MicrobesOnline Operon Predictions for Geobacillus thermodenitrificans NG80-2

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3693438 3693439 GTNG_0001 GTNG_0002 dnaA   TRUE 0.785 172.000 0.328 1.000 Y NA
 3693439 3693440 GTNG_0002 GTNG_0003     FALSE 0.208 190.000 0.103 1.000   NA
 3693440 3693441 GTNG_0003 GTNG_0004   recF TRUE 0.828 12.000 0.209 1.000   NA
 3693441 3693442 GTNG_0004 GTNG_0005 recF gyrB TRUE 0.977 46.000 0.249 0.006 Y NA
 3693442 3693443 GTNG_0005 GTNG_0006 gyrB   TRUE 0.910 153.000 0.306 0.002 Y NA
 3693443 3693444 GTNG_0006 GTNG_0007     FALSE 0.446 129.000 0.019 1.000 N NA
 3693444 3693445 GTNG_0007 GTNG_16s001     FALSE 0.002 429.000 0.000 NA   NA
 3693445 3693446 GTNG_16s001 GTNG_t001     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA   NA
 3693446 3693447 GTNG_t001 GTNG_t002     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693447 3693448 GTNG_t002 GTNG_23s001     FALSE 0.028 188.000 0.000 NA   NA
 3693448 3693449 GTNG_23s001 GTNG_5s001     FALSE 0.095 99.000 0.000 NA   NA
 3693451 3693452 GTNG_0009 GTNG_0010 guaB   TRUE 0.753 104.000 0.267 1.000 N NA
 3693452 3693453 GTNG_0010 GTNG_0011     FALSE 0.454 130.000 0.024 1.000 N NA
 3693453 3693454 GTNG_0011 GTNG_0012     TRUE 0.910 25.000 0.000 NA Y NA
 3693454 3693455 GTNG_0012 GTNG_0013     FALSE 0.028 280.000 0.000 NA N NA
 3693457 3693458 GTNG_0015 GTNG_0016   dnaZX FALSE 0.011 432.000 0.000 1.000 N NA
 3693458 3693459 GTNG_0016 GTNG_0017 dnaZX   TRUE 0.750 23.000 0.071 NA   NA
 3693459 3693460 GTNG_0017 GTNG_0018   recR TRUE 0.920 10.000 0.604 NA   NA
 3693460 3693461 GTNG_0018 GTNG_0019 recR   TRUE 0.752 24.000 0.071 NA   NA
 3693461 3693462 GTNG_0019 GTNG_0020     TRUE 0.750 79.000 0.417 NA   NA
 3693462 3693463 GTNG_0020 GTNG_16s002     FALSE 0.002 417.000 0.000 NA   NA
 3693463 3693464 GTNG_16s002 GTNG_t003     FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 3693464 3693465 GTNG_t003 GTNG_t004     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693465 3693466 GTNG_t004 GTNG_23s002     FALSE 0.028 188.000 0.000 NA   NA
 3693466 3693467 GTNG_23s002 GTNG_5s002     FALSE 0.027 189.000 0.000 NA   NA
 3693467 3693468 GTNG_5s002 GTNG_0021   csfB FALSE 0.338 20.000 0.000 NA   NA
 3693468 3693469 GTNG_0021 GTNG_0022 csfB   FALSE 0.337 203.000 0.400 NA   NA
 3693469 3693470 GTNG_0022 GTNG_0023   tmk TRUE 0.858 24.000 0.045 1.000 N NA
 3693470 3693471 GTNG_0023 GTNG_0024 tmk   TRUE 0.935 32.000 0.254 1.000 N NA
 3693471 3693472 GTNG_0024 GTNG_0025     TRUE 0.883 15.000 0.372 NA   NA
 3693472 3693473 GTNG_0025 GTNG_0026     TRUE 0.821 17.000 0.183 NA   NA
 3693473 3693474 GTNG_0026 GTNG_0027     TRUE 0.719 61.000 0.193 NA   NA
 3693474 3693475 GTNG_0027 GTNG_0028     TRUE 0.886 17.000 0.078 0.007   NA
 3693477 3693478 GTNG_0030 GTNG_0031     TRUE 0.595 142.000 0.221 NA N NA
 3693478 3693479 GTNG_0031 GTNG_0032     FALSE 0.050 202.000 0.007 NA   NA
 3693479 3693480 GTNG_0032 GTNG_0033     TRUE 0.580 -121.000 0.000 NA   NA
 3693480 3693481 GTNG_0033 GTNG_0034     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3693481 3693482 GTNG_0034 GTNG_0035   ksgA TRUE 0.940 -7.000 0.093 1.000 N NA
 3693482 3693483 GTNG_0035 GTNG_0036 ksgA yabG FALSE 0.261 94.000 0.022 NA   NA
 3693483 3693484 GTNG_0036 GTNG_0037 yabG   FALSE 0.202 183.000 0.116 NA   NA
 3693484 3693485 GTNG_0037 GTNG_0038     FALSE 0.033 354.000 0.163 NA   NA
 3693485 3693486 GTNG_0038 GTNG_0039     FALSE 0.060 238.000 0.024 1.000   NA
 3693486 3693487 GTNG_0039 GTNG_0040     TRUE 0.767 55.000 0.062 1.000 N NA
 3693487 3693488 GTNG_0040 GTNG_0041     TRUE 0.854 53.000 0.227 NA N NA
 3693488 3693489 GTNG_0041 GTNG_0042     TRUE 0.765 125.000 0.377 NA N NA
 3693489 3693490 GTNG_0042 GTNG_0043     TRUE 0.704 133.000 0.014 1.000 Y NA
 3693490 3693491 GTNG_0043 GTNG_0044     TRUE 0.809 13.000 0.069 1.000 N NA
 3693491 3693492 GTNG_0044 GTNG_0045     TRUE 0.555 76.000 0.027 1.000 N NA
 3693492 3693493 GTNG_0045 GTNG_0046     TRUE 0.978 61.000 0.496 0.029 Y NA
 3693493 3693494 GTNG_0046 GTNG_0047     FALSE 0.284 103.000 0.033 NA   NA
 3693494 3693495 GTNG_0047 GTNG_0048     FALSE 0.301 90.000 0.035 NA   NA
 3693495 3693496 GTNG_0048 GTNG_0049     FALSE 0.300 223.000 0.026 NA Y NA
 3693496 3693497 GTNG_0049 GTNG_0050     FALSE 0.118 229.000 0.147 NA   NA
 3693497 3693498 GTNG_0050 GTNG_0051     TRUE 0.683 7.000 0.058 1.000   NA
 3693498 3693499 GTNG_0051 GTNG_0052     TRUE 0.677 12.000 0.054 1.000   NA
 3693499 3693500 GTNG_0052 GTNG_0053     FALSE 0.429 117.000 0.108 NA   NA
 3693500 3693501 GTNG_0053 GTNG_0054     TRUE 0.974 -3.000 0.774 NA   NA
 3693501 3693502 GTNG_0054 GTNG_0055     TRUE 0.678 16.000 0.074 NA   NA
 3693502 3693503 GTNG_0055 GTNG_0056     TRUE 0.636 121.000 0.134 1.000 N NA
 3693503 3693504 GTNG_0056 GTNG_t005     FALSE 0.033 179.000 0.000 NA   NA
 3693504 3693505 GTNG_t005 GTNG_t006     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693505 3693506 GTNG_t006 GTNG_0057     FALSE 0.023 197.000 0.000 NA   NA
 3693506 3693507 GTNG_0057 GTNG_0058     TRUE 0.596 67.000 0.132 NA   NA
 3693507 3693508 GTNG_0058 GTNG_0059     TRUE 0.918 -37.000 0.133 NA   NA
 3693508 3693509 GTNG_0059 GTNG_0060   mesJ TRUE 0.700 56.000 0.018 1.000 N NA
 3693509 3693510 GTNG_0060 GTNG_0061 mesJ   TRUE 0.877 12.000 0.067 0.050 N NA
 3693510 3693511 GTNG_0061 GTNG_0062     TRUE 0.711 95.000 0.192 1.000 N NA
 3693511 3693512 GTNG_0062 GTNG_0063   coaA FALSE 0.123 232.000 0.029 1.000 N NA
 3693512 3693513 GTNG_0063 GTNG_0064 coaA hslO TRUE 0.791 9.000 0.060 1.000 N NA
 3693513 3693514 GTNG_0064 GTNG_0065 hslO   TRUE 0.568 87.000 0.053 1.000 N NA
 3693514 3693515 GTNG_0065 GTNG_0066     TRUE 0.819 115.000 0.107 1.000 Y NA
 3693515 3693516 GTNG_0066 GTNG_0067     TRUE 0.988 3.000 0.452 0.013 Y NA
 3693516 3693517 GTNG_0067 GTNG_0068     TRUE 0.986 0.000 0.532 1.000 Y NA
 3693517 3693518 GTNG_0068 GTNG_0069     TRUE 0.990 -3.000 0.519 1.000 Y NA
 3693518 3693519 GTNG_0069 GTNG_0070     TRUE 0.987 -37.000 0.176 1.000 Y NA
 3693519 3693520 GTNG_0070 GTNG_0071     TRUE 0.959 1.000 0.142 1.000 Y NA
 3693520 3693521 GTNG_0071 GTNG_0072     TRUE 0.914 -48.000 0.003 1.000 N NA
 3693521 3693522 GTNG_0072 GTNG_0073     TRUE 0.737 16.000 0.002 1.000 N NA
 3693522 3693523 GTNG_0073 GTNG_0074   lysS TRUE 0.773 85.000 0.021 1.000 Y NA
 3693523 3693524 GTNG_0074 GTNG_5s003 lysS   FALSE 0.009 260.000 0.000 NA   NA
 3693524 3693525 GTNG_5s003 GTNG_t007     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3693525 3693526 GTNG_t007 GTNG_t008     FALSE 0.065 142.000 0.000 NA   NA
 3693526 3693527 GTNG_t008 GTNG_t009     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3693527 3693528 GTNG_t009 GTNG_t010     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693528 3693529 GTNG_t010 GTNG_t011     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3693529 3693530 GTNG_t011 GTNG_t012     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3693530 3693531 GTNG_t012 GTNG_t013     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693531 3693532 GTNG_t013 GTNG_t014     FALSE 0.240 13.000 0.000 NA   NA
 3693532 3693533 GTNG_t014 GTNG_16s003     FALSE 0.183 59.000 0.000 NA   NA
 3693533 3693534 GTNG_16s003 GTNG_23s003     FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 3693534 3693535 GTNG_23s003 GTNG_5s004     FALSE 0.025 193.000 0.000 NA   NA
 3693535 3693536 GTNG_5s004 GTNG_0075     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 3693536 3693537 GTNG_0075 GTNG_0076     TRUE 0.935 15.000 0.681 NA   NA
 3693537 3693538 GTNG_0076 GTNG_0077     TRUE 0.956 5.000 0.848 1.000   NA
 3693538 3693539 GTNG_0077 GTNG_0078     TRUE 0.972 -3.000 0.425 1.000 N NA
 3693539 3693540 GTNG_0078 GTNG_0079     TRUE 0.895 75.000 0.062 0.017 Y NA
 3693540 3693541 GTNG_0079 GTNG_0080     FALSE 0.090 206.000 0.056 NA   NA
 3693541 3693542 GTNG_0080 GTNG_0081   ispD TRUE 0.798 22.000 0.108 NA   NA
 3693542 3693543 GTNG_0081 GTNG_0082 ispD ispF TRUE 0.973 15.000 0.419 1.000 Y NA
 3693543 3693544 GTNG_0082 GTNG_0083 ispF   FALSE 0.206 210.000 0.076 1.000 N NA
 3693544 3693545 GTNG_0083 GTNG_0084     FALSE 0.024 374.000 0.008 1.000 N NA
 3693545 3693546 GTNG_0084 GTNG_0085   cysS TRUE 0.961 -22.000 0.039 0.050 N NA
 3693546 3693547 GTNG_0085 GTNG_0086 cysS   TRUE 0.845 31.000 0.129 1.000   NA
 3693547 3693548 GTNG_0086 GTNG_0087     TRUE 0.952 -3.000 0.150 0.005   NA
 3693548 3693549 GTNG_0087 GTNG_0088     TRUE 0.738 4.000 0.109 NA   NA
 3693549 3693550 GTNG_0088 GTNG_0089     TRUE 0.773 70.000 0.361 NA   NA
 3693550 3693551 GTNG_0089 GTNG_0090   rpmG TRUE 0.754 107.000 0.282 1.000 N NA
 3693551 3693552 GTNG_0090 GTNG_0091 rpmG secE TRUE 0.843 41.000 0.080 1.000 N NA
 3693552 3693553 GTNG_0091 GTNG_0092 secE nusG TRUE 0.898 108.000 0.843 1.000 N NA
 3693553 3693554 GTNG_0092 GTNG_0093 nusG rplK FALSE 0.470 241.000 0.681 1.000 N NA
 3693554 3693555 GTNG_0093 GTNG_0094 rplK rplA TRUE 0.875 203.000 0.838 0.024 Y NA
 3693555 3693556 GTNG_0094 GTNG_0095 rplA   TRUE 0.597 251.000 0.302 0.024 Y NA
 3693556 3693557 GTNG_0095 GTNG_0096   rplL TRUE 0.991 48.000 0.884 0.018 Y NA
 3693557 3693558 GTNG_0096 GTNG_0097 rplL   TRUE 0.781 106.000 0.050 1.000 Y NA
 3693558 3693559 GTNG_0097 GTNG_0098   rpoB FALSE 0.018 406.000 0.008 1.000 N NA
 3693559 3693560 GTNG_0098 GTNG_0099 rpoB   TRUE 0.990 58.000 0.851 0.001 Y NA
 3693560 3693561 GTNG_0099 GTNG_0100     FALSE 0.497 137.000 0.065 1.000 N NA
 3693561 3693562 GTNG_0100 GTNG_0101   rpsL TRUE 0.927 91.000 0.239 0.024 Y NA
 3693562 3693563 GTNG_0101 GTNG_0102 rpsL   TRUE 0.981 40.000 0.224 0.003 Y NA
 3693563 3693564 GTNG_0102 GTNG_0103     TRUE 0.800 191.000 0.579 1.000 Y NA
 3693564 3693565 GTNG_0103 GTNG_0104     TRUE 0.954 123.000 0.400 0.001 Y NA
 3693565 3693566 GTNG_0104 GTNG_0105   rpsJ FALSE 0.147 428.000 0.318 1.000 Y NA
 3693566 3693567 GTNG_0105 GTNG_0106 rpsJ   TRUE 0.990 26.000 0.467 0.024 Y NA
 3693567 3693568 GTNG_0106 GTNG_0107   rplD TRUE 0.992 30.000 0.544 0.018 Y NA
 3693568 3693569 GTNG_0107 GTNG_0108 rplD rplW TRUE 0.986 0.000 0.307 0.018 Y NA
 3693569 3693570 GTNG_0108 GTNG_0109 rplW rplB TRUE 0.995 28.000 0.849 0.024 Y NA
 3693570 3693571 GTNG_0109 GTNG_0110 rplB rpsS TRUE 0.994 34.000 0.820 0.024 Y NA
 3693571 3693572 GTNG_0110 GTNG_0111 rpsS rplV TRUE 0.994 19.000 0.769 0.024 Y NA
 3693572 3693573 GTNG_0111 GTNG_0112 rplV rpsC TRUE 0.991 4.000 0.719 0.024 Y NA
 3693573 3693574 GTNG_0112 GTNG_0113 rpsC rplP TRUE 0.993 3.000 0.828 0.024 Y NA
 3693574 3693575 GTNG_0113 GTNG_0114 rplP   TRUE 0.994 0.000 0.802 0.018 Y NA
 3693575 3693576 GTNG_0114 GTNG_0115   rpsQ TRUE 0.994 23.000 0.828 0.018 Y NA
 3693576 3693577 GTNG_0115 GTNG_0116 rpsQ   TRUE 0.989 50.000 0.791 0.024 Y NA
 3693577 3693578 GTNG_0116 GTNG_0117   rplE FALSE 0.117 376.000 0.003 0.024 Y NA
 3693578 3693579 GTNG_0117 GTNG_0118 rplE   TRUE 0.991 30.000 0.496 0.018 Y NA
 3693579 3693580 GTNG_0118 GTNG_0119     TRUE 0.990 34.000 0.473 0.018 Y NA
 3693580 3693581 GTNG_0119 GTNG_0120   rplF TRUE 0.994 33.000 0.808 0.018 Y NA
 3693581 3693582 GTNG_0120 GTNG_0121 rplF   TRUE 0.994 34.000 0.815 0.018 Y NA
 3693582 3693583 GTNG_0121 GTNG_0122     TRUE 0.993 18.000 0.814 0.024 Y NA
 3693583 3693584 GTNG_0122 GTNG_0123   rpmD TRUE 0.990 14.000 0.789 0.024 Y NA
 3693584 3693585 GTNG_0123 GTNG_0124 rpmD rplO TRUE 0.994 26.000 0.653 0.003 Y NA
 3693585 3693586 GTNG_0124 GTNG_0125 rplO secY TRUE 0.975 0.000 0.730 1.000 N NA
 3693586 3693587 GTNG_0125 GTNG_0126 secY adk TRUE 0.905 44.000 0.241 1.000 N NA
 3693587 3693588 GTNG_0126 GTNG_0127 adk   TRUE 0.961 -3.000 0.290 1.000 N NA
 3693588 3693589 GTNG_0127 GTNG_0128   infA FALSE 0.509 209.000 0.160 1.000 Y NA
 3693589 3693590 GTNG_0128 GTNG_0129 infA rpsM TRUE 0.746 169.000 0.075 0.024 Y NA
 3693590 3693591 GTNG_0129 GTNG_0130 rpsM   TRUE 0.994 26.000 0.810 0.018 Y NA
 3693591 3693592 GTNG_0130 GTNG_0131     TRUE 0.581 172.000 0.308 1.000 N NA
 3693592 3693593 GTNG_0131 GTNG_0132   rplQ TRUE 0.903 116.000 0.873 1.000 N NA
 3693593 3693594 GTNG_0132 GTNG_0133 rplQ   TRUE 0.570 121.000 0.074 1.000 N NA
 3693594 3693595 GTNG_0133 GTNG_0134     TRUE 0.997 -24.000 0.713 0.028 Y NA
 3693595 3693596 GTNG_0134 GTNG_0135     TRUE 0.983 -10.000 0.139 1.000 Y NA
 3693596 3693597 GTNG_0135 GTNG_0136   truA TRUE 0.868 13.000 0.170 1.000 N NA
 3693597 3693598 GTNG_0136 GTNG_0137 truA rplM FALSE 0.139 324.000 0.052 1.000 Y NA
 3693598 3693599 GTNG_0137 GTNG_0138 rplM rpsI TRUE 0.992 23.000 0.601 0.018 Y NA
 3693599 3693600 GTNG_0138 GTNG_0139 rpsI   FALSE 0.236 123.000 0.021 NA   NA
 3693600 3693601 GTNG_0139 GTNG_0140     TRUE 0.688 67.000 0.211 NA   NA
 3693601 3693602 GTNG_0140 GTNG_0141   mrp FALSE 0.446 181.000 0.211 1.000 N NA
 3693606 3693607 GTNG_16s004 GTNG_23s004     FALSE 0.011 249.000 0.000 NA   NA
 3693607 3693608 GTNG_23s004 GTNG_5s005     FALSE 0.059 150.000 0.000 NA   NA
 3693608 3693609 GTNG_5s005 GTNG_t015     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3693609 3693610 GTNG_t015 GTNG_t016     FALSE 0.231 8.000 0.000 NA   NA
 3693610 3693611 GTNG_t016 GTNG_t017     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3693611 3693612 GTNG_t017 GTNG_t018     FALSE 0.091 104.000 0.000 NA   NA
 3693612 3693613 GTNG_t018 GTNG_t019     FALSE 0.075 132.000 0.000 NA   NA
 3693613 3693614 GTNG_t019 GTNG_t020     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693614 3693615 GTNG_t020 GTNG_t021     FALSE 0.235 7.000 0.000 NA   NA
 3693615 3693616 GTNG_t021 GTNG_0145     FALSE 0.029 185.000 0.000 NA   NA
 3693616 3693617 GTNG_0145 GTNG_0146     FALSE 0.023 335.000 0.000 1.000 N NA
 3693617 3693618 GTNG_0146 GTNG_0147     FALSE 0.391 95.000 0.000 1.000 N NA
 3693618 3693619 GTNG_0147 GTNG_0148     TRUE 0.977 15.000 0.583 NA Y NA
 3693619 3693620 GTNG_0148 GTNG_0149     FALSE 0.333 73.000 0.028 NA   NA
 3693620 3693621 GTNG_0149 GTNG_0150     TRUE 0.971 -7.000 0.502 NA   NA
 3693621 3693622 GTNG_0150 GTNG_0151     TRUE 0.832 28.000 0.150 NA   NA
 3693622 3693623 GTNG_0151 GTNG_0152     FALSE 0.015 526.000 0.030 1.000 N NA
 3693623 3693624 GTNG_0152 GTNG_0153     FALSE 0.009 327.000 0.000 1.000   NA
 3693624 3693625 GTNG_0153 GTNG_0154     FALSE 0.008 348.000 0.000 1.000   NA
 3693625 3693626 GTNG_0154 GTNG_0155     FALSE 0.001 579.000 0.000 NA   NA
 3693626 3693627 GTNG_0155 GTNG_0156     FALSE 0.270 265.000 0.667 NA   NA
 3693627 3693628 GTNG_0156 GTNG_0157     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693628 3693629 GTNG_0157 GTNG_0160     FALSE 0.001 812.000 0.000 NA   NA
 3693629 3693630 GTNG_0160 GTNG_0161     FALSE 0.001 756.000 0.000 NA   NA
 3693630 3693631 GTNG_0161 GTNG_0162     TRUE 0.862 11.000 0.333 NA   NA
 3693631 3693632 GTNG_0162 GTNG_0163     TRUE 0.684 17.000 0.062 NA   NA
 3693634 3693635 GTNG_0165 GTNG_0166     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3693637 3693638 GTNG_0168 GTNG_0169     TRUE 0.556 101.000 0.051 1.000 N NA
 3693638 3693639 GTNG_0169 GTNG_0170   rocD TRUE 0.681 60.000 0.023 1.000 N NA
 3693639 3693640 GTNG_0170 GTNG_0171 rocD   FALSE 0.014 290.000 0.000 1.000   NA
 3693641 3693642 GTNG_0172 GTNG_0173   fhuB TRUE 0.996 -3.000 0.857 0.056 Y NA
 3693642 3693643 GTNG_0173 GTNG_0174 fhuB fhuD TRUE 0.946 72.000 0.487 1.000 Y NA
 3693643 3693644 GTNG_0174 GTNG_0175 fhuD fhuC TRUE 0.989 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 3693644 3693645 GTNG_0175 GTNG_0176 fhuC   FALSE 0.089 118.000 0.000 NA   NA
 3693646 3693647 GTNG_0177 GTNG_0178     TRUE 0.976 -28.000 0.286 1.000 N NA
 3693650 3693651 GTNG_0181 GTNG_0182     FALSE 0.157 65.000 0.000 NA   NA
 3693651 3693652 GTNG_0182 GTNG_0183     TRUE 0.995 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3693653 3693654 GTNG_0184 GTNG_0185     FALSE 0.332 19.000 0.000 NA   NA
 3693654 3693655 GTNG_0185 GTNG_0186     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693655 3693656 GTNG_0186 GTNG_0187     FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 3693656 3693657 GTNG_0187 GTNG_0188     FALSE 0.377 125.000 0.049 1.000   NA
 3693659 3693660 GTNG_0190 GTNG_0191   spo0M FALSE 0.438 67.000 0.045 NA   NA
 3693660 3693661 GTNG_0191 GTNG_0192 spo0M   FALSE 0.001 531.000 0.000 NA   NA
 3693661 3693662 GTNG_0192 GTNG_0193     FALSE 0.071 213.000 0.000 NA N NA
 3693664 3693665 GTNG_0195 GTNG_0196     TRUE 0.933 11.000 0.714 NA   NA
 3693665 3693666 GTNG_0196 GTNG_0197     TRUE 0.934 12.000 0.714 NA   NA
 3693666 3693667 GTNG_0197 GTNG_0198   ddl TRUE 0.566 157.000 0.004 NA Y NA
 3693667 3693668 GTNG_0198 GTNG_0199 ddl   TRUE 0.965 17.000 0.044 0.005 Y NA
 3693668 3693669 GTNG_0199 GTNG_0200     TRUE 0.726 68.000 0.214 1.000   NA
 3693669 3693670 GTNG_0200 GTNG_0201     FALSE 0.314 79.000 0.006 1.000   NA
 3693672 3693673 GTNG_0203 GTNG_0204 acpS   FALSE 0.496 80.000 0.038 NA N NA
 3693673 3693674 GTNG_0204 GTNG_0205     FALSE 0.234 295.000 0.194 NA Y NA
 3693674 3693675 GTNG_0205 GTNG_0206     FALSE 0.504 128.000 0.043 1.000 N NA
 3693675 3693676 GTNG_0206 GTNG_0207     TRUE 0.896 5.000 0.221 1.000 N NA
 3693676 3693677 GTNG_0207 GTNG_0208     FALSE 0.183 59.000 0.000 NA   NA
 3693677 3693678 GTNG_0208 GTNG_0209     FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 3693678 3693679 GTNG_0209 GTNG_0210     FALSE 0.174 221.000 0.215 NA   NA
 3693679 3693680 GTNG_0210 GTNG_t022     FALSE 0.012 238.000 0.000 NA   NA
 3693680 3693681 GTNG_t022 GTNG_t023     FALSE 0.235 7.000 0.000 NA   NA
 3693681 3693682 GTNG_t023 GTNG_t024     FALSE 0.289 17.000 0.000 NA   NA
 3693682 3693683 GTNG_t024 GTNG_t025     FALSE 0.335 31.000 0.000 NA   NA
 3693683 3693684 GTNG_t025 GTNG_t026     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3693684 3693685 GTNG_t026 GTNG_t027     FALSE 0.046 163.000 0.000 NA   NA
 3693685 3693686 GTNG_t027 GTNG_t028     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3693686 3693687 GTNG_t028 GTNG_t029     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693687 3693688 GTNG_t029 GTNG_t030     FALSE 0.117 74.000 0.000 NA   NA
 3693688 3693689 GTNG_t030 GTNG_t031     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693689 3693690 GTNG_t031 GTNG_t032     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3693690 3693691 GTNG_t032 GTNG_16s005     FALSE 0.099 85.000 0.000 NA   NA
 3693691 3693692 GTNG_16s005 GTNG_23s005     FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 3693692 3693693 GTNG_23s005 GTNG_5s006     FALSE 0.010 252.000 0.000 NA   NA
 3693693 3693694 GTNG_5s006 GTNG_0211     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 3693694 3693695 GTNG_0211 GTNG_0212     TRUE 0.908 -3.000 0.217 NA   NA
 3693695 3693696 GTNG_0212 GTNG_0213     TRUE 0.934 -40.000 0.127 1.000   NA
 3693696 3693697 GTNG_0213 GTNG_0214     TRUE 0.870 -3.000 0.090 1.000   NA
 3693699 3693700 GTNG_0216 GTNG_0217 moaC   TRUE 0.607 16.000 0.013 1.000   NA
 3693700 3693701 GTNG_0217 GTNG_0218     TRUE 0.664 16.000 0.033 1.000   NA
 3693701 3693702 GTNG_0218 GTNG_0219     TRUE 0.796 21.000 0.107 NA   NA
 3693703 3693704 GTNG_0220 GTNG_0221     TRUE 0.825 -3.000 0.080 NA   NA
 3693705 3693706 GTNG_0222 GTNG_0223 groES groEL TRUE 0.969 103.000 0.674 0.006 Y NA
 3693707 3693708 GTNG_0224 GTNG_0225     TRUE 0.981 10.000 0.667 1.000 Y NA
 3693711 3693712 GTNG_0228 GTNG_0229     TRUE 0.813 123.000 0.714 NA   NA
 3693712 3693713 GTNG_0229 GTNG_0230     TRUE 0.968 -3.000 0.642 NA   NA
 3693713 3693714 GTNG_0230 GTNG_0231   guaA FALSE 0.055 198.000 0.007 NA   NA
 3693714 3693715 GTNG_0231 GTNG_0232 guaA   FALSE 0.009 518.000 0.000 1.000 N NA
 3693715 3693716 GTNG_0232 GTNG_0233     FALSE 0.195 57.000 0.000 NA   NA
 3693716 3693717 GTNG_0233 GTNG_0234     FALSE 0.002 437.000 0.000 NA   NA
 3693717 3693718 GTNG_0234 GTNG_0235     FALSE 0.299 142.000 0.042 1.000   NA
 3693718 3693719 GTNG_0235 GTNG_16s006     FALSE 0.014 230.000 0.000 NA   NA
 3693719 3693720 GTNG_16s006 GTNG_23s006     FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 3693720 3693721 GTNG_23s006 GTNG_5s007     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 3693723 3693724 GTNG_0237 GTNG_0238 purE purK TRUE 0.987 -7.000 0.038 0.001 Y NA
 3693724 3693725 GTNG_0238 GTNG_0239 purK purB TRUE 0.962 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 3693725 3693726 GTNG_0239 GTNG_0240 purB purC TRUE 0.843 74.000 0.072 1.000 Y NA
 3693726 3693727 GTNG_0240 GTNG_0241 purC   TRUE 0.993 -12.000 0.460 1.000 Y NA
 3693727 3693728 GTNG_0241 GTNG_0242   purL TRUE 0.996 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 3693728 3693729 GTNG_0242 GTNG_0243 purL purQ TRUE 0.996 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 3693729 3693730 GTNG_0243 GTNG_0244 purQ purF TRUE 0.988 -24.000 0.223 1.000 Y NA
 3693730 3693731 GTNG_0244 GTNG_0245 purF purM TRUE 0.885 98.000 0.248 1.000 Y NA
 3693731 3693732 GTNG_0245 GTNG_0246 purM purN TRUE 0.990 -3.000 0.238 0.003 Y NA
 3693732 3693733 GTNG_0246 GTNG_0247 purN purH TRUE 0.989 -34.000 0.225 1.000 Y NA
 3693733 3693734 GTNG_0247 GTNG_0248 purH purD TRUE 0.974 27.000 0.238 1.000 Y NA
 3693736 3693737 GTNG_0250 GTNG_0251     TRUE 0.862 20.000 0.200 NA   NA
 3693737 3693738 GTNG_0251 GTNG_0252     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 3693738 3693739 GTNG_0252 GTNG_0253     FALSE 0.001 927.000 0.000 NA   NA
 3693739 3693740 GTNG_0253 GTNG_0254     FALSE 0.223 106.000 0.015 NA   NA
 3693740 3693741 GTNG_0254 GTNG_0255     TRUE 0.711 29.000 0.049 NA   NA
 3693741 3693742 GTNG_0255 GTNG_0256   ligA TRUE 0.976 22.000 0.103 0.012 Y NA
 3693742 3693743 GTNG_0256 GTNG_0257 ligA   TRUE 0.642 -3.000 0.004 NA   NA
 3693743 3693744 GTNG_0257 GTNG_0258     FALSE 0.002 400.000 0.000 NA   NA
 3693745 3693746 GTNG_0259 GTNG_0260     FALSE 0.389 130.000 0.105 NA   NA
 3693747 3693748 GTNG_0261 GTNG_0262 gatC gatA TRUE 0.991 13.000 0.643 0.001 Y NA
 3693748 3693749 GTNG_0262 GTNG_0263 gatA gatB TRUE 0.988 14.000 0.492 0.001 Y NA
 3693749 3693750 GTNG_0263 GTNG_0264 gatB   FALSE 0.190 187.000 0.002 1.000 N NA
 3693750 3693751 GTNG_0264 GTNG_0265   sunA FALSE 0.003 672.000 0.000 1.000   NA
 3693751 3693752 GTNG_0265 GTNG_0266 sunA spaB FALSE 0.001 775.000 0.000 NA   NA
 3693752 3693753 GTNG_0266 GTNG_0267 spaB spaT FALSE 0.246 167.000 0.103 NA   NA
 3693753 3693754 GTNG_0267 GTNG_0268 spaT spaC TRUE 0.907 -31.000 0.069 1.000   NA
 3693754 3693755 GTNG_0268 GTNG_0269 spaC spaR FALSE 0.009 343.000 0.000 1.000   NA
 3693755 3693756 GTNG_0269 GTNG_0270 spaR spaK TRUE 0.986 -13.000 0.037 0.021 Y NA
 3693757 3693758 GTNG_0271 GTNG_0272 spaI spaG TRUE 0.841 55.000 0.333 NA   NA
 3693758 3693759 GTNG_0272 GTNG_0273 spaG spaE FALSE 0.268 176.000 0.163 NA   NA
 3693759 3693760 GTNG_0273 GTNG_0274 spaE spaF TRUE 0.933 19.000 0.449 NA   NA
 3693760 3693761 GTNG_0274 GTNG_0275 spaF   FALSE 0.007 655.000 0.000 1.000 N NA
 3693761 3693762 GTNG_0275 GTNG_0276     FALSE 0.103 390.000 0.018 0.100 Y NA
 3693762 3693763 GTNG_0276 GTNG_0277     TRUE 0.877 17.000 0.125 1.000 N NA
 3693763 3693764 GTNG_0277 GTNG_0278     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 3693765 3693766 GTNG_0279 GTNG_0280     FALSE 0.001 1087.000 0.000 NA   NA
 3693767 3693768 GTNG_0281 GTNG_0282     FALSE 0.447 173.000 0.333 NA   NA
 3693768 3693769 GTNG_0282 GTNG_0283     TRUE 0.986 -40.000 0.833 NA   NA
 3693769 3693770 GTNG_0283 GTNG_0284     FALSE 0.432 161.000 0.250 NA   NA
 3693770 3693771 GTNG_0284 GTNG_0285     TRUE 0.991 -46.000 0.304 1.000 Y NA
 3693772 3693773 GTNG_0286 GTNG_0287 hhoA   FALSE 0.209 53.000 0.000 NA   NA
 3693773 3693774 GTNG_0287 GTNG_0288     FALSE 0.002 413.000 0.000 NA   NA
 3693774 3693775 GTNG_0288 GTNG_0289   panF TRUE 0.888 -3.000 0.170 NA   NA
 3693775 3693776 GTNG_0289 GTNG_0290 panF   TRUE 0.849 4.000 0.095 1.000 N NA
 3693776 3693777 GTNG_0290 GTNG_0291     TRUE 0.950 4.000 0.143 1.000 Y NA
 3693777 3693778 GTNG_0291 GTNG_0292     TRUE 0.980 27.000 0.600 0.082 N NA
 3693778 3693779 GTNG_0292 GTNG_0293     FALSE 0.225 369.000 0.600 0.047 N NA
 3693781 3693782 GTNG_0295 GTNG_0296     TRUE 0.936 22.000 0.464 NA   NA
 3693782 3693783 GTNG_0296 GTNG_0297     FALSE 0.205 145.000 0.033 NA   NA
 3693783 3693784 GTNG_0297 GTNG_0298     TRUE 0.810 75.000 0.299 1.000 N NA
 3693786 3693787 GTNG_0300 GTNG_0301     TRUE 0.740 -25.000 0.000 1.000   NA
 3693787 3693788 GTNG_0301 GTNG_0302     FALSE 0.344 25.000 0.000 NA   NA
 3693788 3693789 GTNG_0302 GTNG_0303     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 11461047 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3566.000 0.000 NA   NA
 11603410 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3566.000 0.000 NA   NA
 11745802 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3566.000 0.000 NA   NA
 11461048 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3596.000 0.000 NA   NA
 11603411 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3596.000 0.000 NA   NA
 11745803 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3596.000 0.000 NA   NA
 11461049 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3632.000 0.000 NA   NA
 11603412 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3632.000 0.000 NA   NA
 11745804 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3632.000 0.000 NA   NA
 11461050 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3662.000 0.000 NA   NA
 11603413 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3662.000 0.000 NA   NA
 11745805 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3662.000 0.000 NA   NA
 11461051 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3699.000 0.000 NA   NA
 11603414 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3699.000 0.000 NA   NA
 11745806 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3699.000 0.000 NA   NA
 11461052 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3729.000 0.000 NA   NA
 11603415 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3729.000 0.000 NA   NA
 11745807 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3729.000 0.000 NA   NA
 11461053 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3766.000 0.000 NA   NA
 11603416 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3766.000 0.000 NA   NA
 11745808 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3766.000 0.000 NA   NA
 11461054 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3796.000 0.000 NA   NA
 11603417 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3796.000 0.000 NA   NA
 11745809 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3796.000 0.000 NA   NA
 11461055 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3832.000 0.000 NA   NA
 11603418 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3832.000 0.000 NA   NA
 11745810 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3832.000 0.000 NA   NA
 11461056 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3862.000 0.000 NA   NA
 11603419 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3862.000 0.000 NA   NA
 11745811 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3862.000 0.000 NA   NA
 11461057 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3900.000 0.000 NA   NA
 11603420 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3900.000 0.000 NA   NA
 11745812 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3900.000 0.000 NA   NA
 11461058 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3930.000 0.000 NA   NA
 11603421 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3930.000 0.000 NA   NA
 11745813 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3930.000 0.000 NA   NA
 11461059 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3966.000 0.000 NA   NA
 11603422 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3966.000 0.000 NA   NA
 11745814 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3966.000 0.000 NA   NA
 3693791 3693792 GTNG_0305 GTNG_0307     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA   NA
