3680179	3680180	SAHV_1821	SAHV_1822			TRUE	0.956	-7.000	0.083	NA	N	NA
3680181	3680182	SAHV_1823	SAHV_1824	hit		FALSE	0.343	142.000	0.137	NA		NA
3680182	3680183	SAHV_1824	SAHV_1825			FALSE	0.037	735.000	0.190	NA		NA
3680183	3680184	SAHV_1825	SAHV_1826		prsA	FALSE	0.063	205.000	0.000	NA		NA
3680185	3680186	SAHV_1827	SAHV_1828	cbf1		TRUE	0.974	-3.000	0.291	NA		NA
3680186	3680187	SAHV_1828	SAHV_1829			TRUE	0.983	-10.000	0.330	NA		NA
3680187	3680188	SAHV_1829	SAHV_1830			FALSE	0.023	928.000	0.093	NA		NA
3680188	3680189	SAHV_1830	SAHV_1831			TRUE	0.684	69.000	0.321	NA		NA
3680189	3680190	SAHV_1831	SAHV_1832			FALSE	0.147	179.000	0.029	NA		NA
3680190	3680191	SAHV_1832	SAHV_1833		yhcR	FALSE	0.243	356.000	0.000	0.016	Y	NA
3680191	3680192	SAHV_1833	SAHV_1834	yhcR	yhcS	TRUE	0.989	22.000	0.536	0.011	Y	NA
3680194	3680195	SAHV_1836	SAHV_1837	citG		FALSE	0.094	196.000	0.009	NA		NA
3680195	3680196	SAHV_1837	SAHV_1838			FALSE	0.084	548.000	0.571	NA		NA
3680196	3680197	SAHV_1838	SAHV_1839			TRUE	0.691	25.000	0.021	NA		NA
3680197	3680198	SAHV_1839	SAHV_1840			FALSE	0.211	159.000	0.021	1.000	N	NA
3680198	3680199	SAHV_1840	SAHV_1841			TRUE	0.873	5.000	0.077	1.000	N	NA
3680199	3680200	SAHV_1841	SAHV_1842			FALSE	0.261	151.000	0.044	1.000	N	NA
3680200	3680201	SAHV_1842	SAHV_1843			TRUE	0.994	-13.000	0.154	1.000	Y	NA
3680201	3680202	SAHV_1843	SAHV_1844			FALSE	0.047	390.000	0.077	1.000		NA
3680204	3680205	SAHV_t0025	SAHV_t0026			FALSE	0.429	39.000	0.000	NA		NA
3680205	3680206	SAHV_t0026	SAHV_t0027			TRUE	0.629	14.000	0.000	NA		NA
3680206	3680207	SAHV_t0027	SAHV_t0028			TRUE	0.653	16.000	0.000	NA		NA
3680207	3680208	SAHV_t0028	SAHV_t0029			TRUE	0.653	8.000	0.000	NA		NA
3680208	3680209	SAHV_t0029	SAHV_t0030			TRUE	0.746	3.000	0.000	NA		NA
3680209	3680210	SAHV_t0030	SAHV_t0031			TRUE	0.653	8.000	0.000	NA		NA
3680210	3680211	SAHV_t0031	SAHV_t0032			TRUE	0.808	1.000	0.000	NA		NA
3680211	3680212	SAHV_t0032	SAHV_t0033			TRUE	0.632	11.000	0.000	NA		NA
3680212	3680213	SAHV_t0033	SAHV_t0034			TRUE	0.692	5.000	0.000	NA		NA
3680213	3680214	SAHV_t0034	SAHV_t0035			TRUE	0.713	4.000	0.000	NA		NA
3680214	3680215	SAHV_t0035	SAHV_t0036			TRUE	0.640	18.000	0.000	NA		NA
3680215	3680216	SAHV_t0036	SAHV_t0037			TRUE	0.640	18.000	0.000	NA		NA
3680216	3680217	SAHV_t0037	SAHV_t0038			TRUE	0.614	13.000	0.000	NA		NA
3680217	3680218	SAHV_t0038	SAHV_t0039			FALSE	0.444	37.000	0.000	NA		NA
3680218	3680219	SAHV_t0039	SAHV_t0040			TRUE	0.676	6.000	0.000	NA		NA
3680219	3680220	SAHV_t0040	SAHV_t0041			TRUE	0.676	6.000	0.000	NA		NA
3680220	3680221	SAHV_t0041	SAHV_t0042			TRUE	0.568	26.000	0.000	NA		NA
3680221	3680222	SAHV_t0042	SAHV_t0043			TRUE	0.615	21.000	0.000	NA		NA
3680222	3680223	SAHV_t0043	SAHV_t0044			TRUE	0.629	14.000	0.000	NA		NA
3680223	3680224	SAHV_t0044	SAHV_t0045			TRUE	0.676	6.000	0.000	NA		NA
3680224	3680225	SAHV_t0045	SAHV_t0046			TRUE	0.650	17.000	0.000	NA		NA
3680225	3680226	SAHV_t0046	SAHV_t0047			TRUE	0.642	10.000	0.000	NA		NA
3680226	3680227	SAHV_t0047	SAHV_t0048			TRUE	0.834	0.000	0.000	NA		NA
3680227	3680228	SAHV_t0048	SAHV_t0049			TRUE	0.746	3.000	0.000	NA		NA
3680228	3680229	SAHV_t0049	SAHV_t0050			TRUE	0.692	5.000	0.000	NA		NA
3680229	3680230	SAHV_t0050	SAHV_t0051			TRUE	0.653	16.000	0.000	NA		NA
3680230	3680231	SAHV_t0051	SAHV_r0008			TRUE	0.617	12.000	0.000	NA		NA
3680231	3680232	SAHV_r0008	SAHV_r0009			FALSE	0.258	73.000	0.000	NA		NA
3680232	3680233	SAHV_r0009	SAHV_t0052			FALSE	0.056	213.000	0.000	NA		NA
3680233	3680234	SAHV_t0052	SAHV_t0053			TRUE	0.650	17.000	0.000	NA		NA
3680234	3680235	SAHV_t0053	SAHV_r0010			FALSE	0.222	89.000	0.000	NA		NA
3680235	3680236	SAHV_r0010	SAHV_1846			FALSE	0.009	741.000	0.000	NA		NA
3680236	3680237	SAHV_1846	SAHV_1847			TRUE	0.525	97.000	0.146	1.000	N	NA
3680237	3680238	SAHV_1847	SAHV_1848			TRUE	0.808	6.000	0.017	1.000	N	NA
3680239	3680240	SAHV_1849	SAHV_1850	gsaB		FALSE	0.072	293.000	0.102	NA		NA
3680241	3680242	SAHV_1851	SAHV_1852			FALSE	0.064	291.000	0.077	NA	N	NA
3680242	3680243	SAHV_1852	SAHV_1853			FALSE	0.037	303.000	0.011	NA	N	NA
3680245	3680246	SAHV_1855	SAHV_1856			TRUE	0.950	9.000	0.727	NA		NA
3680246	3680247	SAHV_1856	SAHV_1857			TRUE	0.881	15.000	0.186	NA		NA
3680247	3680248	SAHV_1857	SAHV_1858			TRUE	0.954	-22.000	0.045	NA		NA
3680248	3680249	SAHV_1858	SAHV_1859		sgtB	FALSE	0.062	260.000	0.004	1.000		NA
3680249	3680250	SAHV_1859	SAHV_1860	sgtB		FALSE	0.029	340.000	0.000	1.000		NA
3680250	3680251	SAHV_1860	SAHV_1861			FALSE	0.305	131.000	0.074	NA		NA
3680253	3680254	SAHV_1863	SAHV_1864		ampS	TRUE	0.704	90.000	0.545	NA	N	NA
3680254	3680255	SAHV_1864	SAHV_1865	ampS		TRUE	0.835	12.000	0.125	NA		NA
3680256	3680257	SAHV_1866	SAHV_1867			TRUE	0.736	7.000	0.010	NA		NA
3680257	3680258	SAHV_1867	SAHV_1868			FALSE	0.030	278.000	0.000	NA		NA
3680259	3680260	SAHV_1869	SAHV_1870	vraR	vraS	TRUE	0.999	-10.000	0.853	0.010	Y	NA
3680260	3680261	SAHV_1870	SAHV_1871	vraS		TRUE	0.985	-3.000	0.679	NA		NA
3680261	3680262	SAHV_1871	SAHV_1872			TRUE	0.826	15.000	0.086	NA		NA
3680262	3680263	SAHV_1872	SAHV_1873		map	FALSE	0.103	217.000	0.051	NA		NA
3680265	3680266	SAHV_1875	SAHV_1876			FALSE	0.080	186.000	0.000	NA		NA
3680266	3680267	SAHV_1876	SAHV_1877			TRUE	0.978	2.000	0.796	1.000		NA
3680268	3680269	SAHV_1878	SAHV_1879			FALSE	0.022	390.000	0.000	1.000	N	NA
3680270	3680271	SAHV_1880	SAHV_1881			FALSE	0.057	247.000	0.015	NA		NA
3680271	3680272	SAHV_1881	SAHV_1882			FALSE	0.186	170.000	0.047	NA		NA
3680272	3680273	SAHV_1882	SAHV_1883			TRUE	0.668	81.000	0.299	1.000	N	NA
3680273	3680274	SAHV_1883	SAHV_1884			FALSE	0.021	768.000	0.034	1.000	N	NA
3680274	3680275	SAHV_1884	SAHV_1885			TRUE	0.991	13.000	0.492	0.001	Y	NA
3680275	3680276	SAHV_1885	SAHV_1886			TRUE	0.997	2.000	0.643	0.001	Y	NA
3680278	3680279	SAHV_1888	SAHV_1889		dnlJ	TRUE	0.738	13.000	0.030	NA		NA
3680279	3680280	SAHV_1889	SAHV_1890	dnlJ	pcrA	TRUE	0.985	4.000	0.103	0.013	Y	NA
3680280	3680281	SAHV_1890	SAHV_1891	pcrA	pcrB	TRUE	0.948	-3.000	0.054	1.000		NA
3680281	3680282	SAHV_1891	SAHV_1892	pcrB		FALSE	0.200	172.000	0.031	1.000		NA
3680282	3680283	SAHV_1892	SAHV_1893		purB	FALSE	0.301	109.000	0.006	1.000		NA
3680284	3680285	SAHV_1894	SAHV_1895			TRUE	0.589	31.000	0.000	1.000		NA
3680286	3680287	SAHV_1896	SAHV_1897		nadE	FALSE	0.053	271.000	0.023	NA		NA
