MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli IAI39

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5888418 5888419 ECIAI39_misc_RNA_1 ECIAI39_4936   thrL TRUE 0.712 -71.000 0.000 NA   NA
 5888419 5888420 ECIAI39_4936 ECIAI39_0001 thrL thrA FALSE 0.268 81.000 0.043 1.000   NA
 5888420 5888421 ECIAI39_0001 ECIAI39_0002 thrA thrB TRUE 0.989 2.000 0.133 1.000 Y NA
 5888421 5888422 ECIAI39_0002 ECIAI39_0003 thrB thrC TRUE 0.994 1.000 0.233 1.000 Y NA
 5888422 5888423 ECIAI39_0003 ECIAI39_0004 thrC yaaX FALSE 0.016 214.000 0.003 NA   NA
 5888424 5888425 ECIAI39_0005 ECIAI39_0006 yaaA yaaJ FALSE 0.227 70.000 0.028 NA   NA
 5888426 5888427 ECIAI39_0008 ECIAI39_0009 talB mogA FALSE 0.098 115.000 0.042 1.000 N NA
 5888428 5888429 ECIAI39_0010 ECIAI39_0011 yaaH htpY FALSE 0.090 149.000 0.043 NA   NA
 5888429 5888430 ECIAI39_0011 ECIAI39_0012 htpY yaaI TRUE 0.946 26.000 0.500 NA   NA
 5888431 5888432 ECIAI39_0013 ECIAI39_misc_RNA_2 dnaK tpke11 TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5888432 5888433 ECIAI39_misc_RNA_2 ECIAI39_0014 tpke11 dnaJ TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5888433 5888434 ECIAI39_0014 ECIAI39_misc_RNA_3 dnaJ sokC FALSE 0.010 305.000 0.000 NA   NA
 5888434 5888435 ECIAI39_misc_RNA_3 ECIAI39_0015 sokC   FALSE 0.005 509.000 0.000 NA   NA
 5888435 5888436 ECIAI39_0015 ECIAI39_0016     TRUE 0.984 -16.000 0.571 NA   NA
 5888436 5888437 ECIAI39_0016 ECIAI39_0017     FALSE 0.232 94.000 0.000 NA   NA
 5888437 5888438 ECIAI39_0017 ECIAI39_0018   nhaA FALSE 0.019 252.000 0.000 NA   NA
 5888438 5888439 ECIAI39_0018 ECIAI39_0019 nhaA nhaR TRUE 0.670 60.000 0.292 1.000 N NA
 5888440 5888441 ECIAI39_0020 ECIAI39_0021     TRUE 0.783 13.000 0.000 1.000   NA
 5888441 5888442 ECIAI39_0021 ECIAI39_0022     TRUE 0.955 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5888442 5888443 ECIAI39_0022 ECIAI39_0023     TRUE 0.945 50.000 0.333 1.000 Y NA
 5888443 5888444 ECIAI39_0023 ECIAI39_0024     FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 5888444 5888445 ECIAI39_0024 ECIAI39_0025   rpsT FALSE 0.005 484.000 0.000 NA   NA
 5888446 5888447 ECIAI39_0026 ECIAI39_0027 ribF ileS TRUE 0.742 43.000 0.254 1.000 N NA
 5888447 5888448 ECIAI39_0027 ECIAI39_0028 ileS lspA TRUE 0.855 0.000 0.045 1.000 N NA
 5888448 5888449 ECIAI39_0028 ECIAI39_0029 lspA fkpB FALSE 0.350 88.000 0.154 1.000 N NA
 5888449 5888450 ECIAI39_0029 ECIAI39_0030 fkpB ispH TRUE 0.991 2.000 0.626 1.000 N NA
 5888450 5888451 ECIAI39_0030 ECIAI39_0031 ispH rihC FALSE 0.093 66.000 0.028 NA N NA
 5888451 5888452 ECIAI39_0031 ECIAI39_0032 rihC dapB FALSE 0.008 167.000 0.003 NA N NA
 5888452 5888453 ECIAI39_0032 ECIAI39_0033 dapB carA FALSE 0.029 456.000 0.034 1.000 Y NA
 5888453 5888454 ECIAI39_0033 ECIAI39_0034 carA carB TRUE 0.993 18.000 0.345 0.001 Y NA
 5888454 5888455 ECIAI39_0034 ECIAI39_0035 carB caiF FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 5888456 5888457 ECIAI39_0036 ECIAI39_0037 caiE caiD TRUE 0.871 6.000 0.000 1.000   NA
 5888457 5888458 ECIAI39_0037 ECIAI39_0038 caiD caiC TRUE 0.770 109.000 0.000 0.022 Y NA
 5888458 5888459 ECIAI39_0038 ECIAI39_0039 caiC caiB TRUE 0.683 58.000 0.154 0.022 N NA
 5888459 5888460 ECIAI39_0039 ECIAI39_0040 caiB caiA TRUE 0.620 129.000 0.529 1.000 N NA
 5888460 5888461 ECIAI39_0040 ECIAI39_0041 caiA caiT TRUE 0.620 31.000 0.118 1.000 N NA
 5888462 5888463 ECIAI39_0042 ECIAI39_0043 fixA fixB TRUE 0.989 15.000 0.231 0.013 Y NA
 5888463 5888464 ECIAI39_0043 ECIAI39_0044 fixB fixC TRUE 0.893 51.000 0.000 0.052 Y NA
 5888464 5888465 ECIAI39_0044 ECIAI39_0045 fixC fixX TRUE 0.997 -3.000 0.167 0.052 Y NA
 5888465 5888466 ECIAI39_0045 ECIAI39_0046 fixX yaaU FALSE 0.243 58.000 0.000 1.000 N NA
 5888466 5888467 ECIAI39_0046 ECIAI39_0047 yaaU kefF FALSE 0.232 108.000 0.000 1.000   NA
 5888467 5888468 ECIAI39_0047 ECIAI39_0048 kefF kefC TRUE 0.991 -7.000 0.560 1.000   NA
 5888468 5888469 ECIAI39_0048 ECIAI39_0049 kefC folA FALSE 0.012 192.000 0.012 1.000 N NA
 5888469 5888470 ECIAI39_0049 ECIAI39_0050 folA   FALSE 0.286 86.000 0.000 1.000   NA
 5888470 5888471 ECIAI39_0050 ECIAI39_0051     TRUE 0.905 3.000 0.000 1.000   NA
 5888472 5888473 ECIAI39_0052 ECIAI39_0053 apaH apaG TRUE 0.945 7.000 0.267 NA N NA
 5888473 5888474 ECIAI39_0053 ECIAI39_0054 apaG ksgA TRUE 0.844 3.000 0.078 NA N NA
 5888474 5888475 ECIAI39_0054 ECIAI39_0055 ksgA pdxA TRUE 0.969 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5888475 5888476 ECIAI39_0055 ECIAI39_0056 pdxA surA TRUE 0.992 0.000 0.561 1.000 N NA
 5888476 5888477 ECIAI39_0056 ECIAI39_0057 surA imp TRUE 0.565 53.000 0.182 1.000 N NA
 5888478 5888479 ECIAI39_0058 ECIAI39_0059 djlA   FALSE 0.315 74.000 0.000 1.000   NA
 5888479 5888480 ECIAI39_0059 ECIAI39_0060     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5888481 5888482 ECIAI39_0061 ECIAI39_0062 rluA hepA TRUE 0.930 12.000 0.294 1.000 N NA
 5888482 5888483 ECIAI39_0062 ECIAI39_0063 hepA polB FALSE 0.426 164.000 0.098 1.000 Y NA
 5888483 5888484 ECIAI39_0063 ECIAI39_0064 polB araD FALSE 0.095 75.000 0.018 1.000 N NA
 5888484 5888485 ECIAI39_0064 ECIAI39_0065 araD araA TRUE 0.563 115.000 0.017 1.000 Y NA
 5888485 5888486 ECIAI39_0065 ECIAI39_0066 araA araB TRUE 0.846 11.000 0.138 1.000 N NA
 5888487 5888488 ECIAI39_0067 ECIAI39_0068 araC   FALSE 0.004 511.000 0.000 NA   NA
 5888488 5888489 ECIAI39_0068 ECIAI39_0069     TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 5888489 5888490 ECIAI39_0069 ECIAI39_0070   yabI FALSE 0.088 155.000 0.000 NA   NA
 5888491 5888492 ECIAI39_0071 ECIAI39_0072 thiQ thiP TRUE 0.988 -16.000 0.522 0.018 N NA
 5888492 5888493 ECIAI39_0072 ECIAI39_0073 thiP tbpA TRUE 0.990 -24.000 0.697 0.073 N NA
 5888493 5888494 ECIAI39_0073 ECIAI39_misc_RNA_4 tbpA   TRUE 0.569 31.000 0.000 NA   NA
 5888498 5888499 ECIAI39_0076 ECIAI39_0077 leuD leuC TRUE 0.995 11.000 0.309 0.001 Y NA
 5888499 5888500 ECIAI39_0077 ECIAI39_0078 leuC leuB TRUE 0.997 3.000 0.275 0.002 Y NA
 5888500 5888501 ECIAI39_0078 ECIAI39_0079 leuB leuA TRUE 0.996 0.000 0.126 0.002 Y NA
 5888501 5888502 ECIAI39_0079 ECIAI39_misc_RNA_6 leuA   FALSE 0.456 44.000 0.000 NA   NA
 5888502 5888503 ECIAI39_misc_RNA_6 ECIAI39_4937   leuL TRUE 0.673 -100.000 0.000 NA   NA
 5888504 5888505 ECIAI39_0080 ECIAI39_0081 leuO ilvI FALSE 0.006 316.000 0.000 1.000 N NA
 5888505 5888506 ECIAI39_0081 ECIAI39_0082 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 5888506 5888507 ECIAI39_0082 ECIAI39_0083 ilvH fruR FALSE 0.040 180.000 0.063 1.000 N NA
 5888507 5888508 ECIAI39_0083 ECIAI39_0084 fruR mraZ FALSE 0.004 602.000 0.000 NA   NA
 5888508 5888509 ECIAI39_0084 ECIAI39_0085 mraZ mraW TRUE 0.993 2.000 0.635 NA   NA
 5888509 5888510 ECIAI39_0085 ECIAI39_0086 mraW ftsL TRUE 0.975 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5888510 5888511 ECIAI39_0086 ECIAI39_0087 ftsL ftsI TRUE 0.775 16.000 0.124 1.000 N NA
 5888511 5888512 ECIAI39_0087 ECIAI39_0088 ftsI murE TRUE 0.974 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 5888512 5888513 ECIAI39_0088 ECIAI39_0089 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5888513 5888514 ECIAI39_0089 ECIAI39_0090 murF mraY TRUE 0.998 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 5888514 5888515 ECIAI39_0090 ECIAI39_0091 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 5888515 5888516 ECIAI39_0091 ECIAI39_0092 murD ftsW TRUE 0.991 0.000 0.297 0.003 N NA
 5888516 5888517 ECIAI39_0092 ECIAI39_0093 ftsW murG TRUE 0.995 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5888517 5888518 ECIAI39_0093 ECIAI39_0094 murG murC TRUE 0.923 54.000 0.283 1.000 Y NA
 5888518 5888519 ECIAI39_0094 ECIAI39_0095 murC ddlB TRUE 0.995 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 5888519 5888520 ECIAI39_0095 ECIAI39_0096 ddlB ftsQ TRUE 0.996 2.000 0.372 NA Y NA
 5888520 5888521 ECIAI39_0096 ECIAI39_0097 ftsQ ftsA TRUE 0.987 -3.000 0.389 NA N NA
 5888521 5888522 ECIAI39_0097 ECIAI39_0098 ftsA ftsZ TRUE 0.947 62.000 0.460 1.000 Y NA
 5888522 5888523 ECIAI39_0098 ECIAI39_0099 ftsZ lpxC FALSE 0.279 101.000 0.134 1.000 N NA
 5888523 5888524 ECIAI39_0099 ECIAI39_0100 lpxC secM FALSE 0.027 231.000 0.000 1.000   NA
 5888524 5888525 ECIAI39_0100 ECIAI39_0101 secM secA FALSE 0.393 62.000 0.065 1.000   NA
 5888525 5888526 ECIAI39_0101 ECIAI39_0102 secA mutT TRUE 0.492 60.000 0.168 1.000 N NA
 5888527 5888528 ECIAI39_0103 ECIAI39_0104 yacF coaE TRUE 0.953 0.000 0.110 NA   NA
 5888530 5888531 ECIAI39_0106 ECIAI39_0107 hofC hofB TRUE 0.997 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 5888531 5888532 ECIAI39_0107 ECIAI39_0108 hofB ppdD TRUE 0.995 10.000 0.556 NA Y NA
 5888532 5888533 ECIAI39_0108 ECIAI39_0109 ppdD nadC FALSE 0.006 203.000 0.015 NA N NA
 5888534 5888535 ECIAI39_0110 ECIAI39_0111 ampD ampE TRUE 0.996 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5888539 5888540 ECIAI39_0114 ECIAI39_0115 aceE aceF TRUE 0.977 15.000 0.220 1.000 Y NA
 5888540 5888541 ECIAI39_0115 ECIAI39_0116 aceF lpd TRUE 0.558 208.000 0.463 1.000 Y NA
 5888543 5888544 ECIAI39_0118 ECIAI39_0119 acnB yacL FALSE 0.073 175.000 0.068 NA   NA
 5888545 5888546 ECIAI39_0120 ECIAI39_0121 speD speE TRUE 0.968 16.000 0.162 1.000 Y NA
 5888546 5888547 ECIAI39_0121 ECIAI39_0122 speE yacC TRUE 0.637 106.000 0.354 NA   NA
 5888552 5888553 ECIAI39_0127 ECIAI39_0128 yadG yadH TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.094 Y NA
 5888553 5888554 ECIAI39_0128 ECIAI39_0129 yadH yadI FALSE 0.098 105.000 0.037 1.000 N NA
 5888554 5888555 ECIAI39_0129 ECIAI39_0130 yadI yadE TRUE 0.883 64.000 0.222 1.000 Y NA
 5888558 5888559 ECIAI39_0134 ECIAI39_0135 panC panB TRUE 0.996 12.000 0.395 0.001 Y NA
 5888559 5888560 ECIAI39_0135 ECIAI39_0136 panB yadC FALSE 0.194 112.000 0.000 NA   NA
 5888561 5888562 ECIAI39_0137 ECIAI39_0138     TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5888563 5888564 ECIAI39_0139 ECIAI39_0140 yadC yadK TRUE 0.811 -19.000 0.000 NA   NA
 5888564 5888565 ECIAI39_0140 ECIAI39_0141 yadK yadL TRUE 0.977 27.000 0.571 0.012   NA
 5888565 5888566 ECIAI39_0141 ECIAI39_0142 yadL yadM TRUE 0.989 12.000 0.571 0.012   NA
 5888566 5888567 ECIAI39_0142 ECIAI39_0143 yadM htrE TRUE 0.858 147.000 0.571 1.000 Y NA
 5888567 5888568 ECIAI39_0143 ECIAI39_0144 htrE ecpD TRUE 0.992 35.000 1.000 1.000 Y NA
 5888568 5888569 ECIAI39_0144 ECIAI39_0145 ecpD yadN TRUE 0.914 105.000 0.500 1.000 Y NA
 5888569 5888570 ECIAI39_0145 ECIAI39_0146 yadN folK FALSE 0.004 371.000 0.000 1.000 N NA
 5888570 5888571 ECIAI39_0146 ECIAI39_0147 folK pcnB TRUE 0.976 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5888571 5888572 ECIAI39_0147 ECIAI39_0148 pcnB yadB TRUE 0.910 39.000 0.131 1.000 Y NA
 5888572 5888573 ECIAI39_0148 ECIAI39_0149 yadB dksA TRUE 0.760 37.000 0.231 1.000 N NA
 5888573 5888574 ECIAI39_0149 ECIAI39_0150 dksA sfsA FALSE 0.124 178.000 0.151 NA   NA
 5888574 5888575 ECIAI39_0150 ECIAI39_0151 sfsA ligT TRUE 0.709 15.000 0.045 NA   NA
 5888576 5888577 ECIAI39_0152 ECIAI39_0153 hrpB mrcB FALSE 0.335 94.000 0.158 1.000 N NA
 5888577 5888578 ECIAI39_0153 ECIAI39_0154 mrcB fhuA FALSE 0.016 220.000 0.000 1.000 N NA
 5888578 5888579 ECIAI39_0154 ECIAI39_0155 fhuA fhuC TRUE 0.884 51.000 0.156 1.000 Y NA
 5888579 5888580 ECIAI39_0155 ECIAI39_0156 fhuC fhuD TRUE 0.986 0.000 0.031 1.000 Y NA
 5888580 5888581 ECIAI39_0156 ECIAI39_0157 fhuD fhuB TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5888583 5888584 ECIAI39_0159 ECIAI39_0160 clcA yadR FALSE 0.205 82.000 0.031 NA   NA
 5888585 5888586 ECIAI39_0161 ECIAI39_0162 yadS btuF TRUE 0.776 38.000 0.213 NA   NA
 5888586 5888587 ECIAI39_0162 ECIAI39_0163 btuF pfs TRUE 0.860 -7.000 0.073 1.000 N NA
 5888588 5888589 ECIAI39_0164 ECIAI39_0165 dgt degP FALSE 0.156 130.000 0.101 1.000 N NA
 5888589 5888590 ECIAI39_0165 ECIAI39_0166 degP cdaR FALSE 0.062 155.000 0.080 NA N NA
 5888591 5888592 ECIAI39_0167 ECIAI39_0168 yaeH dapD FALSE 0.008 315.000 0.035 NA   NA
 5888592 5888593 ECIAI39_0168 ECIAI39_0169 dapD glnD TRUE 0.579 31.000 0.097 1.000 N NA
 5888593 5888594 ECIAI39_0169 ECIAI39_0170 glnD map TRUE 0.604 62.000 0.243 1.000 N NA
 5888595 5888596 ECIAI39_misc_RNA_8 ECIAI39_0171 t44 rpsB TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5888596 5888597 ECIAI39_0171 ECIAI39_0172 rpsB tsf TRUE 0.918 135.000 0.748 1.000 Y NA
 5888597 5888598 ECIAI39_0172 ECIAI39_0173 tsf pyrH FALSE 0.448 147.000 0.416 1.000 N NA
 5888600 5888601 ECIAI39_0175 ECIAI39_0176 frr dxr FALSE 0.104 92.000 0.032 1.000 N NA
 5888601 5888602 ECIAI39_0176 ECIAI39_0177 dxr ispU FALSE 0.235 186.000 0.025 1.000 Y NA
 5888602 5888603 ECIAI39_0177 ECIAI39_0178 ispU cdsA TRUE 0.990 13.000 0.400 1.000 Y NA
 5888603 5888604 ECIAI39_0178 ECIAI39_0179 cdsA yaeL TRUE 0.737 12.000 0.080 1.000 N NA
 5888604 5888605 ECIAI39_0179 ECIAI39_0180 yaeL yaeT TRUE 0.952 30.000 0.204 1.000 Y NA
 5888605 5888606 ECIAI39_0180 ECIAI39_0181 yaeT hlpA TRUE 0.845 122.000 0.354 1.000 Y NA
 5888606 5888607 ECIAI39_0181 ECIAI39_0182 hlpA lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 5888607 5888608 ECIAI39_0182 ECIAI39_0183 lpxD fabZ TRUE 0.823 105.000 0.796 1.000 N NA
 5888608 5888609 ECIAI39_0183 ECIAI39_0184 fabZ lpxA TRUE 0.993 4.000 0.850 1.000 N NA
 5888609 5888610 ECIAI39_0184 ECIAI39_0185 lpxA lpxB TRUE 0.996 0.000 0.289 1.000 Y NA
 5888610 5888611 ECIAI39_0185 ECIAI39_0186 lpxB rnhB TRUE 0.968 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5888611 5888612 ECIAI39_0186 ECIAI39_0187 rnhB dnaE TRUE 0.907 37.000 0.104 1.000 Y NA
 5888612 5888613 ECIAI39_0187 ECIAI39_0188 dnaE accA TRUE 0.797 13.000 0.122 1.000 N NA
 5888613 5888614 ECIAI39_0188 ECIAI39_0189 accA ldcC FALSE 0.062 99.000 0.010 1.000 N NA
 5888614 5888615 ECIAI39_0189 ECIAI39_0190 ldcC yaeR TRUE 0.761 57.000 0.039 NA Y NA
 5888615 5888616 ECIAI39_0190 ECIAI39_0191 yaeR tilS FALSE 0.061 65.000 0.015 NA N NA
 5888617 5888618 ECIAI39_0192 ECIAI39_0193     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5888618 5888619 ECIAI39_0193 ECIAI39_0194   gsk FALSE 0.253 97.000 0.000 1.000   NA
 5888621 5888622 ECIAI39_0196 ECIAI39_0197 hemH adk FALSE 0.040 132.000 0.013 1.000 N NA
 5888622 5888623 ECIAI39_0197 ECIAI39_0198 adk htpG FALSE 0.037 219.000 0.035 0.094 N NA
 5888623 5888624 ECIAI39_0198 ECIAI39_0199 htpG recR FALSE 0.079 110.000 0.028 1.000 N NA
 5888624 5888625 ECIAI39_0199 ECIAI39_0200 recR ybaB TRUE 0.994 0.000 0.604 NA   NA
 5888625 5888626 ECIAI39_0200 ECIAI39_0201 ybaB dnaX TRUE 0.836 53.000 0.411 NA   NA
 5888626 5888627 ECIAI39_0201 ECIAI39_0202 dnaX apt FALSE 0.143 129.000 0.088 1.000 N NA
 5888627 5888628 ECIAI39_0202 ECIAI39_0203 apt ybaN FALSE 0.080 153.000 0.043 NA   NA
 5888629 5888630 ECIAI39_0204 ECIAI39_0205 priC ybaM TRUE 0.966 14.000 0.474 NA   NA
 5888631 5888632 ECIAI39_0206 ECIAI39_0207 kefA acrR FALSE 0.075 128.000 0.000 NA N NA
 5888633 5888634 ECIAI39_0208 ECIAI39_0209 acrA acrB TRUE 0.657 23.000 0.000 NA   NA
 5888635 5888636 ECIAI39_0210 ECIAI39_0211     TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5888637 5888638 ECIAI39_0212 ECIAI39_0213 acrB ybaJ FALSE 0.004 545.000 0.000 NA   NA
 5888638 5888639 ECIAI39_0213 ECIAI39_0214 ybaJ hha TRUE 0.683 26.000 0.080 NA   NA
 5888639 5888640 ECIAI39_0214 ECIAI39_0215 hha maa FALSE 0.083 172.000 0.076 NA   NA
 5888640 5888641 ECIAI39_0215 ECIAI39_0216 maa ylaC FALSE 0.294 116.000 0.101 1.000   NA
 5888641 5888642 ECIAI39_0216 ECIAI39_0217 ylaC ylaB FALSE 0.078 164.000 0.000 NA   NA
 5888643 5888644 ECIAI39_0218 ECIAI39_misc_RNA_9 ybaA ffs FALSE 0.199 110.000 0.000 NA   NA
 5888648 5888649 ECIAI39_0222 ECIAI39_0223 amtB glnK TRUE 0.694 30.000 0.156 1.000 N NA
 5888649 5888650 ECIAI39_0223 ECIAI39_0224 glnK mdlB FALSE 0.020 181.000 0.028 1.000 N NA
 5888650 5888651 ECIAI39_0224 ECIAI39_0225 mdlB mdlA TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.006 Y NA
 5888651 5888652 ECIAI39_0225 ECIAI39_0226 mdlA ybaO TRUE 0.736 30.000 0.179 1.000 N NA
 5888652 5888653 ECIAI39_0226 ECIAI39_0227 ybaO cof FALSE 0.074 153.000 0.020 1.000   NA
 5888654 5888655 ECIAI39_0228 ECIAI39_0229 ybaE queC FALSE 0.266 65.000 0.019 1.000   NA
 5888656 5888657 ECIAI39_0230 ECIAI39_0231 ybaW ybaV FALSE 0.181 106.000 0.027 1.000   NA
 5888657 5888658 ECIAI39_0231 ECIAI39_0232 ybaV ppiD FALSE 0.040 151.000 0.033 1.000 N NA
 5888658 5888659 ECIAI39_0232 ECIAI39_0233 ppiD hupB FALSE 0.021 192.000 0.000 NA N NA
 5888659 5888660 ECIAI39_0233 ECIAI39_0234 hupB lon FALSE 0.015 209.000 0.000 NA N NA
 5888662 5888663 ECIAI39_0235 ECIAI39_0236 clpX clpP TRUE 0.834 126.000 0.352 1.000 Y NA
 5888663 5888664 ECIAI39_0236 ECIAI39_0237 clpP tig FALSE 0.350 246.000 0.351 1.000 Y NA
 5888664 5888665 ECIAI39_0237 ECIAI39_0238 tig bolA FALSE 0.004 344.000 0.000 NA N NA
 5888666 5888667 ECIAI39_0239 ECIAI39_0240 yajG ampG TRUE 0.782 44.000 0.256 NA   NA
 5888667 5888668 ECIAI39_0240 ECIAI39_0241 ampG cyoA FALSE 0.005 460.000 0.000 NA   NA
 5888668 5888669 ECIAI39_0241 ECIAI39_0242 cyoA cyoB TRUE 0.966 22.000 0.041 0.004 Y NA
 5888669 5888670 ECIAI39_0242 ECIAI39_0243 cyoB cyoC TRUE 0.999 -10.000 0.697 0.051 Y NA
 5888670 5888671 ECIAI39_0243 ECIAI39_0244 cyoC cyoD TRUE 0.999 0.000 0.485 0.051 Y NA
 5888671 5888672 ECIAI39_0244 ECIAI39_0245 cyoD cyoE TRUE 0.901 12.000 0.118 0.087 N NA
 5888672 5888673 ECIAI39_0245 ECIAI39_0246 cyoE   FALSE 0.201 119.000 0.000 1.000   NA
 5888673 5888674 ECIAI39_0246 ECIAI39_0247     TRUE 0.849 -16.000 0.000 1.000   NA
 5888678 5888679 ECIAI39_0251 ECIAI39_0252 panE yajL TRUE 0.874 -37.000 0.155 NA   NA
 5888681 5888682 ECIAI39_0254 ECIAI39_0255 xseB ispA TRUE 0.826 0.000 0.035 1.000 N NA
 5888682 5888683 ECIAI39_0255 ECIAI39_0256 ispA dxs TRUE 0.926 25.000 0.060 1.000 Y NA
 5888683 5888684 ECIAI39_0256 ECIAI39_0257 dxs yajO FALSE 0.120 55.000 0.009 1.000 N NA
 5888685 5888686 ECIAI39_0258 ECIAI39_0259 pgpA thiL TRUE 0.908 -22.000 0.206 1.000 N NA
 5888686 5888687 ECIAI39_0259 ECIAI39_0260 thiL nusB TRUE 0.506 78.000 0.225 1.000 N NA
 5888687 5888688 ECIAI39_0260 ECIAI39_0261 nusB ribE TRUE 0.921 20.000 0.347 1.000 N NA
 5888688 5888689 ECIAI39_0261 ECIAI39_0262 ribE ribD TRUE 0.838 89.000 0.034 0.001 Y NA
 5888689 5888690 ECIAI39_0262 ECIAI39_0263 ribD nrdR TRUE 0.958 4.000 0.277 NA N NA
 5888693 5888694 ECIAI39_0266 ECIAI39_0267   yajI FALSE 0.009 324.000 0.000 NA   NA
 5888694 5888695 ECIAI39_0267 ECIAI39_0268 yajI tsx FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 5888696 5888697 ECIAI39_0269 ECIAI39_0270 yajD   FALSE 0.249 88.000 0.000 NA   NA
 5888697 5888698 ECIAI39_0270 ECIAI39_0271     TRUE 0.939 -40.000 0.300 NA   NA
 5888698 5888699 ECIAI39_0271 ECIAI39_0272   secF FALSE 0.058 152.000 0.000 1.000 N NA
 5888699 5888700 ECIAI39_0272 ECIAI39_0273 secF secD TRUE 0.993 11.000 0.206 0.001 Y NA
 5888700 5888701 ECIAI39_0273 ECIAI39_0274 secD yajC TRUE 0.896 28.000 0.045 NA Y NA
 5888701 5888702 ECIAI39_0274 ECIAI39_0275 yajC tgt TRUE 0.888 23.000 0.325 NA N NA
 5888702 5888703 ECIAI39_0275 ECIAI39_0276 tgt queA TRUE 0.974 55.000 0.360 0.001 Y NA
 5888705 5888706 ECIAI39_0278 ECIAI39_0279   malZ FALSE 0.051 186.000 0.000 NA   NA
 5888706 5888707 ECIAI39_0279 ECIAI39_0280 malZ proY FALSE 0.109 156.000 0.123 1.000 N NA
 5888707 5888708 ECIAI39_0280 ECIAI39_0281 proY brnQ TRUE 0.940 76.000 0.348 0.087 Y NA
 5888708 5888709 ECIAI39_0281 ECIAI39_0282 brnQ phoR FALSE 0.003 407.000 0.000 1.000 N NA
 5888709 5888710 ECIAI39_0282 ECIAI39_0283 phoR phoB TRUE 0.968 58.000 0.453 0.086 Y NA
 5888711 5888712 ECIAI39_0284 ECIAI39_0285 sbcD sbcC TRUE 0.995 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 5888712 5888713 ECIAI39_0285 ECIAI39_0286 sbcC araJ FALSE 0.043 126.000 0.030 NA N NA
 5888716 5888717 ECIAI39_0289 ECIAI39_0290 ykiA yaiE FALSE 0.034 208.000 0.000 NA   NA
 5888717 5888718 ECIAI39_0290 ECIAI39_0291 yaiE aroM FALSE 0.270 72.000 0.049 NA   NA
 5888718 5888719 ECIAI39_0291 ECIAI39_0292 aroM yaiA FALSE 0.018 258.000 0.000 NA   NA
 5888719 5888720 ECIAI39_0292 ECIAI39_0293 yaiA aroL FALSE 0.379 50.000 0.044 NA   NA
 5888720 5888721 ECIAI39_0293 ECIAI39_0294 aroL yaiI FALSE 0.031 183.000 0.007 NA   NA
 5888723 5888724 ECIAI39_0296 ECIAI39_0297 yaiC psiF TRUE 0.533 102.000 0.250 NA   NA
 5888724 5888725 ECIAI39_0297 ECIAI39_0298 psiF phoA FALSE 0.136 119.000 0.032 NA   NA
 5888725 5888726 ECIAI39_0298 ECIAI39_0299 phoA yaiB FALSE 0.170 100.000 0.032 NA   NA
 5888726 5888727 ECIAI39_0299 ECIAI39_0300 yaiB   FALSE 0.055 182.000 0.000 NA   NA
 5888731 5888732 ECIAI39_0304 ECIAI39_0305 yaiW sbmA TRUE 0.783 13.000 0.000 1.000   NA
 5888732 5888733 ECIAI39_0305 ECIAI39_0306 sbmA   TRUE 0.691 20.000 0.000 NA   NA
 5888735 5888736 ECIAI39_0308 ECIAI39_0309 yaiV   TRUE 0.941 41.000 0.667 NA   NA
 5888737 5888738 ECIAI39_0310 ECIAI39_0311 hemB   FALSE 0.051 159.000 0.000 1.000 N NA
 5888738 5888739 ECIAI39_0311 ECIAI39_0312     TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5888740 5888741 ECIAI39_0313 ECIAI39_0314 tauD tauC FALSE 0.420 49.000 0.000 NA   NA
 5888741 5888742 ECIAI39_0314 ECIAI39_0315 tauC tauB TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5888742 5888743 ECIAI39_0315 ECIAI39_0316 tauB tauA TRUE 0.952 13.000 0.047 1.000 Y NA
 5888744 5888745 ECIAI39_0317 ECIAI39_0318 yaiS yaiP TRUE 0.938 10.000 0.214 NA   NA
 5888745 5888746 ECIAI39_0318 ECIAI39_0319 yaiP yaiX TRUE 0.932 -22.000 0.214 NA   NA
 5888746 5888747 ECIAI39_0319 ECIAI39_0320 yaiX yaiO TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 5888747 5888748 ECIAI39_0320 ECIAI39_0321 yaiO frmR FALSE 0.052 185.000 0.000 NA   NA
 5888748 5888749 ECIAI39_0321 ECIAI39_0322 frmR frmA TRUE 0.932 35.000 0.531 NA   NA
 5888749 5888750 ECIAI39_0322 ECIAI39_0323 frmA frmB TRUE 0.668 92.000 0.327 1.000   NA
 5888751 5888752 ECIAI39_0324 ECIAI39_0325 yaiL mhpT FALSE 0.215 102.000 0.000 NA   NA
 5888752 5888753 ECIAI39_0325 ECIAI39_0326 mhpT mhpE FALSE 0.205 236.000 0.600 1.000 N NA
 5888753 5888754 ECIAI39_0326 ECIAI39_0327 mhpE mhpF TRUE 0.996 -3.000 0.750 1.000 N NA
 5888754 5888755 ECIAI39_0327 ECIAI39_0328 mhpF mhpD TRUE 0.998 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5888755 5888756 ECIAI39_0328 ECIAI39_0329 mhpD mhpC TRUE 0.962 10.000 0.300 1.000   NA
 5888756 5888757 ECIAI39_0329 ECIAI39_0330 mhpC mhpB TRUE 0.979 3.000 0.300 1.000   NA
 5888757 5888758 ECIAI39_0330 ECIAI39_0331 mhpB mhpA TRUE 0.993 2.000 0.333 0.005   NA
 5888759 5888760 ECIAI39_0332 ECIAI39_0333 mhpR lacI TRUE 0.822 77.000 0.000 0.051 Y NA
 5888760 5888761 ECIAI39_0333 ECIAI39_0334 lacI lacZ FALSE 0.284 123.000 0.174 1.000 N NA
 5888761 5888762 ECIAI39_0334 ECIAI39_0335 lacZ lacY TRUE 0.757 52.000 0.261 1.000   NA
 5888762 5888763 ECIAI39_0335 ECIAI39_0336 lacY lacA TRUE 0.642 66.000 0.222 1.000   NA
 5888764 5888765 ECIAI39_0337 ECIAI39_0338 cynX cynS TRUE 0.895 33.000 0.000 1.000 Y NA
 5888765 5888766 ECIAI39_0338 ECIAI39_0339 cynS cynT TRUE 0.910 31.000 0.075 1.000 Y NA
 5888767 5888768 ECIAI39_0340 ECIAI39_0341 cynR   FALSE 0.189 124.000 0.000 1.000   NA
 5888768 5888769 ECIAI39_0341 ECIAI39_0342     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5888770 5888771 ECIAI39_0343 ECIAI39_0344 codA codB TRUE 0.991 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 5888771 5888772 ECIAI39_0344 ECIAI39_0345 codB prpE FALSE 0.013 238.000 0.000 1.000 N NA
 5888772 5888773 ECIAI39_0345 ECIAI39_0346 prpE prpD TRUE 0.796 40.000 0.038 0.001   NA
 5888773 5888774 ECIAI39_0346 ECIAI39_0347 prpD prpC TRUE 0.822 34.000 0.216 1.000   NA
 5888774 5888775 ECIAI39_0347 ECIAI39_0348 prpC prpB FALSE 0.444 160.000 0.502 1.000 N NA
 5888779 5888780 ECIAI39_0352 ECIAI39_tRNA88 yahM   TRUE 0.860 -10.000 0.000 NA   NA
 5888780 5888781 ECIAI39_tRNA88 ECIAI39_0354   yahL FALSE 0.008 344.000 0.000 NA   NA
 5888781 5888782 ECIAI39_0354 ECIAI39_0355 yahL yahK FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 5888782 5888783 ECIAI39_0355 ECIAI39_0356 yahK yahK TRUE 0.660 -126.000 0.000 NA   NA
 5888783 5888784 ECIAI39_0356 ECIAI39_0357 yahK   FALSE 0.251 87.000 0.000 NA   NA
 5888784 5888785 ECIAI39_0357 ECIAI39_0358     TRUE 0.998 -33.000 1.000 0.057 Y NA
 5888785 5888786 ECIAI39_0358 ECIAI39_0359     TRUE 0.996 -22.000 0.667 1.000 Y NA
 5888786 5888787 ECIAI39_0359 ECIAI39_0360     TRUE 0.982 34.000 0.571 NA Y NA
 5888787 5888788 ECIAI39_0360 ECIAI39_0361     FALSE 0.221 98.000 0.000 NA   NA
 5888788 5888789 ECIAI39_0361 ECIAI39_0362     FALSE 0.273 76.000 0.000 NA   NA
 5888789 5888790 ECIAI39_0362 ECIAI39_0363   yahJ FALSE 0.016 268.000 0.000 NA   NA
 5888790 5888791 ECIAI39_0363 ECIAI39_0364 yahJ yahI TRUE 0.942 10.000 0.278 1.000 N NA
 5888791 5888792 ECIAI39_0364 ECIAI39_0365 yahI yahG FALSE 0.354 95.000 0.125 NA   NA
 5888792 5888793 ECIAI39_0365 ECIAI39_0366 yahG yahF TRUE 0.996 0.000 0.714 NA   NA
 5888793 5888794 ECIAI39_0366 ECIAI39_0367 yahF yahE TRUE 0.982 -10.000 0.429 NA   NA
 5888794 5888795 ECIAI39_0367 ECIAI39_0368 yahE yahD TRUE 0.943 40.000 0.667 NA   NA
 5888796 5888797 ECIAI39_0369 ECIAI39_0370 yahC yahB FALSE 0.240 92.000 0.000 NA   NA
 5888798 5888799 ECIAI39_0371 ECIAI39_0372 yahA betT FALSE 0.002 871.000 0.000 1.000 N NA
 5888800 5888801 ECIAI39_0373 ECIAI39_0374 betI betB TRUE 0.957 14.000 0.459 1.000 N NA
 5888801 5888802 ECIAI39_0374 ECIAI39_0375 betB betA TRUE 0.977 -31.000 0.634 1.000 N NA
 5888802 5888803 ECIAI39_0375 ECIAI39_0376 betA   FALSE 0.044 194.000 0.000 NA   NA
 5888804 5888805 ECIAI39_0377 ECIAI39_0378 ykgG ykgF TRUE 0.991 -7.000 0.286 0.001   NA
 5888805 5888806 ECIAI39_0378 ECIAI39_0379 ykgF ykgE TRUE 0.986 11.000 0.286 NA Y NA
 5888806 5888807 ECIAI39_0379 ECIAI39_0380 ykgE ykgD FALSE 0.002 528.000 0.000 NA N NA
 5888808 5888809 ECIAI39_0381 ECIAI39_0382 ykgC ykgI TRUE 0.812 109.000 0.667 NA   NA
 5888809 5888810 ECIAI39_0382 ECIAI39_0383 ykgI ykgB TRUE 0.745 12.000 0.043 NA   NA
 5888813 5888814 ECIAI39_0386 ECIAI39_0387 eaeH eaeH TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5888815 5888816 ECIAI39_0388 ECIAI39_0389     TRUE 0.938 27.000 0.438 1.000   NA
 5888817 5888818 ECIAI39_0390 ECIAI39_0391     TRUE 0.701 125.000 0.000 0.062 Y NA
 5888819 5888820 ECIAI39_0392 ECIAI39_0393     FALSE 0.024 245.000 0.000 1.000   NA
 5888820 5888821 ECIAI39_0393 ECIAI39_0394   ykgM FALSE 0.002 940.000 0.000 1.000 N NA
 5888821 5888822 ECIAI39_0394 ECIAI39_0395 ykgM   TRUE 0.967 0.000 0.004 0.012   NA
 5888822 5888823 ECIAI39_0395 ECIAI39_0396   insA FALSE 0.004 694.000 0.000 1.000   NA
 5888823 5888824 ECIAI39_0396 ECIAI39_0397 insA insB TRUE 0.967 -81.000 0.000 0.029 Y NA
 5888824 5888825 ECIAI39_0397 ECIAI39_0398 insB ykgK FALSE 0.154 93.000 0.000 1.000 N NA
 5888825 5888826 ECIAI39_0398 ECIAI39_0399 ykgK ecpA FALSE 0.031 212.000 0.000 NA   NA
 5888826 5888827 ECIAI39_0399 ECIAI39_0400 ecpA yagY FALSE 0.353 58.000 0.000 NA   NA
 5888827 5888828 ECIAI39_0400 ECIAI39_0401 yagY yagX TRUE 0.899 26.000 0.308 NA   NA
 5888828 5888829 ECIAI39_0401 ECIAI39_0402 yagX yagW TRUE 0.982 -10.000 0.429 NA   NA
 5888829 5888830 ECIAI39_0402 ECIAI39_0403 yagW yagV TRUE 0.978 -31.000 0.571 NA   NA
 5888831 5888832 ECIAI39_0406 ECIAI39_0407 yagU   FALSE 0.029 215.000 0.000 NA   NA
 5888832 5888833 ECIAI39_0407 ECIAI39_tRNA87     FALSE 0.032 210.000 0.000 NA   NA
 5888833 5888834 ECIAI39_tRNA87 ECIAI39_0408   proA FALSE 0.189 115.000 0.000 NA   NA
 5888834 5888835 ECIAI39_0408 ECIAI39_0409 proA proB TRUE 0.981 12.000 0.026 0.001 Y NA
 5888837 5888838 ECIAI39_0411 ECIAI39_0412 crl frsA FALSE 0.331 58.000 0.048 NA   NA
 5888838 5888839 ECIAI39_0412 ECIAI39_0413 frsA gpt FALSE 0.206 92.000 0.040 NA   NA
 5888841 5888842 ECIAI39_0415 ECIAI39_0416 prfH   TRUE 0.562 111.000 0.303 NA   NA
 5888842 5888843 ECIAI39_0416 ECIAI39_0417   yafP FALSE 0.059 179.000 0.000 NA   NA
 5888843 5888844 ECIAI39_0417 ECIAI39_0418 yafP dinB TRUE 0.909 -3.000 0.011 1.000   NA
 5888844 5888845 ECIAI39_0418 ECIAI39_0419 dinB mbhA FALSE 0.195 71.000 0.000 1.000 N NA
 5888847 5888848 ECIAI39_0422 ECIAI39_0423 yafM yafL FALSE 0.029 176.000 0.000 NA N NA
 5888849 5888850 ECIAI39_0424 ECIAI39_0425 dinJ yafQ TRUE 0.952 3.000 0.167 NA   NA
 5888850 5888851 ECIAI39_0425 ECIAI39_0426 yafQ insM FALSE 0.331 62.000 0.000 NA   NA
 5888851 5888852 ECIAI39_0426 ECIAI39_0427 insM   TRUE 0.937 36.000 0.182 1.000 Y NA
 5888852 5888853 ECIAI39_0427 ECIAI39_0428   yafK FALSE 0.022 235.000 0.000 NA   NA
 5888854 5888855 ECIAI39_0429 ECIAI39_0430 yafJ lpcA TRUE 0.523 105.000 0.229 1.000   NA
 5888859 5888860 ECIAI39_tRNA86 ECIAI39_0434   dnaQ FALSE 0.140 133.000 0.000 NA   NA
 5888863 5888864 ECIAI39_0437 ECIAI39_0438 gloB mltD TRUE 0.632 72.000 0.233 1.000   NA
 5888865 5888866 ECIAI39_0439 ECIAI39_0440 yafE yafD FALSE 0.296 77.000 0.066 NA   NA
 5888868 5888869 ECIAI39_0442 ECIAI39_tRNA85 dkgB   FALSE 0.080 163.000 0.000 NA   NA
 5888869 5888870 ECIAI39_tRNA85 ECIAI39_5S_6     FALSE 0.385 53.000 0.000 NA   NA
 5888870 5888871 ECIAI39_5S_6 ECIAI39_23S_5     FALSE 0.232 94.000 0.000 NA   NA
 5888871 5888872 ECIAI39_23S_5 ECIAI39_tRNA84     FALSE 0.064 175.000 0.000 NA   NA
 5888872 5888873 ECIAI39_tRNA84 ECIAI39_tRNA83     FALSE 0.466 43.000 0.000 NA   NA
 5888873 5888874 ECIAI39_tRNA83 ECIAI39_16S_5     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 5888874 5888875 ECIAI39_16S_5 ECIAI39_0443   gmhB FALSE 0.007 366.000 0.000 NA   NA
 5888876 5888877 ECIAI39_0444 ECIAI39_0445 metN metI TRUE 0.998 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 5888877 5888878 ECIAI39_0445 ECIAI39_0446 metI metQ TRUE 0.981 40.000 0.411 0.057 Y NA
 5888878 5888879 ECIAI39_0446 ECIAI39_0447 metQ rcsF TRUE 0.699 118.000 0.500 NA   NA
 5888879 5888880 ECIAI39_0447 ECIAI39_0448 rcsF yaeB TRUE 0.982 -3.000 0.247 NA   NA
 5888880 5888881 ECIAI39_0448 ECIAI39_0449 yaeB proS FALSE 0.183 111.000 0.048 NA   NA
 5888882 5888883 ECIAI39_0450 ECIAI39_misc_RNA_11     TRUE 0.501 39.000 0.000 NA   NA
 5888883 5888884 ECIAI39_misc_RNA_11 ECIAI39_0451     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5888884 5888885 ECIAI39_0451 ECIAI39_0452     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5888885 5888886 ECIAI39_0452 ECIAI39_0453     FALSE 0.173 120.000 0.000 NA   NA
 5888888 5888889 ECIAI39_0455 ECIAI39_0456 nlpE yaeJ TRUE 0.668 14.000 0.027 NA   NA
 5888889 5888890 ECIAI39_0456 ECIAI39_0457 yaeJ yaeQ TRUE 0.912 -3.000 0.034 NA   NA
 5888891 5888892 ECIAI39_0458 ECIAI39_0459 yaeP rof TRUE 0.956 -7.000 0.179 NA   NA
 5888892 5888893 ECIAI39_0459 ECIAI39_0460 rof   FALSE 0.293 70.000 0.000 NA   NA
 5888893 5888894 ECIAI39_0460 ECIAI39_0461     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5888895 5888896 ECIAI39_0462 ECIAI39_0463 ybbM ybbL TRUE 0.756 -13.000 0.012 NA   NA
 5888897 5888898 ECIAI39_0464 ECIAI39_0465 ybbK ybbJ TRUE 0.996 0.000 0.313 NA Y NA
 5888900 5888901 ECIAI39_0467 ECIAI39_0468     FALSE 0.378 54.000 0.000 NA   NA
 5888901 5888902 ECIAI39_0468 ECIAI39_0469     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5888902 5888903 ECIAI39_0469 ECIAI39_0470   insG FALSE 0.176 119.000 0.000 NA   NA
 5888904 5888905 ECIAI39_0471 ECIAI39_0472 cueR siiDA TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5888905 5888906 ECIAI39_0472 ECIAI39_0473 siiDA insB FALSE 0.311 66.000 0.000 NA   NA
 5888906 5888907 ECIAI39_0473 ECIAI39_0474 insB insA TRUE 0.967 -81.000 0.000 0.029 Y NA
 5888908 5888909 ECIAI39_0475 ECIAI39_0476 allB ybbY TRUE 0.866 57.000 0.161 1.000 Y NA
 5888909 5888910 ECIAI39_0476 ECIAI39_0477 ybbY glxK TRUE 0.737 22.000 0.133 1.000 N NA
 5888911 5888912 ECIAI39_0478 ECIAI39_0479 ylbA allC TRUE 0.803 11.000 0.059 NA   NA
 5888912 5888913 ECIAI39_0479 ECIAI39_0480 allC allD TRUE 0.799 22.000 0.174 1.000 N NA
 5888914 5888915 ECIAI39_0481 ECIAI39_0482 fdrA ylbE TRUE 0.973 10.000 0.412 NA   NA
 5888915 5888916 ECIAI39_0482 ECIAI39_0483 ylbE ylbF TRUE 0.945 11.000 0.265 NA   NA
 5888916 5888917 ECIAI39_0483 ECIAI39_0484 ylbF ybcF TRUE 0.990 -3.000 0.375 NA   NA
 5888918 5888919 ECIAI39_0485 ECIAI39_0486 purK purE TRUE 0.997 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 5888919 5888920 ECIAI39_0486 ECIAI39_0487 purE lpxH FALSE 0.143 118.000 0.016 1.000   NA
 5888920 5888921 ECIAI39_0487 ECIAI39_0488 lpxH ppiB TRUE 0.973 3.000 0.237 1.000   NA
 5888922 5888923 ECIAI39_0489 ECIAI39_0490     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.100 Y NA
 5888923 5888924 ECIAI39_0490 ECIAI39_0491   cysS FALSE 0.340 43.000 0.000 1.000 N NA
 5888925 5888926 ECIAI39_0492 ECIAI39_0493 ybcI ybcJ FALSE 0.128 108.000 0.011 NA   NA
 5888926 5888927 ECIAI39_0493 ECIAI39_0494 ybcJ folD TRUE 0.915 2.000 0.055 1.000   NA
 5888928 5888929 ECIAI39_0495 ECIAI39_0496 sfmA sfmC FALSE 0.164 219.000 0.000 1.000 Y NA
 5888929 5888930 ECIAI39_0496 ECIAI39_0497 sfmC sfmD TRUE 0.992 31.000 0.875 1.000 Y NA
 5888930 5888931 ECIAI39_0497 ECIAI39_0498 sfmD sfmH TRUE 0.987 43.000 0.875 NA Y NA
 5888931 5888932 ECIAI39_0498 ECIAI39_0499 sfmH sfmF TRUE 0.959 102.000 0.875 NA Y NA
 5888935 5888936 ECIAI39_0501 ECIAI39_0502 intD   FALSE 0.132 136.000 0.000 NA   NA
 5888936 5888937 ECIAI39_0502 ECIAI39_0503     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.100 Y NA
 5888938 5888939 ECIAI39_0504 ECIAI39_0505     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5888939 5888940 ECIAI39_0505 ECIAI39_0507     FALSE 0.003 919.000 0.000 NA   NA
 5888940 5888941 ECIAI39_0507 ECIAI39_0508     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5888941 5888942 ECIAI39_0508 ECIAI39_0509     TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5888942 5888943 ECIAI39_0509 ECIAI39_0510     FALSE 0.058 180.000 0.000 NA   NA
 5888943 5888944 ECIAI39_0510 ECIAI39_0511     FALSE 0.013 288.000 0.000 NA   NA
 5888944 5888945 ECIAI39_0511 ECIAI39_0512     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5888945 5888946 ECIAI39_0512 ECIAI39_0513     FALSE 0.456 44.000 0.000 NA   NA
 5888946 5888947 ECIAI39_0513 ECIAI39_0514     TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5888947 5888948 ECIAI39_0514 ECIAI39_0515     TRUE 0.799 12.000 0.000 1.000   NA
 5888950 5888951 ECIAI39_0517 ECIAI39_0518 E fI TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5888951 5888952 ECIAI39_0518 ECIAI39_0519 fI fII TRUE 0.771 12.000 0.000 NA   NA
 5888952 5888953 ECIAI39_0519 ECIAI39_0520 fII   TRUE 0.771 12.000 0.000 NA   NA
 5888953 5888954 ECIAI39_0520 ECIAI39_0521     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5888954 5888955 ECIAI39_0521 ECIAI39_0522     TRUE 0.802 -22.000 0.000 NA   NA
 5888955 5888956 ECIAI39_0522 ECIAI39_0523     TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5888956 5888957 ECIAI39_0523 ECIAI39_0524     TRUE 0.987 -18.000 0.667 NA   NA
 5888957 5888958 ECIAI39_0524 ECIAI39_0525     TRUE 0.769 -31.000 0.000 NA   NA
 5888958 5888959 ECIAI39_0525 ECIAI39_0526     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5888959 5888960 ECIAI39_0526 ECIAI39_0527     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5888960 5888961 ECIAI39_0527 ECIAI39_0528     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5888961 5888962 ECIAI39_0528 ECIAI39_0529     TRUE 0.670 -102.000 0.000 NA   NA
 5888962 5888963 ECIAI39_0529 ECIAI39_0530     FALSE 0.336 61.000 0.000 NA   NA
 5888963 5888964 ECIAI39_0530 ECIAI39_0531     FALSE 0.302 68.000 0.000 NA   NA
 5888964 5888965 ECIAI39_0531 ECIAI39_0532     TRUE 0.784 59.000 0.000 1.000 Y NA
 5888965 5888966 ECIAI39_0532 ECIAI39_0533     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5888966 5888967 ECIAI39_0533 ECIAI39_0534     TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5888967 5888968 ECIAI39_0534 ECIAI39_0535     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5888971 5888972 ECIAI39_0538 ECIAI39_0539   ompT FALSE 0.049 187.000 0.000 NA   NA
 5888972 5888973 ECIAI39_0539 ECIAI39_0540 ompT envY FALSE 0.003 512.000 0.000 1.000 N NA
 5888973 5888974 ECIAI39_0540 ECIAI39_0541 envY ybcH FALSE 0.054 183.000 0.000 NA   NA
 5888974 5888975 ECIAI39_0541 ECIAI39_0542 ybcH nfrA TRUE 0.990 1.000 0.500 NA   NA
 5888975 5888976 ECIAI39_0542 ECIAI39_0543 nfrA nfrB TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 5888976 5888977 ECIAI39_0543 ECIAI39_0544 nfrB nfrB TRUE 0.636 25.000 0.000 NA   NA
 5888977 5888978 ECIAI39_0544 ECIAI39_0545 nfrB cusS FALSE 0.100 150.000 0.000 NA   NA
 5888978 5888979 ECIAI39_0545 ECIAI39_0546 cusS cusR TRUE 0.999 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 5888980 5888981 ECIAI39_0547 ECIAI39_0548 cusC cusF TRUE 0.951 24.000 0.500 NA   NA
 5888981 5888982 ECIAI39_0548 ECIAI39_0549 cusF cusB TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5888982 5888983 ECIAI39_0549 ECIAI39_0550 cusB cusA TRUE 0.967 12.000 0.500 1.000 N NA
 5888983 5888984 ECIAI39_0550 ECIAI39_0551 cusA pheP FALSE 0.319 102.000 0.000 0.084 N NA
 5888985 5888986 ECIAI39_0552 ECIAI39_0553 ybdG nfnB FALSE 0.032 108.000 0.012 NA N NA
 5888986 5888987 ECIAI39_0553 ECIAI39_0554 nfnB ybdF TRUE 0.794 79.000 0.500 NA   NA
 5888987 5888988 ECIAI39_0554 ECIAI39_0555 ybdF ybdJ FALSE 0.264 80.000 0.000 NA   NA
 5888988 5888989 ECIAI39_0555 ECIAI39_0556 ybdJ ybdK FALSE 0.311 66.000 0.000 NA   NA
 5888989 5888990 ECIAI39_0556 ECIAI39_0557 ybdK entD FALSE 0.004 726.000 0.000 1.000   NA
 5888991 5888992 ECIAI39_0558 ECIAI39_0559     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5888994 5888995 ECIAI39_0561 ECIAI39_0562 fes ybdZ TRUE 0.979 3.000 0.320 NA   NA
 5888995 5888996 ECIAI39_0562 ECIAI39_0563 ybdZ entF TRUE 0.947 -3.000 0.080 NA   NA
 5888996 5888997 ECIAI39_0563 ECIAI39_0564 entF fepE FALSE 0.018 215.000 0.000 1.000 N NA
 5888998 5888999 ECIAI39_0565 ECIAI39_0566 fepC fepG TRUE 0.988 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5888999 5889000 ECIAI39_0566 ECIAI39_0567 fepG fepD TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.056 Y NA
 5889003 5889004 ECIAI39_0570 ECIAI39_0571 entC entE TRUE 0.996 10.000 0.667 1.000 Y NA
 5889004 5889005 ECIAI39_0571 ECIAI39_0572 entE entB TRUE 0.995 14.000 0.667 1.000 Y NA
 5889005 5889006 ECIAI39_0572 ECIAI39_0573 entB entA TRUE 0.992 0.000 0.024 0.057 Y NA
 5889006 5889007 ECIAI39_0573 ECIAI39_0574 entA ybdB TRUE 0.982 3.000 0.065 NA Y NA
 5889007 5889008 ECIAI39_0574 ECIAI39_0575 ybdB cstA FALSE 0.128 181.000 0.222 NA N NA
 5889008 5889009 ECIAI39_0575 ECIAI39_0576 cstA ybdD TRUE 0.593 113.000 0.333 NA   NA
 5889012 5889013 ECIAI39_0579 ECIAI39_0580 ibrB ibrA TRUE 0.811 -27.000 0.000 1.000   NA
 5889013 5889014 ECIAI39_0580 ECIAI39_0581 ibrA ybdO FALSE 0.451 147.000 0.333 1.000   NA
 5889014 5889015 ECIAI39_0581 ECIAI39_0582 ybdO dsbG FALSE 0.051 169.000 0.067 1.000 N NA
 5889016 5889017 ECIAI39_0583 ECIAI39_0584 ahpC ahpF TRUE 0.950 129.000 0.551 0.001 Y NA
 5889018 5889019 ECIAI39_0585 ECIAI39_0586 uspG rnk FALSE 0.004 356.000 0.000 1.000 N NA
 5889019 5889020 ECIAI39_0586 ECIAI39_0587 rnk rna FALSE 0.006 230.000 0.018 1.000 N NA
 5889020 5889021 ECIAI39_0587 ECIAI39_0588 rna citT FALSE 0.068 114.000 0.024 1.000 N NA
 5889021 5889022 ECIAI39_0588 ECIAI39_0589 citT citG TRUE 0.612 50.000 0.194 1.000 N NA
 5889022 5889023 ECIAI39_0589 ECIAI39_0590 citG citX TRUE 0.991 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 5889023 5889024 ECIAI39_0590 ECIAI39_0591 citX citF TRUE 0.803 4.000 0.000 1.000 N NA
 5889024 5889025 ECIAI39_0591 ECIAI39_0592 citF citE TRUE 0.924 11.000 0.000 0.001 N NA
 5889025 5889026 ECIAI39_0592 ECIAI39_0593 citE citD TRUE 0.997 -3.000 0.537 0.001 N NA
 5889026 5889027 ECIAI39_0593 ECIAI39_0594 citD citC TRUE 0.950 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5889028 5889029 ECIAI39_0595 ECIAI39_0596 citA citB TRUE 0.958 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 5889031 5889032 ECIAI39_0598 ECIAI39_0599 crcA cspE FALSE 0.312 175.000 0.333 1.000   NA
 5889034 5889035 ECIAI39_0601 ECIAI39_0602 ybeM tatE FALSE 0.372 129.000 0.196 1.000   NA
 5889036 5889037 ECIAI39_0603 ECIAI39_0604 lipA ybeF FALSE 0.007 209.000 0.005 1.000 N NA
 5889037 5889038 ECIAI39_0604 ECIAI39_0605 ybeF lipB FALSE 0.010 259.000 0.000 1.000 N NA
 5889038 5889039 ECIAI39_0605 ECIAI39_0606 lipB ybeD FALSE 0.491 101.000 0.219 NA   NA
 5889039 5889040 ECIAI39_0606 ECIAI39_0607 ybeD dacA FALSE 0.249 110.000 0.081 NA   NA
 5889040 5889041 ECIAI39_0607 ECIAI39_0608 dacA rlpA TRUE 0.829 140.000 0.475 NA Y NA
 5889041 5889042 ECIAI39_0608 ECIAI39_0609 rlpA mrdB TRUE 0.512 11.000 0.035 NA N NA
 5889042 5889043 ECIAI39_0609 ECIAI39_0610 mrdB mrdA TRUE 0.803 3.000 0.046 1.000 N NA
 5889043 5889044 ECIAI39_0610 ECIAI39_0611 mrdA ybeA FALSE 0.489 31.000 0.031 NA   NA
 5889044 5889045 ECIAI39_0611 ECIAI39_0612 ybeA ybeB TRUE 0.974 4.000 0.307 NA   NA
 5889045 5889046 ECIAI39_0612 ECIAI39_0613 ybeB phpB FALSE 0.017 260.000 0.000 NA   NA
 5889046 5889047 ECIAI39_0613 ECIAI39_0614 phpB nadD TRUE 0.533 24.000 0.057 1.000 N NA
 5889047 5889048 ECIAI39_0614 ECIAI39_0615 nadD holA TRUE 0.816 2.000 0.045 1.000 N NA
 5889048 5889049 ECIAI39_0615 ECIAI39_0616 holA rlpB TRUE 0.961 0.000 0.199 NA N NA
 5889049 5889050 ECIAI39_0616 ECIAI39_0617 rlpB leuS TRUE 0.839 15.000 0.182 NA N NA
 5889052 5889053 ECIAI39_0619 ECIAI39_0620 rihA gltL FALSE 0.306 118.000 0.195 NA N NA