 3693792 3693793 GTNG_0307 GTNG_0308     TRUE 0.978 -7.000 0.667 NA   NA
 3693793 3693794 GTNG_0308 GTNG_0309     TRUE 0.933 -7.000 0.222 NA   NA
 3693794 3693795 GTNG_0309 GTNG_0310     FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 3693795 3693796 GTNG_0310 GTNG_0311     FALSE 0.088 120.000 0.000 NA   NA
 3693796 3693797 GTNG_0311 GTNG_0312     FALSE 0.002 415.000 0.000 NA   NA
 3693797 3693798 GTNG_0312 GTNG_0313     TRUE 0.578 -73.000 0.000 NA   NA
 3693798 3693799 GTNG_0313 GTNG_0314     FALSE 0.001 682.000 0.000 NA   NA
 3693799 3693800 GTNG_0314 GTNG_0315     FALSE 0.006 1050.000 0.000 1.000 N NA
 3693800 3693801 GTNG_0315 GTNG_0316     FALSE 0.024 195.000 0.000 NA   NA
 3693803 3693804 GTNG_0318 GTNG_0319     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 3693805 3693806 GTNG_0320 GTNG_0321     FALSE 0.081 174.000 0.000 1.000   NA
 3693806 3693807 GTNG_0321 GTNG_0322     FALSE 0.039 314.000 0.000 0.014   NA
 3693808 3693809 GTNG_0323 GTNG_0324     TRUE 0.895 -3.000 0.184 NA   NA
 3693809 3693810 GTNG_0324 GTNG_0325     FALSE 0.002 470.000 0.000 NA   NA
 3693815 3693816 GTNG_0330 GTNG_0331 resE   TRUE 0.991 0.000 0.833 1.000 Y NA
 3693816 3693817 GTNG_0331 GTNG_0332     TRUE 0.840 116.000 0.500 1.000 N NA
 3693817 3693818 GTNG_0332 GTNG_0333     TRUE 0.968 32.000 0.571 1.000 N NA
 3693818 3693819 GTNG_0333 GTNG_0334     FALSE 0.004 444.000 0.000 1.000   NA
 3693820 3693821 GTNG_0335 GTNG_0336 manC   TRUE 0.983 -3.000 0.087 0.012 Y NA
 3693821 3693822 GTNG_0336 GTNG_0337     TRUE 0.795 20.000 0.068 1.000   NA
 3693822 3693823 GTNG_0337 GTNG_0338   manB TRUE 0.849 -49.000 0.010 1.000   NA
 3693823 3693824 GTNG_0338 GTNG_0339 manB   FALSE 0.071 262.000 0.007 1.000 N NA
 3693824 3693825 GTNG_0339 GTNG_0340     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 3693825 3693826 GTNG_0340 GTNG_0341     TRUE 0.951 23.000 0.600 NA   NA
 3693826 3693827 GTNG_0341 GTNG_0342     TRUE 0.926 7.000 0.115 NA Y NA
 3693829 3693830 GTNG_0344 GTNG_0345     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 3693830 3693831 GTNG_0345 GTNG_0346   thiC FALSE 0.013 405.000 0.000 1.000 N NA
 3693831 3693832 GTNG_0346 GTNG_0347 thiC   FALSE 0.022 343.000 0.000 1.000 N NA
 3693832 3693833 GTNG_0347 GTNG_0348     TRUE 0.994 -18.000 0.556 1.000 Y NA
 3693833 3693834 GTNG_0348 GTNG_0349     TRUE 0.529 135.000 0.082 1.000 N NA
 3693834 3693835 GTNG_0349 GTNG_0350     FALSE 0.499 152.000 0.107 1.000 N NA
 3693836 3693837 GTNG_0351 GTNG_0352     TRUE 0.923 0.000 0.205 1.000 N NA
 3693837 3693838 GTNG_0352 GTNG_0353     FALSE 0.315 136.000 0.000 1.000 N NA
 3693838 3693839 GTNG_0353 GTNG_0354     TRUE 0.992 22.000 0.667 0.054 Y NA
 3693839 3693840 GTNG_0354 GTNG_0355     TRUE 0.997 -13.000 0.800 0.046 Y NA
 3693840 3693841 GTNG_0355 GTNG_0356     TRUE 0.726 -13.000 0.003 NA   NA
 3693841 3693842 GTNG_0356 GTNG_0357     TRUE 0.641 -3.000 0.004 NA   NA
 3693842 3693843 GTNG_0357 GTNG_0358     FALSE 0.174 62.000 0.000 NA   NA
 3693843 3693844 GTNG_0358 GTNG_0359     FALSE 0.096 97.000 0.000 NA   NA
 3693844 3693845 GTNG_0359 GTNG_0360     TRUE 0.934 16.000 0.549 1.000   NA
 3693846 3693847 GTNG_0361 GTNG_0362 hutP   FALSE 0.222 150.000 0.044 NA   NA
 3693847 3693848 GTNG_0362 GTNG_0363     FALSE 0.192 100.000 0.000 1.000   NA
 3693848 3693849 GTNG_0363 GTNG_0364     FALSE 0.015 281.000 0.000 1.000   NA
 3693849 3693850 GTNG_0364 GTNG_0365     TRUE 0.796 43.000 0.038 1.000 N NA
 3693851 3693852 GTNG_0366 GTNG_0367     TRUE 0.982 -3.000 0.447 0.001   NA
 3693852 3693853 GTNG_0367 GTNG_0368     TRUE 0.990 19.000 0.947 NA Y NA
 3693853 3693854 GTNG_0368 GTNG_0369     TRUE 0.778 110.000 0.395 NA N NA
 3693855 3693856 GTNG_0370 GTNG_0371     TRUE 0.692 107.000 0.000 1.000 Y NA
 3693856 3693857 GTNG_0371 GTNG_0372     TRUE 0.986 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 3693861 3693862 GTNG_0376 GTNG_0377     TRUE 0.610 2.000 0.029 NA   NA
 3693862 3693863 GTNG_0377 GTNG_0378     FALSE 0.060 203.000 0.019 NA   NA
 3693863 3693864 GTNG_0378 GTNG_0379     FALSE 0.253 102.000 0.021 NA   NA
 3693865 3693866 GTNG_0380 GTNG_0381     TRUE 0.930 14.000 0.644 NA   NA
 3693868 3693869 GTNG_0383 GTNG_0384     FALSE 0.368 88.000 0.029 1.000   NA
 3693869 3693870 GTNG_0384 GTNG_0385     TRUE 0.906 11.000 0.438 1.000   NA
 3693870 3693871 GTNG_0385 GTNG_0386     FALSE 0.457 141.000 0.049 1.000 N NA
 3693871 3693872 GTNG_0386 GTNG_0387   sat TRUE 0.967 13.000 0.101 0.002 Y NA
 3693872 3693873 GTNG_0387 GTNG_0388 sat   TRUE 0.901 48.000 0.009 1.000 Y NA
 3693873 3693874 GTNG_0388 GTNG_0389     TRUE 0.716 12.000 0.005 1.000 N NA
 3693874 3693875 GTNG_0389 GTNG_0390     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 3693876 3693877 GTNG_0391 GTNG_0392     FALSE 0.384 68.000 0.003 1.000   NA
 3693878 3693879 GTNG_0393 GTNG_0394     FALSE 0.372 120.000 0.077 NA   NA
 3693880 3693881 GTNG_0395 GTNG_0396     FALSE 0.436 153.000 0.212 NA   NA
 3693883 3693884 GTNG_0398 GTNG_0399     FALSE 0.468 173.000 0.185 1.000 N NA
 3693884 3693885 GTNG_0399 GTNG_0400     FALSE 0.505 160.000 0.160 1.000 N NA
 3693885 3693886 GTNG_0400 GTNG_0401     TRUE 0.862 12.000 0.164 1.000 N NA
 3693888 3693889 GTNG_0403 GTNG_0404     FALSE 0.003 716.000 0.000 1.000   NA
 3693889 3693890 GTNG_0404 GTNG_0405     FALSE 0.144 624.000 0.312 0.052 Y NA
 3693890 3693891 GTNG_0405 GTNG_0406     TRUE 0.982 4.000 0.375 0.052 Y NA
 3693891 3693892 GTNG_0406 GTNG_0407     TRUE 0.923 23.000 0.000 1.000 Y NA
 3693894 3693895 GTNG_0409 GTNG_0410     FALSE 0.247 15.000 0.000 NA   NA
 3693895 3693896 GTNG_0410 GTNG_0411     FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 3693896 3693897 GTNG_0411 GTNG_0412     TRUE 0.954 14.000 1.000 NA   NA
 3693897 3693898 GTNG_0412 GTNG_0413     FALSE 0.110 428.000 1.000 NA   NA
 3693898 3693899 GTNG_0413 GTNG_0414     TRUE 0.952 12.000 1.000 NA   NA
 3693899 3693900 GTNG_0414 GTNG_0415     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3693900 3693901 GTNG_0415 GTNG_0416     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 3693901 3693902 GTNG_0416 GTNG_0417     TRUE 0.813 45.000 0.211 NA   NA
 3693902 3693903 GTNG_0417 GTNG_0418     TRUE 0.960 35.000 0.833 NA   NA
 3693903 3693904 GTNG_0418 GTNG_0419     TRUE 0.944 37.000 0.623 NA   NA
 3693904 3693905 GTNG_0419 GTNG_0420     TRUE 0.833 24.000 0.151 NA   NA
 3693905 3693906 GTNG_0420 GTNG_0421     TRUE 0.951 -10.000 0.286 NA   NA
 3693906 3693907 GTNG_0421 GTNG_0422     FALSE 0.245 47.000 0.000 NA   NA
 3693907 3693908 GTNG_0422 GTNG_0423     TRUE 0.906 7.000 0.500 NA   NA
 3693908 3693909 GTNG_0423 GTNG_0424     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693909 3693910 GTNG_0424 GTNG_0425     FALSE 0.017 217.000 0.000 NA   NA
 3693910 3693911 GTNG_0425 GTNG_0426     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3693911 3693912 GTNG_0426 GTNG_0427     FALSE 0.001 525.000 0.000 NA   NA
 3693912 3693913 GTNG_0427 GTNG_0428     FALSE 0.002 397.000 0.000 NA   NA
 3693913 3693914 GTNG_0428 GTNG_0429     FALSE 0.083 127.000 0.000 NA   NA
 3693914 3693915 GTNG_0429 GTNG_0430     TRUE 0.904 18.000 0.333 NA   NA
 3693915 3693916 GTNG_0430 GTNG_0431     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 3693916 3693917 GTNG_0431 GTNG_0432     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3693917 3693918 GTNG_0432 GTNG_0433     FALSE 0.343 24.000 0.000 NA   NA
 3693918 3693919 GTNG_0433 GTNG_0434     FALSE 0.002 411.000 0.000 NA   NA
 3693920 3693921 GTNG_0435 GTNG_0436     TRUE 0.828 42.000 0.054 0.062   NA
 3693922 3693923 GTNG_0437 GTNG_0438     FALSE 0.001 628.000 0.000 NA   NA
 3693923 3693924 GTNG_0438 GTNG_0439     TRUE 0.945 28.000 0.514 NA   NA
 3693924 3693925 GTNG_0439 GTNG_0440     TRUE 0.705 65.000 0.210 NA   NA
 3693925 3693926 GTNG_0440 GTNG_0441     TRUE 0.971 -3.000 0.679 NA   NA
 3693926 3693927 GTNG_0441 GTNG_0442     TRUE 0.993 3.000 0.853 0.020 Y NA
 3693927 3693928 GTNG_0442 GTNG_0443     FALSE 0.006 375.000 0.000 1.000   NA
 3693928 3693929 GTNG_0443 GTNG_0444   tipA FALSE 0.036 220.000 0.000 1.000   NA
 3693929 3693930 GTNG_0444 GTNG_0445 tipA   FALSE 0.001 973.000 0.000 NA   NA
 3693930 3693931 GTNG_0445 GTNG_0446     FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 3693931 3693932 GTNG_0446 GTNG_0447     FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 3693932 3693933 GTNG_0447 GTNG_0448     TRUE 0.849 8.000 0.303 NA   NA
 3693933 3693934 GTNG_0448 GTNG_0449     FALSE 0.088 109.000 0.000 NA   NA
 3693934 3693935 GTNG_0449 GTNG_0450     TRUE 0.982 -7.000 0.833 NA   NA
 3693935 3693936 GTNG_0450 GTNG_0451     FALSE 0.088 111.000 0.000 NA   NA
 3693937 3693938 GTNG_0452 GTNG_0453     TRUE 0.758 100.000 0.259 1.000 N NA
 3693940 3693941 GTNG_0455 GTNG_0456     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 3693941 3693942 GTNG_0456 GTNG_0457     FALSE 0.010 252.000 0.000 NA   NA
 3693943 3693944 GTNG_0458 GTNG_0459 recX   FALSE 0.421 69.000 0.045 NA   NA
 3693945 3693946 GTNG_0460 GTNG_0461   sspK TRUE 0.560 75.000 0.160 NA   NA
 3693946 3693947 GTNG_0461 GTNG_0462 sspK   TRUE 0.732 19.000 0.066 NA   NA
 3693947 3693948 GTNG_0462 GTNG_0463     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 3693948 3693949 GTNG_0463 GTNG_0464     TRUE 0.985 -7.000 1.000 NA   NA
 3693950 3693951 GTNG_0465 GTNG_0466     FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 3693951 3693952 GTNG_0466 GTNG_0467     TRUE 0.798 17.000 0.023 1.000 N NA
 3693952 3693953 GTNG_0467 GTNG_0468     FALSE 0.015 435.000 0.002 1.000 N NA
 3693955 3693956 GTNG_0470 GTNG_0471 fabI   TRUE 0.825 59.000 0.282 1.000   NA
 3693956 3693957 GTNG_0471 GTNG_0472     FALSE 0.031 183.000 0.000 NA   NA
 3693957 3693958 GTNG_0472 GTNG_0473     FALSE 0.194 131.000 0.015 NA   NA
 3693958 3693959 GTNG_0473 GTNG_0474     TRUE 0.668 66.000 0.077 NA N NA
 3693959 3693960 GTNG_0474 GTNG_0475     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693960 3693961 GTNG_0475 GTNG_0476     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3693961 3693962 GTNG_0476 GTNG_0477     TRUE 0.998 -34.000 1.000 0.003 Y NA
 3693962 3693963 GTNG_0477 GTNG_0478   dppA TRUE 0.983 48.000 0.750 1.000 Y NA
 3693963 3693964 GTNG_0478 GTNG_0479 dppA dppB TRUE 0.900 71.000 0.067 0.051 Y NA
 3693964 3693965 GTNG_0479 GTNG_0480 dppB dppC TRUE 0.993 20.000 0.779 0.051 Y NA
 3693966 3693967 GTNG_0481 GTNG_0482     FALSE 0.349 118.000 0.066 NA   NA
 3693967 3693968 GTNG_0482 GTNG_0483     FALSE 0.013 356.000 0.036 NA   NA
 3693969 3693970 GTNG_0484 GTNG_0485     TRUE 0.968 -7.000 0.488 NA   NA
 3693970 3693971 GTNG_0485 GTNG_0486     TRUE 0.914 5.000 0.500 NA   NA
 3693971 3693972 GTNG_0486 GTNG_0487   ldh FALSE 0.212 152.000 0.042 NA   NA
 3693972 3693973 GTNG_0487 GTNG_0488 ldh   FALSE 0.139 186.000 0.065 NA   NA
 3693973 3693974 GTNG_0488 GTNG_0489     FALSE 0.321 64.000 0.005 NA   NA
 3693974 3693975 GTNG_0489 GTNG_0490     FALSE 0.110 226.000 0.005 1.000 N NA
 3693977 3693978 GTNG_0492 GTNG_16s007     FALSE 0.002 472.000 0.000 NA   NA
 3693978 3693979 GTNG_16s007 GTNG_23s007     FALSE 0.002 392.000 0.000 NA   NA
 3693979 3693980 GTNG_23s007 GTNG_5s008     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA   NA
 3693980 3693981 GTNG_5s008 GTNG_t033     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3693981 3693982 GTNG_t033 GTNG_t034     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693982 3693983 GTNG_t034 GTNG_t035     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693983 3693984 GTNG_t035 GTNG_t036     FALSE 0.034 178.000 0.000 NA   NA
 3693984 3693985 GTNG_t036 GTNG_t037     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3693985 3693986 GTNG_t037 GTNG_t038     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3693986 3693987 GTNG_t038 GTNG_t039     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693987 3693988 GTNG_t039 GTNG_t040     FALSE 0.231 8.000 0.000 NA   NA
 3693988 3693989 GTNG_t040 GTNG_t041     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3693989 3693990 GTNG_t041 GTNG_t042     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693990 3693991 GTNG_t042 GTNG_t043     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3693991 3693992 GTNG_t043 GTNG_t044     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3693992 3693993 GTNG_t044 GTNG_t045     FALSE 0.231 9.000 0.000 NA   NA
 3693993 3693994 GTNG_t045 GTNG_t046     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3693994 3693995 GTNG_t046 GTNG_t047     FALSE 0.335 31.000 0.000 NA   NA
 3693995 3693996 GTNG_t047 GTNG_t048     FALSE 0.231 9.000 0.000 NA   NA
 3693996 3693997 GTNG_t048 GTNG_t049     FALSE 0.335 31.000 0.000 NA   NA
 3693997 3693998 GTNG_t049 GTNG_t050     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3693998 3693999 GTNG_t050 GTNG_t051     FALSE 0.012 243.000 0.000 NA   NA
 3693999 3694000 GTNG_t051 GTNG_t052     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3694000 3694001 GTNG_t052 GTNG_t053     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3694003 3694004 GTNG_0494 GTNG_0495     TRUE 0.706 59.000 0.174 NA   NA
 3694004 3694005 GTNG_0495 GTNG_0496     TRUE 0.788 24.000 0.097 NA   NA
 3694005 3694006 GTNG_0496 GTNG_0497     FALSE 0.025 325.000 0.000 1.000 N NA
 3694006 3694007 GTNG_0497 GTNG_0498     FALSE 0.399 226.000 0.683 NA   NA
 3694010 3694011 GTNG_0501 GTNG_0502     TRUE 0.984 66.000 1.000 0.076 Y NA
 3694012 3694013 GTNG_0503 GTNG_0504     FALSE 0.267 180.000 0.037 1.000 N NA
 3694013 3694014 GTNG_0504 GTNG_0505     FALSE 0.011 310.000 0.000 1.000   NA
 3694014 3694015 GTNG_0505 GTNG_0506     FALSE 0.276 127.000 0.010 1.000   NA
 3694015 3694016 GTNG_0506 GTNG_0507     FALSE 0.266 131.000 0.013 1.000   NA
 3694019 3694020 GTNG_0510 GTNG_0511   bdbC TRUE 0.965 -3.000 0.236 0.004   NA
 3694021 3694022 GTNG_0512 GTNG_0513     FALSE 0.360 114.000 0.037 1.000   NA
 3694026 3694027 GTNG_0517 GTNG_0518     FALSE 0.014 285.000 0.000 1.000   NA
 3694027 3694028 GTNG_0518 GTNG_0519     TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.052 Y NA
 3694028 3694029 GTNG_0519 GTNG_0520     FALSE 0.028 187.000 0.000 NA   NA
 3694029 3694030 GTNG_0520 GTNG_0521     FALSE 0.008 267.000 0.000 NA   NA
 3694030 3694031 GTNG_0521 GTNG_0522     FALSE 0.002 413.000 0.000 NA   NA
 3694031 3694032 GTNG_0522 GTNG_0523     TRUE 0.630 7.000 0.067 NA   NA
 3694034 3694035 GTNG_0525 GTNG_0526     TRUE 0.871 -7.000 0.086 NA   NA
 3694035 3694036 GTNG_0526 GTNG_0527     FALSE 0.053 203.000 0.011 NA   NA
 3694036 3694037 GTNG_0527 GTNG_0528     FALSE 0.394 138.000 0.011 1.000 N NA
 3694037 3694038 GTNG_0528 GTNG_0529     FALSE 0.286 100.000 0.031 NA   NA
 3694038 3694039 GTNG_0529 GTNG_0530     FALSE 0.212 141.000 0.031 NA   NA
 3694041 3694042 GTNG_0532 GTNG_0533     TRUE 0.758 16.000 0.138 NA   NA
 3694042 3694043 GTNG_0533 GTNG_0534     TRUE 0.963 -3.000 0.469 1.000   NA
 3694043 3694044 GTNG_0534 GTNG_0535   tenI TRUE 0.710 17.000 0.000 1.000 N NA
 3694044 3694045 GTNG_0535 GTNG_0536 tenI   TRUE 0.819 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3694045 3694046 GTNG_0536 GTNG_0537   thiS TRUE 0.954 -3.000 0.239 1.000 N NA
 3694046 3694047 GTNG_0537 GTNG_0538 thiS thiG TRUE 0.940 2.000 0.054 1.000 Y NA
 3694047 3694048 GTNG_0538 GTNG_0539 thiG moeB TRUE 0.973 -3.000 0.009 0.039 Y NA
 3694048 3694049 GTNG_0539 GTNG_0540 moeB   FALSE 0.012 510.000 0.000 0.039   NA
 3694052 3694053 GTNG_0543 GTNG_0544     TRUE 0.701 135.000 0.321 NA N NA
 3694053 3694054 GTNG_0544 GTNG_0545     FALSE 0.458 83.000 0.107 NA   NA
 3694054 3694055 GTNG_0545 GTNG_0546     FALSE 0.002 472.000 0.000 NA   NA
 3694055 3694056 GTNG_0546 GTNG_0547     TRUE 0.855 -3.000 0.111 NA   NA
 3694056 3694057 GTNG_0547 GTNG_0548     TRUE 0.981 -3.000 0.583 0.039   NA
 3694057 3694058 GTNG_0548 GTNG_0549     TRUE 0.897 4.000 0.167 0.039   NA
 3694059 3694060 GTNG_0550 GTNG_0551     TRUE 0.730 73.000 0.321 NA   NA
 3694060 3694061 GTNG_0551 GTNG_0552     FALSE 0.212 145.000 0.036 NA   NA
 3694061 3694062 GTNG_0552 GTNG_0553     FALSE 0.218 223.000 0.091 0.039   NA
 3694064 3694065 GTNG_0555 GTNG_0556     TRUE 0.961 -7.000 0.382 NA   NA
 3694065 3694066 GTNG_0556 GTNG_0557     FALSE 0.250 119.000 0.024 NA   NA
 3694066 3694067 GTNG_0557 GTNG_0558     FALSE 0.068 247.000 0.087 NA   NA
 3694067 3694068 GTNG_0558 GTNG_0559     FALSE 0.196 123.000 0.008 NA   NA
 3694068 3694069 GTNG_0559 GTNG_0560     FALSE 0.255 95.000 0.020 NA   NA
 3694069 3694070 GTNG_0560 GTNG_0561     FALSE 0.002 462.000 0.000 NA   NA
 3694072 3694073 GTNG_0563 GTNG_0564   prsA FALSE 0.003 365.000 0.000 NA   NA
 3694075 3694076 GTNG_0566 GTNG_0567   escB TRUE 0.951 -3.000 0.271 NA N NA
 3694076 3694077 GTNG_0567 GTNG_0568 escB   FALSE 0.011 247.000 0.000 NA   NA
 3694077 3694078 GTNG_0568 GTNG_0569   hemE FALSE 0.130 146.000 0.002 NA   NA
 3694078 3694079 GTNG_0569 GTNG_0570 hemE hemH TRUE 0.946 16.000 0.131 1.000 Y NA
 3694079 3694080 GTNG_0570 GTNG_0571 hemH   TRUE 0.976 -7.000 0.069 1.000 Y NA
 3694080 3694081 GTNG_0571 GTNG_0572     FALSE 0.194 200.000 0.038 1.000 N NA
 3694081 3694082 GTNG_0572 GTNG_0573     TRUE 0.548 75.000 0.150 NA   NA
 3694082 3694083 GTNG_0573 GTNG_0574     FALSE 0.001 622.000 0.000 NA   NA
 3694083 3694084 GTNG_0574 GTNG_0575     FALSE 0.347 127.000 0.037 1.000   NA
 3694084 3694085 GTNG_0575 GTNG_0576     TRUE 0.730 137.000 0.571 NA   NA
 3694085 3694086 GTNG_0576 GTNG_0577     FALSE 0.458 70.000 0.067 NA   NA
 3694086 3694087 GTNG_0577 GTNG_0578     TRUE 0.893 -34.000 0.048 1.000   NA
 3694089 3694090 GTNG_0580 GTNG_0581     TRUE 0.854 -7.000 0.069 NA   NA
 3694092 3694093 GTNG_0583 GTNG_0584     FALSE 0.202 106.000 0.008 NA   NA
 3694093 3694094 GTNG_0584 GTNG_0585     FALSE 0.309 132.000 0.067 NA   NA
 3694094 3694095 GTNG_0585 GTNG_0586     FALSE 0.294 94.000 0.033 NA   NA
 3694095 3694096 GTNG_0586 GTNG_0587     TRUE 0.918 -3.000 0.246 NA   NA
 3694096 3694097 GTNG_0587 GTNG_0588     FALSE 0.139 248.000 0.086 1.000 N NA
 3694097 3694098 GTNG_0588 GTNG_0589     TRUE 0.994 -3.000 0.408 0.002 Y NA
 3694098 3694099 GTNG_0589 GTNG_0590   sbcD TRUE 0.941 18.000 0.041 1.000 Y NA
 3694099 3694100 GTNG_0590 GTNG_0591 sbcD yirY TRUE 0.991 -3.000 0.669 0.002 N NA
 3694101 3694102 GTNG_0592 GTNG_0593 gerPF gerPE TRUE 0.797 0.000 0.111 NA   NA
 3694102 3694103 GTNG_0593 GTNG_0594 gerPE gerpD TRUE 0.911 -3.000 0.222 NA   NA
 3694103 3694104 GTNG_0594 GTNG_0595 gerpD gerpC TRUE 0.849 3.000 0.231 NA   NA
 3694104 3694105 GTNG_0595 GTNG_0596 gerpC gerpB TRUE 0.843 84.000 0.769 NA   NA
 3694105 3694106 GTNG_0596 GTNG_0597 gerpB gerPA TRUE 0.954 16.000 0.889 NA   NA
 3694106 3694107 GTNG_0597 GTNG_0598 gerPA   TRUE 0.555 69.000 0.111 NA   NA
 3694112 3694113 GTNG_0603 GTNG_0604     FALSE 0.391 141.000 0.141 NA   NA
 3694113 3694114 GTNG_0604 GTNG_0605     FALSE 0.441 123.000 0.125 NA   NA
 3694120 3694121 GTNG_0611 GTNG_0612     TRUE 0.968 70.000 0.800 1.000 Y NA
 3694121 3694122 GTNG_0612 GTNG_0613     TRUE 0.994 0.000 0.909 0.049 Y NA
 3694122 3694123 GTNG_0613 GTNG_0614     TRUE 0.914 74.000 0.273 1.000 Y NA
 3694123 3694124 GTNG_0614 GTNG_0615     TRUE 0.882 17.000 0.136 1.000 N NA
 3694124 3694125 GTNG_0615 GTNG_0616     TRUE 0.847 116.000 0.045 0.048 Y NA
 3694125 3694126 GTNG_0616 GTNG_0617     FALSE 0.117 200.000 0.000 1.000 N NA
 3694126 3694127 GTNG_0617 GTNG_0618     TRUE 0.994 29.000 0.698 0.003 Y NA
 3694127 3694128 GTNG_0618 GTNG_0619     TRUE 0.961 30.000 0.026 0.076 Y NA
 3694129 3694130 GTNG_0620 GTNG_0621   metH FALSE 0.022 344.000 0.000 1.000 N NA
 3694130 3694131 GTNG_0621 GTNG_0622 metH   TRUE 0.988 -7.000 0.045 0.001 Y NA
 3694132 3694133 GTNG_0623 GTNG_0624     TRUE 0.997 -30.000 0.928 1.000 Y NA
 3694133 3694134 GTNG_0624 GTNG_0625     TRUE 0.993 -3.000 0.492 0.049 Y NA
 3694134 3694135 GTNG_0625 GTNG_0626     TRUE 0.981 1.000 0.253 0.049 Y NA
 3694138 3694139 GTNG_0630 GTNG_0631     FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 3694139 3694140 GTNG_0631 GTNG_0632     FALSE 0.001 956.000 0.000 NA   NA
 3694140 3694141 GTNG_0632 GTNG_0633     FALSE 0.212 175.000 0.097 NA   NA
 3694141 3694142 GTNG_0633 GTNG_0634     FALSE 0.003 368.000 0.000 NA   NA
 3694143 3694144 GTNG_0635 GTNG_0636     FALSE 0.049 198.000 0.000 1.000   NA
 3694144 3694145 GTNG_0636 GTNG_0637     TRUE 0.992 -16.000 1.000 1.000 N NA
 3694146 3694147 GTNG_0638 GTNG_0639     FALSE 0.136 171.000 0.031 NA   NA
 3694147 3694148 GTNG_0639 GTNG_0640     TRUE 0.715 6.000 0.071 1.000   NA
 3694148 3694149 GTNG_0640 GTNG_0641     TRUE 0.945 -3.000 0.071 0.001   NA
 3694149 3694150 GTNG_0641 GTNG_0642     FALSE 0.037 217.000 0.000 1.000   NA
 3694151 3694152 GTNG_0643 GTNG_0644 norZ   FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 3694152 3694153 GTNG_0644 GTNG_0645   mobA FALSE 0.220 82.000 0.007 NA   NA
 3694153 3694154 GTNG_0645 GTNG_0646 mobA   FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 3694154 3694155 GTNG_0646 GTNG_0647   pqqE FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 3694155 3694156 GTNG_0647 GTNG_0648 pqqE   FALSE 0.003 355.000 0.000 NA   NA
 3694156 3694157 GTNG_0648 GTNG_0649   narK FALSE 0.001 1227.000 0.000 NA   NA
 3694157 3694158 GTNG_0649 GTNG_0650 narK nirK FALSE 0.012 300.000 0.000 1.000   NA
 3694160 3694161 GTNG_0652 GTNG_0653   narG FALSE 0.330 32.000 0.000 NA   NA
 3694161 3694162 GTNG_0653 GTNG_0654 narG narH TRUE 0.983 -10.000 0.000 0.001 Y NA
 3694162 3694163 GTNG_0654 GTNG_0655 narH narJ TRUE 0.984 -25.000 0.000 0.003 Y NA
 3694163 3694164 GTNG_0655 GTNG_0656 narJ narI TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 3694166 3694167 GTNG_0658 GTNG_0659 modB moaA TRUE 0.706 55.000 0.019 1.000 N NA
 3694169 3694170 GTNG_0661 GTNG_0662   moeA TRUE 0.791 50.000 0.065 1.000 N NA
 3694170 3694171 GTNG_0662 GTNG_0663 moeA mobB TRUE 0.985 -3.000 0.100 0.003 Y NA
 3694171 3694172 GTNG_0663 GTNG_0664 mobB   TRUE 0.981 -3.000 0.040 0.003 Y NA
 3694172 3694173 GTNG_0664 GTNG_0665     TRUE 0.995 -3.000 0.501 0.003 Y NA
 3694173 3694174 GTNG_0665 GTNG_0666     FALSE 0.444 6.000 0.006 NA   NA
 3694175 3694176 GTNG_0667 GTNG_0668     FALSE 0.004 442.000 0.000 1.000   NA
 3694177 3694178 GTNG_0669 GTNG_0670     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694178 3694179 GTNG_0670 GTNG_0671   argJ TRUE 0.988 26.000 0.303 0.003 Y NA
 3694179 3694180 GTNG_0671 GTNG_0672 argJ   TRUE 0.961 13.000 0.067 0.003 Y NA
 3694180 3694181 GTNG_0672 GTNG_0673   argD TRUE 0.986 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 3694181 3694182 GTNG_0673 GTNG_0674 argD carA TRUE 0.898 93.000 0.286 1.000 Y NA
 3694182 3694183 GTNG_0674 GTNG_0675 carA carB TRUE 0.997 -7.000 0.714 0.001 Y NA
 3694183 3694184 GTNG_0675 GTNG_0676 carB   TRUE 0.961 -3.000 0.027 1.000 Y NA
 3694184 3694185 GTNG_0676 GTNG_0677     FALSE 0.047 214.000 0.011 NA   NA
 3694185 3694186 GTNG_0677 GTNG_0678   clpB FALSE 0.204 107.000 0.009 NA   NA
 3694186 3694187 GTNG_0678 GTNG_0679 clpB   FALSE 0.172 178.000 0.000 1.000 N NA
 3694187 3694188 GTNG_0679 GTNG_0680     FALSE 0.196 90.000 0.000 1.000   NA
 3694192 3694193 GTNG_0684 GTNG_0685 fabH fabF TRUE 0.974 38.000 0.076 0.001 Y NA
 3694193 3694194 GTNG_0685 GTNG_0686 fabF   FALSE 0.239 176.000 0.039 NA N NA
 3694194 3694195 GTNG_0686 GTNG_0687     TRUE 0.537 99.000 0.179 NA   NA
 3694195 3694196 GTNG_0687 GTNG_0688     TRUE 0.681 86.000 0.320 NA   NA
 3694197 3694198 GTNG_0689 GTNG_0690     FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 3694199 3694200 GTNG_0691 GTNG_0692 oppA oppB TRUE 0.791 146.000 0.052 0.049 Y NA
 3694200 3694201 GTNG_0692 GTNG_0693 oppB oppC TRUE 0.977 0.000 0.165 0.049 Y NA
 3694201 3694202 GTNG_0693 GTNG_0694 oppC oppD TRUE 0.989 22.000 0.706 1.000 Y NA
 3694202 3694203 GTNG_0694 GTNG_0695 oppD   TRUE 0.996 -43.000 0.375 0.003 Y NA
 3694207 3694208 GTNG_0699 GTNG_0700 mecA cls TRUE 0.758 97.000 0.314 NA N NA
 3694208 3694209 GTNG_0700 GTNG_0701 cls   TRUE 0.560 85.000 0.189 NA   NA
 3694209 3694210 GTNG_0701 GTNG_0702     TRUE 0.922 33.000 0.398 NA   NA
 3694211 3694212 GTNG_0703 GTNG_0704     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 3694212 3694213 GTNG_0704 GTNG_0705     TRUE 0.940 -142.000 0.138 1.000   NA
 3694213 3694214 GTNG_0705 GTNG_0706     FALSE 0.262 102.000 0.024 NA   NA
 3694214 3694215 GTNG_0706 GTNG_0707     TRUE 0.897 -3.000 0.188 NA   NA
 3694216 3694217 GTNG_0708 GTNG_0709     TRUE 0.645 101.000 0.283 NA   NA
 3694217 3694218 GTNG_0709 GTNG_0710   ppnK TRUE 0.976 -3.000 0.725 1.000   NA
 3694218 3694219 GTNG_0710 GTNG_0711 ppnK   TRUE 0.832 116.000 0.480 1.000 N NA
 3694220 3694221 GTNG_0712 GTNG_0713     FALSE 0.342 118.000 0.028 1.000   NA
 3694222 3694223 GTNG_0714 GTNG_0715 fabL   FALSE 0.120 179.000 0.035 NA   NA
 3694225 3694226 GTNG_0717 GTNG_0718     TRUE 0.918 6.000 0.556 NA   NA
 3694226 3694227 GTNG_0718 GTNG_0719     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3694228 3694229 GTNG_0720 GTNG_0721     TRUE 0.977 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 3694229 3694230 GTNG_0721 GTNG_0722     TRUE 0.977 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 3694230 3694231 GTNG_0722 GTNG_0723     FALSE 0.019 207.000 0.000 NA   NA
 3694231 3694232 GTNG_0723 GTNG_0724     FALSE 0.021 201.000 0.000 NA   NA
 3694234 3694235 GTNG_0726 GTNG_0727     FALSE 0.459 226.000 0.857 NA   NA
 3694236 3694237 GTNG_0728 GTNG_0729     FALSE 0.009 266.000 0.000 NA   NA
 3694237 3694238 GTNG_0729 GTNG_0730     TRUE 0.952 28.000 0.600 NA   NA
 3694238 3694239 GTNG_0730 GTNG_0731     TRUE 0.706 164.000 0.800 NA   NA
 3694239 3694240 GTNG_0731 GTNG_0732     TRUE 0.844 97.000 0.800 NA   NA
 3694240 3694241 GTNG_0732 GTNG_0733   spoVAC TRUE 0.914 12.000 0.556 NA   NA
 3694241 3694242 GTNG_0733 GTNG_0734 spoVAC   TRUE 0.970 -15.000 0.444 NA   NA
 3694242 3694243 GTNG_0734 GTNG_0735   spoVAE TRUE 0.915 11.000 0.571 NA   NA
 3694243 3694244 GTNG_0735 GTNG_0736 spoVAE   TRUE 0.916 12.000 0.571 NA   NA
 3694244 3694245 GTNG_0736 GTNG_0737     TRUE 0.908 13.000 0.500 NA   NA
 3694246 3694247 GTNG_0738 GTNG_0739     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694248 3694249 GTNG_0740 GTNG_0741     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 3694250 3694251 GTNG_0742 GTNG_0743     TRUE 0.889 0.000 0.213 1.000   NA
 3694251 3694252 GTNG_0743 GTNG_0744     TRUE 0.917 39.000 0.287 NA N NA
 3694253 3694254 GTNG_0745 GTNG_0746     TRUE 0.990 4.000 0.600 0.006 Y NA
 3694255 3694256 GTNG_0747 GTNG_0748     TRUE 0.799 17.000 0.154 NA   NA
 3694257 3694258 GTNG_0749 GTNG_0750     TRUE 0.904 3.000 0.385 NA   NA
 3694258 3694259 GTNG_0750 GTNG_0751     TRUE 0.723 -3.000 0.024 NA   NA
 3694259 3694260 GTNG_0751 GTNG_t054     FALSE 0.078 130.000 0.000 NA   NA
 3694261 3694262 GTNG_0752 GTNG_0753     FALSE 0.209 53.000 0.000 NA   NA
 3694264 3694265 GTNG_0755 GTNG_0756     FALSE 0.312 137.000 0.000 1.000 N NA
 3694266 3694267 GTNG_0757 GTNG_0758     FALSE 0.002 857.000 0.000 1.000   NA
 3694267 3694268 GTNG_0758 GTNG_0759     TRUE 0.921 48.000 0.000 0.059 Y NA
 3694268 3694269 GTNG_0759 GTNG_0760     FALSE 0.002 2080.000 0.000 1.000   NA
 3694269 3694270 GTNG_0760 GTNG_0761   hsdR FALSE 0.002 774.000 0.000 1.000   NA
 3694270 3694271 GTNG_0761 GTNG_0762 hsdR   TRUE 0.990 1.000 0.567 0.059 Y NA
 3694271 3694272 GTNG_0762 GTNG_0763     TRUE 0.989 -3.000 0.267 0.059 Y NA
 3694275 3694276 GTNG_0766 GTNG_0767     FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 3694277 3694278 GTNG_0768 GTNG_0769     TRUE 0.935 -9.000 0.054 0.059   NA
 3694278 3694279 GTNG_0769 GTNG_0770     FALSE 0.090 105.000 0.000 NA   NA
 3694279 3694280 GTNG_0770 GTNG_0771     FALSE 0.214 52.000 0.000 NA   NA
 3694280 3694281 GTNG_0771 GTNG_0772     FALSE 0.025 193.000 0.000 NA   NA
 3694282 3694283 GTNG_0773 GTNG_0774     FALSE 0.001 588.000 0.000 NA   NA
