MicrobesOnline Operon Predictions for Coxiella burnetii CbuG_Q212

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5609218 5609219 CbuG_0002 CbuG_0003     TRUE 0.932 144.000 0.328 1.000 Y NA
 5609219 5609220 CbuG_0003 CbuG_0004   recF TRUE 0.996 5.000 0.318 1.000 Y NA
 5609220 5609221 CbuG_0004 CbuG_0005 recF gyrB TRUE 0.705 296.000 0.249 0.008 Y NA
 5609221 5609222 CbuG_0005 CbuG_0006 gyrB   FALSE 0.332 145.000 0.000 1.000 Y NA
 5609223 5609224 CbuG_0007 CbuG_0008     FALSE 0.089 51.000 0.000 NA   NA
 5609226 5609227 CbuG_0010 CbuG_0011     FALSE 0.072 107.000 0.000 NA   NA
 5609227 5609228 CbuG_0011 CbuG_0012     TRUE 0.995 0.000 0.598 0.006   NA
 5609229 5609230 CbuG_0013 CbuG_0014   ftsE TRUE 0.982 7.000 0.117 1.000 N NA
 5609230 5609231 CbuG_0014 CbuG_0015 ftsE ftsX TRUE 0.990 -3.000 0.121 1.000 Y NA
 5609231 5609232 CbuG_0015 CbuG_0016 ftsX   FALSE 0.108 49.000 0.000 1.000   NA
 5609233 5609234 CbuG_0017 CbuG_0018     FALSE 0.159 31.000 0.000 NA   NA
 5609235 5609236 CbuG_0019 CbuG_0020 rpoH com1 TRUE 0.546 26.000 0.000 1.000 N NA
 5609238 5609239 CbuG_0022 CbuG_0023 glyQ glyS TRUE 0.998 -6.000 0.651 0.002 Y NA
 5609239 5609240 CbuG_0023 CbuG_0024 glyS sun TRUE 0.912 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5609242 5609243 CbuG_0026 CbuG_0027 rpmH rnpA TRUE 0.995 -3.000 0.787 1.000   NA
 5609243 5609244 CbuG_0027 CbuG_0028 rnpA   TRUE 0.954 36.000 0.540 NA   NA
 5609244 5609245 CbuG_0028 CbuG_0029     TRUE 0.993 4.000 0.461 NA   NA
 5609245 5609246 CbuG_0029 CbuG_0030     FALSE 0.047 145.000 0.000 NA   NA
 5609246 5609247 CbuG_0030 CbuG_0031   trmE FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 5609249 5609250 CbuG_0033 CbuG_0034 gidA gidB TRUE 0.975 32.000 0.466 1.000 N NA
 5609250 5609251 CbuG_0034 CbuG_0035 gidB parA TRUE 0.994 7.000 0.339 1.000 N NA
 5609251 5609252 CbuG_0035 CbuG_0036 parA parB TRUE 0.996 -9.000 0.827 1.000 N NA
 5609252 5609253 CbuG_0036 CbuG_0037 parB   TRUE 0.797 10.000 0.000 1.000 N NA
 5609253 5609254 CbuG_0037 CbuG_0038     TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5609254 5609255 CbuG_0038 CbuG_0039     FALSE 0.087 52.000 0.000 NA   NA
 5609255 5609256 CbuG_0039 CbuG_0040     FALSE 0.075 81.000 0.000 NA   NA
 5609256 5609257 CbuG_0040 CbuG_0041     FALSE 0.271 20.000 0.000 NA   NA
 5609259 5609260 CbuG_0043 CbuG_0044     TRUE 0.549 -3.000 0.000 1.000   NA
 5609260 5609261 CbuG_0044 CbuG_0045     FALSE 0.078 63.000 0.000 NA   NA
 5609262 5609263 CbuG_0046 CbuG_0047     FALSE 0.007 616.000 0.000 NA   NA
 5609263 5609264 CbuG_0047 CbuG_0048     FALSE 0.078 95.000 0.000 NA   NA
 5609265 5609266 CbuG_0049 CbuG_0050 atpI atpB TRUE 0.996 1.000 0.291 1.000 Y NA
 5609266 5609267 CbuG_0050 CbuG_0051 atpB atpE TRUE 0.986 18.000 0.557 0.007   NA
 5609267 5609268 CbuG_0051 CbuG_0052 atpE atpF TRUE 0.917 128.000 0.666 0.007   NA
 5609268 5609269 CbuG_0052 CbuG_0053 atpF atpH TRUE 0.996 0.000 0.242 0.007 Y NA
 5609269 5609270 CbuG_0053 CbuG_0054 atpH atpA TRUE 0.998 8.000 0.864 0.007 Y NA
 5609270 5609271 CbuG_0054 CbuG_0055 atpA atpG TRUE 0.977 99.000 0.846 0.007 Y NA
 5609271 5609272 CbuG_0055 CbuG_0056 atpG atpD TRUE 0.986 36.000 0.724 0.007 Y NA
 5609272 5609273 CbuG_0056 CbuG_0057 atpD atpC TRUE 0.971 124.000 0.837 0.007 Y NA
 5609273 5609274 CbuG_0057 CbuG_0058 atpC glmU TRUE 0.943 19.000 0.067 1.000 N NA
 5609274 5609275 CbuG_0058 CbuG_0059 glmU   FALSE 0.015 267.000 0.000 NA   NA
 5609275 5609276 CbuG_0059 CbuG_0060     FALSE 0.083 55.000 0.000 NA   NA
 5609276 5609277 CbuG_0060 CbuG_0061     FALSE 0.058 128.000 0.000 NA   NA
 5609279 5609280 CbuG_0063 CbuG_0064 pyrC rnt TRUE 0.965 -13.000 0.068 1.000 N NA
 5609281 5609282 CbuG_0065 CbuG_0066     FALSE 0.080 58.000 0.000 NA   NA
 5609282 5609283 CbuG_0066 CbuG_0067     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 5609284 5609285 CbuG_0068 CbuG_0069 sodB dapB TRUE 0.841 2.000 0.000 1.000 N NA
 5609285 5609286 CbuG_0069 CbuG_0070 dapB   TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5609286 5609287 CbuG_0070 CbuG_0071     FALSE 0.009 379.000 0.000 NA   NA
 5609288 5609289 CbuG_0072 CbuG_0073     FALSE 0.334 -72.000 0.000 NA   NA
 5609293 5609294 CbuG_0077 CbuG_0078     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609294 5609295 CbuG_0078 CbuG_0079     FALSE 0.014 273.000 0.000 NA   NA
 5609295 5609296 CbuG_0079 CbuG_0080     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 5609300 5609301 CbuG_0084 CbuG_0085     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5609301 5609302 CbuG_0085 CbuG_0086     FALSE 0.089 51.000 0.000 NA   NA
 5609302 5609303 CbuG_0086 CbuG_0087     FALSE 0.052 137.000 0.000 NA   NA
 5609306 5609307 CbuG_0090 CbuG_0091     FALSE 0.312 17.000 0.000 NA   NA
 5609307 5609308 CbuG_0091 CbuG_0092     FALSE 0.459 64.000 0.000 1.000 Y NA
 5609311 5609312 CbuG_0095 CbuG_0096 gvcPB gvcPA TRUE 0.957 68.000 0.316 0.002 Y NA
 5609312 5609313 CbuG_0096 CbuG_0097 gvcPA gvcH TRUE 0.995 3.000 0.249 1.000 Y NA
 5609313 5609314 CbuG_0097 CbuG_0098 gvcH gvcT TRUE 0.995 11.000 0.317 0.003 Y NA
 5609314 5609315 CbuG_0098 CbuG_0099 gvcT groEL FALSE 0.237 126.000 0.000 1.000 N NA
 5609315 5609316 CbuG_0099 CbuG_0100 groEL groES TRUE 0.687 28.000 0.000 1.000 Y NA
 5609317 5609318 CbuG_0101 CbuG_0102 acnA   FALSE 0.465 11.000 0.000 1.000   NA
 5609322 5609323 CbuG_0106 CbuG_0107 accB accC TRUE 0.995 7.000 0.275 0.003 Y NA
 5609324 5609325 CbuG_0108 CbuG_0109 arcB   TRUE 0.800 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5609325 5609326 CbuG_0109 CbuG_0110   hemF TRUE 0.604 35.000 0.000 1.000 Y NA
 5609326 5609327 CbuG_0110 CbuG_0111 hemF   FALSE 0.090 90.000 0.000 1.000   NA
 5609328 5609329 CbuG_0112 CbuG_0113     TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5609329 5609330 CbuG_0113 CbuG_0114     FALSE 0.049 143.000 0.000 NA   NA
 5609331 5609332 CbuG_0115 CbuG_0116     TRUE 0.980 3.000 0.174 NA   NA
 5609333 5609334 CbuG_0117 CbuG_0118 purM purN TRUE 0.995 -3.000 0.230 0.004 Y NA
 5609334 5609335 CbuG_0118 CbuG_0119 purN ihfB FALSE 0.286 86.000 0.000 1.000 N NA
 5609336 5609337 CbuG_0120 CbuG_0121     FALSE 0.075 82.000 0.000 NA   NA
 5609338 5609339 CbuG_0122 CbuG_0123     TRUE 0.749 124.000 0.172 NA   NA
 5609339 5609340 CbuG_0123 CbuG_0124   gmhA TRUE 0.989 6.000 0.187 1.000 N NA
 5609340 5609341 CbuG_0124 CbuG_0125 gmhA   TRUE 0.994 0.000 0.613 NA   NA
 5609342 5609343 CbuG_0126 CbuG_0127   sspB FALSE 0.077 88.000 0.000 NA   NA
 5609343 5609344 CbuG_0127 CbuG_0128 sspB sspA TRUE 0.995 2.000 0.831 NA   NA
 5609344 5609345 CbuG_0128 CbuG_0129 sspA rpsI TRUE 0.805 31.000 0.014 NA N NA
 5609345 5609346 CbuG_0129 CbuG_0130 rpsI rplM TRUE 0.994 19.000 0.601 0.034 Y NA
 5609347 5609348 CbuG_0131 CbuG_0132     FALSE 0.110 42.000 0.000 NA   NA
 5609348 5609349 CbuG_0132 CbuG_0133     FALSE 0.072 108.000 0.000 NA   NA
 5609349 5609350 CbuG_0133 CbuG_0134     FALSE 0.126 36.000 0.000 NA   NA
 5609350 5609351 CbuG_0134 CbuG_0135     FALSE 0.077 73.000 0.000 NA   NA
 5609352 5609353 CbuG_0136 CbuG_0137     FALSE 0.447 10.000 0.000 NA   NA
 5609357 5609358 CbuG_0141 CbuG_0142     FALSE 0.013 285.000 0.000 NA   NA
 5609358 5609359 CbuG_0142 CbuG_0143     FALSE 0.098 54.000 0.000 1.000   NA
 5609363 5609364 CbuG_0147 CbuG_0148   feoB TRUE 0.993 0.000 0.455 NA   NA
 5609364 5609365 CbuG_0148 CbuG_0149 feoB feoA TRUE 0.995 1.000 0.229 1.000 Y NA
 5609365 5609366 CbuG_0149 CbuG_0150 feoA   FALSE 0.078 62.000 0.000 NA   NA
 5609366 5609367 CbuG_0150 CbuG_0151     FALSE 0.078 63.000 0.000 NA   NA
 5609367 5609368 CbuG_0151 CbuG_0152     FALSE 0.086 104.000 0.000 1.000   NA
 5609368 5609369 CbuG_0152 CbuG_0153     TRUE 0.977 98.000 1.000 1.000 Y NA
 5609369 5609370 CbuG_0153 CbuG_0154     FALSE 0.023 235.000 0.000 1.000   NA
 5609370 5609371 CbuG_0154 CbuG_0155     FALSE 0.098 47.000 0.000 NA   NA
 5609371 5609372 CbuG_0155 CbuG_0156   fbaA FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 5609376 5609377 CbuG_0160 CbuG_0161 pyk pgk TRUE 0.948 -13.000 0.002 0.010 Y NA
 5609377 5609378 CbuG_0161 CbuG_0162 pgk gap TRUE 0.779 72.000 0.017 0.010 Y NA
 5609378 5609379 CbuG_0162 CbuG_0163 gap tkt TRUE 0.958 15.000 0.022 1.000 Y NA
 5609381 5609382 CbuG_0165 CbuG_0166     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 5609383 5609384 CbuG_0167 CbuG_0168 glmS   FALSE 0.021 227.000 0.000 NA   NA
 5609384 5609385 CbuG_0168 CbuG_0169     FALSE 0.037 168.000 0.000 NA   NA
 5609387 5609388 CbuG_0171 CbuG_0172     FALSE 0.007 1536.000 0.000 NA   NA
 5609390 5609391 CbuG_0174 CbuG_0175     TRUE 0.829 5.000 0.000 1.000 N NA
 5609391 5609392 CbuG_0175 CbuG_0176     FALSE 0.227 129.000 0.000 1.000 N NA
 5609392 5609393 CbuG_0176 CbuG_0177     FALSE 0.077 73.000 0.000 NA   NA
 5609394 5609395 CbuG_0178 CbuG_0179     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609395 5609396 CbuG_0179 CbuG_0180     FALSE 0.338 -61.000 0.000 NA   NA
 5609396 5609397 CbuG_0180 CbuG_0181     FALSE 0.025 205.000 0.000 NA   NA
 5609397 5609398 CbuG_0181 CbuG_0182     TRUE 0.977 11.000 0.044 1.000 Y NA
 5609398 5609399 CbuG_0182 CbuG_0183     TRUE 0.965 -7.000 0.044 NA N NA
 5609399 5609400 CbuG_0183 CbuG_0184     TRUE 0.910 3.000 0.000 NA Y NA
 5609401 5609402 CbuG_0185 CbuG_0186 pdxB   FALSE 0.359 -19.000 0.000 NA   NA
 5609402 5609403 CbuG_0186 CbuG_0187     FALSE 0.123 37.000 0.000 NA   NA
 5609405 5609406 CbuG_0189 CbuG_0190 efp   TRUE 0.988 5.000 0.082 0.058 Y NA
 5609406 5609407 CbuG_0190 CbuG_0191     FALSE 0.021 222.000 0.000 NA   NA
 5609407 5609408 CbuG_0191 CbuG_0192     FALSE 0.086 53.000 0.000 NA   NA
 5609409 5609410 CbuG_0193 CbuG_0194     TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5609410 5609411 CbuG_0194 CbuG_0195   sodC FALSE 0.077 116.000 0.000 1.000   NA
 5609418 5609419 CbuG_0202 CbuG_0203 lolB   FALSE 0.075 79.000 0.000 NA   NA
 5609419 5609420 CbuG_0203 CbuG_0204   prs FALSE 0.246 22.000 0.000 NA   NA
 5609420 5609421 CbuG_0204 CbuG_0205 prs   TRUE 0.500 5.000 0.000 NA   NA
 5609424 5609425 CbuG_0208 CbuG_0209     TRUE 0.990 2.000 0.200 NA N NA
 5609425 5609426 CbuG_0209 CbuG_0210     TRUE 0.719 14.000 0.000 NA N NA
 5609426 5609427 CbuG_0210 CbuG_0211   rfbC TRUE 0.912 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5609427 5609428 CbuG_0211 CbuG_0212 rfbC   FALSE 0.488 10.000 0.000 1.000   NA
 5609429 5609430 CbuG_0213 CbuG_0214 rplY pth TRUE 0.997 7.000 0.496 0.054 Y NA
 5609430 5609431 CbuG_0214 CbuG_0215 pth ychF TRUE 0.959 33.000 0.184 1.000 Y NA
 5609431 5609432 CbuG_0215 CbuG_0216 ychF   TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5609432 5609433 CbuG_0216 CbuG_0217     FALSE 0.078 66.000 0.000 NA   NA
 5609433 5609434 CbuG_0217 CbuG_0218     FALSE 0.044 149.000 0.000 NA   NA
 5609434 5609435 CbuG_0218 CbuG_0219     FALSE 0.078 99.000 0.000 NA   NA
 5609435 5609436 CbuG_0219 CbuG_0220     FALSE 0.076 102.000 0.000 NA   NA
 5609437 5609438 CbuG_0221 CbuG_0222     FALSE 0.397 -13.000 0.000 NA   NA
 5609439 5609440 CbuG_0223 CbuG_0224     FALSE 0.078 69.000 0.000 NA   NA
 5609441 5609442 CbuG_0225 CbuG_0226     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 5609443 5609444 CbuG_0227 CbuG_0228     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5609445 5609446 CbuG_0229 CbuG_0230     FALSE 0.075 83.000 0.000 NA   NA
 5609446 5609447 CbuG_0230 CbuG_0231   pilF FALSE 0.007 540.000 0.000 NA   NA
 5609447 5609448 CbuG_0231 CbuG_0232 pilF   FALSE 0.215 27.000 0.000 1.000   NA
 5609448 5609449 CbuG_0232 CbuG_0233   oppD FALSE 0.093 49.000 0.000 NA   NA
 5609449 5609450 CbuG_0233 CbuG_0234 oppD oppC FALSE 0.062 122.000 0.000 NA   NA
 5609450 5609451 CbuG_0234 CbuG_0235 oppC oppB FALSE 0.424 11.000 0.000 NA   NA
 5609451 5609452 CbuG_0235 CbuG_0236 oppB oppA FALSE 0.208 25.000 0.000 NA   NA
 5609454 5609455 CbuG_0238 CbuG_0239     FALSE 0.016 263.000 0.000 NA   NA
 5609455 5609456 CbuG_0239 CbuG_0240     FALSE 0.258 21.000 0.000 NA   NA
 5609456 5609457 CbuG_0240 CbuG_0241   parC TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5609460 5609461 CbuG_0244 CbuG_0245     FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 5609462 5609463 CbuG_0246 CbuG_0247 pabA rpe TRUE 0.731 -19.000 0.000 1.000 N NA
 5609463 5609464 CbuG_0247 CbuG_0248 rpe djlA TRUE 0.948 0.000 0.003 1.000 N NA
 5609465 5609466 CbuG_0249 CbuG_0250 gshA gshB TRUE 0.763 54.000 0.120 1.000   NA
 5609466 5609467 CbuG_0250 CbuG_0251 gshB   FALSE 0.008 419.000 0.000 NA   NA
 5609468 5609469 CbuG_0252 CbuG_0253     FALSE 0.047 145.000 0.000 NA   NA
 5609470 5609471 CbuG_0254 CbuG_0255 def2   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609473 5609474 CbuG_0257 CbuG_0258 hemL   TRUE 0.912 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5609474 5609475 CbuG_0258 CbuG_0259     TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5609476 5609477 CbuG_0260 CbuG_0261   ponA FALSE 0.447 10.000 0.000 NA   NA
 5609478 5609479 CbuG_0262 CbuG_0263   pilN TRUE 0.925 -3.000 0.015 NA   NA
 5609479 5609480 CbuG_0263 CbuG_0264 pilN   FALSE 0.041 158.000 0.000 NA   NA
 5609480 5609481 CbuG_0264 CbuG_0265   pilQ FALSE 0.339 -46.000 0.000 NA   NA
 5609481 5609482 CbuG_0265 CbuG_0266 pilQ aroK FALSE 0.337 -67.000 0.000 NA   NA
 5609482 5609483 CbuG_0266 CbuG_0267 aroK aroB TRUE 0.994 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 5609484 5609485 CbuG_0268 CbuG_0269     FALSE 0.233 23.000 0.000 NA   NA
 5609489 5609490 CbuG_0273 CbuG_0274     FALSE 0.410 -12.000 0.000 NA   NA
 5609490 5609491 CbuG_0274 CbuG_0275     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609492 5609493 CbuG_0276 CbuG_0277     FALSE 0.076 102.000 0.000 NA   NA