3680287	3680288	SAHV_1897	SAHV_1898	nadE		TRUE	0.997	-7.000	0.194	0.001	Y	NA
3680289	3680290	SAHV_1899	SAHV_1900			TRUE	0.943	20.000	0.022	1.000	Y	NA
3680291	3680292	SAHV_1901	SAHV_1902			FALSE	0.087	205.000	0.000	1.000		NA
3680293	3680294	SAHV_1903	SAHV_1904			TRUE	0.532	53.000	0.020	1.000	N	NA
3680294	3680295	SAHV_1904	SAHV_1905		aldH	FALSE	0.118	418.000	0.008	1.000	Y	NA
3680298	3680299	SAHV_1908	SAHV_1909			FALSE	0.016	385.000	0.000	NA		NA
3680301	3680302	SAHV_1911	SAHV_1912			TRUE	0.983	-3.000	0.545	NA		NA
3680302	3680303	SAHV_1912	SAHV_1913			TRUE	0.816	60.000	0.636	NA		NA
3680305	3680306	SAHV_1915	SAHV_1916			TRUE	0.979	0.000	0.615	NA		NA
3680306	3680307	SAHV_1916	SAHV_1917			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3680307	3680308	SAHV_1917	SAHV_1918			TRUE	0.808	1.000	0.000	NA		NA
3680308	3680309	SAHV_1918	SAHV_1919			TRUE	0.978	-3.000	0.292	1.000	N	NA
3680309	3680310	SAHV_1919	SAHV_1920			FALSE	0.106	258.000	0.125	NA		NA
3680312	3680313	SAHV_1922	SAHV_1923			TRUE	0.910	-15.000	0.000	NA		NA
3680314	3680315	SAHV_1924	SAHV_1925			FALSE	0.017	372.000	0.000	NA		NA
3680315	3680316	SAHV_1925	SAHV_1926			TRUE	0.588	24.000	0.000	NA		NA
3680317	3680318	SAHV_1927	SAHV_1928			FALSE	0.011	511.000	0.000	NA		NA
3680320	3680321	SAHV_1930	SAHV_1931	sak		FALSE	0.075	215.000	0.000	1.000		NA
3680321	3680322	SAHV_1931	SAHV_1932			TRUE	0.617	12.000	0.000	NA		NA
3680322	3680323	SAHV_1932	SAHV_1933			FALSE	0.057	212.000	0.000	NA		NA
3680323	3680324	SAHV_1933	SAHV_1934		sep	FALSE	0.124	151.000	0.000	NA		NA
3680326	3680327	SAHV_1936	SAHV_1937			FALSE	0.342	56.000	0.000	NA		NA
3680327	3680328	SAHV_1937	SAHV_1938			TRUE	0.713	4.000	0.000	NA		NA
3680328	3680329	SAHV_1938	SAHV_1939			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3680329	3680330	SAHV_1939	SAHV_1940			TRUE	0.855	16.000	0.125	NA		NA
3680330	3680331	SAHV_1940	SAHV_1941			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3680331	3680332	SAHV_1941	SAHV_1942			FALSE	0.039	245.000	0.000	NA		NA
3680332	3680333	SAHV_1942	SAHV_1943			FALSE	0.024	316.000	0.000	NA		NA
3680333	3680334	SAHV_1943	SAHV_1944			TRUE	0.971	1.000	0.500	NA		NA
3680334	3680335	SAHV_1944	SAHV_1945			TRUE	0.976	-3.000	0.333	NA		NA
3680335	3680336	SAHV_1945	SAHV_1946			TRUE	0.976	-3.000	0.333	NA		NA
3680336	3680337	SAHV_1946	SAHV_1947			TRUE	0.986	-16.000	0.400	NA		NA
3680337	3680338	SAHV_1947	SAHV_1948			TRUE	0.906	-10.000	0.000	NA		NA
3680338	3680339	SAHV_1948	SAHV_1949			TRUE	0.622	20.000	0.000	NA		NA
3680339	3680340	SAHV_1949	SAHV_1950			TRUE	0.913	24.000	0.444	NA		NA
3680340	3680341	SAHV_1950	SAHV_1951			TRUE	0.984	-16.000	0.333	NA		NA
3680341	3680342	SAHV_1951	SAHV_1952			TRUE	0.653	16.000	0.000	NA		NA
3680342	3680343	SAHV_1952	SAHV_1953			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3680343	3680344	SAHV_1953	SAHV_1954			FALSE	0.365	130.000	0.125	NA		NA
3680344	3680345	SAHV_1954	SAHV_1955			FALSE	0.045	232.000	0.000	NA		NA
3680345	3680346	SAHV_1955	SAHV_1956			TRUE	0.545	28.000	0.000	NA		NA
3680346	3680347	SAHV_1956	SAHV_1957			TRUE	0.939	5.000	0.400	NA		NA
3680347	3680348	SAHV_1957	SAHV_1958			TRUE	0.989	-12.000	0.600	NA		NA
3680348	3680349	SAHV_1958	SAHV_1959			TRUE	0.650	17.000	0.000	NA		NA
3680349	3680350	SAHV_1959	SAHV_1960			FALSE	0.444	37.000	0.000	NA		NA
3680350	3680351	SAHV_1960	SAHV_1961			TRUE	0.914	-43.000	0.000	NA		NA
3680351	3680352	SAHV_1961	SAHV_1962			TRUE	0.906	-10.000	0.000	NA		NA
3680352	3680353	SAHV_1962	SAHV_1963			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3680353	3680354	SAHV_1963	SAHV_1964			TRUE	0.645	15.000	0.000	NA		NA
3680354	3680355	SAHV_1964	SAHV_1965			TRUE	0.713	4.000	0.000	NA		NA
3680355	3680356	SAHV_1965	SAHV_1966			TRUE	0.614	13.000	0.000	NA		NA
3680356	3680357	SAHV_1966	SAHV_1967			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3680357	3680358	SAHV_1967	SAHV_1968			TRUE	0.662	7.000	0.000	NA		NA
3680358	3680359	SAHV_1968	SAHV_1969			TRUE	0.881	30.000	0.000	NA	Y	NA
3680359	3680360	SAHV_1969	SAHV_1970			TRUE	0.808	1.000	0.000	NA		NA
3680360	3680361	SAHV_1970	SAHV_1971			FALSE	0.078	213.000	0.011	NA		NA
3680361	3680362	SAHV_1971	SAHV_1972			TRUE	0.932	2.000	0.000	0.051		NA
3680362	3680363	SAHV_1972	SAHV_1973			TRUE	0.648	9.000	0.000	NA		NA
3680363	3680364	SAHV_1973	SAHV_1974			TRUE	0.648	9.000	0.000	NA		NA
3680364	3680365	SAHV_1974	SAHV_1975			TRUE	0.692	5.000	0.000	NA		NA
3680365	3680366	SAHV_1975	SAHV_1976			FALSE	0.221	90.000	0.000	NA		NA
3680366	3680367	SAHV_1976	SAHV_1977			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3680369	3680370	SAHV_1979	SAHV_1980			TRUE	0.653	16.000	0.000	NA		NA
3680372	3680373	SAHV_1982	SAHV_1983			TRUE	0.629	14.000	0.000	NA		NA
3680374	3680375	SAHV_1984	SAHV_1985			TRUE	0.696	12.000	0.000	1.000		NA
3680375	3680376	SAHV_1985	SAHV_1986			FALSE	0.398	45.000	0.000	NA		NA
3680376	3680377	SAHV_1986	SAHV_1987			FALSE	0.101	170.000	0.000	NA		NA
3680377	3680378	SAHV_1987	SAHV_1988		int	FALSE	0.324	59.000	0.000	NA		NA
3680378	3680379	SAHV_1988	SAHV_1989	int		TRUE	0.696	12.000	0.000	1.000		NA
3680380	3680381	SAHV_1990	SAHV_1991			TRUE	0.887	22.000	0.000	0.004		NA
3680382	3680383	SAHV_1992	SAHV_1993			FALSE	0.015	513.000	0.000	1.000	N	NA
3680383	3680384	SAHV_1993	SAHV_1994		sel	FALSE	0.012	1017.000	0.000	1.000		NA
3680386	3680387	SAHV_1996	SAHV_1997		tst	FALSE	0.009	879.000	0.000	NA		NA
3680388	3680389	SAHV_1998	SAHV_1999			TRUE	0.906	-3.000	0.000	1.000		NA
3680389	3680390	SAHV_1999	SAHV_2000			FALSE	0.150	132.000	0.000	NA		NA
3680390	3680391	SAHV_2000	SAHV_2001			FALSE	0.370	51.000	0.000	NA		NA
3680391	3680392	SAHV_2001	SAHV_2002			TRUE	0.640	18.000	0.000	NA		NA
3680392	3680393	SAHV_2002	SAHV_2003			TRUE	0.617	12.000	0.000	NA		NA
3680393	3680394	SAHV_2003	SAHV_2004			FALSE	0.012	461.000	0.000	NA		NA
3680394	3680395	SAHV_2004	SAHV_2005			TRUE	0.872	-3.000	0.000	NA		NA
3680395	3680396	SAHV_2005	SAHV_2006			FALSE	0.025	310.000	0.000	NA		NA
3680396	3680397	SAHV_2006	SAHV_2007			TRUE	0.629	14.000	0.000	NA		NA
3680397	3680398	SAHV_2007	SAHV_2008			TRUE	0.843	65.000	1.000	NA		NA
3680398	3680399	SAHV_2008	SAHV_2009			TRUE	0.974	3.000	1.000	NA		NA
3680399	3680400	SAHV_2009	SAHV_2010			FALSE	0.143	136.000	0.000	NA		NA
3680400	3680401	SAHV_2010	SAHV_2011			TRUE	0.762	5.000	0.000	1.000		NA