 3694283 3694284 GTNG_0774 GTNG_0775     TRUE 0.859 -3.000 0.118 NA   NA
 3694284 3694285 GTNG_0775 GTNG_0776     FALSE 0.002 392.000 0.000 NA   NA
 3694286 3694287 GTNG_0777 GTNG_0778     FALSE 0.204 207.000 0.054 0.059   NA
 3694287 3694288 GTNG_0778 GTNG_0779     FALSE 0.467 71.000 0.000 1.000 N NA
 3694288 3694289 GTNG_0779 GTNG_0780     FALSE 0.036 219.000 0.000 1.000   NA
 3694289 3694290 GTNG_0780 GTNG_0781     FALSE 0.002 926.000 0.000 1.000   NA
 3694290 3694291 GTNG_0781 GTNG_0782   fixA FALSE 0.005 413.000 0.000 1.000   NA
 3694291 3694292 GTNG_0782 GTNG_0783 fixA fixB TRUE 0.879 77.000 0.036 0.013 Y NA
 3694292 3694293 GTNG_0783 GTNG_0784 fixB   FALSE 0.507 -7.000 0.000 NA   NA
 3694293 3694294 GTNG_0784 GTNG_0785     FALSE 0.201 56.000 0.000 NA   NA
 3694294 3694295 GTNG_0785 GTNG_0786     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3694295 3694296 GTNG_0786 GTNG_0787     FALSE 0.333 0.000 0.000 NA   NA
 3694296 3694297 GTNG_0787 GTNG_0788     TRUE 0.660 -3.000 0.008 NA   NA
 3694297 3694298 GTNG_0788 GTNG_0789     FALSE 0.100 83.000 0.000 NA   NA
 3694298 3694299 GTNG_0789 GTNG_0790     FALSE 0.002 518.000 0.000 NA   NA
 3694300 3694301 GTNG_0791 GTNG_0792     TRUE 0.985 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 3694301 3694302 GTNG_0792 GTNG_0793     FALSE 0.084 225.000 0.000 1.000 N NA
 3694302 3694303 GTNG_0793 GTNG_0794     TRUE 0.977 2.000 0.920 1.000 N NA
 3694304 3694305 GTNG_0795 GTNG_0796 nrdE nrdF TRUE 0.905 106.000 0.101 0.001 Y NA
 3694305 3694306 GTNG_0796 GTNG_0797 nrdF   FALSE 0.120 73.000 0.000 NA   NA
 3694306 3694307 GTNG_0797 GTNG_0798     FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 3694307 3694308 GTNG_0798 GTNG_0799     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3694308 3694309 GTNG_0799 GTNG_0800     FALSE 0.132 70.000 0.000 NA   NA
 3694309 3694310 GTNG_0800 GTNG_0801     TRUE 0.544 -16.000 0.000 NA   NA
 3694310 3694311 GTNG_0801 GTNG_0802     FALSE 0.089 116.000 0.000 NA   NA
 3694311 3694312 GTNG_0802 GTNG_0803     FALSE 0.002 399.000 0.000 NA   NA
 3694313 3694314 GTNG_0804 GTNG_0805     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 3694315 3694316 GTNG_0806 GTNG_0807     TRUE 0.841 35.000 0.047 1.000 N NA
 3694316 3694317 GTNG_0807 GTNG_0808     FALSE 0.224 163.000 0.000 1.000 N NA
 3694317 3694318 GTNG_0808 GTNG_0809     FALSE 0.208 182.000 0.005 1.000 N NA
 3694318 3694319 GTNG_0809 GTNG_0810     FALSE 0.452 52.000 0.016 NA   NA
 3694319 3694320 GTNG_0810 GTNG_0811     FALSE 0.001 622.000 0.000 NA   NA
 3694320 3694321 GTNG_0811 GTNG_0812     TRUE 0.963 20.000 0.800 NA   NA
 3694321 3694322 GTNG_0812 GTNG_0813     TRUE 0.603 105.000 0.250 NA   NA
 3694322 3694323 GTNG_0813 GTNG_0814     TRUE 0.944 23.000 0.444 1.000   NA
 3694323 3694324 GTNG_0814 GTNG_0815     TRUE 0.987 -10.000 0.625 0.074   NA
 3694325 3694326 GTNG_0816 GTNG_0817     TRUE 0.927 0.000 0.409 NA   NA
 3694327 3694328 GTNG_0818 GTNG_0819     FALSE 0.031 302.000 0.000 1.000 N NA
 3694328 3694329 GTNG_0819 GTNG_0820     TRUE 0.967 -3.000 0.605 NA   NA
 3694331 3694332 GTNG_0822 GTNG_0823     FALSE 0.399 184.000 0.176 1.000 N NA
 3694332 3694333 GTNG_0823 GTNG_0824     TRUE 0.905 61.000 0.092 1.000 Y NA
 3694333 3694334 GTNG_0824 GTNG_0825     TRUE 0.960 126.000 0.677 0.048 Y NA
 3694334 3694335 GTNG_0825 GTNG_0826     TRUE 0.990 15.000 0.825 0.048 Y NA
 3694335 3694336 GTNG_0826 GTNG_0827     FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 3694336 3694337 GTNG_0827 GTNG_0828     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3694337 3694338 GTNG_0828 GTNG_0829     TRUE 0.954 -3.000 0.444 NA   NA
 3694338 3694339 GTNG_0829 GTNG_0830     FALSE 0.338 30.000 0.000 NA   NA
 3694341 3694342 GTNG_0832 GTNG_0833     TRUE 0.934 -10.000 0.061 1.000 N NA
 3694343 3694344 GTNG_0834 GTNG_0835     TRUE 0.997 -58.000 0.952 1.000 Y NA
 3694344 3694345 GTNG_0835 GTNG_0836     TRUE 0.986 -3.000 0.403 NA Y NA
 3694345 3694346 GTNG_0836 GTNG_0837   mtnA TRUE 0.889 -13.000 0.015 NA N NA
 3694346 3694347 GTNG_0837 GTNG_0838 mtnA mtnK TRUE 0.553 75.000 0.104 1.000   NA
 3694347 3694348 GTNG_0838 GTNG_0839 mtnK   FALSE 0.008 346.000 0.000 1.000   NA
 3694349 3694350 GTNG_0840 GTNG_0841   mtnW FALSE 0.080 274.000 0.043 1.000 N NA
 3694350 3694351 GTNG_0841 GTNG_0842 mtnW mtnX TRUE 0.982 -3.000 0.304 0.001 N NA
 3694351 3694352 GTNG_0842 GTNG_0843 mtnX mtnB TRUE 0.957 -3.000 0.253 1.000 N NA
 3694352 3694353 GTNG_0843 GTNG_0844 mtnB   TRUE 0.817 30.000 0.087 1.000   NA
 3694355 3694356 GTNG_0846 GTNG_0847     FALSE 0.110 210.000 0.087 NA   NA
 3694357 3694358 GTNG_0848 GTNG_0849     TRUE 0.706 19.000 0.021 1.000   NA
 3694358 3694359 GTNG_0849 GTNG_0850     TRUE 0.762 119.000 0.029 1.000 Y NA
 3694360 3694361 GTNG_0851 GTNG_0852     FALSE 0.194 97.000 0.000 1.000   NA
 3694361 3694362 GTNG_0852 GTNG_0853     FALSE 0.259 134.000 0.014 1.000   NA
 3694362 3694363 GTNG_0853 GTNG_0854     TRUE 0.983 -3.000 0.713 1.000 N NA
 3694363 3694364 GTNG_0854 GTNG_0855     TRUE 0.769 12.000 0.037 1.000 N NA
 3694366 3694367 GTNG_0857 GTNG_0858     FALSE 0.426 112.000 0.108 NA   NA
 3694367 3694368 GTNG_0858 GTNG_0859     FALSE 0.102 80.000 0.000 NA   NA
 3694368 3694369 GTNG_0859 GTNG_0860     FALSE 0.060 147.000 0.000 NA   NA
 3694369 3694370 GTNG_0860 GTNG_0861     TRUE 0.973 7.000 0.867 0.007   NA
 3694370 3694371 GTNG_0861 GTNG_0862     TRUE 0.942 27.000 0.200 0.007   NA
 3694371 3694372 GTNG_0862 GTNG_0863     FALSE 0.135 171.000 0.004 1.000   NA
 3694372 3694373 GTNG_0863 GTNG_0864     TRUE 0.821 -3.000 0.041 1.000   NA
 3694373 3694374 GTNG_0864 GTNG_0865     TRUE 0.893 57.000 0.307 1.000 N NA
 3694374 3694375 GTNG_0865 GTNG_0866     TRUE 0.742 49.000 0.101 1.000   NA
 3694375 3694376 GTNG_0866 GTNG_0867     FALSE 0.431 65.000 0.008 1.000   NA
 3694377 3694378 GTNG_0868 GTNG_0869     FALSE 0.177 165.000 0.048 NA   NA
 3694378 3694379 GTNG_0869 GTNG_0870     FALSE 0.358 86.000 0.057 NA   NA
 3694380 3694381 GTNG_0871 GTNG_0872     FALSE 0.018 269.000 0.000 1.000   NA
 3694381 3694382 GTNG_0872 GTNG_0873     FALSE 0.315 68.000 0.012 NA   NA
 3694382 3694383 GTNG_0873 GTNG_0874     TRUE 0.533 77.000 0.150 NA   NA
 3694384 3694385 GTNG_0875 GTNG_0876     FALSE 0.060 188.000 0.000 1.000   NA
 3694386 3694387 GTNG_0877 GTNG_0878     FALSE 0.027 240.000 0.000 1.000   NA
 3694387 3694388 GTNG_0878 GTNG_0879   hpr TRUE 0.855 112.000 0.031 0.007 Y NA
 3694388 3694389 GTNG_0879 GTNG_0880 hpr   TRUE 0.978 0.000 0.132 0.007 Y NA
 3694390 3694391 GTNG_0881 GTNG_0882     FALSE 0.048 160.000 0.000 NA   NA
 3694391 3694392 GTNG_0882 GTNG_0883     FALSE 0.045 164.000 0.000 NA   NA
 3694393 3694394 GTNG_0884 GTNG_0885   kgd FALSE 0.011 434.000 0.000 1.000 N NA
 3694394 3694395 GTNG_0885 GTNG_0886 kgd   TRUE 0.992 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 3694395 3694396 GTNG_0886 GTNG_0887     TRUE 0.547 23.000 0.004 NA   NA
 3694396 3694397 GTNG_0887 GTNG_0888     FALSE 0.281 106.000 0.035 NA   NA
 3694397 3694398 GTNG_0888 GTNG_0889     TRUE 0.781 116.000 0.050 1.000 Y NA
 3694398 3694399 GTNG_0889 GTNG_0890     TRUE 0.730 129.000 0.022 1.000 Y NA
 3694399 3694400 GTNG_0890 GTNG_0891     TRUE 0.980 23.000 0.346 1.000 Y NA
 3694400 3694401 GTNG_0891 GTNG_0892     TRUE 0.984 22.000 0.300 0.074 Y NA
 3694401 3694402 GTNG_0892 GTNG_0893     FALSE 0.389 97.000 0.000 1.000 N NA
 3694402 3694403 GTNG_0893 GTNG_0894     FALSE 0.209 53.000 0.000 NA   NA
 3694403 3694404 GTNG_0894 GTNG_0895     TRUE 0.644 7.000 0.073 NA   NA
 3694404 3694405 GTNG_0895 GTNG_0896     TRUE 0.893 -3.000 0.039 1.000 N NA
 3694406 3694407 GTNG_0897 GTNG_0898     FALSE 0.256 157.000 0.079 NA   NA
 3694408 3694409 GTNG_0899 GTNG_0900     FALSE 0.482 69.000 0.071 NA   NA
 3694409 3694410 GTNG_0900 GTNG_0901     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 3694411 3694412 GTNG_0902 GTNG_0903     TRUE 0.706 52.000 0.136 NA   NA
 3694413 3694414 GTNG_0904 GTNG_0905     FALSE 0.056 283.000 0.043 NA N NA
 3694414 3694415 GTNG_0905 GTNG_0906     TRUE 0.838 19.000 0.167 NA   NA
 3694415 3694416 GTNG_0906 GTNG_0907     FALSE 0.457 114.000 0.133 NA   NA
 3694416 3694417 GTNG_0907 GTNG_0908     FALSE 0.451 104.000 0.120 NA   NA
 3694419 3694420 GTNG_0910 GTNG_0911     TRUE 0.698 74.000 0.121 1.000 N NA
 3694420 3694421 GTNG_0911 GTNG_0912     TRUE 0.869 57.000 0.372 1.000   NA
 3694421 3694422 GTNG_0912 GTNG_0913     TRUE 0.774 31.000 0.091 NA   NA
 3694422 3694423 GTNG_0913 GTNG_0914     FALSE 0.020 203.000 0.000 NA   NA
 3694423 3694424 GTNG_0914 GTNG_0915     TRUE 0.856 78.000 0.000 0.002 Y NA
 3694424 3694425 GTNG_0915 GTNG_0916   ktrA TRUE 0.527 105.000 0.041 1.000 N NA
 3694426 3694427 GTNG_0917 GTNG_0918     TRUE 0.965 -3.000 0.576 NA   NA
 3694428 3694429 GTNG_0919 GTNG_0920     FALSE 0.006 286.000 0.000 NA   NA
 3694431 3694432 GTNG_0922 GTNG_0923     TRUE 0.988 4.000 0.484 0.003 Y NA
 3694432 3694433 GTNG_0923 GTNG_0924     TRUE 0.976 75.000 0.883 0.073 Y NA
 3694433 3694434 GTNG_0924 GTNG_0925     TRUE 0.988 5.000 0.948 1.000 Y NA
 3694434 3694435 GTNG_0925 GTNG_0926     FALSE 0.013 235.000 0.000 NA   NA
 3694439 3694440 GTNG_0930 GTNG_0931     TRUE 0.759 17.000 0.108 NA   NA
 3694440 3694441 GTNG_0931 GTNG_0932     FALSE 0.251 112.000 0.024 NA   NA
 3694441 3694442 GTNG_0932 GTNG_0933     TRUE 0.839 57.000 0.342 NA   NA
 3694444 3694445 GTNG_0935 GTNG_0936 typA   FALSE 0.274 106.000 0.032 NA   NA
 3694445 3694446 GTNG_0936 GTNG_0937     TRUE 0.931 20.000 0.429 NA   NA
 3694447 3694448 GTNG_0938 GTNG_0939     FALSE 0.028 333.000 0.096 NA   NA
 3694451 3694452 GTNG_0942 GTNG_0943     TRUE 0.631 125.000 0.300 NA   NA
 3694452 3694453 GTNG_0943 GTNG_0944     TRUE 0.719 60.000 0.046 1.000 N NA
 3694455 3694456 GTNG_0946 GTNG_0947     TRUE 0.751 76.000 0.084 0.064 N NA
 3694456 3694457 GTNG_0947 GTNG_0948     TRUE 0.995 23.000 0.755 0.003 Y NA
 3694457 3694458 GTNG_0948 GTNG_0949     TRUE 0.995 0.000 0.925 0.005 Y NA
 3694458 3694459 GTNG_0949 GTNG_0950     TRUE 0.993 5.000 0.950 0.005 Y NA
 3694459 3694460 GTNG_0950 GTNG_0951   ctaG TRUE 0.816 106.000 0.707 NA   NA
 3694460 3694461 GTNG_0951 GTNG_0952 ctaG   TRUE 0.889 48.000 0.415 NA   NA
 3694461 3694462 GTNG_0952 GTNG_0953     FALSE 0.417 77.000 0.074 NA   NA
 3694464 3694465 GTNG_0955 GTNG_0956     TRUE 0.523 128.000 0.155 1.000   NA
 3694465 3694466 GTNG_0956 GTNG_0957     TRUE 0.874 39.000 0.276 NA   NA
 3694466 3694467 GTNG_0957 GTNG_0958     TRUE 0.953 4.000 0.852 NA   NA
 3694467 3694468 GTNG_0958 GTNG_0959     TRUE 0.911 41.000 0.440 NA   NA
 3694468 3694469 GTNG_0959 GTNG_0960     FALSE 0.068 260.000 0.110 NA   NA
 3694469 3694470 GTNG_0960 GTNG_0961     TRUE 0.941 20.000 0.500 NA   NA
 3694472 3694473 GTNG_0963 GTNG_0964   coaD TRUE 0.981 -34.000 0.367 1.000 N NA
 3694475 3694476 GTNG_0966 GTNG_0967   ylbL TRUE 0.746 6.000 0.095 1.000   NA
 3694478 3694479 GTNG_0969 GTNG_0970     TRUE 0.966 -3.000 0.599 NA   NA
 3694479 3694480 GTNG_0970 GTNG_0971     FALSE 0.458 118.000 0.010 1.000 N NA
 3694480 3694481 GTNG_0971 GTNG_0972     TRUE 0.528 71.000 0.069 1.000   NA
 3694481 3694482 GTNG_0972 GTNG_0973     FALSE 0.300 98.000 0.008 1.000   NA
 3694482 3694483 GTNG_0973 GTNG_0974     TRUE 0.875 -7.000 0.091 NA   NA
 3694483 3694484 GTNG_0974 GTNG_0975     TRUE 0.728 41.000 0.099 NA   NA
 3694484 3694485 GTNG_0975 GTNG_0976   mraW FALSE 0.016 279.000 0.003 NA   NA
 3694485 3694486 GTNG_0976 GTNG_0977 mraW ftsL TRUE 0.797 51.000 0.077 1.000 N NA
 3694486 3694487 GTNG_0977 GTNG_0978 ftsL   TRUE 0.915 7.000 0.316 1.000 N NA
 3694487 3694488 GTNG_0978 GTNG_0979     TRUE 0.942 72.000 0.157 0.001 Y NA
 3694488 3694489 GTNG_0979 GTNG_0980   murE TRUE 0.851 113.000 0.181 1.000 Y NA
 3694489 3694490 GTNG_0980 GTNG_0981 murE   TRUE 0.841 -3.000 0.095 NA   NA
 3694490 3694491 GTNG_0981 GTNG_0982   mraY TRUE 0.739 -15.000 0.005 NA   NA
 3694491 3694492 GTNG_0982 GTNG_0983 mraY murD TRUE 0.993 34.000 0.647 0.005 Y NA
 3694492 3694493 GTNG_0983 GTNG_0984 murD   TRUE 0.893 53.000 0.067 0.002 N NA
 3694493 3694494 GTNG_0984 GTNG_0985     FALSE 0.097 224.000 0.015 NA N NA
 3694494 3694495 GTNG_0985 GTNG_0986     TRUE 0.813 -46.000 0.022 NA   NA
 3694495 3694496 GTNG_0986 GTNG_0987     TRUE 0.957 27.000 0.667 NA   NA
 3694496 3694497 GTNG_0987 GTNG_0988     TRUE 0.812 2.000 0.165 NA   NA
 3694497 3694498 GTNG_0988 GTNG_0989   ftsA FALSE 0.125 191.000 0.062 NA   NA
 3694498 3694499 GTNG_0989 GTNG_0990 ftsA   TRUE 0.984 27.000 0.460 1.000 Y NA
 3694499 3694500 GTNG_0990 GTNG_0991     FALSE 0.105 198.000 0.024 1.000   NA
 3694500 3694501 GTNG_0991 GTNG_0992     TRUE 0.949 51.000 0.856 1.000   NA
 3694501 3694502 GTNG_0992 GTNG_0993     TRUE 0.962 107.000 0.602 0.009 Y NA
 3694502 3694503 GTNG_0993 GTNG_0994     TRUE 0.645 96.000 0.276 NA   NA
 3694503 3694504 GTNG_0994 GTNG_0995     FALSE 0.253 133.000 0.039 NA   NA
 3694504 3694505 GTNG_0995 GTNG_0996     TRUE 0.799 -3.000 0.061 NA   NA
 3694505 3694506 GTNG_0996 GTNG_0997     TRUE 0.859 22.000 0.194 NA   NA
 3694506 3694507 GTNG_0997 GTNG_0998     TRUE 0.782 4.000 0.158 NA   NA
 3694507 3694508 GTNG_0998 GTNG_0999     TRUE 0.522 121.000 0.138 1.000   NA
 3694508 3694509 GTNG_0999 GTNG_1000     TRUE 0.902 56.000 0.579 NA   NA
 3694509 3694510 GTNG_1000 GTNG_1001   ileS FALSE 0.019 370.000 0.012 NA N NA
 3694510 3694511 GTNG_1001 GTNG_1002 ileS lspA FALSE 0.466 94.000 0.004 1.000 N NA
 3694511 3694512 GTNG_1002 GTNG_1003 lspA   TRUE 0.812 1.000 0.022 1.000 N NA
 3694512 3694513 GTNG_1003 GTNG_1004     FALSE 0.267 184.000 0.048 1.000 N NA
 3694513 3694514 GTNG_1004 GTNG_1005     TRUE 0.741 157.000 0.140 1.000 Y NA
 3694514 3694515 GTNG_1005 GTNG_1006   pyrB TRUE 0.655 162.000 0.064 1.000 Y NA
 3694515 3694516 GTNG_1006 GTNG_1007 pyrB pyrC TRUE 0.994 -37.000 0.452 1.000 Y NA
 3694516 3694517 GTNG_1007 GTNG_1008 pyrC pyrAA TRUE 0.958 2.000 0.155 1.000 Y NA
 3694517 3694518 GTNG_1008 GTNG_1009 pyrAA carB TRUE 0.991 -7.000 0.117 0.001 Y NA
 3694518 3694519 GTNG_1009 GTNG_1010 carB pyrDII TRUE 0.935 -3.000 0.147 1.000 N NA
 3694519 3694520 GTNG_1010 GTNG_1011 pyrDII pyrD TRUE 0.990 -3.000 0.592 0.001 N NA
 3694520 3694521 GTNG_1011 GTNG_1012 pyrD pyrF TRUE 0.987 -28.000 0.003 0.001 Y NA
 3694521 3694522 GTNG_1012 GTNG_1013 pyrF pyrE TRUE 0.955 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 3694523 3694524 GTNG_1014 GTNG_1016     FALSE 0.088 107.000 0.000 NA   NA
 3694525 3694526 GTNG_1017 GTNG_1018     FALSE 0.305 91.000 0.037 NA   NA
 3694526 3694527 GTNG_1018 GTNG_1019     TRUE 0.739 57.000 0.189 NA   NA
 3694527 3694528 GTNG_1019 GTNG_1020   gmk TRUE 0.740 12.000 0.143 NA   NA
 3694528 3694529 GTNG_1020 GTNG_1021 gmk   TRUE 0.974 -3.000 0.471 1.000 N NA
 3694529 3694530 GTNG_1021 GTNG_1022     TRUE 0.870 50.000 0.192 1.000 N NA
 3694530 3694531 GTNG_1022 GTNG_1023   priA TRUE 0.922 -3.000 0.099 1.000 N NA
 3694531 3694532 GTNG_1023 GTNG_1024 priA   TRUE 0.807 17.000 0.029 1.000 N NA
 3694532 3694533 GTNG_1024 GTNG_1025     TRUE 0.946 7.000 0.031 0.024 Y NA
 3694533 3694534 GTNG_1025 GTNG_1026     TRUE 0.990 -13.000 0.305 1.000 Y NA
 3694534 3694535 GTNG_1026 GTNG_1027     TRUE 0.770 10.000 0.135 1.000   NA
 3694535 3694536 GTNG_1027 GTNG_1028     TRUE 0.757 6.000 0.105 1.000   NA
 3694536 3694537 GTNG_1028 GTNG_1029     TRUE 0.983 6.000 0.704 1.000 Y NA
 3694537 3694538 GTNG_1029 GTNG_1030     TRUE 0.835 5.000 0.196 1.000   NA
 3694538 3694539 GTNG_1030 GTNG_1031   rpe TRUE 0.853 4.000 0.213 1.000   NA
 3694539 3694540 GTNG_1031 GTNG_1032 rpe   TRUE 0.569 147.000 0.166 1.000 N NA
 3694542 3694543 GTNG_1034 GTNG_1035     TRUE 0.948 24.000 0.567 NA   NA
 3694543 3694544 GTNG_1035 GTNG_1036     TRUE 0.542 65.000 0.045 1.000   NA
 3694544 3694545 GTNG_1036 GTNG_1037     TRUE 0.961 76.000 0.353 0.001 Y NA
 3694545 3694546 GTNG_1037 GTNG_1038   recG TRUE 0.768 9.000 0.039 1.000 N NA
 3694546 3694547 GTNG_1038 GTNG_1039 recG   FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3694547 3694548 GTNG_1039 GTNG_1040     FALSE 0.204 55.000 0.000 NA   NA
 3694548 3694549 GTNG_1040 GTNG_1041   plsX TRUE 0.928 -16.000 0.035 1.000 N NA
 3694549 3694550 GTNG_1041 GTNG_1042 plsX fabD TRUE 0.975 18.000 0.106 0.005 Y NA
 3694550 3694551 GTNG_1042 GTNG_1043 fabD fabG TRUE 0.980 0.000 0.149 0.005 Y NA
 3694551 3694552 GTNG_1043 GTNG_1044 fabG acpP TRUE 0.959 51.000 0.100 0.005 Y NA
 3694552 3694553 GTNG_1044 GTNG_1045 acpP rnc FALSE 0.307 180.000 0.068 1.000 N NA
 3694553 3694554 GTNG_1045 GTNG_1046 rnc smc FALSE 0.481 158.000 0.120 1.000 N NA
 3694554 3694555 GTNG_1046 GTNG_1047 smc ftsY TRUE 0.950 19.000 0.165 0.014 N NA
 3694555 3694556 GTNG_1047 GTNG_1048 ftsY   FALSE 0.081 251.000 0.081 1.000   NA
 3694556 3694557 GTNG_1048 GTNG_1049   ffh TRUE 0.933 -13.000 0.151 1.000   NA
 3694557 3694558 GTNG_1049 GTNG_1050 ffh   TRUE 0.808 95.000 0.361 1.000 N NA
 3694558 3694559 GTNG_1050 GTNG_1051     TRUE 0.898 12.000 0.385 1.000   NA
 3694559 3694560 GTNG_1051 GTNG_1052     TRUE 0.622 48.000 0.061 NA   NA
 3694560 3694561 GTNG_1052 GTNG_1053   rimM TRUE 0.574 7.000 0.041 NA   NA
 3694561 3694562 GTNG_1053 GTNG_1054 rimM   TRUE 0.992 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 3694562 3694563 GTNG_1054 GTNG_1055     TRUE 0.726 212.000 0.567 1.000 Y NA
 3694563 3694564 GTNG_1055 GTNG_1056     FALSE 0.491 103.000 0.020 1.000 N NA
 3694564 3694565 GTNG_1056 GTNG_1057   rbgA TRUE 0.864 19.000 0.049 0.063   NA
 3694565 3694566 GTNG_1057 GTNG_1058 rbgA   TRUE 0.561 93.000 0.148 1.000   NA
 3694566 3694567 GTNG_1058 GTNG_1059     FALSE 0.203 82.000 0.002 NA   NA
 3694567 3694568 GTNG_1059 GTNG_1060     TRUE 0.774 -12.000 0.016 NA   NA
 3694568 3694569 GTNG_1060 GTNG_1061   sucC FALSE 0.365 116.000 0.038 1.000   NA
 3694569 3694570 GTNG_1061 GTNG_1062 sucC   TRUE 0.982 18.000 0.173 0.001 Y NA
 3694570 3694571 GTNG_1062 GTNG_1063     TRUE 0.643 68.000 0.037 1.000 N NA
 3694571 3694572 GTNG_1063 GTNG_1064     TRUE 0.892 79.000 0.238 1.000 Y NA
 3694572 3694573 GTNG_1064 GTNG_1065   xerC TRUE 0.830 67.000 0.007 1.000 Y NA
 3694573 3694574 GTNG_1065 GTNG_1066 xerC hslV TRUE 0.898 25.000 0.113 1.000 N NA
 3694574 3694575 GTNG_1066 GTNG_1067 hslV hslU TRUE 0.990 19.000 0.752 1.000 Y NA
 3694575 3694576 GTNG_1067 GTNG_1068 hslU codY TRUE 0.880 17.000 0.131 1.000 N NA
 3694576 3694577 GTNG_1068 GTNG_1069 codY flgB FALSE 0.178 204.000 0.037 1.000 N NA
 3694577 3694578 GTNG_1069 GTNG_1070 flgB flgC TRUE 0.992 4.000 0.804 0.004 Y NA
 3694578 3694579 GTNG_1070 GTNG_1071 flgC fliE TRUE 0.981 20.000 0.156 0.004 Y NA
 3694579 3694580 GTNG_1071 GTNG_1072 fliE fliF TRUE 0.916 96.000 0.164 0.005 Y NA
 3694580 3694581 GTNG_1072 GTNG_1073 fliF fliG TRUE 0.986 13.000 0.477 0.005 Y NA
 3694581 3694582 GTNG_1073 GTNG_1074 fliG fliH TRUE 0.988 -16.000 0.048 0.004 Y NA
 3694582 3694583 GTNG_1074 GTNG_1075 fliH fliI TRUE 0.981 20.000 0.152 0.004 Y NA
 3694583 3694584 GTNG_1075 GTNG_1076 fliI fliJ TRUE 0.985 29.000 0.241 0.007 Y NA
 3694584 3694585 GTNG_1076 GTNG_1077 fliJ   FALSE 0.504 1.000 0.000 1.000   NA
 3694585 3694586 GTNG_1077 GTNG_1078   fliK TRUE 0.631 -3.000 0.000 1.000   NA
 3694586 3694587 GTNG_1078 GTNG_1079 fliK flgD FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3694587 3694588 GTNG_1079 GTNG_1080 flgD flgG TRUE 0.531 17.000 0.012 NA   NA
 3694588 3694589 GTNG_1080 GTNG_1081 flgG   TRUE 0.895 45.000 0.014 NA Y NA
 3694589 3694590 GTNG_1081 GTNG_1082   fliL TRUE 0.981 -13.000 0.149 NA Y NA
 3694590 3694591 GTNG_1082 GTNG_1083 fliL fliM TRUE 0.990 28.000 0.323 0.001 Y NA
 3694591 3694592 GTNG_1083 GTNG_1084 fliM fliY TRUE 0.996 -7.000 0.508 0.001 Y NA
 3694592 3694593 GTNG_1084 GTNG_1085 fliY   TRUE 0.971 26.000 0.203 1.000 Y NA
 3694593 3694594 GTNG_1085 GTNG_1086   fliZ TRUE 0.840 15.000 0.101 1.000 N NA
 3694594 3694595 GTNG_1086 GTNG_1087 fliZ fliP TRUE 0.991 -7.000 0.386 1.000 Y NA
 3694595 3694596 GTNG_1087 GTNG_1088 fliP fliQ TRUE 0.976 16.000 0.206 0.005 Y NA
 3694596 3694597 GTNG_1088 GTNG_1089 fliQ fliR TRUE 0.992 7.000 0.817 0.002 Y NA
 3694597 3694598 GTNG_1089 GTNG_1090 fliR flhB TRUE 0.988 2.000 0.750 1.000 Y NA
 3694598 3694599 GTNG_1090 GTNG_1091 flhB flhA TRUE 0.983 19.000 0.203 0.005 Y NA
 3694599 3694600 GTNG_1091 GTNG_1092 flhA   FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694600 3694601 GTNG_1092 GTNG_1094     FALSE 0.495 -6.000 0.000 NA   NA
 3694601 3694602 GTNG_1094 GTNG_1095     TRUE 0.855 10.000 0.153 1.000 N NA
 3694602 3694603 GTNG_1095 GTNG_1096     TRUE 0.984 14.000 0.390 0.005 Y NA
 3694603 3694604 GTNG_1096 GTNG_1097   cheW TRUE 0.734 194.000 0.184 0.005 Y NA
 3694604 3694605 GTNG_1097 GTNG_1098 cheW cheC TRUE 0.963 24.000 0.180 NA Y NA
 3694605 3694606 GTNG_1098 GTNG_1099 cheC cheD TRUE 0.990 -3.000 0.606 NA Y NA
 3694606 3694607 GTNG_1099 GTNG_1100 cheD   TRUE 0.897 31.000 0.120 1.000 N NA
 3694607 3694608 GTNG_1100 GTNG_1101     TRUE 0.777 -49.000 0.008 NA   NA
 3694608 3694609 GTNG_1101 GTNG_1102     TRUE 0.715 9.000 0.125 NA   NA
 3694609 3694610 GTNG_1102 GTNG_1103   rpsB FALSE 0.141 154.000 0.012 NA   NA
 3694610 3694611 GTNG_1103 GTNG_1104 rpsB tsf TRUE 0.909 158.000 0.748 1.000 Y NA
 3694611 3694612 GTNG_1104 GTNG_1105 tsf pyrH TRUE 0.971 -3.000 0.416 1.000 N NA
 3694612 3694613 GTNG_1105 GTNG_1106 pyrH   TRUE 0.964 3.000 0.626 1.000 N NA
 3694613 3694614 GTNG_1106 GTNG_1107     TRUE 0.833 82.000 0.409 1.000 N NA
 3694614 3694615 GTNG_1107 GTNG_1108     TRUE 0.973 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 3694615 3694616 GTNG_1108 GTNG_1109     TRUE 0.925 12.000 0.071 1.000 Y NA
 3694616 3694617 GTNG_1109 GTNG_1110     TRUE 0.952 15.000 0.568 1.000 N NA
 3694617 3694618 GTNG_1110 GTNG_1111     TRUE 0.888 29.000 0.095 1.000 N NA
 3694618 3694619 GTNG_1111 GTNG_1112   polC TRUE 0.732 83.000 0.070 0.041 N NA
 3694619 3694620 GTNG_1112 GTNG_1113 polC   FALSE 0.208 160.000 0.059 NA   NA
 3694620 3694621 GTNG_1113 GTNG_1114   nusA TRUE 0.962 25.000 0.759 NA   NA
 3694621 3694622 GTNG_1114 GTNG_1115 nusA   TRUE 0.960 7.000 0.323 NA Y NA
 3694622 3694623 GTNG_1115 GTNG_1116     TRUE 0.977 -10.000 0.408 NA N NA
 3694623 3694624 GTNG_1116 GTNG_1117   infB TRUE 0.968 20.000 0.223 NA Y NA
 3694624 3694625 GTNG_1117 GTNG_1118 infB   TRUE 0.847 -3.000 0.102 NA   NA
 3694625 3694626 GTNG_1118 GTNG_1119   rbfA TRUE 0.736 16.000 0.113 NA   NA
 3694626 3694627 GTNG_1119 GTNG_1120 rbfA   TRUE 0.925 54.000 0.111 1.000 Y NA
 3694627 3694628 GTNG_1120 GTNG_1121     TRUE 0.927 42.000 0.308 1.000 N NA
 3694628 3694629 GTNG_1121 GTNG_1122     TRUE 0.652 88.000 0.119 1.000 N NA
 3694629 3694630 GTNG_1122 GTNG_1123     TRUE 0.875 138.000 0.335 1.000 Y NA
 3694630 3694631 GTNG_1123 GTNG_1124     TRUE 0.531 112.000 0.048 1.000 N NA
 3694631 3694632 GTNG_1124 GTNG_1125     TRUE 0.926 -13.000 0.127 1.000   NA
 3694634 3694635 GTNG_1127 GTNG_1128   spoVFB TRUE 0.943 0.000 0.450 1.000   NA
 3694635 3694636 GTNG_1128 GTNG_1129 spoVFB   FALSE 0.489 121.000 0.025 1.000 N NA
 3694636 3694637 GTNG_1129 GTNG_1130     TRUE 0.952 21.000 0.065 1.000 Y NA
 3694637 3694638 GTNG_1130 GTNG_1131     TRUE 0.964 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 3694638 3694639 GTNG_1131 GTNG_1132     FALSE 0.214 182.000 0.083 1.000   NA
 3694639 3694640 GTNG_1132 GTNG_1133     FALSE 0.181 118.000 0.000 1.000   NA
 3694640 3694641 GTNG_1133 GTNG_1134     TRUE 0.839 -3.000 0.094 NA   NA
 3694641 3694642 GTNG_1134 GTNG_1135     FALSE 0.321 106.000 0.052 NA   NA
 3694642 3694643 GTNG_1135 GTNG_1136     FALSE 0.504 153.000 0.115 1.000 N NA
 3694643 3694644 GTNG_1136 GTNG_1137     FALSE 0.500 80.000 0.087 1.000   NA
 3694644 3694645 GTNG_1137 GTNG_1138     FALSE 0.035 301.000 0.048 1.000   NA
 3694645 3694646 GTNG_1138 GTNG_1139     TRUE 0.960 -3.000 0.438 1.000   NA
 3694646 3694647 GTNG_1139 GTNG_1140     TRUE 0.974 1.000 0.720 0.046   NA
 3694647 3694648 GTNG_1140 GTNG_1141     FALSE 0.274 165.000 0.077 1.000   NA
 3694648 3694649 GTNG_1141 GTNG_1142     TRUE 0.993 -19.000 0.872 0.005   NA
 3694649 3694650 GTNG_1142 GTNG_1143   fabG TRUE 0.872 58.000 0.397 1.000   NA
 3694650 3694651 GTNG_1143 GTNG_1144 fabG   TRUE 0.848 58.000 0.386 NA   NA
 3694651 3694652 GTNG_1144 GTNG_1145     TRUE 0.677 129.000 0.388 NA   NA
 3694652 3694653 GTNG_1145 GTNG_1146     TRUE 0.933 22.000 0.371 1.000   NA
 3694653 3694654 GTNG_1146 GTNG_1147     FALSE 0.444 118.000 0.077 1.000   NA
 3694654 3694655 GTNG_1147 GTNG_1148   cinA FALSE 0.040 352.000 0.151 1.000   NA
 3694655 3694656 GTNG_1148 GTNG_1149 cinA   FALSE 0.078 256.000 0.083 1.000   NA
 3694658 3694659 GTNG_1151 GTNG_1152     TRUE 0.639 106.000 0.245 1.000   NA
 3694659 3694660 GTNG_1152 GTNG_1153     TRUE 0.552 -22.000 0.000 NA   NA
 3694660 3694661 GTNG_1153 GTNG_1154     FALSE 0.097 94.000 0.000 NA   NA
 3694661 3694662 GTNG_1154 GTNG_1155     FALSE 0.312 172.000 0.041 1.000 N NA
 3694662 3694663 GTNG_1155 GTNG_1156     TRUE 0.997 -33.000 0.437 0.001 Y NA
 3694663 3694664 GTNG_1156 GTNG_1157     TRUE 0.614 64.000 0.004 1.000 N NA
 3694664 3694665 GTNG_1157 GTNG_1158     TRUE 0.649 2.000 0.041 NA   NA
 3694665 3694666 GTNG_1158 GTNG_1159     FALSE 0.045 346.000 0.209 NA   NA
 3694666 3694667 GTNG_1159 GTNG_1160   mutS FALSE 0.281 93.000 0.027 NA   NA
 3694667 3694668 GTNG_1160 GTNG_1161 mutS mutL TRUE 0.979 15.000 0.220 0.001 Y NA
 3694668 3694669 GTNG_1161 GTNG_1162 mutL   FALSE 0.036 291.000 0.000 1.000 N NA
 3694671 3694672 GTNG_1164 GTNG_1165     FALSE 0.088 114.000 0.000 NA   NA
 3694672 3694673 GTNG_1165 GTNG_1167   miaA FALSE 0.021 201.000 0.000 NA   NA
 3694673 3694674 GTNG_1167 GTNG_1168 miaA hfq TRUE 0.946 -16.000 0.192 1.000   NA
 3694674 3694675 GTNG_1168 GTNG_1169 hfq   FALSE 0.022 336.000 0.037 1.000   NA
 3694675 3694676 GTNG_1169 GTNG_1170     FALSE 0.311 163.000 0.100 1.000   NA
 3694676 3694677 GTNG_1170 GTNG_1171     TRUE 0.984 22.000 0.444 1.000 Y NA
 3694677 3694678 GTNG_1171 GTNG_1172     TRUE 0.928 16.000 0.333 1.000 N NA
 3694678 3694679 GTNG_1172 GTNG_1173     TRUE 0.951 3.000 0.250 0.037 N NA
 3694679 3694680 GTNG_1173 GTNG_1174     TRUE 0.977 14.000 0.500 1.000 Y NA
 3694680 3694681 GTNG_1174 GTNG_1175     TRUE 0.845 112.000 0.167 1.000 Y NA
 3694681 3694682 GTNG_1175 GTNG_1176     FALSE 0.112 157.000 0.000 1.000   NA
 3694683 3694684 GTNG_1177 GTNG_1178     FALSE 0.003 360.000 0.000 NA   NA
 3694685 3694686 GTNG_1179 GTNG_1180     TRUE 0.705 14.000 0.065 1.000   NA
 3694686 3694687 GTNG_1180 GTNG_1181     TRUE 0.688 77.000 0.138 1.000 N NA
 3694687 3694688 GTNG_1181 GTNG_1182     TRUE 0.952 40.000 0.481 1.000 N NA
 3694690 3694691 GTNG_1184 GTNG_1185     TRUE 0.649 13.000 0.038 1.000   NA
 3694691 3694692 GTNG_1185 GTNG_1186     TRUE 0.953 -22.000 0.264 NA   NA
 3694692 3694693 GTNG_1186 GTNG_1187   tkt TRUE 0.587 78.000 0.196 NA   NA
 3694693 3694694 GTNG_1187 GTNG_1188 tkt   FALSE 0.437 188.000 0.440 NA   NA
 3694694 3694695 GTNG_1188 GTNG_1189     TRUE 0.566 89.000 0.197 NA   NA
 3694695 3694696 GTNG_1189 GTNG_1190     TRUE 0.543 126.000 0.214 NA   NA
 3694696 3694697 GTNG_1190 GTNG_1191     TRUE 0.995 2.000 0.911 0.003 Y NA
 3694698 3694699 GTNG_1192 GTNG_1193     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3694700 3694701 GTNG_1194 GTNG_1195 ccdA   TRUE 0.932 63.000 0.625 1.000 N NA
 3694701 3694702 GTNG_1195 GTNG_1196   ccdC FALSE 0.519 184.000 0.375 NA N NA
 3694704 3694705 GTNG_1198 GTNG_1199   celR TRUE 0.962 -57.000 0.143 1.000 N NA
 3694705 3694706 GTNG_1199 GTNG_1200 celR celA TRUE 0.673 157.000 0.143 0.007 N NA
 3694706 3694707 GTNG_1200 GTNG_1201 celA celB TRUE 0.984 17.000 0.300 0.005 Y NA
 3694707 3694708 GTNG_1201 GTNG_1202 celB celCD TRUE 0.939 16.000 0.300 0.005   NA
 3694712 3694713 GTNG_1206 GTNG_1207     FALSE 0.181 106.000 0.000 1.000   NA
 3694715 3694716 GTNG_1209 GTNG_1210     TRUE 0.931 7.000 0.680 NA   NA
 3694717 3694718 GTNG_1211 GTNG_1212   cspB TRUE 0.760 132.000 0.619 NA   NA
