MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum B str. Eklund 17B

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5737197 5737198 CLL_A0001 CLL_A0002 dnaA dnaN TRUE 0.651 261.000 0.328 1.000 Y NA
 5737198 5737199 CLL_A0002 CLL_A0003 dnaN yaaA TRUE 0.862 39.000 0.103 1.000   NA
 5737199 5737200 CLL_A0003 CLL_A0004 yaaA   TRUE 0.831 72.000 0.209 1.000   NA
 5737200 5737201 CLL_A0004 CLL_A0005     TRUE 0.908 15.000 0.024 NA   NA
 5737201 5737202 CLL_A0005 CLL_A0006   gyrB TRUE 0.755 36.000 0.017 NA   NA
 5737202 5737203 CLL_A0006 CLL_A0007 gyrB gyrA TRUE 0.990 23.000 0.306 0.002 Y NA
 5737203 5737204 CLL_A0007 CLL_A0008 gyrA rrsA FALSE 0.006 520.000 0.000 NA   NA
 5737204 5737205 CLL_A0008 CLL_A0010 rrsA rrlA FALSE 0.047 230.000 0.000 NA   NA
 5737205 5737206 CLL_A0010 CLL_A0011 rrlA rrfA FALSE 0.288 60.000 0.000 NA   NA
 5737206 5737207 CLL_A0011 CLL_A0012 rrfA   TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 5737207 5737208 CLL_A0012 CLL_A0013     TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 5737208 5737209 CLL_A0013 CLL_A0014     FALSE 0.268 81.000 0.000 NA   NA
 5737209 5737210 CLL_A0014 CLL_A0015     FALSE 0.413 41.000 0.000 1.000   NA
 5737210 5737211 CLL_A0015 CLL_A0016     TRUE 0.910 14.000 0.021 1.000   NA
 5737211 5737212 CLL_A0016 CLL_A0017     TRUE 0.973 19.000 0.370 NA   NA
 5737212 5737213 CLL_A0017 CLL_A0018   serS FALSE 0.016 315.000 0.000 NA   NA
 5737213 5737214 CLL_A0018 CLL_A0019 serS   FALSE 0.050 226.000 0.000 NA   NA
 5737214 5737215 CLL_A0019 CLL_A0020     FALSE 0.461 34.000 0.000 NA   NA
 5737215 5737216 CLL_A0020 CLL_A0021     FALSE 0.022 287.000 0.000 NA   NA
 5737216 5737217 CLL_A0021 CLL_A0022     FALSE 0.461 34.000 0.000 NA   NA
 5737217 5737218 CLL_A0022 CLL_A0023     FALSE 0.017 308.000 0.000 NA   NA
 5737218 5737219 CLL_A0023 CLL_A0024   addB TRUE 0.824 29.000 0.029 1.000 N NA
 5737219 5737220 CLL_A0024 CLL_A0025 addB addA TRUE 0.991 26.000 0.408 0.005 Y NA
 5737224 5737225 CLL_A0029 CLL_A0030     FALSE 0.244 130.000 0.000 NA   NA
 5737226 5737227 CLL_A0031 CLL_A0032     TRUE 0.724 1.000 0.000 1.000 N NA
 5737228 5737229 CLL_A0033 CLL_A0034     FALSE 0.019 296.000 0.000 NA   NA
 5737229 5737230 CLL_A0034 CLL_A0035     FALSE 0.030 258.000 0.000 NA   NA
 5737230 5737231 CLL_A0035 CLL_A0036     FALSE 0.258 123.000 0.000 NA   NA
 5737231 5737232 CLL_A0036 CLL_A0037     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5737232 5737233 CLL_A0037 CLL_A0038     FALSE 0.098 190.000 0.000 NA   NA
 5737233 5737234 CLL_A0038 CLL_A0039     TRUE 0.985 -37.000 0.154 NA   NA
 5737234 5737235 CLL_A0039 CLL_A0040     TRUE 0.989 2.000 0.533 NA   NA
 5737235 5737236 CLL_A0040 CLL_A0041     FALSE 0.127 176.000 0.000 NA   NA
 5737236 5737237 CLL_A0041 CLL_A0042     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5737237 5737238 CLL_A0042 CLL_A0043     FALSE 0.145 170.000 0.000 NA   NA
 5737238 5737239 CLL_A0043 CLL_A0044     FALSE 0.265 100.000 0.000 NA   NA
 5737239 5737240 CLL_A0044 CLL_A0045     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5737240 5737241 CLL_A0045 CLL_A0046     FALSE 0.387 43.000 0.000 NA   NA
 5737241 5737242 CLL_A0046 CLL_A0047     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5737242 5737243 CLL_A0047 CLL_A0048     TRUE 0.837 1.000 0.000 0.014   NA
 5737243 5737244 CLL_A0048 CLL_A0049     FALSE 0.008 431.000 0.000 1.000   NA
 5737246 5737247 CLL_A0051 CLL_A0052     FALSE 0.018 312.000 0.000 1.000   NA
 5737247 5737248 CLL_A0052 CLL_A0053     FALSE 0.032 260.000 0.000 1.000   NA
 5737252 5737253 CLL_A0057 CLL_A0058     TRUE 0.936 1.000 0.017 NA   NA
 5737253 5737254 CLL_A0058 CLL_A0059     FALSE 0.264 89.000 0.000 NA   NA
 5737256 5737257 CLL_A0061 CLL_A0062   proB FALSE 0.008 361.000 0.000 1.000 N NA
 5737257 5737258 CLL_A0062 CLL_A0063 proB proA TRUE 0.993 15.000 0.281 0.002 Y NA
 5737258 5737259 CLL_A0063 CLL_A0064 proA   FALSE 0.283 102.000 0.000 1.000   NA
 5737259 5737260 CLL_A0064 CLL_A0065     FALSE 0.104 186.000 0.000 NA   NA
 5737260 5737261 CLL_A0065 CLL_A0066     FALSE 0.445 191.000 0.078 NA   NA
 5737261 5737262 CLL_A0066 CLL_A0067     FALSE 0.049 227.000 0.000 NA   NA
 5737262 5737263 CLL_A0067 CLL_A0068     FALSE 0.232 157.000 0.000 0.068   NA
 5737263 5737264 CLL_A0068 CLL_A0069     FALSE 0.280 99.000 0.000 1.000   NA
 5737264 5737265 CLL_A0069 CLL_A0070   carA FALSE 0.008 368.000 0.000 1.000 N NA
 5737265 5737266 CLL_A0070 CLL_A0071 carA carB TRUE 0.984 15.000 0.054 0.001 Y NA
 5737267 5737268 CLL_A0072 CLL_A0073     FALSE 0.014 293.000 0.000 1.000 N NA
 5737269 5737270 CLL_A0074 CLL_A0075 murI   FALSE 0.465 139.000 0.007 1.000 N NA
 5737270 5737271 CLL_A0075 CLL_A0076     FALSE 0.428 181.000 0.045 NA   NA
 5737271 5737272 CLL_A0076 CLL_A0077     TRUE 0.980 2.000 0.231 NA   NA
 5737272 5737273 CLL_A0077 CLL_A0078     TRUE 0.805 100.000 0.154 1.000   NA
 5737273 5737274 CLL_A0078 CLL_A0079     TRUE 0.859 70.000 0.286 1.000   NA
 5737275 5737276 CLL_A0080 CLL_A0081     TRUE 0.727 150.000 0.133 NA   NA
 5737277 5737278 CLL_A0082 CLL_A0083     TRUE 0.695 93.000 0.058 NA   NA
 5737278 5737279 CLL_A0083 CLL_A0084     TRUE 0.963 1.000 0.067 1.000   NA
 5737280 5737281 CLL_A0085 CLL_A0086     FALSE 0.007 438.000 0.000 NA   NA
 5737282 5737283 CLL_A0087 CLL_A0088     TRUE 0.996 6.000 0.606 1.000 Y NA
 5737283 5737284 CLL_A0088 CLL_A0089     FALSE 0.019 298.000 0.000 NA   NA
 5737284 5737285 CLL_A0089 CLL_A0090     TRUE 0.965 35.000 0.750 NA   NA
 5737285 5737286 CLL_A0090 CLL_A0091     TRUE 0.871 117.000 0.333 NA   NA
 5737286 5737287 CLL_A0091 CLL_A0092     FALSE 0.013 293.000 0.000 NA N NA
 5737287 5737288 CLL_A0092 CLL_A0093   ileS FALSE 0.003 803.000 0.000 1.000 N NA
 5737288 5737289 CLL_A0093 CLL_A0094 ileS   FALSE 0.530 107.000 0.009 1.000 N NA
 5737289 5737290 CLL_A0094 CLL_A0095     FALSE 0.023 282.000 0.000 NA   NA
 5737290 5737291 CLL_A0095 CLL_A0096     FALSE 0.254 125.000 0.000 NA   NA
 5737293 5737294 CLL_A0098 CLL_A0099     TRUE 0.985 16.000 0.655 NA   NA
 5737294 5737295 CLL_A0099 CLL_A0100     FALSE 0.269 104.000 0.000 NA   NA
 5737295 5737296 CLL_A0100 CLL_A0101     TRUE 0.604 186.000 0.205 NA   NA
 5737296 5737297 CLL_A0101 CLL_A0102     FALSE 0.005 601.000 0.000 NA   NA
 5737297 5737298 CLL_A0102 CLL_A0103     FALSE 0.031 228.000 0.000 NA N NA
 5737300 5737301 CLL_A0105 CLL_A0106     FALSE 0.066 207.000 0.000 NA   NA
 5737301 5737302 CLL_A0106 CLL_A0107     FALSE 0.176 127.000 0.000 NA N NA
 5737302 5737303 CLL_A0107 CLL_A0108     FALSE 0.004 466.000 0.000 NA N NA
 5737303 5737304 CLL_A0108 CLL_A0109   dhaK TRUE 0.882 94.000 0.026 1.000 Y NA
 5737304 5737305 CLL_A0109 CLL_A0110 dhaK   TRUE 0.951 91.000 0.226 0.002 Y NA
 5737305 5737306 CLL_A0110 CLL_A0111     TRUE 0.971 3.000 0.118 1.000   NA
 5737306 5737307 CLL_A0111 CLL_A0112   metG FALSE 0.006 511.000 0.000 1.000   NA
 5737307 5737308 CLL_A0112 CLL_A0113 metG   FALSE 0.515 197.000 0.221 NA N NA
 5737308 5737309 CLL_A0113 CLL_A0114     FALSE 0.023 283.000 0.000 NA   NA
 5737309 5737310 CLL_A0114 CLL_A0115     TRUE 0.589 118.000 0.013 1.000   NA
 5737310 5737311 CLL_A0115 CLL_A0116   ksgA TRUE 0.965 1.000 0.093 1.000 N NA
 5737311 5737312 CLL_A0116 CLL_A0117 ksgA   FALSE 0.083 268.000 0.006 NA   NA
 5737312 5737313 CLL_A0117 CLL_A0118     TRUE 0.978 11.000 0.312 NA   NA
 5737313 5737314 CLL_A0118 CLL_A0119   lgt FALSE 0.533 98.000 0.005 NA   NA
 5737314 5737315 CLL_A0119 CLL_A0120 lgt   TRUE 0.635 50.000 0.006 NA   NA
 5737315 5737316 CLL_A0120 CLL_A0121     TRUE 0.939 15.000 0.067 NA   NA
 5737316 5737317 CLL_A0121 CLL_A0122     FALSE 0.210 67.000 0.000 1.000 N NA
 5737318 5737319 CLL_A0123 CLL_A0124     FALSE 0.032 255.000 0.000 NA   NA
 5737319 5737320 CLL_A0124 CLL_A0125     FALSE 0.057 216.000 0.000 NA   NA
 5737320 5737321 CLL_A0125 CLL_A0126     TRUE 0.779 2.000 0.000 NA   NA
 5737322 5737323 CLL_A0127 CLL_A0128 nrdD nifV FALSE 0.006 428.000 0.000 1.000 N NA
 5737323 5737324 CLL_A0128 CLL_A0129 nifV   TRUE 0.721 63.000 0.074 1.000 N NA
 5737324 5737325 CLL_A0129 CLL_A0130     FALSE 0.039 223.000 0.000 1.000 N NA
 5737325 5737326 CLL_A0130 CLL_A0131   nrdG FALSE 0.021 262.000 0.000 1.000 N NA
 5737326 5737327 CLL_A0131 CLL_A0132 nrdG   FALSE 0.504 77.000 0.005 1.000 N NA
 5737327 5737328 CLL_A0132 CLL_A0133     FALSE 0.248 128.000 0.000 NA   NA
 5737328 5737329 CLL_A0133 CLL_A0134     FALSE 0.233 137.000 0.000 NA   NA
 5737329 5737330 CLL_A0134 CLL_A0135     TRUE 0.667 80.000 0.053 1.000 N NA
 5737330 5737331 CLL_A0135 CLL_A0136     TRUE 0.767 128.000 0.000 1.000 Y NA
 5737331 5737332 CLL_A0136 CLL_A0137     TRUE 0.993 25.000 0.650 0.029 Y NA
 5737332 5737333 CLL_A0137 CLL_A0138     TRUE 0.998 0.000 0.925 0.029 Y NA
 5737335 5737336 CLL_A0140 CLL_A0141   gufA FALSE 0.004 607.000 0.000 1.000 N NA
 5737337 5737338 CLL_A0142 CLL_A0143 asnS   FALSE 0.009 407.000 0.000 1.000   NA
 5737341 5737342 CLL_A0146 CLL_A0147 purR   TRUE 0.737 121.000 0.099 1.000 N NA
 5737342 5737343 CLL_A0147 CLL_A0148   glmU TRUE 0.684 185.000 0.011 1.000 Y NA
 5737343 5737344 CLL_A0148 CLL_A0149 glmU prsA TRUE 0.782 47.000 0.069 1.000 N NA
 5737344 5737345 CLL_A0149 CLL_A0150 prsA   TRUE 0.772 112.000 0.123 1.000 N NA
 5737345 5737346 CLL_A0150 CLL_A0151   pth FALSE 0.207 79.000 0.000 1.000 N NA
 5737346 5737347 CLL_A0151 CLL_A0152 pth mfd TRUE 0.955 15.000 0.137 1.000 N NA
 5737347 5737348 CLL_A0152 CLL_A0153 mfd   FALSE 0.439 136.000 0.002 1.000 N NA
 5737348 5737349 CLL_A0153 CLL_A0154   spoVT FALSE 0.061 192.000 0.000 NA N NA
 5737349 5737350 CLL_A0154 CLL_A0155 spoVT   TRUE 0.769 102.000 0.108 NA   NA
 5737350 5737351 CLL_A0155 CLL_A0156     TRUE 0.900 15.000 0.015 1.000   NA
 5737351 5737352 CLL_A0156 CLL_A0157   hup FALSE 0.238 202.000 0.014 1.000   NA
 5737352 5737353 CLL_A0157 CLL_A0158 hup   TRUE 0.669 51.000 0.024 1.000 N NA
 5737353 5737354 CLL_A0158 CLL_A0159   yabP TRUE 0.741 133.000 0.108 NA   NA
 5737354 5737355 CLL_A0159 CLL_A0160 yabP   FALSE 0.005 567.000 0.000 NA   NA
 5737355 5737356 CLL_A0160 CLL_A0161     TRUE 0.843 57.000 0.179 1.000   NA
 5737356 5737357 CLL_A0161 CLL_A0162     FALSE 0.043 235.000 0.000 NA   NA
 5737357 5737358 CLL_A0162 CLL_A0163     TRUE 0.635 20.000 0.000 NA   NA
 5737358 5737359 CLL_A0163 CLL_A0164     TRUE 0.728 10.000 0.000 NA   NA
 5737359 5737360 CLL_A0164 CLL_A0165     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5737360 5737361 CLL_A0165 CLL_A0166     TRUE 0.647 19.000 0.000 NA   NA
 5737361 5737362 CLL_A0166 CLL_A0167     TRUE 0.728 10.000 0.000 NA   NA
 5737362 5737363 CLL_A0167 CLL_A0168     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5737363 5737364 CLL_A0168 CLL_A0169   spoIIE FALSE 0.006 510.000 0.000 NA   NA
 5737364 5737365 CLL_A0169 CLL_A0170 spoIIE   TRUE 0.591 139.000 0.041 1.000 N NA
 5737365 5737366 CLL_A0170 CLL_A0171   hpt TRUE 0.968 6.000 0.137 0.051 N NA
 5737366 5737367 CLL_A0171 CLL_A0172 hpt ftsH TRUE 0.799 74.000 0.180 1.000 N NA
 5737367 5737368 CLL_A0172 CLL_A0173 ftsH fhs FALSE 0.039 222.000 0.000 1.000 N NA
 5737368 5737369 CLL_A0173 CLL_A0174 fhs coaX FALSE 0.511 128.000 0.011 1.000 N NA
 5737369 5737370 CLL_A0174 CLL_A0175 coaX nifR TRUE 0.942 6.000 0.054 1.000 N NA
 5737370 5737371 CLL_A0175 CLL_A0176 nifR   FALSE 0.543 68.000 0.005 NA   NA
 5737371 5737372 CLL_A0176 CLL_A0177   greA TRUE 0.622 115.000 0.023 NA   NA
 5737372 5737373 CLL_A0177 CLL_A0178 greA lysS TRUE 0.826 45.000 0.098 1.000 N NA
 5737373 5737374 CLL_A0178 CLL_A0179 lysS   FALSE 0.038 243.000 0.000 NA   NA
 5737374 5737375 CLL_A0179 CLL_A0180     FALSE 0.016 317.000 0.000 NA   NA
 5737375 5737376 CLL_A0180 CLL_A0181     FALSE 0.018 304.000 0.000 NA   NA
 5737376 5737377 CLL_A0181 CLL_A0182   glyS FALSE 0.008 434.000 0.000 NA   NA
 5737377 5737378 CLL_A0182 CLL_A0183 glyS murD FALSE 0.225 187.000 0.002 1.000 N NA
 5737380 5737381 CLL_A0185 CLL_A0186   rrsB FALSE 0.011 364.000 0.000 NA   NA
 5737381 5737382 CLL_A0186 CLL_A0187 rrsB   FALSE 0.254 125.000 0.000 NA   NA
 5737382 5737383 CLL_A0187 CLL_A0188     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5737383 5737384 CLL_A0188 CLL_A0190   rrlB FALSE 0.272 109.000 0.000 NA   NA
 5737384 5737385 CLL_A0190 CLL_A0191 rrlB rrfB FALSE 0.293 59.000 0.000 NA   NA
 5737385 5737386 CLL_A0191 CLL_A0192 rrfB   TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5737386 5737387 CLL_A0192 CLL_A0193     TRUE 0.786 1.000 0.000 NA   NA
 5737391 5737392 CLL_A0197 CLL_A0198     FALSE 0.197 153.000 0.000 NA   NA
 5737392 5737393 CLL_A0198 CLL_A0199     TRUE 0.653 115.000 0.034 NA   NA
 5737393 5737394 CLL_A0199 CLL_A0200     TRUE 0.910 12.000 0.018 NA   NA
 5737394 5737395 CLL_A0200 CLL_A0201     TRUE 0.984 4.000 0.372 NA   NA
 5737395 5737396 CLL_A0201 CLL_A0202     FALSE 0.467 144.000 0.005 NA   NA
 5737398 5737399 CLL_A0204 CLL_A0205     TRUE 0.986 15.000 0.681 NA   NA
 5737399 5737400 CLL_A0205 CLL_A0206     TRUE 0.995 -16.000 0.848 1.000   NA
 5737400 5737401 CLL_A0206 CLL_A0207     TRUE 0.929 25.000 0.129 1.000 N NA
 5737401 5737402 CLL_A0207 CLL_A0208     FALSE 0.172 292.000 0.000 1.000 Y NA
 5737402 5737403 CLL_A0208 CLL_A0209     TRUE 0.985 5.000 0.027 1.000 Y NA
 5737404 5737405 CLL_A0210 CLL_A0211     FALSE 0.269 68.000 0.000 NA   NA
 5737406 5737407 CLL_A0212 CLL_A0213 radA   TRUE 0.951 18.000 0.126 NA   NA
 5737409 5737410 CLL_A0215 CLL_A0216   ispD TRUE 0.950 19.000 0.134 NA   NA
 5737410 5737411 CLL_A0216 CLL_A0217 ispD proS FALSE 0.038 323.000 0.002 1.000 N NA
 5737411 5737412 CLL_A0217 CLL_A0218 proS cysS TRUE 0.969 20.000 0.005 0.051 Y NA
 5737412 5737413 CLL_A0218 CLL_A0219 cysS   TRUE 0.846 50.000 0.129 1.000   NA
 5737413 5737414 CLL_A0219 CLL_A0220     TRUE 0.974 5.000 0.150 0.005   NA
 5737414 5737415 CLL_A0220 CLL_A0221     TRUE 0.934 23.000 0.109 NA   NA
 5737415 5737416 CLL_A0221 CLL_A0222   sigH TRUE 0.874 87.000 0.361 NA   NA
 5737416 5737417 CLL_A0222 CLL_A0223 sigH   FALSE 0.267 78.000 0.000 NA   NA
 5737417 5737418 CLL_A0223 CLL_A0224   tuf FALSE 0.293 59.000 0.000 NA   NA
 5737418 5737419 CLL_A0224 CLL_A0225 tuf secE FALSE 0.038 363.000 0.009 1.000   NA
 5737419 5737420 CLL_A0225 CLL_A0226 secE nusG TRUE 0.965 38.000 0.843 1.000   NA
 5737420 5737421 CLL_A0226 CLL_A0227 nusG rplK TRUE 0.916 79.000 0.681 1.000 N NA
 5737421 5737422 CLL_A0227 CLL_A0228 rplK rplA TRUE 0.984 55.000 0.838 0.026 Y NA
 5737422 5737423 CLL_A0228 CLL_A0229 rplA   TRUE 0.800 211.000 0.302 1.000 Y NA
 5737423 5737424 CLL_A0229 CLL_A0230   rplL TRUE 0.983 58.000 0.884 1.000 Y NA
 5737424 5737425 CLL_A0230 CLL_A0231 rplL rpoB FALSE 0.122 365.000 0.223 1.000 N NA
 5737425 5737426 CLL_A0231 CLL_A0232 rpoB rpoC TRUE 0.996 22.000 0.851 0.001 Y NA
 5737426 5737427 CLL_A0232 CLL_A0233 rpoC rpsL FALSE 0.080 298.000 0.035 1.000 N NA
 5737427 5737428 CLL_A0233 CLL_A0234 rpsL rpsG TRUE 0.936 146.000 0.224 0.004 Y NA
 5737428 5737429 CLL_A0234 CLL_A0235 rpsG fusA TRUE 0.971 79.000 0.579 1.000 Y NA
 5737429 5737430 CLL_A0235 CLL_A0236 fusA tuf TRUE 0.965 94.000 0.400 0.002 Y NA
 5737430 5737431 CLL_A0236 CLL_A0237 tuf rpsJ FALSE 0.289 478.000 0.318 1.000 Y NA
 5737431 5737432 CLL_A0237 CLL_A0238 rpsJ rplC TRUE 0.968 73.000 0.467 0.026 Y NA
 5737432 5737433 CLL_A0238 CLL_A0239 rplC rplD TRUE 0.992 26.000 0.544 0.019 Y NA
 5737433 5737434 CLL_A0239 CLL_A0240 rplD rplW TRUE 0.996 0.000 0.307 0.019 Y NA
 5737434 5737435 CLL_A0240 CLL_A0241 rplW rplB TRUE 0.982 60.000 0.849 0.026 Y NA
 5737435 5737436 CLL_A0241 CLL_A0242 rplB rpsS TRUE 0.980 68.000 0.820 0.026 Y NA
 5737436 5737437 CLL_A0242 CLL_A0243 rpsS rplV TRUE 0.995 21.000 0.769 0.026 Y NA
 5737437 5737438 CLL_A0243 CLL_A0244 rplV rpsC TRUE 0.995 19.000 0.719 0.026 Y NA
 5737438 5737439 CLL_A0244 CLL_A0245 rpsC rplP TRUE 0.996 18.000 0.828 0.026 Y NA
 5737439 5737440 CLL_A0245 CLL_A0246 rplP rpmC TRUE 0.998 0.000 0.802 0.019 Y NA
 5737440 5737441 CLL_A0246 CLL_A0247 rpmC rpsQ TRUE 0.995 24.000 0.828 0.019 Y NA
 5737441 5737442 CLL_A0247 CLL_A0248 rpsQ rplN TRUE 0.993 29.000 0.791 0.026 Y NA
 5737442 5737443 CLL_A0248 CLL_A0249 rplN rplX TRUE 0.996 16.000 0.810 0.026 Y NA
 5737443 5737444 CLL_A0249 CLL_A0250 rplX rplE TRUE 0.995 24.000 0.758 0.019 Y NA
 5737444 5737445 CLL_A0250 CLL_A0251 rplE rpsN TRUE 0.994 17.000 0.496 0.019 Y NA
 5737445 5737446 CLL_A0251 CLL_A0252 rpsN rpsH TRUE 0.988 31.000 0.473 0.019 Y NA
 5737446 5737447 CLL_A0252 CLL_A0253 rpsH   TRUE 0.979 73.000 0.808 0.019 Y NA
 5737447 5737448 CLL_A0253 CLL_A0254   rplR TRUE 0.996 19.000 0.815 0.019 Y NA
 5737448 5737449 CLL_A0254 CLL_A0255 rplR rpsE TRUE 0.996 20.000 0.814 0.026 Y NA
 5737449 5737450 CLL_A0255 CLL_A0256 rpsE rpmD TRUE 0.997 12.000 0.789 0.026 Y NA
 5737450 5737451 CLL_A0256 CLL_A0257 rpmD rplO TRUE 0.994 24.000 0.653 0.003 Y NA
 5737451 5737452 CLL_A0257 CLL_A0258 rplO   TRUE 0.991 2.000 0.730 1.000 N NA
 5737452 5737453 CLL_A0258 CLL_A0259   adk TRUE 0.950 25.000 0.241 1.000 N NA
 5737453 5737454 CLL_A0259 CLL_A0260 adk map TRUE 0.980 4.000 0.290 1.000 N NA
 5737454 5737455 CLL_A0260 CLL_A0261 map   TRUE 0.815 89.000 0.185 NA   NA
 5737455 5737456 CLL_A0261 CLL_A0262   infA TRUE 0.958 8.000 0.090 NA   NA
 5737456 5737457 CLL_A0262 CLL_A0263 infA rpmJ TRUE 0.879 54.000 0.257 1.000   NA
 5737457 5737458 CLL_A0263 CLL_A0264 rpmJ rpsM FALSE 0.504 206.000 0.194 0.019   NA
 5737458 5737459 CLL_A0264 CLL_A0265 rpsM rpsK TRUE 0.996 20.000 0.810 0.019 Y NA
 5737459 5737460 CLL_A0265 CLL_A0266 rpsK rpsD TRUE 0.991 28.000 0.509 0.026 Y NA
 5737460 5737461 CLL_A0266 CLL_A0267 rpsD rpoA TRUE 0.902 112.000 0.549 1.000 N NA
 5737461 5737462 CLL_A0267 CLL_A0268 rpoA rplQ TRUE 0.989 13.000 0.873 1.000 N NA
 5737462 5737463 CLL_A0268 CLL_A0269 rplQ   FALSE 0.185 253.000 0.074 1.000 N NA
 5737463 5737464 CLL_A0269 CLL_A0270     TRUE 0.998 -15.000 0.713 0.024 Y NA
 5737464 5737465 CLL_A0270 CLL_A0271     TRUE 0.955 96.000 0.304 1.000 Y NA
 5737465 5737466 CLL_A0271 CLL_A0272   truA TRUE 0.976 16.000 0.404 1.000 N NA
 5737466 5737467 CLL_A0272 CLL_A0273 truA rplM TRUE 0.828 159.000 0.031 1.000 Y NA
 5737467 5737468 CLL_A0273 CLL_A0274 rplM rpsI TRUE 0.992 28.000 0.601 0.019 Y NA
 5737468 5737469 CLL_A0274 CLL_A0275 rpsI   FALSE 0.011 319.000 0.000 1.000 N NA
 5737469 5737470 CLL_A0275 CLL_A0276   cwlD FALSE 0.056 313.000 0.018 1.000 N NA
 5737472 5737473 CLL_A0278 CLL_A0279   fumB TRUE 0.655 257.000 0.262 0.001 Y NA
 5737475 5737476 CLL_A0281 CLL_A0282     FALSE 0.283 79.000 0.000 1.000   NA
 5737476 5737477 CLL_A0282 CLL_A0283     TRUE 0.999 -28.000 0.857 1.000 Y NA
 5737477 5737478 CLL_A0283 CLL_A0284     FALSE 0.229 203.000 0.022 1.000 N NA
 5737478 5737479 CLL_A0284 CLL_A0285     TRUE 0.597 297.000 0.393 0.001 Y NA
 5737479 5737480 CLL_A0285 CLL_A0286   ptsP FALSE 0.067 193.000 0.000 1.000 N NA
 5737480 5737481 CLL_A0286 CLL_A0287 ptsP chrA FALSE 0.028 242.000 0.000 1.000 N NA
 5737481 5737482 CLL_A0287 CLL_A0288 chrA   TRUE 0.996 4.000 0.455 0.001 Y NA
 5737482 5737483 CLL_A0288 CLL_A0289     FALSE 0.171 165.000 0.000 1.000   NA
 5737483 5737484 CLL_A0289 CLL_A0290   iadA FALSE 0.388 46.000 0.000 1.000   NA
 5737485 5737486 CLL_A0291 CLL_A0292     TRUE 0.809 70.000 0.167 NA   NA
 5737487 5737488 CLL_A0293 CLL_A0294     TRUE 0.993 -30.000 0.502 NA   NA
 5737488 5737489 CLL_A0294 CLL_A0295     TRUE 0.746 104.000 0.083 NA   NA
 5737489 5737490 CLL_A0295 CLL_A0296   ptb FALSE 0.364 174.000 0.013 NA   NA
 5737490 5737491 CLL_A0296 CLL_A0297 ptb buk TRUE 0.988 24.000 0.275 1.000 Y NA
 5737491 5737492 CLL_A0297 CLL_A0298 buk   FALSE 0.014 327.000 0.000 NA   NA
 5737492 5737493 CLL_A0298 CLL_A0299     TRUE 0.622 83.000 0.025 NA   NA
 5737493 5737494 CLL_A0299 CLL_A0300   glmM FALSE 0.023 290.000 0.000 1.000   NA
 5737494 5737495 CLL_A0300 CLL_A0301 glmM   FALSE 0.023 284.000 0.000 NA   NA
 5737495 5737496 CLL_A0301 CLL_A0302     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5737496 5737497 CLL_A0302 CLL_A0303     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5737497 5737498 CLL_A0303 CLL_A0304     FALSE 0.496 31.000 0.000 NA   NA
 5737498 5737499 CLL_A0304 CLL_A0305     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5737499 5737500 CLL_A0305 CLL_A0306     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5737500 5737501 CLL_A0306 CLL_A0307     FALSE 0.382 44.000 0.000 NA   NA
 5737501 5737502 CLL_A0307 CLL_A0308     TRUE 0.961 19.000 0.214 NA   NA
 5737502 5737503 CLL_A0308 CLL_A0309     FALSE 0.005 762.000 0.000 NA   NA
 5737503 5737504 CLL_A0309 CLL_A0310     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5737504 5737505 CLL_A0310 CLL_A0311     TRUE 0.626 21.000 0.000 NA   NA
 5737507 5737508 CLL_A0313 CLL_A0314     TRUE 0.689 15.000 0.000 NA   NA
 5737508 5737509 CLL_A0314 CLL_A0315     FALSE 0.120 179.000 0.000 NA   NA
 5737509 5737510 CLL_A0315 CLL_A0316     FALSE 0.309 56.000 0.000 NA   NA
 5737510 5737511 CLL_A0316 CLL_A0317     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5737511 5737512 CLL_A0317 CLL_A0318     FALSE 0.028 266.000 0.000 NA   NA
 5737512 5737513 CLL_A0318 CLL_A0319     FALSE 0.238 133.000 0.000 NA   NA
 5737513 5737514 CLL_A0319 CLL_A0320     FALSE 0.023 283.000 0.000 NA   NA
 5737514 5737515 CLL_A0320 CLL_A0321   ilvN FALSE 0.010 375.000 0.000 NA   NA
 5737515 5737516 CLL_A0321 CLL_A0322 ilvN leuC TRUE 0.736 174.000 0.012 1.000 Y NA
 5737516 5737517 CLL_A0322 CLL_A0323 leuC leuD TRUE 0.996 15.000 0.615 0.001 Y NA
 5737517 5737518 CLL_A0323 CLL_A0324 leuD leuB TRUE 0.888 172.000 0.191 0.002 Y NA
 5737518 5737519 CLL_A0324 CLL_A0325 leuB ilvD TRUE 0.986 7.000 0.044 1.000 Y NA
 5737519 5737520 CLL_A0325 CLL_A0326 ilvD ilvB TRUE 0.916 87.000 0.062 0.003 Y NA
 5737520 5737521 CLL_A0326 CLL_A0327 ilvB ilvC TRUE 0.968 22.000 0.006 0.003 Y NA
 5737521 5737522 CLL_A0327 CLL_A0328 ilvC   FALSE 0.003 850.000 0.000 1.000 N NA
 5737522 5737523 CLL_A0328 CLL_A0329     FALSE 0.366 44.000 0.000 0.056 N NA
 5737523 5737524 CLL_A0329 CLL_A0330     FALSE 0.012 311.000 0.000 1.000 N NA
 5737524 5737525 CLL_A0330 CLL_A0331     TRUE 0.944 62.000 0.167 1.000 Y NA
 5737525 5737526 CLL_A0331 CLL_A0332     TRUE 0.989 5.000 0.610 NA   NA
 5737528 5737529 CLL_A0334 CLL_A0335     TRUE 0.980 5.000 0.333 NA N NA
 5737529 5737530 CLL_A0335 CLL_A0336     TRUE 0.932 27.000 0.182 NA N NA
 5737530 5737531 CLL_A0336 CLL_A0337     FALSE 0.006 512.000 0.000 NA   NA
 5737531 5737532 CLL_A0337 CLL_A3607     FALSE 0.009 389.000 0.000 NA   NA
 5737532 5737533 CLL_A3607 CLL_A0338   glmS FALSE 0.264 120.000 0.000 NA   NA
 5737533 5737534 CLL_A0338 CLL_A0339 glmS   FALSE 0.180 124.000 0.000 NA N NA
 5737534 5737535 CLL_A0339 CLL_A0340     FALSE 0.021 253.000 0.000 NA N NA
 5737535 5737536 CLL_A0340 CLL_A0341     FALSE 0.004 558.000 0.000 1.000 N NA
 5737536 5737537 CLL_A0341 CLL_A0342     FALSE 0.007 381.000 0.000 1.000 N NA
 5737537 5737538 CLL_A0342 CLL_A0343     FALSE 0.050 589.000 0.000 1.000 Y NA
 5737538 5737539 CLL_A0343 CLL_A0344     FALSE 0.183 158.000 0.000 NA   NA
 5737541 5737542 CLL_A0346 CLL_A0347     FALSE 0.011 320.000 0.000 1.000 N NA
 5737543 5737544 CLL_A0348 CLL_A0349 thrS   FALSE 0.009 394.000 0.000 NA   NA
 5737545 5737546 CLL_A0350 CLL_A0351   glpT FALSE 0.212 112.000 0.000 1.000 N NA
 5737546 5737547 CLL_A0351 CLL_A0352 glpT   FALSE 0.008 429.000 0.000 NA   NA
 5737551 5737552 CLL_A0356 CLL_A0357     FALSE 0.271 67.000 0.000 NA   NA
 5737553 5737554 CLL_A0358 CLL_A0359     FALSE 0.177 138.000 0.000 1.000 N NA
 5737557 5737558 CLL_A0362 CLL_A0363     TRUE 0.931 27.000 0.148 NA   NA
 5737558 5737559 CLL_A0363 CLL_A0364     TRUE 0.981 103.000 0.875 0.017 Y NA
 5737559 5737560 CLL_A0364 CLL_A0365     TRUE 0.998 5.000 0.875 0.012 Y NA
 5737560 5737561 CLL_A0365 CLL_A0366     FALSE 0.006 582.000 0.000 1.000   NA
 5737561 5737562 CLL_A0366 CLL_A0367     FALSE 0.148 169.000 0.000 NA   NA
 5737562 5737563 CLL_A0367 CLL_A0368     FALSE 0.060 214.000 0.000 NA   NA
 5737563 5737564 CLL_A0368 CLL_A0369     FALSE 0.027 274.000 0.000 1.000   NA
 5737564 5737565 CLL_A0369 CLL_A0370     TRUE 0.821 129.000 0.222 1.000   NA
 5737565 5737566 CLL_A0370 CLL_A0371   cadA TRUE 0.972 18.000 0.364 1.000 N NA
 5737566 5737567 CLL_A0371 CLL_A0372 cadA   FALSE 0.010 392.000 0.000 1.000   NA
 5737567 5737568 CLL_A0372 CLL_A0373   crt FALSE 0.014 347.000 0.000 1.000   NA
 5737568 5737569 CLL_A0373 CLL_A0374 crt   TRUE 0.938 80.000 0.162 1.000 Y NA
 5737569 5737570 CLL_A0374 CLL_A0375     TRUE 0.978 20.000 0.545 0.047 N NA
 5737570 5737571 CLL_A0375 CLL_A0376     TRUE 0.994 23.000 0.714 0.017 Y NA
 5737571 5737572 CLL_A0376 CLL_A0377     TRUE 0.819 103.000 0.216 1.000 N NA
 5737572 5737573 CLL_A0377 CLL_A0378     FALSE 0.165 164.000 0.000 NA   NA
 5737573 5737574 CLL_A0378 CLL_A0379     TRUE 0.573 75.000 0.012 NA   NA
 5737574 5737575 CLL_A0379 CLL_A0380     FALSE 0.502 159.000 0.024 1.000   NA
 5737575 5737576 CLL_A0380 CLL_A0381     FALSE 0.085 198.000 0.000 1.000   NA
 5737576 5737577 CLL_A0381 CLL_A0382     TRUE 0.969 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5737577 5737578 CLL_A0382 CLL_A0383     TRUE 0.586 25.000 0.000 NA   NA
 5737578 5737579 CLL_A0383 CLL_A0384     TRUE 0.987 21.000 1.000 NA   NA
 5737579 5737580 CLL_A0384 CLL_A0385   groS FALSE 0.006 393.000 0.000 1.000 N NA
 5737580 5737581 CLL_A0385 CLL_A0386 groS groL TRUE 0.996 14.000 0.674 1.000 Y NA
 5737581 5737582 CLL_A0386 CLL_A0387 groL   FALSE 0.038 215.000 0.000 NA N NA
 5737582 5737583 CLL_A0387 CLL_A0388   guaB FALSE 0.009 336.000 0.000 NA N NA
 5737583 5737584 CLL_A0388 CLL_A0389 guaB guaA TRUE 0.948 87.000 0.190 0.001 Y NA
 5737586 5737587 CLL_A0391 CLL_A0392     FALSE 0.008 407.000 0.000 NA   NA
 5737587 5737588 CLL_A0392 CLL_A0393     FALSE 0.265 88.000 0.000 NA   NA
 5737588 5737589 CLL_A0393 CLL_A0394     FALSE 0.052 224.000 0.000 NA   NA
 5737589 5737590 CLL_A0394 CLL_A0395     FALSE 0.016 314.000 0.000 NA   NA
 5737590 5737591 CLL_A0395 CLL_A0396     TRUE 0.969 4.000 0.000 NA Y NA
 5737591 5737592 CLL_A0396 CLL_A0397     TRUE 0.889 32.000 0.116 NA N NA
 5737592 5737593 CLL_A0397 CLL_A0398     TRUE 0.747 83.000 0.070 0.012   NA
 5737593 5737594 CLL_A0398 CLL_A0399     TRUE 0.853 -371.000 0.000 NA   NA
 5737594 5737595 CLL_A0399 CLL_A0400     FALSE 0.362 47.000 0.000 NA   NA
 5737595 5737596 CLL_A0400 CLL_A0401     FALSE 0.019 270.000 0.000 1.000 N NA
 5737596 5737597 CLL_A0401 CLL_A0402     FALSE 0.133 160.000 0.000 1.000 N NA
 5737597 5737598 CLL_A0402 CLL_A0403   pgi FALSE 0.520 190.000 0.000 1.000 Y NA
 5737598 5737599 CLL_A0403 CLL_A0404 pgi   TRUE 0.928 4.000 0.018 NA   NA
 5737599 5737600 CLL_A0404 CLL_A0405     FALSE 0.201 152.000 0.000 NA   NA
 5737600 5737601 CLL_A0405 CLL_A0406     TRUE 0.625 162.000 0.083 NA   NA
 5737601 5737602 CLL_A0406 CLL_A0407   rluB FALSE 0.255 215.000 0.041 NA   NA
 5737602 5737603 CLL_A0407 CLL_A0408 rluB   FALSE 0.004 539.000 0.000 1.000 N NA
 5737603 5737604 CLL_A0408 CLL_A0409   ligA TRUE 0.901 88.000 0.039 0.017 Y NA
 5737604 5737605 CLL_A0409 CLL_A0410 ligA gatC FALSE 0.029 371.000 0.006 1.000 N NA
 5737605 5737606 CLL_A0410 CLL_A0411 gatC   TRUE 0.995 19.000 0.643 0.001 Y NA
 5737606 5737607 CLL_A0411 CLL_A0412   gatB TRUE 0.993 21.000 0.492 0.001 Y NA
 5737611 5737612 CLL_A0416 CLL_A0417   rph FALSE 0.016 316.000 0.000 NA   NA
 5737612 5737613 CLL_A0417 CLL_A0418 rph rdgB TRUE 0.978 4.000 0.262 1.000 N NA
 5737613 5737614 CLL_A0418 CLL_A0419 rdgB   TRUE 0.954 12.000 0.085 1.000   NA
 5737614 5737615 CLL_A0419 CLL_A0420     FALSE 0.246 129.000 0.000 NA   NA
 5737615 5737616 CLL_A0420 CLL_A0421     TRUE 0.606 23.000 0.000 NA   NA
 5737616 5737617 CLL_A0421 CLL_A0422     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5737617 5737618 CLL_A0422 CLL_A0423     TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 5737618 5737619 CLL_A0423 CLL_A0424     TRUE 0.779 2.000 0.000 NA   NA
 5737619 5737620 CLL_A0424 CLL_A0425     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5737620 5737621 CLL_A0425 CLL_A0426     TRUE 0.735 8.000 0.000 NA   NA
 5737621 5737622 CLL_A0426 CLL_A0427     TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 5737622 5737623 CLL_A0427 CLL_A0428     TRUE 0.689 15.000 0.000 NA   NA
 5737623 5737624 CLL_A0428 CLL_A0429     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5737624 5737625 CLL_A0429 CLL_A0430     TRUE 0.735 8.000 0.000 NA   NA
 5737625 5737626 CLL_A0430 CLL_A0431     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5737626 5737627 CLL_A0431 CLL_A0432     TRUE 0.626 21.000 0.000 NA   NA
 5737627 5737628 CLL_A0432 CLL_A0433     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5737628 5737629 CLL_A0433 CLL_A0434     TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 5737629 5737630 CLL_A0434 CLL_A0435     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5737630 5737631 CLL_A0435 CLL_A0436     FALSE 0.369 46.000 0.000 NA   NA