 5609493 5609494 CbuG_0277 CbuG_0278   dacB TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5609494 5609495 CbuG_0278 CbuG_0279 dacB aroE FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5609495 5609496 CbuG_0279 CbuG_0280 aroE   FALSE 0.077 89.000 0.000 NA   NA
 5609497 5609498 CbuG_0281 CbuG_0282     FALSE 0.015 269.000 0.000 NA   NA
 5609499 5609500 CbuG_0283 CbuG_0284   xapA TRUE 0.832 2.000 0.000 NA N NA
 5609500 5609501 CbuG_0284 CbuG_0285 xapA deoC TRUE 0.988 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 5609501 5609502 CbuG_0285 CbuG_0286 deoC   FALSE 0.076 84.000 0.000 NA   NA
 5609503 5609504 CbuG_0287 CbuG_0288     FALSE 0.472 8.000 0.000 NA   NA
 5609505 5609506 CbuG_0289 CbuG_0290     FALSE 0.019 238.000 0.000 NA   NA
 5609507 5609508 CbuG_0291 CbuG_0292   csrA2 FALSE 0.058 128.000 0.000 NA   NA
 5609508 5609509 CbuG_0292 CbuG_0293 csrA2   FALSE 0.078 96.000 0.000 NA   NA
 5609509 5609510 CbuG_0293 CbuG_0294   rpiA FALSE 0.045 147.000 0.000 NA   NA
 5609510 5609511 CbuG_0294 CbuG_0295 rpiA   FALSE 0.203 142.000 0.000 1.000 N NA
 5609511 5609512 CbuG_0295 CbuG_0296     TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5609512 5609513 CbuG_0296 CbuG_0297     TRUE 0.715 -33.000 0.000 1.000 N NA
 5609513 5609514 CbuG_0297 CbuG_0298     TRUE 0.869 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 5609514 5609515 CbuG_0298 CbuG_0299     FALSE 0.091 99.000 0.000 1.000   NA
 5609517 5609518 CbuG_0301 CbuG_0302     TRUE 0.927 4.000 0.014 1.000   NA
 5609518 5609519 CbuG_0302 CbuG_0303     TRUE 0.991 8.000 0.405 1.000   NA
 5609519 5609520 CbuG_0303 CbuG_0304     TRUE 0.998 -3.000 0.852 NA Y NA
 5609520 5609521 CbuG_0304 CbuG_0305   fabA TRUE 0.971 4.000 0.009 NA Y NA
 5609523 5609524 CbuG_0307 CbuG_0308   prlC FALSE 0.282 81.000 0.000 1.000 N NA
 5609528 5609529 CbuG_0312 CbuG_0313   pntB FALSE 0.189 27.000 0.000 NA   NA
 5609529 5609530 CbuG_0313 CbuG_0314 pntB pntAB TRUE 0.991 -3.000 0.321 0.002   NA
 5609530 5609531 CbuG_0314 CbuG_0316 pntAB   TRUE 0.631 383.000 0.829 0.002   NA
 5609532 5609533 CbuG_0315 CbuG_0317 pntAA   FALSE 0.029 190.000 0.000 NA   NA
 5609534 5609535 CbuG_0318 CbuG_0319     FALSE 0.078 66.000 0.000 NA   NA
 5609537 5609538 CbuG_0321 CbuG_0322     FALSE 0.047 145.000 0.000 NA   NA
 5609539 5609540 CbuG_0323 CbuG_0324     TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5609541 5609542 CbuG_0325 CbuG_0326 nth rnfB TRUE 0.970 8.000 0.048 1.000 N NA
 5609542 5609543 CbuG_0326 CbuG_0327 rnfB metG TRUE 0.950 -7.000 0.014 1.000 N NA
 5609546 5609547 CbuG_0330 CbuG_0331     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5609549 5609550 CbuG_0333 CbuG_0334   dcd TRUE 0.984 0.000 0.112 1.000 N NA
 5609550 5609551 CbuG_0334 CbuG_0335 dcd   FALSE 0.013 278.000 0.000 NA   NA
 5609552 5609553 CbuG_0336 CbuG_0337     FALSE 0.246 22.000 0.000 NA   NA
 5609553 5609554 CbuG_0337 CbuG_0338     FALSE 0.076 74.000 0.000 NA   NA
 5609555 5609556 CbuG_0339 CbuG_0340   pyrG FALSE 0.132 35.000 0.000 NA   NA
 5609556 5609557 CbuG_0340 CbuG_0341 pyrG   FALSE 0.113 41.000 0.000 NA   NA
 5609558 5609559 CbuG_0342 CbuG_0343   speG FALSE 0.033 178.000 0.000 NA   NA
 5609560 5609561 CbuG_0344 CbuG_0345     FALSE 0.078 70.000 0.000 NA   NA
 5609561 5609562 CbuG_0345 CbuG_0346   kdsA FALSE 0.011 313.000 0.000 NA   NA
 5609562 5609563 CbuG_0346 CbuG_0347 kdsA eno TRUE 0.737 157.000 0.125 1.000 N NA
 5609563 5609564 CbuG_0347 CbuG_0348 eno ftsB TRUE 0.991 7.000 0.241 1.000 N NA
 5609564 5609565 CbuG_0348 CbuG_0349 ftsB surE FALSE 0.090 70.000 0.000 1.000   NA
 5609565 5609566 CbuG_0349 CbuG_0350 surE   TRUE 0.935 2.000 0.018 1.000   NA
 5609566 5609567 CbuG_0350 CbuG_0351   rpoS TRUE 0.557 80.000 0.027 1.000   NA
 5609567 5609568 CbuG_0351 CbuG_0352 rpoS   FALSE 0.029 189.000 0.000 NA   NA
 5609568 5609569 CbuG_0352 CbuG_0353     FALSE 0.079 61.000 0.000 NA   NA
 5609569 5609570 CbuG_0353 CbuG_0354   rfaF TRUE 0.975 4.000 0.138 NA   NA
 5609571 5609572 CbuG_0355 CbuG_0356     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609573 5609574 CbuG_0357 CbuG_0358     TRUE 0.549 41.000 0.000 NA Y NA
 5609574 5609575 CbuG_0358 CbuG_0359     FALSE 0.078 62.000 0.000 NA   NA
 5609577 5609578 CbuG_0361 CbuG_0362   rfaE FALSE 0.472 8.000 0.000 NA   NA
 5609581 5609582 CbuG_0365 CbuG_0366     FALSE 0.340 15.000 0.000 NA   NA
 5609582 5609583 CbuG_0366 CbuG_0367   icmX FALSE 0.075 82.000 0.000 NA   NA
 5609583 5609584 CbuG_0367 CbuG_0368 icmX   FALSE 0.325 16.000 0.000 NA   NA
 5609584 5609585 CbuG_0368 CbuG_0369   icmW TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609586 5609587 CbuG_0370 CbuG_0371 icmV dotA TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 5609587 5609588 CbuG_0371 CbuG_0372 dotA   FALSE 0.083 55.000 0.000 NA   NA
 5609588 5609589 CbuG_0372 CbuG_0373     FALSE 0.020 234.000 0.000 NA   NA
 5609590 5609591 CbuG_0374 CbuG_0375     FALSE 0.088 102.000 0.000 1.000   NA
 5609591 5609592 CbuG_0375 CbuG_0376   dotB TRUE 0.563 7.000 0.000 0.025   NA
 5609592 5609593 CbuG_0376 CbuG_0377 dotB dotC TRUE 0.938 38.000 0.364 NA   NA
 5609593 5609594 CbuG_0377 CbuG_0378 dotC dotD TRUE 0.994 3.000 0.667 NA   NA
 5609594 5609595 CbuG_0378 CbuG_0379 dotD icmS FALSE 0.042 157.000 0.000 NA   NA
 5609595 5609596 CbuG_0379 CbuG_0380 icmS icmT TRUE 0.992 0.000 0.400 NA   NA
 5609599 5609600 CbuG_0383 CbuG_0384     FALSE 0.069 112.000 0.000 NA   NA
 5609604 5609605 CbuG_0388 CbuG_0389   icmQ TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609605 5609606 CbuG_0389 CbuG_0390 icmQ icmP TRUE 0.993 1.000 0.500 NA   NA
 5609606 5609607 CbuG_0390 CbuG_0391 icmP icmO TRUE 0.979 -24.000 0.308 NA   NA
 5609607 5609608 CbuG_0391 CbuG_0392 icmO icmN FALSE 0.488 10.000 0.000 1.000   NA
 5609608 5609609 CbuG_0392 CbuG_0393 icmN icmL.1 FALSE 0.483 7.000 0.000 NA   NA
 5609609 5609610 CbuG_0393 CbuG_0394 icmL.1 icmL.2 TRUE 0.520 2.000 0.000 NA   NA
 5609610 5609611 CbuG_0394 CbuG_0395 icmL.2 icmK TRUE 0.993 11.000 1.000 NA   NA
 5609611 5609612 CbuG_0395 CbuG_0396 icmK icmE TRUE 0.979 -13.000 0.250 NA   NA
 5609612 5609613 CbuG_0396 CbuG_0397 icmE icmG TRUE 0.968 18.000 0.250 NA   NA
 5609613 5609614 CbuG_0397 CbuG_0398 icmG icmC FALSE 0.077 71.000 0.000 NA   NA
 5609614 5609615 CbuG_0398 CbuG_0399 icmC icmD FALSE 0.078 94.000 0.000 NA   NA
 5609615 5609616 CbuG_0399 CbuG_0400 icmD icmJ FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 5609616 5609617 CbuG_0400 CbuG_0401 icmJ icmB TRUE 0.865 73.000 0.267 NA   NA
 5609618 5609619 CbuG_0402 CbuG_0403     FALSE 0.023 218.000 0.000 NA   NA
 5609619 5609620 CbuG_0403 CbuG_0404     FALSE 0.081 57.000 0.000 NA   NA
 5609621 5609622 CbuG_0405 CbuG_0406     FALSE 0.171 29.000 0.000 NA   NA
 5609622 5609623 CbuG_0406 CbuG_0407     FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 5609624 5609625 CbuG_0408 CbuG_0409     FALSE 0.042 155.000 0.000 NA   NA
 5609625 5609626 CbuG_0409 CbuG_0410   rimK TRUE 0.940 3.000 0.023 1.000   NA
 5609626 5609627 CbuG_0410 CbuG_0411 rimK   TRUE 0.966 -3.000 0.023 1.000 N NA
 5609628 5609629 CbuG_0412 CbuG_0413     FALSE 0.078 66.000 0.000 NA   NA
 5609632 5609633 CbuG_0416 CbuG_0417 rpoD dnaG TRUE 0.911 120.000 0.299 1.000 N NA
 5609633 5609634 CbuG_0417 CbuG_0418 dnaG rpsU FALSE 0.235 518.000 0.067 1.000 N NA
 5609636 5609637 CbuG_0420 CbuG_0421   nhaP FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 5609638 5609639 CbuG_0422 CbuG_0423   mrpA FALSE 0.063 120.000 0.000 NA   NA
 5609639 5609640 CbuG_0423 CbuG_0424 mrpA mrpB TRUE 0.993 -3.000 0.493 NA   NA
 5609640 5609641 CbuG_0424 CbuG_0425 mrpB mrpC TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 5609641 5609642 CbuG_0425 CbuG_0426 mrpC mrpD TRUE 0.998 -3.000 0.896 0.013 Y NA
 5609642 5609643 CbuG_0426 CbuG_0427 mrpD mrpE TRUE 0.998 -3.000 0.810 1.000 Y NA
 5609643 5609644 CbuG_0427 CbuG_0428 mrpE mrpF TRUE 0.998 -3.000 0.644 0.060 Y NA
 5609644 5609645 CbuG_0428 CbuG_0429 mrpF mrpG TRUE 0.997 -7.000 0.614 1.000 Y NA
 5609646 5609647 CbuG_0430 CbuG_0431     FALSE 0.011 296.000 0.000 NA   NA
 5609647 5609648 CbuG_0431 CbuG_0432   wrbA TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609649 5609650 CbuG_0433 CbuG_0434     TRUE 0.554 3.000 0.000 1.000   NA
 5609650 5609651 CbuG_0434 CbuG_0435     FALSE 0.078 96.000 0.000 NA   NA
 5609652 5609653 CbuG_0436 CbuG_0437   tolR FALSE 0.049 143.000 0.000 NA   NA
 5609653 5609654 CbuG_0437 CbuG_0438 tolR tolQ TRUE 0.996 -22.000 0.556 0.024 Y NA
 5609654 5609655 CbuG_0438 CbuG_0439 tolQ   FALSE 0.272 76.000 0.000 NA N NA
 5609657 5609658 CbuG_0441 CbuG_0442   ruvB FALSE 0.359 14.000 0.000 NA   NA
 5609658 5609659 CbuG_0442 CbuG_0443 ruvB   FALSE 0.070 110.000 0.000 NA   NA
 5609659 5609660 CbuG_0443 CbuG_0444   ruvA FALSE 0.077 100.000 0.000 NA   NA
 5609660 5609661 CbuG_0444 CbuG_0445 ruvA ruvC TRUE 0.997 -3.000 0.451 0.013 Y NA
 5609661 5609662 CbuG_0445 CbuG_0446 ruvC   TRUE 0.849 116.000 0.277 NA   NA
 5609662 5609663 CbuG_0446 CbuG_0447   aspS TRUE 0.889 16.000 0.039 NA   NA
 5609665 5609666 CbuG_0449 CbuG_0450     FALSE 0.075 83.000 0.000 NA   NA
 5609666 5609667 CbuG_0450 CbuG_0451     FALSE 0.093 49.000 0.000 NA   NA
 5609667 5609668 CbuG_0451 CbuG_0452     FALSE 0.036 169.000 0.000 NA   NA
 5609668 5609669 CbuG_0452 CbuG_0453     TRUE 0.982 -3.000 0.190 NA   NA
 5609669 5609670 CbuG_0453 CbuG_0454     FALSE 0.009 387.000 0.000 NA   NA
 5609670 5609671 CbuG_0454 CbuG_0455     FALSE 0.070 110.000 0.000 NA   NA
 5609671 5609672 CbuG_0455 CbuG_0456   nrdB FALSE 0.055 294.000 0.000 1.000 N NA
 5609672 5609673 CbuG_0456 CbuG_0457 nrdB nrdA TRUE 0.977 50.000 0.564 0.002 Y NA
 5609673 5609674 CbuG_0457 CbuG_0458 nrdA   FALSE 0.246 22.000 0.000 NA   NA
 5609675 5609676 CbuG_0459 CbuG_0460   nudH FALSE 0.085 54.000 0.000 NA   NA
 5609676 5609677 CbuG_0460 CbuG_0461 nudH ptsP TRUE 0.967 -19.000 0.097 1.000 N NA
 5609677 5609678 CbuG_0461 CbuG_0462 ptsP lgt TRUE 0.660 55.000 0.011 1.000 N NA
 5609678 5609679 CbuG_0462 CbuG_0463 lgt   TRUE 0.520 2.000 0.000 NA   NA
 5609679 5609680 CbuG_0463 CbuG_0464   thyA TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609682 5609683 CbuG_0466 CbuG_0467     FALSE 0.102 45.000 0.000 NA   NA
 5609686 5609687 CbuG_0470 CbuG_0471     FALSE 0.138 34.000 0.000 NA   NA
 5609687 5609688 CbuG_0471 CbuG_0472     FALSE 0.189 27.000 0.000 NA   NA
 5609688 5609689 CbuG_0472 CbuG_0473   cptA TRUE 0.579 24.000 0.000 1.000 N NA
 5609689 5609690 CbuG_0473 CbuG_0474 cptA   TRUE 0.995 -3.000 0.408 0.027 N NA
 5609690 5609691 CbuG_0474 CbuG_0475   gpmI TRUE 0.988 4.000 0.170 1.000 N NA
 5609694 5609695 CbuG_0478 CbuG_0479     TRUE 0.520 2.000 0.000 NA   NA
 5609697 5609698 CbuG_0481 CbuG_0482     FALSE 0.078 67.000 0.000 NA   NA
 5609700 5609701 CbuG_0484 CbuG_0485     FALSE 0.086 53.000 0.000 NA   NA
 5609702 5609703 CbuG_0486 CbuG_0487     FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 5609704 5609705 CbuG_0488 CbuG_0489   grxC TRUE 0.986 5.000 0.166 NA N NA
 5609705 5609706 CbuG_0489 CbuG_0490 grxC secB TRUE 0.986 13.000 0.221 1.000 N NA
 5609706 5609707 CbuG_0490 CbuG_0491 secB gpsA TRUE 0.618 69.000 0.008 1.000 N NA
 5609708 5609709 CbuG_0492 CbuG_0493     FALSE 0.024 208.000 0.000 NA   NA
 5609709 5609710 CbuG_0493 CbuG_0494     FALSE 0.038 164.000 0.000 NA   NA
 5609710 5609711 CbuG_0494 CbuG_0495     TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5609712 5609713 CbuG_0496 CbuG_0497     TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5609715 5609716 CbuG_0499 CbuG_0500 accA tilS TRUE 0.970 -24.000 0.123 1.000 N NA
 5609716 5609717 CbuG_0500 CbuG_0501 tilS   FALSE 0.087 78.000 0.000 1.000   NA
 5609717 5609718 CbuG_0501 CbuG_0502     FALSE 0.263 23.000 0.000 1.000   NA
 5609718 5609719 CbuG_0502 CbuG_0503     FALSE 0.348 17.000 0.000 1.000   NA
 5609719 5609720 CbuG_0503 CbuG_0504   lepA FALSE 0.062 136.000 0.000 1.000   NA
 5609720 5609721 CbuG_0504 CbuG_0505 lepA lepB2 TRUE 0.989 -3.000 0.187 1.000 N NA
 5609721 5609722 CbuG_0505 CbuG_0506 lepB2 rnc TRUE 0.954 21.000 0.117 1.000 N NA
 5609722 5609723 CbuG_0506 CbuG_0507 rnc era TRUE 0.976 -3.000 0.127 0.031   NA
 5609723 5609724 CbuG_0507 CbuG_0508 era recO TRUE 0.971 -3.000 0.109 1.000   NA
 5609724 5609725 CbuG_0508 CbuG_0509 recO   FALSE 0.017 250.000 0.000 NA   NA
 5609725 5609726 CbuG_0509 CbuG_0510     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609726 5609727 CbuG_0510 CbuG_0511     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609727 5609728 CbuG_0511 CbuG_0512   pdxJ FALSE 0.095 48.000 0.000 NA   NA
 5609729 5609730 CbuG_0513 CbuG_0514     FALSE 0.007 558.000 0.000 NA   NA
 5609731 5609732 CbuG_0515 CbuG_0516     TRUE 0.493 6.000 0.000 NA   NA
 5609734 5609735 CbuG_0518 CbuG_0519 gltX1 cysS TRUE 0.971 -9.000 0.021 1.000 Y NA
 5609735 5609736 CbuG_0519 CbuG_0520 cysS   FALSE 0.028 191.000 0.000 NA   NA
 5609736 5609737 CbuG_0520 CbuG_0521     FALSE 0.208 25.000 0.000 NA   NA
 5609739 5609740 CbuG_0523 CbuG_0524     TRUE 0.997 0.000 0.330 NA Y NA
 5609740 5609741 CbuG_0524 CbuG_0525     FALSE 0.024 207.000 0.000 NA   NA
 5609741 5609742 CbuG_0525 CbuG_0526     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609742 5609743 CbuG_0526 CbuG_0527     FALSE 0.220 24.000 0.000 NA   NA
 5609746 5609747 CbuG_0530 CbuG_0531   ahpC TRUE 0.596 23.000 0.000 1.000 N NA
 5609749 5609750 CbuG_0533 CbuG_0534 gatB gatA TRUE 0.997 5.000 0.492 0.002 Y NA
 5609750 5609751 CbuG_0534 CbuG_0535 gatA gatC TRUE 0.998 4.000 0.643 0.002 Y NA
 5609751 5609752 CbuG_0535 CbuG_0536 gatC   FALSE 0.044 148.000 0.000 NA   NA
 5609753 5609754 CbuG_0537 CbuG_0538 mreB mreC TRUE 0.960 83.000 0.689 1.000 N NA
 5609754 5609755 CbuG_0538 CbuG_0539 mreC mreD TRUE 0.998 6.000 0.550 0.005 Y NA
 5609755 5609756 CbuG_0539 CbuG_0540 mreD   TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5609756 5609757 CbuG_0540 CbuG_0541   tldD TRUE 0.621 71.000 0.050 NA   NA