 3694718 3694719 GTNG_1212 GTNG_1213 cspB   FALSE 0.001 545.000 0.000 NA   NA
 3694720 3694721 GTNG_1214 GTNG_1215     FALSE 0.020 203.000 0.000 NA   NA
 3694721 3694722 GTNG_1215 GTNG_1216   glpK TRUE 0.729 61.000 0.057 1.000 N NA
 3694722 3694723 GTNG_1216 GTNG_1217 glpK   FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 3694723 3694724 GTNG_1217 GTNG_1218     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3694726 3694727 GTNG_1220 GTNG_1221     FALSE 0.132 70.000 0.000 NA   NA
 3694729 3694730 GTNG_1223 GTNG_1224     TRUE 0.767 5.000 0.023 1.000 N NA
 3694730 3694731 GTNG_1224 GTNG_1225     FALSE 0.294 164.000 0.012 1.000 N NA
 3694731 3694732 GTNG_1225 GTNG_1226     TRUE 0.854 16.000 0.110 1.000 N NA
 3694732 3694733 GTNG_1226 GTNG_1227     FALSE 0.331 97.000 0.018 1.000   NA
 3694733 3694734 GTNG_1227 GTNG_1228     FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 3694736 3694737 GTNG_1230 GTNG_1231     FALSE 0.282 97.000 0.028 NA   NA
 3694737 3694738 GTNG_1231 GTNG_1232     TRUE 0.855 0.000 0.085 NA N NA
 3694739 3694740 GTNG_1233 GTNG_1235     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3694741 3694742 GTNG_1236 GTNG_1237     FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 3694742 3694743 GTNG_1237 GTNG_1238     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3694743 3694744 GTNG_1238 GTNG_1239     TRUE 0.535 -13.000 0.000 NA   NA
 3694744 3694745 GTNG_1239 GTNG_1240     FALSE 0.001 702.000 0.000 NA   NA
 3694745 3694746 GTNG_1240 GTNG_1241     FALSE 0.406 49.000 0.000 1.000   NA
 3694746 3694747 GTNG_1241 GTNG_1242     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3694747 3694748 GTNG_1242 GTNG_1243     FALSE 0.003 352.000 0.000 NA   NA
 3694748 3694749 GTNG_1243 GTNG_t055     FALSE 0.519 -9.000 0.000 NA   NA
 3694751 3694752 GTNG_1245 GTNG_1246     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 3694752 3694753 GTNG_1246 GTNG_16s008     FALSE 0.001 1037.000 0.000 NA   NA
 3694753 3694754 GTNG_16s008 GTNG_23s008     FALSE 0.071 136.000 0.000 NA   NA
 3694754 3694755 GTNG_23s008 GTNG_5s009     FALSE 0.025 194.000 0.000 NA   NA
 3694755 3694756 GTNG_5s009 GTNG_1247     FALSE 0.002 403.000 0.000 NA   NA
 3694756 3694757 GTNG_1247 GTNG_1248     FALSE 0.262 43.000 0.000 NA   NA
 3694757 3694758 GTNG_1248 GTNG_1249     FALSE 0.002 405.000 0.000 NA   NA
 3694758 3694759 GTNG_1249 GTNG_1250     FALSE 0.001 970.000 0.000 NA   NA
 3694759 3694760 GTNG_1250 GTNG_1251     FALSE 0.004 334.000 0.000 NA   NA
 3694761 3694762 GTNG_1252 GTNG_1253     TRUE 0.743 115.000 0.013 1.000 Y NA
 3694762 3694763 GTNG_1253 GTNG_1254     FALSE 0.029 233.000 0.000 1.000   NA
 3694765 3694766 GTNG_1256 GTNG_1257     FALSE 0.195 57.000 0.000 NA   NA
 3694767 3694768 GTNG_1258 GTNG_1259     FALSE 0.001 611.000 0.000 NA   NA
 3694768 3694769 GTNG_1259 GTNG_1260     FALSE 0.310 99.000 0.000 NA N NA
 3694770 3694771 GTNG_1261 GTNG_1262     FALSE 0.069 138.000 0.000 NA   NA
 3694771 3694772 GTNG_1262 GTNG_1263     TRUE 0.932 16.000 0.429 NA N NA
 3694773 3694774 GTNG_1264 GTNG_1265     TRUE 0.788 57.000 0.250 NA   NA
 3694774 3694775 GTNG_1265 GTNG_1266     FALSE 0.155 176.000 0.056 NA   NA
 3694775 3694776 GTNG_1266 GTNG_1267     TRUE 0.859 15.000 0.139 1.000 N NA
 3694778 3694779 GTNG_1269 GTNG_1270     TRUE 0.995 25.000 0.791 0.001 Y NA
 3694779 3694780 GTNG_1270 GTNG_1271     FALSE 0.054 259.000 0.000 1.000 N NA
 3694780 3694781 GTNG_1271 GTNG_1272     FALSE 0.009 531.000 0.000 1.000 N NA
 3694781 3694782 GTNG_1272 GTNG_1273     TRUE 0.997 -7.000 0.870 0.046 Y NA
 3694782 3694783 GTNG_1273 GTNG_1274     TRUE 0.995 -6.000 0.870 1.000 Y NA
 3694783 3694784 GTNG_1274 GTNG_1275     FALSE 0.384 256.000 0.196 1.000 Y NA
 3694784 3694785 GTNG_1275 GTNG_1276     FALSE 0.039 280.000 0.000 1.000 N NA
 3694785 3694786 GTNG_1276 GTNG_1277     FALSE 0.002 393.000 0.000 NA   NA
 3694786 3694787 GTNG_1277 GTNG_1278     TRUE 0.943 -3.000 0.360 NA   NA
 3694787 3694788 GTNG_1278 GTNG_1279     TRUE 0.764 -3.000 0.040 NA   NA
 3694788 3694789 GTNG_1279 GTNG_1280     TRUE 0.864 -55.000 0.049 NA   NA
 3694789 3694790 GTNG_1280 GTNG_1281     FALSE 0.252 45.000 0.000 NA   NA
 3694790 3694791 GTNG_1281 GTNG_1282     FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 3694792 3694793 GTNG_1283 GTNG_1284     FALSE 0.017 217.000 0.000 NA   NA
 3694794 3694795 GTNG_1285 GTNG_1286     FALSE 0.062 224.000 0.000 NA N NA
 3694795 3694796 GTNG_1286 GTNG_1287     FALSE 0.070 238.000 0.000 1.000 N NA
 3694796 3694797 GTNG_1287 GTNG_1288     FALSE 0.018 362.000 0.000 1.000 N NA
 3694797 3694798 GTNG_1288 GTNG_1289     TRUE 0.874 26.000 0.068 1.000 N NA
 3694798 3694799 GTNG_1289 GTNG_1290     TRUE 0.772 16.000 0.153 NA   NA
 3694801 3694802 GTNG_1292 GTNG_1293   gltD TRUE 0.904 144.000 0.222 0.001 Y NA
 3694802 3694803 GTNG_1293 GTNG_1294 gltD   FALSE 0.445 116.000 0.005 1.000 N NA
 3694803 3694804 GTNG_1294 GTNG_1295     FALSE 0.016 219.000 0.000 NA   NA
 3694805 3694806 GTNG_1296 GTNG_1297     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 3694806 3694807 GTNG_1297 GTNG_1298     TRUE 0.892 -3.000 0.038 1.000 N NA
 3694810 3694811 GTNG_1301 GTNG_1302     FALSE 0.445 123.000 0.083 1.000   NA
 3694813 3694814 GTNG_1304 GTNG_1305     FALSE 0.063 143.000 0.000 NA   NA
 3694814 3694815 GTNG_1305 GTNG_1306     TRUE 0.562 139.000 0.286 NA   NA
 3694817 3694818 GTNG_1308 GTNG_1309 xpaC   TRUE 0.946 -3.000 0.373 NA   NA
 3694820 3694821 GTNG_1311 GTNG_1312     FALSE 0.457 151.000 0.222 NA   NA
 3694821 3694822 GTNG_1312 GTNG_1313     FALSE 0.274 166.000 0.125 NA   NA
 3694822 3694823 GTNG_1313 GTNG_1314     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3694823 3694824 GTNG_1314 GTNG_1315     FALSE 0.507 -7.000 0.000 NA   NA
 3694825 3694826 GTNG_1316 GTNG_1317     FALSE 0.197 197.000 0.167 NA   NA
 3694827 3694828 GTNG_1318 GTNG_1319     TRUE 0.989 -3.000 0.273 0.045 Y NA
 3694828 3694829 GTNG_1319 GTNG_1320     TRUE 0.970 17.000 0.273 1.000 Y NA
 3694829 3694830 GTNG_1320 GTNG_1321     TRUE 0.911 0.000 0.333 NA   NA
 3694830 3694831 GTNG_1321 GTNG_1322     FALSE 0.019 207.000 0.000 NA   NA
 3694831 3694832 GTNG_1322 GTNG_1323     TRUE 0.556 -25.000 0.000 NA   NA
 3694832 3694833 GTNG_1323 GTNG_1324     FALSE 0.001 943.000 0.000 NA   NA
 3694833 3694834 GTNG_1324 GTNG_1325     TRUE 0.884 57.000 0.500 NA   NA
 3694834 3694835 GTNG_1325 GTNG_1326     FALSE 0.253 193.000 0.056 0.070   NA
 3694836 3694837 GTNG_1327 GTNG_1328     TRUE 0.990 -31.000 0.556 0.004   NA
 3694837 3694838 GTNG_1328 GTNG_1329     TRUE 0.951 -7.000 0.250 1.000   NA
 3694840 3694841 GTNG_1331 GTNG_1332     FALSE 0.002 403.000 0.000 NA   NA
 3694842 3694843 GTNG_1333 GTNG_1334     TRUE 0.978 -10.000 0.648 NA   NA
 3694843 3694844 GTNG_1334 GTNG_1335     TRUE 0.748 -3.000 0.034 NA   NA
 3694844 3694845 GTNG_1335 GTNG_1336     FALSE 0.061 146.000 0.000 NA   NA
 3694845 3694846 GTNG_1336 GTNG_1337     TRUE 0.964 -3.000 0.321 1.000 N NA
 3694846 3694847 GTNG_1337 GTNG_1338     TRUE 0.967 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 3694847 3694848 GTNG_1338 GTNG_1339     FALSE 0.014 395.000 0.000 1.000 N NA
 3694848 3694849 GTNG_1339 GTNG_1340     FALSE 0.478 70.000 0.000 1.000 N NA
 3694849 3694850 GTNG_1340 GTNG_1341     FALSE 0.358 69.000 0.024 NA   NA
 3694850 3694851 GTNG_1341 GTNG_1342     FALSE 0.488 15.000 0.014 NA   NA
 3694851 3694852 GTNG_1342 GTNG_1343     FALSE 0.445 10.000 0.009 NA   NA
 3694853 3694854 GTNG_1344 GTNG_1345     FALSE 0.293 117.000 0.000 NA N NA
 3694854 3694855 GTNG_1345 GTNG_1346     TRUE 0.889 38.000 0.000 NA Y NA
 3694855 3694856 GTNG_1346 GTNG_1347     TRUE 0.996 -10.000 0.957 1.000 Y NA
 3694857 3694858 GTNG_1348 GTNG_1349     FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 3694858 3694859 GTNG_1349 GTNG_1350     FALSE 0.413 128.000 0.074 1.000   NA
 3694859 3694860 GTNG_1350 GTNG_1351     TRUE 0.847 3.000 0.077 1.000 N NA
 3694860 3694861 GTNG_1351 GTNG_1352     TRUE 0.993 -19.000 0.191 0.002 Y NA
 3694861 3694862 GTNG_1352 GTNG_1353     TRUE 0.974 -13.000 0.447 1.000   NA
 3694862 3694863 GTNG_1353 GTNG_1354     TRUE 0.904 -3.000 0.158 1.000   NA
 3694863 3694864 GTNG_1354 GTNG_1355     FALSE 0.116 155.000 0.000 1.000   NA
 3694864 3694865 GTNG_1355 GTNG_1356     FALSE 0.136 204.000 0.000 0.036   NA
 3694865 3694866 GTNG_1356 GTNG_1357     TRUE 0.757 0.000 0.043 1.000   NA
 3694866 3694867 GTNG_1357 GTNG_1358     FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 3694867 3694868 GTNG_1358 GTNG_1359     TRUE 0.694 2.000 0.062 NA   NA
 3694868 3694869 GTNG_1359 GTNG_1360     FALSE 0.184 176.000 0.005 NA N NA
 3694869 3694870 GTNG_1360 GTNG_1361     TRUE 0.959 16.000 0.044 0.005 Y NA
 3694870 3694871 GTNG_1361 GTNG_1362   thiE TRUE 0.968 6.000 0.142 0.005 Y NA
 3694873 3694874 GTNG_1364 GTNG_1365     TRUE 0.950 3.000 0.750 NA   NA
 3694874 3694875 GTNG_1365 GTNG_1366     TRUE 0.828 88.000 0.600 1.000   NA
 3694875 3694876 GTNG_1366 GTNG_1367     FALSE 0.467 130.000 0.167 NA   NA
 3694877 3694878 GTNG_1368 GTNG_1369     TRUE 0.852 -67.000 0.000 NA N NA
 3694878 3694879 GTNG_1369 GTNG_1370     FALSE 0.333 0.000 0.000 NA   NA
 3694879 3694880 GTNG_1370 GTNG_1371     FALSE 0.002 451.000 0.000 NA   NA
 3694880 3694881 GTNG_1371 GTNG_1372     TRUE 0.945 39.000 0.667 NA   NA
 3694882 3694883 GTNG_1373 GTNG_1374     FALSE 0.028 187.000 0.000 NA   NA
 3694883 3694884 GTNG_1374 GTNG_1375     FALSE 0.217 107.000 0.013 NA   NA
 3694885 3694886 GTNG_1376 GTNG_1377     TRUE 0.807 4.000 0.188 NA   NA
 3694887 3694888 GTNG_1378 GTNG_1379     TRUE 0.593 57.000 0.000 1.000 N NA
 3694888 3694889 GTNG_1379 GTNG_1380     TRUE 0.932 -3.000 0.136 1.000 N NA
 3694889 3694890 GTNG_1380 GTNG_1381     FALSE 0.332 162.000 0.027 1.000 N NA
 3694890 3694891 GTNG_1381 GTNG_1382     TRUE 0.966 3.000 0.096 0.040 Y NA
 3694891 3694892 GTNG_1382 GTNG_1383     TRUE 0.983 -3.000 0.039 0.001 Y NA
 3694892 3694893 GTNG_1383 GTNG_1384     TRUE 0.751 108.000 0.022 1.000 Y NA
 3694893 3694894 GTNG_1384 GTNG_1385     FALSE 0.518 179.000 0.022 1.000 Y NA
 3694894 3694895 GTNG_1385 GTNG_1386     TRUE 0.865 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3694895 3694896 GTNG_1386 GTNG_1387     FALSE 0.289 165.000 0.012 1.000 N NA
 3694896 3694897 GTNG_1387 GTNG_1388     FALSE 0.070 248.000 0.000 0.055   NA
 3694897 3694898 GTNG_1388 GTNG_1389     TRUE 0.731 113.000 0.185 0.013   NA
 3694898 3694899 GTNG_1389 GTNG_1390     FALSE 0.003 900.000 0.017 NA   NA
 3694899 3694900 GTNG_1390 GTNG_1391     FALSE 0.001 641.000 0.000 NA   NA
 3694900 3694901 GTNG_1391 GTNG_1392     TRUE 0.815 131.000 0.012 0.013 Y NA
 3694901 3694902 GTNG_1392 GTNG_1393     TRUE 0.628 118.000 0.118 1.000 N NA
 3694903 3694904 GTNG_1394 GTNG_1395     TRUE 0.979 2.000 0.786 0.003   NA
 3694904 3694905 GTNG_1395 GTNG_1396     TRUE 0.919 22.000 0.357 NA   NA
 3694906 3694907 GTNG_1397 GTNG_1398 xpt   TRUE 0.949 0.000 0.056 1.000 Y NA
 3694908 3694909 GTNG_1399 GTNG_1400     TRUE 0.988 0.000 0.667 1.000 Y NA
 3694909 3694910 GTNG_1400 GTNG_1401     FALSE 0.001 1189.000 0.000 NA   NA
 3694911 3694912 GTNG_1402 GTNG_1403     TRUE 0.940 -3.000 0.279 1.000   NA
 3694912 3694913 GTNG_1403 GTNG_1404     FALSE 0.065 236.000 0.029 1.000   NA
 3694913 3694914 GTNG_1404 GTNG_1405     FALSE 0.230 185.000 0.107 1.000   NA
 3694914 3694915 GTNG_1405 GTNG_1406     FALSE 0.384 116.000 0.046 1.000   NA
 3694915 3694916 GTNG_1406 GTNG_1407   tlpA FALSE 0.076 232.000 0.000 1.000 N NA
 3694916 3694917 GTNG_1407 GTNG_1408 tlpA sspN FALSE 0.011 312.000 0.000 1.000   NA
 3694917 3694918 GTNG_1408 GTNG_1409 sspN   TRUE 0.959 -3.000 0.500 NA   NA
 3694918 3694919 GTNG_1409 GTNG_1410     FALSE 0.449 116.000 0.125 NA   NA
 3694919 3694920 GTNG_1410 GTNG_1411     TRUE 0.906 -69.000 0.097 NA   NA
 3694920 3694921 GTNG_1411 GTNG_1412     TRUE 0.704 -3.000 0.019 NA   NA
 3694923 3694924 GTNG_1414 GTNG_1415     FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 3694926 3694927 GTNG_1417 GTNG_1418     FALSE 0.086 195.000 0.004 1.000   NA
 3694927 3694928 GTNG_1418 GTNG_1419     FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 3694928 3694929 GTNG_1419 GTNG_1420     FALSE 0.434 81.000 0.091 NA   NA
 3694929 3694930 GTNG_1420 GTNG_1421     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 3694932 3694933 GTNG_1423 GTNG_1424     TRUE 0.539 100.000 0.182 NA   NA
 3694935 3694936 GTNG_1426 GTNG_1427     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 3694936 3694937 GTNG_1427 GTNG_1428     TRUE 0.883 55.000 0.253 1.000 N NA
 3694939 3694940 GTNG_1430 GTNG_1431     FALSE 0.426 78.000 0.000 0.082   NA
 3694940 3694941 GTNG_1431 GTNG_1432     FALSE 0.098 89.000 0.000 NA   NA
 3694941 3694942 GTNG_1432 GTNG_1433     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694942 3694943 GTNG_1433 GTNG_1434   rarD FALSE 0.033 302.000 0.000 0.081   NA
 3694943 3694944 GTNG_1434 GTNG_1435 rarD   FALSE 0.001 620.000 0.000 NA   NA
 3694945 3694946 GTNG_1436 GTNG_1437     TRUE 0.618 96.000 0.009 0.081 N NA
 3694946 3694947 GTNG_1437 GTNG_1438     FALSE 0.088 121.000 0.000 NA   NA
 3694947 3694948 GTNG_1438 GTNG_1439     FALSE 0.019 208.000 0.000 NA   NA
 3694953 3694954 GTNG_1444 GTNG_1445     TRUE 0.525 -10.000 0.000 NA   NA
 3694954 3694955 GTNG_1445 GTNG_1446     FALSE 0.485 129.000 0.037 1.000 N NA
 3694955 3694956 GTNG_1446 GTNG_1447     TRUE 0.899 60.000 0.074 1.000 Y NA
 3694956 3694957 GTNG_1447 GTNG_1448     TRUE 0.893 66.000 0.019 0.069 Y NA
 3694957 3694958 GTNG_1448 GTNG_1449     TRUE 0.897 23.000 0.029 0.002   NA
 3694958 3694959 GTNG_1449 GTNG_1450     TRUE 0.849 118.000 0.778 1.000   NA
 3694959 3694960 GTNG_1450 GTNG_1451     TRUE 0.983 29.000 0.690 0.069 N NA
 3694960 3694961 GTNG_1451 GTNG_1452     FALSE 0.430 282.000 0.426 1.000 Y NA
 3694963 3694964 GTNG_1454 GTNG_1455     TRUE 0.753 4.000 0.081 1.000   NA
 3694964 3694965 GTNG_1455 GTNG_1456     TRUE 0.712 137.000 0.441 1.000   NA
 3694965 3694966 GTNG_1456 GTNG_1457     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 3694966 3694967 GTNG_1457 GTNG_1458     FALSE 0.086 123.000 0.000 NA   NA
 3694969 3694970 GTNG_1460 GTNG_1461     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694971 3694972 GTNG_1462 GTNG_1463 kinB   FALSE 0.003 354.000 0.000 NA   NA
 3694972 3694973 GTNG_1463 GTNG_1464   gerXC FALSE 0.091 104.000 0.000 NA   NA
 3694973 3694974 GTNG_1464 GTNG_1465 gerXC gerXA TRUE 0.981 -3.000 0.500 0.006   NA
 3694974 3694975 GTNG_1465 GTNG_1466 gerXA gerXB TRUE 0.987 -3.000 0.750 0.006   NA
 3694976 3694977 GTNG_1467 GTNG_1468     TRUE 0.983 -34.000 0.419 1.000 N NA
 3694977 3694978 GTNG_1468 GTNG_1469     TRUE 0.936 -7.000 0.231 NA   NA
 3694980 3694981 GTNG_1471 GTNG_1472 gerKA gerKC TRUE 0.989 -3.000 0.889 0.006   NA
 3694981 3694982 GTNG_1472 GTNG_1473 gerKC gerKB TRUE 0.957 66.000 0.900 0.006   NA
 3694982 3694983 GTNG_1473 GTNG_1474 gerKB   FALSE 0.030 232.000 0.000 1.000   NA
 3694983 3694984 GTNG_1474 GTNG_1475   rsbW TRUE 0.908 13.000 0.022 1.000 Y NA
 3694984 3694985 GTNG_1475 GTNG_1476 rsbW   FALSE 0.400 63.000 0.022 NA   NA
 3694985 3694986 GTNG_1476 GTNG_1477     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 3694986 3694987 GTNG_1477 GTNG_1478     TRUE 0.997 -16.000 0.500 0.003 Y NA
 3694988 3694989 GTNG_1479 GTNG_1480     TRUE 0.904 -9.000 0.133 NA   NA
 3694989 3694990 GTNG_1480 GTNG_1481     FALSE 0.022 198.000 0.000 NA   NA
 3694991 3694992 GTNG_1482 GTNG_1483     FALSE 0.003 724.000 0.000 1.000   NA
 3694992 3694993 GTNG_1483 GTNG_1484     FALSE 0.179 110.000 0.000 1.000   NA
 3694993 3694994 GTNG_1484 GTNG_1485     FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 3694994 3694995 GTNG_1485 GTNG_1486     TRUE 0.665 19.000 0.035 NA   NA
 3694995 3694996 GTNG_1486 GTNG_1487     TRUE 0.982 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 3694996 3694997 GTNG_1487 GTNG_1488     TRUE 0.865 129.000 0.250 1.000 Y NA
 3694997 3694998 GTNG_1488 GTNG_1489     TRUE 0.887 85.000 0.667 1.000 N NA
 3694998 3694999 GTNG_1489 GTNG_1490     TRUE 0.920 27.000 0.182 1.000 N NA
 3694999 3695000 GTNG_1490 GTNG_1491     TRUE 0.986 -16.000 0.545 1.000 N NA
 3695000 3695001 GTNG_1491 GTNG_1492     FALSE 0.164 129.000 0.000 1.000   NA
 3695001 3695002 GTNG_1492 GTNG_1493     FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 3695002 3695003 GTNG_1493 GTNG_1494     TRUE 0.591 11.000 0.050 NA   NA
 3695003 3695004 GTNG_1494 GTNG_1495   bcrA TRUE 0.986 -3.000 0.850 1.000 N NA
 3695004 3695005 GTNG_1495 GTNG_1496 bcrA bcrB TRUE 0.981 -7.000 0.791 NA   NA
 3695005 3695006 GTNG_1496 GTNG_t056 bcrB   FALSE 0.001 648.000 0.000 NA   NA
 3695006 3695007 GTNG_t056 GTNG_t057     FALSE 0.231 9.000 0.000 NA   NA
 3695007 3695008 GTNG_t057 GTNG_1497     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 3695008 3695009 GTNG_1497 GTNG_1498     FALSE 0.021 201.000 0.000 NA   NA
 3695009 3695010 GTNG_1498 GTNG_1499     TRUE 0.723 36.000 0.000 1.000 N NA
 3695012 3695013 GTNG_1501 GTNG_1502     TRUE 0.577 -69.000 0.000 NA   NA
 3695013 3695014 GTNG_1502 GTNG_1503     FALSE 0.028 313.000 0.000 1.000 N NA
 3695014 3695015 GTNG_1503 GTNG_1504     TRUE 0.955 38.000 0.136 1.000 Y NA
 3695015 3695016 GTNG_1504 GTNG_1505     TRUE 0.969 20.000 0.238 NA Y NA
 3695016 3695017 GTNG_1505 GTNG_1506     TRUE 0.987 -3.000 0.429 NA Y NA
 3695017 3695018 GTNG_1506 GTNG_1507     TRUE 0.885 115.000 0.273 1.000 Y NA
 3695018 3695019 GTNG_1507 GTNG_1508     TRUE 0.940 20.000 0.273 1.000 N NA
 3695019 3695020 GTNG_1508 GTNG_1509     TRUE 0.740 64.000 0.083 1.000 N NA
 3695020 3695021 GTNG_1509 GTNG_1510     TRUE 0.991 0.000 0.590 0.044 Y NA
 3695021 3695022 GTNG_1510 GTNG_1511     TRUE 0.982 3.000 0.513 1.000 Y NA
 3695022 3695023 GTNG_1511 GTNG_1512     TRUE 0.996 -7.000 0.621 0.022 Y NA
 3695023 3695024 GTNG_1512 GTNG_1513     TRUE 0.879 157.000 0.591 NA Y NA
 3695024 3695025 GTNG_1513 GTNG_1514     FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 3695026 3695027 GTNG_1515 GTNG_1516     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 3695028 3695029 GTNG_1517 GTNG_1518     TRUE 0.994 0.000 0.750 0.003 Y NA
 3695029 3695030 GTNG_1518 GTNG_1519     TRUE 0.985 -7.000 0.524 0.046   NA
 3695030 3695031 GTNG_1519 GTNG_1520     TRUE 0.949 36.000 0.667 NA   NA
 3695031 3695032 GTNG_1520 GTNG_1521     FALSE 0.004 321.000 0.000 NA   NA
 3695032 3695033 GTNG_1521 GTNG_1522     FALSE 0.325 91.000 0.043 NA   NA
 3695033 3695034 GTNG_1522 GTNG_1523     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 3695034 3695035 GTNG_1523 GTNG_1524     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 3695037 3695038 GTNG_1526 GTNG_1527     FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 3695038 3695039 GTNG_1527 GTNG_1528     TRUE 0.941 88.000 0.333 0.039 Y NA
 3695039 3695040 GTNG_1528 GTNG_1529     TRUE 0.986 44.000 0.571 0.069 Y NA
 3695041 3695042 GTNG_1530 GTNG_1531     FALSE 0.059 378.000 0.000 1.000 Y NA
 3695042 3695043 GTNG_1531 GTNG_1532     FALSE 0.003 379.000 0.000 NA   NA
 3695044 3695045 GTNG_1533 GTNG_1534     TRUE 0.781 15.000 0.176 NA   NA
 3695045 3695046 GTNG_1534 GTNG_1535     TRUE 0.949 16.000 0.000 0.001 Y NA
 3695046 3695047 GTNG_1535 GTNG_1536     FALSE 0.052 157.000 0.000 NA   NA
 3695047 3695048 GTNG_1536 GTNG_1538     FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 3695050 3695051 GTNG_1540 GTNG_1541     TRUE 0.975 -7.000 0.600 NA   NA
 3695051 3695052 GTNG_1541 GTNG_1542     TRUE 0.863 -3.000 0.125 NA   NA
 3695052 3695053 GTNG_1542 GTNG_1543     FALSE 0.317 129.000 0.028 1.000   NA
 3695053 3695054 GTNG_1543 GTNG_1544     TRUE 0.578 -73.000 0.000 NA   NA
 3695054 3695055 GTNG_1544 GTNG_1545   cotB FALSE 0.039 172.000 0.000 NA   NA
 3695055 3695056 GTNG_1545 GTNG_1546 cotB   TRUE 0.612 122.000 0.267 NA   NA
 3695057 3695058 GTNG_1547 GTNG_1548     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 3695061 3695062 GTNG_1551 GTNG_1552     TRUE 0.754 106.000 0.500 NA   NA
 3695062 3695063 GTNG_1552 GTNG_1553     FALSE 0.036 175.000 0.000 NA   NA
 3695063 3695064 GTNG_1553 GTNG_1554   uvsE FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 3695064 3695065 GTNG_1554 GTNG_1555 uvsE   FALSE 0.004 1195.000 0.000 NA N NA
 3695065 3695066 GTNG_1555 GTNG_1556     FALSE 0.098 86.000 0.000 NA   NA
 3695066 3695067 GTNG_1556 GTNG_1557     FALSE 0.236 73.000 0.000 1.000   NA
 3695067 3695068 GTNG_1557 GTNG_1558     FALSE 0.002 409.000 0.000 NA   NA
 3695068 3695069 GTNG_1558 GTNG_1559     FALSE 0.098 86.000 0.000 NA   NA
 3695069 3695070 GTNG_1559 GTNG_1560     TRUE 0.862 67.000 0.000 0.067 Y NA
 3695070 3695071 GTNG_1560 GTNG_1561     FALSE 0.005 1223.000 0.000 1.000 N NA
 3695071 3695072 GTNG_1561 GTNG_1562     FALSE 0.005 397.000 0.000 1.000   NA
 3695072 3695073 GTNG_1562 GTNG_1563     FALSE 0.344 26.000 0.000 NA   NA
 3695074 3695075 GTNG_1564 GTNG_1565     FALSE 0.098 87.000 0.000 NA   NA
 3695076 3695077 GTNG_1566 GTNG_1567     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 3695077 3695078 GTNG_1567 GTNG_1568     FALSE 0.022 256.000 0.000 1.000   NA
 3695078 3695079 GTNG_1568 GTNG_1569     FALSE 0.003 639.000 0.000 1.000   NA
 3695079 3695080 GTNG_1569 GTNG_1570     FALSE 0.002 404.000 0.000 NA   NA
 3695080 3695081 GTNG_1570 GTNG_1571     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3695081 3695082 GTNG_1571 GTNG_1572     FALSE 0.016 278.000 0.000 1.000   NA
 3695082 3695083 GTNG_1572 GTNG_1573     FALSE 0.179 111.000 0.000 1.000   NA
 3695084 3695085 GTNG_1574 GTNG_1575     FALSE 0.283 3.000 0.000 NA   NA
 3695086 3695087 GTNG_1576 GTNG_1577     FALSE 0.083 127.000 0.000 NA   NA
 3695087 3695088 GTNG_1577 GTNG_1578     FALSE 0.106 234.000 0.000 0.008   NA
 3695090 3695091 GTNG_1580 GTNG_1581     FALSE 0.001 1949.000 0.000 NA   NA
 3695091 3695092 GTNG_1581 GTNG_1582     FALSE 0.004 442.000 0.000 1.000   NA
 3695092 3695093 GTNG_1582 GTNG_1583     FALSE 0.003 551.000 0.000 1.000   NA
 3695095 3695096 GTNG_1585 GTNG_1587     FALSE 0.021 202.000 0.000 NA   NA
 3695098 3695099 GTNG_1589 GTNG_1590     FALSE 0.017 216.000 0.000 NA   NA
 3695099 3695100 GTNG_1590 GTNG_1591     FALSE 0.106 78.000 0.000 NA   NA
 3695100 3695101 GTNG_1591 GTNG_1592     TRUE 0.921 48.000 0.000 0.053 Y NA
 3695103 3695104 GTNG_1594 GTNG_1595     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 3695104 3695105 GTNG_1595 GTNG_1596     FALSE 0.042 167.000 0.000 NA   NA
 3695105 3695106 GTNG_1596 GTNG_1597     FALSE 0.489 2.000 0.000 1.000   NA
 3695106 3695107 GTNG_1597 GTNG_1598   arsR FALSE 0.002 1367.000 0.000 1.000   NA
 3695107 3695108 GTNG_1598 GTNG_1599 arsR   TRUE 0.897 28.000 0.111 1.000 N NA
 3695108 3695109 GTNG_1599 GTNG_1600     TRUE 0.936 21.000 0.250 1.000 N NA
 3695111 3695112 GTNG_1602 GTNG_1603     FALSE 0.472 76.000 0.062 1.000   NA
 3695112 3695113 GTNG_1603 GTNG_1604     FALSE 0.004 440.000 0.000 1.000   NA
 3695115 3695116 GTNG_1606 GTNG_1607     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695116 3695117 GTNG_1607 GTNG_1608     FALSE 0.006 774.000 0.000 1.000 N NA
 3695117 3695118 GTNG_1608 GTNG_1609     TRUE 0.981 3.000 0.500 1.000 Y NA
 3695118 3695119 GTNG_1609 GTNG_1610     TRUE 0.628 13.000 0.062 NA   NA
 3695119 3695120 GTNG_1610 GTNG_1611     FALSE 0.341 107.000 0.062 NA   NA
 3695120 3695121 GTNG_1611 GTNG_1612     TRUE 0.784 117.000 0.500 1.000   NA
 3695121 3695122 GTNG_1612 GTNG_1613     TRUE 0.942 23.000 0.500 NA   NA
 3695122 3695123 GTNG_1613 GTNG_1614     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 3695123 3695124 GTNG_1614 GTNG_1615     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3695124 3695125 GTNG_1615 GTNG_1617     FALSE 0.338 30.000 0.000 NA   NA
 3695129 3695130 GTNG_1621 GTNG_1622     FALSE 0.096 98.000 0.000 NA   NA
 3695130 3695131 GTNG_1622 GTNG_1623     FALSE 0.001 571.000 0.000 NA   NA
 3695131 3695132 GTNG_1623 GTNG_1624     FALSE 0.207 207.000 0.054 0.053   NA
 3695132 3695133 GTNG_1624 GTNG_1625     FALSE 0.231 180.000 0.000 0.008   NA
 3695136 3695137 GTNG_1628 GTNG_1629     FALSE 0.010 255.000 0.000 NA   NA
 3695137 3695138 GTNG_1629 GTNG_1630     TRUE 0.655 20.000 0.029 NA   NA
 3695138 3695139 GTNG_1630 GTNG_1631     TRUE 0.941 11.000 0.822 NA   NA
 3695139 3695140 GTNG_1631 GTNG_1632     FALSE 0.425 105.000 0.067 1.000   NA
 3695140 3695141 GTNG_1632 GTNG_1633   purU FALSE 0.333 120.000 0.025 1.000   NA
 3695141 3695142 GTNG_1633 GTNG_1634 purU   FALSE 0.227 162.000 0.000 1.000 N NA
 3695143 3695144 GTNG_1635 GTNG_1636     FALSE 0.002 513.000 0.000 NA   NA
 3695144 3695145 GTNG_1636 GTNG_1637     FALSE 0.102 81.000 0.000 NA   NA
 3695146 3695147 GTNG_1638 GTNG_1639     FALSE 0.287 176.000 0.039 1.000 N NA
 3695147 3695148 GTNG_1639 GTNG_1640     FALSE 0.293 117.000 0.039 NA   NA
 3695148 3695149 GTNG_1640 GTNG_1641     FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 3695149 3695150 GTNG_1641 GTNG_1642     FALSE 0.173 199.000 0.019 1.000 N NA
 3695150 3695151 GTNG_1642 GTNG_1643     TRUE 0.951 23.000 0.336 1.000 N NA
 3695151 3695152 GTNG_1643 GTNG_1644     TRUE 0.794 111.000 0.070 1.000 Y NA
 3695154 3695155 GTNG_1646 GTNG_1647     TRUE 0.946 55.000 0.019 0.001 Y NA
 3695155 3695156 GTNG_1647 GTNG_1648     FALSE 0.043 243.000 0.030 NA   NA
 3695158 3695159 GTNG_1650 GTNG_1651     TRUE 0.637 52.000 0.083 NA   NA
 3695161 3695162 GTNG_t058 GTNG_t059     FALSE 0.332 19.000 0.000 NA   NA
 3695162 3695163 GTNG_t059 GTNG_t060     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3695163 3695164 GTNG_t060 GTNG_t061     FALSE 0.295 38.000 0.000 NA   NA
 3695164 3695165 GTNG_t061 GTNG_t062     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3695165 3695166 GTNG_t062 GTNG_t063     FALSE 0.231 9.000 0.000 NA   NA
 3695166 3695167 GTNG_t063 GTNG_t064     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3695167 3695168 GTNG_t064 GTNG_5s010     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3695168 3695169 GTNG_5s010 GTNG_1653     FALSE 0.001 1033.000 0.000 NA   NA
 3695173 3695174 GTNG_1657 GTNG_1658     FALSE 0.002 431.000 0.000 NA   NA
 3695175 3695176 GTNG_1659 GTNG_1660     FALSE 0.002 446.000 0.000 NA   NA
 3695178 3695179 GTNG_1662 GTNG_1663     TRUE 0.605 21.000 0.016 NA   NA
 3695180 3695181 GTNG_1664 GTNG_1665     TRUE 0.960 35.000 0.828 NA   NA
 3695181 3695182 GTNG_1665 GTNG_1666     TRUE 0.796 23.000 0.068 1.000   NA
 3695182 3695183 GTNG_1666 GTNG_1667     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA   NA
 3695183 3695184 GTNG_1667 GTNG_1668     FALSE 0.316 108.000 0.050 NA   NA
 3695184 3695185 GTNG_1668 GTNG_1669     FALSE 0.004 339.000 0.000 NA   NA
 3695185 3695186 GTNG_1669 GTNG_1670     FALSE 0.088 175.000 0.007 NA   NA
 3695186 3695187 GTNG_1670 GTNG_1671   thyA TRUE 0.978 -70.000 0.295 1.000 N NA
 3695187 3695188 GTNG_1671 GTNG_1672 thyA   FALSE 0.326 77.000 0.007 1.000   NA
 3695188 3695189 GTNG_1672 GTNG_1673     FALSE 0.452 99.000 0.111 NA   NA
 3695189 3695190 GTNG_1673 GTNG_1674     TRUE 0.602 16.000 0.040 NA   NA
 3695190 3695191 GTNG_1674 GTNG_1675     FALSE 0.011 249.000 0.000 NA   NA
 3695191 3695192 GTNG_1675 GTNG_1676     FALSE 0.418 73.000 0.061 NA   NA
 3695192 3695193 GTNG_1676 GTNG_1677     FALSE 0.001 580.000 0.000 NA   NA
 3695193 3695194 GTNG_1677 GTNG_1678     TRUE 0.862 26.000 0.049 1.000 N NA
 3695194 3695195 GTNG_1678 GTNG_1679     FALSE 0.259 169.000 0.122 NA   NA
 3695197 3695198 GTNG_1681 GTNG_1682 btuR   TRUE 0.973 -19.000 0.009 1.000 Y NA
 3695198 3695199 GTNG_1682 GTNG_1683   cobT TRUE 0.961 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 3695199 3695200 GTNG_1683 GTNG_1684 cobT cbiP TRUE 0.667 176.000 0.016 0.010 Y NA
 3695200 3695201 GTNG_1684 GTNG_1685 cbiP cbiA TRUE 0.984 -7.000 0.010 0.003 Y NA
 3695201 3695202 GTNG_1685 GTNG_1686 cbiA cbiG TRUE 0.988 -54.000 0.032 0.010 Y NA
 3695202 3695203 GTNG_1686 GTNG_1687 cbiG cbiF TRUE 0.987 2.000 0.397 0.010 Y NA