 5889053 5889054 ECIAI39_0620 ECIAI39_0621 gltL gltK TRUE 0.997 0.000 0.379 1.000 Y NA
 5889054 5889055 ECIAI39_0621 ECIAI39_0622 gltK gltJ TRUE 1.000 0.000 0.933 0.017 Y NA
 5889055 5889056 ECIAI39_0622 ECIAI39_misc_RNA_12 gltJ   TRUE 0.771 12.000 0.000 NA   NA
 5889056 5889057 ECIAI39_misc_RNA_12 ECIAI39_0623   gltI TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5889057 5889058 ECIAI39_0623 ECIAI39_0624 gltI lnt FALSE 0.003 397.000 0.000 1.000 N NA
 5889058 5889059 ECIAI39_0624 ECIAI39_0625 lnt ybeX TRUE 0.947 25.000 0.557 1.000 N NA
 5889059 5889060 ECIAI39_0625 ECIAI39_0626 ybeX ybeY FALSE 0.414 90.000 0.150 NA   NA
 5889060 5889061 ECIAI39_0626 ECIAI39_0627 ybeY ybeZ TRUE 0.992 -3.000 0.457 NA   NA
 5889061 5889062 ECIAI39_0627 ECIAI39_0628 ybeZ miaB FALSE 0.387 114.000 0.220 1.000 N NA
 5889064 5889065 ECIAI39_tRNA82 ECIAI39_tRNA81     TRUE 0.509 38.000 0.000 NA   NA
 5889065 5889066 ECIAI39_tRNA81 ECIAI39_tRNA80     FALSE 0.420 49.000 0.000 NA   NA
 5889066 5889067 ECIAI39_tRNA80 ECIAI39_tRNA79     TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5889067 5889068 ECIAI39_tRNA79 ECIAI39_tRNA78     TRUE 0.540 35.000 0.000 NA   NA
 5889068 5889069 ECIAI39_tRNA78 ECIAI39_tRNA77     TRUE 0.649 24.000 0.000 NA   NA
 5889069 5889070 ECIAI39_tRNA77 ECIAI39_tRNA76     TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 5889072 5889073 ECIAI39_0631 ECIAI39_0632 asnB nagD FALSE 0.011 257.000 0.000 1.000 N NA
 5889073 5889074 ECIAI39_0632 ECIAI39_0633 nagD nagC TRUE 0.849 48.000 0.070 1.000 Y NA
 5889074 5889075 ECIAI39_0633 ECIAI39_0634 nagC nagA TRUE 0.996 9.000 0.571 1.000 Y NA
 5889075 5889076 ECIAI39_0634 ECIAI39_0635 nagA nagB TRUE 0.983 60.000 0.557 0.001 Y NA
 5889077 5889078 ECIAI39_0636 ECIAI39_0637 nagE glnS FALSE 0.008 203.000 0.006 1.000 N NA
 5889078 5889079 ECIAI39_0637 ECIAI39_0638 glnS ybfM FALSE 0.006 442.000 0.000 1.000   NA
 5889079 5889080 ECIAI39_0638 ECIAI39_0639 ybfM ybfN TRUE 0.938 50.000 0.800 NA   NA
 5889083 5889084 ECIAI39_0642 ECIAI39_0643 fldA ybfE TRUE 0.598 140.000 0.473 1.000   NA
 5889084 5889085 ECIAI39_0643 ECIAI39_0644 ybfE ybfF FALSE 0.392 140.000 0.276 NA   NA
 5889086 5889087 ECIAI39_0645 ECIAI39_0646 seqA pgm TRUE 0.724 26.000 0.151 1.000 N NA
 5889087 5889088 ECIAI39_0646 ECIAI39_0647 pgm ybfP FALSE 0.036 205.000 0.000 NA   NA
 5889089 5889090 ECIAI39_0648 ECIAI39_0649     TRUE 0.775 -30.000 0.000 NA   NA
 5889090 5889091 ECIAI39_0649 ECIAI39_0650   potE FALSE 0.170 122.000 0.000 NA   NA
 5889091 5889092 ECIAI39_0650 ECIAI39_0651 potE speF TRUE 0.991 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5889094 5889095 ECIAI39_0653 ECIAI39_0654 kdpE kdpD TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5889095 5889096 ECIAI39_0654 ECIAI39_0655 kdpD kdpC TRUE 0.895 -7.000 0.100 1.000 N NA
 5889096 5889097 ECIAI39_0655 ECIAI39_0656 kdpC kdpB TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 5889097 5889098 ECIAI39_0656 ECIAI39_0657 kdpB kdpA TRUE 0.985 23.000 0.201 0.001 Y NA
 5889099 5889100 ECIAI39_0658 ECIAI39_0659 ybfA ybgA TRUE 0.513 101.000 0.231 NA   NA
 5889100 5889101 ECIAI39_0659 ECIAI39_0660 ybgA phr TRUE 0.897 -3.000 0.019 NA   NA
 5889103 5889104 ECIAI39_0662 ECIAI39_0663 ybgI ybgJ TRUE 0.643 23.000 0.050 NA   NA
 5889104 5889105 ECIAI39_0663 ECIAI39_0664 ybgJ ybgK TRUE 0.996 -6.000 0.379 NA Y NA
 5889105 5889106 ECIAI39_0664 ECIAI39_0665 ybgK ybgL TRUE 0.953 -10.000 0.211 NA   NA
 5889106 5889107 ECIAI39_0665 ECIAI39_0666 ybgL nei TRUE 0.517 36.000 0.037 1.000   NA
 5889108 5889109 ECIAI39_0667 ECIAI39_0668 abrB   FALSE 0.058 180.000 0.000 NA   NA
 5889110 5889111 ECIAI39_0669 ECIAI39_0670     TRUE 0.580 13.000 0.000 NA N NA
 5889111 5889112 ECIAI39_0670 ECIAI39_0671     TRUE 0.904 12.000 0.091 0.028 N NA
 5889112 5889113 ECIAI39_0671 ECIAI39_0672     TRUE 0.766 15.000 0.000 1.000   NA
 5889113 5889114 ECIAI39_0672 ECIAI39_0673     TRUE 0.982 0.000 0.000 0.001   NA
 5889114 5889115 ECIAI39_0673 ECIAI39_0674     TRUE 0.902 28.000 0.000 NA Y NA
 5889115 5889116 ECIAI39_0674 ECIAI39_0675     TRUE 0.979 24.000 0.364 NA Y NA
 5889116 5889117 ECIAI39_0675 ECIAI39_0676     TRUE 0.998 0.000 0.571 NA Y NA
 5889118 5889119 ECIAI39_0677 ECIAI39_0678 gltA   FALSE 0.035 206.000 0.000 NA   NA
 5889120 5889121 ECIAI39_0679 ECIAI39_0680 sdhC sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 5889121 5889122 ECIAI39_0680 ECIAI39_0681 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 5889122 5889123 ECIAI39_0681 ECIAI39_0682 sdhA sdhB TRUE 0.997 16.000 0.604 0.002 Y NA
 5889123 5889124 ECIAI39_0682 ECIAI39_0683 sdhB sucA FALSE 0.231 201.000 0.067 1.000 Y NA
 5889124 5889125 ECIAI39_0683 ECIAI39_0684 sucA sucB TRUE 0.994 15.000 0.667 1.000 Y NA
 5889125 5889126 ECIAI39_0684 ECIAI39_0685 sucB sucC TRUE 0.757 94.000 0.136 1.000 Y NA
 5889126 5889127 ECIAI39_0685 ECIAI39_0686 sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5889127 5889128 ECIAI39_0686 ECIAI39_misc_RNA_13 sucD rybD TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5889130 5889131 ECIAI39_0688 ECIAI39_0689 hutU   FALSE 0.062 119.000 0.024 1.000 N NA
 5889131 5889132 ECIAI39_0689 ECIAI39_0690     TRUE 0.864 2.000 0.028 NA   NA
 5889132 5889133 ECIAI39_0690 ECIAI39_0691   hutI TRUE 0.678 -36.000 0.026 NA   NA
 5889133 5889134 ECIAI39_0691 ECIAI39_0692 hutI hutG TRUE 0.854 -39.000 0.171 1.000 N NA
 5889136 5889137 ECIAI39_0694 ECIAI39_0695 hutH   FALSE 0.009 271.000 0.000 1.000 N NA
 5889138 5889139 ECIAI39_0696 ECIAI39_0697     TRUE 0.522 10.000 0.012 1.000 N NA
 5889139 5889140 ECIAI39_0697 ECIAI39_0698     TRUE 0.895 108.000 0.429 1.000 Y NA
 5889140 5889141 ECIAI39_0698 ECIAI39_0699     FALSE 0.202 140.000 0.121 NA   NA
 5889141 5889142 ECIAI39_0699 ECIAI39_0700     TRUE 0.996 -3.000 0.689 NA   NA
 5889142 5889143 ECIAI39_0700 ECIAI39_0701     TRUE 0.977 4.000 0.333 NA   NA
 5889143 5889144 ECIAI39_0701 ECIAI39_0702     TRUE 0.999 0.000 0.651 1.000 Y NA
 5889144 5889145 ECIAI39_0702 ECIAI39_0703   glmL TRUE 0.982 19.000 0.429 0.001   NA
 5889145 5889146 ECIAI39_0703 ECIAI39_0704 glmL   TRUE 0.996 0.000 0.367 0.001   NA
 5889146 5889147 ECIAI39_0704 ECIAI39_0705     FALSE 0.165 124.000 0.000 NA   NA
 5889147 5889148 ECIAI39_0705 ECIAI39_0706     FALSE 0.045 193.000 0.000 NA   NA
 5889148 5889149 ECIAI39_0706 ECIAI39_0707     FALSE 0.262 81.000 0.000 NA   NA
 5889150 5889151 ECIAI39_0708 ECIAI39_0709 cydA cydB TRUE 0.971 16.000 0.000 0.049 Y NA
 5889151 5889152 ECIAI39_0709 ECIAI39_0710 cydB ybgE FALSE 0.222 128.000 0.100 NA   NA
 5889152 5889153 ECIAI39_0710 ECIAI39_0711 ybgE ybgC FALSE 0.144 150.000 0.095 NA   NA
 5889153 5889154 ECIAI39_0711 ECIAI39_0712 ybgC tolQ TRUE 0.995 -3.000 0.593 1.000   NA
 5889154 5889155 ECIAI39_0712 ECIAI39_0713 tolQ tolR TRUE 0.998 4.000 0.556 0.069 Y NA
 5889155 5889156 ECIAI39_0713 ECIAI39_0714 tolR tolA FALSE 0.321 65.000 0.114 NA N NA
 5889156 5889157 ECIAI39_0714 ECIAI39_0715 tolA tolB FALSE 0.063 133.000 0.051 NA N NA
 5889157 5889158 ECIAI39_0715 ECIAI39_0716 tolB pal TRUE 0.930 35.000 0.592 1.000 N NA
 5889158 5889159 ECIAI39_0716 ECIAI39_0717 pal ybgF TRUE 0.881 10.000 0.088 1.000   NA
 5889159 5889160 ECIAI39_0717 ECIAI39_tRNA2 ybgF   FALSE 0.076 165.000 0.000 NA   NA
 5889160 5889161 ECIAI39_tRNA2 ECIAI39_tRNA3     TRUE 0.531 36.000 0.000 NA   NA
 5889161 5889162 ECIAI39_tRNA3 ECIAI39_tRNA4     TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5889162 5889163 ECIAI39_tRNA4 ECIAI39_tRNA5     FALSE 0.394 52.000 0.000 NA   NA
 5889163 5889164 ECIAI39_tRNA5 ECIAI39_tRNA6     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5889164 5889165 ECIAI39_tRNA6 ECIAI39_tRNA7     FALSE 0.420 49.000 0.000 NA   NA
 5889165 5889166 ECIAI39_tRNA7 ECIAI39_tRNA8     TRUE 0.549 34.000 0.000 NA   NA
 5889166 5889167 ECIAI39_tRNA8 ECIAI39_0718   nadA FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 5889167 5889168 ECIAI39_0718 ECIAI39_0719 nadA pnuC TRUE 0.855 38.000 0.023 1.000 Y NA
 5889169 5889170 ECIAI39_0720 ECIAI39_0721 zitB ybgS FALSE 0.199 114.000 0.057 NA   NA
 5889172 5889173 ECIAI39_0723 ECIAI39_0724 gpmA galM FALSE 0.174 203.000 0.009 1.000 Y NA
 5889173 5889174 ECIAI39_0724 ECIAI39_0725 galM galK TRUE 0.995 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 5889174 5889175 ECIAI39_0725 ECIAI39_0726 galK galT TRUE 0.990 4.000 0.370 0.001 N NA
 5889175 5889176 ECIAI39_0726 ECIAI39_0727 galT galE TRUE 0.933 10.000 0.053 0.001 N NA
 5889176 5889177 ECIAI39_0727 ECIAI39_0728 galE modF FALSE 0.014 262.000 0.023 1.000   NA
 5889177 5889178 ECIAI39_0728 ECIAI39_0729 modF modE FALSE 0.445 68.000 0.009 0.089   NA
 5889179 5889180 ECIAI39_0730 ECIAI39_0731 ybhT modA FALSE 0.087 167.000 0.072 NA   NA
 5889180 5889181 ECIAI39_0731 ECIAI39_0732 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 5889181 5889182 ECIAI39_0732 ECIAI39_0733 modB modC TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 5889186 5889187 ECIAI39_0737 ECIAI39_0738 insA insB TRUE 0.967 -81.000 0.000 0.028 Y NA
 5889187 5889188 ECIAI39_0738 ECIAI39_0739 insB ybhJ FALSE 0.200 69.000 0.000 1.000 N NA
 5889189 5889190 ECIAI39_0740 ECIAI39_0741 ybhC   FALSE 0.265 135.000 0.200 1.000 N NA
 5889190 5889191 ECIAI39_0741 ECIAI39_0742     FALSE 0.116 199.000 0.000 0.028   NA
 5889191 5889192 ECIAI39_0742 ECIAI39_misc_RNA_14     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5889192 5889193 ECIAI39_misc_RNA_14 ECIAI39_0743     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5889193 5889194 ECIAI39_0743 ECIAI39_0744     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5889194 5889195 ECIAI39_0744 ECIAI39_0745     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889199 5889200 ECIAI39_0749 ECIAI39_0750 ybhB bioA FALSE 0.221 59.000 0.003 NA   NA
 5889201 5889202 ECIAI39_0751 ECIAI39_0752 bioB bioF TRUE 0.997 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 5889202 5889203 ECIAI39_0752 ECIAI39_0753 bioF bioC TRUE 0.992 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 5889203 5889204 ECIAI39_0753 ECIAI39_0754 bioC bioD TRUE 0.992 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 5889204 5889205 ECIAI39_0754 ECIAI39_0755 bioD uvrB FALSE 0.007 579.000 0.000 0.088 N NA
 5889207 5889208 ECIAI39_0757 ECIAI39_0758 moaA moaB TRUE 0.976 22.000 0.108 0.003 Y NA
 5889208 5889209 ECIAI39_0758 ECIAI39_0759 moaB moaC TRUE 0.994 3.000 0.109 0.003 Y NA
 5889209 5889210 ECIAI39_0759 ECIAI39_0760 moaC moaD TRUE 0.995 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 5889210 5889211 ECIAI39_0760 ECIAI39_0761 moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 5889211 5889212 ECIAI39_0761 ECIAI39_0762 moaE ybhL FALSE 0.091 137.000 0.025 NA   NA
 5889212 5889213 ECIAI39_0762 ECIAI39_0763 ybhL ybhM FALSE 0.027 207.000 0.037 NA   NA
 5889214 5889215 ECIAI39_0764 ECIAI39_0765 ybhN ybhO TRUE 0.935 0.000 0.071 NA   NA
 5889215 5889216 ECIAI39_0765 ECIAI39_0766 ybhO ybhP TRUE 0.988 -3.000 0.333 NA   NA
 5889218 5889219 ECIAI39_0768 ECIAI39_0769 ybhR ybhS TRUE 0.998 11.000 0.609 0.006 Y NA
 5889219 5889220 ECIAI39_0769 ECIAI39_0770 ybhS ybhF TRUE 0.994 -7.000 0.547 0.088   NA
 5889220 5889221 ECIAI39_0770 ECIAI39_0771 ybhF ybhG TRUE 0.990 -7.000 0.545 1.000   NA
 5889221 5889222 ECIAI39_0771 ECIAI39_0772 ybhG ybiH TRUE 0.973 0.000 0.236 1.000 N NA
 5889223 5889224 ECIAI39_0773 ECIAI39_0774 rhlE   FALSE 0.095 152.000 0.000 NA   NA
 5889224 5889225 ECIAI39_0774 ECIAI39_0775     FALSE 0.010 312.000 0.000 NA   NA
 5889225 5889226 ECIAI39_0775 ECIAI39_0776   dinG FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 5889226 5889227 ECIAI39_0776 ECIAI39_0777 dinG ybiB FALSE 0.398 28.000 0.041 1.000 N NA
 5889227 5889228 ECIAI39_0777 ECIAI39_0778 ybiB ybiC FALSE 0.204 141.000 0.000 0.056 N NA
 5889229 5889230 ECIAI39_0779 ECIAI39_0780 ybiJ ybiI FALSE 0.011 265.000 0.027 NA   NA
 5889230 5889231 ECIAI39_0780 ECIAI39_0781 ybiI ybiX FALSE 0.315 74.000 0.000 1.000   NA
 5889231 5889232 ECIAI39_0781 ECIAI39_0782 ybiX fiu TRUE 0.726 42.000 0.171 1.000   NA
 5889232 5889233 ECIAI39_0782 ECIAI39_0783 fiu   TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5889233 5889234 ECIAI39_0783 ECIAI39_0784   ybiM FALSE 0.080 163.000 0.000 NA   NA
 5889236 5889237 ECIAI39_0786 ECIAI39_0787 ybiO glnQ FALSE 0.092 117.000 0.000 NA N NA
 5889237 5889238 ECIAI39_0787 ECIAI39_0788 glnQ glnP TRUE 0.988 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5889238 5889239 ECIAI39_0788 ECIAI39_0789 glnP glnH TRUE 0.624 139.000 0.051 0.068 Y NA
 5889239 5889240 ECIAI39_0789 ECIAI39_0790 glnH dps FALSE 0.003 404.000 0.000 1.000 N NA
 5889240 5889241 ECIAI39_0790 ECIAI39_0791 dps rhtA FALSE 0.010 300.000 0.044 NA   NA
 5889243 5889244 ECIAI39_0793 ECIAI39_misc_RNA_15 ybiP rybA FALSE 0.007 355.000 0.000 NA   NA
 5889245 5889246 ECIAI39_0794 ECIAI39_0795 mntR ybiR TRUE 0.779 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5889249 5889250 ECIAI39_0798 ECIAI39_0799 ybiU ybiV FALSE 0.095 152.000 0.000 NA   NA
 5889250 5889251 ECIAI39_0799 ECIAI39_0800 ybiV ybiW FALSE 0.130 146.000 0.000 1.000   NA
 5889251 5889252 ECIAI39_0800 ECIAI39_0801 ybiW ybiY TRUE 0.984 6.000 0.316 0.003 N NA
 5889254 5889255 ECIAI39_0803 ECIAI39_0804 moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 5889256 5889257 ECIAI39_0805 ECIAI39_0806 iaaA yliA TRUE 0.806 20.000 0.104 1.000   NA
 5889257 5889258 ECIAI39_0806 ECIAI39_0807 yliA yliB TRUE 0.779 20.000 0.083 1.000   NA
 5889258 5889259 ECIAI39_0807 ECIAI39_0808 yliB yliC TRUE 0.997 18.000 0.803 0.055 Y NA
 5889259 5889260 ECIAI39_0808 ECIAI39_0809 yliC yliD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.055 Y NA
 5889260 5889261 ECIAI39_0809 ECIAI39_0810 yliD yliE FALSE 0.028 178.000 0.000 NA N NA
 5889261 5889262 ECIAI39_0810 ECIAI39_0811 yliE yliF TRUE 0.970 8.000 0.000 NA Y NA
 5889263 5889264 ECIAI39_0812 ECIAI39_0813     TRUE 0.969 -10.000 0.300 NA   NA
 5889264 5889265 ECIAI39_0813 ECIAI39_0814   yliG FALSE 0.026 226.000 0.000 NA   NA
 5889266 5889267 ECIAI39_0815 ECIAI39_0816 bssR yliI FALSE 0.181 111.000 0.047 NA   NA
 5889270 5889271 ECIAI39_0819 ECIAI39_0820 deoR ybjG TRUE 0.702 58.000 0.235 1.000   NA
 5889273 5889274 ECIAI39_0822 ECIAI39_0823 ybjH ybjI FALSE 0.256 85.000 0.000 NA   NA
 5889274 5889275 ECIAI39_0823 ECIAI39_0824 ybjI ybjJ TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5889277 5889278 ECIAI39_misc_RNA_16 ECIAI39_0826 rybB ybjL FALSE 0.271 77.000 0.000 NA   NA
 5889281 5889282 ECIAI39_0829 ECIAI39_0830 ybjC nfsA TRUE 0.918 -16.000 0.159 NA   NA
 5889282 5889283 ECIAI39_0830 ECIAI39_0831 nfsA rimK FALSE 0.230 61.000 0.000 1.000 N NA
 5889283 5889284 ECIAI39_0831 ECIAI39_0832 rimK ybjN FALSE 0.270 88.000 0.065 NA   NA
 5889284 5889285 ECIAI39_0832 ECIAI39_0833 ybjN   FALSE 0.035 206.000 0.000 NA   NA
 5889285 5889286 ECIAI39_0833 ECIAI39_0834   potF TRUE 0.827 -16.000 0.000 NA   NA
 5889286 5889287 ECIAI39_0834 ECIAI39_0835 potF potG TRUE 0.950 95.000 0.679 1.000 Y NA
 5889287 5889288 ECIAI39_0835 ECIAI39_0836 potG potH TRUE 0.997 10.000 0.857 1.000 Y NA
 5889288 5889289 ECIAI39_0836 ECIAI39_0837 potH potI TRUE 0.999 -3.000 0.528 0.054 Y NA
 5889289 5889290 ECIAI39_0837 ECIAI39_0838 potI ybjO TRUE 0.696 60.000 0.264 NA   NA
 5889290 5889291 ECIAI39_0838 ECIAI39_0839 ybjO rumB TRUE 0.776 41.000 0.226 NA   NA
 5889292 5889293 ECIAI39_0840 ECIAI39_0841 artJ artM FALSE 0.181 292.000 0.143 0.068 Y NA
 5889293 5889294 ECIAI39_0841 ECIAI39_0842 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.017 Y NA
 5889294 5889295 ECIAI39_0842 ECIAI39_0843 artQ artI TRUE 0.994 7.000 0.260 0.054 Y NA
 5889295 5889296 ECIAI39_0843 ECIAI39_0844 artI artP TRUE 0.983 18.000 0.323 1.000 Y NA
 5889296 5889297 ECIAI39_0844 ECIAI39_0845 artP ybjP FALSE 0.028 218.000 0.000 NA   NA
 5889298 5889299 ECIAI39_0846 ECIAI39_0847   ybjQ FALSE 0.031 211.000 0.000 NA   NA
 5889299 5889300 ECIAI39_0847 ECIAI39_0848 ybjQ ybjR TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889301 5889302 ECIAI39_0849 ECIAI39_0850 ybjS ybjT TRUE 0.779 99.000 0.022 0.007 Y NA
 5889302 5889303 ECIAI39_0850 ECIAI39_0851 ybjT ltaE TRUE 0.749 11.000 0.074 1.000 N NA
 5889303 5889304 ECIAI39_0851 ECIAI39_0852 ltaE poxB TRUE 0.872 37.000 0.041 1.000 Y NA
 5889304 5889305 ECIAI39_0852 ECIAI39_0853 poxB hcr FALSE 0.050 133.000 0.025 1.000 N NA
 5889305 5889306 ECIAI39_0853 ECIAI39_0854 hcr hcp TRUE 0.979 12.000 0.000 0.015 Y NA
 5889306 5889307 ECIAI39_0854 ECIAI39_0855 hcp ybjE FALSE 0.115 144.000 0.000 NA   NA
 5889308 5889309 ECIAI39_0856 ECIAI39_0857     FALSE 0.025 227.000 0.000 NA   NA
 5889309 5889310 ECIAI39_0857 ECIAI39_0858   yohG FALSE 0.002 1157.000 0.000 1.000 N NA
 5889310 5889311 ECIAI39_0858 ECIAI39_0859 yohG yohF FALSE 0.413 53.000 0.105 1.000 N NA
 5889313 5889314 ECIAI39_0861 ECIAI39_0862 yohC pbpG FALSE 0.130 174.000 0.145 NA   NA
 5889316 5889317 ECIAI39_0864 ECIAI39_0865 bglX yehZ FALSE 0.020 252.000 0.099 1.000 N NA
 5889317 5889318 ECIAI39_0865 ECIAI39_0866 yehZ yehY TRUE 0.989 7.000 0.521 0.054 N NA
 5889318 5889319 ECIAI39_0866 ECIAI39_0867 yehY yehX TRUE 0.997 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 5889319 5889320 ECIAI39_0867 ECIAI39_0868 yehX yehW TRUE 0.996 5.000 0.542 1.000 Y NA
 5889321 5889322 ECIAI39_0869 ECIAI39_0870 yohO mlrA TRUE 0.898 60.000 0.667 NA   NA
 5889322 5889323 ECIAI39_0870 ECIAI39_0871 mlrA   FALSE 0.311 75.000 0.000 1.000   NA
 5889323 5889324 ECIAI39_0871 ECIAI39_0872     TRUE 0.514 87.000 0.000 0.027   NA
 5889324 5889325 ECIAI39_0872 ECIAI39_misc_RNA_17     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5889325 5889326 ECIAI39_misc_RNA_17 ECIAI39_0873     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5889326 5889327 ECIAI39_0873 ECIAI39_0874     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5889327 5889328 ECIAI39_0874 ECIAI39_0875     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889329 5889330 ECIAI39_0876 ECIAI39_0877     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5889330 5889331 ECIAI39_0877 ECIAI39_0878     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5889331 5889332 ECIAI39_0878 ECIAI39_0879     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5889332 5889333 ECIAI39_0879 ECIAI39_0880     TRUE 0.983 -102.000 1.000 NA   NA
 5889333 5889334 ECIAI39_0880 ECIAI39_0881     FALSE 0.008 344.000 0.000 NA   NA
 5889334 5889335 ECIAI39_0881 ECIAI39_0882     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 5889335 5889336 ECIAI39_0882 ECIAI39_0883     FALSE 0.110 152.000 0.000 1.000   NA
 5889336 5889337 ECIAI39_0883 ECIAI39_0884     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889337 5889338 ECIAI39_0884 ECIAI39_0885     TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5889340 5889341 ECIAI39_0887 ECIAI39_0888 yehU yehT TRUE 1.000 -3.000 0.877 0.014 Y NA
 5889341 5889342 ECIAI39_0888 ECIAI39_0889 yehT yehS FALSE 0.421 47.000 0.051 NA   NA
 5889343 5889344 ECIAI39_0890 ECIAI39_0891 yehR yehQ FALSE 0.163 125.000 0.000 NA   NA
 5889344 5889345 ECIAI39_0891 ECIAI39_0892 yehQ yehP TRUE 0.970 -3.000 0.160 NA   NA
 5889345 5889346 ECIAI39_0892 ECIAI39_0893 yehP yehM TRUE 0.935 -7.000 0.120 NA   NA
 5889346 5889347 ECIAI39_0893 ECIAI39_0894 yehM yehL TRUE 0.859 11.000 0.100 NA   NA
 5889347 5889348 ECIAI39_0894 ECIAI39_0895 yehL yehK FALSE 0.003 704.000 0.000 NA   NA
 5889348 5889349 ECIAI39_0895 ECIAI39_0896 yehK yehI FALSE 0.336 61.000 0.000 NA   NA
 5889350 5889351 ECIAI39_0897 ECIAI39_0898 insA insB TRUE 0.967 -81.000 0.000 0.028 Y NA
 5889352 5889353 ECIAI39_0899 ECIAI39_0900     TRUE 0.775 -30.000 0.000 NA   NA
 5889353 5889354 ECIAI39_0900 ECIAI39_0901     TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5889354 5889355 ECIAI39_0901 ECIAI39_0902   metG FALSE 0.119 141.000 0.000 NA   NA
 5889356 5889357 ECIAI39_0903 ECIAI39_0904 mrp yehE FALSE 0.016 263.000 0.000 NA   NA
 5889359 5889360 ECIAI39_0906 ECIAI39_0907 yehD yehC TRUE 0.849 81.000 0.222 1.000 Y NA
 5889360 5889361 ECIAI39_0907 ECIAI39_0908 yehC yehB TRUE 0.996 16.000 1.000 1.000 Y NA
 5889361 5889362 ECIAI39_0908 ECIAI39_0909 yehB yehA TRUE 0.757 16.000 0.000 1.000   NA
 5889363 5889364 ECIAI39_0910 ECIAI39_0911 yohN rncA TRUE 0.501 39.000 0.000 NA   NA
 5889365 5889366 ECIAI39_0912 ECIAI39_misc_RNA_18 yohL   FALSE 0.240 92.000 0.000 NA   NA
 5889366 5889367 ECIAI39_misc_RNA_18 ECIAI39_0913   thiM TRUE 0.540 35.000 0.000 NA   NA
 5889367 5889368 ECIAI39_0913 ECIAI39_0914 thiM thiD TRUE 0.995 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 5889368 5889369 ECIAI39_0914 ECIAI39_0915 thiD yegX FALSE 0.215 65.000 0.000 1.000 N NA
 5889369 5889370 ECIAI39_0915 ECIAI39_0916 yegX yegW FALSE 0.277 52.000 0.000 1.000 N NA
 5889371 5889372 ECIAI39_0917 ECIAI39_0918 yegV yegU TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA N NA
 5889372 5889373 ECIAI39_0918 ECIAI39_0919 yegU yegT TRUE 0.990 -3.000 0.364 NA   NA
 5889374 5889375 ECIAI39_0920 ECIAI39_0921 fbaB gatY FALSE 0.285 229.000 0.000 0.002 Y NA
 5889375 5889376 ECIAI39_0921 ECIAI39_0922 gatY gatZ TRUE 0.961 29.000 0.000 0.001 Y NA
 5889376 5889377 ECIAI39_0922 ECIAI39_0923 gatZ gatA TRUE 0.968 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5889377 5889378 ECIAI39_0923 ECIAI39_0924 gatA gatB TRUE 0.948 31.000 0.000 0.013 Y NA
 5889378 5889379 ECIAI39_0924 ECIAI39_0925 gatB gatC TRUE 0.989 4.000 0.000 0.019 Y NA
 5889379 5889380 ECIAI39_0925 ECIAI39_0926 gatC gatD FALSE 0.307 48.000 0.000 1.000 N NA
 5889380 5889381 ECIAI39_0926 ECIAI39_0927 gatD gatR FALSE 0.141 100.000 0.000 1.000 N NA
 5889384 5889385 ECIAI39_misc_RNA_19 ECIAI39_0930 ryeE yegQ FALSE 0.259 83.000 0.000 NA   NA
 5889385 5889386 ECIAI39_0930 ECIAI39_0931 yegQ   FALSE 0.214 103.000 0.000 NA   NA
 5889386 5889387 ECIAI39_0931 ECIAI39_0932     TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 5889387 5889388 ECIAI39_0932 ECIAI39_0933   yegP FALSE 0.033 209.000 0.000 NA   NA
 5889388 5889389 ECIAI39_0933 ECIAI39_0934 yegP   FALSE 0.492 40.000 0.000 NA   NA
 5889389 5889390 ECIAI39_0934 ECIAI39_0935   baeR TRUE 0.738 -43.000 0.000 NA   NA
 5889390 5889391 ECIAI39_0935 ECIAI39_0936 baeR baeS TRUE 0.999 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 5889391 5889392 ECIAI39_0936 ECIAI39_0937 baeS mdtD TRUE 0.952 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5889392 5889393 ECIAI39_0937 ECIAI39_0938 mdtD mdtC TRUE 0.986 1.000 0.438 1.000 N NA
 5889393 5889394 ECIAI39_0938 ECIAI39_0939 mdtC mdtB TRUE 0.985 1.000 0.062 NA Y NA
 5889394 5889395 ECIAI39_0939 ECIAI39_0940 mdtB mdtA TRUE 0.843 0.000 0.000 NA N NA
 5889395 5889396 ECIAI39_0940 ECIAI39_misc_RNA_20 mdtA   FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 5889396 5889397 ECIAI39_misc_RNA_20 ECIAI39_misc_RNA_21   ryeD FALSE 0.051 186.000 0.000 NA   NA
 5889397 5889398 ECIAI39_misc_RNA_21 ECIAI39_misc_RNA_22 ryeD ryeC FALSE 0.049 187.000 0.000 NA   NA
 5889399 5889400 ECIAI39_0941 ECIAI39_0942 yegL yegK TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889400 5889401 ECIAI39_0942 ECIAI39_0943 yegK yegI TRUE 0.983 -12.000 0.455 1.000   NA
 5889405 5889406 ECIAI39_0947 ECIAI39_0948 udk dcd TRUE 0.734 92.000 0.098 1.000 Y NA
 5889406 5889407 ECIAI39_0948 ECIAI39_0949 dcd asmA TRUE 0.497 22.000 0.057 NA N NA
 5889408 5889409 ECIAI39_0950 ECIAI39_0951     TRUE 0.945 -28.000 0.286 NA   NA
 5889409 5889410 ECIAI39_0951 ECIAI39_0952   yegH FALSE 0.277 75.000 0.000 NA   NA
 5889411 5889412 ECIAI39_0953 ECIAI39_0954 wza wzb TRUE 0.956 6.000 0.286 1.000 N NA
 5889412 5889413 ECIAI39_0954 ECIAI39_0955 wzb wzc TRUE 0.827 3.000 0.000 1.000 N NA
 5889413 5889414 ECIAI39_0955 ECIAI39_0956 wzc wcaA TRUE 0.660 93.000 0.000 NA Y NA
 5889414 5889415 ECIAI39_0956 ECIAI39_0957 wcaA wcaB TRUE 0.961 3.000 0.259 NA N NA
 5889415 5889416 ECIAI39_0957 ECIAI39_0958 wcaB wcaC TRUE 0.979 -3.000 0.259 1.000 N NA
 5889416 5889417 ECIAI39_0958 ECIAI39_0959 wcaC wcaD TRUE 0.967 -25.000 0.400 NA   NA
 5889417 5889418 ECIAI39_0959 ECIAI39_0960 wcaD wcaE TRUE 0.959 11.000 0.333 NA   NA
 5889418 5889419 ECIAI39_0960 ECIAI39_0961 wcaE wcaF TRUE 0.770 16.000 0.077 NA   NA
 5889419 5889420 ECIAI39_0961 ECIAI39_0962 wcaF gmd TRUE 0.555 27.000 0.022 1.000   NA
 5889420 5889421 ECIAI39_0962 ECIAI39_0963 gmd fcl TRUE 0.992 3.000 0.000 0.007 Y NA
 5889421 5889422 ECIAI39_0963 ECIAI39_0964 fcl nudD TRUE 0.984 3.000 0.217 0.001 N NA
 5889422 5889423 ECIAI39_0964 ECIAI39_0965 nudD wcaI TRUE 0.941 -3.000 0.108 1.000 N NA
 5889423 5889424 ECIAI39_0965 ECIAI39_0966 wcaI cpsB TRUE 0.988 3.000 0.123 1.000 Y NA
 5889424 5889425 ECIAI39_0966 ECIAI39_0967 cpsB cpsG TRUE 0.868 102.000 1.000 1.000 N NA
 5889425 5889426 ECIAI39_0967 ECIAI39_0968 cpsG wcaJ TRUE 0.839 55.000 0.538 NA N NA
 5889426 5889427 ECIAI39_0968 ECIAI39_0969 wcaJ wzxC TRUE 0.979 2.000 0.304 NA   NA
 5889427 5889428 ECIAI39_0969 ECIAI39_0970 wzxC wcaK FALSE 0.376 73.000 0.095 NA   NA
 5889428 5889429 ECIAI39_0970 ECIAI39_0971 wcaK wcaL TRUE 0.955 -3.000 0.095 NA   NA
 5889429 5889430 ECIAI39_0971 ECIAI39_0972 wcaL wcaM TRUE 0.950 11.000 0.292 NA   NA
 5889430 5889431 ECIAI39_0972 ECIAI39_0973 wcaM galF FALSE 0.228 175.000 0.259 NA   NA
 5889431 5889432 ECIAI39_0973 ECIAI39_0974 galF rmlB FALSE 0.044 373.000 0.000 1.000 Y NA
 5889432 5889433 ECIAI39_0974 ECIAI39_0975 rmlB rmlD TRUE 0.996 0.000 0.084 0.002 Y NA
 5889433 5889434 ECIAI39_0975 ECIAI39_0976 rmlD rmlA TRUE 0.895 59.000 0.053 0.002 Y NA
 5889434 5889435 ECIAI39_0976 ECIAI39_0977 rmlA rmlC TRUE 0.989 5.000 0.211 1.000 Y NA
 5889435 5889436 ECIAI39_0977 ECIAI39_0978 rmlC wzx TRUE 0.919 1.000 0.054 1.000   NA
 5889436 5889437 ECIAI39_0978 ECIAI39_0979 wzx vioA TRUE 0.937 3.000 0.103 1.000   NA
 5889437 5889438 ECIAI39_0979 ECIAI39_0980 vioA vioB TRUE 0.956 2.000 0.144 1.000   NA
 5889438 5889439 ECIAI39_0980 ECIAI39_0981 vioB wbbA TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889439 5889440 ECIAI39_0981 ECIAI39_0982 wbbA wbbB TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5889440 5889441 ECIAI39_0982 ECIAI39_0983 wbbB wzy TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889441 5889442 ECIAI39_0983 ECIAI39_0984 wzy wbbC TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889442 5889443 ECIAI39_0984 ECIAI39_0985 wbbC wbbD TRUE 0.975 -10.000 0.000 NA Y NA
 5889445 5889446 ECIAI39_0987 ECIAI39_0988 manC cpsG FALSE 0.418 34.000 0.000 1.000 N NA
 5889446 5889447 ECIAI39_0988 ECIAI39_0989 cpsG gnd FALSE 0.309 164.000 0.005 1.000 Y NA
 5889447 5889448 ECIAI39_0989 ECIAI39_0990 gnd ugd FALSE 0.012 248.000 0.000 1.000 N NA
 5889448 5889449 ECIAI39_0990 ECIAI39_0991 ugd cld FALSE 0.465 146.000 0.000 1.000 Y NA
 5889450 5889451 ECIAI39_0992 ECIAI39_0993 hisI hisF TRUE 0.998 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 5889451 5889452 ECIAI39_0993 ECIAI39_0994 hisF hisA TRUE 0.986 -18.000 0.000 0.003 Y NA
 5889452 5889453 ECIAI39_0994 ECIAI39_0995 hisA hisH TRUE 0.995 0.000 0.000 0.003 Y NA
 5889453 5889454 ECIAI39_0995 ECIAI39_0996 hisH hisB TRUE 0.996 0.000 0.128 0.003 Y NA
 5889454 5889455 ECIAI39_0996 ECIAI39_0997 hisB hisC TRUE 0.998 0.000 0.341 0.003 Y NA
 5889455 5889456 ECIAI39_0997 ECIAI39_0998 hisC hisD TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 5889456 5889457 ECIAI39_0998 ECIAI39_0999 hisD hisG TRUE 0.994 6.000 0.171 0.003 Y NA
 5889457 5889458 ECIAI39_0999 ECIAI39_misc_RNA_23 hisG   FALSE 0.435 47.000 0.000 NA   NA
 5889458 5889459 ECIAI39_misc_RNA_23 ECIAI39_4938   hisL TRUE 0.795 -24.000 0.000 NA   NA
 5889460 5889461 ECIAI39_1000 ECIAI39_1001 yeeZ yeeY FALSE 0.170 46.000 0.015 1.000 N NA
 5889461 5889462 ECIAI39_1001 ECIAI39_1002 yeeY yeeF FALSE 0.009 267.000 0.000 1.000 N NA
 5889462 5889463 ECIAI39_1002 ECIAI39_1003 yeeF yeeE FALSE 0.059 179.000 0.000 NA   NA
 5889463 5889464 ECIAI39_1003 ECIAI39_1004 yeeE yeeD TRUE 0.960 14.000 0.419 NA   NA
 5889467 5889468 ECIAI39_1007 ECIAI39_1008     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5889469 5889470 ECIAI39_1009 ECIAI39_1010 sbmC yeeA FALSE 0.062 198.000 0.096 NA   NA
 5889470 5889471 ECIAI39_1010 ECIAI39_1011 yeeA yeeX FALSE 0.420 106.000 0.180 NA   NA
 5889472 5889473 ECIAI39_1012 ECIAI39_1013 yeeW yeeV FALSE 0.205 107.000 0.000 NA   NA
 5889473 5889474 ECIAI39_1013 ECIAI39_1014 yeeV yeeU FALSE 0.248 89.000 0.000 NA   NA
 5889474 5889475 ECIAI39_1014 ECIAI39_1015 yeeU yeeT FALSE 0.104 149.000 0.000 NA   NA
 5889475 5889476 ECIAI39_1015 ECIAI39_1016 yeeT yeeS FALSE 0.327 63.000 0.000 NA   NA
 5889476 5889477 ECIAI39_1016 ECIAI39_1017 yeeS   TRUE 0.735 15.000 0.000 NA   NA
 5889477 5889478 ECIAI39_1017 ECIAI39_1018     FALSE 0.260 82.000 0.000 NA   NA
 5889478 5889479 ECIAI39_1018 ECIAI39_1019     FALSE 0.006 394.000 0.000 NA   NA
 5889479 5889480 ECIAI39_1019 ECIAI39_1020     FALSE 0.118 142.000 0.000 NA   NA
 5889480 5889481 ECIAI39_1020 ECIAI39_1021     FALSE 0.049 187.000 0.000 NA   NA
 5889481 5889482 ECIAI39_1021 ECIAI39_1022     TRUE 0.860 -10.000 0.000 NA   NA
 5889482 5889483 ECIAI39_1022 ECIAI39_1023     FALSE 0.251 87.000 0.000 NA   NA
 5889483 5889484 ECIAI39_1023 ECIAI39_1024     TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA   NA
 5889484 5889485 ECIAI39_1024 ECIAI39_1025     TRUE 0.636 25.000 0.000 NA   NA
 5889485 5889486 ECIAI39_1025 ECIAI39_1026     TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 5889486 5889487 ECIAI39_1026 ECIAI39_1027     FALSE 0.095 218.000 0.000 0.009   NA
 5889487 5889488 ECIAI39_1027 ECIAI39_1028     TRUE 0.668 22.000 0.000 NA   NA
 5889490 5889491 ECIAI39_1030 ECIAI39_misc_RNA_24     TRUE 0.501 39.000 0.000 NA   NA
 5889491 5889492 ECIAI39_misc_RNA_24 ECIAI39_1031     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5889492 5889493 ECIAI39_1031 ECIAI39_1032     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5889493 5889494 ECIAI39_1032 ECIAI39_1033     FALSE 0.173 120.000 0.000 NA   NA
 5889494 5889495 ECIAI39_1033 ECIAI39_1034     FALSE 0.378 54.000 0.000 NA   NA
 5889495 5889496 ECIAI39_1034 ECIAI39_1035     TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5889496 5889497 ECIAI39_1035 ECIAI39_1036   insM TRUE 0.959 36.000 0.182 0.094 Y NA
 5889497 5889498 ECIAI39_1036 ECIAI39_1037 insM   FALSE 0.359 57.000 0.000 NA   NA
 5889498 5889499 ECIAI39_1037 ECIAI39_1038     TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5889499 5889500 ECIAI39_1038 ECIAI39_1039     FALSE 0.378 54.000 0.000 NA   NA
 5889500 5889501 ECIAI39_1039 ECIAI39_1040     TRUE 0.744 14.000 0.000 NA   NA
 5889501 5889502 ECIAI39_1040 ECIAI39_1041     FALSE 0.051 186.000 0.000 NA   NA
 5889502 5889503 ECIAI39_1041 ECIAI39_1042   yaiO FALSE 0.005 479.000 0.000 NA   NA
 5889503 5889504 ECIAI39_1042 ECIAI39_1043 yaiO yaiX FALSE 0.466 43.000 0.000 NA   NA
 5889504 5889505 ECIAI39_1043 ECIAI39_1044 yaiX yaiP TRUE 0.540 35.000 0.000 NA   NA
 5889505 5889506 ECIAI39_1044 ECIAI39_1045 yaiP yaiS TRUE 0.907 14.000 0.214 NA   NA
 5889507 5889508 ECIAI39_1046 ECIAI39_1047 ibrA   FALSE 0.062 184.000 0.000 1.000   NA
 5889508 5889509 ECIAI39_1047 ECIAI39_1048     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.094 Y NA
 5889509 5889510 ECIAI39_1048 ECIAI39_1049   ibrB FALSE 0.394 52.000 0.000 NA   NA
 5889512 5889513 ECIAI39_1051 ECIAI39_1052     FALSE 0.006 393.000 0.000 NA   NA
 5889513 5889514 ECIAI39_1052 ECIAI39_1054   cobU FALSE 0.005 465.000 0.000 NA   NA
 5889514 5889515 ECIAI39_1054 ECIAI39_1055 cobU cobS TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5889515 5889516 ECIAI39_1055 ECIAI39_1056 cobS cobT TRUE 0.981 12.000 0.056 0.004 Y NA
 5889516 5889517 ECIAI39_1056 ECIAI39_1058 cobT erfK FALSE 0.218 65.000 0.015 NA   NA
 5889519 5889520 ECIAI39_1059 ECIAI39_1060 nac cbl TRUE 0.881 102.000 0.222 0.058 Y NA
 5889522 5889523 ECIAI39_1061 ECIAI39_tRNA9 yeeO   FALSE 0.217 101.000 0.000 NA   NA
 5889524 5889525 ECIAI39_1062 ECIAI39_1063 yeeN amn FALSE 0.008 343.000 0.000 NA   NA
 5889525 5889526 ECIAI39_1063 ECIAI39_1064 amn shiA FALSE 0.074 102.000 0.021 1.000 N NA
 5889528 5889529 ECIAI39_1066 ECIAI39_1067 yeeJ yeeJ TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5889529 5889530 ECIAI39_1067 ECIAI39_1068 yeeJ   TRUE 0.531 36.000 0.000 NA   NA
 5889530 5889531 ECIAI39_1068 ECIAI39_1069     TRUE 0.709 -73.000 0.000 NA   NA
 5889531 5889532 ECIAI39_1069 ECIAI39_1070   fyuA FALSE 0.004 594.000 0.000 NA   NA
 5889532 5889533 ECIAI39_1070 ECIAI39_1071 fyuA irp FALSE 0.181 131.000 0.125 1.000 N NA
 5889533 5889534 ECIAI39_1071 ECIAI39_1072 irp irp TRUE 0.983 4.000 0.094 1.000 Y NA
 5889534 5889535 ECIAI39_1072 ECIAI39_1073 irp irp TRUE 0.998 -3.000 0.406 1.000 Y NA
 5889535 5889536 ECIAI39_1073 ECIAI39_1074 irp irp TRUE 0.991 -63.000 0.333 0.027 Y NA
 5889536 5889537 ECIAI39_1074 ECIAI39_1075 irp irp TRUE 0.883 88.000 0.105 0.001 Y NA
 5889537 5889538 ECIAI39_1075 ECIAI39_1076 irp ybtA FALSE 0.040 173.000 0.000 1.000 N NA
 5889539 5889540 ECIAI39_1077 ECIAI39_1078 irp irp TRUE 0.998 -40.000 0.913 0.006 Y NA
 5889540 5889541 ECIAI39_1078 ECIAI39_1079 irp irp TRUE 0.903 -7.000 0.130 NA N NA
 5889541 5889542 ECIAI39_1079 ECIAI39_1080 irp irp TRUE 0.721 28.000 0.176 NA N NA
 5889543 5889544 ECIAI39_1081 ECIAI39_tRNA73 int   FALSE 0.081 162.000 0.000 NA   NA
 5889544 5889545 ECIAI39_tRNA73 ECIAI39_1082   yeeI FALSE 0.217 101.000 0.000 NA   NA
 5889547 5889548 ECIAI39_1084 ECIAI39_1085 yodA yedZ FALSE 0.021 258.000 0.000 1.000   NA
 5889548 5889549 ECIAI39_1085 ECIAI39_1086 yedZ yedY TRUE 0.997 1.000 0.790 0.047   NA
 5889549 5889550 ECIAI39_1086 ECIAI39_1087 yedY yedX FALSE 0.229 109.000 0.000 1.000   NA
 5889551 5889552 ECIAI39_1088 ECIAI39_1089 yedW yedV TRUE 1.000 0.000 0.857 0.001 Y NA
 5889553 5889554 ECIAI39_1090 ECIAI39_1091 hchA   FALSE 0.004 596.000 0.000 NA   NA
 5889554 5889555 ECIAI39_1091 ECIAI39_1092     TRUE 0.638 -550.000 0.000 NA   NA
 5889555 5889556 ECIAI39_1092 ECIAI39_misc_RNA_25   rseX FALSE 0.003 819.000 0.000 NA   NA
 5889557 5889558 ECIAI39_1093 ECIAI39_1094 yedR yedJ TRUE 0.513 40.000 0.062 NA   NA
 5889558 5889559 ECIAI39_1094 ECIAI39_1095 yedJ dcm FALSE 0.342 67.000 0.000 1.000   NA
 5889559 5889560 ECIAI39_1095 ECIAI39_1096 dcm vsr TRUE 0.980 -19.000 0.000 0.094 Y NA
 5889562 5889563 ECIAI39_1098 ECIAI39_1099 yedI yodC FALSE 0.196 79.000 0.025 NA   NA
 5889563 5889564 ECIAI39_1099 ECIAI39_1100 yodC   FALSE 0.331 62.000 0.000 NA   NA
 5889564 5889565 ECIAI39_1100 ECIAI39_1101   yedQ TRUE 0.701 -79.000 0.000 NA   NA
 5889569 5889570 ECIAI39_misc_RNA_27 ECIAI39_1104 dsrB dsrB TRUE 0.645 -186.000 0.000 NA   NA
 5889571 5889572 ECIAI39_1105 ECIAI39_1106 rcsA fliR FALSE 0.007 290.000 0.000 1.000 N NA
 5889572 5889573 ECIAI39_1106 ECIAI39_1107 fliR fliQ TRUE 0.862 75.000 0.000 0.002 Y NA
 5889573 5889574 ECIAI39_1107 ECIAI39_1108 fliQ fliP TRUE 0.999 10.000 0.827 0.008 Y NA
 5889574 5889575 ECIAI39_1108 ECIAI39_1109 fliP fliO TRUE 0.994 0.000 0.203 1.000 Y NA
 5889575 5889576 ECIAI39_1109 ECIAI39_1110 fliO fliN TRUE 0.996 3.000 0.443 1.000 Y NA
 5889576 5889577 ECIAI39_1110 ECIAI39_1111 fliN fliM TRUE 0.997 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 5889577 5889578 ECIAI39_1111 ECIAI39_1112 fliM fliL TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 5889578 5889579 ECIAI39_1112 ECIAI39_1113 fliL fliK TRUE 0.719 105.000 0.119 1.000 Y NA
 5889579 5889580 ECIAI39_1113 ECIAI39_1114 fliK fliJ TRUE 0.998 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 5889580 5889581 ECIAI39_1114 ECIAI39_1115 fliJ fliI TRUE 0.926 19.000 0.006 1.000 Y NA
 5889581 5889582 ECIAI39_1115 ECIAI39_1116 fliI fliH TRUE 0.988 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5889582 5889583 ECIAI39_1116 ECIAI39_1117 fliH fliG TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5889584 5889585 ECIAI39_1118 ECIAI39_1119     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.093 Y NA
 5889586 5889587 ECIAI39_1120 ECIAI39_1121 fliG fliF TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5889589 5889590 ECIAI39_1123 ECIAI39_1124 yedL yedK FALSE 0.197 111.000 0.000 NA   NA
 5889590 5889591 ECIAI39_1124 ECIAI39_1125 yedK yedF FALSE 0.201 109.000 0.000 NA   NA
 5889591 5889592 ECIAI39_1125 ECIAI39_1126 yedF yedE TRUE 0.997 -3.000 0.844 NA   NA
 5889594 5889595 ECIAI39_1128 ECIAI39_1129 amyA fliT FALSE 0.422 78.000 0.115 1.000   NA
 5889595 5889596 ECIAI39_1129 ECIAI39_1130 fliT fliS TRUE 0.987 0.000 0.324 1.000   NA
 5889596 5889597 ECIAI39_1130 ECIAI39_1131 fliS fliD TRUE 0.987 25.000 0.284 0.002 Y NA
 5889598 5889599 ECIAI39_1132 ECIAI39_1133 fliC fliA FALSE 0.019 166.000 0.012 1.000 N NA
 5889599 5889600 ECIAI39_1133 ECIAI39_1134 fliA fliZ TRUE 0.601 46.000 0.108 1.000   NA
 5889600 5889601 ECIAI39_1134 ECIAI39_1135 fliZ fliY TRUE 0.632 88.000 0.280 1.000   NA
 5889601 5889602 ECIAI39_1135 ECIAI39_1136 fliY yedO TRUE 0.907 105.000 0.469 1.000 Y NA
 5889602 5889603 ECIAI39_1136 ECIAI39_1137 yedO yecS TRUE 0.949 15.000 0.050 1.000 Y NA
 5889603 5889604 ECIAI39_1137 ECIAI39_1138 yecS yecC TRUE 0.993 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 5889604 5889605 ECIAI39_1138 ECIAI39_1139 yecC sdiA FALSE 0.018 230.000 0.071 1.000 N NA
 5889607 5889608 ECIAI39_1141 ECIAI39_1142 uvrY uvrC TRUE 0.974 -3.000 0.086 0.027 N NA
 5889608 5889609 ECIAI39_1142 ECIAI39_1143 uvrC pgsA TRUE 0.614 57.000 0.227 1.000 N NA
 5889609 5889610 ECIAI39_1143 ECIAI39_tRNA11 pgsA   FALSE 0.095 152.000 0.000 NA   NA
 5889610 5889611 ECIAI39_tRNA11 ECIAI39_tRNA12     FALSE 0.371 55.000 0.000 NA   NA
 5889611 5889612 ECIAI39_tRNA12 ECIAI39_tRNA13     TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5889612 5889613 ECIAI39_tRNA13 ECIAI39_1144   yecA FALSE 0.043 196.000 0.000 NA   NA
 5889616 5889617 ECIAI39_1147 ECIAI39_1148 ftn yecR FALSE 0.068 172.000 0.000 NA   NA
 5889617 5889618 ECIAI39_1148 ECIAI39_1149 yecR   FALSE 0.035 207.000 0.000 NA   NA
 5889619 5889620 ECIAI39_misc_RNA_28 ECIAI39_1150 isrB yecJ FALSE 0.262 81.000 0.000 NA   NA
 5889622 5889623 ECIAI39_1152 ECIAI39_1153 araF araG TRUE 0.974 70.000 0.917 NA Y NA
 5889623 5889624 ECIAI39_1153 ECIAI39_1154 araG araH TRUE 0.992 12.000 0.451 1.000 Y NA
 5889624 5889625 ECIAI39_1154 ECIAI39_1155 araH otsB FALSE 0.325 167.000 0.037 1.000 Y NA
 5889625 5889626 ECIAI39_1155 ECIAI39_1156 otsB otsA TRUE 0.986 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 5889628 5889629 ECIAI39_1158 ECIAI39_1159 flhD flhC TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5889629 5889630 ECIAI39_1159 ECIAI39_1160 flhC flhC TRUE 0.668 22.000 0.000 NA   NA
 5889630 5889631 ECIAI39_1160 ECIAI39_1161 flhC motA FALSE 0.156 127.000 0.000 NA   NA
 5889631 5889632 ECIAI39_1161 ECIAI39_1162 motA motB TRUE 0.998 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5889632 5889633 ECIAI39_1162 ECIAI39_1163 motB cheA TRUE 0.998 5.000 0.913 1.000 Y NA
 5889633 5889634 ECIAI39_1163 ECIAI39_1164 cheA cheW TRUE 0.994 21.000 0.447 0.003 Y NA
 5889636 5889637 ECIAI39_1165 ECIAI39_1166 tar cheR FALSE 0.072 291.000 0.037 1.000 Y NA
 5889637 5889638 ECIAI39_1166 ECIAI39_1167 cheR cheB TRUE 0.982 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5889638 5889639 ECIAI39_1167 ECIAI39_1168 cheB cheY TRUE 0.975 15.000 0.000 0.011 Y NA
 5889639 5889640 ECIAI39_1168 ECIAI39_1169 cheY cheZ TRUE 0.963 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5889640 5889641 ECIAI39_1169 ECIAI39_1170 cheZ flhB FALSE 0.189 209.000 0.000 1.000 Y NA
 5889641 5889642 ECIAI39_1170 ECIAI39_1171 flhB flhA TRUE 0.997 -7.000 0.287 0.008 Y NA
 5889642 5889643 ECIAI39_1171 ECIAI39_1172 flhA flhE TRUE 0.988 0.000 0.158 0.002   NA
 5889645 5889646 ECIAI39_1174 ECIAI39_1175 yecM cutC TRUE 0.750 14.000 0.057 NA   NA
 5889646 5889647 ECIAI39_1175 ECIAI39_1176 cutC torY FALSE 0.004 387.000 0.000 1.000 N NA
 5889647 5889648 ECIAI39_1176 ECIAI39_1177 torY torZ TRUE 0.991 25.000 0.481 0.046 Y NA
 5889649 5889650 ECIAI39_1178 ECIAI39_1179 yecP yecO TRUE 0.987 -3.000 0.315 NA   NA
 5889650 5889651 ECIAI39_1179 ECIAI39_1180 yecO yecN TRUE 0.576 41.000 0.089 NA   NA
 5889651 5889652 ECIAI39_1180 ECIAI39_1181 yecN yecE TRUE 0.541 53.000 0.126 NA   NA
 5889652 5889653 ECIAI39_1181 ECIAI39_1182 yecE yecD TRUE 0.952 -3.000 0.089 NA   NA
 5889654 5889655 ECIAI39_1183 ECIAI39_1184 aspS nudB TRUE 0.831 2.000 0.050 1.000 N NA
 5889655 5889656 ECIAI39_1184 ECIAI39_1185 nudB yebC TRUE 0.519 29.000 0.035 NA   NA
 5889656 5889657 ECIAI39_1185 ECIAI39_1186 yebC ruvC TRUE 0.846 35.000 0.277 NA   NA
 5889659 5889660 ECIAI39_1188 ECIAI39_1189 ruvA ruvB TRUE 0.998 9.000 0.549 0.001 Y NA
 5889661 5889662 ECIAI39_1190 ECIAI39_1191 znuB znuC TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.084 Y NA
 5889663 5889664 ECIAI39_1192 ECIAI39_1193 znuA yebA TRUE 0.783 16.000 0.131 1.000 N NA
 5889664 5889665 ECIAI39_1193 ECIAI39_1194 yebA lpxM TRUE 0.818 119.000 0.299 1.000 Y NA
 5889666 5889667 ECIAI39_1195 ECIAI39_1196 pykA yebK FALSE 0.120 128.000 0.071 1.000 N NA
 5889668 5889669 ECIAI39_1197 ECIAI39_1198   zwf TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5889669 5889670 ECIAI39_1198 ECIAI39_1199 zwf edd FALSE 0.126 235.000 0.041 1.000 Y NA
 5889670 5889671 ECIAI39_1199 ECIAI39_1200 edd eda TRUE 0.979 37.000 0.523 1.000 Y NA
 5889673 5889674 ECIAI39_1202 ECIAI39_1203 yebG yebF FALSE 0.288 55.000 0.027 NA   NA
