MicrobesOnline Operon Predictions for Sphingobium japonicum UT26S

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10209824 10209825 SJA_C1-00010 SJA_C1-00020     TRUE 0.941 5.000 0.135 NA   NA
 10209825 10209826 SJA_C1-00020 SJA_C1-00030   aroE TRUE 0.983 -3.000 0.169 NA N NA
 10209826 10209827 SJA_C1-00030 SJA_C1-00040 aroE coaE TRUE 0.807 20.000 0.078 1.000 N NA
 10209827 10209828 SJA_C1-00040 SJA_C1-00050 coaE dnaQ TRUE 0.746 32.000 0.092 1.000 N NA
 10209828 10209829 SJA_C1-00050 SJA_C1-00060 dnaQ rpoN FALSE 0.433 96.000 0.026 NA N NA
 10209829 10209830 SJA_C1-00060 SJA_C1-00070 rpoN ptsN TRUE 0.844 46.000 0.353 NA N NA
 10209830 10209831 SJA_C1-00070 SJA_C1-00080 ptsN   TRUE 0.890 -40.000 0.051 NA N NA
 10209831 10209832 SJA_C1-00080 SJA_C1-00090     TRUE 0.688 29.000 0.061 NA   NA
 10209832 10209833 SJA_C1-00090 SJA_C1-00100   cwlJ FALSE 0.184 178.000 0.031 NA   NA
 10209833 10209834 SJA_C1-00100 SJA_C1-00110 cwlJ   FALSE 0.438 101.000 0.032 NA   NA
 10209837 10209838 SJA_C1-00140 SJA_C1-00150     FALSE 0.121 191.000 0.017 1.000   NA
 10209841 10209842 SJA_C1-00180 SJA_C1-00190     TRUE 0.956 -3.000 0.033 1.000 N NA
 10209844 10209845 SJA_C1-00210 SJA_C1-00220 linK linL TRUE 0.995 0.000 0.472 NA Y NA
 10209845 10209846 SJA_C1-00220 SJA_C1-00230 linL linM TRUE 0.988 4.000 0.324 NA Y NA
 10209846 10209847 SJA_C1-00230 SJA_C1-00240 linM linN TRUE 0.880 8.000 0.060 NA   NA
 10209848 10209849 SJA_C1-00250 SJA_C1-00260 pepN   FALSE 0.163 151.000 0.002 1.000 N NA
 10209849 10209850 SJA_C1-00260 SJA_C1-00270   parA TRUE 0.976 15.000 0.827 1.000 N NA
 10209850 10209851 SJA_C1-00270 SJA_C1-00280 parA gidB TRUE 0.991 -3.000 0.339 1.000 N NA
 10209851 10209852 SJA_C1-00280 SJA_C1-00290 gidB gidA TRUE 0.993 -3.000 0.466 1.000 N NA
 10209852 10209853 SJA_C1-00290 SJA_C1-00300 gidA thdF TRUE 0.763 59.000 0.266 1.000   NA
 10209853 10209854 SJA_C1-00300 SJA_C1-00310 thdF   TRUE 0.637 22.000 0.024 NA   NA
 10209855 10209856 SJA_C1-00320 SJA_C1-00330   qor TRUE 0.946 15.000 0.364 1.000 N NA
 10209856 10209857 SJA_C1-00330 SJA_C1-00340 qor   FALSE 0.190 124.000 0.000 NA   NA
 10209858 10209859 SJA_C1-00350 SJA_C1-00360 terC rho FALSE 0.295 122.000 0.006 1.000 N NA
 10209861 10209862 SJA_C1-00380 SJA_C1-00390 pbp msrB FALSE 0.496 112.000 0.032 1.000 N NA
 10209862 10209863 SJA_C1-00390 SJA_C1-00400 msrB   FALSE 0.105 170.000 0.002 1.000 N NA
 10209863 10209864 SJA_C1-00400 SJA_C1-00410     TRUE 0.973 -3.000 0.097 NA   NA
 10209864 10209865 SJA_C1-00410 SJA_C1-00420   leuS TRUE 0.574 124.000 0.090 NA   NA
 10209865 10209866 SJA_C1-00420 SJA_C1-00430 leuS   FALSE 0.485 84.000 0.051 NA   NA
 10209868 10209869 SJA_C1-00450 SJA_C1-00460   tag TRUE 0.667 9.000 0.004 NA   NA
 10209869 10209870 SJA_C1-00460 SJA_C1-00470 tag gyrB TRUE 0.915 5.000 0.002 1.000 Y NA
 10209872 10209873 SJA_C1-00490 SJA_C1-00500     FALSE 0.193 123.000 0.000 NA   NA
 10209873 10209874 SJA_C1-00500 SJA_C1-00510     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10209876 10209877 SJA_C1-00530 SJA_C1-00540     FALSE 0.209 52.000 0.000 NA   NA
 10209877 10209878 SJA_C1-00540 SJA_C1-00550     TRUE 0.604 35.000 0.042 NA   NA
 10209878 10209879 SJA_C1-00550 SJA_C1-00560   sco1 TRUE 0.885 4.000 0.034 NA   NA
 10209880 10209881 SJA_C1-00570 SJA_C1-00580     FALSE 0.006 354.000 0.000 NA   NA
 10209881 10209882 SJA_C1-00580 SJA_C1-00590     TRUE 0.957 18.000 0.615 NA   NA
 10209883 10209884 SJA_C1-00600 SJA_C1-00610 ppa   FALSE 0.351 42.000 0.006 1.000   NA
 10209885 10209886 SJA_C1-00620 SJA_C1-00630 hisS prfA TRUE 0.970 0.000 0.014 0.037 Y NA
 10209886 10209887 SJA_C1-00630 SJA_C1-00640 prfA hemK TRUE 0.699 119.000 0.024 1.000 Y NA
 10209887 10209888 SJA_C1-00640 SJA_C1-00650 hemK   FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10209888 10209889 SJA_C1-00650 SJA_C1-00660     FALSE 0.183 79.000 0.000 NA   NA
 10209890 10209891 SJA_C1-00670 SJA_C1-00680     TRUE 0.977 -7.000 0.273 NA   NA
 10209894 10209895 SJA_C1-r0010 SJA_C1-t0010     FALSE 0.017 270.000 0.000 NA   NA
 10209895 10209896 SJA_C1-t0010 SJA_C1-t0020     TRUE 0.604 10.000 0.000 NA   NA
 10209896 10209897 SJA_C1-t0020 SJA_C1-r0020     FALSE 0.004 406.000 0.000 NA   NA
 10209897 10209898 SJA_C1-r0020 SJA_C1-r0030     FALSE 0.146 143.000 0.000 NA   NA
 10209898 10209899 SJA_C1-r0030 SJA_C1-t0030     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 10209904 10209905 SJA_C1-00750 SJA_C1-00760     TRUE 0.970 -31.000 0.103 NA Y NA
 10209905 10209906 SJA_C1-00760 SJA_C1-00770     FALSE 0.193 91.000 0.000 NA   NA
 10209906 10209907 SJA_C1-00770 SJA_C1-00780     TRUE 0.965 5.000 0.280 NA   NA
 10209907 10209908 SJA_C1-00780 SJA_C1-00790     TRUE 0.988 -16.000 0.696 NA N NA
 10209908 10209909 SJA_C1-00790 SJA_C1-00800     TRUE 0.970 -3.000 0.080 NA   NA
 10209909 10209910 SJA_C1-00800 SJA_C1-00810     TRUE 0.987 -3.000 0.256 NA   NA
 10209912 10209913 SJA_C1-00830 SJA_C1-00840 cysQ pmbA TRUE 0.960 -13.000 0.182 NA   NA
 10209913 10209914 SJA_C1-00840 SJA_C1-00850 pmbA nudC FALSE 0.192 89.000 0.000 NA   NA
 10209914 10209915 SJA_C1-00850 SJA_C1-00860 nudC mutY TRUE 0.933 -13.000 0.005 1.000 Y NA
 10209916 10209917 SJA_C1-00870 SJA_C1-00880     FALSE 0.322 30.000 0.000 NA   NA
 10209917 10209918 SJA_C1-00880 SJA_C1-00890     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10209918 10209919 SJA_C1-00890 SJA_C1-00900     TRUE 0.914 56.000 0.375 NA Y NA
 10209919 10209920 SJA_C1-00900 SJA_C1-00910   smc FALSE 0.298 81.000 0.007 1.000 N NA
 10209921 10209922 SJA_C1-00920 SJA_C1-00930 plD ubiA TRUE 0.903 -3.000 0.004 1.000 N NA
 10209923 10209924 SJA_C1-00940 SJA_C1-00950     FALSE 0.374 162.000 0.087 NA   NA
 10209925 10209926 SJA_C1-00960 SJA_C1-00970     FALSE 0.038 211.000 0.000 NA   NA
 10209926 10209927 SJA_C1-00970 SJA_C1-00980     FALSE 0.260 42.000 0.000 NA   NA
 10209928 10209929 SJA_C1-00990 SJA_C1-01000 ruvA ruvC TRUE 0.570 79.000 0.000 0.017 Y NA
 10209929 10209930 SJA_C1-01000 SJA_C1-01010 ruvC ruvB TRUE 0.702 38.000 0.002 0.017 Y NA
 10209932 10209933 SJA_C1-01030 SJA_C1-01040     TRUE 0.572 17.000 0.008 NA   NA
 10209933 10209934 SJA_C1-01040 SJA_C1-01050   dps FALSE 0.333 120.000 0.013 NA   NA
 10209935 10209936 SJA_C1-01060 SJA_C1-01070   cobT FALSE 0.440 46.000 0.016 1.000 N NA
 10209936 10209937 SJA_C1-01070 SJA_C1-01080 cobT   TRUE 0.931 0.000 0.032 1.000 N NA
 10209937 10209938 SJA_C1-01080 SJA_C1-01090     TRUE 0.931 -3.000 0.012 1.000 N NA
 10209938 10209939 SJA_C1-01090 SJA_C1-01100   cobS TRUE 0.852 2.000 0.012 1.000   NA
 10209939 10209940 SJA_C1-01100 SJA_C1-01110 cobS dnaJ TRUE 0.615 139.000 0.148 1.000   NA
 10209941 10209942 SJA_C1-01120 SJA_C1-01130   gst FALSE 0.251 49.000 0.000 NA N NA
 10209942 10209943 SJA_C1-01130 SJA_C1-01140 gst   TRUE 0.977 -3.000 0.120 NA   NA
 10209945 10209946 SJA_C1-01160 SJA_C1-01170 ftsE ftsX TRUE 0.987 0.000 0.139 NA Y NA
 10209946 10209947 SJA_C1-01170 SJA_C1-01180 ftsX   TRUE 0.991 -3.000 0.417 NA   NA
 10209947 10209948 SJA_C1-01180 SJA_C1-01190   plsC TRUE 0.849 15.000 0.096 NA   NA
 10209949 10209950 SJA_C1-01200 SJA_C1-01210   hisC TRUE 0.990 0.000 0.198 1.000 Y NA
 10209950 10209951 SJA_C1-01210 SJA_C1-01220 hisC   FALSE 0.244 104.000 0.000 1.000 N NA
 10209952 10209953 SJA_C1-01230 SJA_C1-01240 metX metW TRUE 0.993 -3.000 0.509 NA   NA
 10209954 10209955 SJA_C1-01250 SJA_C1-01260 yapH   FALSE 0.026 246.000 0.000 1.000   NA
 10209956 10209957 SJA_C1-01270 SJA_C1-01280     TRUE 0.804 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10209960 10209961 SJA_C1-01310 SJA_C1-01320     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA N NA
 10209962 10209963 SJA_C1-01330 SJA_C1-01340     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10209964 10209965 SJA_C1-01350 SJA_C1-01360     FALSE 0.218 49.000 0.000 NA   NA
 10209965 10209966 SJA_C1-01360 SJA_C1-01370     FALSE 0.181 73.000 0.000 NA   NA
 10209967 10209968 SJA_C1-01380 SJA_C1-01390     FALSE 0.397 28.000 0.000 1.000 N NA
 10209968 10209969 SJA_C1-01390 SJA_C1-01400   atoB TRUE 0.557 57.000 0.000 1.000 Y NA
 10209969 10209970 SJA_C1-01400 SJA_C1-01410 atoB   FALSE 0.253 52.000 0.000 1.000 N NA
 10209972 10209973 SJA_C1-01430 SJA_C1-01440 paaB ehhadh3 TRUE 0.571 73.000 0.000 0.007 Y NA
 10209973 10209974 SJA_C1-01440 SJA_C1-01450 ehhadh3 bcd TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10209974 10209975 SJA_C1-01450 SJA_C1-01460 bcd   TRUE 0.552 13.000 0.000 1.000   NA
 10209975 10209976 SJA_C1-01460 SJA_C1-01470     FALSE 0.468 17.000 0.000 1.000   NA
 10209976 10209977 SJA_C1-01470 SJA_C1-01480   fadB FALSE 0.194 208.000 0.000 0.084 Y NA
 10209977 10209978 SJA_C1-01480 SJA_C1-01490 fadB   FALSE 0.296 34.000 0.000 NA   NA
 10209979 10209980 SJA_C1-01500 SJA_C1-t0040     FALSE 0.003 471.000 0.000 NA   NA
 10209983 10209984 SJA_C1-01530 SJA_C1-01540 ptrB   FALSE 0.488 70.000 0.051 1.000   NA
 10209985 10209986 SJA_C1-01550 SJA_C1-01560 terC   FALSE 0.008 380.000 0.000 0.050 N NA
 10209986 10209987 SJA_C1-01560 SJA_C1-01570   dapD FALSE 0.132 156.000 0.000 1.000 N NA
 10209987 10209988 SJA_C1-01570 SJA_C1-01580 dapD   TRUE 0.968 -3.000 0.071 1.000   NA
 10209988 10209989 SJA_C1-01580 SJA_C1-01590     FALSE 0.031 230.000 0.000 NA   NA
 10209989 10209990 SJA_C1-01590 SJA_C1-01600   crtQ TRUE 0.815 10.000 0.026 NA   NA
 10209990 10209991 SJA_C1-01600 SJA_C1-01610 crtQ crtY TRUE 0.917 14.000 0.163 0.001   NA
 10209992 10209993 SJA_C1-01620 SJA_C1-01630     FALSE 0.296 34.000 0.000 NA   NA
 10209993 10209994 SJA_C1-01630 SJA_C1-01640     TRUE 0.975 -3.000 0.111 NA   NA
 10209995 10209996 SJA_C1-01650 SJA_C1-01660     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10209996 10209997 SJA_C1-01660 SJA_C1-01670   recQ FALSE 0.009 369.000 0.008 NA   NA
 10209997 10209998 SJA_C1-01670 SJA_C1-01680 recQ   FALSE 0.091 163.000 0.000 NA   NA
 10210000 10210001 SJA_C1-01700 SJA_C1-01710 phz   TRUE 0.578 88.000 0.083 1.000   NA
 10210003 10210004 SJA_C1-01730 SJA_C1-01740 aroC fabI FALSE 0.351 90.000 0.011 1.000 N NA
 10210004 10210005 SJA_C1-01740 SJA_C1-01750 fabI   TRUE 0.926 9.000 0.131 1.000   NA
 10210005 10210006 SJA_C1-01750 SJA_C1-01760   dnaJ TRUE 0.873 15.000 0.119 1.000   NA
 10210007 10210008 SJA_C1-01770 SJA_C1-01780 pdxH   FALSE 0.107 176.000 0.004 1.000 N NA
 10210009 10210010 SJA_C1-01790 SJA_C1-01800     FALSE 0.009 318.000 0.000 NA   NA
 10210010 10210011 SJA_C1-01800 SJA_C1-01810   purA TRUE 0.673 6.000 0.002 NA   NA
 10210013 10210014 SJA_C1-01830 SJA_C1-01840 hisZ serA FALSE 0.462 62.000 0.030 1.000 N NA
 10210014 10210015 SJA_C1-01840 SJA_C1-01850 serA serC TRUE 0.850 112.000 0.140 1.000 Y NA
 10210016 10210017 SJA_C1-01860 SJA_C1-01870     FALSE 0.446 77.000 0.041 NA   NA
 10210017 10210018 SJA_C1-01870 SJA_C1-01880     FALSE 0.191 62.000 0.000 NA   NA
 10210018 10210019 SJA_C1-01880 SJA_C1-01890   crtB TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10210020 10210021 SJA_C1-01900 SJA_C1-01910 amt glnB TRUE 0.829 14.000 0.054 1.000 N NA
 10210021 10210022 SJA_C1-01910 SJA_C1-01920 glnB   FALSE 0.018 336.000 0.017 1.000   NA
 10210022 10210023 SJA_C1-01920 SJA_C1-01930   tldD FALSE 0.277 53.000 0.007 NA   NA
 10210023 10210024 SJA_C1-01930 SJA_C1-01940 tldD   FALSE 0.204 154.000 0.014 NA   NA
 10210024 10210025 SJA_C1-01940 SJA_C1-01950     FALSE 0.199 57.000 0.000 NA   NA
 10210025 10210026 SJA_C1-01950 SJA_C1-t0050     FALSE 0.192 89.000 0.000 NA   NA
 10210026 10210027 SJA_C1-t0050 SJA_C1-01960     FALSE 0.191 87.000 0.000 NA   NA
 10210027 10210028 SJA_C1-01960 SJA_C1-01970   dat FALSE 0.028 242.000 0.000 1.000   NA
 10210028 10210029 SJA_C1-01970 SJA_C1-01980 dat rpoN FALSE 0.045 218.000 0.000 1.000 N NA
 10210029 10210030 SJA_C1-01980 SJA_C1-01990 rpoN   FALSE 0.414 49.000 0.018 1.000   NA
 10210032 10210033 SJA_C1-02010 SJA_C1-02020     FALSE 0.192 89.000 0.000 NA   NA
 10210033 10210034 SJA_C1-02020 SJA_C1-02030     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210034 10210035 SJA_C1-02030 SJA_C1-02040   ydjE TRUE 0.771 2.000 0.000 NA N NA
 10210036 10210037 SJA_C1-02050 SJA_C1-02060 gst   TRUE 0.764 1.000 0.000 1.000   NA
 10210037 10210038 SJA_C1-02060 SJA_C1-02070     FALSE 0.339 30.000 0.000 1.000   NA
 10210038 10210039 SJA_C1-02070 SJA_C1-02080     FALSE 0.192 95.000 0.000 NA   NA
 10210039 10210040 SJA_C1-02080 SJA_C1-02090     TRUE 0.604 10.000 0.000 NA   NA
 10210040 10210041 SJA_C1-02090 SJA_C1-02100     TRUE 0.938 3.000 0.000 0.035 Y NA
 10210041 10210042 SJA_C1-02100 SJA_C1-02110     TRUE 0.772 21.000 0.000 1.000 Y NA
 10210043 10210044 SJA_C1-02120 SJA_C1-02130     FALSE 0.118 152.000 0.000 NA   NA
 10210045 10210046 SJA_C1-02140 SJA_C1-02150     FALSE 0.369 24.000 0.000 NA   NA
 10210046 10210047 SJA_C1-02150 SJA_C1-02160     FALSE 0.187 67.000 0.000 NA   NA
 10210047 10210048 SJA_C1-02160 SJA_C1-02170     FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 10210049 10210050 SJA_C1-02180 SJA_C1-02190     FALSE 0.207 107.000 0.000 NA   NA
 10210050 10210051 SJA_C1-02190 SJA_C1-02200     FALSE 0.449 17.000 0.000 NA   NA
 10210051 10210052 SJA_C1-02200 SJA_C1-02210     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210052 10210053 SJA_C1-02210 SJA_C1-02220     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210053 10210054 SJA_C1-02220 SJA_C1-02230     TRUE 0.750 1.000 0.000 NA   NA
 10210054 10210055 SJA_C1-02230 SJA_C1-02240     FALSE 0.208 59.000 0.000 1.000   NA
 10210055 10210056 SJA_C1-02240 SJA_C1-02250     FALSE 0.225 80.000 0.000 1.000 N NA
 10210056 10210057 SJA_C1-02250 SJA_C1-02260   gst FALSE 0.486 19.000 0.000 1.000 N NA
 10210058 10210059 SJA_C1-02270 SJA_C1-02280     FALSE 0.091 163.000 0.000 NA   NA
 10210059 10210060 SJA_C1-02280 SJA_C1-02290   ligX FALSE 0.412 20.000 0.000 NA   NA
 10210060 10210061 SJA_C1-02290 SJA_C1-02300 ligX gst FALSE 0.212 51.000 0.000 NA   NA
 10210063 10210064 SJA_C1-02320 SJA_C1-02330     TRUE 0.988 -3.000 0.077 NA Y NA
 10210064 10210065 SJA_C1-02330 SJA_C1-02340     FALSE 0.025 255.000 0.000 NA N NA
 10210066 10210067 SJA_C1-02350 SJA_C1-02360     TRUE 0.538 125.000 0.000 1.000 Y NA
 10210067 10210068 SJA_C1-02360 SJA_C1-02370   menB TRUE 0.812 -10.000 0.000 0.083 N NA
 10210072 10210073 SJA_C1-02400 SJA_C1-02410 gltB   TRUE 0.695 12.000 0.010 NA   NA
 10210073 10210074 SJA_C1-02410 SJA_C1-02420   gltD TRUE 0.946 -3.000 0.028 NA   NA
 10210074 10210075 SJA_C1-02420 SJA_C1-02430 gltD bacA FALSE 0.312 167.000 0.060 1.000 N NA
 10210075 10210076 SJA_C1-02430 SJA_C1-02440 bacA NDUFA9 FALSE 0.495 146.000 0.082 1.000 N NA
 10210076 10210077 SJA_C1-02440 SJA_C1-02450 NDUFA9   FALSE 0.036 214.000 0.000 NA   NA
 10210077 10210078 SJA_C1-02450 SJA_C1-02460   galU FALSE 0.186 125.000 0.000 NA   NA
 10210078 10210079 SJA_C1-02460 SJA_C1-02470 galU   TRUE 0.662 84.000 0.154 NA   NA
 10210079 10210080 SJA_C1-02470 SJA_C1-02480     FALSE 0.044 202.000 0.000 NA   NA
 10210082 10210083 SJA_C1-02500 SJA_C1-02510   rpe TRUE 0.955 -3.000 0.042 NA   NA
 10210083 10210084 SJA_C1-02510 SJA_C1-02520 rpe   FALSE 0.203 105.000 0.000 NA   NA
 10210084 10210085 SJA_C1-02520 SJA_C1-02530   sun FALSE 0.240 45.000 0.000 NA   NA
 10210085 10210086 SJA_C1-02530 SJA_C1-02540 sun   FALSE 0.225 80.000 0.000 1.000 N NA
 10210086 10210087 SJA_C1-02540 SJA_C1-02550   ybeA FALSE 0.075 270.000 0.067 NA   NA
 10210087 10210088 SJA_C1-02550 SJA_C1-02560 ybeA   TRUE 0.689 147.000 0.307 NA   NA
 10210088 10210089 SJA_C1-02560 SJA_C1-02570   nadD TRUE 0.927 13.000 0.221 NA   NA
 10210089 10210090 SJA_C1-02570 SJA_C1-02580 nadD   FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10210091 10210092 SJA_C1-02590 SJA_C1-02600     TRUE 0.993 -3.000 0.429 0.055   NA
 10210092 10210093 SJA_C1-02600 SJA_C1-02610     TRUE 0.996 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 10210093 10210094 SJA_C1-02610 SJA_C1-02620     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 10210094 10210095 SJA_C1-02620 SJA_C1-02630     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 10210095 10210096 SJA_C1-02630 SJA_C1-02640     FALSE 0.063 181.000 0.000 NA   NA
 10210097 10210098 SJA_C1-t0070 SJA_C1-02650     FALSE 0.029 235.000 0.000 NA   NA
 10210098 10210099 SJA_C1-02650 SJA_C1-02660   maf TRUE 0.761 7.000 0.010 NA   NA
 10210099 10210100 SJA_C1-02660 SJA_C1-02670 maf infA TRUE 0.732 88.000 0.207 NA N NA
 10210100 10210101 SJA_C1-02670 SJA_C1-02680 infA bioA FALSE 0.240 129.000 0.003 1.000 N NA
 10210101 10210102 SJA_C1-02680 SJA_C1-02690 bioA   FALSE 0.048 197.000 0.000 NA   NA
 10210102 10210103 SJA_C1-02690 SJA_C1-02700   pepo FALSE 0.034 220.000 0.000 NA   NA
 10210105 10210106 SJA_C1-02720 SJA_C1-02730 bioD bioF TRUE 0.993 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 10210106 10210107 SJA_C1-02730 SJA_C1-02740 bioF   FALSE 0.026 239.000 0.000 NA   NA
 10210107 10210108 SJA_C1-02740 SJA_C1-02750     FALSE 0.212 112.000 0.000 NA   NA
 10210108 10210109 SJA_C1-02750 SJA_C1-02760   ppa FALSE 0.225 80.000 0.000 1.000 N NA
 10210109 10210110 SJA_C1-02760 SJA_C1-02770 ppa thiL FALSE 0.055 231.000 0.007 1.000 N NA
 10210110 10210111 SJA_C1-02770 SJA_C1-02780 thiL nusB TRUE 0.762 121.000 0.225 1.000 N NA
 10210111 10210112 SJA_C1-02780 SJA_C1-02790 nusB hisD FALSE 0.472 38.000 0.012 1.000 N NA
 10210112 10210113 SJA_C1-02790 SJA_C1-02800 hisD hisG TRUE 0.925 43.000 0.254 0.004 Y NA
 10210113 10210114 SJA_C1-02800 SJA_C1-02810 hisG trmU FALSE 0.207 133.000 0.000 1.000 N NA
 10210115 10210116 SJA_C1-02820 SJA_C1-02830     FALSE 0.400 107.000 0.021 NA   NA
 10210116 10210117 SJA_C1-02830 SJA_C1-02840     FALSE 0.230 159.000 0.021 1.000   NA
 10210119 10210120 SJA_C1-02860 SJA_C1-02870 hlyD acrB TRUE 0.924 53.000 0.900 NA N NA
 10210120 10210121 SJA_C1-02870 SJA_C1-02880 acrB   FALSE 0.518 125.000 0.067 NA   NA
 10210121 10210122 SJA_C1-02880 SJA_C1-02890   tonB FALSE 0.004 464.000 0.000 1.000   NA
 10210122 10210123 SJA_C1-02890 SJA_C1-02900 tonB   TRUE 0.709 24.000 0.055 NA   NA
 10210123 10210124 SJA_C1-02900 SJA_C1-02910   ribD FALSE 0.226 72.000 0.005 NA   NA
 10210124 10210125 SJA_C1-02910 SJA_C1-02920 ribD ribE TRUE 0.929 54.000 0.456 1.000 Y NA
 10210125 10210126 SJA_C1-02920 SJA_C1-02930 ribE ribA TRUE 0.539 72.000 0.002 1.000 Y NA
 10210126 10210127 SJA_C1-02930 SJA_C1-02940 ribA ribH TRUE 0.878 13.000 0.002 0.002 Y NA
 10210129 10210130 SJA_C1-02960 SJA_C1-02970   feoA TRUE 0.524 71.000 0.067 1.000   NA
 10210130 10210131 SJA_C1-02970 SJA_C1-02980 feoA feoB TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000   NA
 10210131 10210132 SJA_C1-02980 SJA_C1-02990 feoB ssb TRUE 0.599 27.000 0.019 1.000 N NA
 10210132 10210133 SJA_C1-02990 SJA_C1-03000 ssb purH FALSE 0.008 358.000 0.000 1.000 N NA
 10210135 10210136 SJA_C1-03020 SJA_C1-03030     FALSE 0.137 146.000 0.000 NA   NA
 10210136 10210137 SJA_C1-03030 SJA_C1-03040     TRUE 0.941 6.000 0.148 1.000   NA
 10210137 10210138 SJA_C1-03040 SJA_C1-03050     TRUE 0.943 -22.000 0.143 NA   NA
 10210139 10210140 SJA_C1-03060 SJA_C1-03070 msrB   TRUE 0.809 8.000 0.016 NA N NA
 10210140 10210141 SJA_C1-03070 SJA_C1-03080     TRUE 0.979 -3.000 0.141 NA   NA
 10210143 10210144 SJA_C1-03100 SJA_C1-03110     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210146 10210147 SJA_C1-03130 SJA_C1-03140   gpsA TRUE 0.540 89.000 0.068 1.000   NA
 10210147 10210148 SJA_C1-03140 SJA_C1-03150 gpsA gcp TRUE 0.970 -3.000 0.070 1.000 N NA
 10210149 10210150 SJA_C1-03160 SJA_C1-03170 hemC hemD TRUE 0.989 -3.000 0.056 0.001 Y NA
 10210150 10210151 SJA_C1-03170 SJA_C1-03180 hemD   TRUE 0.873 11.000 0.071 NA   NA
 10210151 10210152 SJA_C1-03180 SJA_C1-03190     FALSE 0.190 124.000 0.000 NA   NA
 10210153 10210154 SJA_C1-03200 SJA_C1-03210 gltX nadE FALSE 0.446 127.000 0.028 0.087   NA
 10210156 10210157 SJA_C1-03230 SJA_C1-03240     FALSE 0.476 56.000 0.041 NA   NA
 10210158 10210159 SJA_C1-03250 SJA_C1-03260   fadD FALSE 0.053 205.000 0.000 1.000 N NA
 10210160 10210161 SJA_C1-03270 SJA_C1-03280   gloB FALSE 0.290 55.000 0.008 NA   NA
 10210161 10210162 SJA_C1-03280 SJA_C1-03290 gloB gloA TRUE 0.818 5.000 0.014 1.000   NA
 10210164 10210165 SJA_C1-03310 SJA_C1-03320     FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 10210165 10210166 SJA_C1-03320 SJA_C1-03330     TRUE 0.938 0.000 0.048 1.000   NA
 10210167 10210168 SJA_C1-t0080 SJA_C1-03340     FALSE 0.097 161.000 0.000 NA   NA
 10210168 10210169 SJA_C1-03340 SJA_C1-03350     FALSE 0.207 117.000 0.000 NA   NA
 10210169 10210170 SJA_C1-03350 SJA_C1-03360     FALSE 0.191 87.000 0.000 NA   NA
 10210172 10210173 SJA_C1-03380 SJA_C1-03390     FALSE 0.007 340.000 0.000 NA   NA
 10210173 10210174 SJA_C1-03390 SJA_C1-03400     TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10210174 10210175 SJA_C1-03400 SJA_C1-03410     FALSE 0.322 30.000 0.000 NA   NA
 10210176 10210177 SJA_C1-03420 SJA_C1-03430     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA   NA
 10210177 10210178 SJA_C1-03430 SJA_C1-03440     FALSE 0.212 113.000 0.000 NA   NA
 10210179 10210180 SJA_C1-03450 SJA_C1-03460     FALSE 0.056 190.000 0.000 NA   NA
 10210181 10210182 SJA_C1-03470 SJA_C1-03480 tonB   FALSE 0.166 140.000 0.000 1.000   NA
 10210182 10210183 SJA_C1-03480 SJA_C1-03490     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10210183 10210184 SJA_C1-03490 SJA_C1-03500   virD2 FALSE 0.125 150.000 0.000 NA   NA
 10210186 10210187 SJA_C1-03520 SJA_C1-03530     FALSE 0.193 73.000 0.000 1.000   NA
 10210187 10210188 SJA_C1-03530 SJA_C1-03540     FALSE 0.209 58.000 0.000 1.000   NA
 10210189 10210190 SJA_C1-03550 SJA_C1-03560     TRUE 0.560 12.000 0.000 NA   NA
 10210190 10210191 SJA_C1-03560 SJA_C1-03570     FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 10210191 10210192 SJA_C1-03570 SJA_C1-03580     FALSE 0.007 342.000 0.000 NA   NA
 10210193 10210194 SJA_C1-03590 SJA_C1-03600   hels FALSE 0.043 203.000 0.000 NA   NA
 10210194 10210195 SJA_C1-03600 SJA_C1-03610 hels   TRUE 0.989 -13.000 0.750 NA   NA
 10210195 10210196 SJA_C1-03610 SJA_C1-03620     FALSE 0.462 16.000 0.000 NA   NA
 10210197 10210198 SJA_C1-03630 SJA_C1-03640     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10210202 10210203 SJA_C1-03680 SJA_C1-03690     FALSE 0.004 440.000 0.000 NA   NA
 10210205 10210206 SJA_C1-03710 SJA_C1-03720     FALSE 0.041 207.000 0.000 NA   NA
 10210206 10210207 SJA_C1-03720 SJA_C1-03730     TRUE 0.738 139.000 0.320 NA   NA
 10210207 10210208 SJA_C1-03730 SJA_C1-03740     TRUE 0.987 -3.000 0.286 NA   NA
 10210208 10210209 SJA_C1-03740 SJA_C1-03750     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10210210 10210211 SJA_C1-03760 SJA_C1-03770     FALSE 0.024 244.000 0.000 NA   NA
 10210211 10210212 SJA_C1-03770 SJA_C1-03780     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210212 10210213 SJA_C1-03780 SJA_C1-03790     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10210215 10210216 SJA_C1-03810 SJA_C1-03820   fadB TRUE 0.891 -3.000 0.000 0.054   NA
 10210216 10210217 SJA_C1-03820 SJA_C1-03830 fadB   TRUE 0.975 2.000 0.067 1.000 Y NA
 10210217 10210218 SJA_C1-03830 SJA_C1-03840     TRUE 0.993 -7.000 0.375 0.081 Y NA
 10210218 10210219 SJA_C1-03840 SJA_C1-03850     TRUE 0.971 -7.000 0.200 NA   NA
 10210219 10210220 SJA_C1-03850 SJA_C1-03860     TRUE 0.957 4.000 0.182 NA   NA
 10210220 10210221 SJA_C1-03860 SJA_C1-03870     TRUE 0.764 43.000 0.182 NA   NA
 10210221 10210222 SJA_C1-03870 SJA_C1-03880     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210223 10210224 SJA_C1-03890 SJA_C1-03900     TRUE 0.975 -3.000 0.107 NA   NA
 10210224 10210225 SJA_C1-03900 SJA_C1-03910     TRUE 0.846 66.000 0.500 NA   NA
 10210225 10210226 SJA_C1-03910 SJA_C1-03920     TRUE 0.864 104.000 0.500 NA N NA
 10210227 10210228 SJA_C1-03930 SJA_C1-03940     TRUE 0.985 11.000 0.400 1.000 Y NA
 10210228 10210229 SJA_C1-03940 SJA_C1-03950   fadA TRUE 0.985 4.000 0.222 1.000 Y NA
 10210229 10210230 SJA_C1-03950 SJA_C1-03960 fadA   TRUE 0.945 19.000 0.167 1.000 Y NA
 10210230 10210231 SJA_C1-03960 SJA_C1-03970     TRUE 0.985 5.000 0.250 1.000 Y NA
 10210231 10210232 SJA_C1-03970 SJA_C1-03980     TRUE 0.986 -3.000 0.250 NA   NA
 10210232 10210233 SJA_C1-03980 SJA_C1-03990   luxR TRUE 0.881 67.000 0.667 NA   NA
 10210233 10210234 SJA_C1-03990 SJA_C1-04000 luxR   TRUE 0.937 3.000 0.000 0.061 Y NA
 10210236 10210237 SJA_C1-04020 SJA_C1-04030     FALSE 0.188 85.000 0.000 NA   NA
 10210239 10210240 SJA_C1-04050 SJA_C1-04060     FALSE 0.131 160.000 0.000 0.073   NA
 10210240 10210241 SJA_C1-04060 SJA_C1-04070   ybjD TRUE 0.992 -13.000 0.390 0.073 Y NA
 10210241 10210242 SJA_C1-04070 SJA_C1-04080 ybjD   FALSE 0.339 30.000 0.000 1.000   NA
 10210242 10210243 SJA_C1-04080 SJA_C1-04090     TRUE 0.878 53.000 0.565 1.000   NA
 10210243 10210244 SJA_C1-04090 SJA_C1-04100     TRUE 0.732 -10.000 0.000 NA   NA
 10210245 10210246 SJA_C1-04110 SJA_C1-04120     TRUE 0.635 -85.000 0.000 NA   NA
 10210246 10210247 SJA_C1-04120 SJA_C1-04130   dnaE TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10210251 10210252 SJA_C1-04170 SJA_C1-04180 ardC   FALSE 0.112 154.000 0.000 NA   NA
 10210252 10210253 SJA_C1-04180 SJA_C1-04190     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210253 10210254 SJA_C1-04190 SJA_C1-04200     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10210254 10210255 SJA_C1-04200 SJA_C1-04210   ardC TRUE 0.765 45.000 0.200 NA   NA
 10210255 10210256 SJA_C1-04210 SJA_C1-04220 ardC ardC TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210256 10210257 SJA_C1-04220 SJA_C1-04230 ardC arsR TRUE 0.662 -28.000 0.000 NA   NA
 10210257 10210258 SJA_C1-04230 SJA_C1-04240 arsR arsC TRUE 0.939 13.000 0.250 1.000 N NA
 10210258 10210259 SJA_C1-04240 SJA_C1-04250 arsC arsC TRUE 0.989 -3.000 0.250 0.002 N NA
 10210259 10210260 SJA_C1-04250 SJA_C1-04260 arsC   TRUE 0.995 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 10210260 10210261 SJA_C1-04260 SJA_C1-04270     TRUE 0.955 -3.000 0.032 1.000 N NA
 10210261 10210262 SJA_C1-04270 SJA_C1-04280   arsH TRUE 0.922 0.000 0.032 NA   NA
 10210262 10210263 SJA_C1-04280 SJA_C1-04290 arsH   TRUE 0.786 147.000 0.500 NA   NA
 10210263 10210264 SJA_C1-04290 SJA_C1-04300     TRUE 0.768 113.000 0.250 NA   NA
 10210268 10210269 SJA_C1-04340 SJA_C1-04350     TRUE 0.878 78.000 0.667 NA   NA
 10210269 10210270 SJA_C1-04350 SJA_C1-04360     FALSE 0.036 215.000 0.000 NA   NA
 10210270 10210271 SJA_C1-04360 SJA_C1-04370     FALSE 0.010 308.000 0.000 NA   NA
 10210271 10210272 SJA_C1-04370 SJA_C1-04380     TRUE 0.639 193.000 0.667 NA   NA
 10210272 10210273 SJA_C1-04380 SJA_C1-04390     TRUE 0.973 13.000 0.667 NA   NA
 10210273 10210274 SJA_C1-04390 SJA_C1-04400     TRUE 0.992 0.000 0.667 1.000 N NA
 10210274 10210275 SJA_C1-04400 SJA_C1-04410     FALSE 0.041 206.000 0.000 NA   NA
 10210275 10210276 SJA_C1-04410 SJA_C1-04420   virD2 TRUE 0.993 -7.000 1.000 NA   NA
 10210276 10210277 SJA_C1-04420 SJA_C1-04430 virD2   FALSE 0.292 180.000 0.095 NA   NA
 10210277 10210278 SJA_C1-04430 SJA_C1-04440     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10210279 10210280 SJA_C1-04450 SJA_C1-04460     FALSE 0.073 194.000 0.000 0.017   NA
 10210281 10210282 SJA_C1-04470 SJA_C1-04480     FALSE 0.070 176.000 0.000 NA   NA
 10210282 10210283 SJA_C1-04480 SJA_C1-04490     TRUE 0.972 -3.000 0.095 NA   NA
 10210283 10210284 SJA_C1-04490 SJA_C1-04500     TRUE 0.892 3.000 0.032 NA   NA
 10210284 10210285 SJA_C1-04500 SJA_C1-04510     TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10210285 10210286 SJA_C1-04510 SJA_C1-04520     TRUE 0.662 -28.000 0.000 NA   NA
 10210287 10210288 SJA_C1-04530 SJA_C1-04540     TRUE 0.987 -3.000 0.259 NA   NA
 10210288 10210289 SJA_C1-04540 SJA_C1-04550     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10210289 10210290 SJA_C1-04550 SJA_C1-04560   traO FALSE 0.097 161.000 0.000 NA   NA
 10210290 10210291 SJA_C1-04560 SJA_C1-04570 traO virD4 TRUE 0.992 -10.000 1.000 NA   NA
 10210291 10210292 SJA_C1-04570 SJA_C1-04580 virD4 virB11 TRUE 0.995 -16.000 0.750 1.000 Y NA
 10210292 10210293 SJA_C1-04580 SJA_C1-04590 virB11 virB10 TRUE 0.995 4.000 0.750 1.000 Y NA
 10210293 10210294 SJA_C1-04590 SJA_C1-04600 virB10 virB9 TRUE 0.995 4.000 0.750 NA Y NA
 10210294 10210295 SJA_C1-04600 SJA_C1-04610 virB9 virB8 TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA Y NA
 10210295 10210296 SJA_C1-04610 SJA_C1-04620 virB8   TRUE 0.709 -13.000 0.000 NA   NA
 10210296 10210297 SJA_C1-04620 SJA_C1-04630   virB6 TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10210297 10210298 SJA_C1-04630 SJA_C1-04640 virB6 virB5 FALSE 0.028 237.000 0.000 NA   NA
 10210298 10210299 SJA_C1-04640 SJA_C1-04650 virB5 virB4 TRUE 0.989 4.000 0.800 NA   NA
 10210299 10210300 SJA_C1-04650 SJA_C1-04660 virB4 virB3 TRUE 0.991 -13.000 0.400 NA Y NA
 10210300 10210301 SJA_C1-04660 SJA_C1-04670 virB3 virB2 TRUE 0.994 -3.000 0.235 NA Y NA
 10210301 10210302 SJA_C1-04670 SJA_C1-04680 virB2 virB1 TRUE 0.984 -3.000 0.211 NA   NA
 10210302 10210303 SJA_C1-04680 SJA_C1-04690 virB1   TRUE 0.974 -3.000 0.105 NA   NA
 10210303 10210304 SJA_C1-04690 SJA_C1-04700     TRUE 0.883 64.000 0.667 NA   NA
 10210304 10210305 SJA_C1-04700 SJA_C1-04710   luxI TRUE 0.984 12.000 1.000 NA   NA
 10210305 10210306 SJA_C1-04710 SJA_C1-04720 luxI luxR TRUE 0.886 75.000 0.667 1.000 N NA
 10210306 10210307 SJA_C1-04720 SJA_C1-04730 luxR luxR TRUE 0.985 14.000 0.500 0.018 Y NA
 10210309 10210310 SJA_C1-04750 SJA_C1-04760     TRUE 0.992 -3.000 0.457 NA   NA
 10210311 10210312 SJA_C1-04770 SJA_C1-04780     TRUE 0.987 -3.000 0.246 1.000 N NA
 10210312 10210313 SJA_C1-04780 SJA_C1-04790   prsA TRUE 0.996 -3.000 0.412 1.000 Y NA
 10210316 10210317 SJA_C1-04820 SJA_C1-04830   copA TRUE 0.987 -3.000 0.222 1.000 N NA
 10210317 10210318 SJA_C1-04830 SJA_C1-04840 copA ubiE FALSE 0.268 111.000 0.000 0.079   NA
 10210318 10210319 SJA_C1-04840 SJA_C1-04850 ubiE copD FALSE 0.291 39.000 0.000 1.000   NA
 10210319 10210320 SJA_C1-04850 SJA_C1-04860 copD copC TRUE 0.971 5.000 0.333 1.000   NA
 10210321 10210322 SJA_C1-04870 SJA_C1-04880     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 10210322 10210323 SJA_C1-04880 SJA_C1-04890   rpoE TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 10210323 10210324 SJA_C1-04890 SJA_C1-04900 rpoE   TRUE 0.857 67.000 0.500 1.000 N NA
 10210324 10210325 SJA_C1-04900 SJA_C1-04910   copB TRUE 0.988 0.000 0.364 0.005 N NA
 10210325 10210326 SJA_C1-04910 SJA_C1-04920 copB   TRUE 0.756 91.000 0.273 NA   NA
 10210326 10210327 SJA_C1-04920 SJA_C1-04930     TRUE 0.852 59.000 0.500 NA   NA
 10210327 10210328 SJA_C1-04930 SJA_C1-04940   uhpA TRUE 0.994 -10.000 0.500 0.084 Y NA
 10210328 10210329 SJA_C1-04940 SJA_C1-04950 uhpA   TRUE 0.846 82.000 0.143 0.020 Y NA
 10210330 10210331 SJA_C1-04960 SJA_C1-04970   tnpA FALSE 0.034 238.000 0.000 1.000 N NA
 10210332 10210333 SJA_C1-04980 SJA_C1-04990 tnpR   TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10210334 10210335 SJA_C1-05000 SJA_C1-05010   stbE FALSE 0.009 321.000 0.000 NA   NA
 10210335 10210336 SJA_C1-05010 SJA_C1-05020 stbE relB TRUE 0.954 -13.000 0.154 NA   NA
 10210336 10210337 SJA_C1-05020 SJA_C1-05030 relB   FALSE 0.005 385.000 0.000 NA   NA
 10210337 10210338 SJA_C1-05030 SJA_C1-05040     TRUE 0.644 80.000 0.143 NA   NA
 10210338 10210339 SJA_C1-05040 SJA_C1-05050   copB TRUE 0.966 -6.000 0.143 NA   NA
 10210339 10210340 SJA_C1-05050 SJA_C1-05060 copB copA TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.005 N NA
 10210340 10210341 SJA_C1-05060 SJA_C1-05070 copA adh TRUE 0.579 26.000 0.018 1.000   NA
 10210341 10210342 SJA_C1-05070 SJA_C1-05080 adh   TRUE 0.611 26.000 0.024 1.000   NA
 10210342 10210343 SJA_C1-05080 SJA_C1-05090     FALSE 0.004 443.000 0.000 NA   NA
 10210345 10210346 SJA_C1-05110 SJA_C1-05120     FALSE 0.170 132.000 0.000 NA   NA
 10210346 10210347 SJA_C1-05120 SJA_C1-05130     FALSE 0.481 15.000 0.000 NA   NA
 10210347 10210348 SJA_C1-05130 SJA_C1-05140     TRUE 0.948 -13.000 0.129 NA   NA
 10210348 10210349 SJA_C1-05140 SJA_C1-05150     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 10210349 10210350 SJA_C1-05150 SJA_C1-05160     TRUE 0.933 0.000 0.042 NA   NA
 10210350 10210351 SJA_C1-05160 SJA_C1-05170     TRUE 0.574 24.000 0.017 NA   NA
 10210351 10210352 SJA_C1-05170 SJA_C1-05180     TRUE 0.886 60.000 0.667 NA   NA
 10210352 10210353 SJA_C1-05180 SJA_C1-05190     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 10210353 10210354 SJA_C1-05190 SJA_C1-05200     TRUE 0.870 141.000 0.750 NA   NA
 10210355 10210356 SJA_C1-05210 SJA_C1-05220     TRUE 0.913 78.000 1.000 NA   NA
 10210356 10210357 SJA_C1-05220 SJA_C1-05230   czcC TRUE 0.814 64.000 0.400 NA   NA
 10210357 10210358 SJA_C1-05230 SJA_C1-05240 czcC cusB TRUE 0.998 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 10210358 10210359 SJA_C1-05240 SJA_C1-05250 cusB cusA TRUE 0.994 -3.000 0.545 1.000 N NA
 10210359 10210360 SJA_C1-05250 SJA_C1-05260 cusA cusF TRUE 0.987 -3.000 0.273 NA   NA
 10210360 10210361 SJA_C1-05260 SJA_C1-05270 cusF   FALSE 0.023 249.000 0.000 NA   NA
 10210362 10210363 SJA_C1-05280 SJA_C1-05290   tnpR TRUE 0.980 -3.000 0.143 1.000   NA
 10210365 10210366 SJA_C1-05310 SJA_C1-05320 manB copA TRUE 0.968 -3.000 0.071 1.000   NA
 10210366 10210367 SJA_C1-05320 SJA_C1-05330 copA   TRUE 0.988 -3.000 0.071 1.000 Y NA
 10210367 10210368 SJA_C1-05330 SJA_C1-05340     TRUE 0.989 -3.000 0.080 1.000 Y NA
 10210368 10210369 SJA_C1-05340 SJA_C1-05350     TRUE 0.926 4.000 0.080 NA   NA
 10210369 10210370 SJA_C1-05350 SJA_C1-05360     TRUE 0.931 48.000 1.000 NA   NA
 10210370 10210371 SJA_C1-05360 SJA_C1-05370     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10210371 10210372 SJA_C1-05370 SJA_C1-05380   cusA FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 10210372 10210373 SJA_C1-05380 SJA_C1-05390 cusA czcB TRUE 0.984 4.000 0.500 1.000 N NA
 10210373 10210374 SJA_C1-05390 SJA_C1-05400 czcB czcC TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 10210374 10210375 SJA_C1-05400 SJA_C1-05410 czcC   TRUE 0.898 61.000 0.750 NA   NA
 10210375 10210376 SJA_C1-05410 SJA_C1-05420     FALSE 0.446 41.000 0.016 NA   NA
 10210376 10210377 SJA_C1-05420 SJA_C1-05430     TRUE 0.974 0.000 0.032 1.000 Y NA
 10210379 10210380 SJA_C1-05450 SJA_C1-05460     FALSE 0.014 290.000 0.000 1.000   NA
 10210381 10210382 SJA_C1-05470 SJA_C1-05480     TRUE 0.988 -73.000 1.000 NA   NA
 10210383 10210384 SJA_C1-05490 SJA_C1-05500   tnpR FALSE 0.244 77.000 0.000 0.018   NA