 3695203 3695204 GTNG_1687 GTNG_1688 cbiF cbiL TRUE 0.991 -3.000 0.291 0.010 Y NA
 3695204 3695205 GTNG_1688 GTNG_1689 cbiL cbiET TRUE 0.985 -3.000 0.128 0.010 Y NA
 3695205 3695206 GTNG_1689 GTNG_1690 cbiET cbiD TRUE 0.991 -34.000 0.107 0.010 Y NA
 3695206 3695207 GTNG_1690 GTNG_1691 cbiD cbiC TRUE 0.961 7.000 0.102 0.010 Y NA
 3695207 3695208 GTNG_1691 GTNG_1692 cbiC cbiJ TRUE 0.851 115.000 0.026 0.010 Y NA
 3695208 3695209 GTNG_1692 GTNG_1693 cbiJ cbiX TRUE 0.829 16.000 0.026 0.010   NA
 3695209 3695210 GTNG_1693 GTNG_1694 cbiX cbiH FALSE 0.198 213.000 0.025 0.010   NA
 3695210 3695211 GTNG_1694 GTNG_1695 cbiH cbiO TRUE 0.632 64.000 0.011 1.000 N NA
 3695211 3695212 GTNG_1695 GTNG_1696 cbiO cbiQ TRUE 0.986 -3.000 0.335 1.000 Y NA
 3695212 3695213 GTNG_1696 GTNG_1697 cbiQ cbiN TRUE 0.998 -16.000 0.804 0.002 Y NA
 3695213 3695214 GTNG_1697 GTNG_1698 cbiN cbiM TRUE 0.992 5.000 0.861 0.010 Y NA
 3695214 3695215 GTNG_1698 GTNG_1699 cbiM   TRUE 0.808 1.000 0.019 1.000 N NA
 3695215 3695216 GTNG_1699 GTNG_1700     FALSE 0.052 236.000 0.000 NA N NA
 3695216 3695217 GTNG_1700 GTNG_t065     FALSE 0.010 258.000 0.000 NA   NA
 3695219 3695220 GTNG_1702 GTNG_1703     TRUE 0.564 13.000 0.008 1.000   NA
 3695222 3695223 GTNG_1705 GTNG_1706     TRUE 0.663 82.000 0.125 1.000 N NA
 3695223 3695224 GTNG_1706 GTNG_1707     FALSE 0.017 368.000 0.000 1.000 N NA
 3695224 3695225 GTNG_1707 GTNG_1708     TRUE 0.845 43.000 0.250 NA   NA
 3695225 3695226 GTNG_1708 GTNG_1709     FALSE 0.397 83.000 0.074 NA   NA
 3695226 3695227 GTNG_1709 GTNG_1710     FALSE 0.019 393.000 0.000 0.030   NA
 3695227 3695228 GTNG_1710 GTNG_1711     FALSE 0.274 76.000 0.017 NA   NA
 3695229 3695230 GTNG_1712 GTNG_1713 narG2 narH2 TRUE 0.996 -10.000 0.429 0.001 Y NA
 3695230 3695231 GTNG_1713 GTNG_1714 narH2 narJ2 TRUE 0.989 54.000 0.750 0.003 Y NA
 3695231 3695232 GTNG_1714 GTNG_1715 narJ2 narI2 TRUE 0.995 -24.000 0.294 0.003 Y NA
 3695233 3695234 GTNG_1716 GTNG_1717   porA FALSE 0.244 137.000 0.000 NA N NA
 3695234 3695235 GTNG_1717 GTNG_1718 porA porG TRUE 0.994 18.000 0.786 0.001 Y NA
 3695235 3695236 GTNG_1718 GTNG_1719 porG hemD FALSE 0.139 191.000 0.000 1.000 N NA
 3695236 3695237 GTNG_1719 GTNG_1720 hemD   FALSE 0.256 104.000 0.024 NA   NA
 3695237 3695238 GTNG_1720 GTNG_1721     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 3695239 3695240 GTNG_1722 GTNG_1723     FALSE 0.135 193.000 0.000 1.000 N NA
 3695243 3695244 GTNG_1726 GTNG_1727     TRUE 0.991 26.000 0.816 1.000 Y NA
 3695244 3695245 GTNG_1727 GTNG_1728     TRUE 0.993 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 3695245 3695246 GTNG_1728 GTNG_1729     FALSE 0.060 188.000 0.000 1.000   NA
 3695246 3695247 GTNG_1729 GTNG_1730   nosF FALSE 0.480 17.000 0.000 1.000   NA
 3695247 3695248 GTNG_1730 GTNG_1731 nosF nosY FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695248 3695249 GTNG_1731 GTNG_1732 nosY nosD FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695249 3695250 GTNG_1732 GTNG_1733 nosD   FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695250 3695251 GTNG_1733 GTNG_1734   nosZ TRUE 0.824 52.000 0.281 NA   NA
 3695251 3695252 GTNG_1734 GTNG_1735 nosZ   TRUE 0.787 22.000 0.000 0.045   NA
 3695252 3695253 GTNG_1735 GTNG_1736     FALSE 0.082 173.000 0.000 1.000   NA
 3695253 3695254 GTNG_1736 GTNG_1737     FALSE 0.228 185.000 0.154 NA   NA
 3695254 3695255 GTNG_1737 GTNG_1738     FALSE 0.001 589.000 0.000 NA   NA
 3695255 3695256 GTNG_1738 GTNG_1739     TRUE 0.962 -3.000 0.517 NA   NA
 3695256 3695257 GTNG_1739 GTNG_1740     TRUE 0.972 3.000 0.308 1.000 Y NA
 3695259 3695260 GTNG_1742 GTNG_1743     FALSE 0.020 263.000 0.000 1.000   NA
 3695260 3695261 GTNG_1743 GTNG_1744     TRUE 0.911 34.000 0.353 NA   NA
 3695263 3695264 GTNG_1746 GTNG_1747     TRUE 0.711 151.000 0.364 1.000 N NA
 3695264 3695265 GTNG_1747 GTNG_1748     TRUE 0.970 27.000 0.190 1.000 Y NA
 3695265 3695266 GTNG_1748 GTNG_1749     TRUE 0.978 17.000 0.190 0.005 Y NA
 3695266 3695267 GTNG_1749 GTNG_1750     TRUE 0.992 2.000 0.667 0.005 Y NA
 3695267 3695268 GTNG_1750 GTNG_1751     FALSE 0.042 276.000 0.000 1.000 N NA
 3695270 3695271 GTNG_1753 GTNG_1754     FALSE 0.121 176.000 0.031 NA   NA
 3695271 3695272 GTNG_1754 GTNG_1755     TRUE 0.538 104.000 0.021 0.038   NA
 3695272 3695273 GTNG_1755 GTNG_1756   xylB FALSE 0.023 255.000 0.000 1.000   NA
 3695273 3695274 GTNG_1756 GTNG_1757 xylB xylA TRUE 0.935 15.000 0.091 1.000 Y NA
 3695274 3695275 GTNG_1757 GTNG_1758 xylA   TRUE 0.817 99.000 0.000 0.015 Y NA
 3695275 3695276 GTNG_1758 GTNG_1759     FALSE 0.010 446.000 0.000 1.000 N NA
 3695276 3695277 GTNG_1759 GTNG_1760     TRUE 0.559 23.000 0.005 NA   NA
 3695279 3695280 GTNG_1762 GTNG_1763   uxuB FALSE 0.498 80.000 0.133 NA   NA
 3695280 3695281 GTNG_1763 GTNG_1764 uxuB uxuA TRUE 0.980 -24.000 0.367 1.000 N NA
 3695281 3695282 GTNG_1764 GTNG_1765 uxuA uxaC TRUE 0.965 21.000 0.000 0.001 Y NA
 3695282 3695283 GTNG_1765 GTNG_1766 uxaC uxuR TRUE 0.686 42.000 0.000 1.000 N NA
 3695283 3695284 GTNG_1766 GTNG_1767 uxuR kdgA FALSE 0.369 118.000 0.000 1.000 N NA
 3695284 3695285 GTNG_1767 GTNG_1768 kdgA kdgK TRUE 0.914 18.000 0.000 1.000 Y NA
 3695285 3695286 GTNG_1768 GTNG_1769 kdgK xynB TRUE 0.957 33.000 0.105 1.000 Y NA
 3695286 3695287 GTNG_1769 GTNG_1770 xynB   TRUE 0.965 17.000 0.056 0.007 Y NA
 3695287 3695288 GTNG_1770 GTNG_1771     TRUE 0.930 16.000 0.056 1.000 Y NA
 3695288 3695289 GTNG_1771 GTNG_1772     TRUE 0.991 15.000 0.833 0.043 Y NA
 3695289 3695290 GTNG_1772 GTNG_1773     TRUE 0.943 131.000 0.500 0.043 Y NA
 3695290 3695291 GTNG_1773 GTNG_1774   xynA2 FALSE 0.031 549.000 0.000 1.000 Y NA
 3695291 3695292 GTNG_1774 GTNG_1775 xynA2 xynB2 TRUE 0.947 -3.000 0.143 0.015   NA
 3695292 3695293 GTNG_1775 GTNG_1776 xynB2   TRUE 0.696 111.000 0.143 0.015   NA
 3695293 3695294 GTNG_1776 GTNG_1777     TRUE 0.978 14.000 0.286 0.015 Y NA
 3695294 3695295 GTNG_1777 GTNG_1778     FALSE 0.288 216.000 0.000 1.000 Y NA
 3695295 3695296 GTNG_1778 GTNG_1779     TRUE 0.988 15.000 0.625 0.043 Y NA
 3695296 3695297 GTNG_1779 GTNG_1780     TRUE 0.968 76.000 0.625 0.043 Y NA
 3695297 3695298 GTNG_1780 GTNG_1781     TRUE 0.837 115.000 0.700 1.000   NA
 3695298 3695299 GTNG_1781 GTNG_1782     TRUE 0.983 0.000 0.889 0.017   NA
 3695299 3695300 GTNG_1782 GTNG_1783     FALSE 0.002 506.000 0.000 NA   NA
 3695302 3695303 GTNG_1788 GTNG_1789     TRUE 0.984 -3.000 0.500 0.067 N NA
 3695303 3695304 GTNG_1789 GTNG_1790     FALSE 0.345 58.000 0.000 1.000   NA
 3695304 3695305 GTNG_1790 GTNG_1791     TRUE 0.792 63.000 0.250 1.000   NA
 3695305 3695306 GTNG_1791 GTNG_1792     TRUE 0.967 40.000 0.250 1.000 Y NA
 3695306 3695307 GTNG_1792 GTNG_1793     TRUE 0.983 4.000 0.375 0.043 Y NA
 3695307 3695308 GTNG_1793 GTNG_1794     TRUE 0.930 128.000 0.350 0.043 Y NA
 3695308 3695309 GTNG_1794 GTNG_1795   araA FALSE 0.035 501.000 0.000 1.000 Y NA
 3695309 3695310 GTNG_1795 GTNG_1796 araA araB TRUE 0.882 17.000 0.138 1.000 N NA
 3695310 3695311 GTNG_1796 GTNG_1797 araB araD TRUE 0.934 16.000 0.108 0.001 N NA
 3695311 3695312 GTNG_1797 GTNG_1798 araD araR TRUE 0.624 92.000 0.095 1.000 N NA
 3695312 3695313 GTNG_1798 GTNG_1799 araR   FALSE 0.367 120.000 0.000 1.000 N NA
 3695313 3695314 GTNG_1799 GTNG_1800     TRUE 0.988 2.000 0.778 1.000 Y NA
 3695314 3695315 GTNG_1800 GTNG_1801     TRUE 0.834 74.000 0.095 NA Y NA
 3695315 3695316 GTNG_1801 GTNG_1802     FALSE 0.048 285.000 0.027 NA N NA
 3695316 3695317 GTNG_1802 GTNG_1803     TRUE 0.974 14.000 0.636 0.016 N NA
 3695317 3695318 GTNG_1803 GTNG_1804     TRUE 0.889 19.000 0.152 NA N NA
 3695318 3695319 GTNG_1804 GTNG_1805   fbaA FALSE 0.018 1166.000 0.000 NA Y NA
 3695319 3695320 GTNG_1805 GTNG_1806 fbaA   TRUE 0.560 79.000 0.038 1.000 N NA
 3695320 3695321 GTNG_1806 GTNG_1807     TRUE 0.960 17.000 0.556 1.000 N NA
 3695321 3695322 GTNG_1807 GTNG_1808   iolB TRUE 0.928 38.000 0.019 1.000 Y NA
 3695322 3695323 GTNG_1808 GTNG_1809 iolB iolE TRUE 0.882 14.000 0.000 1.000 Y NA
 3695323 3695324 GTNG_1809 GTNG_1810 iolE iolD FALSE 0.397 84.000 0.000 1.000 N NA
 3695324 3695325 GTNG_1810 GTNG_1811 iolD   TRUE 0.635 70.000 0.140 1.000   NA
 3695325 3695326 GTNG_1811 GTNG_1812     FALSE 0.027 240.000 0.000 1.000   NA
 3695326 3695327 GTNG_1812 GTNG_1813     TRUE 0.586 46.000 0.000 NA N NA
 3695327 3695328 GTNG_1813 GTNG_1814     TRUE 0.885 51.000 0.027 NA Y NA
 3695328 3695329 GTNG_1814 GTNG_1815     TRUE 0.922 9.000 0.068 1.000 Y NA
 3695329 3695330 GTNG_1815 GTNG_1816     FALSE 0.026 243.000 0.000 1.000   NA
 3695330 3695331 GTNG_1816 GTNG_1817     FALSE 0.467 80.000 0.000 0.038   NA
 3695333 3695334 GTNG_1819 GTNG_1820     FALSE 0.011 431.000 0.000 1.000 N NA
 3695334 3695335 GTNG_1820 GTNG_1821     TRUE 0.897 41.000 0.000 1.000 Y NA
 3695335 3695336 GTNG_1821 GTNG_1822     TRUE 0.994 22.000 0.818 0.043 Y NA
 3695336 3695337 GTNG_1822 GTNG_1823     TRUE 0.993 35.000 0.857 0.043 Y NA
 3695339 3695340 GTNG_1825 GTNG_1826     TRUE 0.697 122.000 0.083 0.067 N NA
 3695340 3695341 GTNG_1826 GTNG_1827     TRUE 0.596 122.000 0.095 1.000 N NA
 3695341 3695342 GTNG_1827 GTNG_1828     FALSE 0.220 240.000 0.000 1.000 Y NA
 3695343 3695344 GTNG_1829 GTNG_1830     FALSE 0.510 167.000 0.200 1.000 N NA
 3695344 3695345 GTNG_1830 GTNG_1831     FALSE 0.001 819.000 0.000 NA   NA
 3695346 3695347 GTNG_1832 GTNG_1833     FALSE 0.416 70.000 0.019 1.000   NA
 3695349 3695350 GTNG_1835 GTNG_1836     TRUE 0.692 115.000 0.000 1.000 Y NA
 3695350 3695351 GTNG_1836 GTNG_1837     TRUE 0.928 29.000 0.214 1.000 N NA
 3695351 3695352 GTNG_1837 GTNG_1838     FALSE 0.085 171.000 0.000 1.000   NA
 3695352 3695353 GTNG_1838 GTNG_1839     TRUE 0.608 64.000 0.074 1.000   NA
 3695353 3695354 GTNG_1839 GTNG_1840     TRUE 0.993 19.000 0.750 0.065 Y NA
 3695354 3695355 GTNG_1840 GTNG_1841     TRUE 0.801 75.000 0.500 NA   NA
 3695355 3695356 GTNG_1841 GTNG_1842   tctB FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3695356 3695357 GTNG_1842 GTNG_1843 tctB tctC TRUE 0.862 56.000 0.400 NA   NA
 3695357 3695358 GTNG_1843 GTNG_1844 tctC   FALSE 0.005 393.000 0.000 1.000   NA
 3695358 3695359 GTNG_1844 GTNG_1845     TRUE 0.947 0.000 0.043 1.000 Y NA
 3695359 3695360 GTNG_1845 GTNG_1846     TRUE 0.918 6.000 0.115 0.005 N NA
 3695360 3695361 GTNG_1846 GTNG_1847     FALSE 0.117 434.000 0.336 0.005 N NA
 3695361 3695362 GTNG_1847 GTNG_1848     FALSE 0.018 210.000 0.000 NA   NA
 3695362 3695363 GTNG_1848 GTNG_1849     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 3695363 3695364 GTNG_1849 GTNG_1850     TRUE 0.710 17.000 0.000 1.000 N NA
 3695364 3695365 GTNG_1850 GTNG_1851     TRUE 0.751 31.000 0.000 1.000 N NA
 3695365 3695366 GTNG_1851 GTNG_1852     FALSE 0.089 381.000 0.333 1.000 N NA
 3695366 3695367 GTNG_1852 GTNG_1853     FALSE 0.009 515.000 0.000 1.000 N NA
 3695367 3695368 GTNG_1853 GTNG_1854     TRUE 0.563 64.000 0.000 0.066   NA
 3695368 3695369 GTNG_1854 GTNG_1855     TRUE 0.705 49.000 0.000 0.034   NA
 3695369 3695370 GTNG_1855 GTNG_1856     TRUE 0.863 5.000 0.034 0.066 N NA
 3695370 3695371 GTNG_1856 GTNG_1857     TRUE 0.976 13.000 0.500 1.000 Y NA
 3695371 3695372 GTNG_1857 GTNG_1858     TRUE 0.912 58.000 0.095 1.000 Y NA
 3695372 3695373 GTNG_1858 GTNG_1859     TRUE 0.986 -28.000 0.318 0.001   NA
 3695373 3695374 GTNG_1859 GTNG_1860     TRUE 0.813 22.000 0.083 1.000   NA
 3695374 3695375 GTNG_1860 GTNG_1861     TRUE 0.749 16.000 0.083 1.000   NA
 3695375 3695376 GTNG_1861 GTNG_1862     FALSE 0.024 195.000 0.000 NA   NA
 3695376 3695377 GTNG_1862 GTNG_1863     TRUE 0.618 115.000 0.269 NA   NA
 3695377 3695378 GTNG_1863 GTNG_1864     TRUE 0.923 -3.000 0.210 1.000   NA
 3695378 3695379 GTNG_1864 GTNG_1865     FALSE 0.254 131.000 0.008 1.000   NA
 3695379 3695380 GTNG_1865 GTNG_1866     TRUE 0.832 36.000 0.034 0.066   NA
 3695380 3695381 GTNG_1866 GTNG_1867     FALSE 0.362 76.000 0.017 1.000   NA
 3695381 3695382 GTNG_1867 GTNG_1868   ilvD FALSE 0.452 111.000 0.008 1.000 N NA
 3695382 3695383 GTNG_1868 GTNG_1869 ilvD   TRUE 0.579 27.000 0.008 NA   NA
 3695383 3695384 GTNG_1869 GTNG_1870     TRUE 0.570 117.000 0.222 NA   NA
 3695384 3695385 GTNG_1870 GTNG_1871     FALSE 0.311 35.000 0.000 NA   NA
 3695385 3695386 GTNG_1871 GTNG_1873     FALSE 0.310 1.000 0.000 NA   NA
 3695386 3695387 GTNG_1873 GTNG_1874     TRUE 0.955 30.000 0.118 NA Y NA
 3695387 3695388 GTNG_1874 GTNG_1875     FALSE 0.006 783.000 0.000 1.000 N NA
 3695388 3695389 GTNG_1875 GTNG_1876     FALSE 0.004 477.000 0.000 1.000   NA
 3695389 3695390 GTNG_1876 GTNG_1877     TRUE 0.893 13.000 0.357 1.000   NA
 3695390 3695391 GTNG_1877 GTNG_1878   murQ TRUE 0.931 24.000 0.344 1.000   NA
 3695391 3695392 GTNG_1878 GTNG_1879 murQ   TRUE 0.718 128.000 0.156 0.003   NA
 3695394 3695395 GTNG_1881 GTNG_1882     TRUE 0.914 -3.000 0.077 1.000 N NA
 3695395 3695396 GTNG_1882 GTNG_1883     FALSE 0.002 437.000 0.000 NA   NA
 3695396 3695397 GTNG_1883 GTNG_1884     FALSE 0.157 65.000 0.000 NA   NA
 3695398 3695399 GTNG_1885 GTNG_1886     TRUE 0.966 -10.000 0.412 NA   NA
 3695399 3695400 GTNG_1886 GTNG_1887     FALSE 0.085 124.000 0.000 NA   NA
 3695401 3695402 GTNG_1888 GTNG_1889   adeC FALSE 0.361 135.000 0.062 1.000   NA
 3695402 3695403 GTNG_1889 GTNG_1890 adeC   TRUE 0.784 76.000 0.400 1.000   NA
 3695403 3695404 GTNG_1890 GTNG_1891     TRUE 0.927 21.000 0.333 1.000   NA
 3695404 3695405 GTNG_1891 GTNG_1892     TRUE 0.929 113.000 0.333 0.066 Y NA
 3695405 3695406 GTNG_1892 GTNG_1893     TRUE 0.562 159.000 0.333 1.000   NA
 3695406 3695407 GTNG_1893 GTNG_1894     FALSE 0.306 197.000 0.250 1.000   NA
 3695407 3695408 GTNG_1894 GTNG_1895     TRUE 0.971 0.000 0.875 1.000   NA
 3695408 3695409 GTNG_1895 GTNG_1896     FALSE 0.012 307.000 0.000 1.000   NA
 3695409 3695410 GTNG_1896 GTNG_1897     FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 3695410 3695411 GTNG_1897 GTNG_1898     FALSE 0.252 133.000 0.000 NA N NA
 3695411 3695412 GTNG_1898 GTNG_1899     TRUE 0.715 62.000 0.000 0.066 N NA
 3695412 3695413 GTNG_1899 GTNG_1900     TRUE 0.988 -37.000 1.000 NA   NA
 3695413 3695414 GTNG_1900 GTNG_1901     FALSE 0.003 355.000 0.000 NA   NA
 3695414 3695415 GTNG_1901 GTNG_1902     FALSE 0.041 168.000 0.000 NA   NA
 3695417 3695418 GTNG_1904 GTNG_1905     FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 3695418 3695419 GTNG_1905 GTNG_1906     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3695419 3695420 GTNG_1906 GTNG_1907     FALSE 0.333 0.000 0.000 NA   NA
 3695420 3695421 GTNG_1907 GTNG_1910     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3695421 3695422 GTNG_1910 GTNG_1911     FALSE 0.007 763.000 0.000 1.000 N NA
 3695422 3695423 GTNG_1911 GTNG_1912     TRUE 0.996 -3.000 0.800 0.003 Y NA
 3695423 3695424 GTNG_1912 GTNG_1913     TRUE 0.573 53.000 0.024 1.000   NA
 3695424 3695425 GTNG_1913 GTNG_1914     TRUE 0.986 -25.000 0.771 1.000   NA
 3695425 3695426 GTNG_1914 GTNG_1915     TRUE 0.710 25.000 0.048 NA   NA
 3695426 3695427 GTNG_1915 GTNG_1916     FALSE 0.375 142.000 0.133 NA   NA
 3695427 3695428 GTNG_1916 GTNG_1917     FALSE 0.438 188.000 0.200 0.038   NA
 3695430 3695431 GTNG_1919 GTNG_1920     FALSE 0.046 245.000 0.000 NA N NA
 3695431 3695432 GTNG_1920 GTNG_1921   paaH TRUE 0.928 42.000 0.043 1.000 Y NA
 3695432 3695433 GTNG_1921 GTNG_1922 paaH paaZ FALSE 0.302 192.000 0.106 1.000 N NA
 3695433 3695434 GTNG_1922 GTNG_1923 paaZ paaG TRUE 0.956 15.000 0.400 0.066 N NA
 3695434 3695435 GTNG_1923 GTNG_1924 paaG paaF TRUE 0.981 13.000 0.304 0.003 Y NA
 3695435 3695436 GTNG_1924 GTNG_1925 paaF   TRUE 0.926 -7.000 0.200 NA   NA
 3695436 3695437 GTNG_1925 GTNG_1926   paaD TRUE 0.549 8.000 0.036 NA   NA
 3695437 3695438 GTNG_1926 GTNG_1927 paaD paaC TRUE 0.861 103.000 0.919 NA   NA
 3695438 3695439 GTNG_1927 GTNG_1928 paaC paaB TRUE 0.987 -24.000 0.943 NA   NA
 3695439 3695440 GTNG_1928 GTNG_1929 paaB paaA TRUE 0.948 8.000 0.920 NA   NA
 3695440 3695441 GTNG_1929 GTNG_1930 paaA paaK FALSE 0.192 167.000 0.029 1.000   NA
 3695441 3695442 GTNG_1930 GTNG_1931 paaK   FALSE 0.008 621.000 0.000 1.000 N NA
 3695443 3695444 GTNG_1932 GTNG_1933   proA TRUE 0.992 -3.000 0.281 0.002 Y NA
 3695445 3695446 GTNG_1934 GTNG_1935     FALSE 0.004 323.000 0.000 NA   NA
 3695447 3695448 GTNG_1936 GTNG_1937     FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 3695449 3695450 GTNG_1938 GTNG_1939 aroK   TRUE 0.804 18.000 0.013 1.000 N NA
 3695450 3695451 GTNG_1939 GTNG_1940     FALSE 0.217 165.000 0.000 1.000 N NA
 3695451 3695452 GTNG_1940 GTNG_1941   aroD TRUE 0.759 27.000 0.000 1.000 N NA
 3695452 3695453 GTNG_1941 GTNG_1942 aroD   TRUE 0.710 17.000 0.000 1.000 N NA
 3695455 3695456 GTNG_1944 GTNG_1945     TRUE 0.896 1.000 0.000 NA Y NA
 3695456 3695457 GTNG_1945 GTNG_1946     TRUE 0.679 84.000 0.000 NA Y NA
 3695457 3695458 GTNG_1946 GTNG_1947     FALSE 0.018 212.000 0.000 NA   NA
 3695458 3695459 GTNG_1947 GTNG_1948     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695459 3695460 GTNG_1948 GTNG_1949     TRUE 0.677 32.000 0.000 NA N NA
 3695460 3695461 GTNG_1949 GTNG_1950     TRUE 0.969 -3.000 0.080 1.000 Y NA
 3695461 3695462 GTNG_1950 GTNG_1951     TRUE 0.948 19.000 0.167 0.037 N NA
 3695462 3695463 GTNG_1951 GTNG_1952     TRUE 0.956 1.000 0.118 1.000 Y NA
 3695463 3695464 GTNG_1952 GTNG_1953     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 3695464 3695465 GTNG_1953 GTNG_1954     TRUE 0.573 -55.000 0.000 NA   NA
 3695467 3695468 GTNG_1956 GTNG_1957     FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 3695469 3695470 GTNG_1958 GTNG_1959     TRUE 0.990 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3695470 3695471 GTNG_1959 GTNG_1960     TRUE 0.840 110.000 0.333 0.092 N NA
 3695471 3695472 GTNG_1960 GTNG_1961     TRUE 0.980 -3.000 1.000 NA   NA
 3695472 3695473 GTNG_1961 GTNG_1962     TRUE 0.964 1.000 0.889 NA   NA
 3695479 3695480 GTNG_1968 GTNG_1969     FALSE 0.338 21.000 0.000 NA   NA
 3695480 3695481 GTNG_1969 GTNG_1970     FALSE 0.001 639.000 0.000 NA   NA
 3695482 3695483 GTNG_1971 GTNG_1972     FALSE 0.003 362.000 0.000 NA   NA
 3695484 3695485 GTNG_1973 GTNG_1974     FALSE 0.123 72.000 0.000 NA   NA
 3695485 3695486 GTNG_1974 GTNG_1975     TRUE 0.536 20.000 0.000 1.000   NA
 3695486 3695487 GTNG_1975 GTNG_1976     FALSE 0.088 109.000 0.000 NA   NA
 3695488 3695489 GTNG_1977 GTNG_1978     FALSE 0.462 84.000 0.071 1.000   NA
 3695489 3695490 GTNG_1978 GTNG_1979     TRUE 0.654 50.000 0.048 1.000   NA
 3695490 3695491 GTNG_1979 GTNG_1980     TRUE 0.963 24.000 0.175 NA Y NA
 3695491 3695492 GTNG_1980 GTNG_1981     TRUE 0.968 13.000 0.410 NA Y NA
 3695492 3695493 GTNG_1981 GTNG_1982     TRUE 0.882 26.000 0.231 NA   NA
 3695493 3695494 GTNG_1982 GTNG_1983     TRUE 0.694 49.000 0.105 NA   NA
 3695494 3695495 GTNG_1983 GTNG_1984     TRUE 0.666 65.000 0.174 NA   NA
 3695495 3695496 GTNG_1984 GTNG_1985     FALSE 0.001 652.000 0.000 NA   NA
 3695496 3695497 GTNG_1985 GTNG_1988     FALSE 0.247 15.000 0.000 NA   NA
 3695497 3695498 GTNG_1988 GTNG_1989     TRUE 0.932 6.000 0.667 NA   NA
 3695498 3695499 GTNG_1989 GTNG_1990     TRUE 0.918 7.000 0.577 NA   NA
 3695499 3695500 GTNG_1990 GTNG_1991     FALSE 0.001 572.000 0.000 NA   NA
 3695500 3695501 GTNG_1991 GTNG_1992     TRUE 0.547 -18.000 0.000 NA   NA
 3695502 3695503 GTNG_1993 GTNG_1994     FALSE 0.240 13.000 0.000 NA   NA
 3695504 3695505 GTNG_1995 GTNG_1996     TRUE 0.998 -19.000 1.000 0.002 Y NA
 3695505 3695506 GTNG_1996 GTNG_1997     TRUE 0.989 24.000 0.667 1.000 Y NA
 3695506 3695507 GTNG_1997 GTNG_1998     TRUE 0.940 153.000 0.667 0.042 Y NA
 3695507 3695508 GTNG_1998 GTNG_1999     FALSE 0.116 1270.000 0.333 0.042 Y NA
 3695508 3695509 GTNG_1999 GTNG_2000     FALSE 0.012 307.000 0.000 1.000   NA
 3695511 3695512 GTNG_2002 GTNG_2003     TRUE 0.919 -3.000 0.200 1.000   NA
 3695512 3695513 GTNG_2003 GTNG_2004     FALSE 0.001 893.000 0.000 NA   NA
 3695513 3695514 GTNG_2004 GTNG_2005     FALSE 0.065 142.000 0.000 NA   NA
 3695514 3695515 GTNG_2005 GTNG_2006     FALSE 0.297 2.000 0.000 NA   NA
 3695515 3695516 GTNG_2006 GTNG_2007     TRUE 0.580 -112.000 0.000 NA   NA
 3695516 3695517 GTNG_2007 GTNG_2008     FALSE 0.095 99.000 0.000 NA   NA
 3695517 3695518 GTNG_2008 GTNG_2009     TRUE 0.935 -7.000 0.226 NA   NA
 3695519 3695520 GTNG_2010 GTNG_2011     FALSE 0.235 7.000 0.000 NA   NA
 3695520 3695521 GTNG_2011 GTNG_2012     FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 3695522 3695523 GTNG_2013 GTNG_2014     FALSE 0.446 121.000 0.125 NA   NA
 3695523 3695524 GTNG_2014 GTNG_2015     TRUE 0.769 -3.000 0.042 NA   NA
 3695524 3695525 GTNG_2015 GTNG_2016     TRUE 0.892 -43.000 0.080 NA   NA
 3695525 3695526 GTNG_2016 GTNG_2017     TRUE 0.697 151.000 0.500 1.000   NA
 3695526 3695527 GTNG_2017 GTNG_2018     FALSE 0.012 420.000 0.000 1.000 N NA
 3695527 3695528 GTNG_2018 GTNG_2019     FALSE 0.332 157.000 0.014 1.000 N NA
 3695528 3695529 GTNG_2019 GTNG_2020     FALSE 0.020 353.000 0.000 1.000 N NA
 3695529 3695530 GTNG_2020 GTNG_2021     TRUE 0.989 14.000 0.723 0.042 Y NA
 3695530 3695531 GTNG_2021 GTNG_2022     TRUE 0.854 150.000 0.178 0.042 Y NA
 3695531 3695532 GTNG_2022 GTNG_2023     FALSE 0.001 546.000 0.000 NA   NA
 3695532 3695533 GTNG_2023 GTNG_2024     TRUE 0.726 14.000 0.120 NA   NA
 3695537 3695538 GTNG_2027 GTNG_2028     TRUE 0.769 -3.000 0.042 NA   NA
 3695538 3695539 GTNG_2028 GTNG_2029     TRUE 0.637 15.000 0.062 NA   NA
 3695539 3695540 GTNG_2029 GTNG_2030     TRUE 0.792 -3.000 0.056 NA   NA
 3695540 3695541 GTNG_2030 GTNG_2031     FALSE 0.003 561.000 0.000 1.000   NA
 3695541 3695542 GTNG_2031 GTNG_2032     FALSE 0.011 469.000 0.000 0.077   NA
 3695544 3695545 GTNG_2034 GTNG_2035     FALSE 0.032 181.000 0.000 NA   NA
 3695545 3695546 GTNG_2035 GTNG_2036     TRUE 0.749 19.000 0.000 1.000 N NA
 3695546 3695547 GTNG_2036 GTNG_2037     TRUE 0.985 -3.000 0.154 0.042 Y NA
 3695547 3695548 GTNG_2037 GTNG_2038     TRUE 0.980 -3.000 0.219 1.000 Y NA
 3695548 3695549 GTNG_2038 GTNG_2039     TRUE 0.830 9.000 0.219 1.000   NA
 3695549 3695550 GTNG_2039 GTNG_2040     TRUE 0.955 -3.000 0.118 0.001   NA
 3695551 3695552 GTNG_2041 GTNG_2042     TRUE 0.543 26.000 0.000 1.000   NA
 3695552 3695553 GTNG_2042 GTNG_2043     TRUE 0.946 35.000 0.000 0.042 Y NA
 3695556 3695557 GTNG_2046 GTNG_t067     FALSE 0.001 738.000 0.000 NA   NA
 3695557 3695558 GTNG_t067 GTNG_t068     FALSE 0.341 23.000 0.000 NA   NA
 3695558 3695559 GTNG_t068 GTNG_t069     FALSE 0.091 104.000 0.000 NA   NA
 3695559 3695560 GTNG_t069 GTNG_t070     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3695560 3695561 GTNG_t070 GTNG_23s009     FALSE 0.151 66.000 0.000 NA   NA
 3695561 3695562 GTNG_23s009 GTNG_2047     FALSE 0.001 647.000 0.000 NA   NA
 3695564 3695565 GTNG_2049 GTNG_2050     FALSE 0.001 559.000 0.000 NA   NA
 3695565 3695566 GTNG_2050 GTNG_2051     TRUE 0.923 -16.000 0.161 NA   NA
 3695566 3695567 GTNG_2051 GTNG_2052     FALSE 0.001 547.000 0.000 NA   NA
 3695567 3695568 GTNG_2052 GTNG_2053     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3695568 3695569 GTNG_2053 GTNG_2054     FALSE 0.333 0.000 0.000 NA   NA
 3695569 3695570 GTNG_2054 GTNG_2055     FALSE 0.341 23.000 0.000 NA   NA
 3695570 3695571 GTNG_2055 GTNG_2056     FALSE 0.283 3.000 0.000 NA   NA
 3695571 3695572 GTNG_2056 GTNG_2057     FALSE 0.016 219.000 0.000 NA   NA
 3695572 3695573 GTNG_2057 GTNG_2058     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3695573 3695574 GTNG_2058 GTNG_2059     FALSE 0.341 23.000 0.000 NA   NA
 3695574 3695575 GTNG_2059 GTNG_2060     FALSE 0.002 1416.000 0.000 1.000   NA
 3695575 3695576 GTNG_2060 GTNG_2061     FALSE 0.504 1.000 0.000 1.000   NA
 3695576 3695577 GTNG_2061 GTNG_2062     TRUE 0.988 30.000 0.625 1.000 Y NA
 3695577 3695578 GTNG_2062 GTNG_2063   comA FALSE 0.014 398.000 0.000 1.000 N NA
 3695578 3695579 GTNG_2063 GTNG_2064 comA comP TRUE 0.984 26.000 0.222 0.016 Y NA
 3695579 3695580 GTNG_2064 GTNG_2065 comP comQ FALSE 0.166 180.000 0.000 1.000 N NA
 3695581 3695582 GTNG_2066 GTNG_2067     FALSE 0.236 270.000 0.000 0.051 Y NA
 3695584 3695585 GTNG_2069 GTNG_2070     TRUE 0.641 156.000 0.500 NA   NA
 3695587 3695588 GTNG_2072 GTNG_2073 tnpA tnpB FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695589 3695590 GTNG_2074 GTNG_2075     FALSE 0.009 780.000 0.000 0.012   NA
 3695590 3695591 GTNG_2075 GTNG_2076     FALSE 0.002 2719.000 0.000 1.000   NA
 3695591 3695592 GTNG_2076 GTNG_2077     FALSE 0.110 76.000 0.000 NA   NA
 3695592 3695593 GTNG_2077 GTNG_2078     FALSE 0.048 160.000 0.000 NA   NA
 3695593 3695594 GTNG_2078 GTNG_2079     FALSE 0.038 216.000 0.000 1.000   NA
 3695594 3695595 GTNG_2079 GTNG_2080     TRUE 0.535 -13.000 0.000 NA   NA
 3695595 3695596 GTNG_2080 GTNG_16s009     FALSE 0.249 46.000 0.000 NA   NA
 3695597 3695598 GTNG_2081 GTNG_2082   hsp TRUE 0.741 65.000 0.250 NA   NA
 3695599 3695600 GTNG_2083 GTNG_2084     TRUE 0.705 57.000 0.024 1.000 N NA
 3695600 3695601 GTNG_2084 GTNG_2085   galE TRUE 0.914 3.000 0.024 0.001 N NA
 3695601 3695602 GTNG_2085 GTNG_2086 galE galK TRUE 0.994 -3.000 1.000 0.001 N NA
 3695604 3695605 GTNG_2088 GTNG_2089   glpD FALSE 0.484 158.000 0.125 1.000 N NA
 3695605 3695606 GTNG_2089 GTNG_2090 glpD   FALSE 0.178 176.000 0.000 1.000 N NA
 3695606 3695607 GTNG_2090 GTNG_2091     FALSE 0.145 188.000 0.000 1.000 N NA
 3695607 3695608 GTNG_2091 GTNG_2092     TRUE 0.992 -3.000 0.438 0.076 Y NA
 3695608 3695609 GTNG_2092 GTNG_2093     FALSE 0.015 227.000 0.000 NA   NA
 3695610 3695611 GTNG_2094 GTNG_2095     FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 3695611 3695612 GTNG_2095 GTNG_2096     TRUE 0.911 0.000 0.333 NA   NA
 3695612 3695613 GTNG_2096 GTNG_2097     FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 3695613 3695614 GTNG_2097 GTNG_2098     TRUE 0.644 83.000 0.263 NA   NA
 3695615 3695616 GTNG_2099 GTNG_2100     FALSE 0.329 115.000 0.056 NA   NA
 3695617 3695618 GTNG_2101 GTNG_2102 recU   TRUE 0.773 34.000 0.062 1.000   NA
 3695619 3695620 GTNG_2103 GTNG_2104     TRUE 0.830 -22.000 0.034 NA   NA
 3695620 3695621 GTNG_2104 GTNG_2105   dnaD TRUE 0.801 79.000 0.075 NA Y NA
 3695621 3695622 GTNG_2105 GTNG_2106 dnaD asnC TRUE 0.783 69.000 0.234 NA N NA
 3695622 3695623 GTNG_2106 GTNG_2107 asnC   FALSE 0.168 234.000 0.094 1.000 N NA
 3695623 3695624 GTNG_2107 GTNG_2108     TRUE 0.933 22.000 0.367 1.000   NA
 3695624 3695625 GTNG_2108 GTNG_2109     TRUE 0.851 6.000 0.289 NA   NA
 3695625 3695626 GTNG_2109 GTNG_2110     FALSE 0.062 235.000 0.056 NA   NA
 3695626 3695627 GTNG_2110 GTNG_2111     TRUE 0.773 51.000 0.053 1.000 N NA
 3695627 3695628 GTNG_2111 GTNG_2112   panC TRUE 0.968 13.000 0.342 1.000 Y NA
 3695628 3695629 GTNG_2112 GTNG_2113 panC panB TRUE 0.994 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 3695629 3695630 GTNG_2113 GTNG_2114 panB   FALSE 0.205 261.000 0.002 1.000 Y NA
 3695630 3695631 GTNG_2114 GTNG_2115     TRUE 0.960 -42.000 0.134 1.000 N NA
 3695631 3695632 GTNG_2115 GTNG_2116     TRUE 0.930 -3.000 0.126 1.000 N NA
 3695632 3695633 GTNG_2116 GTNG_2117     TRUE 0.906 -3.000 0.210 NA   NA
 3695633 3695634 GTNG_2117 GTNG_2118   mgsA TRUE 0.895 -60.000 0.081 NA   NA
 3695634 3695635 GTNG_2118 GTNG_2119 mgsA   TRUE 0.916 32.000 0.044 0.037 N NA
 3695635 3695636 GTNG_2119 GTNG_2120     TRUE 0.772 -3.000 0.044 NA   NA
 3695638 3695639 GTNG_2122 GTNG_2123     TRUE 0.652 117.000 0.309 NA   NA
 3695639 3695640 GTNG_2123 GTNG_2124     FALSE 0.402 78.000 0.069 NA   NA
 3695640 3695641 GTNG_2124 GTNG_2125     TRUE 0.833 51.000 0.095 0.043   NA
 3695641 3695642 GTNG_2125 GTNG_2126     TRUE 0.951 4.000 0.447 0.043   NA
 3695642 3695643 GTNG_2126 GTNG_2127     TRUE 0.921 44.000 0.540 NA   NA
 3695643 3695644 GTNG_2127 GTNG_2128     TRUE 0.800 86.000 0.583 NA   NA
 3695644 3695645 GTNG_2128 GTNG_2129     TRUE 0.645 57.000 0.104 NA   NA
 3695645 3695646 GTNG_2129 GTNG_2130     FALSE 0.050 284.000 0.002 1.000 N NA
