MicrobesOnline Operon Predictions for Rickettsia rickettsii str. Iowa

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3776338 3776339 RrIowa_0001 RrIowa_0002     FALSE 0.350 260.000 0.053 NA   NA
 3776339 3776340 RrIowa_0002 RrIowa_0003     TRUE 0.989 10.000 0.778 1.000   NA
 3776340 3776341 RrIowa_0003 RrIowa_0004     TRUE 0.993 1.000 0.304 1.000 Y NA
 3776341 3776342 RrIowa_0004 RrIowa_0005     TRUE 0.983 -3.000 0.088 1.000 N NA
 3776343 3776344 RrIowa_0006 RrIowa_0007     TRUE 0.641 124.000 0.000 1.000 N NA
 3776344 3776345 RrIowa_0007 RrIowa_0008     TRUE 0.984 7.000 0.264 1.000 N NA
 3776345 3776346 RrIowa_0008 RrIowa_0009     TRUE 0.853 196.000 0.212 1.000 N NA
 3776346 3776347 RrIowa_0009 RrIowa_0010     FALSE 0.385 52.000 0.000 NA   NA
 3776348 3776349 RrIowa_0011 RrIowa_0012     TRUE 0.670 24.000 0.000 NA   NA
 3776349 3776350 RrIowa_0012 RrIowa_0013     FALSE 0.010 766.000 0.000 NA   NA
 3776350 3776351 RrIowa_0013 RrIowa_0014     TRUE 0.499 112.000 0.000 NA   NA
 3776352 3776353 RrIowa_0015 RrIowa_0016     FALSE 0.366 56.000 0.000 NA   NA
 3776353 3776354 RrIowa_0016 RrIowa_0017     FALSE 0.376 54.000 0.000 NA   NA
 3776354 3776355 RrIowa_0017 RrIowa_0018     TRUE 0.621 144.000 0.000 NA   NA
 3776356 3776357 RrIowa_0019 RrIowa_0020     TRUE 0.845 18.000 0.006 1.000   NA
 3776357 3776358 RrIowa_0020 RrIowa_0021     TRUE 0.699 86.000 0.125 NA   NA
 3776359 3776360 RrIowa_0022 RrIowa_0023     TRUE 0.927 -12.000 0.008 NA   NA
 3776360 3776361 RrIowa_0023 RrIowa_0024     TRUE 0.974 -3.000 0.023 1.000 N NA
 3776361 3776362 RrIowa_0024 RrIowa_0025     FALSE 0.019 490.000 0.000 NA   NA
 3776362 3776363 RrIowa_0025 RrIowa_0026   comA FALSE 0.381 85.000 0.000 NA   NA
 3776363 3776364 RrIowa_0026 RrIowa_0027 comA   TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 3776365 3776366 RrIowa_0028 RrIowa_0029     FALSE 0.033 406.000 0.000 NA   NA
 3776366 3776367 RrIowa_0029 RrIowa_0030     TRUE 0.489 110.000 0.000 NA   NA
 3776367 3776368 RrIowa_0030 RrIowa_0031     FALSE 0.432 98.000 0.000 NA   NA
 3776368 3776369 RrIowa_0031 RrIowa_0032     FALSE 0.008 932.000 0.000 NA   NA
 3776369 3776370 RrIowa_0032 RrIowa_0033     FALSE 0.438 99.000 0.000 NA   NA
 3776370 3776371 RrIowa_0033 RrIowa_0034     TRUE 0.618 141.000 0.000 NA   NA
 3776372 3776373 RrIowa_0035 RrIowa_0036     TRUE 0.998 0.000 0.863 0.012 Y NA
 3776373 3776374 RrIowa_0036 RrIowa_0037     TRUE 0.964 19.000 0.278 0.012   NA
 3776374 3776375 RrIowa_0037 RrIowa_0038     TRUE 0.947 184.000 0.628 0.012   NA
 3776375 3776376 RrIowa_0038 RrIowa_0039     TRUE 0.978 5.000 0.195 NA   NA
 3776376 3776377 RrIowa_0039 RrIowa_0040   dsbA TRUE 0.570 78.000 0.043 NA   NA
 3776381 3776382 RrIowa_0044 RrIowa_0045 recF   TRUE 0.685 24.000 0.003 NA   NA
 3776382 3776383 RrIowa_0045 RrIowa_0046     TRUE 0.893 -16.000 0.000 NA   NA
 3776383 3776384 RrIowa_0046 RrIowa_0047     FALSE 0.234 239.000 0.000 NA   NA
 3776384 3776385 RrIowa_0047 RrIowa_0048     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776385 10746766 RrIowa_0048 RrIowa_0049     TRUE 0.908 -12.000 0.000 NA   NA
 10746766 3776386 RrIowa_0049 RrIowa_0051     FALSE 0.023 459.000 0.000 NA   NA
 3776386 3776387 RrIowa_0051 RrIowa_0052     TRUE 0.731 82.000 0.250 NA   NA
 3776387 3776388 RrIowa_0052 RrIowa_0053     TRUE 0.632 168.000 0.000 NA   NA
 3776392 3776393 RrIowa_0057 RrIowa_0058     TRUE 0.616 173.000 0.000 NA   NA
 3776393 3776394 RrIowa_0058 RrIowa_0059     TRUE 0.912 -10.000 0.000 NA   NA
 3776397 3776398 RrIowa_0062 RrIowa_0063     FALSE 0.014 562.000 0.000 NA   NA
 3776398 3776399 RrIowa_0063 RrIowa_0064     TRUE 0.914 5.000 0.000 NA   NA
 3776399 3776400 RrIowa_0064 RrIowa_0065     FALSE 0.465 103.000 0.000 NA   NA
 3776401 3776402 RrIowa_0066 RrIowa_0067     TRUE 0.915 162.000 0.375 NA   NA
 3776402 3776403 RrIowa_0067 RrIowa_0068     TRUE 0.943 157.000 0.667 NA   NA
 3776403 10746767 RrIowa_0068 RrIowa_0069     TRUE 0.902 -13.000 0.000 NA   NA
 10746767 3776404 RrIowa_0069 RrIowa_0071     TRUE 0.625 146.000 0.000 NA   NA
 3776404 3776405 RrIowa_0071 RrIowa_0072     FALSE 0.029 428.000 0.000 NA   NA
 3776405 3776406 RrIowa_0072 RrIowa_0073     TRUE 0.687 109.000 0.000 0.003   NA
 3776406 3776407 RrIowa_0073 RrIowa_0074     FALSE 0.090 300.000 0.000 NA   NA
 3776407 10746768 RrIowa_0074 RrIowa_0075     TRUE 0.605 175.000 0.000 NA   NA
 3776409 3776410 RrIowa_0080 RrIowa_0081     TRUE 0.566 127.000 0.004 NA   NA
 3776410 3776411 RrIowa_0081 RrIowa_0082     TRUE 0.683 184.000 0.005 1.000 N NA
 3776411 3776412 RrIowa_0082 RrIowa_0083   phoB FALSE 0.160 279.000 0.000 1.000   NA
 3776413 3776414 RrIowa_0084 RrIowa_0085     TRUE 0.964 25.000 0.319 0.051 Y NA
 3776414 3776415 RrIowa_0085 RrIowa_0086     TRUE 0.992 12.000 0.499 0.051 Y NA
 3776417 3776418 RrIowa_0088 RrIowa_0089 tilS ftsH TRUE 0.811 100.000 0.145 1.000 N NA
 3776418 3776419 RrIowa_0089 RrIowa_0090 ftsH   FALSE 0.446 84.000 0.000 1.000   NA
 3776419 3776420 RrIowa_0090 RrIowa_0091     FALSE 0.022 506.000 0.000 1.000   NA
 3776420 3776421 RrIowa_0091 RrIowa_0092     FALSE 0.397 90.000 0.000 NA   NA
 3776421 3776422 RrIowa_0092 RrIowa_0093     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776423 3776424 RrIowa_0094 RrIowa_0095     TRUE 0.967 -21.000 0.170 NA   NA
 3776425 3776426 RrIowa_0096 RrIowa_0097     TRUE 0.920 4.000 0.000 NA   NA
 3776426 3776427 RrIowa_0097 RrIowa_0098   yidC TRUE 0.676 192.000 0.008 1.000 N NA
 3776427 3776428 RrIowa_0098 RrIowa_0099 yidC   TRUE 0.957 4.000 0.008 1.000 N NA
 3776428 3776429 RrIowa_0099 RrIowa_0100     TRUE 0.892 14.000 0.005 1.000   NA
 10746769 3776431 RrIowa_0102 RrIowa_0104     FALSE 0.432 44.000 0.000 NA   NA
 3776433 3776434 RrIowa_0106 RrIowa_0107   uhpC TRUE 0.888 230.000 0.875 0.044 N NA
 3776434 3776435 RrIowa_0107 RrIowa_0108 uhpC   TRUE 0.775 25.000 0.007 1.000 N NA
 3776435 3776436 RrIowa_0108 RrIowa_0109     TRUE 0.955 4.000 0.007 1.000 N NA
 3776436 3776437 RrIowa_0109 RrIowa_0110     TRUE 0.986 -19.000 0.466 1.000 N NA
 3776437 3776438 RrIowa_0110 RrIowa_0111   parA TRUE 0.990 -3.000 0.339 1.000 N NA
 3776438 3776439 RrIowa_0111 RrIowa_0112 parA parB TRUE 0.993 -13.000 0.827 1.000 N NA
 3776439 3776440 RrIowa_0112 RrIowa_0113 parB   FALSE 0.424 234.000 0.006 0.056   NA
 3776440 3776441 RrIowa_0113 RrIowa_0114     TRUE 0.947 3.000 0.013 NA   NA
 3776441 3776442 RrIowa_0114 RrIowa_0115     TRUE 0.600 36.000 0.011 NA   NA
 3776442 3776443 RrIowa_0115 RrIowa_0116     FALSE 0.065 324.000 0.000 NA   NA
 3776443 3776444 RrIowa_0116 RrIowa_0117     FALSE 0.095 292.000 0.000 NA   NA
 3776444 3776445 RrIowa_0117 RrIowa_0118     TRUE 0.476 108.000 0.000 NA   NA
 3776445 3776446 RrIowa_0118 RrIowa_0119     TRUE 0.651 25.000 0.000 NA   NA
 3776446 3776447 RrIowa_0119 RrIowa_0120     TRUE 0.627 27.000 0.000 NA   NA
 3776449 3776450 RrIowa_0122 RrIowa_0123     TRUE 0.804 114.000 0.062 1.000 N NA
 3776452 3776453 RrIowa_0125 RrIowa_0126     TRUE 0.675 168.000 0.007 NA   NA
 3776454 3776455 RrIowa_0127 RrIowa_0128     FALSE 0.039 392.000 0.000 NA   NA
 3776456 3776457 RrIowa_0129 RrIowa_0130   secB TRUE 0.626 46.000 0.015 1.000 N NA
 3776457 3776458 RrIowa_0130 RrIowa_0131 secB ctrA FALSE 0.425 222.000 0.005 1.000 N NA
 3776458 3776459 RrIowa_0131 RrIowa_0132 ctrA queF TRUE 0.971 4.000 0.038 1.000   NA
 3776460 3776461 RrIowa_0133 RrIowa_0134     TRUE 0.598 55.000 0.047 NA   NA
 3776461 3776462 RrIowa_0134 RrIowa_0135     TRUE 0.849 139.000 0.046 1.000 N NA
 3776463 3776464 RrIowa_0136 RrIowa_0137     TRUE 0.986 -13.000 0.444 1.000   NA
 3776464 3776465 RrIowa_0137 RrIowa_0138     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776465 3776466 RrIowa_0138 RrIowa_0139     TRUE 0.476 108.000 0.000 NA   NA
 3776466 3776467 RrIowa_0139 RrIowa_0140     FALSE 0.445 100.000 0.000 NA   NA
 3776467 3776468 RrIowa_0140 RrIowa_0141   secG TRUE 0.584 180.000 0.000 NA   NA
 3776469 3776470 RrIowa_0142 RrIowa_0143     FALSE 0.012 713.000 0.000 NA   NA
 3776471 3776472 RrIowa_0144 RrIowa_0145     FALSE 0.413 241.000 0.000 1.000 Y NA
 3776472 3776473 RrIowa_0145 RrIowa_0146     TRUE 0.944 199.000 0.748 1.000 Y NA
 3776473 3776474 RrIowa_0146 RrIowa_0147     TRUE 0.574 182.000 0.000 NA   NA
 3776474 3776475 RrIowa_0147 RrIowa_0148     FALSE 0.432 98.000 0.000 NA   NA
 3776475 3776476 RrIowa_0148 RrIowa_0149     FALSE 0.423 206.000 0.000 NA   NA
 3776476 3776477 RrIowa_0149 RrIowa_0150     TRUE 0.627 27.000 0.000 NA   NA
 3776478 3776479 RrIowa_0151 RrIowa_0152     TRUE 0.981 -3.000 0.179 NA   NA
 3776479 3776480 RrIowa_0152 RrIowa_0153     TRUE 0.837 151.000 0.062 NA   NA
 3776483 3776484 RrIowa_0156 RrIowa_0157     TRUE 0.972 5.000 0.049 1.000   NA
 3776484 3776485 RrIowa_0157 RrIowa_0158   ttg2D TRUE 0.905 20.000 0.070 NA N NA
 3776485 3776486 RrIowa_0158 RrIowa_0159 ttg2D   FALSE 0.020 487.000 0.000 NA   NA
 3776486 3776487 RrIowa_0159 RrIowa_0160     TRUE 0.947 -19.000 0.000 0.003   NA
 3776487 3776488 RrIowa_0160 RrIowa_0161     TRUE 0.730 20.000 0.000 NA   NA
 3776488 3776489 RrIowa_0161 RrIowa_0162     FALSE 0.338 66.000 0.000 NA   NA
 3776489 3776490 RrIowa_0162 RrIowa_0163     TRUE 0.756 157.000 0.012 NA N NA
 3776490 3776491 RrIowa_0163 RrIowa_0164     TRUE 0.837 15.000 0.000 NA   NA
 3776491 3776492 RrIowa_0164 RrIowa_0165     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776492 3776493 RrIowa_0165 RrIowa_0166     TRUE 0.970 2.000 0.050 NA   NA
 3776494 3776495 RrIowa_0167 RrIowa_0168     FALSE 0.055 343.000 0.000 NA   NA
 3776495 3776496 RrIowa_0168 RrIowa_0169     FALSE 0.025 448.000 0.000 NA   NA
 3776496 3776497 RrIowa_0169 RrIowa_0170     TRUE 0.627 27.000 0.000 NA   NA
 3776497 3776498 RrIowa_0170 RrIowa_0171     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776499 3776500 RrIowa_0172 RrIowa_0173     TRUE 0.982 -3.000 0.009 0.049 Y NA
 3776500 3776501 RrIowa_0173 RrIowa_0174     FALSE 0.464 201.000 0.000 NA   NA
 3776501 3776502 RrIowa_0174 RrIowa_0175   yihA TRUE 0.492 38.000 0.000 NA   NA
 3776502 3776503 RrIowa_0175 RrIowa_0176 yihA   TRUE 0.602 71.000 0.046 1.000   NA
 3776503 3776504 RrIowa_0176 RrIowa_0177   virB3 TRUE 0.889 13.000 0.004 NA N NA
 3776504 3776505 RrIowa_0177 RrIowa_0178 virB3 virB4.1 TRUE 0.908 216.000 0.789 NA Y NA
 3776505 3776506 RrIowa_0178 RrIowa_0179 virB4.1 virB6.1 TRUE 0.930 118.000 0.421 1.000 Y NA
 3776506 3776507 RrIowa_0179 RrIowa_0180 virB6.1 virB6.2 TRUE 0.997 -13.000 1.000 0.006 Y NA
 3776507 3776508 RrIowa_0180 RrIowa_0181 virB6.2 virB6.3 TRUE 0.997 7.000 1.000 0.006 Y NA
 3776508 3776509 RrIowa_0181 RrIowa_0182 virB6.3 virB6.4 TRUE 0.980 164.000 0.750 0.006 Y NA
 3776509 3776510 RrIowa_0182 RrIowa_0183 virB6.4 virB6.5 TRUE 0.984 153.000 0.875 0.006 Y NA
 3776510 10746770 RrIowa_0183 RrIowa_0184 virB6.5   FALSE 0.014 570.000 0.000 NA   NA
 10746770 3776511 RrIowa_0184 RrIowa_0189     FALSE 0.007 1254.000 0.000 NA   NA
 3776511 3776512 RrIowa_0189 RrIowa_0190     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776512 3776513 RrIowa_0190 RrIowa_0191     FALSE 0.187 253.000 0.002 NA   NA
 3776513 3776514 RrIowa_0191 RrIowa_0192     TRUE 0.982 18.000 0.567 1.000 Y NA
 3776516 3776517 RrIowa_0194 RrIowa_0195 secF   TRUE 0.805 165.000 0.015 1.000 N NA
 3776517 3776518 RrIowa_0195 RrIowa_0196     TRUE 0.772 184.000 0.021 1.000 N NA
 3776518 3776519 RrIowa_0196 RrIowa_0197     TRUE 0.963 0.000 0.010 1.000 N NA