 5737631 5737632 CLL_A0436 CLL_A0437     FALSE 0.020 292.000 0.000 NA   NA
 5737632 5737633 CLL_A0437 CLL_A0438   rrsC FALSE 0.005 677.000 0.000 NA   NA
 5737633 5737634 CLL_A0438 CLL_A0439 rrsC   FALSE 0.256 124.000 0.000 NA   NA
 5737634 5737635 CLL_A0439 CLL_A0441   rrlC FALSE 0.009 387.000 0.000 NA   NA
 5737635 5737636 CLL_A0441 CLL_A0442 rrlC   FALSE 0.288 60.000 0.000 NA   NA
 5737636 5737637 CLL_A0442 CLL_A0443     FALSE 0.014 326.000 0.000 NA   NA
 5737637 5737638 CLL_A0443 CLL_A0444     FALSE 0.206 102.000 0.000 1.000 N NA
 5737638 5737639 CLL_A0444 CLL_A0445     TRUE 0.996 5.000 0.472 1.000 Y NA
 5737639 5737640 CLL_A0445 CLL_A0446     TRUE 0.987 -3.000 0.323 NA   NA
 5737640 5737641 CLL_A0446 CLL_A0447     FALSE 0.098 190.000 0.000 NA   NA
 5737641 5737642 CLL_A0447 CLL_A0448     TRUE 0.968 4.000 0.114 NA   NA
 5737644 5737645 CLL_A0450 CLL_A0452   gidA TRUE 0.817 31.000 0.023 1.000   NA
 5737646 5737647 CLL_A0451 CLL_A0453     TRUE 0.604 16.000 0.000 1.000 N NA
 5737648 5737649 CLL_A0454 CLL_A0455     TRUE 0.911 3.000 0.004 NA   NA
 5737649 5737650 CLL_A0455 CLL_A0456     TRUE 0.711 165.000 0.200 NA   NA
 5737650 5737651 CLL_A0456 CLL_A0457     FALSE 0.184 162.000 0.000 1.000   NA
 5737651 5737652 CLL_A0457 CLL_A0458     FALSE 0.015 327.000 0.000 1.000   NA
 5737652 5737653 CLL_A0458 CLL_A0459     FALSE 0.557 26.000 0.000 0.036 N NA
 5737655 5737656 CLL_A0461 CLL_A0462     TRUE 0.971 20.000 0.357 NA   NA
 5737656 5737657 CLL_A0462 CLL_A0463     TRUE 0.928 94.000 0.800 NA   NA
 5737659 5737660 CLL_A0465 CLL_A0466     FALSE 0.443 201.000 0.119 NA   NA
 5737660 5737661 CLL_A0466 CLL_A0467     FALSE 0.515 189.000 0.116 NA   NA
 5737661 5737662 CLL_A0467 CLL_A0468     FALSE 0.062 414.000 0.082 NA   NA
 5737662 5737663 CLL_A0468 CLL_A0469     FALSE 0.336 225.000 0.109 1.000   NA
 5737663 5737664 CLL_A0469 CLL_A0470   cphA TRUE 0.993 -28.000 0.605 1.000 N NA
 5737664 5737665 CLL_A0470 CLL_A0471 cphA ispE FALSE 0.316 181.000 0.016 1.000 N NA
 5737665 5737666 CLL_A0471 CLL_A0472 ispE spoIIR TRUE 0.580 62.000 0.009 NA   NA
 5737666 5737667 CLL_A0472 CLL_A0473 spoIIR   TRUE 0.690 38.000 0.005 NA   NA
 5737667 5737668 CLL_A0473 CLL_A0474     TRUE 0.577 65.000 0.011 NA   NA
 5737668 5737669 CLL_A0474 CLL_A0475     TRUE 0.640 126.000 0.039 NA   NA
 5737669 5737670 CLL_A0475 CLL_A0476   pyrG FALSE 0.267 186.000 0.004 NA   NA
 5737670 5737671 CLL_A0476 CLL_A0477 pyrG rho FALSE 0.007 383.000 0.000 1.000 N NA
 5737672 5737673 CLL_A0478 CLL_A0479   rpmE FALSE 0.430 142.000 0.004 1.000 N NA
 5737674 5737675 CLL_A0480 CLL_A0481 tdk   TRUE 0.826 30.000 0.026 NA   NA
 5737675 5737676 CLL_A0481 CLL_A0482   hemK TRUE 0.975 -7.000 0.098 NA   NA
 5737676 5737677 CLL_A0482 CLL_A0483 hemK prfA FALSE 0.470 266.000 0.081 1.000 Y NA
 5737677 5737678 CLL_A0483 CLL_A0484 prfA   FALSE 0.501 142.000 0.009 NA   NA
 5737678 5737679 CLL_A0484 CLL_A0485     TRUE 0.885 19.000 0.020 NA   NA
 5737679 5737680 CLL_A0485 CLL_A0486   rpiB FALSE 0.551 124.000 0.020 NA N NA
 5737680 5737681 CLL_A0486 CLL_A0487 rpiB upp TRUE 0.681 46.000 0.019 1.000 N NA
 5737681 5737682 CLL_A0487 CLL_A0488 upp   TRUE 0.898 115.000 0.041 1.000 Y NA
 5737682 5737683 CLL_A0488 CLL_A0489     FALSE 0.512 128.000 0.011 1.000 N NA
 5737683 5737684 CLL_A0489 CLL_A0490     TRUE 0.701 130.000 0.083 1.000 N NA
 5737684 5737685 CLL_A0490 CLL_A0491     FALSE 0.004 1044.000 0.000 NA   NA
 5737685 5737686 CLL_A0491 CLL_A0492   atpB TRUE 0.918 2.000 0.005 NA   NA
 5737686 5737687 CLL_A0492 CLL_A0493 atpB atpE TRUE 0.878 33.000 0.069 0.008   NA
 5737687 5737688 CLL_A0493 CLL_A0494 atpE atpF TRUE 0.944 51.000 0.643 0.007   NA
 5737688 5737689 CLL_A0494 CLL_A0495 atpF atpH TRUE 0.988 3.000 0.040 0.007 Y NA
 5737689 5737690 CLL_A0495 CLL_A0496 atpH atpA TRUE 0.997 11.000 0.864 0.007 Y NA
 5737690 5737691 CLL_A0496 CLL_A0497 atpA atpG TRUE 0.989 41.000 0.846 0.007 Y NA
 5737691 5737692 CLL_A0497 CLL_A0498 atpG atpD TRUE 0.996 16.000 0.724 0.007 Y NA
 5737692 5737693 CLL_A0498 CLL_A0499 atpD atpC TRUE 0.997 14.000 0.837 0.007 Y NA
 5737693 5737694 CLL_A0499 CLL_A0500 atpC   FALSE 0.430 158.000 0.007 NA   NA
 5737694 5737695 CLL_A0500 CLL_A0501   murA TRUE 0.881 62.000 0.346 NA   NA
 5737695 5737696 CLL_A0501 CLL_A0502 murA spoIID TRUE 0.832 118.000 0.243 1.000 N NA
 5737696 5737697 CLL_A0502 CLL_A0503 spoIID   FALSE 0.561 173.000 0.090 NA   NA
 5737697 5737698 CLL_A0503 CLL_A0504   spoIIID TRUE 0.748 91.000 0.093 NA   NA
 5737698 5737699 CLL_A0504 CLL_A0505 spoIIID   TRUE 0.857 80.000 0.284 1.000   NA
 5737701 5737702 CLL_A0507 CLL_A0508     FALSE 0.176 161.000 0.000 NA   NA
 5737702 5737703 CLL_A0508 CLL_A0509     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5737703 5737704 CLL_A0509 CLL_A0510     TRUE 0.635 20.000 0.000 NA   NA
 5737704 5737705 CLL_A0510 CLL_A0511     TRUE 0.735 8.000 0.000 NA   NA
 5737705 5737706 CLL_A0511 CLL_A0512     TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5737706 5737707 CLL_A0512 CLL_A0513     TRUE 0.626 21.000 0.000 NA   NA
 5737707 5737708 CLL_A0513 CLL_A0514     TRUE 0.738 7.000 0.000 NA   NA
 5737708 5737709 CLL_A0514 CLL_A0515   metK FALSE 0.011 363.000 0.000 NA   NA
 5737709 5737710 CLL_A0515 CLL_A0516 metK   FALSE 0.044 409.000 0.052 1.000 N NA
 5737710 5737711 CLL_A0516 CLL_A0517     TRUE 0.850 35.000 0.069 NA   NA
 5737711 5737712 CLL_A0517 CLL_A0518     TRUE 0.947 -24.000 0.005 NA   NA
 5737712 5737713 CLL_A0518 CLL_A0519     FALSE 0.065 396.000 0.080 NA   NA
 5737713 5737714 CLL_A0519 CLL_A0520   secA FALSE 0.066 333.000 0.050 NA N NA
 5737714 5737715 CLL_A0520 CLL_A0521 secA   FALSE 0.190 156.000 0.000 NA   NA
 5737715 5737716 CLL_A0521 CLL_A0522   prfB FALSE 0.382 44.000 0.000 NA   NA
 5737720 5737721 CLL_A0526 CLL_A0527     FALSE 0.107 189.000 0.000 1.000   NA
 5737721 5737722 CLL_A0527 CLL_A0528     TRUE 0.741 37.000 0.013 1.000   NA
 5737722 5737723 CLL_A0528 CLL_A0529     FALSE 0.005 588.000 0.000 NA   NA
 5737724 5737725 CLL_A0530 CLL_A0531 rimI   TRUE 0.982 -16.000 0.127 1.000   NA
 5737725 5737726 CLL_A0531 CLL_A0532     TRUE 0.983 -3.000 0.217 NA   NA
 5737727 5737728 CLL_A0533 CLL_A0534     FALSE 0.337 51.000 0.000 NA   NA
 5737728 5737729 CLL_A0534 CLL_A0535     FALSE 0.208 149.000 0.000 NA   NA
 5737729 5737730 CLL_A0535 CLL_A0536     FALSE 0.009 396.000 0.000 NA   NA
 5737730 5737731 CLL_A0536 CLL_A0537     FALSE 0.351 243.000 0.250 1.000 N NA
 5737731 5737732 CLL_A0537 CLL_A0538     TRUE 0.955 0.000 0.053 1.000 N NA
 5737734 5737735 CLL_A0540 CLL_A0541     TRUE 0.882 -13.000 0.000 0.004   NA
 5737735 5737736 CLL_A0541 CLL_A0542     FALSE 0.005 733.000 0.000 NA   NA
 5737738 5737739 CLL_A0544 CLL_A0545     FALSE 0.011 370.000 0.000 1.000   NA
 5737739 5737740 CLL_A0545 CLL_A0546     TRUE 0.606 23.000 0.000 NA   NA
 5737740 5737741 CLL_A0546 CLL_A0547     FALSE 0.018 306.000 0.000 NA   NA
 5737741 5737742 CLL_A0547 CLL_A0548     FALSE 0.339 413.000 0.330 NA Y NA
 5737742 5737743 CLL_A0548 CLL_A0549     TRUE 0.570 86.000 0.021 NA N NA
 5737743 5737744 CLL_A0549 CLL_A0550     FALSE 0.018 275.000 0.000 1.000 N NA
 5737744 5737745 CLL_A0550 CLL_A0551     TRUE 0.651 123.000 0.037 1.000   NA
 5737745 5737746 CLL_A0551 CLL_A0552     FALSE 0.277 95.000 0.000 1.000   NA
 5737747 5737748 CLL_A0553 CLL_A0554     TRUE 0.967 11.000 0.160 NA   NA
 5737748 5737749 CLL_A0554 CLL_A0555     TRUE 0.846 38.000 0.080 NA   NA
 5737752 5737753 CLL_A0558 CLL_A0559     FALSE 0.038 248.000 0.000 1.000   NA
 5737753 5737754 CLL_A0559 CLL_A0560     TRUE 0.869 124.000 0.364 NA   NA
 5737754 5737755 CLL_A0560 CLL_A0561   maf FALSE 0.042 238.000 0.000 NA   NA
 5737755 5737756 CLL_A0561 CLL_A0562 maf   TRUE 0.801 44.000 0.074 NA N NA
 5737756 5737757 CLL_A0562 CLL_A0563     TRUE 0.898 19.000 0.040 1.000 N NA
 5737757 5737758 CLL_A0563 CLL_A0564   mreC TRUE 0.990 4.000 0.689 1.000 N NA
 5737758 5737759 CLL_A0564 CLL_A0565 mreC mreD TRUE 0.987 11.000 0.550 0.003   NA
 5737759 5737760 CLL_A0565 CLL_A0566 mreD   TRUE 0.972 -3.000 0.089 1.000   NA
 5737760 5737761 CLL_A0566 CLL_A0567   minC FALSE 0.065 373.000 0.060 1.000   NA
 5737761 5737762 CLL_A0567 CLL_A0568 minC minD TRUE 0.992 19.000 0.368 1.000 Y NA
 5737762 5737763 CLL_A0568 CLL_A0569 minD minE TRUE 0.993 13.000 0.347 NA Y NA
 5737763 5737764 CLL_A0569 CLL_A0570 minE   TRUE 0.773 122.000 0.000 NA Y NA
 5737764 5737765 CLL_A0570 CLL_A0571   mgsA FALSE 0.277 49.000 0.000 1.000 N NA
 5737765 5737766 CLL_A0571 CLL_A0572 mgsA   TRUE 0.647 19.000 0.000 NA   NA
 5737766 5737767 CLL_A0572 CLL_A0573     FALSE 0.008 419.000 0.000 NA   NA
 5737767 5737768 CLL_A0573 CLL_A0574     TRUE 0.615 29.000 0.000 0.005   NA
 5737768 5737769 CLL_A0574 CLL_A0575     FALSE 0.372 212.000 0.098 1.000   NA
 5737769 5737770 CLL_A0575 CLL_A0576     TRUE 0.992 -16.000 0.420 NA   NA
 5737770 5737771 CLL_A0576 CLL_A0577     TRUE 0.814 79.000 0.180 NA   NA
 5737771 5737772 CLL_A0577 CLL_A0578   rplU TRUE 0.661 195.000 0.018 0.026 Y NA
 5737772 5737773 CLL_A0578 CLL_A0579 rplU   TRUE 0.993 5.000 0.208 NA Y NA
 5737773 5737774 CLL_A0579 CLL_A0580   rpmA TRUE 0.993 5.000 0.203 NA Y NA
 5737774 5737775 CLL_A0580 CLL_A0581 rpmA   FALSE 0.106 503.000 0.335 1.000   NA
 5737775 5737776 CLL_A0581 CLL_A0582     TRUE 0.902 22.000 0.046 NA   NA
 5737776 5737777 CLL_A0582 CLL_A0583   nadD FALSE 0.144 310.000 0.150 NA N NA
 5737777 5737778 CLL_A0583 CLL_A0584 nadD   TRUE 0.993 5.000 0.199 1.000 Y NA
 5737778 5737779 CLL_A0584 CLL_A0585     TRUE 0.609 70.000 0.033 NA N NA
 5737779 5737780 CLL_A0585 CLL_A0586     TRUE 0.913 25.000 0.093 NA N NA
 5737782 5737783 CLL_A0588 CLL_A0589     FALSE 0.236 135.000 0.000 NA   NA
 5737783 5737784 CLL_A0589 CLL_A0590     FALSE 0.111 183.000 0.000 NA   NA
 5737784 5737785 CLL_A0590 CLL_A0591     TRUE 0.947 26.000 0.214 NA   NA
 5737785 5737786 CLL_A0591 CLL_A0592   rumA TRUE 0.924 17.000 0.051 NA   NA
 5737787 5737788 CLL_A0593 CLL_A0594     TRUE 0.843 -16.000 0.000 NA   NA
 5737788 5737789 CLL_A0594 CLL_A0595     FALSE 0.106 185.000 0.000 NA   NA
 5737790 5737791 CLL_A0596 CLL_A0597     FALSE 0.400 52.000 0.000 0.024   NA
 5737791 5737792 CLL_A0597 CLL_A0598     TRUE 0.689 17.000 0.000 1.000   NA
 5737792 5737793 CLL_A0598 CLL_A0599     FALSE 0.267 78.000 0.000 NA   NA
 5737793 5737794 CLL_A0599 CLL_A0600     FALSE 0.222 142.000 0.000 NA   NA
 5737794 5737795 CLL_A0600 CLL_A0601     FALSE 0.111 183.000 0.000 NA   NA
 5737795 5737796 CLL_A0601 CLL_A0602     FALSE 0.004 1665.000 0.000 NA   NA
 5737797 5737798 CLL_A0603 CLL_A0604     FALSE 0.007 441.000 0.000 NA   NA
 5737799 5737800 CLL_A0605 CLL_A0606     FALSE 0.004 990.000 0.000 NA   NA
 5737800 5737801 CLL_A0606 CLL_A0607     TRUE 0.586 25.000 0.000 NA   NA
 5737801 5737802 CLL_A0607 CLL_A0608     FALSE 0.077 199.000 0.000 NA   NA
 5737802 5737803 CLL_A0608 CLL_A0609     FALSE 0.089 194.000 0.000 NA   NA
 5737803 5737804 CLL_A0609 CLL_A0610     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5737804 5737805 CLL_A0610 CLL_A0611     FALSE 0.273 111.000 0.000 NA   NA
 5737807 5737808 CLL_A0613 CLL_A0614     FALSE 0.015 324.000 0.000 NA   NA
 5737808 5737809 CLL_A0614 CLL_A0615     FALSE 0.542 28.000 0.000 NA   NA
 5737810 5737811 CLL_A0616 CLL_A0617     TRUE 0.884 44.000 0.188 NA   NA
 5737812 5737813 CLL_A0618 CLL_A0619     FALSE 0.021 262.000 0.000 1.000 N NA
 5737813 5737814 CLL_A0619 CLL_A0620     FALSE 0.005 449.000 0.000 1.000 N NA
 5737814 5737815 CLL_A0620 CLL_A0621     FALSE 0.008 363.000 0.000 1.000 N NA
 5737815 5737816 CLL_A0621 CLL_A0622     FALSE 0.007 381.000 0.000 1.000 N NA
 5737816 5737817 CLL_A0622 CLL_A0623   ygeW TRUE 0.964 57.000 0.312 1.000 Y NA
 5737817 5737818 CLL_A0623 CLL_A0624 ygeW arcC FALSE 0.345 314.000 0.088 1.000 Y NA
 5737818 5737819 CLL_A0624 CLL_A0625 arcC dpaL TRUE 0.872 39.000 0.000 1.000 Y NA
 5737819 5737820 CLL_A0625 CLL_A0626 dpaL   FALSE 0.473 27.000 0.000 1.000 N NA
 5737820 5737821 CLL_A0626 CLL_A0627     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5737821 5737822 CLL_A0627 CLL_A0628     FALSE 0.266 72.000 0.000 NA   NA
 5737822 5737823 CLL_A0628 CLL_A0629     TRUE 0.876 38.000 0.000 1.000 Y NA
 5737823 5737824 CLL_A0629 CLL_A0630     FALSE 0.056 195.000 0.000 NA N NA
 5737824 5737825 CLL_A0630 CLL_A0631     FALSE 0.189 81.000 0.000 NA N NA
 5737825 5737826 CLL_A0631 CLL_A0632     FALSE 0.004 541.000 0.000 1.000 N NA
 5737826 5737827 CLL_A0632 CLL_A0633     TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5737827 5737828 CLL_A0633 CLL_A0634   hydA FALSE 0.484 32.000 0.000 NA   NA
 5737830 5737831 CLL_A0636 CLL_A0637     TRUE 0.994 18.000 0.500 0.001 Y NA
 5737831 5737832 CLL_A0637 CLL_A0638     TRUE 0.997 2.000 0.667 0.044 Y NA
 5737832 5737833 CLL_A0638 CLL_A0639     FALSE 0.016 287.000 0.000 1.000 N NA
 5737833 5737834 CLL_A0639 CLL_A0640     FALSE 0.032 234.000 0.000 1.000 N NA
 5737834 5737835 CLL_A0640 CLL_A0641     TRUE 0.996 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 5737835 5737836 CLL_A0641 CLL_A0642     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5737836 5737837 CLL_A0642 CLL_A0643     FALSE 0.282 74.000 0.000 1.000   NA
 5737837 5737838 CLL_A0643 CLL_A0644     FALSE 0.233 137.000 0.000 NA   NA
 5737838 5737839 CLL_A0644 CLL_A0645     TRUE 0.651 97.000 0.038 NA   NA
 5737839 5737840 CLL_A0645 CLL_A0646   selD TRUE 0.729 140.000 0.104 1.000   NA
 5737840 5737841 CLL_A0646 CLL_A0647 selD   FALSE 0.038 243.000 0.000 NA   NA
 5737841 5737842 CLL_A0647 CLL_A0649   hgdC FALSE 0.369 46.000 0.000 NA   NA
 5737842 5737843 CLL_A0649 CLL_A0650 hgdC   FALSE 0.012 348.000 0.000 NA   NA
 5737843 5737844 CLL_A0650 CLL_A0651     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5737844 5737845 CLL_A0651 CLL_A0652   cbiQ FALSE 0.033 252.000 0.000 NA   NA
 5737845 5737846 CLL_A0652 CLL_A0653 cbiQ   TRUE 0.995 9.000 0.335 0.002 Y NA
 5737846 5737847 CLL_A0653 CLL_A0654   cbiM FALSE 0.073 428.000 0.000 1.000 Y NA
 5737847 5737848 CLL_A0654 CLL_A0655 cbiM   TRUE 0.998 3.000 0.861 0.013 Y NA
 5737848 5737849 CLL_A0655 CLL_A0656     FALSE 0.024 275.000 0.000 NA   NA
 5737849 5737850 CLL_A0656 CLL_A0657     FALSE 0.266 72.000 0.000 NA   NA
 5737852 5737853 CLL_A0659 CLL_A0660     FALSE 0.267 79.000 0.000 NA   NA
 5737853 5737854 CLL_A0660 CLL_A0661     TRUE 0.951 3.000 0.059 1.000 N NA
 5737854 5737855 CLL_A0661 CLL_A0662     FALSE 0.236 135.000 0.000 NA   NA
 5737855 5737856 CLL_A0662 CLL_A0663     FALSE 0.072 203.000 0.000 NA   NA
 5737856 5737857 CLL_A0663 CLL_A0664     FALSE 0.023 254.000 0.000 1.000 N NA
 5737857 5737858 CLL_A0664 CLL_A0665     FALSE 0.545 21.000 0.000 1.000 N NA
 5737858 5737859 CLL_A0665 CLL_A0666   gltA TRUE 0.990 3.000 0.667 0.044 N NA
 5737859 5737860 CLL_A0666 CLL_A0667 gltA   FALSE 0.009 337.000 0.000 1.000 N NA
 5737860 5737861 CLL_A0667 CLL_A0668     FALSE 0.049 206.000 0.000 1.000 N NA
 5737861 5737862 CLL_A0668 CLL_A0669     FALSE 0.268 83.000 0.000 NA   NA
 5737862 5737863 CLL_A0669 CLL_A0670     FALSE 0.018 304.000 0.000 NA   NA
 5737863 5737864 CLL_A0670 CLL_A0671     FALSE 0.096 187.000 0.000 0.062 N NA
 5737864 5737865 CLL_A0671 CLL_A0672     FALSE 0.165 164.000 0.000 NA   NA
 5737865 5737866 CLL_A0672 CLL_A0673     FALSE 0.020 292.000 0.000 NA   NA
 5737866 5737867 CLL_A0673 CLL_A0674     FALSE 0.252 126.000 0.000 NA   NA
 5737868 5737869 CLL_A0675 CLL_A0676     FALSE 0.273 110.000 0.000 NA   NA
 5737873 5737874 CLL_A0680 CLL_A0681     TRUE 0.990 -6.000 0.471 NA   NA
 5737874 5737875 CLL_A0681 CLL_A0682     TRUE 0.987 0.000 0.412 1.000 N NA
 5737878 5737879 CLL_A0685 CLL_A0686     TRUE 0.993 -31.000 0.500 NA   NA
 5737879 5737880 CLL_A0686 CLL_A0687     TRUE 0.894 18.000 0.022 NA   NA
 5737880 5737881 CLL_A0687 CLL_A0688     TRUE 0.987 0.000 0.435 NA N NA
 5737881 5737882 CLL_A0688 CLL_A0689   dltC TRUE 0.881 79.000 0.387 NA   NA
 5737882 5737883 CLL_A0689 CLL_A0690 dltC ssrA FALSE 0.108 184.000 0.000 NA   NA
 5737885 5737886 CLL_A0692 CLL_A0693     FALSE 0.261 121.000 0.000 NA   NA
 5737888 5737889 CLL_A0695 CLL_A0696     FALSE 0.004 1039.000 0.000 NA   NA
 5737891 5737892 CLL_A0698 CLL_A0699     TRUE 0.997 13.000 0.909 0.061 Y NA
 5737894 5737895 CLL_A0701 CLL_A0702     FALSE 0.187 157.000 0.000 NA   NA
 5737895 5737896 CLL_A0702 CLL_A0703     FALSE 0.268 103.000 0.000 NA   NA
 5737897 5737898 CLL_A0704 CLL_A0705     FALSE 0.073 202.000 0.000 NA   NA
 5737899 5737900 CLL_A0706 CLL_A0707     FALSE 0.048 208.000 0.000 1.000 N NA
 5737900 5737901 CLL_A0707 CLL_A0708     TRUE 0.928 15.000 0.048 NA   NA
 5737903 5737904 CLL_A0710 CLL_A0711     FALSE 0.089 194.000 0.000 NA   NA
 5737904 5737905 CLL_A0711 CLL_A0712     FALSE 0.037 250.000 0.000 1.000   NA
 5737905 5737906 CLL_A0712 CLL_A0713     FALSE 0.014 293.000 0.000 1.000 N NA
 5737906 5737907 CLL_A0713 CLL_A0714     FALSE 0.012 351.000 0.000 NA   NA
 5737907 5737908 CLL_A0714 CLL_A0715     FALSE 0.021 289.000 0.000 NA   NA
 5737908 5737909 CLL_A0715 CLL_A0716   nagA TRUE 0.972 25.000 0.545 1.000 N NA
 5737909 5737910 CLL_A0716 CLL_A0717 nagA nagB TRUE 0.958 110.000 0.273 0.001 Y NA
 5737910 5737911 CLL_A0717 CLL_A0718 nagB nagE TRUE 0.850 47.000 0.000 1.000 Y NA
 5737911 5737912 CLL_A0718 CLL_A0719 nagE   FALSE 0.203 97.000 0.000 1.000 N NA
 5737912 5737913 CLL_A0719 CLL_A0720     FALSE 0.012 351.000 0.000 NA   NA
 5737913 5737914 CLL_A0720 CLL_A0721   bioB TRUE 0.957 -16.000 0.018 NA   NA
 5737914 5737915 CLL_A0721 CLL_A0722 bioB bioD TRUE 0.987 3.000 0.025 0.002 Y NA
 5737917 5737918 CLL_A0724 CLL_A0725     TRUE 0.998 0.000 0.846 0.003 Y NA
 5737919 5737920 CLL_A0726 CLL_A0727 ilvN ilvB TRUE 0.985 -7.000 0.189 0.003   NA
 5737921 5737922 CLL_A0728 CLL_A0729     FALSE 0.075 201.000 0.000 NA   NA
 5737922 5737923 CLL_A0729 CLL_A0730     FALSE 0.005 610.000 0.000 NA   NA
 5737923 5737924 CLL_A0730 CLL_A0731   brnQ FALSE 0.005 611.000 0.000 NA   NA
 5737924 5737925 CLL_A0731 CLL_A0732 brnQ   FALSE 0.047 210.000 0.000 1.000 N NA
 5737927 5737928 CLL_A0734 CLL_A0735 deoC   FALSE 0.114 444.000 0.009 1.000 Y NA
 5737928 5737929 CLL_A0735 CLL_A0736   hcp FALSE 0.005 432.000 0.000 1.000 N NA
 5737929 5737930 CLL_A0736 CLL_A0737 hcp   FALSE 0.225 141.000 0.000 NA   NA
 5737930 5737931 CLL_A0737 CLL_A0738     FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 5737931 5737932 CLL_A0738 CLL_A0739     FALSE 0.036 245.000 0.000 NA   NA
 5737932 5737933 CLL_A0739 CLL_A0740     FALSE 0.393 41.000 0.000 NA   NA
 5737933 5737934 CLL_A0740 CLL_A0741     FALSE 0.542 28.000 0.000 NA   NA
 5737934 5737935 CLL_A0741 CLL_A0742     FALSE 0.268 103.000 0.000 NA   NA
 5737935 5737936 CLL_A0742 CLL_A0743     FALSE 0.007 462.000 0.000 NA   NA
 5737936 5737937 CLL_A0743 CLL_A0744     TRUE 0.997 0.000 0.511 1.000 Y NA
 5737937 5737938 CLL_A0744 CLL_A0745     TRUE 0.950 49.000 0.115 NA Y NA
 5737938 5737939 CLL_A0745 CLL_A0746     FALSE 0.027 268.000 0.000 NA   NA
 5737939 5737940 CLL_A0746 CLL_A0747     FALSE 0.447 35.000 0.000 NA   NA
 5737940 5737941 CLL_A0747 CLL_A0748     FALSE 0.264 89.000 0.000 NA   NA
 5737941 5737942 CLL_A0748 CLL_A0749     FALSE 0.012 357.000 0.000 NA   NA
 5737942 5737943 CLL_A0749 CLL_A0750     FALSE 0.410 51.000 0.000 0.023   NA
 5737943 5737944 CLL_A0750 CLL_A0751     FALSE 0.060 214.000 0.000 NA   NA
 5737944 5737945 CLL_A0751 CLL_A0752   clpB FALSE 0.201 152.000 0.000 NA   NA
 5737946 5737947 CLL_A0753 CLL_A0754     FALSE 0.114 182.000 0.000 NA   NA
 5737947 5737948 CLL_A0754 CLL_A0755     FALSE 0.538 162.000 0.044 NA   NA
 5737949 5737950 CLL_A0756 CLL_A0757     FALSE 0.233 137.000 0.000 NA   NA
 5737950 5737951 CLL_A0757 CLL_A0758     FALSE 0.096 191.000 0.000 NA   NA
 5737951 5737952 CLL_A0758 CLL_A0759     FALSE 0.007 483.000 0.000 NA   NA
 5737954 5737955 CLL_A0761 CLL_A0762     FALSE 0.307 132.000 0.000 0.011   NA
 5737955 5737956 CLL_A0762 CLL_A0763   dut FALSE 0.239 141.000 0.000 1.000   NA
 5737959 5737960 CLL_A0766 CLL_A0767     TRUE 0.939 11.000 0.050 NA   NA
 5737963 5737964 CLL_A0770 CLL_A0771     TRUE 0.661 63.000 0.034 NA   NA
 5737965 5737966 CLL_A0772 CLL_A0773     TRUE 0.978 33.000 0.231 1.000 Y NA
 5737966 5737967 CLL_A0773 CLL_A0774     TRUE 0.652 98.000 0.038 NA   NA
 5737968 5737969 CLL_A0775 CLL_A0776   pepF TRUE 0.807 46.000 0.070 NA   NA
 5737969 5737970 CLL_A0776 CLL_A0777 pepF   FALSE 0.101 284.000 0.028 1.000   NA
 5737970 5737971 CLL_A0777 CLL_A0778     FALSE 0.348 197.000 0.053 NA   NA
 5737971 5737972 CLL_A0778 CLL_A0779   gluD FALSE 0.448 174.000 0.039 NA   NA
 5737972 5737973 CLL_A0779 CLL_A0780 gluD   FALSE 0.003 573.000 0.000 NA N NA
 5737973 5737974 CLL_A0780 CLL_A0781     FALSE 0.005 414.000 0.000 NA N NA
 5737974 5737975 CLL_A0781 CLL_A0782     TRUE 0.994 21.000 0.552 0.002 Y NA
 5737975 5737976 CLL_A0782 CLL_A0783     TRUE 0.886 19.000 0.020 NA   NA
 5737976 5737977 CLL_A0783 CLL_A0784   recJ FALSE 0.507 127.000 0.004 NA   NA
 5737978 5737979 CLL_A0785 CLL_A0786     FALSE 0.510 30.000 0.000 NA   NA
 5737979 5737980 CLL_A0786 CLL_A0787     FALSE 0.007 487.000 0.000 1.000   NA
 5737981 5737982 CLL_A0788 CLL_A0789 murG   FALSE 0.231 191.000 0.006 1.000 N NA
 5737982 5737983 CLL_A0789 CLL_A0790   nifJ TRUE 0.868 124.000 0.016 1.000 Y NA
 5737983 5737984 CLL_A0790 CLL_A0791 nifJ   FALSE 0.065 331.000 0.032 NA   NA
 5737984 5737985 CLL_A0791 CLL_A0792     FALSE 0.006 492.000 0.000 NA   NA
 5737985 5737986 CLL_A0792 CLL_A0793     FALSE 0.361 222.000 0.000 1.000 Y NA
 5737986 5737987 CLL_A0793 CLL_A0794     TRUE 0.974 29.000 0.082 0.061 Y NA
 5737987 5737988 CLL_A0794 CLL_A0795     TRUE 0.666 79.000 0.056 NA N NA
 5737988 5737989 CLL_A0795 CLL_A0796     TRUE 0.949 15.000 0.115 NA N NA
 5737989 5737990 CLL_A0796 CLL_A0797     TRUE 0.987 9.000 0.063 1.000 Y NA
 5737990 5737991 CLL_A0797 CLL_A0798     TRUE 0.993 -13.000 0.070 1.000 Y NA
 5737991 5737992 CLL_A0798 CLL_A0799   cheR TRUE 0.989 10.000 0.107 1.000 Y NA
 5737992 5737993 CLL_A0799 CLL_A0800 cheR   TRUE 0.987 12.000 0.081 1.000 Y NA
 5737993 5737994 CLL_A0800 CLL_A0801     TRUE 0.984 24.000 0.176 NA Y NA
 5737994 5737995 CLL_A0801 CLL_A0802     TRUE 0.982 19.000 0.082 NA Y NA
 5737995 5737996 CLL_A0802 CLL_A0803     TRUE 0.990 25.000 0.417 1.000 Y NA
 5737996 5737997 CLL_A0803 CLL_A0804   fliM TRUE 0.976 22.000 0.039 0.015 Y NA
 5737997 5737998 CLL_A0804 CLL_A0805 fliM   TRUE 0.998 -7.000 0.508 0.002 Y NA
 5737998 5737999 CLL_A0805 CLL_A0806     FALSE 0.012 359.000 0.000 1.000   NA
 5737999 5738000 CLL_A0806 CLL_A0807     TRUE 0.940 4.000 0.019 0.003   NA
 5738000 5738001 CLL_A0807 CLL_A0808   flgK FALSE 0.259 244.000 0.082 0.002   NA
 5738001 5738002 CLL_A0808 CLL_A0809 flgK flgL TRUE 0.845 170.000 0.071 0.001 Y NA
 5738002 5738003 CLL_A0809 CLL_A0810 flgL   TRUE 0.975 18.000 0.385 NA   NA
 5738003 5738004 CLL_A0810 CLL_A0811   csrA TRUE 0.963 5.000 0.096 NA   NA
 5738004 5738005 CLL_A0811 CLL_A0812 csrA   FALSE 0.325 185.000 0.028 NA N NA
 5738005 5738006 CLL_A0812 CLL_A0813     TRUE 0.883 22.000 0.028 NA   NA
 5738006 5738007 CLL_A0813 CLL_A0814   fliS TRUE 0.954 12.000 0.093 NA   NA
 5738007 5738008 CLL_A0814 CLL_A0815 fliS   TRUE 0.992 21.000 0.370 0.002 Y NA
 5738008 5738009 CLL_A0815 CLL_A0816     TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 5738009 5738010 CLL_A0816 CLL_A0817     FALSE 0.272 109.000 0.000 NA   NA
 5738010 5738011 CLL_A0817 CLL_A0818     FALSE 0.008 416.000 0.000 NA   NA
 5738011 5738012 CLL_A0818 CLL_A0819     TRUE 0.690 146.000 0.105 1.000 N NA
 5738012 5738013 CLL_A0819 CLL_A0820     FALSE 0.355 211.000 0.105 1.000 N NA
 5738013 5738014 CLL_A0820 CLL_A0821     TRUE 0.717 164.000 0.200 NA   NA
 5738014 5738015 CLL_A0821 CLL_A0822     TRUE 0.971 28.000 0.600 NA   NA
 5738015 5738016 CLL_A0822 CLL_A0823     FALSE 0.267 71.000 0.000 NA   NA
 5738016 5738017 CLL_A0823 CLL_A0824     FALSE 0.261 92.000 0.000 NA   NA
 5738017 5738018 CLL_A0824 CLL_A0825     TRUE 0.990 -3.000 0.468 1.000   NA
 5738018 5738019 CLL_A0825 CLL_A0826     FALSE 0.382 44.000 0.000 NA   NA
 5738019 5738020 CLL_A0826 CLL_A0827     FALSE 0.266 74.000 0.000 NA   NA
 5738020 5738021 CLL_A0827 CLL_A0828     FALSE 0.335 54.000 0.000 1.000   NA
 5738021 5738022 CLL_A0828 CLL_A0829     FALSE 0.028 288.000 0.000 0.060   NA
 5738022 5738023 CLL_A0829 CLL_A0830     TRUE 0.984 -3.000 0.267 1.000 N NA
 5738023 5738024 CLL_A0830 CLL_A0831     FALSE 0.383 214.000 0.000 NA Y NA
 5738024 5738025 CLL_A0831 CLL_A0832     TRUE 0.952 62.000 0.236 NA Y NA
 5738025 5738026 CLL_A0832 CLL_A0833     FALSE 0.481 34.000 0.000 1.000   NA
 5738026 5738027 CLL_A0833 CLL_A0834     FALSE 0.017 307.000 0.000 NA   NA
 5738027 5738028 CLL_A0834 CLL_A0835     FALSE 0.434 36.000 0.000 NA   NA
 5738028 5738029 CLL_A0835 CLL_A0836     FALSE 0.013 303.000 0.000 1.000 N NA
 5738029 5738030 CLL_A0836 CLL_A0837   flgB FALSE 0.048 800.000 0.000 0.005 Y NA
 5738030 5738031 CLL_A0837 CLL_A0838 flgB flgC TRUE 0.996 15.000 0.804 1.000 Y NA
 5738031 5738032 CLL_A0838 CLL_A0839 flgC fliE TRUE 0.987 14.000 0.095 1.000 Y NA
 5738032 5738033 CLL_A0839 CLL_A0840 fliE fliF TRUE 0.982 25.000 0.112 0.006 Y NA
 5738033 5738034 CLL_A0840 CLL_A0841 fliF fliG TRUE 0.996 7.000 0.477 0.006 Y NA
 5738034 5738035 CLL_A0841 CLL_A0842 fliG   TRUE 0.997 -16.000 0.308 NA Y NA
 5738035 5738036 CLL_A0842 CLL_A0843   fliI TRUE 0.992 18.000 0.379 NA Y NA
 5738036 5738037 CLL_A0843 CLL_A0844 fliI fliJ TRUE 0.977 35.000 0.241 1.000 Y NA
 5738037 5738038 CLL_A0844 CLL_A0845 fliJ   TRUE 0.984 7.000 0.019 0.006 Y NA
 5738038 5738039 CLL_A0845 CLL_A0846     TRUE 0.977 12.000 0.304 NA   NA
 5738039 5738040 CLL_A0846 CLL_A0847     TRUE 0.966 4.000 0.105 NA   NA
 5738040 5738041 CLL_A0847 CLL_A0848     TRUE 0.754 143.000 0.150 NA   NA
 5738041 5738042 CLL_A0848 CLL_A0849     TRUE 0.647 197.000 0.016 0.004 Y NA
 5738042 5738043 CLL_A0849 CLL_A0850     TRUE 0.968 94.000 0.545 NA Y NA
 5738043 5738044 CLL_A0850 CLL_A0851     TRUE 0.992 16.000 0.301 NA Y NA
 5738044 5738045 CLL_A0851 CLL_A0852     TRUE 0.995 3.000 0.350 1.000 Y NA
 5738045 5738046 CLL_A0852 CLL_A0853   fliL TRUE 0.994 6.000 0.314 1.000 Y NA
 5738046 5738047 CLL_A0853 CLL_A0854 fliL   TRUE 0.624 81.000 0.023 1.000   NA
 5738047 5738048 CLL_A0854 CLL_A0855   fliP TRUE 0.986 3.000 0.386 1.000   NA
 5738048 5738049 CLL_A0855 CLL_A0856 fliP fliQ TRUE 0.991 12.000 0.162 0.004 Y NA
 5738049 5738050 CLL_A0856 CLL_A0857 fliQ   TRUE 0.987 18.000 0.114 0.004 Y NA
 5738050 5738051 CLL_A0857 CLL_A0858   flhA TRUE 0.982 30.000 0.207 0.004 Y NA
 5738051 5738052 CLL_A0858 CLL_A0859 flhA flhF TRUE 0.997 0.000 0.440 1.000 Y NA
 5738052 5738053 CLL_A0859 CLL_A0860 flhF   TRUE 0.988 -6.000 0.382 1.000 N NA
 5738053 5738054 CLL_A0860 CLL_A0861     TRUE 0.951 11.000 0.094 NA N NA
 5738054 5738055 CLL_A0861 CLL_A0862     TRUE 0.680 103.000 0.062 NA N NA
 5738055 5738056 CLL_A0862 CLL_A0863     TRUE 0.919 13.000 0.029 NA   NA
 5738056 5738057 CLL_A0863 CLL_A0864     FALSE 0.267 78.000 0.000 NA   NA
 5738057 5738058 CLL_A0864 CLL_A0865     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 5738058 5738059 CLL_A0865 CLL_A0866     TRUE 0.987 14.000 0.088 1.000 Y NA
 5738063 5738064 CLL_A0870 CLL_A0871     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA   NA
 5738064 5738065 CLL_A0871 CLL_A0872     FALSE 0.054 221.000 0.000 NA   NA
 5738065 5738066 CLL_A0872 CLL_A0873     FALSE 0.120 179.000 0.000 NA   NA
 5738066 5738067 CLL_A0873 CLL_A0874   spoIIAA FALSE 0.039 353.000 0.014 1.000 N NA
 5738067 5738068 CLL_A0874 CLL_A0875 spoIIAA spoIIAB TRUE 0.996 17.000 0.669 0.002 Y NA
 5738068 5738069 CLL_A0875 CLL_A0876 spoIIAB sigF TRUE 0.990 10.000 0.842 1.000 N NA
 5738069 5738070 CLL_A0876 CLL_A0877 sigF spoVAC FALSE 0.043 511.000 0.078 NA   NA
 5738070 5738071 CLL_A0877 CLL_A0878 spoVAC spoVAD TRUE 0.823 157.000 0.386 NA   NA
 5738071 5738072 CLL_A0878 CLL_A0879 spoVAD spoVAE TRUE 0.968 24.000 0.386 NA   NA
 5738072 5738073 CLL_A0879 CLL_A0880 spoVAE   FALSE 0.272 114.000 0.000 NA   NA
 5738073 5738074 CLL_A0880 CLL_A0881     TRUE 0.906 6.000 0.006 NA   NA
 5738074 5738075 CLL_A0881 CLL_A0882   holA TRUE 0.922 30.000 0.163 NA   NA
 5738077 5738078 CLL_A0884 CLL_A0885 gpr   FALSE 0.122 571.000 0.521 NA   NA
 5738078 5738079 CLL_A0885 CLL_A0886     TRUE 0.585 147.000 0.038 NA   NA
 5738079 5738080 CLL_A0886 CLL_A0887   lepA FALSE 0.449 144.000 0.002 NA   NA
 5738080 5738081 CLL_A0887 CLL_A0888 lepA   TRUE 0.728 105.000 0.083 1.000 N NA
 5738081 5738082 CLL_A0888 CLL_A0889   hrcA FALSE 0.418 185.000 0.062 1.000 N NA
 5738082 5738083 CLL_A0889 CLL_A0890 hrcA grpE TRUE 0.910 39.000 0.286 1.000 N NA
 5738083 5738084 CLL_A0890 CLL_A0891 grpE dnaK TRUE 0.952 80.000 0.224 0.007 Y NA
 5738084 5738085 CLL_A0891 CLL_A0892 dnaK dnaJ TRUE 0.948 104.000 0.196 0.003 Y NA
 5738085 5738086 CLL_A0892 CLL_A0893 dnaJ   FALSE 0.018 272.000 0.000 1.000 N NA