3680402	3680403	SAHV_2012	SAHV_2013		int	TRUE	0.708	14.000	0.000	1.000		NA
3680404	3680405	SAHV_2014	SAHV_2015	groEL	groES	TRUE	0.959	76.000	0.674	0.005	Y	NA
3680408	3680409	SAHV_2018	SAHV_2019			FALSE	0.072	361.000	0.138	1.000		NA
3680411	3680412	SAHV_2021	SAHV_2022	agrB	agrD	TRUE	0.932	3.000	0.225	NA		NA
3680412	3680413	SAHV_2022	SAHV_2023	agrD	agrC	FALSE	0.263	198.000	0.250	NA		NA
3680413	3680414	SAHV_2023	SAHV_2024	agrC	agrA	TRUE	0.986	19.000	0.875	1.000	Y	NA
3680415	3680416	SAHV_2025	SAHV_2026		scrB	TRUE	0.994	-3.000	0.364	1.000	Y	NA
3680416	3680417	SAHV_2026	SAHV_2027	scrB	scrR	FALSE	0.303	149.000	0.070	1.000	N	NA
3680417	3680418	SAHV_2027	SAHV_2028	scrR	nrgA	FALSE	0.210	183.000	0.070	1.000	N	NA
3680418	3680419	SAHV_2028	SAHV_2029	nrgA		FALSE	0.134	208.000	0.040	1.000	N	NA
3680419	3680420	SAHV_2029	SAHV_2030			TRUE	0.769	60.000	0.419	NA		NA
3680420	3680421	SAHV_2030	SAHV_2031			FALSE	0.025	304.000	0.000	NA		NA
3680422	3680423	SAHV_2032	SAHV_2033	vga		FALSE	0.061	362.000	0.000	0.091		NA
3680424	3680425	SAHV_2034	SAHV_2035			TRUE	0.966	-7.000	0.090	1.000		NA
3680425	3680426	SAHV_2035	SAHV_2036			TRUE	0.976	-27.000	0.127	1.000		NA
3680426	3680427	SAHV_2036	SAHV_2037			TRUE	0.980	-46.000	0.217	NA		NA
3680428	3680429	SAHV_2038	SAHV_2039	ilvD	ilvB	TRUE	0.975	28.000	0.089	0.001	Y	NA
3680429	3680430	SAHV_2039	SAHV_2040	ilvB		TRUE	0.974	0.000	0.013	0.001		NA
3680430	3680431	SAHV_2040	SAHV_2041		ilvC	FALSE	0.229	137.000	0.006	1.000		NA
3680431	3680432	SAHV_2041	SAHV_2042	ilvC	leuA	TRUE	0.937	30.000	0.103	1.000	Y	NA
3680432	3680433	SAHV_2042	SAHV_2043	leuA	leuB	TRUE	0.985	3.000	0.011	0.002	Y	NA
3680433	3680434	SAHV_2043	SAHV_2044	leuB	leuC	TRUE	0.977	14.000	0.027	0.002	Y	NA
3680434	3680435	SAHV_2044	SAHV_2045	leuC	leuD	TRUE	0.997	1.000	0.477	0.001	Y	NA
3680435	3680436	SAHV_2045	SAHV_2046	leuD	ilvA	TRUE	0.961	15.000	0.100	1.000	Y	NA
3680437	3680438	SAHV_r0011	SAHV_r0012			FALSE	0.258	73.000	0.000	NA		NA
3680438	3680439	SAHV_r0012	SAHV_r0013			FALSE	0.012	470.000	0.000	NA		NA
3680439	3680440	SAHV_r0013	SAHV_t0054			FALSE	0.178	117.000	0.000	NA		NA
3680440	3680441	SAHV_t0054	SAHV_t0055			TRUE	0.640	18.000	0.000	NA		NA
3680441	3680442	SAHV_t0055	SAHV_2047			FALSE	0.010	647.000	0.000	NA		NA
3680442	3680443	SAHV_2047	SAHV_2048			TRUE	0.975	-7.000	0.215	NA		NA
3680443	3680444	SAHV_2048	SAHV_2049		sigB	FALSE	0.133	434.000	0.049	1.000	Y	NA
3680444	3680445	SAHV_2049	SAHV_2050	sigB	rsbW	TRUE	0.993	-25.000	0.838	1.000	N	NA
3680445	3680446	SAHV_2050	SAHV_2051	rsbW	rsbV	TRUE	0.992	2.000	0.714	1.000	Y	NA
3680446	3680447	SAHV_2051	SAHV_2052	rsbV	rsbU	TRUE	0.853	119.000	0.440	1.000	Y	NA
3680447	3680448	SAHV_2052	SAHV_2053	rsbU		FALSE	0.139	349.000	0.000	1.000	Y	NA
3680448	3680449	SAHV_2053	SAHV_2054			TRUE	0.928	-3.000	0.039	NA		NA
3680449	3680450	SAHV_2054	SAHV_2055		alr	FALSE	0.406	85.000	0.065	NA		NA
3680450	3680451	SAHV_2055	SAHV_2056	alr	dpj	TRUE	0.573	66.000	0.093	1.000	N	NA
3680451	3680452	SAHV_2056	SAHV_2057	dpj		TRUE	0.785	4.000	0.012	NA		NA
3680452	3680453	SAHV_2057	SAHV_2058			TRUE	0.971	-13.000	0.137	NA		NA
3680453	3680454	SAHV_2058	SAHV_2059			TRUE	0.973	-7.000	0.196	NA		NA
3680454	3680455	SAHV_2059	SAHV_2060		kdpC	FALSE	0.060	208.000	0.000	NA		NA
3680455	3680456	SAHV_2060	SAHV_2061	kdpC	kdpB	TRUE	0.971	20.000	0.000	0.002	Y	NA
3680456	3680457	SAHV_2061	SAHV_2062	kdpB	kdpA	TRUE	0.972	19.000	0.000	0.002	Y	NA
3680458	3680459	SAHV_2063	SAHV_2064	kdpD	kdpE	TRUE	0.976	0.000	0.000	1.000	Y	NA
3680460	3680461	SAHV_2065	SAHV_2066	tnp		FALSE	0.481	169.000	0.000	1.000	Y	NA
3680461	3680462	SAHV_2066	SAHV_2067		murF	FALSE	0.037	517.000	0.000	0.091	N	NA
3680462	3680463	SAHV_2067	SAHV_2068	murF	ddlA	TRUE	0.976	15.000	0.035	0.007	Y	NA
3680465	3680466	SAHV_2070	SAHV_2071			TRUE	0.531	128.000	0.333	NA		NA
3680466	3680467	SAHV_2071	SAHV_2072			TRUE	0.749	12.000	0.036	NA		NA
3680468	3680469	SAHV_2073	SAHV_2074			TRUE	0.873	28.000	0.036	0.025		NA
3680470	3680471	SAHV_2075	SAHV_2076		thiE	FALSE	0.443	86.000	0.055	1.000	N	NA
3680471	3680472	SAHV_2076	SAHV_2077	thiE	thiM	TRUE	0.990	2.000	0.061	0.003	Y	NA
3680472	3680473	SAHV_2077	SAHV_2078	thiM	thiD	TRUE	0.996	-16.000	0.032	0.003	Y	NA
3680473	3680474	SAHV_2078	SAHV_2079	thiD		TRUE	0.987	-7.000	0.478	1.000	N	NA
3680474	3680475	SAHV_2079	SAHV_2080			FALSE	0.023	387.000	0.000	1.000		NA
3680475	3680476	SAHV_2080	SAHV_2081			FALSE	0.022	389.000	0.000	1.000		NA
3680478	3680479	SAHV_2083	SAHV_2084		murA	TRUE	0.684	34.000	0.044	1.000	N	NA
3680479	3680480	SAHV_2084	SAHV_2085	murA		TRUE	0.550	111.000	0.279	NA		NA
3680480	3680481	SAHV_2085	SAHV_2086		atpC	FALSE	0.019	562.000	0.039	NA		NA
3680481	3680482	SAHV_2086	SAHV_2087	atpC	atpD	TRUE	0.993	20.000	0.837	0.004	Y	NA
3680482	3680483	SAHV_2087	SAHV_2088	atpD	atpG	TRUE	0.991	22.000	0.724	0.004	Y	NA
3680483	3680484	SAHV_2088	SAHV_2089	atpG	atpA	TRUE	0.988	31.000	0.846	0.004	Y	NA
3680484	3680485	SAHV_2089	SAHV_2090	atpA	atpH	TRUE	0.992	22.000	0.864	0.004	Y	NA
3680485	3680486	SAHV_2090	SAHV_2091	atpH	atpF	TRUE	0.995	0.000	0.222	0.004	Y	NA
3680486	3680487	SAHV_2091	SAHV_2092	atpF	atpE	TRUE	0.567	198.000	0.402	0.004		NA
3680487	3680488	SAHV_2092	SAHV_2093	atpE	atpB	TRUE	0.892	43.000	0.189	0.004		NA
3680488	3680489	SAHV_2093	SAHV_2094	atpB		TRUE	0.918	21.000	0.330	1.000		NA
3680489	3680490	SAHV_2094	SAHV_2095		mnaA	FALSE	0.212	167.000	0.030	1.000		NA
3680490	3680491	SAHV_2095	SAHV_2096	mnaA	upp	TRUE	0.747	21.000	0.008	1.000	N	NA
3680491	3680492	SAHV_2096	SAHV_2097	upp	glyA	TRUE	0.759	28.000	0.051	1.000	N	NA
3680492	3680493	SAHV_2097	SAHV_2098	glyA		TRUE	0.814	27.000	0.145	NA		NA
3680493	3680494	SAHV_2098	SAHV_2099			FALSE	0.339	107.000	0.052	NA		NA
3680494	3680495	SAHV_2099	SAHV_2100			TRUE	0.934	-3.000	0.052	NA	N	NA
3680495	3680496	SAHV_2100	SAHV_2101			TRUE	0.764	84.000	0.072	NA	Y	NA
3680496	3680497	SAHV_2101	SAHV_2102		prfA	TRUE	0.992	-13.000	0.084	1.000	Y	NA
3680497	3680498	SAHV_2102	SAHV_2103	prfA	tdk	TRUE	0.922	1.000	0.062	1.000	N	NA
3680498	3680499	SAHV_2103	SAHV_2104	tdk	rpmE	FALSE	0.043	347.000	0.028	1.000	N	NA
3680499	3680500	SAHV_2104	SAHV_2105	rpmE	rho	FALSE	0.356	118.000	0.049	1.000	N	NA
3680500	3680501	SAHV_2105	SAHV_2106	rho		FALSE	0.053	247.000	0.000	1.000	N	NA
3680501	3680502	SAHV_2106	SAHV_2107			FALSE	0.156	238.000	0.200	NA	N	NA
3680502	3680503	SAHV_2107	SAHV_2108		murZ	FALSE	0.368	86.000	0.046	NA	N	NA