 5609758 5609759 CbuG_0542 CbuG_0543     TRUE 0.500 5.000 0.000 NA   NA
 5609760 5609761 CbuG_0544 CbuG_0545 hupB   TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5609761 5609762 CbuG_0545 CbuG_0546     FALSE 0.116 39.000 0.000 NA   NA
 5609762 5609763 CbuG_0546 CbuG_0547     FALSE 0.078 96.000 0.000 NA   NA
 5609763 5609764 CbuG_0547 CbuG_0548     FALSE 0.077 71.000 0.000 NA   NA
 5609764 5609765 CbuG_0548 CbuG_0549     FALSE 0.116 39.000 0.000 NA   NA
 5609765 5609766 CbuG_0549 CbuG_0550     FALSE 0.007 506.000 0.000 NA   NA
 5609770 5609771 CbuG_0554 CbuG_0555     FALSE 0.021 228.000 0.000 NA   NA
 5609771 5609772 CbuG_0555 CbuG_0556     FALSE 0.058 128.000 0.000 NA   NA
 5609772 5609773 CbuG_0556 CbuG_0557   tpiA FALSE 0.008 805.000 0.000 1.000   NA
 5609773 5609774 CbuG_0557 CbuG_0558 tpiA secG TRUE 0.981 -18.000 0.184 1.000 N NA
 5609774 5609775 CbuG_0558 CbuG_0559 secG   FALSE 0.447 10.000 0.000 NA   NA
 5609775 5609776 CbuG_0559 CbuG_0560   nuoA FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 5609776 5609777 CbuG_0560 CbuG_0561 nuoA nuoB TRUE 0.998 5.000 0.507 0.006 Y NA
 5609777 5609778 CbuG_0561 CbuG_0562 nuoB nuoC TRUE 0.996 10.000 0.328 0.006 Y NA
 5609778 5609779 CbuG_0562 CbuG_0563 nuoC nuoD TRUE 0.997 -7.000 0.483 0.012 Y NA
 5609779 5609780 CbuG_0563 CbuG_0564 nuoD nuoE TRUE 0.997 0.000 0.355 0.012 Y NA
 5609780 5609781 CbuG_0564 CbuG_0565 nuoE nuoF TRUE 0.996 -10.000 0.343 0.012 Y NA
 5609781 5609782 CbuG_0565 CbuG_0566 nuoF nuoG TRUE 0.961 111.000 0.395 0.012 Y NA
 5609782 5609783 CbuG_0566 CbuG_0567 nuoG nuoH TRUE 0.998 0.000 0.515 0.012 Y NA
 5609783 5609784 CbuG_0567 CbuG_0568 nuoH nuoI TRUE 0.996 -18.000 0.500 0.012 Y NA
 5609784 5609785 CbuG_0568 CbuG_0569 nuoI nuoJ TRUE 0.995 14.000 0.442 0.012 Y NA
 5609785 5609786 CbuG_0569 CbuG_0570 nuoJ nuoK TRUE 0.997 -3.000 0.484 0.006 Y NA
 5609786 5609787 CbuG_0570 CbuG_0571 nuoK nuoL TRUE 0.969 57.000 0.451 0.012 Y NA
 5609787 5609788 CbuG_0571 CbuG_0572 nuoL nuoM TRUE 0.993 5.000 0.175 0.012 Y NA
 5609788 5609789 CbuG_0572 CbuG_0573 nuoM nuoN TRUE 0.996 10.000 0.340 0.012 Y NA
 5609789 5609790 CbuG_0573 CbuG_0574 nuoN   FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 5609790 5609791 CbuG_0574 CbuG_0575     FALSE 0.079 61.000 0.000 NA   NA
 5609791 5609792 CbuG_0575 CbuG_0576   nusA TRUE 0.994 4.000 0.759 NA   NA
 5609792 5609793 CbuG_0576 CbuG_0577 nusA infB TRUE 0.994 6.000 0.342 1.000 N NA
 5609793 5609794 CbuG_0577 CbuG_0578 infB rbfA TRUE 0.970 88.000 0.530 1.000 Y NA
 5609794 5609795 CbuG_0578 CbuG_0579 rbfA truB TRUE 0.993 -22.000 0.318 1.000 Y NA
 5609798 5609799 CbuG_0582 CbuG_0583     FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 5609802 5609803 CbuG_0586 CbuG_0587     FALSE 0.072 108.000 0.000 NA   NA
 5609805 5609806 CbuG_0589 CbuG_0590     FALSE 0.331 -147.000 0.000 NA   NA
 5609808 5609809 CbuG_0591 CbuG_0593   hemB FALSE 0.433 33.000 0.000 NA N NA
 5609813 5609814 CbuG_0597 CbuG_0598 glyA   TRUE 0.967 0.000 0.024 NA N NA
 5609814 5609815 CbuG_0598 CbuG_0599   nusB TRUE 0.963 -10.000 0.012 NA Y NA
 5609817 5609818 CbuG_0601 CbuG_0602 thiL   FALSE 0.090 92.000 0.000 1.000   NA
 5609818 5609819 CbuG_0602 CbuG_0603     FALSE 0.141 44.000 0.000 0.011   NA
 5609819 5609820 CbuG_0603 CbuG_0604     FALSE 0.314 22.000 0.000 0.011   NA
 5609821 5609822 CbuG_0605 CbuG_0606 gltA   FALSE 0.020 234.000 0.000 NA   NA
 5609822 5609823 CbuG_0606 CbuG_0607     FALSE 0.021 223.000 0.000 NA   NA
 5609824 5609825 CbuG_0608 CbuG_0609     FALSE 0.008 427.000 0.000 NA   NA
 5609825 5609826 CbuG_0609 CbuG_0610   sdhC FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 5609826 5609827 CbuG_0610 CbuG_0611 sdhC sdhD TRUE 0.996 -12.000 0.453 0.001 Y NA
 5609827 5609828 CbuG_0611 CbuG_0612 sdhD sdhA TRUE 0.997 13.000 0.705 0.003 Y NA
 5609828 5609829 CbuG_0612 CbuG_0613 sdhA sdhB TRUE 0.998 7.000 0.604 0.003 Y NA
 5609829 5609830 CbuG_0613 CbuG_0614 sdhB sucA TRUE 0.951 24.000 0.067 1.000 Y NA
 5609830 5609831 CbuG_0614 CbuG_0615 sucA sucB TRUE 0.997 10.000 0.667 1.000 Y NA
 5609831 5609832 CbuG_0615 CbuG_0616 sucB sucC TRUE 0.776 182.000 0.136 1.000 Y NA
 5609832 5609833 CbuG_0616 CbuG_0617 sucC sucD TRUE 0.998 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5609833 5609834 CbuG_0617 CbuG_0618 sucD   TRUE 0.549 -3.000 0.000 1.000   NA
 5609836 5609837 CbuG_0620 CbuG_0621     FALSE 0.085 54.000 0.000 NA   NA
 5609837 5609838 CbuG_0621 CbuG_0622     FALSE 0.078 96.000 0.000 NA   NA
 5609839 5609840 CbuG_0623 CbuG_0624 map   FALSE 0.083 55.000 0.000 NA   NA
 5609841 5609842 CbuG_0625 CbuG_0626 rpsB tsf TRUE 0.997 10.000 0.748 1.000 Y NA
 5609842 5609843 CbuG_0626 CbuG_0627 tsf pyrH TRUE 0.996 0.000 0.416 1.000 N NA
 5609843 5609844 CbuG_0627 CbuG_0628 pyrH frr TRUE 0.958 78.000 0.626 1.000 N NA
 5609844 5609845 CbuG_0628 CbuG_0629 frr uppS TRUE 0.995 -3.000 0.409 1.000 N NA
 5609845 5609846 CbuG_0629 CbuG_0630 uppS cdsA TRUE 0.996 -10.000 0.400 1.000 Y NA
 5609846 5609847 CbuG_0630 CbuG_0631 cdsA   FALSE 0.033 178.000 0.000 NA   NA
 5609850 5609851 CbuG_0634 CbuG_0635     FALSE 0.023 214.000 0.000 NA   NA
 5609853 5609854 CbuG_0637 CbuG_0638   pabB TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5609855 5609856 CbuG_0639 CbuG_0640     FALSE 0.220 24.000 0.000 NA   NA
 5609858 5609859 CbuG_0642 CbuG_0643     FALSE 0.028 193.000 0.000 NA   NA
 5609861 5609862 CbuG_0645 CbuG_0646     FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 5609863 5609864 CbuG_0647 CbuG_0648     FALSE 0.220 24.000 0.000 NA   NA
 5609864 5609865 CbuG_0648 CbuG_0649     TRUE 0.800 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5609866 5609867 CbuG_0650 CbuG_0651   sufB TRUE 0.961 -19.000 0.078 NA N NA
 5609867 5609868 CbuG_0651 CbuG_0652 sufB sufC TRUE 0.990 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5609868 5609869 CbuG_0652 CbuG_0653 sufC sufD TRUE 0.997 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 5609869 5609870 CbuG_0653 CbuG_0654 sufD csdB TRUE 0.940 -7.000 0.007 1.000 N NA
 5609870 5609871 CbuG_0654 CbuG_0655 csdB iscU TRUE 0.937 -7.000 0.006 1.000 N NA
 5609871 5609872 CbuG_0655 CbuG_0656 iscU   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609872 5609873 CbuG_0656 CbuG_0657     TRUE 0.986 2.000 0.235 NA   NA
 5609873 5609874 CbuG_0657 CbuG_0658   rrmJ FALSE 0.246 22.000 0.000 NA   NA
 5609874 5609875 CbuG_0658 CbuG_0659 rrmJ ftsH TRUE 0.900 20.000 0.019 NA N NA
 5609875 5609876 CbuG_0659 CbuG_0660 ftsH folP TRUE 0.954 43.000 0.325 1.000 N NA
 5609876 5609877 CbuG_0660 CbuG_0661 folP glmM TRUE 0.916 89.000 0.260 1.000 N NA
 5609878 5609879 CbuG_0662 CbuG_0663   treA FALSE 0.007 1465.000 0.000 NA   NA
 5609879 5609880 CbuG_0663 CbuG_0664 treA   FALSE 0.017 250.000 0.000 NA   NA
 5609881 5609882 CbuG_0665 CbuG_0666   guaB FALSE 0.078 94.000 0.000 NA   NA
 5609882 5609883 CbuG_0666 CbuG_0667 guaB guaA TRUE 0.956 37.000 0.190 0.001 Y NA
 5609883 5609884 CbuG_0667 CbuG_0668 guaA   FALSE 0.397 -13.000 0.000 NA   NA
 5609884 5609885 CbuG_0668 CbuG_0669   rnhB FALSE 0.406 12.000 0.000 NA   NA
 5609885 5609886 CbuG_0669 CbuG_0670 rnhB   FALSE 0.186 147.000 0.000 1.000 N NA
 5609886 5609887 CbuG_0670 CbuG_0671   dnaE TRUE 0.848 2.000 0.000 0.048 N NA
 5609887 5609888 CbuG_0671 CbuG_0672 dnaE   FALSE 0.271 109.000 0.000 1.000 N NA
 5609891 5609892 CbuG_0675 CbuG_0676     FALSE 0.058 128.000 0.000 NA   NA
 5609892 5609893 CbuG_0676 CbuG_0677     FALSE 0.410 -12.000 0.000 NA   NA
 5609894 5609895 CbuG_0678 CbuG_0679     TRUE 0.579 24.000 0.000 1.000 N NA
 5609897 5609898 CbuG_0681 CbuG_0682 thrS infC TRUE 0.920 83.000 0.186 1.000 Y NA
 5609898 5609899 CbuG_0682 CbuG_0683 infC rpmI TRUE 0.996 -19.000 0.652 1.000 Y NA
 5609901 5609902 CbuG_0685 CbuG_0686 rplT pheS TRUE 0.927 77.000 0.202 1.000 Y NA
 5609902 5609903 CbuG_0686 CbuG_0687 pheS pheT TRUE 0.998 0.000 0.574 0.001 Y NA
 5609903 5609904 CbuG_0687 CbuG_0688 pheT ihfA TRUE 0.990 5.000 0.208 1.000 N NA
 5609904 5609905 CbuG_0688 CbuG_0689 ihfA   TRUE 0.993 14.000 0.535 1.000 N NA
 5609905 5609906 CbuG_0689 CbuG_0690     FALSE 0.075 77.000 0.000 NA   NA
 5609906 5609907 CbuG_0690 CbuG_0691     FALSE 0.116 39.000 0.000 NA   NA
 5609907 5609908 CbuG_0691 CbuG_0692     FALSE 0.015 271.000 0.000 NA   NA
 5609910 5609911 CbuG_0694 CbuG_0695     FALSE 0.046 146.000 0.000 NA   NA
 5609911 5609912 CbuG_0695 CbuG_0696     FALSE 0.010 339.000 0.000 NA   NA
 5609912 5609913 CbuG_0696 CbuG_0697     FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 5609913 5609914 CbuG_0697 CbuG_0698     FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 5609914 5609915 CbuG_0698 CbuG_0699     FALSE 0.189 27.000 0.000 NA   NA
 5609915 5609916 CbuG_0699 CbuG_0700     FALSE 0.017 254.000 0.000 NA   NA
 5609919 5609920 CbuG_0703 CbuG_0704 msrA smpB TRUE 0.892 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5609921 5609922 CbuG_0705 CbuG_0706     TRUE 0.943 -3.000 0.035 NA   NA
 5609924 5609925 CbuG_0708 CbuG_0709 fur   FALSE 0.424 11.000 0.000 NA   NA
 5609925 5609926 CbuG_0709 CbuG_0710     FALSE 0.046 146.000 0.000 NA   NA
 5609927 5609928 CbuG_0711 CbuG_0712 recN   TRUE 0.988 5.000 0.170 1.000 N NA
 5609929 5609930 CbuG_0713 CbuG_0714     TRUE 0.968 -10.000 0.167 NA   NA
 5609930 5609931 CbuG_0714 CbuG_0715   grpE FALSE 0.083 55.000 0.000 NA   NA
 5609932 5609933 CbuG_0716 CbuG_0717     TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5609934 5609935 CbuG_0718 CbuG_0719 dnaK dnaJ TRUE 0.911 142.000 0.236 0.005 Y NA
 5609935 5609936 CbuG_0719 CbuG_0720 dnaJ   FALSE 0.077 100.000 0.000 NA   NA
 5609937 5609938 CbuG_0721 CbuG_0722     FALSE 0.098 47.000 0.000 NA   NA
 5609938 5609939 CbuG_0722 CbuG_0723     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609939 5609940 CbuG_0723 CbuG_0724     FALSE 0.074 104.000 0.000 NA   NA
 5609941 5609942 CbuG_0725 CbuG_0726 carA carB TRUE 0.962 82.000 0.345 0.001 Y NA
 5609945 5609946 CbuG_0729 CbuG_0730   exoD FALSE 0.100 46.000 0.000 NA   NA
 5609946 5609947 CbuG_0730 CbuG_0731 exoD   FALSE 0.410 -12.000 0.000 NA   NA
 5609947 5609948 CbuG_0731 CbuG_0732   eda TRUE 0.782 11.000 0.000 1.000 N NA
 5609949 5609950 CbuG_0733 CbuG_0734   rspA TRUE 0.953 31.000 0.333 0.054   NA
 5609950 5609951 CbuG_0734 CbuG_0735 rspA   FALSE 0.468 -6.000 0.000 NA   NA
 5609952 5609953 CbuG_0736 CbuG_0737     FALSE 0.009 378.000 0.000 NA   NA
 5609954 5609955 CbuG_0738 CbuG_0739     TRUE 0.719 14.000 0.000 NA N NA
 5609957 5609958 CbuG_0741 CbuG_0742     FALSE 0.483 7.000 0.000 NA   NA
 5609959 5609960 CbuG_0743 CbuG_0744 scvA   FALSE 0.105 44.000 0.000 NA   NA
 5609960 5609961 CbuG_0744 CbuG_0745   lipA TRUE 0.541 111.000 0.003 1.000 N NA
 5609961 5609962 CbuG_0745 CbuG_0746 lipA lipB TRUE 0.993 -70.000 0.319 0.001 Y NA
 5609962 5609963 CbuG_0746 CbuG_0747 lipB   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609963 5609964 CbuG_0747 CbuG_0748     FALSE 0.333 -78.000 0.000 NA   NA
 5609964 5609965 CbuG_0748 CbuG_0749     FALSE 0.271 20.000 0.000 NA   NA
 5609965 5609966 CbuG_0749 CbuG_0750     FALSE 0.220 24.000 0.000 NA   NA
 5609966 5609967 CbuG_0750 CbuG_0751     TRUE 0.901 -3.000 0.007 NA   NA
 5609967 5609968 CbuG_0751 CbuG_0752     FALSE 0.091 98.000 0.000 1.000   NA
 5609968 5609969 CbuG_0752 CbuG_0753     FALSE 0.010 452.000 0.000 0.054   NA
 5609971 5609972 CbuG_0755 CbuG_0756     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5609977 5609978 CbuG_0760 CbuG_0762     FALSE 0.052 137.000 0.000 NA   NA
 5609978 5609979 CbuG_0762 CbuG_0763   hisS TRUE 0.934 -3.000 0.021 1.000   NA
 5609979 5609980 CbuG_0763 CbuG_0764 hisS   TRUE 0.958 23.000 0.259 1.000   NA
 5609980 5609981 CbuG_0764 CbuG_0765     FALSE 0.167 238.000 0.009 1.000   NA
 5609982 5609983 CbuG_0766 CbuG_0767   xseA TRUE 0.549 -3.000 0.000 1.000   NA
 5609984 5609985 CbuG_0768 CbuG_0769   mdh FALSE 0.120 195.000 0.000 1.000 N NA
 5609985 5609986 CbuG_0769 CbuG_0770 mdh gcp TRUE 0.808 9.000 0.000 1.000 N NA
 5609988 5609989 CbuG_0772 CbuG_0773     TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5609990 5609991 CbuG_0774 CbuG_0775   orn FALSE 0.033 177.000 0.000 NA   NA
 5609991 5609992 CbuG_0775 CbuG_0776 orn   FALSE 0.041 159.000 0.000 NA   NA
 5609992 5609993 CbuG_0776 CbuG_0777     FALSE 0.078 63.000 0.000 NA   NA
 5609993 5609994 CbuG_0777 CbuG_0778     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5609996 5609997 CbuG_0780 CbuG_0781 addA addB TRUE 0.968 -3.000 0.098 NA   NA
 5609997 5609998 CbuG_0781 CbuG_0782 addB qseC FALSE 0.021 230.000 0.000 NA   NA
 5609998 5609999 CbuG_0782 CbuG_0783 qseC qseB TRUE 0.991 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 5610000 5610001 CbuG_0784 CbuG_0785     TRUE 0.549 -3.000 0.000 1.000   NA
 5610003 5610004 CbuG_0787 CbuG_0788 kdgK dapA FALSE 0.104 213.000 0.000 1.000 N NA
 5610004 5610005 CbuG_0788 CbuG_0789 dapA   TRUE 0.925 17.000 0.088 NA   NA
 5610005 5610006 CbuG_0789 CbuG_0790   purC TRUE 0.918 0.000 0.009 NA   NA
 5610006 5610007 CbuG_0790 CbuG_0791 purC   TRUE 0.523 1.000 0.000 NA   NA
 5610007 5610008 CbuG_0791 CbuG_0792     FALSE 0.072 107.000 0.000 NA   NA
 5610012 5610013 CbuG_0796 CbuG_0797     FALSE 0.053 136.000 0.000 NA   NA
 5610015 5610016 CbuG_0799 CbuG_0800     FALSE 0.078 99.000 0.000 NA   NA
 5610016 5610017 CbuG_0800 CbuG_0801     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 5610019 5610020 CbuG_0803 CbuG_0804     FALSE 0.297 18.000 0.000 NA   NA
 5610021 5610022 CbuG_0805 CbuG_0806     TRUE 0.833 4.000 0.000 1.000 N NA
 5610022 5610023 CbuG_0806 CbuG_0807     FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 5610024 5610025 CbuG_0808 CbuG_0809 queA icd FALSE 0.362 44.000 0.000 1.000 N NA