 5889674 5889675 ECIAI39_1203 ECIAI39_1204 yebF yebE FALSE 0.006 326.000 0.028 NA   NA
 5889675 5889676 ECIAI39_1204 ECIAI39_1205 yebE ptrB FALSE 0.051 207.000 0.092 NA   NA
 5889677 5889678 ECIAI39_1206 ECIAI39_1207 exoX yobB TRUE 0.955 24.000 0.500 1.000   NA
 5889678 5889679 ECIAI39_1207 ECIAI39_1208 yobB holE TRUE 0.521 102.000 0.222 1.000   NA
 5889680 5889681 ECIAI39_1209 ECIAI39_1210 yobA yebZ TRUE 0.991 4.000 0.613 1.000   NA
 5889681 5889682 ECIAI39_1210 ECIAI39_1211 yebZ yebY TRUE 0.983 13.000 0.704 NA   NA
 5889684 5889685 ECIAI39_misc_RNA_31 ECIAI39_1212 ryeB pphA FALSE 0.044 195.000 0.000 NA   NA
 5889686 5889687 ECIAI39_1213 ECIAI39_1214 yebW yebV TRUE 0.935 21.000 0.353 NA   NA
 5889687 5889688 ECIAI39_1214 ECIAI39_1215 yebV yebU FALSE 0.285 118.000 0.121 NA   NA
 5889688 5889689 ECIAI39_1215 ECIAI39_1216 yebU yebT TRUE 0.750 80.000 0.420 NA   NA
 5889689 5889690 ECIAI39_1216 ECIAI39_1217 yebT yebS TRUE 0.988 -31.000 0.840 NA   NA
 5889691 5889692 ECIAI39_1218 ECIAI39_1219 yebR proQ TRUE 0.678 97.000 0.081 NA Y NA
 5889692 5889693 ECIAI39_1219 ECIAI39_1220 proQ prc TRUE 0.893 20.000 0.304 NA N NA
 5889693 5889694 ECIAI39_1220 ECIAI39_1221 prc htpX FALSE 0.085 192.000 0.042 0.020 N NA
 5889702 5889703 ECIAI39_1229 ECIAI39_1230 cspC rrmA FALSE 0.072 166.000 0.038 1.000   NA
 5889704 5889705 ECIAI39_1231 ECIAI39_misc_RNA_32 yebN   FALSE 0.201 109.000 0.000 NA   NA
 5889705 5889706 ECIAI39_misc_RNA_32 ECIAI39_1232   yobD FALSE 0.041 198.000 0.000 NA   NA
 5889706 5889707 ECIAI39_1232 ECIAI39_1233 yobD manZ TRUE 0.923 55.000 0.755 NA   NA
 5889707 5889708 ECIAI39_1233 ECIAI39_1234 manZ manY TRUE 0.999 4.000 0.939 0.018 Y NA
 5889708 5889709 ECIAI39_1234 ECIAI39_1235 manY manX TRUE 0.867 63.000 0.000 0.018 Y NA
 5889711 5889712 ECIAI39_1237 ECIAI39_1238 adrB sdaA FALSE 0.482 131.000 0.389 NA N NA
 5889712 5889713 ECIAI39_1238 ECIAI39_1239 sdaA yeaB FALSE 0.331 184.000 0.409 1.000   NA
 5889713 5889714 ECIAI39_1239 ECIAI39_1240 yeaB pabB TRUE 0.932 4.000 0.116 1.000   NA
 5889719 5889720 ECIAI39_1245 ECIAI39_1246 yoaA yeaZ FALSE 0.324 58.000 0.082 1.000 N NA
 5889720 5889721 ECIAI39_1246 ECIAI39_1247 yeaZ yeaY FALSE 0.237 39.000 0.024 1.000 N NA
 5889721 5889722 ECIAI39_1247 ECIAI39_1248 yeaY fadD FALSE 0.067 205.000 0.169 1.000 N NA
 5889722 5889723 ECIAI39_1248 ECIAI39_1249 fadD rnd FALSE 0.335 70.000 0.115 1.000 N NA
 5889724 5889725 ECIAI39_1250 ECIAI39_1251 yeaX yeaW TRUE 0.506 56.000 0.043 0.046 N NA
 5889725 5889726 ECIAI39_1251 ECIAI39_1252 yeaW yeaV FALSE 0.429 32.000 0.000 1.000 N NA
 5889726 5889727 ECIAI39_1252 ECIAI39_1253 yeaV yeaU FALSE 0.026 416.000 0.333 1.000 N NA
 5889728 5889729 ECIAI39_1254 ECIAI39_1255 yeaT yeaS FALSE 0.098 127.000 0.000 1.000 N NA
 5889729 5889730 ECIAI39_1255 ECIAI39_1256 yeaS yeaR FALSE 0.031 173.000 0.000 NA N NA
 5889730 5889731 ECIAI39_1256 ECIAI39_1257 yeaR yoaG TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5889731 5889732 ECIAI39_1257 ECIAI39_1258 yoaG yeaQ FALSE 0.107 148.000 0.000 NA   NA
 5889735 5889736 ECIAI39_1261 ECIAI39_1262 yeaO yeaN FALSE 0.246 55.000 0.007 NA   NA
 5889740 5889741 ECIAI39_1266 ECIAI39_1267 yeaK yeaJ TRUE 0.544 43.000 0.083 NA   NA
 5889741 5889742 ECIAI39_1267 ECIAI39_1268 yeaJ yeaI FALSE 0.477 181.000 0.000 0.005 Y NA
 5889742 5889743 ECIAI39_1268 ECIAI39_1269 yeaI yeaH FALSE 0.110 147.000 0.000 NA   NA
 5889743 5889744 ECIAI39_1269 ECIAI39_1270 yeaH yeaG TRUE 0.812 113.000 0.683 NA   NA
 5889745 5889746 ECIAI39_1271 ECIAI39_1272 mipA yeaE FALSE 0.272 90.000 0.067 NA   NA
 5889747 5889748 ECIAI39_1273 ECIAI39_1274 yeaD gapA TRUE 0.795 84.000 0.154 1.000 Y NA
 5889749 5889750 ECIAI39_1275 ECIAI39_1276 msrB yeaC TRUE 0.756 42.000 0.216 NA   NA
 5889750 5889751 ECIAI39_1276 ECIAI39_1277 yeaC ydjL FALSE 0.007 370.000 0.000 NA   NA
 5889751 5889752 ECIAI39_1277 ECIAI39_1278 ydjL ydjK TRUE 0.833 27.000 0.250 1.000 N NA
 5889752 5889753 ECIAI39_1278 ECIAI39_1279 ydjK ydjJ TRUE 0.821 17.000 0.167 1.000 N NA
 5889753 5889754 ECIAI39_1279 ECIAI39_1280 ydjJ ydjI TRUE 0.917 21.000 0.194 0.015 N NA
 5889754 5889755 ECIAI39_1280 ECIAI39_1281 ydjI ydjH TRUE 0.994 5.000 0.368 NA Y NA
 5889755 5889756 ECIAI39_1281 ECIAI39_1282 ydjH ydjG TRUE 0.934 10.000 0.269 NA N NA
 5889756 5889757 ECIAI39_1282 ECIAI39_1283 ydjG ydjF FALSE 0.344 137.000 0.269 1.000 N NA
 5889758 5889759 ECIAI39_1284 ECIAI39_1285 insB insA TRUE 0.967 -81.000 0.000 0.027 Y NA
 5889761 5889762 ECIAI39_1287 ECIAI39_1288 pncA ansA TRUE 0.627 11.000 0.040 1.000 N NA
 5889762 5889763 ECIAI39_1288 ECIAI39_1289 ansA sppA FALSE 0.086 167.000 0.113 1.000 N NA
 5889764 5889765 ECIAI39_1290 ECIAI39_1291 ydjA   TRUE 0.623 26.000 0.000 NA   NA
 5889765 5889766 ECIAI39_1291 ECIAI39_1292   selD TRUE 0.722 -58.000 0.000 NA   NA
 5889766 5889767 ECIAI39_1292 ECIAI39_1293 selD topB TRUE 0.552 -52.000 0.041 1.000 N NA
 5889768 5889769 ECIAI39_1294 ECIAI39_1295 gdhA nudG FALSE 0.003 474.000 0.000 1.000 N NA
 5889771 5889772 ECIAI39_1297 ECIAI39_1298 ynjE ynjD FALSE 0.462 67.000 0.111 1.000   NA
 5889772 5889773 ECIAI39_1298 ECIAI39_1299 ynjD ynjC TRUE 0.995 0.000 0.602 1.000   NA
 5889773 5889774 ECIAI39_1299 ECIAI39_1300 ynjC ynjB TRUE 0.986 18.000 0.627 0.052   NA
 5889774 5889775 ECIAI39_1300 ECIAI39_1301 ynjB ynjA TRUE 0.766 10.000 0.032 NA   NA
 5889775 5889776 ECIAI39_1301 ECIAI39_1302 ynjA ydjZ TRUE 0.944 0.000 0.087 NA   NA
 5889776 5889777 ECIAI39_1302 ECIAI39_1303 ydjZ ydjY TRUE 0.881 15.000 0.174 NA   NA
 5889777 5889778 ECIAI39_1303 ECIAI39_1304 ydjY ydjX TRUE 0.893 5.000 0.083 NA   NA
 5889778 5889779 ECIAI39_1304 ECIAI39_1305 ydjX xthA FALSE 0.045 167.000 0.016 NA   NA
 5889780 5889781 ECIAI39_1306 ECIAI39_1307 astC astA TRUE 0.999 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5889781 5889782 ECIAI39_1307 ECIAI39_1308 astA astD TRUE 0.966 -3.000 0.179 1.000 N NA
 5889782 5889783 ECIAI39_1308 ECIAI39_1309 astD astB TRUE 0.983 -3.000 0.306 1.000 N NA
 5889783 5889784 ECIAI39_1309 ECIAI39_1310 astB astE TRUE 0.987 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 5889784 5889785 ECIAI39_1310 ECIAI39_1311 astE spy FALSE 0.004 330.000 0.000 NA N NA
 5889785 5889786 ECIAI39_1311 ECIAI39_1312 spy ydjR FALSE 0.027 203.000 0.028 NA   NA
 5889787 5889788 ECIAI39_1313 ECIAI39_1314 ydjQ nadE FALSE 0.006 230.000 0.010 1.000 N NA
 5889789 5889790 ECIAI39_1315 ECIAI39_1316 osmE chbB FALSE 0.013 299.000 0.000 1.000   NA
 5889790 5889791 ECIAI39_1316 ECIAI39_1317 chbB chbC TRUE 0.962 85.000 0.500 0.013 Y NA
 5889791 5889792 ECIAI39_1317 ECIAI39_1318 chbC chbA TRUE 0.991 51.000 0.833 0.013 Y NA
 5889792 5889793 ECIAI39_1318 ECIAI39_1319 chbA chbR TRUE 0.988 8.000 0.727 1.000 N NA
 5889793 5889794 ECIAI39_1319 ECIAI39_1320 chbR chbF TRUE 0.772 104.000 0.625 1.000 N NA
 5889794 5889795 ECIAI39_1320 ECIAI39_1321 chbF chbG TRUE 0.982 13.000 0.429 0.019   NA
 5889797 5889798 ECIAI39_1323 ECIAI39_1324 cedA ydjO FALSE 0.014 277.000 0.000 NA   NA
 5889799 5889800 ECIAI39_1325 ECIAI39_1326 ydjN ydjM FALSE 0.208 133.000 0.102 NA   NA
 5889800 5889801 ECIAI39_1326 ECIAI39_1327 ydjM yniC FALSE 0.091 163.000 0.068 NA   NA
 5889803 5889804 ECIAI39_1329 ECIAI39_1330 yniA ydiZ FALSE 0.207 106.000 0.000 NA   NA
 5889804 5889805 ECIAI39_1330 ECIAI39_1331 ydiZ pfkB FALSE 0.217 101.000 0.000 NA   NA
 5889807 5889808 ECIAI39_1333 ECIAI39_1334     FALSE 0.364 56.000 0.000 NA   NA
 5889809 5889810 ECIAI39_1335 ECIAI39_1336 thrS infC FALSE 0.194 112.000 0.000 NA   NA
 5889810 5889811 ECIAI39_1336 ECIAI39_1337 infC rpmI FALSE 0.223 97.000 0.000 NA   NA
 5889811 5889812 ECIAI39_1337 ECIAI39_1338 rpmI rplT TRUE 0.991 54.000 0.928 0.011 Y NA
 5889812 5889813 ECIAI39_1338 ECIAI39_4939 rplT pheM FALSE 0.167 123.000 0.000 NA   NA
 5889813 5889814 ECIAI39_4939 ECIAI39_1339 pheM pheS FALSE 0.125 139.000 0.000 NA   NA
 5889814 5889815 ECIAI39_1339 ECIAI39_1340 pheS pheT TRUE 0.997 15.000 0.574 0.001 Y NA
 5889815 5889816 ECIAI39_1340 ECIAI39_1341 pheT ihfA TRUE 0.937 5.000 0.208 1.000 N NA
 5889816 5889817 ECIAI39_1341 ECIAI39_1342 ihfA btuC FALSE 0.079 101.000 0.023 1.000 N NA
 5889817 5889818 ECIAI39_1342 ECIAI39_1343 btuC btuE FALSE 0.307 63.000 0.084 1.000 N NA
 5889818 5889819 ECIAI39_1343 ECIAI39_1344 btuE btuD TRUE 0.876 0.000 0.000 1.000 N NA
 5889819 5889820 ECIAI39_1344 ECIAI39_1345 btuD nlpC FALSE 0.142 78.000 0.000 NA N NA
 5889820 5889821 ECIAI39_1345 ECIAI39_1346 nlpC ydiV FALSE 0.009 247.000 0.000 NA N NA
 5889821 5889822 ECIAI39_1346 ECIAI39_1347 ydiV ydiU FALSE 0.261 63.000 0.031 NA   NA
 5889823 5889824 ECIAI39_1348 ECIAI39_1349 ydiE aroH FALSE 0.068 132.000 0.054 NA N NA
 5889824 5889825 ECIAI39_1349 ECIAI39_1350 aroH ydiA FALSE 0.199 157.000 0.165 1.000   NA
 5889826 5889827 ECIAI39_1351 ECIAI39_1352 pps   FALSE 0.003 483.000 0.000 1.000 N NA
 5889827 5889828 ECIAI39_1352 ECIAI39_1353     FALSE 0.401 36.000 0.000 1.000 N NA
 5889828 5889829 ECIAI39_1353 ECIAI39_1354     TRUE 0.634 11.000 0.000 NA N NA
 5889829 5889830 ECIAI39_1354 ECIAI39_1355     TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5889831 5889832 ECIAI39_1356 ECIAI39_1357 ydiD ydiT TRUE 0.872 3.000 0.080 1.000 N NA
 5889832 5889833 ECIAI39_1357 ECIAI39_1358 ydiT ydiS TRUE 0.999 -3.000 0.400 0.046 Y NA
 5889833 5889834 ECIAI39_1358 ECIAI39_1359 ydiS ydiR TRUE 0.991 55.000 1.000 0.046 Y NA
 5889834 5889835 ECIAI39_1359 ECIAI39_1360 ydiR ydiQ TRUE 0.998 20.000 1.000 0.011 Y NA
 5889837 5889838 ECIAI39_1362 ECIAI39_1363 ydiO ydiO TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 5889838 5889839 ECIAI39_1363 ECIAI39_1364 ydiO ydiF TRUE 0.747 -40.000 0.000 NA   NA
 5889839 5889840 ECIAI39_1364 ECIAI39_1365 ydiF aroD FALSE 0.034 146.000 0.019 1.000 N NA
 5889840 5889841 ECIAI39_1365 ECIAI39_1366 aroD ydiB TRUE 0.925 31.000 0.113 1.000 Y NA
 5889841 5889842 ECIAI39_1366 ECIAI39_1367 ydiB ydiN TRUE 0.707 12.000 0.082 NA N NA
 5889842 5889843 ECIAI39_1367 ECIAI39_1368 ydiN ydiM FALSE 0.025 227.000 0.000 NA   NA
 5889843 5889844 ECIAI39_1368 ECIAI39_1369 ydiM ydiL FALSE 0.328 100.000 0.095 1.000   NA
 5889844 5889845 ECIAI39_1369 ECIAI39_misc_RNA_33 ydiL rprA FALSE 0.116 143.000 0.000 NA   NA
 5889845 5889846 ECIAI39_misc_RNA_33 ECIAI39_1370 rprA ydiK FALSE 0.051 186.000 0.000 NA   NA
 5889847 5889848 ECIAI39_1371 ECIAI39_1372 ydiJ ydiI TRUE 0.941 -3.000 0.129 NA N NA
 5889848 5889849 ECIAI39_1372 ECIAI39_1373 ydiI ydiH TRUE 0.635 19.000 0.032 NA   NA
 5889851 5889852 ECIAI39_1374 ECIAI39_1375 sufA sufB TRUE 0.806 9.000 0.041 NA   NA
 5889852 5889853 ECIAI39_1375 ECIAI39_1376 sufB sufC TRUE 0.994 10.000 0.466 1.000 Y NA
 5889853 5889854 ECIAI39_1376 ECIAI39_1377 sufC sufD TRUE 0.993 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5889854 5889855 ECIAI39_1377 ECIAI39_1378 sufD sufS TRUE 0.969 -3.000 0.193 1.000 N NA
 5889855 5889856 ECIAI39_1378 ECIAI39_1379 sufS sufE TRUE 0.897 13.000 0.183 NA   NA
 5889856 5889857 ECIAI39_1379 ECIAI39_1380 sufE ynhG FALSE 0.119 149.000 0.069 NA   NA
 5889858 5889859 ECIAI39_1381 ECIAI39_1382 lpp pykF FALSE 0.006 311.000 0.000 1.000 N NA
 5889860 5889861 ECIAI39_1383 ECIAI39_1384 ydhZ ydhY FALSE 0.005 457.000 0.000 NA   NA
 5889861 5889862 ECIAI39_1384 ECIAI39_1385 ydhY ydhV TRUE 0.995 21.000 0.600 0.014 Y NA
 5889862 5889863 ECIAI39_1385 ECIAI39_1386 ydhV ydhW TRUE 0.985 4.000 0.458 NA   NA
 5889863 5889864 ECIAI39_1386 ECIAI39_1387 ydhW ydhU FALSE 0.003 729.000 0.000 NA   NA
 5889864 5889865 ECIAI39_1387 ECIAI39_1388 ydhU ydhT TRUE 0.961 4.000 0.222 NA   NA
 5889866 5889867 ECIAI39_1389 ECIAI39_1390 ydhS ydhR FALSE 0.159 126.000 0.000 NA   NA
 5889867 5889868 ECIAI39_1390 ECIAI39_tRNA72 ydhR   FALSE 0.201 109.000 0.000 NA   NA
 5889868 5889869 ECIAI39_tRNA72 ECIAI39_tRNA71     TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 5889873 5889874 ECIAI39_1395 ECIAI39_1396 cfa ydhC FALSE 0.007 291.000 0.000 1.000 N NA
 5889878 5889879 ECIAI39_1400 ECIAI39_1401 sodB ydhO FALSE 0.045 128.000 0.015 1.000 N NA
 5889881 5889882 ECIAI39_1403 ECIAI39_1404 lhr rnt TRUE 0.520 93.000 0.000 0.010   NA
 5889882 5889883 ECIAI39_1404 ECIAI39_1405 rnt gloA FALSE 0.278 103.000 0.136 1.000 N NA
 5889883 5889884 ECIAI39_1405 ECIAI39_1406 gloA nemA FALSE 0.180 81.000 0.057 1.000 N NA
 5889884 5889885 ECIAI39_1406 ECIAI39_1407 nemA ydhM TRUE 0.856 37.000 0.362 1.000 N NA
 5889886 5889887 ECIAI39_1408 ECIAI39_1409 ydhF sodC FALSE 0.246 80.000 0.033 1.000   NA
 5889888 5889889 ECIAI39_1410 ECIAI39_1411 ydhK ydhJ TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5889889 5889890 ECIAI39_1411 ECIAI39_1412 ydhJ ydhI TRUE 0.985 3.000 0.412 NA   NA
 5889893 5889894 ECIAI39_1415 ECIAI39_1416 anmK ydhA FALSE 0.178 98.000 0.034 NA   NA
 5889894 5889895 ECIAI39_1416 ECIAI39_1417 ydhA pdxH FALSE 0.284 59.000 0.034 NA   NA
 5889895 5889896 ECIAI39_1417 ECIAI39_1418 pdxH tyrS FALSE 0.092 129.000 0.054 1.000 N NA
 5889896 5889897 ECIAI39_1418 ECIAI39_1419 tyrS pdxY FALSE 0.195 59.000 0.041 1.000 N NA
 5889898 5889899 ECIAI39_1420 ECIAI39_1421 gst ydgR TRUE 0.571 106.000 0.344 1.000 N NA
 5889899 5889900 ECIAI39_1421 ECIAI39_1422 ydgR   FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 5889900 5889901 ECIAI39_1422 ECIAI39_1423   nth FALSE 0.153 128.000 0.000 NA   NA
 5889901 5889902 ECIAI39_1423 ECIAI39_1424 nth rsxE TRUE 0.933 0.000 0.109 1.000 N NA
 5889902 5889903 ECIAI39_1424 ECIAI39_1425 rsxE rsxG TRUE 0.999 4.000 0.908 0.045 Y NA
 5889903 5889904 ECIAI39_1425 ECIAI39_1426 rsxG rsxD TRUE 0.999 4.000 0.924 0.045 Y NA
 5889904 5889905 ECIAI39_1426 ECIAI39_1427 rsxD rsxC TRUE 0.999 1.000 0.814 0.045 Y NA
 5889905 5889906 ECIAI39_1427 ECIAI39_1428 rsxC rsxB TRUE 0.998 -7.000 0.537 0.045 Y NA
 5889906 5889907 ECIAI39_1428 ECIAI39_1429 rsxB rsxA TRUE 0.999 0.000 0.564 0.045 Y NA
 5889907 5889908 ECIAI39_1429 ECIAI39_1430 rsxA ydgK FALSE 0.447 77.000 0.148 NA   NA
 5889908 5889909 ECIAI39_1430 ECIAI39_1431 ydgK ydgT FALSE 0.380 86.000 0.120 NA   NA
 5889909 5889910 ECIAI39_1431 ECIAI39_1432 ydgT blr FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 5889912 5889913 ECIAI39_1434 ECIAI39_1435 add malY FALSE 0.271 104.000 0.132 1.000 N NA
 5889913 5889914 ECIAI39_1435 ECIAI39_1436 malY malX TRUE 0.977 10.000 0.531 1.000 N NA
 5889915 5889916 ECIAI39_1437 ECIAI39_1438 malI insG FALSE 0.073 142.000 0.000 1.000 N NA
 5889916 5889917 ECIAI39_1438 ECIAI39_1439 insG hdhA FALSE 0.226 62.000 0.000 1.000 N NA
 5889917 5889918 ECIAI39_1439 ECIAI39_1440 hdhA uidR FALSE 0.016 221.000 0.000 1.000 N NA
 5889918 5889919 ECIAI39_1440 ECIAI39_1441 uidR uidA FALSE 0.004 392.000 0.000 1.000 N NA
 5889919 5889920 ECIAI39_1441 ECIAI39_1442 uidA uidB TRUE 0.996 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 5889920 5889921 ECIAI39_1442 ECIAI39_1443 uidB uidC TRUE 0.888 39.000 0.375 1.000   NA
 5889922 5889923 ECIAI39_1444 ECIAI39_1445 ydgA manA TRUE 0.851 101.000 0.778 NA   NA
 5889924 5889925 ECIAI39_1446 ECIAI39_1447 fumA fumC TRUE 0.697 143.000 0.000 0.001 Y NA
 5889926 5889927 ECIAI39_1448 ECIAI39_1449 tus rstB TRUE 0.564 76.000 0.200 1.000   NA
 5889927 5889928 ECIAI39_1449 ECIAI39_1450 rstB rstA TRUE 0.989 4.000 0.181 1.000 Y NA
 5889930 5889931 ECIAI39_1452 ECIAI39_1453 folM ydgI TRUE 0.610 37.000 0.140 1.000 N NA
 5889931 5889932 ECIAI39_1453 ECIAI39_1454 ydgI ydgH FALSE 0.101 186.000 0.143 NA   NA
 5889933 5889934 ECIAI39_1455 ECIAI39_1456 pntA pntB TRUE 0.998 11.000 0.745 0.001 Y NA
 5889936 5889937 ECIAI39_1458 ECIAI39_1459 mdtJ mdtI TRUE 0.999 -13.000 0.869 0.077 Y NA
 5889938 5889939 ECIAI39_1460 ECIAI39_1461 ydgD asr FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 5889939 5889940 ECIAI39_1461 ECIAI39_1462 asr ynfM FALSE 0.005 424.000 0.000 NA   NA
 5889941 5889942 ECIAI39_1463 ECIAI39_1464 ynfL dgsA TRUE 0.818 135.000 0.408 NA Y NA
 5889942 5889943 ECIAI39_1464 ECIAI39_1465 dgsA ynfK TRUE 0.572 125.000 0.455 NA N NA
 5889944 5889945 ECIAI39_1466 ECIAI39_1467 clcB dmsD FALSE 0.065 194.000 0.079 1.000   NA
 5889945 5889946 ECIAI39_1467 ECIAI39_1468 dmsD ynfH TRUE 0.648 43.000 0.125 1.000   NA
 5889946 5889947 ECIAI39_1468 ECIAI39_1469 ynfH ynfG TRUE 0.984 2.000 0.333 1.000   NA
 5889947 5889948 ECIAI39_1469 ECIAI39_1470 ynfG ynfF TRUE 0.998 11.000 0.667 0.045 Y NA
 5889948 5889949 ECIAI39_1470 ECIAI39_1471 ynfF ynfE TRUE 0.953 61.000 0.231 0.001 Y NA
 5889949 5889950 ECIAI39_1471 ECIAI39_1472 ynfE ynfD FALSE 0.181 199.000 0.304 NA   NA
 5889952 5889953 ECIAI39_1474 ECIAI39_1475 speG ynfB TRUE 0.541 35.000 0.055 NA   NA
 5889954 5889955 ECIAI39_1476 ECIAI39_1477 ynfA rspA FALSE 0.028 206.000 0.020 1.000   NA
 5889955 5889956 ECIAI39_1477 ECIAI39_1478 rspA rspB TRUE 0.640 12.000 0.049 1.000 N NA
 5889957 5889958 ECIAI39_1479 ECIAI39_1480 intQ xis TRUE 0.691 20.000 0.000 NA   NA
 5889958 5889959 ECIAI39_1480 ECIAI39_1481 xis   FALSE 0.203 108.000 0.000 NA   NA
 5889960 5889961 ECIAI39_1482 ECIAI39_1483     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889961 5889962 ECIAI39_1483 ECIAI39_1484     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5889962 5889963 ECIAI39_1484 ECIAI39_misc_RNA_35     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5889963 5889964 ECIAI39_misc_RNA_35 ECIAI39_1485     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5889964 5889965 ECIAI39_1485 ECIAI39_1486   ydfX FALSE 0.340 60.000 0.000 NA   NA
 5889965 5889966 ECIAI39_1486 ECIAI39_1487 ydfX   TRUE 0.709 -73.000 0.000 NA   NA
 5889966 5889967 ECIAI39_1487 ECIAI39_1488     FALSE 0.484 41.000 0.000 NA   NA
 5889967 5889968 ECIAI39_1488 ECIAI39_1489     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889968 5889969 ECIAI39_1489 ECIAI39_1490     FALSE 0.005 423.000 0.000 NA   NA
 5889971 5889972 ECIAI39_1492 ECIAI39_1493   insM TRUE 0.560 62.000 0.000 0.090   NA
 5889972 5889973 ECIAI39_1493 ECIAI39_1494 insM   TRUE 0.960 36.000 0.182 0.090 Y NA
 5889973 5889974 ECIAI39_1494 ECIAI39_1495     TRUE 0.842 -94.000 0.000 0.090   NA
 5889975 5889976 ECIAI39_1496 ECIAI39_1497     TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5889979 5889980 ECIAI39_1500 ECIAI39_1501 cspB essQ FALSE 0.003 754.000 0.000 NA   NA
 5889980 5889981 ECIAI39_1501 ECIAI39_1502 essQ ydfR TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 5889981 5889982 ECIAI39_1502 ECIAI39_1503 ydfR ydfQ TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889982 5889983 ECIAI39_1503 ECIAI39_1504 ydfQ ydfP TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889983 5889984 ECIAI39_1504 ECIAI39_1505 ydfP cspI FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   NA
 5889984 5889985 ECIAI39_1505 ECIAI39_1506 cspI gnsB FALSE 0.003 674.000 0.000 NA   NA
 5889987 5889988 ECIAI39_1508 ECIAI39_1509 nohB A TRUE 0.789 -25.000 0.000 NA   NA
 5889988 5889989 ECIAI39_1509 ECIAI39_1510 A W TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889989 5889990 ECIAI39_1510 ECIAI39_1511 W B TRUE 0.961 -3.000 0.100 1.000   NA
 5889990 5889991 ECIAI39_1511 ECIAI39_1512 B C TRUE 0.686 -154.000 0.000 1.000   NA
 5889991 5889992 ECIAI39_1512 ECIAI39_1513 C D TRUE 0.840 10.000 0.000 1.000   NA
 5889992 5889993 ECIAI39_1513 ECIAI39_1514 D   FALSE 0.364 56.000 0.000 NA   NA
 5889993 5889994 ECIAI39_1514 ECIAI39_1515   fI TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5889995 5889996 ECIAI39_1516 ECIAI39_misc_RNA_36     TRUE 0.501 39.000 0.000 NA   NA
 5889996 5889997 ECIAI39_misc_RNA_36 ECIAI39_1517     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5889997 5889998 ECIAI39_1517 ECIAI39_1518     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5889998 5889999 ECIAI39_1518 ECIAI39_1519     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5889999 5890000 ECIAI39_1519 ECIAI39_1520   ipaH FALSE 0.394 52.000 0.000 NA   NA
 5890000 5890001 ECIAI39_1520 ECIAI39_1522 ipaH cvrA FALSE 0.003 620.000 0.000 NA   NA
 5890001 5890002 ECIAI39_1522 ECIAI39_1523 cvrA ldcA FALSE 0.215 95.000 0.103 NA N NA
 5890006 5890007 ECIAI39_1527 ECIAI39_1528 prrA modD TRUE 0.704 5.000 0.034 1.000 N NA
 5890007 5890008 ECIAI39_1528 ECIAI39_1529 modD   TRUE 0.913 -3.000 0.034 NA   NA
 5890008 5890009 ECIAI39_1529 ECIAI39_1530     TRUE 0.892 10.000 0.123 NA   NA
 5890009 5890010 ECIAI39_1530 ECIAI39_1531     TRUE 0.999 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 5890010 5890011 ECIAI39_1531 ECIAI39_1532     TRUE 0.997 0.000 0.422 1.000 Y NA
 5890011 5890012 ECIAI39_1532 ECIAI39_1533   treA FALSE 0.008 288.000 0.000 1.000 N NA
 5890012 5890013 ECIAI39_1533 ECIAI39_1534 treA dhaH FALSE 0.011 320.000 0.000 1.000   NA
 5890013 5890014 ECIAI39_1534 ECIAI39_1535 dhaH dhaL TRUE 0.886 11.000 0.118 1.000   NA
 5890014 5890015 ECIAI39_1535 ECIAI39_1536 dhaL dhaK TRUE 0.993 11.000 0.226 0.001 Y NA
 5890017 5890018 ECIAI39_1538 ECIAI39_1539   ychF FALSE 0.127 138.000 0.000 NA   NA
 5890018 5890019 ECIAI39_1539 ECIAI39_1540 ychF pth TRUE 0.749 117.000 0.184 1.000 Y NA
 5890021 5890022 ECIAI39_1542 ECIAI39_1543 ychM prsA FALSE 0.061 125.000 0.027 1.000 N NA
 5890022 5890023 ECIAI39_1543 ECIAI39_1544 prsA ispE FALSE 0.058 151.000 0.053 1.000 N NA
 5890023 5890024 ECIAI39_1544 ECIAI39_1545 ispE lolB TRUE 0.952 0.000 0.157 1.000 N NA
 5890025 5890026 ECIAI39_1546 ECIAI39_1547 hemA prfA TRUE 0.798 42.000 0.171 0.042 N NA
 5890026 5890027 ECIAI39_1547 ECIAI39_1548 prfA prmC TRUE 0.997 0.000 0.229 0.042 Y NA
 5890027 5890028 ECIAI39_1548 ECIAI39_1549 prmC ychQ TRUE 0.959 -3.000 0.109 NA   NA
 5890028 5890029 ECIAI39_1549 ECIAI39_1550 ychQ ychA TRUE 0.954 4.000 0.195 NA   NA
 5890029 5890030 ECIAI39_1550 ECIAI39_1551 ychA kdsA TRUE 0.653 36.000 0.089 1.000   NA
 5890036 5890037 ECIAI39_1555 ECIAI39_1556 chaB chaC FALSE 0.231 137.000 0.140 NA   NA
 5890040 5890041 ECIAI39_1559 ECIAI39_1560 narL narX TRUE 0.998 -7.000 0.521 0.014 Y NA
 5890042 5890043 ECIAI39_1561 ECIAI39_1562   narK FALSE 0.227 95.000 0.000 NA   NA
 5890043 5890044 ECIAI39_1562 ECIAI39_1563 narK narG FALSE 0.004 394.000 0.000 1.000 N NA
 5890044 5890045 ECIAI39_1563 ECIAI39_1564 narG narH TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 5890045 5890046 ECIAI39_1564 ECIAI39_1565 narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 5890046 5890047 ECIAI39_1565 ECIAI39_1566 narJ narI TRUE 0.999 0.000 0.500 0.003 Y NA
 5890048 5890049 ECIAI39_tRNA70 ECIAI39_tRNA69     TRUE 0.540 35.000 0.000 NA   NA
 5890049 5890050 ECIAI39_tRNA69 ECIAI39_1567   purU FALSE 0.084 159.000 0.000 NA   NA
 5890050 5890051 ECIAI39_1567 ECIAI39_1568 purU ychJ TRUE 0.684 50.000 0.200 NA   NA
 5890052 5890053 ECIAI39_1569 ECIAI39_1570 rssA rssB FALSE 0.254 92.000 0.048 1.000   NA
 5890053 5890054 ECIAI39_1570 ECIAI39_1571 rssB galU FALSE 0.109 202.000 0.235 1.000 N NA
 5890057 5890058 ECIAI39_1574 ECIAI39_1575 insG adhE FALSE 0.131 108.000 0.000 1.000 N NA
 5890061 5890062 ECIAI39_1578 ECIAI39_1579 oppA oppB TRUE 0.869 86.000 0.151 0.050 Y NA
 5890062 5890063 ECIAI39_1579 ECIAI39_1580 oppB oppC TRUE 0.998 15.000 0.870 0.050 Y NA
 5890063 5890064 ECIAI39_1580 ECIAI39_1581 oppC oppD TRUE 0.994 12.000 0.554 1.000 Y NA
 5890064 5890065 ECIAI39_1581 ECIAI39_1582 oppD oppF TRUE 0.999 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 5890066 5890067 ECIAI39_1583 ECIAI39_1584 yciU cls TRUE 0.817 35.000 0.231 NA   NA
 5890069 5890070 ECIAI39_1586 ECIAI39_1588 kch yciI FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 5890072 5890073 ECIAI39_1590 ECIAI39_1591 yciA yciB FALSE 0.296 105.000 0.167 NA N NA
 5890073 5890074 ECIAI39_1591 ECIAI39_1592 yciB yciC TRUE 0.597 30.000 0.061 NA   NA
 5890076 5890077 ECIAI39_1594 ECIAI39_1595 yciE yciF TRUE 0.657 94.000 0.115 0.001   NA
 5890077 5890078 ECIAI39_1595 ECIAI39_1596 yciF yciG FALSE 0.254 86.000 0.000 NA   NA
 5890078 5890079 ECIAI39_1596 ECIAI39_1597 yciG trpA FALSE 0.006 381.000 0.000 NA   NA
 5890079 5890080 ECIAI39_1597 ECIAI39_1598 trpA trpB TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 5890080 5890081 ECIAI39_1598 ECIAI39_1599 trpB trpC TRUE 0.992 12.000 0.221 0.001 Y NA
 5890081 5890082 ECIAI39_1599 ECIAI39_1600 trpC trpD TRUE 0.993 4.000 0.293 1.000 Y NA
 5890082 5890083 ECIAI39_1600 ECIAI39_1601 trpD trpE TRUE 0.994 0.000 0.010 0.001 Y NA
 5890083 5890084 ECIAI39_1601 ECIAI39_misc_RNA_39 trpE   TRUE 0.668 22.000 0.000 NA   NA
 5890084 5890085 ECIAI39_misc_RNA_39 ECIAI39_4940   trpL TRUE 0.797 -23.000 0.000 NA   NA
 5890086 5890087 ECIAI39_1602 ECIAI39_1603 yciV yciO TRUE 0.985 -3.000 0.281 NA   NA
 5890087 5890088 ECIAI39_1603 ECIAI39_1604 yciO yciQ TRUE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5890088 5890089 ECIAI39_1604 ECIAI39_1605 yciQ rluB FALSE 0.031 211.000 0.000 NA   NA
 5890089 5890090 ECIAI39_1605 ECIAI39_1606 rluB   FALSE 0.069 170.000 0.000 NA   NA
 5890090 5890091 ECIAI39_1606 ECIAI39_1607     FALSE 0.218 100.000 0.000 NA   NA
 5890092 5890093 ECIAI39_1608 ECIAI39_1609 btuR yciK TRUE 0.881 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5890093 5890094 ECIAI39_1609 ECIAI39_1610 yciK   FALSE 0.456 44.000 0.000 NA   NA
 5890097 5890098 ECIAI39_1613 ECIAI39_1614 topA cysB FALSE 0.007 210.000 0.008 1.000 N NA
 5890098 5890099 ECIAI39_1614 ECIAI39_1615 cysB   FALSE 0.011 295.000 0.000 NA   NA
 5890099 5890100 ECIAI39_1615 ECIAI39_1616     TRUE 0.982 -18.000 0.556 NA   NA
 5890100 5890101 ECIAI39_1616 ECIAI39_1617   acnA FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 5890103 5890104 ECIAI39_1619 ECIAI39_1620 pgpB yciS FALSE 0.194 149.000 0.143 NA   NA
 5890104 5890105 ECIAI39_1620 ECIAI39_1621 yciS yciM TRUE 0.986 7.000 0.576 NA   NA
 5890105 5890106 ECIAI39_1621 ECIAI39_1622 yciM pyrF FALSE 0.060 192.000 0.125 1.000 N NA
 5890106 5890107 ECIAI39_1622 ECIAI39_1623 pyrF yciH TRUE 0.855 0.000 0.045 1.000 N NA
 5890108 5890109 ECIAI39_1624 ECIAI39_1625 osmB deoT FALSE 0.016 269.000 0.000 NA   NA
 5890109 5890110 ECIAI39_1625 ECIAI39_1626 deoT   FALSE 0.410 90.000 0.146 NA   NA
 5890110 5890111 ECIAI39_1626 ECIAI39_1627   gmr FALSE 0.267 105.000 0.083 NA   NA
 5890111 5890112 ECIAI39_1627 ECIAI39_1628 gmr rnb FALSE 0.013 235.000 0.000 1.000 N NA
 5890112 5890113 ECIAI39_1628 ECIAI39_1629 rnb yciW FALSE 0.416 68.000 0.105 NA   NA
 5890113 5890114 ECIAI39_1629 ECIAI39_1630 yciW fabI FALSE 0.118 144.000 0.057 NA   NA
 5890115 5890116 ECIAI39_1631 ECIAI39_1632     FALSE 0.086 156.000 0.000 NA   NA
 5890116 5890117 ECIAI39_1632 ECIAI39_1633     FALSE 0.464 116.000 0.286 1.000 N NA
 5890117 5890118 ECIAI39_1633 ECIAI39_1634     FALSE 0.277 52.000 0.000 1.000 N NA
 5890118 5890119 ECIAI39_1634 ECIAI39_1635     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890119 5890120 ECIAI39_1635 ECIAI39_1636     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5890120 5890121 ECIAI39_1636 ECIAI39_misc_RNA_40     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5890121 5890122 ECIAI39_misc_RNA_40 ECIAI39_1637     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5890122 5890123 ECIAI39_1637 ECIAI39_1638     FALSE 0.443 51.000 0.000 1.000   NA
 5890123 5890124 ECIAI39_1638 ECIAI39_1639     TRUE 0.986 4.000 0.367 0.050 N NA
 5890124 5890125 ECIAI39_1639 ECIAI39_1640     TRUE 0.945 9.000 0.143 0.050 N NA
 5890126 5890127 ECIAI39_1641 ECIAI39_1642 sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.014 Y NA
 5890127 5890128 ECIAI39_1642 ECIAI39_1643 sapD sapC TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y NA
 5890128 5890129 ECIAI39_1643 ECIAI39_1644 sapC sapB TRUE 0.995 -13.000 0.284 0.050 Y NA
 5890129 5890130 ECIAI39_1644 ECIAI39_1645 sapB sapA TRUE 0.989 -3.000 0.264 0.050 N NA
 5890130 5890131 ECIAI39_1645 ECIAI39_1646 sapA ymjA FALSE 0.010 313.000 0.000 NA   NA
 5890131 5890132 ECIAI39_1646 ECIAI39_1647 ymjA puuP FALSE 0.137 134.000 0.000 NA   NA
 5890132 5890133 ECIAI39_1647 ECIAI39_1648 puuP puuA FALSE 0.068 303.000 0.000 1.000 Y NA
 5890134 5890135 ECIAI39_1649 ECIAI39_1650 puuD puuR TRUE 0.622 27.000 0.046 1.000   NA
 5890135 5890136 ECIAI39_1650 ECIAI39_1651 puuR puuC FALSE 0.047 150.000 0.040 1.000 N NA
 5890136 5890137 ECIAI39_1651 ECIAI39_1652 puuC puuB TRUE 0.993 2.000 0.500 0.026 N NA
 5890137 5890138 ECIAI39_1652 ECIAI39_1653 puuB puuE TRUE 0.902 38.000 0.100 1.000 Y NA
 5890140 5890141 ECIAI39_1655 ECIAI39_1656 pspA pspB TRUE 0.923 54.000 0.739 NA   NA
 5890141 5890142 ECIAI39_1656 ECIAI39_1657 pspB pspC TRUE 0.997 0.000 0.913 NA   NA
 5890142 5890143 ECIAI39_1657 ECIAI39_1658 pspC pspD TRUE 0.924 9.000 0.167 NA   NA
 5890143 5890144 ECIAI39_1658 ECIAI39_1659 pspD pspE FALSE 0.429 75.000 0.133 NA   NA
 5890144 5890145 ECIAI39_1659 ECIAI39_1660 pspE ycjM FALSE 0.018 214.000 0.000 1.000 N NA
 5890147 5890148 ECIAI39_1662 ECIAI39_1663 ycjN ycjO TRUE 0.995 21.000 0.620 0.050 Y NA
 5890148 5890149 ECIAI39_1663 ECIAI39_1664 ycjO ycjP TRUE 0.999 -13.000 0.805 0.050 Y NA
 5890149 5890150 ECIAI39_1664 ECIAI39_1665 ycjP ycjQ TRUE 0.760 31.000 0.205 1.000 N NA
 5890150 5890151 ECIAI39_1665 ECIAI39_1666 ycjQ ycjR TRUE 0.878 19.000 0.261 NA N NA
 5890151 5890152 ECIAI39_1666 ECIAI39_1667 ycjR ycjS TRUE 0.967 10.000 0.347 NA   NA
 5890152 5890153 ECIAI39_1667 ECIAI39_1668 ycjS ycjT TRUE 0.942 -3.000 0.000 1.000   NA
 5890153 5890154 ECIAI39_1668 ECIAI39_1669 ycjT ycjU TRUE 0.942 -3.000 0.000 1.000   NA
 5890154 5890155 ECIAI39_1669 ECIAI39_1670 ycjU ycjV TRUE 0.842 14.000 0.103 1.000   NA
 5890155 5890156 ECIAI39_1670 ECIAI39_1671 ycjV ompG TRUE 0.861 45.000 0.222 0.050   NA
 5890158 5890159 ECIAI39_1673 ECIAI39_1674 ycjX ycjF TRUE 0.997 -3.000 0.791 NA   NA
 5890159 5890160 ECIAI39_1674 ECIAI39_1675 ycjF tyrR FALSE 0.194 148.000 0.137 NA   NA
 5890167 5890168 ECIAI39_1682 ECIAI39_1683 uspE fnr TRUE 0.853 152.000 0.619 1.000 Y NA
 5890168 5890169 ECIAI39_1683 ECIAI39_1684 fnr ogt FALSE 0.026 195.000 0.000 1.000 N NA
 5890169 5890170 ECIAI39_1684 ECIAI39_1685 ogt abgT TRUE 0.634 11.000 0.000 NA N NA
 5890170 5890171 ECIAI39_1685 ECIAI39_1686 abgT abgB TRUE 0.519 37.000 0.000 NA   NA
 5890171 5890172 ECIAI39_1686 ECIAI39_1687 abgB abgB TRUE 0.733 -49.000 0.000 NA   NA
 5890172 5890173 ECIAI39_1687 ECIAI39_1688 abgB abgA TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5890174 5890175 ECIAI39_1689 ECIAI39_misc_RNA_41 abgR isrA TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5890175 5890176 ECIAI39_misc_RNA_41 ECIAI39_1690 isrA ydaL FALSE 0.069 170.000 0.000 NA   NA
 5890178 5890179 ECIAI39_1692 ECIAI39_1693 ydaN   FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 5890179 5890180 ECIAI39_1693 ECIAI39_misc_RNA_42   c0343 TRUE 0.663 -118.000 0.000 NA   NA
 5890180 5890181 ECIAI39_misc_RNA_42 ECIAI39_1694 c0343 dbpA FALSE 0.280 74.000 0.000 NA   NA
 5890182 5890183 ECIAI39_1695 ECIAI39_1696 ydaO uspF FALSE 0.029 176.000 0.000 NA N NA
 5890183 5890184 ECIAI39_1696 ECIAI39_1697 uspF ompN FALSE 0.074 141.000 0.000 1.000 N NA
 5890189 5890190 ECIAI39_1701 ECIAI39_1702     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890190 5890191 ECIAI39_1702 ECIAI39_1703     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5890191 5890192 ECIAI39_1703 ECIAI39_misc_RNA_44     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5890192 5890193 ECIAI39_misc_RNA_44 ECIAI39_1704     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5890195 5890196 ECIAI39_1706 ECIAI39_1707 ydbH ynbE TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890196 5890197 ECIAI39_1707 ECIAI39_1708 ynbE ydbL TRUE 0.992 5.000 0.726 NA   NA
 5890197 5890198 ECIAI39_1708 ECIAI39_1709 ydbL ydbA FALSE 0.005 453.000 0.000 NA   NA
 5890198 5890199 ECIAI39_1709 ECIAI39_1710 ydbA ydbC FALSE 0.034 208.000 0.000 NA   NA
 5890199 5890200 ECIAI39_1710 ECIAI39_1711 ydbC ydbD FALSE 0.322 64.000 0.000 NA   NA
 5890200 5890201 ECIAI39_1711 ECIAI39_1712 ydbD ynbA FALSE 0.078 164.000 0.000 NA   NA
 5890201 5890202 ECIAI39_1712 ECIAI39_1713 ynbA ynbB TRUE 0.990 0.000 0.179 0.002   NA
 5890202 5890203 ECIAI39_1713 ECIAI39_1714 ynbB ynbC TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5890203 5890204 ECIAI39_1714 ECIAI39_1715 ynbC ynbD TRUE 0.982 14.000 0.285 NA Y NA
 5890206 5890207 ECIAI39_1717 ECIAI39_1718   hrpA FALSE 0.256 85.000 0.000 NA   NA
 5890207 5890208 ECIAI39_1718 ECIAI39_1719 hrpA ydcF FALSE 0.007 369.000 0.000 NA   NA
 5890208 5890209 ECIAI39_1719 ECIAI39_1720 ydcF aldA FALSE 0.042 197.000 0.000 NA   NA
 5890209 5890210 ECIAI39_1720 ECIAI39_1721 aldA   TRUE 0.623 26.000 0.000 NA   NA
 5890210 5890211 ECIAI39_1721 ECIAI39_1722     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.088   NA
 5890211 5890212 ECIAI39_1722 ECIAI39_1723   ydcE FALSE 0.004 630.000 0.000 1.000   NA
 5890215 5890216 ECIAI39_1726 ECIAI39_1727 yddE narV FALSE 0.298 80.000 0.000 1.000   NA
 5890216 5890217 ECIAI39_1727 ECIAI39_1728 narV narW TRUE 0.999 -3.000 0.714 0.003 Y NA
 5890217 5890218 ECIAI39_1728 ECIAI39_1729 narW narY TRUE 0.999 0.000 0.714 0.003 Y NA
 5890218 5890219 ECIAI39_1729 ECIAI39_1730 narY narZ TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 5890219 5890220 ECIAI39_1730 ECIAI39_1731 narZ narU TRUE 0.748 95.000 0.556 1.000 N NA
 5890220 5890221 ECIAI39_1731 ECIAI39_1732 narU   FALSE 0.012 310.000 0.000 1.000   NA
 5890221 5890222 ECIAI39_1732 ECIAI39_1733     TRUE 0.626 63.000 0.000 0.011   NA
 5890222 5890223 ECIAI39_1733 ECIAI39_1734     FALSE 0.091 164.000 0.000 1.000   NA
 5890223 5890224 ECIAI39_1734 ECIAI39_1735   yddG FALSE 0.044 258.000 0.000 0.092   NA
 5890225 5890226 ECIAI39_1736 ECIAI39_1738 fdnG fdnH TRUE 0.996 13.000 0.429 0.002 Y NA
 5890226 5890227 ECIAI39_1738 ECIAI39_1739 fdnH fdnI TRUE 0.998 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 5890228 5890229 ECIAI39_1740 ECIAI39_1741 yddM   TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5890229 5890230 ECIAI39_1741 ECIAI39_1742   adhP FALSE 0.051 186.000 0.000 NA   NA
 5890230 5890231 ECIAI39_1742 ECIAI39_1743 adhP sfcA FALSE 0.158 134.000 0.000 1.000   NA
 5890235 5890236 ECIAI39_1747 ECIAI39_1748 ddpF ddpD TRUE 0.996 -7.000 0.219 0.002 Y NA
 5890236 5890237 ECIAI39_1748 ECIAI39_1749 ddpD ddpC TRUE 0.997 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5890237 5890238 ECIAI39_1749 ECIAI39_1750 ddpC ddpB TRUE 0.996 -3.000 0.143 0.050 Y NA
 5890238 5890239 ECIAI39_1750 ECIAI39_1751 ddpB ddpA TRUE 0.993 2.000 0.091 0.050 Y NA
 5890239 5890240 ECIAI39_1751 ECIAI39_1752 ddpA ddpX TRUE 0.740 14.000 0.091 1.000 N NA
 5890240 5890241 ECIAI39_1752 ECIAI39_1753 ddpX dos FALSE 0.018 258.000 0.000 NA   NA
 5890241 5890242 ECIAI39_1753 ECIAI39_1754 dos dos FALSE 0.236 93.000 0.000 NA   NA
 5890242 5890243 ECIAI39_1754 ECIAI39_1755 dos yddV TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5890243 5890244 ECIAI39_1755 ECIAI39_1756 yddV yddW FALSE 0.008 376.000 0.000 1.000   NA
 5890244 5890245 ECIAI39_1756 ECIAI39_1757 yddW gadC FALSE 0.166 131.000 0.000 1.000   NA
 5890245 5890246 ECIAI39_1757 ECIAI39_1758 gadC gadB FALSE 0.459 156.000 0.103 1.000 Y NA
 5890246 5890247 ECIAI39_1758 ECIAI39_1759 gadB pqqL FALSE 0.008 363.000 0.000 1.000   NA
 5890247 5890248 ECIAI39_1759 ECIAI39_1760 pqqL yddB TRUE 0.691 45.000 0.167 1.000   NA
 5890248 5890249 ECIAI39_1760 ECIAI39_1761 yddB yddA TRUE 0.744 38.000 0.000 0.062   NA
 5890249 5890250 ECIAI39_1761 ECIAI39_1762 yddA ydeM FALSE 0.014 292.000 0.000 1.000   NA
 5890250 5890251 ECIAI39_1762 ECIAI39_1763 ydeM ydeN TRUE 0.909 52.000 0.600 1.000   NA
 5890251 5890252 ECIAI39_1763 ECIAI39_1764 ydeN ydeO FALSE 0.003 403.000 0.000 1.000 N NA
 5890252 5890253 ECIAI39_1764 ECIAI39_1765 ydeO   FALSE 0.277 75.000 0.000 NA   NA
 5890253 5890254 ECIAI39_1765 ECIAI39_1766   ydeP FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 5890254 5890255 ECIAI39_1766 ECIAI39_1767 ydeP ydeQ FALSE 0.010 339.000 0.000 1.000   NA
 5890255 5890256 ECIAI39_1767 ECIAI39_1768 ydeQ   FALSE 0.011 321.000 0.000 1.000   NA
 5890256 5890257 ECIAI39_1768 ECIAI39_1769     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.088 Y NA
 5890257 5890258 ECIAI39_1769 ECIAI39_1770   ydeT FALSE 0.394 52.000 0.000 NA   NA
 5890258 5890259 ECIAI39_1770 ECIAI39_1771 ydeT   TRUE 0.735 15.000 0.000 NA   NA
 5890260 5890261 ECIAI39_1772 ECIAI39_1773 insC insD TRUE 0.742 -42.000 0.000 NA   NA
 5890262 5890263 ECIAI39_1774 ECIAI39_1775     FALSE 0.007 354.000 0.000 NA   NA
 5890263 5890264 ECIAI39_1775 ECIAI39_1776   hipA FALSE 0.006 394.000 0.000 NA   NA
 5890264 5890265 ECIAI39_1776 ECIAI39_1777 hipA ydeK FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 5890266 5890267 ECIAI39_1778 ECIAI39_1779 lsrD lsrB TRUE 0.771 12.000 0.000 NA   NA
 5890267 5890268 ECIAI39_1779 ECIAI39_1780 lsrB lsrF TRUE 0.907 27.000 0.000 NA Y NA
 5890268 5890269 ECIAI39_1780 ECIAI39_1781 lsrF lsrG TRUE 0.685 24.000 0.000 1.000   NA
 5890269 5890270 ECIAI39_1781 ECIAI39_1782 lsrG tam FALSE 0.399 57.000 0.000 1.000   NA
 5890273 5890274 ECIAI39_1785 ECIAI39_1786 uxaB yneF FALSE 0.015 228.000 0.000 1.000 N NA
 5890274 5890275 ECIAI39_1786 ECIAI39_1787 yneF yneG FALSE 0.182 139.000 0.098 NA   NA
 5890275 5890276 ECIAI39_1787 ECIAI39_1788 yneG yneH TRUE 0.904 0.000 0.037 NA   NA
 5890276 5890277 ECIAI39_1788 ECIAI39_1789 yneH yneI FALSE 0.219 64.000 0.000 1.000 N NA
 5890279 5890280 ECIAI39_1791 ECIAI39_1792 D U TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5890280 5890281 ECIAI39_1792 ECIAI39_1793 U   TRUE 0.988 -3.000 0.333 NA   NA
 5890281 5890282 ECIAI39_1793 ECIAI39_1794     FALSE 0.156 127.000 0.000 NA   NA
 5890282 5890283 ECIAI39_1794 ECIAI39_1795   fII FALSE 0.371 55.000 0.000 NA   NA
 5890283 5890284 ECIAI39_1795 ECIAI39_1796 fII fI TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5890284 5890285 ECIAI39_1796 ECIAI39_1797 fI   FALSE 0.030 214.000 0.000 NA   NA
 5890285 5890286 ECIAI39_1797 ECIAI39_1798     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5890286 5890287 ECIAI39_1798 ECIAI39_1799   I TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890287 5890288 ECIAI39_1799 ECIAI39_1800 I J TRUE 0.996 -7.000 1.000 NA   NA
 5890288 5890289 ECIAI39_1800 ECIAI39_1801 J W TRUE 0.730 -52.000 0.000 NA   NA
 5890289 5890290 ECIAI39_1801 ECIAI39_1802 W V TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890290 5890291 ECIAI39_1802 ECIAI39_1803 V   TRUE 0.925 69.000 1.000 NA   NA
 5890291 5890292 ECIAI39_1803 ECIAI39_1804   R TRUE 0.996 -7.000 1.000 NA   NA
 5890292 5890293 ECIAI39_1804 ECIAI39_1805 R   TRUE 0.987 -58.000 1.000 NA   NA
 5890293 5890294 ECIAI39_1805 ECIAI39_1806     TRUE 0.982 -157.000 1.000 NA   NA
 5890294 5890295 ECIAI39_1806 ECIAI39_1807     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5890295 5890296 ECIAI39_1807 ECIAI39_1808   R TRUE 0.977 -70.000 0.667 NA   NA
 5890296 5890297 ECIAI39_1808 ECIAI39_1809 R   TRUE 0.979 -19.000 0.500 NA   NA
 5890297 5890298 ECIAI39_1809 ECIAI39_1810   X TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5890298 5890299 ECIAI39_1810 ECIAI39_1811 X L TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5890299 5890300 ECIAI39_1811 ECIAI39_1812 L M TRUE 0.989 33.000 1.000 0.001   NA
 5890300 5890301 ECIAI39_1812 ECIAI39_1813 M N TRUE 0.891 4.000 0.000 1.000   NA
 5890301 5890302 ECIAI39_1813 ECIAI39_1814 N O TRUE 0.750 17.000 0.000 1.000   NA
 5890303 5890304 ECIAI39_1815 ECIAI39_1816 P   TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5890304 5890305 ECIAI39_1816 ECIAI39_1817   P FALSE 0.492 40.000 0.000 NA   NA
 5890305 5890306 ECIAI39_1817 ECIAI39_1818 P   TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890306 5890307 ECIAI39_1818 ECIAI39_1819     FALSE 0.146 130.000 0.000 NA   NA
 5890307 5890308 ECIAI39_1819 ECIAI39_1820     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.087 Y NA
 5890308 5890309 ECIAI39_1820 ECIAI39_1821     TRUE 0.656 -142.000 0.000 NA   NA
 5890309 5890310 ECIAI39_1821 ECIAI39_1822   yneJ FALSE 0.062 176.000 0.000 NA   NA
 5890310 5890311 ECIAI39_1822 ECIAI39_1823 yneJ yneK FALSE 0.258 84.000 0.000 NA   NA
 5890311 5890312 ECIAI39_1823 ECIAI39_1824 yneK ydeA FALSE 0.100 150.000 0.000 NA   NA
 5890314 5890315 ECIAI39_1826 ECIAI39_1827 marR marA TRUE 0.996 21.000 0.667 0.043 Y NA
 5890315 5890316 ECIAI39_1827 ECIAI39_1828 marA marB TRUE 0.560 32.000 0.000 NA   NA
 5890317 5890318 ECIAI39_1829 ECIAI39_1830     TRUE 0.942 19.000 0.000 1.000 Y NA
 5890318 5890319 ECIAI39_1830 ECIAI39_1831     TRUE 0.951 56.000 0.250 0.013 Y NA
 5890319 5890320 ECIAI39_1831 ECIAI39_1832     TRUE 0.973 22.000 0.105 0.012 Y NA
 5890320 5890321 ECIAI39_1832 ECIAI39_1833     TRUE 0.971 114.000 0.789 0.012 Y NA
 5890327 5890328 ECIAI39_1839 ECIAI39_1840 ydeH ydeI FALSE 0.018 255.000 0.000 NA   NA
 5890328 5890329 ECIAI39_1840 ECIAI39_1841 ydeI dcp FALSE 0.007 366.000 0.000 NA   NA
 5890330 5890331 ECIAI39_1842 ECIAI39_1843 ydfG ydfH FALSE 0.280 89.000 0.000 1.000   NA
 5890331 5890332 ECIAI39_1843 ECIAI39_1844 ydfH ydfZ FALSE 0.060 178.000 0.000 NA   NA
 5890333 5890334 ECIAI39_1845 ECIAI39_1846 ydfI ydfJ TRUE 0.691 90.000 0.000 1.000 Y NA
 5890335 5890336 ECIAI39_1847 ECIAI39_1848 ydfK pinR FALSE 0.010 317.000 0.000 NA   NA
 5890337 5890338 ECIAI39_1849 ECIAI39_1850     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.087 Y NA
