MicrobesOnline Operon Predictions for Tolumonas auensis DSM 9187

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
7697974	7697975	Tola_0001	Tola_0002			TRUE	0.990	19.000	0.328	1.000	Y	NA
7697975	7697976	Tola_0002	Tola_0003			TRUE	0.997	6.000	0.318	1.000	Y	NA
7697976	7697977	Tola_0003	Tola_0004			TRUE	0.990	21.000	0.249	0.005	Y	NA
7697977	7697978	Tola_0004	Tola_0005			FALSE	0.014	194.000	0.000	1.000	N	NA
7697978	7697979	Tola_0005	Tola_0006			TRUE	0.848	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7697980	7697981	Tola_0007	Tola_0008			FALSE	0.058	106.000	0.005	1.000	N	NA
7697981	7697982	Tola_0008	Tola_0009			TRUE	0.999	14.000	0.651	0.001	Y	NA
7697983	7697984	Tola_0010	Tola_0011			TRUE	0.596	16.000	0.000	1.000	N	NA
7697984	7697985	Tola_0011	Tola_0012			FALSE	0.256	118.000	0.000	1.000	Y	NA
7697985	7697986	Tola_0012	Tola_0013			TRUE	0.419	63.000	0.038	NA		NA
7697986	7697987	Tola_0013	Tola_0014			FALSE	0.044	239.000	0.041	NA		NA
7697987	7697988	Tola_0014	Tola_0015			TRUE	1.000	0.000	0.935	0.001	N	NA
7697988	7697989	Tola_0015	Tola_0016			TRUE	0.997	18.000	0.587	1.000	Y	NA
7697989	7697990	Tola_0016	Tola_0017			TRUE	0.954	-3.000	0.053	1.000	N	NA
7697991	7697992	Tola_0018	Tola_0019			FALSE	0.203	40.000	0.000	1.000	N	NA
7697992	7697993	Tola_0019	Tola_0020			TRUE	0.972	4.000	0.143	1.000	N	NA
7697993	7697994	Tola_0020	Tola_0021			TRUE	0.992	53.000	0.909	1.000	Y	NA
7697995	7697996	Tola_0022	Tola_R0001			FALSE	0.016	349.000	0.000	NA		NA
7697996	7697997	Tola_R0001	Tola_R0002			FALSE	0.251	70.000	0.000	NA		NA
7697997	7697998	Tola_R0002	Tola_R0003			TRUE	0.832	12.000	0.000	NA		NA
7697998	7697999	Tola_R0003	Tola_R0004			FALSE	0.026	207.000	0.000	NA		NA
7697999	7698000	Tola_R0004	Tola_R0005			FALSE	0.066	129.000	0.000	NA		NA
7698000	7698001	Tola_R0005	Tola_R0006			FALSE	0.265	63.000	0.000	NA		NA
7698001	7698002	Tola_R0006	Tola_0023			FALSE	0.030	193.000	0.000	NA		NA
7698003	7698004	Tola_0024	Tola_0025			TRUE	0.695	117.000	0.167	0.061	Y	NA
7698004	7698005	Tola_0025	Tola_0026			FALSE	0.127	71.000	0.000	1.000	N	NA
7698005	7698006	Tola_0026	Tola_0027			TRUE	0.811	39.000	0.000	0.014	Y	NA
7698006	7698007	Tola_0027	Tola_0028			TRUE	0.692	64.000	0.040	NA	Y	NA
7698007	7698008	Tola_0028	Tola_0029			TRUE	0.990	-7.000	0.058	NA	Y	NA
7698008	7698009	Tola_0029	Tola_0030			FALSE	0.328	104.000	0.000	1.000	Y	NA
7698009	7698010	Tola_0030	Tola_0031			TRUE	0.984	0.000	0.029	NA	Y	NA
7698010	7698011	Tola_0031	Tola_0032			TRUE	0.486	85.000	0.006	NA	Y	NA
7698011	7698012	Tola_0032	Tola_0033			TRUE	0.356	100.000	0.000	1.000	Y	NA
7698012	7698013	Tola_0033	Tola_0034			FALSE	0.046	147.000	0.000	1.000		NA
7698013	7698014	Tola_0034	Tola_0035			FALSE	0.249	67.000	0.000	1.000		NA
7698014	7698015	Tola_0035	Tola_0036			TRUE	0.657	73.000	0.000	0.072	Y	NA
7698016	7698017	Tola_0037	Tola_0038			TRUE	0.567	70.000	0.000	1.000	Y	NA
7698017	7698018	Tola_0038	Tola_0039			TRUE	0.999	12.000	0.814	0.056	Y	NA
7698018	7698019	Tola_0039	Tola_0040			FALSE	0.042	157.000	0.000	NA		NA
7698019	7698020	Tola_0040	Tola_0041			TRUE	0.926	-16.000	0.000	NA		NA