 5610026 5610027 CbuG_0810 CbuG_0811     FALSE 0.138 34.000 0.000 NA   NA
 5610027 5610028 CbuG_0811 CbuG_0812     FALSE 0.077 90.000 0.000 NA   NA
 5610030 5610031 CbuG_0814 CbuG_0815 infA   FALSE 0.095 48.000 0.000 NA   NA
 5610031 5610032 CbuG_0815 CbuG_0816   trxB FALSE 0.199 26.000 0.000 NA   NA
 5610033 5610034 CbuG_0817 CbuG_0818 ftsK   TRUE 0.991 12.000 0.305 1.000 N NA
 5610034 5610035 CbuG_0818 CbuG_0819     TRUE 0.958 23.000 0.167 1.000 N NA
 5610035 5610036 CbuG_0819 CbuG_0820   serS TRUE 0.793 76.000 0.078 0.098 N NA
 5610037 5610038 CbuG_0821 CbuG_0822     FALSE 0.017 253.000 0.000 NA   NA
 5610041 5610042 CbuG_0825 CbuG_0826   uvrC FALSE 0.159 31.000 0.000 NA   NA
 5610042 5610043 CbuG_0826 CbuG_0827 uvrC   FALSE 0.283 103.000 0.000 1.000 N NA
 5610045 5610046 CbuG_0829 CbuG_0830 iscS.1 thiI TRUE 0.995 1.000 0.349 1.000 N NA
 5610046 5610047 CbuG_0830 CbuG_0831 thiI   FALSE 0.116 39.000 0.000 NA   NA
 5610048 5610049 CbuG_0832 CbuG_0833     FALSE 0.108 43.000 0.000 NA   NA
 5610052 5610053 CbuG_0836 CbuG_0837     FALSE 0.483 7.000 0.000 NA   NA
 5610055 5610056 CbuG_0839 CbuG_0840     TRUE 0.736 22.000 0.005 NA   NA
 5610057 5610058 CbuG_0841 CbuG_0842     FALSE 0.044 148.000 0.000 NA   NA
 5610058 5610059 CbuG_0842 CbuG_0843     FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 5610059 5610060 CbuG_0843 CbuG_0844     FALSE 0.078 99.000 0.000 NA   NA
 5610061 5610062 CbuG_0845 CbuG_0846     FALSE 0.050 142.000 0.000 NA   NA
 5610062 5610063 CbuG_0846 CbuG_0847     FALSE 0.083 55.000 0.000 NA   NA
 5610064 5610065 CbuG_0848 CbuG_0849     FALSE 0.011 307.000 0.000 NA   NA
 5610065 5610066 CbuG_0849 CbuG_0850     FALSE 0.012 290.000 0.000 NA   NA
 5610066 5610067 CbuG_0850 CbuG_0851     FALSE 0.312 17.000 0.000 NA   NA
 5610069 5610070 CbuG_0853 CbuG_0854 trpABF trpC FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5610070 5610071 CbuG_0854 CbuG_0855 trpC trpD FALSE 0.095 48.000 0.000 NA   NA
 5610071 5610072 CbuG_0855 CbuG_0856 trpD   FALSE 0.464 9.000 0.000 NA   NA
 5610072 5610073 CbuG_0856 CbuG_0857   trpE FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 5610075 5610076 CbuG_0859 CbuG_0860   mfd FALSE 0.048 144.000 0.000 NA   NA
 5610076 5610077 CbuG_0860 CbuG_0861 mfd trmU TRUE 0.778 12.000 0.000 0.096 N NA
 5610077 5610078 CbuG_0861 CbuG_0862 trmU   FALSE 0.008 404.000 0.000 NA   NA
 5610081 5610082 CbuG_0865 CbuG_0866   yajC FALSE 0.189 27.000 0.000 NA   NA
 5610082 5610083 CbuG_0866 CbuG_0867 yajC secD TRUE 0.936 16.000 0.007 NA Y NA
 5610083 5610084 CbuG_0867 CbuG_0868 secD secF TRUE 0.983 0.000 0.030 0.001 Y NA
 5610086 5610087 CbuG_0870 CbuG_0871     FALSE 0.077 72.000 0.000 NA   NA
 5610087 5610088 CbuG_0871 CbuG_0872   enhA.2 FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 5610088 5610089 CbuG_0872 CbuG_0873 enhA.2 enhB.1 TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5610089 5610090 CbuG_0873 CbuG_0874 enhB.1 enhC TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 5610093 5610094 CbuG_0877 CbuG_0878 suhB   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610095 5610096 CbuG_0879 CbuG_0880     FALSE 0.435 -9.000 0.000 NA   NA
 5610096 5610097 CbuG_0880 CbuG_0881   iscS.2 TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610097 5610098 CbuG_0881 CbuG_0882 iscS.2   TRUE 0.914 7.000 0.011 1.000   NA
 5610098 5610099 CbuG_0882 CbuG_0883     TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5610100 5610101 CbuG_0884 CbuG_0885     TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5610101 5610102 CbuG_0885 CbuG_0886   cbpA TRUE 0.989 3.000 0.286 NA   NA
 5610102 5610103 CbuG_0886 CbuG_0887 cbpA enhA.3 FALSE 0.047 145.000 0.000 NA   NA
 5610106 5610107 CbuG_0890 CbuG_0891   etfB TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5610107 5610108 CbuG_0891 CbuG_0892 etfB etfA TRUE 0.917 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 5610108 5610109 CbuG_0892 CbuG_0893 etfA ald TRUE 0.516 29.000 0.000 0.030 N NA
 5610111 5610112 CbuG_0895 CbuG_0896     FALSE 0.037 168.000 0.000 NA   NA
 5610112 5610113 CbuG_0896 CbuG_0897     TRUE 0.741 -18.000 0.000 1.000 N NA
 5610116 5610117 CbuG_0900 CbuG_0901     FALSE 0.073 105.000 0.000 NA   NA
 5610118 5610119 CbuG_0902 CbuG_0903   lepB1 FALSE 0.447 10.000 0.000 NA   NA
 5610119 5610120 CbuG_0903 CbuG_0904 lepB1   FALSE 0.053 136.000 0.000 NA   NA
 5610121 5610122 CbuG_0905 CbuG_0906 aldC   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610122 5610123 CbuG_0906 CbuG_0907   fumC FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 5610123 5610124 CbuG_0907 CbuG_0908 fumC   TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5610124 5610125 CbuG_0908 CbuG_0909     TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5610126 5610127 CbuG_0910 CbuG_0911     TRUE 0.997 0.000 0.600 NA N NA
 5610131 5610132 CbuG_0915 CbuG_0916     TRUE 0.949 14.000 0.118 NA   NA
 5610134 5610135 CbuG_0918 CbuG_0919     FALSE 0.397 38.000 0.000 1.000 N NA
 5610135 5610136 CbuG_0919 CbuG_0920   mutL FALSE 0.305 61.000 0.000 0.094 N NA
 5610136 5610137 CbuG_0920 CbuG_0921 mutL miaA TRUE 0.940 33.000 0.188 0.094 N NA
 5610137 5610138 CbuG_0921 CbuG_0922 miaA   FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 5610138 5610139 CbuG_0922 CbuG_0923     FALSE 0.077 73.000 0.000 NA   NA
 5610139 5610140 CbuG_0923 CbuG_0924     FALSE 0.075 78.000 0.000 NA   NA
 5610140 5610141 CbuG_0924 CbuG_0925     TRUE 0.513 8.000 0.000 1.000   NA
 5610141 5610142 CbuG_0925 CbuG_0926   nagZ TRUE 0.547 4.000 0.000 1.000   NA
 5610142 5610143 CbuG_0926 CbuG_0927 nagZ   FALSE 0.291 67.000 0.000 1.000 N NA
 5610145 5610146 CbuG_0929 CbuG_0930     TRUE 0.959 -13.000 0.045 1.000 N NA
 5610147 5610148 CbuG_0931 CbuG_0933   tgt TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5610149 5610150 CbuG_0932 CbuG_0934     FALSE 0.350 -21.000 0.000 NA   NA
 5610151 5610152 CbuG_0935 CbuG_0936     FALSE 0.016 265.000 0.000 NA   NA
 5610155 5610156 CbuG_0939 CbuG_0940     FALSE 0.179 28.000 0.000 NA   NA
 5610157 5610158 CbuG_0941 CbuG_0942     FALSE 0.055 134.000 0.000 NA   NA
 5610159 5610160 CbuG_0943 CbuG_0944 scpA scpB TRUE 0.964 5.000 0.083 NA   NA
 5610160 5610161 CbuG_0944 CbuG_0945 scpB   TRUE 0.988 10.000 0.210 NA N NA
 5610162 5610163 CbuG_0946 CbuG_0947     FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 5610163 5610164 CbuG_0947 CbuG_0948   mutS TRUE 0.825 -3.000 0.000 NA N NA
 5610165 5610166 CbuG_0949 CbuG_0950   recA FALSE 0.384 88.000 0.003 NA   NA
 5610166 5610167 CbuG_0950 CbuG_0951 recA recX TRUE 0.989 -3.000 0.296 1.000   NA
 5610167 5610168 CbuG_0951 CbuG_0952 recX alaS TRUE 0.958 -7.000 0.085 1.000   NA
 5610168 5610169 CbuG_0952 CbuG_0953 alaS lysC TRUE 0.975 6.000 0.065 1.000 N NA
 5610169 5610170 CbuG_0953 CbuG_0954 lysC csrA1 TRUE 0.799 59.000 0.079 1.000 N NA
 5610170 5610171 CbuG_0954 CbuG_0955 csrA1   FALSE 0.013 280.000 0.000 NA   NA
 5610171 5610172 CbuG_0955 CbuG_0956     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 5610180 5610181 CbuG_0963 CbuG_0965   cyoA FALSE 0.472 8.000 0.000 NA   NA
 5610181 5610182 CbuG_0965 CbuG_0966 cyoA cyoB TRUE 0.984 20.000 0.200 0.002 Y NA
 5610182 5610183 CbuG_0966 CbuG_0967 cyoB cyoC TRUE 0.996 -3.000 0.267 0.029 Y NA
 5610183 5610184 CbuG_0967 CbuG_0968 cyoC cyoD TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.029 Y NA
 5610185 5610186 CbuG_0969 CbuG_0970     FALSE 0.074 104.000 0.000 NA   NA
 5610186 5610187 CbuG_0970 CbuG_0971     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610189 5610190 CbuG_0973 CbuG_0974     FALSE 0.065 118.000 0.000 NA   NA
 5610190 5610191 CbuG_0974 CbuG_0975     TRUE 0.963 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5610192 5610193 CbuG_0976 CbuG_0977 pgsA   FALSE 0.297 18.000 0.000 NA   NA
 5610194 5610195 CbuG_0978 CbuG_0979     FALSE 0.350 -21.000 0.000 NA   NA
 5610196 5610197 CbuG_0980 CbuG_0981     FALSE 0.447 10.000 0.000 NA   NA
 5610200 5610201 CbuG_0984 CbuG_0985     TRUE 0.534 6.000 0.000 1.000   NA
 5610201 5610202 CbuG_0985 CbuG_0986     FALSE 0.008 794.000 0.000 1.000   NA
 5610202 5610203 CbuG_0986 CbuG_0987     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5610205 5610206 CbuG_0989 CbuG_0990     FALSE 0.037 168.000 0.000 NA   NA
 5610206 5610207 CbuG_0990 CbuG_0991     FALSE 0.078 65.000 0.000 NA   NA
 5610209 5610210 CbuG_0993 CbuG_0994     FALSE 0.098 47.000 0.000 NA   NA
 5610210 5610211 CbuG_0994 CbuG_0995     FALSE 0.011 312.000 0.000 NA   NA
 5610213 5610214 CbuG_0997 CbuG_0998     FALSE 0.423 -10.000 0.000 NA   NA
 5610214 5610215 CbuG_0998 CbuG_0999   bioA TRUE 0.523 1.000 0.000 NA   NA
 5610216 5610217 CbuG_1000 CbuG_1001 bioB bioF TRUE 0.988 -13.000 0.168 1.000 Y NA
 5610217 5610218 CbuG_1001 CbuG_1002 bioF bioH TRUE 0.961 -6.000 0.092 NA   NA
 5610218 5610219 CbuG_1002 CbuG_1003 bioH bioC TRUE 0.968 -10.000 0.163 NA   NA
 5610219 5610220 CbuG_1003 CbuG_1004 bioC bioD TRUE 0.970 -3.000 0.004 0.003 Y NA
 5610222 5610223 CbuG_1006 CbuG_1007 lolC lolD TRUE 0.996 -7.000 0.620 0.020 N NA
 5610223 5610224 CbuG_1007 CbuG_1008 lolD hflX TRUE 0.549 -3.000 0.000 1.000   NA
 5610224 5610225 CbuG_1008 CbuG_1009 hflX purA TRUE 0.737 21.000 0.002 0.013   NA
 5610226 5610227 CbuG_1010 CbuG_1011   cyoE FALSE 0.464 9.000 0.000 NA   NA
 5610227 5610228 CbuG_1011 CbuG_1012 cyoE   TRUE 0.959 -3.000 0.064 0.049   NA
 5610230 5610231 CbuG_1014 CbuG_1015 def1   FALSE 0.167 30.000 0.000 NA   NA
 5610233 5610234 CbuG_1017 CbuG_1018 ung   TRUE 0.824 4.000 0.000 NA N NA
 5610236 5610237 CbuG_1020 CbuG_1021     FALSE 0.171 29.000 0.000 NA   NA
 5610237 5610238 CbuG_1021 CbuG_1022     FALSE 0.381 -16.000 0.000 NA   NA
 5610238 5610239 CbuG_1022 CbuG_1023     FALSE 0.423 -10.000 0.000 NA   NA
 5610239 5610240 CbuG_1023 CbuG_1024     FALSE 0.078 68.000 0.000 NA   NA
 5610241 5610242 CbuG_1025 CbuG_1026     FALSE 0.077 89.000 0.000 NA   NA
 5610243 5610244 CbuG_1027 CbuG_1028     FALSE 0.089 51.000 0.000 NA   NA
 5610244 5610245 CbuG_1028 CbuG_1029     TRUE 0.994 2.000 0.205 0.048 Y NA
 5610245 5610246 CbuG_1029 CbuG_1030     TRUE 0.982 20.000 0.189 1.000 Y NA
 5610246 5610247 CbuG_1030 CbuG_1031     TRUE 0.725 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5610247 5610248 CbuG_1031 CbuG_1032     TRUE 0.917 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5610249 5610250 CbuG_1033 CbuG_1034   pyrD TRUE 0.889 -3.000 0.003 NA   NA
 5610253 5610254 CbuG_1037 CbuG_1038   cybB1 TRUE 0.945 11.000 0.070 NA   NA
 5610254 5610255 CbuG_1038 CbuG_1039 cybB1 cydA1 TRUE 0.998 -3.000 0.953 0.028 Y NA
 5610255 5610256 CbuG_1039 CbuG_1040 cydA1   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610256 5610257 CbuG_1040 CbuG_1041     FALSE 0.016 258.000 0.000 NA   NA
 5610258 5610259 CbuG_1042 CbuG_1043 bcp   TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5610260 5610261 CbuG_1044 CbuG_1045     FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 5610262 5610263 CbuG_1046 CbuG_1047     FALSE 0.132 35.000 0.000 NA   NA
 5610263 5610264 CbuG_1047 CbuG_1048     FALSE 0.076 74.000 0.000 NA   NA
 5610266 5610267 CbuG_1050 CbuG_1051     FALSE 0.078 68.000 0.000 NA   NA
 5610267 5610268 CbuG_1051 CbuG_1052   nudC FALSE 0.285 19.000 0.000 NA   NA
 5610268 5610269 CbuG_1052 CbuG_1053 nudC   FALSE 0.100 46.000 0.000 NA   NA
 5610269 5610270 CbuG_1053 CbuG_1054     FALSE 0.079 61.000 0.000 NA   NA
 5610272 5610273 CbuG_1056 CbuG_1057     FALSE 0.008 389.000 0.000 NA   NA
 5610273 5610274 CbuG_1057 CbuG_1058     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 5610274 5610275 CbuG_1058 CbuG_1059     FALSE 0.009 346.000 0.000 NA   NA
 5610276 5610277 CbuG_1060 CbuG_1061     FALSE 0.116 39.000 0.000 NA   NA
 5610279 5610280 CbuG_1063 CbuG_1064   mutY TRUE 0.986 -3.000 0.150 NA N NA
 5610280 5610281 CbuG_1064 CbuG_1065 mutY   TRUE 0.816 6.000 0.000 NA N NA
 5610281 5610282 CbuG_1065 CbuG_1066     FALSE 0.483 7.000 0.000 NA   NA
 5610285 5610286 CbuG_1069 CbuG_1070     FALSE 0.033 193.000 0.000 1.000   NA
 5610286 5610287 CbuG_1070 CbuG_1071     TRUE 0.534 6.000 0.000 1.000   NA
 5610287 5610288 CbuG_1071 CbuG_1072     TRUE 0.997 1.000 0.688 0.089 N NA
 5610290 5610291 CbuG_1074 CbuG_1075 glpD mpg TRUE 0.749 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5610291 5610292 CbuG_1075 CbuG_1076 mpg   FALSE 0.464 -10.000 0.000 1.000   NA
 5610292 5610293 CbuG_1076 CbuG_1077   pdxH FALSE 0.277 22.000 0.000 1.000   NA
 5610293 5610294 CbuG_1077 CbuG_1078 pdxH mmsA FALSE 0.149 32.000 0.000 NA   NA
 5610294 5610295 CbuG_1078 CbuG_1079 mmsA mmsB FALSE 0.447 10.000 0.000 NA   NA
 5610295 5610296 CbuG_1079 CbuG_1080 mmsB   FALSE 0.274 101.000 0.000 NA N NA
 5610296 5610297 CbuG_1080 CbuG_1081   mdmC TRUE 0.520 2.000 0.000 NA   NA
 5610300 5610301 CbuG_1084 CbuG_1085     FALSE 0.159 31.000 0.000 NA   NA
 5610303 5610304 CbuG_1087 CbuG_1088     FALSE 0.074 104.000 0.000 NA   NA
 5610305 5610306 CbuG_1089 CbuG_1090 enhB.2   TRUE 0.520 2.000 0.000 NA   NA
 5610306 5610307 CbuG_1090 CbuG_1091     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 5610307 5610308 CbuG_1091 CbuG_1092   prpD TRUE 0.520 2.000 0.000 NA   NA
 5610308 5610309 CbuG_1092 CbuG_1093 prpD   FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 5610310 5610311 CbuG_1094 CbuG_1095     FALSE 0.078 98.000 0.000 NA   NA
 5610312 5610313 CbuG_1096 CbuG_1097 ispZ   TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5610316 5610317 CbuG_1100 CbuG_1101     FALSE 0.024 210.000 0.000 NA   NA
 5610317 5610318 CbuG_1101 CbuG_1102     FALSE 0.012 289.000 0.000 NA   NA
 5610318 5610319 CbuG_1102 CbuG_1103     FALSE 0.010 329.000 0.000 NA   NA
 5610319 5610320 CbuG_1103 CbuG_1104     FALSE 0.312 17.000 0.000 NA   NA