 5890338 5890339 ECIAI39_1850 ECIAI39_1851     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5890339 5890340 ECIAI39_1851 ECIAI39_1852     TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5890340 5890341 ECIAI39_1852 ECIAI39_1853     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890341 5890342 ECIAI39_1853 ECIAI39_1854     TRUE 0.784 59.000 0.000 1.000 Y NA
 5890342 5890343 ECIAI39_1854 ECIAI39_1855     FALSE 0.302 68.000 0.000 NA   NA
 5890343 5890344 ECIAI39_1855 ECIAI39_1856     FALSE 0.008 344.000 0.000 NA   NA
 5890344 5890345 ECIAI39_1856 ECIAI39_1857   K TRUE 0.983 -102.000 1.000 NA   NA
 5890345 5890346 ECIAI39_1857 ECIAI39_1858 K   TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5890346 5890347 ECIAI39_1858 ECIAI39_1859     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5890347 5890348 ECIAI39_1859 ECIAI39_1860     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890348 5890349 ECIAI39_1860 ECIAI39_1861     TRUE 0.811 -19.000 0.000 NA   NA
 5890349 5890350 ECIAI39_1861 ECIAI39_1862     TRUE 0.964 27.000 0.667 NA   NA
 5890350 5890351 ECIAI39_1862 ECIAI39_1863     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5890351 5890352 ECIAI39_1863 ECIAI39_1864     TRUE 0.838 8.000 0.000 NA   NA
 5890352 5890353 ECIAI39_1864 ECIAI39_1865     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890353 5890354 ECIAI39_1865 ECIAI39_1866     TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5890354 5890355 ECIAI39_1866 ECIAI39_1867     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5890355 5890356 ECIAI39_1867 ECIAI39_1868     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5890356 5890357 ECIAI39_1868 ECIAI39_1869     FALSE 0.353 58.000 0.000 NA   NA
 5890357 5890358 ECIAI39_1869 ECIAI39_1870     TRUE 0.560 37.000 0.000 1.000   NA
 5890358 5890359 ECIAI39_1870 ECIAI39_1871     TRUE 0.938 -10.000 0.150 1.000   NA
 5890359 5890360 ECIAI39_1871 ECIAI39_1872     TRUE 0.942 -3.000 0.000 1.000   NA
 5890360 5890361 ECIAI39_1872 ECIAI39_1873     TRUE 0.827 -16.000 0.000 NA   NA
 5890361 5890362 ECIAI39_1873 ECIAI39_1874     TRUE 0.780 -28.000 0.000 NA   NA
 5890363 5890364 ECIAI39_1875 ECIAI39_1876     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890364 5890365 ECIAI39_1876 ECIAI39_1877     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5890365 5890366 ECIAI39_1877 ECIAI39_misc_RNA_45     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5890366 5890367 ECIAI39_misc_RNA_45 ECIAI39_1878     FALSE 0.251 87.000 0.000 NA   NA
 5890367 5890368 ECIAI39_1878 ECIAI39_1879     FALSE 0.232 94.000 0.000 NA   NA
 5890369 5890370 ECIAI39_1880 ECIAI39_1881 dadX dadA TRUE 0.894 10.000 0.168 1.000 N NA
 5890373 5890374 ECIAI39_1884 ECIAI39_1885 nhaB dsbB TRUE 0.665 146.000 0.723 1.000 N NA
 5890375 5890376 ECIAI39_1886 ECIAI39_1887 umuC umuD TRUE 0.876 0.000 0.000 1.000 N NA
 5890377 5890378 ECIAI39_1889 ECIAI39_1890     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5890381 5890382 ECIAI39_1892 ECIAI39_1893 ycgN ycgM FALSE 0.311 92.000 0.088 NA   NA
 5890382 5890383 ECIAI39_1893 ECIAI39_1894 ycgM ycgL FALSE 0.292 72.000 0.056 NA   NA
 5890386 5890387 ECIAI39_1897 ECIAI39_1898 minC minD TRUE 0.985 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5890387 5890388 ECIAI39_1898 ECIAI39_1899 minD minE TRUE 0.997 4.000 0.618 NA Y NA
 5890390 5890391 ECIAI39_1901 ECIAI39_1902   ymgG FALSE 0.290 71.000 0.000 NA   NA
 5890391 5890392 ECIAI39_1902 ECIAI39_1903 ymgG ymgD TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5890393 5890394 ECIAI39_1904 ECIAI39_1906   ycgG FALSE 0.001 750.000 0.000 NA N NA
 5890395 5890396 ECIAI39_1907 ECIAI39_1908     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.086 Y NA
 5890397 5890398 ECIAI39_1909 ECIAI39_1910 ymgC ymgB FALSE 0.193 113.000 0.000 NA   NA
 5890398 5890399 ECIAI39_1910 ECIAI39_1911 ymgB ymgA TRUE 0.585 29.000 0.000 NA   NA
 5890399 5890400 ECIAI39_1911 ECIAI39_1912 ymgA ycgZ FALSE 0.466 43.000 0.000 NA   NA
 5890401 5890402 ECIAI39_1913 ECIAI39_1914 ycgF ycgE FALSE 0.154 205.000 0.333 1.000 N NA
 5890402 5890403 ECIAI39_1914 ECIAI39_1915 ycgE ycgX FALSE 0.027 221.000 0.000 NA   NA
 5890403 5890404 ECIAI39_1915 ECIAI39_1916 ycgX elbA FALSE 0.003 705.000 0.000 NA   NA
 5890405 5890406 ECIAI39_1917 ECIAI39_1918 icd   FALSE 0.005 472.000 0.000 NA   NA
 5890407 5890408 ECIAI39_1919 ECIAI39_1920 sitA sitB TRUE 0.999 0.000 0.894 1.000 Y NA
 5890408 5890409 ECIAI39_1920 ECIAI39_1921 sitB sitC TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.078 Y NA
 5890409 5890410 ECIAI39_1921 ECIAI39_1922 sitC sitD TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.005 Y NA
 5890411 5890412 ECIAI39_1923 ECIAI39_1924     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5890412 5890413 ECIAI39_1924 ECIAI39_1925     TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5890413 5890414 ECIAI39_1925 ECIAI39_1926     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890414 5890415 ECIAI39_1926 ECIAI39_1927     FALSE 0.345 59.000 0.000 NA   NA
 5890415 5890416 ECIAI39_1927 ECIAI39_1928     FALSE 0.078 164.000 0.000 NA   NA
 5890416 5890417 ECIAI39_1928 ECIAI39_1929     TRUE 0.923 -28.000 0.214 NA   NA
 5890417 5890418 ECIAI39_1929 ECIAI39_1930     FALSE 0.103 156.000 0.071 NA   NA
 5890418 5890419 ECIAI39_1930 ECIAI39_1931     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890419 5890420 ECIAI39_1931 ECIAI39_1932     TRUE 0.751 -39.000 0.000 NA   NA
 5890420 5890421 ECIAI39_1932 ECIAI39_1933     TRUE 0.735 15.000 0.000 NA   NA
 5890421 5890422 ECIAI39_1933 ECIAI39_1934     TRUE 0.987 10.000 0.667 NA   NA
 5890422 5890423 ECIAI39_1934 ECIAI39_1935   gam FALSE 0.013 289.000 0.000 NA   NA
 5890423 5890424 ECIAI39_1935 ECIAI39_1936 gam   FALSE 0.013 300.000 0.000 1.000   NA
 5890424 5890425 ECIAI39_1936 ECIAI39_1937     TRUE 0.991 -16.000 0.571 0.086   NA
 5890425 5890426 ECIAI39_1937 ECIAI39_1938     TRUE 0.900 4.000 0.080 NA   NA
 5890426 5890427 ECIAI39_1938 ECIAI39_1939     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5890427 5890428 ECIAI39_1939 ECIAI39_1940     FALSE 0.425 53.000 0.000 1.000   NA
 5890429 5890430 ECIAI39_1941 ECIAI39_1942     TRUE 0.944 -3.000 0.074 NA   NA
 5890430 5890431 ECIAI39_1942 ECIAI39_1943     FALSE 0.260 82.000 0.000 NA   NA
 5890433 5890434 ECIAI39_1945 ECIAI39_1946     TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5890434 5890435 ECIAI39_1946 ECIAI39_1947     TRUE 0.827 -16.000 0.000 NA   NA
 5890435 5890436 ECIAI39_1947 ECIAI39_1948     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890436 5890437 ECIAI39_1948 ECIAI39_1949     TRUE 0.996 0.000 0.800 NA   NA
 5890437 5890438 ECIAI39_1949 ECIAI39_1950     TRUE 0.996 0.000 0.800 NA   NA
 5890438 5890439 ECIAI39_1950 ECIAI39_1951     FALSE 0.236 93.000 0.000 NA   NA
 5890439 5890440 ECIAI39_1951 ECIAI39_1952     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5890440 5890441 ECIAI39_1952 ECIAI39_1953     TRUE 0.811 -19.000 0.000 NA   NA
 5890441 5890442 ECIAI39_1953 ECIAI39_1954     TRUE 0.995 3.000 0.818 NA   NA
 5890442 5890443 ECIAI39_1954 ECIAI39_1955     FALSE 0.029 215.000 0.000 NA   NA
 5890443 5890444 ECIAI39_1955 ECIAI39_1956     TRUE 0.735 15.000 0.000 NA   NA
 5890444 5890445 ECIAI39_1956 ECIAI39_1957     TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5890445 5890446 ECIAI39_1957 ECIAI39_1958     TRUE 0.969 2.000 0.220 NA   NA
 5890446 5890447 ECIAI39_1958 ECIAI39_1959     TRUE 0.917 0.000 0.049 NA   NA
 5890447 5890448 ECIAI39_1959 ECIAI39_1960     TRUE 0.988 -3.000 0.333 NA   NA
 5890448 5890449 ECIAI39_1960 ECIAI39_1961     TRUE 0.993 -10.000 0.833 NA   NA
 5890449 5890450 ECIAI39_1961 ECIAI39_1962     TRUE 0.967 0.000 0.167 NA   NA
 5890450 5890451 ECIAI39_1962 ECIAI39_1963     FALSE 0.403 51.000 0.000 NA   NA
 5890451 5890452 ECIAI39_1963 ECIAI39_1964     FALSE 0.042 197.000 0.000 NA   NA
 5890452 5890453 ECIAI39_1964 ECIAI39_1965     TRUE 0.614 158.000 0.667 NA   NA
 5890453 5890454 ECIAI39_1965 ECIAI39_1966     TRUE 0.994 0.000 0.600 NA   NA
 5890454 5890455 ECIAI39_1966 ECIAI39_1967     TRUE 0.981 -3.000 0.231 NA   NA
 5890455 5890456 ECIAI39_1967 ECIAI39_1968     TRUE 0.926 -12.000 0.154 NA   NA
 5890456 5890457 ECIAI39_1968 ECIAI39_1969     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5890457 5890458 ECIAI39_1969 ECIAI39_1970     FALSE 0.371 55.000 0.000 NA   NA
 5890458 5890459 ECIAI39_1970 ECIAI39_1971     FALSE 0.069 171.000 0.000 NA   NA
 5890459 5890460 ECIAI39_1971 ECIAI39_1972     TRUE 0.966 -7.000 0.222 NA   NA
 5890460 5890461 ECIAI39_1972 ECIAI39_1973     TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5890462 5890463 ECIAI39_1974 ECIAI39_1975     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5890465 5890466 ECIAI39_1977 ECIAI39_1978     TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5890466 5890467 ECIAI39_1978 ECIAI39_1979     TRUE 0.714 -70.000 0.000 NA   NA
 5890467 5890468 ECIAI39_1979 ECIAI39_1980     FALSE 0.260 82.000 0.000 NA   NA
 5890470 5890471 ECIAI39_1982 ECIAI39_1983     FALSE 0.035 207.000 0.000 NA   NA
 5890473 5890474 ECIAI39_1985 ECIAI39_1986     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.085 Y NA
 5890475 5890476 ECIAI39_1987 ECIAI39_1988   kil FALSE 0.264 80.000 0.000 NA   NA
 5890476 5890477 ECIAI39_1988 ECIAI39_1989 kil   FALSE 0.273 76.000 0.000 NA   NA
 5890477 5890478 ECIAI39_1989 ECIAI39_1990     TRUE 0.824 6.000 0.040 NA   NA
 5890478 5890479 ECIAI39_1990 ECIAI39_1991     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890479 5890480 ECIAI39_1991 ECIAI39_1992     FALSE 0.095 152.000 0.000 NA   NA
 5890480 5890481 ECIAI39_1992 ECIAI39_1993     TRUE 0.838 8.000 0.000 NA   NA
 5890481 5890482 ECIAI39_1993 ECIAI39_1994   ymfG FALSE 0.003 744.000 0.000 NA   NA
 5890483 5890484 ECIAI39_1995 ECIAI39_1996 icd   FALSE 0.009 334.000 0.000 NA   NA
 5890486 5890487 ECIAI39_1998 ECIAI39_1999     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.085 Y NA
 5890488 5890489 ECIAI39_2000 ECIAI39_2002   ymfC FALSE 0.009 321.000 0.000 NA   NA
 5890489 5890490 ECIAI39_2002 ECIAI39_2003 ymfC ymfB TRUE 0.904 10.000 0.182 1.000 N NA
 5890490 5890491 ECIAI39_2003 ECIAI39_2004 ymfB trmU TRUE 0.507 54.000 0.158 1.000 N NA
 5890491 5890492 ECIAI39_2004 ECIAI39_2005 trmU hflD TRUE 0.757 36.000 0.180 NA   NA
 5890492 5890493 ECIAI39_2005 ECIAI39_2006 hflD purB TRUE 0.912 4.000 0.093 NA   NA
 5890493 5890494 ECIAI39_2006 ECIAI39_2007 purB phoP FALSE 0.018 169.000 0.011 1.000 N NA
 5890494 5890495 ECIAI39_2007 ECIAI39_2008 phoP phoQ TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 5890496 5890497 ECIAI39_2009 ECIAI39_2010     TRUE 0.744 14.000 0.000 NA   NA
 5890497 5890498 ECIAI39_2010 ECIAI39_2011     TRUE 0.977 -16.000 0.444 NA   NA
 5890498 5890499 ECIAI39_2011 ECIAI39_2012     FALSE 0.006 289.000 0.000 NA N NA
 5890499 5890500 ECIAI39_2012 ECIAI39_2013     TRUE 0.957 0.000 0.125 NA   NA
 5890500 5890501 ECIAI39_2013 ECIAI39_2014     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890501 5890502 ECIAI39_2014 ECIAI39_2015     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890502 5890503 ECIAI39_2015 ECIAI39_2016     TRUE 0.916 2.000 0.071 NA   NA
 5890503 5890504 ECIAI39_2016 ECIAI39_2017     TRUE 0.506 36.000 0.048 NA   NA
 5890504 5890505 ECIAI39_2017 ECIAI39_2018     FALSE 0.004 570.000 0.000 NA   NA
 5890505 5890506 ECIAI39_2018 ECIAI39_2019     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890506 5890507 ECIAI39_2019 ECIAI39_2020     FALSE 0.013 289.000 0.000 NA   NA
 5890507 5890508 ECIAI39_2020 ECIAI39_2021     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890508 5890509 ECIAI39_2021 ECIAI39_2023     FALSE 0.026 226.000 0.000 NA   NA
 5890509 5890510 ECIAI39_2023 ECIAI39_misc_RNA_47   c4 TRUE 0.640 -239.000 0.000 NA   NA
 5890510 5890511 ECIAI39_misc_RNA_47 ECIAI39_2024 c4   FALSE 0.090 154.000 0.000 NA   NA
 5890511 5890512 ECIAI39_2024 ECIAI39_2026     FALSE 0.353 58.000 0.000 NA   NA
 5890512 5890513 ECIAI39_2026 ECIAI39_2027   int FALSE 0.008 375.000 0.000 1.000   NA
 5890516 5890517 ECIAI39_2030 ECIAI39_2031     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890517 5890518 ECIAI39_2031 ECIAI39_2032     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5890518 5890519 ECIAI39_2032 ECIAI39_misc_RNA_48     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5890519 5890520 ECIAI39_misc_RNA_48 ECIAI39_2033     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5890520 5890521 ECIAI39_2033 ECIAI39_2034   potA FALSE 0.006 440.000 0.000 1.000   NA
 5890521 5890522 ECIAI39_2034 ECIAI39_2035 potA potB TRUE 0.995 14.000 0.789 1.000 Y NA
 5890522 5890523 ECIAI39_2035 ECIAI39_2036 potB potC TRUE 0.998 -3.000 0.286 0.048 Y NA
 5890523 5890524 ECIAI39_2036 ECIAI39_2037 potC potD TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.048 Y NA
 5890524 5890525 ECIAI39_2037 ECIAI39_2038 potD ymfA FALSE 0.353 58.000 0.000 NA   NA
 5890525 5890526 ECIAI39_2038 ECIAI39_2039 ymfA ycfZ TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890527 5890528 ECIAI39_2040 ECIAI39_2041 cobB ycfX TRUE 0.962 16.000 0.119 1.000 Y NA
 5890528 5890529 ECIAI39_2041 ECIAI39_2042 ycfX lolE TRUE 0.797 29.000 0.225 1.000 N NA
 5890529 5890530 ECIAI39_2042 ECIAI39_2043 lolE lolD TRUE 0.973 0.000 0.125 0.060 N NA
 5890530 5890531 ECIAI39_2043 ECIAI39_2044 lolD lolC TRUE 0.971 -7.000 0.175 0.060 N NA
 5890532 5890533 ECIAI39_2045 ECIAI39_2046 ycfT mfd FALSE 0.110 128.000 0.003 1.000   NA
 5890533 5890534 ECIAI39_2046 ECIAI39_2047 mfd ycfS FALSE 0.084 143.000 0.006 1.000   NA
 5890537 5890538 ECIAI39_2050 ECIAI39_2051 ycfJ ndh FALSE 0.035 227.000 0.071 1.000   NA
 5890538 5890539 ECIAI39_2051 ECIAI39_2052 ndh ycfP FALSE 0.006 400.000 0.057 NA   NA
 5890539 5890540 ECIAI39_2052 ECIAI39_2053 ycfP nagZ TRUE 0.739 23.000 0.091 NA   NA
 5890540 5890541 ECIAI39_2053 ECIAI39_2054 nagZ ycfN TRUE 0.737 11.000 0.069 1.000 N NA
 5890541 5890542 ECIAI39_2054 ECIAI39_2055 ycfN ycfM TRUE 0.959 -19.000 0.310 NA   NA
 5890542 5890543 ECIAI39_2055 ECIAI39_2056 ycfM ycfL TRUE 0.970 14.000 0.516 NA   NA
 5890543 5890544 ECIAI39_2056 ECIAI39_2057 ycfL hinT TRUE 0.886 3.000 0.051 NA   NA
 5890545 5890546 ECIAI39_2058 ECIAI39_2059 fhuE fhuE FALSE 0.256 85.000 0.000 NA   NA
 5890547 5890548 ECIAI39_2060 ECIAI39_2061 ptsG ycfH FALSE 0.001 295.000 0.004 NA N NA
 5890548 5890549 ECIAI39_2061 ECIAI39_2062 ycfH holB TRUE 0.970 11.000 0.110 NA Y NA
 5890549 5890550 ECIAI39_2062 ECIAI39_2063 holB tmk TRUE 0.972 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5890550 5890551 ECIAI39_2063 ECIAI39_2064 tmk yceG TRUE 0.952 -10.000 0.209 NA   NA
 5890551 5890552 ECIAI39_2064 ECIAI39_2065 yceG pabC TRUE 0.963 3.000 0.204 NA   NA
 5890552 5890553 ECIAI39_2065 ECIAI39_2066 pabC fabF FALSE 0.313 120.000 0.187 1.000 N NA
 5890553 5890554 ECIAI39_2066 ECIAI39_2067 fabF acpP TRUE 0.896 88.000 0.346 1.000 Y NA
 5890554 5890555 ECIAI39_2067 ECIAI39_2068 acpP fabG TRUE 0.615 211.000 0.321 0.003 Y NA
 5890555 5890556 ECIAI39_2068 ECIAI39_2069 fabG fabD TRUE 0.995 13.000 0.432 0.003 Y NA
 5890556 5890557 ECIAI39_2069 ECIAI39_2070 fabD fabH TRUE 0.987 16.000 0.182 0.003 Y NA
 5890557 5890558 ECIAI39_2070 ECIAI39_2071 fabH plsX TRUE 0.964 68.000 0.380 0.003 Y NA
 5890558 5890559 ECIAI39_2071 ECIAI39_2072 plsX rpmF TRUE 0.702 81.000 0.418 1.000 N NA
 5890559 5890560 ECIAI39_2072 ECIAI39_2073 rpmF yceD TRUE 0.900 52.000 0.599 NA   NA
 5890560 5890561 ECIAI39_2073 ECIAI39_misc_RNA_49 yceD sraB TRUE 0.519 37.000 0.000 NA   NA
 5890564 5890565 ECIAI39_misc_RNA_50 ECIAI39_2076   rne TRUE 0.636 25.000 0.000 NA   NA
 5890565 5890566 ECIAI39_2076 ECIAI39_2077 rne   FALSE 0.280 89.000 0.000 1.000   NA
 5890566 5890567 ECIAI39_2077 ECIAI39_2078     TRUE 0.841 -18.000 0.000 1.000   NA
 5890568 5890569 ECIAI39_2079 ECIAI39_2080 flgL flgK TRUE 0.989 12.000 0.142 0.001 Y NA
 5890569 5890570 ECIAI39_2080 ECIAI39_2081 flgK flgJ TRUE 0.985 66.000 0.705 0.002 Y NA
 5890570 5890571 ECIAI39_2081 ECIAI39_2082 flgJ flgI TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5890571 5890572 ECIAI39_2082 ECIAI39_2083 flgI flgI TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5890572 5890573 ECIAI39_2083 ECIAI39_2084 flgI flgH TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 5890573 5890574 ECIAI39_2084 ECIAI39_2085 flgH flgG TRUE 0.961 53.000 0.268 0.004 Y NA
 5890574 5890575 ECIAI39_2085 ECIAI39_2086 flgG flgF TRUE 0.919 137.000 0.420 0.001 Y NA
 5890575 5890576 ECIAI39_2086 ECIAI39_2087 flgF flgE TRUE 0.995 20.000 0.476 0.002 Y NA
 5890576 5890577 ECIAI39_2087 ECIAI39_2088 flgE flgD TRUE 0.938 25.000 0.116 NA Y NA
 5890577 5890578 ECIAI39_2088 ECIAI39_2089 flgD flgC TRUE 0.977 12.000 0.186 NA Y NA
 5890578 5890579 ECIAI39_2089 ECIAI39_2090 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.824 0.002 Y NA
 5890580 5890581 ECIAI39_2091 ECIAI39_2092 flgA flgM TRUE 0.892 76.000 0.330 NA Y NA
 5890581 5890582 ECIAI39_2092 ECIAI39_2093 flgM flgN TRUE 0.997 5.000 0.361 0.002 Y NA
 5890583 5890584 ECIAI39_2094 ECIAI39_2095 mviN mviM FALSE 0.167 110.000 0.022 1.000   NA
 5890584 5890585 ECIAI39_2095 ECIAI39_2096 mviM yceH TRUE 0.936 2.000 0.103 NA   NA
 5890585 5890586 ECIAI39_2096 ECIAI39_2097 yceH rimJ TRUE 0.871 11.000 0.116 NA   NA
 5890587 5890588 ECIAI39_2098 ECIAI39_2099 mdtH grxB FALSE 0.305 64.000 0.103 NA N NA
 5890588 5890589 ECIAI39_2099 ECIAI39_2100 grxB yceB FALSE 0.169 134.000 0.078 NA   NA
 5890589 5890590 ECIAI39_2100 ECIAI39_2101 yceB pyrC FALSE 0.145 106.000 0.022 NA   NA
 5890590 5890591 ECIAI39_2101 ECIAI39_2102 pyrC dinI FALSE 0.220 74.000 0.031 NA   NA
 5890591 5890592 ECIAI39_2102 ECIAI39_2103 dinI bssS FALSE 0.013 290.000 0.000 NA   NA
 5890592 5890593 ECIAI39_2103 ECIAI39_2104 bssS solA TRUE 0.663 115.000 0.423 NA   NA
 5890593 5890594 ECIAI39_2104 ECIAI39_2105 solA yceO TRUE 0.906 21.000 0.269 NA   NA
 5890594 5890595 ECIAI39_2105 ECIAI39_2106 yceO yceJ FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 5890599 5890600 ECIAI39_2110 ECIAI39_2111 lpxL mdtG TRUE 0.705 172.000 0.857 0.071 N NA
 5890600 5890601 ECIAI39_2111 ECIAI39_2112 mdtG msyB TRUE 0.681 83.000 0.333 NA   NA
 5890602 5890603 ECIAI39_2113 ECIAI39_2114 yceK mdoH FALSE 0.070 205.000 0.135 NA   NA
 5890603 5890604 ECIAI39_2114 ECIAI39_2115 mdoH mdoG TRUE 0.983 -7.000 0.469 NA N NA
 5890606 5890607 ECIAI39_2117 ECIAI39_2118 ymdC ymdB TRUE 0.890 2.000 0.046 NA   NA
 5890607 5890608 ECIAI39_2118 ECIAI39_2119 ymdB ymdA FALSE 0.170 95.000 0.028 NA   NA
 5890608 5890609 ECIAI39_2119 ECIAI39_2120 ymdA csgC TRUE 0.642 121.000 0.429 NA   NA
 5890609 5890610 ECIAI39_2120 ECIAI39_2121 csgC csgA TRUE 0.900 59.000 0.667 NA   NA
 5890610 5890611 ECIAI39_2121 ECIAI39_2122 csgA csgB TRUE 0.929 41.000 0.333 0.010   NA
 5890612 5890613 ECIAI39_2123 ECIAI39_2124 csgD csgE TRUE 0.943 5.000 0.176 NA   NA
 5890613 5890614 ECIAI39_2124 ECIAI39_2125 csgE csgF TRUE 0.971 25.000 0.723 NA   NA
 5890614 5890615 ECIAI39_2125 ECIAI39_2126 csgF csgG TRUE 0.569 27.000 0.043 NA   NA
 5890616 5890617 ECIAI39_2127 ECIAI39_2128 ycdZ ycdY FALSE 0.369 102.000 0.145 NA   NA
 5890617 5890618 ECIAI39_2128 ECIAI39_2129 ycdY ycdX TRUE 0.943 24.000 0.417 1.000   NA
 5890618 5890619 ECIAI39_2129 ECIAI39_2130 ycdX ycdW TRUE 0.879 55.000 0.169 1.000 Y NA
 5890622 5890623 ECIAI39_2132 ECIAI39_2133 pgaA pgaB TRUE 0.990 9.000 0.696 1.000   NA
 5890623 5890624 ECIAI39_2133 ECIAI39_2134 pgaB pgaC TRUE 0.983 -7.000 0.435 1.000 N NA
 5890624 5890625 ECIAI39_2134 ECIAI39_2135 pgaC pgaD TRUE 0.853 54.000 0.462 NA   NA
 5890626 5890627 ECIAI39_2136 ECIAI39_2137 phoH efeB FALSE 0.009 245.000 0.000 NA N NA
 5890627 5890628 ECIAI39_2137 ECIAI39_2138 efeB efeO TRUE 0.993 6.000 0.378 NA Y NA
 5890628 5890629 ECIAI39_2138 ECIAI39_2139 efeO efeU TRUE 0.931 58.000 0.356 NA Y NA
 5890629 5890630 ECIAI39_2139 ECIAI39_2140 efeU putP FALSE 0.019 211.000 0.000 1.000 N NA
 5890633 5890634 ECIAI39_2143 ECIAI39_2144 rutA rutB TRUE 0.898 47.000 0.621 NA N NA
 5890634 5890635 ECIAI39_2144 ECIAI39_2145 rutB rutC TRUE 0.957 12.000 0.442 NA N NA
 5890635 5890636 ECIAI39_2145 ECIAI39_2146 rutC rutD TRUE 0.973 8.000 0.365 NA   NA
 5890636 5890637 ECIAI39_2146 ECIAI39_2147 rutD rutE TRUE 0.950 10.000 0.256 NA   NA
 5890637 5890638 ECIAI39_2147 ECIAI39_2148 rutE rutF TRUE 0.992 11.000 0.625 0.024   NA
 5890638 5890639 ECIAI39_2148 ECIAI39_2149 rutF rutG TRUE 0.964 21.000 0.533 1.000   NA
 5890639 5890640 ECIAI39_2149 ECIAI39_2150 rutG wrbA FALSE 0.004 629.000 0.000 1.000   NA
 5890640 5890641 ECIAI39_2150 ECIAI39_2151 wrbA yccJ TRUE 0.914 21.000 0.290 NA   NA
 5890642 5890643 ECIAI39_2152 ECIAI39_2153 agp yccE FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 5890644 5890645 ECIAI39_2154 ECIAI39_2155 cbpA cbpM TRUE 0.993 0.000 0.512 NA   NA
 5890646 5890647 ECIAI39_2156 ECIAI39_2157 torD torA TRUE 0.980 -3.000 0.077 0.042   NA
 5890647 5890648 ECIAI39_2157 ECIAI39_2158 torA torC TRUE 0.994 0.000 0.000 0.042 Y NA
 5890651 5890652 ECIAI39_2161 ECIAI39_2162 torS yccM FALSE 0.154 72.000 0.000 NA N NA
 5890653 5890654 ECIAI39_2163 ECIAI39_2164 gnsA cspG FALSE 0.006 394.000 0.000 NA   NA
 5890656 5890657 ECIAI39_2166 ECIAI39_2167 appA appB FALSE 0.049 197.000 0.000 1.000   NA
 5890657 5890658 ECIAI39_2167 ECIAI39_2168 appB appC TRUE 0.986 12.000 0.158 0.042 Y NA
 5890658 5890659 ECIAI39_2168 ECIAI39_2169 appC hyaF FALSE 0.146 134.000 0.061 NA   NA
 5890659 5890660 ECIAI39_2169 ECIAI39_2170 hyaF hyaE TRUE 0.996 -3.000 0.769 NA   NA
 5890660 5890661 ECIAI39_2170 ECIAI39_2171 hyaE hyaD TRUE 0.955 -3.000 0.096 NA   NA
 5890661 5890662 ECIAI39_2171 ECIAI39_2172 hyaD hyaC TRUE 0.994 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 5890662 5890663 ECIAI39_2172 ECIAI39_2173 hyaC hyaB TRUE 0.991 19.000 0.355 0.042 Y NA
 5890663 5890664 ECIAI39_2173 ECIAI39_2174 hyaB hyaA TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5890665 5890666 ECIAI39_tRNA15 ECIAI39_2175   yccA FALSE 0.035 207.000 0.000 NA   NA
 5890666 5890667 ECIAI39_2175 ECIAI39_2176 yccA tusE FALSE 0.391 92.000 0.140 NA   NA
 5890669 5890670 ECIAI39_2178 ECIAI39_2179 yccW yccV FALSE 0.452 58.000 0.094 NA   NA
 5890672 5890673 ECIAI39_2181 ECIAI39_2182   yccT FALSE 0.492 40.000 0.000 NA   NA
 5890673 5890674 ECIAI39_2182 ECIAI39_2183 yccT mgsA FALSE 0.225 96.000 0.055 NA   NA
 5890676 5890677 ECIAI39_2185 ECIAI39_2186 yccF yccS TRUE 0.775 19.000 0.090 NA   NA
 5890680 5890681 ECIAI39_misc_RNA_51 ECIAI39_2189 isf   TRUE 0.662 -125.000 0.000 NA   NA
 5890684 5890685 ECIAI39_2192 ECIAI39_2193 ycbZ fabA TRUE 0.620 69.000 0.290 1.000 N NA
 5890686 5890687 ECIAI39_2194 ECIAI39_2195 rmf ymbA FALSE 0.018 256.000 0.000 NA   NA
 5890687 5890688 ECIAI39_2195 ECIAI39_2196 ymbA pqiB TRUE 0.975 12.000 0.531 NA   NA
 5890688 5890689 ECIAI39_2196 ECIAI39_2197 pqiB pqiA TRUE 0.993 5.000 0.819 NA   NA
 5890689 5890690 ECIAI39_2197 ECIAI39_2198 pqiA uup FALSE 0.145 130.000 0.054 NA   NA
 5890690 5890691 ECIAI39_2198 ECIAI39_2199 uup ycbY TRUE 0.811 12.000 0.061 1.000   NA
 5890693 5890694 ECIAI39_2201 ECIAI39_2202 ycbW pyrD FALSE 0.086 174.000 0.081 NA   NA
 5890694 5890695 ECIAI39_2202 ECIAI39_2203 pyrD ycbF FALSE 0.126 111.000 0.000 1.000 N NA
 5890695 5890696 ECIAI39_2203 ECIAI39_2204 ycbF ycbV TRUE 0.997 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 5890696 5890697 ECIAI39_2204 ECIAI39_2205 ycbV ycbU TRUE 0.998 8.000 0.667 0.010 Y NA
 5890697 5890698 ECIAI39_2205 ECIAI39_2206 ycbU ycbT TRUE 0.980 12.000 0.000 0.010 Y NA
 5890698 5890699 ECIAI39_2206 ECIAI39_2207 ycbT ycbS TRUE 0.979 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5890699 5890700 ECIAI39_2207 ECIAI39_2208 ycbS ycbR TRUE 0.991 25.000 0.667 1.000 Y NA
 5890700 5890701 ECIAI39_2208 ECIAI39_2209 ycbR ycbQ TRUE 0.934 81.000 0.500 1.000 Y NA
 5890702 5890703 ECIAI39_2210 ECIAI39_2211 ssuE ssuA TRUE 0.958 -7.000 0.169 1.000   NA
 5890703 5890704 ECIAI39_2211 ECIAI39_2212 ssuA ssuD TRUE 0.986 -3.000 0.341 1.000 N NA
 5890704 5890705 ECIAI39_2212 ECIAI39_2213 ssuD ssuC TRUE 0.905 12.000 0.226 1.000 N NA
 5890705 5890706 ECIAI39_2213 ECIAI39_2214 ssuC ssuB TRUE 0.998 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5890708 5890709 ECIAI39_2216 ECIAI39_2217 pncB asnS FALSE 0.029 169.000 0.034 1.000 N NA
 5890709 5890710 ECIAI39_2217 ECIAI39_2218 asnS ompF FALSE 0.002 602.000 0.000 1.000 N NA
 5890710 5890711 ECIAI39_2218 ECIAI39_2219 ompF aspC FALSE 0.022 185.000 0.036 1.000 N NA
 5890712 5890713 ECIAI39_2220 ECIAI39_2221 ycbL ycbK TRUE 0.693 27.000 0.089 NA   NA
 5890713 5890714 ECIAI39_2221 ECIAI39_2222 ycbK ycbB FALSE 0.300 181.000 0.372 NA   NA
 5890714 5890715 ECIAI39_2222 ECIAI39_2223 ycbB mukB FALSE 0.020 261.000 0.000 1.000   NA
 5890715 5890716 ECIAI39_2223 ECIAI39_2224 mukB mukE TRUE 0.995 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5890716 5890717 ECIAI39_2224 ECIAI39_2225 mukE mukF TRUE 0.966 8.000 0.036 NA Y NA
 5890717 5890718 ECIAI39_2225 ECIAI39_2226 mukF smtA TRUE 0.983 -3.000 0.325 NA N NA
 5890720 5890721 ECIAI39_2228 ECIAI39_2229 ycbJ kdsB FALSE 0.061 154.000 0.023 NA   NA
 5890721 5890722 ECIAI39_2229 ECIAI39_2230 kdsB ycaR TRUE 0.984 -3.000 0.265 NA   NA
 5890722 5890723 ECIAI39_2230 ECIAI39_2231 ycaR ycaQ FALSE 0.283 52.000 0.016 NA   NA
 5890723 5890724 ECIAI39_2231 ECIAI39_2232 ycaQ lpxK FALSE 0.397 37.000 0.017 NA   NA
 5890724 5890725 ECIAI39_2232 ECIAI39_2233 lpxK msbA TRUE 0.971 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5890725 5890726 ECIAI39_2233 ECIAI39_2234 msbA ycaI TRUE 0.771 37.000 0.075 0.071   NA
 5890726 5890727 ECIAI39_2234 ECIAI39_2235 ycaI ihfB FALSE 0.024 207.000 0.003 1.000   NA
 5890727 5890728 ECIAI39_2235 ECIAI39_2236 ihfB rpsA FALSE 0.259 160.000 0.292 1.000 N NA
 5890728 5890729 ECIAI39_2236 ECIAI39_2237 rpsA cmk FALSE 0.474 111.000 0.281 1.000 N NA
 5890729 5890730 ECIAI39_2237 ECIAI39_2238 cmk ycaL FALSE 0.015 173.000 0.004 1.000 N NA
 5890732 5890733 ECIAI39_2240 ECIAI39_2241 aroA serC TRUE 0.710 71.000 0.033 1.000 Y NA
 5890733 5890734 ECIAI39_2241 ECIAI39_2242 serC ycaP FALSE 0.024 199.000 0.014 NA   NA
 5890735 5890736 ECIAI39_2243 ECIAI39_2244 ycaO focA FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 5890736 5890737 ECIAI39_2244 ECIAI39_2245 focA pflB TRUE 0.752 55.000 0.345 1.000 N NA
 5890737 5890738 ECIAI39_2245 ECIAI39_2246 pflB pflA FALSE 0.046 192.000 0.092 1.000 N NA
 5890741 5890742 ECIAI39_2249 ECIAI39_2250 ycaM ycaD FALSE 0.015 210.000 0.000 NA N NA
 5890744 5890745 ECIAI39_2252 ECIAI39_2253 dmsC dmsB TRUE 0.984 2.000 0.333 1.000   NA
 5890745 5890746 ECIAI39_2253 ECIAI39_2254 dmsB dmsA TRUE 0.989 11.000 0.172 0.041 Y NA
 5890746 5890747 ECIAI39_2254 ECIAI39_2255 dmsA serS FALSE 0.013 239.000 0.000 1.000 N NA
 5890747 5890748 ECIAI39_2255 ECIAI39_2256 serS ycaJ FALSE 0.405 91.000 0.078 0.075 N NA
 5890748 5890749 ECIAI39_2256 ECIAI39_2257 ycaJ lolA TRUE 0.878 11.000 0.167 1.000 N NA
 5890749 5890750 ECIAI39_2257 ECIAI39_2258 lolA   FALSE 0.050 160.000 0.000 1.000 N NA
 5890750 5890751 ECIAI39_2258 ECIAI39_2259     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5890751 5890752 ECIAI39_2259 ECIAI39_2260   ftsK FALSE 0.311 75.000 0.000 1.000   NA
 5890752 5890753 ECIAI39_2260 ECIAI39_2261 ftsK lrp FALSE 0.444 135.000 0.345 1.000 N NA
 5890754 5890755 ECIAI39_2262 ECIAI39_2263 trxB cydD TRUE 0.569 123.000 0.049 1.000 Y NA
 5890755 5890756 ECIAI39_2263 ECIAI39_2264 cydD cydC TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 5890756 5890757 ECIAI39_2264 ECIAI39_2265 cydC aat TRUE 0.857 42.000 0.049 1.000 Y NA
 5890757 5890758 ECIAI39_2265 ECIAI39_2266 aat infA FALSE 0.004 285.000 0.020 1.000 N NA
 5890758 5890759 ECIAI39_2266 ECIAI39_tRNA16 infA   FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 5890759 5890760 ECIAI39_tRNA16 ECIAI39_2267     FALSE 0.163 125.000 0.000 NA   NA
 11534121 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 573.000 0.000 NA   NA
 11676484 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 573.000 0.000 NA   NA
 11818876 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 573.000 0.000 NA   NA
 11534122 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 593.000 0.000 NA   NA
 11676485 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 593.000 0.000 NA   NA
 11818877 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 593.000 0.000 NA   NA
 11534123 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 633.000 0.000 NA   NA
 11676486 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 633.000 0.000 NA   NA
 11818878 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 633.000 0.000 NA   NA
 11534124 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 653.000 0.000 NA   NA
 11676487 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 653.000 0.000 NA   NA
 11818879 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 653.000 0.000 NA   NA
 11534125 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 693.000 0.000 NA   NA
 11676488 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 693.000 0.000 NA   NA
 11818880 5890758   ECIAI39_2266   infA FALSE NA 693.000 0.000 NA   NA
 5890761 5890762 ECIAI39_2269 ECIAI39_2270 clpA clpS TRUE 0.948 31.000 0.596 NA   NA
 5890762 5890763 ECIAI39_2270 ECIAI39_2271 clpS   FALSE 0.220 99.000 0.000 NA   NA
 5890765 5890766 ECIAI39_2273 ECIAI39_2274 macB macA TRUE 0.997 -3.000 0.789 0.086 N NA
 5890770 5890771 ECIAI39_2278 ECIAI39_2279   dusC FALSE 0.014 231.000 0.000 1.000 N NA
 5890772 5890773 ECIAI39_2280 ECIAI39_2281 yohJ yohK TRUE 0.990 -3.000 0.340 1.000   NA
 5890773 5890774 ECIAI39_2281 ECIAI39_2282 yohK cdd FALSE 0.282 130.000 0.198 1.000 N NA
 5890774 5890775 ECIAI39_2282 ECIAI39_2283 cdd sanA FALSE 0.089 150.000 0.045 NA   NA
 5890775 5890776 ECIAI39_2283 ECIAI39_2284 sanA yeiS TRUE 0.835 3.000 0.019 NA   NA
 5890776 5890777 ECIAI39_2284 ECIAI39_2285 yeiS yeiT FALSE 0.035 194.000 0.036 NA   NA
 5890777 5890778 ECIAI39_2285 ECIAI39_2286 yeiT yeiA TRUE 0.859 -6.000 0.062 1.000 N NA
 5890779 5890780 ECIAI39_2287 ECIAI39_2288 mglC mglA TRUE 0.996 16.000 0.905 1.000 Y NA
 5890780 5890781 ECIAI39_2288 ECIAI39_2289 mglA mglB TRUE 0.892 61.000 0.250 NA Y NA
 5890781 5890782 ECIAI39_2289 ECIAI39_2290 mglB galS FALSE 0.006 280.000 0.000 NA N NA
 5890782 5890783 ECIAI39_2290 ECIAI39_2291 galS yeiB TRUE 0.586 142.000 0.500 NA   NA
 5890783 5890784 ECIAI39_2291 ECIAI39_2292 yeiB folE TRUE 0.980 17.000 0.719 NA   NA
 5890786 5890787 ECIAI39_2294 ECIAI39_2295 cirA cirA FALSE 0.245 90.000 0.000 NA   NA
 5890787 5890788 ECIAI39_2295 ECIAI39_2296 cirA lysP FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 5890788 5890789 ECIAI39_2296 ECIAI39_2297 lysP yeiE FALSE 0.022 205.000 0.000 1.000 N NA
 5890790 5890791 ECIAI39_2298 ECIAI39_2299 yeiH nfo FALSE 0.244 74.000 0.040 NA   NA
 5890791 5890792 ECIAI39_2299 ECIAI39_2300 nfo yeiI FALSE 0.445 3.000 0.004 NA N NA
 5890793 5890794 ECIAI39_2301 ECIAI39_2302 yeiJ rihB TRUE 0.638 100.000 0.056 NA Y NA
 5890796 5890797 ECIAI39_2304 ECIAI39_2305 yeiM yeiN FALSE 0.120 94.000 0.000 NA N NA
 5890797 5890798 ECIAI39_2305 ECIAI39_2306 yeiN yeiC FALSE 0.379 -12.000 0.008 NA N NA
 5890798 5890799 ECIAI39_2306 ECIAI39_2307 yeiC fruA FALSE 0.033 424.000 0.000 NA Y NA
 5890799 5890800 ECIAI39_2307 ECIAI39_2308 fruA fruK TRUE 0.992 17.000 0.562 1.000 Y NA
 5890800 5890801 ECIAI39_2308 ECIAI39_2309 fruK fruB TRUE 0.991 0.000 0.112 1.000 Y NA
 5890804 5890805 ECIAI39_2312 ECIAI39_2313 yeiP yeiQ FALSE 0.016 223.000 0.000 1.000 N NA
 5890805 5890806 ECIAI39_2313 ECIAI39_2314 yeiQ yeiR FALSE 0.351 118.000 0.167 NA   NA
 5890806 5890807 ECIAI39_2314 ECIAI39_2315 yeiR yeiU TRUE 0.822 39.000 0.275 NA   NA
 5890807 5890808 ECIAI39_2315 ECIAI39_2316 yeiU spr FALSE 0.006 412.000 0.000 NA   NA
 5890808 5890809 ECIAI39_2316 ECIAI39_2317 spr rtn FALSE 0.124 181.000 0.219 NA N NA
 5890809 5890810 ECIAI39_2317 ECIAI39_2318 rtn yejA TRUE 0.662 82.000 0.394 NA N NA
 5890810 5890811 ECIAI39_2318 ECIAI39_2319 yejA yejB TRUE 0.998 1.000 0.848 0.046   NA
 5890811 5890812 ECIAI39_2319 ECIAI39_2320 yejB yejE TRUE 0.998 0.000 0.833 0.046   NA
 5890812 5890813 ECIAI39_2320 ECIAI39_2321 yejE yejF TRUE 0.995 2.000 0.758 1.000   NA
 5890814 5890815 ECIAI39_2322 ECIAI39_2323 yejG bcr FALSE 0.009 333.000 0.000 NA   NA
 5890815 5890816 ECIAI39_2323 ECIAI39_2324 bcr rsuA FALSE 0.372 28.000 0.036 1.000 N NA
 5890817 5890818 ECIAI39_2325 ECIAI39_2326 yejH rplY FALSE 0.246 125.000 0.024 0.015 N NA
 5890820 5890821 ECIAI39_2328 ECIAI39_2329 yejL yejM TRUE 0.647 20.000 0.040 NA   NA
 5890821 5890822 ECIAI39_2329 ECIAI39_tRNA17 yejM   FALSE 0.277 75.000 0.000 NA   NA
 5890825 5890826 ECIAI39_2332 ECIAI39_2333 ccmH ccmG TRUE 0.999 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 5890826 5890827 ECIAI39_2333 ECIAI39_2334 ccmG ccmF TRUE 1.000 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 5890827 5890828 ECIAI39_2334 ECIAI39_2335 ccmF ccmE TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 5890828 5890829 ECIAI39_2335 ECIAI39_2336 ccmE ccmD TRUE 0.986 -3.000 0.344 1.000 N NA
 5890829 5890830 ECIAI39_2336 ECIAI39_2337 ccmD ccmC TRUE 0.992 -3.000 0.501 1.000 N NA
 5890830 5890831 ECIAI39_2337 ECIAI39_2338 ccmC ccmB TRUE 0.989 42.000 0.501 0.001 Y NA
 5890831 5890832 ECIAI39_2338 ECIAI39_2339 ccmB ccmA TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 5890832 5890833 ECIAI39_2339 ECIAI39_2340 ccmA napC TRUE 0.589 13.000 0.043 1.000 N NA
 5890833 5890834 ECIAI39_2340 ECIAI39_2341 napC napB TRUE 0.997 10.000 0.490 0.003 Y NA
 5890834 5890835 ECIAI39_2341 ECIAI39_2342 napB napH TRUE 0.998 -3.000 0.316 0.008 Y NA
 5890835 5890836 ECIAI39_2342 ECIAI39_2343 napH napG TRUE 0.995 -13.000 0.795 0.041   NA
 5890836 5890837 ECIAI39_2343 ECIAI39_2344 napG napA TRUE 0.979 7.000 0.243 0.041   NA
 5890837 5890838 ECIAI39_2344 ECIAI39_2345 napA napD TRUE 0.996 -3.000 0.875 NA N NA
 5890840 5890841 ECIAI39_2347 ECIAI39_2348 mqo yojI FALSE 0.033 218.000 0.000 1.000   NA
 5890841 5890842 ECIAI39_2348 ECIAI39_2349 yojI alkB FALSE 0.231 76.000 0.076 1.000 N NA
 5890842 5890843 ECIAI39_2349 ECIAI39_2350 alkB ada TRUE 0.954 0.000 0.015 0.010 N NA
 5890843 5890844 ECIAI39_2350 ECIAI39_2351 ada yojL FALSE 0.098 74.000 0.019 1.000 N NA
 5890844 5890845 ECIAI39_2351 ECIAI39_2352 yojL ompC FALSE 0.144 112.000 0.066 1.000 N NA
 5890848 5890849 ECIAI39_2354 ECIAI39_2355 rcsD rcsB TRUE 0.992 17.000 0.558 1.000 Y NA
 5890851 5890852 ECIAI39_2357 ECIAI39_2358 atoS atoC TRUE 0.999 -3.000 0.364 0.012 Y NA
 5890852 5890853 ECIAI39_2358 ECIAI39_2359 atoC atoD FALSE 0.137 196.000 0.273 1.000 N NA
 5890853 5890854 ECIAI39_2359 ECIAI39_2360 atoD atoA TRUE 1.000 0.000 0.800 0.000 Y NA
 5890854 5890855 ECIAI39_2360 ECIAI39_2361 atoA atoE TRUE 0.994 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 5890855 5890856 ECIAI39_2361 ECIAI39_2362 atoE atoB TRUE 0.943 31.000 0.174 1.000 Y NA
 5890857 5890858 ECIAI39_2363 ECIAI39_2364 yfaP yfaQ TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 5890858 5890859 ECIAI39_2364 ECIAI39_2365 yfaQ yfaS TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5890859 5890860 ECIAI39_2365 ECIAI39_2366 yfaS yfaS FALSE 0.097 151.000 0.000 NA   NA
 5890860 5890861 ECIAI39_2366 ECIAI39_2367 yfaS yfaT TRUE 0.693 -81.000 0.000 NA   NA
 5890861 5890862 ECIAI39_2367 ECIAI39_2368 yfaT yfaA TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5890862 5890863 ECIAI39_2368 ECIAI39_2369 yfaA gyrA FALSE 0.104 149.000 0.000 NA   NA
 5890863 5890864 ECIAI39_2369 ECIAI39_2370 gyrA   FALSE 0.005 351.000 0.000 1.000 N NA
 5890864 5890865 ECIAI39_2370 ECIAI39_2371     TRUE 0.992 1.000 0.667 NA N NA
 5890866 5890867 ECIAI39_2372 ECIAI39_2373   ubiG FALSE 0.073 78.000 0.004 1.000 N NA
 5890869 5890870 ECIAI39_2375 ECIAI39_2376   nrdA FALSE 0.262 81.000 0.000 NA   NA
 5890870 5890871 ECIAI39_2376 ECIAI39_2377 nrdA nrdB TRUE 0.690 146.000 0.000 0.001 Y NA
 5890871 5890872 ECIAI39_2377 ECIAI39_2378 nrdB yfaE TRUE 0.825 0.000 0.034 1.000 N NA
 5890873 5890874 ECIAI39_2379 ECIAI39_2380 inaA   FALSE 0.262 81.000 0.000 NA   NA
 5890876 5890877 ECIAI39_2382 ECIAI39_2383 glpQ glpT TRUE 0.974 5.000 0.396 1.000 N NA
 5890878 5890879 ECIAI39_2384 ECIAI39_2385 glpA glpB TRUE 0.995 -10.000 0.650 0.001 N NA
 5890879 5890880 ECIAI39_2385 ECIAI39_2386 glpB glpC TRUE 0.997 -3.000 0.547 0.001 N NA
 5890880 5890881 ECIAI39_2386 ECIAI39_2387 glpC yfaD FALSE 0.045 193.000 0.000 NA   NA
 5890881 5890882 ECIAI39_2387 ECIAI39_2388 yfaD ypaA TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5890883 5890884 ECIAI39_2389 ECIAI39_2390 yfaU yfaV TRUE 0.976 18.000 0.250 NA Y NA
 5890884 5890885 ECIAI39_2390 ECIAI39_2391 yfaV yfaW FALSE 0.359 57.000 0.000 NA   NA
 5890886 5890887 ECIAI39_2392 ECIAI39_2393     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.082 Y NA
 5890888 5890889 ECIAI39_2394 ECIAI39_2395 yfaW yfaX TRUE 0.890 3.000 0.000 NA   NA
 5890889 5890890 ECIAI39_2395 ECIAI39_2396 yfaX yfaY FALSE 0.032 220.000 0.000 1.000   NA
 5890890 5890891 ECIAI39_2396 ECIAI39_2397 yfaY yfaZ FALSE 0.162 100.000 0.005 1.000   NA
 5890894 5890895 ECIAI39_2400 ECIAI39_2401 yfbE yfbF TRUE 0.995 4.000 0.378 NA Y NA
 5890895 5890896 ECIAI39_2401 ECIAI39_2402 yfbF yfbG TRUE 0.994 0.000 0.220 NA Y NA
 5890896 5890897 ECIAI39_2402 ECIAI39_2403 yfbG yfbH TRUE 0.998 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 5890897 5890898 ECIAI39_2403 ECIAI39_2404 yfbH arnT TRUE 0.812 0.000 0.031 1.000 N NA
 5890898 5890899 ECIAI39_2404 ECIAI39_2405 arnT yfbW TRUE 0.959 -3.000 0.158 1.000 N NA
 5890899 5890900 ECIAI39_2405 ECIAI39_2406 yfbW yfbJ TRUE 0.978 0.000 0.226 NA   NA
 5890901 5890902 ECIAI39_2407 ECIAI39_2408 pmrD menE FALSE 0.120 110.000 0.005 NA   NA
 5890902 5890903 ECIAI39_2408 ECIAI39_2409 menE menC TRUE 0.993 -3.000 0.283 0.001 N NA
 5890903 5890904 ECIAI39_2409 ECIAI39_2410 menC menB TRUE 0.997 0.000 0.171 0.001 Y NA
 5890904 5890905 ECIAI39_2410 ECIAI39_2411 menB yfbB TRUE 0.929 15.000 0.280 NA   NA
 5890905 5890906 ECIAI39_2411 ECIAI39_2412 yfbB menD TRUE 0.989 -3.000 0.355 NA   NA
 5890906 5890907 ECIAI39_2412 ECIAI39_2413 menD menF TRUE 0.867 89.000 0.281 1.000 Y NA
 5890907 5890908 ECIAI39_2413 ECIAI39_2414 menF elaB FALSE 0.238 79.000 0.043 NA   NA
 5890908 5890909 ECIAI39_2414 ECIAI39_2415 elaB elaA FALSE 0.487 48.000 0.077 NA   NA
 5890910 5890911 ECIAI39_2416 ECIAI39_2417 elaC elaD FALSE 0.055 191.000 0.000 1.000   NA
 5890912 5890913 ECIAI39_2418 ECIAI39_2419 yfbK insB FALSE 0.140 133.000 0.000 NA   NA
 5890913 5890914 ECIAI39_2419 ECIAI39_2420 insB insA TRUE 0.967 -81.000 0.000 0.024 Y NA
 5890915 5890916 ECIAI39_2421 ECIAI39_2422 yfbL yfbM FALSE 0.214 103.000 0.000 NA   NA
 5890917 5890918 ECIAI39_2423 ECIAI39_2424 nuoN nuoM TRUE 0.998 7.000 0.437 0.002 Y NA
 5890918 5890919 ECIAI39_2424 ECIAI39_2425 nuoM nuoL TRUE 0.923 166.000 0.713 0.002 Y NA
 5890919 5890920 ECIAI39_2425 ECIAI39_2426 nuoL nuoK TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.006 Y NA
 5890920 5890921 ECIAI39_2426 ECIAI39_2427 nuoK nuoJ TRUE 0.998 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 5890921 5890922 ECIAI39_2427 ECIAI39_2428 nuoJ nuoI TRUE 0.996 12.000 0.428 0.006 Y NA
 5890922 5890923 ECIAI39_2428 ECIAI39_2429 nuoI nuoH TRUE 0.995 15.000 0.423 0.006 Y NA
 5890923 5890924 ECIAI39_2429 ECIAI39_2430 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.006 Y NA
 5890924 5890925 ECIAI39_2430 ECIAI39_2431 nuoG nuoF TRUE 0.955 47.000 0.180 0.006 Y NA
 5890925 5890926 ECIAI39_2431 ECIAI39_2432 nuoF nuoE TRUE 0.997 -3.000 0.186 0.006 Y NA
 5890926 5890927 ECIAI39_2432 ECIAI39_2433 nuoE nuoC TRUE 0.998 3.000 0.407 0.006 Y NA
 5890927 5890928 ECIAI39_2433 ECIAI39_2434 nuoC nuoB TRUE 0.977 94.000 0.691 0.003 Y NA
 5890928 5890929 ECIAI39_2434 ECIAI39_2435 nuoB nuoA TRUE 0.994 16.000 0.377 0.003 Y NA
 5890929 5890930 ECIAI39_2435 ECIAI39_2436 nuoA lrhA FALSE 0.002 630.000 0.000 1.000 N NA
 5890931 5890932 ECIAI39_2437 ECIAI39_2438 yfbQ yfbR FALSE 0.392 84.000 0.104 1.000   NA
 5890933 5890934 ECIAI39_2439 ECIAI39_2440 yfbS yfbT TRUE 0.665 87.000 0.308 1.000   NA
 5890934 5890935 ECIAI39_2440 ECIAI39_2441 yfbT yfbU TRUE 0.965 11.000 0.375 NA   NA
 5890935 5890936 ECIAI39_2441 ECIAI39_2442 yfbU yfbV TRUE 0.552 83.000 0.221 NA   NA
 5890937 5890938 ECIAI39_2443 ECIAI39_2444 ackA pta TRUE 0.868 75.000 0.634 1.000   NA
 5890938 5890939 ECIAI39_2444 ECIAI39_2445 pta yfcC FALSE 0.048 190.000 0.000 NA   NA
 5890940 5890941 ECIAI39_2446 ECIAI39_2447 yfcD yfcE TRUE 0.764 58.000 0.143 0.008   NA
 5890941 5890942 ECIAI39_2447 ECIAI39_2448 yfcE yfcF FALSE 0.483 53.000 0.092 NA   NA
 5890943 5890944 ECIAI39_2449 ECIAI39_2450 yfcG folX FALSE 0.122 57.000 0.012 1.000 N NA
 5890944 5890945 ECIAI39_2450 ECIAI39_2451 folX yfcH TRUE 0.816 21.000 0.122 1.000   NA
 5890946 5890947 ECIAI39_2452 ECIAI39_2453     TRUE 0.976 -3.000 0.231 1.000 N NA
 5890947 5890948 ECIAI39_2453 ECIAI39_2454   yfcI FALSE 0.010 307.000 0.000 NA   NA
 5890948 5890949 ECIAI39_2454 ECIAI39_2455 yfcI hisP FALSE 0.043 196.000 0.000 NA   NA
 5890949 5890950 ECIAI39_2455 ECIAI39_2456 hisP hisM TRUE 0.997 8.000 0.643 1.000 Y NA
 5890950 5890951 ECIAI39_2456 ECIAI39_2457 hisM hisQ TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.014 Y NA