 10210388 10210389 SJA_C1-05540 SJA_C1-05550     FALSE 0.181 73.000 0.000 NA   NA
 10210389 10210390 SJA_C1-05550 SJA_C1-05560     FALSE 0.273 47.000 0.000 1.000 N NA
 10210390 10210391 SJA_C1-05560 SJA_C1-05570     TRUE 0.960 14.000 0.500 NA   NA
 10210391 10210392 SJA_C1-05570 SJA_C1-05580     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10210392 10210393 SJA_C1-05580 SJA_C1-05590   linC FALSE 0.389 22.000 0.000 NA   NA
 10210393 10210394 SJA_C1-05590 SJA_C1-05600 linC   FALSE 0.286 40.000 0.000 1.000   NA
 10210394 10210395 SJA_C1-05600 SJA_C1-05610   tnp FALSE 0.275 42.000 0.000 1.000   NA
 10210399 10210400 SJA_C1-05650 SJA_C1-05660   bdh FALSE 0.003 483.000 0.000 NA   NA
 10210400 10210401 SJA_C1-05660 SJA_C1-05670 bdh   TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10210401 10210402 SJA_C1-05670 SJA_C1-05680   adc FALSE 0.205 91.000 0.000 1.000   NA
 10210403 10210404 SJA_C1-05690 SJA_C1-05700     FALSE 0.212 113.000 0.000 NA   NA
 10210404 10210405 SJA_C1-05700 SJA_C1-05710     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 10210406 10210407 SJA_C1-05720 SJA_C1-05730   guaA FALSE 0.006 391.000 0.002 1.000 N NA
 10210407 10210408 SJA_C1-05730 SJA_C1-05740 guaA   FALSE 0.253 43.000 0.000 NA   NA
 10210408 10210409 SJA_C1-05740 SJA_C1-05750     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 10210409 10210410 SJA_C1-05750 SJA_C1-05760     FALSE 0.192 93.000 0.000 NA   NA
 10210410 10210411 SJA_C1-05760 SJA_C1-05770   preP FALSE 0.314 71.000 0.014 NA   NA
 10210411 10210412 SJA_C1-05770 SJA_C1-05780 preP rplQ FALSE 0.041 230.000 0.002 1.000 N NA
 10210412 10210413 SJA_C1-05780 SJA_C1-05790 rplQ rpoA TRUE 0.773 178.000 0.873 1.000 N NA
 10210413 10210414 SJA_C1-05790 SJA_C1-05800 rpoA rpsK TRUE 0.796 122.000 0.308 1.000 N NA
 10210414 10210415 SJA_C1-05800 SJA_C1-05810 rpsK rpsM TRUE 0.963 102.000 0.810 0.014 Y NA
 10210419 10210420 SJA_C1-05850 SJA_C1-05860     TRUE 0.904 11.000 0.111 NA   NA
 10210420 10210421 SJA_C1-05860 SJA_C1-t0090     FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10210422 10210423 SJA_C1-05870 SJA_C1-05880 yajC secD TRUE 0.962 10.000 0.099 NA Y NA
 10210423 10210424 SJA_C1-05880 SJA_C1-05890 secD secF TRUE 0.977 16.000 0.356 0.001 Y NA
 10210424 10210425 SJA_C1-05890 SJA_C1-05900 secF   TRUE 0.594 129.000 0.113 NA   NA
 10210425 10210426 SJA_C1-05900 SJA_C1-05910   ppx FALSE 0.198 103.000 0.000 NA   NA
 10210426 10210427 SJA_C1-05910 SJA_C1-05920 ppx ftsJ TRUE 0.867 35.000 0.316 NA N NA
 10210427 10210428 SJA_C1-05920 SJA_C1-05930 ftsJ comM FALSE 0.411 110.000 0.017 NA N NA
 10210429 10210430 SJA_C1-05940 SJA_C1-05950     TRUE 0.728 18.000 0.034 1.000   NA
 10210430 10210431 SJA_C1-05950 SJA_C1-05960     TRUE 0.977 -3.000 0.119 1.000   NA
 10210431 10210432 SJA_C1-05960 SJA_C1-05970     TRUE 0.742 21.000 0.041 0.078   NA
 10210432 10210433 SJA_C1-05970 SJA_C1-05980     TRUE 0.769 23.000 0.057 0.078 N NA
 10210434 10210435 SJA_C1-05990 SJA_C1-06000 dgoK dgoAa TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 10210437 10210438 SJA_C1-06020 SJA_C1-06030 cox15 rplM FALSE 0.202 149.000 0.006 1.000 N NA
 10210438 10210439 SJA_C1-06030 SJA_C1-06040 rplM rpsI TRUE 0.992 0.000 0.231 0.014 Y NA
 10210439 10210440 SJA_C1-06040 SJA_C1-06050 rpsI   FALSE 0.034 228.000 0.000 1.000   NA
 10210442 10210443 SJA_C1-06070 SJA_C1-06080     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10210443 10210444 SJA_C1-06080 SJA_C1-06090     FALSE 0.196 70.000 0.000 1.000   NA
 10210444 10210445 SJA_C1-06090 SJA_C1-06100     TRUE 0.896 -3.000 0.000 0.010   NA
 10210447 10210448 SJA_C1-06120 SJA_C1-06130     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10210449 10210450 SJA_C1-06140 SJA_C1-06150     FALSE 0.003 552.000 0.000 NA   NA
 10210451 10210452 SJA_C1-06160 SJA_C1-06170     TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10210452 10210453 SJA_C1-06170 SJA_C1-06180     FALSE 0.265 41.000 0.000 NA   NA
 10210454 10210455 SJA_C1-06190 SJA_C1-06200     FALSE 0.094 162.000 0.000 NA   NA
 10210455 10210456 SJA_C1-06200 SJA_C1-06210     FALSE 0.020 259.000 0.000 NA   NA
 10210457 10210458 SJA_C1-06220 SJA_C1-06230 rpsL rpsG TRUE 0.986 16.000 0.620 0.003 Y NA
 10210458 10210459 SJA_C1-06230 SJA_C1-06240 rpsG fusA TRUE 0.593 175.000 0.114 1.000 Y NA
 10210459 10210460 SJA_C1-06240 SJA_C1-06250 fusA tufA TRUE 0.799 137.000 0.102 0.001 Y NA
 10210460 10210461 SJA_C1-06250 SJA_C1-06260 tufA rpsJ TRUE 0.603 210.000 0.318 1.000 Y NA
 10210461 10210462 SJA_C1-06260 SJA_C1-06270 rpsJ rplC FALSE 0.272 318.000 0.307 0.019 Y NA
 10210462 10210463 SJA_C1-06270 SJA_C1-06280 rplC rplD TRUE 0.994 3.000 0.486 0.014 Y NA
 10210463 10210464 SJA_C1-06280 SJA_C1-06290 rplD rplW TRUE 0.996 -7.000 0.513 0.014 Y NA
 10210464 10210465 SJA_C1-06290 SJA_C1-06300 rplW rplB TRUE 0.997 3.000 0.849 0.014 Y NA
 10210465 10210466 SJA_C1-06300 SJA_C1-06310 rplB rpsS TRUE 0.995 6.000 0.820 0.019 Y NA
 10210466 10210467 SJA_C1-06310 SJA_C1-06320 rpsS rplV TRUE 0.988 0.000 0.119 0.019 Y NA
 10210467 10210468 SJA_C1-06320 SJA_C1-06330 rplV rpsC TRUE 0.977 5.000 0.109 0.019 Y NA
 10210468 10210469 SJA_C1-06330 SJA_C1-06340 rpsC rplP TRUE 0.986 22.000 0.828 0.019 Y NA
 10210469 10210470 SJA_C1-06340 SJA_C1-06350 rplP rpmC TRUE 0.996 4.000 0.802 0.014 Y NA
 10210470 10210471 SJA_C1-06350 SJA_C1-06360 rpmC rpsQ TRUE 0.992 13.000 0.828 0.014 Y NA
 10210471 10210472 SJA_C1-06360 SJA_C1-06370 rpsQ rplN TRUE 0.906 165.000 0.791 0.019 Y NA
 10210472 10210473 SJA_C1-06370 SJA_C1-06380 rplN rplX TRUE 0.997 0.000 0.810 0.019 Y NA
 10210473 10210474 SJA_C1-06380 SJA_C1-06390 rplX rplE TRUE 0.997 0.000 0.758 0.014 Y NA
 10210474 10210475 SJA_C1-06390 SJA_C1-06400 rplE rpsN TRUE 0.917 51.000 0.309 0.014 Y NA
 10210475 10210476 SJA_C1-06400 SJA_C1-06410 rpsN rpsH TRUE 0.978 13.000 0.295 0.014 Y NA
 10210476 10210477 SJA_C1-06410 SJA_C1-06420 rpsH rplF TRUE 0.997 0.000 0.808 0.014 Y NA
 10210477 10210478 SJA_C1-06420 SJA_C1-06430 rplF rplR TRUE 0.997 2.000 0.815 0.014 Y NA
 10210478 10210479 SJA_C1-06430 SJA_C1-06440 rplR rpsE TRUE 0.996 4.000 0.814 0.019 Y NA
 10210479 10210480 SJA_C1-06440 SJA_C1-06450 rpsE rpmD TRUE 0.995 7.000 0.789 0.019 Y NA
 10210480 10210481 SJA_C1-06450 SJA_C1-06460 rpmD rplO TRUE 0.914 154.000 0.653 0.002 Y NA
 10210481 10210482 SJA_C1-06460 SJA_C1-06470 rplO secY TRUE 0.693 191.000 0.730 1.000 N NA
 10210482 10210483 SJA_C1-06470 SJA_C1-06480 secY adk FALSE 0.504 42.000 0.019 1.000 N NA
 10210483 10210484 SJA_C1-06480 SJA_C1-06490 adk   TRUE 0.859 33.000 0.300 NA   NA
 10210484 10210485 SJA_C1-06490 SJA_C1-06500     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 10210485 10210486 SJA_C1-06500 SJA_C1-06510     FALSE 0.190 86.000 0.000 NA   NA
 10210486 10210487 SJA_C1-06510 SJA_C1-06520     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10210489 10210490 SJA_C1-06540 SJA_C1-06550 mgtE   TRUE 0.703 29.000 0.069 NA   NA
 10210491 10210492 SJA_C1-06560 SJA_C1-06570 dpo   TRUE 0.767 6.000 0.009 NA   NA
 10210492 10210493 SJA_C1-06570 SJA_C1-06580     FALSE 0.460 54.000 0.034 NA   NA
 10210493 10210494 SJA_C1-06580 SJA_C1-06590     TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10210494 10210495 SJA_C1-06590 SJA_C1-06600     FALSE 0.240 47.000 0.000 1.000   NA
 10210495 10210496 SJA_C1-06600 SJA_C1-06610     FALSE 0.150 151.000 0.000 1.000 N NA
 10210497 10210498 SJA_C1-06620 SJA_C1-06630 rpsU   FALSE 0.515 82.000 0.062 1.000   NA
 10210499 10210500 SJA_C1-06640 SJA_C1-06650   lepB TRUE 0.863 24.000 0.209 NA   NA
 10210500 10210501 SJA_C1-06650 SJA_C1-06660 lepB acpS TRUE 0.529 32.000 0.018 1.000   NA
 10210501 10210502 SJA_C1-06660 SJA_C1-06670 acpS pdxJ TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10210502 10210503 SJA_C1-06670 SJA_C1-06680 pdxJ pyrE TRUE 0.748 4.000 0.000 1.000 N NA
 10210504 10210505 SJA_C1-06690 SJA_C1-06700 coxB coxA TRUE 0.986 19.000 0.741 0.004 Y NA
 10210505 10210506 SJA_C1-06700 SJA_C1-06710 coxA cyoE TRUE 0.732 118.000 0.153 0.047 N NA
 10210506 10210507 SJA_C1-06710 SJA_C1-06720 cyoE   TRUE 0.910 -3.000 0.009 NA   NA
 10210507 10210508 SJA_C1-06720 SJA_C1-06730   cox11 TRUE 0.882 0.000 0.013 NA   NA
 10210508 10210509 SJA_C1-06730 SJA_C1-06740 cox11 cox3 TRUE 0.918 37.000 0.536 1.000 N NA
 10210509 10210510 SJA_C1-06740 SJA_C1-06750 cox3   TRUE 0.618 73.000 0.122 NA   NA
 10210510 10210511 SJA_C1-06750 SJA_C1-06760     TRUE 0.979 -3.000 0.140 NA   NA
 10210511 10210512 SJA_C1-06760 SJA_C1-06770   thrC FALSE 0.387 43.000 0.011 NA   NA
 10210512 10210513 SJA_C1-06770 SJA_C1-06780 thrC   TRUE 0.840 2.000 0.011 NA   NA
 10210514 10210515 SJA_C1-06790 SJA_C1-06800 marC   TRUE 0.956 -3.000 0.042 NA   NA
 10210515 10210516 SJA_C1-06800 SJA_C1-06810   folD TRUE 0.975 -3.000 0.107 NA   NA
 10210516 10210517 SJA_C1-06810 SJA_C1-06820 folD   TRUE 0.680 15.000 0.017 NA   NA
 10210517 10210518 SJA_C1-06820 SJA_C1-06830     TRUE 0.985 -3.000 0.220 NA   NA
 10210518 10210519 SJA_C1-06830 SJA_C1-06840   argB FALSE 0.070 189.000 0.004 NA   NA
 10210519 10210520 SJA_C1-06840 SJA_C1-06850 argB   FALSE 0.462 26.000 0.008 NA   NA
 10210520 10210521 SJA_C1-06850 SJA_C1-06860   crtZ FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 10210521 10210522 SJA_C1-06860 SJA_C1-06870 crtZ   FALSE 0.207 107.000 0.000 NA   NA
 10210522 10210523 SJA_C1-06870 SJA_C1-06880   mscS FALSE 0.022 253.000 0.000 NA   NA
 10210523 10210524 SJA_C1-06880 SJA_C1-06890 mscS metC TRUE 0.965 -3.000 0.069 NA   NA
 10210524 10210525 SJA_C1-06890 SJA_C1-06900 metC sseA TRUE 0.975 -3.000 0.094 1.000 N NA
 10210525 10210526 SJA_C1-06900 SJA_C1-06910 sseA   FALSE 0.459 96.000 0.040 NA   NA
 10210527 10210528 SJA_C1-06920 SJA_C1-06930 ykvM npepps FALSE 0.023 253.000 0.000 1.000   NA
 10210529 10210530 SJA_C1-06940 SJA_C1-06950 opt   FALSE 0.183 79.000 0.000 NA   NA
 10210530 10210531 SJA_C1-06950 SJA_C1-06960     TRUE 0.642 -43.000 0.000 NA   NA
 10210532 10210533 SJA_C1-t0100 SJA_C1-06970     FALSE 0.006 351.000 0.000 NA   NA
 10210534 10210535 SJA_C1-06980 SJA_C1-06990     TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.047 Y NA
 10210535 10210536 SJA_C1-06990 SJA_C1-07000     TRUE 0.988 -7.000 0.467 0.053 N NA
 10210538 10210539 SJA_C1-07020 SJA_C1-07030     FALSE 0.005 390.000 0.000 NA   NA
 10210540 10210541 SJA_C1-07040 SJA_C1-07050   papD TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10210541 10210542 SJA_C1-07050 SJA_C1-07060 papD papC TRUE 0.992 -19.000 0.500 NA Y NA
 10210542 10210543 SJA_C1-07060 SJA_C1-07070 papC   TRUE 0.979 -3.000 0.143 NA   NA
 10210544 10210545 SJA_C1-07080 SJA_C1-07090     FALSE 0.037 213.000 0.000 NA   NA
 10210547 10210548 SJA_C1-07110 SJA_C1-07120   copA FALSE 0.185 142.000 0.000 1.000 N NA
 10210549 10210550 SJA_C1-07130 SJA_C1-07140     TRUE 0.628 8.000 0.000 NA   NA
 10210551 10210552 SJA_C1-07150 SJA_C1-07160   cpxA FALSE 0.235 123.000 0.000 1.000 N NA
 10210552 10210553 SJA_C1-07160 SJA_C1-07170 cpxA cusR TRUE 0.723 121.000 0.035 1.000 Y NA
 10210553 10210554 SJA_C1-07170 SJA_C1-07180 cusR   TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10210554 10210555 SJA_C1-07180 SJA_C1-07190     FALSE 0.275 42.000 0.000 1.000   NA
 10210558 10210559 SJA_C1-07220 SJA_C1-07230 cls glpA FALSE 0.239 58.000 0.000 1.000 N NA
 10210559 10210560 SJA_C1-07230 SJA_C1-07240 glpA glpK TRUE 0.990 -3.000 0.074 0.001 Y NA
 10210560 10210561 SJA_C1-07240 SJA_C1-07250 glpK   FALSE 0.228 67.000 0.000 1.000 N NA
 10210561 10210562 SJA_C1-07250 SJA_C1-07260     FALSE 0.094 162.000 0.000 NA   NA
 10210563 10210564 SJA_C1-07270 SJA_C1-07280 glpX thrA FALSE 0.061 322.000 0.112 1.000 N NA
 10210564 10210565 SJA_C1-07280 SJA_C1-07290 thrA   FALSE 0.319 115.000 0.010 NA   NA
 10210566 10210567 SJA_C1-07300 SJA_C1-07310 tonB exbB TRUE 0.860 86.000 0.455 0.014 N NA
 10210567 10210568 SJA_C1-07310 SJA_C1-07320 exbB exbD TRUE 0.951 116.000 0.588 0.053 Y NA
 10210568 10210569 SJA_C1-07320 SJA_C1-07330 exbD exbD TRUE 0.937 20.000 0.118 0.044 Y NA
 10210569 10210570 SJA_C1-07330 SJA_C1-07340 exbD   FALSE 0.009 320.000 0.000 NA   NA
 10210572 10210573 SJA_C1-07360 SJA_C1-07370 pip   TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10210574 10210575 SJA_C1-07380 SJA_C1-07390     FALSE 0.294 53.000 0.008 NA   NA
 10210577 10210578 SJA_C1-07410 SJA_C1-07420     FALSE 0.411 80.000 0.029 NA   NA
 10210578 10210579 SJA_C1-07420 SJA_C1-07430     TRUE 0.531 28.000 0.012 NA N NA
 10210579 10210580 SJA_C1-07430 SJA_C1-07440     FALSE 0.024 244.000 0.000 NA   NA
 10210580 10210581 SJA_C1-07440 SJA_C1-07450     TRUE 0.967 -3.000 0.071 NA   NA
 10210581 10210582 SJA_C1-07450 SJA_C1-07460     TRUE 0.941 -7.000 0.071 NA   NA
 10210582 10210583 SJA_C1-07460 SJA_C1-07470     FALSE 0.389 22.000 0.000 NA   NA
 10210584 10210585 SJA_C1-07480 SJA_C1-07490     TRUE 0.895 6.000 0.062 NA   NA
 10210586 10210587 SJA_C1-07500 SJA_C1-07510     TRUE 0.989 -3.000 0.333 NA   NA
 10210588 10210589 SJA_C1-07520 SJA_C1-07530   xdhC FALSE 0.025 257.000 0.000 NA N NA
 10210590 10210591 SJA_C1-07540 SJA_C1-07550   cstA TRUE 0.984 -3.000 0.200 NA   NA
 10210593 10210594 SJA_C1-07570 SJA_C1-07580 phnA engB TRUE 0.714 4.000 0.000 1.000   NA
 10210594 10210595 SJA_C1-07580 SJA_C1-07590 engB yidC TRUE 0.901 11.000 0.082 0.046   NA
 10210595 10210596 SJA_C1-07590 SJA_C1-07600 yidC   TRUE 0.921 26.000 0.461 NA   NA
 10210596 10210597 SJA_C1-07600 SJA_C1-07610     TRUE 0.994 -3.000 0.540 NA   NA
 10210597 10210598 SJA_C1-07610 SJA_C1-07620   rpmH TRUE 0.945 33.000 0.787 1.000   NA
 10210598 10210599 SJA_C1-07620 SJA_C1-07630 rpmH dsbA FALSE 0.007 350.000 0.000 1.000   NA
 10210599 10210600 SJA_C1-07630 SJA_C1-07640 dsbA   TRUE 0.976 -3.000 0.109 1.000   NA
 10210600 10210601 SJA_C1-07640 SJA_C1-07650     TRUE 0.675 -21.000 0.000 NA   NA
 10210601 10210602 SJA_C1-07650 SJA_C1-07660     FALSE 0.006 370.000 0.000 NA   NA
 10210603 10210604 SJA_C1-07670 SJA_C1-07680 amiA mrcA TRUE 0.701 196.000 0.396 1.000 Y NA
 10210604 10210605 SJA_C1-07680 SJA_C1-07690 mrcA   FALSE 0.164 136.000 0.000 NA   NA
 10210605 10210606 SJA_C1-07690 SJA_C1-07700     FALSE 0.192 90.000 0.000 NA   NA
 10210606 10210607 SJA_C1-07700 SJA_C1-07710     FALSE 0.190 86.000 0.000 NA   NA
 10210609 10210610 SJA_C1-07730 SJA_C1-07740     FALSE 0.106 156.000 0.000 NA   NA
 10210614 10210615 SJA_C1-07780 SJA_C1-07790 prfB ubiE TRUE 0.867 0.000 0.008 1.000   NA
 10210615 10210616 SJA_C1-07790 SJA_C1-07800 ubiE   FALSE 0.193 91.000 0.000 NA   NA
 10210617 10210618 SJA_C1-07810 SJA_C1-07820     TRUE 0.867 16.000 0.133 NA   NA
 10210618 10210619 SJA_C1-07820 SJA_C1-07830     TRUE 0.961 5.000 0.240 NA   NA
 10210620 10210621 SJA_C1-07840 SJA_C1-07850     TRUE 0.995 -3.000 0.684 NA   NA
 10210621 10210622 SJA_C1-07850 SJA_C1-07860   typA FALSE 0.209 122.000 0.000 1.000   NA
 10210623 10210624 SJA_C1-07870 SJA_C1-07880     TRUE 0.983 6.000 0.637 NA   NA
 10210624 10210625 SJA_C1-07880 SJA_C1-07890   exbD FALSE 0.199 121.000 0.000 NA   NA
 10210626 10210627 SJA_C1-07900 SJA_C1-07910 thrS infC TRUE 0.851 127.000 0.186 1.000 Y NA
 10210628 10210629 SJA_C1-07920 SJA_C1-07930     FALSE 0.048 202.000 0.000 1.000   NA
 10210629 10210630 SJA_C1-07930 SJA_C1-07940     TRUE 0.889 -7.000 0.020 NA   NA
 10210630 10210631 SJA_C1-07940 SJA_C1-07950   gltX TRUE 0.804 10.000 0.022 NA   NA
 10210634 10210635 SJA_C1-07980 SJA_C1-07990 murA   TRUE 0.836 -7.000 0.004 1.000 N NA
 10210636 10210637 SJA_C1-08000 SJA_C1-08010     FALSE 0.181 73.000 0.000 NA   NA
 10210637 10210638 SJA_C1-08010 SJA_C1-08020   alkA TRUE 0.812 1.000 0.006 NA   NA
 10210640 10210641 SJA_C1-08040 SJA_C1-08050   yjfH TRUE 0.533 17.000 0.006 NA   NA
 10210642 10210643 SJA_C1-t0110 SJA_C1-08060   bglX FALSE 0.211 115.000 0.000 NA   NA
 10210643 10210644 SJA_C1-08060 SJA_C1-08070 bglX   FALSE 0.005 397.000 0.000 1.000   NA
 10210645 10210646 SJA_C1-08080 SJA_C1-08090     FALSE 0.247 44.000 0.000 NA   NA
 10210647 10210648 SJA_C1-08100 SJA_C1-08110     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 10210650 10210651 SJA_C1-08130 SJA_C1-08140 pabB   TRUE 0.892 47.000 0.219 1.000 Y NA
 10210651 10210652 SJA_C1-08140 SJA_C1-08150   aspB TRUE 0.581 149.000 0.026 1.000 Y NA
 10210652 10210653 SJA_C1-08150 SJA_C1-08160 aspB   FALSE 0.004 453.000 0.000 NA   NA
 10210653 10210654 SJA_C1-08160 SJA_C1-08170   msrA TRUE 0.859 -13.000 0.020 NA   NA
 10210654 10210655 SJA_C1-08170 SJA_C1-08180 msrA   TRUE 0.788 12.000 0.020 1.000 N NA
 10210656 10210657 SJA_C1-08190 SJA_C1-08200 ubiB coq5 TRUE 0.661 50.000 0.115 1.000   NA
 10210658 10210659 SJA_C1-08210 SJA_C1-08220 mutM rpsT FALSE 0.394 120.000 0.016 1.000 N NA
 10210661 10210662 SJA_C1-08240 SJA_C1-08250 dnaA   FALSE 0.378 32.000 0.002 1.000 N NA
 10210663 10210664 SJA_C1-08260 SJA_C1-08270   trpS FALSE 0.065 197.000 0.005 NA   NA
 10210664 10210665 SJA_C1-08270 SJA_C1-08280 trpS mviN TRUE 0.919 5.000 0.078 1.000   NA
 10210665 10210666 SJA_C1-08280 SJA_C1-08290 mviN secB FALSE 0.296 148.000 0.022 1.000   NA
 10210667 10210668 SJA_C1-08300 SJA_C1-08310   mltA TRUE 0.989 -3.000 0.324 1.000   NA
 10210668 10210669 SJA_C1-08310 SJA_C1-08320 mltA   TRUE 0.946 13.000 0.332 NA   NA
 10210669 10210670 SJA_C1-08320 SJA_C1-08330     FALSE 0.419 96.000 0.029 NA   NA
 10210672 10210673 SJA_C1-08350 SJA_C1-08360   mccF TRUE 0.963 -3.000 0.061 NA   NA
 10210675 10210676 SJA_C1-08380 SJA_C1-08390 trpG trpD TRUE 0.789 110.000 0.070 1.000 Y NA
 10210676 10210677 SJA_C1-08390 SJA_C1-08400 trpD trpC TRUE 0.995 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 10210677 10210678 SJA_C1-08400 SJA_C1-08410 trpC moaC TRUE 0.978 -3.000 0.113 1.000 N NA
 10210678 10210679 SJA_C1-08410 SJA_C1-08420 moaC moeA TRUE 0.980 -3.000 0.012 0.003 Y NA
 10210679 10210680 SJA_C1-08420 SJA_C1-08430 moeA   FALSE 0.134 147.000 0.000 NA   NA
 10210680 10210681 SJA_C1-08430 SJA_C1-08440   lexA FALSE 0.212 112.000 0.000 NA   NA
 10210685 10210686 SJA_C1-08480 SJA_C1-08490     FALSE 0.240 45.000 0.000 NA   NA
 10210686 10210687 SJA_C1-08490 SJA_C1-08500     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210687 10210688 SJA_C1-08500 SJA_C1-08510     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 10210688 10210689 SJA_C1-08510 SJA_C1-08520     FALSE 0.193 123.000 0.000 NA   NA
 10210689 10210690 SJA_C1-08520 SJA_C1-08530     FALSE 0.203 105.000 0.000 NA   NA
 10210690 10210691 SJA_C1-08530 SJA_C1-08540     FALSE 0.153 141.000 0.000 NA   NA
 10210691 10210692 SJA_C1-08540 SJA_C1-08550     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10210692 10210693 SJA_C1-08550 SJA_C1-08560     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10210693 10210694 SJA_C1-08560 SJA_C1-08570     FALSE 0.188 85.000 0.000 NA   NA
 10210694 10210695 SJA_C1-08570 SJA_C1-08580     FALSE 0.210 109.000 0.000 NA   NA
 10210695 10210696 SJA_C1-08580 SJA_C1-08590     FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 10210696 10210697 SJA_C1-08590 SJA_C1-08600     TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10210697 10210698 SJA_C1-08600 SJA_C1-08610     TRUE 0.737 2.000 0.000 NA   NA
 10210698 10210699 SJA_C1-08610 SJA_C1-08620     FALSE 0.212 51.000 0.000 NA   NA
 10210699 10210700 SJA_C1-08620 SJA_C1-08630     FALSE 0.002 738.000 0.000 NA   NA
 10210700 10210701 SJA_C1-08630 SJA_C1-08640     FALSE 0.361 25.000 0.000 NA   NA
 10210701 10210702 SJA_C1-08640 SJA_C1-08650     FALSE 0.003 658.000 0.000 NA   NA
 10210702 10210703 SJA_C1-08650 SJA_C1-08660     FALSE 0.195 59.000 0.000 NA   NA
 10210704 10210705 SJA_C1-08670 SJA_C1-08680     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210705 10210706 SJA_C1-08680 SJA_C1-08690     FALSE 0.247 44.000 0.000 NA   NA
 10210708 10210709 SJA_C1-08710 SJA_C1-08720     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210709 10210710 SJA_C1-08720 SJA_C1-08730     FALSE 0.005 383.000 0.000 NA   NA
 10210710 10210711 SJA_C1-08730 SJA_C1-08740     FALSE 0.134 147.000 0.000 NA   NA
 10210711 10210712 SJA_C1-08740 SJA_C1-08750     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10210713 10210714 SJA_C1-08760 SJA_C1-08770     FALSE 0.099 160.000 0.000 NA   NA
 10210715 10210716 SJA_C1-08780 SJA_C1-08790     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10210716 10210717 SJA_C1-08790 SJA_C1-08800     FALSE 0.194 100.000 0.000 NA   NA
 10210717 10210718 SJA_C1-08800 SJA_C1-08810     TRUE 0.737 2.000 0.000 NA   NA
 10210719 10210720 SJA_C1-08820 SJA_C1-08830     FALSE 0.182 72.000 0.000 NA   NA
 10210721 10210722 SJA_C1-08840 SJA_C1-08850     FALSE 0.400 21.000 0.000 NA   NA
 10210722 10210723 SJA_C1-08850 SJA_C1-08860     TRUE 0.674 5.000 0.000 NA   NA
 10210724 10210725 SJA_C1-08870 SJA_C1-08880     FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 10210725 10210726 SJA_C1-08880 SJA_C1-08890     TRUE 0.709 -13.000 0.000 NA   NA
 10210726 10210727 SJA_C1-08890 SJA_C1-08900     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 10210731 10210732 SJA_C1-08940 SJA_C1-08950 gltX gltA TRUE 0.865 18.000 0.127 1.000 N NA
 10210732 10210733 SJA_C1-08950 SJA_C1-08960 gltA recF FALSE 0.049 211.000 0.000 1.000 N NA
 10210733 10210734 SJA_C1-08960 SJA_C1-08970 recF   FALSE 0.229 108.000 0.003 NA   NA
 10210734 10210735 SJA_C1-08970 SJA_C1-08980     TRUE 0.678 87.000 0.167 NA   NA
 10210736 10210737 SJA_C1-08990 SJA_C1-09000     FALSE 0.366 63.000 0.019 NA   NA
 10210737 10210738 SJA_C1-09000 SJA_C1-09010     TRUE 0.988 4.000 0.750 NA   NA
 10210738 10210739 SJA_C1-09010 SJA_C1-09020     FALSE 0.192 94.000 0.000 NA   NA
 10210739 10210740 SJA_C1-09020 SJA_C1-09030   cfa FALSE 0.211 111.000 0.000 NA   NA
 10210740 10210741 SJA_C1-09030 SJA_C1-09040 cfa   TRUE 0.714 32.000 0.080 1.000   NA
 10210741 10210742 SJA_C1-09040 SJA_C1-09050     TRUE 0.997 -3.000 0.920 0.055   NA
 10210744 10210745 SJA_C1-09070 SJA_C1-09080     FALSE 0.205 87.000 0.002 NA   NA
 10210745 10210746 SJA_C1-09080 SJA_C1-09090     FALSE 0.093 165.000 0.002 NA   NA
 10210747 10210748 SJA_C1-09100 SJA_C1-09110 dnaN   FALSE 0.269 51.000 0.002 1.000 N NA
 10210748 10210749 SJA_C1-09110 SJA_C1-09120     FALSE 0.118 159.000 0.000 NA N NA
 10210749 10210750 SJA_C1-09120 SJA_C1-09130     TRUE 0.970 -31.000 0.103 NA Y NA
 10210751 10210752 SJA_C1-09140 SJA_C1-09150 apbE   TRUE 0.860 48.000 0.462 NA   NA
 10210752 10210753 SJA_C1-09150 SJA_C1-09160     TRUE 0.981 12.000 0.808 NA   NA
 10210753 10210754 SJA_C1-09160 SJA_C1-09170     TRUE 0.967 20.000 0.848 NA   NA
 10210760 10210761 SJA_C1-09220 SJA_C1-09230     FALSE 0.207 107.000 0.000 NA   NA
 10210762 10210763 SJA_C1-09240 SJA_C1-09250   ccdA FALSE 0.002 1075.000 0.000 NA   NA
 10210763 10210764 SJA_C1-09250 SJA_C1-09260 ccdA ccdB TRUE 0.981 0.000 0.298 NA   NA
 10210764 10210765 SJA_C1-09260 SJA_C1-09270 ccdB   FALSE 0.212 114.000 0.000 NA   NA
 10210765 10210766 SJA_C1-09270 SJA_C1-09280     TRUE 0.679 -19.000 0.000 NA   NA
 10210766 10210767 SJA_C1-09280 SJA_C1-09290     FALSE 0.209 116.000 0.000 NA   NA
 10210767 10210768 SJA_C1-09290 SJA_C1-09300     FALSE 0.043 203.000 0.000 NA   NA
 10210768 10210769 SJA_C1-09300 SJA_C1-09310     FALSE 0.150 142.000 0.000 NA   NA
 10210770 10210771 SJA_C1-09320 SJA_C1-09330     FALSE 0.322 30.000 0.000 NA   NA
 10210771 10210772 SJA_C1-09330 SJA_C1-09340     TRUE 0.968 -3.000 0.048 0.018 N NA
 10210772 10210773 SJA_C1-09340 SJA_C1-09350   ureJ TRUE 0.734 4.000 0.000 NA N NA
 10210773 10210774 SJA_C1-09350 SJA_C1-09360 ureJ ureG TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 10210774 10210775 SJA_C1-09360 SJA_C1-09370 ureG ureF TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 10210775 10210776 SJA_C1-09370 SJA_C1-09380 ureF ureE TRUE 0.993 -7.000 0.330 0.002 Y NA
 10210776 10210777 SJA_C1-09380 SJA_C1-09390 ureE ureC TRUE 0.961 12.000 0.315 0.001 N NA
 10210777 10210778 SJA_C1-09390 SJA_C1-09400 ureC ureB TRUE 0.996 0.000 0.486 0.001 Y NA
 10210778 10210779 SJA_C1-09400 SJA_C1-09410 ureB ureA TRUE 0.994 -16.000 0.595 0.001 Y NA
 10210779 10210780 SJA_C1-09410 SJA_C1-09420 ureA ureD TRUE 0.991 2.000 0.664 0.002 N NA
 10210781 10210782 SJA_C1-09430 SJA_C1-09440   livK FALSE 0.217 119.000 0.000 1.000   NA
 10210782 10210783 SJA_C1-09440 SJA_C1-09450 livK livH TRUE 0.836 115.000 0.118 1.000 Y NA
 10210783 10210784 SJA_C1-09450 SJA_C1-09460 livH livM TRUE 0.949 12.000 0.062 0.042 Y NA
 10210784 10210785 SJA_C1-09460 SJA_C1-09470 livM livG TRUE 0.968 -3.000 0.072 1.000   NA
 10210785 10210786 SJA_C1-09470 SJA_C1-09480 livG livF TRUE 0.988 -3.000 0.227 0.009   NA
 10210788 10210789 SJA_C1-09500 SJA_C1-09510     TRUE 0.989 -3.000 0.333 NA   NA
 10210789 10210790 SJA_C1-09510 SJA_C1-09520     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10210791 10210792 SJA_C1-09530 SJA_C1-09540 speE   FALSE 0.037 234.000 0.000 1.000 N NA
 10210792 10210793 SJA_C1-09540 SJA_C1-09550     FALSE 0.185 142.000 0.000 1.000 N NA
 10210794 10210795 SJA_C1-09560 SJA_C1-09570     FALSE 0.007 338.000 0.000 NA   NA
 10210795 10210796 SJA_C1-09570 SJA_C1-09580     FALSE 0.192 94.000 0.000 NA   NA
 10210796 10210797 SJA_C1-09580 SJA_C1-09590     FALSE 0.003 513.000 0.000 1.000   NA
 10210797 10210798 SJA_C1-09590 SJA_C1-09600     FALSE 0.302 36.000 0.000 1.000   NA
 10210798 10210799 SJA_C1-09600 SJA_C1-09610     TRUE 0.553 17.000 0.000 0.004   NA
 10210802 10210803 SJA_C1-09640 SJA_C1-09650     TRUE 0.990 -3.000 0.357 NA   NA
 10210804 10210805 SJA_C1-09660 SJA_C1-09670 dnaK dnaJ TRUE 0.890 64.000 0.236 0.003 Y NA
 10210806 10210807 SJA_C1-09680 SJA_C1-09690     FALSE 0.018 264.000 0.000 NA   NA
 10210807 10210808 SJA_C1-09690 SJA_C1-09700     TRUE 0.714 39.000 0.092 1.000 N NA
 10210809 10210810 SJA_C1-09710 SJA_C1-09720     TRUE 0.654 46.000 0.100 NA   NA
 10210810 10210811 SJA_C1-09720 SJA_C1-09730     TRUE 0.955 3.000 0.150 NA   NA
 10210811 10210812 SJA_C1-09730 SJA_C1-09740     FALSE 0.018 265.000 0.000 NA   NA
 10210812 10210813 SJA_C1-09740 SJA_C1-09750     FALSE 0.032 233.000 0.000 1.000   NA
 10210813 10210814 SJA_C1-09750 SJA_C1-09760     FALSE 0.034 229.000 0.000 1.000   NA
 10210814 10210815 SJA_C1-09760 SJA_C1-09770     TRUE 0.709 -13.000 0.000 NA   NA
 10210815 10210816 SJA_C1-09770 SJA_C1-09780     FALSE 0.038 212.000 0.000 NA   NA
 10210816 10210817 SJA_C1-09780 SJA_C1-09790     TRUE 0.723 -12.000 0.000 NA   NA
 10210817 10210818 SJA_C1-09790 SJA_C1-09800     TRUE 0.671 -24.000 0.000 NA   NA
 10210818 10210819 SJA_C1-09800 SJA_C1-09810     FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 10210819 10210820 SJA_C1-09810 SJA_C1-09820     FALSE 0.301 33.000 0.000 NA   NA
 10210820 10210821 SJA_C1-09820 SJA_C1-09830     TRUE 0.674 5.000 0.000 NA   NA
 10210822 10210823 SJA_C1-09840 SJA_C1-09850     TRUE 0.970 -31.000 0.103 NA Y NA
 10210823 10210824 SJA_C1-09850 SJA_C1-09860     FALSE 0.162 137.000 0.000 NA   NA
 10210824 10210825 SJA_C1-09860 SJA_C1-09870     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10210825 10210826 SJA_C1-09870 SJA_C1-09880     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10210827 10210828 SJA_C1-09890 SJA_C1-09900     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10210830 10210831 SJA_C1-09920 SJA_C1-09930     TRUE 0.709 -13.000 0.000 NA   NA
 10210833 10210834 SJA_C1-09950 SJA_C1-09960     FALSE 0.058 187.000 0.000 NA   NA
 10210834 10210835 SJA_C1-09960 SJA_C1-09970     FALSE 0.296 34.000 0.000 NA   NA
 10210835 10210836 SJA_C1-09970 SJA_C1-09980   tolA FALSE 0.379 23.000 0.000 NA   NA
 10210836 10210837 SJA_C1-09980 SJA_C1-09990 tolA   TRUE 0.584 11.000 0.000 NA   NA
 10210837 10210838 SJA_C1-09990 SJA_C1-10000     FALSE 0.128 149.000 0.000 NA   NA
 10210841 10210842 SJA_C1-10030 SJA_C1-10040     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10210842 10210843 SJA_C1-10040 SJA_C1-10050     FALSE 0.187 84.000 0.000 NA   NA
 10210844 10210845 SJA_C1-10060 SJA_C1-10070     FALSE 0.322 30.000 0.000 NA   NA
 10210845 10210846 SJA_C1-10070 SJA_C1-10080     FALSE 0.035 218.000 0.000 NA   NA
 10210847 10210848 SJA_C1-10090 SJA_C1-10100     TRUE 0.985 3.000 0.519 NA   NA
 10210848 10210849 SJA_C1-10100 SJA_C1-10110     FALSE 0.032 227.000 0.000 NA   NA
 10210851 10210852 SJA_C1-t0130 SJA_C1-10130   rpoC FALSE 0.029 234.000 0.000 NA   NA
 10210852 10210853 SJA_C1-10130 SJA_C1-10140 rpoC rpoB TRUE 0.866 154.000 0.851 0.001   NA
 10210857 10210858 SJA_C1-10180 SJA_C1-10190   cysK TRUE 0.559 31.000 0.018 1.000 N NA
 10210858 10210859 SJA_C1-10190 SJA_C1-10200 cysK   TRUE 0.965 -3.000 0.057 NA N NA
 10210859 10210860 SJA_C1-10200 SJA_C1-10210     FALSE 0.014 286.000 0.000 NA   NA
 10210860 10210861 SJA_C1-10210 SJA_C1-10220     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 10210861 10210862 SJA_C1-10220 SJA_C1-10230     FALSE 0.205 145.000 0.007 1.000   NA
 10210862 10210863 SJA_C1-10230 SJA_C1-10240   hflC TRUE 0.670 111.000 0.014 1.000 Y NA
 10210863 10210864 SJA_C1-10240 SJA_C1-10250 hflC hflK TRUE 0.997 0.000 0.947 1.000 Y NA
 10210865 10210866 SJA_C1-10260 SJA_C1-10270 mrp   FALSE 0.017 312.000 0.010 NA   NA
 10210866 10210867 SJA_C1-10270 SJA_C1-10280     FALSE 0.340 40.000 0.006 NA   NA
 10210867 10210868 SJA_C1-10280 SJA_C1-10290   hemH TRUE 0.978 -3.000 0.111 1.000 N NA
 10210868 10210869 SJA_C1-10290 SJA_C1-10300 hemH phbB TRUE 0.631 37.000 0.044 1.000 N NA
 10210869 10210870 SJA_C1-10300 SJA_C1-10310 phbB   TRUE 0.943 0.000 0.062 NA   NA
 10210870 10210871 SJA_C1-10310 SJA_C1-10320     FALSE 0.398 87.000 0.025 NA   NA
 10210871 10210872 SJA_C1-10320 SJA_C1-10330   tonB FALSE 0.244 176.000 0.033 0.098 N NA
 10210872 10210873 SJA_C1-10330 SJA_C1-10340 tonB   TRUE 0.704 29.000 0.066 1.000   NA
 10210873 10210874 SJA_C1-10340 SJA_C1-10350   prmA FALSE 0.120 154.000 0.000 1.000   NA
 10210875 10210876 SJA_C1-10360 SJA_C1-10370     TRUE 0.959 -3.000 0.049 NA   NA
 10210876 10210877 SJA_C1-10370 SJA_C1-10380     TRUE 0.984 0.000 0.338 NA   NA
 10210877 10210878 SJA_C1-10380 SJA_C1-10390   lemA TRUE 0.955 8.000 0.257 NA   NA
 10210879 10210880 SJA_C1-10400 SJA_C1-10410 mscL   TRUE 0.671 6.000 0.000 1.000   NA
 10210880 10210881 SJA_C1-10410 SJA_C1-10420     FALSE 0.030 233.000 0.000 NA   NA
 10210881 10210882 SJA_C1-10420 SJA_C1-10430   cheA FALSE 0.149 163.000 0.009 NA   NA
 10210882 10210883 SJA_C1-10430 SJA_C1-10440 cheA cheW TRUE 0.907 18.000 0.038 0.003 Y NA
 10210883 10210884 SJA_C1-10440 SJA_C1-10450 cheW cheY TRUE 0.908 83.000 0.375 1.000 Y NA
 10210884 10210885 SJA_C1-10450 SJA_C1-10460 cheY cheB TRUE 0.894 83.000 0.268 0.018 Y NA
 10210885 10210886 SJA_C1-10460 SJA_C1-10470 cheB cheR TRUE 0.863 57.000 0.183 1.000 Y NA
 10210886 10210887 SJA_C1-10470 SJA_C1-10480 cheR   TRUE 0.537 114.000 0.043 1.000 N NA
 10210887 10210888 SJA_C1-10480 SJA_C1-rnp0010     FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10210890 10210891 SJA_C1-10500 SJA_C1-10510 radA cvpA TRUE 0.887 12.000 0.094 1.000   NA
 10210891 10210892 SJA_C1-10510 SJA_C1-10520 cvpA   FALSE 0.193 92.000 0.000 NA   NA
 10210892 10210893 SJA_C1-10520 SJA_C1-10530   pepP FALSE 0.201 120.000 0.000 NA   NA
 10210895 10210896 SJA_C1-10550 SJA_C1-10560 ffh rpsP TRUE 0.849 46.000 0.361 1.000 N NA
 10210896 10210897 SJA_C1-10560 SJA_C1-10570 rpsP rimM TRUE 0.989 6.000 0.342 0.013 Y NA
 10210897 10210898 SJA_C1-10570 SJA_C1-10580 rimM   FALSE 0.181 74.000 0.000 NA   NA
 10210898 10210899 SJA_C1-10580 SJA_C1-10590   trmD TRUE 0.860 -3.000 0.002 NA   NA
 10210899 10210900 SJA_C1-10590 SJA_C1-10600 trmD rplS TRUE 0.987 13.000 0.567 1.000 Y NA
 10210900 10210901 SJA_C1-10600 SJA_C1-10610 rplS   FALSE 0.008 348.000 0.000 1.000 N NA
 10210901 10210902 SJA_C1-10610 SJA_C1-10620     FALSE 0.482 72.000 0.050 1.000   NA
 10210903 10210904 SJA_C1-10630 SJA_C1-10640   spoU TRUE 0.920 -3.000 0.011 1.000   NA
 10210904 10210905 SJA_C1-10640 SJA_C1-10650 spoU ham1 FALSE 0.231 86.000 0.000 1.000 N NA
 10210905 10210906 SJA_C1-10650 SJA_C1-10660 ham1 rph TRUE 0.798 49.000 0.262 1.000 N NA
 10210907 10210908 SJA_C1-10670 SJA_C1-10680   hrcA FALSE 0.268 45.000 0.003 NA   NA
 10210908 10210909 SJA_C1-10680 SJA_C1-10690 hrcA grpE TRUE 0.979 -3.000 0.120 1.000 N NA
 10210911 10210912 SJA_C1-10710 SJA_C1-10720 sdhC sdhD TRUE 0.993 0.000 0.291 0.001 Y NA
 10210912 10210913 SJA_C1-10720 SJA_C1-10730 sdhD sdhA TRUE 0.997 0.000 0.705 0.001 Y NA
 10210914 10210915 SJA_C1-10740 SJA_C1-10750     FALSE 0.245 120.000 0.000 1.000 N NA
 10210915 10210916 SJA_C1-10750 SJA_C1-10760     TRUE 0.997 -3.000 0.420 0.001 Y NA
 10210916 10210917 SJA_C1-10760 SJA_C1-10770     TRUE 0.803 33.000 0.171 1.000   NA
 10210917 10210918 SJA_C1-10770 SJA_C1-10780   ptsK TRUE 0.984 -3.000 0.194 1.000   NA
 10210918 10210919 SJA_C1-10780 SJA_C1-10790 ptsK sasA FALSE 0.284 250.000 0.304 0.012   NA
 10210919 10210920 SJA_C1-10790 SJA_C1-10800 sasA creB TRUE 0.994 -34.000 0.829 1.000 Y NA
 10210920 10210921 SJA_C1-10800 SJA_C1-10810 creB   TRUE 0.652 -31.000 0.000 NA   NA
 10210922 10210923 SJA_C1-10820 SJA_C1-10830 pckA   FALSE 0.266 116.000 0.005 NA   NA
 10210923 10210924 SJA_C1-10830 SJA_C1-10840     FALSE 0.045 201.000 0.000 NA   NA
 10210924 10210925 SJA_C1-10840 SJA_C1-10850   fpr FALSE 0.146 143.000 0.000 NA   NA
 10210926 10210927 SJA_C1-10860 SJA_C1-10870     FALSE 0.003 477.000 0.000 NA   NA
 10210928 10210929 SJA_C1-10880 SJA_C1-10890     TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10210929 10210930 SJA_C1-10890 SJA_C1-10900     TRUE 0.586 49.000 0.000 1.000 Y NA
 10210930 10210931 SJA_C1-10900 SJA_C1-10910     FALSE 0.172 131.000 0.000 NA   NA
 10210931 10210932 SJA_C1-10910 SJA_C1-10920     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210933 10210934 SJA_C1-10930 SJA_C1-10940     FALSE 0.134 147.000 0.000 NA   NA
 10210935 10210936 SJA_C1-10950 SJA_C1-10960     FALSE 0.177 129.000 0.000 NA   NA
 10210936 10210937 SJA_C1-10960 SJA_C1-10970     FALSE 0.118 152.000 0.000 NA   NA
 10210937 10210938 SJA_C1-10970 SJA_C1-10980     TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 10210938 10210939 SJA_C1-10980 SJA_C1-10990   cinA FALSE 0.462 16.000 0.000 NA   NA
 10210939 10210940 SJA_C1-10990 SJA_C1-11000 cinA nadE TRUE 0.709 -13.000 0.000 NA   NA
 10210940 10210941 SJA_C1-11000 SJA_C1-11010 nadE   FALSE 0.181 74.000 0.000 NA   NA
 10210941 10210942 SJA_C1-11010 SJA_C1-11020   crp FALSE 0.186 82.000 0.000 NA   NA
 10210944 10210945 SJA_C1-11040 SJA_C1-11050     TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 10210945 10210946 SJA_C1-11050 SJA_C1-11060     TRUE 0.673 -22.000 0.000 NA   NA