 5610320 5610321 CbuG_1104 CbuG_1105   purF TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610321 5610322 CbuG_1105 CbuG_1106 purF dedE TRUE 0.985 9.000 0.262 1.000   NA
 5610322 5610323 CbuG_1106 CbuG_1107 dedE dedD TRUE 0.730 68.000 0.116 NA   NA
 5610323 5610324 CbuG_1107 CbuG_1108 dedD folC TRUE 0.974 -16.000 0.216 NA   NA
 5610324 5610325 CbuG_1108 CbuG_1109 folC accD TRUE 0.921 133.000 0.383 1.000 N NA
 5610325 5610326 CbuG_1109 CbuG_1110 accD truA TRUE 0.866 31.000 0.044 1.000 N NA
 5610326 5610327 CbuG_1110 CbuG_1111 truA   TRUE 0.500 5.000 0.000 NA   NA
 5610328 5610329 CbuG_1112 CbuG_1113     FALSE 0.116 39.000 0.000 NA   NA
 5610329 5610330 CbuG_1113 CbuG_1114   bdbC TRUE 0.989 -3.000 0.308 NA   NA
 5610331 5610332 CbuG_1115 CbuG_1116   coaBC FALSE 0.013 284.000 0.000 NA   NA
 5610332 5610333 CbuG_1116 CbuG_1117 coaBC   FALSE 0.149 32.000 0.000 NA   NA
 5610333 5610334 CbuG_1117 CbuG_1118   bipA FALSE 0.406 12.000 0.000 NA   NA
 5610335 5610336 CbuG_1119 CbuG_1120     FALSE 0.046 146.000 0.000 NA   NA
 5610336 5610337 CbuG_1120 CbuG_1121     FALSE 0.011 305.000 0.000 NA   NA
 5610338 5610339 CbuG_1122 CbuG_1123     FALSE 0.078 95.000 0.000 NA   NA
 5610339 5610340 CbuG_1123 CbuG_1124     FALSE 0.067 114.000 0.000 NA   NA
 5610342 5610343 CbuG_1126 CbuG_1127   asd FALSE 0.359 -19.000 0.000 NA   NA
 5610343 5610344 CbuG_1127 CbuG_1128 asd aroC TRUE 0.862 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5610345 5610346 CbuG_1129 CbuG_1130   udk FALSE 0.423 -10.000 0.000 NA   NA
 5610346 5610347 CbuG_1130 CbuG_1131 udk   FALSE 0.075 81.000 0.000 NA   NA
 5610348 5610349 CbuG_1132 CbuG_1133   alr TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610349 5610350 CbuG_1133 CbuG_1134 alr dnaB TRUE 0.970 -3.000 0.035 1.000 N NA
 5610350 5610351 CbuG_1134 CbuG_1135 dnaB rplI FALSE 0.444 249.000 0.074 1.000 N NA
 5610351 5610352 CbuG_1135 CbuG_1136 rplI   TRUE 0.914 12.000 0.034 NA   NA
 5610352 5610353 CbuG_1136 CbuG_1137   rpsR TRUE 0.942 4.000 0.034 NA   NA
 5610353 5610354 CbuG_1137 CbuG_1138 rpsR rpsF TRUE 0.994 13.000 0.319 0.023 Y NA
 5610354 5610355 CbuG_1138 CbuG_1139 rpsF   FALSE 0.397 -13.000 0.000 NA   NA
 5610355 5610356 CbuG_1139 CbuG_1140     FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 5610356 5610357 CbuG_1140 CbuG_1141     FALSE 0.027 195.000 0.000 NA   NA
 5610358 5610359 CbuG_1142 CbuG_1143   nadE FALSE 0.483 7.000 0.000 NA   NA
 5610360 5610361 CbuG_1144 CbuG_1145 lpxK   TRUE 0.991 0.000 0.205 1.000 N NA
 5610361 5610362 CbuG_1145 CbuG_1146     FALSE 0.371 -18.000 0.000 NA   NA
 5610362 5610363 CbuG_1146 CbuG_1147     FALSE 0.098 47.000 0.000 NA   NA
 5610365 5610366 CbuG_1149 CbuG_1150 pnp rpsO TRUE 0.995 11.000 0.335 1.000 Y NA
 5610366 5610367 CbuG_1150 CbuG_1151 rpsO   FALSE 0.076 101.000 0.000 NA   NA
 5610367 5610368 CbuG_1151 CbuG_1152   galU FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 5610368 5610369 CbuG_1152 CbuG_1153 galU pgi TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5610369 5610370 CbuG_1153 CbuG_1154 pgi   TRUE 0.797 10.000 0.000 1.000 N NA
 5610370 5610371 CbuG_1154 CbuG_1155   ugd TRUE 0.731 14.000 0.000 1.000 N NA
 5610372 5610373 CbuG_1156 CbuG_1157     TRUE 0.976 -12.000 0.046 1.000 Y NA
 5610374 5610375 CbuG_1158 CbuG_1159   wecB TRUE 0.881 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5610375 5610376 CbuG_1159 CbuG_1160 wecB   FALSE 0.173 231.000 0.000 1.000 Y NA
 5610376 5610377 CbuG_1160 CbuG_1161   asnB1 TRUE 0.973 7.000 0.061 1.000 N NA
 5610377 5610378 CbuG_1161 CbuG_1162 asnB1   TRUE 0.843 0.000 0.000 1.000 N NA
 5610378 5610379 CbuG_1162 CbuG_1163     FALSE 0.374 136.000 0.000 0.013 Y NA
 5610379 5610380 CbuG_1163 CbuG_1164     FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 5610380 5610381 CbuG_1164 CbuG_1165     FALSE 0.340 15.000 0.000 NA   NA
 5610381 5610382 CbuG_1165 CbuG_1166     TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5610382 5610383 CbuG_1166 CbuG_1167     FALSE 0.464 9.000 0.000 NA   NA
 5610383 5610384 CbuG_1167 CbuG_1168     TRUE 0.751 13.000 0.000 1.000 N NA
 5610384 5610385 CbuG_1168 CbuG_1169     FALSE 0.465 11.000 0.000 1.000   NA
 5610385 5610386 CbuG_1169 CbuG_1170   asnB2 TRUE 0.564 1.000 0.000 1.000   NA
 5610386 5610387 CbuG_1170 CbuG_1171 asnB2   TRUE 0.989 3.000 0.178 1.000 N NA
 5610387 5610388 CbuG_1171 CbuG_1172     TRUE 0.998 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 5610388 5610389 CbuG_1172 CbuG_1173     TRUE 0.938 15.000 0.094 1.000   NA
 5610389 5610390 CbuG_1173 CbuG_1174     FALSE 0.075 77.000 0.000 NA   NA
 5610390 5610391 CbuG_1174 CbuG_1175   rfaH TRUE 0.714 35.000 0.036 NA   NA
 5610391 5610392 CbuG_1175 CbuG_1176 rfaH   TRUE 0.762 -13.000 0.000 1.000 N NA
 5610393 5610394 CbuG_1177 CbuG_1178 purB sfcA TRUE 0.514 28.000 0.000 1.000 N NA
 5610397 5610398 CbuG_1181 CbuG_1182     FALSE 0.076 74.000 0.000 NA   NA
 5610398 5610399 CbuG_1182 CbuG_1183     FALSE 0.299 57.000 0.000 1.000 N NA
 5610403 5610404 CbuG_1187 CbuG_1188     FALSE 0.012 288.000 0.000 NA   NA
 5610404 5610405 CbuG_1188 CbuG_1189   prfC TRUE 0.892 15.000 0.003 1.000 N NA
 5610405 5610406 CbuG_1189 CbuG_1190 prfC   TRUE 0.564 1.000 0.000 1.000   NA
 5610406 5610407 CbuG_1190 CbuG_1191     TRUE 0.992 -12.000 0.631 0.047   NA
 5610410 5610411 CbuG_1194 CbuG_1195     FALSE 0.074 104.000 0.000 NA   NA
 5610412 5610413 CbuG_1196 CbuG_1197     TRUE 0.821 8.000 0.000 0.049 N NA
 5610415 5610416 CbuG_1199 CbuG_1200 rimI   FALSE 0.079 60.000 0.000 NA   NA
 5610416 5610417 CbuG_1200 CbuG_1201     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610418 5610419 CbuG_1202 CbuG_1203     TRUE 0.997 1.000 0.600 1.000 N NA
 5610419 5610420 CbuG_1203 CbuG_1204     TRUE 0.820 17.000 0.000 1.000 Y NA
 5610420 5610421 CbuG_1204 CbuG_1205   folE TRUE 0.843 0.000 0.000 1.000 N NA
 5610421 5610422 CbuG_1205 CbuG_1206 folE   FALSE 0.159 31.000 0.000 NA   NA
 5610422 5610423 CbuG_1206 CbuG_1207     FALSE 0.010 319.000 0.000 NA   NA
 5610423 5610424 CbuG_1207 CbuG_1208     FALSE 0.098 47.000 0.000 NA   NA
 5610425 5610426 CbuG_1209 CbuG_1210     FALSE 0.319 19.000 0.000 1.000   NA
 5610426 5610427 CbuG_1210 CbuG_1211     FALSE 0.010 318.000 0.000 NA   NA
 5610427 5610428 CbuG_1211 CbuG_1212     FALSE 0.017 250.000 0.000 NA   NA
 5610428 5610429 CbuG_1212 CbuG_1213     FALSE 0.256 116.000 0.000 1.000 N NA
 5610429 5610430 CbuG_1213 CbuG_1214     TRUE 0.881 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 5610430 5610431 CbuG_1214 CbuG_1215     FALSE 0.427 36.000 0.000 0.046 N NA
 5610431 5610432 CbuG_1215 CbuG_1216     FALSE 0.015 270.000 0.000 NA   NA
 5610433 5610434 CbuG_1217 CbuG_1218     FALSE 0.387 -15.000 0.000 NA   NA
 5610435 5610436 CbuG_1219 CbuG_1220     FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 5610436 5610437 CbuG_1220 CbuG_1221     FALSE 0.078 65.000 0.000 NA   NA
 5610438 5610439 CbuG_1222 CbuG_1223   pfpI FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 5610440 5610441 CbuG_1224 CbuG_1225     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 5610441 5610442 CbuG_1225 CbuG_1226     TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5610442 5610443 CbuG_1226 CbuG_1227     TRUE 0.900 7.000 0.000 NA Y NA
 5610443 5610444 CbuG_1227 CbuG_1228     FALSE 0.054 135.000 0.000 NA   NA
 5610444 5610445 CbuG_1228 CbuG_1229   prpC TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5610445 5610446 CbuG_1229 CbuG_1230 prpC prpB TRUE 0.995 -7.000 0.502 1.000 N NA
 5610446 5610447 CbuG_1230 CbuG_1231 prpB   FALSE 0.035 172.000 0.000 NA   NA
 5610447 5610448 CbuG_1231 CbuG_1232     FALSE 0.037 167.000 0.000 NA   NA
 5610448 5610449 CbuG_1232 CbuG_1233     FALSE 0.289 100.000 0.000 1.000 N NA
 5610449 5610450 CbuG_1233 CbuG_1234     FALSE 0.007 547.000 0.000 NA   NA
 5610450 5610451 CbuG_1234 CbuG_1235     FALSE 0.055 134.000 0.000 NA   NA
 5610453 5610454 CbuG_1237 CbuG_1238     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610454 5610455 CbuG_1238 CbuG_1239     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5610455 5610456 CbuG_1239 CbuG_1240     FALSE 0.258 21.000 0.000 NA   NA
 5610456 5610457 CbuG_1240 CbuG_1241     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5610458 5610459 CbuG_1242 CbuG_1243     FALSE 0.075 82.000 0.000 NA   NA
 5610461 5610462 CbuG_1245 CbuG_1246 rluD   TRUE 0.847 41.000 0.168 NA   NA
 5610462 5610463 CbuG_1246 CbuG_1247   htrA FALSE 0.245 161.000 0.004 NA   NA
 5610463 5610464 CbuG_1247 CbuG_1248 htrA   TRUE 0.843 0.000 0.000 1.000 N NA
 5610464 5610465 CbuG_1248 CbuG_1249     FALSE 0.324 48.000 0.000 NA N NA
 5610466 5610467 CbuG_1250 CbuG_1251     FALSE 0.159 31.000 0.000 NA   NA
 5610467 5610468 CbuG_1251 CbuG_1252   murA FALSE 0.081 56.000 0.000 NA   NA
 5610469 5610470 CbuG_1253 CbuG_1254 kdsD   TRUE 0.994 2.000 0.598 1.000   NA
 5610470 5610471 CbuG_1254 CbuG_1255     TRUE 0.987 16.000 0.617 NA   NA
 5610471 5610472 CbuG_1255 CbuG_1256     TRUE 0.927 50.000 0.459 NA   NA
 5610472 5610473 CbuG_1256 CbuG_1257     TRUE 0.994 3.000 0.543 NA   NA
 5610473 5610474 CbuG_1257 CbuG_1258   yfiA FALSE 0.423 98.000 0.006 NA   NA
 5610474 5610475 CbuG_1258 CbuG_1259 yfiA hprK TRUE 0.937 0.000 0.021 NA   NA
 5610475 5610476 CbuG_1259 CbuG_1260 hprK ptsH FALSE 0.398 -19.000 0.000 1.000   NA
 5610477 5610478 CbuG_1261 CbuG_1262   pmbA FALSE 0.076 85.000 0.000 NA   NA
 5610478 5610479 CbuG_1262 CbuG_1263 pmbA lon FALSE 0.464 9.000 0.000 NA   NA
 5610479 5610480 CbuG_1263 CbuG_1264 lon clpX TRUE 0.989 14.000 0.201 0.085 Y NA
 5610480 5610481 CbuG_1264 CbuG_1265 clpX clpP TRUE 0.965 55.000 0.352 1.000 Y NA
 5610481 5610482 CbuG_1265 CbuG_1266 clpP tig TRUE 0.996 10.000 0.351 1.000 Y NA
 5610482 5610483 CbuG_1266 CbuG_1267 tig   FALSE 0.472 8.000 0.000 NA   NA
 5610486 5610487 CbuG_1269 CbuG_1271     FALSE 0.079 60.000 0.000 NA   NA
 5610487 5610488 CbuG_1271 CbuG_1272     FALSE 0.075 103.000 0.000 NA   NA
 5610489 5610490 CbuG_1273 CbuG_1274     TRUE 0.986 3.000 0.239 NA   NA
 5610490 5610491 CbuG_1274 CbuG_1275     TRUE 0.973 -16.000 0.054 NA Y NA
 5610491 5610492 CbuG_1275 CbuG_1276     TRUE 0.998 -3.000 0.556 NA Y NA
 5610493 5610494 CbuG_1277 CbuG_1278     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610494 5610495 CbuG_1278 CbuG_1279     FALSE 0.012 288.000 0.000 NA   NA
 5610495 5610496 CbuG_1279 CbuG_1280     FALSE 0.074 104.000 0.000 NA   NA
 5610496 5610497 CbuG_1280 CbuG_1281     TRUE 0.930 24.000 0.081 1.000 N NA
 5610497 5610498 CbuG_1281 CbuG_1282   sepB TRUE 0.977 0.000 0.061 1.000 N NA
 5610499 5610500 CbuG_1283 CbuG_1284     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610500 5610501 CbuG_1284 CbuG_1285   poxB FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 5610504 5610505 CbuG_1288 CbuG_1289     FALSE 0.091 50.000 0.000 NA   NA
 5610505 5610506 CbuG_1289 CbuG_1290     FALSE 0.296 59.000 0.000 1.000 N NA
 5610506 5610507 CbuG_1290 CbuG_1291     FALSE 0.007 1000.000 0.000 NA   NA
 5610507 5610508 CbuG_1291 CbuG_1292     FALSE 0.011 308.000 0.000 NA   NA
 5610510 5610511 CbuG_1294 CbuG_1295     FALSE 0.025 205.000 0.000 NA   NA
 5610511 5610512 CbuG_1295 CbuG_1296     FALSE 0.010 341.000 0.000 NA   NA
 5610513 5610514 CbuG_1297 CbuG_1298   rfbI FALSE 0.008 485.000 0.000 NA   NA
 5610514 5610515 CbuG_1298 CbuG_1299 rfbI   TRUE 0.886 10.000 0.000 NA Y NA
 5610515 5610516 CbuG_1299 CbuG_1300     TRUE 0.787 10.000 0.000 NA N NA
 5610517 5610518 CbuG_1301 CbuG_1302 cysQ2   TRUE 0.855 -18.000 0.000 1.000 Y NA
 5610520 5610521 CbuG_1304 CbuG_1305     FALSE 0.233 23.000 0.000 NA   NA
 5610521 5610522 CbuG_1305 CbuG_1306     TRUE 0.668 31.000 0.000 0.011 Y NA
 5610522 5610523 CbuG_1306 CbuG_1307     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5610523 5610524 CbuG_1307 CbuG_1308     FALSE 0.078 62.000 0.000 NA   NA
 5610524 5610525 CbuG_1308 CbuG_1309     FALSE 0.059 127.000 0.000 NA   NA
 5610525 5610526 CbuG_1309 CbuG_1310     TRUE 0.981 -3.000 0.026 0.003 Y NA
 5610527 5610528 CbuG_1311 CbuG_1312     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5610528 5610529 CbuG_1312 CbuG_1313   gmd TRUE 0.892 9.000 0.000 NA Y NA
 5610529 5610530 CbuG_1313 CbuG_1314 gmd wcaG TRUE 0.898 -7.000 0.000 0.006 Y NA
 5610530 5610531 CbuG_1314 CbuG_1315 wcaG   FALSE 0.009 380.000 0.000 NA   NA
 5610531 5610532 CbuG_1315 CbuG_1316     FALSE 0.312 17.000 0.000 NA   NA
 5610532 5610533 CbuG_1316 CbuG_1317     FALSE 0.397 -13.000 0.000 NA   NA
 5610533 5610534 CbuG_1317 CbuG_1318     FALSE 0.086 53.000 0.000 NA   NA
 5610534 5610535 CbuG_1318 CbuG_1319     FALSE 0.008 436.000 0.000 NA   NA
 5610537 5610538 CbuG_1321 CbuG_1322     TRUE 0.962 3.000 0.069 1.000   NA
 5610538 5610539 CbuG_1322 CbuG_1323     TRUE 0.995 -7.000 0.286 1.000 Y NA
 5610539 5610540 CbuG_1323 CbuG_1324     TRUE 0.982 -15.000 0.286 0.026   NA
 5610540 5610541 CbuG_1324 CbuG_1325     TRUE 0.957 3.000 0.059 1.000   NA
 5610541 5610542 CbuG_1325 CbuG_1326     TRUE 0.982 -25.000 0.206 0.013 N NA
 5610542 5610543 CbuG_1326 CbuG_1327     TRUE 0.990 -3.000 0.111 0.002 Y NA
 5610544 5610545 CbuG_1328 CbuG_1329     TRUE 0.916 4.000 0.000 0.009 Y NA
 5610545 5610546 CbuG_1329 CbuG_1330     TRUE 0.955 -6.000 0.015 1.000 N NA
 5610546 5610547 CbuG_1330 CbuG_1331     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5610548 5610549 CbuG_1332 CbuG_1333 rfbA.2   FALSE 0.149 32.000 0.000 NA   NA
 5610549 5610550 CbuG_1333 CbuG_1334     FALSE 0.064 119.000 0.000 NA   NA
 5610550 5610551 CbuG_1334 CbuG_1335   rhlE FALSE 0.051 139.000 0.000 NA   NA
 5610551 5610552 CbuG_1335 CbuG_1336 rhlE   FALSE 0.059 127.000 0.000 NA   NA
 5610552 5610553 CbuG_1336 CbuG_1337     FALSE 0.089 51.000 0.000 NA   NA