 5890951 5890952 ECIAI39_2457 ECIAI39_2458 hisQ hisJ TRUE 0.979 90.000 0.833 0.046 Y NA
 5890952 5890953 ECIAI39_2458 ECIAI39_2459 hisJ argT FALSE 0.279 221.000 0.000 0.011 Y NA
 5890953 5890954 ECIAI39_2459 ECIAI39_2460 argT ubiX FALSE 0.009 266.000 0.000 1.000 N NA
 5890954 5890955 ECIAI39_2460 ECIAI39_2461 ubiX purF FALSE 0.152 95.000 0.056 1.000 N NA
 5890955 5890956 ECIAI39_2461 ECIAI39_2462 purF cvpA TRUE 0.839 37.000 0.262 1.000   NA
 5890956 5890957 ECIAI39_2462 ECIAI39_2463 cvpA dedD FALSE 0.015 330.000 0.116 NA   NA
 5890957 5890958 ECIAI39_2463 ECIAI39_2464 dedD folC TRUE 0.954 -10.000 0.216 NA   NA
 5890958 5890959 ECIAI39_2464 ECIAI39_2465 folC accD TRUE 0.713 70.000 0.383 1.000 N NA
 5890959 5890960 ECIAI39_2465 ECIAI39_2466 accD dedA FALSE 0.057 156.000 0.020 NA   NA
 5890960 5890961 ECIAI39_2466 ECIAI39_2467 dedA truA FALSE 0.218 83.000 0.038 NA   NA
 5890961 5890962 ECIAI39_2467 ECIAI39_2468 truA usg TRUE 0.842 0.000 0.040 1.000 N NA
 5890962 5890963 ECIAI39_2468 ECIAI39_2469 usg pdxB TRUE 0.893 66.000 0.097 0.008 Y NA
 5890965 5890966 ECIAI39_2471 ECIAI39_2472 yfcJ fabB FALSE 0.007 265.000 0.000 NA N NA
 5890968 5890969 ECIAI39_2474 ECIAI39_2475 yfcL yfcM TRUE 0.912 34.000 0.425 NA   NA
 5890969 5890970 ECIAI39_2475 ECIAI39_2476 yfcM yfcA TRUE 0.964 0.000 0.153 NA   NA
 5890970 5890971 ECIAI39_2476 ECIAI39_2477 yfcA mepA TRUE 0.969 0.000 0.160 1.000   NA
 5890971 5890972 ECIAI39_2477 ECIAI39_2478 mepA aroC TRUE 0.717 3.000 0.025 1.000 N NA
 5890972 5890973 ECIAI39_2478 ECIAI39_2479 aroC prmB TRUE 0.504 35.000 0.081 1.000 N NA
 5890974 5890975 ECIAI39_2480 ECIAI39_2481 yfcN   FALSE 0.254 86.000 0.000 NA   NA
 5890975 5890976 ECIAI39_2481 ECIAI39_2482     TRUE 0.513 115.000 0.000 0.001   NA
 5890976 5890977 ECIAI39_2482 ECIAI39_2483     TRUE 0.975 -34.000 0.556 NA   NA
 5890978 5890979 ECIAI39_2485 ECIAI39_2486 yfcO yfcP TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 5890979 5890980 ECIAI39_2486 ECIAI39_2487 yfcP yfcQ TRUE 0.998 -3.000 0.286 0.010 Y NA
 5890980 5890981 ECIAI39_2487 ECIAI39_2488 yfcQ yfcR TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.010 Y NA
 5890981 5890982 ECIAI39_2488 ECIAI39_2489 yfcR yfcS TRUE 0.985 -49.000 0.333 1.000 Y NA
 5890982 5890983 ECIAI39_2489 ECIAI39_2490 yfcS yfcU TRUE 0.996 20.000 1.000 1.000 Y NA
 5890983 5890984 ECIAI39_2490 ECIAI39_2491 yfcU yfcV TRUE 0.975 75.000 1.000 1.000 Y NA
 5890984 5890985 ECIAI39_2491 ECIAI39_2492 yfcV sixA FALSE 0.003 520.000 0.000 1.000 N NA
 5890985 5890986 ECIAI39_2492 ECIAI39_2493 sixA yfcX FALSE 0.023 203.000 0.000 1.000 N NA
 5890986 5890987 ECIAI39_2493 ECIAI39_2494 yfcX yfcY TRUE 0.998 0.000 0.430 1.000 Y NA
 5890987 5890988 ECIAI39_2494 ECIAI39_2495 yfcY yfcZ FALSE 0.061 181.000 0.061 NA   NA
 5890989 5890990 ECIAI39_2497 ECIAI39_2498 fadL yfdF FALSE 0.007 367.000 0.000 NA   NA
 5890992 5890993 ECIAI39_2500 ECIAI39_tRNA18 yfdC   FALSE 0.273 76.000 0.000 NA   NA
 5890993 5890994 ECIAI39_tRNA18 ECIAI39_2501   intS FALSE 0.081 162.000 0.000 NA   NA
 5890994 5890995 ECIAI39_2501 ECIAI39_2502 intS   FALSE 0.047 535.000 0.000 0.081 Y NA
 5890995 5890996 ECIAI39_2502 ECIAI39_2503     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.081 Y NA
 5890997 5890998 ECIAI39_2504 ECIAI39_2505     FALSE 0.003 963.000 0.000 NA   NA
 5891001 5891002 ECIAI39_2508 ECIAI39_2509 dsdX dsdA TRUE 0.952 18.000 0.083 1.000 Y NA
 5891003 5891004 ECIAI39_2510 ECIAI39_2511 emrY emrK TRUE 0.997 0.000 1.000 1.000   NA
 5891005 5891006 ECIAI39_2512 ECIAI39_2513 evgA evgS TRUE 0.989 5.000 0.000 0.010 Y NA
 5891007 5891008 ECIAI39_2514 ECIAI39_2515 yfdE yfdV FALSE 0.315 74.000 0.000 1.000   NA
 5891008 5891009 ECIAI39_2515 ECIAI39_2516 yfdV oxc FALSE 0.333 69.000 0.000 1.000   NA
 5891009 5891010 ECIAI39_2516 ECIAI39_2517 oxc frc FALSE 0.460 54.000 0.134 1.000 N NA
 5891010 5891011 ECIAI39_2517 ECIAI39_2518 frc yfdX FALSE 0.004 512.000 0.000 NA   NA
 5891013 5891014 ECIAI39_2520 ECIAI39_2521   yfdY TRUE 0.736 -45.000 0.000 NA   NA
 5891016 5891017 ECIAI39_misc_RNA_53 ECIAI39_2523 tpke70 yfdZ FALSE 0.005 428.000 0.000 NA   NA
 5891018 5891019 ECIAI39_2524 ECIAI39_2525 ypdA ypdB TRUE 0.999 -3.000 0.744 0.012 Y NA
 5891019 5891020 ECIAI39_2525 ECIAI39_2526 ypdB ypdC TRUE 0.973 13.000 0.051 0.068 Y NA
 5891021 5891022 ECIAI39_2527 ECIAI39_2528 ypdD ypdD TRUE 0.683 -82.000 0.000 NA   NA
 5891022 5891023 ECIAI39_2528 ECIAI39_2529 ypdD ypdE TRUE 0.636 25.000 0.000 NA   NA
 5891023 5891024 ECIAI39_2529 ECIAI39_2530 ypdE ypdF TRUE 0.948 0.000 0.009 0.017 N NA
 5891024 5891025 ECIAI39_2530 ECIAI39_2531 ypdF ypdG FALSE 0.401 15.000 0.011 1.000 N NA
 5891025 5891026 ECIAI39_2531 ECIAI39_2532 ypdG ypdH TRUE 0.997 22.000 0.875 0.012 Y NA
 5891026 5891027 ECIAI39_2532 ECIAI39_2533 ypdH glk FALSE 0.195 219.000 0.091 1.000 Y NA
 5891028 5891029 ECIAI39_2534 ECIAI39_2535 yfeO ypeC FALSE 0.189 115.000 0.000 NA   NA
 5891029 5891030 ECIAI39_2535 ECIAI39_2536 ypeC   FALSE 0.256 85.000 0.000 NA   NA
 5891030 5891031 ECIAI39_2536 ECIAI39_2537     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5891034 5891035 ECIAI39_2540 ECIAI39_tRNA68 yfeA   FALSE 0.034 208.000 0.000 NA   NA
 5891035 5891036 ECIAI39_tRNA68 ECIAI39_tRNA67     FALSE 0.492 40.000 0.000 NA   NA
 5891037 5891038 ECIAI39_2541 ECIAI39_2542 yfeC yfeD TRUE 0.971 2.000 0.000 0.006   NA
 5891039 5891040 ECIAI39_2543 ECIAI39_2544 ydcM ydcM FALSE 0.092 153.000 0.000 NA   NA
 5891043 5891044 ECIAI39_tRNA19 ECIAI39_tRNA20     FALSE 0.448 45.000 0.000 NA   NA
 5891044 5891045 ECIAI39_tRNA20 ECIAI39_tRNA21     FALSE 0.448 45.000 0.000 NA   NA
 5891045 5891046 ECIAI39_tRNA21 ECIAI39_tRNA22     FALSE 0.441 46.000 0.000 NA   NA
 5891046 5891047 ECIAI39_tRNA22 ECIAI39_tRNA23     TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 5891048 5891049 ECIAI39_2547 ECIAI39_2548 xapR xapB FALSE 0.455 75.000 0.130 1.000   NA
 5891049 5891050 ECIAI39_2548 ECIAI39_2549 xapB   TRUE 0.665 -115.000 0.000 NA   NA
 5891050 5891051 ECIAI39_2549 ECIAI39_2550   xapA TRUE 0.784 -27.000 0.000 NA   NA
 5891051 5891052 ECIAI39_2550 ECIAI39_2551 xapA   FALSE 0.024 229.000 0.000 NA   NA
 5891052 5891053 ECIAI39_2551 ECIAI39_2552     FALSE 0.371 55.000 0.000 NA   NA
 5891054 5891055 ECIAI39_2553 ECIAI39_2554 yfeN yfeH FALSE 0.021 239.000 0.000 NA   NA
 5891056 5891057 ECIAI39_2555 ECIAI39_2556 ypeB ligA TRUE 0.847 2.000 0.017 NA   NA
 5891057 5891058 ECIAI39_2556 ECIAI39_2557 ligA zipA FALSE 0.078 71.000 0.002 1.000 N NA
 5891059 5891060 ECIAI39_2558 ECIAI39_2559 cysZ   TRUE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5891060 5891061 ECIAI39_2559 ECIAI39_2560   cysK TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5891061 5891062 ECIAI39_2560 ECIAI39_2561 cysK ptsH FALSE 0.002 384.000 0.019 1.000 N NA
 5891062 5891063 ECIAI39_2561 ECIAI39_2562 ptsH ptsI TRUE 0.919 45.000 0.000 0.012 Y NA
 5891063 5891064 ECIAI39_2562 ECIAI39_2563 ptsI crr TRUE 0.929 41.000 0.000 0.012 Y NA
 5891067 5891068 ECIAI39_2566 ECIAI39_2567 cysM cysA FALSE 0.076 134.000 0.049 1.000 N NA
 5891068 5891069 ECIAI39_2567 ECIAI39_2568 cysA cysW TRUE 0.988 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 5891069 5891070 ECIAI39_2568 ECIAI39_2569 cysW cysU TRUE 0.997 0.000 0.583 0.000 N NA
 5891070 5891071 ECIAI39_2569 ECIAI39_2570 cysU cysP TRUE 0.996 0.000 0.479 0.002 N NA
 5891071 5891072 ECIAI39_2570 ECIAI39_2571 cysP ucpA FALSE 0.043 158.000 0.043 1.000 N NA
 5891072 5891073 ECIAI39_2571 ECIAI39_2572 ucpA yfeT FALSE 0.094 129.000 0.000 1.000 N NA
 5891074 5891075 ECIAI39_2573 ECIAI39_2574 yfeU murP TRUE 0.947 4.000 0.158 1.000   NA
 5891075 5891076 ECIAI39_2574 ECIAI39_2575 murP murQ TRUE 0.917 5.000 0.167 1.000 N NA
 5891077 5891078 ECIAI39_2576 ECIAI39_2577 yfeX yfeY TRUE 0.639 96.000 0.333 NA   NA
 5891078 5891079 ECIAI39_2577 ECIAI39_2578 yfeY yfeZ TRUE 0.616 61.000 0.204 NA   NA
 5891079 5891080 ECIAI39_2578 ECIAI39_2579 yfeZ ypeA TRUE 0.850 -13.000 0.059 NA   NA
 5891081 5891082 ECIAI39_2580 ECIAI39_2581 amiA hemF TRUE 0.685 4.000 0.025 1.000 N NA
 5891083 5891084 ECIAI39_2582 ECIAI39_2583 yfeG yffI TRUE 0.694 46.000 0.250 NA N NA
 5891084 5891085 ECIAI39_2583 ECIAI39_2584 yffI eutL TRUE 0.746 13.000 0.106 NA N NA
 5891085 5891086 ECIAI39_2584 ECIAI39_2585 eutL eutC TRUE 0.968 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5891086 5891087 ECIAI39_2585 ECIAI39_2586 eutC eutB TRUE 0.681 21.000 0.000 NA   NA
 5891087 5891088 ECIAI39_2586 ECIAI39_2587 eutB eutB TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 5891088 5891089 ECIAI39_2587 ECIAI39_2588 eutB eutA TRUE 0.771 12.000 0.000 NA   NA
 5891089 5891090 ECIAI39_2588 ECIAI39_2589 eutA eutH TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA Y NA
 5891090 5891091 ECIAI39_2589 ECIAI39_2590 eutH eutG FALSE 0.381 117.000 0.222 1.000 N NA
 5891091 5891092 ECIAI39_2590 ECIAI39_2591 eutG eutJ TRUE 0.984 -10.000 0.556 1.000 N NA
 5891092 5891093 ECIAI39_2591 ECIAI39_2592 eutJ eutE TRUE 0.957 11.000 0.375 1.000 N NA
 5891093 5891094 ECIAI39_2592 ECIAI39_2593 eutE cchB TRUE 0.995 12.000 0.667 NA Y NA
 5891094 5891095 ECIAI39_2593 ECIAI39_2594 cchB cchA TRUE 0.759 106.000 0.182 NA Y NA
 5891095 5891096 ECIAI39_2594 ECIAI39_2595 cchA eutI TRUE 0.971 39.000 0.455 NA Y NA
 5891096 5891097 ECIAI39_2595 ECIAI39_2596 eutI eutT TRUE 0.934 -3.000 0.095 1.000 N NA
 5891097 5891098 ECIAI39_2596 ECIAI39_2597 eutT eutQ TRUE 0.995 -3.000 0.214 NA Y NA
 5891098 5891099 ECIAI39_2597 ECIAI39_2598 eutQ eutP TRUE 0.976 -25.000 0.167 NA Y NA
 5891099 5891100 ECIAI39_2598 ECIAI39_2599 eutP ypfE TRUE 0.955 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5891100 5891101 ECIAI39_2599 ECIAI39_2600 ypfE maeB FALSE 0.009 293.000 0.070 1.000 N NA
 5891102 5891103 ECIAI39_2601 ECIAI39_2602 talA tktB TRUE 0.994 20.000 0.739 1.000 Y NA
 5891104 5891105 ECIAI39_2603 ECIAI39_2604 ypfG yffH TRUE 0.536 126.000 0.333 NA   NA
 5891105 5891106 ECIAI39_2604 ECIAI39_2605 yffH aegA FALSE 0.438 68.000 0.167 1.000 N NA
 5891107 5891108 ECIAI39_2606 ECIAI39_2607 narQ acrD FALSE 0.205 164.000 0.133 0.069 N NA
 5891108 5891109 ECIAI39_2607 ECIAI39_2608 acrD   TRUE 0.510 87.000 0.200 NA   NA
 5891109 5891110 ECIAI39_2608 ECIAI39_2609   yffB FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 5891110 5891111 ECIAI39_2609 ECIAI39_2610 yffB dapE TRUE 0.964 4.000 0.292 1.000 N NA
 5891111 5891112 ECIAI39_2610 ECIAI39_2611 dapE ypfN TRUE 0.494 28.000 0.025 NA   NA
 5891113 5891114 ECIAI39_2612 ECIAI39_2613 ypfH ypfI FALSE 0.280 74.000 0.000 NA   NA
 5891114 5891115 ECIAI39_2613 ECIAI39_2614 ypfI ypfJ TRUE 0.663 15.000 0.029 NA   NA
 5891115 5891116 ECIAI39_2614 ECIAI39_2615 ypfJ purC FALSE 0.040 168.000 0.006 NA   NA
 5891116 5891117 ECIAI39_2615 ECIAI39_2616 purC nlpB FALSE 0.005 213.000 0.019 NA N NA
 5891117 5891118 ECIAI39_2616 ECIAI39_2617 nlpB dapA TRUE 0.978 17.000 0.267 NA Y NA
 5891119 5891120 ECIAI39_2618 ECIAI39_2619 gcvR bcp TRUE 0.929 0.000 0.102 1.000 N NA
 5891120 5891121 ECIAI39_2619 ECIAI39_2620 bcp hyfA FALSE 0.011 253.000 0.000 1.000 N NA
 5891121 5891122 ECIAI39_2620 ECIAI39_2621 hyfA hyfB TRUE 0.988 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5891122 5891123 ECIAI39_2621 ECIAI39_2622 hyfB hyfC TRUE 0.963 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5891123 5891124 ECIAI39_2622 ECIAI39_2623 hyfC hyfD TRUE 0.988 17.000 0.412 1.000 Y NA
 5891124 5891125 ECIAI39_2623 ECIAI39_2624 hyfD hyfE TRUE 0.984 12.000 0.093 0.006 Y NA
 5891125 5891126 ECIAI39_2624 ECIAI39_2625 hyfE hyfF TRUE 0.999 5.000 0.864 0.006 Y NA
 5891126 5891127 ECIAI39_2625 ECIAI39_2626 hyfF hyfG TRUE 0.927 38.000 0.016 0.006 Y NA
 5891127 5891128 ECIAI39_2626 ECIAI39_2627 hyfG hyfH TRUE 0.966 10.000 0.044 1.000 Y NA
 5891128 5891129 ECIAI39_2627 ECIAI39_2628 hyfH hyfI TRUE 0.995 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 5891129 5891130 ECIAI39_2628 ECIAI39_2629 hyfI hyfJ TRUE 0.970 -7.000 0.250 NA   NA
 5891130 5891131 ECIAI39_2629 ECIAI39_2630 hyfJ hyfR TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5891131 5891132 ECIAI39_2630 ECIAI39_2631 hyfR hyfR TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 5891132 5891133 ECIAI39_2631 ECIAI39_2632 hyfR focB TRUE 0.668 22.000 0.000 NA   NA
 5891135 5891136 ECIAI39_2635 ECIAI39_2636 yfgC yfgD TRUE 0.910 21.000 0.259 1.000   NA
 5891137 5891138 ECIAI39_2637 ECIAI39_2638 hda uraA FALSE 0.210 50.000 0.048 NA N NA
 5891138 5891139 ECIAI39_2638 ECIAI39_2639 uraA upp TRUE 0.752 86.000 0.101 1.000 Y NA
 5891140 5891141 ECIAI39_2640 ECIAI39_2641 purM purN TRUE 0.998 0.000 0.230 0.001 Y NA
 5891141 5891142 ECIAI39_2641 ECIAI39_2642 purN ppk FALSE 0.019 172.000 0.017 1.000 N NA
 5891142 5891143 ECIAI39_2642 ECIAI39_2643 ppk ppx TRUE 0.996 5.000 0.486 1.000 Y NA
 5891144 5891145 ECIAI39_2644 ECIAI39_2645 yfgF yfgF TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 5891145 5891146 ECIAI39_2645 ECIAI39_2646 yfgF   FALSE 0.055 182.000 0.000 NA   NA
 5891147 5891148 ECIAI39_2647 ECIAI39_2648 yfgH yfgI TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5891148 5891149 ECIAI39_2648 ECIAI39_2649 yfgI   TRUE 0.623 26.000 0.000 NA   NA
 5891149 5891150 ECIAI39_2649 ECIAI39_2650     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891150 5891151 ECIAI39_2650 ECIAI39_2651     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5891151 5891152 ECIAI39_2651 ECIAI39_misc_RNA_54     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5891152 5891153 ECIAI39_misc_RNA_54 ECIAI39_2652     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5891153 5891154 ECIAI39_2652 ECIAI39_2653   yfgI FALSE 0.201 109.000 0.000 NA   NA
 5891155 5891156 ECIAI39_2654 ECIAI39_2655     TRUE 0.980 -3.000 0.222 NA   NA
 5891156 5891157 ECIAI39_2655 ECIAI39_2656     FALSE 0.013 285.000 0.000 NA   NA
 5891157 5891158 ECIAI39_2656 ECIAI39_2657     FALSE 0.010 307.000 0.000 NA   NA
 5891159 5891160 ECIAI39_2658 ECIAI39_2659     FALSE 0.009 318.000 0.000 NA   NA
 5891160 5891161 ECIAI39_2659 ECIAI39_2660     FALSE 0.023 230.000 0.000 NA   NA
 5891162 5891163 ECIAI39_2661 ECIAI39_2662     FALSE 0.036 205.000 0.000 NA   NA
 5891164 5891165 ECIAI39_2663 ECIAI39_2664     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.080 Y NA
 5891166 5891167 ECIAI39_2665 ECIAI39_2666     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891167 5891168 ECIAI39_2666 ECIAI39_2667     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5891168 5891169 ECIAI39_2667 ECIAI39_2668     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5891169 5891170 ECIAI39_2668 ECIAI39_2669     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891170 5891171 ECIAI39_2669 ECIAI39_2670     TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5891171 5891172 ECIAI39_2670 ECIAI39_2671     TRUE 0.974 0.000 0.200 NA   NA
 5891172 5891173 ECIAI39_2671 ECIAI39_2672     TRUE 0.984 0.000 0.300 NA   NA
 5891173 5891174 ECIAI39_2672 ECIAI39_2673     TRUE 0.984 0.000 0.300 NA   NA
 5891174 5891175 ECIAI39_2673 ECIAI39_2674     TRUE 0.974 0.000 0.200 NA   NA
 5891175 5891176 ECIAI39_2674 ECIAI39_2675     TRUE 0.864 45.000 0.400 NA   NA
 5891176 5891177 ECIAI39_2675 ECIAI39_2676     TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 5891177 5891178 ECIAI39_2676 ECIAI39_2677     TRUE 0.819 52.000 0.364 NA   NA
 5891178 5891179 ECIAI39_2677 ECIAI39_2678     TRUE 0.988 9.000 0.667 NA   NA
 5891179 5891180 ECIAI39_2678 ECIAI39_2679     TRUE 0.991 3.000 0.583 NA   NA
 5891180 5891181 ECIAI39_2679 ECIAI39_2680     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 5891181 5891182 ECIAI39_2680 ECIAI39_2681     TRUE 0.904 15.000 0.214 NA   NA
 5891183 5891184 ECIAI39_2682 ECIAI39_tRNA24     FALSE 0.240 92.000 0.000 NA   NA
 5891184 5891185 ECIAI39_tRNA24 ECIAI39_2683     FALSE 0.011 297.000 0.000 NA   NA
 5891186 5891187 ECIAI39_2684 ECIAI39_2685     TRUE 0.929 -3.000 0.051 NA   NA
 5891187 5891188 ECIAI39_2685 ECIAI39_2686     FALSE 0.484 41.000 0.000 NA   NA
 5891188 5891189 ECIAI39_2686 ECIAI39_2687     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5891189 5891190 ECIAI39_2687 ECIAI39_2688     TRUE 0.706 -75.000 0.000 NA   NA
 5891190 5891191 ECIAI39_2688 ECIAI39_2689     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5891191 5891192 ECIAI39_2689 ECIAI39_2690     TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 5891192 5891193 ECIAI39_2690 ECIAI39_2691     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891193 5891194 ECIAI39_2691 ECIAI39_2692     FALSE 0.331 62.000 0.000 NA   NA
 5891194 5891195 ECIAI39_2692 ECIAI39_2693     FALSE 0.206 118.000 0.000 1.000   NA
 5891195 5891196 ECIAI39_2693 ECIAI39_2694     TRUE 0.754 -37.000 0.000 NA   NA
 5891196 5891197 ECIAI39_2694 ECIAI39_2695     TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5891197 5891198 ECIAI39_2695 ECIAI39_2696     FALSE 0.249 88.000 0.000 NA   NA
 5891199 5891200 ECIAI39_2697 ECIAI39_2698     FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 5891200 5891201 ECIAI39_2698 ECIAI39_2699     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891201 5891202 ECIAI39_2699 ECIAI39_2700     TRUE 0.775 -30.000 0.000 NA   NA
 5891202 5891203 ECIAI39_2700 ECIAI39_2701     FALSE 0.411 50.000 0.000 NA   NA
 5891203 5891204 ECIAI39_2701 ECIAI39_2702     FALSE 0.199 110.000 0.000 NA   NA
 5891204 5891205 ECIAI39_2702 ECIAI39_2703     TRUE 0.811 -19.000 0.000 NA   NA
 5891206 5891207 ECIAI39_2704 ECIAI39_2705   guaA FALSE 0.010 193.000 0.002 1.000 N NA
 5891207 5891208 ECIAI39_2705 ECIAI39_2706 guaA guaB TRUE 0.936 69.000 0.190 0.000 Y NA
 5891210 5891211 ECIAI39_2708 ECIAI39_2709     TRUE 0.508 110.000 0.250 NA   NA
 5891211 5891212 ECIAI39_2709 ECIAI39_2710     TRUE 0.881 50.000 0.500 NA   NA
 5891212 5891213 ECIAI39_2710 ECIAI39_2711     FALSE 0.058 180.000 0.000 NA   NA
 5891213 5891214 ECIAI39_2711 ECIAI39_2712   der FALSE 0.215 63.000 0.009 NA   NA
 5891214 5891215 ECIAI39_2712 ECIAI39_2713 der yfgL FALSE 0.434 118.000 0.203 1.000   NA
 5891215 5891216 ECIAI39_2713 ECIAI39_2714 yfgL yfgM TRUE 0.977 11.000 0.492 1.000   NA
 5891216 5891217 ECIAI39_2714 ECIAI39_2715 yfgM hisS TRUE 0.921 18.000 0.259 1.000   NA
 5891217 5891218 ECIAI39_2715 ECIAI39_misc_RNA_55 hisS   TRUE 0.691 20.000 0.000 NA   NA
 5891218 5891219 ECIAI39_misc_RNA_55 ECIAI39_2716   ispG TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5891219 5891220 ECIAI39_2716 ECIAI39_2717 ispG yfgA TRUE 0.868 27.000 0.233 1.000   NA
 5891220 5891221 ECIAI39_2717 ECIAI39_2718 yfgA yfgB FALSE 0.011 285.000 0.020 1.000   NA
 5891221 5891222 ECIAI39_2718 ECIAI39_2719 yfgB ndk FALSE 0.220 150.000 0.156 1.000   NA
 5891222 5891223 ECIAI39_2719 ECIAI39_2720 ndk pbpC FALSE 0.025 149.000 0.008 1.000 N NA
 5891223 5891224 ECIAI39_2720 ECIAI39_2721 pbpC yfhM TRUE 0.995 1.000 0.711 1.000   NA
 5891228 5891229 ECIAI39_2723 ECIAI39_2724 sseB pepB FALSE 0.475 119.000 0.253 NA   NA
 5891229 5891230 ECIAI39_2724 ECIAI39_2725 pepB yfhJ TRUE 0.606 59.000 0.171 1.000   NA
 5891230 5891231 ECIAI39_2725 ECIAI39_2726 yfhJ fdx TRUE 0.982 12.000 0.625 1.000   NA
 5891231 5891232 ECIAI39_2726 ECIAI39_2727 fdx hscA TRUE 0.994 2.000 0.794 1.000 N NA
 5891232 5891233 ECIAI39_2727 ECIAI39_2728 hscA hscB TRUE 0.998 3.000 0.634 1.000 Y NA
 5891233 5891234 ECIAI39_2728 ECIAI39_2729 hscB iscA TRUE 0.770 96.000 0.500 1.000   NA
 5891234 5891235 ECIAI39_2729 ECIAI39_2730 iscA iscU TRUE 0.978 17.000 0.359 0.002   NA
 5891235 5891236 ECIAI39_2730 ECIAI39_2731 iscU iscS TRUE 0.915 28.000 0.448 1.000 N NA
 5891236 5891237 ECIAI39_2731 ECIAI39_2732 iscS iscR TRUE 0.620 112.000 0.424 1.000 N NA
 5891237 5891238 ECIAI39_2732 ECIAI39_2733 iscR yfhQ FALSE 0.020 271.000 0.126 1.000 N NA
 5891239 5891240 ECIAI39_2734 ECIAI39_2735 suhB yfhR FALSE 0.131 118.000 0.003 1.000   NA
 5891240 5891241 ECIAI39_2735 ECIAI39_2736 yfhR csiE FALSE 0.055 191.000 0.000 1.000   NA
 5891242 5891243 ECIAI39_2737 ECIAI39_2738 hcaT hcaR FALSE 0.096 160.000 0.000 1.000   NA
 5891244 5891245 ECIAI39_2739 ECIAI39_2740 hcaE hcaF TRUE 0.995 -3.000 0.333 0.000 N NA
 5891245 5891246 ECIAI39_2740 ECIAI39_2741 hcaF hcaC TRUE 0.898 0.000 0.083 NA N NA
 5891246 5891247 ECIAI39_2741 ECIAI39_2742 hcaC hcaB TRUE 0.910 -3.000 0.083 NA N NA
 5891247 5891248 ECIAI39_2742 ECIAI39_2743 hcaB hcaD TRUE 0.840 10.000 0.000 1.000   NA
 5891248 5891249 ECIAI39_2743 ECIAI39_2744 hcaD yphA TRUE 0.636 25.000 0.000 NA   NA
 5891249 5891250 ECIAI39_2744 ECIAI39_2745 yphA   FALSE 0.306 67.000 0.000 NA   NA
 5891250 5891251 ECIAI39_2745 ECIAI39_2746     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5891252 5891253 ECIAI39_2747 ECIAI39_2748 yphB yphC TRUE 0.666 12.000 0.000 1.000 N NA
 5891253 5891254 ECIAI39_2748 ECIAI39_2749 yphC yphD FALSE 0.211 66.000 0.000 1.000 N NA
 5891254 5891255 ECIAI39_2749 ECIAI39_2750 yphD yphE TRUE 0.950 25.000 0.148 1.000 Y NA
 5891255 5891256 ECIAI39_2750 ECIAI39_2751 yphE yphF TRUE 0.953 23.000 0.161 NA Y NA
 5891256 5891257 ECIAI39_2751 ECIAI39_2752 yphF yphG FALSE 0.223 97.000 0.000 NA   NA
 5891259 5891260 ECIAI39_2754 ECIAI39_2755 glyA   FALSE 0.413 41.000 0.033 NA   NA
 5891262 5891263 ECIAI39_2757 ECIAI39_2758 glnB yfhA FALSE 0.438 61.000 0.146 1.000 N NA
 5891263 5891264 ECIAI39_2758 ECIAI39_2759 yfhA yfhG TRUE 0.814 -10.000 0.029 NA   NA
 5891264 5891265 ECIAI39_2759 ECIAI39_2760 yfhG yfhK FALSE 0.056 165.000 0.029 NA   NA
 5891265 5891266 ECIAI39_2760 ECIAI39_misc_RNA_58 yfhK tke1 FALSE 0.232 94.000 0.000 NA   NA
 5891266 5891267 ECIAI39_misc_RNA_58 ECIAI39_2761 tke1 purL FALSE 0.008 336.000 0.000 NA   NA
 5891269 5891270 ECIAI39_2763 ECIAI39_2764 tadA yfhB FALSE 0.476 25.000 0.062 NA N NA
 5891271 5891272 ECIAI39_2765 ECIAI39_2766 yfhH yfhL FALSE 0.367 56.000 0.056 NA   NA
 5891273 5891274 ECIAI39_misc_RNA_59 ECIAI39_2767 ryfB   TRUE 0.646 -183.000 0.000 NA   NA
 5891276 5891277 ECIAI39_2768 ECIAI39_2769 acpS pdxJ TRUE 0.982 0.000 0.326 1.000 N NA
 5891277 5891278 ECIAI39_2769 ECIAI39_2770 pdxJ recO TRUE 0.854 12.000 0.166 1.000 N NA
 5891278 5891279 ECIAI39_2770 ECIAI39_2771 recO era TRUE 0.866 12.000 0.109 1.000   NA
 5891279 5891280 ECIAI39_2771 ECIAI39_2772 era rnc TRUE 0.985 -3.000 0.127 0.039   NA
 5891280 5891281 ECIAI39_2772 ECIAI39_misc_RNA_61 rnc   TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5891281 5891282 ECIAI39_misc_RNA_61 ECIAI39_2773   lepB FALSE 0.193 113.000 0.000 NA   NA
 5891282 5891283 ECIAI39_2773 ECIAI39_2774 lepB lepA TRUE 0.896 16.000 0.187 1.000   NA
 5891283 5891284 ECIAI39_2774 ECIAI39_2775 lepA rseC FALSE 0.015 198.000 0.045 NA N NA
 5891284 5891285 ECIAI39_2775 ECIAI39_2776 rseC rseB TRUE 0.999 -3.000 0.609 NA Y NA
 5891285 5891286 ECIAI39_2776 ECIAI39_2777 rseB rseA TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 5891286 5891287 ECIAI39_2777 ECIAI39_2778 rseA rpoE TRUE 0.946 33.000 0.705 NA N NA
 5891290 5891291 ECIAI39_2781 ECIAI39_2782 srmB   FALSE 0.066 181.000 0.000 1.000   NA
 5891291 5891292 ECIAI39_2782 ECIAI39_2783     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5891293 5891294 ECIAI39_2784 ECIAI39_2785 yfiE yfiE TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5891299 5891300 ECIAI39_2790 ECIAI39_2791 trxC yfiP FALSE 0.370 69.000 0.084 NA   NA
 5891300 5891301 ECIAI39_2791 ECIAI39_2792 yfiP yfiQ TRUE 0.821 32.000 0.222 NA   NA
 5891301 5891302 ECIAI39_2792 ECIAI39_2793 yfiQ pssA FALSE 0.426 114.000 0.121 0.046 N NA
 5891302 5891303 ECIAI39_2793 ECIAI39_2794 pssA yfiM FALSE 0.295 97.000 0.089 NA   NA
 5891306 5891307 ECIAI39_5S_5 ECIAI39_23S_4     FALSE 0.240 92.000 0.000 NA   NA
 5891307 5891308 ECIAI39_23S_4 ECIAI39_tRNA66     FALSE 0.051 186.000 0.000 NA   NA
 5891308 5891309 ECIAI39_tRNA66 ECIAI39_16S_4     FALSE 0.254 86.000 0.000 NA   NA
 5891309 5891310 ECIAI39_16S_4 ECIAI39_2797   clpB FALSE 0.005 443.000 0.000 NA   NA
 5891310 5891311 ECIAI39_2797 ECIAI39_misc_RNA_62 clpB ryfD TRUE 0.802 -22.000 0.000 NA   NA
 5891311 5891312 ECIAI39_misc_RNA_62 ECIAI39_2798 ryfD yfiH TRUE 0.838 8.000 0.000 NA   NA
 5891312 5891313 ECIAI39_2798 ECIAI39_2799 yfiH rluD TRUE 0.973 -3.000 0.168 NA   NA
 5891316 5891317 ECIAI39_2802 ECIAI39_4941 yfiA pheL FALSE 0.213 104.000 0.000 NA   NA
 5891317 5891318 ECIAI39_4941 ECIAI39_2803 pheL pheA FALSE 0.220 99.000 0.000 NA   NA
 5891319 5891320 ECIAI39_2804 ECIAI39_2805 tyrA aroF TRUE 0.963 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5891321 5891322 ECIAI39_2806 ECIAI39_2807   yfiR FALSE 0.193 150.000 0.148 NA   NA
 5891322 5891323 ECIAI39_2807 ECIAI39_2808 yfiR yfiN TRUE 0.984 -10.000 0.475 NA   NA
 5891323 5891324 ECIAI39_2808 ECIAI39_2809 yfiN yfiB TRUE 0.955 16.000 0.475 1.000 N NA
 5891325 5891326 ECIAI39_2810 ECIAI39_2811 rplS trmD TRUE 0.978 42.000 0.567 1.000 Y NA
 5891326 5891327 ECIAI39_2811 ECIAI39_2812 trmD rimM TRUE 0.988 31.000 0.672 1.000 Y NA
 5891327 5891328 ECIAI39_2812 ECIAI39_2813 rimM rpsP TRUE 0.992 19.000 0.342 0.009 Y NA
 5891328 5891329 ECIAI39_2813 ECIAI39_2814 rpsP ffh FALSE 0.449 137.000 0.361 1.000 N NA
 5891330 5891331 ECIAI39_2815 ECIAI39_2816 ypjD yfjD TRUE 0.619 111.000 0.349 NA   NA
 5891333 5891334 ECIAI39_2818 ECIAI39_2819 yfjB recN FALSE 0.394 86.000 0.170 1.000 N NA
 5891334 5891335 ECIAI39_2819 ECIAI39_2820 recN smpA FALSE 0.058 149.000 0.049 1.000 N NA
 5891336 5891337 ECIAI39_2821 ECIAI39_2822 yfjF yfjG TRUE 0.919 -10.000 0.124 NA   NA
 5891338 5891339 ECIAI39_2823 ECIAI39_misc_RNA_63 smpB ssrA FALSE 0.034 208.000 0.000 NA   NA
 5891339 5891340 ECIAI39_misc_RNA_63 ECIAI39_2824 ssrA   FALSE 0.025 228.000 0.000 NA   NA
 5891343 5891344 ECIAI39_2827 ECIAI39_2828     FALSE 0.005 437.000 0.000 NA   NA
 5891344 5891345 ECIAI39_2828 ECIAI39_2829     TRUE 0.834 -15.000 0.000 NA   NA
 5891345 5891346 ECIAI39_2829 ECIAI39_2830   ymfQ TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5891346 5891347 ECIAI39_2830 ECIAI39_2831 ymfQ   TRUE 0.903 -9.000 0.083 NA   NA
 5891347 5891348 ECIAI39_2831 ECIAI39_2832     TRUE 0.879 -13.000 0.083 NA   NA
 5891348 5891349 ECIAI39_2832 ECIAI39_2833     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5891349 5891350 ECIAI39_2833 ECIAI39_2834     TRUE 0.929 0.000 0.062 NA   NA
 5891350 5891351 ECIAI39_2834 ECIAI39_2835     TRUE 0.983 -3.000 0.250 NA   NA
 5891351 5891352 ECIAI39_2835 ECIAI39_2836     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5891352 5891353 ECIAI39_2836 ECIAI39_2837     TRUE 0.760 -34.000 0.000 NA   NA
 5891353 5891354 ECIAI39_2837 ECIAI39_2838     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.079 Y NA
 5891354 5891355 ECIAI39_2838 ECIAI39_2839   ypjA TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5891355 5891356 ECIAI39_2839 ECIAI39_2840 ypjA pinH FALSE 0.032 210.000 0.000 NA   NA
 5891356 5891357 ECIAI39_2840 ECIAI39_2841 pinH ypjB FALSE 0.005 470.000 0.000 NA   NA
 5891357 5891358 ECIAI39_2841 ECIAI39_2842 ypjB ypjB FALSE 0.026 226.000 0.000 NA   NA
 5891358 5891359 ECIAI39_2842 ECIAI39_2843 ypjB   FALSE 0.004 521.000 0.000 NA   NA
 5891359 5891360 ECIAI39_2843 ECIAI39_tRNA65     TRUE 0.677 -93.000 0.000 NA   NA
 5891361 5891362 ECIAI39_2844 ECIAI39_2845   ygaT FALSE 0.008 337.000 0.000 NA   NA
 5891362 5891363 ECIAI39_2845 ECIAI39_2846 ygaT ygaF TRUE 0.691 20.000 0.000 NA   NA
 5891363 5891364 ECIAI39_2846 ECIAI39_2847 ygaF gabD TRUE 0.694 23.000 0.000 1.000   NA
 5891364 5891365 ECIAI39_2847 ECIAI39_2848 gabD gabT TRUE 0.923 14.000 0.303 1.000 N NA
 5891366 5891367 ECIAI39_2849 ECIAI39_2850     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5891368 5891369 ECIAI39_2851 ECIAI39_2852 gabP csiR TRUE 0.964 21.000 0.625 1.000 N NA
 5891370 5891371 ECIAI39_2853 ECIAI39_2854 ygaU yqaE FALSE 0.227 84.000 0.027 1.000   NA
 5891372 5891373 ECIAI39_2855 ECIAI39_2856 ygaV ygaP TRUE 0.766 10.000 0.083 NA N NA
 5891379 5891380 ECIAI39_2862 ECIAI39_2863   nrdH FALSE 0.019 209.000 0.009 NA   NA
 5891380 5891381 ECIAI39_2863 ECIAI39_2864 nrdH nrdI TRUE 0.739 -3.000 0.026 NA N NA
 5891381 5891382 ECIAI39_2864 ECIAI39_2865 nrdI nrdE TRUE 0.958 -27.000 0.000 NA Y NA
 5891382 5891383 ECIAI39_2865 ECIAI39_2866 nrdE nrdF TRUE 0.987 10.000 0.000 0.001 Y NA
 5891383 5891384 ECIAI39_2866 ECIAI39_2867 nrdF proV FALSE 0.004 356.000 0.000 1.000 N NA
 5891384 5891385 ECIAI39_2867 ECIAI39_2868 proV proW TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.082 Y NA
 5891385 5891386 ECIAI39_2868 ECIAI39_2869 proW proX TRUE 0.985 57.000 0.695 0.044 Y NA
 5891386 5891387 ECIAI39_2869 ECIAI39_2870 proX   FALSE 0.077 192.000 0.174 NA N NA
 5891387 5891388 ECIAI39_2870 ECIAI39_2871   ygaZ FALSE 0.091 124.000 0.060 NA N NA
 5891388 5891389 ECIAI39_2871 ECIAI39_2872 ygaZ ygaH TRUE 0.994 -10.000 0.915 NA   NA
 5891389 5891390 ECIAI39_2872 ECIAI39_2873 ygaH mprA FALSE 0.265 91.000 0.065 NA   NA
 5891392 5891393 ECIAI39_2875 ECIAI39_2876 emrA emrB TRUE 0.982 17.000 0.875 1.000 N NA
 5891396 5891397 ECIAI39_2878 ECIAI39_2879 gshA yqaA FALSE 0.321 73.000 0.071 NA   NA
 5891397 5891398 ECIAI39_2879 ECIAI39_2880 yqaA yqaB TRUE 0.940 -3.000 0.067 NA   NA
 5891398 5891399 ECIAI39_2880 ECIAI39_tRNA64 yqaB   FALSE 0.107 148.000 0.000 NA   NA
 5891399 5891400 ECIAI39_tRNA64 ECIAI39_tRNA63     FALSE 0.327 63.000 0.000 NA   NA
 5891400 5891401 ECIAI39_tRNA63 ECIAI39_tRNA62     FALSE 0.317 65.000 0.000 NA   NA
 5891401 5891402 ECIAI39_tRNA62 ECIAI39_tRNA61     FALSE 0.317 65.000 0.000 NA   NA
 5891402 5891403 ECIAI39_tRNA61 ECIAI39_tRNA60     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5891403 5891404 ECIAI39_tRNA60 ECIAI39_2881   csrA FALSE 0.010 316.000 0.000 NA   NA
 5891404 5891405 ECIAI39_2881 ECIAI39_2882 csrA alaS FALSE 0.006 235.000 0.020 1.000 N NA
 5891405 5891406 ECIAI39_2882 ECIAI39_2884 alaS recX FALSE 0.221 129.000 0.085 1.000   NA
 5891406 5891407 ECIAI39_2884 ECIAI39_2885 recX recA TRUE 0.702 69.000 0.296 1.000   NA
 5891407 5891408 ECIAI39_2885 ECIAI39_2886 recA ygaD FALSE 0.326 80.000 0.082 NA   NA
 5891408 5891409 ECIAI39_2886 ECIAI39_2887 ygaD mltB FALSE 0.081 145.000 0.026 NA   NA
 5891410 5891411 ECIAI39_2888 ECIAI39_2889 srlA srlE TRUE 0.999 -3.000 0.349 0.011 Y NA
 5891411 5891412 ECIAI39_2889 ECIAI39_2890 srlE srlB TRUE 0.982 11.000 0.000 0.011 Y NA
 5891412 5891413 ECIAI39_2890 ECIAI39_2891 srlB srlD TRUE 0.753 4.000 0.040 1.000 N NA
 5891413 5891414 ECIAI39_2891 ECIAI39_2892 srlD gutM FALSE 0.346 106.000 0.197 NA N NA
 5891414 5891415 ECIAI39_2892 ECIAI39_2893 gutM srlR TRUE 0.844 67.000 0.183 NA Y NA
 5891415 5891416 ECIAI39_2893 ECIAI39_2894 srlR gutQ TRUE 0.988 -7.000 0.562 1.000 N NA
 5891418 5891419 ECIAI39_2896 ECIAI39_2897 norV norW TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891420 5891421 ECIAI39_2898 ECIAI39_2899 hypF hydN FALSE 0.088 81.000 0.018 1.000 N NA
 5891421 5891422 ECIAI39_2899 ECIAI39_2900 hydN ascG FALSE 0.336 149.000 0.316 1.000 N NA
 5891423 5891424 ECIAI39_2901 ECIAI39_2902 ascF ascB TRUE 0.995 9.000 0.485 1.000 Y NA
 5891425 5891426 ECIAI39_2903 ECIAI39_2904     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5891426 5891427 ECIAI39_2904 ECIAI39_2905   hycI FALSE 0.068 180.000 0.000 1.000   NA
 5891427 5891428 ECIAI39_2905 ECIAI39_2906 hycI hycH TRUE 0.982 -7.000 0.360 NA   NA
 5891428 5891429 ECIAI39_2906 ECIAI39_2907 hycH hycG TRUE 0.969 -3.000 0.156 NA   NA
 5891429 5891430 ECIAI39_2907 ECIAI39_2908 hycG hycF TRUE 0.996 0.000 0.111 0.001 Y NA
 5891430 5891431 ECIAI39_2908 ECIAI39_2909 hycF hycE TRUE 0.993 10.000 0.200 0.001 Y NA
 5891431 5891432 ECIAI39_2909 ECIAI39_2910 hycE hycD TRUE 0.977 18.000 0.235 1.000 Y NA
 5891432 5891433 ECIAI39_2910 ECIAI39_2911 hycD hycC TRUE 0.996 3.000 0.382 1.000 Y NA
 5891433 5891434 ECIAI39_2911 ECIAI39_2912 hycC hycB TRUE 0.994 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 5891434 5891435 ECIAI39_2912 ECIAI39_2913 hycB hycA FALSE 0.163 125.000 0.000 NA   NA
 5891436 5891437 ECIAI39_2915 ECIAI39_2916 hypA hypB TRUE 0.990 4.000 0.306 0.002   NA
 5891437 5891438 ECIAI39_2916 ECIAI39_2917 hypB hypC TRUE 0.985 -9.000 0.139 NA Y NA
 5891438 5891439 ECIAI39_2917 ECIAI39_2918 hypC hypD TRUE 0.984 0.000 0.021 NA Y NA
 5891439 5891440 ECIAI39_2918 ECIAI39_2919 hypD hypE TRUE 0.964 39.000 0.353 1.000 Y NA
 5891440 5891441 ECIAI39_2919 ECIAI39_2920 hypE fhlA FALSE 0.097 74.000 0.019 1.000 N NA
 5891441 5891442 ECIAI39_2920 ECIAI39_2921 fhlA   TRUE 0.969 6.000 0.231 0.071 N NA
 5891444 5891445 ECIAI39_2923 ECIAI39_2924 mutS pphB FALSE 0.235 106.000 0.000 1.000   NA
 5891446 5891447 ECIAI39_2925 ECIAI39_2926     TRUE 0.793 11.000 0.000 NA   NA
 5891447 5891448 ECIAI39_2926 ECIAI39_2927     TRUE 0.987 0.000 0.000 NA Y NA
 5891450 5891451 ECIAI39_2929 ECIAI39_2930 rpoS nlpD FALSE 0.416 63.000 0.142 1.000 N NA
 5891451 5891452 ECIAI39_2930 ECIAI39_2932 nlpD pcm FALSE 0.047 140.000 0.030 1.000 N NA
 5891452 5891453 ECIAI39_2932 ECIAI39_2933 pcm surE TRUE 0.985 -6.000 0.353 1.000   NA
 5891453 5891454 ECIAI39_2933 ECIAI39_2934 surE truD TRUE 0.949 -19.000 0.235 1.000   NA
 5891454 5891455 ECIAI39_2934 ECIAI39_2935 truD ispF TRUE 0.976 -3.000 0.173 1.000   NA
 5891455 5891456 ECIAI39_2935 ECIAI39_2936 ispF ispD TRUE 0.997 0.000 0.419 1.000 Y NA
 5891456 5891457 ECIAI39_2936 ECIAI39_2937 ispD ftsB TRUE 0.835 19.000 0.185 1.000 N NA
 5891457 5891458 ECIAI39_2937 ECIAI39_2938 ftsB ygbE FALSE 0.031 194.000 0.028 NA   NA
 5891458 5891459 ECIAI39_2938 ECIAI39_2939 ygbE cysC TRUE 0.681 50.000 0.198 NA   NA
 5891459 5891460 ECIAI39_2939 ECIAI39_2940 cysC cysN TRUE 0.997 0.000 0.340 1.000 Y NA
 5891460 5891461 ECIAI39_2940 ECIAI39_2941 cysN cysD TRUE 0.996 2.000 0.574 0.000 N NA
 5891463 5891464 ECIAI39_2943 ECIAI39_2944   cysH FALSE 0.019 265.000 0.000 1.000   NA
 5891464 5891465 ECIAI39_2944 ECIAI39_2945 cysH cysI FALSE 0.322 74.000 0.116 1.000 N NA
 5891465 5891466 ECIAI39_2945 ECIAI39_2946 cysI cysJ TRUE 1.000 0.000 0.791 0.000 Y NA
 5891467 5891468 ECIAI39_2947 ECIAI39_2948 ygcM ygcN FALSE 0.085 78.000 0.014 1.000 N NA
 5891468 5891469 ECIAI39_2948 ECIAI39_2949 ygcN ygcO TRUE 0.973 -9.000 0.026 NA Y NA
 5891469 5891470 ECIAI39_2949 ECIAI39_2950 ygcO ygcP FALSE 0.345 17.000 0.026 NA N NA
 5891471 5891472 ECIAI39_2951 ECIAI39_2952 ygcQ ygcR TRUE 0.991 -3.000 0.102 NA Y NA
 5891472 5891473 ECIAI39_2952 ECIAI39_2953 ygcR ygcS TRUE 0.895 -22.000 0.182 1.000 N NA
 5891473 5891474 ECIAI39_2953 ECIAI39_2954 ygcS ygcU FALSE 0.492 94.000 0.250 1.000 N NA
 5891474 5891475 ECIAI39_2954 ECIAI39_2955 ygcU ygcW TRUE 0.871 70.000 0.500 0.023 N NA
 5891477 5891478 ECIAI39_2957 ECIAI39_2958     FALSE 0.210 117.000 0.000 1.000   NA
 5891478 5891479 ECIAI39_2958 ECIAI39_2959     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5891479 5891480 ECIAI39_2959 ECIAI39_2960     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891481 5891482 ECIAI39_2961 ECIAI39_2962 yqcE ygcE TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5891482 5891483 ECIAI39_2962 ECIAI39_2963 ygcE   FALSE 0.360 165.000 0.000 1.000 Y NA
 5891483 5891484 ECIAI39_2963 ECIAI39_2964     FALSE 0.477 168.000 0.167 1.000 Y NA
 5891484 5891485 ECIAI39_2964 ECIAI39_2965     TRUE 0.949 61.000 0.275 0.012 Y NA
 5891485 5891486 ECIAI39_2965 ECIAI39_2966     TRUE 0.998 0.000 0.475 1.000 Y NA
 5891486 5891487 ECIAI39_2966 ECIAI39_2967     TRUE 0.912 26.000 0.400 1.000 N NA
 5891489 5891490 ECIAI39_2969 ECIAI39_2970   ygcG FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 5891492 5891493 ECIAI39_2972 ECIAI39_2973 yigE   FALSE 0.259 83.000 0.000 NA   NA
 5891494 5891495 ECIAI39_2974 ECIAI39_2975 uvrD yigB FALSE 0.428 84.000 0.128 1.000   NA
 5891495 5891496 ECIAI39_2975 ECIAI39_2976 yigB xerC TRUE 0.989 0.000 0.367 1.000   NA
 5891496 5891497 ECIAI39_2976 ECIAI39_2977 xerC yigA TRUE 0.996 -3.000 0.714 NA   NA
 5891497 5891498 ECIAI39_2977 ECIAI39_2978 yigA dapF TRUE 0.974 -3.000 0.175 NA   NA
 5891498 5891499 ECIAI39_2978 ECIAI39_2979 dapF yifL FALSE 0.160 37.000 0.021 NA N NA
 5891500 5891501 ECIAI39_2980 ECIAI39_2981     FALSE 0.484 41.000 0.000 NA   NA
 5891501 5891502 ECIAI39_2981 ECIAI39_2982     FALSE 0.251 87.000 0.000 NA   NA
 5891502 5891503 ECIAI39_2982 ECIAI39_2983   cyaY FALSE 0.428 48.000 0.000 NA   NA
 5891505 5891506 ECIAI39_2985 ECIAI39_2986 hemC hemD TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 5891506 5891507 ECIAI39_2986 ECIAI39_2987 hemD hemX TRUE 0.991 22.000 0.600 1.000 Y NA
 5891507 5891508 ECIAI39_2987 ECIAI39_2988 hemX hemY TRUE 0.989 3.000 0.144 1.000 Y NA
 5891511 5891512 ECIAI39_2990 ECIAI39_tRNA59 aslB   FALSE 0.110 147.000 0.000 NA   NA
 5891512 5891513 ECIAI39_tRNA59 ECIAI39_tRNA58     FALSE 0.466 43.000 0.000 NA   NA
 5891513 5891514 ECIAI39_tRNA58 ECIAI39_tRNA57     TRUE 0.681 21.000 0.000 NA   NA
 5891514 5891515 ECIAI39_tRNA57 ECIAI39_tRNA56     FALSE 0.345 59.000 0.000 NA   NA
 5891515 5891516 ECIAI39_tRNA56 ECIAI39_2991   yifK FALSE 0.214 103.000 0.000 NA   NA
 5891516 5891517 ECIAI39_2991 ECIAI39_2992 yifK rffM FALSE 0.028 191.000 0.000 1.000 N NA
 5891517 5891518 ECIAI39_2992 ECIAI39_2993 rffM wzyE TRUE 0.945 3.000 0.126 1.000   NA
 5891518 5891519 ECIAI39_2993 ECIAI39_2994 wzyE rffT TRUE 0.996 -3.000 0.684 1.000   NA
 5891519 5891520 ECIAI39_2994 ECIAI39_2995 rffT wzxE TRUE 0.995 -3.000 0.605 1.000   NA
 5891520 5891521 ECIAI39_2995 ECIAI39_2996 wzxE rffA TRUE 0.972 2.000 0.218 1.000   NA
 5891521 5891522 ECIAI39_2996 ECIAI39_2997 rffA rffC TRUE 0.964 5.000 0.248 1.000   NA
 5891522 5891523 ECIAI39_2997 ECIAI39_2998 rffC rffH TRUE 0.907 -22.000 0.145 1.000   NA
 5891523 5891524 ECIAI39_2998 ECIAI39_2999 rffH rffG TRUE 0.997 19.000 0.739 0.002 Y NA
 5891524 5891525 ECIAI39_2999 ECIAI39_3000 rffG rffD TRUE 0.996 0.000 0.273 1.000 Y NA
 5891525 5891526 ECIAI39_3000 ECIAI39_3001 rffD rffE TRUE 0.997 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 5891526 5891527 ECIAI39_3001 ECIAI39_3002 rffE wzzE TRUE 0.987 56.000 0.677 0.004 Y NA
 5891527 5891528 ECIAI39_3002 ECIAI39_3003 wzzE rfe TRUE 0.998 12.000 0.735 0.004 Y NA
 5891528 5891529 ECIAI39_3003 ECIAI39_3004 rfe   TRUE 0.771 12.000 0.000 NA   NA
 5891529 5891530 ECIAI39_3004 ECIAI39_3005   rho TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5891530 5891531 ECIAI39_3005 ECIAI39_4942 rho rhoL FALSE 0.156 85.000 0.002 NA   NA
 5891531 5891532 ECIAI39_4942 ECIAI39_3006 rhoL trxA FALSE 0.069 141.000 0.004 NA   NA
 5891533 5891534 ECIAI39_3007 ECIAI39_3008 rhlB gpp TRUE 0.493 136.000 0.406 1.000 N NA
 5891536 5891537 ECIAI39_3010 ECIAI39_3011   ppiC FALSE 0.107 153.000 0.000 1.000   NA
 5891540 5891541 ECIAI39_3014 ECIAI39_3015 ilvA ilvD TRUE 0.987 3.000 0.106 1.000 Y NA
 5891541 5891542 ECIAI39_3015 ECIAI39_3016 ilvD ilvE TRUE 0.781 65.000 0.075 1.000 Y NA
 5891542 5891543 ECIAI39_3016 ECIAI39_3017 ilvE ilvM TRUE 0.888 20.000 0.205 1.000   NA
 5891543 5891544 ECIAI39_3017 ECIAI39_3018 ilvM ilvG TRUE 0.999 -3.000 0.943 0.001   NA
 5891544 5891545 ECIAI39_3018 ECIAI39_4943 ilvG ilvL FALSE 0.421 140.000 0.091 0.002   NA
 5891549 5891550 ECIAI39_tRNA55 ECIAI39_tRNA54     TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 5891550 5891551 ECIAI39_tRNA54 ECIAI39_5S_4     FALSE 0.385 53.000 0.000 NA   NA
 5891551 5891552 ECIAI39_5S_4 ECIAI39_23S_3     FALSE 0.232 94.000 0.000 NA   NA
 5891552 5891553 ECIAI39_23S_3 ECIAI39_tRNA53     FALSE 0.023 233.000 0.000 NA   NA
 5891553 5891554 ECIAI39_tRNA53 ECIAI39_16S_3     FALSE 0.254 86.000 0.000 NA   NA
 5891554 5891555 ECIAI39_16S_3 ECIAI39_3022   murI FALSE 0.007 373.000 0.000 NA   NA
 5891555 5891556 ECIAI39_3022 ECIAI39_3023 murI btuB FALSE 0.456 -55.000 0.025 1.000 N NA
 5891556 5891557 ECIAI39_3023 ECIAI39_misc_RNA_67 btuB   FALSE 0.317 65.000 0.000 NA   NA
 5891559 5891560 ECIAI39_3025 ECIAI39_3026 yijD fabR TRUE 0.973 0.000 0.194 NA   NA
 5891564 5891565 ECIAI39_3029 ECIAI39_3030 argH argB TRUE 0.736 61.000 0.017 1.000 Y NA
 5891565 5891566 ECIAI39_3030 ECIAI39_3031 argB argC TRUE 0.987 11.000 0.097 0.002 Y NA
 5891567 5891568 ECIAI39_3032 ECIAI39_3033 argE ppc FALSE 0.006 302.000 0.053 1.000 N NA
 5891568 5891569 ECIAI39_3033 ECIAI39_3034 ppc yijP FALSE 0.063 183.000 0.000 1.000   NA
 5891569 5891570 ECIAI39_3034 ECIAI39_3035 yijP yijO FALSE 0.202 149.000 0.130 1.000   NA
 5891571 5891572 ECIAI39_3036 ECIAI39_3037 frwD pflC TRUE 0.937 2.000 0.156 1.000 N NA
 5891572 5891573 ECIAI39_3037 ECIAI39_3038 pflC pflD TRUE 0.971 -34.000 0.312 0.003 N NA
 5891573 5891574 ECIAI39_3038 ECIAI39_3039 pflD frwB TRUE 0.712 51.000 0.280 1.000 N NA
 5891574 5891575 ECIAI39_3039 ECIAI39_3040 frwB frwC TRUE 0.994 15.000 0.400 0.011 Y NA
 5891576 5891577 ECIAI39_3041 ECIAI39_3042 ptsA fsaB TRUE 0.959 12.000 0.000 1.000 Y NA
 5891577 5891578 ECIAI39_3042 ECIAI39_3043 fsaB gldA TRUE 0.978 11.000 0.600 1.000 N NA
 5891578 5891579 ECIAI39_3043 ECIAI39_3044 gldA yijF FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 5891580 5891581 ECIAI39_3045 ECIAI39_3046 yijE katG FALSE 0.181 94.000 0.012 1.000   NA
 5891581 5891582 ECIAI39_3046 ECIAI39_3047 katG metF FALSE 0.002 328.000 0.010 1.000 N NA
 5891582 5891583 ECIAI39_3047 ECIAI39_3048 metF   FALSE 0.004 382.000 0.000 1.000 N NA
 5891586 5891587 ECIAI39_3051 ECIAI39_3052     TRUE 0.954 35.000 0.000 0.001 Y NA
 5891587 5891588 ECIAI39_3052 ECIAI39_3053   tsx FALSE 0.177 79.000 0.000 1.000 N NA