 3695646 3695647 GTNG_2130 GTNG_2131     TRUE 0.925 12.000 0.069 1.000 Y NA
 3695647 3695648 GTNG_2131 GTNG_2132     TRUE 0.814 101.000 0.080 1.000 Y NA
 3695648 3695649 GTNG_2132 GTNG_2133   trpA TRUE 0.918 33.000 0.000 1.000 Y NA
 3695649 3695650 GTNG_2133 GTNG_2134 trpA   TRUE 0.984 -16.000 0.000 0.001 Y NA
 3695650 3695651 GTNG_2134 GTNG_2135     TRUE 0.951 113.000 0.375 0.002 Y NA
 3695651 3695652 GTNG_2135 GTNG_2136   trpC TRUE 0.995 -19.000 0.264 0.002 Y NA
 3695652 3695653 GTNG_2136 GTNG_2137 trpC trpD TRUE 0.986 -7.000 0.216 1.000 Y NA
 3695653 3695654 GTNG_2137 GTNG_2138 trpD   TRUE 0.986 -6.000 0.032 0.001 Y NA
 3695654 3695655 GTNG_2138 GTNG_2139     FALSE 0.279 232.000 0.006 1.000 Y NA
 3695655 3695656 GTNG_2139 GTNG_2140   aroB TRUE 0.964 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 3695656 3695657 GTNG_2140 GTNG_2141 aroB   TRUE 0.974 3.000 0.110 0.002 Y NA
 3695657 3695658 GTNG_2141 GTNG_2142   cheR FALSE 0.488 102.000 0.017 1.000 N NA
 3695658 3695659 GTNG_2142 GTNG_2143 cheR ndk TRUE 0.531 79.000 0.023 1.000 N NA
 3695659 3695660 GTNG_2143 GTNG_2144 ndk   TRUE 0.941 -37.000 0.054 1.000 N NA
 3695660 3695661 GTNG_2144 GTNG_2145   ubiE TRUE 0.980 17.000 0.476 1.000 Y NA
 3695661 3695662 GTNG_2145 GTNG_2146 ubiE   TRUE 0.957 2.000 0.708 1.000   NA
 3695662 3695663 GTNG_2146 GTNG_2147     TRUE 0.836 51.000 0.245 1.000   NA
 3695663 3695664 GTNG_2147 GTNG_2148   folE TRUE 0.766 10.000 0.130 1.000   NA
 3695664 3695665 GTNG_2148 GTNG_2149 folE   TRUE 0.656 110.000 0.154 1.000 N NA
 3695665 3695666 GTNG_2149 GTNG_2150     FALSE 0.001 537.000 0.000 NA   NA
 3695666 3695667 GTNG_2150 GTNG_2151     FALSE 0.048 272.000 0.081 NA   NA
 3695667 3695668 GTNG_2151 GTNG_2152     TRUE 0.937 8.000 0.771 NA   NA
 3695668 3695669 GTNG_2152 GTNG_2153   gpsA FALSE 0.093 183.000 0.021 NA   NA
 3695669 3695670 GTNG_2153 GTNG_2154 gpsA engA FALSE 0.069 257.000 0.068 1.000   NA
 3695670 3695671 GTNG_2154 GTNG_2155 engA   FALSE 0.021 276.000 0.014 NA   NA
 3695671 3695672 GTNG_2155 GTNG_2156     TRUE 0.979 -13.000 0.633 NA   NA
 3695672 3695673 GTNG_2156 GTNG_2157     TRUE 0.964 -3.000 0.567 NA   NA
 3695673 3695674 GTNG_2157 GTNG_2158     FALSE 0.001 852.000 0.000 NA   NA
 3695674 3695675 GTNG_2158 GTNG_2159     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3695675 3695676 GTNG_2159 GTNG_2161   rpsA FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 3695676 3695677 GTNG_2161 GTNG_2162 rpsA   TRUE 0.531 139.000 0.095 1.000 N NA
 3695677 3695678 GTNG_2162 GTNG_2163   cmk TRUE 0.895 -3.000 0.041 1.000 N NA
 3695678 3695679 GTNG_2163 GTNG_2164 cmk   FALSE 0.244 96.000 0.016 NA   NA
 3695679 3695680 GTNG_2164 GTNG_2165     TRUE 0.661 53.000 0.103 NA   NA
 3695680 3695681 GTNG_2165 GTNG_2166     FALSE 0.445 159.000 0.205 1.000   NA
 3695681 3695682 GTNG_2166 GTNG_2167     TRUE 0.914 16.000 0.408 1.000   NA
 3695682 3695683 GTNG_2167 GTNG_2168     FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 3695683 3695684 GTNG_2168 GTNG_2169     FALSE 0.240 85.000 0.014 NA   NA
 3695684 3695685 GTNG_2169 GTNG_2170     TRUE 0.730 71.000 0.138 1.000 N NA
 3695685 3695686 GTNG_2170 GTNG_2171     TRUE 0.744 90.000 0.083 0.036 N NA
 3695686 3695687 GTNG_2171 GTNG_2172     FALSE 0.464 172.000 0.222 NA N NA
 3695687 3695688 GTNG_2172 GTNG_2173     TRUE 0.943 -214.000 0.194 NA   NA
 3695688 3695689 GTNG_2173 GTNG_2174     TRUE 0.689 12.000 0.100 NA   NA
 3695690 3695691 GTNG_2175 GTNG_2176 cotJA cotJB TRUE 0.962 -3.000 0.516 NA   NA
 3695691 3695692 GTNG_2176 GTNG_2177 cotJB cotJC TRUE 0.932 31.000 0.438 NA   NA
 3695693 3695694 GTNG_2178 GTNG_2179     FALSE 0.440 114.000 0.118 NA   NA
 3695694 3695695 GTNG_2179 GTNG_2180     TRUE 0.678 5.000 0.080 NA   NA
 3695695 3695696 GTNG_2180 GTNG_2181   recQ TRUE 0.952 -16.000 0.270 NA   NA
 3695696 3695697 GTNG_2181 GTNG_2182 recQ   TRUE 0.978 -12.000 0.508 1.000   NA
 3695698 3695699 GTNG_2183 GTNG_2184     FALSE 0.020 388.000 0.004 1.000 N NA
 3695700 3695701 GTNG_2185 GTNG_2186     FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 3695701 3695702 GTNG_2186 GTNG_2187     TRUE 0.987 -22.000 0.917 NA   NA
 3695702 3695703 GTNG_2187 GTNG_2188     FALSE 0.402 116.000 0.094 NA   NA
 3695703 3695704 GTNG_2188 GTNG_2189     TRUE 0.976 -7.000 0.639 NA   NA
 3695704 3695705 GTNG_2189 GTNG_2190     TRUE 0.853 -3.000 0.108 NA   NA
 3695705 3695706 GTNG_2190 GTNG_2191     FALSE 0.247 15.000 0.000 NA   NA
 3695706 3695707 GTNG_2191 GTNG_2192   cobC TRUE 0.928 -66.000 0.151 NA   NA
 3695707 3695708 GTNG_2192 GTNG_2193 cobC cobS TRUE 0.930 -42.000 0.028 1.000 N NA
 3695708 3695709 GTNG_2193 GTNG_2194 cobS cobU TRUE 0.971 -3.000 0.092 1.000 Y NA
 3695709 3695710 GTNG_2194 GTNG_2195 cobU   TRUE 0.887 -3.000 0.031 1.000 N NA
 3695710 3695711 GTNG_2195 GTNG_2196     TRUE 0.978 -43.000 0.112 0.009 N NA
 3695711 3695712 GTNG_2196 GTNG_2197     TRUE 0.963 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 3695712 3695713 GTNG_2197 GTNG_2198     TRUE 0.987 -3.000 0.373 1.000 Y NA
 3695713 3695714 GTNG_2198 GTNG_2199     TRUE 0.986 -13.000 0.183 1.000 Y NA
 3695714 3695715 GTNG_2199 GTNG_2200     FALSE 0.001 651.000 0.000 NA   NA
 3695715 3695716 GTNG_2200 GTNG_2201     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 3695716 3695717 GTNG_2201 GTNG_2202     FALSE 0.337 59.000 0.000 1.000   NA
 3695717 3695718 GTNG_2202 GTNG_2203     TRUE 0.643 10.000 0.000 1.000 N NA
 3695718 3695719 GTNG_2203 GTNG_2204     TRUE 0.860 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3695719 3695720 GTNG_2204 GTNG_2205     TRUE 0.993 -19.000 0.139 0.001 Y NA
 3695720 3695721 GTNG_2205 GTNG_2206     TRUE 0.542 101.000 0.042 1.000 N NA
 3695721 3695722 GTNG_2206 GTNG_2207     TRUE 0.993 -3.000 0.511 0.063 Y NA
 3695722 3695723 GTNG_2207 GTNG_2208   resC TRUE 0.697 97.000 0.178 1.000 N NA
 3695723 3695724 GTNG_2208 GTNG_2209 resC resB TRUE 0.989 -13.000 0.278 1.000 Y NA
 3695724 3695725 GTNG_2209 GTNG_2210 resB resA TRUE 0.966 14.000 0.306 1.000 Y NA
 3695725 3695726 GTNG_2210 GTNG_2211 resA   FALSE 0.459 149.000 0.069 1.000 N NA
 3695726 3695727 GTNG_2211 GTNG_2212     FALSE 0.181 185.000 0.063 1.000   NA
 3695727 3695728 GTNG_2212 GTNG_2213     TRUE 0.980 0.000 0.655 0.002   NA
 3695728 3695729 GTNG_2213 GTNG_2214     TRUE 0.951 -7.000 0.252 1.000   NA
 3695729 3695730 GTNG_2214 GTNG_2215     TRUE 0.615 104.000 0.101 1.000 N NA
 3695732 3695733 GTNG_2217 GTNG_2218     FALSE 0.446 47.000 0.006 NA   NA
 3695733 3695734 GTNG_2218 GTNG_2219   scpA FALSE 0.326 232.000 0.570 NA   NA
 3695736 3695737 GTNG_2221 GTNG_2222   ribH FALSE 0.283 121.000 0.008 1.000   NA
 3695737 3695738 GTNG_2222 GTNG_2223 ribH   TRUE 0.970 18.000 0.034 0.002 Y NA
 3695738 3695739 GTNG_2223 GTNG_2224     TRUE 0.941 18.000 0.040 1.000 Y NA
 3695739 3695740 GTNG_2224 GTNG_2225     TRUE 0.984 0.000 0.456 1.000 Y NA
 3695742 3695743 GTNG_2227 GTNG_2228     TRUE 0.569 -46.000 0.000 NA   NA
 3695744 3695745 GTNG_2229 GTNG_2230     TRUE 0.569 -46.000 0.000 NA   NA
 3695746 3695747 GTNG_2231 GTNG_2232   spoVAF FALSE 0.020 320.000 0.015 1.000   NA
 3695747 3695748 GTNG_2232 GTNG_2233 spoVAF   TRUE 0.982 -52.000 0.650 NA   NA
 3695748 3695749 GTNG_2233 GTNG_2234     TRUE 0.658 6.000 0.075 NA   NA
 3695749 3695750 GTNG_2234 GTNG_2235   spoVAD TRUE 0.790 34.000 0.115 NA   NA
 3695750 3695751 GTNG_2235 GTNG_2236 spoVAD   TRUE 0.817 18.000 0.154 NA   NA
 3695751 3695752 GTNG_2236 GTNG_2237     TRUE 0.741 18.000 0.080 NA   NA
 3695752 3695753 GTNG_2237 GTNG_2238     TRUE 0.986 -13.000 0.923 NA   NA
 3695753 3695754 GTNG_2238 GTNG_2239     FALSE 0.098 249.000 0.165 NA   NA
 3695754 3695755 GTNG_2239 GTNG_2240     TRUE 0.965 8.000 0.842 1.000 N NA
 3695755 3695756 GTNG_2240 GTNG_2241     TRUE 0.993 1.000 0.669 0.002 Y NA
 3695756 3695757 GTNG_2241 GTNG_2242     TRUE 0.741 126.000 0.276 1.000 N NA
 3695757 3695758 GTNG_2242 GTNG_2243     FALSE 0.382 155.000 0.035 1.000 N NA
 3695758 3695759 GTNG_2243 GTNG_2244     TRUE 0.955 19.000 0.084 1.000 Y NA
 3695759 3695760 GTNG_2244 GTNG_2245     TRUE 0.959 43.000 0.609 1.000 N NA
 3695760 3695761 GTNG_2245 GTNG_2246   xerD TRUE 0.670 144.000 0.267 1.000 N NA
 3695761 3695762 GTNG_2246 GTNG_2247 xerD   TRUE 0.900 7.000 0.476 NA   NA
 3695762 3695763 GTNG_2247 GTNG_2248     TRUE 0.643 102.000 0.284 NA   NA
 3695763 3695764 GTNG_2248 GTNG_2249     TRUE 0.799 65.000 0.341 NA   NA
 3695764 3695765 GTNG_2249 GTNG_2250     TRUE 0.890 -3.000 0.176 NA   NA
 3695765 3695766 GTNG_2250 GTNG_2251     TRUE 0.795 -3.000 0.058 NA   NA
 3695768 3695769 GTNG_2253 GTNG_2254     TRUE 0.712 16.000 0.095 NA   NA
 3695769 3695770 GTNG_2254 GTNG_2255     FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 3695770 3695771 GTNG_2255 GTNG_2256     TRUE 0.920 -10.000 0.167 NA   NA
 3695772 3695773 GTNG_2257 GTNG_2258     FALSE 0.500 65.000 0.062 NA   NA
 3695774 3695775 GTNG_2259 GTNG_2260     TRUE 0.940 -9.000 0.188 1.000   NA
 3695776 3695777 GTNG_2261 GTNG_2262     TRUE 0.564 139.000 0.128 1.000 N NA
 3695779 3695780 GTNG_2264 GTNG_2265 zwf   FALSE 0.388 118.000 0.084 NA   NA
 3695781 3695782 GTNG_2266 GTNG_2267     FALSE 0.095 216.000 0.000 1.000 N NA
 3695782 3695783 GTNG_2267 GTNG_2268     TRUE 0.901 16.000 0.222 1.000 N NA
 3695783 3695784 GTNG_2268 GTNG_2269     TRUE 0.624 5.000 0.022 1.000   NA
 3695784 3695785 GTNG_2269 GTNG_2270     FALSE 0.368 78.000 0.022 1.000   NA
 3695785 3695786 GTNG_2270 GTNG_2271     TRUE 0.920 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3695786 3695787 GTNG_2271 GTNG_2272     TRUE 0.979 30.000 0.333 1.000 Y NA
 3695787 3695788 GTNG_2272 GTNG_2273     FALSE 0.002 479.000 0.000 NA   NA
 3695788 3695789 GTNG_2273 GTNG_2274     FALSE 0.010 252.000 0.000 NA   NA
 3695789 3695790 GTNG_2274 GTNG_2275   aspA FALSE 0.489 69.000 0.000 1.000 N NA
 3695790 3695791 GTNG_2275 GTNG_2276 aspA   TRUE 0.924 28.000 0.000 1.000 Y NA
 3695791 3695792 GTNG_2276 GTNG_2277     FALSE 0.224 163.000 0.000 1.000 N NA
 3695792 3695793 GTNG_2277 GTNG_2278     FALSE 0.343 28.000 0.000 NA   NA
 3695793 3695794 GTNG_2278 GTNG_2279     FALSE 0.016 221.000 0.000 NA   NA
 3695794 3695795 GTNG_2279 GTNG_2280     TRUE 0.988 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 3695795 3695796 GTNG_2280 GTNG_2281     TRUE 0.995 0.000 0.842 0.006 Y NA
 3695796 3695797 GTNG_2281 GTNG_2282     TRUE 0.960 116.000 0.611 0.041 Y NA
 3695798 3695799 GTNG_2283 GTNG_2284     TRUE 0.756 29.000 0.000 1.000 N NA
 3695799 3695800 GTNG_2284 GTNG_2285     TRUE 0.986 17.000 0.373 0.011 Y NA
 3695800 3695801 GTNG_2285 GTNG_2286     FALSE 0.205 80.000 0.000 1.000   NA
 3695802 3695803 GTNG_2287 GTNG_2288     FALSE 0.388 98.000 0.000 1.000 N NA
 3695803 3695804 GTNG_2288 GTNG_2289   gntZ FALSE 0.026 322.000 0.000 1.000 N NA
 3695804 3695805 GTNG_2289 GTNG_2290 gntZ   FALSE 0.012 415.000 0.000 1.000 N NA
 3695805 3695806 GTNG_2290 GTNG_2291     TRUE 0.552 114.000 0.062 1.000 N NA
 3695806 3695807 GTNG_2291 GTNG_2292     FALSE 0.061 315.000 0.074 1.000 N NA
 3695807 3695808 GTNG_2292 GTNG_2293     TRUE 0.882 -3.000 0.108 1.000   NA
 3695810 3695811 GTNG_2295 GTNG_2296     TRUE 0.654 76.000 0.250 NA   NA
 3695811 3695812 GTNG_2296 GTNG_2297     FALSE 0.008 681.000 0.097 NA   NA
 3695812 3695813 GTNG_2297 GTNG_2298     TRUE 0.639 25.000 0.023 NA   NA
 3695813 3695814 GTNG_2298 GTNG_2299     TRUE 0.962 -3.000 0.366 NA N NA
 3695814 3695815 GTNG_2299 GTNG_2300     TRUE 0.977 11.000 0.220 0.001 Y NA
 3695815 3695816 GTNG_2300 GTNG_2301     FALSE 0.169 63.000 0.000 NA   NA
 3695816 3695817 GTNG_2301 GTNG_2302     FALSE 0.002 413.000 0.000 NA   NA
 3695817 3695818 GTNG_2302 GTNG_2303     TRUE 0.952 4.000 0.154 1.000 Y NA
 3695818 3695819 GTNG_2303 GTNG_2304     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695819 3695820 GTNG_2304 GTNG_2305     FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 3695820 3695821 GTNG_2305 GTNG_2306     TRUE 0.880 199.000 0.882 0.063 Y NA
 3695821 3695822 GTNG_2306 GTNG_2307     TRUE 0.991 15.000 0.897 0.063 Y NA
 3695822 3695823 GTNG_2307 GTNG_2308     TRUE 0.923 86.000 0.414 1.000 Y NA
 3695823 3695824 GTNG_2308 GTNG_2309   buk TRUE 0.979 31.000 0.172 0.036 Y NA
 3695824 3695825 GTNG_2309 GTNG_2310 buk   TRUE 0.926 57.000 0.490 1.000 N NA
 3695825 3695826 GTNG_2310 GTNG_2311     TRUE 0.959 20.000 0.431 1.000 N NA
 3695826 3695827 GTNG_2311 GTNG_2312     TRUE 0.726 140.000 0.333 1.000 N NA
 3695830 3695831 GTNG_2315 GTNG_2316     FALSE 0.049 159.000 0.000 NA   NA
 3695832 3695833 GTNG_2317 GTNG_2318     FALSE 0.207 292.000 0.393 1.000 N NA
 3695833 3695834 GTNG_2318 GTNG_2319     FALSE 0.173 227.000 0.079 1.000 N NA
 3695834 3695835 GTNG_2319 GTNG_2320     FALSE 0.457 143.000 0.056 1.000 N NA
 3695835 3695836 GTNG_2320 GTNG_2321     TRUE 0.587 84.000 0.064 1.000 N NA
 3695836 3695837 GTNG_2321 GTNG_2322     TRUE 0.879 6.000 0.189 1.000 N NA
 3695837 3695838 GTNG_2322 GTNG_2323     FALSE 0.218 265.000 0.024 1.000 Y NA
 3695838 3695839 GTNG_2323 GTNG_2324     TRUE 0.851 4.000 0.100 1.000 N NA
 3695839 3695840 GTNG_2324 GTNG_2325     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695840 3695841 GTNG_2325 GTNG_2327     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3695841 3695842 GTNG_2327 GTNG_2328   nusB TRUE 0.572 91.000 0.056 1.000 N NA
 3695842 3695843 GTNG_2328 GTNG_2329 nusB   FALSE 0.068 201.000 0.023 NA   NA
 3695843 3695844 GTNG_2329 GTNG_2330   accC TRUE 0.875 11.000 0.373 NA   NA
 3695844 3695845 GTNG_2330 GTNG_2331 accC accB TRUE 0.970 16.000 0.086 0.001 Y NA
 3695845 3695846 GTNG_2331 GTNG_2332 accB spoIIIAH FALSE 0.170 147.000 0.020 NA   NA
 3695846 3695847 GTNG_2332 GTNG_2333 spoIIIAH spoIIIAG TRUE 0.945 24.000 0.509 NA   NA
 3695847 3695848 GTNG_2333 GTNG_2334 spoIIIAG spoIIIAF TRUE 0.951 6.000 0.907 NA   NA
 3695848 3695849 GTNG_2334 GTNG_2335 spoIIIAF spoIIIAE TRUE 0.948 11.000 0.918 NA   NA
 3695849 3695850 GTNG_2335 GTNG_2336 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.947 13.000 0.864 NA   NA
 3695850 3695851 GTNG_2336 GTNG_2337 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.947 8.000 0.895 NA   NA
 3695851 3695852 GTNG_2337 GTNG_2338 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.966 18.000 0.926 NA   NA
 3695852 3695853 GTNG_2338 GTNG_2339 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.967 -3.000 0.604 NA   NA
 3695853 3695854 GTNG_2339 GTNG_2340 spoIIIAA   TRUE 0.664 62.000 0.148 NA   NA
 3695854 3695855 GTNG_2340 GTNG_2341     FALSE 0.059 197.000 0.009 NA   NA
 3695855 3695856 GTNG_2341 GTNG_2342     TRUE 0.912 29.000 0.160 1.000 N NA
 3695856 3695857 GTNG_2342 GTNG_2343     FALSE 0.024 258.000 0.007 NA   NA
 3695858 3695859 GTNG_2344 GTNG_2345     TRUE 0.745 14.000 0.140 NA   NA
 3695860 3695861 GTNG_2346 GTNG_2347     FALSE 0.505 90.000 0.101 1.000   NA
 3695861 3695862 GTNG_2347 GTNG_2348     TRUE 0.569 133.000 0.110 1.000 N NA
 3695862 3695863 GTNG_2348 GTNG_2349     FALSE 0.351 103.000 0.027 1.000   NA
 3695863 3695864 GTNG_2349 GTNG_2350     FALSE 0.344 27.000 0.000 NA   NA
 3695866 3695867 GTNG_2352 GTNG_2353     FALSE 0.036 175.000 0.000 NA   NA
 3695867 3695868 GTNG_2353 GTNG_2354     TRUE 0.874 0.000 0.226 NA   NA
 3695868 3695869 GTNG_2354 GTNG_2355     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 3695869 3695870 GTNG_2355 GTNG_2356     FALSE 0.097 91.000 0.000 NA   NA
 3695870 3695871 GTNG_2356 GTNG_2357     FALSE 0.088 114.000 0.000 NA   NA
 3695871 3695872 GTNG_2357 GTNG_2358     FALSE 0.010 257.000 0.000 NA   NA
 3695874 3695875 GTNG_2360 GTNG_2361     TRUE 0.648 12.000 0.000 1.000 N NA
 3695875 3695876 GTNG_2361 GTNG_2362     FALSE 0.497 68.000 0.000 1.000 N NA
 3695876 3695877 GTNG_2362 GTNG_2363     TRUE 0.995 -7.000 0.316 0.001 Y NA
 3695877 3695878 GTNG_2363 GTNG_2364   gcvT TRUE 0.980 20.000 0.092 0.001 Y NA
 3695879 3695880 GTNG_2365 GTNG_2366     TRUE 0.931 -13.000 0.190 NA   NA
 3695881 3695882 GTNG_2367 GTNG_2368     TRUE 0.656 43.000 0.062 NA   NA
 3695882 3695883 GTNG_2368 GTNG_2369     FALSE 0.241 134.000 0.036 NA   NA
 3695883 3695884 GTNG_2369 GTNG_2370     TRUE 0.912 -63.000 0.107 NA   NA
 3695884 3695885 GTNG_2370 GTNG_2371     TRUE 0.896 -16.000 0.100 NA   NA
 3695885 3695886 GTNG_2371 GTNG_2372     TRUE 0.970 -10.000 0.040 NA Y NA
 3695886 3695887 GTNG_2372 GTNG_2373     TRUE 0.969 68.000 0.861 NA Y NA
 3695887 3695888 GTNG_2373 GTNG_2374     TRUE 0.992 -3.000 0.639 1.000 Y NA
 3695889 3695890 GTNG_2375 GTNG_2376     TRUE 0.558 164.000 0.432 NA   NA
 3695891 3695892 GTNG_2377 GTNG_2378     FALSE 0.042 232.000 0.021 NA   NA
 3695894 3695895 GTNG_2380 GTNG_2381     TRUE 0.521 104.000 0.036 1.000 N NA
 3695895 3695896 GTNG_2381 GTNG_2382     TRUE 0.901 8.000 0.496 NA   NA
 3695896 3695897 GTNG_2382 GTNG_2383     FALSE 0.352 99.000 0.058 NA   NA
 3695899 3695900 GTNG_2385 GTNG_2386     FALSE 0.405 9.000 0.000 1.000   NA
 3695900 3695901 GTNG_2386 GTNG_2387     FALSE 0.231 8.000 0.000 NA   NA
 3695901 3695902 GTNG_2387 GTNG_2388     TRUE 0.530 4.000 0.018 NA   NA
 3695902 3695903 GTNG_2388 GTNG_2389     TRUE 0.755 -10.000 0.012 NA   NA
 3695903 3695904 GTNG_2389 GTNG_2390   rpmGA TRUE 0.738 57.000 0.045 1.000 N NA
 3695905 3695906 GTNG_2391 GTNG_2392     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695907 3695908 GTNG_2393 GTNG_2394 phoU   TRUE 0.956 24.000 0.118 NA Y NA
 3695908 3695909 GTNG_2394 GTNG_2395     TRUE 0.976 39.000 0.125 0.002 Y NA
 3695909 3695910 GTNG_2395 GTNG_2396     TRUE 0.989 4.000 0.485 0.002 Y NA
 3695910 3695911 GTNG_2396 GTNG_2397     TRUE 0.818 86.000 0.077 1.000 Y NA
 3695911 3695912 GTNG_2397 GTNG_2398     FALSE 0.073 234.000 0.000 1.000 N NA
 3695912 3695913 GTNG_2398 GTNG_2399     FALSE 0.493 78.000 0.078 1.000   NA
 3695913 3695914 GTNG_2399 GTNG_2400     TRUE 0.651 121.000 0.255 1.000   NA
 3695915 3695916 GTNG_2401 GTNG_2402     FALSE 0.003 355.000 0.000 NA   NA
 3695916 3695917 GTNG_2402 GTNG_2403   ispG FALSE 0.200 84.000 0.000 1.000   NA
 3695920 3695921 GTNG_2406 GTNG_2407   znuB TRUE 0.980 3.000 0.480 1.000 Y NA
 3695921 3695922 GTNG_2407 GTNG_2408 znuB znuC TRUE 0.983 41.000 0.389 0.087 Y NA
 3695922 3695923 GTNG_2408 GTNG_2409 znuC   TRUE 0.752 83.000 0.440 NA   NA
 3695925 3695926 GTNG_2411 GTNG_2412     TRUE 0.951 38.000 0.104 1.000 Y NA
 3695927 3695928 GTNG_2413 GTNG_2414   ispH TRUE 0.579 107.000 0.231 NA   NA
 3695929 3695930 GTNG_2415 GTNG_2416     TRUE 0.870 -3.000 0.138 NA   NA
 3695930 3695931 GTNG_2416 GTNG_2417     FALSE 0.301 130.000 0.057 NA   NA
 3695931 3695932 GTNG_2417 GTNG_2418     FALSE 0.088 109.000 0.000 NA   NA
 3695932 3695933 GTNG_2418 GTNG_2419   rpoD FALSE 0.427 70.000 0.053 NA   NA
 3695933 3695934 GTNG_2419 GTNG_2420 rpoD dnaG TRUE 0.917 35.000 0.209 1.000 N NA
 3695934 3695935 GTNG_2420 GTNG_2421 dnaG   FALSE 0.003 781.000 0.011 NA   NA
 3695935 3695936 GTNG_2421 GTNG_2422     TRUE 0.953 20.000 0.621 NA   NA
 3695936 3695937 GTNG_2422 GTNG_2423   recO FALSE 0.299 114.000 0.013 1.000   NA
 3695937 3695938 GTNG_2423 GTNG_2424 recO   TRUE 0.612 32.000 0.020 NA   NA
 3695938 3695939 GTNG_2424 GTNG_2425     FALSE 0.376 72.000 0.040 NA   NA
 3695939 3695940 GTNG_2425 GTNG_2426   cdd TRUE 0.905 -7.000 0.098 1.000   NA
 3695940 3695941 GTNG_2426 GTNG_2427 cdd   TRUE 0.673 123.000 0.179 1.000 N NA
 3695941 3695942 GTNG_2427 GTNG_2428     TRUE 0.766 3.000 0.123 NA   NA
 3695942 3695943 GTNG_2428 GTNG_2429     TRUE 0.894 -3.000 0.182 NA   NA
 3695943 3695944 GTNG_2429 GTNG_2430     TRUE 0.789 51.000 0.172 1.000   NA
 3695944 3695945 GTNG_2430 GTNG_2431     TRUE 0.759 3.000 0.114 NA   NA
 3695945 3695946 GTNG_2431 GTNG_2432     TRUE 0.977 -3.000 0.851 NA   NA
 3695946 3695947 GTNG_2432 GTNG_2433     FALSE 0.274 104.000 0.029 NA   NA
 3695949 3695950 GTNG_2435 GTNG_2436     FALSE 0.109 229.000 0.010 1.000 N NA
 3695950 3695951 GTNG_2436 GTNG_2437     TRUE 0.539 79.000 0.163 NA   NA
 3695951 3695952 GTNG_2437 GTNG_2438   prmA TRUE 0.874 19.000 0.227 NA   NA
 3695952 3695953 GTNG_2438 GTNG_2439 prmA dnaJ TRUE 0.852 6.000 0.133 1.000 N NA
 3695953 3695954 GTNG_2439 GTNG_2440 dnaJ dnaK TRUE 0.916 128.000 0.196 0.002 Y NA
 3695954 3695955 GTNG_2440 GTNG_2441 dnaK grpE TRUE 0.985 23.000 0.224 0.005 Y NA
 3695955 3695956 GTNG_2441 GTNG_2442 grpE hrcA TRUE 0.773 96.000 0.286 1.000 N NA
 3695956 3695957 GTNG_2442 GTNG_2443 hrcA   TRUE 0.585 117.000 0.082 1.000 N NA
 3695957 3695958 GTNG_2443 GTNG_2444   lepA FALSE 0.504 114.000 0.032 1.000 N NA
 3695958 3695959 GTNG_2444 GTNG_2445 lepA   FALSE 0.135 152.000 0.008 NA   NA
 3695959 3695960 GTNG_2445 GTNG_2446     TRUE 0.863 14.000 0.318 NA   NA
 3695960 3695961 GTNG_2446 GTNG_2447     TRUE 0.545 75.000 0.147 NA   NA
 3695965 3695966 GTNG_2451 GTNG_2452 comEC comEB TRUE 0.837 -3.000 0.055 1.000   NA
 3695966 3695967 GTNG_2452 GTNG_2453 comEB comEA TRUE 0.616 101.000 0.095 1.000 N NA
 3695969 3695970 GTNG_2455 GTNG_2456     TRUE 0.831 -3.000 0.085 NA   NA
 3695970 3695971 GTNG_2456 GTNG_2457     TRUE 0.876 -3.000 0.149 NA   NA
 3695971 3695972 GTNG_2457 GTNG_2458   nadD TRUE 0.989 -91.000 0.199 1.000 Y NA
 3695972 3695973 GTNG_2458 GTNG_2459 nadD   TRUE 0.862 40.000 0.150 NA N NA
 3695973 3695974 GTNG_2459 GTNG_2460   aroE TRUE 0.815 4.000 0.089 NA N NA
 3695974 3695975 GTNG_2460 GTNG_2461 aroE   TRUE 0.929 22.000 0.336 1.000   NA
 3695975 3695976 GTNG_2461 GTNG_2462     TRUE 0.968 -3.000 0.555 1.000   NA
 3695979 3695980 GTNG_2465 GTNG_2466     FALSE 0.384 171.000 0.007 0.073 N NA
 3695980 3695981 GTNG_2466 GTNG_2467   motB TRUE 0.987 -7.000 0.257 1.000 Y NA
 3695982 3695983 GTNG_2468 GTNG_2469     FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 3695983 3695984 GTNG_2469 GTNG_2470     FALSE 0.010 447.000 0.000 1.000 N NA
 3695986 3695987 GTNG_2472 GTNG_2473     TRUE 0.603 56.000 0.076 NA   NA
 3695987 3695988 GTNG_2473 GTNG_2474     TRUE 0.996 -3.000 0.690 0.014 Y NA
 3695988 3695989 GTNG_2474 GTNG_2475     TRUE 0.717 61.000 0.048 1.000 N NA
 3695989 3695990 GTNG_2475 GTNG_2476     TRUE 0.804 15.000 0.057 1.000 N NA
 3695992 3695993 GTNG_2478 GTNG_2479     TRUE 0.717 63.000 0.203 NA   NA
 3695993 3695994 GTNG_2479 GTNG_2480   greA FALSE 0.495 139.000 0.070 1.000 N NA
 3695994 3695995 GTNG_2480 GTNG_2481 greA udk TRUE 0.598 108.000 0.095 1.000 N NA
 3695995 3695996 GTNG_2481 GTNG_2482 udk   TRUE 0.870 2.000 0.100 1.000 N NA
 3695996 3695997 GTNG_2482 GTNG_2483     TRUE 0.979 18.000 0.156 0.004 Y NA
 3695997 3695998 GTNG_2483 GTNG_2484     TRUE 0.897 -3.000 0.142 1.000   NA
 3695998 3695999 GTNG_2484 GTNG_2485     FALSE 0.160 205.000 0.154 NA   NA
 3695999 3696000 GTNG_2485 GTNG_2486     FALSE 0.038 329.000 0.151 NA   NA
 3696000 3696001 GTNG_2486 GTNG_2487     TRUE 0.969 -3.000 0.651 NA   NA
 3696001 3696002 GTNG_2487 GTNG_2488     TRUE 0.925 4.000 0.537 NA   NA
 3696002 3696003 GTNG_2488 GTNG_2489   alaS TRUE 0.752 40.000 0.110 NA   NA
 3696005 3696006 GTNG_2491 GTNG_2492     FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 3696006 3696007 GTNG_2492 GTNG_2493     TRUE 0.861 16.000 0.286 NA   NA
 3696007 3696008 GTNG_2493 GTNG_2494     TRUE 0.902 -61.000 0.091 NA   NA
 3696008 3696009 GTNG_2494 GTNG_2495     TRUE 0.907 18.000 0.174 1.000 N NA
 3696009 3696010 GTNG_2495 GTNG_2496     FALSE 0.485 103.000 0.017 1.000 N NA
 3696010 3696011 GTNG_2496 GTNG_2497     TRUE 0.815 14.000 0.072 1.000 N NA
 3696011 3696012 GTNG_2497 GTNG_2498     TRUE 0.911 23.000 0.201 NA N NA
 3696012 3696013 GTNG_2498 GTNG_2499     TRUE 0.807 -3.000 0.067 NA   NA
 3696013 3696014 GTNG_2499 GTNG_2500     FALSE 0.491 65.000 0.059 NA   NA
 3696016 3696017 GTNG_2502 GTNG_2503     FALSE 0.019 403.000 0.008 1.000 N NA
 3696017 3696018 GTNG_2503 GTNG_2504   hisS FALSE 0.155 415.000 0.161 0.035 Y NA
 3696018 3696019 GTNG_2504 GTNG_2505 hisS   FALSE 0.012 422.000 0.000 1.000 N NA
 3696019 3696020 GTNG_2505 GTNG_2506     TRUE 0.979 15.000 0.551 1.000 Y NA
 3696020 3696021 GTNG_2506 GTNG_2507     FALSE 0.003 358.000 0.000 NA   NA
 3696021 3696022 GTNG_2507 GTNG_2508     FALSE 0.220 79.000 0.005 NA   NA
 3696022 3696023 GTNG_2508 GTNG_2509     TRUE 0.918 23.000 0.177 1.000 N NA
 3696023 3696024 GTNG_2509 GTNG_2510   apt FALSE 0.461 147.000 0.068 1.000 N NA
 3696024 3696025 GTNG_2510 GTNG_2511 apt   TRUE 0.899 0.000 0.128 1.000 N NA
 3696025 3696026 GTNG_2511 GTNG_2512     TRUE 0.677 58.000 0.015 1.000 N NA
 3696026 3696027 GTNG_2512 GTNG_2513     TRUE 0.602 140.000 0.060 0.073 N NA
 3696027 3696028 GTNG_2513 GTNG_2514     TRUE 0.525 120.000 0.185 NA   NA
 3696029 3696030 GTNG_2515 GTNG_2516     FALSE 0.416 68.000 0.040 NA   NA
 3696031 3696032 GTNG_2517 GTNG_2518 yajC tgt TRUE 0.941 24.000 0.325 NA N NA
 3696032 3696033 GTNG_2518 GTNG_2519 tgt queA TRUE 0.989 18.000 0.360 0.001 Y NA
 3696033 3696034 GTNG_2519 GTNG_2520 queA   TRUE 0.598 16.000 0.039 NA   NA
 3696034 3696035 GTNG_2520 GTNG_2521   ruvB TRUE 0.763 -3.000 0.040 NA   NA
 3696035 3696036 GTNG_2521 GTNG_2522 ruvB ruvA TRUE 0.991 38.000 0.549 0.002 Y NA
 3696036 3696037 GTNG_2522 GTNG_2523 ruvA   FALSE 0.218 101.000 0.010 NA   NA
 3696037 3696038 GTNG_2523 GTNG_2524     FALSE 0.016 280.000 0.005 NA   NA
 3696038 3696039 GTNG_2524 GTNG_2525     FALSE 0.176 131.000 0.008 NA   NA
 3696039 3696040 GTNG_2525 GTNG_2526     FALSE 0.195 117.000 0.006 NA   NA
 3696040 3696041 GTNG_2526 GTNG_2527     FALSE 0.303 36.000 0.000 NA   NA
 3696041 3696042 GTNG_2527 GTNG_2528     TRUE 0.544 -16.000 0.000 NA   NA
 3696042 3696043 GTNG_2528 GTNG_2529     FALSE 0.019 270.000 0.004 NA   NA
 3696043 3696044 GTNG_2529 GTNG_2530     TRUE 0.975 15.000 0.198 0.003 Y NA
 3696044 3696045 GTNG_2530 GTNG_2531     TRUE 0.967 33.000 0.014 0.003 Y NA
 3696046 3696047 GTNG_2532 GTNG_2533     TRUE 0.953 -12.000 0.243 1.000   NA
 3696048 3696049 GTNG_2534 GTNG_2535     TRUE 0.899 22.000 0.054 0.005   NA
 3696049 3696050 GTNG_2535 GTNG_2536   obgE FALSE 0.472 66.000 0.024 1.000   NA
 3696050 3696051 GTNG_2536 GTNG_2537 obgE   FALSE 0.256 95.000 0.021 NA   NA
 3696051 3696052 GTNG_2537 GTNG_2538   rpmA FALSE 0.091 178.000 0.013 NA   NA
 3696052 3696053 GTNG_2538 GTNG_2539 rpmA   TRUE 0.944 7.000 0.203 NA Y NA
 3696053 3696054 GTNG_2539 GTNG_2540     TRUE 0.953 4.000 0.208 NA Y NA
 3696054 3696055 GTNG_2540 GTNG_2541     FALSE 0.041 247.000 0.004 1.000   NA
 3696055 3696056 GTNG_2541 GTNG_2542     TRUE 0.947 23.000 0.219 0.004   NA
 3696056 3696057 GTNG_2542 GTNG_2543   minD FALSE 0.023 435.000 0.060 1.000 N NA
 3696057 3696058 GTNG_2543 GTNG_2544 minD minC TRUE 0.975 3.000 0.368 1.000 Y NA
 3696058 3696059 GTNG_2544 GTNG_2545 minC mreD TRUE 0.826 50.000 0.106 1.000 N NA
 3696059 3696060 GTNG_2545 GTNG_2546 mreD mreC TRUE 0.995 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 3696060 3696061 GTNG_2546 GTNG_2547 mreC mreB TRUE 0.974 21.000 0.689 1.000 N NA
 3696061 3696062 GTNG_2547 GTNG_2548 mreB radC FALSE 0.305 158.000 0.005 1.000 N NA
 3696062 3696063 GTNG_2548 GTNG_2549 radC maf FALSE 0.388 116.000 0.009 NA N NA
 3696063 3696064 GTNG_2549 GTNG_2550 maf spoIIB FALSE 0.205 118.000 0.009 NA   NA
 3696064 3696065 GTNG_2550 GTNG_2551 spoIIB   FALSE 0.333 0.000 0.000 NA   NA
 3696065 3696066 GTNG_2551 GTNG_2552     TRUE 0.833 22.000 0.154 NA   NA
 3696066 3696067 GTNG_2552 GTNG_2553     TRUE 0.977 -3.000 0.846 NA   NA
 3696067 3696068 GTNG_2553 GTNG_2554     TRUE 0.930 -10.000 0.196 NA   NA
 3696068 3696069 GTNG_2554 GTNG_2555   comC TRUE 0.939 26.000 0.038 NA Y NA
 3696069 3696070 GTNG_2555 GTNG_2556 comC   TRUE 0.877 9.000 0.005 NA Y NA
 3696070 3696071 GTNG_2556 GTNG_2557   pilC TRUE 0.755 84.000 0.031 NA Y NA
 3696071 3696072 GTNG_2557 GTNG_2558 pilC pilT TRUE 0.993 -13.000 0.493 1.000 Y NA
 3696072 3696073 GTNG_2558 GTNG_2559 pilT pilB TRUE 0.974 13.000 0.225 0.012 Y NA
 3696073 3696074 GTNG_2559 GTNG_2560 pilB   TRUE 0.965 -3.000 0.500 1.000   NA
 3696074 3696075 GTNG_2560 GTNG_2561     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 3696076 3696077 GTNG_2562 GTNG_2563     TRUE 0.978 -16.000 0.583 NA   NA