 5610554 5610555 CbuG_1338 CbuG_1339   dapD TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610555 5610556 CbuG_1339 CbuG_1340 dapD dapE TRUE 0.989 6.000 0.109 0.002 Y NA
 5610557 5610558 CbuG_1341 CbuG_1342     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610558 5610559 CbuG_1342 CbuG_1343     FALSE 0.073 105.000 0.000 NA   NA
 5610559 5610560 CbuG_1343 CbuG_1344     FALSE 0.149 32.000 0.000 NA   NA
 5610560 5610561 CbuG_1344 CbuG_1345     FALSE 0.423 -10.000 0.000 NA   NA
 5610562 5610563 CbuG_1346 CbuG_1347     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 5610563 5610564 CbuG_1347 CbuG_1348   dnaX TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5610564 5610565 CbuG_1348 CbuG_1349 dnaX   TRUE 0.901 110.000 0.411 NA   NA
 5610565 5610566 CbuG_1349 CbuG_1350   recR TRUE 0.991 12.000 0.604 NA   NA
 5610566 5610567 CbuG_1350 CbuG_1351 recR   TRUE 0.989 14.000 0.604 NA   NA
 5610568 5610569 CbuG_1352 CbuG_1353     FALSE 0.220 24.000 0.000 NA   NA
 5610569 5610570 CbuG_1353 CbuG_1354     FALSE 0.033 178.000 0.000 NA   NA
 5610570 5610571 CbuG_1354 CbuG_1355     FALSE 0.035 173.000 0.000 NA   NA
 5610571 5610572 CbuG_1355 CbuG_1356   ribH FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5610572 5610573 CbuG_1356 CbuG_1357 ribH ribA TRUE 0.973 -3.000 0.008 0.002 Y NA
 5610573 5610574 CbuG_1357 CbuG_1358 ribA ribE TRUE 0.809 41.000 0.009 1.000 Y NA
 5610575 5610576 CbuG_1359 CbuG_1360     TRUE 0.967 6.000 0.107 NA   NA
 5610577 5610578 CbuG_1361 CbuG_1362 ribD   TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5610579 5610580 CbuG_1363 CbuG_1364     TRUE 0.977 -3.000 0.065 1.000 N NA
 5610580 5610581 CbuG_1364 CbuG_1365     TRUE 0.904 205.000 0.458 0.003 Y NA
 5610581 5610582 CbuG_1365 CbuG_1366   pdhC TRUE 0.998 0.000 0.556 0.044 Y NA
 5610582 5610583 CbuG_1366 CbuG_1367 pdhC   FALSE 0.037 413.000 0.000 NA N NA
 5610584 5610585 CbuG_1368 CbuG_1369     FALSE 0.108 43.000 0.000 NA   NA
 5610585 5610586 CbuG_1369 CbuG_1370     FALSE 0.285 19.000 0.000 NA   NA
 5610588 5610589 CbuG_1372 CbuG_1373 purL mip FALSE 0.375 42.000 0.000 1.000 N NA
 5610589 5610590 CbuG_1373 CbuG_1374 mip putA FALSE 0.288 73.000 0.000 1.000 N NA
 5610590 5610591 CbuG_1374 CbuG_1375 putA ppa FALSE 0.408 119.000 0.000 1.000 Y NA
 5610593 5610594 CbuG_1377 CbuG_1378     FALSE 0.071 109.000 0.000 NA   NA
 5610594 5610595 CbuG_1378 CbuG_1379     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 5610595 5610596 CbuG_1379 CbuG_1380     FALSE 0.063 120.000 0.000 NA   NA
 5610596 5610597 CbuG_1380 CbuG_1381     TRUE 0.500 5.000 0.000 NA   NA
 5610598 5610599 CbuG_1382 CbuG_1383   lpxB TRUE 0.933 -10.000 0.044 1.000   NA
 5610599 5610600 CbuG_1383 CbuG_1384 lpxB   FALSE 0.041 158.000 0.000 NA   NA
 5610600 5610601 CbuG_1384 CbuG_1385     TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5610601 5610602 CbuG_1385 CbuG_1386     TRUE 0.500 5.000 0.000 NA   NA
 5610603 5610604 CbuG_1387 CbuG_1388   lpxA TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610604 5610605 CbuG_1388 CbuG_1389 lpxA fabZ TRUE 0.997 5.000 0.850 1.000 N NA
 5610605 5610606 CbuG_1389 CbuG_1390 fabZ lpxD TRUE 0.997 -3.000 0.796 1.000 N NA
 5610606 5610607 CbuG_1390 CbuG_1391 lpxD   TRUE 0.997 10.000 0.814 1.000 Y NA
 5610607 5610608 CbuG_1391 CbuG_1392   yaeT FALSE 0.065 118.000 0.000 NA   NA
 5610609 5610610 CbuG_1393 CbuG_1394 hmgA   TRUE 0.912 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5610610 5610611 CbuG_1394 CbuG_1395   mvk TRUE 0.828 99.000 0.040 0.001 Y NA
 5610611 5610612 CbuG_1395 CbuG_1396 mvk mvaD TRUE 0.995 -7.000 0.312 0.002 Y NA
 5610613 5610614 CbuG_1397 CbuG_1398     FALSE 0.091 50.000 0.000 NA   NA
 5610616 5610617 CbuG_1400 CbuG_1401   cysQ1 TRUE 0.659 19.000 0.000 1.000 N NA
 5610617 5610618 CbuG_1401 CbuG_1402 cysQ1 nudE TRUE 0.988 -10.000 0.373 1.000   NA
 5610621 5610622 CbuG_1405 CbuG_1406     FALSE 0.043 151.000 0.000 NA   NA
 5610623 5610624 CbuG_1407 CbuG_1408     TRUE 0.520 2.000 0.000 NA   NA
 5610624 5610625 CbuG_1408 CbuG_1409     FALSE 0.033 177.000 0.000 NA   NA
 5610625 5610626 CbuG_1409 CbuG_1410   nadA TRUE 0.825 -3.000 0.000 NA N NA
 5610626 5610627 CbuG_1410 CbuG_1411 nadA   FALSE 0.282 80.000 0.000 1.000 N NA
 5610627 5610628 CbuG_1411 CbuG_1412     FALSE 0.355 45.000 0.000 1.000 N NA
 5610630 5610631 CbuG_1414 CbuG_1415     FALSE 0.027 197.000 0.000 NA   NA
 5610631 5610632 CbuG_1415 CbuG_1416     TRUE 0.991 3.000 0.216 NA N NA
 5610635 5610636 CbuG_1419 CbuG_1420     TRUE 0.863 -13.000 0.000 NA Y NA
 5610637 5610638 CbuG_1421 CbuG_1422   yfcX FALSE 0.410 -12.000 0.000 NA   NA
 5610642 5610643 CbuG_1426 CbuG_1427     TRUE 0.797 10.000 0.000 1.000 N NA
 5610644 5610645 CbuG_1428 CbuG_1429     FALSE 0.023 215.000 0.000 NA   NA
 5610645 5610646 CbuG_1429 CbuG_1430   miaB TRUE 0.629 21.000 0.000 1.000 N NA
 5610646 5610647 CbuG_1430 CbuG_1431 miaB   TRUE 0.988 11.000 0.220 1.000 N NA
 5610647 5610648 CbuG_1431 CbuG_1432     TRUE 0.992 -3.000 0.457 NA   NA
 5610648 5610649 CbuG_1432 CbuG_1433     FALSE 0.081 56.000 0.000 NA   NA
 5610649 5610650 CbuG_1433 CbuG_1434     FALSE 0.355 43.000 0.000 NA N NA
 5610650 5610651 CbuG_1434 CbuG_1435   cutE TRUE 0.838 233.000 0.557 NA N NA
 5610651 5610652 CbuG_1435 CbuG_1436 cutE   FALSE 0.011 371.000 0.000 1.000   NA
 5610654 5610655 CbuG_1438 CbuG_1439 leuS   TRUE 0.984 -10.000 0.182 NA N NA
 5610655 5610656 CbuG_1439 CbuG_1440   holA TRUE 0.990 3.000 0.199 NA N NA
 5610656 5610657 CbuG_1440 CbuG_1441 holA nadD TRUE 0.922 -19.000 0.010 1.000 N NA
 5610657 5610658 CbuG_1441 CbuG_1442 nadD   FALSE 0.025 206.000 0.000 NA   NA
 5610660 5610661 CbuG_1444 CbuG_1445     FALSE 0.159 31.000 0.000 NA   NA
 5610661 5610662 CbuG_1445 CbuG_1446   pbpA FALSE 0.271 20.000 0.000 NA   NA
 5610662 5610663 CbuG_1446 CbuG_1447 pbpA rodA TRUE 0.841 43.000 0.073 1.000 N NA
 5610663 5610664 CbuG_1447 CbuG_1448 rodA mltB TRUE 0.803 80.000 0.096 NA N NA
 5610664 5610665 CbuG_1448 CbuG_1449 mltB   FALSE 0.359 -19.000 0.000 NA   NA
 5610666 5610667 CbuG_1450 CbuG_1451 htpX   TRUE 0.986 10.000 0.307 NA   NA
 5610667 5610668 CbuG_1451 CbuG_1452     FALSE 0.080 59.000 0.000 NA   NA
 5610668 5610669 CbuG_1452 CbuG_1453     FALSE 0.010 322.000 0.000 NA   NA
 5610669 5610670 CbuG_1453 CbuG_1454   ligA FALSE 0.023 218.000 0.000 NA   NA
 5610670 5610671 CbuG_1454 CbuG_1455 ligA zipA TRUE 0.971 1.000 0.106 1.000   NA
 5610671 5610672 CbuG_1455 CbuG_1456 zipA smc TRUE 0.757 55.000 0.115 0.010   NA
 5610672 5610673 CbuG_1456 CbuG_1457 smc   FALSE 0.138 179.000 0.000 1.000 N NA
 5610677 5610678 CbuG_1461 CbuG_1462 rfe   FALSE 0.028 211.000 0.000 1.000   NA
 5610678 5610679 CbuG_1462 CbuG_1463   pyrF TRUE 0.562 63.000 0.024 1.000   NA
 5610679 5610680 CbuG_1463 CbuG_1464 pyrF   TRUE 0.985 4.000 0.125 1.000 N NA
 5610680 5610681 CbuG_1464 CbuG_1465     TRUE 0.994 -3.000 0.576 NA   NA
 5610681 5610682 CbuG_1465 CbuG_1466   rpsA FALSE 0.270 155.000 0.005 NA   NA
 5610682 5610683 CbuG_1466 CbuG_1467 rpsA cmk TRUE 0.893 132.000 0.281 1.000 N NA
 5610683 5610684 CbuG_1467 CbuG_1468 cmk aroA TRUE 0.991 1.000 0.209 1.000 N NA
 5610684 5610685 CbuG_1468 CbuG_1469 aroA serC TRUE 0.979 6.000 0.033 1.000 Y NA
 5610685 5610686 CbuG_1469 CbuG_1470 serC gyrA TRUE 0.778 61.000 0.067 1.000 N NA
 5610688 5610689 CbuG_1472 CbuG_1473     FALSE 0.025 204.000 0.000 NA   NA
 5610690 5610691 CbuG_1474 CbuG_1475   leuA TRUE 0.762 -13.000 0.000 1.000 N NA
 5610692 5610693 CbuG_1476 CbuG_1478   uvrB FALSE 0.079 60.000 0.000 NA   NA
 5610694 5610695 CbuG_1477 CbuG_1479 aspC   FALSE 0.083 55.000 0.000 NA   NA
 5610696 5610697 CbuG_1480 CbuG_1481     FALSE 0.073 105.000 0.000 NA   NA
 5610697 5610698 CbuG_1481 CbuG_1482     FALSE 0.033 177.000 0.000 NA   NA
 5610699 5610700 CbuG_1483 CbuG_1484     FALSE 0.040 160.000 0.000 NA   NA
 5610701 5610702 CbuG_1485 CbuG_1486     FALSE 0.017 254.000 0.000 NA   NA
 5610702 5610703 CbuG_1486 CbuG_1487     FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 5610703 5610704 CbuG_1487 CbuG_1488     FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 5610704 5610705 CbuG_1488 CbuG_1489     FALSE 0.143 33.000 0.000 NA   NA
 5610707 5610708 CbuG_1491 CbuG_1492     TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5610708 5610709 CbuG_1492 CbuG_1493     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610711 5610712 CbuG_1495 CbuG_1496     FALSE 0.078 98.000 0.000 NA   NA
 5610712 5610713 CbuG_1496 CbuG_1497     FALSE 0.007 671.000 0.000 NA   NA
 5610713 5610714 CbuG_1497 CbuG_1498     TRUE 0.566 0.000 0.000 1.000   NA
 5610715 5610716 CbuG_1499 CbuG_1500     TRUE 0.786 28.000 0.039 NA   NA
 5610717 5610718 CbuG_1501 CbuG_1502     FALSE 0.036 171.000 0.000 NA   NA
 5610718 5610719 CbuG_1502 CbuG_1503   trpR FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 5610720 5610721 CbuG_1504 CbuG_1505     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 5610722 5610723 CbuG_1506 CbuG_1507 recJ   FALSE 0.064 119.000 0.000 NA   NA
 5610724 5610725 CbuG_1508 CbuG_1509     FALSE 0.291 64.000 0.000 1.000 N NA
 5610725 5610726 CbuG_1509 CbuG_1510   glnA FALSE 0.287 163.000 0.000 1.000 Y NA
 5610727 5610728 CbuG_1511 CbuG_1512     FALSE 0.271 20.000 0.000 NA   NA
 5610728 5610729 CbuG_1512 CbuG_1513   holB FALSE 0.285 19.000 0.000 NA   NA
 5610729 5610730 CbuG_1513 CbuG_1514 holB tmk TRUE 0.991 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5610730 5610731 CbuG_1514 CbuG_1515 tmk   TRUE 0.676 176.000 0.209 NA   NA
 5610731 5610732 CbuG_1515 CbuG_1516   fabF TRUE 0.913 10.000 0.019 NA   NA
 5610732 5610733 CbuG_1516 CbuG_1517 fabF   TRUE 0.971 45.000 0.346 1.000 Y NA
 5610733 5610734 CbuG_1517 CbuG_1518   fabG TRUE 0.959 68.000 0.321 0.007 Y NA
 5610734 5610735 CbuG_1518 CbuG_1519 fabG fabD TRUE 0.967 68.000 0.432 0.007 Y NA
 5610735 5610736 CbuG_1519 CbuG_1520 fabD fabH TRUE 0.922 101.000 0.182 0.007 Y NA
 5610736 5610737 CbuG_1520 CbuG_1521 fabH plsX TRUE 0.997 -3.000 0.380 0.007 Y NA
 5610737 5610738 CbuG_1521 CbuG_1522 plsX rpmF TRUE 0.995 8.000 0.418 1.000 N NA
 5610739 5610740 CbuG_1523 CbuG_1524     FALSE 0.300 56.000 0.000 1.000 N NA
 5610741 5610742 CbuG_1525 CbuG_1526   rluC FALSE 0.196 29.000 0.000 1.000   NA
 5610744 5610745 CbuG_1528 CbuG_1529   artM FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 5610745 5610746 CbuG_1529 CbuG_1530 artM artQ TRUE 0.998 -3.000 0.714 0.010 Y NA
 5610746 5610747 CbuG_1530 CbuG_1531 artQ artI TRUE 0.921 0.000 0.000 0.013 Y NA
 5610747 5610748 CbuG_1531 CbuG_1532 artI artP TRUE 0.912 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5610750 5610751 CbuG_1534 CbuG_1535 kdsB   TRUE 0.982 -10.000 0.265 NA   NA
 5610751 5610752 CbuG_1535 CbuG_1536     FALSE 0.063 120.000 0.000 NA   NA
 5610754 5610755 CbuG_1538 CbuG_1539     FALSE 0.008 482.000 0.000 NA   NA
 5610755 5610756 CbuG_1539 CbuG_1540   bph2_1 FALSE 0.406 12.000 0.000 NA   NA
 5610756 5610757 CbuG_1540 CbuG_1541 bph2_1 recQ FALSE 0.355 137.000 0.000 1.000 Y NA
 5610757 5610758 CbuG_1541 CbuG_1542 recQ   FALSE 0.077 73.000 0.000 NA   NA
 5610759 5610760 CbuG_1543 CbuG_1544     FALSE 0.098 47.000 0.000 NA   NA
 5610760 5610761 CbuG_1544 CbuG_1545   xseB FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 5610762 5610763 CbuG_1546 CbuG_1548     FALSE 0.007 579.000 0.000 NA   NA
 5610765 5610766 CbuG_1549 CbuG_1550 lpdA aceF TRUE 0.995 13.000 0.463 1.000 Y NA
 5610766 5610767 CbuG_1550 CbuG_1551 aceF aceE TRUE 0.914 66.000 0.167 0.042 Y NA
 5610767 5610768 CbuG_1551 CbuG_1552 aceE   TRUE 0.647 44.000 0.028 1.000   NA
 5610768 5610769 CbuG_1552 CbuG_1553     TRUE 0.608 76.000 0.042 0.042   NA
 5610769 5610770 CbuG_1553 CbuG_1554     FALSE 0.350 -21.000 0.000 NA   NA
 5610772 5610773 CbuG_1556 CbuG_1557 trx adk TRUE 0.653 34.000 0.013 1.000   NA
 5610773 5610774 CbuG_1557 CbuG_1558 adk   FALSE 0.410 35.000 0.000 NA N NA
 5610774 5610775 CbuG_1558 CbuG_1559     TRUE 0.832 2.000 0.000 NA N NA
 5610775 5610776 CbuG_1559 CbuG_1560     TRUE 0.991 -3.000 0.349 NA   NA
 5610778 5610779 CbuG_1562 CbuG_1563 cpdP   FALSE 0.371 -18.000 0.000 NA   NA
 5610782 5610783 CbuG_1566 CbuG_1567 rpsP rimM TRUE 0.961 81.000 0.342 0.021 Y NA
 5610783 5610784 CbuG_1567 CbuG_1568 rimM trmD TRUE 0.998 2.000 0.672 1.000 Y NA
 5610784 5610785 CbuG_1568 CbuG_1569 trmD rplS TRUE 0.998 -3.000 0.567 1.000 Y NA
 5610785 5610786 CbuG_1569 CbuG_1570 rplS ogt TRUE 0.954 6.000 0.011 1.000 N NA
 5610787 5610788 CbuG_1571 CbuG_1572     TRUE 0.493 6.000 0.000 NA   NA
 5610788 5610789 CbuG_1572 CbuG_1573     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610790 5610791 CbuG_1574 CbuG_1575     FALSE 0.009 345.000 0.000 NA   NA
 5610791 5610792 CbuG_1575 CbuG_1576     FALSE 0.108 43.000 0.000 NA   NA
 5610792 5610793 CbuG_1576 CbuG_1577     FALSE 0.078 99.000 0.000 NA   NA
 5610794 5610795 CbuG_1578 CbuG_1579     FALSE 0.078 67.000 0.000 NA   NA
 5610797 5610798 CbuG_1581 CbuG_1582 lysS   FALSE 0.035 188.000 0.000 1.000   NA
 5610798 5610799 CbuG_1582 CbuG_1583   prfB FALSE 0.472 -16.000 0.000 0.002   NA
 5610802 5610803 CbuG_1586 CbuG_1587     FALSE 0.057 130.000 0.000 NA   NA
 5610803 5610804 CbuG_1587 CbuG_1588   panB FALSE 0.078 92.000 0.000 NA   NA
 5610804 5610805 CbuG_1588 CbuG_1589 panB panC TRUE 0.996 11.000 0.395 0.001 Y NA
 5610805 5610806 CbuG_1589 CbuG_1590 panC panD TRUE 0.996 -6.000 0.342 1.000 Y NA
 5610806 5610807 CbuG_1590 CbuG_1591 panD frgA FALSE 0.483 7.000 0.000 NA   NA
 5610807 5610808 CbuG_1591 CbuG_1592 frgA   FALSE 0.018 247.000 0.000 NA   NA
 5610808 5610809 CbuG_1592 CbuG_1593     FALSE 0.285 85.000 0.000 1.000 N NA
 5610810 5610811 CbuG_1594 CbuG_1595     FALSE 0.087 52.000 0.000 NA   NA
 5610813 5610814 CbuG_1597 CbuG_1598     FALSE 0.039 161.000 0.000 NA   NA
 5610815 5610816 CbuG_1599 CbuG_1600     FALSE 0.077 72.000 0.000 NA   NA