3680503	3680504	SAHV_2108	SAHV_2109	murZ	fbaA	FALSE	0.017	466.000	0.000	1.000	N	NA
3680506	3680507	SAHV_2111	SAHV_2112	pyrG	rpoE	FALSE	0.046	336.000	0.029	1.000	N	NA
3680507	3680508	SAHV_2112	SAHV_2113	rpoE		FALSE	0.392	112.000	0.060	1.000		NA
3680510	3680511	SAHV_2115	SAHV_2116			FALSE	0.015	399.000	0.000	NA		NA
3680511	3680512	SAHV_2116	SAHV_2117		hmrA	TRUE	0.950	0.000	0.121	1.000		NA
3680514	3680515	SAHV_2119	SAHV_2120		pdp	TRUE	0.629	14.000	0.000	NA		NA
3680515	3680516	SAHV_2120	SAHV_2121	pdp		FALSE	0.305	240.000	0.026	1.000	Y	NA
3680518	3680519	SAHV_2123	SAHV_2124	dps		FALSE	0.091	200.000	0.009	NA		NA
3680519	3680520	SAHV_2124	SAHV_2125			FALSE	0.017	457.000	0.007	NA		NA
3680520	3680521	SAHV_2125	SAHV_2126			FALSE	0.009	672.000	0.000	NA		NA
3680521	3680522	SAHV_2126	SAHV_2127			TRUE	0.937	31.000	1.000	1.000		NA
3680522	3680523	SAHV_2127	SAHV_2128			FALSE	0.019	436.000	0.000	1.000		NA
3680524	3680525	SAHV_2129	SAHV_2130	czrA	czrB	TRUE	0.937	2.000	0.139	1.000	N	NA
3680525	3680526	SAHV_2130	SAHV_2131	czrB		FALSE	0.034	266.000	0.000	NA		NA
3680526	3680527	SAHV_2131	SAHV_2132			FALSE	0.009	862.000	0.000	NA		NA
3680529	3680530	SAHV_2134	SAHV_2135			TRUE	0.909	-13.000	0.000	NA		NA
3680531	3680532	SAHV_2136	SAHV_2137			TRUE	0.651	68.000	0.188	1.000		NA
3680532	3680533	SAHV_2137	SAHV_2138		glmS	FALSE	0.062	232.000	0.000	1.000	N	NA
3680534	3680535	SAHV_2139	SAHV_2140		mtlF	FALSE	0.330	58.000	0.000	NA		NA
3680535	3680536	SAHV_2140	SAHV_2141	mtlF		TRUE	0.929	35.000	0.336	0.011	N	NA
3680536	3680537	SAHV_2141	SAHV_2142		mtlA	TRUE	0.931	12.000	0.098	0.011	N	NA
3680537	3680538	SAHV_2142	SAHV_2143	mtlA	mtlD	TRUE	0.984	0.000	0.062	1.000	Y	NA
3680539	3680540	SAHV_2144	SAHV_2145	fmtB	glmM	FALSE	0.042	278.000	0.000	1.000	N	NA
3680540	3680541	SAHV_2145	SAHV_2146	glmM		TRUE	0.819	27.000	0.150	NA		NA
3680541	3680542	SAHV_2146	SAHV_2147			TRUE	0.968	2.000	0.502	NA		NA
3680542	3680543	SAHV_2147	SAHV_2148		arg	FALSE	0.103	189.000	0.007	NA		NA
3680543	3680544	SAHV_2148	SAHV_t0056	arg		FALSE	0.145	135.000	0.000	NA		NA
3680544	3680545	SAHV_t0056	SAHV_t0057			TRUE	0.746	3.000	0.000	NA		NA
3680545	3680546	SAHV_t0057	SAHV_t0058			TRUE	0.653	8.000	0.000	NA		NA
3680546	3680547	SAHV_t0058	SAHV_t0059			TRUE	0.545	28.000	0.000	NA		NA
3680547	3680548	SAHV_t0059	SAHV_t0060			TRUE	0.746	3.000	0.000	NA		NA
3680548	3680549	SAHV_t0060	SAHV_t0061			TRUE	0.808	1.000	0.000	NA		NA
3680549	3680550	SAHV_t0061	SAHV_r0014			TRUE	0.632	11.000	0.000	NA		NA
3680550	3680551	SAHV_r0014	SAHV_r0015			FALSE	0.258	73.000	0.000	NA		NA
3680551	3680552	SAHV_r0015	SAHV_r0016			FALSE	0.012	470.000	0.000	NA		NA
3680552	3680553	SAHV_r0016	SAHV_2149			FALSE	0.013	456.000	0.000	NA		NA
3680553	3680554	SAHV_2149	SAHV_2150			FALSE	0.400	148.000	0.162	1.000		NA
3680554	3680555	SAHV_2150	SAHV_2151		sepA	FALSE	0.160	323.000	0.500	NA		NA
3680555	3680556	SAHV_2151	SAHV_2152	sepA		TRUE	0.758	99.000	0.875	NA		NA
3680556	3680557	SAHV_2152	SAHV_2153			TRUE	0.855	12.000	0.000	0.058		NA
3680557	3680558	SAHV_2153	SAHV_2154			FALSE	0.463	177.000	0.162	0.058		NA
3680558	3680559	SAHV_2154	SAHV_2155			TRUE	0.834	16.000	0.051	1.000		NA
3680559	3680560	SAHV_2155	SAHV_2156			TRUE	0.570	44.000	0.044	NA		NA
3680562	3680563	SAHV_2158	SAHV_2159			FALSE	0.060	236.000	0.000	1.000		NA
3680563	3680564	SAHV_2159	SAHV_2160			TRUE	0.996	-3.000	0.280	0.034	Y	NA
3680564	3680565	SAHV_2160	SAHV_2161			TRUE	0.980	12.000	0.500	1.000	Y	NA
3680565	3680566	SAHV_2161	SAHV_2162			FALSE	0.043	392.000	0.105	NA	N	NA
3680566	3680567	SAHV_2162	SAHV_2163			TRUE	0.927	7.000	0.368	NA	N	NA
3680567	3680568	SAHV_2163	SAHV_2164			TRUE	0.988	-13.000	0.429	1.000		NA
3680570	3680571	SAHV_2166	SAHV_2167	asp23		TRUE	0.529	63.000	0.083	NA		NA
3680571	3680572	SAHV_2167	SAHV_2168			TRUE	0.821	13.000	0.107	NA		NA
3680572	3680573	SAHV_2168	SAHV_2169			FALSE	0.432	175.000	0.455	NA		NA
3680573	3680574	SAHV_2169	SAHV_2170			FALSE	0.055	308.000	0.032	1.000	N	NA
3680574	3680575	SAHV_2170	SAHV_2171			FALSE	0.260	235.000	0.079	0.015		NA
3680575	3680576	SAHV_2171	SAHV_2172			FALSE	0.056	278.000	0.039	NA		NA
3680576	3680577	SAHV_2172	SAHV_2173		lacG	FALSE	0.034	266.000	0.000	NA		NA
3680577	3680578	SAHV_2173	SAHV_2174	lacG	lacE	TRUE	0.975	18.000	0.300	1.000	Y	NA
3680578	3680579	SAHV_2174	SAHV_2175	lacE	lacF	TRUE	0.993	6.000	0.600	0.009	Y	NA
3680579	3680580	SAHV_2175	SAHV_2176	lacF	lacD	TRUE	0.976	22.000	0.417	1.000	Y	NA
3680580	3680581	SAHV_2176	SAHV_2177	lacD	lacC	TRUE	0.995	4.000	0.556	0.001	Y	NA
3680581	3680582	SAHV_2177	SAHV_2178	lacC	lacB	TRUE	0.982	13.000	0.667	1.000	Y	NA
3680582	3680583	SAHV_2178	SAHV_2179	lacB	lacA	TRUE	0.994	16.000	0.750	0.001	Y	NA
3680583	3680584	SAHV_2179	SAHV_2180	lacA	lacR	FALSE	0.129	367.000	0.000	1.000	Y	NA
3680585	3680586	SAHV_2181	SAHV_2182			FALSE	0.378	49.000	0.000	NA		NA
3680587	3680588	SAHV_2183	SAHV_2184			FALSE	0.045	233.000	0.000	NA		NA
3680588	3680589	SAHV_2184	SAHV_2185			FALSE	0.342	70.000	0.000	1.000		NA
3680591	3680592	SAHV_2187	SAHV_2188			FALSE	0.080	211.000	0.000	1.000		NA
3680594	3680595	SAHV_2190	SAHV_2191		alsS	TRUE	0.629	37.000	0.022	1.000	N	NA
3680597	3680598	SAHV_2193	SAHV_2194			FALSE	0.039	245.000	0.000	NA		NA
3680598	3680599	SAHV_2194	SAHV_2195			TRUE	0.914	-36.000	0.000	NA		NA
3680599	3680600	SAHV_2195	SAHV_2196			FALSE	0.009	1251.000	0.000	NA		NA
3680600	3680601	SAHV_2196	SAHV_2197			FALSE	0.017	381.000	0.000	NA		NA
3680601	3680602	SAHV_2197	SAHV_2198			TRUE	0.912	-22.000	0.000	NA		NA
3680602	3680603	SAHV_2198	SAHV_2199			TRUE	0.595	23.000	0.000	NA		NA
3680605	3680606	SAHV_2201	SAHV_2202	rpsI	rplM	TRUE	0.967	20.000	0.006	0.017	Y	NA
3680606	3680607	SAHV_2202	SAHV_2203	rplM	truA	FALSE	0.330	240.000	0.052	1.000	Y	NA
3680607	3680608	SAHV_2203	SAHV_2204	truA		TRUE	0.912	5.000	0.170	1.000	N	NA
3680608	3680609	SAHV_2204	SAHV_2205			TRUE	0.993	-10.000	0.139	1.000	Y	NA
3680609	3680610	SAHV_2205	SAHV_2206			TRUE	0.998	-3.000	0.713	0.021	Y	NA
3680610	3680611	SAHV_2206	SAHV_2207		rplQ	FALSE	0.031	538.000	0.074	1.000	N	NA
3680611	3680612	SAHV_2207	SAHV_2208	rplQ	rpoA	TRUE	0.962	17.000	0.873	1.000	N	NA
3680612	3680613	SAHV_2208	SAHV_2209	rpoA	rpsK	TRUE	0.689	75.000	0.308	1.000	N	NA
3680613	3680614	SAHV_2209	SAHV_2210	rpsK	rpsM	TRUE	0.990	24.000	0.810	0.017	Y	NA