7698020	7698021	Tola_0041	Tola_0042			FALSE	0.138	97.000	0.000	NA		NA
7698022	7698023	Tola_0043	Tola_0044			TRUE	0.977	10.000	0.000	0.031	Y	NA
7698027	7698028	Tola_0048	Tola_0049			TRUE	0.995	0.000	0.180	NA	Y	NA
7698028	7698029	Tola_0049	Tola_0050			TRUE	0.966	13.000	0.149	NA		NA
7698029	7698030	Tola_0050	Tola_0051			TRUE	0.910	1.000	0.000	NA		NA
7698030	7698031	Tola_0051	Tola_0052			FALSE	0.296	110.000	0.000	NA	Y	NA
7698031	7698032	Tola_0052	Tola_0053			TRUE	0.788	74.000	0.238	NA		NA
7698032	7698033	Tola_0053	Tola_0054			TRUE	0.791	14.000	0.000	1.000		NA
7698034	7698035	Tola_0055	Tola_0056			FALSE	0.012	218.000	0.000	NA	N	NA
7698037	7698038	Tola_0058	Tola_0059			TRUE	1.000	-3.000	0.542	0.001	Y	NA
7698038	7698039	Tola_0059	Tola_0060			TRUE	1.000	-3.000	0.688	0.001	Y	NA
7698039	7698040	Tola_0060	Tola_0061			FALSE	0.018	163.000	0.000	1.000	N	NA
7698043	7698044	Tola_0064	Tola_0065			TRUE	0.750	73.000	0.019	0.006	Y	NA
7698046	7698047	Tola_0067	Tola_0068			FALSE	0.274	172.000	0.010	0.001	Y	NA
7698047	7698048	Tola_0068	Tola_0069			FALSE	0.038	168.000	0.000	NA		NA
7698049	7698050	Tola_0070	Tola_0071			TRUE	0.906	1.000	0.000	1.000		NA
7698050	7698051	Tola_0071	Tola_0072			FALSE	0.054	140.000	0.000	NA		NA
7698051	7698052	Tola_0072	Tola_0073			TRUE	0.985	0.000	0.133	NA		NA
7698052	7698053	Tola_0073	Tola_0074			TRUE	0.981	3.000	0.133	NA		NA
7698053	7698054	Tola_0074	Tola_0075			TRUE	0.927	-3.000	0.000	NA		NA
7698055	7698056	Tola_0076	Tola_0077			FALSE	0.024	217.000	0.000	NA		NA
7698056	7698057	Tola_0077	Tola_0078			FALSE	0.063	132.000	0.000	NA		NA
7698057	7698058	Tola_0078	Tola_0079			FALSE	0.048	147.000	0.000	NA		NA
7698058	7698059	Tola_0079	Tola_0080			TRUE	0.616	15.000	0.000	1.000	N	NA
7698059	7698060	Tola_0080	Tola_0081			TRUE	0.981	0.000	0.111	1.000		NA
7698061	7698062	Tola_0082	Tola_0083			FALSE	0.109	105.000	0.000	NA		NA
7698063	7698064	Tola_0084	Tola_0085			FALSE	0.038	167.000	0.000	NA		NA
7698064	7698065	Tola_0085	Tola_0086			TRUE	0.998	14.000	0.913	NA		NA
7698065	7698066	Tola_0086	Tola_0087			TRUE	0.999	0.000	0.739	NA		NA
7698067	7698068	Tola_0088	Tola_0089			FALSE	0.014	575.000	0.000	NA		NA
7698071	7698072	Tola_0092	Tola_0093			FALSE	0.100	130.000	0.053	1.000	N	NA
7698073	7698074	Tola_0094	Tola_0095			TRUE	0.982	18.000	0.097	0.003	Y	NA
7698074	7698075	Tola_0095	Tola_0096			TRUE	0.951	27.000	0.171	1.000	Y	NA
7698075	7698076	Tola_0096	Tola_0097			TRUE	0.429	90.000	0.000	1.000	Y	NA
7698076	7698077	Tola_0097	Tola_0098			FALSE	0.008	287.000	0.000	1.000	N	NA
7698077	7698078	Tola_0098	Tola_0099			TRUE	0.990	23.000	0.307	0.024	Y	NA
7698078	7698079	Tola_0099	Tola_0100			TRUE	0.997	18.000	0.486	0.018	Y	NA
7698079	7698080	Tola_0100	Tola_0101			TRUE	0.999	-3.000	0.513	1.000	Y	NA
7698080	7698081	Tola_0101	Tola_0102			TRUE	0.999	15.000	0.849	1.000	Y	NA
7698081	7698082	Tola_0102	Tola_0103			TRUE	0.998	22.000	0.820	0.024	Y	NA
7698082	7698083	Tola_0103	Tola_0104			TRUE	1.000	8.000	0.769	0.024	Y	NA
7698083	7698084	Tola_0104	Tola_0105			TRUE	1.000	4.000	0.719	0.024	Y	NA