 5738086 5738087 CLL_A0893 CLL_A0894   trmB FALSE 0.025 280.000 0.000 1.000   NA
 5738087 5738088 CLL_A0894 CLL_A0895 trmB prmA FALSE 0.365 167.000 0.003 1.000   NA
 5738088 5738089 CLL_A0895 CLL_A0896 prmA   TRUE 0.832 93.000 0.227 NA   NA
 5738089 5738090 CLL_A0896 CLL_A0897     TRUE 0.978 0.000 0.163 NA   NA
 5738090 5738091 CLL_A0897 CLL_A0898     FALSE 0.262 217.000 0.051 0.035 N NA
 5738091 5738092 CLL_A0898 CLL_A0899   rpsU TRUE 0.692 137.000 0.071 1.000   NA
 5738092 5738093 CLL_A0899 CLL_A0900 rpsU   TRUE 0.926 30.000 0.150 0.028   NA
 5738093 5738094 CLL_A0900 CLL_A0901   yqfC FALSE 0.140 253.000 0.029 NA   NA
 5738094 5738095 CLL_A0901 CLL_A0902 yqfC yqfD TRUE 0.992 3.000 0.851 NA   NA
 5738095 5738096 CLL_A0902 CLL_A0903 yqfD   TRUE 0.798 35.000 0.032 NA   NA
 5738096 5738097 CLL_A0903 CLL_A0904     TRUE 0.967 13.000 0.182 NA   NA
 5738097 5738098 CLL_A0904 CLL_A0905     TRUE 0.862 25.000 0.023 NA   NA
 5738098 5738099 CLL_A0905 CLL_A0906   era FALSE 0.018 551.000 0.005 1.000   NA
 5738099 5738100 CLL_A0906 CLL_A0907 era recO TRUE 0.930 25.000 0.108 1.000   NA
 5738100 5738101 CLL_A0907 CLL_A0908 recO   TRUE 0.905 7.000 0.007 NA   NA
 5738101 5738102 CLL_A0908 CLL_A0909     TRUE 0.908 43.000 0.273 NA   NA
 5738102 5738103 CLL_A0909 CLL_A0910   ppdK TRUE 0.605 89.000 0.019 1.000   NA
 5738105 5738106 CLL_A0912 CLL_A0913     FALSE 0.169 249.000 0.056 1.000 N NA
 5738106 5738107 CLL_A0913 CLL_A0914   rpoD TRUE 0.972 6.000 0.209 1.000 N NA
 5738107 5738108 CLL_A0914 CLL_A0915 rpoD   TRUE 0.837 93.000 0.239 NA   NA
 5738108 5738109 CLL_A0915 CLL_A0916     TRUE 0.900 47.000 0.283 NA   NA
 5738109 5738110 CLL_A0916 CLL_A0917     FALSE 0.305 57.000 0.000 NA   NA
 5738110 5738111 CLL_A0917 CLL_A3606     FALSE 0.215 145.000 0.000 NA   NA
 5738112 5738113 CLL_A0918 CLL_A0919     TRUE 0.881 40.000 0.154 NA   NA
 5738113 5738114 CLL_A0919 CLL_A0920     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5738115 5738116 CLL_A0921 CLL_A0922     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5738116 5738117 CLL_A0922 CLL_A0923     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5738117 5738118 CLL_A0923 CLL_A0924     FALSE 0.244 130.000 0.000 NA   NA
 5738118 5738119 CLL_A0924 CLL_A0925     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5738119 5738120 CLL_A0925 CLL_A0926     FALSE 0.148 169.000 0.000 NA   NA
 5738120 5738121 CLL_A0926 CLL_A0927     FALSE 0.266 87.000 0.000 NA   NA
 5738121 5738122 CLL_A0927 CLL_A0928     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5738122 5738123 CLL_A0928 CLL_A0929     FALSE 0.323 100.000 0.000 0.058   NA
 5738123 5738124 CLL_A0929 CLL_A0930     TRUE 0.847 -22.000 0.000 NA   NA
 5738124 5738125 CLL_A0930 CLL_A0931     FALSE 0.272 114.000 0.000 NA   NA
 5738125 5738126 CLL_A0931 CLL_A0932     FALSE 0.085 195.000 0.000 NA   NA
 5738126 5738127 CLL_A0932 CLL_A0933     FALSE 0.510 30.000 0.000 NA   NA
 5738127 5738128 CLL_A0933 CLL_A0934     TRUE 0.735 8.000 0.000 NA   NA
 5738128 5738129 CLL_A0934 CLL_A0935     FALSE 0.266 72.000 0.000 NA   NA
 5738129 5738130 CLL_A0935 CLL_A0936     TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5738130 5738131 CLL_A0936 CLL_A0937     FALSE 0.205 150.000 0.000 NA   NA
 5738131 5738132 CLL_A0937 CLL_A0938     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5738132 5738133 CLL_A0938 CLL_A0939     FALSE 0.021 296.000 0.000 1.000   NA
 5738133 5738134 CLL_A0939 CLL_A0940     TRUE 0.728 10.000 0.000 NA   NA
 5738134 5738135 CLL_A0940 CLL_A0941     FALSE 0.264 89.000 0.000 NA   NA
 5738135 5738136 CLL_A0941 CLL_A0942     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5738136 5738137 CLL_A0942 CLL_A0943     TRUE 0.722 11.000 0.000 NA   NA
 5738137 5738138 CLL_A0943 CLL_A0944     TRUE 0.735 8.000 0.000 NA   NA
 5738138 5738139 CLL_A0944 CLL_A0945     TRUE 0.979 1.000 0.200 NA   NA
 5738139 5738140 CLL_A0945 CLL_A0946     TRUE 0.874 49.000 0.200 NA   NA
 5738140 5738141 CLL_A0946 CLL_A0947     FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 5738141 5738142 CLL_A0947 CLL_A0948     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA   NA
 5738142 5738143 CLL_A0948 CLL_A0949     TRUE 0.942 84.000 1.000 NA   NA
 5738143 5738144 CLL_A0949 CLL_A0950     TRUE 0.991 5.000 0.750 NA   NA
 5738144 5738145 CLL_A0950 CLL_A0951     TRUE 0.954 37.000 0.600 NA   NA
 5738145 5738146 CLL_A0951 CLL_A0952     TRUE 0.939 48.000 0.600 NA   NA
 5738146 5738147 CLL_A0952 CLL_A0953     TRUE 0.942 75.000 1.000 NA   NA
 5738147 5738148 CLL_A0953 CLL_A0954     FALSE 0.267 71.000 0.000 NA   NA
 5738148 5738149 CLL_A0954 CLL_A0955     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5738149 5738150 CLL_A0955 CLL_A0956     TRUE 0.988 -3.000 0.375 NA   NA
 5738150 5738151 CLL_A0956 CLL_A0957     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5738151 5738152 CLL_A0957 CLL_A0958     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5738152 5738153 CLL_A0958 CLL_A0959     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5738153 5738154 CLL_A0959 CLL_A0960     FALSE 0.265 88.000 0.000 NA   NA
 5738154 5738155 CLL_A0960 CLL_A0961     FALSE 0.414 38.000 0.000 NA   NA
 5738155 5738156 CLL_A0961 CLL_A0963     FALSE 0.151 168.000 0.000 NA   NA
 5738158 5738159 CLL_A0964 CLL_A0965     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5738159 5738160 CLL_A0965 CLL_A0966     FALSE 0.369 46.000 0.000 NA   NA
 5738160 5738161 CLL_A0966 CLL_A0967     FALSE 0.093 192.000 0.000 NA   NA
 5738161 5738162 CLL_A0967 CLL_A0968     FALSE 0.005 599.000 0.000 NA   NA
 5738162 5738163 CLL_A0968 CLL_A0969     FALSE 0.014 334.000 0.000 NA   NA
 5738165 5738166 CLL_A0971 CLL_A0972     TRUE 0.647 19.000 0.000 NA   NA
 5738166 5738167 CLL_A0972 CLL_A0973     FALSE 0.197 153.000 0.000 NA   NA
 5738167 5738168 CLL_A0973 CLL_A0974     TRUE 0.941 22.000 0.122 NA   NA
 5738168 5738169 CLL_A0974 CLL_A0975     FALSE 0.172 162.000 0.000 NA   NA
 5738169 5738170 CLL_A0975 CLL_A0976   malQ TRUE 0.693 148.000 0.111 1.000 N NA
 5738170 5738171 CLL_A0976 CLL_A0977 malQ   TRUE 0.991 0.000 0.058 0.022 Y NA
 5738171 5738172 CLL_A0977 CLL_A0978   kdpA FALSE 0.004 517.000 0.000 1.000 N NA
 5738172 5738173 CLL_A0978 CLL_A0979 kdpA kdpB TRUE 0.988 16.000 0.112 0.001 Y NA
 5738173 5738174 CLL_A0979 CLL_A0980 kdpB kdpC TRUE 0.996 18.000 0.877 0.001 Y NA
 5738174 5738175 CLL_A0980 CLL_A0981 kdpC   FALSE 0.415 163.000 0.011 0.090 N NA
 5738175 5738176 CLL_A0981 CLL_A0982     TRUE 0.996 -7.000 0.243 1.000 Y NA
 5738179 5738180 CLL_A0985 CLL_A0986     FALSE 0.127 176.000 0.000 NA   NA
 5738180 5738181 CLL_A0986 CLL_A0987     FALSE 0.013 338.000 0.000 NA   NA
 5738182 5738183 CLL_A0988 CLL_A0989     FALSE 0.284 70.000 0.000 1.000   NA
 5738183 5738184 CLL_A0989 CLL_A0990     FALSE 0.006 510.000 0.000 NA   NA
 5738184 5738185 CLL_A0990 CLL_A0992     FALSE 0.010 372.000 0.000 NA   NA
 5738186 5738187 CLL_A0993 CLL_A0994     TRUE 0.995 -13.000 0.131 0.025 Y NA
 5738187 5738188 CLL_A0994 CLL_A0995     TRUE 0.997 -6.000 0.492 0.025 Y NA
 5738188 5738189 CLL_A0995 CLL_A0996     TRUE 0.998 -7.000 0.928 1.000 Y NA
 5738189 5738190 CLL_A0996 CLL_A0997     TRUE 0.959 25.000 0.326 1.000 N NA
 5738191 5738192 CLL_A0998 CLL_A0999     FALSE 0.266 74.000 0.000 NA   NA
 5738193 5738194 CLL_A1000 CLL_A1001     FALSE 0.011 321.000 0.000 1.000 N NA
 5738197 5738198 CLL_A1004 CLL_A1005     FALSE 0.047 235.000 0.000 1.000   NA
 5738198 5738199 CLL_A1005 CLL_A1006     TRUE 0.953 21.000 0.176 1.000   NA
 5738199 5738200 CLL_A1006 CLL_A1007     TRUE 0.954 -12.000 0.015 1.000   NA
 5738200 5738201 CLL_A1007 CLL_A1008     FALSE 0.307 187.000 0.015 NA   NA
 5738203 5738204 CLL_A1010 CLL_A1011   speD FALSE 0.151 168.000 0.000 NA   NA
 5738204 5738205 CLL_A1011 CLL_A1012 speD   TRUE 0.985 17.000 0.091 1.000 Y NA
 5738205 5738206 CLL_A1012 CLL_A1013   speE TRUE 0.995 0.000 0.237 1.000 Y NA
 5738206 5738207 CLL_A1013 CLL_A1014 speE   TRUE 0.914 54.000 0.036 1.000 Y NA
 5738207 5738208 CLL_A1014 CLL_A1015   nspC FALSE 0.508 336.000 0.444 1.000 Y NA
 5738212 5738213 CLL_A1019 CLL_A1020     FALSE 0.025 283.000 0.000 1.000   NA
 5738213 5738214 CLL_A1020 CLL_A1021     FALSE 0.261 94.000 0.000 NA   NA
 5738214 5738215 CLL_A1021 CLL_A1022   ruvA FALSE 0.099 255.000 0.007 NA   NA
 5738215 5738216 CLL_A1022 CLL_A1023 ruvA ruvB TRUE 0.987 36.000 0.549 0.002 Y NA
 5738216 5738217 CLL_A1023 CLL_A1024 ruvB queA TRUE 0.921 19.000 0.069 1.000 N NA
 5738217 5738218 CLL_A1024 CLL_A1025 queA tgt TRUE 0.855 142.000 0.014 0.001 Y NA
 5738218 5738219 CLL_A1025 CLL_A1026 tgt yajC TRUE 0.619 108.000 0.035 NA N NA
 5738219 5738220 CLL_A1026 CLL_A1027 yajC   TRUE 0.711 62.000 0.055 NA   NA
 5738220 5738221 CLL_A1027 CLL_A1028     FALSE 0.035 248.000 0.000 NA   NA
 5738221 5738222 CLL_A1028 CLL_A1029     FALSE 0.019 309.000 0.000 1.000   NA
 5738222 5738223 CLL_A1029 CLL_A1030   apt TRUE 0.705 41.000 0.010 1.000   NA
 5738223 5738224 CLL_A1030 CLL_A1031 apt relA TRUE 0.701 107.000 0.068 1.000 N NA
 5738224 5738225 CLL_A1031 CLL_A1032 relA dtd TRUE 0.964 12.000 0.177 1.000 N NA
 5738225 5738226 CLL_A1032 CLL_A1033 dtd   TRUE 0.849 32.000 0.048 1.000   NA
 5738226 5738227 CLL_A1033 CLL_A1034     TRUE 0.934 10.000 0.035 1.000   NA
 5738227 5738228 CLL_A1034 CLL_A1035   hisS TRUE 0.762 65.000 0.111 1.000 N NA
 5738228 5738229 CLL_A1035 CLL_A1036 hisS aspS FALSE 0.543 226.000 0.028 0.044 Y NA
 5738231 5738232 CLL_A1038 CLL_A1039     FALSE 0.201 152.000 0.000 NA   NA
 5738232 5738233 CLL_A1039 CLL_A1040     FALSE 0.240 132.000 0.000 NA   NA
 5738233 5738234 CLL_A1040 CLL_A1041   hom FALSE 0.014 343.000 0.000 1.000   NA
 5738234 5738235 CLL_A1041 CLL_A1042 hom   FALSE 0.008 360.000 0.000 1.000 N NA
 5738235 5738236 CLL_A1042 CLL_A1043   glpK FALSE 0.486 96.000 0.004 1.000 N NA
 5738236 5738237 CLL_A1043 CLL_A1044 glpK   FALSE 0.442 156.000 0.006 1.000   NA
 5738237 5738238 CLL_A1044 CLL_A1045     TRUE 0.984 13.000 0.476 0.031   NA
 5738238 5738239 CLL_A1045 CLL_A1046     TRUE 0.987 2.000 0.417 NA   NA
 5738241 5738242 CLL_A1048 CLL_A1049     TRUE 0.993 12.000 0.222 0.001 Y NA
 5738242 5738243 CLL_A1049 CLL_A1050     FALSE 0.343 226.000 0.000 1.000 Y NA
 5738243 5738244 CLL_A1050 CLL_A1051     FALSE 0.260 122.000 0.000 NA   NA
 5738244 5738245 CLL_A1051 CLL_A1052     FALSE 0.039 242.000 0.000 NA   NA
 5738247 5738248 CLL_A1054 CLL_A1055     FALSE 0.227 140.000 0.000 NA   NA
 5738248 5738249 CLL_A1055 CLL_A1056   udk FALSE 0.007 383.000 0.000 1.000 N NA
 5738250 5738251 CLL_A1057 CLL_A1058     FALSE 0.250 127.000 0.000 NA   NA
 5738251 5738252 CLL_A1058 CLL_A1059   rnz FALSE 0.277 121.000 0.000 1.000   NA
 5738253 5738254 CLL_A1060 CLL_A1061     FALSE 0.156 166.000 0.000 NA   NA
 5738254 5738255 CLL_A1061 CLL_A1062     FALSE 0.261 95.000 0.000 NA   NA
 5738255 5738256 CLL_A1062 CLL_A1063     TRUE 0.989 6.000 0.667 NA   NA
 5738256 5738257 CLL_A1063 CLL_A1064     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 5738257 5738258 CLL_A1064 CLL_A1065     TRUE 0.962 21.000 0.250 NA   NA
 5738258 5738259 CLL_A1065 CLL_A1066     TRUE 0.924 35.000 0.250 NA   NA
 5738259 5738260 CLL_A1066 CLL_A1067     FALSE 0.014 328.000 0.000 NA   NA
 5738260 5738261 CLL_A1067 CLL_A1068     FALSE 0.239 141.000 0.000 1.000   NA
 5738261 5738262 CLL_A1068 CLL_A1069     FALSE 0.026 272.000 0.000 NA   NA
 5738264 5738265 CLL_A1071 CLL_A1072     TRUE 0.981 1.000 0.231 NA   NA
 5738265 5738266 CLL_A1072 CLL_A1073     FALSE 0.039 242.000 0.000 NA   NA
 5738267 5738268 CLL_A1074 CLL_A1075     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 5738269 5738270 CLL_A1076 CLL_A1077   brnQ FALSE 0.011 376.000 0.000 1.000   NA
 5738272 5738273 CLL_A1079 CLL_A1080     FALSE 0.137 172.000 0.000 NA   NA
 5738273 5738274 CLL_A1080 CLL_A1081     FALSE 0.012 356.000 0.000 NA   NA
 5738276 5738277 CLL_A1083 CLL_A1084   glyA FALSE 0.261 121.000 0.000 NA   NA
 5738277 5738278 CLL_A1084 CLL_A1085 glyA   FALSE 0.011 360.000 0.000 NA   NA
 5738278 5738279 CLL_A1085 CLL_A1086     TRUE 0.727 48.000 0.031 NA   NA
 5738279 5738280 CLL_A1086 CLL_A1087   fabG FALSE 0.035 229.000 0.000 1.000 N NA
 5738281 5738282 CLL_A1088 CLL_A1089 ilvE nadE TRUE 0.710 153.000 0.000 1.000 Y NA
 5738283 5738284 CLL_A1090 CLL_A1091     TRUE 0.996 -7.000 0.313 NA Y NA
 5738284 5738285 CLL_A1091 CLL_A1092     FALSE 0.008 407.000 0.000 0.089 N NA
 5738285 5738286 CLL_A1092 CLL_A1093     FALSE 0.021 289.000 0.000 NA   NA
 5738288 5738289 CLL_A1095 CLL_A1096     TRUE 0.843 -16.000 0.000 NA   NA
 5738289 5738290 CLL_A1096 CLL_A1097     FALSE 0.005 433.000 0.000 1.000 N NA
 5738290 5738291 CLL_A1097 CLL_A1098     TRUE 0.994 16.000 0.461 0.024 Y NA
 5738291 5738292 CLL_A1098 CLL_A1099     TRUE 0.979 17.000 0.039 1.000 Y NA
 5738292 5738293 CLL_A1099 CLL_A1100     FALSE 0.203 151.000 0.000 NA   NA
 5738293 5738294 CLL_A1100 CLL_A1101     FALSE 0.261 92.000 0.000 NA   NA
 5738294 5738295 CLL_A1101 CLL_A1102     FALSE 0.007 389.000 0.000 1.000 N NA
 5738295 5738296 CLL_A1102 CLL_A1103   purE FALSE 0.104 492.000 0.012 1.000 Y NA
 5738296 5738297 CLL_A1103 CLL_A1104 purE purC TRUE 0.989 0.000 0.035 1.000 Y NA
 5738297 5738298 CLL_A1104 CLL_A1105 purC purF TRUE 0.920 116.000 0.082 1.000 Y NA
 5738298 5738299 CLL_A1105 CLL_A1106 purF purM TRUE 0.993 10.000 0.248 1.000 Y NA
 5738299 5738300 CLL_A1106 CLL_A1107 purM purN TRUE 0.997 -12.000 0.238 0.001 Y NA
 5738300 5738301 CLL_A1107 CLL_A1108 purN purH TRUE 0.929 149.000 0.225 1.000 Y NA
 5738301 5738302 CLL_A1108 CLL_A1109 purH purD TRUE 0.640 252.000 0.238 1.000 Y NA
 5738303 5738304 CLL_A1110 CLL_A1111     FALSE 0.039 242.000 0.000 NA   NA
 5738304 5738305 CLL_A1111 CLL_A1112     FALSE 0.038 243.000 0.000 NA   NA
 5738306 5738307 CLL_A1113 CLL_A1114     TRUE 0.964 1.000 0.071 NA   NA
 5738307 5738308 CLL_A1114 CLL_A1115     FALSE 0.014 288.000 0.000 NA N NA
 5738308 5738309 CLL_A1115 CLL_A1116     FALSE 0.007 391.000 0.000 1.000 N NA
 5738309 5738310 CLL_A1116 CLL_A1117     FALSE 0.011 363.000 0.000 NA   NA
 5738310 5738311 CLL_A1117 CLL_A1118     TRUE 0.992 2.000 0.714 NA   NA
 5738314 5738315 CLL_A1121 CLL_A1122     TRUE 0.793 2.000 0.000 1.000   NA
 5738315 5738316 CLL_A1122 CLL_A1123     FALSE 0.259 130.000 0.000 1.000   NA
 5738316 5738317 CLL_A1123 CLL_A1124     TRUE 0.843 -10.000 0.000 1.000   NA
 5738317 5738318 CLL_A1124 CLL_A1125     TRUE 0.650 11.000 0.000 1.000 N NA
 5738318 5738319 CLL_A1125 CLL_A1126     TRUE 0.977 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5738320 5738321 CLL_A1127 CLL_A1128     FALSE 0.022 286.000 0.000 NA   NA
 5738321 5738322 CLL_A1128 CLL_A1129     FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 5738322 5738323 CLL_A1129 CLL_A1130     FALSE 0.011 369.000 0.000 NA   NA
 5738323 5738324 CLL_A1130 CLL_A1131     TRUE 0.966 37.000 0.133 1.000 Y NA
 5738324 5738325 CLL_A1131 CLL_A1132     TRUE 0.790 84.000 0.133 NA   NA
 5738325 5738326 CLL_A1132 CLL_A1133     TRUE 0.977 32.000 1.000 NA   NA
 5738326 5738327 CLL_A1133 CLL_A1134     FALSE 0.034 224.000 0.000 NA N NA
 5738327 5738328 CLL_A1134 CLL_A1135     FALSE 0.069 224.000 0.000 0.045   NA
 5738328 5738329 CLL_A1135 CLL_A1136     TRUE 0.852 -43.000 0.000 NA   NA
 5738329 5738330 CLL_A1136 CLL_A1137     FALSE 0.006 562.000 0.000 NA   NA
 5738330 5738331 CLL_A1137 CLL_A1138   panE TRUE 0.922 36.000 0.267 NA   NA
 5738331 5738332 CLL_A1138 CLL_A1139 panE   FALSE 0.040 219.000 0.000 1.000 N NA
 5738332 5738333 CLL_A1139 CLL_A1140     FALSE 0.013 345.000 0.000 NA   NA
 5738333 5738334 CLL_A1140 CLL_A1141     FALSE 0.240 132.000 0.000 NA   NA
 5738334 5738335 CLL_A1141 CLL_A1142     FALSE 0.194 154.000 0.000 NA   NA
 5738335 5738336 CLL_A1142 CLL_A1143     FALSE 0.100 192.000 0.000 1.000   NA
 5738338 5738339 CLL_A1145 CLL_A1146   fabH TRUE 0.946 15.000 0.098 1.000 N NA
 5738339 5738340 CLL_A1146 CLL_A1147 fabH   TRUE 0.952 72.000 0.235 0.005 Y NA
 5738340 5738341 CLL_A1147 CLL_A1148     TRUE 0.738 110.000 0.072 1.000   NA
 5738341 5738342 CLL_A1148 CLL_A1149   fabD TRUE 0.976 -7.000 0.099 1.000   NA
 5738342 5738343 CLL_A1149 CLL_A1150 fabD fabG TRUE 0.987 21.000 0.149 0.005 Y NA
 5738343 5738344 CLL_A1150 CLL_A1151 fabG fabF TRUE 0.990 18.000 0.236 1.000 Y NA
 5738344 5738345 CLL_A1151 CLL_A1152 fabF accB TRUE 0.987 12.000 0.074 1.000 Y NA
 5738345 5738346 CLL_A1152 CLL_A1153 accB fabZ TRUE 0.987 6.000 0.047 0.005 Y NA
 5738346 5738347 CLL_A1153 CLL_A1154 fabZ accC TRUE 0.985 10.000 0.045 1.000 Y NA
 5738347 5738348 CLL_A1154 CLL_A1155 accC accD TRUE 0.994 -7.000 0.090 0.002 Y NA
 5738348 5738349 CLL_A1155 CLL_A1156 accD accA TRUE 0.996 -7.000 0.234 0.001 Y NA
 5738349 5738350 CLL_A1156 CLL_A1157 accA   FALSE 0.116 181.000 0.000 NA   NA
 5738350 5738351 CLL_A1157 CLL_A1158     FALSE 0.461 34.000 0.000 NA   NA
 5738351 5738352 CLL_A1158 CLL_A1159     FALSE 0.022 285.000 0.000 NA   NA
 5738352 5738353 CLL_A1159 CLL_A1160     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 5738353 5738354 CLL_A1160 CLL_A1161     FALSE 0.006 414.000 0.000 1.000 N NA
 5738354 5738355 CLL_A1161 CLL_A1162     TRUE 0.710 86.000 0.062 NA   NA
 5738355 5738356 CLL_A1162 CLL_A1163     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5738356 5738357 CLL_A1163 CLL_A1164   moaC TRUE 0.771 14.000 0.000 0.002   NA
 5738357 5738358 CLL_A1164 CLL_A1165 moaC moaA TRUE 0.816 61.000 0.000 0.002 Y NA
 5738358 5738359 CLL_A1165 CLL_A1166 moaA   TRUE 0.954 3.000 0.042 0.033   NA
 5738359 5738360 CLL_A1166 CLL_A1167     FALSE 0.147 172.000 0.000 1.000   NA
 5738360 5738361 CLL_A1167 CLL_A1168     TRUE 0.740 37.000 0.025 NA N NA
 5738361 5738362 CLL_A1168 CLL_A1169   nifS TRUE 0.966 4.000 0.125 NA N NA
 5738362 5738363 CLL_A1169 CLL_A1170 nifS nifU TRUE 0.942 2.000 0.035 1.000 N NA
 5738363 5738364 CLL_A1170 CLL_A1171 nifU trmU TRUE 0.961 1.000 0.073 1.000 N NA
 5738364 5738365 CLL_A1171 CLL_A1172 trmU   FALSE 0.023 444.000 0.006 NA   NA
 5738365 5738366 CLL_A1172 CLL_A1173     TRUE 0.987 -22.000 0.209 NA   NA
 5738366 5738367 CLL_A1173 CLL_A1174   alaS FALSE 0.040 370.000 0.015 NA   NA
 5738367 5738368 CLL_A1174 CLL_A1175 alaS   FALSE 0.461 195.000 0.110 NA   NA
 5738368 5738369 CLL_A1175 CLL_A1176     TRUE 0.927 52.000 0.537 NA   NA
 5738369 5738370 CLL_A1176 CLL_A1177     FALSE 0.282 210.000 0.047 NA   NA
 5738370 5738371 CLL_A1177 CLL_A1178     TRUE 0.892 44.000 0.211 NA   NA
 5738371 5738372 CLL_A1178 CLL_A1179     TRUE 0.867 64.000 0.289 1.000   NA
 5738372 5738373 CLL_A1179 CLL_A1180   typA FALSE 0.233 195.000 0.004 1.000   NA
 5738373 5738374 CLL_A1180 CLL_A1181 typA   TRUE 0.569 97.000 0.012 NA   NA
 5738374 5738375 CLL_A1181 CLL_A1182     TRUE 0.923 20.000 0.067 NA   NA
 5738375 5738376 CLL_A1182 CLL_A1183     TRUE 0.969 7.000 0.146 1.000   NA
 5738376 5738377 CLL_A1183 CLL_A1184     FALSE 0.353 166.000 0.008 1.000 N NA
 5738377 5738378 CLL_A1184 CLL_A1185   sigK TRUE 0.729 83.000 0.087 1.000 N NA
 5738378 5738379 CLL_A1185 CLL_A1186 sigK pilT FALSE 0.434 165.000 0.025 1.000 N NA
 5738379 5738380 CLL_A1186 CLL_A1187 pilT ftsA FALSE 0.527 92.000 0.004 0.007 N NA
 5738380 5738381 CLL_A1187 CLL_A1188 ftsA ftsZ TRUE 0.994 14.000 0.460 1.000 Y NA
 5738381 5738382 CLL_A1188 CLL_A1189 ftsZ spoIIGA FALSE 0.077 304.000 0.024 1.000   NA
 5738382 5738383 CLL_A1189 CLL_A1190 spoIIGA sigE TRUE 0.990 13.000 0.856 1.000   NA
 5738383 5738384 CLL_A1190 CLL_A1191 sigE sigG TRUE 0.974 82.000 0.602 0.011 Y NA
 5738384 5738385 CLL_A1191 CLL_A1192 sigG   FALSE 0.137 280.000 0.060 NA   NA
 5738385 5738386 CLL_A1192 CLL_A1193   nrdR TRUE 0.579 70.000 0.013 NA   NA
 5738386 5738387 CLL_A1193 CLL_A1194 nrdR   FALSE 0.318 183.000 0.013 NA   NA
 5738387 5738388 CLL_A1194 CLL_A1195     TRUE 0.910 12.000 0.018 NA   NA
 5738388 5738389 CLL_A1195 CLL_A1196     TRUE 0.993 0.000 0.110 1.000 Y NA
 5738389 5738390 CLL_A1196 CLL_A1197     FALSE 0.151 239.000 0.028 1.000 N NA
 5738390 5738391 CLL_A1197 CLL_A1198   pstC TRUE 0.987 22.000 0.206 1.000 Y NA
 5738391 5738392 CLL_A1198 CLL_A1199 pstC pstA TRUE 0.998 0.000 0.907 0.002 Y NA
 5738392 5738393 CLL_A1199 CLL_A1200 pstA pstB TRUE 0.989 14.000 0.112 0.002 Y NA
 5738393 5738394 CLL_A1200 CLL_A1201 pstB phoU TRUE 0.988 19.000 0.182 NA Y NA
 5738394 5738395 CLL_A1201 CLL_A1202 phoU   FALSE 0.281 194.000 0.028 NA N NA
 5738395 5738396 CLL_A1202 CLL_A1203   engA TRUE 0.964 0.000 0.061 1.000   NA
 5738396 5738397 CLL_A1203 CLL_A1204 engA   TRUE 0.960 3.000 0.068 1.000   NA
 5738397 5738398 CLL_A1204 CLL_A1205   spoIVA TRUE 0.631 149.000 0.060 NA   NA
 5738398 5738399 CLL_A1205 CLL_A1206 spoIVA   FALSE 0.177 160.000 0.000 NA   NA
 5738399 5738400 CLL_A1206 CLL_A1207   ansA FALSE 0.197 153.000 0.000 NA   NA
 5738400 5738401 CLL_A1207 CLL_A1208 ansA   FALSE 0.021 294.000 0.000 1.000   NA
 5738401 5738402 CLL_A1208 CLL_A1209     FALSE 0.008 429.000 0.000 NA   NA
 5738402 5738403 CLL_A1209 CLL_A1210     TRUE 0.966 14.000 0.189 NA   NA
 5738403 5738404 CLL_A1210 CLL_A1211   gmk TRUE 0.977 0.000 0.143 NA   NA
 5738404 5738405 CLL_A1211 CLL_A1212 gmk rpoZ TRUE 0.992 -19.000 0.471 1.000 N NA
 5738405 5738406 CLL_A1212 CLL_A1213 rpoZ coaBC TRUE 0.951 21.000 0.192 1.000 N NA
 5738406 5738407 CLL_A1213 CLL_A1214 coaBC priA TRUE 0.753 64.000 0.099 1.000 N NA
 5738407 5738408 CLL_A1214 CLL_A1215 priA def TRUE 0.881 13.000 0.010 1.000 N NA
 5738408 5738409 CLL_A1215 CLL_A1216 def fmt TRUE 0.977 14.000 0.009 0.027 Y NA
 5738409 5738410 CLL_A1216 CLL_A1217 fmt   TRUE 0.769 41.000 0.035 NA   NA
 5738410 5738411 CLL_A1217 CLL_A1218   sun TRUE 0.935 18.000 0.076 NA   NA
 5738411 5738412 CLL_A1218 CLL_A1219 sun   TRUE 0.959 15.000 0.135 1.000   NA
 5738412 5738413 CLL_A1219 CLL_A1220     TRUE 0.970 2.000 0.105 1.000   NA
 5738413 5738414 CLL_A1220 CLL_A1221     TRUE 0.997 2.000 0.704 1.000 Y NA
 5738414 5738415 CLL_A1221 CLL_A1222   rsgA TRUE 0.792 140.000 0.196 1.000   NA
 5738415 5738416 CLL_A1222 CLL_A1223 rsgA rpe TRUE 0.984 -6.000 0.213 1.000   NA
 5738416 5738417 CLL_A1223 CLL_A1224 rpe   TRUE 0.966 9.000 0.166 1.000 N NA
 5738419 5738420 CLL_A1226 CLL_A1227     TRUE 0.984 14.000 0.567 NA   NA
 5738420 5738421 CLL_A1227 CLL_A1228   recG TRUE 0.691 67.000 0.048 1.000   NA
 5738421 5738422 CLL_A1228 CLL_A1229 recG rsmD TRUE 0.881 63.000 0.016 1.000 Y NA
 5738422 5738423 CLL_A1229 CLL_A1230 rsmD coaD TRUE 0.983 3.000 0.367 1.000 N NA
 5738423 5738424 CLL_A1230 CLL_A1232 coaD   TRUE 0.939 12.000 0.055 NA   NA
 5738425 5738426 CLL_A1231 CLL_A1233 ylbJ   FALSE 0.273 206.000 0.036 NA   NA
 5738427 5738428 CLL_A1234 CLL_A1235 pta ackA TRUE 0.981 26.000 0.137 1.000 Y NA
 5738428 5738429 CLL_A1235 CLL_A1236 ackA   TRUE 0.681 130.000 0.061 NA   NA
 5738429 5738430 CLL_A1236 CLL_A1237   rpmF TRUE 0.989 3.000 0.599 NA   NA
 5738430 5738431 CLL_A1237 CLL_A1238 rpmF plsX TRUE 0.739 177.000 0.418 1.000 N NA
 5738431 5738432 CLL_A1238 CLL_A1239 plsX acpP TRUE 0.898 89.000 0.034 0.005 Y NA
 5738432 5738433 CLL_A1239 CLL_A1240 acpP rnc TRUE 0.696 119.000 0.068 1.000 N NA
 5738433 5738434 CLL_A1240 CLL_A1241 rnc   TRUE 0.992 -7.000 0.064 1.000 Y NA
 5738434 5738435 CLL_A1241 CLL_A1242   smc FALSE 0.082 289.000 0.027 1.000 N NA
 5738435 5738436 CLL_A1242 CLL_A1243 smc ftsY FALSE 0.525 194.000 0.165 0.017 N NA
 5738436 5738437 CLL_A1243 CLL_A1244 ftsY   FALSE 0.389 202.000 0.081 1.000   NA
 5738437 5738438 CLL_A1244 CLL_A1245   ffh TRUE 0.961 15.000 0.151 1.000   NA
 5738438 5738439 CLL_A1245 CLL_A1246 ffh rpsP TRUE 0.934 35.000 0.361 1.000 N NA
 5738439 5738440 CLL_A1246 CLL_A1247 rpsP   TRUE 0.915 50.000 0.385 1.000   NA
 5738440 5738441 CLL_A1247 CLL_A1248   rimM TRUE 0.868 76.000 0.324 1.000   NA
 5738441 5738442 CLL_A1248 CLL_A1249 rimM trmD TRUE 0.998 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 5738442 5738443 CLL_A1249 CLL_A1250 trmD rplS TRUE 0.969 124.000 0.567 1.000 Y NA
 5738443 5738444 CLL_A1250 CLL_A1251 rplS   TRUE 0.642 114.000 0.027 1.000   NA
 5738444 5738445 CLL_A1251 CLL_A1252     TRUE 0.981 -7.000 0.148 1.000   NA
 5738447 5738448 CLL_A1254 CLL_A1255   dprA TRUE 0.906 20.000 0.053 1.000 N NA
 5738448 5738449 CLL_A1255 CLL_A1256 dprA topA TRUE 0.962 52.000 0.238 1.000 Y NA
 5738449 5738450 CLL_A1256 CLL_A1257 topA codY FALSE 0.282 194.000 0.025 1.000 N NA
 5738450 5738451 CLL_A1257 CLL_A1258 codY rpsB FALSE 0.118 232.000 0.006 1.000 N NA
 5738451 5738452 CLL_A1258 CLL_A1259 rpsB tsf TRUE 0.933 183.000 0.748 1.000 Y NA
 5738452 5738453 CLL_A1259 CLL_A1260 tsf pyrH TRUE 0.881 109.000 0.416 1.000 N NA
 5738453 5738454 CLL_A1260 CLL_A1261 pyrH frr TRUE 0.986 11.000 0.626 1.000 N NA
 5738454 5738455 CLL_A1261 CLL_A1262 frr uppS TRUE 0.877 101.000 0.409 1.000 N NA
 5738455 5738456 CLL_A1262 CLL_A1263 uppS cdsA TRUE 0.983 15.000 0.055 1.000 Y NA
 5738456 5738457 CLL_A1263 CLL_A1264 cdsA   FALSE 0.292 218.000 0.068 NA   NA
 5738457 5738458 CLL_A1264 CLL_A1265   dxr TRUE 0.637 51.000 0.008 NA   NA
 5738458 5738459 CLL_A1265 CLL_A1266 dxr rseP TRUE 0.923 7.000 0.029 1.000 N NA
 5738459 5738460 CLL_A1266 CLL_A1267 rseP ispG TRUE 0.914 12.000 0.029 1.000 N NA
 5738460 5738461 CLL_A1267 CLL_A1268 ispG polC TRUE 0.641 105.000 0.040 1.000 N NA
 5738461 5738462 CLL_A1268 CLL_A1269 polC   FALSE 0.131 284.000 0.059 NA   NA
 5738462 5738463 CLL_A1269 CLL_A1270   nusA TRUE 0.986 18.000 0.759 NA   NA
 5738463 5738464 CLL_A1270 CLL_A1271 nusA   TRUE 0.993 15.000 0.323 NA Y NA
 5738464 5738465 CLL_A1271 CLL_A1272     TRUE 0.989 -7.000 0.408 NA N NA
 5738465 5738466 CLL_A1272 CLL_A1273   infB TRUE 0.988 20.000 0.223 NA Y NA
 5738466 5738467 CLL_A1273 CLL_A1274 infB rbfA TRUE 0.995 14.000 0.530 1.000 Y NA
 5738467 5738468 CLL_A1274 CLL_A1275 rbfA   TRUE 0.979 0.000 0.173 1.000   NA
 5738468 5738469 CLL_A1275 CLL_A1276   truB TRUE 0.983 -3.000 0.221 1.000   NA
 5738469 5738470 CLL_A1276 CLL_A1277 truB ribF TRUE 0.970 17.000 0.308 1.000 N NA
 5738470 5738471 CLL_A1277 CLL_A1278 ribF rpsO TRUE 0.766 117.000 0.119 1.000 N NA
 5738471 5738472 CLL_A1278 CLL_A1279 rpsO   TRUE 0.959 81.000 0.335 1.000 Y NA
 5738472 5738473 CLL_A1279 CLL_A1280     FALSE 0.143 274.000 0.057 1.000   NA
 5738473 5738474 CLL_A1280 CLL_A1281     TRUE 0.766 69.000 0.104 NA   NA
 5738474 5738475 CLL_A1281 CLL_A1282     TRUE 0.789 123.000 0.148 NA   NA
 5738475 5738476 CLL_A1282 CLL_A1283   clpP TRUE 0.726 65.000 0.080 1.000 N NA
 5738476 5738477 CLL_A1283 CLL_A1284 clpP ftsK TRUE 0.640 120.000 0.042 1.000 N NA
 5738477 5738478 CLL_A1284 CLL_A1285 ftsK   TRUE 0.613 102.000 0.031 1.000 N NA
 5738478 5738479 CLL_A1285 CLL_A1286   pgsA TRUE 0.980 -16.000 0.132 1.000 N NA
 5738479 5738480 CLL_A1286 CLL_A1287 pgsA recA FALSE 0.399 169.000 0.022 1.000 N NA
 5738480 5738481 CLL_A1287 CLL_A1288 recA   FALSE 0.053 338.000 0.018 1.000   NA
 5738481 5738482 CLL_A1288 CLL_A1289     FALSE 0.514 148.000 0.016 NA   NA
 5738482 5738483 CLL_A1289 CLL_A1290     FALSE 0.568 127.000 0.015 NA   NA
 5738487 5738488 CLL_A1294 CLL_A1295   ribD FALSE 0.006 567.000 0.000 1.000   NA
 5738488 5738489 CLL_A1295 CLL_A1296 ribD ribE TRUE 0.994 15.000 0.456 1.000 Y NA
 5738489 5738490 CLL_A1296 CLL_A1297 ribE   FALSE 0.432 262.000 0.051 1.000 Y NA
 5738490 5738491 CLL_A1297 CLL_A1298   ribH TRUE 0.911 89.000 0.054 0.002 Y NA
 5738493 5738494 CLL_A1300 CLL_A1301     TRUE 0.981 6.000 0.375 1.000 N NA
 5738494 5738495 CLL_A1301 CLL_A1302     TRUE 0.951 78.000 0.250 1.000 Y NA
 5738495 5738496 CLL_A1302 CLL_A1303     TRUE 0.991 16.000 0.241 1.000 Y NA
 5738496 5738497 CLL_A1303 CLL_A1304     TRUE 0.657 162.000 0.128 1.000 N NA
 5738497 5738498 CLL_A1304 CLL_A1305     TRUE 0.957 17.000 0.140 1.000   NA
 5738498 5738499 CLL_A1305 CLL_A1306     TRUE 0.784 96.000 0.125 1.000   NA
 5738499 5738500 CLL_A1306 CLL_A1307     TRUE 0.709 118.000 0.059 1.000   NA
 5738502 5738503 CLL_A1309 CLL_A1310   gntK FALSE 0.010 335.000 0.000 1.000 N NA
 5738503 5738504 CLL_A1310 CLL_A1311 gntK   TRUE 0.934 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5738504 5738505 CLL_A1311 CLL_A1312   gnd TRUE 0.830 52.000 0.000 1.000 Y NA
 5738505 5738506 CLL_A1312 CLL_A1313 gnd   FALSE 0.172 162.000 0.000 NA   NA
 5738506 5738507 CLL_A1313 CLL_A1314     FALSE 0.266 87.000 0.000 NA   NA
 5738509 5738510 CLL_A1316 CLL_A1317     FALSE 0.252 126.000 0.000 NA   NA
 5738510 5738511 CLL_A1317 CLL_A1318     FALSE 0.005 673.000 0.000 NA   NA
 5738511 5738512 CLL_A1318 CLL_A1319     FALSE 0.267 85.000 0.000 NA   NA
 5738512 5738513 CLL_A1319 CLL_A1320     FALSE 0.060 214.000 0.000 NA   NA
 5738517 5738518 CLL_A1324 CLL_A1325     FALSE 0.277 121.000 0.000 1.000   NA
 5738518 5738519 CLL_A1325 CLL_A1326     FALSE 0.041 243.000 0.000 1.000   NA
 5738519 5738520 CLL_A1326 CLL_A1327     FALSE 0.013 344.000 0.000 NA   NA
 5738524 5738525 CLL_A1331 CLL_A1333     TRUE 0.958 15.000 0.132 NA   NA
 5738528 5738529 CLL_A1335 CLL_A1336     FALSE 0.051 225.000 0.000 NA   NA