 5610816 5610817 CbuG_1600 CbuG_1601     FALSE 0.123 37.000 0.000 NA   NA
 5610819 5610820 CbuG_1603 CbuG_1604     FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 5610820 5610821 CbuG_1604 CbuG_1605     FALSE 0.406 12.000 0.000 NA   NA
 5610821 5610822 CbuG_1605 CbuG_1606     FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5610823 5610824 CbuG_1607 CbuG_1608     TRUE 0.493 6.000 0.000 NA   NA
 5610824 5610825 CbuG_1608 CbuG_1609     FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 5610825 5610826 CbuG_1609 CbuG_1610     FALSE 0.246 22.000 0.000 NA   NA
 5610826 5610827 CbuG_1610 CbuG_1611   lspA FALSE 0.406 12.000 0.000 NA   NA
 5610827 5610828 CbuG_1611 CbuG_1612 lspA ileS TRUE 0.987 3.000 0.147 1.000 N NA
 5610828 5610829 CbuG_1612 CbuG_1613 ileS   FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 5610830 5610831 CbuG_1614 CbuG_1615     FALSE 0.035 175.000 0.000 NA   NA
 5610832 5610833 CbuG_1616 CbuG_1617 ribF mviN TRUE 0.979 -3.000 0.169 1.000   NA
 5610835 5610836 CbuG_1619 CbuG_1620     FALSE 0.077 100.000 0.000 NA   NA
 5610836 5610837 CbuG_1620 CbuG_1621   rpmA TRUE 0.806 165.000 0.335 1.000   NA
 5610837 5610838 CbuG_1621 CbuG_1622 rpmA rplU TRUE 0.997 -10.000 0.667 0.020 Y NA
 5610838 5610839 CbuG_1622 CbuG_1623 rplU   FALSE 0.076 87.000 0.000 NA   NA
 5610841 5610842 CbuG_1625 CbuG_1626   tag FALSE 0.133 269.000 0.000 1.000 Y NA
 5610843 5610844 CbuG_1627 CbuG_1628 ispB   FALSE 0.078 65.000 0.000 NA   NA
 5610846 5610847 CbuG_1630 CbuG_1631   ampD FALSE 0.312 17.000 0.000 NA   NA
 5610848 5610849 CbuG_1632 CbuG_1633     FALSE 0.042 157.000 0.000 NA   NA
 5610849 5610850 CbuG_1633 CbuG_1634     FALSE 0.016 260.000 0.000 NA   NA
 5610851 5610852 CbuG_1635 CbuG_1636     TRUE 0.749 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5610852 5610853 CbuG_1636 CbuG_1637     FALSE 0.045 147.000 0.000 NA   NA
 5610853 5610854 CbuG_1637 CbuG_1638     FALSE 0.075 103.000 0.000 NA   NA
 5610854 5610855 CbuG_1638 CbuG_1639     FALSE 0.077 72.000 0.000 NA   NA
 5610855 5610856 CbuG_1639 CbuG_1640     FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 5610858 5610859 CbuG_1642 CbuG_1643 phoB phoR TRUE 0.995 -19.000 0.453 0.007 Y NA
 5610859 5610860 CbuG_1643 CbuG_1644 phoR   FALSE 0.147 176.000 0.000 1.000 N NA
 5610860 5610861 CbuG_1644 CbuG_1645     FALSE 0.023 234.000 0.000 1.000   NA
 5610861 5610862 CbuG_1645 CbuG_1646     FALSE 0.408 -82.000 0.000 0.019   NA
 5610864 5610865 CbuG_1647 CbuG_1649     FALSE 0.233 23.000 0.000 NA   NA
 5610868 5610869 CbuG_1652 CbuG_1653     FALSE 0.076 76.000 0.000 NA   NA
 5610870 5610871 CbuG_1654 CbuG_1655   czcD FALSE 0.210 137.000 0.000 1.000 N NA
 5610871 5610872 CbuG_1655 CbuG_1656 czcD   FALSE 0.336 46.000 0.000 NA N NA
 5610872 5610873 CbuG_1656 CbuG_1657   ubiG TRUE 0.750 -13.000 0.000 NA N NA
 5610873 5610874 CbuG_1657 CbuG_1658 ubiG gph TRUE 0.984 -7.000 0.259 1.000   NA
 5610874 5610875 CbuG_1658 CbuG_1659 gph   FALSE 0.246 22.000 0.000 NA   NA
 5610875 5610876 CbuG_1659 CbuG_1660   xylT FALSE 0.199 26.000 0.000 NA   NA
 5610876 5610877 CbuG_1660 CbuG_1661 xylT xylB TRUE 0.500 5.000 0.000 NA   NA
 5610877 5610878 CbuG_1661 CbuG_1662 xylB xylA FALSE 0.078 70.000 0.000 NA   NA
 5610879 5610880 CbuG_1663 CbuG_1665     FALSE 0.010 337.000 0.000 NA   NA
 5610885 5610886 CbuG_1669 CbuG_1670 fis purH TRUE 0.968 -19.000 0.101 1.000 N NA
 5610887 5610888 CbuG_1671 CbuG_1672   thiDE FALSE 0.087 78.000 0.000 1.000   NA
 5610888 5610889 CbuG_1672 CbuG_1673 thiDE thiG TRUE 0.976 -3.000 0.012 0.003 Y NA
 5610889 5610890 CbuG_1673 CbuG_1674 thiG thiS TRUE 0.986 2.000 0.064 1.000 Y NA
 5610890 5610891 CbuG_1674 CbuG_1675 thiS thiO TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5610891 5610892 CbuG_1675 CbuG_1676 thiO thiC TRUE 0.967 0.000 0.022 1.000 N NA
 5610892 5610893 CbuG_1676 CbuG_1677 thiC   FALSE 0.078 97.000 0.000 NA   NA
 5610895 5610896 CbuG_1679 CbuG_1680     TRUE 0.849 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5610896 5610897 CbuG_1680 CbuG_1681     TRUE 0.549 -3.000 0.000 1.000   NA
 5610898 5610899 CbuG_1682 CbuG_1683 icmH   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610899 5610900 CbuG_1683 CbuG_1684     FALSE 0.447 10.000 0.000 NA   NA
 5610903 5610904 CbuG_1687 CbuG_1688 dnaQ rnhA TRUE 0.615 418.000 0.248 1.000 Y NA
 5610904 5610905 CbuG_1688 CbuG_1689 rnhA   TRUE 0.806 15.000 0.003 1.000   NA
 5610906 5610907 CbuG_1690 CbuG_1691     TRUE 0.789 137.000 0.233 1.000   NA
 5610914 5610915 CbuG_1698 CbuG_1699     TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5610915 5610916 CbuG_1699 CbuG_1700   recG FALSE 0.013 281.000 0.000 NA   NA
 5610916 5610917 CbuG_1700 CbuG_1701 recG   TRUE 0.976 7.000 0.076 NA N NA
 5610917 5610918 CbuG_1701 CbuG_1702   spoT TRUE 0.958 28.000 0.215 NA N NA
 5610918 5610919 CbuG_1702 CbuG_1703 spoT rpoZ TRUE 0.956 54.000 0.291 1.000 Y NA
 5610919 5610920 CbuG_1703 CbuG_1704 rpoZ gmk TRUE 0.949 78.000 0.471 1.000 N NA
 5610920 5610921 CbuG_1704 CbuG_1705 gmk yicC TRUE 0.985 -7.000 0.276 NA   NA
 5610922 5610923 CbuG_1706 CbuG_1707 rph murI TRUE 0.976 0.000 0.048 1.000 N NA
 5610925 5610926 CbuG_1709 CbuG_1710 pyrE   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5610927 5610928 CbuG_1711 CbuG_1712 algC dut TRUE 0.944 -22.000 0.039 1.000 N NA
 5610929 5610930 CbuG_1713 CbuG_1714   radC FALSE 0.078 97.000 0.000 NA   NA
 5610930 5610931 CbuG_1714 CbuG_1715 radC rpmB FALSE 0.400 94.000 0.003 1.000   NA
 5610931 5610932 CbuG_1715 CbuG_1716 rpmB rpmG TRUE 0.988 11.000 0.332 0.020   NA
 5610933 5610934 CbuG_1717 CbuG_1718   coaD TRUE 0.934 15.000 0.088 NA   NA
 5610934 5610935 CbuG_1718 CbuG_1719 coaD folK TRUE 0.912 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5610935 5610936 CbuG_1719 CbuG_1720 folK pcnB TRUE 0.992 0.000 0.234 1.000 N NA
 5610938 5610939 CbuG_1722 CbuG_1723     TRUE 0.506 4.000 0.000 NA   NA
 5610939 5610940 CbuG_1723 CbuG_1724     FALSE 0.410 -12.000 0.000 NA   NA
 5610942 5610943 CbuG_1726 CbuG_1727 katE dinP FALSE 0.090 72.000 0.000 1.000   NA
 5610947 5610948 CbuG_1731 CbuG_1732   hemE FALSE 0.130 41.000 0.000 1.000   NA
 5610951 5610952 CbuG_1735 CbuG_1736     FALSE 0.077 88.000 0.000 NA   NA
 5610952 5610953 CbuG_1736 CbuG_1737   ssb TRUE 0.811 50.000 0.075 NA N NA
 5610954 5610955 CbuG_1738 CbuG_1739     FALSE 0.060 126.000 0.000 NA   NA
 5610955 5610956 CbuG_1739 CbuG_1740     FALSE 0.076 87.000 0.000 NA   NA
 5610956 5610957 CbuG_1740 CbuG_1741   rplQ TRUE 0.837 3.000 0.000 1.000 N NA
 5610957 5610958 CbuG_1741 CbuG_1742 rplQ rpoA TRUE 0.995 12.000 0.873 1.000 N NA
 5610958 5610959 CbuG_1742 CbuG_1743 rpoA rpsD TRUE 0.994 13.000 0.549 1.000 N NA
 5610959 5610960 CbuG_1743 CbuG_1744 rpsD rpsK TRUE 0.996 13.000 0.509 0.027 Y NA
 5610960 5610961 CbuG_1744 CbuG_1745 rpsK rpsM TRUE 0.991 28.000 0.810 0.020 Y NA
 5610961 5610962 CbuG_1745 CbuG_1746 rpsM   TRUE 0.500 5.000 0.000 NA   NA
 5610962 5610963 CbuG_1746 CbuG_1747   secY FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 5610963 5610964 CbuG_1747 CbuG_1748 secY rplO TRUE 0.992 18.000 0.730 1.000 N NA
 5610964 5610965 CbuG_1748 CbuG_1749 rplO rpmD TRUE 0.998 3.000 0.653 0.004 Y NA
 5610965 5610966 CbuG_1749 CbuG_1750 rpmD rpsE TRUE 0.998 4.000 0.789 0.027 Y NA
 5610966 5610967 CbuG_1750 CbuG_1751 rpsE rplR TRUE 0.997 12.000 0.814 0.027 Y NA
 5610967 5610968 CbuG_1751 CbuG_1752 rplR rplF TRUE 0.998 0.000 0.815 0.020 Y NA
 5610968 5610969 CbuG_1752 CbuG_1753 rplF rpsH TRUE 0.985 38.000 0.808 0.020 Y NA
 5610969 5610970 CbuG_1753 CbuG_1754 rpsH rpsN TRUE 0.997 -6.000 0.473 0.020 Y NA
 5610970 5610971 CbuG_1754 CbuG_1755 rpsN rplE TRUE 0.997 5.000 0.496 0.020 Y NA
 5610971 5610972 CbuG_1755 CbuG_1756 rplE rplX TRUE 0.972 116.000 0.758 0.020 Y NA
 5610972 5610973 CbuG_1756 CbuG_1757 rplX rplN TRUE 0.997 12.000 0.810 0.027 Y NA
 5610973 5610974 CbuG_1757 CbuG_1758 rplN rpsQ TRUE 0.997 11.000 0.791 0.027 Y NA
 5610974 5610975 CbuG_1758 CbuG_1759 rpsQ rpmC TRUE 0.997 11.000 0.828 0.020 Y NA
 5610975 5610976 CbuG_1759 CbuG_1760 rpmC rplP TRUE 0.998 1.000 0.802 0.020 Y NA
 5610976 5610977 CbuG_1760 CbuG_1761 rplP rpsC TRUE 0.997 12.000 0.828 0.027 Y NA
 5610977 5610978 CbuG_1761 CbuG_1762 rpsC rplV TRUE 0.998 0.000 0.719 0.027 Y NA
 5610978 5610979 CbuG_1762 CbuG_1763 rplV rpsS TRUE 0.998 0.000 0.769 0.027 Y NA
 5610979 5610980 CbuG_1763 CbuG_1764 rpsS rplB TRUE 0.997 13.000 0.820 0.027 Y NA
 5610980 5610981 CbuG_1764 CbuG_1765 rplB rplW TRUE 0.995 20.000 0.849 1.000 Y NA
 5610981 5610982 CbuG_1765 CbuG_1766 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 5610982 5610983 CbuG_1766 CbuG_1767 rplD rplC TRUE 0.997 -3.000 0.486 0.020 Y NA
 5610983 5610984 CbuG_1767 CbuG_1768 rplC rpsJ TRUE 0.988 22.000 0.307 0.027 Y NA
 5610984 5610985 CbuG_1768 CbuG_1769 rpsJ tuf2 TRUE 0.894 181.000 0.318 1.000 Y NA
 5610985 5610986 CbuG_1769 CbuG_1770 tuf2 fusA TRUE 0.994 16.000 0.400 0.002 Y NA
 5610986 5610987 CbuG_1770 CbuG_1771 fusA rpsG TRUE 0.997 10.000 0.579 1.000 Y NA
 5610987 5610988 CbuG_1771 CbuG_1772 rpsG rpsL TRUE 0.997 13.000 0.620 0.004 Y NA
 5610988 5610989 CbuG_1772 CbuG_1773 rpsL rpoC FALSE 0.423 294.000 0.122 1.000 N NA
 5610989 5610990 CbuG_1773 CbuG_1774 rpoC rpoB TRUE 0.890 267.000 0.851 0.001 Y NA
 5610990 5610991 CbuG_1774 CbuG_1775 rpoB   FALSE 0.340 15.000 0.000 NA   NA
 5610991 5610992 CbuG_1775 CbuG_1776   rplL FALSE 0.384 13.000 0.000 NA   NA
 5610992 5610993 CbuG_1776 CbuG_1777 rplL rplJ TRUE 0.988 34.000 0.884 0.020 Y NA
 5610993 5610994 CbuG_1777 CbuG_1778 rplJ rplA TRUE 0.806 254.000 0.302 0.027 Y NA
 5610994 5610995 CbuG_1778 CbuG_1779 rplA rplK TRUE 0.998 0.000 0.838 0.027 Y NA
 5610995 5610996 CbuG_1779 CbuG_1780 rplK nusG TRUE 0.950 125.000 0.681 1.000 N NA
 5610996 5610997 CbuG_1780 CbuG_1781 nusG secE TRUE 0.988 25.000 0.843 1.000 N NA
 5610997 5610998 CbuG_1781 CbuG_1782 secE   FALSE 0.110 42.000 0.000 NA   NA
 5610998 5610999 CbuG_1782 CbuG_1783   tuf1 FALSE 0.058 128.000 0.000 NA   NA
 5610999 5611000 CbuG_1783 CbuG_1784 tuf1   FALSE 0.076 74.000 0.000 NA   NA
 5611000 5611001 CbuG_1784 CbuG_1785     TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5611001 5611002 CbuG_1785 CbuG_1786     FALSE 0.056 131.000 0.000 NA   NA
 5611002 5611003 CbuG_1786 CbuG_1787   mtaA FALSE 0.043 154.000 0.000 NA   NA
 5611003 5611004 CbuG_1787 CbuG_1788 mtaA   FALSE 0.452 -7.000 0.000 NA   NA
 5611004 5611005 CbuG_1788 CbuG_1789   cydB2 FALSE 0.483 7.000 0.000 NA   NA
 5611005 5611006 CbuG_1789 CbuG_1790 cydB2 cydA2 FALSE 0.464 9.000 0.000 NA   NA
 5611006 5611007 CbuG_1790 CbuG_1791 cydA2   FALSE 0.076 85.000 0.000 NA   NA
 5611007 5611008 CbuG_1791 CbuG_1792     FALSE 0.040 160.000 0.000 NA   NA
 5611012 5611013 CbuG_1796 CbuG_1797     FALSE 0.013 284.000 0.000 NA   NA
 5611013 5611014 CbuG_1797 CbuG_1798     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 5611014 5611015 CbuG_1798 CbuG_1799     FALSE 0.091 50.000 0.000 NA   NA
 5611015 5611016 CbuG_1799 CbuG_1800     FALSE 0.012 334.000 0.000 1.000   NA
 5611016 5611017 CbuG_1800 CbuG_1801     FALSE 0.078 68.000 0.000 NA   NA
 5611017 5611018 CbuG_1801 CbuG_1802     FALSE 0.072 107.000 0.000 NA   NA
 5611018 5611019 CbuG_1802 CbuG_1803   gltX2 FALSE 0.078 62.000 0.000 NA   NA
 5611019 5611020 CbuG_1803 CbuG_1804 gltX2   FALSE 0.078 70.000 0.000 NA   NA
 5611022 5611023 CbuG_1806 CbuG_1807   coaA FALSE 0.261 113.000 0.000 1.000 N NA
 5611023 5611024 CbuG_1807 CbuG_1808 coaA   FALSE 0.381 -16.000 0.000 NA   NA
 5611025 5611026 CbuG_1809 CbuG_1810     TRUE 0.994 -3.000 0.575 NA   NA
 5611027 5611028 CbuG_1811 CbuG_1812   ampG FALSE 0.076 87.000 0.000 NA   NA
 5611030 5611031 CbuG_1814 CbuG_1815     FALSE 0.062 123.000 0.000 NA   NA
 5611032 5611033 CbuG_1816 CbuG_1817     TRUE 0.523 1.000 0.000 NA   NA
 5611033 5611034 CbuG_1817 CbuG_1818     TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5611036 5611037 CbuG_1820 CbuG_1821     FALSE 0.077 91.000 0.000 NA   NA
 5611038 5611039 CbuG_1822 CbuG_1823     FALSE 0.038 165.000 0.000 NA   NA
 5611039 5611040 CbuG_1823 CbuG_1825     FALSE 0.102 45.000 0.000 NA   NA
 5611040 5611041 CbuG_1825 CbuG_1824     FALSE 0.330 -1456.000 0.000 NA   NA
 5611041 5611042 CbuG_1824 CbuG_1827     FALSE 0.006 3086.000 0.000 NA   NA
 5611042 5611043 CbuG_1827 CbuG_1828     TRUE 0.500 5.000 0.000 NA   NA
 5611043 5611044 CbuG_1828 CbuG_1829     FALSE 0.038 166.000 0.000 NA   NA
 5611047 5611048 CbuG_1832 CbuG_1833     TRUE 0.989 4.000 0.184 NA N NA
 5611048 5611049 CbuG_1833 CbuG_1834     FALSE 0.330 47.000 0.000 NA N NA
 5611049 5611050 CbuG_1834 CbuG_1835     TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5611051 5611052 CbuG_1836 CbuG_1837     FALSE 0.093 58.000 0.000 1.000   NA
 5611053 5611054 CbuG_1838 CbuG_1839     FALSE 0.065 117.000 0.000 NA   NA
 5611055 5611056 CbuG_1840 CbuG_1841     TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5611056 5611057 CbuG_1841 CbuG_1843   pksH TRUE 0.557 146.000 0.080 1.000   NA
 5611058 5611059 CbuG_1842 CbuG_1844     FALSE 0.468 -6.000 0.000 NA   NA
 5611063 5611064 CbuG_1848 CbuG_1849     FALSE 0.371 -18.000 0.000 NA   NA
 5611064 5611065 CbuG_1849 CbuG_1850     TRUE 0.514 3.000 0.000 NA   NA
 5611065 5611066 CbuG_1850 CbuG_1851     FALSE 0.015 270.000 0.000 NA   NA
 5611066 5611067 CbuG_1851 CbuG_1852     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611067 5611068 CbuG_1852 CbuG_1853     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611068 5611069 CbuG_1853 CbuG_1854     TRUE 0.991 -16.000 0.787 NA   NA
 5611069 5611070 CbuG_1854 CbuG_1855     TRUE 0.939 9.000 0.043 NA   NA
 5611070 5611071 CbuG_1855 CbuG_1856     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611071 5611072 CbuG_1856 CbuG_1857     FALSE 0.049 143.000 0.000 NA   NA