 5891589 5891590 ECIAI39_3054 ECIAI39_3055 metL metB TRUE 0.996 3.000 0.428 1.000 Y NA
 5891591 5891592 ECIAI39_3056 ECIAI39_3057 metJ yiiX FALSE 0.340 60.000 0.000 NA   NA
 5891594 5891595 ECIAI39_3059 ECIAI39_3060 priA cytR FALSE 0.023 156.000 0.013 1.000 N NA
 5891595 5891596 ECIAI39_3060 ECIAI39_3061 cytR ftsN FALSE 0.467 92.000 0.245 NA N NA
 5891596 5891597 ECIAI39_3061 ECIAI39_3062 ftsN hslV FALSE 0.255 92.000 0.122 NA N NA
 5891597 5891598 ECIAI39_3062 ECIAI39_3063 hslV hslU TRUE 0.997 10.000 0.752 1.000 Y NA
 5891598 5891599 ECIAI39_3063 ECIAI39_3064 hslU menA FALSE 0.194 67.000 0.051 1.000 N NA
 5891599 5891600 ECIAI39_3064 ECIAI39_3065 menA rraA TRUE 0.763 93.000 0.158 NA Y NA
 5891600 5891601 ECIAI39_3065 ECIAI39_3066 rraA   FALSE 0.428 48.000 0.000 NA   NA
 5891601 5891602 ECIAI39_3066 ECIAI39_3067     TRUE 0.555 33.000 0.000 NA   NA
 5891604 5891605 ECIAI39_3069 ECIAI39_3070 glpF glpK FALSE 0.288 23.000 0.004 1.000 N NA
 5891605 5891606 ECIAI39_3070 ECIAI39_3071 glpK glpX FALSE 0.046 135.000 0.025 1.000 N NA
 5891606 5891607 ECIAI39_3071 ECIAI39_3072 glpX fpr FALSE 0.260 97.000 0.117 1.000 N NA
 5891608 5891609 ECIAI39_3073 ECIAI39_3074 yiiT yiiS TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5891609 5891610 ECIAI39_3074 ECIAI39_3075 yiiS yiiR FALSE 0.031 212.000 0.000 NA   NA
 5891611 5891612 ECIAI39_3076 ECIAI39_3077 yiiQ tpiA FALSE 0.212 108.000 0.058 NA   NA
 5891613 5891614 ECIAI39_3078 ECIAI39_3079 cdh sbp FALSE 0.132 107.000 0.000 1.000 N NA
 5891614 5891615 ECIAI39_3079 ECIAI39_3080 sbp pfkA FALSE 0.005 320.000 0.049 1.000 N NA
 5891615 5891616 ECIAI39_3080 ECIAI39_3081 pfkA fieF FALSE 0.026 181.000 0.040 1.000 N NA
 5891616 5891617 ECIAI39_3081 ECIAI39_3082 fieF cpxP FALSE 0.385 149.000 0.031 NA Y NA
 5891618 5891619 ECIAI39_3083 ECIAI39_3084 cpxR cpxA TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 5891620 5891621 ECIAI39_3085 ECIAI39_3086 yiiM kdgT FALSE 0.120 149.000 0.000 1.000   NA
 5891621 5891622 ECIAI39_3086 ECIAI39_3087 kdgT sodA FALSE 0.020 260.000 0.000 1.000   NA
 5891624 5891625 ECIAI39_3089 ECIAI39_3090 rhaR rhaS TRUE 0.999 -16.000 0.800 0.022 Y NA
 5891626 5891627 ECIAI39_3091 ECIAI39_3092 rhaB rhaA TRUE 0.998 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 5891627 5891628 ECIAI39_3092 ECIAI39_3093 rhaA   FALSE 0.348 66.000 0.000 1.000   NA
 5891628 5891629 ECIAI39_3093 ECIAI39_3094     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5891629 5891630 ECIAI39_3094 ECIAI39_3095   rhaD FALSE 0.148 95.000 0.000 1.000 N NA
 5891630 5891631 ECIAI39_3095 ECIAI39_3096 rhaD yiiL TRUE 0.885 10.000 0.112 NA   NA
 5891633 5891634 ECIAI39_3098 ECIAI39_3099 frvA frvB TRUE 0.982 11.000 0.000 0.011 Y NA
 5891634 5891635 ECIAI39_3099 ECIAI39_3100 frvB frvX TRUE 0.997 -10.000 0.667 NA Y NA
 5891635 5891636 ECIAI39_3100 ECIAI39_3101 frvX frvR TRUE 0.986 0.000 0.400 NA N NA
 5891637 5891638 ECIAI39_3102 ECIAI39_3103 yiiG fdhD FALSE 0.117 153.000 0.080 NA   NA
 5891639 5891640 ECIAI39_3104 ECIAI39_3106 fdoG fdoH TRUE 0.998 13.000 0.833 0.001 Y NA
 5891640 5891641 ECIAI39_3106 ECIAI39_3107 fdoH fdoI TRUE 1.000 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 5891641 5891642 ECIAI39_3107 ECIAI39_3108 fdoI fdhE TRUE 0.962 -3.000 0.182 NA N NA
 5891643 5891644 ECIAI39_3109 ECIAI39_3110 yiiF yiiE FALSE 0.027 220.000 0.000 NA   NA
 5891644 5891645 ECIAI39_3110 ECIAI39_3111 yiiE   FALSE 0.003 696.000 0.000 NA   NA
 5891645 5891646 ECIAI39_3111 ECIAI39_3112   yiiD FALSE 0.007 377.000 0.000 NA   NA
 5891646 5891647 ECIAI39_3112 ECIAI39_3113 yiiD dtd TRUE 0.947 -3.000 0.065 1.000   NA
 5891647 5891648 ECIAI39_3113 ECIAI39_3114 dtd rbn TRUE 0.949 -3.000 0.069 1.000   NA
 5891648 5891649 ECIAI39_3114 ECIAI39_3115 rbn yihX TRUE 0.915 -6.000 0.000 1.000   NA
 5891649 5891650 ECIAI39_3115 ECIAI39_3116 yihX yihW FALSE 0.249 99.000 0.000 1.000   NA
 5891650 5891651 ECIAI39_3116 ECIAI39_3117 yihW yihV TRUE 0.893 34.000 0.000 1.000 Y NA
 5891652 5891653 ECIAI39_3118 ECIAI39_3119 yihU yihT TRUE 0.856 24.000 0.250 1.000 N NA
 5891653 5891654 ECIAI39_3119 ECIAI39_3120 yihT yihS TRUE 0.946 16.000 0.051 1.000 Y NA
 5891654 5891655 ECIAI39_3120 ECIAI39_3121 yihS yihR TRUE 0.752 59.000 0.026 1.000 Y NA
 5891655 5891656 ECIAI39_3121 ECIAI39_3122 yihR yihQ FALSE 0.401 198.000 0.000 0.003 Y NA
 5891656 5891657 ECIAI39_3122 ECIAI39_3123 yihQ yihP TRUE 0.955 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5891657 5891658 ECIAI39_3123 ECIAI39_3124 yihP yihO TRUE 0.970 43.000 0.250 0.004 Y NA
 5891658 5891659 ECIAI39_3124 ECIAI39_3125 yihO ompL TRUE 0.871 67.000 0.625 NA   NA
 5891660 5891661 ECIAI39_3126 ECIAI39_3127 yihN yihM TRUE 0.866 102.000 0.833 NA   NA
 5891661 5891662 ECIAI39_3127 ECIAI39_3128 yihM yihL TRUE 0.991 8.000 0.800 NA   NA
 5891665 5891666 ECIAI39_3131 ECIAI39_3132 glnA glnL FALSE 0.038 174.000 0.053 1.000 N NA
 5891666 5891667 ECIAI39_3132 ECIAI39_3133 glnL glnG TRUE 0.996 12.000 0.587 0.065 Y NA
 5891668 5891669 ECIAI39_3134 ECIAI39_3135 hemN yihI FALSE 0.079 189.000 0.107 NA   NA
 5891669 5891670 ECIAI39_3135 ECIAI39_misc_RNA_69 yihI csrC FALSE 0.306 67.000 0.000 NA   NA
 5891672 5891673 ECIAI39_misc_RNA_70 ECIAI39_3137 spf polA FALSE 0.107 148.000 0.000 NA   NA
 5891675 5891676 ECIAI39_3139 ECIAI39_3140 yihF dsbA FALSE 0.088 155.000 0.000 NA   NA
 5891676 5891677 ECIAI39_3140 ECIAI39_3141 dsbA yihE TRUE 0.812 17.000 0.111 NA   NA
 5891677 5891678 ECIAI39_3141 ECIAI39_3142 yihE yihD FALSE 0.381 77.000 0.106 NA   NA
 5891679 5891680 ECIAI39_3143 ECIAI39_3144 mobA mobB TRUE 0.996 -3.000 0.064 0.002 Y NA
 5891681 5891682 ECIAI39_5S_3 ECIAI39_23S_2     FALSE 0.232 94.000 0.000 NA   NA
 5891682 5891683 ECIAI39_23S_2 ECIAI39_tRNA52     FALSE 0.064 175.000 0.000 NA   NA
 5891683 5891684 ECIAI39_tRNA52 ECIAI39_tRNA51     FALSE 0.466 43.000 0.000 NA   NA
 5891684 5891685 ECIAI39_tRNA51 ECIAI39_16S_2     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 5891685 5891686 ECIAI39_16S_2 ECIAI39_3145   hemG FALSE 0.006 378.000 0.000 NA   NA
 5891686 5891687 ECIAI39_3145 ECIAI39_3146 hemG trkH TRUE 0.962 12.000 0.455 1.000 N NA
 5891687 5891688 ECIAI39_3146 ECIAI39_3147 trkH yigZ TRUE 0.778 39.000 0.202 1.000   NA
 5891688 5891689 ECIAI39_3147 ECIAI39_3148 yigZ pepQ TRUE 0.962 0.000 0.127 1.000   NA
 5891690 5891691 ECIAI39_3149 ECIAI39_3150 fadB fadA TRUE 0.996 10.000 0.607 1.000 Y NA
 5891692 5891693 ECIAI39_3151 ECIAI39_3152     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5891693 5891694 ECIAI39_3152 ECIAI39_3153   fre FALSE 0.096 160.000 0.000 1.000   NA
 5891694 5891695 ECIAI39_3153 ECIAI39_3154 fre ubiD TRUE 0.859 46.000 0.090 NA Y NA
 5891697 5891698 ECIAI39_3156 ECIAI39_3157 tatD tatC TRUE 0.496 42.000 0.121 NA N NA
 5891698 5891699 ECIAI39_3157 ECIAI39_3158 tatC tatB TRUE 0.995 3.000 0.333 NA Y NA
 5891699 5891700 ECIAI39_3158 ECIAI39_3159 tatB tatA TRUE 0.989 4.000 0.188 1.000 Y NA
 5891700 5891701 ECIAI39_3159 ECIAI39_3160 tatA ubiB FALSE 0.246 79.000 0.032 1.000   NA
 5891701 5891702 ECIAI39_3160 ECIAI39_3161 ubiB yigP TRUE 0.993 -3.000 0.432 1.000   NA
 5891702 5891703 ECIAI39_3161 ECIAI39_3162 yigP ubiE TRUE 0.874 14.000 0.145 1.000   NA
 5891703 5891704 ECIAI39_3162 ECIAI39_3163 ubiE rmuC FALSE 0.210 95.000 0.047 NA   NA
 5891705 5891706 ECIAI39_3164 ECIAI39_3165     TRUE 0.522 24.000 0.000 1.000 N NA
 5891706 5891707 ECIAI39_3165 ECIAI39_3166     TRUE 0.681 -85.000 0.000 NA   NA
 5891707 5891708 ECIAI39_3166 ECIAI39_3167     FALSE 0.336 61.000 0.000 NA   NA
 5891708 5891709 ECIAI39_3167 ECIAI39_3168     TRUE 0.636 25.000 0.000 NA   NA
 5891709 5891710 ECIAI39_3168 ECIAI39_3169     TRUE 0.744 14.000 0.000 NA   NA
 5891710 5891711 ECIAI39_3169 ECIAI39_3170     TRUE 0.949 13.000 0.333 NA   NA
 5891713 5891714 ECIAI39_3172 ECIAI39_3173 ysgA   FALSE 0.006 393.000 0.000 NA   NA
 5891715 5891716 ECIAI39_3174 ECIAI39_3175     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.077 Y NA
 5891716 5891717 ECIAI39_3175 ECIAI39_3176   insD TRUE 0.655 133.000 0.000 0.077 Y NA
 5891717 5891718 ECIAI39_3176 ECIAI39_3177 insD insC TRUE 0.971 -42.000 0.000 0.077 Y NA
 5891719 5891720 ECIAI39_3178 ECIAI39_3179     FALSE 0.302 68.000 0.000 NA   NA
 5891723 5891724 ECIAI39_3182 ECIAI39_3183 yigM yigL FALSE 0.334 76.000 0.067 1.000   NA
 5891724 5891725 ECIAI39_3183 ECIAI39_3184 yigL pldB TRUE 0.984 8.000 0.524 1.000   NA
 5891727 5891728 ECIAI39_3186 ECIAI39_3187 rhtC recQ FALSE 0.185 64.000 0.043 1.000 N NA
 5891728 5891729 ECIAI39_3187 ECIAI39_3188 recQ pldA FALSE 0.108 125.000 0.057 1.000 N NA
 5891730 5891731 ECIAI39_3189 ECIAI39_3190 yigI rarD TRUE 0.505 52.000 0.099 NA   NA
 5891731 5891732 ECIAI39_3190 ECIAI39_3191 rarD yigF FALSE 0.005 489.000 0.000 NA   NA
 5891734 5891735 ECIAI39_3193 ECIAI39_3194     TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 5891738 5891739 ECIAI39_3197 ECIAI39_3198 insG eno FALSE 0.131 108.000 0.000 1.000 N NA
 5891739 5891740 ECIAI39_3198 ECIAI39_3199 eno pyrG FALSE 0.195 87.000 0.068 1.000 N NA
 5891740 5891741 ECIAI39_3199 ECIAI39_3200 pyrG mazG FALSE 0.020 228.000 0.025 1.000   NA
 5891741 5891742 ECIAI39_3200 ECIAI39_3201 mazG chpA FALSE 0.322 72.000 0.000 1.000   NA
 5891742 5891743 ECIAI39_3201 ECIAI39_3202 chpA chpR TRUE 0.998 0.000 0.531 NA Y NA
 5891743 5891744 ECIAI39_3202 ECIAI39_3203 chpR relA TRUE 0.698 78.000 0.000 NA Y NA
 5891744 5891745 ECIAI39_3203 ECIAI39_3204 relA rumA FALSE 0.397 48.000 0.082 1.000 N NA
 5891747 5891748 ECIAI39_3206 ECIAI39_3207     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5891750 5891751 ECIAI39_3209 ECIAI39_3210 gudD gudX TRUE 0.973 21.000 0.037 0.000 Y NA
 5891751 5891752 ECIAI39_3210 ECIAI39_3211 gudX gudP TRUE 0.938 2.000 0.158 1.000 N NA
 5891752 5891753 ECIAI39_3211 ECIAI39_3212 gudP yqcA FALSE 0.003 435.000 0.000 1.000 N NA
 5891753 5891754 ECIAI39_3212 ECIAI39_3213 yqcA truC TRUE 0.858 18.000 0.209 1.000 N NA
 5891754 5891755 ECIAI39_3213 ECIAI39_3214 truC yqcC TRUE 0.993 0.000 0.518 NA   NA
 5891755 5891756 ECIAI39_3214 ECIAI39_misc_RNA_71 yqcC csrB FALSE 0.420 49.000 0.000 NA   NA
 5891756 5891757 ECIAI39_misc_RNA_71 ECIAI39_3215 csrB syd FALSE 0.028 218.000 0.000 NA   NA
 5891758 5891759 ECIAI39_3216 ECIAI39_3217 queF ygdH FALSE 0.236 112.000 0.079 NA   NA
 5891759 5891760 ECIAI39_3217 ECIAI39_3218 ygdH sdaC FALSE 0.004 556.000 0.000 NA   NA
 5891760 5891761 ECIAI39_3218 ECIAI39_3219 sdaC sdaB TRUE 0.789 58.000 0.000 1.000 Y NA
 5891761 5891762 ECIAI39_3219 ECIAI39_3220 sdaB exo TRUE 0.543 22.000 0.000 1.000 N NA
 5891763 5891764 ECIAI39_3221 ECIAI39_3222 fucO fucA TRUE 0.548 25.000 0.066 1.000 N NA
 5891765 5891766 ECIAI39_3223 ECIAI39_3224 fucP fucI TRUE 0.912 33.000 0.104 NA Y NA
 5891766 5891767 ECIAI39_3224 ECIAI39_3225 fucI fucK TRUE 0.874 79.000 0.269 1.000 Y NA
 5891767 5891768 ECIAI39_3225 ECIAI39_3226 fucK fucU TRUE 0.993 2.000 0.211 1.000 Y NA
 5891768 5891769 ECIAI39_3226 ECIAI39_3227 fucU fucR TRUE 0.923 58.000 0.308 1.000 Y NA
 5891770 5891771 ECIAI39_3228 ECIAI39_3229 ygdE ygdD TRUE 0.944 -7.000 0.144 NA   NA
 5891771 5891772 ECIAI39_3229 ECIAI39_3230 ygdD gcvA TRUE 0.759 19.000 0.081 NA   NA
 5891775 5891776 ECIAI39_3232 ECIAI39_3233 csdA ygdK TRUE 0.987 0.000 0.122 0.001   NA
 5891777 5891778 ECIAI39_3234 ECIAI39_3235 ygdL mltA FALSE 0.005 239.000 0.009 1.000 N NA
 5891779 5891780 ECIAI39_tRNA25 ECIAI39_tRNA26     TRUE 0.540 35.000 0.000 NA   NA
 5891783 5891784 ECIAI39_3238 ECIAI39_3239 recD recB TRUE 0.999 0.000 0.688 0.001 Y NA
 5891784 5891785 ECIAI39_3239 ECIAI39_3240 recB ptr TRUE 0.887 -7.000 0.092 1.000 N NA
 5891785 5891786 ECIAI39_3240 ECIAI39_3241 ptr recC FALSE 0.061 176.000 0.092 1.000 N NA
 5891786 5891787 ECIAI39_3241 ECIAI39_3242 recC ppdC TRUE 0.665 13.000 0.076 NA N NA
 5891787 5891788 ECIAI39_3242 ECIAI39_3243 ppdC ygdB TRUE 0.984 -15.000 0.538 NA   NA
 5891788 5891789 ECIAI39_3243 ECIAI39_3244 ygdB ppdB TRUE 0.990 -3.000 0.373 NA   NA
 5891789 5891790 ECIAI39_3244 ECIAI39_3245 ppdB ppdA TRUE 0.994 -9.000 0.368 NA Y NA
 5891790 5891791 ECIAI39_3245 ECIAI39_3246 ppdA thyA FALSE 0.008 185.000 0.016 NA N NA
 5891791 5891792 ECIAI39_3246 ECIAI39_3247 thyA lgt TRUE 0.903 7.000 0.164 1.000 N NA
 5891792 5891793 ECIAI39_3247 ECIAI39_3248 lgt ptsP FALSE 0.060 151.000 0.000 1.000 N NA
 5891793 5891794 ECIAI39_3248 ECIAI39_3249 ptsP nudH FALSE 0.408 13.000 0.008 1.000 N NA
 5891795 5891796 ECIAI39_3250 ECIAI39_3251   mutH FALSE 0.198 79.000 0.026 NA   NA
 5891796 5891797 ECIAI39_3251 ECIAI39_3252 mutH ygdQ FALSE 0.190 69.000 0.052 1.000 N NA
 5891797 5891798 ECIAI39_3252 ECIAI39_3253 ygdQ ygdR TRUE 0.558 138.000 0.429 NA   NA
 5891798 5891799 ECIAI39_3253 ECIAI39_3254 ygdR tas FALSE 0.179 108.000 0.043 NA   NA
 5891800 5891801 ECIAI39_3255 ECIAI39_3256 ygeD aas TRUE 0.936 -7.000 0.124 NA   NA
 5891801 5891802 ECIAI39_3256 ECIAI39_misc_RNA_73 aas omrA FALSE 0.249 88.000 0.000 NA   NA
 5891802 5891803 ECIAI39_misc_RNA_73 ECIAI39_misc_RNA_74 omrA omrB FALSE 0.186 116.000 0.000 NA   NA
 5891807 5891808 ECIAI39_3260 ECIAI39_3261 ygeA araE FALSE 0.040 129.000 0.011 1.000 N NA
 5891808 5891809 ECIAI39_3261 ECIAI39_3262 araE kduD FALSE 0.006 315.000 0.000 1.000 N NA
 5891809 5891810 ECIAI39_3262 ECIAI39_3263 kduD kduI TRUE 0.829 30.000 0.269 1.000 N NA
 5891810 5891811 ECIAI39_3263 ECIAI39_3264 kduI yqeF FALSE 0.008 287.000 0.000 1.000 N NA
 5891812 5891813 ECIAI39_3265 ECIAI39_3266 yqeG yqeH FALSE 0.006 460.000 0.000 1.000   NA
 5891813 5891814 ECIAI39_3266 ECIAI39_3267 yqeH yqeI FALSE 0.023 334.000 0.000 0.064   NA
 5891814 5891815 ECIAI39_3267 ECIAI39_3268 yqeI yqeJ TRUE 0.984 -7.000 0.400 NA   NA
 5891816 5891817 ECIAI39_3269 ECIAI39_3270 yqeK   FALSE 0.011 295.000 0.000 NA   NA
 5891818 5891819 ECIAI39_3271 ECIAI39_3272 ygeF ygeG FALSE 0.013 285.000 0.000 NA   NA
 5891819 5891820 ECIAI39_3272 ECIAI39_3273 ygeG ygeH FALSE 0.010 335.000 0.000 1.000   NA
 5891820 5891821 ECIAI39_3273 ECIAI39_3274 ygeH ygeI FALSE 0.159 126.000 0.000 NA   NA
 5891821 5891822 ECIAI39_3274 ECIAI39_3275 ygeI   FALSE 0.258 84.000 0.000 NA   NA
 5891823 5891824 ECIAI39_3276 ECIAI39_3277 insB insA TRUE 0.968 -81.000 0.000 0.022 Y NA
 5891824 5891825 ECIAI39_3277 ECIAI39_3278 insA   FALSE 0.116 143.000 0.000 NA   NA
 5891825 5891826 ECIAI39_3278 ECIAI39_3279     FALSE 0.306 67.000 0.000 NA   NA
 5891826 5891827 ECIAI39_3279 ECIAI39_tRNA50     FALSE 0.047 191.000 0.000 NA   NA
 5891827 5891828 ECIAI39_tRNA50 ECIAI39_3280   ygeR FALSE 0.266 79.000 0.000 NA   NA
 5891829 5891830 ECIAI39_3281 ECIAI39_3282 xdhA xdhB TRUE 0.997 11.000 0.500 0.000 Y NA
 5891830 5891831 ECIAI39_3282 ECIAI39_3283 xdhB xdhC TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.038 Y NA
 5891833 5891834 ECIAI39_3285 ECIAI39_3286 ygeW ygeX TRUE 0.911 58.000 0.265 1.000 Y NA
 5891834 5891835 ECIAI39_3286 ECIAI39_3287 ygeX ygeY TRUE 0.881 58.000 0.188 1.000 Y NA
 5891835 5891836 ECIAI39_3287 ECIAI39_3288 ygeY hyuA FALSE 0.251 53.000 0.050 1.000 N NA
 5891836 5891837 ECIAI39_3288 ECIAI39_3289 hyuA yqeA FALSE 0.216 48.000 0.031 1.000 N NA
 5891838 5891839 ECIAI39_3290 ECIAI39_3291 yqeB yqeC TRUE 0.573 48.000 0.119 NA   NA
 5891840 5891841 ECIAI39_3292 ECIAI39_3293 ygfJ ygfK FALSE 0.009 322.000 0.000 NA   NA
 5891841 5891842 ECIAI39_3293 ECIAI39_3294 ygfK ssnA TRUE 0.983 3.000 0.443 1.000 N NA
 5891842 5891843 ECIAI39_3294 ECIAI39_3295 ssnA ygfM FALSE 0.318 51.000 0.066 1.000 N NA
 5891843 5891844 ECIAI39_3295 ECIAI39_3296 ygfM xdhD TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.022 Y NA
 5891844 5891845 ECIAI39_3296 ECIAI39_3297 xdhD ygfO FALSE 0.046 165.000 0.000 1.000 N NA
 5891845 5891846 ECIAI39_3297 ECIAI39_3298 ygfO guaD TRUE 0.950 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5891846 5891847 ECIAI39_3298 ECIAI39_3299 guaD ygfQ TRUE 0.572 36.000 0.000 1.000   NA
 5891848 5891849 ECIAI39_3300 ECIAI39_3301 ygfS ygfT TRUE 0.992 0.000 0.333 0.010 N NA
 5891850 5891851 ECIAI39_3302 ECIAI39_3303   ygfU TRUE 0.727 -55.000 0.000 NA   NA
 5891851 5891852 ECIAI39_3303 ECIAI39_3305 ygfU idi FALSE 0.011 249.000 0.000 1.000 N NA
 5891853 5891854 ECIAI39_3306 ECIAI39_3307 lysS prfB TRUE 0.990 10.000 0.162 0.035 Y NA
 5891854 5891855 ECIAI39_3307 ECIAI39_3308 prfB recJ FALSE 0.099 91.000 0.028 1.000 N NA
 5891855 5891856 ECIAI39_3308 ECIAI39_3309 recJ dsbC TRUE 0.833 6.000 0.082 1.000 N NA
 5891856 5891857 ECIAI39_3309 ECIAI39_3310 dsbC xerD TRUE 0.592 25.000 0.079 1.000 N NA
 5891859 5891860 ECIAI39_3312 ECIAI39_3313 ygfX ygfY TRUE 0.823 -19.000 0.061 NA   NA
 5891862 5891863 ECIAI39_3315 ECIAI39_3316 yqfA yqfB FALSE 0.127 164.000 0.113 NA   NA
 5891865 5891866 ECIAI39_3318 ECIAI39_3319 gcvP gcvH TRUE 0.793 118.000 0.249 1.000 Y NA
 5891866 5891867 ECIAI39_3319 ECIAI39_3320 gcvH gcvT TRUE 0.990 24.000 0.317 0.001 Y NA
 5891867 5891868 ECIAI39_3320 ECIAI39_3322 gcvT visC FALSE 0.001 448.000 0.004 1.000 N NA
 5891868 5891869 ECIAI39_3322 ECIAI39_3323 visC ubiH TRUE 0.994 23.000 0.474 0.001 Y NA
 5891869 5891870 ECIAI39_3323 ECIAI39_3324 ubiH pepP TRUE 0.818 -3.000 0.026 1.000 N NA
 5891870 5891871 ECIAI39_3324 ECIAI39_3325 pepP ygfB TRUE 0.563 26.000 0.036 NA   NA
 5891872 5891873 ECIAI39_3326 ECIAI39_misc_RNA_75 zapA ssrS FALSE 0.476 42.000 0.000 NA   NA
 5891873 5891874 ECIAI39_misc_RNA_75 ECIAI39_3327 ssrS ygfA FALSE 0.273 76.000 0.000 NA   NA
 5891874 5891875 ECIAI39_3327 ECIAI39_misc_RNA_76 ygfA rygC TRUE 0.623 26.000 0.000 NA   NA
 5891876 5891877 ECIAI39_3328 ECIAI39_3329 serA rpiA FALSE 0.006 256.000 0.029 1.000 N NA
 5891878 5891879 ECIAI39_3330 ECIAI39_3331 argP yliK FALSE 0.022 204.000 0.000 1.000 N NA
 5891879 5891880 ECIAI39_3331 ECIAI39_3332 yliK argK TRUE 0.978 -7.000 0.366 1.000 N NA
 5891880 5891881 ECIAI39_3332 ECIAI39_3333 argK ygfG TRUE 0.499 11.000 0.015 1.000 N NA
 5891881 5891882 ECIAI39_3333 ECIAI39_3334 ygfG ygfH TRUE 0.629 24.000 0.085 1.000 N NA
 5891883 5891884 ECIAI39_3335 ECIAI39_3336 ygfI yggE FALSE 0.057 168.000 0.037 NA   NA
 5891884 5891885 ECIAI39_3336 ECIAI39_3337 yggE argO FALSE 0.278 93.000 0.075 NA   NA
 5891885 5891886 ECIAI39_3337 ECIAI39_3338 argO mscS FALSE 0.136 139.000 0.049 1.000   NA
 5891886 5891887 ECIAI39_3338 ECIAI39_3339 mscS fbaA FALSE 0.021 191.000 0.038 1.000 N NA
 5891887 5891888 ECIAI39_3339 ECIAI39_3340 fbaA pgk FALSE 0.315 215.000 0.056 0.006 Y NA
 5891888 5891889 ECIAI39_3340 ECIAI39_3341 pgk epd TRUE 0.920 50.000 0.070 0.006 Y NA
 5891890 5891891 ECIAI39_3342 ECIAI39_3343     TRUE 0.793 -76.000 0.103 NA   NA
 5891891 5891892 ECIAI39_3343 ECIAI39_3344     TRUE 0.993 1.000 0.605 NA   NA
 5891892 5891893 ECIAI39_3344 ECIAI39_3345     TRUE 0.975 -18.000 0.093 1.000 Y NA
 5891893 5891894 ECIAI39_3345 ECIAI39_3346     TRUE 0.989 -39.000 0.214 0.012 Y NA
 5891895 5891896 ECIAI39_3347 ECIAI39_3348 yggC yggD TRUE 0.993 -3.000 0.588 NA N NA
 5891896 5891897 ECIAI39_3348 ECIAI39_3349 yggD yggF TRUE 0.948 22.000 0.545 NA N NA
 5891897 5891898 ECIAI39_3349 ECIAI39_3350 yggF yggP TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5891898 5891899 ECIAI39_3350 ECIAI39_3351 yggP cmtA TRUE 0.955 15.000 0.458 1.000 N NA
 5891899 5891900 ECIAI39_3351 ECIAI39_3352 cmtA cmtB TRUE 0.981 28.000 0.250 0.010 Y NA
 5891904 5891905 ECIAI39_3356 ECIAI39_3357 speB   FALSE 0.132 136.000 0.000 NA   NA
 5891905 5891906 ECIAI39_3357 ECIAI39_3358   speA FALSE 0.112 146.000 0.000 NA   NA
 5891906 5891907 ECIAI39_3358 ECIAI39_3359 speA yqgB TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 5891908 5891909 ECIAI39_3360 ECIAI39_3361 metK galP FALSE 0.003 436.000 0.000 1.000 N NA
 5891909 5891910 ECIAI39_3361 ECIAI39_3362 galP sprT FALSE 0.240 77.000 0.042 NA   NA
 5891910 5891911 ECIAI39_3362 ECIAI39_3363 sprT endA FALSE 0.489 95.000 0.210 NA   NA
 5891911 5891912 ECIAI39_3363 ECIAI39_3364 endA yggJ TRUE 0.530 80.000 0.201 NA   NA
 5891912 5891913 ECIAI39_3364 ECIAI39_3365 yggJ gshB TRUE 0.890 13.000 0.173 NA   NA
 5891913 5891914 ECIAI39_3365 ECIAI39_3366 gshB yqgE FALSE 0.212 109.000 0.120 NA N NA
 5891914 5891915 ECIAI39_3366 ECIAI39_3367 yqgE yqgF TRUE 0.974 0.000 0.263 NA N NA
 5891917 5891918 ECIAI39_3369 ECIAI39_3370 yggS yggT TRUE 0.879 18.000 0.189 NA   NA
 5891918 5891919 ECIAI39_3370 ECIAI39_3371 yggT yggU TRUE 0.949 -3.000 0.081 NA   NA
 5891919 5891920 ECIAI39_3371 ECIAI39_3372 yggU yggV TRUE 0.756 8.000 0.016 NA   NA
 5891920 5891921 ECIAI39_3372 ECIAI39_3373 yggV yggW TRUE 0.954 -7.000 0.218 1.000 N NA
 5891921 5891922 ECIAI39_3373 ECIAI39_3374 yggW   FALSE 0.006 313.000 0.000 1.000 N NA
 5891922 5891923 ECIAI39_3374 ECIAI39_3375     TRUE 0.955 36.000 0.286 NA Y NA
 5891923 5891924 ECIAI39_3375 ECIAI39_3376     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5891924 5891925 ECIAI39_3376 ECIAI39_3377     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5891925 5891926 ECIAI39_3377 ECIAI39_3378     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.076 Y NA
 5891926 5891927 ECIAI39_3378 ECIAI39_3379   ygiK TRUE 0.656 -142.000 0.000 NA   NA
 5891928 5891929 ECIAI39_3380 ECIAI39_3381 yggM ansB FALSE 0.122 117.000 0.018 NA   NA
 5891929 5891930 ECIAI39_3381 ECIAI39_3382 ansB yggN FALSE 0.043 176.000 0.027 NA   NA
 5891930 5891931 ECIAI39_3382 ECIAI39_3383 yggN yggL FALSE 0.113 184.000 0.155 NA   NA
 5891931 5891932 ECIAI39_3383 ECIAI39_3384 yggL yggH TRUE 0.947 0.000 0.092 NA   NA
 5891933 5891934 ECIAI39_3385 ECIAI39_3386 mutY yggX TRUE 0.667 28.000 0.150 NA N NA
 5891934 5891935 ECIAI39_3386 ECIAI39_3387 yggX mltC FALSE 0.347 65.000 0.128 NA N NA
 5891935 5891936 ECIAI39_3387 ECIAI39_3388 mltC nupG FALSE 0.039 202.000 0.056 NA   NA
 5891938 5891939 ECIAI39_3390 ECIAI39_tRNA27 yqgA   FALSE 0.207 106.000 0.000 NA   NA
 5891939 5891940 ECIAI39_tRNA27 ECIAI39_3391   int FALSE 0.041 198.000 0.000 NA   NA
 5891940 5891941 ECIAI39_3391 ECIAI39_3392 int   FALSE 0.030 226.000 0.000 1.000   NA
 5891941 5891942 ECIAI39_3392 ECIAI39_3393   insA FALSE 0.005 530.000 0.000 1.000   NA
 5891942 5891943 ECIAI39_3393 ECIAI39_3394 insA insB TRUE 0.968 -81.000 0.000 0.022 Y NA
 5891944 5891945 ECIAI39_3395 ECIAI39_3396     FALSE 0.085 167.000 0.000 1.000   NA
 5891945 5891946 ECIAI39_3396 ECIAI39_3397     FALSE 0.037 470.000 0.250 0.076   NA
 5891946 5891947 ECIAI39_3397 ECIAI39_3398   papG FALSE 0.036 205.000 0.000 NA   NA
 5891947 5891948 ECIAI39_3398 ECIAI39_3399 papG papG TRUE 0.716 -67.000 0.000 NA   NA
 5891948 5891949 ECIAI39_3399 ECIAI39_3400 papG papF FALSE 0.456 44.000 0.000 NA   NA
 5891949 5891950 ECIAI39_3400 ECIAI39_3401 papF papE TRUE 0.744 45.000 0.000 0.009   NA
 5891950 5891951 ECIAI39_3401 ECIAI39_3402 papE insB FALSE 0.389 37.000 0.000 1.000 N NA
 5891951 5891952 ECIAI39_3402 ECIAI39_3403 insB insA TRUE 0.968 -81.000 0.000 0.022 Y NA
 5891952 5891953 ECIAI39_3403 ECIAI39_3404 insA papA TRUE 0.585 29.000 0.000 NA   NA
 5891953 5891954 ECIAI39_3404 ECIAI39_3405 papA papA TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891954 5891955 ECIAI39_3405 ECIAI39_3406 papA papB FALSE 0.064 175.000 0.000 NA   NA
 5891957 5891958 ECIAI39_3408 ECIAI39_misc_RNA_77     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5891958 5891959 ECIAI39_misc_RNA_77 ECIAI39_3409     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5891959 5891960 ECIAI39_3409 ECIAI39_3410     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5891961 5891962 ECIAI39_3411 ECIAI39_3412     TRUE 0.642 -208.000 0.000 NA   NA
 5891962 5891963 ECIAI39_3412 ECIAI39_3413     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891964 5891965 ECIAI39_3414 ECIAI39_3415     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5891965 5891966 ECIAI39_3415 ECIAI39_3416     FALSE 0.010 740.000 0.000 0.020   NA
 5891967 5891968 ECIAI39_3417 ECIAI39_3418     TRUE 0.940 42.000 0.667 NA   NA
 5891968 5891969 ECIAI39_3418 ECIAI39_3419     TRUE 0.933 10.000 0.200 NA   NA
 5891969 5891970 ECIAI39_3419 ECIAI39_3420   insC FALSE 0.003 664.000 0.000 NA   NA
 5891970 5891971 ECIAI39_3420 ECIAI39_3421 insC insD TRUE 0.989 -7.000 0.000 0.075 Y NA
 5891973 5891974 ECIAI39_3423 ECIAI39_3424 iucA iucB TRUE 0.994 1.000 0.609 1.000   NA
 5891974 5891975 ECIAI39_3424 ECIAI39_3425 iucB iucC TRUE 0.982 0.000 0.250 1.000   NA
 5891975 5891976 ECIAI39_3425 ECIAI39_3426 iucC iucD TRUE 0.998 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 5891976 5891977 ECIAI39_3426 ECIAI39_3427 iucD iutA FALSE 0.160 82.000 0.050 1.000 N NA
 5891977 5891978 ECIAI39_3427 ECIAI39_3428 iutA sat FALSE 0.003 933.000 0.000 NA   NA
 5891978 5891979 ECIAI39_3428 ECIAI39_3429 sat   FALSE 0.394 52.000 0.000 NA   NA
 5891979 5891980 ECIAI39_3429 ECIAI39_3430     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5891980 5891981 ECIAI39_3430 ECIAI39_3431     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5891981 5891982 ECIAI39_3431 ECIAI39_misc_RNA_78     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5891982 5891983 ECIAI39_misc_RNA_78 ECIAI39_3432     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5891983 5891984 ECIAI39_3432 ECIAI39_3433   kpsF FALSE 0.359 57.000 0.000 NA   NA
 5891984 5891985 ECIAI39_3433 ECIAI39_3434 kpsF kpsE FALSE 0.287 72.000 0.000 NA   NA
 5891985 5891986 ECIAI39_3434 ECIAI39_3435 kpsE kpsD TRUE 0.936 21.000 0.000 1.000 Y NA
 5891986 5891987 ECIAI39_3435 ECIAI39_3436 kpsD kpsU TRUE 0.968 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5891987 5891988 ECIAI39_3436 ECIAI39_3437 kpsU kpsC TRUE 0.987 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 5891988 5891989 ECIAI39_3437 ECIAI39_3438 kpsC kpsS TRUE 0.984 35.000 0.315 0.001 Y NA
 5891990 5891991 ECIAI39_3439 ECIAI39_3440 neuS neuE TRUE 0.860 -10.000 0.000 NA   NA
 5891991 5891992 ECIAI39_3440 ECIAI39_3441 neuE neuC TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5891992 5891993 ECIAI39_3441 ECIAI39_3442 neuC neuA TRUE 0.996 -3.000 0.111 0.004 Y NA
 5891993 5891994 ECIAI39_3442 ECIAI39_3443 neuA neuB TRUE 0.991 0.000 0.105 1.000 Y NA
 5891994 5891995 ECIAI39_3443 ECIAI39_3444 neuB neuD TRUE 0.929 -3.000 0.036 1.000   NA
 5891995 5891996 ECIAI39_3444 ECIAI39_3445 neuD kpsT TRUE 0.658 50.000 0.000 0.068   NA
 5891996 5891997 ECIAI39_3445 ECIAI39_3446 kpsT kpsM TRUE 0.994 -3.000 0.056 0.068 Y NA
 5891997 5891998 ECIAI39_3446 ECIAI39_3447 kpsM yghD FALSE 0.002 999.000 0.000 1.000 N NA
 5891998 5891999 ECIAI39_3447 ECIAI39_3448 yghD yghE TRUE 0.999 2.000 0.811 1.000 Y NA
 5891999 5892000 ECIAI39_3448 ECIAI39_3449 yghE   TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.064 Y NA
 5892000 5892001 ECIAI39_3449 ECIAI39_3450     TRUE 0.998 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 5892001 5892002 ECIAI39_3450 ECIAI39_3451     TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.002   NA
 5892002 5892003 ECIAI39_3451 ECIAI39_3452     TRUE 0.998 -3.000 0.605 0.002   NA
 5892003 5892004 ECIAI39_3452 ECIAI39_3453     TRUE 0.993 4.000 0.425 0.002   NA
 5892004 5892005 ECIAI39_3453 ECIAI39_3454   epsF TRUE 0.999 -10.000 0.599 0.002 Y NA
 5892005 5892006 ECIAI39_3454 ECIAI39_3455 epsF epsE TRUE 0.999 0.000 0.653 0.002 Y NA
 5892006 5892007 ECIAI39_3455 ECIAI39_3456 epsE epsD TRUE 0.999 0.000 0.776 0.002 Y NA
 5892007 5892008 ECIAI39_3456 ECIAI39_3457 epsD yghF TRUE 0.993 30.000 0.575 0.002 Y NA
 5892008 5892009 ECIAI39_3457 ECIAI39_3458 yghF yghG TRUE 0.711 18.000 0.000 NA   NA
 5892009 5892010 ECIAI39_3458 ECIAI39_3459 yghG pppA FALSE 0.311 66.000 0.000 NA   NA
 5892010 5892011 ECIAI39_3459 ECIAI39_3460 pppA yghJ FALSE 0.146 130.000 0.000 NA   NA
 5892015 5892016 ECIAI39_3463 ECIAI39_3464 glcB glcG TRUE 0.659 22.000 0.052 NA   NA
 5892016 5892017 ECIAI39_3464 ECIAI39_3465 glcG glcF TRUE 0.864 5.000 0.057 NA   NA
 5892017 5892018 ECIAI39_3465 ECIAI39_3466 glcF glcE TRUE 0.983 11.000 0.074 0.022 Y NA
 5892018 5892019 ECIAI39_3466 ECIAI39_3467 glcE glcD TRUE 0.995 0.000 0.070 0.006 Y NA
 5892022 5892023 ECIAI39_3470 ECIAI39_3471     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5892023 5892024 ECIAI39_3471 ECIAI39_3472     TRUE 0.623 32.000 0.064 1.000   NA
 5892024 5892025 ECIAI39_3472 ECIAI39_3473     TRUE 0.953 0.000 0.091 1.000   NA
 5892026 5892027 ECIAI39_3474 ECIAI39_3475     TRUE 0.997 -3.000 0.631 0.064   NA
 5892027 5892028 ECIAI39_3475 ECIAI39_3476     TRUE 0.569 31.000 0.000 NA   NA
 5892028 5892029 ECIAI39_3476 ECIAI39_3477     TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 5892029 5892030 ECIAI39_3477 ECIAI39_3478     TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 5892030 5892031 ECIAI39_3478 ECIAI39_3479   yghR TRUE 0.931 46.000 0.667 NA   NA
 5892031 5892032 ECIAI39_3479 ECIAI39_3480 yghR yghS TRUE 0.560 32.000 0.000 NA   NA
 5892033 5892034 ECIAI39_3481 ECIAI39_3482 yghT yghT TRUE 0.652 -147.000 0.000 NA   NA
 5892035 5892036 ECIAI39_3483 ECIAI39_3484 pitB gss FALSE 0.007 292.000 0.000 1.000 N NA
 5892038 5892039 ECIAI39_3486 ECIAI39_3487 hybG hybF TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5892039 5892040 ECIAI39_3487 ECIAI39_3488 hybF hybE TRUE 0.887 -7.000 0.055 NA   NA
 5892040 5892041 ECIAI39_3488 ECIAI39_3489 hybE hybD TRUE 0.975 -7.000 0.291 NA   NA
 5892041 5892042 ECIAI39_3489 ECIAI39_3490 hybD hybC TRUE 0.999 0.000 0.828 1.000 Y NA
 5892042 5892043 ECIAI39_3490 ECIAI39_3491 hybC hybB TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 5892043 5892044 ECIAI39_3491 ECIAI39_3492 hybB hybA TRUE 0.975 -10.000 0.000 NA Y NA
 5892044 5892045 ECIAI39_3492 ECIAI39_3493 hybA hybO TRUE 0.998 3.000 0.615 NA Y NA
 5892045 5892046 ECIAI39_3493 ECIAI39_3494 hybO   TRUE 0.837 7.000 0.051 NA   NA
 5892046 5892047 ECIAI39_3494 ECIAI39_3495   yghW TRUE 0.971 -3.000 0.167 NA   NA
 5892047 5892048 ECIAI39_3495 ECIAI39_3496 yghW   FALSE 0.115 119.000 0.017 NA   NA
 5892052 5892053 ECIAI39_3500 ECIAI39_3501 exbD exbB TRUE 0.999 7.000 0.810 0.053 Y NA
 5892054 5892055 ECIAI39_3502 ECIAI39_3503 metC yghB FALSE 0.316 140.000 0.212 NA   NA
 5892057 5892058 ECIAI39_3505 ECIAI39_3506 yqhD dkgA FALSE 0.478 105.000 0.200 1.000   NA
 5892058 5892059 ECIAI39_3506 ECIAI39_3507 dkgA yqhG FALSE 0.040 200.000 0.000 NA   NA
 5892059 5892060 ECIAI39_3507 ECIAI39_3508 yqhG yqhH FALSE 0.403 51.000 0.000 NA   NA
 5892061 5892062 ECIAI39_3509 ECIAI39_3510 ygiQ sufI FALSE 0.072 111.000 0.025 1.000 N NA
 5892062 5892063 ECIAI39_3510 ECIAI39_3511 sufI plsC FALSE 0.382 75.000 0.154 1.000 N NA
 5892063 5892064 ECIAI39_3511 ECIAI39_3512 plsC   FALSE 0.428 48.000 0.000 NA   NA
 5892064 5892065 ECIAI39_3512 ECIAI39_3513   parC TRUE 0.569 31.000 0.000 NA   NA
 5892065 5892066 ECIAI39_3513 ECIAI39_3514 parC ygiS FALSE 0.079 138.000 0.000 1.000 N NA
 5892066 5892067 ECIAI39_3514 ECIAI39_3516 ygiS ygiT FALSE 0.162 133.000 0.000 1.000   NA
 5892067 5892068 ECIAI39_3516 ECIAI39_3517 ygiT mqsR TRUE 0.996 2.000 0.857 NA   NA
 5892068 5892069 ECIAI39_3517 ECIAI39_3518 mqsR ygiV FALSE 0.036 205.000 0.000 NA   NA
 5892069 5892070 ECIAI39_3518 ECIAI39_3519 ygiV ygiW FALSE 0.380 53.000 0.053 NA   NA
 5892071 5892072 ECIAI39_3520 ECIAI39_3521 qseB qseC TRUE 0.998 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 5892073 5892074 ECIAI39_3522 ECIAI39_3523 ygiZ   TRUE 0.994 7.000 1.000 NA   NA
 5892074 5892075 ECIAI39_3523 ECIAI39_3524     TRUE 0.795 -24.000 0.000 NA   NA
 5892076 5892077 ECIAI39_3525 ECIAI39_3526 mdaB ygiN TRUE 0.770 31.000 0.025 0.022   NA
 5892078 5892079 ECIAI39_3527 ECIAI39_3528 parE yqiA TRUE 0.829 29.000 0.217 NA   NA
 5892079 5892080 ECIAI39_3528 ECIAI39_3529 yqiA cpdA TRUE 0.990 0.000 0.427 NA   NA
 5892080 5892081 ECIAI39_3529 ECIAI39_3530 cpdA yqiB TRUE 0.939 25.000 0.433 NA   NA
 5892081 5892082 ECIAI39_3530 ECIAI39_3531 yqiB nudF TRUE 0.989 1.000 0.443 NA   NA
 5892083 5892084 ECIAI39_3532 ECIAI39_3533 tolC ygiB FALSE 0.173 244.000 0.480 NA   NA
 5892084 5892085 ECIAI39_3533 ECIAI39_3534 ygiB ygiC TRUE 0.989 6.000 0.632 NA   NA
 5892088 5892089 ECIAI39_3537 ECIAI39_3538   ribB FALSE 0.021 238.000 0.000 NA   NA
 5892089 5892090 ECIAI39_3538 ECIAI39_misc_RNA_80 ribB   FALSE 0.213 104.000 0.000 NA   NA
 5892091 5892092 ECIAI39_3539 ECIAI39_3540 yqiC ygiL FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 5892092 5892093 ECIAI39_3540 ECIAI39_3541 ygiL yqiG FALSE 0.403 51.000 0.000 NA   NA
 5892093 5892094 ECIAI39_3541 ECIAI39_3542 yqiG yqiG TRUE 0.569 31.000 0.000 NA   NA
 5892094 5892095 ECIAI39_3542 ECIAI39_3543 yqiG yqiH TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 5892095 5892096 ECIAI39_3543 ECIAI39_3544 yqiH yqiI TRUE 0.987 2.000 0.400 1.000   NA
 5892098 5892099 ECIAI39_3546 ECIAI39_3547 yqiJ yqiK TRUE 0.961 27.000 0.641 NA   NA
 5892100 5892101 ECIAI39_misc_RNA_81 ECIAI39_misc_RNA_82 rygD   FALSE 0.026 226.000 0.000 NA   NA
 5892101 5892102 ECIAI39_misc_RNA_82 ECIAI39_3548   rfaE FALSE 0.448 45.000 0.000 NA   NA
 5892102 5892103 ECIAI39_3548 ECIAI39_3549 rfaE glnE FALSE 0.398 48.000 0.083 1.000 N NA
 5892103 5892104 ECIAI39_3549 ECIAI39_3550 glnE ygiF TRUE 0.689 23.000 0.053 1.000   NA
 5892105 5892106 ECIAI39_3551 ECIAI39_3552 htrG cca FALSE 0.313 64.000 0.106 NA N NA
 5892107 5892108 ECIAI39_3553 ECIAI39_3554 bacA folB FALSE 0.301 91.000 0.128 1.000 N NA
 5892111 5892112 ECIAI39_3557 ECIAI39_3558 ttdA ttdB TRUE 1.000 -3.000 0.667 0.001 Y NA
 5892112 5892113 ECIAI39_3558 ECIAI39_3559 ttdB ygjE FALSE 0.231 49.000 0.037 1.000 N NA
 5892115 5892116 ECIAI39_3561 ECIAI39_3562 rpsU dnaG FALSE 0.148 111.000 0.067 1.000 N NA
 5892116 5892117 ECIAI39_3562 ECIAI39_3563 dnaG rpoD FALSE 0.154 195.000 0.299 1.000 N NA
 5892117 5892118 ECIAI39_3563 ECIAI39_3564 rpoD insG FALSE 0.079 138.000 0.000 1.000 N NA
 5892122 5892123 ECIAI39_3567 ECIAI39_3568     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5892123 5892124 ECIAI39_3568 ECIAI39_3569   yqjI FALSE 0.042 155.000 0.000 NA N NA
 5892128 5892129 ECIAI39_3573 ECIAI39_3574 ebgR ebgA FALSE 0.074 184.000 0.136 1.000 N NA
 5892129 5892130 ECIAI39_3574 ECIAI39_3575 ebgA ebgC TRUE 0.999 -3.000 0.682 NA Y NA
 5892130 5892131 ECIAI39_3575 ECIAI39_3576 ebgC ygjI TRUE 0.744 63.000 0.412 NA N NA
 5892131 5892132 ECIAI39_3576 ECIAI39_3577 ygjI ygjJ FALSE 0.137 134.000 0.000 NA   NA
 5892132 5892133 ECIAI39_3577 ECIAI39_3578 ygjJ ygjK TRUE 0.718 17.000 0.000 NA   NA
 5892133 5892134 ECIAI39_3578 ECIAI39_3579 ygjK fadH FALSE 0.005 526.000 0.000 1.000   NA
 5892136 5892137 ECIAI39_3581 ECIAI39_3582 ygjP ygjQ FALSE 0.189 77.000 0.019 NA   NA
 5892137 5892138 ECIAI39_3582 ECIAI39_3583 ygjQ ygjR FALSE 0.240 61.000 0.019 NA   NA
 5892138 5892139 ECIAI39_3583 ECIAI39_misc_RNA_83 ygjR sraF FALSE 0.271 77.000 0.000 NA   NA
 5892139 5892140 ECIAI39_misc_RNA_83 ECIAI39_3584 sraF alx TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5892140 5892141 ECIAI39_3584 ECIAI39_3586 alx sstT FALSE 0.002 616.000 0.000 1.000 N NA
 5892142 5892143 ECIAI39_3587 ECIAI39_3588 ygjV uxaA FALSE 0.398 83.000 0.126 NA   NA
 5892143 5892144 ECIAI39_3588 ECIAI39_3589 uxaA uxaC TRUE 0.960 15.000 0.092 1.000 Y NA
 5892146 5892147 ECIAI39_3591 ECIAI39_3592     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5892147 5892148 ECIAI39_3592 ECIAI39_3593     TRUE 0.872 73.000 0.667 NA   NA
 5892148 5892149 ECIAI39_3593 ECIAI39_3594     TRUE 0.945 30.000 0.556 NA   NA
 5892150 5892151 ECIAI39_3595 ECIAI39_3596 exuR yqjA FALSE 0.008 345.000 0.000 NA   NA
 5892151 5892152 ECIAI39_3596 ECIAI39_3597 yqjA yqjB TRUE 0.988 4.000 0.529 NA   NA
 5892152 5892153 ECIAI39_3597 ECIAI39_3598 yqjB yqjC TRUE 0.691 147.000 0.684 NA   NA
 5892153 5892154 ECIAI39_3598 ECIAI39_3599 yqjC yqjD TRUE 0.939 38.000 0.609 NA   NA
 5892154 5892155 ECIAI39_3599 ECIAI39_3600 yqjD yqjE TRUE 0.959 3.000 0.185 NA   NA
 5892155 5892156 ECIAI39_3600 ECIAI39_3601 yqjE yqjK TRUE 0.947 -10.000 0.185 NA   NA
 5892156 5892157 ECIAI39_3601 ECIAI39_3602 yqjK yqjF FALSE 0.112 186.000 0.161 NA   NA
 5892157 5892158 ECIAI39_3602 ECIAI39_3603 yqjF yqjG FALSE 0.293 70.000 0.000 NA   NA
 5892158 5892159 ECIAI39_3603 ECIAI39_3604 yqjG yhaH FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 5892159 5892160 ECIAI39_3604 ECIAI39_3605 yhaH yhaI FALSE 0.056 242.000 0.000 0.063   NA
 5892162 5892163 ECIAI39_3607 ECIAI39_3608 yhaK yhaL TRUE 0.511 23.000 0.005 NA   NA
 5892164 5892165 ECIAI39_3609 ECIAI39_3610     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5892165 5892166 ECIAI39_3610 ECIAI39_3611   yhaM FALSE 0.092 153.000 0.000 NA   NA
 5892166 5892167 ECIAI39_3611 ECIAI39_3612 yhaM yhaO TRUE 0.770 28.000 0.157 NA   NA
 5892167 5892168 ECIAI39_3612 ECIAI39_3613 yhaO tdcG FALSE 0.054 338.000 0.000 1.000 Y NA
 5892168 5892169 ECIAI39_3613 ECIAI39_3614 tdcG tdcF FALSE 0.355 72.000 0.150 NA N NA
 5892169 5892170 ECIAI39_3614 ECIAI39_3615 tdcF tdcE TRUE 0.567 14.000 0.000 NA N NA
 5892170 5892171 ECIAI39_3615 ECIAI39_3616 tdcE tdcD TRUE 0.961 34.000 0.286 1.000 Y NA
 5892171 5892172 ECIAI39_3616 ECIAI39_3617 tdcD tdcC TRUE 0.925 14.000 0.308 1.000 N NA
 5892172 5892173 ECIAI39_3617 ECIAI39_3618 tdcC tdcB TRUE 0.922 22.000 0.029 1.000 Y NA
 5892173 5892174 ECIAI39_3618 ECIAI39_3619 tdcB tdcA FALSE 0.080 99.000 0.023 1.000 N NA
 5892175 5892176 ECIAI39_3620 ECIAI39_3621 tdcR yhaB FALSE 0.018 256.000 0.000 NA   NA
 5892176 5892177 ECIAI39_3621 ECIAI39_3622 yhaB yhaC TRUE 0.668 22.000 0.000 NA   NA
 5892178 5892179 ECIAI39_misc_RNA_84 ECIAI39_3623   garK FALSE 0.236 93.000 0.000 NA   NA
 5892179 5892180 ECIAI39_3623 ECIAI39_3624 garK garR TRUE 0.808 16.000 0.152 1.000 N NA
 5892180 5892181 ECIAI39_3624 ECIAI39_3625 garR garL TRUE 0.903 30.000 0.424 1.000 N NA
 5892181 5892182 ECIAI39_3625 ECIAI39_3626 garL garP TRUE 0.966 16.000 0.143 1.000 Y NA
 5892183 5892184 ECIAI39_3627 ECIAI39_3628 garD sohA FALSE 0.050 149.000 0.000 NA N NA
 5892184 5892185 ECIAI39_3628 ECIAI39_3629 sohA yhaV TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5892187 5892188 ECIAI39_3631 ECIAI39_3632 kbaZ agaV TRUE 0.974 23.000 0.280 1.000 Y NA
 5892188 5892189 ECIAI39_3632 ECIAI39_3633 agaV   TRUE 0.998 11.000 0.905 0.014 Y NA
 5892189 5892190 ECIAI39_3633 ECIAI39_3634     TRUE 0.998 -16.000 0.619 0.014 Y NA
 5892190 5892191 ECIAI39_3634 ECIAI39_3635     TRUE 0.997 18.000 0.692 0.014 Y NA
 5892191 5892192 ECIAI39_3635 ECIAI39_3636   agaA TRUE 0.972 -24.000 0.104 1.000 Y NA
 5892192 5892193 ECIAI39_3636 ECIAI39_3637 agaA agaS FALSE 0.005 351.000 0.000 1.000 N NA
 5892193 5892194 ECIAI39_3637 ECIAI39_3638 agaS kbaY TRUE 0.949 13.000 0.391 1.000 N NA
 5892194 5892195 ECIAI39_3638 ECIAI39_3639 kbaY agaB FALSE 0.394 167.000 0.087 1.000 Y NA
 5892195 5892196 ECIAI39_3639 ECIAI39_3640 agaB agaC TRUE 0.980 39.000 0.333 0.010 Y NA
 5892196 5892197 ECIAI39_3640 ECIAI39_3641 agaC agaD TRUE 0.998 -10.000 0.444 0.010 Y NA
 5892197 5892198 ECIAI39_3641 ECIAI39_3642 agaD agaI TRUE 0.987 1.000 0.080 1.000 Y NA
 5892200 5892201 ECIAI39_3644 ECIAI39_3645 yraM yraN TRUE 0.894 -42.000 0.172 1.000   NA
 5892201 5892202 ECIAI39_3645 ECIAI39_3646 yraN yraO TRUE 0.830 20.000 0.187 1.000 N NA
 5892202 5892203 ECIAI39_3646 ECIAI39_3647 yraO ecfH TRUE 0.985 10.000 0.613 NA   NA
 5892204 5892205 ECIAI39_3648 ECIAI39_3649 yraQ yraR FALSE 0.260 73.000 0.045 NA   NA
 5892209 5892210 ECIAI39_3653 ECIAI39_3654 yhbS yhbT TRUE 0.981 -6.000 0.295 1.000   NA
 5892211 5892212 ECIAI39_3655 ECIAI39_3656 yhbU yhbV TRUE 0.999 9.000 0.948 0.003 Y NA
 5892212 5892213 ECIAI39_3656 ECIAI39_3657 yhbV yhbW FALSE 0.104 81.000 0.041 NA N NA
 5892214 5892215 ECIAI39_3658 ECIAI39_3659 mtr deaD FALSE 0.023 154.000 0.009 1.000 N NA
 5892215 5892216 ECIAI39_3659 ECIAI39_3660 deaD nlpI FALSE 0.066 180.000 0.053 1.000   NA
 5892216 5892217 ECIAI39_3660 ECIAI39_3661 nlpI pnp FALSE 0.260 109.000 0.071 1.000   NA
 5892219 5892220 ECIAI39_3662 ECIAI39_3663 rpsO truB TRUE 0.632 149.000 0.211 1.000 Y NA
 5892220 5892221 ECIAI39_3663 ECIAI39_3664 truB rbfA TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5892221 5892222 ECIAI39_3664 ECIAI39_3665 rbfA infB TRUE 0.785 164.000 0.530 1.000 Y NA
 5892222 5892223 ECIAI39_3665 ECIAI39_3666 infB nusA TRUE 0.899 25.000 0.342 1.000 N NA
 5892223 5892224 ECIAI39_3666 ECIAI39_3667 nusA yhbC TRUE 0.967 28.000 0.759 NA   NA
 5892224 5892225 ECIAI39_3667 ECIAI39_tRNA49 yhbC   FALSE 0.035 207.000 0.000 NA   NA
 5892227 5892228 ECIAI39_3669 ECIAI39_tRNA48 yhbX   FALSE 0.005 459.000 0.000 NA   NA
 5892228 5892229 ECIAI39_tRNA48 ECIAI39_3670   secG TRUE 0.735 15.000 0.000 NA   NA
 5892229 5892230 ECIAI39_3670 ECIAI39_3671 secG glmM FALSE 0.007 228.000 0.016 1.000 N NA
 5892230 5892231 ECIAI39_3671 ECIAI39_3672 glmM folP TRUE 0.964 -7.000 0.260 1.000 N NA
 5892231 5892232 ECIAI39_3672 ECIAI39_3673 folP ftsH TRUE 0.598 90.000 0.325 1.000 N NA
 5892232 5892233 ECIAI39_3673 ECIAI39_3674 ftsH rrmJ FALSE 0.308 100.000 0.152 1.000 N NA
 5892237 5892238 ECIAI39_3678 ECIAI39_3679 obgE yhbE TRUE 0.663 16.000 0.015 1.000   NA
 5892238 5892239 ECIAI39_3679 ECIAI39_3680 yhbE rpmA FALSE 0.126 127.000 0.019 1.000   NA
 5892239 5892240 ECIAI39_3680 ECIAI39_3681 rpmA rplU TRUE 0.996 21.000 0.667 0.009 Y NA
 5892241 5892242 ECIAI39_3682 ECIAI39_3683 ispB sfsB FALSE 0.015 228.000 0.000 1.000 N NA
 5892243 5892244 ECIAI39_3684 ECIAI39_3685 murA yrbA TRUE 0.638 55.000 0.258 NA N NA
 5892244 5892245 ECIAI39_3685 ECIAI39_3686 yrbA yrbB FALSE 0.454 160.000 0.453 NA   NA