 3696077 3696078 GTNG_2563 GTNG_2564     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3696079 3696080 GTNG_2565 GTNG_2566     TRUE 0.558 59.000 0.068 NA   NA
 3696080 3696081 GTNG_2566 GTNG_2567   valS TRUE 0.607 131.000 0.041 0.086 N NA
 3696083 3696084 GTNG_2569 GTNG_2570     TRUE 0.916 44.000 0.500 NA   NA
 3696084 3696085 GTNG_2570 GTNG_2571   hemL TRUE 0.759 119.000 0.288 1.000 N NA
 3696085 3696086 GTNG_2571 GTNG_2572 hemL hemB TRUE 0.972 16.000 0.126 0.002 Y NA
 3696086 3696087 GTNG_2572 GTNG_2573 hemB hemD TRUE 0.972 1.000 0.061 0.002 Y NA
 3696087 3696088 GTNG_2573 GTNG_2574 hemD hemC TRUE 0.971 0.000 0.028 0.002 Y NA
 3696088 3696089 GTNG_2574 GTNG_2575 hemC hemX TRUE 0.797 16.000 0.040 1.000 N NA
 3696089 3696090 GTNG_2575 GTNG_2576 hemX hemA TRUE 0.952 11.000 0.613 1.000 N NA
 3696092 3696093 GTNG_2578 GTNG_2579   lonA TRUE 0.838 -3.000 0.055 1.000   NA
 3696093 3696094 GTNG_2579 GTNG_2580 lonA lonB TRUE 0.656 270.000 0.435 0.001 Y NA
 3696094 3696095 GTNG_2580 GTNG_2581 lonB clpX TRUE 0.838 141.000 0.042 0.002 Y NA
 3696095 3696096 GTNG_2581 GTNG_2582 clpX tig FALSE 0.484 230.000 0.033 0.003 Y NA
 3696096 3696097 GTNG_2582 GTNG_2583 tig   FALSE 0.266 130.000 0.011 1.000   NA
 3696097 3696098 GTNG_2583 GTNG_2584   leuD FALSE 0.032 356.000 0.111 1.000   NA
 3696098 3696099 GTNG_2584 GTNG_2585 leuD   TRUE 0.914 89.000 0.103 0.001 Y NA
 3696099 3696100 GTNG_2585 GTNG_2586     TRUE 0.989 -7.000 0.076 0.001 Y NA
 3696100 3696101 GTNG_2586 GTNG_2587     TRUE 0.968 17.000 0.033 0.001 Y NA
 3696101 3696102 GTNG_2587 GTNG_2588     TRUE 0.981 -13.000 0.103 1.000 Y NA
 3696102 3696103 GTNG_2588 GTNG_2589   ilvH TRUE 0.980 34.000 0.130 0.001 Y NA
 3696103 3696104 GTNG_2589 GTNG_2590 ilvH   TRUE 0.995 -21.000 0.249 0.001 Y NA
 3696104 3696105 GTNG_2590 GTNG_2591     FALSE 0.067 362.000 0.000 1.000 Y NA
 3696105 3696106 GTNG_2591 GTNG_2592     FALSE 0.015 283.000 0.000 1.000   NA
 3696106 3696107 GTNG_2592 GTNG_2593     TRUE 0.960 -39.000 0.085 0.017   NA
 3696107 3696108 GTNG_2593 GTNG_2594   rph TRUE 0.958 -3.000 0.262 1.000 N NA
 3696108 3696109 GTNG_2594 GTNG_2595 rph gerM FALSE 0.058 229.000 0.040 NA   NA
 3696109 3696110 GTNG_2595 GTNG_2596 gerM   FALSE 0.259 106.000 0.026 NA   NA
 3696110 3696111 GTNG_2596 GTNG_2597     FALSE 0.271 175.000 0.024 1.000 N NA
 3696111 3696112 GTNG_2597 GTNG_2598   gerE TRUE 0.595 214.000 0.138 0.039 Y NA
 3696112 3696113 GTNG_2598 GTNG_2599 gerE sdhB FALSE 0.054 260.000 0.000 1.000 N NA
 3696113 3696114 GTNG_2599 GTNG_2600 sdhB sdhA TRUE 0.984 2.000 0.231 0.001 Y NA
 3696114 3696115 GTNG_2600 GTNG_2601 sdhA   TRUE 0.847 167.000 0.184 0.001 Y NA
 3696116 3696117 GTNG_2602 GTNG_2603     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3696118 3696119 GTNG_2604 GTNG_2605 uvrC   FALSE 0.002 404.000 0.000 NA   NA
 3696119 3696120 GTNG_2605 GTNG_2606     FALSE 0.002 394.000 0.000 NA   NA
 3696120 3696121 GTNG_2606 GTNG_2607     TRUE 0.692 40.000 0.036 1.000   NA
 3696121 3696122 GTNG_2607 GTNG_2608     TRUE 0.540 23.000 0.000 1.000   NA
 3696122 3696123 GTNG_2608 GTNG_2609     TRUE 0.894 4.000 0.000 1.000 Y NA
 3696123 3696124 GTNG_2609 GTNG_2610     TRUE 0.976 35.000 0.321 1.000 Y NA
 3696124 3696125 GTNG_2610 GTNG_2611     FALSE 0.200 287.000 0.000 0.040 Y NA
 3696125 3696126 GTNG_2611 GTNG_2612     FALSE 0.038 284.000 0.000 1.000 N NA
 3696126 3696127 GTNG_2612 GTNG_2613     TRUE 0.782 158.000 0.055 0.010 Y NA
 3696127 3696128 GTNG_2613 GTNG_2614     TRUE 0.957 75.000 0.373 0.010 Y NA
 3696128 3696129 GTNG_2614 GTNG_2615     TRUE 0.847 66.000 0.275 1.000 N NA
 3696129 3696130 GTNG_2615 GTNG_2616     TRUE 0.945 27.000 0.294 1.000 N NA
 3696130 3696131 GTNG_2616 GTNG_2617     TRUE 0.883 67.000 0.406 1.000 N NA
 3696131 3696132 GTNG_2617 GTNG_2618     FALSE 0.461 82.000 0.107 NA   NA
 3696132 3696133 GTNG_2618 GTNG_2619     TRUE 0.738 16.000 0.115 NA   NA
 3696133 3696134 GTNG_2619 GTNG_2620   mutSB TRUE 0.641 15.000 0.065 NA   NA
 3696134 3696135 GTNG_2620 GTNG_2621 mutSB   TRUE 0.961 23.000 0.114 1.000 Y NA
 3696135 3696136 GTNG_2621 GTNG_2622     TRUE 0.725 43.000 0.066 1.000   NA
 3696136 3696137 GTNG_2622 GTNG_2623     TRUE 0.875 -7.000 0.091 NA   NA
 3696138 3696139 GTNG_2624 GTNG_2625 rnhC   FALSE 0.003 374.000 0.000 NA   NA
 3696140 3696141 GTNG_2626 GTNG_2627     TRUE 0.932 -3.000 0.243 1.000   NA
 3696143 3696144 GTNG_2629 GTNG_2630     TRUE 0.987 -3.000 0.229 0.072 Y NA
 3696144 3696145 GTNG_2630 GTNG_2631     FALSE 0.274 168.000 0.011 1.000 N NA
 3696145 3696146 GTNG_2631 GTNG_2632   pheT FALSE 0.402 82.000 0.000 1.000 N NA
 3696146 3696147 GTNG_2632 GTNG_2633 pheT pheS TRUE 0.994 22.000 0.574 0.001 Y NA
 3696147 3696148 GTNG_2633 GTNG_2634 pheS   FALSE 0.086 355.000 0.006 1.000 Y NA
 3696148 3696149 GTNG_2634 GTNG_2635     TRUE 0.867 -3.000 0.010 1.000 N NA
 3696151 3696152 GTNG_2637 GTNG_2638     TRUE 0.755 93.000 0.463 NA   NA
 3696152 3696153 GTNG_2638 GTNG_2639     FALSE 0.490 16.000 0.011 NA   NA
 3696153 3696154 GTNG_2639 GTNG_2640   rplT FALSE 0.299 71.000 0.014 NA   NA
 3696154 3696155 GTNG_2640 GTNG_2641 rplT rpmI TRUE 0.995 28.000 0.928 0.012 Y NA
 3696155 3696156 GTNG_2641 GTNG_2642 rpmI   TRUE 0.981 13.000 0.652 1.000 Y NA
 3696156 3696157 GTNG_2642 GTNG_2643   thrS FALSE 0.031 559.000 0.000 1.000 Y NA
 3696157 3696158 GTNG_2643 GTNG_2644 thrS   FALSE 0.004 322.000 0.000 NA   NA
 3696158 3696159 GTNG_2644 GTNG_2645     FALSE 0.114 189.000 0.048 NA   NA
 3696159 3696160 GTNG_2645 GTNG_2646     TRUE 0.984 12.000 0.817 1.000 Y NA
 3696160 3696161 GTNG_2646 GTNG_2647     TRUE 0.572 105.000 0.109 NA N NA
 3696161 3696162 GTNG_2647 GTNG_2648     TRUE 0.606 32.000 0.019 NA   NA
 3696162 3696163 GTNG_2648 GTNG_2649     FALSE 0.228 124.000 0.019 NA   NA
 3696163 3696164 GTNG_2649 GTNG_2650     FALSE 0.101 82.000 0.000 NA   NA
 3696164 3696165 GTNG_2650 GTNG_2651     FALSE 0.146 67.000 0.000 NA   NA
 3696165 3696166 GTNG_2651 GTNG_2652     FALSE 0.479 117.000 0.020 1.000 N NA
 3696166 3696167 GTNG_2652 GTNG_2653     TRUE 0.871 29.000 0.066 1.000 N NA
 3696167 3696168 GTNG_2653 GTNG_2654     FALSE 0.357 240.000 0.101 1.000 Y NA
 3696168 3696169 GTNG_2654 GTNG_2655     TRUE 0.602 65.000 0.004 1.000 N NA
 3696169 3696170 GTNG_2655 GTNG_2656     TRUE 0.991 -3.000 0.384 0.060 Y NA
 3696170 3696171 GTNG_2656 GTNG_2657     FALSE 0.126 217.000 0.082 1.000   NA
 3696171 3696172 GTNG_2657 GTNG_2658     FALSE 0.354 83.000 0.022 1.000   NA
 3696172 3696173 GTNG_2658 GTNG_2659     TRUE 0.962 26.000 0.115 1.000 Y NA
 3696173 3696174 GTNG_2659 GTNG_2660     TRUE 0.879 72.000 0.140 1.000 Y NA
 3696174 3696175 GTNG_2660 GTNG_2661     FALSE 0.035 267.000 0.039 NA   NA
 3696177 3696178 GTNG_2663 GTNG_2664 pykA   TRUE 0.987 28.000 0.261 0.004 Y NA
 3696178 3696179 GTNG_2664 GTNG_2665   accA FALSE 0.326 171.000 0.047 1.000 N NA
 3696179 3696180 GTNG_2665 GTNG_2666 accA accD TRUE 0.994 -15.000 0.234 0.001 Y NA
 3696180 3696181 GTNG_2666 GTNG_2667 accD   FALSE 0.347 160.000 0.032 1.000 N NA
 3696181 3696182 GTNG_2667 GTNG_2668     FALSE 0.421 154.000 0.056 1.000 N NA
 3696183 3696184 GTNG_2669 GTNG_2670     TRUE 0.957 -3.000 0.481 NA   NA
 3696187 3696188 GTNG_2673 GTNG_2674     FALSE 0.021 201.000 0.000 NA   NA
 3696188 3696189 GTNG_2674 GTNG_2675     FALSE 0.042 262.000 0.021 1.000   NA
 3696191 3696192 GTNG_2677 GTNG_2678   fabG TRUE 0.534 92.000 0.034 1.000 N NA
 3696192 3696193 GTNG_2678 GTNG_2679 fabG ytzD FALSE 0.032 268.000 0.034 NA   NA
 3696195 3696196 GTNG_2681 GTNG_2682     TRUE 0.959 50.000 0.278 1.000 Y NA
 3696197 3696198 GTNG_2683 GTNG_2684     FALSE 0.065 142.000 0.000 NA   NA
 3696201 3696202 GTNG_2687 GTNG_2688   ackA FALSE 0.472 105.000 0.015 1.000 N NA
 3696202 3696203 GTNG_2688 GTNG_2689 ackA   TRUE 0.592 155.000 0.217 1.000 N NA
 3696203 3696204 GTNG_2689 GTNG_2690     FALSE 0.305 187.000 0.089 1.000 N NA
 3696204 3696205 GTNG_2690 GTNG_2691     FALSE 0.062 205.000 0.022 NA   NA
 3696205 3696206 GTNG_2691 GTNG_2692     TRUE 0.736 6.000 0.133 NA   NA
 3696206 3696207 GTNG_2692 GTNG_2693     FALSE 0.281 101.000 0.029 NA   NA
 3696207 3696208 GTNG_2693 GTNG_2694     TRUE 0.901 -88.000 0.087 NA   NA
 3696210 3696211 GTNG_2696 GTNG_2697     FALSE 0.327 136.000 0.044 1.000   NA
 3696211 3696212 GTNG_2697 GTNG_2698     FALSE 0.302 82.000 0.005 1.000   NA
 3696212 3696213 GTNG_2698 GTNG_2699     TRUE 0.921 8.000 0.349 1.000 N NA
 3696213 3696214 GTNG_2699 GTNG_2700     TRUE 0.618 143.000 0.201 1.000 N NA
 3696215 3696216 GTNG_2701 GTNG_2702     TRUE 0.786 27.000 0.016 NA N NA
 3696219 3696220 GTNG_2705 GTNG_2706     FALSE 0.012 298.000 0.000 1.000   NA
 3696220 3696221 GTNG_2706 GTNG_2707     FALSE 0.006 378.000 0.000 1.000   NA
 3696221 3696222 GTNG_2707 GTNG_2708     FALSE 0.052 196.000 0.000 1.000   NA
 3696222 3696223 GTNG_2708 GTNG_2709     FALSE 0.011 1024.000 0.000 0.085 N NA
 3696226 3696227 GTNG_2712 GTNG_2713 acuA acuB TRUE 0.962 32.000 0.446 0.061   NA
 3696227 3696228 GTNG_2713 GTNG_2714 acuB acuC TRUE 0.939 -3.000 0.271 1.000   NA
 3696229 3696230 GTNG_2715 GTNG_2716     FALSE 0.010 473.000 0.000 1.000 N NA
 3696230 3696231 GTNG_2716 GTNG_2717     FALSE 0.011 244.000 0.000 NA   NA
 3696231 3696232 GTNG_2717 GTNG_2718   ytxH TRUE 0.783 -3.000 0.050 NA   NA
 3696232 3696233 GTNG_2718 GTNG_2719 ytxH   TRUE 0.955 -82.000 0.250 NA   NA
 3696233 3696234 GTNG_2719 GTNG_2720   murC FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 3696234 3696235 GTNG_2720 GTNG_2721 murC   TRUE 0.664 128.000 0.017 0.004 N NA
 3696235 3696236 GTNG_2721 GTNG_2722     TRUE 0.529 107.000 0.143 1.000   NA
 3696236 3696237 GTNG_2722 GTNG_2723     TRUE 0.944 22.000 0.511 NA   NA
 3696237 3696238 GTNG_2723 GTNG_2724     FALSE 0.245 47.000 0.000 NA   NA
 3696238 3696239 GTNG_2724 GTNG_2725     FALSE 0.399 103.000 0.084 NA   NA
 3696241 3696242 GTNG_2727 GTNG_2728     FALSE 0.091 258.000 0.117 1.000   NA
 3696244 3696245 GTNG_2730 GTNG_2731     FALSE 0.046 325.000 0.078 NA N NA
 3696245 3696246 GTNG_2731 GTNG_2732     FALSE 0.493 107.000 0.162 NA   NA
 3696246 3696247 GTNG_2732 GTNG_2733     TRUE 0.809 12.000 0.224 NA   NA
 3696247 3696248 GTNG_2733 GTNG_2734     TRUE 0.924 -3.000 0.103 1.000 N NA
 3696248 3696249 GTNG_2734 GTNG_2735     TRUE 0.659 83.000 0.122 1.000 N NA
 3696249 3696250 GTNG_2735 GTNG_2736     FALSE 0.096 96.000 0.000 NA   NA
 3696250 3696251 GTNG_2736 GTNG_2737     FALSE 0.088 120.000 0.000 NA   NA
 3696251 3696252 GTNG_2737 GTNG_2738     FALSE 0.005 410.000 0.000 1.000   NA
 3696254 3696255 GTNG_2740 GTNG_2741 yteV   FALSE 0.133 201.000 0.097 NA   NA
 3696255 3696256 GTNG_2741 GTNG_2742   leuS TRUE 0.552 64.000 0.006 NA N NA
 3696256 3696257 GTNG_2742 GTNG_2743 leuS   FALSE 0.018 363.000 0.000 1.000 N NA
 3696257 3696258 GTNG_2743 GTNG_2744     FALSE 0.343 117.000 0.062 NA   NA
 3696258 3696259 GTNG_2744 GTNG_2745     TRUE 0.756 130.000 0.583 NA   NA
 3696260 3696261 GTNG_2746 GTNG_2747     TRUE 0.950 -3.000 0.408 NA   NA
 3696266 3696267 GTNG_2752 GTNG_2753 ytmB   FALSE 0.438 149.000 0.200 NA   NA
 3696268 3696269 GTNG_2754 GTNG_2755     TRUE 0.984 19.000 0.528 NA Y NA
 3696269 3696270 GTNG_2755 GTNG_2756     TRUE 0.996 -13.000 0.876 1.000 Y NA
 3696271 3696272 GTNG_2757 GTNG_2758     TRUE 0.961 -67.000 0.292 NA   NA
 3696272 3696273 GTNG_2758 GTNG_2759     FALSE 0.148 254.000 0.273 NA   NA
 3696273 3696274 GTNG_2759 GTNG_2760     FALSE 0.444 161.000 0.259 NA   NA
 3696276 3696277 GTNG_2762 GTNG_2763     FALSE 0.097 93.000 0.000 NA   NA
 3696278 3696279 GTNG_2764 GTNG_2765 znuA   FALSE 0.260 154.000 0.000 1.000 N NA
 3696280 3696281 GTNG_2766 GTNG_2767     TRUE 0.609 19.000 0.019 NA   NA
 3696282 3696283 GTNG_2768 GTNG_2769     TRUE 0.640 67.000 0.167 NA   NA
 3696284 3696285 GTNG_2770 GTNG_2771     TRUE 0.562 196.000 0.193 0.001 N NA
 3696285 3696286 GTNG_2771 GTNG_2772     TRUE 0.870 6.000 0.280 1.000   NA
 3696286 3696287 GTNG_2772 GTNG_2773     TRUE 0.966 -9.000 0.355 1.000   NA
 3696287 3696288 GTNG_2773 GTNG_2774     TRUE 0.982 -7.000 0.142 1.000 Y NA
 3696289 3696290 GTNG_2775 GTNG_2776     TRUE 0.757 86.000 0.250 1.000 N NA
 3696290 3696291 GTNG_2776 GTNG_2777     FALSE 0.167 143.000 0.015 NA   NA
 3696292 3696293 GTNG_2778 GTNG_2779   glgA TRUE 0.990 -13.000 0.314 1.000 Y NA
 3696293 3696294 GTNG_2779 GTNG_2780 glgA   TRUE 0.992 -3.000 0.630 1.000 Y NA
 3696294 3696295 GTNG_2780 GTNG_2781   glgC TRUE 0.985 0.000 0.210 0.001 Y NA
 3696295 3696296 GTNG_2781 GTNG_2782 glgC   TRUE 0.996 -79.000 0.296 0.001 Y NA
 3696298 3696299 GTNG_2784 GTNG_2785     FALSE 0.147 317.000 0.588 NA   NA
 3696301 3696302 GTNG_2787 GTNG_2788     FALSE 0.021 349.000 0.000 1.000 N NA
 3696303 3696304 GTNG_2789 GTNG_2790     TRUE 0.895 -3.000 0.077 NA N NA
 3696305 3696306 GTNG_2791 GTNG_2792     FALSE 0.025 193.000 0.000 NA   NA
 3696307 3696308 GTNG_2793 GTNG_2794     FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 3696308 3696309 GTNG_2794 GTNG_2795     FALSE 0.094 101.000 0.000 NA   NA
 3696310 3696311 GTNG_2796 GTNG_2797     FALSE 0.098 89.000 0.000 NA   NA
 3696312 3696313 GTNG_2798 GTNG_2799     FALSE 0.051 158.000 0.000 NA   NA
 3696313 3696314 GTNG_2799 GTNG_2800     FALSE 0.011 309.000 0.000 1.000   NA
 3696315 3696316 GTNG_2801 GTNG_2802 yolB yolA TRUE 0.925 19.000 0.400 NA   NA
 3696317 3696318 GTNG_2803 GTNG_2804     FALSE 0.001 645.000 0.000 NA   NA
 3696319 3696320 GTNG_2805 GTNG_2806     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3696320 3696321 GTNG_2806 GTNG_2807     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3696321 3696322 GTNG_2807 GTNG_2808     TRUE 0.871 15.000 0.333 NA   NA
 3696322 3696323 GTNG_2808 GTNG_2809     TRUE 0.939 -3.000 0.333 NA   NA
 3696323 3696324 GTNG_2809 GTNG_2810     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3696324 3696325 GTNG_2810 GTNG_2811     TRUE 0.949 -3.000 0.400 NA   NA
 3696325 3696326 GTNG_2811 GTNG_2812     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3696326 3696327 GTNG_2812 GTNG_2813     TRUE 0.937 16.000 0.667 NA   NA
 3696327 3696328 GTNG_2813 GTNG_2814     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3696328 3696329 GTNG_2814 GTNG_2815     FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 3696329 3696330 GTNG_2815 GTNG_2816     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3696330 3696331 GTNG_2816 GTNG_2817     TRUE 0.556 -25.000 0.000 NA   NA
 3696331 3696332 GTNG_2817 GTNG_2818     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3696332 3696333 GTNG_2818 GTNG_2819     FALSE 0.232 49.000 0.000 NA   NA
 3696333 3696334 GTNG_2819 GTNG_2820     FALSE 0.137 69.000 0.000 NA   NA
 3696334 3696335 GTNG_2820 GTNG_2821     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3696335 3696336 GTNG_2821 GTNG_2822     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3696336 3696337 GTNG_2822 GTNG_2823     TRUE 0.940 0.000 0.500 NA   NA
 3696337 3696338 GTNG_2823 GTNG_2824     FALSE 0.235 7.000 0.000 NA   NA
 3696338 3696339 GTNG_2824 GTNG_2825     FALSE 0.289 17.000 0.000 NA   NA
 3696339 3696340 GTNG_2825 GTNG_2826     FALSE 0.325 33.000 0.000 NA   NA
 3696340 3696341 GTNG_2826 GTNG_2827     TRUE 0.928 23.000 0.400 NA   NA
 3696341 3696342 GTNG_2827 GTNG_2828     FALSE 0.507 -7.000 0.000 NA   NA
 3696342 3696343 GTNG_2828 GTNG_2829     FALSE 0.332 19.000 0.000 NA   NA
 3696343 3696344 GTNG_2829 GTNG_2830     TRUE 0.581 -124.000 0.000 NA   NA
 3696344 3696345 GTNG_2830 GTNG_2831     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 3696345 3696346 GTNG_2831 GTNG_2832     FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 3696346 3696347 GTNG_2832 GTNG_2833     FALSE 0.036 175.000 0.000 NA   NA
 3696347 3696348 GTNG_2833 GTNG_2834     FALSE 0.001 728.000 0.000 NA   NA
 3696348 3696349 GTNG_2834 GTNG_2835     TRUE 0.560 -31.000 0.000 NA   NA
 3696349 3696350 GTNG_2835 GTNG_2836     FALSE 0.022 199.000 0.000 NA   NA
 3696350 3696351 GTNG_2836 GTNG_2837     FALSE 0.086 123.000 0.000 NA   NA
 3696351 3696352 GTNG_2837 GTNG_2838     FALSE 0.002 419.000 0.000 NA   NA
 3696352 3696353 GTNG_2838 GTNG_2839     FALSE 0.003 682.000 0.000 1.000   NA
 3696355 3696356 GTNG_2841 GTNG_2842     TRUE 0.701 41.000 0.080 NA   NA
 3696356 3696357 GTNG_2842 GTNG_2843     FALSE 0.240 13.000 0.000 NA   NA
 3696357 3696358 GTNG_2843 GTNG_2844     TRUE 0.573 -55.000 0.000 NA   NA
 3696358 3696359 GTNG_2844 GTNG_2845     FALSE 0.332 19.000 0.000 NA   NA
 3696359 3696360 GTNG_2845 GTNG_2846     FALSE 0.117 74.000 0.000 NA   NA
 3696360 3696361 GTNG_2846 GTNG_2847     FALSE 0.332 19.000 0.000 NA   NA
 3696361 3696362 GTNG_2847 GTNG_2848     FALSE 0.196 90.000 0.000 1.000   NA
 3696362 3696363 GTNG_2848 GTNG_2849     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3696363 3696364 GTNG_2849 GTNG_2850     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3696364 3696365 GTNG_2850 GTNG_2851     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3696365 3696366 GTNG_2851 GTNG_2852     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3696366 3696367 GTNG_2852 GTNG_2853     FALSE 0.011 248.000 0.000 NA   NA
 3696367 3696368 GTNG_2853 GTNG_2854     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3696368 3696369 GTNG_2854 GTNG_2855     TRUE 0.784 -3.000 0.051 NA   NA
 3696369 3696370 GTNG_2855 GTNG_2856     FALSE 0.343 24.000 0.000 NA   NA
 3696370 3696371 GTNG_2856 GTNG_2857     FALSE 0.310 1.000 0.000 NA   NA
 3696371 3696372 GTNG_2857 GTNG_2858     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 3696372 3696373 GTNG_2858 GTNG_2859     TRUE 0.558 -28.000 0.000 NA   NA
 3696374 3696375 GTNG_2860 GTNG_2861     TRUE 0.970 21.000 1.000 NA   NA
 3696375 3696376 GTNG_2861 GTNG_2862     TRUE 0.965 35.000 0.667 NA N NA
 3696377 3696378 GTNG_t071 GTNG_t072     FALSE 0.188 58.000 0.000 NA   NA
 3696378 3696379 GTNG_t072 GTNG_t073     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3696379 3696380 GTNG_t073 GTNG_t074     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3696380 3696381 GTNG_t074 GTNG_t075     FALSE 0.289 17.000 0.000 NA   NA
 3696381 3696382 GTNG_t075 GTNG_t076     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3696382 3696383 GTNG_t076 GTNG_t077     FALSE 0.235 7.000 0.000 NA   NA
 3696383 3696384 GTNG_t077 GTNG_t078     FALSE 0.235 7.000 0.000 NA   NA
 3696384 3696385 GTNG_t078 GTNG_t079     FALSE 0.295 38.000 0.000 NA   NA
 3696385 3696386 GTNG_t079 GTNG_t080     FALSE 0.303 36.000 0.000 NA   NA
 3696386 3696387 GTNG_t080 GTNG_t081     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3696387 3696388 GTNG_t081 GTNG_t082     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3696388 3696389 GTNG_t082 GTNG_t083     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3696389 3696390 GTNG_t083 GTNG_t084     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3696390 3696391 GTNG_t084 GTNG_t085     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3696391 3696392 GTNG_t085 GTNG_23s010     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 3696392 3696393 GTNG_23s010 GTNG_16s010     FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 3696396 3696397 GTNG_2865 GTNG_t086 sapB   FALSE 0.132 70.000 0.000 NA   NA
 3696399 3696400 GTNG_2867 GTNG_2868     FALSE 0.085 124.000 0.000 NA   NA
 3696401 3696402 GTNG_2869 GTNG_2870     TRUE 0.630 39.000 0.039 NA   NA
 3696402 3696403 GTNG_2870 GTNG_2871     FALSE 0.333 0.000 0.000 NA   NA
 3696403 3696404 GTNG_2871 GTNG_2872     FALSE 0.007 277.000 0.000 NA   NA
 3696408 3696409 GTNG_2876 GTNG_2877   pgi FALSE 0.014 334.000 0.027 NA   NA
 3696409 3696410 GTNG_2877 GTNG_2878 pgi   FALSE 0.094 237.000 0.005 1.000 N NA
 3696412 3696413 GTNG_2880 GTNG_2881     TRUE 0.529 97.000 0.033 1.000 N NA
 3696413 3696414 GTNG_2881 GTNG_2882     TRUE 0.987 -3.000 0.894 1.000 N NA
 3696416 3696417 GTNG_2884 GTNG_2885     TRUE 0.700 58.000 0.163 NA   NA
 3696417 3696418 GTNG_2885 GTNG_2886     TRUE 0.616 51.000 0.069 NA   NA
 3696418 3696419 GTNG_2886 GTNG_2887     FALSE 0.088 169.000 0.000 1.000   NA
 3696419 3696420 GTNG_2887 GTNG_2888     TRUE 0.988 -22.000 0.220 1.000 Y NA
 3696420 3696421 GTNG_2888 GTNG_2889     TRUE 0.996 -3.000 0.829 0.051 Y NA
 3696421 3696422 GTNG_2889 GTNG_2890     TRUE 0.985 7.000 0.842 1.000 Y NA
 3696422 3696423 GTNG_2890 GTNG_2891     TRUE 0.995 -7.000 0.368 0.004 Y NA
 3696423 3696424 GTNG_2891 GTNG_2892     TRUE 0.974 1.000 0.341 NA Y NA
 3696424 3696425 GTNG_2892 GTNG_2893     TRUE 0.990 -7.000 0.439 NA Y NA
 3696429 3696430 GTNG_2897 GTNG_2898     TRUE 0.919 18.000 0.011 NA Y NA
 3696430 3696431 GTNG_2898 GTNG_2899     FALSE 0.128 198.000 0.007 NA N NA
 3696433 3696434 GTNG_2901 GTNG_2902     FALSE 0.271 219.000 0.361 NA   NA
 3696434 3696435 GTNG_2902 GTNG_2903     FALSE 0.059 329.000 0.250 NA   NA
 3696435 3696436 GTNG_2903 GTNG_2904     TRUE 0.602 120.000 0.208 1.000   NA
 3696438 3696439 GTNG_2906 GTNG_2907 hesB dapF FALSE 0.510 47.000 0.020 NA   NA
 3696439 3696440 GTNG_2907 GTNG_2908 dapF   FALSE 0.155 132.000 0.002 NA   NA
 3696444 3696445 GTNG_2912 GTNG_2913     TRUE 0.981 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 3696445 3696446 GTNG_2913 GTNG_2914     TRUE 0.949 0.000 0.052 1.000 Y NA
 3696446 3696447 GTNG_2914 GTNG_2915     TRUE 0.657 93.000 0.129 1.000 N NA
 3696447 3696448 GTNG_2915 GTNG_2916     TRUE 0.680 128.000 0.385 NA   NA
 3696450 3696451 GTNG_2918 GTNG_2919     FALSE 0.222 205.000 0.237 NA   NA
 3696452 3696453 GTNG_2920 GTNG_2921     TRUE 0.722 58.000 0.182 NA   NA
 3696458 3696459 GTNG_2926 GTNG_2927     TRUE 0.961 3.000 0.046 0.019 Y NA
 3696459 3696460 GTNG_2927 GTNG_2928     TRUE 0.992 -25.000 0.349 1.000 Y NA
 3696460 3696461 GTNG_2928 GTNG_2929     TRUE 0.983 4.000 0.363 0.038 Y NA
 3696461 3696462 GTNG_2929 GTNG_2930     TRUE 0.780 112.000 0.088 NA Y NA
 3696462 3696463 GTNG_2930 GTNG_2931     FALSE 0.003 359.000 0.000 NA   NA
 3696463 3696464 GTNG_2931 GTNG_2932     TRUE 0.910 -3.000 0.221 NA   NA
 3696464 3696465 GTNG_2932 GTNG_2933   yunD TRUE 0.756 62.000 0.241 NA   NA
 3696465 3696466 GTNG_2933 GTNG_2934 yunD   TRUE 0.910 18.000 0.299 1.000   NA
 3696466 3696467 GTNG_2934 GTNG_2935     TRUE 0.868 16.000 0.303 NA   NA
 3696467 3696468 GTNG_2935 GTNG_2936     FALSE 0.088 120.000 0.000 NA   NA
 3696468 3696469 GTNG_2936 GTNG_2937     FALSE 0.117 74.000 0.000 NA   NA
 3696469 3696470 GTNG_2937 GTNG_2938     FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 3696470 3696471 GTNG_2938 GTNG_2939     FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   NA
 3696473 3696474 GTNG_2941 GTNG_2942     FALSE 0.002 505.000 0.000 NA   NA
 3696474 3696475 GTNG_2942 GTNG_2943   iscU TRUE 0.959 22.000 0.152 0.001 N NA
 3696475 3696476 GTNG_2943 GTNG_2944 iscU   TRUE 0.973 -10.000 0.292 1.000 N NA
 3696476 3696477 GTNG_2944 GTNG_2945     TRUE 0.980 -3.000 0.606 1.000 N NA
 3696477 3696478 GTNG_2945 GTNG_2946     TRUE 0.959 18.000 0.139 1.000 Y NA
 3696478 3696479 GTNG_2946 GTNG_2947     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 3696481 3696482 GTNG_2949 GTNG_2950     TRUE 0.939 16.000 0.138 NA Y NA
 3696482 3696483 GTNG_2950 GTNG_2951     TRUE 0.995 -10.000 0.642 1.000 Y NA
 3696483 3696484 GTNG_2951 GTNG_2952     FALSE 0.016 278.000 0.000 1.000   NA
 3696484 3696485 GTNG_2952 GTNG_2953     FALSE 0.219 154.000 0.049 NA   NA
 3696485 3696486 GTNG_2953 GTNG_2954     TRUE 0.954 -3.000 0.443 NA   NA
 3696486 3696487 GTNG_2954 GTNG_2955   yusG TRUE 0.625 74.000 0.205 NA   NA
 3696487 3696488 GTNG_2955 GTNG_2956 yusG   TRUE 0.671 75.000 0.255 NA   NA
 3696488 3696489 GTNG_2956 GTNG_2957     TRUE 0.692 94.000 0.170 1.000 N NA
 3696489 3696490 GTNG_2957 GTNG_2958     TRUE 0.855 56.000 0.060 0.039 N NA
 3696490 3696491 GTNG_2958 GTNG_2959     TRUE 0.851 79.000 0.124 1.000 Y NA
 3696491 3696492 GTNG_2959 GTNG_2960     TRUE 0.987 29.000 0.588 1.000 Y NA
 3696495 3696496 GTNG_2963 GTNG_2964     TRUE 0.952 17.000 0.762 NA   NA
 3696496 3696497 GTNG_2964 GTNG_2965     FALSE 0.097 90.000 0.000 NA   NA
 3696497 3696498 GTNG_2965 GTNG_2966     TRUE 0.973 21.000 0.500 0.005   NA
 3696498 3696499 GTNG_2966 GTNG_2967     TRUE 0.981 -3.000 0.500 0.005   NA
 3696500 3696501 GTNG_2968 GTNG_2969     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3696501 3696502 GTNG_2969 GTNG_2970     FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 3696502 3696503 GTNG_2970 GTNG_2971     FALSE 0.005 394.000 0.000 1.000   NA
 3696505 3696506 GTNG_2973 GTNG_2974 hpaC   FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 3696506 3696507 GTNG_2974 GTNG_2975     FALSE 0.188 58.000 0.000 NA   NA
 3696507 3696508 GTNG_2975 GTNG_2976     TRUE 0.937 -7.000 0.237 NA   NA
 3696508 3696509 GTNG_2976 GTNG_2977     TRUE 0.752 75.000 0.381 NA   NA
 3696509 3696510 GTNG_2977 GTNG_2978     FALSE 0.190 102.000 0.000 1.000   NA
 3696510 3696511 GTNG_2978 GTNG_2979     FALSE 0.004 440.000 0.000 1.000   NA
 3696511 3696512 GTNG_2979 GTNG_2980     FALSE 0.132 144.000 0.000 1.000   NA
 3696512 3696513 GTNG_2980 GTNG_2981     TRUE 0.988 -6.000 0.130 0.018 Y NA
 3696513 3696514 GTNG_2981 GTNG_2982     TRUE 0.970 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 3696514 3696515 GTNG_2982 GTNG_2983     TRUE 0.990 7.000 0.800 0.038 Y NA
 3696515 3696516 GTNG_2983 GTNG_2984     TRUE 0.959 70.000 0.600 1.000 Y NA
 3696516 3696517 GTNG_2984 GTNG_2985     TRUE 0.619 85.000 0.087 1.000 N NA
 3696517 3696518 GTNG_2985 GTNG_2986   hpaE TRUE 0.896 22.000 0.112 1.000 N NA
 3696518 3696519 GTNG_2986 GTNG_2987 hpaE hpaF TRUE 0.911 16.000 0.252 1.000 N NA
 3696519 3696520 GTNG_2987 GTNG_2988 hpaF   TRUE 0.812 75.000 0.068 0.001 N NA
 3696520 3696521 GTNG_2988 GTNG_2989     TRUE 0.996 -3.000 0.618 0.001 Y NA
 3696521 3696522 GTNG_2989 GTNG_2990   hpaD TRUE 0.530 107.000 0.045 1.000 N NA
 3696522 3696523 GTNG_2990 GTNG_2991 hpaD   TRUE 0.802 98.000 0.062 1.000 Y NA
 3696523 3696524 GTNG_2991 GTNG_2992   hpaB TRUE 0.932 20.000 0.231 1.000 N NA
 3696526 3696527 GTNG_2994 GTNG_2995   yuzF TRUE 0.952 -16.000 0.267 NA   NA
 3696529 3696530 GTNG_2997 GTNG_2998 smpB   TRUE 0.878 63.000 0.143 0.016 N NA
 3696530 3696531 GTNG_2998 GTNG_2999     TRUE 0.787 24.000 0.060 1.000   NA
 3696531 3696532 GTNG_2999 GTNG_3000   secG FALSE 0.438 72.000 0.032 1.000   NA
 3696534 3696535 GTNG_3002 GTNG_3003   eno FALSE 0.254 156.000 0.000 1.000 N NA
 3696535 3696536 GTNG_3003 GTNG_3004 eno   TRUE 0.964 27.000 0.136 1.000 Y NA
 3696536 3696537 GTNG_3004 GTNG_3005   tpiA TRUE 0.981 -7.000 0.138 1.000 Y NA
 3696537 3696538 GTNG_3005 GTNG_3006 tpiA pgk TRUE 0.910 64.000 0.141 1.000 Y NA
 3696538 3696539 GTNG_3006 GTNG_3007 pgk gapA TRUE 0.819 152.000 0.063 0.004 Y NA
 3696539 3696540 GTNG_3007 GTNG_3008 gapA   TRUE 0.923 48.000 0.348 1.000 N NA
 3696540 3696541 GTNG_3008 GTNG_3009     TRUE 0.597 124.000 0.101 1.000 N NA
 3696541 3696542 GTNG_3009 GTNG_3010     TRUE 0.827 56.000 0.145 1.000 N NA
 3696542 3696543 GTNG_3010 GTNG_t087     FALSE 0.001 533.000 0.000 NA   NA
 3696545 3696546 GTNG_3012 GTNG_3013     TRUE 0.706 15.000 0.101 NA   NA
 3696546 3696547 GTNG_3013 GTNG_3014     TRUE 0.710 130.000 0.470 NA   NA
 3696547 3696548 GTNG_3014 GTNG_3015     TRUE 0.907 -3.000 0.214 NA   NA
 3696548 3696549 GTNG_3015 GTNG_3016     TRUE 0.890 19.000 0.263 NA   NA
 3696549 3696550 GTNG_3016 GTNG_3017     FALSE 0.051 263.000 0.000 1.000 N NA
 3696550 3696551 GTNG_3017 GTNG_3018     TRUE 0.590 103.000 0.183 1.000   NA
 3696551 3696552 GTNG_3018 GTNG_3019     FALSE 0.049 159.000 0.000 NA   NA
 3696552 3696553 GTNG_3019 GTNG_3020     FALSE 0.245 47.000 0.000 NA   NA
 3696553 3696554 GTNG_3020 GTNG_3021     TRUE 0.994 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 3696554 3696555 GTNG_3021 GTNG_3022     TRUE 0.994 -3.000 0.433 0.003 Y NA
 3696555 3696556 GTNG_3022 GTNG_3023   hisH TRUE 0.979 0.000 0.124 0.003 Y NA