3680614	3680615	SAHV_2210	SAHV_2211	rpsM	rpmJ	TRUE	0.941	23.000	0.194	0.017		NA
3680615	3680616	SAHV_2211	SAHV_2212	rpmJ	infA	TRUE	0.849	32.000	0.257	1.000		NA
3680616	3680617	SAHV_2212	SAHV_2213	infA	adk	FALSE	0.178	193.000	0.059	1.000	N	NA
3680617	3680618	SAHV_2213	SAHV_2214	adk	secY	TRUE	0.914	17.000	0.241	1.000	N	NA
3680618	3680619	SAHV_2214	SAHV_2215	secY	rplO	TRUE	0.983	0.000	0.730	1.000	N	NA
3680619	3680620	SAHV_2215	SAHV_2216	rplO	rpmD	TRUE	0.993	17.000	0.653	0.003	Y	NA
3680620	3680621	SAHV_2216	SAHV_2217	rpmD	rpsE	TRUE	0.992	17.000	0.789	0.022	Y	NA
3680621	3680622	SAHV_2217	SAHV_2218	rpsE	rplR	TRUE	0.991	21.000	0.814	0.022	Y	NA
3680622	3680623	SAHV_2218	SAHV_2219	rplR	rplF	TRUE	0.986	31.000	0.815	0.017	Y	NA
3680623	3680624	SAHV_2219	SAHV_2220	rplF	rpsH	TRUE	0.990	25.000	0.808	0.017	Y	NA
3680624	3680625	SAHV_2220	SAHV_2221	rpsH	rpsN	TRUE	0.980	32.000	0.473	0.017	Y	NA
3680625	3680626	SAHV_2221	SAHV_2222	rpsN	rplE	TRUE	0.988	23.000	0.496	0.017	Y	NA
3680626	3680627	SAHV_2222	SAHV_2223	rplE	rplX	TRUE	0.989	27.000	0.758	0.017	Y	NA
3680627	3680628	SAHV_2223	SAHV_2224	rplX	rplN	TRUE	0.983	36.000	0.810	0.022	Y	NA
3680628	3680629	SAHV_2224	SAHV_2225	rplN	rpsQ	TRUE	0.984	32.000	0.791	0.022	Y	NA
3680629	3680630	SAHV_2225	SAHV_2226	rpsQ	rpmC	TRUE	0.990	24.000	0.828	0.017	Y	NA
3680630	3680631	SAHV_2226	SAHV_2227	rpmC	rplP	TRUE	0.999	-10.000	0.802	0.017	Y	NA
3680631	3680632	SAHV_2227	SAHV_2228	rplP	rpsC	TRUE	0.995	3.000	0.828	0.022	Y	NA
3680632	3680633	SAHV_2228	SAHV_2229	rpsC	rplV	TRUE	0.989	24.000	0.719	0.022	Y	NA
3680633	3680634	SAHV_2229	SAHV_2230	rplV	rpsS	TRUE	0.987	29.000	0.769	0.022	Y	NA
3680634	3680635	SAHV_2230	SAHV_2231	rpsS	rplB	TRUE	0.965	67.000	0.820	0.022	Y	NA
3680635	3680636	SAHV_2231	SAHV_2232	rplB	rplW	TRUE	0.973	33.000	0.849	1.000	Y	NA
3680636	3680637	SAHV_2232	SAHV_2233	rplW	rplD	TRUE	0.991	0.000	0.307	1.000	Y	NA
3680637	3680638	SAHV_2233	SAHV_2234	rplD	rplC	TRUE	0.986	27.000	0.544	0.017	Y	NA
3680638	3680639	SAHV_2234	SAHV_2235	rplC	rpsJ	TRUE	0.984	28.000	0.467	0.022	Y	NA
3680641	3680642	SAHV_2237	SAHV_2238		topB	FALSE	0.389	113.000	0.060	1.000		NA
3680643	3680644	SAHV_2239	SAHV_2240			FALSE	0.167	181.000	0.022	1.000		NA
3680644	3680645	SAHV_2240	SAHV_2241			FALSE	0.029	284.000	0.000	NA		NA
3680647	3680648	SAHV_2243	SAHV_2244			FALSE	0.180	245.000	0.286	NA		NA
3680649	3680650	SAHV_2245	SAHV_2246		fmhB	TRUE	0.761	117.000	0.167	NA	Y	NA
3680653	3680654	SAHV_2249	SAHV_2250			TRUE	0.985	-7.000	0.370	1.000	N	NA
3680655	3680656	SAHV_2251	SAHV_2252		moaA	FALSE	0.014	577.000	0.000	1.000		NA
3680656	3680657	SAHV_2252	SAHV_2253	moaA	mobA	TRUE	0.974	20.000	0.016	0.003	Y	NA
3680657	3680658	SAHV_2253	SAHV_2254	mobA	moaD	TRUE	0.979	7.000	0.027	0.003	Y	NA
3680658	3680659	SAHV_2254	SAHV_2255	moaD	moaE	TRUE	0.993	6.000	0.501	0.003	Y	NA
3680659	3680660	SAHV_2255	SAHV_2256	moaE	mobB	TRUE	0.977	14.000	0.040	0.003	Y	NA
3680660	3680661	SAHV_2256	SAHV_2257	mobB	moeA	TRUE	0.996	-3.000	0.200	0.003	Y	NA
3680663	3680664	SAHV_2259	SAHV_2260	moaB	moeB	TRUE	0.910	31.000	0.023	1.000	Y	NA
3680664	3680665	SAHV_2260	SAHV_2261	moeB	modC	FALSE	0.186	170.000	0.017	1.000		NA
3680665	3680666	SAHV_2261	SAHV_2262	modC	modB	TRUE	0.903	1.000	0.025	1.000		NA
3680666	3680667	SAHV_2262	SAHV_2263	modB	modA	TRUE	0.991	14.000	0.430	0.001	Y	NA
3680669	3680670	SAHV_2265	SAHV_2266			FALSE	0.370	77.000	0.033	NA		NA
3680670	3680671	SAHV_2266	SAHV_2267			FALSE	0.268	121.000	0.033	NA		NA
3680671	3680672	SAHV_2267	SAHV_2268			FALSE	0.041	398.000	0.059	1.000	N	NA
3680672	3680673	SAHV_2268	SAHV_2269			FALSE	0.142	214.000	0.065	1.000	N	NA
3680673	3680674	SAHV_2269	SAHV_2270			FALSE	0.391	47.000	0.000	NA		NA
3680674	3680675	SAHV_2270	SAHV_2271			FALSE	0.242	78.000	0.000	NA		NA
3680676	3680677	SAHV_2272	SAHV_2273	ureA	ureB	TRUE	0.985	14.000	0.135	0.001	Y	NA
3680677	3680678	SAHV_2273	SAHV_2274	ureB	ureC	TRUE	0.995	-3.000	0.045	0.001	Y	NA
3680678	3680679	SAHV_2274	SAHV_2275	ureC	ureE	TRUE	0.943	13.000	0.087	0.001	N	NA
3680679	3680680	SAHV_2275	SAHV_2276	ureE	ureF	TRUE	0.998	-7.000	0.460	0.003	Y	NA
3680680	3680681	SAHV_2276	SAHV_2277	ureF	ureG	TRUE	0.989	13.000	0.439	0.003	Y	NA
3680681	3680682	SAHV_2277	SAHV_2278	ureG	ureD	TRUE	0.805	192.000	0.337	0.003	Y	NA
3680683	3680684	SAHV_2279	SAHV_2280	sarR		FALSE	0.014	428.000	0.000	NA		NA
3680684	3680685	SAHV_2280	SAHV_2281			TRUE	0.774	64.000	0.500	NA		NA
3680685	3680686	SAHV_2281	SAHV_2282			TRUE	0.953	26.000	0.429	0.031		NA
3680688	3680689	SAHV_2284	SAHV_2285			FALSE	0.028	288.000	0.000	NA		NA
3680689	3680690	SAHV_2285	SAHV_2286			TRUE	0.716	95.000	0.500	1.000		NA
3680691	3680692	SAHV_2287	SAHV_2288			FALSE	0.042	237.000	0.000	NA		NA
3680692	3680693	SAHV_2288	SAHV_2289			FALSE	0.019	361.000	0.000	NA		NA
3680694	3680695	SAHV_2290	SAHV_2291			FALSE	0.084	311.000	0.118	1.000	N	NA
3680695	3680696	SAHV_2291	SAHV_2292			FALSE	0.012	483.000	0.000	NA		NA
3680696	3680697	SAHV_2292	SAHV_2293			TRUE	0.983	0.000	0.846	NA		NA
3680697	3680698	SAHV_2293	SAHV_2294			FALSE	0.010	603.000	0.000	NA		NA
3680698	3680699	SAHV_2294	SAHV_2295			FALSE	0.351	133.000	0.125	NA	N	NA
3680702	3680703	SAHV_2298	SAHV_2299			FALSE	0.013	445.000	0.000	NA		NA
3680705	3680706	SAHV_2301	SAHV_2302			TRUE	0.986	-3.000	0.714	NA		NA
3680707	3680708	SAHV_2303	SAHV_2304			TRUE	0.904	11.000	0.294	NA		NA
3680708	3680709	SAHV_2304	SAHV_2305			FALSE	0.422	75.000	0.025	1.000		NA
3680713	3680714	SAHV_2309	SAHV_2310			FALSE	0.226	167.000	0.077	NA		NA
3680714	3680715	SAHV_2310	SAHV_2311			FALSE	0.112	159.000	0.000	NA		NA
3680715	3680716	SAHV_2311	SAHV_2312			FALSE	0.012	487.000	0.000	NA		NA
3680716	3680717	SAHV_2312	SAHV_2313			FALSE	0.485	111.000	0.137	1.000		NA
3680717	3680718	SAHV_2313	SAHV_2314		hutI	FALSE	0.044	276.000	0.000	1.000		NA
3680718	3680719	SAHV_2314	SAHV_2315	hutI	hutU	TRUE	0.947	0.000	0.110	1.000	N	NA
3680720	3680721	SAHV_2316	SAHV_2317		fosB	FALSE	0.039	242.000	0.000	NA	N	NA
3680726	3680727	SAHV_2322	SAHV_2323			TRUE	0.784	30.000	0.095	1.000		NA
3680727	3680728	SAHV_2323	SAHV_2324			FALSE	0.051	218.000	0.000	NA		NA
3680728	3680729	SAHV_2324	SAHV_2325			TRUE	0.983	-7.000	0.382	NA		NA
3680729	3680730	SAHV_2325	SAHV_2326			FALSE	0.064	231.000	0.000	1.000		NA
3680731	3680732	SAHV_2327	SAHV_2328			FALSE	0.053	216.000	0.000	NA		NA
3680732	3680733	SAHV_2328	SAHV_2329			FALSE	0.030	333.000	0.000	1.000	N	NA