 3776519 3776520 RrIowa_0197 RrIowa_0198   era TRUE 0.986 -7.000 0.098 0.027   NA
 3776520 3776521 RrIowa_0198 RrIowa_0199 era ruvC TRUE 0.631 118.000 0.007 1.000   NA
 3776521 3776522 RrIowa_0199 RrIowa_0200 ruvC   TRUE 0.957 2.000 0.006 1.000 N NA
 3776523 3776524 RrIowa_0201 RrIowa_0202     FALSE 0.451 101.000 0.000 NA   NA
 3776524 3776525 RrIowa_0202 RrIowa_0203     FALSE 0.330 73.000 0.000 NA   NA
 3776525 3776526 RrIowa_0203 RrIowa_0204   apbC TRUE 0.968 -3.000 0.025 NA N NA
 3776527 3776528 RrIowa_0205 RrIowa_0206 hflK hflC TRUE 0.959 93.000 0.947 0.020 Y NA
 3776528 3776529 RrIowa_0206 RrIowa_0207 hflC degP.1 TRUE 0.914 35.000 0.084 0.020 Y NA
 3776529 3776530 RrIowa_0207 RrIowa_0208 degP.1   TRUE 0.771 147.000 0.023 NA   NA
 3776530 3776531 RrIowa_0208 RrIowa_0209     TRUE 0.785 167.000 0.026 NA   NA
 3776531 3776532 RrIowa_0209 RrIowa_0210     TRUE 0.964 145.000 0.291 0.002 Y NA
 3776532 3776533 RrIowa_0210 RrIowa_0211     TRUE 0.975 134.000 0.705 0.005 Y NA
 3776533 3776534 RrIowa_0211 RrIowa_0212     TRUE 0.751 147.000 0.006 1.000 N NA
 3776534 3776535 RrIowa_0212 RrIowa_0213     TRUE 0.632 69.000 0.044 1.000 N NA
 3776535 3776536 RrIowa_0213 RrIowa_0214     TRUE 0.922 27.000 0.029 0.010 Y NA
 3776536 3776537 RrIowa_0214 RrIowa_0215     TRUE 0.979 13.000 0.114 1.000 Y NA
 3776537 3776538 RrIowa_0215 RrIowa_0216     TRUE 0.621 144.000 0.000 NA   NA
 3776538 3776539 RrIowa_0216 RrIowa_0217   secE TRUE 0.472 199.000 0.000 NA   NA
 3776539 3776540 RrIowa_0217 RrIowa_0218 secE nusG TRUE 0.986 16.000 0.843 1.000 N NA
 3776540 3776541 RrIowa_0218 RrIowa_0219 nusG   TRUE 0.673 270.000 0.681 1.000 N NA
 3776541 3776542 RrIowa_0219 RrIowa_0220     TRUE 0.996 6.000 0.838 0.065 Y NA
 3776542 3776543 RrIowa_0220 RrIowa_0221     TRUE 0.930 111.000 0.302 0.065 Y NA
 3776543 3776544 RrIowa_0221 RrIowa_0222     TRUE 0.981 144.000 0.884 0.048 Y NA
 3776544 3776545 RrIowa_0222 RrIowa_0223     FALSE 0.042 947.000 0.223 1.000   NA
 3776545 3776546 RrIowa_0223 RrIowa_0224     TRUE 0.812 258.000 0.851 0.002   NA
 3776548 3776549 RrIowa_0226 RrIowa_0227     TRUE 0.617 219.000 0.061 NA N NA
 3776549 3776550 RrIowa_0227 RrIowa_0228     TRUE 0.658 83.000 0.082 NA   NA
 3776550 3776551 RrIowa_0228 RrIowa_0229     FALSE 0.412 52.000 0.005 NA   NA
 3776552 3776553 RrIowa_0230 RrIowa_0231     FALSE 0.342 65.000 0.000 NA   NA
 3776553 3776554 RrIowa_0231 RrIowa_0232   secY.1 FALSE 0.465 103.000 0.000 NA   NA
 3776554 3776555 RrIowa_0232 RrIowa_0233 secY.1   FALSE 0.436 74.000 0.006 1.000   NA
 3776555 3776556 RrIowa_0233 RrIowa_0234     TRUE 0.744 140.000 0.011 1.000   NA
 3776556 3776557 RrIowa_0234 RrIowa_0235     TRUE 0.980 -15.000 0.250 1.000   NA
 3776557 3776558 RrIowa_0235 RrIowa_0236     FALSE 0.262 258.000 0.005 1.000 N NA
 3776558 3776559 RrIowa_0236 RrIowa_0237     TRUE 0.996 3.000 0.492 0.004 Y NA
 3776559 3776560 RrIowa_0237 RrIowa_0238     TRUE 0.997 3.000 0.643 0.004 Y NA
 3776560 3776561 RrIowa_0238 RrIowa_0239     FALSE 0.086 304.000 0.000 NA   NA
 3776563 3776564 RrIowa_0241 RrIowa_0242     TRUE 0.556 286.000 0.626 1.000 N NA
 3776564 3776565 RrIowa_0242 RrIowa_0243   shaE TRUE 0.960 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3776565 3776566 RrIowa_0243 RrIowa_0244 shaE   TRUE 0.984 -16.000 0.171 0.097 N NA
 3776567 3776568 RrIowa_0245 RrIowa_0246     FALSE 0.338 66.000 0.000 NA   NA
 3776569 3776570 RrIowa_0247 RrIowa_0248     FALSE 0.363 57.000 0.000 NA   NA
 3776570 3776571 RrIowa_0248 RrIowa_0249     FALSE 0.025 450.000 0.000 NA   NA
 3776571 3776572 RrIowa_0249 RrIowa_0250   yaeT TRUE 0.616 173.000 0.000 NA   NA
 3776572 3776573 RrIowa_0250 RrIowa_0251 yaeT   TRUE 0.523 240.000 0.016 1.000 Y NA
 3776574 3776575 RrIowa_0252 RrIowa_0253     TRUE 0.698 134.000 0.010 NA N NA
 3776578 3776579 RrIowa_0256 RrIowa_0257     TRUE 0.942 0.000 0.008 NA   NA
 3776581 3776582 RrIowa_0259 RrIowa_0260     FALSE 0.465 255.000 0.179 NA   NA
 3776583 3776584 RrIowa_0261 RrIowa_0262     TRUE 0.872 140.000 0.020 1.000 Y NA
 3776584 3776585 RrIowa_0262 RrIowa_0263     TRUE 0.498 211.000 0.000 1.000 N NA
 3776585 3776586 RrIowa_0263 RrIowa_0264     FALSE 0.329 70.000 0.000 NA   NA
 3776587 3776588 RrIowa_0265 RrIowa_0266     TRUE 0.823 24.000 0.000 0.005   NA
 3776588 3776589 RrIowa_0266 RrIowa_0267     FALSE 0.030 426.000 0.000 NA   NA
 3776589 10746771 RrIowa_0267 RrIowa_0268     TRUE 0.888 -18.000 0.000 NA   NA
 10746771 3776590 RrIowa_0268 RrIowa_0270     TRUE 0.780 18.000 0.000 NA   NA
 3776591 3776592 RrIowa_0271 RrIowa_0272     FALSE 0.446 43.000 0.000 NA   NA
 3776592 3776593 RrIowa_0272 RrIowa_0273     TRUE 0.580 30.000 0.000 NA   NA
 3776593 3776594 RrIowa_0273 RrIowa_0274     FALSE 0.347 62.000 0.000 NA   NA
 3776595 3776596 RrIowa_0275 RrIowa_0276     FALSE 0.062 325.000 0.000 NA   NA
 3776596 3776597 RrIowa_0276 RrIowa_0277     FALSE 0.390 51.000 0.000 NA   NA
 3776597 3776598 RrIowa_0277 RrIowa_0278   cutA TRUE 0.701 39.000 0.017 1.000 N NA
 3776598 3776599 RrIowa_0278 RrIowa_0279 cutA   TRUE 0.968 3.000 0.017 1.000 N NA
 3776599 3776600 RrIowa_0279 RrIowa_0280     TRUE 0.649 102.000 0.013 1.000 N NA
 3776600 3776601 RrIowa_0280 RrIowa_0281     TRUE 0.873 15.000 0.000 1.000   NA
 3776601 3776602 RrIowa_0281 RrIowa_0282     TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.002   NA
 3776602 3776603 RrIowa_0282 RrIowa_0283     TRUE 0.718 136.000 0.003 1.000 N NA
 3776603 3776604 RrIowa_0283 RrIowa_0284   recN TRUE 0.477 66.000 0.006 1.000 N NA
 3776604 3776605 RrIowa_0284 RrIowa_0285 recN   TRUE 0.975 8.000 0.117 1.000   NA
 3776605 3776606 RrIowa_0285 RrIowa_0286   chaB FALSE 0.124 279.000 0.000 NA   NA
 3776606 3776607 RrIowa_0286 RrIowa_0287 chaB dnaJ FALSE 0.389 79.000 0.005 NA   NA
 3776607 3776608 RrIowa_0287 RrIowa_0288 dnaJ dnaK TRUE 0.944 129.000 0.236 0.007 Y NA
 3776609 3776610 RrIowa_0289 RrIowa_0290 degP.2   FALSE 0.011 746.000 0.000 NA   NA
 3776612 3776613 RrIowa_0292 RrIowa_0293     TRUE 0.969 8.000 0.097 NA   NA
 3776613 3776614 RrIowa_0293 RrIowa_0294     TRUE 0.739 136.000 0.007 1.000 N NA
 3776614 3776615 RrIowa_0294 RrIowa_0295     FALSE 0.032 474.000 0.000 1.000 N NA
 3776615 3776616 RrIowa_0295 RrIowa_0296     TRUE 0.807 156.000 0.022 NA N NA
 3776619 3776620 RrIowa_0299 RrIowa_0300     FALSE 0.030 425.000 0.000 NA   NA
 3776620 3776621 RrIowa_0300 RrIowa_0301     TRUE 0.557 129.000 0.000 NA   NA
 3776621 3776622 RrIowa_0301 RrIowa_0302     TRUE 0.986 -12.000 0.500 NA   NA
 3776622 3776623 RrIowa_0302 RrIowa_0303     FALSE 0.469 41.000 0.000 NA   NA
 3776623 10746772 RrIowa_0303 RrIowa_0304     TRUE 0.837 15.000 0.000 NA   NA
 3776624 3776625 RrIowa_0307 RrIowa_0308     FALSE 0.072 315.000 0.000 NA   NA
 3776625 3776626 RrIowa_0308 RrIowa_0309     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 3776628 10746773 RrIowa_0311 RrIowa_0312     FALSE 0.259 233.000 0.000 NA   NA
 10746773 3776629 RrIowa_0312 RrIowa_0314     FALSE 0.234 239.000 0.000 NA   NA
 3776630 3776631 RrIowa_0315 RrIowa_0316     TRUE 0.971 10.000 0.200 NA   NA
 3776631 3776632 RrIowa_0316 RrIowa_0317     TRUE 0.991 5.000 0.778 NA   NA
 3776632 3776633 RrIowa_0317 RrIowa_0318     TRUE 0.949 13.000 0.068 NA   NA
 3776633 3776634 RrIowa_0318 RrIowa_0319   hscA TRUE 0.710 64.000 0.091 1.000 N NA
 3776634 3776635 RrIowa_0319 RrIowa_0320 hscA hscB TRUE 0.994 -9.000 0.634 1.000 Y NA
 3776638 10746774 RrIowa_0323 RrIowa_0324     TRUE 0.577 132.000 0.000 NA   NA
 10746774 3776639 RrIowa_0324 RrIowa_0326     FALSE 0.412 94.000 0.000 NA   NA
 3776639 3776640 RrIowa_0326 RrIowa_0327     FALSE 0.058 339.000 0.000 NA   NA
 3776640 3776641 RrIowa_0327 RrIowa_0328     FALSE 0.016 518.000 0.000 NA   NA
 3776641 3776642 RrIowa_0328 RrIowa_0329     FALSE 0.028 431.000 0.000 NA   NA
 10746775 3776644 RrIowa_0331 RrIowa_0333     FALSE 0.445 100.000 0.000 NA   NA
 3776644 3776645 RrIowa_0333 RrIowa_0334     TRUE 0.637 122.000 0.015 NA   NA
 3776647 3776648 RrIowa_0336 RrIowa_0337     TRUE 0.981 -3.000 0.008 0.073 Y NA
 3776648 3776649 RrIowa_0337 RrIowa_0338     FALSE 0.353 217.000 0.000 NA   NA
 3776649 3776650 RrIowa_0338 RrIowa_0339     FALSE 0.275 229.000 0.000 NA   NA
 3776650 3776651 RrIowa_0339 RrIowa_0340     FALSE 0.139 271.000 0.000 NA   NA
 3776651 3776652 RrIowa_0340 RrIowa_0341     FALSE 0.035 404.000 0.000 NA   NA
 3776653 3776654 RrIowa_0342 RrIowa_0343     FALSE 0.445 215.000 0.000 1.000   NA
 3776655 3776656 RrIowa_0344 RrIowa_0345     TRUE 0.627 171.000 0.000 NA   NA
 3776656 3776657 RrIowa_0345 RrIowa_0346     FALSE 0.376 84.000 0.000 NA   NA
 3776659 3776660 RrIowa_0348 RrIowa_0349     TRUE 0.927 152.000 0.500 NA   NA
 3776660 3776661 RrIowa_0349 RrIowa_0350     TRUE 0.988 8.000 0.095 0.047 Y NA
 3776661 3776662 RrIowa_0350 RrIowa_0351   relB.2 TRUE 0.645 136.000 0.000 NA N NA
 3776662 3776663 RrIowa_0351 RrIowa_0352 relB.2 relE TRUE 0.985 11.000 0.681 NA   NA
 3776663 3776664 RrIowa_0352 RrIowa_0353 relE   TRUE 0.933 -7.000 0.007 NA   NA
 3776664 3776665 RrIowa_0353 RrIowa_0354     TRUE 0.527 77.000 0.025 NA   NA
 3776665 3776666 RrIowa_0354 RrIowa_0355     TRUE 0.771 154.000 0.011 1.000   NA
 3776666 3776667 RrIowa_0355 RrIowa_0356     FALSE 0.422 217.000 0.000 1.000   NA
 3776667 3776668 RrIowa_0356 RrIowa_0357     FALSE 0.427 70.000 0.006 1.000   NA
 3776668 3776669 RrIowa_0357 RrIowa_0358     FALSE 0.391 88.000 0.000 NA   NA
 3776669 3776670 RrIowa_0358 RrIowa_0359     TRUE 0.535 34.000 0.000 NA   NA
 3776670 3776671 RrIowa_0359 RrIowa_0360     TRUE 0.506 115.000 0.000 NA   NA
 3776671 3776672 RrIowa_0360 RrIowa_0361     FALSE 0.386 86.000 0.000 NA   NA
 3776672 3776673 RrIowa_0361 RrIowa_0362     FALSE 0.340 75.000 0.000 NA   NA
 3776673 3776674 RrIowa_0362 RrIowa_0363     FALSE 0.370 55.000 0.000 NA   NA
 10746776 3776675 RrIowa_0364 RrIowa_0366     TRUE 0.888 -18.000 0.000 NA   NA
 3776675 3776676 RrIowa_0366 RrIowa_0367     FALSE 0.337 218.000 0.000 NA   NA
 3776676 3776677 RrIowa_0367 RrIowa_0368     FALSE 0.013 637.000 0.000 NA   NA
 3776677 3776678 RrIowa_0368 RrIowa_0369     TRUE 0.512 194.000 0.000 NA   NA
 3776679 3776680 RrIowa_0370 RrIowa_0371     TRUE 0.925 2.000 0.000 NA   NA
 3776680 3776681 RrIowa_0371 RrIowa_0372     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 3776681 3776682 RrIowa_0372 RrIowa_0373     TRUE 0.912 -10.000 0.000 NA   NA
 3776682 3776683 RrIowa_0373 RrIowa_0374     TRUE 0.524 210.000 0.016 NA   NA
 3776683 3776684 RrIowa_0374 RrIowa_0375     TRUE 0.610 90.000 0.015 1.000 N NA
 3776684 3776685 RrIowa_0375 RrIowa_0376     TRUE 0.485 215.000 0.000 1.000 N NA
 3776685 3776686 RrIowa_0376 RrIowa_0377   ybgF TRUE 0.706 66.000 0.143 1.000   NA
 3776686 3776687 RrIowa_0377 RrIowa_0378 ybgF   TRUE 0.980 13.000 0.583 NA   NA
 3776687 3776688 RrIowa_0378 RrIowa_0379     TRUE 0.807 23.000 0.022 NA   NA
 3776688 3776689 RrIowa_0379 RrIowa_0380     TRUE 0.516 94.000 0.006 1.000   NA
 3776689 3776690 RrIowa_0380 RrIowa_0381     TRUE 0.991 7.000 0.231 0.044 Y NA
 3776690 3776691 RrIowa_0381 RrIowa_0382     FALSE 0.252 235.000 0.000 NA   NA
 3776691 3776692 RrIowa_0382 RrIowa_0383     FALSE 0.029 428.000 0.000 NA   NA
 3776692 3776693 RrIowa_0383 RrIowa_0384     FALSE 0.059 337.000 0.000 NA   NA
 3776693 3776694 RrIowa_0384 RrIowa_0385     TRUE 0.750 152.000 0.008 1.000   NA