 5738529 5738530 CLL_A1336 CLL_A1337     FALSE 0.240 132.000 0.000 NA   NA
 5738533 5738534 CLL_A1340 CLL_A1341   map FALSE 0.052 568.000 0.000 1.000 Y NA
 5738534 5738535 CLL_A1341 CLL_A1342 map   FALSE 0.032 255.000 0.000 NA   NA
 5738535 5738536 CLL_A1342 CLL_A1343     FALSE 0.004 1528.000 0.000 NA   NA
 5738536 5738537 CLL_A1343 CLL_A1344     FALSE 0.264 120.000 0.000 NA   NA
 5738537 5738538 CLL_A1344 CLL_A1345     TRUE 0.991 11.000 0.900 NA   NA
 5738538 5738539 CLL_A1345 CLL_A1346     TRUE 0.738 7.000 0.000 NA   NA
 5738539 5738540 CLL_A1346 CLL_A1347     TRUE 0.833 -7.000 0.000 1.000   NA
 5738540 5738541 CLL_A1347 CLL_A1348     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 5738541 5738542 CLL_A1348 CLL_A1349   thyA TRUE 0.917 1.000 0.003 NA   NA
 5738542 5738543 CLL_A1349 CLL_A1350 thyA   FALSE 0.414 38.000 0.000 NA   NA
 5738543 5738544 CLL_A1350 CLL_A1351     TRUE 0.914 18.000 0.041 NA   NA
 5738544 5738545 CLL_A1351 CLL_A1352     FALSE 0.322 130.000 0.000 0.002   NA
 5738545 5738546 CLL_A1352 CLL_A1353     TRUE 0.686 24.000 0.000 0.002   NA
 5738546 5738547 CLL_A1353 CLL_A1354     FALSE 0.148 169.000 0.000 NA   NA
 5738547 5738548 CLL_A1354 CLL_A1355     TRUE 0.689 15.000 0.000 NA   NA
 5738548 5738549 CLL_A1355 CLL_A1356     FALSE 0.013 338.000 0.000 NA   NA
 5738550 5738551 CLL_A1357 CLL_A1358     FALSE 0.026 269.000 0.000 NA   NA
 5738552 5738553 CLL_A1359 CLL_A1360     FALSE 0.006 571.000 0.000 1.000   NA
 5738553 5738554 CLL_A1360 CLL_A1361     FALSE 0.006 529.000 0.000 1.000   NA
 5738554 5738555 CLL_A1361 CLL_A1362     TRUE 0.992 22.000 0.429 0.014 Y NA
 5738555 5738556 CLL_A1362 CLL_A1363   lctP FALSE 0.208 272.000 0.000 1.000 Y NA
 5738556 5738557 CLL_A1363 CLL_A1364 lctP   TRUE 0.894 155.000 0.111 1.000 Y NA
 5738557 5738558 CLL_A1364 CLL_A1365     TRUE 0.650 174.000 0.182 0.010 N NA
 5738561 5738562 CLL_A1368 CLL_A1369     FALSE 0.388 46.000 0.000 1.000   NA
 5738562 5738563 CLL_A1369 CLL_A1370     TRUE 0.996 19.000 1.000 0.040 Y NA
 5738563 5738564 CLL_A1370 CLL_A1371     FALSE 0.024 251.000 0.000 1.000 N NA
 5738564 5738565 CLL_A1371 CLL_A1372     FALSE 0.289 110.000 0.000 1.000   NA
 5738566 5738567 CLL_A1373 CLL_A1374     TRUE 0.993 33.000 0.943 0.017 Y NA
 5738567 5738568 CLL_A1374 CLL_A1375     TRUE 0.996 20.000 0.812 0.017 Y NA
 5738568 5738569 CLL_A1375 CLL_A1376     TRUE 0.678 204.000 0.583 NA   NA
 5738569 5738570 CLL_A1376 CLL_A1377     FALSE 0.013 347.000 0.000 NA   NA
 5738570 5738571 CLL_A1377 CLL_A1378     FALSE 0.273 66.000 0.000 NA   NA
 5738571 5738572 CLL_A1378 CLL_A1379     FALSE 0.072 190.000 0.000 1.000 N NA
 5738572 5738573 CLL_A1379 CLL_A1380     TRUE 0.994 -15.000 0.079 1.000 Y NA
 5738573 5738574 CLL_A1380 CLL_A1381     TRUE 0.889 53.000 0.333 1.000 N NA
 5738574 5738575 CLL_A1381 CLL_A1382     TRUE 0.987 7.000 0.600 1.000 N NA
 5738575 5738576 CLL_A1382 CLL_A1383     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5738576 5738577 CLL_A1383 CLL_A1384     TRUE 0.586 25.000 0.000 NA   NA
 5738579 5738580 CLL_A1386 CLL_A1387     TRUE 0.854 144.000 0.455 1.000 N NA
 5738580 5738581 CLL_A1387 CLL_A1388     TRUE 0.997 -10.000 0.455 1.000 Y NA
 5738581 5738582 CLL_A1388 CLL_A1389   modA FALSE 0.016 286.000 0.000 1.000 N NA
 5738582 5738583 CLL_A1389 CLL_A1390 modA   TRUE 0.940 43.000 0.556 1.000 N NA
 5738583 5738584 CLL_A1390 CLL_A1391     TRUE 0.619 21.000 0.000 0.024 N NA
 5738584 5738585 CLL_A1391 CLL_A1392     TRUE 0.616 22.000 0.000 NA   NA
 5738585 5738586 CLL_A1392 CLL_A1393     FALSE 0.019 298.000 0.000 NA   NA
 5738586 5738587 CLL_A1393 CLL_A1394   ade FALSE 0.014 330.000 0.000 NA   NA
 5738588 5738589 CLL_A1395 CLL_A1396 asnB   FALSE 0.005 689.000 0.000 NA   NA
 5738590 5738591 CLL_A1397 CLL_A1398     FALSE 0.246 129.000 0.000 NA   NA
 5738591 5738592 CLL_A1398 CLL_A1399     FALSE 0.004 953.000 0.000 NA   NA
 5738593 5738594 CLL_A1400 CLL_A1401     FALSE 0.007 467.000 0.000 NA   NA
 5738595 5738596 CLL_A1402 CLL_A1403     TRUE 0.993 -19.000 0.061 1.000 Y NA
 5738596 5738597 CLL_A1403 CLL_A1404     TRUE 0.987 16.000 0.119 1.000 Y NA
 5738597 5738598 CLL_A1404 CLL_A1405     TRUE 0.679 57.000 0.030 NA   NA
 5738598 5738599 CLL_A1405 CLL_A1406     FALSE 0.025 274.000 0.000 NA   NA
 5738599 5738600 CLL_A1406 CLL_A1407     TRUE 0.910 109.000 0.625 1.000 N NA
 5738600 5738601 CLL_A1407 CLL_A1408     TRUE 0.994 -7.000 0.778 NA   NA
 5738601 5738602 CLL_A1408 CLL_A1409     TRUE 0.905 97.000 0.556 NA   NA
 5738602 5738603 CLL_A1409 CLL_A1410     TRUE 0.650 25.000 0.000 0.086   NA
 5738603 5738604 CLL_A1410 CLL_A1411     FALSE 0.008 449.000 0.000 1.000   NA
 5738604 5738605 CLL_A1411 CLL_A1412     TRUE 0.967 20.000 0.333 1.000 N NA
 5738605 5738606 CLL_A1412 CLL_A1413     FALSE 0.005 785.000 0.000 NA   NA
 5738606 5738607 CLL_A1413 CLL_A1414     FALSE 0.165 164.000 0.000 NA   NA
 5738607 5738608 CLL_A1414 CLL_A1415     FALSE 0.104 186.000 0.000 NA   NA
 5738608 5738609 CLL_A1415 CLL_A1416     FALSE 0.015 324.000 0.000 NA   NA
 5738609 5738610 CLL_A1416 CLL_A1417     TRUE 0.965 -28.000 0.032 NA   NA
 5738610 5738611 CLL_A1417 CLL_A1418     FALSE 0.009 395.000 0.000 NA   NA
 5738611 5738612 CLL_A1418 CLL_A1419     FALSE 0.349 49.000 0.000 NA   NA
 5738612 5738613 CLL_A1419 CLL_A1420     FALSE 0.019 296.000 0.000 NA   NA
 5738613 5738614 CLL_A1420 CLL_A1421     TRUE 0.777 120.000 0.000 NA Y NA
 5738614 5738615 CLL_A1421 CLL_A1422     FALSE 0.273 66.000 0.000 NA   NA
 5738615 5738616 CLL_A1422 CLL_A1424     FALSE 0.313 55.000 0.000 NA   NA
 5738616 5738617 CLL_A1424 CLL_A1425     TRUE 0.735 8.000 0.000 NA   NA
 5738617 5738618 CLL_A1425 CLL_A1426     FALSE 0.006 491.000 0.000 NA   NA
 5738618 5738619 CLL_A1426 CLL_A1427   mgtA FALSE 0.048 861.000 0.000 0.003 Y NA
 5738619 5738620 CLL_A1427 CLL_A1428 mgtA   FALSE 0.009 401.000 0.000 1.000   NA
 5738620 5738621 CLL_A1428 CLL_A1429     FALSE 0.013 340.000 0.000 NA   NA
 5738621 5738622 CLL_A1429 CLL_A1430     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5738622 5738623 CLL_A1430 CLL_A1431     FALSE 0.076 200.000 0.000 NA   NA
 5738623 5738624 CLL_A1431 CLL_A1432     FALSE 0.244 130.000 0.000 NA   NA
 5738624 5738625 CLL_A1432 CLL_A1433     FALSE 0.006 547.000 0.000 1.000   NA
 5738625 5738626 CLL_A1433 CLL_A1434     FALSE 0.006 395.000 0.000 1.000 N NA
 5738626 5738627 CLL_A1434 CLL_A1435   fprA TRUE 0.952 37.000 0.571 0.040 N NA
 5738627 5738628 CLL_A1435 CLL_A1436 fprA   FALSE 0.007 387.000 0.000 1.000 N NA
 5738628 5738629 CLL_A1436 CLL_A1437     TRUE 0.722 11.000 0.000 NA   NA
 5738630 5738631 CLL_A1439 CLL_A1440     FALSE 0.254 125.000 0.000 NA   NA
 5738632 5738633 CLL_A1441 CLL_A1442     FALSE 0.313 124.000 0.000 0.055   NA
 5738633 5738634 CLL_A1442 CLL_A1443     FALSE 0.014 329.000 0.000 NA   NA
 5738634 5738635 CLL_A1443 CLL_A1444     FALSE 0.044 234.000 0.000 NA   NA
 5738635 5738636 CLL_A1444 CLL_A1445     FALSE 0.009 421.000 0.000 1.000   NA
 5738636 5738637 CLL_A1445 CLL_A1446     FALSE 0.086 181.000 0.000 1.000 N NA
 5738637 5738638 CLL_A1446 CLL_A1447     FALSE 0.046 498.000 0.094 1.000 N NA
 5738638 5738639 CLL_A1447 CLL_A1448     FALSE 0.005 580.000 0.000 NA   NA
 5738639 5738640 CLL_A1448 CLL_A1449     TRUE 0.993 0.000 0.810 NA   NA
 5738640 5738641 CLL_A1449 CLL_A1450     TRUE 0.958 25.000 0.286 NA   NA
 5738641 5738642 CLL_A1450 CLL_A1451     TRUE 0.972 27.000 0.571 NA   NA
 5738642 5738643 CLL_A1451 CLL_A1452     TRUE 0.900 76.000 0.500 NA   NA
 5738643 5738644 CLL_A1452 CLL_A1453     TRUE 0.968 56.000 0.370 1.000 Y NA
 5738644 5738645 CLL_A1453 CLL_A1454     TRUE 0.871 168.000 0.815 0.004 N NA
 5738645 5738646 CLL_A1454 CLL_A1455     TRUE 0.924 40.000 0.375 1.000 N NA
 5738646 5738647 CLL_A1455 CLL_A1456     TRUE 0.986 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 5738647 5738648 CLL_A1456 CLL_A1457     TRUE 0.974 0.000 0.000 NA Y NA
 5738648 5738649 CLL_A1457 CLL_A1458     TRUE 0.998 -18.000 0.615 NA Y NA
 5738649 5738650 CLL_A1458 CLL_A1459     TRUE 0.980 16.000 0.444 NA   NA
 5738650 5738651 CLL_A1459 CLL_A1460     TRUE 0.988 -3.000 0.389 NA   NA
 5738651 5738652 CLL_A1460 CLL_A1461     TRUE 0.994 18.000 0.500 NA Y NA
 5738652 5738653 CLL_A1461 CLL_A1462     TRUE 0.998 2.000 0.833 NA Y NA
 5738653 5738654 CLL_A1462 CLL_A1463     TRUE 0.897 58.000 0.455 NA N NA
 5738654 5738655 CLL_A1463 CLL_A1464     TRUE 0.980 23.000 0.750 NA N NA
 5738655 5738656 CLL_A1464 CLL_A1465     TRUE 0.986 39.000 0.692 NA Y NA
 5738656 5738657 CLL_A1465 CLL_A1466     TRUE 0.992 1.000 0.769 NA N NA
 5738657 5738658 CLL_A1466 CLL_A1467     TRUE 0.915 57.000 0.500 NA   NA
 5738658 5738659 CLL_A1467 CLL_A1468     FALSE 0.026 269.000 0.000 NA   NA
 5738659 5738660 CLL_A1468 CLL_A1469     FALSE 0.007 502.000 0.000 1.000   NA
 5738660 5738661 CLL_A1469 CLL_A1470   hypB FALSE 0.009 423.000 0.000 1.000   NA
 5738661 5738662 CLL_A1470 CLL_A1471 hypB   TRUE 0.933 22.000 0.115 1.000 N NA
 5738662 5738663 CLL_A1471 CLL_A1472     TRUE 0.875 109.000 0.333 1.000   NA
 5738663 5738664 CLL_A1472 CLL_A1473     FALSE 0.356 51.000 0.000 1.000   NA
 5738664 5738665 CLL_A1473 CLL_A1474     TRUE 0.975 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5738665 5738666 CLL_A1474 CLL_A1475     TRUE 0.997 0.000 0.625 1.000 Y NA
 5738666 5738667 CLL_A1475 CLL_A1476     FALSE 0.101 188.000 0.000 NA   NA
 5738669 5738670 CLL_A1478 CLL_A1479     FALSE 0.172 162.000 0.000 NA   NA
 5738672 5738673 CLL_A1481 CLL_A1482     TRUE 0.921 22.000 0.085 1.000 N NA
 5738673 5738674 CLL_A1482 CLL_A1483     TRUE 0.977 137.000 0.932 1.000 Y NA
 5738678 5738679 CLL_A1487 CLL_A1488     FALSE 0.031 257.000 0.000 NA   NA
 5738679 5738680 CLL_A1488 CLL_A1489     FALSE 0.268 82.000 0.000 NA   NA
 5738680 5738681 CLL_A1489 CLL_A1490     FALSE 0.168 163.000 0.000 NA   NA
 5738681 5738682 CLL_A1490 CLL_A1491     FALSE 0.008 412.000 0.000 NA   NA
 5738686 5738687 CLL_A1495 CLL_A1496     FALSE 0.317 54.000 0.000 NA   NA
 5738687 5738688 CLL_A1496 CLL_A1497     FALSE 0.229 139.000 0.000 NA   NA
 5738688 5738689 CLL_A1497 CLL_A1498     FALSE 0.011 319.000 0.000 1.000 N NA
 5738689 5738690 CLL_A1498 CLL_A1499     FALSE 0.265 287.000 0.286 0.016 N NA
 5738690 5738691 CLL_A1499 CLL_A1500     TRUE 0.994 23.000 0.600 0.009 Y NA
 5738691 5738692 CLL_A1500 CLL_A1501     TRUE 0.971 83.000 0.600 NA Y NA
 5738692 5738693 CLL_A1501 CLL_A1502     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 5738693 5738694 CLL_A1502 CLL_A1503     TRUE 0.809 47.000 0.071 1.000   NA
 5738694 5738695 CLL_A1503 CLL_A1504     FALSE 0.009 401.000 0.000 NA   NA
 5738695 5738696 CLL_A1504 CLL_A1505     FALSE 0.273 66.000 0.000 NA   NA
 5738696 5738697 CLL_A1505 CLL_A1506     TRUE 0.996 -10.000 0.256 1.000 Y NA
 5738697 5738698 CLL_A1506 CLL_A1507     FALSE 0.434 36.000 0.000 NA   NA
 5738700 5738701 CLL_A1509 CLL_A1510     FALSE 0.004 566.000 0.000 1.000 N NA
 5738703 5738704 CLL_A1512 CLL_A1513     TRUE 0.959 5.000 0.079 0.004 N NA
 5738704 5738705 CLL_A1513 CLL_A1514     TRUE 0.629 13.000 0.000 1.000 N NA
 5738706 5738707 CLL_A1515 CLL_A1516     FALSE 0.204 120.000 0.000 1.000 N NA
 5738707 5738708 CLL_A1516 CLL_A1517     FALSE 0.013 342.000 0.000 NA   NA
 5738709 5738710 CLL_A1518 CLL_A1519     TRUE 0.783 88.000 0.000 1.000 Y NA
 5738710 5738711 CLL_A1519 CLL_A1520     FALSE 0.419 40.000 0.000 1.000   NA
 5738711 5738712 CLL_A1520 CLL_A1521     FALSE 0.007 456.000 0.000 NA   NA
 5738712 5738713 CLL_A1521 CLL_A1522     FALSE 0.273 110.000 0.000 NA   NA
 5738713 5738714 CLL_A1522 CLL_A1523     FALSE 0.006 491.000 0.000 NA   NA
 5738714 5738715 CLL_A1523 CLL_A1524     FALSE 0.225 141.000 0.000 NA   NA
 5738715 5738716 CLL_A1524 CLL_A1525     FALSE 0.015 322.000 0.000 NA   NA
 5738718 5738719 CLL_A1527 CLL_A1528 rbsK   TRUE 0.983 6.000 0.020 1.000 Y NA
 5738719 5738720 CLL_A1528 CLL_A1529     TRUE 0.993 15.000 0.337 1.000 Y NA
 5738720 5738721 CLL_A1529 CLL_A1530     TRUE 0.994 17.000 0.504 1.000 Y NA
 5738721 5738722 CLL_A1530 CLL_A1531     TRUE 0.932 25.000 0.000 NA Y NA
 5738722 5738723 CLL_A1531 CLL_A1532     FALSE 0.238 52.000 0.000 NA N NA
 5738724 5738725 CLL_A1533 CLL_A1534   pcp TRUE 0.949 0.000 0.029 NA   NA
 5738725 5738726 CLL_A1534 CLL_A1535 pcp   FALSE 0.102 475.000 0.300 NA   NA
 5738726 5738727 CLL_A1535 CLL_A1536     TRUE 0.987 19.000 0.939 NA   NA
 5738728 5738729 CLL_A1537 CLL_A1538     TRUE 0.914 78.000 0.071 1.000 Y NA
 5738729 5738730 CLL_A1538 CLL_A1539     FALSE 0.216 268.000 0.000 1.000 Y NA
 5738730 5738731 CLL_A1539 CLL_A1540     TRUE 0.979 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5738731 5738732 CLL_A1540 CLL_A1541     FALSE 0.114 185.000 0.000 1.000   NA
 5738732 5738733 CLL_A1541 CLL_A1542     FALSE 0.261 121.000 0.000 NA   NA
 5738733 5738734 CLL_A1542 CLL_A1543     FALSE 0.040 241.000 0.000 NA   NA
 5738736 5738737 CLL_A1545 CLL_A1546     TRUE 0.940 94.000 1.000 NA   NA
 5738737 5738738 CLL_A1546 CLL_A1547     FALSE 0.309 56.000 0.000 NA   NA
 5738738 5738739 CLL_A1547 CLL_A1548     FALSE 0.262 96.000 0.000 NA   NA
 5738739 5738740 CLL_A1548 CLL_A1549     TRUE 0.754 17.000 0.000 0.001   NA
 5738740 5738741 CLL_A1549 CLL_A1550     FALSE 0.447 35.000 0.000 NA   NA
 5738741 5738742 CLL_A1550 CLL_A1551     FALSE 0.268 83.000 0.000 NA   NA
 5738744 5738745 CLL_A1553 CLL_A1554     TRUE 0.966 -10.000 0.046 NA   NA
 5738745 5738746 CLL_A1554 CLL_A1555     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5738746 5738747 CLL_A1555 CLL_A1556     FALSE 0.154 167.000 0.000 NA   NA
 5738748 5738749 CLL_A1557 CLL_A1558     TRUE 0.974 19.000 0.386 NA   NA
 5738750 5738751 CLL_A1559 CLL_A1560     FALSE 0.057 216.000 0.000 NA   NA
 5738753 5738754 CLL_A1562 CLL_A1563     FALSE 0.210 153.000 0.000 1.000   NA
 5738754 5738755 CLL_A1563 CLL_A1564     FALSE 0.014 326.000 0.000 NA   NA
 5738755 5738756 CLL_A1564 CLL_A1565     FALSE 0.102 187.000 0.000 NA   NA
 5738757 5738758 CLL_A1566 CLL_A1567     FALSE 0.264 99.000 0.000 NA   NA
 5738759 5738760 CLL_A1568 CLL_A1569     FALSE 0.232 144.000 0.000 1.000   NA
 5738760 5738761 CLL_A1569 CLL_A1570     FALSE 0.058 222.000 0.000 1.000   NA
 5738764 5738765 CLL_A1573 CLL_A1574 alr   TRUE 0.884 127.000 0.500 1.000 N NA
 5738766 5738767 CLL_A1575 CLL_A1576     FALSE 0.218 144.000 0.000 NA   NA
 5738767 5738768 CLL_A1576 CLL_A1577     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5738768 5738769 CLL_A1577 CLL_A1578     FALSE 0.137 172.000 0.000 NA   NA
 5738771 5738772 CLL_A1580 CLL_A1581 udp   TRUE 0.585 177.000 0.000 1.000 Y NA
 5738772 5738773 CLL_A1581 CLL_A1582   deoB FALSE 0.488 183.000 0.093 1.000 N NA
 5738773 5738774 CLL_A1582 CLL_A1583 deoB   TRUE 0.789 111.000 0.000 1.000 Y NA
 5738774 5738775 CLL_A1583 CLL_A1584     TRUE 0.964 13.000 0.000 0.002 Y NA
 5738775 5738776 CLL_A1584 CLL_A1585   deoD FALSE 0.206 73.000 0.000 1.000 N NA
 5738776 5738777 CLL_A1585 CLL_A1586 deoD   FALSE 0.092 177.000 0.000 1.000 N NA
 5738777 5738778 CLL_A1586 CLL_A1587     FALSE 0.006 535.000 0.000 NA   NA
 5738778 5738779 CLL_A1587 CLL_A1588     FALSE 0.011 359.000 0.000 NA   NA
 5738781 5738782 CLL_A1590 CLL_A1591     FALSE 0.007 488.000 0.000 1.000   NA
 5738782 5738783 CLL_A1591 CLL_A1592     FALSE 0.542 28.000 0.000 NA   NA
 5738783 5738784 CLL_A1592 CLL_A1593     TRUE 0.990 7.000 0.750 NA   NA
 5738784 5738785 CLL_A1593 CLL_A1594     TRUE 0.814 37.000 0.036 0.009   NA
 5738785 5738786 CLL_A1594 CLL_A1595     FALSE 0.006 512.000 0.000 1.000   NA
 5738786 5738787 CLL_A1595 CLL_A1596     FALSE 0.024 595.000 0.039 1.000 N NA
 5738787 5738788 CLL_A1596 CLL_A1597     FALSE 0.268 83.000 0.000 NA   NA
 5738788 5738789 CLL_A1597 CLL_A1598     FALSE 0.010 375.000 0.000 NA   NA
 5738789 5738790 CLL_A1598 CLL_A1599     TRUE 0.827 67.000 0.200 NA   NA
 5738790 5738791 CLL_A1599 CLL_A1600     TRUE 0.977 14.000 0.333 NA   NA
 5738791 5738792 CLL_A1600 CLL_A1601     FALSE 0.012 357.000 0.000 NA   NA
 5738792 5738793 CLL_A1601 CLL_A1602     TRUE 0.690 49.000 0.019 NA   NA
 5738793 5738794 CLL_A1602 CLL_A1603     TRUE 0.986 14.000 0.667 NA   NA
 5738794 5738795 CLL_A1603 CLL_A1604     TRUE 0.985 6.000 0.429 NA   NA
 5738795 5738796 CLL_A1604 CLL_A1605     TRUE 0.987 30.000 0.429 1.000 Y NA
 5738796 5738797 CLL_A1605 CLL_A1606     TRUE 0.992 -7.000 0.556 NA   NA
 5738797 5738798 CLL_A1606 CLL_A1607     TRUE 0.992 -3.000 0.625 NA   NA
 5738798 5738799 CLL_A1607 CLL_A1608     TRUE 0.863 108.000 0.300 NA   NA
 5738799 5738800 CLL_A1608 CLL_A1609     FALSE 0.006 528.000 0.000 NA   NA
 5738800 5738801 CLL_A1609 CLL_A1610     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5738801 5738802 CLL_A1610 CLL_A1611     TRUE 0.972 29.000 0.667 NA   NA
 5738802 5738803 CLL_A1611 CLL_A1612     TRUE 0.984 25.000 1.000 NA   NA
 5738803 5738804 CLL_A1612 CLL_A1613     TRUE 0.988 19.000 1.000 NA   NA
 5738804 5738805 CLL_A1613 CLL_A1614     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 5738805 5738806 CLL_A1614 CLL_A1615     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 5738806 5738807 CLL_A1615 CLL_A1616     TRUE 0.948 29.000 0.286 NA   NA
 5738807 5738808 CLL_A1616 CLL_A1617     TRUE 0.635 20.000 0.000 NA   NA
 5738808 5738809 CLL_A1617 CLL_A1618     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5738809 5738810 CLL_A1618 CLL_A1619     FALSE 0.005 710.000 0.000 NA   NA
 5738810 5738811 CLL_A1619 CLL_A1620     FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5738811 5738812 CLL_A1620 CLL_A1621     TRUE 0.647 19.000 0.000 NA   NA
 5738812 5738813 CLL_A1621 CLL_A1622     FALSE 0.007 473.000 0.000 NA   NA
 5738813 5738814 CLL_A1622 CLL_A1623     TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5738814 5738815 CLL_A1623 CLL_A1624     FALSE 0.005 653.000 0.000 NA   NA
 5738815 5738816 CLL_A1624 CLL_A1625     FALSE 0.183 158.000 0.000 NA   NA
 5738816 5738817 CLL_A1625 CLL_A1626     FALSE 0.248 128.000 0.000 NA   NA
 5738817 5738818 CLL_A1626 CLL_A1627     FALSE 0.022 285.000 0.000 NA   NA
 5738818 5738819 CLL_A1627 CLL_A1628     TRUE 0.958 27.000 0.333 NA   NA
 5738819 5738820 CLL_A1628 CLL_A1629     FALSE 0.082 196.000 0.000 NA   NA
 5738820 5738821 CLL_A1629 CLL_A1630     FALSE 0.266 87.000 0.000 NA   NA
 5738821 5738822 CLL_A1630 CLL_A1631     FALSE 0.007 458.000 0.000 NA   NA
 5738822 5738823 CLL_A1631 CLL_A1632     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 5738823 5738824 CLL_A1632 CLL_A1633     FALSE 0.192 155.000 0.000 NA   NA
 5738824 5738825 CLL_A1633 CLL_A1634     FALSE 0.006 491.000 0.000 NA   NA
 5738825 5738826 CLL_A1634 CLL_A1635     FALSE 0.266 74.000 0.000 NA   NA
 5738826 5738827 CLL_A1635 CLL_A1636     FALSE 0.015 325.000 0.000 NA   NA
 5738827 5738828 CLL_A1636 CLL_A1637     FALSE 0.004 1021.000 0.000 NA   NA
 5738828 5738829 CLL_A1637 CLL_A1638     FALSE 0.068 206.000 0.000 NA   NA
 5738829 5738830 CLL_A1638 CLL_A1639     FALSE 0.148 169.000 0.000 NA   NA
 5738830 5738831 CLL_A1639 CLL_A1640     TRUE 0.586 25.000 0.000 NA   NA
 5738831 5738832 CLL_A1640 CLL_A1641     FALSE 0.011 363.000 0.000 NA   NA
 5738832 5738833 CLL_A1641 CLL_A1642     FALSE 0.266 72.000 0.000 NA   NA
 5738833 5738834 CLL_A1642 CLL_A1643     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5738834 5738835 CLL_A1643 CLL_A1644     FALSE 0.005 689.000 0.000 NA   NA
 5738835 5738836 CLL_A1644 CLL_A1645     FALSE 0.244 130.000 0.000 NA   NA
 5738836 5738837 CLL_A1645 CLL_A1646     FALSE 0.322 53.000 0.000 NA   NA
 5738837 5738838 CLL_A1646 CLL_A1647     FALSE 0.484 32.000 0.000 NA   NA
 5738838 5738839 CLL_A1647 CLL_A1648     FALSE 0.027 267.000 0.000 NA   NA
 5738839 5738840 CLL_A1648 CLL_A1649     FALSE 0.005 577.000 0.000 NA   NA
 5738840 5738841 CLL_A1649 CLL_A1650     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5738841 5738842 CLL_A1650 CLL_A1651     TRUE 0.571 26.000 0.000 NA   NA
 5738842 5738843 CLL_A1651 CLL_A1653     FALSE 0.270 117.000 0.000 NA   NA
 5738845 5738846 CLL_A1654 CLL_A1655     TRUE 0.851 -37.000 0.000 NA   NA
 5738846 5738847 CLL_A1655 CLL_A1656     FALSE 0.009 398.000 0.000 NA   NA
 5738847 5738848 CLL_A1656 CLL_A1657     TRUE 0.656 10.000 0.000 1.000 N NA
 5738848 5738849 CLL_A1657 CLL_A1658     FALSE 0.133 177.000 0.000 1.000   NA
 5738849 5738850 CLL_A1658 CLL_A1659     TRUE 0.645 172.000 0.154 1.000   NA
 5738850 5738851 CLL_A1659 CLL_A1660     TRUE 0.715 104.000 0.078 1.000 N NA
 5738851 5738852 CLL_A1660 CLL_A1661     FALSE 0.375 45.000 0.000 NA   NA
 5738854 5738855 CLL_A1663 CLL_A1664     TRUE 0.883 -13.000 0.000 0.003   NA
 5738855 5738856 CLL_A1664 CLL_A1665     FALSE 0.192 159.000 0.000 1.000   NA
 5738856 5738857 CLL_A1665 CLL_A1666   gshAB FALSE 0.012 310.000 0.000 1.000 N NA
 5738857 5738858 CLL_A1666 CLL_A1667 gshAB   FALSE 0.019 268.000 0.000 1.000 N NA
 5738859 5738860 CLL_A1668 CLL_A1669     FALSE 0.073 202.000 0.000 NA   NA
 5738861 5738862 CLL_A1670 CLL_A1671     FALSE 0.008 426.000 0.000 NA   NA
 5738862 5738863 CLL_A1671 CLL_A1672     TRUE 0.966 -13.000 0.041 NA   NA
 5738863 5738864 CLL_A1672 CLL_A1673     TRUE 0.991 -16.000 0.419 1.000 N NA
 5738864 5738865 CLL_A1673 CLL_A1674     TRUE 0.972 -19.000 0.058 NA   NA
 5738867 5738868 CLL_A1676 CLL_A1677   rluB FALSE 0.011 359.000 0.000 NA   NA
 5738868 5738869 CLL_A1677 CLL_A1678 rluB   FALSE 0.332 174.000 0.013 1.000 N NA
 5738869 5738870 CLL_A1678 CLL_A1679     FALSE 0.491 130.000 0.009 1.000 N NA
 5738870 5738871 CLL_A1679 CLL_A1680     TRUE 0.857 19.000 0.006 NA   NA
 5738871 5738872 CLL_A1680 CLL_A1681     FALSE 0.017 309.000 0.000 NA   NA
 5738872 5738873 CLL_A1681 CLL_A1682     TRUE 0.982 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 5738873 5738874 CLL_A1682 CLL_A1683     FALSE 0.227 146.000 0.000 1.000   NA
 5738874 5738875 CLL_A1683 CLL_A1684     FALSE 0.344 50.000 0.000 NA   NA
 5738875 5738876 CLL_A1684 CLL_A1685     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 5738876 5738877 CLL_A1685 CLL_A1686     FALSE 0.028 265.000 0.000 NA   NA
 5738877 5738878 CLL_A1686 CLL_A1687     FALSE 0.093 192.000 0.000 NA   NA
 5738878 5738879 CLL_A1687 CLL_A1688   topB FALSE 0.026 271.000 0.000 NA   NA
 5738879 5738880 CLL_A1688 CLL_A1689 topB   FALSE 0.011 359.000 0.000 NA   NA
 5738880 5738881 CLL_A1689 CLL_A1690     FALSE 0.349 49.000 0.000 NA   NA
 5738881 5738882 CLL_A1690 CLL_A1691     FALSE 0.261 95.000 0.000 NA   NA
 5738882 5738883 CLL_A1691 CLL_A1692     FALSE 0.012 348.000 0.000 NA   NA
 5738883 5738884 CLL_A1692 CLL_A1693     TRUE 0.728 10.000 0.000 NA   NA
 5738884 5738885 CLL_A1693 CLL_A1694     FALSE 0.189 129.000 0.000 1.000 N NA
 5738885 5738886 CLL_A1694 CLL_A1695     FALSE 0.013 304.000 0.000 1.000 N NA
 5738886 5738887 CLL_A1695 CLL_A1696     FALSE 0.010 335.000 0.000 1.000 N NA
 5738887 5738888 CLL_A1696 CLL_A1697   xpt TRUE 0.987 3.000 0.032 1.000 Y NA
 5738888 5738889 CLL_A1697 CLL_A1698 xpt   FALSE 0.006 410.000 0.000 1.000 N NA
 5738889 5738890 CLL_A1698 CLL_A1699   pyc FALSE 0.003 704.000 0.000 1.000 N NA
 5738890 5738891 CLL_A1699 CLL_A1700 pyc amyX FALSE 0.179 137.000 0.000 1.000 N NA
 5738891 5738892 CLL_A1700 CLL_A1701 amyX   FALSE 0.009 342.000 0.000 1.000 N NA
 5738892 5738893 CLL_A1701 CLL_A1702   tyrS FALSE 0.003 1051.000 0.000 1.000 N NA
 5738893 5738894 CLL_A1702 CLL_A1703 tyrS   FALSE 0.207 71.000 0.000 1.000 N NA
 5738894 5738895 CLL_A1703 CLL_A1704     FALSE 0.354 36.000 0.000 1.000 N NA
 5738896 5738897 CLL_A1705 CLL_A1706     FALSE 0.012 353.000 0.000 NA   NA
 5738898 5738899 CLL_A1707 CLL_A1708   galE FALSE 0.200 157.000 0.000 1.000   NA
 5738899 5738900 CLL_A1708 CLL_A1709 galE   FALSE 0.006 500.000 0.000 NA   NA
 5738900 5738901 CLL_A1709 CLL_A1710     FALSE 0.244 130.000 0.000 NA   NA
 5738901 5738902 CLL_A1710 CLL_A1711     FALSE 0.268 83.000 0.000 NA   NA
 5738902 5738903 CLL_A1711 CLL_A1712     FALSE 0.007 445.000 0.000 NA   NA
 5738903 5738904 CLL_A1712 CLL_A1713     FALSE 0.197 153.000 0.000 NA   NA
 5738904 5738905 CLL_A1713 CLL_A1714     TRUE 0.843 -16.000 0.000 NA   NA
 5738905 5738906 CLL_A1714 CLL_A1715     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5738906 5738907 CLL_A1715 CLL_A1716     TRUE 0.957 22.000 0.230 NA   NA
 5738907 5738908 CLL_A1716 CLL_A1717     FALSE 0.194 154.000 0.000 NA   NA
 5738908 5738909 CLL_A1717 CLL_A1718     TRUE 0.983 16.000 0.569 NA   NA
 5738909 5738910 CLL_A1718 CLL_A1719     FALSE 0.022 286.000 0.000 NA   NA
 5738910 5738911 CLL_A1719 CLL_A1720     FALSE 0.066 456.000 0.000 1.000 Y NA
 5738911 5738912 CLL_A1720 CLL_A1721     TRUE 0.963 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5738912 5738913 CLL_A1721 CLL_A1722     TRUE 0.917 29.000 0.000 1.000 Y NA
 5738913 5738914 CLL_A1722 CLL_A1723     FALSE 0.008 355.000 0.000 1.000 N NA
 5738914 5738915 CLL_A1723 CLL_A1724     TRUE 0.983 7.000 0.400 NA   NA
 5738915 5738916 CLL_A1724 CLL_A1725     TRUE 0.804 152.000 0.286 NA   NA
 5738916 5738917 CLL_A1725 CLL_A1726     FALSE 0.298 40.000 0.000 NA N NA
 5738917 5738918 CLL_A1726 CLL_A1727     FALSE 0.006 512.000 0.000 NA   NA
 5738918 5738919 CLL_A1727 CLL_A1728     FALSE 0.019 299.000 0.000 NA   NA
 5738919 5738920 CLL_A1728 CLL_A1729     FALSE 0.273 111.000 0.000 NA   NA
 5738920 5738921 CLL_A1729 CLL_A1730     FALSE 0.020 267.000 0.000 1.000 N NA
 5738921 5738922 CLL_A1730 CLL_A1731     FALSE 0.015 325.000 0.000 NA   NA
 5738922 5738923 CLL_A1731 CLL_A1732   xth FALSE 0.006 490.000 0.000 NA   NA
 5738923 5738924 CLL_A1732 CLL_A1733 xth   FALSE 0.472 33.000 0.000 NA   NA
 5738924 5738925 CLL_A1733 CLL_A1734     FALSE 0.337 51.000 0.000 NA   NA
 5738925 5738926 CLL_A1734 CLL_A1735     FALSE 0.018 264.000 0.000 NA N NA
 5738926 5738927 CLL_A1735 CLL_A1736     FALSE 0.016 316.000 0.000 NA   NA
 5738927 5738928 CLL_A1736 CLL_A1737     FALSE 0.007 444.000 0.000 NA   NA
 5738928 5738929 CLL_A1737 CLL_A1738     FALSE 0.009 386.000 0.000 NA   NA
 5738929 5738930 CLL_A1738 CLL_A1739     FALSE 0.006 557.000 0.000 NA   NA
 5738930 5738931 CLL_A1739 CLL_A1740     FALSE 0.009 354.000 0.000 1.000 N NA
 5738931 5738932 CLL_A1740 CLL_A1741     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA N NA
 5738932 5738933 CLL_A1741 CLL_A1742     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5738933 5738934 CLL_A1742 CLL_A1743     FALSE 0.270 105.000 0.000 NA   NA
 5738934 5738935 CLL_A1743 CLL_A1744     TRUE 0.928 26.000 0.000 NA Y NA
 5738935 5738936 CLL_A1744 CLL_A1745     TRUE 0.975 3.000 0.200 NA N NA
 5738936 5738937 CLL_A1745 CLL_A1746     TRUE 0.963 11.000 0.120 1.000   NA
 5738937 5738938 CLL_A1746 CLL_A1747     TRUE 0.980 10.000 0.333 NA   NA
 5738938 5738939 CLL_A1747 CLL_A1748     TRUE 0.947 19.000 0.000 NA Y NA
 5738939 5738940 CLL_A1748 CLL_A1749     TRUE 0.951 18.000 0.000 1.000 Y NA
 5738940 5738941 CLL_A1749 CLL_A1750     TRUE 0.980 25.000 0.105 NA Y NA
 5738945 5738946 CLL_A1754 CLL_A1755     FALSE 0.261 94.000 0.000 NA   NA
 5738946 5738947 CLL_A1755 CLL_A1756     FALSE 0.006 544.000 0.000 NA   NA
 5738947 5738948 CLL_A1756 CLL_A1757     TRUE 0.996 -16.000 0.200 1.000 Y NA
 5738948 5738949 CLL_A1757 CLL_A1758     FALSE 0.003 799.000 0.000 NA N NA
 5738949 5738950 CLL_A1758 CLL_A1759     FALSE 0.006 490.000 0.000 NA   NA
 5738952 5738953 CLL_A1761 CLL_A1762     TRUE 0.713 14.000 0.000 1.000   NA
 5738953 5738954 CLL_A1762 CLL_A1763     FALSE 0.273 112.000 0.000 NA   NA
 5738954 5738955 CLL_A1763 CLL_A1764     FALSE 0.225 141.000 0.000 NA   NA
 5738955 5738956 CLL_A1764 CLL_A1765     FALSE 0.089 194.000 0.000 NA   NA
 5738956 5738957 CLL_A1765 CLL_A1766     FALSE 0.006 503.000 0.000 NA   NA
 5738959 5738960 CLL_A1768 CLL_A1769     FALSE 0.039 242.000 0.000 NA   NA
 5738962 5738963 CLL_A1771 CLL_A1772     FALSE 0.156 166.000 0.000 NA   NA
 5738963 5738964 CLL_A1772 CLL_A1773     FALSE 0.044 234.000 0.000 NA   NA
 5738964 5738965 CLL_A1773 CLL_A1774     FALSE 0.028 265.000 0.000 NA   NA
 5738965 5738966 CLL_A1774 CLL_A1775     TRUE 0.988 16.000 0.833 NA   NA
 5738966 5738967 CLL_A1775 CLL_A1776     TRUE 0.991 6.000 0.833 NA   NA
 5738967 5738968 CLL_A1776 CLL_A1777     TRUE 0.798 96.000 0.154 NA   NA
 5738968 5738969 CLL_A1777 CLL_A1778     TRUE 0.998 2.000 0.765 1.000 Y NA
 5738969 5738970 CLL_A1778 CLL_A1779     TRUE 0.781 104.000 0.118 NA   NA
 5738971 5738972 CLL_A1780 CLL_A1781     FALSE 0.225 141.000 0.000 NA   NA
 5738972 5738973 CLL_A1781 CLL_A1782     TRUE 0.901 75.000 0.050 1.000 Y NA
 5738974 5738975 CLL_A1783 CLL_A1784     FALSE 0.236 135.000 0.000 NA   NA
 5738975 5738976 CLL_A1784 CLL_A1785     FALSE 0.009 399.000 0.000 NA   NA
 5738978 5738979 CLL_A1787 CLL_A1788   amyB FALSE 0.007 477.000 0.000 NA   NA
 5738983 5738984 CLL_A1792 CLL_A1793     FALSE 0.267 86.000 0.000 NA   NA
 5738984 5738985 CLL_A1793 CLL_A1794     FALSE 0.042 238.000 0.000 NA   NA