3680734	3680735	SAHV_2330	SAHV_2331	fni		TRUE	0.672	31.000	0.018	1.000	N	NA
3680736	3680737	SAHV_2332	SAHV_2333			TRUE	0.989	-3.000	1.000	NA		NA
3680740	3680741	SAHV_2336	SAHV_2337			TRUE	0.891	13.000	0.206	1.000	N	NA
3680743	3680744	SAHV_2339	SAHV_2340	tcaB	tcaA	FALSE	0.245	269.000	0.500	1.000		NA
3680744	3680745	SAHV_2340	SAHV_2341	tcaA	tcaR	FALSE	0.135	240.000	0.111	1.000		NA
3680747	3680748	SAHV_2343	SAHV_2344			TRUE	0.974	0.000	0.364	1.000	N	NA
3680749	3680750	SAHV_2345	SAHV_2346			TRUE	0.997	-7.000	0.833	1.000	Y	NA
3680750	3680751	SAHV_2346	SAHV_2347			TRUE	0.534	163.000	0.039	NA	Y	NA
3680751	3680752	SAHV_2347	SAHV_2348			TRUE	0.979	-3.000	0.392	NA		NA
3680753	3680754	SAHV_2349	SAHV_2350			FALSE	0.032	324.000	0.000	1.000		NA
3680756	3680757	SAHV_2352	SAHV_2353			FALSE	0.024	314.000	0.000	NA		NA
3680759	3680760	SAHV_2355	SAHV_2356			TRUE	0.731	36.000	0.091	1.000		NA
3680760	3680761	SAHV_2356	SAHV_2357			FALSE	0.194	271.000	0.429	NA		NA
3680761	3680762	SAHV_2357	SAHV_2358			FALSE	0.061	207.000	0.000	NA		NA
3680763	3680764	SAHV_2359	SAHV_2360			TRUE	0.866	46.000	0.556	1.000	N	NA
3680768	3680769	SAHV_2364	SAHV_2365			FALSE	0.008	1488.000	0.000	NA		NA
3680769	3680770	SAHV_2365	SAHV_2366			TRUE	0.544	71.000	0.093	1.000		NA
3680770	3680771	SAHV_2366	SAHV_2367			FALSE	0.035	264.000	0.000	NA		NA
3680772	3680773	SAHV_2368	SAHV_2369	gltT		FALSE	0.312	182.000	0.250	NA		NA
3680774	3680775	SAHV_2370	SAHV_2371			FALSE	0.048	222.000	0.000	NA	N	NA
3680777	3680778	SAHV_2373	SAHV_2374			TRUE	0.935	-21.000	0.000	1.000	N	NA
3680779	3680780	SAHV_2375	SAHV_2376			TRUE	0.991	23.000	0.800	0.010	Y	NA
3680780	3680781	SAHV_2376	SAHV_2377			TRUE	0.896	24.000	0.333	NA		NA
3680781	3680782	SAHV_2377	SAHV_2378		narI	TRUE	0.812	20.000	0.088	NA		NA
3680782	3680783	SAHV_2378	SAHV_2379	narI		TRUE	0.997	-7.000	0.206	0.001	Y	NA
3680783	3680784	SAHV_2379	SAHV_2380		narH	TRUE	0.999	-7.000	0.933	0.001	Y	NA
3680784	3680785	SAHV_2380	SAHV_2381	narH	narG	TRUE	0.998	-10.000	0.429	0.001	Y	NA
3680785	3680786	SAHV_2381	SAHV_2382	narG	nasF	FALSE	0.034	309.000	0.000	1.000	N	NA
3680786	3680787	SAHV_2382	SAHV_2383	nasF	nasE	TRUE	0.958	-9.000	0.042	1.000	N	NA
3680787	3680788	SAHV_2383	SAHV_2384	nasE	nasD	TRUE	0.963	4.000	0.091	0.001	N	NA
3680788	3680789	SAHV_2384	SAHV_2385	nasD		TRUE	0.609	66.000	0.125	1.000		NA
3680789	3680790	SAHV_2385	SAHV_2386			FALSE	0.064	230.000	0.000	1.000		NA
3680790	3680791	SAHV_2386	SAHV_2387			FALSE	0.062	234.000	0.000	1.000		NA
3680791	3680792	SAHV_2387	SAHV_2388			FALSE	0.052	217.000	0.000	NA		NA
3680792	3680793	SAHV_2388	SAHV_2389			TRUE	0.707	84.000	0.500	NA		NA
3680793	3680794	SAHV_2389	SAHV_2390			FALSE	0.302	186.000	0.250	NA		NA
3680794	3680795	SAHV_2390	SAHV_2391			FALSE	0.026	295.000	0.000	NA		NA
3680795	3680796	SAHV_2391	SAHV_2392			TRUE	0.929	0.000	0.087	NA		NA
3680796	3680797	SAHV_2392	SAHV_2393			FALSE	0.032	273.000	0.000	NA	N	NA
3680797	3680798	SAHV_2393	SAHV_2394			TRUE	0.820	19.000	0.092	NA		NA
3680800	3680801	SAHV_2396	SAHV_2397			TRUE	0.995	-3.000	0.481	1.000	Y	NA
3680801	3680802	SAHV_2397	SAHV_2398			TRUE	0.787	206.000	0.594	0.033	Y	NA
3680802	3680803	SAHV_2398	SAHV_2399			FALSE	0.305	121.000	0.024	1.000		NA
3680803	3680804	SAHV_2399	SAHV_2400			FALSE	0.019	432.000	0.000	1.000		NA
3680804	3680805	SAHV_2400	SAHV_2401			FALSE	0.031	327.000	0.000	1.000	N	NA
3680806	3680807	SAHV_2402	SAHV_2403	sbi	hlgA	FALSE	0.047	536.000	0.000	0.015		NA
3680807	3680808	SAHV_2403	SAHV_2404	hlgA	hlgC	FALSE	0.052	567.000	0.000	0.003		NA
3680808	3680809	SAHV_2404	SAHV_2405	hlgC	hlgB	TRUE	0.952	2.000	0.000	0.003		NA
3680810	3680811	SAHV_2406	SAHV_2407			TRUE	0.632	11.000	0.000	NA		NA
3680811	3680812	SAHV_2407	SAHV_2408			TRUE	0.961	11.000	0.118	1.000	Y	NA
3680812	3680813	SAHV_2408	SAHV_2409		bioB	TRUE	0.988	-22.000	0.000	1.000	Y	NA
3680813	3680814	SAHV_2409	SAHV_2410	bioB	bioA	TRUE	0.993	2.000	0.176	0.001	Y	NA
3680814	3680815	SAHV_2410	SAHV_2411	bioA	bioD	TRUE	0.997	-22.000	0.051	0.001	Y	NA
3680815	3680816	SAHV_2411	SAHV_2412	bioD		FALSE	0.042	453.000	0.000	0.088	N	NA
3680816	3680817	SAHV_2412	SAHV_2413			TRUE	0.991	25.000	0.867	0.004	Y	NA
3680820	3680821	SAHV_2416	SAHV_2417			TRUE	0.763	60.000	0.400	NA		NA
3680821	3680822	SAHV_2417	SAHV_2418			FALSE	0.330	182.000	0.286	NA		NA
3680826	3680827	SAHV_2422	SAHV_2423			TRUE	0.530	139.000	0.333	1.000	N	NA
3680830	3680831	SAHV_2426	SAHV_2427			FALSE	0.033	322.000	0.000	1.000	N	NA
3680831	3680832	SAHV_2427	SAHV_2428			FALSE	0.295	226.000	0.429	1.000		NA
3680832	3680833	SAHV_2428	SAHV_2429		opuCD	FALSE	0.098	294.000	0.000	0.033		NA
3680833	3680834	SAHV_2429	SAHV_2430	opuCD	opuCC	TRUE	0.980	0.000	0.190	0.033	N	NA
3680834	3680835	SAHV_2430	SAHV_2431	opuCC	opuCB	TRUE	0.949	17.000	0.200	0.033	N	NA
3680835	3680836	SAHV_2431	SAHV_2432	opuCB	opuCA	TRUE	0.995	-3.000	0.200	0.068	Y	NA
3680836	3680837	SAHV_2432	SAHV_2433	opuCA		FALSE	0.010	664.000	0.000	NA		NA
3680838	3680839	SAHV_2434	SAHV_2435			FALSE	0.057	309.000	0.036	1.000	N	NA
3680840	3680841	SAHV_2436	SAHV_2437			FALSE	0.021	396.000	0.009	NA		NA
3680841	3680842	SAHV_2437	SAHV_2438			TRUE	0.965	-7.000	0.127	NA		NA
3680842	3680843	SAHV_2438	SAHV_2439			FALSE	0.054	248.000	0.000	1.000		NA
3680843	3680844	SAHV_2439	SAHV_2440			FALSE	0.019	355.000	0.000	NA		NA
3680844	3680845	SAHV_2440	SAHV_2441			TRUE	0.907	0.000	0.043	NA		NA
3680849	3680850	SAHV_2445	SAHV_2446			FALSE	0.224	88.000	0.000	NA		NA
3680850	3680851	SAHV_2446	SAHV_2447			TRUE	0.895	12.000	0.214	1.000	N	NA
3680851	3680852	SAHV_2447	SAHV_2448			TRUE	0.997	-7.000	0.273	0.021	Y	NA
3680852	3680853	SAHV_2448	SAHV_2449			TRUE	0.995	-3.000	0.545	1.000	Y	NA
3680853	3680854	SAHV_2449	SAHV_2450			TRUE	0.998	-3.000	1.000	0.033	Y	NA
3680854	3680855	SAHV_2450	SAHV_2451			TRUE	0.985	13.000	0.353	0.033	Y	NA
3680855	3680856	SAHV_2451	SAHV_2452			FALSE	0.425	143.000	0.235	NA		NA
3680856	3680857	SAHV_2452	SAHV_2453			TRUE	0.896	-7.000	0.000	NA		NA
3680857	3680858	SAHV_2453	SAHV_2454			TRUE	0.632	11.000	0.000	NA		NA
3680858	3680859	SAHV_2454	SAHV_2455			FALSE	0.009	690.000	0.000	NA		NA
3680859	3680860	SAHV_2455	SAHV_2456			FALSE	0.266	100.000	0.000	1.000		NA
3680862	3680863	SAHV_2458	SAHV_2459			FALSE	0.013	452.000	0.000	NA		NA
3680863	3680864	SAHV_2459	SAHV_2460			TRUE	0.559	27.000	0.000	NA		NA