 3776694 3776695 RrIowa_0385 RrIowa_0386     FALSE 0.139 271.000 0.000 NA   NA
 3776695 3776696 RrIowa_0386 RrIowa_0387     TRUE 0.904 7.000 0.000 NA   NA
 3776697 3776698 RrIowa_0388 RrIowa_0389     TRUE 0.824 25.000 0.017 1.000 N NA
 3776699 3776700 RrIowa_0390 RrIowa_0391     TRUE 0.584 225.000 0.047 1.000 N NA
 3776700 3776701 RrIowa_0391 RrIowa_0392     FALSE 0.355 72.000 0.005 NA   NA
 3776701 3776702 RrIowa_0392 RrIowa_0393     TRUE 0.667 34.000 0.018 NA   NA
 3776702 3776703 RrIowa_0393 RrIowa_0394     TRUE 0.784 262.000 0.466 0.006 Y NA
 3776703 3776704 RrIowa_0394 RrIowa_0395     TRUE 0.973 -6.000 0.013 0.064 N NA
 3776704 3776705 RrIowa_0395 RrIowa_0396     FALSE 0.054 344.000 0.000 NA   NA
 3776705 3776706 RrIowa_0396 RrIowa_0397     TRUE 0.683 23.000 0.000 NA   NA
 3776707 3776708 RrIowa_0398 RrIowa_0399   bolA.1 TRUE 0.961 -3.000 0.022 NA   NA
 3776709 3776710 RrIowa_0400 RrIowa_0401     FALSE 0.385 221.000 0.006 NA N NA
 3776710 3776711 RrIowa_0401 RrIowa_0402     TRUE 0.827 221.000 0.108 0.010 Y NA
 3776711 3776712 RrIowa_0402 RrIowa_0403     TRUE 0.738 244.000 0.135 0.010 Y NA
 3776712 3776713 RrIowa_0403 RrIowa_0404   ftsQ TRUE 0.992 -3.000 0.372 NA Y NA
 3776713 3776714 RrIowa_0404 RrIowa_0405 ftsQ ftsA TRUE 0.840 128.000 0.137 NA N NA
 3776715 3776716 RrIowa_0406 RrIowa_0407     TRUE 0.938 -16.000 0.014 NA N NA
 3776718 3776719 RrIowa_0409 RrIowa_0410     FALSE 0.052 358.000 0.005 NA   NA
 3776720 3776721 RrIowa_0411 RrIowa_0412     FALSE 0.324 239.000 0.000 1.000 N NA
 3776721 3776722 RrIowa_0412 RrIowa_0413     TRUE 0.945 13.000 0.022 1.000 N NA
 3776722 10746777 RrIowa_0413 RrIowa_0414     TRUE 0.549 128.000 0.000 NA   NA
 10746777 3776723 RrIowa_0414 RrIowa_0417     TRUE 0.914 5.000 0.000 NA   NA
 3776723 3776724 RrIowa_0417 RrIowa_0418     TRUE 0.847 23.000 0.018 1.000 N NA
 3776724 3776725 RrIowa_0418 RrIowa_0419     TRUE 0.973 161.000 0.456 0.003 Y NA
 3776727 3776728 RrIowa_0421 RrIowa_0422     TRUE 0.882 82.000 1.000 NA   NA
 3776728 3776729 RrIowa_0422 RrIowa_0423     FALSE 0.351 61.000 0.000 NA   NA
 3776729 3776730 RrIowa_0423 RrIowa_0424     FALSE 0.322 220.000 0.000 NA   NA
 3776730 3776731 RrIowa_0424 RrIowa_0425     TRUE 0.858 177.000 0.062 1.000 N NA
 3776731 3776732 RrIowa_0425 RrIowa_0426   shaG TRUE 0.814 115.000 0.069 1.000 N NA
 3776732 3776733 RrIowa_0426 RrIowa_0427 shaG shaA TRUE 0.790 64.000 0.184 NA Y NA
 3776733 3776734 RrIowa_0427 RrIowa_0428 shaA   TRUE 0.931 -7.000 0.000 NA N NA
 3776734 3776735 RrIowa_0428 RrIowa_0429     FALSE 0.340 75.000 0.000 NA   NA
 3776735 3776736 RrIowa_0429 RrIowa_0430     TRUE 0.965 22.000 0.875 NA   NA
 3776736 3776737 RrIowa_0430 RrIowa_0431     TRUE 0.985 7.000 0.021 0.003 Y NA
 3776739 10746778 RrIowa_0433 RrIowa_0434     FALSE 0.131 276.000 0.000 NA   NA
 10746778 3776740 RrIowa_0434 RrIowa_0436     FALSE 0.351 61.000 0.000 NA   NA
 3776741 3776742 RrIowa_0437 RrIowa_0438     FALSE 0.469 41.000 0.000 NA   NA
 3776742 3776743 RrIowa_0438 RrIowa_0439     FALSE 0.322 220.000 0.000 NA   NA
 3776743 10746779 RrIowa_0439 RrIowa_0440     TRUE 0.893 -16.000 0.000 NA   NA
 10746779 3776744 RrIowa_0440 RrIowa_0442     TRUE 0.885 10.000 0.000 NA   NA
 3776745 3776746 RrIowa_0443 RrIowa_0444 lepA.2   FALSE 0.403 92.000 0.000 NA   NA
 3776747 3776748 RrIowa_0445 RrIowa_0446     FALSE 0.020 482.000 0.000 NA   NA
 10746780 3776749 RrIowa_0447 RrIowa_0450     FALSE 0.011 715.000 0.000 NA   NA
 3776749 10746781 RrIowa_0450 RrIowa_0451     FALSE 0.009 859.000 0.000 NA   NA
 10746781 3776750 RrIowa_0451 RrIowa_0453     TRUE 0.567 183.000 0.000 NA   NA
 3776751 3776752 RrIowa_0454 RrIowa_0455   rodA FALSE 0.047 447.000 0.000 0.086   NA
 3776752 3776753 RrIowa_0455 RrIowa_0456 rodA   TRUE 0.790 156.000 0.010 1.000 N NA
 3776753 3776754 RrIowa_0456 RrIowa_0457     TRUE 0.922 186.000 0.538 1.000 N NA
 3776754 3776755 RrIowa_0457 RrIowa_0458     TRUE 0.990 2.000 0.556 NA   NA
 3776755 3776756 RrIowa_0458 RrIowa_0459     TRUE 0.985 -9.000 0.444 NA   NA
 3776756 3776757 RrIowa_0459 RrIowa_0460   shaA TRUE 0.826 175.000 0.070 NA   NA
 3776757 3776758 RrIowa_0460 RrIowa_0461 shaA shaD TRUE 0.940 147.000 0.067 0.008 Y NA
 3776758 3776759 RrIowa_0461 RrIowa_0462 shaD shaC TRUE 0.995 -3.000 0.426 0.021 Y NA
 3776759 3776760 RrIowa_0462 RrIowa_0463 shaC virB9.1 TRUE 0.651 79.000 0.065 NA N NA
 3776760 3776761 RrIowa_0463 RrIowa_0464 virB9.1 virB8.1 TRUE 0.993 2.000 0.455 NA Y NA
 3776762 3776763 RrIowa_0465 RrIowa_0466 virB7 virB8.2 TRUE 0.780 50.000 0.316 NA   NA
 3776763 3776764 RrIowa_0466 RrIowa_0467 virB8.2 virB9.2 TRUE 0.983 -13.000 0.421 NA   NA
 3776764 3776765 RrIowa_0467 RrIowa_0468 virB9.2 virB10 TRUE 0.890 183.000 0.421 NA   NA
 3776765 3776766 RrIowa_0468 RrIowa_0469 virB10 virB11 TRUE 0.994 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 3776766 3776767 RrIowa_0469 RrIowa_0470 virB11 virD4 TRUE 0.946 134.000 0.405 1.000 Y NA
 3776767 3776768 RrIowa_0470 RrIowa_0471 virD4   TRUE 0.978 -7.000 0.054 1.000 N NA
 3776769 3776770 RrIowa_0472 RrIowa_0473     TRUE 0.730 20.000 0.000 NA   NA
 3776770 3776771 RrIowa_0473 RrIowa_0474     FALSE 0.072 315.000 0.000 NA   NA
 3776771 3776772 RrIowa_0474 RrIowa_0475     FALSE 0.021 475.000 0.000 NA   NA
 3776775 3776776 RrIowa_0478 RrIowa_0479     TRUE 0.990 -16.000 0.875 NA   NA
 3776776 3776777 RrIowa_0479 RrIowa_0480     TRUE 0.968 3.000 0.048 NA   NA
 3776778 3776779 RrIowa_0481 RrIowa_0482   mutS FALSE 0.456 42.000 0.000 NA   NA
 3776779 3776780 RrIowa_0482 RrIowa_0483 mutS   TRUE 0.725 171.000 0.000 1.000 N NA
 3776781 3776782 RrIowa_0484 RrIowa_0485     TRUE 0.943 1.000 0.009 NA   NA
 3776782 3776783 RrIowa_0485 RrIowa_0486   thyX TRUE 0.482 109.000 0.000 NA   NA
 3776783 3776784 RrIowa_0486 RrIowa_0487 thyX tolB TRUE 0.540 75.000 0.014 1.000 N NA
 3776788 3776789 RrIowa_0491 RrIowa_0492     TRUE 0.567 82.000 0.014 1.000 N NA
 3776789 3776790 RrIowa_0492 RrIowa_0493     TRUE 0.781 154.000 0.008 1.000 N NA
 3776790 3776791 RrIowa_0493 RrIowa_0494     FALSE 0.046 362.000 0.000 NA   NA
 3776791 3776792 RrIowa_0494 RrIowa_0495     TRUE 0.616 173.000 0.000 NA   NA
 3776792 3776793 RrIowa_0495 RrIowa_0496     FALSE 0.456 102.000 0.000 NA   NA
 3776794 10746782 RrIowa_0497 RrIowa_0498     FALSE 0.234 239.000 0.000 NA   NA
 10746782 3776795 RrIowa_0498 RrIowa_0500     TRUE 0.912 -10.000 0.000 NA   NA
 3776795 3776796 RrIowa_0500 RrIowa_0501     FALSE 0.076 312.000 0.000 NA   NA
 3776796 3776797 RrIowa_0501 RrIowa_0502     FALSE 0.446 43.000 0.000 NA   NA
 3776797 3776798 RrIowa_0502 RrIowa_0503     TRUE 0.646 163.000 0.000 NA   NA
 3776799 3776800 RrIowa_0504 RrIowa_0505 tolQ tolR TRUE 0.991 0.000 0.059 0.036 Y NA
 3776800 3776801 RrIowa_0505 RrIowa_0506 tolR tolA TRUE 0.979 -10.000 0.240 NA   NA
 3776802 3776803 RrIowa_0507 RrIowa_0508     TRUE 0.693 22.000 0.000 NA   NA
 3776803 3776804 RrIowa_0508 RrIowa_0509     FALSE 0.348 76.000 0.000 NA   NA
 3776804 3776805 RrIowa_0509 RrIowa_0510     FALSE 0.009 786.000 0.000 NA   NA
 3776805 3776806 RrIowa_0510 RrIowa_0511     TRUE 0.925 139.000 0.273 0.083   NA
 3776806 3776807 RrIowa_0511 RrIowa_0512     TRUE 0.914 184.000 0.267 0.011   NA
 3776807 3776808 RrIowa_0512 RrIowa_0513     TRUE 0.938 9.000 0.011 1.000   NA
 3776808 3776809 RrIowa_0513 RrIowa_0514     TRUE 0.961 -7.000 0.012 1.000 N NA
 3776809 3776810 RrIowa_0514 RrIowa_0515     TRUE 0.580 195.000 0.010 NA   NA
 3776810 3776811 RrIowa_0515 RrIowa_0516     FALSE 0.328 71.000 0.000 NA   NA
 3776812 3776813 RrIowa_0517 RrIowa_0518 hslV hslU TRUE 0.996 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 3776814 3776815 RrIowa_0519 RrIowa_0520     TRUE 0.519 119.000 0.000 NA   NA
 3776816 3776817 RrIowa_0521 RrIowa_0522 chlI   FALSE 0.465 103.000 0.000 NA   NA
 3776817 3776818 RrIowa_0522 RrIowa_0523     FALSE 0.363 57.000 0.000 NA   NA
 3776818 3776819 RrIowa_0523 RrIowa_0524     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776819 3776820 RrIowa_0524 RrIowa_0525     TRUE 0.893 10.000 0.003 NA   NA
 3776822 3776823 RrIowa_0527 RrIowa_0528     TRUE 0.702 140.000 0.012 NA   NA
 3776823 10746783 RrIowa_0528 RrIowa_0529     TRUE 0.612 138.000 0.000 NA   NA
 10746783 3776824 RrIowa_0529 RrIowa_0531     FALSE 0.031 421.000 0.000 NA   NA
 3776824 10746784 RrIowa_0531 RrIowa_0532     FALSE 0.026 447.000 0.000 NA   NA
 10746784 3776825 RrIowa_0532 RrIowa_0534     FALSE 0.438 99.000 0.000 NA   NA
 3776826 3776827 RrIowa_0535 RrIowa_0536     TRUE 0.630 109.000 0.007 1.000 N NA
 3776827 10746785 RrIowa_0536 RrIowa_0537     TRUE 0.602 29.000 0.000 NA   NA
 3776829 3776830 RrIowa_0540 RrIowa_0541     TRUE 0.664 76.000 0.014 1.000 Y NA
 3776830 3776831 RrIowa_0541 RrIowa_0542     TRUE 0.530 74.000 0.035 NA   NA
 3776831 3776832 RrIowa_0542 RrIowa_0543     TRUE 0.606 67.000 0.069 NA   NA
 3776833 3776834 RrIowa_0544 RrIowa_0545     FALSE 0.185 267.000 0.000 1.000   NA
 3776834 3776835 RrIowa_0545 RrIowa_0546     TRUE 0.692 171.000 0.000 1.000   NA
 3776835 3776836 RrIowa_0546 RrIowa_0547     TRUE 0.925 183.000 0.271 0.002   NA
 3776836 3776837 RrIowa_0547 RrIowa_0548     TRUE 0.982 -7.000 0.148 1.000   NA
 3776837 3776838 RrIowa_0548 RrIowa_0549     TRUE 0.602 29.000 0.000 NA   NA
 3776838 3776839 RrIowa_0549 RrIowa_0550     TRUE 0.819 16.000 0.000 NA   NA
 3776839 3776840 RrIowa_0550 RrIowa_0551     TRUE 0.616 173.000 0.000 NA   NA
 3776840 3776841 RrIowa_0551 RrIowa_0552     TRUE 0.648 159.000 0.000 NA   NA
 3776842 3776843 RrIowa_0553 RrIowa_0554     TRUE 0.788 93.000 0.312 NA   NA
 3776843 3776844 RrIowa_0554 RrIowa_0555     TRUE 0.966 10.000 0.129 NA   NA
 3776846 3776847 RrIowa_0557 RrIowa_0558     FALSE 0.328 71.000 0.000 NA   NA
 3776847 3776848 RrIowa_0558 RrIowa_0559     FALSE 0.007 1141.000 0.000 NA   NA
 3776851 3776852 RrIowa_0562 RrIowa_0563     FALSE 0.329 72.000 0.000 NA   NA
 3776853 3776854 RrIowa_0564 RrIowa_0565   rimM FALSE 0.094 321.000 0.007 NA N NA
 3776855 3776856 RrIowa_0566 RrIowa_0567     TRUE 0.881 13.000 0.007 NA   NA
 3776856 3776857 RrIowa_0567 RrIowa_0568     TRUE 0.632 148.000 0.000 NA   NA
 3776857 10746786 RrIowa_0568 RrIowa_0569     FALSE 0.370 55.000 0.000 NA   NA
 3776858 3776859 RrIowa_0572 RrIowa_0573     TRUE 0.934 -7.000 0.008 NA   NA
 3776859 3776860 RrIowa_0573 RrIowa_0574     FALSE 0.442 97.000 0.002 NA   NA
 3776860 3776861 RrIowa_0574 RrIowa_0575     TRUE 0.932 -7.000 0.007 NA   NA
 3776861 3776862 RrIowa_0575 RrIowa_0576     FALSE 0.357 413.000 0.355 0.008 Y NA
 3776862 3776863 RrIowa_0576 RrIowa_0577     TRUE 0.978 21.000 0.483 0.019 Y NA
 3776863 3776864 RrIowa_0577 RrIowa_0578     TRUE 0.910 86.000 0.328 0.007 Y NA
 3776864 3776865 RrIowa_0578 RrIowa_0579     TRUE 0.995 5.000 0.507 0.007 Y NA
 3776865 3776866 RrIowa_0579 RrIowa_0580     TRUE 0.970 -3.000 0.031 NA N NA
 3776866 3776867 RrIowa_0580 RrIowa_0581     TRUE 0.974 1.000 0.066 NA   NA
 10746787 3776868 RrIowa_0582 RrIowa_0584     TRUE 0.565 130.000 0.000 NA   NA
 3776868 3776869 RrIowa_0584 RrIowa_0585     TRUE 0.693 22.000 0.000 NA   NA
 3776869 3776870 RrIowa_0585 RrIowa_0586     FALSE 0.434 83.000 0.008 NA   NA
 3776870 3776871 RrIowa_0586 RrIowa_0587     TRUE 0.877 107.000 0.571 NA   NA
 3776873 3776874 RrIowa_0589 RrIowa_0590     TRUE 0.715 119.000 0.037 NA   NA
 3776874 3776875 RrIowa_0590 RrIowa_0591     FALSE 0.027 439.000 0.000 NA   NA
 3776875 3776876 RrIowa_0591 RrIowa_0592     FALSE 0.010 758.000 0.000 NA   NA