 5738985 5738986 CLL_A1794 CLL_A1795     FALSE 0.016 322.000 0.000 1.000   NA
 5738986 5738987 CLL_A1795 CLL_A1796     FALSE 0.008 458.000 0.000 1.000   NA
 5738987 5738988 CLL_A1796 CLL_A1797   adh FALSE 0.007 378.000 0.000 1.000 N NA
 5738988 5738989 CLL_A1797 CLL_A1798 adh   FALSE 0.183 158.000 0.000 NA   NA
 5738989 5738990 CLL_A1798 CLL_A1799     FALSE 0.215 145.000 0.000 NA   NA
 5738990 5738991 CLL_A1799 CLL_A1800   cytX FALSE 0.081 197.000 0.000 NA   NA
 5738991 5738992 CLL_A1800 CLL_A1801 cytX   FALSE 0.160 165.000 0.000 NA   NA
 5738992 5738993 CLL_A1801 CLL_A1802     FALSE 0.288 60.000 0.000 NA   NA
 5738993 5738994 CLL_A1802 CLL_A1803     FALSE 0.220 143.000 0.000 NA   NA
 5738994 5738995 CLL_A1803 CLL_A1804   cmk TRUE 0.659 97.000 0.039 1.000   NA
 5738995 5738996 CLL_A1804 CLL_A1805 cmk   TRUE 0.852 29.000 0.047 1.000 N NA
 5738996 5738997 CLL_A1805 CLL_A1806     FALSE 0.227 146.000 0.000 1.000   NA
 5738997 5738998 CLL_A1806 CLL_A1807     FALSE 0.375 45.000 0.000 NA   NA
 5738998 5738999 CLL_A1807 CLL_A1808   miaB FALSE 0.007 446.000 0.000 NA   NA
 5739002 5739003 CLL_A1811 CLL_A1812     FALSE 0.137 172.000 0.000 NA   NA
 5739003 5739004 CLL_A1812 CLL_A1813     FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 5739006 5739007 CLL_A1815 CLL_A1816   hfq TRUE 0.718 76.000 0.064 1.000   NA
 5739007 5739008 CLL_A1816 CLL_A1817 hfq miaA TRUE 0.871 50.000 0.192 1.000   NA
 5739008 5739009 CLL_A1817 CLL_A1818 miaA   TRUE 0.963 3.000 0.097 1.000 N NA
 5739009 5739010 CLL_A1818 CLL_A1819   treR FALSE 0.031 237.000 0.000 1.000 N NA
 5739010 5739011 CLL_A1819 CLL_A1820 treR treC TRUE 0.927 37.000 0.336 1.000 N NA
 5739011 5739012 CLL_A1820 CLL_A1821 treC treP TRUE 0.986 37.000 0.650 1.000 Y NA
 5739012 5739013 CLL_A1821 CLL_A1822 treP   FALSE 0.019 297.000 0.000 NA   NA
 5739013 5739014 CLL_A1822 CLL_A1823   mutS TRUE 0.586 25.000 0.000 NA   NA
 5739014 5739015 CLL_A1823 CLL_A1824 mutS   FALSE 0.473 196.000 0.000 1.000 Y NA
 5739015 5739016 CLL_A1824 CLL_A1825     FALSE 0.006 551.000 0.000 1.000   NA
 5739016 5739017 CLL_A1825 CLL_A1826     FALSE 0.257 131.000 0.000 1.000   NA
 5739017 5739018 CLL_A1826 CLL_A1827     FALSE 0.030 267.000 0.000 1.000   NA
 5739018 5739019 CLL_A1827 CLL_A1828     FALSE 0.153 270.000 0.061 1.000   NA
 5739019 5739020 CLL_A1828 CLL_A1829     TRUE 0.974 21.000 0.429 NA   NA
 5739020 5739021 CLL_A1829 CLL_A1830     TRUE 0.887 14.000 0.008 NA   NA
 5739021 5739022 CLL_A1830 CLL_A1831     FALSE 0.032 254.000 0.000 NA   NA
 5739023 5739024 CLL_A1832 CLL_A1833     FALSE 0.203 151.000 0.000 NA   NA
 5739024 5739025 CLL_A1833 CLL_A1834     TRUE 0.928 29.000 0.167 NA   NA
 5739026 5739027 CLL_A1835 CLL_A1836     FALSE 0.084 182.000 0.000 1.000 N NA
 5739027 5739028 CLL_A1836 CLL_A1837     TRUE 0.752 15.000 0.000 0.020   NA
 5739028 5739029 CLL_A1837 CLL_A1838     FALSE 0.012 402.000 0.000 0.020   NA
 5739029 5739030 CLL_A1838 CLL_A1839     FALSE 0.014 328.000 0.000 NA   NA
 5739030 5739031 CLL_A1839 CLL_A1840     FALSE 0.250 127.000 0.000 NA   NA
 5739031 5739032 CLL_A1840 CLL_A1841     TRUE 0.949 59.000 1.000 0.004 N NA
 5739032 5739033 CLL_A1841 CLL_A1842     FALSE 0.027 244.000 0.000 1.000 N NA
 5739033 5739034 CLL_A1842 CLL_A1843     TRUE 0.952 182.000 1.000 0.016 Y NA
 5739034 5739035 CLL_A1843 CLL_A1844     FALSE 0.054 226.000 0.000 1.000   NA
 5739035 5739036 CLL_A1844 CLL_A1845     FALSE 0.059 221.000 0.000 1.000   NA
 5739036 5739037 CLL_A1845 CLL_A1846     FALSE 0.042 216.000 0.000 1.000 N NA
 5739041 5739042 CLL_A1850 CLL_A1851     FALSE 0.142 171.000 0.000 NA   NA
 5739042 5739043 CLL_A1851 CLL_A1852     FALSE 0.130 334.000 0.000 0.014 Y NA
 5739047 5739048 CLL_A1856 CLL_A1857     FALSE 0.035 249.000 0.000 NA   NA
 5739048 5739049 CLL_A1857 CLL_A1858     FALSE 0.114 185.000 0.000 1.000   NA
 5739050 5739051 CLL_A1859 CLL_A1860     TRUE 0.783 101.000 0.000 1.000 Y NA
 5739051 5739052 CLL_A1860 CLL_A1861   fliL FALSE 0.041 218.000 0.000 1.000 N NA
 5739052 5739053 CLL_A1861 CLL_A1862 fliL   FALSE 0.426 30.000 0.000 1.000 N NA
 5739053 5739054 CLL_A1862 CLL_A1863     FALSE 0.279 97.000 0.000 1.000   NA
 5739055 5739056 CLL_A1864 CLL_A1865     FALSE 0.155 311.000 0.000 0.014 Y NA
 5739056 5739057 CLL_A1865 CLL_A1866     TRUE 0.969 47.000 0.278 1.000 Y NA
 5739057 5739058 CLL_A1866 CLL_A1867   mgtE FALSE 0.317 41.000 0.000 1.000 N NA
 5739058 5739059 CLL_A1867 CLL_A1868 mgtE   FALSE 0.007 642.000 0.000 0.051   NA
 5739059 5739060 CLL_A1868 CLL_A1869   hcp FALSE 0.022 293.000 0.000 1.000   NA
 5739060 5739061 CLL_A1869 CLL_A1870 hcp   FALSE 0.155 170.000 0.000 1.000   NA
 5739063 5739064 CLL_A1872 CLL_A1873     FALSE 0.043 237.000 0.000 NA   NA
 5739064 5739065 CLL_A1873 CLL_A1874     FALSE 0.015 320.000 0.000 NA   NA
 5739065 5739066 CLL_A1874 CLL_A1875     FALSE 0.049 227.000 0.000 NA   NA
 5739069 5739070 CLL_A1878 CLL_A1879     TRUE 0.617 24.000 0.000 1.000   NA
 5739070 5739071 CLL_A1879 CLL_A1880     FALSE 0.272 115.000 0.000 NA   NA
 5739073 5739074 CLL_A1882 CLL_A1883     FALSE 0.447 35.000 0.000 NA   NA
 5739075 5739076 CLL_A1884 CLL_A1885     FALSE 0.542 28.000 0.000 NA   NA
 5739076 5739077 CLL_A1885 CLL_A1886     FALSE 0.293 59.000 0.000 NA   NA
 5739077 5739078 CLL_A1886 CLL_A1887     FALSE 0.015 320.000 0.000 NA   NA
 5739078 5739079 CLL_A1887 CLL_A1888     FALSE 0.006 544.000 0.000 NA   NA
 5739079 5739080 CLL_A1888 CLL_A1889     FALSE 0.309 56.000 0.000 NA   NA
 5739080 5739081 CLL_A1889 CLL_A1890     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5739081 5739082 CLL_A1890 CLL_A1891     FALSE 0.275 65.000 0.000 NA   NA
 5739082 5739083 CLL_A1891 CLL_A1892     FALSE 0.051 225.000 0.000 NA   NA
 5739083 5739084 CLL_A1892 CLL_A1893     FALSE 0.268 82.000 0.000 NA   NA
 5739084 5739085 CLL_A1893 CLL_A1894     FALSE 0.262 96.000 0.000 NA   NA
 5739085 5739086 CLL_A1894 CLL_A1895     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5739086 5739087 CLL_A1895 CLL_A1896     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5739087 5739088 CLL_A1896 CLL_A1897     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5739088 5739089 CLL_A1897 CLL_A1898     TRUE 0.987 -10.000 0.250 NA   NA
 5739089 5739090 CLL_A1898 CLL_A1899     TRUE 0.981 12.000 0.400 NA   NA
 5739090 5739091 CLL_A1899 CLL_A1900     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5739091 5739092 CLL_A1900 CLL_A1901     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5739092 5739093 CLL_A1901 CLL_A1902     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5739093 5739094 CLL_A1902 CLL_A1903     TRUE 0.732 9.000 0.000 NA   NA
 5739094 5739095 CLL_A1903 CLL_A1904     TRUE 0.732 9.000 0.000 NA   NA
 5739095 5739096 CLL_A1904 CLL_A1905     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5739096 5739097 CLL_A1905 CLL_A1906     FALSE 0.389 42.000 0.000 NA   NA
 5739097 5739098 CLL_A1906 CLL_A1907     FALSE 0.328 52.000 0.000 NA   NA
 5739098 5739099 CLL_A1907 CLL_A1908     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5739099 5739100 CLL_A1908 CLL_A1909     TRUE 0.951 57.000 1.000 NA   NA
 5739100 5739101 CLL_A1909 CLL_A1910     TRUE 0.732 9.000 0.000 NA   NA
 5739101 5739102 CLL_A1910 CLL_A1911     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA   NA
 5739102 5739103 CLL_A1911 CLL_A1912     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5739103 5739104 CLL_A1912 CLL_A1913     TRUE 0.689 15.000 0.000 NA   NA
 5739104 5739105 CLL_A1913 CLL_A1914     TRUE 0.905 37.000 0.200 NA   NA
 5739105 5739106 CLL_A1914 CLL_A1915     FALSE 0.263 98.000 0.000 NA   NA
 5739106 5739107 CLL_A1915 CLL_A1916     FALSE 0.472 33.000 0.000 NA   NA
 5739107 5739108 CLL_A1916 CLL_A1917     FALSE 0.288 60.000 0.000 NA   NA
 5739108 5739109 CLL_A1917 CLL_A1918     FALSE 0.434 36.000 0.000 NA   NA
 5739109 5739110 CLL_A1918 CLL_A1919     FALSE 0.313 55.000 0.000 NA   NA
 5739110 5739111 CLL_A1919 CLL_A1920     TRUE 0.832 -10.000 0.000 NA   NA
 5739111 5739112 CLL_A1920 CLL_A1921     TRUE 0.961 16.000 0.167 NA   NA
 5739112 5739113 CLL_A1921 CLL_A1922     FALSE 0.414 38.000 0.000 NA   NA
 5739113 5739114 CLL_A1922 CLL_A1923     FALSE 0.266 73.000 0.000 NA   NA
 5739114 5739115 CLL_A1923 CLL_A1924     FALSE 0.061 230.000 0.000 0.050   NA
 5739115 5739116 CLL_A1924 CLL_A1925     FALSE 0.210 148.000 0.000 NA   NA
 5739116 5739117 CLL_A1925 CLL_A1926     TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 5739117 5739118 CLL_A1926 CLL_A1927     FALSE 0.305 57.000 0.000 NA   NA
 5739118 5739119 CLL_A1927 CLL_A1928     FALSE 0.007 471.000 0.000 NA   NA
 5739119 5739120 CLL_A1928 CLL_A1929     FALSE 0.222 142.000 0.000 NA   NA
 5739120 5739121 CLL_A1929 CLL_A1930     TRUE 0.586 25.000 0.000 NA   NA
 5739121 5739122 CLL_A1930 CLL_A1931     TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 5739122 5739123 CLL_A1931 CLL_A1932     FALSE 0.262 90.000 0.000 NA   NA
 5739123 5739124 CLL_A1932 CLL_A1933     TRUE 0.728 10.000 0.000 NA   NA
 5739124 5739125 CLL_A1933 CLL_A1934     TRUE 0.833 -7.000 0.000 1.000   NA
 5739125 5739126 CLL_A1934 CLL_A1935     FALSE 0.375 45.000 0.000 NA   NA
 5739126 5739127 CLL_A1935 CLL_A1936     TRUE 0.923 69.000 0.708 NA   NA
 5739127 5739128 CLL_A1936 CLL_A1937     FALSE 0.270 105.000 0.000 NA   NA
 5739128 5739129 CLL_A1937 CLL_A1938     FALSE 0.510 30.000 0.000 NA   NA
 5739129 5739130 CLL_A1938 CLL_A1939     FALSE 0.510 30.000 0.000 NA   NA
 5739130 5739131 CLL_A1939 CLL_A1940     TRUE 0.786 1.000 0.000 NA   NA
 5739131 5739132 CLL_A1940 CLL_A1941     TRUE 0.732 9.000 0.000 NA   NA
 5739132 5739133 CLL_A1941 CLL_A1942     TRUE 0.949 14.000 0.085 NA   NA
 5739133 5739134 CLL_A1942 CLL_A1943     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5739134 5739135 CLL_A1943 CLL_A1944     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5739135 5739136 CLL_A1944 CLL_A1945     TRUE 0.832 -10.000 0.000 NA   NA
 5739136 5739137 CLL_A1945 CLL_A1946     FALSE 0.218 144.000 0.000 NA   NA
 5739139 5739140 CLL_A1947 CLL_A1949     FALSE 0.266 72.000 0.000 NA   NA
 5739140 5739141 CLL_A1949 CLL_A1950     FALSE 0.273 113.000 0.000 NA   NA
 5739141 5739142 CLL_A1950 CLL_A1951     FALSE 0.461 34.000 0.000 NA   NA
 5739143 5739144 CLL_A1952 CLL_A1953     FALSE 0.251 135.000 0.000 1.000   NA
 5739145 5739146 CLL_A1954 CLL_A1955     FALSE 0.009 404.000 0.000 NA   NA
 5739148 5739149 CLL_A1957 CLL_A1958     FALSE 0.096 191.000 0.000 NA   NA
 5739149 5739150 CLL_A1958 CLL_A1959     FALSE 0.108 184.000 0.000 NA   NA
 5739152 5739153 CLL_A1961 CLL_A1962     FALSE 0.165 164.000 0.000 NA   NA
 5739153 5739154 CLL_A1962 CLL_A1963     FALSE 0.005 736.000 0.000 NA   NA
 5739154 5739155 CLL_A1963 CLL_A1964     TRUE 0.820 -3.000 0.000 1.000   NA
 5739155 5739156 CLL_A1964 CLL_A1965     TRUE 0.995 -10.000 1.000 NA   NA
 5739156 5739157 CLL_A1965 CLL_A1966     FALSE 0.008 422.000 0.000 NA   NA
 5739157 5739158 CLL_A1966 CLL_A1967     FALSE 0.006 501.000 0.000 NA   NA
 5739158 5739159 CLL_A1967 CLL_A1968     TRUE 0.598 24.000 0.000 NA   NA
 5739159 5739160 CLL_A1968 CLL_A1969     FALSE 0.272 114.000 0.000 NA   NA
 5739160 5739161 CLL_A1969 CLL_A1970     FALSE 0.007 435.000 0.000 NA   NA
 5739161 5739162 CLL_A1970 CLL_A1971     TRUE 0.981 28.000 0.182 NA Y NA
 5739162 5739163 CLL_A1971 CLL_A1972     FALSE 0.004 591.000 0.000 1.000 N NA
 5739163 5739164 CLL_A1972 CLL_A1973   trpB FALSE 0.021 260.000 0.000 1.000 N NA
 5739164 5739165 CLL_A1973 CLL_A1974 trpB lexA FALSE 0.284 80.000 0.000 1.000   NA
 5739165 5739166 CLL_A1974 CLL_A1975 lexA phnA FALSE 0.046 237.000 0.000 1.000   NA
 5739166 5739167 CLL_A1975 CLL_A1976 phnA   FALSE 0.013 302.000 0.000 1.000 N NA
 5739167 5739168 CLL_A1976 CLL_A1977     FALSE 0.013 327.000 0.000 0.047 N NA
 5739170 5739171 CLL_A1979 CLL_A1980     FALSE 0.395 45.000 0.000 1.000   NA
 5739171 5739172 CLL_A1980 CLL_A1981     FALSE 0.280 99.000 0.000 1.000   NA
 5739172 5739173 CLL_A1981 CLL_A1982     TRUE 0.676 86.000 0.047 NA   NA
 5739173 5739174 CLL_A1982 CLL_A1983     FALSE 0.018 300.000 0.000 NA   NA
 5739174 5739175 CLL_A1983 CLL_A1984     FALSE 0.269 68.000 0.000 NA   NA
 5739175 5739176 CLL_A1984 CLL_A1985     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5739176 5739177 CLL_A1985 CLL_A1986     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 5739177 5739178 CLL_A1986 CLL_A1987     FALSE 0.007 444.000 0.000 NA   NA
 5739178 5739179 CLL_A1987 CLL_A1988     FALSE 0.009 353.000 0.000 1.000 N NA
 5739179 5739180 CLL_A1988 CLL_A1989     TRUE 0.909 180.000 0.429 1.000 Y NA
 5739180 5739181 CLL_A1989 CLL_A1990     TRUE 0.975 70.000 0.667 0.050 Y NA
 5739181 5739182 CLL_A1990 CLL_A1991     FALSE 0.008 422.000 0.000 NA   NA
 5739184 5739185 CLL_A1993 CLL_A1994     FALSE 0.104 186.000 0.000 NA   NA
 5739185 5739186 CLL_A1994 CLL_A1995     TRUE 0.626 21.000 0.000 NA   NA
 5739189 5739190 CLL_A1998 CLL_A1999     TRUE 0.703 67.000 0.058 NA   NA
 5739191 5739192 CLL_A2000 CLL_A2001     FALSE 0.007 504.000 0.000 1.000   NA
 5739192 5739193 CLL_A2001 CLL_A2002   hypE TRUE 0.951 139.000 0.353 1.000 Y NA
 5739193 5739194 CLL_A2002 CLL_A2003 hypE hypC TRUE 0.793 165.000 0.024 NA Y NA
 5739194 5739195 CLL_A2003 CLL_A2004 hypC hypF TRUE 0.988 18.000 0.181 NA Y NA
 5739195 5739196 CLL_A2004 CLL_A2005 hypF   TRUE 0.881 15.000 0.005 1.000   NA
 5739196 5739197 CLL_A2005 CLL_A2006     TRUE 0.601 120.000 0.018 1.000   NA
 5739197 5739198 CLL_A2006 CLL_A2007   hupL TRUE 0.992 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 5739198 5739199 CLL_A2007 CLL_A2008 hupL hupS TRUE 0.997 5.000 0.778 0.001 Y NA
 5739199 5739200 CLL_A2008 CLL_A2009 hupS   FALSE 0.009 347.000 0.000 1.000 N NA
 5739202 5739203 CLL_A2011 CLL_A2012     FALSE 0.042 238.000 0.000 NA   NA
 5739203 5739204 CLL_A2012 CLL_A2013     FALSE 0.040 240.000 0.000 NA   NA
 5739204 5739205 CLL_A2013 CLL_A2014     FALSE 0.027 268.000 0.000 NA   NA
 5739205 5739206 CLL_A2014 CLL_A2015     FALSE 0.005 780.000 0.000 NA   NA
 5739210 5739211 CLL_A2019 CLL_A2020     FALSE 0.010 371.000 0.000 NA   NA
 5739211 5739212 CLL_A2020 CLL_A2021     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5739212 5739213 CLL_A2021 CLL_A2022     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5739213 5739214 CLL_A2022 CLL_A2023     TRUE 0.888 89.000 0.033 1.000 Y NA
 5739214 5739215 CLL_A2023 CLL_A2024     TRUE 0.977 26.000 0.074 0.021 Y NA
 5739215 5739216 CLL_A2024 CLL_A2025     TRUE 0.997 15.000 0.857 0.021 Y NA
 5739216 5739217 CLL_A2025 CLL_A2026     FALSE 0.006 564.000 0.000 1.000   NA
 5739219 5739220 CLL_A2028 CLL_A2029     TRUE 0.997 1.000 0.489 1.000 Y NA
 5739220 5739221 CLL_A2029 CLL_A2030     TRUE 0.989 22.000 0.236 0.010 Y NA
 5739221 5739222 CLL_A2030 CLL_A2031   mscL FALSE 0.006 397.000 0.000 1.000 N NA
 5739222 5739223 CLL_A2031 CLL_A2032 mscL   FALSE 0.033 258.000 0.000 1.000   NA
 5739223 5739224 CLL_A2032 CLL_A2033     TRUE 0.811 104.000 0.168 NA   NA
 5739224 5739225 CLL_A2033 CLL_A2034     TRUE 0.805 147.000 0.263 NA   NA
 5739225 5739226 CLL_A2034 CLL_A2035     FALSE 0.016 317.000 0.000 NA   NA
 5739226 5739227 CLL_A2035 CLL_A2036     TRUE 0.929 22.000 0.089 NA   NA
 5739227 5739228 CLL_A2036 CLL_A2037     FALSE 0.028 237.000 0.000 NA N NA
 5739230 5739231 CLL_A2039 CLL_A2040     TRUE 0.883 92.000 0.021 0.027 Y NA
 5739231 5739232 CLL_A2040 CLL_A2041     TRUE 0.907 52.000 0.021 1.000 Y NA
 5739234 5739235 CLL_A2043 CLL_A2044     FALSE 0.079 198.000 0.000 NA   NA
 5739235 5739236 CLL_A2044 CLL_A2045   hcp FALSE 0.011 363.000 0.000 NA   NA
 5739236 5739237 CLL_A2045 CLL_A2046 hcp   FALSE 0.057 217.000 0.000 NA   NA
 5739237 5739238 CLL_A2046 CLL_A2047     FALSE 0.231 138.000 0.000 NA   NA
 5739238 5739239 CLL_A2047 CLL_A2048     FALSE 0.004 1596.000 0.000 NA   NA
 5739239 5739240 CLL_A2048 CLL_A2049     TRUE 0.779 2.000 0.000 NA   NA
 5739240 5739241 CLL_A2049 CLL_A2050     FALSE 0.005 590.000 0.000 NA   NA
 5739241 5739242 CLL_A2050 CLL_A2051     TRUE 0.779 2.000 0.000 NA   NA
 5739242 5739243 CLL_A2051 CLL_A2052     FALSE 0.007 459.000 0.000 NA   NA
 5739244 5739245 CLL_A2053 CLL_A2054     FALSE 0.081 197.000 0.000 NA   NA
 5739246 5739247 CLL_A2055 CLL_A2056     FALSE 0.286 105.000 0.000 1.000   NA
 5739247 5739248 CLL_A2056 CLL_A2057   manA TRUE 0.963 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5739248 5739249 CLL_A2057 CLL_A2058 manA   TRUE 0.601 178.000 0.000 0.018 Y NA
 5739249 5739250 CLL_A2058 CLL_A2059     TRUE 0.689 15.000 0.000 NA   NA
 5739250 5739251 CLL_A2059 CLL_A2060     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5739251 5739252 CLL_A2060 CLL_A2061     FALSE 0.190 69.000 0.000 NA N NA
 5739252 5739253 CLL_A2061 CLL_A2062     TRUE 0.957 14.000 0.000 NA Y NA
 5739253 5739254 CLL_A2062 CLL_A2063     TRUE 0.993 27.000 0.711 0.020 Y NA
 5739254 5739255 CLL_A2063 CLL_A2064     TRUE 0.976 67.000 0.733 NA Y NA
 5739255 5739256 CLL_A2064 CLL_A2065   mutT FALSE 0.008 351.000 0.000 NA N NA
 5739256 5739257 CLL_A2065 CLL_A2066 mutT   FALSE 0.213 146.000 0.000 NA   NA
 5739257 5739258 CLL_A2066 CLL_A2067     TRUE 0.849 -25.000 0.000 NA   NA
 5739258 5739259 CLL_A2067 CLL_A2068     FALSE 0.160 165.000 0.000 NA   NA
 5739259 5739260 CLL_A2068 CLL_A2069     FALSE 0.032 254.000 0.000 NA   NA
 5739260 5739261 CLL_A2069 CLL_A2070     FALSE 0.008 418.000 0.000 NA   NA
 5739262 5739263 CLL_A2071 CLL_A2072     FALSE 0.024 278.000 0.000 NA   NA
 5739264 5739265 CLL_A2073 CLL_A2074     FALSE 0.009 397.000 0.000 NA   NA
 5739265 5739266 CLL_A2074 CLL_A2075     TRUE 0.986 -7.000 0.250 NA   NA
 5739266 5739267 CLL_A2075 CLL_A2076     FALSE 0.007 442.000 0.000 NA   NA
 5739267 5739268 CLL_A2076 CLL_A2077     FALSE 0.035 248.000 0.000 NA   NA
 5739268 5739269 CLL_A2077 CLL_A2078     FALSE 0.472 33.000 0.000 NA   NA
 5739269 5739270 CLL_A2078 CLL_A2079     FALSE 0.262 90.000 0.000 NA   NA
 5739270 5739271 CLL_A2079 CLL_A2080     FALSE 0.012 352.000 0.000 NA   NA
 5739271 5739272 CLL_A2080 CLL_A2081   hsdM FALSE 0.115 194.000 0.000 0.047   NA
 5739272 5739273 CLL_A2081 CLL_A2082 hsdM   TRUE 0.929 39.000 0.011 0.047 Y NA
 5739273 5739274 CLL_A2082 CLL_A2083     TRUE 0.803 77.000 0.000 0.001 Y NA
 5739274 5739275 CLL_A2083 CLL_A2084     TRUE 0.976 -3.000 0.104 0.047   NA
 5739275 5739276 CLL_A2084 CLL_A2085     FALSE 0.010 377.000 0.000 NA   NA
 5739278 5739279 CLL_A2087 CLL_A2088     FALSE 0.231 138.000 0.000 NA   NA
 5739279 5739280 CLL_A2088 CLL_A2089     FALSE 0.111 183.000 0.000 NA   NA
 5739280 5739281 CLL_A2089 CLL_A2090     FALSE 0.322 53.000 0.000 NA   NA
 5739281 5739282 CLL_A2090 CLL_A2091     FALSE 0.313 55.000 0.000 NA   NA
 5739282 5739283 CLL_A2091 CLL_A2092     FALSE 0.012 351.000 0.000 NA   NA
 5739283 5739284 CLL_A2092 CLL_A2093     TRUE 0.880 52.000 0.250 NA   NA
 5739284 5739285 CLL_A2093 CLL_A2094     TRUE 0.990 25.000 0.375 1.000 Y NA
 5739285 5739286 CLL_A2094 CLL_A2095     TRUE 0.928 100.000 0.111 1.000 Y NA
 5739286 5739287 CLL_A2095 CLL_A2096     TRUE 0.984 48.000 0.667 0.008 Y NA
 5739287 5739288 CLL_A2096 CLL_A2097     FALSE 0.054 545.000 0.000 1.000 Y NA
 5739288 5739289 CLL_A2097 CLL_A2098     FALSE 0.183 133.000 0.000 1.000 N NA
 5739289 5739290 CLL_A2098 CLL_A2099     TRUE 0.619 133.000 0.037 NA   NA
 5739290 5739291 CLL_A2099 CLL_A2100     TRUE 0.920 20.000 0.061 NA   NA
 5739291 5739292 CLL_A2100 CLL_A2101     TRUE 0.904 22.000 0.049 NA   NA
 5739292 5739293 CLL_A2101 CLL_A2102     TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   NA
 5739293 5739294 CLL_A2102 CLL_A2103     TRUE 0.975 28.000 0.714 NA   NA
 5739294 5739295 CLL_A2103 CLL_A2104     TRUE 0.981 22.000 0.600 0.001   NA
 5739295 5739296 CLL_A2104 CLL_A2105     TRUE 0.989 19.000 1.000 0.001   NA
 5739296 5739297 CLL_A2105 CLL_A2106     FALSE 0.019 309.000 0.000 1.000   NA
 5739297 5739298 CLL_A2106 CLL_A2107     TRUE 0.983 16.000 0.500 0.015   NA
 5739300 5739301 CLL_A2109 CLL_A2110     FALSE 0.172 162.000 0.000 NA   NA
 5739301 5739302 CLL_A2110 CLL_A2111     TRUE 0.976 6.000 0.222 NA   NA
 5739304 5739305 CLL_A2113 CLL_A2114     TRUE 0.968 35.000 0.121 1.000 Y NA
 5739305 5739306 CLL_A2114 CLL_A2115     TRUE 0.995 1.000 0.217 0.073 Y NA
 5739306 5739307 CLL_A2115 CLL_A2116     TRUE 0.980 89.000 0.889 1.000 Y NA
 5739307 5739308 CLL_A2116 CLL_A2117     FALSE 0.015 290.000 0.000 1.000 N NA
 5739308 5739309 CLL_A2117 CLL_A2118     FALSE 0.236 142.000 0.000 1.000   NA
 5739310 5739311 CLL_A2119 CLL_A2120     FALSE 0.021 291.000 0.000 NA   NA
 5739311 5739312 CLL_A2120 CLL_A2121     FALSE 0.183 158.000 0.000 NA   NA
 5739313 5739314 CLL_A2122 CLL_A2123     TRUE 0.598 24.000 0.000 NA   NA
 5739314 5739315 CLL_A2123 CLL_A2124     FALSE 0.055 220.000 0.000 NA   NA
 5739315 5739316 CLL_A2124 CLL_A2125     TRUE 0.992 25.000 0.500 0.017 Y NA
 5739316 5739317 CLL_A2125 CLL_A2126     TRUE 0.969 83.000 0.529 1.000 Y NA
 5739319 5739320 CLL_A2128 CLL_A2129     FALSE 0.168 163.000 0.000 NA   NA
 5739320 5739321 CLL_A2129 CLL_A2130     FALSE 0.266 74.000 0.000 NA   NA
 5739321 5739322 CLL_A2130 CLL_A2131     FALSE 0.030 260.000 0.000 NA   NA
 5739322 5739323 CLL_A2131 CLL_A2132     FALSE 0.010 377.000 0.000 NA   NA
 5739323 5739324 CLL_A2132 CLL_A2133     TRUE 0.995 1.000 0.200 0.047 Y NA
 5739324 5739325 CLL_A2133 CLL_A2134     TRUE 0.759 86.000 0.100 0.047 N NA
 5739325 5739326 CLL_A2134 CLL_A2135     FALSE 0.003 758.000 0.000 1.000 N NA
 5739326 5739327 CLL_A2135 CLL_A2136     FALSE 0.034 250.000 0.000 NA   NA
 5739327 5739328 CLL_A2136 CLL_A2137     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5739328 5739329 CLL_A2137 CLL_A2138     FALSE 0.227 140.000 0.000 NA   NA
 5739329 5739330 CLL_A2138 CLL_A2139     FALSE 0.322 53.000 0.000 NA   NA
 5739330 5739331 CLL_A2139 CLL_A2140     FALSE 0.447 35.000 0.000 NA   NA
 5739331 5739332 CLL_A2140 CLL_A2141     FALSE 0.272 115.000 0.000 NA   NA
 5739332 5739333 CLL_A2141 CLL_A2142     FALSE 0.268 82.000 0.000 NA   NA
 5739333 5739334 CLL_A2142 CLL_A2143     TRUE 0.850 -31.000 0.000 NA   NA
 5739334 5739335 CLL_A2143 CLL_A2144     FALSE 0.011 359.000 0.000 NA   NA
 5739335 5739336 CLL_A2144 CLL_A2145     TRUE 0.814 -6.000 0.000 NA   NA
 5739336 5739337 CLL_A2145 CLL_A2146     TRUE 0.606 23.000 0.000 NA   NA
 5739337 5739338 CLL_A2146 CLL_A2147     FALSE 0.263 97.000 0.000 NA   NA
 5739338 5739339 CLL_A2147 CLL_A2148     FALSE 0.038 243.000 0.000 NA   NA
 5739339 5739340 CLL_A2148 CLL_A2149     FALSE 0.262 96.000 0.000 NA   NA
 5739340 5739341 CLL_A2149 CLL_A2150     FALSE 0.337 51.000 0.000 NA   NA
 5739341 5739342 CLL_A2150 CLL_A2151     FALSE 0.328 52.000 0.000 NA   NA
 5739342 5739343 CLL_A2151 CLL_A2152     FALSE 0.061 213.000 0.000 NA   NA
 5739343 5739344 CLL_A2152 CLL_A2153     FALSE 0.344 50.000 0.000 NA   NA
 5739344 5739345 CLL_A2153 CLL_A2154     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 5739345 5739346 CLL_A2154 CLL_A2155     TRUE 0.966 6.000 0.000 NA Y NA
 5739346 5739347 CLL_A2155 CLL_A2156     FALSE 0.005 711.000 0.000 NA   NA
 5739348 5739349 CLL_A2157 CLL_A2158     TRUE 0.981 -7.000 0.154 NA   NA
 5739350 5739351 CLL_A2159 CLL_A2160     TRUE 0.851 -39.000 0.000 NA   NA
 5739351 5739352 CLL_A2160 CLL_A2161     FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 5739352 5739353 CLL_A2161 CLL_A2162     TRUE 0.852 -173.000 0.000 NA   NA
 5739353 5739354 CLL_A2162 CLL_A2163     FALSE 0.261 92.000 0.000 NA   NA
 5739354 5739355 CLL_A2163 CLL_A2164     FALSE 0.222 61.000 0.000 1.000 N NA
 5739355 5739356 CLL_A2164 CLL_A2165     FALSE 0.283 87.000 0.000 1.000   NA
 5739356 5739357 CLL_A2165 CLL_A2166     FALSE 0.016 324.000 0.000 1.000   NA
 5739357 5739358 CLL_A2166 CLL_A2167     FALSE 0.484 32.000 0.000 NA   NA
 5739358 5739359 CLL_A2167 CLL_A2168     FALSE 0.091 193.000 0.000 NA   NA
 5739359 5739360 CLL_A2168 CLL_A2169     FALSE 0.434 36.000 0.000 NA   NA
 5739360 5739361 CLL_A2169 CLL_A2170     FALSE 0.270 117.000 0.000 NA   NA
 5739361 5739362 CLL_A2170 CLL_A2171     FALSE 0.052 224.000 0.000 NA   NA
 5739362 5739363 CLL_A2171 CLL_A2172     FALSE 0.007 483.000 0.000 NA   NA
 5739363 5739364 CLL_A2172 CLL_A2173     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 5739364 5739365 CLL_A2173 CLL_A2174     FALSE 0.007 457.000 0.000 NA   NA
 5739365 5739366 CLL_A2174 CLL_A2175     TRUE 0.806 110.000 0.000 0.003 Y NA
 5739366 5739367 CLL_A2175 CLL_A2176     FALSE 0.004 619.000 0.000 1.000 N NA
 5739367 5739368 CLL_A2176 CLL_A2177     FALSE 0.273 66.000 0.000 NA   NA
 5739368 5739369 CLL_A2177 CLL_A2178     FALSE 0.266 72.000 0.000 NA   NA
 5739369 5739370 CLL_A2178 CLL_A2179     FALSE 0.327 82.000 0.000 0.047   NA
 5739370 5739371 CLL_A2179 CLL_A2180     FALSE 0.023 315.000 0.000 0.008   NA
 5739371 5739372 CLL_A2180 CLL_A2181     FALSE 0.400 40.000 0.000 NA   NA
 5739372 5739373 CLL_A2181 CLL_A2182     FALSE 0.496 31.000 0.000 NA   NA
 5739373 5739374 CLL_A2182 CLL_A2183     FALSE 0.009 402.000 0.000 NA   NA
 5739376 5739377 CLL_A2185 CLL_A2186 def   TRUE 0.989 1.000 0.529 1.000 N NA
 5739377 5739378 CLL_A2186 CLL_A2187     FALSE 0.069 210.000 0.000 1.000   NA
 5739378 5739379 CLL_A2187 CLL_A2188     FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 5739379 5739380 CLL_A2188 CLL_A2189     FALSE 0.279 63.000 0.000 NA   NA
 5739381 5739382 CLL_A2190 CLL_A2191     TRUE 0.950 5.000 0.056 NA   NA
 5739382 5739383 CLL_A2191 CLL_A2192     FALSE 0.024 277.000 0.000 NA   NA
 5739384 5739385 CLL_A2193 CLL_A2194     FALSE 0.268 84.000 0.000 NA   NA
 5739385 5739386 CLL_A2194 CLL_A2195     FALSE 0.009 390.000 0.000 NA   NA
 5739386 5739387 CLL_A2195 CLL_A2196     FALSE 0.081 197.000 0.000 NA   NA
 5739387 5739388 CLL_A2196 CLL_A2197     TRUE 0.990 5.000 0.667 NA   NA
 5739390 5739391 CLL_A2199 CLL_A2200     TRUE 0.900 141.000 0.667 NA   NA
 5739391 5739392 CLL_A2200 CLL_A2201     FALSE 0.010 371.000 0.000 NA   NA
 5739394 5739395 CLL_A2203 CLL_A2204     TRUE 0.983 -3.000 0.222 NA   NA
 5739395 5739396 CLL_A2204 CLL_A2205     TRUE 0.779 2.000 0.000 NA   NA
 5739396 5739397 CLL_A2205 CLL_A2206     FALSE 0.028 258.000 0.000 0.093 N NA
 5739397 5739398 CLL_A2206 CLL_A2207     TRUE 0.998 -12.000 0.741 0.015 Y NA
 5739398 5739399 CLL_A2207 CLL_A2208     TRUE 0.626 21.000 0.000 NA   NA
 5739399 5739400 CLL_A2208 CLL_A2209     FALSE 0.172 162.000 0.000 NA   NA
 5739400 5739401 CLL_A2209 CLL_A2210     TRUE 0.988 3.000 0.490 NA   NA
 5739401 5739402 CLL_A2210 CLL_A2211     TRUE 0.974 3.000 0.163 NA   NA
 5739402 5739403 CLL_A2211 CLL_A2212     FALSE 0.273 111.000 0.000 NA   NA
 5739403 5739404 CLL_A2212 CLL_A2213     FALSE 0.077 199.000 0.000 NA   NA
 5739406 5739407 CLL_A2215 CLL_A2216     FALSE 0.028 265.000 0.000 NA   NA
 5739408 5739409 CLL_A2217 CLL_A2218     FALSE 0.040 241.000 0.000 NA   NA
 5739410 5739411 CLL_A2219 CLL_A2220     FALSE 0.030 259.000 0.000 NA   NA
 5739411 5739412 CLL_A2220 CLL_A2221     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA   NA
 5739412 5739413 CLL_A2221 CLL_A2222     FALSE 0.015 290.000 0.000 1.000 N NA
 5739414 5739415 CLL_A2223 CLL_A2224     FALSE 0.426 241.000 0.002 0.001 Y NA
 5739418 5739419 CLL_A2227 CLL_A2228 aroD pepT TRUE 0.655 165.000 0.000 1.000 Y NA
 5739419 5739420 CLL_A2228 CLL_A2229 pepT   FALSE 0.215 197.000 0.013 NA N NA
 5739423 5739424 CLL_A2232 CLL_A2233     FALSE 0.076 443.000 0.000 0.004 Y NA
 5739424 5739425 CLL_A2233 CLL_A2234     FALSE 0.037 216.000 0.000 NA N NA
 5739427 5739428 CLL_A2236 CLL_A2237     FALSE 0.114 182.000 0.000 NA   NA
 5739431 5739432 CLL_A2240 CLL_A2241     FALSE 0.005 753.000 0.000 1.000   NA
 5739432 5739433 CLL_A2241 CLL_A2242     FALSE 0.293 59.000 0.000 NA   NA
 5739433 5739434 CLL_A2242 CLL_A2243     TRUE 0.647 19.000 0.000 NA   NA
 5739434 5739435 CLL_A2243 CLL_A2244     FALSE 0.008 418.000 0.000 NA   NA
 5739435 5739436 CLL_A2244 CLL_A2245     TRUE 0.586 25.000 0.000 NA   NA
 5739436 5739437 CLL_A2245 CLL_A2246     TRUE 0.779 2.000 0.000 NA   NA
 5739437 5739438 CLL_A2246 CLL_A2247     TRUE 0.968 12.000 0.182 NA   NA
 5739438 5739439 CLL_A2247 CLL_A2248     TRUE 0.985 -3.000 0.273 NA   NA
 5739439 5739440 CLL_A2248 CLL_A2249     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5739440 5739441 CLL_A2249 CLL_A2250     FALSE 0.337 51.000 0.000 NA   NA
 5739441 5739442 CLL_A2250 CLL_A2251     TRUE 0.986 3.000 0.400 NA   NA
 5739442 5739443 CLL_A2251 CLL_A2252     TRUE 0.988 3.000 0.500 NA   NA
 5739443 5739444 CLL_A2252 CLL_A2253     TRUE 0.984 3.000 0.333 NA   NA
 5739444 5739445 CLL_A2253 CLL_A2254     TRUE 0.988 -7.000 0.333 NA   NA
 5739445 5739446 CLL_A2254 CLL_A2255     TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   NA
 5739446 5739447 CLL_A2255 CLL_A2256     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5739447 5739448 CLL_A2256 CLL_A2257     TRUE 0.689 15.000 0.000 NA   NA