7698084	7698085	Tola_0105	Tola_0106			TRUE	0.999	14.000	0.828	0.024	Y	NA
7698085	7698086	Tola_0106	Tola_0107			TRUE	1.000	0.000	0.802	0.018	Y	NA
7698086	7698087	Tola_0107	Tola_0108			TRUE	1.000	0.000	0.828	0.018	Y	NA
7698087	7698088	Tola_0108	Tola_0109			TRUE	0.936	155.000	0.791	0.024	Y	NA
7698088	7698089	Tola_0109	Tola_0110			TRUE	0.999	13.000	0.810	0.024	Y	NA
7698089	7698090	Tola_0110	Tola_0111			TRUE	0.999	14.000	0.758	0.018	Y	NA
7698090	7698091	Tola_0111	Tola_0112			TRUE	0.998	12.000	0.496	0.018	Y	NA
7698091	7698092	Tola_0112	Tola_0113			TRUE	0.995	23.000	0.473	0.018	Y	NA
7698092	7698093	Tola_0113	Tola_0114			TRUE	0.999	12.000	0.808	0.018	Y	NA
7698093	7698094	Tola_0114	Tola_0115			TRUE	1.000	10.000	0.815	0.018	Y	NA
7698094	7698095	Tola_0115	Tola_0116			TRUE	0.999	15.000	0.814	0.024	Y	NA
7698095	7698096	Tola_0116	Tola_0117			TRUE	1.000	8.000	0.789	0.024	Y	NA
7698096	7698097	Tola_0117	Tola_0118			TRUE	1.000	3.000	0.653	0.003	Y	NA
7698097	7698098	Tola_0118	Tola_0119			TRUE	0.998	8.000	0.730	1.000	N	NA
7698098	7698099	Tola_0119	Tola_0120			TRUE	0.775	28.000	0.089	1.000		NA
7698099	7698100	Tola_0120	Tola_0121			TRUE	0.455	141.000	0.194	0.018		NA
7698100	7698101	Tola_0121	Tola_0122			TRUE	0.999	16.000	0.810	0.018	Y	NA
7698101	7698102	Tola_0122	Tola_0123			TRUE	0.990	32.000	0.509	0.024	Y	NA
7698102	7698103	Tola_0123	Tola_0124			TRUE	0.976	26.000	0.549	1.000	N	NA
7698103	7698104	Tola_0124	Tola_0125			TRUE	0.981	44.000	0.873	1.000	N	NA
7698104	7698105	Tola_0125	Tola_0126			FALSE	0.106	197.000	0.000	1.000	Y	NA
7698107	7698108	Tola_0128	Tola_0129			TRUE	0.965	53.000	0.428	1.000	Y	NA
7698112	7698113	Tola_0133	Tola_0134			TRUE	0.996	4.000	0.429	NA		NA
7698113	7698114	Tola_0134	Tola_0135			FALSE	0.245	69.000	0.000	1.000		NA
7698116	7698117	Tola_0137	Tola_0138			FALSE	0.324	121.000	0.033	1.000	Y	NA
7698117	7698118	Tola_0138	Tola_0139			TRUE	0.999	-3.000	0.574	0.056	Y	NA
7698118	7698119	Tola_0139	Tola_0140			TRUE	0.999	-3.000	0.574	1.000	Y	NA
7698119	7698120	Tola_0140	Tola_0141			TRUE	1.000	11.000	0.967	0.023	Y	NA
7698120	7698121	Tola_0141	Tola_0142			FALSE	0.129	70.000	0.000	1.000	N	NA
7698121	7698122	Tola_0142	Tola_0143			TRUE	0.997	-3.000	0.405	1.000		NA
7698122	7698123	Tola_0143	Tola_0144			FALSE	0.034	196.000	0.006	NA		NA
7698123	7698124	Tola_0144	Tola_0145			TRUE	0.996	3.000	0.248	NA	Y	NA
7698124	7698125	Tola_0145	Tola_0146			FALSE	0.084	87.000	0.000	1.000	N	NA
7698128	7698129	Tola_0149	Tola_0150			TRUE	0.994	6.000	0.126	0.003	Y	NA
7698129	7698130	Tola_0150	Tola_0151			TRUE	0.979	-3.000	0.122	1.000	N	NA
7698130	7698131	Tola_0151	Tola_0152			TRUE	0.985	22.000	0.305	1.000	Y	NA
7698131	7698132	Tola_0152	Tola_0153			TRUE	0.971	18.000	0.058	0.027	Y	NA
7698133	7698134	Tola_0154	Tola_0155			TRUE	0.957	-19.000	0.033	1.000		NA
7698134	7698135	Tola_0155	Tola_0156			TRUE	0.979	3.000	0.124	NA		NA
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7698136	7698137	Tola_0157	Tola_0158			FALSE	0.209	47.000	0.005	1.000	N	NA
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