 3776876 3776877 RrIowa_0592 RrIowa_0593     TRUE 0.988 5.000 0.545 NA   NA
 3776877 3776878 RrIowa_0593 RrIowa_0594     TRUE 0.990 -3.000 0.455 1.000   NA
 3776879 3776880 RrIowa_0595 RrIowa_0596     TRUE 0.730 20.000 0.000 NA   NA
 3776880 3776881 RrIowa_0596 RrIowa_0597     FALSE 0.042 372.000 0.000 NA   NA
 3776881 3776882 RrIowa_0597 RrIowa_0598     FALSE 0.418 96.000 0.000 NA   NA
 3776882 3776883 RrIowa_0598 RrIowa_0599     TRUE 0.500 113.000 0.000 NA   NA
 3776884 3776885 RrIowa_0600 RrIowa_0601     TRUE 0.775 134.000 0.021 1.000   NA
 3776885 3776886 RrIowa_0601 RrIowa_0602     TRUE 0.956 14.000 0.071 1.000   NA
 3776886 3776887 RrIowa_0602 RrIowa_0603     TRUE 0.602 29.000 0.000 NA   NA
 3776887 3776888 RrIowa_0603 RrIowa_0604   ralF FALSE 0.035 404.000 0.000 NA   NA
 3776889 3776890 RrIowa_0605 RrIowa_0606     TRUE 0.546 33.000 0.000 NA   NA
 3776890 3776891 RrIowa_0606 RrIowa_0607     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 3776893 3776894 RrIowa_0609 RrIowa_0610     TRUE 0.603 136.000 0.000 NA   NA
 3776894 3776895 RrIowa_0610 RrIowa_0611     TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 3776895 3776896 RrIowa_0611 RrIowa_0612     FALSE 0.411 46.000 0.000 NA   NA
 10746788 3776898 RrIowa_0614 RrIowa_0616     TRUE 0.577 132.000 0.000 NA   NA
 3776898 3776899 RrIowa_0616 RrIowa_0617     FALSE 0.329 70.000 0.000 NA   NA
 3776899 3776900 RrIowa_0617 RrIowa_0618     TRUE 0.583 133.000 0.000 NA   NA
 3776901 3776902 RrIowa_0619 RrIowa_0620     TRUE 0.580 30.000 0.000 NA   NA
 3776902 3776903 RrIowa_0620 RrIowa_0621     FALSE 0.345 63.000 0.000 NA   NA
 3776904 3776905 RrIowa_0622 RrIowa_0623     TRUE 0.514 210.000 0.000 1.000 N NA
 3776905 3776906 RrIowa_0623 RrIowa_0624     TRUE 0.969 3.000 0.019 1.000 N NA
 3776907 3776908 RrIowa_0625 RrIowa_0626     TRUE 0.837 15.000 0.000 NA   NA
 3776908 3776909 RrIowa_0626 RrIowa_0627     TRUE 0.471 106.000 0.000 NA   NA
 3776911 3776912 RrIowa_0629 RrIowa_0630     TRUE 0.979 -7.000 0.092 1.000   NA
 3776912 3776913 RrIowa_0630 RrIowa_0631     TRUE 0.829 165.000 0.008 0.049 N NA
 3776913 3776914 RrIowa_0631 RrIowa_0632     FALSE 0.437 216.000 0.000 1.000   NA
 3776914 3776915 RrIowa_0632 RrIowa_0633     FALSE 0.388 240.000 0.034 NA   NA
 3776915 3776916 RrIowa_0633 RrIowa_0634   ruvA TRUE 0.927 5.000 0.007 NA   NA
 3776916 3776917 RrIowa_0634 RrIowa_0635 ruvA   FALSE 0.117 281.000 0.000 NA   NA
 3776917 3776918 RrIowa_0635 RrIowa_0636     TRUE 0.535 34.000 0.000 NA   NA
 3776918 3776919 RrIowa_0636 RrIowa_0637   ruvB TRUE 0.670 156.000 0.004 NA   NA
 3776919 3776920 RrIowa_0637 RrIowa_0638 ruvB   TRUE 0.954 -7.000 0.007 1.000 N NA
 3776920 3776921 RrIowa_0638 RrIowa_0639     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776921 3776922 RrIowa_0639 RrIowa_0640   ampG.1 FALSE 0.397 90.000 0.000 NA   NA
 3776922 3776923 RrIowa_0640 RrIowa_0641 ampG.1   TRUE 0.937 177.000 0.625 1.000   NA
 3776924 3776925 RrIowa_0642 RrIowa_0643     TRUE 0.897 17.000 0.029 NA   NA
 3776925 3776926 RrIowa_0643 RrIowa_0644     FALSE 0.131 300.000 0.014 NA   NA
 3776926 3776927 RrIowa_0644 RrIowa_0645     TRUE 0.807 30.000 0.027 1.000 N NA
 3776927 3776928 RrIowa_0645 RrIowa_0646     TRUE 0.985 10.000 0.629 NA   NA
 3776928 3776929 RrIowa_0646 RrIowa_0647     FALSE 0.352 77.000 0.000 NA   NA
 3776929 3776930 RrIowa_0647 RrIowa_0648     TRUE 0.904 7.000 0.000 NA   NA
 3776933 3776934 RrIowa_0651 RrIowa_0652 tlpA sppA.1 TRUE 0.903 165.000 0.042 1.000 Y NA
 3776934 3776935 RrIowa_0652 RrIowa_0653 sppA.1   TRUE 0.960 2.000 0.008 1.000 N NA
 3776935 3776936 RrIowa_0653 RrIowa_0654     TRUE 0.492 217.000 0.006 1.000 N NA
 3776936 3776937 RrIowa_0654 RrIowa_0655     TRUE 0.603 87.000 0.041 NA   NA
 3776937 3776938 RrIowa_0655 RrIowa_0656     TRUE 0.884 196.000 0.571 NA   NA
 3776941 3776942 RrIowa_0659 RrIowa_0660     TRUE 0.573 207.000 0.012 1.000   NA
 3776942 3776943 RrIowa_0660 RrIowa_0661     TRUE 0.930 6.000 0.000 1.000   NA
 3776943 3776944 RrIowa_0661 RrIowa_0662     TRUE 0.591 193.000 0.000 1.000   NA
 3776945 3776946 RrIowa_0663 RrIowa_0664     TRUE 0.901 181.000 0.031 0.031 Y NA
 3776946 3776947 RrIowa_0664 RrIowa_0665     TRUE 0.828 167.000 0.054 NA   NA
 3776947 3776948 RrIowa_0665 RrIowa_0666     TRUE 0.660 172.000 0.006 NA   NA
 3776948 3776949 RrIowa_0666 RrIowa_0667   ftsW TRUE 0.920 117.000 0.297 0.002 N NA
 3776949 3776950 RrIowa_0667 RrIowa_0668 ftsW   TRUE 0.993 -3.000 0.647 1.000 N NA
 3776950 3776951 RrIowa_0668 RrIowa_0669     FALSE 0.036 395.000 0.000 NA   NA
 3776951 3776952 RrIowa_0669 RrIowa_0670     TRUE 0.649 158.000 0.000 NA   NA
 3776952 3776953 RrIowa_0670 RrIowa_0671     TRUE 0.602 29.000 0.000 NA   NA
 3776953 3776954 RrIowa_0671 RrIowa_0672     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776954 3776955 RrIowa_0672 RrIowa_0673     TRUE 0.849 14.000 0.000 NA   NA
 3776956 3776957 RrIowa_0674 RrIowa_0675     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776957 3776958 RrIowa_0675 RrIowa_0676     TRUE 0.904 7.000 0.000 NA   NA
 3776958 3776959 RrIowa_0676 RrIowa_0677     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776959 3776960 RrIowa_0677 RrIowa_0678     TRUE 0.648 159.000 0.000 NA   NA
 3776960 3776961 RrIowa_0678 RrIowa_0679     TRUE 0.643 164.000 0.000 NA   NA
 3776961 3776962 RrIowa_0679 RrIowa_0680     TRUE 0.619 142.000 0.000 NA   NA
 3776962 10746789 RrIowa_0680 RrIowa_0681     TRUE 0.644 153.000 0.000 NA   NA
 10746789 3776963 RrIowa_0681 RrIowa_0683     FALSE 0.399 49.000 0.000 NA   NA
 3776963 10746790 RrIowa_0683 RrIowa_0684     FALSE 0.335 67.000 0.000 NA   NA
 10746790 3776964 RrIowa_0684 RrIowa_0686     FALSE 0.469 41.000 0.000 NA   NA
 3776964 3776965 RrIowa_0686 RrIowa_0687     FALSE 0.291 223.000 0.000 NA   NA
 3776965 3776966 RrIowa_0687 RrIowa_0688     TRUE 0.979 4.000 0.182 NA   NA
 3776966 10746791 RrIowa_0688 RrIowa_0689     TRUE 0.602 29.000 0.000 NA   NA
 3776967 3776968 RrIowa_0691 RrIowa_0692     TRUE 0.972 -25.000 0.109 1.000 N NA
 3776968 3776969 RrIowa_0692 RrIowa_0693     TRUE 0.753 195.000 0.007 1.000 Y NA
 3776969 3776970 RrIowa_0693 RrIowa_0694     TRUE 0.997 -3.000 0.574 0.002 Y NA
 3776970 3776971 RrIowa_0694 RrIowa_0695     TRUE 0.961 5.000 0.015 1.000 N NA
 3776971 3776972 RrIowa_0695 RrIowa_0696     TRUE 0.909 6.000 0.000 NA   NA
 3776972 3776973 RrIowa_0696 RrIowa_0697     TRUE 0.871 -34.000 0.000 NA   NA
 3776975 3776976 RrIowa_0699 RrIowa_0700     TRUE 0.770 129.000 0.051 NA   NA
 3776977 3776978 RrIowa_0701 RrIowa_0702     FALSE 0.376 84.000 0.000 NA   NA
 3776978 3776979 RrIowa_0702 RrIowa_0703     TRUE 0.779 149.000 0.015 1.000   NA
 3776979 3776980 RrIowa_0703 RrIowa_0704     TRUE 0.964 -3.000 0.011 1.000 N NA
 3776980 3776981 RrIowa_0704 RrIowa_0705     TRUE 0.991 -13.000 0.400 1.000 Y NA
 3776981 3776982 RrIowa_0705 RrIowa_0706   envZ TRUE 0.750 146.000 0.006 1.000 N NA
 3776982 3776983 RrIowa_0706 RrIowa_0707 envZ ompR TRUE 0.967 158.000 0.592 1.000 Y NA
 3776984 3776985 RrIowa_0708 RrIowa_0709     TRUE 0.891 186.000 0.087 1.000 Y NA
 3776985 3776986 RrIowa_0709 RrIowa_0710     TRUE 0.961 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3776986 3776987 RrIowa_0710 RrIowa_0711     TRUE 0.806 132.000 0.007 1.000 Y NA
 3776988 3776989 RrIowa_0712 RrIowa_0713     TRUE 0.960 174.000 0.256 0.002 Y NA
 3776989 3776990 RrIowa_0713 RrIowa_0714     TRUE 0.597 32.000 0.006 NA   NA
 3776990 3776991 RrIowa_0714 RrIowa_0715     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3776991 3776992 RrIowa_0715 RrIowa_0716     TRUE 0.982 -13.000 0.400 NA   NA
 3776992 3776993 RrIowa_0716 RrIowa_0717     TRUE 0.554 184.000 0.000 NA   NA
 3776993 3776994 RrIowa_0717 RrIowa_0718     FALSE 0.420 45.000 0.000 NA   NA
 3776994 3776995 RrIowa_0718 RrIowa_0719     TRUE 0.830 155.000 0.028 1.000   NA
 3776995 3776996 RrIowa_0719 RrIowa_0720     TRUE 0.589 88.000 0.018 1.000   NA
 3776996 3776997 RrIowa_0720 RrIowa_0721     FALSE 0.065 324.000 0.000 NA   NA
 3776997 3776998 RrIowa_0721 RrIowa_0722     TRUE 0.532 189.000 0.000 NA   NA
 3776998 3776999 RrIowa_0722 RrIowa_0723     TRUE 0.597 177.000 0.000 NA   NA
 3776999 3777000 RrIowa_0723 RrIowa_0724     TRUE 0.940 -3.000 0.007 NA   NA
 3777001 3777002 RrIowa_0725 RrIowa_0726   recR TRUE 0.667 148.000 0.006 NA   NA
 3777003 3777004 RrIowa_0727 RrIowa_0728     FALSE 0.065 324.000 0.000 NA   NA
 3777004 3777005 RrIowa_0728 RrIowa_0729     TRUE 0.597 177.000 0.000 NA   NA
 3777005 3777006 RrIowa_0729 RrIowa_0730     FALSE 0.332 74.000 0.000 NA   NA
 3777006 3777007 RrIowa_0730 RrIowa_0731     TRUE 0.621 144.000 0.000 NA   NA
 3777007 3777008 RrIowa_0731 RrIowa_0732     TRUE 0.584 180.000 0.000 NA   NA
 3777009 3777010 RrIowa_0733 RrIowa_0734     FALSE 0.391 248.000 0.029 1.000   NA
 3777010 3777011 RrIowa_0734 RrIowa_0735     TRUE 0.610 186.000 0.000 1.000   NA
 3777011 3777012 RrIowa_0735 RrIowa_0736     TRUE 0.631 69.000 0.096 NA   NA
 3777012 3777013 RrIowa_0736 RrIowa_0737     TRUE 0.505 202.000 0.007 NA   NA
 3777013 3777014 RrIowa_0737 RrIowa_0738     FALSE 0.309 221.000 0.000 NA   NA
 3777014 3777015 RrIowa_0738 RrIowa_0739     FALSE 0.347 62.000 0.000 NA   NA
 3777015 3777016 RrIowa_0739 RrIowa_0740     TRUE 0.636 150.000 0.000 NA   NA
 3777016 3777017 RrIowa_0740 RrIowa_0741     TRUE 0.534 125.000 0.000 NA   NA
 3777017 3777018 RrIowa_0741 RrIowa_0742     FALSE 0.387 241.000 0.040 NA   NA
 3777018 3777019 RrIowa_0742 RrIowa_0743     TRUE 0.979 -7.000 0.182 NA   NA
 3777019 3777020 RrIowa_0743 RrIowa_0744     FALSE 0.469 75.000 0.012 NA N NA
 3777020 3777021 RrIowa_0744 RrIowa_0745     FALSE 0.338 66.000 0.000 NA   NA
 3777021 3777022 RrIowa_0745 RrIowa_0746     FALSE 0.338 66.000 0.000 NA   NA
 3777022 3777023 RrIowa_0746 RrIowa_0747     TRUE 0.920 4.000 0.000 NA   NA
 3777023 3777024 RrIowa_0747 RrIowa_0748     TRUE 0.820 51.000 0.500 NA   NA
 3777026 10746792 RrIowa_0750 RrIowa_0751     FALSE 0.012 675.000 0.000 NA   NA
 3777027 3777028 RrIowa_0753 RrIowa_0754     TRUE 0.904 7.000 0.000 NA   NA
 3777028 3777029 RrIowa_0754 RrIowa_0756     FALSE 0.008 973.000 0.000 NA   NA
 3777030 3777031 RrIowa_0757 RrIowa_0758     TRUE 0.659 117.000 0.020 NA   NA
 3777031 10746793 RrIowa_0758 RrIowa_0759     TRUE 0.927 0.000 0.000 NA   NA
 3777032 3777033 RrIowa_0761 RrIowa_0762     TRUE 0.824 137.000 0.026 1.000 N NA
 3777033 3777034 RrIowa_0762 RrIowa_0763     TRUE 0.532 124.000 0.000 NA   NA
 3777035 3777036 RrIowa_0764 RrIowa_0765     TRUE 0.930 181.000 0.750 NA   NA
 3777036 3777037 RrIowa_0765 RrIowa_0766     TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 3777037 10746794 RrIowa_0766 RrIowa_0767     FALSE 0.411 46.000 0.000 NA   NA
 10746794 3777038 RrIowa_0767 RrIowa_0773     FALSE 0.007 1510.000 0.000 NA   NA
 3777038 3777039 RrIowa_0773 RrIowa_0774     FALSE 0.266 231.000 0.000 NA   NA
 3777039 3777040 RrIowa_0774 RrIowa_0775     FALSE 0.357 59.000 0.000 NA   NA
 3777040 3777041 RrIowa_0775 RrIowa_0776     FALSE 0.015 540.000 0.000 NA   NA
 3777041 3777042 RrIowa_0776 RrIowa_0777     FALSE 0.332 74.000 0.000 NA   NA
 3777042 3777043 RrIowa_0777 RrIowa_0778     TRUE 0.610 174.000 0.000 NA   NA
 3777043 3777044 RrIowa_0778 RrIowa_0779     FALSE 0.044 365.000 0.000 NA   NA
 3777044 3777045 RrIowa_0779 RrIowa_0780     TRUE 0.835 148.000 0.065 NA   NA