 5739448 5739449 CLL_A2257 CLL_A2258     TRUE 0.986 0.000 0.333 NA   NA
 5739449 5739450 CLL_A2258 CLL_A2259     TRUE 0.989 -7.000 0.375 NA   NA
 5739450 5739451 CLL_A2259 CLL_A2260     FALSE 0.387 43.000 0.000 NA   NA
 5739451 5739452 CLL_A2260 CLL_A2261     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5739452 5739453 CLL_A2261 CLL_A2262     TRUE 0.991 -10.000 0.444 NA   NA
 5739453 5739454 CLL_A2262 CLL_A2263     TRUE 0.764 157.000 0.222 1.000   NA
 5739454 5739455 CLL_A2263 CLL_A2264     TRUE 0.836 -12.000 0.000 NA   NA
 5739455 5739456 CLL_A2264 CLL_A2265     FALSE 0.101 188.000 0.000 NA   NA
 5739456 5739457 CLL_A2265 CLL_A2266     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 5739457 5739458 CLL_A2266 CLL_A2267     FALSE 0.328 52.000 0.000 NA   NA
 5739458 5739459 CLL_A2267 CLL_A2268     FALSE 0.231 138.000 0.000 NA   NA
 5739459 5739460 CLL_A2268 CLL_A2269     TRUE 0.989 13.000 0.828 NA   NA
 5739460 5739461 CLL_A2269 CLL_A2270     FALSE 0.268 103.000 0.000 NA   NA
 5739461 5739462 CLL_A2270 CLL_A2271     FALSE 0.254 125.000 0.000 NA   NA
 5739462 5739463 CLL_A2271 CLL_A2272     FALSE 0.484 32.000 0.000 NA   NA
 5739463 5739464 CLL_A2272 CLL_A2273     FALSE 0.049 227.000 0.000 NA   NA
 5739464 5739465 CLL_A2273 CLL_A2274     TRUE 0.987 13.000 0.667 NA   NA
 5739465 5739466 CLL_A2274 CLL_A2275     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5739466 5739467 CLL_A2275 CLL_A2276     TRUE 0.640 12.000 0.000 1.000 N NA
 5739467 5739468 CLL_A2276 CLL_A2277     TRUE 0.766 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5739468 5739469 CLL_A2277 CLL_A2278     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5739469 5739470 CLL_A2278 CLL_A2279     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5739470 5739471 CLL_A2279 CLL_A2280     TRUE 0.981 -10.000 0.143 NA   NA
 5739471 5739472 CLL_A2280 CLL_A2281     TRUE 0.968 7.000 0.143 NA   NA
 5739476 5739477 CLL_A2285 CLL_A2286     FALSE 0.051 225.000 0.000 NA   NA
 5739478 5739479 CLL_A2287 CLL_A2288     FALSE 0.262 90.000 0.000 NA   NA
 5739479 5739480 CLL_A2288 CLL_A2289     TRUE 0.786 40.000 0.042 NA   NA
 5739480 5739481 CLL_A2289 CLL_A2290     FALSE 0.267 80.000 0.000 NA   NA
 5739481 5739482 CLL_A2290 CLL_A2291     FALSE 0.266 76.000 0.000 NA   NA
 5739483 5739484 CLL_A2292 CLL_A2293     FALSE 0.430 28.000 0.000 NA N NA
 5739486 5739487 CLL_A2295 CLL_A2296     FALSE 0.075 201.000 0.000 NA   NA
 5739487 5739488 CLL_A2296 CLL_A2297   pfkB TRUE 0.995 22.000 0.816 1.000 Y NA
 5739488 5739489 CLL_A2297 CLL_A2298 pfkB   TRUE 0.998 -7.000 0.721 1.000 Y NA
 5739489 5739490 CLL_A2298 CLL_A2299     FALSE 0.005 783.000 0.000 NA   NA
 5739490 5739491 CLL_A2299 CLL_A2300     FALSE 0.277 64.000 0.000 NA   NA
 5739491 5739492 CLL_A2300 CLL_A2301     FALSE 0.257 131.000 0.000 1.000   NA
 5739492 5739493 CLL_A2301 CLL_A2302     FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 5739493 5739494 CLL_A2302 CLL_A2303     TRUE 0.991 -3.000 0.571 NA   NA
 5739494 5739495 CLL_A2303 CLL_A2304     FALSE 0.060 214.000 0.000 NA   NA
 5739495 5739496 CLL_A2304 CLL_A2305     FALSE 0.256 124.000 0.000 NA   NA
 5739496 5739497 CLL_A2305 CLL_A2306     FALSE 0.005 602.000 0.000 NA   NA
 5739497 5739498 CLL_A2306 CLL_A2307     FALSE 0.006 545.000 0.000 NA   NA
 5739498 5739499 CLL_A2307 CLL_A2308     TRUE 0.960 43.000 0.733 0.002   NA
 5739499 5739500 CLL_A2308 CLL_A2309     TRUE 0.998 -10.000 0.576 0.002 Y NA
 5739500 5739501 CLL_A2309 CLL_A2310     FALSE 0.011 369.000 0.000 NA   NA
 5739502 5739503 CLL_A2311 CLL_A2312     FALSE 0.271 107.000 0.000 NA   NA
 5739504 5739505 CLL_A2313 CLL_A2314     FALSE 0.007 472.000 0.000 NA   NA
 5739505 5739506 CLL_A2314 CLL_A2315     FALSE 0.025 282.000 0.000 1.000   NA
 5739506 5739507 CLL_A2315 CLL_A2316     FALSE 0.019 296.000 0.000 NA   NA
 5739507 5739508 CLL_A2316 CLL_A2317     FALSE 0.129 240.000 0.010 NA   NA
 5739508 5739509 CLL_A2317 CLL_A2318     TRUE 0.959 0.000 0.062 1.000 N NA
 5739509 5739510 CLL_A2318 CLL_A2319     FALSE 0.004 1108.000 0.000 NA   NA
 5739510 5739511 CLL_A2319 CLL_A2320     TRUE 0.957 7.000 0.081 NA   NA
 5739511 5739512 CLL_A2320 CLL_A2321     FALSE 0.005 631.000 0.000 NA   NA
 5739512 5739513 CLL_A2321 CLL_A2322     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA   NA
 5739513 5739514 CLL_A2322 CLL_A2323     TRUE 0.654 96.000 0.039 NA   NA
 5739514 5739515 CLL_A2323 CLL_A2324     TRUE 0.644 167.000 0.125 NA   NA
 5739516 5739517 CLL_A2325 CLL_A2326     FALSE 0.183 158.000 0.000 NA   NA
 5739517 5739518 CLL_A2326 CLL_A2327     FALSE 0.009 405.000 0.000 NA   NA
 5739519 5739520 CLL_A2328 CLL_A2329     FALSE 0.009 404.000 0.000 NA   NA
 5739520 5739521 CLL_A2329 CLL_A2330     FALSE 0.268 103.000 0.000 NA   NA
 5739521 5739522 CLL_A2330 CLL_A2331     TRUE 0.598 24.000 0.000 NA   NA
 5739522 5739523 CLL_A2331 CLL_A2332     FALSE 0.040 240.000 0.000 NA   NA
 5739523 5739524 CLL_A2332 CLL_A2333     FALSE 0.461 34.000 0.000 NA   NA
 5739524 5739525 CLL_A2333 CLL_A2334     TRUE 0.645 21.000 0.000 1.000   NA
 5739525 5739526 CLL_A2334 CLL_A2335     FALSE 0.239 57.000 0.000 1.000 N NA
 5739526 5739527 CLL_A2335 CLL_A2336     TRUE 0.684 5.000 0.000 1.000 N NA
 5739527 5739528 CLL_A2336 CLL_A2337   rfbG TRUE 0.912 30.000 0.000 1.000 Y NA
 5739528 5739529 CLL_A2337 CLL_A2338 rfbG rfbF TRUE 0.997 0.000 0.624 1.000 Y NA
 5739529 5739530 CLL_A2338 CLL_A2339 rfbF   FALSE 0.017 279.000 0.000 1.000 N NA
 5739530 5739531 CLL_A2339 CLL_A2340     TRUE 0.890 124.000 0.040 1.000 Y NA
 5739531 5739532 CLL_A2340 CLL_A2341     FALSE 0.011 370.000 0.000 NA   NA
 5739534 5739535 CLL_A2343 CLL_A2344     FALSE 0.132 192.000 0.000 0.002   NA
 5739535 5739536 CLL_A2344 CLL_A2345     FALSE 0.039 247.000 0.000 1.000   NA
 5739536 5739537 CLL_A2345 CLL_A2346     FALSE 0.072 207.000 0.000 1.000   NA
 5739537 5739538 CLL_A2346 CLL_A2347   recQ FALSE 0.098 193.000 0.000 1.000   NA
 5739538 5739539 CLL_A2347 CLL_A2348 recQ   FALSE 0.026 247.000 0.000 1.000 N NA
 5739539 5739540 CLL_A2348 CLL_A2349     FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5739540 5739541 CLL_A2349 CLL_A2350     FALSE 0.282 62.000 0.000 NA   NA
 5739541 5739542 CLL_A2350 CLL_A2351     FALSE 0.055 219.000 0.000 NA   NA
 5739542 5739543 CLL_A2351 CLL_A2352     FALSE 0.014 328.000 0.000 NA   NA
 5739543 5739544 CLL_A2352 CLL_A2353   nifJ FALSE 0.009 385.000 0.000 NA   NA
 5739544 5739545 CLL_A2353 CLL_A2354 nifJ   FALSE 0.007 372.000 0.000 1.000 N NA
 5739545 5739546 CLL_A2354 CLL_A2355     TRUE 0.939 51.000 0.078 1.000 Y NA
 5739546 5739547 CLL_A2355 CLL_A2356     TRUE 0.735 166.000 0.290 NA N NA
 5739547 5739548 CLL_A2356 CLL_A2357     FALSE 0.012 356.000 0.000 NA   NA
 5739548 5739549 CLL_A2357 CLL_A2358     FALSE 0.010 384.000 0.000 NA   NA
 5739549 5739550 CLL_A2358 CLL_A2359     FALSE 0.061 213.000 0.000 NA   NA
 5739550 5739551 CLL_A2359 CLL_A2360     TRUE 0.945 -3.000 0.010 0.033   NA
 5739554 5739555 CLL_A2363 CLL_A2364   ytfJ TRUE 0.832 -10.000 0.000 NA   NA
 5739556 5739557 CLL_A2365 CLL_A2366 scpB   TRUE 0.993 -16.000 0.570 NA   NA
 5739557 5739558 CLL_A2366 CLL_A2367     FALSE 0.111 242.000 0.004 NA   NA
 5739558 5739559 CLL_A2367 CLL_A2368     FALSE 0.023 415.000 0.006 1.000 N NA
 5739559 5739560 CLL_A2368 CLL_A2369   spoIIM TRUE 0.604 120.000 0.021 NA   NA
 5739560 5739561 CLL_A2369 CLL_A2370 spoIIM   FALSE 0.072 203.000 0.000 NA   NA
 5739561 5739562 CLL_A2370 CLL_A2371     FALSE 0.273 110.000 0.000 NA   NA
 5739563 5739564 CLL_A2372 CLL_A2373     FALSE 0.028 266.000 0.000 NA   NA
 5739565 5739566 CLL_A2374 CLL_A2375     FALSE 0.262 91.000 0.000 NA   NA
 5739568 5739569 CLL_A2377 CLL_A2378     FALSE 0.008 433.000 0.000 NA   NA
 5739569 5739570 CLL_A2378 CLL_A2379     FALSE 0.004 919.000 0.000 NA   NA
 5739570 5739571 CLL_A2379 CLL_A2380     TRUE 0.990 5.000 0.667 NA   NA
 5739571 5739572 CLL_A2380 CLL_A2381     TRUE 0.966 14.000 0.188 NA   NA
 5739572 5739573 CLL_A2381 CLL_A2382     FALSE 0.260 122.000 0.000 NA   NA
 5739573 5739574 CLL_A2382 CLL_A2383     FALSE 0.005 627.000 0.000 NA   NA
 5739574 5739575 CLL_A2383 CLL_A2384     FALSE 0.112 299.000 0.062 NA   NA
 5739575 5739576 CLL_A2384 CLL_A2385     TRUE 0.976 -7.000 0.104 NA   NA
 5739576 5739577 CLL_A2385 CLL_A2386     FALSE 0.007 458.000 0.000 NA   NA
 5739577 5739578 CLL_A2386 CLL_A2387     TRUE 0.571 26.000 0.000 NA   NA
 5739578 5739579 CLL_A2387 CLL_A2388     FALSE 0.246 129.000 0.000 NA   NA
 5739579 5739580 CLL_A2388 CLL_A2389     TRUE 0.902 108.000 0.500 NA   NA
 5739580 5739581 CLL_A2389 CLL_A2390     TRUE 0.840 106.000 0.231 NA   NA
 5739581 5739582 CLL_A2390 CLL_A2391     FALSE 0.267 71.000 0.000 NA   NA
 5739582 5739583 CLL_A2391 CLL_A2392     TRUE 0.832 -10.000 0.000 NA   NA
 5739583 5739584 CLL_A2392 CLL_A2393     FALSE 0.005 819.000 0.000 NA   NA
 5739584 5739585 CLL_A2393 CLL_A2394     FALSE 0.004 1363.000 0.000 NA   NA
 5739585 5739586 CLL_A2394 CLL_A2395   spo0A FALSE 0.461 162.000 0.027 1.000 N NA
 5739586 5739587 CLL_A2395 CLL_A2396 spo0A spoIVB FALSE 0.167 384.000 0.393 1.000   NA
 5739587 5739588 CLL_A2396 CLL_A2397 spoIVB recN FALSE 0.139 293.000 0.079 1.000   NA
 5739588 5739589 CLL_A2397 CLL_A2398 recN argR TRUE 0.931 19.000 0.086 1.000 N NA
 5739589 5739590 CLL_A2398 CLL_A2399 argR   TRUE 0.974 -3.000 0.117 1.000 N NA
 5739590 5739591 CLL_A2399 CLL_A2400     TRUE 0.946 18.000 0.120 1.000 N NA
 5739591 5739592 CLL_A2400 CLL_A2401   dxs TRUE 0.959 17.000 0.189 1.000 N NA
 5739592 5739593 CLL_A2401 CLL_A2402 dxs   TRUE 0.980 18.000 0.048 1.000 Y NA
 5739593 5739594 CLL_A2402 CLL_A2403     TRUE 0.970 -13.000 0.053 1.000   NA
 5739594 5739595 CLL_A2403 CLL_A2404   xseA TRUE 0.983 13.000 0.412 0.001   NA
 5739595 5739596 CLL_A2404 CLL_A2405 xseA   TRUE 0.962 -10.000 0.045 1.000 N NA
 5739596 5739597 CLL_A2405 CLL_A2406   nusB TRUE 0.879 23.000 0.039 1.000 N NA
 5739597 5739598 CLL_A2406 CLL_A2407 nusB   TRUE 0.835 118.000 0.223 NA   NA
 5739598 5739599 CLL_A2407 CLL_A2408     TRUE 0.772 117.000 0.108 NA   NA
 5739599 5739600 CLL_A2408 CLL_A2409   spoIIIAG TRUE 0.934 40.000 0.407 NA   NA
 5739600 5739601 CLL_A2409 CLL_A2410 spoIIIAG   TRUE 0.990 12.000 0.907 NA   NA
 5739601 5739602 CLL_A2410 CLL_A2411   spoIIIAE TRUE 0.993 4.000 0.918 NA   NA
 5739602 5739603 CLL_A2411 CLL_A2412 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.990 12.000 0.864 NA   NA
 5739603 5739604 CLL_A2412 CLL_A2413 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.991 9.000 0.895 NA   NA
 5739604 5739605 CLL_A2413 CLL_A2414 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.989 15.000 0.926 NA   NA
 5739605 5739606 CLL_A2414 CLL_A2415 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.993 -12.000 0.604 NA   NA
 5739606 5739607 CLL_A2415 CLL_A2416 spoIIIAA   FALSE 0.071 419.000 0.112 NA   NA
 5739607 5739608 CLL_A2416 CLL_A2417   efp TRUE 0.655 87.000 0.037 NA   NA
 5739608 5739609 CLL_A2417 CLL_A2418 efp   FALSE 0.237 191.000 0.002 NA   NA
 5739609 5739610 CLL_A2418 CLL_A2419     TRUE 0.994 -13.000 0.667 NA   NA
 5739610 5739611 CLL_A2419 CLL_A2420     TRUE 0.996 -49.000 1.000 NA   NA
 5739611 5739612 CLL_A2420 CLL_A2421     TRUE 0.918 101.000 0.667 NA   NA
 5739612 5739613 CLL_A2421 CLL_A2422     TRUE 0.995 -9.000 1.000 NA   NA
 5739613 5739614 CLL_A2422 CLL_A2423     TRUE 0.995 -7.000 1.000 NA   NA
 5739614 5739615 CLL_A2423 CLL_A2424     FALSE 0.484 32.000 0.000 NA   NA
 5739615 5739616 CLL_A2424 CLL_A2425     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 5739616 5739617 CLL_A2425 CLL_A2426     TRUE 0.995 -13.000 0.135 1.000 Y NA
 5739617 5739618 CLL_A2426 CLL_A2427     FALSE 0.007 450.000 0.000 NA   NA
 5739618 5739619 CLL_A2427 CLL_A2428   dapF FALSE 0.557 27.000 0.000 NA   NA
 5739621 5739622 CLL_A2430 CLL_A2431     TRUE 0.716 34.000 0.008 1.000 N NA
 5739622 5739623 CLL_A2431 CLL_A2432     TRUE 0.853 29.000 0.048 1.000 N NA
 5739623 5739624 CLL_A2432 CLL_A2433     FALSE 0.056 277.000 0.002 NA N NA
 5739624 5739625 CLL_A2433 CLL_A2434     TRUE 0.984 14.000 0.579 NA   NA
 5739625 5739626 CLL_A2434 CLL_A2435     TRUE 0.971 3.000 0.118 1.000   NA
 5739626 5739627 CLL_A2435 CLL_A2436     TRUE 0.976 9.000 0.246 NA   NA
 5739627 5739628 CLL_A2436 CLL_A2437     TRUE 0.951 0.000 0.032 NA   NA
 5739628 5739629 CLL_A2437 CLL_A2438     TRUE 0.593 101.000 0.017 NA   NA
 5739629 5739630 CLL_A2438 CLL_A2439     TRUE 0.942 14.000 0.070 NA   NA
 5739630 5739631 CLL_A2439 CLL_A2440     TRUE 0.922 21.000 0.070 NA   NA
 5739631 5739632 CLL_A2440 CLL_A2441     TRUE 0.890 16.000 0.014 NA   NA
 5739632 5739633 CLL_A2441 CLL_A2442   ftsW FALSE 0.042 341.000 0.015 NA N NA
 5739633 5739634 CLL_A2442 CLL_A2443 ftsW mraY FALSE 0.525 142.000 0.014 0.004 N NA
 5739634 5739635 CLL_A2443 CLL_A2444 mraY murF TRUE 0.936 41.000 0.024 0.004 Y NA
 5739635 5739636 CLL_A2444 CLL_A2445 murF murE TRUE 0.992 20.000 0.328 0.002 Y NA
 5739636 5739637 CLL_A2445 CLL_A2446 murE   TRUE 0.948 126.000 0.265 1.000 Y NA
 5739637 5739638 CLL_A2446 CLL_A2447     TRUE 0.678 153.000 0.096 NA   NA
 5739638 5739639 CLL_A2447 CLL_A2448   mraW TRUE 0.707 38.000 0.008 NA   NA
 5739639 5739640 CLL_A2448 CLL_A2449 mraW mraZ TRUE 0.986 13.000 0.635 NA   NA
 5739640 5739641 CLL_A2449 CLL_A2450 mraZ   FALSE 0.142 171.000 0.000 NA   NA
 5739641 5739642 CLL_A2450 CLL_A2451     FALSE 0.013 345.000 0.000 NA   NA
 5739642 5739643 CLL_A2451 CLL_A2452   ychF FALSE 0.199 149.000 0.000 0.035 N NA
 5739645 5739646 CLL_A2454 CLL_A2455     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5739646 5739647 CLL_A2455 CLL_A2456     TRUE 0.846 -19.000 0.000 NA   NA
 5739647 5739648 CLL_A2456 CLL_A2457     TRUE 0.948 6.000 0.056 NA   NA
 5739648 5739649 CLL_A2457 CLL_A2458   mviN TRUE 0.976 12.000 0.286 NA   NA
 5739649 5739650 CLL_A2458 CLL_A2459 mviN   TRUE 0.921 6.000 0.015 1.000   NA
 5739650 5739651 CLL_A2459 CLL_A2460     FALSE 0.018 898.000 0.015 1.000   NA
 5739651 5739652 CLL_A2460 CLL_A2461     TRUE 0.888 99.000 0.417 1.000   NA
 5739652 5739653 CLL_A2461 CLL_A2462     FALSE 0.165 164.000 0.000 NA   NA
 5739653 5739654 CLL_A2462 CLL_A2463     FALSE 0.060 341.000 0.031 NA   NA
 5739654 5739655 CLL_A2463 CLL_A2464     TRUE 0.940 14.000 0.078 1.000 N NA
 5739655 5739656 CLL_A2464 CLL_A2465     FALSE 0.062 212.000 0.000 NA   NA
 5739656 5739657 CLL_A2465 CLL_A2466     FALSE 0.017 310.000 0.000 NA   NA
 5739659 5739660 CLL_A2468 CLL_A2469     FALSE 0.214 152.000 0.000 1.000   NA
 5739660 5739661 CLL_A2469 CLL_A2470     FALSE 0.186 120.000 0.000 NA N NA
 5739661 5739662 CLL_A2470 CLL_A2471     FALSE 0.033 252.000 0.000 NA   NA
 5739662 5739663 CLL_A2471 CLL_A2472   pheT FALSE 0.005 736.000 0.000 1.000   NA
 5739663 5739664 CLL_A2472 CLL_A2473 pheT pheS TRUE 0.973 120.000 0.574 0.001 Y NA
 5739664 5739665 CLL_A2473 CLL_A2474 pheS   FALSE 0.192 332.000 0.006 1.000 Y NA
 5739665 5739666 CLL_A2474 CLL_A2475     TRUE 0.895 15.000 0.022 1.000 N NA
 5739666 5739667 CLL_A2475 CLL_A2476     TRUE 0.990 14.000 0.137 0.002 Y NA
 5739667 5739668 CLL_A2476 CLL_A2477   rplT FALSE 0.414 149.000 0.004 1.000 N NA
 5739668 5739669 CLL_A2477 CLL_A2478 rplT rpmI TRUE 0.994 29.000 0.928 0.013 Y NA
 5739669 5739670 CLL_A2478 CLL_A2479 rpmI infC TRUE 0.994 22.000 0.652 1.000 Y NA
 5739670 5739671 CLL_A2479 CLL_A2480 infC   FALSE 0.404 157.000 0.002 NA   NA
 5739673 5739674 CLL_A2482 CLL_A2483 hslO   TRUE 0.922 18.000 0.063 1.000 N NA
 5739674 5739675 CLL_A2483 CLL_A2484     FALSE 0.140 275.000 0.056 1.000   NA
 5739676 5739677 CLL_A2485 CLL_A2486 asd dapA TRUE 0.978 17.000 0.029 1.000 Y NA
 5739677 5739678 CLL_A2486 CLL_A2487 dapA dapB TRUE 0.982 10.000 0.022 1.000 Y NA
 5739679 5739680 CLL_A2488 CLL_A2489     TRUE 0.814 193.000 0.179 1.000 Y NA
 5739680 5739681 CLL_A2489 CLL_A2490     TRUE 0.997 0.000 0.436 0.001 Y NA
 5739681 5739682 CLL_A2490 CLL_A2491     TRUE 0.993 13.000 0.300 1.000 Y NA
 5739682 5739683 CLL_A2491 CLL_A2492     TRUE 0.996 19.000 0.806 0.019 Y NA
 5739685 5739686 CLL_A2494 CLL_A2495 oppA   FALSE 0.066 456.000 0.000 1.000 Y NA
 5739688 5739689 CLL_A2497 CLL_A2498     TRUE 0.713 99.000 0.079 1.000 N NA
 5739693 5739694 CLL_A2502 CLL_A2503     TRUE 0.786 47.000 0.059 NA   NA
 5739694 5739695 CLL_A2503 CLL_A2504     FALSE 0.151 168.000 0.000 NA   NA
 5739695 5739696 CLL_A2504 CLL_A2505   valS FALSE 0.016 316.000 0.000 NA   NA
 5739696 5739697 CLL_A2505 CLL_A2506 valS aspS FALSE 0.046 832.000 0.000 0.034 Y NA
 5739697 5739698 CLL_A2506 CLL_A2507 aspS   FALSE 0.004 508.000 0.000 NA N NA
 5739699 5739700 CLL_A2508 CLL_A2509     TRUE 0.964 10.000 0.125 NA   NA
 5739701 5739702 CLL_A2510 CLL_A2511     FALSE 0.033 231.000 0.000 1.000 N NA
 5739702 5739703 CLL_A2511 CLL_A2512     FALSE 0.202 94.000 0.000 1.000 N NA
 5739703 5739704 CLL_A2512 CLL_A2513   uvdE FALSE 0.047 210.000 0.000 1.000 N NA
 5739704 5739705 CLL_A2513 CLL_A2514 uvdE   FALSE 0.496 31.000 0.000 NA   NA
 5739705 5739706 CLL_A2514 CLL_A2515     FALSE 0.414 38.000 0.000 NA   NA
 5739706 5739707 CLL_A2515 CLL_A2516     FALSE 0.527 29.000 0.000 NA   NA
 5739707 5739708 CLL_A2516 CLL_A2517     FALSE 0.201 152.000 0.000 NA   NA
 5739710 5739711 CLL_A2519 CLL_A2520     FALSE 0.010 373.000 0.000 NA   NA
 5739713 5739714 CLL_A2522 CLL_A2523     FALSE 0.328 52.000 0.000 NA   NA
 5739714 5739715 CLL_A2523 CLL_A2524     FALSE 0.266 76.000 0.000 NA   NA
 5739715 5739716 CLL_A2524 CLL_A2525     FALSE 0.241 131.000 0.000 NA   NA
 5739716 5739717 CLL_A2525 CLL_A2526     FALSE 0.016 313.000 0.000 NA   NA
 5739719 5739720 CLL_A2528 CLL_A2529     TRUE 0.897 13.000 0.012 NA   NA
 5739720 5739721 CLL_A2529 CLL_A2530     TRUE 0.568 128.000 0.015 1.000   NA
 5739722 5739723 CLL_A2531 CLL_A2532     TRUE 0.998 0.000 0.750 1.000 Y NA
 5739726 5739727 CLL_A2535 CLL_A2536 gidA trx TRUE 0.968 18.000 0.250 1.000   NA
 5739729 5739730 CLL_A2538 CLL_A2539     FALSE 0.251 76.000 0.000 0.088 N NA
 5739730 5739731 CLL_A2539 CLL_A2540     TRUE 0.997 -16.000 0.270 1.000 Y NA
 5739731 5739732 CLL_A2540 CLL_A2541     TRUE 0.998 -25.000 0.646 NA Y NA
 5739732 5739733 CLL_A2541 CLL_A2542     FALSE 0.018 300.000 0.000 NA   NA
 5739737 5739738 CLL_A2546 CLL_A2547     TRUE 0.839 24.000 0.009 NA   NA
 5739741 5739742 CLL_A2550 CLL_A2551     TRUE 0.669 78.000 0.043 NA   NA
 5739742 5739743 CLL_A2551 CLL_A2552     FALSE 0.215 145.000 0.000 NA   NA
 5739745 5739746 CLL_A2554 CLL_A2555   gltX FALSE 0.207 154.000 0.000 1.000   NA
 5739747 5739748 CLL_A2556 CLL_A2557     TRUE 0.936 15.000 0.058 1.000   NA
 5739749 5739750 CLL_A2558 CLL_A2559   feoB TRUE 0.993 15.000 0.308 1.000 Y NA
 5739750 5739751 CLL_A2559 CLL_A2560 feoB   FALSE 0.322 53.000 0.000 NA   NA
 5739752 5739753 CLL_A2561 CLL_A2562   argS FALSE 0.028 264.000 0.000 NA   NA
 5739755 5739756 CLL_A2564 CLL_A2565     FALSE 0.036 245.000 0.000 NA   NA
 5739756 5739757 CLL_A2565 CLL_A2566     TRUE 0.983 19.000 0.667 NA   NA
 5739759 5739760 CLL_A2568 CLL_A2569 asnA   FALSE 0.175 158.000 0.000 0.034 N NA
 5739761 5739762 CLL_A2570 CLL_A2571     FALSE 0.423 190.000 0.077 1.000 N NA
 5739763 5739764 CLL_A2572 CLL_A2573 pflA pflB TRUE 0.632 171.000 0.163 1.000 N NA
 5739766 5739767 CLL_A2575 CLL_A2576 pyrE   FALSE 0.305 302.000 0.041 1.000 Y NA
 5739767 5739768 CLL_A2576 CLL_A2577     TRUE 0.976 22.000 0.592 1.000 N NA
 5739768 5739769 CLL_A2577 CLL_A2578   pyrF TRUE 0.960 12.000 0.112 0.003 N NA
 5739769 5739770 CLL_A2578 CLL_A2579 pyrF pyrC TRUE 0.912 115.000 0.064 1.000 Y NA
 5739770 5739771 CLL_A2579 CLL_A2580 pyrC   TRUE 0.971 23.000 0.032 NA Y NA
 5739771 5739772 CLL_A2580 CLL_A2581   pyrB TRUE 0.994 2.000 0.197 NA Y NA
 5739772 5739773 CLL_A2581 CLL_A2582 pyrB uppP FALSE 0.004 517.000 0.000 1.000 N NA
 5739773 5739774 CLL_A2582 CLL_A2583 uppP   TRUE 0.870 69.000 0.333 NA   NA
 5739774 5739775 CLL_A2583 CLL_A2584     FALSE 0.547 155.000 0.035 NA   NA
 5739776 5739777 CLL_A2585 CLL_A2586     TRUE 0.985 19.000 0.796 1.000   NA
 5739779 5739780 CLL_A2588 CLL_A2589     TRUE 0.666 60.000 0.029 1.000   NA
 5739783 5739784 CLL_A2592 CLL_A2593     FALSE 0.270 117.000 0.000 NA   NA
 5739784 5739785 CLL_A2593 CLL_A2594     FALSE 0.012 349.000 0.000 NA   NA
 5739791 5739792 CLL_A2600 CLL_A2601     FALSE 0.270 105.000 0.000 NA   NA
 5739792 5739793 CLL_A2601 CLL_A2602     FALSE 0.025 274.000 0.000 NA   NA
 5739793 5739794 CLL_A2602 CLL_A2603     FALSE 0.011 361.000 0.000 NA   NA
 5739794 5739795 CLL_A2603 CLL_A2604     TRUE 0.952 3.000 0.051 NA   NA
 5739795 5739796 CLL_A2604 CLL_A2605     FALSE 0.016 323.000 0.000 1.000   NA
 5739796 5739797 CLL_A2605 CLL_A2606   tehB FALSE 0.289 110.000 0.000 1.000   NA
 5739797 5739798 CLL_A2606 CLL_A2607 tehB   FALSE 0.029 262.000 0.000 NA   NA
 5739798 5739799 CLL_A2607 CLL_A2608     FALSE 0.266 76.000 0.000 NA   NA
 5739803 5739804 CLL_A2612 CLL_A2613     FALSE 0.137 176.000 0.000 1.000   NA
 5739804 5739805 CLL_A2613 CLL_A2614     TRUE 0.654 20.000 0.000 1.000   NA
 5739807 5739808 CLL_A2616 CLL_A2617     FALSE 0.005 807.000 0.000 NA   NA
 5739808 5739809 CLL_A2617 CLL_A2618     FALSE 0.267 79.000 0.000 NA   NA
 5739809 5739810 CLL_A2618 CLL_A2619     TRUE 0.990 2.000 0.600 NA   NA
 5739810 5739811 CLL_A2619 CLL_A2620     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 5739813 5739814 CLL_A2622 CLL_A2623     FALSE 0.007 468.000 0.000 NA   NA
 5739817 5739818 CLL_A2626 CLL_A2627     TRUE 0.884 44.000 0.188 NA   NA
 5739819 5739820 CLL_A2628 CLL_A2629     TRUE 0.828 -9.000 0.000 NA   NA
 5739820 5739821 CLL_A2629 CLL_A2630     FALSE 0.016 317.000 0.000 NA   NA
 5739822 5739823 CLL_A2631 CLL_A2632     TRUE 0.993 20.000 0.528 NA Y NA
 5739823 5739824 CLL_A2632 CLL_A2633     TRUE 0.998 -7.000 0.876 1.000 Y NA
 5739824 5739825 CLL_A2633 CLL_A2634     FALSE 0.045 239.000 0.000 1.000   NA
 5739825 5739826 CLL_A2634 CLL_A2635     TRUE 0.995 -16.000 0.869 1.000   NA
 5739827 5739828 CLL_A2636 CLL_A2637     FALSE 0.481 150.000 0.018 1.000 N NA
 5739828 5739829 CLL_A2637 CLL_A2638     FALSE 0.428 250.000 0.027 1.000 Y NA
 5739829 5739830 CLL_A2638 CLL_A2639     FALSE 0.298 722.000 0.500 0.012 Y NA
 5739830 5739831 CLL_A2639 CLL_A2640     FALSE 0.004 1017.000 0.000 NA   NA
 5739831 5739832 CLL_A2640 CLL_A2641     TRUE 0.987 12.000 0.667 NA   NA
 5739832 5739833 CLL_A2641 CLL_A2642     FALSE 0.007 471.000 0.000 NA   NA
 5739833 5739834 CLL_A2642 CLL_A2643     FALSE 0.389 42.000 0.000 NA   NA
 5739834 5739835 CLL_A2643 CLL_A2644   coaE FALSE 0.180 243.000 0.058 NA N NA
 5739835 5739836 CLL_A2644 CLL_A2645 coaE polA TRUE 0.906 23.000 0.068 1.000 N NA
 5739838 5739839 CLL_A2647 CLL_A2648   dcd FALSE 0.261 93.000 0.000 NA   NA
 5739839 5739840 CLL_A2648 CLL_A2649 dcd   FALSE 0.015 289.000 0.000 1.000 N NA
 5739840 5739841 CLL_A2649 CLL_A2650     FALSE 0.510 136.000 0.008 NA   NA
 5739841 5739842 CLL_A2650 CLL_A2651     TRUE 0.573 125.000 0.016 NA   NA
 5739842 5739843 CLL_A2651 CLL_A2652     FALSE 0.027 244.000 0.000 1.000 N NA
 5739844 5739845 CLL_A2653 CLL_A2654     TRUE 0.973 155.000 1.000 0.019 Y NA
 5739845 5739846 CLL_A2654 CLL_A2655     TRUE 0.998 0.000 1.000 0.019 Y NA
 5739847 5739848 CLL_A2656 CLL_A2657     FALSE 0.056 195.000 0.000 NA N NA
 5739848 5739849 CLL_A2657 CLL_A2658     FALSE 0.206 119.000 0.000 1.000 N NA
 5739849 5739850 CLL_A2658 CLL_A2659     FALSE 0.023 282.000 0.000 NA   NA
 5739850 5739851 CLL_A2659 CLL_A2660     FALSE 0.014 333.000 0.000 NA   NA
 5739851 5739852 CLL_A2660 CLL_A2661     FALSE 0.187 100.000 0.000 NA N NA
 5739852 5739853 CLL_A2661 CLL_A2662     TRUE 0.960 12.000 0.000 NA Y NA
 5739855 5739856 CLL_A2664 CLL_A2665     FALSE 0.472 33.000 0.000 NA   NA
 5739856 5739857 CLL_A2665 CLL_A2666     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5739857 5739858 CLL_A2666 CLL_A2667     FALSE 0.064 210.000 0.000 NA   NA
 5739858 5739859 CLL_A2667 CLL_A2668     TRUE 0.987 -7.000 0.300 NA   NA
 5739859 5739860 CLL_A2668 CLL_A2669     FALSE 0.005 662.000 0.000 NA   NA
 5739860 5739861 CLL_A2669 CLL_A2670     FALSE 0.273 113.000 0.000 NA   NA
 5739861 5739862 CLL_A2670 CLL_A2671     TRUE 0.843 -16.000 0.000 NA   NA
 5739862 5739863 CLL_A2671 CLL_A2672     FALSE 0.563 28.000 0.000 1.000   NA
 5739863 5739864 CLL_A2672 CLL_A2673     TRUE 0.625 23.000 0.000 1.000   NA
 5739864 5739865 CLL_A2673 CLL_A2674     FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5739865 5739866 CLL_A2674 CLL_A2675     FALSE 0.165 164.000 0.000 NA   NA
 5739866 5739867 CLL_A2675 CLL_A2676     FALSE 0.293 59.000 0.000 NA   NA
 5739867 5739868 CLL_A2676 CLL_A2677     FALSE 0.241 131.000 0.000 NA   NA
 5739868 5739869 CLL_A2677 CLL_A2678     FALSE 0.337 51.000 0.000 NA   NA
 5739869 5739870 CLL_A2678 CLL_A2679     FALSE 0.077 199.000 0.000 NA   NA
 5739870 5739871 CLL_A2679 CLL_A2680     FALSE 0.017 310.000 0.000 NA   NA
 5739871 5739872 CLL_A2680 CLL_A2681     TRUE 0.977 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5739872 5739873 CLL_A2681 CLL_A2682     TRUE 0.973 14.000 0.308 1.000 N NA
 5739873 5739874 CLL_A2682 CLL_A2683     FALSE 0.019 297.000 0.000 NA   NA
 5739874 5739875 CLL_A2683 CLL_A2684     FALSE 0.268 84.000 0.000 NA   NA
 5739877 5739878 CLL_A2686 CLL_A2687     TRUE 0.598 24.000 0.000 NA   NA
 5739878 5739879 CLL_A2687 CLL_A2688     FALSE 0.073 202.000 0.000 NA   NA
 5739881 5739882 CLL_A2690 CLL_A2691     FALSE 0.036 247.000 0.000 NA   NA
 5739882 5739883 CLL_A2691 CLL_A2692     FALSE 0.527 29.000 0.000 NA   NA
 5739883 5739884 CLL_A2692 CLL_A2693     TRUE 0.739 77.000 0.100 NA N NA
 5739884 5739885 CLL_A2693 CLL_A2694     FALSE 0.059 215.000 0.000 NA   NA
 5739885 5739886 CLL_A2694 CLL_A2695     TRUE 0.635 20.000 0.000 NA   NA
 5739886 5739887 CLL_A2695 CLL_A2696     FALSE 0.085 195.000 0.000 NA   NA
 5739887 5739888 CLL_A2696 CLL_A2697     FALSE 0.005 593.000 0.000 NA   NA
 5739888 5739889 CLL_A2697 CLL_A2698     FALSE 0.148 169.000 0.000 NA   NA
 5739889 5739890 CLL_A2698 CLL_A2699     FALSE 0.007 458.000 0.000 NA   NA
 5739890 5739891 CLL_A2699 CLL_A2700     FALSE 0.275 65.000 0.000 NA   NA
 5739892 5739893 CLL_A2701 CLL_A2702     FALSE 0.004 1083.000 0.000 NA   NA
 5739894 5739895 CLL_A2703 CLL_A2704     TRUE 0.571 26.000 0.000 NA   NA
 5739895 5739896 CLL_A2704 CLL_A2705     FALSE 0.051 225.000 0.000 NA   NA
 5739896 5739897 CLL_A2705 CLL_A2706     TRUE 0.885 -13.000 0.000 0.002   NA
 5739897 5739898 CLL_A2706 CLL_A2707     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 5739898 5739899 CLL_A2707 CLL_A2708     FALSE 0.005 802.000 0.000 NA   NA
 5739899 5739900 CLL_A2708 CLL_A2709     FALSE 0.005 750.000 0.000 1.000   NA
 5739900 5739901 CLL_A2709 CLL_A2710     FALSE 0.305 57.000 0.000 NA   NA
 5739901 5739902 CLL_A2710 CLL_A2711     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5739902 5739903 CLL_A2711 CLL_A2712     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 5739903 5739904 CLL_A2712 CLL_A2713     FALSE 0.369 46.000 0.000 NA   NA
 5739904 5739905 CLL_A2713 CLL_A2714     FALSE 0.007 437.000 0.000 NA   NA
 5739905 5739906 CLL_A2714 CLL_A2715     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5739906 5739907 CLL_A2715 CLL_A2716     TRUE 0.689 15.000 0.000 NA   NA
 5739907 5739908 CLL_A2716 CLL_A2717     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 5739908 5739909 CLL_A2717 CLL_A2718     TRUE 0.996 -13.000 1.000 NA   NA
 5739909 5739910 CLL_A2718 CLL_A2719     TRUE 0.987 6.000 0.571 NA   NA
 5739910 5739911 CLL_A2719 CLL_A2720     TRUE 0.993 -7.000 0.643 NA   NA
 5739911 5739912 CLL_A2720 CLL_A2721     TRUE 0.995 -10.000 0.900 NA   NA
 5739912 5739913 CLL_A2721 CLL_A2722     TRUE 0.986 8.000 0.500 NA   NA
 5739913 5739914 CLL_A2722 CLL_A2723     FALSE 0.252 126.000 0.000 NA   NA
 5739914 5739915 CLL_A2723 CLL_A2724     FALSE 0.393 41.000 0.000 NA   NA
 5739915 5739916 CLL_A2724 CLL_A2725     FALSE 0.369 46.000 0.000 NA   NA
 5739916 5739917 CLL_A2725 CLL_A2726     FALSE 0.406 39.000 0.000 NA   NA
 5739917 5739918 CLL_A2726 CLL_A2727     TRUE 0.908 61.000 0.500 NA   NA
 5739918 5739919 CLL_A2727 CLL_A2728     TRUE 0.983 21.000 0.750 NA   NA
 5739919 5739920 CLL_A2728 CLL_A2729     TRUE 0.989 1.000 0.500 NA   NA
 5739920 5739921 CLL_A2729 CLL_A2730     TRUE 0.990 6.000 0.750 NA   NA
 5739921 5739922 CLL_A2730 CLL_A2731     TRUE 0.786 1.000 0.000 NA   NA
 5739922 5739923 CLL_A2731 CLL_A2732     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5739923 5739924 CLL_A2732 CLL_A2733     TRUE 0.986 0.000 0.333 NA   NA
 5739924 5739925 CLL_A2733 CLL_A2734     TRUE 0.779 2.000 0.000 NA   NA
 5739925 5739926 CLL_A2734 CLL_A2735     FALSE 0.293 59.000 0.000 NA   NA
 5739926 5739927 CLL_A2735 CLL_A2736     TRUE 0.979 14.000 0.400 NA   NA
 5739927 5739928 CLL_A2736 CLL_A2737     TRUE 0.986 14.000 0.667 NA   NA
 5739928 5739929 CLL_A2737 CLL_A2738     FALSE 0.238 133.000 0.000 NA   NA