 10210946 10210947 SJA_C1-11060 SJA_C1-11070     TRUE 0.981 -3.000 0.161 NA   NA
 10210948 10210949 SJA_C1-11080 SJA_C1-11090     TRUE 0.828 16.000 0.083 NA   NA
 10210949 10210950 SJA_C1-11090 SJA_C1-11100   gutB TRUE 0.995 -3.000 0.621 0.048   NA
 10210950 10210951 SJA_C1-11100 SJA_C1-11110 gutB ino1 TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10210951 10210952 SJA_C1-11110 SJA_C1-11120 ino1   TRUE 0.768 13.000 0.019 1.000 N NA
 10210952 10210953 SJA_C1-11120 SJA_C1-11130     TRUE 0.989 -3.000 0.318 NA   NA
 10210953 10210954 SJA_C1-11130 SJA_C1-11140     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210955 10210956 SJA_C1-11150 SJA_C1-11160 galE rfbB TRUE 0.993 -3.000 0.161 0.009 Y NA
 10210956 10210957 SJA_C1-11160 SJA_C1-11170 rfbB   TRUE 0.987 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 10210957 10210958 SJA_C1-11170 SJA_C1-11180     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210958 10210959 SJA_C1-11180 SJA_C1-11190     TRUE 0.988 -3.000 0.292 NA   NA
 10210959 10210960 SJA_C1-11190 SJA_C1-11200     TRUE 0.989 -3.000 0.333 NA   NA
 10210960 10210961 SJA_C1-11200 SJA_C1-11210   rfbB TRUE 0.965 -3.000 0.067 NA   NA
 10210962 10210963 SJA_C1-11220 SJA_C1-11230     TRUE 0.584 11.000 0.000 NA   NA
 10210963 10210964 SJA_C1-11230 SJA_C1-11240     FALSE 0.188 85.000 0.000 NA   NA
 10210964 10210965 SJA_C1-11240 SJA_C1-11250     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210966 10210967 SJA_C1-11260 SJA_C1-11270 crp   FALSE 0.142 144.000 0.000 NA   NA
 10210968 10210969 SJA_C1-11280 SJA_C1-11290   crp TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10210972 10210973 SJA_C1-11320 SJA_C1-11330     FALSE 0.181 77.000 0.000 NA   NA
 10210974 10210975 SJA_C1-11340 SJA_C1-11350   malZ TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10210975 10210976 SJA_C1-11350 SJA_C1-11360 malZ cyc FALSE 0.255 110.000 0.000 1.000 N NA
 10210976 10210977 SJA_C1-11360 SJA_C1-11370 cyc   TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10210977 10210978 SJA_C1-11370 SJA_C1-11380   coxC TRUE 0.958 14.000 0.488 NA   NA
 10210978 10210979 SJA_C1-11380 SJA_C1-11390 coxC   TRUE 0.986 12.000 0.440 0.004 Y NA
 10210979 10210980 SJA_C1-11390 SJA_C1-11400     TRUE 0.998 -3.000 0.786 0.004 Y NA
 10210980 10210981 SJA_C1-11400 SJA_C1-11410   coxB TRUE 0.994 0.000 0.344 0.004 Y NA
 10210982 10210983 SJA_C1-11420 SJA_C1-11430     TRUE 0.932 -73.000 0.139 NA   NA
 10210983 10210984 SJA_C1-11430 SJA_C1-11440   dnaE TRUE 0.991 -3.000 0.120 1.000 Y NA
 10210984 10210985 SJA_C1-11440 SJA_C1-11450 dnaE   FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 10210985 10210986 SJA_C1-11450 SJA_C1-11460     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210986 10210987 SJA_C1-11460 SJA_C1-11470     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10210987 10210988 SJA_C1-11470 SJA_C1-11480   mreB FALSE 0.078 171.000 0.000 NA   NA
 10210991 10210992 SJA_C1-11510 SJA_C1-11520     TRUE 0.994 -3.000 0.632 NA   NA
 10210992 10210993 SJA_C1-11520 SJA_C1-11530     TRUE 0.536 50.000 0.057 NA   NA
 10210993 10210994 SJA_C1-11530 SJA_C1-11540     TRUE 0.971 -3.000 0.091 NA   NA
 10210995 10210996 SJA_C1-11550 SJA_C1-11560 nhaA   TRUE 0.673 153.000 0.333 NA   NA
 10210998 10210999 SJA_C1-11580 SJA_C1-11590   sucC FALSE 0.289 140.000 0.016 NA   NA
 10210999 10211000 SJA_C1-11590 SJA_C1-11600 sucC etfB TRUE 0.637 127.000 0.016 1.000 Y NA
 10211000 10211001 SJA_C1-11600 SJA_C1-11610 etfB etfA TRUE 0.997 -3.000 0.417 0.013 Y NA
 10211002 10211003 SJA_C1-11620 SJA_C1-11630     FALSE 0.078 171.000 0.000 NA   NA
 10211003 10211004 SJA_C1-11630 SJA_C1-11640     FALSE 0.205 118.000 0.000 NA   NA
 10211004 10211005 SJA_C1-11640 SJA_C1-11650   cspA TRUE 0.883 63.000 0.667 NA   NA
 10211005 10211006 SJA_C1-11650 SJA_C1-11660 cspA   FALSE 0.078 171.000 0.000 NA   NA
 10211006 10211007 SJA_C1-11660 SJA_C1-11670     FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10211007 10211008 SJA_C1-11670 SJA_C1-11680     FALSE 0.010 308.000 0.000 NA   NA
 10211011 10211012 SJA_C1-11710 SJA_C1-11720 rlpA   FALSE 0.030 233.000 0.000 NA   NA
 10211012 10211013 SJA_C1-11720 SJA_C1-11730     FALSE 0.247 44.000 0.000 NA   NA
 10211014 10211015 SJA_C1-11740 SJA_C1-11750   yesM TRUE 0.585 192.000 0.154 0.023 Y NA
 10211016 10211017 SJA_C1-11760 SJA_C1-11770     TRUE 0.914 80.000 1.000 NA   NA
 10211017 10211018 SJA_C1-11770 SJA_C1-11780     FALSE 0.010 311.000 0.000 NA   NA
 10211026 10211027 SJA_C1-11860 SJA_C1-11870 hpaE/xylG mhpD TRUE 0.996 -3.000 0.667 0.072 N NA
 10211027 10211028 SJA_C1-11870 SJA_C1-11880 mhpD hpaH/xylI TRUE 0.998 -7.000 1.000 0.030 Y NA
 10211028 10211029 SJA_C1-11880 SJA_C1-11890 hpaH/xylI xylH TRUE 0.800 0.000 0.000 1.000   NA
 10211029 10211030 SJA_C1-11890 SJA_C1-11900 xylH mhpF TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10211030 10211031 SJA_C1-11900 SJA_C1-11910 mhpF mhpE/xylK TRUE 0.996 -3.000 0.750 1.000 N NA
 10211031 10211032 SJA_C1-11910 SJA_C1-11920 mhpE/xylK   TRUE 0.612 29.000 0.024 1.000 N NA
 10211032 10211033 SJA_C1-11920 SJA_C1-11930   xylH TRUE 0.781 17.000 0.056 1.000   NA
 10211033 10211034 SJA_C1-11930 SJA_C1-11940 xylH cbzT FALSE 0.199 125.000 0.000 1.000   NA
 10211034 10211035 SJA_C1-11940 SJA_C1-11950 cbzT nahX TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211035 10211036 SJA_C1-11950 SJA_C1-11960 nahX xylE TRUE 0.929 1.000 0.059 NA   NA
 10211036 10211037 SJA_C1-11960 SJA_C1-11970 xylE   FALSE 0.201 65.000 0.000 1.000   NA
 10211037 10211038 SJA_C1-11970 SJA_C1-11980   tomA0 FALSE 0.181 77.000 0.000 NA   NA
 10211038 10211039 SJA_C1-11980 SJA_C1-11990 tomA0 tomA1 FALSE 0.369 24.000 0.000 NA   NA
 10211039 10211040 SJA_C1-11990 SJA_C1-12000 tomA1 tomA2 TRUE 0.982 -3.000 0.133 0.009   NA
 10211040 10211041 SJA_C1-12000 SJA_C1-12010 tomA2 tomA3 TRUE 0.991 4.000 0.800 0.009   NA
 10211041 10211042 SJA_C1-12010 SJA_C1-12020 tomA3 tomA4 TRUE 0.902 52.000 0.706 NA   NA
 10211042 10211043 SJA_C1-12020 SJA_C1-12030 tomA4 tomA5 TRUE 0.972 0.000 0.176 NA   NA
 10211043 10211044 SJA_C1-12030 SJA_C1-12040 tomA5 nifA FALSE 0.225 70.000 0.000 1.000 N NA
 10211045 10211046 SJA_C1-12050 SJA_C1-12060     TRUE 0.764 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10211047 10211048 SJA_C1-12070 SJA_C1-12080     FALSE 0.185 69.000 0.000 NA   NA
 10211049 10211050 SJA_C1-12090 SJA_C1-12100     FALSE 0.006 423.000 0.000 0.015   NA
 10211050 10211051 SJA_C1-12100 SJA_C1-12110     FALSE 0.369 24.000 0.000 NA   NA
 10211051 10211052 SJA_C1-12110 SJA_C1-12120     FALSE 0.209 108.000 0.000 NA   NA
 10211052 10211053 SJA_C1-12120 SJA_C1-12130     FALSE 0.004 466.000 0.000 1.000   NA
 10211053 10211054 SJA_C1-12130 SJA_C1-12140   metK FALSE 0.019 266.000 0.000 1.000   NA
 10211054 10211055 SJA_C1-12140 SJA_C1-12150 metK lnt TRUE 0.593 59.000 0.078 1.000 N NA
 10211055 10211056 SJA_C1-12150 SJA_C1-12160 lnt   TRUE 0.796 -33.000 0.015 NA   NA
 10211057 10211058 SJA_C1-12170 SJA_C1-12180     FALSE 0.185 69.000 0.000 NA   NA
 10211058 10211059 SJA_C1-12180 SJA_C1-12190     FALSE 0.091 163.000 0.000 NA   NA
 10211061 10211062 SJA_C1-12210 SJA_C1-12220     FALSE 0.028 236.000 0.000 NA   NA
 10211062 10211063 SJA_C1-12220 SJA_C1-12230     FALSE 0.418 113.000 0.022 NA   NA
 10211063 10211064 SJA_C1-12230 SJA_C1-12240     TRUE 0.566 121.000 0.077 NA   NA
 10211064 10211065 SJA_C1-12240 SJA_C1-12250     TRUE 0.981 -7.000 0.348 NA   NA
 10211065 10211066 SJA_C1-12250 SJA_C1-12260     TRUE 0.758 128.000 0.304 NA   NA
 10211066 10211067 SJA_C1-12260 SJA_C1-12270     TRUE 0.581 124.000 0.094 NA   NA
 10211067 10211068 SJA_C1-12270 SJA_C1-12280     TRUE 0.893 -33.000 0.062 NA   NA
 10211068 10211069 SJA_C1-12280 SJA_C1-12290     TRUE 0.989 -3.000 0.333 NA   NA
 10211071 10211072 SJA_C1-12310 SJA_C1-12320     TRUE 0.860 72.000 0.577 NA   NA
 10211072 10211073 SJA_C1-12320 SJA_C1-12330     TRUE 0.990 -3.000 0.344 NA   NA
 10211073 10211074 SJA_C1-12330 SJA_C1-12340     TRUE 0.754 90.000 0.267 NA   NA
 10211074 10211075 SJA_C1-12340 SJA_C1-12350     TRUE 0.994 -3.000 0.600 NA   NA
 10211075 10211076 SJA_C1-12350 SJA_C1-12360     TRUE 0.987 -3.000 0.280 NA   NA
 10211076 10211077 SJA_C1-12360 SJA_C1-12370     TRUE 0.921 9.000 0.120 NA   NA
 10211077 10211078 SJA_C1-12370 SJA_C1-12380     TRUE 0.952 9.000 0.250 NA   NA
 10211078 10211079 SJA_C1-12380 SJA_C1-12390     TRUE 0.789 34.000 0.167 NA   NA
 10211079 10211080 SJA_C1-12390 SJA_C1-12400     FALSE 0.054 191.000 0.000 NA   NA
 10211085 10211086 SJA_C1-12450 SJA_C1-12460 gst clpA FALSE 0.243 186.000 0.000 1.000 Y NA
 10211087 10211088 SJA_C1-12470 SJA_C1-12480     FALSE 0.186 82.000 0.000 NA   NA
 10211088 10211089 SJA_C1-12480 SJA_C1-12490     FALSE 0.177 153.000 0.008 NA   NA
 10211089 10211090 SJA_C1-12490 SJA_C1-12500     TRUE 0.921 15.000 0.255 NA   NA
 10211090 10211091 SJA_C1-12500 SJA_C1-12510     FALSE 0.513 113.000 0.047 NA   NA
 10211091 10211092 SJA_C1-12510 SJA_C1-12520   fadD FALSE 0.399 139.000 0.039 NA   NA
 10211092 10211093 SJA_C1-12520 SJA_C1-12530 fadD msrA TRUE 0.817 22.000 0.100 1.000 N NA
 10211093 10211094 SJA_C1-12530 SJA_C1-12540 msrA   TRUE 0.579 75.000 0.100 NA   NA
 10211097 10211098 SJA_C1-12570 SJA_C1-12580     FALSE 0.486 61.000 0.049 NA   NA
 10211099 10211100 SJA_C1-12590 SJA_C1-12600     TRUE 0.652 -31.000 0.000 NA   NA
 10211101 10211102 SJA_C1-12610 SJA_C1-12620 argC   TRUE 0.966 -3.000 0.061 NA N NA
 10211102 10211103 SJA_C1-12620 SJA_C1-12630     TRUE 0.942 -40.000 0.150 NA N NA
 10211103 10211104 SJA_C1-12630 SJA_C1-12640   pepB TRUE 0.743 46.000 0.130 0.038 N NA
 10211105 10211106 SJA_C1-12650 SJA_C1-12660     TRUE 0.938 0.000 0.051 NA   NA
 10211107 10211108 SJA_C1-12670 SJA_C1-12680     FALSE 0.463 25.000 0.004 1.000 N NA
 10211108 10211109 SJA_C1-12680 SJA_C1-12690   surE FALSE 0.208 173.000 0.030 1.000   NA
 10211109 10211110 SJA_C1-12690 SJA_C1-12700 surE serS FALSE 0.514 89.000 0.058 1.000   NA
 10211111 10211112 SJA_C1-12710 SJA_C1-12720 atsE   FALSE 0.033 222.000 0.000 NA   NA
 10211112 10211113 SJA_C1-12720 SJA_C1-12730     FALSE 0.003 577.000 0.000 NA   NA
 10211113 10211114 SJA_C1-12730 SJA_C1-12740     FALSE 0.420 65.000 0.030 NA   NA
 10211116 10211117 SJA_C1-12760 SJA_C1-12770     TRUE 0.528 116.000 0.057 NA   NA
 10211117 10211118 SJA_C1-12770 SJA_C1-12780   ytfM FALSE 0.160 153.000 0.007 NA   NA
 10211118 10211119 SJA_C1-12780 SJA_C1-12790 ytfM   TRUE 0.902 0.000 0.020 NA   NA
 10211119 10211120 SJA_C1-12790 SJA_C1-12800   sdaA TRUE 0.961 3.000 0.182 NA   NA
 10211120 10211121 SJA_C1-12800 SJA_C1-12810 sdaA   FALSE 0.468 172.000 0.182 1.000 N NA
 10211122 10211123 SJA_C1-12820 SJA_C1-12830 pyrF   TRUE 0.901 -3.000 0.008 NA   NA
 10211123 10211124 SJA_C1-12830 SJA_C1-12840     TRUE 0.861 31.000 0.286 NA   NA
 10211124 10211125 SJA_C1-12840 SJA_C1-12850   hxt TRUE 0.730 15.000 0.025 1.000   NA
 10211125 10211126 SJA_C1-12850 SJA_C1-12860 hxt   TRUE 0.640 22.000 0.025 NA   NA
 10211126 10211127 SJA_C1-12860 SJA_C1-12870     TRUE 0.978 5.000 0.417 NA N NA
 10211127 10211128 SJA_C1-12870 SJA_C1-12880     TRUE 0.958 -3.000 0.034 0.071   NA
 10211129 10211130 SJA_C1-12890 SJA_C1-12900   lig TRUE 0.957 4.000 0.174 1.000   NA
 10211130 10211131 SJA_C1-12900 SJA_C1-12910 lig   FALSE 0.193 98.000 0.000 NA   NA
 10211131 10211132 SJA_C1-12910 SJA_C1-12920     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211135 10211136 SJA_C1-12950 SJA_C1-12960     TRUE 0.575 68.000 0.000 0.016 Y NA
 10211136 10211137 SJA_C1-12960 SJA_C1-t0140     FALSE 0.199 57.000 0.000 NA   NA
 10211137 10211138 SJA_C1-t0140 SJA_C1-12970   radC FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10211139 10211140 SJA_C1-12980 SJA_C1-12990 thyA bkdA1 FALSE 0.360 108.000 0.010 1.000 N NA
 10211140 10211141 SJA_C1-12990 SJA_C1-13000 bkdA1 bkdA2 TRUE 0.994 -21.000 0.558 0.001 Y NA
 10211141 10211142 SJA_C1-13000 SJA_C1-13010 bkdA2 pdhC TRUE 0.938 10.000 0.022 0.071 Y NA
 10211144 10211145 SJA_C1-13030 SJA_C1-t0150     FALSE 0.265 41.000 0.000 NA   NA
 10211145 10211146 SJA_C1-t0150 SJA_C1-t0160     FALSE 0.188 85.000 0.000 NA   NA
 10211146 10211147 SJA_C1-t0160 SJA_C1-13040     FALSE 0.028 236.000 0.000 NA   NA
 10211148 10211149 SJA_C1-13050 SJA_C1-13060     TRUE 0.912 -3.000 0.010 NA   NA
 10211149 10211150 SJA_C1-13060 SJA_C1-13070     FALSE 0.112 213.000 0.034 NA   NA
 10211150 10211151 SJA_C1-13070 SJA_C1-13080     TRUE 0.793 -7.000 0.003 NA   NA
 10211152 10211153 SJA_C1-13090 SJA_C1-13100 tktA gapD TRUE 0.979 28.000 0.786 1.000 Y NA
 10211153 10211154 SJA_C1-13100 SJA_C1-13110 gapD pgk TRUE 0.620 70.000 0.006 0.003 Y NA
 10211154 10211155 SJA_C1-13110 SJA_C1-13120 pgk   TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10211155 10211156 SJA_C1-13120 SJA_C1-13130   fbaB FALSE 0.155 140.000 0.000 NA   NA
 10211158 10211159 SJA_C1-13150 SJA_C1-13160 thiE   FALSE 0.034 221.000 0.000 NA   NA
 10211159 10211160 SJA_C1-13160 SJA_C1-13170     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211160 10211161 SJA_C1-13170 SJA_C1-13180     TRUE 0.980 -3.000 0.146 NA   NA
 10211161 10211162 SJA_C1-13180 SJA_C1-13190   efp FALSE 0.219 102.000 0.003 NA   NA
 10211162 10211163 SJA_C1-13190 SJA_C1-13200 efp impA FALSE 0.402 148.000 0.047 1.000 N NA
 10211163 10211164 SJA_C1-13200 SJA_C1-13210 impA nuoA FALSE 0.258 130.000 0.005 1.000 N NA
 10211164 10211165 SJA_C1-13210 SJA_C1-13220 nuoA nuoB TRUE 0.993 -9.000 0.396 0.002 Y NA
 10211165 10211166 SJA_C1-13220 SJA_C1-13230 nuoB nuoC TRUE 0.991 2.000 0.262 0.002 Y NA
 10211166 10211167 SJA_C1-13230 SJA_C1-13240 nuoC nuoD TRUE 0.996 0.000 0.483 0.006 Y NA
 10211167 10211168 SJA_C1-13240 SJA_C1-13250 nuoD   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211168 10211169 SJA_C1-13250 SJA_C1-13260   nuoE TRUE 0.750 1.000 0.000 NA   NA
 10211169 10211170 SJA_C1-13260 SJA_C1-13270 nuoE nuoF TRUE 0.849 155.000 0.343 0.006 Y NA
 10211170 10211171 SJA_C1-13270 SJA_C1-13280 nuoF   TRUE 0.891 -3.000 0.006 NA   NA
 10211171 10211172 SJA_C1-13280 SJA_C1-13290   nuoG TRUE 0.840 0.000 0.006 NA   NA
 10211172 10211173 SJA_C1-13290 SJA_C1-13300 nuoG nuoH TRUE 0.896 155.000 0.515 0.006 Y NA
 10211173 10211174 SJA_C1-13300 SJA_C1-13310 nuoH nuoI TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.006 Y NA
 10211174 10211175 SJA_C1-13310 SJA_C1-13320 nuoI nuoJ TRUE 0.846 164.000 0.442 0.006 Y NA
 10211175 10211176 SJA_C1-13320 SJA_C1-13330 nuoJ nuoK TRUE 0.943 116.000 0.484 0.002 Y NA
 10211176 10211177 SJA_C1-13330 SJA_C1-13340 nuoK nuoL TRUE 0.990 7.000 0.451 0.006 Y NA
 10211177 10211178 SJA_C1-13340 SJA_C1-13350 nuoL nuoM TRUE 0.993 0.000 0.251 0.001 Y NA
 10211178 10211179 SJA_C1-13350 SJA_C1-13360 nuoM nuoN TRUE 0.996 0.000 0.453 0.001 Y NA
 10211179 10211180 SJA_C1-13360 SJA_C1-13370 nuoN birA TRUE 0.857 45.000 0.372 1.000 N NA
 10211180 10211181 SJA_C1-13370 SJA_C1-13380 birA baf TRUE 0.829 16.000 0.071 1.000 N NA
 10211181 10211182 SJA_C1-13380 SJA_C1-13390 baf   TRUE 0.970 -3.000 0.080 1.000   NA
 10211182 10211183 SJA_C1-13390 SJA_C1-13400     TRUE 0.899 11.000 0.102 NA   NA
 10211187 10211188 SJA_C1-13440 SJA_C1-13450   tgt FALSE 0.204 54.000 0.000 NA   NA
 10211189 10211190 SJA_C1-13460 SJA_C1-13470 purU   FALSE 0.192 89.000 0.000 NA   NA
 10211190 10211191 SJA_C1-13470 SJA_C1-13480     FALSE 0.187 66.000 0.000 NA   NA
 10211192 10211193 SJA_C1-13490 SJA_C1-13500     TRUE 0.945 16.000 0.409 1.000   NA
 10211193 10211194 SJA_C1-13500 SJA_C1-13510   tadD TRUE 0.960 5.000 0.222 1.000   NA
 10211195 10211196 SJA_C1-13520 SJA_C1-13530 elaC   FALSE 0.196 80.000 0.000 1.000   NA
 10211197 10211198 SJA_C1-13540 SJA_C1-13550     FALSE 0.019 279.000 0.000 1.000 N NA
 10211198 10211199 SJA_C1-13550 SJA_C1-13560   vanK TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10211199 10211200 SJA_C1-13560 SJA_C1-13570 vanK   FALSE 0.234 89.000 0.000 1.000 N NA
 10211205 10211206 SJA_C1-13620 SJA_C1-13630 dld fabG FALSE 0.234 95.000 0.000 1.000 N NA
 10211206 10211207 SJA_C1-13630 SJA_C1-13640 fabG   FALSE 0.193 74.000 0.000 1.000   NA
 10211210 10211211 SJA_C1-13670 SJA_C1-13680     FALSE 0.312 34.000 0.000 1.000   NA
 10211211 10211212 SJA_C1-13680 SJA_C1-13690     FALSE 0.051 198.000 0.000 1.000   NA
 10211212 10211213 SJA_C1-13690 SJA_C1-13700   fadA FALSE 0.096 172.000 0.000 1.000 N NA
 10211213 10211214 SJA_C1-13700 SJA_C1-13710 fadA   FALSE 0.017 291.000 0.000 1.000 N NA
 10211216 10211217 SJA_C1-13730 SJA_C1-13740   adh FALSE 0.268 79.000 0.000 0.047 N NA
 10211218 10211219 SJA_C1-13750 SJA_C1-13760     FALSE 0.201 120.000 0.000 NA   NA
 10211219 10211220 SJA_C1-13760 SJA_C1-13770     TRUE 0.568 14.000 0.000 1.000 N NA
 10211220 10211221 SJA_C1-13770 SJA_C1-13780     FALSE 0.193 123.000 0.000 NA   NA
 10211222 10211223 SJA_C1-13790 SJA_C1-13800     FALSE 0.122 163.000 0.000 0.070   NA
 10211223 10211224 SJA_C1-13800 SJA_C1-13810     FALSE 0.224 110.000 0.000 1.000   NA
 10211224 10211225 SJA_C1-13810 SJA_C1-13820   fadB TRUE 0.853 13.000 0.000 1.000 Y NA
 10211225 10211226 SJA_C1-13820 SJA_C1-13830 fadB   FALSE 0.193 123.000 0.000 NA   NA
 10211226 10211227 SJA_C1-13830 SJA_C1-13840     FALSE 0.192 94.000 0.000 NA   NA
 10211227 10211228 SJA_C1-13840 SJA_C1-13850   hyuA FALSE 0.010 314.000 0.000 NA   NA
 10211228 10211229 SJA_C1-13850 SJA_C1-13860 hyuA   TRUE 0.968 16.000 0.636 0.002   NA
 10211229 10211230 SJA_C1-13860 SJA_C1-13870   ISsp1 FALSE 0.195 79.000 0.000 1.000   NA
 10211230 10211231 SJA_C1-13870 SJA_C1-13880 ISsp1 hyuB FALSE 0.050 199.000 0.000 1.000   NA
 10211232 10211233 SJA_C1-13890 SJA_C1-13900 fadB   FALSE 0.239 102.000 0.000 1.000 N NA
 10211235 10211236 SJA_C1-13920 SJA_C1-13930   adh FALSE 0.274 106.000 0.000 0.014   NA
 10211236 10211237 SJA_C1-13930 SJA_C1-13940 adh   FALSE 0.397 23.000 0.000 1.000   NA
 10211237 10211238 SJA_C1-13940 SJA_C1-13950     FALSE 0.455 18.000 0.000 1.000   NA
 10211239 10211240 SJA_C1-13960 SJA_C1-13970 fadA   TRUE 0.591 48.000 0.000 1.000 Y NA
 10211240 10211241 SJA_C1-13970 SJA_C1-13980     TRUE 0.983 0.000 0.333 NA   NA
 10211242 10211243 SJA_C1-13990 SJA_C1-14000     FALSE 0.004 440.000 0.000 NA N NA
 10211243 10211244 SJA_C1-14000 SJA_C1-14010   kduD TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 10211244 10211245 SJA_C1-14010 SJA_C1-14020 kduD   TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10211245 10211246 SJA_C1-14020 SJA_C1-14030     FALSE 0.209 122.000 0.000 1.000   NA
 10211247 10211248 SJA_C1-14040 SJA_C1-14050 tpx   FALSE 0.205 129.000 0.000 NA N NA
 10211248 10211249 SJA_C1-14050 SJA_C1-14060     FALSE 0.201 120.000 0.000 NA   NA
 10211249 10211250 SJA_C1-14060 SJA_C1-14070     FALSE 0.003 491.000 0.000 NA   NA
 10211250 10211251 SJA_C1-14070 SJA_C1-14080     TRUE 0.669 42.000 0.000 0.070 Y NA
 10211251 10211252 SJA_C1-14080 SJA_C1-14090   atoB FALSE 0.042 321.000 0.000 1.000 Y NA
 10211252 10211253 SJA_C1-14090 SJA_C1-14100 atoB   FALSE 0.196 102.000 0.000 NA   NA
 10211253 10211254 SJA_C1-14100 SJA_C1-14110     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10211254 10211255 SJA_C1-14110 SJA_C1-14120     TRUE 0.837 0.000 0.000 0.063   NA
 10211256 10211257 SJA_C1-14130 SJA_C1-t0170     FALSE 0.057 188.000 0.000 NA   NA
 10211257 10211258 SJA_C1-t0170 SJA_C1-t0180     FALSE 0.064 180.000 0.000 NA   NA
 10211258 10211259 SJA_C1-t0180 SJA_C1-14140     FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 10211259 10211260 SJA_C1-14140 SJA_C1-14150   moaA TRUE 0.959 -3.000 0.036 1.000 N NA
 10211262 10211263 SJA_C1-14170 SJA_C1-14180     TRUE 0.979 -13.000 0.400 NA   NA
 10211263 10211264 SJA_C1-14180 SJA_C1-14190   mfd FALSE 0.008 329.000 0.000 NA   NA
 10211264 10211265 SJA_C1-14190 SJA_C1-14200 mfd   TRUE 0.589 112.000 0.078 NA   NA
 10211269 10211270 SJA_C1-14240 SJA_C1-14250   tyrS FALSE 0.287 77.000 0.010 NA   NA
 10211274 10211275 SJA_C1-14290 SJA_C1-14300     FALSE 0.480 95.000 0.047 NA   NA
 10211275 10211276 SJA_C1-14300 SJA_C1-14310     FALSE 0.296 72.000 0.010 1.000   NA
 10211276 10211277 SJA_C1-14310 SJA_C1-14320     FALSE 0.369 66.000 0.020 NA   NA
 10211277 10211278 SJA_C1-14320 SJA_C1-14330   rpoD FALSE 0.131 156.000 0.004 NA   NA
 10211278 10211279 SJA_C1-14330 SJA_C1-14340 rpoD dnaG TRUE 0.825 46.000 0.299 1.000 N NA
 10211279 10211280 SJA_C1-14340 SJA_C1-14350 dnaG   TRUE 0.928 3.000 0.000 1.000 Y NA
 10211280 10211281 SJA_C1-14350 SJA_C1-14360     FALSE 0.171 138.000 0.000 1.000   NA
 10211282 10211283 SJA_C1-14370 SJA_C1-14380 carA   TRUE 0.867 -3.000 0.002 NA   NA
 10211283 10211284 SJA_C1-14380 SJA_C1-14390   carB FALSE 0.023 251.000 0.000 NA   NA
 10211284 10211285 SJA_C1-14390 SJA_C1-14400 carB greA TRUE 0.752 82.000 0.241 1.000 N NA
 10211285 10211286 SJA_C1-14400 SJA_C1-14410 greA   FALSE 0.505 29.000 0.012 1.000   NA
 10211287 10211288 SJA_C1-14420 SJA_C1-14430     FALSE 0.418 106.000 0.025 NA   NA
 10211288 10211289 SJA_C1-14430 SJA_C1-14440     TRUE 0.966 -7.000 0.167 NA   NA
 10211289 10211290 SJA_C1-14440 SJA_C1-14450     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 10211290 10211291 SJA_C1-14450 SJA_C1-14460     TRUE 0.731 99.000 0.222 NA   NA
 10211292 10211293 SJA_C1-14470 SJA_C1-14480 eno   FALSE 0.403 77.000 0.027 1.000   NA
 10211293 10211294 SJA_C1-14480 SJA_C1-14490   pdhA FALSE 0.459 127.000 0.041 1.000   NA
 10211294 10211295 SJA_C1-14490 SJA_C1-14500 pdhA pdhB TRUE 0.996 0.000 0.456 0.001 Y NA
 10211296 10211297 SJA_C1-14510 SJA_C1-14520     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211297 10211298 SJA_C1-14520 SJA_C1-14530     TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10211299 10211300 SJA_C1-14540 SJA_C1-14550     TRUE 0.966 10.000 0.400 NA   NA
 10211301 10211302 SJA_C1-14560 SJA_C1-14570 gid   FALSE 0.303 43.000 0.000 1.000 N NA
 10211304 10211305 SJA_C1-14590 SJA_C1-14600 leuA yceI FALSE 0.003 473.000 0.000 NA   NA
 10211305 10211306 SJA_C1-14600 SJA_C1-14610 yceI ilvC FALSE 0.259 118.000 0.005 NA   NA
 10211306 10211307 SJA_C1-14610 SJA_C1-14620 ilvC ilvH TRUE 0.561 158.000 0.026 0.001 Y NA
 10211307 10211308 SJA_C1-14620 SJA_C1-14630 ilvH   TRUE 0.904 0.000 0.020 NA   NA
 10211308 10211309 SJA_C1-14630 SJA_C1-14640   ilvB TRUE 0.617 12.000 0.004 NA   NA
 10211309 10211310 SJA_C1-14640 SJA_C1-14650 ilvB miaA FALSE 0.493 101.000 0.038 1.000 N NA
 10211312 10211313 SJA_C1-14670 SJA_C1-14680 purL purS TRUE 0.995 4.000 0.656 0.001 Y NA
 10211315 10211316 SJA_C1-14700 SJA_C1-14710 purC   FALSE 0.204 131.000 0.004 NA   NA
 10211316 10211317 SJA_C1-14710 SJA_C1-14720   otsA TRUE 0.893 32.000 0.400 NA   NA
 10211317 10211318 SJA_C1-14720 SJA_C1-14730 otsA   TRUE 0.937 11.000 0.034 1.000 Y NA
 10211318 10211319 SJA_C1-14730 SJA_C1-14740   otsB TRUE 0.753 154.000 0.174 1.000 Y NA
 10211319 10211320 SJA_C1-14740 SJA_C1-14750 otsB   FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 10211321 10211322 SJA_C1-14760 SJA_C1-14770 gcvA   FALSE 0.449 17.000 0.000 NA   NA
 10211322 10211323 SJA_C1-14770 SJA_C1-14780   parC TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211323 10211324 SJA_C1-14780 SJA_C1-14790 parC   FALSE 0.422 41.000 0.009 1.000 N NA
 10211325 10211326 SJA_C1-14800 SJA_C1-14810 cca   TRUE 0.951 -19.000 0.163 1.000   NA
 10211326 10211327 SJA_C1-14810 SJA_C1-14820     TRUE 0.990 -3.000 0.346 NA   NA
 10211327 10211328 SJA_C1-14820 SJA_C1-14830     TRUE 0.623 46.000 0.080 NA   NA
 10211331 10211332 SJA_C1-14860 SJA_C1-14870     FALSE 0.210 134.000 0.005 NA   NA
 10211335 10211336 SJA_C1-14900 SJA_C1-14910     FALSE 0.192 94.000 0.000 NA   NA
 10211336 10211337 SJA_C1-14910 SJA_C1-t0190     TRUE 0.813 -1.000 0.000 NA   NA
 10211337 10211338 SJA_C1-t0190 SJA_C1-14920     FALSE 0.314 31.000 0.000 NA   NA
 10211338 10211339 SJA_C1-14920 SJA_C1-14930   ycaJ TRUE 0.904 -3.000 0.008 NA   NA
 10211339 10211340 SJA_C1-14930 SJA_C1-14940 ycaJ sqd2 FALSE 0.427 29.000 0.003 1.000 N NA
 10211341 10211342 SJA_C1-14950 SJA_C1-14960     FALSE 0.197 58.000 0.000 NA   NA
 10211343 10211344 SJA_C1-14970 SJA_C1-14980     TRUE 0.819 29.000 0.171 NA   NA
 10211345 10211346 SJA_C1-14990 SJA_C1-15000 entF lysA TRUE 0.988 -3.000 0.259 1.000 N NA
 10211346 10211347 SJA_C1-15000 SJA_C1-15010 lysA wza TRUE 0.538 147.000 0.111 1.000 N NA
 10211347 10211348 SJA_C1-15010 SJA_C1-15020 wza   TRUE 0.995 2.000 0.633 0.093 Y NA
 10211348 10211349 SJA_C1-15020 SJA_C1-15030     TRUE 0.964 14.000 0.500 1.000 N NA
 10211349 10211350 SJA_C1-15030 SJA_C1-15040     TRUE 0.940 0.000 0.057 NA   NA
 10211350 10211351 SJA_C1-15040 SJA_C1-15050   exeA TRUE 0.668 25.000 0.040 NA   NA
 10211351 10211352 SJA_C1-15050 SJA_C1-15060 exeA   TRUE 0.951 9.000 0.229 1.000   NA
 10211352 10211353 SJA_C1-15060 SJA_C1-15070     TRUE 0.994 -3.000 0.557 NA   NA
 10211353 10211354 SJA_C1-15070 SJA_C1-15080     TRUE 0.997 -3.000 0.509 NA Y NA
 10211354 10211355 SJA_C1-15080 SJA_C1-15090     TRUE 0.986 0.000 0.413 NA   NA
 10211355 10211356 SJA_C1-15090 SJA_C1-15100   asnB TRUE 0.922 11.000 0.152 NA   NA
 10211356 10211357 SJA_C1-15100 SJA_C1-15110 asnB wcaJ FALSE 0.079 178.000 0.000 NA N NA
 10211357 10211358 SJA_C1-15110 SJA_C1-15120 wcaJ   TRUE 0.966 0.000 0.016 NA Y NA
 10211358 10211359 SJA_C1-15120 SJA_C1-15130     FALSE 0.211 110.000 0.000 NA   NA
 10211359 10211360 SJA_C1-15130 SJA_C1-15140     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10211360 10211361 SJA_C1-15140 SJA_C1-15150     TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA   NA
 10211361 10211362 SJA_C1-15150 SJA_C1-15160   fkbM TRUE 0.975 -3.000 0.107 NA   NA
 10211362 10211363 SJA_C1-15160 SJA_C1-15170 fkbM   TRUE 0.949 0.000 0.071 NA   NA
 10211364 10211365 SJA_C1-15180 SJA_C1-15190   mmsB FALSE 0.500 54.000 0.043 1.000   NA
 10211366 10211367 SJA_C1-15200 SJA_C1-15210 ilvA   FALSE 0.021 303.000 0.008 1.000 N NA
 10211367 10211368 SJA_C1-15210 SJA_C1-15220     TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 10211368 10211369 SJA_C1-15220 SJA_C1-15230     TRUE 0.750 1.000 0.000 NA   NA
 10211370 10211371 SJA_C1-15240 SJA_C1-15250     FALSE 0.198 103.000 0.000 NA   NA
 10211371 10211372 SJA_C1-15250 SJA_C1-15260     FALSE 0.257 109.000 0.005 NA   NA
 10211372 10211373 SJA_C1-15260 SJA_C1-15270     FALSE 0.388 33.000 0.007 NA   NA
 10211373 10211374 SJA_C1-15270 SJA_C1-15280     TRUE 0.825 6.000 0.018 1.000   NA
 10211376 10211377 SJA_C1-15300 SJA_C1-15310 rpoE   TRUE 0.985 0.000 0.381 NA   NA
 10211377 10211378 SJA_C1-15310 SJA_C1-15320     FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 10211378 10211379 SJA_C1-15320 SJA_C1-15330     TRUE 0.878 -3.000 0.004 NA   NA
 10211381 10211382 SJA_C1-15350 SJA_C1-15360 rarD   FALSE 0.272 51.000 0.006 NA   NA
 10211383 10211384 SJA_C1-15370 SJA_C1-15380     FALSE 0.270 40.000 0.000 NA   NA
 10211384 10211385 SJA_C1-15380 SJA_C1-15390   crcB FALSE 0.012 296.000 0.000 NA   NA
 10211385 10211386 SJA_C1-15390 SJA_C1-15400 crcB rluC TRUE 0.973 -3.000 0.083 1.000 N NA
 10211386 10211387 SJA_C1-15400 SJA_C1-15410 rluC gph TRUE 0.991 -3.000 0.389 1.000   NA
 10211387 10211388 SJA_C1-15410 SJA_C1-15420 gph   TRUE 0.912 -3.000 0.010 NA   NA
 10211388 10211389 SJA_C1-15420 SJA_C1-15430     TRUE 0.918 -3.000 0.012 NA   NA
 10211389 10211390 SJA_C1-15430 SJA_C1-15440     FALSE 0.192 93.000 0.000 NA   NA
 10211390 10211391 SJA_C1-15440 SJA_C1-15450     FALSE 0.188 65.000 0.000 NA   NA
 10211392 10211393 SJA_C1-15460 SJA_C1-15470     TRUE 0.840 74.000 0.500 NA   NA
 10211393 10211394 SJA_C1-15470 SJA_C1-15480     TRUE 0.948 6.000 0.182 NA   NA
 10211396 10211397 SJA_C1-15500 SJA_C1-15510   hisE FALSE 0.226 78.000 0.005 NA   NA
 10211397 10211398 SJA_C1-15510 SJA_C1-15520 hisE   FALSE 0.253 43.000 0.000 NA   NA
 10211398 10211399 SJA_C1-15520 SJA_C1-15530   hisF FALSE 0.192 95.000 0.000 NA   NA
 10211399 10211400 SJA_C1-15530 SJA_C1-15540 hisF hisA TRUE 0.957 2.000 0.009 0.003 Y NA
 10211400 10211401 SJA_C1-15540 SJA_C1-15550 hisA hisH TRUE 0.796 92.000 0.070 0.003 Y NA
 10211401 10211402 SJA_C1-15550 SJA_C1-15560 hisH hisB TRUE 0.988 -3.000 0.049 0.003 Y NA
 10211403 10211404 SJA_C1-15570 SJA_C1-15580   fumC FALSE 0.502 59.000 0.054 NA   NA
 10211404 10211405 SJA_C1-15580 SJA_C1-15590 fumC   FALSE 0.247 50.000 0.003 NA   NA
 10211405 10211406 SJA_C1-15590 SJA_C1-15600   gmk FALSE 0.290 35.000 0.000 NA   NA
 10211407 10211408 SJA_C1-15610 SJA_C1-15620     TRUE 0.961 -10.000 0.170 NA   NA
 10211409 10211410 SJA_C1-15630 SJA_C1-15640     TRUE 0.957 18.000 0.615 NA   NA
 10211411 10211412 SJA_C1-15650 SJA_C1-15660 wrbA   TRUE 0.751 127.000 0.286 NA   NA
 10211413 10211414 SJA_C1-15670 SJA_C1-15680     FALSE 0.189 210.000 0.000 0.073 Y NA
 10211415 10211416 SJA_C1-15690 SJA_C1-15700     FALSE 0.009 315.000 0.000 NA   NA
 10211416 10211417 SJA_C1-15700 SJA_C1-15710     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 10211418 10211419 SJA_C1-15720 SJA_C1-15730 rpoE   TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 10211420 10211421 SJA_C1-15740 SJA_C1-15750     FALSE 0.431 20.000 0.000 1.000   NA
 10211421 10211422 SJA_C1-15750 SJA_C1-15760   dcd FALSE 0.262 44.000 0.000 1.000   NA
 10211422 10211423 SJA_C1-15760 SJA_C1-15770 dcd cdd TRUE 0.939 7.000 0.021 1.000 Y NA
 10211423 10211424 SJA_C1-15770 SJA_C1-15780 cdd   TRUE 0.968 -3.000 0.063 1.000 N NA
 10211424 10211425 SJA_C1-15780 SJA_C1-15790     TRUE 0.679 33.000 0.071 NA   NA
 10211427 10211428 SJA_C1-15810 SJA_C1-15820   cysH FALSE 0.196 122.000 0.000 NA   NA
 10211428 10211429 SJA_C1-15820 SJA_C1-15830 cysH   TRUE 0.950 -13.000 0.139 NA   NA
 10211429 10211430 SJA_C1-15830 SJA_C1-15840   nirA TRUE 0.979 -7.000 0.309 NA   NA
 10211430 10211431 SJA_C1-15840 SJA_C1-15850 nirA   TRUE 0.990 4.000 0.919 NA   NA
 10211431 10211432 SJA_C1-15850 SJA_C1-15860   cysG TRUE 0.985 -3.000 0.224 NA   NA
 10211432 10211433 SJA_C1-15860 SJA_C1-15870 cysG astD TRUE 0.618 128.000 0.107 1.000 N NA
 10211433 10211434 SJA_C1-15870 SJA_C1-15880 astD   FALSE 0.349 63.000 0.017 NA   NA
 10211435 10211436 SJA_C1-15890 SJA_C1-15900     TRUE 0.866 16.000 0.132 NA   NA
 10211436 10211437 SJA_C1-15900 SJA_C1-15910     FALSE 0.371 95.000 0.018 1.000   NA
 10211437 10211438 SJA_C1-15910 SJA_C1-15920     TRUE 0.849 0.000 0.007 NA   NA
 10211438 10211439 SJA_C1-15920 SJA_C1-15930     FALSE 0.003 549.000 0.000 NA   NA
 10211440 10211441 SJA_C1-15940 SJA_C1-15950 cyc rplI FALSE 0.021 271.000 0.000 1.000 N NA
 10211441 10211442 SJA_C1-15950 SJA_C1-15960 rplI rpsR TRUE 0.984 14.000 0.499 0.012 Y NA
 10211442 10211443 SJA_C1-15960 SJA_C1-15970 rpsR rpsF TRUE 0.977 14.000 0.319 0.012 Y NA
 10211445 10211446 SJA_C1-15990 SJA_C1-16000     FALSE 0.135 191.000 0.024 NA   NA
 10211446 10211447 SJA_C1-16000 SJA_C1-16010     TRUE 0.925 62.000 0.459 1.000 Y NA
 10211447 10211448 SJA_C1-16010 SJA_C1-16020     TRUE 0.989 6.000 0.929 1.000 N NA
 10211448 10211449 SJA_C1-16020 SJA_C1-16030     TRUE 0.995 -7.000 0.500 0.092 Y NA
 10211450 10211451 SJA_C1-16040 SJA_C1-16050 fabD menB TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10211451 10211452 SJA_C1-16050 SJA_C1-16060 menB fabG TRUE 0.934 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10211452 10211453 SJA_C1-16060 SJA_C1-16070 fabG acpP TRUE 0.550 237.000 0.321 0.004 Y NA
 10211453 10211454 SJA_C1-16070 SJA_C1-16080 acpP fabF TRUE 0.551 180.000 0.106 1.000 Y NA
 10211454 10211455 SJA_C1-16080 SJA_C1-16090 fabF   TRUE 0.918 11.000 0.134 1.000   NA
 10211456 10211457 SJA_C1-16100 SJA_C1-16110 trpE ppiD TRUE 0.734 35.000 0.106 1.000   NA
 10211458 10211459 SJA_C1-16120 SJA_C1-16130 tpiA secG FALSE 0.264 226.000 0.184 1.000 N NA
 10211459 10211460 SJA_C1-16130 SJA_C1-16140 secG pyrG TRUE 0.603 92.000 0.083 1.000 N NA
 10211462 10211463 SJA_C1-16160 SJA_C1-16170   nusA TRUE 0.975 14.000 0.759 NA   NA
 10211463 10211464 SJA_C1-16170 SJA_C1-16180 nusA   TRUE 0.698 7.000 0.004 1.000   NA
 10211464 10211465 SJA_C1-16180 SJA_C1-16190     FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 10211465 10211466 SJA_C1-16190 SJA_C1-16200   infB TRUE 0.736 71.000 0.223 NA N NA
 10211466 10211467 SJA_C1-16200 SJA_C1-16210 infB rbfA TRUE 0.936 124.000 0.530 1.000 Y NA
 10211467 10211468 SJA_C1-16210 SJA_C1-16220 rbfA   FALSE 0.092 169.000 0.002 1.000   NA
 10211468 10211469 SJA_C1-16220 SJA_C1-16230   tdk TRUE 0.832 0.000 0.004 1.000   NA
 10211469 10211470 SJA_C1-16230 SJA_C1-16240 tdk truB FALSE 0.272 70.000 0.005 1.000 N NA
 10211470 10211471 SJA_C1-16240 SJA_C1-16250 truB rpsO TRUE 0.951 20.000 0.211 1.000 Y NA
 10211471 10211472 SJA_C1-16250 SJA_C1-16260 rpsO pnp FALSE 0.453 259.000 0.335 1.000 Y NA
 10211472 10211473 SJA_C1-16260 SJA_C1-16270 pnp   FALSE 0.187 144.000 0.002 1.000 N NA
 10211473 10211474 SJA_C1-16270 SJA_C1-16280   comL FALSE 0.239 60.000 0.004 1.000   NA
 10211474 10211475 SJA_C1-16280 SJA_C1-16290 comL recN FALSE 0.500 151.000 0.117 1.000   NA
 10211476 10211477 SJA_C1-16300 SJA_C1-16310     TRUE 0.958 -3.000 0.036 1.000 N NA
 10211477 10211478 SJA_C1-16310 SJA_C1-16320   arsR TRUE 0.971 12.000 0.500 1.000 N NA
 10211481 10211482 SJA_C1-16350 SJA_C1-16360     TRUE 0.888 50.000 0.600 1.000   NA
 10211482 10211483 SJA_C1-16360 SJA_C1-t0200     FALSE 0.352 26.000 0.000 NA   NA
 10211483 10211484 SJA_C1-t0200 SJA_C1-16370   ssuA FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 10211484 10211485 SJA_C1-16370 SJA_C1-16380 ssuA ssuC TRUE 0.991 14.000 0.915 NA Y NA
 10211485 10211486 SJA_C1-16380 SJA_C1-16390 ssuC ssuB TRUE 0.970 19.000 0.323 0.001 Y NA
 10211486 10211487 SJA_C1-16390 SJA_C1-16400 ssuB   FALSE 0.368 70.000 0.021 NA   NA
 10211488 10211489 SJA_C1-t0210 SJA_C1-16410     FALSE 0.166 135.000 0.000 NA   NA
 10211489 10211490 SJA_C1-16410 SJA_C1-16420     FALSE 0.245 156.000 0.024 NA   NA
 10211491 10211492 SJA_C1-16430 SJA_C1-16440     FALSE 0.006 362.000 0.000 NA   NA
 10211492 10211493 SJA_C1-16440 SJA_C1-16450     FALSE 0.197 58.000 0.000 NA   NA
 10211493 10211494 SJA_C1-16450 SJA_C1-16460     TRUE 0.858 -7.000 0.011 NA   NA
 10211494 10211495 SJA_C1-16460 SJA_C1-16470     TRUE 0.899 -15.000 0.047 NA   NA
 10211495 10211496 SJA_C1-16470 SJA_C1-16480     TRUE 0.994 -3.000 0.642 NA   NA
 10211496 10211497 SJA_C1-16480 SJA_C1-16490     TRUE 0.973 -7.000 0.196 1.000 N NA
 10211497 10211498 SJA_C1-16490 SJA_C1-16500     TRUE 0.996 -19.000 0.863 0.062 Y NA
 10211498 10211499 SJA_C1-16500 SJA_C1-16510   trxA TRUE 0.818 30.000 0.173 1.000   NA
 10211500 10211501 SJA_C1-16520 SJA_C1-16530 gst   TRUE 0.810 19.000 0.074 1.000 N NA