 5611074 5611075 CbuG_1859 CbuG_1860 pilA pilB TRUE 0.997 -10.000 0.556 NA Y NA
 5611075 5611076 CbuG_1860 CbuG_1861 pilB pilC FALSE 0.138 34.000 0.000 NA   NA
 5611076 5611077 CbuG_1861 CbuG_1862 pilC pilD FALSE 0.199 26.000 0.000 NA   NA
 5611077 5611078 CbuG_1862 CbuG_1863 pilD coaE TRUE 0.979 11.000 0.122 1.000 N NA
 5611078 5611079 CbuG_1863 CbuG_1864 coaE queF FALSE 0.291 21.000 0.000 1.000   NA
 5611079 5611080 CbuG_1864 CbuG_1865 queF   FALSE 0.246 22.000 0.000 NA   NA
 5611081 5611082 CbuG_1866 CbuG_1867   mutT TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611082 5611083 CbuG_1867 CbuG_1868 mutT secA TRUE 0.976 -21.000 0.168 1.000 N NA
 5611086 5611087 CbuG_1871 CbuG_1872     FALSE 0.017 251.000 0.000 NA   NA
 5611088 5611089 CbuG_1873 CbuG_1874   lpxC FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 5611089 5611090 CbuG_1874 CbuG_1875 lpxC ftsZ TRUE 0.734 160.000 0.134 1.000 N NA
 5611090 5611091 CbuG_1875 CbuG_1876 ftsZ ftsA TRUE 0.997 1.000 0.460 1.000 Y NA
 5611093 5611094 CbuG_1878 CbuG_1879 ftsQ murB TRUE 0.987 0.000 0.070 NA Y NA
 5611094 5611095 CbuG_1879 CbuG_1880 murB murC TRUE 0.989 -7.000 0.136 0.005 Y NA
 5611095 5611096 CbuG_1880 CbuG_1881 murC murG TRUE 0.993 -13.000 0.283 1.000 Y NA
 5611096 5611097 CbuG_1881 CbuG_1882 murG   FALSE 0.091 50.000 0.000 NA   NA
 5611097 5611098 CbuG_1882 CbuG_1883   ftsW FALSE 0.087 52.000 0.000 NA   NA
 5611098 5611099 CbuG_1883 CbuG_1884 ftsW murD TRUE 0.994 0.000 0.297 0.005 N NA
 5611099 5611100 CbuG_1884 CbuG_1885 murD   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611100 5611101 CbuG_1885 CbuG_1886     FALSE 0.064 119.000 0.000 NA   NA
 5611101 5611102 CbuG_1886 CbuG_1887     FALSE 0.078 68.000 0.000 NA   NA
 5611102 5611103 CbuG_1887 CbuG_1888   mray FALSE 0.035 172.000 0.000 NA   NA
 5611103 5611104 CbuG_1888 CbuG_1889 mray murF TRUE 0.996 5.000 0.309 0.005 Y NA
 5611104 5611105 CbuG_1889 CbuG_1890 murF murE TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 5611105 5611106 CbuG_1890 CbuG_1891 murE   FALSE 0.089 51.000 0.000 NA   NA
 5611107 5611108 CbuG_1892 CbuG_1893     FALSE 0.078 98.000 0.000 NA   NA
 5611109 5611110 CbuG_1894 CbuG_1895 ftsI ftsL TRUE 0.983 -7.000 0.153 1.000 N NA
 5611110 5611111 CbuG_1895 CbuG_1896 ftsL mraW TRUE 0.991 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5611111 5611112 CbuG_1896 CbuG_1897 mraW mraZ TRUE 0.994 6.000 0.635 NA   NA
 5611112 5611113 CbuG_1897 CbuG_1898 mraZ   FALSE 0.041 159.000 0.000 NA   NA
 5611115 5611116 CbuG_1900 CbuG_1901 tdh kbl TRUE 0.969 42.000 0.547 1.000 N NA
 5611117 5611118 CbuG_1902 CbuG_1903     FALSE 0.016 255.000 0.000 NA   NA
 5611119 5611120 CbuG_1904 CbuG_1905 metQ metI TRUE 0.856 13.000 0.000 NA Y NA
 5611120 5611121 CbuG_1905 CbuG_1906 metI metN TRUE 0.753 23.000 0.000 1.000 Y NA
 5611121 5611122 CbuG_1906 CbuG_1907 metN   FALSE 0.011 306.000 0.000 NA   NA
 5611123 5611124 CbuG_1908 CbuG_1909     FALSE 0.075 78.000 0.000 NA   NA
 5611124 5611125 CbuG_1909 CbuG_1910     FALSE 0.132 35.000 0.000 NA   NA
 5611125 5611126 CbuG_1910 CbuG_1911   nadB FALSE 0.062 121.000 0.000 NA   NA
 5611127 5611128 CbuG_1912 CbuG_1913   sixA TRUE 0.520 2.000 0.000 NA   NA
 5611128 5611129 CbuG_1913 CbuG_1914 sixA   FALSE 0.435 -9.000 0.000 NA   NA
 5611130 5611131 CbuG_1915 CbuG_1916     FALSE 0.102 45.000 0.000 NA   NA
 5611132 5611133 CbuG_1917 CbuG_1918   madC FALSE 0.340 15.000 0.000 NA   NA
 5611133 5611134 CbuG_1918 CbuG_1919 madC ppsC TRUE 0.843 0.000 0.000 1.000 N NA
 5611135 5611136 CbuG_1920 CbuG_1921   cls TRUE 0.525 0.000 0.000 NA   NA
 5611137 5611138 CbuG_1922 CbuG_1923   clpB TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5611138 5611139 CbuG_1923 CbuG_1924 clpB queE FALSE 0.097 313.000 0.000 1.000 Y NA
 5611139 5611140 CbuG_1924 CbuG_1925 queE ybgF TRUE 0.958 3.000 0.059 1.000   NA
 5611140 5611141 CbuG_1925 CbuG_1926 ybgF   TRUE 0.982 -13.000 0.278 1.000   NA
 5611141 5611142 CbuG_1926 CbuG_1927   tolB TRUE 0.995 10.000 0.592 1.000 N NA
 5611142 5611143 CbuG_1927 CbuG_1928 tolB   FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 5611143 5611144 CbuG_1928 CbuG_1929     FALSE 0.059 127.000 0.000 NA   NA
 5611144 5611145 CbuG_1929 CbuG_1930   tolA FALSE 0.359 14.000 0.000 NA   NA
 5611145 5611146 CbuG_1930 CbuG_1931 tolA   FALSE 0.100 53.000 0.000 1.000   NA
 5611146 5611147 CbuG_1931 CbuG_1932     FALSE 0.411 15.000 0.000 0.038   NA
 5611147 5611148 CbuG_1932 CbuG_1933   ecnB FALSE 0.465 11.000 0.000 1.000   NA
 5611148 5611149 CbuG_1933 CbuG_1934 ecnB   FALSE 0.020 253.000 0.000 1.000   NA
 5611149 5611150 CbuG_1934 CbuG_1935     FALSE 0.054 135.000 0.000 NA   NA
 5611150 5611151 CbuG_1935 CbuG_1936   proS TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611151 5611152 CbuG_1936 CbuG_1937 proS   FALSE 0.060 139.000 0.000 1.000   NA
 5611152 5611153 CbuG_1937 CbuG_1938     FALSE 0.034 176.000 0.000 NA   NA
 5611153 5611154 CbuG_1938 CbuG_1939   visC FALSE 0.067 115.000 0.000 NA   NA
 5611154 5611155 CbuG_1939 CbuG_1940 visC ubiH TRUE 0.996 -13.000 0.474 0.001 Y NA
 5611156 5611157 CbuG_1941 CbuG_1942     FALSE 0.080 58.000 0.000 NA   NA
 5611157 5611158 CbuG_1942 CbuG_1943     TRUE 0.546 26.000 0.000 1.000 N NA
 5611160 5611161 CbuG_1945 CbuG_1946     TRUE 0.954 -3.000 0.053 NA   NA
 5611161 5611162 CbuG_1946 CbuG_1947     FALSE 0.279 209.000 0.034 NA   NA
 5611163 5611164 CbuG_1948 CbuG_1949     FALSE 0.089 51.000 0.000 NA   NA
 5611164 5611165 CbuG_1949 CbuG_1950   parE FALSE 0.120 189.000 0.000 NA N NA
 5611167 5611168 CbuG_1952 CbuG_1953     FALSE 0.077 100.000 0.000 NA   NA
 5611168 5611169 CbuG_1953 CbuG_1954     FALSE 0.050 142.000 0.000 NA   NA
 5611169 5611170 CbuG_1954 CbuG_1955     FALSE 0.076 86.000 0.000 NA   NA
 5611170 5611171 CbuG_1955 CbuG_1956     FALSE 0.095 48.000 0.000 NA   NA
 5611171 5611172 CbuG_1956 CbuG_1957   ubiA FALSE 0.264 112.000 0.000 1.000 N NA
 5611172 5611173 CbuG_1957 CbuG_1958 ubiA   TRUE 0.994 -7.000 0.248 NA Y NA
 5611173 5611174 CbuG_1958 CbuG_1959   enhA.5 FALSE 0.078 70.000 0.000 NA   NA
 5611175 5611176 CbuG_1960 CbuG_1961     FALSE 0.208 25.000 0.000 NA   NA
 5611176 5611177 CbuG_1961 CbuG_1962     FALSE 0.028 193.000 0.000 NA   NA
 5611177 5611178 CbuG_1962 CbuG_1963     FALSE 0.126 36.000 0.000 NA   NA
 5611178 5611179 CbuG_1963 CbuG_1964     TRUE 0.861 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 5611179 5611180 CbuG_1964 CbuG_1965     FALSE 0.423 -10.000 0.000 NA   NA
 5611180 5611181 CbuG_1965 CbuG_1966     FALSE 0.095 48.000 0.000 NA   NA
 5611182 5611183 CbuG_1967 CbuG_1968     FALSE 0.070 110.000 0.000 NA   NA
 5611184 5611185 CbuG_1969 CbuG_1970 hemH   FALSE 0.078 99.000 0.000 NA   NA
 5611185 5611186 CbuG_1970 CbuG_1971     FALSE 0.029 189.000 0.000 NA   NA
 5611187 5611188 CbuG_1972 CbuG_1973 hemK prfA TRUE 0.995 3.000 0.229 0.033 Y NA
 5611188 5611189 CbuG_1973 CbuG_1974 prfA hemA TRUE 0.989 -3.000 0.171 0.033 N NA
 5611191 5611192 CbuG_1976 CbuG_1977 folB dksA FALSE 0.362 44.000 0.000 1.000 N NA
 5611192 5611193 CbuG_1977 CbuG_1978 dksA dapF FALSE 0.203 142.000 0.000 1.000 N NA
 5611193 5611194 CbuG_1978 CbuG_1979 dapF   FALSE 0.423 -10.000 0.000 NA   NA
 5611194 5611195 CbuG_1979 CbuG_1980     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 5611195 5611196 CbuG_1980 CbuG_1981     FALSE 0.340 15.000 0.000 NA   NA
 5611197 5611198 CbuG_1982 CbuG_1983     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611199 5611200 CbuG_1984 CbuG_1986     TRUE 0.994 6.000 0.642 NA   NA
 5611201 5611202 CbuG_1985 CbuG_1987 ostA   TRUE 0.957 6.000 0.014 1.000 N NA
 5611202 5611203 CbuG_1987 CbuG_1988   pdxA TRUE 0.997 0.000 0.561 1.000 N NA
 5611203 5611204 CbuG_1988 CbuG_1989 pdxA ksgA TRUE 0.746 185.000 0.197 1.000 N NA
 5611204 5611205 CbuG_1989 CbuG_1990 ksgA uspA FALSE 0.261 113.000 0.000 1.000 N NA
 5611205 5611206 CbuG_1990 CbuG_1991 uspA   FALSE 0.036 169.000 0.000 NA   NA
 5611206 5611207 CbuG_1991 CbuG_1992     FALSE 0.102 45.000 0.000 NA   NA
 5611207 5611208 CbuG_1992 CbuG_1993   sppA FALSE 0.091 64.000 0.000 1.000   NA
 5611208 5611209 CbuG_1993 CbuG_1994 sppA apaH FALSE 0.423 13.000 0.000 1.000   NA
 5611209 5611210 CbuG_1994 CbuG_1995 apaH   FALSE 0.044 149.000 0.000 NA   NA
 5611214 5611215 CbuG_1999 CbuG_2000 relB   TRUE 0.951 0.000 0.042 NA   NA
 5611216 5611217 CbuG_2001 CbuG_2002 folA   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611219 5611220 CbuG_2004 CbuG_2005   fmt TRUE 0.751 13.000 0.000 1.000 N NA
 5611221 5611222 CbuG_2006 CbuG_2007     TRUE 0.973 -3.000 0.124 NA   NA
 5611222 5611223 CbuG_2007 CbuG_2008   topA TRUE 0.947 3.000 0.040 NA   NA
 5611225 5611226 CbuG_2010 CbuG_2011 purE   TRUE 0.965 3.000 0.023 NA N NA
 5611226 5611227 CbuG_2011 CbuG_2012     FALSE 0.008 443.000 0.000 NA   NA
 5611228 5611229 CbuG_2013 CbuG_2014     TRUE 0.813 8.000 0.000 1.000 N NA
 5611229 5611230 CbuG_2014 CbuG_2015     TRUE 0.912 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5611230 5611231 CbuG_2015 CbuG_2016     FALSE 0.093 49.000 0.000 NA   NA
 5611232 5611233 CbuG_2017 CbuG_2018 argS   TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611233 5611234 CbuG_2018 CbuG_2019     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611234 5611235 CbuG_2019 CbuG_2020   hslV FALSE 0.028 191.000 0.000 NA   NA
 5611235 5611236 CbuG_2020 CbuG_2021 hslV hslU TRUE 0.992 25.000 0.752 1.000 Y NA
 5611240 5611241 CbuG_2025 CbuG_2026   ubiE FALSE 0.075 80.000 0.000 NA   NA
 5611241 5611242 CbuG_2026 CbuG_2027 ubiE   TRUE 0.978 0.000 0.145 1.000   NA
 5611242 5611243 CbuG_2027 CbuG_2028   ubiB TRUE 0.992 -3.000 0.432 1.000   NA
 5611244 5611245 CbuG_2029 CbuG_2030     FALSE 0.078 62.000 0.000 NA   NA
 5611245 5611246 CbuG_2030 CbuG_2031     FALSE 0.371 -18.000 0.000 NA   NA
 5611246 5611247 CbuG_2031 CbuG_2032     TRUE 0.895 7.000 0.007 NA   NA
 5611248 5611249 CbuG_2033 CbuG_2034   metC FALSE 0.463 79.000 0.000 0.009 Y NA
 5611250 5611251 CbuG_2035 CbuG_2036     FALSE 0.043 151.000 0.000 NA   NA
 5611251 5611252 CbuG_2036 CbuG_2037     FALSE 0.093 49.000 0.000 NA   NA
 5611252 5611253 CbuG_2037 CbuG_2038     FALSE 0.024 209.000 0.000 NA   NA
 5611253 5611254 CbuG_2038 CbuG_2039     FALSE 0.105 44.000 0.000 NA   NA
 5611255 5611256 CbuG_2040 CbuG_2041 metK ahcY TRUE 0.991 2.000 0.114 0.001 Y NA
 5611256 5611257 CbuG_2041 CbuG_2042 ahcY   TRUE 0.531 27.000 0.000 1.000 N NA
 5611257 5611258 CbuG_2042 CbuG_2043     FALSE 0.040 160.000 0.000 NA   NA
 5611260 5611261 CbuG_2045 CbuG_2046     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 5611261 5611262 CbuG_2046 CbuG_2047     TRUE 0.508 -3.000 0.000 NA   NA
 5611262 5611263 CbuG_2047 CbuG_2048     FALSE 0.199 26.000 0.000 NA   NA
 5611263 5611264 CbuG_2048 CbuG_2049     TRUE 0.549 -3.000 0.000 1.000   NA
 5611264 5611265 CbuG_2049 CbuG_2050     FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 5611265 5611266 CbuG_2050 CbuG_2051     FALSE 0.069 112.000 0.000 NA   NA
 5611267 5611268 CbuG_2052 CbuG_2053 metF metE TRUE 0.939 18.000 0.009 0.001 Y NA
 5611268 5611269 CbuG_2053 CbuG_2054 metE trpS FALSE 0.131 185.000 0.000 1.000 N NA
 5611269 5611270 CbuG_2054 CbuG_2055 trpS   FALSE 0.020 231.000 0.000 NA   NA
 5611270 5611271 CbuG_2055 CbuG_2056     FALSE 0.059 127.000 0.000 NA   NA
 5611271 5611272 CbuG_2056 CbuG_2057     FALSE 0.010 326.000 0.000 NA   NA
 5611273 5611274 CbuG_2058 CbuG_2059 uvrD   TRUE 0.834 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5611275 5611276 CbuG_2060 CbuG_2061     FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 5611276 5611277 CbuG_2061 CbuG_2062     FALSE 0.009 385.000 0.000 NA   NA
 5611277 5611278 CbuG_2062 CbuG_2063     FALSE 0.033 178.000 0.000 NA   NA
 5611278 5611279 CbuG_2063 CbuG_2064     FALSE 0.053 136.000 0.000 NA   NA
 5611281 5611282 CbuG_2066 CbuG_2067     FALSE 0.359 -19.000 0.000 NA   NA
 5611282 5611283 CbuG_2067 CbuG_2068     FALSE 0.406 12.000 0.000 NA   NA
 5611283 5611284 CbuG_2068 CbuG_2069     TRUE 0.974 107.000 1.000 NA Y NA
 5611284 5611285 CbuG_2069 CbuG_2070   tdk FALSE 0.466 141.000 0.004 NA N NA
 5611285 5611286 CbuG_2070 CbuG_2071 tdk   TRUE 0.688 17.000 0.000 1.000 N NA
 5611287 5611288 CbuG_2072 CbuG_2073     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 5611288 5611289 CbuG_2073 CbuG_2074     FALSE 0.126 36.000 0.000 NA   NA
 5611289 5611290 CbuG_2074 CbuG_2075   hemC TRUE 0.749 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5611290 5611291 CbuG_2075 CbuG_2076 hemC aroD TRUE 0.843 0.000 0.000 1.000 N NA
 5611291 5611292 CbuG_2076 CbuG_2077 aroD   FALSE 0.488 10.000 0.000 1.000   NA
 5611292 5611293 CbuG_2077 CbuG_2078   hemD FALSE 0.464 -10.000 0.000 1.000   NA
 5611295 5611296 CbuG_2080 CbuG_2081     FALSE 0.075 81.000 0.000 NA   NA
 5611296 5611297 CbuG_2081 CbuG_2082   hemY TRUE 0.998 5.000 0.765 1.000 Y NA
 5611297 5611298 CbuG_2082 CbuG_2083 hemY   TRUE 0.828 3.000 0.000 NA N NA
 5611298 5611299 CbuG_2083 CbuG_2084   queC FALSE 0.297 18.000 0.000 NA   NA
 5611299 5611300 CbuG_2084 CbuG_2085 queC   FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 5611300 5611301 CbuG_2085 CbuG_2086     FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 5611302 5611303 CbuG_2087 CbuG_2088 rho trxA TRUE 0.497 176.000 0.087 1.000   NA
 5611304 5611305 CbuG_2089 CbuG_2090     FALSE 0.271 20.000 0.000 NA   NA
 5611306 5611307 CbuG_2091 CbuG_2092   proC TRUE 0.977 -3.000 0.152 1.000   NA
 5611307 5611308 CbuG_2092 CbuG_2093 proC   TRUE 0.977 -3.000 0.158 NA   NA
 5611308 5611309 CbuG_2093 CbuG_2094   pckA FALSE 0.423 -10.000 0.000 NA   NA
 5611310 5611311 CbuG_2095 CbuG_2096 algH   TRUE 0.991 -7.000 0.263 NA N NA
 5611311 5611312 CbuG_2096 CbuG_2097   pyrB TRUE 0.956 -7.000 0.022 1.000 N NA