 3777045 10746795 RrIowa_0780 RrIowa_0781     FALSE 0.010 762.000 0.000 NA   NA
 3777046 3777047 RrIowa_0784 RrIowa_0785     TRUE 0.603 136.000 0.000 NA   NA
 3777047 3777048 RrIowa_0785 RrIowa_0786     FALSE 0.328 71.000 0.000 NA   NA
 3777048 3777049 RrIowa_0786 RrIowa_0787     TRUE 0.745 171.000 0.009 1.000   NA
 3777049 3777050 RrIowa_0787 RrIowa_0788     TRUE 0.909 183.000 0.543 NA   NA
 3777050 3777051 RrIowa_0788 RrIowa_0789     TRUE 0.780 18.000 0.000 NA   NA
 3777051 3777052 RrIowa_0789 RrIowa_0790     FALSE 0.432 44.000 0.000 NA   NA
 3777052 3777053 RrIowa_0790 RrIowa_0791     TRUE 0.973 6.000 0.115 NA   NA
 3777053 3777054 RrIowa_0791 RrIowa_0792     TRUE 0.914 5.000 0.000 NA   NA
 3777054 3777055 RrIowa_0792 RrIowa_0793     TRUE 0.754 19.000 0.000 NA   NA
 3777055 3777056 RrIowa_0793 RrIowa_0794     TRUE 0.951 148.000 0.335 1.000 Y NA
 3777056 3777057 RrIowa_0794 RrIowa_0795     TRUE 0.906 36.000 0.211 1.000 Y NA
 3777058 3777059 RrIowa_0796 RrIowa_0797     FALSE 0.117 281.000 0.000 NA   NA
 3777063 3777064 RrIowa_0800 RrIowa_0802     FALSE 0.358 218.000 0.004 NA   NA
 10746796 3777067 RrIowa_0805 RrIowa_0807     FALSE 0.247 236.000 0.000 NA   NA
 3777067 3777068 RrIowa_0807 RrIowa_0808     FALSE 0.154 263.000 0.000 NA   NA
 3777071 3777072 RrIowa_0811 RrIowa_0812 bioY   FALSE 0.376 217.000 0.004 NA   NA
 3777072 3777073 RrIowa_0812 RrIowa_0813     TRUE 0.782 173.000 0.013 1.000 N NA
 3777073 3777074 RrIowa_0813 RrIowa_0814     TRUE 0.914 5.000 0.000 NA   NA
 3777074 10746797 RrIowa_0814 RrIowa_0815     TRUE 0.908 -12.000 0.000 NA   NA
 10746797 3777075 RrIowa_0815 RrIowa_0818     TRUE 0.819 16.000 0.000 NA   NA
 3777075 3777076 RrIowa_0818 RrIowa_0819     FALSE 0.333 68.000 0.000 NA   NA
 3777076 3777077 RrIowa_0819 RrIowa_0820     TRUE 0.512 194.000 0.000 NA   NA
 3777077 3777078 RrIowa_0820 RrIowa_0821     TRUE 0.983 -3.000 0.240 NA   NA
 3777078 3777079 RrIowa_0821 RrIowa_0822     TRUE 0.830 29.000 0.080 NA   NA
 3777079 3777080 RrIowa_0822 RrIowa_0823     TRUE 0.988 4.000 0.500 NA   NA
 3777080 3777081 RrIowa_0823 RrIowa_0824     TRUE 0.975 -13.000 0.194 NA   NA
 3777081 3777082 RrIowa_0824 RrIowa_0825     TRUE 0.679 151.000 0.007 NA   NA
 3777082 3777083 RrIowa_0825 RrIowa_0826     TRUE 0.743 146.000 0.005 1.000 N NA
 3777083 3777084 RrIowa_0826 RrIowa_0827     TRUE 0.706 133.000 0.005 1.000 N NA
 3777084 3777085 RrIowa_0827 RrIowa_0828   recJ TRUE 0.760 161.000 0.005 1.000 N NA
 3777085 3777086 RrIowa_0828 RrIowa_0829 recJ   TRUE 0.570 44.000 0.005 1.000 N NA
 3777086 3777087 RrIowa_0829 RrIowa_0830     FALSE 0.061 385.000 0.000 1.000 N NA
 3777087 3777088 RrIowa_0830 RrIowa_0831   sppA.2 TRUE 0.667 126.000 0.005 1.000 N NA
 3777088 3777089 RrIowa_0831 RrIowa_0832 sppA.2   TRUE 0.985 3.000 0.142 1.000 N NA
 3777089 3777090 RrIowa_0832 RrIowa_0833     TRUE 0.917 7.000 0.006 NA   NA
 3777090 3777091 RrIowa_0833 RrIowa_0834     FALSE 0.333 68.000 0.000 NA   NA
 3777091 3777092 RrIowa_0834 RrIowa_0835     TRUE 0.616 173.000 0.000 NA   NA
 3777092 3777093 RrIowa_0835 RrIowa_0836     TRUE 0.935 3.000 0.007 NA   NA
 3777094 3777095 RrIowa_0837 RrIowa_0838     TRUE 0.884 -19.000 0.000 NA   NA
 3777096 3777097 RrIowa_0839 RrIowa_0840     FALSE 0.448 203.000 0.000 NA   NA
 3777098 3777099 RrIowa_0841 RrIowa_0842     FALSE 0.354 60.000 0.000 NA   NA
 3777100 3777101 RrIowa_0843 RrIowa_0844     FALSE 0.424 53.000 0.000 NA N NA
 3777102 3777103 RrIowa_0845 RrIowa_0846     TRUE 0.780 18.000 0.000 NA   NA
 3777105 3777106 RrIowa_0848 RrIowa_0849     FALSE 0.399 49.000 0.000 NA   NA
 3777106 3777107 RrIowa_0849 RrIowa_0850     TRUE 0.963 -7.000 0.036 NA   NA
 3777107 3777108 RrIowa_0850 RrIowa_0851     TRUE 0.954 -16.000 0.045 NA   NA
 3777108 3777109 RrIowa_0851 RrIowa_0852     TRUE 0.949 -22.000 0.026 1.000   NA
 3777109 3777110 RrIowa_0852 RrIowa_0853     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 3777110 3777111 RrIowa_0853 RrIowa_0854   ampG.2 FALSE 0.021 465.000 0.000 NA   NA
 3777111 3777112 RrIowa_0854 RrIowa_0855 ampG.2   TRUE 0.636 166.000 0.000 NA   NA
 3777113 3777114 RrIowa_0856 RrIowa_0857     FALSE 0.141 283.000 0.000 1.000   NA
 3777114 3777115 RrIowa_0857 RrIowa_0858     TRUE 0.943 172.000 0.778 NA   NA
 3777115 3777116 RrIowa_0858 RrIowa_0859     TRUE 0.934 -13.000 0.014 NA   NA
 3777116 3777117 RrIowa_0859 RrIowa_0860     TRUE 0.904 7.000 0.000 NA   NA
 3777118 3777119 RrIowa_0861 RrIowa_0862     TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 3777119 3777120 RrIowa_0862 RrIowa_0863     FALSE 0.402 48.000 0.000 NA   NA
 3777120 3777121 RrIowa_0863 RrIowa_0864     TRUE 0.928 142.000 0.136 1.000 Y NA
 3777123 3777124 RrIowa_0866 RrIowa_0867   iscU TRUE 0.970 4.000 0.056 NA   NA
 3777124 3777125 RrIowa_0867 RrIowa_0868 iscU   TRUE 0.939 152.000 0.448 1.000 N NA
 3777125 3777126 RrIowa_0868 RrIowa_0869     TRUE 0.890 103.000 0.052 0.002 Y NA
 3777126 3777127 RrIowa_0869 RrIowa_0870     TRUE 0.986 -3.000 0.168 1.000 N NA
 3777127 3777128 RrIowa_0870 RrIowa_0871     FALSE 0.024 456.000 0.000 NA   NA
 3777128 10746798 RrIowa_0871 RrIowa_0872     FALSE 0.360 58.000 0.000 NA   NA
 10746798 3777129 RrIowa_0872 RrIowa_0874     FALSE 0.121 280.000 0.000 NA   NA
 3777129 3777130 RrIowa_0874 RrIowa_0875     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 3777130 3777131 RrIowa_0875 RrIowa_0876     TRUE 0.544 127.000 0.000 NA   NA
 3777132 3777133 RrIowa_0877 RrIowa_0878     FALSE 0.053 346.000 0.000 NA   NA
 3777133 3777134 RrIowa_0878 RrIowa_0879     TRUE 0.501 195.000 0.000 NA   NA
 3777134 10746799 RrIowa_0879 RrIowa_0880     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3777135 3777136 RrIowa_0882 RrIowa_0883     FALSE 0.121 280.000 0.000 NA   NA
 3777136 3777137 RrIowa_0883 RrIowa_0884     FALSE 0.034 405.000 0.000 NA   NA
 3777137 3777138 RrIowa_0884 RrIowa_0885   clpP TRUE 0.646 163.000 0.000 NA   NA
 3777138 3777139 RrIowa_0885 RrIowa_0886 clpP   TRUE 0.670 115.000 0.009 1.000 N NA
 3777139 3777140 RrIowa_0886 RrIowa_0887     TRUE 0.539 267.000 0.281 1.000 N NA
 3777140 3777141 RrIowa_0887 RrIowa_0888     TRUE 0.597 122.000 0.000 1.000   NA
 3777142 3777143 RrIowa_0889 RrIowa_0890     TRUE 0.557 129.000 0.000 NA   NA
 3777143 3777144 RrIowa_0890 RrIowa_0891     FALSE 0.136 274.000 0.000 NA   NA
 3777144 3777145 RrIowa_0891 RrIowa_0892     FALSE 0.009 882.000 0.000 NA   NA
 3777145 3777146 RrIowa_0892 RrIowa_0893     FALSE 0.348 76.000 0.000 NA   NA
 3777146 3777147 RrIowa_0893 RrIowa_0894     TRUE 0.565 130.000 0.000 NA   NA
 3777148 3777149 RrIowa_0895 RrIowa_0896     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 3777151 3777152 RrIowa_0898 RrIowa_0899     TRUE 0.942 -3.000 0.003 NA N NA
 3777152 3777153 RrIowa_0899 RrIowa_0900   resE.1 TRUE 0.646 163.000 0.000 NA   NA
 3777153 3777154 RrIowa_0900 RrIowa_0901 resE.1 resE.2 FALSE 0.376 54.000 0.000 NA   NA
 3777154 10746800 RrIowa_0901 RrIowa_0902 resE.2   TRUE 0.577 132.000 0.000 NA   NA
 10746800 3777155 RrIowa_0902 RrIowa_0904     FALSE 0.015 533.000 0.000 NA   NA
 3777155 3777156 RrIowa_0904 RrIowa_0905     TRUE 0.780 18.000 0.000 NA   NA
 3777156 3777157 RrIowa_0905 RrIowa_0906     FALSE 0.083 306.000 0.000 NA   NA
 3777158 3777159 RrIowa_0907 RrIowa_0908     TRUE 0.925 10.000 0.015 NA   NA
 3777160 3777161 RrIowa_0909 RrIowa_0910     FALSE 0.425 97.000 0.000 NA   NA
 3777163 3777164 RrIowa_0912 RrIowa_0913   bioC TRUE 0.770 153.000 0.012 1.000   NA
 3777164 3777165 RrIowa_0913 RrIowa_0914 bioC   FALSE 0.381 71.000 0.008 NA   NA
 3777165 3777166 RrIowa_0914 RrIowa_0915     FALSE 0.425 97.000 0.000 NA   NA
 3777166 3777167 RrIowa_0915 RrIowa_0916     FALSE 0.067 322.000 0.000 NA   NA
 3777167 3777168 RrIowa_0916 RrIowa_0917     TRUE 0.884 -19.000 0.000 NA   NA
 3777168 3777169 RrIowa_0917 RrIowa_0918     FALSE 0.080 307.000 0.000 NA   NA
 3777169 3777170 RrIowa_0918 RrIowa_0919     TRUE 0.976 5.000 0.146 NA   NA
 3777170 3777171 RrIowa_0919 RrIowa_0920     FALSE 0.456 102.000 0.000 NA   NA
 3777171 3777172 RrIowa_0920 RrIowa_0921     TRUE 0.819 16.000 0.000 NA   NA
 3777172 3777173 RrIowa_0921 RrIowa_0922     FALSE 0.194 246.000 0.000 NA   NA
 3777174 3777175 RrIowa_0923 RrIowa_0924     TRUE 0.535 81.000 0.024 NA   NA
 3777175 3777176 RrIowa_0924 RrIowa_0925     TRUE 0.941 -3.000 0.008 NA   NA
 3777176 3777177 RrIowa_0925 RrIowa_0926     FALSE 0.188 250.000 0.000 NA   NA
 3777179 3777180 RrIowa_0928 RrIowa_0929     TRUE 0.557 129.000 0.000 NA   NA
 3777180 3777181 RrIowa_0929 RrIowa_0930     FALSE 0.458 202.000 0.000 NA   NA
 3777182 3777183 RrIowa_0931 RrIowa_0932     TRUE 0.884 -19.000 0.000 NA   NA
 3777183 3777184 RrIowa_0932 RrIowa_0933   mazG TRUE 0.902 -13.000 0.000 NA   NA
 3777184 3777185 RrIowa_0933 RrIowa_0934 mazG   TRUE 0.650 130.000 0.003 1.000   NA
 3777186 3777187 RrIowa_0935 RrIowa_0936     FALSE 0.397 90.000 0.000 NA   NA
 3777187 3777188 RrIowa_0936 RrIowa_0937     FALSE 0.168 258.000 0.000 NA   NA
 3777188 3777189 RrIowa_0937 RrIowa_0938     FALSE 0.376 54.000 0.000 NA   NA
 10746801 3777190 RrIowa_0939 RrIowa_0941     FALSE 0.014 553.000 0.000 NA   NA
 3777190 3777191 RrIowa_0941 RrIowa_0942     TRUE 0.605 175.000 0.000 NA   NA
 3777193 3777194 RrIowa_0944 RrIowa_0945     FALSE 0.466 65.000 0.017 NA   NA
 3777194 3777195 RrIowa_0945 RrIowa_0946     FALSE 0.221 240.000 0.000 NA   NA
 3777196 3777197 RrIowa_0947 RrIowa_0948     TRUE 0.481 198.000 0.000 NA   NA
 3777202 10746802 RrIowa_0953 RrIowa_0954     TRUE 0.636 150.000 0.000 NA   NA
 10746802 3777203 RrIowa_0954 RrIowa_0957     FALSE 0.445 100.000 0.000 NA   NA
 3777204 3777205 RrIowa_0958 RrIowa_0959     TRUE 0.602 47.000 0.034 NA   NA
 3777205 3777206 RrIowa_0959 RrIowa_0960     TRUE 0.949 5.000 0.017 NA   NA
 3777206 3777207 RrIowa_0960 RrIowa_0961   radA TRUE 0.746 146.000 0.005 1.000 N NA
 3777207 3777208 RrIowa_0961 RrIowa_0962 radA   TRUE 0.938 -3.000 0.007 NA   NA
 3777208 3777209 RrIowa_0962 RrIowa_0963   recO TRUE 0.581 122.000 0.008 NA   NA
 3777209 3777210 RrIowa_0963 RrIowa_0964 recO   TRUE 0.641 152.000 0.000 NA   NA
 3777210 3777211 RrIowa_0964 RrIowa_0965     FALSE 0.353 217.000 0.000 NA   NA
 3777212 3777213 RrIowa_0966 RrIowa_0967     FALSE 0.043 367.000 0.000 NA   NA
 3777213 3777214 RrIowa_0967 RrIowa_0968     TRUE 0.702 239.000 0.342 1.000 N NA
 3777214 3777215 RrIowa_0968 RrIowa_0969     TRUE 0.986 11.000 0.759 NA   NA
 3777215 3777216 RrIowa_0969 RrIowa_0970     TRUE 0.610 174.000 0.000 NA   NA
 3777220 3777221 RrIowa_0974 RrIowa_0975     TRUE 0.893 159.000 0.008 0.024 Y NA
 3777221 3777222 RrIowa_0975 RrIowa_0976     TRUE 0.927 4.000 0.004 NA   NA
 3777222 3777223 RrIowa_0976 RrIowa_0977     TRUE 0.984 5.000 0.400 NA   NA
 3777224 3777225 RrIowa_0978 RrIowa_0979     FALSE 0.007 1299.000 0.000 NA   NA
 3777226 3777227 RrIowa_0980 RrIowa_0981     FALSE 0.432 205.000 0.000 NA   NA
 3777227 3777228 RrIowa_0981 RrIowa_0982     FALSE 0.332 74.000 0.000 NA   NA
 3777228 3777229 RrIowa_0982 RrIowa_0984     FALSE 0.105 284.000 0.000 NA   NA
 10746803 3777231 RrIowa_0985 RrIowa_0987     FALSE 0.340 75.000 0.000 NA   NA
 3777231 3777232 RrIowa_0987 RrIowa_0988     FALSE 0.113 282.000 0.000 NA   NA
 3777232 3777233 RrIowa_0988 RrIowa_0989     TRUE 0.869 -52.000 0.000 NA   NA
 3777233 3777234 RrIowa_0989 RrIowa_0990     TRUE 0.909 6.000 0.000 NA   NA