 5892245 5892246 ECIAI39_3686 ECIAI39_3687 yrbB yrbC TRUE 0.985 0.000 0.308 NA   NA
 5892246 5892247 ECIAI39_3687 ECIAI39_3688 yrbC yrbD TRUE 0.874 19.000 0.188 NA   NA
 5892247 5892248 ECIAI39_3688 ECIAI39_3689 yrbD yrbE TRUE 0.987 5.000 0.562 NA   NA
 5892248 5892249 ECIAI39_3689 ECIAI39_3690 yrbE yrbF TRUE 0.995 8.000 0.530 NA Y NA
 5892250 5892251 ECIAI39_3691 ECIAI39_3692 yrbG kdsD TRUE 0.891 14.000 0.226 1.000 N NA
 5892251 5892252 ECIAI39_3692 ECIAI39_3693 kdsD kdsC TRUE 0.970 21.000 0.598 1.000   NA
 5892252 5892253 ECIAI39_3693 ECIAI39_3694 kdsC yrbK TRUE 0.995 -3.000 0.617 NA   NA
 5892253 5892254 ECIAI39_3694 ECIAI39_3695 yrbK lptA TRUE 0.969 -31.000 0.459 NA   NA
 5892254 5892255 ECIAI39_3695 ECIAI39_3696 lptA lptB TRUE 0.985 7.000 0.543 NA   NA
 5892255 5892256 ECIAI39_3696 ECIAI39_3697 lptB rpoN TRUE 0.666 48.000 0.163 1.000   NA
 5892256 5892257 ECIAI39_3697 ECIAI39_3698 rpoN yhbH TRUE 0.971 23.000 0.820 NA N NA
 5892257 5892258 ECIAI39_3698 ECIAI39_3699 yhbH ptsN TRUE 0.763 118.000 0.728 NA N NA
 5892258 5892259 ECIAI39_3699 ECIAI39_3700 ptsN yhbJ TRUE 0.696 46.000 0.186 NA   NA
 5892259 5892260 ECIAI39_3700 ECIAI39_3701 yhbJ npr TRUE 0.975 -3.000 0.182 NA   NA
 5892260 5892261 ECIAI39_3701 ECIAI39_3702 npr yrbL FALSE 0.030 213.000 0.000 NA   NA
 5892262 5892263 ECIAI39_3703 ECIAI39_3704 mtgA elbB TRUE 0.940 -3.000 0.066 NA   NA
 5892265 5892266 ECIAI39_3705 ECIAI39_3706 arcB yhcC FALSE 0.363 96.000 0.113 1.000   NA
 5892267 5892268 ECIAI39_3707 ECIAI39_3708 gltB gltD TRUE 0.986 13.000 0.096 0.000 Y NA
 5892268 5892269 ECIAI39_3708 ECIAI39_3709 gltD yhcG FALSE 0.070 169.000 0.000 NA   NA
 5892270 5892271 ECIAI39_3710 ECIAI39_3711 yhcH nanK TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 5892271 5892272 ECIAI39_3711 ECIAI39_3712 nanK nanE TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5892272 5892273 ECIAI39_3712 ECIAI39_3713 nanE nanT TRUE 0.837 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5892273 5892274 ECIAI39_3713 ECIAI39_3714 nanT nanA TRUE 0.528 109.000 0.318 1.000 N NA
 5892274 5892275 ECIAI39_3714 ECIAI39_3715 nanA nanR FALSE 0.167 122.000 0.091 1.000 N NA
 5892277 5892278 ECIAI39_3717 ECIAI39_3718 sspB sspA TRUE 0.993 6.000 0.831 NA   NA
 5892278 5892279 ECIAI39_3718 ECIAI39_3719 sspA   FALSE 0.015 270.000 0.000 NA   NA
 5892279 5892280 ECIAI39_3719 ECIAI39_3720   rpsI FALSE 0.050 155.000 0.003 NA   NA
 5892280 5892281 ECIAI39_3720 ECIAI39_3721 rpsI rplM TRUE 0.996 16.000 0.601 0.009 Y NA
 5892281 5892282 ECIAI39_3721 ECIAI39_3722 rplM yhcM FALSE 0.015 219.000 0.003 NA   NA
 5892283 5892284 ECIAI39_3723 ECIAI39_3724 yhcB degQ FALSE 0.182 154.000 0.154 NA   NA
 5892284 5892285 ECIAI39_3724 ECIAI39_3725 degQ degS TRUE 0.935 90.000 0.262 0.001 Y NA
 5892285 5892286 ECIAI39_3725 ECIAI39_3726 degS insG FALSE 0.138 104.000 0.000 1.000 N NA
 5892288 5892289 ECIAI39_3728 ECIAI39_3729 argR yhcN FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 5892290 5892291 ECIAI39_3730 ECIAI39_3731 yhcO aaeB FALSE 0.180 92.000 0.027 NA   NA
 5892291 5892292 ECIAI39_3731 ECIAI39_3732 aaeB aaeA TRUE 0.990 6.000 0.667 NA   NA
 5892292 5892293 ECIAI39_3732 ECIAI39_3733 aaeA aaeX TRUE 0.891 8.000 0.100 NA   NA
 5892295 5892296 ECIAI39_3735 ECIAI39_3736 tldD   FALSE 0.221 98.000 0.000 NA   NA
 5892296 5892297 ECIAI39_3736 ECIAI39_3737     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5892297 5892298 ECIAI39_3737 ECIAI39_3738   yhdP FALSE 0.132 136.000 0.000 NA   NA
 5892298 5892299 ECIAI39_3738 ECIAI39_3739 yhdP rng TRUE 0.688 68.000 0.296 NA   NA
 5892299 5892300 ECIAI39_3739 ECIAI39_3740 rng yhdE TRUE 0.974 -10.000 0.417 NA N NA
 5892300 5892301 ECIAI39_3740 ECIAI39_3741 yhdE mreD TRUE 0.914 9.000 0.206 NA N NA
 5892301 5892302 ECIAI39_3741 ECIAI39_3742 mreD mreC TRUE 0.999 0.000 0.550 0.001 Y NA
 5892302 5892303 ECIAI39_3742 ECIAI39_3743 mreC mreB TRUE 0.871 66.000 0.689 1.000 N NA
 5892303 5892304 ECIAI39_3743 ECIAI39_3744 mreB csrD FALSE 0.006 305.000 0.000 1.000 N NA
 5892305 5892306 ECIAI39_3745 ECIAI39_3747 yhdH accB FALSE 0.002 978.000 0.000 1.000 N NA
 5892306 5892307 ECIAI39_3747 ECIAI39_3748 accB accC TRUE 0.995 11.000 0.275 0.000 Y NA
 5892308 5892309 ECIAI39_3749 ECIAI39_3750     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5892309 5892310 ECIAI39_3750 ECIAI39_3751     TRUE 0.927 22.000 0.000 NA Y NA
 5892310 5892311 ECIAI39_3751 ECIAI39_3752     TRUE 0.999 1.000 0.818 1.000 Y NA
 5892311 5892312 ECIAI39_3752 ECIAI39_3753     TRUE 0.990 61.000 0.900 0.002 Y NA
 5892312 5892313 ECIAI39_3753 ECIAI39_3754     TRUE 0.904 30.000 0.000 1.000 Y NA
 5892314 5892315 ECIAI39_3755 ECIAI39_3756     TRUE 0.966 -43.000 0.150 NA Y NA
 5892315 5892316 ECIAI39_3756 ECIAI39_3757   yhdT FALSE 0.232 94.000 0.000 NA   NA
 5892316 5892317 ECIAI39_3757 ECIAI39_3758 yhdT panF TRUE 0.991 -10.000 0.682 NA   NA
 5892317 5892318 ECIAI39_3758 ECIAI39_3759 panF prmA TRUE 0.607 12.000 0.041 1.000 N NA
 5892318 5892319 ECIAI39_3759 ECIAI39_3760 prmA dusB FALSE 0.053 329.000 0.042 1.000 Y NA
 5892319 5892320 ECIAI39_3760 ECIAI39_3761 dusB fis TRUE 0.738 26.000 0.161 1.000 N NA
 5892320 5892321 ECIAI39_3761 ECIAI39_3762 fis yhdJ TRUE 0.652 86.000 0.016 1.000 Y NA
 5892321 5892322 ECIAI39_3762 ECIAI39_3763 yhdJ yhdU FALSE 0.420 84.000 0.143 NA   NA
 5892324 5892325 ECIAI39_3765 ECIAI39_3766 acrE acrF TRUE 0.771 12.000 0.000 NA   NA
 5892325 5892326 ECIAI39_3766 ECIAI39_3767 acrF acrF TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5892326 5892327 ECIAI39_3767 ECIAI39_3768 acrF yhdV FALSE 0.019 253.000 0.000 NA   NA
 5892327 5892328 ECIAI39_3768 ECIAI39_3769 yhdV aapJ FALSE 0.004 539.000 0.000 NA   NA
 5892328 5892329 ECIAI39_3769 ECIAI39_3770 aapJ aapQ TRUE 0.972 68.000 0.548 0.041 Y NA
 5892329 5892330 ECIAI39_3770 ECIAI39_3771 aapQ aapM TRUE 0.999 10.000 0.815 0.013 Y NA
 5892330 5892331 ECIAI39_3771 ECIAI39_3772 aapM aapP TRUE 0.997 8.000 0.734 1.000 Y NA
 5892332 5892333 ECIAI39_5S_2 ECIAI39_tRNA47     FALSE 0.484 41.000 0.000 NA   NA
 5892333 5892334 ECIAI39_tRNA47 ECIAI39_5S_1     TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5892334 5892335 ECIAI39_5S_1 ECIAI39_23S_1     FALSE 0.218 100.000 0.000 NA   NA
 5892335 5892336 ECIAI39_23S_1 ECIAI39_tRNA46     FALSE 0.064 175.000 0.000 NA   NA
 5892336 5892337 ECIAI39_tRNA46 ECIAI39_tRNA45     FALSE 0.466 43.000 0.000 NA   NA
 5892337 5892338 ECIAI39_tRNA45 ECIAI39_16S_1     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 5892340 5892341 ECIAI39_3775 ECIAI39_3776 aroE yrdC TRUE 0.826 5.000 0.087 NA N NA
 5892341 5892342 ECIAI39_3776 ECIAI39_3777 yrdC yrdD TRUE 0.882 5.000 0.137 NA N NA
 5892342 5892343 ECIAI39_3777 ECIAI39_3778 yrdD smg TRUE 0.892 29.000 0.331 NA   NA
 5892343 5892344 ECIAI39_3778 ECIAI39_3779 smg smf TRUE 0.780 -28.000 0.000 NA   NA
 5892344 5892345 ECIAI39_3779 ECIAI39_3780 smf smf TRUE 0.519 37.000 0.000 NA   NA
 5892346 5892347 ECIAI39_3781 ECIAI39_3782 def fmt TRUE 0.975 15.000 0.058 0.013 Y NA
 5892347 5892348 ECIAI39_3782 ECIAI39_3783 fmt rsmB TRUE 0.945 46.000 0.305 1.000 Y NA
 5892348 5892349 ECIAI39_3783 ECIAI39_3784 rsmB trkA TRUE 0.719 22.000 0.122 1.000 N NA
 5892349 5892350 ECIAI39_3784 ECIAI39_3785 trkA mscL FALSE 0.064 130.000 0.035 1.000 N NA
 5892351 5892352 ECIAI39_3786 ECIAI39_3787 yhdL zntR TRUE 0.667 56.000 0.219 NA   NA
 5892352 5892353 ECIAI39_3787 ECIAI39_3788 zntR yhdN TRUE 0.854 11.000 0.095 NA   NA
 5892353 5892354 ECIAI39_3788 ECIAI39_3789 yhdN rplQ FALSE 0.131 107.000 0.012 NA   NA
 5892354 5892355 ECIAI39_3789 ECIAI39_3790 rplQ rpoA TRUE 0.951 41.000 0.873 1.000 N NA
 5892355 5892356 ECIAI39_3790 ECIAI39_3791 rpoA rpsD TRUE 0.942 26.000 0.549 1.000 N NA
 5892356 5892357 ECIAI39_3791 ECIAI39_3792 rpsD rpsK TRUE 0.990 34.000 0.509 0.012 Y NA
 5892357 5892358 ECIAI39_3792 ECIAI39_3793 rpsK rpsM TRUE 0.997 17.000 0.810 0.009 Y NA
 5892358 5892359 ECIAI39_3793 ECIAI39_misc_RNA_87 rpsM   TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5892359 5892360 ECIAI39_misc_RNA_87 ECIAI39_3794   secY FALSE 0.029 216.000 0.000 NA   NA
 5892360 5892361 ECIAI39_3794 ECIAI39_3795 secY rplO TRUE 0.988 8.000 0.730 1.000 N NA
 5892361 5892362 ECIAI39_3795 ECIAI39_3796 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.001 Y NA
 5892362 5892363 ECIAI39_3796 ECIAI39_3797 rpmD rpsE TRUE 0.999 4.000 0.789 0.012 Y NA
 5892363 5892364 ECIAI39_3797 ECIAI39_3798 rpsE rplR TRUE 0.998 15.000 0.814 0.012 Y NA
 5892364 5892365 ECIAI39_3798 ECIAI39_3799 rplR rplF TRUE 0.999 10.000 0.815 0.009 Y NA
 5892365 5892366 ECIAI39_3799 ECIAI39_3800 rplF rpsH TRUE 0.998 13.000 0.808 0.009 Y NA
 5892366 5892367 ECIAI39_3800 ECIAI39_3801 rpsH rpsN TRUE 0.989 34.000 0.473 0.009 Y NA
 5892367 5892368 ECIAI39_3801 ECIAI39_3802 rpsN rplE TRUE 0.995 15.000 0.496 0.009 Y NA
 5892368 5892369 ECIAI39_3802 ECIAI39_3803 rplE rplX TRUE 0.997 15.000 0.758 0.009 Y NA
 5892369 5892370 ECIAI39_3803 ECIAI39_3804 rplX rplN TRUE 0.998 11.000 0.810 0.012 Y NA
 5892370 5892371 ECIAI39_3804 ECIAI39_3805 rplN rpsQ TRUE 0.922 165.000 0.791 0.012 Y NA
 5892371 5892372 ECIAI39_3805 ECIAI39_3806 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.009 Y NA
 5892372 5892373 ECIAI39_3806 ECIAI39_3807 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009 Y NA
 5892373 5892374 ECIAI39_3807 ECIAI39_3808 rplP rpsC TRUE 0.998 13.000 0.828 0.012 Y NA
 5892374 5892375 ECIAI39_3808 ECIAI39_3809 rpsC rplV TRUE 0.997 18.000 0.719 0.012 Y NA
 5892375 5892376 ECIAI39_3809 ECIAI39_3810 rplV rpsS TRUE 0.997 15.000 0.769 0.012 Y NA
 5892376 5892377 ECIAI39_3810 ECIAI39_3811 rpsS rplB TRUE 0.997 17.000 0.820 0.012 Y NA
 5892377 5892378 ECIAI39_3811 ECIAI39_3812 rplB rplW TRUE 0.998 18.000 0.849 0.012 Y NA
 5892378 5892379 ECIAI39_3812 ECIAI39_3813 rplW rplD TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 5892379 5892380 ECIAI39_3813 ECIAI39_3814 rplD rplC TRUE 0.997 11.000 0.486 0.009 Y NA
 5892380 5892381 ECIAI39_3814 ECIAI39_3815 rplC rpsJ TRUE 0.981 33.000 0.307 0.012 Y NA
 5892383 5892384 ECIAI39_3817 ECIAI39_3818 bfr bfd TRUE 0.685 73.000 0.033 NA Y NA
 5892384 5892385 ECIAI39_3818 ECIAI39_3819 bfd tufA FALSE 0.006 183.000 0.007 NA N NA
 5892385 5892386 ECIAI39_3819 ECIAI39_3820 tufA fusA TRUE 0.967 71.000 0.400 0.001 Y NA
 5892386 5892387 ECIAI39_3820 ECIAI39_3821 fusA rpsG TRUE 0.935 97.000 0.579 1.000 Y NA
 5892387 5892388 ECIAI39_3821 ECIAI39_3822 rpsG rpsL TRUE 0.972 97.000 0.620 0.002 Y NA
 5892388 5892389 ECIAI39_3822 ECIAI39_3823 rpsL tusB FALSE 0.085 126.000 0.058 NA N NA
 5892389 5892390 ECIAI39_3823 ECIAI39_3824 tusB tusC TRUE 0.997 8.000 0.804 NA Y NA
 5892390 5892391 ECIAI39_3824 ECIAI39_3825 tusC tusD TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 5892391 5892392 ECIAI39_3825 ECIAI39_3826 tusD yheO TRUE 0.977 0.000 0.220 NA   NA
 5892392 5892393 ECIAI39_3826 ECIAI39_3827 yheO fkpA FALSE 0.301 167.000 0.310 NA   NA
 5892395 5892396 ECIAI39_3829 ECIAI39_3830 slyD yheV TRUE 0.676 95.000 0.370 NA   NA
 5892396 5892397 ECIAI39_3830 ECIAI39_3831 yheV kefB TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5892397 5892398 ECIAI39_3831 ECIAI39_3832 kefB kefB TRUE 0.668 22.000 0.000 NA   NA
 5892398 5892399 ECIAI39_3832 ECIAI39_3833 kefB kefG TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5892400 5892401 ECIAI39_3835 ECIAI39_3836 yheS yheT TRUE 0.878 0.000 0.016 NA   NA
 5892401 5892402 ECIAI39_3836 ECIAI39_3837 yheT yheU TRUE 0.970 -6.000 0.222 NA   NA
 5892402 5892403 ECIAI39_3837 ECIAI39_3838 yheU prkB TRUE 0.761 54.000 0.303 NA   NA
 5892404 5892405 ECIAI39_3839 ECIAI39_misc_RNA_88 yhfA crpTic TRUE 0.735 15.000 0.000 NA   NA
 5892406 5892407 ECIAI39_3840 ECIAI39_3841   crp TRUE 0.766 7.000 0.016 NA   NA
 5892407 5892408 ECIAI39_3841 ECIAI39_3842 crp yhfK TRUE 0.632 39.000 0.111 NA   NA
 5892409 5892410 ECIAI39_3843 ECIAI39_3844 argD pabA TRUE 0.855 85.000 0.088 0.010 Y NA
 5892410 5892411 ECIAI39_3844 ECIAI39_3845 pabA fic FALSE 0.224 32.000 0.008 1.000 N NA
 5892411 5892412 ECIAI39_3845 ECIAI39_3846 fic yhfG TRUE 0.860 -10.000 0.000 NA   NA
 5892412 5892413 ECIAI39_3846 ECIAI39_3847 yhfG ppiA TRUE 0.649 105.000 0.364 NA   NA
 5892414 5892415 ECIAI39_3848 ECIAI39_3849 tsgA nirB FALSE 0.008 262.000 0.000 NA N NA
 5892415 5892416 ECIAI39_3849 ECIAI39_3850 nirB nirD TRUE 0.998 -3.000 0.829 0.000 N NA
 5892416 5892417 ECIAI39_3850 ECIAI39_3851 nirD nirC TRUE 0.789 126.000 0.283 1.000 Y NA
 5892417 5892418 ECIAI39_3851 ECIAI39_3852 nirC cysG TRUE 0.581 19.000 0.000 1.000 N NA
 5892418 5892419 ECIAI39_3852 ECIAI39_3853 cysG yhfL FALSE 0.019 251.000 0.000 NA   NA
 5892420 5892421 ECIAI39_3854 ECIAI39_3855 yhfS yhfT TRUE 0.907 12.000 0.185 NA   NA
 5892421 5892422 ECIAI39_3855 ECIAI39_3856 yhfT yhfU TRUE 0.987 12.000 0.828 NA   NA
 5892422 5892423 ECIAI39_3856 ECIAI39_3857 yhfU php TRUE 0.959 11.000 0.312 1.000   NA
 5892423 5892424 ECIAI39_3857 ECIAI39_3858 php yhfW TRUE 0.960 -3.000 0.094 1.000   NA
 5892424 5892425 ECIAI39_3858 ECIAI39_3859 yhfW yhfX TRUE 0.993 0.000 0.625 NA N NA
 5892425 5892426 ECIAI39_3859 ECIAI39_3860 yhfX yhfY TRUE 0.574 84.000 0.233 NA   NA
 5892426 5892427 ECIAI39_3860 ECIAI39_3861 yhfY yhfZ TRUE 0.970 17.000 0.562 NA   NA
 5892427 5892428 ECIAI39_3861 ECIAI39_3862 yhfZ trpS FALSE 0.046 160.000 0.004 NA   NA
 5892428 5892429 ECIAI39_3862 ECIAI39_3863 trpS gph TRUE 0.941 -7.000 0.118 1.000   NA
 5892429 5892430 ECIAI39_3863 ECIAI39_3864 gph rpe TRUE 0.942 -7.000 0.120 1.000   NA
 5892430 5892431 ECIAI39_3864 ECIAI39_3865 rpe dam TRUE 0.519 18.000 0.040 1.000 N NA
 5892431 5892432 ECIAI39_3865 ECIAI39_3866 dam damX TRUE 0.501 107.000 0.234 NA   NA
 5892432 5892433 ECIAI39_3866 ECIAI39_3867 damX aroB FALSE 0.170 92.000 0.022 NA   NA
 5892433 5892434 ECIAI39_3867 ECIAI39_3868 aroB aroK TRUE 0.891 57.000 0.208 1.000 Y NA
 5892434 5892435 ECIAI39_3868 ECIAI39_3869 aroK hofQ FALSE 0.025 401.000 0.319 1.000 N NA
 5892435 5892436 ECIAI39_3869 ECIAI39_3870 hofQ yrfA TRUE 0.721 -88.000 0.072 NA   NA
 5892436 5892437 ECIAI39_3870 ECIAI39_3871 yrfA yrfB TRUE 0.982 -10.000 0.444 NA   NA
 5892437 5892438 ECIAI39_3871 ECIAI39_3872 yrfB yrfC TRUE 0.969 -16.000 0.348 NA   NA
 5892438 5892439 ECIAI39_3872 ECIAI39_3873 yrfC yrfD TRUE 0.997 0.000 0.870 NA   NA
 5892442 5892443 ECIAI39_3876 ECIAI39_3877 igaA yrfG FALSE 0.492 65.000 0.122 1.000   NA
 5892443 5892444 ECIAI39_3877 ECIAI39_3878 yrfG hslR TRUE 0.823 11.000 0.056 1.000   NA
 5892444 5892445 ECIAI39_3878 ECIAI39_3879 hslR hslO TRUE 0.716 25.000 0.140 1.000 N NA
 5892447 5892448 ECIAI39_3881 ECIAI39_3882 pck   FALSE 0.189 115.000 0.000 NA   NA
 5892448 5892449 ECIAI39_3882 ECIAI39_3883     TRUE 0.687 59.000 0.250 NA   NA
 5892450 5892451 ECIAI39_3884 ECIAI39_3885 envZ ompR TRUE 0.999 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 5892452 5892453 ECIAI39_3886 ECIAI39_3887 greB yhgF TRUE 0.737 97.000 0.123 1.000 Y NA
 5892453 5892454 ECIAI39_3887 ECIAI39_3888 yhgF feoA FALSE 0.003 438.000 0.000 1.000 N NA
 5892454 5892455 ECIAI39_3888 ECIAI39_3889 feoA feoB TRUE 0.970 17.000 0.177 1.000 Y NA
 5892455 5892456 ECIAI39_3889 ECIAI39_3890 feoB yhgG TRUE 0.991 0.000 0.455 NA   NA
 5892456 5892457 ECIAI39_3890 ECIAI39_3891 yhgG yhgA FALSE 0.038 203.000 0.000 NA   NA
 5892459 5892460 ECIAI39_3894 ECIAI39_3895 gntX gntY FALSE 0.411 59.000 0.066 1.000   NA
 5892460 5892461 ECIAI39_3895 ECIAI39_3896 gntY gntT FALSE 0.009 352.000 0.000 1.000   NA
 5892462 5892463 ECIAI39_3897 ECIAI39_3898 malQ malP TRUE 0.989 10.000 0.137 0.015 Y NA
 5892465 5892466 ECIAI39_3900 ECIAI39_3901 rtcA rtcB TRUE 0.902 4.000 0.081 NA   NA
 5892468 5892469 ECIAI39_3903 ECIAI39_3904 glpR glpG TRUE 0.893 17.000 0.190 1.000   NA
 5892469 5892470 ECIAI39_3904 ECIAI39_3905 glpG glpE TRUE 0.876 45.000 0.405 1.000   NA
 5892472 5892473 ECIAI39_3907 ECIAI39_3908     TRUE 0.912 26.000 0.000 NA Y NA
 5892473 5892474 ECIAI39_3908 ECIAI39_3909   glgP FALSE 0.032 117.000 0.016 NA N NA
 5892474 5892475 ECIAI39_3909 ECIAI39_3910 glgP glgA TRUE 0.974 19.000 0.228 1.000 Y NA
 5892475 5892476 ECIAI39_3910 ECIAI39_3911 glgA glgC TRUE 0.996 0.000 0.307 1.000 Y NA
 5892476 5892477 ECIAI39_3911 ECIAI39_3912 glgC glgX TRUE 0.976 18.000 0.228 1.000 Y NA
 5892477 5892478 ECIAI39_3912 ECIAI39_3913 glgX glgB TRUE 0.995 -3.000 0.020 0.001 Y NA
 5892478 5892479 ECIAI39_3913 ECIAI39_3914 glgB asd FALSE 0.009 273.000 0.000 1.000 N NA
 5892481 5892482 ECIAI39_3916 ECIAI39_3917     TRUE 0.972 -93.000 0.233 1.000 Y NA
 5892482 5892483 ECIAI39_3917 ECIAI39_3918   gntU FALSE 0.076 140.000 0.000 1.000 N NA
 5892483 5892484 ECIAI39_3918 ECIAI39_3919 gntU gntK TRUE 0.979 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5892484 5892485 ECIAI39_3919 ECIAI39_3920 gntK gntR FALSE 0.078 139.000 0.000 1.000 N NA
 5892485 5892486 ECIAI39_3920 ECIAI39_3921 gntR yhhW FALSE 0.026 224.000 0.000 NA   NA
 5892486 5892487 ECIAI39_3921 ECIAI39_3922 yhhW yhhX TRUE 0.611 123.000 0.400 NA   NA
 5892487 5892488 ECIAI39_3922 ECIAI39_misc_RNA_89 yhhX ryhB FALSE 0.170 122.000 0.000 NA   NA
 5892489 5892490 ECIAI39_3923 ECIAI39_3924 yhhY yhhZ FALSE 0.022 236.000 0.000 NA   NA
 5892490 5892491 ECIAI39_3924 ECIAI39_3925 yhhZ yrhA TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5892491 5892492 ECIAI39_3925 ECIAI39_3926 yrhA yrhB FALSE 0.005 450.000 0.000 NA   NA
 5892495 5892496 ECIAI39_3929 ECIAI39_3930 ugpQ ugpC TRUE 0.921 -3.000 0.080 1.000 N NA
 5892496 5892497 ECIAI39_3930 ECIAI39_3931 ugpC ugpE TRUE 0.997 2.000 0.272 0.041 Y NA
 5892497 5892498 ECIAI39_3931 ECIAI39_3932 ugpE ugpA TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.041 Y NA
 5892498 5892499 ECIAI39_3932 ECIAI39_3933 ugpA ugpB TRUE 0.974 98.000 0.793 0.041 Y NA
 5892499 5892500 ECIAI39_3933 ECIAI39_3934 ugpB   FALSE 0.009 360.000 0.000 1.000   NA
 5892500 5892501 ECIAI39_3934 ECIAI39_3935   livF FALSE 0.201 119.000 0.000 1.000   NA
 5892501 5892502 ECIAI39_3935 ECIAI39_3936 livF livG TRUE 0.999 2.000 0.967 0.012 Y NA
 5892502 5892503 ECIAI39_3936 ECIAI39_3937 livG livM TRUE 0.999 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 5892503 5892504 ECIAI39_3937 ECIAI39_3938 livM livH TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.041 Y NA
 5892504 5892505 ECIAI39_3938 ECIAI39_3939 livH livK TRUE 0.837 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5892507 5892508 ECIAI39_3941 ECIAI39_3942 livJ rpoH FALSE 0.009 272.000 0.000 1.000 N NA
 5892508 5892509 ECIAI39_3942 ECIAI39_3943 rpoH ftsX FALSE 0.011 245.000 0.051 1.000 N NA
 5892509 5892510 ECIAI39_3943 ECIAI39_3944 ftsX ftsE TRUE 0.987 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 5892510 5892511 ECIAI39_3944 ECIAI39_3945 ftsE ftsY TRUE 0.959 3.000 0.117 0.066 N NA
 5892512 5892513 ECIAI39_3946 ECIAI39_3947 yhhF yhhL TRUE 0.871 -10.000 0.063 NA   NA
 5892515 5892516 ECIAI39_3949 ECIAI39_3950 yhhN zntA TRUE 0.814 74.000 0.325 0.062   NA
 5892518 5892519 ECIAI39_3952 ECIAI39_3953 yhhQ dcrB FALSE 0.310 73.000 0.066 NA   NA
 5892521 5892522 ECIAI39_3955 ECIAI39_3956 yhhT acpT TRUE 0.753 55.000 0.300 NA   NA
 5892522 5892523 ECIAI39_3956 ECIAI39_3957 acpT nikA FALSE 0.126 111.000 0.000 1.000 N NA
 5892523 5892524 ECIAI39_3957 ECIAI39_3958 nikA nikB TRUE 0.999 0.000 0.833 0.051 Y NA
 5892524 5892525 ECIAI39_3958 ECIAI39_3959 nikB nikC TRUE 0.999 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 5892525 5892526 ECIAI39_3959 ECIAI39_3960 nikC nikD TRUE 0.997 0.000 0.409 1.000 Y NA
 5892526 5892527 ECIAI39_3960 ECIAI39_3961 nikD nikE TRUE 0.998 -3.000 0.290 0.066 Y NA
 5892527 5892528 ECIAI39_3961 ECIAI39_3962 nikE nikR TRUE 0.690 5.000 0.031 1.000 N NA
 5892528 5892529 ECIAI39_3962 ECIAI39_3963 nikR   FALSE 0.381 190.000 0.000 0.061 Y NA
 5892529 5892530 ECIAI39_3963 ECIAI39_3964     TRUE 0.733 25.000 0.150 1.000 N NA
 5892530 5892531 ECIAI39_3964 ECIAI39_3965     TRUE 0.998 -3.000 0.231 0.010 Y NA
 5892531 5892532 ECIAI39_3965 ECIAI39_3966     TRUE 0.982 44.000 0.444 0.014 Y NA
 5892532 5892533 ECIAI39_3966 ECIAI39_3967     TRUE 0.993 -7.000 0.273 1.000 Y NA
 5892533 5892534 ECIAI39_3967 ECIAI39_3968     TRUE 0.977 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 5892534 5892535 ECIAI39_3968 ECIAI39_3969     TRUE 0.977 32.000 0.429 1.000 Y NA
 5892536 5892537 ECIAI39_3970 ECIAI39_3971   yhhJ FALSE 0.009 345.000 0.000 1.000   NA
 5892537 5892538 ECIAI39_3971 ECIAI39_3972 yhhJ rbbA TRUE 0.997 0.000 0.500 0.004   NA
 5892538 5892539 ECIAI39_3972 ECIAI39_3973 rbbA yhiI TRUE 0.972 -3.000 0.049 0.076   NA
 5892539 5892540 ECIAI39_3973 ECIAI39_3974 yhiI yhiJ FALSE 0.007 366.000 0.000 NA   NA
 5892542 5892543 ECIAI39_3976 ECIAI39_3977     TRUE 0.666 -109.000 0.000 NA   NA
 5892543 5892544 ECIAI39_3977 ECIAI39_3979     FALSE 0.150 129.000 0.000 NA   NA
 5892546 5892547 ECIAI39_3980 ECIAI39_3981   yhiN FALSE 0.022 235.000 0.000 NA   NA
 5892550 5892551 ECIAI39_3985 ECIAI39_3986 uspA yhiP FALSE 0.006 316.000 0.000 1.000 N NA
 5892552 5892553 ECIAI39_3987 ECIAI39_3988 yhiQ prlC TRUE 0.889 8.000 0.098 NA   NA
 5892554 5892555 ECIAI39_3989 ECIAI39_3990 yhiR gor FALSE 0.421 72.000 0.100 1.000   NA
 5892557 5892558 ECIAI39_3992 ECIAI39_3993   arsR FALSE 0.004 538.000 0.000 NA   NA
 5892558 5892559 ECIAI39_3993 ECIAI39_3994 arsR arsB FALSE 0.258 55.000 0.000 1.000 N NA
 5892559 5892560 ECIAI39_3994 ECIAI39_3995 arsB arsC TRUE 0.955 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5892562 5892563 ECIAI39_3997 ECIAI39_3998     FALSE 0.004 581.000 0.000 NA   NA
 5892563 5892564 ECIAI39_3998 ECIAI39_3999   slp FALSE 0.020 246.000 0.000 NA   NA
 5892564 5892565 ECIAI39_3999 ECIAI39_4000 slp yhiF FALSE 0.057 153.000 0.000 1.000 N NA
 5892566 5892567 ECIAI39_4001 ECIAI39_4002 chuS chuA TRUE 0.834 49.000 0.056 1.000 Y NA
 5892568 5892569 ECIAI39_4003 ECIAI39_4004   chuT FALSE 0.005 509.000 0.000 NA   NA
 5892569 5892570 ECIAI39_4004 ECIAI39_4005 chuT   FALSE 0.344 20.000 0.010 1.000 N NA
 5892570 5892571 ECIAI39_4005 ECIAI39_4006     TRUE 0.812 13.000 0.135 1.000 N NA
 5892571 5892572 ECIAI39_4006 ECIAI39_4007     TRUE 0.874 0.000 0.054 1.000 N NA
 5892572 5892573 ECIAI39_4007 ECIAI39_4008   chuU FALSE 0.145 49.000 0.010 1.000 N NA
 5892573 5892574 ECIAI39_4008 ECIAI39_4009 chuU chuV TRUE 0.980 -33.000 0.220 1.000 Y NA
 5892575 5892576 ECIAI39_4010 ECIAI39_4011 yhiD hdeB FALSE 0.322 64.000 0.000 NA   NA
 5892576 5892577 ECIAI39_4011 ECIAI39_4012 hdeB hdeA FALSE 0.186 116.000 0.000 NA   NA
 5892578 5892579 ECIAI39_4013 ECIAI39_4014 hdeD gadE FALSE 0.003 798.000 0.000 NA   NA
 5892579 5892580 ECIAI39_4014 ECIAI39_4015 gadE mdtE FALSE 0.010 338.000 0.000 1.000   NA
 5892580 5892581 ECIAI39_4015 ECIAI39_4016 mdtE mdtF TRUE 0.508 25.000 0.000 1.000 N NA
 5892584 5892585 ECIAI39_4019 ECIAI39_4020 gadX gadA FALSE 0.004 369.000 0.000 1.000 N NA
 5892585 5892586 ECIAI39_4020 ECIAI39_4021 gadA yhjA FALSE 0.019 211.000 0.000 1.000 N NA
 5892589 5892590 ECIAI39_4024 ECIAI39_4025 yhjC yhjD TRUE 0.563 49.000 0.098 1.000   NA
 5892590 5892591 ECIAI39_4025 ECIAI39_4026 yhjD yhjE FALSE 0.007 392.000 0.000 1.000   NA
 5892592 5892593 ECIAI39_4027 ECIAI39_4028 yhjG yhjH FALSE 0.210 55.000 0.000 NA N NA
 5892595 5892596 ECIAI39_4030 ECIAI39_4031 yhjJ dctA FALSE 0.044 220.000 0.088 1.000   NA
 5892596 5892597 ECIAI39_4031 ECIAI39_4032 dctA yhjK FALSE 0.235 183.000 0.229 0.076 N NA
 5892597 5892598 ECIAI39_4032 ECIAI39_4033 yhjK bcsC FALSE 0.163 121.000 0.088 1.000 N NA
 5892598 5892599 ECIAI39_4033 ECIAI39_4034 bcsC bcsZ TRUE 0.939 -18.000 0.263 1.000 N NA
 5892599 5892600 ECIAI39_4034 ECIAI39_4035 bcsZ bcsB TRUE 0.865 7.000 0.000 1.000   NA
 5892600 5892601 ECIAI39_4035 ECIAI39_4036 bcsB bcsA TRUE 0.945 11.000 0.000 0.001   NA
 5892601 5892602 ECIAI39_4036 ECIAI39_4038 bcsA   TRUE 0.982 -10.000 0.545 NA N NA
 5892602 5892603 ECIAI39_4038 ECIAI39_4039   yhjR TRUE 0.970 12.000 0.464 NA   NA
 5892604 5892605 ECIAI39_4040 ECIAI39_4041 bcsE bcsF TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5892605 5892606 ECIAI39_4041 ECIAI39_4042 bcsF bcsG TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5892606 5892607 ECIAI39_4042 ECIAI39_4043 bcsG insG FALSE 0.411 50.000 0.000 NA   NA
 5892607 5892608 ECIAI39_4043 ECIAI39_4044 insG bcsG TRUE 0.718 17.000 0.000 NA   NA
 5892608 5892609 ECIAI39_4044 ECIAI39_misc_RNA_91 bcsG rdlC FALSE 0.003 727.000 0.000 NA   NA
 5892609 5892610 ECIAI39_misc_RNA_91 ECIAI39_misc_RNA_92 rdlC rdlD FALSE 0.006 421.000 0.000 NA   NA
 5892613 5892614 ECIAI39_4049 ECIAI39_4050 dppF dppD TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 5892614 5892615 ECIAI39_4050 ECIAI39_4051 dppD dppC TRUE 0.994 11.000 0.560 1.000 Y NA
 5892615 5892616 ECIAI39_4051 ECIAI39_4052 dppC dppB TRUE 0.998 10.000 0.779 0.041 Y NA
 5892616 5892617 ECIAI39_4052 ECIAI39_4053 dppB dppA TRUE 0.625 151.000 0.087 0.041 Y NA
 5892617 5892618 ECIAI39_4053 ECIAI39_tRNA44 dppA   FALSE 0.003 744.000 0.000 NA   NA
 5892618 5892619 ECIAI39_tRNA44 ECIAI39_4054   eptB FALSE 0.240 92.000 0.000 NA   NA
 5892619 5892620 ECIAI39_4054 ECIAI39_4055 eptB yhjX FALSE 0.025 324.000 0.000 0.061   NA
 5892620 5892621 ECIAI39_4055 ECIAI39_4056 yhjX yhjY FALSE 0.014 229.000 0.000 1.000 N NA
 5892622 5892623 ECIAI39_4057 ECIAI39_4058 tag yiaC TRUE 0.923 -3.000 0.028 1.000   NA
 5892625 5892626 ECIAI39_4060 ECIAI39_4061 yiaD tiaE FALSE 0.138 104.000 0.000 1.000 N NA
 5892628 5892629 ECIAI39_4063 ECIAI39_4064 yiaG cspA FALSE 0.088 281.000 0.000 1.000 Y NA
 5892630 5892631 ECIAI39_4065 ECIAI39_4066 insK insJ TRUE 0.999 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 5892631 5892632 ECIAI39_4066 ECIAI39_4067 insJ glyS FALSE 0.007 299.000 0.000 1.000 N NA
 5892632 5892633 ECIAI39_4067 ECIAI39_4068 glyS glyQ TRUE 0.998 10.000 0.651 0.000 Y NA
 5892633 5892634 ECIAI39_4068 ECIAI39_4069 glyQ ysaB FALSE 0.143 95.000 0.010 NA   NA
 5892636 5892637 ECIAI39_4071 ECIAI39_4072     TRUE 0.974 -3.000 0.000 0.072   NA
 5892639 5892640 ECIAI39_4074 ECIAI39_4075 yiaA yiaB FALSE 0.186 116.000 0.000 NA   NA
 5892640 5892641 ECIAI39_4075 ECIAI39_4076 yiaB xylB FALSE 0.156 127.000 0.000 NA   NA
 5892641 5892642 ECIAI39_4076 ECIAI39_4077 xylB xylA TRUE 0.708 72.000 0.034 1.000 Y NA
 5892643 5892644 ECIAI39_4078 ECIAI39_4079 xylF xylG TRUE 0.935 78.000 0.518 NA Y NA
 5892644 5892645 ECIAI39_4079 ECIAI39_4080 xylG xylH TRUE 0.993 -22.000 0.469 1.000 Y NA
 5892645 5892646 ECIAI39_4080 ECIAI39_4081 xylH xylR FALSE 0.361 78.000 0.146 1.000 N NA
 5892648 5892649 ECIAI39_4083 ECIAI39_4084 malS avtA FALSE 0.056 178.000 0.085 1.000 N NA
 5892650 5892651 ECIAI39_4085 ECIAI39_4086 yiaI yiaJ TRUE 0.631 102.000 0.400 1.000 N NA
 5892652 5892653 ECIAI39_4087 ECIAI39_4088 yiaK yiaL TRUE 0.604 12.000 0.000 NA N NA
 5892653 5892654 ECIAI39_4088 ECIAI39_4089 yiaL yiaM TRUE 0.579 118.000 0.000 NA Y NA
 5892654 5892655 ECIAI39_4089 ECIAI39_4090 yiaM yiaN TRUE 0.999 3.000 0.864 NA Y NA
 5892655 5892656 ECIAI39_4090 ECIAI39_4091 yiaN yiaO TRUE 0.955 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5892656 5892657 ECIAI39_4091 ECIAI39_4092 yiaO lyxK TRUE 0.979 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5892657 5892658 ECIAI39_4092 ECIAI39_4093 lyxK sgbH TRUE 0.999 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 5892658 5892659 ECIAI39_4093 ECIAI39_4094 sgbH sgbU TRUE 0.995 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 5892659 5892660 ECIAI39_4094 ECIAI39_4095 sgbU sgbE TRUE 0.992 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 5892662 5892663 ECIAI39_4097 ECIAI39_4098     TRUE 0.754 -37.000 0.000 NA   NA
 5892663 5892664 ECIAI39_4098 ECIAI39_4099     FALSE 0.466 43.000 0.000 NA   NA
 5892667 5892668 ECIAI39_4102 ECIAI39_4103 yiaV yiaW TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5892670 5892671 ECIAI39_4105 ECIAI39_4106 aldB   FALSE 0.232 108.000 0.000 1.000   NA
 5892671 5892672 ECIAI39_4106 ECIAI39_4107   yiaY FALSE 0.074 175.000 0.000 1.000   NA
 5892672 5892673 ECIAI39_4107 ECIAI39_4108 yiaY selB FALSE 0.013 191.000 0.015 1.000 N NA
 5892673 5892674 ECIAI39_4108 ECIAI39_4109 selB selA TRUE 0.997 -3.000 0.569 0.000 N NA
 5892674 5892675 ECIAI39_4109 ECIAI39_4110 selA yibF FALSE 0.221 98.000 0.000 NA   NA
 5892675 5892676 ECIAI39_4110 ECIAI39_4111 yibF yibF TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5892676 5892677 ECIAI39_4111 ECIAI39_4112 yibF yibH FALSE 0.290 71.000 0.000 NA   NA
 5892677 5892678 ECIAI39_4112 ECIAI39_4113 yibH yibI TRUE 0.990 3.000 0.556 NA   NA
 5892679 5892680 ECIAI39_4114 ECIAI39_4115 mtlA mtlD TRUE 0.859 95.000 0.292 1.000 Y NA
 5892680 5892681 ECIAI39_4115 ECIAI39_4116 mtlD mtlR TRUE 0.968 0.000 0.230 NA N NA
 5892682 5892683 ECIAI39_4117 ECIAI39_4118 yibT   FALSE 0.040 200.000 0.000 NA   NA
 5892686 5892687 ECIAI39_4121 ECIAI39_4122     FALSE 0.456 44.000 0.000 NA   NA
 5892687 5892688 ECIAI39_4122 ECIAI39_4123     TRUE 0.659 -133.000 0.000 NA   NA
 5892688 5892689 ECIAI39_4123 ECIAI39_4124   lldP FALSE 0.011 298.000 0.000 NA   NA
 5892689 5892690 ECIAI39_4124 ECIAI39_4125 lldP lldR TRUE 0.994 0.000 0.652 1.000 N NA
 5892690 5892691 ECIAI39_4125 ECIAI39_4126 lldR lldD TRUE 0.983 -3.000 0.309 1.000 N NA
 5892691 5892692 ECIAI39_4126 ECIAI39_4127 lldD yibK FALSE 0.103 73.000 0.020 1.000 N NA
 5892693 5892694 ECIAI39_4128 ECIAI39_4129 cysE gpsA TRUE 0.714 80.000 0.429 1.000 N NA
 5892694 5892695 ECIAI39_4129 ECIAI39_4130 gpsA secB TRUE 0.967 0.000 0.206 1.000 N NA
 5892695 5892696 ECIAI39_4130 ECIAI39_4131 secB grxC FALSE 0.172 63.000 0.038 1.000 N NA
 5892696 5892697 ECIAI39_4131 ECIAI39_4132 grxC yibN FALSE 0.048 142.000 0.048 NA N NA
 5892698 5892699 ECIAI39_4133 ECIAI39_4134 gpmI envC TRUE 0.700 34.000 0.170 1.000 N NA
 5892699 5892700 ECIAI39_4134 ECIAI39_4135 envC yibQ TRUE 0.919 4.000 0.088 1.000   NA
 5892701 5892702 ECIAI39_4136 ECIAI39_4137 yibD tdh FALSE 0.010 239.000 0.000 NA N NA
 5892702 5892703 ECIAI39_4137 ECIAI39_4138 tdh kbl TRUE 0.978 10.000 0.547 1.000 N NA
 5892704 5892705 ECIAI39_4139 ECIAI39_4140 waaD waaF TRUE 0.980 10.000 0.146 1.000 Y NA
 5892705 5892706 ECIAI39_4140 ECIAI39_4141 waaF waaC TRUE 0.996 4.000 0.205 0.001 Y NA
 5892707 5892708 ECIAI39_4142 ECIAI39_4143 waaL waaV TRUE 0.607 46.000 0.133 NA   NA
 5892708 5892709 ECIAI39_4143 ECIAI39_4144 waaV waaW TRUE 0.695 79.000 0.000 NA Y NA
 5892709 5892710 ECIAI39_4144 ECIAI39_4145 waaW waaY TRUE 0.661 26.000 0.000 1.000   NA
 5892710 5892711 ECIAI39_4145 ECIAI39_4146 waaY waaT TRUE 0.972 10.000 0.375 1.000   NA
 5892711 5892712 ECIAI39_4146 ECIAI39_4147 waaT waaO TRUE 0.998 17.000 0.833 0.001 Y NA
 5892712 5892713 ECIAI39_4147 ECIAI39_4148 waaO waaP TRUE 0.757 16.000 0.000 1.000   NA
 5892713 5892714 ECIAI39_4148 ECIAI39_4149 waaP waaG TRUE 0.849 -16.000 0.000 1.000   NA
 5892714 5892715 ECIAI39_4149 ECIAI39_4150 waaG waaQ TRUE 0.991 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 5892716 5892717 ECIAI39_4151 ECIAI39_4152 kdtA coaD TRUE 0.600 8.000 0.020 1.000 N NA
 5892718 5892719 ECIAI39_4153 ECIAI39_4154 mutM rpmG FALSE 0.100 98.000 0.034 1.000 N NA
 5892719 5892720 ECIAI39_4154 ECIAI39_4155 rpmG rpmB TRUE 0.990 21.000 0.332 0.009 Y NA
 5892720 5892721 ECIAI39_4155 ECIAI39_4156 rpmB yicR FALSE 0.006 217.000 0.002 1.000 N NA
 5892722 5892723 ECIAI39_4157 ECIAI39_4158 dfp dut TRUE 0.911 -19.000 0.201 1.000 N NA
 5892723 5892724 ECIAI39_4158 ECIAI39_4159 dut ttk FALSE 0.145 107.000 0.060 1.000 N NA
 5892725 5892726 ECIAI39_4160 ECIAI39_4161   pyrE FALSE 0.015 286.000 0.000 1.000   NA
 5892726 5892727 ECIAI39_4161 ECIAI39_4162 pyrE rph FALSE 0.118 66.000 0.022 1.000 N NA
 5892728 5892729 ECIAI39_4163 ECIAI39_4164 yicC   FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 5892729 5892730 ECIAI39_4164 ECIAI39_4165     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5892730 5892731 ECIAI39_4165 ECIAI39_4166   dinD FALSE 0.280 74.000 0.000 NA   NA
 5892731 5892732 ECIAI39_4166 ECIAI39_4167 dinD yicG FALSE 0.012 292.000 0.000 NA   NA
 5892734 5892735 ECIAI39_4170 ECIAI39_4171 gmk rpoZ TRUE 0.823 55.000 0.471 1.000 N NA
 5892735 5892736 ECIAI39_4171 ECIAI39_4172 rpoZ spoT TRUE 0.980 19.000 0.291 1.000 Y NA
 5892736 5892737 ECIAI39_4172 ECIAI39_4173 spoT trmH TRUE 0.848 7.000 0.095 1.000 N NA
 5892737 5892738 ECIAI39_4173 ECIAI39_4174 trmH recG TRUE 0.821 6.000 0.076 1.000 N NA
 5892740 5892741 ECIAI39_4176 ECIAI39_4177 yicE yicH FALSE 0.470 121.000 0.257 NA   NA
 5892742 5892743 ECIAI39_4178 ECIAI39_4179     TRUE 0.754 -58.000 0.000 1.000   NA
 5892743 5892744 ECIAI39_4179 ECIAI39_4180     TRUE 0.977 15.000 0.000 0.005 Y NA
 5892744 5892745 ECIAI39_4180 ECIAI39_4181     TRUE 0.906 81.000 0.167 0.002 Y NA
 5892745 5892746 ECIAI39_4181 ECIAI39_4182     TRUE 0.994 12.000 0.600 1.000 Y NA
 5892746 5892747 ECIAI39_4182 ECIAI39_4183     TRUE 0.970 25.000 0.107 0.011 Y NA
 5892747 5892748 ECIAI39_4183 ECIAI39_4184     TRUE 0.987 18.000 0.214 0.010 Y NA
 5892748 5892749 ECIAI39_4184 ECIAI39_4185     TRUE 0.862 27.000 0.143 0.011 N NA
 5892749 5892750 ECIAI39_4185 ECIAI39_4186   yicI FALSE 0.007 295.000 0.000 1.000 N NA
 5892750 5892751 ECIAI39_4186 ECIAI39_4187 yicI yicJ TRUE 0.968 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5892752 5892753 ECIAI39_tRNA29 ECIAI39_4188     FALSE 0.011 304.000 0.000 NA   NA
 5892753 5892754 ECIAI39_4188 ECIAI39_4189     TRUE 0.681 21.000 0.000 NA   NA
 5892754 5892755 ECIAI39_4189 ECIAI39_4190     FALSE 0.022 236.000 0.000 NA   NA
 5892756 5892757 ECIAI39_4191 ECIAI39_4192   tia FALSE 0.074 175.000 0.000 1.000   NA
 5892758 5892759 ECIAI39_4193 ECIAI39_4194     FALSE 0.104 149.000 0.000 NA   NA
 5892760 5892761 ECIAI39_4195 ECIAI39_4196     TRUE 0.904 -55.000 0.269 1.000 N NA
 5892762 5892763 ECIAI39_4197 ECIAI39_4198     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5892763 5892764 ECIAI39_4198 ECIAI39_4199     FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 5892764 5892765 ECIAI39_4199 ECIAI39_misc_RNA_93     TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5892765 5892766 ECIAI39_misc_RNA_93 ECIAI39_4200     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5892766 5892767 ECIAI39_4200 ECIAI39_4201     FALSE 0.015 290.000 0.000 1.000   NA
 5892767 5892768 ECIAI39_4201 ECIAI39_4202     TRUE 0.953 23.000 0.308 0.060   NA
 5892768 5892769 ECIAI39_4202 ECIAI39_4203     TRUE 0.988 -12.000 0.625 NA   NA
 5892771 5892772 ECIAI39_4205 ECIAI39_4206     TRUE 0.977 18.000 0.667 NA   NA
 5892772 5892773 ECIAI39_4206 ECIAI39_4207     TRUE 0.988 15.000 1.000 NA   NA
 5892773 5892774 ECIAI39_4207 ECIAI39_4208   adhE TRUE 0.501 39.000 0.000 NA   NA
 5892774 5892775 ECIAI39_4208 ECIAI39_4209 adhE   TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 5892775 5892776 ECIAI39_4209 ECIAI39_4210   adhE TRUE 0.874 4.000 0.000 NA   NA
 5892776 5892777 ECIAI39_4210 ECIAI39_4211 adhE   TRUE 0.871 -9.000 0.000 NA   NA
 5892777 5892778 ECIAI39_4211 ECIAI39_4212     TRUE 0.964 52.000 0.815 0.002 N NA
 5892778 5892779 ECIAI39_4212 ECIAI39_4213     TRUE 0.907 12.000 0.250 NA N NA
 5892779 5892780 ECIAI39_4213 ECIAI39_4214     TRUE 0.997 -3.000 0.375 NA Y NA
 5892780 5892781 ECIAI39_4214 ECIAI39_4215     TRUE 0.961 12.000 0.375 NA   NA
 5892781 5892782 ECIAI39_4215 ECIAI39_4216     TRUE 0.961 33.000 0.750 NA   NA
 5892782 5892783 ECIAI39_4216 ECIAI39_4217     TRUE 0.999 10.000 1.000 0.061 Y NA
 5892784 5892785 ECIAI39_4218 ECIAI39_4219   dsdC FALSE 0.262 94.000 0.000 1.000   NA
 5892786 5892787 ECIAI39_4220 ECIAI39_4221 dsdX dsdA TRUE 0.952 18.000 0.083 1.000 Y NA
 5892788 5892789 ECIAI39_4222 ECIAI39_4223     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 5892789 5892790 ECIAI39_4223 ECIAI39_4224     FALSE 0.025 228.000 0.000 NA   NA
 5892790 5892791 ECIAI39_4224 ECIAI39_4225     FALSE 0.003 820.000 0.000 NA   NA
 5892793 5892794 ECIAI39_4227 ECIAI39_4228 yeiM yeiN FALSE 0.043 84.000 0.012 NA N NA
 5892794 5892795 ECIAI39_4228 ECIAI39_4229 yeiN   FALSE 0.464 -7.000 0.008 NA N NA
 5892795 5892796 ECIAI39_4229 ECIAI39_4230     FALSE 0.005 509.000 0.000 NA   NA
 5892796 5892797 ECIAI39_4230 ECIAI39_4231     FALSE 0.466 43.000 0.000 NA   NA
 5892797 5892798 ECIAI39_4231 ECIAI39_4232     FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 5892800 5892801 ECIAI39_4234 ECIAI39_4235     TRUE 0.727 -55.000 0.000 NA   NA
 5892802 5892803 ECIAI39_4236 ECIAI39_4237     FALSE 0.003 926.000 0.000 NA   NA
 5892803 5892804 ECIAI39_4237 ECIAI39_4238     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5892804 5892805 ECIAI39_4238 ECIAI39_4239     FALSE 0.245 90.000 0.000 NA   NA
 5892805 5892806 ECIAI39_4239 ECIAI39_4240     FALSE 0.044 194.000 0.000 NA   NA
 5892806 5892807 ECIAI39_4240 ECIAI39_4241   yeeS TRUE 0.906 1.000 0.000 NA   NA
 5892807 5892808 ECIAI39_4241 ECIAI39_4242 yeeS yeeT FALSE 0.251 87.000 0.000 NA   NA
 5892808 5892809 ECIAI39_4242 ECIAI39_4243 yeeT yeeU FALSE 0.264 80.000 0.000 NA   NA
 5892809 5892810 ECIAI39_4243 ECIAI39_4244 yeeU yeeV FALSE 0.248 89.000 0.000 NA   NA
 5892810 5892811 ECIAI39_4244 ECIAI39_4245 yeeV yeeW TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5892811 5892812 ECIAI39_4245 ECIAI39_4246 yeeW   FALSE 0.256 85.000 0.000 NA   NA
 5892812 5892813 ECIAI39_4246 ECIAI39_4247     FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 5892813 5892814 ECIAI39_4247 ECIAI39_4248   setC FALSE 0.006 387.000 0.000 NA   NA
 5892814 5892815 ECIAI39_4248 ECIAI39_4249 setC yicL TRUE 0.749 111.000 0.000 0.060 Y NA
 5892817 5892818 ECIAI39_4251 ECIAI39_4252 yicS   FALSE 0.011 302.000 0.000 NA   NA
 5892818 5892819 ECIAI39_4252 ECIAI39_4254     FALSE 0.023 248.000 0.000 1.000   NA
 5892819 5892820 ECIAI39_4254 ECIAI39_4255     TRUE 0.754 13.000 0.000 NA   NA
 5892820 5892821 ECIAI39_4255 ECIAI39_4256     FALSE 0.456 44.000 0.000 NA   NA
 5892821 5892822 ECIAI39_4256 ECIAI39_4257     FALSE 0.044 203.000 0.000 1.000   NA
 5892823 5892824 ECIAI39_4258 ECIAI39_4259   yicM FALSE 0.039 202.000 0.000 NA   NA
 5892824 5892825 ECIAI39_4259 ECIAI39_4260 yicM   TRUE 0.531 36.000 0.000 NA   NA
 5892826 5892827 ECIAI39_4261 ECIAI39_4262     TRUE 0.980 13.000 0.636 NA   NA
 5892828 5892829 ECIAI39_4263 ECIAI39_4264 yicN yicO FALSE 0.385 53.000 0.000 NA   NA
 5892831 5892832 ECIAI39_4266 ECIAI39_4267 uhpT uhpC TRUE 0.654 138.000 0.000 0.040 Y NA
 5892832 5892833 ECIAI39_4267 ECIAI39_4268 uhpC uhpB TRUE 0.893 10.000 0.000 0.060 N NA
 5892833 5892834 ECIAI39_4268 ECIAI39_4269 uhpB uhpA TRUE 0.994 0.000 0.000 0.011 Y NA
 5892834 5892835 ECIAI39_4269 ECIAI39_4270 uhpA   FALSE 0.081 162.000 0.000 NA   NA
 5892835 5892836 ECIAI39_4270 ECIAI39_4271     FALSE 0.029 215.000 0.000 NA   NA
 5892836 5892837 ECIAI39_4271 ECIAI39_4272   ilvN FALSE 0.019 251.000 0.000 NA   NA
 5892837 5892838 ECIAI39_4272 ECIAI39_4273 ilvN ilvB TRUE 0.997 4.000 0.649 0.001   NA
 5892840 5892841 ECIAI39_4944 ECIAI39_misc_RNA_94 ivbL istR FALSE 0.146 130.000 0.000 NA   NA
 5892842 5892843 ECIAI39_4275 ECIAI39_4276     FALSE 0.140 133.000 0.000 NA   NA
 5892843 5892844 ECIAI39_4276 ECIAI39_4277   emrD FALSE 0.014 280.000 0.000 NA   NA
 5892845 5892846 ECIAI39_4278 ECIAI39_4279 yidF yidG TRUE 0.992 -3.000 0.429 NA   NA
 5892846 5892847 ECIAI39_4279 ECIAI39_4280 yidG yidH TRUE 0.988 -10.000 0.571 NA   NA
 5892847 5892848 ECIAI39_4280 ECIAI39_4281 yidH yidJ FALSE 0.438 60.000 0.094 NA   NA
 5892848 5892849 ECIAI39_4281 ECIAI39_4282 yidJ yidK TRUE 0.984 -3.000 0.235 1.000   NA
 5892851 5892852 ECIAI39_4284 ECIAI39_4285     TRUE 0.996 0.000 0.309 1.000 Y NA
 5892854 5892855 ECIAI39_4287 ECIAI39_4288 yidE ibpB FALSE 0.043 196.000 0.000 NA   NA
 5892855 5892856 ECIAI39_4288 ECIAI39_4289 ibpB ibpA TRUE 0.662 112.000 0.099 NA Y NA
 5892860 5892861 ECIAI39_4293 ECIAI39_4294 dgoT dgoD FALSE 0.319 120.000 0.192 1.000 N NA
 5892861 5892862 ECIAI39_4294 ECIAI39_4295 dgoD dgoA TRUE 0.994 -3.000 0.385 0.041 N NA
 5892862 5892863 ECIAI39_4295 ECIAI39_4296 dgoA dgoK TRUE 0.998 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 5892863 5892864 ECIAI39_4296 ECIAI39_4297 dgoK dgoR TRUE 0.995 -3.000 0.733 1.000 N NA
 5892866 5892867 ECIAI39_4299 ECIAI39_4300 yidA yidB FALSE 0.189 115.000 0.000 NA   NA
 5892867 5892868 ECIAI39_4300 ECIAI39_4301 yidB   FALSE 0.069 171.000 0.000 NA   NA
 5892868 5892869 ECIAI39_4301 ECIAI39_4302     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5892869 5892870 ECIAI39_4302 ECIAI39_4303   gyrB FALSE 0.127 147.000 0.000 1.000   NA
 5892870 5892871 ECIAI39_4303 ECIAI39_4304 gyrB recF TRUE 0.982 29.000 0.249 0.002 Y NA
 5892871 5892872 ECIAI39_4304 ECIAI39_4305 recF dnaN TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5892872 5892873 ECIAI39_4305 ECIAI39_4306 dnaN dnaA TRUE 0.993 5.000 0.328 1.000 Y NA
 5892874 5892875 ECIAI39_4307 ECIAI39_4308 rpmH rnpA TRUE 0.983 17.000 0.787 1.000   NA
 5892875 5892876 ECIAI39_4308 ECIAI39_4309 rnpA yidD TRUE 0.974 -36.000 0.540 NA   NA
 5892876 5892877 ECIAI39_4309 ECIAI39_4310 yidD yidC TRUE 0.987 3.000 0.461 NA   NA
 5892877 5892878 ECIAI39_4310 ECIAI39_4311 yidC trmE TRUE 0.656 106.000 0.221 0.060   NA
 5892878 5892879 ECIAI39_4311 ECIAI39_4945 trmE tnaC FALSE 0.021 242.000 0.000 NA   NA
 5892879 5892880 ECIAI39_4945 ECIAI39_4312 tnaC tnaA FALSE 0.034 220.000 0.077 NA   NA
 5892880 5892881 ECIAI39_4312 ECIAI39_4313 tnaA tnaB TRUE 0.779 92.000 0.154 1.000 Y NA