 10211501 10211502 SJA_C1-16530 SJA_C1-16540   argJ TRUE 0.625 15.000 0.007 1.000 N NA
 10211504 10211505 SJA_C1-16560 SJA_C1-16570     FALSE 0.012 296.000 0.000 NA   NA
 10211505 10211506 SJA_C1-16570 SJA_C1-t0220     FALSE 0.181 74.000 0.000 NA   NA
 10211507 10211508 SJA_C1-16580 SJA_C1-16590 mltB dacA TRUE 0.704 81.000 0.037 NA Y NA
 10211508 10211509 SJA_C1-16590 SJA_C1-16600 dacA tmk TRUE 0.976 -3.000 0.099 1.000 N NA
 10211509 10211510 SJA_C1-16600 SJA_C1-16610 tmk holB TRUE 0.989 -3.000 0.254 0.072 N NA
 10211510 10211511 SJA_C1-16610 SJA_C1-16620 holB metG TRUE 0.684 44.000 0.075 0.072 N NA
 10211511 10211512 SJA_C1-16620 SJA_C1-16630 metG tatD TRUE 0.961 5.000 0.221 NA N NA
 10211512 10211513 SJA_C1-16630 SJA_C1-16640 tatD phnP TRUE 0.979 -3.000 0.139 NA   NA
 10211513 10211514 SJA_C1-16640 SJA_C1-16650 phnP   FALSE 0.468 17.000 0.000 1.000   NA
 10211514 10211515 SJA_C1-16650 SJA_C1-16660   kgtP TRUE 0.953 -3.000 0.034 1.000   NA
 10211515 10211516 SJA_C1-16660 SJA_C1-16670 kgtP   FALSE 0.204 135.000 0.000 1.000 N NA
 10211516 10211517 SJA_C1-16670 SJA_C1-16680   mazG FALSE 0.112 157.000 0.000 1.000   NA
 10211518 10211519 SJA_C1-16690 SJA_C1-16700 hflX hfq TRUE 0.622 66.000 0.115 1.000   NA
 10211519 10211520 SJA_C1-16700 SJA_C1-16710 hfq   FALSE 0.455 144.000 0.058 0.072   NA
 10211520 10211521 SJA_C1-16710 SJA_C1-16720     TRUE 0.995 -10.000 0.533 0.072 Y NA
 10211521 10211522 SJA_C1-16720 SJA_C1-16730   glnG TRUE 0.877 96.000 0.205 0.072 Y NA
 10211522 10211523 SJA_C1-16730 SJA_C1-16740 glnG glnL TRUE 0.993 0.000 0.297 0.072 Y NA
 10211523 10211524 SJA_C1-16740 SJA_C1-16750 glnL   TRUE 0.975 -3.000 0.094 1.000 N NA
 10211525 10211526 SJA_C1-16760 SJA_C1-16770 ispF cinA TRUE 0.758 6.000 0.009 NA   NA
 10211527 10211528 SJA_C1-16780 SJA_C1-16790   lipA TRUE 0.925 5.000 0.081 NA N NA
 10211529 10211530 SJA_C1-16800 SJA_C1-16810 cynT   TRUE 0.890 2.000 0.026 NA   NA
 10211530 10211531 SJA_C1-16810 SJA_C1-16820   acyP TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10211532 10211533 SJA_C1-16830 SJA_C1-16840 ahcY   FALSE 0.235 122.000 0.004 NA   NA
 10211533 10211534 SJA_C1-16840 SJA_C1-16850   algH FALSE 0.091 163.000 0.000 NA   NA
 10211535 10211536 SJA_C1-16860 SJA_C1-16870 ahpC amn FALSE 0.426 75.000 0.026 1.000 N NA
 10211537 10211538 SJA_C1-16880 SJA_C1-16890   yjdF TRUE 0.872 5.000 0.033 NA   NA
 10211538 10211539 SJA_C1-16890 SJA_C1-16900 yjdF asd TRUE 0.647 11.000 0.005 NA   NA
 10211539 10211540 SJA_C1-16900 SJA_C1-16910 asd dpp4 FALSE 0.245 195.000 0.006 1.000 Y NA
 10211540 10211541 SJA_C1-16910 SJA_C1-t0230 dpp4   FALSE 0.180 128.000 0.000 NA   NA
 10211541 10211542 SJA_C1-t0230 SJA_C1-16920     FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 10211543 10211544 SJA_C1-16930 SJA_C1-16940 hslV hslU TRUE 0.567 142.000 0.013 1.000 Y NA
 10211545 10211546 SJA_C1-16950 SJA_C1-16960 proS phaR FALSE 0.350 103.000 0.016 NA   NA
 10211547 10211548 SJA_C1-16970 SJA_C1-16980 phbC atoB TRUE 0.892 46.000 0.214 NA Y NA
 10211549 10211550 SJA_C1-16990 SJA_C1-17000 alr proP TRUE 0.774 42.000 0.162 1.000 N NA
 10211550 10211551 SJA_C1-17000 SJA_C1-17010 proP csaA FALSE 0.027 243.000 0.000 1.000   NA
 10211551 10211552 SJA_C1-17010 SJA_C1-17020 csaA pccA FALSE 0.284 74.000 0.009 1.000   NA
 10211552 10211553 SJA_C1-17020 SJA_C1-17030 pccA bioB FALSE 0.139 164.000 0.005 1.000 N NA
 10211553 10211554 SJA_C1-17030 SJA_C1-17040 bioB mcmA1 FALSE 0.304 117.000 0.005 1.000 N NA
 10211554 10211555 SJA_C1-17040 SJA_C1-17050 mcmA1   FALSE 0.378 149.000 0.041 1.000 N NA
 10211555 10211556 SJA_C1-17050 SJA_C1-17060   pccB TRUE 0.590 112.000 0.067 1.000 N NA
 10211557 10211558 SJA_C1-17070 SJA_C1-17080     FALSE 0.187 84.000 0.000 NA   NA
 10211559 10211560 SJA_C1-17090 SJA_C1-17100 gor pgi FALSE 0.401 102.000 0.017 1.000 N NA
 10211561 10211562 SJA_C1-17110 SJA_C1-17120   lepB FALSE 0.412 20.000 0.000 NA   NA
 10211562 10211563 SJA_C1-17120 SJA_C1-17130 lepB rnc TRUE 0.781 -45.000 0.009 1.000 N NA
 10211563 10211564 SJA_C1-17130 SJA_C1-17140 rnc   FALSE 0.272 80.000 0.000 0.036 N NA
 10211564 10211565 SJA_C1-17140 SJA_C1-17150   era FALSE 0.360 37.000 0.000 0.036   NA
 10211566 10211567 SJA_C1-17160 SJA_C1-17170 topA smf TRUE 0.891 114.000 0.238 1.000 Y NA
 10211567 10211568 SJA_C1-17170 SJA_C1-17180 smf ygiH TRUE 0.966 -3.000 0.070 NA   NA
 10211569 10211570 SJA_C1-17190 SJA_C1-17200 murI alaS FALSE 0.305 127.000 0.008 1.000 N NA
 10211570 10211571 SJA_C1-17200 SJA_C1-17210 alaS   FALSE 0.073 187.000 0.000 1.000 N NA
 10211571 10211572 SJA_C1-17210 SJA_C1-17220   lig TRUE 0.888 138.000 0.751 1.000 N NA
 10211574 10211575 SJA_C1-17240 SJA_C1-17250     TRUE 0.921 93.000 0.444 NA Y NA
 10211575 10211576 SJA_C1-17250 SJA_C1-17260   speF FALSE 0.521 149.000 0.013 1.000 Y NA
 10211577 10211578 SJA_C1-17270 SJA_C1-17280 ygcA   TRUE 0.923 -3.000 0.010 NA N NA
 10211578 10211579 SJA_C1-17280 SJA_C1-17290     TRUE 0.901 -3.000 0.008 NA   NA
 10211579 10211580 SJA_C1-17290 SJA_C1-17300     TRUE 0.726 17.000 0.033 NA   NA
 10211580 10211581 SJA_C1-17300 SJA_C1-17310   ispE TRUE 0.929 -3.000 0.011 1.000 N NA
 10211581 10211582 SJA_C1-17310 SJA_C1-17320 ispE   TRUE 0.943 -13.000 0.107 1.000   NA
 10211582 10211583 SJA_C1-17320 SJA_C1-17330   etf TRUE 0.766 26.000 0.091 1.000   NA
 10211584 10211585 SJA_C1-17340 SJA_C1-17350     TRUE 0.960 -3.000 0.051 NA   NA
 10211585 10211586 SJA_C1-17350 SJA_C1-17360   moaB TRUE 0.919 0.000 0.029 NA   NA
 10211591 10211592 SJA_C1-17410 SJA_C1-17420     TRUE 0.990 -7.000 0.620 1.000 N NA
 10211593 10211594 SJA_C1-17430 SJA_C1-17440   ibpA TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211595 10211596 SJA_C1-17450 SJA_C1-17460 kup cycH TRUE 0.645 143.000 0.182 1.000 N NA
 10211596 10211597 SJA_C1-17460 SJA_C1-17470 cycH ccmH TRUE 0.989 -3.000 0.083 NA Y NA
 10211597 10211598 SJA_C1-17470 SJA_C1-17480 ccmH ccmG TRUE 0.993 -3.000 0.167 NA Y NA
 10211598 10211599 SJA_C1-17480 SJA_C1-17490 ccmG ccmF TRUE 0.996 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 10211599 10211600 SJA_C1-17490 SJA_C1-17500 ccmF ccmE TRUE 0.922 13.000 0.021 0.002 Y NA
 10211600 10211601 SJA_C1-17500 SJA_C1-17510 ccmE   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211601 10211602 SJA_C1-17510 SJA_C1-17520   ccmC TRUE 0.674 5.000 0.000 NA   NA
 10211602 10211603 SJA_C1-17520 SJA_C1-17530 ccmC   FALSE 0.322 30.000 0.000 NA   NA
 10211604 10211605 SJA_C1-17540 SJA_C1-17550 purF   TRUE 0.612 82.000 0.100 1.000 N NA
 10211606 10211607 SJA_C1-17560 SJA_C1-17570 cfa phrB TRUE 0.833 5.000 0.014 1.000 N NA
 10211608 10211609 SJA_C1-17580 SJA_C1-17590 nudH ydiY FALSE 0.356 45.000 0.007 NA N NA
 10211609 10211610 SJA_C1-17590 SJA_C1-17600 ydiY   FALSE 0.430 74.000 0.029 NA N NA
 10211610 10211611 SJA_C1-17600 SJA_C1-17610   astA TRUE 0.992 -3.000 0.145 1.000 Y NA
 10211611 10211612 SJA_C1-17610 SJA_C1-17620 astA astB TRUE 0.989 -3.000 0.090 1.000 Y NA
 10211612 10211613 SJA_C1-17620 SJA_C1-17630 astB   TRUE 0.712 26.000 0.063 NA   NA
 10211613 10211614 SJA_C1-17630 SJA_C1-17640   cobQ FALSE 0.259 47.000 0.003 NA   NA
 10211614 10211615 SJA_C1-17640 SJA_C1-17650 cobQ   FALSE 0.116 155.000 0.000 1.000   NA
 10211615 10211616 SJA_C1-17650 SJA_C1-17660     TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.008   NA
 10211617 10211618 SJA_C1-17670 SJA_C1-17680     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211618 10211619 SJA_C1-17680 SJA_C1-17690     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211619 10211620 SJA_C1-17690 SJA_C1-17700     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 10211620 10211621 SJA_C1-17700 SJA_C1-17710     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211621 10211622 SJA_C1-17710 SJA_C1-17720     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211622 10211623 SJA_C1-17720 SJA_C1-17730     TRUE 0.965 -3.000 0.067 NA   NA
 10211623 10211624 SJA_C1-17730 SJA_C1-17740     TRUE 0.942 16.000 0.400 NA   NA
 10211626 10211627 SJA_C1-t0240 SJA_C1-t0250     FALSE 0.146 143.000 0.000 NA   NA
 10211629 10211630 SJA_C1-17770 SJA_C1-17780 ppdK glyS FALSE 0.517 143.000 0.071 0.072 N NA
 10211630 10211631 SJA_C1-17780 SJA_C1-17790 glyS glyQ TRUE 0.950 79.000 0.651 0.001 Y NA
 10211632 10211633 SJA_C1-17800 SJA_C1-17810 gumN gumN TRUE 0.989 2.000 0.667 NA   NA
 10211633 10211634 SJA_C1-17810 SJA_C1-17820 gumN rplY FALSE 0.266 123.000 0.007 NA   NA
 10211634 10211635 SJA_C1-17820 SJA_C1-17830 rplY pth1 TRUE 0.909 144.000 0.496 0.019 Y NA
 10211637 10211638 SJA_C1-17850 SJA_C1-17860 pgm   FALSE 0.043 203.000 0.000 NA   NA
 10211638 10211639 SJA_C1-17860 SJA_C1-17870     FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 10211639 10211640 SJA_C1-17870 SJA_C1-17880     TRUE 0.706 7.000 0.003 NA N NA
 10211640 10211641 SJA_C1-17880 SJA_C1-17890     FALSE 0.295 47.000 0.006 NA   NA
 10211641 10211642 SJA_C1-17890 SJA_C1-17900     FALSE 0.222 52.000 0.000 1.000   NA
 10211643 10211644 SJA_C1-17910 SJA_C1-17920   mutL FALSE 0.187 83.000 0.000 NA   NA
 10211645 10211646 SJA_C1-17930 SJA_C1-17940 mreB mreC TRUE 0.977 13.000 0.689 1.000 N NA
 10211646 10211647 SJA_C1-17940 SJA_C1-17950 mreC   TRUE 0.927 -3.000 0.015 NA   NA
 10211647 10211648 SJA_C1-17950 SJA_C1-17960   mrdA TRUE 0.980 -3.000 0.156 NA   NA
 10211648 10211649 SJA_C1-17960 SJA_C1-17970 mrdA rodA TRUE 0.975 -3.000 0.094 1.000 N NA
 10211649 10211650 SJA_C1-17970 SJA_C1-t0260 rodA   FALSE 0.186 125.000 0.000 NA   NA
 10211650 10211651 SJA_C1-t0260 SJA_C1-17980     FALSE 0.016 272.000 0.000 NA   NA
 10211652 10211653 SJA_C1-17990 SJA_C1-t0270     FALSE 0.026 242.000 0.000 NA   NA
 10211653 10211654 SJA_C1-t0270 SJA_C1-18000     FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 10211654 10211655 SJA_C1-18000 SJA_C1-18010     FALSE 0.166 135.000 0.000 NA   NA
 10211655 10211656 SJA_C1-18010 SJA_C1-18020     FALSE 0.501 15.000 0.000 1.000   NA
 10211656 10211657 SJA_C1-18020 SJA_C1-18030     TRUE 0.994 -3.000 0.500 0.011   NA
 10211657 10211658 SJA_C1-18030 SJA_C1-18040     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10211658 10211659 SJA_C1-18040 SJA_C1-18050     FALSE 0.003 568.000 0.000 NA   NA
 10211659 10211660 SJA_C1-18050 SJA_C1-18060     FALSE 0.006 365.000 0.000 NA   NA
 10211660 10211661 SJA_C1-18060 SJA_C1-18070     FALSE 0.006 353.000 0.000 NA   NA
 10211661 10211662 SJA_C1-18070 SJA_C1-18080     FALSE 0.389 22.000 0.000 NA   NA
 10211662 10211663 SJA_C1-18080 SJA_C1-18090     FALSE 0.209 108.000 0.000 NA   NA
 10211664 10211665 SJA_C1-18100 SJA_C1-18110     FALSE 0.031 229.000 0.000 NA   NA
 10211666 10211667 SJA_C1-18120 SJA_C1-18130     TRUE 0.915 81.000 1.000 NA   NA
 10211670 10211671 SJA_C1-18160 SJA_C1-18170     FALSE 0.003 482.000 0.000 NA   NA
 10211671 10211672 SJA_C1-18170 SJA_C1-18180     TRUE 0.567 111.000 0.000 NA Y NA
 10211673 10211674 SJA_C1-18190 SJA_C1-18200     FALSE 0.199 121.000 0.000 NA   NA
 10211674 10211675 SJA_C1-18200 SJA_C1-18210     FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 10211675 10211676 SJA_C1-18210 SJA_C1-18220     FALSE 0.003 488.000 0.000 NA   NA
 10211676 10211677 SJA_C1-18220 SJA_C1-18230     FALSE 0.412 20.000 0.000 NA   NA
 10211677 10211678 SJA_C1-18230 SJA_C1-18240     FALSE 0.121 151.000 0.000 NA   NA
 10211678 10211679 SJA_C1-18240 SJA_C1-18250     FALSE 0.192 90.000 0.000 NA   NA
 10211679 10211680 SJA_C1-18250 SJA_C1-18260     FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 10211680 10211681 SJA_C1-18260 SJA_C1-18270     FALSE 0.182 72.000 0.000 NA   NA
 10211681 10211682 SJA_C1-18270 SJA_C1-18280     FALSE 0.054 191.000 0.000 NA   NA
 10211682 10211683 SJA_C1-18280 SJA_C1-18290     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211683 10211684 SJA_C1-18290 SJA_C1-18300     FALSE 0.125 150.000 0.000 NA   NA
 10211684 10211685 SJA_C1-18300 SJA_C1-18310     FALSE 0.207 107.000 0.000 NA   NA
 10211685 10211686 SJA_C1-18310 SJA_C1-18320     TRUE 0.989 -10.000 0.667 NA   NA
 10211686 10211687 SJA_C1-18320 SJA_C1-18330     TRUE 0.972 3.000 0.286 NA   NA
 10211687 10211688 SJA_C1-18330 SJA_C1-18340     TRUE 0.967 8.000 0.375 NA   NA
 10211688 10211689 SJA_C1-18340 SJA_C1-18350     TRUE 0.894 107.000 0.667 NA   NA
 10211689 10211690 SJA_C1-18350 SJA_C1-18360     TRUE 0.992 3.000 1.000 NA   NA
 10211690 10211691 SJA_C1-18360 SJA_C1-18370     TRUE 0.758 46.000 0.200 NA   NA
 10211691 10211692 SJA_C1-18370 SJA_C1-18380     TRUE 0.853 35.000 0.300 NA   NA
 10211692 10211693 SJA_C1-18380 SJA_C1-18390     FALSE 0.060 186.000 0.000 NA   NA
 10211693 10211694 SJA_C1-18390 SJA_C1-18400     FALSE 0.233 46.000 0.000 NA   NA
 10211695 10211696 SJA_C1-18410 SJA_C1-18420     TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10211697 10211698 SJA_C1-18430 SJA_C1-18440     TRUE 0.709 -13.000 0.000 NA   NA
 10211698 10211699 SJA_C1-18440 SJA_C1-18450     FALSE 0.146 143.000 0.000 NA   NA
 10211699 10211700 SJA_C1-18450 SJA_C1-18460     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10211700 10211701 SJA_C1-18460 SJA_C1-18470     FALSE 0.192 89.000 0.000 NA   NA
 10211701 10211702 SJA_C1-18470 SJA_C1-18480     FALSE 0.282 37.000 0.000 NA   NA
 10211702 10211703 SJA_C1-18480 SJA_C1-18490     FALSE 0.247 44.000 0.000 NA   NA
 10211703 10211704 SJA_C1-18490 SJA_C1-18500     FALSE 0.017 268.000 0.000 NA   NA
 10211706 10211707 SJA_C1-18520 SJA_C1-18530     TRUE 0.683 -18.000 0.000 NA   NA
 10211707 10211708 SJA_C1-18530 SJA_C1-18540     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211708 10211709 SJA_C1-18540 SJA_C1-18550     FALSE 0.012 296.000 0.000 NA   NA
 10211709 10211710 SJA_C1-18550 SJA_C1-18560   linA FALSE 0.162 137.000 0.000 NA   NA
 10211710 10211711 SJA_C1-18560 SJA_C1-18570 linA orfup FALSE 0.193 61.000 0.000 NA   NA
 10211711 10211712 SJA_C1-18570 SJA_C1-18580 orfup linX FALSE 0.021 450.000 0.000 0.044 Y NA
 10211713 10211714 SJA_C1-18590 SJA_C1-18600   acd TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211715 10211716 SJA_C1-18610 SJA_C1-18620 gor   FALSE 0.328 39.000 0.000 1.000 N NA
 10211716 10211717 SJA_C1-18620 SJA_C1-18630   xdhC TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 10211717 10211718 SJA_C1-18630 SJA_C1-18640 xdhC   FALSE 0.092 171.000 0.000 NA N NA
 10211718 10211719 SJA_C1-18640 SJA_C1-18650     FALSE 0.205 118.000 0.000 NA   NA
 10211719 10211720 SJA_C1-18650 SJA_C1-18660   pdhB TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10211720 10211721 SJA_C1-18660 SJA_C1-18670 pdhB pdhA TRUE 0.994 -7.000 0.375 0.001 Y NA
 10211721 10211722 SJA_C1-18670 SJA_C1-18680 pdhA   TRUE 0.904 -3.000 0.000 0.066 N NA
 10211723 10211724 SJA_C1-18690 SJA_C1-18700     FALSE 0.036 222.000 0.000 1.000   NA
 10211724 10211725 SJA_C1-18700 SJA_C1-18710   idnO FALSE 0.199 67.000 0.000 1.000   NA
 10211725 10211726 SJA_C1-18710 SJA_C1-18720 idnO   TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10211726 10211727 SJA_C1-18720 SJA_C1-18730     FALSE 0.191 88.000 0.000 NA   NA
 10211727 10211728 SJA_C1-18730 SJA_C1-18740     FALSE 0.203 87.000 0.000 1.000   NA
 10211728 10211729 SJA_C1-18740 SJA_C1-18750   tnp TRUE 0.663 10.000 0.000 1.000 N NA
 10211730 10211731 SJA_C1-18760 SJA_C1-18770     TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 10211731 10211732 SJA_C1-18770 SJA_C1-18780     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10211732 10211733 SJA_C1-18780 SJA_C1-18790   hyuA TRUE 0.942 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 10211733 10211734 SJA_C1-18790 SJA_C1-18800 hyuA hyuB TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 10211739 10211740 SJA_C1-18850 SJA_C1-18860     TRUE 0.778 -15.000 0.000 0.003   NA
 10211740 10211741 SJA_C1-18860 SJA_C1-18870     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211741 10211742 SJA_C1-18870 SJA_C1-18880     FALSE 0.009 320.000 0.000 NA   NA
 10211743 10211744 SJA_C1-18890 SJA_C1-18900     TRUE 0.543 124.000 0.000 1.000 Y NA
 10211744 10211745 SJA_C1-18900 SJA_C1-18910     FALSE 0.023 389.000 0.000 NA Y NA
 10211745 10211746 SJA_C1-18910 SJA_C1-18920     FALSE 0.089 261.000 0.000 NA Y NA
 10211746 10211747 SJA_C1-18920 SJA_C1-18930     FALSE 0.181 76.000 0.000 NA   NA
 10211747 10211748 SJA_C1-18930 SJA_C1-18940     FALSE 0.212 113.000 0.000 NA   NA
 10211748 10211749 SJA_C1-18940 SJA_C1-18950     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211749 10211750 SJA_C1-18950 SJA_C1-18960     TRUE 0.674 5.000 0.000 NA   NA
 10211750 10211751 SJA_C1-18960 SJA_C1-18970     FALSE 0.397 51.000 0.019 NA   NA
 10211751 10211752 SJA_C1-18970 SJA_C1-18980     TRUE 0.998 -3.000 0.605 1.000 Y NA
 10211752 10211753 SJA_C1-18980 SJA_C1-18990     TRUE 0.739 -12.000 0.000 1.000   NA
 10211753 10211754 SJA_C1-18990 SJA_C1-19000     FALSE 0.188 65.000 0.000 NA   NA
 10211754 10211755 SJA_C1-19000 SJA_C1-19010     FALSE 0.181 73.000 0.000 NA   NA
 10211756 10211757 SJA_C1-19020 SJA_C1-19030   hisI TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211757 10211758 SJA_C1-19030 SJA_C1-19040 hisI   TRUE 0.885 -3.000 0.002 NA N NA
 10211758 10211759 SJA_C1-19040 SJA_C1-19050     TRUE 0.882 10.000 0.000 NA Y NA
 10211760 10211761 SJA_C1-19060 SJA_C1-19070     TRUE 0.709 -13.000 0.000 NA   NA
 10211761 10211762 SJA_C1-19070 SJA_C1-19080     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211762 10211763 SJA_C1-19080 SJA_C1-19090     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211763 10211764 SJA_C1-19090 SJA_C1-19100     TRUE 0.992 -3.000 0.444 NA   NA
 10211764 10211765 SJA_C1-19100 SJA_C1-19110     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211765 10211766 SJA_C1-19110 SJA_C1-19120     FALSE 0.004 453.000 0.000 1.000   NA
 10211769 10211770 SJA_C1-19140 SJA_C1-19150     TRUE 0.618 9.000 0.000 NA   NA
 10211770 10211771 SJA_C1-19150 SJA_C1-19160     TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10211771 10211772 SJA_C1-19160 SJA_C1-19170     FALSE 0.008 328.000 0.000 NA   NA
 10211772 10211773 SJA_C1-19170 SJA_C1-19180     FALSE 0.011 302.000 0.000 NA   NA
 10211773 10211774 SJA_C1-19180 SJA_C1-19190   gelD FALSE 0.410 28.000 0.000 0.088   NA
 10211774 10211775 SJA_C1-19190 SJA_C1-19200 gelD gelJ TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10211775 10211776 SJA_C1-19200 SJA_C1-19210 gelJ gelC TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10211776 10211777 SJA_C1-19210 SJA_C1-19220 gelC epsG TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 10211777 10211778 SJA_C1-19220 SJA_C1-19230 epsG   TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 10211778 10211779 SJA_C1-19230 SJA_C1-19240     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10211779 10211780 SJA_C1-19240 SJA_C1-19250   exoQ TRUE 0.658 -30.000 0.000 NA   NA
 10211780 10211781 SJA_C1-19250 SJA_C1-19260 exoQ   TRUE 0.963 -7.000 0.143 NA   NA
 10211781 10211782 SJA_C1-19260 SJA_C1-19270     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211782 10211783 SJA_C1-19270 SJA_C1-19280     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211783 10211784 SJA_C1-19280 SJA_C1-19290     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 10211784 10211785 SJA_C1-19290 SJA_C1-19300     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10211785 10211786 SJA_C1-19300 SJA_C1-19310     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10211787 10211788 SJA_C1-19320 SJA_C1-19330   ugd FALSE 0.019 268.000 0.000 1.000   NA
 10211788 10211789 SJA_C1-19330 SJA_C1-19340 ugd cinA FALSE 0.007 359.000 0.000 1.000   NA
 10211790 10211791 SJA_C1-19350 SJA_C1-19360 map glnB FALSE 0.063 243.000 0.016 1.000 N NA
 10211791 10211792 SJA_C1-19360 SJA_C1-19370 glnB glnA TRUE 0.786 143.000 0.145 1.000 Y NA
 10211792 10211793 SJA_C1-19370 SJA_C1-19380 glnA   FALSE 0.094 164.000 0.000 1.000   NA
 10211794 10211795 SJA_C1-19390 SJA_C1-19400     TRUE 0.537 82.000 0.073 NA   NA
 10211796 10211797 SJA_C1-19410 SJA_C1-19420 rluD rpoH FALSE 0.494 76.000 0.046 1.000 N NA
 10211797 10211798 SJA_C1-19420 SJA_C1-19430 rpoH mtgA FALSE 0.275 151.000 0.022 1.000   NA
 10211799 10211800 SJA_C1-19440 SJA_C1-19450   clpX FALSE 0.008 360.000 0.000 1.000 N NA
 10211800 10211801 SJA_C1-19450 SJA_C1-19460 clpX clpP TRUE 0.891 135.000 0.352 1.000 Y NA
 10211801 10211802 SJA_C1-19460 SJA_C1-19470 clpP   FALSE 0.276 114.000 0.004 NA N NA
 10211802 10211803 SJA_C1-19470 SJA_C1-19480   tig FALSE 0.282 115.000 0.004 NA N NA
 10211803 10211804 SJA_C1-19480 SJA_C1-t0290 tig   FALSE 0.184 70.000 0.000 NA   NA
 10211805 10211806 SJA_C1-19490 SJA_C1-19500     TRUE 0.877 148.000 1.000 NA   NA
 10211806 10211807 SJA_C1-19500 SJA_C1-19510   fecR TRUE 0.707 200.000 1.000 NA N NA
 10211809 10211810 SJA_C1-19530 SJA_C1-19540 dapB   TRUE 0.844 3.000 0.010 1.000 N NA
 10211810 10211811 SJA_C1-19540 SJA_C1-19550     FALSE 0.252 48.000 0.003 NA   NA
 10211811 10211812 SJA_C1-19550 SJA_C1-t0300     FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 10211813 10211814 SJA_C1-19560 SJA_C1-19570 gst   FALSE 0.019 263.000 0.000 NA   NA
 10211815 10211816 SJA_C1-19580 SJA_C1-19590   linB FALSE 0.190 86.000 0.000 NA   NA
 10211817 10211818 SJA_C1-19600 SJA_C1-19610     FALSE 0.186 68.000 0.000 NA   NA
 10211819 10211820 SJA_C1-19620 SJA_C1-19630     TRUE 0.685 41.000 0.095 NA   NA
 10211820 10211821 SJA_C1-19630 SJA_C1-19640     TRUE 0.598 57.000 0.095 NA   NA
 10211821 10211822 SJA_C1-19640 SJA_C1-19650     FALSE 0.201 56.000 0.000 NA   NA
 10211822 10211823 SJA_C1-19650 SJA_C1-19660     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA   NA
 10211823 10211824 SJA_C1-19660 SJA_C1-19670     FALSE 0.253 43.000 0.000 NA   NA
 10211824 10211825 SJA_C1-19670 SJA_C1-19680   mmcH FALSE 0.184 126.000 0.000 NA   NA
 10211825 10211826 SJA_C1-19680 SJA_C1-19690 mmcH mmcH TRUE 0.536 88.000 0.000 NA Y NA
 10211826 10211827 SJA_C1-19690 SJA_C1-19700 mmcH ephA FALSE 0.212 114.000 0.000 NA   NA
 10211827 10211828 SJA_C1-19700 SJA_C1-19710 ephA   FALSE 0.199 67.000 0.000 1.000   NA
 10211829 10211830 SJA_C1-19720 SJA_C1-19730     FALSE 0.343 27.000 0.000 NA   NA
 10211830 10211831 SJA_C1-19730 SJA_C1-19740   ahpD TRUE 0.565 63.000 0.082 NA   NA
 10211832 10211833 SJA_C1-19750 SJA_C1-19760     FALSE 0.006 354.000 0.000 NA   NA
 10211833 10211834 SJA_C1-19760 SJA_C1-19770     FALSE 0.007 343.000 0.000 NA   NA
 10211834 10211835 SJA_C1-19770 SJA_C1-19780     FALSE 0.343 27.000 0.000 NA   NA
 10211835 10211836 SJA_C1-19780 SJA_C1-19790     FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10211836 10211837 SJA_C1-19790 SJA_C1-19800   yjgF FALSE 0.274 45.000 0.000 NA N NA
 10211839 10211840 SJA_C1-19820 SJA_C1-19830     TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 10211840 10211841 SJA_C1-19830 SJA_C1-19840   ahpC FALSE 0.088 164.000 0.000 NA   NA
 10211841 10211842 SJA_C1-19840 SJA_C1-19850 ahpC   TRUE 0.628 8.000 0.000 NA   NA
 10211842 10211843 SJA_C1-19850 SJA_C1-19860   gst FALSE 0.314 31.000 0.000 NA   NA
 10211843 10211844 SJA_C1-19860 SJA_C1-19870 gst gst TRUE 0.577 70.000 0.000 0.005 Y NA
 10211844 10211845 SJA_C1-19870 SJA_C1-19880 gst   TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10211846 10211847 SJA_C1-19890 SJA_C1-19900   virB10 TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211847 10211848 SJA_C1-19900 SJA_C1-19910 virB10 virB9 TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA Y NA
 10211848 10211849 SJA_C1-19910 SJA_C1-19920 virB9 trbF TRUE 0.997 -3.000 0.600 NA Y NA
 10211849 10211850 SJA_C1-19920 SJA_C1-19930 trbF trbL TRUE 0.996 0.000 0.667 NA Y NA
 10211850 10211851 SJA_C1-19930 SJA_C1-19940 trbL trbK TRUE 0.978 2.000 0.333 NA   NA
 10211851 10211852 SJA_C1-19940 SJA_C1-19950 trbK trbJ FALSE 0.505 14.000 0.000 NA   NA
 10211852 10211853 SJA_C1-19950 SJA_C1-19960 trbJ virB4 TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 10211853 10211854 SJA_C1-19960 SJA_C1-19970 virB4 trbD TRUE 0.977 15.000 0.400 NA Y NA
 10211854 10211855 SJA_C1-19970 SJA_C1-19980 trbD virB2 TRUE 0.992 0.000 0.286 NA Y NA
 10211855 10211856 SJA_C1-19980 SJA_C1-19990 virB2 trbB TRUE 0.997 -3.000 0.571 NA Y NA
 10211858 10211859 SJA_C1-20010 SJA_C1-20020   virD4 TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211859 10211860 SJA_C1-20020 SJA_C1-20030 virD4 virD2 TRUE 0.734 25.000 0.000 NA Y NA
 10211860 10211861 SJA_C1-20030 SJA_C1-20040 virD2   FALSE 0.024 244.000 0.000 NA   NA
 10211861 10211862 SJA_C1-20040 SJA_C1-20050     TRUE 0.980 5.000 0.500 NA   NA
 10211862 10211863 SJA_C1-20050 SJA_C1-20060   traF FALSE 0.369 24.000 0.000 NA   NA
 10211863 10211864 SJA_C1-20060 SJA_C1-20070 traF   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211864 10211865 SJA_C1-20070 SJA_C1-20080     TRUE 0.982 -3.000 0.182 NA   NA
 10211865 10211866 SJA_C1-20080 SJA_C1-20090     TRUE 0.990 -3.000 0.333 1.000   NA
 10211866 10211867 SJA_C1-20090 SJA_C1-20100   repA TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA N NA
 10211867 10211868 SJA_C1-20100 SJA_C1-20110 repA   TRUE 0.916 18.000 0.300 NA   NA
 10211868 10211869 SJA_C1-20110 SJA_C1-20120     TRUE 0.813 140.000 0.500 NA   NA
 10211869 10211870 SJA_C1-20120 SJA_C1-20130     TRUE 0.855 140.000 0.667 NA   NA
 10211870 10211871 SJA_C1-20130 SJA_C1-20140     TRUE 0.894 117.000 0.667 NA   NA
 10211871 10211872 SJA_C1-20140 SJA_C1-20150     FALSE 0.203 105.000 0.000 NA   NA
 10211872 10211873 SJA_C1-20150 SJA_C1-20160     FALSE 0.082 168.000 0.000 NA   NA
 10211873 10211874 SJA_C1-20160 SJA_C1-20170     FALSE 0.180 128.000 0.000 NA   NA
 10211874 10211875 SJA_C1-20170 SJA_C1-20180   ssb FALSE 0.150 142.000 0.000 NA   NA
 10211875 10211876 SJA_C1-20180 SJA_C1-20190 ssb   FALSE 0.015 277.000 0.000 NA   NA
 10211876 10211877 SJA_C1-20190 SJA_C1-20200     FALSE 0.211 110.000 0.000 NA   NA
 10211877 10211878 SJA_C1-20200 SJA_C1-20210     FALSE 0.511 166.000 0.222 NA   NA
 10211878 10211879 SJA_C1-20210 SJA_C1-20220     FALSE 0.007 342.000 0.000 NA   NA
 10211879 10211880 SJA_C1-20220 SJA_C1-20230     TRUE 0.981 0.000 0.300 NA   NA
 10211880 10211881 SJA_C1-20230 SJA_C1-20240     FALSE 0.100 159.000 0.000 NA   NA
 10211881 10211882 SJA_C1-20240 SJA_C1-20250     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10211882 10211883 SJA_C1-20250 SJA_C1-20260     FALSE 0.192 95.000 0.000 NA   NA
 10211883 10211884 SJA_C1-20260 SJA_C1-20270     TRUE 0.961 11.000 0.375 NA   NA
 10211884 10211885 SJA_C1-20270 SJA_C1-20280     FALSE 0.193 99.000 0.000 NA   NA
 10211885 10211886 SJA_C1-20280 SJA_C1-20290     FALSE 0.082 168.000 0.000 NA   NA
 10211887 10211888 SJA_C1-20300 SJA_C1-20310     FALSE 0.193 99.000 0.000 NA   NA
 10211888 10211889 SJA_C1-20310 SJA_C1-20320     TRUE 0.781 -6.000 0.000 NA   NA
 10211889 10211890 SJA_C1-20320 SJA_C1-20330     TRUE 0.913 -13.000 0.059 NA   NA
 10211890 10211891 SJA_C1-20330 SJA_C1-20340     FALSE 0.226 47.000 0.000 NA   NA
 10211891 10211892 SJA_C1-20340 SJA_C1-20350     TRUE 0.996 -3.000 0.833 NA   NA
 10211892 10211893 SJA_C1-20350 SJA_C1-20360     TRUE 0.939 2.000 0.081 NA   NA
 10211893 10211894 SJA_C1-20360 SJA_C1-20370     FALSE 0.440 81.000 0.037 NA   NA
 10211894 10211895 SJA_C1-20370 SJA_C1-20380     TRUE 0.878 88.000 0.652 NA   NA
 10211895 10211896 SJA_C1-20380 SJA_C1-20390     TRUE 0.996 -3.000 0.818 NA   NA
 10211897 10211898 SJA_C1-20400 SJA_C1-20410   ada FALSE 0.103 252.000 0.000 1.000 Y NA
 10211898 10211899 SJA_C1-20410 SJA_C1-20420 ada   FALSE 0.180 143.000 0.000 1.000 N NA
 10211899 10211900 SJA_C1-20420 SJA_C1-20430   acrB TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.037 N NA
 10211900 10211901 SJA_C1-20430 SJA_C1-20440 acrB acrA TRUE 0.992 4.000 1.000 1.000 N NA
 10211902 10211903 SJA_C1-20450 SJA_C1-20460     FALSE 0.177 129.000 0.000 NA   NA
 10211904 10211905 SJA_C1-20470 SJA_C1-20480 pqqL   FALSE 0.043 209.000 0.000 1.000   NA
 10211905 10211906 SJA_C1-20480 SJA_C1-20490     FALSE 0.024 251.000 0.000 1.000   NA
 10211907 10211908 SJA_C1-20500 SJA_C1-20510 nifU   TRUE 0.757 100.000 0.061 1.000 Y NA
 10211908 10211909 SJA_C1-20510 SJA_C1-20520   rimI TRUE 0.985 -3.000 0.209 1.000   NA
 10211909 10211910 SJA_C1-20520 SJA_C1-20530 rimI   FALSE 0.360 113.000 0.013 1.000   NA
 10211910 10211911 SJA_C1-20530 SJA_C1-20540   fur TRUE 0.575 122.000 0.071 1.000 N NA
 10211911 10211912 SJA_C1-20540 SJA_C1-20550 fur plsC TRUE 0.920 7.000 0.091 1.000 N NA
 10211912 10211913 SJA_C1-20550 SJA_C1-20560 plsC miaB TRUE 0.647 28.000 0.030 1.000 N NA
 10211913 10211914 SJA_C1-20560 SJA_C1-20570 miaB   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10211914 10211915 SJA_C1-20570 SJA_C1-20580   phoH TRUE 0.750 1.000 0.000 NA   NA
 10211915 10211916 SJA_C1-20580 SJA_C1-20590 phoH   TRUE 0.899 34.000 0.457 NA   NA
 10211916 10211917 SJA_C1-20590 SJA_C1-20600   corC TRUE 0.740 104.000 0.222 NA   NA
 10211918 10211919 SJA_C1-20610 SJA_C1-20620   pdhD TRUE 0.525 14.000 0.000 1.000   NA
 10211919 10211920 SJA_C1-20620 SJA_C1-20630 pdhD   TRUE 0.663 22.000 0.024 NA N NA
 10211920 10211921 SJA_C1-20630 SJA_C1-20640   pdhC TRUE 0.904 0.000 0.016 NA N NA
 10211923 10211924 SJA_C1-20660 SJA_C1-20670     TRUE 0.990 -3.000 0.303 0.069 N NA
 10211924 10211925 SJA_C1-20670 SJA_C1-20680     FALSE 0.017 284.000 0.000 NA N NA
 10211925 10211926 SJA_C1-20680 SJA_C1-20690     TRUE 0.545 106.000 0.057 NA N NA
 10211927 10211928 SJA_C1-20700 SJA_C1-20710     TRUE 0.955 12.000 0.096 1.000 Y NA
 10211928 10211929 SJA_C1-20710 SJA_C1-20720   mmsB TRUE 0.923 23.000 0.122 1.000 Y NA
 10211930 10211931 SJA_C1-20730 SJA_C1-20740 paaG gdh TRUE 0.754 90.000 0.044 0.064 Y NA
 10211931 10211932 SJA_C1-20740 SJA_C1-20750 gdh folE TRUE 0.962 -3.000 0.045 1.000 N NA
 10211934 10211935 SJA_C1-20770 SJA_C1-20780     FALSE 0.240 45.000 0.000 NA   NA
 10211936 10211937 SJA_C1-20790 SJA_C1-20800 fadA fadB TRUE 0.927 136.000 0.562 1.000 Y NA
 10211939 10211940 SJA_C1-20820 SJA_C1-20830 galE pgl TRUE 0.727 5.000 0.000 1.000 N NA
 10211944 10211945 SJA_C1-20860 SJA_C1-20870 zwf edd TRUE 0.973 -7.000 0.041 1.000 Y NA
 10211945 10211946 SJA_C1-20870 SJA_C1-20880 edd glk TRUE 0.717 135.000 0.058 1.000 Y NA
 10211946 10211947 SJA_C1-20880 SJA_C1-20890 glk eda TRUE 0.984 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 10211947 10211948 SJA_C1-20890 SJA_C1-20900 eda   FALSE 0.450 29.000 0.008 NA   NA
 10211949 10211950 SJA_C1-20910 SJA_C1-20920   hemB TRUE 0.799 2.000 0.005 1.000   NA
 10211950 10211951 SJA_C1-20920 SJA_C1-20930 hemB   FALSE 0.232 49.000 0.000 1.000   NA
 10211952 10211953 SJA_C1-20940 SJA_C1-20950   amtB FALSE 0.009 320.000 0.000 NA   NA
 10211953 10211954 SJA_C1-20950 SJA_C1-20960 amtB   TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10211956 10211957 SJA_C1-20980 SJA_C1-20990 cyoA cyoB TRUE 0.996 6.000 0.915 0.010 Y NA
 10211957 10211958 SJA_C1-20990 SJA_C1-21000 cyoB cyoC TRUE 0.983 27.000 0.847 0.047 Y NA
 10211958 10211959 SJA_C1-21000 SJA_C1-21010 cyoC cyoD TRUE 0.999 -3.000 0.906 0.047 Y NA
 10211959 10211960 SJA_C1-21010 SJA_C1-21020 cyoD   TRUE 0.996 -3.000 0.849 NA   NA
 10211960 10211961 SJA_C1-21020 SJA_C1-21030     TRUE 0.968 -3.000 0.074 NA   NA
 10211961 10211962 SJA_C1-21030 SJA_C1-21040     TRUE 0.993 -3.000 0.197 1.000 Y NA
 10211963 10211964 SJA_C1-21050 SJA_C1-21060     FALSE 0.486 22.000 0.000 0.010   NA
 10211964 10211965 SJA_C1-21060 SJA_C1-21070     TRUE 0.637 113.000 0.106 NA   NA
 10211966 10211967 SJA_C1-21080 SJA_C1-21090     TRUE 0.632 139.000 0.172 NA   NA
 10211967 10211968 SJA_C1-21090 SJA_C1-t0320     FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 10211971 10211972 SJA_C1-21120 SJA_C1-21130   tfdD FALSE 0.296 44.000 0.000 1.000 N NA
 10211973 10211974 SJA_C1-21140 SJA_C1-21150 tfdR tfdC FALSE 0.249 106.000 0.000 1.000 N NA
 10211974 10211975 SJA_C1-21150 SJA_C1-21160 tfdC tfdE TRUE 0.764 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10211975 10211976 SJA_C1-21160 SJA_C1-21170 tfdE tfdB FALSE 0.474 20.000 0.000 1.000 N NA
 10211977 10211978 SJA_C1-21180 SJA_C1-21190     FALSE 0.247 44.000 0.000 NA   NA
 10211978 10211979 SJA_C1-21190 SJA_C1-21200   dpep1 FALSE 0.173 137.000 0.000 1.000   NA
 10211979 10211980 SJA_C1-21200 SJA_C1-21210 dpep1   TRUE 0.987 0.000 0.385 1.000 N NA
 10211980 10211981 SJA_C1-21210 SJA_C1-21220     FALSE 0.027 238.000 0.000 NA   NA
 10211982 10211983 SJA_C1-21230 SJA_C1-21240 chrB chrA TRUE 0.976 -3.000 0.114 NA   NA
 10211984 10211985 SJA_C1-21250 SJA_C1-21260 groEL groES TRUE 0.793 97.000 0.072 0.068 Y NA
 10211986 10211987 SJA_C1-21270 SJA_C1-21280   gst FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 10211988 10211989 SJA_C1-21290 SJA_C1-21300     TRUE 0.720 114.000 0.182 NA   NA
 10211990 10211991 SJA_C1-21310 SJA_C1-21320 gyrA   TRUE 0.879 -3.000 0.004 NA   NA
 10211993 10211994 SJA_C1-21340 SJA_C1-21350 htrB trpF FALSE 0.337 42.000 0.003 1.000 N NA
 10211994 10211995 SJA_C1-21350 SJA_C1-21360 trpF trpB TRUE 0.935 49.000 0.375 0.001 Y NA
 10211995 10211996 SJA_C1-21360 SJA_C1-21370 trpB trpA TRUE 0.894 142.000 0.344 0.001 Y NA
 10211996 10211997 SJA_C1-21370 SJA_C1-21380 trpA accD TRUE 0.987 -3.000 0.232 1.000 N NA
 10211997 10211998 SJA_C1-21380 SJA_C1-21390 accD folC TRUE 0.929 21.000 0.383 1.000 N NA
 10211998 10211999 SJA_C1-21390 SJA_C1-21400 folC   FALSE 0.247 69.000 0.006 NA   NA
 10212000 10212001 SJA_C1-21410 SJA_C1-21420 ampG   TRUE 0.840 95.000 0.444 NA N NA
 10212002 10212003 SJA_C1-21430 SJA_C1-21440 rluB yhhF TRUE 0.972 -3.000 0.079 1.000 N NA
 10212004 10212005 SJA_C1-21450 SJA_C1-21460     TRUE 0.722 130.000 0.250 NA   NA
 10212006 10212007 SJA_C1-21470 SJA_C1-21480 uvrD   FALSE 0.181 74.000 0.000 NA   NA
 10212008 10212009 SJA_C1-t0330 SJA_C1-t0340     FALSE 0.048 197.000 0.000 NA   NA
 10212009 10212010 SJA_C1-t0340 SJA_C1-21490     FALSE 0.192 90.000 0.000 NA   NA
 10212010 10212011 SJA_C1-21490 SJA_C1-21500     FALSE 0.260 42.000 0.000 NA   NA
 10212012 10212013 SJA_C1-21510 SJA_C1-21520 aroA   TRUE 0.652 11.000 0.005 NA   NA
 10212013 10212014 SJA_C1-21520 SJA_C1-21530   cmk TRUE 0.897 -3.000 0.007 NA   NA
 10212014 10212015 SJA_C1-21530 SJA_C1-21540 cmk rpsA TRUE 0.544 173.000 0.281 1.000 N NA
 10212015 10212016 SJA_C1-21540 SJA_C1-21550 rpsA ihfB TRUE 0.572 169.000 0.292 1.000 N NA
 10212016 10212017 SJA_C1-21550 SJA_C1-t0350 ihfB   FALSE 0.201 56.000 0.000 NA   NA
 10212017 10212018 SJA_C1-t0350 SJA_C1-21560   kef FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 10212019 10212020 SJA_C1-21570 SJA_C1-21580 glsA alaS FALSE 0.005 433.000 0.000 1.000 N NA