 3777235 3777236 RrIowa_1002 RrIowa_1003     FALSE 0.173 257.000 0.000 NA   NA
 3777236 3777237 RrIowa_1003 RrIowa_1004     FALSE 0.041 375.000 0.000 NA   NA
 3777237 3777238 RrIowa_1004 RrIowa_1005     TRUE 0.670 24.000 0.000 NA   NA
 3777238 3777239 RrIowa_1005 RrIowa_1006     FALSE 0.158 262.000 0.000 NA   NA
 3777239 3777240 RrIowa_1006 RrIowa_1007     TRUE 0.909 190.000 0.667 NA   NA
 3777240 3777241 RrIowa_1007 RrIowa_1008     TRUE 0.592 178.000 0.000 NA   NA
 3777241 3777242 RrIowa_1008 RrIowa_1009     TRUE 0.866 143.000 0.057 1.000 N NA
 3777243 3777244 RrIowa_1010 RrIowa_1011 ntrX   TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 3777244 3777245 RrIowa_1011 RrIowa_1012     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 3777246 3777247 RrIowa_1013 RrIowa_1014     FALSE 0.012 679.000 0.000 NA   NA
 3777247 3777248 RrIowa_1014 RrIowa_1015     TRUE 0.972 -10.000 0.091 NA   NA
 3777248 3777249 RrIowa_1015 RrIowa_1016     FALSE 0.188 250.000 0.000 NA   NA
 3777249 3777250 RrIowa_1016 RrIowa_1017   ftsI FALSE 0.266 231.000 0.000 NA   NA
 3777250 3777251 RrIowa_1017 RrIowa_1018 ftsI   FALSE 0.446 43.000 0.000 NA   NA
 3777251 3777252 RrIowa_1018 RrIowa_1019     TRUE 0.571 131.000 0.000 NA   NA
 3777252 3777253 RrIowa_1019 RrIowa_1020   mraW TRUE 0.969 7.000 0.089 NA   NA
 3777253 3777254 RrIowa_1020 RrIowa_1021 mraW mraZ TRUE 0.991 0.000 0.635 NA   NA
 3777255 3777256 RrIowa_1022 RrIowa_1023     FALSE 0.097 290.000 0.000 NA   NA
 3777256 3777257 RrIowa_1023 RrIowa_1024     TRUE 0.920 4.000 0.000 NA   NA
 3777257 3777258 RrIowa_1024 RrIowa_1025     FALSE 0.283 225.000 0.000 NA   NA
 3777259 3777260 RrIowa_1026 RrIowa_1027     TRUE 0.671 165.000 0.006 NA   NA
 3777260 3777261 RrIowa_1027 RrIowa_1028     TRUE 0.606 54.000 0.048 NA   NA
 3777261 10746805 RrIowa_1028 RrIowa_1029     FALSE 0.266 231.000 0.000 NA   NA
 10746805 3777262 RrIowa_1029 RrIowa_1032     FALSE 0.024 455.000 0.000 NA   NA
 3777263 3777264 RrIowa_1033 RrIowa_1034     FALSE 0.390 51.000 0.000 NA   NA
 3777264 3777265 RrIowa_1034 RrIowa_1035     TRUE 0.603 136.000 0.000 NA   NA
 3777266 3777267 RrIowa_1036 RrIowa_1037     TRUE 0.893 -16.000 0.000 NA   NA
 3777267 3777268 RrIowa_1037 RrIowa_1038     TRUE 0.870 -45.000 0.000 NA   NA
 3777268 3777269 RrIowa_1038 RrIowa_1039     FALSE 0.390 51.000 0.000 NA   NA
 3777269 3777270 RrIowa_1039 RrIowa_1040     FALSE 0.352 77.000 0.000 NA   NA
 3777270 3777271 RrIowa_1040 RrIowa_1041     FALSE 0.016 510.000 0.000 NA   NA
 3777271 3777272 RrIowa_1041 RrIowa_1042     TRUE 0.503 37.000 0.000 NA   NA
 3777272 3777273 RrIowa_1042 RrIowa_1043     FALSE 0.052 348.000 0.000 NA   NA
 3777273 3777274 RrIowa_1043 RrIowa_1044     FALSE 0.009 812.000 0.000 NA   NA
 3777274 3777275 RrIowa_1044 RrIowa_1045   secA TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 3777275 3777276 RrIowa_1045 RrIowa_1046 secA   FALSE 0.366 82.000 0.000 NA   NA
 3777278 3777279 RrIowa_1048 RrIowa_1049     TRUE 0.962 1.000 0.009 1.000 N NA
 3777279 3777280 RrIowa_1049 RrIowa_1050     TRUE 0.732 179.000 0.008 1.000 N NA
 3777280 3777281 RrIowa_1050 RrIowa_1051     TRUE 0.534 92.000 0.004 1.000 N NA
 3777282 3777283 RrIowa_1052 RrIowa_1053     TRUE 0.646 154.000 0.000 NA   NA
 3777283 3777284 RrIowa_1053 RrIowa_1054   mgtE FALSE 0.149 265.000 0.000 NA   NA
 3777287 10746806 RrIowa_1057 RrIowa_1058     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 3777290 3777291 RrIowa_1062 RrIowa_1063   yajC TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 3777291 3777292 RrIowa_1063 RrIowa_1064 yajC secD TRUE 0.957 -16.000 0.009 NA Y NA
 3777292 3777293 RrIowa_1064 RrIowa_1065 secD   TRUE 0.592 245.000 0.263 1.000   NA
 3777293 3777294 RrIowa_1065 RrIowa_1066     TRUE 0.654 102.000 0.018 1.000   NA
 3777294 3777295 RrIowa_1066 RrIowa_1067     TRUE 0.723 126.000 0.013 1.000 N NA
 3777295 3777296 RrIowa_1067 RrIowa_1068   mviN TRUE 0.492 211.000 0.006 1.000   NA
 3777296 3777297 RrIowa_1068 RrIowa_1069 mviN   TRUE 0.917 -19.000 0.012 NA   NA
 3777297 3777298 RrIowa_1069 RrIowa_1070     TRUE 0.777 71.000 0.500 NA   NA
 3777299 10746807 RrIowa_1071 RrIowa_1072 recG   FALSE 0.432 205.000 0.000 NA   NA
 3777300 3777301 RrIowa_1075 RrIowa_1076     FALSE 0.465 103.000 0.000 NA   NA
 3777301 3777302 RrIowa_1076 RrIowa_1077     TRUE 0.980 4.000 0.000 0.002 Y NA
 3777302 3777303 RrIowa_1077 RrIowa_1078     TRUE 0.569 82.000 0.036 NA   NA
 3777303 3777304 RrIowa_1078 RrIowa_1079     TRUE 0.698 37.000 0.036 NA   NA
 3777305 3777306 RrIowa_1080 RrIowa_1081 rickA   TRUE 0.537 119.000 0.003 NA   NA
 3777306 3777307 RrIowa_1081 RrIowa_1082     TRUE 0.900 185.000 0.037 0.007 Y NA
 3777307 3777308 RrIowa_1082 RrIowa_1084     TRUE 0.859 208.000 0.051 0.005 Y NA
 3777310 3777311 RrIowa_1085 RrIowa_1086     TRUE 0.955 12.000 0.078 NA   NA
 3777312 3777313 RrIowa_1087 RrIowa_1088   dnaA TRUE 0.950 1.000 0.008 NA N NA
 3777313 3777314 RrIowa_1088 RrIowa_1089 dnaA   FALSE 0.014 546.000 0.000 NA   NA
 3777315 3777316 RrIowa_1090 RrIowa_1091     FALSE 0.058 339.000 0.000 NA   NA
 3777316 3777317 RrIowa_1091 RrIowa_1092     FALSE 0.044 365.000 0.000 NA   NA
 3777317 3777318 RrIowa_1092 RrIowa_1093     FALSE 0.381 85.000 0.000 NA   NA
 3777318 3777319 RrIowa_1093 RrIowa_1094     TRUE 0.602 29.000 0.000 NA   NA
 3777321 10746808 RrIowa_1096 RrIowa_1097     FALSE 0.151 264.000 0.000 NA   NA
 10746808 3777322 RrIowa_1097 RrIowa_1100     TRUE 0.628 147.000 0.000 NA   NA
 3777322 3777323 RrIowa_1100 RrIowa_1101     FALSE 0.363 57.000 0.000 NA   NA
 3777323 3777324 RrIowa_1101 RrIowa_1102     FALSE 0.259 233.000 0.000 NA   NA
 3777324 3777325 RrIowa_1102 RrIowa_1103     FALSE 0.341 70.000 0.002 NA   NA
 3777325 10746809 RrIowa_1103 RrIowa_1104     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 10746809 3777326 RrIowa_1104 RrIowa_1106     FALSE 0.432 205.000 0.000 NA   NA
 3777326 3777327 RrIowa_1106 RrIowa_1107     TRUE 0.540 325.000 0.496 0.050 Y NA
 3777327 3777328 RrIowa_1107 RrIowa_1108   queE FALSE 0.017 751.000 0.002 1.000 N NA
 3777329 3777330 RrIowa_1109 RrIowa_1110     TRUE 0.989 20.000 0.928 0.031 Y NA
 3777330 3777331 RrIowa_1110 RrIowa_1111     TRUE 0.582 83.000 0.007 0.031   NA
 3777331 3777332 RrIowa_1111 RrIowa_1112     TRUE 0.981 20.000 0.787 0.002   NA
 3777333 3777334 RrIowa_1113 RrIowa_1114     FALSE 0.037 394.000 0.000 NA   NA
 3777334 3777335 RrIowa_1114 RrIowa_1115     FALSE 0.013 656.000 0.000 NA   NA
 3777335 3777336 RrIowa_1115 RrIowa_1116     FALSE 0.322 220.000 0.000 NA   NA
 3777336 3777337 RrIowa_1116 RrIowa_1117   corA FALSE 0.337 218.000 0.000 NA   NA
 3777337 3777338 RrIowa_1117 RrIowa_1118 corA   FALSE 0.011 747.000 0.000 NA   NA
 3777338 3777339 RrIowa_1118 RrIowa_1119     FALSE 0.009 877.000 0.000 NA   NA
 10746810 3777341 RrIowa_1121 RrIowa_1124   ntrY FALSE 0.407 93.000 0.000 NA   NA
 3777341 3777342 RrIowa_1124 RrIowa_1125 ntrY   TRUE 0.780 18.000 0.000 NA   NA
 3777342 3777343 RrIowa_1125 RrIowa_1126     FALSE 0.201 244.000 0.000 NA   NA
 3777344 3777345 RrIowa_1127 RrIowa_1128     TRUE 0.885 10.000 0.000 NA   NA
 3777345 3777346 RrIowa_1128 RrIowa_1129     FALSE 0.030 425.000 0.000 NA   NA
 3777346 3777347 RrIowa_1129 RrIowa_1130     FALSE 0.046 489.000 0.000 0.002   NA
 3777347 3777348 RrIowa_1130 RrIowa_1131     FALSE 0.023 460.000 0.000 NA   NA
 3777348 3777349 RrIowa_1131 RrIowa_1132     TRUE 0.627 171.000 0.000 NA   NA
 3777349 3777350 RrIowa_1132 RrIowa_1133     FALSE 0.012 710.000 0.000 NA   NA
 3777351 3777352 RrIowa_1134 RrIowa_1135     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 3777352 3777353 RrIowa_1135 RrIowa_1136     TRUE 0.907 98.000 0.157 0.002 Y NA
 3777354 3777355 RrIowa_1137 RrIowa_1138     FALSE 0.417 207.000 0.000 NA   NA
 3777357 3777358 RrIowa_1140 RrIowa_1141     FALSE 0.162 299.000 0.008 1.000 N NA
 3777358 3777359 RrIowa_1141 RrIowa_1142     TRUE 0.946 -3.000 0.010 NA   NA
 3777360 3777361 RrIowa_1143 RrIowa_1144     FALSE 0.007 1276.000 0.000 NA   NA
 3777361 3777362 RrIowa_1144 RrIowa_1145     TRUE 0.930 28.000 0.050 0.008 Y NA
 3777362 10746811 RrIowa_1145 RrIowa_1146     FALSE 0.381 85.000 0.000 NA   NA
 10746811 3777363 RrIowa_1146 RrIowa_1150     FALSE 0.340 75.000 0.000 NA   NA
 3777363 10746812 RrIowa_1150 RrIowa_1151     FALSE 0.332 74.000 0.000 NA   NA
 10746812 3777364 RrIowa_1151 RrIowa_1155     FALSE 0.007 1295.000 0.000 NA   NA
 3777365 3777366 RrIowa_1156 RrIowa_1157 grpE   TRUE 0.703 118.000 0.034 NA   NA
 3777366 3777367 RrIowa_1157 RrIowa_1158     TRUE 0.963 16.000 0.362 NA   NA
 3777367 3777368 RrIowa_1158 RrIowa_1159     TRUE 0.584 180.000 0.000 NA   NA
 3777368 3777369 RrIowa_1159 RrIowa_1160     TRUE 0.591 134.000 0.000 NA   NA
 3777369 10746813 RrIowa_1160 RrIowa_1161     FALSE 0.328 71.000 0.000 NA   NA
 3777371 3777372 RrIowa_1164 RrIowa_1165     TRUE 0.648 161.000 0.000 NA   NA
 3777372 10746814 RrIowa_1165 RrIowa_1166     FALSE 0.008 1125.000 0.000 NA   NA
 3777373 3777374 RrIowa_1168 RrIowa_1169     TRUE 0.730 20.000 0.000 NA   NA
 3777374 3777375 RrIowa_1169 RrIowa_1170     FALSE 0.008 983.000 0.000 NA   NA
 3777375 3777376 RrIowa_1170 RrIowa_1171     FALSE 0.425 97.000 0.000 NA   NA
 3777376 3777377 RrIowa_1171 RrIowa_1172     TRUE 0.952 16.000 0.008 0.030 Y NA
 3777377 3777378 RrIowa_1172 RrIowa_1173     TRUE 0.991 11.000 0.873 1.000 N NA
 3777378 3777379 RrIowa_1173 RrIowa_1174     TRUE 0.957 19.000 0.308 1.000 N NA
 3777379 3777380 RrIowa_1174 RrIowa_1175     TRUE 0.981 25.000 0.810 0.030 Y NA
 3777380 3777381 RrIowa_1175 RrIowa_1176     TRUE 0.583 59.000 0.017 1.000 N NA
 3777381 3777382 RrIowa_1176 RrIowa_1177   secY.2 TRUE 0.966 16.000 0.241 1.000 N NA
 3777382 3777383 RrIowa_1177 RrIowa_1178 secY.2   TRUE 0.993 4.000 0.730 1.000 N NA
 3777383 3777384 RrIowa_1178 RrIowa_1179     TRUE 0.993 14.000 0.653 0.005 Y NA
 3777384 3777385 RrIowa_1179 RrIowa_1180     TRUE 0.982 24.000 0.789 0.041 Y NA
 3777385 3777386 RrIowa_1180 RrIowa_1181     TRUE 0.990 18.000 0.814 0.041 Y NA
 3777386 3777387 RrIowa_1181 RrIowa_1182     TRUE 0.992 16.000 0.815 0.030 Y NA
 3777387 3777388 RrIowa_1182 RrIowa_1183     TRUE 0.996 9.000 0.808 0.030 Y NA
 3777388 3777389 RrIowa_1183 RrIowa_1184     TRUE 0.974 20.000 0.295 0.030 Y NA
 3777389 3777390 RrIowa_1184 RrIowa_1185     TRUE 0.981 18.000 0.309 0.030 Y NA
 3777390 3777391 RrIowa_1185 RrIowa_1186     TRUE 0.991 0.000 0.057 0.030 Y NA
 3777391 3777392 RrIowa_1186 RrIowa_1187     TRUE 0.991 1.000 0.071 0.041 Y NA
 3777392 3777393 RrIowa_1187 RrIowa_1188     TRUE 0.932 75.000 0.791 0.041 Y NA
 3777393 3777394 RrIowa_1188 RrIowa_1189     TRUE 0.996 -13.000 0.828 0.030 Y NA
 3777394 3777395 RrIowa_1189 RrIowa_1190     TRUE 0.997 -7.000 0.802 0.030 Y NA
 3777395 3777396 RrIowa_1190 RrIowa_1191     TRUE 0.993 15.000 0.828 0.041 Y NA
 3777396 3777397 RrIowa_1191 RrIowa_1192     TRUE 0.992 2.000 0.109 0.041 Y NA
 3777397 3777398 RrIowa_1192 RrIowa_1193     TRUE 0.988 9.000 0.119 0.041 Y NA
 3777398 3777399 RrIowa_1193 RrIowa_1194     TRUE 0.981 25.000 0.820 0.041 Y NA
 3777399 3777400 RrIowa_1194 RrIowa_1195     TRUE 0.997 1.000 0.849 1.000 Y NA
 3777400 3777401 RrIowa_1195 RrIowa_1196     TRUE 0.995 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3777401 3777402 RrIowa_1196 RrIowa_1197     TRUE 0.947 111.000 0.486 0.030 Y NA
 3777402 3777403 RrIowa_1197 RrIowa_1198     TRUE 0.994 1.000 0.307 0.041 Y NA