 5739929 5739930 CLL_A2738 CLL_A2739     FALSE 0.264 89.000 0.000 NA   NA
 5739930 5739931 CLL_A2739 CLL_A2740     TRUE 0.847 -21.000 0.000 NA   NA
 5739931 5739932 CLL_A2740 CLL_A2741     FALSE 0.288 60.000 0.000 NA   NA
 5739932 5739933 CLL_A2741 CLL_A2742     FALSE 0.248 128.000 0.000 NA   NA
 5739933 5739934 CLL_A2742 CLL_A2743     TRUE 0.976 13.000 0.300 NA   NA
 5739934 5739935 CLL_A2743 CLL_A2744     TRUE 0.987 0.000 0.375 NA   NA
 5739935 5739936 CLL_A2744 CLL_A2745     TRUE 0.948 3.000 0.026 0.001   NA
 5739936 5739937 CLL_A2745 CLL_A2746     FALSE 0.414 38.000 0.000 NA   NA
 5739937 5739938 CLL_A2746 CLL_A2747     TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5739938 5739939 CLL_A2747 CLL_A2748     FALSE 0.267 80.000 0.000 NA   NA
 5739939 5739940 CLL_A2748 CLL_A2749     TRUE 0.991 5.000 0.750 NA   NA
 5739940 5739941 CLL_A2749 CLL_A2750     FALSE 0.266 101.000 0.000 NA   NA
 5739941 5739942 CLL_A2750 CLL_A2751     FALSE 0.445 27.000 0.000 NA N NA
 5739942 5739943 CLL_A2751 CLL_A2752     FALSE 0.264 89.000 0.000 NA   NA
 5739943 5739944 CLL_A2752 CLL_A2753     FALSE 0.036 246.000 0.000 NA   NA
 5739944 5739945 CLL_A2753 CLL_A2754     FALSE 0.007 443.000 0.000 NA   NA
 5739945 5739946 CLL_A2754 CLL_A2755     FALSE 0.108 184.000 0.000 NA   NA
 5739946 5739947 CLL_A2755 CLL_A2756     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5739947 5739948 CLL_A2756 CLL_A2757     FALSE 0.142 171.000 0.000 NA   NA
 5739948 5739949 CLL_A2757 CLL_A2758     FALSE 0.265 88.000 0.000 NA   NA
 5739949 5739950 CLL_A2758 CLL_A2759     TRUE 0.814 -6.000 0.000 NA   NA
 5739950 5739951 CLL_A2759 CLL_A2760     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5739951 5739952 CLL_A2760 CLL_A2761     FALSE 0.262 90.000 0.000 NA   NA
 5739952 5739953 CLL_A2761 CLL_A2762     TRUE 0.635 20.000 0.000 NA   NA
 5739953 5739954 CLL_A2762 CLL_A2763     FALSE 0.273 112.000 0.000 NA   NA
 5739954 5739955 CLL_A2763 CLL_A2764     FALSE 0.510 30.000 0.000 NA   NA
 5739955 5739956 CLL_A2764 CLL_A2765     FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 5739956 5739957 CLL_A2765 CLL_A2766     FALSE 0.393 41.000 0.000 NA   NA
 5739957 5739958 CLL_A2766 CLL_A2767     FALSE 0.389 42.000 0.000 NA   NA
 5739958 5739959 CLL_A2767 CLL_A2768     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 5739959 5739960 CLL_A2768 CLL_A2769     FALSE 0.293 59.000 0.000 NA   NA
 5739960 5739961 CLL_A2769 CLL_A2770     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA   NA
 5739961 5739962 CLL_A2770 CLL_A2771     FALSE 0.272 108.000 0.000 NA   NA
 5739962 5739963 CLL_A2771 CLL_A2772     TRUE 0.984 4.000 0.375 NA   NA
 5739963 5739964 CLL_A2772 CLL_A2773     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5739964 5739965 CLL_A2773 CLL_A2774     TRUE 0.626 21.000 0.000 NA   NA
 5739965 5739966 CLL_A2774 CLL_A2775     TRUE 0.732 9.000 0.000 NA   NA
 5739966 5739967 CLL_A2775 CLL_A2776     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 5739967 5739968 CLL_A2776 CLL_A2777     TRUE 0.846 -19.000 0.000 NA   NA
 5739968 5739969 CLL_A2777 CLL_A2778     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5739969 5739970 CLL_A2778 CLL_A2779     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5739970 5739971 CLL_A2779 CLL_A2780     TRUE 0.795 0.000 0.000 NA   NA
 5739971 5739972 CLL_A2780 CLL_A2781     FALSE 0.263 97.000 0.000 NA   NA
 5739972 5739973 CLL_A2781 CLL_A2782     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5739973 5739974 CLL_A2782 CLL_A2783     TRUE 0.722 11.000 0.000 NA   NA
 5739974 5739975 CLL_A2783 CLL_A2784     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA   NA
 5739975 5739976 CLL_A2784 CLL_A2785     TRUE 0.728 10.000 0.000 NA   NA
 5739976 5739977 CLL_A2785 CLL_A2786     FALSE 0.137 172.000 0.000 NA   NA
 5739977 5739978 CLL_A2786 CLL_A2787     FALSE 0.273 113.000 0.000 NA   NA
 5739978 5739979 CLL_A2787 CLL_A2788     TRUE 0.830 1.000 0.000 0.042   NA
 5739979 5739980 CLL_A2788 CLL_A2789     FALSE 0.264 147.000 0.000 0.042   NA
 5739981 5739982 CLL_A2790 CLL_A2791     TRUE 0.739 169.000 0.286 NA   NA
 5739982 5739983 CLL_A2791 CLL_A2792     FALSE 0.362 47.000 0.000 NA   NA
 5739984 5739985 CLL_A2793 CLL_A2794     TRUE 0.983 26.000 0.933 NA   NA
 5739986 5739987 CLL_A2795 CLL_A2796     FALSE 0.006 546.000 0.000 NA   NA
 5739988 5739989 CLL_A2797 CLL_A2798     FALSE 0.006 514.000 0.000 NA   NA
 5739989 5739990 CLL_A2798 CLL_A2799     FALSE 0.007 477.000 0.000 NA   NA
 5739990 5739991 CLL_A2799 CLL_A2800     FALSE 0.137 172.000 0.000 NA   NA
 5739991 5739992 CLL_A2800 CLL_A2801     FALSE 0.267 85.000 0.000 NA   NA
 5739992 5739993 CLL_A2801 CLL_A2802     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5739993 5739994 CLL_A2802 CLL_A2803     FALSE 0.023 284.000 0.000 NA   NA
 5739994 5739995 CLL_A2803 CLL_A2804     FALSE 0.271 116.000 0.000 NA   NA
 5739995 5739996 CLL_A2804 CLL_A2805     FALSE 0.049 232.000 0.000 1.000   NA
 5739996 5739997 CLL_A2805 CLL_A2806     FALSE 0.032 259.000 0.000 1.000   NA
 5739997 5739998 CLL_A2806 CLL_A2807   trx TRUE 0.975 2.000 0.000 0.004 Y NA
 5740000 5740001 CLL_A2809 CLL_A2810     FALSE 0.120 179.000 0.000 NA   NA
 5740001 5740002 CLL_A2810 CLL_A2811     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5740002 5740003 CLL_A2811 CLL_A2812     FALSE 0.268 81.000 0.000 NA   NA
 5740003 5740004 CLL_A2812 CLL_A2813     TRUE 0.851 -37.000 0.000 NA   NA
 5740004 5740005 CLL_A2813 CLL_A2814     FALSE 0.267 71.000 0.000 NA   NA
 5740005 5740006 CLL_A2814 CLL_A2815     FALSE 0.233 137.000 0.000 NA   NA
 5740006 5740007 CLL_A2815 CLL_A2816     FALSE 0.266 72.000 0.000 NA   NA
 5740007 5740008 CLL_A2816 CLL_A2817     TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5740008 5740009 CLL_A2817 CLL_A2818     FALSE 0.313 55.000 0.000 NA   NA
 5740009 5740010 CLL_A2818 CLL_A2819     FALSE 0.510 30.000 0.000 NA   NA
 5740010 5740011 CLL_A2819 CLL_A2820     FALSE 0.008 419.000 0.000 NA   NA
 5740011 5740012 CLL_A2820 CLL_A2821     FALSE 0.127 176.000 0.000 NA   NA
 5740012 5740013 CLL_A2821 CLL_A2822     FALSE 0.266 119.000 0.000 NA   NA
 5740013 5740014 CLL_A2822 CLL_A2823     FALSE 0.215 145.000 0.000 NA   NA
 5740014 5740015 CLL_A2823 CLL_A2824     FALSE 0.269 104.000 0.000 NA   NA
 5740017 5740018 CLL_A2826 CLL_A2827     FALSE 0.007 483.000 0.000 NA   NA
 5740020 5740021 CLL_A2829 CLL_A2830     FALSE 0.021 289.000 0.000 NA   NA
 5740023 5740024 CLL_A2832 CLL_A2833     TRUE 0.980 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5740024 5740025 CLL_A2833 CLL_A2834     TRUE 0.980 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 5740025 5740026 CLL_A2834 CLL_A2835     TRUE 0.647 19.000 0.000 NA   NA
 5740026 5740027 CLL_A2835 CLL_A2836     FALSE 0.014 327.000 0.000 NA   NA
 5740027 5740028 CLL_A2836 CLL_A2837     FALSE 0.007 475.000 0.000 NA   NA
 5740028 5740029 CLL_A2837 CLL_A2838     TRUE 0.924 91.000 0.080 0.001 Y NA
 5740031 5740032 CLL_A2840 CLL_A2841     TRUE 0.832 -10.000 0.000 NA   NA
 5740033 5740034 CLL_A2842 CLL_A2843     FALSE 0.051 225.000 0.000 NA   NA
 5740035 5740036 CLL_A2844 CLL_A2845     FALSE 0.012 350.000 0.000 NA   NA
 5740036 5740037 CLL_A2845 CLL_A2846   hprK FALSE 0.307 177.000 0.011 1.000 N NA
 5740037 5740038 CLL_A2846 CLL_A2847 hprK   TRUE 0.698 16.000 0.000 1.000   NA
 5740040 5740041 CLL_A3608 CLL_A2849 ssrS   FALSE 0.271 67.000 0.000 NA   NA
 5740041 5740042 CLL_A2849 CLL_A2850     TRUE 0.948 14.000 0.083 NA   NA
 5740042 5740043 CLL_A2850 CLL_A2851     TRUE 0.665 99.000 0.042 NA   NA
 5740043 5740044 CLL_A2851 CLL_A2852     FALSE 0.041 239.000 0.000 NA   NA
 5740044 5740045 CLL_A2852 CLL_A2853     FALSE 0.031 257.000 0.000 NA   NA
 5740045 5740046 CLL_A2853 CLL_A2854     TRUE 0.977 -10.000 0.075 0.001   NA
 5740046 5740047 CLL_A2854 CLL_A2855   luxS TRUE 0.925 2.000 0.008 1.000   NA
 5740047 5740048 CLL_A2855 CLL_A2856 luxS metF TRUE 0.629 13.000 0.000 1.000 N NA
 5740048 5740049 CLL_A2856 CLL_A2857 metF tagO FALSE 0.006 417.000 0.000 1.000 N NA
 5740049 5740050 CLL_A2857 CLL_A2858 tagO   FALSE 0.007 380.000 0.000 1.000 N NA
 5740050 5740051 CLL_A2858 CLL_A2859     FALSE 0.010 325.000 0.000 1.000 N NA
 5740051 5740052 CLL_A2859 CLL_A2860     TRUE 0.994 4.000 0.238 0.005 Y NA
 5740052 5740053 CLL_A2860 CLL_A2861     TRUE 0.998 -7.000 0.776 0.005 Y NA
 5740053 5740054 CLL_A2861 CLL_A2862     TRUE 0.994 18.000 0.462 0.005 Y NA
 5740054 5740055 CLL_A2862 CLL_A2863     TRUE 0.997 -7.000 0.487 0.005 Y NA
 5740055 5740056 CLL_A2863 CLL_A2864     TRUE 0.993 13.000 0.258 0.005 Y NA
 5740056 5740057 CLL_A2864 CLL_A2865     TRUE 0.955 35.000 0.489 0.005   NA
 5740057 5740058 CLL_A2865 CLL_A2866     TRUE 0.990 14.000 0.848 0.006   NA
 5740058 5740059 CLL_A2866 CLL_A2867     TRUE 0.894 17.000 0.009 0.006   NA
 5740059 5740060 CLL_A2867 CLL_A2868     FALSE 0.061 217.000 0.000 1.000   NA
 5740060 5740061 CLL_A2868 CLL_A2869     TRUE 0.974 -25.000 0.063 NA   NA
 5740061 5740062 CLL_A2869 CLL_A2870     TRUE 0.641 191.000 0.300 NA   NA
 5740064 5740065 CLL_A2872 CLL_A2873     TRUE 0.966 10.000 0.137 1.000   NA
 5740065 5740066 CLL_A2873 CLL_A2874     TRUE 0.880 32.000 0.078 1.000   NA
 5740066 5740067 CLL_A2874 CLL_A2875     TRUE 0.908 27.000 0.079 1.000   NA
 5740067 5740068 CLL_A2875 CLL_A2876     FALSE 0.043 236.000 0.000 NA   NA
 5740068 5740069 CLL_A2876 CLL_A2877     FALSE 0.130 175.000 0.000 NA   NA
 5740071 5740072 CLL_A2879 CLL_A2880     FALSE 0.025 274.000 0.000 NA   NA
 5740072 5740073 CLL_A2880 CLL_A2881     FALSE 0.035 249.000 0.000 NA   NA
 5740074 5740075 CLL_A2882 CLL_A2883     TRUE 0.650 125.000 0.041 NA   NA
 5740076 5740077 CLL_A2884 CLL_A2885     FALSE 0.008 429.000 0.000 NA   NA
 5740077 5740078 CLL_A2885 CLL_A2886     FALSE 0.108 184.000 0.000 NA   NA
 5740078 5740079 CLL_A2886 CLL_A2887   lon TRUE 0.967 -10.000 0.048 1.000   NA
 5740079 5740080 CLL_A2887 CLL_A2888 lon clpX FALSE 0.239 335.000 0.030 0.083 Y NA
 5740080 5740081 CLL_A2888 CLL_A2889 clpX clpP TRUE 0.931 40.000 0.022 1.000 Y NA
 5740081 5740082 CLL_A2889 CLL_A2890 clpP tig TRUE 0.838 152.000 0.024 1.000 Y NA
 5740082 5740083 CLL_A2890 CLL_A2891 tig   FALSE 0.511 93.000 0.002 NA   NA
 5740083 5740084 CLL_A2891 CLL_A2892     TRUE 0.844 99.000 0.250 NA   NA
 5740086 5740087 CLL_A2894 CLL_A2895     FALSE 0.271 106.000 0.000 NA   NA
 5740087 5740088 CLL_A2895 CLL_A2896     FALSE 0.026 269.000 0.000 NA   NA
 5740088 5740089 CLL_A2896 CLL_A2897   thrB TRUE 0.936 0.000 0.011 1.000   NA
 5740089 5740090 CLL_A2897 CLL_A2898 thrB thrC TRUE 0.994 4.000 0.233 1.000 Y NA
 5740090 5740091 CLL_A2898 CLL_A2899 thrC   FALSE 0.530 117.000 0.003 NA   NA
 5740093 5740094 CLL_A2901 CLL_A2902     FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 5740094 5740095 CLL_A2902 CLL_A2903     FALSE 0.006 487.000 0.000 NA   NA
 5740095 5740096 CLL_A2903 CLL_A2904   hemL TRUE 0.980 -10.000 0.000 NA Y NA
 5740096 5740097 CLL_A2904 CLL_A2905 hemL hemB TRUE 0.919 52.000 0.026 0.001 Y NA
 5740097 5740098 CLL_A2905 CLL_A2906 hemB   TRUE 0.988 3.000 0.044 1.000 Y NA
 5740098 5740099 CLL_A2906 CLL_A2907   hemC TRUE 0.577 215.000 0.031 1.000 Y NA
 5740099 5740100 CLL_A2907 CLL_A2908 hemC   TRUE 0.898 51.000 0.009 NA Y NA
 5740100 5740101 CLL_A2908 CLL_A2909   hemA TRUE 0.991 -42.000 0.018 NA Y NA
 5740101 5740102 CLL_A2909 CLL_A2910 hemA   FALSE 0.006 400.000 0.000 1.000 N NA
 5740104 5740105 CLL_A2912 CLL_A2913   metA FALSE 0.012 363.000 0.000 1.000   NA
 5740109 5740110 CLL_A2917 CLL_A2918 cobQ   FALSE 0.041 240.000 0.000 0.009 N NA
 5740110 5740111 CLL_A2918 CLL_A2919   cobD TRUE 0.949 -7.000 0.017 0.009 N NA
 5740111 5740112 CLL_A2919 CLL_A2920 cobD   TRUE 0.734 120.000 0.094 1.000 N NA
 5740112 5740113 CLL_A2920 CLL_A2921     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA   NA
 5740113 5740114 CLL_A2921 CLL_A2922   cobS FALSE 0.272 115.000 0.000 NA   NA
 5740114 5740115 CLL_A2922 CLL_A2923 cobS   TRUE 0.989 9.000 0.092 1.000 Y NA
 5740115 5740116 CLL_A2923 CLL_A2924     TRUE 0.984 2.000 0.006 1.000 Y NA
 5740116 5740117 CLL_A2924 CLL_A2925     FALSE 0.016 285.000 0.000 1.000 N NA
 5740117 5740118 CLL_A2925 CLL_A2926     TRUE 0.992 2.000 0.793 0.064 N NA
 5740118 5740119 CLL_A2926 CLL_A2927     TRUE 0.716 107.000 0.077 1.000 N NA
 5740119 5740120 CLL_A2927 CLL_A2928   cobT FALSE 0.018 275.000 0.000 1.000 N NA
 5740120 5740121 CLL_A2928 CLL_A2929 cobT cobK TRUE 0.987 -3.000 0.006 0.009 Y NA
 5740121 5740122 CLL_A2929 CLL_A2930 cobK cobJ TRUE 0.997 0.000 0.423 0.009 Y NA
 5740122 5740123 CLL_A2930 CLL_A2931 cobJ   TRUE 0.992 19.000 0.352 0.009 Y NA
 5740123 5740124 CLL_A2931 CLL_A2932   cobM TRUE 0.997 -3.000 0.397 0.009 Y NA
 5740124 5740125 CLL_A2932 CLL_A2933 cobM cobI TRUE 0.982 34.000 0.291 0.009 Y NA
 5740125 5740126 CLL_A2933 CLL_A2934 cobI   TRUE 0.986 2.000 0.010 0.009 Y NA
 5740126 5740127 CLL_A2934 CLL_A2935   cbiE TRUE 0.997 13.000 0.750 0.001 Y NA
 5740127 5740128 CLL_A2935 CLL_A2936 cbiE cbiD TRUE 0.981 8.000 0.008 0.009 Y NA
 5740128 5740129 CLL_A2936 CLL_A2937 cbiD cobH TRUE 0.925 148.000 0.168 0.009 Y NA
 5740129 5740130 CLL_A2937 CLL_A2938 cobH cobB TRUE 0.929 88.000 0.097 0.009 Y NA
 5740130 5740131 CLL_A2938 CLL_A2939 cobB   TRUE 0.762 179.000 0.039 1.000 Y NA
 5740133 5740134 CLL_A2941 CLL_A2942     FALSE 0.026 269.000 0.000 NA   NA
 5740140 5740141 CLL_A2948 CLL_A2949     FALSE 0.013 358.000 0.000 1.000   NA
 5740141 5740142 CLL_A2949 CLL_A2950     FALSE 0.024 286.000 0.000 1.000   NA
 5740142 5740143 CLL_A2950 CLL_A2951     TRUE 0.903 17.000 0.023 1.000   NA
 5740143 5740144 CLL_A2951 CLL_A2952     FALSE 0.010 393.000 0.000 1.000   NA
 5740144 5740145 CLL_A2952 CLL_A2953     TRUE 0.999 -7.000 0.933 0.002 Y NA
 5740147 5740148 CLL_A2955 CLL_A2956 araB   TRUE 0.857 45.000 0.000 1.000 Y NA
 5740149 5740150 CLL_A2957 CLL_A2958     FALSE 0.005 469.000 0.000 1.000 N NA
 5740152 5740153 CLL_A2960 CLL_A2961     FALSE 0.273 110.000 0.000 NA   NA
 5740154 5740155 CLL_A2962 CLL_A2963     TRUE 0.786 33.000 0.010 0.030   NA
 5740155 5740156 CLL_A2963 CLL_A2964     FALSE 0.085 195.000 0.000 NA   NA
 5740156 5740157 CLL_A2964 CLL_A2965     FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 5740157 5740158 CLL_A2965 CLL_A2966     FALSE 0.127 176.000 0.000 NA   NA
 5740158 5740159 CLL_A2966 CLL_A2967     FALSE 0.177 160.000 0.000 NA   NA
 5740161 5740162 CLL_A2969 CLL_A2970 deoD cdd TRUE 0.850 47.000 0.000 1.000 Y NA
 5740162 5740163 CLL_A2970 CLL_A2971 cdd   FALSE 0.243 206.000 0.021 1.000   NA
 5740163 5740164 CLL_A2971 CLL_A2972     TRUE 0.992 2.000 0.720 0.018   NA
 5740164 5740165 CLL_A2972 CLL_A2973     TRUE 0.990 -3.000 0.438 1.000   NA
 5740165 5740166 CLL_A2973 CLL_A2974     FALSE 0.156 247.000 0.030 1.000   NA
 5740166 5740167 CLL_A2974 CLL_A2975     TRUE 0.655 174.000 0.182 1.000   NA
 5740167 5740168 CLL_A2975 CLL_A2976     FALSE 0.004 588.000 0.000 1.000 N NA
 5740168 5740169 CLL_A2976 CLL_A2977     TRUE 0.994 -3.000 0.894 NA N NA
 5740169 5740170 CLL_A2977 CLL_A2978   pulA FALSE 0.003 736.000 0.000 NA N NA
 5740170 5740171 CLL_A2978 CLL_A2979 pulA   FALSE 0.011 361.000 0.000 NA   NA
 5740171 5740172 CLL_A2979 CLL_A2980     FALSE 0.557 27.000 0.000 NA   NA
 5740174 5740175 CLL_A2982 CLL_A2983     FALSE 0.033 257.000 0.000 1.000   NA
 5740175 5740176 CLL_A2983 CLL_A2984     FALSE 0.289 111.000 0.000 1.000   NA
 5740176 5740177 CLL_A2984 CLL_A2985     FALSE 0.006 556.000 0.000 1.000   NA
 5740177 5740178 CLL_A2985 CLL_A2986     FALSE 0.133 177.000 0.000 1.000   NA
 5740178 5740179 CLL_A2986 CLL_A2987     FALSE 0.240 353.000 0.540 NA   NA
 5740179 5740180 CLL_A2987 CLL_A2988     FALSE 0.008 422.000 0.000 NA   NA
 5740180 5740181 CLL_A2988 CLL_A2989     FALSE 0.068 211.000 0.000 1.000   NA
 5740181 5740182 CLL_A2989 CLL_A2990     FALSE 0.286 68.000 0.000 1.000   NA
 5740182 5740183 CLL_A2990 CLL_A2991     TRUE 0.994 -13.000 0.669 1.000 N NA
 5740183 5740184 CLL_A2991 CLL_A2992     TRUE 0.698 16.000 0.000 1.000   NA
 5740186 5740187 CLL_A2994 CLL_A2995 surE   FALSE 0.250 136.000 0.000 1.000   NA
 5740187 5740188 CLL_A2995 CLL_A2996     FALSE 0.004 500.000 0.000 1.000 N NA
 5740194 5740195 CLL_A3002 CLL_A3003   trpF FALSE 0.203 90.000 0.000 1.000 N NA
 5740195 5740196 CLL_A3003 CLL_A3004 trpF   TRUE 0.659 5.000 0.000 NA N NA
 5740196 5740197 CLL_A3004 CLL_A3005     FALSE 0.008 424.000 0.000 NA   NA
 5740197 5740198 CLL_A3005 CLL_A3006     TRUE 0.948 37.000 0.500 NA   NA
 5740198 5740199 CLL_A3006 CLL_A3007     FALSE 0.019 306.000 0.000 1.000   NA
 5740199 5740200 CLL_A3007 CLL_A3008     TRUE 0.847 50.000 0.133 1.000   NA
 5740200 5740201 CLL_A3008 CLL_A3009     FALSE 0.017 311.000 0.000 NA   NA
 5740201 5740202 CLL_A3009 CLL_A3010     TRUE 0.661 18.000 0.000 NA   NA
 5740202 5740203 CLL_A3010 CLL_A3011     FALSE 0.011 362.000 0.000 NA   NA
 5740203 5740204 CLL_A3011 CLL_A3012     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA   NA
 5740204 5740205 CLL_A3012 CLL_A3013     FALSE 0.283 72.000 0.000 1.000   NA
 5740205 5740206 CLL_A3013 CLL_A3014     FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 5740206 5740207 CLL_A3014 CLL_A3015     FALSE 0.047 230.000 0.000 NA   NA
 5740207 5740208 CLL_A3015 CLL_A3016     TRUE 0.997 6.000 0.833 1.000 Y NA
 5740208 5740209 CLL_A3016 CLL_A3017     FALSE 0.022 259.000 0.000 1.000 N NA
 5740211 5740212 CLL_A3019 CLL_A3020     TRUE 0.839 -13.000 0.000 NA   NA
 5740212 5740213 CLL_A3020 CLL_A3021     TRUE 0.598 24.000 0.000 NA   NA
 5740213 5740214 CLL_A3021 CLL_A3022     FALSE 0.006 542.000 0.000 NA   NA
 5740214 5740215 CLL_A3022 CLL_A3023     FALSE 0.005 708.000 0.000 NA   NA
 5740216 5740217 CLL_A3024 CLL_A3025     TRUE 0.758 144.000 0.160 NA   NA
 5740217 5740218 CLL_A3025 CLL_A3026     FALSE 0.018 302.000 0.000 NA   NA
 5740219 5740220 CLL_A3027 CLL_A3028   feoB TRUE 0.633 71.000 0.029 NA   NA
 5740220 5740221 CLL_A3028 CLL_A3029 feoB   TRUE 0.979 73.000 0.871 1.000 Y NA
 5740221 5740222 CLL_A3029 CLL_A3030     TRUE 0.997 14.000 0.791 0.007 Y NA
 5740222 5740223 CLL_A3030 CLL_A3031     FALSE 0.008 426.000 0.000 1.000   NA
 5740223 5740224 CLL_A3031 CLL_A3032     FALSE 0.006 564.000 0.000 1.000   NA
 5740225 5740226 CLL_A3033 CLL_A3034     TRUE 0.991 3.000 0.748 NA   NA
 5740228 5740229 CLL_A3036 CLL_A3037     TRUE 0.981 17.000 0.516 NA   NA
 5740229 5740230 CLL_A3037 CLL_A3038     TRUE 0.935 16.000 0.062 NA   NA
 5740231 5740232 CLL_A3039 CLL_A3040 asrC asrB TRUE 0.996 13.000 0.720 0.022 Y NA
 5740232 5740233 CLL_A3040 CLL_A3041 asrB asrA TRUE 0.994 -7.000 0.750 0.022   NA
 5740233 5740234 CLL_A3041 CLL_A3042 asrA   TRUE 0.965 14.000 0.174 1.000   NA
 5740234 5740235 CLL_A3042 CLL_A3043     TRUE 0.781 94.000 0.152 1.000 N NA
 5740235 5740236 CLL_A3043 CLL_A3044     FALSE 0.217 63.000 0.000 1.000 N NA
 5740237 5740238 CLL_A3045 CLL_A3046 modA modB TRUE 0.606 23.000 0.000 NA   NA
 5740238 5740239 CLL_A3046 CLL_A3047 modB   TRUE 0.853 -1049.000 0.000 NA   NA
 5740240 5740241 CLL_A3048 CLL_A3049 gltA   TRUE 0.787 0.000 0.000 0.030 N NA
 5740241 5740242 CLL_A3049 CLL_A3050   smpB FALSE 0.013 301.000 0.000 1.000 N NA
 5740242 5740243 CLL_A3050 CLL_A3051 smpB rnr TRUE 0.608 176.000 0.143 0.017 N NA
 5740243 5740244 CLL_A3051 CLL_A3052 rnr   FALSE 0.126 224.000 0.003 1.000 N NA
 5740244 5740245 CLL_A3052 CLL_A3053   secG FALSE 0.028 471.000 0.019 1.000   NA
 5740245 5740246 CLL_A3053 CLL_A3054 secG   FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 5740246 5740247 CLL_A3054 CLL_A3055   eno FALSE 0.272 108.000 0.000 NA   NA
 5740249 5740250 CLL_A3057 CLL_A3058   gpmI FALSE 0.030 260.000 0.000 NA   NA
 5740250 5740251 CLL_A3058 CLL_A3059 gpmI murQ FALSE 0.092 195.000 0.000 1.000   NA
 5740252 5740253 CLL_A3060 CLL_A3061     TRUE 0.970 21.000 0.357 1.000   NA
 5740256 5740257 CLL_A3064 CLL_A3065 tpiA pgk TRUE 0.932 123.000 0.141 1.000 Y NA
 5740257 5740258 CLL_A3065 CLL_A3066 pgk gap TRUE 0.901 117.000 0.035 0.004 Y NA
 5740258 5740259 CLL_A3066 CLL_A3067 gap   TRUE 0.593 73.000 0.025 1.000 N NA
 5740259 5740260 CLL_A3067 CLL_A3068   rpoN FALSE 0.484 240.000 0.034 1.000 Y NA
 5740260 5740261 CLL_A3068 CLL_A3069 rpoN   FALSE 0.050 226.000 0.000 NA   NA
 5740261 5740262 CLL_A3069 CLL_A3070     TRUE 0.916 9.000 0.016 NA   NA
 5740262 5740263 CLL_A3070 CLL_A3071     FALSE 0.007 372.000 0.000 1.000 N NA
 5740263 5740264 CLL_A3071 CLL_A3072     FALSE 0.540 208.000 0.333 1.000 N NA
 5740264 5740265 CLL_A3072 CLL_A3073     TRUE 0.846 85.000 0.286 1.000 N NA
 5740265 5740266 CLL_A3073 CLL_A3074     TRUE 0.996 -10.000 0.286 1.000 Y NA
 5740266 5740267 CLL_A3074 CLL_A3075   ddlB FALSE 0.012 314.000 0.000 1.000 N NA
 5740267 5740268 CLL_A3075 CLL_A3076 ddlB nth FALSE 0.040 315.000 0.002 1.000 N NA
 5740268 5740269 CLL_A3076 CLL_A3077 nth   TRUE 0.852 19.000 0.011 1.000 N NA
 5740269 5740270 CLL_A3077 CLL_A3078     TRUE 0.777 47.000 0.064 1.000 N NA
 5740270 5740271 CLL_A3078 CLL_A3079   cysE TRUE 0.944 9.000 0.064 1.000 N NA
 5740271 5740272 CLL_A3079 CLL_A3080 cysE cysK TRUE 0.934 114.000 0.101 0.001 Y NA
 5740272 5740273 CLL_A3080 CLL_A3081 cysK   FALSE 0.006 555.000 0.000 1.000   NA
 5740275 5740276 CLL_A3083 CLL_A3084     FALSE 0.229 139.000 0.000 NA   NA
 5740276 5740277 CLL_A3084 CLL_A3085     TRUE 0.852 88.000 0.281 NA   NA
 5740279 5740280 CLL_A3087 CLL_A3088     FALSE 0.019 296.000 0.000 NA   NA
 5740280 5740281 CLL_A3088 CLL_A3089     TRUE 0.689 15.000 0.000 NA   NA
 5740281 5740282 CLL_A3089 CLL_A3090     FALSE 0.233 202.000 0.014 NA   NA
 5740282 5740283 CLL_A3090 CLL_A3091   yhbH TRUE 0.991 5.000 0.761 NA   NA
 5740283 5740284 CLL_A3091 CLL_A3092 yhbH   TRUE 0.989 9.000 0.683 NA   NA
 5740284 5740285 CLL_A3092 CLL_A3093   recQ FALSE 0.377 159.000 0.006 NA N NA
 5740285 5740286 CLL_A3093 CLL_A3094 recQ   TRUE 0.571 26.000 0.000 NA   NA
 5740286 5740287 CLL_A3094 CLL_A3095     TRUE 0.985 4.000 0.400 NA   NA
 5740287 5740288 CLL_A3095 CLL_A3096     FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 5740288 5740289 CLL_A3096 CLL_A3097     TRUE 0.995 -7.000 0.855 1.000   NA
 5740289 5740290 CLL_A3097 CLL_A3098     TRUE 0.892 122.000 0.492 0.082 N NA
 5740290 5740291 CLL_A3098 CLL_A3099     TRUE 0.998 3.000 0.812 1.000 Y NA
 5740291 5740292 CLL_A3099 CLL_A3100     FALSE 0.051 225.000 0.000 NA   NA
 5740294 5740295 CLL_A3102 CLL_A3103     FALSE 0.076 204.000 0.000 1.000   NA
 5740295 5740296 CLL_A3103 CLL_A3104   thiE FALSE 0.034 256.000 0.000 1.000   NA
 5740296 5740297 CLL_A3104 CLL_A3105 thiE thiM TRUE 0.869 180.000 0.190 0.003 Y NA
 5740297 5740298 CLL_A3105 CLL_A3106 thiM thiD TRUE 0.713 194.000 0.039 0.003 Y NA
 5740298 5740299 CLL_A3106 CLL_A3107 thiD thiW TRUE 0.778 51.000 0.065 NA   NA
 5740299 5740300 CLL_A3107 CLL_A3108 thiW sdaAA FALSE 0.026 269.000 0.000 NA   NA
 5740300 5740301 CLL_A3108 CLL_A3109 sdaAA sdaAB TRUE 0.992 2.000 0.098 0.001 Y NA
 5740301 5740302 CLL_A3109 CLL_A3110 sdaAB   FALSE 0.005 451.000 0.000 1.000 N NA
 5740303 5740304 CLL_A3111 CLL_A3112     TRUE 0.969 0.000 0.082 NA   NA
 5740304 5740305 CLL_A3112 CLL_A3113   fba FALSE 0.089 194.000 0.000 NA   NA
 5740305 5740306 CLL_A3113 CLL_A3114 fba argG FALSE 0.004 655.000 0.000 1.000 N NA
 5740306 5740307 CLL_A3114 CLL_A3115 argG argH TRUE 0.995 3.000 0.278 1.000 Y NA
 5740307 5740308 CLL_A3115 CLL_A3116 argH argC TRUE 0.989 -7.000 0.020 1.000 Y NA
 5740308 5740309 CLL_A3116 CLL_A3117 argC argJ FALSE 0.557 297.000 0.303 0.002 Y NA
 5740309 5740310 CLL_A3117 CLL_A3118 argJ argB TRUE 0.954 103.000 0.239 0.002 Y NA
 5740310 5740311 CLL_A3118 CLL_A3119 argB   TRUE 0.675 192.000 0.022 1.000 Y NA
 5740311 5740312 CLL_A3119 CLL_A3120   argF TRUE 0.872 93.000 0.017 1.000 Y NA
 5740312 5740313 CLL_A3120 CLL_A3121 argF   FALSE 0.014 294.000 0.000 1.000 N NA
 5740318 5740319 CLL_A3126 CLL_A3127 pfkB   FALSE 0.227 263.000 0.000 1.000 Y NA
 5740319 5740320 CLL_A3127 CLL_A3128     TRUE 0.949 45.000 0.080 1.000 Y NA
 5740320 5740321 CLL_A3128 CLL_A3129     TRUE 0.625 111.000 0.033 1.000 N NA
 5740321 5740322 CLL_A3129 CLL_A3130     FALSE 0.253 53.000 0.000 1.000 N NA
 5740322 5740323 CLL_A3130 CLL_A3131     FALSE 0.021 263.000 0.000 1.000 N NA
 5740323 5740324 CLL_A3131 CLL_A3132     TRUE 0.995 -10.000 0.143 0.012 Y NA
 5740324 5740325 CLL_A3132 CLL_A3133     TRUE 0.983 60.000 0.905 0.012 Y NA
 5740325 5740326 CLL_A3133 CLL_A3134     FALSE 0.227 140.000 0.000 NA   NA
 5740328 5740329 CLL_A3136 CLL_A3137   aroF TRUE 0.973 17.000 0.009 1.000 Y NA
 5740329 5740330 CLL_A3137 CLL_A3138 aroF aroK TRUE 0.785 83.000 0.000 1.000 Y NA
 5740330 5740331 CLL_A3138 CLL_A3139 aroK aroE TRUE 0.985 14.000 0.069 1.000 Y NA
 5740331 5740332 CLL_A3139 CLL_A3140 aroE   TRUE 0.966 24.000 0.009 0.031 Y NA
 5740332 5740333 CLL_A3140 CLL_A3141   aroC TRUE 0.690 191.000 0.026 1.000 Y NA
 5740333 5740334 CLL_A3141 CLL_A3142 aroC aroA TRUE 0.993 -22.000 0.057 1.000 Y NA
 5740334 5740335 CLL_A3142 CLL_A3143 aroA aroB TRUE 0.899 93.000 0.051 1.000 Y NA
 5740335 5740336 CLL_A3143 CLL_A3144 aroB aroF TRUE 0.684 188.000 0.008 0.002 Y NA
 5740336 5740337 CLL_A3144 CLL_A3145 aroF   FALSE 0.005 769.000 0.000 NA   NA
 5740339 5740340 CLL_A3147 CLL_A3148   putP FALSE 0.052 204.000 0.000 1.000 N NA
 5740342 5740343 CLL_A3150 CLL_A3151     FALSE 0.286 105.000 0.000 1.000   NA
 5740343 5740344 CLL_A3151 CLL_A3152     FALSE 0.362 47.000 0.000 NA   NA
 5740344 5740345 CLL_A3152 CLL_A3153     FALSE 0.006 485.000 0.000 NA   NA
 5740347 5740348 CLL_A3155 CLL_A3156     TRUE 0.741 54.000 0.054 NA   NA
 5740348 5740349 CLL_A3156 CLL_A3157     TRUE 0.693 116.000 0.052 NA   NA
 5740349 5740350 CLL_A3157 CLL_A3158     FALSE 0.149 258.000 0.043 NA   NA
 5740350 5740351 CLL_A3158 CLL_A3159     TRUE 0.593 79.000 0.017 NA   NA
 5740352 5740353 CLL_A3160 CLL_A3161     FALSE 0.554 154.000 0.033 1.000   NA
 5740354 5740355 CLL_A3162 CLL_A3163     FALSE 0.022 292.000 0.000 1.000   NA
 5740355 5740356 CLL_A3163 CLL_A3164     TRUE 0.883 31.000 0.077 1.000   NA
 5740356 5740357 CLL_A3164 CLL_A3165     TRUE 0.931 48.000 0.500 NA   NA
 5740357 5740358 CLL_A3165 CLL_A3166   tyrS FALSE 0.007 465.000 0.000 NA   NA
 5740358 5740359 CLL_A3166 CLL_A3167 tyrS   FALSE 0.008 431.000 0.000 1.000   NA
 5740359 5740360 CLL_A3167 CLL_A3168     TRUE 0.995 0.000 1.000 0.002   NA
 5740366 5740367 CLL_A3174 CLL_A3175   pglB FALSE 0.048 229.000 0.000 NA   NA
 5740367 5740368 CLL_A3175 CLL_A3176 pglB   TRUE 0.847 151.000 0.033 NA Y NA
 5740368 5740369 CLL_A3176 CLL_A3177     FALSE 0.008 433.000 0.000 NA   NA
 5740369 5740370 CLL_A3177 CLL_A3178     FALSE 0.013 336.000 0.000 NA   NA
 5740370 5740371 CLL_A3178 CLL_A3179     FALSE 0.111 183.000 0.000 NA   NA
 5740371 5740372 CLL_A3179 CLL_A3180     TRUE 0.993 27.000 0.692 1.000 Y NA
 5740372 5740373 CLL_A3180 CLL_A3181     FALSE 0.017 282.000 0.000 1.000 N NA
 5740375 5740376 CLL_A3183 CLL_A3184     TRUE 0.850 -30.000 0.000 NA   NA
 5740376 5740377 CLL_A3184 CLL_A3185     FALSE 0.033 252.000 0.000 NA   NA
 5740377 5740378 CLL_A3185 CLL_A3186     TRUE 0.769 3.000 0.000 NA   NA
 5740378 5740379 CLL_A3186 CLL_A3187     TRUE 0.704 65.000 0.056 NA   NA
 5740379 5740380 CLL_A3187 CLL_A3188     FALSE 0.044 234.000 0.000 NA   NA
 5740382 5740383 CLL_A3190 CLL_A3191     TRUE 0.807 255.000 0.800 0.017 Y NA
 5740383 5740384 CLL_A3191 CLL_A3192     FALSE 0.062 509.000 0.000 0.017 Y NA
 5740384 5740385 CLL_A3192 CLL_A3193     FALSE 0.065 214.000 0.000 1.000   NA
 5740385 5740386 CLL_A3193 CLL_A3194     FALSE 0.335 54.000 0.000 1.000   NA
 5740386 5740387 CLL_A3194 CLL_A3195     FALSE 0.008 507.000 0.000 0.063   NA
 5740387 5740388 CLL_A3195 CLL_A3196     FALSE 0.031 256.000 0.000 NA   NA
 5740388 5740389 CLL_A3196 CLL_A3197     FALSE 0.011 369.000 0.000 NA   NA
 5740389 5740390 CLL_A3197 CLL_A3198     FALSE 0.035 253.000 0.000 1.000   NA
 5740390 5740391 CLL_A3198 CLL_A3199     TRUE 0.992 15.000 0.267 1.000 Y NA
 5740391 5740392 CLL_A3199 CLL_A3200     FALSE 0.017 307.000 0.000 NA   NA
 5740392 5740393 CLL_A3200 CLL_A3201     FALSE 0.012 357.000 0.000 NA   NA
 5740393 5740394 CLL_A3201 CLL_A3202     FALSE 0.019 296.000 0.000 NA   NA
 5740394 5740395 CLL_A3202 CLL_A3203     FALSE 0.010 371.000 0.000 NA   NA
 5740395 5740396 CLL_A3203 CLL_A3204     FALSE 0.484 32.000 0.000 NA   NA
 5740396 5740397 CLL_A3204 CLL_A3205     FALSE 0.026 304.000 0.000 0.001   NA
 5740398 5740399 CLL_A3206 CLL_A3207     FALSE 0.031 256.000 0.000 NA   NA
 5740399 5740400 CLL_A3207 CLL_A3208     FALSE 0.021 295.000 0.000 1.000   NA
 5740401 5740402 CLL_A3209 CLL_A3210 trx gidA FALSE 0.289 114.000 0.000 1.000   NA
 5740404 5740405 CLL_A3212 CLL_A3213   gltA FALSE 0.004 553.000 0.000 1.000 N NA
 5740405 5740406 CLL_A3213 CLL_A3214 gltA   TRUE 0.992 0.000 0.667 0.029 N NA
 5740406 5740407 CLL_A3214 CLL_A3215     FALSE 0.263 249.000 0.000 1.000 Y NA