3680864	3680865	SAHV_2460	SAHV_2461			FALSE	0.034	267.000	0.000	NA		NA
3680865	3680866	SAHV_2461	SAHV_2462			FALSE	0.111	160.000	0.000	NA		NA
3680868	3680869	SAHV_2464	SAHV_2465			FALSE	0.010	561.000	0.000	NA		NA
3680869	3680870	SAHV_2465	SAHV_2466			FALSE	0.011	536.000	0.000	NA		NA
3680870	3680871	SAHV_2466	SAHV_2467			TRUE	0.966	3.000	0.667	NA		NA
3680871	3680872	SAHV_2467	SAHV_2468			TRUE	0.976	0.000	0.500	NA		NA
3680872	3680873	SAHV_2468	SAHV_2469			TRUE	0.909	-13.000	0.000	NA		NA
3680873	3680874	SAHV_2469	SAHV_2470			FALSE	0.040	244.000	0.000	NA		NA
3680874	3680875	SAHV_2470	SAHV_2471			FALSE	0.187	112.000	0.000	NA		NA
3680875	3680876	SAHV_2471	SAHV_2472			FALSE	0.025	304.000	0.000	NA		NA
3680876	3680877	SAHV_2472	SAHV_2473			TRUE	0.910	40.000	0.000	0.087	Y	NA
3680877	3680878	SAHV_2473	SAHV_2474			TRUE	0.994	2.000	0.327	0.017	Y	NA
3680879	3680880	SAHV_2475	SAHV_2476			FALSE	0.029	284.000	0.000	NA		NA
3680880	3680881	SAHV_2476	SAHV_2477			FALSE	0.133	144.000	0.000	NA		NA
3680882	3680883	SAHV_2478	SAHV_2479			FALSE	0.209	97.000	0.000	NA		NA
3680883	3680884	SAHV_2479	SAHV_2481			FALSE	0.016	384.000	0.000	NA		NA
3680884	3680885	SAHV_2481	SAHV_2480			TRUE	0.981	-590.000	0.000	0.008		NA
3680885	3680886	SAHV_2480	SAHV_2482		sarH3	FALSE	0.008	3062.000	0.000	NA		NA
3680888	3680889	SAHV_2484	SAHV_2485	gtaB	tnp	FALSE	0.129	173.000	0.000	1.000	N	NA
3680889	3680890	SAHV_2485	SAHV_2486	tnp	fnbB	FALSE	0.082	209.000	0.000	1.000		NA
3680890	3680891	SAHV_2486	SAHV_2487	fnbB	fnb	FALSE	0.049	681.000	0.000	0.003		NA
3680891	3680892	SAHV_2487	SAHV_2488	fnb		FALSE	0.145	135.000	0.000	NA		NA
3680892	3680893	SAHV_2488	SAHV_2489		gntP	FALSE	0.147	134.000	0.000	NA		NA
3680893	3680894	SAHV_2489	SAHV_2490	gntP	gntK	TRUE	0.887	117.000	0.696	1.000	Y	NA
3680894	3680895	SAHV_2490	SAHV_2491	gntK	gntR	TRUE	0.942	24.000	0.680	1.000	N	NA
3680895	3680896	SAHV_2491	SAHV_2492	gntR		TRUE	0.750	153.000	0.062	0.031	Y	NA
3680896	3680897	SAHV_2492	SAHV_2493			FALSE	0.257	165.000	0.062	1.000		NA
3680897	3680898	SAHV_2493	SAHV_2494			FALSE	0.071	231.000	0.021	NA		NA
3680898	3680899	SAHV_2494	SAHV_2495			FALSE	0.471	67.000	0.062	NA		NA
3680899	3680900	SAHV_2495	SAHV_2496			FALSE	0.012	477.000	0.000	NA		NA
3680901	3680902	SAHV_2497	SAHV_2498			FALSE	0.016	518.000	0.000	1.000		NA
3680902	3680903	SAHV_2498	SAHV_2499			TRUE	0.959	2.000	0.368	NA		NA
3680903	3680904	SAHV_2499	SAHV_2500		fbp	FALSE	0.017	373.000	0.000	NA		NA
3680904	3680905	SAHV_2500	SAHV_2501	fbp		FALSE	0.020	342.000	0.000	NA		NA
3680906	3680907	SAHV_2502	SAHV_2503			TRUE	0.859	31.000	0.333	NA		NA
3680907	3680908	SAHV_2503	SAHV_2504			TRUE	0.683	78.000	0.312	1.000	N	NA
3680909	3680910	SAHV_2505	SAHV_2506			FALSE	0.135	171.000	0.000	1.000		NA
3680914	3680915	SAHV_2510	SAHV_2511			TRUE	0.645	15.000	0.000	NA		NA
3680918	3680919	SAHV_2514	SAHV_2515			TRUE	0.990	14.000	0.324	0.001	Y	NA
3680919	3680920	SAHV_2515	SAHV_2516			TRUE	0.951	3.000	0.304	1.000	N	NA
3680921	3680922	SAHV_2517	SAHV_2518			FALSE	0.102	192.000	0.000	1.000		NA
3680923	3680924	SAHV_2519	SAHV_2520			FALSE	0.223	121.000	0.000	1.000		NA
3680924	3680925	SAHV_2520	SAHV_2521			TRUE	0.590	42.000	0.047	NA		NA
3680925	3680926	SAHV_2521	SAHV_2522		ptsG	FALSE	0.017	380.000	0.000	NA		NA
3680926	3680927	SAHV_2522	SAHV_2523	ptsG		FALSE	0.036	301.000	0.000	1.000	N	NA
3680927	3680928	SAHV_2523	SAHV_2524			TRUE	0.793	51.000	0.300	1.000	N	NA
3680928	3680929	SAHV_2524	SAHV_2525			TRUE	0.963	-7.000	0.070	1.000		NA
3680929	3680930	SAHV_2525	SAHV_2526			FALSE	0.077	213.000	0.000	1.000		NA
3680931	3680932	SAHV_2527	SAHV_2528			FALSE	0.016	390.000	0.000	NA		NA
3680937	3680938	SAHV_2533	SAHV_2534		feoB	TRUE	0.930	13.000	0.517	NA		NA
3680938	3680939	SAHV_2534	SAHV_2535	feoB		TRUE	0.973	12.000	0.308	1.000	Y	NA
3680939	3680940	SAHV_2535	SAHV_2536			FALSE	0.074	216.000	0.000	1.000		NA
3680942	3680943	SAHV_2538	SAHV_2539	rocA		FALSE	0.105	190.000	0.000	1.000		NA
3680944	3680945	SAHV_2540	SAHV_2541		copA	FALSE	0.041	240.000	0.000	NA		NA
3680945	3680946	SAHV_2541	SAHV_2542	copA		FALSE	0.277	538.000	0.118	0.001	Y	NA
3680947	3680948	SAHV_2543	SAHV_2544			TRUE	0.833	23.000	0.100	1.000	N	NA
3680948	3680949	SAHV_2544	SAHV_2545		crtN	FALSE	0.019	428.000	0.000	1.000	N	NA
3680949	3680950	SAHV_2545	SAHV_2546	crtN	crtM	TRUE	0.952	12.000	0.800	1.000	N	NA
3680950	3680951	SAHV_2546	SAHV_2547	crtM		TRUE	0.748	37.000	0.160	NA		NA
3680951	3680952	SAHV_2547	SAHV_2548			TRUE	0.914	6.000	0.263	NA		NA
3680952	3680953	SAHV_2548	SAHV_2549			TRUE	0.975	-7.000	0.211	NA		NA
3680953	3680954	SAHV_2549	SAHV_2550			FALSE	0.107	166.000	0.000	NA		NA
3680954	3680955	SAHV_2550	SAHV_2551			FALSE	0.019	361.000	0.000	NA		NA
3680955	3680956	SAHV_2551	SAHV_2552			FALSE	0.016	513.000	0.000	1.000		NA
3680956	3680957	SAHV_2552	SAHV_2553		isaA	FALSE	0.044	276.000	0.000	1.000		NA
3680957	3680958	SAHV_2553	SAHV_2554	isaA		FALSE	0.014	608.000	0.000	1.000		NA
3680959	3680960	SAHV_2555	SAHV_2556			FALSE	0.017	378.000	0.000	NA		NA
3680960	3680961	SAHV_2556	SAHV_2557			FALSE	0.051	220.000	0.000	NA		NA
3680962	3680963	SAHV_2558	SAHV_2559			FALSE	0.265	71.000	0.000	NA		NA
3680963	3680964	SAHV_2559	SAHV_2560			TRUE	0.946	17.000	0.500	1.000		NA
3680964	3680965	SAHV_2560	SAHV_2561			TRUE	0.830	20.000	0.111	NA		NA
3680966	3680967	SAHV_2562	SAHV_2563			TRUE	0.984	-7.000	0.333	1.000	N	NA
3680967	3680968	SAHV_2563	SAHV_2564			TRUE	0.743	98.000	0.250	0.047		NA
3680968	3680969	SAHV_2564	SAHV_2565			TRUE	0.821	20.000	0.100	NA		NA
3680970	3680971	SAHV_2566	SAHV_2567			TRUE	0.560	97.000	0.182	1.000		NA
3680971	3680972	SAHV_2567	SAHV_2568			TRUE	0.979	-6.000	0.267	1.000	N	NA
3680972	3680973	SAHV_2568	SAHV_2569			FALSE	0.022	333.000	0.000	NA		NA
3680973	3680974	SAHV_2569	SAHV_2570			TRUE	0.908	-12.000	0.000	NA		NA
3680974	3680975	SAHV_2570	SAHV_2571			TRUE	0.947	15.000	0.667	NA		NA
3680975	3680976	SAHV_2571	SAHV_2572			FALSE	0.020	344.000	0.000	NA		NA
3680977	3680978	SAHV_2573	SAHV_2574			FALSE	0.152	155.000	0.006	NA		NA
3680983	3680984	SAHV_2579	SAHV_2580			TRUE	0.729	16.000	0.000	1.000		NA
3680984	3680985	SAHV_2580	SAHV_2581		panD	FALSE	0.028	343.000	0.000	1.000	N	NA
3680985	3680986	SAHV_2581	SAHV_2582	panD	panC	TRUE	0.976	14.000	0.342	1.000	Y	NA
3680986	3680987	SAHV_2582	SAHV_2583	panC	panB	TRUE	0.998	-7.000	0.395	0.001	Y	NA