 3777403 3777404 RrIowa_1198 RrIowa_1199     TRUE 0.748 241.000 0.318 1.000 Y NA
 3777404 3777405 RrIowa_1199 RrIowa_1200     FALSE 0.391 88.000 0.000 NA   NA
 3777405 3777406 RrIowa_1200 RrIowa_1201     TRUE 0.603 136.000 0.000 NA   NA
 3777407 3777408 RrIowa_1202 RrIowa_1203     TRUE 0.509 111.000 0.002 NA   NA
 3777408 3777409 RrIowa_1203 RrIowa_1204     TRUE 0.939 -3.000 0.007 NA   NA
 3777409 3777410 RrIowa_1204 RrIowa_1205     TRUE 0.513 97.000 0.007 NA N NA
 3777410 3777411 RrIowa_1205 RrIowa_1206     TRUE 0.902 -13.000 0.000 NA   NA
 3777411 3777412 RrIowa_1206 RrIowa_1207   ftsZ FALSE 0.060 341.000 0.002 NA   NA
 3777412 3777413 RrIowa_1207 RrIowa_1208 ftsZ   FALSE 0.019 502.000 0.002 NA   NA
 3777413 3777414 RrIowa_1208 RrIowa_1209     TRUE 0.759 180.000 0.034 NA   NA
 3777415 3777416 RrIowa_1210 RrIowa_1211   ampG.3 FALSE 0.072 348.000 0.011 NA   NA
 3777416 3777417 RrIowa_1211 RrIowa_1212 ampG.3   TRUE 0.510 116.000 0.000 NA   NA
 3777417 3777418 RrIowa_1212 RrIowa_1213     FALSE 0.044 503.000 0.000 1.000 Y NA
 3777420 3777421 RrIowa_1215 RrIowa_1216     TRUE 0.893 -16.000 0.000 NA   NA
 3777421 3777422 RrIowa_1216 RrIowa_1217     TRUE 0.600 111.000 0.006 1.000   NA
 3777422 3777423 RrIowa_1217 RrIowa_1218     TRUE 0.854 152.000 0.051 1.000   NA
 3777424 10746815 RrIowa_1219 RrIowa_1220     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA   NA
 10746815 3777425 RrIowa_1220 RrIowa_1222     FALSE 0.448 203.000 0.000 NA   NA
 3777425 3777426 RrIowa_1222 RrIowa_1223     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3777429 10746816 RrIowa_1226 RrIowa_1227     FALSE 0.094 298.000 0.000 NA   NA
 10746816 3777430 RrIowa_1227 RrIowa_1231     FALSE 0.389 87.000 0.000 NA   NA
 3777430 3777431 RrIowa_1231 RrIowa_1232     TRUE 0.540 186.000 0.000 NA   NA
 3777431 3777432 RrIowa_1232 RrIowa_1233   ubiB TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3777432 3777433 RrIowa_1233 RrIowa_1234 ubiB   TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3777433 3777434 RrIowa_1234 RrIowa_1235   ubiE TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 3777435 3777436 RrIowa_1236 RrIowa_1237     TRUE 0.489 50.000 0.004 1.000   NA
 3777436 10746817 RrIowa_1237 RrIowa_1238     TRUE 0.888 -18.000 0.000 NA   NA
 10746817 3777437 RrIowa_1238 RrIowa_1240     FALSE 0.329 70.000 0.000 NA   NA
 3777437 3777438 RrIowa_1240 RrIowa_1241     FALSE 0.023 460.000 0.000 NA   NA
 10746818 3777439 RrIowa_1242 RrIowa_1244     TRUE 0.591 134.000 0.000 NA   NA
 3777439 3777440 RrIowa_1244 RrIowa_1245     FALSE 0.072 315.000 0.000 NA   NA
 3777440 3777441 RrIowa_1245 RrIowa_1246     FALSE 0.041 374.000 0.000 NA   NA
 3777441 3777442 RrIowa_1246 RrIowa_1247     TRUE 0.754 53.000 0.221 NA N NA
 3777442 3777443 RrIowa_1247 RrIowa_1248     TRUE 0.970 -3.000 0.008 0.091 N NA
 10746819 3777446 RrIowa_1251 RrIowa_1254     TRUE 0.526 122.000 0.000 NA   NA
 3777446 3777447 RrIowa_1254 RrIowa_1255     TRUE 0.694 152.000 0.002 NA N NA
 3777447 3777448 RrIowa_1255 RrIowa_1256     TRUE 0.891 66.000 0.750 NA Y NA
 3777449 3777450 RrIowa_1259 RrIowa_1260     FALSE 0.280 236.000 0.006 NA   NA
 3777450 3777451 RrIowa_1260 RrIowa_1261     FALSE 0.010 769.000 0.000 NA   NA
 3777452 10746821 RrIowa_1262 RrIowa_1263     FALSE 0.469 41.000 0.000 NA   NA
 3777453 3777454 RrIowa_1267 RrIowa_1268     FALSE 0.070 319.000 0.000 NA   NA
 3777454 3777455 RrIowa_1268 RrIowa_1269     FALSE 0.351 61.000 0.000 NA   NA
 3777455 3777456 RrIowa_1269 RrIowa_1270     FALSE 0.432 44.000 0.000 NA   NA
 3777456 3777457 RrIowa_1270 RrIowa_1271     TRUE 0.927 -3.000 0.000 NA   NA
 3777458 3777459 RrIowa_1272 RrIowa_1273     TRUE 0.643 37.000 0.006 1.000 N NA
 3777459 3777460 RrIowa_1273 RrIowa_1274   queC TRUE 0.673 164.000 0.005 NA   NA
 3777460 3777461 RrIowa_1274 RrIowa_1275 queC   TRUE 0.933 -3.000 0.004 NA   NA
 3777461 3777462 RrIowa_1275 RrIowa_1276     TRUE 0.934 14.000 0.047 NA   NA
 3777463 3777464 RrIowa_1277 RrIowa_1278     FALSE 0.448 203.000 0.000 NA   NA
 3777464 3777465 RrIowa_1278 RrIowa_1279     FALSE 0.088 303.000 0.000 NA   NA
 3777465 3777466 RrIowa_1279 RrIowa_1280     FALSE 0.011 741.000 0.000 NA   NA
 3777466 3777467 RrIowa_1280 RrIowa_1281   lolE TRUE 0.659 74.000 0.020 0.025 N NA
 3777467 3777468 RrIowa_1281 RrIowa_1282 lolE lolD TRUE 0.992 -7.000 0.620 1.000 N NA
 3777470 3777471 RrIowa_1284 RrIowa_1285   corB FALSE 0.427 75.000 0.012 NA   NA
 3777471 3777472 RrIowa_1285 RrIowa_1286 corB   TRUE 0.965 -7.000 0.028 NA N NA
 10746822 3777473 RrIowa_1287 RrIowa_1289     FALSE 0.332 74.000 0.000 NA   NA
 3777473 10746823 RrIowa_1289 RrIowa_1290     TRUE 0.885 10.000 0.000 NA   NA
 10746823 3777474 RrIowa_1290 RrIowa_1292     TRUE 0.580 30.000 0.000 NA   NA
 3777474 10746824 RrIowa_1292 RrIowa_1293     FALSE 0.134 275.000 0.000 NA   NA
 10746824 3777475 RrIowa_1293 RrIowa_1295     FALSE 0.018 493.000 0.000 NA   NA
 3777475 3777476 RrIowa_1295 RrIowa_1296   gidB FALSE 0.050 393.000 0.000 1.000   NA
 3777476 3777477 RrIowa_1296 RrIowa_1297 gidB   FALSE 0.098 314.000 0.000 1.000   NA
 3777477 3777478 RrIowa_1297 RrIowa_1298     TRUE 0.592 38.000 0.005 1.000   NA
 3777478 3777479 RrIowa_1298 RrIowa_1299     TRUE 0.910 189.000 0.535 1.000   NA
 3777479 3777480 RrIowa_1299 RrIowa_1300     TRUE 0.678 147.000 0.008 NA   NA
 3777482 3777483 RrIowa_1302 RrIowa_1303     TRUE 0.974 -25.000 0.044 1.000 Y NA
 3777483 3777484 RrIowa_1303 RrIowa_1304     TRUE 0.971 4.000 0.006 1.000 Y NA
 3777484 3777485 RrIowa_1304 RrIowa_1305     TRUE 0.966 0.000 0.017 1.000   NA
 3777487 3777488 RrIowa_1307 RrIowa_1308     FALSE 0.158 287.000 0.004 1.000 N NA
 10746825 3777490 RrIowa_1310 RrIowa_1312     FALSE 0.047 356.000 0.000 NA   NA
 3777491 3777492 RrIowa_1315 RrIowa_1316     FALSE 0.469 41.000 0.000 NA   NA
 3777492 3777493 RrIowa_1316 RrIowa_1317     TRUE 0.980 9.000 0.400 NA   NA
 3777493 3777494 RrIowa_1317 RrIowa_1318     TRUE 0.568 31.000 0.000 NA   NA
 3777494 3777495 RrIowa_1318 RrIowa_1319   ttg2C TRUE 0.643 164.000 0.000 NA   NA
 3777495 3777496 RrIowa_1319 RrIowa_1320 ttg2C   TRUE 0.911 21.000 0.199 NA   NA
 3777496 3777497 RrIowa_1320 RrIowa_1321     TRUE 0.956 -12.000 0.012 1.000 N NA
 3777497 3777498 RrIowa_1321 RrIowa_1322     TRUE 0.950 0.000 0.012 NA   NA
 3777499 3777500 RrIowa_1323 RrIowa_1324     TRUE 0.933 -6.000 0.006 NA   NA
 3777500 3777501 RrIowa_1324 RrIowa_1325     TRUE 0.979 -12.000 0.092 1.000 N NA
 3777501 3777502 RrIowa_1325 RrIowa_1326     TRUE 0.618 127.000 0.010 NA   NA
 3777502 3777503 RrIowa_1326 RrIowa_1327     TRUE 0.534 56.000 0.023 NA   NA
 3777504 3777505 RrIowa_1328 RrIowa_1329     FALSE 0.027 442.000 0.000 NA   NA
 3777506 3777507 RrIowa_1330 RrIowa_1331     TRUE 0.489 110.000 0.000 NA   NA
 3777507 3777508 RrIowa_1331 RrIowa_1332     TRUE 0.517 36.000 0.000 NA   NA
 3777508 3777509 RrIowa_1332 RrIowa_1333     FALSE 0.402 210.000 0.000 NA   NA
 3777509 3777510 RrIowa_1333 RrIowa_1334     FALSE 0.345 63.000 0.000 NA   NA
 3777510 3777511 RrIowa_1334 RrIowa_1335     FALSE 0.032 417.000 0.000 NA   NA
 10746827 3777512 RrIowa_1336 RrIowa_1339     TRUE 0.885 10.000 0.000 NA   NA
 3777512 3777513 RrIowa_1339 RrIowa_1340     FALSE 0.060 327.000 0.000 NA   NA
 3777513 10746828 RrIowa_1340 RrIowa_1341     TRUE 0.706 21.000 0.000 NA   NA
 10746828 3777514 RrIowa_1341 RrIowa_1343     FALSE 0.342 65.000 0.000 NA   NA
 3777514 3777515 RrIowa_1343 RrIowa_1344     TRUE 0.638 26.000 0.000 NA   NA
 3777515 3777516 RrIowa_1344 RrIowa_1345     FALSE 0.403 92.000 0.000 NA   NA
 3777520 3777521 RrIowa_1349 RrIowa_1350     TRUE 0.947 17.000 0.222 NA   NA
 3777521 3777522 RrIowa_1350 RrIowa_1351     TRUE 0.641 27.000 0.002 NA   NA
 3777522 3777523 RrIowa_1351 RrIowa_1352     FALSE 0.015 541.000 0.000 NA   NA
 3777523 3777524 RrIowa_1352 RrIowa_1353     TRUE 0.958 -7.000 0.009 1.000 N NA
 3777524 3777525 RrIowa_1353 RrIowa_1354     TRUE 0.838 115.000 0.182 1.000   NA
 3777525 3777526 RrIowa_1354 RrIowa_1355     TRUE 0.943 156.000 0.538 1.000   NA
 3777528 3777529 RrIowa_1357 RrIowa_1358     FALSE 0.381 53.000 0.000 NA   NA
 3777529 3777530 RrIowa_1358 RrIowa_1359     TRUE 0.908 -12.000 0.000 NA   NA
 3777530 3777531 RrIowa_1359 RrIowa_1360     TRUE 0.958 152.000 1.000 NA   NA
 3777531 3777532 RrIowa_1360 RrIowa_1361     FALSE 0.357 59.000 0.000 NA   NA
 3777534 3777535 RrIowa_1363 RrIowa_1364     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 3777535 3777536 RrIowa_1364 RrIowa_1365     TRUE 0.634 149.000 0.000 NA   NA
 3777539 3777540 RrIowa_1368 RrIowa_1369     TRUE 0.525 89.000 0.004 1.000 N NA
 3777540 3777541 RrIowa_1369 RrIowa_1370     TRUE 0.979 25.000 0.667 0.028 Y NA
 3777541 3777542 RrIowa_1370 RrIowa_1371     FALSE 0.156 284.000 0.000 1.000 N NA
 3777542 3777543 RrIowa_1371 RrIowa_1372     FALSE 0.141 283.000 0.000 1.000   NA
 3777543 3777544 RrIowa_1372 RrIowa_1373     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 3777544 3777545 RrIowa_1373 RrIowa_1374   romA FALSE 0.381 85.000 0.000 NA   NA
 3777545 3777546 RrIowa_1374 RrIowa_1375 romA   FALSE 0.438 99.000 0.000 NA   NA
 3777546 3777547 RrIowa_1375 RrIowa_1376     FALSE 0.360 80.000 0.000 NA   NA
 3777548 3777549 RrIowa_1377 RrIowa_1378     FALSE 0.354 60.000 0.000 NA   NA
 3777549 3777550 RrIowa_1378 RrIowa_1379     FALSE 0.158 262.000 0.000 NA   NA
 3777550 3777551 RrIowa_1379 RrIowa_1380     TRUE 0.939 3.000 0.008 NA   NA
 3777551 3777552 RrIowa_1380 RrIowa_1381     TRUE 0.968 7.000 0.077 NA   NA
 3777552 3777553 RrIowa_1381 RrIowa_1382     TRUE 0.977 4.000 0.115 NA   NA
 3777554 3777555 RrIowa_1383 RrIowa_1384     FALSE 0.038 393.000 0.000 NA   NA
 3777556 3777557 RrIowa_1385 RrIowa_1386     TRUE 0.849 14.000 0.000 NA   NA
 3777557 3777558 RrIowa_1386 RrIowa_1387     FALSE 0.394 89.000 0.000 NA   NA
 3777558 3777559 RrIowa_1387 RrIowa_1388     FALSE 0.340 75.000 0.000 NA   NA
 3777559 3777560 RrIowa_1388 RrIowa_1389     TRUE 0.868 -70.000 0.000 NA   NA
 3777561 3777562 RrIowa_1390 RrIowa_1391   recA TRUE 0.489 110.000 0.000 NA   NA
 3777562 3777563 RrIowa_1391 RrIowa_1392 recA   TRUE 0.956 -7.000 0.008 1.000 N NA
 3777563 3777564 RrIowa_1392 RrIowa_1393     TRUE 0.968 164.000 0.321 0.004 Y NA
 3777564 3777565 RrIowa_1393 RrIowa_1394     TRUE 0.895 34.000 0.106 1.000 Y NA
 3777565 3777566 RrIowa_1394 RrIowa_1395     FALSE 0.193 282.000 0.000 0.086   NA
 3777566 3777567 RrIowa_1395 RrIowa_1396     FALSE 0.378 68.000 0.007 NA   NA
 3777567 3777568 RrIowa_1396 RrIowa_1397     TRUE 0.780 18.000 0.000 NA   NA
 3777569 3777570 RrIowa_1398 RrIowa_1399     FALSE 0.329 70.000 0.000 NA   NA
 3777570 3777571 RrIowa_1399 RrIowa_1400     TRUE 0.724 141.000 0.008 1.000   NA
 3777571 3777572 RrIowa_1400 RrIowa_1401   mreC FALSE 0.065 352.000 0.000 1.000   NA
 3777572 3777573 RrIowa_1401 RrIowa_1402 mreC mreB TRUE 0.993 3.000 0.689 1.000 N NA
 3777573 3777574 RrIowa_1402 RrIowa_1403 mreB   TRUE 0.483 211.000 0.005 1.000   NA
 3777574 3777575 RrIowa_1403 RrIowa_1404     FALSE 0.456 42.000 0.000 NA   NA
 3777575 3777576 RrIowa_1404 RrIowa_1405     FALSE 0.078 311.000 0.000 NA   NA
 3777578 3777579 RrIowa_1407 RrIowa_1408     TRUE 0.953 8.000 0.014 1.000 N NA
 3777580 3777581 RrIowa_1409 RrIowa_1410   ftsY TRUE 0.580 204.000 0.005 1.000 N NA
 3777581 3777582 RrIowa_1410 RrIowa_1411 ftsY   TRUE 0.760 164.000 0.005 1.000 N NA