 10212023 10212024 SJA_C1-21610 SJA_C1-21620   maeB TRUE 0.810 23.000 0.100 1.000 N NA
 10212024 10212025 SJA_C1-21620 SJA_C1-21630 maeB   FALSE 0.209 52.000 0.000 NA   NA
 10212025 10212026 SJA_C1-21630 SJA_C1-21640   araJ FALSE 0.205 118.000 0.000 NA   NA
 10212027 10212028 SJA_C1-21650 SJA_C1-21660   hisI TRUE 0.744 -13.000 0.003 NA   NA
 10212028 10212029 SJA_C1-21660 SJA_C1-t0360 hisI   FALSE 0.102 158.000 0.000 NA   NA
 10212031 10212032 SJA_C1-21680 SJA_C1-21690 hupB lon FALSE 0.239 177.000 0.043 1.000 N NA
 10212032 10212033 SJA_C1-21690 SJA_C1-21700 lon   FALSE 0.186 131.000 0.002 NA   NA
 10212033 10212034 SJA_C1-21700 SJA_C1-21710   dnaX TRUE 0.991 -3.000 0.411 NA   NA
 10212036 10212037 SJA_C1-21720 SJA_C1-21730 ampC   TRUE 0.944 -3.000 0.019 1.000 N NA
 10212037 10212038 SJA_C1-21730 SJA_C1-21740   iscS TRUE 0.673 70.000 0.146 1.000 N NA
 10212038 10212039 SJA_C1-21740 SJA_C1-21750 iscS nifS TRUE 0.990 -3.000 0.069 0.001 Y NA
 10212042 10212043 SJA_C1-21780 SJA_C1-21790 rpiB glyA TRUE 0.880 13.000 0.090 1.000 N NA
 10212043 10212044 SJA_C1-21790 SJA_C1-21800 glyA   FALSE 0.283 129.000 0.008 NA N NA
 10212044 10212045 SJA_C1-21800 SJA_C1-21810   trmH FALSE 0.342 82.000 0.013 NA N NA
 10212047 10212048 SJA_C1-21830 SJA_C1-21840 rpsD   FALSE 0.065 185.000 0.000 1.000   NA
 10212048 10212049 SJA_C1-21840 SJA_C1-21850     FALSE 0.049 200.000 0.000 1.000   NA
 10212051 10212052 SJA_C1-21870 SJA_C1-21880     TRUE 0.702 116.000 0.158 1.000   NA
 10212052 10212053 SJA_C1-21880 SJA_C1-21890     TRUE 0.657 20.000 0.021 1.000   NA
 10212055 10212056 SJA_C1-21910 SJA_C1-t0370 folK   FALSE 0.233 46.000 0.000 NA   NA
 10212057 10212058 SJA_C1-21920 SJA_C1-21930   glgX FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 10212058 10212059 SJA_C1-21930 SJA_C1-21940 glgX glgA TRUE 0.983 -3.000 0.029 1.000 Y NA
 10212059 10212060 SJA_C1-21940 SJA_C1-21950 glgA glgC TRUE 0.946 16.000 0.134 1.000 Y NA
 10212060 10212061 SJA_C1-21950 SJA_C1-21960 glgC glgB TRUE 0.896 51.000 0.205 0.001 Y NA
 10212061 10212062 SJA_C1-21960 SJA_C1-21970 glgB glgP TRUE 0.950 19.000 0.189 1.000 Y NA
 10212062 10212063 SJA_C1-21970 SJA_C1-21980 glgP   FALSE 0.380 88.000 0.016 1.000 N NA
 10212064 10212065 SJA_C1-21990 SJA_C1-22000     FALSE 0.379 23.000 0.000 NA   NA
 10212065 10212066 SJA_C1-22000 SJA_C1-22010   fecR TRUE 0.927 56.000 1.000 NA N NA
 10212066 10212067 SJA_C1-22010 SJA_C1-22020 fecR   TRUE 0.990 -16.000 0.400 NA Y NA
 10212067 10212068 SJA_C1-22020 SJA_C1-22030     FALSE 0.198 103.000 0.000 NA   NA
 10212068 10212069 SJA_C1-22030 SJA_C1-22040     FALSE 0.322 30.000 0.000 NA   NA
 10212070 10212071 SJA_C1-22050 SJA_C1-22060   gatB TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10212071 10212072 SJA_C1-22060 SJA_C1-22070 gatB   TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10212072 10212073 SJA_C1-22070 SJA_C1-22080     FALSE 0.436 18.000 0.000 NA   NA
 10212073 10212074 SJA_C1-22080 SJA_C1-22090   gatA FALSE 0.247 44.000 0.000 NA   NA
 10212074 10212075 SJA_C1-22090 SJA_C1-22100 gatA gatC TRUE 0.998 -3.000 0.643 0.001 Y NA
 10212076 10212077 SJA_C1-22110 SJA_C1-22120   ruvX TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10212078 10212079 SJA_C1-22130 SJA_C1-22140     FALSE 0.260 42.000 0.000 NA   NA
 10212079 10212080 SJA_C1-22140 SJA_C1-22150     FALSE 0.062 183.000 0.000 NA   NA
 10212080 10212081 SJA_C1-22150 SJA_C1-22160     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 10212081 10212082 SJA_C1-22160 SJA_C1-22170   gumB TRUE 0.997 0.000 0.833 0.085 Y NA
 10212082 10212083 SJA_C1-22170 SJA_C1-22180 gumB wecC TRUE 0.690 78.000 0.030 1.000 Y NA
 10212083 10212084 SJA_C1-22180 SJA_C1-22190 wecC wecB TRUE 0.607 162.000 0.076 1.000 Y NA
 10212085 10212086 SJA_C1-22200 SJA_C1-22210 ugd   TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10212090 10212091 SJA_C1-22250 SJA_C1-22260   gyrB FALSE 0.231 64.000 0.000 1.000 N NA
 10212091 10212092 SJA_C1-22260 SJA_C1-22270 gyrB   FALSE 0.023 251.000 0.000 NA   NA
 10212093 10212094 SJA_C1-22280 SJA_C1-22290     TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10212094 10212095 SJA_C1-22290 SJA_C1-22300     FALSE 0.225 126.000 0.000 1.000 N NA
 10212095 10212096 SJA_C1-22300 SJA_C1-22310     TRUE 0.899 54.000 0.600 0.043 N NA
 10212096 10212097 SJA_C1-22310 SJA_C1-22320     TRUE 0.853 13.000 0.000 1.000 Y NA
 10212097 10212098 SJA_C1-22320 SJA_C1-22330     FALSE 0.290 35.000 0.000 NA   NA
 10212098 10212099 SJA_C1-22330 SJA_C1-22340     FALSE 0.003 736.000 0.000 NA   NA
 10212099 10212100 SJA_C1-22340 SJA_C1-22350     FALSE 0.018 271.000 0.000 1.000   NA
 10212100 10212101 SJA_C1-22350 SJA_C1-22360   apaG TRUE 0.948 -3.000 0.025 NA N NA
 10212101 10212102 SJA_C1-22360 SJA_C1-22370 apaG metB TRUE 0.681 34.000 0.066 NA N NA
 10212102 10212103 SJA_C1-22370 SJA_C1-22380 metB leuB TRUE 0.909 11.000 0.011 1.000 Y NA
 10212103 10212104 SJA_C1-22380 SJA_C1-22390 leuB recO FALSE 0.336 62.000 0.010 1.000 N NA
 10212105 10212106 SJA_C1-22400 SJA_C1-22410     TRUE 0.894 -3.000 0.000 0.020   NA
 10212107 10212108 SJA_C1-22420 SJA_C1-22430 cpaA   TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10212108 10212109 SJA_C1-22430 SJA_C1-22440   tadD TRUE 0.897 -3.000 0.000 0.008   NA
 10212109 10212110 SJA_C1-22440 SJA_C1-22450 tadD tadC FALSE 0.400 21.000 0.000 NA   NA
 10212110 10212111 SJA_C1-22450 SJA_C1-22460 tadC tadB TRUE 0.995 5.000 0.838 NA Y NA
 10212111 10212112 SJA_C1-22460 SJA_C1-22470 tadB cpaF TRUE 0.997 0.000 0.968 NA Y NA
 10212112 10212113 SJA_C1-22470 SJA_C1-22480 cpaF cpaE TRUE 0.985 0.000 0.100 1.000 Y NA
 10212113 10212114 SJA_C1-22480 SJA_C1-22490 cpaE   TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA Y NA
 10212114 10212115 SJA_C1-22490 SJA_C1-22500     TRUE 0.989 -3.000 0.083 NA Y NA
 10212115 10212116 SJA_C1-22500 SJA_C1-22510     TRUE 0.900 9.000 0.083 NA   NA
 10212116 10212117 SJA_C1-22510 SJA_C1-22520     TRUE 0.957 23.000 0.750 NA   NA
 10212117 10212118 SJA_C1-22520 SJA_C1-22530   cpaC TRUE 0.823 15.000 0.071 NA   NA
 10212118 10212119 SJA_C1-22530 SJA_C1-22540 cpaC cpaB TRUE 0.951 11.000 0.071 NA Y NA
 10212119 10212120 SJA_C1-22540 SJA_C1-22550 cpaB flp TRUE 0.865 114.000 0.500 NA   NA
 10212120 10212121 SJA_C1-22550 SJA_C1-22560 flp flp TRUE 0.925 27.000 0.500 NA   NA
 10212121 10212122 SJA_C1-22560 SJA_C1-22570 flp   FALSE 0.003 508.000 0.000 NA   NA
 10212122 10212123 SJA_C1-22570 SJA_C1-22580     FALSE 0.181 73.000 0.000 NA   NA
 10212123 10212124 SJA_C1-22580 SJA_C1-22590     FALSE 0.134 147.000 0.000 NA   NA
 10212124 10212125 SJA_C1-22590 SJA_C1-22600   uvrC FALSE 0.211 121.000 0.000 1.000   NA
 10212125 10212126 SJA_C1-22600 SJA_C1-22610 uvrC   FALSE 0.010 337.000 0.000 1.000 N NA
 10212126 10212127 SJA_C1-22610 SJA_C1-22620     TRUE 0.997 -7.000 0.863 0.003 Y NA
 10212127 10212128 SJA_C1-22620 SJA_C1-22630     TRUE 0.790 89.000 0.278 0.003   NA
 10212128 10212129 SJA_C1-22630 SJA_C1-22640   atpB TRUE 0.899 54.000 0.628 0.003   NA
 10212129 10212130 SJA_C1-22640 SJA_C1-22650 atpB   TRUE 0.726 52.000 0.195 NA   NA
 10212130 10212131 SJA_C1-22650 SJA_C1-22660     FALSE 0.171 190.000 0.037 NA   NA
 10212131 10212132 SJA_C1-22660 SJA_C1-22670     TRUE 0.995 -3.000 0.726 NA   NA
 10212132 10212133 SJA_C1-22670 SJA_C1-22680     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212135 10212136 SJA_C1-t0380 SJA_C1-22700   kdgK FALSE 0.193 61.000 0.000 NA   NA
 10212138 10212139 SJA_C1-22720 SJA_C1-22730   cysE TRUE 0.963 0.000 0.118 NA   NA
 10212140 10212141 SJA_C1-22740 SJA_C1-22750   oxyR FALSE 0.467 40.000 0.016 1.000   NA
 10212142 10212143 SJA_C1-22760 SJA_C1-22770 moaE moaD TRUE 0.998 -3.000 0.501 0.003 Y NA
 10212143 10212144 SJA_C1-22770 SJA_C1-22780 moaD pgsA TRUE 0.935 4.000 0.082 1.000 N NA
 10212147 10212148 SJA_C1-22810 SJA_C1-22820 pbp   FALSE 0.009 347.000 0.000 1.000 N NA
 10212148 10212149 SJA_C1-22820 SJA_C1-22830   kef TRUE 0.898 0.000 0.013 1.000 N NA
 10212149 10212150 SJA_C1-22830 SJA_C1-22840 kef   TRUE 0.914 -3.000 0.011 NA   NA
 10212150 10212151 SJA_C1-22840 SJA_C1-22850     FALSE 0.261 53.000 0.005 NA   NA
 10212151 10212152 SJA_C1-22850 SJA_C1-22860   dxs TRUE 0.688 47.000 0.111 1.000 N NA
 10212152 10212153 SJA_C1-22860 SJA_C1-22870 dxs   FALSE 0.187 66.000 0.000 NA   NA
 10212153 10212154 SJA_C1-22870 SJA_C1-22880     TRUE 0.981 -13.000 0.449 NA   NA
 10212155 10212156 SJA_C1-22890 SJA_C1-22900   lspA TRUE 0.971 0.000 0.167 NA   NA
 10212156 10212157 SJA_C1-22900 SJA_C1-22910 lspA ileS FALSE 0.393 119.000 0.015 1.000 N NA
 10212157 10212158 SJA_C1-22910 SJA_C1-22920 ileS ribF FALSE 0.441 126.000 0.029 1.000 N NA
 10212158 10212159 SJA_C1-22920 SJA_C1-22930 ribF folA TRUE 0.909 9.000 0.007 1.000 Y NA
 10212159 10212160 SJA_C1-22930 SJA_C1-22940 folA purK FALSE 0.338 133.000 0.015 1.000 N NA
 10212160 10212161 SJA_C1-22940 SJA_C1-22950 purK purE TRUE 0.989 2.000 0.201 0.001 Y NA
 10212161 10212162 SJA_C1-22950 SJA_C1-22960 purE gpm FALSE 0.135 174.000 0.008 1.000 N NA
 10212163 10212164 SJA_C1-22970 SJA_C1-22980 sppA   FALSE 0.024 263.000 0.000 1.000 N NA
 10212165 10212166 SJA_C1-22990 SJA_C1-23000     FALSE 0.345 101.000 0.015 NA   NA
 10212166 10212167 SJA_C1-23000 SJA_C1-23010     TRUE 0.859 0.000 0.008 NA   NA
 10212167 10212168 SJA_C1-23010 SJA_C1-23020     FALSE 0.305 115.000 0.008 NA   NA
 10212168 10212169 SJA_C1-23020 SJA_C1-23030     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212171 10212172 SJA_C1-23050 SJA_C1-23060     FALSE 0.449 17.000 0.000 NA   NA
 10212172 10212173 SJA_C1-23060 SJA_C1-23070     FALSE 0.436 36.000 0.012 NA   NA
 10212173 10212174 SJA_C1-23070 SJA_C1-23080     FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 10212175 10212176 SJA_C1-23090 SJA_C1-23100     FALSE 0.102 273.000 0.115 NA   NA
 10212176 10212177 SJA_C1-23100 SJA_C1-23110   phoP TRUE 0.708 36.000 0.096 NA   NA
 10212177 10212178 SJA_C1-23110 SJA_C1-23120 phoP phoQ TRUE 0.889 164.000 0.713 1.000 Y NA
 10212178 10212179 SJA_C1-23120 SJA_C1-23130 phoQ   TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10212182 10212183 SJA_C1-23160 SJA_C1-23170     FALSE 0.182 72.000 0.000 NA   NA
 10212183 10212184 SJA_C1-23170 SJA_C1-23180   acnA FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 10212186 10212187 SJA_C1-23200 SJA_C1-23210     TRUE 0.874 4.000 0.028 NA   NA
 10212187 10212188 SJA_C1-23210 SJA_C1-23220   copB FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 10212188 10212189 SJA_C1-23220 SJA_C1-23230 copB copA TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.004 N NA
 10212189 10212190 SJA_C1-23230 SJA_C1-23240 copA   FALSE 0.296 44.000 0.000 1.000 N NA
 10212193 10212194 SJA_C1-23270 SJA_C1-23280     FALSE 0.372 73.000 0.017 1.000 N NA
 10212195 10212196 SJA_C1-23290 SJA_C1-23300 atoC   TRUE 0.997 0.000 0.693 0.067 Y NA
 10212196 10212197 SJA_C1-23300 SJA_C1-23310     TRUE 0.989 -3.000 0.320 NA N NA
 10212197 10212198 SJA_C1-23310 SJA_C1-23320     FALSE 0.184 178.000 0.031 NA   NA
 10212198 10212199 SJA_C1-23320 SJA_C1-23330     TRUE 0.760 49.000 0.222 NA   NA
 10212199 10212200 SJA_C1-23330 SJA_C1-23340     TRUE 0.753 114.000 0.222 NA   NA
 10212200 10212201 SJA_C1-23340 SJA_C1-23350     FALSE 0.192 94.000 0.000 NA   NA
 10212201 10212202 SJA_C1-23350 SJA_C1-23360     FALSE 0.202 55.000 0.000 NA   NA
 10212203 10212204 SJA_C1-23370 SJA_C1-23380     TRUE 0.535 177.000 0.333 NA   NA
 10212205 10212206 SJA_C1-23390 SJA_C1-23400 trxB   FALSE 0.145 225.000 0.000 1.000 Y NA
 10212206 10212207 SJA_C1-23400 SJA_C1-23410     TRUE 0.916 25.000 0.383 NA N NA
 10212207 10212208 SJA_C1-23410 SJA_C1-23420     TRUE 0.936 16.000 0.365 NA   NA
 10212208 10212209 SJA_C1-23420 SJA_C1-23430     TRUE 0.906 122.000 0.805 NA   NA
 10212211 10212212 SJA_C1-t0390 SJA_C1-23450   pulO FALSE 0.209 108.000 0.000 NA   NA
 10212212 10212213 SJA_C1-23450 SJA_C1-23460 pulO pulN TRUE 0.961 -3.000 0.051 1.000   NA
 10212213 10212214 SJA_C1-23460 SJA_C1-23470 pulN pulM TRUE 0.991 0.000 0.649 1.000   NA
 10212214 10212215 SJA_C1-23470 SJA_C1-23480 pulM pulL TRUE 0.998 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 10212215 10212216 SJA_C1-23480 SJA_C1-23490 pulL pulK TRUE 0.998 -3.000 0.537 0.038 Y NA
 10212216 10212217 SJA_C1-23490 SJA_C1-23500 pulK pulJ TRUE 0.994 -7.000 0.461 1.000 Y NA
 10212217 10212218 SJA_C1-23500 SJA_C1-23510 pulJ pulI TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.003   NA
 10212218 10212219 SJA_C1-23510 SJA_C1-23520 pulI pulH TRUE 0.979 11.000 0.605 0.003   NA
 10212219 10212220 SJA_C1-23520 SJA_C1-23530 pulH pulG TRUE 0.850 92.000 0.425 0.003   NA
 10212220 10212221 SJA_C1-23530 SJA_C1-23540 pulG pulF TRUE 0.945 73.000 0.599 0.003 Y NA
 10212221 10212222 SJA_C1-23540 SJA_C1-23550 pulF pulE TRUE 0.996 -7.000 0.653 0.003 Y NA
 10212222 10212223 SJA_C1-23550 SJA_C1-23560 pulE pulD TRUE 0.998 -3.000 0.776 0.003 Y NA
 10212223 10212224 SJA_C1-23560 SJA_C1-23570 pulD pulC TRUE 0.997 -3.000 0.575 1.000 Y NA
 10212226 10212227 SJA_C1-23590 SJA_C1-23600     TRUE 0.882 33.000 0.373 NA   NA
 10212227 10212228 SJA_C1-23600 SJA_C1-23610     FALSE 0.015 275.000 0.000 NA   NA
 10212228 10212229 SJA_C1-23610 SJA_C1-tm0010     FALSE 0.015 277.000 0.000 NA   NA
 10212231 10212232 SJA_C1-23630 SJA_C1-23640     FALSE 0.212 113.000 0.000 NA   NA
 10212232 10212233 SJA_C1-23640 SJA_C1-23650     TRUE 0.933 0.000 0.043 NA   NA
 10212233 10212234 SJA_C1-23650 SJA_C1-23660     TRUE 0.915 47.000 0.750 NA   NA
 10212234 10212235 SJA_C1-23660 SJA_C1-23670     TRUE 0.715 77.000 0.222 NA   NA
 10212237 10212238 SJA_C1-23690 SJA_C1-23700     FALSE 0.198 103.000 0.000 NA   NA
 10212238 10212239 SJA_C1-23700 SJA_C1-23710     TRUE 0.898 4.000 0.045 NA   NA
 10212239 10212240 SJA_C1-23710 SJA_C1-23720     FALSE 0.220 107.000 0.000 1.000   NA
 10212240 10212241 SJA_C1-23720 SJA_C1-23730     FALSE 0.268 43.000 0.000 1.000   NA
 10212241 10212242 SJA_C1-23730 SJA_C1-23740   betA FALSE 0.281 41.000 0.000 1.000   NA
 10212244 10212245 SJA_C1-23760 SJA_C1-23770     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 10212245 10212246 SJA_C1-23770 SJA_C1-23780     FALSE 0.193 123.000 0.000 NA   NA
 10212246 10212247 SJA_C1-23780 SJA_C1-23790     FALSE 0.004 468.000 0.000 1.000   NA
 10212247 10212248 SJA_C1-23790 SJA_C1-23800     TRUE 0.734 3.000 0.000 1.000   NA
 10212249 10212250 SJA_C1-23810 SJA_C1-23820 scoA scoB TRUE 0.997 2.000 1.000 0.002 Y NA
 10212253 10212254 SJA_C1-23840 SJA_C1-23850 citE   TRUE 0.979 -3.000 0.120 1.000 N NA
 10212254 10212255 SJA_C1-23850 SJA_C1-23860     TRUE 0.982 0.000 0.060 0.062 Y NA
 10212255 10212256 SJA_C1-23860 SJA_C1-23870   pccB TRUE 0.994 -3.000 0.158 0.001 Y NA
 10212261 10212262 SJA_C1-23920 SJA_C1-23930     FALSE 0.424 55.000 0.026 NA   NA
 10212262 10212263 SJA_C1-23930 SJA_C1-23940   bfr FALSE 0.336 150.000 0.039 NA   NA
 10212265 10212266 SJA_C1-23960 SJA_C1-23970     TRUE 0.767 139.000 0.375 NA   NA
 10212267 10212268 SJA_C1-23980 SJA_C1-23990   accA FALSE 0.310 79.000 0.011 1.000   NA
 10212268 10212269 SJA_C1-23990 SJA_C1-24000 accA xerD TRUE 0.862 12.000 0.058 1.000 N NA
 10212269 10212270 SJA_C1-24000 SJA_C1-24010 xerD   TRUE 0.898 0.000 0.018 NA   NA
 10212270 10212271 SJA_C1-24010 SJA_C1-24020     TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10212272 10212273 SJA_C1-24030 SJA_C1-24040 aroK aro1 TRUE 0.984 -9.000 0.147 1.000 Y NA
 10212274 10212275 SJA_C1-24050 SJA_C1-24060 rpmE fabZ FALSE 0.145 179.000 0.014 1.000 N NA
 10212275 10212276 SJA_C1-24060 SJA_C1-24070 fabZ ompH TRUE 0.923 8.000 0.102 1.000 N NA
 10212276 10212277 SJA_C1-24070 SJA_C1-24080 ompH yaeT TRUE 0.987 0.000 0.123 1.000 Y NA
 10212277 10212278 SJA_C1-24080 SJA_C1-24090 yaeT   TRUE 0.867 93.000 0.204 1.000 Y NA
 10212278 10212279 SJA_C1-24090 SJA_C1-24100   dxr TRUE 0.994 -3.000 0.568 1.000 N NA
 10212279 10212280 SJA_C1-24100 SJA_C1-24110 dxr cdsA TRUE 0.996 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 10212280 10212281 SJA_C1-24110 SJA_C1-24120 cdsA uppS TRUE 0.996 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 10212281 10212282 SJA_C1-24120 SJA_C1-24130 uppS frr TRUE 0.875 44.000 0.409 1.000 N NA
 10212282 10212283 SJA_C1-24130 SJA_C1-24140 frr   TRUE 0.983 7.000 0.626 1.000 N NA
 10212283 10212284 SJA_C1-24140 SJA_C1-24150   tsf TRUE 0.651 170.000 0.416 1.000 N NA
 10212284 10212285 SJA_C1-24150 SJA_C1-24160 tsf rpsB TRUE 0.839 189.000 0.748 1.000 Y NA
 10212287 10212288 SJA_C1-24180 SJA_C1-24190 pssA psd TRUE 0.996 0.000 0.466 0.002 Y NA
 10212288 10212289 SJA_C1-24190 SJA_C1-24200 psd   TRUE 0.584 11.000 0.000 NA   NA
 10212290 10212291 SJA_C1-24210 SJA_C1-24220 icd yhcX FALSE 0.228 158.000 0.019 1.000   NA
 10212292 10212293 SJA_C1-24230 SJA_C1-24240 glmS   FALSE 0.366 85.000 0.018 1.000   NA
 10212293 10212294 SJA_C1-24240 SJA_C1-24250   glmU FALSE 0.385 27.000 0.002 1.000   NA
 10212295 10212296 SJA_C1-24260 SJA_C1-24270 gph paaG TRUE 0.956 -3.000 0.029 0.062   NA
 10212296 10212297 SJA_C1-24270 SJA_C1-24280 paaG   FALSE 0.188 141.000 0.000 1.000 N NA
 10212298 10212299 SJA_C1-24290 SJA_C1-24300 pdhD   FALSE 0.314 50.000 0.005 1.000 N NA
 10212299 10212300 SJA_C1-24300 SJA_C1-24310   sucB FALSE 0.251 76.000 0.004 1.000 N NA
 10212300 10212301 SJA_C1-24310 SJA_C1-24320 sucB sucA TRUE 0.992 9.000 0.667 1.000 Y NA
 10212301 10212302 SJA_C1-24320 SJA_C1-24330 sucA sucD TRUE 0.793 86.000 0.092 1.000 Y NA
 10212302 10212303 SJA_C1-24330 SJA_C1-24340 sucD mdh TRUE 0.654 103.000 0.015 1.000 Y NA
 10212303 10212304 SJA_C1-24340 SJA_C1-24350 mdh   FALSE 0.032 306.000 0.032 NA   NA
 10212304 10212305 SJA_C1-24350 SJA_C1-24360     TRUE 0.975 -3.000 0.108 NA   NA
 10212305 10212306 SJA_C1-24360 SJA_C1-24370   sdhB TRUE 0.531 35.000 0.019 NA N NA
 10212307 10212308 SJA_C1-24380 SJA_C1-24390     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10212308 10212309 SJA_C1-24390 SJA_C1-24400     TRUE 0.946 -3.000 0.021 1.000 N NA
 10212312 10212313 SJA_C1-24430 SJA_C1-24440   pldB TRUE 0.964 -3.000 0.049 1.000 N NA
 10212314 10212315 SJA_C1-24450 SJA_C1-24460 cpaA cpaB TRUE 0.944 53.000 0.583 NA Y NA
 10212315 10212316 SJA_C1-24460 SJA_C1-24470 cpaB cpaC TRUE 0.994 2.000 0.500 NA Y NA
 10212316 10212317 SJA_C1-24470 SJA_C1-24480 cpaC cpaD TRUE 0.911 18.000 0.250 NA N NA
 10212317 10212318 SJA_C1-24480 SJA_C1-24490 cpaD cpaE TRUE 0.975 2.000 0.278 NA N NA
 10212318 10212319 SJA_C1-24490 SJA_C1-24500 cpaE tadB TRUE 0.879 71.000 0.278 NA Y NA
 10212319 10212320 SJA_C1-24500 SJA_C1-24510 tadB tadC TRUE 0.991 14.000 1.000 NA Y NA
 10212320 10212321 SJA_C1-24510 SJA_C1-24520 tadC   TRUE 0.599 136.000 0.133 NA   NA
 10212322 10212323 SJA_C1-24530 SJA_C1-24540   recR FALSE 0.396 49.000 0.013 1.000 N NA
 10212324 10212325 SJA_C1-24550 SJA_C1-24560 fmt truA TRUE 0.966 5.000 0.069 1.000 Y NA
 10212329 10212330 SJA_C1-24590 SJA_C1-24600     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212332 10212333 SJA_C1-24620 SJA_C1-24630   bdh TRUE 0.982 -3.000 0.167 1.000   NA
 10212333 10212334 SJA_C1-24630 SJA_C1-24640 bdh   FALSE 0.097 161.000 0.000 NA   NA
 10212334 10212335 SJA_C1-24640 SJA_C1-24650     FALSE 0.142 144.000 0.000 NA   NA
 10212336 10212337 SJA_C1-24660 SJA_C1-24670 ftsH   FALSE 0.220 68.000 0.004 NA   NA
 10212337 10212338 SJA_C1-24670 SJA_C1-24680   mesJ FALSE 0.184 129.000 0.002 NA   NA
 10212338 10212339 SJA_C1-24680 SJA_C1-24690 mesJ   TRUE 0.908 8.000 0.085 1.000   NA
 10212339 10212340 SJA_C1-24690 SJA_C1-24700     FALSE 0.412 67.000 0.027 1.000   NA
 10212340 10212341 SJA_C1-24700 SJA_C1-24710   ptsP TRUE 0.533 104.000 0.060 1.000   NA
 10212342 10212343 SJA_C1-24720 SJA_C1-24730     TRUE 0.955 124.000 0.667 0.001 Y NA
 10212344 10212345 SJA_C1-24740 SJA_C1-24750     TRUE 0.935 -3.000 0.019 NA   NA
 10212345 10212346 SJA_C1-24750 SJA_C1-24760     TRUE 0.681 26.000 0.048 NA   NA
 10212346 10212347 SJA_C1-24760 SJA_C1-24770     TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10212347 10212348 SJA_C1-24770 SJA_C1-24780     FALSE 0.184 80.000 0.000 NA   NA
 10212350 10212351 SJA_C1-24800 SJA_C1-24810     TRUE 0.551 115.000 0.065 NA   NA
 10212351 10212352 SJA_C1-24810 SJA_C1-24820   lysC FALSE 0.412 121.000 0.023 1.000   NA
 10212353 10212354 SJA_C1-24830 SJA_C1-24840   coq3 FALSE 0.296 34.000 0.000 NA   NA
 10212354 10212355 SJA_C1-24840 SJA_C1-24850 coq3   TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 10212357 10212358 SJA_C1-24870 SJA_C1-24880     FALSE 0.369 24.000 0.000 NA   NA
 10212358 10212359 SJA_C1-24880 SJA_C1-24890     TRUE 0.604 10.000 0.000 NA   NA
 10212361 10212362 SJA_C1-24910 SJA_C1-24920     TRUE 0.719 174.000 0.667 NA   NA
 10212362 10212363 SJA_C1-24920 SJA_C1-24930     FALSE 0.336 151.000 0.042 NA   NA
 10212365 10212366 SJA_C1-24950 SJA_C1-24960   panB FALSE 0.104 167.000 0.000 1.000 N NA
 10212366 10212367 SJA_C1-24960 SJA_C1-24970 panB   FALSE 0.387 75.000 0.026 NA   NA
 10212367 10212368 SJA_C1-24970 SJA_C1-24980     TRUE 0.980 -3.000 0.154 NA   NA
 10212368 10212369 SJA_C1-24980 SJA_C1-24990   engA TRUE 0.634 146.000 0.203 1.000   NA
 10212369 10212370 SJA_C1-24990 SJA_C1-25000 engA   TRUE 0.753 -13.000 0.003 1.000   NA
 10212370 10212371 SJA_C1-25000 SJA_C1-25010     FALSE 0.306 74.000 0.013 NA   NA
 10212371 10212372 SJA_C1-25010 SJA_C1-25020     FALSE 0.294 113.000 0.007 NA   NA
 10212375 10212376 SJA_C1-25050 SJA_C1-25060   valS FALSE 0.269 86.000 0.004 1.000 N NA
 10212376 10212377 SJA_C1-25060 SJA_C1-25070 valS   FALSE 0.252 82.000 0.003 1.000 N NA
 10212377 10212378 SJA_C1-25070 SJA_C1-25080     FALSE 0.153 220.000 0.073 NA   NA
 10212378 10212379 SJA_C1-25080 SJA_C1-25090     TRUE 0.562 70.000 0.085 NA   NA
 10212379 10212380 SJA_C1-25090 SJA_C1-25100   pcm TRUE 0.714 21.000 0.033 1.000 N NA
 10212382 10212383 SJA_C1-25110 SJA_C1-25120     FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10212383 10212384 SJA_C1-25120 SJA_C1-25130     TRUE 0.795 3.000 0.000 0.004   NA
 10212384 10212385 SJA_C1-25130 SJA_C1-25140     FALSE 0.370 26.000 0.000 1.000   NA
 10212385 10212386 SJA_C1-25140 SJA_C1-25150     FALSE 0.005 379.000 0.000 NA   NA
 10212386 10212387 SJA_C1-25150 SJA_C1-25160   catD FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 10212387 10212388 SJA_C1-25160 SJA_C1-25170 catD pcaI/pcaF/catF TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10212388 10212389 SJA_C1-25170 SJA_C1-25180 pcaI/pcaF/catF catA/pcaH TRUE 0.623 10.000 0.000 1.000   NA
 10212389 10212390 SJA_C1-25180 SJA_C1-25190 catA/pcaH catC TRUE 0.963 22.000 0.343 1.000 Y NA
 10212390 10212391 SJA_C1-25190 SJA_C1-25200 catC catB TRUE 0.981 4.000 0.450 1.000 N NA
 10212392 10212393 SJA_C1-25210 SJA_C1-25220 catR andAc TRUE 0.647 124.000 0.133 1.000   NA
 10212393 10212394 SJA_C1-25220 SJA_C1-25230 andAc andAd TRUE 0.987 -3.000 0.200 0.001   NA
 10212394 10212395 SJA_C1-25230 SJA_C1-25240 andAd andAb TRUE 0.918 11.000 0.125 NA N NA
 10212395 10212396 SJA_C1-25240 SJA_C1-25250 andAb andAa TRUE 0.938 2.000 0.080 NA   NA
 10212397 10212398 SJA_C1-25260 SJA_C1-25270 andR   FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 10212399 10212400 SJA_C1-25280 SJA_C1-25290   cpo FALSE 0.304 46.000 0.000 0.026   NA
 10212400 10212401 SJA_C1-25290 SJA_C1-25300 cpo   FALSE 0.379 23.000 0.000 NA   NA
 10212401 10212402 SJA_C1-25300 SJA_C1-25310     TRUE 0.964 -3.000 0.066 NA   NA
 10212402 10212403 SJA_C1-25310 SJA_C1-25320     FALSE 0.197 58.000 0.000 NA   NA
 10212403 10212404 SJA_C1-25320 SJA_C1-25330     FALSE 0.182 72.000 0.000 NA   NA
 10212404 10212405 SJA_C1-25330 SJA_C1-25340     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10212405 10212406 SJA_C1-25340 SJA_C1-25350     FALSE 0.205 106.000 0.000 NA   NA
 10212407 10212408 SJA_C1-25360 SJA_C1-25370     FALSE 0.331 29.000 0.000 NA   NA
 10212409 10212410 SJA_C1-25380 SJA_C1-25390     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 10212410 10212411 SJA_C1-25390 SJA_C1-25400     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 10212411 10212412 SJA_C1-25400 SJA_C1-25410     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212413 10212414 SJA_C1-25420 SJA_C1-25430 cpxA ompR TRUE 0.998 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 10212415 10212416 SJA_C1-25440 SJA_C1-25450     FALSE 0.184 70.000 0.000 NA   NA
 10212416 10212417 SJA_C1-25450 SJA_C1-25460     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10212417 10212418 SJA_C1-25460 SJA_C1-25470     FALSE 0.481 15.000 0.000 NA   NA
 10212421 10212422 SJA_C1-25500 SJA_C1-25510 ndk   FALSE 0.283 94.000 0.005 1.000 N NA
 10212422 10212423 SJA_C1-25510 SJA_C1-25520   pepA TRUE 0.980 0.000 0.230 1.000 N NA
 10212424 10212425 SJA_C1-25530 SJA_C1-25540 ostA surA TRUE 0.642 87.000 0.112 1.000 N NA
 10212425 10212426 SJA_C1-25540 SJA_C1-25550 surA pdxA TRUE 0.976 11.000 0.561 1.000 N NA
 10212426 10212427 SJA_C1-25550 SJA_C1-25560 pdxA ksgA TRUE 0.955 6.000 0.197 1.000 N NA
 10212428 10212429 SJA_C1-25570 SJA_C1-25580     FALSE 0.027 238.000 0.000 NA   NA
 10212429 10212430 SJA_C1-25580 SJA_C1-25590   sun TRUE 0.805 9.000 0.020 NA   NA
 10212430 10212431 SJA_C1-25590 SJA_C1-25600 sun guaB FALSE 0.476 124.000 0.039 NA N NA
 10212431 10212432 SJA_C1-25600 SJA_C1-25610 guaB   FALSE 0.028 253.000 0.000 1.000 N NA
 10212432 10212433 SJA_C1-25610 SJA_C1-25620   pntB TRUE 0.579 12.000 0.000 1.000   NA
 10212433 10212434 SJA_C1-25620 SJA_C1-25630 pntB pntA TRUE 0.903 -3.000 0.000 0.001   NA
 10212434 10212435 SJA_C1-25630 SJA_C1-25640 pntA   FALSE 0.170 132.000 0.000 NA   NA
 10212436 10212437 SJA_C1-25650 SJA_C1-25660 hydG   FALSE 0.396 124.000 0.025 NA   NA
 10212438 10212439 SJA_C1-25670 SJA_C1-25680   proC FALSE 0.198 68.000 0.000 1.000   NA
 10212439 10212440 SJA_C1-25680 SJA_C1-25690 proC   TRUE 0.813 12.000 0.036 NA   NA
 10212440 10212441 SJA_C1-25690 SJA_C1-25700     TRUE 0.562 92.000 0.080 NA   NA
 10212441 10212442 SJA_C1-25700 SJA_C1-25710   bzrP FALSE 0.303 47.000 0.007 NA   NA
 10212442 10212443 SJA_C1-25710 SJA_C1-25720 bzrP   TRUE 0.895 15.000 0.154 NA N NA
 10212443 10212444 SJA_C1-25720 SJA_C1-25730     TRUE 0.940 13.000 0.260 NA N NA
 10212444 10212445 SJA_C1-25730 SJA_C1-25740   tlyA FALSE 0.263 60.000 0.003 1.000 N NA
 10212445 10212446 SJA_C1-25740 SJA_C1-25750 tlyA dsbD TRUE 0.859 0.000 0.005 1.000 N NA
 10212448 10212449 SJA_C1-25770 SJA_C1-25780 cysE envZ FALSE 0.249 106.000 0.000 1.000 N NA
 10212449 10212450 SJA_C1-25780 SJA_C1-25790 envZ ompR TRUE 0.996 -3.000 0.364 1.000 Y NA
 10212450 10212451 SJA_C1-25790 SJA_C1-25800 ompR   FALSE 0.084 166.000 0.000 NA   NA
 10212451 10212452 SJA_C1-25800 SJA_C1-25810     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 10212452 10212453 SJA_C1-25810 SJA_C1-25820   cynT TRUE 0.990 5.000 0.414 1.000 Y NA
 10212453 10212454 SJA_C1-25820 SJA_C1-25830 cynT   FALSE 0.052 207.000 0.000 1.000 N NA
 10212454 10212455 SJA_C1-25830 SJA_C1-25840     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212455 10212456 SJA_C1-25840 SJA_C1-25850     FALSE 0.193 92.000 0.000 NA   NA
 10212457 10212458 SJA_C1-25860 SJA_C1-25870     TRUE 0.893 62.000 0.667 1.000 N NA
 10212458 10212459 SJA_C1-25870 SJA_C1-25880     FALSE 0.195 71.000 0.000 1.000   NA
 10212461 10212462 SJA_C1-25900 SJA_C1-25910     TRUE 0.579 12.000 0.000 1.000   NA
 10212462 10212463 SJA_C1-25910 SJA_C1-25920     TRUE 0.646 8.000 0.000 1.000   NA
 10212463 10212464 SJA_C1-25920 SJA_C1-25930     TRUE 0.995 -3.000 0.314 1.000 Y NA
 10212464 10212465 SJA_C1-25930 SJA_C1-25940     FALSE 0.290 35.000 0.000 NA   NA
 10212465 10212466 SJA_C1-25940 SJA_C1-25950     FALSE 0.210 109.000 0.000 NA   NA
 10212466 10212467 SJA_C1-25950 SJA_C1-25960   hsp20 TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212467 10212468 SJA_C1-25960 SJA_C1-25970 hsp20   FALSE 0.224 60.000 0.000 NA N NA
 10212468 10212469 SJA_C1-25970 SJA_C1-25980     TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.082 Y NA
 10212469 10212470 SJA_C1-25980 SJA_C1-25990     TRUE 0.992 -3.000 0.400 1.000 N NA
 10212470 10212471 SJA_C1-25990 SJA_C1-26000     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212471 10212472 SJA_C1-26000 SJA_C1-26010   gloB FALSE 0.253 43.000 0.000 NA   NA
 10212472 10212473 SJA_C1-26010 SJA_C1-26020 gloB   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212473 10212474 SJA_C1-26020 SJA_C1-26030     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212474 10212475 SJA_C1-26030 SJA_C1-26040     FALSE 0.462 16.000 0.000 NA   NA
 10212476 10212477 SJA_C1-26050 SJA_C1-26060     FALSE 0.247 44.000 0.000 NA   NA
 10212478 10212479 SJA_C1-26070 SJA_C1-26080     FALSE 0.191 87.000 0.000 NA   NA
 10212479 10212480 SJA_C1-26080 SJA_C1-26090     FALSE 0.186 68.000 0.000 NA   NA
 10212480 10212481 SJA_C1-26090 SJA_C1-26100     TRUE 0.821 137.000 0.500 NA   NA
 10212482 10212483 SJA_C1-26110 SJA_C1-26120     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212486 10212487 SJA_C1-26150 SJA_C1-26160     TRUE 0.709 -13.000 0.000 NA   NA
 10212488 10212489 SJA_C1-26170 SJA_C1-26180     TRUE 0.980 9.000 0.250 NA Y NA
 10212491 10212492 SJA_C1-26200 SJA_C1-26210     FALSE 0.106 156.000 0.000 NA   NA
 10212492 10212493 SJA_C1-26210 SJA_C1-26220     FALSE 0.104 157.000 0.000 NA   NA
 10212494 10212495 SJA_C1-26230 SJA_C1-26240     TRUE 0.957 18.000 0.615 NA   NA
 10212497 10212498 SJA_C1-26260 SJA_C1-26270     FALSE 0.066 184.000 0.000 1.000   NA
 10212498 10212499 SJA_C1-26270 SJA_C1-26280     FALSE 0.187 67.000 0.000 NA   NA
 10212499 10212500 SJA_C1-26280 SJA_C1-26290   radC TRUE 0.560 12.000 0.000 NA   NA
 10212500 10212501 SJA_C1-26290 SJA_C1-26300 radC   FALSE 0.051 195.000 0.000 NA   NA
 10212505 10212506 SJA_C1-26340 SJA_C1-26350     FALSE 0.218 49.000 0.000 NA   NA
 10212506 10212507 SJA_C1-26350 SJA_C1-26360     FALSE 0.196 102.000 0.000 NA   NA
 10212507 10212508 SJA_C1-26360 SJA_C1-26370     FALSE 0.005 378.000 0.000 NA   NA
 10212508 10212509 SJA_C1-26370 SJA_C1-26380     TRUE 0.753 51.000 0.222 NA   NA
 10212509 10212510 SJA_C1-26380 SJA_C1-26390     FALSE 0.183 79.000 0.000 NA   NA
 10212510 10212511 SJA_C1-26390 SJA_C1-26400     FALSE 0.174 130.000 0.000 NA   NA
 10212511 10212512 SJA_C1-26400 SJA_C1-26410     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10212512 10212513 SJA_C1-26410 SJA_C1-26420     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212514 10212515 SJA_C1-t0430 SJA_C1-26430     FALSE 0.290 35.000 0.000 NA   NA
 10212515 10212516 SJA_C1-26430 SJA_C1-26440     TRUE 0.973 -3.000 0.097 NA   NA
 10212516 10212517 SJA_C1-26440 SJA_C1-26450   grxC TRUE 0.934 6.000 0.121 1.000   NA
 10212517 10212518 SJA_C1-26450 SJA_C1-26460 grxC   TRUE 0.593 45.000 0.061 1.000   NA
 10212520 10212521 SJA_C1-26480 SJA_C1-26490     TRUE 0.930 15.000 0.250 0.040   NA
 10212521 10212522 SJA_C1-26490 SJA_C1-26500     TRUE 0.990 0.000 0.565 NA   NA
 10212522 10212523 SJA_C1-26500 SJA_C1-26510     FALSE 0.290 35.000 0.000 NA   NA
 10212524 10212525 SJA_C1-26520 SJA_C1-26530     FALSE 0.210 109.000 0.000 NA   NA
 10212525 10212526 SJA_C1-26530 SJA_C1-26540     FALSE 0.142 144.000 0.000 NA   NA
 10212526 10212527 SJA_C1-26540 SJA_C1-26550   htpG FALSE 0.190 124.000 0.000 NA   NA
 10212527 10212528 SJA_C1-26550 SJA_C1-26560 htpG   FALSE 0.218 106.000 0.000 1.000   NA
 10212531 10212532 SJA_C1-26590 SJA_C1-26600 metA   FALSE 0.012 298.000 0.000 1.000   NA
 10212532 10212533 SJA_C1-26600 SJA_C1-26610     TRUE 0.895 10.000 0.083 NA   NA
 10212534 10212535 SJA_C1-26620 SJA_C1-26630     TRUE 0.987 4.000 0.631 0.036   NA
 10212540 10212541 SJA_C1-26680 SJA_C1-26690 xthA   FALSE 0.349 67.000 0.017 NA   NA
 10212541 10212542 SJA_C1-26690 SJA_C1-26700     FALSE 0.181 77.000 0.000 NA   NA
 10212542 10212543 SJA_C1-26700 SJA_C1-26710     FALSE 0.284 181.000 0.086 1.000   NA
 10212543 10212544 SJA_C1-26710 SJA_C1-26720   bcp TRUE 0.961 -3.000 0.052 1.000   NA
 10212544 10212545 SJA_C1-26720 SJA_C1-26730 bcp glnE TRUE 0.956 3.000 0.020 1.000 Y NA
 10212547 10212548 SJA_C1-26750 SJA_C1-26760   talA FALSE 0.220 107.000 0.000 1.000   NA
 10212549 10212550 SJA_C1-26770 SJA_C1-26780   priA FALSE 0.251 46.000 0.002 NA   NA
 10212552 10212553 SJA_C1-26800 SJA_C1-26810   atpH FALSE 0.048 217.000 0.002 1.000 N NA
 10212553 10212554 SJA_C1-26810 SJA_C1-26820 atpH atpA TRUE 0.994 11.000 0.864 0.003 Y NA
 10212554 10212555 SJA_C1-26820 SJA_C1-26830 atpA rhtC FALSE 0.245 120.000 0.000 1.000 N NA
 10212555 10212556 SJA_C1-26830 SJA_C1-26840 rhtC atpG TRUE 0.748 4.000 0.000 1.000 N NA
 10212556 10212557 SJA_C1-26840 SJA_C1-26850 atpG atpD TRUE 0.982 26.000 0.724 0.001 Y NA
 10212557 10212558 SJA_C1-26850 SJA_C1-26860 atpD atpC TRUE 0.922 162.000 0.837 0.003 Y NA
 10212558 10212559 SJA_C1-26860 SJA_C1-26870 atpC flaI FALSE 0.028 252.000 0.000 1.000 N NA
 10212559 10212560 SJA_C1-26870 SJA_C1-26880 flaI   FALSE 0.521 126.000 0.069 NA   NA
 10212562 10212563 SJA_C1-26900 SJA_C1-26910     TRUE 0.993 0.000 0.313 NA Y NA
 10212564 10212565 SJA_C1-26920 SJA_C1-26930     TRUE 0.618 9.000 0.000 NA   NA
 10212566 10212567 SJA_C1-26940 SJA_C1-26950     TRUE 0.982 -3.000 0.176 NA   NA
 10212567 10212568 SJA_C1-26950 SJA_C1-26960     TRUE 0.992 -3.000 0.136 1.000 Y NA
 10212568 10212569 SJA_C1-26960 SJA_C1-26970     TRUE 0.929 -19.000 0.000 0.002 Y NA
 10212570 10212571 SJA_C1-26980 SJA_C1-26990     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212571 10212572 SJA_C1-26990 SJA_C1-27000   emrA TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 10212574 10212575 SJA_C1-t0440 SJA_C1-27020     FALSE 0.158 139.000 0.000 NA   NA
 10212576 10212577 SJA_C1-27030 SJA_C1-27040     FALSE 0.181 73.000 0.000 NA   NA
 10212577 10212578 SJA_C1-27040 SJA_C1-27050     FALSE 0.379 23.000 0.000 NA   NA
 10212580 10212581 SJA_C1-27070 SJA_C1-27080     FALSE 0.149 145.000 0.000 1.000   NA
 10212581 10212582 SJA_C1-27080 SJA_C1-27090     TRUE 0.953 -18.000 0.129 0.044 N NA
 10212582 10212583 SJA_C1-27090 SJA_C1-27100   pyrB FALSE 0.238 59.000 0.000 1.000 N NA
 10212583 10212584 SJA_C1-27100 SJA_C1-27110 pyrB pyrC TRUE 0.930 107.000 0.452 1.000 Y NA
 10212584 10212585 SJA_C1-27110 SJA_C1-t0450 pyrC   FALSE 0.082 168.000 0.000 NA   NA
 10212585 10212586 SJA_C1-t0450 SJA_C1-27120   secE FALSE 0.097 161.000 0.000 NA   NA
 10212586 10212587 SJA_C1-27120 SJA_C1-27130 secE nusG TRUE 0.917 60.000 0.843 1.000 N NA
 10212587 10212588 SJA_C1-27130 SJA_C1-27140 nusG rplK TRUE 0.618 205.000 0.681 1.000 N NA