 3696556 3696557 GTNG_3023 GTNG_3024 hisH hisB TRUE 0.976 37.000 0.125 0.003 Y NA
 3696557 3696558 GTNG_3024 GTNG_3025 hisB hisD TRUE 0.978 0.000 0.096 0.003 Y NA
 3696558 3696559 GTNG_3025 GTNG_3026 hisD hisG TRUE 0.936 103.000 0.254 0.003 Y NA
 3696559 3696560 GTNG_3026 GTNG_3027 hisG hisZ TRUE 0.869 162.000 0.239 0.003 Y NA
 3696560 3696561 GTNG_3027 GTNG_3028 hisZ   FALSE 0.007 493.000 0.012 1.000   NA
 3696561 3696562 GTNG_3028 GTNG_3029     TRUE 0.940 21.000 0.417 1.000   NA
 3696562 3696563 GTNG_3029 GTNG_3030     TRUE 0.899 -3.000 0.146 1.000   NA
 3696563 3696564 GTNG_3030 GTNG_3031     TRUE 0.689 56.000 0.090 1.000   NA
 3696564 3696565 GTNG_3031 GTNG_3032     FALSE 0.206 310.000 0.494 1.000 N NA
 3696565 3696566 GTNG_3032 GTNG_3033     TRUE 0.558 111.000 0.215 NA   NA
 3696566 3696567 GTNG_3033 GTNG_3034     FALSE 0.143 170.000 0.034 NA   NA
 3696567 3696568 GTNG_3034 GTNG_3035   uvrA FALSE 0.192 106.000 0.005 NA   NA
 3696568 3696569 GTNG_3035 GTNG_3036 uvrA uvrB TRUE 0.972 8.000 0.154 0.001 Y NA
 3696569 3696570 GTNG_3036 GTNG_3037 uvrB   FALSE 0.081 177.000 0.007 NA   NA
 3696570 3696571 GTNG_3037 GTNG_3038     TRUE 0.695 15.000 0.094 NA   NA
 3696573 3696574 GTNG_3040 GTNG_3041     FALSE 0.010 258.000 0.000 NA   NA
 3696574 3696575 GTNG_3041 GTNG_3042     FALSE 0.003 360.000 0.000 NA   NA
 3696575 3696576 GTNG_3042 GTNG_3043     TRUE 0.941 32.000 0.026 1.000 Y NA
 3696576 3696577 GTNG_3043 GTNG_3044     TRUE 0.994 -85.000 0.431 1.000 Y NA
 3696577 3696578 GTNG_3044 GTNG_3045     FALSE 0.013 352.000 0.003 1.000   NA
 3696578 3696579 GTNG_3045 GTNG_3046     FALSE 0.513 63.000 0.059 NA   NA
 3696579 3696580 GTNG_3046 GTNG_3047     FALSE 0.168 155.000 0.024 NA   NA
 3696580 3696581 GTNG_3047 GTNG_3048   secA FALSE 0.176 214.000 0.052 1.000 N NA
 3696581 3696582 GTNG_3048 GTNG_3049 secA   FALSE 0.013 545.000 0.041 NA N NA
 3696582 3696583 GTNG_3049 GTNG_3050     FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 3696583 3696584 GTNG_3050 GTNG_3051     FALSE 0.048 160.000 0.000 NA   NA
 3696584 3696585 GTNG_3051 GTNG_3052   fliT TRUE 0.837 13.000 0.263 NA   NA
 3696585 3696586 GTNG_3052 GTNG_3053 fliT fliS TRUE 0.843 0.000 0.174 NA   NA
 3696586 3696587 GTNG_3053 GTNG_3054 fliS fliD TRUE 0.561 284.000 0.370 0.002 Y NA
 3696587 3696588 GTNG_3054 GTNG_3055 fliD   TRUE 0.974 28.000 0.298 NA Y NA
 3696588 3696589 GTNG_3055 GTNG_3056     FALSE 0.019 982.000 0.000 NA Y NA
 3696589 3696590 GTNG_3056 GTNG_3057     FALSE 0.322 156.000 0.125 NA   NA
 3696590 3696591 GTNG_3057 GTNG_3058     TRUE 0.834 -3.000 0.089 NA   NA
 3696591 3696592 GTNG_3058 GTNG_3059     TRUE 0.907 15.000 0.489 NA   NA
 3696592 3696593 GTNG_3059 GTNG_3060   yviE TRUE 0.924 23.000 0.375 NA   NA
 3696593 3696594 GTNG_3060 GTNG_3061 yviE flgL TRUE 0.578 86.000 0.207 NA   NA
 3696594 3696595 GTNG_3061 GTNG_3062 flgL flgK TRUE 0.979 11.000 0.257 0.001 Y NA
 3696595 3696596 GTNG_3062 GTNG_3063 flgK yvyG TRUE 0.924 12.000 0.233 0.002   NA
 3696596 3696597 GTNG_3063 GTNG_3064 yvyG flgM TRUE 0.901 16.000 0.113 0.002   NA
 3696597 3696598 GTNG_3064 GTNG_3065 flgM yvyF FALSE 0.427 72.000 0.062 NA   NA
 3696598 3696599 GTNG_3065 GTNG_3066 yvyF   TRUE 0.639 33.000 0.028 NA   NA
 3696599 3696600 GTNG_3066 GTNG_3067   yvzB FALSE 0.385 85.000 0.069 NA   NA
 3696600 3696601 GTNG_3067 GTNG_3068 yvzB   TRUE 0.973 7.000 0.440 1.000 Y NA
 3696601 3696602 GTNG_3068 GTNG_3069     TRUE 0.805 53.000 0.208 1.000   NA
 3696602 3696603 GTNG_3069 GTNG_3070     TRUE 0.914 -3.000 0.229 NA   NA
 3696603 3696604 GTNG_3070 GTNG_3071   comFC FALSE 0.256 72.000 0.005 NA   NA
 3696604 3696605 GTNG_3071 GTNG_3072 comFC comFA TRUE 0.892 -3.000 0.130 1.000   NA
 3696605 3696606 GTNG_3072 GTNG_3073 comFA   FALSE 0.023 197.000 0.000 NA   NA
 3696606 3696607 GTNG_3073 GTNG_3074     FALSE 0.065 142.000 0.000 NA   NA
 3696607 3696608 GTNG_3074 GTNG_3075     FALSE 0.020 485.000 0.210 NA   NA
 3696608 3696609 GTNG_3075 GTNG_3076     TRUE 0.981 -3.000 0.519 0.014   NA
 3696610 3696611 GTNG_3077 GTNG_3078     FALSE 0.456 13.000 0.009 NA   NA
 3696612 3696613 GTNG_3079 GTNG_3080     FALSE 0.001 548.000 0.000 NA   NA
 3696613 3696614 GTNG_3080 GTNG_3081     TRUE 0.915 14.000 0.519 NA   NA
 3696615 3696616 GTNG_3082 GTNG_3083     TRUE 0.604 16.000 0.041 NA   NA
 3696616 3696617 GTNG_3083 GTNG_3084     TRUE 0.833 -13.000 0.041 NA   NA
 3696617 3696618 GTNG_3084 GTNG_3085     FALSE 0.344 25.000 0.000 NA   NA
 3696620 3696621 GTNG_3087 GTNG_3088     TRUE 0.943 15.000 0.800 NA   NA
 3696621 3696622 GTNG_3088 GTNG_3089     FALSE 0.025 194.000 0.000 NA   NA
 3696623 3696624 GTNG_3090 GTNG_3091   sbsB FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 3696624 3696625 GTNG_3091 GTNG_3092 sbsB   FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   NA
 3696625 3696626 GTNG_3092 GTNG_3093     TRUE 0.933 4.000 0.098 NA Y NA
 3696626 3696627 GTNG_3093 GTNG_3094     TRUE 0.959 7.000 0.083 0.009 Y NA
 3696627 3696628 GTNG_3094 GTNG_3095     TRUE 0.905 7.000 0.019 1.000 Y NA
 3696629 3696630 GTNG_3096 GTNG_3097     TRUE 0.744 -3.000 0.032 NA   NA
 3696630 3696631 GTNG_3097 GTNG_3098   mviN TRUE 0.801 49.000 0.174 1.000   NA
 3696634 3696635 GTNG_3101 GTNG_3102     TRUE 0.667 114.000 0.167 1.000 N NA
 3696635 3696636 GTNG_3102 GTNG_3103     FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 3696636 3696637 GTNG_3103 GTNG_3104     TRUE 0.744 51.000 0.167 NA   NA
 3696639 3696640 GTNG_3106 GTNG_3107     FALSE 0.005 311.000 0.000 NA   NA
 3696642 3696643 GTNG_3109 GTNG_3110     FALSE 0.281 40.000 0.000 NA   NA
 3696645 3696646 GTNG_3112 GTNG_3113     TRUE 0.929 7.000 0.667 NA   NA
 3696646 3696647 GTNG_3113 GTNG_3114     FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 3696647 3696648 GTNG_3114 GTNG_3115     FALSE 0.156 151.000 0.015 NA   NA
 3696649 3696650 GTNG_3116 GTNG_3117     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 3696650 3696651 GTNG_3117 GTNG_3118     FALSE 0.105 195.000 0.049 NA   NA
 3696652 3696653 GTNG_3119 GTNG_3120     TRUE 0.812 12.000 0.077 1.000 N NA
 3696653 3696654 GTNG_3120 GTNG_3121     TRUE 0.759 29.000 0.077 NA   NA
 3696656 3696657 GTNG_3123 GTNG_3124     FALSE 0.120 294.000 0.000 1.000 Y NA
 3696657 3696658 GTNG_3124 GTNG_3125     TRUE 0.993 0.000 0.683 0.037 Y NA
 3696658 3696659 GTNG_3125 GTNG_3126     TRUE 0.986 62.000 0.822 0.037 Y NA
 3696659 3696660 GTNG_3126 GTNG_3127     FALSE 0.017 369.000 0.000 1.000 N NA
 3696660 3696661 GTNG_3127 GTNG_3128     TRUE 0.962 4.000 0.067 0.014 Y NA
 3696661 3696662 GTNG_3128 GTNG_3129     FALSE 0.128 374.000 0.571 NA N NA
 3696662 3696663 GTNG_3129 GTNG_3130     FALSE 0.257 44.000 0.000 NA   NA
 3696663 3696664 GTNG_3130 GTNG_3131     FALSE 0.072 135.000 0.000 NA   NA
 3696664 3696665 GTNG_3131 GTNG_3132     FALSE 0.018 210.000 0.000 NA   NA
 3696665 3696666 GTNG_3132 GTNG_3133     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3696668 3696669 GTNG_3135 GTNG_3136     FALSE 0.013 408.000 0.000 1.000 N NA
 3696669 3696670 GTNG_3136 GTNG_3137     TRUE 0.912 82.000 0.333 1.000 Y NA
 3696670 3696671 GTNG_3137 GTNG_3138     TRUE 0.995 2.000 0.889 0.002 Y NA
 3696671 3696672 GTNG_3138 GTNG_3139     TRUE 0.974 57.000 0.375 0.057 Y NA
 3696673 3696674 GTNG_3140 GTNG_3141     FALSE 0.240 88.000 0.014 NA   NA
 3696674 3696675 GTNG_3141 GTNG_3142     FALSE 0.001 545.000 0.000 NA   NA
 3696675 3696676 GTNG_3142 GTNG_3143     FALSE 0.001 1171.000 0.000 NA   NA
 3696676 3696677 GTNG_3143 GTNG_3144     FALSE 0.004 350.000 0.000 NA   NA
 3696678 3696679 GTNG_3145 GTNG_3146   yngL FALSE 0.003 389.000 0.000 NA   NA
 3696679 3696680 GTNG_3146 GTNG_3147 yngL   FALSE 0.016 222.000 0.000 NA   NA
 3696681 3696682 GTNG_3148 GTNG_3149     FALSE 0.051 158.000 0.000 NA   NA
 3696683 3696684 GTNG_3150 GTNG_3151 nbaG nbaI TRUE 0.950 13.000 0.571 1.000 N NA
 3696684 3696685 GTNG_3151 GTNG_3152 nbaI nbaJ TRUE 0.927 40.000 0.292 1.000 N NA
 3696685 3696686 GTNG_3152 GTNG_3153 nbaJ nbaH TRUE 0.993 -7.000 0.542 1.000 Y NA
 3696686 3696687 GTNG_3153 GTNG_3154 nbaH nbaE TRUE 0.894 65.000 0.250 0.057 N NA
 3696687 3696688 GTNG_3154 GTNG_3155 nbaE nbaF TRUE 0.879 11.000 0.250 NA N NA
 3696688 3696689 GTNG_3155 GTNG_3156 nbaF nbaD TRUE 0.972 -3.000 0.714 NA   NA
 3696689 3696690 GTNG_3156 GTNG_3157 nbaD nbaC TRUE 0.926 -9.000 0.031 0.057   NA
 3696690 3696691 GTNG_3157 GTNG_3158 nbaC   FALSE 0.095 196.000 0.012 1.000   NA
 3696691 3696692 GTNG_3158 GTNG_3159     TRUE 0.690 21.000 0.012 1.000   NA
 3696692 3696693 GTNG_3159 GTNG_3160     TRUE 0.685 0.000 0.012 1.000   NA
 3696693 3696694 GTNG_3160 GTNG_3161     FALSE 0.016 382.000 0.000 1.000 N NA
 3696699 3696700 GTNG_3166 GTNG_3167     TRUE 0.959 20.000 0.103 1.000 Y NA
 3696700 3696701 GTNG_3167 GTNG_3168     TRUE 0.926 40.000 0.025 1.000 Y NA
 3696701 3696702 GTNG_3168 GTNG_3169     TRUE 0.871 25.000 0.165 1.000   NA
 3696703 3696704 GTNG_3170 GTNG_3171     TRUE 0.983 13.000 0.847 NA Y NA
 3696704 3696705 GTNG_3171 GTNG_3172     TRUE 0.980 0.000 0.358 1.000 Y NA
 3696705 3696706 GTNG_3172 GTNG_3173   rbsD TRUE 0.971 34.000 0.243 1.000 Y NA
 3696706 3696707 GTNG_3173 GTNG_3174 rbsD rbsK TRUE 0.978 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 3696707 3696708 GTNG_3174 GTNG_3175 rbsK   TRUE 0.869 36.000 0.094 1.000 N NA
 3696708 3696709 GTNG_3175 GTNG_3176     FALSE 0.001 744.000 0.000 NA   NA
 3696709 3696710 GTNG_3176 GTNG_3177     FALSE 0.283 3.000 0.000 NA   NA
 3696711 3696712 GTNG_3178 GTNG_3179     TRUE 0.672 80.000 0.292 NA   NA
 3696714 3696715 GTNG_3181 GTNG_3182     TRUE 0.957 19.000 0.147 NA Y NA
 3696716 3696717 GTNG_3183 GTNG_3184 yhjB   TRUE 0.959 -3.000 0.500 NA   NA
 3696717 3696718 GTNG_3184 GTNG_3185     TRUE 0.725 44.000 0.107 NA   NA
 3696718 3696719 GTNG_3185 GTNG_3186     TRUE 0.766 176.000 0.667 0.006   NA
 3696719 3696720 GTNG_3186 GTNG_3187     FALSE 0.011 246.000 0.000 NA   NA
 3696720 3696721 GTNG_3187 GTNG_3188     FALSE 0.002 470.000 0.000 NA   NA
 3696721 3696722 GTNG_3188 GTNG_3189     FALSE 0.007 670.000 0.000 1.000 N NA
 3696722 3696723 GTNG_3189 GTNG_3190     FALSE 0.240 13.000 0.000 NA   NA
 3696723 3696724 GTNG_3190 GTNG_3191     FALSE 0.091 104.000 0.000 NA   NA
 3696725 3696726 GTNG_3192 GTNG_3193     FALSE 0.281 40.000 0.000 NA   NA
 3696726 3696727 GTNG_3193 GTNG_3194     TRUE 0.974 -3.000 0.667 1.000   NA
 3696727 3696728 GTNG_3194 GTNG_3195     FALSE 0.001 698.000 0.000 NA   NA
 3696728 3696729 GTNG_3195 GTNG_3196     FALSE 0.032 180.000 0.000 NA   NA
 3696730 3696731 GTNG_3197 GTNG_3198     FALSE 0.006 286.000 0.000 NA   NA
 3696731 3696732 GTNG_3198 GTNG_3199     TRUE 0.559 31.000 0.007 NA   NA
 3696732 3696733 GTNG_3199 GTNG_3200     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 3696733 3696734 GTNG_3200 GTNG_3201   ktrB TRUE 0.733 18.000 0.000 1.000 N NA
 3696734 3696735 GTNG_3201 GTNG_3202 ktrB   FALSE 0.012 368.000 0.000 NA N NA
 3696735 3696736 GTNG_3202 GTNG_3203     TRUE 0.859 -3.000 0.118 NA   NA
 3696736 3696737 GTNG_3203 GTNG_3204     TRUE 0.636 13.000 0.067 NA   NA
 3696737 3696738 GTNG_3204 GTNG_3205     TRUE 0.997 -13.000 0.711 0.037 Y NA
 3696738 3696739 GTNG_3205 GTNG_3206     TRUE 0.992 2.000 0.733 0.037 Y NA
 3696742 3696743 GTNG_3209 GTNG_3210     FALSE 0.005 302.000 0.000 NA   NA
 3696744 3696745 GTNG_3211 GTNG_3212     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 3696746 3696747 GTNG_3213 GTNG_3214     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 3696748 3696749 GTNG_3215 GTNG_3216     TRUE 0.994 -3.000 0.500 0.006 Y NA
 3696749 3696750 GTNG_3216 GTNG_3217     FALSE 0.336 349.000 0.529 1.000 Y NA
 3696752 3696753 GTNG_3219 GTNG_3220     FALSE 0.004 493.000 0.000 1.000   NA
 3696753 3696754 GTNG_3220 GTNG_3221     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3696754 3696755 GTNG_3221 GTNG_3222     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3696755 3696756 GTNG_3222 GTNG_3224     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3696756 3696757 GTNG_3224 GTNG_3225     TRUE 0.986 -3.000 0.182 0.037 Y NA
 3696757 3696758 GTNG_3225 GTNG_3226     TRUE 0.930 15.000 0.000 0.037 Y NA
 3696758 3696759 GTNG_3226 GTNG_3227     TRUE 0.949 18.000 0.000 0.037 Y NA
 3696759 3696760 GTNG_3227 GTNG_3228     FALSE 0.015 392.000 0.000 1.000 N NA
 3696761 3696762 GTNG_3229 GTNG_3230     TRUE 0.584 111.000 0.190 1.000   NA
 3696762 3696763 GTNG_3230 GTNG_3231     TRUE 0.852 40.000 0.194 1.000   NA
 3696763 3696764 GTNG_3231 GTNG_3232   pdxA TRUE 0.944 -3.000 0.300 1.000   NA
 3696766 3696767 GTNG_3234 GTNG_3235     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 3696767 3696768 GTNG_3235 GTNG_3236     TRUE 0.540 23.000 0.000 1.000   NA
 3696768 3696769 GTNG_3236 GTNG_3237     TRUE 0.862 6.000 0.080 0.006   NA
 3696772 3696773 GTNG_3240 GTNG_3241     FALSE 0.055 154.000 0.000 NA   NA
 3696773 3696774 GTNG_3241 GTNG_3243     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3696774 3696775 GTNG_3243 GTNG_3244     TRUE 0.955 157.000 1.000 0.037 Y NA
 3696777 3696778 GTNG_3246 GTNG_3247     TRUE 0.940 -31.000 0.200 NA   NA
 3696778 3696779 GTNG_3247 GTNG_3248     TRUE 0.622 0.000 0.022 NA   NA
 3696779 3696780 GTNG_3248 GTNG_3249     FALSE 0.006 289.000 0.000 NA   NA
 3696780 3696781 GTNG_3249 GTNG_3250     TRUE 0.770 6.000 0.118 1.000   NA
 3696781 3696782 GTNG_3250 GTNG_3251     FALSE 0.037 174.000 0.000 NA   NA
 3696784 3696785 GTNG_3253 GTNG_3255     FALSE 0.005 301.000 0.000 NA   NA
 3696785 3696786 GTNG_3255 GTNG_3256     FALSE 0.127 71.000 0.000 NA   NA
 3696786 3696787 GTNG_3256 GTNG_3257   wzy FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3696787 3696788 GTNG_3257 GTNG_3258 wzy   FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 3696788 3696789 GTNG_3258 GTNG_3259     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 3696789 3696790 GTNG_3259 GTNG_3260     FALSE 0.049 159.000 0.000 NA   NA
 3696790 3696791 GTNG_3260 GTNG_3261   wzx TRUE 0.921 -7.000 0.033 0.067   NA
 3696791 3696792 GTNG_3261 GTNG_3262 wzx   TRUE 0.537 21.000 0.000 1.000   NA
 3696792 3696793 GTNG_3262 GTNG_3263     TRUE 0.584 139.000 0.000 NA Y NA
 3696793 3696794 GTNG_3263 GTNG_3264   gtaB TRUE 0.943 15.000 0.182 NA Y NA
 3696794 3696795 GTNG_3264 GTNG_3265 gtaB   FALSE 0.050 402.000 0.000 1.000 Y NA
 3696797 3696798 GTNG_3267 GTNG_3268 epsX wze TRUE 0.799 34.000 0.083 1.000   NA
 3696798 3696799 GTNG_3268 GTNG_3269 wze wzz TRUE 0.957 -10.000 0.158 1.000 N NA
 3696799 3696800 GTNG_3269 GTNG_3270 wzz   FALSE 0.347 141.000 0.105 NA   NA
 3696800 3696801 GTNG_3270 GTNG_3271   fabZ FALSE 0.118 158.000 0.006 NA   NA
 3696801 3696802 GTNG_3271 GTNG_3272 fabZ   FALSE 0.174 62.000 0.000 NA   NA
 3696802 3696803 GTNG_3272 GTNG_3273   flhP FALSE 0.240 13.000 0.000 NA   NA
 3696803 3696804 GTNG_3273 GTNG_3274 flhP flhO TRUE 0.986 19.000 0.248 0.003 Y NA
 3696804 3696805 GTNG_3274 GTNG_3275 flhO   TRUE 0.850 56.000 0.186 1.000 N NA
 3696805 3696806 GTNG_3275 GTNG_3276     TRUE 0.674 106.000 0.284 1.000   NA
 3696808 3696809 GTNG_3278 GTNG_3279     TRUE 0.994 -3.000 0.435 0.001 Y NA
 3696809 3696810 GTNG_3279 GTNG_3280     TRUE 0.892 26.000 0.100 1.000 N NA
 3696810 3696811 GTNG_3280 GTNG_3281     TRUE 0.914 13.000 0.033 1.000 Y NA
 3696811 3696812 GTNG_3281 GTNG_3282     TRUE 0.992 -28.000 0.143 0.002 Y NA
 3696812 3696813 GTNG_3282 GTNG_3283     TRUE 0.940 9.000 0.143 1.000 Y NA
 3696813 3696814 GTNG_3283 GTNG_3284     TRUE 0.955 25.000 0.000 0.037 Y NA
 3696814 3696815 GTNG_3284 GTNG_3285     TRUE 0.977 26.000 0.118 0.037 Y NA
 3696815 3696816 GTNG_3285 GTNG_3286     FALSE 0.028 313.000 0.000 1.000 N NA
 3696816 3696817 GTNG_3286 GTNG_3287   spoIIQ FALSE 0.011 309.000 0.000 1.000   NA
 3696817 3696818 GTNG_3287 GTNG_3288 spoIIQ spoIID FALSE 0.508 125.000 0.135 1.000   NA
 3696818 3696819 GTNG_3288 GTNG_3289 spoIID   FALSE 0.136 296.000 0.243 1.000 N NA
 3696819 3696820 GTNG_3289 GTNG_3290     TRUE 0.914 32.000 0.346 NA   NA
 3696820 3696821 GTNG_3290 GTNG_3291     FALSE 0.052 337.000 0.228 NA   NA
 3696821 3696822 GTNG_3291 GTNG_3292     FALSE 0.334 88.000 0.047 NA   NA
 3696822 3696823 GTNG_3292 GTNG_3293     TRUE 0.970 6.000 0.128 0.002 Y NA
 3696823 3696824 GTNG_3293 GTNG_3294     TRUE 0.982 -3.000 0.041 0.002 Y NA
 3696824 3696825 GTNG_3294 GTNG_3295     TRUE 0.986 19.000 0.253 0.004 Y NA
 3696825 3696826 GTNG_3295 GTNG_3296     TRUE 0.995 -3.000 0.506 0.002 Y NA
 3696826 3696827 GTNG_3296 GTNG_3297     TRUE 0.990 -3.000 0.223 0.004 Y NA
 3696827 3696828 GTNG_3297 GTNG_3298     TRUE 0.864 112.000 0.035 0.004 Y NA
 3696828 3696829 GTNG_3298 GTNG_3299     TRUE 0.986 0.000 0.258 0.004 Y NA
 3696829 3696830 GTNG_3299 GTNG_3300     TRUE 0.945 4.000 0.000 0.004 Y NA
 3696830 3696831 GTNG_3300 GTNG_3301     TRUE 0.948 4.000 0.000 0.002 Y NA
 3696831 3696832 GTNG_3301 GTNG_3302     TRUE 0.990 -9.000 0.091 0.002 Y NA
 3696832 3696833 GTNG_3302 GTNG_3303   atpC FALSE 0.307 222.000 0.003 1.000 Y NA
 3696833 3696834 GTNG_3303 GTNG_3304 atpC   TRUE 0.995 23.000 0.837 0.002 Y NA
 3696834 3696835 GTNG_3304 GTNG_3305     TRUE 0.995 28.000 0.724 0.002 Y NA
 3696835 3696836 GTNG_3305 GTNG_3306     TRUE 0.989 59.000 0.846 0.002 Y NA
 3696836 3696837 GTNG_3306 GTNG_3307     TRUE 0.996 25.000 0.864 0.002 Y NA
 3696837 3696838 GTNG_3307 GTNG_3308     TRUE 0.990 -3.000 0.222 0.002 Y NA
 3696838 3696839 GTNG_3308 GTNG_3309     TRUE 0.858 109.000 0.402 0.002   NA
 3696839 3696840 GTNG_3309 GTNG_3310   atpB TRUE 0.797 79.000 0.189 0.002   NA
 3696840 3696841 GTNG_3310 GTNG_3311 atpB atpI TRUE 0.923 19.000 0.330 1.000   NA
 3696841 3696842 GTNG_3311 GTNG_3312 atpI   TRUE 0.779 7.000 0.187 NA   NA
 3696842 3696843 GTNG_3312 GTNG_3313   upp FALSE 0.002 415.000 0.000 NA   NA
 3696843 3696844 GTNG_3313 GTNG_3314 upp glyA FALSE 0.442 145.000 0.051 1.000 N NA
 3696844 3696845 GTNG_3314 GTNG_3315 glyA   FALSE 0.498 94.000 0.145 NA   NA
 3696845 3696846 GTNG_3315 GTNG_3316     TRUE 0.852 36.000 0.218 NA   NA
 3696846 3696847 GTNG_3316 GTNG_3317     FALSE 0.239 220.000 0.150 1.000 N NA
 3696847 3696848 GTNG_3317 GTNG_3318     TRUE 0.937 14.000 0.105 1.000 Y NA
 3696848 3696849 GTNG_3318 GTNG_3319     FALSE 0.471 138.000 0.196 NA   NA
 3696849 3696850 GTNG_3319 GTNG_3320     FALSE 0.164 231.000 0.230 NA   NA
 3696850 3696851 GTNG_3320 GTNG_3321     FALSE 0.283 138.000 0.062 NA   NA
 3696851 3696852 GTNG_3321 GTNG_3322     TRUE 0.691 63.000 0.178 NA   NA
 3696852 3696853 GTNG_3322 GTNG_3323   prfA TRUE 0.988 -10.000 0.084 0.032 Y NA
 3696853 3696854 GTNG_3323 GTNG_3324 prfA   FALSE 0.194 95.000 0.002 NA   NA
 3696854 3696855 GTNG_3324 GTNG_3325   tdk FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 3696855 3696856 GTNG_3325 GTNG_3326 tdk rpmE FALSE 0.358 165.000 0.052 1.000 N NA
 3696856 3696857 GTNG_3326 GTNG_3327 rpmE rho FALSE 0.145 256.000 0.115 1.000 N NA
 3696857 3696858 GTNG_3327 GTNG_3328 rho glpX FALSE 0.065 267.000 0.005 1.000 N NA
 3696858 3696859 GTNG_3328 GTNG_3329 glpX   TRUE 0.910 33.000 0.170 1.000 N NA
 3696859 3696860 GTNG_3329 GTNG_3330     FALSE 0.494 131.000 0.049 1.000 N NA
 3696860 3696861 GTNG_3330 GTNG_3331     TRUE 0.804 93.000 0.061 1.000 Y NA
 3696861 3696862 GTNG_3331 GTNG_3332     FALSE 0.378 165.000 0.170 1.000   NA
 3696864 3696865 GTNG_3334 GTNG_3335 ctrA   FALSE 0.317 166.000 0.029 1.000 N NA
 3696865 3696866 GTNG_3335 GTNG_3336     FALSE 0.055 293.000 0.023 1.000 N NA
 3696866 3696867 GTNG_3336 GTNG_3337     TRUE 0.862 15.000 0.146 1.000 N NA
 3696867 3696868 GTNG_3337 GTNG_3338     FALSE 0.435 219.000 0.432 1.000 N NA
 3696868 3696869 GTNG_3338 GTNG_3339     TRUE 0.977 50.000 0.270 0.004 Y NA
 3696869 3696870 GTNG_3339 GTNG_3340     TRUE 0.934 49.000 0.110 1.000 Y NA
 3696870 3696871 GTNG_3340 GTNG_3341     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 3696871 3696872 GTNG_3341 GTNG_3343     FALSE 0.042 167.000 0.000 NA   NA
 3696874 3696875 GTNG_3345 GTNG_3346   argS FALSE 0.353 58.000 0.004 NA   NA
 3696875 3696876 GTNG_3346 GTNG_3347 argS   TRUE 0.676 5.000 0.079 NA   NA
 3696876 3696877 GTNG_3347 GTNG_3348     FALSE 0.088 121.000 0.000 NA   NA
 3696877 3696878 GTNG_3348 GTNG_3349     FALSE 0.228 138.000 0.006 1.000   NA
 3696878 3696879 GTNG_3349 GTNG_3350     TRUE 0.955 17.000 0.141 1.000 Y NA
 3696881 3696882 GTNG_3352 GTNG_3353     TRUE 0.673 18.000 0.044 NA   NA
 3696883 3696884 GTNG_3354 GTNG_3355     FALSE 0.443 102.000 0.070 1.000   NA
 3696885 3696886 GTNG_3356 GTNG_3357     TRUE 0.653 14.000 0.071 NA   NA
 3696886 3696887 GTNG_3357 GTNG_3358     FALSE 0.291 118.000 0.039 NA   NA
 3696889 3696890 GTNG_3360 GTNG_3361   eutD FALSE 0.076 315.000 0.123 1.000 N NA
 3696891 3696892 GTNG_3362 GTNG_3363     FALSE 0.019 294.000 0.023 NA   NA
 3696892 3696893 GTNG_3363 GTNG_3364     TRUE 0.961 25.000 0.722 NA   NA
 3696893 3696894 GTNG_3364 GTNG_3365     TRUE 0.552 -22.000 0.000 NA   NA
 3696894 3696895 GTNG_3365 GTNG_3366     TRUE 0.988 -37.000 1.000 NA   NA
 3696896 3696897 GTNG_3367 GTNG_3368     FALSE 0.006 626.000 0.042 NA   NA
 3696897 3696898 GTNG_3368 GTNG_3369     TRUE 0.648 17.000 0.044 NA   NA
 3696899 3696900 GTNG_3370 GTNG_3371 rsbV   TRUE 0.741 151.000 0.714 NA   NA
 3696900 3696901 GTNG_3371 GTNG_3372     TRUE 0.992 -46.000 0.838 1.000 N NA
 3696902 3696903 GTNG_3373 GTNG_3374     FALSE 0.064 245.000 0.000 1.000 N NA
 3696903 3696904 GTNG_3374 GTNG_3375     FALSE 0.007 762.000 0.000 1.000 N NA
 3696904 3696905 GTNG_3375 GTNG_3376     FALSE 0.011 247.000 0.000 NA   NA
 3696905 3696906 GTNG_3376 GTNG_3377     FALSE 0.066 223.000 0.044 NA   NA
 3696906 3696907 GTNG_3377 GTNG_3378     FALSE 0.086 331.000 0.000 1.000 Y NA
 3696907 3696908 GTNG_3378 GTNG_3379     FALSE 0.392 93.000 0.000 1.000 N NA
 3696909 3696910 GTNG_3380 GTNG_3381     TRUE 0.793 118.000 0.360 1.000 N NA
 3696910 3696911 GTNG_3381 GTNG_3382     FALSE 0.338 30.000 0.000 NA   NA
 3696911 3696912 GTNG_3382 GTNG_3383     FALSE 0.245 47.000 0.000 NA   NA
 3696914 3696915 GTNG_3385 GTNG_3386     TRUE 0.931 71.000 0.179 0.043 Y NA
 3696915 3696916 GTNG_3386 GTNG_3387     TRUE 0.988 -3.000 0.392 1.000 Y NA
 3696917 3696918 GTNG_3388 GTNG_3389     TRUE 0.990 2.000 0.959 1.000 Y NA
 3696918 3696919 GTNG_3389 GTNG_3390     TRUE 0.994 4.000 0.957 0.004 Y NA
 3696919 3696920 GTNG_3390 GTNG_3391     TRUE 0.984 18.000 0.234 0.004 Y NA
 3696920 3696921 GTNG_3391 GTNG_3392   spoU FALSE 0.043 275.000 0.000 1.000 N NA
 3696923 3696924 GTNG_3394 GTNG_3395     FALSE 0.005 410.000 0.000 1.000   NA
 3696924 3696925 GTNG_3395 GTNG_3396     FALSE 0.090 105.000 0.000 NA   NA
 3696926 3696927 GTNG_3397 GTNG_3398   manA FALSE 0.281 168.000 0.015 1.000 N NA
 3696928 3696929 GTNG_3399 GTNG_3400     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3696932 3696933 GTNG_3403 GTNG_3404     FALSE 0.405 9.000 0.000 1.000   NA
 3696936 3696937 GTNG_3407 GTNG_3408     FALSE 0.075 132.000 0.000 NA   NA
 3696939 3696940 GTNG_3410 GTNG_3411     FALSE 0.500 72.000 0.060 1.000   NA
 3696940 3696941 GTNG_3411 GTNG_3412     TRUE 0.768 7.000 0.176 NA   NA
 3696941 3696942 GTNG_3412 GTNG_3413   yycH TRUE 0.986 -13.000 0.890 NA   NA
 3696942 3696943 GTNG_3413 GTNG_3414 yycH yycG TRUE 0.978 -19.000 0.575 NA   NA
 3696943 3696944 GTNG_3414 GTNG_3415 yycG yycF TRUE 0.987 7.000 0.597 0.014 Y NA
 3696944 3696945 GTNG_3415 GTNG_3416 yycF purA FALSE 0.109 225.000 0.003 1.000 N NA
 3696945 3696946 GTNG_3416 GTNG_3417 purA   FALSE 0.456 127.000 0.018 1.000 N NA
 3696946 3696947 GTNG_3417 GTNG_3418   rplI TRUE 0.580 95.000 0.064 1.000 N NA
 3696947 3696948 GTNG_3418 GTNG_3419 rplI   TRUE 0.877 -3.000 0.020 1.000 N NA
 3696948 3696949 GTNG_3419 GTNG_3420     TRUE 0.723 47.000 0.116 NA   NA
 3696950 3696951 GTNG_3421 GTNG_3422 tnpA2 tnpB2 TRUE 0.996 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 3696951 3696952 GTNG_3422 GTNG_3423 tnpB2 tnpC TRUE 0.882 -7.000 0.000 0.044   NA
 3696952 3696953 GTNG_3423 GTNG_3424 tnpC   FALSE 0.201 83.000 0.000 1.000   NA
 3696954 3696955 GTNG_3425 GTNG_3426     TRUE 0.803 1.000 0.015 1.000 N NA
 3696955 3696956 GTNG_3426 GTNG_3427     TRUE 0.821 30.000 0.015 1.000 N NA
 3696956 3696957 GTNG_3427 GTNG_3428   ychF FALSE 0.359 217.000 0.029 1.000 Y NA
 3696957 3696958 GTNG_3428 GTNG_3429 ychF   FALSE 0.095 100.000 0.000 NA   NA
 3696958 3696959 GTNG_3429 GTNG_3431     FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 3696959 3696960 GTNG_3431 GTNG_3432     TRUE 0.841 19.000 0.171 NA   NA
 3696962 3696963 GTNG_3434 GTNG_3435     FALSE 0.453 52.000 0.017 NA   NA
 3696963 3696964 GTNG_3435 GTNG_3436     TRUE 0.992 -64.000 0.827 1.000 N NA
 3696964 3696965 GTNG_3436 GTNG_3437     TRUE 0.552 125.000 0.069 1.000 N NA
 3696965 3696966 GTNG_3437 GTNG_3438   gidB FALSE 0.431 160.000 0.089 1.000 N NA
 3696966 3696967 GTNG_3438 GTNG_3439 gidB   TRUE 0.963 24.000 0.466 1.000 N NA
 3696967 3696968 GTNG_3439 GTNG_3440   trmE TRUE 0.890 17.000 0.266 1.000   NA
 3696968 3696969 GTNG_3440 GTNG_3441 trmE jag FALSE 0.070 277.000 0.116 1.000   NA
 3696969 3696970 GTNG_3441 GTNG_3442 jag   TRUE 0.855 -3.000 0.071 1.000   NA
 3696970 3696971 GTNG_3442 GTNG_3443   rnpA FALSE 0.487 122.000 0.025 1.000 N NA
 3696971 3696972 GTNG_3443 GTNG_3444 rnpA rpmH TRUE 0.869 80.000 0.787 1.000   NA
 10730001 3693386 GTNG_3447 GTNG_3448     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693387 3693388 GTNG_3449 GTNG_3450 radC   FALSE 0.026 192.000 0.000 NA   NA
 3693391 3693392 GTNG_3453 GTNG_3454     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3693392 3693393 GTNG_3454 GTNG_3455   traL FALSE 0.240 13.000 0.000 NA   NA
 3693393 3693394 GTNG_3455 GTNG_3456 traL   FALSE 0.009 265.000 0.000 NA   NA
 3693394 3693395 GTNG_3456 GTNG_3457   traG FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693395 3693396 GTNG_3457 GTNG_3458 traG traE FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693396 3693397 GTNG_3458 GTNG_3459 traE traD TRUE 0.942 17.000 0.625 NA   NA
 3693397 3693398 GTNG_3459 GTNG_3460 traD   FALSE 0.003 358.000 0.000 NA   NA
 3693399 3693400 GTNG_3461 GTNG_3462     FALSE 0.134 220.000 0.000 0.005   NA
 3693400 3693401 GTNG_3462 GTNG_3463   repA FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 3693403 3693404 GTNG_3465 GTNG_3466     FALSE 0.297 2.000 0.000 NA   NA
 3693404 3693405 GTNG_3466 GTNG_3467     FALSE 0.311 35.000 0.000 NA   NA
 3693406 3693407 GTNG_3468 GTNG_3469     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3693408 3693409 GTNG_3470 GTNG_3471     TRUE 0.525 -10.000 0.000 NA   NA
 3693410 3693411 GTNG_3472 GTNG_3473     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3693411 3693412 GTNG_3473 GTNG_3474     FALSE 0.080 129.000 0.000 NA   NA
 3693412 3693413 GTNG_3474 GTNG_3475     FALSE 0.082 128.000 0.000 NA   NA
 3693413 3693414 GTNG_3475 GTNG_3476     FALSE 0.289 17.000 0.000 NA   NA
 3693415 3693416 GTNG_3477 GTNG_3478 traA traK TRUE 0.966 19.000 0.333 0.001   NA
 3693416 3693417 GTNG_3478 GTNG_3479 traK traI TRUE 0.755 22.000 0.000 1.000 N NA
 3693417 3693418 GTNG_3479 GTNG_3480 traI ltrC FALSE 0.034 224.000 0.000 1.000   NA
 3693418 3693419 GTNG_3480 GTNG_3481 ltrC   FALSE 0.231 8.000 0.000 NA   NA
 3693419 3693420 GTNG_3481 GTNG_3482     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3693420 3693421 GTNG_3482 GTNG_3483     FALSE 0.001 1159.000 0.000 NA   NA
 3693421 3693422 GTNG_3483 GTNG_3484     FALSE 0.102 81.000 0.000 NA   NA
 3693422 3693423 GTNG_3484 GTNG_3485     FALSE 0.380 103.000 0.000 1.000 N NA
 3693423 3693424 GTNG_3485 GTNG_3486     TRUE 0.988 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 3693425 3693426 GTNG_3487 GTNG_3488     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 3693427 3693428 GTNG_3489 GTNG_3490     TRUE 0.938 -9.000 0.054 0.044   NA
 3693430 3693431 GTNG_3492 GTNG_3493     FALSE 0.009 335.000 0.000 1.000   NA
 3693434 3693435 GTNG_3496 GTNG_3497     TRUE 0.663 15.000 0.000 1.000 N NA
 3693435 3693436 GTNG_3497 GTNG_3498     FALSE 0.423 14.000 0.000 1.000   NA