 3777582 10746829 RrIowa_1411 RrIowa_1412     TRUE 0.601 176.000 0.000 NA   NA
 10746829 3777583 RrIowa_1412 RrIowa_1414     FALSE 0.405 47.000 0.000 NA   NA
 3777583 3777584 RrIowa_1414 RrIowa_1415     TRUE 0.789 184.000 0.008 0.001   NA
 3777584 3777585 RrIowa_1415 RrIowa_1416     FALSE 0.333 68.000 0.000 NA   NA
 3777585 3777586 RrIowa_1416 RrIowa_1417     FALSE 0.347 62.000 0.000 NA   NA
 3777586 3777587 RrIowa_1417 RrIowa_1418     TRUE 0.616 173.000 0.000 NA   NA
 3777588 3777589 RrIowa_1419 RrIowa_1420     TRUE 0.736 136.000 0.007 1.000 N NA
 3777589 3777590 RrIowa_1420 RrIowa_1421     TRUE 0.706 21.000 0.000 NA   NA
 3777591 3777592 RrIowa_1422 RrIowa_1423   ampG.4 TRUE 0.844 27.000 0.079 NA   NA
 3777592 3777593 RrIowa_1423 RrIowa_1424 ampG.4 tatC TRUE 0.582 67.000 0.033 1.000   NA
 3777593 3777594 RrIowa_1424 RrIowa_1425 tatC   TRUE 0.967 -22.000 0.065 1.000 N NA
 3777594 3777595 RrIowa_1425 RrIowa_1426     FALSE 0.420 45.000 0.000 NA   NA
 3777595 3777596 RrIowa_1426 RrIowa_1427   virB4.2 FALSE 0.381 85.000 0.000 NA   NA
 3777596 3777597 RrIowa_1427 RrIowa_1428 virB4.2   TRUE 0.899 136.000 0.375 NA   NA
 3777597 3777598 RrIowa_1428 RrIowa_1429   terC TRUE 0.967 5.000 0.051 NA   NA
 3777598 3777599 RrIowa_1429 RrIowa_1430 terC   TRUE 0.747 44.000 0.037 0.056   NA
 3777599 3777600 RrIowa_1430 RrIowa_1431     TRUE 0.898 86.000 0.857 1.000   NA
 3777600 3777601 RrIowa_1431 RrIowa_1432     FALSE 0.446 43.000 0.000 NA   NA
 3777601 3777602 RrIowa_1432 RrIowa_1433     FALSE 0.357 59.000 0.000 NA   NA
 3777602 3777603 RrIowa_1433 RrIowa_1434     TRUE 0.654 33.000 0.000 1.000 N NA
 3777603 3777604 RrIowa_1434 RrIowa_1435     TRUE 0.996 -7.000 0.484 0.005 Y NA
 3777604 3777605 RrIowa_1435 RrIowa_1436     TRUE 0.995 -9.000 0.451 0.013 Y NA
 3777605 3777606 RrIowa_1436 RrIowa_1437     TRUE 0.964 154.000 0.251 0.005 Y NA
 3777606 3777607 RrIowa_1437 RrIowa_1438     FALSE 0.074 354.000 0.000 1.000 N NA
 3777608 3777609 RrIowa_1439 RrIowa_1440     TRUE 0.963 183.000 0.500 0.013 Y NA
 3777609 3777610 RrIowa_1440 RrIowa_1441     TRUE 0.958 122.000 0.515 0.013 Y NA
 3777610 3777611 RrIowa_1441 RrIowa_1442     TRUE 0.950 -12.000 0.021 NA   NA
 3777611 3777612 RrIowa_1442 RrIowa_1443     TRUE 0.688 169.000 0.008 NA   NA
 3777612 3777613 RrIowa_1443 RrIowa_1444     TRUE 0.796 182.000 0.005 1.000 Y NA
 3777613 3777614 RrIowa_1444 RrIowa_1445     TRUE 0.947 58.000 0.837 0.006 Y NA
 3777614 3777615 RrIowa_1445 RrIowa_1446     TRUE 0.950 95.000 0.724 0.006 Y NA
 3777615 3777616 RrIowa_1446 RrIowa_1447     TRUE 0.979 134.000 0.846 0.006 Y NA
 3777616 3777617 RrIowa_1447 RrIowa_1448     TRUE 0.993 16.000 0.864 0.006 Y NA
 3777617 3777618 RrIowa_1448 RrIowa_1449     TRUE 0.846 164.000 0.007 1.000 Y NA
 3777618 3777619 RrIowa_1449 RrIowa_1450     TRUE 0.807 155.000 0.014 1.000 N NA
 3777620 3777621 RrIowa_1451 RrIowa_1452     FALSE 0.388 211.000 0.000 NA   NA
 3777622 3777623 RrIowa_1453 RrIowa_1454     TRUE 0.790 139.000 0.000 0.003   NA
 3777623 3777624 RrIowa_1454 RrIowa_1455     FALSE 0.371 276.000 0.022 0.004   NA
 3777624 3777625 RrIowa_1455 RrIowa_1456     TRUE 0.952 4.000 0.005 1.000 N NA
 10746830 3777627 RrIowa_1458 RrIowa_1462     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 3777627 3777628 RrIowa_1462 RrIowa_1463     TRUE 0.482 40.000 0.000 NA   NA
 3777628 3777629 RrIowa_1463 RrIowa_1464     FALSE 0.362 81.000 0.000 NA   NA
 3777629 3777630 RrIowa_1464 RrIowa_1465     FALSE 0.085 305.000 0.000 NA   NA
 3777630 3777631 RrIowa_1465 RrIowa_1466   kefC TRUE 0.955 -7.000 0.021 NA   NA
 3777631 3777632 RrIowa_1466 RrIowa_1467 kefC   TRUE 0.925 -12.000 0.008 NA   NA
 3777635 3777636 RrIowa_1473 RrIowa_1474     FALSE 0.127 277.000 0.000 NA   NA
 3777636 3777637 RrIowa_1474 RrIowa_1475     TRUE 0.885 10.000 0.000 NA   NA
 3777637 10746832 RrIowa_1475 RrIowa_1476     TRUE 0.875 -24.000 0.000 NA   NA
 10746832 3777638 RrIowa_1476 RrIowa_1479     FALSE 0.287 224.000 0.000 NA   NA
 3777638 3777639 RrIowa_1479 RrIowa_1480     FALSE 0.016 521.000 0.000 NA   NA
 3777640 3777641 RrIowa_1481 RrIowa_1482     TRUE 0.647 155.000 0.000 NA   NA
 3777641 3777642 RrIowa_1482 RrIowa_1483     TRUE 0.780 18.000 0.000 NA   NA
 3777642 3777643 RrIowa_1483 RrIowa_1484   maf TRUE 0.970 12.000 0.207 NA N NA
 3777644 3777645 RrIowa_1485 RrIowa_1486     TRUE 0.861 162.000 0.040 1.000 N NA
 3777647 3777648 RrIowa_1488 RrIowa_1489     TRUE 0.634 149.000 0.000 NA   NA
 3777648 3777649 RrIowa_1489 RrIowa_1490     TRUE 0.592 178.000 0.000 NA   NA
 3777649 3777650 RrIowa_1490 RrIowa_1491     TRUE 0.521 121.000 0.000 NA   NA
 3777650 3777651 RrIowa_1491 RrIowa_1492     TRUE 0.759 147.000 0.015 NA N NA
 3777651 3777652 RrIowa_1492 RrIowa_1493     TRUE 0.583 194.000 0.000 1.000   NA
 3777652 3777653 RrIowa_1493 RrIowa_1494     TRUE 0.892 126.000 0.500 NA   NA
 3777653 3777654 RrIowa_1494 RrIowa_1495     FALSE 0.019 491.000 0.000 NA   NA
 3777654 3777655 RrIowa_1495 RrIowa_1496   ftsK TRUE 0.605 175.000 0.000 NA   NA
 3777655 3777656 RrIowa_1496 RrIowa_1497 ftsK   TRUE 0.729 168.000 0.000 1.000 N NA
 3777657 3777658 RrIowa_1498 RrIowa_1499   radC.1 FALSE 0.184 251.000 0.000 NA   NA
 3777658 3777659 RrIowa_1499 RrIowa_1500 radC.1 radC.2 TRUE 0.914 5.000 0.000 NA   NA
 3777659 3777660 RrIowa_1500 RrIowa_1501 radC.2   TRUE 0.956 -13.000 0.020 1.000   NA
 3777660 3777661 RrIowa_1501 RrIowa_1502     TRUE 0.962 -3.000 0.023 NA   NA
 3777662 3777663 RrIowa_1503 RrIowa_1504     TRUE 0.524 243.000 0.000 0.003 Y NA
 3777663 3777664 RrIowa_1504 RrIowa_1505     TRUE 0.799 226.000 0.545 1.000 N NA
 3777664 3777665 RrIowa_1505 RrIowa_1506     TRUE 0.965 5.000 0.018 1.000 N NA
 3777665 3777666 RrIowa_1506 RrIowa_1507     TRUE 0.914 15.000 0.010 1.000 N NA
 3777666 3777667 RrIowa_1507 RrIowa_1508     TRUE 0.956 -19.000 0.023 1.000 N NA
 3777668 3777669 RrIowa_1509 RrIowa_1510     TRUE 0.813 131.000 0.085 NA   NA
 3777669 3777670 RrIowa_1510 RrIowa_1511   znuC FALSE 0.124 310.000 0.016 NA   NA
 3777671 3777672 RrIowa_1512 RrIowa_1513     TRUE 0.872 -31.000 0.000 NA   NA
 3777672 3777673 RrIowa_1513 RrIowa_1514     FALSE 0.181 252.000 0.000 NA   NA
 3777673 3777674 RrIowa_1514 RrIowa_1515     TRUE 0.884 -19.000 0.000 NA   NA
 3777674 3777675 RrIowa_1515 RrIowa_1516     TRUE 0.472 199.000 0.000 NA   NA
 3777675 3777676 RrIowa_1516 RrIowa_1517     TRUE 0.612 138.000 0.000 NA   NA
 3777676 3777677 RrIowa_1517 RrIowa_1518     TRUE 0.622 172.000 0.000 NA   NA
 3777678 3777679 RrIowa_1519 RrIowa_1520     TRUE 0.612 138.000 0.000 NA   NA
 3777679 3777680 RrIowa_1520 RrIowa_1521     FALSE 0.469 41.000 0.000 NA   NA
 3777681 3777682 RrIowa_1522 RrIowa_1523     FALSE 0.329 70.000 0.000 NA   NA
 3777682 3777683 RrIowa_1523 RrIowa_1524     TRUE 0.877 -22.000 0.000 NA   NA
 3777683 3777684 RrIowa_1524 RrIowa_1525     FALSE 0.105 284.000 0.000 NA   NA
 3777685 3777686 RrIowa_1526 RrIowa_1527   htpG TRUE 0.682 144.000 0.008 NA   NA
 3777686 3777687 RrIowa_1527 RrIowa_1528 htpG   TRUE 0.764 144.000 0.008 1.000 N NA
 3777687 3777688 RrIowa_1528 RrIowa_1529     FALSE 0.008 906.000 0.000 NA   NA
 3777688 3777689 RrIowa_1529 RrIowa_1530     TRUE 0.754 19.000 0.000 NA   NA
 3777689 3777690 RrIowa_1530 RrIowa_1531     FALSE 0.310 222.000 0.002 NA   NA
 3777691 3777692 RrIowa_1532 RrIowa_1533 cgtA   TRUE 0.896 13.000 0.002 1.000   NA
 3777692 3777693 RrIowa_1533 RrIowa_1534     TRUE 0.571 131.000 0.000 NA   NA
 3777693 3777694 RrIowa_1534 RrIowa_1535     TRUE 0.580 30.000 0.000 NA   NA
 3777694 3777695 RrIowa_1535 RrIowa_1536     FALSE 0.243 238.000 0.000 NA   NA
 3777696 3777697 RrIowa_1537 RrIowa_1538     FALSE 0.102 285.000 0.000 NA   NA
 3777697 3777698 RrIowa_1538 RrIowa_1539     TRUE 0.638 151.000 0.000 NA   NA
 3777698 3777699 RrIowa_1539 RrIowa_1540     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 3777700 3777701 RrIowa_1541 RrIowa_1542     TRUE 0.951 45.000 0.651 0.001 Y NA
 3777701 3777702 RrIowa_1542 RrIowa_1543   stbB FALSE 0.389 55.000 0.003 NA   NA
 3777702 3777703 RrIowa_1543 RrIowa_1544 stbB   TRUE 0.980 -3.000 0.154 NA   NA
 3777703 3777704 RrIowa_1544 RrIowa_1545     FALSE 0.389 87.000 0.000 NA   NA
 3777704 10746833 RrIowa_1545 RrIowa_1546     TRUE 0.925 2.000 0.000 NA   NA
 3777706 3777707 RrIowa_1549 RrIowa_1550     TRUE 0.990 10.000 1.000 NA   NA
 3777707 3777708 RrIowa_1550 RrIowa_1551     TRUE 0.800 75.000 0.556 NA   NA
 3777710 3777711 RrIowa_1553 RrIowa_1554   rpoD TRUE 0.564 96.000 0.006 1.000 N NA
 3777711 3777712 RrIowa_1554 RrIowa_1555 rpoD   TRUE 0.837 45.000 0.299 1.000 N NA
 3777712 3777713 RrIowa_1555 RrIowa_1556     TRUE 0.953 5.000 0.008 1.000 N NA
 3777715 3777716 RrIowa_1558 RrIowa_1559     TRUE 0.996 -3.000 0.829 0.002   NA
 3777717 3777718 RrIowa_1560 RrIowa_1561     FALSE 0.399 222.000 0.000 1.000 N NA
 3777718 3777719 RrIowa_1561 RrIowa_1562     TRUE 0.943 20.000 0.411 NA   NA
 3777720 3777721 RrIowa_1563 RrIowa_1564     FALSE 0.399 49.000 0.000 NA   NA
 3777721 3777722 RrIowa_1564 RrIowa_1565     TRUE 0.549 128.000 0.000 NA   NA
 3777722 3777723 RrIowa_1565 RrIowa_1566     TRUE 0.481 198.000 0.000 NA   NA
 3777723 3777724 RrIowa_1566 RrIowa_1567     TRUE 0.573 61.000 0.022 1.000   NA
 3777724 3777725 RrIowa_1567 RrIowa_1568     TRUE 0.651 25.000 0.000 NA   NA
 3777725 3777726 RrIowa_1568 RrIowa_1569     FALSE 0.050 350.000 0.000 NA   NA
 3777726 3777727 RrIowa_1569 RrIowa_1570   relB.3 TRUE 0.491 196.000 0.000 NA   NA
 3777727 3777728 RrIowa_1570 RrIowa_1571 relB.3   TRUE 0.836 193.000 0.250 NA   NA
 3777728 3777729 RrIowa_1571 RrIowa_1572     TRUE 0.963 4.000 0.019 1.000   NA
 3777730 3777731 RrIowa_1573 RrIowa_1574     TRUE 0.658 94.000 0.053 NA   NA
 3777731 3777732 RrIowa_1574 RrIowa_1575   yafQ FALSE 0.400 91.000 0.000 NA   NA
 3777732 3777733 RrIowa_1575 RrIowa_1576 yafQ   TRUE 0.482 109.000 0.000 NA   NA
 3777734 3777735 RrIowa_1577 RrIowa_1578     TRUE 0.503 37.000 0.000 NA   NA
 3777735 3777736 RrIowa_1578 RrIowa_1579     FALSE 0.357 79.000 0.000 NA   NA
 3777736 3777737 RrIowa_1579 RrIowa_1580     TRUE 0.944 1.000 0.000 1.000   NA
 3777737 3777738 RrIowa_1580 RrIowa_1581     FALSE 0.018 500.000 0.000 NA   NA
 3777738 3777739 RrIowa_1581 RrIowa_1582     FALSE 0.411 46.000 0.000 NA   NA
 3777739 3777740 RrIowa_1582 RrIowa_1583     FALSE 0.013 640.000 0.000 NA   NA
 3777740 3777741 RrIowa_1583 RrIowa_1584     TRUE 0.506 115.000 0.000 NA   NA
 3777743 3777744 RrIowa_1586 RrIowa_1587     TRUE 0.940 -3.000 0.007 NA   NA
 3777744 3777745 RrIowa_1587 RrIowa_1588     TRUE 0.956 -3.000 0.004 1.000 N NA
 3777745 3777746 RrIowa_1588 RrIowa_1589     FALSE 0.221 240.000 0.000 NA   NA
 3777746 3777747 RrIowa_1589 RrIowa_1590     TRUE 0.589 179.000 0.000 NA   NA
 3777747 3777748 RrIowa_1590 RrIowa_1591     TRUE 0.948 17.000 0.008 0.026 Y NA
 3777748 3777749 RrIowa_1591 RrIowa_1592   mutL FALSE 0.435 221.000 0.004 1.000 N NA
 3777749 3777750 RrIowa_1592 RrIowa_1593 mutL   TRUE 0.906 8.000 0.004 NA   NA
 3777751 3777752 RrIowa_1594 RrIowa_1595     FALSE 0.083 306.000 0.000 NA   NA
 3777754 3777755 RrIowa_1597 RrIowa_1598     TRUE 0.951 -16.000 0.014 1.000 N NA
 10746834 3777756 RrIowa_1599 RrIowa_1602     FALSE 0.022 463.000 0.000 NA   NA
 3777756 3777757 RrIowa_1602 RrIowa_1603     TRUE 0.953 12.000 0.043 1.000   NA
 3777757 3777758 RrIowa_1603 RrIowa_1604     TRUE 0.836 89.000 0.131 1.000 Y NA