 10212588 10212589 SJA_C1-27140 SJA_C1-27150 rplK rplA TRUE 0.996 5.000 0.838 0.014 Y NA
 10212589 10212590 SJA_C1-27150 SJA_C1-27160 rplA   FALSE 0.270 40.000 0.000 NA   NA
 10212590 10212591 SJA_C1-27160 SJA_C1-27170     TRUE 0.737 2.000 0.000 NA   NA
 10212592 10212593 SJA_C1-27180 SJA_C1-27190     FALSE 0.394 59.000 0.022 NA   NA
 10212593 10212594 SJA_C1-27190 SJA_C1-27200     TRUE 0.926 52.000 1.000 NA   NA
 10212595 10212596 SJA_C1-27210 SJA_C1-27220 rplU rpmA TRUE 0.977 31.000 0.667 0.011 Y NA
 10212596 10212597 SJA_C1-27220 SJA_C1-27230 rpmA   FALSE 0.101 274.000 0.011 1.000 Y NA
 10212597 10212598 SJA_C1-27230 SJA_C1-27240     FALSE 0.282 124.000 0.008 1.000   NA
 10212598 10212599 SJA_C1-27240 SJA_C1-27250   proB TRUE 0.591 122.000 0.087 1.000   NA
 10212599 10212600 SJA_C1-27250 SJA_C1-27260 proB   TRUE 0.915 5.000 0.064 1.000 N NA
 10212601 10212602 SJA_C1-27270 SJA_C1-27280 folP yhdJ FALSE 0.427 45.000 0.013 1.000 N NA
 10212604 10212605 SJA_C1-27300 SJA_C1-27310     TRUE 0.567 37.000 0.034 NA   NA
 10212606 10212607 SJA_C1-27320 SJA_C1-27330     TRUE 0.959 -7.000 0.116 1.000   NA
 10212607 10212608 SJA_C1-27330 SJA_C1-27340   fdxA FALSE 0.081 203.000 0.008 1.000 N NA
 10212608 10212609 SJA_C1-27340 SJA_C1-27350 fdxA   FALSE 0.019 280.000 0.000 1.000 N NA
 10212610 10212611 SJA_C1-27360 SJA_C1-27370     FALSE 0.379 23.000 0.000 NA   NA
 10212611 10212612 SJA_C1-27370 SJA_C1-27380     FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 10212613 10212614 SJA_C1-27390 SJA_C1-27400   ahpC FALSE 0.011 324.000 0.000 1.000 N NA
 10212614 10212615 SJA_C1-27400 SJA_C1-27410 ahpC ahpF TRUE 0.605 248.000 0.551 1.000 Y NA
 10212616 10212617 SJA_C1-27420 SJA_C1-27430   rnhB FALSE 0.197 80.000 0.002 NA   NA
 10212617 10212618 SJA_C1-27430 SJA_C1-27440 rnhB   TRUE 0.836 -7.000 0.004 1.000 N NA
 10212618 10212619 SJA_C1-27440 SJA_C1-27450     TRUE 0.966 -3.000 0.070 NA   NA
 10212619 10212620 SJA_C1-27450 SJA_C1-27460   glmM TRUE 0.853 0.000 0.008 NA   NA
 10212621 10212622 SJA_C1-27470 SJA_C1-27480     FALSE 0.209 108.000 0.000 NA   NA
 10212622 10212623 SJA_C1-27480 SJA_C1-27490     FALSE 0.010 311.000 0.000 NA   NA
 10212623 10212624 SJA_C1-27490 SJA_C1-27500   dapF TRUE 0.647 41.000 0.000 1.000 Y NA
 10212624 10212625 SJA_C1-27500 SJA_C1-27510 dapF   TRUE 0.954 2.000 0.109 1.000 N NA
 10212625 10212626 SJA_C1-27510 SJA_C1-27520   ftsY TRUE 0.527 108.000 0.042 1.000 N NA
 10212626 10212627 SJA_C1-27520 SJA_C1-27530 ftsY   TRUE 0.538 105.000 0.050 1.000 N NA
 10212629 10212630 SJA_C1-27550 SJA_C1-27560 sodA   FALSE 0.190 124.000 0.000 NA   NA
 10212631 10212632 SJA_C1-27570 SJA_C1-27580     TRUE 0.664 -27.000 0.000 NA   NA
 10212632 10212633 SJA_C1-27580 SJA_C1-27590     FALSE 0.019 263.000 0.000 NA   NA
 10212634 10212635 SJA_C1-27600 SJA_C1-27610     TRUE 0.960 -3.000 0.051 NA   NA
 10212637 10212638 SJA_C1-27630 SJA_C1-27640   ccmA TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212638 10212639 SJA_C1-27640 SJA_C1-27650 ccmA ccmB TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 10212639 10212640 SJA_C1-27650 SJA_C1-27660 ccmB   FALSE 0.025 264.000 0.000 0.080   NA
 10212642 10212643 SJA_C1-27680 SJA_C1-27690 ispB   FALSE 0.229 125.000 0.004 1.000   NA
 10212643 10212644 SJA_C1-27690 SJA_C1-27700   hrpB FALSE 0.419 21.000 0.000 1.000   NA
 10212644 10212645 SJA_C1-27700 SJA_C1-27710 hrpB   FALSE 0.303 59.000 0.009 1.000   NA
 10212647 10212648 SJA_C1-27730 SJA_C1-27740   bioF TRUE 0.612 150.000 0.191 1.000 N NA
 10212648 10212649 SJA_C1-27740 SJA_C1-27750 bioF   FALSE 0.486 123.000 0.036 1.000 N NA
 10212652 10212653 SJA_C1-27780 SJA_C1-27790   gcvPB TRUE 0.893 -3.000 0.006 NA   NA
 10212653 10212654 SJA_C1-27790 SJA_C1-27800 gcvPB gcvPA TRUE 0.912 98.000 0.316 0.001 Y NA
 10212654 10212655 SJA_C1-27800 SJA_C1-27810 gcvPA gcvH TRUE 0.821 125.000 0.130 1.000 Y NA
 10212655 10212656 SJA_C1-27810 SJA_C1-27820 gcvH gcvT TRUE 0.883 62.000 0.202 0.001 Y NA
 10212656 10212657 SJA_C1-27820 SJA_C1-27830 gcvT dgt FALSE 0.006 392.000 0.000 1.000 N NA
 10212657 10212658 SJA_C1-27830 SJA_C1-27840 dgt   FALSE 0.403 39.000 0.009 1.000   NA
 10212658 10212659 SJA_C1-27840 SJA_C1-27850   ftsZ FALSE 0.072 178.000 0.000 1.000   NA
 10212659 10212660 SJA_C1-27850 SJA_C1-27860 ftsZ ftsA TRUE 0.834 112.000 0.114 1.000 Y NA
 10212660 10212661 SJA_C1-27860 SJA_C1-27870 ftsA ftsQ TRUE 0.937 7.000 0.137 NA N NA
 10212661 10212662 SJA_C1-27870 SJA_C1-27880 ftsQ ddlA TRUE 0.993 -7.000 0.372 NA Y NA
 10212662 10212663 SJA_C1-27880 SJA_C1-27890 ddlA murB TRUE 0.993 -3.000 0.135 0.003 Y NA
 10212663 10212664 SJA_C1-27890 SJA_C1-27900 murB   TRUE 0.883 -3.000 0.005 NA   NA
 10212664 10212665 SJA_C1-27900 SJA_C1-27910   murC TRUE 0.800 0.000 0.002 NA   NA
 10212665 10212666 SJA_C1-27910 SJA_C1-27920 murC   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212666 10212667 SJA_C1-27920 SJA_C1-27930   murG TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212667 10212668 SJA_C1-27930 SJA_C1-27940 murG ftsW TRUE 0.766 48.000 0.200 1.000 N NA
 10212668 10212669 SJA_C1-27940 SJA_C1-27950 ftsW murD TRUE 0.678 26.000 0.035 1.000 N NA
 10212669 10212670 SJA_C1-27950 SJA_C1-27960 murD mraY TRUE 0.998 -3.000 0.647 0.003 Y NA
 10212670 10212671 SJA_C1-27960 SJA_C1-27970 mraY murF TRUE 0.994 0.000 0.309 0.003 Y NA
 10212671 10212672 SJA_C1-27970 SJA_C1-27980 murF murE TRUE 0.953 110.000 0.569 0.002 Y NA
 10212672 10212673 SJA_C1-27980 SJA_C1-27990 murE ftsI TRUE 0.984 0.000 0.091 1.000 Y NA
 10212673 10212674 SJA_C1-27990 SJA_C1-28000 ftsI   TRUE 0.972 1.000 0.224 NA   NA
 10212674 10212675 SJA_C1-28000 SJA_C1-28010   mraW TRUE 0.917 -3.000 0.011 NA   NA
 10212675 10212676 SJA_C1-28010 SJA_C1-28020 mraW mraZ TRUE 0.994 -3.000 0.635 NA   NA
 10212676 10212677 SJA_C1-28020 SJA_C1-28030 mraZ   FALSE 0.068 186.000 0.003 NA   NA
 10212677 10212678 SJA_C1-28030 SJA_C1-28040     TRUE 0.822 52.000 0.375 NA   NA
 10212678 10212679 SJA_C1-28040 SJA_C1-28050   cysK FALSE 0.479 43.000 0.023 NA   NA
 10212680 10212681 SJA_C1-28060 SJA_C1-28070     FALSE 0.005 387.000 0.000 1.000   NA
 10212682 10212683 SJA_C1-28080 SJA_C1-28090 tatC tatB TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 10212683 10212684 SJA_C1-28090 SJA_C1-28100 tatB tatA TRUE 0.951 30.000 0.353 1.000 Y NA
 10212684 10212685 SJA_C1-28100 SJA_C1-28110 tatA scpB TRUE 0.694 30.000 0.060 NA N NA
 10212685 10212686 SJA_C1-28110 SJA_C1-28120 scpB scpA TRUE 0.994 -3.000 0.570 NA   NA
 10212686 10212687 SJA_C1-28120 SJA_C1-28130 scpA   TRUE 0.713 38.000 0.103 NA   NA
 10212687 10212688 SJA_C1-28130 SJA_C1-28140     FALSE 0.053 258.000 0.022 NA   NA
 10212688 10212689 SJA_C1-28140 SJA_C1-28150   argS TRUE 0.527 20.000 0.008 NA   NA
 10212689 10212690 SJA_C1-28150 SJA_C1-28160 argS   FALSE 0.296 116.000 0.008 NA   NA
 10212691 10212692 SJA_C1-28170 SJA_C1-28180 lytB thrB TRUE 0.964 5.000 0.251 1.000   NA
 10212692 10212693 SJA_C1-28180 SJA_C1-28190 thrB rnhA TRUE 0.975 -3.000 0.104 1.000   NA
 10212696 10212697 SJA_C1-28220 SJA_C1-28230     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA Y NA
 10212697 10212698 SJA_C1-28230 SJA_C1-28240   ydhD FALSE 0.007 372.000 0.000 1.000 N NA
 10212698 10212699 SJA_C1-28240 SJA_C1-28250 ydhD   TRUE 0.749 56.000 0.220 NA N NA
 10212699 10212700 SJA_C1-28250 SJA_C1-28260     TRUE 0.715 20.000 0.040 NA   NA
 10212700 10212701 SJA_C1-28260 SJA_C1-28270   leuD TRUE 0.802 61.000 0.364 NA   NA
 10212701 10212702 SJA_C1-28270 SJA_C1-28280 leuD   TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10212702 10212703 SJA_C1-28280 SJA_C1-28290   leuC TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212703 10212704 SJA_C1-28290 SJA_C1-28300 leuC gst FALSE 0.271 149.000 0.015 1.000 N NA
 10212704 10212705 SJA_C1-28300 SJA_C1-28310 gst aceA FALSE 0.043 221.000 0.000 1.000 N NA
 10212707 10212708 SJA_C1-28330 SJA_C1-28340     FALSE 0.476 100.000 0.043 NA   NA
 10212709 10212710 SJA_C1-28350 SJA_C1-28360     TRUE 0.725 33.000 0.097 NA   NA
 10212711 10212712 SJA_C1-28370 SJA_C1-28380 nadC   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212712 10212713 SJA_C1-28380 SJA_C1-28390   nadA TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10212713 10212714 SJA_C1-28390 SJA_C1-28400 nadA   FALSE 0.238 119.000 0.003 1.000   NA
 10212716 10212717 SJA_C1-28420 SJA_C1-28430   gshB TRUE 0.648 14.000 0.010 NA   NA
 10212717 10212718 SJA_C1-28430 SJA_C1-28440 gshB   FALSE 0.479 142.000 0.064 1.000 N NA
 10212718 10212719 SJA_C1-28440 SJA_C1-28450     TRUE 0.982 -3.000 0.165 1.000   NA
 10212721 10212722 SJA_C1-28470 SJA_C1-28480     TRUE 0.993 -6.000 0.333 1.000 Y NA
 10212726 10212727 SJA_C1-28520 SJA_C1-28530 cysG1 narB TRUE 0.898 -13.000 0.030 1.000 N NA
 10212727 10212728 SJA_C1-28530 SJA_C1-28540 narB nirD TRUE 0.763 131.000 0.294 1.000 N NA
 10212728 10212729 SJA_C1-28540 SJA_C1-28550 nirD nirB TRUE 0.985 6.000 0.539 0.001 N NA
 10212729 10212730 SJA_C1-28550 SJA_C1-28560 nirB narK FALSE 0.068 293.000 0.074 NA N NA
 10212732 10212733 SJA_C1-28580 SJA_C1-28590   nasT TRUE 0.989 0.000 0.466 NA N NA
 10212733 10212734 SJA_C1-28590 SJA_C1-28600 nasT   FALSE 0.044 208.000 0.000 1.000   NA
 10212734 10212735 SJA_C1-28600 SJA_C1-28610   emrA TRUE 0.977 13.000 0.750 1.000   NA
 10212735 10212736 SJA_C1-28610 SJA_C1-28620 emrA   TRUE 0.994 -7.000 0.833 0.080 N NA
 10212737 10212738 SJA_C1-28630 SJA_C1-28640     TRUE 0.771 24.000 0.000 0.063 Y NA
 10212739 10212740 SJA_C1-28650 SJA_C1-28660     TRUE 0.943 -3.000 0.019 1.000 N NA
 10212740 10212741 SJA_C1-28660 SJA_C1-28670   lysA TRUE 0.857 0.000 0.005 1.000 N NA
 10212741 10212742 SJA_C1-28670 SJA_C1-28680 lysA   FALSE 0.433 34.000 0.010 NA   NA
 10212742 10212743 SJA_C1-28680 SJA_C1-28690   argH TRUE 0.914 -3.000 0.011 NA   NA
 10212746 10212747 SJA_C1-28720 SJA_C1-28730   tdcF FALSE 0.218 65.000 0.000 NA N NA
 10212748 10212749 SJA_C1-28740 SJA_C1-28750     TRUE 0.695 94.000 0.182 NA   NA
 10212749 10212750 SJA_C1-28750 SJA_C1-28760   coq7 FALSE 0.480 25.000 0.008 NA   NA
 10212750 10212751 SJA_C1-28760 SJA_C1-28770 coq7 dsbB TRUE 0.981 -3.000 0.145 1.000 N NA
 10212751 10212752 SJA_C1-28770 SJA_C1-28780 dsbB prc FALSE 0.351 142.000 0.021 1.000 N NA
 10212754 10212755 SJA_C1-28800 SJA_C1-28810     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212755 10212756 SJA_C1-28810 SJA_C1-28820     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212756 10212757 SJA_C1-28820 SJA_C1-28830     TRUE 0.844 68.000 0.500 NA   NA
 10212757 10212758 SJA_C1-28830 SJA_C1-28840     TRUE 0.850 98.000 0.500 NA   NA
 10212759 10212760 SJA_C1-28850 SJA_C1-28860 phoR pstS FALSE 0.174 156.000 0.007 NA N NA
 10212760 10212761 SJA_C1-28860 SJA_C1-28870 pstS pstC TRUE 0.894 11.000 0.007 NA Y NA
 10212761 10212762 SJA_C1-28870 SJA_C1-28880 pstC pstA TRUE 0.996 0.000 0.485 0.001 Y NA
 10212762 10212763 SJA_C1-28880 SJA_C1-28890 pstA pstB TRUE 0.995 -6.000 0.402 0.001 Y NA
 10212763 10212764 SJA_C1-28890 SJA_C1-28900 pstB phoU TRUE 0.954 19.000 0.222 NA Y NA
 10212764 10212765 SJA_C1-28900 SJA_C1-28910 phoU phoB TRUE 0.944 3.000 0.096 NA N NA
 10212766 10212767 SJA_C1-28920 SJA_C1-28930     TRUE 0.980 -3.000 0.148 NA   NA
 10212767 10212768 SJA_C1-28930 SJA_C1-28940   ybbN TRUE 0.923 14.000 0.222 1.000   NA
 10212768 10212769 SJA_C1-28940 SJA_C1-28950 ybbN   FALSE 0.023 251.000 0.000 NA   NA
 10212769 10212770 SJA_C1-28950 SJA_C1-28960     TRUE 0.917 18.000 0.304 NA   NA
 10212770 10212771 SJA_C1-28960 SJA_C1-28970   pheA2 FALSE 0.406 29.000 0.003 NA N NA
 10212773 10212774 SJA_C1-28990 SJA_C1-29000   tlyC TRUE 0.906 2.000 0.036 NA   NA
 10212776 10212777 SJA_C1-29020 SJA_C1-29030 ppx ppk TRUE 0.942 6.000 0.149 1.000   NA
 10212777 10212778 SJA_C1-29030 SJA_C1-29040 ppk ppk TRUE 0.921 0.000 0.017 0.001   NA
 10212778 10212779 SJA_C1-29040 SJA_C1-29050 ppk   TRUE 0.796 28.000 0.134 NA   NA
 10212779 10212780 SJA_C1-29050 SJA_C1-29060     TRUE 0.971 -3.000 0.084 NA   NA
 10212781 10212782 SJA_C1-29070 SJA_C1-29080 purM purN TRUE 0.892 89.000 0.230 0.002 Y NA
 10212782 10212783 SJA_C1-29080 SJA_C1-29090 purN   FALSE 0.206 134.000 0.000 1.000 N NA
 10212783 10212784 SJA_C1-29090 SJA_C1-29100     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10212784 10212785 SJA_C1-29100 SJA_C1-29110   nadB TRUE 0.636 9.000 0.000 1.000   NA
 10212788 10212789 SJA_C1-29140 SJA_C1-29150 metH   TRUE 0.717 120.000 0.019 0.001 Y NA
 10212789 10212790 SJA_C1-29150 SJA_C1-29160   metF TRUE 0.724 138.000 0.044 0.001 Y NA
 10212790 10212791 SJA_C1-29160 SJA_C1-29170 metF   TRUE 0.981 -3.000 0.160 1.000   NA
 10212796 10212797 SJA_C1-29220 SJA_C1-29230     FALSE 0.390 86.000 0.024 NA   NA
 10212800 10212801 SJA_C1-29260 SJA_C1-29270   lytT FALSE 0.250 118.000 0.000 1.000 N NA
 10212801 10212802 SJA_C1-29270 SJA_C1-29280 lytT yesM TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.019 Y NA
 10212802 10212803 SJA_C1-29280 SJA_C1-29290 yesM   TRUE 0.673 96.000 0.136 1.000 N NA
 10212804 10212805 SJA_C1-29300 SJA_C1-29310 spoT   FALSE 0.314 31.000 0.000 NA   NA
 10212805 10212806 SJA_C1-29310 SJA_C1-29320     FALSE 0.193 91.000 0.000 NA   NA
 10212806 10212807 SJA_C1-29320 SJA_C1-29330   rplJ FALSE 0.013 288.000 0.000 NA   NA
 10212807 10212808 SJA_C1-29330 SJA_C1-29340 rplJ rplL TRUE 0.965 90.000 0.884 0.010 Y NA
 10212814 10212815 SJA_C1-29390 SJA_C1-29400     FALSE 0.125 150.000 0.000 NA   NA
 10212815 10212816 SJA_C1-29400 SJA_C1-29410   pilT TRUE 0.995 -3.000 0.689 NA   NA
 10212817 10212818 SJA_C1-29420 SJA_C1-29430     FALSE 0.180 128.000 0.000 NA   NA
 10212818 10212819 SJA_C1-29430 SJA_C1-29440     FALSE 0.042 204.000 0.000 NA   NA
 10212821 10212822 SJA_C1-29460 SJA_C1-29470 doc   FALSE 0.186 68.000 0.000 NA   NA
 10212824 10212825 SJA_C1-29490 SJA_C1-29500     TRUE 0.683 -18.000 0.000 NA   NA
 10212826 10212827 SJA_C1-29510 SJA_C1-29520   fic TRUE 0.560 12.000 0.000 NA   NA
 10212827 10212828 SJA_C1-29520 SJA_C1-29530 fic   FALSE 0.019 263.000 0.000 NA   NA
 10212830 10212831 SJA_C1-29550 SJA_C1-29560     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 10212831 10212832 SJA_C1-29560 SJA_C1-29570   dpm1 FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 10212832 10212833 SJA_C1-29570 SJA_C1-29580 dpm1   TRUE 0.951 -7.000 0.091 1.000   NA
 10212833 10212834 SJA_C1-29580 SJA_C1-29590     FALSE 0.468 17.000 0.000 1.000   NA
 10212834 10212835 SJA_C1-29590 SJA_C1-29600     TRUE 0.658 -30.000 0.000 NA   NA
 10212836 10212837 SJA_C1-29610 SJA_C1-29620   trbI TRUE 0.604 10.000 0.000 NA   NA
 10212837 10212838 SJA_C1-29620 SJA_C1-29630 trbI trbG TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 10212838 10212839 SJA_C1-29630 SJA_C1-29640 trbG trbF TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 10212839 10212840 SJA_C1-29640 SJA_C1-29650 trbF trbL TRUE 0.993 2.000 0.429 NA Y NA
 10212840 10212841 SJA_C1-29650 SJA_C1-29660 trbL trbJ TRUE 0.896 126.000 0.333 NA Y NA
 10212841 10212842 SJA_C1-29660 SJA_C1-29670 trbJ trbE TRUE 0.996 2.000 0.714 NA Y NA
 10212842 10212843 SJA_C1-29670 SJA_C1-29680 trbE trbD TRUE 0.997 -6.000 0.714 NA Y NA
 10212843 10212844 SJA_C1-29680 SJA_C1-29690 trbD trbC TRUE 0.998 -3.000 0.800 NA Y NA
 10212844 10212845 SJA_C1-29690 SJA_C1-29700 trbC trbB TRUE 0.933 57.000 0.500 NA Y NA
 10212845 10212846 SJA_C1-29700 SJA_C1-29710 trbB   TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 10212846 10212847 SJA_C1-29710 SJA_C1-29720   traG TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA   NA
 10212847 10212848 SJA_C1-29720 SJA_C1-29730 traG   FALSE 0.146 146.000 0.000 1.000   NA
 10212851 10212852 SJA_C1-29760 SJA_C1-29770     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10212853 10212854 SJA_C1-29780 SJA_C1-29790     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 10212854 10212855 SJA_C1-29790 SJA_C1-29800   traF TRUE 0.992 -12.000 1.000 NA   NA
 10212855 10212856 SJA_C1-29800 SJA_C1-29810 traF   TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10212856 10212857 SJA_C1-29810 SJA_C1-29820     FALSE 0.070 176.000 0.000 NA   NA
 10212858 10212859 SJA_C1-29830 SJA_C1-29840     TRUE 0.750 1.000 0.000 NA   NA
 10212860 10212861 SJA_C1-29850 SJA_C1-29860     TRUE 0.996 0.000 0.531 NA Y NA
 10212861 10212862 SJA_C1-29860 SJA_C1-29870     FALSE 0.186 125.000 0.000 NA   NA
 10212862 10212863 SJA_C1-29870 SJA_C1-29880     FALSE 0.063 181.000 0.000 NA   NA
 10212863 10212864 SJA_C1-29880 SJA_C1-29890     FALSE 0.207 117.000 0.000 NA   NA
 10212864 10212865 SJA_C1-29890 SJA_C1-29900   ardC TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212865 10212866 SJA_C1-29900 SJA_C1-29910 ardC ardC FALSE 0.187 66.000 0.000 NA   NA
 10212866 10212867 SJA_C1-29910 SJA_C1-29920 ardC   TRUE 0.765 45.000 0.200 NA   NA
 10212867 10212868 SJA_C1-29920 SJA_C1-29930     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10212868 10212869 SJA_C1-29930 SJA_C1-29940     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10212869 10212870 SJA_C1-29940 SJA_C1-29950   ardC FALSE 0.112 154.000 0.000 NA   NA
 10212870 10212871 SJA_C1-29950 SJA_C1-29960 ardC   FALSE 0.003 463.000 0.000 NA   NA
 10212871 10212872 SJA_C1-29960 SJA_C1-29970     FALSE 0.193 98.000 0.000 NA   NA
 10212873 10212874 SJA_C1-29980 SJA_C1-29990 luxR luxI FALSE 0.242 57.000 0.000 1.000 N NA
 10212874 10212875 SJA_C1-29990 SJA_C1-30000 luxI   TRUE 0.985 -25.000 0.667 NA   NA
 10212875 10212876 SJA_C1-30000 SJA_C1-30010     FALSE 0.193 61.000 0.000 NA   NA
 10212876 10212877 SJA_C1-30010 SJA_C1-30020     FALSE 0.007 339.000 0.000 NA   NA
 10212877 10212878 SJA_C1-30020 SJA_C1-30030     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10212879 10212880 SJA_C1-30040 SJA_C1-30050     TRUE 0.992 -6.000 0.667 1.000 N NA
 10212880 10212881 SJA_C1-30050 SJA_C1-30060   fecR TRUE 0.926 78.000 0.500 NA Y NA
 10212881 10212882 SJA_C1-30060 SJA_C1-30070 fecR   TRUE 0.988 -7.000 0.500 NA N NA
 10212882 10212883 SJA_C1-30070 SJA_C1-30080     FALSE 0.028 237.000 0.000 NA   NA
 10212884 10212885 SJA_C1-30090 SJA_C1-30100     FALSE 0.026 239.000 0.000 NA   NA
 10212887 10212888 SJA_C1-30120 SJA_C1-30130 manC manB FALSE 0.379 30.000 0.000 1.000 N NA
 10212889 10212890 SJA_C1-30140 SJA_C1-30150   wcbC TRUE 0.686 33.000 0.000 1.000 Y NA
 10212891 10212892 SJA_C1-30160 SJA_C1-30170   wcbD FALSE 0.192 89.000 0.000 NA   NA
 10212892 10212893 SJA_C1-30170 SJA_C1-30180 wcbD cpxB TRUE 0.992 8.000 0.639 NA Y NA
 10212894 10212895 SJA_C1-30190 SJA_C1-30200     FALSE 0.003 584.000 0.000 NA   NA
 10212896 10212897 SJA_C1-30210 SJA_C1-30220     FALSE 0.188 65.000 0.000 NA   NA
 10212897 10212898 SJA_C1-30220 SJA_C1-30230   alg2 TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10212898 10212899 SJA_C1-30230 SJA_C1-30240 alg2   TRUE 0.998 -3.000 0.714 0.015 Y NA
 10212899 10212900 SJA_C1-30240 SJA_C1-30250   wcbH TRUE 0.991 0.000 0.200 0.015 Y NA
 10212900 10212901 SJA_C1-30250 SJA_C1-30260 wcbH   TRUE 0.971 5.000 0.087 1.000 Y NA
 10212901 10212902 SJA_C1-30260 SJA_C1-30270   gmd TRUE 0.772 21.000 0.000 1.000 Y NA
 10212902 10212903 SJA_C1-30270 SJA_C1-30280 gmd   TRUE 0.671 6.000 0.000 1.000   NA
 10212903 10212904 SJA_C1-30280 SJA_C1-30290     FALSE 0.053 196.000 0.000 1.000   NA
 10212904 10212905 SJA_C1-30290 SJA_C1-30300     FALSE 0.002 882.000 0.000 NA   NA
 10212905 10212906 SJA_C1-30300 SJA_C1-30310     FALSE 0.004 423.000 0.000 NA   NA
 10212906 10212907 SJA_C1-30310 SJA_C1-30320     FALSE 0.188 65.000 0.000 NA   NA
 10212907 10212908 SJA_C1-30320 SJA_C1-30330     TRUE 0.998 -3.000 0.846 1.000 Y NA
 10212908 10212909 SJA_C1-30330 SJA_C1-30340     FALSE 0.198 82.000 0.000 1.000   NA
 10212910 10212911 SJA_C1-30350 SJA_C1-30360 wbpX   TRUE 0.978 -3.000 0.135 NA   NA
 10212913 10212914 SJA_C1-30380 SJA_C1-30390     TRUE 0.833 22.000 0.105 0.009   NA
 10212914 10212915 SJA_C1-30390 SJA_C1-30400     FALSE 0.146 143.000 0.000 NA   NA
 10212917 10212918 SJA_C1-30420 SJA_C1-30430     FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 10212918 10212919 SJA_C1-30430 SJA_C1-30440     FALSE 0.212 114.000 0.000 NA   NA
 10212921 10212922 SJA_C1-30460 SJA_C1-30470     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10212923 10212924 SJA_C1-30480 SJA_C1-30490 manA   FALSE 0.296 44.000 0.000 1.000 N NA
 10212925 10212926 SJA_C1-30500 SJA_C1-30510 apt cyt1 FALSE 0.382 57.000 0.015 1.000 N NA
 10212926 10212927 SJA_C1-30510 SJA_C1-30520 cyt1 cytB TRUE 0.987 15.000 0.630 0.001 Y NA
 10212927 10212928 SJA_C1-30520 SJA_C1-30530 cytB rip1 TRUE 0.950 12.000 0.058 0.001 Y NA
 10212929 10212930 SJA_C1-30540 SJA_C1-30550 cspR hemF TRUE 0.957 -3.000 0.033 1.000 N NA
 10212930 10212931 SJA_C1-30550 SJA_C1-30560 hemF   TRUE 0.854 -9.000 0.012 1.000   NA
 10212933 10212934 SJA_C1-30580 SJA_C1-30590 lipB   FALSE 0.215 62.000 0.003 NA   NA
 10212934 10212935 SJA_C1-30590 SJA_C1-30600     TRUE 0.806 76.000 0.400 NA   NA
 10212936 10212937 SJA_C1-30610 SJA_C1-30620   exsB TRUE 0.964 5.000 0.270 NA   NA
 10212937 10212938 SJA_C1-30620 SJA_C1-30630 exsB   FALSE 0.330 47.000 0.009 NA   NA
 10212938 10212939 SJA_C1-30630 SJA_C1-30640   hsp33 FALSE 0.340 96.000 0.015 NA   NA
 10212939 10212940 SJA_C1-30640 SJA_C1-30650 hsp33 argF FALSE 0.072 272.000 0.052 1.000 N NA
 10212940 10212941 SJA_C1-30650 SJA_C1-30660 argF argD FALSE 0.412 174.000 0.021 1.000 Y NA
 10212941 10212942 SJA_C1-30660 SJA_C1-30670 argD fliS TRUE 0.522 145.000 0.095 1.000 N NA
 10212942 10212943 SJA_C1-30670 SJA_C1-30680 fliS fliD TRUE 0.974 15.000 0.286 0.001 Y NA
 10212943 10212944 SJA_C1-30680 SJA_C1-30690 fliD   FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 10212944 10212945 SJA_C1-30690 SJA_C1-30700   flhB TRUE 0.758 46.000 0.200 NA   NA
 10212945 10212946 SJA_C1-30700 SJA_C1-30710 flhB fliR TRUE 0.993 4.000 0.556 1.000 Y NA
 10212946 10212947 SJA_C1-30710 SJA_C1-30720 fliR fliQ TRUE 0.995 -3.000 0.215 0.001 Y NA
 10212947 10212948 SJA_C1-30720 SJA_C1-30730 fliQ fliP TRUE 0.871 122.000 0.177 0.009 Y NA
 10212948 10212949 SJA_C1-30730 SJA_C1-30740 fliP fliO TRUE 0.865 -25.000 0.029 1.000   NA
 10212949 10212950 SJA_C1-30740 SJA_C1-30750 fliO fliN FALSE 0.318 84.000 0.012 1.000   NA
 10212950 10212951 SJA_C1-30750 SJA_C1-30760 fliN fliM TRUE 0.986 -3.000 0.185 0.001   NA
 10212951 10212952 SJA_C1-30760 SJA_C1-30770 fliM fliL TRUE 0.892 52.000 0.200 0.001 Y NA
 10212952 10212953 SJA_C1-30770 SJA_C1-30780 fliL   TRUE 0.804 29.000 0.143 1.000   NA
 10212953 10212954 SJA_C1-30780 SJA_C1-30790     TRUE 0.981 -7.000 0.333 NA   NA
 10212954 10212955 SJA_C1-30790 SJA_C1-30800   fliI TRUE 0.992 -3.000 0.462 NA   NA
 10212955 10212956 SJA_C1-30800 SJA_C1-30810 fliI fliH TRUE 0.972 0.000 0.028 NA Y NA
 10212956 10212957 SJA_C1-30810 SJA_C1-30820 fliH fliG TRUE 0.988 -13.000 0.308 NA Y NA
 10212957 10212958 SJA_C1-30820 SJA_C1-30830 fliG fliF TRUE 0.990 -7.000 0.220 0.004 Y NA
 10212958 10212959 SJA_C1-30830 SJA_C1-30840 fliF fliE TRUE 0.966 2.000 0.020 0.004 Y NA
 10212959 10212960 SJA_C1-30840 SJA_C1-30850 fliE   TRUE 0.901 16.000 0.182 1.000 N NA
 10212961 10212962 SJA_C1-30860 SJA_C1-30870 fliC   FALSE 0.007 367.000 0.000 1.000 N NA
 10212962 10212963 SJA_C1-30870 SJA_C1-30880   mdoH TRUE 0.543 67.000 0.068 NA N NA
 10212964 10212965 SJA_C1-30890 SJA_C1-30900 fliA flhA TRUE 0.883 13.000 0.093 1.000 N NA
 10212965 10212966 SJA_C1-30900 SJA_C1-30910 flhA   TRUE 0.949 10.000 0.250 NA   NA
 10212966 10212967 SJA_C1-30910 SJA_C1-30920     FALSE 0.009 319.000 0.000 NA   NA
 10212967 10212968 SJA_C1-30920 SJA_C1-30930   flgM TRUE 0.790 5.000 0.010 NA   NA
 10212968 10212969 SJA_C1-30930 SJA_C1-30940 flgM   TRUE 0.833 47.000 0.371 NA   NA
 10212969 10212970 SJA_C1-30940 SJA_C1-30950     FALSE 0.422 108.000 0.024 NA   NA
 10212970 10212971 SJA_C1-30950 SJA_C1-30960   motA TRUE 0.956 -3.000 0.040 1.000   NA
 10212972 10212973 SJA_C1-30970 SJA_C1-30980 flgB flgC TRUE 0.998 -3.000 0.611 0.002 Y NA
 10212973 10212974 SJA_C1-30980 SJA_C1-30990 flgC flgD TRUE 0.993 -3.000 0.174 NA Y NA
 10212974 10212975 SJA_C1-30990 SJA_C1-31000 flgD flgE TRUE 0.979 31.000 0.875 NA Y NA
 10212975 10212976 SJA_C1-31000 SJA_C1-31010 flgE flgF TRUE 0.953 118.000 0.594 0.002 Y NA
 10212976 10212977 SJA_C1-31010 SJA_C1-31020 flgF flgG TRUE 0.869 63.000 0.174 0.001 Y NA
 10212977 10212978 SJA_C1-31020 SJA_C1-31030 flgG flgH TRUE 0.903 120.000 0.260 0.004 Y NA
 10212978 10212979 SJA_C1-31030 SJA_C1-31040 flgH flgI TRUE 0.989 0.000 0.149 0.005 Y NA
 10212979 10212980 SJA_C1-31040 SJA_C1-31050 flgI flgJ TRUE 0.963 0.000 0.117 NA   NA
 10212980 10212981 SJA_C1-31050 SJA_C1-31060 flgJ flgK TRUE 0.985 -3.000 0.217 NA   NA
 10212981 10212982 SJA_C1-31060 SJA_C1-31070 flgK flgL TRUE 0.978 18.000 0.429 0.003 Y NA
 10212982 10212983 SJA_C1-31070 SJA_C1-31080 flgL motA FALSE 0.269 263.000 0.093 0.005 Y NA
 10212983 10212984 SJA_C1-31080 SJA_C1-31090 motA motB TRUE 0.983 4.000 0.186 1.000 Y NA
 10212985 10212986 SJA_C1-31100 SJA_C1-31110     TRUE 0.998 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 10212986 10212987 SJA_C1-31110 SJA_C1-31120     TRUE 0.647 76.000 0.143 1.000   NA
 10212987 10212988 SJA_C1-31120 SJA_C1-31130   argG FALSE 0.175 136.000 0.000 1.000   NA
 10212988 10212989 SJA_C1-31130 SJA_C1-31140 argG   FALSE 0.099 162.000 0.002 NA   NA
 10212989 10212990 SJA_C1-31140 SJA_C1-31150     FALSE 0.016 273.000 0.000 NA   NA
 10212990 10212991 SJA_C1-31150 SJA_C1-t0470     FALSE 0.352 26.000 0.000 NA   NA
 10212992 10212993 SJA_C1-31160 SJA_C1-31170     TRUE 0.726 130.000 0.222 1.000 N NA
 10212993 10212994 SJA_C1-31170 SJA_C1-31180     TRUE 0.619 106.000 0.007 1.000 Y NA
 10212994 10212995 SJA_C1-31180 SJA_C1-31190     TRUE 0.971 19.000 0.396 1.000 Y NA
 10212998 10212999 SJA_C1-31220 SJA_C1-31230     TRUE 0.906 29.000 0.412 NA   NA
 10212999 10213000 SJA_C1-31230 SJA_C1-31240   cspA FALSE 0.066 193.000 0.000 1.000 N NA
 10213000 10213001 SJA_C1-31240 SJA_C1-31250 cspA   FALSE 0.194 100.000 0.000 NA   NA
 10213002 10213003 SJA_C1-31260 SJA_C1-31270 rnd   TRUE 0.859 13.000 0.078 NA   NA
 10213003 10213004 SJA_C1-31270 SJA_C1-31280     TRUE 0.940 0.000 0.055 NA   NA
 10213005 10213006 SJA_C1-31290 SJA_C1-31300   kdsB TRUE 0.548 38.000 0.023 1.000 N NA
 10213006 10213007 SJA_C1-31300 SJA_C1-31310 kdsB kpsF FALSE 0.080 313.000 0.023 1.000 Y NA
 10213007 10213008 SJA_C1-31310 SJA_C1-31320 kpsF   TRUE 0.723 -12.000 0.000 NA   NA
 10213008 10213009 SJA_C1-31320 SJA_C1-31330     FALSE 0.062 182.000 0.000 NA   NA
 10213010 10213011 SJA_C1-31340 SJA_C1-31350   jmjC TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10213012 10213013 SJA_C1-31360 SJA_C1-31370     FALSE 0.190 86.000 0.000 NA   NA
 10213013 10213014 SJA_C1-31370 SJA_C1-31380   ampC FALSE 0.356 81.000 0.019 NA   NA
 10213015 10213016 SJA_C1-31390 SJA_C1-31400 ung   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213016 10213017 SJA_C1-31400 SJA_C1-31410     FALSE 0.505 14.000 0.000 NA   NA
 10213019 10213020 SJA_C1-31430 SJA_C1-31440     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 10213020 10213021 SJA_C1-31440 SJA_C1-31450     TRUE 0.995 -3.000 0.734 NA   NA
 10213022 10213023 SJA_C1-31460 SJA_C1-31470     FALSE 0.043 203.000 0.000 NA   NA
 10213025 10213026 SJA_C1-31490 SJA_C1-31500 ald   FALSE 0.221 74.000 0.000 1.000 N NA
 10213027 10213028 SJA_C1-t0480 SJA_C1-31510     FALSE 0.068 177.000 0.000 NA   NA
 10213029 10213030 SJA_C1-31520 SJA_C1-31530 mod   FALSE 0.091 175.000 0.000 1.000 N NA
 10213032 10213033 SJA_C1-31550 SJA_C1-31560     FALSE 0.196 102.000 0.000 NA   NA
 10213034 10213035 SJA_C1-31570 SJA_C1-31580     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213035 10213036 SJA_C1-31580 SJA_C1-31590     FALSE 0.209 116.000 0.000 NA   NA
 10213037 10213038 SJA_C1-31600 SJA_C1-31610     FALSE 0.203 105.000 0.000 NA   NA
 10213038 10213039 SJA_C1-31610 SJA_C1-31620     FALSE 0.308 32.000 0.000 NA   NA
 10213039 10213040 SJA_C1-31620 SJA_C1-31630     FALSE 0.018 267.000 0.000 NA   NA
 10213040 10213041 SJA_C1-31630 SJA_C1-31640     FALSE 0.212 51.000 0.000 NA   NA
 10213041 10213042 SJA_C1-31640 SJA_C1-31650     TRUE 0.529 65.000 0.070 NA   NA
 10213042 10213043 SJA_C1-31650 SJA_C1-31660     TRUE 0.789 51.000 0.286 1.000   NA
 10213045 10213046 SJA_C1-31680 SJA_C1-31690     FALSE 0.212 113.000 0.000 NA   NA
 10213046 10213047 SJA_C1-31690 SJA_C1-31700     TRUE 0.979 -10.000 0.375 NA   NA
 10213047 10213048 SJA_C1-31700 SJA_C1-31710     FALSE 0.207 133.000 0.000 1.000 N NA
 10213048 10213049 SJA_C1-31710 SJA_C1-31720     TRUE 0.980 -3.000 0.152 NA   NA
 10213050 10213051 SJA_C1-31730 SJA_C1-31740   hlyB FALSE 0.003 707.000 0.000 1.000 N NA
 10213051 10213052 SJA_C1-31740 SJA_C1-31750 hlyB hlyD TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.007 Y NA
 10213052 10213053 SJA_C1-31750 SJA_C1-31760 hlyD hlyC FALSE 0.268 48.000 0.000 1.000 N NA
 10213053 10213054 SJA_C1-31760 SJA_C1-31770 hlyC   TRUE 0.755 -9.000 0.000 1.000   NA
 10213054 10213055 SJA_C1-31770 SJA_C1-31780     TRUE 0.689 -16.000 0.000 NA   NA
 10213058 10213059 SJA_C1-31810 SJA_C1-31820   traA TRUE 0.604 10.000 0.000 NA   NA
 10213060 10213061 SJA_C1-31830 SJA_C1-31840 traC traD TRUE 0.990 -46.000 1.000 0.002   NA
 10213061 10213062 SJA_C1-31840 SJA_C1-31850 traD   FALSE 0.436 18.000 0.000 NA   NA
 10213063 10213064 SJA_C1-31860 SJA_C1-31870     FALSE 0.195 71.000 0.000 1.000   NA
 10213064 10213065 SJA_C1-31870 SJA_C1-31880     FALSE 0.225 51.000 0.000 1.000   NA
 10213066 10213067 SJA_C1-31890 SJA_C1-31900   alpA FALSE 0.005 372.000 0.000 NA   NA
 10213067 10213068 SJA_C1-31900 SJA_C1-31910 alpA   FALSE 0.187 83.000 0.000 NA   NA
 10213069 10213070 SJA_C1-31920 SJA_C1-31930     TRUE 0.641 63.000 0.133 NA   NA
 10213070 10213071 SJA_C1-31930 SJA_C1-31940     FALSE 0.182 72.000 0.000 NA   NA
 10213071 10213072 SJA_C1-31940 SJA_C1-31950     FALSE 0.086 165.000 0.000 NA   NA
 10213073 10213074 SJA_C1-31960 SJA_C1-31970     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213074 10213075 SJA_C1-31970 SJA_C1-31980     TRUE 0.584 11.000 0.000 NA   NA
 10213075 10213076 SJA_C1-31980 SJA_C1-31990     TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 10213076 10213077 SJA_C1-31990 SJA_C1-32000     FALSE 0.019 263.000 0.000 NA   NA
 10213078 10213079 SJA_C1-32010 SJA_C1-32020     TRUE 0.980 -3.000 0.154 NA   NA
 10213080 10213081 SJA_C1-32030 SJA_C1-32040     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213081 10213082 SJA_C1-32040 SJA_C1-32050     FALSE 0.369 24.000 0.000 NA   NA
 10213082 10213083 SJA_C1-32050 SJA_C1-32060     FALSE 0.369 24.000 0.000 NA   NA
 10213088 10213089 SJA_C1-32110 SJA_C1-32120     TRUE 0.689 -16.000 0.000 NA   NA
 10213089 10213090 SJA_C1-32120 SJA_C1-t0490     FALSE 0.091 163.000 0.000 NA   NA
 10213090 10213091 SJA_C1-t0490 SJA_C1-32130   recJ FALSE 0.199 121.000 0.000 NA   NA
 10213092 10213093 SJA_C1-32140 SJA_C1-32150     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 10213094 10213095 SJA_C1-32160 SJA_C1-32170     FALSE 0.437 123.000 0.022 0.077   NA
 10213095 10213096 SJA_C1-32170 SJA_C1-32180     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213096 10213097 SJA_C1-32180 SJA_C1-32190   fumA FALSE 0.206 99.000 0.000 1.000   NA
 10213100 10213101 SJA_C1-32220 SJA_C1-32230 nrdA   TRUE 0.876 -25.000 0.035 1.000   NA
 10213101 10213102 SJA_C1-32230 SJA_C1-32240   nrdB TRUE 0.839 6.000 0.022 1.000   NA
 10213102 10213103 SJA_C1-32240 SJA_C1-32250 nrdB   TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10213109 10213110 SJA_C1-32310 SJA_C1-32320     TRUE 0.751 6.000 0.006 NA N NA
 10213110 10213111 SJA_C1-32320 SJA_C1-32330   glpQ TRUE 0.940 -3.000 0.017 1.000 N NA
 10213111 10213112 SJA_C1-32330 SJA_C1-32340 glpQ   TRUE 0.539 40.000 0.025 NA N NA
 10213112 10213113 SJA_C1-32340 SJA_C1-32350     FALSE 0.020 260.000 0.000 NA   NA
 10213115 10213116 SJA_C1-32370 SJA_C1-32380 rpm32 plsX TRUE 0.897 36.000 0.418 1.000 N NA
 10213116 10213117 SJA_C1-32380 SJA_C1-32390 plsX fabH TRUE 0.997 -3.000 0.380 0.003 Y NA
 10213117 10213118 SJA_C1-32390 SJA_C1-32400 fabH ihfA FALSE 0.044 435.000 0.207 1.000 N NA
 10213118 10213119 SJA_C1-32400 SJA_C1-32410 ihfA   TRUE 0.863 73.000 0.535 1.000 N NA
 10213120 10213121 SJA_C1-32420 SJA_C1-32430   sixA TRUE 0.628 8.000 0.000 NA   NA
 10213121 10213122 SJA_C1-32430 SJA_C1-32440 sixA dinG TRUE 0.695 76.000 0.182 NA N NA
 10213122 10213123 SJA_C1-32440 SJA_C1-32450 dinG   TRUE 0.535 53.000 0.061 NA   NA
 10213125 10213126 SJA_C1-32470 SJA_C1-32480     FALSE 0.051 194.000 0.000 NA   NA
 10213126 10213127 SJA_C1-32480 SJA_C1-32490     TRUE 0.927 115.000 1.000 NA   NA
 10213128 10213129 SJA_C1-32500 SJA_C1-32510     TRUE 0.980 -7.000 0.294 NA N NA
 10213129 10213130 SJA_C1-32510 SJA_C1-32520   ligB FALSE 0.204 96.000 0.000 1.000   NA
 10213131 10213132 SJA_C1-32530 SJA_C1-32540     TRUE 0.942 -3.000 0.025 NA   NA
 10213132 10213133 SJA_C1-32540 SJA_C1-32550     FALSE 0.067 220.000 0.013 NA   NA
 10213134 10213135 SJA_C1-32560 SJA_C1-32570 phbC   FALSE 0.026 242.000 0.000 NA   NA
 10213135 10213136 SJA_C1-32570 SJA_C1-32580   clpS FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 10213137 10213138 SJA_C1-32590 SJA_C1-32600     FALSE 0.301 33.000 0.000 NA   NA
 10213138 10213139 SJA_C1-32600 SJA_C1-32610     FALSE 0.325 32.000 0.000 1.000   NA
 10213139 10213140 SJA_C1-32610 SJA_C1-32620     FALSE 0.025 243.000 0.000 NA   NA
 10213140 10213141 SJA_C1-32620 SJA_C1-32630     FALSE 0.043 203.000 0.000 NA   NA
 10213142 10213143 SJA_C1-32640 SJA_C1-32650     TRUE 0.985 -3.000 0.191 1.000 N NA
 10213144 10213145 SJA_C1-32660 SJA_C1-32670 proP hutU TRUE 0.976 -3.000 0.102 1.000 N NA
 10213145 10213146 SJA_C1-32670 SJA_C1-32680 hutU   TRUE 0.885 9.000 0.068 NA   NA
 10213147 10213148 SJA_C1-32690 SJA_C1-32700     FALSE 0.037 213.000 0.000 NA   NA
 10213148 10213149 SJA_C1-32700 SJA_C1-32710     FALSE 0.290 35.000 0.000 NA   NA
 10213149 10213150 SJA_C1-32710 SJA_C1-32720     TRUE 0.689 -16.000 0.000 NA   NA
 10213150 10213151 SJA_C1-32720 SJA_C1-32730     FALSE 0.186 68.000 0.000 NA   NA
 10213151 10213152 SJA_C1-32730 SJA_C1-32740   ppiA FALSE 0.016 294.000 0.000 1.000 N NA
 10213153 10213154 SJA_C1-32750 SJA_C1-32760     FALSE 0.212 114.000 0.000 NA   NA
 10213155 10213156 SJA_C1-32770 SJA_C1-32780     TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10213156 10213157 SJA_C1-32780 SJA_C1-32790     TRUE 0.709 -13.000 0.000 NA   NA