 5892881 5892882 ECIAI39_4313 ECIAI39_4314 tnaB mdtL FALSE 0.069 133.000 0.000 NA N NA
 5892882 5892883 ECIAI39_4314 ECIAI39_4315 mdtL yidZ TRUE 0.969 -25.000 0.526 NA N NA
 5892883 5892884 ECIAI39_4315 ECIAI39_4316 yidZ yieE FALSE 0.134 145.000 0.114 1.000 N NA
 5892884 5892885 ECIAI39_4316 ECIAI39_4317 yieE yieF TRUE 0.713 22.000 0.074 NA   NA
 5892889 5892890 ECIAI39_4321 ECIAI39_4322     FALSE 0.062 176.000 0.000 NA   NA
 5892891 5892892 ECIAI39_4323 ECIAI39_4324   phoU FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 5892892 5892893 ECIAI39_4324 ECIAI39_4325 phoU pstB TRUE 0.983 15.000 0.317 NA Y NA
 5892893 5892894 ECIAI39_4325 ECIAI39_4326 pstB pstA TRUE 0.970 91.000 0.526 0.001 Y NA
 5892894 5892895 ECIAI39_4326 ECIAI39_4327 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 5892895 5892896 ECIAI39_4327 ECIAI39_4328 pstC pstS TRUE 0.899 87.000 0.145 0.001 Y NA
 5892896 5892897 ECIAI39_4328 ECIAI39_4329 pstS lpfD FALSE 0.012 248.000 0.000 1.000 N NA
 5892897 5892898 ECIAI39_4329 ECIAI39_4330 lpfD lpfC TRUE 0.963 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5892898 5892899 ECIAI39_4330 ECIAI39_4331 lpfC lfpB TRUE 0.923 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5892899 5892900 ECIAI39_4331 ECIAI39_4332 lfpB lpfA TRUE 0.987 48.000 1.000 1.000 Y NA
 5892900 5892901 ECIAI39_4332 ECIAI39_4333 lpfA glmS FALSE 0.006 308.000 0.000 1.000 N NA
 5892901 5892902 ECIAI39_4333 ECIAI39_4334 glmS glmU FALSE 0.376 162.000 0.055 1.000 Y NA
 5892902 5892903 ECIAI39_4334 ECIAI39_4335 glmU atpC FALSE 0.006 349.000 0.067 1.000 N NA
 5892903 5892904 ECIAI39_4335 ECIAI39_4336 atpC atpD TRUE 0.997 21.000 0.837 0.002 Y NA
 5892904 5892905 ECIAI39_4336 ECIAI39_4337 atpD atpG TRUE 0.996 27.000 0.724 0.002 Y NA
 5892905 5892906 ECIAI39_4337 ECIAI39_4338 atpG atpA TRUE 0.992 51.000 0.846 0.002 Y NA
 5892906 5892907 ECIAI39_4338 ECIAI39_4339 atpA atpH TRUE 0.998 13.000 0.864 0.002 Y NA
 5892907 5892908 ECIAI39_4339 ECIAI39_4340 atpH atpF TRUE 0.991 15.000 0.242 0.002 Y NA
 5892908 5892909 ECIAI39_4340 ECIAI39_4341 atpF atpE TRUE 0.985 62.000 0.666 0.002 Y NA
 5892909 5892910 ECIAI39_4341 ECIAI39_4342 atpE atpB TRUE 0.987 47.000 0.557 0.002 Y NA
 5892910 5892911 ECIAI39_4342 ECIAI39_4343 atpB atpI TRUE 0.996 9.000 0.291 0.002 Y NA
 5892911 5892912 ECIAI39_4343 ECIAI39_4344 atpI gidB FALSE 0.001 617.000 0.005 1.000 N NA
 5892912 5892913 ECIAI39_4344 ECIAI39_4345 gidB gidA TRUE 0.787 64.000 0.466 1.000 N NA
 5892913 5892914 ECIAI39_4345 ECIAI39_4346 gidA mioC FALSE 0.004 379.000 0.000 1.000 N NA
 5892914 5892915 ECIAI39_4346 ECIAI39_4347 mioC asnC FALSE 0.361 90.000 0.165 1.000 N NA
 5892917 5892918 ECIAI39_4349 ECIAI39_4350 yieM ravA TRUE 0.988 -6.000 0.443 NA   NA
 5892919 5892920 ECIAI39_4351 ECIAI39_4352 insG trkD FALSE 0.051 159.000 0.000 1.000 N NA
 5892920 5892921 ECIAI39_4352 ECIAI39_4353 trkD rbsD FALSE 0.044 167.000 0.000 1.000 N NA
 5892921 5892922 ECIAI39_4353 ECIAI39_4354 rbsD rbsA TRUE 0.992 8.000 0.337 1.000 Y NA
 5892922 5892923 ECIAI39_4354 ECIAI39_4355 rbsA rbsC TRUE 0.996 5.000 0.504 1.000 Y NA
 5892923 5892924 ECIAI39_4355 ECIAI39_4356 rbsC rbsB TRUE 0.993 25.000 0.847 NA Y NA
 5892924 5892925 ECIAI39_4356 ECIAI39_4357 rbsB rbsK TRUE 0.820 126.000 0.347 NA Y NA
 5892925 5892926 ECIAI39_4357 ECIAI39_4358 rbsK rbsR TRUE 0.983 4.000 0.500 1.000 N NA
 5892927 5892928 ECIAI39_4359 ECIAI39_4360 hsrA yieP TRUE 0.776 23.000 0.100 1.000   NA
 5892929 5892930 ECIAI39_16S_6 ECIAI39_tRNA30     FALSE 0.254 86.000 0.000 NA   NA
 5892930 5892931 ECIAI39_tRNA30 ECIAI39_23S_6     FALSE 0.023 233.000 0.000 NA   NA
 5892931 5892932 ECIAI39_23S_6 ECIAI39_5S_7     FALSE 0.232 94.000 0.000 NA   NA
 5892932 5892933 ECIAI39_5S_7 ECIAI39_4361   murB FALSE 0.134 135.000 0.000 NA   NA
 5892933 5892934 ECIAI39_4361 ECIAI39_4362 murB birA TRUE 0.972 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5892936 5892937 ECIAI39_tRNA31 ECIAI39_tRNA32     TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 5892937 5892938 ECIAI39_tRNA32 ECIAI39_tRNA33     FALSE 0.184 117.000 0.000 NA   NA
 5892938 5892939 ECIAI39_tRNA33 ECIAI39_tRNA34     TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 5892939 5892940 ECIAI39_tRNA34 ECIAI39_4365   tufB FALSE 0.189 115.000 0.000 NA   NA
 5892940 5892941 ECIAI39_4365 ECIAI39_4366 tufB secE FALSE 0.005 230.000 0.009 1.000 N NA
 5892941 5892942 ECIAI39_4366 ECIAI39_4367 secE nusG TRUE 0.994 2.000 0.843 1.000 N NA
 5892942 5892943 ECIAI39_4367 ECIAI39_4368 nusG rplK TRUE 0.574 159.000 0.681 1.000 N NA
 5892943 5892944 ECIAI39_4368 ECIAI39_4369 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.011 Y NA
 5892944 5892945 ECIAI39_4369 ECIAI39_4370 rplA rplJ FALSE 0.338 292.000 0.302 0.011 Y NA
 5892945 5892946 ECIAI39_4370 ECIAI39_4371 rplJ rplL TRUE 0.988 67.000 0.884 0.008 Y NA
 5892946 5892947 ECIAI39_4371 ECIAI39_4372 rplL rpoB FALSE 0.037 320.000 0.223 1.000   NA
 5892947 5892948 ECIAI39_4372 ECIAI39_4373 rpoB rpoC TRUE 0.960 77.000 0.851 0.000   NA
 5892948 5892949 ECIAI39_4373 ECIAI39_4374 rpoC   FALSE 0.011 257.000 0.000 1.000 N NA
 5892949 5892950 ECIAI39_4374 ECIAI39_4375     TRUE 0.914 2.000 0.000 1.000   NA
 5892950 5892951 ECIAI39_4375 ECIAI39_4376     FALSE 0.394 52.000 0.000 NA   NA
 5892951 5892952 ECIAI39_4376 ECIAI39_4377     TRUE 0.724 -40.000 0.045 NA   NA
 5892953 5892954 ECIAI39_4378 ECIAI39_4379   thiH FALSE 0.009 318.000 0.000 NA   NA
 5892954 5892955 ECIAI39_4379 ECIAI39_4380 thiH thiG TRUE 0.998 -3.000 0.277 0.003 Y NA
 5892955 5892956 ECIAI39_4380 ECIAI39_4381 thiG thiS TRUE 0.987 2.000 0.087 1.000 Y NA
 5892956 5892957 ECIAI39_4381 ECIAI39_4382 thiS thiF TRUE 0.995 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 5892957 5892958 ECIAI39_4382 ECIAI39_4383 thiF thiE TRUE 0.993 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 5892958 5892959 ECIAI39_4383 ECIAI39_4384 thiE thiC TRUE 0.995 0.000 0.063 0.003 Y NA
 5892959 5892960 ECIAI39_4384 ECIAI39_misc_RNA_95 thiC   FALSE 0.262 81.000 0.000 NA   NA
 5892960 5892961 ECIAI39_misc_RNA_95 ECIAI39_4385   rsd FALSE 0.394 52.000 0.000 NA   NA
 5892962 5892963 ECIAI39_4386 ECIAI39_4387 nudC hemE FALSE 0.301 40.000 0.040 1.000 N NA
 5892963 5892964 ECIAI39_4387 ECIAI39_4388 hemE nfi TRUE 0.606 10.000 0.028 1.000 N NA
 5892964 5892965 ECIAI39_4388 ECIAI39_4389 nfi yjaG TRUE 0.551 43.000 0.086 NA   NA
 5892965 5892966 ECIAI39_4389 ECIAI39_4390 yjaG hupA FALSE 0.261 187.000 0.355 NA   NA
 5892966 5892967 ECIAI39_4390 ECIAI39_4391 hupA yjaH TRUE 0.957 13.000 0.375 NA   NA
 5892969 5892970 ECIAI39_4393 ECIAI39_4394 zraS zraR TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.064 Y NA
 5892971 5892972 ECIAI39_4395 ECIAI39_4396 purD purH TRUE 0.983 12.000 0.238 1.000 Y NA
 5892972 5892973 ECIAI39_4396 ECIAI39_4397 purH   TRUE 0.735 -46.000 0.000 NA   NA
 5892974 5892975 ECIAI39_16S_7 ECIAI39_tRNA35     FALSE 0.254 86.000 0.000 NA   NA
 5892975 5892976 ECIAI39_tRNA35 ECIAI39_23S_7     FALSE 0.051 186.000 0.000 NA   NA
 5892976 5892977 ECIAI39_23S_7 ECIAI39_5S_8     FALSE 0.221 98.000 0.000 NA   NA
 5892979 5892980 ECIAI39_4399 ECIAI39_4400 metA aceB FALSE 0.009 269.000 0.000 1.000 N NA
 5892980 5892981 ECIAI39_4400 ECIAI39_4401 aceB aceA TRUE 0.897 30.000 0.043 1.000 Y NA
 5892981 5892982 ECIAI39_4401 ECIAI39_4402 aceA   FALSE 0.286 86.000 0.000 1.000   NA
 5892982 5892983 ECIAI39_4402 ECIAI39_4403     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5892983 5892984 ECIAI39_4403 ECIAI39_4404   aceK FALSE 0.037 177.000 0.000 1.000 N NA
 5892986 5892987 ECIAI39_4406 ECIAI39_4407 metH   FALSE 0.378 54.000 0.000 NA   NA
 5892987 5892988 ECIAI39_4407 ECIAI39_4408     FALSE 0.466 43.000 0.000 NA   NA
 5892988 5892989 ECIAI39_4408 ECIAI39_4409   yjbB FALSE 0.069 171.000 0.000 NA   NA
 5892990 5892991 ECIAI39_4410 ECIAI39_4411 pepE   TRUE 0.580 123.000 0.000 1.000 Y NA
 5892991 5892992 ECIAI39_4411 ECIAI39_4412     TRUE 0.979 -7.000 0.031 1.000 Y NA
 5892992 5892993 ECIAI39_4412 ECIAI39_4413     TRUE 0.785 40.000 0.286 1.000 N NA
 5892993 5892994 ECIAI39_4413 ECIAI39_4414     TRUE 0.995 -19.000 0.333 0.014 Y NA
 5892994 5892995 ECIAI39_4414 ECIAI39_4415     TRUE 0.962 66.000 0.400 0.014 Y NA
 5892995 5892996 ECIAI39_4415 ECIAI39_4416     TRUE 0.997 0.000 0.167 0.010 Y NA
 5892996 5892997 ECIAI39_4416 ECIAI39_4417     TRUE 0.800 10.000 0.083 1.000 N NA
 5892997 5892998 ECIAI39_4417 ECIAI39_4418     FALSE 0.290 70.000 0.091 1.000 N NA
 5893001 5893002 ECIAI39_4421 ECIAI39_4422     FALSE 0.165 124.000 0.000 NA   NA
 5893002 5893003 ECIAI39_4422 ECIAI39_4423     TRUE 0.903 -3.000 0.026 NA   NA
 5893004 5893005 ECIAI39_4424 ECIAI39_4425     TRUE 0.977 -3.000 0.200 NA   NA
 5893005 5893006 ECIAI39_4425 ECIAI39_4426     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5893006 5893007 ECIAI39_4426 ECIAI39_4427     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA   NA
 5893007 5893008 ECIAI39_4427 ECIAI39_4428     TRUE 0.992 -22.000 1.000 NA   NA
 5893008 5893009 ECIAI39_4428 ECIAI39_4429     TRUE 0.943 -9.000 0.167 NA   NA
 5893009 5893010 ECIAI39_4429 ECIAI39_4430     FALSE 0.325 99.000 0.111 NA   NA
 5893010 5893011 ECIAI39_4430 ECIAI39_4431     TRUE 0.992 10.000 1.000 NA   NA
 5893011 5893012 ECIAI39_4431 ECIAI39_4432     TRUE 0.848 -12.000 0.000 NA   NA
 5893012 5893013 ECIAI39_4432 ECIAI39_4433     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5893013 5893014 ECIAI39_4433 ECIAI39_4434     TRUE 0.994 0.000 0.600 NA   NA
 5893014 5893015 ECIAI39_4434 ECIAI39_4435     FALSE 0.420 190.000 0.600 NA   NA
 5893015 5893016 ECIAI39_4435 ECIAI39_4436     TRUE 0.569 51.000 0.133 NA   NA
 5893016 5893017 ECIAI39_4436 ECIAI39_4437     TRUE 0.959 0.000 0.133 NA   NA
 5893017 5893018 ECIAI39_4437 ECIAI39_4438     TRUE 0.990 -16.000 0.750 NA   NA
 5893018 5893019 ECIAI39_4438 ECIAI39_4439     TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 5893019 5893020 ECIAI39_4439 ECIAI39_4440     FALSE 0.491 147.000 0.400 NA   NA
 5893020 5893021 ECIAI39_4440 ECIAI39_4441     TRUE 0.978 13.000 0.600 NA   NA
 5893021 5893022 ECIAI39_4441 ECIAI39_4442     TRUE 0.972 -75.000 0.600 NA   NA
 5893022 5893023 ECIAI39_4442 ECIAI39_4443     FALSE 0.008 339.000 0.000 NA   NA
 5893023 5893024 ECIAI39_4443 ECIAI39_4444     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5893026 5893027 ECIAI39_4446 ECIAI39_misc_RNA_96 lysC   FALSE 0.240 92.000 0.000 NA   NA
 5893030 5893031 ECIAI39_4449 ECIAI39_4450 yjbF yjbG TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5893031 5893032 ECIAI39_4450 ECIAI39_4451 yjbG yjbH TRUE 0.960 0.000 0.140 NA   NA
 5893032 5893033 ECIAI39_4451 ECIAI39_4452 yjbH yjbA FALSE 0.004 539.000 0.000 NA   NA
 5893034 5893035 ECIAI39_4453 ECIAI39_4454 malG malF TRUE 0.997 15.000 0.814 0.039 Y NA
 5893035 5893036 ECIAI39_4454 ECIAI39_4455 malF malE TRUE 0.563 154.000 0.000 0.039 Y NA
 5893037 5893038 ECIAI39_4456 ECIAI39_4457 malK lamB TRUE 0.871 72.000 0.111 0.049 Y NA
 5893038 5893039 ECIAI39_4457 ECIAI39_4458 lamB malM FALSE 0.047 243.000 0.143 1.000   NA
 5893039 5893040 ECIAI39_4458 ECIAI39_4459 malM yjbI FALSE 0.025 228.000 0.000 NA   NA
 5893040 5893041 ECIAI39_4459 ECIAI39_4460 yjbI ubiC FALSE 0.026 223.000 0.000 NA   NA
 5893041 5893042 ECIAI39_4460 ECIAI39_4461 ubiC ubiA TRUE 0.980 13.000 0.248 NA Y NA
 5893044 5893045 ECIAI39_4463 ECIAI39_4464 dgkA lexA FALSE 0.266 110.000 0.141 1.000 N NA
 5893045 5893046 ECIAI39_4464 ECIAI39_4465 lexA dinF FALSE 0.475 19.000 0.033 1.000 N NA
 5893046 5893047 ECIAI39_4465 ECIAI39_4466 dinF yjbJ FALSE 0.128 116.000 0.021 NA   NA
 5893049 5893050 ECIAI39_4468 ECIAI39_4469   yjbN FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 5893050 5893051 ECIAI39_4469 ECIAI39_4470 yjbN yjbO TRUE 0.704 -76.000 0.000 NA   NA
 5893053 5893054 ECIAI39_4472 ECIAI39_4473 dnaB alr TRUE 0.733 53.000 0.317 1.000 N NA
 5893054 5893055 ECIAI39_4473 ECIAI39_4474 alr tyrB FALSE 0.038 253.000 0.181 1.000 N NA
 5893057 5893058 ECIAI39_4476 ECIAI39_4477 aphA yjbQ FALSE 0.122 111.000 0.009 NA   NA
 5893058 5893059 ECIAI39_4477 ECIAI39_4478 yjbQ yjbR TRUE 0.811 4.000 0.018 NA   NA
 5893067 5893068 ECIAI39_4485 ECIAI39_4486 yjcD yjcE FALSE 0.190 151.000 0.130 1.000   NA
 5893069 5893070 ECIAI39_4487 ECIAI39_4488 actP   TRUE 0.996 -3.000 0.733 NA   NA
 5893071 5893072 ECIAI39_4489 ECIAI39_4490     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5893074 5893075 ECIAI39_4492 ECIAI39_4493 nrfA nrfB TRUE 0.810 46.000 0.083 0.001   NA
 5893075 5893076 ECIAI39_4493 ECIAI39_4494 nrfB nrfC TRUE 0.984 -3.000 0.049 0.001   NA
 5893076 5893077 ECIAI39_4494 ECIAI39_4495 nrfC nrfD TRUE 0.999 -3.000 0.927 0.001 N NA
 5893077 5893078 ECIAI39_4495 ECIAI39_4496 nrfD nrfE TRUE 0.692 80.000 0.400 1.000 N NA
 5893078 5893079 ECIAI39_4496 ECIAI39_4497 nrfE nrfF TRUE 0.991 -7.000 0.214 NA Y NA
 5893079 5893080 ECIAI39_4497 ECIAI39_4498 nrfF nrfG TRUE 0.998 -3.000 0.464 NA Y NA
 5893080 5893081 ECIAI39_4498 ECIAI39_4499 nrfG gltP FALSE 0.005 342.000 0.000 1.000 N NA
 5893082 5893083 ECIAI39_4500 ECIAI39_4501 yjcO fdhF FALSE 0.361 94.000 0.105 1.000   NA
 5893083 5893084 ECIAI39_4501 ECIAI39_4503 fdhF yjcP FALSE 0.048 198.000 0.000 1.000   NA
 5893084 5893085 ECIAI39_4503 ECIAI39_4504 yjcP yjcQ TRUE 0.995 -3.000 0.625 NA   NA
 5893085 5893086 ECIAI39_4504 ECIAI39_4505 yjcQ yjcR TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5893086 5893087 ECIAI39_4505 ECIAI39_4506 yjcR   TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5893087 5893088 ECIAI39_4506 ECIAI39_4507   yjcS FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 5893088 5893089 ECIAI39_4507 ECIAI39_4508 yjcS alsK FALSE 0.009 273.000 0.000 1.000 N NA
 5893089 5893090 ECIAI39_4508 ECIAI39_4509 alsK alsE TRUE 0.974 -16.000 0.081 1.000 Y NA
 5893090 5893091 ECIAI39_4509 ECIAI39_4510 alsE alsC TRUE 0.969 11.000 0.385 1.000   NA
 5893091 5893092 ECIAI39_4510 ECIAI39_4511 alsC alsA TRUE 0.913 -21.000 0.154 1.000   NA
 5893092 5893093 ECIAI39_4511 ECIAI39_4512 alsA alsB TRUE 0.537 127.000 0.000 NA Y NA
 5893093 5893094 ECIAI39_4512 ECIAI39_4513 alsB rpiR TRUE 0.604 59.000 0.250 NA N NA
 5893095 5893096 ECIAI39_4514 ECIAI39_4515 rpiB yjdP FALSE 0.441 69.000 0.125 NA   NA
 5893097 5893098 ECIAI39_4516 ECIAI39_4517 phnP phnO TRUE 0.914 2.000 0.000 1.000   NA
 5893098 5893099 ECIAI39_4517 ECIAI39_4518 phnO phnN TRUE 0.705 -13.000 0.000 NA N NA
 5893099 5893100 ECIAI39_4518 ECIAI39_4519 phnN phnM TRUE 0.995 0.000 0.235 NA Y NA
 5893100 5893101 ECIAI39_4519 ECIAI39_4520 phnM phnL TRUE 0.997 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 5893101 5893102 ECIAI39_4520 ECIAI39_4521 phnL phnK TRUE 0.914 179.000 0.859 0.011 Y NA
 5893102 5893103 ECIAI39_4521 ECIAI39_4522 phnK phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 5893103 5893104 ECIAI39_4522 ECIAI39_4523 phnJ phnI TRUE 0.999 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 5893104 5893105 ECIAI39_4523 ECIAI39_4524 phnI phnH TRUE 1.000 0.000 0.960 0.001 Y NA
 5893105 5893106 ECIAI39_4524 ECIAI39_4525 phnH phnG TRUE 1.000 -3.000 0.967 0.001 Y NA
 5893106 5893107 ECIAI39_4525 ECIAI39_4526 phnG phnF TRUE 0.993 1.000 0.691 1.000 N NA
 5893107 5893108 ECIAI39_4526 ECIAI39_4527 phnF phnE TRUE 0.782 21.000 0.158 1.000 N NA
 5893108 5893109 ECIAI39_4527 ECIAI39_4528 phnE phnD TRUE 0.965 65.000 0.330 0.000 Y NA
 5893109 5893110 ECIAI39_4528 ECIAI39_4529 phnD phnC TRUE 0.991 25.000 0.337 0.001 Y NA
 5893110 5893111 ECIAI39_4529 ECIAI39_4530 phnC phnB FALSE 0.026 223.000 0.000 NA   NA
 5893111 5893112 ECIAI39_4530 ECIAI39_4531 phnB   FALSE 0.082 160.000 0.000 NA   NA
 5893113 5893114 ECIAI39_4532 ECIAI39_4533 yjdA yjcZ TRUE 0.997 -3.000 0.857 NA   NA
 5893114 5893115 ECIAI39_4533 ECIAI39_4534 yjcZ proP FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 5893116 5893117 ECIAI39_4536 ECIAI39_4537 basS basR TRUE 0.990 1.000 0.143 1.000 Y NA
 5893117 5893118 ECIAI39_4537 ECIAI39_4538 basR eptA TRUE 0.960 -3.000 0.095 1.000   NA
 5893118 5893119 ECIAI39_4538 ECIAI39_4539 eptA adiC FALSE 0.242 104.000 0.000 1.000   NA
 5893119 5893120 ECIAI39_4539 ECIAI39_4540 adiC adiY FALSE 0.212 137.000 0.167 1.000 N NA
 5893120 5893121 ECIAI39_4540 ECIAI39_4541 adiY adiA FALSE 0.005 336.000 0.000 1.000 N NA
 5893121 5893122 ECIAI39_4541 ECIAI39_4542 adiA melR FALSE 0.026 196.000 0.000 1.000 N NA
 5893123 5893124 ECIAI39_4543 ECIAI39_4544 melA melB TRUE 0.779 115.000 0.214 1.000 Y NA
 5893125 5893126 ECIAI39_4545 ECIAI39_4546 yjdF fumB FALSE 0.167 123.000 0.000 NA   NA
 5893126 5893127 ECIAI39_4546 ECIAI39_4547 fumB dcuB FALSE 0.302 78.000 0.000 1.000   NA
 5893127 5893128 ECIAI39_4547 ECIAI39_4549 dcuB dcuR FALSE 0.005 571.000 0.000 1.000   NA
 5893128 5893129 ECIAI39_4549 ECIAI39_4550 dcuR dcuS TRUE 0.995 -3.000 0.086 0.058 Y NA
 5893130 5893131 ECIAI39_4553 ECIAI39_4554 yjdI yjdJ TRUE 0.897 12.000 0.168 NA   NA
 5893131 5893132 ECIAI39_4554 ECIAI39_4555 yjdJ yjdK FALSE 0.024 229.000 0.000 NA   NA
 5893132 5893133 ECIAI39_4555 ECIAI39_4556 yjdK yjdO TRUE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5893134 5893135 ECIAI39_4557 ECIAI39_4558 lysU yjdL FALSE 0.013 237.000 0.000 1.000 N NA
 5893135 5893136 ECIAI39_4558 ECIAI39_4560 yjdL cadA FALSE 0.482 141.000 0.000 1.000 Y NA
 5893136 5893137 ECIAI39_4560 ECIAI39_4561 cadA cadB TRUE 0.712 80.000 0.000 1.000 Y NA
 5893137 5893138 ECIAI39_4561 ECIAI39_4562 cadB cadC FALSE 0.004 366.000 0.000 1.000 N NA
 5893138 5893139 ECIAI39_4562 ECIAI39_4563 cadC   FALSE 0.001 804.000 0.000 NA N NA
 5893140 5893141 ECIAI39_4564 ECIAI39_4565     TRUE 0.970 0.000 0.000 0.069   NA
 5893142 5893143 ECIAI39_4566 ECIAI39_4567     FALSE 0.290 71.000 0.000 NA   NA
 5893143 5893144 ECIAI39_4567 ECIAI39_4568     FALSE 0.256 85.000 0.000 NA   NA
 5893144 5893145 ECIAI39_4568 ECIAI39_4569   yeeW TRUE 0.764 -33.000 0.000 NA   NA
 5893145 5893146 ECIAI39_4569 ECIAI39_4570 yeeW yeeV TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5893146 5893147 ECIAI39_4570 ECIAI39_4571 yeeV yeeU FALSE 0.245 90.000 0.000 NA   NA
 5893147 5893148 ECIAI39_4571 ECIAI39_4572 yeeU yeeT FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 5893148 5893149 ECIAI39_4572 ECIAI39_4573 yeeT yeeS FALSE 0.327 63.000 0.000 NA   NA
 5893149 5893150 ECIAI39_4573 ECIAI39_4574 yeeS   FALSE 0.448 45.000 0.000 NA   NA
 5893150 5893151 ECIAI39_4574 ECIAI39_4575     FALSE 0.243 91.000 0.000 NA   NA
 5893151 5893152 ECIAI39_4575 ECIAI39_4576     TRUE 0.904 90.000 1.000 NA   NA
 5893152 5893153 ECIAI39_4576 ECIAI39_4577     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5893153 5893154 ECIAI39_4577 ECIAI39_4578     FALSE 0.003 752.000 0.000 NA   NA
 5893154 5893155 ECIAI39_4578 ECIAI39_4579     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5893156 5893157 ECIAI39_4580 ECIAI39_4581     FALSE 0.003 994.000 0.000 NA   NA
 5893157 5893158 ECIAI39_4581 ECIAI39_4582     TRUE 0.974 -3.000 0.000 0.069   NA
 5893158 5893159 ECIAI39_4582 ECIAI39_4583     FALSE 0.202 57.000 0.000 NA N NA
 5893161 5893162 ECIAI39_4585 ECIAI39_4586   papB TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 5893162 5893163 ECIAI39_4586 ECIAI39_4587 papB papA FALSE 0.076 174.000 0.000 1.000   NA
 5893163 5893164 ECIAI39_4587 ECIAI39_4588 papA papH TRUE 0.876 64.000 0.000 0.008 Y NA
 5893164 5893165 ECIAI39_4588 ECIAI39_4589 papH papC TRUE 0.985 38.000 0.667 1.000 Y NA
 5893165 5893166 ECIAI39_4589 ECIAI39_4590 papC papD TRUE 0.967 71.000 0.750 1.000 Y NA
 5893166 5893167 ECIAI39_4590 ECIAI39_4591 papD papJ TRUE 0.519 37.000 0.000 NA   NA
 5893167 5893168 ECIAI39_4591 ECIAI39_4592 papJ papK TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 5893168 5893169 ECIAI39_4592 ECIAI39_4593 papK papE TRUE 0.987 9.000 0.000 0.008 Y NA
 5893169 5893170 ECIAI39_4593 ECIAI39_4594 papE papF TRUE 0.850 75.000 0.000 0.008 Y NA
 5893170 5893171 ECIAI39_4594 ECIAI39_4595 papF papG TRUE 0.750 44.000 0.000 0.009   NA
 5893171 5893172 ECIAI39_4595 ECIAI39_4596 papG tia FALSE 0.009 351.000 0.000 1.000   NA
 5893172 5893173 ECIAI39_4596 ECIAI39_4597 tia   FALSE 0.074 175.000 0.000 1.000   NA
 5893174 5893175 ECIAI39_4598 ECIAI39_4599   int FALSE 0.035 440.000 0.000 1.000 Y NA
 5893175 5893176 ECIAI39_4599 ECIAI39_tRNA43 int   FALSE 0.041 198.000 0.000 NA   NA
 5893176 5893177 ECIAI39_tRNA43 ECIAI39_4600   yjdC FALSE 0.205 107.000 0.000 NA   NA
 5893177 5893178 ECIAI39_4600 ECIAI39_4601 yjdC dipZ TRUE 0.804 37.000 0.217 1.000   NA
 5893178 5893179 ECIAI39_4601 ECIAI39_4602 dipZ cutA TRUE 0.793 -24.000 0.092 1.000 N NA
 5893179 5893180 ECIAI39_4602 ECIAI39_4603 cutA dcuA FALSE 0.137 116.000 0.005 1.000   NA
 5893180 5893181 ECIAI39_4603 ECIAI39_4604 dcuA aspA FALSE 0.141 118.000 0.015 1.000   NA
 5893184 5893185 ECIAI39_4607 ECIAI39_4608 groS groL TRUE 0.988 44.000 0.631 0.063 Y NA
 5893185 5893186 ECIAI39_4608 ECIAI39_4609 groL yjeI FALSE 0.144 135.000 0.062 NA   NA
 5893187 5893188 ECIAI39_4610 ECIAI39_4611 yjeJ yjeK FALSE 0.022 235.000 0.000 NA   NA
 5893190 5893191 ECIAI39_4613 ECIAI39_4614 insB insA TRUE 0.968 -81.000 0.000 0.020 Y NA
 5893193 5893194 ECIAI39_4616 ECIAI39_4617 blc ampC FALSE 0.092 88.000 0.022 1.000 N NA
 5893194 5893195 ECIAI39_4617 ECIAI39_4618 ampC frdD FALSE 0.129 63.000 0.022 1.000 N NA
 5893195 5893196 ECIAI39_4618 ECIAI39_4619 frdD frdC TRUE 0.998 11.000 0.787 0.002 Y NA
 5893196 5893197 ECIAI39_4619 ECIAI39_4620 frdC frdB TRUE 0.997 11.000 0.454 0.002 Y NA
 5893197 5893198 ECIAI39_4620 ECIAI39_4621 frdB frdA TRUE 0.998 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 5893199 5893200 ECIAI39_4622 ECIAI39_4623 poxA yjeM FALSE 0.006 219.000 0.009 1.000 N NA
 5893201 5893202 ECIAI39_4624 ECIAI39_4625 yjeP psd TRUE 0.758 22.000 0.148 1.000 N NA
 5893202 5893203 ECIAI39_4625 ECIAI39_4626 psd rsgA FALSE 0.333 97.000 0.095 1.000   NA
 5893204 5893205 ECIAI39_4627 ECIAI39_tRNA36 orn   FALSE 0.031 211.000 0.000 NA   NA
 5893205 5893206 ECIAI39_tRNA36 ECIAI39_tRNA37     TRUE 0.519 37.000 0.000 NA   NA
 5893206 5893207 ECIAI39_tRNA37 ECIAI39_tRNA38     TRUE 0.531 36.000 0.000 NA   NA
 5893209 5893210 ECIAI39_4631 ECIAI39_4632 yjeF yjeE TRUE 0.864 -28.000 0.118 NA   NA
 5893210 5893211 ECIAI39_4632 ECIAI39_4633 yjeE amiB TRUE 0.799 19.000 0.109 NA   NA
 5893211 5893212 ECIAI39_4633 ECIAI39_4634 amiB mutL TRUE 0.843 7.000 0.092 1.000 N NA
 5893212 5893213 ECIAI39_4634 ECIAI39_4636 mutL miaA TRUE 0.972 -7.000 0.188 0.063 N NA
 5893213 5893214 ECIAI39_4636 ECIAI39_4637 miaA hfq TRUE 0.808 87.000 0.531 1.000   NA
 5893214 5893215 ECIAI39_4637 ECIAI39_4638 hfq hflX FALSE 0.461 77.000 0.141 1.000   NA
 5893215 5893216 ECIAI39_4638 ECIAI39_4639 hflX hflK TRUE 0.676 86.000 0.184 0.059   NA
 5893216 5893217 ECIAI39_4639 ECIAI39_4640 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.008 Y NA
 5893217 5893218 ECIAI39_4640 ECIAI39_4641 hflC yjeT TRUE 0.698 82.000 0.348 NA   NA
 5893218 5893219 ECIAI39_4641 ECIAI39_4642 yjeT purA FALSE 0.204 104.000 0.051 NA   NA
 5893219 5893220 ECIAI39_4642 ECIAI39_4643 purA nsrR FALSE 0.005 205.000 0.010 NA N NA
 5893220 5893221 ECIAI39_4643 ECIAI39_4644 nsrR rnr TRUE 0.850 39.000 0.038 NA Y NA
 5893221 5893222 ECIAI39_4644 ECIAI39_4645 rnr rlmB FALSE 0.191 181.000 0.147 0.014 N NA
 5893222 5893223 ECIAI39_4645 ECIAI39_4646 rlmB yjfI FALSE 0.090 127.000 0.002 NA   NA
 5893223 5893224 ECIAI39_4646 ECIAI39_4647 yjfI yjfJ TRUE 0.984 19.000 0.911 NA   NA
 5893224 5893225 ECIAI39_4647 ECIAI39_4648 yjfJ yjfK FALSE 0.457 50.000 0.071 NA   NA
 5893225 5893226 ECIAI39_4648 ECIAI39_4649 yjfK yjfL TRUE 0.948 18.000 0.379 NA   NA
 5893226 5893227 ECIAI39_4649 ECIAI39_4650 yjfL yjfM TRUE 0.977 10.000 0.470 NA   NA
 5893227 5893228 ECIAI39_4650 ECIAI39_4651 yjfM yjfC TRUE 0.882 3.000 0.049 NA   NA
 5893228 5893229 ECIAI39_4651 ECIAI39_4652 yjfC aidB FALSE 0.293 84.000 0.133 NA N NA
 5893230 5893231 ECIAI39_4653 ECIAI39_4654 yjfN yjfO TRUE 0.614 149.000 0.588 NA   NA
 5893233 5893234 ECIAI39_4656 ECIAI39_4657 ulaR ulaG FALSE 0.232 108.000 0.000 1.000   NA
 5893235 5893236 ECIAI39_4658 ECIAI39_4659 ulaA ulaB TRUE 0.901 16.000 0.059 0.013   NA
 5893236 5893237 ECIAI39_4659 ECIAI39_4660 ulaB ulaC TRUE 0.989 10.000 0.115 0.009 Y NA
 5893237 5893238 ECIAI39_4660 ECIAI39_4661 ulaC ulaD TRUE 0.986 14.000 0.328 1.000 Y NA
 5893238 5893239 ECIAI39_4661 ECIAI39_4662 ulaD ulaE TRUE 0.988 10.000 0.250 1.000 Y NA
 5893239 5893240 ECIAI39_4662 ECIAI39_4663 ulaE ulaF TRUE 0.994 0.000 0.200 1.000 Y NA
 5893242 5893243 ECIAI39_4665 ECIAI39_4666 rpsF rpsR FALSE 0.295 326.000 0.319 0.008 Y NA
 5893243 5893244 ECIAI39_4666 ECIAI39_4667 rpsR rplI TRUE 0.986 42.000 0.499 0.008 Y NA
 5893245 5893246 ECIAI39_4668 ECIAI39_4669 yjfZ   FALSE 0.015 270.000 0.000 NA   NA
 5893246 5893247 ECIAI39_4669 ECIAI39_4670     FALSE 0.154 93.000 0.000 1.000 N NA
 5893247 5893248 ECIAI39_4670 ECIAI39_4671     TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5893248 5893249 ECIAI39_4671 ECIAI39_4672     TRUE 0.991 10.000 0.200 0.040 Y NA
 5893249 5893250 ECIAI39_4672 ECIAI39_4673     TRUE 0.668 10.000 0.000 NA N NA
 5893250 5893251 ECIAI39_4673 ECIAI39_4674     TRUE 0.668 10.000 0.000 NA N NA
 5893254 5893255 ECIAI39_4677 ECIAI39_4678 fklB cycA FALSE 0.006 309.000 0.000 1.000 N NA
 5893255 5893256 ECIAI39_4678 ECIAI39_4679 cycA   FALSE 0.137 134.000 0.000 NA   NA
 5893256 5893257 ECIAI39_4679 ECIAI39_4680     TRUE 0.973 33.000 1.000 NA   NA
 5893258 5893259 ECIAI39_4681 ECIAI39_4682 ytfE ytfF FALSE 0.258 108.000 0.150 NA N NA
 5893259 5893260 ECIAI39_4682 ECIAI39_4683 ytfF ytfG TRUE 0.613 99.000 0.021 1.000 Y NA
 5893266 5893267 ECIAI39_4689 ECIAI39_4690 ytfL msrA FALSE 0.008 323.000 0.042 NA   NA
 5893268 5893269 ECIAI39_4691 ECIAI39_4692 ytfM ytfN TRUE 0.995 -3.000 0.575 NA   NA
 5893269 5893270 ECIAI39_4692 ECIAI39_4693 ytfN ytfP TRUE 0.952 3.000 0.167 NA   NA
 5893270 5893271 ECIAI39_4693 ECIAI39_4694 ytfP chpS FALSE 0.031 212.000 0.000 NA   NA
 5893271 5893272 ECIAI39_4694 ECIAI39_4695 chpS chpB TRUE 0.996 -6.000 0.375 NA Y NA
 5893274 5893275 ECIAI39_4698 ECIAI39_4699 ytfQ ytfR TRUE 0.911 140.000 0.804 NA Y NA
 5893275 5893276 ECIAI39_4699 ECIAI39_4700 ytfR ytfT TRUE 0.992 14.000 0.506 1.000 Y NA
 5893276 5893277 ECIAI39_4700 ECIAI39_4701 ytfT yjfF TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 5893277 5893278 ECIAI39_4701 ECIAI39_4702 yjfF insG FALSE 0.322 64.000 0.000 NA   NA
 5893278 5893279 ECIAI39_4702 ECIAI39_4703 insG yjfF TRUE 0.643 -198.000 0.000 NA   NA
 5893282 5893283 ECIAI39_4706 ECIAI39_4707     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5893283 5893284 ECIAI39_4707 ECIAI39_4708   yjgA FALSE 0.090 154.000 0.000 NA   NA
 5893285 5893286 ECIAI39_4709 ECIAI39_4710 pmbA cybC FALSE 0.038 184.000 0.028 NA   NA
 5893286 5893287 ECIAI39_4710 ECIAI39_4711 cybC   FALSE 0.022 191.000 0.000 NA N NA
 5893288 5893289 ECIAI39_4712 ECIAI39_4713 nrdG nrdD FALSE 0.281 190.000 0.464 1.000 N NA
 5893289 5893290 ECIAI39_4713 ECIAI39_4714 nrdD treC FALSE 0.004 394.000 0.000 1.000 N NA
 5893290 5893291 ECIAI39_4714 ECIAI39_4715 treC treB TRUE 0.976 50.000 0.650 1.000 Y NA
 5893291 5893292 ECIAI39_4715 ECIAI39_4716 treB treR FALSE 0.287 119.000 0.168 1.000 N NA
 5893294 5893295 ECIAI39_4718 ECIAI39_4719 yjgF pyrI FALSE 0.230 73.000 0.084 NA N NA
 5893295 5893296 ECIAI39_4719 ECIAI39_4720 pyrI pyrB TRUE 0.990 13.000 0.197 0.002 Y NA
 5893296 5893297 ECIAI39_4720 ECIAI39_4946 pyrB pyrL TRUE 0.827 4.000 0.005 1.000   NA
 5893297 5893298 ECIAI39_4946 ECIAI39_4721 pyrL   TRUE 0.634 90.000 0.286 1.000   NA
 5893298 5893299 ECIAI39_4721 ECIAI39_4722     FALSE 0.411 50.000 0.000 NA   NA
 5893299 5893300 ECIAI39_4722 ECIAI39_4723   arcB TRUE 0.771 12.000 0.000 NA   NA
 5893300 5893301 ECIAI39_4723 ECIAI39_4724 arcB arcC TRUE 0.998 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5893301 5893302 ECIAI39_4724 ECIAI39_4725 arcC   TRUE 0.997 -13.000 0.750 1.000 Y NA
 5893308 5893309 ECIAI39_4731 ECIAI39_4732 valS holC TRUE 0.920 0.000 0.089 1.000 N NA
 5893309 5893310 ECIAI39_4732 ECIAI39_4733 holC pepA FALSE 0.059 354.000 0.494 1.000 N NA
 5893311 5893312 ECIAI39_4734 ECIAI39_4735 yjgP yjgQ TRUE 0.997 0.000 0.631 0.058   NA
 5893313 5893314 ECIAI39_4736 ECIAI39_4737 yjgR idnR FALSE 0.205 78.000 0.007 1.000   NA
 5893314 5893315 ECIAI39_4737 ECIAI39_4738 idnR idnT TRUE 0.507 67.000 0.200 1.000 N NA
 5893315 5893316 ECIAI39_4738 ECIAI39_4739 idnT idnO FALSE 0.354 65.000 0.111 1.000 N NA
 5893316 5893317 ECIAI39_4739 ECIAI39_4740 idnO idnD TRUE 0.931 24.000 0.444 1.000 N NA
 5893320 5893321 ECIAI39_tRNA39 ECIAI39_4743   intB FALSE 0.017 262.000 0.000 NA   NA
 5893322 5893323 ECIAI39_4744 ECIAI39_4745     FALSE 0.003 869.000 0.000 NA   NA
 5893324 5893325 ECIAI39_4746 ECIAI39_4747   yjhB FALSE 0.004 545.000 0.000 NA   NA
 5893325 5893326 ECIAI39_4747 ECIAI39_4748 yjhB yjhC TRUE 0.914 12.000 0.182 1.000   NA
 5893328 5893329 ECIAI39_4750 ECIAI39_4751     FALSE 0.249 88.000 0.000 NA   NA
 5893329 5893330 ECIAI39_4751 ECIAI39_4752     FALSE 0.041 286.000 0.000 0.018   NA
 5893331 5893332 ECIAI39_4753 ECIAI39_4754     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.068 Y NA
 5893332 5893333 ECIAI39_4754 ECIAI39_4755   betU TRUE 0.493 26.000 0.000 1.000 N NA
 5893333 5893334 ECIAI39_4755 ECIAI39_4756 betU   FALSE 0.066 148.000 0.000 1.000 N NA
 5893334 5893335 ECIAI39_4756 ECIAI39_4757   insM TRUE 0.531 36.000 0.000 NA   NA
 5893335 5893336 ECIAI39_4757 ECIAI39_4758 insM msbB FALSE 0.056 181.000 0.000 NA   NA
 5893336 5893337 ECIAI39_4758 ECIAI39_4759 msbB virK FALSE 0.317 65.000 0.000 NA   NA
 5893337 5893338 ECIAI39_4759 ECIAI39_4760 virK   TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 5893338 5893339 ECIAI39_4760 ECIAI39_4761   shf TRUE 0.827 3.000 0.000 1.000 N NA
 5893340 5893341 ECIAI39_4762 ECIAI39_4763   insO TRUE 0.612 56.000 0.000 0.068   NA
 5893341 5893342 ECIAI39_4763 ECIAI39_4764 insO yjhV FALSE 0.075 166.000 0.000 NA   NA
 5893343 5893344 ECIAI39_4765 ECIAI39_4766 fecE fecD TRUE 0.996 1.000 0.380 1.000 Y NA
 5893344 5893345 ECIAI39_4766 ECIAI39_4767 fecD fecC TRUE 0.993 -33.000 0.340 0.039 Y NA
 5893345 5893346 ECIAI39_4767 ECIAI39_4768 fecC fecB TRUE 0.999 -3.000 0.864 1.000 Y NA
 5893346 5893347 ECIAI39_4768 ECIAI39_4769 fecB fecA TRUE 0.923 45.000 0.211 1.000 Y NA
 5893347 5893348 ECIAI39_4769 ECIAI39_4770 fecA fecR TRUE 0.854 87.000 0.267 NA Y NA
 5893348 5893349 ECIAI39_4770 ECIAI39_4771 fecR fecI TRUE 0.981 -3.000 0.308 NA N NA
 5893350 5893351 ECIAI39_4772 ECIAI39_4773 insA insB TRUE 0.968 -81.000 0.000 0.020 Y NA
 5893352 5893353 ECIAI39_4774 ECIAI39_4775     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.068 Y NA
 5893353 5893354 ECIAI39_4775 ECIAI39_4776     FALSE 0.227 52.000 0.000 NA N NA
 5893354 5893355 ECIAI39_4776 ECIAI39_4777     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 5893355 5893356 ECIAI39_4777 ECIAI39_4778     TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 5893356 5893357 ECIAI39_4778 ECIAI39_4779     FALSE 0.069 170.000 0.000 NA   NA
 5893357 5893358 ECIAI39_4779 ECIAI39_4780   yjhS FALSE 0.088 155.000 0.000 NA   NA
 5893358 5893359 ECIAI39_4780 ECIAI39_4781 yjhS yjhT FALSE 0.317 65.000 0.000 NA   NA
 5893359 5893360 ECIAI39_4781 ECIAI39_4782 yjhT yjhA TRUE 0.691 20.000 0.000 NA   NA
 5893360 5893361 ECIAI39_4782 ECIAI39_4783 yjhA   FALSE 0.003 877.000 0.000 NA   NA
 5893362 5893363 ECIAI39_4784 ECIAI39_4785 fimB fimE FALSE 0.065 478.000 0.000 0.008 Y NA
 5893365 5893366 ECIAI39_4787 ECIAI39_4788 fimA fimI TRUE 0.980 65.000 0.600 0.008 Y NA
 5893366 5893367 ECIAI39_4788 ECIAI39_4789 fimI fimC TRUE 0.988 37.000 0.800 1.000 Y NA
 5893367 5893368 ECIAI39_4789 ECIAI39_4790 fimC fimD TRUE 0.970 67.000 0.750 1.000 Y NA
 5893368 5893369 ECIAI39_4790 ECIAI39_4791 fimD fimF TRUE 0.968 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5893369 5893370 ECIAI39_4791 ECIAI39_4792 fimF fimG TRUE 0.978 13.000 0.000 0.008 Y NA
 5893370 5893371 ECIAI39_4792 ECIAI39_4793 fimG fimH TRUE 0.991 20.000 0.833 0.008   NA
 5893373 5893374 ECIAI39_4795 ECIAI39_4796 uxuA uxuB TRUE 0.727 81.000 0.070 1.000 Y NA
 5893374 5893375 ECIAI39_4796 ECIAI39_4797 uxuB uxuR FALSE 0.018 215.000 0.000 1.000 N NA
 5893376 5893377 ECIAI39_4798 ECIAI39_4799 yjiC   TRUE 0.683 -82.000 0.000 NA   NA
 5893379 5893380 ECIAI39_4801 ECIAI39_4802 yjiE iadA FALSE 0.163 65.000 0.037 1.000 N NA
 5893380 5893381 ECIAI39_4802 ECIAI39_4803 iadA yjiG TRUE 0.726 13.000 0.028 1.000   NA
 5893381 5893382 ECIAI39_4803 ECIAI39_4804 yjiG yjiH TRUE 0.980 -3.000 0.019 0.001   NA
 5893383 5893384 ECIAI39_4805 ECIAI39_4806 kptA kptA TRUE 0.681 21.000 0.000 NA   NA
 5893385 5893386 ECIAI39_4807 ECIAI39_4808 yjiJ yjiJ TRUE 0.519 37.000 0.000 NA   NA
 5893386 5893387 ECIAI39_4808 ECIAI39_4809 yjiJ yjiK FALSE 0.302 68.000 0.000 NA   NA
 5893387 5893388 ECIAI39_4809 ECIAI39_4810 yjiK   TRUE 0.738 -43.000 0.000 NA   NA
 5893388 5893389 ECIAI39_4810 ECIAI39_4811   hgdC TRUE 0.946 -3.000 0.078 NA   NA
 5893389 5893390 ECIAI39_4811 ECIAI39_4812 hgdC yjiM TRUE 0.749 10.000 0.078 NA N NA
 5893390 5893391 ECIAI39_4812 ECIAI39_4813 yjiM yjiN FALSE 0.119 116.000 0.013 NA   NA
 5893392 5893393 ECIAI39_4814 ECIAI39_4815     FALSE 0.014 280.000 0.000 NA   NA
 5893396 5893397 ECIAI39_4817 ECIAI39_4818 hsdS hsdM TRUE 0.994 0.000 0.080 0.068 Y NA
 5893397 5893398 ECIAI39_4818 ECIAI39_4819 hsdM hsdR TRUE 0.990 31.000 0.564 0.068 Y NA
 5893399 5893400 ECIAI39_4820 ECIAI39_4821     TRUE 0.531 36.000 0.000 NA   NA
 5893401 5893402 ECIAI39_4822 ECIAI39_4823 yjiA yjiX TRUE 0.927 11.000 0.212 NA   NA
 5893402 5893403 ECIAI39_4823 ECIAI39_4824 yjiX yjiY TRUE 0.891 50.000 0.531 NA   NA
 5893405 5893406 ECIAI39_4826 ECIAI39_4827     TRUE 0.616 108.000 0.000 NA Y NA
 5893406 5893407 ECIAI39_4827 ECIAI39_4828     TRUE 0.749 64.000 0.000 NA Y NA
 5893411 5893412 ECIAI39_4832 ECIAI39_4833 mdoB yjjA FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 5893412 5893413 ECIAI39_4833 ECIAI39_4834 yjjA dnaC TRUE 0.837 49.000 0.368 NA   NA
 5893413 5893414 ECIAI39_4834 ECIAI39_4835 dnaC dnaT TRUE 0.994 3.000 0.778 NA   NA
 5893414 5893415 ECIAI39_4835 ECIAI39_4836 dnaT   FALSE 0.186 108.000 0.046 NA   NA
 5893415 5893416 ECIAI39_4836 ECIAI39_4837   yjjP TRUE 0.992 -9.000 0.704 NA   NA
 5893417 5893418 ECIAI39_4838 ECIAI39_4839 yjjQ bglJ TRUE 0.998 12.000 0.889 0.020 Y NA
 5893421 5893422 ECIAI39_tRNA42 ECIAI39_tRNA41     TRUE 0.540 35.000 0.000 NA   NA
 5893422 5893423 ECIAI39_tRNA41 ECIAI39_tRNA40     TRUE 0.585 29.000 0.000 NA   NA
 5893423 5893424 ECIAI39_tRNA40 ECIAI39_4842   rsmC FALSE 0.040 200.000 0.000 NA   NA
 5893425 5893426 ECIAI39_4843 ECIAI39_4844 holD rimI TRUE 0.873 -31.000 0.121 1.000   NA
 5893426 5893427 ECIAI39_4844 ECIAI39_4845 rimI yjjG TRUE 0.681 15.000 0.018 1.000   NA
 5893427 5893428 ECIAI39_4845 ECIAI39_4846 yjjG   FALSE 0.007 386.000 0.000 1.000   NA
 5893428 5893429 ECIAI39_4846 ECIAI39_4847     FALSE 0.067 173.000 0.000 NA   NA
 5893430 5893431 ECIAI39_4848 ECIAI39_4849 yfdT   TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5893431 5893432 ECIAI39_4849 ECIAI39_4850   yfdR TRUE 0.668 22.000 0.000 NA   NA
 5893432 5893433 ECIAI39_4850 ECIAI39_4851 yfdR yfdQ FALSE 0.268 66.000 0.039 NA   NA
 5893433 5893434 ECIAI39_4851 ECIAI39_4852 yfdQ   TRUE 0.636 66.000 0.233 NA   NA
 5893434 5893435 ECIAI39_4852 ECIAI39_4853   ymfK FALSE 0.004 560.000 0.000 NA   NA
 5893436 5893437 ECIAI39_4854 ECIAI39_4855 ymfT ymfL TRUE 0.560 32.000 0.000 NA   NA
 5893437 5893438 ECIAI39_4855 ECIAI39_4856 ymfL   TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5893438 5893439 ECIAI39_4856 ECIAI39_4857     TRUE 0.974 -3.000 0.000 0.068   NA
 5893439 5893440 ECIAI39_4857 ECIAI39_4858   ymfL TRUE 0.656 -142.000 0.000 NA   NA
 5893440 5893441 ECIAI39_4858 ECIAI39_4860 ymfL   TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5893441 5893442 ECIAI39_4860 ECIAI39_4861     TRUE 0.996 -7.000 1.000 NA   NA
 5893442 5893443 ECIAI39_4861 ECIAI39_4862     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5893443 5893444 ECIAI39_4862 ECIAI39_4863     FALSE 0.005 458.000 0.000 NA   NA
 5893444 5893445 ECIAI39_4863 ECIAI39_4864     TRUE 0.942 -3.000 0.000 1.000   NA
 5893445 5893446 ECIAI39_4864 ECIAI39_4865   rusA TRUE 0.942 -3.000 0.000 1.000   NA
 5893446 5893447 ECIAI39_4865 ECIAI39_4866 rusA   TRUE 0.691 20.000 0.000 NA   NA
 5893447 5893448 ECIAI39_4866 ECIAI39_4867     TRUE 0.900 2.000 0.000 NA   NA
 5893448 5893449 ECIAI39_4867 ECIAI39_4868   ydfT TRUE 0.608 14.000 0.002 NA   NA
 5893449 5893450 ECIAI39_4868 ECIAI39_4869 ydfT   FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   NA
 5893450 5893451 ECIAI39_4869 ECIAI39_4870     FALSE 0.040 200.000 0.000 NA   NA
 5893451 5893452 ECIAI39_4870 ECIAI39_4871     FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 5893452 5893453 ECIAI39_4871 ECIAI39_4872     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5893453 5893454 ECIAI39_4872 ECIAI39_4873     TRUE 0.976 12.000 0.000 0.068 Y NA
 5893454 5893455 ECIAI39_4873 ECIAI39_4874   essD FALSE 0.306 67.000 0.000 NA   NA
 5893455 5893456 ECIAI39_4874 ECIAI39_4875 essD ybcS TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5893456 5893457 ECIAI39_4875 ECIAI39_4876 ybcS Rz TRUE 0.856 -15.000 0.000 1.000   NA
 5893457 5893458 ECIAI39_4876 ECIAI39_4877 Rz   FALSE 0.003 659.000 0.000 NA   NA
 5893458 5893459 ECIAI39_4877 ECIAI39_4878     FALSE 0.095 152.000 0.000 NA   NA
 5893459 5893460 ECIAI39_4878 ECIAI39_4879     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 5893460 5893461 ECIAI39_4879 ECIAI39_4880     TRUE 0.991 -9.000 0.667 NA   NA
 5893461 5893462 ECIAI39_4880 ECIAI39_4881     TRUE 0.977 -72.000 0.667 NA   NA
 5893462 5893463 ECIAI39_4881 ECIAI39_4882     TRUE 0.672 -151.000 0.049 1.000   NA
 5893463 5893464 ECIAI39_4882 ECIAI39_4883     TRUE 0.914 42.000 0.537 NA   NA
 5893464 5893465 ECIAI39_4883 ECIAI39_4884     TRUE 0.946 -7.000 0.152 NA   NA
 5893465 5893466 ECIAI39_4884 ECIAI39_4885     TRUE 0.771 12.000 0.000 NA   NA
 5893466 5893467 ECIAI39_4885 ECIAI39_4886     TRUE 0.993 -15.000 1.000 NA   NA
 5893467 5893468 ECIAI39_4886 ECIAI39_4887     TRUE 0.987 -64.000 1.000 NA   NA
 5893468 5893469 ECIAI39_4887 ECIAI39_4888     TRUE 0.702 19.000 0.000 NA   NA
 5893469 5893470 ECIAI39_4888 ECIAI39_4889     TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 5893470 5893471 ECIAI39_4889 ECIAI39_4890     TRUE 0.953 -58.000 0.400 NA   NA
 5893471 5893472 ECIAI39_4890 ECIAI39_4891     TRUE 0.989 0.000 0.400 NA   NA
 5893472 5893473 ECIAI39_4891 ECIAI39_4892     TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5893473 5893474 ECIAI39_4892 ECIAI39_4893     TRUE 0.851 6.000 0.000 NA   NA
 5893474 5893475 ECIAI39_4893 ECIAI39_4894     TRUE 0.670 -102.000 0.000 NA   NA
 5893475 5893476 ECIAI39_4894 ECIAI39_4895     TRUE 0.843 61.000 0.500 NA   NA
 5893476 5893477 ECIAI39_4895 ECIAI39_4896     FALSE 0.302 68.000 0.000 NA   NA
 5893477 5893478 ECIAI39_4896 ECIAI39_4897     FALSE 0.110 152.000 0.000 1.000   NA
 5893478 5893479 ECIAI39_4897 ECIAI39_4898     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   NA
 5893479 5893480 ECIAI39_4898 ECIAI39_4899     TRUE 0.817 10.000 0.000 NA   NA
 5893481 5893482 ECIAI39_4900 ECIAI39_4901     TRUE 0.956 -28.000 0.333 NA   NA
 5893482 5893483 ECIAI39_4901 ECIAI39_4902     FALSE 0.240 92.000 0.000 NA   NA
 5893484 5893485 ECIAI39_4903 ECIAI39_4904 prfC osmY FALSE 0.006 393.000 0.000 NA   NA
 5893485 5893486 ECIAI39_4904 ECIAI39_4905 osmY ytjA FALSE 0.201 109.000 0.000 NA   NA
 5893486 5893487 ECIAI39_4905 ECIAI39_4906 ytjA yjjU FALSE 0.401 122.000 0.211 NA   NA
 5893487 5893488 ECIAI39_4906 ECIAI39_4907 yjjU yjjV TRUE 0.935 -3.000 0.057 NA   NA
 5893488 5893489 ECIAI39_4907 ECIAI39_4908 yjjV   FALSE 0.340 60.000 0.000 NA   NA
 5893489 5893490 ECIAI39_4908 ECIAI39_4909     FALSE 0.423 105.000 0.167 1.000   NA
 5893491 5893492 ECIAI39_4910 ECIAI39_4911 yjjW yjjI TRUE 0.780 -28.000 0.000 NA   NA
 5893492 5893493 ECIAI39_4911 ECIAI39_4912 yjjI yjjI TRUE 0.742 -42.000 0.000 NA   NA
 5893494 5893495 ECIAI39_4913 ECIAI39_4914 deoC deoA TRUE 0.881 78.000 0.286 1.000 Y NA
 5893495 5893496 ECIAI39_4914 ECIAI39_4915 deoA deoB TRUE 0.799 52.000 0.398 1.000 N NA
 5893496 5893497 ECIAI39_4915 ECIAI39_4916 deoB deoD TRUE 0.787 57.000 0.414 1.000 N NA
 5893498 5893499 ECIAI39_4917 ECIAI39_4918   lplA TRUE 0.601 32.000 0.000 1.000   NA
 5893499 5893500 ECIAI39_4918 ECIAI39_4919 lplA ytjB TRUE 0.622 28.000 0.066 NA   NA
 5893501 5893502 ECIAI39_4920 ECIAI39_4921 serB radA FALSE 0.184 49.000 0.024 1.000 N NA
 5893502 5893503 ECIAI39_4921 ECIAI39_4922 radA nadR FALSE 0.383 21.000 0.021 1.000 N NA
 5893503 5893504 ECIAI39_4922 ECIAI39_4923 nadR   TRUE 0.724 34.000 0.000 0.019 N NA
 5893506 5893507 ECIAI39_4925 ECIAI39_4926 slt trpR FALSE 0.379 90.000 0.167 1.000 N NA
 5893511 5893512 ECIAI39_4930 ECIAI39_4931 creA creB TRUE 0.710 13.000 0.038 NA   NA
 5893512 5893513 ECIAI39_4931 ECIAI39_4932 creB creC TRUE 0.999 0.000 0.776 1.000 Y NA
 5893513 5893514 ECIAI39_4932 ECIAI39_4933 creC creD TRUE 0.681 58.000 0.311 NA N NA
 5893516 5888418 ECIAI39_4935 ECIAI39_misc_RNA_1 yjtD   FALSE 0.034 208.000 0.000 NA   NA