 5740407 5740408 CLL_A3215 CLL_A3216     FALSE 0.005 431.000 0.000 1.000 N NA
 5740408 5740409 CLL_A3216 CLL_A3217     FALSE 0.019 306.000 0.000 1.000   NA
 5740409 5740410 CLL_A3217 CLL_A3218     FALSE 0.012 351.000 0.000 NA   NA
 5740410 5740411 CLL_A3218 CLL_A3219   prfC FALSE 0.011 362.000 0.000 NA   NA
 5740411 5740412 CLL_A3219 CLL_A3220 prfC   FALSE 0.007 435.000 0.000 NA   NA
 5740412 5740413 CLL_A3220 CLL_A3221     FALSE 0.263 97.000 0.000 NA   NA
 5740413 5740414 CLL_A3221 CLL_A3222     FALSE 0.020 293.000 0.000 NA   NA
 5740414 5740415 CLL_A3222 CLL_A3223     FALSE 0.382 44.000 0.000 NA   NA
 5740415 5740416 CLL_A3223 CLL_A3224     FALSE 0.005 656.000 0.000 NA   NA
 5740416 5740417 CLL_A3224 CLL_A3225     FALSE 0.205 150.000 0.000 NA   NA
 5740417 5740418 CLL_A3225 CLL_A3226     FALSE 0.052 224.000 0.000 NA   NA
 5740418 5740419 CLL_A3226 CLL_A3227     FALSE 0.022 287.000 0.000 NA   NA
 5740419 5740420 CLL_A3227 CLL_A3228     FALSE 0.007 484.000 0.000 NA   NA
 5740420 5740421 CLL_A3228 CLL_A3229     FALSE 0.258 123.000 0.000 NA   NA
 5740421 5740422 CLL_A3229 CLL_A3230     FALSE 0.005 603.000 0.000 NA   NA
 5740422 5740423 CLL_A3230 CLL_A3231     FALSE 0.020 293.000 0.000 NA   NA
 5740423 5740424 CLL_A3231 CLL_A3232     FALSE 0.008 419.000 0.000 NA   NA
 5740424 5740425 CLL_A3232 CLL_A3233     FALSE 0.007 477.000 0.000 NA   NA
 5740427 5740428 CLL_A3235 CLL_A3236     FALSE 0.009 386.000 0.000 NA   NA
 5740428 5740429 CLL_A3236 CLL_A3237     FALSE 0.055 220.000 0.000 NA   NA
 5740429 5740430 CLL_A3237 CLL_A3238     FALSE 0.036 247.000 0.000 NA   NA
 5740430 5740431 CLL_A3238 CLL_A3239     TRUE 0.987 -7.000 0.250 0.063   NA
 5740431 5740432 CLL_A3239 CLL_A3240     TRUE 0.774 4.000 0.000 1.000   NA
 5740432 5740433 CLL_A3240 CLL_A3241     TRUE 0.941 11.000 0.065 1.000 N NA
 5740433 5740434 CLL_A3241 CLL_A3242     TRUE 0.970 3.000 0.000 NA Y NA
 5740434 5740435 CLL_A3242 CLL_A3243     TRUE 0.975 17.000 0.018 NA Y NA
 5740435 5740436 CLL_A3243 CLL_A3244     FALSE 0.317 54.000 0.000 NA   NA
 5740436 5740437 CLL_A3244 CLL_A3245     TRUE 0.722 11.000 0.000 NA   NA
 5740437 5740438 CLL_A3245 CLL_A3246     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5740438 5740439 CLL_A3246 CLL_A3247     TRUE 0.808 0.000 0.000 1.000   NA
 5740439 5740440 CLL_A3247 CLL_A3248     TRUE 0.654 17.000 0.000 0.081 N NA
 5740440 5740441 CLL_A3248 CLL_A3249   rfbD FALSE 0.051 572.000 0.000 1.000 Y NA
 5740441 5740442 CLL_A3249 CLL_A3250 rfbD   TRUE 0.937 13.000 0.056 NA   NA
 5740442 5740443 CLL_A3250 CLL_A3251   rfbB TRUE 0.970 -13.000 0.054 NA   NA
 5740443 5740444 CLL_A3251 CLL_A3252 rfbB rfbC TRUE 0.928 117.000 0.106 1.000 Y NA
 5740444 5740445 CLL_A3252 CLL_A3253 rfbC rfbA TRUE 0.956 45.000 0.115 1.000 Y NA
 5740446 5740447 CLL_A3254 CLL_A3255     FALSE 0.006 487.000 0.000 NA   NA
 5740448 5740449 CLL_A3256 CLL_A3257     FALSE 0.077 199.000 0.000 NA   NA
 5740449 5740450 CLL_A3257 CLL_A3258     FALSE 0.005 720.000 0.000 NA   NA
 5740452 5740453 CLL_A3260 CLL_A3261     FALSE 0.011 372.000 0.000 1.000   NA
 5740453 5740454 CLL_A3261 CLL_A3262     TRUE 0.844 196.000 0.308 1.000 Y NA
 5740454 5740455 CLL_A3262 CLL_A3263     FALSE 0.174 299.000 0.154 NA   NA
 5740455 5740456 CLL_A3263 CLL_A3264     TRUE 0.739 139.000 0.115 NA   NA
 5740456 5740457 CLL_A3264 CLL_A3265     TRUE 0.712 193.000 0.431 0.012   NA
 5740457 5740458 CLL_A3265 CLL_A3266     TRUE 0.849 95.000 0.235 0.012   NA
 5740458 5740459 CLL_A3266 CLL_A3267     TRUE 0.714 167.000 0.214 1.000   NA
 5740462 5740463 CLL_A3270 CLL_A3271     FALSE 0.205 150.000 0.000 NA   NA
 5740464 5740465 CLL_A3272 CLL_A3273     TRUE 0.986 -13.000 0.222 NA   NA
 5740465 5740466 CLL_A3273 CLL_A3274     FALSE 0.006 505.000 0.000 NA   NA
 5740466 5740467 CLL_A3274 CLL_A3275     FALSE 0.081 197.000 0.000 NA   NA
 5740469 5740470 CLL_A3277 CLL_A3278     FALSE 0.007 383.000 0.000 1.000 N NA
 5740470 5740471 CLL_A3278 CLL_A3279     TRUE 0.998 -13.000 0.640 1.000 Y NA
 5740471 5740472 CLL_A3279 CLL_A3280     TRUE 0.799 85.000 0.000 0.017 Y NA
 5740472 5740473 CLL_A3280 CLL_A3281     FALSE 0.010 384.000 0.000 1.000   NA
 5740473 5740474 CLL_A3281 CLL_A3282     FALSE 0.235 374.000 0.583 0.080   NA
 5740474 5740475 CLL_A3282 CLL_A3283     TRUE 0.879 45.000 0.182 NA   NA
 5740475 5740476 CLL_A3283 CLL_A3284   lepB TRUE 0.791 134.000 0.182 NA   NA
 5740476 5740477 CLL_A3284 CLL_A3285 lepB lepB TRUE 0.807 67.000 0.000 0.001 Y NA
 5740477 5740478 CLL_A3285 CLL_A3286 lepB lysA FALSE 0.017 277.000 0.000 1.000 N NA
 5740478 5740479 CLL_A3286 CLL_A3287 lysA   FALSE 0.015 320.000 0.000 NA   NA
 5740479 5740480 CLL_A3287 CLL_A3288     FALSE 0.032 255.000 0.000 NA   NA
 5740480 5740481 CLL_A3288 CLL_A3289     FALSE 0.262 96.000 0.000 NA   NA
 5740481 5740482 CLL_A3289 CLL_A3290     FALSE 0.006 560.000 0.000 NA   NA
 5740482 5740483 CLL_A3290 CLL_A3291     FALSE 0.053 227.000 0.000 1.000   NA
 5740485 5740486 CLL_A3293 CLL_A3294     TRUE 0.798 136.000 0.200 NA   NA
 5740486 5740487 CLL_A3294 CLL_A3295     TRUE 0.965 26.000 0.400 NA   NA
 5740487 5740488 CLL_A3295 CLL_A3296     TRUE 0.986 -3.000 0.300 NA   NA
 5740488 5740489 CLL_A3296 CLL_A3297     TRUE 0.979 11.000 0.333 NA   NA
 5740489 5740490 CLL_A3297 CLL_A3298     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 5740490 5740491 CLL_A3298 CLL_A3299     TRUE 0.954 15.000 0.111 NA   NA
 5740491 5740492 CLL_A3299 CLL_A3300     FALSE 0.212 268.000 0.000 NA Y NA
 5740492 5740493 CLL_A3300 CLL_A3301     FALSE 0.141 311.000 0.000 NA Y NA
 5740493 5740494 CLL_A3301 CLL_A3302     TRUE 0.936 108.000 0.141 1.000 Y NA
 5740494 5740495 CLL_A3302 CLL_A3303     TRUE 0.892 61.000 0.025 1.000 Y NA
 5740495 5740496 CLL_A3303 CLL_A3304     FALSE 0.006 512.000 0.000 NA   NA
 5740496 5740497 CLL_A3304 CLL_A3305     FALSE 0.014 332.000 0.000 NA   NA
 5740497 5740498 CLL_A3305 CLL_A3306     TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   NA
 5740498 5740499 CLL_A3306 CLL_A3307     TRUE 0.991 0.000 0.667 1.000 N NA
 5740499 5740500 CLL_A3307 CLL_A3308     FALSE 0.010 377.000 0.000 NA   NA
 5740502 5740503 CLL_A3310 CLL_A3311     TRUE 0.766 195.000 0.088 0.001 Y NA
 5740503 5740504 CLL_A3311 CLL_A3312     TRUE 0.840 132.000 0.287 NA   NA
 5740504 5740505 CLL_A3312 CLL_A3313     FALSE 0.012 352.000 0.000 NA   NA
 5740507 5740508 CLL_A3315 CLL_A3316     FALSE 0.042 238.000 0.000 NA   NA
 5740508 5740509 CLL_A3316 CLL_A3317     FALSE 0.261 95.000 0.000 NA   NA
 5740509 5740510 CLL_A3317 CLL_A3318     FALSE 0.004 1243.000 0.000 NA   NA
 5740510 5740511 CLL_A3318 CLL_A3319   luxS TRUE 0.943 -16.000 0.010 1.000 N NA
 5740511 5740512 CLL_A3319 CLL_A3320 luxS   TRUE 0.960 -7.000 0.048 1.000 N NA
 5740512 5740513 CLL_A3320 CLL_A3321     TRUE 0.879 18.000 0.021 1.000 N NA
 5740513 5740514 CLL_A3321 CLL_A3322     FALSE 0.003 841.000 0.000 1.000 N NA
 5740514 5740515 CLL_A3322 CLL_A3323     FALSE 0.207 81.000 0.000 1.000 N NA
 5740515 5740516 CLL_A3323 CLL_A3324     TRUE 0.965 19.000 0.250 NA   NA
 5740516 5740517 CLL_A3324 CLL_A3325     FALSE 0.187 157.000 0.000 NA   NA
 5740517 5740518 CLL_A3325 CLL_A3326     FALSE 0.007 444.000 0.000 NA   NA
 5740518 5740519 CLL_A3326 CLL_A3327     TRUE 0.997 -6.000 0.471 0.029 Y NA
 5740519 5740520 CLL_A3327 CLL_A3328     TRUE 0.997 2.000 0.500 0.029 Y NA
 5740520 5740521 CLL_A3328 CLL_A3329     FALSE 0.519 123.000 0.002 1.000   NA
 5740521 5740522 CLL_A3329 CLL_A3330   rumA FALSE 0.063 215.000 0.000 1.000   NA
 5740522 5740523 CLL_A3330 CLL_A3331 rumA   FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 5740523 5740524 CLL_A3331 CLL_A3332     FALSE 0.005 661.000 0.000 NA   NA
 5740524 5740525 CLL_A3332 CLL_A3333   xylB FALSE 0.447 35.000 0.000 NA   NA
 5740525 5740526 CLL_A3333 CLL_A3334 xylB   FALSE 0.458 186.000 0.083 1.000 N NA
 5740526 5740527 CLL_A3334 CLL_A3335     FALSE 0.034 230.000 0.000 1.000 N NA
 5740527 5740528 CLL_A3335 CLL_A3336   pyk FALSE 0.048 653.000 0.000 1.000 Y NA
 5740528 5740529 CLL_A3336 CLL_A3337 pyk pfkA TRUE 0.890 60.000 0.011 0.004 Y NA
 5740529 5740530 CLL_A3337 CLL_A3338 pfkA   FALSE 0.040 379.000 0.029 1.000 N NA
 5740530 5740531 CLL_A3338 CLL_A3339     FALSE 0.020 458.000 0.002 NA   NA
 5740531 5740532 CLL_A3339 CLL_A3340     FALSE 0.097 259.000 0.009 NA   NA
 5740532 5740533 CLL_A3340 CLL_A3341     TRUE 0.980 16.000 0.470 NA   NA
 5740533 5740534 CLL_A3341 CLL_A3342     TRUE 0.985 -3.000 0.259 NA   NA
 5740534 5740535 CLL_A3342 CLL_A3343   murB FALSE 0.104 325.000 0.080 NA   NA
 5740535 5740536 CLL_A3343 CLL_A3344 murB uvrC FALSE 0.488 73.000 0.003 1.000 N NA
 5740536 5740537 CLL_A3344 CLL_A3345 uvrC   FALSE 0.088 251.000 0.005 1.000 N NA
 5740537 5740538 CLL_A3345 CLL_A3346     TRUE 0.980 3.000 0.285 1.000 N NA
 5740538 5740539 CLL_A3346 CLL_A3347     TRUE 0.777 52.000 0.070 NA   NA
 5740539 5740540 CLL_A3347 CLL_A3348   uvrA FALSE 0.029 374.000 0.002 NA   NA
 5740540 5740541 CLL_A3348 CLL_A3349 uvrA uvrB TRUE 0.993 5.000 0.154 0.001 Y NA
 5740541 5740542 CLL_A3349 CLL_A3350 uvrB   FALSE 0.035 392.000 0.013 1.000   NA
 5740542 5740543 CLL_A3350 CLL_A3351     TRUE 0.951 11.000 0.060 0.006   NA
 5740543 5740544 CLL_A3351 CLL_A3352     FALSE 0.033 376.000 0.015 1.000 N NA
 5740544 5740545 CLL_A3352 CLL_A3353   ftsE TRUE 0.997 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 5740545 5740546 CLL_A3353 CLL_A3354 ftsE   FALSE 0.565 118.000 0.010 NA   NA
 5740546 5740547 CLL_A3354 CLL_A3355     FALSE 0.129 346.000 0.167 NA   NA
 5740547 5740548 CLL_A3355 CLL_A3356     TRUE 0.995 0.000 0.180 0.002 Y NA
 5740548 5740549 CLL_A3356 CLL_A3357     FALSE 0.082 395.000 0.000 1.000 Y NA
 5740549 5740550 CLL_A3357 CLL_A3358     TRUE 0.994 27.000 0.875 0.012 Y NA
 5740550 5740551 CLL_A3358 CLL_A3359     TRUE 0.953 98.000 0.250 0.012 Y NA
 5740551 5740552 CLL_A3359 CLL_A3360     TRUE 0.939 25.000 0.000 0.008 Y NA
 5740552 5740553 CLL_A3360 CLL_A3361     FALSE 0.006 540.000 0.000 0.012 N NA
 5740553 5740554 CLL_A3361 CLL_A3362     FALSE 0.216 268.000 0.000 1.000 Y NA
 5740554 5740555 CLL_A3362 CLL_A3363     TRUE 0.973 10.000 0.221 NA   NA
 5740555 5740556 CLL_A3363 CLL_A3364     FALSE 0.010 371.000 0.000 NA   NA
 5740556 5740557 CLL_A3364 CLL_A3365     TRUE 0.718 66.000 0.064 NA   NA
 5740557 5740558 CLL_A3365 CLL_A3366   acpS TRUE 0.926 2.000 0.020 NA N NA
 5740558 5740559 CLL_A3366 CLL_A3367 acpS   TRUE 0.603 74.000 0.020 NA   NA
 5740559 5740560 CLL_A3367 CLL_A3368     FALSE 0.005 662.000 0.000 NA   NA
 5740560 5740561 CLL_A3368 CLL_A3369     TRUE 0.803 72.000 0.150 1.000   NA
 5740561 5740562 CLL_A3369 CLL_A3370     FALSE 0.013 358.000 0.000 1.000   NA
 5740562 5740563 CLL_A3370 CLL_A3371     TRUE 0.944 1.000 0.023 1.000   NA
 5740563 5740564 CLL_A3371 CLL_A3372     TRUE 0.930 14.000 0.045 1.000   NA
 5740564 5740565 CLL_A3372 CLL_A3373     FALSE 0.010 393.000 0.000 1.000   NA
 5740565 5740566 CLL_A3373 CLL_A3374     FALSE 0.005 1156.000 0.000 1.000   NA
 5740566 5740567 CLL_A3374 CLL_A3375     TRUE 0.968 2.000 0.078 0.003   NA
 5740567 5740568 CLL_A3375 CLL_A3376     FALSE 0.041 239.000 0.000 NA   NA
 5740574 5740575 CLL_A3382 CLL_A3383   rrfM TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5740575 5740576 CLL_A3383 CLL_A3384 rrfM   FALSE 0.044 234.000 0.000 NA   NA
 5740576 5740577 CLL_A3384 CLL_A3385     FALSE 0.009 388.000 0.000 NA   NA
 5740577 5740578 CLL_A3385 CLL_A3386     FALSE 0.269 68.000 0.000 NA   NA
 5740580 5740581 CLL_A3388 CLL_A3389   lpdA TRUE 0.980 -7.000 0.167 1.000 N NA
 5740581 5740582 CLL_A3389 CLL_A3390 lpdA   TRUE 0.804 92.000 0.167 NA   NA
 5740582 5740583 CLL_A3390 CLL_A3391     TRUE 0.857 104.000 0.286 NA   NA
 5740583 5740584 CLL_A3391 CLL_A3392     FALSE 0.041 239.000 0.000 NA   NA
 5740586 5740587 CLL_A3394 CLL_A3395     FALSE 0.041 239.000 0.000 NA   NA
 5740587 5740588 CLL_A3395 CLL_A3396     TRUE 0.598 24.000 0.000 NA   NA
 5740588 5740589 CLL_A3396 CLL_A3397     FALSE 0.177 289.000 0.000 1.000 Y NA
 5740589 5740590 CLL_A3397 CLL_A3398     TRUE 0.584 119.000 0.015 NA   NA
 5740590 5740591 CLL_A3398 CLL_A3399   fusA FALSE 0.414 171.000 0.021 NA   NA
 5740592 5740593 CLL_A3400 CLL_A3401     FALSE 0.077 199.000 0.000 NA   NA
 5740594 5740595 CLL_A3402 CLL_A3403     FALSE 0.045 232.000 0.000 NA   NA
 5740595 5740596 CLL_A3403 CLL_A3404     TRUE 0.629 195.000 0.333 NA   NA
 5740598 5740599 CLL_A3406 CLL_A3407     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5740599 5740600 CLL_A3407 CLL_A3408   rrfD TRUE 0.732 9.000 0.000 NA   NA
 5740600 5740601 CLL_A3408 CLL_A3409 rrfD rrlD FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5740601 5740602 CLL_A3409 CLL_A3411 rrlD rrsD FALSE 0.047 230.000 0.000 NA   NA
 5740602 5740603 CLL_A3411 CLL_A3412 rrsD glgD FALSE 0.004 899.000 0.000 NA   NA
 5740603 5740604 CLL_A3412 CLL_A3413 glgD glgC TRUE 0.991 22.000 0.309 0.001 Y NA
 5740604 5740605 CLL_A3413 CLL_A3414 glgC   TRUE 0.904 110.000 0.049 1.000 Y NA
 5740605 5740606 CLL_A3414 CLL_A3415     TRUE 0.899 166.000 0.186 0.015 Y NA
 5740606 5740607 CLL_A3415 CLL_A3416     TRUE 0.975 31.000 0.143 1.000 Y NA
 5740607 5740608 CLL_A3416 CLL_A3417   glgB TRUE 0.877 142.000 0.050 1.000 Y NA
 5740608 5740609 CLL_A3417 CLL_A3418 glgB rrfE FALSE 0.005 667.000 0.000 NA   NA
 5740609 5740610 CLL_A3418 CLL_A3419 rrfE rrlE FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5740610 5740611 CLL_A3419 CLL_A3421 rrlE rrsE FALSE 0.047 230.000 0.000 NA   NA
 5740613 5740614 CLL_A3423 CLL_A3424     FALSE 0.027 244.000 0.000 1.000 N NA
 5740614 5740615 CLL_A3424 CLL_A3425     FALSE 0.029 241.000 0.000 1.000 N NA
 5740615 5740616 CLL_A3425 CLL_A3426     FALSE 0.260 122.000 0.000 NA   NA
 5740616 5740617 CLL_A3426 CLL_A3427     FALSE 0.044 234.000 0.000 NA   NA
 5740617 5740618 CLL_A3427 CLL_A3428     FALSE 0.006 418.000 0.000 1.000 N NA
 5740618 5740619 CLL_A3428 CLL_A3429     FALSE 0.006 510.000 0.000 NA   NA
 5740619 5740620 CLL_A3429 CLL_A3430     FALSE 0.006 510.000 0.000 NA   NA
 5740622 5740623 CLL_A3432 CLL_A3433     FALSE 0.120 179.000 0.000 NA   NA
 5740623 5740624 CLL_A3433 CLL_A3434     FALSE 0.397 242.000 0.286 NA   NA
 5740624 5740625 CLL_A3434 CLL_A3435   rfbC FALSE 0.005 627.000 0.000 1.000   NA
 5740625 5740626 CLL_A3435 CLL_A3436 rfbC   FALSE 0.373 48.000 0.000 1.000   NA
 5740626 5740627 CLL_A3436 CLL_A3437     FALSE 0.014 326.000 0.000 NA   NA
 5740627 5740628 CLL_A3437 CLL_A3438     FALSE 0.066 384.000 0.072 NA   NA
 5740628 5740629 CLL_A3438 CLL_A3439     TRUE 0.919 27.000 0.110 0.040 N NA
 5740629 5740630 CLL_A3439 CLL_A3440     FALSE 0.005 716.000 0.000 NA   NA
 5740630 5740631 CLL_A3440 CLL_A3441     FALSE 0.265 88.000 0.000 NA   NA
 5740631 5740632 CLL_A3441 CLL_A3442     TRUE 0.955 1.000 0.047 NA   NA
 5740632 5740633 CLL_A3442 CLL_A3443     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 5740633 5740634 CLL_A3443 CLL_A3444     TRUE 0.972 22.000 0.417 NA   NA
 5740634 5740635 CLL_A3444 CLL_A3445   recR FALSE 0.250 234.000 0.071 NA   NA
 5740635 5740636 CLL_A3445 CLL_A3446 recR   FALSE 0.504 250.000 0.604 NA   NA
 5740636 5740637 CLL_A3446 CLL_A3447   dnaX TRUE 0.762 79.000 0.100 NA   NA
 5740638 5740639 CLL_A3448 CLL_A3449 thyA folA TRUE 0.858 28.000 0.046 1.000 N NA
 5740640 5740641 CLL_A3605 CLL_A3450 srpB   FALSE 0.006 520.000 0.000 NA   NA
 5740641 5740642 CLL_A3450 CLL_A3451     FALSE 0.114 182.000 0.000 NA   NA
 5740642 5740643 CLL_A3451 CLL_A3452     FALSE 0.116 181.000 0.000 NA   NA
 5740643 5740644 CLL_A3452 CLL_A3453     FALSE 0.266 78.000 0.000 0.015 N NA
 5740644 5740645 CLL_A3453 CLL_A3454     TRUE 0.601 56.000 0.005 1.000   NA
 5740645 5740646 CLL_A3454 CLL_A3455     FALSE 0.022 291.000 0.000 1.000   NA
 5740646 5740647 CLL_A3455 CLL_A3456     TRUE 0.995 -7.000 0.174 1.000 Y NA
 5740647 5740648 CLL_A3456 CLL_A3457     TRUE 0.922 19.000 0.070 1.000 N NA
 5740648 5740649 CLL_A3457 CLL_A3458     FALSE 0.412 177.000 0.042 1.000 N NA
 5740649 5740650 CLL_A3458 CLL_A3459     FALSE 0.005 593.000 0.000 NA   NA
 5740650 5740651 CLL_A3459 CLL_A3460     FALSE 0.043 235.000 0.000 NA   NA
 5740651 5740652 CLL_A3460 CLL_A3461     FALSE 0.003 978.000 0.000 NA N NA
 5740652 5740653 CLL_A3461 CLL_A3462     TRUE 0.783 3.000 0.000 1.000   NA
 5740653 5740654 CLL_A3462 CLL_A3463     TRUE 0.847 -3.000 0.000 0.061   NA
 5740654 5740655 CLL_A3463 CLL_A3464     FALSE 0.322 53.000 0.000 NA   NA
 5740655 5740656 CLL_A3464 CLL_A3465     FALSE 0.007 439.000 0.000 NA   NA
 5740656 5740657 CLL_A3465 CLL_A3466     FALSE 0.055 219.000 0.000 NA   NA
 5740657 5740658 CLL_A3466 CLL_A3467     FALSE 0.010 381.000 0.000 NA   NA
 5740658 5740659 CLL_A3467 CLL_A3468     TRUE 0.616 22.000 0.000 NA   NA
 5740660 5740661 CLL_A3469 CLL_A3470     FALSE 0.144 156.000 0.000 1.000 N NA
 5740662 5740663 CLL_A3471 CLL_A3472     FALSE 0.266 101.000 0.000 NA   NA
 5740663 5740664 CLL_A3472 CLL_A3473     FALSE 0.142 171.000 0.000 NA   NA
 5740664 5740665 CLL_A3473 CLL_A3474     FALSE 0.065 208.000 0.000 NA   NA
 5740667 5740668 CLL_A3476 CLL_A3477   dapA FALSE 0.009 353.000 0.000 1.000 N NA
 5740670 5740671 CLL_A3479 CLL_A3480     FALSE 0.268 83.000 0.000 NA   NA
 5740671 5740672 CLL_A3480 CLL_A3481   rrfF FALSE 0.098 190.000 0.000 NA   NA
 5740672 5740673 CLL_A3481 CLL_A3482 rrfF rrlF FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5740673 5740674 CLL_A3482 CLL_A3484 rrlF rrsF FALSE 0.047 230.000 0.000 NA   NA
 5740674 5740675 CLL_A3484 CLL_A3485 rrsF rrfG FALSE 0.004 883.000 0.000 NA   NA
 5740675 5740676 CLL_A3485 CLL_A3486 rrfG rrlG FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5740676 5740677 CLL_A3486 CLL_A3488 rrlG rrsG FALSE 0.047 230.000 0.000 NA   NA
 5740677 5740678 CLL_A3488 CLL_A3489 rrsG   FALSE 0.004 1841.000 0.000 NA   NA
 5740678 5740679 CLL_A3489 CLL_A3490   rrfH TRUE 0.828 -8.000 0.000 NA   NA
 5740679 5740680 CLL_A3490 CLL_A3491 rrfH rrlH FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5740680 5740681 CLL_A3491 CLL_A3493 rrlH rrsH FALSE 0.047 230.000 0.000 NA   NA
 5740681 5740682 CLL_A3493 CLL_A3494 rrsH   FALSE 0.005 619.000 0.000 NA   NA
 5740682 5740683 CLL_A3494 CLL_A3495   rrfI FALSE 0.015 322.000 0.000 NA   NA
 5740683 5740684 CLL_A3495 CLL_A3496 rrfI rrlI FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5740684 5740685 CLL_A3496 CLL_A3498 rrlI rrsI FALSE 0.047 230.000 0.000 NA   NA
 5740685 5740686 CLL_A3498 CLL_A3499 rrsI rrfJ FALSE 0.004 1222.000 0.000 NA   NA
 5740686 5740687 CLL_A3499 CLL_A3500 rrfJ rrlJ FALSE 0.298 58.000 0.000 NA   NA
 5740687 5740688 CLL_A3500 CLL_A3502 rrlJ rrsJ FALSE 0.075 201.000 0.000 NA   NA
 5740688 5740689 CLL_A3502 CLL_A3503 rrsJ   FALSE 0.024 278.000 0.000 NA   NA
 5740689 5740690 CLL_A3503 CLL_A3504     FALSE 0.461 34.000 0.000 NA   NA
 5740691 5740692 CLL_A3505 CLL_A3506     TRUE 0.706 15.000 0.000 1.000   NA
 5740693 5740694 CLL_A3507 CLL_A3508   rrfN TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5740694 5740695 CLL_A3508 CLL_A3509 rrfN motB FALSE 0.025 274.000 0.000 NA   NA
 5740695 5740696 CLL_A3509 CLL_A3510 motB   TRUE 0.992 5.000 0.144 1.000 Y NA
 5740696 5740697 CLL_A3510 CLL_A3511     FALSE 0.011 319.000 0.000 1.000 N NA
 5740697 5740698 CLL_A3511 CLL_A3512     FALSE 0.008 414.000 0.000 NA   NA
 5740698 5740699 CLL_A3512 CLL_A3513   rrfK TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5740699 5740700 CLL_A3513 CLL_A3514 rrfK rrlK FALSE 0.248 128.000 0.000 NA   NA
 5740700 5740701 CLL_A3514 CLL_A3516 rrlK rrsK FALSE 0.047 230.000 0.000 NA   NA
 5740701 5740702 CLL_A3516 CLL_A3517 rrsK   FALSE 0.005 642.000 0.000 NA   NA
 5740702 5740703 CLL_A3517 CLL_A3518     TRUE 0.996 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 5740703 5740704 CLL_A3518 CLL_A3519     FALSE 0.277 121.000 0.000 1.000   NA
 5740704 5740705 CLL_A3519 CLL_A3520     TRUE 0.995 -10.000 0.800 1.000   NA
 5740705 5740706 CLL_A3520 CLL_A3521     FALSE 0.011 316.000 0.000 1.000 N NA
 5740706 5740707 CLL_A3521 CLL_A3522     FALSE 0.040 244.000 0.000 1.000   NA
 5740707 5740708 CLL_A3522 CLL_A3523     FALSE 0.075 205.000 0.000 1.000   NA
 5740708 5740709 CLL_A3523 CLL_A3524     FALSE 0.017 310.000 0.000 NA   NA
 5740709 5740710 CLL_A3524 CLL_A3525     FALSE 0.061 213.000 0.000 NA   NA
 5740710 5740711 CLL_A3525 CLL_A3526     TRUE 0.974 2.000 0.148 NA   NA
 5740711 5740712 CLL_A3526 CLL_A3527     TRUE 0.940 19.000 0.095 NA   NA
 5740712 5740713 CLL_A3527 CLL_A3528     FALSE 0.009 386.000 0.000 NA   NA
 5740713 5740714 CLL_A3528 CLL_A3529     TRUE 0.958 17.000 0.000 0.002 Y NA
 5740714 5740715 CLL_A3529 CLL_A3530     FALSE 0.283 79.000 0.000 1.000   NA
 5740715 5740716 CLL_A3530 CLL_A3531     TRUE 0.716 72.000 0.052 0.012   NA
 5740716 5740717 CLL_A3531 CLL_A3532     TRUE 0.987 3.000 0.026 0.007 Y NA
 5740717 5740718 CLL_A3532 CLL_A3533     TRUE 0.982 15.000 0.500 0.007 N NA
 5740718 5740719 CLL_A3533 CLL_A3534     FALSE 0.003 689.000 0.000 1.000 N NA
 5740719 5740720 CLL_A3534 CLL_A3535     TRUE 0.821 150.000 0.364 1.000 N NA
 5740720 5740721 CLL_A3535 CLL_A3536     FALSE 0.029 263.000 0.000 NA   NA
 5740721 5740722 CLL_A3536 CLL_A3537     TRUE 0.987 0.000 0.364 NA   NA
 5740722 5740723 CLL_A3537 CLL_A3538     FALSE 0.015 290.000 0.000 1.000 N NA
 5740723 5740724 CLL_A3538 CLL_A3539     TRUE 0.991 -7.000 0.041 NA Y NA
 5740726 5740727 CLL_A3541 CLL_A3542     FALSE 0.248 128.000 0.000 NA   NA
 5740727 5740728 CLL_A3542 CLL_A3543     TRUE 0.991 0.000 0.077 1.000 Y NA
 5740730 5740731 CLL_A3545 CLL_A3546     FALSE 0.014 330.000 0.000 NA   NA
 5740731 5740732 CLL_A3546 CLL_A3547     FALSE 0.127 176.000 0.000 NA   NA
 5740732 5740733 CLL_A3547 CLL_A3548     FALSE 0.137 172.000 0.000 NA   NA
 5740733 5740734 CLL_A3548 CLL_A3549     FALSE 0.120 179.000 0.000 NA   NA
 5740734 5740735 CLL_A3549 CLL_A3550     FALSE 0.009 394.000 0.000 NA   NA
 5740735 5740736 CLL_A3550 CLL_A3551     FALSE 0.562 66.000 0.008 NA   NA
 5740736 5740737 CLL_A3551 CLL_A3552   murA TRUE 0.842 35.000 0.058 1.000   NA
 5740738 5740739 CLL_A3553 CLL_A3554     FALSE 0.467 175.000 0.049 NA   NA
 5740739 5740740 CLL_A3554 CLL_A3555     TRUE 0.600 189.000 0.220 NA   NA
 5740740 5740741 CLL_A3555 CLL_A3556     TRUE 0.786 58.000 0.097 NA   NA
 5740741 5740742 CLL_A3556 CLL_A3557     TRUE 0.786 120.000 0.125 1.000   NA
 5740744 5740745 CLL_A3559 CLL_A3560     TRUE 0.998 -7.000 0.600 NA Y NA
 5740746 5740747 CLL_A3561 CLL_A3562     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 5740747 5740748 CLL_A3562 CLL_A3563     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5740748 5740749 CLL_A3563 CLL_A3564     FALSE 0.542 28.000 0.000 NA   NA
 5740749 5740750 CLL_A3564 CLL_A3565     TRUE 0.735 8.000 0.000 NA   NA
 5740750 5740751 CLL_A3565 CLL_A3566     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5740751 5740752 CLL_A3566 CLL_A3567     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5740752 5740753 CLL_A3567 CLL_A3568     FALSE 0.510 30.000 0.000 NA   NA
 5740753 5740754 CLL_A3568 CLL_A3569     TRUE 0.735 8.000 0.000 NA   NA
 5740754 5740755 CLL_A3569 CLL_A3570     TRUE 0.752 5.000 0.000 NA   NA
 5740755 5740756 CLL_A3570 CLL_A3571     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5740756 5740757 CLL_A3571 CLL_A3572     FALSE 0.272 115.000 0.000 NA   NA
 5740759 5740760 CLL_A3574 CLL_A3575     FALSE 0.068 206.000 0.000 NA   NA
 5740760 5740761 CLL_A3575 CLL_A3576   purA FALSE 0.529 103.000 0.003 NA   NA
 5740765 5740766 CLL_A3580 CLL_A3581 dnaB lonC TRUE 0.685 87.000 0.053 0.077 N NA
 5740766 5740767 CLL_A3581 CLL_A3582 lonC rplI TRUE 0.894 16.000 0.024 1.000 N NA
 5740767 5740768 CLL_A3582 CLL_A3583 rplI   TRUE 0.967 3.000 0.119 1.000 N NA
 5740768 5740769 CLL_A3583 CLL_A3584     TRUE 0.892 24.000 0.043 NA   NA
 5740769 5740770 CLL_A3584 CLL_A3585   rpsR FALSE 0.300 189.000 0.015 NA   NA
 5740770 5740771 CLL_A3585 CLL_A3586 rpsR ssb TRUE 0.808 22.000 0.003 1.000 N NA
 5740771 5740772 CLL_A3586 CLL_A3587 ssb rpsF TRUE 0.857 14.000 0.003 1.000 N NA
 5740772 5740773 CLL_A3587 CLL_A3588 rpsF   TRUE 0.635 107.000 0.028 NA   NA
 5740773 5740774 CLL_A3588 CLL_A3589     TRUE 0.975 0.000 0.121 NA   NA
 5740774 5740775 CLL_A3589 CLL_A3590     TRUE 0.919 27.000 0.105 NA   NA
 5740776 5740777 CLL_A3591 CLL_A3592     TRUE 0.988 16.000 0.148 1.000 Y NA
 5740777 5740778 CLL_A3592 CLL_A3593     TRUE 0.645 98.000 0.035 NA   NA
 5740779 5740780 CLL_A3594 CLL_A3595     TRUE 0.789 41.000 0.047 NA   NA
 5740780 5740781 CLL_A3595 CLL_A3596     TRUE 0.988 13.000 0.827 1.000 N NA
 5740781 5740782 CLL_A3596 CLL_A3597     FALSE 0.442 183.000 0.069 1.000 N NA
 5740782 5740783 CLL_A3597 CLL_A3598   gidB FALSE 0.262 231.000 0.089 1.000 N NA
 5740783 5740784 CLL_A3598 CLL_A3599 gidB gidA TRUE 0.978 16.000 0.466 1.000 N NA
 5740784 5740785 CLL_A3599 CLL_A3600 gidA trmE TRUE 0.977 10.000 0.266 1.000   NA
 5740785 5740786 CLL_A3600 CLL_A3601 trmE   FALSE 0.122 331.000 0.116 1.000   NA
 5740786 5740787 CLL_A3601 CLL_A3602     FALSE 0.373 48.000 0.000 1.000   NA
 5740787 5740788 CLL_A3602 CLL_A3603   rnpA FALSE 0.048 207.000 0.000 1.000 N NA
 5740788 5740789 CLL_A3603 CLL_A3604 rnpA rpmH TRUE 0.934 63.000 0.787 1.000   NA
 5740790 5740791 CLL_0001 CLL_0002     FALSE 0.282 62.000 0.000 NA   NA
 5740791 5740792 CLL_0002 CLL_0003     TRUE 0.606 23.000 0.000 NA   NA
 5740792 5740793 CLL_0003 CLL_0004     TRUE 0.704 13.000 0.000 NA   NA
 5740793 5740794 CLL_0004 CLL_0005     TRUE 0.904 64.000 0.500 NA   NA
 5740794 5740795 CLL_0005 CLL_0006     TRUE 0.990 5.000 0.667 NA   NA
 5740795 5740796 CLL_0006 CLL_0007     TRUE 0.985 1.000 0.333 NA   NA
 5740796 5740797 CLL_0007 CLL_0008     TRUE 0.943 112.000 1.000 NA   NA
 5740797 5740798 CLL_0008 CLL_0009     TRUE 0.952 56.000 1.000 NA   NA
 5740798 5740799 CLL_0009 CLL_0010     TRUE 0.994 2.000 1.000 NA   NA
 5740799 5740800 CLL_0010 CLL_0011     TRUE 0.892 61.000 0.400 NA   NA
 5740800 5740801 CLL_0011 CLL_0012     TRUE 0.974 19.000 0.400 NA   NA
 5740801 5740802 CLL_0012 CLL_0013     FALSE 0.023 283.000 0.000 NA   NA
 5740802 5740803 CLL_0013 CLL_0014     TRUE 0.744 6.000 0.000 NA   NA
 5740803 5740804 CLL_0014 CLL_0015     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5740804 5740805 CLL_0015 CLL_0016     TRUE 0.571 26.000 0.000 NA   NA
 5740805 5740806 CLL_0016 CLL_0017     FALSE 0.275 65.000 0.000 NA   NA
 5740806 5740807 CLL_0017 CLL_0018     TRUE 0.606 23.000 0.000 NA   NA
 5740807 5740808 CLL_0018 CLL_0019     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 5740808 5740809 CLL_0019 CLL_0020     FALSE 0.073 202.000 0.000 NA   NA
 5740809 5740810 CLL_0020 CLL_0021     FALSE 0.268 81.000 0.000 NA   NA
 5740810 5740811 CLL_0021 CLL_0022     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 5740811 5740812 CLL_0022 CLL_0023     FALSE 0.375 45.000 0.000 NA   NA
 5740812 5740813 CLL_0023 CLL_0024     FALSE 0.406 39.000 0.000 NA   NA
 5740813 5740814 CLL_0024 CLL_0025     FALSE 0.010 382.000 0.000 NA   NA
 5740814 5740815 CLL_0025 CLL_0026     FALSE 0.496 31.000 0.000 NA   NA
 5740815 5740816 CLL_0026 CLL_0027     FALSE 0.263 97.000 0.000 NA   NA
 5740816 5740817 CLL_0027 CLL_0028     FALSE 0.266 74.000 0.000 NA   NA
 5740817 5740818 CLL_0028 CLL_0029     FALSE 0.005 572.000 0.000 NA   NA
 5740818 5740819 CLL_0029 CLL_0030     TRUE 0.616 22.000 0.000 NA   NA
 5740819 5740820 CLL_0030 CLL_0031     TRUE 0.843 -16.000 0.000 NA   NA
 5740820 5740821 CLL_0031 CLL_0032     FALSE 0.018 306.000 0.000 NA   NA
 5740822 5740823 CLL_0033 CLL_0034 ha70 ha17 TRUE 0.981 14.000 0.429 NA   NA
 5740823 5740824 CLL_0034 CLL_0035 ha17 ha33 TRUE 0.863 63.000 0.286 NA   NA
 5740825 5740826 CLL_0036 CLL_0037 botR ntnH TRUE 0.904 139.000 0.667 1.000   NA
 5740826 5740827 CLL_0037 CLL_0038 ntnH   TRUE 0.979 26.000 0.667 0.001   NA
 5740827 5740828 CLL_0038 CLL_0039     FALSE 0.005 663.000 0.000 NA   NA
 5740828 5740829 CLL_0039 CLL_0040     FALSE 0.261 121.000 0.000 NA   NA
 5740829 5740830 CLL_0040 CLL_0042     TRUE 0.650 171.000 0.000 0.001 Y NA
 5740830 5740831 CLL_0042 CLL_0044     FALSE 0.077 199.000 0.000 NA   NA
 5740831 5740832 CLL_0044 CLL_0045     FALSE 0.005 651.000 0.000 NA   NA
 5740832 5740833 CLL_0045 CLL_0046     FALSE 0.065 208.000 0.000 NA   NA
 5740833 5740834 CLL_0046 CLL_0047     FALSE 0.036 247.000 0.000 NA   NA
 5740834 5740835 CLL_0047 CLL_0048     TRUE 0.995 -7.000 1.000 NA   NA
 5740837 5740838 CLL_0050 CLL_0051     FALSE 0.388 55.000 0.000 0.015   NA
 5740838 5740839 CLL_0051 CLL_0052     FALSE 0.229 161.000 0.000 0.015   NA
 5740839 5740840 CLL_0052 CLL_0053     FALSE 0.266 73.000 0.000 NA   NA
 5740840 5740841 CLL_0053 CLL_0054     TRUE 0.722 11.000 0.000 NA   NA
 5740841 5740842 CLL_0054 CLL_0055     FALSE 0.263 97.000 0.000 NA   NA
 5740842 5740843 CLL_0055 CLL_0056     TRUE 0.713 12.000 0.000 NA   NA
 5740843 5740790 CLL_0056 CLL_0001     FALSE 0.266 119.000 0.000 NA   NA