 10213157 10213158 SJA_C1-32790 SJA_C1-32800   uvrB FALSE 0.193 92.000 0.000 NA   NA
 10213159 10213160 SJA_C1-32810 SJA_C1-32820 recA   FALSE 0.245 100.000 0.002 1.000 N NA
 10213160 10213161 SJA_C1-32820 SJA_C1-32830   kinA TRUE 0.587 91.000 0.000 0.014 Y NA
 10213161 10213162 SJA_C1-32830 SJA_C1-32840 kinA   FALSE 0.352 54.000 0.015 NA   NA
 10213162 10213163 SJA_C1-32840 SJA_C1-32850   smpB TRUE 0.863 0.000 0.009 NA   NA
 10213163 10213164 SJA_C1-32850 SJA_C1-32860 smpB dapA FALSE 0.311 166.000 0.058 1.000 N NA
 10213165 10213166 SJA_C1-32870 SJA_C1-32880   greB FALSE 0.454 95.000 0.029 1.000 N NA
 10213167 10213168 SJA_C1-32890 SJA_C1-32900     FALSE 0.186 68.000 0.000 NA   NA
 10213168 10213169 SJA_C1-32900 SJA_C1-32910   aspS FALSE 0.192 81.000 0.002 NA   NA
 10213170 10213171 SJA_C1-32920 SJA_C1-32930 rnd   TRUE 0.622 13.000 0.006 NA   NA
 10213172 10213173 SJA_C1-32940 SJA_C1-32950     FALSE 0.076 172.000 0.000 NA   NA
 10213174 10213175 SJA_C1-32960 SJA_C1-32970   doc TRUE 0.886 10.000 0.074 NA   NA
 10213179 10213180 SJA_C1-33010 SJA_C1-33020     TRUE 0.669 71.000 0.162 1.000   NA
 10213180 10213181 SJA_C1-33020 SJA_C1-33030     FALSE 0.004 423.000 0.000 NA   NA
 10213181 10213182 SJA_C1-33030 SJA_C1-33040     TRUE 0.957 18.000 0.615 NA   NA
 10213186 10213187 SJA_C1-33080 SJA_C1-33090 modB modC TRUE 0.912 -10.000 0.041 1.000   NA
 10213188 10213189 SJA_C1-33100 SJA_C1-33110   lipB TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 10213189 10213190 SJA_C1-33110 SJA_C1-33120 lipB lipA TRUE 0.983 -7.000 0.315 0.002   NA
 10213190 10213191 SJA_C1-33120 SJA_C1-33130 lipA   FALSE 0.481 112.000 0.034 1.000   NA
 10213191 10213192 SJA_C1-33130 SJA_C1-33140   hit TRUE 0.543 31.000 0.016 1.000 N NA
 10213192 10213193 SJA_C1-33140 SJA_C1-33150 hit scoB FALSE 0.388 102.000 0.016 1.000 N NA
 10213193 10213194 SJA_C1-33150 SJA_C1-33160 scoB scoA TRUE 0.995 0.000 0.429 0.002 Y NA
 10213197 10213198 SJA_C1-33190 SJA_C1-33200 aroQ bccP TRUE 0.533 112.000 0.042 1.000 N NA
 10213198 10213199 SJA_C1-33200 SJA_C1-33210 bccP accC TRUE 0.964 14.000 0.153 0.001 Y NA
 10213199 10213200 SJA_C1-33210 SJA_C1-33220 accC arsC TRUE 0.952 -3.000 0.027 1.000 N NA
 10213200 10213201 SJA_C1-33220 SJA_C1-33230 arsC   FALSE 0.233 62.000 0.000 1.000 N NA
 10213201 10213202 SJA_C1-33230 SJA_C1-33240   dpo1 FALSE 0.014 520.000 0.000 1.000 Y NA
 10213203 10213204 SJA_C1-33250 SJA_C1-33260 manC   FALSE 0.194 100.000 0.000 NA   NA
 10213204 10213205 SJA_C1-33260 SJA_C1-33270     TRUE 0.922 5.000 0.086 NA   NA
 10213205 10213206 SJA_C1-33270 SJA_C1-33280     TRUE 0.674 5.000 0.000 NA   NA
 10213207 10213208 SJA_C1-33290 SJA_C1-33300 cysS   FALSE 0.018 265.000 0.000 NA   NA
 10213208 10213209 SJA_C1-33300 SJA_C1-33310   aroF FALSE 0.193 123.000 0.000 NA   NA
 10213209 10213210 SJA_C1-33310 SJA_C1-33320 aroF   FALSE 0.147 152.000 0.000 1.000 N NA
 10213211 10213212 SJA_C1-33330 SJA_C1-33340     FALSE 0.114 163.000 0.000 1.000 N NA
 10213213 10213214 SJA_C1-33350 SJA_C1-33360   recX FALSE 0.204 54.000 0.000 NA   NA
 10213214 10213215 SJA_C1-33360 SJA_C1-33370 recX   FALSE 0.263 63.000 0.007 NA   NA
 10213215 10213216 SJA_C1-33370 SJA_C1-33380     FALSE 0.484 50.000 0.036 NA   NA
 10213217 10213218 SJA_C1-33390 SJA_C1-33400 aat queA FALSE 0.194 139.000 0.000 1.000 N NA
 10213218 10213219 SJA_C1-33400 SJA_C1-33410 queA ppiB FALSE 0.034 279.000 0.012 1.000 N NA
 10213219 10213220 SJA_C1-33410 SJA_C1-33420 ppiB coaD FALSE 0.377 96.000 0.015 1.000 N NA
 10213220 10213221 SJA_C1-33420 SJA_C1-33430 coaD ispA TRUE 0.941 5.000 0.015 1.000 Y NA
 10213221 10213222 SJA_C1-33430 SJA_C1-33440 ispA   TRUE 0.729 27.000 0.062 1.000 N NA
 10213223 10213224 SJA_C1-33450 SJA_C1-33460   purL FALSE 0.006 352.000 0.000 NA   NA
 10213224 10213225 SJA_C1-33460 SJA_C1-33470 purL   FALSE 0.225 126.000 0.000 1.000 N NA
 10213226 10213227 SJA_C1-33480 SJA_C1-33490     TRUE 0.956 -3.000 0.043 NA   NA
 10213228 10213229 SJA_C1-33500 SJA_C1-33510 rpmJ   TRUE 0.915 4.000 0.062 1.000   NA
 10213231 10213232 SJA_C1-33530 SJA_C1-33540     FALSE 0.270 40.000 0.000 NA   NA
 10213232 10213233 SJA_C1-33540 SJA_C1-33550     FALSE 0.400 21.000 0.000 NA   NA
 10213233 10213234 SJA_C1-33550 SJA_C1-33560     FALSE 0.016 272.000 0.000 NA   NA
 10213234 10213235 SJA_C1-33560 SJA_C1-33570   ruvC FALSE 0.439 119.000 0.027 1.000   NA
 10213237 10213238 SJA_C1-33590 SJA_C1-33600     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213239 10213240 SJA_C1-33610 SJA_C1-33620     FALSE 0.209 58.000 0.000 1.000   NA
 10213240 10213241 SJA_C1-33620 SJA_C1-33630     TRUE 0.575 15.000 0.000 0.018   NA
 10213241 10213242 SJA_C1-33630 SJA_C1-33640   yagR FALSE 0.250 53.000 0.000 1.000 N NA
 10213242 10213243 SJA_C1-33640 SJA_C1-33650 yagR yagS TRUE 0.996 4.000 0.917 0.001 Y NA
 10213243 10213244 SJA_C1-33650 SJA_C1-33660 yagS yagT TRUE 0.998 -3.000 0.705 0.001 Y NA
 10213246 10213247 SJA_C1-33670 SJA_C1-33680   thiC TRUE 0.750 1.000 0.000 NA   NA
 10213247 10213248 SJA_C1-33680 SJA_C1-33690 thiC   TRUE 0.596 12.000 0.003 NA   NA
 10213250 10213251 SJA_C1-33710 SJA_C1-33720   acs FALSE 0.462 21.000 0.000 1.000 N NA
 10213251 10213252 SJA_C1-33720 SJA_C1-33730 acs   FALSE 0.172 131.000 0.000 NA   NA
 10213254 10213255 SJA_C1-33750 SJA_C1-33760     TRUE 0.703 78.000 0.182 1.000 N NA
 10213256 10213257 SJA_C1-33770 SJA_C1-33780     FALSE 0.399 158.000 0.074 1.000 N NA
 10213257 10213258 SJA_C1-33780 SJA_C1-33790   proA FALSE 0.018 286.000 0.000 1.000 N NA
 10213259 10213260 SJA_C1-33800 SJA_C1-33810     TRUE 0.970 -31.000 0.103 NA Y NA
 10213260 10213261 SJA_C1-33810 SJA_C1-33820   kdsA FALSE 0.065 191.000 0.000 NA N NA
 10213261 10213262 SJA_C1-33820 SJA_C1-33830 kdsA   TRUE 0.876 -3.000 0.004 NA   NA
 10213263 10213264 SJA_C1-33840 SJA_C1-33850     TRUE 0.974 -3.000 0.105 NA   NA
 10213265 10213266 SJA_C1-33860 SJA_C1-33870 ubiH ilvE FALSE 0.373 164.000 0.007 1.000 Y NA
 10213267 10213268 SJA_C1-33880 SJA_C1-33890 ltaA   TRUE 0.947 -3.000 0.027 1.000   NA
 10213269 10213270 SJA_C1-33900 SJA_C1-33910     FALSE 0.193 92.000 0.000 NA   NA
 10213270 10213271 SJA_C1-33910 SJA_C1-33920     TRUE 0.543 15.000 0.004 NA   NA
 10213271 10213272 SJA_C1-33920 SJA_C1-33930     TRUE 0.978 0.000 0.240 NA   NA
 10213272 10213273 SJA_C1-33930 SJA_C1-33940     TRUE 0.979 -7.000 0.309 NA   NA
 10213273 10213274 SJA_C1-33940 SJA_C1-33950   sufD TRUE 0.984 -3.000 0.193 1.000   NA
 10213274 10213275 SJA_C1-33950 SJA_C1-33960 sufD sufC TRUE 0.837 68.000 0.482 1.000   NA
 10213275 10213276 SJA_C1-33960 SJA_C1-33970 sufC   TRUE 0.725 4.000 0.003 NA   NA
 10213276 10213277 SJA_C1-33970 SJA_C1-33980     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213277 10213278 SJA_C1-33980 SJA_C1-33990   sufB FALSE 0.257 120.000 0.004 1.000   NA
 10213278 10213279 SJA_C1-33990 SJA_C1-34000 sufB   TRUE 0.971 -3.000 0.078 NA N NA
 10213279 10213280 SJA_C1-34000 SJA_C1-34010     TRUE 0.732 107.000 0.037 NA Y NA
 10213280 10213281 SJA_C1-34010 SJA_C1-34020     FALSE 0.008 329.000 0.000 NA   NA
 10213282 10213283 SJA_C1-34030 SJA_C1-34040 pyrD ggt FALSE 0.465 40.000 0.013 1.000 N NA
 10213284 10213285 SJA_C1-34050 SJA_C1-34060   sufE FALSE 0.299 65.000 0.011 NA   NA
 10213285 10213286 SJA_C1-34060 SJA_C1-34070 sufE   FALSE 0.440 130.000 0.042 NA   NA
 10213286 10213287 SJA_C1-34070 SJA_C1-34080     FALSE 0.331 29.000 0.000 NA   NA
 10213287 10213288 SJA_C1-34080 SJA_C1-34090     FALSE 0.308 32.000 0.000 NA   NA
 10213288 10213289 SJA_C1-34090 SJA_C1-34100   pspC FALSE 0.406 131.000 0.033 NA   NA
 10213289 10213290 SJA_C1-34100 SJA_C1-34110 pspC pspB TRUE 0.992 2.000 0.913 NA   NA
 10213290 10213291 SJA_C1-34110 SJA_C1-34120 pspB pspA TRUE 0.943 4.000 0.120 NA   NA
 10213291 10213292 SJA_C1-34120 SJA_C1-34130 pspA   TRUE 0.784 39.000 0.182 NA   NA
 10213295 10213296 SJA_C1-34160 SJA_C1-34170   tolQ TRUE 0.994 -3.000 0.593 1.000   NA
 10213296 10213297 SJA_C1-34170 SJA_C1-34180 tolQ tolR TRUE 0.788 119.000 0.059 0.038 Y NA
 10213297 10213298 SJA_C1-34180 SJA_C1-34190 tolR tolA FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 10213298 10213299 SJA_C1-34190 SJA_C1-34200 tolA tolB FALSE 0.060 186.000 0.000 NA   NA
 10213299 10213300 SJA_C1-34200 SJA_C1-34210 tolB pal TRUE 0.872 72.000 0.592 1.000 N NA
 10213301 10213302 SJA_C1-34220 SJA_C1-34230     TRUE 0.863 128.000 0.500 0.075 N NA
 10213302 10213303 SJA_C1-34230 SJA_C1-34240     TRUE 0.982 -3.000 0.182 NA   NA
 10213303 10213304 SJA_C1-34240 SJA_C1-34250   fusB TRUE 0.991 -3.000 0.391 NA   NA
 10213304 10213305 SJA_C1-34250 SJA_C1-34260 fusB tnp FALSE 0.197 58.000 0.000 NA   NA
 10213305 10213306 SJA_C1-34260 SJA_C1-34270 tnp   FALSE 0.019 286.000 0.000 0.051   NA
 10213307 10213308 SJA_C1-34280 SJA_C1-34290     FALSE 0.116 153.000 0.000 NA   NA
 10213309 10213310 SJA_C1-34300 SJA_C1-34310     FALSE 0.203 105.000 0.000 NA   NA
 10213310 10213311 SJA_C1-34310 SJA_C1-34320   dinJ TRUE 0.650 62.000 0.139 NA   NA
 10213313 10213314 SJA_C1-34340 SJA_C1-34350   tnp FALSE 0.260 42.000 0.000 NA   NA
 10213314 10213315 SJA_C1-34350 SJA_C1-34360 tnp   FALSE 0.357 33.000 0.000 1.000 N NA
 10213315 10213316 SJA_C1-34360 SJA_C1-34370     FALSE 0.521 130.000 0.074 NA   NA
 10213316 10213317 SJA_C1-34370 SJA_C1-34380   pqqL TRUE 0.835 24.000 0.160 NA   NA
 10213318 10213319 SJA_C1-34390 SJA_C1-34400   clpB FALSE 0.048 209.000 0.003 1.000   NA
 10213320 10213321 SJA_C1-34410 SJA_C1-34420     TRUE 0.817 84.000 0.400 1.000   NA
 10213323 10213324 SJA_C1-34440 SJA_C1-34450     TRUE 0.774 16.000 0.049 NA   NA
 10213324 10213325 SJA_C1-34450 SJA_C1-34460   xseA FALSE 0.484 32.000 0.015 NA   NA
 10213326 10213327 SJA_C1-34470 SJA_C1-34480 purD   FALSE 0.255 65.000 0.006 1.000   NA
 10213331 10213332 SJA_C1-34520 SJA_C1-34530 rpmI rplT TRUE 0.991 15.000 0.928 0.010 Y NA
 10213332 10213333 SJA_C1-34530 SJA_C1-34540 rplT   FALSE 0.066 196.000 0.002 1.000 N NA
 10213333 10213334 SJA_C1-34540 SJA_C1-34550     FALSE 0.236 60.000 0.000 1.000 N NA
 10213334 10213335 SJA_C1-34550 SJA_C1-34560   pheS FALSE 0.268 48.000 0.000 1.000 N NA
 10213335 10213336 SJA_C1-34560 SJA_C1-34570 pheS pheT TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.000 Y NA
 10213336 10213337 SJA_C1-34570 SJA_C1-34580 pheT   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213339 10213340 SJA_C1-34600 SJA_C1-34610   prfC FALSE 0.275 62.000 0.005 1.000 N NA
 10213340 10213341 SJA_C1-34610 SJA_C1-34620 prfC   FALSE 0.412 20.000 0.000 NA   NA
 10213344 10213345 SJA_C1-34640 SJA_C1-34650 dinB dinB FALSE 0.031 258.000 0.000 0.003   NA
 10213345 10213346 SJA_C1-34650 SJA_C1-34660 dinB   FALSE 0.188 85.000 0.000 NA   NA
 10213346 10213347 SJA_C1-34660 SJA_C1-34670     TRUE 0.967 -3.000 0.071 NA   NA
 10213349 10213350 SJA_C1-34690 SJA_C1-34700     TRUE 0.972 -3.000 0.077 1.000 N NA
 10213350 10213351 SJA_C1-34700 SJA_C1-34710     TRUE 0.978 -3.000 0.128 1.000   NA
 10213351 10213352 SJA_C1-34710 SJA_C1-34720     TRUE 0.755 -9.000 0.000 1.000   NA
 10213352 10213353 SJA_C1-34720 SJA_C1-34730     TRUE 0.752 2.000 0.000 1.000   NA
 10213353 10213354 SJA_C1-34730 SJA_C1-34740     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213354 10213355 SJA_C1-34740 SJA_C1-34750     FALSE 0.166 135.000 0.000 NA   NA
 10213355 10213356 SJA_C1-34750 SJA_C1-34760     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10213356 10213357 SJA_C1-34760 SJA_C1-34770     FALSE 0.040 212.000 0.000 1.000   NA
 10213357 10213358 SJA_C1-34770 SJA_C1-34780     FALSE 0.468 17.000 0.000 1.000   NA
 10213358 10213359 SJA_C1-34780 SJA_C1-34790     TRUE 0.789 19.000 0.000 1.000 Y NA
 10213360 10213361 SJA_C1-34800 SJA_C1-34810     TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10213361 10213362 SJA_C1-34810 SJA_C1-34820     TRUE 0.927 -37.000 0.100 1.000 N NA
 10213362 10213363 SJA_C1-34820 SJA_C1-34830     TRUE 0.969 4.000 0.286 NA   NA
 10213363 10213364 SJA_C1-34830 SJA_C1-34840     FALSE 0.007 345.000 0.000 NA   NA
 10213364 10213365 SJA_C1-34840 SJA_C1-34850     FALSE 0.356 28.000 0.000 1.000   NA
 10213366 10213367 SJA_C1-34860 SJA_C1-34870     FALSE 0.192 128.000 0.000 1.000   NA
 10213367 10213368 SJA_C1-34870 SJA_C1-34880     TRUE 0.848 0.000 0.000 0.007   NA
 10213368 10213369 SJA_C1-34880 SJA_C1-34890     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213369 10213370 SJA_C1-34890 SJA_C1-34900     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10213370 10213371 SJA_C1-34900 SJA_C1-34910     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213374 10213375 SJA_C1-34940 SJA_C1-34950 exoP   FALSE 0.236 60.000 0.000 1.000 N NA
 10213377 10213378 SJA_C1-34970 SJA_C1-34980     TRUE 0.891 21.000 0.250 NA   NA
 10213379 10213380 SJA_C1-34990 SJA_C1-35000   maeB FALSE 0.389 22.000 0.000 NA   NA
 10213381 10213382 SJA_C1-35010 SJA_C1-35020 mutS glnD TRUE 0.823 10.000 0.021 1.000 N NA
 10213382 10213383 SJA_C1-35020 SJA_C1-35030 glnD   FALSE 0.054 200.000 0.000 NA N NA
 10213383 10213384 SJA_C1-35030 SJA_C1-35040     TRUE 0.970 -31.000 0.103 NA Y NA
 10213385 10213386 SJA_C1-35050 SJA_C1-35060   ribA TRUE 0.976 -3.000 0.116 NA   NA
 10213386 10213387 SJA_C1-35060 SJA_C1-35070 ribA xthA TRUE 0.946 0.000 0.055 1.000 N NA
 10213389 10213390 SJA_C1-35090 SJA_C1-35100 lolA   FALSE 0.125 150.000 0.000 NA   NA
 10213390 10213391 SJA_C1-35100 SJA_C1-35110   moeB TRUE 0.823 -12.000 0.010 NA   NA
 10213391 10213392 SJA_C1-35110 SJA_C1-35120 moeB dut TRUE 0.915 -3.000 0.007 1.000 N NA
 10213392 10213393 SJA_C1-35120 SJA_C1-35130 dut   TRUE 0.959 -25.000 0.201 1.000 N NA
 10213394 10213395 SJA_C1-35140 SJA_C1-35150     TRUE 0.972 5.000 0.354 NA   NA
 10213396 10213397 SJA_C1-35160 SJA_C1-35170     FALSE 0.198 103.000 0.000 NA   NA
 10213397 10213398 SJA_C1-35170 SJA_C1-35180     TRUE 0.596 62.000 0.100 NA   NA
 10213398 10213399 SJA_C1-35180 SJA_C1-35190   ftsK FALSE 0.006 401.000 0.000 1.000 N NA
 10213399 10213400 SJA_C1-35190 SJA_C1-35200 ftsK speG FALSE 0.042 222.000 0.000 1.000 N NA
 10213400 10213401 SJA_C1-35200 SJA_C1-35210 speG   TRUE 0.855 11.000 0.050 1.000   NA
 10213401 10213402 SJA_C1-35210 SJA_C1-35220   gcpE TRUE 0.534 17.000 0.005 1.000   NA
 10213402 10213403 SJA_C1-35220 SJA_C1-35230 gcpE fadL FALSE 0.272 179.000 0.002 1.000 Y NA
 10213403 10213404 SJA_C1-35230 SJA_C1-35240 fadL manB FALSE 0.006 398.000 0.000 1.000 N NA
 10213404 10213405 SJA_C1-35240 SJA_C1-35250 manB dnaJ TRUE 0.521 20.000 0.007 1.000   NA
 10213405 10213406 SJA_C1-35250 SJA_C1-35260 dnaJ   TRUE 0.916 0.000 0.027 NA   NA
 10213408 10213409 SJA_C1-35280 SJA_C1-35290   hemE TRUE 0.906 3.000 0.044 NA   NA
 10213649 10213650 SJA_C2-00080 SJA_C2-00090     FALSE 0.033 224.000 0.000 NA   NA
 10213651 10213652 SJA_C2-00100 SJA_C2-00110     FALSE 0.209 116.000 0.000 NA   NA
 10213652 10213653 SJA_C2-00110 SJA_C2-00120     FALSE 0.232 49.000 0.000 1.000   NA
 10213654 10213655 SJA_C2-00130 SJA_C2-00140     FALSE 0.369 24.000 0.000 NA   NA
 10213656 10213657 SJA_C2-00150 SJA_C2-00160     FALSE 0.052 193.000 0.000 NA   NA
 10213657 10213658 SJA_C2-00160 SJA_C2-00170     FALSE 0.204 95.000 0.000 1.000   NA
 10213659 10213660 SJA_C2-00180 SJA_C2-00190     TRUE 0.893 -3.000 0.000 0.040   NA
 10213661 10213662 SJA_C2-00200 SJA_C2-00210     FALSE 0.209 116.000 0.000 NA   NA
 10213663 10213664 SJA_C2-00220 SJA_C2-00230   rfbD FALSE 0.043 235.000 0.000 0.003   NA
 10213666 10213667 SJA_C2-00250 SJA_C2-00260     FALSE 0.209 116.000 0.000 NA   NA
 10213667 10213668 SJA_C2-00260 SJA_C2-00270     TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10213668 10213669 SJA_C2-00270 SJA_C2-00280     FALSE 0.181 74.000 0.000 NA   NA
 10213669 10213670 SJA_C2-00280 SJA_C2-00290     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10213670 10213671 SJA_C2-00290 SJA_C2-00300   tadD TRUE 0.993 2.000 1.000 NA   NA
 10213671 10213672 SJA_C2-00300 SJA_C2-00310 tadD tadC TRUE 0.985 -3.000 0.045 NA Y NA
 10213672 10213673 SJA_C2-00310 SJA_C2-00320 tadC tadB TRUE 0.997 0.000 0.844 NA Y NA
 10213673 10213674 SJA_C2-00320 SJA_C2-00330 tadB cpaF TRUE 0.997 -6.000 0.822 NA Y NA
 10213674 10213675 SJA_C2-00330 SJA_C2-00340 cpaF cpaE TRUE 0.998 -3.000 0.732 1.000 Y NA
 10213675 10213676 SJA_C2-00340 SJA_C2-00350 cpaE cpaC TRUE 0.989 3.000 0.696 1.000   NA
 10213676 10213677 SJA_C2-00350 SJA_C2-00360 cpaC cpaB TRUE 0.646 36.000 0.064 NA   NA
 10213677 10213678 SJA_C2-00360 SJA_C2-00370 cpaB   FALSE 0.012 304.000 0.000 NA N NA
 10213678 10213679 SJA_C2-00370 SJA_C2-00380     TRUE 0.726 38.000 0.010 1.000 Y NA
 10213679 10213680 SJA_C2-00380 SJA_C2-00390     FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10213680 10213681 SJA_C2-00390 SJA_C2-00400   aas FALSE 0.275 39.000 0.000 NA   NA
 10213681 10213682 SJA_C2-00400 SJA_C2-00410 aas   FALSE 0.361 25.000 0.000 NA   NA
 10213683 10213684 SJA_C2-00420 SJA_C2-00430     FALSE 0.217 54.000 0.000 1.000   NA
 10213684 10213685 SJA_C2-00430 SJA_C2-00440     FALSE 0.275 39.000 0.000 NA   NA
 10213685 10213686 SJA_C2-00440 SJA_C2-00450     TRUE 0.986 3.000 0.565 NA   NA
 10213687 10213688 SJA_C2-00460 SJA_C2-00470     TRUE 0.993 13.000 1.000 0.017 Y NA
 10213688 10213689 SJA_C2-00470 SJA_C2-00480   uspA TRUE 0.894 21.000 0.250 1.000   NA
 10213690 10213691 SJA_C2-00490 SJA_C2-00500     FALSE 0.038 211.000 0.000 NA   NA
 10213691 10213692 SJA_C2-00500 SJA_C2-00510     TRUE 0.973 0.000 0.182 NA   NA
 10213693 10213694 SJA_C2-00520 SJA_C2-00530     TRUE 0.960 -16.000 0.215 NA   NA
 10213694 10213695 SJA_C2-00530 SJA_C2-00540   mmsA FALSE 0.202 55.000 0.000 NA   NA
 10213696 10213697 SJA_C2-00550 SJA_C2-00560     FALSE 0.253 108.000 0.000 1.000 N NA
 10213698 10213699 SJA_C2-00570 SJA_C2-00580   cysC TRUE 0.948 18.000 0.169 1.000 Y NA
 10213699 10213700 SJA_C2-00580 SJA_C2-00590 cysC cysD TRUE 0.855 104.000 0.390 0.000 N NA
 10213702 10213703 SJA_C2-00610 SJA_C2-00620   hemN TRUE 0.732 -10.000 0.000 NA   NA
 10213703 10213704 SJA_C2-00620 SJA_C2-00630 hemN   FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 10213705 10213706 SJA_C2-00640 SJA_C2-00650   ompW FALSE 0.018 286.000 0.000 1.000 N NA
 10213706 10213707 SJA_C2-00650 SJA_C2-00660 ompW crp FALSE 0.041 225.000 0.000 1.000 N NA
 10213707 10213708 SJA_C2-00660 SJA_C2-00670 crp ccoN FALSE 0.037 235.000 0.000 1.000 N NA
 10213708 10213709 SJA_C2-00670 SJA_C2-00680 ccoN ccoO TRUE 0.972 15.000 0.625 0.003 N NA
 10213709 10213710 SJA_C2-00680 SJA_C2-00690 ccoO ccoQ TRUE 0.990 -3.000 0.312 0.003   NA
 10213710 10213711 SJA_C2-00690 SJA_C2-00700 ccoQ ccoP TRUE 0.978 -7.000 0.232 0.003   NA
 10213711 10213712 SJA_C2-00700 SJA_C2-00710 ccoP fixG TRUE 0.776 154.000 0.203 1.000 Y NA
 10213712 10213713 SJA_C2-00710 SJA_C2-00720 fixG fixH TRUE 0.984 4.000 0.506 NA N NA
 10213713 10213714 SJA_C2-00720 SJA_C2-00730 fixH fixI TRUE 0.990 0.000 0.206 NA Y NA
 10213714 10213715 SJA_C2-00730 SJA_C2-00740 fixI fixS TRUE 0.998 -3.000 0.713 NA Y NA
 10213715 10213716 SJA_C2-00740 SJA_C2-00750 fixS putA FALSE 0.200 131.000 0.000 NA N NA
 10213718 10213719 SJA_C2-00770 SJA_C2-00780     TRUE 0.995 -3.000 0.626 1.000 N NA
 10213720 10213721 SJA_C2-00790 SJA_C2-00800     TRUE 0.990 -3.000 0.375 NA   NA
 10213721 10213722 SJA_C2-00800 SJA_C2-00810     TRUE 0.980 -12.000 0.400 NA   NA
 10213722 10213723 SJA_C2-00810 SJA_C2-00820     FALSE 0.114 173.000 0.000 0.074 N NA
 10213723 10213724 SJA_C2-00820 SJA_C2-00830   kaiC TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.059 Y NA
 10213724 10213725 SJA_C2-00830 SJA_C2-00840 kaiC   FALSE 0.205 106.000 0.000 NA   NA
 10213725 10213726 SJA_C2-00840 SJA_C2-00850   crp FALSE 0.199 57.000 0.000 NA   NA
 10213727 10213728 SJA_C2-00860 SJA_C2-00870     FALSE 0.225 114.000 0.000 1.000   NA
 10213728 10213729 SJA_C2-00870 SJA_C2-00880     FALSE 0.218 106.000 0.000 1.000   NA
 10213729 10213730 SJA_C2-00880 SJA_C2-00890     FALSE 0.048 212.000 0.000 1.000 N NA
 10213730 10213731 SJA_C2-00890 SJA_C2-00900     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 10213731 10213732 SJA_C2-00900 SJA_C2-00910     FALSE 0.307 40.000 0.000 NA N NA
 10213732 10213733 SJA_C2-00910 SJA_C2-00920   adh TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10213733 10213734 SJA_C2-00920 SJA_C2-00930 adh gabD TRUE 0.970 21.000 0.381 0.055 Y NA
 10213734 10213735 SJA_C2-00930 SJA_C2-00940 gabD   FALSE 0.311 42.000 0.000 1.000 N NA
 10213735 10213736 SJA_C2-00940 SJA_C2-00950     TRUE 0.919 17.000 0.286 1.000   NA
 10213737 10213738 SJA_C2-00960 SJA_C2-00970     TRUE 0.977 -3.000 0.091 0.055 N NA
 10213739 10213740 SJA_C2-00980 SJA_C2-00990 gcd   TRUE 0.685 10.000 0.000 0.040   NA
 10213741 10213742 SJA_C2-01000 SJA_C2-01010     FALSE 0.197 58.000 0.000 NA   NA
 10213745 10213746 SJA_C2-01040 SJA_C2-01050     FALSE 0.204 119.000 0.000 NA   NA
 10213746 10213747 SJA_C2-01050 SJA_C2-01060     FALSE 0.010 331.000 0.000 0.074   NA
 10213747 10213748 SJA_C2-01060 SJA_C2-01070     FALSE 0.128 149.000 0.000 NA   NA
 10213750 10213751 SJA_C2-r0010 SJA_C2-t0010     FALSE 0.072 175.000 0.000 NA   NA
 10213751 10213752 SJA_C2-t0010 SJA_C2-t0020     TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10213752 10213753 SJA_C2-t0020 SJA_C2-r0020     FALSE 0.008 330.000 0.000 NA   NA
 10213753 10213754 SJA_C2-r0020 SJA_C2-r0030     FALSE 0.146 143.000 0.000 NA   NA
 10213755 10213756 SJA_C2-01090 SJA_C2-01100     TRUE 0.981 3.000 0.429 NA   NA
 10213756 10213757 SJA_C2-01100 SJA_C2-01110     FALSE 0.060 186.000 0.000 NA   NA
 10213760 10213761 SJA_C2-01140 SJA_C2-01150   estC FALSE 0.188 85.000 0.000 NA   NA
 10213764 10213765 SJA_C2-01180 SJA_C2-01190     FALSE 0.005 419.000 0.000 1.000 N NA
 10213765 10213766 SJA_C2-01190 SJA_C2-01200   metF FALSE 0.020 275.000 0.000 1.000 N NA
 10213766 10213767 SJA_C2-01200 SJA_C2-01210 metF   TRUE 0.539 66.000 0.000 1.000 Y NA
 10213767 10213768 SJA_C2-01210 SJA_C2-01220     FALSE 0.010 310.000 0.000 NA   NA
 10213769 10213770 SJA_C2-01230 SJA_C2-01240     TRUE 0.958 12.000 0.391 NA   NA
 10213770 10213771 SJA_C2-01240 SJA_C2-01250     TRUE 0.995 -27.000 0.893 1.000 Y NA
 10213773 10213774 SJA_C2-01270 SJA_C2-01280     FALSE 0.024 251.000 0.000 1.000   NA
 10213774 10213775 SJA_C2-01280 SJA_C2-01290     TRUE 0.955 32.000 1.000 NA   NA
 10213776 10213777 SJA_C2-01300 SJA_C2-01310     FALSE 0.354 155.000 0.059 1.000   NA
 10213777 10213778 SJA_C2-01310 SJA_C2-01320     FALSE 0.070 176.000 0.000 NA   NA
 10213779 10213780 SJA_C2-01330 SJA_C2-01340     TRUE 0.970 37.000 0.719 NA Y NA
 10213780 10213781 SJA_C2-01340 SJA_C2-01350     TRUE 0.998 -3.000 0.797 1.000 Y NA
 10213781 10213782 SJA_C2-01350 SJA_C2-01360   nikR TRUE 0.874 -7.000 0.010 1.000 N NA
 10213782 10213783 SJA_C2-01360 SJA_C2-01370 nikR   TRUE 0.958 -3.000 0.046 NA   NA
 10213783 10213784 SJA_C2-01370 SJA_C2-01380     TRUE 0.923 109.000 0.931 NA   NA
 10213784 10213785 SJA_C2-01380 SJA_C2-01390     TRUE 0.996 -3.000 0.835 NA   NA
 10213785 10213786 SJA_C2-01390 SJA_C2-01400     TRUE 0.994 -3.000 0.437 0.000 N NA
 10213786 10213787 SJA_C2-01400 SJA_C2-01410     TRUE 0.754 3.000 0.000 NA N NA
 10213788 10213789 SJA_C2-01420 SJA_C2-01430     TRUE 0.923 120.000 1.000 NA   NA
 10213789 10213790 SJA_C2-01430 SJA_C2-01440     FALSE 0.260 42.000 0.000 NA   NA
 10213790 10213791 SJA_C2-01440 SJA_C2-01450     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213791 10213792 SJA_C2-01450 SJA_C2-01460     TRUE 0.894 91.000 0.667 1.000 N NA
 10213793 10213794 SJA_C2-01470 SJA_C2-01480     TRUE 0.994 -3.000 0.545 NA   NA
 10213795 10213796 SJA_C2-01490 SJA_C2-01500     TRUE 0.865 20.000 0.154 NA N NA
 10213796 10213797 SJA_C2-01500 SJA_C2-01510     FALSE 0.099 166.000 0.000 NA N NA
 10213797 10213798 SJA_C2-01510 SJA_C2-01520     TRUE 0.919 9.000 0.080 0.031 N NA
 10213798 10213799 SJA_C2-01520 SJA_C2-01530     TRUE 0.831 154.000 0.720 1.000 N NA
 10213799 10213800 SJA_C2-01530 SJA_C2-01540     TRUE 0.903 4.000 0.050 NA   NA
 10213800 10213801 SJA_C2-01540 SJA_C2-01550     FALSE 0.007 346.000 0.000 NA   NA
 10213804 10213805 SJA_C2-01580 SJA_C2-01590 hmgA hmgB TRUE 0.993 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 10213805 10213806 SJA_C2-01590 SJA_C2-01600 hmgB hmgC TRUE 0.933 -30.000 0.077 0.001 N NA
 10213806 10213807 SJA_C2-01600 SJA_C2-01610 hmgC   FALSE 0.229 84.000 0.000 1.000 N NA
 10213807 10213808 SJA_C2-01610 SJA_C2-01620     TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.001 Y NA
 10213808 10213809 SJA_C2-01620 SJA_C2-01630     TRUE 0.993 -3.000 0.466 0.001   NA
 10213809 10213810 SJA_C2-01630 SJA_C2-01640     TRUE 0.941 11.000 0.175 0.001   NA
 10213810 10213811 SJA_C2-01640 SJA_C2-01650   fdhD TRUE 0.993 -3.000 0.458 0.001   NA
 10213812 10213813 SJA_C2-01660 SJA_C2-01670 pntB pntA TRUE 0.981 2.000 0.321 0.001   NA
 10213813 10213814 SJA_C2-01670 SJA_C2-01680 pntA   TRUE 0.997 -3.000 0.829 0.001   NA
 10213815 10213816 SJA_C2-01690 SJA_C2-01700     TRUE 0.581 89.000 0.000 0.042 Y NA
 10213818 10213819 SJA_C2-01720 SJA_C2-01730     TRUE 0.877 11.000 0.000 1.000 Y NA
 10213821 10213822 SJA_C2-01750 SJA_C2-01760     FALSE 0.338 28.000 0.000 NA   NA
 10213822 10213823 SJA_C2-01760 SJA_C2-01770     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10213824 10213825 SJA_C2-01780 SJA_C2-01790 ggt   TRUE 0.617 75.000 0.118 1.000   NA
 10213826 10213827 SJA_C2-01800 SJA_C2-01810 ggt   TRUE 0.889 13.000 0.100 1.000 N NA
 10213827 10213828 SJA_C2-01810 SJA_C2-01820   tdcF FALSE 0.053 201.000 0.000 NA N NA
 10213828 10213829 SJA_C2-01820 SJA_C2-01830 tdcF   TRUE 0.670 31.000 0.050 NA N NA
 10213829 10213830 SJA_C2-01830 SJA_C2-01840     TRUE 0.996 -3.000 0.667 0.040 N NA
 10213830 10213831 SJA_C2-01840 SJA_C2-01850     FALSE 0.140 154.000 0.000 1.000 N NA
 10213831 10213832 SJA_C2-01850 SJA_C2-01860     TRUE 0.692 22.000 0.035 1.000   NA
 10213832 10213833 SJA_C2-01860 SJA_C2-01870     TRUE 0.737 2.000 0.000 NA   NA
 10213834 10213835 SJA_C2-01880 SJA_C2-01890     TRUE 0.522 20.000 0.000 0.002   NA
 10213835 10213836 SJA_C2-01890 SJA_C2-01900   gumE TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213836 10213837 SJA_C2-01900 SJA_C2-01910 gumE gumK FALSE 0.352 26.000 0.000 NA   NA
 10213837 10213838 SJA_C2-01910 SJA_C2-01920 gumK   TRUE 0.957 -3.000 0.045 NA   NA
 10213840 10213841 SJA_C2-01940 SJA_C2-01950     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213841 10213842 SJA_C2-01950 SJA_C2-01960   gumH TRUE 0.707 29.000 0.000 NA Y NA
 10213842 10213843 SJA_C2-01960 SJA_C2-01970 gumH   FALSE 0.422 23.000 0.000 NA N NA
 10213843 10213844 SJA_C2-01970 SJA_C2-01980   gumC TRUE 0.773 -9.000 0.000 NA N NA
 10213844 10213845 SJA_C2-01980 SJA_C2-01990 gumC gelJ FALSE 0.332 31.000 0.000 1.000   NA
 10213845 10213846 SJA_C2-01990 SJA_C2-02000 gelJ gelD FALSE 0.397 23.000 0.000 1.000   NA
 10213846 10213847 SJA_C2-02000 SJA_C2-02010 gelD gelF TRUE 0.658 11.000 0.000 0.073   NA
 10213847 10213848 SJA_C2-02010 SJA_C2-02020 gelF   TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213850 10213851 SJA_C2-02040 SJA_C2-02050     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10213851 10213852 SJA_C2-02050 SJA_C2-02060     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 10213853 10213854 SJA_C2-02070 SJA_C2-02080 dpm1   TRUE 0.919 4.000 0.000 NA Y NA
 10213854 10213855 SJA_C2-02080 SJA_C2-02090     TRUE 0.793 -7.000 0.000 NA N NA
 10213855 10213856 SJA_C2-02090 SJA_C2-02100     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10213856 10213857 SJA_C2-02100 SJA_C2-02110     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213857 10213858 SJA_C2-02110 SJA_C2-02120     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213858 10213859 SJA_C2-02120 SJA_C2-02130     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10213859 10213860 SJA_C2-02130 SJA_C2-02140     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10213860 10213861 SJA_C2-02140 SJA_C2-02150     TRUE 0.691 5.000 0.000 1.000   NA
 10213861 10213862 SJA_C2-02150 SJA_C2-02160   maa TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213862 10213863 SJA_C2-02160 SJA_C2-02170 maa   TRUE 0.603 11.000 0.000 1.000   NA
 10213863 10213864 SJA_C2-02170 SJA_C2-02180     FALSE 0.026 263.000 0.000 0.073   NA
 10213864 10213865 SJA_C2-02180 SJA_C2-02190     TRUE 0.858 14.000 0.000 0.017 Y NA
 10213866 10213867 SJA_C2-02200 SJA_C2-02210     FALSE 0.003 477.000 0.000 NA   NA
 10213868 10213869 SJA_C2-02220 SJA_C2-02230     FALSE 0.182 127.000 0.000 NA   NA
 10213870 10213871 SJA_C2-02240 SJA_C2-02250   abfA FALSE 0.411 26.000 0.000 1.000 N NA
 10213871 10213872 SJA_C2-02250 SJA_C2-02260 abfA   TRUE 0.653 40.000 0.000 1.000 Y NA
 10213872 10213873 SJA_C2-02260 SJA_C2-02270   xynB FALSE 0.271 102.000 0.000 0.004   NA
 10213873 10213874 SJA_C2-02270 SJA_C2-02280 xynB   FALSE 0.212 113.000 0.000 NA   NA
 10213874 10213875 SJA_C2-02280 SJA_C2-02290     TRUE 0.961 21.000 0.750 NA   NA
 10213876 10213877 SJA_C2-02300 SJA_C2-02310     TRUE 0.990 3.000 0.800 NA   NA
 10213877 10213878 SJA_C2-02310 SJA_C2-02320     TRUE 0.704 163.000 0.500 NA   NA
 10213879 10213880 SJA_C2-02330 SJA_C2-02340 galA   TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213880 10213881 SJA_C2-02340 SJA_C2-02350   xynB TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213881 10213882 SJA_C2-02350 SJA_C2-02360 xynB xynB TRUE 0.979 12.000 0.250 0.001 Y NA
 10213882 10213883 SJA_C2-02360 SJA_C2-02370 xynB pnbA FALSE 0.231 86.000 0.000 1.000 N NA
 10213883 10213884 SJA_C2-02370 SJA_C2-02380 pnbA xynB FALSE 0.175 144.000 0.000 1.000 N NA
 10213884 10213885 SJA_C2-02380 SJA_C2-02390 xynB exuT TRUE 0.993 -3.000 0.171 1.000 Y NA
 10213887 10213888 SJA_C2-02410 SJA_C2-02420     FALSE 0.052 197.000 0.000 1.000   NA
 10213890 10213891 SJA_C2-02440 SJA_C2-02450     FALSE 0.021 254.000 0.000 NA   NA
 10213891 10213892 SJA_C2-02450 SJA_C2-02460     FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10213892 10213893 SJA_C2-02460 SJA_C2-02470     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 10213894 10213895 SJA_C2-02480 SJA_C2-02490   bglX FALSE 0.038 233.000 0.000 1.000 N NA
 10213895 10213896 SJA_C2-02490 SJA_C2-02500 bglX   FALSE 0.470 150.000 0.000 0.001 Y NA
 10213896 10213897 SJA_C2-02500 SJA_C2-02510     FALSE 0.192 95.000 0.000 NA   NA
 10213898 10213899 SJA_C2-02520 SJA_C2-02530     TRUE 0.732 -10.000 0.000 NA   NA
 10213902 10213903 SJA_C2-r0040 SJA_C2-t0030     FALSE 0.017 270.000 0.000 NA   NA
 10213903 10213904 SJA_C2-t0030 SJA_C2-t0040     TRUE 0.604 10.000 0.000 NA   NA
 10213904 10213905 SJA_C2-t0040 SJA_C2-r0050     FALSE 0.004 406.000 0.000 NA   NA
 10213905 10213906 SJA_C2-r0050 SJA_C2-r0060     FALSE 0.137 146.000 0.000 NA   NA
 10213906 10213907 SJA_C2-r0060 SJA_C2-02560     FALSE 0.308 32.000 0.000 NA   NA
 10213907 10213908 SJA_C2-02560 SJA_C2-02570   kup FALSE 0.076 172.000 0.000 NA   NA
 10213908 10213909 SJA_C2-02570 SJA_C2-02580 kup   FALSE 0.015 298.000 0.000 1.000 N NA
 10213909 10213910 SJA_C2-02580 SJA_C2-02590     TRUE 0.979 -3.000 0.120 1.000 N NA
 10213911 10213912 SJA_C2-02600 SJA_C2-02610   oprN FALSE 0.225 70.000 0.000 1.000 N NA
 10213912 10213913 SJA_C2-02610 SJA_C2-02620 oprN   TRUE 0.976 11.000 0.520 0.037   NA
 10213913 10213914 SJA_C2-02620 SJA_C2-02630     TRUE 0.996 -3.000 0.880 1.000   NA
 10213915 10213916 SJA_C2-02640 SJA_C2-02650     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10213920 10213921 SJA_C2-02690 SJA_C2-02700   trxB TRUE 0.691 5.000 0.000 1.000   NA
 10213921 10213922 SJA_C2-02700 SJA_C2-02710 trxB   FALSE 0.191 62.000 0.000 NA   NA
 10213922 10213923 SJA_C2-02710 SJA_C2-02720     FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 10213923 10213924 SJA_C2-02720 SJA_C2-02730     FALSE 0.033 222.000 0.000 NA   NA
 10213924 10213925 SJA_C2-02730 SJA_C2-02740     FALSE 0.006 423.000 0.000 0.011   NA
 10213926 10213927 SJA_C2-02750 SJA_C2-02760     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 10213929 10213930 SJA_C2-02780 SJA_C2-02790     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10213930 10213931 SJA_C2-02790 SJA_C2-02800     FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 10213931 10213932 SJA_C2-02800 SJA_C2-02810   cbr TRUE 0.991 -3.000 0.100 0.036 Y NA
 10213932 10213933 SJA_C2-02810 SJA_C2-02820 cbr   TRUE 0.690 30.000 0.067 NA   NA
 10213933 10213934 SJA_C2-02820 SJA_C2-02830   acd TRUE 0.987 -3.000 0.286 NA   NA
 10213936 10213937 SJA_C2-02850 SJA_C2-02860     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213937 10213938 SJA_C2-02860 SJA_C2-02870     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10213938 10213939 SJA_C2-02870 SJA_C2-02880   adh FALSE 0.197 69.000 0.000 1.000   NA
 10213941 10213942 SJA_C2-02900 SJA_C2-02910     TRUE 0.860 46.000 0.429 NA   NA
 10213942 10213943 SJA_C2-02910 SJA_C2-02920     TRUE 0.979 8.000 0.571 NA   NA
 10213943 10213944 SJA_C2-02920 SJA_C2-02930     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10213946 10213947 SJA_C2-02950 SJA_C2-02960     TRUE 0.903 114.000 0.700 NA   NA
 10213947 10213948 SJA_C2-02960 SJA_C2-02970     TRUE 0.985 4.000 0.600 NA   NA
 10213948 10213949 SJA_C2-02970 SJA_C2-02980     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213949 10213950 SJA_C2-02980 SJA_C2-02990     FALSE 0.210 109.000 0.000 NA   NA
 10213950 10213951 SJA_C2-02990 SJA_C2-03000     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 10213951 10213952 SJA_C2-03000 SJA_C2-03010     TRUE 0.681 155.000 0.375 NA   NA
 10213952 10213953 SJA_C2-03010 SJA_C2-03020     TRUE 0.989 -13.000 0.727 NA   NA
 10213953 10213954 SJA_C2-03020 SJA_C2-03030     TRUE 0.949 6.000 0.182 1.000   NA
 10213955 10213956 SJA_C2-03040 SJA_C2-03050   nixA FALSE 0.003 538.000 0.000 NA   NA
 10213956 10213957 SJA_C2-03050 SJA_C2-03060 nixA cobW TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213957 10213958 SJA_C2-03060 SJA_C2-03070 cobW cobN TRUE 0.980 0.000 0.274 1.000   NA
 10213958 10213959 SJA_C2-03070 SJA_C2-03080 cobN cobO TRUE 0.986 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 10213959 10213960 SJA_C2-03080 SJA_C2-03090 cobO bluB FALSE 0.453 57.000 0.026 1.000 N NA
 10213960 10213961 SJA_C2-03090 SJA_C2-03100 bluB cobG FALSE 0.004 478.000 0.000 1.000 N NA
 10213961 10213962 SJA_C2-03100 SJA_C2-03110 cobG cobH TRUE 0.982 0.000 0.273 1.000 N NA
 10213962 10213963 SJA_C2-03110 SJA_C2-03120 cobH cobI TRUE 0.994 -3.000 0.191 0.009 Y NA
 10213963 10213964 SJA_C2-03120 SJA_C2-03130 cobI cobJ TRUE 0.993 -3.000 0.138 0.009 Y NA