3680989	3680990	SAHV_2585	SAHV_2586			FALSE	0.042	278.000	0.000	1.000	N	NA
3680993	3680994	SAHV_2589	SAHV_2590			FALSE	0.163	123.000	0.000	NA		NA
3680997	3680998	SAHV_2593	SAHV_2594			FALSE	0.211	173.000	0.044	1.000		NA
3680998	3680999	SAHV_2594	SAHV_2595			FALSE	0.218	280.000	0.600	NA		NA
3680999	3681000	SAHV_2595	SAHV_2596		betA	FALSE	0.030	278.000	0.000	NA		NA
3681000	3681001	SAHV_2596	SAHV_2597	betA	gbsA	FALSE	0.099	261.000	0.072	1.000	N	NA
3681003	3681004	SAHV_2599	SAHV_2600	cudT		FALSE	0.015	519.000	0.000	1.000	N	NA
3681004	3681005	SAHV_2600	SAHV_2601		nrdD	TRUE	0.975	-3.000	0.240	1.000	N	NA
3681005	3681006	SAHV_2601	SAHV_2602	nrdD		FALSE	0.104	190.000	0.000	1.000	N	NA
3681006	3681007	SAHV_2602	SAHV_2603			FALSE	0.016	493.000	0.000	1.000	N	NA
3681007	3681008	SAHV_2603	SAHV_2604			FALSE	0.380	63.000	0.000	1.000	N	NA
3681008	3681009	SAHV_2604	SAHV_2605			FALSE	0.021	394.000	0.000	1.000	N	NA
3681009	3681010	SAHV_2605	SAHV_2606			FALSE	0.012	1424.000	0.000	1.000		NA
3681010	3681011	SAHV_2606	SAHV_2607			TRUE	0.989	-3.000	0.855	1.000		NA
3681011	3681012	SAHV_2607	SAHV_2608			TRUE	0.785	108.000	0.492	0.086	N	NA
3681012	3681013	SAHV_2608	SAHV_2609			TRUE	0.985	11.000	0.812	1.000	Y	NA
3681013	3681014	SAHV_2609	SAHV_2610			TRUE	0.728	26.000	0.047	NA		NA
3681016	3681017	SAHV_2612	SAHV_2613			FALSE	0.047	227.000	0.000	NA		NA
3681017	3681018	SAHV_2613	SAHV_2614		clfB	FALSE	0.181	116.000	0.000	NA		NA
3681018	3681019	SAHV_2614	SAHV_2615	clfB		FALSE	0.028	350.000	0.000	1.000		NA
3681019	3681020	SAHV_2615	SAHV_2616		arcC	FALSE	0.266	99.000	0.000	1.000	N	NA
3681020	3681021	SAHV_2616	SAHV_2617	arcC	arcD	TRUE	0.994	-10.000	0.182	1.000	Y	NA
3681021	3681022	SAHV_2617	SAHV_2618	arcD	arcB	TRUE	0.692	91.000	0.000	1.000	Y	NA
3681022	3681023	SAHV_2618	SAHV_2619	arcB	arcA	TRUE	0.915	33.000	0.062	1.000	Y	NA
3681023	3681024	SAHV_2619	SAHV_2620	arcA		FALSE	0.028	347.000	0.000	1.000	N	NA
3681024	3681025	SAHV_2620	SAHV_2621		aur	FALSE	0.025	367.000	0.000	1.000	N	NA
3681025	3681026	SAHV_2621	SAHV_2622	aur	isaB	FALSE	0.014	424.000	0.000	NA		NA
3681027	3681028	SAHV_2623	SAHV_2624			FALSE	0.041	240.000	0.000	NA		NA
3681028	3681029	SAHV_2624	SAHV_2625			TRUE	0.741	76.000	0.111	0.011	N	NA
3681029	3681030	SAHV_2625	SAHV_2626		pmi	TRUE	0.960	14.000	0.111	1.000	Y	NA
3681033	3681034	SAHV_2629	SAHV_2630			FALSE	0.244	169.000	0.061	1.000		NA
3681034	3681035	SAHV_2630	SAHV_2631			FALSE	0.040	241.000	0.000	NA		NA
3681035	3681036	SAHV_2631	SAHV_2632			TRUE	0.983	-7.000	0.400	NA		NA
3681036	3681037	SAHV_2632	SAHV_2633			TRUE	0.714	18.000	0.000	1.000	N	NA
3681037	3681038	SAHV_2633	SAHV_2634			TRUE	0.906	-10.000	0.000	NA		NA
3681038	3681039	SAHV_2634	SAHV_2635			TRUE	0.914	-103.000	0.000	NA		NA
3681039	3681040	SAHV_2635	SAHV_2636			TRUE	0.906	-10.000	0.000	NA		NA
3681040	3681041	SAHV_2636	SAHV_2637			TRUE	0.687	11.000	0.002	NA		NA
3681041	3681042	SAHV_2637	SAHV_2638			FALSE	0.429	130.000	0.002	0.066		NA
3681042	3681043	SAHV_2638	SAHV_2639			FALSE	0.015	544.000	0.000	1.000		NA
3681044	3681045	SAHV_2640	SAHV_2641			TRUE	0.911	-16.000	0.000	NA		NA
3681045	3681046	SAHV_2641	SAHV_2642			FALSE	0.120	154.000	0.000	NA		NA
3681047	3681048	SAHV_2643	SAHV_2644			FALSE	0.311	79.000	0.000	1.000		NA
3681048	3681049	SAHV_2644	SAHV_2645			TRUE	0.807	3.000	0.000	1.000		NA
3681049	3681050	SAHV_2645	SAHV_2646			FALSE	0.061	235.000	0.000	1.000		NA
3681050	3681051	SAHV_2646	SAHV_2647			TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3681051	3681052	SAHV_2647	SAHV_2648			TRUE	0.872	17.000	0.115	1.000	N	NA
3681052	3681053	SAHV_2648	SAHV_2649		icaR	FALSE	0.013	849.000	0.000	1.000	N	NA
3681054	3681055	SAHV_2650	SAHV_2651	icaA	icaD	TRUE	0.990	-36.000	0.625	NA		NA
3681055	3681056	SAHV_2651	SAHV_2652	icaD	icaB	TRUE	0.987	-3.000	0.833	NA		NA
3681056	3681057	SAHV_2652	SAHV_2653	icaB	icaC	TRUE	0.994	-13.000	0.156	1.000	Y	NA
3681057	3681058	SAHV_2653	SAHV_2654	icaC		FALSE	0.135	143.000	0.000	NA		NA
3681059	3681060	SAHV_2655	SAHV_2656	lip	hisI	FALSE	0.012	1090.000	0.000	1.000		NA
3681060	3681061	SAHV_2656	SAHV_2657	hisI	hisF	TRUE	0.997	-3.000	0.430	0.003	Y	NA
3681061	3681062	SAHV_2657	SAHV_2658	hisF		TRUE	0.993	-3.000	0.002	0.003	Y	NA
3681062	3681063	SAHV_2658	SAHV_2659		hisH	TRUE	0.995	-7.000	0.009	0.003	Y	NA
3681063	3681064	SAHV_2659	SAHV_2660	hisH	hisB	TRUE	0.995	-3.000	0.125	0.003	Y	NA
3681064	3681065	SAHV_2660	SAHV_2661	hisB		TRUE	0.996	-31.000	0.341	1.000	Y	NA
3681065	3681066	SAHV_2661	SAHV_2662			TRUE	0.946	16.000	0.009	1.000	Y	NA
3681066	3681067	SAHV_2662	SAHV_2663		hisG	TRUE	0.995	-7.000	0.007	0.003	Y	NA
3681067	3681068	SAHV_2663	SAHV_2664	hisG		TRUE	0.969	18.000	0.239	NA	Y	NA
3681068	3681069	SAHV_2664	SAHV_2665			FALSE	0.025	304.000	0.000	NA		NA
3681069	3681070	SAHV_2665	SAHV_2666			FALSE	0.176	118.000	0.000	NA		NA
3681070	3681071	SAHV_2666	SAHV_2667			FALSE	0.386	47.000	0.000	NA	N	NA
3681071	3681072	SAHV_2667	SAHV_2668			TRUE	0.985	-3.000	0.530	1.000		NA
3681072	3681073	SAHV_2668	SAHV_2669			FALSE	0.483	158.000	0.435	NA		NA
3681073	3681074	SAHV_2669	SAHV_2670			TRUE	0.726	29.000	0.068	NA		NA
3681077	3681078	SAHV_2673	SAHV_2674		pcp	FALSE	0.171	152.000	0.013	NA		NA
3681079	3681080	SAHV_2675	SAHV_2676			TRUE	0.974	-10.000	0.172	NA		NA
3681081	3681082	SAHV_2677	SAHV_2678			FALSE	0.042	238.000	0.000	NA		NA
3681082	3681083	SAHV_2678	SAHV_2679			TRUE	0.972	-3.000	0.000	0.004		NA
3681085	3681086	SAHV_2681	SAHV_2682			FALSE	0.150	162.000	0.000	1.000		NA
3681086	3681087	SAHV_2682	SAHV_2683			FALSE	0.058	237.000	0.000	1.000	N	NA
3681089	3681090	SAHV_2685	SAHV_2686	vraD	vraE	TRUE	0.992	-10.000	0.857	1.000		NA
3681090	3681091	SAHV_2686	SAHV_2687	vraE		FALSE	0.215	92.000	0.000	NA		NA
3681091	3681092	SAHV_2687	SAHV_2688		cspB	FALSE	0.015	392.000	0.000	NA		NA
3681093	3681094	SAHV_2689	SAHV_2690			FALSE	0.036	260.000	0.000	NA		NA
3681094	3681095	SAHV_2690	SAHV_2691			TRUE	0.794	68.000	0.714	NA		NA
3681097	3681098	SAHV_2693	SAHV_2694		gidB	TRUE	0.690	43.000	0.089	1.000	N	NA
3681098	3681099	SAHV_2694	SAHV_2695	gidB	gidA	TRUE	0.978	0.000	0.466	1.000	N	NA
3681099	3681100	SAHV_2695	SAHV_2696	gidA	thdF	TRUE	0.705	67.000	0.266	1.000		NA
3681100	3681101	SAHV_2696	SAHV_2697	thdF	rnpA	FALSE	0.195	157.000	0.007	1.000		NA
3681101	3681102	SAHV_2697	SAHV_2698	rnpA	rpmH	TRUE	0.700	127.000	0.787	1.000		NA