 10213966 10213967 SJA_C2-03150 SJA_C2-03160 cobL cbiG TRUE 0.982 -3.000 0.139 0.009   NA
 10213967 10213968 SJA_C2-03160 SJA_C2-03170 cbiG cobM TRUE 0.992 -3.000 0.397 0.009   NA
 10213968 10213969 SJA_C2-03170 SJA_C2-03180 cobM cobB TRUE 0.989 -3.000 0.065 0.009 Y NA
 10213969 10213970 SJA_C2-03180 SJA_C2-03190 cobB cobF TRUE 0.980 -3.000 0.018 1.000 Y NA
 10213971 10213972 SJA_C2-03200 SJA_C2-03210     FALSE 0.088 164.000 0.000 NA   NA
 10213972 10213973 SJA_C2-03210 SJA_C2-03220     TRUE 0.975 14.000 0.761 NA   NA
 10213973 10213974 SJA_C2-03220 SJA_C2-03230   prkA TRUE 0.960 20.000 0.683 NA   NA
 10213974 10213975 SJA_C2-03230 SJA_C2-03240 prkA   FALSE 0.017 463.000 0.000 NA Y NA
 10213975 10213976 SJA_C2-03240 SJA_C2-03250     TRUE 0.986 19.000 0.800 1.000 Y NA
 10213977 10213978 SJA_C2-03260 SJA_C2-03270     TRUE 0.919 13.000 0.167 1.000 N NA
 10213978 10213979 SJA_C2-03270 SJA_C2-03280     TRUE 0.987 -3.000 0.200 0.031 N NA
 10213980 10213981 SJA_C2-03290 SJA_C2-03300 cobU/cobP cobD TRUE 0.933 6.000 0.013 1.000 Y NA
 10213981 10213982 SJA_C2-03300 SJA_C2-03310 cobD cobC TRUE 0.969 -7.000 0.128 0.009 N NA
 10213982 10213983 SJA_C2-03310 SJA_C2-03320 cobC cobS TRUE 0.919 -3.000 0.003 0.009 N NA
 10213983 10213984 SJA_C2-03320 SJA_C2-03330 cobS   TRUE 0.925 -3.000 0.010 1.000 N NA
 10213984 10213985 SJA_C2-03330 SJA_C2-03340   cobT TRUE 0.958 -3.000 0.036 1.000 N NA
 10213985 10213986 SJA_C2-03340 SJA_C2-03350 cobT   TRUE 0.932 -3.000 0.018 NA   NA
 10213987 10213988 SJA_C2-03360 SJA_C2-03370   atoB FALSE 0.129 151.000 0.000 1.000   NA
 10213989 10213990 SJA_C2-03380 SJA_C2-03390     FALSE 0.116 153.000 0.000 NA   NA
 10213990 10213991 SJA_C2-03390 SJA_C2-03400     FALSE 0.225 70.000 0.000 1.000 N NA
 10213991 10213992 SJA_C2-03400 SJA_C2-03410     FALSE 0.009 340.000 0.000 1.000 N NA
 10213992 10213993 SJA_C2-03410 SJA_C2-03420   uxaC TRUE 0.984 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 10213993 10213994 SJA_C2-03420 SJA_C2-03430 uxaC   TRUE 0.986 -3.000 0.049 1.000 Y NA
 10213994 10213995 SJA_C2-03430 SJA_C2-03440   rspA TRUE 0.733 128.000 0.222 1.000 N NA
 10213995 10213996 SJA_C2-03440 SJA_C2-03450 rspA bglX TRUE 0.970 15.000 0.667 1.000 N NA
 10213996 10213997 SJA_C2-03450 SJA_C2-03460 bglX bglX TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.001 Y NA
 10213998 10213999 SJA_C2-03470 SJA_C2-03480 aguA   FALSE 0.235 98.000 0.000 1.000 N NA
 10214001 10214002 SJA_C2-03500 SJA_C2-03510     FALSE 0.182 72.000 0.000 NA   NA
 10214002 10214003 SJA_C2-03510 SJA_C2-03520     FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 10214003 10214004 SJA_C2-03520 SJA_C2-03530     FALSE 0.190 86.000 0.000 NA   NA
 10214005 10214006 SJA_C2-03540 SJA_C2-03550     FALSE 0.233 55.000 0.000 NA N NA
 10214007 10214008 SJA_C2-03560 SJA_C2-03570 apbA   FALSE 0.234 97.000 0.000 1.000 N NA
 10214009 10214010 SJA_C2-03580 SJA_C2-03590 gip garR TRUE 0.684 8.000 0.000 1.000 N NA
 10214011 10214012 SJA_C2-03600 SJA_C2-03610     FALSE 0.085 170.000 0.000 1.000   NA
 10214013 10214014 SJA_C2-03620 SJA_C2-03630     TRUE 0.674 5.000 0.000 NA   NA
 10214018 10214019 SJA_C2-03670 SJA_C2-03680     FALSE 0.158 139.000 0.000 NA   NA
 10214019 10214020 SJA_C2-03680 SJA_C2-03690     FALSE 0.253 43.000 0.000 NA   NA
 10214020 10214021 SJA_C2-03690 SJA_C2-03700     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10214022 10214023 SJA_C2-03710 SJA_C2-03720     FALSE 0.265 41.000 0.000 NA   NA
 10214024 10214025 SJA_C2-03730 SJA_C2-03740     FALSE 0.013 297.000 0.000 1.000   NA
 10214026 10214027 SJA_C2-03750 SJA_C2-03760     FALSE 0.412 20.000 0.000 NA   NA
 10214027 10214028 SJA_C2-03760 SJA_C2-03770     FALSE 0.121 151.000 0.000 NA   NA
 10214028 10214029 SJA_C2-03770 SJA_C2-03780     FALSE 0.201 56.000 0.000 NA   NA
 10214029 10214030 SJA_C2-03780 SJA_C2-03790     FALSE 0.240 45.000 0.000 NA   NA
 10214030 10214031 SJA_C2-03790 SJA_C2-03800     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214031 10214032 SJA_C2-03800 SJA_C2-03810     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 10214033 10214034 SJA_C2-03820 SJA_C2-03830   ribA FALSE 0.257 113.000 0.000 1.000 N NA
 10214036 10214037 SJA_C2-03850 SJA_C2-03860 paaG fadA TRUE 0.529 73.000 0.000 1.000 Y NA
 10214038 10214039 SJA_C2-03870 SJA_C2-03880     FALSE 0.241 103.000 0.000 1.000 N NA
 10214040 10214041 SJA_C2-03890 SJA_C2-03900   paaG FALSE 0.109 258.000 0.000 0.054 Y NA
 10214041 10214042 SJA_C2-03900 SJA_C2-03910 paaG   FALSE 0.314 176.000 0.000 0.005 Y NA
 10214042 10214043 SJA_C2-03910 SJA_C2-03920     FALSE 0.308 32.000 0.000 NA   NA
 10214044 10214045 SJA_C2-03930 SJA_C2-03940     FALSE 0.004 407.000 0.000 NA   NA
 10214046 10214047 SJA_C2-03950 SJA_C2-03960   fadB FALSE 0.026 244.000 0.000 1.000   NA
 10214047 10214048 SJA_C2-03960 SJA_C2-03970 fadB fadA TRUE 0.989 11.000 0.562 1.000 Y NA
 10214048 10214049 SJA_C2-03970 SJA_C2-03980 fadA   FALSE 0.242 57.000 0.000 1.000 N NA
 10214050 10214051 SJA_C2-03990 SJA_C2-04000     FALSE 0.191 62.000 0.000 NA   NA
 10214053 10214054 SJA_C2-04020 SJA_C2-04030     FALSE 0.170 132.000 0.000 NA   NA
 10214055 10214056 SJA_C2-04040 SJA_C2-04050     TRUE 0.764 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10214056 10214057 SJA_C2-04050 SJA_C2-04060     TRUE 0.715 29.000 0.000 1.000 Y NA
 10214057 10214058 SJA_C2-04060 SJA_C2-04070     FALSE 0.192 93.000 0.000 NA   NA
 10214058 10214059 SJA_C2-04070 SJA_C2-04080     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214059 10214060 SJA_C2-04080 SJA_C2-04090     FALSE 0.233 62.000 0.000 1.000 N NA
 10214060 10214061 SJA_C2-04090 SJA_C2-04100   qor TRUE 0.629 14.000 0.000 0.036 N NA
 10214061 10214062 SJA_C2-04100 SJA_C2-04110 qor   TRUE 0.689 -16.000 0.000 NA   NA
 10214062 10214063 SJA_C2-04110 SJA_C2-04120     TRUE 0.979 -10.000 0.367 NA   NA
 10214063 10214064 SJA_C2-04120 SJA_C2-04130     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214064 10214065 SJA_C2-04130 SJA_C2-04140     FALSE 0.235 98.000 0.000 1.000 N NA
 10214065 10214066 SJA_C2-04140 SJA_C2-04150     FALSE 0.083 179.000 0.000 1.000 N NA
 10214066 10214067 SJA_C2-04150 SJA_C2-04160     FALSE 0.078 183.000 0.000 1.000 N NA
 10214067 10214068 SJA_C2-04160 SJA_C2-04170     TRUE 0.543 86.000 0.000 1.000 Y NA
 10214068 10214069 SJA_C2-04170 SJA_C2-04180     FALSE 0.150 142.000 0.000 NA   NA
 10214069 10214070 SJA_C2-04180 SJA_C2-04190     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214073 10214074 SJA_C2-04220 SJA_C2-04230     FALSE 0.137 146.000 0.000 NA   NA
 10214076 10214077 SJA_C2-04250 SJA_C2-04260     TRUE 0.628 8.000 0.000 NA   NA
 10214077 10214078 SJA_C2-04260 SJA_C2-04270     FALSE 0.481 15.000 0.000 NA   NA
 10214079 10214080 SJA_C2-04280 SJA_C2-04290     FALSE 0.226 69.000 0.000 1.000 N NA
 10214080 10214081 SJA_C2-04290 SJA_C2-04300     TRUE 0.566 106.000 0.000 1.000 Y NA
 10214081 10214082 SJA_C2-04300 SJA_C2-04310     TRUE 0.994 -3.000 0.511 1.000   NA
 10214082 10214083 SJA_C2-04310 SJA_C2-04320     TRUE 0.958 -3.000 0.043 1.000   NA
 10214083 10214084 SJA_C2-04320 SJA_C2-04330     TRUE 0.992 3.000 0.429 1.000 Y NA
 10214086 10214087 SJA_C2-04350 SJA_C2-04360     TRUE 0.976 2.000 0.273 1.000 N NA
 10214087 10214088 SJA_C2-04360 SJA_C2-04370     TRUE 0.708 6.000 0.000 1.000 N NA
 10214088 10214089 SJA_C2-04370 SJA_C2-04380     TRUE 0.732 -10.000 0.000 NA   NA
 10214090 10214091 SJA_C2-04390 SJA_C2-04400     FALSE 0.436 18.000 0.000 NA   NA
 10214092 10214093 SJA_C2-04410 SJA_C2-04420     FALSE 0.322 30.000 0.000 NA   NA
 10214093 10214094 SJA_C2-04420 SJA_C2-04430   tnpR FALSE 0.199 67.000 0.000 1.000   NA
 10214097 10214098 SJA_C2-04460 SJA_C2-04470 parB1 ardC FALSE 0.004 503.000 0.000 NA N NA
 10214098 10214099 SJA_C2-04470 SJA_C2-04480 ardC   FALSE 0.131 148.000 0.000 NA   NA
 10214099 10214100 SJA_C2-04480 SJA_C2-04490   fic TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10214100 10214101 SJA_C2-04490 SJA_C2-04500 fic   FALSE 0.008 328.000 0.000 NA   NA
 10214101 10214102 SJA_C2-04500 SJA_C2-04510     TRUE 0.560 12.000 0.000 NA   NA
 10214102 10214103 SJA_C2-04510 SJA_C2-04520     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214103 10214104 SJA_C2-04520 SJA_C2-04530     TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10214104 10214105 SJA_C2-04530 SJA_C2-04540     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214107 10214108 SJA_C2-04560 SJA_C2-04570     FALSE 0.004 400.000 0.000 NA   NA
 10214108 10214109 SJA_C2-04570 SJA_C2-04580     FALSE 0.436 18.000 0.000 NA   NA
 10214109 10214110 SJA_C2-04580 SJA_C2-04590     FALSE 0.009 318.000 0.000 NA   NA
 10214110 10214111 SJA_C2-04590 SJA_C2-04600     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214111 10214112 SJA_C2-04600 SJA_C2-04610     TRUE 0.560 12.000 0.000 NA   NA
 10214113 10214114 SJA_C2-04620 SJA_C2-04630     TRUE 0.658 -30.000 0.000 NA   NA
 10214119 10214120 SJA_C2-04680 SJA_C2-04690     TRUE 0.747 -10.000 0.000 1.000   NA
 10214120 10214121 SJA_C2-04690 SJA_C2-04700     FALSE 0.023 394.000 0.000 1.000 Y NA
 10214121 10214122 SJA_C2-04700 SJA_C2-04710     FALSE 0.004 426.000 0.000 NA   NA
 10214122 10214123 SJA_C2-04710 SJA_C2-04720     FALSE 0.233 46.000 0.000 NA   NA
 10214123 10214124 SJA_C2-04720 SJA_C2-04730     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10214124 10214125 SJA_C2-04730 SJA_C2-04740     FALSE 0.054 191.000 0.000 NA   NA
 10214126 10214127 SJA_C2-04750 SJA_C2-04760     FALSE 0.270 40.000 0.000 NA   NA
 10214129 10214130 SJA_C2-04780 SJA_C2-04790 gst   FALSE 0.139 145.000 0.000 NA   NA
 10214131 10214132 SJA_C2-04800 SJA_C2-04810     FALSE 0.026 241.000 0.000 NA   NA
 10214133 10214134 SJA_C2-04820 SJA_C2-04830 linF   FALSE 0.400 21.000 0.000 NA   NA
 10214134 10214135 SJA_C2-04830 SJA_C2-04840     TRUE 0.750 1.000 0.000 NA   NA
 10214137 10214138 SJA_C2-04860 SJA_C2-04870     FALSE 0.187 84.000 0.000 NA   NA
 10214138 10214139 SJA_C2-04870 SJA_C2-04880     FALSE 0.108 159.000 0.000 1.000   NA
 10214139 10214140 SJA_C2-04880 SJA_C2-04890     FALSE 0.185 69.000 0.000 NA   NA
 10214140 10214141 SJA_C2-04890 SJA_C2-04900     FALSE 0.007 370.000 0.000 NA N NA
 10214141 10214142 SJA_C2-04900 SJA_C2-04910     FALSE 0.026 242.000 0.000 NA   NA
 10214142 10214143 SJA_C2-04910 SJA_C2-04920     FALSE 0.187 84.000 0.000 NA   NA
 10214146 10214147 SJA_C2-04950 SJA_C2-04960     FALSE 0.253 43.000 0.000 NA   NA
 10214147 10214148 SJA_C2-04960 SJA_C2-04970     FALSE 0.296 44.000 0.000 1.000 N NA
 10214148 10214149 SJA_C2-04970 SJA_C2-04980     FALSE 0.400 21.000 0.000 NA   NA
 10214149 10214150 SJA_C2-04980 SJA_C2-04990     TRUE 0.584 11.000 0.000 NA   NA
 10214150 10214151 SJA_C2-04990 SJA_C2-05000     FALSE 0.306 45.000 0.000 0.053   NA
 10214151 10214152 SJA_C2-05000 SJA_C2-05010     TRUE 0.709 34.000 0.000 0.053 Y NA
 10214152 10214153 SJA_C2-05010 SJA_C2-05020     FALSE 0.327 47.000 0.000 0.035 N NA
 10214153 10214154 SJA_C2-05020 SJA_C2-05030     FALSE 0.352 26.000 0.000 NA   NA
 10214154 10214155 SJA_C2-05030 SJA_C2-05040     TRUE 0.990 3.000 0.750 NA   NA
 10214155 10214156 SJA_C2-05040 SJA_C2-05050     FALSE 0.216 83.000 0.000 NA N NA
 10214157 10214158 SJA_C2-05060 SJA_C2-05070 gabD aes TRUE 0.905 -3.000 0.000 0.053 N NA
 10214158 10214159 SJA_C2-05070 SJA_C2-05080 aes   TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.053 Y NA
 10214159 10214160 SJA_C2-05080 SJA_C2-05090     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10214160 10214161 SJA_C2-05090 SJA_C2-05100   adh FALSE 0.230 65.000 0.000 1.000 N NA
 10214161 10214162 SJA_C2-05100 SJA_C2-05110 adh   FALSE 0.475 26.000 0.000 0.035 N NA
 10214162 10214163 SJA_C2-05110 SJA_C2-05120     FALSE 0.159 149.000 0.000 1.000 N NA
 10214164 10214165 SJA_C2-05130 SJA_C2-05140     FALSE 0.187 84.000 0.000 NA   NA
 10214165 10214166 SJA_C2-05140 SJA_C2-05150     TRUE 0.691 5.000 0.000 1.000   NA
 10214167 10214168 SJA_C2-05160 SJA_C2-05170     FALSE 0.320 138.000 0.019 NA   NA
 10214168 10214169 SJA_C2-05170 SJA_C2-05180     FALSE 0.121 151.000 0.000 NA   NA
 10214169 10214170 SJA_C2-05180 SJA_C2-05190   linJ FALSE 0.006 369.000 0.000 NA   NA
 10214170 10214171 SJA_C2-05190 SJA_C2-05200 linJ linI FALSE 0.339 36.000 0.000 1.000 N NA
 10214172 10214173 SJA_C2-05210 SJA_C2-05220 linG linH TRUE 0.994 0.000 0.333 0.002 Y NA
 10214174 10214175 SJA_C2-05230 SJA_C2-05240     FALSE 0.020 274.000 0.000 1.000 N NA
 10214175 10214176 SJA_C2-05240 SJA_C2-05250     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA N NA
 10214176 10214177 SJA_C2-05250 SJA_C2-05260     TRUE 0.986 4.000 0.579 NA N NA
 10214177 10214178 SJA_C2-05260 SJA_C2-05270   mipA TRUE 0.588 47.000 0.000 NA Y NA
 10214179 10214180 SJA_C2-05280 SJA_C2-05290     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214180 10214181 SJA_C2-05290 SJA_C2-05300     FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 10214181 10214182 SJA_C2-05300 SJA_C2-05310     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214182 10214183 SJA_C2-05310 SJA_C2-05320     FALSE 0.204 54.000 0.000 NA   NA
 10214185 10214186 SJA_C2-05340 SJA_C2-05350   jmjC FALSE 0.187 66.000 0.000 NA   NA
 10214186 10214187 SJA_C2-05350 SJA_C2-05360 jmjC rluE TRUE 0.735 7.000 0.008 NA   NA
 10214187 10214188 SJA_C2-05360 SJA_C2-05370 rluE   TRUE 0.674 5.000 0.000 NA   NA
 10214188 10214189 SJA_C2-05370 SJA_C2-05380     FALSE 0.308 32.000 0.000 NA   NA
 10214189 10214190 SJA_C2-05380 SJA_C2-05390     FALSE 0.190 86.000 0.000 NA   NA
 10214192 10214193 SJA_C2-05410 SJA_C2-05420     TRUE 0.957 18.000 0.615 NA   NA
 10214193 10214194 SJA_C2-05420 SJA_C2-05430     FALSE 0.003 654.000 0.000 NA   NA
 10214194 10214195 SJA_C2-05430 SJA_C2-05440     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10214195 10214196 SJA_C2-05440 SJA_C2-05450     TRUE 0.989 0.000 0.458 1.000 N NA
 10214196 10214197 SJA_C2-05450 SJA_C2-05460     TRUE 0.983 -3.000 0.120 0.001 N NA
 10214197 10214198 SJA_C2-05460 SJA_C2-05470     TRUE 0.985 0.000 0.360 1.000   NA
 10214198 10214199 SJA_C2-05470 SJA_C2-05480     TRUE 0.977 -25.000 0.444 1.000   NA
 10214199 10214200 SJA_C2-05480 SJA_C2-05490     FALSE 0.036 216.000 0.000 NA   NA
 10214200 10214201 SJA_C2-05490 SJA_C2-05500   prlC FALSE 0.188 85.000 0.000 NA   NA
 10214202 10214203 SJA_C2-05510 SJA_C2-05520 idnO   FALSE 0.412 24.000 0.000 NA N NA
 10214205 10214206 SJA_C2-05540 SJA_C2-05550     FALSE 0.255 115.000 0.000 1.000 N NA
 10214207 10214208 SJA_C2-05560 SJA_C2-05570   traI FALSE 0.047 198.000 0.000 NA   NA
 10214208 10214209 SJA_C2-05570 SJA_C2-05580 traI   TRUE 0.800 0.000 0.000 1.000   NA
 10214209 10214210 SJA_C2-05580 SJA_C2-05590     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10214210 10214211 SJA_C2-05590 SJA_C2-05600     FALSE 0.239 122.000 0.000 1.000 N NA
 10214211 10214212 SJA_C2-05600 SJA_C2-05610     FALSE 0.074 174.000 0.000 NA   NA
 10214213 10214214 SJA_C2-05620 SJA_C2-05630   acs FALSE 0.060 198.000 0.000 1.000 N NA
 10214214 10214215 SJA_C2-05630 SJA_C2-05640 acs   TRUE 0.663 10.000 0.000 1.000 N NA
 10214215 10214216 SJA_C2-05640 SJA_C2-05650     FALSE 0.033 327.000 0.049 1.000   NA
 10214217 10214218 SJA_C2-05660 SJA_C2-05670     TRUE 0.996 -3.000 0.857 NA   NA
 10214219 10214220 SJA_C2-05680 SJA_C2-05690     FALSE 0.263 121.000 0.000 0.030   NA
 10214220 10214221 SJA_C2-05690 SJA_C2-05700     FALSE 0.059 347.000 0.167 1.000   NA
 10214222 10214223 SJA_C2-05710 SJA_C2-05720     TRUE 0.988 5.000 0.786 1.000   NA
 10214223 10214224 SJA_C2-05720 SJA_C2-05730     TRUE 0.668 129.000 0.119 0.004 N NA
 10214224 10214225 SJA_C2-05730 SJA_C2-05740     TRUE 0.853 14.000 0.071 1.000 N NA
 10214225 10214226 SJA_C2-05740 SJA_C2-05750     FALSE 0.245 120.000 0.000 1.000 N NA
 10214226 10214227 SJA_C2-05750 SJA_C2-05760     FALSE 0.070 176.000 0.000 NA   NA
 10214227 10214228 SJA_C2-05760 SJA_C2-05770   katG FALSE 0.047 198.000 0.000 NA   NA
 10214228 10214229 SJA_C2-05770 SJA_C2-05780 katG   FALSE 0.201 120.000 0.000 NA   NA
 10214230 10214231 SJA_C2-05790 SJA_C2-05800     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10214231 10214232 SJA_C2-05800 SJA_C2-05810     FALSE 0.364 49.000 0.014 NA   NA
 10214232 10214233 SJA_C2-05810 SJA_C2-05820     FALSE 0.121 264.000 0.125 NA   NA
 10214234 10214235 SJA_C2-05830 SJA_C2-05840 atoB   TRUE 0.816 0.000 0.000 NA N NA
 10214236 10214237 SJA_C2-05850 SJA_C2-05860     TRUE 0.673 -22.000 0.000 NA   NA
 10214238 10214239 SJA_C2-05870 SJA_C2-05880   parA FALSE 0.008 330.000 0.000 1.000   NA
 10214239 10214240 SJA_C2-05880 SJA_C2-05890 parA   TRUE 0.924 63.000 1.000 1.000 N NA
 10214240 10213642 SJA_C2-05890 SJA_C2-00010   repA FALSE 0.011 317.000 0.000 NA N NA
 10209781 10209782 SJA_P2-00020 SJA_P2-00030   parA TRUE 0.975 0.000 0.200 NA   NA
 10209782 10209783 SJA_P2-00030 SJA_P2-00040 parA   FALSE 0.196 122.000 0.000 NA   NA
 10209783 10209784 SJA_P2-00040 SJA_P2-00050     FALSE 0.481 15.000 0.000 NA   NA
 10209785 10209786 SJA_P2-00060 SJA_P2-00070     TRUE 0.994 -3.000 0.588 NA   NA
 10209786 10209787 SJA_P2-00070 SJA_P2-00080     TRUE 0.533 13.000 0.000 NA   NA
 10209787 10209788 SJA_P2-00080 SJA_P2-00090     TRUE 0.732 -10.000 0.000 NA   NA
 10209788 10209789 SJA_P2-00090 SJA_P2-00100     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10209790 10209791 SJA_P2-00110 SJA_P2-00120   tnpA FALSE 0.462 16.000 0.000 NA   NA
 10209792 10209793 SJA_P2-00130 SJA_P2-00140 tnp   FALSE 0.205 94.000 0.000 1.000   NA
 10209793 10209794 SJA_P2-00140 SJA_P2-00150   cusC TRUE 0.815 -7.000 0.000 0.071   NA
 10209794 10209795 SJA_P2-00150 SJA_P2-00160 cusC   FALSE 0.081 169.000 0.000 NA   NA
 10209795 10209796 SJA_P2-00160 SJA_P2-00170     TRUE 0.982 -3.000 0.182 NA   NA
 10209796 10209797 SJA_P2-00170 SJA_P2-00180     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10209797 10209798 SJA_P2-00180 SJA_P2-00190     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10209798 10209799 SJA_P2-00190 SJA_P2-00200     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10209799 10209800 SJA_P2-00200 SJA_P2-00210     FALSE 0.257 64.000 0.000 0.011   NA
 10209801 10209802 SJA_P2-00220 SJA_P2-00230     TRUE 0.623 10.000 0.000 1.000   NA
 10209802 10209803 SJA_P2-00230 SJA_P2-00240     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10209803 10209804 SJA_P2-00240 SJA_P2-00250     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 10209804 10209805 SJA_P2-00250 SJA_P2-00260   tnp TRUE 0.581 91.000 0.000 0.048 Y NA
 10209805 10209806 SJA_P2-00260 SJA_P2-00270 tnp   TRUE 0.911 -64.000 0.000 0.048 Y NA
 10209807 10209808 SJA_P2-00280 SJA_P2-00290     FALSE 0.226 47.000 0.000 NA   NA
 10209811 10209812 SJA_P2-00320 SJA_P2-00330     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10209812 10209813 SJA_P2-00330 SJA_P2-00340   traA FALSE 0.102 158.000 0.000 NA   NA
 10209814 10209815 SJA_P2-00350 SJA_P2-00360   traD FALSE 0.376 38.000 0.000 0.002   NA
 10209815 10209816 SJA_P2-00360 SJA_P2-00370 traD   TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10209816 10209817 SJA_P2-00370 SJA_P2-00380     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10209817 10209818 SJA_P2-00380 SJA_P2-00390     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10209818 10209819 SJA_P2-00390 SJA_P2-00400     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10209819 10209820 SJA_P2-00400 SJA_P2-00410   traG TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 10209820 10209821 SJA_P2-00410 SJA_P2-00420 traG   FALSE 0.279 38.000 0.000 NA   NA
 10209823 10209780 SJA_P2-00440 SJA_P2-00010   repA FALSE 0.006 364.000 0.000 NA   NA
 10213410 10213411 SJA_P1-00010 SJA_P1-00020 repA parA FALSE 0.053 196.000 0.000 1.000   NA
 10213411 10213412 SJA_P1-00020 SJA_P1-00030 parA parB TRUE 0.927 45.000 0.750 1.000 N NA
 10213412 10213413 SJA_P1-00030 SJA_P1-00040 parB   FALSE 0.188 65.000 0.000 NA   NA
 10213414 10213415 SJA_P1-00050 SJA_P1-00060     TRUE 0.976 0.000 0.208 NA   NA
 10213415 10213416 SJA_P1-00060 SJA_P1-00070     FALSE 0.480 97.000 0.047 NA   NA
 10213416 10213417 SJA_P1-00070 SJA_P1-00080   tnpA FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 10213418 10213419 SJA_P1-00090 SJA_P1-00100 tnpR   TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 10213420 10213421 SJA_P1-00110 SJA_P1-00120     TRUE 0.985 -19.000 0.654 NA   NA
 10213422 10213423 SJA_P1-00130 SJA_P1-00140 tnp tnpA FALSE 0.047 326.000 0.000 0.047 Y NA
 10213425 10213426 SJA_P1-00160 SJA_P1-00170     TRUE 0.618 9.000 0.000 NA   NA
 10213426 10213427 SJA_P1-00170 SJA_P1-00180     TRUE 0.985 -3.000 0.222 NA   NA
 10213427 10213428 SJA_P1-00180 SJA_P1-00190     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10213428 10213429 SJA_P1-00190 SJA_P1-00200     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10213430 10213431 SJA_P1-00210 SJA_P1-00220 trbN trbL TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10213431 10213432 SJA_P1-00220 SJA_P1-00230 trbL tnp FALSE 0.260 42.000 0.000 NA   NA
 10213433 10213434 SJA_P1-00240 SJA_P1-00250     FALSE 0.193 123.000 0.000 NA   NA
 10213434 10213435 SJA_P1-00250 SJA_P1-00260     FALSE 0.481 15.000 0.000 NA   NA
 10213435 10213436 SJA_P1-00260 SJA_P1-00270     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 10213437 10213438 SJA_P1-00280 SJA_P1-00290   relE TRUE 0.960 10.000 0.333 NA   NA
 10213438 10213439 SJA_P1-00290 SJA_P1-00300 relE relB TRUE 0.972 -13.000 0.308 NA   NA
 10213440 10213441 SJA_P1-00310 SJA_P1-00320     FALSE 0.481 15.000 0.000 NA   NA
 10213441 10213442 SJA_P1-00320 SJA_P1-00330     FALSE 0.181 76.000 0.000 NA   NA
 10213442 10213443 SJA_P1-00330 SJA_P1-00340     TRUE 0.996 -3.000 0.833 NA   NA
 10213443 10213444 SJA_P1-00340 SJA_P1-00350     FALSE 0.424 19.000 0.000 NA   NA
 10213447 10213448 SJA_P1-00380 SJA_P1-00390     TRUE 0.938 -3.000 0.021 NA   NA
 10213448 10213449 SJA_P1-00390 SJA_P1-00400     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213449 10213450 SJA_P1-00400 SJA_P1-00410     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213450 10213451 SJA_P1-00410 SJA_P1-00420     TRUE 0.560 12.000 0.000 NA   NA
 10213451 10213452 SJA_P1-00420 SJA_P1-00430     FALSE 0.102 158.000 0.000 NA   NA
 10213454 10213455 SJA_P1-00450 SJA_P1-00460     FALSE 0.194 100.000 0.000 NA   NA
 10213455 10213456 SJA_P1-00460 SJA_P1-00470     TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10213456 10213457 SJA_P1-00470 SJA_P1-00480     FALSE 0.155 140.000 0.000 NA   NA
 10213457 10213458 SJA_P1-00480 SJA_P1-00490     FALSE 0.211 111.000 0.000 NA   NA
 10213458 10213459 SJA_P1-00490 SJA_P1-00500     FALSE 0.352 26.000 0.000 NA   NA
 10213459 10213460 SJA_P1-00500 SJA_P1-00510     FALSE 0.199 57.000 0.000 NA   NA
 10213460 10213461 SJA_P1-00510 SJA_P1-00520     FALSE 0.379 23.000 0.000 NA   NA
 10213461 10213462 SJA_P1-00520 SJA_P1-00530     TRUE 0.737 2.000 0.000 NA   NA
 10213462 10213463 SJA_P1-00530 SJA_P1-00540     FALSE 0.003 563.000 0.000 NA   NA
 10213465 10213466 SJA_P1-00560 SJA_P1-00570     FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 10213466 10213467 SJA_P1-00570 SJA_P1-00580     FALSE 0.449 17.000 0.000 NA   NA
 10213467 10213468 SJA_P1-00580 SJA_P1-00590     FALSE 0.118 152.000 0.000 NA   NA
 10213468 10213469 SJA_P1-00590 SJA_P1-00600     FALSE 0.082 168.000 0.000 NA   NA
 10213469 10213470 SJA_P1-00600 SJA_P1-00610     TRUE 0.959 -3.000 0.050 NA   NA
 10213470 10213471 SJA_P1-00610 SJA_P1-00620     FALSE 0.039 210.000 0.000 NA   NA
 10213471 10213472 SJA_P1-00620 SJA_P1-00630     TRUE 0.992 -3.000 0.429 NA   NA
 10213472 10213473 SJA_P1-00630 SJA_P1-00640     FALSE 0.026 239.000 0.000 NA   NA
 10213473 10213474 SJA_P1-00640 SJA_P1-00650     TRUE 0.992 -3.000 0.483 1.000   NA
 10213474 10213475 SJA_P1-00650 SJA_P1-00660     FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 10213475 10213476 SJA_P1-00660 SJA_P1-00670     FALSE 0.481 15.000 0.000 NA   NA
 10213476 10213477 SJA_P1-00670 SJA_P1-00680   ardC FALSE 0.190 124.000 0.000 NA   NA
 10213477 10213478 SJA_P1-00680 SJA_P1-00690 ardC   FALSE 0.181 75.000 0.000 NA   NA
 10213478 10213479 SJA_P1-00690 SJA_P1-00700     FALSE 0.035 219.000 0.000 NA   NA
 10213479 10213480 SJA_P1-00700 SJA_P1-00710   virE FALSE 0.223 133.000 0.000 0.047   NA
 10213480 10213481 SJA_P1-00710 SJA_P1-00720 virE   FALSE 0.007 341.000 0.000 NA   NA
 10213482 10213483 SJA_P1-00730 SJA_P1-00740     FALSE 0.060 186.000 0.000 NA   NA
 10213484 10213485 SJA_P1-00750 SJA_P1-00760     FALSE 0.215 50.000 0.000 NA   NA
 10213485 10213486 SJA_P1-00760 SJA_P1-00770     TRUE 0.877 -16.000 0.032 NA   NA
 10213487 10213488 SJA_P1-00780 SJA_P1-00790     FALSE 0.193 61.000 0.000 NA   NA
 10213490 10213491 SJA_P1-00810 SJA_P1-00820 traI   TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 10213491 10213492 SJA_P1-00820 SJA_P1-00830     FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 10213492 10213493 SJA_P1-00830 SJA_P1-00840     FALSE 0.056 190.000 0.000 NA   NA
 10213497 10213498 SJA_P1-00880 SJA_P1-00890     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213498 10213499 SJA_P1-00890 SJA_P1-00900     FALSE 0.004 453.000 0.000 NA   NA
 10213499 10213500 SJA_P1-00900 SJA_P1-00910     TRUE 0.990 -3.000 0.333 NA N NA
 10213500 10213501 SJA_P1-00910 SJA_P1-00920     TRUE 0.894 76.000 0.333 NA Y NA
 10213501 10213502 SJA_P1-00920 SJA_P1-00930     TRUE 0.827 0.000 0.000 1.000 N NA
 10213503 10213504 SJA_P1-00940 SJA_P1-00950     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 10213504 10213505 SJA_P1-00950 SJA_P1-00960     FALSE 0.190 63.000 0.000 NA   NA
 10213505 10213506 SJA_P1-00960 SJA_P1-00970     FALSE 0.070 176.000 0.000 NA   NA
 10213506 10213507 SJA_P1-00970 SJA_P1-00980     TRUE 0.623 10.000 0.000 1.000   NA
 10213507 10213508 SJA_P1-00980 SJA_P1-00990     FALSE 0.097 161.000 0.000 NA   NA
 10213509 10213510 SJA_P1-01000 SJA_P1-01010     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213510 10213511 SJA_P1-01010 SJA_P1-01020     TRUE 0.559 195.000 0.500 NA   NA
 10213511 10213512 SJA_P1-01020 SJA_P1-01030     TRUE 0.830 117.000 0.400 NA   NA
 10213512 10213513 SJA_P1-01030 SJA_P1-01040     TRUE 0.982 9.000 0.600 0.002   NA
 10213513 10213514 SJA_P1-01040 SJA_P1-01050     TRUE 0.991 -13.000 0.750 0.002   NA
 10213514 10213515 SJA_P1-01050 SJA_P1-01060   traB TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000   NA
 10213515 10213516 SJA_P1-01060 SJA_P1-01070 traB   TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10213516 10213517 SJA_P1-01070 SJA_P1-01080   traC TRUE 0.988 -3.000 0.292 NA   NA
 10213517 10213518 SJA_P1-01080 SJA_P1-01090 traC   TRUE 0.955 6.000 0.222 NA   NA
 10213518 10213519 SJA_P1-01090 SJA_P1-01100     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 10213519 10213520 SJA_P1-01100 SJA_P1-01110   traW TRUE 0.992 -10.000 1.000 NA   NA
 10213520 10213521 SJA_P1-01110 SJA_P1-01120 traW traU TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213521 10213522 SJA_P1-01120 SJA_P1-01130 traU   FALSE 0.193 99.000 0.000 NA   NA
 10213522 10213523 SJA_P1-01130 SJA_P1-01140     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213523 10213524 SJA_P1-01140 SJA_P1-01150   traN TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10213524 10213525 SJA_P1-01150 SJA_P1-01160 traN   TRUE 0.798 56.000 0.333 NA   NA
 10213525 10213526 SJA_P1-01160 SJA_P1-01170     TRUE 0.662 -28.000 0.000 NA   NA
 10213526 10213527 SJA_P1-01170 SJA_P1-01180     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213528 10213529 SJA_P1-01190 SJA_P1-01200     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213530 10213531 SJA_P1-01210 SJA_P1-01220   traH TRUE 0.816 95.000 0.400 NA   NA
 10213531 10213532 SJA_P1-01220 SJA_P1-01230 traH traG TRUE 0.988 5.000 0.800 NA   NA
 10213534 10213535 SJA_P1-01250 SJA_P1-01260     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10213536 10213537 SJA_P1-01270 SJA_P1-01280     FALSE 0.369 24.000 0.000 NA   NA
 10213539 10213540 SJA_P1-01300 SJA_P1-01310     FALSE 0.109 155.000 0.000 NA   NA
 10213540 10213541 SJA_P1-01310 SJA_P1-01320     FALSE 0.208 101.000 0.000 1.000   NA
 10213541 10213542 SJA_P1-01320 SJA_P1-01330     TRUE 0.563 34.000 0.029 NA   NA
 10213546 10213547 SJA_P1-01370 SJA_P1-01380   vanB FALSE 0.118 162.000 0.000 1.000 N NA
 10213547 10213548 SJA_P1-01380 SJA_P1-01390 vanB linD FALSE 0.244 114.000 0.000 NA N NA
 10213548 10213549 SJA_P1-01390 SJA_P1-01400 linD   FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 10213549 10213550 SJA_P1-01400 SJA_P1-01410     TRUE 0.628 8.000 0.000 NA   NA
 10213550 10213551 SJA_P1-01410 SJA_P1-01420     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213551 10213552 SJA_P1-01420 SJA_P1-01430   linE FALSE 0.352 26.000 0.000 NA   NA
 10213554 10213555 SJA_P1-01450 SJA_P1-01460   vanA FALSE 0.221 192.000 0.000 1.000 Y NA
 10213557 10213558 SJA_P1-01480 SJA_P1-01490     FALSE 0.186 68.000 0.000 NA   NA
 10213559 10213560 SJA_P1-01500 SJA_P1-01510     FALSE 0.505 14.000 0.000 NA   NA
 10213560 10213561 SJA_P1-01510 SJA_P1-01520     FALSE 0.064 180.000 0.000 NA   NA
 10213561 10213562 SJA_P1-01520 SJA_P1-01530   tnp FALSE 0.155 150.000 0.000 1.000 N NA
 10213563 10213564 SJA_P1-01540 SJA_P1-01550     FALSE 0.206 53.000 0.000 NA   NA
 10213565 10213566 SJA_P1-01560 SJA_P1-01570     TRUE 0.654 6.000 0.000 NA   NA
 10213569 10213570 SJA_P1-01600 SJA_P1-01610     TRUE 0.898 -3.000 0.000 0.007   NA
 10213570 10213571 SJA_P1-01610 SJA_P1-01620     FALSE 0.004 556.000 0.000 0.007   NA
 10213572 10213573 SJA_P1-01630 SJA_P1-01640     TRUE 0.981 14.000 0.833 0.069 N NA
 10213573 10213574 SJA_P1-01640 SJA_P1-01650     TRUE 0.991 2.000 0.750 1.000   NA
 10213574 10213575 SJA_P1-01650 SJA_P1-01660     FALSE 0.205 90.000 0.000 1.000   NA
 10213575 10213576 SJA_P1-01660 SJA_P1-01670     TRUE 0.574 66.000 0.000 0.039 Y NA
 10213577 10213578 SJA_P1-01680 SJA_P1-01690   trbI TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10213578 10213579 SJA_P1-01690 SJA_P1-01700 trbI trbG TRUE 0.995 -3.000 0.286 NA Y NA
 10213579 10213580 SJA_P1-01700 SJA_P1-01710 trbG trbF TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 10213580 10213581 SJA_P1-01710 SJA_P1-01720 trbF trbL TRUE 0.948 0.000 0.000 NA Y NA
 10213581 10213582 SJA_P1-01720 SJA_P1-01730 trbL trbK TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 10213582 10213583 SJA_P1-01730 SJA_P1-01740 trbK trbJ TRUE 0.957 11.000 0.333 NA   NA
 10213583 10213584 SJA_P1-01740 SJA_P1-01750 trbJ trbE TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 10213584 10213585 SJA_P1-01750 SJA_P1-01760 trbE trbD TRUE 0.873 11.000 0.000 NA Y NA
 10213585 10213586 SJA_P1-01760 SJA_P1-01770 trbD trbC TRUE 0.948 0.000 0.000 NA Y NA
 10213586 10213587 SJA_P1-01770 SJA_P1-01780 trbC trbB TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA Y NA
 10213587 10213588 SJA_P1-01780 SJA_P1-01790 trbB   FALSE 0.020 260.000 0.000 NA   NA
 10213588 10213589 SJA_P1-01790 SJA_P1-01800   traG TRUE 0.960 10.000 0.333 NA   NA
 10213589 10213590 SJA_P1-01800 SJA_P1-01810 traG traI TRUE 0.727 26.000 0.000 NA Y NA
 10213590 10213591 SJA_P1-01810 SJA_P1-01820 traI   FALSE 0.024 245.000 0.000 NA   NA
 10213591 10213592 SJA_P1-01820 SJA_P1-01830     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 10213592 10213593 SJA_P1-01830 SJA_P1-01840   traF FALSE 0.226 47.000 0.000 NA   NA
 10213593 10213594 SJA_P1-01840 SJA_P1-01850 traF   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213594 10213595 SJA_P1-01850 SJA_P1-01860     TRUE 0.989 -3.000 0.333 NA   NA
 10213595 10213596 SJA_P1-01860 SJA_P1-01870     TRUE 0.986 -3.000 0.222 1.000   NA
 10213596 10213597 SJA_P1-01870 SJA_P1-01880   repA FALSE 0.047 209.000 0.000 NA N NA
 10213597 10213598 SJA_P1-01880 SJA_P1-01890 repA   TRUE 0.968 12.000 0.500 NA   NA
 10213598 10213599 SJA_P1-01890 SJA_P1-01900     FALSE 0.180 128.000 0.000 NA   NA
 10213599 10213600 SJA_P1-01900 SJA_P1-01910     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 10213600 10213601 SJA_P1-01910 SJA_P1-01920     FALSE 0.201 104.000 0.000 NA   NA
 10213601 10213602 SJA_P1-01920 SJA_P1-01930     FALSE 0.371 187.000 0.182 NA   NA
 10213608 10213609 SJA_P1-01990 SJA_P1-02000     FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 10213609 10213610 SJA_P1-02000 SJA_P1-02010     TRUE 0.788 0.000 0.000 NA   NA
 10213610 10213611 SJA_P1-02010 SJA_P1-02020     FALSE 0.099 160.000 0.000 NA   NA
 10213613 10213614 SJA_P1-02040 SJA_P1-02050     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10213614 10213615 SJA_P1-02050 SJA_P1-02060     FALSE 0.182 72.000 0.000 NA   NA
 10213615 10213616 SJA_P1-02060 SJA_P1-02070     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10213616 10213617 SJA_P1-02070 SJA_P1-02080     TRUE 0.735 70.000 0.250 NA   NA
 10213617 10213618 SJA_P1-02080 SJA_P1-02090     FALSE 0.199 57.000 0.000 NA   NA
 10213619 10213620 SJA_P1-02100 SJA_P1-02110     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213621 10213622 SJA_P1-02120 SJA_P1-02130     TRUE 0.980 -3.000 0.154 NA   NA
 10213622 10213623 SJA_P1-02130 SJA_P1-02140   ardC TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213623 10213624 SJA_P1-02140 SJA_P1-02150 ardC ardC TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213624 10213625 SJA_P1-02150 SJA_P1-02160 ardC   TRUE 0.765 45.000 0.200 NA   NA
 10213625 10213626 SJA_P1-02160 SJA_P1-02170     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 10213626 10213627 SJA_P1-02170 SJA_P1-02180     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 10213627 10213628 SJA_P1-02180 SJA_P1-02190   ardC FALSE 0.112 154.000 0.000 NA   NA
 10213628 10213629 SJA_P1-02190 SJA_P1-02200 ardC   TRUE 0.891 93.000 0.667 NA N NA
 10213629 10213630 SJA_P1-02200 SJA_P1-02210     TRUE 0.899 112.000 0.667 1.000   NA
 10213630 10213631 SJA_P1-02210 SJA_P1-02220     TRUE 0.884 67.000 0.667 1.000   NA
 10213631 10213632 SJA_P1-02220 SJA_P1-02230     FALSE 0.263 62.000 0.000 0.005   NA
 10213633 10213410 SJA_P1-02240 SJA_P1-00010   repA FALSE 0.010 312.000 0.000 NA   NA
 10213634 10213635 SJA_P3-00010 SJA_P3-00020 rep   FALSE 0.285 36.000 0.000 NA   NA
 10213635 10213636 SJA_P3-00020 SJA_P3-00030     FALSE 0.150 142.000 0.000 NA   NA
 10213638 10213639 SJA_P3-00050 SJA_P3-00060     TRUE 0.762 -7.000 0.000 NA   NA
 10213640 10213641 SJA_P3-00070 SJA_P3-00080 pemK   TRUE 0.992 -3.000 0.429 NA   NA